Tandem Repeats Finder Program written by: Gary Benson Program in Bioinformatics Boston University Version 4.09 Sequence: NW_019167993.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_25, whole genome shotgun sequence Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Pmatch=0.80,Pindel=0.10 tuple sizes 0,4,5,7 tuple distances 0, 29, 159, 1000 Length: 17943224 ACGTcount: A:0.35, C:0.15, G:0.15, T:0.35 Warning! 94000 characters in sequence are not A, C, G, or T File 93 of 100 Found at i:15997706 original size:17 final size:18 Alignment explanation
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* * * * * * 16009563 GTTTGATGCAAA-A-ACAAAAGGT-TAT-AAC-AATTT-G-ACATA-AATAATTTTTCATATAAT 112 AATTG-TTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-CT * 16009620 CTTAATTA 174 CTTACTTA ** * ** * * * * ** 16009628 TTTAAACTGGTTCG-GCA--AACAGATT--TATT-TTTTAAATCTCATAGTTATTAAATTTCAGA 1 -TT-AA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--AT-T--TCG--AATAAGCTT--G- * * ** ** **** * *** 16009687 ATATTACTA-AATTATTATT-TTTTATTTCAAATA-AGCTTGT-ATGAATAGAAGCTATTGTTTT 53 -TATGAATAGAA--ACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTCAT-AA-CG-A--T-TTGAAAT ** * * * * * * * * * 16009748 ATGAT-A--GAACAAA-AGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACA-A-TCATGACTA 108 A-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-T--TTGGT-AAATAGATTTAT--TTT * * * 16009807 TT--ATCAAC-AACCATA 166 TTAAATC-TCTTA-CTTA ** * * * ** ** * * * * * * * * 16009822 TTTCTTTTTTA-AATCTCT-TTTAATTCTTAAAATATTA-AT-AAATTAGCATTATTTTTATTTA 1 -TTAATTTTTAGAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TT-GTATGA-ATA * * * * * 16009883 -AAAAAAGCTTGTATGTTGAATGAAAATTGTTTTATGACAAAA---CAAAAAGTAATAGTGATTT 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AACTATTTGAATTTGTTCAATAAAT-TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-GAA * * * ** * * * * * 16003367 TATTAATAAAATAGCATTATTTTATTTTGAATAAGGTTTTTTGAACAAAAACAATTGGTTTATGA 192 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-AATTGTTTTATGA * * ** * 16003432 CAAAACAAATGATCATAATGACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TG 256 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT- ** * * ** * * * 16003496 TGTTCAAAAAATTGATTTATTTTTTAAAATTTTACTTATTAATATTTGGAACATTAATAAATTTA 320 TGTTTGATAAATAGATTTATTTTTT-AAA--TCCCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTA ** ** * 16003561 -TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTACATGAATAGAACCAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGT 381 GTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT * * * * * * * 16003625 CAAAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACA 445 CATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATA * ** 16003689 GATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA 509 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16008238 TTAATTTTTGGAATATTATTAAATTTGTATTATTTTTAAT-CGAATAAGCTTCTATGATTAGAAA 1 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAA * * * ** * * ** * 16008302 AAATTGTTTTATTACAAAAC-AAAGATTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAATCA- 64 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * * ** * ** * * 16008365 AATTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGATTTATGGTTT-AATCTGTTACCAATTAATTTTTAAAA 129 AACTATTTGAATTTGTTCAATAAAT-TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-GAA * ** * * 16008429 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTAAG 192 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AATTGTTTTATG * * * * * * * 16008493 ACAAAATAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GCCCATAATTATTTTAAC 255 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAAC * * * * ** 16008557 -TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA-TTTGGGAAATATTAATAAA 319 TTG-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--CCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA ** * * * * * 16008620 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* * * 16009023 CAATTATTTTATGACAAAA-GAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTTATATAGACTT 64 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT * *** ** * ** 16009087 AACTATTTGAATTAGTTTGGT-AATTAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTGGTTATTCAGTTTCAA 129 AACTATTTGAATTTGTTCAATAAATT--ATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATT-AATTTCTG * ** * ** ** * * * * * * 16009150 AATATTATTAAA-TTACATTACTTTATTTTGAATAAAATAGTATAAACAAAACCAATTATTTGAT 190 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA-AAATTGTTTTAT * * ** * * * 16009214 GACAAAATAAAAAGGTTATAATGATTTGATATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAA 254 GACAAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * ** * * * * 16009279 ATGGTTT-AGCAAGCATATTTACTTTTTAAATTTCTTAATGATTAATTTTTTA-AATATTAATAA 318 CTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAA-TCCCT--T-ATTAA-TTTTTAGAATATTAATAA * * * * * * 16009342 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC-T-TAT-ATTA-AAAGCAATTATTTTATGACAAAATGA 377 ATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-TAATTGTTTTATGACAAAA-CA * ** * * * * 16009403 AAA-GTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAGTTATAATTATTTGAA-TTGGTTTTG 439 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGG * * * * * 16009466 TAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTAC--A--AAGTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTA 503 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTA * * * * * * * * 16009526 TTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAGCTTAAATAATTGTTTGATG-CAAAAACAAAAGGTTATAA 567 TTTTATTTC-AATAAGCTTATATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAATGTCATAA * * * * * * * * * * * * * * 16009590 CAATTTGACATAAATAATTTTTCATATAATCTTAATTATTTAAACTGGTTCGGCAAACAGATTTA 629 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA ** * 16009655 TTTTTTAAATCTCATAGTTA 694 -TTTTTAAATCTTTTACTTA * * * * * * * 16009675 TTAAATTTCAGAATATTACTAAATTATTATT-TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAGC 1 TTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC * * * * * * * * * 16009739 TATTGTTTTATGATAGAACAAAA-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATG 65 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* * * * 16013251 TTAAATTATGAAAGATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAA-AAAGCTTGAATGTTCATA-A 1 TT-AATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAA-CTTGTATG--AATAGA * * * * * * * * * * * 16013314 AA-AATTCTTATATGACGAAACAAGAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTGACATAGCC 62 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC * * ** * * * ** 16013378 ATAATTATTTGAA-CTGATTCGGTAAACATATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAAATTT-T 127 ATAACTATTTGAATTTG-TTCAATAAA-TTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTCT * * ** * * * * ** 16013441 AGAATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGGACTGAAATGATTGTTTT 189 -GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA-TGAATAAAAAAATTGTTTT * * * 16013506 ATGACAAAGCGAAAGGTCATAACTAA-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG----GA--A-TTG 252 ATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * 16013563 -----GTTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTAATTATAAATGTTT-GAAATATTAAT 316 AACTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CC---TTATTAATTTTTAG-AATATTAAT * * * * 16013621 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* * * * * 16014027 AAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATCGTCTT 64 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT * **** * * * * * 16014092 AACTATTTGAATTAGTTTGGCAAATACATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTGATTTTTAGAA 129 AACTATTTGAATTTGTTCAATAAAT-TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-GAA * * * * * * * * * 16014157 TATT-ATTAATTTAGCAATATTTTACTCCGAATAAGTTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATG 192 TATTAATAAATTT-GTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATG ** * * * * 16014221 ACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAACT-GGT--TTG-----ATA--AAT-A-TATTT-AGCT 255 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT ** *** * * * * * * *** * * 16014272 T-TTAAATCTCT-TATTAATTTTTGAAAT--ATCA-AAAAAATTAG--TATT-AT---TTTGTTT 320 TGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT * * * * * ** * * 16014326 TGA-ATAATTTTG--TATG--------AATGGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTAAT 385 T-ATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT * * * * * * * *** 16014380 AA-CAGTTTGAAATAGATGATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGAT 448 AATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGAT * * * * 16014444 TTATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTGTTTTATTTC 512 TTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC ** * * * 16014508 AAATAAAATTATACGAGTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAA 576 -AATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTGAA * * * * * ** 16014572 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTCT-CTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAA 638 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTT-A * 16014636 AATTTTTTACTTA 700 AATCTTTTACTTA * ** * * * * 16014649 TTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCGAACAAGCTTTTATGAATAGAAAC 1 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC * * * * * * 16014714 AATTGATTTATGACAAAGCAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTCTTCAAAGAGTCATA 65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA ** * * * * 16014779 ACTATTTGAACATGTTTAGA-AAACATATTTATTTTTGAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAA 130 ACTATTTGAATTTGTTCA-ATAAA-TTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTG-AA * * * * ** * * 16014842 TATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACATAACCATTTATTTTATGA 192 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATGA * * *** * 16014907 AAAAACAAAAGGTAATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT 256 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT ** * * * ** * * * 16014972 GTTTGGCAAACAAATTCATTTTTTTATTTTCTTACTCATTAATTTTTAGAAGATTAATAAATTAG 321 GTTTGATAAATAGATTTA-TTTTTTA-AATC--CCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG * * * * * 16015037 TTTTATTTTATTTCGAATAAGC-TGATATGAACTA-AAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAGC 382 TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTG-TATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG * * * * * * * * 16015100 TTACAATAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGAAAACA 444 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATA * * * * 16015165 TG-TTTATTTTTTAAAATCGT-TTACTAATTAATCGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTT 509 -GATTTATTTTTT-AAATC-TCTTACTTATTAAT-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * * * ** 16015227 TATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAAGTCATAAAAAT 570 TATT-TCAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGAT * * * * ** * * 16015292 TTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTT 633 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTT 16015357 TAAATCTTTTACTTA 698 TAAATCTTTTACTTA *** ** * 16015372 TTAATTATCCTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-CGAATAAAGCTTGTATGAATAGAAA 1 TTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAA-CTTGTATGAATAGAAA * * ** * * * * * * * * 16015436 AAATTATTTTACAACAAAATAAAACGTTATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTGAAATAGTTAT 64 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT * * * * ** ** * * * * 16015501 AATTATTTAAACTTATTTGATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAA 129 AACTATTTGAATTTGTTCAATAAA-TTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-GAA * * * * * 16015566 TATTAAT-AATTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACT-GAAATATTATTTTTAT 192 TATTAATAAATTT-GTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATT-GTTTTAT * * * * ** * * * * * 16015629 GATAGAACAAAATGTTATAAGGATTTGAAGTAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTG-AT 254 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC * * * * * * *** * 16015693 TTAATTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTAGTT-ATTAATTATTGAAATATTAATAAA 319 TT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTTA-TTAATT--TT-TAG-AATATTAATAAA * * * * 16015757 -TAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACT-ATTATTTTATGGCAGAACACA 378 TTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-TAATTGTTTTATGACAAAACA-A ** * * ** * * * * 16015820 AA-GTCATAACAATTTGAAAGAAATAATTACTCAAATAGTCA-CACATATTTAAACTGGTTTGAT 440 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTTGGT * * * 16015883 AAATAGATTTA-TTTTTAAA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAG---TATT 504 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * 16015941 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16016330 TGATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGT-GTACAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTT-A 253 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * ** * * * 16016393 AATTGGTTCAATAAACAAATTTATATTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTT-GAA-AGTTTAAT 317 ACTT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAGAATA--TTAAT * * * * * * * 16016456 AAGTCAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATG-ATAAAAAATAATTATTATATG-----AC 375 AAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC * * * * * * * 16016515 -AAAGTGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATTGCCATAATTATTTGAA-TAGATTT 438 AAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTT * * ** * * * 16016578 GGTTAACAGATACACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAT-AATTAGTATT 501 GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT * * * ** 16016642 ATTTTCTTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAAATCATAA 566 ATTTTATTTC-AATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA * * * * * * * * ** * * 16016707 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAATCTTAACTGTTTAAACTACTTTGGAAAATAGATTCA 629 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA * 16016772 TATTTTAAATCTTTTAGTTA 694 T-TTTTAAATCTTTTACTTA * * * * * * * * 16016792 TTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTATATGATTTGAAAT 1 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC * * * * * 16016857 AATTATTTTATAACATAATA-AAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA---A 65 AATTGTTTTATGACA-AA-ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA * * * * * * * 16016918 GAACTA---G--TTTAG--CAA-ACA-TATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCATATTAATTTTTTA 128 TAACTATTTGAATTT-GTTCAATAAATTATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCTG * ** * * * 16016974 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAGTAATTGTTTAA 190 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAA-AAATTGTTTTA * ** * * * * * 16017038 TGACAAAACAAAAGTTTGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAA 253 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA ** * * 16017103 C-TGATCCGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAGCTTATCAATTTTT-GAAATATTAATA 318 CTTG-TTTGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATA * * * * 16017165 AAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTT-TCATGAACT-GAAACT-ATTGTTTTATGATAAAA 376 AATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGT-ATGAA-TAGAAA-TAATTGTTTTATGACAAAA * * * * * * * 16017227 CAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTGTTTGAGCTTATTCG 437 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG * ** * * 16017292 GTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTA-TGTATTAATTTTTTGAATGTTGATAAATTAGTAT 502 GTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACT-TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT * * * * * 16017356 TATTTTATTTTAAATAAGCTCGA-ATGAACTAAAAAAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCAT 565 TATTTTA-TTTCAATAAGCT-TATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAT * * * * * * * * * * * 16017419 AATGATTTGAAATAGAGAATTACTCTAATA-ACCTTAGCTATTTGAACTGGTTTGGCAAACACAT 627 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGAT * 16017483 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTA 691 TTA-TTTTTAAATCTTTTACTTA * * * * ** * * * * * 16017506 TTTATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAC 1 TTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC * * * * * 16017571 AATTGTTTTATGACAAAACCAAAA--TCATAACAATATGAACT-AGT--TTGAT-AAATAG--AT 65 AATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA- * * * * * * * * ** * *** * * 16017628 TTAGTTTTTAAATTTCTT-ATTAACTT-TTGAAATATTAAA-AAATTA-GTATT-ATTT-T-ATT 128 TAACTATTTGAATTTGTTCAATAAATTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTGAAT * * * 16017686 CTTAAT--A-----ATT-TTGTA--T--A--AA-----TA-G----AAACAATTGTTTTATGACA 193 ATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAATTGTTTTATGACA * * * * * * 16017727 AAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGTTGATAGTTCAAATA--CATGACTATTTGAAGTTG- 258 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT * * ** * * 16017789 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTAACTTATTAATTTTTATAATATTAATAAATTGGT 323 TTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAA----TCCCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT * ** * * * * 16017854 ATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCA 383 ATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA * * * * ** * 16017919 TAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTAAACTCT-CCTGGTAAATAAA 447 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGA * * * 16017983 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGACAAT-TTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT 511 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT * * ** * * * 16018047 TGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTAATTTATGACAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGA 574 TCAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAATGTCATAACGATTTGA * * ** * * * * 16018112 AATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGAAAACATATCTATTTTTTAA 637 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTAA 16018177 AT-TTTTACTTA 701 ATCTTTTACTTA * * * * * * 16018188 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACC 1 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC * * * * 16018253 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGCTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA 65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA ** * * * * * 16018318 ACTATTTGAACATGTTCAATAAATAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAAATTT-TGAAA 130 ACTATTTGAATTTGTTCAATAAAT-TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTCTG-AA * * * * * * 16018382 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACTGAAACAATTATTTTATTG 192 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTA-TG ** * * * ** * 16018447 -CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGAAAATTATTCGCATAGTCATGACTATTTGAACT 255 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT ** * ** * * 16018511 TGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTGTCAAAATATTAATAAATTA 320 TGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTTA-TTA--ATTT-TTAGAATATTAATAAATTA * * * * 16018576 ATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTAT-AATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG 381 GTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG ** * * * ** * * 16018640 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* * 16019043 GATTATTTG-ATCTAGTTCCGAA-AACA-TATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATCA 129 AACTATTTGAAT-TTGTT-C-AATAA-ATTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TCT * * * * * * ** 16019104 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACATAAACTATTGTTTTA 189 GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTA * * * ** * ** * * * 16019169 TAATAGAACAAAAATTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATACTTATAACTATTTGCA 253 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * 16019234 CTGGTTTGATAAATAGGTTTATTTTTTAAATCCCTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAGATTAG 318 CTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAG * * * * * * * * ** * 16019298 GATT-TTTTATTTTGAACAAACTTATATGAAGA-AAACATTTATTTTACAAAAAAACAAAAGGTC 382 TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC ** * * * 16019361 ATAACAAGTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAAC-CGATTAGGTAAATA 446 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTG-TTTGGTAAATA * * * * 16019423 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16019803 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAGTAAACTTGTATG-ATACAAAACAATTGTTATATGAC 194 TTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAA-AATTGTTTTATGA- * * ** * * * * 16019867 CAAAA-AAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATACTTGTTGAAATGGTCATAATTATTTGAA-TT 256 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT * * * * * * * 16019930 AATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTA 321 -GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAA--TT-----T-TT-A-GAA-TA * * * 16019995 GTATCAATTCTTGGACTATTATTAACTTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATCGA 370 -T-T-AA----T--A--A--ATT-A----GTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGA * * * * * * * 16020060 AATAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAACTGTGCAAATAG-- 416 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC * * * 16020123 ---AC-------AC-GGTTCGGTAAATAGATTTATTTGTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAA 481 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA * * * * 16020173 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAGACAATTGTTTTA 546 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTATATGAAT-AAA-ACAATTGTTTTA * ** * * * * * * 16020237 TGACAAAATAAAA-GTTTGTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGTCGTAATTATTTGA 608 TGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGA * * * * * 16020301 A-GTGATTCGATAAACTA-ACTTATTTTTCAAAT-TTTAACTT- 672 ACTTG-TTTGGTAAA-TAGATTTATTTTT-AAATCTTTTACTTA * * * * * ** 16020341 TTCAATTTTTGAAATATTATTAAAGTAATATTATTTTATAT-CAGATAAGCTTTTATGAATTCAA 1 TT-AA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA ** * * *** * * * 16020405 ACAATCATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATTCTTAT-TAATATATAATTGTTTAAATAGTC 63 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC * * * * * ** * 16020469 A-AACTATTTAAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAACTTCTTGTTTATTAATTTTTT 127 ATAACTATTTGAATTTGTTCAATAAA-TTATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTCT * * ** * * * 16020533 GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAAAAATTATTTTA 189 GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT- * * * * * * * * * 16020598 ATGACTAAACCAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAAATAATTGATCTAATAGTCTTAACTATTTGA 252 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * * * 16020663 ACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAT 317 ACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA * * 16020728 TTAGTAATATTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAA 378 TTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA * ** * * * * * 16020792 GATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTGAAGTAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAA 442 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA * * 16020857 TAGATTTAATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA 507 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA * ** * * * * ** * * * 16020918 TTCTAAATAATTTTGTATAAATAGAAATAATTTTTTTAAAATAAAACAAAATGTTATAACCATTT 572 TT-TCAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTT * * * * * * * * 16020983 GAAATAGATAA-TAGCTCAAACAGACAAGATTATTTGAACTTGTTTGGTGAACATATTTATTTTT 635 GAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTT ** 16021047 TAAAT-TTCCAACTTA 698 TAAATCTT-TTACTTA * ** * *** * * 16021062 TTAATTTTTACAATCCTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTTATATGAATAGAAA 1 TTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAAT-AAACTTGTATGAATAGAAA * * ** * * * 16021127 CAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATGAATAATTGTTCAAAGATTCAT 64 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT * * ** * * * 16021192 AACTATTTGAACTTGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGA 129 AACTATTTGAATTTGTTCAATAAAT-TATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTCT-GA * * * * * * 16021257 ATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATG 191 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATG ** * * * 16021322 ACAAAACAAAAAAATCATAACAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCACAAATATTTGAAC 255 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* 16021767 AATCTTTTACTCA 700 AATCTTTTACTTA * * * * * 16021780 TT-ATTTGTCAAAATATTTATATATTAATATTATTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAATAGAA 1 TTAATTT-T-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA * * * * 16021843 ACAATTGTCTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAGTCA 63 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA * * *** ** * * 16021908 TAAAC-CTTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTATCTT 128 T-AACTATTTGAATTTGTTCAATAAA-TTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TCTG * * * ** 16021972 AATATTAATAAA-TTGTATTATTTGATTTGAAATAAGCTTGTGTGAATAGAAAAAA-TCATTTAG 190 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTA- * * * * * * 16022035 TGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAA 253 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * * 16022100 CTTG-TTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCA-AAAATTAATAAC 318 CTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA * * * * 16022163 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TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC * ** * 16022564 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA 65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA * * * * * 16022629 ATTATTTGAACTGGTTAGGCAAATAAA--A-TTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGA 130 ACTATTTGAATTTGTT---C-AATAAATTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTG- ** * * * 16022691 AATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTAT 190 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTAT * * * * * 16022756 GACAAAACAAAA----AT---GATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGTCTTAATTATTTGAAC 254 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC * ** * * * * ** * 16022814 TAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTTTTATATT 319 TTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT * * * * * * 16022879 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAAAAAAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGG 380 AGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG * * * * * * * * * * 16022944 TTATAACGATTTGAAGTATG-CAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGATAAAC 444 TCATAATGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT * * * * 16023008 AAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTA 508 AGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA * * * * * * * * 16023073 TTTCAAATAAACATATATG-ATAAAAACAATTATTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTT 572 TTTC-AATAAGCTTATATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTT * * * * * * * * * * 16023137 GAAATTGATAATTGTTGAAAT-GGCTATAATTATTTGAAC-TGATTTAGTATATAGATTCACCTT 635 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTA-TTT 16023200 TTAAATC----ACTTA 697 TTAAATCTTTTACTTA * * * *** * ** ** * 16023212 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGACTAAGGTTGTATGAATTCAGAC 1 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAAC * * * * * * 16023277 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTTACATAGTCATA 65 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* ** 16026301 TTACT-TATT-ATTTTG-TC-A-AAA-TATTAATAAATTATATTATTTTA-ATATGAATAAGCTT 128 TAACTAT-TTGAATTTGTTCAATAAATTATTTATTTTTTA-AATCTTTTACTTATTAAT-TTC-T * * * ** * * * * * 16026359 G--TATGAACTAAA--AGAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCAT-AACGATTTAAAATAAAT 189 GAATATTAA-TAAATTTGTATTATTTTATTTC---A-AATAAG-CTTGTATGA-ATAAAA-AAAT ** * ** * * * * * * 16026419 AATTGT-T-------CAAATTGTGATAACTATTTGAACT---TATTTAGTAAACAAATTTATTTT 246 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-GT--TCAAA--TA--GT ** * * * * ** * ** *** * 16026473 TTTAAATCTTT-TACTT-TTTAATGTAT-GA-ATA-TTAATAAAGTTGTGTTATT--TTATTTGG 304 CATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCCCTTATTAATT-TTTAG ** * ** * ** * 16026531 AATAAGCTTGTCTAAA-TAGAAAAAATTGTT-TTATGACA-AAGC----A--AAAAGTTAT-AGT 366 AAT-A--TT-AATAAATTAG-TATTATT-TTATT-TGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATT * * * * * * * ** ** ** 16026586 G-ATT-TGA-AAAAGATAATTGTTCA-AAT-A-GTCATA-AG-TAATTGAACTTAT-GTGGTAAA 423 GTTTTATGACAAAACA-AA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AA * * * * * * * ** * * 16026642 CAAATT-CA-TT-TTT--TAAAT--CTCTTACTTATT-AAT-TTTTGAAATATTAATATGTT-AG 485 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAAT-TTTTAAA * * * * ** * * * * ** 16026697 A-ATTATATCATTTCA-AATAAGGTT-GTACGAATAAAAGCAATTGATTTGTGATAAAACAAAAG 547 ATATTA-ATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-AAT--AAGC--TT-ATATG-AATAAAAC-AATT * * * ** ** * * * * * 16026759 GTTATAATGATTTGAAATAGAAAATTGT-ATAAATAGTCAGAACCAACAAATTCATTTTTAAAAT 602 GTT-TTATGA---CAAA-ACAAAA-TGTCATAACGA-TTTG-A--AATAGA-TAATTATTCAAAT * * * *** 16026823 CTGT--TG-CT-TATT-AA-TT-TTTAG--AAT--A-TTA---ATAAAT-TGGCA-TTA 656 -AGTCATGACTAT-TTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTA * * * * * * ** * * * 16026865 CTTTATTTTGAATAAGACTATATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAATGGTCAT-AA 1 -TTAATTTTG-A-AATATTA-AT-AA-ATTAA-TATTATTTTATTCCAAATAAACTTGT-ATGAA * ** * * ** * * 16026929 TAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTACAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATATAGA 58 T-A---G----AAACAATTGTT-TTAT-G-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATA * * * * * * ** 16026994 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* * * * * * 16032355 TTGACTT-AGTCAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTTTTAA-TTTTGGAATATTAATAAA 319 TTG-TTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC----CCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA * * * * * * * * * 16032418 TTATTATTATTTTATTTCAAACAAGGTTTTTTTGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAA 378 TTAGTATTATTTTATTT-GAATAA-GCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA * * * * * * * * **** 16032483 TGTTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATCTAAACGTGTTAAAAAA 441 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAA * * ** * * ** 16032548 ATTGATTTATTTATTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAACATTAATAATTTTTTATTATTT 506 ATAGATTTATTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * * * * * * * 16032611 TATTTGAAATAAGCTTGTGTGAATGGAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGTT 570 TATTT-CAATAAGCTTATATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGAT * * * * * 16032676 TTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATATATTTATTTT 633 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA--TT * * 16032741 TTTAATTCTCTTACTCT- 696 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*** ** 16034941 ACAGCCAGTTACGTCACCTTCATGTCCACGGCAGC-TA-GCCAA-GCAA-AATGTAGTTTCCATA 556 A-A-TTAG-TA--TTA-TTTTAT-TTCA-ATAAGCTTATATGAATAAAACAAT-T-GTTT---TA *** * * * ** * * * * 16035002 T-ACCTAATTTTAACAAGGTGAT--C-ATCTGAACCAG-TAA-TAAT-ATAT-CTCCCA-GAGCG 608 TGA-C-AA-AACAA-AATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT--CATGA-CT * * * *** ** ** * * ** * 16035058 A--TCAA---GTATGGCACAATAGACAGCATTCCGATGTACCCTCAACTTCG 666 ATTTGAACTTGTTTGGTA-AATAGA-TTTATT--TTTAAATCTTTTACTT-A * ** *** ** ** ** ** * * 16035105 TTATATTTTG-CAT-TTTTTTTTTTGCACCATGGTAGATGGTTTAACAATAGCATAGCATGCAGA 1 TTA-ATTTTGAAATATTAATAAATT--A--ATATTATTTTATTCCA-AATA--A-A-CTTG--TA * * ** * * * *** ** *** * *** * * 16035168 GCGAACAGAAGGAGATCG-GTGATG-C-TTCCAAAACCTGC-CCCCAATTT-CTCT-TATACTTA 54 -TGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAAATAATT- ** * ** * ****** * *** ** * 16035227 GCCCCCAAACTTGATCAGCTTGC-ATGTGAAGCCAACACAGATAGGCAAGTATAGGCTTCTCCTG 115 G--TTCAAA-TAG-TCA--TAACTATTTGAA-TTTGTTCA-ATA---AATTAT-TTATT-TTTTA ** * * * * * *** * 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16036321 TCAAA-TAGTTAATTATTTGATCAAGTTCG-GTAAACATATTTATTTTTACAATTTTTTACTTAT 374 T-AAATTAG-T-ATTATTT--T--A-TTTGAATAAGC-T-TGTATGAATAGAAATAATT-GTT-T * * ** * * * * * * * 16036384 TAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGT-ATTATATT-AATCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAGA 427 T-A-TGACAAAACA--AA-AGGTCA-TAATGAT-TTGAA-ATAGATAA--TTGT-TCAA-ATAGT * * * * * ** *** * * * ** * * ** 16036447 C-T-ATTGTTTTATAATAGAATAAAAAATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCCTAAATATTC 480 CATAACTATTTGA-ACTTGTTTGGTAAAT-AGATTTATTT--TTTAAAT--CT-CTTACTTA-T- * * * * * * * * * 16036510 ATAACTATTTGAATTGGTTTGATAAATATA-TATATATATATATTT-TA-AATCTCT-TATTAAT 536 -TAA-TTTTTAAAAT--ATTAATAAAT-TAGTAT-TAT-TTTATTTCAATAAGCT-TATATGAA- * * * * 16036571 TTTCAAAACATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTCGA-ACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATT 592 --T-AAAAC------A-ATT-G-----TTTTA--T-GACA-AAAC-AAAATG-TC-ATAACGATT *** * * * * * * 16036634 TGTTTTATGACAA--A-ACAAA-AGGTCAT-AATAATTTGAAATAAATAATTAT-TTAAATAGTC 634 TGAAATA-GATAATTATTCAAATA-GTCATGACT-ATTTGAACT---T-GTT-TGGTAAATAG-- * 16036693 ATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAACCATAATTATTTTTTAAATCTCTTATTGA 689 ------ATTT--A-T--TT---T-----TAA--ATCTTTT--A---C---TT-A * ** * * ** * * 16036747 TTAATTTTTTAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTTCAAAT-AGTTTAGTAAGAGCTA-AA 1 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTT-GTATGA-ATAGAA * * * * * * * 16036810 AAAATTGTTTTATGATAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAG-AA 63 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA * * * ** * * 16036874 AAACTATTTGAACTCGCTTGGCGAAT-AA--ATTTATTTTTTAGTTCTTTTAGTTATTAATTTTT 128 TAACTATTTGAATTTG-TT--C-AATAAATTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT * ** * * * * ** 16036936 AGAATATTATTGTATTTGTATTATTTTATTCCCACTAAGCTTGTATGAACATAATTAATTGTTTT 189 -GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTT * ** * * * * * 16037001 ATGAC-AAACAAAAGGTTAT-ATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGA 252 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * * ** * ** 16037064 ACTAG-CTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAATTCTTTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTGC 317 ACTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC----CCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA * ** * * * * * * ** 16037128 ATTTGTATTATTTTATTCCCAATAAGTTTGTATGAACATAATTATTTGTTTTATTATGAAA-AAA 377 ATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA * ** * * * * ** 16037192 AGGTTATAACAATTTAAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTGGAA-TTGGTTTAATA 441 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTA * * * 16037256 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTT 505 AATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT * * * * * 16037321 TATTCCTAATAGGCTTGTATATTAA-AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACA 570 TATTTC-AATAAGC-T-TATATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACG * * * * * 16037384 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAAC-TGTTTGATAAACT-GATTTAT 631 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-TAGATTTAT * * 16037447 GTTTTAAATCTCTAACTTA 695 -TTTTAAATCTTTTACTTA * * * ** * * 16037466 TCAATTTTTATAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAAA-AAGCTTTTATGAACT-GAA 1 TTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAA ** * * * * * * 16037529 ATGATTGTTTTATGATAAAATATACGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA 63 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA * * ** * * * * * 16037594 AAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTT-TTCTCT-AATTTTTTACTTAATAATTTTCTGA 128 TAACTATTTGAATTTGTTCAATAAAT-TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCTGA * * ** * * * ** * 16037657 ATGTTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAGTTGAAGCAATTATTTTATG 191 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAAAAATTGTTTTATG * * ** * * * 16037722 ACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGATATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-T 255 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT * ** * * * * * 16037786 TGGTTCGGCAAA-CGCATTTATTTTTTAAAT-CCTTATTAATGTTTAGAATATTATTAATTTAGC 320 T-GTTTGATAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCCCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT * * * * * * 16037849 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16038218 AAA-TATAT-AATTAT--C--AA-GATA-GTCATAACTATTTGAGCT---T-ATTCGAT-AAATA 61 AAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT-GTTCAAATA * * * * * * * ** * * * * 16038270 G--ATTTATTTTTTTAA-TT-CTC-CT-ACTT-TTTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT-AT 124 GTCA-TAACTATTTGAATTTGTTCAATAAATTATTT-ATTTTTTAAATCTT--TTACTTATTAAT * * ** ** * * * ** * * * 16038327 TATCT--TTTTTCAAATAAGCTTACATGAATTGA-GAC-AAT-TG-TTTTATTACA-AAGAAAAA 185 T-TCTGAATATT--AATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAA-AAAAA * * **** ** ** * * * 16038385 -GGTTATAATGATTTGA-AGTA-G--ATAATTA-TTCAAACAG-TCA-TGATT---AT--T--TG 245 TTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCAT- * * ** * 16038435 AACTA---G--CTCG---G-TAAA-A-ATATATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAGTTGTTGAA 307 AACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTTA-TTAATT--TT-TAGAA * *** * * * * 16038488 TTATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGGAAGGATAGAAACAATTGTTTTATG 368 -TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATG * * * * 16038553 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ATAACTATTTGAATTTGTTCAATAAAT-TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTG- * ** * * * 16039713 AAGATTAATAAA--T-TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGCATG-ATAAAATAACAATGGTTAT 190 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAA-AA-AATTGTTTT * * * * * * * 16039774 ATGACCAAACAAAAGGTGATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GACCATAATTATTTA 252 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTG ** * ** * * * * 16039838 AACTAATTCGGCAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACATATTAATTTTTGGAATATTAATAA 316 AACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA * * * * 16039903 ATTAGAATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAA 377 ATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAA * * * * ** * 16039967 AAGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATCAGAATTTGTTTGGTA 440 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTA * * * * 16040032 AACAAAAGTTT-TATTTTAAA-CTCTTGCTTATTAA----T----T-TT--T--ATT--TA--A- 505 AA-TAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT ** * * * * * * * 16040077 --T-TTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTATGTCAAAGCAAAAGGTCATAATGA 568 TTTATTTCAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGA * * * * * * * * * 16040139 TTTTATACA-ATTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAGTT-TTTCGGTAAACAAATTTAT 632 TTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAATAGATTTA- ** 16040202 TTTTTCAAATCTTTTGGTTA 694 TTTTT-AAATCTTTTACTTA * * * * *** * * 16040222 TTAATTTTCCAAATGTTCATAAATT-TTGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGACAT-GAA 1 TTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAAT-ATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGA-ATAGAA * * * * * * * * * * 16040285 ACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGT-TTGAACTATTTAAAATAAAAAATTATTCTAATAGTT 63 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC * * * * ** ** * * 16040349 TTAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAA 127 ATAACTATTTGAATTTGTTCAATAAA-TTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-G ** ** * * * 16040410 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A-TTAA----T-AAAGTAGT-ATTATTTTATTTCAGATA-AGGTTTGATGACCTAAAATAACTAT 285 AGATAATTGTTCAAA-TAGTCA-TA-ACTATTT--GA-ACTTGTTTGAT-A---AATAGATTTAT * *** * * ** * * 16042743 TTTATGACAAAATGAATGGTCA-TAATGACTTTAAATGGAAAATTGTTCAAA-TAGTCA--AATC 340 TTT-T---TAAATCCCT--T-ATTAAT---TTT---TAGAATATTAAT-AAATTAGT-ATTATTT * * * * * * **** * ** 16042804 TATTTG---AA-CTTGTTTG-GTA-AACATATTTATTTT-TTA-AAATCTCTTGCTCATTAATTT 390 TATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAA-ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAATGA * ** * * 16042861 TTTG-AAT-GTTAA----T-AAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA 453 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCA-TA-ACTA-TTTG---AA-CTTGTTTG--GT-AAA * * ** * *** ** 16042918 TA-A-CTATTTTAT-AA-CT-AAAC--A-AAAAGGTTAAAATGATT--TGAAA-TAG-A-TAAAT 507 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT-ATTAAT-AAATTAGTATTATTT * * ** * ** * ** * 16042970 T-GTTCTAAT-AGTCTTA-ACT-ATTTGAAC--TAG--TT-TGACAAACACATTTATTTTTTAAA 570 TATTTC-AATAAG-CTTATA-TGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACA-AAATGTCATAAC ** * * * ** * * 16043026 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--AA--TA--AA-TTT--G--TA-T--TATTTTA-T-TTCAAATAAGCTT-----------GTAT * * * * * 16043440 GAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCA 234 GAATA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA * * * * 16043505 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTTGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA 298 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC----CCTTATTAA * * * * * * * * 16043570 TTTTTCGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTTTATGAACATAAACAATT 359 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATT * * * * * * * * 16043635 GGTTTACGATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAAACAATTCTTCAAATAGTCATAACTA 423 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA * ** * * * * * ** 16043700 TTTTAA-TGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAAAT-T-TTATTTATTAATTTATGGAATAT 488 TTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT * * * * ** * * 16043762 TAATAAATTTA-AATTATATTA-TCCGAAATAAACTTGCATGAACCAAACCAATTGTTTTATGAC 551 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* * * * * * * * 16044969 TTAGGTAAACAAAATTGTTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATTTT 322 TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTAT ** * ** * * * 16045033 TATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAACAAACCTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA 385 TATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-TAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA * ** * * ** * * 16045098 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTTGAA-TTGGTTCGACAAACAAA 447 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGA * * ** * * * 16045162 TTTATTATTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTGTTATTTTATTT 511 TTTATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT * * * * * * * * * 16045227 TAAATAAACTTGTATGTACA-AAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGA 574 TCAATAAGCTTATATG-A-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA * ** * ** * 16045291 AGTTTACAATTGCTCAAATAGTCATTACTATTTGAA-TTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTA 637 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTA * * 16045355 AATCTCTTACATA 700 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*** * * * 16046145 AATTGTTTTACGATAAAACAAAAGTTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATA 65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA * *** ** * * * * 16046210 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTCATTTTTTAAAAT-TTCTT-GTGTGTTAATTTTTTG 130 ACTATTTGAATTTGTTCAATAAA-TTATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACT-TATTAA-TTTCTG * * ** * * * * 16046273 AATGTTAATAAATTAT-TTTTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATAAACCAAAACAATTGTTTTA 190 AATATTAATAAATT-TGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTA * ** * 16046337 TGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA 253 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * * 16046402 CTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTATTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCA-AATGTTAATAA 318 CTTGTTTGATAAATAGATTTATTT-TTTAAATC-C---CTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAA ** * * * * * * 16046466 ATTAGTATTATTTTATTCCAATAAGCTTGTATGAACT-TAAACAATTATTATATGACTAACCAAA 377 ATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAA * * * * * * * * * * * 16046530 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* * * 16046921 AATCTATTTGAGTTTGGTAAATAGATT-TATA-TTTTTAAATCTCTTGCTCACTGATTTTTCAAA 129 AA-CTATTTGAATTTGTTCAATAAATTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-GAA * * ** * * * * * 16046984 TGTTAATAAAGTAATATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTTTATAAATTGAAATAATTGTTTTATG 192 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTATG * * * ** * ** 16047048 ACTAAACCAAAGGTCAAAATGATTTGAACTAGATAATTGTT-ATAATAGTTTTAACTATTTGAAC 255 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAAC * * * * * * * * * 16047112 TGGTTTGACAAACACATTTTATTTTTAAATATCTTACTGATTAGTTTTTAGAATATTATTAAATT 319 TTGTTTGATAAATAGA-TTTATTTTTTAA-ATC--CCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT ** * * * * * 16047177 AGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATTTGGAA-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAA- 380 AGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTAT-GAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG * * * ** * * ** ** 16047240 -TCTTAATAATTAGCGATGGATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAAT 443 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT * * * 16047304 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ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAAC ** * * ** * * * * 16048513 TTG-TCCAGTAAACAAATTCGTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCATAATACTAATAAAT 319 TTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT * * * * * * * * * 16048577 TGGCATTATTTTA-TTGCAGTAAACGTATATGAATTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAG 379 TAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG * * * * * * * * * * 16048641 GTCAAAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCATATAGTCATGACTAATTGATCTAGTTCGGTAAAC 443 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT * * * * * * * 16048706 ATATTTA-TTTTTAATTTTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA 508 AGATTTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT- * * * ** * * * 16048770 ATTTGAAAAAGCTTGTATGAATAGAAGTAATTGTTTTATAATAGAAA-AAAGA-GTCATAAGGAT 571 ATTTCAATAAGCTTATATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAA-ATGTCATAACGAT * * * * 16048833 TTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTT 633 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* ** 16050401 AACTGTTTTATGACAAAAC-AAATGTCATAACAATTTTAAATAAGTAATTAATCAAATAGTCATA 65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA * ** * * * 16050465 ACTATTTG-ATCTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGA 130 ACTATTTGAAT-TTGTTCAATAAA-TTATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCTGA * * * * * * * * * * 16050529 ATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCCGAATAAGTTTGTATGATATGAAACAAA-TATTGTAT 191 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-AT-AAAAAAATTGTTTTAT * * * * * * * 16050593 GACTAAA-AAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAAC 254 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC ** * * * 16050657 TAATTCGATAAACA-AATT-TTTTTT-AATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAAT 319 TTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAAT * * ** * * * 16050718 TAATATTAATTTATTCCCAATAAGCTTGTATGAACT-TAAACAATTATTTTATGACTAAATA-AA 379 TAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAA * * * * ** ** 16050781 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* * * * * * * * * * 16051184 AAACTATTTGAAATGGTTTAGTAAACATATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAA 128 TAACTATTTGAATTTGTTCAATAAA-TTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCTGA * * * * * * 16051249 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAATAATTGTTTGATG 191 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-AATTGTTTTATG * * * * * 16051314 ACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAAGTATTTAAATAGACAATTGCTTAAATAGTAATA 255 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-AG-A--T-AATTG----TT-C--AAATAGTCATA * * * * * * 16051379 GCTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTTAAAATCTCTT-TCGTAATTAATTCTT 308 ACTATTTGAACTTGTTTGATAAATAGATTTA--TTTTTT-AAATCCCTTAT--TAATT--TT-TA * * * * * * * 16051443 CAA-A-T-ATAAATTACTATTAATTTATTTTTAATAAGCTTGTATGAGTTGAAACAATTGTTTTA 365 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTA * * * * * * * * * 16051505 TAACTAAACAAAATGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAA 429 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * 16051570 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AACTTGTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAA----TCCCTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT * ** * ** * 16054294 CAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTACATGAACAGAACCAATTGTTTTATGAAAAAAC 375 -AAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC * * * * ** 16054358 AAAAGGTCATGATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTCAG 438 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGG * * * * * * 16054423 TAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCATTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT 503 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTAT * * * ** * * * * 16054488 TTTATTTCAAATAAACTTATTTGAATTGAAACGGTTGTTTTATTACAAAATAAAAGGTCATAATG 568 TTTATTTC-AATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACG * * * * * * * * * * 16054553 ATTTAAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATGACTGTTTCAACTTATTCGATAAACATATTTATT 631 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA-- * * 16054618 TTTTTTAATTTTTTACTTA 694 TTTTTAAATCTTTTACTTA ** * ** * * 16054637 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190 -AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAA-GCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT ** * * * 16057002 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTG 252 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG * * ** * * * 16057066 AGCTTATACGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATA 316 AACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTT-AAATC-C---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATA * * * * * 16057131 TATTAGGATT-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATG-ATATGAAACAAATATTTTATGA-ACAAA- 376 AATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAATAATTGTTTTATGACA-AAAC * * * ** * ** * ** 16057192 AATAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTTATCGTTTTAACTATTTGAA-TTGCTTTG 438 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTG ** * * * 16057256 ACAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTA 502 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * * * 16057321 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATAGAAAACAATTGTTTGATAACAAAGC-AAATGGTTATAG 567 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* * 16059306 TTAGTATTATTTTAATCCAAATTAGCTTGTATG-ATAAGAAACAATTTTTTTTTTTAACAAAAC- 378 TTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAATAA--TTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * * ** 16059369 AAAGATCA-AAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAG 439 AAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGG * * * * * * * * * 16059433 AAAACA-ACTTTAGTTTTAAAATCTCTTCCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTA 503 TAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * 16059497 TTTTATTTCAGATAA-ATATTTTTGAACTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GATCATA 567 TTTTATTTCA-ATAAGCT-TATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATA * * * * * * 16059560 ATGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCAT-ATATATTTGAACTTGTTAGGTAAACATATG 628 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGA-CTATTTGAACTTGTTTGGT-AA-ATA-G * * * * 16059624 AATT-TTTTAAAATCTCTTGCTTA 689 ATTTATTTTTAAATCTTTTACTTA * * * * 16059647 TTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAA 1 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AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA ** * * * * * * * 16060468 ACTATTTGAACGTGTTCAAAAAAAATAATTTATTTCTTAAA-ATTCTACTTATTAATTTTTAAAA 130 ACTATTTGAATTTGTTC--AATAAATTATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-GAA * * * * * 16060532 TATTAATAAATTTATATTGTTTTA-TTCAAAATAAGCTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATG 192 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTTATG * * ** * * 16060596 GCAAAACAAAAGGTCAAAACTGTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTTAAAC 255 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAAC * * * * * * 16060660 TTCTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTAGGAATATTAATAAAT 319 TTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAAT * * * * * * ** 16060724 TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATATGAACT-GATACAATTATTTTAAAATC-AAACAAA 379 TAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGA-CAAAACAAA * * * * 16060787 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTT-TTTGGGTA 441 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TATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAAC-AG 570 TA-TTTCAATAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGA- * * * * * * * 16062412 TTTTAAATAGATGATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTT 632 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA-TT * * 16062477 TTTTAAT-TTCTTGCTTA 696 TTTAAATCTT-TTACTTA * * * *** * * 16062494 TTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATCAGCTTGTATGAACT-GAA 1 TTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAA * *** * * * * * * 16062557 ACAATTATTTTATGACTGGACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGGTCT 63 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA 16062622 TAACTATTTGAA 128 TAACTATTTGAA 16062634 CTATTCGGCA Statistics Matches: 47949, Mismatches: 12399, Indels: 9741 0.68 0.18 0.14 Matches are distributed among these distances: 650 14 0.00 651 5 0.00 652 5 0.00 653 3 0.00 654 4 0.00 655 28 0.00 656 26 0.00 657 2 0.00 658 70 0.00 659 6 0.00 660 2 0.00 661 12 0.00 662 53 0.00 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* * * * * 16000878 AATTAGTATTTTTTTATTTAAAATAAG-TTTACATGAATTGAAACCATTGTTTTATTACAAAACG 377 AATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTT-TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * * * 16000942 AAAGGTCACAATGATTTGAAGTAAATAATTATTCAAATAGCCATGACTATTTAAACTTGTTTGGT 441 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGT * * * 16001007 AAAC--ATATATTTTTAAAAATCTTTTACTTA 506 AAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTA * *** * * * * * * * * 16001037 TTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTGGTATGGATAGAAAC 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA * * * * * 16001102 AATTGTTTTAT-AATAAAACAAGAAAGCCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC 66 AATTATTTTATGACT-AAACAA-AAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC * ** * * * * 16001165 ATAAAGATTTAAACTTG-TTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTGCCT 128 TTAACTATTTGAAC-TGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATT--TT * * * * ** 16001229 T-AATATTAATAAATTTGTATTA-TTTTATTTAAAATAAGTTTGTATGAATAAAAAAAATCATTT 186 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* * ** * * 16003969 AAAAAATGAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCGAATAGTCATAACGATTTGAA 254 ACAAAA--CAAAGATCATAACG-ATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * * * 16004033 CTAGTTCA-ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTGTCTT--AATATTAATA 316 TTGGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATA * * ** * ** * 16004095 AATTTGTATTATGTTATTCGAAATAAGCTTGTT-TGAA-TAGAAAAAATCATTTTATGACAAACC 377 AATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT-TTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC * * ** * * * * * 16004158 AAAAGGTTATAGTGATTCCAAATCGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGG 440 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGG * * * 16004223 TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA 505 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * ** * * * 16004255 TTAACTTTCGGAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTATATGAATTGAAA 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAA * * * * * * * 16004319 TAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAGTTTAAAAAAGATAATTATTCAAATAGTCG 65 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16007328 TTGAACTGCTCCA-ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCATAGTTATTAATTTTTGGATTATTA 311 TTGAATTGGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTCTTATTAATTTTTGAAATATTA * * * * * * * * * * 16007392 TTAGATTAGTATTGTTTTA-TATAGAATAAACCTGTATGAAC-AGAAATAATTATTTTATGACAT 374 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTA-AATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAA * ** * * * * ** 16007455 AACAAAAGGTTATAACAATTTCAAGTATAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-GGTT 437 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT ** * * ** 16007519 CAATAAATAGATTCATTTTTTAAATCGATTACTTA 502 CGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * * * * * ** 16007554 TTAA-CTTTTGAAAGACTAATAAATTATTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGCATG-ATAAAAA 1 TTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAA * * * * * * * 16007617 ACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTGATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GACC 65 A-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TC * * * ** * * * * 16007681 ATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTAGAATA 128 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TTAA-----TG----TTCATAAATTTGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGACA-TGAAA 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-ATTGAAA * * ** * 16008125 GAAA-TATTTTATGACTAAACAAAAGGT-TTGAATAATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAGTT 65 -AAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC * * * * * * 16008188 TTAACTATTTGAACTGGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAAGCTCTTATTAATTTTTGGAATA 128 TTAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-AAATA * * * * * * * 16008253 TTATTAAATTTGTATTATTTTTA-ATCGAATAAGCTTCTATGATTAGAAAA-AATTGTTTTATTA 192 TTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA--AAAAAACAATTGTTTTATGA ** * * * * * 16008316 CAAAACAAAGATTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAATCA-AATTATTTGAACTGG 255 CAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG * ** * ** * 16008380 -TTCGATAAATAGATTTATGGTTT-AATCTGTTACCAATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG 320 TTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG * * * * * * * * 16008443 TATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTAAGACAAAATAAAAAGT 383 TATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT * * * * * * * 16008507 CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GCCCATAATTATTTTAACTGATTTGGTAAACA 447 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACA * * 16008571 AATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTA 511 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA ** ** ** * 16008597 TTAA-TTTGGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAATTGAAA 1 TTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAA * * * * * * * * * 16008661 CAATTATTTTATGAC-AAATTAAAAAGCTTATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCGAATAGTA 65 AAATTATTTTATGACTAAA--CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC * * * * 16008725 ATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTGAATCTCTTTCTAATTAAATTTTT 128 TTAACTATTTGAAC-TGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTC--T-T-ATT-AATTTTT * * * ** 16008789 GAATGTTAATAAATTAGTATTA-ATTTATTATC-AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTT 187 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTT * * * * * * ** * 16008852 GATGACTAAACAAATGGTCAAAACGATTTGAAGTAT-ATAATTATTTTAATAGTCTTAACTATTT 250 TATGACAAAACAAA-GATCATAACGATTTGAAAT-TGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT * * * * * * * 16008916 GAAATGATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTTAAATATT-ATG 313 GAATTGGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAAT- * * * * * * * * 16008980 AAATTAGTATTATTGTAATATAAATACGCTTGTATAAAC-AAAACAATTATTTTATGACAAAA-G 376 AAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA ** * * * * * 16009043 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTTATATAGACTTAACTATTTGAA-TTAGTTTGG 441 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCGG ** * ** 16009107 TAATTAGATTTATTTTTTAAATTTCTTGGTTA 505 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * *** * * * * ** * ** 16009139 TTCAGTTTCAAAATATTATTAAATTA-CATTACTTTATTTTGAATAAAATAGTAT-AA-ACAAAA 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA * * * * * 16009201 CCAATTATTTGATGACAAAATAAAAAGGTTATAATGATTTGATATAGATAATTATTCAAATAGTC 66 --AATTATTTTATGACTAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC ** * * * * ** * * * 16009266 AAAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAGCATATTTACTTTTTAAATTTCTTAATGATTAATTTTTTA 128 TTAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAA-TTTTTA * * * * * 16009331 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAACTTATAT--TAAAAGCAATTATTTTAT 188 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAAAAAACAATTGTTTTAT * * * * * * * 16009393 GACAAAATGAAA-AGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTGCAAATAGTTATAATTATTTGAA 253 GACAAAA-CAAAGA-TCATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * 16009457 TTGGTTTTGTAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTTAC--A--AAGTTTTGAAATATTAATAAAT 316 TTGGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA- * ** * * * * * 16009518 TTA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAGCTTAAATAATTGTTTGATG-CAAAAACAAA 379 TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAA * ** * * * * * * * * ** * 16009581 AGGTTATAACAATTTGACATAAATAATTTTTCATATAATCTTAATTATTTAAACTGGTTCGGCAA 443 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAA * * 16009646 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTA 508 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * ** * * * * ** 16009675 TTAAATTTCAGAATATTACTAAATTATTATT-TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAGC 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA * * * ** * * * * 16009739 TATTGTTTTATGA-TAGAACAAAA-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCAT 66 AATTATTTTATGACTA-AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTT * * * * * 16009802 GACTATTATCAAC--A------ACCAT--ATTTCTTTTTTAAATCTCTT-TTAATTCTTAAAATA 130 AACTATT-TGAACTGATTTGGTA-AATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATT-TTTAAATA * * * * ** 16009856 TTAATAAATTAGCATTATTTTTATTTAAAAAAAGCTTGTATGTTGAATGAA-AATTGTTTTATGA 192 TTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG--AAAAAAACAATTGTTTTATGA * * ** * * * * * * 16009920 CAAAACAAAAAGTAATAGTGATTT-AAAAT-ATAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAATTG 255 CAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG * * * * * 16009983 ATTCAGTAAACT-TATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTA 319 GTTTAG-AAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA ** * * * * 16010047 GTATTATTTTATTTTGGATACGCTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAATGGT 382 GTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT * * * * * 16010112 CGTAATGATTTTAAATAAATAATTGTTGAAATAGTCA-AACTATTTGAACTTATTCGATAAACAG 447 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAG * * 16010176 ATTTATTTTTTTCAAATCTCATGCTTA 512 ATTTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTA * * * ** * 16010203 TTAATTTTTTGAATGTCAACAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAT 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA * * * * * 16010268 AGTTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAAACAATTATTCAAATAGTCTTA 66 AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTA * * 16010333 ACTATTTGAACTGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTATCAAAGTATTA 131 ACTATTTGAACTGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAA-TATTA * * * * 16010398 TTAAATTAGTATTATTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGAGAAA 195 ATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-AAAAAACAATTGTTTTATGACAAA * * * * * * * * * 16010462 ACAAAGATCATAATGATATGAGATTGATATTTATTCAAGTAGTCATAACTATTTAAAATGGTTCA 259 ACAAAGATCATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTA * * * 16010527 GAAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTGCATATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTA 324 GAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA * * * * * ** 16010592 TTTTATTTCAGATAAGGTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATTGTCATAAT 388 TTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT * * * * * * * * 16010657 GACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATTGTTA-AATCTATTTCAACTTGTTTGATAAATATATTT 453 GA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTT * * 16010720 ATTTTTTAAAATCTCTTAATCA 516 ATTTTTT-AAATCTCTTACTTA * * * * * 16010742 TTAATTTATTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATATGCTTGTATGAACT-AAAA 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA * * ** * * 16010806 TAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTTGA-AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCT 66 -AATTATTTTATGACTAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT * * * * 16010870 TAACTATTTGAATTGGTTCT-GCAAAGACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATA 129 TAACTATTTGAACTGATT-TGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTA-AATA * * * * * * 16010934 TTATTATATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAGGAAACACTTGTTTTATGAC 192 TTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAA-AAAACAATTGTTTTATGAC * * * * * * 16010998 AAAATAAAG-TCATAAAGATTT----TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTGTT 256 AAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGT * * * ** * * * 16011058 TTGGTAAATAGATTT-TGTTTTT-AA--TC-TCTTATTAATTATCAAAATATTAATAGATCAATA 321 TTAGAAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA * * ** * 16011118 TTATTTTATTCTAAATAA--TTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATTTT 385 TTATTTTATTTTAAATAAGCTTTT--ATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * * * * ** * 16011181 ATTACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGACAAACAAA 448 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGA ** 16011246 TTTATTTTTTAAATCTCAAACTTA 513 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * ** * 16011270 TTAATTTTTAGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAACTAAAATTGTATGAATAGAAA 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAA-TAAGCTTGTATGAATTGAAA * * * * * * 16011334 CAAGTT-TTTTATGAC-AAACCAAAAGATCATAACGATTTCAAAGA-ATAATTATTCAAATAATC 65 -AAATTATTTTATGACTAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC * * * 16011396 ATAACTATTTGAACTTG-CTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG 128 TTAACTATTTGAAC-TGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT- * * * * * * 16011460 GAATTTTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAAAAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGATTT 187 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTT * * * * 16011524 -TGATAAAA-AAA-ATCATAACAATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA 251 ATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * * * * * 16011586 -CGTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAAATTTC-ACTTATTAATTTTTTTGGAATATTAATA 316 TTG-GTTTAGAAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTCTTATTAA--TTTTTGAAATATTAATA * * * * *** * 16011649 AATTTA-AATTATATTGTTTGAAATAAGCTAGCATGAAC-AGAACCAATTGTTTTATGACAAAAC 377 AA-TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC * * * 16011712 AAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATTATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGG 440 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGG * * * * * 16011777 TAAATATATTCT-TTTTTTAATTTTCTTACTCA 505 TAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * * * * 16011809 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTACTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAAC 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA * * * * * * 16011874 AAGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGT-TAT 66 AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCT-T * * * * ** 16011938 GACTATTTGAACTTATTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAATATTTAACTTATTAATTGTCAAAA 130 AACTATTTGAACTGATTTGGTAAATACATTTATTTTTT-AA-ATCT--CTTATTAATT-TTTAAA * * * * * * * 16012003 TATTTACAAATTAATATTA-TTTTAATTCAAATAAACTTGTTTGAACAAAAATAATTGTTTTATG 190 TATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATG * * ** * * * 16012067 ACAAAAC-AAGAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGCCATAACAATTTAAA 254 ACAAAACAAAG-A-TCATAACGATTTGAAATTGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA * * * * 16012130 CTT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAAT 316 -TTGGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTT-CTTATTAATT-T-TTGAAATATTAAT * * ** ** * * * * * 16012192 AAATTTGCATTATTTTATTTGCAATAAGCTTAGATGAACAGAAAAAAAATGCTTTTATAAAAAAA 376 AAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAAC-TAAAACAATTG-TTTTATGACAAAA * * * * * * * * * * 16012257 CAAAAGGTTATAGCT-ATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCCTAATTATTTAAATTTGTTC 439 CAAAAGGTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC ** * * * 16012321 ATTAAATAGATTCAATTTTTAAATCTCTTTA-TTA 503 GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTA * * * * * * * 16012355 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TAAGTATAATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAA 379 TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA * * * * ** * 16012798 AGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAA 444 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAA * 16012863 CAGAATTATTTTTTAAA--TC--ACTTA 509 CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * ** * * 16012887 CTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAA 1 TTAATTTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAA * * * * ** 16012950 ACAAACCTATTTTATGACAAAACAAAAAGGT-TTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCGTATAG 64 A-AAA-TTATTTTATGACTAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG * * * * * * * * 16013014 TTTTAAATATTTGAACTGGTTAGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTT 126 TCTTAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTT * * * * * * * * * 16013079 GGAATATTATTAGATCAGTGTT-GTTTTA-TTCTTAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTT 187 -AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-AAAAACAATTGTT * * * * 16013142 TTATGATAGAACAAA-ATGCTATAACGATTTGAAGTTTATAATTG-TCTAAATAGTCATAACTAT 249 TTATGACAAAACAAAGAT-C-ATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTAT * * * * * * * * * 16013205 TTGAATTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAAATTATGAAAGATTAA 311 TTGAATTGGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA * ** * ** ** * * * 16013270 TAAATTAATATTATTTTATTCCAAAAAAGCTTGAATGTTCATAAAA-AATTCTTATATGACGAAA 375 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAAC-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAA * * * * * * * * 16013334 CAAGAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTGACATAGCCATAATTATTTGAACTGATTCG 439 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCG * * * * 16013399 GTAAACATATTCACTTTTTAAATCACTTACTTA 504 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA * * * * * * * * 16013432 TTAAATTTTAGAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAGCTTATACGGACTGAAA 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAA ** * * * * 16013496 TGATTGTTTTATGAC-AAAGCGAAAGGTCATAACT-AATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-- 65 AAATTATTTTATGACTAAA-CAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC * * * * * 16013557 --GA--A-TTG----G-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTAATTATAAATGTTTGA 128 TTAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCT-C---TTATTAAT-TTTTA ** * * 16013612 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAAT-AGACGTGTATGATAAAAACAATTGTTTTA 188 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAAAAAAACAATTGTTTTA * * ** * * 16013675 TGATAAAACAAA-ATTTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTG 252 TGACAAAACAAAGA--TCATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTG * * * * * 16013738 AATTGATTT-GATAAGCT-GACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT 314 AATTGGTTTAGA-AA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT * * * * * * * * 16013801 AAAGTAATGTTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACA 376 AAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * 16013866 AATGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT 441 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGT * * ** 16013931 AAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TTTTTGTGTA 506 AAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACT-TA * * * * 16013963 TTAATTTTCTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAAA 1 TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA * ** * * * 16014028 AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATCGTCTTA 66 AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTA * * * 16014093 ACTATTTGAA-TTAGTTTGGCAAATACATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTGATTTTTAGAA 131 ACTATTTGAACTGA-TTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA---ATTTTTA-AA * * * * * * * * 16014157 TATTATTAATTTAGCAATA-TTTTACTCCGAATAAGTTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTAT 190 TATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAA-A-AAACAATTGTTTTAT * * 16014220 GACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAA 253 GACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAA 16014248 CTGGTTTGAT Statistics Matches: 12966, Mismatches: 3063, Indels: 1963 0.72 0.17 0.11 Matches are distributed among these distances: 504 2 0.00 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* * * * * * * 16027324 AATAAAAGGTCATAACGATTTTAAATGGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTTGAT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-T *** * * * 16027389 T-GGTAAAC-AATTT-T-TTTTTAATTTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTA 65 TCAACAAACAAATTTATGTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA * * * * * ** * 16027450 TTATTTTATTTCGAATAAGCATGTATGAGTTGAAGCAATTATTTTACAACTA 130 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAA * * * * * * 16027502 AACAAATGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT ** * * * * ** * * * 16027567 TGACAAACACATTTATTTTTTAAA-TCCTTACTTATTAATGTTTAGAATATTTTTAATTTAGCAA 66 CAACAAACAAATTTATGTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT * * * 16027631 TATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAAATGTTTT-TGGACAA 131 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTAT-GACAA * * * ** 16027682 AAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCGGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT * ** * * * 16027746 TAGTAAA-ATGATTTAGGTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-GAAATAGTAATAAATTAGT 66 CAACAAACA-AATTTATGTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGT * ** 16027805 ATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA 129 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAA * ** * * * 16027858 AGCAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAAT-GACATGACTATTTGAACTTGT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG- * * * * 16027921 TTGAA-AAACAAATTAATGTTTTAAATCTTC-AAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG 64 TTCAACAAACAAATTTATGTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG * * * * 16027984 TATTATTTTATTTTGAACAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGAC-- 128 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAA * * * * * 16028036 AA-AGAA--TCATAAGGATTTGAAATAAATAGTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-T * * * * * * * * 16028098 T-GACAAGCATATTTAT-TTTTAAAATCTT-TTAATTATTAA-TTTTGGAATATTGATAAGTGAG 65 TCAACAAACAAATTTATGTTTT-AAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAG * * * * * 16028159 GATTATTTTATTTCGAATAATG-TT-TTTCAAATGGAAAC-ATTGGTTTATGACAA 128 TATTATTTTATTTCGAATAA-GCTTGTAT-GAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAA * * * * * 16028212 AACAAATGGCCCTAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACATGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT * * 16028277 C-ACAAACAAATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATTAATTTTT-GAAACATTAATAAATTTA-T 66 CAACAAACAAATTTATGTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGT * * * * 16028338 ATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGCATGAATAGAACTAATTGTCTTATGATAA 129 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAC-AATTGTTTTATGACAA * * * * * 16028390 AACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTAAACTTGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT * * * * * 16028455 CAGCAAACAGATTTATTTTTTTAA-TTCTTACTCT-TT-ATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTA 66 CAACAAACAAATTTATGTTTTAAATTTCTTACT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA * ** * * * 16028517 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGACTTGAAACAATTGTTTTATTACAA 130 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAA * * * * * 16028569 AACAAAAGGTCACAATGATTTGAAGTAAATAATTATTCTAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT **** * * * * * * 16028634 TGGTAAAC--ATAT-TCTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATA 66 CAACAAACAAATTTATGTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA * * * * * * * * * 16028695 TTATATTAATCCAAATAAGATCGTATGGACAGAAAACAATTATTTTATGATAA 130 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAA * * * * 16028748 AACAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-TGATTTTAACCT 1 AAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTT **** * 16028811 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATT-TTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAAT 63 GTTCAACAAACAAATTTATGTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAAT * * * ** * 16028873 TTGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATCATTTTATGAGAA 125 TAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAA * * ** ** * * * * 16028929 ACCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATCGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAACTTGTT 1 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT 16028994 C 66 C 16028995 GGTAAATGGA Statistics Matches: 1481, Mismatches: 297, Indels: 147 0.77 0.15 0.08 Matches are distributed among these distances: 174 13 0.01 175 77 0.05 176 162 0.11 177 111 0.07 178 293 0.20 179 270 0.18 180 357 0.24 181 122 0.08 182 16 0.01 183 59 0.04 185 1 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41 Consensus pattern (180 bp): AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT CAACAAACAAATTTATGTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAA Found at i:16029046 original size:180 final size:182 Alignment explanation
Indices: 16028594--16029050 Score: 478 Period size: 180 Copynumber: 2.5 Consensus size: 182 16028584 TGATTTGAAG * * * * * 16028594 TAAATAATTATTCTAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTC--TTTTAAATC 1 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAAATTCTTTTTTAAATC * 16028657 TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATATTAATCCAAATAAGATCGTATG 66 ATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATATTAATCCAAATAAGATCGTATG * * ** 16028722 GACAGAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAAGTCATAAGAATTTGAAA 131 AACAGAAAACAATCATTTTATGATAAAACAAAAAAGTCATAAGAATTCCAAA * * * * 16028774 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATGATTTTAACCTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT 1 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAAA-TTCTTTTTTAAAT ** ** * * ** * * 16028839 -ATTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTA 65 CA-TTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATATTAATCCAAATAAGATCGTA * * * * * 16028903 TGAACA-AAAA-AATCATTTTATGA-GAAACCAAAAGGTTAT-AGCGATTCCAAA 129 TGAACAGAAAACAATCATTTTATGATAAAACAAAAAAGTCATAAG-AATTCCAAA ** * * *** 16028954 TCGATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATGGATTCTTTTTTAAAAT 1 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAAATTCTTTTTT-AAAT * * * 16029019 CATTTAATTATAAATTTTCAAAATATTAATAA 65 CATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAA 16029051 GATAGTATTA Statistics Matches: 226, Mismatches: 44, Indels: 14 0.80 0.15 0.05 Matches are distributed among these distances: 179 10 0.04 180 132 0.58 181 15 0.07 182 4 0.02 183 65 0.29 ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.41 Consensus pattern (182 bp): TAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAAATTCTTTTTTAAATC ATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATATTAATCCAAATAAGATCGTATG AACAGAAAACAATCATTTTATGATAAAACAAAAAAGTCATAAGAATTCCAAA Found at i:16029131 original size:87 final size:87 Alignment explanation
Indices: 16028977--16029148 Score: 231 Period size: 87 Copynumber: 2.0 Consensus size: 87 16028967 AAATGGTCAT * * * 16028977 AATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATGGATTCTTTTTTAAAATCATTTAATTATAAATTTTCAAAA 1 AATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTAAAATCATCTAATTATAAATTTTCAAAA * 16029042 TATTAATAAGATAGTATTATAA 66 TATTAATAACATAGTATTATAA * * * ** 16029064 AATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTAAAATC-TCCTAATTAT-TAGTTTCTGG 1 AATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTAAAATCAT-CTAATTATAAATTTTC-AA 16029127 AATATTAATAACATAGTATTAT 64 AATATTAATAACATAGTATTAT 16029149 TTTATTTTGA Statistics Matches: 74, Mismatches: 9, Indels: 4 0.85 0.10 0.05 Matches are distributed among these distances: 86 6 0.08 87 68 0.92 ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.09, T:0.45 Consensus pattern (87 bp): AATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTAAAATCATCTAATTATAAATTTTCAAAA TATTAATAACATAGTATTATAA Found at i:16029788 original size:182 final size:178 Alignment explanation
Indices: 16029126--16030099 Score: 780 Period size: 176 Copynumber: 5.4 Consensus size: 178 16029116 TTAGTTTCTG * ** * * 16029126 GAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAACCTTATATGAATTGAAATAATTTTTTT 1 GAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTT * ** * 16029190 ACGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATTGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGA 64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * ** * ** 16029255 TCTAGTTCGGTAAACATATTTATTTGTAAAATTGTTTACTTATTAATTGTCA 129 ACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTTAC-TATTAATT-TTT * * * * * * 16029307 AAATATTAATAAATTAG---T-TGTTATTTGAAGAAGCTTGTATGAACAGAAACTATTGTTTGAT 1 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTAT * * * * * * 16029368 AACATAACAAAAAGTGA-AATTGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCATAACTATTTGA 66 GACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * 16029431 ACTGGTTTGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCT--TATTAATTTTT 129 ACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTTACTATTAATTTTT * ** * * * * * * * 16029478 CAAATATTAATAGGTTAGCATTATTTTATTCTTAA-AAACATATATGAACAAAAACATTTTTTTT 1 -GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTT * * * * * * 16029542 ATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTATATATTCATAACTATTTGA 64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * 16029607 ACTTGTTCGATAAACAAAATTATTTTTTTAATTTTCTTACTCCTTAATTTTT 129 ACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATTTT-TTACT-ATTAATTTTT * * * ** 16029659 GGAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTGAAACAATTGTTTT 1 -GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTT * * * * * * 16029724 ATTACAAAACGAAAGGTCACAATGATTTGAAGTAAATAATTATTCAAATAGTCATGAGTATTTGA 64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA * * * * * 16029789 ACTTGTT-TAGTAAACACA--TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT 129 ACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTTAC-TATTAATTTTT * ** * * * 16029838 GAAGTATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTCGTATGGACAAAAATAATTGTTTT 1 GAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTT * * * * 16029903 GTGACAAAACAAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT 64 ATGACAAAAC--AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT * * * 16029967 TGAACTTGTTC-AGTAAACAGATTTA-TTTTTTAATTCTTTTACTTTTAAATTGTCT 126 TGAACTTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTTAATT-TTTTACTATT-AATT-TTT * * * * * 16030022 GAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTCTGAATC-GAAA-ATATTATTT 1 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAA-CAGAAACA-ATTGTTT * 16030085 TTTGACAAAACAAAA 63 TATGACAAAACAAAA 16030100 AGTTATAGCG Statistics Matches: 629, Mismatches: 130, Indels: 68 0.76 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 171 1 0.00 172 23 0.04 175 13 0.02 176 190 0.30 177 21 0.03 178 5 0.01 179 65 0.10 180 22 0.03 181 115 0.18 182 104 0.17 183 65 0.10 184 5 0.01 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41 Consensus pattern (178 bp): GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTAT GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC TTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTTACTATTAATTTTT Found at i:16029953 original size:983 final size:981 Alignment explanation
Indices: 16028202--16029983 Score: 2100 Period size: 983 Copynumber: 1.8 Consensus size: 981 16028192 GAAACATTGG * * * 16028202 TTTATGACAAAACAAATGGCCCTAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATT 1 TTTACGACAAAACAAAAGGCCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATT * * * ** 16028267 TGAACATGTTCACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAACATTAATAA 66 TGAACATGTTCACAAACAAATTTATTTGTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCAAAACATTAATAA * * * * * * 16028332 ATTTATATTATTTTATTTGAATAAGCTTGCATGAATAGAACTAATTGTCTTATGATAAAACAAAA 131 A-TTATAGTATGTTATTTGAAGAAGCTTGCATGAACAGAACTAATTGTCTTATAACAAAACAAAA * * * * * * 16028397 GGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGCAAA 195 AGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAGCAAA * * * * * 16028462 CAGATTTATTTTTTTAATTCTTACTCTTTATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT 260 CAAATTTATTTTTTAAATTCTTA--CTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATT * ** * 16028527 TCAAATAAGCTTACATGACTTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGA 323 TCAAATAAGCATACATGACTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGA * * * * 16028592 AGTAAATAATTATTCTAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTCTTTTAAATC 388 AATAAATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTCTTTTAAATC * ** 16028657 TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATATTAATCCAAATAAGATCGTATG 453 TTTTACTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATATTAATCCAAATAAGATCACATG * * * 16028722 GACAGAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAAGTCATAAGAATTTGAAATAAATAATTATTC 518 AACAGAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCACAAGAATTTGAAATAAATAATTATTC * * 16028787 AAATAGTCATAATGATTTTAACCTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTA 583 AAATAGTCATAATGATTTGAACCTGTTTAGTAAACAAA-TTATTTTTTAAATATTTTACTTATTA * ** * 16028852 ATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATC 647 ATTGTCTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAAATAAGCTCGTATGAACAAAAAAATC * * * * * ** * ** 16028917 ATTTTATGAGAAACCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATCGATAATTATTCAAATGGTCATAATTA 712 ATTTTATGAAAAACAAAAAAGTCATAGCAATTCCAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAA * 16028982 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* 16029816 AATCTTTTACTTATTAATTGT-TGAAGTATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTG-AATAAGCT 631 AATATTTTACTTATTAATTGTCTGAA-TATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTGAAATAAGCT * ** * ** 16029879 CGTATGGACAAAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAAAAGTCATAAG-AATTTGAAATAAATA 694 CGTATGAACAAAAA-AATCATTTTATGA-AAAAC-AAAAAAGTCAT-AGCAATTCCAAATAAATA * * 16029943 ATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTGTTCAGTAAA 755 ATTATTCAAATAGTCATAACAATTTAAACTTGTTCAGTAAA 16029984 CAGATTTATT Statistics Matches: 657, Mismatches: 114, Indels: 54 0.80 0.14 0.07 Matches are distributed among these distances: 979 5 0.01 980 154 0.23 981 52 0.08 982 74 0.11 983 190 0.29 984 69 0.11 985 67 0.10 986 19 0.03 987 27 0.04 ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41 Consensus pattern (981 bp): TTTACGACAAAACAAAAGGCCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATT TGAACATGTTCACAAACAAATTTATTTGTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCAAAACATTAATAA ATTATAGTATGTTATTTGAAGAAGCTTGCATGAACAGAACTAATTGTCTTATAACAAAACAAAAA GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAGCAAAC AAATTTATTTTTTAAATTCTTACTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCA AATAAGCATACATGACTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAAT AAATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTCTTTTAAATCTTT TACTCATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATATTAATCCAAATAAGATCACATGAAC AGAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAGTCACAAGAATTTGAAATAAATAATTATTCAAA TAGTCATAATGATTTGAACCTGTTTAGTAAACAAATTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTG TCTGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAAATAAGCTCGTATGAACAAAAAAATCATTT TATGAAAAACAAAAAAGTCATAGCAATTCCAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTA AACTTGTTCAGTAAATGGATTCTTTTTTAAAATCATTTAATTATAAATTTTCAAAATATTAATAA GATAGTATTATAAAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTAAAATCTCCTAATTA TTAGTTTCTGGAATATTAATAACATAGTATTATTTTATTTTGAATAACCTTATATGAATTGAAAT AATTTT Found at i:16030166 original size:134 final size:132 Alignment explanation
