Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167827.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_10, whole genome shotgun sequence
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Warning! 47000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 131
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1807 CATTTGAACA
*
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* *
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GGAATTTACTGGCTTCTTTTCC
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2259 AAGCATGAAG
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2296 ACGTAATGTA
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AT
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* *
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* *
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TCAAAAAAAAAAAAGTTTAAT
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4933 TAATTAGCCC
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1 CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT CT
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5001 TTTAAGAAGA
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CT
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1 TT
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TTCACTC
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19997 TCACTCTTCA
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20038 TATAATATTA
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CTCTTATTTTTTTTTT
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20842 AAGATAAATA
* *
20852 TTTAAAAATTATATATAAT
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20903 TTTCAAATTT
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TTTAAAAATTAAAAATAAT
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25979 GTTGGCAATG
* *
25989 AAAACAACATATACTTGAGTAATAC
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*
26014 AAAACAACATTTACATGAATAATA
1 AAAACAACATATACATGAATAATA
26038 TATATCAAAT
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AAAACAACATATACATGAATAATAC
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27251 GAGATTTTGG
*
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*
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1 ACTTGAAAATATCAAGCC
27297 ACT
1 ACT
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ACTTGAAAATATCAAGCC
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29542 CCTAAAACTA
*
29552 AAACTCTAAA-CCCCAAATCCTAAA-TTCG
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*
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*
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AAACCCTAAACCCCCAAATCCTAAATTTCG
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29613 ACCTTAAACC
*
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29696 AACTCAAACA
*
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36093 ATTTTTTTTG
*
36103 TTAATTATTTTAATATAAAAT
1 TTAATTATTTAAATATAAAAT
36124 TTAATATATTTAAATATAAAA-
1 TTAAT-TATTTAAATATAAAAT
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1 TTAATTATTT
36154 TACTTTTGTA
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36093 ATTTTTTTTG
36103 TTAATTATTTT-AATATAAAAT
1 TTAATTATTTTAAATATAAAAT
36124 TTAA-TATATTTAAATATAAAA-
1 TTAATTAT-TTTAAATATAAAAT
36145 -TAATTATTTTA
1 TTAATTATTTTA
36156 CTTTTGTAAA
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TTAATTATTTTAAATATAAAAT
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52166 AATAAGTTAA
52176 AATAATTATTGGTATTTT
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52209 AAAATTGTTA
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52213 TTGTTATGAT
* *
52223 TTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTA
1 TTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATAAAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTA
* * * *
52288 CTTT-TTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAA
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* * * * * *
52351 ATTCAAATAGTTATAATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTCTATT
127 GTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTATGTC
* * * * * ** *
52416 ATAAAAGAAGTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
192 AT-AAAGAATTGTTT-TATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAAAATT
*** * * * * * * *
52481 TTGAAAATTAATAAGTAAGTGGTTTAAAAAGTGAATTTGTTTACAAAATCAATTCAAATAATTAT
255 CAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTACAAAACCAATTCAAATAATTAA
** * *
52546 TGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACC
320 AACCATATCAACAATTATCTATTTCAAA-CATTATGACC
* * *
52585 TTTT-TTTTGGTCATATAACAATTGTTTT---TTCATACACGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTT-GTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATAAAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT
* * *
52646 AATTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA
63 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAACTA
* * * *
52711 GTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATTGTGTACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTATGTC
127 GTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTATGTC
* * * *
52776 ATGAAGCAATTATTGTTATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATATTAGTCTAACAAAATT
192 ATAAAG-AATTGTT-TTATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAAAATT
* ** *
52841 CAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAA-TAAATTTGTTTGCCGAACCAATTCAAATAGTTAA
255 CAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTACAAAACCAATTCAAATAATTAA
* * * *
52905 AACTATATGAACAATTTTCTATTTTAAA-ATGT-TGACC
320 AACCATATCAACAATTATCTATTTCAAACAT-TATGACC
* * * * *
52942 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAACTCATATAAGCTTATTAGGAATATAATAAAACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATAAAAGCTTATTA-AAATAAAATAATACTAA
* * * * *
53007 TTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAAAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACTAGT
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* * * * * * * *
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129 TCAAATAGTTATAATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTATGTCAT
* * * * * * ** * *
53134 AAAATAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA
194 -AAAGAATTG-TTTTATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAAAATTCA
* * * * * * *
53199 GAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGT-AAGTTGCTTAGC-AAACCATTTCAAATAGTTAT
257 AAAAATGAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTA-CAAAACCAATTCAAATAATTAA
* * * * ** * ** *
53261 GACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACT
320 AACCATATCAACAATTATCTATTTCAAA-CATTATGACC
* * * ** * * * * *
53300 TTTTGTTCTGTGATAAAATAA-TAGTTC--CT-ATATAAGCTTATTCAGATTAAAATAATA-AAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATAAAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAA
** * * * * * *
53360 TTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGA
65 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAACTAGT
* *** * * * * * * *
53424 TCAAATAGTCATGGCTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCATTATGACCCTTTGTTTTGTAAT
129 TCAAATAGTTATAATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTATGTCAT
* * * * ** * * * *
53488 AAAAAAATTATTTCAATTCACATAAGCGTATTC-AAATAAAATAATACTAAGTTGTTA-ATATTT
194 -AAAGAATTGTTT-TATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAA--TCTAACAAAATT
* * * * * * * * **
53551 C-AAAATTTAATAATTAA-AAATTAAAAAAATGAATTTATTTATCGAATAA--GTTTC-AATAAT
255 CAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTA-C-AA-AACCAATTCAAATAAT
** * * * * * * *
53611 TATGACTATTTGAAAAATTATC-ATTTGAAATCACTATAACC
317 TAAAACCATATCAACAATTATCTATTTCAAA-CATTATGACC
* * * * * ** *
53652 TTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTGTTTTGAATAAAATAATACA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTTTTTCAATTCATAAAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATACT
*
53717 AATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGT-AGAAGA-TTAAAAAATATATCTGTTTACCGAA
63 AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATA-ATTTGTTTACCGAA
* * * * * * * *
53778 CAAGTTCATATCA-TTATGACTATTTGAATAATT-TTTATTTCAAATTGTTATGA-CTGTTTGTT
124 CTAGTTCAAAT-AGTTATAATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCT-TTTGTT
* * * * * * * **
53840 TTATCATAAA-ATAATGTTTCTGATTGTATACTAGGCTAATTTC-ATAATTTAATAGATA-TAAT
187 ATGTCATAAAGA-ATTGTTT-T-ATT-CATA-TAAGTTTA-TTCGA-AATAAAATA-ATACTAAT
* ** * * * * * * * *
53902 TTATTAATATT------TTGATTAAGTAA-AAAATTAAAAA--AAA--TGTTTATCGAATA--AG
244 CTAACAAAATTCAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTA-C-AAAACCAA
* * * ** * * * * **
53954 TTCAAGTAGTTAAGATTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATCGTGACC
307 TTCAAATAATTAAAACCATATCAACAATTATCTATTTCAAA-CATTATGACC
* * * *
54006 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAA
* ** ** * *
54071 TTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AGAATAAGAGAATCAAAAAAATAAATCCGTTTACCAAACAA
65 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAG-ATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAACTA
* * * * * * * * *
54135 GTTTAAATAGTTATGAA-TATCTAAAAAATTATCTATTTCAAAA-CATTTTGACCTTTTGTTTTG
127 GTTCAAATAGTTAT-AATTATTTGAATAATTGTCTATTT-AAAATCGTTATAACCTTTTGTTATG
* ** * * * * **
54198 TCATAAAATAATTGGTTTTATTCATGCAAGCTAATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
190 TCAT-AAAGAATT-GTTTTATTCATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATCTAACAA
* * * * * * * * ** * *
54261 TATTCCAAAATTTAATAAGTGAA-A-TTTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAATTC-TTTCGAAT
251 AATTCAAAAAATGAATAACT-AAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTAC-AAAACCAATTCAAAT
** * * * * * *
54323 AATTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCTTTTATGACC
314 AATTAAAACCATATCAACAATTATCTATTTCAAA-C-ATTATGACC
* * * * * * *
54369 ATTTGTTTTGTCATAAACCAATTTGTTCCATTCA-AACAAGTTTATTTAGAATAAAATACTACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATAA-AAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * * *
54433 ATTTATTAATA-CTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCTATTTGCTG-AGTGA
64 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAACT-A
* * * * * * *
54496 GGTTCAAATAGTTTATGAA-TATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTATTTT
127 -GTTCAAATAG-TTAT-AATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTAT
* * * * * * * ** **
54560 ATCATTAAAACAATTGTTCTATTCAGACAAGTTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTATT
189 GTCA-T-AAAGAATTGTTTTATTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAAA
* * * * * * * *
54624 ATTCTAAAAAT-AATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTATC-GAA-CAAGTTCAAAT
252 ATTCAAAAAATGAATAACTAAG-AGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTA-CAAAACCAA-TTCAAAT
* * * * * * * * * * * *
54685 AGTCATATCTATTTGAACTATTATCTATTTTAAATTATTAAGACA
314 AATTAAAACCATATCAACAATTATCTATTTCAAA-CATTATGACC
* * * *
54730 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTC-TTTCCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATT-CATA-AAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT
*
54793 AATTTATTACA-ATTTAAAAAATTAATAAG
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54822 ACATTTAAAA
Statistics
Matches: 1747, Mismatches: 377, Indels: 226
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Matches are distributed among these distances:
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ATCAACAATTATCTATTTCAAACATTATGACC
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* * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * * **
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
** **
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65 ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
** * * * * * *
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130 AAAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTA-TGAC
* * * ** * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTT
* * * *
52612 T-TTCATACACGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTTAAAAATTAATAAGT
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * ** * * *
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* * * * **
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* * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-
* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
** * * * ** *
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* * * * * *
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** * * * * **
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * *
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65 ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
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130 AAAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAACT-AG-TTCAAATAGTTATGAC
* * *** * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTT
* * *** *
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* * * *
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* * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * * * ** * *
53861 GATTGTATACTAGGCTAATTTCATAATTTAATAGATA-TAATTTATTAATATTT------TGATT
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* * * * *
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* ** ** * **
53970 TATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATCGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCA
1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
** *
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* ** ** * * * *
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* * * *** * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
** * * * *
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* * * ** * ** * *
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* * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TT
** * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTT
* * * ** *
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** * * * * *
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* * * *
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1 TATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-
* * ** *
54758 TT-TCCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTACA-ATTTAAAAAATTAATAA
63 TTATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
54821 G----ACATTTAAAAACTAAATCTT-TTTATCAAAATAGTTCAAATAGTTATGAC
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* * * * *
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1 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* *** * ** * *
54934 GTTCATATAAGCTTATTTGGAGTAAAAT-ATACCTAAAATAATAATA-TTCTAAAACTTAATAAG
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* * * * *
54997 TAAGA-ATTTAAAAAATGAATATGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
128 TAAAAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
* *
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AAGATTTAAAAAATAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
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*
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*
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* *
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1 AATAATTATGACTATTAG
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1 AATAATTAT
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*
55036 AAATAGTTATGACTATTAGAATAATTAT-GTATTTCAA
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55110 A
1 A
55111 TCATTCTAGT
Statistics
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* *
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66 TGT
55215 TT
1 TT
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TGT
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* * * ** * * **
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* * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * **
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* ** * * *
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* *
55564 CATAAAATAATTATTTTTCA-TCATACAAG-ACTATTCGGTATAAAATAATACTAATTTATTATT
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* ** *
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63 ATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAACAAATCAGTTTACTAAATCAATTCAAATAATT
**
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128 ATGACTATTTGAAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATT
* *
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1 ATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCATATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATTATT
* * *
55811 TCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAA
66 TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAA
55841 ATAAATAATT
Statistics
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* *
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1 TCATAAAACATTTGTTTCTAT
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1 TCATA
56215 CAAGCTTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* * ** * *
55486 AGTTTATTGAATCGGTTCAAATAATTATGGTGATTTGAGTAATTATTTATTTTAAATCATTATGA
1 AGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGTGATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * **
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* * * *
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131 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGGAGATTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACCAA
* * *
55681 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATT
195 TTCAAATAGTTATGACTATCTGAAACAATTATATATTTCAAATTGTCATAACCTTTTGTTCTATC
* *
55746 ATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCATATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
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*
55934 AGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCT-ATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCATTATT
1 AGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGG-TGATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCATTATG
*
55998 ACCTTTAGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTTAAAT-ATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAAT
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* * *
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* *
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* * * *
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*
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56293 TGATTTGCTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACTTTAGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTTAATCATACAAGACTATTCGAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGGAGATTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACCAAT
TCAAATAGTTATGACTATCTGAAACAATTATATATTTCAAATTGTCATAACCTTTTGTTCTATCA
TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
CAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAGAAAAATAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCCTTTCCA
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* * ** * * * ** *
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* * * ** *
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* *
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* * * *
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* * * *
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* *
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1 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAAT-
* * * * * *
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* * * *
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* * *
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1 AAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAT
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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** ** * * * * * * *
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* * * *
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128 AACC-TTT-TTTTATCATAAAACAATT-ATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCG
* * * * * ** * * * *
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* * ** * * * *** **
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAT
* * * * ** * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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** *
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** * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * * * * **
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* *
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* * * * * * *
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** * * * *
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* * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* *
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59278 TTGAATCTAT
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CTTTTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCG
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57422 TGTTATGACC
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*
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*
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*
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* *
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Statistics
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TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
Found at i:58667 original size:192 final size:192
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** * * * *
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* * * *
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* **
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* * *
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* * *
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58668 TGTTATAACA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CAAATAGATATAACTATATGAACAATTATATACTTCAAATCAATTATTTAAAAAATAAACTT
Found at i:60159 original size:180 final size:178
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59304 AATAATTACA
* * * * * * **
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** *
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* * * *
59441 AAGTAAAAAATTTAAATAATAAATCTGTTTACTGAACATGTTTAAATCA-TTATG
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* * * * *
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* * * * * * *
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** * * ** * *
59624 GTAAAAGATTTAAAAAGCAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATG
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
59805 GTAAGAGAATTAAAAAAATCAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATT
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** *
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** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * * *
60217 ATTGTTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGGTTGGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
60282 CTATTCATACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTGATAG
66 CTATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA
** * * ** * *
60346 GTTTGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATG
129 G-TAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATG
* * *** * * * * * * *
60398 TCCATTTGAGTTATTATCTATTTTAAAACATTATGACATTTTGTTTTATCATAAGACAATTATTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** *
60463 CTACTCATACAAAATTATTCA-AATAAAATAATACAAATTTA-TAACTATTTCAAAAATTAATAA
66 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TA-TTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
60526 G----GATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAG
129 GTAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
60572 ACTGTTAGAATAATTA-CGTATTTCAAATCATTTTAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTT
1 ACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
60636 TCAATTCATACATGCTTATTAAAAATATACTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAATTTAATAA
65 TCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA-TTAATAA
* * * *
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129 GTAA-AAA-TTT-AAAAAATAAATTTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
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66 CTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* * ** * * * *
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127 AAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-GAA-CAGTTCAAATAGTTATG
* * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
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66 CT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAA
* * * *
61065 G--------T----AAGAGA-TTA--TACCGAACCAGTTCAAATAGTAATG
129 GTAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
61165 CTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAAC
66 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAG
* * * * *
61230 TAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTT-GTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAG
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* * * * * ** * *
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1 ACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
61344 T-TAGTTCTTA-ATAACTTATTC-GAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAATTTA
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* * * *
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* * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * ** *
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* *
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* * * * * * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * ** * * *
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* * * * * * * * *
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130 TAA-AAATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTGAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
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* * * * *
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** ** * *
62000 ACTAACTGAACAATTATCTATTTTCAAA-CACTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
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* *
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* * *
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1 A-CTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
62243 TTTTGTTCATACAAGCTTAATCTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
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* ** ** *
62307 AAGCAAAAATTTAAAAAATAAATCAATTTTTTAAACATGTTCAAATAG----G
127 AAGTAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAACA-GTTCAAATAGTTATG
* * * * *
62356 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGGTTTGTCATAAATCATTTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
62421 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCCACAAATTAATAAG
66 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAG
* * * *
62486 TAAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAACTAAGCTCAAATAGTTAT-
130 TAAA-AATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC--AGTTCAAATAGTTATG
* * * **
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1 ACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
62600 TCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAGTTTTTTAATATT-ATACAAGTTAATA
65 TCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-A-AAATTAATA
* * * * * *
62664 GGTAGGATATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATG
128 AGTA-AAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
62782 CTATTCATAC-AG--AATT--TAA-AAATTAATACTAATCTATTAGTATTTTAAAAATTAAT-A-
66 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
62839 T-GAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACTGAATCAATTCAAATAGTTATG
130 TAAAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAA-CAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
62952 CTTTTCATACAAGCATATTTAGATTAAAATA
66 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
62983 TTCTAAAAAT
Statistics
Matches: 2783, Mismatches: 554, Indels: 307
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Matches are distributed among these distances:
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172 2 0.00
173 6 0.00
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Found at i:60989 original size:719 final size:710
Alignment explanation
Indices: 59314--63813 Score: 2961
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
59825 AATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTAATTGAACT-ATTATCTATTTCAAAACAT
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* * *** * *
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* ** *
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* * *
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* * * ** * * *
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* * *
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* * * * *
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128 AAGTTAGAAA--TTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAATCAGTT-AAATAATTATGACTATTTA
* * * * *
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189 AACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * ***
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253 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT-ATAAGTAAAAGAT
* * * ***
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317 TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * **
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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60743 CAAATAGTTATG
699 CAAATAGTTATG
* * *
60755 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTCTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
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* ** * * *
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* *
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* * * * *
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257 GCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTATAAGTAAAAGATTTAA
* * * ** * * *
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321 AAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
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386 ATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAA
* * * ** *
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** * * * * *
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* ** * * * * * * ** *
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569 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAT-GCTTATTTAAAATAAAATAATACT-
* * * *
61381 AATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTGCCGAACT
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*
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* * * * *
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** * ** *
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65 TCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-ATCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
61716 TATTATTCATAAT-AAATAATGCTAATTTATTAATATTCT-AAAATTCAATAAGTAACAGATTGA
257 GCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT--ATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * * * *
61779 AAAAATGAATTTGTTGACCTTACTAA-TGCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTC
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
62037 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTAA-TCATACAAGGC-TATTTCAAATAAAATTATACA
569 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AATTCATAC-ATGCTTATTTAAAATAAAATAATACT
* *
62100 AATTTATTAATATTCAGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAGAAAATAAATCTT-TTTACTGAAT
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62163 AAGTTCAAATAGTTAT-
694 AAGTTCAAATAGTTATG
* *
62179 ATCTATTT-ATGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGT
1 A-CTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * * *
62243 TTTTGTTCATACAAGCTTAATCTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
64 TTCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * *
62308 AG-CAAAAATTTAAAAAATAAATCAATTTTTTAAA-CATGTT-CA-AA-TAGGACTATTTGAACA
129 AGTTAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCA-GTTAAATAATTATGACTATTTAAACA
* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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** * * *
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448 AAAATAATAC-AAATTTATAATATT-TCAAAAATTAAGTA---AGG--ATTT-AAAAATAAATCT
* ** * * * ** *
62689 ATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATTGTTATGAC
505 GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * * *
62754 ATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGCTTCTATTCATACA-G--AATTT--AA-AAATTAATACTA
569 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTTAAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
62813 ATCTATTAGTATTTTAAAAATTAAT-A-T--GAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACTGAATCAA
633 ATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAAT-AA
62874 -TTCAAATAGTTATG
696 GTTCAAATAGTTATG
* * * * *
62888 ACTATTTGAACAATTATCTATGTCAAATCATTATAATC-TATATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * *
62952 CTTTTCATACAAGCATATT-----T-AGAT--TA--AA---A-T-AT-TCT-AAAAATTAATAAG
66 CAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
63000 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTGTTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAA
131 TTAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAGTT-AAATAATTATGACTATTTA-AACAA
* * * * * * * * *
63064 TTATGTATTTCAAAT-TGTTTGACCTTCTATGTAGTCATAAAACAATT-ATTTTAGTGCATACAA
194 TTATCTATTTCAAATAT-TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAA
** ** * * *
63127 TATTATTCGAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAACA-T-TAAAAATTTAATAAGTAAGAGACTT
257 GCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAA-TT-ATAAGTAAAAGA-TT
* * * * * ** * * * * * *
63189 AAAAAAATAATTTTGTTTGCTAAACCA-TTCAAATAATTATGATTATTTAAATAATTATTTATTT
318 TAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
63253 TAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGAA
383 CAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAA
* * * * * * *
63318 ATAAAGTAATATTAATAGTAATATTAAT-TTATTAAAATTTGAAAAGTAATAAGCCATTCAAAAA
446 ATAAAATAATA-CAA-A-T-TTA-TAATATT-TCAAAAATT---AAG---TAAG-GATT-TAAAA
* * ** * ** *
63382 ATAAATCTATTTACCAAATCAA-TTCAGTTAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAAT
497 ATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * ** * * *** * * * *
63446 CATTATGAGCATTTACTTTATCACAAAACAATTGTTTTTGTTCACACA-GTTTTATTCAGAATAA
560 CATTAT-AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACATG-CTTATTTAAAATAA
** * * ** * * ** ***
63510 TGTAATGCTAATTTATTAGTATTTTGAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAGAAAATGTATCCGTT
623 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-GAAATTTAAAAAATAAATTTATT
** * * *
63574 GGCTTGACT-AGTTAAAACAGTTATG
686 TAC-TGAATAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
63599 ACTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAGTCATTATAACCATTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * * * *
63664 CTA-TTTGTACAAGCTTATTC-GAAATAACATAAT-TCTAGTTTATTAATAGTCCAAAAATTAAT
66 C-AGTTCATATAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATC-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * *
63726 AAGTAAGATATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
128 AAGTTAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATC-AGTT-AAATAATTATGACTATTTAAA
63790 CAATTATCTATTTCAAACTATTAT
191 CAATTATCTATTTCAAA-TATTAT
63814 ACCCTTTTGT
Statistics
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731 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (710 bp):
ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
CAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
TTAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAGTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATT
ATCTATTTCAAATATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTT
ATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
AAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
TATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAAT
ACAAATTTATAATATTTCAAAAATTAAGTAAGGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
CAAATAGTTATGACTATTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTGTTTTGTCATAAA
ACAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAA
ATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATG
Found at i:61214 original size:164 final size:165
Alignment explanation
Indices: 60919--61228 Score: 401
Period size: 164 Copynumber: 1.9 Consensus size: 165
60909 TTTATCAAAT
* * * *
60919 CAGTTAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTG
1 CAGTTAAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAACCTTTGTTATG
* * * * * * *
60984 TCATAACACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTAGTAATA
66 TCAAAAAACAATTATTTCTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA
*
61049 TT-TCATAAATTAATAAGTAAGAGATTATACCGAAC
131 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTATACCGAAC
* * * **
61084 CAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGGACAATTATATATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTGTTATG
1 CAGTTAAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAACCTTTGTTATG
* **
61148 TCAAAAAATAATTATTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAAT
66 TCAAAAAACAATTATTTCTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAAT
61212 ATTCTAAAAATTAATAA
130 ATTCTAAAAATTAATAA
61229 CTAAAAAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CAGTTAAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAACCTTTGTTATG
TCAAAAAACAATTATTTCTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA
TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTATACCGAAC
Found at i:63242 original size:18 final size:17
Alignment explanation
Indices: 63219--63264 Score: 58
Period size: 17 Copynumber: 2.6 Consensus size: 17
63209 TAAACCATTC
63219 AAATAATTATGATTA-TTT
1 AAATAATTAT--TTATTTT
63237 AAATAATTATTTATTTT
1 AAATAATTATTTATTTT
*
63254 AAATCATTATT
1 AAATAATTATT
63265 ACCTTTTGTT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
16 3 0.12
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Consensus pattern (17 bp):
AAATAATTATTTATTTT
Found at i:63708 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 63411--63814 Score: 408
Period size: 181 Copynumber: 2.2 Consensus size: 181
63401 CAATTCAGTT
* * * *
63411 AGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGAGCATTTACTTTATCACAAAACA
1 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTTACTTTATCACAAAACA
* ** * * ***
63476 ATTGTTTTTGTTCACACAGTTTTATTCAGAATAATGTAATGCTAATTTATTAGTATTTTGAAAAT
66 ATTGTTTTTGTTCACACAGTCTTATTCAGAATAACATAATGCTAATTTATTAATAGTCCAAAAAT
* * * * *
63541 TAATAAGTAATG-GATTTAGAAAATGTATCCGTTGGCTTG-ACTAGTTAAAAC
131 TAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATGAATCCGTT-GATCGAACAAGTTAAAAC
* * * * ** *
63592 AGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTTAAGTCATTATAACCATTTGTTTTGTCACAAAACA
1 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTTACTTTATCACAAAACA
* * *
63657 ATTGTTTCTAT-TTGTACA-AG-CTTATTC-GAAATAACATAATTCTAGTTTATTAATAGTCCAA
66 ATTGTTT-T-TGTT-CACACAGTCTTATTCAG-AATAACATAATGCTAATTTATTAATAGTCCAA
* * * * *
63718 AAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
127 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCCGTTGATCGAACAAGTTAAAAC
63773 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-CTATTATA
1 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATA
63815 CCCTTTTGTC
Statistics
Matches: 180, Mismatches: 36, Indels: 14
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
180 5 0.03
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ACGTcount: A:0.38, C:0.11, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTTACTTTATCACAAAACA
ATTGTTTTTGTTCACACAGTCTTATTCAGAATAACATAATGCTAATTTATTAATAGTCCAAAAAT
TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCCGTTGATCGAACAAGTTAAAAC
Found at i:64408 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 63880--65919 Score: 1480
Period size: 181 Copynumber: 11.4 Consensus size: 178
63870 TTGTTTGCTA
* * * * * * **
63880 AATAAGTTCAAATAGTTATGTCTTTTTAAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-CTATTTGT
1 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGT
* * * *
63944 TTTGTCATAAAA-TAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATATTATTAATTTA
65 TTTGTCATAAAACT-ATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTA
* * **
64007 TTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATATGTTTATC-
128 TTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTA-CG
* * * * * * *
64060 ATATAAGTTTAAATAATAATAACTATTTGGATAATTATCGATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGT
1 A-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * * * *
64124 TCTATCATAAAACAATTGTATTAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAACAATATTAACTTATT
65 TTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
64189 AATATTTCAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTATCG
130 AATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTA-CG
* * *
64242 AATAAGTTCAAATAGTTATCACTAATTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
1 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** * * *
64307 TTGTCATAAAACTATTGTTTTTGGTTCTTAAAAGCTTATTTTGACTAAAGTAATA-TAAATTTAC
66 TTGTCATAAAACTATTGTTTTT-ATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * *
64371 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATCAATATGTTTTCT
129 TAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACG
*
64422 AA-ACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
1 AATA-A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * ** *
64486 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAAT-ATTTAT
64 TTTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
64550 TAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATTGGTTTACC
129 TAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-GTTTACG
* * * * **
64601 AAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACTATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGT
1 AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
64666 TTTCTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTA
65 TTTGTCATAAAACT-ATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTA
* * *
64729 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTA
128 TTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTAC-G
* * * * * * * * * * *
64783 AACAAATTCCAATAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCGATTTTAAATCATTATGACATTTTGTT
1 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * *
64848 TTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTCATACAAA-ATTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTAT
66 TTGTCATAAAACT-ATTGTTTTTATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
64911 TAGTATTTCAAAAATT--TTA--AAAAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTACC
129 TAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACG
* * * * * *
64959 AAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCAATATGATC-TTTG
