Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168015.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_27, whole genome shotgun sequence
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Warning! 118000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 29 of 93
Found at i:3342301 original size:34 final size:34
Alignment explanation
Indices: 3342219--3342323 Score: 122
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3342209 GGCTTGTGAT
* * * *
3342219 TTAATACCAATCATTTTCATTTTCTGACTCATGAT
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* *
3342254 TTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGG
1 TTAATCCCAATCATTTTCATTTTCTAACCCATGG
*
3342288 TTAATCCCAATCATTTTCATTTTTTGAA-CCATGG
1 TTAATCCCAATCATTTTCATTTTCT-AACCCATGG
3342322 TT
1 TT
3342324 TAATTTCGAT
Statistics
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TTAATCCCAATCATTTTCATTTTCTAACCCATGG
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3342112 AATTTTCATT
* * ** * * * *
3342122 ATCATTTTCATTTTTTGATTTGTGGTTTAATCTTGATTGTTTTGATTTTCTTACTCATGATTTAA
1 ATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAA
* * * * * ** * ** *
3342187 TTTCAATCATTTTTATTTTAGTGGCTTGTGATTTAATACCA
66 -TCCCACCATTTTCATTTT-CTAACATGTGATTTAATTTCG
* ** *
3342228 ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGG-TTAA
1 ATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAA
* *
3342292 TCCCAATCATTTTCATTTTTTGAACCATG-G-TTTAATTTCG
66 TCCC-ACCATTTTCATTTTCT-AA-CATGTGATTTAATTTCG
* * * ***
3342332 ATTATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAA
1 ATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAA
* * * *
3342397 TTCCACCATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTGG
66 TCCCACCATTTTCATTTTCTAACATGTGATTTAATTTCG
* *
3342436 GTCATTTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATC
1 ATCATTTTCAT-TTTT-TGACTTGTGGTTTAATC
3342470 CCAATTGTCT
Statistics
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102 3 0.02
103 3 0.02
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ATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAA
TCCCACCATTTTCATTTTCTAACATGTGATTTAATTTCG
Found at i:3342422 original size:69 final size:69
Alignment explanation
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3342114 TTTTCATTAT
* * * * ** * *
3342124 CATTTTCATTTTTTGATTTGTGGTTTAATCTTGATTGTTTTGATTTTCTT-ACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAA-
* *
3342188 TTCAAT
64 TTCCAC
* * ** * * * *
3342194 CATTTTTATTTTAGTGGCTTGTGATTTAATAC-CAATCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTT-CTAACTTGTGGTTTAAT-CTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA
* *
3342258 TCTCGAT
64 T-TCCAC
*** * *
3342265 CATTTTCATTTTCTAACCCATGG-TTAATCCCAATCATTTTCATTTTTTGAAC-CATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTG-ACTCATGGTTTAA-
* *
3342328 TTCGAT
64 TTCCAC
* * * **
3342334 TATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATT
3342399 CCAC
66 CCAC
* * * * * * **
3342403 CATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTGGGTCATTTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCAT-TTTT-TGACTCATGGTTTAA
3342468 -TCC-C
64 TTCCAC
* * * *
3342472 AATTGTCTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAACCT-GATCATTTT
1 CA-T-T-TTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTT
3342515 TCCTTTTCTA
Statistics
Matches: 256, Mismatches: 51, Indels: 27
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
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69 97 0.38
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72 22 0.09
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Consensus pattern (69 bp):
CATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATT
CCAC
Found at i:3342513 original size:106 final size:106
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Period size: 106 Copynumber: 8.8 Consensus size: 106
3342113 ATTTTCATTA
* *** * * * * *
3342123 TCATTTTCAT-TTTT-TGATTTGTGGTTTAATCTTGATTGTTTTGATTTTCTTACTCATGATTTA
1 TCATTTT-ATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
* * * ** ** **
3342186 AT-TTCAATCATTTTTATTTTAGTGGCTTGTGATTTAATACCAA
65 ATCCT-GATCATTTTTATTTT-CTAACTTGTGATTTAATTTCGG
* ** * * * * * * *
3342229 TCATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGG-TTAA
1 TCATTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
** * * * *
3342292 TCCCAATCATTTTCATTTTTTGAACCATG-G-TTTAATTTCGA
66 TCCTGATCATTTTTATTTTCT-AA-CTTGTGATTTAATTTCGG
* * * * * *
3342333 TTATTTTCAT-TTTT-TGACTTGTGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTA
1 TCATTTT-ATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
* *
3342396 ATTCC--ACCATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTGGG
65 A-TCCTGATCATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTCGG
* *
3342437 TCATTTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATTGTCTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
1 TCA-TTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
* * * * * * *
3342502 A-CCTGATCATTTTTCCTTTTCTAGCTGGTGGTTTCATCTCAG
65 ATCCTGATCATTTTT-ATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTCGG
* * * * * * * * *
3342544 TCATTTT-CACTCTCTAACTCGTGCTTTAATCCCTATGGTTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
* * * * *
3342608 TCTTGATCATTTTCAGTTT-TAGACTTATGATTTAATTTTGG
66 TCCTGATCATTTTTATTTTCTA-ACTTGTGATTTAATTTCGG
* * * * * * *** * * * * ** *
3342649 TCAATTT-TATTTTCTAACTCGTGATTTAGTTCTGGTTGTTTTCATTTTTTAACTAGTGGCCTGA
1 TCATTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
* * * * * *
3342713 T-CTCGATC-TTTTTCTTTTTTTGACTCGTGATTTGATTTTGG
66 TCCT-GATCATTTTT-ATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTCGG
* * * ** * ** * * * *
3342754 TTATTTT-TATTTCTTTGACCTGTTATTTAATGCTGATCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTA
1 TCATTTTATATTT-TCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
** * * ** * *
3342818 ATTTTGATCATTTTCT-TTTGCTGACTCATGGTTTAATGTCGG
65 ATCCTGATCATTTT-TATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTCGG
* * * * * *
3342860 TCATTTTCA-CTTTT-TGACTTGTGGTTTAATCCCCTATTGTTTTACATTTTTTGACTCATGCTT
1 TCATTTT-ATATTTTCTGACTTGTGGTTTAAT-CCCAATCGTTTT-CATTTTCTGACTCGTGGTT
* * * ** **
3342923 TAATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTGATGCAT-TG-TTTAATCCCTT
63 TAAT-CCTGATCATTTTTATTTTCT-A-ACTTGTGATTTAATTTCGG
* * * * * * *
3342967 TCATTTT-TATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCCAGTCATTTTTCATATTT-TTACTCGTCGTTT
1 TCATTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATC-GTTTTCAT-TTTCTGACTCGTGGTTT
* *
3343030 AAT-CTCGATCGTTTTTATTTTTTAACT
64 AATCCT-GATCATTTTTATTTTCTAACT
3343057 CATGGTGTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TCATTTTATATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
TCCTGATCATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTCGG
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Alignment explanation
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3343217 TTTCATTATT
* *
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* * * *
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1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * ** * * *
3343297 ATTTTTATCTTTCT-AGCTTGTGATTTAATGTAGACC
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* * * *
3343333 ATTTTCATTTTCTAACTCGTTATTTAATCTC-AGTC
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* * * *
3343368 GTTTTCATTTTCTAAC-CGATGGTTTAATCT-TAGTT
1 GTTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCTCGA-TC
* * *
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1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTC-GATC
* * *
3343438 GTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATC-CTAGTT
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGA-TC
* * * * *
3343473 GTTTTTATTTTCTGACTCATTATTTAATGTCGGTT
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * * *
3343508 GTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAACCCCGATC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * * * *
3343543 ATTTTCATTTCCTGACTCATGTTTTGAT-TCTGGTC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTC-GATC
* * * *
3343578 ATTATT-ATTTCTCCGACTCATGGTTTAATC-C-CT-
1 GTT-TTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * *
3343611 GTTATCATCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCTCGATC
1 GTT-T--TCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* *
3343649 GTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTCATCTC-AGTC
1 G-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGA-TC
* * * *
3343685 ATTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTAATCTTC-ATC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-TCGATC
* * * *
3343720 GTTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATC-CTGGTC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTC-GATC
* * * * * *
3343755 TTTTTCAATTTT-AGGCTCATGATTTAATTTGGGTC
1 GTTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * * ** *
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1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGA-TC
* * *
3343825 ATTTTCA-ATTCTTGACT-A-GTAGTTTAATC-CTGGTC
1 GTTTTCATTTTC-TGACTCATG-A-TTTAATCTC-GATC
* * * *
3343860 ATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGAT-TCTGGTC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTC-GATC
* ** * * * *
3343895 ATTTTTGTTTCTTTGACTCGTGATTTAATGTCGGTC
1 GTTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * * *
3343931 ATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAAT-TCCAGTC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGA-TC
* * * * *
3343966 GTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTC-TTA
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-TCGATC
* * * * * * *
3344001 ATTTTCATTTT-TCAAGTTAT-AGTTACATCCCTG-TT
1 GTTTTCATTTTCT-GACTCATGATTTA-ATCTC-GATC
* * ** * * *
3344036 GTTTTATATTTTTTGACTTGTGCTTTAATCCCTATC
1 GTTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * *
3344072 ATTTTCATTTTTTGACACATTG-TTTAATC-CTG-TC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCTC-GATC
* * *
3344106 -TTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAAT-TCCTATC
1 GTTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCT-CGATC
* * * *
3344141 ATTTTCATTTTTTGACTCATGATATAATCTTGATC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* * * * *
3344176 ATTTCTCATTTTTTAACTCGTCATTTAATCTCGATC
1 GTTT-TCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
* *
3344212 GCTTTCATTTACTGACT
1 GTTTTCATTTTCTGACT
3344229 GGCGGTTTTC
Statistics
Matches: 738, Mismatches: 166, Indels: 126
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
33 13 0.02
34 41 0.06
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39 2 0.00
ACGTcount: A:0.20, C:0.18, G:0.11, T:0.51
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GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC
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Indices: 3343514--3343713 Score: 253
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* * * *
3343514 ATTTTTTGACTCATGATTTAACCCCGATC-ATTTTCATTTCCTGACTCATGTTTTGAT-TCTGGT
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*
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* * * * *
3343620 ATTTTTTGACCCATGGTTTAATCTCGATCGTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTCATCTCAGTC
1 ATTTTTTGACCCATGATTTAACCCCGATCGATTTTCATTTCCTGACTCATGGTTTCATCTCAGTC
*
3343685 ATTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTAATC
66 ATTTTCATTCTCCAACTCATGGTTTAATC
3343714 TTCATCGTTT
Statistics
Matches: 80, Mismatches: 11, Indels: 6
0.82 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
106 47 0.59
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108 2 0.03
ACGTcount: A:0.20, C:0.22, G:0.12, T:0.47
Consensus pattern (106 bp):
ATTTTTTGACCCATGATTTAACCCCGATCGATTTTCATTTCCTGACTCATGGTTTCATCTCAGTC
ATTTTCATTCTCCAACTCATGGTTTAATCCCTGTTATCATC
Found at i:3343931 original size:36 final size:35
Alignment explanation
Indices: 3343404--3353209 Score: 939
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3343394 ATCTTAGTTG
* * * * *
3343404 TTTTCATTTTCTGACCCATGGTTTAATCCTGGTCG
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* * **
3343439 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAGTTG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
* * * **
3343474 TTTTTATTTTCTGACTCATTATTTAATGTC-GGTTG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TCTGGTCA
* ** * *
3343509 TTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAACCCCGATCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
** * *
3343544 TTTTCATTTCCTGACTCATGTTTTGATTCTGGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
** * * *
3343579 TTATT-ATTTCTCCGACTCATGGTTTAATCCCT-GTTA
1 TT-TTCATTT-TTTGACTCATGATTTAAT-TCTGGTCA
** * * * *
3343615 TCATCATTTTTTGACCCATGGTTTAA-TCTCGATCGT
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTC-A
* * * *
3343651 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTCA-TCTCAGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTCA
* * * * ** *
3343686 TTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTAA-TCTTCATCG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTC-TGGTCA
* * * * * *
3343721 TTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGGTCT
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
* * *
3343756 TTTTCAATTTTAGGCTCATGATTTAATT-TGGGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTCA
* * * ** *
3343791 TTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATT-TCAGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTCA
* * *
3343826 TTTTCAATTCTTGACT-A-GTAGTTTAATCCTGGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATG-A-TTTAATTCTGGTCA
* * *
3343861 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
** *
3343896 TTTTTGTTTCTTTGACTCGTGATTTAATGTC-GGTCA
1 TTTTCATTT-TTTGACTCATGATTTAAT-TCTGGTCA
* ** *
3343932 TTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
* * * * *
3343967 TTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTCT--TAA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA--TTCTGGTCA
** * * * * **
3344002 TTTTCATTTTTCAAGTTAT-AGTTACATCCCT-GTTG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA-AT-TCTGGTCA
* ** * * *
3344037 TTTTATATTTTTTGACTTGTGCTTTAATCCCT-ATCA
1 TTTT-CATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TCTGGTCA
* *
3344073 TTTTCATTTTTTGACACATTG-TTTAATCCT-GTC-
1 TTTTCATTTTTTGACTCA-TGATTTAATTCTGGTCA
* *
3344106 TTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCT-ATCA
1 TTTTC-ATTTTTTGACTCATGATTTAATT-CTGGTCA
* *
3344142 TTTTCATTTTTTGACTCATGATATAA-TCTTGATCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTC-TGGTCA
* * * * *
3344177 TTTCTCATTTTTTAACTCGTCATTTAA-TCTCGATCG
1 TTT-TCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTCA
* ** * * *
3344213 CTTTCATTTACTGACTGGC-GGTTTTCATTTTCCCACTAAAGGTTCA
1 TTTTCATTTTTTGACT--CATGATTT-A-ATT----CT---GG-TCA
* * * *
3344259 TTCCCAATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAATT-TAGGTCG
1 TT----TTC-ATTT-----TTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTCA
* * * * * * * **
3344304 TTTCCATTTTTTAACTCACGTTTTACTCCCGGTTG
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* * * * * *
3344339 TTTTCATTTTCTGACTCCTAAATTAATT-TCAGTAA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTCA
* * * * *
3344374 TTTTTATTATCATTT--TTC-T-TTTCTGACTCGTGGTTCAA
1 TTTTCATT-T--TTTGACTCATGATT-TAATTC-TGG-TC-A
* * *
3344412 TCTTGATCATTTTCATTTTGACTCGTGATTGAATT-TCGATCA
1 T-TT--TCA--TT--TTTTGACTCATGATTTAATTCT-GGTCA
** * ** * * *
3344454 TTTTTGTTTCTCTGACTTGTGATTTAATACTGATCG
1 TTTTCATTT-TTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
* * **
3344490 TTTTCATTTTCTT-ACTCGTAATTTAA-TCTTGGTTG
1 TTTTCATTTT-TTGACTCATGATTTAATTC-TGGTCA
* * * * ** **
3344525 TTTTCATTTTCTAACCCATTG-TTTAATCCTAATTGG
1 TTTTCATTTTTTGACTCA-TGATTTAATTCT-GGTCA
* * * * * *** *
3344561 TTTT-AATTTCTGACCCGT-AGTTTAATCCCAATCG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGA-TTTAATTCTGGTCA
* * ** * * *
3344595 TTTTCATTTTCTAACTTGTGATTTAATCCAGGTCG
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
* * * **
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
* *
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* * ***
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*** ** * * * *
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** **** * * *
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* ***
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* * * * *
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* * * * *
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*** * **
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* **
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* * * **
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* * * * * * *
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* * * * **
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* * * ** *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCA
* * * ***
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* * *
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* * * ***
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* * * * * * **
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* *
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* * * *
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** * * ** **
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** ** *
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** * * *
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* * * * *
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* * * ** *
3345188 TCATTTTCTCTTTT-TGACTTGTGGTTTAATCCCCG-TTGTTTTGCATTTTCTGACTCATGCTTT
1 TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTT-CATTTTCTGACTCATGGTTT
* * ** * *
3345251 AATCCTTGTAGTTTTCA-TTTTCCA-ACATGTTGTTTTATCCCTA-
63 AATCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATG--GTTTAATCCC-AG
* * * * * * * *
3345294 TAATTTTTATTTT-TGATTTGTGGTGTAATCCGGATCATTTTTCAATTTCTAACTCATTGTTTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * **
3345358 TCCTGATCGCTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAATCCTTG
65 TCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * * * * * * *
3345399 TGGTTTTCATTTTCTCACTCAG-GGTTTAGTCC-CAGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTGCTTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACT-TGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * *
3345462 ATTCTAGTCGTTTTCA-TTTTTCA-ACAGGCGTTTTAATCCTAG
64 A-TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATG-G-TTTAATCCCAG
* * * * * * *
3345504 TCATTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAATTTTGGTAATTTTCATTATCATTTTCATTTTCTGAT
1 TCATTTTTATTTTCTGA--C-T--TGTGA--TT--TAA---TCCTGATCATTTTCATTTTCTGAC
* * * **
3345569 TTATGGTTTAATCTC-GATCGTTTTCATTTTTTGATTCATGATTTAATTTC-G
54 TCATGGTTTAATC-CAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * *
3345620 ATCATTTTTA-TTTCATTGGCTTATGATTTAATACC-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATT
1 -TCATTTTTATTTTC--TGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTT
* * * * * *
3345683 TAATCTCAGTCATTTTCATTTTCTAACCCATTG-ATAATCCC-G
62 TAATC-CAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * ** * * *
3345725 ATCATTTTCATTTTCTGAACCATG-G-TTTAAT-TTTAGTTGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATT
1 -TCATTTTTATTTTCTG-A-CTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTT
**
3345787 TAATCTGGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTCCCA-
62 TAATCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCCAG
* * * *
3345831 TCATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTTTCTAACT-ATGGTTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * *
3345894 ATCCCCA-TTGTCTTT-GTTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-CCTG
64 AT--CCAGTCGT-TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * * *
3345935 ATCGTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCATCTTAATCATTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTA
1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * * **
3346000 ATCCCCGTGGTTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAAT-CTTG
64 AT-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** ** * * * * *
3346041 ATCATTTTCGATTTT-AGACTCATGATTTAATTTTGGTCAATTTT-AATTTCTAACTCGTGATTA
1 -TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTT-
** * * * *
3346104 TGTTCCTA-TTGTTTTC-TTTCTTTTACT-AGTGGTCTAATCTC-G
62 TAATCC-AGTCGTTTTCATTT-TTTGACTCA-TGGTTTAATCCCAG
* * ** * * * **
3346146 ATC-TTTTTCATTTT-TCGACTCGTGATTTGATTTTGGA-CATTTTTATTTCTTTGACTCGTTAT
1 -TCATTTTT-ATTTTCT-GACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGT
* * * * ***
3346208 TTAATGCTGATCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAAT-TTTG
61 TTAATCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** * * ** *
3346252 ATCATTTTCT-TTTACTAACTCATGGTTTAAT-CTCGGTCATTTTCACTTTT-TGACTTGTGGAT
1 -TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTT
* * * * *
3346314 TAATCCCTGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCCAG
62 TAAT-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * *
3346358 TCATTTTTCATTTTTTGACTCGTCG-TTTAAT-CTCGATCGCTTTT-ATTTTTTGACTCAAGGTT
1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGT-GATTTAATCCT-GATC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTT
* * * * * * * * * *
3346420 TAACCCTAATGGTTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTACCAA
62 TAATCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * * * * ** *
3346464 TCGTTTTCATTTTTTGAGTCGTGCTTTAATACC-GGTCATTTTTATTTTTTAACTCGCGTTTTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * ** ****
3346528 TCCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAATTATGG
65 TCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** * * *
3346569 TAATTTTCATTATTGTTTTCATTTTCGAAGTCATGGTTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTAA
1 TCA-TTT--TTA---TTTTC----T-G-ACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGA
* * * * * * * ** * ***
3346633 CTCTTGATTTAATTTCAATCATTTTTATTTCTCT-AGCTTGTGATTTAAT-GTTG
53 CTCATGGTTTAA-TCCAGTCGTTTTCATTT-TTTGA-CTCATGGTTTAATCCCAG
* * * ** * * * *
3346686 ACTATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT-CTCAGTCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTA
1 TC-ATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * **
3346750 ATCCTGGTTGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTTAATCCTGG
64 ATCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * ** * * *
3346792 TCGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTGACTCATTGTTTAAT
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3346857 GCTAGT-TTTTTTA-TTTCTGACTCATGATTTAATCCC-G
66 -CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * ** ** ** * ** *
3346894 ATCGTTTTCATTTTCTAACTCATG-TTTTGTTTTGGTCATTATT-ATTTCTCCAACTCATGATTT
1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATT-TTCATTT-TCTGACTCATGGTTT
* * * *
3346957 AATCCCTGTTGTCTTCATTTTTTGAC-CTGTGGTTTAATCCC-G
63 AAT-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAATCCCAG
* ** * * * * * *
3346999 ATCGTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTCAT-CTCAGTCATTTTCATTCTCTAACTCATGCTTT
1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
* * *
3347063 AATCTTC-CTCGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG
63 AATC--CAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * ** * * * * *
3347106 TCATTTTCAATTT-TAAGCTCGTGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTTTAACTCATGATTTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGA-CTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * ***
3347170 TTCCAGTCATTTTCGTTTCTTGACT-AGTGGTTTAATCTTGG
65 -TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * * * *
3347211 TCATTTTCATTTTCTAAC-TGATGATTTGATTCTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATATA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTG-TGATTTAATCCTGATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTA
** * ** *** *
3347275 ATAATAGT-GATTTTCATTTTTTCACTCATAATTTAATTATAC
64 AT-CCAGTCG-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** * * ** * * **
3347317 T-AGTTTTCATTTTCTAACTTAAGGTTTAATCTTCTTCATTTTCCTTTTTTGACTTGTGGTTTAA
1 TCA-TTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* ** * *
3347381 TCCCCGTTTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCAA
65 T-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * *
3347422 TCATTTTTCATTTTTTGAC-TGATGGA-TTCAT-CTCGGTCATTTTCATTCTT-TGACTCATGGT
1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTG-T-GATTTAATCCT-GATCATTTTCATT-TTCTGACTCATGGT
* * * * * *
3347483 TTAATTCCTA-TCGTTTTAATTTTCTAACTCATGGATTAATCTCGG
61 TTAA-TCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** ** * * *
3347528 TCGTTTTTAATTTT-AGACTCATGATTTAATTTTGATCATTTTAAATTTT-TGACTAATGGTTCA
1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTT-CATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * * * **
3347591 ATCCCAATCATTTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATTCGGG
64 AT-CCAGTC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* ** **
3347634 TCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATGTCC--ATCATTTTCAATTTT-TGACTCATCATT
1 TCATTTTTATTT-TCTGACTTGTGATTTAA--TCCTGATCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTT
* * ** * **
3347696 TAATTTC-GATCATTTTCATTTGCTGAGTCATGGTTTAATCTTTA-
62 TAA-TCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CCAG
* ** * ** * * **
3347740 TCATTTTCTCTTTT-TGACTTAAGGTTTAATCCCT-ATTGTTTTACATTTTCTTACTCGTTCTTT
1 TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTT-CATTTTCTGACTCATGGTTT
* * ** * * *
3347803 AATCCCTGTAGTTTTC-TTTTTCCAACACATTGTTTTATCCCTA-
63 AAT-CCAGTCGTTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCC-AG
* * * * * * * *
3347846 TCAATTTTATTTT-TAACTCGTGATTTAATCCT-AGTCCTTTCCATTTTTTGACTCGTGGTGTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * * *
3347909 TCCTAATCATTATTCATTTTCTGACTCATTGTTTAAT-CCTG
65 TCC-AGTCGTT-TTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * ** * ** * *
3347950 ACCACTTTCATTTTCTGGCTCATGGTTTAATCCTTG-TGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTA
1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCC-TGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * * ** * * *
3348014 GTCCCAGTCATTTTCAGTTTCTAACTTGTGCTTTAATTCTAG
64 AT-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * **
3348056 TCGTTTTCATTTT-TCAAC-AG-GCATTTTAACCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTA
1 TCATTTTTATTTTCT-GACTTGTG-A-TTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTC---ATGG
* *** * * * * * * * *
3348118 TGGTAATGTTGACCATTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATCTCAA
60 T-TTAATCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * *
3348165 TCGTTTTCATTTTCTAGCCCATG-G-TTTAATCCTGGTCATTTTCA-TTTCTTAACTCATGATTT
1 TCATTTTTATTTTCT-G-ACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTT
* * * *
3348227 AATCCAGGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATTGTTTAATACCGG
63 AATCCA-GTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * * *
3348270 TTGTTTTTATTTTCTGACTTATGATTTAATCCCGATCTTTTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATC-ATTTTCATTTTCTGACTCATG-GTTTA
* ** * * * *
3348335 TTCTGGTCATTATT-ATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCCTG
64 ATCCAGTCGTT-TTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * ** * * *
3348377 TTGTCTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT-CTCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTCA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * *
3348441 TCTCAGTCATTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTAATCCTC-G
65 TC-CAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-CAG
* * * * * * * * *
3348482 TCGTTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCT-AGTCATTTTCAATTTT-AGGCTTATGATTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTA
*** * * * * * * *
3348545 ATTTTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAA
64 A-TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * *
3348587 TCATCTCTA---ACT--CATG-G-TTTAATCCTCG-TCGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * * * * ****
3348644 TCCTAGTCATTTTCAATTTTAGGCTTATGATTTAATTTTGG
65 TCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* ** * * *
3348685 TCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCC-AATCATTTTC-GTTTCTTGACTAATGGTTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAA-TCCTGATCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTA
** * * * * * * **
3348748 ATCTTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGG
64 ATC-CAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * ** * * * **
3348790 CCGTTTTTATTTTTTTGACTCATGATTTAATGCC-GGTTATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTA
1 TCATTTTTA-TTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * * * *
3348854 ATTCCAGTTGTTTTCATTTTCTAACTCAAGATTTAATCTTC-T
64 A-TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CCAG
* * ** * *
3348896 TCATTTTCACTTTTC-GACTTGTGGTTTAATCCCTG-TTGTTTTATATTTTTTCTGACTCATGCT
1 TCATTTTTA-TTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTT-CA--TTTTCTGACTCATGGT
* *** * *
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61 TTAAT-CC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCCAG
* * * *
3349004 TCATTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCT-ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTATA
1 TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAA-TCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
** * * * * **
3349068 ATCTTGATCATTTTTCATTTTTTAAGTCGTCATTTAATCTCCA-
64 ATCCAG-TC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CCAG
* * * * * * * *
3349111 TCACTTTCATTTTCTGAC--------T-A-GC-G---GTTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGT
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
* * * *** ***
3349162 CCCAATCATTTTC-TTTTTCTGACTCCTAACTTAATTTTTAG
66 -CCAGTCGTTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAA-TCCCAG
* * * *
3349203 TAATTTTTATTATCATTTTCCTTTTTTGACTAGTGGTTTAAT-CTCGATCATTTTTATTTTCTGA
1 TCA---TT-TT-T-ATTTT-C-----TGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGA
* * * ** * ***
3349267 CTC---G--TAAT-CAATCATTTTTATTTCTCTTG-CTTGTGATTTAAT-ATTG
53 CTCATGGTTTAATCCAGTCGTTTTCATTT-T-TTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * ** * * *
3349313 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTAATTTAATCTTGGTTGTTTTTATTTTCTAACCCATGGTTTAA
1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * * * * *
3349378 TCCTGATCG-TTTCATTTTCTAACCCGTAGTTTAATCCCAA
65 TCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * *
3349418 TCATTTTCATTTTTTCTGACTCGTGATTTAATCC-AAGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTT
1 TCATTTT--TATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
* * * ** * *
3349482 AATCCTAGTCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTG
63 AATCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** * * * * * * *
3349524 ATCATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCCT-ATCGTTTCCATTTTTTGACTCGTGATTCA
1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAA-TCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
** * * * * **
3349588 ATTCTGGTCTTTTTTATTTCTCTAACTTGTGGTTTAATCCC--
64 A-TCCAGTCGTTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * ** * * ** *
3349629 -CATTTTCTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTTCATTTTTTGGCTGGTGGAT
1 TCA-TTT-TT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTT
* * * * * *
3349693 TCATCTAGGTCATTTTCATTTTATGACTCATGGTTTAATTCCTG
62 TAATCCA-GTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * ** *
3349737 TCATTTTAATTTTCTAACTCGTGGA-TTAAT-CTCGATCGTTTTTAATTTT-AGACTTGTGATTT
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGT-GATTTAATCCT-GATC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
*** * * ** * **
3349799 AATTTTGGTCATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAATTTC-G
63 AA-TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* ** * * * * * *
3349841 ATCATTTTAAATTTT-TGACTAATGGTTCAATCCTAATCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTT
1 -TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
*** * * * ** *
3349905 AATTTGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTAATTTAATGCC-G
63 AA-TCCAGTCGTTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* ** * *
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1 -TCATTTT-TATTTTCTGACTTGT-GATTTAATCCT-GATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGT
* ** *
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** * * ** * ** * * *
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1 TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAATCC-TGATCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
* * * * * *
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63 -A-ATCCAGTC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* ** * * * * *
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1 TCATTTTTAT-TTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATT-TTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * **
3350223 ATCCTGATCGCTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATTCTTG
64 ATCCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACT-TGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * * *
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* * * ** * * * *
3350370 TCATTTTCT-TTTTCTAACTCGTAATTTTGGTAATGTTGACCGTTTTCATTTTCTAACTCATGAT
1 TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGA--TT--TAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGT
* * * * **
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61 TTAATC-CAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * *** * * * * ** *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
* * ** **
3350544 CCTGGTCGTTTTTATTTTCGGAC-CA---TTTAAT-GTAG
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* * * ** *
3350579 ATTATTTTTATTTTTTGAGTCATGATTTAAT-CTCGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGTTTTG
1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT-
* * * ** **
3350643 ATTCTAGTCATTATT-ATTTCTCGGACTCATGGTTTAATCCTTG
63 AATCCAGTCGTT-TTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * *
3350686 TTGTCTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAT-CTCGATCATTTTTCATTTTCTG----A-GGTTTA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * * ** * *
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64 ATC-CAG-TC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * *
3350788 TCATTTTCATTCTCTGACTTATGGTTTAATCCTTG-TCGTTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCC-TGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * * ** ****
3350852 TCCTAGTCATTTTCAATTTTAGGCTCATGACTTAATTTTGG
65 TCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAA-TCCTGATCATTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTA
* * * * * * * **
3350956 ATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGG
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** * * * * **
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1 TCATTTTTATTT-TCTGACTTG-TGATTTAAT-CCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
* * * * ****
3351061 AATTCCAGTCGTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTCATCTTTT
63 AA-TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * ** * * * * *
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1 TCATTTTTA-TTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTT-CA-TTTTCTGACTCATGGTT
* * * *
3351166 TAATCCCTA-TCATTTTCATTTTTTGACGT-TTTGTTTAATCCCTG
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* * * * *
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1 TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAA-TCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
** * * * ** *
3351274 ATCTTGCTCATTTTTCATTTTTTAACTCGTCATTTAATCTC-G
64 ATCCAG-TC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
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* ** * **
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATC-CT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
** ** * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
* * * * *
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* ** ** ** ** *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTA
* * * * * * *
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* * * *
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1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGT-GATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
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* * * ** * * * **
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1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTTA
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3352157 TCATTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTG
1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTA
* * * * ***
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* * * ** * * **
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1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATC-CTGATCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTT
* * * * * * *
3352326 AATCCCTGTTGTTTAACATTTTCTAACTCGTGCTTTAATCCCTA-
63 AAT-CCAGTCGTTT-TCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCC-AG
** * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * ** *
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* * * * * *
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62 TAATCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * ***
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* * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * * *
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65 T-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** ** * * *
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1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATT-TTCATTT-TCTGACTCATGGTT
* * * * *
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** * * * *
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1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
* * **
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* * ** * * * * *
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1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * * * **
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* * * ** * * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTA
* * ** **
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64 AT-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * *** * ** * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGAT-CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * *
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* * * * * * * **
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1 TCATTTTTATTTTCTGA-CTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTT
* * * * **
3353385 AATTCCTA-TCATTTTCATCTTTTGACTCGTGGTATAAT-CTTG
63 AA-TCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * ** *
3353427 ATCATTTTTCATCTTCTAACTCGTCATTTAAT-CTCGATCGCTTTCATTTTCTAACT-A--G---
1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
* * * * * *
3353485 ----C-G--GTTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTCCCAA
63 AATCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * * * ** *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * ** **
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64 ATCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** ** *
3353625 TAATTTTTATTATCATTTTCCTTTTTCTACTCATGGCTTAAT-CTCGATCATTTTTATTTT-TCG
1 TCA---TT-TT-T-ATTTT-C----T-GACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCT-G
* * * *** * * * * ** * * *
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* * * * * * ** * *
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1 -TCATTTTTATTTTCTGACTT-GTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * *
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* * * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * ** * *
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* * * ** * * * ** *
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1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTT
* * * * **
3354121 AATGCC-GATCATTTTCAATTTTTGACTCATCGTTTACTTTC-G
63 AAT-CCAG-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * ** * * * **
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1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTCAT-TTTCTGACTCATGGTTT
* ** * * * *
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63 AAT--CCAGTCGTTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-CAG
** * * * *
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1 TCA-TTTT-TATTTTCTGACTTG-TGATTTAAT-CCTGATC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGT
* * * *
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* ** * *
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1 -TCATT-TTTATTTTCTGACT-TGTGATTTAATCCTGATCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTT
** * * * * ** *
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* * * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTT--CTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCA--T-GG
* ** * * * * * * * *
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60 TTTAATCCA-GTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCT-GACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTT-CTGACTCAT-GGTTT
* ** * **
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63 AATCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * *
3354675 TCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTGACTCTTTGTTTAAT
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
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66 -CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** * * * * * * ** **
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1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTA
* * * * * * *
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* * * * * *
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1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTG-TGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTT
* * * **
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* * * ** * * * * *
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1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * ***
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* * ** * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTTTAA
* * * ** *
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65 T-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* *** * * ** *
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1 TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCT-GACTCATGG-TTT
* * * * **
3355266 AATCCCTA-TTGTTTT-ATATTTTCTGACTCGTGATTTAATTCGGG
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* ** * *
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1 TCATTTTTATTT-TCTGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTT
*** * * ** * * * *
3355373 AATTTTGGTCATTTTCATGTGCTAAGTCATGGTTTAAT-CTATA
63 AA-TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCA-G
* * * ** * * * * * *