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Indices: 16030365--16033315 Score: 1735 Period size: 181 Copynumber: 16.4 Consensus size: 181 16030355 ATTATAAAAT * * * *** * * 16030365 TATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCA-TTTTTAGAATCTCCCAATTATTAATTTTTGAAATA 1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTA-AATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA * * * * * * 16030429 TTAATAACA--TGATATTATTTTATT-TAAATAACCTTATAGGAATTGAAATAATTTTTTTATGA 65 TTAATAA-ATTTG-TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA * * * * * * 16030491 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATTGATAATTATTCAAATAGTCTTGAC 128 CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * * * * * * *** 16030545 TATGTGATCTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATAT 1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT * * * * * * * * * 16030610 TAATATATTAGTGTTA---TA---TGAACAAGCTTGTATGAACATAAACTATTGTTTTATAACAA 66 TAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA * * * * * 16030669 AACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATATTCATAAC 131 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16031851 CTTACTTATTAATGTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTCTATGAATAAGCTTGTATGAA 63 --TA-TTAATAA-ATTT-G-----TATT-ATTT-----TATTCTAAATA----AGCTTGTATGAA * * * * * 16031916 TAGAAATAAATGTTTTAGGACAAAACAAAGAT-T-ATAACGATTT-AAGATAGATAATTATTCAA 108 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAA * 16031978 ATAATCATAAC 171 ATAGTCATAAC * * * * 16031989 TATTTGAACTAGTTCGGT-AATGAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATA 1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAAT-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATA * * * ** ** 16032049 GTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACA 65 TTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA * * * 16032114 AAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGAT-ATGAC 130 AAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAAC * * * ** * 16032166 TATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTTTTGAATAT 1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT * * * 16032231 TAATAAATTTCTATTATTTTATTCTAGATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA 66 TAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA * * 16032296 AACAAAGGAT-T-ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAAC 131 AACAAA--ATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * 16032347 TATTTGAA-TTGACTT-AGTCAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTTTTAA-TTTTGGAAT 1 TATTTGAACTTG--TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT * * * * * * 16032409 ATTAATAAATTAT-TATTATTTTATT-TCAAACAAGGTTTTTTTGAACAGAAACAATTGGTTTAT 64 ATTAATAAATT-TGTATTATTTTATTCT-AAATAA-GCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT * * * 16032472 GACAAAAC-AAATGTTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAT 126 GACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * * ** * * * * 16032528 TATCTAAACGTGTTAAAAAAATTGATTTATTTATTAAA-ATTTTACTTATTAATTTTTGGAACAT 1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT * * * * * * 16032592 TAATAATTTTTTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTGTGAATGGAACCAATTATTTTATGACA 66 TAATAAATTTGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA * * * 16032656 AAACAAAAAGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAAC 130 AAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * * 16032708 TATTTGAACTTGTT-TGATAAATATATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTTGGAA 1 TATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACT-TATTAATTTTTGGAA * * ** * * 16032771 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTTCAAATAAGCTTACATGAATTGAAACAATTGTTTTATT 63 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG ** * * 16032835 ACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGATGT-GAATAATTATTCAAATAGTCATGAC 127 ACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAAC ** * * * * * * 16032890 TATTTGAACTTGTTTGGT-AA-ACATAT-TTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTGTCGAAATAT 1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT * *** * ** * 16032952 TAACAAATAAATATTATTTTAATTC-GAATAAGC-CCTATAGACAT--AAACAATTATTTTATGA 66 TAATAAATTTGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTAT-GA-ATAGAAACAATTGTTTTATGA * * * * * 16033013 CAAAACAAAA-GTCACAA-GAATTTAAAACA-AGCAATTGTTCAAATTGTCATAA- 128 CAAAACAAAATGTCATAATG-ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * 16033065 TGATTTGAAC-T-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTGTCTT--AA 1 T-ATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGGAA * * * * * * ** 16033126 TATTAATAAATTTGTATTATGTTATTCGAAATAAGCTTATATGAACATAAAAAATCATTTTATGA 63 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA * * * ** ** * * * * 16033191 CAAACCAAAAGGTTATAGCGATTCCAAATCGATAATTGTTCAAGTGGTCATAAT 128 CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC * * * * ** * * 16033245 TATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATCGACTTTCGGAATAT 1 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT 16033310 TAATAA 66 TAATAA 16033316 CGTAGTATTG Statistics Matches: 2151, Mismatches: 469, Indels: 301 0.74 0.16 0.10 Matches are distributed among these distances: 170 35 0.02 171 32 0.01 172 4 0.00 173 6 0.00 174 15 0.01 175 180 0.08 176 86 0.04 177 262 0.12 178 244 0.11 179 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Indices: 16033887--16034153 Score: 304 Period size: 57 Copynumber: 4.7 Consensus size: 57 16033877 AAATGTTTTT * * * * * *** * 16033887 TTTTTAAGGAAAATTGGTACTTCCAACTTTTCCCCAAAATGTTTTTTTGAAACTTTA 1 TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAATATTTTTAAAAAAATTTA * * * * 16033944 ATTTCGAGAAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAGAAACATTTTTAAAAAAATTTA 1 TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCA-AAATATTTTTAAAAAAATTTA * * * 16034002 TTTTTAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAA-ATATTTAAAAAACTTTTA 1 TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAATATTTTTAAAAAA-ATTTA * * * * * 16034059 TTTTCAAGAAAAATTGATACTTTTACCTTTTCCTCAAAAATATTTTTTAGAAAA-TTA 1 TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTC-AAAATATTTTTAAAAAAATTTA 16034116 TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAA 1 TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAA 16034154 TTTTTTTTTA Statistics Matches: 176, Mismatches: 30, Indels: 9 0.82 0.14 0.04 Matches are distributed among these distances: 56 14 0.08 57 102 0.58 58 51 0.29 59 9 0.05 ACGTcount: A:0.37, C:0.14, G:0.07, T:0.42 Consensus pattern (57 bp): TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAATATTTTTAAAAAAATTTA Found at i:16036597 original size:183 final size:183 Alignment explanation
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Indices: 16036230--16042510 Score: 1406 Period size: 359 Copynumber: 17.8 Consensus size: 362 16036220 GGTGTCTACA * * * * * * * 16036230 AGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTATATGA--ACTAAAATAATTTTTTTATGA-AAAACAAAA 1 AGTATTATTTTATTCCTAATAAGCTTGTATGATTA-AAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA * * * * * 16036292 GGTCATAACAATTTGAAATAGCA-AATTATTCAAATAGT--TAATTATTTGATCAAG-TTCGGTA 65 GGTCATAATAATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGTTTCAGTA * * * * * * 16036353 AACATATTTA-TTTTTACAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATA 128 AACATATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * * ** * 16036417 TTAATCT-AAATAAGCTTGTATGAACAGAGACTATTGTTTTATAATAGAATAAAAAATCATAATG 192 TTATTCTCAAA-AAGTTTGTATGAACTGAGAATATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACG * * * * * 16036481 ATTTGAAATAAATAATTG-CCTAAATATTCATAACTATTTGAATTGGTTTGATAAATATATATA- 256 ATTTGAAATAAATAATTGTTC-AAATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTTGATAAATAGATTTAT * * * * * * 16036544 TATATATATTTTAAATCT-CTTATTAATTTTCAAAACATTAGTAGATT 320 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AGTATTATTTTATTTTTGGATAAGCTCT-TATGA--ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA 1 AGTATTATTTTATTCCT-AATAAGCT-TGTATGATTA-AAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAA * * * * * * * * * * 16042276 ATGGTCATAATGATTTTAGATAGATAATTATT-GAATAGTCATAACTATCTGAA-TATGTTCAAT 63 AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGT-TTCAGT * * * * * 16042339 AAGCAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTCATTAATTTTT-TAA-ATGTCAATAAATTAGTATT 127 AAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTATAATAT-T-AATAAATTAGTATT * * * * * 16042402 ATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATTGA-AATAATTATTATATGACT-AAACAAAAGGTCA 189 ATTTTATTCTCAAA-AAGTTTGTATGAACTGAGAAT-ATTGTTTTATGA-TAAAATAAAAGGTCA * * * * * ** 16042464 AAATGATTTG-AATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAT 251 TAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAT 16042511 GATTCAGTAA Statistics Matches: 4360, Mismatches: 1133, Indels: 853 0.69 0.18 0.13 Matches are distributed among these distances: 318 4 0.00 319 7 0.00 320 22 0.01 321 15 0.00 322 8 0.00 323 17 0.00 324 55 0.01 325 16 0.00 326 34 0.01 327 26 0.01 328 22 0.01 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Indices: 16038907--16039514 Score: 466 Period size: 179 Copynumber: 3.4 Consensus size: 178 16038897 AACTGAAATA * * ** * * * * 16038907 ATTTAAAATAGATAATCATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAACATATTTATT 1 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATAGTTCGATAAACAAATTTATT * * * * 16038972 TTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG 65 TTTAAAATTATTA-TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTCTAAACAAA * * * * * 16039037 CTCGTATGAATAGAAACTATTGTTTTAT-AGTAGAACAAAAAGTCACAATG 129 CTCATATGAACAAAAACTATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAAGTCACAATG * * 16039087 ATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCATAACTATTTGAATAGTTTGATAAACAAATTTATT 1 ATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAGTTCGATAAACAAATTTATT * * * * * * 16039151 TTTTAAA-TATT-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAGATTAGTACTATTTTATTTTATACAAAC 65 TTTAAAATTATTATTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTCTAAACAAAC * * * * 16039214 TTATATGAGCAAAAACTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATG 130 TCATATGAACAAAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAATG * * * * * * * 16039263 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACCATTTAGGTAAATAGAATTT-T 1 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TAGTTCGATAAACA-AATTTAT * * * * ** * 16039327 TTTT--AATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAGTATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATT-TCGAA 64 TTTTAAAAT-TATTA-TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA-TTAGTACTATTTTATTCT-AAA * * * * * ** * * * * 16039388 TAAGCT-AGTATGAATTGAGAAA--ATTCTTTTATGATGAGACAAAAGGTCATAACG 125 CAAACTCA-TATGAA--CAAAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAATG * * * * * 16039442 ATTTGAATTAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACAAATTTATT 1 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TAGTTCGATAAACAAATTTATT * 16039507 TTTTAAAT 65 TTTAAAAT 16039515 CCCTTAGTTA Statistics Matches: 345, Mismatches: 66, Indels: 33 0.78 0.15 0.07 Matches are distributed among these distances: 175 4 0.01 176 118 0.34 177 18 0.05 178 15 0.04 179 146 0.42 180 35 0.10 181 9 0.03 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43 Consensus pattern (178 bp): ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAGTTCGATAAACAAATTTATTT TTAAAATTATTATTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTCTAAACAAACT CATATGAACAAAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAATG Found at i:16039601 original size:181 final size:181 Alignment explanation
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GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT * * * * 16044480 -----TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAGCTTATATGAACTG 129 AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAACTTGTATGAACAG * * * * * 16044528 AAACAATTCTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAGTTG 1 AAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * * * * * * 16044593 TCATGATTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTC 65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATT-TT * * * * * 16044658 AA-ATTATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAG 129 AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAG * * * * * ** 16044710 AAACATTTGTTTTATAACAGAACAAAA-GTCATAATGATTTGTAATAAATAATTACTCAAATAGT 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT * * * * * 16044774 CATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTT-T 66 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTAA * * * * * 16044834 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* * * * 16047569 AAACAACTATTTTATGACAAAACAAAAGAT-ATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAG 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG * * * * 16047632 TCATAACTAATTGAACTTGCTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTAGTTATTAATTTT 65 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTT ** * ** ** 16047696 TGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTATGAACAG 129 AAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAG * * 16047749 -AACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAA 1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAA 16047792 CATGTTCAAA Statistics Matches: 3965, Mismatches: 870, Indels: 448 0.75 0.16 0.08 Matches are distributed among these distances: 166 8 0.00 167 117 0.03 168 54 0.01 169 71 0.02 170 16 0.00 171 104 0.03 172 67 0.02 173 49 0.01 174 53 0.01 175 85 0.02 176 211 0.05 177 208 0.05 178 128 0.03 179 173 0.04 180 638 0.16 181 1119 0.28 182 570 0.14 183 49 0.01 184 82 0.02 185 15 0.00 186 2 0.00 188 2 0.00 189 1 0.00 190 2 0.00 192 41 0.01 193 70 0.02 194 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* * 16060861 TTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAAATGAATGTTATTTTGA-TCTGA 1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TGAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTGA * * * * 16060924 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT-A-AAAA-AAGAA-GTCATAA-TGATTTAAAA 64 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACAG-TTTGAAA * * * ** * 16060984 TAAATAATTATTCAAATAGTCATTATTATTTGAACTTATTCAATAAACTGATTTATTTTTTAAAT 127 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT ** * * 16061049 CTTTT--TT-TTAATTGTTTGTATATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTAT 192 CTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTAT * * * * * 16061111 GAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGTTT 256 GAACT-GAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC ** * * * * * 16061175 AAATAGTCATAGCTATTTTAACTTGTTCAATAAATATATTTA 320 AAATAGTCATAATTATTTAAATTTG-TCAGTAAACA-AATTA * ** * * ** 16061217 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-GAATATTAATCAGCTAGAATTATGTTATTTCAAA 1 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Indices: 16049932--16062629 Score: 3865 Period size: 542 Copynumber: 23.7 Consensus size: 526 16049922 ACTCGAATAG * * * * * * * 16049932 GAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGATATATTAATA 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAA * * * * * * ** 16049997 ACTCAGTAGTATTTTATTTCTAGTGAGCTTGTAT-GA-TGAGCGACAATTGTTTTATGACAAAAC 66 AGT-AGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATAAACT-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC * ** * * * * * * * ** 16050060 -AAAGTTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTAAACT-GATTTG 127 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAG-TTCA ** * * ** * * * 16050123 GTAAATAGATTCATTTTTTAAAT-TGCTTACTTATTAATTTTCAAA-ATAACAATAAATTATTAT 191 ACAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTGGTTATTAATTTTTAAATAT-TC--TAAATTAGTAT * * * * * * * 16050186 TATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATGAACT-GAAGCAATTATTTTATGACAAAACAACAGGTCA 252 TATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTGATGA-AAAACAAAAGGTTA ** * * * * * * ** * * * 16050249 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16052624 AATGGCCATAATTATTT 510 AATAGTCATAATTATTT * * * * * * 16052641 GAACTGATTCGGTAAACTAT-TTTATTTTTTAAATAT-TTTCTTATTAACTTTTGAAATATTAAT 1 GAACTGGTTTGGTAAA-TATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA- * * * * * 16052704 AAAGTAGTATTATTTTATTT-AGATAAGATTTTATGAACTAAAACAACTGTTTTATTACAAAA-A 64 AAAGTAGTATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * * * 16052767 AATGGTCA-AATAATTTTAAATAGATAATTGTTTAAACAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAA 128 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TAGTTCAA * * * * * * * * 16052830 TAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTTAGTGTTAATAAATTAGTATTA 192 CAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTGGTTATTAA-TTTTTAAATATT-CTAAATTAGTATTA * * * * * 16052895 TTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATT-ATTGTATGAATAAACAAAAGGTTAGA 254 TTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTG-ATGAA-AAACAAAAGGTTATA * * * * * 16052958 GCAATTTGAAATAGATAATTATTCTAA-AGTCTTAATTATTTAAACTAGTTT-AGTAAACACA-T 316 ACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTATTGAAA-TAGTTTGA-TAAACAAATT * * * 16053020 TAATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCCAATAA 378 TAATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTCGAATAA * * * * * * 16053085 GCTTATATGATCAGAAATAATTATTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATA 442 -ATTATATTA-CA-AAATAA-TATTTTATGACAAAACAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGATA * * * 16053149 TTTGTTAAAATAGTCATAACTATTT 502 ATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * * *** * ** 16053174 GAACTAGTTTGGAAAACAGCTTTAGTTTTTAAAATCTCTTGTTTATTAATTTTTGAAATATTAAA 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-AA * * * * * * 16053239 AAAGTATTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACA 64 AAAGTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA * * ** 16053304 AAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTATTTAAACTTGTTTG 128 AAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAA-CTATTTAAACTAGTTCA ** * * *** *** * * 16053367 GTAAACAGATTTATTTTTTTAAATTTCCTACCTATTAATTCTCCGAATATTAATAAAATAGTATT 191 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ATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTGATGA-AAAACAAAAGGTTATA ** * * * * * * * * * * 16054550 ATGATTTAAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATGACTGTTTCAACTTA-TTCGATAAACATATT 316 ACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACT-ATTGAA-ATAGTTTGATAAACAAATT * * * ** * ** 16054614 TATTTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT-AATTAATATTATTTTAATCTG 378 TA-ATTTTTTAA--ATCT-CTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTC-G * * * * * ** 16054678 AATAACATTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAACAATTTGAAAT 437 AATAA-ATTATAT-TAC-AAAATAA-TATTTTATGACAAAACAAA-AGTAATAATGATTTGAAAT * * 16054743 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CATTT 497 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * * * * * * * 16054772 GAATTTGTTTGATATACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAA 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAA ** * * * * * * * 16054835 TAATTTTGTATTATTTTATTCGAA-ATAG-TATGGAT--A-GAAAA-AGTTATTTTATGTCAAAA 64 -AAAGTAGTATTATTTTATTTGAATA-AGCT-TGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAA * * * * * * * * * * 16054894 CAAAATGTTATAGCGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCG 126 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCA ** * ** * * * 16054959 GTAAATAGATTCT-TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATT 191 ACAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTT-AAATATT-CTAAATTAGTATT * * * * * ** * * * * 16055023 ATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACCGAAACAAATCTTTTATGAAAAA-AAAAGGGTCATAA 253 ATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTGATGAAAAACAAAA-GGTTATAA * * * * * * * * * 16055087 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTCT 317 CAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTATTGAAA-TAGTTTGATAAACAAATT-T * * * 16055152 --TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGA 379 AATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGA * * * * 16055215 ATAAACTTATATGAACCGAAACA-AATCTTTTATGA-AAAA-AAAAGGGTCATAACGATTTGAAA 438 ATAAA-TTATAT-TA-C-AAA-ATAATATTTTATGACAAAACAAAA--GTAATAATGATTTGAAA * * *** 16055277 TAGATAATTATTCAAATAATCATGGCTATTT 496 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * * * * * * 16055308 GATCTAGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAAAGT-TTTTACTTTTTAATTGTTGAAATATTAAT 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA- * * * * *** * ** 16055371 AAA-TAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCATGTATGAACAAAAACAAACATTTTATAACAGGACA 64 AAAGTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * ** 16055435 AAAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA 128 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCAA * * * * * * * * * 16055499 TAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTC----TTA-TAATTCATGAAAAATTAATAGATTAGTATTAC 192 CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATT-TTTAAATATT-CTAAATTAGTATTAT * * * * * * * * * * * * ** 16055558 TTTATTTTGAACAAACTTATTTGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTTTAATG 255 TTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTGATGA-AAAACAAAAGGTTATAACA * * * 16055623 ATTTGAAATAGATAATTA-TT--T-G-----A--ATTG-----GTTAGGTAAACAGAA-AT-ATT 319 ATTTGAAATAGATAATTATTTAATAGTCATAACTATTGAAATAGTTTGATAAACA-AATTTAATT * * * * 16055670 TTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAATTTTA-TTTTATTTTATTCCAAATC 383 TTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTT-AAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTT-TTTCGAAT- * * * * * * * * * * 16055734 AGCTAGTATGAATT-GAAAAT-TTGTTTTATGACAAAGCAAAGGTCATAA-CATTTTGAAAGAGA 440 A--AATTAT--ATTACAAAATAATATTTTATGACAAAACAAAAGTAATAATGA-TTTGAAATAGA * * * * 16055796 TAATTGTTCATACAGTCTTAAATATTT 500 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * ** * * * * * * 16055823 GAACTAG-TTCATCAAACA-AATT-TATTTTCAATTCTCCTAGTTATTAATTTTTCAAATATTAT 1 GAACTGGTTTGGT-AAATATAATTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA- * * * ** * * * * * * 16055885 TATATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAA-TAAAAATAATTGTTTTGTGATAGAA 63 AAAAGTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATAAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAA * * * * * * * * * * * ** 16055949 CCAAAGGTTATAACAACTCGAAGTACATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTTG 126 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCA * * ** * * 16056014 ACAAACATATTTATTTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTA 191 ACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTT-AAATATT-CTAAATTAGTATTA * * * * * * * * 16056079 TTATATTTTGAATAAGCTTGAATGAAAAAAAAACATTTGTTAT-AT-AACCAAACAAAAGGTAAT 254 TTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTT-TGATGAA--AAACAAAAGGTTAT ** * * * * * * * * * * 16056142 AATGATTTGAAATAGATAAATGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAAT-GATTCAGTAAATAGA- 315 AACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTA-TTGAAATAGTTTGA-TAAACAAAT * * * * * 16056205 TTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAAT 377 TTAATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGAAT * * * * * * * * * 16056270 AAGCTTGTATGAACTAAAATGATTTTTTGTGACAAAACAAAATTTCATAACGATTTGAAATAGAT 440 AA-ATTATAT-TAC-AAAATAATATTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAATGATTTGAAATAGAT * * *** 16056335 AATTGTTCATATAGTCTTAACCGTTT 501 AATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * * * * * * * * * * 16056361 AAACTGCTTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTAAGTTATTAATTTTTGTAATATTATTA 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-AA * * * * * 16056426 AATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTTGTATGAACTAAAAC-ATT-TATTTATAATAAAACA 65 AAGTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGT-TTTATGACAAAACA * ** * * * * 16056489 AAAGGTTATAATGATTTGAAACA-AGTAATTATTCAAATAG---GAAC----T--ACT--TT-GA 128 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCAA * * ** * 16056541 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT 192 CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTT-AAATATT-CTAAATTAGTATTAT * * ** * ** * 16056606 TTTATTCCAAATAGGCTTGTAT-GGTGAAAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAATA--TTCATAA 255 TTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTGATGA-AAAACAAAAGGTT-ATAA * * * * * * ** * 16056668 CGATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAATTATTTG-AATTGATTCGGCAAACAAA-AT 317 CAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTA-TTGAAATAG-TTTGATAAACAAATTT * * * * * * * * * 16056731 CACTTTTTACATCACTTATTAATTTTTGGAACATCAATAAATTATTATT-TTATTTT-GAATAAG 379 AATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTCGAATAA- * * * * * ** * * * * * * 16056794 CTT-TAATAAAATGAAACAATTGTTTTATGGTAAAACAAAACATCATAACGATTTTAAATATACA 442 ATTAT-ATTACA--AAATAA-TATTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAATGATTTGAAATAGATA * * 16056858 ATTGTTCAAATAGTCACAACTATTT 502 ATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * * * * * * * 16056883 GAATTTGTTTAGAAAACACATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAA 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-AA * * * * * * 16056948 AAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAATG-TTTTATGAACTGAAGCAATTGTTTTATGACAAAAC 64 AAAGTAGTATTATTTTATTTGA-ATAA-GCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC ** * * ** * * * 16057012 AAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAGCTTA-TAC 