1 AATA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* ** * * * * * * * *
65023 TTTTGTCATAAAAC-ATTGTTTCTATTTGTACAATCTTATTCGGAGTAAAATATTACAAAACTGA
64 TTTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC-TAATTTA
* *
65087 -TAATATTCTAAAAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTACTG
128 TTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTAC-G
** * * * * * *
65140 AACCAGTTCAACTAGTTAGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTT
1 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * ** * * * *
65205 TAGTTATCAAA-TAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCCA-AATAAAATAATAGTATTTTAT
66 TTGTCATAAAACT-ATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
65268 TAATGTTTAGCAAATTAATAAG-CAAGGAATTTAAGAAAACAAATTTGTTTACG
129 TAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAA-AAAATAAA-TTGTTTACG
* * * * * *
65321 AAACAAATTTAAATAGTTATGCCTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
1 -AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * ** * * *
65386 TTTATCATAAAGCAATTGTTTTCGTTTATAAAAGCTTATCCAGAA-ATAAATAATACTACTTTAT
65 TTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACTAATTTAT
* * * * *
65450 TAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGAATTAAAAAATAAATTAGTTTATCA
129 TAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-GTTTA-CG
* * * ** *
65503 AATTAGTTCGAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTT
1 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
65568 TTGTCATAAAACAATTATTTTTCA-TCTTACAAA-CCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
66 TTGTCATAAAACTATTGTTTTT-ATTCATA-AAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
65631 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT-----AT---TTGTTCACTG
129 TAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTAC-G
** * * * * * *
65674 AACCAGTTCAAAAAGTTCTGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGA-TATAACCATTTGT
1 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGT
* * * * ** * * * * *
65738 TTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACCAGCGTATTC-GAA-ATAAATAATACCAGTCTAA
65 TTTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
65801 TAATAATATGAAAATTAATAACTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTG
129 TAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTAC-G
* * * * * * * * *
65854 AA-ACAATTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGGCTTTTTGT
1 AATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
65918 TT
65 TT
65920 AAATAAGTTC
Statistics
Matches: 1484, Mismatches: 296, Indels: 160
0.76 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 40 0.03
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172 3 0.00
175 4 0.00
176 49 0.03
177 45 0.03
178 48 0.03
179 202 0.14
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184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
TTGTCATAAAACTATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
ATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACG
Found at i:65184 original size:538 final size:533
Alignment explanation
Indices: 64081--65580 Score: 1495
Period size: 538 Copynumber: 2.8 Consensus size: 533
64071 AATAATAATA
* * * * *
64081 ACTATTTGGATAATTATCGATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTATT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGT-TT
* * * * * *
64146 -AATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAACAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATTAG
65 CAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
64210 TAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTA-TCGAATAAGTTCAAATAGTTAT-CACTAATTGAAC
129 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACT-AAACAAATTCAAATAGTTATGC-C-ATTTGAAC
* * * * *
64273 AATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACT-ATTGTTTTTGGTTCTTA
190 TATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCT--TTCATA
* * *
64337 AAAGCTTATTTTG-ACTAAAGTAATA-TAAATTTACTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAA-A
252 AAAGCTTATTTAGAAC-AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-TAAAGA
*
64398 GTTTAAAAAATCAATATGTTT-TCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
313 -TTTAAAAAATAAAT-TGTTTATC-AAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* *
64461 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAT
374 TATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAT
* * * * * *
64526 TTGGAATAAAATAATAATATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAATAAA
438 TCGGAATAAAATAACAAAACTGATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTAAAAAATAAA
* ** *
64591 TTGGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATG
503 TTGGTCTACCAAGCCAGTTCAAATAGTTAGG
* * *
64622 ACTATTTA-AACT-ATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGT
1 ACTA-TTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGT
* * **
64685 TTCTATTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
63 TTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATA
* * * *
64750 AGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCCAATAGTCATGTCCATTTAAACT
127 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTATG-CCATTTGAACT
* * *
64815 ATTATCGATTTTAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA
191 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-TTCATA-AA
* * *
64880 A-ATTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAATT-TTAA-AAAGATTTAAA
254 AGCTTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAAGATTTAAA
* * * * *
64942 AACTAAATCTGTTTACCAAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAA
319 AAATAAAT-TGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * ** * * *
65007 ATCAATATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACATTGTTTCTATTTGTACAATCTTATTCGGAGTAA
382 ATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAATAA
*
65071 AATATTACAAAACTGA-TAATA-TTCTAAAAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAA-TGT
447 AATA--ACAAAACTGATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGCAAA-AGA-TTAAAAAATAAATTG-
* *
65132 GTCTACTGAA-CCAGTTCAACTAGTTAGG
506 GTCTAC-CAAGCCAGTTCAAATAGTTAGG
* * * *
65160 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTG-TTTAGTTATCAAATAATTGTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTT
* * * * * *
65224 TCAATTCATACATGCTTATTCCAAATAAAATAATAGTATTTTATTAATGTTTAGCAAATTAATAA
64 TCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAA
* * * *
65289 GCAAG-GAATTTAAGAAAACAAATTTGTTTACGAAACAAATTTAAATAGTTATGCCTATTTGAA-
128 GTAAGAG-ATTTAA-AAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTATGCC-ATTTGAAC
* **
65352 TAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAGCAATTGTTTTCGTTT-ATA
190 T-ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTC-TTTCATA
** * * * *
65416 AAAGCTTATCCAGAA-ATAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGAA
252 AAAGCTTATTTAGAACA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--TAAAGAT
** * *
65480 TTAAAAAATAAATTAGTTTATCAAATTAGTTCGAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATT
314 TTAAAAAATAAATT-GTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
**
65545 TCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACA
378 TCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACA
65581 ATTATTTTTC
Statistics
Matches: 794, Mismatches: 124, Indels: 80
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
536 38 0.05
537 70 0.09
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539 131 0.16
540 47 0.06
541 123 0.15
542 137 0.17
543 43 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (533 bp):
ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTC
AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTA
AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAATTCAAATAGTTATGCCATTTGAACTATTAT
CTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTTTCATAAAAGCTTAT
TTAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAAGATTTAAAAAATAAA
TTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
AACTTTTGTTTTGTCATAAAACATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAACAAA
ACTGATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTAAAAAATAAATTGGTCTACCAAGCCAGT
TCAAATAGTTAGG
Found at i:65323 original size:18 final size:17
Alignment explanation
Indices: 65297--65330 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
65287 AAGCAAGGAA
65297 TTTAAGAAAACAAATTTG
1 TTTAAG-AAACAAATTTG
*
65315 TTTACGAAACAAATTT
1 TTTAAGAAACAAATTT
65331 AAATAGTTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
17 10 0.67
18 5 0.33
ACGTcount: A:0.47, C:0.09, G:0.09, T:0.35
Consensus pattern (17 bp):
TTTAAGAAACAAATTTG
Found at i:65465 original size:720 final size:719
Alignment explanation
Indices: 63865--65647 Score: 1886
Period size: 720 Copynumber: 2.5 Consensus size: 719
63855 AAGCTTATTT
* * * * * **
63865 CAAATTTGTTTGCTAAATAAGTTCAAATAGTTATGTCTTTTTAAATAATTATTTATTTTAAATTG
1 CAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCA
* * * *
63930 TTATGACTATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAA
66 TTATGACT-TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTCGTTTATACAAGCTTA-TCAGAAATAAAA
* * ** * * * ** *
63994 TATTATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATATGTTTAT
129 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT
* * * * *
64059 CATATAAGTTTAAATAATAATAACTATTTGGA-TAATTATCGATTTCAAATCATTATGAC-TTTT
194 CAAATAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACT-ATTATCGATTTCAAATCATTATGACATTTT
* * * * ** * * * * *
64122 GTTCTATCATAAAACAATTGTATTAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAACAATATTAACTTA
258 GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTATTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
64187 TTAATATTTCAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAATGAATCTATTTATCGAATAAGTTCA
322 TTAATATTTCAAAAATT-ATTAG-AAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAAAGTTCA
* *
64252 AATAGTTATCACTAATTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
385 AATAGTTATCACTAATTAAACAATTATCTATCTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * ** * * * *
64317 ACTATTGTTTTTGGTTCTTAAAAGCTTATTTTGACTAAAGTAATATAAATTTACTAATATTCTAA
450 ACTATTGTTTCTGATTCTTAAAAGCTTATTCGGACTAAAATAATAAAAACTGACTAATATTCTAA
* * * * *
64382 AAATTAATAAGTAAAAGTTTAAAAAATCAATATGTTTTCTAAACACATTCAAATAGTTATGACTA
515 AAATTAATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTCTACTAAACACATTCAAATAGTTAGGACTA
* * *
64447 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTAT
580 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAACCAATTGTTTCAAT
*** *
64512 TCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
645 TCATAAAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAATATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAA
64577 GATTAAAAAA
710 GATTAAAAAA
* * * * *
64587 TAAATTGGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACT-ATTATTTATTTCAAATC
1 CAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAA-TAATTATTTATTTAAAATC
* * * **
64651 ATTATGATTTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTG-TTTCTATTTATACAAGCTTATTTGAAATAAA
65 ATTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTC-GTTTATACAAGCTTATCAGAAATAAA
64715 ATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
128 ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
* * * * * * * *
64779 A-CTAAACAAATTCCAATAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCGATTTTAAATCATTATGACATT
192 ATC-AAATAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACTATTATCGATTTCAAATCATTATGACATT
* * *
64843 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAACAAAATAATACTAATT
256 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATT
* * *
64908 TATTAGTATTTCAAAAATT-TTA-AAAAGATTT-AAAAACTAAATCTGTTTA-CCAAAACCAGTT
320 TATTAATATTTCAAAAATTATTAGAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAA--AGTT
* * * * * *
64969 TAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCAATATGATC-TTTGTTTTGTCATA
383 CAAATAGTTATCACTAATTAAACAATTATCTATCTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
65033 AAAC-ATTGTTTCT-ATT-TGTACAATCTTATTCGGAGTAAAATATTACAAAACTGA-TAATATT
448 AAACTATTGTTTCTGATTCT-TAAAAGCTTATTCGGACTAAAATAATA-AAAACTGACTAATATT
* * *
65094 CTAAAAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTCTACTGAAC-CAGTTCAACTAGTT
511 CTAAAAATTAATAAGCAAA-AG-TTTAAAAAATAAATATGTCTACTAAACACA-TTCAAATAGTT
* * * * *
65157 AGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTTATCAAA-TAATT
573 AGGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAACCAATT
* * * ** *
65221 GTTTCAATTCATACATGCTTATTCCAAATAAAATAATAGTATTTTATTAATGTTT-AGCAAATTA
637 GTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAATA-TTTATTAAAATTTCA-AAAATTA
*
65285 ATAAGCAAGGAA-TTTAAGAAAA
700 ATAAGCAA--AAGATTAA-AAAA
* * * * * * *
65307 CAAATTTGTTTACGAAACAAATTTAAATAGTTATGCCTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCA
1 CAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCA
** *
65372 TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAGCAATTGTTTTCGTTTATAAAAGCTTATCCAGAAAT-AAA
66 TTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTCGTTTATACAAGCTTAT-CAGAAATAAAA
* * * *
65436 TAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGAATTAAAAAATAAATTAGTTTAT
129 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT
* * * * * * **
65501 CAAATTAGTTCGAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-ACTTTT
194 CAAATAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACTATTATCGATTTCAAATCATTATGACA-TTTT
* * *
65565 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TCATCTTACAAACCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT
258 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT
*
65629 ATTAATATTTTAAAAATTA
321 ATTAATATTTCAAAAATTA
65648 ATAAGTAAGA
Statistics
Matches: 874, Mismatches: 156, Indels: 63
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
715 4 0.00
716 47 0.05
717 136 0.16
718 61 0.07
719 61 0.07
720 275 0.31
721 23 0.03
722 196 0.22
723 71 0.08
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (719 bp):
CAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCA
TTATGACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTCGTTTATACAAGCTTATCAGAAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCA
AATAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACTATTATCGATTTCAAATCATTATGACATTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
TATTTCAAAAATTATTAGAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCCAAAAAGTTCAAATAGT
TATCACTAATTAAACAATTATCTATCTCAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACTATT
GTTTCTGATTCTTAAAAGCTTATTCGGACTAAAATAATAAAAACTGACTAATATTCTAAAAATTA
ATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTCTACTAAACACATTCAAATAGTTAGGACTATTAGAA
CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAACCAATTGTTTCAATTCATAA
AAGCTTATTCCAAATAAAATAATAATATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTAA
AAAA
Found at i:65545 original size:363 final size:363
Alignment explanation
Indices: 63865--65920 Score: 1625
Period size: 363 Copynumber: 5.7 Consensus size: 363
63855 AAGCTTATTT
* * * * * * **
63865 CAAATTTGTTTGCTAAATAAGTTCAAATAGTTATGTCTTTTTAAATAATTATTTATTTTAAATTG
1 CAAATTTGTTTACGAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
63930 TTATGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAA
66 TTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCGTTTATACAAGCTTATTCAGAAATAAA
* * * * * * **
63993 ATATTATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAA-TATGTTT
130 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTT
* * * * * * * * *
64057 ATC-ATATAAGTTTAAATAATAATAACTATTTGGATAATTATCGATTTCAAATCATTATGA-CTT
194 ATCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * *
64120 TTGTTCTA-TCATAAAACAATTGTATT-AATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAACAATATTAA
259 TTGTT-TAGTCATAAAACAATTGT-TTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAA
* *
64183 CTTATTAATATTTCAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAA
322 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAA
* * * * * * *
64226 -ATGAATCTATTTATCG-AATAAGTTCAAATAGTTATCACTAATTGAACAATTATCTATCTCAAA
1 CA--AATTTGTTTA-CGAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAA
* * * ** *
64289 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTGTTTTTGGTTCT-TAAAAGCTTATTTTG-AC
63 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCGTT-TATACAAGCTTATTCAGAAA
* * * *
64352 TAAAGTAATA-TAAATTTACTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATCAA-TA
126 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA
64414 TGTTT-TCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
190 -GTTTATCTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * ***
64477 GACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
253 GACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* *
64542 AT-ATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTAAAAAA
318 ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-TTTAAAAAA
* * * * * *
64587 TAAATTGGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACT-ATTATTTATTTCAAATC
1 CAAATTTGTTTACGAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAA-TAATTATCTATTTCAAATC
** * * * *
64651 ATTATGATTTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTG-TTTCTATTTATACAAGCTTATT-TGAAATAA
65 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-GTTTATACAAGCTTATTCAGAAATAA
* *
64714 AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
129 AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTT
* * * * * * * * * *
64779 A-CTAAACAAATTCCAATAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCGATTTTAAATCATTATGACATT
194 ATCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * ** * * * *
64843 TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAACAAAATAATACTAATT
259 TTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATT
* * *
64908 TATTAGTATTTCAAAAATT-TTAA-AAAG-ATTT-AAAAA
324 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAA
* * * * *
64944 CTAAATCTGTTTACCAAA-ACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAA
1 C-AAATTTGTTTACGAAATA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
65008 TCAATATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTG-TTTCTATTTGTACAATCTTATTC-GGAGT
63 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-GTTTATACAAGCTTATTCAGAAAT
* * * * **
65069 AAAATATTACAAAACTGA-TAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-
127 AAAATAATAC-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TA
* * * * * * * * *
65132 GTCTA-CTGAACCAGTTCAACTAGTTAGGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGA
190 GTTTATCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * *
65196 CCTTTTGTTTAGTTATCAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCCAAATAAAATAATAGT
255 CCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAAT
* * * *
65261 ATTTTATTAATGTTT-AGCAAATTAATAAGCAAGGAATTTAAGAAAA
320 AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-GAATTTAA-AAAA
* * * * * *
65307 CAAATTTGTTTACGAAACAAATTTAAATAGTTATGCCTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCA
1 CAAATTTGTTTACGAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
65372 TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAGCAATTGTTTTCGTTTATAAAAGCTTATCCAGAAAT-AAA
66 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCGTTTATACAAGCTTATTCAGAAATAAAA
* * * *
65436 TAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGATAAGTTAGAGAATTAAAAAATAAATTAGTTTA
131 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTA
** * * ** *
65500 TC-AAATTAGTTCGAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTT
195 TCTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * * * * * *
65564 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTC-A-TCTTACAAACCTATTTAGAATAAAATAATACTAAT
260 TGTTTAGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAAT
*
65627 TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT------
323 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAA
* ** * * * * *
65662 ---ATTTGTTCACTG-AACCAGTTCAAAAAGTTCTGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATT
1 CAAATTTGTTTAC-GAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAA-T
* * * * * * *
65723 GA-TATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTAT-GTTCATACCAGCGTATTC-GAAAT-
64 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TCGTTTATACAAGCTTATTCAGAAATA
* * * * * * * * * * * *
65784 AAATAATACCAGTCTAATAATAATATGAAAATTAATAACTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTT
128 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTT
* * * * * * * *
65849 T-TCTGAAACAA-TTTAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGGCT
193 TATCT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
65912 TTTTGTTTA
257 TTTTGTTTA
65921 AATAAGTTCG
Statistics
Matches: 1365, Mismatches: 270, Indels: 130
0.77 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
350 2 0.00
351 106 0.08
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353 4 0.00
356 1 0.00
357 196 0.14
358 45 0.03
359 109 0.08
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361 83 0.06
362 209 0.15
363 297 0.22
364 11 0.01
365 5 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (363 bp):
CAAATTTGTTTACGAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCGTTTATACAAGCTTATTCAGAAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAT
CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
GTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTA
TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAA
Found at i:66923 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 66350--67428 Score: 877
Period size: 181 Copynumber: 6.0 Consensus size: 182
66340 AATTGTTTAT
* * * * * **
66350 CAAATAAACTTGTATGAGCTACAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAACAATTTTG
1 CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGA-TTTG
* * * * ** * *
66415 AAATAAATAATTTGTTCATATAGTCTA-AACTGCTTGAAC-GGTTCCAGTAAA-TGGATTTATTT
64 AAATAGATAA-TTGTTCAAATTG-CTATAATTATTTGAACTGGTT-TAGTAAACTAGATTTATTT
* * * * *
66477 TTAAAATCTCTTAGC-TATTAATTTTTGAAATTTTACTAAATTAGCATTATTTCATTC
126 TTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * **
66534 CAAATAAGCTTGTATG-AGTAGAAACAATTATTTTACGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGA
1 CAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * *
66598 AATAGATAATTGTTCAAATATTC-ATAACTATTTGAACTGGTTTAATAAAC-ATATTTATTTTTT
65 AATAGATAATTGTTCAAAT-TGCTATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACTAGATTTATTTTTT
* * * *
66661 AAA--TC-TGC-TATTAATTCTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTT
129 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** **** * *
66711 TGAATAAGCTTGTATGTTGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAA
1 CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * *
66776 ATAGGTAGTTGTTCAAATTGCTGTAATTATTTGAATTGATTTAGTAAACT-GATTTATTTTTTAA
66 ATAGATAATTGTTCAAATTGCTATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACTAGATTTATTTTTTAA
* *
66840 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT
131 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * *
66892 TGAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAA
1 CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * *
66957 ATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTAAACTTGTTTAATAAA-TAGATTT-TTTTTTC
66 ATAGATAATTGTTCAAATTGCT-ATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACTAGATTTATTTTTT-
* * *
67019 AACTATCTTACTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
129 AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * * *
67073 CAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATCACTAAACAAAATGTC-TGAATAATTTCA
1 CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGA
* * *** * * * *
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65 AATAGATAATTGTTCAAATTGCTATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACTAGATTTATTTTTTA
* * *
67201 AA--TC-T-CGTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGAATTATTTTCA-TC
130 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTC
* * * *
67250 CAAATAAGCTTGTATGATC-ATAAACAATTGTTTTATAAGAAAACAAATA--TCCTAATGATTT-
1 CAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTG
* * * * * * * *
67311 AAGATTGATATTTGTTCAAATAAT-C-ATAATAATTTGACCTGGTTTA-AAAAATAGCTTTAGTT
64 AA-ATAGATAATTGTTCAAAT--TGCTATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACTAGATTTATTT
* * * ** *
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67429 TTAGATAAGT
Statistics
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CAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
ATAGATAATTGTTCAAATTGCTATAATTATTTGAACTGGTTTAGTAAACTAGATTTATTTTTTAA
ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
Found at i:67195 original size:539 final size:539
Alignment explanation
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66342 TTGTTTATCA
* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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196 ATGACTAGAAACAATTATTATACGATAGAACAAAAGGTTAGAACAATTTCAAATAGATAATTATT
* *
66612 CAAATATTCATAACTATTTGAACTGGTTTAATAAACATATTTATTTTTTAAATCT-GCTATTAAT
261 CAAATATTCATAACTATTTGAACTGGTTTAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCG-TATTAAT
* *** * * *
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* * *
66740 GTTTTATGACAAAACAAA-AGGTAATAATGATTTGAA-ATAGGTAGTTGTTCAAAT-TGCTGTAA
389 GTTTTATAACAAAACAAATA--TAATAATGATTT-AAGATAGATAGTTGTTCAAATAT-C-ATAA
* * * * * * **
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449 TAATTTGAACTGATTTA-AAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATGTTCAAAAT
66866 ATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTT
513 ATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTT
**
66893 GAATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTT-A
1 -AATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAACAATTTTGA
* * * * *
66956 AATAGATAA-TTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTAAACTTGTT-TAATAAATAGATTTTTTTTT
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* * * *
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128 AAAATATCTTAGC-TATTAA-TTTTTGAAATGTTAATAAATTAGCATTATTTCATTCCAAATAAG
* *
67081 CTTGTATGAACT-GAAACAATTATTATATC-ACTA-AACAAAATGTCT-GAATAATTTCAAATAG
191 CTTGTATG-ACTAGAAACAATTATTATA-CGA-TAGAACAAAAGGT-TAGAACAATTTCAAATAG
* * * * *
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* * * *
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* ** * *
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381 AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAATATAATAATGATTTAAGATAGATAGTTGTTCAAAT-ATC
* * * * *
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67401 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTT
510 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTT
* *
67431 AGATAAGTTTTTATAAACTA
1 A-ATAAGCTTTTATGAACTA
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Statistics
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ATAAATAATTTGTTCAAATAGTCTAAACTACTTAAACGGTTCCAATAAATAGATTTATTTTTAAA
ATATCTTAGCTATTAATTTTTGAAATGTTAATAAATTAGCATTATTTCATTCCAAATAAGCTTGT
ATGACTAGAAACAATTATTATACGATAGAACAAAAGGTTAGAACAATTTCAAATAGATAATTATT
CAAATATTCATAACTATTTGAACTGGTTTAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCGTATTAATT
CTTGAAATATTAATAAACTAGAATTATTTTCATCCAAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGT
TTTATAACAAAACAAATATAATAATGATTTAAGATAGATAGTTGTTCAAATATCATAATAATTTG
AACTGATTTAAAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATGTTCAAAATATTAATAA
AGTAGTATTATTTTATTTT
Found at i:67214 original size:358 final size:358
Alignment explanation
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66459 CAGTAAATGG
* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * *
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* ***
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* * * * * * * * * *
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** * * **
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320 TCAAATAACTGTAATTATTTGAACTGATTTAGCAAACAC
* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CGTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTC
** *
66892 TGAATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTA
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* * *
66956 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAATAAATAGATTT-TTTTTTCA
127 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTT-A
* * *
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* * *
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256 TATG--CTGAAAACAATTATTATATCACAAAACAAAAGGTAAT-AATAATTTCAAATAGATAATT
* * * * *
67148 ATTCTAATAATTTTAATTATTTGAACTGGTTTAGCAAGCAC
318 ATTCAAATAACTGTAATTATTTGAACTGATTTAGCAAACAC
*
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCGTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTT-ATTCCAA
* * * * *
67253 ATAAGCTTGTATGATC-ATAAACAATTGTTTTATAAGAAAACAAATA--TCCTAATGA-TTTAAG
65 ATAAGCTTGTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTTAA-
* * * * * *
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128 ATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACT-ATTTGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAA
* * *** *
67378 CTCTCTTGCTTATTAATGTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT
192 CTATCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATT
67429 TTAGATAAGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
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TAAGCTTGTATGAACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA
GATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAACTAT
CTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGC
TGAAAACAATTATTATATCACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTCAAATAGATAATTATTCAAAT
AACTGTAATTATTTGAACTGATTTAGCAAACAC
Found at i:68676 original size:65 final size:64
Alignment explanation
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68586 AAAATTTTTC
**
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1 AATTTTAGAGGTGAGCCTTGAAAA-CTTTGATGTGAATCTGCAAATTTTCCAAATA-GAAAATTT
68660 G
64 G
* *
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1 AATTTTAGAGGTGAGCCTTGAAAACTTTGATGTGAATCTGCAAATTTTCCAAATAGAAAATTTG
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1 AATTT
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Statistics
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Found at i:68902 original size:16 final size:17
Alignment explanation
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68835 AAATTCTTACGAA-CTTT
1 AAATTCTTACGAATC-TT
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*
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*
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AAATTCTTACGAATCTT
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68825 GTAAATCTAA
*
68835 AAATTCTTACGAACTTTAAATTCTTACGAATCTT
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*
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1 AAATTCTT
68910 GCAAACCTGA
Statistics
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AAATTCTTACGAACCTTAAATTCTTACGAATCTT
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*
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* * *
68886 AAATT-TTGCGAATCTT
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* * *
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1 AAATTCTTGAGAACCTG
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1 AA
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AAATTCTTGAGAACCTG
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*
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*
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*
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* * *
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*
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* *
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*
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*** *
69575 TTTTAAAGTTGTTTAGCCTCCATATAGAGGAGCCCATTTCATA
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*
69618 TTTTAAAGTTGTTTTGCCTTTGTATAGAGGAGCCCATTTCTTA
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* * *
69661 TTTTAAAGTTGTTTAGCATCTATATAGAGGAGCCCATTTCTTA
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* * * *
69704 TTTTAAACTTGTTTTAGCCTCTATATAGAGGAGCCCACTTCTTAA
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*
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* * **
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* * *
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* * ** *
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* * * * * ** *
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190 -GTTTATGACAAAACAAAAGGT-AGTAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACT
* * * * * *
71825 ATTTAAACTAGTTTG-ACAGACACATTTACTTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGCATATTAT
252 ATTTGAACTTGTTTGTA-A-ACAAATTTA-TTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * ** ** *
71889 TAAATTAGTATTATTTGAATCCAAATAA-GGTG-TTTGAAAA
314 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATATTGCATT-AAAA
* * * * ** * *
71929 GAAACAATTATTTTATGATAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGAA-AGTTAATTGTTTAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
71992 GTTATAACTATTTGAATTGTTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTT-AAA-TC-ACTTATTAATTTTT
65 GTCATAACTATTTGAATTGTTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTT
** * ** * *
72054 AAAATATTAATATATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATTAAAAGAAACAATTGTTAT
130 TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTT-T
* * * * * *
72119 ATGACAAAACAGAAGGTTGTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGGACATGACTATTTGA
194 ATGACAAAACAAAAGGTAGTAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
72184 ACTTGTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAGATTAG
258 ACTTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
*
72248 TATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATTAAAA
322 TATTATTTTATTCTGAATAATATTGCATTAAAA
* ** * *
72281 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTTGTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
72346 ACATGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AGATCTCCTACCTATTAATTT
66 TCATAACTATTTGAA-TTGTTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-T-CTACTTATTAATTT
* * *
72409 TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGCT
128 TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTG-T
* * * * *
72474 TTATGACAAAACAAAAGATAATAACTATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATAATTATTT
192 TTATGACAAAACAAAAGGTAGTAA-TATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTT
* ** *
72539 GAATTTGCTGGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
256 GAACTTG-TTTGTAAACAAATTTATTTTTT-AA-A--TCACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
*
72604 AATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-ATGATTGCA-TAAACA
316 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAT-ATTGCATTAAA-A
** * * * * *
72643 GAAACAATTGGATAATGACAAAACAAAATGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAGTTATTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
72707 ATCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAAATTTA-TTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTT
65 GTCATAACTATTTGAATTGT-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAA-TTCTACTTATTAATTT
* * * *
72770 TTGGAATATTAATAAATCTA-TATTATTTTATTC-AAGACAAGCTTTTATGAATAA-AAACAATT
128 TTTGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATT
* * * * *
72832 ATTTTACGACCAAAACAAAAGGTTA-TAGTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
190 -GTTTATGA-CAAAACAAAAGG-TAGTAAT-ATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAAC
72896 TATTTG
251 TATTTG
72902 TATGAACAGA
Statistics
Matches: 790, Mismatches: 144, Indels: 76
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
351 29 0.04
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354 5 0.01
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363 4 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (354 bp):
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAATTGTTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTT
GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTAT
GACAAAACAAAAGGTAGTAATATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT
TGTTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTCTGAATAATATTGCATTAAAA
Found at i:72540 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 71569--72901 Score: 1137
Period size: 181 Copynumber: 7.4 Consensus size: 181
71559 ATGATAAGCT
* * **
71569 GAAACAATTGTTCTATGACAAAACAAAA-AGTCATAA-TGACTTT-ATGTAGATAATTGTTCAAA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACT-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
71631 TAGT-AAAATCTATTTGAAATTTTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTA
64 TAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATATC-TACTTATTA
* * * **
71695 ATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
125 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
* * * * * * * *
71752 GAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAA-AGTCAGAA-TAATTTGGAATAGAAAATTATTCCAAT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * ** * *
71815 AGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGACAGACACATTTACTTTTTT-AA-ATCT-CTTATTAATTT
65 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATATCTACTTATTAATTT
* * * * ** * *
71877 TTGGCATATTATTAAATTAGTATTATTTGAATCCAAATAAG-GTGTTTGAAAA
129 TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
* * * * *
71929 GAAACAATTATTTTATGATAAAA-TAAAGATCATAAC-AATTTGAGAA-AGTTAATTGTTTAAAT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTAATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAAT
* * *
71991 AGTTATAACTATTTGAA-TTGTTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTT-AA-ATC-ACTTATTAATTT
65 AGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATATCTACTTATTAATTT
** * ** * *
72052 TTAAAATATTAATATATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATTAAAA
129 TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
* * * ** * * *
72105 GAAACAATTGTTATATGACAAAACAGAAGGTTGTAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
72169 GACATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTT-AA-ATC-ACTTATTAATTTTT
66 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATATCTACTTATTAATTTTT
* * ** * *
72231 -AAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGCATTAAAA
131 GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
* * ** * * *
72281 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAGGTTGTAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
72345 GACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAGATCTCCTACCTATTAATTTT
66 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATAT-CTACTTATTAATTTT
* * * *
72410 TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAATA
130 TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
* * * * *
72462 GAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATAATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTTAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
72526 GTTATAATTATTTGAATTTGCTGGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTT
66 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATA-TCTACTTATTAATTTT
* * * *
72591 TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGATTGCAT-AAACA
130 TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAA-A
** * * * *
72643 GAAACAATTGGATAATGACAAAACAAAATG-TCATAACT-ATTTGAAATAAATAGTTATTCAAAT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * *
72706 AATCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTT
65 AGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATATCTACTTATTAATTT
* * *
72770 TTGGAATATTAATAAATCTA-TATTATTTTATTC-AAGACAAGCTTTTATGAATAA
129 TTGGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAA-AA
* * * * *
72824 -AAACAATTATTTTACGACCAAAACAAAAGGTTAT-AGTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
1 GAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGATCATAACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
72887 AGTCATAACTATTTG
65 AGTCATAACTATTTG
72902 TATGAACAGA
Statistics
Matches: 954, Mismatches: 167, Indels: 60
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 54 0.06
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184 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATATCTACTTATTAATTTTT
GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
Found at i:73343 original size:21 final size:22
Alignment explanation
Indices: 73287--73343 Score: 62
Period size: 24 Copynumber: 2.4 Consensus size: 22
73277 GTTTTAGTCA
73287 TAAAAATTTAAATAGAATAATTAT
1 TAAAAA-TT-AATAGAATAATTAT
73311 TCATATAAATTAATA-AATAATTAT
1 T-A-A-AAATTAATAGAATAATTAT
73335 TAAAAATTA
1 TAAAAATTA
73344 TTTATTCGAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 9
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.58, C:0.02, G:0.02, T:0.39
Consensus pattern (22 bp):
TAAAAATTAATAGAATAATTAT
Found at i:73847 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 73535--73960 Score: 409
Period size: 182 Copynumber: 2.4 Consensus size: 181
73525 GTATGATGAA
* *
73535 AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAATTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATGGC
1 AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGC
* ** *
73600 CATAATTATTTGAATTGATTCAATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAATTGATTCAATAAACTGATTTATTTTAAAAATCTCCAACTTATCAATTTTTG
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131 -AATATTAATAATA-TAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTTTTGAATTG
* * * * * *
73717 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCGAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGC
*** * *** *
73782 CATAACTATTTGAACTT-ATTTGGTAAA-TAGATTT-TTTTAAAAATTTCTTGCTTATTAACTTT
66 CATAACTATTTGAA-TTGATTCAATAAACT-GATTTATTTTAAAAATCTCCAACTTATCAA-TTT
* ** * * * *
73844 TTGAATGTTAATAATATTGTATTATTTTA-TTTGGAATTAGC-TTGTGTGAACT-
128 TTGAATATTAATAATATAATATTATTTTATTTTGG-ATAAGCTTTTTTTGAATTG
* * ** * * * *
73896 AAA-AATTTTTTTTTGTAATAAAACAGCAAGTTAGAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATA
1 AAACAA--TTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATA
73960 G
64 G
73961 TCTTAATTAT
Statistics
Matches: 199, Mismatches: 38, Indels: 16
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 2 0.01
179 3 0.02
180 60 0.30
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183 2 0.01
ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGC
CATAACTATTTGAATTGATTCAATAAACTGATTTATTTTAAAAATCTCCAACTTATCAATTTTTG
AATATTAATAATATAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTTTTGAATTG
Found at i:74817 original size:169 final size:172
Alignment explanation
Indices: 74320--75194 Score: 486
Period size: 182 Copynumber: 4.9 Consensus size: 172
74310 GATTTATTTT
* * * * * * *
74320 TTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAC
1 TTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTACTTCAAATAAAC
** * * * * *
74385 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAAGATCATAATGATTTAAAATAAATAAT
66 TTACATGAA-CGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
74449 TATTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-T-TTCTTGTTAAACAGATTTA
130 TGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATGTTC-AG--AAA-ACA--TA
