Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167994.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_250, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
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Found at i:579 original size:181 final size:181
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Indices: 131--715 Score: 683
Period size: 181 Copynumber: 3.2 Consensus size: 181
121 GATTAGGTAA
* * *
131 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
1 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT
* * * * *
196 AGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATATCTTATTTATTATTTTTTGAAATATTAGTAAATTC
66 AGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-
* * * ** *
261 A-TTTTATTTTATTCCAAATAGGCTAGTATGAATTCAAACAA-ACCTCTTTTATG
130 AGTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA--CAAA-AATAATTGTTTTATG
* * **
314 ACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTTGAACT
1 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT
* * * * * * * * * * *
378 AGCTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAACTTTTGGAATATTATTAGATTA
66 AGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* *
443 GTGTTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
131 GTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
* * * * * * *
494 ACAAACCAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT
1 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT
* *
559 AGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTA
66 AGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* ** *
624 GTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATGATTGTTTTATG
131 GTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
* * *
675 ATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATATATAA-TGTTC
1 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTC
716 TGAATCACTT
Statistics
Matches: 333, Mismatches: 66, Indels: 9
0.82 0.16 0.02
Matches are distributed among these distances:
179 2 0.01
180 28 0.08
181 170 0.51
182 122 0.37
183 11 0.03
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT
AGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
GTTTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
Found at i:958 original size:166 final size:163
Alignment explanation
Indices: 565--971 Score: 457
Period size: 166 Copynumber: 2.5 Consensus size: 163
555 AATTAGTTTG
* * *
565 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTTTTA
1 GTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** * * * *
630 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATGATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAAT
66 TTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAAACAATATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAAC
* *
695 GATTTGAAATATATAATGTTCTGAATCACTTCA
131 AATTTGAAATAGATAATGTTCTGAATCACTTCA
* * * *
728 GCAAACAA-TTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATT-ATTAATTAGTATT
1 GTAAA-AAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
791 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-AAAACAATATTTTATAATAAAGCGAAAGGTTATAA
65 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAAACAATATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAA
**
855 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACTGGAA-CTGGTTC-
130 CAATTTGAAATAGATAA-TGTT----CT-GAATC-ACTTCA
* * * *
894 GTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCCTAC-TATAAATGTTTGAAATATTAACAAATTAGTATTA
1 GTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
958 TTTTATTTCAAATA
66 TTTTATTTCAAATA
972 GGTGTGTATG
Statistics
Matches: 203, Mismatches: 31, Indels: 17
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
161 40 0.20
162 42 0.21
163 43 0.21
164 1 0.00
165 18 0.09
166 53 0.26
167 6 0.03
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (163 bp):
GTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAAACAATATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAAC
AATTTGAAATAGATAATGTTCTGAATCACTTCA
Found at i:1245 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 985--1427 Score: 428
Period size: 180 Copynumber: 2.4 Consensus size: 181
975 GTGTATGATA
* ** * * * *
985 AAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAATTTTCATAACAATTTGAACTAAATAATTGTTCAAAT
1 AAAA-AATTAGTTTTATGACTAAACAAAA-GGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAA
* * *
1049 GCCCATAATTATTTGAACCAATTTGACAAACTGACTTATTTTGTAAATCTCTAACT-TATCAATT
64 G-TCATAACTATTTGAACCAATTTGACAAACAGACTTATTTTGTAAATCTCTAA-TGTATCAATT
* * * * *
1113 TT-TCAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATTG
127 TTCT-AAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTG
* * * * *** *
1168 GAATAA-TGGTTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAACAG
1 AAAAAATTAGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-AG
*** * * * * * * *
1231 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTATGTATTAATTTTC
65 TCATAACTATTTGAACCAATTTGACAAACAGACTTATTTTGTAAATCTCTAATGTATCAATTTTC
* * *
1296 TAAATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTG
130 TAAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTG
* * *
1348 AAAAAATTATTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
1 AAAAAATTAGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAAAG
*
1413 TCTTAACTATTTGAA
65 TCATAACTATTTGAA
1428 TTGGTTTGTC
Statistics
Matches: 208, Mismatches: 45, Indels: 15
0.78 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
179 1 0.00
180 122 0.59
181 20 0.10
182 61 0.29
183 4 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AAAAAATTAGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAGT
CATAACTATTTGAACCAATTTGACAAACAGACTTATTTTGTAAATCTCTAATGTATCAATTTTCT
AAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTG
Found at i:1426 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1112--1466 Score: 421
Period size: 182 Copynumber: 2.0 Consensus size: 180
1102 ACTTATCAAT
* * * * * * * *
1112 TTTTCAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAATTGGAATAATGG
1 TTTTCAAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTGAAAAAATAG
* *** *
1177 TTTTATGATAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATT
66 TTTTATGATAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATT
* *
1242 TGAACTT-GTTTGAT-AAACA-GATTTATTTTTTTAATT-TCTTATGTATTAA
131 TGAA-TTGGTTTG-TCAAACACG-TTTATATTTTAAATTCTCTTATGTATTAA
* * *
1291 TTTTCTAAATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTGAAAAAATT
1 TTTTC-AAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTGAAAAAA-T
* * * * *
1356 ATTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACT
64 AGTTTTATGA-TAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACT
1421 ATTTGAATTGGTTTGTCAAACACGTTTATATTTTAAATTCTCTTAT
128 ATTTGAATTGGTTTGTCAAACACGTTTATATTTTAAATTCTCTTAT
1467 TAATTTTTAA
Statistics
Matches: 146, Mismatches: 23, Indels: 10
0.82 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
179 5 0.03
180 47 0.32
181 12 0.08
182 75 0.51
183 7 0.05
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
TTTTCAAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATGAACTGAAAAAATAG
TTTTATGATAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATT
TGAATTGGTTTGTCAAACACGTTTATATTTTAAATTCTCTTATGTATTAA
Found at i:2052 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 1669--4548 Score: 1526
Period size: 181 Copynumber: 16.1 Consensus size: 178
1659 TGTATGAATC
* ** * * *
1669 AACAATTGTTTTATGGACAAAAC-AAATGTCCATAACAATTTGAAAAAATGA-TAGTTCAAATGG
1 AACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGT-CATAATGATTTGAATAAATAATTA-TTCAAATAG
* * * * * ***
1732 AT-ATGACTATTTGATCTTATTCGATTAACAGATTTA-TTTTTCAATCTCCAACTTATTAATTTT
63 -TCATAACTATTTGAACTT-TTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * ** * *
1795 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTAT-AAGTAGA
125 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAA
** * **
1849 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATTATAACAATTTGAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
* * *
1914 CAACTATTTAAACTCTTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTATTTAATTAATTTTTTG
66 TAACTATTTGAACT-TTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTTTG
* * * * * *
1978 AATTTTAATAAATAAGTATAATTTCATTCCGAATAAGCTTTTATGAACAAA
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* *
2029 AACAATTGATTTT-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATGTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAG
1 AACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTG-AATAAATAATTATTCAAATAG
* * * * *
2093 TCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTT
63 TCATAACTATTTGAAC-TTTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
2156 GGAAATATTAATAACTTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACATA
126 TG-AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * * * * * * *
2210 ACCAATTATTTTAATGGA-AAAACAAAAGGTAATAATGTTTTAAAATAGATAATTGTTTAGATAG
1 AACAATTGTTTT-AT-GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-GAATAAATAATTATTCAAATAG
* * * * *
2274 TCATAACTATTTGAACATATTCGATAAATAAATTCATTTTTTAATTCTCTTT-CTAATTAATTTT
63 TCATAACTATTTGAAC-TTTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
2338 TGGAATATT-TTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATGAACTAA
125 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * * *
2391 AACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTTACAATGATTTGAAATACATAATTATTCAAATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * *
2456 ATGACTATTTGAACTTGTTCG-AAAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTT
65 ATAACTATTTGAACTT-TTCGTAAACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* *
2519 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
127 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * ** * *
2572 AATAATTCTTTTATGACAAAA-TAAAGAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTT-GAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * *
2636 CATAA-GATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTTT
64 CATAACTATTTGAAC-T-TTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTT
*
2699 T-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAGAATAAGCTTTTATGAACAGAA
126 TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-AATAAGCTTGTATGAACA-AA
* ** * * * * * * * *
2752 GA-AATCATTTTACGACAAAACAAATGGTTATAGT-AGTTTCAAATAGATAAATTGTTGAAATAG
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTT-GAATAAAT-AATTATTCAAATAG
* * * * * *
2815 ACA-AAC---TTG-----TTCAATAAAC-AATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTG
63 TCATAACTATTTGAACTTTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * *** * **
2870 GAATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGA
127 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * ** * * *
2922 CATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGTC
* ** * * * * **
2987 ATAATTATTTGAACTAGTTAAGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCCTTTACATATTAATTTCTAA
65 ATAACTATTTGAACT--TTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTG
* *** * ***
3052 AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTATGAATAAGCTAGTATGAATTGA
128 AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * * *
3103 AA-AATTATTTTATGACAAAATAAAA-G------TGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
3160 TTAATTATTGGAA-TTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTA
65 ATAACTATTTGAACTT--TTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * * * ** *
3223 GAGTATTATTATATTAGTATTATTTCATT-TGAATAAACTTGTATGAACAAA
127 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
** * * * * * * *
3274 AGTAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTT
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-TAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
3339 ATAATTATTTAAACTGATTT-GATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTTATACTTATTAAATTTTT
65 ATAACTATTTGAACT--TTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * * ** *
3403 AAAGATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAACTTGTATGATA-AAA
127 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-ACAAA
* ** * * ** * * * *
3455 AATAATTGTTACATGAC-AAACAAAATGTAATAACAATTTTGGAAATAGATAATTGTTGAAATGG
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTT-G-AATAAATAATTATTCAAATAG
* * * ***
3519 CCATAATTATTTGAACTGATTTTGGTAAATGGATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTT
63 TCATAACTATTTGAAC---TTTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * *** * * **
3580 TAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTAATTTTGAACAAGC-TGTTGTGAACTGA
125 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG-TATGAACAAA
* * * * *
3633 AACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * * *
3698 TTAATTGTTTAAACCGCTTT-GACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTT
65 ATAACTATTTGAA-C-TTTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* ** * * **
3761 GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTATATGAACTGA
127 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * * * * ** * * *
3814 AA-ATTTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTGTAACGATTTGAAATAGATAA-TGTTCAAATAG--
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * ** ** *
3875 -GAAC----T-AA--TATAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACAAATT-ACTTTTTGAA
65 ATAACTATTTGAACTTTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAA
* ** * * **
3931 TATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCTGAATATGCTTATATG-ATGAA
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * ** * * ** *
3979 AACTAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGTTTGTAATAATTTGAAATAGATAATTATTTGAA-AGG
1 AAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGT
** * *** * * *
4042 CAATAGTTATTTGAATCGATTT-GATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TTCTAACTTATCAA-TT
64 C-ATAACTATTTGAA-C-TTTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTT
* * * ** * **
4104 TTTGAACTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAAATTTTTATGAACTGA
124 TTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * * * * *
4160 AACAATTTGTTTTATGATAAAAACAAAAGGT-ATATTTATTTTAAATAGATAATTATTTAAAAAG
1 AACAA-TTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAATAAATAATTATTCAAATAG
* * * ***
4224 TCATAACTATTTAAACTTACTCCATAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TTTTTGGTATTAATTTT
63 TCATAACTATTTGAACTT--TTCGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * * *
4288 TTGAATGTTAATAAATTCGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTGTATGAACTTAAA
125 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC--AAA
* * * * * * ** * *
4344 AA-AATTATTTTATTACTAAACAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTGCTCTAATAATC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-GAATAAATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * *
4408 TTAACTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAACATATTTATTTTTTATATCTCTTACTTCTTAATTTTTA
65 ATAACTATTTGAACTT--TTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
* * * * * * * *
4472 GAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATGAGCTTGTGTGAGC-AA
127 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
*
4523 AACAATTGTTTTATGACCAAACAAAA
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
4549 ATCTTAACAA
Statistics
Matches: 2116, Mismatches: 441, Indels: 286
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
165 4 0.00
166 74 0.03
167 52 0.02
168 1 0.00
170 27 0.01
171 127 0.06
172 48 0.02
173 70 0.03
174 4 0.00
175 3 0.00
176 25 0.01
177 37 0.02
178 59 0.03
179 330 0.16
180 415 0.20
181 432 0.20
182 324 0.15
183 79 0.04
184 4 0.00
185 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTTTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGAAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
Found at i:2196 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 1603--4548 Score: 1718
Period size: 180 Copynumber: 16.5 Consensus size: 179
1593 TTTTGAATCT
* * * **
1603 CTTATTAAATTTTGAAATATTTAAAAAATTAGTATTATTTTTCTTTTGAATAATTTTGTATGAAT
1 CTTATT-AATTTTGAAATA-TTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-
* ** * * *
1668 C---AACAATTGTTTTATGGACAAAAC-AAATGTCCATAACAATTTGAAA-AAATGATAGTTCAA
62 CAAAAACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGT-CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * * ***
1728 ATGGAT-ATGACTATTTGATCTTATTC-GATTAACAGATTTA-TTTTTCAATCTCCAA
125 ATAG-TCATAATTATTTGAAC-TGTTCAGA-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * ** *
1783 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAAATTGTAT-AAGT
1 CTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-C
* ** * ** * *
1846 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATTATAACAATTTG-AATAAATAATTATTCAAATA
63 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
1910 GTCACAACTATTTAAACTCTTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
128 GTCATAATTATTTGAACT-GTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * *
1962 TTTAATTAATTTTTTG-AATTTTAATAAATAAGTATAATTTCATTCCGAATAAGCTTTTATGAAC
1 CTT-ATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAC
*
2026 AAAAACAATTGATTTT-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATGTTGAAATAGATAATTCTTCAAA
63 AAAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * *
2090 TAGTCATAAATATTTGAACGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAAT-TTTTA
126 TAGTCATAATTATTTGAAC-TGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* ** *
2144 CTTATTAATTTTGGAAATATTAATAACTTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACA
1 CTTATTAATTTT-GAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * * *
2208 TAACCAATTATTTTAATGGA-AAAACAAAAGGTAATAATGTTTTAAAATAGATAATTGTTTAGAT
64 AAAACAATTGTTTT-AT-GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
2272 AGTCATAACTATTTGAACATATTC-GATAAATAAATTCATTTTTTAATTCTCTTT-
127 AGTCATAATTATTTGAAC-TGTTCAGA-AAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTA
* * * * * * * *
2326 CTAATTAATTTTTGGAATATT-TTAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACATATATGAACT
1 CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * *
2389 AAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTTACAATGATTTGAAATACATAATTATTCAAATAG
64 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *
2454 TCATGACTATTTGAACTTGTTC-GAAAA-ATATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
129 TCATAATTATTTGAAC-TGTTCAGAAAACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* *
2506 CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACA
1 CTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACA
* * * ** * *
2570 AAAATAATTCTTTTATGACAAAA-TAAAGAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATA
64 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * * *
2634 GTCATAA-GATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATCTTTTG
128 GTCATAATTATTTGAAC-TGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
** * *
2685 CTTATTAATTGTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAGAATAAGCTTTTATGAACAG
1 CTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACA-
* ** * * * * * *
2750 AAGA-AATCATTTTACGACAAAACAAATGGTTATAGT-AGTTTCAAATAGATAAATTGTTGAAAT
64 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAAT
* * * *
2813 AG--ACAA--A-CT----TGTTCA-ATAAAC-AATTCATTTTTTAAATCTCTTA
127 AGTCATAATTATTTGAACTGTTCAGA-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * **
2856 ATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTG
1 CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAA
* * * ** *
2921 ACATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATT
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
2986 CATAATTATTTGAACTAGTTAAGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCCTTTA
130 CATAATTATTTGAACT-GTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * **
3037 CATATTAATTTCTAAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTATGAATAAGCTAGTATGAATT
1 CTTATTAATTT-TGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * *
3101 GAAA-AATTATTTTATGACAAAATAAAA-G------TGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAG
64 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
3158 TCTTAATTATTGGAATTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
129 TCATAATTATTTGAACT-GTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * *
3210 GTTATTAATTTT-AGAGTATTATTATATTAGTATTATTTCATT-TGAATAAACTTGTATGAACAA
1 CTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAA
** * * * * * * * *
3273 AAGTAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTAGAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGT
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
3338 TATAATTATTTAAACTGATT-TGATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTTATA
130 CATAATTATTTGAACTG-TTCAGA-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * *
3389 CTTATTAAATTTTTAAAGATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAACTTGTATGATA-A
1 CTTATT-AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ACA
* ** * * ** *
3453 AAAATAATTGTTACATGAC-AAACAAAATGTAATAACAATTTTGGAAATAGATAATTGTTGAAAT
64 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTT-GAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** * ***
3517 GGCCATAATTATTTGAACTGATTTTGGTAAATGGATTTATTTTTTAAATC----A
127 AGTCATAATTATTTGAACTG--TTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * *
3568 CTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTAATTTTGAACAAGC-TGTTGTGAACT
1 CTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG-TATGAACA
* * * *
3631 GAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAG
64 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
3696 TCTTAATTGTTTAAACCGCTT-TGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
129 TCATAATTATTTGAACTG-TTCAGA-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * **
3748 GTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTATATGAACTG
1 CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAA
* * * * * * ** * *
3813 AAA-ATTTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTGTAACGATTTGAAATAGATAA-TGTTCAAATAGG
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * **
3876 AACTAA-TA--T--A--G-T----AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTA
130 CA-TAATTATTTGAACTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
** * * * * **
3915 CAAATTACTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCTGAATATGCTTATATG-ATGA
1 CTTATTA-ATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAA
* * ** * * **
3978 AAACTAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGTTTGTAATAATTTGAAATAGATAATTATTTGAA-AG
65 AAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *** * *
4041 GCAATAGTTATTTGAA-TCGATT-TGATAAATTGACTTATTTTTTAAAT-TTCTAA
129 TC-ATAATTATTTGAACT-G-TTCAGA-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTA
* * * * ** * *
4094 CTTATCAATTTTTGAACTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-TCAGATAAATTTTTATGAACT
1 CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * * *
4158 GAAACAATTTGTTTTATGATAAAAACAAAAGGT-ATATTTATTTTAAATAGATAATTATTTAAAA
64 AAAACAA-TTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
4222 AGTCATAACTATTTAAACT-TACTCCA-TAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TTTTT
127 AGTCATAATTATTTGAACTGT--T-CAGAAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTA
** * * * *
4276 GGTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTCGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCCTGTATGAAC
1 CTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * * *
4339 TTAAAAA-AATTATTTTATTACTAAACAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTGCTCTAA
63 --AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * * *
4403 TAATCTTAACTATTTGAATTGGTTCGGCAAACATATTTATTTTTTATATCTCTTA
126 TAGTCATAATTATTTGAACT-GTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * * ** * * *
4458 CTTCTTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATGAGCTTGTGTGAGC-A
1 CTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAA
*
4522 AAACAATTGTTTTATGACCAAACAAAA
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
4549 ATCTTAACAA
Statistics
Matches: 2170, Mismatches: 452, Indels: 288
0.75 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
165 4 0.00
166 76 0.04
167 53 0.02
169 1 0.00
170 18 0.01
171 131 0.06
172 47 0.02
173 80 0.04
174 1 0.00
175 4 0.00
176 23 0.01
177 41 0.02
178 82 0.04
179 348 0.16
180 432 0.20
181 426 0.20
182 328 0.15
183 70 0.03
184 5 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
CTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAATTATTTGAACTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA
Found at i:2530 original size:362 final size:358
Alignment explanation
Indices: 1782--3000 Score: 1003
Period size: 361 Copynumber: 3.4 Consensus size: 358
1772 TCAATCTCCA
* * ** *
1782 ACTTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTAT-AAG
1 ACTTATTAATTTTGGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAA-
* * * * * * *
1845 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATA-TTATAACAATTT-GAATAAATAATTATTCAAA
64 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAA
* * * * * **
1908 TAGTCACAACTATTTAAAC-TCTTTC-AGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTTTTATTTAATTAA
128 TAGTCATAA-GATTTGAACAT-ATTCGA-TAAACAAATTCATTTTTAAATCTTTT-GCTAATTAA
* * * * * * * *
1971 TTTTTTGAAT-TTTAATAAATAAGTATAATTTCATTCCGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAAT
189 -TTTTTGAATATTT--TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATGAACAAAAACAAT
* * *
2035 TGATTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATGTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATAAA
251 TGATTTTTGACAAAACAAAAGGTCACAATGATGTTGAAATACATAATTATTCAAATAGTCATAAA
2100 TATTTGAACGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATTTTT
316 TATTTGAACGTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATTTTT
* *
2143 ACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAACTTTATATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAAC
1 ACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGCATGAAC
* * *** * * *
2207 ATAACCAATTATTTTAATGGA-AAAACAAAAG-GTAATAATGTTTTAAAATAGATAATTGTTTAG
65 AAAAACAATTATTTT-AT-GACAAAA-AAAAGAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAA
* * *
2270 ATAGTCATAACTATTTGAACATATTCGATAAATAAATTCATTTTTTAATTCTCTTT-CTAATTAA
127 ATAGTCATAA-GATTTGAACATATTCGATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCT-TTTGCTAATTAA
*
2334 TTTTTGGAATATTTTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATGAACTAAAACAATTG
189 TTTTT-GAATATTTTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATGAACAAAAACAATTG
* * * * *
2399 -TTTTATTATAAAACAAAAGGTTACAATGAT-TTGAAATACATAATTATTCAAATAGTCATGACT
253 ATTTT-TGACAAAACAAAAGGTCACAATGATGTTGAAATACATAATTATTCAAATAGTCATAAAT
*
2462 ATTTGAACTTGTTC-GAAAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTT
317 ATTTGAACGTGTTCAG-AAAATATATTTATTTTTTAAAT-TTTT
*
2505 ACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
1 ACTTATTAATT-TTGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAAC
* * * *
2569 AAAAATAATTCTTTTATGACAAAATAAAGAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATA
65 AAAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAGAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
2634 GTCATAAGATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTTT
130 GTCATAAGATTTGAACATATTCGATAAACAAATTCATTTTTAAATCTTTTGCTAATTAATT-TTT
* * * * * * *
2699 TAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTTTATGAACAGAAGA-AA-TCATT
194 GAATATT-TTAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAACATATATGAACA-AAAACAATTGATT
* * * * * * * * * *
2761 TTACGACAAAACAAATGGTTATAGT-A-GTTTCAAATAGATAAATTGTTGAAATAG------ACA
256 TT-TGACAAAACAAAAGGTCACAATGATG-TTGAAATACAT-AATTATTCAAATAGTCATAAATA
* * * *
2818 ----AACTTGTTCA-ATAAACA-ATTCATTTTTTAAATCTCTT
318 TTTGAACGTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAAT-TTTT
* * ** **
2855 AATTATTAATTTTTGG-AATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC
1 ACTTATTAA-TTTTGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAAC
** * * * * * *
2919 TGACATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
65 AAAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAAGAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAAT
* *
2983 ATTCATAATTATTTGAAC
129 AGTCATAA-GATTTGAAC
3001 TAGTTAAGTA
Statistics
Matches: 715, Mismatches: 108, Indels: 80
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
350 132 0.18
351 28 0.04
355 1 0.00
358 3 0.00
359 31 0.04
360 98 0.14
361 183 0.26
362 159 0.22
363 62 0.09
364 15 0.02
365 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (358 bp):
ACTTATTAATTTTGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACA
AAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAGAGTAATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG
TCATAAGATTTGAACATATTCGATAAACAAATTCATTTTTAAATCTTTTGCTAATTAATTTTTGA
ATATTTTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACATATATGAACAAAAACAATTGATTTTTGA
CAAAACAAAAGGTCACAATGATGTTGAAATACATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACG
TGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATTTTT
Found at i:2814 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 2792--2825 Score: 52
Period size: 17 Copynumber: 1.9 Consensus size: 18
2782 TAGTAGTTTC
*
2792 AAATAGATAAA-TTGTTG
1 AAATAGACAAACTTGTTG
2809 AAATAGACAAACTTGTT
1 AAATAGACAAACTTGTT
2826 CAATAAACAA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
17 10 0.67
18 5 0.33
ACGTcount: A:0.47, C:0.06, G:0.15, T:0.32
Consensus pattern (18 bp):
AAATAGACAAACTTGTTG
Found at i:3642 original size:178 final size:178
Alignment explanation
Indices: 3339--3795 Score: 437
Period size: 178 Copynumber: 2.5 Consensus size: 178
3329 TCAAATAGTT
3339 ATAATTATTTAAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTTATACTTATTAAATTTTTA
1 ATAATTATTTAAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTGTTAAATC---TACTTATTAAATTTTTA
* *
3404 AAGATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAACTTGTATGATAAAAAATAATTGTTACAT
63 AAGATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAACAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTACAT
*
3469 GAC-AAACAAAATGTAATAACAATTTTGGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCC
128 GACAAAACAAAAAGTAATAACAA-TTT-GAAATAGATAATTGTTGAAATGGCC
* * * *
3521 ATAATTATTTGAACTGATTTTGGTAAATGGATTTATTTTTTAAATC-ACTTATT-AATTTTTAGA
1 ATAATTATTTAAACTGA-TTTGATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTACTTATTAAATTTTTA-A
* * * * *
3584 ATATTAAT-AATTAGTATT-ATTTAATTTTGAACAAGC-TGT-TG-TGAACTGAAACAATTGTTT
64 AGATTAATAAATTAGTATTAATTT-ATTCTGAACAAACTTGTATGAT-AA--AAAACAATTGTTA
* * * ** * * * *
3644 TATGACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTC
125 CATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCC
* * * * * * *
3698 TTAATTGTTTAAACCGCTTTGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTAGTTATTAATTTTTG
1 ATAATTATTTAAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTACTTA-TTA--AATTTTT-
* * *
3762 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA
62 AAAGATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAA
3796 TATGCTTATA
Statistics
Matches: 227, Mismatches: 33, Indels: 31
0.78 0.11 0.11
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 32 0.14
177 42 0.19
178 46 0.20
179 29 0.13
180 15 0.07
181 18 0.08
182 19 0.08
183 25 0.11
ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (178 bp):
ATAATTATTTAAACTGATTTGATAAATAGATTTATTTGTTAAATCTACTTATTAAATTTTTAAAG
ATTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAACAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTACATGAC
AAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCC
Found at i:4021 original size:166 final size:167
Alignment explanation
Indices: 3725--4030 Score: 440
Period size: 166 Copynumber: 1.8 Consensus size: 167
3715 TTTGACAAAC
* *** * *
3725 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAT
1 AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACAAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCAT
* * *
3790 TCTGAATATGCTTATATGAACTGAAAATTTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTGTAACGATTTGA
66 TCTGAATATGCTTATATGAACTGAAAATTTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTGTAACAATTTGA
3855 AATAGATAATGTTCAAATAGGAACTAATATAGTAAAT
131 AATAGATAATGTTCAAATAGGAACTAATATAGTAAAT
*
3892 AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACAAATTACTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTCAT
1 AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACAAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCAT
* * *
3956 TCTGAATATGCTTATATG-A-TGAAAACTAATTATTTTATGACA-AACAAAAGTTTGTAATAATT
66 TCTGAATATGCTTATATGAACTGAAAA-T--TTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTGTAACAATT
4018 TGAAATAGATAAT
128 TGAAATAGATAAT
4031 TATTTGAAAG
Statistics
Matches: 123, Mismatches: 13, Indels: 7
0.86 0.09 0.05
Matches are distributed among these distances:
164 6 0.05
165 2 0.02
166 72 0.59
167 43 0.35
ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (167 bp):
AGATTTATTTTTTAAATCTCCTACAAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCAT
TCTGAATATGCTTATATGAACTGAAAATTTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTGTAACAATTTGA
AATAGATAATGTTCAAATAGGAACTAATATAGTAAAT
Found at i:4264 original size:528 final size:526
Alignment explanation
Indices: 3361--4318 Score: 1147
Period size: 528 Copynumber: 1.8 Consensus size: 526
3351 ACTGATTTGA
* **
3361 TAAATAGATTTATTTGTTAAATCTTATACTTATTAAATTTTTAAAGATTAATAAATTAGTATTAA
1 TAAATAGATTTATTTGTTAAATCTCATACAAATTAAATTTTTAAAGATTAATAAATTAGTATTAA
* *
3426 TTTATTCTGAATAAACTTGTATGATAAAAAATAATTGTTACATGACAAACAAAATGTAATAACAA
66 TTTATTCTGAATAAACTTATATGATAAAAAATAATTATTACATGACAAACAAAATGTAATAACAA
* * *
3491 TTTTGGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTTTGGTAAATGGATTTA
131 TTTTGGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCAATAATTATTTGAACTGATTTTGATAAATGGACTTA
* * *
3556 TTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAATTAGTATTATTTAATTTTGAACAAGCT
196 TTTTTTAAATCACTTATCAATTTTTAGAATATTAATAAGTAGTATTATTTAATTTAGAACAAGCT
*
3621 GTTGTGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
261 GTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * ** * *
3686 GTTCATATAGTCTTAATTGTTTAAACCGCTTTGACAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAGT
326 ATTCAAAAAGTCATAACTATTTAAACCACTTCCACAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TCTTAGG
*
3750 TATTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTATATGAACTGA
390 TATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTATATGAACTGA
3814 AAATTTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTGTAACGATTTGAAATAGATAATGTTCAAATAGGAAC
454 AAATTTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTGTAACGATTTGAAATAGATAATGTTCAAATAGGAAC
3879 TAATATAG
519 TAATATAG
* * * * *
3887 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACAAATT-ACTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT-A
1 TAAATAGATTTATTTGTTAAATCTCATACAAATTAAATTTTTAAAGATTAATAAATTAGTATTAA
** * * ** ** *
3950 TTTCATTCTGAATATGCTTATATGATGAAAACTAATTATTTTATGACAAACAAAA-GTTTGTAAT
66 TTT-ATTCTGAATAAACTTATATGATAAAAAATAATTATTACATGACAAACAAAATG-TAATAAC
* * *
4014 AA-TTT-GAAATAGATAATTATTTGAAA-GGCAATAGTTATTTGAA-TCGA-TTTGATAAATTGA
129 AATTTTGGAAATAGATAATT-GTTGAAATGGCAATAATTATTTGAACT-GATTTTGATAAATGGA
*
4074 CTTATTTTTTAAATTTCTAACTTATCAATTTTT-GAACTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT
192 CTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATCAATTTTTAGAA-TATTAAT-AAGTAGTATTATTTAATTT
* * * * *
4138 CAGATA-AA-TTTTTATGAACTGAAACAATTTGTTTTATGATAAAA-ACAAAAGGT-ATATTTAT
251 -AGA-ACAAGCTGTTATGAACTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAAGA-AAAA-GTCATAATGAT
* * * *
4199 TTTAAATAGATAATTATTTAAAAAGTCATAACTATTTAAACTTAC-TCCATAAACAAATTTATTT
311 TTGAAATAGATAATTATTCAAAAAGTCATAACTATTTAAAC-CACTTCCACAAACAAATTTATTT
* * * *
4263 TTTAAAATTTTTTGGTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTCGTATTATTTTATT
375 TTTAAAATTCTTAGGTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
4319 TCAAATAAGC
Statistics
Matches: 359, Mismatches: 55, Indels: 34
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
522 24 0.07
523 30 0.08
524 16 0.04
525 77 0.21
526 49 0.14
527 34 0.09
528 115 0.32
529 14 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (526 bp):
TAAATAGATTTATTTGTTAAATCTCATACAAATTAAATTTTTAAAGATTAATAAATTAGTATTAA
TTTATTCTGAATAAACTTATATGATAAAAAATAATTATTACATGACAAACAAAATGTAATAACAA
TTTTGGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCAATAATTATTTGAACTGATTTTGATAAATGGACTTA
TTTTTTAAATCACTTATCAATTTTTAGAATATTAATAAGTAGTATTATTTAATTTAGAACAAGCT
GTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
ATTCAAAAAGTCATAACTATTTAAACCACTTCCACAAACAAATTTATTTTTTAAAATTCTTAGGT
ATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATATGCTTATATGAACTGAAA
ATTTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTGTAACGATTTGAAATAGATAATGTTCAAATAGGAACTA
ATATAG
Found at i:5329 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 4553--6314 Score: 1253
Period size: 181 Copynumber: 9.9 Consensus size: 180
4543 ACAAAAATCT
* * * *
4553 TAACAATTTGAACTGGTTC-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAA--T-TT--TTATTAATTTTTGA
1 TAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * ** * *
4612 AATATTAAAAAATTAGCATTATTTTA-TTCTTAATAATTTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTA
65 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTA
* * * *
4676 TGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATGATAGTTCAAAT-GAACA
128 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCA
* * * ** *
4729 TGACTATTTGAACTTGTTC-GATTAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAATTTATTAATTTTT-A
1 TAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * ** * *
4792 GAATATTAATATATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAAATTGTATGAATAGAACAATTGTTTTAT
65 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTAT
* * ** *
4857 GACAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATT-TTCAAATAGTCA
129 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
4908 TAACTATTTAAACTTGCTT-GGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTAATAATTTTTGG
1 TAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * **
4972 AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAGGCTTTTATGAATAGAAACAATTAATTTA
65 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTA
* * *
5037 TGACAAAACAAAAAGGTCATAATGACTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTTA
128 TGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * ** * *
5091 TAACTA-TTCAAATGTGTTTAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGA
1 TAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* *
5154 AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACAAAACCAATTGTTTTA
65 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTTTA
* *
5218 TCACAAAACAAAAGTTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
128 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
5271 TAACTATTTGAACATGTTCAGTAAACATGTTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGA
1 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * * * **
5336 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATAAACTGAAACAATCATTTTATT
66 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTA-T
* * * * **
5401 G-CAAAACAAAAAGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTTGAATAGTCA
129 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *
5452 TGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTATTGA
1 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGA
* * * *
5516 AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTATATAAGCTTATAT-AATCAAAAACAATTGTTTT
65 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAA-C-AAAACAATTGTTTT
* * *