127 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TAGTTC *** * * * * * * * 16057075 GGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGAT 190 AACAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTGGTTATTAA-TTTTTAAATATT-CTAAATTAGTAT * * * * * * * 16057140 T-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTAT-GATATGAAACAAATATTTTATGAACAAA-AATAGGTTAG 252 TATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATA-GAAACAATTGTTTGATGAA-AAACAAAAGGTTAT * * ** * * * * 16057202 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCTTATCGTTTTAACTATTTG-AATTGCTTTGACAAATACAT 315 AACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTA-TTGAAATAG-TTTGATAAACAAAT * 16057266 TT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC 377 TTAATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTC * * * * * * * * * ** 16057330 AAATAAGCTTGTATGATAGAAAACAAT-TGTTTGATAACAAAGCAAATGGTTATAGCGATTTGAA 436 GAATAA-ATTATAT--TACAAAATAATAT-TTT-ATGACAAAACAAA-AGTAATAATGATTTGAA * * 16057394 ATAGATAATTGTTCAAATTGCCATAATTATTT 495 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT ** * * * * * * 16057426 -AACTACTTCGATAAACA-AATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTTAT 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA-TTAA * * * * * * * 16057489 AAATTTGTATTATTTTATTTCGTAA-AA-CTTGTATTAACTAAAATAGTTATTTTATGAAAAAAC 64 AAAGTAGTATTATTTTATTT-G-AATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC *** * * * 16057552 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ATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTA-TTGA-AA-TAGTTTG-A-T-A-A-A-CA * * * 16058351 AATAGAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATT 374 AAT----TTAATTTTTTAAATCTCTTA-T--T--AATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATT * * * * * 16058415 TTATTCTGAATGAACTTGAATGAGTT--GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT 430 TTTTTC-GAAT-AAATT--AT-A-TTACAAAATAA-TATTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAAT * * * * * 16058478 GATTTGAAATAGATACTTGTTTATATAGTCTTAACTATTT 487 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * **** * * * 16058518 GAATTGATTCAACAAA-AAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTT-AGAATATTAT 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA- * * * * * * * * 16058581 CAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGATAGA 63 AAAAGTAGTATTATTTTATT-TGAAT-AAGCTTGTATAAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAA * * * * * * 16058645 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAATTATTTT 125 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTC *** * * * * * 16058710 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GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA * * * * * 16059121 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTCTTTTATGACTAAAC 64 -AAAGTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC * * * ** * * * * * 16059186 TAAAGGTTAGAATGATTTTAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAA-T-GATTT 127 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT-AAACTAG-TTC ** * ** * 16059249 GGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT 190 AACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTT-AAATATT-CTAAATTAGTATT * * * * * ** * * * 16059314 ATTTTAATCCAAATTAGCTTGTAT-GATAAGAAACAATTTTTTTTTTTAACAAA-ACAAAGATCA 253 ATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAA-TTGTTTGATGAA-AAACA-AAAGGTTA * * * * * * * * * 16059377 -AAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAGA-AAACAA 314 TAA-CAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTATTGAAA-TAGTT-TGATAAACAA * * * * * * 16059440 CTTT-AGTTTTAAAATCTCTTCCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATT 375 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* * * * * 16060241 -AGAATATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTAAGCTTGCTCG 126 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTC- ** * * ** * ** 16060305 GTC-AACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATT 190 AACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTT-AAATA-TTCTAAATTAGTATT * * * * * * 16060369 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTT-ATGACAAAACAAATGGTCATA 253 ATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATT-GTTTGATGA-AAAACAAAAGGTTATA * * * * * ** * * 16060433 ACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGT-GTTCAAAAAAAATAAT 316 ACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTA-TTGAA-ATAGTTTGATAAACA-AAT * * * 16060497 TT-ATTTCTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTGTTTTATTCA 377 TTAATTT-TTTAAA-TCT-CTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTTTTC- * ** * * * * 16060560 AAATAAGCTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCAA-AACTG-TTTGA 436 GAATAAATTA-TAT-TACA-AAATAA-TATTTTATGACAAAACAAAA-GT-AATAA-TGATTTGA * * 16060623 AATAGATAATTATTCAAATAG-CAATAACTATTT 494 AATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAATTATTT * ** * * * * * * 16060656 AAACTTCTTTGGTAAACA-GATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTAGGAATATTAAT 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA- * * * * * * * * ** 16060720 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATATGAACTGATACAATTATTTTAAAATC-AAAC 64 AAAGTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAAC ** * * ** ** ** 16060784 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATGACTATTTGGACTTTTTGG 127 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTAAACTAGTTCA ** * * * ** * * * * * 16060848 GTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAAATGAATGTT 191 ACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTT-T-TAAATATT-CTAAATTAGTATT * * * * * * 16060912 ATTTTGA-TCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT-AAAAA-AAGAA-GTCATA 253 ATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTGATGAAAAACAA-AAGGTTATA ** * * * * * * ** ** 16060973 ATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATTATTATTTGAACTTA-TTCAATAAACTGATT 316 ACAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTA-TTGAA-ATAGTTTGATAAACAAATT * * ** * * 16061037 T-ATTTTTTAAATCTTTTTTTTAATTGTTTGTATATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTT-GAAA 378 TAATTTTTTAAATC-TCTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCG-AA * * * * * ** 16061100 TAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATA 439 TAA--AT-TAT-ATTACAAAATAA-TATTTTATGACAAAACAAAA-GTAATAATGATTTGAAATA * ** 16061164 GATAATTGTTTAAATAGTCATAGCTATTT 498 GATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * *** * * ** 16061193 TAACTTGTTCAATAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATC 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAA * * * * * * * * * * 16061258 AGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTATATGAA-TATAAACAATTGATTTGTGATAACACA 66 AG-TAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATAAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA * * * * * ** * ** * 16061322 AAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATGGTTCAAATAGTCATAAATATTTGCA-TTGGGCAGG 128 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCA-A * * * * * * * 16061386 CTAATAGATTCATTTGTTAAAT-TCATTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTA 192 CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTGGTTATTAATTTTTA-AATATT-CTAAATTAGTATTA * * * * * * * * * * 16061450 CTTTATTTTGAATAAGAC-TATATGACTAGAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA 254 TTTTATTCTAAATAAG-CTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTGATGA-AAAACAAAAGGTTATAA * * * * * * * 16061514 CAATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTGAACTGGTTT-AGTAAACAAA-TT 317 CAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACT-ATTGAAATAGTTTGA-TAAACAAATTT * * * * 16061576 GATTTTTTAACTCTCTTACTAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGA 379 AATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTCGA ** * * * * 16061641 CCAAACTTAT-TTGAAAAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAA 438 ATAAA-TTATATT-ACAAAATA-A--TATTTTATGACAAAAC-AAAA-GTAATAATGATTTGAAA * * * * 16061705 TCGATAACTATTCAAATAGTCTTAATTATTT 496 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT * * * * * * * * * 16061736 AAATTGGTTTAGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTGATT-ATTTTTCAAATATT---A 1 GAACTGGTTTGGTAAATATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAA * ** * * * 16061797 ACTTCTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTA-AGAACTGAAAA-AATTGTTTTATGATAAAAC 66 AGTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTT-GTATA-AACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC * ** * * * * * ** * 16061859 AAAAGGTCATTATGATTTGAAATAAAGAATTATTGATATACCCTTAACTATTTGAAC-AGGTTCA 127 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTA-GTTCA * * * * * 16061923 A-ATA-A-ATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTACATTAGTATTA 191 ACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTA-AATATT-CTAAATTAGTATTA * * * ** * * * * * 16061985 TTTTATTCCAAGTAAGCTTATATGGACAGAAATAATTATTTTAT-AATAGAACACAAGGTTATAA 254 TTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTGATGAA-A-AACAAAAGGTTATAA * * * * * 16062049 CAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TCATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTT 317 CAATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACT-A-TTGAAATAGTTTGATAAACAAATTT * * * * 16062113 -A-TTTTAAAATCTCCTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATT-TTTTATTCCAA 379 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TTTATTTTGAATCAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTGGACAAAAGGTCAAAAT 255 TTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTGATGA-AAAACAAAAGGTTATAAC * * * * 16062591 GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGGTCTTAACTATT 318 AATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCATAACTATT 16062630 TGAACTATTC Statistics Matches: 9417, Mismatches: 2013, Indels: 1456 0.73 0.16 0.11 Matches are distributed among these distances: 509 2 0.00 510 119 0.01 511 190 0.02 512 201 0.02 513 24 0.00 514 17 0.00 515 167 0.02 516 185 0.02 517 77 0.01 518 16 0.00 519 40 0.00 520 14 0.00 521 23 0.00 522 138 0.01 523 115 0.01 524 152 0.02 525 28 0.00 526 84 0.01 527 11 0.00 528 27 0.00 529 133 0.01 530 119 0.01 531 81 0.01 532 102 0.01 533 215 0.02 534 131 0.01 535 339 0.04 536 372 0.04 537 651 0.07 538 613 0.07 539 765 0.08 540 791 0.08 541 602 0.06 542 880 0.09 543 562 0.06 544 302 0.03 545 286 0.03 546 5 0.00 547 7 0.00 548 5 0.00 549 8 0.00 550 75 0.01 551 52 0.01 552 48 0.01 553 180 0.02 554 279 0.03 555 156 0.02 556 19 0.00 557 9 0.00 ACGTcount: 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Indices: 16053865--16059788 Score: 3773 Period size: 180 Copynumber: 33.0 Consensus size: 179 16053855 TCGAACAGAC * * * *** 16053865 TTGAACTTGTTTAGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATATAAAGAATATTAA 1 TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGAATATTAA * * * * * 16053930 TAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTAT-AAGTAGAAACAATTGTTTTATGAGAAGA 65 TAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTATATGAA-CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA * * * * * 16053994 CAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTAT 128 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT *** * * * * * 16054046 TTGAACTCACTCAATAAATAGATTTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTT 1 TTGAACTTGTTCAGTAAACA-AATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATT * * * * * 16054111 AATAAGTTAGTATTATTTTATACTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTAG-TTTATGACAA 63 AATAAATTAGTATTATTTTAT-TTGAATAAACTTATATGAACAGAAACAATT-GTTTTATGACAA * * * * * * * * 16054175 AATAAAAGATCAAAACAATTTGAAATGGATAACTGTTCAAATAG--ATTAAGTAT 126 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ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG * * * 16055740 TATGAATTG-AAA-ATTTGTTTTATGACAAAGCAAA-GGTCATAAC-ATTTTGAAAGAGATAATT 258 TATGAA--GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATT * * * * * * 16055801 GTTCATACAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTC-ATCAAACAAATTTA-TTTTCAATTCTCCTAGT 320 GTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTACTTCGA-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT ** * ** * 16055864 TATTAATTTTTCAAATATTATTATATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTATATGAA-TAA 384 TATTAATTTTAGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTATTTCGTAA-AA-CTTGTATGAACT-A * * * * ** * * * * * * 16055927 AAATAATTGTTTTGTGATAGAACCAAAGGTTATAACAACTCGAAGTACATAATTGTTTAAATAGT 445 AAATAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT * * ** * ** * * 16055992 CATAATTATTTGAACTGGTTTGACAAACAT 510 CAAAACTATTT-AACTTATTCGGTAAATAG * * * 16056022 ATTTATTTTTTAAATCGCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTATATT 1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * ** * * * * * * * 16056086 TTGAATAAGCTTGA-ATGAAAAAAAAACATTTGTTATATAACCAAACAAAAGGTAATAATGATTT 65 CTGAATAAGCTT-ATATG-AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATAGGTTATAACGATTT * ** * *** * * * * * 16056150 GAAATAGATAAATGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAATGATTC-AGTAAATAGATTCACTTTT 128 GAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAATTATTTGAATTGATTCGA-CAAACAAATT-ATTTTT * 16056214 TAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT 191 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT * ** * * 16056275 TGTATGAACTAAAATGATT-TTTTGTGACAAAACAAAAT-TTCATAACGATTTGAAATAGATAAT 256 TGTATGAA-GAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT ** * * * * * * * 16056338 TGTTCATATAGTCTTAACCGTTTAAACTGCTTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCCCTAAGT 319 TGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTACTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT * * * * * 16056403 TATTAATTTTTGTAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTTGTATGAACTAAA 384 TATTAATTTTAGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTATTTCG-TAAAACTTGTATGAACTAAA * * 16056468 A-CATT-TATTTAT-AATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAACA-AGTAATTATTCAAATAG 447 ATAATTGT-TTTATGAA-AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAG * * 16056529 ---GAAC----T-AC-T-TT-GATAAATAG 509 TCAAAACTATTTAACTTATTCGGTAAATAG 16056548 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT 1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT ** * * **** * 16056612 CCAAATAGGCTTGTATGGTGAAAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAATA--TTCATAACGATTTG 65 CTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATAGGTT-ATAACGATTTG ** ** * * * 16056675 AAATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAATTATTTGAATTGATTCGGCAAACAAAATCACTTTTTA 129 AAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAATTATTTGAATTGATTCGACAAAC-AAATTATTTTTTA * * * * ** 16056740 CA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAACATCAATAAA-T--TATTATTTTATTTTGAATAAGCTT- 193 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG * ** *** * * * 16056797 TAAT-AAAATGAAACAATTGTTTTATGGTAAAACAAAACATCATAACGATTTTAAATATACAATT 258 T-ATGAAGA--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT * ** * ** * * 16056861 GTTCAAATAGTCACAACTATTTGAATTTGTTTAGA-AAACACATTTATTTTTTAAAATCTCTT-G 320 GTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-CTACTTCGACAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAG * * ** * 16056924 CTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTCAG-ATAATGTTTTATGAACT 383 -TTATTAATTTTAGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GTA-AAACTTGTATGAACT * ** * * * 16056988 GAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-ATTAATTATTCAAATA 444 AAAATAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATA * * 16057052 GTCAAAACTATTTGAGCTTATACGGTAAATAG 508 GTCAAAACTATTT-AACTTATTCGGTAAATAG * * * * 16057084 ATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATT-TTTTATT 1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * * 16057148 CTGAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATATTTTATGA-ACAAA-AATAGGTTAGAACAATTT 65 CTGAATAAGCTTATATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAATAGGTTATAACGATTT * * * * * * * * 16057210 GAAATAGATAATTATTCTTATCGTTTTAACTATTTGAATTGCTTTGACAAATACATTTATTTTTT 128 GAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAATTATTTGAATTGATTCGACAAACA-AATTATTTTTT * 16057275 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT 192 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT * * * * * 16057340 GTATGATAGAAAACAATTGTTTGATAACAAAGCAAATGGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTG 257 GTATGA-AGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG * * * * * * * * 16057405 TTCAAATTGCCATAATTATTT-AACTACTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTA 321 TTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTACTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA * * 16057469 TTAATTTTAGAAATATTTATAAATTTGTATTATTTTATTTCGTAAAACTTGTATTAACTAAAATA 386 TTAATTTTAGAAATA-TTATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTAAAACTTGTATGAACTAAAATA * * * * * * * * * 16057534 GTTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAGTGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTTATAA 450 ATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAA 16057599 CTATTTGAACTTATTCGGTAAATAG 515 CTATTT-AACTTATTCGGTAAATAG * * * * * 16057624 ATTTATTTTCTTAAATGTCTTTCTTCTTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATT 1 ATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * * 16057689 TTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGCTTTATGACTAAACAA-ATGGTCAAAATGATTTG 65 CTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATA-GGTTATAACGATTTG * * * * * * * 16057753 AAATAGATAATTGTTCTAATAGTATTAATCATATAAATTGGTTCGATAAAC-AATT-TTTTTAAA 129 AAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAATTATTTGAATTGATTCGACAAACAAATTATTTTT-TA ** * * * * 16057816 AATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG 193 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG * * * *** 16057881 TATGAACAAAA-AATTTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCAC 258 TATGAAGAAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT ** ** * * * * * 16057945 TCATATAGTCTTAACTATTTGAACT-CATTCGGTAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTA 322 TCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAC-TTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA ** * * 16058009 TTAAGTTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAAATAATCGTATGAAC-AAAA 386 TTAA-TTTTAGAAATATTA-TAAATTAGTATTATTTTATTTCGTAAA-ACTTGTATGAACTAAAA * * * * 16058071 CTAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCA 448 -TAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA * ** * * 16058136 AAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAACAG 512 AAACTATTT-AACTTATTCGGTAAATAG * * * * * * * 16058164 ATTTATTCTTTAAATCTCTTACTAATTAATTCTCTAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTT 1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC * * * * * * * * 16058229 TGAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAA 66 TGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATAGGTTATAACGATTTGAA * * * * * 16058294 ATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTTATAATTATTTGAATTGATATAG-TAAATAGAA 131 ATAGATAATTGTTC---------TAA-TAGTTT-TAATTATTTGAATTGAT-TCGACAAACA-AA * * * * * 16058358 TTATTTTTTAAATCTCTTACTCATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCT 183 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC- * * * * * * 16058422 GAATGAA-CTTGAATG-AGTTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA 247 AAAT-AAGCTTGTATGAAG--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGA * * * * * 16058485 AATAGATACTTGTTTATATAGTCTTAACTATTTGAATTGA-TTCAACAAAAAAATTTATTTTTTA 309 AATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACT-ACTTCGACAAACAAATTTATTTTTTA * ** 16058549 AATCTCTTAGTTATGAATTTTTAG-AATATTATCAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAACT 373 AATCTCTTAGTTATTAA-TTTTAGAAATATTAT-AAATTAGTATTATTTTATT-T-CGTAAAACT * * ** 16058613 TGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAAT 434 TGTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAAT * * * * * 16058677 TGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAATTATTTTGGTAAATAG 498 TATTCAAATAGTCAAAACTATTTAACTTA-TTCGGTAAATAG * * 16058719 ATTTA-TTTTTAGATCTCTTAC----TAA-TTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT 1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT * * * * * * * * * 16058778 -TCAAATAAGCTTGTATG--CTGAAAAAGAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGGTAATAATGGT 65 CT-GAATAAGCTTATATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AATAGGTTATAACGAT * * * * ** *** * * * 16058840 TTGAAATATATAAATGTTCAAATGGCCATT-ATTATTTGAACCAATTCGATAAACTGATTTATTT 126 TTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG-TTTTAATTATTTGAATTGATTCGACAAAC-AAATTATTT * * * * *** 16058904 TTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATGAATAAACTATTATTATTTTATTTTGGATAAG 189 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG * * * * * * * ** * 16058969 -TTTTCATGAACTAAAATAATTATTTTATTACAAAA-AAAAGTTCATAATAATTTTAAATAGATA 254 CTTGT-ATGAA-GAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAGATA * * ** * ** * * * * 16059032 ATTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAGCTTGTTCAATAAATATATTTATTTTTTCAAATCTCTT 317 ATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTACTTCGACAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTT * * * * 16059097 -GCTTATTAATTTTTTGAAGGT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGA 381 AG-TTATTAA-TTTTAGAA-ATATTATAAATTAGTATTATTTTATTTCGTAA-AA-CTTGTATGA * * * ** * * * * 16059159 ACTGAAACAATTCTTTTATGACTAAACTAAAGGTTAGAATGATTTTAAATAGATAATTATTCTAA 441 ACTAAAATAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA ** * * * * * * * 16059224 TAGTCTTAACCATTTGAAATGATTTGGCAAACAT 506 TAGTCAAAACTATTT-AACTTATTCGGTAAATAG * * * 16059258 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* * * * 16060171 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATTAAACTTGTATGAATATAAACAATTTTTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG * ** * * 16060235 ACAAAA-AGAATATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTT-AAGC 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C * * * * * 16060298 TTGCTCGGTCAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA 129 TTGTTC-ATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TTCTACTTATTAATTTTTAGAA * * 16060351 TACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA * * * 16060416 CAAAACAAATGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGT 66 CAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT * * * * 16060481 GTTCAAAAAAAATAATTTATTTCTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTAAAA 131 GTTC-ATAAACA-AATTTATTT-TTTAAATTCTACTTATTAATTTTTAGAA * *** * * * 16060532 TATTAATAAATTTA-TATTGTTTTATTCAAAATAAGCTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATG 1 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TTGGTTTAGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTGATT-ATTTTTCA-AA 129 TT-GTTCA-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TC-TACTTATTAATTTTT-AGAA * * * * * * * 16061792 TA-T--TAACTT-CTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTGAAAAAATTGTTTTATG 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG * * * * * * * ** * 16061852 ATAAAACAAAAGGTCATTA-TGATTTGAAATAAAGAATTATTGATATACCCTTAACTATTTGAAC 