* * * * * * * * * *
74496 TTTTTCAAATCTTTTTCTTATTAATTTTTAGTATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAA
1 ---TT-AATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTTACTTCAAA
* ** * ** * * **
74561 TAAGCTTTTATAGATA-GAAACAATAAG-TTTATGGCAAAATC-AAAGATTATAACAATTTGAAA
61 TAAACTTACAT-GA-ACGAAACAAT-TGTTTTATAACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
*
74623 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAGAAAACATA
122 TAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATGTTCAGAAAACATA
* * * *
74674 TT-ATT-T-TT-CTTATTAATTTTTGTAATATTAATAAATTTGAATTATTTTA-TTCAATATAAG
1 TTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTACTTCAA-ATAAA
* *
74734 CTTGCATGAAC-AAAGCCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATA
65 CTTACATGAACGAAA--CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * ** *
74798 AATGTTCAGATAATCATAACTATTT-AAAATTTTTGGTAAATAGATTCATTT
128 ATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATGTTCAG--AA-A-A--CA-TA
*
74849 TTAAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAA
1 TT-AATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTACTTCAAATAAA
* * * * *
74914 CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAAGAAAAGGTCATAATGATATGAAATAGATAA
65 CTTACATGAAC-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * *
74979 TTATTCAAATAGA-CATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATA
129 TTGTTCAAATA-ATCATAACTATTTGAACATGTTCAGAAAACATA
* * * * * * *
75023 TTTATGTTTCCAAATATTTTATTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTAAT
1 -TTA--ATT-C-----TCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTACT
** * ** ** * * ** * *
75087 TTTAATAAACATGTATGCGCATAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAGTTAA
56 TCAAATAAACTTACATGAAC-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * *
75152 AATAGATAATTGTACAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTC
120 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACT-ATTTGAACATGTTC
75195 GGCAAACAAA
Statistics
Matches: 555, Mismatches: 97, Indels: 85
0.75 0.13 0.12
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.01
168 15 0.03
169 73 0.13
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173 2 0.00
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183 4 0.01
184 3 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (172 bp):
TTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTACTTCAAATAAAC
TTACATGAACGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
GTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATGTTCAGAAAACATA
Found at i:75002 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 74683--75541 Score: 690
Period size: 180 Copynumber: 4.8 Consensus size: 179
74673 ATTATTTTTC
* * * * *
74683 TTATTAATTTTTGTAATATTAATAAATTTGAATTATTTTA-TTCAATATAAGCTTGCATGAAC-A
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-ATAAACTTGTATGAACTA
* * *
74746 AAGCCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAAATGTTCAGATA-
65 AA--CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * *
74810 ATCATAACTATTTAAAATT-TTTGGTAAATAGATTCATTTTTAAATTCTCTTAC
128 A-CATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTAAATT-TCTTAT
* * *
74863 TCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAACTTATATGAACTGA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACT-A
* * * * *
74928 AACAATTGTTTTATTATAAAAGAAAAGGTCATAATGATATGAAATAGATAATTATTCAAATAGAC
65 AACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGAC
* * * * *
74993 ATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATGTTTCCAAATATT-TTAT
130 ATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCAT-TTT-TAAAT-TTCTTAT
* * * * * **
75045 TTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-TAATAAACATGTATGCGCAT
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAACTTGTATGAAC-T
* ** * * * *
75109 AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAGTTAAAATAGATAATTGTACAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGA
* * * * *
75174 CATAA-TGATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTAT
129 CATAACT-ATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCA-TTTTTAAAT-TTCTTAT
* * * *
75226 TTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATGATATTATTTGAAATAAGA-TTGTATGAA-
1 TTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ACTTGTATGAAC
* * * * * * * *** * *
75287 TAGAAAAAATTCTTTCATGACAAATCGAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAAC
63 T--AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
75352 AGTCATAATTTTTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCATTTTTTAATTTCTT-T
126 AGACATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTAAATTTCTTAT
* * * ** * ** *
75405 ATTATTAATTTTTGGATTACTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTAGTTTATATGAACTA
1 -TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACT-
* * * *
75470 AAACAATT-TTTTATGA-TAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGT
64 AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGA
*
75531 CATAATTATTT
129 CATAACTATTT
75542 GATCTTTTAT
Statistics
Matches: 548, Mismatches: 106, Indels: 54
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 13 0.02
177 31 0.06
178 4 0.01
179 12 0.02
180 180 0.33
181 151 0.28
182 144 0.26
183 12 0.02
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACTAA
ACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACA
TAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTAAATTTCTTAT
Found at i:75115 original size:182 final size:181
Alignment explanation
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66 CAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAGT-TAAAATAGATAATTATACAAATAGACA
* * *
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** * **
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1 ATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAACATATATGAAC-TGAA
* *
75111 ACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAGTTAAAATAGATAATTGTACAAATAGTCA
65 ACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAGTTAAAATAGATAATTATACAAATAGACA
* ** *
75176 TAATGATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTT
130 TAATGATTTGAACTTGTTCAGCAAACAAATTTATTTTCCAAATATTTTATTT
* ** * * * * * *
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1 ATTAATTGT-TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAA-ACATATATGAACT-G
* * * * * * * * * * * * * *
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63 AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAAGTTAAAATAGATAATTATACAAATAGA
** * ** * * ** *
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* * * * * * * ** * *** *
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* * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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* * ** *
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** * * * * * * * *
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*
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* ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * *
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1 TATGA-ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *
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* * ** * * **
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* * *
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* * * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * * **
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* * *
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1 TATGAAT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * ** *
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** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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*** * * * *
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**
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* * * * * * * * *
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1 TATGAATA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
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* * * **
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* * * * * * *
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1 TATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
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65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTAT
* * * ** * * * *
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* ** * ** *
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*
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Statistics
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* * *
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* *
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* * * * * * *
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* * *
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* ** ** * * *
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*
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* ** * * * *
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* * *
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* * *
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** * * * * * * *
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* *
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* ** **
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* * * *
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** * * * ** *
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* *
76600 TATTTT-ATTTCAAATAAGCTTG
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* ** * * * *
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1 TATGAACAGAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
* * * *
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66 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAA
* * * ** * ** **
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* * * * * * * ** * *
76813 T--TGTTATAACCAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATGGAAATGGCCATAAT
194 TCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAACTATTCAAATAGTCATAAT
* * * *
76876 TATTTGAAC-TGCTTCGGCAAGCAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTAGAATA
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* * * *** * * ** *
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* ** ** * * ** * *
76999 AAAAAAAAGTCATAGTGATTTTAAATAGACAATTG-TTCAAATGGTTGTAACTATTTGAATTTG-
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* * * * *
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* * * ** *
77125 GTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT
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** * * * * *** * *
77151 TATGAATTG-AAACAATTGTTTTAT-ATCAAAACGAAAGGTGATATTGATTTCAAATAAATAACT
1 TATGAACAGAAAATAATTGTTTTATGAT-AGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT
* * * ** *
77214 GTTTAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTCCT
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* * ** *** *
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126 -ATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAT-ATTATTTTATT-TCAAAACAAACTTACATGAACA
* *** * * * * *
77334 -AACAAAT-ATTTTCCAACTAAAA-AAAAGGTCAGAACGATTT-AAACTATATAATTATTCTAAT
187 GAAAAAATCATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAA-TAGATAACTATTCAAAT
** * * * ** * * *
77395 AGTTTTAAATATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTT
250 AGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAACAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * * ** *
77456 TTGAAATATTATTAAATTAGTATTACTTTGA-ACCAAATAAGCTTCTATGATA-AAAAATAATTG
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* * ** * *
77519 TTTTATGACAAAACAAAGATCTTAATGATGT-GAGATTCATAATTG-CTCAAATAGACATAACTA
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* * * * * * *
77582 TTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTATTGAAGTATTA
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* * * * * *
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501 ATAAATTAGTATCATTTTAATATAAATAAGCTTG
** * * * * *** * **
77681 TATGATTA-AAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATATTGATTTGAAATAGATAATCA
1 TATGAACAGAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * * *
77745 TTCAAA-AGTTCATAATTATTTTAA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATCTTTTAAAT-TTCTTAC
66 TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAG-TTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTAT
* * * * * ** * *
77807 AAATTCTTTTAGGAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTC-CATCTAAGCTTGTATTAACT
128 TAA-T-TTTT--GAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAAAC-AAACTTACATGAACA
* ** * * ** * * *
77870 GAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACAATTTTAAAATAGATAATTGTAT-AAAT
187 GAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTCAAATAGATAACTAT-TCAAAT
* * * * * * * * *
77934 AATAATAACTATTTGAACTTGTT-TGATAAACAAATTTATTGTTTCAAATCCCTTTCTTATTAAT
250 AGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAG-TAAACAGATTCATT-TTT-AAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * * *** ** **
77998 TTTTCGGATGTTAACAAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-AAAAAGAAATAAT
312 TTTT-AGATATGAA-TAAATTAATACTATTTTATTCCCAATAAGCTAATATGAACCA-AAATAAT
* * * ** *
78062 TGTTTTATGACTAAACAAAAATCAGAATGATTTCAAATAGATAATTG-TTC-AATAGTCTTAACT
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* * * * * *
78125 ATTTGAACT-GATTCAGTAAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
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* *
78189 TATTAAATTAGCAGT-ATTTTAATCA-AAATAAGCTTG
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* * * * * * * ** * *
78225 TA-CAA-ACAAAACAATTATTTTATGGA-A-AAGAAAAGGTTACAATGATTTGAAATAGATAATC
1 TATGAACAGAAAATAATTGTTTTAT-GATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT
* * * * * * * * * *
78286 ATTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGT
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* * * * * * *
78350 TATTAAGTATCT-AAATATTATTAAATTACTATTATTTTATTCTGAATA-AAA--TAGTATGAAT
125 TATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATT-TCAAAACAAACTTA-CATGAAC
* * * * * * * * *
78411 ATAACTAATTC-TTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATCCAAAT
186 AGAA-AAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAACTATTCAAAT
* * * ** ** * *
78475 AGTCAAAACTATTTGAAA-TGGTTTGGTAAACATTTTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATT
250 AGTCATAATTATTT-AAACTTGTTCAGTAAACAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * *** * * * * * *
78539 TTATAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAATAATTAT
313 TT-TAGATATGAATAAATTAATACTATTTTATTCCCAATAAGCTAATATGAACCAAAATAATTGT
* ** ** *
78604 TTTAT-AGCAAAATAAAAGTAATAATAATTTCAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTTAT-ACTTA
377 TTTATGA-CAAAA-CAAAG--ATAACGATTAGAAATAGATAA-TGATTCAAATAGTCATAAC-TA
* * * * * *
78666 TTTGAATTTGTTTGATTAATAGAA-TTATTTTCTAAATCTCTTATCA-A-T--TT-TTCAAATAT
436 TTTGAACTAGTTTGATAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CATATTAATTGTTGAAATAT
* * * * * * *
78725 TAATAAATTAGTTTTACTCTATTCTGAATAAGCTTG
499 TAATAAATTAGTATCATTTTAATATAAATAAGCTTG
* * * * *
78761 TATGAACTG-AAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGATATAAATAATTG
1 TATGAACAGAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * * * * **
78825 TTTATATAGTCTTAATTGTTTGAATTGGTTTGACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
66 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTA
** * * * * ** * * *
78890 TTAATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATAATTTTA-TTCCAAATAGGCTTATATAAATAGAAA
127 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAAACAAACTTACATGAACAGAAA
* ** * * * * * ** * * *
78954 CAATTGTTTTATTATACAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
191 AAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAACTATTCAAATAGTCAT
* * * * * *
79019 AACTATTTAAA-TTGGTT-TGTTAAACATATTTATTTTTTTAA--TC-T-CTTATTAATTCTT-G
256 AATTATTTAAACTT-GTTCAG-TAAACAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG
* * * * * * ** **** *
79077 AACTATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTA
318 -A-TATGAATAAATTAATACTATTTTATTCCCAATAAGCTAATATGAACCAAAATAATTGTTTTA
** * * * * * * *
79142 TGACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAGTTG-TTCACATGGCCATAATTATTTAA
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*** * * * *
79206 ACTTA-TTT-AGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAGTAACTT-TCGAAATAATAAT
441 AC-TAGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAA-TTGTTGAAATATTAAT
** * ** * *
79268 AAAGCAATA-CTATTTTCCT-TAGGATAAGCTTT
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* * * *
79300 TATGAACTA-AAAA-AATTATTTTATGACTA-AACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAAT
1 TATGAAC-AGAAAATAATTGTTTTATGA-TAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAAT
* * * * * * *
79362 TGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACT-GGTTCAGTAAACACATTTATTTTTCAAATCTATTAC
64 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATC--TT--
* * * * * * ** ** *
79426 TTATTAA-TTTTAAAATACT-ATCAATTTAGTAATATTTTACTTCGAAA-AAGTTTGTATGAATA
124 TTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTA-TATTATTTTATTTCAAAACAAACTTACATGAACA
** ** * * ** * * * *
79488 GAAACTATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAGGATCACAACAATTTGAGATAGATAATTATTCTAATA
187 GAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTCAAATAGATAACTATTCAAATA
** * * * *
79551 GTCATAACAATTTGAACTAG-TCTAGTAAGCAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTT
251 GTCATAATTATTTAAACTTGTTC-AGTAAACAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * ** ** ** ** *
79611 TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGTTCTAAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTT
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* * * * * * *
79676 TTATGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-AGTTCAAGT-GAACATGACTTT
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* * * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * **
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* *** * * * *
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* * ** * ** *** * **
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * **
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** * * * * * * * * ** * *
80376 TATGAATTG-AAACAACTATTTTATTACAAAAGAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
1 TATGAACAGAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * * *
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TATAAATAAGCTTG
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* ***
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* * * * * * * ** * *
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* *
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255 ATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTAT-
* ** * * *
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* * * * * * *
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* * *
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** * * * ** * *
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* * * *
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* * * * *
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** * **
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* * * * * * * * * *
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1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
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66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* ** ** * * *
76748 TAATTGTTGAAAGATTAATAAATTTCTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTAT-ATTAAAAACA
131 TAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* * * * ** * *
76812 ATTG--TTATAACCAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TGGAAATGGCCATA
194 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAGTCATA
* * ** * * * *
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258 ACTATTTGAACTTG-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA-TTTTATAA
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321 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * *
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1 TAT-GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* ** * * * * *
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* * **** * *
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* * * * * *
77163 CAATTGTTTTAT-ATCAAAACGAAAGGTGATATTGATTTCAAATAAATAACT-GTTTAAATAGTC
192 CAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATAGTC
* ** * * * *
77226 ATCACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTT-TTCCTAATTAATTTTT
255 ATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AAAT-TTCTTACTTATTAATTTTA
* * *
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* * * * *** * * *
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1 TATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAAT
* * ** * * * * * *
77386 TATTCTAATAGTTTTAAATATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TC--ACT
63 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * *
77447 TATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTACTTTGAACCAAATAAGCTTCTATG-ATAAAA
128 TATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATCCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGA
* * * * * ** * * *
77511 AATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAATGATGTGAGATTCATAATTGCTCAAATAGAC
190 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTC
* * *
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* * *
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* * * * **
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1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * **
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* * ** *
77809 ATT-CTTTTAGGAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAACT-GA
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* * ** * * *
77872 AACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACAATTTTAAAATAGATAATTGTAT-AAATAA
190 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATAGT-TCAAATAG
* * * ** *
77936 TAATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTTATTGTTTCAAATCCCTTTCTTATTAATTTT
253 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATT-TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
78001 -TCGGATGTTAACAAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTG
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* * * * * * *
78046 TATAAAAAGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAA-ATCAGAATGATTTCAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
78110 TC-AATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAACAAATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * ** *
78173 TTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGCAGTATTTTAATCAAAATAAGCTTGTACAAACA-AAAC
130 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * * * *
78237 AATTATTTTATG-GAAAAGAAAAGGTTACAATGATTTGAAATAGATAATCA-TTCATATAGTCTT
193 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-AGTTCAAATAGTCAT
* * * ** * ** *
78300 AACTATTTGAA-TTGGTTCAGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTATCTA-
257 AACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA-T-TTTAT
* * * ** *
78363 AATATTATTAAATTACTATTATTTTATTCTGAATAAAATAG
319 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * * *
78404 TATGAATA-TAACTAATTCTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTA
1 TATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * ** * *
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65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* *** * * * * * * *
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130 TTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * * * *
78598 AATTATTTTAT-AGCAAAATAAAA-GTAATAATAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTAT
193 AATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
78661 -ACTTATTTGAATTTGTTTGATTAATAGAATTATTTTCTAAA--TC-T-CTTATCAATTTT-TCA
257 AAC-TATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTAT--
* * * *
78720 AATATTAATAAATTAGTTTTACTCTATTCTGAATAAGCTTG
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* * * * * *
78761 TATGAACT-GAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGATATAAATAATTG
1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * *
78825 TTTATATAGTCTTAATTGTTTGAA-TTGGTTT-GACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * *
78888 TATTAATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATTCCAAATAGGCTTATATAAATAGAA
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* * * * * ** *
78953 ACAATTGTTTTATTATACAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
191 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCA
* * * *
79018 TAACTATTT-AAATTGGTTTGTTAAACATATTTATTTTTTTAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGA
256 TAACTATTTGAACTT-GTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATT-TT-A
* * **
79078 -ACTATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
318 TAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
* * * * *
79119 TATG-TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAGTTG
1 TATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
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65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * ** * * * *
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130 TTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCC--A-AATAAGCTTGTATGAA-TAGA
* * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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255 ATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTAT
* * * * * * *
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* * * ** * *
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1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** *
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* * * * ** *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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*
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* * * *
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1 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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*** * * *
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** *
80157 ATATTAATAAATTTTTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTG
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* * * * * * * * *
80197 CATAAACAGAACCAATTGTTTTAAGACAACACAGAAGGTCATAATGTTTTTAAATAGATAATTGT
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* * * * * *
80262 TTAGATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGA-TTCTTTTTTAATTCTCTTACTTAT
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* * ** *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * * ** *
80518 TATTAATAAATTAAAATTACTTTAATCCGAATAAGTTTG
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* ** * ** *
80557 TATGAATAGAAAAAAAGGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTT-AAATAAATAATTG
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*
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Statistics
Matches: 3707, Mismatches: 841, Indels: 381
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Matches are distributed among these distances:
347 1 0.00
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TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
TAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACT
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Indices: 80644--83949 Score: 2354
Period size: 180 Copynumber: 18.4 Consensus size: 180
80634 AATGATTTGA
* * * * * *
80644 ACTTATTAATTGTCTT-CATATTAATCAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATTAAG
1 ACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * *
80708 TGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACAATTAT-AAATAGACAATTGTTCAGAT
64 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAAT
*
80772 AGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTT
** * * * *
80826 TTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * ** * *
80891 GAAACAAATGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAAAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATA
65 GAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
80955 GTCTTAACCATTTGAA-TTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * *
81007 ATTTATTAATTTTTGAACTATTATTAACTTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACA
1 ACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * *
81072 -AAATAATTGTTTTACGATAAAACAATAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
81136 TCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
*** * * ** * *
81187 GA-TTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAATAGTGTGAAC
1 -ACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * * * *
81251 AGAACCAATTGTTTGATCACAAAATAAATGGTTATAACAATTT-AAAGTAGATAATTATTCAAAT
64 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
81315 TGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATTGGTTTACTTTTTAAATCTCTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
81368 ACTAATTAATTTTCT-AAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAACAAACTTATATTAAC
1 ACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * *
81431 TA-AAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCATAT
64 -AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * * ** *
81495 AGTTTTAACTATATGAACTGGTTTGACAAATAGATTT-TTTTTT-AATTTCTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
81546 AGTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAACAAGCCTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * *** * * ** *
81611 GAATA-AA-AG-GTTATAATAATTTAAAA--T-A-GATAA-TT---ATTCA-AATAG-T--AATA
65 GAA-ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
81661 ------ACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATATATTTACTTTTTAAATATCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * **
81707 A-TTAAT-A-CTTTAAATATTAATGAATTAAATATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGTTC
1 ACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * * * * *
81768 A-AAAGCAATT-ATTTAAGACAAAACAAAA-GTAATAACGATTTGAAATAGGTAGTTATTAAAAT
64 AGAAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * *
81830 -GGCTATAATTATTTGAAC-TGTTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATCGCTT
128 AGTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * ** * *
81883 ACTTATTAACTTTTGAAATATTACTAAAGTAGTATTATTTT-TTTTGGATAAGCTTGTATGAGCT
1 ACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * *
81947 GAAATAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-ATAATAAATAATTGTTTATATA
65 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
82011 GTCTTAATTGTTT-AAATAGGTTTGGCAAACATATTTA-TTTTTAAATCTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
82062 AGTTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTTGTTTGAATA
1 ACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * *
82127 GAAACAATTGTTTCATTATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *** *
82192 TCATAACTATTTGATCTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTATATCTAC-T
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTT
* * * * *
82243 ACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * * *
82308 GAAACAATTGTTTAATGACAAAATAAAAAGATCATAACTATTTCAAATAAATAATTGTTCAAACA
65 GAAACAATTGTTTTATGATAAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * * *
82373 ATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
82425 ACTTATCAATTTTAGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * *
82490 GAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTTATAACCATTTGAAATAGATAATTGTTTAAA-AG
65 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * *
82554 TCATATCTATTTGAA-TATGTTCAGAAAACT-TATTTATTTTTTAAAT-TTTT
130 TCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
82604 ACTTATTAATGTTTTGAATATTAACAAGTTTA-TATTATTTTATTCGAAAAAAGCTTCTATGAAC
1 ACTTATTAAT-TTTTGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * *
82668 A-AACACAATTGTTTTATGACAAAGA-AAAAGGTCATAACAGTTTTAAATAGATAATTGTTCAAA
64 AGAA-ACAATTGTTTTATGATAAA-ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * *
82731 TAATCTTAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAATAG-TTTCATTTTTTAAAACTCTT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
82785 ACTCATTAATTTTCAT-AATATTAATAAATTAGTTTTTTTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAAC
1 ACTTATTAATTTT--TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * ** * * * **
82849 TGATACCGCAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATACTTACTCAA
64 AGA-A--ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *** * * * *
82914 ATACTTATGACTATTTAAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTT
126 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* *** * * * * *
82968 TCTTATTAATTATCAAAATATTAAAAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGGAGA
1 ACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * * * *
83033 AAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAAATGTTCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
83098 TCATAACTAATTGAAATTATATAGTAAAT-GATTTATTTTTTTAATCTTTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* ** * * * **
83148 GCTTATTAATTAACTGAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTTTAAATAAATTTGTATG-ACT
1 ACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC-
* * * * * *
83212 AGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGA-AATTTGAAATAGATAATTATTTAAAT
64 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA-ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
83276 AGTCATAACTGTTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** ** *
83329 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGGATAAGCTTGTACAAATA
1 ACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * *
83394 GAAACAATTGTTTTGT-AGTAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 GAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** ** * * *
83458 GTCATAACTATTTGCAC-TGATCAGGCCAACAAATTCACTTTTTTAAATC-CATT
129 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-TT
* * * * ** *
83511 ACTAACTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CTTGTATGAAC
* * * * ** * *
83575 AGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAATTGTCATTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
64 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * ** *
83640 AGTTATAACTAATTAAACTACTTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTC-T
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * * *
83691 --TT-TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCAAATAAACTTATATAAAC
1 ACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAC
* * * **
83752 A-AAAGCATTTGTTTTATGACAAGACAAAAGGT-ATTAATGATTTGAAATAGA-AAGTTGTTCAA
64 AGAAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAA
* * * * *
83814 ATAGTCATAATTATTTAAAC-TGATTTGGTAAACAGAATTATTTTTTATATCTCTT
126 ATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
83869 ACTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCGAACTAAG-TTACTAAGAAC
1 ACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTT-GTATGAAC
* *
83933 TGAAAAAATTGTTTTAT
64 AGAAACAATTGTTTTAT
83950 TTTATTCTAA
Statistics
Matches: 2447, Mismatches: 552, Indels: 251
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
156 1 0.00
157 15 0.01
158 32 0.01
159 36 0.01
160 10 0.00
161 9 0.00
162 2 0.00
163 2 0.00
165 3 0.00
166 2 0.00
167 3 0.00
168 5 0.00
169 3 0.00
170 3 0.00
172 2 0.00
173 3 0.00
174 1 0.00
175 5 0.00
176 95 0.04
177 97 0.04
178 44 0.02
179 250 0.10
180 706 0.29
181 552 0.23
182 371 0.15
183 109 0.04
184 83 0.03
185 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAG
AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
Found at i:81360 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 80644--83910 Score: 2059
Period size: 361 Copynumber: 9.1 Consensus size: 357
80634 AATGATTTGA
* * * * * * * *
80644 ACTTATTAATTGTCTTCATATTAATCAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATTAAGT
1 ACTTATTAATT-T-TTAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAA-C
* * * * *
80709 GAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACAATTAT-AAATAGACAATTGTTCAGATA
63 AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * **
80773 GTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTTTTATTAATTT
127 GTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTA-TTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
80838 TTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAATGTT
191 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* * * * ** * * *
80903 TTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTT
256 TGATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
80968 GAATTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
320 GAAATGGTTTGGTAAAC-TATTTACTTTTTAAATCTCTT
* *
81007 ATTTATTAATTTTTGAACTATTATTAACTTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACA
1 ACTTATTAATTTTT-AA-TATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * *
81072 AAATAATTGTTTTACGATAAAACAATAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
81137 CTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGA-TTATTAAGTTTC
129 CTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTT-ACTTATTAATTTTT
* * * * * *
81201 AAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAATAGTGTGAACAGAACCAATTGTTTG
193 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTG
* * * * * * *
81266 ATCACAAAATAAATGGTTATAACAATTTAAAGTAGATAATTATTCAAATTGTCAAAACTATTTGA
258 ATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTAAA-TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* *
81331 AATGGTTTGGTAAATTGGTTTACTTTTTAAATCTCTT
322 AATGGTTTGGTAAACT-ATTTACTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * *
81368 ACTAATTAATTTTCTAAAATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAACAAACTTATATTAACT
1 ACTTATTAATTTT-TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGAAC-
* * * * * *
81432 AAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCATATAG
63 AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
81497 TTTTAACTATATGAACTGGTTTGACAAATAGATTT-TTTTTT-AATTTCTTAGTTATTAATTTTT
128 TCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
81560 AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTC----TAAAC--------A-AG---C--CTGTATG
193 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTG
* * * * * * *
81607 A--ATAGAATAAAAGGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGA
258 ATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
81670 ACTGGTTCGGTAAATATATTTACTTTTTAAATATCTT
322 AATGGTTTGGTAAA-CTATTTACTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * **
81707 A-TTAAT-ACTTTAAATATTAATGAATTAAATATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGTTCA
1 ACTTATTAATTTTTAATATTATTAAATT-AGTATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * * * *
81769 AAAGCAATT-ATTTAAGACAAAACAAAA-GTAATAACGATTTGAAATAGGTAGTTATTAAAAT-G
64 AAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** *
81831 GCTATAATTATTTGAAC-TGTTTTGGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATCGCTTACTTATTAACT
128 TCT-TAACTATTTGAACTTG-TTTGGCAAA-TAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATT
* * * * * * * * *
81894 TTT-GAAATATTACTAAAGTAGTATTATTTT-TTTTGGATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTA
190 TTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTG
* * * * * * * * *
81957 TTTTATAAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTATAATAAATAATTGTTTATATAGTCTTAATTGT
254 TTTGATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTA-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
*
82022 TT-AAATAGGTTTGGCAAACATATTTA-TTTTTAAATCTCTT
318 TTGAAAT-GGTTTGGTAAAC-TATTTACTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
82062 AGTTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGTTTGTTTGAATA
1 ACTTATTAATTTTT--AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * *
82127 GAAACAATTGTTTCATTATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG
64 -AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * **** * * *
82192 TCATAACTATTTGATCTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTATATCTAC-TACCTATTAATTTT
128 TCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTT
** * *
82256 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTT
192 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* * * * *
82321 AATGACAAAATAAAAAGATCATAACTATTTCAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTT
257 GATGACAAAAT-AAAAGGTCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * *
82386 GAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
320 GAAATGGTTTGGTAAAC-TATTTACTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * * *
82425 ACTTATCAATTTTAGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTT--TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * *
82490 GAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTTATAACCATTTGAAATAGATAATTGTTTAAA-AG
64 -AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * *
82554 TCATATCTATTTGAA-TATGTTCAGAAAACT-TATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATTAATGT
128 TCTTAACTATTTGAACT-TGTTTGGCAAA-TAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAAT-T
* * * *
82616 TTT-GAATATTAACAAGTTTA-TATTATTTTATTC-GAAAAAAGCTTCTATGAACA-AACACAAT
190 TTTAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAA-CTTGTATGAACAGAA-ACAAT
* * * * *
82677 TGTTTTATGACAAAGA-AAAAGGTCATAACAGTTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCTTAAC
252 TGTTTGATGACAAA-ATAAAAGGTCATAACA-ATTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * *
82741 TATTT-AAACTTGTTCGGTAAA-TAGTTTCATTTTTTAAAACTCTT
315 TATTTGAAA-TGGTTTGGTAAACTA-TTT-ACTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * * *
82785 ACTCATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTTTTTTTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT
1 ACTTATTAATTTT--TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAAC-
** * * * ** * * * **
82850 GATACCGCAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATACTTACTCAAA
63 -A-A-AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* **** * * * *
82915 TA--CTTATGACTATTTAAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATTT-TTTCTTATTAA
125 TAGTCTTA--ACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAA
* * * * * * * * * * * *
82977 TTATCAAAATATTAAAAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGGAGAAAAATAATT
188 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATT
* * * * * * *
83042 ATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAAATGTTCAAATAGTCATAACTA
253 GTTTGATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTT-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** * * * * *
83107 ATTGAAATTATATAGTAAA-TGATTTATTTTTTTAATCTTTT
317 TTTGAAATGGTTTGGTAAACT-ATTTACTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * * **
83148 GCTTATTAATTAACTGAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTTTAAATAAATTTGTATG-ACT
1 ACTTATTAATT--TTTAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAAC-
* * * * *
83212 AGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGA-AATTTGAAATAGATAATTATTTAAAT