3355416 TCATTTTCTCTTTT-TGACTTATGGTTTAATCCCCATTATTTTACATTTTTTGACCCGTGCTTTC
1 TCATTTT-TATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTT-CATTTTCTGACTCATGGTTTA
* *** * * * *
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64 ATCC--AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCC-AG
* * * * * *
3355522 TCATTTTTATTTT-T-ATCTCGTGATTTAATACT-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTGTA
1 TCATTTTTATTTTCTGA-CTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* * * *
3355584 ATCCTGATCATTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CCTG
64 ATCCAG-TC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * * * * * * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACT-TGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
* ** * **
3355689 ATTCTAGTCGTTTTCATTTTTCAACAAGCAT--TTTAATCCTGG
64 A-TCCAGTCGTTTTCATTTTTTGAC--TCATGGTTTAATCCCAG
* * * ** * *
3355731 TCATTTTCATTTTCTAACTTGTAATTTAATTTTAGTAATTTTCATTATCGTTTTCATTTTTTGAT
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-G--A---TC---A---TTTTCATTTTCTGAC
** ** * * * ** * **
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* * * ** * * * *
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1 -TCATTTTTATTTTC--TGACTTGTGATTTAAT-CCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTT
* * * * * *
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* * *** * * * ** * *
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1 -TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTTTCTGAC-TCATGGTTT
* * *
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* * * * ** * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCA-TTTTCTGACTCATGGTTTAA
* * * *
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** * * * * *
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1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTG-TGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTT
* * * * * * **
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62 TAAT-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * ** * * ** * * * *
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1 -TCATTTTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATC-ATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
* * * * *
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* * * * ** * * * * **
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1 -TCATTTTT-ATTTTCT-GACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTT-TCTGACTCATGGTT
* * * ***
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* * * * *
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* * * * *
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63 AAT---CCAGTCGTTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* ** * * * *
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**** * ** *
3356635 TCCCGAAAATTTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAATCTTAA
65 T-CC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * * * ** * * * *
3356677 TCGCTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAACCCT-AGTGGTTTTCATTTTCTCACTAACGGTTTAG
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGA-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
* ** * * * **
3356741 TCCCAGTCATTTTTGTTTTTTGACTCGTGCTTTAATACTGG
65 T-CCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * * **
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCC-TGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
** ** * *
3356846 TTCTGGTAATTTTCATTATTGTTTTCATTCTCGAACTCATTGTTTAATCTC-G
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* * * * * * ** **
3356898 ATCGTTTTGATTTTTTGACTCT-TGATTTAAT-TTCAATCATTTTTATTTCTCT-AGCTTGTAAT
1 -TCATTTTTATTTTCTGACT-TGTGATTTAATCCT-GATCATTTTCATTT-TCTGA-CTCATGGT
*** * *
3356960 TTAATGTTGATCGTTTTCATTTTTTAACCCATGGTTTAAT-CCAGG
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** * * * * * * * ** * * *
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1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3357070 CCTAGTCGTTTTTGTTTTCTGACTCGTTGATTAATGCCAG
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** * ** * * * * *
3357110 TTGTTTTTGTTTTCTGACTCATGATTTAATCCCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGTTTTATT
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3357175 CTGGTCATTATT-ATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCCTG
66 CCAGTCGTT-TTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
** * * * * * * *
3357215 TTGTCTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCGATCGTTTTTCATTTTCTGATTTC-TGGTTTC
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATC-ATTTTCATTTTCTGA-CTCATGGTTTA
* * * * ****
3357279 ATCTCAGTCATTTT-ATTCTCTGTCTCATGGTTTAATTATTG
64 ATC-CAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAG
* * * * * * *
3357320 TCATTTTAATTTTCTGACTCGTCATTTAATCCTGGTCATTTTCAATTTT-AGGCTCATGATTTAA
1 TCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAA
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1 ATTTTCTGACTCGTGGTTTAA-TCCTGATCGATTTTCATTTT-TAGACTCATGATTTAATTTTGA
* *
3345866 TCATTTTTATTTTTCTAACT-ATGGTTTAATCCCCATTGTCTTT
64 TCA-TTTTA-ATTTCTAACTCATGGTTTAATCCCCATGGTCTTT
* * * * ** * * * *
3345909 GTTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTGATCGTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCATCTTAATC
1 ATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGATCGATTTTCATTTTTAGACTCATGATTTAATTTTGATC
* *
3345974 ATTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTAATCCCCGTGGT-TTT
66 ATTTTAATT-TCTAACTCATGGTTTAATCCCCATGGTCTTT
* *
3346014 AATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTTGATC-ATTTTCGA-TTTTAGACTCATGATTTAATTTTGG
1 -ATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGATCGATTTTC-ATTTTTAGACTCATGATTTAATTTTGA
3346077 TCAATTTTAATTTCTAACTC
64 TC-ATTTTAATTTCTAACTC
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ATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGATCGATTTTCATTTTTAGACTCATGATTTAATTTTGATC
ATTTTAATTTCTAACTCATGGTTTAATCCCCATGGTCTTT
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3346123 CTTTTACTAG
* * **
3346133 TGGTCTAATCTCGATCTTTTTCA-TTTTTCGACTCGT-GATTTGAT-TTTGGACATTTTTATTTC
1 TGGTCTAATCTCGATCATTTTCACTTTTT-GACTCGTGGA-TTAATCCCT-GACATTTTTATTT-
* * * *
3346195 TTTGACTCGTTATTTAAT-GCTGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAATTTTGATCATT
62 TTTGACTCGTGATTTAATCCCAG-TCATTTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAATTTTGATCATT
3346258 TTCTTTTACTAACTCA
126 TTCTTTTACTAACTCA
* * * *
3346274 TGGTTTAATCTCGGTCATTTTCACTTTTTGACTTGTGGATTAATCCCTGTCATTTTTATTTTTTG
1 TGGTCTAATCTCGATCATTTTCACTTTTTGACTCGTGGATTAATCCCTGACATTTTTATTTTTTG
*
3346339 ACTCGTGATTTAATCCCAGTCATTTTTCATTTTTTGACTCGTCGTTTAAT
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Statistics
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TGGTCTAATCTCGATCATTTTCACTTTTTGACTCGTGGATTAATCCCTGACATTTTTATTTTTTG
ACTCGTGATTTAATCCCAGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAATTTTGATCATTTTCTT
TTACTAACTCA
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3346574 TTCATTATTG
* ** * * * *
3346584 TTTTCATTTTCGAAGTCATGGTTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTAACTCT-TGATTTAATT
1 TTTTCATTTTCCAACCCATGATTTAATCCT-GGTCGTCTTCATTTTCTAAC-CTATGATTTAATC
* * ** * * * * *
3346647 TCAATCATTTTT-ATTTCTCT-AGCTTGTGATTTAATGTTGACTATTTTCATTTTCTAACTCATG
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* **
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125 ATTTAATCCCAGTCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTGGTCA
** * *
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1 TTTTCATTTTCCAACCCATGATTTAATCCTGGTCGTCTTCATTTTCTAACCT-ATGATTTAATCC
* * * *
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65 CGATCATTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATGCTAGTTTTTTTATTTCTAACTCATGATTTA
* ** **
3346888 ATCCC-GATCGTTTTCATTTTCTAACTCAT-GTTTTGTTTTGGTCA
130 ATCCCAG-TCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTGGTCA
* * * * * *
3346932 TTATT-ATTTCTCCAACTCATGATTTAATCCCT-GTTGTCTTCATTTTTTGACCTGTGGTTTAAT
1 TT-TTCATTT-TCCAACCCATGATTTAAT-CCTGGTCGTCTTCATTTTCTAACCTATGATTTAAT
* * * *
3346995 CCCGATCGTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTCAT-CTCAGTCATTTTCATTCTCTAACTCATG
63 CCCGATCATTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATGCT-AGT-TTTTTTATT-TCTAACTCATG
* * * * * *
3347059 CTTTAATCTTCC--TCGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGTCA
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3347109 TTTTCAATTTT
1 TTTTC-ATTTT
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TTTTCATTTTCCAACCCATGATTTAATCCTGGTCGTCTTCATTTTCTAACCTATGATTTAATCCC
GATCATTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATGCTAGTTTTTTTATTTCTAACTCATGATTTAA
TCCCAGTCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTGGTCA
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Alignment explanation
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3347310 ATTATACTAG
* * * * * * *
3347320 TTTTCATTTTCTAACTTAAGGTTTAATCTTCTTCATTTTCCTTTTTTGACTTG-TGGTTTAATCC
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**
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*
3347390 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATC-CCAATCATTTTTCATTTTTTGACTGATGGATTCATC
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCC-ATCA-TTTTCATTTTTTGACTGATGGATTAATC
* *
3347454 TCGGTCA
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* * * * *
3347461 TTTTCATTCTT-TGACTCATGGTTTAAT-TCCTATCGTTTTAATTTTCTAACTCATGGATTAATC
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* * *
3347524 TCGGTCGT
64 CCCGTC-A
* * * * ** * * *
3347532 TTTTAATTTT-AGACTCATGATTTAATTTTGATCATTTTAAATTTTTGACTAATGG-TTCAATCC
1 TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCCATCATTTTCATTTTTTGACTGATGGATT-AATCC
**
3347595 CAATCA
65 CCGTCA
* * ** * *
3347601 TTTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAAT-TCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCAT-GATTTAA
1 -TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTC-CATCATTTTCATTT-TTTGACTGATGGA-TTAA
** *
3347664 TGTCCATCA
62 TCCCCGTCA
** * *
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1 TTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCCATCATTTTCATTT
3347717 GCTGAGTCAT
Statistics
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TTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCCATCATTTTCATTTTTTGACTGATGGATTAATCCC
CGTCA
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3348447 TCATTTTCAT
*
3348457 TCTCTAACTCATGGTTTAATCCTCGTCGTTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTAGTCATT
1 TCTCTAACTCATGGTTTAATCCTCGTCGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGTCATT
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66 TTCAATTTTAGGCTTATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAA
3348587 TCA
131 TCA
3348590 TCTCTAACTCATGGTTTAATCCTCGTCGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGTCATT
1 TCTCTAACTCATGGTTTAATCCTCGTCGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGTCATT
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66 TTCAATTTTAGGCTTATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAA
3348720 TCA
131 TCA
3348723 T
1 T
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TCTCTAACTCATGGTTTAATCCTCGTCGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGTCATT
TTCAATTTTAGGCTTATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAA
TCA
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3348909 TCGACTTGTG
** *
3348919 GTTTAATCCCTGTTGTTTTATATTTTTTCTGACTCATGCTTTAATCCCTATCATTTTCATTTTTT
1 GTTTAATCCCTGTCATTTTATATTTTTTCTGACTCATGATTTAATCCCTATCATTTTCATTTTTT
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66 AAAAATTT
* * *
3348992 GTTTAATCCCTGTCATTTTCTA-TTTTT-TGACTTATGATTTAATTCCTATCATTTTCATTTTTT
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Statistics
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GTTTAATCCCTGTCATTTTATATTTTTTCTGACTCATGATTTAATCCCTATCATTTTCATTTTTT
AAAAATTT
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3349397 TAACCCGTAG
* * * * * **
3349407 TTTAATCCCAATCATTTTCATTTTTTCTGACTCGTGATTTAA-TCCAAGTCGTTTTTATTTTTTG
1 TTTAATCCCCATCATTTTCA--TTTTCTAACTCATGCTTTAATTCCTA-TCGTTTCCATTTTTTG
* * *
3349471 ACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTTATTTTCTGACTTGTGA
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**
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1 TTTAATCCCCATCATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCCTATCGTTTCCATTTTTTGACT
* * * * *
3349579 CGTGATTCAATTCTGGTCTTTTTTATTTCTCTAACTTGTGG
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* * * * * * * *
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** * * * ** *
3349684 CTGGTGGATTC-AT-CTAGGTCATTTTCATTTTATGACTCATGG
64 CTCAT-GATTCAATCCTA-GTCATTTTTATTTTCTAACTTGTGA
* ** * * ** * ** * *
3349726 TTTAATTCCTGTCATTTTAATTTTCTAACTCGTGGATTAA-TCTCGATCGTTTTTAATTTTAGAC
1 TTTAATCCCCATCATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTC-CTATCGTTTCCATTTTTTGAC
** * ** * * *
3349790 TTGTGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTTTGACTTGTGA
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** * * * * * * * *
3349831 TTTAATTTCGATCATTTTAAATTTT-TGACTAATGGTTCAA-TCCTAATCATTTTTCATTTTTTG
1 TTTAATCCCCATCATTTT-CATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCCT-ATC-GTTTCCATTTTTTG
* * * * * * * *
3349894 ACTCGTGATTTAAT-TTGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTAA
63 ACTCATGATTCAATCCT-AGTCATTTTTATTT-TCTAACTTGTGA
* * * * * * * *
3349938 TTTAATGCCGATCATTTTCAATTTT-TGACTCAT-CGTTTAATTTCGATCATTTTCATTTGTTGA
1 TTTAATCCCCATCATTTTC-ATTTTCTAACTCATGC-TTTAATTCCTATCGTTTCCATTTTTTGA
* * * * * *
3350001 GTCATGGTTTAATCTCTA-TCATTTTCTCTTTT-TGACTTGTGG
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.20, C:0.17, G:0.12, T:0.51
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TTTAATCCCCATCATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCCTATCGTTTCCATTTTTTGACT
CATGATTCAATCCTAGTCATTTTTATTTTCTAACTTGTGA
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3349767 CTCGATCGTT
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* * *
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1 TTTAATTTTAGACTTGTGA
* *
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1 TTTAATTT
3349839 CGATCATTTT
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 8, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
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TTTAATTTTAGACTTGTGA
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Period size: 144 Copynumber: 1.8 Consensus size: 144
3350257 AATTCTTGTG
* * * * *
3350267 GTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCTCAGTCATTTTCATTTTCTAACCCATGCTTTAATTC
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*
3350332 TAGTCATTTTCATTTTTCAACAGGCGTTTTAACCCTGGTCATTTTCTTTTTCTAACTCGTAATTT
66 TAGTCATTTTCATTTTTCAACAGGCGTTTTAACCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTT
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131 TGGTAATGTTGACC
* * *
3350411 GTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTCAATCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCC
1 GTTTTCATTTTCTAACTCAGGATTTAATCTCAATCATTTTCATTTTCTAACCCATGCTTTAATCC
* ** * * * * *
3350476 TGGTTGTTTTCATTTTTTGACCCATG-G-TTTAATCCTGGTCGTTTTCATTTTCTAACT
66 TAGTCATTTTCA-TTTTTCA-ACAGGCGTTTTAACCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACT
3350533 TGTGATTTAA
Statistics
Matches: 103, Mismatches: 17, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
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GTTTTCATTTTCTAACTCAGGATTTAATCTCAATCATTTTCATTTTCTAACCCATGCTTTAATCC
TAGTCATTTTCATTTTTCAACAGGCGTTTTAACCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTT
TGGTAATGTTGACC
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* *
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1 GGTTTAATCTCGATCATTTTTCATTTTCT
3350768 AACTTGTGGT
Statistics
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3350594 TGAGTCATGA
* * *
3350604 TTTAATCTCGATCA-TTTTCATTTTCTGACTCATGTTTTGAT-TCTAGTCATTATT-ATTTCTCG
1 TTTAATCTCGATCATTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTCATCTC-AGTCATT-TTCA-TTCTCG
* *
3350666 GACTCATGGTTTAATCCTTGTTGTCTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTCGATCATTTTTCA
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128 TTTTCTGAGG
* * ** *
3350741 TTTACTCTCGATCATTTTTTATTTTCTAACTTGTGGTTTCATCTCAGTCATTTTCATTCTCTGAC
1 TTTAATCTCGATCATTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTCATCTCAGTCATTTTCATTCTCGGAC
* * *
3350806 TTATGGTTTAATCCTTGTCGTTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATC
66 TCATGGTTTAATCCTTGTCGTCTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATC
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Statistics
Matches: 97, Mismatches: 13, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
137 66 0.68
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TTTAATCTCGATCATTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTCATCTCAGTCATTTTCATTCTCGGAC
TCATGGTTTAATCCTTGTCGTCTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTCGATCATTTTTCATTT
TCTGAGG
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Period size: 172 Copynumber: 2.6 Consensus size: 170
3350402 ATGTTGACCG
* * * * *
3350412 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTCAATCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCT
1 TTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATCTCAGTCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCT
* * * * *
3350477 GGTTGTTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCTGGTCGTTTTCATTTTCTAACTTGTGATTTA
66 AGTCGTTTT-ATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTGGTCGTCTTCATTTTCTAACTCGTGATTTA
* * * *
3350542 ATCCTGGTCGTTTTTATTTTCGGACCATTTAATGTAGATTA
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* * * * * *
3350583 TTTTTATTTTTTGAGTCATGATTTAATCTC-GATCATTTTCATTTTCTGACTCATGTTTTGATTC
1 TTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATCTCAG-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCC
* ** * * * *
3350647 TAGTCATTATTATTTCTCGGACTCATGGTTTAATCCTTGTTGTCTTCATTTTCTGACTCGTGGTT
65 TAGTCGTT-TTATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTGGTCGTCTTCATTTTCTAACTCGTGATT
* ** * *
3350712 TAAT-CTCGATCATTTTTCATTTTCTGA-GGTTTACTCTCGATCA
128 TAATCCT-GATCATTTTT-ATTTTCGGACCATTTAATCTAGATCA
** * * * *
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* *
3350820 TTGTCGTTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCT
65 TAGTCGTTTT-ATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT
3350856 AGTCATTTTC
Statistics
Matches: 216, Mismatches: 49, Indels: 15
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Matches are distributed among these distances:
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AGTCGTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTGGTCGTCTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAA
TCCTGATCATTTTTATTTTCGGACCATTTAATCTAGATCA
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3353369 TTTTCACTTA
* * *
3353379 TCATTTAATTCCT-ATCATTTTCATCTTTTGACTCG
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** *
3353414 TGGTATAATCTTGATCATTTTTCATCTTCTAACTCG
1 TCATTTAATCTTGATCA-TTTTCATCTTCTAACTCG
* ** *
3353450 TCATTTAATCTCGATCGCTTTCATTTTCTAACT
1 TCATTTAATCTTGATCATTTTCATCTTCTAACT
3353483 AGCGGTTTTC
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TCATTTAATCTTGATCATTTTCATCTTCTAACTCG
Found at i:3353875 original size:35 final size:35
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3353792 TAACCCATGG
*
3353802 TTTAATCTCAGTCA-TTTC-TTTTTCTGACTCGT-A
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*
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1 -TTTAATCTCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGA
* * * * *
3353871 TTTAATCT-AGGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATGG
1 TTTAATCTCA-ATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGA
* * * * * * *
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1 TTTAATCTCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGT-GA
* * * * *
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* *** * *
3353976 TTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTCTT-ACTTGTGA
1 TTTAATCTCAATCATTTTCATTTT-TTGACTCGTGA
* * * * ** *
3354011 TTTAATTTCGATCATTTTAAATTTTTGACTAATGG
1 TTTAATCTCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGA
* * * *
3354046 TTCAATCCCAATCATTTTTCATTTTCTAACTCGTGA
1 TTTAATCTCAATCA-TTTTCATTTTTTGACTCGTGA
* * *
3354082 TTTAAT-TTAGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGA
1 TTTAATCTCA-ATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTGA
* * *
3354118 TTTAATGC-CGATCATTTTCAATTTTTGACTCATCG-
1 TTTAAT-CTCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGT-GA
* * * ** * * *
3354153 TTTACTTTCGATCATTTTCATTTGCTGAGTCATGG
1 TTTAATCTCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGA
* * * * *
3354188 TTTAATCCCTACCATTTTC-TCTTTTTGACTTGTGG
1 TTTAATCTCAATCATTTTCAT-TTTTTGACTCGTGA
* * * * * *
3354223 TTTGATCCCCATTATTTTACATTTTTTCACTCGTGC
1 TTTAATCTCAATCATTTT-CATTTTTTGACTCGTGA
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1 TTTAATC
3354266 CTTATAGTTT
Statistics
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TTTAATCTCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGA
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3353792 TAACCCATGG
* * * * * * * *
3353802 TTTAATCTCAG-TCATTTCT-TTTTCTGACTCGTAGTTTAATCTCAATCCTTTTCATTTTTTGAC
1 TTTAATCT-AGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCAGTCATTTTAATTTTTTAAC
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65 TCGTGA
* * * * *
3353871 TTTAATCTAGGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCAGTCGTTTTAATTTTCTAACT
1 TTTAATCTAGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCAGTCATTTTAATTTTTTAACT
*
3353936 TGTGGA
66 CGT-GA
* * * * * **** *
3353942 -TTAATCTCGATCGTTTTTAATTTTAGACTCGTGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTCTT-AC
1 TTTAATCTAGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCAGTCATTTTAATTTT-TTAAC
*
3354005 TTGTGA
65 TCGTGA
* * * * ** * * * *
3354011 TTTAATTTCGATCATTTTAAATTTTTGACTAATGGTTCAATCCCAATCATTTTTCATTTTCTAAC
1 TTTAATCTAGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCAGTCA-TTTTAATTTTTTAAC
3354076 TCGTGA
65 TCGTGA
* * * *
3354082 TTTAATTTAGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCC-GATCATTTTCAATTTTT
1 TTTAATCTAGATCATTTTTATTT-TTTGACTCGTGGTTTAATCCCAG-TCATTTT-AATTTTT
3354144 GACTCATCGT
Statistics
Matches: 210, Mismatches: 53, Indels: 17
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (70 bp):
TTTAATCTAGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCAGTCATTTTAATTTTTTAACT
CGTGA
Found at i:3354686 original size:35 final size:35
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3354633 TATCTAGTTT
* * *
3354643 TTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCTGGTCG
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* *
3354678 TTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * * * **
3354713 TTTTTATTTTCTGACTCTTTG-TTTAAT-GTCGGTTG
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* * * * *
3354748 TTTTTATTTTCTGACTAATGATTTAATCCCGATCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * *
3354783 TTTTCATTTTTTGACTCATGTTTTGATTCTGGTCA
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* ** ** * **
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* * * * * * *
3354854 TCTTCATTTTCTGAC-CTGTGGTTTAAACCTGATCGT
1 TTTTCATTTTTTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTC-A
** * **
3354890 TTTTCATTTTTTGACTTGTTG-TTTCAT-CTCAATCA
1 TTTTCATTTTTTGAC-TCATGATTTAATCCT-GGTCA
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * **
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* * * *
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* * * *
3355065 TTTTCGTTTCTTGACT-AGTGGTTTAATCTTGGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCA
* * * *
3355100 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGATGCTGGTCA
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* *
3355135 TTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT-GTCGGTCA
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* * *
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* * * * * **
3355206 TTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTTTTCA
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* * * * **
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1 TTTTCATTTTTTGACTCAT-GATTTAAT-CCTGGTCA
* * *
3355277 TTTT-ATATTTTCTGACTCGTGATTTAATTCGGGTCA
1 TTTTCAT-TTTT-TGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * *
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* **
3355349 TTTTCAATTTTTGACTCATCG-TTTAATTTTGGTCA
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* ** * * * **
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* * *** *
3355419 TTTTC-TCTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCCATTA
1 TTTTCAT-TTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * * * ** **
3355454 TTTTACATTTTTTGACCCGTGCTTTCATCCTTATTG
1 TTTT-CATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
*** * * * *
3355490 TTTTCATTTTCCAACACGTTG-TTTTATCCCT-ATCA
1 TTTTCATTTTTTGACTC-ATGATTTAAT-CCTGGTCA
* * * * *
3355525 TTTTTA-TTTTT-ATCTCGTGATTTAATACTAGTCG
1 TTTTCATTTTTTGA-CTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * * *
3355559 TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTGTAATCCTGATCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * **
3355594 TTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCT-GTGG
1 -TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * * * * **
3355629 TTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCCAGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
* * * * * * * *
3355664 TTTTCATTTTCTAAATCGTGCTTTAATTCTAGTCG
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* * *
3355699 TTTTCA-TTTTTCA-ACAAGCATTTTAATCCTGGTCA
1 TTTTCATTTTTTGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCA
3355734 TTTTCATTTT
1 TTTTCATTTT
3355744 CTAACTTGTA
Statistics
Matches: 781, Mismatches: 232, Indels: 105
0.70 0.21 0.09
Matches are distributed among these distances:
33 7 0.01
34 66 0.08
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37 18 0.02
ACGTcount: A:0.19, C:0.17, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (35 bp):
TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA
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Indices: 3354643--3355390 Score: 408
Period size: 141 Copynumber: 5.3 Consensus size: 140
3354633 TATCTAGTTT
* * * * *
3354643 TTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCTGGTCGTTTTCA-TTTTCTGACTCGT-GATTTAAT-
1 TTTTCA-TTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTC-AACTCATGGATTTAATC
* * ** * *
3354705 CCTGGTCATTTT-TATTTTCTGACTCTTTG-TTTAATGTCGGTTGTTTTTATTTTCTGACTAATG
64 CCT-ATCATTTTATATTTTCTGACTC-ATGATTTAAT-TCGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATG
*
3354768 ATTTAA-TCCCGATCA
126 ATTTAATTCCAG-TCA
* * * * *
3354783 TTTTCATTTTTTGACTCATGTTTTGAT-TCTGGTCATTATCATTTCTCAGACT--TGTCATTTAA
1 TTTTCA-TTTTTGACTCATGGTTTAATCT-TGGTCATTTTCATTTTTCA-ACTCATG-GATTTAA
* * ** * * * * ** * * *
3354845 TTCCTGTTGTCTT-CATTTTCTGAC-CTGTGGTTTAAACCTGATCGTTTTTCATTTTTTGACTTG
62 TCCCTATCATTTTATATTTTCTGACTC-ATGATTTAATTC-GGTCATTTTT-ATTTTTTGAC-TC
* * *
3354908 TTG-TTTCA-TCTCAATCA
123 ATGATTTAATTC-CAGTCA
* * * * * ** * *
3354925 TTTTCATTCTCTGATTCATGGTTTAATCTTCGTCGTTTTAATTTTTTGATTCGTGG-TTTAAT-C
1 TTTTCATT-TTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTCAACTCATGGATTTAATCC
* * * * *** * *
3354988 CTGGTCGTTTT-TAATTTT-AGGCTCATGATTTAATTTAAATCATTTTTATTTTCTAACTCATGA
65 CT-ATCATTTTAT-ATTTTCTGACTCATGATTTAA-TTCGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGA
3355051 TTTAATTCCAGTCA
127 TTTAATTCCAGTCA
* *
3355065 TTTTCGTTTCTTGACT-AGTGGTTTAATCTTGGTCATTTTCA-TTTTCTAACTCAT-GATTTGAT
1 TTTTCATTT-TTGACTCA-TGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTC-AACTCATGGATTTAAT
* * * *
3355127 -GCTGGTCATTTT-TATTTCTTTGACTCATGATTTAATGTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCAT
63 CCCT-ATCATTTTATATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-TCGGTCATTTTTATTTTTTGACTCAT
* *
3355190 CATTTAATTCCAGTCT
125 GATTTAATTCCAGTCA
* * ** * * *
3355206 TTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTTTTCATTTTCATTTTTCGACTTATGGTTTTAATCC
1 TTTTCATTTT-TGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTCAACTCATGGATTTAATCC
** *
3355271 CTATTGTTTTATATTTTCTGACTCGTGATTTAATTCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGAT
65 CTATCATTTTATATTTTCTGACTCATGATTTAATTC-GGTCATTTTTATTT-TTTGACTCATGAT
* *
3355336 TTAATGCC-GATCG
128 TTAATTCCAG-TCA
* *
3355349 TTTTCAATTTTTGACTCATCGTTTAATTTTGGTCATTTTCAT
1 TTTTC-ATTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCAT
3355391 GTGCTAAGTC
Statistics
Matches: 467, Mismatches: 103, Indels: 73
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
139 15 0.03
140 113 0.24
141 163 0.35
142 106 0.23
143 65 0.14
144 5 0.01
ACGTcount: A:0.19, C:0.16, G:0.13, T:0.52
Consensus pattern (140 bp):
TTTTCATTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTTCAACTCATGGATTTAATCCC
TATCATTTTATATTTTCTGACTCATGATTTAATTCGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTA
ATTCCAGTCA
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Alignment explanation
Indices: 3355027--3355232 Score: 238
Period size: 106 Copynumber: 2.0 Consensus size: 105
3355017 TTAATTTAAA
* **
3355027 TCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAGTCATTTTCGTTTCTTGACTAGTGGTTTAAT
1 TCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAGTCATTTTCATTTCTTGACTAGTCATTTAAT
** * *
3355092 CTTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGATGCTGG
66 CTCAGTCATTTTCATTTTCTAACTCAAGATTTAATGCTGG
* * * *
3355132 TCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATGT-CGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TCATTT
1 TCATTTTTATTT-TCTAACTCATGATTTAAT-TCCAGTCATTTTCATTTCTTGACT-AGTCATTT
* *
3355195 AAT-TCCAGTCTTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAAT
63 AATCT-CAGTCATTTTCATTTTCTAACTCAAGATTTAAT
3355233 CTTTTTCATT
Statistics
Matches: 84, Mismatches: 13, Indels: 7
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
105 13 0.15
106 69 0.82
107 2 0.02
ACGTcount: A:0.21, C:0.17, G:0.11, T:0.51
Consensus pattern (105 bp):
TCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAGTCATTTTCATTTCTTGACTAGTCATTTAAT
CTCAGTCATTTTCATTTTCTAACTCAAGATTTAATGCTGG
Found at i:3355314 original size:72 final size:71
Alignment explanation
Indices: 3355145--3355390 Score: 168
Period size: 72 Copynumber: 3.5 Consensus size: 71
3355135 TTTTTATTTC
* * * *
3355145 TTTGACTCAT-GATTTAATGTC-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATCATTTAATTCC-AGTCT
1 TTTGACTCATCG-TTTAAT-TCGGGTCATTTTCATTTCTTCGACTCATGATTTAATCCCGA-TCG
3355206 TTTTC-ATT
63 TTTTCAATT
* ** *** * * * *
3355214 TTCTAACTCAAGGTTTAA-TCTTTTTCATTTTCATTT-TTCGACTTATGGTTTTAATCCCTATTG
1 TT-TGACTCATCGTTTAATTC-GGGTCATTTTCATTTCTTCGACTCAT-GATTTAATCCCGATCG
3355277 TTTT-ATATT
63 TTTTCA-ATT
* * * *
3355286 TTCTGACTCGT-GATTTAATTCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATGCCGATCGT
1 TT-TGACTCATCG-TTTAATTCGGGTCATTTTCATTTCTTCGACTCATGATTTAATCCCGATCGT
3355350 TTTCAATT
64 TTTCAATT
**
3355358 TTTGACTCATCGTTTAATTTTGGTCATTTTCAT
1 TTTGACTCATCGTTTAATTCGGGTCATTTTCAT
3355391 GTGCTAAGTC
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 28, Indels: 24
0.72 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
68 2 0.01
69 2 0.01
70 31 0.23
71 40 0.29
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73 11 0.08
ACGTcount: A:0.20, C:0.16, G:0.11, T:0.52
Consensus pattern (71 bp):
TTTGACTCATCGTTTAATTCGGGTCATTTTCATTTCTTCGACTCATGATTTAATCCCGATCGTTT
TCAATT
Found at i:3355329 original size:178 final size:177
Alignment explanation
Indices: 3355099--3355474 Score: 486
Period size: 178 Copynumber: 2.1 Consensus size: 177
3355089 AATCTTGGTC
* * * *
3355099 ATTTT-CATTTTCTAACTCATGATTTGATGCTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT
1 ATTTTACATTTTCTGACTCGTGATTTAATGCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT
* * * * * *
3355163 GTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCTTTTTCATTTTCTAACTCAAGGT
66 GCCGATCATTTTCAATTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCATTTTCATGTGCTAACTCAAGGT
* * *
3355228 TTAATCTTTTTCATTTTCAT-TTTTCGACTTATGGTTTTAATCCCTATT
131 TTAATCTATATCATTTTC-TCTTTTCGACTTATGG-TTTAATCCCCATT
* * *
3355276 GTTTTATATTTTCTGACTCGTGATTTAATTCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT
1 ATTTTACATTTTCTGACTCGTGATTTAATGCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT
* * *** * *
3355341 GCCGATCGTTTTCAATTTTTGACTCATCGTTTAATTTTGGTCATTTTCATGTGCTAAGTCATGGT
66 GCCGATCATTTTCAATTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCATTTTCATGTGCTAACTCAAGGT
*
3355406 TTAATCTATATCATTTTCTCTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCCATT
131 TTAATCTATATCATTTTCTCTTTTCGACTTATGGTTTAATCCCCATT
* *
3355453 ATTTTACATTTTTTGACCCGTG
1 ATTTTACATTTTCTGACTCGTG
3355475 CTTTCATCCT
Statistics
Matches: 169, Mismatches: 28, Indels: 4
0.84 0.14 0.02
Matches are distributed among these distances:
177 35 0.21
178 134 0.79
ACGTcount: A:0.20, C:0.16, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (177 bp):
ATTTTACATTTTCTGACTCGTGATTTAATGCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT
GCCGATCATTTTCAATTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCATTTTCATGTGCTAACTCAAGGT
TTAATCTATATCATTTTCTCTTTTCGACTTATGGTTTAATCCCCATT
Found at i:3355405 original size:143 final size:141
Alignment explanation
Indices: 3355147--3355411 Score: 306
Period size: 143 Copynumber: 1.9 Consensus size: 141
3355137 TTTATTTCTT
* *
3355147 TGACTCATGATTTAATGTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCTTTTTCA
1 TGACTCATGATTTAATGTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATGCCAGTCGTTTTCA
* * ** * *
3355212 TTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTTTTCATTTTCATTTTTCGACTTATGGTTTTAATCCCTATTG
66 TTTTCTAACTCAACGTTTAATCTTTGTCATTTTCATTGCTCAACTCATGG-TTTAATCCCTATTG
3355277 TTTTATATTTTC
130 TTTTATATTTTC
* * *
3355289 TGACTCGTGATTTAAT-TCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATGCC-GATCGTTT
1 TGACTCATGATTTAATGTC-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATCATTTAATGCCAG-TCGTTT
* * *
3355352 TCAATTTT-TGACTCATCGTTTAAT-TTTGGTCATTTTCATGTGCT-AAGTCATGGTTTAATC
63 TC-ATTTTCTAACTCAACGTTTAATCTTT-GTCATTTTCAT-TGCTCAACTCATGGTTTAATC
3355412 TATATCATTT
Statistics
Matches: 103, Mismatches: 14, Indels: 12
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
141 2 0.02
142 39 0.38
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Consensus pattern (141 bp):
TGACTCATGATTTAATGTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATGCCAGTCGTTTTCA
TTTTCTAACTCAACGTTTAATCTTTGTCATTTTCATTGCTCAACTCATGGTTTAATCCCTATTGT
TTTATATTTTC
Found at i:3355759 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 3355518--3355776 Score: 100
Period size: 35 Copynumber: 7.5 Consensus size: 35
3355508 TTGTTTTATC
* * * *
3355518 CCTA-TCATTTTTATTTT-TATCTCGTGATTTAAT
1 CCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTAGTAATTTAAT
* * * * * ** *
3355551 ACTAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTGTAAT
1 CCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTAGTAATTTAAT
* **
3355586 CCT-GATCATTTTTCATTTTCTGACTCA-TGGTTTAAT
1 CCTAG-TCA-TTTTCATTTTCTAACT-AGTAATTTAAT
** * ** *
3355622 CCT-GTGGTTTTCATTTTCTCACTCAG-GGTTTAGT
1 CCTAGTCATTTTCATTTTCTAACT-AGTAATTTAAT
* * * **
3355656 CCCAGTCATTTTCATTTTCTAAATCGTGCTTTAAT
1 CCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTAGTAATTTAAT
* * * * *
3355691 TCTAGTCGTTTTCATTTT-TCAACAAGCATTTTAAT
1 CCTAGTCATTTTCATTTTCT-AACTAGTAATTTAAT
* *
3355726 CCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTTGTAATTTAAT
1 CCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTAGTAATTTAAT
** *
3355761 TTTAGTAATTTTCATT
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CCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTAGTAATTTAAT
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* *
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* *
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Statistics
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TTAATCCCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATCG
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3355898 CGACTCATGA
* * * * * *
3355908 TTTAATCTCGATCATTTTCCTTTTCTAACCCATCG
1 TTTAATTTCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCGTGG
** *
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1 TTTAATTTCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCGTGG
* * ** *
3355977 TTTAATTTCGGTTGTTTTCATTTTCTGACGTGTGA
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
3356116 TTTAATCCCCATTGTCTTCATTTTTTGACTCGTGG
1 TTTAATTTCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCGTGG
** *
3356151 TTTAATGCCGATCATTTTTCATTTTCTGAC
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Statistics
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TTTAATTTCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCGTGG
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3355933 TAACCCATCG
* * * * * **
3355943 TTAATCCCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTTAATTTCGGTTGTTTTCATTTTCTGACGT
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65 GTGAT
** *
3356013 TTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTCCCACCGTTTTAATTTTCTGACCT
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65 GTGAT
* * * * * * *
3356083 TTAATTTTGATCA-TTT-ATTTTTTTGTCTCGTGGTTTAATCCCCATTGTCTTCATTTTTTGACT
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*
3356146 CGTGGT
65 -GTGAT
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Statistics
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TTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTCCCATTGTTTTCATTTTCTGACTG
TGAT
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3355940 TCGTTAATCC
* * * * *
3355950 CGATCGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTTAATTT
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
* ** * *
3355985 CGGTTGTTTTCATTTTCTGA--CGTGTGATTTAATCT
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGT-TG-TTTAATTT
* * *
3356020 CGATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTC
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
* * * * *
3356055 CCACCGTTTTAATTTTCTGAC-C-TGTGATTTAATTT
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGT-TG-TTTAATTT
* * * **
3356090 TGATCA-TTT-ATTTTTTTGTCTCGTGGTTTAATCC
1 CGATCATTTTCA-TTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
* ** * * **
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1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
* * * *
3356159 CGATCATTTTTCATTTTCTGACT-GATGGCTTCATCTT
1 CGATCA-TTTTCATTTTTTGACTCG-TTGTTTAAT-TT
* * * * * * **
3356196 AG-TCATTTTCATTCTCTAACTCGTGGTTAAATCC
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
** * * * * *
3356230 CTG-TGGTTTTAATTTTCTGACTCATGGTTTAGTCTT
1 C-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAAT-TT
*** * * ** *
3356266 -GATCATTTTTGGTTTTAGACTCATAATTAAATTT
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
* * * *
3356300 TGGTCAATTTT-ATTTTTTGACTCG-TGATTTAGTTC
1 CGATC-ATTTTCATTTTTTGACTCGTTG-TTTAATTT
* ** * * * *
3356335 CGGTTGTTTTCATTTTTTGACTAGTGGTCTAATCT
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
* * ** *
3356370 CGATCTTTTTCCTTTTTCAACTCG-TGATTTGATTT
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTG-TTTAATTT
* * * * **
3356405 TGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTTATTTAATGC
1 CGATCATTTTCATTT-TTTGACTCGTTGTTTAATTT
3356441 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
1 CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
*
3356476 TGATCATTTT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTT
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Alignment explanation
Indices: 3356450--3356515 Score: 69
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3356440 CCGATCATTT
* * * *
3356450 TCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTTTGA
1 TCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGA
* *
3356479 TCATTTTTTTTACTCATGGTTTAATCTCGG
1 TCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGA
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1 TCATTTT
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Statistics
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TCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGA
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Alignment explanation
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3356559 TAACTCATGC
* *
3356569 TTTAATCCCTGTCGTTTTTATTTTTG
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*
3356595 TTTAATCCCTATCATTTTTGTTTTT
1 TTTAATCCCTATCATTTTTATTTTT
3356620 TGACTTATGA
Statistics
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Consensus pattern (26 bp):
TTTAATCCCTATCATTTTTATTTTTG
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Alignment explanation
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3356635 TCCCGAAAAT
* *
3356645 TTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAATCTTAATCG
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* * * * *
3356680 CTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAACCCTAGTGG
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TTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAACCCTAATCG
Found at i:3356795 original size:35 final size:35
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Indices: 3356746--3356858 Score: 118
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3356736 TTTAGTCCCA
* * *
3356746 GTCATTTTTGTTTTTTGACTCGTGCTTTAATACTG
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* * * *
3356781 GTCATTTTTATTTTTTAACTCGCGTTTTAATCCTT
1 GTCATTTTTATTTTTTAACTCGTGATTTAATACTG
* * * *
3356816 GTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAATTCTG
1 GTCATTTTTATTTTTTAACTCGTGATTTAATACTG
*
3356851 GTAATTTT
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3356859 CATTATTGTT
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 14, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (35 bp):
GTCATTTTTATTTTTTAACTCGTGATTTAATACTG
Found at i:3357068 original size:70 final size:68
Alignment explanation
Indices: 3356994--3357245 Score: 179
Period size: 70 Copynumber: 3.6 Consensus size: 68
3356984 TAACCCATGG
* *
3356994 TTTAATCCAGGTTGTTTTCATTTTTTGACGTATGGTTTAATCTTGGTTGTTTTCTTTTTCTGACT
1 TTTAATCCAGGTCGTTTTCATTTTCTGACGTATGGTTTAATC-TGGTTGTTTT-TTTTTCTGACT
3357059 CGTGA
64 CGTGA
** * **
3357064 TTTAATCCTA-GTCGTTTTTGTTTTCTGACTCGT-T-GATTAATGCCAGTTGTTTTTGTTTTCTG
1 TTTAATCC-AGGTCGTTTTCATTTTCTGA--CGTATGGTTTAAT-CTGGTTGTTTTT-TTTTCTG
*
3357126 ACTCATGA
61 ACTCGTGA
* * * * * ** *
3357134 TTTAATCCCGATCGTTTTCATTTTTTGAC-TCATGTTTTATTCTGGTCATTATTATTTCTCTGAC
1 TTTAATCCAGGTCGTTTTCATTTTCTGACGT-ATGGTTTAATCTGGTTGTT-TT-TTTTTCTGAC
*
3357198 TCGTGG
63 TCGTGA
** * * * *
3357204 TTTAATCCCTGTTGTCTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATC
1 TTTAATCCAGGTCGTTTTCATTTTCTGACGTATGGTTTAATC
3357246 CCGATCGTTT
Statistics
Matches: 139, Mismatches: 31, Indels: 24
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