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC ** * * * 16061916 AGGTTC--AAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAA 129 TTGTTCATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TC-TACTTATTAATTTTTAGAA * * ** * * * * * 16061966 TATTATTACATTAGTATTATTTTA-TTCCAAGTAAGCTTATATGGACAGAAATAATTATTTTATA 1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG * * * * * * 16062030 ATAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TCATTTGAAC 65 ACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC * * * 16062094 TAGTTCGATAAACAAATTTA-TTTTAAAATCTCCTGCTTATTAATTTTT-GAAA 129 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* * * 16061422 TTTTTAGAATATTAATAAATTAG 509 TTTTCAAAATACTAATAAATGAA * * * * * * * 16061445 CATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TATATG-ACTAGAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAATGG 1 TATTATTTTA-TCTGAATAAG-CTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGA-AAAA-AAA-AG ** * * * ** * * * 16061508 TCATAACAATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTGAACTGGTTTAGTAAACA 60 TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACT * * * * * ** 16061572 AATTGATTTTTTAACTCTCTTACTAATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT 125 GATTTATTTTTTAA--ATCTT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT * ** * * * * 16061637 TCGACCAAACTTATTTGAA-A-AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT 187 T-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAA-A-TTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATT * * * ** * * * * * * 16061700 TGAAATCGATAACTATTCAAATAGTCTTAATTATTTAAA-TTGGTTTAGCAAACAAAATTATTTT 248 TGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CATAGCTATTTAAACTT-ATTTGGTAAATAGATTTATTTT * * * * * * * ** * 16061764 TTAAATCTCTTGCTGATT-ATTTTT-CAA-A-TATTAACTT-CTTTTATTTTATTTTGAAT-AAG 311 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AATTAATAAGGAA-ATGATTTGGAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT 128 AATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT * * * * * * 16069494 AGTGAT-GACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATCATGACCCTTTTGTTTTGACATAAAA 1 AGTTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAA * * * * * * 16069558 TAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTC-AAA 64 TAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAA * * * 16069622 AATTAATAAGCAAG-GA-TT--AAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAAT 128 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT * * * * 16069672 TGTTAT-GACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAT 1 AGTTATAG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT * * ** * * * 16069736 AATTGTTTGAATTCACACAAGCTTGGTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAA 65 AATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAA * * * * * * 16069801 TTAATAAGTTAGTGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTATCGAATCAA-TTCAAAT 130 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAAT * * * * * * * * 16069853 AATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCACTATTTG-CCTTTTGTTTGGTCATATAA 1 AGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA * ** *** * ** * * 16069917 CAATTGTTTTTGA-TCATATGTGTTTATTTAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATTTTTC-AA 64 TAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCAAA * * * 16069980 AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTATCAAACCAGTTTAAAT 127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT * * * * * * 16070030 ATTTAT-GACTATTTGAATAAGT-TCATACTTCAAATCATTATAACCATTTGTT 1 AGTTATAG-CTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT 16070082 CTATTATAAA Statistics Matches: 2136, Mismatches: 475, Indels: 245 0.75 0.17 0.09 Matches are distributed among these distances: 163 53 0.02 164 66 0.03 165 11 0.01 166 1 0.00 170 2 0.00 174 5 0.00 175 82 0.04 176 189 0.09 177 275 0.13 178 179 0.08 179 40 0.02 180 117 0.05 181 392 0.18 182 499 0.23 183 212 0.10 184 13 0.01 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40 Consensus pattern (181 bp): 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* * * * * 16086964 GGTTCAAATAATTATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACGTTTTATTTTGT 1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT * * ** * * * * * * * * 16087029 CATAAAGCAAATGTTTTTGTTCGTATAAGTTTATTCGGAATAAAGTAATACT-ATTCTGTTAACA 66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATA ** * * * * * * 16087093 TTTTGAATATTAATAA--AAG--ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTT 130 -TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTT * * * * * * * * 16087154 AAGATTATCTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTA 194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG ** * * * * * * 16087219 TTTTTGTTTATACAAGCTTATTTCGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAAA 259 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT * * * * * * * 16087284 AAGTAAAAAATTTAAATAATAAATATATTTACCAAACT 323 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACA * * * * * * * * 16087322 AGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTTT 1 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Indices: 16090280--16090593 Score: 378 Period size: 165 Copynumber: 1.9 Consensus size: 164 16090270 ATTTTTTCTA * * * 16090280 TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATAGTCAAACAACTAATTAGTAA 1 TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAACACTCAAACAACTAATAAGTAA * * * * * 16090345 AAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTGT 66 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGAACAATTAT * * 16090410 TTATTTCAATTCATTATGAAAACTATTGTTTTTG 131 CTATTTCAAATCATTATGAAAACTATTGTTTTTG * ** **** * 16090444 TTCATACAAGCTT-TCTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAACACTTTTCCAATTAATAAGT 1 TTCATACAAGCTTAT-TTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAACACTCAAACAACTAATAAGT * * * * * * 16090508 AAAATATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAATAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATT 64 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGAACAATT * 16090573 ATCTATTTCAAATCGTTATGA 129 ATCTATTTCAAATCATTATGA 16090594 CCTTTTGTTT Statistics Matches: 123, Mismatches: 25, Indels: 3 0.81 0.17 0.02 Matches are distributed among these distances: 163 1 0.01 164 16 0.13 165 106 0.86 ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41 Consensus pattern (164 bp): TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAACACTCAAACAACTAATAAGTAA AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGAACAATTAT CTATTTCAAATCATTATGAAAACTATTGTTTTTG Found at i:16092230 original size:20 final size:20 Alignment explanation
Indices: 16092205--16092253 Score: 82 Period size: 20 Copynumber: 2.5 Consensus size: 20 16092195 ACCTTTGTTT 16092205 TGTCATAAACAATTGTTTTA 1 TGTCATAAACAATTGTTTTA 16092225 TGTCATAAACAATTGTTTTA 1 TGTCATAAACAATTGTTTTA 16092245 -GTTCATAAA 1 TG-TCATAAA 16092254 AGCTTATCCA Statistics Matches: 28, Mismatches: 0, Indels: 2 0.93 0.00 0.07 Matches are distributed among these distances: 19 1 0.04 20 27 0.96 ACGTcount: A:0.37, C:0.10, G:0.10, T:0.43 Consensus pattern (20 bp): TGTCATAAACAATTGTTTTA Found at i:16095074 original size:16 final size:17 Alignment explanation
Indices: 16095042--16095074 Score: 50 Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17 16095032 AACTAGTTTA 16095042 AATAATTATGACTATTTG 1 AATAATTAT-ACTATTTG 16095060 AATAATTAT-CTATTT 1 AATAATTATACTATTT 16095075 CAAATTGCTA Statistics Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2 0.88 0.00 0.12 Matches are distributed among these distances: 16 6 0.40 18 9 0.60 ACGTcount: A:0.39, C:0.06, G:0.06, T:0.48 Consensus pattern (17 bp): AATAATTATACTATTTG Found at i:16111308 original size:16 final size:17 Alignment explanation
Indices: 16111287--16111319 Score: 50 Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17 16111277 TAACAATTTG 16111287 AAATAG-ATAATTATTC 1 AAATAGTATAATTATTC 16111303 AAATAGTTATAATTATT 1 AAATAG-TATAATTATT 16111320 TGAACTGGTT Statistics Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2 0.88 0.00 0.12 Matches are distributed among these distances: 16 6 0.40 18 9 0.60 ACGTcount: A:0.48, C:0.03, G:0.06, T:0.42 Consensus pattern (17 bp): AAATAGTATAATTATTC Found at i:16111464 original size:185 final size:186 Alignment explanation
Indices: 16111180--16113205 Score: 480 Period size: 181 Copynumber: 11.3 Consensus size: 186 16111170 ATTTAAATCT * * * * 16111180 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTCAAACAAACTTA---T--A-T 1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAA-TTATTGTGAATT * * * * 16111239 -AAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAGATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC 65 GAAA-AAAAAAACTTATTTTATGACAAGACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC * ** * * * 16111303 AAATAGT-TATAATTATTTGAACTGGTTAGATAAATAGAA-TTATTTTTAAATT-TCTTC 129 AAATAGTCT-TAAATATTCAAACTGGTTAGACAAACA-AATTTATTTTTAAATTCTCTTA * 16111360 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCCAAATAAATTATTGTGAATT 1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAATTATTGTGAATT * ** * 16111424 GAAAAAAAAAACTTATTTTATGACAA-AGCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC 65 GAAAAAAAAAACTTATTTTATGACAAGA-CAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC * * * * 16111488 ATATAGTCTTAAATATTCAAACTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTA 129 AAATAGTCTTAAATATTCAAACTGGTTAGACAAACAAATTTATTTTTAAATTCTCTTA * * * * * ** 16111546 GTTATTAATTTTTGAAATATTACTAGATTAGTATTATTTTATTCTAACT-AA-GCTTGT--A-TG 1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAATTATTGTGAATTG * * * * * ** * ** * * 16111606 AATGAAAATAA-TTGTTTTATGA-TAGA-ATAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTT 66 AA-AAAAAAAACTTATTTTATGACAAGACA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT * * * * * * 16111668 CAAATAG--TTATATATTTGAAA-TAGTTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTTTTA 128 CAAATAGTCTTAAATA-TTCAAACT-GGTTAGACAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCTCTTA * * * * * * *** 16111725 CTTACTAATTTTTGAAAGATTTATAAATTAGAATTATTTTATTTCGAAT--A-GGGT-TGAA-TG 1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAATTATTGTGAATTG * * * * * * *** * * * 16111785 ATAAAAAACAA-TTGTTATATGACCAA-ACAAAAGGCCACAATTTTTTATAAACAGATAATTGTT 66 A-AAAAAAAAACTTATTTTATGA-CAAGACAAAAAGTCATAACAATTT-GAAATAGATAATTATT * * * ** ** * * * ** 16111848 CATATAGTCTTAATTTTTTGAACTACTTCGACAAATAGATTTATTTTTTCCA-TCTCTTA 128 CAAATAGTCTTAAATATTCAAACTGGTTAGACAAACAAATTTA-TTTTTAAATTCTCTTA * * * * * * 16111907 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CTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA-AATTATTGTGAAT * * * * * * 16112320 TG----AAACAA-TCATTTTATGATAA-A-AAAAGGGTCAT-AC-TTCTTATAAATAGATAATTA 64 TGAAAAAAAAAACTTATTTTATGACAAGACAAAA-AGTCATAACAAT-TT-GAAATAGATAATTA * ** * * ** * * * * 16112376 TTCAAATAGTCAT-AATAATTTGAACTTGTTTGGTATACAAATTTATTTCTTTTAATT-TATTG 126 TTCAAATAGTCTTAAAT-ATTCAAACTGGTTAGACAAACAAATTTA-TT-TTTAAATTCTCTTA * *** ** 16112438 TTTATTAATTTTCT-AAATGA-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGCA-TGT--A- 1 CTTATTAATTTT-TGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAATTATTGTGAAT ** * * * * * * 16112496 TGAATAGGAAAAA-TTATTTTATGACTAA-ACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATATAAAATTGT 64 TGAA-AAAAAAAACTTATTTTATGAC-AAGACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT * * * ** * * * * * 16112559 TCTAATAATCTTAACTATTTGAATTAGATCGACAAA-AATATTTTTTTTTAAA-TCTCTTA 127 TCAAATAGTCTTAAATATTCAAACTGGTTAGACAAACAA-ATTTATTTTTAAATTCTCTTA * * * * * *** 16112618 CTTATTGATTTTT-AGAATATTATTAATTTTA-TAATATTTTATTTCAAAT-AA-GCCTGT--A- 1 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GTTTGAACTGGTTCAAAAAATAGCTTTA-GTTTTGAAAACTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATAT 1 ATTTGAA-TTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATAT * * * * 16116047 TAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACA 64 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTATATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACA * ** * * 16116111 AAACAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCT 127 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT * * ** * * * * 16116164 AATTGAGCTTGTTATATAAATAGATTT-TTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTCTAATGT 1 ATTTGA-ATTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATAT * * * * * * 16116228 TAATAAATAAGTATTATTTTATTTCGTAGAAGCTTGTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGACT 64 TAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACA * ** * * * * 16116292 AAACAAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAGTAGTCTTAACT 127 AAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT 16116346 ATTTGAATT 1 ATTTGAATT 16116355 AGTTTGGCAA Statistics Matches: 2276, Mismatches: 484, Indels: 281 0.75 0.16 0.09 Matches are 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AATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAAAAAACTTATATGAATAAAATATTTGTTTAATGACAAAA 66 AATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTATTTTATGACAAAA * * * * 16114481 CAAAAGGTCATAGCGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-A 130 CAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA * * * * * 16114545 GGTAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTCA-TT 194 -ATAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATT-AGTA * * * * 16114608 TTATTTTA-TTCTGAATAAGC-TAGTATGAAGTGAAAAAATTGTTCTATGATAAAAC--AA---- 255 TTATTTTATTTC-GAATAAGCTTA-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC * * * * 16114665 A-AACAATTTGAAATAGATAATT-GTAAATATAGTCTTAACT 318 ATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAA-ATAGTCATAACT * **** * * * * 16114705 GTTTGAA-TTAGTT-TGGCAA-AAATTTATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTGATATAT 1 ATTTGAACTT-GTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT * * * * * * * 16114767 T-TTATATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAGCTTGTATAAACAAAA-ATATTTGTTTTATAACA 65 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Indices: 16117190--16117903 Score: 845 Period size: 362 Copynumber: 2.0 Consensus size: 361 16117180 TTTTTGGAAA * * *** * 16117190 ATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAAAGAAACAATTATTTTATGACA 1 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAAAGAAACAATTATTTTATGACA * * * * * 16117255 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATATTTATAACTATTTGAACTTGT 66 AAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAT * * ** 16117320 TTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAGTTTTCAGAATATTAATTAATTTGTA 131 TTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAGAATATTAACAAATTTGTA * * * ** * * * * * * 16117385 TTATTTTATTCCAAATATGCCTATATGAATTGGTATAATTGTTTTATAACGAAACAAAAGTTCAT 196 TTATTTTATTCAAAATAAGCCTATATGAATAGAAAAAATTATTTAATAACAAAAAAAAAGGTCAT * * * * * * 16117450 AACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATTATGATTATTTGGACTTGTTTGGTAAACAGATT 261 AACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGGTTGATAAACAGATT * * 16117515 TATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATCGTCTAAAT 326 GATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATCGTCTAAAT * * * 16117551 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACATAATCAATTGTTTTATGAC 1 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTATGAC * * 16117616 AAAACAAAAAGTCATAACGATTT-AAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTT 65 AAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAA-AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT * * * * * * * ** * 16117680 ATTTAGTAAGCAGATTTATTTTTTTAATTTTTTATTTATTAATTTTTTGAATATTTACAAATTTG 129 ATTTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAGAATATTAACAAATTTG * ** * * 16117745 TATTATTTTATTTAAAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTAATGACAAAAAAAAAGGTC 194 TATTATTTTATTCAAAATAAGCCTATATGAATAGAAAAAATTATTTAATAACAAAAAAAAAGGTC * * * * * * ** 16117810 ATAGCTATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCCTAACTGTTTGAACTTGGTTGATGGACAGA 259 ATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGGTTGATAAACAGA 16117875 TTGATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAAT 324 TTGATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAAT 16117904 TTTTGGATTG Statistics Matches: 289, Mismatches: 62, Indels: 3 0.82 0.18 0.01 Matches are distributed among these distances: 361 42 0.15 362 247 0.85 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43 Consensus pattern (361 bp): ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAAAGAAACAATTATTTTATGACA AAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAT TTAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAGAATATTAACAAATTTGTA TTATTTTATTCAAAATAAGCCTATATGAATAGAAAAAATTATTTAATAACAAAAAAAAAGGTCAT AACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGGTTGATAAACAGATT GATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATCGTCTAAAT Found at i:16117907 original size:181 final size:180 Alignment explanation
Indices: 16117153--16117907 Score: 708 Period size: 181 Copynumber: 4.2 Consensus size: 180 16117143 AAACAATTAT * * * * * 16117153 TTTATTTT-TAAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGAAAATTAATAAATTTATATTATTTTATTT 1 TTTATTTTCT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC ** * * 16117216 GGAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA 65 CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAA * * * * * 16117280 AAAGATAATTATTCAAATATTTATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGA 130 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGA-TAAACAGA * * * * ** * * 16117332 TTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAGTTTTCAGAATATTAATTAATTTGTATTATTTTATTCC 1 TTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCC * * * * ** * * * * * * 16117397 AAATATGCCTATATGAATTGGTATAATTGTTTTATAACGAAACAAAAGTTCATAACTATTTGAAA 66 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAA * * * * * * 16117462 TAGATAATTATTCAAATAATTATGATTATTTGGACTTGTTTGGTAAACAGA 131 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTGATAAACAGA * ** * * * * 16117513 TTTATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATCGTCTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC 1 TTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCC * * * * * * * 16117578 AAATAAACTTGTATGAACATAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-GTCATAACGATTTAAA 66 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAAAGGTCATAACTATTTGAA * * * * * 16117642 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTTAGTAAGCAGA 130 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGA-TAAACAGA * * * * * * * * ** 16117694 TTTATTTTTTTAATTTTTTATTTATTAATTTTTTGAATATTTACAAATTTGTATTATTTTATTTA 1 TTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCC * * * * 16117759 AAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTAATGACAAAAAAAAAGGTCATAGCTATTTGAAA 66 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAA * * * * ** 16117824 TAGATAATTGTTTAAATAGTCCTAACTGTTTGAACTTGGTTGATGGACAGA 131 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTGATAAACAGA * 16117875 TTGATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT 1 TTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT 16117908 GGATTGTACG Statistics Matches: 453, Mismatches: 115, Indels: 14 0.78 0.20 0.02 Matches are distributed among these distances: 179 11 0.02 180 60 0.13 181 373 0.82 182 9 0.02 ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.09, T:0.44 Consensus pattern (180 bp): TTTATTTTCTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCC AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAA TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGATAAACAGA Found at i:16118298 original size:181 final size:180 Alignment explanation
Indices: 16117933--16120786 Score: 2220 Period size: 181 Copynumber: 15.9 Consensus size: 180 16117923 GAAATACTTA * * * * ** * * * 16117933 TTTTGTGATAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAACT-GTTATAGCTA 1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTA * ** * * * 16117997 TTTGCAA-TGGTTAGGCCAACATATTCATTCTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTTAGAATAT 65 TTTG-AACTGGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAATAT * * *** * * * 16118060 TAATAAATTAGCATTACTTTATTCCGAGTAGGA-TTGTATGAACAAAAACAATTG 128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA-AACTTGTATGAA-TAAAACAATTG ** * * * * * * 16118114 TTTTATGATGAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATCATTGTTTAAATAGTTATAACTAA 1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT ** * * * * 16118179 TTGAACTGGTTTAGTAAGCAGATTTATTTTTTAATTCTCTTATTTATTAATTTTTAAAATATTAA 66 TTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA * * * * * 16118244 TAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTGTTTGAATAAAATCATTTG 131 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** 16120628 TTTTATAACAAAGCAAAGGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAACTATTCAAATAATCATAGTTAT 1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT * * * * * * * * * 16120693 TTAAACTTGATCAGTAAACATATTCATTTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA 66 TTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA * * * 16120758 ACAACTTAGTATTATTTTATTTCAAATAA 130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAA 16120787 GCTTATACAA Statistics Matches: 2127, Mismatches: 468, Indels: 155 0.77 0.17 0.06 Matches are distributed among these distances: 173 122 0.06 174 6 0.00 175 9 0.00 176 68 0.03 177 67 0.03 178 66 0.03 179 275 0.13 180 545 0.26 181 709 0.33 182 254 0.12 183 6 0.00 ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42 Consensus pattern (180 bp): TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT TTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAAAACAATTG Found at i:16121488 original size:182 final size:177 Alignment explanation