63 A-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATA-ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * *
83276 AGTCATAACTGTTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
126 AGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTT
* * * * ** *
83341 TT-GAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGGATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTGT
191 TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* * * *
83405 TT--TGTAGTAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
255 TTGATG-A-CAAAATAAAAGGTCATAAC-AATTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * ** ** * *
83468 TTTGCACTGATCAGGCCAACAAATTCACTTTTTTAAATC-CATT
317 TTTGAAATGGTTTGGTAAAC-TATTTAC-TTTTTAAATCTC-TT
* * * * * * ** *
83511 ACTAACTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTT--TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAG-CTTGTATGAAC
* * * * * ** * *
83575 AGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAATTGTCATTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
63 A-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** * * *
83640 AGT-TATAACTAATTAAACTACTTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAA--TC-T-CTTTTTAATT
126 AGTCT-TAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATT
* * * * * * *
83699 TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCAAATAAACTTATATAAACA-AAAGCATTT
190 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAACTTGTATGAACAGAAA-CAATT
* * * ** * *
83762 GTTTTATGACAAGACAAAAGGT-ATTAATGATTTGAAATAGAA-AGTTGTTCAAATAGTCATAAT
253 GTTTGATGACAAAATAAAAGGTCA-TAACAATTT-AAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * *
83825 TATTT-AAACTGATTTGGTAAACAGAATTATTTTTTATATCTCTT
315 TATTTGAAA-TGGTTTGGTAAAC-TATTTACTTTTTAAATCTCTT
* * * *
83869 ACTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTA
1 ACTTATTAATTTTT--AATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
83911 TTCGAACTAA
Statistics
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Consensus pattern (357 bp):
ACTTATTAATTTTTAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAA
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TAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAGA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTGATG
ACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATG
GTTTGGTAAACTATTTACTTTTTAAATCTCTT
Found at i:83230 original size:544 final size:541
Alignment explanation
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81605 TGAATAGAAT
* * * * * * *
81615 AAAAGGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGTTCGG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* * * * * * * *
81680 TAAATA-TATTTACTTTTTAAATATCTTA-TTAAT-ACTTT-AAATATTAATGAATTAAATATTA
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** * * * * *
81741 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-TTCA-AAAGCAATTATTTAA-GACAAAA-CAAAAG-TAAT
129 TTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAAT-AGAAA-CAATTATTTAATGACAAAATAAAAAGATCAT
* * ** * * * * *** *
81801 AACGATTTGAAATAGGTAGTTA-T-TAA-AATGGCTATAATTATTTGAAC-TGTTTTGGTAAACT
192 AACTATTTCAAATAAATAATTACTCAAACAAT--C-ATAACTATTTAAACTTG-TTCAATAAACA
* * ** * * ** * * *
81862 GATTTATTTTTTAAATCGCTTACTTATTAACTTT-TGAAATATTACTAAAGTAGTATTATTTT-T
253 AATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATCAA-TTTCAGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAA
* ** ** * * * *
81925 TTTGGATAAGCTTGTATG-AGCTGAAATAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
317 TCTAAATAAGCTTGTATGAAG-AAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACCATTT
* * * * * ** * * ** *
81989 -ATAATAAATAATTGTTTATATAGTCTTAATTGTTTAAATAGGTTTGGCAAACAT-ATTTA-TTT
381 GA-AATAAATAAATGTTCA-AAAGTCATAACTAATTGAATATGTTCAGAAAAC-TGATTTATTTT
* * ** * * * *
82051 TTAAATCTCTTAGTTATTAAT-TTTTAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG
443 TTAAAT-TTTTACTTATTAATGTACT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAA
* * * * *
82115 TTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTCATTATAAAAC
506 TTTGTATGACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* *
82151 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGATCTTGTTCAA
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* *
82216 TAAATAGATTT-ATTTTTTATATCTAC-TAC-CTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
66 TAAATAG-TTTCATTTTTTAAATCT-CTTACTC-ATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTAT
*** * * * *
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** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
82473 ATATGCTTGTATGAATAGAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTTATAACCATTTGAAATA
322 ATAAGCTTGTATGAAGAAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACCATTTGAAATA
* * * * * *
82538 GATAATTGTTTAAAAGTCATATCTATTTGAATATGTTCAGAAAACTTATTTATTTTTTAAATTTT
387 AATAAATGTTCAAAAGTCATAACTAATTGAATATGTTCAGAAAACTGATTTATTTTTTAAATTTT
** * * * * * *
82603 TACTTATTAATGTTTTGAATATTAACAAGTTTATATTATTTTATTCGAAA-AAAGCTTCTATGAA
452 TACTTATTAATGTACTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAA-TTTGTATG-A
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515 CTAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAA-AC
* * * * * * * *
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1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* * *
82758 TAAATAGTTTCATTTTTTAAAACTCTTACTCATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTTTTTT
66 TAAATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * *
82823 TTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GATACCGCAATTATTTTATGATGAAA-CAAAAGGTCA
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* * * * * * *
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* * *
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255 TTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATCAATT-TCAGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAATC
* * *
83013 TAAATAAGCTTGTATGGAGAAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
319 TAAATAAGCTTGTATGAAGAAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACCATTTGAA
* * *
83078 ATAAATAAATGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAA-AT-TATATAGTAAA-TGATTTATTTTTTT
384 ATAAATAAATGTTCAAA-AGTCATAACTAATTGAATATGT-T-CAGAAAACTGATTTATTTTTTA
* * **
83140 AATCTTTTGCTTATTAAT-TAACTGAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTTTAAATAAATTT
446 AAT-TTTTACTTATTAATGT-ACTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAATTT
* *
83204 GTATGACTAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAC
509 GTATGACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * *
83237 AAAAGGTTATAGA-AATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTGTTTGAACTTGTTTA
1 AAAAGGTTATA-ACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* ** * * *
83301 GTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTA
65 GTAAATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * ** * * * *
83366 TTTTATTTTGGATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTGTTT--TGTAGTAAAA-CAAAAGGTCAT
129 TTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATAGAAACAATTATTTAATG-A-CAAAATAAAAAGATCAT
* * * ** * * ** * ***
83428 AACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGCAC-TGATCAGGCCAACAAAT
192 AACTATTTCAAATAAATAATTACTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGTTCA-ATAAACAAAT
* * ** * * * * * *
83492 TCACTTTTTTAAATCCATTAC-TAACTAATTTTCAG-AATATTAATAAATTAGTATTACTTTATT
256 TTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATC-AA-TTTCAGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAAT
** * * * ** * * * * **
83555 CCGAATAAGAC-TGTATGAATAGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAATTGTCATTATGATTT
318 CTAAATAAG-CTTGTATGAAGAAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAA-GGTTATAACCATTT
* * * * *
83619 GAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTAATTAAACTACT-TT-AGTAAA-TAGATTTA-TT
381 GAAATAAATAAATGTTCAAA-AGTCATAACTAATTGAA-TA-TGTTCAGAAAACT-GATTTATTT
* * * * ** ** * *
83680 TTTAAA--TCT-CTTTTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAAC
442 TTTAAATTTTTACTTATTAATGTACTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAAT
* * * *
83742 TTATATAAAC-A-AAAGCATTTGTTTTATGACAAGAC
507 TTGTAT-GACTAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAAC
** * * *
83777 AAAAGG-TATTAATGATTTGAAATAGA-AAGTTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-TGATT
1 AAAAGGTTA-TAACAATTTGAAATAGATAA-TTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TT
** * * * * * * * *
83839 TGGTAAACAGAATT-ATTTTTTATATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTTGTT
63 CAGTAAATAG-TTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTA-ATTTTCAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
83903 TTATTTTA-TTCGAACTAAG-TTACTAAGAACT-GAAAAAATTGTTTTATTTTATTCTAACTAAG
126 TTATTTTATTTTGAA-TAAGCCTA-TATGAA-TAGAAACAATT-ATTTA-ATGA--C-AA--AA-
** * * ** *** * ** * ** * * ***
83965 TTACTAAGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAAAAA
180 -TAAAAAGATC-ATAACTATT-TCAAAT-A-AATA-ATTA-CTCA-AACAATCAT-AACT-ATTT
* ** * ** * * *
84029 AAAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTTATTTTTTAAATTTC
235 AAACTTGTTCA-ATAAAC--AA--ATTT--A-T--TTTTA-AAAT-CTTTTA-CTTATCAATTTC
* * * * * * *
84094 TTAGTTATTAATTTTTAAAATATTATTATATTAGTATTATTTT-TTTTCAAATAAACTTGTGTTA
287 --AG--A--AA-TATTAAAA-A--A--CTA--A-TATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * * *
84158 ATAGAAATAATT-GTTTTATGACATAACAAAATGTTATGACAATTTGAAATATATAATTGTTCAA
336 AGAAAAATAATTAG-TTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACCATTTGAAATAAATAAATGTTCAA
* * * * * *
84222 ATGGTCATAACTATTTGAACTA-GTTTAGTAAA-TAGATTTATTTTTTATATCTCTTACTTATTA
400 A-AGTCATAACTAATTGAA-TATGTTCAGAAAACT-GATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTA
** * * ** * * *** * * *
84285 AT-TTTTGAAACATTAGTAAATTACTATTATTTTATACCGAATAGGCTTGTAT-AATGAAAAAAA
461 ATGTACTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAATTTGTATGACT-AGAAACA
*
84348 ATTATTTTATGAC--AAC
524 ATTGTTTTATGACAAAAC
** * * * * * *
84364 AAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTATTCA
1 AAAAGGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* * * * * * * *
84428 ATAAACT-GATTT-AATTTTTAAATCTCTAACTTATGAATTTTTGAAATATTAAT-AAGTAATAT
65 GTAAA-TAG-TTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * ** * *
84490 TGTTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGCTCTA-AAACAATTGTTTTACAAT-A-AAAAT-AAAAGG
127 TATTTTATTTTGAATAAGCCTATATG-AATAGAAACAATT-ATTT--AATGACAAAATAAAAAGA
* * ** * * * * *
84551 TCATAA-TAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGAACTTATTCAATAAAC
188 TCATAACT-ATTTCAAATAAATAATTACTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAAC
* * ** * * * * *
84615 -AATTGT-TTTTT--AAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTTG-CATGTTAATAAATTAGTATTATTT
252 AAATT-TATTTTTAAAATCTT-TTACTTATCAA-TTTCAGAAATATTAAAAAACTAATATTATTT
* * * * *** * * * * * *
84674 TATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAAT
314 TAATCTAAATAAGCTTGTATGAAGAAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACCAT
* * * * * * * * * *
84739 TTAAAATAGATAATTGTTCTCATAGGCTTAACTATTTGAAT-GGTTC-GATAGACAT-ATTTACT
379 TTGAAATAAATAAATGTTC-AAAAGTCATAACTAATTGAATATGTTCAGA-AAAC-TGATTTA-T
* * ** * * * * *
84801 TTTTTGAA----TCCTTATTAAT-TTTTGAAATAGTAATAAGTTGGTATTATTTAATTCTAAATA
440 TTTTTAAATTTTTACTTATTAATGTACTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATA
* * * * * *
84861 ATTTTTACGAATACCAATTATTTTAAATAACTATATTATTTTACGACAAAAC
504 A-ATTT--G--T----ATGA--CTAGA-AAC-A-ATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * * *
84913 AAAATGTCATGACGATTTGAAATAGATGATAGTTCAAAT-GGCATGACTATTTGAACTTGTTTAG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* * * *
84977 TAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTAACTTC-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATT
66 TAAATAG-TTTCATTTTTTAAATCTCTTAC-TCATTAATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATT
*** * * * ** * ** *
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128 ATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATAGAAACAA-TTATTTAATGACAAAATAAAAAGATCAT
* * * * * * * ** *
85103 AACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGCTCGGTAAACATATT
192 AACTATTTCAAATAAATAATTACTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAAATT
* * * * * * * * * * **
85168 TATTTTTAAAATCTTTTAATTATTAATTTTTAG-AATTTTAATAAATTAGTGTTATTTCATTCCG
257 TATTTTTAAAATCTTTTACTTATCAA-TTTCAGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAATCTA
* * * * ** * * *
85232 AATAAGCTTGTATGAATAGAAGTAATTAGTTTATGACAAAACAATTGGTCAT-ACTGATTGGAAA
321 AATAAGCTTGTATGAAGAAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAAC-CATTTGAAA
* * * * * * ** *
85296 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATGTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTCAAAT
385 TAAATAAATGTTCAAA-AGTCATAACTAATTGAATATGTTCAGAAAACTGATTTATTTTTTAAAT
* * * ** * * * *** *
85361 ATTTGCTTATTAGT-TTTTGGAATATTAATAAAGTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCATGGAT
449 TTTTACTTATTAATGTACT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAATTTGTAT
* * * *
85425 GAATAGAACCAATTGTTTTCTGACAAAAT
513 GACTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
85454 AAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGTGATAACTATTTCAACTTGTTCAG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* ** * **
85519 TAAATAGATTCATTGTTTTAGTTCTCTTACTCACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
66 TAAATAGTTTCATT-TTTTAAATCTCTTACTCATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * * * * *
85584 TTTTA-TTTCAATTAAGTTTATATTAACT-GAAA-ATTTTTTTTATTACAAAA-CAAAAGGTCAC
129 TTTTATTTTGAA-TAAGCCTATATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAATAAAAAGATCAT
* ** * * * * ** * *
85645 AA-TGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAA-TTGTTTGATATACATA
192 AACT-ATTTCAAATAAATAATTACTCAAACAATCATAACTATTT-AAACTTGTTCAATAAACAAA
* * * * *
85708 TTT-TTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTATTA-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT
255 TTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATCAATT-TCAGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAATC
** * * * * * * * * * *
85770 TGTATGAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACCAAACAAAAAGTCATAACAATTTG--
319 TAAATAAGCTTGTATGAAGAAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACCATTTGAA
* * * ** ** **
85833 -----T---TGTTCAAATAGTCATAACGATTTAAACT-TGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAA
384 ATAAATAAATGTTCAAA-AGTCATAACTAATTGAA-TATGTTCAGAAAACTGATTTATTTTTTAA
* ** *
85889 ATCTTTTACTTATTAATTGT-CTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-TGAATAAACTTG
447 AT-TTTTACTTATTAA-TGTACTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAATTTG
*
85952 TATGAAC-AGATAA-AATCT-TTTTATAACAAAAC
510 TATG-ACTAGA-AACAAT-TGTTTTATGACAAAAC
*** * * * * *
85984 AAAAGGTTATATTGATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACATGTTCGG
1 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
* ** * *
86049 TAAATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTAATTACAATT--TTTTGGAATATTAATAACTTAATATT
66 TAAATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTT-ACT-C-ATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * *
86112 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAA
128 ATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAA-TAGAAACAATTATTTAATGACAAAATAAAA
86169 TTAAAAAGAG
Statistics
Matches: 3101, Mismatches: 683, Indels: 473
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (541 bp):
AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG
TAAATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTTGAATAAGCCTATATGAATAGAAACAATTATTTAATGACAAAATAAAAAGATCATAACT
ATTTCAAATAAATAATTACTCAAACAATCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAAATTTATT
TTTAAAATCTTTTACTTATCAATTTCAGAAATATTAAAAAACTAATATTATTTTAATCTAAATAA
GCTTGTATGAAGAAAAATAATTAGTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACCATTTGAAATAAATA
AATGTTCAAAAGTCATAACTAATTGAATATGTTCAGAAAACTGATTTATTTTTTAAATTTTTACT
TATTAATGTACTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAATTTGTATGACTAGAA
ACAATTGTTTTATGACAAAAC
Found at i:83946 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 83898--83992 Score: 172
Period size: 43 Copynumber: 2.2 Consensus size: 43
83888 ATTAATAAAT
*
83898 TTGTTTTATTTTATTCGAACTAAGTTACTAAGAACTGAAAAAA
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*
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1 TTGTTTTATTTTATTCGAACTAAGTTACTAAGAACTAAAAAAA
83984 TTGTTTTAT
1 TTGTTTTAT
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TTGTTTTATTTTATTCGAACTAAGTTACTAAGAACTAAAAAAA
Found at i:84285 original size:181 final size:181
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Indices: 83982--86168 Score: 1533
Period size: 181 Copynumber: 12.1 Consensus size: 181
83972 GAACTAAAAA
** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
84111 AAATATTATTATATTAGTATTATTTTTTTTCAAATAAACTTGTGTTAATAGAAAT
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* * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
84231 ACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAA
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* * * ** * * * *
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130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAAT
* * ** * * *
84347 AATTATTTTATGAC--AACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGCCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
84410 ATTATTTGAACTTATTCAATAAACTGATTTAATTTTTAAATCTCTAACTTATGAATTTTT-GAAA
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* * * * ** *
84474 TATTAAT-AAGTAATATTGTTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGCTCTA-AAAC
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-AATAGAAAT
** * * * * *
84525 AATTGTTTTACAATAAAAATAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTGAT
1 AATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
84590 AACTATTTGAACTTATTCAATAAACA-A-TTGTTTTTT-AATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGCA
65 AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * *
84652 TGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAAT
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT
* * * * ** * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
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66 ACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-
* * * * ** * * *
84826 AATAGTAATAAGTTGGTATTA-TTTAATTCTAAATAATTTTTACGAATACCAATTATTTTAAATA
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAA-GCTT--G--T----ATGA--ATAGA-A
84890 ACT
180 A-T
* * * * * * * *
84893 ATATTATTTTACGACAAAACAAAATGTCATGACGATTTGAAATAGATGATAGTTCAAAT-GGCAT
1 A-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * *
84957 GACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTCTTAATTTTTAGAA
65 AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * ** * *
85022 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTTTACAAATTGAAAC
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT
* * ** * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * ** * * * *
85139 ACTATTTAAACTTGCTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTAATTATTAATTTTTAGAAT
66 ACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAT
* * * * * *
85204 TTTAATAAATTAGTGTTATTTCATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAGT
131 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT
** * * *
85255 AATTAG-TTTATGACAAAACAATTGGTCAT-ACTGATTGGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
1 AATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * * *
85318 TAATTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTCAAATAT-TTGCTTATTAGTTTTTGG
64 TAACTATTTGAACT-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG
* * **
85381 AATATTAATAAAGTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCATGGATGAATAGAACC
128 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT
* * * * * * *
85435 AATTGTTTTCTGACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGTGATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * ** * * *
85500 ACTATTTCAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTGTTTTAGTTCTCTTACTCACTAATTTTTGGAA
66 ACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * *
85565 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAATTAAGTTTATATTAACT-GAAA-
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAT
* * * * ** * * *
85616 ATTTTTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATG
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
85681 ACTATTTGAAATTGTTT-GATATACATA-TT-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTAAAA
66 ACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * *
85743 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GTATGAGCTTGTATGAATAGAAAC
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT
* * *
85795 AATTATTTTATGACCAAACAAAAAGTCATAACAA-TT----T-G----TTGTTCAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
85850 ACGATTTAAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--A
66 ACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAGA
* * * *
85913 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAACAGATAA-
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGA-AAT
* * *** * *
85965 AATCT-TTTTATAACAAAACAAAAGGTTATATTGATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCAT
1 AAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * ** * * * *
86029 AATTATTTAAACATGTTCGGTAAATAG-TTTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA-CAATTTTTTGG
65 AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAG
* * *
86092 AATATTAATAACTTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAAT
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAT
*
86146 AATTTTTTTATGACAAAACAAAA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA
86169 TTAAAAAGAG
Statistics
Matches: 1566, Mismatches: 353, Indels: 171
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 34 0.02
170 49 0.03
171 54 0.03
173 3 0.00
174 1 0.00
175 8 0.01
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177 7 0.00
178 180 0.11
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187 2 0.00
188 2 0.00
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194 35 0.02
195 7 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT
Found at i:85408 original size:361 final size:353
Alignment explanation
Indices: 83982--86168 Score: 1295
Period size: 361 Copynumber: 6.1 Consensus size: 353
83972 GAACTAAAAA
* ** * * * *
83982 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAAAAAAATTGTTCATATAGCC
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAT----AATAATTATTCAAATAGTC
* * * * ** * *
84047 TTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTATTAATTTTTA
62 ATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTT-
* * * * * * * * *
84111 AAATATTATTATATTAGTATTATTTTTTTTCAAATAAACTTGTGTTAATAGAAATAATTGTTTTA
125 GAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AA-AATTATTTTA
* * * * * *
84176 TGACATAACAAAATGTTATGAC-AATTTGAAATATATAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGA
187 TGACAAAACAAAAGGTCAT-ACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * * *
84240 ACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAACATTAGTAA
251 A-TTG-TTAGAAAACAAATTTA-TTTTTAAATAT-TTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAA
* * ** * * *
84304 ATTACTATTATTTTATACCGAATAGGCTTGTAT-AATGAAAAAA
311 ATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAAC
* ** * * *
84347 AATTATTTTATGAC--AAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGCCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAAT-AATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * ** ** * * * *
84409 AATTATTTGAACTTATTCAATAAACTGATTTAATTTTTAAATCTCTAACTTATGAATTTTTGAAA
64 AACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AA
* * * * * ** * * **
84474 TATTAAT-AAGTAATATTGTTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGCTCTAAAACAATTGTTTTACAA
128 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATG-AATAGAA-AATTATTTTATGA
* * * * * *
84538 TAAAAATAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGAACT
190 -CAAAACAAAAGGTCATACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T
* * * * * *
84603 TATTCA-ATAAAC-AATTGT-TTTTT-AATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGCATGTTAATAAATT
253 TGTT-AGA-AAACAAATT-TATTTTTAAATAT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
* *** * * *
84664 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAAT
314 AATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * * * ** * *
84704 AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCTCATAGGCTTA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATA-ATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * *
84769 ACTATTTGAA-TGGTTCGATAGACATATTTACTTTTTTGAATC-----CTTATTAATTTTTGAAA
65 ACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AA
* * * * * ** * * *
84828 TAGTAATAAGTTGGTATTATTTAATTCTAAATAATTTTTACGAATACCAATTATTTTAAATAACT
128 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAA-GCTT--G--T----ATGA----ATAGAA--
* * * * *
84893 ATATTATTTTACGACAAAACAAAATGTCATGAC-GATTTGAAATAGATGATAGTTCAAAT-GGCA
177 A-ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-ACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
84956 TGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTCTTAATTTTTAGA
240 TAACTATTTGAA-TTG-TTAGAAAACAAATTTA-TTTTTAAATAT-TTACTTATTAATTTTTAGA
* * * ** *
85021 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTTTACAAATTGAAAC
301 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * *
85074 AACTGCTTTATGACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAT-AATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
85139 ACTATTTAAACTTGCTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTAATTATTAATTTTTAGAAT
65 ACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAT
* * * *
85204 TTTAATAAATTAGTGTTATTTCATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAGTAATTAGTTTATGAC
129 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAATAGAA--AATTATTTTATGAC
** * * *
85269 AAAACAATTGGTCATACTGATTGGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATGTG
191 AAAACAAAAGGTCATACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TG
* * *
85334 TTCAGAAAACAAATTTATTTTTCAAATATTTGCTTATTAGTTTTTGGAATATTAATAAAGTT-AT
255 TT-AGAAAACAAATTTATTTTT-AAATATTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAAT
* * *
85398 ATTATTTTATTCAAAATAAGCATGGATGAATAGAACC
317 ATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * * * *
85435 AATTGTTTTCTGACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGTGATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATA-ATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * ** * * *
85500 ACTATTTCAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTGTTTTAGTTCTCTTACTCACTAATTTTTGGAA
65 ACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATT-TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAA
* * * * *
85565 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATTAAGTTTATATTAACT-GAAAATTTTTTTTATT
128 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA-TAAGCTTGTATGAA-TAGAAAA-TTATTTTATG
* * * * *
85628 ACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAAT
189 ACAAAACAAAAGGTCATACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AAT
* * * * * *
85693 TGTTTGATATACATATTT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTAAAATATTAATAAATTAA
253 TGTTAGA-AAACAAATTTATTTTTAAAT-ATTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAA
*** *
85757 TATTATTTTAATT-TGTATGAGCTTGTATGAATAGAAAC
316 TATTATTTT-ATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * *
85795 AATTATTTTATGACCAAACAAAAAGTCATAACAATTTG---------TTGTTCAAATAGTCATAA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * *
85851 CGATTTAAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AAT
66 CTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAT
* * * * *
85915 ATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAATAAACTTGTATGAACAGATAAAATCT-TTTTATAAC
129 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAG--AAAAT-TATTTTATGAC
* * * * * * *
85979 AAAACAAAAGGTTATATTGATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACATG
191 AAAACAAAAGGTCATACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG
* * * * * * * * *
86044 TTCGGTAAA-TAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA-CAATTTTTTGGAATATTAATAACTTA
255 TT-AGAAAACAAATTT-A-TTTTTAAATAT-TTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTA
* *
86107 ATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAAT
315 ATATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAC
*
86146 AATTTTTTTATGACAAAACAAAA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA
86169 TTAAAAAGAG
Statistics
Matches: 1416, Mismatches: 322, Indels: 182
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
348 18 0.01
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365 13 0.01
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (353 bp):
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAATAATTATTCAAATAGTCATAA
CTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATAT
TAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAATTATTTTATGACAAAAC
AAAAGGTCATACTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTAGAA
AACAAATTTATTTTTAAATATTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
TTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
Found at i:86309 original size:300 final size:298
Alignment explanation
Indices: 85914--86468 Score: 687
Period size: 300 Copynumber: 1.9 Consensus size: 298
85904 ATTGTCTTAA
* * **
85914 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAATAAACTTGTATGAACAGATAAAATCTTTTTATAAC
1 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTAAACAAACTTACATGAACAGATAAAATCTTTTTATAAC
* * *
85979 AAAACAAAAGGTTATATTGATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTA-AACAT
66 AAAACAAAAGGTTATATAGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTA-TTAGAA-AT
* * * **
86043 -GTTCGGTAAATAG-TTTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA-CAATTTTTTGGAATATTAATA-AC
129 GGTTAGGTAAACAGAATTC-TTTTTTAAATCTCTTAATTATCAA-TTTTTAAAATATTAATATA-
* * *
86104 TTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGACA-AAACAAA
191 TTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTAACATGAACTGAAATAATTGTTTTAT-A-ATAAACAAA
86168 ATTAAAAAGAGTTTAATTTTTAAAATCTTTCATTAATTTTTAAAG
254 ATTAAAAAGAGTTTAATTTTTAAAATCTTTCATTAATTTTTAAAG
* *
86213 TATTAATAGATTTGTATTATTTTATTCTAAACAAACTTACATGAACA-A-AAACATTTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-TAAACAAACTTACATGAACAGATAAA-ATCT-TTTTAT
* *
86276 GACAAAACAAAAGGTTATAATAG-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTAGAA
63 AACAAAACAAAAGGTTAT-ATAGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTAGAA
* * * *
86340 TTGGTTAGGTAACCAGAATTCTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATATAT
127 ATGGTTAGGTAAACAGAATTCTTTTTTAAATCTCTTAATTATCAATTTTTAAAATATTAATATAT
* * ** * *
86405 TCATTTTATTTTATTTTGAATAATCTAACATGAATTGAAATAATTGTTTTATAATAAACAAAAT
192 TAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTAACATGAACTGAAATAATTGTTTTATAATAAACAAAAT
86469 GTAGTAAAAA
Statistics
Matches: 217, Mismatches: 29, Indels: 20
0.82 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
298 4 0.02
299 43 0.20
300 161 0.74
301 9 0.04
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ATTATTTTATTTCAAATAAGCTAACATGAACTGAAATAATTGTTTTATAATAAACAAAATTAAAA
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * *** * *
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* *** * * * *
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** * * * * *
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** **
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* * *
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* * * * * **
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* ** * * * * **
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* * * ** * * *
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* ** ** * *
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* * * ** * *
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** * *
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* *
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* ****
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * ** * *
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* **
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* * * ***
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** * * * *
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* * * * ** * **
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** * * ** * *
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** * * * *
89750 ATAA-TAATTTGAACTGGTTTAGAAAACA-ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTT
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* * * ** * * * *
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* * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * *
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* ** * * ** *
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* ** * * *
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* *
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* ** * * * *
92353 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCA
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* ** * * * * *
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* * *
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1 ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-A
** * * * *
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* * **** * * *
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*** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * ** * * * * * * *
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* * * * * * * ** * * * * ** *
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* * * * * * * **** *
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* * * * * *
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*
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166 TTTAAATCTCTTACTT
* *
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1 ATTAA-TT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * *
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** * *
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** ** * * **
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* * * * * *
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65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** *** * ** *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * * *
93707 TATAACTAATTGAAC-CAGTTTGGTAAATAGATTTTATTTATTAAA--TCTT--TT
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* * ** * * *
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* * * * * ** *
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* ** * *
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* * * * **
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* * * * * * * *
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* ** ** * *
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* * * * ** * * ***
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1 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA
* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * *
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130 TAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTT
* * * *** *
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* * * * * * * * * * * *
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66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
** **** *
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Statistics
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * ***
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* * * * * * * *
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* ** * * **
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* * * * * * *
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* * *
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255 CAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--T
*
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* * * * * * * * *
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** * * * * * **
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** * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* *
87654 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAAAA
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAA
* * * * * * *
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65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * * * * **
87784 TATTTTAACTGATTTGGTAAATATATTTATTTTTAAAATTTCTTACATATTAATTTTAAAAATAT
130 TATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * *
87849 TAATAAATTAGCATTATTTTATTCTATCTAAGCTTATACT-AACTGAAACAATTATGTTGTGACA
195 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-ATAAGCTTATA-TGAACAGAAACAATTGT-TTATGACA
* * * * * *
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257 AAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TA-
**
87978 TTGGTAA-ATGGA-TT-TTTTT-AAATCTCTTTTTGTTATTA
318 TTGGTAACA--GATTTATTTTTCAAA--TCTTTTACTTATTA
* * * * * * *
88016 ATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGGTTGTATGAACTAAAGCAA
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* * * * * * *
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65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * *** *
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129 CTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * ** **
88209 TTACTAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAGTAAGTTTGCACAAACA-AAACAATTGTTT-T-ACA
194 TTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAA-TAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTATGACA
* * * * * * * *
88270 AAAAAAAAATGTCATAACAATTGGAAATAGATAATGGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAAT-TA
257 AAACAAAGA--TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATATT
* * **
88334 GTTCAACAATTAGATTTATTTGTT--AATTTTCTTGGTTATTA
320 GGT-AAC----AGATTTATTT-TTCAAATCTT-TTACTTATTA
* * * * * * *
88375 AGTTTTGAAATATTATTAAA-TAGTATTATTTT-GTTCTAAATAA-CATAGTATGAACAGAACCA
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGC-TTGTATGAACAAAAACA
* * * * * *
88437 ATTATTTGATGACAAAATAAAATG-TTATAATGATTTGAAATAGAAAATTATTCAAATGGTCAAA
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* * * ** * * *
88501 AATATTTGAAAT-AGTTTGGTAAGTAGATTT-TCTTTTTAAATATCATACTAATTAATTTTCT-A
128 ACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGA
* * ** * *
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190 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAAT-TGTTTAT
* * * * *
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* * * * *
88690 TGGTTCAGTAAATAGACTTATTTTTTAAATC----ACTTA-TA
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* * * * ** *
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* ** * ** * **
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130 TATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * *
88921 TTACTAAATTATTATTATTTTATTTTG-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTATC
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* * * * *
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*
89048 TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTC-AATC---T-CTTATT-
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***
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* * ** * * * * *
89147 ATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAATTAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAA
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* * * *
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* * * **
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* * ** * *
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257 AAACAAA--GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC----T--A-TT-
* ***
89403 TGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCACACTTATTA
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** * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
89640 TATTAAATTAATATTATTTTTATCCGAATAAGCTTATATGGTCAGAAACAATTAATTTATGAGAA
195 TAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT-GTTTATGACAA
* * ** * * *
89705 AACAAAGGTCATAATGATTTGAGTTTGATATTTGTTCAAATAGTCATAA-TAATTTGAACTGGTT
258 AACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-T--AT
** * *
89769 TAGAAAACA-ATTTTAGTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTA
319 T-GGTAACAGA-TTTA-TTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * * * **
89807 ATTTTTGAAATATTAAAAAAGTATTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTATAAACTGAAACAAT
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * ** *
89872 TTTTTTATGAAAAAACAAAAGGA-CATAACAACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AA
66 TATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
*
89934 TCTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTG-
129 -CTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGA
* * * * * * *
89997 AATGTTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTCTGAACTA-AAATAATTGTTTTA
190 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAAC-AGAAACAATTG-TTTA
* * * * * * * *
90061 TGACCAAGCAAAAGGTTAGAACTATTTGAAATAGATAATTATT-ATAATAGTCTTAACTATTTGA
252 TGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * *
90125 ATTGGTTCAGCAAACACATGTATTTTTTAAATC---T-CTTACTA
315 A-T-ATT--GGTAACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * * *
90166 ATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTTTTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAATAA
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAA
* * * * * *
90230 TTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAA-CATTTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCCTAA
65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * * * *
90293 CTATTTGAATTGTTTCGATGAACAGATTTAGTTTTTAAATATCTT-GTCTATTACTTTTT-AGAA
129 CTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGA-AA
* * * * * * *
90356 TATTAATAAAATA-TATTATTTTA-TCATGACTAAACTTGTATGAAGAGAAATAAGTT-TTTGTG
192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC--GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA-TTGTTTATG
*** * * * * *
90418 ACAGAATGGAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAA-TAATATGAAC
254 ACA-AAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-
* * * * *
90482 T-TGCTCGATAA-ATTGATTTATTTTTTTATAT-TTTTTCCTATTA
316 TAT--T-GGTAACA--GATTTA-TTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * *
90525 ATTTTTGGAATATTAATAAAATT-GTATTATTTTATTTCG-ATACGCTTGTATGAACAAAAACAA
1 AATTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
** * * * * * *
90588 TTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCA-ACT-ATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAATCATAAC
65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* ** *** * * * **
90651 TATTTGAATTTTTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGGGATAT
130 TATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * *
90715 TAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TGATTTTATGAC
195 TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCG-AATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG--TTTATGAC