5579 ATGAC-AAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATA-AAAATTTGTTCAAATAGTCA
127 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTCA
** * * * *
5632 TAAAGATTTGAATTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAA---TTG-
1 TAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * **
5692 --TA--AAT---TT-TTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATAAATATAAAAAAATCATTTT
65 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTAT-GA-ACAAAACAATTGTTTT
* * * ** * * * * *
5748 ATGATAGAACAAAAGGTTATAGCGGTTTCAAATATATAATTGTTGAAATAGTTA
127 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * **
5802 TAATTATTT-AGACTTGTTCGGTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAA
1 TAACTATTTGA-ACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * ** * ** * *
5866 AACATTAATAACA-TAGTAATACTTTATTTCAAATAATTTTATATGAATTGAAATATATTTTTTT
65 AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACA-ATTGTTTT
* ** * * *
5930 ATGACAAAAGAAAATATCATAATGGTTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCA
127 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * ** * * ** ** * * **
5984 TGACTATTTGATCAAGTTTAGTAAATATATTTATTTTAAAAAAATTTTACTTATTAATTGTCAAA
1 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * * * * * *
6049 ATATTAATAAATAAGTATTATTTTAATCCAAAGAAGCTTGTATGAATAGAAAACTATTATTTTAT
66 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-A-ACAAAACAATTGTTTTAT
* * ** * ** *
6114 GATAGATA-AAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATAGTTA
129 GACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * *
6165 TAACTATTTGAACTGGTT-TGATAAATAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTGA
1 TAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * * *
6224 AATATTAATAGATTAGTATTTTTTTATTTTG-ATCAAACTTATATAAACAAAA-ATATTTATTTT
65 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATGAACAAAACA-A-TTGTTTT
** *
6287 ACAACAAAACAAAAGGTCATAAGGATTT
127 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
6315 TGTCACAAAA
Statistics
Matches: 1250, Mismatches: 267, Indels: 138
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
168 21 0.02
169 20 0.02
170 79 0.06
171 5 0.00
172 3 0.00
173 1 0.00
174 10 0.01
175 16 0.01
176 83 0.07
177 11 0.01
178 5 0.00
179 83 0.07
180 240 0.19
181 389 0.31
182 236 0.19
183 47 0.04
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
Found at i:5362 original size:362 final size:359
Alignment explanation
Indices: 4600--6252 Score: 1242
Period size: 361 Copynumber: 4.6 Consensus size: 359
4590 TTAAATTTTT
* * * * *
4600 ATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGCATTATTTTA-TTCTTAATAATTTTGTATAAATAGAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAACTTT-TATAAATAGAA
* * * *
4664 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATGA-TAGTTCAAAT-GAA
64 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-T
* * * *** *
4727 CATGACTATTTGAACTTGTTCGATTAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAATTTATTAATTTTT-
127 CATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** * *
4791 AGAATATTAATATA-TTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAAATTGTATGAATAGAACAATTGTTTT
192 A-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTT
* * *
4855 ATGACAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTAA
255 ATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAAT-AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * *
4919 ACTTGCTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTT
319 ACATGCTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTC
* * * *
4960 AATAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAGGCTTTTATGAATAGAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATA-ACTTTTATAAATAGAA
* * * *
5025 ACAATTAATTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGACTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTT
64 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * *
5090 ATAACTA-TTCAAATGTGTTTAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG
128 ATGACTATTTGAACT-TGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
*
5153 AAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACAAAACCAATTGTTTTA
192 AAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTTTA
* * *
5218 TCACAAAACAAAAGTTCATAATATTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
256 TGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** *
5283 CATG-TTCAGTAAACATGTTCATTTTTTAATTCTCTTACTC
320 CATGCTT-AGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTC
* *
5323 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATAAACT-GAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AACTTTTATAAA-TAGAA
* * * **
5387 ACAATCATTTTATTG-CAAAACAAAAAGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTTGAATAGTC
64 ACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* *
5451 ATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTATTG
128 ATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTG
* * * *
5515 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTATATAAGCTTATAT-AATCAAAAACAATTGTTT
192 AAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-C-AAAACAATTGTTT
* * * **
5578 TATGAC-AAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAAAATTTGTTCAAATAGTCATAAAGATTTG
254 TATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * * *
5642 AATTTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTT
318 AACATGCTTAG-TAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTC
* * *
5684 ATTAA---TT-G--TA--AAT---TT-TTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATAAATATAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAA-CTTTTATAAATA-GA
* * * * * * ** * * * * * *
5736 AAAAATCATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAGCGGTTTCAAATATATAATTGTTGAAATAGTT
63 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * ** * * * * **
5801 ATAATTATTT-AGACTTGTTCGGTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCA
128 ATGACTATTTGA-ACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** * ** * *
5865 AAACATTAATAACA--TAGTAATACTTTATTTCAAATAATTTTATATGAATTGAAATATATTTTT
192 AAATATTAATAA-ATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACA-ATTGTT
* * ** * * *
5928 TTATGACAAAAGAAAATATCATAATGGTTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * ** ** * *
5993 GATCAAGTTTAGTAAATATATTTATTTTAAAAAAATTTTACTT
317 GAACATGCTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTC
* *** * * * * * * *
6036 ATTAATTGTCAAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTAATCCAAAGAAGCTTGTATGAATAGAAA
1 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-CTTTTATAAATAG-AA
* * * * ** * ** *
6101 ACTATTATTTTATGA-TAGATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCCTCAAATAGTTA
64 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * ** * *
6165 TAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTTTGAA
129 TGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA
* *
6225 ATATTAATAGA-TTAGTATTTTTTTATTT
194 ATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT
6253 TGATCAAACT
Statistics
Matches: 1036, Mismatches: 202, Indels: 112
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
348 4 0.00
349 29 0.03
350 131 0.13
351 22 0.02
352 76 0.07
353 8 0.01
355 3 0.00
357 2 0.00
358 30 0.03
359 7 0.01
360 36 0.03
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362 229 0.22
363 163 0.16
364 42 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (359 bp):
ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAACTTTTATAAATAGAAAC
AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
ACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
ATTAATAAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACA
AAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGCT
TAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTC
Found at i:6646 original size:120 final size:120
Alignment explanation
Indices: 6432--6648 Score: 310
Period size: 120 Copynumber: 1.8 Consensus size: 120
6422 ATTAAACAAG
* *
6432 TTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAATTTGCTATAACCTTTTGTATTGCCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTATTGCCA
* *
6497 TAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATCTTAAATCTATTTACTGAATAAT
66 TAAAACAATTCTTTCTATTCATACAAGCTTATCTTAAATCTATTTACTGAATAAT
* * * * * *
6552 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTATTGCCA
* *
6617 TAAAACAATTACTTT-TGTTCATACTAGCTTAT
66 TAAAACAATT-CTTTCTATTCATACAAGCTTAT
6649 TCAAATTAAA
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 12, Indels: 2
0.86 0.12 0.02
Matches are distributed among these distances:
120 81 0.96
121 3 0.04
ACGTcount: A:0.32, C:0.13, G:0.08, T:0.47
Consensus pattern (120 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTATTGCCA
TAAAACAATTCTTTCTATTCATACAAGCTTATCTTAAATCTATTTACTGAATAAT
Found at i:6985 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 6531--10326 Score: 3161
Period size: 180 Copynumber: 21.2 Consensus size: 181
6521 AAGCTTATCT
* * * * * * *
6531 TAAATCTATTTACTGAATAATTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTG
1 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * *
6596 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTACTTT-TGTTCATACTAGCTTATTCAAATTAAAA
66 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * ** * *
6660 TAATATTAATTTGTTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAAGATATAAAAAAA
130 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAA
* * * * * *
6713 TAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA
1 TAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * *
6777 ATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTATCAATTCATATAGGCTCATTCAAAATAAAA
65 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * *
6842 TAATACTAACTTATTACTATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAA
130 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * *
6894 TGAATCTGTTTACTAAACAAGTTC-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA
1 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * *
6958 TTATGAGCTTTTGTTTCGCCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAA
66 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAA
* * * * * *
7022 TAACA-TGAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAAGTAA-AAATAT-AAAAA
130 TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * **
7072 TAATATAT-TTT--TGAACACGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAGA
1 TAA-ATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * ** * * *
7134 GTGATGACTTTTTGTTTTACCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTA-TCAGAATAAAA
65 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * *
7198 T--GA-TAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAA
130 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * ** * * * *
7246 TAATTTTGTTTAACT-AGTAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTAAATAATTAGT-TATTTTAAAT
1 TAAATCTGTTT-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAAT
** * *
7309 CGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-ATTATTCAGAATAAA
64 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* *
7373 ATAATACTAATTTATTAATAGTTT--GAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAC
129 ATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * *
7421 TAAATCTGTTTACTAGACAA-TTCAAATAGTTATGAGTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTG
1 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * *
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* * ** * * *
7548 TATTGCTAAACTAATAATATTT-TAAAATT--T-A-TAAGAGATATAAAAAA
130 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * *
7595 TAAATATATTTA-TCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT
1 TAAATCTGTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
7658 CGTTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCGTACATA-CTTATTCTAAATAA
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* * * *
7722 AAATAATATTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGCA-ATTTAAAAACA
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* * * * *
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1 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATC
* * * * *
7842 GTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTC-ATTTCATAAAACCTTATCCAAAATAAA
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* * * ** * *
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** * * * *
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1 TAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
8023 ATTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTAGAATAAA
65 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* *
8087 AAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA-TT-----A
129 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
8134 T---T-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGTGG
1 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * *
8195 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
66 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* ** * * * * *
8260 AATATTAAACTAATAATATTAT-GAAAATTAATAATTATGAGATTT-GAAAA
131 AATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* ** * * * * * * *
8310 TAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAATAATTATCCATTTCAAATA
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* * * * * * * * *
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* * **
8438 AATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAA
128 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * * * * *
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*** * * * * *** *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * * * * *
8733 ATTATGACCTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAACA
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* * * * *
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* * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * ** *
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* * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
9388 TGAATTTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTTATCTATTTCAAATC
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* * * * * **
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** * *
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129 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * *
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1 TAAATCTGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * **
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65 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* *
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* ***** * * * *
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1 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * *
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66 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
9879 AATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAACTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAA
131 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
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1 TAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * **
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66 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
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* *
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1 TAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT
* * * * * * * *
10169 CGTTATG--CTTTTCATTTTGTCACAAAA-AATTGTTTCTTTTCGTACCAGCTTATTTAGATTAA
64 CGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
*
10231 AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
128 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * **
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1 TAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
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Statistics
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Found at i:8990 original size:360 final size:359
Alignment explanation
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6542 ACTGAATAAT
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* * * *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * **
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* * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * ** *
7577 T-A-TAAGAGATATAAAAAATAAATATATTTATCAAATCAG
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* * * * * *
7616 TTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTTA
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* ** * * * * *
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* * * * * ** * *
7745 TCAAAAAATTAATAAGCAAGCA-ATTTAAAAACATAAATCTGTTAACCAAACAAGTTTAAATAAT
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* * *
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* * * * *
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* ** ** * * * * *
7935 TTGAA-AATTTGGAA-ATTTAAAACATAAATCAATTTATTCAATCAA
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* * * * *
7980 TTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
8230 ATGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAAACTAATAAT-ATTATGAAAATTAATA
260 CTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAATA
* ** * * *
8293 ATTATGAGATTTGAAAATAAATTTGTTTG-TTGAACCAG
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* * * *
8331 TTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAATAATTATCCATTTCAAATAATTATGTA-CTTTTGTTTTGT
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* * * * * * * * *
8394 CGTAAAACAAATGTTTTTGTTTCATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATATTGATTTATTAATA
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* ** * *
8459 TTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAGTTCAATTAGTT
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* * * * * * * *** * * *
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* * ** * * *
8585 TTTCTATTGATACAATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATAATCTAAAAATTAAT
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAAT
* * *
8650 AAGTAACAGATTTAAATAATGAATCTGTTCGCCTGACCAG
322 AAGTAAAAGATTTAAA-AATAAATCTGTT-GACTGACCAG
* *
8690 TGCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
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* * * *
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* * * *
8820 TAAAATTAATAAATAAAAGATTT-AAAACTGAATTTGTTTA-TCGAACAAGTTTAAATAGTTATG
131 TAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * *
8883 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTATTTTATCATAAAATAATT-TTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
8947 GCTATTCTTATAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATT-ATCATTTAGATAATTAATG
260 -CTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTA-AAAATTAATA
* * * ** **
9011 AGCAAAATATTTGAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAG
323 AGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* *
9050 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATTAA-TATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * *
9114 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTATTTTATTAAT-TT
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* * * * * *
9178 TTGACAGTTAATAAGTATAAA-ATTT-AAAAATAAATATGTTTACTTAACAAGTTTAAATAGTTA
130 CT-AAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
9241 TAATTATTTGAATAATAATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTCATCAT-AAACAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * * * *
9305 ATC-ATTTCATATAGGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTCTAAAAAATTAA
258 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT-TTAAAAATTAA
* * * * * * *
9369 TGAG-AAAGAGATTTAAAAATGAATTTATTTACTAAACAAG
321 TAAGTAAA-AGATTTAAAAATAAATCTGTTGACT-GACCAG
*
9409 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTC
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* * ** ** *
9473 ATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATAT-TGAATAAAATAATAGAAATATATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * *
9537 TTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTT
128 TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTT
* * *
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192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * *
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257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTAA
* * * *
9729 TAAGTAAAAAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACCG-CGTAAG
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
9964 TCCATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
* * ** * * * *
10029 CTGTTCATGCAAAATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATCTACTAATATTTTGAAAATTAATAA
260 CTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAATAA
* * *
10093 G----AGATTTAAAAACTAAATCTATTTACTGAAACAG
324 GTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* *
10127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCGTTATG--CTTTTCATTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGT
* * * * * * * *
10189 CACAAAA-AATTGTTTCTTTTCGTACCAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
64 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * * *
10253 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCAAACTAGGTCAAATAGTT
128 TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT
** ** * * * **
10317 AAAACTATTTTGTCATA-AAACA-C-A-TTCAAATAGTTATTA---TTAG--TTA--A-ACAATT
192 ATGACTA-TTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA-AAAC
* * **** * * ** *
10370 ATTTATTTCAAATAGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-ACCAATGTTTCTGTTCAAACATGT
252 AATTGTTTC---TA-TTCAT-ACAAGCT-TATT-TCA-AATA-AAATAATAC---T---A-AT-T
* * *
10433 GTATTCAAAATAAAATAATGCTAGTTTATTCATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAA
300 -TATT---AAT--AAT--T--TA----A---A-AAT-TAATAA-------GTAAAAGAT-T-TAA
* * * *
10498 AAATAAATCTATTTACTAAGCAAG
337 AAATAAATCTGTTGACTGA-CCAG
*** * * * *
10522 TTCAAATAGTTATGACTGGATGAACAAGTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *** *
10586 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAAGAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * * *
10651 TTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAATAAGTTCAAATAGTCA
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
10715 TGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * ** * * * * *
10780 TTCTATTTATGCAAAATTATTT-AGAAT-AAATAATATTTATCTATTAATATTTTGAAAATTAAT
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAAT
* * *** * *
10843 AAG----AGATTTAAAACTAAATCTATTTTTTGAAACAA
322 AAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* *
10878 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT-ATTAT-TATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTT-T
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGT
* * * * *
10939 TATAAAACAATTGTTTCTTTTAATAC-AGCCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
64 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
11003 TTACAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTAGCTGAACCAA-TTCAAATAG
128 TT-CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAA-CAAGTTCAAATAG
** * * * * * * *
11066 TTAACAATATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACATTTTGTTTAATCATAAAGCAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* * ** * * *
11131 TATTTCAATTCATACAAATTTA-TTCAGAATAAAATAACACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAAT
255 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAAT
* * * * * *
11194 TAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGATAAA-ATGTTTATTGAACAAG
318 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAA-ATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * *
11238 TTTAAATGGATT-GGACTATTTGAACAATCAATCTAACTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTCT
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTG---AAT-AAT-TATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGT
*** * * * * * * * * *
11301 TCCATTATAAAATAA-TGTTTCAGCTCATAGAAACTTA-TCTGAAATAAAATAATACTACTTTAC
59 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** * ** *
11364 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTATTTTTTGAATCAA-TTTAA
123 TAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAA
* * * *** * * *
11428 ATAGTTATGACTAGTTAAACAAATATC-ATTCTCAAACCATTATGATC-TTTGTTTTCTCTTAAA
186 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* ** * * * * *
11491 ATAATTGTTTCTGA-TCAT----GCTTATTT-GGATTAAATAATAATAATTTAATAAGATTTTAA
250 ACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAA
* *
11550 AAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTG-CTGAACTAG
314 AAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTG-TTGACTG-ACCAG
* * * ** * * * * **
11594 TTCGAATAATTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTAATCATTTGTTTAATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
11659 TATAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAACTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
66 TAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *** *** * * *
11723 -TATTTATTTCAA-ATTGTTATAACTTTTTGTTCAAAT-AGTTAAGACTATA-TGAACAATTATT
130 CTA--AAATT-AATA-AG-TA-AAAGATTT-AAAAAATAAATT-TG--TTTACTGAAC-A--A--
* ** ** * * * ** * * *
11784 TATTCAAAGT-GTTATGACTTTTATTTTAGCTCATACAAGCGCA-TTCGGAACAG-AATAAAACT
180 -GTTCAAA-TAGTTATGAC---TA-TTT-GAACA-ATTATC-TATTTC-AAATTGTTAT-GACCT
* * * * * * * * *** ** *
11846 AATTTATTAATAT-TTCAAA-AATT-TAT-AAGT-A-A-AAGATT-TAGAAAATAATTCTATTAC
234 --TTTGTT-TTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAA-AATAATAC
* *** * * * *** * * *
11903 GAAACCAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAACAA-TAATCTATTTCAAATCATTAATACT-TTT
295 TAATTTA--TT-AATAATT-TAA-AAATT-AATAAGTAAAAGATTT-AAA-AATAAAT-CTGTTG
** *
11966 TTTG-TCA-
351 ACTGACCAG
* * * * * ** * * *
11973 -TAAAACA-AT-TG--TTTTTG-TTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACT-AACTTATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT-TATCTAT-TTC-AAAT--CAT--TA-TGACCTT-TT
* * * * **** * * * * **** * * *
12031 AATATT-T-AGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTA-AAAAG-TGAATCTGTTTACCAAACCATTTC
57 -GTTTTGTCATAAAA-CAATT-GTTTCTG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATA--AAA-TAATAC
* * * * ** * **** * * *
12092 AAATAGTT-TTGAAAATT-TGGATAATTATCTATTTCAAATCG-TTATAACCTTTTATTTTG-TC
115 TAAT--TTATT-AATATTCT--AAAATTA-ATAAGT-AAA-AGATT-TAAAAAATAAATTTGTTT
* *** * * *
12153 A-TCAAACAA-TT-GGTTATGTTCAT-ACTATTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAA
171 ACT-GAACAAGTTCAAATA-GTT-ATGAC-----TATTT-G-A-ACAATTAT-CT-ATTTCA-AA
* * ** * * * * *
12214 TAT-TT-TGAAACTTAATAACCAAGAAAGTTATCAATATCAAATCGTTAAGATCTTTGTTTTGTA
222 T-TGTTATG-ACCTT--T-----TG--TTTTATC-ATA--AAA-C---AA-TTGTTT-CTAT-TC
* ** * * * * * *
12277 ATAAAATAATTGATTTTGATCATAGAAGGTTATTC-AATTAAATATAATGCTAATTTAATAATAT
266 ATACAA-GCTT-A-TTTCA-AATA-AA-ATAATACTAATT-TAT-TAA---TAATTTAA-AA-A-
* * * * * *
12341 TTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTTATAATATAAATGTATTTG-CTGAACCAG
317 TTAATAAG----T-A--AA-AGATTTA-AAAATAAATCT-GTTGACTG-ACCAG
* * * * * *
12394 TTCAAATAATTA-CAGCTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTTTACCTTTTGTTTAGT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
12458 CATAAAATATTTGTTTCAT-ATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCAAATTTATTGACA
64 CATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
12522 TTCAAAAAATTAATAAGCT-AAAGGTTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAACAA
128 TTC-TAAAATTAATAAG-TAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * **
12586 TTATGACTATTTGAACAATTGTTTTTTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAAT-ATAAAACAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAA
* * * *
12650 TTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAGTACTAATTTCTTAAT-ATTTCAAAA
254 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAA
* * * * * ** * *
12712 ATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAAATAATTTTTTTTACCAAACAAA
316 ATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
** * ** * *
12758 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACGATTGTCTATTGAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
12823 CAAAATAATTGTTTCAT-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
12887 CTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAT-ATC-AGTTTAAATAATT
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C-TGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * ** * ** * *
12946 ATGGCCATTTCAATAATTATGTATTTCGAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTTATATAACAATTG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* ** * * * *
13011 TTT-TTTATCATACAAATTTATTTGAAAAAAAATAATACTAATTTATTCAT-CTTTCAAAAA-T-
257 TTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTA
13072 -TAA-TAAAAGATGTT-----T--A-C---TGA---ACCAG
320 ATAAGTAAAAGAT-TTAAAAATAAATCTGTTGACTGACCAG
* * * * * * * * *
13097 TTAAAATAATTATGACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCATTTTGTTCTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTC
* ** * *
13162 ATAAAACAATTATTT-TGGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAATAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * *
13226 T-TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACTAA-TTCTAATAATT
129 TCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTT
* * *
13289 AAGACCATATT-AACAATTATCTATTTCAAATTG---T----TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
192 ATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * * * *
13346 TTTTCAATTCATACTAGCTTA-TTCGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAAT-ATTTCAAAATT
256 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATTT-AAAAAT
* * * * * * *
13408 TAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAATCAG
318 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * *
13452 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
13517 TAAAATAA--ATAT-T-TT--T----G----TTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * * * **
13568 CAAAAATTAATAAG----AGATTTAGAAAATAAATCTATTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTAT
130 CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
13628 GACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATTATTATGA--TTTT-TTTCTATTATAAAATAATAG
194 GACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT-TATCATAAAACAATTG
* * *
13689 TTTCTATTCATACAAACTTA-TTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAACAATTA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTA
* * * * *
13752 ATAA--AAAA-ATTTTCAAAAGTAAATATGTTTATTGAACTAG
320 ATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * ** *
13792 ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTGGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
13857 TAAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATT
66 T-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* * * * * * * * *
13922 TCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTGT
129 TCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
13987 GACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAT---ACAA--G--
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * * *
14045 ----------C---CTT-TTTCTAATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATTAAGACAATTAATA
259 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTA-AAAATTAATA
* * * * *
14095 AGTAAAATATTTAAACAATAAATATGTTCACCGAACAAG
323 AGTAAAAGATTTAAA-AATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* ** * * ** *
14134 TTTAAATCTTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *** * *
14199 TAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * *
14263 TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAATTCAAATAGTCAT
131 T-AA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
14328 GACTATTTGAATAATTGTTTAGTTT-AAATTATTGTGACCTTTTATTTTGT-AGTAAAACGATTG
194 GACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCA-TAAAACAATTG
* * * * * **
14391 TTTCAACTCATATAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCCAAAATTAAT
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAAT
* * * * * * *
14455 GAA-TAAGAGAATTAAAAAATGAATATGTTTACCGAACATG
322 -AAGTAAAAG-ATTTAAAAATAAATCTGTTGACTGACCA-G
* * * * *
14495 TTTAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGGCCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
14560 TAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-
* * * ** *
14623 TTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAGTATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTA
128 TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * *
14687 TGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATTGTTATGTCCTTTTGTTTTATCATAAATCAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * * * * ***
14752 TTTTGTTCATAAAAGCTTA-TTCGGAATAAAAGAATACTAATTTCTTAA-AAGACCAAAAATTAA
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAA-TTTAAAAATTAA
* * * **
14815 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCT-AGGAG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * ** *
14855 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAA-CTGTTATGATATTTTGATTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *** * ** *
14919 ATAAAATAGTTGTTTCCAATAATACAAATTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
14984 CTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCA-TAAAACAAGTTCAAATGGTCA
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
15048 T-ATCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC-TTTGTTTTATCATCAAACAAAT
193 TGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAAC-AAT
**
15111 TGTTTCTATTCATACAAAATTA-TTCAGAA-AAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAAT
255 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAAT
* * * *
15173 TAATAAG----AGATTAAAAAACAAAATCTATTTA-TCGAACCA-
318 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTGACT-G-ACCAG
* * * * * ** *
15212 ATCTAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTCATTTGGTC
1 TTC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * * * * *
15276 ATAAAATAATTGTTTTTAG-TCACACTAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
15340 TCTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGCTTA-TAGAACTAGCTCAAATAGTT
129 TCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * *** * * *
15400 AAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAACCATTCTAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATT
* * * * * * *
15464 -TTTTTAGCTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATGATACTAATTTTATTAACT--TGTAGAACA
256 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAA-TAATTTA-AAAA
* * * * * ** **
15526 TCAA-AA-CACAAGAAATTTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAAAAAG
317 TTAATAAGTA-AA-AGA-TTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * * * * * * *
15572 TTTAAATCGTTACGACAATTTAAATAATTATCTATTTAAAAT-ATATATAACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
15636 ATAAAATAATTGTTTCAGTTTGA-AAAAGCTTATTCGAGATAAAATAATATTATTTTATTAAAAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * * * * ** * * *
15700 TTCAAAAATTGATGAGTTAGATATTTAAAAATTAAGTCAGTTTA-TCAA-ATTGATTCAAATAAT
128 TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACA-AG-TTCAAATAGT
* * * * * * *
15763 TGT-AGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTCTTTTGTCATAAAACAAT
191 TATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* * * ***
15827 TGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTTGGGATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAAT
255 TGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAAT
* **
15890 TAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTT---T-A-C--
318 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-GTTGACTGACCAG
* * * * * * * **
15926 -T-AAATTGGTT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTTAATTGC--TATAACCTATTATTAAGT
1 TTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-CATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
15984 TATAAAATAA-TGTTT-TAGTTTATATAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
64 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * *
16047 TTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAAGTAGTTCTAACAGTT
128 TTCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
16112 AAGACTATATGAACAATTATCTGTTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAGAACAATCG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * **
16177 TTTC-AGTTCGTAGAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAAT-ATTTCAAATTTT
257 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATT
** * * *
16239 AATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTGAC-GAATCTA-
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTG-TTGACTG-A-CCAG
* * * ** * * * * ***
16282 TTCAAATAATTATGGCCAGGTCAATAATTATCTATTTCAAGT-ATTATTACCTTTTGCTTCACCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * * * *
16346 TATAACAATT-TTATTTG-AAAGTTCAATCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAATCT
66 TAAAACAATTGTT-TCTGTTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-A
* * * *
16409 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-ACTTAGTTCAAATAGTT
128 TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * *
16473 TTGACTATTTGAACAATTATAAACTTT-AAATCGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * ** * ** * * *
16537 ATTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACACCGATCTAATAAT-ATTCCAAAAATTA
256 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTA
* * * * **
16601 ATAACTAAGAGAATTAAAAA-AAATTTCT-TTGTCAAACCAG
320 ATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAA--TCTGTTGACTGACCAG
* * * * *
16641 TTCAAATATTTAAGACTA-TAGAATAATTATCTACTTCAAATGATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *** *
16705 TAAAATAAGTTTTTTTTAATTCATACTAGATTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATA
66 TAAAACAA-TTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
16769 TTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTAC-GTAACCAGTTCAAATAAT
128 -TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTG-AACAAGTTCAAATAGT
* * ** ** * * * *
16833 TATGACTAATTGAATACCTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-CAAT
* * * * * *
16898 T-TTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCGAAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTTAAAAAT
255 TGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAAT
* * * * *
16960 TAATAAGT----GATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACTAG
318 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTGACT-GACCAG
** * ** *
17000 TTCAAATAGTTAT-ACCTATTTGAGCAATTATTTATTTC-AA-C--T-TG-CCAGCTT-TTTTGA
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGT
* * ** ** * * *
17057 AATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT-TAA---TATTTCAACAAT-TAATAAGAC--ATTTA--AA-
64 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** ** ** * * * *** * * * * *
17109 A-AAT-AAATTTGTTTGCTAAACTAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
127 ATTCTAAAATTAATAAG-TAAA--AGATTTAAA-A--AAT-A-AATTTGTTTACTGAACAAGTTC
* * * * * * * * *** *
17171 AAATTGTTATAACTCTTT------TTTTCTATTATAAAAATTTGTTTCTGTTCATAAAAG-CTTA
184 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-T-CAAA-TTG-TTATG-ACCT-TTTGTTTTA
* ** * * * * * **
17229 TTCAGAATAA-AA-TAATACTAATTTA-ATAA---TA-TTCTAA-AAATTAATAACTAAGAT-TT
243 -TCATAA-AACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ACTAATTTATT
** * * * * * *
17285 AA-AAAATGAATATGT--T-TGTCAAACCAG-TTCAAATAGCTAAGA-C-GATATGAACAATTAT
304 AATAATTTAAAAAT-TAATAAGT-AAA--AGATTTAAA-A-ATAA-ATCTG-T-TG-AC--TGA-
** *
17343 TTAT
356 CCAG
* * * * * * ** *
17347 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTCAACTCA-TACAAGCTTATT
1 TTCAAATAGTTATGA-C---T-ATTTG--A-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCT-TT