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--AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA ** * * * ** 16122295 TGTTTGTCTATTTAAAATTC-TTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAACAATTGTTTCAATTCATA 1 TAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATA * * * 16122359 CAAGCTTATTCGAAATGAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATT 64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG--A--GATT * * * * * * * * * 16122424 TAAAAAGTTAATTTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATTGTCATGTCCATTTAAA 125 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * 16122476 TAATTATCTAGTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGTTCATGC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC ** * 16122541 AAAATTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTGAAA 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTT-AAA * * * * 16122605 AAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGGA 129 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * 16122653 CAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAA 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATAC * * * * * * 16122718 AAGCTTATCCAAAATAAAGTAATACTACTTTATTAAAATTTTTAAAATTAATAAGAGATTTAAAA 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA * * * * * 16122783 AATGAAT-TAGTTTACCAAATC-AGATCAAATAATTATGGCCATTTGAA 130 AATAAATCTA-TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * ** * * * *** * 16122830 CAA-TATCTATTTCAAATCAATACT-ACCTTTCGTTTTGTCATCAAACAATTTTTTTCAACATGC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATAC *** * * * 16122893 AAGCTTATTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAGTAAGAGATTTAAAA 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA * * * * 16122958 AATAAATTTATTTATCGAACCAA-TTCAAATAGTTATCACTATTTGAA 130 AATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * * * 16123005 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAA 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC ** *** * * * 16123070 AAATTTATTTGGAATGAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTCAT-AGCTAGGAATTT 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG--A-G-ATTT ** * ** * * * * * 16123134 AAAAAATAAATCTGCTTGCTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGTA 126 AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * * * 16123185 TAATTATATATTTTAAATTGTTATGACC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCGTGC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATAC * * * * ** * * * 16123248 AAGTTTATTCAGAATAAAATAAAATTAATTTGCTAATATT-TCAAAATTTTATAAGGAAGAGATT 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA-G-AGA-TTT * * * * * * 16123312 AAAAAA-AATTCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAA 126 AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * 16123362 TAATTATCTATTTCAAAT-GTCATCACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAT 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATAC * * * * * 16123426 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AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAA * * * * * * 16123850 AAATAAATTTATTTACCAAACCACTTCATATGGTTAAGACTATTTGAA 129 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * ** * * * 16123898 TAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTCATTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAGTTCATAC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC *** * * ** * 16123963 AAGCTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAAAGATTTTAAA 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGA-TTTAAA * * * * 16124028 AAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATACTTA-GTACTATTTGAA 129 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAA * * * * * 16124076 CAATTGTCTATTTAAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTGTTTTAGTTAATAC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATAC * * * * 16124140 AAGCTTATACAATATAAAATAATA-AAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTT * * ** * * ** * * * 16124204 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAATTATTTAAAATAACTATGGCCATTTAAA 126 AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * 16124255 TAATTATCTTTTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGATCATAC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATAC ** 16124320 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAA 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAA * * * * * * * 16124384 AAAGAAATATGTGTACTGAACCAA-TTCGAATAGTTATGACTATTTGAA 129 AAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * ** ** *** * * *** * *** 16124432 CATTTAAAATAATAACAATTTATTAATATTCGACAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAA-AAGAA 1 TAATT-ATCT-ATTTCAA---ATCGTTA-T-GAC-CTT--T-TGT-TTTG-TCATAAAACAATTG * * * * * * * * 16124495 ATATGTT--TACCAA-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AA-TTATTTAT-TTC-AA 53 TTTTGTTCATA-CAAGCTTA-TTCAAA-A--TA-AAATA-AT--ACTAATTTATTAATATTCTAA * ** *** * * * ** * * 16124553 ATCATTATGATTTTTTGTTTTGTTATAAAACT--ATTTTTTTGTTCATACAAG--C--TTA-TT- 109 A-AATTA--A---TAAGAGAT-TTA-AAAAATAAATCTATTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTA * ** 16124610 CGA--ATTAAAA 165 TGACTATTTGAA * *** * *** 16124620 TAA-TAT-TAATTT---AT--TAAT-A--TTTTGACAAT-TAATAAGTAA-AA--GATTTTAAAC 1 TAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAA--AACAATTG-TTTTGTTC * * *** * * * 16124671 ATAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAATAAT-TATCTATTTTAAA 61 AT--ACAAGCTTATTCAA-AA--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-ATTAATAT-TCTA---AAAA ** * * * * * * * 16124734 TTGTTATGACCTTTTG-TTTCATCATAAAATAATTGTATCAATTTA-TATAGGCTTATTTGAAAT 112 TTAATAAGA------GATTT-A--A-AAAATAA----ATCTATTTACCA-A-AC-AAGTTCAAAT * * * * 16124797 AAAATAAT-ACTAATTGAT 160 --AGTTATGACTATTTGAA * * ** *** * * 16124815 TAA-TATTCCAAAAATTATTGAGTAAGGGATT-T-AAAATTTGATTTGTTTACTGAATAAGTTCA 1 TAATTA-T-C---TA-T-TTCA--AATCG-TTATGACCTTTTGTTTTG-TCA-T-AA-AA---C- * * * ** * ** * ** ** * * * * 16124877 AATAG-TTTGACTAT-TTAAAAAATTATT-TATTTCAAATCGTTA-TGACCTT-TT-GTTTTGTG 48 AATTGTTTTG--T-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-AATACT-AATTTATTAATATTCTA * ** **** * * * * 16124936 ATAA--AATAATTG-TTTATGTTCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATAT-AAAT--TTAT 108 AAAATTAATAAGAGATTTA-AAAAATA-AATC-TA-TTTACCA-AACA-AGT-TCAAATAGTTAT * * * 16124994 TAATATTTCAA 166 GACTATTTGAA * ** * * * ** ** 16125005 -AATTA-ATA-AGCAAAACTTTAAAAATAAAATTTT-TTTAATACGTTCA-AAAA-GTTATGACA 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTT----ATGACCTTTTGTTT--T--G-TCATAAAACAAT-TG--- * * * ** * * ** * * 16125064 ATTTG--AATA-ATTA-TTTATTTCAAAA-ACTCATAA-GCCAA-TTATTTCTGTTCATACAAGC 53 TTTTGTTCATACA--AGCTTA-TTCAAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTC-TA-AA-A * * * * * * ** 16125122 A-TATTCAA-A-A--TAAAGTAATACTAATTTATTAATATTCCAAA-AA-TTGATA-AGTAAAAA 111 ATTAAT-AAGAGATTTAAA-AAATA--AATCTATT--TA--CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA * * 16125179 AT-TTTAAAAA 168 CTATTT--GAA * * * * * * 16125189 TAAATTATTTATCGAGCAAGTTCAAATAGTTAT-AACTGTTTGAACAATTATTTGTTTCACATAG 1 T-AATTATCTAT--------TTCAAATCGTTATGACCT-TTTG------T-TTTG--TCATAAAA ** * * * * *** * * * * 16125253 TTATGATCTTTTGTTTCATCATAAAAC-AATT--GTTTATATTCATAC-AAGTTTATTGGGA-AT 47 CAAT--TGTTTTG-TTCAT-A-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATT--AATAT * * * * * * * * ** * 16125313 CCATAATACTAATTTATTAATA-TTTTGAAAATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAAAAAATTTGT 104 TC-TAA-A--AA-TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CT-----ATTT-ACCAAACAA---G- * * * 16125377 TTACCAAATAAGTTCAAAAAGTCATGTCCATTTAAA 153 TT--CAAAT-AG-T-------T-ATGACTATTTGAA * * * * 16125413 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC ** * * * * * * * 16125478 AAAATTATACAAAATAAAATAATACTGATATATTGATATTTTGAAAATTAATAAGACATTTAAAA 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA * * * 16125543 ACTAAATCTATTTACTGAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAA 130 AATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * 16125590 CAATTATCTATCTCAAATCATTA--ATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TATCATA 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGT-TCATA *** * * ** * 16125651 CAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAATAATTTAACAA-ATTTCCAAAAAAATTAATAAGCAAGAG 64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-C-TAAAAATTAAT----AAGAG * * * * * * * 16125715 ATTT-TAAAA-AAATGTGTTTGCCAAACTAGATCAAATAGTTAAGACTA-TTGAA 122 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * * ** * 16125767 TAATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTATTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCACTTCATCC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC * * * 16125832 AAGCTTATATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATT 65 AAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT----AAGAGATT ** * * 16125897 TTTAAAA-AAATCTATTTACCGAACAAG-TCTAAATA-TATTTGACTA-TTGAA 125 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTC-AAATAGT-TATGACTATTTGAA * * * * 16125947 CAATTATCTATTT-AAAGTCATTATTACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA 1 TAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATA * * * * * * * 16126011 AAAACTTA-TCTGAAATAAAGTAATATTACTCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGTGA 64 CAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG--A--GA * * **** * * * 16126074 TTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAA 123 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * ** * * * * ** 16126128 CAAATATCAACCTCAAATCATTATGA--TATCTATTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATA 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATA * * * * * 16126191 CAAGCCTATTC-AGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATGAGAGATTTAA 64 CAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAA * * * * * * * * 16126255 AAAATAAATGTATTTGCCGAACCAGTTCTAATAGTTAAGATTATTAGAA 128 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * 16126304 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATAC 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAC * * *** 16126369 AAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTTCCATT-TGAAAAATTAATAAACATGAGATT 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT--A-A-GAGATT * * * * * * 16126433 TAAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTTAAATATTTATGACTATTTGAA 125 T-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * * * 16126486 CAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAA 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATAC * * * 16126551 AAGCTTATCCAAAAT--AA-AATAC-CA-CT-TT-AT-TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT 65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT ** * * * * 16126607 AAAAAATAAAT-TAGTTTATGGAATCAA-TTCAAATAATTATGACCATCTGAA 126 AAAAAATAAATCTA-TTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA * * * * * * * 16126658 CAACTATATATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTT-TCAACATA 1 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT--TCATA ** * * * * 16126722 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATCCTAATTCATTAACATT-TCAAGAATTAATAAGAGA-TTAA 64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAA * * * * * 16126785 AAAA-AAATTTGTTTTCTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA 128 AAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA ** * * * * * * * * 16126833 TAAAGATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTATTAATAT 1 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Indices: 16124334--16124538 Score: 274 Period size: 105 Copynumber: 2.0 Consensus size: 102 16124324 TTATTTGAAA 16124334 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAGAAATATGTGTA 1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAGAAATATGTGTA * * * 16124399 CTGAACCAA-TTCGAATAGTTATGACTATTTGAACATT 66 C-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATT 16124436 TAAAATAATAAC-AATTTATTAATA-TTCGACAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATA 1 TAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTC-A-AA--AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAAGAAATA * * 16124498 TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA 60 TGTGTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA 16124539 ATTATTTATT Statistics Matches: 91, Mismatches: 5, Indels: 11 0.85 0.05 0.10 Matches are distributed among these distances: 101 3 0.03 102 22 0.24 103 4 0.04 104 7 0.08 105 55 0.60 ACGTcount: A:0.48, C:0.08, G:0.10, T:0.34 Consensus pattern (102 bp): TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAGAAATATGTGTA CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACATT Found at i:16124942 original size:179 final size:177 Alignment explanation
Indices: 16124436--16128205 Score: 1465 Period size: 180 Copynumber: 21.3 Consensus size: 177 16124426 TTTGAACATT * * * * * * * 16124436 TAAAATAATAACAATTTATTAATA-TTCGACAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGAAATATG 1 TAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATG * * ** 16124500 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATT 65 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC * * * * * * * 16124565 TTTTGTTTTGTTATAAAACTATTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAT 129 TTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTATTTATACAAGCTTATTTGAAA ** * 16124615 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATG 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATG * * * * * * * * 16124680 CTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACC 65 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGT-TTGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC ** * * * 16124745 TTTTGTTTCATCATAAAATAATTGTATCAATTTATATAGGCTTATTTGAAA 129 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-T-TATTTATACAAGCTTATTTGAAA * * * * ** ** * 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TAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATGT * * ** * * * * * * * 16125197 TTATCGAGCAAGTTCAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTGTTTCACATAGTTATGATCT 66 TTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCT ** * * * * 16125262 TTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGTTTATTGGGAA 130 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAT-TT-ATACAAGCTTATTTGAAA ** ** ** ** * * * * 16125312 T-CCATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAAAAAATTTG 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATG * * * * * 16125376 TTTACCAAATAAGTTCAAAAAGTCATGTCCATTT-AAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC 65 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGT-TTGACTATTTGAAA-AATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * * * ** *** 16125440 ATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATACAAAA 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAT-TT-ATACAAGCTTATTTGAAA * * * ** * * * 16125492 TAAAATAATACTGATATATTGATATTTTGAAAATTAATAAG----ACA-TTTAAAAACTAAATCT 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACA-TAAATAT * * * * * * * * 16125552 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TGTTTACCAAATAAGTTC-AAATA-GTTTGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAA-TCGTTAT * * * * * * * 16125971 TACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCTGAAA 125 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTA-TTTATACAAGCTTATTTGAAA * * * * ** * 16126026 TAAAGTAATATTACTCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGTGA-TTTAAAAACTAAAGCT 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACA-TAAA--T *** ** * * ** ** * 16126090 AT-TTT-TTGAACCAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAACAAA-TATCAACCTCAAATCATTAT 62 ATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAA-AAATTATTTATTTCAAATCGTTAT * * * * * * * * * 16126152 GA--TATCTATTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATACAAGCCTA-TTCAGA 125 GACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TT-TATTTATACAAGCTTATTTGAAA * * * * * * 16126205 TAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATGT 1 T-AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATAT * * * ** * * * * * * 16126266 ATTTGCCGAACCAGTTCTAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC 64 GTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * * * ** 16126331 CTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCCTATTCAAAA 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-A-TTTATACAAGCTTATTTGAAA * *** * ** ** * * 16126383 TAAAATAATACTAATTTCTTTCCATTTGAAAAATTAATAAACATGAGATTTAAAAAAATAAATAT 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAACATAAATAT * * * * * * * 16126448 GTTTACCGAATAAGTTTAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC 64 GTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * * * * * ** 16126513 CTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAA 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTA-TTTATACAAGCTTATTTGAAA * ** * * * * 16126564 -ATAA-AATACCA---CTT--TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAG 1 TAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATAT-G *** * * * * * * * * 16126621 TTTATGGAATCAA-TTCAAATAATTATGACCATCTGAACAACTATATATTTCAAATTGTTATTAC 65 TTTACCAAAT-AAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * * 16126685 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTT-TTCAACATACAAGCTTATTTGAAA 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATT---TATACAAGCTTATTTGAAA * * * * * * * 16126737 TAAAATAATCCTAATTCATTAACATTTCAAGAATTAATAAG----AGA--TTAAAAAAAAATTTG 1 TAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATG * ** * * * * * 16126796 TTTTCTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAA-GATCTATTTCAAATCATTATTAC 65 TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAA-AAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * * * * * * * ** 16126860 TTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTATTAATATAAGTTTGTTCAAAA 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TGTTTATTTATACAAGCTTATTTGAAA * * * * * 16126912 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATTT 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACA-TAAATAT * * * * ** * * 16126976 GCTTGCCAAA-ACATTTCAAATAGTTTGGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATAA 64 GTTTACCAAATA-AGTTCAAATAGTTT-GACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA * * * * * ** ** 16127040 CATTTT-ATTTG------AATAGTT-TTAACTGTTCATACTATTTTATTCAAAA 127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTA-T-TT-ATACAAGCTTATTTGAAA * * * ** * * * * 16127086 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCT 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAACATAAATAT ** ** * * * * * * * * 16127150 AATTGTCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAAC 64 GTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * * * 16127215 CTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAAC 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-A-TTTATACAAGCTTATTT-GAAA ** * * * ** * * 16127268 T-AAATAATACTAATTTATTACCATTTGAAAAAATAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATAT 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAACATAAATAT * * * * * 16127332 GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGAC 64 GTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * * * * *** 16127397 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTA-TTTATACAAGCTTATTTGAAA * * * * * 16127449 TAAAATAATACT-A-CT-TT--T-TTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA- 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAAT-AT * *** * * * * * * * * 16127507 ATTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCAATTTGAACAATTGTCTATTTCAAATAGTTATTA 64 GTTTACCAAAT-AAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA * * * 16127571 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTCAACATACAAGCTTATTCGAAA 127 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATT---TATACAAGCTTATTTGAAA * * * * * * 16127624 TAAAATAATCCTAATTTATTAACATTTCAAGAATTAATAAG----AGA-TTTAAAAATAAATTTA 1 TAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATG * * * * * * * 16127684 TTTTCTAAGCT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC 65 TTTACCAA-ATAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAC * * ** * * ** 16127748 CTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTGTCTGGTCATACAGGC-TATTCAAAA 128 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-T-TATTTATACAAGCTTATTTGAAA * ** * * * * * 16127799 TAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CG 1 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAACATAAATATG ** * * * * * * ** 16127863 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Indices: 16125099--16128548 Score: 1527 Period size: 180 Copynumber: 19.4 Consensus size: 177 16125089 ACTCATAAGC * * * * * * * 16125099 CAATTATTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA 1 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTTCAAAA * * * * ** * * * * 16125164 ATTGATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT-TATTTATCGAGCAAGTTCAAATAGTTATAACTGT 66 ATTAATAAGCAAGAGATTTT-AAAA-AAATGTATTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-A * * * * * ** 16125228 TTGAACAATTATTTGTTTCACAT-AGTTATGATCTTTTGTTTCATCATAAAA 128 TTGAACAATTATCT-ATTCAAATCA-TTATGACCTATTGTTTTGTCATAAAA * * *** ** * * ** 16125279 CAATTGTTT-ATATTCATACAAGTTTATTGGGAAT-CCATAATACTAATTTATTAATATTTTGAA 1 CAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTTCAAA ** * * * * * * * ** * * * * 16125342 AATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAAAAGTCATGTCCA 65 AATTAATAAGCAAGAGATTT--TAAAAAAATGTATTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA * * * * * * 16125407 TTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA 128 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Indices: 16125099--16128563 Score: 2123 Period size: 357 Copynumber: 9.8 Consensus size: 359 16125089 ACTCATAAGC * * * * * 16125099 CAATTATTTCT-GTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTCCAAA 1 CAATTGTTTCTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAA * * * * * * * * * 16125163 AATTGATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAA-TTATTTATCGAGCAAGTTCAAATAGTTATAACTG 66 AATTAAT-AG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA * * * * * * ** 16125227 TTTGAACAATTATTTGTTTCACAT-AGTTATGATCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTATA 129 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA * ** ** * ** ** * 16125291 -TTCATACAAGTTTATTGGGAAT-CCATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATTGGTA 192 GTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCA * * * * **** * * * * * * * 16125354 GGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAAAAGTCATGTCCATTTAAATAATTA 256 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA * * 16125419 TCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAA 321 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Indices: 16128881--16132457 Score: 2636 Period size: 895 Copynumber: 4.0 Consensus size: 884 16128871 GGTGTTTGTC * * * * * * * * 16128881 GAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTA-CTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTATT-A 1 GAACCAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA--TTTTGT * * * * 16128944 TTTAGCCATAAAACAATTATTTCATTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTA 64 TTTA-TCATAAAACAATTTTTTGA--TCATACAAGCTTATTCAGATA-AAAATAATACTAATTTA * * ** * * * * * 16129008 TTAACATTAAAAAAATTAATTTGCAAAAGATTTTAAAAA-AAA-TGTTTACCAAACAAGATT-AA 125 ATAATATT-CCAAATTTAA--T--AAGAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCGAACCAG-TTCAA * * * * * ** * * * * * * 16129070 ATAGATT-TGGCTATTGAAAAATCATCTATTTAAAGTCATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAA 184 ATAG-TTAAGACTATTGAATAATTATCTATTCAAA-TTGTTCT-AACATTTTGTTTAGTCATAAA * * * * * * * * * * * 16129134 ACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAG 246 ACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAA * * ** * * * * 16129199 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Indices: 16135948--16136074 Score: 188 Period size: 67 Copynumber: 1.9 Consensus size: 67 16135938 TCTTAGTATT 16135948 ATTTTTTTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTACTAA 1 ATTTTTTTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTACTAA 16136013 TA 66 TA * ** 16136015 ATTTTATTTT-AAATAAACTTGTATGTTGAAAACA-AA-TGTTTTATGACAAAATGAAAGGTA 1 ATTTT-TTTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAA-ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTA 16136075 ATAACATTTA Statistics Matches: 55, Mismatches: 3, Indels: 5 0.87 0.05 0.08 Matches are distributed among these distances: 66 22 0.40 67 28 0.51 68 5 0.09 ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.11, T:0.39 Consensus pattern (67 bp): ATTTTTTTTCAAATAAACTTGTATGTTCAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTACTAA TA Done.