* * * * * * * *
90778 AAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAGTAGTCATAACCAATTGAACTTG
256 AAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TA
* * * *
90843 TCTAGTAAACAAATTCATATTTT-AAATCTCTTA-TTCATTA
318 T-TGGT-AACAGATTTAT-TTTTCAAATCTTTTACTT-ATTA
* * * * * * * * * *
90883 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTGTTTCATTTTGAATAATCCTATATGAACTAATA-AAT
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * * * * * * * *
90947 TA--GTAT-------TAATA-ATTATGA-GATTTGAAATAGATAATTATTTAACTAGTTATGACT
66 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * ** * * *
91001 ATTTAAATTTG-TTCGATAAACATATTT-TTTTGAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCGAAATAT
131 ATTTGAA-CTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * *
91064 TAATAAATTAATATTATTTAATAT-GAACAAGCTTATATGAACA-AAACAATTGCTTTATGATAA
195 TAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG-TTTATGACAA
* * * * *
91127 AACAAA-AGTCATTATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTT
258 AACAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA---TAT
* * *
91191 TGGTAAATAGTTTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-
319 TGGT-AACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * ** * *
91228 AGTTGTCT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTAAAATGAGCTTGTATGAATAGAAAA-
1 AATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAC
* * ** * * * *
91291 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATG
63 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
** * * *
91356 ACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAGATTCATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA
128 ACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * * * * *
91420 TATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTGGAATCAGCTTGTAAGAATAGAAAGAGTTGTTTTGTGA
192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG-TTTATGA
* * * * * * * *
91485 CAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTAAAATAGTTATAACTATTTGCACTG
255 CAAAA-CAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AAT-
* * * * ** *
91550 GTTAGGCCT-ATAGATTTTTTTTTTAAATCCATTACATATTA
317 ATT-GG--TAACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * * * * *
91591 AATTTT-AGAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATATGATTGTATTAATAGAAACAA
1 AATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
* * * ** * * * * * *
91655 TTGTTTTATGAC-AAACAAATGGTCATAACAACTTGAAACAAATAATTGTTCAAATTGTTATAAC
65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * ** *
91719 TAATCGAACT-AGTTTGGTAAATAGATTTATTTACTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAACA
130 TATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * *
91779 TTAATAAATT-GATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATAAACAAAAATATTTGTTTTACGAC
194 TTAATAAATTAG-TATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG-TTTATGAC
* ** ** * * * * *
91843 AAAACAAAAGGTCGGAGTGATTTGAAATAGGTAATTCTTCTAATAATCTTAACTATTTGAAATAG
256 AAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATA-
* * * *
91908 TTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-TCT-
318 -TTGG-TAACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTAT-TA
* * * * *
91947 AATTCTTGGAATATT-AT---TAAG--TTA--GTA-TT--AATAAGCTTGTGTGAGA-AGAAACA
1 AATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACA
* *** *
92000 ATTGTTTTATGA-AAAA-ATAAAGATCATAGCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
64 ATTATTTTATGACAAAACA-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * **
92063 ACTATTTGAACT-ATTTCGATAAATAAATCTAGTTTTTAAA--TC--ACTTATTACTTTTCAAAA
128 ACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * ** ** *
92123 TATTAATAGATCAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAATAATTGTTTTATGA
192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG-TTTATGA
* * * * * * *
92188 CAAAACAAAAAATCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATGGAT-ATGATTATTTGAGCT
255 CAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGA--A
* * ** *
92252 TATTCAGTAAACATATTTA-TTTTCTAAATCTCCTACCTATT-
316 TATT-GGT-AACAGATTTATTTTTC-AAATCTTTTACTTATTA
* * * * *
92293 AATTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAA
1 AATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
* * * * * *
92357 TTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAA
65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ** * * * * *
92421 -TAATATGAACTTCCTT-AGTAAACATATTTACTTTTTAAAACTTTTACTTATTAATTTTT-AGA
129 CT-ATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-A
* * *
92483 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTTGAATATGCTTATATGAACAGAAACAATTGGCTTATG
191 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT-GTTTATG
* * * * *
92548 AC-AAACAAAAGGTCATATCTATTTGAAAGAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA-A
254 ACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATA
* *
92611 TTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTGT-AAAT-TTTTACTTATTA
318 TTGGT-----AACAGATTTATTTT-TCAAATCTTTTACTTATTA
* * *
92653 ATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATTAACAAAAACA
1 AATTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
* * * * * *
92716 ATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATATATAGTTGTTCAAATAGTCATAA
64 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ** * * * * *
92781 CCATTTGAACTTTTTTGGTAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATA
129 CTATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * *
92846 TTAATACATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAGCTTAAATGAACTA-ATACAATTGTTTTATGGC
194 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAAC-AGAAACAATTG-TTTATGAC
* * * * * * * *
92910 AAAACCAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-ATCCAATAGTTATGA-GATTTGAA-ATA
256 AAAA-CAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATATT
* * * * *
92972 GATAATTATTCAAATAGTATGACTATTT-GAA-CTTGTT-C-TATAA
320 GGT-A--A--CAGAT--T-T-A-TTTTTCAAATCTT-TTACTTATTA
* * ** * * * **
93015 ACATATTT---ATTTTTA-AAATCTTTTACTTA-TTAATTGTTGAA-ATA--TT-AAT-AA-ATT
1 A-AT-TTTGAAATATTAATAAAT-TAGTA-TTATTTTATT-TCGAATA-AGCTTGTATGAACAAA
* * * * * * * *** * *
93069 AA-TATTATTTTAATCA-AATAAGCTTATATGAACAAAAAT-AATTGTTTTATGACAA--A-ACA
60 AACAATTATTTT-ATGACAA-AA-C--AAAAGATC-ATAATGATTTGAAATA-GATAATTATTCA
* * * * * * * * * *
93128 AAAAGTCATAACGATATGAAATAAATAATTC-TTCAAATAGTTTTAATTATTTGAACTTATTGGG
118 AATAGTCATAACTATTTG----AACTGATTCGGT-AAACAGATTT-ATT-TTTTAA---A-T--C
* *
93192 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTAAGTTGTCTAAATATTAATAAATTTA-TATTA
170 T---C----TTA---CTT--A----TTA-ATTT---TTG---AAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * * * * *
93256 TTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATACAAAAAATTATTTTATGA-AAAATCAAAAGGTTATA
211 TTTT-ATTCG-AATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT-GTTTATGACAAAA-C-AAAGATCATA
* * * * * * **
93319 GCAATTTAAAACAAATAATTGTTCAAATAGTCATAGA-TATTTGAACTTTTTCAATAAACAGATT
271 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAA--TATT-GGT-AACAGATT
*
93383 CAATTTTT-AAATC---T-CTTATTA
331 -TATTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* ** ** * ** * *
93404 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAAAATTATACTATTAT-GAATCAGCTTGTGCGAACAGAATCAA
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
* * * * *
93468 TTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTTATAAC
65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * *** * ** * * *
93533 TATTTGTACT-AGTCAGGCCCATAGATTCCTTTTTCAAATC-CATTACTTACTAAGTTTTAGAAA
130 TATTTGAACTGATTC-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTTGAAA
* * * * * * * *
93596 -ATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCGAATAAGATTGTGTTAATAGAAACAATTATTTTATGA
192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT-GTTTATGA
* * * * * * * *
93660 CGAAACAAATGGTCATAATGACTTGAAA-AAATAATTGTTCAAATTA-TTATAACTAATTGAACC
255 CAAAACAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAA-T
*
93723 AGTTTGGTAAATAGATTTTATTTATT-AAATC--TT--TTATTA
317 A--TTGGT-AACAGA-TTTATTT-TTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * ** * * * *
93762 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATCTTATTTTGAGCAAACTTATATGAACAAAAATATT
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * * ** *
93827 TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAACCTTAACT
66 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * ** * * * *
93892 ATTTGAA-TTAGTTAGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAA-TTTTCAGAATA
131 ATTTGAACTGA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATA
* * * * * * * *
93955 TTAGTAGATTAGTATTTATTTATTTATTTATTTTGAATAAGCTTACATGAAGATAAATAATTATT
194 TTAATAAATTAG----TA-TTA--T-TTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT-GT
* * * * * *
94020 TTATGATAAAACCAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTT
249 TTATGACAAAA-CAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * **
94085 GAACTGGTTTGGTAAGTATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATT-
313 GAA-T--ATTGGTAA-CAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * ** *
94131 AATGTTTGAAATACTAATCAATTAGTATTATTTTCTTCCGAATAGGCTTGTTTGATGAAAAATAA
1 AAT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
* * * * * *
94196 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAAT
65 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * * *
94261 TATTTAAACTAATTTGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAACTTTTGAAAAA
130 TATTTGAACTGATTCGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * *
94321 ATAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGAC
194 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAAC-AGAAACAATTG-TTTATGAC
* * *
94385 AAAAAAAAAAGTCATAACGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT
256 AAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--T
* * * * * *
94449 GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTCAGATCTCTTGCTTATTA
317 -ATTGGT-AACAGATTTA-TTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * **
94491 ATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGAATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAAT
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * * * * * ** * * * * * *
94555 TATTATATAACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATATATAATTGTTCTAACATTCTTATA-
66 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA-AC
* *** * *
94619 TATTTGAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA--TA--AATTTTTGGAATA-
130 TATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* *
94679 T-AT---TTA--A--A--TTA---G--T-A---T-TATGAAAAGAAAAAATTGTTTTATGACAAA
195 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG-TTTATGACAAA
* * * * * *
94724 AGAAAGATCATAAAGATTT-AAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCATACCTATTTAAATTGTTTT
259 ACAAAGATCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA---TATT
*
94788 GGTAAACGGATTTAGTTTTT-AAATC---T-CTTATT-
320 GGT-AACAGATTTA-TTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * *
94820 AATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAA-CTTTGCATGAACAAAAAA
1 AATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGC-TTGTATGAAC-AAAAA
* * * * * *
94883 TAATTGTTTTATGA-AAAAGCAAAAGCTCCTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GAAC
62 CAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TC
* * * ***
94946 ATGATTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC---CTGCCT-A---TT-
125 ATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * *
95002 --A-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ATTGGTATAAATAGAAATAATTGTTTT
189 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTT-ATATGAACAGAAACAATTG-TTT
* * * * * *
95063 ACGACAAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATATTTGTTCAAACAAG-CACAACTATTT
251 ATGAC-AAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTT
* * * * * *
95127 GAACTTGCTTAGTAAACAGATTTGTTTTTTAAATTTTTTACTTAATA
313 GAA--T-ATTGGT-AACAGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * * * * *
95174 ATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTACTA-TTTATTTCAAAAAACACTTGTATGAATAGAAATAA
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-GCTTGTATGAACAAAAACAA
** * * *
95238 TTGGTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAA-GTTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATA
65 TTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
** * * * * *
95301 ACTATTTGAACGTG-TTAAGAAAATAGATGTA-TTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
128 ACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * *
95363 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATG
192 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT-GTTTATG
* * * *
95427 ACAAAACAAA-ATGTCATAACAATTTGAAATAGAAAATCGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-
254 ACAAAACAAAGA--TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
* * * * *
95490 CTTGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
317 ATTGGT--A-ACA--GATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * ** ***
95534 ATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTGATGTAAT
1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * ** * ** ** *
95599 TGTTTTAGGATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTTGACT
66 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * **
95664 ATTTAAACTTG-TTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-TGTCAAAATAT
131 ATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * *
95727 TAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
195 TAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG-TTTATGACAA
* * * * * * * *
95792 AAGAAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAAATGTTCAAATTGTCCTAATTATTTGAATTTAT
258 AA-CAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TA-
* * * * *
95857 TTGATAAACAAAGTTATTTTTTAAAATCTTTTACATATT-
318 TTGGT-AACAGATTTA-TTTTTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * *
95896 GATTATCT-AAATATTAATAAATTTGCATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAA
1 AATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAAC
* * * * * *
95959 AATTATTTTTTGACAAAACAAAAGATTATAACGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATA
63 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * *
96024 ACTATTTAAACTTG-TTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
128 ACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ** *
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192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTGTTTATGACA
* * * *
96136 AAACAAATGATCATAACAATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-TATTGAACTGG
257 AAACAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAA-T--
* * *
96200 TTTAGTAA-ATGATTTATTTATT-AAATCTCTT--TT-TTA
317 ATTGGTAACA-GATTTATTT-TTCAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * * * *
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1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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194 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTG-TTTATGACA
* * * * * * *
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257 AAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T-AT
** * * *
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* * * * * * **
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1 AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
* * * * * * *
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66 TATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * * **
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130 TATTTGAACTGATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATA
* * * * * * * ** * *
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194 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT-GTTTATGACAA
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * ***
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* *
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** * * * * * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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Statistics
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** * * * * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * *
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* * ** ** * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * *
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* * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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*** * * *
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* * * *
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* * *
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* **** * *
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* * * *
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*
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*** ** ** *
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* *
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* *
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* * * *
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** * * ** ** * *
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* * *
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* * * ** *
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** * * * * ** * * * * *
90916 ATTTTGAATAATCCTATATGAACTAATA-AA-TTAGTATTA-ATAAT--TA--T-GA-GATTTGA
62 A-TTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTTTTTATGACAAAATAAAAGGTAAACAATTTGA
* * * * * * * *
90972 AATAGATAATTATTTAACTAGTTATGACTATTT-AA--AT----TTGTTCGATAAAC
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATGAACTTATTCGGTAAAT
* ** * * * * *
91022 ATA-TT-TTTTTGAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTAA
1 AGATTTATTTTTTCAAATC---TACTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * **
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63 T-TCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGT-A-AACAATTT
* * *
91147 GAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-T----TT-TT-GGTAAAT
124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATGAACTTATTCGGTAAAT
* * * * *
91199 AGTTTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAGTTGTCT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTT
1 AGATTTATTTTTTCAAATC---TACTTATTACTT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * *
91262 AATTAAAATGAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAAT
62 -ATTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGG-TA-AACAAT
* * * * ** *
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122 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATGAACTTATTCGGTAAAT
* * * * * *
91380 AGATTCATTTCTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTA
1 AGATTTATTTTTTCAAA--TC-TACTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * * * * * **
91444 TTTGGAATCAGCTTGTAAGAA-TAGAAAGAGTTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGATT
63 -TTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGT-A-AACAATT
* * * * * * * ***
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* * ** * * *
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1 AGATTTATTTTTTCAAAT-C--TACTTATTACTTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * *
91624 ATTCCAAATATGATTGTATTAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAATGGTCATAACAAC
62 ATT-CAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGT-A-AACAAT
* * * * * * *
91687 TTGAAACAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATCGAACTA-G----T-TT-GGTAAAT
122 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATGAACTTATTCGGTAAAT
** * *
91741 AGATTTATTTACT-AAATCT-CTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATT-GATATTATTTTATT
1 AGATTTATTTTTTCAAATCTACTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTA-T
** * * * * * * * * * ***
91803 TTGAATAAACTTATATAAACAAAAATATTTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCGGAGTGATTTGA
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* * * * * * * *
91868 AATAGGTAATTCTTCTAATAATCTTAACTATTTGAA--AT--A-GT-TT-GGCAAAC
126 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATGAACTTATTCGGTAAAT
* * * * *
91918 ACATTTATTTTTT-AAATCT-CTTACTTTCTAATTCTTGGAATATT-AT---TAAG--TTA--GT
1 AGATTTATTTTTTCAAATCTACTTA-TTACT--TT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * *
91973 ATT--AATAAGCTTGTGTGAGA--AGAAACAATTGTTTTATGAAAAAAT-AAAGATCATAGCAAT
62 ATTCAAATAAGCTTGTATGA-ACTA-AAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGT-A-AACAAT
* * * *
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* * * ** * *
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1 AGATTTATTTTTTCAAATCTACTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
** ** * * * ** ** *
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* * * *
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* * * * *
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1 AGATTTATTTTTTCAAA--T-CTACTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * * * ** *
92327 TTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTATT
63 -TTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGT-A-AACAATT
* * * * * *
92391 TGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCAT-A--A--T-AA-TATGAACTTCCTT-AGTAAAC
123 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATGAACTT-ATTCGGTAAAT
* * * * *
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1 AGATTTATTTTTTCAAA--TCTACTTATTACTTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * * ** * * *
92508 TCTTGAATATGCTTATATGAAC-AGAAACAATTGGCTTATGAC-AAACAAAAGGTCATATCTATT
63 T-TCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGT-A-AACAATT
* * * ***
92571 TGAAAGAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG----A--AA-TTGTTCAAAAAAT
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* * *
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1 AGATTTATTTTTTCAAA--TCTACTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
* * * * *
92687 TTCAAAATAAGCTTGTATTAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTT
63 TTC-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATT-TTTTATGACAAAATAAAAGGT-A-AACAATTT
* * * * *
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124 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATGAACTTATTCGGTAAAT
* * * * * *
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1 AGATTTATTTTTTCAAA--TC-TACTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * **
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*
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*
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ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTATGACG
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* *
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* * *
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193 ATAATT
93158 CTTCAAATAG
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ATTATCCAATAGTTATGA
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* * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* *** * * * *
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* * *
93214 CTTTTACTTTTAAGTTGTCT-AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTG
252 CTTTTA---TTAA-TT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAA-CTTA
* * * * * * *
93276 TATGAATACAAAA-AATTATTTTATGA-AAAATCAAAAGGTTATAGCAATTTAAAACAAATAATT
309 TATGAACA-AAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
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372 GTTCAAATAAG-CTTA-ACTATTTGAACTTGTT-AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * * **
93398 -TTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAAAATTATA-CTATTATGAATCAGCTTGTGCGA-A
434 GTTATTAATTTTAGAAATTAGTAATTAATT--TATTATATTTATTTTGAATAAGCTTATATGAGA
* * * **
93459 CAGAATCAATTGTTTTGTGAC-AAAACAAAAGGTCATAATG
497 TA-AAT-AATTATTTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * * *** **
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1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACAT--ATTTA
* ** * * *
93562 TTTTTCAAATCCAT-TACTTACTAA-GTTTTAGAAA-ATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCG
64 TTTTTTAAAT-TTTCTACTTATTAATG-TTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTTTCCG
* * * * * * * * *
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* ** * * * *
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189 AAATAATTGTTCAAATGACCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAACTA-A-TTTATTT-TTAAA
* *
93752 TCTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATCTTATTTTGAGCA-AACTTATATGA
251 TCTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA--ATAACTTATATGA
* * * *
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314 ACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * *
93881 TAACCTTAACTATTTGAA-TTAGTTAGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAAT
379 TAAGCTTAACTATTTGAACTT-GTTAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAT
*
93945 TTTCAGAATATTAGTAGATTAGTATTTATTTATTTATTTATTTTGAATAAGCTTACATGAAGATA
443 TTT-AGAA-ATTAGTA-ATTA--ATTTA-TTA--TATTTATTTTGAATAAGCTTATATG-AGATA
* * **
94010 AATAATTATTTTATGA-TAAAACCAAAGGTTATAATG
499 AATAATTATTTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* **
94046 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAGTATATTTATT
1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATT
* * * * *
94111 TTTTAAATCTCCTACTTATTAATGTTTGAAATACTAATCAATTAGTATTATTTTCTTCCGAATAG
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* * *
94176 GCTTGTTTGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATA
130 GCTTGTATGAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAAATA
* * * *
94241 ATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAACTAATTTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
194 ATTGTTCAAATGACCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAACTAATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * *
94306 TTAACTTTTGAAAAAATAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAAC
258 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-CTTATATGAACAAAAAC
* * * *
94371 AATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCAAAT-AGTCA
322 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAAG-CT
* * * *
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385 TAACTATTTGAACTTG-TTAGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAG-TTATTAATTTTA
* * * *** * *
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447 GAAATTAG-TAATTAATT--TATTATATTTATTTTGAATAAGCTTATATGAGAT-AAATAATTAT
* * * *
94558 TATATAACT-AAACAAAAGGTTAGAACA
508 TTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * ** * ** *
94585 ATTTGAAATATATAATTGTTCTAACATTCTTATA-TATTTGAACTGGTTCAACAAACACATTTAT
1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACA-ACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTAT
* *
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* * *
94699 AA------A-G---AAAA-AATTGTTTTATGACAAAA-GAAAGATCATAAAGATTT-AAGATAAA
128 AAGCTTGTATGATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAA-ATAAA
* * * * ** * ** *
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192 TAATTGTTCAAATGA-CCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAACTAATTTA-TTTTTAAATCTT
** * *
94815 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTGAATAACTT-TGCATGAACAA
255 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAACTTAT--ATGAAC-A
* * * * *
94879 AAAATAATTGTTTTATGA-AAAAGCAAAAGCTCCTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
317 AAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-
* * * * * *
94943 AA-CATGATTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCT-GCCTATTAA-T
380 AAGCTTAACTATTTGAACTTGTTAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATT
* * * ** * * * * *
95005 TAATAAATTAGT-ATT-A-TT-TTAT-TTCA-AATAAAT-TGGTATAAAT-AG--AAATAATTGT
444 TTAGAAATTAGTAATTAATTTATTATATTTATTTTGAATAAGCT-TATATGAGATAAATAATTAT
* * * *
95060 TTTACGACAAAAACAAAAGATCATAACT
508 TTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * *
95088 ATTTGAAATAAATATTTGTTCAAACAAG-CACAACTATTTGAACTTGCTTAGTAAACAGATTTGT
1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAA-TAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTAT
* * * * * * * *
95152 TTTTTAAATTTTTTACTTAATAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTACTATTTATTT-CAAAAA
65 TTTTTAAATTTTCTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TTTCCGAATA
* * * * *
95216 ACACTTGTATGAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAA-TGTCATAA-GTTTTTGAAATA
129 A-GCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATAATG-ATTTGAAATA
* * * *
95279 GATAATTGTTCAAAT-ACTCATAACTATTTGAACGT-GTTAAGA-AAA-TAGATGTATTTTTAAA
190 AATAATTGTTCAAATGAC-CATAACTATTTGAAC-TAATT-TGATAAACTA-ATTTATTTTTAAA
* * *
95340 CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATA
251 -TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-CTTATA
* * * * * *
95404 TGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGAAAATCGTTC
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* ** *
95469 AAAT-AGTTATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
376 AAATAAGCT-TAACTATTTGAACTTGTT-AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
* * * * *
95532 TAATTTTTGAAA-TATTAA-TAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGA-ACTGAT
439 TAATTTTAGAAATTAGTAATTAATTTATTA-TA-TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAGA-T-AA
* * * *
95594 GTAATTGTTTTAGGA-TGAAACAAAAGGTCATAACA
500 ATAATTATTTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * **** * * *
95629 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACATATTTATT
1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATT
* * ** * *
95694 TTTAAAATTTTTTACTTATTAATG-TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATA
66 TTTTAAATTTTCTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--TTCCGAATA
* *
95757 AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAA
129 AGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAA
* * * * * * *
95821 ATAAATGTTCAAATTGTCC-TAATTATTTGAATTTATTTGATAAACAAAGTTATTTTTTAAAATC
191 ATAATTGTTCAAA-TGACCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAACTAATTTA-TTTTT-AAATC
* * * * * *
95885 TTTTA-CATATTGATTATCTAAATATTAATAAATTTGCATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTA
253 TTTTATTA-ATT--TT-T-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAA-CTTATA
* * * * * *
95948 TGAATAAAAAAAATTATTTTTTGACAAAACAAAAGATTATAACGATTTGAAATAGGTAATTGTTC
311 TGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
96013 AAAT-AGTTATAACTATTTAAACTTGTTCA-ATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAT
376 AAATAAGCT-TAACTATTTGAACTTGTT-AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
* * * * *
96076 TAATTTTTGAAA-TATTAA-TAA---ATTAGA---A--TT--AT--GC-TAT-T---CTAAACAA
439 TAATTTTAGAAATTAGTAATTAATTTATTATATTTATTTTGAATAAGCTTATATGAGATAAA-TA
* * *
96122 ATTATTTTATGGC-AAAACAAATGATCATAACA
503 ATTATTTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * *
96154 ATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-TATTGAACTGGTTTAGT-AA-ATGATTTA
1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTAT-TTGAACTGGTTTAGTAAACAT-ATTTA
* * * * * * * * *
96216 TTTATTAAA-TCTCT--TTTTTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAC
64 TTTTTTAAATTTTCTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCCGAAT
* * * * **
96278 AAACTTATATGA-ACAAAGACATTTGTTATACAACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATA
128 AAGCTTGTATGATA-AAA-ACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * *** * * *
96341 GATAATTATCCATATTG-TCTTAACTATTT-AAATTGGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAAT
190 AATAATTGTTCA-AATGACCATAACTATTTGAACTAATTTGA-TAAACTAATTTA-TTTTTAAA-
* * * * * *
96404 CTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTTTTATTTTATTTCT-AATAAGTTTGT
251 -TCTT--TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAA-CTTAT
* * * * * * *
96467 ATGAAGATAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTT
310 ATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * *
96532 CAAAT-AG-TTATGATTATTTGAACTGGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TCTACT
375 CAAATAAGCTTA--ACTATTTGAACTTGTT-AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TAGT
* * * ** * **
96593 TATTAATTTTTA-AAA-TATTAA-TAAATTAGTATGATTTTATTTCAAATAGGCTTGCATGATGA
436 TATTAA-TTTTAGAAATTAGTAATTAATTTATTAT-A-TTTATTTTGAATAAGCTTATATGA-GA
* * * * * **
96655 AAAACAATTGTTTTATGA-TAAAATAAAAGTTCATAATG
497 TAAATAATTATTTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * *
96693 ATTT-AAAGTAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGATCTGATTT-GATAAAC-TGATTT
1 ATTTGAAA-TATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTAG-TAAACAT-ATTT
* * * * * * * * * *
96755 ACTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTATTTTATT-TGG
63 ATTTTTTAAATTTTCTACTTATT-AATGTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCCGA
* * ** * * * *
96818 ATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA
126 ATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * *
96883 GATAATTGTTTAAAT-AGTCATAACTACTTGAACTTA-TTCAGTAAAC-AGACTTATTTTTTAAA
190 AATAATTGTTCAAATGA-CCATAACTATTTGAACTAATTTGA-TAAACTA-ATTTA-TTTTT-AA
* * * * * *
96945 ATTTCTTGCCTATTAATTTTTTG-AATATTAACAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATGAGCATG
250 A--TCTT--TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AACTTA
* *** * * *
97009 TATAAATTGAAACAATTATTTTATTACTAAACAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
309 TATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * ** * *
97074 TTCTAAT-AGTCTTTACTATTTAAACTGGTTCGGCAAA-TGCATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
373 TTCAAATAAG-CTTAACTATTTGAACTTGTTAGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT
* * ** * ** * *
97137 TATTAATTTTTAG-AA-TA-TTATTAGTTTAACAATATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATGAACA
436 TATTAA-TTTTAGAAATTAGTAATTAATTT-ATTATA-TTTATTTTGAATAAGCTTATATG-AGA
* * * * * **
97199 GAAACAATTGTTTTATGAC-AAAATAAAA-ATCATAATG
497 TAAATAATTATTTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * * * *
97236 ATATGAGATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGATTTAGTAAACAGATTTAAT
1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATT
* * * * * **
97301 TTTTAAA---TGT-CTTATTAGTTTTTGAAATACTGATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
66 TTTTAAATTTTCTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCCGAATAA
* * ** *
97362 -TTTAGTATGAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-TGTCATAACAATTTGAAATAGA
130 GCTT-GTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATAATGATTTGAAATAAA
* * * * * * *
97425 TAATAGTTCAAATTAACATGACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTC
192 TAATTGTTCAAATGACCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAACTAATTTA-TTTTTAAATCTT-
** * *
97490 AACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTACGAA
255 ---TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AACTTATATGAA
* * * ** * * * * *
97554 TAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTT-TAAT
315 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
*** * *** * * * * * *
97618 AATAATAACTATTTAAACTCACTCGGTAAACAAATTT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTT
380 AAGCTTAACTATTTGAACTTGTTAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTT
* * ** ** *
97682 TTGGAATTTTTAATTTTCATAAATTAGTATTAT-TTTATTTTGAATAAGCTGCTAT-AAATAGAA
445 TAGAAATTAGTAA---T--T-AATT--TATTATATTTATTTTGAATAAGCTTATATGAGATA-AA
97745 -ACGATTGA-TTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACA
501 TA--ATT-ATTTTATGACTAAAACAAAAGGTCATAACA
* * *
97780 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCA-AA--A----CA-T-GTTTAG-AAA-AAAATTATT
1 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACTGGTTTAGTAAACATATTTATT
* * * * **
97834 TTTTAAATTTT-TACTTCTTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTCAAAATA
66 TTTTAAATTTTCTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT-TTCCGAATA
* * ** * * * *
97897 AGCTTGCATGAGCAAAGCCAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAAGAGAA
129 AGCTTGTATGA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATA-AA
* * * * * **
97962 -AATTGTTTAGACA-G-TCATAACTATTTAAACTAATTAGGTCAAAAAAATCTT-TTTTTAATTA
192 TAATTGTTCA-A-ATGACCATAACTATTTGAACTAATTTGAT-AAACTAAT-TTATTTTTAA--A
* *
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251 TCTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
98069 CTTCAAATAA
Statistics
Matches: 3580, Mismatches: 696, Indels: 589
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (535 bp):
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TTTTAAATTTTCTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTCCGAATAAG
CTTGTATGATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
TGTTCAAATGACCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAACTAATTTATTTTTAAATCTTTTATTA
ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAACTTATATGAACAAAAACAATT
ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAGCTTAACTA
TTTGAACTTGTTAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTAGAAATTAGT
AATTAATTTATTATATTTATTTTGAATAAGCTTATATGAGATAAATAATTATTTTATGACTAAAA
CAAAAGGTCATAACA
Found at i:94345 original size:370 final size:363
Alignment explanation
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93637 TAATAGAAAC
* * *
93647 AATTATTTTATGACGAAACAAATGGTCATAATGACTTGAAAAAATAATTGTTCAAATTATTATAA
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* *
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** * *
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* * * * *
93842 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAACCTTAACTATTTGAATTAGTTAG
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* * *
93907 ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTCAGAATATTAGTAGATTAGTATTT
261 ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA---TTTAATTTTAAAAATATAAGTAGATTAGTATTT
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323 ATTTATTTATTTATTTTGAATAAGCTTACATGAAGATAAAT
* * * *
94013 AATTATTTTATGATAAAACCAAA-GGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAA-TAGTCA
1 AATTATTTTATGACAAAA-CAAATGGTCATAATGACTTGAAA-AAATAATTGTTCAAATTA-TCA
* ** * * *
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* * * * * ** * * ** *
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124 AATACTAATAAATTAATATTATCTTATTCCGAACAAACTTATATGAACAAAAATAATTATTTTAT
* * * ** *
94205 GACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAAC
189 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAACCATAACTATTTAAAC
* * *
94270 TAATTTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAACTTTTGAAAAA-ATAA-TA-A--A
254 TAATTAGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTAA-TTTT-AAAAATATAAGTAGATTA
* * ** * *
94329 GTA-GTA-TTA--T-TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA-CTAAAAC
317 GTATTTATTTATTTATTTATTTTGAATAAGCTTACATGAAGAT-AAAT
* * ** * * *
94371 AATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTCATAACGATTTGAAATCAATAATTGTTCAAAT
1 AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGACTTGAAA-AAATAATTGTTCAAAT
94429 AGTCATAACT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGACTTGAAAAAATAATTGTTCAAATTATCACAA
CTAATTGAACCAGTTTGGTAAATAGATTTTATTTATTAAATCTTTTATTAATGTTTGAAATACTA
ATAAATTAATATTATCTTATTCCGAACAAACTTATATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAA
CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAACCATAACTATTTAAACTAATTAG
ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTAATTTTAAAAATATAAGTAGATTAGTATTTATT
TATTTATTTATTTTGAATAAGCTTACATGAAGATAAAT
Found at i:94718 original size:21 final size:23
Alignment explanation
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*
94706 AAATT-GTTTTATGACAAAAGAAA
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94729 GATCATAAAG
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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AAATTAGTATTATGAAAAAGAAA
Found at i:95094 original size:171 final size:171
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94822 TTTTCAAAAT
* * * *
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* * * * * ** *
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*
94961 TG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTGCCTATTA
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* * *
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*
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*
95129 ACTTGCTTAGTAAACAGATTTGTTTTTTAAAT
127 ACTTGCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
95161 TTTTTACTTA
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 18, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
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ATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTAAATAAATTGGCATGAACAAAAAATAATTGTTTTACGA
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GCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTGCCTATTA
Found at i:95308 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 95003--96107 Score: 1068
Period size: 181 Copynumber: 6.1 Consensus size: 180
94993 CTGCCTATTA
* * * *
95003 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ATTGGTATAAATAGAAATAATTGTTTTACGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTT-GTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA
* * * *
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* * * *
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127 TTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * * *
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1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAA-GCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA
* * * *
95249 CAAAACAAAATGTCATAAGTTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACGT
65 CAAAACAAAA-GTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
95314 GTTAAGAAAATAGATGTA-TTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT
129 GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * *
95364 ATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 ATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA
* * * *
95428 CAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGAAAATCGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT
65 CAAAACAAAA-GTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* ** *
95493 GTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
129 GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * ** *
95545 ATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTG-AATAAGCCTATATGAACT-GATGTAATTGTTTTAGG
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATG
** * * ** * *
95608 ATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACT
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** * * * * **
95673 TGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-TGTCAAAAT
128 TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * *
95725 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA
1 ATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
95789 CAAAAGAAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAAATGTTCAAATTGTCCTAATTATTTGAAT
65 C-AAA-ACAAAAGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
95853 TTATT-TGATAAACAAAGTTATTTTTTAAAATCTTTTACATATTGATTATCT-AAAT
127 TTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAAAT
* * * * * * *
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* * * * *
95973 AAAACAAAAGATTATAACGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTG
66 AAAACAAAAG-TCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * *
96038 TTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
130 TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
*
96089 ATTAATAAATTAGAATTAT
1 ATTAATAAATTAGTATTAT
96108 GCTATTCTAA
Statistics
Matches: 757, Mismatches: 140, Indels: 53
0.80 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
179 131 0.17
180 96 0.13
181 340 0.45
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* * * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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252 TTTTATGACA-AAACAAAA-GATCA-TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * *
86512 AATTTGAA-TTAGTTT-GATAAACA--ATTTAATTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAA
314 TATTTAAACTGA-TTTAG-TAAACATGATTT-ATTTTTAAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAA
* * ** * * * * *
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374 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
86638 CAGAACAAAAGGTTTATTTTGTAAATAATTGATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATAGTCATAAC
438 CAAAACAAAA-----A----GT-CATAA-TGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAAC
* * * *
86703 TATTTGAACTGA-TTC-GATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTACCT
492 TATTTGAACTTATTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * *
86751 ATTAATTTT-T-GAAAGATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTCTATGATAAA
1 ATTAATTTTCTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATG--AAT
* * * * * * * * *
86813 AAAAAAACATT-TGTTATATGACCAAACAAAAGGTAACAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAA
62 AGAAACA-ATTAT-TT-TATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* ** * * * *** * * * *
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* * * ** *
86937 TTTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGAATTGAAACAATT
188 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAA--GAAACAATT
* * * * ** * *
87002 GTTTTATGATAAAAAAAAAAGGTCTTAATGATTTCAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACT
251 GTTTTATGA-CAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
** * * *
87067 ATTTGAATTTG-TTCTA-TAAACA-AATTTATTTTTCTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTCAAAA
315 ATTT-AAACTGATT-TAGTAAACATGATTTA-TTTT-TAAATCTCTT-ATT-TTAATTTTTAAAA
* * ** * * * * *
87128 TATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTAAAATAATTGTTTTATGT
374 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
87193 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
438 CAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
87258 ATTT-GGTAAACAGATTTATTTTTCCAAATCTTTTGCTT
503 ATTTCAGTAAACAAATTTATTTTT-TAAATCTTTTACTT
* * * * * *
87296 ATTAATTTTCTA-AATGTTAATGAATTTGGATTATTTTATTCCG-AATAAGCTTGTAAG-ATATG
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATA-G
* * ** * * * * * * *
87358 AAATAAATATTTTATGACTTAACAAAATATTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATGGT
64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * ****
87423 TTTAACTATTTGAACTGATTCCATAAGCACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
129 TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* **** * * *
87488 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCGAATAAACATATATGATCAGAAACAATTGTTTG
194 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAAATAAGCCTATATGA--AGAAACAATTGTTTT
* ** * * * *
87552 ATGACAAAAC-AAAGATCTTAATGATTTGAGATTGAAAATTGTTCAAATAGTCATAATTA-TT--
256 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * * * *
87613 --TGAATTGGT--ACA-GATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAA
321 ACTGATTTAGTAAACATGATTTATTTTT-AAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * *
87673 ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-TA
383 ATTAATATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * *
87737 AAAGATCATAATGATTTCAAATAGAT-AGTCATTCAAATGGTCATAATTATTTTAACTGATTT-G
446 AAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAAAT-GTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCA
* * * *
87800 GTAAATATATTTATTTTTAAAAT-TTCTTACAT
509 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTT
* * * ** *
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1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTA-TGAA-TA
* * * * * * *
87893 GAAACAATTATGTTGTGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAG
63 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** *** * **
87958 TAATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAATGGA--T-TTTTTTAAATCTCTTTTTGTTATTAATTT
128 TTATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTC--TTACTTATTAA-TT
* * * ** * *
88020 TTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGGTTGTATGAACTAAAGCAATTGT
190 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAA-GAAA-CAATTGT
* * * * * * * *
88084 TTTATAACTAAACAAAAGGTCA-AAGCGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCAT
253 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * ** * *
88148 TTGAATTGATTCAACAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
317 TTAAACTGATTTAGTAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * * **
88212 CTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAGTAAGTTTGCACAAAC-AAAACAATTG-TTT-T-ACAAAA
379 ATAAATTAATATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * * * *
88273 AAAAAATGTCATAACAATTGGAAATAGAT-AATGGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTAGT
443 CAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAAAT-GTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATT
** ** * * * **
88336 TCAACAATTAGATTTATTTGTT-AATTTTCTTGGTT
506 TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTT
* * * * *
88371 ATTAAGTTT-T-GAAATATTATTAAA-TAGTATTATTTTGTTCT-AAATAA-CATAGTATGAACA
1 ATTAATTTTCTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGC-TTGTATGAATA
* * * * * * * *
88431 GAACCAATTATTTGATGACAAAATAAAATG-TTATAATGATTTGAAATAGAAAATTATTCAAATG
63 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *** * * * * *
88495 GTCAAAAATATTTGAAA-TAGTTTGGTAAGTAGATTT-TCTTTTTAAATATCATACTAATTAATT
127 GTTATAACTATTT-AAACTGGTTCAATAAATTGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * *** * * *
88558 TTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTCAAA-AAATTTATATTAACAAAAACAA-TA
190 TT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATA-TGA-AGAAACAATTG
* ** * * *
88620 TTTTATGACAAAACATAAAG-TAATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTA
252 TTTTATGACAAAACA-AAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * * *
88684 TTTGAA-TGGTTCAGTAAATA-GACTTATTTTTTAAATCACTTA--TAAATTTTTGAAATATTAA
316 TTTAAACTGATTTAGTAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTTTAATTTTTAAAATATTAA
* * * ** * ** * *
88745 -AAATTAGTTTTATTCTATTCCGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTATTTTATGACAAAAC
380 TAAATTAATATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * *
88809 -AAAAGATCATAATAATTTCAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAC-TAGTTT
444 AAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTA-TTT
* *** * *
88872 -AGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
507 CAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
88905 ATTAATTTTC-AAAATATTACTAAATTATTATTATTTTATTTTG--ATAAGCTTGTATGAATAGA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * * * *
88967 AACAATTGTTTTATTATCGAAA-AAAAG-TTATAACAATTTGAAAAAGATAATTGCTCAAATAAT
65 AACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *** *** * *
89030 CATAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAA--TC-T-CTTATTAATTCTTG
129 TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * *
89091 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGTTGAA-AAACAATT-TTTT
194 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGC--CTAT-ATGAAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * * *
89154 ATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAATTAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGA
256 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA
** * * *
89219 ACTGATTCGGTAAAC-TGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAA
321 ACTGATTTAGTAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * ** ** * * *
89283 AGTAGTATTATTTTATTTGGATAAGAGT-TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAT
383 ATTAATATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
89347 TGTAATAAAT-ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAGAACTATTTGAACTTATGAACTTA
448 AGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAAC-T-T--A--T-
* * * ***
89411 TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCACACTT
505 TTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTT
* * * * **
89448 ATTACTTTT-TTGAATGTTCATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTA-A
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
* * * * * * * *
89511 AACAATTA-TTGATGACTAAATAAAAGGTCA-AGCAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC
65 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-
* *** *** * *
89574 T-TAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCCTA-TTA--AATTTTAG
129 TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *** * * **
89635 -AATCTTATTAAATTAATATTATTTT-TATCCGAATAAGCTTATATGGTCAGAAACAATTAATTT
194 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAAATAAGCCTATAT-G-AAGAAACAATTGTTTT
* * ** ** * * *
89698 ATGAGAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAGTTTGATATTTGTTCAAATAGTCATAA-TAATTTG
256 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTA
* * * * *
89761 AACTGGTTTAGAAAACA--ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAA
320 AACTGATTTAGTAAACATGA-TTTA-TTTTTAAATCTCTT-ATT-TTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * ** * *
89824 AAAGTATTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTTATAAACTGAAACAATTTTTTTATGAAAAAACA
381 AAATTAATATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * ** * * *
89889 AAAGGACATAACAACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTT-GTTC
445 AAAAGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAA-CTATTTGAACTTATTTC
* * * *
89951 GGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTC
508 AGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * *
89985 ATTAATTTT-TTGAATGTTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTG-AATAAACTTGTCTGAACTA-
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * * * * * *
90047 AAATAATTGTTTTATGACCAAGCAAAAGGTTAGAACTATTTGAAATAGATAATTATT-ATAATAG
64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAG
* * ** *** *
90111 TCT-TAACTATTTGAATTGGTTCAGCAAACACATGTATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTT
128 T-TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * ** * * *
90171 TGGAATATTATTAAATTAGTTTTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTT
192 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATG--AAGAAACAATTGTTT
* * * * *
90236 TATGACAAAA-TAAAGATCATAACATTTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTTG
255 TATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
* * * * * * *
90300 AATTG-TTTCGATGAACA-GATTTAGTTTTTAAATATCTTGTCTATTACTTTTTAGAATATTAAT
320 AACTGATTTAG-TAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTAT-T-TTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * * * * * *
90363 AAAAT-ATATTATTTTATCATGACTAAACTTGTATGAAGAGAAATAAGT-TTTTGTGACAGAA-T
381 AAATTAATATTATTTTAT-TTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
** * * *** * **
90425 GGAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAA-TAATATGAACTT-GCT
445 AAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACT-ATTTGAACTTATTT
*** * * *
90487 C-GATAAATTGATTTATTTTTTTATAT-TTTTTCCT
507 CAG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * *
90521 ATTAATTTT-TGGAATATTAATAAAATT-GTATTATTTTATTTCG--ATACGCTTGTATGAACAA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAG
** * * * * *
90582 AAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTC--AACTATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAAT
64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * * *
90645 CATAACTATTTGAATTTTTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTG
129 TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * * * *
90709 GGATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TGATTT
194 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATG-A-AGAAACAATTG-TTT
* * * * *
90772 TATGACAAAATAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAGTAGTCATAACCAATT
255 TATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * **
90836 GAACTTG-TCTAGTAAACA-AATTCATATTTTAAATCTCTTATTCATTAATTTTTGGAATATTAA
319 AAAC-TGATTTAGTAAACATGATTTAT-TTTTAAATCTCTTATT--TTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * * * * * *
90899 TAAATTAGTATTGTTTCATTTTGAATAATCCTATATGAACTAATA-AATTAG---TAT-------
380 TAAATTAATATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTTTATGACAAAA
* * * * * * * * * * * *
90953 TAATAA-TTATGA-GATTTGAAATAGATAATTATTTAACTAGTTATGACTATTT-AAATT-TGTT
443 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTAT-TT
* ** *
91014 C-GATAAACATATTT-TTTTGAAAATCTGTTACTT
507 CAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * * * *
91047 ATTAATTGTCGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTAATATG-AACAAGCTTATATGAACA-AA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
** * * * * * *
91109 ACAATTGCTTTATGATAAAACAAAAG-TCATTATGATTTGAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCA
66 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
* ** *** * * * * * *
91173 TAACTATTTGAACTTTTTTGGTAAATAGTTTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAGTTGTCT-A
131 TAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGA
* * * * * * * *
91237 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTAAAATGAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTAT
195 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATG-A-AGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
91302 GACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
258 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* * * **
91367 TTG-TTCAATAAACA-GATTCATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
323 -TGATTTAGTAAACATGATTTATTT-TTAAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * * * * * *
91430 TTAGA-ATTATGTTATTTGGAATCAGCTTGTAAGAATAGAAAGAGTTGTTTTGTGACAAAATAAA
384 TTA-ATATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * ** *
91494 AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTAAAATAGTTATAACTATTTGCAC-TGGTT-AGGC
447 AAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCA-GT
** * * * ** *
91557 CTATAGATTTTTTTTTTAAATCCATTACAT
511 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * ** * * *
91587 ATTAAATTT-TAGAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATATGATTGTATTAATAGAA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * * * *
91651 ACAATTGTTTTATGAC-AAACAAATGGTCATAACAACTTGAAACAAATAATTGTTCAAATTGTTA
66 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
* ** * *** * **
91715 TAACTAATCGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTACTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAA
131 TAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * * * * * *
91776 ACATTAATAAATT-GATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATAAACAAAAATATTTGTTTTAC
196 ATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAAGAAACA-A-TTGTTTTAT
* ** *** * * * * *
91840 GACAAAACAAAAGGTCGGAGTGATTTGAAATAGGTAATTCTTCTAATAATCTTAACTATTTGAAA
258 GACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAA
* * * * **
91905 -T-AGTTTGGCAAACA-CATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTCTAATTCTTGGAATA-T--T--
322 CTGA-TTTAGTAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA-TTT-TAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * *
91962 ATTAA-GTTA--GTA-TT-AATAAGCTTGTGTGAGA-AGAAACAATTGTTTTATGA-AAAA-ATA
383 ATTAATATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
*** * * * *
92019 AAGATCATAGCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTTC-GA
447 AAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCAG-
* * *
92082 TAAATAAATCTAGTTTTTAAATC----ACTT
510 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * ** * *
92109 ATTACTTTTC-AAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTTTG-AATAATTTTGCATGAACAGA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * * *
92172 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATGGAT
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* * * * ** * * * * * *
92237 ATGATTATTTGAGCTTATTCAGTAAACAT-ATTTATTTTCTAAATCTCCTACCTATTAATTTTAG
130 ATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAA-TTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
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*** * * *
92429 ACTTCCTTAGTAAACAT-ATTTACTTTTTAAAACTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
321 ACTGATTTAGTAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * * **
92493 ATTAGTATTATTTTATCTTGAATATGCTTATATGAACAGAAACAATTGGCTTATGAC-AAACAAA
383 ATTAATATTATTTTAT-TTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * ** * * **
92557 AGGTCAT-ATCTATTTGAAAGAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAATT-GTTCAAA
447 AAGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCAGT
* * *
92620 AAATAGATTTATTTTGTAAAT-TTTTACTT
511 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
** * * *
92649 ATTAATTTT-T-GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATTAACAA
1 ATTAATTTTCTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *
92711 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATATATAGTTGTTCAAATAGT
64 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** *** ** * * *
92776 CATAACCATTTGAACTTTTTTGGTAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTG
129 TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
92841 GAATATTAATACATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAGCTTAAATGAACTAATACAATTGTTTT
194 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-AAATAAGCCTATATGAA-GAA-ACAATTGTTTT
* * * * * *
92905 ATGGCAAAACCAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATCCAATAGTTATGAGATTTGAAA
256 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-A-A---AT-AG---T--CA
*
92970 TAGA-TAATTATTCAAATAGTATGACTATTTGAACTTGTTCTATAAACAT-ATTTATTTTTAAAA
310 TA-ACT-A-T-TT--AA-A--CTG---ATTT--A---G-----TAAACATGATTTATTTTT-AAA
* * * * * *
93033 TCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCAAATAAGCTTATAT
352 TCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTAT
* * * * * *
93098 GAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATATGAAATAAATAATTCTTCA
415 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCA
* ** * ** *
93163 AATAGTTTTAATTATTTGAACTTA-TTGGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
480 AATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
93223 -TTAAGTTGTCTA-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAC
1 ATTAA-TTTTCTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * *
93285 AAAAAATTATTTTATGA-AAAATCAAAAGGTTATAGCAATTTAAAACAAATAATTGTTCAAATAG
64 AAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** ** * *
93349 TCATAGA-TATTTGAACTTTTTCAATAAACAGATTCAATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTT
128 TTATA-ACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** ** * * * * * ** *
93409 TGAAATATTAATAAATTAAAATTATACTATTATGAATCAGCTTGTGCGAACAGAATCAATTGTTT
192 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATG-A-AGAAACAATTGTTT
* * ** * * * *
93474 TGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTTATAACTATTTG
255 TATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
* * * *** ** * *
93539 TACT-AGTCAG-GCCCATAGATTCCTTTTTCAAATC-CATTACTTACTAAGTTTTAGAAA-ATTA
320 AACTGATTTAGTAAACAT-GATTTATTTTT-AAATCTC-TTA-TT-TTAATTTTTA-AAATATTA
* ** * * * * * * *
93600 ATAAATTAATATTACTTTATTCCGAATAAGATTGTGTTAATAGAAACAATTATTTTATGACGAAA
379 ATAAATTAATATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
** * * * * * * *
93665 CAAATGGTCATAATGACTTGAAA-AAATAATTGTTCAAATTATTATAACTAATTGAAC-CAGTTT
443 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTA-TTT
* * * *
93728 -GGTAAATAGATTTTATTTATTAAATC--TT--TT
507 CAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * *
93758 ATTAATTTT-T-GAAATATTAATAAATTAATATTATCTTATTTTGAGCA-AA-CTTATATGAACA
1 ATTAATTTTCTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGA-AATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * *
93819 AAAATATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAA
63 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-A
** * * * * *** * *
93884 CCT-TAACTATTTGAATTAGTT-AGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAA-TT
127 GTTATAACTATTTAAACTGGTTCA-ATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
93946 TTCAGAATATTAGTAGATTAGTATTTATTTATTTATTTATTTTGAATAAGCTTACATGAAGATAA
191 TTGA-AATATTAATAAATTAG----TA-TTA--T-TTTATTTTAAATAAGCCTATATGAAG--AA
* * * * * * ** *
94011 ATAATTATTTTATGATAAAACCAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCA
245 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * ** * * *
94076 CAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAGTAT-ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATGTTTGA
310 TAACTATTTAAACTGATTTAGTAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAA
* * * * ** * * ** *
94140 AATACTAATCAATTAGTATTATTTTCTTCCGAATAGGCTTGTTTGATGAAAAATAATTGTTTTAT
372 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
94205 GACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTAAA
436 GACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAA
* * *
94269 CTAATTTGA-TAAACTAATTTATTTTTTAAATC---T-CTT
500 CTTATTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * *
94305 ATTAACTTT-T-GAAAAAATAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTG-GATAAGCTTTTATGAACTA
1 ATTAATTTTCTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TA
* *
94367 -AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAAGTCATAACGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCAAAT
63 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAAT
* * * * *** * *
94429 AGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTCAGATCTCTTGCTTATTAATT
126 AGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** * * *
94494 TTTTAAATGTTAATAAATTAGAATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTATT
190 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAA-GAAACAATTGTT
* * * * * * * * * * *
94559 ATATAACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATATATAATTGTTCTAACATTCTTATA-TATT
254 TTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATT
* * * ** * * **
94623 TGAACTGGTTCAACAAACA-CATTTATTTTTTAAATCTCTTA--TAAATTTTTGGAATA-T-AT-
318 TAAACTGATTTAGTAAACATGATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTTTAATTTTTAAAATATTAATA
* *
94682 --TTAA-ATTA--GTA--T---T-A---TG-A--AA-AGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAAGAA
382 AATTAATATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * * **
94728 AGA-TCATAAAGATTT-AAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCATACCTATTT-AAATTGTTTTGG
446 AAAGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCAG
** *
94790 TAAACGGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTT
510 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * *
94817 ATTAATTTTC-AAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTG-AATAA-CTTTGCATGAACAA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGC-TTGTATGAA-TA
* * * * * *
94879 AAAATAATTGTTTTATGA-AAAAGCAAAAGCTCCTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-
63 GAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * * * * ** ***
94942 GAACATGATTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC---CTGCCT-A---
127 G-TTATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
95000 TT---A-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATTG-GTATA-AATAGAAATAATTG
191 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAT-AA--GCCTATATGA-AGAAACAATTG
* * * * * *
95059 TTTTACGACAAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATATTTGTTCAAACAAG-CACAACT
252 TTTTATGAC-AAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACT
* * * * * * **
95123 ATTTGAACTTG-CTTAGTAAACA-GATTTGTTTTTTAAATTTTTTACTTAATAATTTTTGGAATA
315 ATTTAAAC-TGATTTAGTAAACATGATTT-ATTTTTAAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATA
* * * * * * * * *
95186 TTAATAAACTAGTACTA-TTTATTTCAAAAAACACTTGTATGAATAGAAATAATTGGTTTATGAC
376 TTAATAAATTAATATTATTTTATTT-AAATAA-GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * ** *
95250 AAAACAAAATGTCATAA-GTTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACGT
439 AAAACAAAAAGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * *
95314 -GTTAAGAAAATAGATGTA-TTTTTAAA-CTTTTACTT
503 ATTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
95349 ATTAATTTT-TGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAATAGA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * *
95412 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACAATTTGAAATAGAAAATCGTTCAAATAGT
65 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* *
95476 TATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
129 TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * ***
95541 AAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTGATGTAATTGTTTTA
194 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAA--GAAACAATTGTTTTA
* ** * * ** *
95606 GGATGAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTTGACTATTTAAA
257 TGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * * *
95671 CTTG-TTTGGTAAACAT-ATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-TGTCAAAATATTAATAA
322 C-TGATTTAGTAAACATGATTTATTTTT-AAATCTCTTA-TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAA
* *
95733 ATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAA
383 ATTAATATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAA
* * * * *
95798 AAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAAATGTTCAAATTGTCCTAATTATTTGAATTTATTTGA-T
446 AAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCAGT
* *
95862 AAACAAAGTTATTTTTTAAAATCTTTTACAT
511 AAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTT
* * * * * *
95893 ATTGATTATCTA-AATATTAATAAATTTGCATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAAAA
1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * *
95957 AAAATTATTTTTTGACAAAACAAAAGATTATAACGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTA
66 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
* * *
96022 TAACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
131 TAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
** * *
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196 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAAGAAAC-AATTGTTTTATGA
* * * * *
96134 CAAAACAAATGATCATAACAATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-TATTGAACT
260 CAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTAAACT
*
96198 GGTTTAGT-AA-ATGATTTATTTATTAAATCTCTT-TTTTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAA
324 GATTTAGTAAACATGATTTATTT-TTAAATCTCTTATTTTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAA
* * * * * * **
96260 TATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAGACATTTGTTATACAACAAAACAAAAAGTC
388 TATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTC
* * * * * * ** *
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452 ATAATGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCAGTAAACAA
* *
96389 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTT
517 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * ** * * *
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1 ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * *
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66 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
* * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * *
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* ** * *
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* ** * * *** * *
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* * * * * *
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* * * *
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511 AAACAAATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTT
* * * * * * *
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* * * * *
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* ***
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129 -TATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** ** * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** ** *
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**
97463 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCAACTT
510 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * *
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* ** * * * * * *
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*** ** *** * *
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* * * * *
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194 A-----AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGC--CTATATGA-AGAAACAATT
* * *
97751 GATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTC--AA--A
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* * * * **
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* * * **
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** * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * *
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98083 ATTGTAGACA
Statistics
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Consensus pattern (540 bp):
ATTAATTTTCTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
TAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAAGAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGA
TTTAGTAAACATGATTTATTTTTAAATCTCTTATTTTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATAT
TATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
TGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTCAGTAAACAAATTT
ATTTTTTAAATCTTTTACTT
Found at i:96449 original size:181 final size:180
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96136 AAACAAATGA
* * * * * * * **
96146 TCATAACAATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-TATTGAACTGGTTTAGTAAA-
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGTTATAACTAT-TTAAACTGGTTCAACAAAC
** * *
96209 TGATTTATTTATTAAATCTCTT-TT-TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
65 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
*
96272 TCAAACAAACTTATATGAACA-AAGACATTTGTTATACAACAAAACAAAAAG
130 TCAAACAAACTTATATGAACATAA-ACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
* * * * *
96323 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATCCATATTGTCT-TAACTATTTAAATTGGTTCAGCAAAC
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGT-TATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAAC
* * * * *
96387 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTTTTATTTTAT
65 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * ** * * * * ** * *
96452 TTCTAATAAGTTTGTATGAAGATAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGG
129 TTCAAACAAACTTATATGAACATAAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
* * * * * * * *
96504 TTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACTGGTTCAATAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACA
* *
96569 TATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATGATTTTAT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCT-TA-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* ** ** ** * * ** * *
96633 TTCAAATAGGCTTGCATGATGAAAAACAATTGTTTTATGATAAAA-TAAAAG
129 TTCAAACAAACTTATATGAACATAAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
* * * ** * * * * ** *
96684 TTCATAATGATTT-AAAGTAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGATCTGATTTGATAAA
1 -TCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTATCCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAA
** * ** * * * *
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64 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATT-AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * ** * * * * ** * *
96812 ATTT-GGATAAGTTTTTATGAA-TTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGG
127 ATTTCAAACAAACTTATATGAACAT-AAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
* * * ** * * * ** **
96865 TCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTACTTGAACTTATTCAGTAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACA
* * * ** ** * *
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66 AATTTATTTTTT-AAATCTCTT-ATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** ** * * * * * ** *
96995 TTTGAATGAGCATGTAT-AA-ATTGAAACAATTATTTTATTACTAAACAAAAAGG
129 TTCAAACAAACTTATATGAACA-T-AAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAA-G
* * * ** *
97048 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TTACTATTTAAACTGGTTCGGCAAAT
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGT-TATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAAC
** * * ** ** * *
97112 GCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAACAATATTTTAC
65 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * ** *
97177 TTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAA-
129 TTCAAACAAACTTATATGAACATAAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
* * * * * * * * * * **
97228 TCATAATGATATGAGATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGATTTAGTAAACA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACA
* * * * * * *
97293 GATTTAATTTTTAAATGTC---TTATTAGTTTTTGAAATACTGATAAATTAGTATTATTTTA-TT
66 AATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * ** *
97354 CTAAA-TAATTTAGTATGAATAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG
131 C-AAACAAACTTA-TATGAACATAAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
* * ** * * ** * *
97405 TCATAACAATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATTA-ACATGACTATTTGAACTTATTCGATAAA
1 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TCCAAA-TAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAA
* *
97468 CAAATTTATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
64 CAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TA-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * *
97532 ATTTCAAATAAACTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAAC-AAAAG
127 ATTTCAAACAAACTTATATGAACATAAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
* * * * ** * * *** ***
97585 ATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGT-TTAATAATAATAACTATTTAAACTCACTCGGTAAAC
1 -TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAACAAAC
* *
97649 AAATTT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
65 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT
97684 GGAATTTTTA
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AATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
CAAACAAACTTATATGAACATAAACAATTGTTATACAACAAAACAAAAAG
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* * * * *
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* *
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**** * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * **
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** * * * **
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389 AGTAGATAATTATTCAAATGAACATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTACTTTTTAA
** ** *
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454 ATCTCCAACTTTTCAATTTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTATTTTATTTAAATAAACTTGTA
* * ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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*
97024 TT-ATTTTATT
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* * *
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* *** * *
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*
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* * * * *
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196 TCATAACGATATGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGATTCAATAAACA
* * * * *
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261 GATTTAATTTTTAAATTCTACTTATTAATTTTTAAAATACTAATAAATTAGTATGATTTTATTTC
* *
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* * * *
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387 -AAAGTAGATAATTA-TTCAAATGAACATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTACTTT
* * * *
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450 TTAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGA-AATATTAACAAAGTAATATTATTTTATTT-AAATAA
*
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* *
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577 ATTGTTTAAATAATAATAACTACTTAAACTCACTCAGTAAACAGAATTATTTTTTAAAAT-TTCT
* *
97669 TACTTATTAATTTTTGGAATTTTTAATTTTCATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-TG
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*
97733 CTATAAATAGAAACGATTGATTTATG
699 -TATAAATAGAAACAATTGATTTATG
* * * *
97759 ACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTC--AA--A---ACA-
1 ACAAAACAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTAAAC
* * * * ** * *
97815 T-GTTTAG-AAA-AAAATTATTTTTTAAAT-TTTTACTTCTTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
66 TGGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAATATTATTAGA-T
* * * *
97876 TAA-ATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAGCA-AAGCCAATTGTTTTATGACAAAACAAA
130 TAACAATATTTTACTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * * * * * *
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193 AGATCATAACGATATGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGATTCA-AT-
* * * * ** * *
98002 AAAAAAATCTT--TTTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
256 AAACAGAT-TTAATTTTTAAAT-TC-TACTTATTAATTTTTAAAATACTAATAAATTAGTATGAT
*
98065 TTTACTTCAAATA
318 TTTATTTCAAATA
98078 AGCTTATTGT
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TGGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAATATTATTAGATT
AACAATATTTTACTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA
TCATAACGATATGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTGATTCAATAAACA
GATTTAATTTTTAAATTCTACTTATTAATTTTTAAAATACTAATAAATTAGTATGATTTTATTTC
AAATAGACTTGCATGATGAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTAAAG
TAGATAATTATTCAAATGAACATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTACTTTTTAAAT
CTCCAACTTTTCAATTTTTGAAATATTAACAAAGTAATATTATTTTATTTAAATAAACTTGTACG
AATAGAAACAATTATTTTACAACAAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAA
ATAATAATAACTACTTAAACTCACTCAGTAAACAGAATTATTTTTTAAAATTTCTTACCTATTAA
TTTTTGGAATATTAACAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATAAATAGAAACAATT
GATTTATG
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*
98170 TTTTAT TTTTAT TTTTAT TTTGTAT TTTACAT TTTTA- TTTTAT TTTTA-
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* *
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1 TTTTAT TTTTAT TTTTAT TTT
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TTTTAT
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98150 TTTTCTTTTC
* * * * *
98160 TTTCTC-TTCATTTTATTTTTATTTTTATTTTGTATTTTACAT-TTT
1 TTTCTCTTTTATTTTATTATTATTATTATTTTATATTGTACATATTT
* * *
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1 T-TTCT-CTTTTATTTTATTATTATTATTATTTTATAT-TGTACATATTT
* * *
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*
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* * *
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*
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* * * * *
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Statistics
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* *
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1 TTA
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** *
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* ** *
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* *
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* **
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* *
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* * *
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*
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* * *
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* *
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*
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* * **
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** * * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * * * *
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**** * * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * *
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128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCGGTAAACAGA
* * * * * *
110709 TTTATTTTTTAAATC-TCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTT
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* * * * *
110773 CGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGAGTTT-A
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* * * *
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* *
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** * * * * *
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* ** ** * * * * ** * *
111009 TTGAAGTA-ACTAATACTTTGAATAGACTTGACTATTTAAACTTGTTTAGTGAATAGA
125 TTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* *
111066 TTTATTTTTTAAATCTTCAT-CTTATTAATTTTTAGAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
111130 CAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAGTTGTTTTATGACAAGACAAAAGATCACAACAATTTGAA
65 CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * *** ** * *
111195 ATAAATAATTGTTCAAATCGTCATAACTATTTGAACTCACTCAATAAATATA
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* *
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* * * * * * * * * *
111310 TTCAAATAAGTTTTTTTGTACAAAAACAATTGGTTTATGTCAAAACAAAAGATCATAACAATTTG
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* * ** *
111375 AAAT-GAATAATTGTTCAAATAGTTC-TAACTCTTTGAACGTGTTTAGAAAACAGA
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*
111429 TTTATTTTTTAAAT-TT-TTACTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTA-TATTATTTTATT
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* * * * * ** *
111491 TGAAATAAGCTTGCATAAATAGAACCAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTGTTTTGA
64 TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * *
111556 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTCAGTAAACATA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* * *
111609 TTCATTTTTTAATTC-TCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
111673 CAAATAAGCTTATTTGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
65 CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* ** * * * * *
111738 AATAGTTAATTACTGAAATAATCATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACATA
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*** * * *
111791 TTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTGTCAAAATATTCAT-AATTAATGTTATTTTAATT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT
* * * * *
111854 T-GAATAACCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGA
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* *
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* * *
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* * * * * *
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** * * * *
112150 -TT-TTTTAAAAATATT-TTAATTATTAATTTTTGGAATATAAATAAATTGGTATTATTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * * * *
112212 CGAATAAAATTATATGAACT-GAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGAGGTTATAACGATTTG
65 CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTG
* * * * ** *
112276 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATA
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* * * *
112330 TTTATTTTTAAAAAT-TT-TTACTTATTAATTATAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
1 TTTATTTTT-TAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * ** * *
112393 CCAAATAAGGTTGTCTGAATAGAAAAAAATTGTTTTATAATAGGACAAAAAGTCATAACAATTTG
64 TCAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * *
112458 AAATAAATAATT-TTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGA
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* *
112511 TTTATTTTTTAAA---TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * * * * *
112571 TGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
65 CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * *
112636 ATAGATAAATGTTCAAAT-GATCATAATTATTTGAA-TTGGTTAGGTAAATAGAAA
130 ATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAG--A
* * * *
112690 TGTT-TTTATTAAATC-TCTTACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATT
1 T-TTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * * *
112753 CCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAA-TTTTGTTTTATGCCAAATCAAAAGGTCATTACGTTTTGA
64 TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* ** * * * *
112817 AATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTCGAA-TTAGTTTGGTAAACAAA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGA
* * ** * *
112870 TATA-TTTTT-AAT-TATCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATT
1 TTTATTTTTTAAATCT-TCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * ** * * * **
112932 TCGAATAATCTTGTATGAACAGAAATACTTGTATTGTGGTAGAACAAAAGTTTATAAAAATTTGA
64 TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * ** * * * * * *
112997 AGTATACAATTGTTCAAATAACCATAATTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAAA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* *
113050 TTTATTTTTTAAA---TC--ACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTAGTTTA-TT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * * *
113109 CTAAATAAGCTTAAATG-ATAAAAAACATTTGTTATATGAGC-AAACAAAAGGTAATAATGATTT
65 C-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * *
113172 GAAATAGATAATTGTTAAAATGGCCATAA--A--TG-A----TTCGGTAAACAGA
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* * ** * *
113218 TTCA-CTTTTAAATC-AGTTACTTATTAATTTTTGGGATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * *
113280 CGAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAACGATTTG
65 C-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * *
113344 AAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTGAA-TTAATTCAGTAAACAAA
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGA
* * * *
113398 TTTATTTTTTAAATC-ACTTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTATTATTCTTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
113462 CAAATAAGTTTTTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGTGTCATAATGATTTT
65 CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTG
* * * * * * *** *
113525 AAATATACAATTGTTTAAATAGTCACAACTATTTAAATTTGTTCAAAAAACACA
128 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* *
113579 TTTATTTTTTTAAAATC-TCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTAT
1 TTTA-TTTTTT-AAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
**** * * * * *
113643 TTTGGGTAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAATGATTT
63 TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * *
113707 TAAATA-ATTAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAAA
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* * * *
113762 TTTATTTTTTCAAATC-TCTTACTTGTTAATTTTTTAAATGTTAATATATTAAG-ATTATTTTAT
1 TTTATTTTTT-AAATCTTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAT
** * ** * * *
113825 TTGGAATAAGCTTGTATG-ATATGAAACAAATAATTTATGACTAAA-AAAAGGTTAGAACGATTT
63 TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* ** ** * * **
113888 GAAATAGATAATTATTCTTATAGTTTTAACTATTTGAACTAGATCGACAAAC--A
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* *
113941 --T-TTTTTTAAATC-TCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * *
114002 CAAATAAGCTTGCACG-ATCA-AGAACAATTGTTTTATAAAAAAAAAAAAATGTCATAATGATTT
65 CAAATAAGCTTGTATGAAT-AGA-AACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * *
114065 GAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT-AAC-TGATTCGATAAACAAA
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGA
* *
114119 TTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
114183 CATATAAACTTCTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGAAAAAATAAAAGGTCATAGCGATTTTA
65 CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * *
114247 AATA-ATCAAGTGTTCAAACAG-CAATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGA
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* * * * *
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* * * * *
114364 CAAATAAGCTTGTATGAACT-G-AACAATTGCTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAACAATTTGA
65 CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * *
114427 AATAGATAATTG-TCTAACAGT-ATTAA-TCATATGAAC-TGTTTCGATAAACAAA
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* *
114479 TTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTT-TAT
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* * * ** * * *
114542 CCGAACAAGCTTGTACAAACA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATA-GTCATAATGATTTG
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* * * * * ** **
114605 GAATAGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAATTAGA
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* * * **
114659 TTTATCTTTTT--ATTTTCTTGCTTATAAATTTTCAAATA-TAATTAAATTAGTATTATTTTATT
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* * * * * * * * * * *
114721 TTGAATTAA-ATAGTATGAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAACTATTTA
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* * * * * *
114785 AAATAGATAATTATTCATATAGTCA-AATCTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGA
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* * * *
114839 TTTACTTTTTAAATC-TCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * ** * * *
114903 CGAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTAAA
65 CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * **
114968 ATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTAGAACTGGTTTGGTAAGGAGA
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* * * * * * *
115020 ATTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATAAAATTTTGAATTATTAACAAATTAATTTTATTTTA-TA
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
115083 CTAAATAAACCTGTATGAGAT-GAAATAATTATTTTATGACAAAACGAAAAGGTCATAACAATTT
65 C-AAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * *
115147 GAAAGAGATAATTGTTCATACAGTCTTAATTGTTTGAA-TTGGTTCGGCAAACAGA
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGA
* * *
115202 TTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TT
1 TTTATTTTTTAAATCTTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * **
115265 CTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGA
65 C-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * *
115330 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAACTTGTTTGGCAAACATA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
* * *
115383 TTTATTTTTATAAAT-TGCTTACTTATTAATGTTTTGAATATTAATAAATTAGCATTATTTAATT
1 TTTATTTTT-TAAATCTTCTTACTTATTAAT-TTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * *
115447 TTAAATAAGCTTATATAAATTGAAATAATTGTTTAATGAC-TAACAAAAGGTCATAATGATTTAA
64 TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* ** ** * *
115511 AATAGTTAATTGTTCTGATAGTTTTAACTATTTGAACTGGATT-GGTAAAGCATA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAA-CAGA
115565 TTTATTTTTTA
1 TTTATTTTTTA
115576 TTATTAAATT
Statistics
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168 12 0.00
170 1 0.00
171 111 0.03
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Consensus pattern (181 bp):
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TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA
Found at i:112353 original size:539 final size:536
Alignment explanation
Indices: 110004--132991 Score: 6148
Period size: 539 Copynumber: 42.3 Consensus size: 536
109994 AATAGATTTA
* **
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** * * * * * * * *
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* ** * **
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* * * * *
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* * * *
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* * * ***
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* * * * * * *** * * *
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* * * * * * **
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* * *
110502 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAGCAAACTT
507 TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA--T
* * * * * * *
110534 GTTTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAATGTTATTTTGTTTCAAA
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* * * * * * * * ** * * *
110596 TAAGCATGTATAAATTAAAACAACTATTTTATGAGTTAACCAAAAGATCAGAA-GATTTGAAATA
65 TAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * *
110660 GCTAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT-ATACTGGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTAAATC
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* * * * * * ** *
110724 TCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTCGAATAAACTTGTATG
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATG
* * * * *
110789 AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGAGTTT-AGATAGATAATTGTTCA
257 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
110852 AATAGTCAT-ACTATTTGAA-TTGGTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTA
321 AATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
**
110911 ATTTTTCCAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGT-TAGAAT-GAAAATA
385 ATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-GAATAG-AAA-A
* * * * ** *
110974 ATTGTCTTACATTA-AAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAGTA-ACTAA-TACTTTGAATAGAC
445 ATTGT-TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTA-TTCAAATAGTC
* * * ** * *
111036 TTGACTATTTAAACTTGTTTAGTGAATAGATTT
506 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGT-AA-ACATAT
* * *
111069 ATTTTTTAAATCT-TCATCTTATTAATTTTTAGAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
1 -TTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * *
111133 ATAAACTTGTATGAA-TAGAAATAGTTGTTTTATGACAAGACAAAAGATCACAACAATTTGAAAT
64 ATAAACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * ** *
111197 AAATAATTGTTCAAATCGTCATAACTATTTGAACTCA-CTCAATAAATATATTTATTGTTTTAAA
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCGGTAAACATATTTATT-TTTTAAA
* * * * * *
111261 TCTTTTACTTATTATTTTTTAGAAT-TGTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTTT
191 TCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGT
* * * * * *
111325 TTGTACAAAAACAATTGGTTTATGTCAAAAC-AAAAGATCATAACAATTTGAAAT-GAATAATTG
254 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAG-ATAATTG
* * *
111388 TTCAAATAGTTC-TAACTCTTTGAACGTGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACT
317 TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
* * *
111450 TATTAATTTTTGTAATATTAATCAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATAAATAG
380 TATTAA-TTTT-TAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAG
* * ****
111513 AACCAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTGTTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
441 AA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *
111578 CATAACTATTTGAGCTTGTTCAGTAAACATATT
505 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA-T
* *
111611 CATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
1 --TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * *
111676 ATAAGCTTATTTGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* ** * * * * *
111741 AGTTAATTACTGAAATAATCATGACTATTTCAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * *
111806 TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTCAT-AATTAATGTTATTTTAATTTGAATAACCTTGTATG
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATG
* *
111870 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
257 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
*
111935 ATAGTCATAA-TATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTGAT
322 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * *
111999 TGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTGTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAATTAT
387 T-T-TTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAATTGT
* * * ** * * * *
112064 TTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCTAATAGATAATTATTTAAATAATTATAATTATT
450 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
*
112129 TAAACTTGTTCGGTAAACATAT
515 TGAACTTGTTCGGTAAACATAT
* * * * * * *
112151 TTTTTAAAAATATTTTAATTATTAATTTTTGGAATATAAATAAATTGGTATTATTTTATTTCGAA
1 TTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * *
112216 TAAAATTATATGAACTGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGAGGTTATAACGATTTGAAATA
65 TAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * ** *
112281 GATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAAAT-
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTT-TAAATC
* * ** * *
112345 TTTTACTTATTAA-TTATAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGGTTGTCT
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* * * ** * *
112409 GAATAGAAAAAAATTGTTTTATAATAGGACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATT-TTT
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* * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * * *
112662 TTATTTGAA-TTGGTTAGGTAAATAGAAATGT
510 CTATTTGAACTT-GTTCGGT--A-A-ACATAT
* * * * *
112693 TTTTATTAAATCTCTTACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAA
1 TTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * ** * * * *
112758 TAAGC-TAGTATGAATTGAAA-TTTTGTTTTATGCCAAATCAAAAGGTCATTACGTTTTGAAATA
65 TAAACTTA-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* ** * * * * * * * *
112821 GATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTCGAATTAGTTTGGTAAACAAATATA-TTTTTAATTAT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
112885 CTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAATCTTGTATGA
194 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGA
* * * * * ** * * * * * *
112950 ACAGAAATACTTGTATTGTGGTAGAAC-AAAAGTTTATAAAAATTTGAAGTATACAATTGTTCAA
258 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
** * * * * *
113014 ATAACCATAATTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAAATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAAT
322 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * ** *
113075 TTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTAGTTTATTCTAAATAAGCTTAAATG-ATAAAAAACATTT
387 TTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-A-TT
* * ** * * * *
113139 GTTATATGAGC-AAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATGGCCATAA--
448 GTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
*
113201 A--TG-A----TTCGGTAAACAGAT
512 ATTTGAACTTGTTCGGTAAACATAT
* ** * *
113219 TCACTTTTAAATCAGTTACTTATTAATTTTTGGGATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCGA
1 T--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
* * * ** * *
113283 AATAAGCTTGTATGAACTAAAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAACGATTTGAAAT
63 AATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * *
113348 AGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTGAATTAATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
113413 ACTTACTTATTAATTTTTGAAAA-ATTAATAAATTATTATTCTTTTATTTCAAATAAGTTTTTAT
193 TCTTACTTATTAATTTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTAT
* ** ** * * * *
113477 GAACT-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAGTGTCATAATGATTTTAAATATACAATTGTTT
256 GAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
113541 AAATAGTCACAACTATTTAAATTTGTTCAAAAAACACATTTATTTTTTTAAAATCTCTTGCTTAT
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTT-AAATCTTTTACTTAT
* * *** *
113606 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGGGTAAGCTTTTATGAACT-GAAAC
383 TAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-
* * * ** * * *
113670 AATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-ATTAATTGTTAAAATAGTCAT
444 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCAT
* *
113734 AACTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAAATTTAT
508 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC--A--TAT
* * ** * * **
113767 TTTTTCAAATCTCTTACTTGTTAATTTTTTAAATGTTAATATATTAAG-ATTATTTTATTTGGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAA
* * * ** * * *
113831 TAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATAATTTATGACTAAA-AAAAGGTTAGAACGATTTGAAATA
65 TAAACTTATATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* ** ** * **
113894 GATAATTATTCTTATAGTTTTAACTATTTGAACTAGATCGACAAAC--A--T-TTTTTTAAATCT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
* * * * *
113954 CTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCAAATAAGCTTGCACG-
194 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGA
* * * **
114018 ATCA-AGAACAATTGTTTTATAAAAAAAAAAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
258 AT-AGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
114082 AAATGGCCATAATTATTT-AAC-TGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * * *
114145 AATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATATAAACTTCTATTAACT-GAAACA
384 AATTTT--TAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-A
* * * * * * * *
114209 ATTGTTTTATGAAAAAATAAAAGGTCATAGCGATTTTAAATA-ATCAAGTGTTCAAACAG-CAAT
445 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTC-AT
*
114272 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTAT
508 AACTATTTGAACTTGTTCGGT-AA-ACA--TAT
* * ** * *
114305 TTTTTAAAATCTCTTTCTTATT-ATTTTTTTAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * * * * *
114369 AAGCTTGTATGAACTG-AACAATTGCTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAACAATTTGAAATAGA
66 AAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
114433 TAATTG-TCTAACAGT-ATTAA-TCATATGAACT-GTTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATT
131 TAATTGTTCAAATAGTCA-TAACT-ATTTGAACTAG-TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * * *** * **
114494 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTTATCCGAACAAGCTTGTACA
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAAATAAGCTTGTATG
* * * ** * * *
114559 AACA-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATAGTCATAATGATTTGGAATAGATAATCGTTCAT
257 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * ** * * *
114623 ATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAATTAGATTTATCTTTTT--ATTTTCTTGCTTATAA
322 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTT-TTACTTATTA
* * * * * * *
114686 ATTTTCAA-ATATAATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTAA-ATAGTATGAACAGAACCAA
385 ATTTTTAATAT-TAA-TAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAA-AAA
* * * * * *
114749 TTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAACTATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGTCA-AAT
446 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-
* * * * *
114813 CTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGATT
510 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA-T
* * * *
114841 TACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCG
1 T--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
** * ** * * *
114905 AATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTAAAAT
63 AATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * ** * *
114970 AGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTAGAACTGGTTTGGTAAGGAGAATTATTTTTTAAATC
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * * * *
115035 TCTTACTTATAAAATTTTGAATTATTAACAAATTAATTTTATTTTATACTAAATAAACCTGTATG
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTAAATAAGCTTGTATG
* * * *
115100 AGAT-GAAATAATTATTTTATGACAAAACGAAAAGGTCATAACAATTTGAAAGAGATAATTGTTC
257 A-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * ** *
115164 ATACAGTCTTAATTGTTTGAA-TTGGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTAT
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTAT
* * *
115227 GAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAATA
383 TAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-A
* * * * * *
115292 ATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAT
445 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* *
115357 CTATTTGAACTTGTTTGGCAAACATATTT
510 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA--T
* * *
115386 ATTTTTATAAAT-TGCTTACTTATTAATGTTTT-GAATATTAATAAATTAGCATTATTTAATTTT
1 -TTTTT-TAAATCT-CTTACTTATTAAT-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * *
115449 AAATAAGCTTATATAAATTGAAATAATTGTTTAATGAC-TAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAA
62 AAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* ** ** *
115513 TAGTTAATTGTTCTGATAGTTTTAACTATTTGAACTGGATT-GGTAAAGCATATTTATTTTTT--
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAA-CATATTTATTTTTTAA
* * * * ** ** *
115575 AT-TATTAAATTAGTTCA-TCTTAATCCGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTCTATGA
190 ATCTCTT-ACTTA-TTAATTTTTAA----AAT-A--TTA-AT--AAA-TTAGTATTATTTTAT--
** * ** * * * ** ** ** *
115638 CAAAATAAAGATAATAATGATTTGAGATAGATAATTG-TTCA--AGTAGTCATAATTGT-TTAAA
240 TTAAAT-AAGCTTGT-ATGA-AT-AGA-A-ACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAAGTCAT-AA
* * * * * ** * *
115699 CTGATTTAGCAAATAAATTTAGTT-TTCAAAT-CTCTTATTAA-T-TTTCAAAATATT-AATAAA
297 C-AATTT-G-AAATAGA--TAATTGTTCAAATAGTC--A-TAACTATTTGAACTTGTTCGATAAA
* * * * * * * * *
115759 TCA-ATGTTA--TTTT--AT-TTTGAATCATT--TGTATGAACA-GAA-ACAATT-GTTTTATGG
354 -CAGAT-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-TTTTAATATTAATA-AATTAGTATTAT-T
** ** * * * * * ** ** *
115813 CAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TA-AAATA-AATAATTATTCAAATGGACATGAC--TA--T-
414 TTATTC-TAA----ATAA-GCTTGTATGAATAGAAAAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTC
* ** * * * * *
115870 TTGAACTTGTTTTGTACATAGATTTATTTTTTAAAT-CTCCA-AACTA-TT-AA-TT-TT---TA
471 AT-AAC--AATTTG-AAATAGA-TAATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTA
*
115926 GA-ATA-
530 AACATAT
** ** * ** * *
115931 -TTAATAAAT-TAGTA-TTATT--TTATTTTGAATAAATTTGTAAA-TAGAAATAATTGTT-TTG
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGGAAT--ATTAATAAATTAG-TATTATT-TTATT-
* * * ** * ** * *
115989 TGACAAAACAAAAGATCATCACT-ATTTGAAATAAATAATTGT-T--C---A-AATA-GTCATAA
60 T--C-AAA-TAAA-CTTAT-A-TGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ** * * * *
116045 CTATTTGAACAT-G-T--TTAG--AAAATAG--ATTTCTTTTTTAA--ATTTC--T--ACTTATT
117 CGATTTGAA-ATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATT
* ** * * * * * *** * * ** **
116096 AATTTTTGGAA--TATTAATAATTTA-TATTATTTTATTCA-AAATAAGCT-TGTA-TGAATGGA
180 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-TAT-TATTTTATTTA
* ** * * * *** ** *
116155 AACAATTATTTTATGACA-A-AAA-AA-------AAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
243 AATAA-GCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA-ACAA-T-TT
* * * * ** *** **
116210 CAAATAG-TAA----T-AACTA-T-TTGAACTTGTTTGGTAAACTAATTC-AT--TTTG-TAAAT
303 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AAC-TATTT-G--AACTTGTTCGATAAACAGATTTAT
* * * * ** * * *
116263 CTCTT-ACTC-TTTA---A-T-GTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAG
363 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG
* * *** ** * *
116321 CCTATATGAACTTA-TTCAATTGTTTTAAAACTAAACAAAAGGGCATAACAATTTGAAATAGATA
428 CTTGTATGAA--TAGAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * *
116385 ATTATTCAAATAGTTATGACTATTT-AGACTTGTTTGGTAAA-ATATT
491 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCGGTAAACATA-T
* * ** * *
116431 TATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAGTATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCA
1 T-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * ** * * * * *
116494 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT-AAAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAC
63 -AATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * ** * * ** ** *
116558 T---TATTTAGTAAACAAAGTTATTTTTTAATTGTTTGAA-TA-TT-AATAAATTTGTGTTATTT
127 TAGATAATT-GT--TCAAA--TA-GTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATAT-TTATTT
* * * ** * * * *
116617 TATTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATAACA-AAATAAATGTTA-TAATGA
185 T-TT--AAAT---C-TCT-T-ACT--TATTAA-T-TTTTAAAATATTAATAAA--TTAGT-ATTA
* ** * * * *
116680 TTTGAAATAGATAA--TTGT-TCAAGTAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAATAAACAAATTTT
234 TTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAA-TAG--A-AAC------AA-TTGTTTTAT-GACAAA----
** * * ** * * * ** * * *
116742 TTTTAAATA-TCTTATTAATTTTTGGAATA-TTAATAAG--CAAGAATTATGTCATTTCGA-ATA
283 --ACAAAAAGTCATAACAA--TTTGAAATAGATAAT-TGTTC-A-AA-TA-GTCATAACTATTTG
* * * * *** *
116802 AAGTTGTAT-GAATAAAAACA-ATTGATTTGTGATAATAC-AAAAGGTTA-TAATGATTTTAA-A
339 AACTTGT-TCG-AT--AAACAGATTTATTTTTTA-AAT-CTTTTA-CTTATTAAT--TTTTAATA
* * *** * * * * * ** ** * **
116862 TTGAT-AATT-GT-TCA-AACAGTCATAACT-A-TTTGTACT-AGTCGAGCAACAGTTTCATTTC
395 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-TAAATAAGCTTGTA-TGAATAGAAAAATTGTTTTATGAC
* ** * * * * * * *
116920 TTAAATTCATTA-CTGAT--CAATTT---TTAGA-ATATTAAT-AAATTA-ACATTACTTTTTTT
458 --AAA-ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA-ATTATTCAAA-TAGTCATAAC---TATT
* **
116976 TGGAC-TGTGTAAGTAGAAACAATTAT
515 TGAACTTGT-TCGGT--AAAC-A-TAT
* * *** ** * * * * *
117002 TTTATGATAAAACAAATGGTCA-TAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAGTTATACTAAT
1 TTT-T-TTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTGGAAT-ATTAA----TAAATTAG-TAT--T-AT
** * * * * * *** * * *
117066 TGAACTGGTTTAGTAATCAGATTTATTTTTTAACTCTTTTACTTATTAATTTT-T-A-AAATATT
54 TTTA-T--TTCA--AAT-AAACTTA--TATGAA--CTGAAAC-AATT-GTTTTATGACAAA-A-C
** * ** * * * * * *
117128 AATAAAATAAT-ATTATTTTATTCCAAGCAGACT--TTTTTGAAA-A---AAAATCTGTTTGATG
105 AA-AAGGTCATAACGATTTGA----AA-TAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGA--
*** * *** * * * * *
117186 AC-AAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGACATCAATAATTGCTCAAATAGTCA-TAATTATTTGA
160 ACTAGTTC----GGT-A-AACATATTT-A-TTTTTTAAAT-CTC--TTACTTATTAATT-TTTAA
* * * * **
117248 ACTAGTTCGGTAAACAAAATT-GT-TT-TTTAAATCTCTTACTAATTAA--TT-TTTGAAATATT
213 AATA--T---T-AA-TAAATTAGTATTATTT---TAT-TTA--AA-TAAGCTTGTATG-AATAGA
* * * **
117307 AACAAATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTAAAGAAATTGT-TTTACGATAA
263 AAC-AA-TTG----------TTTT--AT--G--AC-AA-AAC--AA-AAA--GTCATAACAATTT
* * * ** * *
117371 AACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATCTAGCCTT-AACTAT-TTGAACTG
303 GA-AATA-G--ATAATTG--TTCAAAT--AG---TCAT-AACTA--TTTGAACT-TGTT---C--
* * * * * * * * * *
117433 GTTTGGCAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATAATATTACATTAG
348 G-AT---AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATTAG
** * * * *
117498 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATAATTTTATAATAGAACAAAAAAGT
407 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGT
* * * * **
117563 TATAAAAAGTTT-AAATATATAATTTTTCAAATAGTCATAAC-ATTTGAA-TTGGTTTTGTAAAC
470 CATAACAA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAAC
*
117625 AGATT
533 ATA-T
* * * * *
117630 TATTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTCTATTCCAAA
1 T-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * *
117695 TAAAATTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGTTCATTACAATTTGAAAT
65 TAAACTTATATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
117758 AGATAATTATTCAAATGAG-CATAATTATTTGAACTAATTCGATAGA-ATAATTTATTTTTTAAA
128 AGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAA
* * * ** *
117821 TCTC-TATCTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTTCATAAGCTTTT
191 TCTCTTA-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGT
* * * * *
117885 ATGAACTA-AAACAATTTTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGT
254 ATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
117949 TCAAATAGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTTATTC
318 TCAAATAGTCATAAC-----------------TATT----T--G---AAC---TTG------TTC
* * * * * * *
118014 AATAAACATATTTATTTTTTTAAT-TTCTTGCTT-TTAAAATTTTT-ATGTTAATAAAATAGCAT
348 GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATT--AATTTTTAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * *
118076 TATTTTATTTTAAATAAGCATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAGCCAAAGGTTAA
410 TATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * ** *
118140 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTCGACAAACACATT
473 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG-GTAA-ACATA
118204 T
536 T
* * *
118205 ATTTTTTAAA--TC---CTTATTAATTTTTAGAGAACTATTAAT---TTAGCAATATTTTACTTC
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-G-GAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * ** * * *
118262 GAATAAGCTTGTTTGAA-TAGAAATAAATGTTTTGGGATAAAAC-AAAGATCAT-ACTTATTTGA
62 AAATAAACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-GATTTGA
* * * * * * *
118324 GATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAAGAGATTTAGTTTTTAA
125 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* * ** *
118389 ATCTC--A--TATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTT-TTATGAAA-AATTTTA
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-T-AAATAAGCTTG
* ** * * * *
118448 TATGAATAGAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAATA-TCATCACGATTTTAAATAGATAATAG
253 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG
* * * ** * * * ** *
118512 TTCAAATGGACATCACTATTTGAACTTGTTTTATAAACAAATTAATTTTCTAAATCTTCAATTTA
317 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * ** * *
118577 TTAATTCTTAGAACATTAATAAATTAGTAATGTTTTGCTCCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAT
382 TTAATT-TT-TAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-
* * * * * * *
118642 AATTGTTTTATGATATAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAAATAATTGTTCAAGTAGTCAT
444 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * *
118707 TA-TAATTTGAACTCGCTAGGTAAACGGAT-T
508 AACT-ATTTGAACTTGTTCGGTAAAC--ATAT
* * ** * **
118737 TATTTTTAAATCTTTTACCTATTAA-TTTTACAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAA
1 T-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * * * *
118801 TAATA-TTGTTTGAA-TAGAAACAATTGGTTTAAGACAAAACAAATGGTCATAATGTTTTGAAAT
65 TAA-ACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * ** * *
118864 AGATAATTGTTCAGATAGCCATAACTATTTGAACTTA-ATCGGTAAATAGGTTCATTTTTTAATT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* ** * * * *
118928 CTTTTACTCT-TTAATTTTTGGAATACTAATCAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATA
192 CTCTTACT-TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTA
** ** ** ** * * * *
118992 TGAACTCAGTTAGTATTACTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGA-AACAATTGTTTTTATT
255 TGAA-T-AGAAACAATTGTTTTATGAC-AA-AA-C--A-A-AAAGTCATAACAA----TTTGA--
* * ** * * * * ** * * * *
119056 ACA-AAAAAAAAGGTCACAATGATTTA-AAATAGAT-AA-TTATTCAAATAGTAATGAATATTTG
305 A-ATAGATAATTGTTCA-AAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GATA--AA--CAGATTT-
* * * * ** *
119117 AACTTCTCTGATAAA-CATATTTATTTTTTAAATCATTTACTTACTAATTGTTGAAATGTTAATA
361 -A-TT-T-T-TTAAATC-T-TTTACTTATT--A--ATTT--TTAAT-ATTAAT-AAA--TTAGT-
* * * * *
119181 AATTAATATTATTTTAATTCGAA--TAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAA
408 -ATT-ATTTTATTCTAAAT--AAGCT-TG-TATG----AATAGAAA-AATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * * ** * * * *
119243 TAAAAAATTGATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGGGTCATAGCAATTTAAACTTGTTT
462 -CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* *
119308 GGTAAATAGAT
526 GGTAAACATAT
* * * * * *
119319 TTTTTAAAAATCTTTTACTTCTTAATTGTTT-CAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAA
1 TTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * ** * * * **
119383 ATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATCATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATGATTCCAAATA
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
119448 GATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAATTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTGAAATCT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
119513 CTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATCAA-TTTATATG
194 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAAT-AAGCTTGTATG
* * * * ** * *
119577 AACT-GAAATAATTTTTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCA
257 AA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
119641 AATAGTCAATGACTATTTGATCTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTA
321 AATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * *
119706 ATTTTTAAAATATTAATAATTTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAACA-AAAATTA
385 ATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA--A
* * * * *
119770 TTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAAC
446 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * **
119835 TATTTGAACTGGTTTGACAAACATATTT
511 TATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA--T
* * * * **
119863 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTACTTTTTGAAATATTAATAGATTAGTACTATTTTATTTTGAA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * ** * *
119924 CAAACTTGTATGAACT-AAACGTTTGTTTTATGAC--AACAAAAGGTTATAACCATTTGAAATAG
65 TAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
119986 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTTAATCTC
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC
* * * **
120051 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAACTTCA-TTTTATTTTATTCTAAATAATCTAATATG
195 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TT-AGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATG
* * * *
120114 AATTGAAAAAATTATTTTATGACAAGAC-AAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
257 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* ** ** * * * * *
120178 TATAGTTTTAACTATTTGAA-TTAGTTCGGCAAACAAATTAATTTTTTGAATCTCTTAGTTATTA
321 AATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * *
120242 ATTTTTGGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAATAAT
385 ATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AAT
* * * * * * * * *
120307 TATTTAATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCAAAACT
447 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* *
120372 ATTTGAA-TTGGTTCTGTAAACAAATTT
512 ATTTGAACTT-GTTCGGTAAAC--ATAT
* * * * * *
120399 ATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAGTAAATTAATATTATTTTA-TTCTGA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
* * * ** * * * *
120463 ATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATAACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATA
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * *
120528 GATAATTGTTGAAATGGGCATAATTATTTGAACTAATTCTGTAAACAAATTCATTTTTTAAA--T
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
** * * *
120591 C--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGCTTGTCTGA
194 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGA
* ** * * *
120654 ATTGAAACAATCATTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAA
258 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
** * * * * * * *
120718 TAGTTGTAATTATCTAAATTTGTTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTTTTGCTTATTAG
323 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* ** *
120781 TTTTTGAAATATTAATAAATTATTATT-TTTTAATT-TGGATAAGCTT-TGATGAACTTA-AACA
386 TTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGT-ATGAA--TAGAAAA
* * * * *
120842 ATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA
445 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * *
120907 ATATTTAAACTTATTTGGTAAACAAATT
510 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA-T
* * * * * *
120935 TATTTTTCAAATAAT-TTGCTTATTAATTTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTATTTTA-TTC
1 T-TTTTT-AAAT-CTCTTACTTATTAA-TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * ** *
120998 TAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGATTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGA
62 -AAATAAACTTATATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * ** * * * * ** *
121062 AATAGATAATTATTCCAACAATTTTAACTACTTAAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAA
125 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* ** * **** *
121127 ATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAACCGAATAAGCTTCT
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAAATAAGCTTGT
* * * ** ** * *
121192 ATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTT
254 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* *
121256 CAAATAG-CTATGACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA-CTTGTTACTT
319 CAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTT
* * * * *
121318 ATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTTTTTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAAA
381 ATTAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGA
* ** * * *
121382 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATATATAATCATTCAAAT-GAC
442 AA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-T
* * * ** * *
121446 CATAATTATTTTAAATAATTTGGTAAACAAGTTT
505 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-A-TAT
* * * * * * ***
121480 ATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAA-TTTAGGAAAGAATAATAAATTATTATTATTTTATTTTGT
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * * *
121544 TTAAGCTTGTATTAACTGAAACACTTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTA-AATTGATTTTG--A
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CGA-TTTGAAA
** * * * * * ** *
121606 TCAGGCAATTGTT-AAATTAATTATAAGTATTT-AAATGTGTTCAATAAACATATTTGTTTTTTA
127 T-AGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * * * * *
121669 GACCTATTTCTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAATTTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCCTG
189 AATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTG
* ** * ** * * * * ** * *
121734 CAT-AA-A-CTA-AATTGTTTAATGACTCAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAATTAGATAATTAT
253 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * *
121795 TCTAATAGTCTTAA-TCATTTAAAC-TGATTCGGTACACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
318 TCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * *
121858 ATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTACTATTTTAGTT-TGAATAATCTTGTATGAACA-AA
381 ATTAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
** * * * * * * **
121921 ACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAAGTGTTCATATAGTTT
443 A-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * *
121986 TAACTATTTGAACTGGTTGGGCAATTAGAT-T
507 TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAA--ACATAT
* ** * * ** **
122017 TATTTTTAAAATTTCTTGGTTATTAAGTGTCAGAATATTGTTAAATTAGTATTATTTTATTTC-A
1 T-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * *
122081 A-AAAC--A-A--AAC-----CAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTC-TAATGATTTGAAAT
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * ** *
122134 AGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATAGTTTGATAGACGGATTTACTTTTTAAATC
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * * * * *
122199 TCATACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATAT
193 TCTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * ***
122263 TAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATAGTAATAATGGTTTGAAATAGATAATTGTTCA
256 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* ** * * ** * * * *
122328 AATAGTTATAGTTATGTGAACTGGTTC-AGTAAATGGAATTAGTTTCTAAATC---T-CTTATAA
321 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * ** * * *
122388 ATTTTTGAAATAGTAATAAATAAATGTTATTCCATTTTGAATAAGCTTGTATGCACT-GAAATAA
385 ATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATG-AATAGAAA-AA
* * * * * *
122452 TTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAAC
446 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* **
122517 TATTTGAACTGGTTCGACAAACGGA-ATT
511 TATTTGAACTTGTTCGGTAAAC--ATA-T
* ** ** *
122545 ATTTTTTAAA--TCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTTCTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * **
122608 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGGTTATAATAATTTGAAAT
65 TAAACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAAT
* * ** * * *
122672 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGCAAACATGTTAATTTTTTAAAT-
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * *
122736 GC---CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAGCTTGTAT
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTT-AAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * * * *
122797 G-TTGAAAAACAGTTGCTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACAATTTGTAATAAATAATTGCTC
256 GAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
122861 AAATAGTCATAACAATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTA
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
** * * ** * * * *
122922 ATTTTTGAACTATTAATGGATTAATATTACTTTATTCT-GCTCAAACATATATGAACA-AAAGCA
385 ATTTTT-AA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAA--A
* * * * * *
122985 TTTCTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAACTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
445 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * *
123050 TTATTTGAACTAGTTAGGTAAATAGAATT
510 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACA-TA-T
* * *
123079 ATTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TTCATTTTA--TGA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATT-ATTTTATTTCA
* ** * *
123140 CA-AAAC--A-A--AA--G-GTCATATTG-ATT-TGA-AAAA-AATAATTGTTCATATA-G-TCT
63 AATAAACTTATATGAACTGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAA-AA--GGTCATA-ACGAT-T
** * * ** * ** * **
123190 T-AAATATTTGAACTGGTTCGACAA-AG--A-AATTTATTT--TTTAATTCTCT-TAGTTA-TTA
122 TGAAATAGAT-AA-TTGTTC-A-AATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTA
** * * * * **
123246 GTTTTGGAATAT-TAC-TAGATTAGTGTTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAAAAGTAA
182 -TTTTTTAA-ATCT-CTTA-CTTA---TTAATTT-TT--AAA-ATA-TT-AAT-AA-ATTAGT-A
* ** * * *** * ** * *
123309 TTGTCTTATGATAGAACAAAAG-GT-TAT-AAT-GATTTTAA--GTTTGCAATTTC--TA-AAAT