** * * * * * * *
17410 TGAAATAG-AATAAAATTAATT-TATTAATATTTC-TA-AA-ATT-TTTAAGAGATTTAGAAAAT
56 TG-TTTTGTCATAAAA-CAATTGT-TT-CT-GTTCATACAAGCTTATTCAA-A-A--T--AAAAT
* * * * ** * * * * *
17469 AAT-TTTATTTACTGAACTAGTTC--AAA-TAATTA-T-AACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-
110 AATACTAATTTA-TTAA-TA-TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
* * * * * *** * * *
17526 C---A-AA-TCGCTATTACTTTTTTGT-TTTGTAATAAAATAAT-TGTTT----TTGTTAAT-AT
172 CTGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATTGTT-ATGA-
*** * * * * * * *
17579 AAATTTGTTTGA--A-ATAA-AATTG-TACTAATTTAT-TAA-C--ATTT-AGA-AAATTAATCA
231 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-A
* *** * * ** * * ** * *
17633 GTAAGAGATT--TAA-GT-AAATTTGCT-TGCCAAACTATTT-CAAAT-AGT-T-TTGACT----
294 CTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTGACC
17685 A-
358 AG
** * * *
17686 TTTGAATAATTAT--CTATTT---CAA--ATC-A--T----T-A-TA--ACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * ** * *
17733 GCAAACAATTGGTTCTATTTATACTATTTTATTCAAAATAAAGTAATACTAATTTAATAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * ** * * ** * ** * *
17798 CGAAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGCCCAACTAGTTCAAATAGTTAA
130 CTAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** ** * * * *
17862 GACTATATGAACGGTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCGTAAAAGAATTGTT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* ** ** *
17927 T-TGTTTGTACAAGCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTAAAAATATTTTAAAAA-T-A-A
259 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAATA
* * **
17987 ACT---TG--TT-----T--ATC----GA---ATTAG
323 AGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTGACCAG
* ** * * * **
18005 TTCAAAT-GATTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTATTGAGTC
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * * * *
18069 --AAAACAATTGTTTAAGCTCAAACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
18132 -TGGAAAATTAATAAG-AAAGTGATTAAAAAAATAAATATATTTACTGAATAAGTTCAAATAATT
130 CT--AAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * ** *
18195 ATTATTATTTTAAGAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAACAATTG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * ** * **
18260 TTTCAATTAATACAAG-TTAGAT-ACAATAAAATATTACTAATTTATTAAT-ATTTCCTAAATTA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTA
* * * **
18322 ATAA-TCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCGGTTTACCGAATTAG
320 ATAAGT-AA-AAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * * * * *
18364 TTAAAATAATTATGGCCACTTGAATGATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG-TTT-TCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
18427 TAAAACAATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACCAATTGATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * * * * *
18491 CAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAACAATAAATTTATTTA-TCGAAC--CTT----TTGTT-T
130 CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * ** * * ** *
18548 -AGTCA--T-AA-AA-TATTTGTTTTATA-TCTTACAAGCTTAT-TTGGA--ATAAAATAATCTA
194 GACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT-T-
** * *** * * * * **
18603 AATT-TATTGACATTCAA-AAAATTACTAAGTAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGCTTACCGAA
256 GTTTCTATT--CATACAAGCTTATTTC-AAAT-AAA-A--T--AATACT-AA--T--TTA-TTAA
* * ** ** ** *
18666 TAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA-ATTATTTATTTAAAAT-TGGT-A-TGACC--
306 T-AATTTAAA-AATTA--A-TAAGTAAA-AGATT-TAAAAAT-AAATCTGTTGACTGACCAG
* * ** * ** * * **** **
18722 TT----TTGTTTTGAC-A--T-AA-AACAAT-TATTCCAGTTCATTA-AAGCTTATCCAAATTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-T-TGTTTTGT
* * * * * * * *
18776 AATAATACTAATT-TCTTAATATTTCA-A-AA-ATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATA--AAT
64 CATAAAAC-AATTGT-TT-CT-GTTCATACAAGCTTATTCA--AA-A---TAAAATAATACTAAT
* * * * * * * ** * *** * * * * * *
18835 TTGTT--TA-GCGAACA--AAT---TCAAATAGTT-ATGACT--ATTTGAACAATTATCTATTTA
119 TTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTC
* * ** * *** * * * * * **
18889 AAATTGTTATGACCT-TTT-TA-TTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAGGCTTA-C
184 AAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATTGTTAT-G-ACCTTTTGTTTTATC
* * ** * * * * * **
18949 TTGAAATA-AAGTAATGCTAATTTAT-TAA---TATTCCAAA-AATTAATAAGTGATTTAA-AAA
245 AT-AAA-ACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAA--AATAA-T-A-CTAATTTA
* * * * ** * ** *
19007 GTGAATCTATTTATAAAATCAATTTAAATAATTATCCATTTCAATAATTGTTATCCAT-TTCAAT
302 -TTAAT-AATTTA-AAAATTAA--TAAGTAA--A-AGATTT-AA-AAAT-AAAT-C-TGTT---G
* *
19071 AATTATCCA-
351 ACTGA-CCAG
* * * * * * * ** * * *
19080 TTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGATTGGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * ** *
19145 TATAACAATTATTTTTTTATCATACAAACTTATTCCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
19210 -TCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTA
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
19270 TGATTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTACCATAAAACAATTAT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * * *
19335 TTATATTCATACAAGCTTA-TACAAAATAAAATAATACTAATCTAATAAT-ATTCCAAAAATTAA
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAA
* * * * * **
19398 TAACTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCCA-
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGA-CCAG
* * * ** *
19439 TT-AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * *
19503 TAAAAAAATAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATT-AAGAATCAAATAA-AATGAATTTATTAAT
66 TAAAACAAT--TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * *
19565 ATT-TAAAAAATTAATAAATAAGAGATTAAAAAAAT-AATTCTATTTACCT-AATTAA-TTCAAA
127 ATTCT--AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAA-CAAGTTCAAA
* * * * *
19626 TAATTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAAC
187 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
** * * * * *
19691 AAAGGTTTATGTTCA-ATAAG-TT-TGTTCAGAATAAAATAATATTAATCTATTAAT-ATTTCAA
252 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AA
* * ** *
19752 AAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCAAAGCAG
314 AAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-GTTGACTGACCAG
* * * * * * *
19796 TTCAAACAGTTATGACTATCTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGGCTTTTTGTTTTG-CT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-
* * * * * *
19860 ATAAAACAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * *
19925 TTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATCTTAAAAAATAAATATGTTTAAC-GAACTACATCAAATTGTA
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATTTGTTT-ACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * ** * * * *
19988 ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-AAAAAAAAATTA
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * *
20052 TTTCAATTCATATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAAT-ATTATGAAAATTA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATAATT-TAAAAATTA
* * * * *
20115 ATAATTAAGAGATTTCAAAAATGAATCTGTTTA-TCGAACAAG
320 ATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACT-G-ACCAG
* * * ** ** * * *
20157 TTTAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTGGAATCGCTATAACTTTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ***
20222 TAAAATGACTT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
66 TAAAA-CAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
** * * * * **
20285 TGAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTCTATTTACCGAACAAGTTTGAATCA-TT
129 TCTAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAAT-AGTT
* * * ** *
20349 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTGTGATTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * ** * * * *
20414 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAGTATTAATTTATTAAT-ATTTCGACAAA-T
256 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT--AAAAATT
* * * **
20477 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAGAAG
319 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
** * * * * *
20520 TTCAAATAGCCATGATTATTTGAATAATTATCGATTTCAAATCATTGTGACTTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
20585 TAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * * * * * * *
20650 CAAAAATCAAAAAGCAAGAGAATTAAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTAT
130 CTAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
20715 GACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GT
* * *
20780 TT-TGTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAA
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATT-TAAAAATTAA
* ** ** ***
20842 TAATTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCAATTTTCTGAACTTT
321 TAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * **
20882 TTTAAGTAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCAATTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * *** *
20947 TAAATGAATTATTTCTTTTCAAACAAGCTTATTTTGAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * ** * *
21012 CAAAATTAATAAGTAAAACATTT-AAAAATAAATTTGCTTAC-CAAGTGAGTTTAAATTGTTATG
131 TAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** *
21075 ACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATG-CTCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* ** * **
21139 TCTATTCATACAAGTTTATTAAAAATATAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAA
259 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAATAA
** * * * *
21204 GTTGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACTGAACAAG
324 GTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * * ** ** *
21242 TTCAAATTGTCATGTCTATTTGAACT-ATTATATATTTGAAATTGTTATGATATTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * ** * * *
21306 GTAAAAAAAATATTTTTATTCATACAAAATTATTCATAA-AAAATAATATTAATTTATTACTATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* * * * * * *
21370 TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTCTTTACCGAATC-GGTTTAAATAGTTA
129 TCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
21430 TAACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGGTATGATC-TTTGTTTTATCCTAAAACATTTAT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * * * * *
21494 TTCTATTCATAGAAACTT-GTTCAAAGTAAAATACTACTAAATTAATAGT-ATTCTAAAAATTAA
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAA
* * ** *
21557 TAAG-----GATTTAAAAAATAGATGTGTTTG-CCAAACAG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTG-TTGACTGACCAG
* * * * * * * **
21592 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTGTTTCAAATCGTTTTGACCTTTTCTTTAATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
21657 TAAAATAATTATTTCAGTTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* *
21722 -AAAATTTTAATAAGTAAGAA-A-TTAAAAAA-GAATTCTATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGT
131 TAAAA--TTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGT
** * * * *
21782 TATGACTACATGAACAATTATCTATTTAAAACTATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * * *
21847 GTTT-TAGCTT-ATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAAT
256 GTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAAT
* *** ** * **
21909 TGATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-TCGAATTAG
318 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACT-G-ACCAG
* * * * * *
21953 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAAT-GTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * *
22017 TAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAACCTATTCAAAATAAAATAACAGTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* ** * **
22082 CAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAATTAGTTCAAA-AGGTTAT
130 CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA-GTTAT
* * * * * * * *
22145 GACTATTTGAGCAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTGTGTTCTGTCATAAAACAATTATT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * * * *
22210 TTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAAT-ATTATGAAAATTAAT
259 TCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAAT
* * ** * *
22273 AACTAAGAGA-TT-CCAATAAATTTATT---TGAACCAG
322 AAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * * * * * * *
22307 TTTAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
22372 TAAAACAATTTTTTCAGTTCTTAGTAA-CTTATTCGAAATAAAATAAAACAAATCTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
22436 -TCAAAAATAATCAGCAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTT-GTCGAACCAA-TTCAAAAAATT
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
22498 ATGACTATTTAAATAATTATCGATTTCATATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * * * * *
22563 TTTTTTTTTCAAATAAG-TT-TGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTTTCAAAATC
257 -TTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATT
* * * * * * *
22625 AATAAGTAAGAGAGTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACTAG
319 AATAAGTAAAAGA-TT-TAAAAATAAATCTGTTGACT-GACCAG
* * * * * * *
22669 TTCAATTAGTT-TAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCATTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
22733 TAAAATAATTGTTTCTAG-TCATAC-AGTCTTATTC-AAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
22795 TCTAAAAATTAATAACT-AATGAATTTCAAAAATGAATTTG-TTAGCTTG-CCCAGTGCAAATAT
129 TCT-AAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C-TGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * ** *
22857 TTATGATTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATCTTTTGTGTTATCGCAAATCAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* * * * * ** *
22922 TATTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAACATAATTCTAGCTTATTAAT-ATTCCAAAAATT
255 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATT
** * * * * * *
22986 AGCAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTG-TTGAACAAA
319 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-GTTGACTG-ACCAG
* * ** *
23029 TTAAAATAGTTATGACTATTT--ATCAATTATCTATTTCATATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
23092 ATAAAACAATT-TTTGCTATTCATACAATCTTATTTC-AAATAAAATAACACAAATTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTT-CTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
23155 TT-TAAACAATTAAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAATAAGTTTAAATA
128 TTCT-AA-AATT-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATA
* * * ** *
23218 GTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTT-AAATCATTACGA-C-TTT-TTTT-T-ATAAAA-AA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * * * **
23276 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTTCCTCAA
254 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT--AAAA
* * * ** **
23339 A-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAGAAATATGTTTACCCAAAAAG
316 ATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* ** * ** *
23384 TCCAAATAGCCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTGATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TC
* * * * * * *
23448 TTAAAATAATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
23513 CCTAAAATCAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTAGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTTCT
130 -CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * *
23578 TACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * *
23643 TCTGTTCATATACAG-TTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAA
259 TCTATTCATACA-AGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATTT-AAAAATTAA
* * ** * *
23705 TAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTAAACACG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTGACCA-G
* * *
23745 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * **
23809 ATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAACAAAATAATACTAATTTATTTGTATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * **
23874 CCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TTAAGCAAACTCAAATAGTTA
130 -CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * ** * *
23938 TGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
** *
24003 TTCTATTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAAT
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAAT
* *** * * ** *
24067 AGGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACATG
322 AAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTGACCA-G
* ** * ** *
24107 TTCAAATAGTTATGTCCCTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAGATTTT-TTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * *
24171 TAAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAAATTATTTATAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * *
24236 TAAAAATTAAT---T-AGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTGCTAAATAAATTCAAATAGTTATG
131 T-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
24297 ACTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
24361 CTTTTCATATAAGCTTATTCCGATTAAGATAATACTAA--T-TTAATAA--T---AA--AA-AA-
260 CTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAATAAG
* * ** *
24414 TAAATG-TGT-----T---T-TGCCGA-T--CTAG
325 TAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTGACCAG
* ** * * *
24436 TTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** **
24501 TAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * *
24566 AAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATTAATATGTTTACAT-AACAAGTTTAAATAGATA
131 -TAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTAC-TGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * ** **
24630 TAACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * ** * * * * *
24695 TTCAATTCATAAAAATTTATCTGAAATAAAATAATACTACTTCATTAAT-ATTTCAAAAATTATT
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTAAT
* * * * ** **
24759 AAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCCAAACCAG
322 AAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCT-GTTGACTGACCAG
* * * * ** *
24799 TTCAAATAGTTATGA-TCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGCTATGATC-TTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
24862 ATAAAAAAACTATTTCT-TATCATATAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * *
24926 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATC-ATTTCAAATGGTT
128 TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * ** * * * *
24990 AAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTT-ATTTAGTCATAAAATAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATT
* *
25054 GTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAAT
256 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAAT
* * * * ** *
25116 TAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAG
318 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * * * * * *
25160 CTT-AAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTACTTAAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
25224 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCTAAATAAAATAATTCTACTTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* * * * * *
25289 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATTAGTTTA-TCGAATC-GGTTCAAATAATT
129 TCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * ** *
25352 ATGGCCATTTGAACAGTTATAAATTAT-AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * *
25416 ATTT-TCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAGAA-T
256 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATT
* *
25477 --T-AGTAAGAGA--T----CT-AA-------A---A--A-
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTGACCAG
* * * ** * *
25495 -T-AAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATGTATTTCAAATTGTTATAACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
25558 TAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * *** ** * * *
25623 TAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATTTGTTAAACCAA-TTCGAACAGTTA
131 T-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * ** * * *
25687 AGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * * * *
25752 TTC-AGCTCATACAAGTTTATTT-AGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAAT-ATTTCAAAATTTT
258 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTA
* * * ** *
25814 ATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAATACTATTTACCAAATCGGTTAAAATAAT
320 ATAAGTAAAAGATTTAAAAATA-AAT-CTGTTGA-C---T--G-----ACCAG
* * * * * * * *
25866 TATAAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTC
1 T-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * **
25931 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
25996 -TAGAAAATTAATCAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAA-----TT--TG-----G-T---ATAGTT
130 CT--AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * ** * * * *
26043 TTGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * ** ** * * * * *
26108 GTTCTGTTCATACTATTTTATTTGGAACAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTTAAAACTTAAT
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAAT
** * * * ** **
26173 AACCAAGAA-AATTAAAAGATAAATCTAATTGTCAAAGGAG
322 AAGTAA-AAGATTTAAAA-ATAAATCT-GTTGACTGACCAG
* * * *
26213 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCATTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
26277 ATAAAACAATT-TTTTTG-TCTGTACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACAAATTTAATAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTC-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
26340 T-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAA-AAA-TTGTTTATCT-AACCAGTTTATAT-GAT
129 TCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAG-T
* * * * * **
26398 TAAT-ACTATTAGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTTTGATCTTTTGTTTTGTTGTAAAAGCAA
191 T-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-CAA
* * * * * *
26462 TTGTTTC-AGTTTATACAAGCTTA-CTCAAAATAAATTAATACTAATTCATTAA-CATTCAAAAA
254 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAA
* * * **
26524 ATTAAGAAG-AAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTA-TCGAAAAAG
316 ATTAATAAGTAAA-AGATTT-A-AAAATAAATCTGTTGACT-G-ACCAG
* * * * *** *
26571 TTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTGTCTATTT-AGAATTGCTATGACCTTTTGTTTTTTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * **
26635 ATAAAACAATTATTTCAGTTAATACAAGTTTATACGGAATAAAATAAT-C------A--AA-ATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** *
26690 -T---ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-TCGAATTAGTT-AAATAATTAT
130 CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * *
26749 GGCAATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* *
26813 TTTTTATCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAA
259 TCTAT-TCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTAA
* * **
26876 TAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTG-TTGACTGACCAG
* ** * ** * ** * *
26913 TTTAAATAGTTAAAATTATAAGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTCT-AGCC--TAGTTTTAGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTT-GT
* * * * * * * * *
26975 CATAAAATATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTTAGAACAAAATAATCCTAATATATTAACA
64 CATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** ** * * *
27039 TT-TGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGCTCAAGTAG
128 TTCT--AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * ** * * *
27103 TTATGACTATTTGAA-AGATTA-ATATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
190 TTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * * * * *
27166 TTGCTTC-AGTTCATAAAAGGTTA-TCCAAAATAAAATAATACCAATTTTTTAAT-ATTTCAAAA
254 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAA
* * * ** ** *
27228 ATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGTTTTCTGAATAAA
316 ATTAATAAGTAAAAGATTT---AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * * ** *
27276 TTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGATATTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** ** * *
27341 TAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAG-TTAATTTGAAATAAAATAACAATAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCA-TACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* ** * * ** * *
27404 TTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCCGTTTACCAT-ATCAA-TTCAAATAAT
128 TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C-TGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * ** * * *
27467 TATGGCTATTTCAACAATTACCTATTTTAAATCATTATGAACATTT-TTTCATCATAAAACAATT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * * **
27531 GTTTTTCA-TCATAAAAGCCTGTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATT
256 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATT
*
27594 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATT---T----A-
319 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTGACCAG
* * * * * * * *
27628 TTGAAGTAGTTCT---TATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTATTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTC
* * * * ** *
27690 -T-GAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * *
27753 ATGAAAATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAAATTTGTTT-GTCGAAGCAA-TTTAAATAGT
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGT
* * ** * ** *
27816 TAAGACAATACGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * * * *
27881 GTCT-TAGTTCATAGAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAA-CATTCCAAAAATT
256 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATT
* * * * *
27944 AATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATCAT
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * * * * * *
27983 TTCAAATAATTATGGCCATTTCAACATTTATCTATTTCAAACCATTATTACCTTTTGTTTGGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
28048 TATAACAAGTGTTTTTGATCATTCAAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATTTATTAATCTTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * * * * *
28113 CAAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAATAAATCTGTTCATTAAACTAGTTCAAATAATTATG
130 CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
28177 ACTATTTGAACGATTATATACTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
** * * *
28242 CTATTCATACAAGCTTATTTGGAATTAAATAATA-TAAATATAATAAT-ATTCTAAAAATTAATA
260 CTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATT-TAAAAATTAATA
* * * * * ** *
28305 ACTAAGAGAATTAAAAATAAATTTATTTGACAAAACAG
323 AGTAAAAGATTTAAAAATAAATCT-GTTGACTGACCAG
* * * * * *
28343 TTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * ** *
28407 ATAAAAGAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTAATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * **
28470 TGCAAAAATTAATAAGTAAGATATTT-AAAAAT--A--TATTT-CT------GTT----TACCTA
129 T-CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * ** * * * *
28519 --ACCAATTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG-
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* *
28581 -T-T-TT--T----G-----TTCATAATAAAGTAATACT--TCTATTAAT-ATTTCAAAAATTAA
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTAA
* * ** *
28629 TAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACAAACTAG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-GTTGACTGACCAG
* ** *
28666 TTCAAATAGTTATGACTATTTGACA-AATTATTTATTTCAAATTGTTTTGA-CTTTT-TTTCCTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT--TG
* * * * * *
28728 TTATAAAACATTTGTTTCTGTTCATACATGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
63 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
28793 TT-TCAACAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACTAGATCAAATGG
128 TTCT-AA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
28855 TCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAAGATT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
** * * * *
28920 TGTTTCGGTTCATATAAG-TTTTTTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAAT-ATTCCAAAAAT
255 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAAT
* * * * ** **
28983 TAATAATTAAGAGATTTAAAAA-AGAATCTATTTATCAAATAAG
318 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAATA-AATCTGTTGA-CTGACCAG
* * * * ** * * *
29026 TTTAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGCTATAACATTTTGTTTTGAC
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *** * *
29090 AT-AAATAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAAATTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
29154 -AAGATAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAAT-GTT
130 CTA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
29216 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-CTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * * * * * *
29280 GTTTTTGTTCATACAAGGTTATTT-AGATTAAAATAATACTAA-TTATTCATATTTTGACAATTA
256 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTA
* * * * * *
29343 ATAAGTAAAATATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAA
320 ATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * * *
29386 TTGAAATAATCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** ** * * ** *
29451 TAAAACAACGGTTTCAATTCAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTA
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * * * * *
29516 CTTAAATTAATGAGTAATAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGCTCAAATAGCTATG
130 CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *** * *
29581 ACTATCTAAACAGTTATCTATTTTAAAACATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTT
* * * * *
29646 T-TGTTCATGCAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTGATTAAT-ATTACAAAAATTAAT
259 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATT-TAAAAATTAAT
* **
29708 AAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCT-ACACA-
322 AAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTGACTGAC-CAG
* ** * * ** * * *
29745 TTCAAATAATTATTTCTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * **** * * *
29810 TAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGCTACAAAATAACACTAATTTATTAAAAATT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATT
* * * * * ** **
29875 -TAAAAATTAATAACTAAAATATTTTAAAAAATAAAATATGTTTATTGAGCGGGTTTGAATAGTT
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
29939 ATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTCTTCTTATAAAACAATTG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* ** * * *
30004 TTTCTACTCATACAAATTTA-TTCGAACTAGAATAATGCTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTA
*** * * * **
30067 ATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAG
320 ATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACT-GACCAG
* * * * **** *
30109 TTCAAATAGTTAAGTCTATTCGAACT-ATTAACTATTTCAAATCATTATTTTATTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * **** ** * **** ** ** *
30173 GTAAAACAATTGTTTCTGTTAGCTTTA-TAGGTTACATGGTGATCCAAGAGGGGTGGTGAATTGG
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTT--C-ATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT-A
* ** ** * * * * * * *
30237 AT-TTCTTTAAATTCTTCCCAAACAAATGATTT---CAAT--A-TAGTTGAATGGA-AA-TTAAA
125 ATATTC-TAAAATTAAT---AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAA
* * * * ** * * * **** **
30293 ACAATTA-GCACT-TTTGATGAAAATATAATGCAAACAAT-AACAAT-TAATGAATCTAAAATCA
186 ATAGTTATG-ACTATTTGA--ACAAT-T-AT-C-TA-TTTCAA-ATTGTTATG-ACCTTTTGTTT
* *** * *** * * ** *** * * *
30354 AAT-ATAAACAACAATAAATTGTAAGGAGATAAGGATA-GAGAAATCAAACACA-A-TGATTTA-
241 TATCAT-AA-AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATA-ATACTAATTTAT
* ** ***** ** * * * ** **** *** * **
30414 T-AGAGGTTCTGTCTTTCTCCA--CAAGGCACCTACGTCCTCTCTTCTTGGTTGTCCACACCAAG
303 TAATAATTTAAAAATTAAT-AAGTAAAAG-ATTTA-AAAAT-AAATC-T-GTTG-ACTGACC-A-
30476 G
359 G
* * * ** * *
30477 CTTCAATCCACTA-TTCTTGA--A-TTGAAAATACAACCTATCTTTTTC-TTTC--TAAG-GCTT
1 -TTCAA---A-TAGTT-ATGACTATTTG--AAT--AA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
** * * * * ** * ** * * * ** * * * *
30534 AAG-ATAGAAACCTCTACCCTTTGTAGTAT-TTTACCCAATCTTACTACAAAGCTCTCAAGAA-G
55 TTGTTTTG--TCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAA---AT-AA-AATA
* * * * * *** * * *
30596 ATACCTCACCTCTTGTT-CTCTTCCACCCTT-GTATA-TCAAAGGTAATTTTGCAAACAATAGAA
111 ATA-CT-A-AT-TTATTAATATTCTAAAATTAATA-AGT-AAAAG--A-TTT--AAA-AA-A-TA
* ** * * * * * **
30658 CAACCTCTCTAAGGCTAAGTGTTTGCTAAGTTTAAGTACAAGAAAATGATGAATGAACAACAAAT
162 -AA--T-T-T---G-T--TT-ACTG--AA---CAAGTTC-A-AATA-G-T-TATG-AC--TATTT
* * * * **** ** *
30723 -AAAAATTGGATACAATAAATACAAA--GATATGGA-C-TTTG-AAGCTC-TAAAAACTCTTGAT
202 GAACAATT--AT-C--T-ATTTCAAATTGTTAT-GACCTTTTGTTTTATCAT-AAAACAATTGTT
* * * *** * ** **** ** * * * *****
30781 TCT-TTGAGAAAATGAAAATGTGGCTTATTGGCTCTTGCT-CTCTTGATTCATCAATCTTCTTGG
259 TCTATTCATACAA-GCTTAT-T-TCAAATAAAATAATACTAAT-TT-ATTAAT-AAT-TTAAAAA
** * *** * * ** * ***
30844 TGTGTTGGAGTGCCCA-ATTTATAAAGAAAT-TGAAGA-AGTAGTTG
317 T-TAAT-AAGT-AAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
** * * * * ** ** ** * ** * * **
30888 TTGGGAA-AGCT-TG--GA-GTGAAGCAA-TGCCCGTTGGAATGATGAAAAAAT-AGCTGTTGGA
1 TT-CAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAA--AT--CATTATGACCTTTTGTT
* * * * * ** * *** * * ** * ** ** **
30946 GTGCCCATGCCTAGAATCGATCGATCCCT-TCCATGAGGGGATCGA-TC-CTATCAGCTGCTGGG
60 TTG----T-CATA-AAACAATTG-TTTCTGTTCAT-ACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAAT-AC
** ** * **** * * * * ** * * *
31008 TGGTTGT-TTCCTGTT-TTGTGTT-CT-ACTAACTA-ATTT-GACTATAACTTGAGTTATAC-AA
115 TAATT-TATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATT-TGTT-TACTGA
* ** ** * *
31066 ATCCAAATTACAAACCGTT-TGAAGATTTGGAAACTAGACTTAAAGGGCTTTCTATCCATATAAT
176 A--CAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTT-G-AAC-A-A-TT--A--TCTAT-T-T-C--A-AAT
* * * *** * * *
31130 T-TCATCACCTAATTCACTG-TGTA-CGAATTATAGTGAA-T-TTTCAAATT--TAC-ACCTT-G
223 TGTTATGACCT--TT---TGTTTTATC--A-TA-AAACAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTAT
* ** **** * * * * ** *
31186 TGCAGTTTTTCTGACA-ACTGCAGAGTGTCTAGTAAAAATTCAAAATCCTTTCTTAG--AAA-AT
278 TTCAAATAAAAT-A-ATACT--A-A-T-T-TATTAATAATTTAAAA--ATTAATAAGTAAAAGAT
** ** ** **
31247 TTGGATTTTGAT-T-TTGTTTGATCCA-
333 TTAAAAATAAATCTGTTGACTGA-CCAG
* * ** ** * ** * *
31272 TTAGAAAGTAGACTCAAAT-ATCT-TTCCAACCA-CATAAAATTCAAAT-ATTAAGA-CTTTGTG
1 TT-CAAA-TAG--T--TATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TG
* ** * * * ***
31332 AATTAATACAGAAAAATAAAACAA--G-TTCAATGTT-AGA-AAACTTTGTTC-TTGTAAAATAG
58 --TT--T--TG--TCATAAAACAATTGTTTC--TGTTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATA-
* * * **
31391 CTTTCTTAAGTTAATCT-AT-TTCTCAAAACCAATATTA-TCAAAATTG-TATTAAGTCCAAAAT
111 -ATAC-TAA-TTTAT-TAATATTCT-AAAATTAATA--AGT-AAAA--GAT-TTAA----AAAAT
* ** * * * * * **
31452 GAATAAGTTCACTTTAA-AA--ACAACA-A-TT-GGACTTTCATTT-AAGCTCAAATAAATAATC
161 AAATTTGTTTAC-TGAACAAGTTCAA-ATAGTTATGAC--T-ATTTGAA---CAATTATCT-AT-
* * * * * * * * * *
31510 TTTAAA--GATA-GA---TTTGGTTT-TGA-GAAA-TA-TG--AC-A-CCA-AGAAAGGTT-TGT
216 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTAT-T
* * * * *** * * *
31559 TTAAACTTTGAAATCAATA-TTATTTATT--TAGTACCAAAATATAA-AACTTCAGAA-CTTGTA
279 TCAAA---TAAAAT-AATACTAATTTATTAATAATTTAAAAAT-TAATAA-GT-AAAAGATT-TA
* * * ** **
31619 CTAAATAAATCCTTTTCA-AAATCTTG
336 -AAAATAAAT-CTGTTGACTGA-CCAG
* * ** * ** * * * ***
31645 ATCAAGT--TTAT-TTTAGCTTTAAATGTTTTTGTCATTTCAAAT-A--AGGA-----T-CAAT-
1 TTCAAATAGTTATGACTA--TTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * ** * * * *
31697 TC--AAGGCTAATAGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAGTAGTACCAATTTATTAAT
63 TCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * * * *
31760 ATTTTCAAAA--ATTAAG-AGGAGA-TTAAAGGACTAAATCTATTTA-TCGAAC-AGTTCAAATA
127 ATTCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA-AAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATA
* * * * * * **
31819 ATTATGACTATTTGAACAATT-TATATCTAAAATTGTTTATGATCTTTT-TTTTCTCATAAAGTA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA
* * * * *
31882 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTAAATAAT-ATTCTAAA
253 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATT-TAAA
* * * *
31945 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCAG
315 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACT-GACCAG
* * * * * *
31992 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAGCTATTTCAAATCATTTTGACCATTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * ** * *
32057 TAAAATAATTGTTTCAATTTATATAA--TTA-TCTATTTAAAATTGTTATGAC-ATTTTATTTTA
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA---TAAT-ACTAATTTA--TTA
* ** * * * * *
32118 ACA-TAAAATAATTATTTCAATTCATAAA-ATCTTATCCAAAATAAAATAATG-TTACTTTATTA
125 ATATTCTAA-AATTA-AT-AAGT-A-AAAGAT-TTA--AAAAAT-AAAT-TTGTTTAC-TGA--A
* * * * * * * *
32180 -ATATTTCAAAAATTGAGAAGTT-GGA-GATTTAAAAAAATAAATC-AGTTTATCGAATCAGTTA
177 CA-AGTTC--AAA-T----AGTTATGACTATTT-GAACAAT-TATCTA--TT-TCAAAT-TGTTA
* * * ** *
32241 TGA-CTATTTAAACAATTACTTATTC-CAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
228 TGACCT-TTT-----GTT--TTA-TCATAAAACAAT-TG--TTTCTA---T-TCAT---ACAA--
* * * * ** * * ** * * *
32304 GATTTTGTTCACACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAG
272 GCTTAT-TTCAAATAA-AATA-AT--ACTAATTTATTAATAATTTA--AA-A-ATT---AA-T--
* * * * * *
32369 AAAGTAAAAGGTTTTCAAAATAAATATGTTTAATGAACAAG
322 -AAGTAAAA-GATTTAAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * *
32410 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TCAT-AACTATTTGAATAATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTG--T-TTT
* * *
32473 ATCTATTTCAAATTGCTATGATCTTTTGTTTCATCATAAAACAACTGTATTAGCTCACATAGGCT
62 GTC-A--T-AAA--AC-A--A----TTG--T--T--T-------CTGT-TCA--T-ACA-A-GCT
** * * * * *
32538 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGATATTTAAAAT
95 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * * * * *
32603 ATGAATGTGTTTACCGGACAAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-C
159 ATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * * * * ** *
32667 ATTATAACCTTTTGTTGTGTTATCAAATAATTGTTTATGTTCATATAAGCTTATTTTGAATACAA
224 GTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAA
* * * *
32732 TAATA-TAAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTT
289 TAATACT-AATTTATTAATAATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTG
* * * *
32794 TCTAAACATA
351 ACTGACCA-G
* * *
32804 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAAACTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * *
32868 ATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAG-TGTATTTGAAATAAAATAATAATATTTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
32932 TCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCATATCA-T
129 T-CTAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAAT-AGT
* * ** *
32995 TATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATAGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * * * * * * *
33059 CTTTCTATTCATACAAGTTTAGTT-AGATTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGAAAATCA
256 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTA
** ** * * *
33123 ATGGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTTTTTACTGAACAAG
320 ATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * ** *
33166 TT-TAA-A--TA-G---ATTTGACT-ATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
33221 ACAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-AAACTTA-TCTGAAATAAAATAATAATAATTTTTTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * ** *
33283 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAACTAAAGTTGTTTTCCAAACCAGTTCAAATAGTT
128 -TTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * ** * *
33348 ATGACTATTTGAAGAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAC-ATCT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT-T
* * ** *
33411 GTTTTTGA-TCATATAAGCTTA-TTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAAT-ATTTCAAAAAT