67 1 0.01
68 1 0.01
69 7 0.05
70 122 0.88
71 5 0.04
72 3 0.02
ACGTcount: A:0.15, C:0.16, G:0.16, T:0.52
Consensus pattern (68 bp):
TTTAATCCAGGTCGTTTTCATTTTCTGACGTATGGTTTAATCTGGTTGTTTTTTTTTCTGACTCG
TGA
Found at i:3357165 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 3356866--3357267 Score: 158
Period size: 35 Copynumber: 11.4 Consensus size: 35
3356856 TTTCATTATT
* *
3356866 GTTTTCATTCTC-GAACTCATTG-TTTAATCTCGATC
1 GTTTTCATTTTCTG-ACTCA-TGATTTAATCCCGATC
* * * ** *
3356901 GTTTTGATTTTTTGACTCTTGATTTAATTTCAATC
1 GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCCGATC
* * ** * ***
3356936 ATTTTTATTTCTCT-AGCTTGTAATTTAATGTTGATC
1 GTTTTCATTT-TCTGA-CTCATGATTTAATCCCGATC
* * * * * * *
3356972 GTTTTCATTTTTTAACCCATGGTTTAATCCAGGTT
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* * ** * *
3357007 GTTTTCATTTTTTGACGT-ATGGTTTAATCTTGGTT
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* * *
3357042 GTTTTCTTTTTCTGACTCGTGATTTAAT-CCTAGTC
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** * * *
3357077 GTTTTTGTTTTCTGACTCGTTGA-TTAATGCC-AGTT
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**
3357112 GTTTTTGTTTTCTGACTCATGATTTAATCCCGATC
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* * * * *
3357147 GTTTTCATTTTTTGACTCATG-TTTTATTCTGGTC
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* * * *
3357181 ATTATT-ATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCCTG-TT
1 GTT-TTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCC-GATC
* ** *
3357217 GTCTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCGATC
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3357252 GTTTTTCATTTTCTGA
1 G-TTTTCATTTTCTGA
3357268 TTTCTGGTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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35 201 0.72
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37 1 0.00
ACGTcount: A:0.17, C:0.16, G:0.15, T:0.52
Consensus pattern (35 bp):
GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCCGATC
Found at i:3357358 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 3357049--3357560 Score: 220
Period size: 35 Copynumber: 14.6 Consensus size: 35
3357039 GTTGTTTTCT
* * **
3357049 TTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTAGTCGTTTTTG
1 TTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGTCATTTTAA
* ** **
3357084 TTTTCTGACTCGTTGA-TTAATGCC-AGTTGTTTTTG
1 TTTTCTGACTCG-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTAA
* * * * *
3357119 TTTTCTGACTCATGATTTAATCCCGATCGTTTTCA
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* * * *
3357154 TTTTTTGACTCATG-TTTTATTCTGGTCATTATT-A
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* ** * *
3357188 TTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCCT-GTTGTCTTCA
1 TTT-TCTGACTCGTGATTTAAT-CCTGGTCATTTTAA
* * * * * *
3357224 TTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCCGATCGTTTTTCA
1 TTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGTC-ATTTTAA
* * * *
3357260 TTTTCTGATTTC-TGGTTTCAT-CTCAGTCATTTT-A
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* * * * ** *
3357294 TTCTCTGTCTCATGGTTTAATTATTGTCATTTTAA
1 TTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGTCATTTTAA
*
3357329 TTTTCTGACTCGTCATTTAATCCTGGTCATTTTCAA
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* * * ** *
3357365 TTTT-AGGCTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTA
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* * * *
3357399 TTTTCTAACTTGTGATTTAATTCC-AGTCATTTT-C
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* * *
3357433 GTTTCTTGACTAGTGGTTTAATCCTGGTCATTTTAA
1 TTTTC-TGACTCGTGATTTAATCCTGGTCATTTTAA
* * * * * *
3357469 TTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGGTCGTTTTTA
1 TTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGTCATTTTAA
* * * *
3357504 TTTCTTTGACTCGTTATTTAAT-GTCGGTCATTTTCA
1 TTT-TCTGACTCGTGATTTAATCCT-GGTCATTTTAA
* * *
3357540 TTTTTTGACTCATCATTTAAT
1 TTTTCTGACTCGTGATTTAAT
3357561 TCCAGTCGTT
Statistics
Matches: 365, Mismatches: 88, Indels: 48
0.73 0.18 0.10
Matches are distributed among these distances:
33 2 0.01
34 57 0.16
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37 3 0.01
ACGTcount: A:0.17, C:0.17, G:0.14, T:0.52
Consensus pattern (35 bp):
TTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGTCATTTTAA
Found at i:3357811 original size:36 final size:34
Alignment explanation
Indices: 3357733--3357812 Score: 97
Period size: 36 Copynumber: 2.3 Consensus size: 34
3357723 TTGACTTACG
* *
3357733 ATTTAATTCTTATCATTTTCATTTTTTGACTCGTG
1 ATTTAA-TCTTATCATTTTCATTTTTTAACTCGTC
* *
3357768 GTATAATCTTGATCATTTTTCATTTTTTAACTCGTC
1 ATTTAATCTT-ATCA-TTTTCATTTTTTAACTCGTC
3357804 ATTTAATCT
1 ATTTAATCT
3357813 CAATCCCTTT
Statistics
Matches: 37, Mismatches: 6, Indels: 3
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
34 4 0.11
35 8 0.22
36 25 0.68
ACGTcount: A:0.23, C:0.15, G:0.07, T:0.55
Consensus pattern (34 bp):
ATTTAATCTTATCATTTTCATTTTTTAACTCGTC
Found at i:3358042 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 3357988--3359039 Score: 492
Period size: 35 Copynumber: 29.9 Consensus size: 35
3357978 AATTTTTATT
* *
3357988 ATCATTTTCCTTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTCG
1 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTCG
* * * * *
3358023 ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTGAATTTTG
1 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTCG
* * *
3358058 ATCATTTTTATTTCTCTGGC-CTGTGATTTAATACT-G
1 ATCATTTTCATTT-TCTGACTC-GTGGTTTAAT-CTCG
** *
3358094 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTAATTTAATCTTG
1 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTCG
* ** * * * *
3358129 GTTGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCCG
1 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTCG
* * * * * * *
3358164 ATTATTTTTATTTTTTGACCCGTAGTTTAA-CCCTA
1 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTC-G
* *
3358199 ATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATC-CAG
1 ATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTC-G
* * * * *
3358234 GTCGTTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATC-CC
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* * * *
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* * * * *
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*
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * *
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* * * * * *
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** * * * * * *
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** * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * **
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* * * * *
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* * ** *
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* ** * * * *
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** * *
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* ** *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* *
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* * * * ** * *
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*
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* * *
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CCCA
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*
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** *
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* * * * * * * *
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* *
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** * *
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* * *
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* * * * * **
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* *
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66 TTTCG
* * * * * * * * ** *
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* ** *
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* * * * *
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** * ** **** * * * **
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*
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* * * * * * *
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1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAA
*
3359260 TTTTG
66 TTTCG
* ** *
3359265 GTTGTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTACTCTTGGTTTAA
1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAA
* *
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66 TTTCG
* * * ** * * * * **
3359335 ACCATTTTTAGTTTCTGACTTGTGATTTAATTTCGATCATTTTTATTTTTTTTTGCTTGTGGTTT
1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCA--TTTTCTTACTCATGGTTT
** *
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64 AATTTCG
** * * * * * * * **
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1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCT-CGATC-ATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTT
* *
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64 AATTTCG
* * * * * * * ** * * * **
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1 A-TCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTC-GATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTT
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64 AAT-TTCG
** * * * ** * * *
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1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATC-ATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTA
* *
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65 ATTTCG
* ** * * * * *
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* *
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63 TAATTTCG
* * * * **
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1 ATCATTTTTATTT-TTTGACTCATGATTTAAT-CTCGATCATTTTCATTTTCTT-ACTCATGGTT
*
3359750 TAATTTTG
63 TAATTTCG
* * * **
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1 ATCATTTT-TATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCA-TTTTCTTACTCATGGTTT
*** *
3359821 AAACCCCC
64 -AATTTCG
** * * * * * * * * *
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1 ATCATTTT-TATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGATCATTTTCATTTTCTT-ACTCATGGTT
**
3359892 TAATCCCTG
63 TAATTTC-G
* * * ** * * * *
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1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCA-TTTTCATTTTCTT-ACTCATGGTTT
* *
3359964 AATCTCT
64 AATTTCG
** * * *
3359971 ATCGCTTTCATTTTTTGACTCAAGGTTTAACCTTCATTTAATCTC-ATCGTTTTCATTTT-TTGA
1 ATCATTTTTATTTTTTGACTC--------A---TGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTT-A
* * *
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54 CTCATGGTTTAATTTC-G
* * * * * * **
3360051 GTCATTTTTATTTTTTAACTC--GCATTTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTT
1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATG-A-TTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTT
*
3360114 AATTTTGG
64 AA-TTTCG
* * * * *
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1 --A---TCATT-TT-TATT--TTTT--GACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTAC
* * *
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55 TCATGGTTTAATTTCG
* * ** * * * * *
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1 ATCATTTTTATTT-TTTGA-CTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTT
*
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64 AATTTCG
* * * * * * ** * *
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1 A-TCATTTTTATTTTTTGACTC-ATGATTTAATCTCGA-TCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTT
*
3360336 TAA-TCCTG
63 TAATTTC-G
* * * * * * ** * * *
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1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTC-GATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTA
**
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65 ATTTCG
** * * * * *
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1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAA
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66 TTTC-G
* ** * * ** * * *
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1 ATCATTTTTATTT-TTTGACTCATGATTTAATCTC-GATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTT
**
3360548 AATCCCG
64 AATTTCG
* * * * *
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1 ATCATTTTT-ATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTC-TT-ACTCATGGTT
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63 TAATTTCG
* * * * * * *
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1 AT-CAT-TTTTA-TTTTTTGACTCATGATTTAATCTC-GATCATTTTCATTTTCTTA--CTCATG
* *
3360684 ATTTTATTT-G
60 GTTTAATTTCG
* ** * * ** *
3360694 GTCATTTTTATTTCCTAACTCATGATTTAATC-CTAGTCATTTTC-GCTTCTTGACTAATGGTTT
1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGA-TCATTTTCATTTTCTT-ACTCATGGTTT
*
3360757 AA-TCCTG
64 AATTTC-G
* * * * * * * ** *
3360764 GTCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGAT-TCTAGTCATTTTTA-TTTCTTTGACTTGTGATT
1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGA-TCATTTTCATTTTC-TT-ACTCATGGTT
*
3360827 TAA-TGCTG
63 TAATTTC-G
* * * * * * * *
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1 ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGA-TCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTA
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* * * * * *
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ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAA
TTTCG
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* * * * * *
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* *
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* * *** * * *
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* *
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* * *
3359340 TTTTAGTTTCTGACTTGTGATTTAATTTCGATCATTTTTATTTTT
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TTTTATTTTCTGACTTGTGGTTTAATTTCGATCGTTTTTATTTTTGACTCATGATTTAATCTCGA
TCATTTTCATTTTTTAACCCATGGTTAATCCCGACCAT
Found at i:3360072 original size:35 final size:35
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TTTTCATTTTTTAACTCGTACTTTAATCTTGGTCA
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* *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* * **
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** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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GTTTTCATTTTCTAACTCGTGGTTTAATCTCGATC
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* * *
3360240 TCATTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATCTCAGTCGTTTTAATTTTCTAACCTATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCAGTCATTTT-ATTTTCTAACCTATGGTTTAAT
*
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65 CCTAGTTGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCTGG
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCAG-TCATT-TTATTT-TCTAACCTATGGTTTA
* * * * *
3360514 ATCCCT-GTTGTCTTCATTTTCTAACTCGTGGTTTAATCCCGA
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* * * * * * * *
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** *
3360619 ATCCTCCTTGTTTT-ACTTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGG
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* * * ** * *
3360661 TCATTTTCAATTTT-AGGCTCATGATTTTAT-TTGGTCATTTTTATTTCCTAA-CTCATGATTTA
1 TCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCAGTCA-TTTTATTTTCTAACCT-ATGGTTTA
** ** *
3360723 ATCCTAGTCATTTTC-GCTTCTTGACTAATGGTTTAATCCTGG
63 ATCCTAGTTGTTTTCATTTTC-TGACTCATGGTTTAATCCTGG
* * * * * * *
3360765 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGAT-TCTAGTCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTC-AGTCA-TTTTATTT-TCTAACCTATGGTTTA
* * ** * ** *
3360829 ATGCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCC-AG
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* * * * * * *
3360871 TCGTTTTCATTTTCTAACTCAAGTTTTAATCTTC-TTCATTTTCACTTTTC-GACTTATGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-TCAGTCATTTT-A-TTTTCTAACCTATGGTTTA
* * *
3360934 ATCCCT-GTTGTTTTATATTTTTTCTGACTCATGCTTTAATCCCT-A
63 AT-CCTAGTTGTTTT-CA--TTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CCTGG
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Statistics
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TCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCAGTCATTTTATTTTCTAACCTATGGTTTAATC
CTAGTTGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCTGG
Found at i:3360803 original size:35 final size:35
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3360127 TTCATTATTG
* * * *
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* * *
3360172 TTTTCATTTTCTGACTCTTGATTTAATT-TCAATCA
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* **
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* *
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* * * **
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* * * * *
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* * * * *
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** * * * **
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* * * ** *
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* * *
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* * ** * * **
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * ** **
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* * * * *
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* * *
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** * * * * *
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*
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* * * ** * *
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* * * * *
3360839 TTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCG
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* *
3360874 TTTTCATTTTCTAACTCAAGTTTTAAT
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT
3360901 CTTCTTCATT
Statistics
Matches: 553, Mismatches: 138, Indels: 76
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATTCTAGTCA
Found at i:3360830 original size:71 final size:70
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Indices: 3360635--3360882 Score: 230
Period size: 71 Copynumber: 3.5 Consensus size: 70
3360625 CTTGTTTTAC
* * * * * * * * * *
3360635 TTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGGTCATTTTCAATTT-TAGGCTCATGATTTTAT-TTGGTCA
1 TTTTCTAACTCATGATTTAATTCTAGTCATTTTC-ATTTCTTGACTAATGATTTAATCCTGGTCA
*
3360698 TTTTTA
65 TTTTCA
* * ** *
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1 TTTTCTAACTCATGATTTAATTCTAGTCATTTTCATTTCTTGACTAATGATTTAATCCTGGTCAT
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66 TTTCA
* * ** *
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* * * * *
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TTTCA
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*
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ATCTCCTA
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*
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AATCA
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* *** **
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* *
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* ** **** *
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* * * * *
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* * * *
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*
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * **
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** * * ** *
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* * * *
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* * *
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ATGTGA
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* * *
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*
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* *
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** * * * * ** * *
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**
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* ***
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* * * * ** * *
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* **
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* * * *
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3369182 TGACTCATGC
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* * **
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** * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * * * *
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** * *
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* * * * * * * * **
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** * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * ** *
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* ** * * * *
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* * * * * * * * * ** ** * *
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* * * * ** * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * *
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*** * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * ** * **
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* ** *
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* * * * * * **
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* * * ** * * *
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* * * ** * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * *
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* * * ** * * ** *
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** ** * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
3372290 CTTAGCCATTTTCATTCTCTAACTCGTGGTTTAATCCCT-GT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * ** * * * * * * *
3372331 GGTTTTAATTTTCTAACTTGTGGTCTAATCTTGATCATTTTTGGTTTT-AAACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3372395 TTTGGTCAATTTT-ATTTTTTGACTCGTGATTTAGTTCC-AGT
65 CCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA-ATCCTAGT
** * * * * * * * *
3372436 TGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTCTAAT-CTCGATC-TTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTG
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * ** * *
3372498 ATTTTGGTCATTTTTATTTATTTGACACGTTATTTAAT-GTCGAT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** ** * *
3372542 CATTTTCATTTTTTGACTTGTTG-TTTAATTTTGATCATTTTCT-TTTTCTGACTCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** *
3372605 T-CTCGGTCATTTTCACTTTTTGACTTGTGGTTTAATCCCCCA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT--CCTAGT
** * * * * *
3372648 TGTTTTACATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCT-GTCATTTTTATTTTTTGATTCATGATTTAA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3372712 T-CTCGATCGCTTTT-GTTTTTTGACTCATGCTTTAACCCTAGT
64 TCCT-GGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * ** * * * * *
3372754 GGTTTCCATTTTCTTACTAAGGGTTTAGA-CCCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTA-ATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3372818 ACC-GATCATTTTTATTTTTTAACTCGCAT--TTTAATCCTGGT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT--CATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3372859 CATTTTCATTTTCTAACACGTAATTTAATTCC-GGTAATTTTCATTATTGTTTTTCACTTTCGAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCA-TTT--TTA----TTTT--C--T--AA
* * * * * * *
3372923 CTCATGGTTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTTTTACTCTTGATTTAAT-TTCAAT
52 CTCATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * * * *
3372977 CATTTTTATTTCTCT-AGCTTATGATTTAATTTTGATCGTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGA-CTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * *
3373041 T-CTCAGTCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTGGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * *
3373083 TGTTTTCATTTTCAGACCCATGGTGTAATCCTGGTCGTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * ** *
3373148 CTGGTCGTTTTTATTTTCTGACTTGTTGTTTAATGCC-AGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * ** * * * *
3373188 TGTTTTTATTTTCTGACTAATGATTTAATCCCGATCGTTTCCATTTTCTAACTTATGTTTTGATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * *
3373253 CTGGTCATTATT-ATTTCTCCGACTCATTGTTTAATCCTTGT
66 CTGGTCATT-TTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * ** *
3373294 TGTCTTCATTTTTTGACCCGTGGTTTAATCCCGATCGTTTTTTCATTTTTTGGCTCATGGTTTCA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTC-ATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * * *
3373359 TCTTAGTCATTTTTGTTCTCTGACTCATGGTTTAATCCTCGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3373401 CGTTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTAGTCATTTTCCA-TTT-TAGGCTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA
** * * * * *
3373464 TTTTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCC-AGC
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * *
3373506 CATTTTC-GTTTCTTGACT-A-GTAGTGTAATCCTGGTCATTTTCT-TTTTCTAACTCATGATTT
1 CATTTTCATTTTC-TGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * * *
3373567 GATTCTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCC-AGC
62 AATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * *
3373612 CATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCC-AGTCGTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3373676 CTTCTTCATTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTCATCGCT-GT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * * * * * * * * * * *
3373717 --TGTTCTATTTTTTCTAAGTCGTGCTTTAATCCCT-ATCGTTTTCATTTTTTGA-TGCGTTGTT
1 CATTTTC-A--TTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT-CATGGTT
* * *
3373778 TAATCCTTGTCATTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCTA-T
61 TAATCCTGGTCATTTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * ** *
3373824 CATTTTCCTTTTTTGACT-A-G--------C-GG---TTTTCATTTTCTCACTAAGCGTTTAGTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * * * * *
3373875 CCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAAT-TTAGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * * ** * ** ** * * * * * ** *
3373915 CGTTTCCATTTTTTAACTCGCGTTTTACGCCCAGTAAATTTCATTTTCTGACTCTTAATTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3373980 TTAGTACTTTTTATTATCAATTTCTTTTTCTAACTCGTGGTTTAAT-CTCGAT
66 CTGGT-C-----ATTTTC-A----TTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * ** ** *
3374032 TATTTTCTTTTTCTGACTCGTGATTAAATTTTGATCATTTTTAGTTTCTCTGGCTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * ** * *
3374097 TACTGATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTAATTTAATCTTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * ** * * * * * *
3374139 TGTTTTCA-TTTCTAACCCATGGTTTAATCCCAGTCGTTTTCATTTTCTGACCCGTAGTTTAA-C
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * * *
3374202 CCAATCATTATCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CTAGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * *** * ** *
3374242 CATTTTTATTTTTTGACTCGTGGA-TTAATCCCAATCATTTTTATTTTCTAAGTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3374306 CCTGATCATTTTCATTTTCTAACTCACGCTTTAATTCCCT--T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-T-CCTAGT
* * * * ** * **
3374347 CGTTTTCATTTTTTTACTCGTGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTCTCTTACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3374412 CCCCGT-TTTCTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATCCCAAT
65 CCTGGTCATT-TTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * *
3374453 CATTTTTCATTTTCTGACTGGTGGA-TTCAT-CTCGATCATTTTCATTTTCTGACTTATTGTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * * * *
3374516 ATTCAT-ATCGTTTTAATTTTCT-AGCTCATGGATTAAT-CTCGAT
63 A-TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * ** *
3374559 CATTTTTAATTT-T-AGTCTAGTGATTTAATTC-GATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-A-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * *
3374621 TTTTGATCATTTTAATTTTTTGACT-AGTGGTTCAATCCCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * ** *
3374663 CATTTTTCATTTTTTGACACGTGATTTAATTCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * ** *
3374728 TGCC-GATCATTTTCAATTTTTGACTCATCATTTAAT-TTCAGT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * *
3374770 CATTTTCATTCGCTG-CATCATGGTTTAATCTCT-ATCATTTTGTCTTTT-TGACTTATGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATC-CTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * *
3374832 ATCCCT-GTTGTTTTACATTTTTTGCCTTATGCTTTAATCCCT-GT
63 AT-CCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3374876 -AGTTTTCATTTTC-CA-ACATGTTGTTTATCC-GTATCATTTTTATTTT-TAACTCGTGATTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGAT-TTAATCCTG-GTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
3374936 ATCCTTGTCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTGTAATCCTAAT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** ** *
3374979 CATTTTTTATTTTCTAACTCATTG-TTTAAT-CTCGATCGCTTTCGTTTTCTGACTCATGGTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * * * * *
3375042 ATCCTTGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3375085 CATTTTCATTTTCTAACTCGTGCTTTAATTCTAGTCATTTTCATTTT-TCAAC-AAGGGTTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGG-TTTAA
* * * ** *
3375148 TCCTGGTTATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAATTTTAGAAATTTTCATTA-T
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC---A--T-GGTTT---AA---TC-CTAGT
* ** * * * * * * * *
3375202 CATTTTCATTTTCTGATTTGTGGTTTAAT-CTCGATCCTTTTCATTTTTTGATTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * ** * *
3375266 TTTGATCATTTTTATTTCATTGGCTTGTGGTTTAAT-ATCGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *
3375308 CGTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGATCATTTTTAGTTTCTAACCCATGG-TTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * ** *
3375371 CCCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTGAATTTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
*** * * * * * * * * *
3375412 GGCTTTCATTTTTTGACTCATGACTTAAT-TTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* **** * * * * * *
3375476 TCACACCGTTTTTATTTTTTGACTTACGATTTAAT-TTCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * ** * *
3375517 CATTTTTATTTTTCTGACTCACGGTTTAATCCCCACT-GTC-TTCGT-TTTT-TGACTCATGATT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT---C-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTT
* * ** *
3375578 TAATCCTGATCGTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCAT-CTCAGT
61 TAATCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * ** * * * * *
3375624 CATTTTCATTCTCTAACTCGTGGTTTAATCCTTGTGGTTTTGATTTTTTGACTCGTGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * ** *
3375689 TTGATCATTTTCAGTTTTAGACTCATGATTTAATTTTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * *
3375729 CAATTTT-ATTTTCTGACTCGTGATTTAGTTCC-AGTTGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTCTA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTA-ATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
* * * * * ** *
3375791 AT-CTCGATCTTTTTCATTTTTCGACTCGA-GATTTGATTTTGGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * ** *
3375834 CATTTTTATTTCTTTGACTCGTTATTTAAT-GTCGATCATTTTCATTTTTTGACTTGTTGTTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * *
3375898 TTTTGATCATTTTCTTTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTCGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * *
3375940 CATTTTCACTTTT-TGACTTATGTTTTAATCC-CCT-ATTGTTTTACATTTCTGACTCATGATTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-T-TTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * *
3376002 AATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTGATTCATGATTTAATCACGA-T
62 AAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * ** * * * * *
3376046 CATTTTTCATTTTTTGACTCATTG-TTTAAT-CTCGATCGCTTTCATTTTTTGACTCGTGCTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * ** * * * *
3376109 ACCCTAGTGGTTTTCATTTTCTT-ACTAAGGGTTTAAACCCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** *
3376152 CATTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAATACC-GGTCATTTTTATTTTTTAGCTCGCGTTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** ** *
3376216 CCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAATTATGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3376257 AATTTTCATTATTATTTTTGTTCTCGAACTCATGGTTTAAT-CTCGATCATTTTCATTTTTTGAC
1 CATTTTC------A---TT-TTCT-G-ACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAAC
* ** * ** * * * * * * *
3376321 TCTTCATTTAAT-TTCAATCATTTTTATTTCTCT-AGCTTATGATTTAAT-TTTGAC
53 TCATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3376375 CGTTTTCATTTTTTAACTCGTGATTTAAT-CTCAGTCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * *
3376439 CTTGGTTGTTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * **
3376480 CGTTTTCATTTTCTAACTCATGATATAATCCTGGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATTATTTAATG
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT-
* ** * * * * *
3376545 CC-AGTTGTTTTTATTTTCTGACACATGATTTAATCC-CGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * *
3376585 CATTTTCATTTTCTGACTCATGTTTTGATTCTGGTCATTATTA-TTTCTTCAACTCATTGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTC-T-AACTCATGGTTTAA
** * * *
3376649 TCCCT-GTTGTCTTCATTTTTTGAAC-CGTGGTTTAATCC-CGAT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTG-ACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * *
3376691 CGTTTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTCAT-CTCAGTCATTTTTGTTCTCTGACTCATGGTTTA
1 C--ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
3376755 ATCCTCGTCATTTTAATTTTCTGGCTCGTGGTTTAATCCTAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * * *
3376798 CATTTTAAAATTT-AGGCTCATGATTTAATTTTGGTCTTTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAAT
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
* ** * * *
3376862 TCC-AGTCATTTTTGTTTCTTGACT-AGTAGTGTAATCCTAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3376903 CATTTTCTTTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* **
3376968 GCC-AGTCATTTTCATTTTTTGACTCATTATTTAATTCC-AGT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * ** * * * * *
3377009 CGTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTCTTCATTTTCACTTTTC-GATTTATGGTTTCAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3377073 CGCT-GTTGTTTTCTTTTTTCTGACTCGTGCTTTAATCCCTA-T
65 C-CTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * * *
3377115 CATTTTCATTTTTTGACGCGTTG-TTTAATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACGCGTTGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* *
3377179 CCCT-GTCATTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCTA-T
65 -CCTGGTCATTTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * *
3377221 CATTTTCATTTTTTGACT-A-G--------C-GG---TTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * * * * *
3377272 CCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAAT-TTAGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * * *** * * * * **
3377312 CGTTTCCATTTTCTAACTC--GCATTTTACTCCCAATAATTTTCATTTTCTGACTCCTAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3377375 T-TTCAGTAATTTTTATTATCATTTTCCTTTTCTGACTCATGGTTTAATCTTAAT
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* * * * * * ** *
3377429 CATTTTCATTTTCTGACTCGTGATTGAAT-TTCGATCATTTTTTGTTTCTCTAGCTTGTGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCA-TTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTA
* * * ** * * *
3377493 ATACTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATAATTTCATCTTGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * *
3377536 TGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCCGGTCGTTTTAATTTTCTGACCCATAGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * * *
3377601 CCAATCATTTTCATTTTTTGGCTCATGATTTAATCC-AGGC
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* *** *
3377641 CATTTTTACTTTT-TGACTCATGATTTAATCCCAATCATTTTTATTTTCTGA--CATGTGATTTA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG-G-TTTA
* * * * *
3377703 ATCCTGATCACTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTGCC-A-T
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-T-CCTAGT
* * * * * * *
3377746 CGTTTT--TTTTTTGACTCGTGACTTAATTCTAGTCATTTTTATTTCTCTAACTTATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * * *
3377809 CCCCGTTTTTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCAAT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * *
3377851 CATTTTTCATTTTCTGACTGGTGGA-TTCAT-CTCGGTCATTTTCATTCTCTGACTCATGCTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * * *
3377914 ACTCCT-GTCATTTTAATTTTCTAACTCGTGGATTAAT-CTCGGT
63 A-TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * ** * * ** *
3377957 CGTTTTTAATTTT-AGACTCGTGATTTAATTTTGGTCACTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAAT
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3378021 TTTGATCATTTTAATTTTTTAACT-AGTGGTTCAATGCC-AGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * ** * *
3378062 CATTTTTCATTTTCTGACTCAGGATTTAAT-TTGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATGTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTA
* * * **
3378126 ATGCC-GATCATTTTCAATTATTGACTCATCATTTAATTCC-AGT
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * ** *
3378169 CATTTTCATTTGCTGAGTCATGGTTTAATCTCT-ATCATTTTCTCCTTT-TGACTC-TGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
*** ** * ** *
3378231 TCCCCATTGTTTTACATGTTTTGACTTGTGCTTTAATCCCT-GT
64 TCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3378274 -AGTTTTCATTTT-TCAACACGTTG-TTTTATCCCT-CTCATTTTTATTTT-TAGCTCATGATTT
1 CA-TTTTCATTTTCT-GACTC-ATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* *
3378334 AATCCTAGTCATTTTCA---TTTGACTCATGGTGTAATCCT-GAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * * *
3378375 CATTTTTCATTTTTTGACTCATTG-TTTAATCCCGACCACTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * * * * *
3378439 CCCTTGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * ** * *
3378481 CATTTTTATTCTCTAACTCGTGCTTCAATTCTAGTTGTTTTCATTTT-TCAA-T-AGGTGTTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCA--TGGTTTA
* * * * ** * *
3378543 ATCCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAAT-TTCGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * ** * * * *
3378586 AATTTTCATTATCATTA-TCAT--TTTCAT-TTTCTGATTTGT-GTTT-TAATCTCAAATGTTTT
1 CATTTTCATTTTC-TGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAA-CTC--ATGGTTT
* * ** * * * * * * *
3378645 CATTTTCTGACCCATGATTT-A-ATTTGGA-TCAT-TTTTATTTCATTGG
62 -A-ATCCTG-GTCAT--TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA-ATCCTAGT
* * ** * * ** * * * * **
3378691 C-TTGTGATTTAAT-AC-CGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCA
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-AT-GATTT-A-ATCCTG-GTCAT-TTTTATTTTC--T-A-ACTCA
* * * * * ** *
3378753 T-TTTCTAACCCATAGTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATTTTGGT
56 TGGTT-TAATCC-T-GGTCAT-T--TTCA-TT----TTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * *
3378814 TGTTTTCATTTTTTAACTCGTGATTTAATCTTGATCATTTTCATTTTTTGATTCGTGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
*** * * ** * ** *
3378879 CC-CACCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATTTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * *
3378919 AATTTTTATTTTTTTGACTCATGGTTTAATCC---CCACTGTCTTCGTTTTCTTACTTATGGTTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-T-T-TTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * ** *
3378981 AATCCCGAT-AGTTTTTCATTTTCTGAATGGTGGTTTCAT-CTCAGT
62 AATCCTGGTCA--TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * ** * * * *
3379026 CATTTTCATTCTCTAACTCGTGGTTTAATCCCT-GTGGTTTTAATTTTCTGATTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * ** *
3379090 CTTGATCATTTTCGGTTTTAGACTCATGATTTAATTTTGGTT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** ** ** * * * *
3379132 AATTTT-ATTTTTTGACTTGTGATTT--TGTTGCAGTTGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTCTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG--GTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
* * * * * ** *
3379193 AT-CTCGATCTTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTGATTTTGGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * * **
3379236 CATTTTTATTTCTTTGACTCATTATTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTTGATTCGTTATTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3379301 TTTGATCATTTTC-TTTTTCTGACTCATGGTTTAATCTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * ** * *
3379342 CATTTTCACTTT-TGACTTGTGGTTTAATCC--CCCATTGTTTTACCTCTTT-TGACTCATGCTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-T-TTTTA--T-TTTCTAACTCATGGTT
* * *
3379403 TAATCCCT-GTCGTTTTTATTTTTTGA-TGCATTGTTTAATCTCTA-T
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT-CATGGTTTAATC-CTAGT
* * * * ** * * * *
3379448 CGTTTTTATTTTTTGACTCATCG-TTTAAT-CTCGATCGCTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * * * * * * *
3379511 CCCTAGTGGTTTTCATTTTCTCATTAAGGGTTTAGTCCCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3379553 CGTTTTCATTTTTTGACTCGTGCTTTAATACC-GATCATTTTTATTTTTTAACTCGCAT--TTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT--CATGGTTTA
* * * * ** * *
3379615 ATCCTGGTCTTTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAATTTCGATAATTTT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA--TC-CT-A--GT
* * * * * * *
3379664 CATTAATGTTTTTATTTT-TGAACTCATGGTTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTGACTCTTG
1 C----A--TTTTCATTTTCTG-ACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG
* * ** * * * * * * *
3379727 ATTTAAT-TTCAATCGTTTTTATTTCTCT-AGCTTATGATTTAAT-GTTGAT
58 GTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * * * * *
3379776 CGTTTTCATTTTCTAACTTGTGATTTAATCTTAGTCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * * *
3379841 CTGGTTGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTTAATCCTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * **
3379881 CATTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATCCTGGTCATTTTTTATTTTTTGACTCATTATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * *
3379946 GCC-AGTTGTTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATCC-CGAT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * **
3379987 CATTTTTATTTTCTGACTCTTGTTTTGATTCTGGTCATTATTATTTCTCCGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3380052 CGCT-GTTGTCTTCATTTTCTGACCCGTGGTTTAAT-CTTGAT
65 C-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** *
3380093 -ATTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTCAT-CTCAGTCATTTTCGTTCTT-TGACTCATGGTTT
1 CA--TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATT-TTCTAACTCATGGTTT
** * * *
3380155 AATCCTCATCATTTTAATTTTTTGATTCGTGGTTTAATCCTAGT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * *
3380199 CATTTTCAATTTT-AGGCTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
* ** * * *
3380263 TCC-AGTCATTTTTGTTTCTTGACT-AGTAGTTTAATCCTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3380304 CATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGGTCGTTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** *