256 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAAT
* * * ** *
33473 TAATAAG----AGATTTAAAAA-ACTAATGTATTTACCAAACTAG
318 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAATA--AATCTGTTGA-CTGACCAG
* * *** * * *
33513 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGACCTTTTGTTTAGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** ** *
33578 TAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * * * *
33642 CAAAAAATTAATAAGCACGAGATTTGAAAATATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTA
130 C-TAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * ** * * *
33707 TGAATATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATT-TGACCATTTGTTTTATCATAAAATAGTTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
* * * * * *
33771 TT-TAGTTCATAAAATCATA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT-ATTTCAAAAGTTAA
258 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTAA
* * * *
33833 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAATCAA
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-GTTGACTG-ACCAG
* * * * *
33874 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-
* * * *** * * *
33939 AAAAAAAAAAACTGTTT-TCAACATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTCATTAATA
65 --ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * **
34003 TT-TCAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAATCAA-TTCAAATAG
128 TTCT-AA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
34062 TTATGACTATATGAATAATTACCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* * * *
34127 TGTTTCTATCCATACAAACTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAT-ATTCTGAAAAT
255 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAAT
* * * * * *
34190 TAATAACTACAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTG-CTAAACTAG
318 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTG-TTGACT-GACCAG
* * ** * * ** **
34234 TTTAAACAGTTAAAACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACAATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
34299 TAAAACAATTATTT-TAGCTCATACAAGATTATTCAAAATAGAATAAAACTAATTT-TTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T
* * * * * ** ** *
34362 TCAAAAATT--T-A-T-AAGGATTTAGAAAATAATTTTGTTTACTAAATTAGTTTGAATAATTAT
129 TCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * ** * * *
34422 AACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATTG--CTTTATGTTTTGTCATAAAATAATTT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TGACCTTT-TGTTTTATCATAAAACAATTG
* * * * * * *
34485 TTTTTGTTAATATAAGTTTA-TTCGAAAGAAAATAACACTAATTTATTAAT-ATTTAGAAAATTA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTA-AAAATTA
* * * * ** *
34548 ATCAGTAAGAGAATTAAAAAGTAAATTTGCTT-ATCAAACCAT
320 ATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTG-TTGA-CTGACCAG
* * * * **
34590 TTCAAATAGTTTTGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCATTATAAAATTTTAG-TTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTC
* * * * * * * * * *
34654 ATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTAGTTTATTTAGAATAAAATAACATTAATTTAATAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** *
34719 TTGAAACTTAATAA-TCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAGTT
130 CT-AAAATTAATAAGT-AA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* ** ** * * * * *
34782 AAGACTACATGAATGATTATCTATGTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
*** * * * **
34847 TTT-TATTCATACAAGCTTATTAGGATTTAAATAATACTAATTCGA-TAATGTTTTAAAAATTAA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATAATTTAAAAATTAA
* * **
34910 TAAGT--AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAATAAG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACT-G-ACCAG
* * * * * * * * *
34949 TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTATCACATTTTGTTTAGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
35014 TAAAACAATTGTTTCAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATCCTAATTTATTAACATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * **
35079 AAAAAATTAATTACA-AAAAGAGATTCAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
131 -TAAAATTAA-TA-AGTAAA-AGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
35143 AATTACTATTT-AAGTAATTGTCTATTT-AAATTCTTTATAACCAGTATTTGAGTAATTGTCTAT
191 TATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATT-GTTATGACC--T-TTT--GT-TTTATC-AT
** ** * *** * *
35206 TTAA-AA-T-CAT-TA-TAAT-C-A-CTTGATTTGTCATAAAACAAT--T-GTTTCAGTTAGCAC
247 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTCAAATAAAATAATACTAATTT-A-TTA--A-
* * * * ** * * *
35260 AAATTTAAACAA--AATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTTGAAAT-TAATAAGTAAGA-A
306 TAATTTAAA-AATTAAT-AAGTAA-A-AGATTTA--AA-A---AT-AAATCTGTTGACT--GACC
*
35321 AT
358 AG
* * * * * *
35323 TTAAAAAATAAATT-TGTTTACCGAATTAGTAAAAATAATTATGGCCA-TTCGAAA-GATTAT--
1 TT--CAAAT-AGTTATG---A-C-TATT--T--GAATAATTAT--CTATTTC-AAATCATTATGA
** * * * * **
35383 -CTATTTGAAATCGTTAT-GAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAATCATACAAGCT
51 CCT-TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTG---T-T--T----C---TG----T--TCATACAAGCT
* * * *
35446 TATTCGAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
95 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * ** * * *
35510 AATAAATCTATTTA-TCGAACTAGTTCAAATGGTTACAACTATTTGAACAATTTTCAATCTC-AA
158 AATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
35573 TTGTTAAGATC-TTTGTTTTATAATTAAACAATTGTTTTTGA-TCATAAAAGCTTA-TTCAATTA
222 TTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAAT-
* * *
35635 AAAATAATACTAATTTAATAAT-ATTCAAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAATTAAATGTG
285 AAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTG
*
35695 CTTG-CGGCACCAG
348 -TTGACTG-ACCAG
* ** * * * * ** * ** ** *
35708 TTCAAATAATTAAAACCATTAGAATAATTATCTATTACAGATTGTTTTGATATTTTGTTAAGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * * * * *
35773 AAAAATATTTATTTCAT-ATCTTATAAGCTTATTCGAAATAACATAATCCAAATTTATTAACATT
66 TAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
35837 -TGGAAAATTAAAAAGAAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTT
130 CT--AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * ** *
35901 ATAATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTCCTTTTGA-CATATAACAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATT
* * * * * * *
35965 GTTTCAATTCATAAAAGCATA-TCCAAAATAAAATAATAATAATTTCTTAATATTTTAAAAATTA
256 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTA
* * * * * * *
36029 ATAAGTAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTATTTACAGAACAAA
320 ATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * *
36071 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** *
36136 TAAAACAATTGCTTCAGTTCCTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * ** ** * *
36201 CAAAAGTAATAAGT----TATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATCA
131 TAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * ** * *
36262 CCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGTTACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTGTTT-
196 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * *
36326 TATATCATACAAGCTTA-TTCAGAAATAAAATAATACTAATTTCTTCAT-CTTTCAAAAATTAAT
261 TAT-TCATACAAGCTTATTTC--AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAAATTAAT
* * * * *
36389 AAGTAAGAGATTTAAAAAAAAATTTGTTTACTGAATCAG
322 AAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * * *
36428 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTGTATACTTCAAATCAAATTTTTACAAAATAAACCTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC--A---TT-----AT-GACCTT
* * * * * * * *
36493 TTGTTCTATTATAAAATAATTATTTATGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATC
55 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * *
36558 TAATAATATT-TAAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTT-GTCAAACTAGT
120 TATTAATATTCT-AAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGT
* * * * * * * * *
36621 TTAATTTGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTAT
182 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * * * * * *
36686 AAAATAATTTTTTCGATTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATAAAATTATTAAT-ATT
247 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATT
* * * * * *
36749 ACAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCTAACTAG
311 -TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * * * * *
36797 TTCTAATAATTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAAT-GTTATAACTTTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
36861 CAT-AAA-ATTTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATACAAATCTATTAATAT
64 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
36924 TACAAAAATTCATAAG----AGATTTTAAAAATAAATCTT-TTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGT
129 T-CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * ** *
36983 TATAACTATTTGAGCAATTAAT-TATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTCCATTATAAAACAAT
191 TATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* * * * * *
37047 AGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTATTATTTTGACAATT
255 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATT
* * * * ** *
37111 AATAATTAAAAAATTTAAAACATAAATATGTTTACCAAACTAG
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAA-ATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * * *
37154 ATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
37218 TAAGAA-AATTATTTCAGTTCATATAAGGTTATTCAAAATAAAATAATAGTAAGTTGTTAATATT
66 TAA-AACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * * *
37282 CCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTAT
130 -CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * * *
37347 GACTATTTAAATAATTATCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATT-T
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA-ATTGT
* * * * * * * *
37410 CATCTATTTATACAAGCCTATTTCAGATAAAATAATTCAAATTTATTACTAA--CAAGATAATTA
258 -TTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAA-A-AATTA
* * *
37473 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCAC-CACAAAAG
320 ATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTGAC--CAG
* * * * * * *
37515 TTCAAATCGTTATGACTATTTG----A--A-C-A--ACGAATTATTATAACATTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
37570 TAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * ** * * *
37635 TAACAATTAGTAAGCAAAAGATTTAAAACATAAATATGTTTACCAAACAATTTCAAATACTCATG
131 TAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * *
37700 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTT-GCAATAAAATAATTGTT
195 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATC-ATAAAACAATTGTT
* ** * * * * * * * *
37764 GCGGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAACAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAAATTAATG
259 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAATA
* ** * * * *
37828 AGTAAGAGAACTAGAAAAATGAATCTGTTTACTAAACAAG
323 AGTAAAAG-A-TTTAAAAATAAATCTGTTGACT-GACCAG
* * * * *
37868 TTCAAAGAGTTATGACTATCTGAACAATTATATATTTAAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
37932 AGAAAATAATTGGTTT-TGTTCATCCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTAATTAATA
65 ATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * * * * *
37994 TTCCAAAAGTT-ATAAGCGAAA-ATTTGAAAAATGAATTTTTTTATTAAACATGTTCAAATAGTT
128 TTCTAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
38057 ATGACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTA
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
* **
38122 TTTCTATTCATGCAAGCTTATTTGGAA-AAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAA
* * * ** *
38185 TAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCAAGCGAG
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTGA-CCAG
* * *
38226 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *** *
38291 TAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAG-TATATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * **
38355 CTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAGAATAAA-TTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCCT
130 CT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * * * *
38419 GTCTATTTGACCAAACATCTATTTCGAACTATTATGA-CATTT-TTTTATCATAAAATAAGGCCA
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT--AA-AA---CA
* * ** * *
38482 ATTATTCAAAATAATTGGCATTCATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACAAATTTATTACT
253 ATTGTT-----T--CT---ATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
38546 -ATTTCAAAAATTAATAAG-----GATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACTAG
307 AATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * * ** * * * * *
38596 TTCAAATAATGAAG-CTTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGAACTTTTATTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
38660 ATAAAATAATTATTT-TAATGT-ATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
65 ATAAAACAATTGTTTCT-GT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
38723 TT-TAGAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTAAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAAAAGTTCAAATAG
128 TTCT--AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * **
38785 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTTATTTTTATTGTAAAACA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTT-GTTTTATCATAAAACA
* * * * * * *
38850 ATTGTTTCAATACATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATA-TTACTTATTAAT-ATTTCAAAT
253 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAA
* * * * * * *
38912 TTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATCAA
316 ATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-GTTGACT-G-ACCAG
* * * * * * ** *
38958 TTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAATGATTATGAATTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * *** * *
39023 TAAAATAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
** ** ** *
39088 TAGAAATTAATAAGTAGGAGATGCAAAAAATTGATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTAT
131 TA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
39152 GACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTATATCATAAAACAATTATT
194 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
39217 TTTGTTCATAAAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAAT-ATTCTAAAATTTAAT
259 TCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAAT
* * * * * ** *
39280 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAACCGG
322 AAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * * * * * * * * * *
39320 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCTTTATTTTAAATCGTTAGGACTTTTTGTTTTATCG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ***
39385 TAAAACAATT-TTTTTAGTT-TTAGTAA-CTTATTTAGCGTAAAA-AA-A--AA-TTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCT-GTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
39442 T-TCAAA--AATTAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTATGTTTGCCGAATCAA-TTCAAATAATT
129 TCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * *
39502 ATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCGAAGTCATTATTACCTTTTG-TTTGTCAAAAAACAAAT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
* * ** * ** * **
39565 GCTTTTTGTTCATGTAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGGAAAAAT
256 G-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT--AAAAAT
* * * *
39630 TAAGAAGTTAAGAGATTTAAAAA-ATAAT-TGTTTACTAAACCAG
318 TAATAAG-TAAAAGATTTAAAAATA-AATCTGTTGACT-GACCAG
* * * ** * *
39673 TTGAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTAT-T-TTACATGTTAATCATGAGTGA-CTATTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA----AATCATTA-TGACCT-TTTGTT
* * ** ** * *
39735 TTGTCATAAAAGAATTGTTTCTATTCATGACATCCTTATTTC-GGATAAAGTAATGCTAATTTAT
60 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-ACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
39799 TAACCAGTTCTAAAAAATTAAAAATGTAACGAA-ATTTCAAAAATGAAATTTG-TTAGCTTG-AC
123 TAA-TA-TTCT--AAAATTAATAA-GTAA--AAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTA-C-TGAAC
* * * * *
39861 GAGTGCAAATA-TTATAACTGTTTGAAACAATT-TCTATTTTCAAAATTGTTATGACGCATTT-T
178 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTA-TTTC-AAATTGTTATGAC-CTTTTGT
*** * * * * *
39923 TTTATTGCAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATT
239 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
39988 AAT-ATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGCTTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAG
304 AATAATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACTG-ACCAG
* * ** * *** * * *
40046 TTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATTATCTATATCAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** *
40111 TAAAACAATTTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACAAAATTT-TTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATT
* * *
40175 CCAAAAATTAATGAGTAAAA-A-TTAAAAAA-AAAGTT-TTT--TGAACACA-TTCAAATAGTT-
130 -CTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
40232 TGACTATTTGATCAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCAGAAACCAATTTG
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTG
* * * * * * * *
40297 TTTCTGTTCATACGAGCCTATTTGAAATAAAATAATGCTAGTTTATTAAT-ATTCCAAAAATTGA
257 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATT-TAAAAATTAA
* * * *
40361 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAGCAAC
321 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTGACT-GA-CCAG
* * * * * * * *
40402 TTTAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTG-TTTTGT
* * * *** *
40466 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTGGGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATAT
64 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * *
40531 TCTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTA
129 TCT-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
40596 TGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
** * ** * *
40661 TTCTATTTGTGCAAAATTATTT-AGAAT-AAATAATACTAATCTATTAAT-ATTTTAAAATTAAT
258 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTTAAAAATTAAT
* * * *
40723 ACG----AGATTTAAAAACT-AATATGTTTG--TAGAAACAA
322 AAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTG-TTGACT-G-ACCAG
* * * * * * * *
40758 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATAATTATGATC-TTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
40822 TAAAATAGTTTGTTTCTTTTTATACAAGTTTCATTCAATTAA-AAAATAATACTAATTTAATAAT
66 TAAAACA-ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCAA--AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
40886 ATTCCAAAA--ATTAA-TAAAAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTA-TCGAACCA-TTCAAATAG
127 ATTCTAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
40946 TTCA-GACTATTAGAGC-ATTATTTATTTCAAATTGTTCCTGCACCCTTTG-TTTAGTCATAAAA
190 TT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT-ATG-ACCTTTTGTTTTA-TCATAAAA
* * * * *
41008 TAATTATTT-TCAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAACAAAATAATAGC-AATTTATTAA-CATTTG
251 CAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATAATTTA
* * * * ** *
41069 AAAA-TAATGAGTAAGAGA-TTAAAAA-AAA-ATGTTTATCAAACAAG
313 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTGA-CTGACCAG
** * * * * * * *
41113 TTGTAATAGAT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAGTTATTACGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
41176 TAAAACATTTGTTT-TGGTTCA-AAAAACTTAACCGAAATCAAAATAATACTAACTTCACTAATA
66 TAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAA-TTTATTAATA
* * * * * * * * *
41239 TTTTAAAACTTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAACT-AATCTGTTT-TTCGCACCAAATTCAAATA-
128 TTCTAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-G-AACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
41301 TTATGAACTATTTGAACAAATATCAATCTTAAAATAGTTATGATC-TTT-TTTTGTCATAAAACA
190 TTATG-ACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA
* * * * *
41364 ATTGTTTCTAATCATAC-AG-GT-TTT-AGATAAAAATAATATTAAATTTAATAAT-ATTCTAAA
253 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAAT-AAAATAATACT-AATTTATTAATAATT-T-AA
* * *
41424 AAATTAATAAG---AAGATTTAAAAA-ATATATGTTTGTC-GAGCCAG
314 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTG-TTGACTGA-CCAG
* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * * *
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66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT--AATTTATTAATAT
* * * * * *
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129 TC-TAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
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* * * *
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* ** * ** **
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* * * * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * ** *
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65 ATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
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129 TCTA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
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* * *
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* * ** **
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* * * * * * ** * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
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66 TAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** *
42308 T-TCAAAAGTTAATAAG----GGATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCGAA-ATAGTTCAAATAA
129 TCT-AAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACA-AGTTCAAATAG
* * * ** * *
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* * * * * * *
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254 TTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATTT-AAAA
* * ** *
42492 ATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAG
316 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTGA-CTGACCAG
* * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
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66 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * *
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258 TTCTA--TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT-TTAAAAATT
* * * * * *
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* * *
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TAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 AAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGT
* * * ** * * *
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* * * **
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130 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG
* * * *
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1 AAACAATTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTT-TG
* * * * *
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* *
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* * * * *
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1 AAACAATTCAAATAGTTATGACTATA-T-GAACAATTATTTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTT
** * * * * * *
11113 GTTTAATCATAAAGCAATTATTTCAATTCATACAAATTTATTCAGAATAAAATAACACTAATTTA
63 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
11178 TTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGATAAA-ATGTTTATTG
128 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACTG
* * * * *
11232 -AACAAGTTTAAATGGATT-GGACTATTTGAACAATCAATCTAACTATTT-AAAGTCA-TTATGA
1 AAACAA-TTCAAATAG-TTATGACTATATGAACAAT-TAT-T---TATTTCAAA-T-AGTTATGA
* *** * * * * ** *
11293 CCTTTTCTTCCATTATAAAATAA-TGTTTC-AGCTCATAGAAACTTATCT-GAAATAAAATAATA
57 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATA
* * * * **
11355 CTACTTTACTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTATTTTTTG
120 CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG
* * * * * * *
11417 AATCAATTTAAATAGTTATGACTAGT-TAAACAAATA-TCATTCTCAAACCA-TTATGATC-TTT
1 AAACAATTCAAATAGTTATGACTA-TATGAACAATTATTTATT-TCAAA-TAGTTATGACCTTTT
* * * * * * *
11478 GTTTTCTCTTAAAATAATTGTTTCTGA-TCAT----GCTTATTT-GGATTAAATAATAATAATTT
63 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
11537 AATAAGATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTG
127 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG
* * * * * * * * * * *
11588 -AACTAGTTCGAATAATTAAGACTAT-TAAAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTAATCATTT
1 AAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATAT-GAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTT
** * * **
11650 GTTTAATCATATAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAACTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATT
63 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATT
11713 TATTAA
126 TATTAA
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Matches are distributed among these distances:
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AAACAATTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT
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Found at i:11558 original size:18 final size:19
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*
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1 TTAATAAGAGATTTAAAAA
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TTAATAAGAGATTTAAAAA
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11531 TAATTTAATA
* *
11541 AGATTTTAAAAATTAATAAG
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11561 AGATTTAAAAAATAAATA
1 AGATTTAAAAAATAAATA
11579 TGTTTGCTGA
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Matches are distributed among these distances:
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AGATTTAAAAAATAAATAAG
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12256 CGTTAAGATC
* * * * * *
12266 TTTGTTTTGTAATAAAATAATTGATTTTGA-TCATAGAAGGTTATTC-AATTAAATATAATGCTA
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* * * * * * ** *
12329 ATTTAATAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAGAGATTT-ATAATATAAATGTATTTGCTGAACCA
62 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAA
* * * * * * ** * *
12393 GTTCAAATAATTA-CAGCTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTTTACCT
125 ATTCAAACAATTATGA-CTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCA-TTATGACCT
* * * *
12448 TTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCAAAT
1 TTTGTTTAGT-ATAAAATAATTGTTTCAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * ** *
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* * * *
12577 TTTAAACAATTATGACTATTTGAACAATTGTTTTTTTAAAATCATTATGACCT
126 TTCAAACAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCATTATGACCT
* * * * *
12630 TTTGTTTTAATATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTACTAAT
1 TTTG-TTTAGTATAAAATAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * *
12695 TTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATAATTTTTTTTACCAAACAAATT
64 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATT
* * * *
12760 CAAATAGTTATGACTATTTGAACGATTGTCTATTGAAAATCGTTATGACCT
128 CAAACAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCATTATGACCT
* * *
12811 TTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTTCATTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATGATACTAAT
1 TTTGTTTAG-TATAAAATAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
12876 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG--AGA-TTT-AAAAAGTGAATCTGTTTACCATATC-AGT
64 TTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAAT
* * * * * * * * *** *
12936 TTAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATGTATTTCGAATCATTATTACCT
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* * * ** ** *
12988 TTTGTTTGGTTATATAACAATTGTTTTTTATCATACAAATTTATTTGAAAA-AAAATAATACTAA
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* *
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13078 AAGATGTTTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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180 10 0.02
181 149 0.29
182 139 0.27
183 74 0.14
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TTTGTTTAGTATAAAATAATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
ATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAA
ACAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCATTATGACCT
Found at i:13345 original size:173 final size:174
Alignment explanation
Indices: 13150--13493 Score: 430
Period size: 174 Copynumber: 2.0 Consensus size: 174
13140 ATTATAACCA
** * *
13150 TTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTT-GGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-
1 TTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATG
* **
13213 AATATAATAATATTTGAAAA-TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GTTGAA-C
64 AATATAATAATATTTCAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AATC
*
13275 TAATTCTAATAATTAAGACCATATT-AACAATTATCTATTTCAAATTGT
128 -AATTCAAATAATTAAGACCAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * *
13323 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAAAATGAA
1 TTTTGTTCTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAATGAA
* * ** * *
13388 TTTATTAATATTTCAAAATTTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAATCAGT
66 TATAATAATATTTCAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAATCAAT
* *
13453 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
131 TCAAATAATTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
13494 CATTATGACC
Statistics
Matches: 146, Mismatches: 19, Indels: 11
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
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174 71 0.49
175 2 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (174 bp):
TTTTGTTCTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAATGAA
TATAATAATATTTCAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAATCAAT
TCAAATAATTAAGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
Found at i:13920 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 13534--14040 Score: 457
Period size: 182 Copynumber: 2.8 Consensus size: 181
13524 AATATTTTTG
* * * * *
13534 TTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAGAAAATA
1 TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAAATTTAAAAAATA
* ** * * * * * * *
13596 AATCTATTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATTA
66 AATATATTTA-CTGAACAAGATCAAATAATCATGACTATTTGAA-CAAATATCTATTTGAAATTG
* * * *
13659 TTATGA--TTT--TTTTCT-ATTATAAAATAA-TAGTTTCTA-TTCATACAAACTTA
129 CTATAACCTTTGGTTTTGTCA-TA-AAAAAAATTA-TTTC-AGTTCATACAAACTTA
* * * * * *
13709 TTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAA-AA-AAATTTTCAAAAGT
1 TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAAA-TTTAAAAAAT
* * * * * *
13772 AAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTGAAATTGT
65 AAATATATTTACTGAACAAGATCAAATAATCATGACTATTTGAACAAATATCTATTTGAAATTGC
* * *
13837 TATGACCTTTGGTTTTGTCATAAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTA
130 TATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAAAAAATTATTTCAGTTCATACAAACTTA
*
13889 TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT
1 TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAAATTTAAAAAAT
* * * ** * *
13954 GAATATATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTGTGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATTGC
65 AAATATATTTACTGAACAAGATCAAATAATCATGACTATTTGAACAAATATCTATTTGAAATTGC
*
14019 TATAACCTTTTGTTTTGTCATA
130 TATAACCTTTGGTTTTGTCATA
14041 CAAGCCTTTT
Statistics
Matches: 270, Mismatches: 46, Indels: 25
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 37 0.14
176 7 0.03
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179 4 0.01
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ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAAATTTAAAAAATA
AATATATTTACTGAACAAGATCAAATAATCATGACTATTTGAACAAATATCTATTTGAAATTGCT
ATAACCTTTGGTTTTGTCATAAAAAAAATTATTTCAGTTCATACAAACTTA
Found at i:14077 original size:160 final size:160
Alignment explanation
Indices: 13894--14200 Score: 393
Period size: 160 Copynumber: 1.9 Consensus size: 160
13884 GCTTATTCAA
* * * *
13894 AATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAA
1 AATAAAATAATACAAAGTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
13957 TATATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTGTGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATTGCTAT
64 TATATTCACCGAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTAT
14022 AACCTTTTGTTTTGTCATACAAGCCTTTTTCT
129 AACCTTTTGTTTTGTCATACAAGCCTTTTTCT
* * *
14054 AATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAATATTTAAACAATAAATA
1 AATAAAATAATACAAAGTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
* ** * * * *
14119 TGTTCACCGAACAAGTTTAAATCTTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
66 TATTCACCGAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAA
*
14184 CTTTTTGTTTTGTCATA
131 CCTTTTGTTTTGTCATA
14201 AAACAATTGT
Statistics
Matches: 124, Mismatches: 21, Indels: 4
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
158 2 0.02
159 3 0.02
160 119 0.96
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (160 bp):
AATAAAATAATACAAAGTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
TATTCACCGAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAA
CCTTTTGTTTTGTCATACAAGCCTTTTTCT
Found at i:14342 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 14036--17039 Score: 1873
Period size: 181 Copynumber: 16.8 Consensus size: 181
14026 TTTTGTTTTG
** *
14036 TCATACAAGCCTT-TTTCTAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGT
1 TCATACAAG-CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT
* * * ** * * * ** *
14098 AAAATATTTAAACAATAAATATGTTCACCGAACAAGTTTAAATCTTTATAACTATTTGAATAATT
63 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* *
14163 ATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
128 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * *
14217 TTATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
14282 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTGTT
66 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* * * * * *
14347 TAGTTT-AAATTATTGTGACCTTTTATTTTGT-AGTAAAACGATTGTTTCAAC
131 TA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTAT
* * ** *
14398 TCATATAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATGAA-TAA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAA
* * * * * * * * *
14461 GAGAATTAAAAAATGAATATGTTTACCGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
65 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
*** * *
14526 CTATTTCAAAACATTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTAT
130 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* **
14578 TCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
14642 -AAATTTAAAAAATAAGTATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
65 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * *
14706 CTACTTCAAATTGTTATGTCCTTTTGTTTTATCATAAATCAATTGTTTTTGT
130 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * *** *
14758 TCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAAGAATACTAATTTCTTAAAAGACCAAAAATTAATAAGTAAA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * **
14823 AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCT--AGGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
66 AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * ** * * * * *
14886 TTATTTCAAACTGTTATGATATTTTGATTTGTCATAAAATAGTTGTTTCCAA
130 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** * * *
14938 TAATACAAATTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
15002 GAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTCATAAAACAAGTTCAAATGGTCAT-ATCCATTTGAACT-A
65 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTC-T-GAATAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAA-TAA
* * *
15063 TTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC-TTTGTTTTATCATCAAACAAATTGTTTCTAT
126 TTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTAT
** **
15120 TCATACAAAATTATTCAGAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAG
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
15180 AGA-TTAAAAAACAAA-ATCTATTTATCGAACCAA--TCTAAATAGTTATGAGTATTTGAACAAT
66 AGATTTAAAAAATAAATATGT-TTTCT-GAA-TAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* ** * ** * * * *
15241 TATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTCATTTGGTCATAAAATAATTGTTTTTAG
127 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * * *
15295 TCACACTAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAA-T--TAA-TAA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
15355 GAGATTTAAAAAATAAATATGCTTAT-AGAACT-AGCTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATT
65 GAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTTCTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
*** * * * * * *
15418 ATCTATTTCAAACCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTAGC
128 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * * * *
15472 TCATACATGCTTATTTGAAATAAAATGATACTAATTTTATTAACT-TGT-AGAACATCAA-AACA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAA-TATTTCA-AAAATTAATAA-G
* * * * ** * * * * * *
15534 CAAGAAATTTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAAAAAGTTTAAATCGTTACGACAATTTAAATAA
62 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * *
15599 TTATCTATTTAAAATAT-ATATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTC-AGTT
126 TTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA--T
* * * * * * * * *
15656 TGA-AAAAGCTTA-TTCGAGATAAAATAATATTATTTTATTAAAATTTCAAAAATTGATGAGTTA
1 TCATACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
15719 GATATTTAAAAATTAAGTCA-GTTTATC-AAAT-TGATTCAAATAATTGT-AGCCATTTGAATAA
65 GAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTT-TCTGAATAAG-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAA
* * * *
15780 TTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-
126 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AT
* * * * *
15836 TCATATAAGCCTATTTGGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGG
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * *
15901 AGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTACT--A-AA--T----TGGTT-T--CTATTTGAACAATTAT
66 AGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * ** * *
15953 CTATTT-TAATTGCTATAACCTATTATTAAGTTATAAAATAA-TGTTT-TAGT
130 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * *** * *
16003 TTATATAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
16067 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAAGT-AGTTCTAACAGTTAAGACTATATGAACAATTA
65 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * *
16131 TCTGTTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAGAACAATCGTTTC-AGT
129 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * *** * **
16184 TCGTAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAATTTTAATAAGTAAG
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * * ** *
16249 TGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTGAC-GAATCTA-TTCAAATAATTATGGCCAGGTCAATAATTA
66 AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * *** *
16312 TCTATTTC-AAGTATTATTACCTTTTGCTTCACCATATAACAATT-TTAT-T-T
129 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTAT
** * * * * *
16362 GAAAGTTCAATCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTA
1 -TCA-TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
16427 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGACTTAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTA
64 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
** * * * * * *
16492 TAAACTTT-AAATCGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTAT
129 TCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * ** * * * *
16545 TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACACCGATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAG
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** * * *
16610 AGAATT-AAAAA-AAATTTCTTTGTC-AAACCAGTTCAAATATTTAAGACTA-TAGAATAATTAT
66 AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * *
16671 CTACTTCAAA-TGATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTAAT
130 CTATTTCAAATTG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT-AT
* * *
16725 TCATACTAGATTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * ** * * **
16789 CAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTAC-GTAACCAGTTCAAATAATTATGACTAATTGAATACCTA
65 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTG-AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
** * * * * *
16853 TCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTTTGT
129 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTAT
* * * * * * * *
16906 TCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT---
1 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * **
16968 -GATTTAAAAATTAAATCTATTTAT-TAAACT-AGTTCAAATAGTTAT-ACCTATTTGAGCAATT
66 AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATT
*
17029 ATTTATTTCAA
128 ATCTATTTCAA
17040 CTTGCCAGCT
Statistics
Matches: 2194, Mismatches: 505, Indels: 252
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
165 1 0.00
166 4 0.00
167 79 0.04
168 25 0.01
169 21 0.01
170 1 0.00
171 1 0.00
172 4 0.00
175 28 0.01
176 118 0.05
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178 67 0.03
179 70 0.03
180 655 0.30
181 689 0.31
182 114 0.05
183 149 0.07
184 7 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
Found at i:15351 original size:176 final size:176
Alignment explanation
Indices: 15140--15505 Score: 400
Period size: 176 Copynumber: 2.1 Consensus size: 176
15130 TTATTCAGAA
* * * *
15140 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA-TTAAAAAACAAAATCTATTTA
1 AAAATAATACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA-AAAATATACTTA
* * * * * * * *
15204 TCGAACCAATCT-AAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TT
65 TAGAA-CAAGCTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAACCATTATAACCTTT
*
15267 CATTTGGTCATAAAATAATTGTTTTTAGTCACACTAGCTTATTCGGAGT
129 CATTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTCACACTAGCTTATTCGGAGT
* * * *
15316 AAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTA
1 AAAATAATACTAAATTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAAATATACTTA
* * * *
15380 TAGAACTAGCTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAACCATTCTAACCTTTT
65 TAGAACAAGCTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAACCATTATAACCTTTC
* * * * *
15445 GTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGCTCATAC-ATGCTTATTTGAAAT
130 ATTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAG-TCACACTA-GCTTATTCGGAGT
*
15493 AAAATGATACTAA
1 AAAATAATACTAA
15506 TTTTATTAAC
Statistics
Matches: 155, Mismatches: 29, Indels: 11
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 7 0.05
176 96 0.62
177 52 0.34
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.37
Consensus pattern (176 bp):
AAAATAATACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAAATATACTTAT
AGAACAAGCTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAACCATTATAACCTTTCA
TTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTCACACTAGCTTATTCGGAGT
Found at i:17161 original size:133 final size:133
Alignment explanation
Indices: 16922--17172 Score: 369
Period size: 133 Copynumber: 1.9 Consensus size: 133
16912 AAGTTTGTTC
* * ** *
16922 GAAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAATTAAATCTA
1 GAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTA
* * *
16987 TTTATTAAACTAGTTCAAATAGTTATACCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGCCAGCTTT
66 TTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATACCTATTTGAACAATTATCTATTTCAACTTGCCAGCTTT
17052 TTT
131 TTT
* * * *
17055 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATTTG
1 GAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTA
*
17120 TTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
66 TTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTAT-ACCTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
17173 ATTGTTATAA
Statistics
Matches: 104, Mismatches: 13, Indels: 2
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
133 103 0.99
134 1 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (133 bp):
GAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATACCTATTTGAACAATTATCTATTTCAACTTGCCAGCTTT
TTT
Found at i:17355 original size:179 final size:177
Alignment explanation
Indices: 17046--17984 Score: 488
Period size: 179 Copynumber: 5.3 Consensus size: 177
17036 TCAACTTGCC
* * * *
17046 AGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGACATTTAAAA
1 AGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAAACATTTAAAA
* * * * * *
17110 AATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
65 AATAAATATGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * ***
17175 TGTTATAACTCTTTT-TTTCTATTATAAAA-ATTTGTTTCTGTTCATAAA
130 TGTTATAAC-CTTTTGTTT-TATCATAAAATAATTGTTTCAACTCATAAA
* *
17223 AGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGATTTAA
1 AGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA--AACATTTAA
* *
17287 AAAATGAATATGTTTG-TCAAACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATTTATTTCA
63 AAAATAAATATGTTTGCT-AAACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTTCA
* * *
17351 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAACTCATACA
127 AATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAACTCATAAA
* * * * ** * * *
17402 AGCTTATTTGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCT-AAAATTTTTAAGAGATTTAGAA
1 AGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAAACATTTAAAA
* * * * * * ** * *
17466 AATAATTTTATTTACTGAACTAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
65 AATAAATATGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGCTA-AGACGATATGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * **** *
17530 TCGCTATTACTTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTTGTTAATATAA
129 TTGTTATAAC-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAACTCATA-AA
* * * ** * *
17581 A-TTTGTTTGAAATAAAATTGTACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTT
1 AGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAAT-A--AA-ACATTT
* * * * * * * ** * * *
17644 ---AAGTAAATTTGCTTGCCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
61 AAAAAATAAATATGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTTC
** * * ** * * * * * **
17706 AAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCAGCAAACAATTGGTTCTATTTATACT
126 AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAACTCATAAA
** * * * * * *
17758 ATTTTATTCA-AAATAAAGTAATACTAATTTAATAATATT-TCGAAACTTAATAACCAAGAAAAT
1 AGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT-A--AA-ACATT
* ** ** * * * **
17821 TAAAAAATAAATCTAATTGCCCAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGGTTATCTATTT
60 TAAAAAATAAATATGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTT
** * * * * * *** ** *
17886 CAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCGTAAAAGAATTGTTT-TGTTTGTACA
125 CAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAACTCATAAA
* ** *
17938 AGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTAAAAATATTTTAAAAAT
1 AGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
17985 AAACTTGTTT
Statistics
Matches: 600, Mismatches: 135, Indels: 51
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
176 1 0.00
177 112 0.19
178 156 0.26
179 190 0.32
180 49 0.08
181 86 0.14
182 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
AGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAAACATTTAAAAA
ATAAATATGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTTCAAATT
GTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAACTCATAAA
Found at i:17645 original size:671 final size:671
Alignment explanation
Indices: 16382--17630 Score: 1623
Period size: 671 Copynumber: 1.9 Consensus size: 671
16372 TCTTATTTAG
* *
16382 AATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATC
* *
16447 TGTTTACTGACTTAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATAAACTTTAAATCGTTATAA
65 TGTTTACTAACTTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATAAACTTTAAATCGTTATAA
* * * * **
16512 CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACACC
130 CATTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAACACC
* *
16577 GATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAATTTCTTTGTCAAACCAGT
195 AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAATATCTTTGTCAAACCAGT
** * *
16642 TCAAATATTTAAGACTATAGAATAATTATCTACTTCAAATGATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
260 TCAAATAGCTAAGACGATAGAACAATTATCTACTTCAAATGATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
16707 AAATAAGTTTTTTTTAATTCATACTAGATTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTT
325 AAATAAG-TTGTTTCAACTCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTT
* *
16772 CAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACGTAACCAGTTCAAATAATTATG
389 CAAAAATT-AT-AGTAACAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACGTAACCAGTTCAAATAATTATA
* * * *
16837 ACTAATTGAATACCTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATTTTT
452 ACTAATTGAACAACTATCTATTTCAAATCACTATTAACTTTTGTTTTGTAATAAAATAAATTTTT
* * * *
16902 TTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
517 TTGTTAATATAAATTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAACATTTTAAAAATTAATAAG
*
16967 TGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACTAGTTCAAATAGTTATACCTATTTGAGCAATTATT
582 AGATTTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACTAGTTCAAATAGTTATACCTATTTGAGCAATTATT
17032 TATTTCAACTTGCCAGCTTTTTTGA
647 TATTTCAACTTGCCAGCTTTTTTGA
* * *
17057 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAA-T-TAA-TAAGACATTTAAAAAATAAATTT
1 AATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATCT
* ** *
17119 GTTTGCTAAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATA
66 GTTTACT-AACTTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATAAACTTT-AAATCGTTATA
* * * * * *
17182 AC-TCTTTTTTTCTATTATAAAA-ATTTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
129 ACAT-TTTGTTT-TATCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAAC
* * * * *
17245 ACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACT-A-AGATTTAAAAAATGAATATGTTTGTCAAA
192 ACCAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAA--AATATCTTTGTCAAA
* *
17308 CCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATTTATTTCAAATTG-TTATGACCTTTTGTTT
255 CCAGTTCAAATAGCTAAGACGATA-GAACAATTATCTACTTCAAA-TGATTATGACCTTTTGTTT
* * *
17372 TGTCATAAAATAA-TTGTTTCAACTCATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAATTAATTTATTA
318 TGTCATAAAATAAGTTGTTTCAACTCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAAAATGAATTTATTA
* * * * *
17436 ATATTTCTAAAATT-T-TTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTAC-TGAACTAGTTCAAATAA
383 ATATTTCAAAAATTATAGTAACAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACGT-AACCAGTTCAAATAA
* * *
17498 TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATT-ACTTTTTTGTTTTGTAATAAAAT-
447 TTATAACTAATTGAACAACTATCTATTTCAAATCACTATTAAC--TTTTGTTTTGTAATAAAATA
* ** *
17561 AATTGTTTTTGTTAATATAAATTTGTTTGAAATAAAATTGTACTAATTTATTAACA-TTTAGAAA
510 AATT-TTTTTGTTAATATAAATTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAACATTTTA-AAA
17625 ATTAAT
573 ATTAAT
17631 CAGTAAGAGA
Statistics
Matches: 495, Mismatches: 66, Indels: 34
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
665 3 0.01
666 81 0.16
667 70 0.14
668 1 0.00
669 11 0.02
670 61 0.12
671 174 0.35
672 59 0.12
673 2 0.00
674 1 0.00
675 32 0.06
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (671 bp):
AATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATCT
GTTTACTAACTTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATAAACTTTAAATCGTTATAAC
ATTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAACACCA
ATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAATATCTTTGTCAAACCAGTT
CAAATAGCTAAGACGATAGAACAATTATCTACTTCAAATGATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AATAAGTTGTTTCAACTCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCA
AAAATTATAGTAACAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACGTAACCAGTTCAAATAATTATAACTA
ATTGAACAACTATCTATTTCAAATCACTATTAACTTTTGTTTTGTAATAAAATAAATTTTTTTGT
TAATATAAATTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAACATTTTAAAAATTAATAAGAGAT
TTAAAAATTAAATCTATTTATTAAACTAGTTCAAATAGTTATACCTATTTGAGCAATTATTTATT
TCAACTTGCCAGCTTTTTTGA
Found at i:17706 original size:356 final size:354
Alignment explanation
Indices: 17046--17984 Score: 824
Period size: 356 Copynumber: 2.6 Consensus size: 354
17036 TCAACTTGCC
* *
17046 AGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGACATTTAAAAA
1 AGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGACATTTAAAAA
* * * * *
17111 ATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
66 ATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
17176 GTTATAACTCTTTTTTTCTATTATAAAAATTTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAA
131 GCTATAACTCTTTTTTTCTATAATAAAAAATTGTTTCTGTTAATAAAAGCTTATTCAGAATAAAA
* * *
17241 TAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGATTTAAAAAATGAATATGTTTGTCA
196 TAATACTAATTTAATAACATTCTAAAAATTAATAACTAAGATTTAAAAAAT--ATATGCTTGCCA
* ** * *
17306 AACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
259 AACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATT
17371 TTGTCATAAAATAATTGTTTCAACTCATACA
324 TTGTCATAAAATAATTGTTTCAACTCATACA
* * ** * *
17402 AGCTTATTTGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCTAA-AATTTTTAAGAGATTTAGAA
1 AGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AACAATTAATAAGACATTTAAAA
* *
17466 AATAATTTTATTTACTGAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
65 AATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
17531 CGCTATTACT-TTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTTGTTAATATAAA-TTTGTT-TGAAA
130 CGCTATAACTCTTTTT-TTCTATAATAAAA-AATTGTTTCTGTTAATA-AAAGCTTATTCAG-AA
** * * * *
17593 TAAAATTGTACTAATTTATTAACATT-TAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAGTAAAT-T-TG
191 TAAAATAATACTAATTTAATAACATTCTA-AAAATTAATAACT-A-AGATTTAA-AAAATATATG
* * * ** * * *
17655 CTTGCCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
252 CTTGCCAAACCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
** * * * * * *
17720 TTTTATTTTGTCAGCAAACAATTGGTTCTATTTATACT
317 TTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAACTCATACA
** ** * * * * * *
17758 ATTTTATTCAAAATAAAGTAATACTAATTTAATAATATTTCGAAACTTAA-TAACCAAGAAAATT
1 AGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC--AAC--AATTAA-TAAGACATTT
* * * ** * * **
17822 AAAAAATAAATCTAATTGCCCAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACGGTTATCTATTT
61 AAAAAATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * ** ** *
17886 CAAATCATTATGAC-CTTTTCTTT-TGTCGTAAAAGAATTGTTT-TGTTTGTACAAGCTTATTCA
125 CAAATCGCTATAACTCTTTT-TTTCTATAATAAAA-AATTGTTTCTGTTAATAAAAGCTTATTCA
* * *
17948 -AATTAAAATAATACTAATTTAAAAATATTTTAAAAAT
188 GAA-TAAAATAATACTAATTTAATAACATTCTAAAAAT
17985 AAACTTGTTT
Statistics
Matches: 463, Mismatches: 99, Indels: 40
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
355 5 0.01
356 246 0.53
357 62 0.13
358 40 0.09
359 28 0.06
360 81 0.17
361 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (354 bp):
AGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGACATTTAAAAA
ATAAATTTATTTACTAAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
GCTATAACTCTTTTTTTCTATAATAAAAAATTGTTTCTGTTAATAAAAGCTTATTCAGAATAAAA
TAATACTAATTTAATAACATTCTAAAAATTAATAACTAAGATTTAAAAAATATATGCTTGCCAAA
CCAGTTCAAATAGCTAAGACGATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTT
GTCATAAAATAATTGTTTCAACTCATACA
Found at i:18517 original size:178 final size:179
Alignment explanation
Indices: 18069--18525 Score: 440
Period size: 180 Copynumber: 2.5 Consensus size: 179
18059 TTATTGAGTC
* * * * * *
18069 AAAACAATTGTTTAAGCTCAAACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTG
1 AAAACAATTGTTTTAGATCATACAAGCTTA-TTAAAATAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * * *
18134 GAAAATTAATAAGAAAGTGATTAAAAAAATAAATATATTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATTA
64 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAGATTTACCGAATAAGTTAAAATAATTATGA
** * *
18199 TTATTTTAAGAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTAATTTGTCAT
129 CCACTTGAAGAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTAATTTGTCAT
* * * * *
18250 AAAACAATTGTTTCA-ATTAATACAAG-TTAGATACAATAAAATATTACTAATTTATTAATATTT
1 AAAACAATTGTTTTAGA-TCATACAAGCTTA-TTAAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * *
18313 CCTAAATTAATAA-TCAAGAAATTTAAAAAATAAATCGGTTTACCGAATTAGTTAAAATAATTAT
63 CAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATAGATTTACCGAATAAGTTAAAATAATTAT
* * * * *
18377 GGCCACTTGAATG-ATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTT-GTTT-TCAT
127 GACCACTTGAA-GAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTAATTTGTCAT
* * * *
18428 AAAACAATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAATAATACCAATTGATTAATATTTCA
1 AAAACAATTGTTTTAGATCATACAAGCTTATT-AAAATAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
18493 AAAATTAATAAGTAACAGATTTAAACAATAAAT
65 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
18526 TTATTTATCG
Statistics
Matches: 222, Mismatches: 46, Indels: 19
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
178 75 0.34
179 12 0.05
180 110 0.50
181 25 0.11
ACGTcount: A:0.45, C:0.09, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
AAAACAATTGTTTTAGATCATACAAGCTTATTAAAATAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAGATTTACCGAATAAGTTAAAATAATTATGACC
ACTTGAAGAATTATCTATTTAAAATTATTATAACCTTTTAATTTGTCAT
Found at i:18593 original size:126 final size:126
Alignment explanation
Indices: 18413--18653 Score: 276
Period size: 127 Copynumber: 1.9 Consensus size: 126
18403 AATTATTATG
* *
18413 ACCTTTTGTTTTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATAC-C
1 ACCTTTTGTTTTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTA
* * *
18476 AATTGATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAACAGATTT-AAACAATAAATTTATTTATCGA
65 AATTGATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTATTTATCGA
* * * ***
18537 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTTAT-ATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATC
1 ACCTTTTGTTT--TCATAAAACAATTGTTTT-TGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATC
* * *
18601 TAAATTTATTGACATTCAAAAAATTACTAAGTAAAAGATTTGAAAAAATAAAT
63 TAAATTGATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAAATAAAT
18654 CTGCTTACCG
Statistics
Matches: 96, Mismatches: 14, Indels: 10
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
124 11 0.11
126 37 0.39
127 38 0.40
128 10 0.10
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (126 bp):
ACCTTTTGTTTTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTAA
ATTGATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTATTTATCGA
Found at i:19003 original size:487 final size:481
Alignment explanation
Indices: 18090--19004 Score: 1063
Period size: 487 Copynumber: 1.9 Consensus size: 481
18080 TTAAGCTCAA
* *** *
18090 ACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGAAAGTGAT
1 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGAT
* * * * * * *
18155 TAAAAAAATAAATATATTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATTATTATTTTAAGAATTATCTATT
66 TAAAAAAATAAATATACTTACCGAATAAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
* * * *
18220 TAAAATTATTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGTTAGATACA
131 TAAAATTAGTATAACCTTTTAATTTGACATAAAACAATTATTCCAATTAATACAAGTTA-ATACA
* **
18285 ATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAATCAAGAAATTTAAAAAATAAATCG
195 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATCAAGAAATTTAAAAAATAAATCG
** * * ** * *
18350 GTTTACCGAATTAGTTAAAATAATTATGGCCACTTGAATGATTATTTATTTCAAATTATTATGAC
260 GTTTACCGAACAAATTAAAATAATTATGACCACTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGAC
*
18415 CTTTTGTTTTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAATAATACCAATT
325 CTTTTGTTTTCATAAAACAATTGTTTTAGATCATATAAGCTTATTCAAAATAAATAATACCAATT
*
18480 GATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAACAATAAATTTATTTATCGAACCTTTTG
390 GATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT---AGATTTAAACAATAAATTTATTTATCGAACCTTTTG
18545 TTTAGTCATAAAATATTTGTTTTATATCTT
452 TTTAGTCATAAAATATTTGTTTTATATCTT
* * *
18575 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTGACATTCAAAAAATTACTAAGTAAA-AG
1 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AAAGAG
* * * * *
18638 ATTTGAAAAAATAAATCTGCTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTT
64 A-TTAAAAAAATAAATATACTTACCGAATAAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCT
* * ** * *
18703 ATTTAAAATTGGTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTATTCCAGTTCATTA-AAGCTT-A
128 ATTTAAAATTAGTATAACCTTTTAATTTGACATAAAACAATTATTCCAATT-AATACAAG-TTAA
* * *
18766 TCCAAATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAG-AGTTTAAAAAA
191 TAC-AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TCAAGAAATTT-AAAAA
** * * * * *
18829 ATAAATTTGTTTAGCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATT
252 ATAAATCGGTTTACCGAACAAATTAAAATAATTATGACCACTTGAACAATTATCTATTTAAAATT
* * * * *
18894 GTTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAGGCTTACTT-GAAATAA
317 ATTATGACC-TTTT-GTTT-TCATAAAACAATTGTTTTAGATCATATAAGCTTA-TTCAAAATAA
* * *
18958 AGTAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-GATTTAAA
378 A-TAATACCAATTGATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGATTTAAA
19005 AAGTGAATCT
Statistics
Matches: 355, Mismatches: 61, Indels: 26
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
484 2 0.01
485 52 0.15
486 105 0.30
487 115 0.32
488 5 0.01
489 3 0.01
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24802 AAATAGTTATGA-TCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGCTATGATC-TTTGTTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
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65 AAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
* * * *
24929 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATC-ATTTC
129 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTC
* * * * * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
25047 AATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAA
66 AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* * * *
25111 AAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGCTT-
130 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAG-TTC
* * * * ** *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
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66 AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* * *
25292 AAAATTAATAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAATC-GGTTC
130 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAA-CAAGTTC
* * * * ** * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * ** *
25408 AAACAATTATTT-TCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
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* *
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*
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* * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* *
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AATAAATGTGTTTTGCCGATCTAG
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* ** * *
25344 AAATAATTATGGCCATTTGAACAGTTATAAATTAT-AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATCATA
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*
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* * ** *
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*** *
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GAATTAGTAAGAGATCTAAAAAT
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1 TAA
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TAAAATAATTA
Found at i:25974 original size:192 final size:181
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25486 ATCTAAAAAT
* * * **
25496 AAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATGTATTTCAAATTGTTATAACCA-TTTGTTTTGTCATA
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*
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* ** * *
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129 AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * * * *
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** * * *
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* * *
25808 AATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATACTATTTACCAAATCGGTTAAAATAATTATA
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* * * * *
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* * *
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* *
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130 -AAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAA
** * * * * * * * *
26100 AACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTTGGAACAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTTAA
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* * * * * * * * ** * *
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* * * ** *
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1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTAT-AACATTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
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*** ** * * *
26341 TC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-ATTGTTTATC---T-AACCAGTTT
127 TCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * ** * * *
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1 AAATAG-TT-ATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTTGTC
* * ** * * * * * * * *
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62 ATAAAA-CAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *** * * *
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126 TTC-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAA-AAAATAAAATCCATCGGT-TAAAACAATTA
* * *** * * *
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** * ***
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65 AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
*** *** ** ** *
26691 ---ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTTTTTATCGAATTAGTT-
130 AAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * * * * * *** *
26739 AAATAATTATGGCAATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCA-TTTGTTTTGTTATA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA-CATTTTGTTTTGTCATA
* * *
26803 AAACAATT-TTTTTTTATCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
65 AAACAATTATTTTTGT-TCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
*** ** * * * *
26866 CAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAAT-AAATGTGTTTGTCAAACCAGTTT
128 CAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
** * * * * ** * * * *
26916 AAATAGTTAAAATTA-TAAGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTCTAGC--CTAGTTTTAGTCAT
1 AAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTT-GTCAT
* ** * * * * *
26978 AAAA-TATT-TGTTTCATATCATACAAGCTTATTTAGAACAAAATAATCCTAATATATTAACATT
64 AAAACAATTAT-TTTTGT-TCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
27041 TGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAAT-AAAT---TTGTTTACCAAATAAGCTC
127 TCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAAATCCATCGGTTA--AAACAA-TTA
* * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTTGTCAT
* ** ** * * ** * * *
27159 AAAATAATTGCTTCAGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTC
64 AAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *** ** * *
27224 AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGT-TTTCTGAATA-AATTC
129 AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATA-AAATCCATCGGT-T-AAAACAATTA
* * * * * * * *
27279 AAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGATATTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAA
* *** * * *
27344 AACAATTGTTTCAATTCATTA-AAGTTAATTT-GAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATTTC
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* * * * * *
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129 AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTA--A-AACAATTA
* * * * * **
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1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTTGTCATA
* ** * ** * *
27523 AAACAATTGTTTTTCATCATAAAAGCCTGTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
65 AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * *
27588 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTAT---TT------ATTG
130 AAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * * * * * * *
27631 AAGTAGTTCT---TATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTATTC-T-
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTT-GTCATA
* * ** * *
27691 GAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTAT
65 AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T
* * *** ** ** * *
27755 -GAAAATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTGTCGAAGCAATTT
128 CAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * *** * **
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* * * * * * * *
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65 AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * **** * * * *
27937 AAAAA-T--TAATAAGTGATTTAAAAAGT-GAATCTATTTACTGAATCATTTC
129 AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * * * * * * * * *
27986 AAATAATTATGGCCATTTCAACATTTATCTATTTCAAACCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATAT
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * * *
28051 AACAAGTGTTTTTGATCATTCAAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATTTATTAATCTTCCAA
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** * * *
28116 AAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAAT-AAATCTGTTC-ATT-AAACTAGTTC
131 AAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATC-CATCGGTTAAAAC-AATTA
* * * * * **
28166 AAATAATTATGACTATTTGAACGATTATATACTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
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66 AACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-
* ** ** ** * *
28294 AAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAAT-AAATTTATTTGACAAAACAGTTC
129 AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
* * * * * * * *
28346 AAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATA
* ** * * * *
28410 AAAGAA--ATTTTCAATTCATACTAGCTAATTT-GAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT
65 AAACAATTATTTT-TGTTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* *
28471 GCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAA
127 TCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAA
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AACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
AAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAAATCCATCGGTTAAAACAATTA
Found at i:26345 original size:17 final size:16
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26297 GTACAAGCTT
26307 ATTCAAATTAA-AATA
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*
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*
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26354 GTAAGAGATT
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Matches are distributed among these distances:
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ATTCAAATTAATAATA
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Indices: 26524--26862 Score: 393
Period size: 165 Copynumber: 2.0 Consensus size: 166
26514 CATTCAAAAA
* * *
26524 ATTAAGAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAGTTATAACTA
1 ATTAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAATTATAACAA
* * *
26589 TTTAAACAATTGTCTATTTAGAATTGCTATGACCTTTTGTTTT-TTCATAAAACAATTATTTCAG
66 TTTAAACAATTATCTATTTAGAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTT-ATAAAACAATT-TTT-AG
* *
26653 TTA-ATACAAGTTTATACGGAATAAAATAAT-CAAAATTT
128 TTACATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATAC-AAATTT
* * * ** **
26691 ATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTTTTTATCGAATTAGTT-AAATAATTATGGCAA
1 ATTAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAATTATAACAA
* * **
26754 TTTGAATAATTATCTATTTTA-AATTGCTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTT
66 TTTAAACAATTATCTA-TTTAGAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTAGTT
* *
26818 ATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
130 A-CATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATACAAATTT
26856 ATTAATA
1 ATTAATA
26863 TTTCAAAAAT
Statistics
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163 3 0.02
164 3 0.02
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166 30 0.21
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Consensus pattern (166 bp):
ATTAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAATTATAACAA
TTTAAACAATTATCTATTTAGAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTAGTTA
CATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATACAAATTT
Found at i:27001 original size:176 final size:180
Alignment explanation
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Period size: 176 Copynumber: 1.8 Consensus size: 180
26747 ATGGCAATTT
* * **
26757 GAATAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTTATCA
1 GAATAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCA-TAGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCATATCA
* * *
26822 TACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-A-GAGA
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26883 TTT-AAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAGTTTAAATAGTTAAAATTATAA
129 TTTGAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAGTTTAAATAGTTAAAATTATAA
* * * *
26934 GAATAATTATCTATTTTAAATTGTTCTAGCC-TAGTTTTAGTCATAAAA-TATTTGTTTCATATC
1 GAATAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCATAGTTTT-GTCATAAAACAATTT-TTTCATATC
* * *
26997 ATACAAGCTTATTTAGAACAAAATAATCCTAATATATTAACATTTGAAAAATTAATAAGCATGAG
64 ATACAAGCTTATTGAGAACAAAATAATACTAATATATTAACATTTCAAAAATTAATAA-CATGAG
*
27062 ATTTGAAAAAATAAATTTGTTT
128 ATTTGAAAAAATAAATGTGTTT
27084 ACCAAATAAG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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179 1 0.01
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181 16 0.13
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GAATAATTATCTATTTTAAATTGCTATAACCATAGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCATATCAT
ACAAGCTTATTGAGAACAAAATAATACTAATATATTAACATTTCAAAAATTAATAACATGAGATT
TGAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAGTTTAAATAGTTAAAATTATAA
Found at i:27576 original size:180 final size:181
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 19.5 Consensus size: 181
26681 ATCAAAATTT
* * * * * *
26691 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATCGAATTAGTT-AAATAATTATGGCAAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * *** * * * *
26755 TTGAATAATTATCTATTTTAAATTGCTAT-AACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTTA
65 TTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA
*
26819 -TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
129 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * ** *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAATCAATTCAAATAATTATGACTAT
*** * * ** * * * * * *
26932 AAGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTCT-AGC-CTAGTTTTAGTCATAAAA-TATT-TGTTTCA
65 TTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTCA
* * * * *
26993 TATCATACAAGCTTATTT-AGAACAAAATAATCCTAATATATTAACATTTGAAAA
129 T-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
27047 ATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAT-AAGCTCAAGTAGTTATGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAATTATGACT
* * * * * * * *
27111 ATTTGAA-AGATTA-ATATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG--CTT
63 ATTTCAACA-ATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
* * *** * *
27172 CAGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTCAAAA
127 CA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
27228 ATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGTTTTCTGAATAAATTCAAATAGTTGTGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTAC-GAATCAATTCAAATAATTATGACT
* * * * *
27293 ATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGATA-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTG--TTT
63 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-ACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
* *
27355 CAATTCATTA-AAG-TTAATTTGAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATTTCAAAA
127 C-ATTCA-TACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
27411 ATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCCGTTTACCATATCAATTCAAATAATTATGGCTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGA-ATCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * *
27476 TTCAACAATTACCTATTTTAAATCATTATGAACATTT-TTTCATCATAAAACAATTGTTTTTCA-
65 TTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCAT
* * * *
27539 TCATAAAAGCCTGTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
130 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
27591 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-----T--ATTGAAGTAGTTCT---TATT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAATCAATTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * * * * ***
27645 TGAATAATTACCTATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTATTTTATTC-T-GAATAATT-ATTTCAG
66 TCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-ATTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTCA
* *
27706 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTAT-GAAA
129 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA
* * * * * * * *
27759 ATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTGTCGAAGCAATTTAAATAGTTAAGAC-A
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTT-ACGAATCAATTCAAATAATTATGACTA
* * * ** * *
27823 ATACGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TCTT
64 TTTC-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACA-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
* * * *
27886 -AGTTCATAGAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAACATTCCAAAA
127 CA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
27941 ATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATCATTTCAAATAATTATGGCCAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAATCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * ** * * *
28002 TTCAACATTTATCTATTTCAAACCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAGTGTTTTTGA-
65 TTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCAT
* * * *
28066 TCATTCAAGCTTATTT-AGAATACAATAATACTAATTTATTAATCTTCCAAAA
130 TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * *
28118 ATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATAAATCTGTTCATTAAACTAGTTCAAATAATTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAATC-AATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * ** * * *
28182 TTGAACGATTATATACTTCAAATTGTTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-A
65 TTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACA-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA
* * * *
28245 TTCATACAAGCTTATTTGGAATTAAATAATA-TAAATATAATAATA-TTCTAAAA
129 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAATCAATTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * * *
28362 ATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAAGAA---ATTTTCA
65 TTCAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTC-
* * * *
28423 ATTCATACTAGCTAATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTGCAAAA
128 ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * * *
28477 ATTAATAAGTAAGATATTTAAAAATATATTTCTGTTTACCTAACCAATTC-AACAATTAT--CTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTA-CGAATCAATTCAAATAATTATGACTA
* * *
28539 TTTC-A-AATCAT-TA--T--AA-C---AT-----TTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT--
64 TTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA
* * *
28586 GT--T-----C--A--T--AATAAAGTAATACT--TCTATTAATATTTCAAAA
129 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
28624 ATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAAC-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAATC-AATTCAAATAATTATGACTA
* * ** * * * * * *
28684 TTT-GACAAATTATTTATTTCAAATTGTTTTG-AC-TTTTTTTCCTGTTATAAAACATTTGTTTC
64 TTTCAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTT--TATCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
28746 T-GTTCATACATGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACA
126 TCATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * ** * *
28801 ATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CTAGA-TCAAATGGTCATGATT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAATC-A-ATTCAAATAATTATGACT
* * * * * * * *
28863 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAA-GATT-TGTTT
63 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
28925 CGGTTCATATAAG-TTTTTTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAA
127 C-ATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
28981 ATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-GAATCTATTTATCAAAT-AAGTTTAAATGATTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAATTATGACTA
* * * ** *
29044 TTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGCTAT-AACATTTTGTTTTGA-CAT-AAATAA-T-TTTTT
64 TTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACA-TTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTT
* * *
29104 CTGTTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACAAAATTATTAATA-TT-AAGATA
127 C-ATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-A
* * * * *
29160 ATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAATTATGACTA
* * * ** * *
29223 TTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATG-ACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-
64 TTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-ATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTC
* * * * ** *
29286 GTTCATACAAGGTTATTT-AGATTAAAATAATACTAA-TTATTCATATTTTGACA
128 ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
29339 ATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAATTGAAATAATCATGATT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CGAATC-AATTCAAATAATTATGACT
* * * * * * * * *
29403 ATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA-CG-GTTTC
63 ATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTC
* * * * **
29466 AATTCAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTACTTAA
128 -ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * **
29521 ATTAATGAGTAATAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAT-AAGCTCAAATAGCTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAATCAA-TTCAAATAATTATGACTA
* * * * * * * * *
29585 TCTAAACAGTTATCTATTTTAAAACATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTT-G
64 TTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA
* * * *
29649 TTCATGCAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTACAAAA
129 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * **
29702 ATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTC-TA-CACATTCAAATAATTATTTCTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAATCA-ATTCAAATAATTATGACTAT
* * ** * * * * *
29764 TTGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCGTAAACCAATTGTTTTT-GT
65 TTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCAT
* ** * * *
29828 TCATAAAAGCTTATTTGCTACAAAATAACACTAATTTATTAAAAATTT-AAAA
130 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTCAAAA
* * * * * * ** ** *
29880 ATTAATAACTAAAATATTTTAAAAAATAAAATATGTTTATTG-AGCGGGTTTGAATAGTTATGAC
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AAATCTGTTTA-CGAATC-AATTCAAATAATTATGAC
* * * ** * * * * * *
29944 TATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTCTTCTTATAAAACAATTGTTTCT
62 TATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
* ** * * * *
30009 -ACTCATACAAATTTATTCGAACTAGAATAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
127 CATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * * * *
30063 ATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAT-AAGTTCAAATAGTTAAGTCTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAATCAA-TTCAAATAATTATGACTA
* *
30127 -TTCGAACTATTAACTATTTCAAATCATTAT
64 TTTC-AACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
30157 TTTATTTTGT
Statistics
Matches: 2550, Mismatches: 536, Indels: 399
0.73 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
141 3 0.00
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145 7 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGAATCAATTCAAATAATTATGACTATT
TCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCATT
CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
Found at i:32446 original size:16 final size:16
Alignment explanation
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32415 ATAGTCATAA
32425 CTATTTGAATAATTAT
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*
32441 CTATTT-CA-AATCTCAT
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1 --CTATTTGAATAATTAT
32475 CTATTT
1 CTATTT
32481 CAAATTGCTA
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 2, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
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CTATTTGAATAATTAT
Found at i:32459 original size:34 final size:35
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32400 AATGAACAAG
*
32410 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAT
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Statistics
Matches: 40, Mismatches: 1, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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TTCAAATACTCATAACTATTTGAATAATTATCTAT
Found at i:32747 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 32458--42929 Score: 5867
Period size: 181 Copynumber: 58.1 Consensus size: 180
32448 AAATCTCATA
*** * * ** *
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* * * * * *
32523 TAGCTCACATAGGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGA
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* * * * ** *
32587 GTAAGATATTTAAAATATGAATGTGTTTACCGGACAAGTTCAAATGGTTATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
32639 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-CATTATAACCTTTTGTTGTGTTATCAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
32703 ATGTTCATATAAGCTTATTTTGAATACAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
32767 GCAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACATA-TTCAAATAGTTATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATG
* * *
32818 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
32882 TCTATTCATACAAG-TGTATTT-GAAATAAAATAATAATATTTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
65 T-TGTTCATACAAGCT-TATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * *
32945 AAGTAA-AAATTTTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCATATCA-TTATG
127 AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATG
* * * ** *
32999 ACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAAT-AGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * ** * **
33062 TCTATTCATACAAGTTTAGTTAGATTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGAAAATCAATGG
65 T-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** *
33127 GTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTTTTTACTGAACAAGTT-TAA-A--TA-G
129 GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** *
33175 ---ATTTGACT-ATTATCTATTT-AAAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
33235 TTAGTTCATA-AAACTTATCT-GAAATAAAATAATAATAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATA
65 TT-GTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * *
33298 AGCAAGAGATTTTAAAACTAAAGT-TGTTTTCCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
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1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TG-T
* * * * *
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64 TTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * *
33475 A-TAAGAGATTTAAAAAACT-AATGTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* *** * * * * *
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1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * *
33592 CAATTCATACAAGCTTATATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAA
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * * *
33656 GCACGAGATTTGAAAATATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATG
129 GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * * *
33709 AATATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATT-TGACCATTTGTTTTATCATAAAATAGTTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * *
33773 TAGTTCATAAAATCATATCCA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG
66 T-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *
33837 TAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAATCAA-TTCAAATAATTATG
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
33888 GCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAAAAACTG
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC---ATAAAACAATTG
*** * * * *
33953 TTTTCAACATACAAGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTTCAAGAA-T--TA
63 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* *
34015 A-TAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAATCAA-TTCAAATAGTTATG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** * * *
34067 ACTATATGAATAATTACCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
34132 CTATCCATACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTGAAAATTAATAA
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * * * * * * **
34196 CTACA-ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTTAAACAGTTAAA
129 GTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * ** *
34248 ACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
34313 TAGCTCATACAAGATTATTCAAAATAGAATAAAACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATT--T-A-
66 T-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** ** * *
34373 TAAG-GATTTAGAAAATAATTTTGTTTACTAAATTAGTTTGAATAATTATA
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * *
34423 ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTAT-TGCTTTATGTTTTGTCATAAAATAATTTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA-TTGT
* * * * * *
34487 TTTGTTAATATAAGTTTA-TTCGAAAGAAAATAACACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAAT
64 TTTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT
* * * * * * * * *
34550 CAGTAAGAGAATTAAAAAGTAAATTTGCTTATCAAACCATTTCAAATAGTTTTG
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** *
34604 TCTATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCATTATAAAATTTTAG-TTTGTCATCAAACAATTGGT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATT-GT
* * * * * * * ** *
34668 TCTATTCATACTAGTTTATTTAGAATAAAATAACATTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAA
64 TTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** ** * *
34733 -TCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAAG
129 GT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
** * * ** * *
34785 ACTACATGAATGATTATCTATGTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
34850 TATTCATACAAGCTTA-TTAGGATTTAAATAATACTAATTCGA-TAATGTTTTAAAAATTAATAA
66 TGTTCATACAAGCTTATTTA-GAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
34913 GT-A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATGGTTAAG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
34963 ACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTATCACATTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
35028 CAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATCCTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATTA
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-TA
** * * * *
35092 CAAAAAGAGATTCAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATT
128 -AGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * *
35147 ACTATTT-AAGTAATTGTCTATTT-AAATTCTTTATAACCAGTATTTGAGTAATTGTCTATTTAA
1 ACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACC--T-TTT--GT-TTTGTC-A--TAA
* * * * * * *
35210 AATC-ATTATAATCACTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAGCACAAATTTAA-ACAAA
55 AA-CAATTGT--T---TTG---T-TCAT---ACAA--GCTT-ATTTAGAATAAA-ATAATAC-TA
** * * * *
35273 ATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTTGAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTT
102 ATTTATTAATA------T-TTCA-A------AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** ** *
35338 GTTTACCGAATTAGTAAAAATAATTATG
153 GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
35366 GCCATTCGAA-AGATTATCTATTTGAAATCGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAATA-ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
35430 TT-TAATCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT
65 TTGT--TCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * **
35493 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATGGTTACA
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * * * *
35547 ACTATTTGAACAATTTTCAATCTC-AATTGTTA-AGATC-TTTGTTTTATAATTAAACAATTGTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T
* * * * * *
35609 TTTGATCATAAAAGCTTATTCA-ATTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAA--ATTA
64 TTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * *** * * **
35670 A-TAAGAGATTTAAAAATTAAATGTGCTTGCGGCACCAGTTCAAATAATTAAA
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * * ** ** * * * * *
35722 ACCATTAGAATAATTATCTATTACAGATTGTTTTGATATTTTGTTAAGTTAAAAAATATTTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * * * * * ** *
35787 CATATCTTATAAGCTTA-TTCGAAATAACATAATCCAAATTTATTAACATTTGGAAAATTAAAAA
66 TGT-TCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** * *
35851 GAAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATA
129 GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * ** * *
35904 ATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTCCTTTTGACATATAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * ** * * * *
35969 CAATTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATAATAATTTCTTAATATTTTAAAAATTAATAAG
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *
36034 TAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTATTTA-CAGAACAAATTCAAATAGTTATG
130 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
36085 ACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
** * * * * *
36150 CAGTTCCTATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAGTAATAA
65 TTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * ** * *
36213 GT----TATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATC
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
36261 ACCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGTTACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
36326 TATATCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTCTTCATCTTTCAAAAATTAATAA
66 TGT-TCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * *
36391 GTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
36442 ACTATTTGAAGAATTGTATACTTCAAATCAAATTTTTACAAAATAAACCTTTTGTTCTATTATAA
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC--A---TT-----AT-AACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
36507 AATAATTATTTATGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTT-AA
55 AACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * ** * * * * *
36571 AAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTTAATTTGTTAAG
119 AAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** * * * *
36634 ACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT-TTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
36698 TCGATTCATACTAGCTTATTT-GAAATAAAATAA-AATAAAATTATTAATATTACAAAAA-T--T
66 T-G-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
36758 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTACCTAACTAGTTCTAATAATTATG
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
36811 ACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAAT-GTTATAACTTTTTTGTTTTGTCAT-AAA-ATTTGT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-
* * * * * * *
36873 TTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATACAAATCTATTAATATTACAAAAA-T--TC
63 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * *
36935 A-TAAGAGATTTTAAAAATAAATCTTTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATA
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
** * * * * *** * *
36987 ACTATTTGAGCAATTAAT-TATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTCCATTATAAAACAATAGTT
1 ACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * ** *
37051 TCTATTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAA
65 T-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
37116 TTAAAAAATTTAAAACATAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
37168 ACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAGAA-AATTATT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGTT
* * * * * * * * *
37231 TCAGTTCATATAAGGTTATTCAAAATAAAATAATAGTAAGTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAA
65 T-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * ** * *
37296 TTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** ***
37348 ACTATTTAAATAATTATCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATT-TC
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGT-
* * * * * * * *
37411 ATCTATTTATACAAGCCTATTTCAG-ATAAAATAATTCAAATTTATTACTA--ACAAGATAATTA
64 -TTTGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTA
* * *
37473 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCACAA-AAGTTCAAATCGTTATG
125 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
37529 ACTATTTG----A--A-C-A--ACGAATTATTATAACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
37584 ATGTTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAGTAA
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * *
37648 GCAAAAGATTTAAAACATAAATATGTTTACCAAACAATTTCAAATACTCATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * *
37700 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTG-CAATAAAATAATTGTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTT
** * * * *
37764 GCGGTTAACATAAGCTTATTT-GAAGTAAAACAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAAT
65 -TTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* ** * * *
37827 GAGTAAGAGAACTAGAAAAATGAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAGAGTTATG
127 AAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
37882 ACTATCTGAACAATTATATATTTAAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAATAATTGGT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GT
* * * *
37946 TTTGTTCATCCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTAATTAATATTCCAAAAGTT-ATA
64 TTTGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * ** *
38008 AGCGAA-A-ATTTGAAAAATGAATTTTTTTATTAAACATGTTCAAATAGTTATG
128 AG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
38060 ACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
38125 CTATTCATGCAAGCTTATTTGGAA-AAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAA
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * * *
38188 GCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
38240 ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
38305 CTATTCATAAAAG-TATATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATA
66 -TGTTCATACAAGCT-TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
* * * **
38368 AGTTAGAGATTTAAAGAATAAAT-TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCCTG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** ** * * * *
38420 TCTATTTGACCAAACATCTATTTCGAA-CTATTATGA-CATTT-TTTTATCATAAAATAAGGCCA
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT--AA-AA---CA
* ** * *
38482 ATTATTCAAAATAATTGGCATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTACTA
59 ATT-GT-----T--TT-G--TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *** * * *
38547 TTTCAAAAA-T--TAA-TAAG-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAATG
113 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
*
38607 AAG
178 ATG
** * * * * * *
38610 -CTTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGAA-CTTTTATTTAGTCATAAAATAATTAT
1 AC-TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
38673 TTTAATGT-ATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAA
64 TTT-GT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAA
* * * *
38736 TAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATG
126 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * **
38790 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTTATTTTTATTGTAAAACAATTGT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * ** * * * ** *
38855 TTCAATACATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAATTTTGATA
64 TT-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * *
38919 AGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATCAA-TTCAAATAATTTTG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
38972 GCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAATGATTATGAA-TTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * * * *
39036 TT-TCATCATACAAGCCTATTCGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAGAAATTAATA
65 TTGT--TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* ** ** * *
39100 AGTAGGAGATGCAAAAAATTGATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * * *
39153 ACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTATATCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT
* * * * * * *
39218 TTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAATTTAATAA
65 TTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * ** *
39282 CTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTAAG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * ** * * * *
39334 ACTATATGAACAATTCTTTATTTTAAATCGTTAGGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTTTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * **
39399 TAGTT-TTAGTAA-CTTATTTAGCGTAAAA-AA-A--AA-TTATTAATATTTCAAAAA-T--T-A
66 T-GTTCATA-CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
39453 GTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGCCGAATCAA-TTCAAATAATTATG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
39505 A-TATTTGAACAATTATCTATTTCGAAGTCATTATTACCTTTTG-TTTGTCAAAAAACAAATGCT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--
** * * * * *
39568 TTTTGTTCATGTAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGGAAAAATTAA
63 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTT-CAAAAATTAA
* * * * * *
39633 GAAGTTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TGTTTACTAAACCAGTTGAATTAGTTATA
126 TAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
** * * * *
39687 ACTATTTGAACCATTAT-T-TTACATGTTAATCATGAGTGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAAGAA
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCA----AATCATTA-TAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * * * *
39749 TTGTTTCTATTCATGACATCCTTATTTCGGATAAAGTAATGCTAATTTATTAACCAGTTCTAAAA
60 TTGTTT-TGTTCAT-ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TA-TT-TCAAA
* * * * *** * * *
39814 AATTAAAAATGTAACGAAATTTCAAAAATGAAATTTG-TTAGCTTGACGAGTGCAAATA-TTATA
120 AATTAATAA-GTAA-GAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * *
39877 ACTGTTTGAAACAATT-TCTATTTTCAAAATTGTTATGACGCATTTTTTTATTG-C--AAAACAA
1 ACTATTTG-AATAATTATCTA-TTTC-AAATCATTATAAC-C-TTTTGTT-TTGTCATAAAACAA
* * * * * *
39938 TTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAAAT
60 TTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * **
40002 TAATAAGTAAGAGCTTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
123 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * *** * * *
40060 ATTGTTTGAGCAATTATCTATATCAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTT
* * * *
40125 TTATTCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATACAAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATG
65 TTGTTCATACAAGCTTA-TTTAGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* **
40188 AGTAA-A-AATTAAAAAA-AAAGT-T-TTT--TGAACACA-TTCAAATAGTT-TG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATG
* * * *
40234 ACTATTTG-ATCAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCAGAAACCAATTTG
1 ACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTG
* * * * * *
40297 TTTCTGTTCATACGAGCCTATTT-GAAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGA
63 TTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * *
40361 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCAACTTTAAATAGTTATG
126 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
40416 ATTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTAT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGT
* * ** *
40480 TTCTATTCATACAAGTTTATTGGGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAT
64 TT-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * *
40544 AAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATG
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
40598 TCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * ** * *
40663 CTATTTGTGCAAAATTATTTAGAAT-AAATAATACTAATCTATTAATATTT-TAAAA-T--TAA-
66 -TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
40722 TACGAGATTTAAAAACT-AATATGTTTGTA-GAAACAA-TTCAAATAGTTATG
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * * * *
40772 ATTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATAATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAATAGTTTGTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTT
* * * * * * *
40836 TCTTTTTATACAAGTTTCATTCA-ATTAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA
65 T-TGTTCATACAAGCTT-ATTTAGA--ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * *
40900 T-A--AA-AGATTTAAAAAAATAAATGTATTTATCGAACCA-TTCAAATAGTTCA-G
126 TAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATG
* ** * ** * * * * * *
40951 ACTATTAG-AGCATTATTTATTTCAAATTGTTCCTGCACCCTTTGTTTAGTCATAAAATAATTAT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-AT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
41015 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCA-AACAAAATAATAGC-AATTTATTAACATTT-GAAAA-TAA
64 TTT--GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * ** *
41076 TGAGTAAGAGA-TTAAAAAA-AAA--TGTTTATCAAACAAGTTGTAATAGAT-TG
126 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * *
41126 ACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAGTTATTACGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACATTTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *** * * * * *
41190 TGGTTCA-AAAAACTTA-ACCGAAATCAAAATAATACTAACTTCACTAATATTTTAAAACTTAGT
66 T-GTTCATACAAGCTTATTTAG-AAT-AAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * *
41253 AAGCAAGAGATTTAAAAACT-AATCTGTTTTTCGC-ACCAAATTCAAATA-TTATG
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
41306 AACTATTTGAACAAATATCAATCTTAAAAT-AGTTATGATC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTG
1 -ACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * *
41368 TTTCTAATCATAC-AG-GT-TTTAG-ATAAAAATAATATTAAATTTAATAATATTCTAAAAAATT
63 TTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TCAAAAATT
* ** * * * *
41429 AATAAG--A-AGATTTAAAAAAT--ATATGTTTGTCGAGCCAGTTCAAATAGTTAAG
124 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
41481 ACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTGGTTTAGTCATATAATAATTGCTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TT
** * * * * * *
41546 CAGTTTATACAGGCTTAATCAGAAT-AAATAATATTAAAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAAT
65 TTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT--AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * * * *
41609 AAGCAAAAGATTTGAAAAATTAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATG
127 AAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
41664 ACTATTTGAACAATGATCTATTTAAAATCGTTAT-ACCTTTTTATTTTGGTCATAAAAACCATTG
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTTGTTTT-GTCAT-AAAACAATTG
* ** * * * *
41728 TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAATAACACTATTTTATTAATATTTC-AAAAGT--T
63 TTTT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
** *
41789 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-CAAA-ATAGTTCAAATAATTATG
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATG
* * * ** * ** * * * ** *
41841 GCCATTTGAACAGCTACCTATTTCAAATCATTATTGCTTTTTATTTTGTCTTAAAA-TTTTTTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * **
41905 TAAAT-ATACAATCTTATTT-GAATAAAATAAAACTAATTTATT-ATA-TTCACTAA-T--TAA-
66 T-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
41962 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTTAAATAGTTATG
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * * * * *
42013 AGTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTATTGTTCTATCATAAAATAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *
42078 CTATTTATAC-AGACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCATAAAATTAATA
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* ** * *
42141 AGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCCAATTAGTTCAAACAGTTAAG
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * * * * *
42193 ACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGCTTTATTATAAAATAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * * * * *
42258 TAGCTCATATAACCTTATACCAAAAAAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAA
66 T-GTTCATACAAGCTTAT-TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
42323 G---G-GATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAAA-TAGTTCAAATAATTATGG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-G
* * * * * * *
42372 GC-ATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
*** * * * * * * *
42436 TCCAACATTCAAGCCTATTCAAAATAAAATAAAACTAAGTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-
66 T-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *
42497 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTTTG
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * *
42548 ACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT
* * * * * * *
42613 TTATTCCTACAGGCGT-TTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAGTA-TTCTAAAAATTAATA
65 TTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
* * * * *
42676 ACTAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTTCCAAACTAGTTCAAA-AGTTAAG
128 AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * * * *
42729 ACTATATGTACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
42794 CAGCTT-ATACAAGCTTA-TTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT-TGTTC-AAAATT--T
66 -TG-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAAT
* * * * * ** * *
42853 -TGTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTACTGAACCAGTTTAAAT-GATTATG
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATG
* *
42906 ACTATTTGAACAATTATCAATTTC
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTC
Statistics
Matches: 7970, Mismatches: 1793, Indels: 1060
0.74 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
170 37 0.00
171 245 0.03
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173 153 0.02
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AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
Found at i:34109 original size:540 final size:536
Alignment explanation
Indices: 32458--42922 Score: 5668
Period size: 540 Copynumber: 19.4 Consensus size: 536
32448 AAATCTCATA
* * * ** * * *
32458 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATGATCTTTTGTTTCATCATAAAACAACTGTAT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
32523 -TAGCTCACATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATG
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* * * * *** * *
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128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
32651 ATTATCTATTTCAAA-CATTATAACCTTTTGTTGTGTTATCAAATAATTG-TTTATGTTCATATA
193 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATAAA
*** * * *
32714 AGCTTATTTTGAATACAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTT
257 AGCTTA-TCCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * *
32777 AAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
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* * *
32842 AAAT-AGTTATAAACTTTTGTTTTGTC-ATAAACCAATTG-TTTCTATTCATACAAG-TGTATTT
384 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACAAGCT-TATTT
* * * * *
32903 GAAATAAAATAATAATATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTTAAAAATAAA
446 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAATAAA
* * *
32968 TCTGTTTACCGAGCAAGTTCATATCA-TTATG
507 TCTGTTTACCAAACAA-TTCAAAT-AGTTATG
* * * * ** * *
32999 ACTATTTGAACAATTAT-TTTTTCAAATAGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * * **
33063 CTATTCATACAAGTTTAGTT-AGATTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGAAAATCAATGG
66 CTATTCATACAAGCTTA-TTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* * * * *
33127 GTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTTTTTACTGAACAAGTTTAAATAGATT-TGACTA-TT-ATC
129 GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAAC
* * * *
33189 ---TATTTA----AAGTTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
192 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
* * * * * *
33247 A-CTTATCTGAAATAAAATAATAATAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTT
257 AGCTTATC-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * * *
33311 AAAACTAAAGTT-GTTTTCCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAAATATCAATCTC
321 AAAAATAAA-TTAGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
33375 AAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTC-ATAAAAC-ATCTGTTTTTGA-TCATATAAGCTTATTCG
384 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAAT-TG-TTTTCATTCATACAAGCTTATTTG
* * *
33436 -GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAACT-AATGT
447 AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCT
* * *
33499 ATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAG
510 GTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATG
* * * * * *
33527 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * *
33592 CAATTCATACAAGCTTATATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG
66 CTATTCATACAAGCTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * *
33657 CACGAGATTTGAAAATATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTAAACAA
130 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
33722 TTATTTATTTAAAATCATT-TGACCATTTGTTTTATCATAAAATAGTTGTTTTAGTTCATAAAAT
194 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAG
* * *
33786 CATATCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
259 CTTATCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * *
33851 AATAAATTAGTTTACCGAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
324 AATAAATTAGTTTACC-AAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
33916 CATTATTACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAAAAACTGTTTTCA-ACATACAAGTTTATTTAAAAT
388 CATTATGACCTTTTGTTTTGTC--AATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * * *
33980 AAAATAATACTAATTCATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTAC
451 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
34045 CAAATCAATTCAAATAGTTATG
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* * * * *
34067 ACTATATGAATAATTACCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * *
34132 CTATCCATACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATTAATAAC
66 CTATTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * ** * *
34197 TACA-ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTTAAACAGTTAAAACTATATGAATAA
130 TA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * * *
34261 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAG
194 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAG
* * * * * *
34326 ATTATTCAAAATAGAATAAAACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATT--T-A-T-AAGGATTTAGA
259 CTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * ** * * * *
34385 AAATAATTTTGTTTACTAAATTAGTTTGAATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
323 AAATAAATTAGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * ** * * * *
34450 TCATTATTG--CTTTATGTTTTGTC-ATAAAATAATTTTTTTTGTTAATATAAGTTTATTCGAAA
387 TCATTA-TGACCTTT-TGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
34512 GAAAATAACACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGAATTAAAAAGTAAATTT
450 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * *
34576 GCTTATCAAACCATTTCAAATAGTTTTG
510 GTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATG
* * ** ** * * *
34604 TCTATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCATTATAAAATTTTAG-TTTGTCATCAAACAATTGGT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * * * * *
34668 TCTATTCATACTAGTTTATTTAGAATAAAATAACATTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAA
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* * ** * * * ** **
34733 -TCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATG
129 GT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
34797 ATTATCTATGTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAA
193 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAA
* * * * * *
34861 GCTTAT-TAGGATTTAAATAATACTAATTCGA-TAATGTTTTAAAAATTAATAAGT--AAGATTT
258 GCTTATCCA--AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * * * * * *
34922 AAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTG
320 AAAAAATAAATTAGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * **
34987 AAATCGTTATCACATTTTGTTTAGT-TATAAAACAATTG-TTTCAGCTCATACAAGCTTATTCAA
384 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGA
* * * *
35050 AATAAATTAATCCTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATTACAAAAAGAGATTCAAAAAAATA
448 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-T-----AAGAGATT-TAAAAAATA
* * *
35114 AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATT
505 AATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATG
* * *
35147 ACTATTT-AAGTAATTGTCTATTT-AAATTCTTTATAACCAGTATTTGAGTAATTGTCTATTTAA
1 ACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATT-GTTATAACC--T-TTT--GT-TTTGTC-A--TAA
* * * *
35210 AATCATTATAATCACTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAGCACAAATTTAAACAAAAT
55 AATAATTGT--T-TC-T-A--T-TCAT---ACAA--GCTT-A-TT-G---AAA--T----AAAAT
* * ** * *
35275 AAAATAATATTGATTTATTAATATTTTTGAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGT
95 --AATACTA---ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
** ** ** * * * * * * *
35340 TTACCGAATTAGTAAAAATAATTATGGCCATTCGAA-AGATTATCTATTTGAAATCGTTATGAGC
155 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
35404 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-ATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAATA
219 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTA
* * * *
35468 ATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAACTA
282 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAAC-A
* * ** * * * ** * * *
35532 GTTCAAATGGTTACAACTATTTGAACAATTTTCAATCTC-AATTGTTAAGATC-TTTGTTTTAT-