3380369 GCC-AGACATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCC-AAT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
** * * * * ** * **
3380410 TGTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTCTTCATTTTCACTTTT-GGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** *
3380474 CCCT-GTTGTTTT-ATATTTTCTGACTCATGCTTTAATCCCTA-T
65 -CCTGGTCATTTTCAT-TTTT-TGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3380516 CGTTTTCATTTTTTGACGCATTG-TTTAATCCCT-GTCATTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * *
3380579 ATTCCT-ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTATAAT-CTTGAT
63 A-TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * ** * *
3380622 CATTTTTCATTTTTTAACTTGTCATTTAAT-CTCGATCGCTTTCATTTTCTGACT-A--G-----
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * *
3380678 --C--G--ATTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTCCCAAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** ** * ** * *
3380714 CGTTTTCATTTTCTAACTCGTGCTTTAAT-TTAGGTCGCTTCCATTTTTTAACTCGCGTTTTACT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** *
3380778 CCAT-GTAATTTTCATTTCTTGACTCTTAATTTAATTTCAGTACTTTTTATTAT
65 CC-TGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA--TC----C----TA--GT
* * * * * * * *
3380831 CAATTTCCTTTTCTGACTCACGGTTTAATCC-GAATCATTTTCT-TTTTCTAACTCGTGATTGAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG-GTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * ** * *
3380894 T-TTCGATCATTTTTTGTTTCTTTGGCTTGTGATTTAATACT-GAT
64 TCCT-GGTCA-TTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * ** * * **
3380938 AATTTTCATTTTATGACTTGTAATTTAATCTTGGTTGTTTTCA-TTTCTAACCCACAGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * *
3381002 CCGGTCATTTTCATTTTTCGACTCATGATTTAAT-CTAGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * ** *** * ** *
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1 CATTTTCATTTTCT-GACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3381106 CCTGATCA-TTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCCCA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * **
3381146 CGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGTCATTTTTATTTCTCTAACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* *
3381211 CCCT-GT-TTTCTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCGC-AAT
65 -CCTGGTCATT-TTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * * * *
3381252 CATTTTTCATTTTTTGAC-CGGTGGA-TTCAT-CTCGGTCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTC-AT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * *
3381314 AATTCCT-GTCGTTTTAATTCTTT-AGCTCATGGATTAAT-CTCGGT
62 AA-TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * * *
3381358 TGTTTTTA-ATTCTAGACTCGTGATTTAAT-TTCGGTCATTTTTATTTTCTGACTTATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCT-GACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * *
3381421 TTTTGATCATTTTTATTTTTTGACT-AGTGGTTCAATCCCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * ** *
3381463 CATTTTTTATTTTCTGACTCGTGATTCAATTCGGGTCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3381528 TGCC-GATCATTTTCAATTTTTGACTCATCGTTTAAT-TTCGAT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * * * **
3381570 CATTTTCACTTGCTGAGTCACGGCTTAATCTCT-ATCATTTTCTCTTTT-TGACTTGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * *
3381633 TTACC--GTTTTTTTACATTTTCTGACTCGTGCTTTAATCCCT-GT
64 -T-CCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3381676 -AGTTTTCATTTTC-CA-ACATGTTGTTTATCCCT-ATCATTTTTATTTT-TAACTCGTGATTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGAT-TTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * *
3381736 ATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTGTAATCCTAAT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * *
3381779 CATTTTTCATTTTCTGACTCATTG-TTTAAT-CTCGACCGTTTTTGTTTTCTACCTCATGGTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * * * * *
3381842 ATCCTTGTGGTTTTTATTTTCTCACTCA-GGATTTAGTCCCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGG-TTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3381885 CATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCTAGTCGTTTTCATTTT-TCAA--CAGGCGTTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATG-G-TTTA
* *** ** ** *
3381947 ATCCTGGTCATGTTCATTTTCCAACTCGTAATTTAATTTTGGTAATTTTCATT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC---A--T--GGTT--TAATCCT-AGT
* * * * * * * * *
3382000 ACCGTTTTCATTTTCTGATTTATGGTTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTA
1 --CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * * ** * *
3382064 ATTTTGATCATTTTTATTTCATTGGCTTGTGATTTAATACCGA-T
63 ATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * *
3382108 CGTTTTCATTTTTTGACTCTTGATTCAAT-CTCGGTTATTTTCATTTTCTAACCCATGG-TCAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3382171 CCCGATCATTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAAT-TTGGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * *
3382212 TGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
** * * * ** * * *
3382276 TCC-CATCGTTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-TTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3382317 CATTTTTATTTTTCTAACTCGA-GGTTTAATCC---CCACTGTCTTCATTTTCTGAGTCATGGTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCA-T-T-TTTATTTTCTAACTCATGGTT
* * * ** *
3382378 TAATCCCGATCGTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCAT-CTCAGT
61 TAATCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * ** * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *** * * * *
3382488 CTTGATCATTTTTGGTTTTAGACTCATGATTTAAT-TTTGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** ** * * * *
3382529 CAATTTT-A-TTTCTTGACTCGTGATTTAGTTCC-AATTGTTTTCATTTTTTTACT-AGTGGTCT
1 C-ATTTTCATTTTC-TGACTCATGATTTA-ATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTT
* * * * * * * ** *
3382590 AA-GCTCGATCTTTTTCATTTTTCGACTCGTGATTTGATTTTGGT
62 AATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * *
3382634 CATTTTTATTTCTTTGACTCATTATTTAATGCTGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** ** * *
3382699 TTTAATCATTTTC-TTTTTCTGACTCATGGTTTAATCTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * * * *
3382740 CATTTTTACTTTT-TGACTTGTGGTTTAATCC--CTCATTGTTTTACATTTTTTGACTCATGCTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-T-TTTT--ATTTTCTAACTCATGGTT
* * *
3382802 TAATCCCT-GTCGTTTTTATTTTTTGACGT-ATTGTTTAATCCCTA-T
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGAC-TCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * *
3382847 CATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGGTCATTTTTCATTTT-TGACTCATCGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* *** * *
3382910 T-CTCGATTGCTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAACCCTAGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * * * * *
3382952 GGTTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTCCTAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGCTTTAATA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * *
3383017 CTGGTCATTTTTATTTTTTAATTCACGTTTTAATCCTAGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * *
3383057 CATTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAATTTTGATAACTTTCATTATTGTTTCCATTTTCAAACT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG------GTC---ATT-TTT--ATTTTCTAACT
** ** * * * * *
3383122 CATGG-TTAAT-CTCAATTGTTTTCATTTTCTGACTCTTGATTTAAT-TTCAAT
54 CATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* ** * * ** * * *
3383173 CATTTTTATTTCTCT-AGCTTGTGATTAAATCTTGACCGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGA-CTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
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64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * ** *
3383279 TGTTTTCATTTTTTGACCCATTG-TTTAATCCTAGTCGTTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3383343 CCTGGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATTGTTTAATGCCAATT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * *** * * * *
3383385 GATTTT-ATTTTCTGACTCATGATTTAACCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCAT-GTTGTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTT-TAAT
** * * *
3383448 TTTGATCATTATT-ATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCCT-GT
65 CCTGGTCATT-TTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * ** * * ** *
3383490 TGTCTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-CTCGATTGTTTTTAATTTTTTGACTGGTGGTTT-C
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * *
3383553 TTCTCAGTCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCTCA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * ** * *
3383596 TGTTTTAATTTTTCTTACTCGTGGTTTAATCCTGGTCATTTTCAAATT-TAGGCTCATGATTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA
** * * * * *
3383660 TTTTGGTCTTTTTTATTTTTTAACTCGTGATTTAATTCC-AGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * *
3383702 CATTTTC-GTTTCTTGACT-AGTGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGA
1 CATTTTCATTTTC-TGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * *
3383765 TTCTGGTCGTTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCC-AAT
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* * * * * *
3383808 CATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * * * *
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66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * ** * * * * * *
3383913 TGTTTTATATTTTCTGACTTGTGCTTTAATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTGACACATTGTTTAA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * *
3383977 TTTCT-GTCATTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCTA-T
64 -TCCTGGTCATTTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * * * * * * **
3384020 CATTTTCATTTTTTAACTCGTGGTATAATCTTGATCACTTTTCATTTTTTAAGTCATCATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** *
3384085 -CTCGATCGCTTTCATTTTCTGACT-A--G-------C--G-
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *** * * * *
3384113 -ATTTTCATTTTCTCATTAAGGGTTTAGTCCCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCATGCTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3384176 TTAGGTCATTTCCATTTTTTAACTCGCT-TTTTACTCCT-GAT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *
3384217 AATTTTCATTTTCTGACTTC-TAATTTAAT-TTCAGTAATTTTTATTATCATTTTCTTTTTTTGA
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATCCT-GGTCA---TT-TT-T-ATTTTC------TAA
** * * ** * * * *
3384280 CTTGTGGTTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTGACTTGTGATTGAAT-TTCGAT
52 CTCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * ** * * * * * **
3384334 CATTTTTTGTTTCTCTGGCTTGTGATTTAATACTGATCATTTTCAATTTT-TGACTCGTAATTTA
1 CA-TTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * ** * * * * *
3384398 ATCTTTGTTGTTTTCAATTTCTAACCCATGGTTTAATCC-CGAT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** ** * **
3384441 CGTTTTAATCTCAATCGTTT-TAATTTTTGACCTACAGT-TTAATCTCAATCGTTTTCATTTTCT
1 C--ATT--T-TC-AT--TTTCTGACTCATGATTTA-A-TCCT--GGTC-AT--TTTT-ATTTTCT
* * * ** * * *
3384504 GACTCATGATTTAAT-CTAGGTCATTTTTA-TTTTTGACTTGTGGGTTAATCCCAAT
50 AACTCATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * *
3384559 CATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
** * * * ** *
3384624 CC-CATCATTTTCATTTTCTGAC-CACGATTTAATTTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * *
3384663 CATTTTTATTTTTCTAACTTC-TGGTTTAATTCC-CGT--TTTCTTCATTTTCTAACTCATGGTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGAC-TCATGATTTAA-TCCTGGTCATTT-TT-ATTTTCTAACTCATGGTT
** * * * *
3384724 TAATCCTAATCATTTTTCATTTTCTGACT-AGTGGATTCAT-CTCGAT
61 TAATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** *
3384770 CATTTTCATTCTCTGAC-CTATGGTTTAATTCCT-GTCGTTTTAATTTTCTAACTTGTGGATTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * ** *
3384833 T-CTCGGTCATTTT-AATTTTAGACTCGTGATTTAATTTTGGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** ** * * *
3384874 CATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATTTTGTTCATTTTTATTGTT-TGACT-AGTGGTTCAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATT-TTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * * * *
3384937 TCC-AGTCATTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAAT-TTGGGT
64 TCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * ** * * **
3384979 CATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCC-GACCATTTTCAATTTT-TGACTCATCATTTA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * ** *
3385042 ATTCTGGTCATTTTGACTTGCTGAGTCATGGTTTAATCTCTA-T
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* ** * ** * * * *
3385085 CATTTTC-TCTTTTTGACTTGTGATTTAATCCTCGTTGTTTTACATTTTCTGACTCGTGCTTTAA
1 CATTTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * **
3385149 TCCCT-GT-AGTTTTCATTTTCTAACACGTTGTTTTGTCCCT-GT
64 T-CCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * ** * * * ** *
3385191 CACTTTT-ATTTT-TAACTCGTGATTTAATCCTAGTTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGGTGTAAT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3385254 CCTGATCATTTTTCATTTTCT-AGCTCATTGTTTAATCCT-GAT
65 CCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * * * * * *
3385296 CGCTTTCATTTTCTGACTCACGGTTTAATCCTTGTGGA-TTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGT-CATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3385360 CCCAGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * **
3385401 CGTTTTCATTTT-TCA-ACAGGCGTTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA--TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * *
3385464 TTTTGGTAATTTTCATTATCGTTT-ACATTTTCTGATTTGTGGTTTAAT-CTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATT-T--TTTGAC----TC--A----TGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** ** *
3385518 CGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTTCT-CTCATTTTTA-TTTCATTGGCTTGTGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTC--TAACTCATGGTTTA
* * *
3385581 ATACC-GATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGGT
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * * * *
3385624 CATTTACATTTTCTAACCCATG-GTTAATCCTGATCGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * * *
3385688 TTGGTTGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAAT-CTCGAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * ** ** *
3385728 TGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAT--TGCCACCATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG--GTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3385791 T-TTCGGTCATTTTTATTTTTCTAACTCGTGGTTTAATCCCCA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * * ** *
3385834 TGTCTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGATCGTTTTCCATTTTCTAACTGGTGGTTTCAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
3385899 -GTCAGTCATTTTCATTCTCTAACTCTTGGTTTAATCCCAGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * *
3385940 TGTCTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCATTTTCAGTTT-TAGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3386004 -CTGGTCAATTTT-ATTTTCTGACTCGTGATTTAGTTGC-AGT
65 CCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA-ATCCTAGT
** * * * * * * * * * * *
3386044 TGTTTTCATTTTTTTACT-AGTGGTCTAAGCTTGATC-TTTTTCATTTT-TCGACTCGTGATTTG
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCT-AACTCATGGTTTA
** * ** *
3386106 ATTTTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATTATTTAATGCCGA-T
63 ATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * ** * * *
3386150 CATTTTC-TTTTTTGAGTCGTTATTTAATTTTGATCA--TTT-TTTT-TGACTCATTGTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * *
3386209 CTCAGTCATTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCCCA-T
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT--CCTAGT
** * * ** * * * *
3386251 TGTTTTACATTTTTTGACTCATGCTTTAATCCCT-ACCGTTTTTATTTTTTGACTCATTGTTTAA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3386315 TCC--CTCGTTTT-ATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3386354 CATTTTTCATTTTTTAACTCATCATTTAAT-CTCG--ATTGCTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT--TTT-ATTTTCTAACTCATGGTTT
* ** ** * * * * * * *
3386416 AAGCCAAGTGGTTTTGATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTCCCAGT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * *
3386460 TGTTTTCATTTTTTGACTCGTGCTTTATTACTGGTCATTTTTATTTTTTAACTCGCAT--TTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT--CATGGTTTAA
* * * ** *
3386523 TCCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAAT-TTCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * ** * * *
3386565 AATTTTCATTATTGTTTTTGTTTTCGAACTTATGGTTTAAT-CTCGATTGTTTTCATTTTTTGAC
1 CATTTTC---A------TT-TTCT-G-ACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAAC
* * ** * * * * * * *
3386629 T-TTGGATTTAAT-TTCAATCATTTTTATTTCTCT-AGCTTATGATTTAAT-GTTGAC
53 TCATGG-TTTAATCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** * * * * * *
3386683 CATTTTCATTTTCTAACTTGTGACTTAATCTTAGTCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * *
3386748 CTGGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * *
3386788 CATTTTTATTTTCTGACTCGTTG-TTTAAT-GTCGGTTGTTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * * *
3386851 TCCCAGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGTTTTGATTCT-GAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * *
3386893 CATTATT-ATTTCTCTAACT-AGTGGTTTAATCCCT-GTTGTCTTCATTTTCTGACTCATGGTTT
1 CATT-TTCATTT-TCTGACTCA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * * ** *
3386955 AAT-TTCGATCGTTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTCGTCTTAGT
62 AATCCT-GGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * ** *
3387064 CCTGGTCATTTTCAATTTTAGGCTCATGATTTAATTTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * *
3387105 CATTTTTATTTTCTAACACATGATTCAATTCC-AGTCA-TTTTCGTTTCTTGACT-AGTGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTC-TAACTCA-TGGTTTA
* * ** * * *
3387167 ATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATTATTTGATTCTGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * * * * **
3387210 CGTTTTTATTTCTTTGATTCGTGATTTAATGTTGGTAATTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
* * * * * **
3387275 TCC-AGTCATTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATCTTCTT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * ** *
3387316 CATTTTCACTTTTC-AACTTATGATTTAATCCCT-GTTGTTTTATATTTTCTGACTTGTGCTTTA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * **
3387379 ATCCCT-ATCATTTTCATTTTTTGACACATCATTTAATCCCT-GT
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * **
3387422 CATTTTCTATTTTGTGACTTACGATTTAATTCCT-ATCATTTTTCATTTTTTCACTCGTCATTTA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
3387486 AT-CTCGATCGTTTTCGTTTTCTGA--C-------AA-GC--G-
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *** * * * *
3387516 -GTTTTCATTTTCTCATTAAGGGTTTACTCCCAATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * * * * * *
3387579 TTAGGTCGTTTCCGTTTGTTAACTCGTGTTTTACTCCTTGT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * *
3387620 AATTTTCATTTTTTGACTTTTAATTTAAGTTC-AGTAATTTTTATTATCATTTTCCTTTTCTGAC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCA---TT-TT-T-A------TTTTCTAAC
* * * * * * * * * *
3387684 TCACGATTTAATCCCGATCATTTTCATTTTTCGACTCGTGATTGAAT-TTTGAT
53 TCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * ** * * * * * ** **
3387737 CATTTTTTGTTTCTCTGGCTTGTGATGTAATACTGATCGTTTTGATTTT-TGGCTCATAATTTAA
1 CA-TTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * * *
3387801 TCTTAGTTTTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAAT-CTCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* *** ** * * * * *
3387843 CATTTTCATTTTCTGACTCGT-AGTTTAATCCCAATTGTTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTTAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** * *
3387907 CCAGGTCATTTTTATTTTTTGACT-GTGGGCTAATCCCAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * *
3387947 CATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGATCATTTTCATTTTCTAACT-ATGCTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * * *
3388011 C-CATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * **
3388050 TATTTTTATTTCTCTAAGTTTTGGTTTAATCCCCGT--TTTCTTCATTTTCTGAACTCATGGTTT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTT-TT-ATTTTCT-AACTCATGGTTT
*** * * *
3388113 AATCCCAATCATTTTTCATTTTCTGACT-AGTGGATTAAT-CTCGGT
62 AATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * * *
3388158 TATTTTCGTTCTCTAACTCATGGTTTAATTCCT-ATCATTTTAATTTTCTAACTCGTGGATTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * ** *
3388222 -CTCGATCGTTTTTAATTTTAGACTCATGATTTAATTTTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3388263 CATTTTTATTTTCTAACTTATGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTTTTGACT-AGTGGTTCAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
** ** * * *
3388326 TCCCAGTCATTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAAT-TTGGGT
64 TCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * *
3388369 CATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATGCC-CATCATTTTTTATTTT-TGACTTATCGTTTA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * ** *
3388432 AT-TTCGATCATTTTTATTTGCTGAGTCATGGTTTAATCTCTA-T
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* ** * * ** * * * * *
3388475 CATTTTC-TCTTTTTGACTTGTGGTTTATTCCCCGTTATTTTACATTTTCTGACTCGTGTTTTAA
1 CATTTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * *
3388539 TCCCT-AT-AGTTTTCA-TTTTCCAGCACATTGTTTTATCCCTA-T
64 T-CCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * *
3388581 CATTTTCATTTT-TAACTCGTGATTTAATCCTAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTGTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * *
3388645 CTGATCATTTTTCTTTTTTTGGCTCATTGTTTAATCCT-GAC
66 CTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * * * *
3388686 CGCTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCTTGT-AGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3388750 CCCAGTCATTTTCATTTTCTAACT-AGTGCTTTAATTCTACT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
** * * * *
3388791 TGTTTTCATTTT-TCA-ACAGGCACTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTC---A--T--
** * ** * * ** *
3388854 TTTTGGTAATTTTCATTATCATTTTCTTTTTTTGATTTTGTGGTTTAAT-CTTGAT
57 GGTT--TAA---TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** ** *
3388909 CGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-TTCGAG-CATTTTTA-TTTCATTGGCTTGTGATTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-G-GTCATTTTTATTTTC--TAACTCATGGTTT
* * * * *
3388971 AAT-ATCGATCGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CTCAGT
62 AATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * * *
3389015 CATTTTCATTTTCTAACCCATGGA--TAATCCCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTTAGT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** ** * * *
3389078 TTTGGTTGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAAT-CTCAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * *** * ** ** *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3389183 -TTCGATCATTTTTATTTTTTTGGCTCATGGTTTAATCCCCACT
65 CCT-GGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * *
3389226 -GTCTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCCATTGTC-TTTCT-TTTT-TGACACGTGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT--CC-TGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * *
3389287 ATCCTGATCATTTTTCATTTTCTGACT-AGTGGTTTCAT-CTCAGT
63 ATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCT-AGT
* * * ** * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
* ** * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * **
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64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** ** ** *
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1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * **
3389606 TCCCT-ATCGTTTTCATTTTTTGACGT-GTTATTTAATCCCT-GT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGAC-TCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3389648 -AATTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCT-ATCATTTTCATTTT-TGAACTCGTGGTATA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGGTTTA
* ** * * * * *
3389710 ATCTTAATCATTTTTTATTTTTTAACTCGTCGTTTAAT-CTCGAT
63 ATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * ** * * *
3389754 CGCTTTCATTTTCTGACT-A-GCAATTTTCAT-TTTCTCATTAAGGGTTTA-GTCCCAATCATTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG--A-TTTAATCCTGGTCATT-----TTTATTTTCTAA-C----
* * * * * * ** * * * *
3389815 TCAT--TTCCTAACCCATGGTTTAATTTCGGTTGTTTTTATTTTTTGGCTCGTGAT-TTAAT
53 TCATGGTT--TAATCC-TGG-TCATTTTC-ATT-TTTTGA-CTCATGG-T-TTAATCCTAGT
* * * ** * * ** *
3389874 CTTGATCGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCC-CATCGTTTTTATTTTCTGACTTGTGA
1 C---AT--TTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG
* * * *
3389938 TTTAATTTCT-ATCATTTTTATTTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCCT-GT
59 TTTAA-TCCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * ** *
3389986 TGTCTTCATTTTCTGACTTATGGTTTAATCCTGACCATTTTTCATTTTCTAACT-AGTGGTTTCA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * * * * *
3390050 T-CTCAGTCATTTTTATTCTCTCACTCATGGTTTAAT-CTCGAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * ** * * *
3390092 CATTTTCACTTTT-TGACTTGTGGTTTAATCC--CCCATTGTTTTACATTTTCTGACCCATGCTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-T-TTTT--ATTTTCTAACTCATGGTT
* * * * *
3390154 TAATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTGACACATTGTTTAATCCTTGT
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *** *
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1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTC-ATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGTTTA
* * * *
3390263 AT-CTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAAT-CTGGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * **
3390305 CATTTTTATTTTTTAACTC--GCATTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTATACCTCATAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * *
3390368 TTATGGTAATTTTCATTATTGTTTTCATTTTCGAACTCATGGTTTAAT-CTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTC---A-----TT--TTTT-G-ACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** * ** *
3390422 CGTTTTCATTTTTTGGCTCTTCATTTAAT-TTCAATCATTTTTA-TTTCATTAGCTTGTGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTC--TAACTCATGGTTTA
* * * * *
3390485 ATACC-GATCGTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAAT-CTCGAT
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * ** *
3390528 CATTTTCATTTTCTGACCCATG-GTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTGTCCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * *
3390591 TTTGGT--TGTTTCTATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGAT
65 CCTGGTCAT-TTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** *
3390632 CGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTCCT-GTTATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3390696 -TTCGATCATTTTTATTTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCCATTGT
65 CCT-GGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAAT--CC-TAGT
* * * * ** *
3390741 C-TTTGT--TTTT-TGACTCATGGTTTAATCCCT-ATCATTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTC
1 CATTT-TCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * **
3390801 AT-CTCAGTCATTTTCATTCTCT-AATTGTGGTTTAATCCCT-GT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * * *
3390843 GGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGATCATTTTCAATTT-TAGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** ** * * * * *
3390907 TTTTTTCAATTTT-ATTTTTCGACTCATGATTTAGT-TTCGAT
65 CCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * * * *
3390948 TGTTTTCATTTTTTAACT-AGTGGTCTAAT-CTCGATC-TTTTTCATTTTCTGACT-AGTGG--T
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTT
* * * ** *
3391007 --T--T--TCATTTTCA------AACTCATGATTTGATTTTGGT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * **
3391039 CATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAATGCC-AGTCATTTTCATTTTTTGACTCATTATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * ** * *
3391103 TTAC-AGTTGTTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAATCCTGGT
64 -TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * * *
3391145 CATTTTTATTTTCTGACTCATTG-TTTATTGCCAATTGTTTTTATTTTTTTTTTGACTTATGTTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAAT-CC--TGGTCATT-TTTATTTTCTAACTCATGGTT
* * *
3391209 TGATTCTGGTCATTATT-ATTTCTTTGACTCGTGGTTTAATTCCT-GT
61 TAATCCTGGTCATT-TTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
** * * * * * * * *
3391255 TGTCTTCATTTTCTAACTTATGGTTTAAT-CTCGATCATTTTTTATTTTCTTGACTCGTGGTTTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCA-TTTTTATTTTC-TAACTCATGGTTTA
* * * * * *
3391319 GT-CTCAGTCGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATTCTTGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * ** * *
3391362 CATTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTGGCCATTTTCAAATT-TAGGCTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** ** * * * * *
3391426 TTTCATCATTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAATTCC-AGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * *
3391467 CATTGTT--GTTTCTTGACT-AGTGCTTTAATCCAGGTCATTTTCATTTTCTAACTC-T--TATT
1 CATT-TTCATTTTC-TGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGT-TT
* * * ** *
3391526 GATTCTAGTTGTTTTCATTTTTTGAC-C-TGTGATTTAAT-CTCGAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-G-TTTAATCCTAG-T
* * * ** ** *
3391570 CGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTCC--ACCATTTTTATTTTCTAACTTTTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3391633 TTTGATCATTTTTATTTTTTTGACTCATGGTTTAATTCCCATT
65 CCTGGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
** * * * * * * * * ** *
3391676 TGTCTTCCTTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCGATCGTTTTTCATTTTCTGATTGGTGGTTTCAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3391741 -CTCAGTCATTTTCATTCTCTAACTCCTGATTTAATCCCTA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * ** * *
3391782 GGTTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTTGATCACTTGCAGTTT-TAGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3391846 TTTGGTCAATTTT-ATTTTCTGACTCGTGATTTAGTTCC-AGT
65 CCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA-ATCCTAGT
** * * * * ** * * *
3391887 TGTTTT-AGTTTTTTAACT-AGTGGTCTAAT-CTCAATC-TTTTTCATTTTTTGACTCATGATTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTT
* ** * * ** *
3391948 GATTTTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTTATTTAATGCCGA-T
62 AATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * ** *
3391993 AATTTTCATTTTTTCACTCATTG-TTTAATTTTGATCATTTTCT-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3392056 T-CTCAGTCATTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTAGTCCCCCA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT--CCTAGT
** * * * * * * * * *
3392099 TGTTTTACATTTTTTGACTCCTGCTTTAATCCCT-ATCCTTTTTATTTTTTGACGCATTGTTTAA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * ** *
3392163 TCCCT-ATCATTTTTTATTTTTTGACTCGTCATTTAAT-CTCGAT
64 T-CCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * * ** * * *
3392206 CGCTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTTGTGGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * ** * ** *
3392271 TTGATCATTTTCAATTTTACACTCATGATTTAATTTTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * * * *
3392311 CAATTTT-ATTTTCTGACTCGTGATTTAGT-TTCAGTTGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTCTA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
* * * * * * * ** *
3392373 ATCTTGATCTTTTTCATTTTTCGACTCGTGATTTGATTTTGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * *
3392416 CATTTTTATTTCTTTGACTCGTTATTTAATGCC-GATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * *
3392480 TTTTGATCATTTTC-TTTTTCTGACTCATTGTTTAA-CCTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** * ** * *
3392522 CATTTTCACTTTT-TAACTTGTGGTTTAATCC-CCT-ATTGTTTTACATTTTCTGACTCATGCTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-T-TTTT--ATTTTCTAACTCATGGTT
* * *
3392584 TAATCCCT-GTCGTTTTTATTTTTTGA-TGCATTGTTTAATCCCT-GT
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT-CATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * *
3392629 CATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAAT-CTCGATCATTTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** *
3392693 T-CTCAATCCA-TTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
64 TCCT-GGT-CATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * ** * * * ** *
3392735 GGTTTTCGTTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTGCTTTAATA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT-
** * * * * *
3392800 CC-AATCATTTACATTTCTTAACTCGCAT--TTTGATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT--CATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * **
3392840 CATTTTTATTTTGTAACTGGTAATTTAATTTCAATAATTTTTGTTTTTTTTTTCATTTTCTAACT
1 CATTTTCATTTTCTGAC---TCA--TGA-TT---TAA-TCCTG-GTCATTTTT-ATTTTCTAACT
* ** * * * * * *
3392905 TATGGTTTAAT-CTCAATCATTTTCATTTTCTGATTCTTGATTTAAT-TTCAAT
54 CATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* ** ** * ** ** * *
3392957 CATTTTTATTTCTCT-AGCTTGTGATTTAATGTTGATTGTTTTCCTTTTCTAACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGA-CTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * *** *
3393021 T-CTCATCGTTTTCATTTTCCAACCCATGGTTTTAAT-CTAGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGG-TTTAATCCTAG-T
** * * * ** * * * *
3393063 TGTTTTCACTTTCTGACTCGTCATTTAATCCTGGTTGTTTTTATTTTCTGACTCGTTGTTTAATG
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * ** * * *
3393128 TTGATTGTTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCCTAAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * *
3393168 CATTTTCATTTTCCGACTCATGTTTTGATGTTGGTCATTATTATTTCTTTGACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * ** *
3393233 CCTTGTTGTCTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCC-CGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * *
3393274 CATTTATCATTTTTTGACTCGTGGTTTCATCTTAGTCATTTTCATTCTCTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTT-TCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * ** *
3393339 CCTTGTCATTTTCAATTTTAGGCTCATGATTTCATTTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** *
3393380 CATTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAATTCC-AGTCA-TTTTCGTTTCTTGACT-AGTGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTC-TAACTCA-TGGTTTA
* * * * *
3393442 ATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * *
3393485 CATTTTTATTTCTTTGACTCATCATTTAATTCTAGTCGTTTTCATTTTCCAACTCAAGGTTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3393550 CTTCTTCATTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTAATCCTTGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * ** * * * * * * *
3393591 TGTTTTATATTTTTTGACTCGTGCTTTAATCCTTATCGTTTTCATTTTTTGACGCGTTGTTTAAT
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* *
3393656 CCCT-GTCA-TTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCTA-T
65 -CCTGGTCATTTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * * **
3393697 CATTTTCATTTTTTGACTCATGGTATAATCTTGATCATTTTTCATTTTTTAACTCATCATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3393762 CTCAATTG-C--TTTCATTTTATGACTAATGGTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTT
65 C-C--TGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGG--------TT-TAA-TCCT-A-GT
* * *** * * * * *
3393815 AATTTAGGTCGTTTTCATTTTTTAACTCGCATTTTACTCCCT-ATCATTTTCATTTTTTAACTTC
1 CATTT---TCATTTTC--TGACTCA-T-G-A-TTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAAC-TC
** * ** * * *
3393879 -TAATTTAA-CTTCAATAATTTTTATTATCATTTTCCTTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-CTCGAT
55 ATGGTTTAATCCT-GGTCA--T---TT-TCA------TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** ** *
3393941 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTGAAT-TTCGATCATTTTTATTTCTCTGGCTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
** * * * ** * *
3394005 TATTGATCATTTTCATTTTCTGATTCATAATTTAATCTTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * *
3394047 TGTTTTCATTTTCT-AATCCATGGTTTAATTCTAGTCATTTTCATTTTCTGACCCGTAGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACT-CATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
*** * * *
3394111 CCCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCC-AGGC
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * ** *
3394152 CGTTTTCTTTTTTTGTCTGACTCATG-TTTAATTCC-AATCATTTTTCATTTTCTGACT-AGTGG
1 CATTTTC---ATTT-TCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGG
* * * * * * *
3394214 ATT-CTTCTCGGTCATTTTCATTCTCTGACTCATGGTTTAATTCTTGT
59 TTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3394261 CGTTTTAATTTTCTAACTCATGGA-TTAAT-CTCGGTCGTTTTT-TATTT-TAGACTCATGATTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTAT-TTTCTA-ACTCATGGTTT
** ** * * * * ** * * *
3394322 AATTTTACTAATTTTTAATTTTTAACTTGTGATTTAAT-TTCGAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * *
3394366 CATTTTAATTTTTTGACT-AGTGGTTCAATCCCAGTCATTTTTCATTTTTTGA--CATGTGATTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATG-G-TTT
* * * * *
3394428 AATTCAGGTCATTTAT-ATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCC-AAT
62 AATCCTGGTCATTT-TCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * *
3394473 CATTTTCAATTTT-TTACCCATCG-TTTAATTCTGATCATTTTCATTTGCTGAGTCATGGTTTAA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * **
3394536 TCTCT-ATCTTTTTC-TCTTTTTGACTTGTGGTTTAATCCCT-GT
64 TC-CTGGTCATTTTCAT-TTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * * *
3394578 TGTTTTACATTTTTTGACTCATGCTTTAATCCTTGT-AGTTTTCATTTTCCAACACATTGTTTTA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * ** * *
3394642 TCCCT-ATCATTTTTA-TTTTTAACTCGTAATTTAATCCCAAT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
*** * * * * ** * * ** *
3394683 TGCTTTCATTTTTTGACTCACGGTTTAATCCTTGTGGTTTTCATTTTCTCACTCGGGGTTTAGT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3394747 CTCAGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTGCTTTAATTCTAGT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * *** **
3394788 TGTTTTCATTTT-TCA-ACAGGCGTTTTAATCCTGGGTCATTTTCGCTTTCTAACTCATAATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA--TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * *
3394851 ATTTTGGTAATTTTCATTATCGTTTTCATTTTTTGATTCAAGGTTTAAT-CTCGAT
63 ATCCTGG------TC---A---TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * *
3394906 CGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CTCGGTCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * *
3394970 GCC-GGTCATTTTCATTTTATGACTTGTGATTTAATCCTGGT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * * * * *
3395011 CA-TTTCTATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-TTCAATCATTTCTATTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3395074 T-CTCGATCGTTTTCATTTTTTTGACTCGTGGTTTAATTCCCA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * ** * *
3395117 CTTTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * *
3395182 CCTTATTC-TCTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAAT-CTCGAT
65 CC-TGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3395223 CGTTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTTAT-CTCGGTCAATTTCATTCTCTAACTCATGGTTTA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * *
3395286 ATCCCT-GT-TTTTGTAATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTCGAT
63 AT-CCTGGTCATTT-TCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * * * *
3395329 CGTTTTTCGATTTT-AGACTTATGATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTCTGAGTCATGATTTAG
1 C-ATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** *
3395393 T-TTCGGTTGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAAT-CTCAAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * *
3395435 CTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTGATTCTGGTCATTTTTATTTATTTGACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** * * *
3395500 GCTGATCA--TT--TTTTTTGAATTGTTGTTTAAT-TTTGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
*** * * *
3395600 TCCCCATTATTTTACATTTTCTT-ACTCGTGCTTTAATTCCTA-T
64 TCCTGGTCATTTT-CATTTT-TTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
*** * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3395705 T-CTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTTATGATGTAATTC-AGTT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * ** ** * * * *
3395747 CATTTTTATTTTTTGTTTCGTGGTTTAATCCTATTGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * * * * *
3395812 CCAGTCTTTTTCATTTTTTGACTCGTGCTTTAAT-ATCGAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *
3395852 CGCTTTT-ATTTTTTTACTC--GCATTTTGATCCTAGTCATTTTCATTTTCATTTTCTGACTAGT
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCA---T--TTTT-ATTTTCT-A--ACT
* ** ** ** * *
3395914 AATTTATTTTCAATAATTTTCATTATTGTTTTCA-TTTTTGAACTCGTGGTTTAAT-CTCGAT
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* * * * * * **
3395975 CATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTCATTTT-TGACTCATTATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * * * *
3396039 CCGGTTGTTTTTATTTTTTGAATCATGATTTAAT-CTCGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * *
3396079 CATTTTCATTTTCTGACTCATGTTTTGATTCTGGTAATTTTTATTTCTTTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * * *
3396144 CCTTGTTGTCTTCATTGTCTAACTCATGGTTTAATCC-CGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** * * * *
3396185 CATTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTAAT-CTCGGTCATTTTCATTCTCTGACTCATGGTTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * *
3396249 TCTTTGTCGTTTTAATTTTTAGGCTCATGGTTTAATCCTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3396291 CGTTTTCAATTTT-AGGCTCATGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * *
3396354 TTCC-AGTCATTTTTGTTTCTAGACT-AGTAGTTTAATCCT-GAT
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* * * * * ** * * *
3396396 CATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTAGTTGTTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** *
3396461 -GTCGGTCATTTTCATTGTTTGACTCATCATTTAATTCTAGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGTTTAAT
** ** * * *
3396566 CCCCCGTTGTTTTACATTTTCTAACTCATGTTTTAATCCCTA-T
65 -CCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3396609 CATTTTCATTTTTTGACACGTTG-TTTAATCCCCT-GTCATTTCTATTTTTTAACTTATGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAAT--CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * ** * * *
3396672 ATTCCT-ATCATATTCATTTTTTGACTTGTAGTATAAT-CTTGAT
63 A-TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *
3396715 CATTTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAAT-CTCG--A---TTGTTTTC--A-T--T-TTTTGAT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * * * **
3396768 --TGGTGGTTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTCCCAAA
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * *
3396807 CGCTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAAT-TTAGGTCATTTTCT-TTTTTTAACT--TGAATTCT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATG-GTT-T
* * * * * ** *