345 ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
35594 AATTAAACAATTGTTTTTGA-TCATAAAAGCTTA-TTCAATTAAAAATAATACTAATTTAATAAT
410 AATAAAACAATTG-TTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
35657 A-TTCAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTAAATGTGCTTGCGGC-ACCAGTTCAAATAATTA
473 ATTTC-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC--CAAACAATTCAAATAGTTA
**
35720 AA
535 TG
* * * * * * ** ** * * * *
35722 ACCATTAGAATAATTATCTATTACAGATTGTTTTGATATTTTGTTAAGTTAAAAAATATTTATTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * * * *
35787 C-ATATCTTATAAGCTTATTCGAAATAACATAATCCAAATTTATTAACATT-TGGAAAATTAAAA
66 CTAT-TCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATA
* * * * * *
35850 AGAAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAAC
128 AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** * * * *
35915 AATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTCCTTTTGACATATAACAATTGTTTCAATTCATAAA
192 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
* * * * *
35980 AGCATATCCAAAATAAAATAATAATAATTTCTTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTA
257 AGCTTATCC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-
*
36044 AAAAAATAAATTTA-TTTA-CAGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
320 AAAAAATAAA-TTAGTTTACCA-AAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * *
36107 TAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTG-CTTCAGTTCCTATAAGCTTATTT
382 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTT
* * * ** * * *
36170 GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAGTAATAAGTTATTTAAAAAGTGAATATG
446 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * *
36234 TTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATC
511 TTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
36261 ACCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGTTACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * *
36326 -TATATCATACAAGCTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTCTTCATCTT-TCAAAAATTAAT
66 CTAT-TCATACAAGCTTATT--GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT
* *
36389 AAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* ** ** * * * * * *
36452 GAATTGTATACTTCAAATCAAATTTTTACAAAATAAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATT-AT
191 CAA-T-TAT--TT-ATTTCAAATCGTT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
36516 TTATGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTT-AAAAATTTAAT
245 TTA-GTTCATAAAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAAT
* * * * ** * * * * * * *
36580 AACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTTAATTTGTTAAGACTATATAAAC
307 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
** * * *
36645 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT-TATAAAATAATT-TTTTCGATTCATA
371 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATA
* * * *
36708 CTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATAAAATTATTAATATTACAAAAATTAATAAGAGATTTAA
435 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * * * * *
36772 AAAATAATTATGTTTACCTAACTAGTTCTAATAATTATG
499 AAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATG
* * *
36811 ACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAATGTTATAACTTTTTTGTTTTGTCATAAAAT--TTGTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* * * * * * * * *
36874 TTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATACAAATCTATTAATATTAC-AAAAA-T--TC
65 TCTATTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATA
* * * * *
36935 A-TAAGAGATTTTAAAAATAAATCTTTTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGC
128 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *** * * *
36998 AATTAATTATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTCCATTATAAAACAATAGTTTCTA-TTCATAC
192 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAA
** * * ** * * *
37062 AAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAATTAAAAAATTT
256 AAGCTTATCCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * *
37127 AAAACATAAA-TATGTTTACCAAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATT
320 AAAAAATAAATTA-GTTTACCAAAC-A-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * *
37190 TCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGTC-ATAAGAA-AATT-ATTTCAGTTCATATAAGGTTATT
382 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAA-AACAATTGTTTTCA-TTCATACAAGCTTATT
** * * * *
37251 CAAAATAAAATAATAGTAAGTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAA
445 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* * ** * *
37316 AACTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATG
506 ATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATG
* ** *
37348 ACTATTTAAATAATTATCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATT-TC
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA-ATTGT-
* * * * * * * * *
37411 ATCTATTTATACAAGCCTATTTCAGATAAAATAATTCAAATTTATTACTA-AC-AAGATAATTAA
64 TTCTATTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAA
* * * *
37474 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCACAA-AAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGA
126 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
** * * * * *
37538 ACAACGA---A-TT---A---TTATAACATTTTATTTTGTCATAAAATAATT-ATTTATGTTCAT
190 ACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCAT
* * * * * * *
37592 ACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAGTAAGCAAAAGAT
254 AAAAGCTTATCCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * *
37657 TTAAAACATAAA-TATGTTTACCAAACAATTTCAAATACTCATGACTATTTGAATAATTATCTAT
318 TTAAAAAATAAATTA-GTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
37721 TTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTG-CAATAAAATAATTG-TTGCGGTTAACATAAGCTTATT
381 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACAAGCTTATT
* * **
37784 TGAAGTAAAACAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAGAAAAAT
445 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAAGAGATTTA-AAAAAT
* * *
37848 GAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAGAGTTATG
504 AAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
37882 ACTATCTGAACAATTATATATTTAAAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAATAATTGGTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTT
* * * * * *
37947 T-TGTTCATCCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTAATTAATATTCCAAAAGTT-ATAA
65 TCTATTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* * * * * * *
38009 GCGAA-A-ATTTGAAAAATGAATTTTTTTATTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
129 G-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * **
38072 GTTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTA-TTCATGCA
193 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAA
*** * *
38136 AGCTTATTTGGAA-AAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT
257 AGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * *
38199 AAAAAATAAATCT-TTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
320 AAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * *
38263 CAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC-ATAAAACAATTG-TTTCTATTCATAAAAG-TATATTT
383 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACAAGCT-TATTT
* * *
38325 GGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAGAATAA
446 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAA
* **
38389 AT-TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCCTG
506 ATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATG
* ** ** * * * * * *
38420 TCTATTTGACCAAACATCTATTTCGAACTATTATGA-CATTT-TTTTATCATAAAATAAGGCCAA
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT------AA
* * ** * * *
38483 TTATTCAAAATAATTGGCATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTACTAT
60 TTGTT-----T--CT---ATTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
38548 T-TCAAAAA-T--TAA-TAAG-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAATG
114 TCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * * * *
38607 AAG-CTTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGAACTTTTATTTAGTCATAAAATAATT
178 ATGAC-TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
38671 ATTTTAATGT-ATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATT
242 GTTTTAGT-TCATAAAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT
* * *
38734 AATAAGCAAGAA-ATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
304 AATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * *
38797 GAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGACCTTTT-TATTT-TTATTGTAAAACAATTG-TTTCA
367 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTTGTCA--ATAAAACAATTGTTTTC-
* * *** * * ** *
38859 ATACATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAATTTTGATAAGTT
428 ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AAT--TAA-TA
* * *
38923 AGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TAGAATCAATTCAAATAATTTTG
489 AGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCA-AA-CAATTCAAATAGTTATG
* * * * * *
38972 GCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAA-TGATTATGAA-TTTTTGTTTTATCATAAAATAATTAT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * ** * * *
39035 TTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAGAAATTAAT
64 TTCT-ATTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
* ** ** *
39099 AAGTAGGAGATGCAAAAAATTGATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * * *
39163 TAATTATATATTTCAAATTGTTATAAGCTTTTGTTATATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAA
191 CAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAA
* * * * * * *
39228 AAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAATTTAATAACTAAGAGATT
256 AAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
** * * * *
39292 TAAAAAATAAATGTA-TTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCTTTATT
319 TAAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
39356 TTAAATCGTTAGGACTTTTTGTTTTATC-GTAAAACAATT-TTTTTAGTT-TTAGTAA-CTTATT
382 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATA-CAAGCTTATT
** * * *
39417 T-AGCGTAAAA-AA-A--AA-TTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTA
445 TGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * *
39476 TGTTTGCCGAATCAATTCAAATAATTATG
509 TGTTTACC-AAACAATTCAAATAGTTATG
* * ** * * * *
39505 A-TATTTGAACAATTATCTATTTCGAAGTCATTATTACCTTTTG-TTTGTCAAAAAACAAATGCT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-T
* * ** * * * * *
39568 TTTTGTTCATGTAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGGAAAAATTAA
64 TTCTATTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAAAATTAA
* * * * *
39633 GAAGTTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TGTTTACTAAACCAGTTGAATTAGTTATAACTATTTGA
126 TAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * *
39696 ACCATTATTTTACATGTT--AATCATGAGTGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCTA
190 ACAATTA-TTT--AT-TTCAAATCGTTA-TGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* ** * ** * * * * *
39758 -TTCATGACATCCTTATTTCGGATAAAGTAATGCTAATTTATTAACCAGTTCTAAAAAATTAAAA
248 GTTCAT-AAAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TA-TT-TCAAAAATTAATA
* * *** * * * *
39822 ATGTAACGAA-ATTTCAAAAATGAAATTTG-TTAGCTTGACGAGTGCAAATA-TTATAACTGTTT
308 A-GTAA--AAGATTTAAAAAAT-AAATTAGTTTA-CCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTT
** *
39884 GAAACAATT-TCTATTTTCAAAATTGTTATGACGCATTTTTTTATTG-C---AAAACAATTG-TT
367 G-AACAATTATCTA-TTTC-AAATCATTATGAC-C-TTTTGTT-TTGTCAATAAAACAATTGTTT
* * * * *
39943 TCTATTCGTACAAGCTTATCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATA
426 TC-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
* * **
40007 AGTAAGAGCTTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
489 AG--AGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATG
* * ** * * * * * *
40060 ATTGTTTGAGCAATTATCTATATCAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * *
40125 TTATTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATACAAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATGA
66 CTATTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* * *
40189 GTAA-A-AATTAAAAAA-AAAGT-T-TTT--TGAACACA-TTCAAATAGTT-TGACTATTTGATC
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
40245 AATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCAGAAACCAATTTGTTTCT-GTTCATA
192 AATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT-TAGTTCATA
** * ** * * * *
40309 CGAGCCTATTTGAAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATT
255 AAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
40374 TAAAAAATAAATTTGTTTATCGAGCAACTTTAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTGTTTATTT
319 TAAAAAATAAATTAGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
40439 AAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTTGTC-ATAAAACAATT-ATTTCTATTCATACAAGTTTATT
383 CAAATCA-TTATGACCTTTTG-TTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACAAGCTTATT
* * *
40501 GGGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATA
445 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAAATA
* *
40565 AATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATG
505 AATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
40598 TCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
** * ** * * *
40663 CTATTTGTGCAAAATTATTTAGAAT-AAATAATACTAATCTATTAATATT-TTAAAA-T--TAA-
66 CTATTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * *
40722 TACGAGATTTAAAAACT-AATATGTTTGTA-GAAACAA-TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACA
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * * * *
40784 ATTATTTATCTCAAATAATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAATAGTTTGTTTCT-TTTTATAC
193 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTT-TAGTTCATAA
* * * * *
40847 AAGTTTCATTCAATTAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAAAGAT
256 AAGCTT-ATCCAA--ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * *
40908 TTAAAAAAATAAATGTA-TTTATCGAACCATTCAAATAGTTCA-GACTATTAGAGC-ATTATTTA
318 TT-AAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAACAATTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * *
40970 TTTCAAATTGTTCCTGCACCCTTTGTTTAGTC-ATAAAATAATTATTTTCAGTTCATACAAGCTT
380 TTTCAAATCATT-ATG-ACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACAAGCTT
* * * * * *
41034 A-TTCAAACAAAATAATAGC-AATTTATTAACATTTGAAAATAATGAGTAAGAGA-TTAAAAAA-
442 ATTTGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTT-CAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* ** *
41095 AAA--TGTTTATCAAACAAGTTGTAATAGAT-TG
504 AAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATG
* * * * ** * * *
41126 ACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAGTTATTACGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACATTTGTTT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * ** * * * * *
41190 -TGGTTCA-AAAAACTTAACCGAAATCAAAATAATACTAACTTCACTAATATTTTAAAACTTAGT
66 CT-ATTCATACAAGCTT-ATTGAAAT-AAAATAATACTAA-TTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
* * * ** * *
41253 AAGCAAGAGATTTAAAAACT-AATCTGTTTTTCGCACCAAATTCAAATA-TTATGAACTATTTGA
127 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGA
* ** * * * *
41316 ACAAATATCAATCTTAAAATAGTTATGATC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-ATCA
190 ACAATTATTTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCA
* * * * * * *
41378 T-ACAGGTT-T-TAGATAAAAATAATATTAAATTTAATAATATTCTAAAAAATTAATAAG---AA
253 TAAAAGCTTATCCAAAT-AAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAA
* * * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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379 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACAAGCTTA
* * * *
41563 -ATCAGAAT-AAATAATATTAAAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAA
443 TTTGA-AATAAAATAATACT--AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AGATTT-AA
* * *
41625 AAATTAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATG
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* * * * *
41664 ACTATTTGAACAATGATCTATTTAAAATCGTTAT-ACCTTTTTATTTTGGTCATAAAA-ACCATT
1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTGTTTT-GTCATAAAATA--ATT
* ** * * * *
41727 GTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAA-ATAAATAACACTATTTTATTAATATT-TCAAAAGT-
62 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTGAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
** * * *
41788 -TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTAC-AAA-ATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTG
125 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** ** * * * * ** * **
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189 AACAATTATTTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA
* * *** * **
41911 TACAATCTTATTTGAATAAAATAAAACTAATTTATT-ATA-TTCACTAATTAATAAG----AGAT
253 TAAAAGCTTATCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * *
41970 TTAAAAAATAAATCTA-TTTACTAAACTAGTTTAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTAT
318 TTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * * *
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381 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACAAG-CTTAT
*
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** * * *
42158 TAAATCTGTTTACCCAATTAGTTCAAACAGTTAAG
503 TAAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
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1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * ** * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * **** *
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* * * * * *
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255 AAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * *
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** * * * * * * * *
42570 TCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTGTC-ATAAAACAATTATTTTTATTCCTACAGGCGTT-TTC
382 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAAGC-TTATTT
* *
42633 GAAATAAAATAATACTAATTTAGTAGTA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAATA
446 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATA
* * * *
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505 AATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATG
* * * * * * ** *
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1 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * *
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66 CTA--TTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCTAAAAATTAAT
* * * * * * * *
42853 -TGTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTACTGAACCAGTTTAAAT-GATTATGACTATTTGAA
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Statistics
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TAAATTAGTTTACCAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
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AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
AATTCAAATAGTTATG
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * ** ** * * * * *
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* * *
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* * * ** * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * * * ** **
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* * * * * * * * *
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517 TTATATCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
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1 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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375 CT-AATTTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACA
* * * * *
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* * * * * *
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500 GTCATAAAACAATTGTTTTAT-ATCATACAAGCTTATTCAG
* * * *
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1 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
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66 -TTGTTTACTGAATA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
* *** * * * * *
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128 ATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * * *
37083 ATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAATTAAAAAATTTAAAACATAAATATGTTTACCA
191 ATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA
* * * * * * *
37148 AACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTT
256 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * ** * * *
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321 TTGTCATAA-AACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
37276 AATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA-ACTATTTACTGAACAAGTTTAAA
385 AATATT-CAAAAA--ATTAA-TAAGTGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACTGAACAAGTTCAAA
* * ** * * *
37340 TAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-
445 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * *
37404 AGATT-TCATCTAT-TTATACAAGCCTATTTCAG
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* * * *
37436 --ATAAAATAATTCAAATTTATTACTA--ACAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
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64 ATTTGTTTACTGA-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
* * * * *
37551 ATAACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATA
128 ATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * *
37615 ATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAGTAAGCAAAAGATTTAAAACATAAATATGTTTACCA
191 ATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA
* * * * * ** *
37680 AACAATTTCAAATACTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTT
256 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
37745 TTG-CAATAAAATAATTGTTGCGGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAACAATACTAATTTATT
321 TTGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * *
37809 AATATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAGAAAAATGAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAA
385 AATATTCAAAAAATT-A--A-TAAGTGATTTA-AAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAA
* * * * * * *
37874 GAGTTATGACTATCTGAACAATTATATATTTAAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAA
445 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *
37938 TAATTGGTTTTGT-TCATCCAAGCTTATTTC--
509 CAATT-GTTTTATATCATACAAGCTTA-TTCAG
* * * * * * *
37968 AAATAAAATAATA-TAATTAATTAATATTCCAAAAGTT-ATAAGCGAA-A-ATTTGAAAAATGAA
1 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
38029 TTTTTTTATTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCGTTAT
65 TTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT
* * * * ***
38094 GACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTATTCATGCAAGCTTATTTGGAA-AAAATAATA
130 GA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * *
38158 CTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTACCAAG
194 CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAA
* * * * ** *
38222 CGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTT
258 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
38287 ATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAG-TATATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTA
323 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
38350 ATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAGAATAAAT-TGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
386 ATATTCAAAAAATTAATAAG-T---GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
* ** * * ** * * * *
38414 GTCCTGTCTATTTGACCAAACATCTATTTCGAA-CTATTATGA-CATTT-TTTTATCATAAAATA
447 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT--AA-A
* * ** *
38476 AGGCCAATTATTCAAAATAATTGGCATTCATACAAAATTATTTAG
508 A---CAATTGTT-----TTA-T---A-TCATACAAGCTTATTCAG
*
38521 -AATAAAATAATACAAATTTATTACTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAG-GATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** * * * *
38580 GTGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAATGAAG-CTTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTC
66 TTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTA
* * * * *
38643 TGAACTTTTATTTAGTCATAAAATAATTATTTTAATGT-ATACATGCTTATTCAAAATAAAATAA
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* * * *
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192 TACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA
* *
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** *
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* * * * * ** *
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* * *
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** * * * * * ** **
39058 GTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAGAAATTAATAAGTAGGAGATGCAAAAAATTGAT
1 AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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*** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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36606 GTTTGTCAAACTAGTTTAATTTGTTA-AGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
240 GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * *
36670 CTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTTTTTCGATTCATACTAGCTTATTT-G
304 CTTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * ** *
36720 AAATAAAATAA-AATAAAATTATTAATATTACAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAT
1 -AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
36780 TATGTTTACCTAACTAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAATGTTAT
64 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * * * * * *
36845 AACTTTTTTGTTTTGTCATAAAAT--TTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAAT
129 GAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * *
36908 ACAAATCTATTAATATTACAAAAATTCATAAGAGATTTTAAAAATAAATCTTTTTATCAAACTAG
192 ACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGAGA-TTTAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAG
* * * * *
36973 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTAAT-TATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTCCATT
254 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTC
*
37037 ATAAAACAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
318 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * * * * *
37074 ATTAAAATAATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAATTAAAAAATTTAAAACATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * *
37139 TGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
66 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * *
37204 -CTTTTGTTTTGTCATAAGAA-AATTATTTCAGTTCATATAAGGTTATTCAAAATAAAATAATAG
131 CCTTTTGTTTTGTCATAA-AATAATTGTTT-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * **
37267 TAAGTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTACTGAACA
194 TAATTTATTAATATT-CAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAT-AAATTGTTTACCAAACA
* * * * * ** * * * * *
37332 AGTTTAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTGGAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGT
252 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGT
* * *
37397 CATAAAA-AGATT-TCATCTATTTATACAAGCCTATTTCAG
317 CATAAAACA-ATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTT-AG
* * * **
37436 -ATAAAATAATTCAAATTTATTACTA--ACAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
37498 TCTGTTCACCACAA-AAGTTCAAATCGTTATGACTATTTG----A--A-C-A--ACGAATTATTA
64 TCTGTTTACCA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * *
37552 TAACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAAT
128 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * *
37617 ATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAGTAAGCAAAAGATTTAAAACATAAATATGTTTACCAAA
192 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAA-ATAAAT-TGTTTACCAAA
* * * * * * * * *
37682 CAATTTCAAATACTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTT
250 CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTC
* * ** * * *
37747 G-CAATAAAATAATTGTTGCGGTTAACATAAGCTTATTT-G
315 GTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* ** * * ** *
37786 AAGTAAAACAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAGAAAAATGAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAA
* * * * * * * *
37851 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATCTGAACAATTATATATTTAAAAATATTAT
64 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * *
37916 GACCTTTTGTTTTGTCAGAAAATAATTGGTTTTGTTCATCCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT
129 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAT
* * * * * **
37980 A-TAATTAATTAATATTCCAAAAGTT-ATAAGCGAAAATTTGAAAAATGAATTTTTTTATTAAAC
192 ACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAA--G-AGATTT-AAAAAT-AAATTGTTTACCAAAC
* * * * ** *
38043 ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTG
251 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCG
* * * *
38108 TCATAAACCAATTATTTCTATTCATGCAAGCTTATTTGG
316 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * *
38147 AA-AAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
38211 TTTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA
66 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * ***
38276 TCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAG-TATATTTGGAATAAAATAATA
131 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TT-TAGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATA
* *
38339 TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAGAATAAATTGTTTACCGAACA
193 CTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAA-AATAAATTGTTTACCAAACA
** ** * ** * *
38404 AGTTCAAATAGTCCTGTCTATTTGACCAAACATCTATTTCGAA-CTATTATGACATTTTT-TTAT
252 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGAC-TTTTTGTT-T
* * * * **
38467 CAT-AAAATAAGGCCAATTATTCAAAATAATTGGCATTCATACAAAATTATTTAG
314 CGTCATAA-AA---CAATTGTT-----T--CT---ATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * *
38521 AATAAAATAATACAAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG-----GATTTAAAAAATAAATG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
*** * * * ** ** *
38581 TGTTTATTGAACTAGTTCAAATAATGAAG-CTTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTG
66 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * *
38645 AACTTTTATTTAGTCATAAAATAATTATTTTAATGT-ATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * *
38709 CTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-
193 CTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAG--AG--ATT-TAAAAATAAA-TTGTTTACCAAAC
* * ** *
38773 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTTATTTT
251 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTT-GTTT
** ** * * * ** *
38838 TATTGTAAAACAATTGTTTCAATACATAAAAGCTTATCCAA
314 CGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * ** * * *
38879 AATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAATTTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
38942 TAGTTTA-TAGAA-TCAATTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAATGATTA
66 T-GTTTACCA-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTA
** * * * * ***
39005 TGAATTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTT-TTCATCATACAAGCCTATTCGGTATAAAATAA
128 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAGT--TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * ** ** *
39069 TACTAATTTACTAATATTTTAGAAATTAATAAGTAGGAGATGCAAAAAATTGATCTGTTTACTGA
191 TACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-A--A-GAGAT-TTAAAAATAAAT-TGTTTAC-CA
* * * * * *
39134 ATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAAGC-TTTTGT
248 AACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGT
* * * * * * * *
39197 TAT-ATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAA
312 T-TCGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * * * *
39240 AATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATG
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * * ** *
39305 TATTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCTTTATTTTAAATCGTTAGGA
66 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * * * * ***
39370 CTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTTTTTTAGTT-TTAGTAA-CTTATTTAGCGTAAAA-AA-A-
131 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTAGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
39430 -AA-TTATTAATATTTCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGCCGAATCAA-T
194 TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAAT-TGTTTACC-AAACAAGT
* * * * * *
39492 TCAAATAATTATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCGAAGTCATTATTACCTTTTGTTT-GTCA
255 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTCA
* * * * ** * *
39555 AAAAACAAATGCTTTTTGTTCATGTAAGTTTATTTGG
319 TAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * *
39592 AATAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGGAAAAATTAAGAAGTTAAGAGATTTAAAAAAT-A
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT--AAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAA
* * * * * ** * *
39656 AT-TGTTTACTAAACCAGTTGAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTAT-T-TTACATGTTAATC
63 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA----AATT
* * ** **
39718 ATGAGTGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCTA-TTCATGACATCCTTATTTC-GGA
124 ATTA-TGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TT-TAGTTCAT-ACAAGCTTA-TTCAAAA
* * * *
39780 TAAAGTAATGCTAATTTATTAACCAGTTCTAAAAAATTAAAAATGTAACGAAATTTCAAAAATGA
183 TAAAATAATACTAATTTATTAA-TA-TTC--AAAAATT---AA--TAA-GAGATTT-AAAAAT-A
*** * * *
39845 AATT-TGTTAGCTTGACGAGTGCAAATA-TTATAACTGTTTGAAACAATT-TCTATTTTCAAAAT
236 AATTGT-TTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTG-AACAATTATCTA-TTTC-AAAT
* * * * *
39907 TGTTATGACGCATTTTT-TTATTG-C--AAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATCTAA
296 CGTTATGA--C-TTTTTGTT-TCGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * ** * * * *
39966 AATAAGATAATTCTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGCTTTAAAAAATGAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * ** * ** *
40031 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATTATCTATATCAAATTGCTATAA
66 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * **
40096 CTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATAC
131 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA--TTGTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * **
40160 AAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAATTAAAAAAAAAGTT-TTT--TGAACACA
194 -TAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACA-A
* * * * * *
40221 -TTCAAATAGTT-TGACTATTTGATCAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTC
253 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTC
* * * * *
40284 AGAAACCAATTTGTTTCTGTTCATACGAGCCTATTT-G
318 ATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * ** *
40321 AAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * * * *
40386 TTGTTTATCGAGCAACTTTAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTGTTTATTT-AAAATAGTTAT
65 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTAT
* * * * *** *
40450 GATCTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTGGGAATAAAAAAA
129 GACCTTTTG-TTTTGTCATAAAATAATT-GTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
*
40514 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAA
191 TACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAT-A--A-GAGATTT-AAAAATAAAT-TGTTTACCAA
* ** * *
40579 ACAAGTTTAAATAGTTATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGA-TCTTTTGTT
249 ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTT
* ** * **
40643 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTGTGCAAAATTATTTAG
313 TCGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * *
40685 AAT-AAATAATACTAATCTATTAATATTTT-AAAATTAATACG----AGATTTAAAAACT-AATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
40743 TGTTTGTA-GAAAC-AATTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATAATTAT
66 TG-TT-TACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * ** * *
40806 GATC-TTTATTTTGTCATAAAATAGTTTGTTTCTTTTTATACAAGTTTCATTCAATTAA-AAAAT
129 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA-ATTGTTT-AGTTCATACAAGCTT-ATTCAA--AATAAAAT
* * * * *
40869 AATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTATCGAA
189 AATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGAGATTT--AAAAATAAAT-TGTTTACCAAA
* * * * * * * **
40934 CCA-TTCAAATAGTTCA-GACTATTAGAGC-ATTATTTATTTCAAATTGTTCCTGCACCCTTTGT
250 CAAGTTCAAATAGTT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATG-ACTTTTTGT
* * * *
40996 TTAGTCATAAAATAATTATTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTCA-
312 TTCGTCATAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * *
41039 AACAAAATAATAGC-AATTTATTAACA-TTTGAAAA-TAATGAGTAAGAGA-TTAAAAAA-AAA-
1 AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * *
41098 -TGTTTATCAAACAAGTTGTAATAGAT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAGTTATTACG
65 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * ** *
41160 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACATTTGTTTTGGTTCA-AAAAACTTAACCGAAATCAAAATAATA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATA
* * * * * *
41224 CTAACTTCACTAATATTTTAAAACTTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAACT-AATCTGTTTTTCGC-
193 CTAA-TTTATTAATA-TTCAAAA---ATTAA-TAAGAGATTTAAAAA-TAAAT-TG-TTTAC-CA
* * * * * *
41287 ACCAAATTCAAATA-TTATGAACTATTTGAACAAATATCAATCTTAAAATAGTTATGA-TCTTTT
248 AACAAGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACT-TTTT
* *
41350 -TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATAC-AG-GT-TTTAG
310 GTTTCGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * *
41390 -ATAAAAATAATATTAAATTTAATAATATTCTAAAAAATTAATAAG---AAGATTTAAAAAAT--
1 AAT-AAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * * * * * *
41449 ATATGTTTGTCGAGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTT
63 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * * * * *
41514 TGACCTTTGGTTTAGTCATATAATAATTGCTTCAGTTTATACAGGCTTAATCAGAAT-AAATAAT
128 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * *
41578 ATTAAAATTTAATAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAATTAAATCTGTTTACT
192 ACT--AATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAA-TAAAT-TGTTTACC
* * * *
41643 AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATGATCTATTTAAAATCGTTAT-ACCTTTTTA
247 AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTT-
* * * * ** *
41707 TTTTGGTCATAAAAACCATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
310 GTTTCGTCAT-AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG
* * * *
41753 AAT-AAATAACACTATTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * ** * *
41813 AATTTA-CAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAGCTACCTATTTCAAATCATTATTG
66 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTA-TG
* * * ** * ** * ** *
41877 -CTTTTTATTTTGTCTTAAAATTTTTTTTTAAAT-ATACAATCTTATT-TGAATAAAATAAAACT
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
** * * * *
41939 AATTTATT-ATATTCACTAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTTA
195 AATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCA
* * * * * * *
42003 AATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTATTG-TTCTATCATAA
258 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTC-GTCATAA
* * *
42067 AATAATTATTTCTATTTATAC-AGACTTATTTAG
322 AACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTAG
* * *
42100 AATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
42163 CTGTTTACCCAATTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATA
65 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * * * *
42228 ACCTTTTGCTTTATTATAAAATAATTATTTTAGCTCATATAACCTTATACCAAAAAAAAATAATA