3396868 ACTCCTAGTCATTTTTTATTTTCTGACTCCTAATTTAATTCCAAAAATTTTTATTAT
62 AATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCC---------TA--GT
* * * ** * * * *
3396925 CATTTTCCTTTTCTGACTCGTGTTTTAAT-CTCAATCATTTTCATTTCTCTAGCTTATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * ** ** *
3396989 TACTGATCGA-TTTCATTTTCAGACTCATAATTTAAT-CTCGGT
64 TCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * * * * * * *
3397031 TGTTTTCATTCTCTAACCCATGGTTTAATCTCT-ATCGTATTCATTTTCTGACCCATAGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
*** * ** *
3397095 CCCAATCATTTTCATTTTTTGACTCGTAATTTAATCCAAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * ** *
3397136 CGTTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTAGTCATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3397201 CCGATCTTTTTTATTTTTTGACTCATAGTTTAATTCTCA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * ** * * **
3397241 TGTTTTCATTTTCTGATTCGTGATTTAATTTTGGTCATTTTTGTTTCTCTTACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* *
3397306 CCTCGT--TTTCATCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAAT
65 CCTGGTCATTT--TCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * *
3397347 CATTTTTCATTTTCTGACTAATGGA-TTAAT-CTCGATTGTTTTCATTCTCTGACTCTTGGTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * * * *
3397410 ATTCCT-ATCATTTTAATTTTCTAACTCGTGGATTAAT-CTCGGT
63 A-TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * ** * ** * *
3397453 CATTTTTAATTTT-AGACTCGTGATTTAATTTTGATCATTTTTA-CCT-TAGACTCGTGATTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA
** * ** * * *
3397515 TTTTGGTCATATTT-ATTTTCTGACTTGTGATTTAAT-TTTGAT
64 TCCTGGTCAT-TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * * **
3397557 CATTTTAATTTTTTGACT-AGTGGTTTAATCCCAGTCATTTTTCATTTTTTGACTCGTAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * * * *
3397621 TTTTGATCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAAT-GTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * *
3397664 CATTTTCATTTTTTGACTCATCG-TTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTACTGACTCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** *
3397727 TCTCT-ATCATTTTC-TCTTTTTGACTTGTGGTTCAATCCCTA-T
64 TC-CTGGTCATTTTCAT-TTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * *
3397769 -AGTTTTACATTTTTTGACTCATGCTTTAATCCCT-AT-AGTTTTTATTTTCCAGCACGTTGTTT
1 CA-TTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * * *
3397831 TATCCCT-ATC-TCTTTTA-TTTTTAACTCATGATTTAATCCTAAT
62 AAT-CCTGGTCAT-TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * *
3397874 CGTTTTTATTTTTTGACTCGTGGTGTAATCCTGATCATTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
3397939 CCTGGTGATTTTCATTTTCTCACTTAGGGTTTAGTCCCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGAC---TCA--TGA---T-TTAA---TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT
** * * * * * * * * *
3398045 TGTGGTTTAAT-CTCGATCGTTTTTATTTTCTCACTAATGATTTAAT-TTCAAT
54 CATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * ** *
3398097 CATTTTTA-TTTCATTGGCTTGTGATTTAATACC-GATCATTTTCATTTTCTGGCTCATGATTTA
1 CATTTTCATTTTC--TGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * *
3398160 AT-CTCGGTCATTTTCATTTTCTAACCCATGG-TTAATCCT-GAT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * ** *
3398202 CGTTTTTATTTTCTAACCCATGGTTTAAT-CTCGGTCATTTTCATTTTATGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3398266 CTTGGCCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-TTCGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * * * **
3398307 CATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAAT-CTCGATCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
** * * * * * ** *
3398371 TCC-CATCTTTTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTTTGGT
64 TCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * *** ** * *
3398413 CATTTTTATTTTTCTTACTCATGGTTTAATCCCCATTGTTTTTGTTTTCTGACT-AGTGGTTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * ** * *
3398477 TCCTGATCGTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCAT-CTCGGT
64 TCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * ** * * * *
3398520 TATTTTCATTCTCTAACTCATGGTTTAATCCTTGTTGTTGTAATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * * ** ** *
3398584 CTAGATTGTTTTCAGTTTTAGACTCATAATTTAATTTTGGT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3398625 CATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAGT--T--TCAATTGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTC-A-T-TTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTT
* * * * * *
3398685 TAAT-CTCGATCTTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTGATTCCGA-T
61 TAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT-AATCCTAGT
* * * * * * * * * *
3398730 CATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAGTGCTGATCATTTTCATATTT-GAACTCGTTGTTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * * * * *
3398794 TTTTGATCATTTTCATTTTCTAATTCATGATTTAATCTTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * *** * * *
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1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTC-TA--ACTCAT-GGT
* * * * *
3398898 TTAATTCCT-ATCATTTTCATTTTCTAACGCATTGTTTAATCCCTA-T
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* * * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
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65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * **
3399049 CA-TTTCATTTTTTAACTCA-CATTTTGATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT-AGTAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * * ** *
3399111 T-TTCGATAATTTTCACTATTGTTTTCGTTTTTGAACTTGTGGTTTAAT-CTCGAT
64 TCCT-GGTCATTTT--C-A------T--TTTTTG-ACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * ** *
3399165 CATTTTTATTTTTTGACTCTTAATTTAAT-TTCAATCATTTTTATTTCTCTAGCT--TGGGATTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCAT-GG-TTT
** * * * * * ** *
3399227 AATGTTAGCCGTTTTCATTTTCTAACTTGTGATTTAAT-CTCAGT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * ** * * * *
3399271 CATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTAGTTGTTTTCATTTTCTGACCCATTGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3399336 GTGGTTATTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** ** * * * *
3399376 CATTTTTTATTTTCTAACTCGTTG-TTTAATCCCAGTTGTTTTTGTTTTTTGACTCATGATTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * * *
3399440 TCCCGGTCGTTTTTATTTTCTGACTCATGTTTTGATTCTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * *
3399482 CATTTTAATTTCTCTGACTCATGGTTTAATCCAT-GTTGTCTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCC-TGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3399546 T-ATCGATCATTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTCATCTTGGT
64 TCCT-GGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3399589 CATTTTCATTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCTTGTCATTTTAATTTTTTGACACATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * * ** *
3399654 CCGGTTATTTTCAATTTTAGGCTCATGATTTAATTTTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3399694 CATTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAATTCTAGTCGTTTTT-GTTTCTTGACT-A-GCAGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTC-TAACTCATG--GTTTA
* * * * * *
3399756 ATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACT-AGTGATTTGATTCTGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * * * **
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1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
* * * * * * **
3399864 TCC-AGTCGTTTCCATTTTCTAACTCATGGTTTAATCTTTTT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** ** * * * *
3399905 CATTTTCACTTTTC-GAATTACA-G-TTTAATCCCCGTTGTTTTACATTTTCTGACTCGTGCTTT
1 CATTTTCA-TTTTCTG-ACT-CATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTT
* * *
3399967 AATCCCT-ATCATTTTCATTTTTTGACGT-GTTGTTTAATCCCTA-T
62 AAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGAC-TCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3400011 CA-TTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAATTCCT-ATCATTTTCATTGTT-TGACTCGTGGTATA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATT-TTCTAACTCATGGTTTA
* * ** *
3400073 ATCTTGATCATTTTTCATTTTTTGACTCATTATTTAAT-CTCGAT
63 ATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * ** * * ** * * *
3400117 CGCTTTCATTTTATGACTGGTGGTTT--TCATTTTC-TTACTAAGGGTTTAGTCCTAA--C-TGT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-TTTA---TTT--T-CTAACTCATGG
* * * * * * ** ** *
3400176 TTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAATTTAGGTTGTTTTCATTTTTTAACTCACGTTTTACT
59 TTT-A-ATCCTG-GTCAT--TTTCATTT--TTTG-ACTCATGGTTTAA-TC-C----TAGT
** * * * * *
3400237 CCCGATCATTTTCCTTTTCTGACTCTTAATTAAATTCC-AGTAATTTTTATTATCATTTTCTTTT
1 --C-AT--TTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCA---TT-TT-T-ATTTTC----
* * * * * * * *
3400301 TTTGACTCATGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTTTAACTCATGGATGAAT-TTTGAT
49 --TAACTCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * * * * * * **
3400360 CATTTTTATTTCTTTGGCTTGTGATTTAATACTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCGTAATTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * * * *
3400425 CTTTGTTGTTTTCATTTTCTAACCCACGGTTTAATCTTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * *** ** * * ** *
3400466 CATTTTCATTTTTTGACCCGT-AGTTTAATCCCAATGGTTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3400530 -CTAAGTTGTTTTTA-TTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCAGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * * * *
3400570 CATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATACTGATCATTTTCATTTTCTGACTCGT-GATTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** *
3400634 TTGGTCATTTTTC-TTTCTTTGACTTGTGGTTTAATCCTCGT
66 CTGGTCA-TTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * *** ** * *
3400675 -TTTCTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCAATCATTTTTCATTTTCTAACTGGTGGATTCA
1 CATT-TTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * *
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64 TCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * * * *
3400781 CGTTTTAAATTTCTAACTCATAGA-TTAAT-CTCAGTCATTTTTA-GTTCTAGACTCGTGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTA
** * * * * ** *
3400843 ATTTTGATCATTTTTA-TTTTAGACTCATGATTTAATTTTGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * ** * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * * *
3400948 TCCTAGTCATTTTTCA--TTTTGACTCGTGATTTAATGCT-GAT
64 TCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * * *
3400989 CATTTTCATTTTTTGACTTATCATTTAAT-TTCAATCATTTTCATTTGCTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * *
3401053 CTCT-ATCATTTTC-TCTTTTTGACTTGTGGTTCAATCCCCA-T
65 C-CTGGTCATTTTCAT-TTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * * * *
3401094 TGTTTTAAATTTTTTGACTTATGCTTTAATCCCT-GT-AGTTTTCATTTTCCAACACGTTGATTT
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTC-ATGGTTT
* * * *
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62 AAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-GTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * *
3401198 CATTTTCATTTTTTGACTAATGGTGTAATCCTGATTATTTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3401263 -CTCGACCACTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTCTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * * *
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65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA--TGGTTTAATCCTAGT
* * ** * *
3401409 CATTTTCATTTTCTAACTCGT-ATTTTAATTTTGGCAATTTTCATTATCATTATCATTTTCTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGG------TCA-T-T--TT-T-ATTTTCTAAC
* ** * * * * *
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** * * ** * * * **
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1 CATTTTCATTTT-CTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * *
3401590 T-CTCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATGG-TTAATCCCAAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3401695 CCTGGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-TTCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
** * * * * * * *
3401800 TCC-CATAATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAAT-TTCAAT
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* * * * * *
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1 CATT-TTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-T-TT-ATTTTCTAACTCATGGTTT
*** * ** * *
3401902 AATCCCAATCATTTTTCATTTTCTGACTGGTGGTTTCATCAC-GGT
62 AATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * * * * * * * * *
3401947 CATTTTCGTTCTCTAACTCGTGGTTTAAT-CTCGATCATTTTCAGTTT-TAGATTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA
** * ** * *
3402010 TTTTGGTCATTTTTTTCTGACTCATGATTTAGTTTCAATTGTTTAAT-CTTGAT
64 TCCTGGTCA---TTTTC--A-T--T--TTTTGACTC-ATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * *
3402063 C-TATTTCATTTT-TCGACTCATGATTTGATTCC-GGTCATTTTTATTTTTTTGACTCGTGATTT
1 CAT-TTTCATTTTCT-GACTCATGATTT-AATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTT
* ** * * *
3402125 AATGCTAATCATTTTCATTTTTTGACTCATTGTTTAAT-TTTGAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
*** * * * *
3402232 -CCCCATTATTTTACATTTTTTGACTCGTGCTTTAATTTCTA-T
64 TCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * ** * * * *
3402274 CATTTTCATTTTTTGACGCGTTG-TTTAATCCTTATCATTTTTATTTTTTGACTTATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
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65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * ** * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG-G-TTTAA
* * *
3402442 TCATGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTCATTTCC-A-T
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** * * * *
3402484 TGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTCTAGTCATTTTTATTTCTCTGACTAATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* *
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* * * * * * * * *
3402590 CATTTTTCATTTTCTAAGT-AGCGGTTTTATCTTGGCCATTTTCATTTT-TGACTCATGGTTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * *
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64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* ** * **
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1 CATTTTCA-TTTT-CTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * * *
3402758 TTCTAGTCATTTTTGTTTTTTGAGT-AGTGATTTAAT-CTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * * *
3402800 CATTTTCATTATCTGACTTATAATTTGATTTTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAA-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3402864 CACCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAAT-TTCGGT
65 C-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * *
3402906 TGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAAT-CTCGTTCATTTTTAGTTTT-TGACT--TGCAATTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATG--GTTT
** ** ** *
3402967 AATCCTTATTGTTTTACATTTTTTGACTCATACTTTAATCCTTGT
62 AATCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * *
3403012 CATTTTCA-TTTCTGACATGTTG-TTTAATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * *
3403074 T-CTCAATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTATAATCCCAAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * *
3403116 CATTTTTCATTTTCTGGCTCATTG-TTCAAT-TTCGATCACTTTCATTTTTTGACTCATGGATTG
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * * * * * *
3403179 ATACTGGTGGTTTTCATTTTCTCATTCAGGGTTTAGTCCCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** *
3403222 CGTTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAATTTTGGTCATTTTCATTTT-TAAACTCGCAT--TTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACT--CATGGTTTA
** * * ** *
3403284 ATCCCAGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTATTCTGATAATTTTCATTA-T
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC---A--TGGT-T--TAA---TC-CTAGT
** * * ** * * * * *
3403338 CATTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCTTAATCATTTTCATTTTTTAACTCGTGATTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * ** ** * *
3403403 TTGATCATTTT-ATTTCCCT-AGCTTGTGATTTAATACCGA-T
66 CTGGTCATTTTCATTT-TTTGA-CTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * *
3403443 CGTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAAT--TGCGATCATTTTCATTTTCTAACCCATAGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG-G-TCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3403506 TCCTGGTCATTTTTATTTTCTGACCCATGGTTTAATCCTAATT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * *
3403549 TTTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTCT-GTCTTTTTTATTTTCTAACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3403613 CCTGGTCATTTTCATTTTCTAAC-C-TAGGTTTAATCCCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCAT-GGTTTAATCCTAGT
** * * *
3403653 TGTTTTCATTTTCTGAATTC-TGATTTAAT-CTGGGTCATTTTTATTTTCTGACTCATGGTATAA
1 CATTTTCATTTTCTG-ACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3403716 T-CTAGGTCTTTTTTATTTTCT-AGCTCGTGATTTAATCCTAGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3403758 CATTTTCATTTCCTAACTCATGGTTTAATTTCC--ATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA--TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3403821 GT--TGGGTCATTTTTATTTCTCTGACTTATGGTTTAATCCCCA-T
64 -TCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * ** * *** * * * ** *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGT-CATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * ** *
3403928 CCTCGATCGTTTTCATTCTTTGATTTGTGGTTTAATCCTTGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *** * * *
3403970 CGTTTTAATTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCAATCATTTTCAATTTT-AAACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
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* * * * ** * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * ** *
3404137 TTTGGTCATTTT-ATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** ** *
3404242 -CTCGGTCATTTTCCCTTTTTGACTTGTGGTTTAATCCTTGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * *
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1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG--GTTTA
* * * *
3404346 ATCCCT-ATCA-TTT--TTATTT--CTCATGATTTAAT-CTCGAT
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* * * * * ** ** * * * ** ** *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGAT-TTAATCCTGGTCAT-TTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
*** * * * * * *
3404448 TCCCAATCGCTTTT-ATTTTCTAACTCATCGTTTAATCTTGGT
64 TCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3404553 -TTCGATCATTTTCATTTTTTAACTCCAT--TTTAATCCTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACT-CATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GG-----TCA-T-TT-TTAT--TTT-CTAACT
* * * * * * * *
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** * ** * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * *
3404774 T-CTCGGTCGTTTTAATTTTCTAACCCATGGTTTAATCC-CGAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * * *
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1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTC-ATGGTTTA
* * * * *
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* * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * * ** *
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* * * * * * *
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1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-T-TT-ATTTTCTAACT-CATGGTT
* * * * * * *
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* * ** * * ** *
3405136 CATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCGCT-ATTGTTTTAATTTTTTGCCTCATAGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * ** ** * *
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65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * ** * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAAT
* * * * * * * *
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* * * * * ** **
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1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * ** * *
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* * *** * * * * *
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1 CATTTTCAT--TTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
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63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG--GTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * *
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* * * * ** * * * *
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1 -CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** *
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* * * * * * * ** **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
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* * * * * ** *
3405884 CTTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTTTTTGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * *
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* * ** * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3406052 CTTGGTTGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTCCCA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
** * ** * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * **
3406156 CTCAGTCATTTTCCACTTTTTGACTTGTGGTTTAATCCT-GT
66 CT-GGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * ** * * * **
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1 CATTTT-CATTTTCTG-ACTCATGATTTAATCC-TGGTCATTTT-TAT-TTTCTAACTCATGGTT
* * *
3406259 TAATCCCT-GTCATTTTTATTTTTTGA-TCATGATTTAAT-CTTGAT
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * ** * * * *** *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *** * * * * *
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65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGT-CATTTTTATTTTCTAACTCATG-GTTTAA
* * * *
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* ** * ** * ** *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
** * * *
3406682 TCC-CATCATTTTCA-TTTTTGACTCGTGATTTAATTCT-GAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * *
3406722 CATTTTTATTTCTCTGACTCAT-AGTTTAATCC---CCATTGTCTTCATTTTTTGACTCGTGGTT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATT-T-TT-ATTTTCTAACTCATGGTT
*** * * ** * *
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* * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * ** * ** *
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65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * ** * **
3406934 CATTTTTATATTT-TGACTTGTGATTTAATTCTAGTTGTTTTCATTTT-TTGCT-AGTGGTTTAA
1 CATTTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* ** * * *
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64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT-AATCCTAGT
* * * * * * ** *
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1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * ** *
3407103 TATGATCATTTTTATTTTTTGACTTGTGGTTTAAT-CTCGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * ** ** * * *
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1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
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64 T-CCTGGTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * *
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1 CATTTTCA-TTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * *
3407312 TCTTGGTTGTTTTTCATTTTTTGAC-CAGTCGTTTAATCCTGATT
64 TCCTGG-TCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCT-AGT
* ** * * * ** * * *
3407356 GC--TTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTGATCTTGGT-GGTTTTCTTTTCTCACTCA-GGTTTTAG
1 -CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG-TTTAA
* ** * * * * *
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64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * *
3407522 TTTTGATAATTTTCATTATCAGTTTCATTTCTTGACTCATTGTTTAATCAT-GAT
64 TCCTG------GTC---AT---TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** ** * * * ** **
3407576 CATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATTTTGATCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGACTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * *
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* * * * * * * **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT--C-A--TGGTT
* * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
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65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA--TCCTAGT
* * * * * * *
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* ** * * *
3407960 CCTTGTTGTTTTCATTTTCTGACTCTTGGTTTAAT-CTTGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * * * *
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1 CATTT-TCATTTTCTGACTCATGA--TTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * * *
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62 AAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** ** ** * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG-TTTAAT
* ** ** * * *
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* * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * ** * *
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65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3408318 CATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-CTCGATCATTTTCACTTT-TGACTTATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** ** *
3408381 CC-CGTTGTTTTACA-TTTTTGACTTGTGCTTTAAATCTCT-GT
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* * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCT-GACT-CA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTT
* * * ** * * *
3408482 TAAT-CTCAGTCGTTTTCATTTTTTGATTTGTGGTATAAT-TTCGAT
61 TAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * * *
3408527 CATTTTTTATTTTTTGACT-AGTTG-TTTAATCTTGATCGCTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA--TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * ** *
3408590 ATCCTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTGGTCCCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * **
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1 CATTTTCATTTTCTGACT--CATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * * *
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* ** * ** * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATT-TTCTAACTCATGGTTTAA-
** * * * * *
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64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
** * * * * * ** * * * * *
3408854 TGTTTTTATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCCGGTTGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* *
3408918 TTGGGTCATTTT--TTTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTAGT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3408958 CGTTTTTATTTTCTTACTCATGATTTAATCCAGATCAGTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
** * * *
3409023 CC-CATCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCT-GAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * *
3409063 CATTTTTATGTCTCTGACTCATGGTTTAATCCCT-GTTGTCTTCATTTTCTAACTCGA-GGTTTA
1 CATTTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTC-ATGGTTTA
* * * ** *
3409126 AT-CTCGATCTTTTTTCATTTTCTGACTGGTGGTTTCAT-CT--T
63 ATCCT-GGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3409167 CA---TCAATTTT-TGACTCGTGGTTTAATCCCT-GTC-GTTTTAATTTCTGACTCATGGTTTAA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * * *
3409226 TCCAGATCGTTTTCAATTTTAGACTCATGATTTAAT-TTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * *** * * *
3409268 CATTTTTTATTTTCTGACTCATGATTCAATTCC-AACCATTTTTGCTTTT-TGACT-AGTGGTTG
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTT
** * * ** * * *
3409330 AATCCCAGACATTATCATTTTTTGACTTGTGCTTTAAT-TTCGGT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * ** * * * **
3409374 CGTTTTCATTTT-TAACTCATGTTTTAATCCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATAATTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * ** *
3409437 TTCAGTAATTTTCATTATAGTTTTCAATTCTTGACTTGTGGTTTAAT-CTTGAT
66 CT-GGTCATTTTC-----A---TT---TT-TTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * ** *
3409490 TATTTTCGTTTTCTGACTCGTGATTTAAT-TTCAATCATTTTTATTTCTCTGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3409554 TACTGATCATTTTCA-TTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * *** * * * *
3409595 TGTTTTCATTTTCTAACCCCCAATTTAATCTTAGTCATTTTTA-TTTCTGACCCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * *
3409659 CTGGTCGTTGTCATTTTTTGACTCATGCTTTAATTCGAGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * * * *
3409699 CATTTTTATATTT-TAACTTGTGGTTTAATCTTAGTCGTTTTCATTTT-TGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** *
3409762 CCCGATTGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTCCCA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * ** * * * ** *
3409803 CATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTGATTTTGGTCGTTTTTATTTTTTTTGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA--TTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * ** *
3409868 TGCAAGTCATTTTCATTTTTTTGACTTATTGTTTAATTATGGT
64 TCCTGGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * **
3409911 TGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCATTTTCACATTT-TGACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** *
3409975 CCCT-GTTGTTTTACATTTTTTGACTCATGCTTTAATCCCTA-T
65 -CCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * **
3410017 CGTTTTCATTTTTTGA-TGCATTG-TTTAATCCTTGTCATTTTTATTTTTTGACTCATAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACT-CA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3410080 TCAC-GATTATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTATAAT-CTCGAT
64 TC-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** *** * * * *
3410122 CATTTTTCATTTTCTGACTCATCTTTTAATCCCAATCACTTTCATTTTCTGACTTATGGTTTAA-
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
3410186 CACTAGT-AGTTTTCATTTTCTCACTAAGGGTTTAGTCCTGGT
65 C-CTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * ***
3410228 CATTTTCATTTTTTGACTCGTG-TTTAAATTTTGAT-AGTTTTCATTTT-TAACTCACATTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTT-AATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * ** ** *
3410290 TCCCGATCATTTTTATTTTTTGACTTGTAATTTAATTCCTGTAATTTTCATTAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCC--------T-A--GT
* * * * * ** * * * * *
3410344 CATTTTCATTTCCTGAATCATGGTTTAGT-CTCGATTGTTTTCATATTT-TGATTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * ** * *
3410407 TTTTGATCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAATACCGA-T
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * ** * *
3410450 TGTTTTCATTTTATGACTCGTGATTTAATCTTGGTTGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * * * *
3410515 CCAATCA-TTTCATTTTCCTGACTAAAGGTTTAAT-CTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** ** **
3410554 CGTTTTTAATTTTCTGACTTAGGATTCCATCCAAGTTGTTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3410619 CCTAGTC-GTTTCTATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCT-GAT
65 CCTGGTCATTTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * ** ** * * * *
3410660 TGTTTTCATTCTT-AGACTCGT-AGTTTAATTCC-CATTGTTTTCATTTTTTCACTCATGATTTA
1 CATTTTCATT-TTCTGACTCATGA-TTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * **
3410722 ATTCTAGTCATCTTT-ATTTCTTTGACTCATGGTTTAATCCCCGT
63 ATCCTGGTCAT-TTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * ** *
3410766 TGTCTTCATTTTTTAACTCGTGGTTTAATCCCGATCGTTTTTTAGTTTT-TGACTGGTGGTTTCA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTC-ATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * *
3410830 TTTTGGTCGTTTTCATTTTTTGACTAATGGTTTAATCCT-GT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * ** *
3410871 CGTTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTGGTCATTTTTAGTTT-TAGGTGCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT-CATGGTTTAAT
* * * *
3410935 -TTTGTCATTTTTATTTTTCTGACTCAT-GATTAATTCC-AGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
** * * * * * * * *
3410975 CATTTTTGTTTGT-TGTCT-AGTGGTTTAATCCTGATCATTTTAATTTTTTGACTCATGATTTGA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * *
3411038 TTCTAGT-AGTTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATGCTGGT
64 TCCTGGTCA-TTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-G------A--TT-TAA-TC--C-TGG--T--C-AT---TTTTA
* * ** * * ** * * * * *
3411146 TTTTTTGACTTGTGATTTAATCCTAGT-GGTTTCTATTTTCTCAATCACGGTTTAGA--CTCGAT
44 TTTTCTAACTCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTA-ATCCTAG-T
* * * ** * * *
3411208 CATTTTCTTTTTTTGACTCGTGATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTTTCACTTGCAT--TTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAAC-T-CATGGTTTAA
* * * ** *
3411271 TCCTAGTCATTTTCATTTTCTGACTCGTAATTTAAT-TTAGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * * *** * *
3411313 AATTTTCATTATTGTTTTCATTTCTTGACTCGTGATTTAAT-GTCGATTGCTTTTGTTTT-TGGA
1 CATTTTC---A------T--TTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCT-AA
* * ** * * * * ** * *
3411376 CTCCTGATTTAATTTTGATCATTTTTATTTCTCTAACTTGTGATTTAATACC-AAT
52 CTCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3411431 CGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCAC-GATCGTTTTCATTTTCTAACCCATAGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3411495 -CTCGGTCATTATCGTTTTCTGACCCATGGTTTAAT-CTTGAC
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * *
3411536 CATTTTCATTTTCTAACTCAAGATTTAAT-CTGGGTCATTTTTATTTTCTGACT-AGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * * * * *
3411599 TCCTGGTCGTTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATCCTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * *
3411641 CATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCC-CATCATTTTCATTTT-TGGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGGTTTAA
** * * * * *
3411704 TTATTGTTATTTTTACTTCTCTGACTCATGGTTTAATCC-ATGT
64 TCCTGGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
** * * * * * * ** *
3411747 TGTCTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATCCCGATCATTTTTCATTCTCTAACTGGTGGTTTTAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3411812 -CTCGATCATTTTCAATTTCTAATTCATGGTTTAATCCCT-GT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * *
3411853 CATTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCGTAGTCA-TTTCAGTTT-TAGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** * * * * ** *
3411916 TTTGATCATTTTTATTTTCTGACTCGTAATTTAATTCT-GAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** * * * * * *
3411957 CATTTTCATTTT-TGACT-AGTGGTTTAATCCCAGTCATTTTAATTTTTTGACTCGTGATTTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3412020 TTTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCCGA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* ** *** * ** * **
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1 CA--TTTTCA-TTTTC-TGACTCATGATT-TAA-TC--C---TGGT--C--A--TTTTTATTTTC
* ** * * * ** * * * * * * *
3412126 TGACTTGTGATTTAATCATAGTGGTTTTCATTTTCTCAATCAGGGTTTAGTCC-CGAC
49 TAACTCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * *
3412183 CATTTTCATTTTATTTCTCTAACTCATGGTTTAATCCTTGTTATTTTCATTTTTTGACTCGTGGT
1 CATTTTC-----ATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGT
* * * ** * *
3412248 TTAATCTTGATCATTTTTCATTTTTTGATTGGTGGTTTCAT-CTCGAT
60 TTAATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * *
3412360 TTGGTTGTTTTCATTTTTTGAC-CACGGTTTAATTCCCA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * ** * *
3412399 CATTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATTTTGGTTCATTTTTACTTCTCTGACTCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGG-TCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * ** * *
3412464 T-CTCCATTATCTTCATTTTTTGGCTTGTGGTTTAAT-ATCGAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3412506 CATTTTTCATTTTTTGACTGATGGTTTCAT-CTCGGTTATTTTCATTTTCTGACTCGA-GGTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTC-ATGGTTTA
* * * * *
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63 ATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * ** * * *
3412612 TGTTTTCAGTTTT-AGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * *
3412676 -TTCAATCGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAATCCTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* ** * * * * * ** *
3412717 CATTTTCATTTTATGACTTGTGATTTGATTCC-AGTCATGTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTT-AATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * ** *
3412781 TGCC-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAATTATGGT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * * * * * **
3412823 CATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCTTGATCATTTTCACTTGT-TGACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3412887 CACT-ATTATTTTACATTTTCTGGCTCGTGCTTTAATCCCT-GT
65 C-CTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * ** *
3412929 CTTTTTCATTTT-TAGA-TGCACTG-TTTTATCCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTA
1 CATTTTCATTTTCT-GACT-CA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * * * * * *
3412990 AT-CTCGATTGTTTTTATTTTTTGACTCGTAGTATAATCCCAAT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * *** * *
3413033 CATTTTTCATTTTCTGACTCATCATTTAATCCCGATTGCTTTCATTTTCTAAATCATGGTTTAAT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * *
3413098 CCTTGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAAGGTTTAGTCCTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * ** * *
3413139 CATTTTCTTTTTCTGACTTATGCCTTAATTCTAGTTGTTTTCATTTTTTAA--C-TGGCATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG--TTTAA
** * * ** *
3413201 TCCTAAT-ATTTTCATTTTTTAACCCATAATTTAATTCCGATAATTTT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCC--T-A--GT
* ** * ** * * * *
3413248 CATTATCATTTTTGTTTCCTGACTCGGGGTTTAAT-CTCAATCATTTTCATTTTTTGACCCATGG
1 CATTTTCA----T-TTT-CTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG
* * * * * *
3413312 TTTAATCCCGATCATTTTCATTTTCTGACCCTTGGTTTAATCCTGGT
59 TTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3413359 CCTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCGGGTCATTTTTATTTTTTGACTTATGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* *** *
3413424 CTGGTC-GTTTCTATTTTTTGACTCACAATTTAATCC-CGAT
66 CTGGTCATTTTC-ATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * ** *
3413464 CTTTTTCAATTTCTAACTCATGGTTTAATTCCT-ATCGTTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3413528 TCTAGTCATGTTT-ATTTCTTTAAGTCGTGGTTTAATTCCCTTTGT
65 CCTGGTCAT-TTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAA-T-CC-TAGT
* * * * *
3413573 C---TTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTCGATCGTTTTTCATTTTTTAACT-AGTGGTTTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
* * * * *
3413633 AT-CTCGATCTTTTTCATTTTCTAACTTGA-GGTTTAATCCTAGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGAC-TCATGGTTTAATCCTAGT
** ** * * * * * *
3413676 CATTTTCAGTTTT-AAACTTGTAATTTAAT-TTGGTCATTGTTATTTTTTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * *
3413739 TATGGTCATTTTCGTGTTTTGACT-AGTGGTTTAA-CCTAAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * *
3413780 CTTTTTCATTGTT-TGACTCATGATTTGAT-TTCGATCATTTATT-TTTT-TGACT--TGTGATA
1 CATTTTCATT-TTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTT-TTATTTTCTAACTCATG-GTTT
* ** * ** *
3413839 AATGCC-GATCATTTTCATTTTTTGACTTGTCGTTTAATTTTGGT
62 AAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * **
3413883 CATTTTCATTTTTTGACTTATGGTTTAAT-CTCGATCATTTTCACTTTT-TGACTTATAATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
*** ** * * ** * * *
3413946 TCCCCATTGTTTTACATGTTCTGACTTGTGCTTTAATTCTGGT
64 TCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3413989 CATTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAAT-TTCGGTCATTTAATTTCATTTTTTGACTCAT--TT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCA-TT--TTT-ATTTTCTAACTCATGGTT
* * ** * * ** ** *
3414051 T-TTCATTTTCATTTTCATTTTTTTGAAATGTAATTTAATTTTAATAATTTTTGTTAT
61 TAATCCTGGTCATTTTCA-TTTTTTG--A-CTCA--T--GGTT--TAATCCTAG---T
* * ** * * * * * *
3414108 CATTTTCGTTTCCTGACTCGGGGTTTAATCCT-ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3414172 TTGATCATTTTTATTTCTCTGACTTC-TGATTTAATACT-GAT
66 CTGGTCATTTTCATTT-TTTGAC-TCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * *
3414213 CATTTTTATTTTTTTACTCATGATTTAATCTTGGTGGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** ** * * *
3414278 CCAGTTGTTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCC-AGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * * ** * ** *
3414318 CGTTTGT-ATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGATTGTTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTT-TCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * *
3414382 CCTAGTCATTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAATTCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** ** * *
3414423 CATTTTTATTTCTTTGACTCATGGTTTAATCCCCGTTGTCTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3414488 CCCT-GTTGTTTTAATTTTCTAACTCATGGTTTAATCCCT-GT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * *
3414529 TGTTTTCAGTTTT-AGACTCATGATTTCATTTCT-GTAATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTT-AATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** ** *
3414592 T-TTCAATTGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAAT-CTCGAT
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* ** * * ** * ** * * *
3414634 CACTTTCAGTTTT-TGACTTGTTATTCAATTTTAGTCATTGCTATTTCTTTCACTCATGATTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * **
3414698 TGCC-AGTCATTTTCATTTTTTAACTTC-TTGTTTAATTTTAGT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGAC-TCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * ** *
3414740 TGTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAGT-CTCGATCATTTTCACTTTT-TGACTTGTAGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
*** ** * *
3414803 TCCCCATTGTTTTACATTTTTTGACTCACGCTTTAATCCCT-GT
64 TCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * *
3414846 CATTTTCATTTTC--ACT-ATTG-TTCTCATTTCTTGACTCGTGGTTTAATCTC-AATCATTTTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATT-T-A-ATCCTG-GTCAT-TTTTATTTTCTAA-C----TC
* * * * ** *
3414906 AT-TTTCTAAGTCGTGATTTAATTTCAATCATTTTTATTTCTCTAACCTGTGATTTAATACT-GA
55 ATGGTT-TAA-TCCTG--GTCATTT---TCATTTTT-TGACTC--A--TG-G-TTTAATCCTAG-
3414969 T
105 T
* * * * *
3414970 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3415034 CCCAGTCATTTTCATTTTCTAAC-CTATGGTTTAAT-CTCGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * *
3415075 CGTTTTCATTTTTTGAC-CTATGATTTAAT-CTAAGTCATCTTTCT-TTTTTTGACTCATGGTTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCT-GGTCAT-TTT-TATTTTCTAACTCATGGTTT
** * * **
3415137 AATTTTGGTTATTTTTATTTTTTGACTCATTATTTAATCCTAGT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** ** * **
3415181 CATTTTCATTTTTTGACTCATCG-TTTAATCC-CATCGCTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * * *
3415244 CCTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAAGGTTTAGTCCCAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** ** * * *