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATA
* * * * * * *
42293 TTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGGGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAAA-TAG
193 CTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAAT-TGTTTA-CCAAACAAG
* ** * * * * * **
42357 TTCAAATAATTATGGGC-ATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATC
254 TTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTC
* * * * * * *
42421 TTAAAACAATTGTTTTCCA-ACATTCAAGCCTATTCAA
318 ATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * *
42458 AATAAAATAAAACTAAGTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
42519 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA
66 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * * *
42584 CCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCCTACAGGCGTT-TTCGAAATAAAATAATA
131 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TGTTTAGTTCATACAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATA
* * * *
42647 CTAATTTAGTAGTATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTTCCAAA
193 CTAATTTATTAATATTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTT-AAAAATAAAT-TGTTTACCAAA
* * * * * *
42712 CTAGTTCAAA-AGTTA-AGACTATATGTACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
250 CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTT
** * * *
42775 TTTCATAAAGCAATTATTTC-AGCTT-ATACAAGCTTA-TTCG
314 CGTCATAAAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * * * * *
42815 AAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT-TGTTCAAAATT--T-TGTAAGAGATTTAGAAAATAATT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * *
42876 TTATTTACTGAACCAGTTTAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTC
65 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
Statistics
Matches: 5630, Mismatches: 1254, Indels: 831
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
346 2 0.00
347 30 0.01
348 40 0.01
349 71 0.01
350 17 0.00
351 102 0.02
352 423 0.08
353 299 0.05
354 262 0.05
355 282 0.05
356 513 0.09
357 610 0.11
358 562 0.10
359 241 0.04
360 310 0.06
361 315 0.06
362 342 0.06
363 280 0.05
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368 92 0.02
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377 6 0.00
378 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (354 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTCGTCATAAAACA
ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
Found at i:41607 original size:18 final size:16
Alignment explanation
Indices: 41572--41610 Score: 51
Period size: 18 Copynumber: 2.3 Consensus size: 16
41562 AATCAGAATA
*
41572 AATAATATTAAAATTT
1 AATAATATTAAAAATT
41588 AATAATATTCAAAAAATT
1 AATAATATT--AAAAATT
41606 AATAA
1 AATAA
41611 GCAAAAGATT
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 2
0.87 0.04 0.09
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.45
18 11 0.55
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AATAATATTAAAAATT
Found at i:41885 original size:177 final size:175
Alignment explanation
Indices: 41616--42883 Score: 785
Period size: 177 Copynumber: 7.1 Consensus size: 175
41606 AATAAGCAAA
* * * * * * *
41616 AGATTTGAAAAATTAAATCTGTTTACTAAACA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TG
1 AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAA-ATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACT-
* * * * * *
41679 ATCTATTTAAAATCGTTAT-ACCTTTTTATTTTGGTCATAAAAACCATTGTTTTAGTTCATAAAA
63 ACCTATTTCAAATCGTTATAACC-TTTTGTTTT-ATCATAAAAA--ATTATTTTAGATCATAAAA
* *
41743 GCTTATCCAAAAT-AAATAACACTATTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG
124 GCTTATCCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAG
* *
41795 AGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-CAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAGCTACC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTACC
* ** * * * * ** * * * *
41859 TATTTCAAATCATTATTGCTTTTTATTTTGTCTTAAAATTTTTTTTTAAAT-ATACAATCTTAT-
66 TATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAAATTATTTTAGATCATAAAAGCTTATC
*** *
41922 TTGAATAAAATAAAACTAATTTATT-ATA-TTCACTAATTAATAAG
131 CAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCA-AAATTAATAAG
* * * * * * *
41966 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTTAAATAGTTATGAG-TATTTGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAATAGTTCAAATAATTATG-GCCATTTGAACAACTAC
* * * * * *
42030 CTATTTCAAATTGTTATAACCTATTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCTA-TTTAT-ACAGACT
65 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTATTT-TAGATCATAAAAG-CT
** * * *
42093 TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAG
127 TATCCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC--AAAA-T--TAA-TAAG
* * * * * * * * * * * **
42147 AGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCCAATTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATAAACAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTACC
* * * * * *
42211 TATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGCTTTATTATAAAATAATTATTTTAGCTCATATAACCTTAT
66 TATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTATTTTAGATCATAAAAGCTTAT
* * * *
42276 ACCAAAAAAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG
130 -CCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAG
* * * *
42324 GGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATCGAAATAGTTCAAATAATTATGGGCATTTGAACAACTAC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTAC
* * * * ** * ** *
42388 CTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTTTCCAACATTCAAGCCTA
65 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTATTTTAGATCATAAAAGCTTA
* *
42453 TTCAAAATAAAATAAAACTAAGTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG
129 TCCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAG
* * * * * * * * *
42501 AGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTTTGACTACTTGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-ATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTAC
* * * * * * * *
42565 CTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCCTACAGGCGT
65 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTA-TTTTAGATCATAAAAGC-T
* * * * * *
42629 T-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAGTATTCTAAAAATTAATAACTAAG
127 TATCCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATT-TCAAAA-T--TAA-TAAG
* * * * * * * * * *
42682 AGATTTTAAAAAATAAATCTATTTTCCAAACTAGTTCAAA-AGTTAAGACTATATGTACAATTAT
1 AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTAC
* * * * * * * * *
42746 TTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTATTTCAGCTTATACAAGCTTA
65 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAA-AAATTATTTTAGATCATAAAAGCTTA
* * * **
42811 TTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT-TGTTCAAAATTTTGTAAG
129 TCCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATAT-TTCAAAA-TTAATAAG
* * *
42859 AGATTTAGAAAATAATTTTATTTAC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
42884 TGAACCAGTT
Statistics
Matches: 858, Mismatches: 189, Indels: 87
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
171 35 0.04
172 66 0.08
173 34 0.04
174 17 0.02
175 22 0.03
176 33 0.04
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181 131 0.15
182 35 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTACC
TATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAAATTATTTTAGATCATAAAAGCTTATC
CAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAG
Found at i:42584 original size:535 final size:523
Alignment explanation
Indices: 41465--42873 Score: 1583
Period size: 535 Copynumber: 2.6 Consensus size: 523
41455 TTGTCGAGCC
* * ** * *
41465 AGTTCAAATAGTTAAGACTACTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTGGTT-TAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT-GTTCTA-
* ** * * * *
41529 TCATATAATAATTGCTTC-AGTTTATACAGGCTTAATCAGAAT-AAATAATATTAAAATTTAATA
64 TCATAAAATAATTATTTCTA-TTTATACAGGCTTATTTAGAATAAAATAATACT--AATTTAGTA
* * * * * * *
41592 ATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAATTAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAAT
126 ATATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAA-
* * * * * * *
41657 AGTTATGACTATTTGAACAATGATCTATTTAAAATCGTTATACCTTTTTATTTTGGTCATAAAAA
189 AGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATACC-TTTTGTTTT--TCATAAAAA
* * * * *
41722 CCATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAATAACACTATTTTATTAATATTTCAAAAG
251 --ATTATTTTAGCTCATAAAACCTTATCCAAAAAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAG
41787 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAAC
314 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAAC
* * * * * * * * *
41852 AGCTACCTATTTCAAATCATTATTGCTTTTTATTTTGTCTTAAAATTTTTTTTTAAATATACAAT
379 AACTACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTTATCTTAAAAATTGTTTTCAAACATACAAG
* ** * **
41917 CTTATTTGAATAAAATAAAACTAATTTATTATATTCACTAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
444 CCTATTAAAATAAAATAAAACTAAGTTATTATATTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* *
41982 TCTATTTACTAAACT
509 TCTATTTACCAAACA
* * * *
41997 AGTTTAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTATTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT-TTGTTCTAT
*
42062 CATAAAATAATTATTTCTATTTATACAGACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAT
65 CATAAAATAATTATTTCTATTTATACAGGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAT
* *
42127 TCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCCAATTAGTTCAAACAGTTA
130 TCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAA-AGTTA
*
42191 AGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGCTTTATT-ATAAAATAATTA
194 AGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-ACCTTTTG-TTT-TTCATAAAA-AATTA
* * *
42255 TTTTAGCTCATATAACCTTATACCAAAAAAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAA
255 TTTTAGCTCATAAAACCTTAT-CC-AAAAAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAA
* * * *
42320 TAAGGGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAAATAGTTCAAATAATTATGGGCATTTGAACAAC
318 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-CAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAAC
* * *
42385 TACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTTTCCAACATTCAAGC
382 TACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTTATCTT-AAA-AATTGTTTTCAAACATACAAGC
*
42450 CTATTCAAAATAAAATAAAACTAAGTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTA
445 CTATT-AAAATAAAATAAAACTAAGTTATT-ATA-TTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATA
42515 AATCTATTTACCAAACA
507 AATCTATTTACCAAACA
* * *
42532 AGTTCAAATAGTTTTGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTCTAT
* * ** * * *
42597 CATAAAACAATTATTTTTATTCCTACAGGCGT-TTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAGTA
65 CATAAAATAATTATTTCTATTTATACAGGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAGTAATA
* * *
42661 TTC-TAAAAATTAATAACTAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTTCCAAACTAGTTCAAAAGT
129 TTCAT-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAAAGT
* *
42725 TAAGACTATATGTACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATT
192 TAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-ACCTTTTG-TTTTTCATAAA-AAATT
* * * * * * * * * * *
42790 ATTTCAGCTTATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT-TGTTCAAAATTTT
254 ATTTTAGCTCATAAAACCTTA-TCCAAAAAAAATAACACTACTTTATTAATAT-TTCAAAAGTTA
* *
42854 GTAAGAGATTTAGAAAATAA
317 ATAAGAGATTTAAAAAATAA
42874 TTTTATTTAC
Statistics
Matches: 743, Mismatches: 109, Indels: 47
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
527 21 0.03
528 8 0.01
529 128 0.17
530 73 0.10
531 39 0.05
532 101 0.14
533 35 0.05
534 9 0.01
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536 81 0.11
537 29 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (523 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTGTTCTATC
ATAAAATAATTATTTCTATTTATACAGGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATT
CATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAAAGTTAAG
ACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATACCTTTTGTTTTTCATAAAAAATTATTTTAG
CTCATAAAACCTTATCCAAAAAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGAGAT
TTAAAAAATAAATCAATTTACAAAATAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTACCTATTT
CAAATCATTATTACCTTTTATTTTATCTTAAAAATTGTTTTCAAACATACAAGCCTATTAAAATA
AAATAAAACTAAGTTATTATATTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAA
ACA
Found at i:42774 original size:358 final size:349
Alignment explanation
Indices: 32536--42929 Score: 3753
Period size: 358 Copynumber: 28.9 Consensus size: 349
32526 CTCACATAGG
* * *
32536 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAAGATATTTAA
1 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT--T-AATAAGAGATTTAA
* * * * *** * * *
32600 AATATGAATGTGTTTACCGGACAAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
62 AAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *** * ***
32665 A-CATTATAACCTTTTGTTGTGTTATCAAATAATTGTTTATGTTCATATAAGCTTATTTTGAATA
127 ATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-CCATCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * * * *
32729 CAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTT
190 AAATAAAACT-AATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAG---AGATTT-AAAAATAAATCTATT
* * * *
32793 TTCTAAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAACT
250 TACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT
* * * * *
32857 TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAA
314 TTT-ATTTGTCATAAA-AAATTATTTTTAATCATACAA
* * * * * * *
32895 GTGTATTTGAAATAAAATAATAATATTTTATTAATATTCCAAAAA-TTAATAAGTAAAAATTTTT
1 CT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTAATAAG---AGA-TTTA
* ** * * * *
32959 AAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCATATCA-TTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTC
61 AAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * *
33022 AAATAGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTCTATTCATACAAGTTTAGTT-AGA
125 AAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCA-TCATACAAGCTTA-TTCAAA
* * * * * *
33086 TTAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTGAAAA-TCAATGGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAAT
187 ATAAAATAAAACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTTAA----TAAGAGATTT--AAAAATAAAT
* ** * *
33150 CTTTTTACTGAACAAGTT-TAA-A--TA-G---ATTTG-ACTATTATCTATTT-AAAGTTGTTAT
245 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTGTTAT
* * * * *
33205 AACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATT-GTTTTAGTTCATAAAA
309 AACCTTTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTA-ATCATACAA
* * * *
33248 CTTA-TCTGAAATAAAATAATAATAATTTTTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTT
1 CTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT--TAA-TAAGAGATTTA
* * * * * * * * *
33311 AAAACTAAAGT-TGTTTTCCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAAATATCAATCTC
61 AAAAATAAA-TCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * ** * **
33375 AAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAC-ATCTGTTTTTGATCATATAAGCTTATTC-GG
125 AAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT-T-ATTTCCATCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
33437 ATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-ACTAATGTAT
187 AT-AAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAATA--AATCTAT
* * * * * * *
33501 TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGACCT
249 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT
* * * *
33566 TTTGTTTAGTTATAAAATAATT-GTTTCAATTCATACAA
314 TTTATTT-GTCATAAAA-AATTATTTTTAA-TCATACAA
* * *
33604 GCTTATAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC-AAAAAATTAATAAGCACGAGATTT
1 -CTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTAAT-A--A-GAGATTT
* * * * *
33667 GAAAATATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTAAACAATTATTTATTT
60 -AAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * * *
33732 AAAATCATT-TGACCATTTGTTTTATCATAAAATAGTTGTTT-TAGTTCATAAAATCATA-TCCA
124 CAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCA--TCATACAAGCTTATTCAA
* * *
33794 AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-
186 AATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATC
* * * * **
33858 TAGTTTACCGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
246 TA-TTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * **
33922 TACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAAAAAAACTGTTTTCAA-CATACAA
309 AACCTTTT-ATTTGTC-ATAAAAAATTA-T-TTTT-AATCATACAA
* ** * *
33967 GTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTCATTAATATT-TCAAGAA-TTAATAAGAGATTTAAAA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTTAATAAGAGATTTAAAA
* * * * * * *
34030 AATATATCTATTTACCAAA-TCAATTCAAATAGTTATGACTATATGAATAATTACCTATTTTAAA
64 AATAAATCTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
34094 TTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAACTTATTCAGAATAA
128 TCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCAT-CATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * * *
34159 AATAATACTAATTTAGTAATATTCTGAAAATTAATAACTACA-ATATTTAAAAAATAAATTTGTT
191 AATAAAACTAATTTATTAATATT-TCAAAATT--TAA-TA-AGAGATTT-AAAAATAAATCTATT
* * * * * ** * * * * *
34223 TGCTAAACTAGTTTAAACAGTTAAAACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACAAT
250 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC-CT
*
34288 TTGT-TTTGTCATAAAACAATTA-TTTTAGCTCATACAA
314 TT-TATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTA-ATCATACAA
* * * * *
34325 GATTATTCAAAATAGAATAAAACTAATTT-TTAATATT-TCAAAAATTT-ATAAG-GATTTAGAA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTTAATAAGAGATTTAAAA
* * * * ** * * * *
34386 AATAATTTTGTTTACTAAATTAGTTTGAATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
64 AATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* ** * * * *** * * * * *
34451 CATTATTGCTTTATGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTAATATAAGTTTATTCGAAAGAAA
129 CGTTATACCTTT-TGTTTTATCATAAAACAA-TTATTTCCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * **
34516 ATAACACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGAATTAAAAAGTAAATTTGCTTA
192 ATAAAACTAATTTATTAATATTT-CAAAATT--T-AATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTA
* * * * * * * ** **
34581 TCAAACCATTTCAAATAGTTTTGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCATTATAAAATTTT
252 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
* ** * * *
34646 AGTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTAG
317 A-TTTGTCAT-AAAAAATTATTTTTAATCATAC-AA
* * * * * * * * * *
34682 TTTATT-TAGAATAAAATAACATTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAATCAAGAAAATTAA
1 CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--TAAT-AAGAGATTTAA
* * * * ** ** *
34746 AAAATAAATCTAATTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATGATTATCTATGTCAA
62 AAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
34811 ATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATT-AGGATT
127 ATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCA-TCATACAAGCTTATTCA-AAAT
* * * * * * * *
34874 TAAATAATACTAATTCGA-TAATGTTTTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
189 AAAATAAAACTAATT-TATTAATATTTCAAAATTTAATAAG--AGATTT-AAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * * * *
34938 TATCGAATAAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTATCACATT
250 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTT
* * * * *
35003 TTGTTTAGTTATAAAACAATT-GTTTCAGCTCATACAA
315 TTATTT-GTCATAAAA-AATTATTTTTA-ATCATACAA
* * * * * *
35040 GCTTATTCAAAATAAATTAATCCTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATTACAAAAAGAGATTC
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA-T--TT--AATAAGAGATT-
* * * * * * * * *
35105 AAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATTACTATTT-AAGTAATTGTCTATT
59 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATT
* * * *
35169 T-AAATTCTTTATAACCAGTATTTGAGTAATTGTCTATTTAAAATC-ATTATAATCACTTGATTT
123 TCAAA-TCGTTAT-ACC--T-TTT--GT-TTTATC-A--TAAAA-CAATTAT-TTC-C---A---
* *
35232 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAGCACAAATTTAAACAAAATAAAATAATATTGATTTATTAAT
168 -TCAT---ACAA--GCTT-A-TT--CA-AAA--T----AAAAT-AAA-ACTA---ATTTATTAAT
** * * * * ** ** *
35297 ATTTTTGAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATTAGTAAAAATAAT
211 A-TTTCAAAATT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
35362 TATGGCCATTCGAA-AGATTATCTATTTGAAATCGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
271 TATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATAAAA-AAT
*
35426 TGTTTTTAATCATACAA
333 TATTTTTAATCATACAA
* *
35443 GCTTATTCGAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT--TAA-TAAGAGATTTA
* * ** * * *
35507 AAAAATAAATCTATTTA-TCGAACTAGTTCAAATGGTTACAACTATTTGAACAATTTTCAATCTC
61 AAAAATAAATCTATTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * ** * *
35571 -AATTGTTA-AGATCTTTGTTTTATAATTAAACAATTGTTTTTGATCATAAAAGCTTATTC-AAT
125 AAATCGTTATACCT-TTTGTTTTATCATAAAACAATT-ATTTCCATCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * **
35633 TAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTAAATGTGCT
188 T-AAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATT
* *** * * ** * * * * * * * **
35697 TGCGGCACCAGTTCAAATAATTAAAACCATTAGAATAATTATCTATTACAGATTGTTTTGATATT
250 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTT
* * * *
35762 TTGTTAAGT--TAAAAAA-TATTTATTTCATATCTTATAA
315 TTATT-TGTCATAAAAAATTA-TT-TTT-A-ATCATACAA
* * * * * *
35799 GCTTATTCGAAATAACATAATCCAAATTTATTAACATT-TGGAAAA-TTAAAAAGAAAAAGATTT
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTTAATAAG----AGATTT
* * * * *
35862 GAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATTATTTATT
60 -AAAAAATAAATCTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * * * * * *
35926 TAAAATTGTTATGACCTTTCCTTTTGA-CATATAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCATATCCA
123 TCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTATTTCCA-TCATACAAGCTTATTCA
* * *
35990 AAATAAAATAATAA-TAATTTCTTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATAAA
185 AAATAAAATAA-AACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAG--AGA-TTT--AAAAATAAA
* * * * *
36054 TTTATTTA-CAGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTA
244 TCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * ** * * * *
36118 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GCTTCAGTTCCTATAA
308 TAACCTTTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTA-ATCATACAA
* * * * **
36162 GCTTATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTC-CAAAA-GTAATAAGTTATTTAAAAA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * * *
36225 GTGAATATGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATCACCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATC
65 ATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* ** * * * **
36290 GTTGTTACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTGTTTTATATCATACAAGCTTATTCAGAAATAAA
130 GTT-ATACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-ATTTCCATCATACAAGCTTATTCA-AAATAAA
* * * * * * *
36355 ATAATACTAATTTCTTCATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAATTTGTTTAC
192 ATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTAC
* * * ** *
36420 TGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTGTATACTTCAAATCAAATTTTTACAAA
253 -CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T-TAT-C-T-ATTTCAAATTGTT-----
* * * * ** *
36484 ATAAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTATGTTCATACATG
307 AT-AACCTTTTATT-TGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACA-A
* * *
36531 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-TAAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAA
1 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA-TT--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * * * * * * * *
36595 AAATTAAATTTGTTT-GTCAAACTAGTTTAATTTGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCA
62 AAAATAAATCTATTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * **
36659 AATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTTTTTCGATTCATACTAGCTTATTTGAAAT
126 AATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCA-TCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
36724 AAAATAAAA-TAAAATTATTAATATTACAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTA
189 AAAATAAAACT-AATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * * *
36788 CCTAACTAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAAATGTTATAACTTTTT
252 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC-CTTT
* * * ** *
36853 TGTTTTGTCAT-AAAATTTGTTTTTGTTCATATAA
316 T-ATTTGTCATAAAAAATTATTTTTAATCATACAA
* ** * * * *
36887 GTT-TGTTTAGAATAAAATAATACAAATCTATTAATATTAC-AAAAA-TTCATAAGAGATTTTAA
1 CTTAT-TCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTTAATAAGAGATTTAAA
* * *
36949 AAATAAATCTTTTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTAAT-TATTTCA
63 AAATAAATCTATTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCA
* * ** * * * * *
37012 AATCGTTTTGACTTTTTGTTCCATTATAAAACAA-TAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAT
126 AATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA-TTTCCA-TCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * * *
37076 TAAAATAATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAATTAAAAAATTTAAAACATAAATATG
188 TAAAATAAAACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAA-ATAAATCTA
* * * * * * *
37141 TTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-C
248 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
* * * *
37205 TTTTGTTTTGTCATAAGAAAATTA-TTTCAGTTCATATAA
313 TTTT-ATTTGTCATAA-AAAATTATTTTTA-ATCATACAA
* * * * * *
37244 GGTTATTCAAAATAAAATAATAGTAAGTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * * * * * **
37309 AAAATAAAACTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTGGA
62 AAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
37374 ATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATT-TCATCTATTTATACAAGCCTATTTC-AG
127 ATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACA-ATTAT-TTCCA-TCATACAAGCTTA-TTCAAA
** * * * *
37436 ATAAAATAATTCAAATTTATTACTA--ACAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
187 ATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-A-A-AATT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAT
* * * * *
37499 CTGTTCACCACAA-AAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAC----A---A---CGAATTATTAT
245 CTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * **
37553 AACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAA
309 AACCTTTTA-TTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACAA
* * * * *
37596 GCTTATTC-AAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAGTAAGCAAAAGATTTA
1 -CTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--TAA-TAAGAGATTTA
* * * * * * * * *
37660 AAACATAAATATGTTTACCAAACAATTTCAAATACTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
61 AAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * ** * **
37725 AATCATTGTGACCTTTTGTTTT-GCAATAAAATAATTGTTGCGGTTA-ACATAAGCTTATTTGAA
126 AATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATC-ATAAAACAATTATTTCCATCATAC--AAGCTTATTCAAA
* * * * ** *
37788 GTAAAACAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAGAAAAATGAAT
187 ATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC--AAAATT--T-AATAAGAG-A-TTTAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
37852 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATCTGAACAATTATATATTTAAAAATATTATG
245 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * ** ** *
37917 ACCTTTTGTTTTGTCAGAAAATAATTGGTTTTGTTCATCCAA
310 ACCTTTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACAA
* * * * *
37959 GCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTAATTAATATTC-CAAAAGTT-ATAAGCGAAAATTTG
1 -CTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTAATAA--G-AGATTTA
* * * * * *
38020 AAAAATGAATTTTTTTATTAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATTTATTTC
61 AAAAATAAATCTATTTACTAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ***
38084 AAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTATTCATGCAAGCTTATTTGGAA
125 AAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCA-TCATACAAGCTTATTCAAAA
* * *
38149 -AAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
188 TAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTTAATAAG----AGATTT-AAAAATAAATCT
* * * * * ** * *
38212 TTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAT
247 ATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
* * * * * *
38277 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAA
312 CTTTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACAA
* * * * *
38317 GTATATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAA
1 CT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAA
* * ** * ** * * ** *
38382 AGAATAAAT-TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCCTGTCTATTTGACCAAACATCTATTTCGA
62 AAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
38446 A-CTATTATGA-CATTT-TTTTATCATAAAATAAGGCCAATTATTCAAAATAATTGGCATTCATA
127 ATC-GTTAT-ACCTTTTGTTTTATCAT--AA-AA---C-A--ATT----AT--TT-CCA-TCATA
** * * * * * *
38508 CAAAATTATTTAGAATAAAATAATACAAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG-GATTTAAA
173 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGATTT-AA
* * *** * * * * ** *
38572 AAATAAATGTGTTTATTGAACTAGTTCAAATAATGAAG-CTTATGAGAATAATTATCTATTTCAA
237 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * *
38636 ATCGTTCTGAA-CTTTTATTTAGTCATAAAATAATTA-TTTTAATGTATACATG
301 ATTGTTAT-AACCTTTTATTT-GTCATAAAA-AATTATTTTTAAT-CATACA-A
* * *
38688 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAGAAAA-TTAATAAGCAAGAAATTAA
1 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTTAATAAG--AG--ATTTA
* * * * *
38751 AAAAATAAATTTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
61 AAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * ** * * * *
38815 AATTATTATGACCTTTTTATTTTTATTGTAAAACAATTGTTTCAATACATAAAAGCTTATCCAAA
126 AATCGTTAT-ACC-TTTT-GTTTTATCATAAAACAATTATTTCCAT-CATACAAGCTTATTCAAA
* * * * *
38880 ATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAATTTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT-T
187 ATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAA-ATT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCT
* * * * * * *
38943 AGTTTA-TAGAATCAA-TTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAA-TGATTA
247 A-TTTACCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG-TTA
* * * *
39005 TGAA-TTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTTTCATCATACAA
308 T-AACCTTTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACAA
* ** * * * * **
39049 GCCTATTCGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAGAAATTAATAAGTAGGAGATGCAA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAA
** * * * *
39114 AAAATTGATCTGTTTACTGAA-TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCA
62 AAAATAAATCTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *** * *
39178 AATTGTTATAAGCTTTTGTTATATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAAT
126 AATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA-TTTCCATCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
39243 AAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAATTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTA
189 AAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAA-TT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA
** * * * * * * ** *
39307 TTTACCAAACCGGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCTTTATTTTAAATCGTTAGGACT
248 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
* * * * ** *
39372 TTTTGTTTTATCGTAAAACAATT-TTTTTAGTTTTAGTAA
313 TTTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATA-CAA
* ** *
39411 CTTATT-TAGCGTAAAA-AA-A--AA-TTATTAATATT-TCAAAAA-TTAGTAAGAGATTTAAAA
1 CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTTAATAAGAGATTTAAAA
* * * * ** * *
39468 AATAATTATGTTTGCCGAA-TCAATTCAAATAATTATGA-TATTTGAACAATTATCTATTTCGAA
64 AATAAATCTATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AA
* * * * *** ** * ***
39531 GTCATTATTACCTTTTG-TTTGTCAAAAAACAAATGCT-TTTTGTTCATGTAAGTTTATTTGGAA
127 ATCGTTA-TACCTTTTGTTTTATCATAAAAC-AAT--TATTTCCATCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
39594 TAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGGAAAAATTAAGAAGTTAAGAGATTTAAAAA-ATAAT
188 TAAAATAAAACTAATTTATTAA-TATTT--CAAAATT--TAA--TAAGAGATTTAAAAATA-AAT
* * * * * * * * **
39658 -TGTTTACTAAACCAGTTGAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTAT-T-TTACATGTTAATCAT
245 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA----AATTGT
* * * * * * *
39720 GAGTGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCTATTCATGACATC
306 TA-TAACCT-TTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCAT-ACA-A
* * * * * *
39769 CTTATTTCG-GATAAAGTAATGCTAATTTATTAACCAGTTCTAAAAAATTAAAAATGTAACGAAA
1 CTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TA-TTCT-AAAAATT--TAA--TAA-GAGA
* ** * * * *
39833 TTTCAAAAATGAAAT-T-TGTTAGCTTGACGAGTGCAAATA-TTATAACTGTTTGAAACAATT-T
57 TTTAAAAAAT-AAATCTAT-TTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTAT
* * *** * * *
39894 CTATTTTCAAAATTGTTATGACGCATTT-TTTTATTGCAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGC
118 CTA-TTTC-AAATCGTTAT-AC-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCA-TCATACAAGC
* ** *
39958 TTA-TCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGCTTTAA
178 TTATTC-AAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC--AAAATT--TAA-TAAGAGATTT-A
* * * ** * * * *
40021 AAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAGCAATTATCTATATCAA
236 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
40086 ATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTATTCATACAA
301 ATTGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACAA
** * * * * *
40137 GCTTATTTTAAATAAAATAATACAAAATTT-TTAATATTCCAAAAA-TTAATGAGTAAAAATTAA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTTAATAAG--AGATTTAA
*
40200 AAAA-AAAGT-T-TTT--TGAACAC-A-TTCAAATAGTT-TGACTATTTGATCAATTATCTATTT
62 AAAATAAA-TCTATTTACT-AA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * ** * * **
40257 CAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCAGAAACCAATTTGTTTCTGTTCATACGAGCCTATTTGA
124 CAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTATTTC-CATCATACAAGCTTATTCAA
** * * * *
40322 AATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
186 AATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATC
* * * * * * * * * * * *
40387 TGTTTATCGAGCAACTTTAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTGTTTATTTAAAATAGTTATGA
246 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-A
* * * * *
40452 TCTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA
310 ACCTTT-TATTTGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACAA
* * * * *
40494 GTTTATTGGGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAA
1 -CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * * * *
40559 AAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAAA
62 AAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * ** * ** * *
40624 ATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTGTGCAAAATTATTTAGAAT-
127 ATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCA-TCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * *
40688 AAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAA-TTAATACGAGATTTAAAAACTAATATGT-TTGTA
190 AAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAA-TAA-ATCTATT-TA
* * * * * ** * *
40751 -GAAACAA-TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATCTCAAATAATTATGATC-TTT
252 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
* ** *
40813 ATTTTGTCATAAAATAGTT-TGTTTCTTTTTATACAA
317 A-TTTGTCATAAAA-AATTAT-TTT-TAATCATACAA
* * * * *
40849 GTTTCATTC-AATTAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-TTAATAAAAGATTTAA
1 -CTT-ATTCGAA--ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTAATAAGAGATTT-A
* * * * * *
40912 AAAAATAAATGTATTTA-TCGAACCA-TTCAAATAGTTCA-GACTATTAGAGC-ATTATTTATTT
61 AAAAATAAATCTATTTACT-AAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
40973 CAAATTGTTCCTGCACCCTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTATTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
124 CAAATCGTT-AT--ACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTATTTCCA--TCATACAAGCTTATT
* * * * * *
41037 C-AAACAAAATAATAGC-AATTTATTAACATTTGAAAATAATGAGTAAGAGA-TTAAAAA-AAA-
183 CAAAATAAAATAA-AACTAATTTATTAATATTTCAAAAT--TTAATAAGAGATTTAAAAATAAAT
* * * ** * * * * **
41097 ATGTTTATCAAACAAGTTGTAATAGAT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAGTTATTACG
245 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * ** * *
41160 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACATT-TGTTTTGGTTCAAAAAA
310 ACCTTTT-ATTTGTCATAAAAAATTAT-TTTT-AATCATACAA
** * * * * *
41202 CTTAACCGAAATCAAAATAATACTAACTTCACTAATATTTTAAAACTTAGTAAGCAAGAGATTTA
1 CTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAA-TTTATTAATATTCTAAAAATT--TAA-TAAGAGATTTA
* * * ** * * * * *
41267 AAAACT-AATCTGTTTTTCGCACCAAATTCAAATA-TTATGAACTATTTGAACAAATATCAATCT
61 AAAAATAAATCT-ATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTAT-T
* * * * * * *
41330 TAAAATAGTTATGATC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATAC-AGGTT-TT--A
123 TCAAATCGTTAT-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC-CATCATACAAGCTTATTCAA
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183 CAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCT
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252 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
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* * * * * *
42396 AATCATTATTACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTTTCCAACATTCAAGCCTATTCAAAAT
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*
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252 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
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317 ATT-TGTCATAAAA-AATTATTTTTAATCATACA-A
* *
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1 C-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--TAA-TAAGAGA-TTTA
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42690 AAAAATAAATCTATTTTCCAAACTAGTTCAAA-AGTTAAGACTATATGTACAATTATTTATTTCA
61 AAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
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42818 TAGAATAAAACTAATTTATTAAT-TGTTCAAAATTTTGTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTT
188 TAAAATAAAACTAATTTATTAATAT-TTCAAAATTTAATAAGAGATTTA-AAAATAAATCTATTT
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42882 ACTGAACCAGTTTAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTC
251 ACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
Statistics
Matches: 7655, Mismatches: 1737, Indels: 1287
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
345 1 0.00
346 7 0.00
347 43 0.01
348 36 0.00
349 80 0.01
350 14 0.00
351 120 0.02
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392 4 0.00
393 2 0.00
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405 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (349 bp):
CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAAA
TAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
TTATACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCCATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
AACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTGTCAT
AAAAAATTATTTTTAATCATACAA
Done.