3415285 CGTTTTCATTTTATGACTCGTGCTTTAATTTTGGTTGTTTTCATTTTCTAACTTATGCTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * * ** *
3415350 CTTATCATTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAATTCTAGTAATTTT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG------T
* * ** ** * * * *
3415396 CATTATCATTTTTGTTTCTTGACTCATGGTTTAAT-CTCAATTGTTTTTGTTTTTTGACTCATGA
1 CATTTTCA----T-TTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG
** * * * * * * * *
3415460 TTTAATTTTGATCATTTTTATTTCTCTAACTTATGATTTAAT-ATTGAT
59 TTTAATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * *
3415508 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTTGATTGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * *
3415573 CTAGT-ATTTTTA-TTTCTGACCCATGGTTTAATCCTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * ** * * *
3415611 CCTTTTCATTTTTTGACTCGTGATCTAATTTTGTTTGTTTTTATTTTTTGAC-CAATGGCTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTC-ATGGTTTAAT
* * ** *
3415675 CCTGGTCATTTTTATTTTTTTACTTGTGATTTAAT-CTCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * *
3415716 CACTTTCATTTTTTGA-TTATGGTTTAATTCCT-ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3415779 TTTGTTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGGTTTAATCC-CGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** ** *
3415821 CATTTTCAGTTTT-AGACTCATGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTTCTTGCTTGTGATTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** *
3415884 T--TACATCATTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAATCC-CGAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * *
3415925 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTGAT-TTCGATCGTTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
** * **
3415989 TGTTGATCATTTTCA-TTTTTGACTCATCATTTAATTCC-AGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
** * * * * * **
3416030 TGTTTTCATTTTTTGACAGT-ACGGTTTAATCTTGGTCATTTTCACTTTT-TAACTTGTGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGAC--TCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTA
*** ** * *
3416093 ATCCCCATTGTTTTACATTTTCTGACTCATGCTTTAAATCCTTA-T
63 ATCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTT-AATCC-TAGT
** * * * * * ** *
3416138 TGTTTTCATTTTCCT-A-TGCATTATTTAATCCCT-ATCTTTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTA
1 CATTTTCATTTT-CTGACT-CATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
*** ** ** *
3416200 ATCCCCATTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGGTATAATCCCTA-T
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * *
3416243 CATTTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAAT-C---TCAATTGCTTTCATTTTCTGACTCGTGGTT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTC-ATT--TTT-ATTTTCTAACTCATGGTT
* * * * *
3416304 TAATCCTAGTGC-TTTTCATTTTCTCACTCA-GGCTTTAGTCCCAGT
61 TAATCCTGGT-CATTTTCATTTTTTGACTCATGG-TTTAATCCTAGT
* * * * * ***
3416349 CGTTTTCATTTTCTAACTCATGCA-TTAATTCTGATCATTTTCAATTTT-TAACTCACATTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-ATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
*** * * * ** * *
3416412 TCCCAATCTTTTTCATTTTCTGACACATAATTTAATTTCGATAATTTT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA--TC-CT-A--GT
* * * * * * *
3416460 CATTATCGTTTTCATTTCCTGACTCATGGTTTTATTCTCGATCGTTTTTATTTCTCTGA--CATG
1 C---A---TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATG
* * * *
3416523 TGATTTAATACCACTCGT--TTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTTAGT
58 -G-TTTAAT--C-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * *
3416574 CGTTTTCATTTT-TGAACCCAGGGTTTGATCCAGGTCATTTTCATTTTCTGACTTATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTG-ACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3416638 -TTGAGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTGGT
65 CCTG-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * *
3416679 CATTTTTATTTTCTGACTCATGGTTTAATTCC-CATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3416743 TCTGGTCATTTTTATTTCTCTAACT-AGTGGTTTAATCCCCA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCA-TGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * ** * * ** *
3416785 TGTCTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCATAATCATTTTTCATTTTATGACTGGTGGTTTCAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3416850 -CTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTAGTTTAATCC-AAT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * ** *
3416890 TGTTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGTCATTTTCAATTT-TAGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** * * * * * * *
3416954 TTTTGTCATTTTTATTTTTTCACTCGTGATTTAAT-TTCGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * *
3416995 CATTTTCATTTTTTGACT-AGTGTTTTAAT-TTCGATCATTTTCATTTTC-AACTCGTGATTTGA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * ** * ** * **
3417057 T-TTCGATTATTTTTGTTTCTTTGAATTGTGATTTAAAGCTAGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * *** * **
3417100 CATTTTCATTTTTTGACTTGTTG-TTTAATTCTGGTCGTTCCCATTTTCTGACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** * **
3417164 CTTGGTCATTTTCACTTTTTGTCTTGTGATTTAATCCCCGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * * *
3417205 TGTTTTATATTTTATGACTCGTGCTTTAATCCTTGT-AGTTTTCATTTTTTGA-TGCGTTTGTTC
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACT-C-ATGGTTT
** * *
3417268 AATCCTTATCATTTTTATTTTTTGACTCATGGATTTAATGCC-AAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGG-TTTAAT-CCTAGT
* * * * * * ** * ** *
3417313 C-GTTTCAATTTTTTTACTCA-GGTATAATCCTAGTCATTTTCCTTTT-TGACTTGGTGGTAATA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAAC-TCATGGT-TTA
** * * * * *
3417375 ATCCTACCAATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTCGTTTAATCTTA--
63 ATCCT---GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3417419 CACTTTT-A-TTTCTGACTCCATGCTTCAATTCTAGT-AGTTTTCATTTTTTAACTC--GTTTTC
1 CA-TTTTCATTTTCTGACT-CATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT-
* * * * ** *
3417479 CATCTTGATCATTCCTCA-TTTTTG-CTCATAATTTAATTCCAGTATTTT
62 AATCCTGGTCATT-TTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCC--TA--GT
* * *
3417527 CATTATCGTTTTCA-TTTCTTGACTCATG-GTTAAT-CTCG--ATTGTTTCATTTTTTAACTCAT
1 C---A---TTTTCATTTTC-TGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-TTT-ATTTTCTAACTCAT
* * * * ** * *
3417587 GATTTAAATTTCGGAGTCATTTT-ATTTCTCTGACTTGTGGATTTAGTACCGA-T
57 GGTTT-AA-TCCTG-GTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGG-TTTAAT-CCTAGT
* * * * * *
3417640 CATTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAAT-CTCGATCATTTTCATTTTCTAACTTATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * * *
3417704 CCTGATTGTTTTCCTTTTCTGACCCATGGTCTAATCCGA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * *
3417744 CGTTTTCATTTTTTGACTCACAATTTAATCCAGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * *** * * * **
3417808 CTGGGTACTTTTTGTGATTTAATCCCAATCAT--TTTCAT-TTTTT
66 CT-GGT-C-ATTT-TCATTT--TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * ** * * * ** *
3417851 GACTTGTGGTTTAAT-TCCAATCAT-TTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTT
1 CA-TTTTCATTT--TCT-GACTCATGATTTA-ATCCTG-GTCAT--TTTTATTTT-CT-A-ACTC
* * * * *
3417914 AT-TTCTCTGACTCGTGGATTAATCCTTGTTGTC-TTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCAT-G
55 ATGGT-T-T-AATCCTGG-----T-CAT-TT-TCATT--T-TT-TGACTCATGGTTTAATCCTAG
3417976 AT
105 -T
** * * * * * *
3417978 CATTTTCATTTTCTGACTGGTGGTTTCATCTTAGTCATTTTCA--TTCTGACTCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT-
* * * * * *
3418041 CCT-ATCATTTTAATCTTCTGACTCATGGTTTAATCTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * ** * * **
3418081 TGTTTTTAGTTTT-AGATTCAGGAATTAATTTTGGTCATTTTCATTTTTTAACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * *
3418145 CCTGCTCATTTTCATTTTCTGACTTTTGATTTGAT--T--T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * ** * * *
3418182 --TGGTCATTTT-T-A-T--T--TTTAATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGATTTGTGATTTGATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * * ** ** * *
3418238 TTTTTCGTTTT-ATTTTTTTAACTTGTGACTTAATGCTGGT
66 CTGGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * * *
3418278 CATTTTCACTTTT-TGACTCATCATTTAATTTTGATCGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3418342 CTTGG-CTATTTTCACTTTTTGATTTATGGTTTAATCCCT-GT
65 CCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * *
3418383 TATTTTACATTTTTTGACTCGTGCTTTAATCCAT-GTCATTTTCA-TTTCTGACGCATTGTTTAA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATCC-TGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3418446 TCCCT-GCCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTTGAT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *** * * * *
3418488 CGTTTTCATTTTTTGACTTATGGTATAATCCCAATCGTTTTTCATTTTCTGACTTATCGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** ** * * ** * *
3418553 CTTAATCGCTATCATTTTCTGACTTGTGTTTTAATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * ** * * * **
3418594 GGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGT-CTCAATCATTTTTATTTTTTGACTCCTATTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *** *
3418658 -TTCGACTGTTTTCATTTTTTAACTCACATTTTAAT-CTCGAT
65 CCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * *
3418699 CATTTTCATTTTCTTACTCATAATTTAATTCTCCTAATTTTCATTATCATTTTTATTTCCTGACT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA---T-C-------C-TGGTCATTTTTATTTTCTAACT
* ** * * * * * * *
3418764 CATGGTTTAATCTTTATCGTTTT-AGTTTTCTAACTCGTGATTTAAT-TTTGAT
54 CATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** ** * * * *
3418816 CATTTTTATTTT-TGACTTGTGATTTAATACC-AATCATTTTCATTTTCTGACTTATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * *
3418879 -CTCAGTTGTTTTCATTTTCTAACCCATGG-TTAATCCGAGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** *
3418919 CATTTTTATTTTTTTGACTCAT-AGTTTAATCTTGATCTTTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * ** * **
3418983 ACTTAATCATTTTCATTTTTTGAGTCATGGTTTAATTCC-CCT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * ** * **
3419025 CGTTTTTATTTTCTGACTCATGAGTTAATTCTAATCATTTTTATTTCTCTGACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3419090 CCCAGCCATTTTCA--TTTT--CTGATGGTTTAATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3419127 CGTTTGCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCC-GAGTCATTTTTATTTTTTTGACTCATAGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG-GTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * ** * * * *
3419191 TCTTGATCTTTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAAACTTAAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * *
3419233 CATTTTCATTTTTTGAGTCATGGTTTAATTCC-CCTCGTTTTTATTTTCTGACTCATGAG-TTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG-GTTTAA
* ** * * **
3419296 TTCTAATCATTTTTATTTCTCTGACTTGTGGTTTAATCCCT-GT
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * ** * *
3419339 TGTCTTCATTTTTTGATTCATGGTTTAATCAC-GATTGTTTTTCATTTTCTGACT-ATTGGTTTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
** *
3419402 AT-CTCGGTTGTTTTCATTTTCTT-ACTCGTGGTTTAATCCCT-GT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * ** * * * * * * *
3419445 C-TTTCTAATTTTTTGACTGGTGGTTTAATCCTGATCGTTTTCAGTTT-TAGACTCATGATTTTA
1 CATTT-TCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA
* * * * * ** * * **
3419508 T-TTCGATCATTTTTAGTTTCTGACTTGTGATTTATTTTTAGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * *
3419550 CATTTTTGTTTTTTGACT-AGTTATTTAATCCTAGTCATTTTTATTTTTTTACTCATGATTTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** ** **
3419614 TCTAGTCATTTTTATTTCTTTGACTTGTCATTTAATTTTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* *** * * * * * * ** *
3419656 CATTTTCATTTTTTGACTTGGGGTTTAAT-CTCAGTCCTTTTCA-CTTCTGACTGGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * *
3419719 -ATCAATCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT-CTCGTT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * *
3419760 CGTTTTCATTTTCTAAC-CTATGGTTTAATCCT-GTCGTTTTCATTCTCTAACCCTTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3419823 CTTGGTCATTTTCATTTTTCTGACTCATGATTTATTGC-AGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
** * * * ** * * *
3419865 TGTTTTTATTTTTTGACTCATTG-TTTAATCCTGATGTTTTTTATTTTTTTACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * ** **
3419929 TCTGGTCATTTTTGTTTCTCTGATTGGTGGTTTAATCCCCGT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * ** * * *
3419971 TGTCTTCATTTTTTGATTCATGGCTTAATCAC-GATCATTTTGTCATTTTTTGACT-AGTGGTTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTT-T-ATTTTCTAACTCA-TGGTTT
* * * ** *
3420034 CATCTTGGTCATTTTAATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCC-CGAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * * ** *
3420078 CGTTTTCAAATTT-AGACTCATGAATTAATTTTGATCATTTTTATCTTT-TCACTTTTGATTTAA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGTTTAA
* * *
3420141 TTCC-AGTCATTTTTATTTTTTGACT-AGTGGTTTAAT-CTCGAT
64 -TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * *
3420183 CA-TTTCATTTTTTGACTCATGATTTGAT-TTCGATCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
** * ** * ** *
3420246 TGCC-CATCATTTTTATTTTTTGACTCATCATTTGATTTTGGT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * **
3420288 CGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTTGGTCATTTTCAATTTT-TGACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3420352 CCAT-GTTGTTTTACATTCTTTGTCTCGA-GCTTTAATCCCT-GT
65 CC-TGGTCATTTT-CATTTTTTGACTC-ATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * ** * * **
3420394 CGTTTTCACTTTCGGATGTGTTG-TTTAATCCCT-ATCATTTTTATATTT-TGACTCATCATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGA-CTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGTTTA
* * * *
3420456 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTTATGGTATAA-GCTCGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * * * * *
3420499 CATCTTTCATTTTTTGACTCGTCATTTTATCCCGATCACTTTCATTTTCTGAGTCGTGGTTTAAT
1 CAT-TTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * * * * * *
3420564 CCTAGTGGTTTTTATTTTCTCAATTAGGGTTTAGTCCTAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3420605 CATTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAAT-TTCGGTCATTTTCATTTTTTAACTCACGTTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3420669 CCTGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATATTCAT--TA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGT-TTAATCCTAGT
* * ** * * * * * *
3420708 CATTTT--TGTTTCTTGACTCTTGGTTTAAT-CTCACTCATATTCATTTTTTGACTCGTGATTTA
1 CATTTTCAT-TTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * ** ** * *
3420770 ATTTTGATCATTTTTATTTCTCTGACTTGTCATTTAGTACC-AAT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* ** * ** * *
3420814 CATTTTCATTTTCTAACTTGTGATTTAGTCGC-AATCATTTTCT-TGTTCTAACCCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3420877 TCC-GAGTTATTTTTATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCCAGT
64 TCCTG-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * *
3420919 CGTTTTAATTTTCTAACTCATGATTTAAT-TTGGGTCATTTTTATTTT-TGAACTCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGGTTTAA
* * * * *
3420982 TCCTGGTCATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3421024 CGTTTTCATTTT-TGACTCATGCTTTAATTCCT-ATCGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * *
3421087 TCTATTCATTTTTATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCTTGT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * ** *
3421129 TGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCTGATCGTTTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTCAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* *
3421194 -CTAGGTCATTTTCATTTTCTGACTCCTGGTTTAATCCCTA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * ** *
3421235 CATTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCGATCGTTTTCAATTT-TAGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3421299 -TTGGATCATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCC-GGT
65 CCTGG-TCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * *** * * ** * *
3421340 CTTTTTCATTTTTTGACTAATGGTTTAGTCCCAATCATTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTGATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT-AAT
* * ** * *
3421405 CC-GATCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAATGCC-AAT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * ** * **
3421446 GATTTTCATTTTCTCACTCATCATTTGATTCC-AATCATTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTT-AATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3421510 -CTCAGTCATTTTCACTTTTCGACTCATGGTTTAATCGCCA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * * * * * * **
3421551 TATTTTACATTTTTTGACTCATGCTTTAATCCCT-ATCGTTTTCATTTT-TCGA-TGCATTATTT
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACT-CATGGTTT
* * * * * *
3421613 AATCCCT-GTCATTTTTATTTTTTGATTCGTGATCTAATCC-CGAT
62 AAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * * *
3421657 CGTTTTCATTTTTTAACTCGTGGTATAAT-CTCGATCATTTTTCATTTTCTGACTCGTCGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * *** * * * *
3421721 TCTTGATTGCTTTCATTTTTTGACCCATGGTATAATCATGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * ** ** * * * *
3421763 GGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTTGTCCCAGTCATTTTCATTTTTTAACTCGTGCTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * *
3421827 TTCGGTCGTTTTCATTTTTTAACTTGCAT--TTTAATCC-CGAT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGAC-T-CATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * *
3421868 CATTTTCATTTTTTGACTCGTAATTAAATTCTCGCAATTTTCATTTTTGTTTTCATTCCCTAGCT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA---TC-C--TGGTCA-TTTT-TATT--TT--CTAACT
* * * ** * ** * * *
3421933 CTTGGTTCAATCTTCATCGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAAT-TTTGAT
54 CATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** *
3421985 CATTTTTATTTCTCTGACTTATGATTTAATACC-GATCGTTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * *
3422049 T-CTCGTTCATTTTCATTTTCT-AATCCATGGTTTAAT-CTAGAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACT-CATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *
3422091 CATTTGT-ATTTTCTAACCCAT-AGTTTAATCCCT-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA
1 CATTT-TCATTTTCTGACTCATGA-TTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * *
3422153 AT-CTGGGTCATTTTTATTTACTAACTCGTGGTTTAATCCTAG-
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** ** * *
3422195 CTGTTTTTATTTTTTAACTCGTGATTTAATCCTAATTGTTTTCATTTT-TGGACTCATGGTTTAA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGGTTTAA
** * * ** * ** *
3422259 TTCC-CATCCTTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAATTATGGT
64 -TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * ** ** * * * * *
3422301 CATTTTTATTTCTCTGACTTGTGGTTTAATCCCCGTTGTCTTCATTTTTTGACTCGTGG----AT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * *
3422362 -C--AT--TTTTCATTTTCT-AGCTGGTGGTTTCATCATGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * * *
3422398 TATTTTCATTTACTGACTCGTGGTTTAATCCCT-ATCATTTAAATTTTCTGACCCATCGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * ** * *
3422462 -CTCAGTCGTTTTCAATTTTAGAATCATGATTTAATTTTGGC
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * * *
3422503 CATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTAAATTTTGGTCATTTTCATTTTTTGACT-AGTGATTTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAAT
** * * * * * *
3422567 TTTGATCATTTTTATTTCTTGACTCATGATTTAAT-GTCAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * ** * * * * *
3422608 CCTTTTTATTTTTTGACTCGTCG-TTTAATTTTAGTCATTTTCATTTTTTGATTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3422672 -CTCGATCATTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTAATCCCTA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * ** * **
3422713 TGTTTTACATTTTTTGACTCGTGCTTTAATCAAT-GTCATTTTCATTTTTCGATGT-GTTATTTA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * *
3422776 ATGCCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCTTGGT
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** ** * * * * * * * *
3422819 TTTTTTCAAAATT-TGATTCGTGGTATAAT-TTCGATCATTTTTCATTTTCTGACTCATTGTTT-
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * ** * * *
3422881 ATTCTCGATCGCTTTCATATTTTGACTCGTGGTTTAATCCTGGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * ** * ** *
3422925 GGTTTTCATTTTCTCACTCAGGA-TTAAGTCCCAGTCATTTTCATTTTCTAACTTGTGCTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * **
3422989 -TTCGGTCATTTTCATTTTTTAACTCGT-GTTTAGT--TTTT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * ** * * *** * ** * *
3423027 AACTTGTAATTTAAT-TCTGGTAATTT--TCATTACCGTTTTCGTTTCCTAACTCATGGTTTGAT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3423089 CTTGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-TTCAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * * * ** *
3423130 CATTTTTATTTCTCTAACTTGTGATTTAATACTGATCATTTTCATTTTTTGGCTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3423195 -CTCGATCATTTTCCTTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * *
3423236 CATTTTTATTTTCTAACCCATCG-TTTAAT-CTCAATCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3423299 T-CTGGGTCATTTTTATTTTCTGACTCGTGGCTTAATCCTGGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3423341 CGTTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
** * * ** * * ** *
3423406 CC-CATCATTTTCATTTTCTGAGTTGTGATTTACTTTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * ** *
3423446 CATTTTTATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCTCGT--TGTCTTCTTTTCTGTCTCGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCAT-TTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** ** * * ** * * *
3423509 TTCCTATTGTTTTTCATTTTCTGATTGGTGGTTTCATCTTGGT
64 -TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3423552 CATTTTCATTTTCTAAC-CATCG-TTTAATCCCT-GCCATTTTAAATTTCTGACTCATAGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * ** *
3423614 TACCT-GTCATTTTTAGTTTTAGACTCGTGATTTAATTTTGGT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3423656 CATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTGA-CTCTAGTCTTTTTTATTTCTCTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * ** * * *
3423720 T-GTCGGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTCATCTAAT-TTTGAT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * * * * * * **
3423762 TGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTACT-GTCAGTCATTTTCACTTTT-TGACTTGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
** ** * * *
3423825 TCCCCGTTGTTTTACATTTTCTGACTCGTGCTTTAATCCCTA-T
64 TCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * * * **
3423868 TGTTTTCATTTTTTGA-TACGTTG-CTTAATCACT-ATCTTTTTTATTTTTTGACTCGTAATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACT-C-ATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
3423930 ATCCTAGTCATTTTCATTTTTTGATTCGTGGTATAAT-CTCAAT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * ** ** * * * *
3423973 CATTTTTCATTTTCTGACTTGTCG-TTTAGTCCTAATCGCTTTCATTTTTTGACTCATAGTTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * * * * *
3424037 TCATGGTGGTTTTCATTTTCTCATTCATGGGTTAGTCCCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3424079 CGTTTTCAATTTCTGACTC---A--T-A--CT-TTCATTTTCATTTCCTAACTCGTGGTTTCA-C
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * ** * * * * *
3424134 CCGATCATTTTTGTTTTCTGACTCGTGATTTAAT-TTCGAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * * * *
3424174 CATTTTTATTTCTCTAACTTTTGATTTAA-CACTGATCGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** ** * * * * * *
3424238 TATTGGTTGTTTTCATTTTCTGATTTATGATTTAATCTTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * ** * *
3424280 TGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCCAGTCATTTTTATTTTTTGA-TCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT-CATGGTTTAAT
* * * * ** * *
3424344 CCCGATCATTTTCATTTTCTAACTTGTGATTTAAT-TTAGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * * * * *
3424385 CATTTTTATTTTCTGACTGAAGGTTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * *
3424450 CTAGTCGTTTTCATTTTCT-A-TCACGTGGTTTAATTCCTA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA--TGGTTTAA-TCCTAGT
* * * ** * ** * *
3424490 CATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATTTTAGTTGTTTTTATTTCTCTGACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
*** ** * ** *
3424555 CCCCATTGTCTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAAT-TTCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * *
3424596 CATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCT-GT-GTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3424659 TTTGGTCATTTTTATTTCTCTGACTCCTGGTTTAATCCCCA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * ** * * * *
3424701 TGTCTTAATTTTTTGACTTGTGCTTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * * *
3424766 CCCATCGTTTTCATTTTTTAACTCATGGTTTAATTCCCA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * **
3424806 CCTTTTCATTTTCTGACTAATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTCTCTAACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
*** ** * * *
3424871 CCCCATTGTCTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATCCT-GAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * * * * * *
3424912 CGTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCATCTTAGTCATATTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3424977 CCCT-GTCGCTTTAATTTTTTAACTTATGGTTTAATCCCAAT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * *
3425018 CATTTTCAGTTTT-AAACTCATGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTT-TCGAGTCATGATTTA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGGTTTA
* * * **
3425080 AT-TTCGGTCATTTT--TTTTTT-ACTAATGGTTTATTCCCGGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * * *
3425120 CGTTTTCATTTTCTGATTTGTGATTTGAT-TTCGATCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * ** ** *
3425184 TGCTGGTCATTTTCATTTTTGGACTTTTCATTTAATTCT-GAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *
3425226 CATTTTAATTTTTTGACTCGTGATTTAAT-CTCGATCATTTTCACTTTT-TAACTTATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * *
3425289 TCCT-GTTGTTTTACATTTTCTGACTCATGCTTTAATCCCT-GT
64 TCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * *
3425331 CGTTTTCATTTTC-CAATGTATTG-TTTAATCCTTGTCATTTTTATTTTTTGACTTATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACT-CA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * *
3425394 TCCTAGTCATTTTCAGTTTTTGACTCGTGCTATAATCTTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3425436 CATTTTTCATTTTCTAACTCATCG-TTTAAT-CTCG--ATTGCTTTCATTTTCTCACTTAGGGTT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATT--TTT-ATTTTCTAACTCATGGTT
* ** ** * * * * *
3425497 TAGTCCCAGTTGTTTTCATTCTCTGACTCAT-CTTTAAT-TTCGGT
61 TAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * * * * **
3425541 CGTTTTCATTTTTTAACTCACGTTTTAAT-CTAGATAATTTTCATTTTTTGACTCATAATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3425605 TCTGGTAATTTTCATTATTGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAAT-CTCGAT
65 CCTGG------TC---A---TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * * * * *
3425658 CGTTTTCGTTTTTTGACTCGTGATTTAATTTTGATCATTTTTATTTCTCTGACTTATGATTTAAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3425723 ACTAATCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATCTTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * *
3425764 CGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCATGGTCATTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * ** * * * *
3425829 TTGACCCATGGTTT-A-ATCCT-AGTCAT--TTTCATTTTCTGACT
66 CTG-GTCAT--TTTCATTTTTTGACTCATGGTTT-A-ATCCT-AGT
* ** * * * * * * * * * *
3425870 CATGATTT-A-ATT-TGGGTCAT-TTTTATTTTCTGACTCATGGTTTA-ATCCT-AGTCGT-TTT
1 CAT--TTTCATTTTCTGACTCATGATTTA-ATCCTG-GTCAT-TTTTATTTTCTAACTCATGGTT
* * ** * * * * **
3425928 TATTTTCTAACTCATGATTT-A-ATCTTGA-TCAT--TTTCAT-TTTTT
61 TA-ATCCT-GGTCAT--TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** ** * * * ** * * * *
3425971 GACTCTTGGTTTAAT-TCCCATTG-TTT--TCATTTTC-TATCTTATGATT-TAATTCAAGTTAG
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCAT-TTTTAT-TTTCTAACTC-A--TGG
* * * * * *** * * ** * * *
3426030 TTTATTTCTTTGACTTATGGTTTAATCACCATTGTCTTTATTTTTTGACTCGTGGTT
59 TTTA-ATC-CTG-GTCAT--TTTCAT--TTTTTGAC-TCATGGTTT-AATCCTAG-T
* * * * ** * ** * * * *
3426087 TAATCTCGATTATT-T--TTCATTTTTTGACTAGTGGTTTCATCTTGATCGTT-T---TCAT-TT
1 CATTTTC-ATT-TTCTGACTCATGATTT-AATCCTGG--TCATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGT
* * * * * *
3426144 TCTAACTCATGATTTAATCATTTTCGTTTTAATTTTCTAACTCTTGGTTTAATCGC-GGT
60 T-TAA-TCCTG-----GTCATTTTC------ATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * ** ** * ** *
3426203 CATTTTCAATTTCAGACTTGTGATTTAATTTTAGTCATTTTTATTTTCTAACTTGTGATTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
* * *
3426268 CC-GATCGTTTTCATTTTTTGAAT-AGTGGTTTAATCCT-GAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * * ** *
3426308 CATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTAATCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA-
* ** *
3426373 TCC-GATTGTTTTCATTTTTTGAAT-AGTGGTTTAATCCT-GAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * * ** *
3426414 CATTTTTATTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGATCAATCTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * *
3426479 GCTGGTTGTTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAAT-CTCAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * *
3426520 CATTTTCACTTTT-TAACTCGTGGTTTAATCCCT-GT--TGTTTTACGTTTTTTGACTCGTGATT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCAT-TTTTA--TTTTCTAACTCATGGTT
* * * *
3426581 TAATCCCT-GTCATTTCCATTTTTCGA-TGCGTTGTTTAATCCCT-GT
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT-CATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * *** ** * ** *
3426626 CATTTTTATTTTTTGACTCATCATTTAATCCCAATCGCTTTCATTTAT-TGGCTCATGGATTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3426690 CCTGGTGGTTTTCATTTTCTCATTCAGGGTTTAGTCCTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * ** *
3426731 CATTTTCATTTCCTGACTCGTGCTTTAATTCC-AGTCAATTTCATTTTTTAACTCGCGTTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * *
3426795 CCTGATTATTTTCATTTTTTGAC-CTATAATTTAATTTCGATAATTTT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAA--TC-CT-A--GT
* * ** * *
3426842 CATTATCGTTTTCA-TTTCTTGACTCGTGAATTAAT-CTCAATCA-TTTT-TTTCCTGACTCATG
1 C---A---TTTTCATTTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG
* * * * * ** * *
3426903 ATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTCTCTGACTTGTGATTTAATACCGA-T
58 GTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** ** * * * *
3426952 GGTTTTCATTTT-TGACTTGTGACTTAAT-CTCGATCATTTTTATCTTCT-ACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3427014 -CTCAGTTGTTTTCCTTTTTTGACCCATGGTTTAATCCTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * *
3427055 TGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTGGGTC-TTTGTTATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTT-TTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * * *
3427118 TCTTAGTTATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCCAAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * *
3427160 CATTTTCATTTTCTGACT--TGTAGTTGAATTCC-CATCCA-TTTCATTTTTTGA--CATGTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAA-TCCTGGT-CATTTTTATTTTCTAACTCATG-G-T
* * * *
3427219 TTAATTCTGATCATTTTTATTTCTATGACTCATGGTTTAATCCCT-GT
60 TTAATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * **
3427266 TGTCTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCGATCATTTTTCATTTCCTAACTGGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** **
3427331 -CTCGATCATTTTCACTTGTTGTTTTGTGGTTTAATCCTTA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-TAGT
* * * * * * * * ***
3427372 CGTTTTAATTTTCTTATTCATGGTTTAAT-CTCAGTCATTTTTAGTTT-TAGA-TGCCTGACATA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTA-ACT-CATGGTTTA
* * * ** * * *
3427434 AT-TTCAGTCATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAATTCTTGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * * *
3427477 CGTTTTCATTTTTTGA-TGAGTGCTTTAATCCTGATAATTTTCACTTTCTGAA-ACGTGATTTGA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGGTTT-A
* * * * *
3427540 TTCC-GGTCATTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATACTGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * ** **
3427583 TATTTTTATTTTTTGACTCATCATTTAAT-GTCAGTCATTTTAATTTTTTGACTTGTTCTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3427647 -CTCGGTCAATTTCACTTTTTGACT-GTGGTTTAATCCCT-GT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * **
3427687 TATTTTACATTTTCTGACTCGTGCTTTAATCCCT-ATCATTTTTATTTTCCAA-TGCATTATTTA
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT-CATGGTTTA
* * * *
3427750 ATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCCA-T
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * * ** **
3427793 CATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTATACT-TTCGCTCGTTTTTCATTTTCTAACTTGTCATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * *
3427857 T-CTCGATCGCTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * *** * * *
3427899 GGTTCTCATTTTCTCACTCAAGGTGTAGTCCCAATCATTTTTATTTTTTGACTCATGCTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
* * *
3427964 CCT-ATCATTTTCATTTTTTAACTCGCAT--TTTAATCC-CGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT--CATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * ** * *
3428004 CATTTTCTTTTTCTAACTCGTAATTTAATTTTGGTAATTTTCATTATCATTTTCGTTTCCTGACT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGG------TCATT-T--TTAT--TTT-CTAACT
* * * * * * ** * * *
3428069 GATGGTTTAAT-CTCGTTCGTTTTTATTTTCTGACTCGTTATTCAAT-TTTGAT
54 CATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * ** * ** * * ** **
3428121 CATTTTTGTTTCTCTAACTTGTAATTTAATACC--AACAGTTTTCATTTTCTGACTTGTTATTTA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * *
3428184 AT-CTCGATCATTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCTAGG
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * **
3428227 CATTTTCATTTTCTCACTTATGATTGAGT--T-G---TTTGTATTTTCCGACTCATGGTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * * *
3428285 CTAGGTCATTTTTATTTTCCGACTCGA-GATTTAAT-ATCGAT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAATCCTAG-T
** * * ** * ** * * * * * *
3428326 TGTTTTTATTTTCTAACTTGTGGTTTAATTCC-CATCATTTTCATTTTATGATTCATGATTAAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * ** **
3428390 TCTAGTCATTTT-ATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCCCCGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * ** *
3428430 TGTCTTCATTTTCTGAAT-AGTGGTTTAATCTTGATCGTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * **
3428494 TCCTGGTCGTTTTCATTTTCTAACTCATGAATTAATCTCT-GT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * * * * * * * *** * * * *
3428536 CATTTTTATTTTTTGATTCGTGGTTTACTCTTGATTGCTTTCAGTTT-TAGACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3428600 TTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTGAT-TTTGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * * * * *
3428641 CTTTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTAATGCC-AATCATTTTCATTTTTTGACTCGTTGTTTAC
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** ** * * * * *
3428705 TTTTGGTTGTTTTCATTTTCTAACTCGTGGTCTAAT-CTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * ** * * ** *
3428747 CATTTTCACTTTT-TGACTTGTGGTTTAATTCTTGTTGTTTTACATTTTCTGACTTGTGCTTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3428811 TCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACACATTGTTTAAACCTTGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * * * *
3428853 CATTTTTATTTTTTGACTTATAATTTAGTCCTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTATATTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * ** * *
3428918 TTGGTCATTTTTCATTTTTTGACTCGTCATTTAATCACGATT
66 CTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * * * * * * * *
3428960 GA-TTTCATTTTCTCACTTAACG-TTTAGTCCTAGTCATTTTTATTTTTTAACTCTTGCTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3429023 TCTATTCATTTTCATTTTTTAACTCGTGTTTTAATCCTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3429064 TATTTTCATTTTCTGACTCGTAATTTAATTTCAATAACT-TTCATTATTGTTTTCATTTCCTGAC
1 CATTTTCATTTTCTGACTC---A--TGATTT-AAT-CCTGGTC---A-T-TTTT-ATTTTCTAAC
* * * ** * * * * *
3429128 TCATGGTTTAATCATGATCGTTTTTGTTTTCTGACTCGTGATTTAAT-TTTGAT
53 TCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3429181 CATTTTTATTTCTCTAACT--TGAAATTTAATACC-GATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATG--ATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * *
3429243 AAT-CTCAGTCATTTTCATTTTTTAACCCATGGTTTAATCC-CGAT
62 AATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * *
3429287 CATTTTCATTTTCAAACTCATGGTTTAATCATGGTCA-TTTT-TTTTCTAACTCATGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * *
3429350 TCAT--TCGTTTCCATTTTCTGAC-CGTGGTTTAATTCCCA-T
66 -C-TGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* **
3429389 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTATGGTCATTTTTATTTCTCTAACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA-
* * * * **
3429454 TTCT-GTTATCTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAATCCT-GAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * * *
3429495 CGTTTTTCTTTTTTTGACT-AGTGGTTTCAT-CTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCTTGGTTGA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * * *
3429558 ACCCT--T-ATTTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCTTAGC
63 ATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * *
3429599 CTTTTTCAATTTT-AGACTCGTGATTTAATTTTGATCATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3429663 -TTCGGTCATTTTTATTTTTTGACT-AGTGGTTTAATCC-CGAT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** *
3429704 CATTCTCATTTTTTGACTCGTGATTTGATTCTGGTCATTTTTATTGCTT-TGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATT--TTCTAACTCATGGTTTAA
** * ** *
3429768 TGTTGGTCATTTTCATTTTTTGATTCATCATTTTAAT-TTATGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCAT-GGTTTAATCCTA-GT
** * * * * * * * * * **
3429811 TGTTTTCATTTTTTTACAT-GTGGTTTAATCTTGATCATTTTCACTTTT-TGAGTTGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * *
3429874 TCCCT-ATTGTTTTACATTTTTTGACTCGTGCTTTAATCCTTGT
64 T-CCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * *
3429917 TGTTTTCATTTTTTGA-TGCATTG-TTTAATCCTTGTCA-TTTT-TTTT-T-A--CATGTAATTT
1 CATTTTCATTTTCTGACT-CA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG--GTTT
* * * *
3429974 AAT-CTCAGTCATTTTTATTTTTTAACTCATGGTATT-ATCCCAGTT
62 AATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGT-TTAATCCTAG-T
** * * * * * *
3430019 GTTTTTCAATTTT-TGACTCGTCG-TTTAAT-CTCGATCACTTTAATTTTCTGACTCGTGG-TTA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * * * *
3430080 ATCTTGGTGGTTTTCATTTTCTT--CCCAAGGTTTAGTCCCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * ***
3430122 CATTTTTATTTTTTGACTCGTGCTTTAAT-TTCGATCATTTTCATTTT-GAACTCACATTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * *
3430185 CCAGG-CAATTTTCATTTTTTGACTCATAATTTTATTTCGGTAATTTT
65 CCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCAT-GGTTTA-ATC-CT-A--GT
** * * * * * *
3430232 CATTATCGTTTTTGTTTCTTAACTCATGGTTTAAT-CTCGAT-AGTTTTCATTTTCCAACCCATG
1 CA-T-T--TTCAT-TTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCA-TTTTTATTTTCTAACTCATG
*** *** * * *
3430295 GTTTAATCCCAATCATTTTCATTTTCCCACCCATGGTTAAATCCCAGT
58 GTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** *
3430343 CATTTTCATTTTTTAACTCATGATTTAATCC-GAGTCATTTAAATTTTCTAACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG-GTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3430407 CCTAGTCATTTTTATTTTTTGACTTATGATTTAATCC-CGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * *
3430448 CATTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTTCC--ATCCTTTTCATTTTTTGACTTATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA--TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * **
3430511 TTCTGGTCATTTTTATTTCTCTGACTTGTGGTTTAAT-CT--T
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * **
3430551 CAATGTCTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTGATCTTTTTTCATTTTTTAACTGGTGGTTT
1 C-AT-T-TTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTT
* *
3430616 CAT-CTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCCT-GT
62 AATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * * * * * * * * *
3430660 TGTTTTAATTTTCTGATTCGTGGTTTAAT-CTCAGTCATTTTCAGTTT-TAGTCTTATGATTTAG
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA
* * * ** * * *
3430723 T-TTCGATCATTTTTATTTTCAGCCTCGTGATTTAAGTCCTA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * ** * ** * *
3430765 CATTTTCATTTTTTGAC-AAGTTG-TTTAATCCCAGTCATTTTTGTTTTCTGGCTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA--TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * * * * *
3430828 T-TTCAATTATTTTTAGTTTTTTAACTCATGATTTAAT-GTTGAT
64 TCCT-GGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * *
3430871 CATTTTTAATTTTTTAACTCATCG-TTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * **
3430935 TCTTGGTCATTTTCACTTTTTCACTTGTGGTTTAATCCCT-G-
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * *
3430976 CTGTTTTACATTTTCTGACTCATGCTTTAATCCCT-ATCATTTTCATTTTCTAA-TGCTTTGTTT
1 C-ATTTT-CATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT-CATGGTTT
* * ** *
3431039 AA---TGATCATTTTCATTTTTTTGACTCATCGTTTAATTTTGGT
62 AATCCTGGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * **
3431081 CGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGGTCATTTTCACTTTT-TCACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * *
3431145 CTCT-GTTGTTTTACATTTTCTGACTCATGCTTTAATCCCTA-T
65 C-CTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * **
3431187 CATTTTCATTTTCT-AATGCATTG-TTTAATCCCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTTGTGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACT-CA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
3431249 AT-TTCAGTCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTATAATCCTAGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * *
3431292 CATTTTTCATTTTCTGACT-AGTTG-TTTAGTCCTGATCGCTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCA--TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * * *
3431355 ATCCTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTTAGGGTTTAGTCC-AGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3431397 CGTTTTCATTTTCTGACTCATGCTTTAATTCTAGTCGTTTTCATTTTTTAACT--TGCTTTGTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG-GTT-TAA
* ** * *
3431460 TCC----CATTTTCATTTTTTGACTCCTAATTTAAT-TTTGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * * ** * * * *
3431498 AATTTTCA-TTTCTTAACTTGTGGTTTAATCTTGATCATTTTCGTTTTCTGACCCATGATTGAAT
1 CATTTTCATTTTC-TGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * * ** * * *
3431562 -TTCAATTATTTTTATTTCTCTAACTTGTGATTTAAT-ATCGAT
65 CCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3431604 CGTTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT-CTCAGTCGTTTTCATTTTCTAACCCATTGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** * * * *
3431668 CCCGATCGTTTTTGTTTTTTGACCCATGGTTCAATCTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * *
3431709 CATTTTCATTTTCTGACACGTGATTTAAT-CTGAGTCATTTTTGTTTTCTAACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG-GTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3431773 CCTAGTCA-TTT--TTTTTTGACTCATGATTTAATTCT-GAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3431811 CTTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT--T-GCCATCCTTTTCATTTTCTGACTTATGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCAT--TTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * **
3431873 ATTTTGGTCATTTTTATTTTTGTGACTCGTGGTTTAATCCCCGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * ** * * * **
3431917 TGTCTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCCCCT-GT--TGTTTTAATTT-TGACTTGTGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT--CCTGGTCAT-TTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * * *
3431978 AT-CTCAATCATTTTCAATTTTAGACTCATGATTTAAT-TTCGAT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * **
3432021 CATTTTTATTTTTTGACTCATGA-TTAATTCTGATCATTTTGT-TTTT-TGGCT-AGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * * * *
3432082 TCC-AGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTGAT-TTCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * * * * * **
3432123 CATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAATACC-AGCCATTTTCATTTTTTGACTTATCATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * *
3432187 TTTTGGTC-TCTTTCATTTTCTAACTCGTGGTTTAAT-CTCAGT
64 TCCTGGTCAT-TTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * ** * * *
3432229 CATTTTCACTTTT-TGGCTTATGGTTTAATCCCT-GTTGTTTTACATTTTCTGACTCATGTTTTA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * ** * *
3432292 ATCTTTGTTGTTTTCATTTTTTGACACATTGTTTAATTCCT-GT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * *
3432335 CA-TTT--TTTT-T-ACTCATGATTTAATCCTGATCGTTTTCATGTTT-TGACTCATGGTATATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTAT-TTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3432394 CTCAATTGT--TTTTCATTTTCTGACTCGTCGTTT-ATTCTCGAT
65 C-C--TGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * ** * * * *
3432436 CACTTTCACTTTCTAACTCATGGTTTAATCTTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAAGGTTTAGTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * * * * *
3432501 GC-AATCGTTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCTAGT
66 -CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * *** ** * * **
3432541 CA-TTT--TTTT-TAACTCGT-ATTTTCATCCCCATCATTTCCATTTTTTGACTCATAATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** ** ** *
3432601 TTTGGTAATTTCCATTATTGTTTTCATTTCCTGACTTGTGGTTTAAT-CTCGAT
65 CCTGG-----T-C---A---TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * * ** *
3432654 CAGTTTCATTTTTTTACTCATGATTTAATTTTGATCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * * * *
3432719 -ATCGATTGTTTTCATTTTTTGACACATGATTTAATCTTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *** * * * * *
3432760 -AGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTAGTTGGTTTCATTTTTTGACCCATGATTT-AT
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3432823 TCTCGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCAAGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3432865 CTTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAATCTTGGTCACTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*
3432930 TTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-CTCTCA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CT-AGT
* ** * * * * *
3432970 CCTTTTCATTTTCTGACTTGTGATTTAATTCTAGTCATTTTTATTTCTTTCACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3433035 CCCTGTTGTC--TTT-ATTTTCTGACT-AGTGGTTTAATCTCGATT
65 -CCTG--GTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATC-CTAGT
** * * * ** * *
3433077 GTTTTTCATTTTCTGACT-AGTGGTTTCATCTTCATCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTATAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3433141 CCTAGTCATTTTAATTTTCTAAC-CATGCTTTAATCC-CGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * * *
3433181 CATTTTTAGTTTT-AGACTCGTGATTTAATTTTAGTTATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3433245 -TTAGATCATTTTTATTTTGTGACT-AGTGGTTTAATCCCAGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* ** * ** * * ** *
3433286 CATTTTTATTTT-TGACTTGTGATTTGATTATGATCA----T-TTTT-T-ATTGGTGATTTAATG
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT-
** * * * * *
3433343 CC-AATCATCTTCCTTTTTTGACTCGTCGTTTAATTCTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * **
3433383 CATTTTCATTTTTTGACTC-TTAGTTTTAT-CTCAATCATTTTCACTTTT-TGAGTTGTGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * * ** **
3433445 ATCCCT-ATTGTTTTACATTTTTTCATTTGTTCTTTAATCCTTA-T
63 AT-CCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-TAGT
** * * * *
3433489 TGTTTTCATTTT-TCGACAT-ATTG-TTTAATCCCT-GTCA-TTTTATTTTTTGACTCCTGATTT
1 CATTTTCATTTTCT-GAC-TCA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * ** * * *
3433549 AATCCCGGCCATTTTCATTTATTAACTTGTGATATAAT-CTCGAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * ** * * ** * **
3433593 CGTTATTCATTTTTTGACTTGTTG-TTTAAT-TTCGATCGCTTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTA
1 CATT-TTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* ** * * * *
3433656 ATCTTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCTAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * * *
3433699 CATTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAATTTTGATCATTTTCATTTTTTAACTCGTGTTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** *
3433764 CTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCATAATTTAATTCCTAATAATCTTT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCC---T-A---GT
* * * * ** * *
3433812 CATTATCATTTTTTGTTTCTTGACTCATGGTTT-ATTCTCGATTGTTTTTCTTTTTTAACT-ATG
1 CATTTTCA-----T-TTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG
* * * * * * * ** ** *
3433875 ATTTAAT-TTCGATCATTTTTTATTTCTCTAATTTGTCATTTAATACC-AAT
58 GTTTAATCCT-GGTCA-TTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * ** * * ** * * * * *
3433925 CATTTTTAATTTCTAACTTGTGATTT-ATTCTCGATTGTTTTCATTTTTTAACCCAAGCTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3433989 -CTCGGTCATTTTCATTTTCTGACCCATAGTTTAGTCCTAGT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * ** * * * *
3434030 TGTTTTCATTTTCTAACTTGTGCTTTAATTCAGGTCATTTTTACTTTT-TAACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3434094 CTTGGTCATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCTTA-T
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-TAGT
* * ** * * * *
3434135 CTTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATTCC-CATCCTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3434199 TATGGTCATTTTTATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCC-ATGT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
** * * * * *
3434241 TGTCTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGATCATTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTCA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* ** * * * * *
3434305 T-CTCGATTGTTTTCATTTTCTAACTCGTCGTTTAATCCCCA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * *
3434347 CATTTTAATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTGGTCATTTTGAGTTT-TAGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** * * * ** * *
3434411 TTTGGTAATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATTCTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * *
3434452 CATTTTTATTTT-TGACT-AGTG-TTT-ATCCCT-GTCATTTCT-TTTT-TGACTTGTGATTTGA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3434510 T-CTGGTAATTTT--TTTTCAATGACTCATGATTTAATGCTAGC
64 TCCTGGTCATTTTCATTTT--TTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * *
3434551 CATTTTCATTTTTTGACTCGTCG-TTTAATTCTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTCAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * **
3434615 -CTCGATCATTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTATTCCTCCTT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * ** * ** ** * * ** * *
3434657 GTTTTTAATTTTTTGACTTGTGCTTTAATCCTTATTGTTTTCATTGTCT-GGTGCGTTGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACT-CATGGTTTAAT
* * *
3434721 CTCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTAAAT
65 C-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * ** * * * * **
3434762 CATTTTTATTTT-TGACT-GTGGTATAATCCTGGTTGTTTTCATTTTTTGACTCGTCATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * ** * *
3434825 CCGATCGCTTTCATTTTTTGACTTATGGTCTAATCCTAGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * *
3434865 GGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCC-AGTCGTTTTCATTTTTTGACTCATGCTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
* ** * ** * *
3434929 CC-AGTTGTTTTCATTTTTTTAACTCGCGTTTTAAT-CTCAAT
65 CCTGGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * *
3434970 CATTTTCATTTTCTGACTCTTAATTTAATTCTAGTAATTTTCATTATCGTTTTCATTTCTTGACT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-G-----GTCATT-T--TTAT--TTTC-TAACT
* * * * * * * * *
3435035 CGTGGTTTAATCTTGATCACTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT-TTGGAT
54 CATGGTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** * * *
3435087 CATTTTTATTTCCTTGACTTATTATTTAAT-ATCGATTGTTTTCATTTTTTAACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * *
3435151 T-ATCGGTCATTTTCATTTTCTT-ACCCAAGGTTTAAT-C---T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * *
3435189 C--GGTC---GT-TGAAC-CATGGTTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTG-ACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3435247 TCGGGTCATTTTTATTTTTTTACTCAT-GTTTAATCTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3435287 CGTTTTTAATTTCTGACTCGTGATTTAATCCCGATCATTTTCATTTT-TAGACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA-
** * * * *
3435351 TCC-CATCTTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGT
64 TCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * *
3435393 CATTTTTATTTTCTCTGACTCATGGTTTAAT-CT--CCATTGTCTTCATTTTCTGACTCATGGTT
1 CATTTTCA-TTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-T-TT-ATTTTCTAACTCATGGTT
* ** * * * *
3435455 TAACCCTAATCGTTTTTCATTTTTTGACTGATGGTTTCAT--TTGAT
61 TAATCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** * *
3435500 CATTTTCAGTTTT-TGACTCGTGGTTTAATCCCT-ATCATTTTAATTTTTTGACTTGTGCTTTCA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * * * * ** *
3435563 TCCCGATCGTTTTTAGTTTTAGACTCGTGATTCAATTTTGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * ** ** * * * *
3435605 CATTTTTGTTTT-TCAACTTGTGATTTAATTTTAGTCATTTTCATTTTTTTGACT-AGTGGTTTA
1 CATTTTCATTTTCT-GACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCA-TGGTTTA
* ** * * * * *
3435668 ATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTGAT-TTCGAC
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * *
3435711 CAATTTT-ATTTCTTTGACTCATTATTTAAT-GTCAGTC-TTTTACATTTTTTGACTCATCGTTT
1 C-ATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * *
3435773 AATTCTGGTCATTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAATCCTTA-T
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-TAGT
* ** * * * * *
3435817 CATTTTCATTTTTTGA-TGCATTG-TTTAATCCTTATCATGTTTATTTTTTGACTAAT-GATTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACT-CA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * **
3435879 TCCCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTATAATCCCGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3435921 CGTTTTTTATTTTTTGACTCATCATTTAATCCCGATCACTTTTATTTTCTAACTCGA-GGTTTAA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTC-ATGGTTTAA
* ** * * *** * * *
3435985 TCCTAGTGGTTTTCATTTTCTCACTTGGGGTTTAGTCCCAAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** * * * ** * ***
3436027 C-GTTTCATTTTCTAACTTGTGCTTTAATTCC-AGTCGTTTTCGTTTTTTAACTCACATTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
*** * ** * *
3436090 CCCAATCATTTTCATTTTCTGACTCATAATTTAATTTCAGTAATTT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA--TC-CT-A-GT
* * * * ** * * *
3436136 CATTATCATTTTTGTTTCCTAACTCATGGTTTAAT-CTCGATCATTTTCGTTTTCTGACTCGTGA
1 CATTTTCA----T-TTT-CTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG
** * * ** * *
3436200 TTTAATTTTGATCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAATACCGA-T
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* ** * *
3436248 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-CTCAATCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
3436312 CCCGATCGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3436353 CATTTTCATTTTCTGACTCCTGATTTAAT-CTAGGTAAATTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** *
3436417 CCTGGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTAATTTAATCTTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * * * *
3436458 CGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAATTCC-CATCCTTTTCATTTTCTGACACGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * *
3436522 TTTGATCATTTTTATTTCTTTGACTCATGGTATT--TCTCT--T
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGT-TTAATC-CTAGT
* ** * * * * ** * * * *
3436562 -ATTTGTGATTTAAT-ACTGATTATTTTCAT-TTTTTGACTTATAATTTAATCTCGATCATTTTC
1 CATTT-TCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTT--TCT--A--A--CTC
* * * *
3436624 AT-TTTCTAACCCATGGTTTAATTCCAGTCTTTTTCATTTTTTGACAT-ACGGTTTAATCCCAGT
55 ATGGTT-TAATCC-TGG------T-CA----TTTTCATTTTTTGAC-TCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * *
3436687 CATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCC-GAGTCGTTTCAATTTTTTAACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG-GTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * * *
3436751 TTTGGTCGTTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * ** * * * * *
3436792 CGTTGTCATTTTTTTAATTGTGGTTTAATTCC-CATCCTTTTGT-TTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * ** *
3436855 TTCTGGTAATTTTTATTTCTCT-AGCTTGTGGTTTAATTCCCA-T
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGA-CTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * ** **
3436898 CTTTTTCTTTTTTTGACTCATGATTTAATTCTGGT-ACTTTTTATTTCTCTGGCTTGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-TTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
*** * * * *
3436962 TCCCCATTATCTTCATTTTTCTGACTCATGGCTTAATCC-CGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3437005 CGTTTTTCATTTTTTAACT-AGTGGTTTCAT-CTCGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * *
3437068 ATCCCT-GTTGTTTTAATTTTTTGATTCATGGTTTAATTCCGA-T
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * * * *
3437111 CGTTTTCAATTTT-AGACTCATGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* *
3437174 TTCCT-ATCATTTTCATTTTTTGAC-CAGTGGTTTAATCCCAGT
64 -TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * * * *
3437216 CATTCTCATTTTTTGACTTATGATTTGAT-TTCAATCGTTTTTATTTGTTTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * ** *
3437280 T-GTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCATCGTTTAATTTTGGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3437322 CATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCTTGGTCATTTTCACTTTT-TGACTTATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * *
3437386 CCCT-GTTGTTTTACATTTTCTAACTCGT-GTTTAATCCCTA-T
65 -CCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * ** *
3437427 CATTTTCATTTTCAAACGCATTG-TTTAATCCCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * *
3437490 T-TTCGATCGTTTTCA--TTTTGACTCGTGGTATAATCCTGGTT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * * * *
3437531 GTTTTTCA-TTTCTGACTCATCG-TTTAATCCCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * *
3437594 CCTGGTGGTTTTCATTTTCTCG-CTTAAGGTTTAGTCCCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTT-TTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3437635 CATTTTTCATTTTCTAACTCATGCTTTAATTCTAGTCATTTTCATTTT-TAACT--TGCCTTTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG--GTTTA
* ** *
3437697 ATCCTGATCATTTTCATTTTTTGACTCGTATTTAATTTCGATAATTTTCATTA-T
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC--A--T-GGTT---TAA---TC-CTAGT
* * * * * * * * * * * *
3437751 CATTTTCA-TTTCTTAACTCGTGGTTTTAT-CTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTGAA
1 CATTTTCATTTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * ** * * *
3437814 TTTTGATTATTTTTATTTCTCTT-ACTTGTGATTTAAT-GTCGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-T-TTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * *
3437857 CATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTTAT-CTCGATCGTTTTCATTTTCTAACCCACGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * *
3437921 CCTAATCATTTTTATTTTTTGACCCATGGTTCAATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * *
3437962 CATTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAAT-CTGGGTCATTTTTATTTTCTTACT-AGTTGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * ** * * *
3438025 TCTTGGTCGTTTTTGTTATTTGACTCATGATTTAAT-CTTGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** * ** * * * * *
3438067 CTTTTTCATTTTCTGACTTGTGCTTTAATTCC-CATCCTTTTCATTTTCTGACTTATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * * **
3438131 TTTGGTCATTTTTATTTCTGTGAGTCATGGTTTAAGCCCCGT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * *
3438173 TGTCTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCT-GTCATTTTAATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * ** *
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65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * ** **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * * * *
3438343 CCGGTCATTTTTATTTTCTGACTCGTGATTTGAT-TTCGAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * **
3438383 CATTTT-TTTTTCTTTGACTCATGATTTAGT-GTAGGTCATTTTTATTTTTTAACTCATCATTTA
1 CATTTTCATTTTC--TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** ** * * **
3438446 ATTTTGGTTGTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CTCAAC
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * ** * * *
3438489 CATTTTCACTTTT-TGACTTGTGGTTTAATACCCATTGT--TTTACATTTTCTGACTCATGCTCT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT--CC-TGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
* * **
3438551 AATCCTTGTCATTTTCATTTTTTGACACATTATTTAATCCCT-GT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * *
3438595 CATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCGATCATTTTCAATTTT-TGACTCGTGGTATATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** ** *
3438659 CTCAGTTGTTTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAAT-CTCAAT
65 C-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * ** * * * *
3438701 CGCTTTCACTTTCTAACTCGTGGTTTAATCTTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAAGGTTTAGTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** ** ** *
3438766 AC-AATCATTTTCATTTTTTGACTTGTACTTTAATTCTAGT
66 -CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * *** * * * * **
3438806 CGTTTTCA-TTTCTTAACT-A-GCATTTTAATCCCCATTATTTTCATTTTTTGACTCATAATTTA
1 CATTTTCATTTTC-TGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * *
3438868 AT-TTCGGTAATTTTCATTATCATTTTTATTTCCTGACTTGAGGTTTAAT-CTTGAT
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* * ** ** * * * * *
3438923 CATTTTTATTTCTCTAACTTGTGATTTAATATTGATCATTTTCATTTTTTGAGA-T-GTGATTTA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-A-ACTCATGGTTTA
* * * *
3438986 AT-CTCAGT-AGTTTTCATTTTCT-AGCCCATGGTTTAATCCTGGT
63 ATCCT-GGTCA-TTTTCATTTTTTGA-CTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** * * * *
3439029 CAGTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATCCCAGTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATCTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * *
3439093 CTAGGTTGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTGGT
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* * * * ** *
3439134 CATTTTTATTTT-TTAGCTCGTGATTTAATCTTGGTTGTTTTCATTTTCTGAA-TCATGGTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGA-CTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACTCATGGTTTAA
** * ** * * *
3439197 TTCC-CATCCTTTTCATTTTTTGACTTGTGATCTAATTCTAGT
64 -TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** ** * * *
3439239 CATTTTTATTTCTCTGACTCATGGTTTAATCCCCGTTGTCTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3439304 CCCAATTG-C-TTTTCATTTTCTGACT-AGTGGTTTCATCTTTGT
65 -CC--TGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * *
3439346 CATTTTCA-TTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTTGTCATTTTAATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * ** * ** *
3439410 CTGGTCATTTTTAGTTTTAGACTTGTGATTTAATTTTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * * *
3439450 CATTTTGATTTTTTGACTCATGATTTAATTCTAATC-GTTTAATTTTGTAAGT-AGTAGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAAT
* * * * *
3439513 -CTCAGTCAATTTT-ATTTTTTGACTCGTGATTTGATTCC-AAT
65 CCT-GGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT-AATCCTAGT
* ** * ** *
3439554 CATTTT--TTTCTTTGACTCATGATTTAATGCC-AATCATTTTCATTTT-TAGACTTGTCGTTTA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTA
* * * * *
3439615 ATTCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCTTGGTTTAAT-CTCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * * ** * * * * *
3439658 CTTTTTCACTTTT-TGAGTTGTGGTTTAACCCCT-ATTGTTTTACATTTTTTGACTCGTGCTTTA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * *
3439721 ATCCCT-ATTATTTTCATTTTTTGA-TGCATTGTTTAATCCCTA-C
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT-CATGGTTTAAT-CCTAGT
* * ** * * * *
3439764 CATTTT-ATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTGGTTGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTATAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3439827 CTCGATCGTTTTTCATTTTTTGACTCATTGTTAAAT-TTCAAT
66 CT-GGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * ** * * * *
3439869 CGCTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * *
3439934 CTAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-TTTGAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * **
3439974 CATTTTCATTTTTTAACTCATGTTTTAAT-CTAGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATAATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
** * * *
3440038 TCCGATAATTTTCATTATCATTTTTGTTTCTTGACTCATGGTTTAATCTCGATT
64 TCC-----TGGTCATTTTCA----T-TTT-TTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * * ** *
3440092 GC--TTTC-TTTTTTCGACTCATGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTCTCTAACTTGTGATTT
1 -CATTTTCATTTTCT-GACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTT
* * * * *
3440153 AATACC-GATCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTT-ATTCTCAGT
62 AAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * **
3440257 CCTGGTTGTTTTCATTTTCTAACTTGTGAG-TTAATCCTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-GTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * *
3440363 CTAGTCATTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATTCCCA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * ** * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3440467 TTAC-GGTCATTTT-ATTTCTCTAACTCATGGTTTAATCGTAAT
64 -TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** ** * * * ** *
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1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * *
3440573 TCTAGTCATTTTCATTTTTTGACT-AGTTGTTTAATCTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * ** *
3440678 GCC-AGTCATTTTCATTTTTTAACTCGTCGTTTAATTGTAAT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * **
3440719 CGTTTTCATTTTCTTACTCATGGTTTAAT-CTCGGTCATTTTCACTTTT-TAACTTGTGGTTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGG-TTTA
* ** ** * * * * *
3440782 TTCCTCCTTGTTTTAAATTTTCTGACTCGTGCTTTAATCC-ATGC
63 ATCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * * * * *
3440826 CATTTTCATTTTCTTACGCATTG-TTTAATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * * * *
3440889 TCCCAGTCATTTTTA-TTTATGAGTCGTGGTATAATCC-CGAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** * *
3440930 CGTTTTCATTTTTTGACTCGTCATTTAATCCCGATCGCTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * *
3440995 CTAG-CAGTTTTCATTTTCTCACTCATGGTTTAGTTCC-AGT
66 CTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTA-ATCCTAGT
** * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACT--CATGGT
* * * * * * * *
3441095 TTGAT-CTCAGTCATTTTCATTTTCTAACCCATGATTTAAT-TTGGAT
60 TTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * *
3441141 CATTTTTATTTCTCTGGCTTATGATTTAATATTGAGT-TTTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTG-GTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * *
3441205 AT-CTCAATCATTTTCACTTTCTT-ACCCAAGGTTTAAT-CTCAAT
63 ATCCT-GGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * *
3441248 CATTTTCATTTTATGACCCATGGTTTAAT-CTCGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3441312 -TTGTGTCATTTTTATTTTTTGACTCAT-GTTTAATCTTGGT
65 CCTG-GTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3441352 CA-TTTCTAATTTCTAACTCATGATTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTC-AGACTCTTGGTCATG
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGG---T-
** * * *
3441415 ATCTAATTCC-CATCCTTTTCATTTTTCTGACTCATGGTTTAATTCTGGT
60 -T-TAA-TCCTGGTCATTTTCATTTTT-TGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * ** *
3441464 CATTTTTATTTCTCTGACTCATGGTTTAAT-CT--CCATTGTCTTCATTTTTTGACTTGTGGCTT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-T-TT-ATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * * * *
3441526 AACCCCGATCATTTTTCATTTTCTGACTGATGGTTTCAT-CTCGAT
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** * * * * ** * * * *
3441571 TGTTTTCATTTTCTAACTCGTGCTTTAATCCCT-ATTGTTTTTAATTTTTTGACTCGTGTTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * ** * * *
3441635 TCCCGATCGTTTTTAGTTTTACACTCATGATTTAAT-TTCGGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* *
3441740 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTGATTCC-AGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT-AATCCTAGT
* * * * * * **
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1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * *
3441845 ATTATGGTCATTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAAT-CTCGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* ** * * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3441952 CCCT-ATCATTTTCATTTTCCT-A-TGCGTTGTTTAATCCCTA-T
65 -CCTGGTCATTTTCATTTT-TTGACT-CATGGTTTAAT-CCTAGT
** ** * * *
3441993 CATGTTT-ATGTTT-TGACTCATGATTTAATCCCAGTCATTTTCGTTTTCTGACTCGTGGTATAA
1 CAT-TTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * *
3442056 TCCCT-ATCGTTTGACATTTTCTGACTCATTGTTTAATCCATA-T
64 T-CCTGGTCATTT-TCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCC-TAGT
* * * * * * ** * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * * ** *
3442164 CCAATCATTTTCATTTTCTAACTCATCCTTTAATTCTAGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * **
3442204 CGTTTTCATTTTTTAACT--TGCATTTTAAT-CTCGGTTATTTTTATTTTTTGACTCATAATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATG-A-TTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * *
3442266 ATTTTAGTAATTTTCACTATCATTTTTATTTCCTGACTCGTGGTTTAAT-CTTGAT
63 ATCCTGGTCA--TT---T-TCA---TT-TTT--TGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * ** * * ** *
3442321 CGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAATTGTGATCATTTTTATTTCTTTAACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3442386 ACC-GATCATTTTCATTTTTTTACTCATGATTTAAT-CTCGGT
65 -CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * * * * * *
3442427 CGTTTTCATTTTCTAACCCATGGTCTAATCTTGATC-TTTTTCATTCTCTAACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3442491 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGAATCGTCGTTTAATCCTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * * * *
3442532 CATTTTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATCTTAGTCGTTTTCATTTTCTAACTCATCGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
* * * * *
3442597 CCT-ATCCTTTTAATTTTCTGA--CATGTGATTTAATTCT-GTT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-G-TTTAATCCTAG-T
* * * ** * * * * *
3442637 CATTTTTATTTCTCTAACTCATGGTTTAATCACT-GTTGTCTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3442701 T-CTCGATCATTTTTTATTTTCTT-ACT-A-GTGTCTTCAT-GTAGGT
64 TCCT-GGTCA-TTTTCATTTT-TTGACTCATG-GT-TTAATCCTA-GT
* * * ** * * * ** *
3442744 CATTTTCAGTTCCAGACTCATGATTTAATTTTGGCCATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * *
3442808 TTCGATCATTTTCACTTTTTGACT-AGTGGTTTAAT-CTCGAT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCA-TGGTTTAATCCTAG-T
* ** * ** * * * * *
3442849 CATTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTGATTTTGGTCATTTTTATTTCTTTGA-TACGTGATATAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACT-CATGGTTTAA
** ** ** * *
3442913 TGCC-AATCATTTTCATTTTTTGACTTTTCATTTAAT-TTTGAT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * ** *
3442955 CATTTTCATTTTCTAACAT-ATGGTTTAAT-CTCAGTCATTTTCACCTTT-TGACTTGTAGTTTA
1 CATTTTCATTTTCTGAC-TCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTA-TTTTCTAACTCATGGTTTA
* * ** ** **
3443017 ATTCTCGTTGTTTTACATTTTTTGACTTGTACTTTAATCCCTA-T
63 ATCCTGGTCATTTT-CATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* ** * * * *
3443061 CGTTTTCAGTTTT-TGA--CATG-TTTAATCCTTATCATTTTTATTTTTTGACTTATGATTTAAT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** * *
3443122 CAC-AGTCCTTTTCATTTTTTGATTCACAGTATAAT-CTCGGT
65 C-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** *** * *
3443163 CGTTTTTCATTTTCTGACTCGTTG-TTTAATCCTAATTGCTTTCATTTTCTCACTCATGGTTTAA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * * * * *
3443227 TCTTGGTGGTTTTCATTTTCTCA-TGAGGGTTTAGTCCCAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * ** * * * *
3443268 CATTTTCATTTTTTGACTTGTGCTTTAATTCTGGTTGTTTTCATTTTTTAACTCATGTTTTACTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
*** * ** *
3443333 CCAATCATTTTCATTTTCTGACTCGTAATTCAATTCCAATAATTTTCATTA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTC---A-T-GGTT----TAA---TC-CTAGT
* * * * * * * * ** * *
3443385 CATTTTCATTTCCTGACTCATGGTTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * ** * * *
3443450 TTTATCATTTTTATTTCTTTGACTTGTGATTTAAT-ATTGAT
66 CTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * *
3443491 CATTTTCATTTTATGACTCGTGATTTAATCTTGGTCATTTTCATTTTCTAACCCATTGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** ** * *
3443556 CCAGTTGTTTTCATTTTCTGAC-CATGGTTTAAT-CTTGAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* ** * * *
3443595 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCAGTCGTTTTTATTTTCTGACTCGTGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-T
** * * ** * ** *
3443660 CCTATTGA-TTTCATTTTCTGACTTTTGATTTAATTATGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3443700 CATTTTTATTTCTCTAACTCATGGTTTAATCC---CCATTGTCTTCATTTTCTAACTCGTAGTTT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-T-TT-ATTTTCTAACTCATGGTTT
* * * * ** * * *
3443762 AATCCTGATCGTTTTTCATTTTCTAACTGGTGGTTTCATCTTGGT
62 AATCCTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATT-TT-T-ATTTTCTAACTCATGGTTTA
** * * * * * * *
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63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA--TCCTAGT
* ** * * * *
3443912 CATTTTTATATTT-TGACTTGTGATTTAATTCC-AGTCATTTTCATTTTTTTACT-AGTGGTTTA
1 CATTTTCAT-TTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
* * ** * *
3443974 AT-CTCGGTCATTTTTATTTTCTGACTCATAATTTGATTCCGA-T
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTT-AATCCTAGT
* * * * * * ** * * **
3444017 CATTTTTATTTCTTTGGCTCGTAATTTAATGCC-AGTCATTTCCATTTTTTGACTCAT-CATTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * ** *
3444080 TTTTAGTCATTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAAT-CTCAAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** ** * *** *
3444122 CATTTTCACTTTT-TGACTTATGGTTTAATCCCCGTTGTTTTACATTTTCTGTGTCATGCTTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3444186 TCCCT-GTCGTTTTCATTTTTTGACACATTGTTTAATCCTTGT
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * ** ** * * *
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** ** * *
3444293 CTAGTTTTTTTTCATTTTTTGACTTGTCGTTTAAT-CTCGAT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * ** * * * *
3444334 CACTTTCATTTTTCTAACTCGTGGTTTAATCTTGGTGGTTTTCATTTTCTTACTCAAGGTTTAGT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** *
3444399 CCTAGTCATTTTCATTTTCTCACTCATGCATTAATTCC-AAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * * * **
3444440 CGTTTTCATTTTTTAACTCGAT-TTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTCTAACTCATAATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTC-ATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
** * * * **
3444504 TTTGATAATTTTCATCATTTTCATTTCCTAACTCATGGTTTAAT-CTCAAA
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* ** * ** ** * * ** *
3444554 CATTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAAT-TTCAATTGTTTTTATTTCTCTGAGTTGTGATTTA
1 CA-TTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTA
** * * * * * *
3444618 AAACTGATCGTTTTCATTTTCTAAGTCATGATTTAAT-CTCAGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * * * * * * **
3444661 CGCTTTCATTTTCTAACCCAAGGTTTAATCCCGATCGTTTTCATTTTTTGAC-CTATTATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTC-ATGGTTTAAT
* * * * * *
3444725 -CTAGTCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGATTTAATCCAAGT
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* * * * * * *
3444765 CATTTTTATTTTTTGACTCATG-TTTAATCCTAGACATTTTTATTTTTTGA-TCATGATTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * *** *
3444828 TTGGTCGTTTTCATTTTCAAACTCATGGTTTAATTCCCA-T
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * ** *
3444868 CATTTTCATATTCTAACTCTTGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTCTCTAACTCAAGGTTTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGG-TTTAA
** ** * * *
3444933 TCCCCGTTGTCTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAATCTTGATT
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** * ** * * ** ** * *
3444976 GTTTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTCAT-CTCAATTGTTTTCATTTTATAACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
3445040 CCTAGTAATTTTCAGTTTTAGACTCATGATTTAAT-TTCGAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3445081 AATTATT-ATTTT-TCAACTCATGATTTAAT-TTGATCATTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTTTA
1 CATT-TTCATTTTCT-GACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
** * * *
3445142 ATCCTGACCATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTGA--CTATGGC
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA--GT
* * * ** * * * *
3445185 CATTGTT-A-TTTCATTGACTCGTGACTTAAT-GTCAATCATTTTCATTTTTTAACTCGTCGTTT
1 CATT-TTCATTTTC--TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTT
** ** ** *
3445247 AATTTTGGTTGTTTTCATTTTTTGACTTGTGGTTTAATCTTAGT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * *
3445291 CATTTTCACTTTT-TGACTCGTGGCTTAATCCCCATTGTTTTACATTTTTTGACTTGTGCTTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT--CC--TG--GT-CA-TTTTT-A-TT-T--TCTAA
* * * * * ** *
3445355 TCCCTATTGTTT--TCTCTCGAT-AGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTATAATATTGGT
52 -CTC-ATGGTTTAATC-CT-GGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** ** * * *
3445411 CGTTTTTCATTTTCTGACTCATCATTTAAT-CTCAATCGCTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAA
1 C-ATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* ** * * * * * *
3445475 TCCTAGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCCAAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * *
3445517 CATTTTCATTTTCTGACTCATGCTTTAATTCTAGTCGTTTTAATTTTTTAACTCACGTTTTACTC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** ** ** ** *
3445582 CCAGTCATTTTCATTTGCTGACTTGTAATTTAATTCCAATAATTTT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCC--T-A--GT
* * * * * * *
3445628 CATTATTGTTTTCATTTAT-TGACTCATGGTTTAATCTTGATCATTTTCATTTTCTGACTCGTGA
1 C---A---TTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGG
* ** * * *
3445692 TTTAAT-CTCGATTGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTT-ATACCTTGT
59 TTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * ** * * * *
3445739 CATTTTCATTTTCTGACTTATGATTTAATTCGGGTTGTTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * *
3445803 CTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATTACC-A-A
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-T-CCTAGT
* * ** ** * * *
3445844 CCTTTTC-TTTGACTGACTTGTGATTTAATTTTGGTGATTTTTATTTCTCCAACTCGTGGTTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATGGTTTAA
* * * ** *
3445908 TCCAT--T-TTTCTTCATTTTCTAACTTGTGGTTTAATCCTGGT
64 TCC-TGGTCATT-TTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * *
3445949 CATTTTTTCATTTTCTGACT-AGTGATTTAATCCTTGTCGTTTTAATTTTTTGACTCGTGATTTA
1 CA--TTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * ** * *
3446013 AT-CTCGATCATTTTCAGTTTTAAACTCATGATTTAATTTCT-GT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * * * *
3446056 CATTTT-ATTTTCTAACTTATGATTTAATTCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTAAAGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
** * * * * *
3446120 CCAGTCATTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTGAT-TTCGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * * * * * * **
3446160 TGTTTTTATTTCTTTGACTCATGATTTGATACTGGTCACTTTCATTTTCTGACTTGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * ** * *
3446225 CAC-GATCATTTTCACTTTTTGACTTGTGGTGTAATCCTTGT
65 C-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * ** * *
3446266 TGTTTTACATTTTTTTGACTCATCCTTTAATCCCT-GTCATTTTCATTTTCTAA-T-GTGTTGTT
1 CATTTT-CA-TTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG--GTT
* * * ** * *
3446328 TAATCCCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGATACAACCCTGGT
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * ***
3446373 CATTTTCATTTTTTGACTCATGGTATAATCCCAGTCATTTTTCATTTTCTGACTCATCACTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
*** ** * *
3446438 CCCAATTGTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * ** * * * ** *
3446479 GGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCCAGTCATTTTCATTTTTTGA-TCATACTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* *
3446543 CTGGTCATTTTCATTTTTTAACTCATGTTTTAAT-CTAGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * * ** * *
3446583 CATTTT--TTTTACTCGTAATTTAATTTCGATAATT-TTCATTCTCA-TTTTCTTTTCTTGACTC
1 CATTTTCATTTT-CT-G--A-CTCA--T-GAT--TTAATCCTGGTCATTTTTATTTTC-TAACTC
* * * * * * * * * * *
3446644 ATGGTTTCAT-CTCGATCGTTTCCAATTTCTGACTCGTGATGTAAT-TTCGAT
55 ATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * *
3446695 CATTTTTATTTCTTTGACTTATGATTTAATACTGATCATTTTCATTTTATGACTCATGATTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * *
3446760 -TTCGGTCGTTTACATTTTCTAACCCATGGTTTAATCC-CGAT
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * *
3446801 CATTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCGGGTCATTTTTATTTTTTGACTCGTGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * ** * *
3446866 TTGATCATTTTTATTTTCTGACTTTTGATTTAAT-CTCGAT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * *
3446906 CATTTTCATTTTTTGATTCGTGGTTTAATTCCT-ATCCTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3446970 TCTAGTCATTTTTATTTCTCTGACTCGTGGTTTAATCCTCGT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * *
3447012 TGTTTTCATTTTTTGACTTATAATTTAATCCCGATCATTTTTCATTTTCTGACT-AGTGGTTTCA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
* * *
3447076 T-CTCGATCATTTTCATTTTCTGAC-CTGTGGTTTAATACCTA-T
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTC-ATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * * * * * * *
3447118 CGTTTTAATTTTTTGA-TGCGTGGTTTAATCTTAGTCGTTTTCATTTT-TAGAATCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACT-CATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAA
** * ** *
3447181 TTTTGATCATTTT-ATTTTTTGACTTGTGAG-TTAATTCC-AAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-GTTTAA-TCCTAGT
* * * *** * * * *
3447222 CGTTTTCATTTTTTGAC-CAGTGGTTTAATCCCAATCGTTTTTATTTTCTGACTCATGATTTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCA-TGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** * * *
3447286 TCTGGTCATTTTTATTTCTTTAACTTGTGATTTAATGCTAAT
65 CCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * *
3447328 CATTTTCATTTT-TCGACTCGTCATTTAATTCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCT-GACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3447392 -CTCGGTCATTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTAATGCCCA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** ** ** * * * * *
3447433 TGTTTTACATTGTT-TGACTTTTGCGTTAATCCCT-ATCATTTTCATTTT-TCGA-TGCGTTGTT
1 CATTTT-CATT-TTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCT-AACT-CATGGTT
* * * *
3447494 TAGTCCCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTCATGATTTAATCC-CGAT
61 TAAT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3447539 CGTTTTAACTTTT-TGACTCATGGTATAGT-CTAGTCATTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** *** *
3447602 TCCTAATTGCTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTAGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * * * * * * *
3447644 GGTTTTCATTTCCTCACTCAAGGTTTAGTCCTAGTCATTTTCATTTTCTGACTCGTGCTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * *** * *
3447708 TTCAGTCGTTTTCATTTTTTAACTCACATTTTAATCATGGT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * *
3447749 CATTTTCAATTTT-TGACTCATAATTTAATTCCAATAATTTTCATTATTGTTTTTGTTTCCTGAC
1 CATTTTC-ATTTTCTGACTCATGATTTAA-TCC-----TGGTC---ATT-TTTAT-TTT-CTAAC
** * ** ** * * *
3447813 TCATGGTTTAAT-CTCAATCGTTTTTGTTTTTTGACTTGTGATTTAAT-TTTGAT
53 TCATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * *
3447866 CATTTTTATTTCTTTGGCT-AGTGATTTAAT-ATCGATCGTTTTCATTTTCTAACTTATGATTTA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCA-TGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * * * * * *
3447929 AT-CTCGGTCATTTTCATATTCTAACCCATTGTTTTATCTTGGT
63 ATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * *
3447972 CATTTTCATTTTCTGACTCTTGATTTAATCCGGGTCGTTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* ** * * * *
3448037 CTAGTTGTTTTTATTTTTTGACTCGTGATTTAATCCTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3448077 CGTTTTCATTTT-TCATTCATGGTTTAATTCCCT--TCCTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-T-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * * * * **
3448139 TTCTGGTCATTTTTATTTCTCTAACTCGTGCTTTAATCCCCGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * *** * * ** *
3448182 TGTCTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCCCATCATTTTTCATTTTTTGACTGGT-GTTTCAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3448246 -CTCGATCATTTTCATTTTCTGACTCATAGTTTAATCCCTA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * * * *** * * **
3448287 CGTTTTAACTTTCTAACTCATCATTTAATCCCAATCATTTTTA-GTTGTAGACTCATCATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACTCATGGTTTAAT
** * * * ** *
3448351 TTTGGTCATTTTTATTTTCTGACTCATGATTTAATTTTGGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** ** * * * * * * * * *
3448392 CATTTTCATTTT-TGATTGGTGGCTTAAT-CTCAGCCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGATTTGAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * * * **
3448455 TCTAGTCATTTTTAATTCTTTAACTCGTGATTTTGTGCC-A-T
65 CCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
* * * ** * *
3448496 CATTTTTATTTTTTGACTCATCATTTAATTTTGGTCATTTTCATTTTCTAACTTC-TAGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAAC-TCATGGTTTAAT
* * *
3448560 -CTCAGTC-TTTTCACTTTTTGACTTATGGTTTAATCCTCA-T
65 CCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * *
3448600 TGTTTTACATTTTCTGACT--TGGCTTTAATCTCT-GTCGTTTTCATTTTC-AGA-TGCGAT-GT
1 CATTTT-CATTTTCTGACTCAT-GATTTAATC-CTGGTCATTTTTATTTTCTA-ACT-C-ATGGT
* * *
3448659 TTAATCTCT-GTCATTTTTATTTTTTGACTCATGGTATAATCC-CGAT
60 TTAATC-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * ** * * * *
3448705 CATTTTCATTTTCTGACTTGTCG-TTTAATCATGATCGCTTTCATTTTTTGATTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCAT-GATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* ** * * * * *
3448769 CCTAGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAAGGTTTAGTCCCAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * ** * * *
3448810 TGTTTTTATTTTCTAACTTGTGCTTTAAT--TGCGATCATTTTCATTTTTTAACTCGCAT--TTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTG-G-TCATTTTTATTTTCTAACT--CATGGTTT
* * * ** ** * *
3448871 TATCTTGGTCATTTACATTTTTTGACTGGTAATTTAAT-TTTGAT
62 AATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * *
3448915 AATTTTAATTATCATATTCATTTCTTGACTCGTGATTTGAT-CTCGATCATTTTCATTTTTTGAC
1 CA---T--TT-TC--A-T--TTTC-TGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAAC
* * * * * * ** ** * *
3448979 TCGTGATTTAAT-TTCGATCATTTTTATTTCTCTGACTTGTAATTTAAT-ATCGAT
53 TCATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * *
3449033 AATTTTCATTTTCTGACTCATTATTTAAT-CTCGGTCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3449097 -CTAAGTCATTTTCATTTTTTTGACCCATGGTTTAATCCTGGT
65 CCT-GGTCATTTTCA-TTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * ** ** * * * * *
3449139 CGTTTTCATTTTTTGACTTGTGATTTAATCCAT-GTTGTTTTAATTTTTTGACTCGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCC-TGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * *
3449203 CCAGGTCTTTTTTATTTTTTGACTCATGGTTTAAT-CTAGT
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * ** *
3449243 TGTTTTAATTTTCTGACTCGTGATTTAAT-CTCGGTCGTTTTCATTTTCGGACTCGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
* * ** * * ** ** *
3449307 TTCT-ATTGTTTTCATTTTCTGACTCGTGACTTAATTTTCGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * ** * * * * *
3449348 CATTTTTATTCCTCTGACT--TGTAGTTTAATCCCGGTTGTCTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTA
1 CATTTTCATT-TTCTGACTCATG-A-TTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTA
* * * ** *
3449411 ATCTTGATCACTTTTTATTTTTTGACTGGTGGTTTCAT-CTCAGT
63 ATCCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * ** ** * * *
3449455 CATTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAGTCCCAGTTGTTTTAATTTTATAACTCATAGTTTAATC
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * ** * *
3449520 TTGG-CTGTTTTCAATTTTAGACTCGTTATTTAAT-TTCGGT
66 CTGGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * * * ** * * * * * *
3449560 CATTTTTATTTTTTGGCTCATTATTTAATTTTAGTCATTTTCATTTTTTTACTAATGGTTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * * * *
3449625 TTGGTCATTTTCATTTTATGACTCATGATTTGATTCTGGT
66 CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * * * **
3449665 CGTTTTTATTTCTTTGGCTCATGATTTAATGCC-AGTCATTTTCATTTTTTGATTCATCATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** ** *
3449729 TTTTGGTCATTTTCATTTTCGGACTCGTGGTTTAATCTCTA-T
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATC-CTAGT
* * ** ** * * * *
3449771 CATTTTCACTTTT-TGACTTATGGTTTAATCCCCGTTGTTTTACATTTT-TTAGTCATGCTTTAA
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTT-TATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3449834 TCCCT-ATCATTTTAATTTTTTGA-TACGTTGTTTAATCCTTA-T
64 T-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACT-CATGGTTTAATCC-TAGT
* * * * * * * * * ** **
3449876 CTTTTTTATTTTTTAACTCGTGGTATAAT-CTCGATCATTTTTCCTTTT-TAGACTTGTCATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTT-ATTTTCTA-ACTCATGGTTTA
* ** ** *
3449939 ATCCTGATCGCTTTCATTTTTTGACTGGTGAG-TTAATCCTGGT
63 ATCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-GTTTAATCCTAGT
** * * * * *** ** * * ** *
3449982 GGTTTTCATTTTCTCACTCAGGGTTTAGTCCCAATCATTTTCGTTTTTTGACTTGTGCTTTAAT-
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * ** *
3450046 TTCAGTTGTTTTCATTTTTTAACT--TGCGTTTTAATCCTAGT
66 CT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATG-G-TTTAATCCTAGT
* ** * ** *
3450087 CATTTTCATTTTCTAACTTGTAATTTAATTTTGGTAATTTTCATTATCATTTTTGTTTCCTAACT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGG------TCA-T-T--TTTAT-TTT-CTAACT
* ** ** * * ** * * *
3450152 CGTGGTTTAAT-CTCAATTGTTTTCGTTTTTTAACTTGTGATTTAAT-TTTGAT
54 CATGGTTTAATCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
* * * * * * * * *
3450204 CATTTTTATTTCTCTAACTTATGATTTAATACTGATCATTTTCATTTTTTGACT-AGTGATTTAA
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
** * * * * *
3450268 T-CTCCATCGTTTT-ATTTTCTAACCCATGGTGTAATCCTAGT
64 TCCT-GGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
** * * * * ** **
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1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * *
3450373 -CTCGGTCGCTTTT-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTTTGT
65 CCT-GGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * *
3450414 CTTTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATCCCT-GTCGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAAT-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA-
* * * *
3450478 TCCCATTGT--TTTT-ATTTTCTT-ACTCATGATTTAATTCTGGT
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* * ** * ** ** * * * ** *
3450519 CATTTTTATTTCTTTGACTTGTGGTTTAATCCCCGTTGTCTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * ** * *
3450584 CTTGATCATTTTTCATTTTCTGACTGGTGGTTTCAT-CTCAAT
65 CCTGGTCA-TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
* * ** * * * **
3450626 CATTTTCATTGTT-TAACTCATGGTTTAA-CCTTATCGTTTTAATTTTCTGACT-ATTACTTTAA
1 CATTTTCATT-TTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAA
** * * * *
3450688 TCCTGGTCATTTTCAGATTTAGACTCGTGATTTAAT-TTATGT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTA-GT
* * * ** * ** * *
3450730 CATTTTTATTTTTTGATTCATGATTTAATTTTAGTCATTTCCATTTTTTGACT-AGTGGTTTAAT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCA-TGGTTTAAT
* * * * * *
3450794 CCTGGTTATTTTCATTTTCTT-ACTCGTGATTTGAT-TTCGAT
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* * * * * * * * *
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1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCT-GGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
** * * * * *
3450899 TTTTGGCCGTTTTCATTTTCTAACTCATGGTTTAAT-CTCAAT
64 TCCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCT-AGT
** * * ** *
3450941 CATTTTCACTTTT-TGACTTGTGGTTTAAT-CT--CCATTGTTTTACATTTTCTAACTTGTGTTT
1 CATTTTCA-TTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCA-T-TTTT--ATTTTCTAACTCATGGTT
* * * * **
3451002 TAATCTCT-ATCTTTTTTATTTTTTGACACATTTTTTAATCCTA-T
61 TAATC-CTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* * * * * * * *
3451046 CATTTTTATTTGT-TGAGTCATGATTTAATCCAGGTCGTTTTCATTTTGTGACTCATGGTATAAT
1 CATTTTCATTT-TCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAAT
* * * * * *
3451110 -CTCGGTCGTTTTTCATTTTCTAACTCATCGATTAAT-CTCGAT
65 CCT-GGTC-ATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * * ** * * *
3451152 CGCTTTCATTTTCTGATTCGTGGTTTAATCCTGGTGGTTTTCATTTTCTCACTCA-GAGTTTAGT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATG-GTTTAAT
* * ** * **
3451216 CCTAGTCATTTTCATTTTCTGACTTGTGCTTTAATTCC-AAC
65 CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAA-TCCTAGT
* * * * * * * * ** *
3451257 CGTTTTCATTTTTTAACTCATGTTTTAATCCTGATCATTTTCATTTTTTGACTCATAATTTAATT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAATC
* * * *
3451322 ATGGTAATTTTCATTATCGTTTTCCTTTTTTGACTCGTGGTTTAAT-CTCGAT
66 CTGG------TC---A---TTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAG-T
** * * ** * *
3451374 TGTTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATTTTGATCATTTTTATTTCTCTGA--CATGTGATTTA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCCTGGTCATTTTTATTT-TCTAACTCATG-G-TTTA
* ** * * * * *
3451437 ATACC-GATTGTTTTCATTTTCTGACTCCT-ATTTAATCTTAAT
63 AT-CCTGGTCATTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTAATCCTAGT
* ** * * * * * * * *
3451479 CATTTTCATTTTTTGACTGGTGGTTTAATTACC--ATCATCTTCATTTTTTGACTCGTGATTTAA
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAA-T-CCTGGTCATTTTTATTTTCTAACTCATGGTTTAA
* * * *
3451542 TTCTGATCATTTTTATTTCTTTGACTCATAGTTTAATCCCTA-T
64 TCCTGGTCATTTTCATTT-TTTGACTCATGGTTTAAT-CCTAGT
** * * * ** * * *
3451585 TGTCTTCTTTTTCTGACTCCT-AGTTTAATCCTAATCGTTTTTCATTTTCTGACT-AGTGGTTTT
1 CATTTTCATTTTCTGACTCATGA-TTTAATCCTGGTCATTTTT-ATTTTCTAACTCA-TGGTTTA
* * * *** * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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65 TAGTCA
* ** * * *
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65 TAGTCA
* * * * * *
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*
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* * * * * * *
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AGTCA
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* *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * *
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* * ** * *
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* *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* *
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* * **
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* * * * *
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* * **
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*
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* * *
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CCAATCATTTTTCATTTTCTGACTCATGATTTAATTCTAG
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* * * * *
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*
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* *
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* *
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* * * *
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ATCCCAA
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* * * *
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65 GTCAT
*
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*
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TCAT
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1 ATTTTCATT
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3371841 AATTTTGGTA
* *
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ATTTTC
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** * *
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3371887 TGATTTGTGG
* * * * * * * **
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***
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64 CCCATGA
* * *
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65 CCATGA
* * * * ** * * * **
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66 CATGA
** * *
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CATGA
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3372076 ATTTTGGTTG
* * *
3372086 TTTTCATTTTTTGAGTCATGATTTAATCTT-AATC-GTTTTCGTTTTCTGACTCGTGGTTTAATT
1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT-TTGAATCAGTTTTAGTTTTCTGACTCGTGGTTTAATC
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65 CCCACCA
* ** * * *
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1 TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATTTGAATCAGTTTTAGTTTTCTGACTCGTGGTTTAATCC
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66 CCAC
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CCACCA
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3372117 ATCGTTTTCG
* * * * *****
3372127 TTTTCTGACTCGTGGTTTAATTCCCACCATTTTTATTTTTTGACTTGTGATTTAATTTGGATCAT
1 TTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCCCACCATCTTTATTTTCTGACTCGTGATTTAAGCCCAATCAT
3372192 TTTT-AT
66 TTTTCAT
** * *
3372198 TTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCCCACTGTCTTTGTTTTCTGACTCGTGGTTTAAGCCCAATCAT
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3372263 TTTTCAT
66 TTTTCAT
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1 TTT
3372273 CTACCTGGTG
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TTTTCAT
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3372340 TTTCTAACTT
** ** *
3372350 GTGGTCTAATCTTGATCATTTTTGGTTTTAAACTCATGATTTAATTTTGGTCAATTTTATTTTTT
1 GTGGTCTAATCTTGATC-TTTTTCTTTTTTGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTTT
* * **
3372415 GACTCGTGATTTAGTTCCAGTTGTTTTCATTTTTTGACTA
65 GACACGTGATTTAATTCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTA
* *
3372455 GTGGTCTAATCTCGATCTTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTGATTTTGGTCATTTTTATTTATT
1 GTGGTCTAATCTTGATCTTTTTC-TTTTTTGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTT-TT
* * *
3372520 TGACACGTTATTTAATGTCGA-TCATTTTCATTTTTTGACTT
64 TGACACGTGATTTAAT-TCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTA
* * * * * * * * *
3372561 GTTGTTTAATTTTGATCATTTTCTTTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCGGTCATTTTCACTTTTT
1 GTGGTCTAATCTTGATCTTTTTCTTTTT-TGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTTT
3372626 GAC
65 GAC
3372629 TTGTGGTTTA
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Matches are distributed among these distances:
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GTGGTCTAATCTTGATCTTTTTCTTTTTTGACTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTTTG
ACACGTGATTTAATTCCAGTCATTTTCATTTTTTGACTA
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3372802 TGACTCATGC
* * * * * *
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*
3372847 TTTAA-TCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACACGTAA
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*
3372882 TTTAATTCCGGTAATTTTCATT
1 TTTAATTCCGGTCATTTTCATT
3372904 ATTGTTTTTC
Statistics
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3372899 TCATTATTGT
* * *
3372909 TTTTCACTTTCGAACTCATGGTTTAATCTC-GATCG
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* * * * * *
3372944 TTTTCATTTTTTTACTCTTGATTTAATTTCAATCA
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAA-TCCAGTCG
* * * ***
3372979 TTTTTATTTCTCTAGCTTATGATTTAATTTTGATCG
1 TTTTCATTT-TCTAACTCATGATTTAATCCAG-TCG
*
3373015 TTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATCTCAGTCG
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATC-CAGTCG
* * * *
3373050 TTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCCTGGTTG
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* * * *
3373085 TTTTCATTTTC-AGACCCATGGTGTAATCCTGGTCG
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* *
3373120 TTTTCATTTTCTAACTCGTGATTTAATCCTGGTCG
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCC-AGTCG
* * ** *
3373155 TTTTTATTTTCTGACTTGTTG-TTTAATGCCAGTTG
1 TTTTCATTTTCTAAC-TCATGATTTAAT-CCAGTCG
* * * *
3373190 TTTTTATTTTCTGACTAATGATTTAATCCCGATCG
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCAG-TCG
* * * * ** *
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1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTT-AATCCAGTCG
** * *
3373260 TTATT-ATTTCTCCGACTCATTG-TTTAATCCTTGTTG
1 TT-TTCATTT-TCTAACTCA-TGATTTAATCC-AGTCG
* * * * * * *
3373296 TCTTCATTTTTTGACCCGTGGTTTAATCCCGATCG
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCAG-TCG
* ** * * * *
3373331 TTTTTTCATTTTTTGGCTCATGGTTTCATCTTAGTCA
1 --TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATC-CAGTCG
** * * * *
3373368 TTTTTGTTCTCTGACTCATGGTTTAATCCTCGTCG
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCC-AGTCG
* * * * *
3373403 TTTTAATTTTCTGACTCGTGGTTTAATCCTAGTCA
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCC-AGTCG
* *** *
3373438 TTTTCCA-TTT-TAGGCTCATGATTTAATTTTGGTCA
1 TTTT-CATTTTCTA-ACTCATGATTTAA-TCCAGTCG
* * *
3373473 TTTTTATTTTCTAACTCATGATTTAATTCCAGCCA
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAA-TCCAGTCG
* * * * *
3373508 TTTTC-GTTTCTTGACT-A-GTAGTGTAATCCTGGTCA
1 TTTTCATTTTC-TAACTCATG-A-TTTAATCC-AGTCG
* * ** *
3373543 TTTTCTTTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGGTCA
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* * * * * *
3373578 TTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCCAGCCA
1 TTTTCATTT-TCTAACTCATGATTTAAT-CCAGTCG
* * *
3373614 TTTTCATTTTTTGACTCATCATTTAATTCCAGTCG
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAA-TCCAGTCG
* *
3373649 TTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAATC
1 TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATC
3373677 TTCTTCATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
33 1 0.00
34 24 0.04
35 411 0.74
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37 28 0.05
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ACGTcount: A:0.18, C:0.18, G:0.13, T:0.50
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TTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCCAGTCG
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3373416 ACTCGTGGTT
* * *
3373426 TAATCCTAGTCATTTTCCA-TTT-TAGGCTCATGATTTAATTTTGGTCATTTTTATTTTCTAACT
1 TAATCCTAGTCATTTT-CATTTTCTA-ACTCAAGATTTAATTCT-GTCATTTTTATTTTCTAACT
* *
3373489 CATGATTTAATTCCAGCCATTTTCGTTTCTTGACTAGTAGTG
63 CATGATTTAATGCCAGCCATTTTCATTTCTTGACTAGTAGTG
* * * * * *
3373531 TAATCCTGGTCATTTTCTTTTTCTAACTCATGATTTGATTCTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTC
1 TAATCCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCAAGATTTAATTCT-GTCATTTTTATTT-TCTAACTC
* * *
3373596 GTGATTTAATGCCAGCCATTTTCATTTTTTGACTCA-TCA-TT
64 ATGATTTAATGCCAGCCATTTTCATTTCTTGACT-AGT-AGTG
* *
3373637 TAATTCC-AGTCGTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAAT
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3373676 CTTCTTCATT
Statistics
Matches: 121, Mismatches: 18, Indels: 11
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
104 1 0.01
105 46 0.38
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TAATCCTAGTCATTTTCATTTTCTAACTCAAGATTTAATTCTGTCATTTTTATTTTCTAACTCAT
GATTTAATGCCAGCCATTTTCATTTCTTGACTAGTAGTG
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Indices: 3373741--3373840 Score: 105
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3373731 TAAGTCGTGC
*
3373741 TTTAATCCCTATCGTTTTCATTTTTTGATGCGT-TG-
1 TTTAATCCCTATCATTTTCATTTTTTGA--CGTATGA
* * *
3373776 TTTAATCCTTGTCATTTTCTATTTTTTGACTTATGA
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* *
3373812 TTTAATTCCTATCATTTTCCTTTTTTGAC
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3373841 TAGCGGTTTT
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 8, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
34 2 0.04
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TTTAATCCCTATCATTTTCATTTTTTGACGTATGA
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Indices: 3374103--3374223 Score: 120
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3374093 TTAATACTGA
* * ***
3374103 TCGTTTTCATTTTCTGACTCGTAATTTAATCTTGG
1 TCGTTTTCATTTTCTGACCCGTAGTTTAATCCCAG
* * * *
3374138 TTGTTTTCA-TTTCTAACCCATGGTTTAATCCCAG
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*
3374172 TCGTTTTCATTTTCTGACCCGTAGTTTAA-CCCAA
1 TCGTTTTCATTTTCTGACCCGTAGTTTAATCCCAG
* *
3374206 TCATTATCATTTTCTGAC
1 TCGTTTTCATTTTCTGAC
3374224 TCATGATTTA
Statistics
Matches: 69, Mismatches: 16, Indels: 3
0.78 0.18 0.03
Matches are distributed among these distances:
34 45 0.65
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Found at i:3374253 original size:35 final size:35
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Indices: 3374005--3374834 Score: 251
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3373995 ATCAATTTCT
* * * *
3374005 TTTTCTAACTCGTGGTTTAATCTCGATTATTTTCT-
1 TTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTT-TA
* * * *
3374040 TTTTCTGACTCGTGATTAAATTTTGATCATTTTTA
1 TTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTTA
* ** * *
3374075 GTTTCTCTGGCTTGTGATTTAATACT-GATCGTTTTCA
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* * * * ** *
3374112 TTTTCTGACTCGTAATTTAATCTTGGTTGTTTTCA
1 TTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTTA
* * * * * *
3374147 -TTTCTAACCCATGGTTTAATC-CCAGTCGTTTTCA
1 TTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGA-TCATTTTTA
* * * * * *
3374181 TTTTCTGACCCGT-AGTTTAA-CCCAATCATTATCA
1 TTTTCTGACTCATGA-TTTAATCTCGATCATTTTTA
* *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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* *
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** * *
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* ** * * *
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* ** *
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* *
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* * *
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** * *
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TTTTCATTTTTTGACTCGTGGTTTAATCCTTGTCA
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3374922 TAACTCGTGA
* * * *
3374932 TTTAATCCTTGTCGTTTTCATTTTTTGACTCGTGGTGTAATCCTAATCATTTTTTATTTTCTAAC
1 TTTAATCCTTGTCGTTTTCATTTTCTCACTCGTGGTGTAATCCCAATCATTTTTCATTTTCTAAC
* * *
3374997 TCATTGTTTAATCTCGATCGCTTTCGTTTTCTGACTCATGG
66 TCAGTGTTTAATCTAGATCACTTTCGTTTTCTGACTCATGG
* * * *
3375038 TTTAATCCTTGTGGTTTTCATTTTCTCACTCAG-GGTTTAGTCCCAGTCA-TTTTCATTTTCTAA
1 TTTAATCCTTGTCGTTTTCATTTTCTCACTC-GTGGTGTAATCCCAATCATTTTTCATTTTCTAA
* *
3375101 CTC-GTGCTTTAATTCTAG-TCATTTTCATTTT
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3375132 TCAACAAGGG
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TTTAATCCTTGTCGTTTTCATTTTCTCACTCGTGGTGTAATCCCAATCATTTTTCATTTTCTAAC
TCAGTGTTTAATCTAGATCACTTTCGTTTTCTGACTCATGG
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* *
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* * *
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1 TT
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TTAATCCCGATCATTTTCAGTTTCTAACCCATGG
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3375756 GTTCCAGTTG
* * * * * *
3375766 TTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTCTAATCTCGATCTTTTTCATTTTTCGACTCGA-GATTTGATT
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*
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* ** * *
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* *
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1 TTTTCTTTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCA-TTTTTGACTTATGTTTTAAT--T
* **
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63 TTGATCA
* * * * * * * *
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1 TTTT-CTTTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCA-TTTTTGACTT-ATGTTTTAATT
**
3376041 ACGATCA
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* * **
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3376100 CGTGCTTTAA
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TTTTCTTTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTGACTTATGTTTTAATTTTG
ATCA
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3375214 CTGATTTGTG
* * ** *
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* ** * * * *
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* * * * * * * * * * *
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1 G-TTTAATCTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCTATCATTTTTATTTTTTGA
* * * * * ***
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* * * * *
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* * * * **
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63 GACTCATGATTTAATCTCGGTCATTTTTCATTTTT-TGACTCATT
* * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
3375750 GATTTAGT-TCCAGTTGTTTTCATTTTTTGACT-AGTGGTCTAATCTCGATC-TTTTTCATTTTT
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* * * * *
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* * * ** **
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1 GTTTAATCTCGATCGTTTTCATTTTTTGAC-TCATGATTTAATCCCT-ATCATTTT-TATTTTTT
* * *
3375919 GACTCATGGTTTAATCTCGGTCA-TTTTCACTTTTTGACTTA-T
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* * * *
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* * *
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63 GACTCATGATTTAATCTCGGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATT
* * * ** *
3376069 GTTTAATCTCGATCGCTTTCATTTTTTGACTCGTGCTTTAA-CCCTAGTGGTTTTCATTTTCTT-
1 GTTTAATCTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCTA-TCATTTTTATTTT-TTG
* * * * * *
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* * * ** * * * *
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1 G-TTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTTTGA-CTCATGATTTAATCCCT-ATCATTTTTATTTTT
* * * * * * *
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* * * ** * *
3376291 GTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTGACTCTTCATTTAATTTCAATCATTTTTATTTCTCT-A
1 GTTTAATCTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCTATCATTTTTATTT-TTTGA
* ** * ** * *
3376355 GCTTATGATTTAAT-TTTGACCGTTTTCATTTTTTAACTC-GT
65 -CTCATGATTTAATCTCGGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATT
* * * * * * * ** *
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1 G-TTTAATCTCGA-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCT-ATCATTTTTATTTTTT
* * * * *
3376459 GACCCATGGTTTAATC-CTGGTC-GTTTTCATTTTCTAACTCA-T
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* * * * * ** *
3376501 GATATAATC-CTGGTCGTTTTTATTTTTTGACTCATTATTTAATGCC-AGTTGTTTTTATTTTCT
1 G-TTTAATCTC-GATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCTA-TCATTTTTATTTTTT
* * * *
3376564 GACACATGATTTAATCCCGATCA-TTTTCATTTTCTGACTCA-T
63 GACTCATGATTTAATCTCGGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATT
* * * ** * ** * *
3376606 GTTTTGAT-TCTGGTCATTATT-ATTTCTTCAACTCATTG-TTTAATCCCTGTTGTCTTCATTTT
1 G-TTTAATCTC-GATCGTT-TTCATTT-TTTGACTCA-TGATTTAATCCCTATCATTTTTATTTT
* * * * * *
3376668 TTGAAC-CGTGGTTTAATCCCGATCGTTTTTTCATTTTTTGACTCATG
61 TTG-ACTCATGATTTAATCTCGGTC-ATTTTTCATTTTTTGACTCATT
* * ** * * * * * *
3376715 GTTTCATCTC-AGTCATTTTTGTTCTCTGACTCATGGTTTAAT-CCTCGTCATTTTAATTTTCTG
1 GTTTAATCTCGA-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCT-ATCATTTTTATTTTTTG
* * * * * ** * *
3376778 GCTCGTGGTTTAATC-CTAGTCA-TTTTAAAATTTAGGCTCA-T
64 ACTCATGATTTAATCTC-GGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATT
* * * * * * * * * * *
3376819 GATTTAATTTTGGTCTTTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAATTCC-AGTCATTTTTGTTTCTTG
1 G-TTTAATCTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCTA-TCATTTTTATTTTTTG
* * *
3376883 ACT-A-GTAGTGTAATC-CTAGTCA-TTTTC-TTTTTCTAACTCA-T
64 ACTCATG-A-TTTAATCTC-GGTCATTTTTCATTTTT-TGACTCATT
* * * * * * *
3376924 GATTTGAT-TCTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTAATGCC-AGTCATTTTCATTTTT
1 G-TTTAATCTC-GATCGTTTTCATTT-TTTGACTCATGATTTAATCCCTA-TCATTTTTATTTTT
* * * * * **
3376987 TGACTCATTATTTAAT-TCCAGTC-GTTTTCATTTTCTAACTCAAG
62 TGACTCATGATTTAATCT-CGGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATT
* * * * * * * * * * **
3377031 GTTTAATCTTC-TTCATTTTCACTTTTCGATTTATGGTTTCATCGCTGTTGTTTTCT-TTTTTCT
1 GTTTAATC-TCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCCCTATCATTTT-TATTTTT-T
* * * ** * *
3377094 GACTCGTGCTTTAATCCCTATCA-TTTTCATTTTTTGACGCGTT
63 GACTCATGATTTAATCTCGGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATT
* * * * *
3377137 GTTTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACGCGTTG-TTTAATCCCTGTCATTTTCTATTTTTT
1 GTTTAAT-CTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTC-ATGATTTAATCCCTATCATTTT-TATTTTTT
* **
3377200 GACTTATGATTTAAT-TCCTATCA-TTTTCATTTTTTGACT
63 GACTCATGATTTAATCT-CGGTCATTTTTCATTTTTTGACT
3377239 AGCGGTTTTC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TCATGATTTAATCTCGGTCATTTTTCATTTTTTGACTCATT
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1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
**
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66 CTCAG
* ** ** * * * *
3375270 ATCATTTTTA-TTTCATTGGCTTGTGGTTTAATATCGATCGTTTTTATTTTTTGACTCATGATTT
1 -TCATTTTCATTTTC--TAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTT
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63 AATCTCAG
* * * * ** * * * *
3375341 ATCATTTTTAGTTTCTAACCCATG-GTTAATCCCGATCGTTTTCATTTTCTGACCCATGGTTGAA
1 -TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
* **
3375405 TTTTGG
65 TCTCAG
*** * * *
3375411 TGGCTTTCATTTTTTGACTCATGACTTAAT-TTCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCAT-AGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTT-GATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGA-TTTA
*
3375474 AT-TCACA
64 ATCTCA-G
* * * * * * * * * * * *
3375481 CCGTTTTTATTTTTTGACTTACGATTTAAT-TTCAGTCATTTTTATTTTTCTGACTCACGGTTTA
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGA-TCGTTTTCATTTTT-TGACTCATGATTTA
* *
3375545 ATCCCCAC
64 AT-CTCAG
* * * * * * ** * *
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1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCG-TTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
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65 TCTCAG
* * * * * *
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1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAAT-CTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
*
3375687 TCT-TG
65 TCTCAG
* * * * * *
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1 -TCATTTTCATTTTCTA-ACTCATGATTTAATCTTGATC-GTTTTCATTTTTTGACTCATGATTT
*
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** * * * * * * * *
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1 TCATTTTCATTTTCTAACTCA-TGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTC-ATGATTTA
* **
3375826 ATTTTGG
64 ATCTCAG
* * * * * * * * **
3375833 TCATTTTTATTTCTTTGACTCGTTATTTAATGTCGATCATTTTCATTTTTTGACTTGTTG-TTTA
1 TCATTTTCATTT-TCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGAC-TCATGATTTA
**
3375897 AT-TTTG
64 ATCTCAG
* * * * * * * * * *
3375903 ATCATTTTCTTTTTTTGACTCATGGTTTAATCTCGGTCATTTTCACTTTTTGACTTATGTTTTAA
1 -TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
*
3375968 TCCCCTA-
65 T-CTC-AG
** * * * * *
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1 TCATTTT-CATTTTCTAACTCATGATTTAAT-CTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTA
*
3376038 ATCAC-G
64 ATCTCAG
* * * * * *
3376044 ATCATTTTTCATTTTTTGACTCATTG-TTTAATCTCGATCGCTTTCATTTTTTGACTCGTGCTTT
1 -TCA-TTTTCATTTTCTAACTCA-TGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTT
*
3376108 AA-CCCTAG
63 AATCTC-AG
** * * * * * ** * *
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1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGA-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
*
3376180 TAC-CGG
65 T-CTCAG
* * * ** * * * * * * * *
3376186 TCATTTTTATTTTTTAGCTCGCGTTTTAATCCTGGTCATTTTCATTTTCTAACTCGTAATTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
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66 CTCA--G
* * * *
3376256 TAATTTTCATTATTATTTTTGTTCTCGAACTCATGGTTTAATCTCGATCATTTTCATTTTTTGAC
1 TCATTTTC------A---TT-TTCT--AACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGAC
* * * *
3376321 TCTTCATTTAATTTCAA
54 TCATGATTTAATCTCAG
* * * * * * *
3376338 TCATTTTTATTTCTCTAGCTTATGATTTAATTTTGACCGTTTTCATTTTTTAACTCGTGATTTAA
1 TCATTTTCATTT-TCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
3376403 TCTCAG
65 TCTCAG
* * * * * *
3376409 TCATTTTCATTTTCTAACCCATGGTTTAATCTTGGTTGTTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAAT
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
*
3376474 C-CTGG
66 CTC-AG
* * * * * *
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1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
3376544 GC-CAG
66 -CTCAG
** * * * ** * * * *
3376549 TTGTTTTTATTTTCTGACACATGATTTAATCCCGATCATTTTCATTTTCTGACTCATGTTTTGAT
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
*
3376614 -TCTGG
66 CTC-AG
* * * * *
3376619 TCATTATT-A-TTTCTTCAACTCATTG-TTTAATCCCTG-TTGTCTTCATTTTTTGAAC-CGTGG
1 TCATT-TTCATTTTC-T-AACTCA-TGATTTAAT-CTTGATCGTTTTCATTTTTTG-ACTCATGA
*
3376679 TTTAATC-CCG
60 TTTAATCTCAG
* * * * * * * ** * * *
3376689 ATCGTTTTTTCATTTTTTGACTCATGGTTTCATC-TCAGTCATTTTTGTTCTCTGACTCATGGTT
1 -TC--ATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGA-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATT
3376753 TAATCCTC-G
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* ** * * * * * ** * *
3376762 TCATTTTAATTTTCTGGCTCGTGGTTTAATCCT-AGTCATTTTAAAATTTAGGCTCATGATTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGA-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
* **
3376826 TTTTGG
65 TCTCAG
* * * ** * ** * *
3376832 TCTTTTTTATTTTCTAACTCGTGATTTAAT-TCCAGTCATTTTTGTTTCTTGACT-A-GTAGTGT
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGA-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATG-A-TTT
3376894 AATC-CTAG
63 AATCTC-AG
* * * * * *
3376902 TCATTTTCTTTTTCTAACTCATGATTTGAT-TCTGGTCATTTTTATTTCTTTGACTCGTGATTTA
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCT-TGATCGTTTTCATTT-TTTGACTCATGATTTA
3376966 ATGC-CAG
64 AT-CTCAG
* * * ** * * * *
3376973 TCATTTTCATTTTTTGACTCATTATTTAAT-TCCAGTCGTTTTCATTTTCTAACTCAAGGTTTAA
1 TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGA-TCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAA
*
3377037 TCTTC-T
65 TC-TCAG
* * * * * * * * * *
3377043 TCATTTTCACTTTTC-GATTTATGGTTTCATCGCTG-TTGTTTTCTTTTTTCTGACTCGTGCTTT
1 TCATTTTCA-TTTTCTAACTCATGATTTAATC-TTGATCGTTTTCATTTTT-TGACTCATGATTT
*
3377106 AATCCCTA-
63 AATCTC-AG
* * * * * * *
3377114 TCATTTTCATTTTTTGACGCGTTG-TTTAATCCTTG-TCATTTTCATTTTTTGACGCGTTG-TTT
1 TCATTTTCATTTTCTAACTC-ATGATTTAAT-CTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTC-ATGATTT
* *
3377176 AATCCCTG
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* * * * *
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3377239 AGCGGTTTTC
Statistics
Matches: 1456, Mismatches: 390, Indels: 243
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TCATTTTCATTTTCTAACTCATGATTTAATCTTGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTTAAT
CTCAG
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** * **
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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* ** * *
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** * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * ***
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* ** * ***
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* * * * *
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***
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* * * ** * * *
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* ** *
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1 ATCATTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCG
* * * *
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1 A-TCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCG
*
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** ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* *
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* * *
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** * * *
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ATCATTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCCCG
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* * * *
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* * * *
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GTCATTTTTCATTTTCTGACTCAGGATTTAATTTGGATCATTTTAATTTTTTAACTAGTGATTCA
ATGCCA
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* * *** *
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** *
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* *
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* * * *
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GATTTAATTTGGGTCACTTTTATTTTCTGACTTGTGATGTAATGCCGATCATTTTAATTTATTAA
CTAGTCATTCAATGCCAGTCATTTTCATTTGCTGACTCATG
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*
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*
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CTCATGATGTAATCCTGATCATTTTTCATTTGA
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* * * *
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*
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** * ** * * *
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* * *
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* * * * ** *
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** * * *
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* * *
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* * **
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* * * * *
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** * * ** *
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** * **
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* * * *
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* ** * * **
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* * **
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**
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* * * **
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* ** * * *
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* * *
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* * * *
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** *
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* * ** * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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** * * * ** *
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** * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * **
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** * * *
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* * * *
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* * * **
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** * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * * * *
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**
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* ** * * *
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* * *
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** *
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* * * *
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* *
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*
3380575 TTTAATTCCTATCATTTTCATTTTTTGACTCATGG
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* *
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* *
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66 AATCT
*
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Statistics
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* ** *
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* * *
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* * ** *
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* * * * *
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Statistics
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ATCTCGATCA
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* * *
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**** ** * * *
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*
3379293 TATTTAAT-TTTGATCA
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* * * * *
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* * * *
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*
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AATCCC
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** * * **
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* * * *
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** *
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* *
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*** * *
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* * * *
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* * * **
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*
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* * * * * *
3383949 CATTTTTATTTTTTGACACATTGTTTAATTTCTG-T
1 CGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTC-GAT
* * * * *
3383984 CATTTTCTATTTTTTGACTTATGATTTAAT-TCCTAT
1 CGTTTTC-ATTTTCTGACTCATGGTTTAATCT-CGAT
* * * * * *
3384020 CATTTTCATTTTTTAACTCGTGGTATAATCTTGAT
1 CGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCGAT
* * * * **
3384055 CACTTTTCATTTTTTAAGTCATCATTTAATCTCGAT
1 C-GTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCGAT
*
3384091 CGCTTTCATTTTCTGACT
1 CGTTTTCATTTTCTGACT
3384109 AGCGATTTTC
Statistics
Matches: 1530, Mismatches: 425, Indels: 234
0.70 0.19 0.11
Matches are distributed among these distances:
33 3 0.00
34 79 0.05
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43 3 0.00
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46 13 0.01
ACGTcount: A:0.19, C:0.17, G:0.12, T:0.52
Consensus pattern (35 bp):
CGTTTTCATTTTCTGACTCATGGTTTAATCTCGAT
Found at i:3382190 original size:69 final size:70
Alignment explanation
Indices: 3382103--3382265 Score: 184
Period size: 69 Copynumber: 2.3 Consensus size: 70
3382093 TGATTTAATA
*
3382103 CCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCTTGATTCAATCTCGGTTATTTTCATTTTCTAACCCATG-GT
1 CCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTCAATCTCGGTTATTTTCATTTTCTAACCCATGAGT
3382167 CAATC
66 CAATC
* * * * * * * * * * *
3382172 CCGATCATTTTCATTTTTTGACCCATGGTTTAATTTGGGTTGTTTTCATTTTTTGACTCATGATT
1 CCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTCAATCTCGGTTATTTTCATTTTCTAACCCATGAGT
*
3382237 TAATC
66 CAATC
* *
3382242 TCGATCGTTTTCATTTTCTGACTC
1 CCGATCGTTTTCATTTTTTGACTC
3382266 GTGGTTTAAT
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 17, Indels: 1
0.81 0.18 0.01
Matches are distributed among these distances:
69 51 0.67
70 25 0.33
ACGTcount: A:0.18, C:0.20, G:0.13, T:0.49
Consensus pattern (70 bp):
CCGATCGTTTTCATTTTTTGACTCATGATTCAATCTCGGTTATTTTCATTTTCTAACCCATGAGT
CAATC
Found at i:3382365 original size:71 final size:70
Alignment explanation
Indices: 3382216--3382400 Score: 201
Period size: 71 Copynumber: 2.6 Consensus size: 70
3382206 TTGGGTTGTT
* * * * *
3382216 TTCATTTTTTGACTCATGATTTAATCTCGATCGTTTTCATTTTCTGACTCGTGGTTTAATTCCCA
1 TTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACTCGAGGTTTAATCCCCA
*
3382281 TCGTT
66 TCGTC
* ** * *
3382286 TTTATTTTCTGACTTGTGATTTAATTTCGATCATTTTTATTTTTCTAACTCGAGGTTTAATCCCC
1 TTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCA-TTTTCTAACTCGAGGTTTAATCCCC
3382351 A-CTGTC
65 ATC-GTC
* * * *
3382357 TTCATTTTCTGAGTCATGGTTTAATCCCGATCGTTTTTCATTTT
1 TTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATC-ATTTTCATTTT
3382401 TTGACTGGTG
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 20, Indels: 5
0.79 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
70 33 0.36
71 54 0.59
72 5 0.05
ACGTcount: A:0.18, C:0.19, G:0.12, T:0.51
Consensus pattern (70 bp):
TTCATTTTCTGACTCATGATTTAATCTCGATCATTTTCATTTTCTAACTCGAGGTTTAATCCCCA
TCGTC
Done.