231 TTAT-TT-T-ATTTAA-ATAAGCTTGTATGAATAGA-AACAATTGTTT--TATGACAAAACAAAA
* * * ** * * ** * * *
123365 AGTTATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATT-TATTTTTTA-AATCTTTTATTAA-TT-T
289 AGTCATAACAATTTGAA--A--TAGAT-AATTG-TTCAAATAGTCATAA-CTATT-TGAACTTGT
* * ** * * * * * ** * * *
123426 T---TGAA-AGATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTAAATGTTCAAATACAAA
346 TCGATAAACAGATTTAT-TTTTTA-AATCTTTTACTT--ATTAATTTTTAATATT--AATA-AAT
* * ** * **** * * * ** * *
123487 T-GT-TATATAATGAAGCAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTG-ATAATTGTTGACATGGCCATT
404 TAGTAT-TAT-TTTATTCTAAA--TAAGCTTG-TATG-AATAGAAAAATTGTT-TTAT-GACA-A
** *** ** * * * * * * *
123549 ATTATTTGG--AT--TGATTCGATAAATAAATTTACTT-TTTAAATCACTTATTAAAT-TTTGGA
460 AACAAAAGGTCATAACAATTTG--AAATAGA--TAATTATTCAAAT-AGTCA-TAACTATTT-GA
* ** *** * * *
123608 AATTAATAAATTAGCTTTATT
518 ACTTGTTCGGTAAAC-ATA-T
* * * ** ***
123629 TTATTTTGAATACTCTTA--TATGAA---TT-G---A--AAT-AATT-GTTTTA-TGAAAAACAA
1 TT-TTTTAAAT-CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * * ** ** * * *
123680 TAGGTAATAATGATTTGAAAT-AGATAATTG-TTCAT-AC-AGTCTTAA-CT-ATTTGAGCTGCT
64 -A--TAA-ACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA--T-AAC-GAT
* * * * * * * **
123739 TTGGCAAAGAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTTGGAA-TA-TT-ATTAAATT
121 TT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAA-----TAGTCA-TAACTATTT-GAACTAGTTCGGTAAA--
* * * * * ** * **
123800 AATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTCTTTTATAACATAATAATAGG
174 CATATT-TATT-TTTT--A-AATC-TCT-T--ACT-TATTAA-T-TTTTA-AA-ATATTAATAAA
** * ** * * ** *
123865 TTA-TAACAATTTAAAATAGAT-AG-TTGGTCA--AATAGAAAC--TGGTTCAATAAACAGATTT
225 TTAGT-ATTATTTTATTTAAATAAGCTT-GT-ATGAATAGAAACAATTGTTTTAT-GACA-A---
*** ** ** * * ** *
123923 ATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-A
282 A---ACAAAAAGT-C-A--TAACAA--TTTGAAATA--GAT-AATT-GT-TCA-AATAGT-CATA
* * * * * * ** * **
123987 A-TAGGCTTGTA--TGAT-GAAAAACA-ATTGT-TTTATGACAA-CAAAAGTT-CATAACAATTT
331 ACTA--TTTGAACTTGTTCGATAAACAGATT-TATTTTTTA-AATC---TTTTACTTATTAATTT
* ** * * * ** * * * ****
124044 GAAATAGATAATTGTTCAAA-TGGCCATAATTATTTGA-GCT-AATTCGATT-TTTAAATCTCTA
389 ---TTA-AT-ATTAAT-AAATTAG---T-ATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
** * * ** * * **
124105 CCTTGTTTTTTAATCTCTAACTTATCAA-TTTTTGAA-ATATTAAT-AAAGTA-ATATTATTTTA
444 AATTGTTTTATGA-C-AAAAC--A-AAAGGTCAT-AACA-ATT--TGAAA-TAGATA--A--TTA
* ** *
124166 TTTCAAATATGCTTTTTATGAACTGA-AAGAA-TTGTTTTATGAGAAAACTAAAGGTCATAT
495 -TTCAAATA-G----TCAT-AACT-ATTTGAACTTG--TT-CG-G-----TAAA---CATAT
* * * *
124226 TTATTTTAAATATATAATAGTTTAAATTGTCATAACTATTT-GAACTTATTTGGTAA-ACAGATT
1 TT-TTTTAAATCTCT--TA-CTT--A---T--TAA-TTTTTGGAA--TA--T--TAATA-A-ATT
* * *** * * * * *
124289 -GATTTTTTTTTAATTTCTTGTGTATTACTTTTCT-AAATGTTAATA-AATTAGTATTATTTTGT
46 AG-TATTATTTT-ATTTC--AAATA-AACTTATATGAACTG--AA-ACAATT-G--TT-TTATG-
*** * * * * *** * ** * *
124351 TTTAAATAAGCATGT-ATGAACTA-AAAAAAT-TATTTTATGACTAAACAAAATA-TCATAACAA
98 ACAAAACAA-AAGGTCAT-AACGATTTGAAATAGATAAT-TG--T--TC-AAATAGTCATAACTA
* * * * * * * *
124412 TTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTCAACTATTTGAATTAGTTTGGAAAACACTTATTTTT
155 TTTGAACTAG-T--TCG--GTAA-A----C-A-TATTT--ATT--TTT-TAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
124477 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTATAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGCT
203 T-AA-----T--TT-TT-A-----A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCT
* * * * * * *
124542 TTTATAAATAGAAATAATT-ATTTGTGACAAAACAAAGA-TCATAACAATTTGAGATAGATAATT
251 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
* * *
124605 GTTCAAATACTCATAACTATTTGAA-TTGGCTCGATAAATAGATTT-TATTTTTAAATC---T-C
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTAC
* *
124664 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTAGTTTATTCTGAATAA--TTCGTATGAATA
379 TTATTAATTTTT--AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTT-GTATGAATA
* * * * * *
124726 GAAAAATTGTTTTACGATAAAACAAAATGTCACAACTATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGG
440 GAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG
* * * * *
124790 ACATGACTATTTGAAATTGTTCGGTGAACAGATTT
504 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGGT-AA-ACATAT
** * * * *
124825 ATTTTTTAAATCTCCAATTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTATTAATATTTTATTTCAAA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * *
124890 TAAACTTGTACGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATCATAACGATTTCAAATA
65 TAAACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * *
124954 AATAATTATTCAACTAGTCATAACTATTTGAACTTGCTT-AGTAAATAAATTTATTTTTTAAATG
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* ** * *
125018 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTTTATG
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTA-AATAAGCTTGTATG
* * * *** * * **
125083 AATACAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGCTTTGGAATAGAAAATTGCACAA
257 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* *
125148 ATAGTCATAATTATTTGAA-TGTGTTC-A-AAAAATGTATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATT
322 ATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGATAAACA-G-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * *
125209 ATTCATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACA-AA
384 A---ATTTTT--AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * * *
125272 ATAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGCCATAATC-TTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTC
443 A-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* ** *
125336 ATAACTATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATT
506 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA-T
* * * *** ** * *
125368 CATTTTTTAATTCACTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTACAATTAGTTTGTTTCAA
1 --TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * *
125433 ATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTG-TTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * *** *
125497 GATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTCTTAAATCA
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC-
* * ** * *
125562 T-TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTATCCAAATAAGCTCGTATA
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
125626 AATAGAAACAATCT-TTTTATAACAAAATAAAAATTCGTAACAATTTGAAATAAATAATTATTCA
257 AATAGAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* *** * * * * *
125690 AATATTCATAAAGGTTTGAACATGTTTGATGAACAAATTTATTTTTTAGATC-TTTACTTATTAA
321 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* ** * *
125754 TTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTAGAAATAAGCTTGTAAGAATAGAAAAAATC
386 TT-T-TTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAAAATT
* * * * *
125819 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTTC-TAGCAATTTCAAATAGATAATTATTAAAATAGTCATAATT
448 GTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * *
125883 ATTTAAAATTGTTTGATAAACAAATT
512 ATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA-T
* * **
125909 GATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AATGTAGTATTATTTTATTTTG
1 --TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCA
* * * * *
125973 AATAAGCTTATATGAACTGAAATAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAA
63 AATAAACTTATATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
126037 TAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGATAAACATATTTATTTTTTTAAA
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTTAAA
* * * **
126102 T-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA
191 TCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTA
* * * * * * * *
126166 TAAATAGAAACTATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACAGTTTGAAA-AAATACTTGCTC
255 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *
126230 AAACAATCATAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA---TTT--TTATT
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * * *
126289 AATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTATT-TCGAACAAGCTTATAT-AA-ACAAAA
384 AATTTTT--AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA
** * * *
126351 ACTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA
445 A---TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * ** *
126416 TAATTATTTGAA-TAGGTAAGGTAAACAAAATT
507 TAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAAC-ATA-T
* ** * * *
126448 ATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATCAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAA
* * * * *
126512 ATAAGC-TAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAACAAAA----AT---TATTTGAAAT
64 ATAAACTTA-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
** * * **** *
126569 AGATAATTGTT-AATATAGTGTTAATTATTAGAACTAGTTTAACAAACAAATTTATTTTTTAAAT
128 AGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
126633 CTCTTACTTGTTAATTTTCAGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTT---TGAA---T-TAT
192 CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAAT-AAGCTTGTAT
* * * * * * * * * *
126691 G-A-AGAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACGATTTGAAATATACAATTATTCA
256 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * *
126754 AATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAATAAAC---------------ATC---T-CCTATTAA
321 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * *
126800 TTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAACTTGTATG-ATCAAAAACAA
386 TTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAA-AA
* * ** ** * * *
126863 TTGTTATATGACCAAACAAAAGGAAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GACCATAA
446 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAA
* * * *
126927 TTTTTTGAAC-TGATTTGGTAAAGTGATTCATTT
510 CTATTTGAACTTG-TTCGGT-AA---A--CATAT
* * *
126960 TTTTTTAAA--TC--ACTTATTCATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
* * * * * * * * * * **
127021 AAGCCTGTATGAACTTAAAAAATTGTTTTGTAACAAAACAACAGGTTATAATGATTTTCAATAGA
66 AAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * ** * * * * *
127086 CATTTGTTCAAATAATTGTAATTATTTGAATTTGTTTGGTAAA-AAATTTTATCTTTTT---T-T
131 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATA-TTTAT-TTTTTAAATCT
* * * ** * * *
127146 AC-T-CTTATTAATTTTTGAAATGTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGATTTTATT
194 -CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATG
* * * * ** * *
127209 AATTGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAA
257 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *
127274 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTT-GGTAAACATATTTCTTTTTTCAAATCTTTTGCTTGTTA
322 ATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTA
* * * * *
127338 ATTTTTTGAATGTTAATAAAATT-GGATTATTTTATTGTGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACA
385 A-TTTTT-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAA-A
* * * * * * **
127401 AATATTTTATGACTACAA-AAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTA
445 ATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
127465 ACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACACATT
509 ACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA-T
* * * ** *
127494 TATATTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTTGTATTTTTTTAACT-GA
1 T-T-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * * * *
127557 ATAACCTTCTATGATCAGAATCAATT-ATTTATGACAAAAC-AAAGAT-ATTAACAATTTGAGAT
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAAT
* * *
127619 TGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
* * ** *
127682 TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATT
193 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * *
127745 AACTA-AAACAATTGTTTTATGAC-AAATAAAAGGTTATAA-ATGATTTTAAATAAAGAAATGTT
257 AA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACA--ATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *
127807 CAAATAGTAATAGCTATTTGAACTTATTC-AGTAAATACATTTATTTTTTAAAATCTCTTT-CTT
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCT-TTTACTT
* * * * * * **
127870 ATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGAAATAATTTATTTTGAATAAGCTTGTACAAACTA-AA
381 ATTAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
* * * * * * * *
127934 ACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAACGATTTCATATAGATAATTATTCTAATAGTCT
443 A-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * *
127999 TAACTGTTTGAAC-TGATTAGGTAAACAAATTT
507 TAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAAC--ATAT
** * *
128031 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATCAGA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-A
* * ** ** * * *
128095 ATAAGCTTGTACAAACAAAAAAAATTCTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * ** * * * ** * * *
128160 GAAAATCGTTCATGTTGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
** * ** * ** *
128225 CTTGGTTATTAAGTTTTCGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATGA
194 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGA
* * * * ** * *
128290 ACA-AAACCAATT-TTTTGATGACAAAATAAAACGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTA
258 ATAGAAA-CAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
128353 AATAGTCAAAACTATTTGAAAATTGGTT-TAGTAAACAGATTCACTTTTTAAAT-TTCTTACTGA
321 AATAGTCATAACTATTTG-AACTT-GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTA
* * * * *
128416 TTAATTTTATAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAACAAACTTGTATTAACAAAAA
382 TTAATTTT-T-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
** * ** * * *
128480 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTAT
444 -AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * *
128545 AATTATTTGTACTAG-TCTGGTAAATAAAAT
508 AACTATTTGAACTTGTTC-GGTAAA-CATAT
* * * * * *
128575 TATTTTCTAAATCTCTCAATTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGA
1 T-TTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * *
128640 ATATACTTATATGAACTGAAACAAATATTATATGAGAAAAC-AAATGTCATAATGATTT-AAGAT
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-AT
* * * *** *
128703 TGATATTTGTTCATATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTTCAAAAAACA-ATTTTAGTTTTTAAAT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATA-TTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
128766 CTCTTACTTATTAATTTTCAAACTATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTCTTA
192 CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTT-GTA
* * * * *
128830 TGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGTCAGATCTAT
255 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAA-TTTGAA-A-T-AGAT-AAT
* * * * * *
128895 TCTTCAAATAGTCCA-ATCTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTTAAATCTTATG
315 TGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTT-TTAAATCTTTTA
* *
128959 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTG
378 CTTATTAA-TTTTT-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * *
129024 AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAACAAATAATTATTCCAATAGT
441 AAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** *
129089 CTTAACTATTTTAAATTGTTCGACAAACACATTT
505 CATAACTATTTGAACTTGTTCG-GTAA-ACATAT
**
129123 ATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTATTT-G--TACTT-ATCAAA--AGGTCA-TA-ACTATT
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGGAATA-TTAAT-AAATTA-GT-ATTATTTTATT
** ** * * ** * * * *
129179 TTGAATACGCATGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTCA
60 TCAAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * ** *
129244 AATAAATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAA
125 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAA
* * * * *
129309 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGC
190 ATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGT
* * * * ** *
129374 ATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAATAAAGA-TCATAATGATTT-AAGATAGATAATTAT
254 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAA-ATAGATAATTGT
* * * * ** * * *
129437 TCAAATTGTTATAACTATTTAAACTGGTTTAATAAATAGATTTAGTTTGTAAATC---T-CTTAT
318 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* ** * * * * ** * *
129498 TAATTTTCAATTATTAATAGGTCAATATTATTTTATTATGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAA
383 TAATTTTTAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG-AA-AA
* * * ** * * * *
129563 ATTGTTTTATGACAAAATAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTC-AATAGACATGA
445 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * *
129627 CTATTTGAACTTGTTCGATAAGTAGATTT
510 CTATTTGAACTTGTTCGGTAA--ACATAT
* * * * * *
129656 ATTTTTTAAATTTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
* * *
129720 ATAAACTTGTGTGAA-TAGAAACAATTGCTTTATG--------AAA----A-AAC-------AA-
64 ATAAACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
129763 A-ATAATTGTTCAAACACTTATAACTATTTGAACTTACTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* ** * * * ** *
129826 CTTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTGATAAAATAATATTATTTTATTTTGTATACGCTTGTA
192 CTCTTACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTA
* * * * * * * *
129891 TGAACAAAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATTC-TAACTATTTGAAATAGATAATTTTT
255 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *
129955 CAAATAGTCCTAACTATTTGAACATGTTTAGA-AAACATATTTA-TTTTTAAAT-TCTTACTTAT
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
130017 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC-AGAATGAGCTTGTATAAACAAAAA
383 TAATTTTT--AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* ** *
130080 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCAT
444 -AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* ** * *
130145 AACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGAT
508 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATAT
* * * * **
130174 TCATTTTTTACTCTCTTACTCA-TCA------GAATATTAATAAATTA--A-TATTTT-TTTTGA
1 T--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * *
130228 ATAAGCCTATATGAACTGATACAATTGTTTTATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * *
130293 GATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
130358 -TCTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAA-AAGCTTGTAT
194 CT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT-TTAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
130421 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAAAAAAT-ATAAGTTC
256 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT-TGTTC
* * *
130485 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTA
320 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * *
130549 ATTATCTAA-ATGATAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTAGGAATAGAAAAA
385 ATT-TTTAATAT--TAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAAA
* * * ** * * *
130612 ATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAGTCATAA
445 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * *
130677 CTATTT-AAATAT-TTTGATAAACAAATT
510 CTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACATA-T
* * * * **
130704 TAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTGA
1 T--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* *** * * * * * *
130769 ATAAGCTCGCATGAACAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATA
64 ATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * ** * *
130834 GATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGTA-TTGATCAGGCCAACAGATTCATTTTTTTAAAT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC-GGTAAACATATTTA-TTTTTTAAAT
* * * * *
130898 C-CATTACTTATTAGTTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTAAATAAGAC-AGC
192 CTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAG-CTTGT
* * * * * * * *
130961 ATTAATAGAAATAGTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGATATGAAATAAATAATTGT
254 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
131025 TTAAATTA-TTATAACTAATTGAAC-TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTT
318 TCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
* * * * * *
131084 AATAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACA-AAA
381 ATTAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * * * * * *
131148 ACATTTGTTTTACGACAAACCAAAAGGACATAACACTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCT
444 A-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * *** *
131213 TAACTCTTT-AAATTGGTTCAACAAACAAATT
507 TAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACATA-T
* *** * * *
131244 TATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTATATTGGTATTA-TTTATTTCAA
1 T-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* ** * * * * * *
131308 ATAAGCTTGCATGAACAT-AAATAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAA-TAGCTTGAAA
64 ATAAACTTATATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAA
* * * * * * *
131371 TACATAATTGTTCAAATAGTCATTATTATTTGAATTGGTTCGATAAAC--A--GA-----T-AAT
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
131426 CTCCTATTTATTTATTTATGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTA
192 CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAG-CTTGTA
* * ** *
131490 TG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCAAAATGATTTGAAAAAGATAATTGT
255 TGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * * * **
131553 TTAAACT-GCCATAACTATTTGAACTAATTCGATAAACTGATATATGTTTTAAATC-TCCAGCTT
318 TCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTT
* * * ** * *
131616 CTCAATTTTTGAAGTATTAAT-AA--A-TATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAA-ATGAA
381 ATTAATTTTT-AA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA-GAA
* * * * *
131676 ATAGTTGTTATATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATATTCA
443 A-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * *
131741 AAAGTATTTGAACTTGTTTC-GTAAATAGATTTAT
507 TAACTATTTGAACTTG-TTCGGT-AA-ACA--TAT
* * * * *
131775 TTTTTAAAAT-TCTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAA
1 TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * *
131839 TAAGCATGTATGAACTGAAACAAAATG--TTA-G----------A----AT--C-ATTTGAAATA
65 TAAACTTATATGAACTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
131884 GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATACATTTATTTTTTAAACCT
129 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
* * * *** * * ** * * *
131949 CTTACTTATAAATTTTTAGAATATTATTGGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATATGTTTGTATGG
194 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
132014 ATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATACCAATTTGAGATAAATAATTGTTCAAA
258 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
132078 TAGTCCTAACTATTT-AAATTGATTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAAT
323 TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * ** * * *
132138 TTTCAAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTTTGTGAATAGAAACACTTG
387 TTT-TA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATTG
* * * * * * *
132203 TTTTATGACAAAACAAAAGATCAT-ACTAACTTGAAATAAATAATTATTTAAATTGTCATAATTG
449 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
** ** *
132267 TTTGAACTCACTAAGG-AAACAAATTT
513 TTTGAACT-TGTTCGGTAAAC--ATAT
* * * *
132293 ATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTGGGAATTTTAATAAATTAG-AGTTATTTTATTCCAA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAA
* * * * *
132357 ATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAA-TAGTTTGAAA
64 ATAAACTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAA
** * * *
132420 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGT-GTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAA
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * ** ** * *
132484 T-TTTTACTTGTTAATCTTTGGAATATTGGTAATTTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGT
191 TCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGT
* * * ** * *
132547 TTGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAACAATTGTT
254 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *
132612 C-AA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAT
319 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * *
132674 CAATTTTTGAAATAGTAATAAGTCAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCCTATGTA--AATTGATA
383 TAATTTTT--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CT-TGTATGAATAGA-A
* ** ** *
132736 CAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
443 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* *
132801 TACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTT
508 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA--T
* * * * * * *
132832 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTCTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTGATCT-GA
1 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAA
** * *
132896 AT-AAGGTAGTATGAAC-GAAAATAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAACGATTTGAAA
64 ATAAACTTA-TATGAACTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* *
132958 TAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
132992 ATTATTTGGT
Statistics
Matches: 16585, Mismatches: 4124, Indels: 3489
0.69 0.17 0.14
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Consensus pattern (536 bp):
TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
AAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT
TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAATA
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAATTGTTTTATG
ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
TGTTCGGTAAACATAT
Found at i:115951 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 115601--116556 Score: 820
Period size: 179 Copynumber: 5.4 Consensus size: 181
115591 ATCTTAATCC
* * * * * * * ** *
115601 GAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTCTATGACAAAA-TAAAGATAATAATGATTTGAGA
1 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * * * * * * * *
115665 TAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAATTGTTTAAAC-TGATTTAGCAAATAAATTTAGTTTTCAAA
66 TAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * *
115729 --TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAATGTTATTTTATTTT
130 TCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
* * * * *
115777 GAATCA-TTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * *
115841 TAAATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTTGTACATAGATTTATTTTTTAAAT
66 TAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
** *
115906 CTCCAAAC-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
131 CT-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
** * * * * * *
115957 GAATAAATTTGTA--AATAGAAATAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGATCATCACTATTTGAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * *
116020 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGAAAATAGATTTCTTTTTTAAAT
66 TAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
* * * **
116085 TTC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTTATATTATTTTATTCA
131 CTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
* ** * * *
116134 AAATAAGCTTGTATGAATGGAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAAAGTCAAAACAATTTGAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * *
116198 TAGATAATTGTTCAAATAGTA-ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTA-ATTCATTTTGTAA
66 TAAATAATTATTCAAATAG-ACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAA
* * * *
116261 ATCTCTTACTCT-TTAATGTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTT
129 ATCTCTTACT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
* * ** ** ** * *
116314 GAATAAGCCTATATGAACTTATTCAATTGTTTTAAAACTAAACAAAAGGGCATAACAATTTGAAA
1 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* ** * * *
116379 TAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTT-AGACTTGTTTGGTAAA-ATATTTATTTTTAAAA
66 TAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGA-ACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * **
116442 TCTTTTACTTATT-ATTTGTCA-AAGTATTAATAAATTAATATTATTTTAATCA
130 TCTCTTACTTATTAATTT-TTAGAA-TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
* * * * *
116494 GAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT-AAAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAA
1 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
116557 CTTATTTAGT
Statistics
Matches: 628, Mismatches: 129, Indels: 43
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 29 0.05
176 67 0.11
177 30 0.05
178 95 0.15
179 178 0.28
180 162 0.26
181 67 0.11
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
TAAATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
CTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
Found at i:116289 original size:357 final size:355
Alignment explanation
Indices: 115657--116556 Score: 919
Period size: 357 Copynumber: 2.5 Consensus size: 355
115647 GATAATAATG
* * * * * *
115657 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAATTGTTTAAACTGATTTAGCAAATAAATTTAGT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTG-TTTAGAAAAT-AATTTATT
* * * * ** *
115722 TTTCAAA--TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAATGTTATTTTATTTTGAATCA-
63 TTTAAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCAGAATAAG
* * * * *
115783 TTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAA
128 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
* * * * *
115848 TTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTTGTACATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAA
193 TTATTCAAATGGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTGTAAATCTCCAAA
* *
115913 CTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-ATTTGTAAATAGAA
258 CTATTAATGTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAACATATG-AAAT--AA
*** * * *
115977 AT-AATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGATCATCACT
320 ATCAATTGTTTTAAAACAAAACAAAAGAGCATAACA
* *
116012 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGAAAATAGATTTCTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTAGAAAATA-ATTTATT
* ** * *
116077 TTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTTATATTATTTTATTCAAAATAAG
63 TTTAAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCAGAATAAG
** * * *
116141 CTTGTATGAATGGAAACAATTATTTTATGACAAAA-AAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAA
128 CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
* * *
116205 TTGTTCAAATAGTA-ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACTA-ATTCATTTTGTAAATCT-CT
193 TTATTCAAAT-GGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-TAGATTCATTTTGTAAATCTCCA
* * * * *
116267 TACTCTTTAATGTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAGCCTATATGAAC
256 AACT-ATTAATGTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA--C-ATATGAAA
* * * *
116332 TTATTCAATTGTTTTAAAACTAAACAAAAGGGCATAACA
317 TAAATCAATTGTTTTAAAACAAAACAAAAGAGCATAACA
* * * *
116371 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTAGACTTGTTTGGTAAAAT-ATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA-AC-TGTTTAG-AAAATAATTTATT
* * * *
116435 TTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAGTATTAATAAATTAATATTATTTTAATCAGAATA
63 TTTAAAAT-TTCTACTTATTAATTT-TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCAGAATA
* * * *
116499 AGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT-AAAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAA
126 AGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAA
116557 CTTATTTAGT
Statistics
Matches: 446, Mismatches: 79, Indels: 35
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
354 1 0.00
355 57 0.13
356 6 0.01
357 137 0.31
358 75 0.17
359 92 0.21
360 74 0.17
361 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAACTGTTTAGAAAATAATTTATTTTT
AAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCAGAATAAGCTT
GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTA
TTCAAATGGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTGTAAATCTCCAAACTA
TTAATGTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAACATATGAAATAAATCAAT
TGTTTTAAAACAAAACAAAAGAGCATAACA
Found at i:117954 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 116593--117968 Score: 904
Period size: 181 Copynumber: 7.7 Consensus size: 178
116583 TAATTGTTTG
* * ** *
116593 AATATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTAT
* * * * * ** * *
116658 AACAAAA-TAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAAC
65 GATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* ** * * * **
116722 TTGTTTAATAAACAAATT-TTTTTTAAA--T-AT-CTTATTAATTTTTGG
130 -TGGTTCGTAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
*** * * * ** * *
116767 AATATTAATAAGCAAGAATTATGTCATTTCGAATAAAG-TTGTATGAATAAAAACAATTGATTTG
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAT-AAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTGTTTTA
* * ** * ** * *
116831 TGATAATACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGTA
64 TGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * *
116896 CTAG-TCG-AGCAACAGTTTCATTTCTTAAAT-TCATTACTGATCAATTTTTAG
129 CTGGTTCGTA--AATAATTT-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAA
** * * * *
116947 AATATTAATAAATTAACATTACTTT-TTTT---T-GGACTGTGTA--AGTAGAAACAATTATTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAG-CT-TGTATGAATA-AAACAATTGTTTT
* * * * *
117005 ATGATAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAGTTAT-ACTAATTGA
63 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * *
117069 ACTGGTTTAGT-AATCAGATTTATTTTTTAACTCTTTTACTTATTAATTTTTAA
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* * ** ** * * *
117122 AATATTAATAAAATAATATTATTTTA-TTCCAAGCAGACTTTTTTGAA-AAAA-AATCTGTTTGA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAG-CTTGTATGAATAAAACAAT-TGTTTTA
* * * * *
117184 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGACATCAATAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
64 TGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
117249 CTAGTTCGGTAAACAAAATTGTTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTGA
129 CTGGTTC-GTAAA-TAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * *
117301 AATATTAACAAATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTAAAGA-AATTGTTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT-GTATGAA-TAAA-ACAATTGTTTT
* ** * ** * *
117364 ACGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATCTAGCCTTAACTATTTGA
63 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
117429 ACTGGTTTGGCAAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAG
128 ACTGG-TTCGTAAAT-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * **
117482 AATAATATTACATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATAATTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTAT
* * * * * * *
117547 AATAGAACAAAAAAGTTATAAAAAGTTT-AAATATATAATTTTTCAAATAGTCATAAC-ATTTGA
65 GATAAAAC-AAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
117610 ATTGGTTTTGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGA
128 ACTGG-TTCGTAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* * ** **
117662 AACATTAATAAATTAGTATTATTCTATTCCAAATAAAATTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT--AAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
117726 TTACAAAACAAAAGTTCATTACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGAG-CATAATTATTTGA
64 TGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGA
** *
117790 ACTAATTCGATAGAATAATTTATTTTTTAAATCTC-TATCTTATCAATTTTTAA
128 ACTGGTTCG-TA-AATAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTAA
* * ** * *
117843 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTTCATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTTTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTAT
* * * *
117908 GATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTT
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GGTTCGTAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
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117911 AAAATAAAAG
*
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*
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* *
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GTCATAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATA
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117938 TAGATAATTG
* *
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* *
117966 TTTTAAATA-G-ATAATTA
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1 TT
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117739 GTTCATTACA
* * *
117749 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGAGCATAATTATTTGAACTAATTCGATAGAATAATTTATT
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* * * **
117814 TTTTAAATCTCTATCTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTTCATAA
66 TTTTAAATCTCTATCTTATAAATTTTT--AATATTAATAAAATAACATTATTTTATTTTAAATAA
* * * * * *
117879 GCTTTTATGAACTAAAACAATTTTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATA
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*
117944 ATTGTTCAAATAGTCATAACG
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* *
117965 ATTTTAAATAGATAATTATTCAAAT-AGGCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAT-ATTTA
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* * * * *
118028 TTTTTTTAATTTCT-TGCTTTTAAAATTTTT-ATGTTAATAAAATAGCATTATTTTATTTTAAAT
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* * * * **
118091 AAGCATGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACT-AAGCCAAAGGTTAAAATGATTTGAAATAG
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* * *
118155 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACT
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TTTTAAATCTCTATCTTATAAATTTTTAATATTAATAAAATAACATTATTTTATTTTAAATAAGC
ATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAAT
TATTCAAATAGTCATAACG
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118947 GGAATACTAA
*
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TCAGTTAGTATTACTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
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118991 ATGAACTCAG
* ** * * *
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* * * * * ** * *
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* * * *
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* * * * *
119183 TTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAA
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** * * * ** * * * *
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* ** * * *
119312 AATAGA-TT-TTTTAAAAATCTTTTACTTCTTAATTGTTTCAATATTAATAAA
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* * * ** *
119363 TTTGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATCATTTTATAACAAAACAAA
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* * ** * * * *
119427 AGGTTATAATGATTCCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAATTTGTTTGGTAA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAA
* * * * *
119492 ATAGATTCATTTTTGAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAC
130 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA
* * * * *
119544 TTAGTATTATTTTATTTTGAATCAA-TTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTAAGACAAAACAAA
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* * * * * *
119608 AGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCAATGACTATTTGATCTAGTTCGGTA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGGTA
* * * * *
119673 AACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAT
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* * * ** ** *
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1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * **
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* * *
119856 CATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTACTTTTTGAAATATTAATAGA
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* * * **
119903 TTAGTACTATTTTATTTTGAACAAACTTGTATGAACT-AAACGTTTGTTTTATGAC--AACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * *
119965 GGTTATAACCATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAA
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAA
* * *
120030 CAAAATTATTTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
131 CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * ** * * * *
120080 CTTCA-TTTTATTTTATTCTAAATAATCTAATATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAGACAA
1 -TT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * ** * * *
120144 AAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAATTAGTTCGGCA
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTA
* * * * * *
120209 AACAAATTAATTTTTTGAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGA
129 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA
* * * * * * * *
120262 TTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTATTTAATGATAGAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * *
120327 GGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTCT-GTAA
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGGTAA
* * * *
120391 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAAGATTAGTAAA
130 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * ** * *
120443 TTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATAACCAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
120508 GGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGGCATAATTATTTGAACTAATTCT-GTAA
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGGTAA
* *
120572 ACAAATTCATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
130 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA
* * ** * * **
120620 TTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGCTTGTCTGAATTGAAACAATCATTTTATGA-AAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * ** * * * * * **
120684 TGTCATAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTTGTAATTATCTAAATTTGTTCAGTAAA
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* * * *
120749 CAAATTTATTTTTTTAAA-CTTTTGCTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAA
131 CAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * *
120800 TTATTATT-TTTTAATTTGGATAAGCTT-TGATGAACTTAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * *
120863 AGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTA-TTTGGTA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTA
* * * * *
120927 AACAAATTTATTTTTCAAATAAT-TTGCTTATTAATTTTTTTGAATGTTAATAAA
129 AACAGATTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTATTAA--TTTTTGAATATTAATAAA
* * * * * * * **
120981 TTTGGATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGATTAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * ** * * * * * **
121045 AGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCCAACAATTTTAACTACTTAAATTGGTTCGACAA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAA
* * *
121110 ACACATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAA
130 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA
*** * * *
121162 TTAGTATTATTTT-TAACCGAATAAGCTTCTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TA
1 TTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * * * * * *
121224 AAGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAG-CTATGACTATTTGAATTGGTTCGAT
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTTGGT
* * *
121288 AAATAGATTTATTTTTTAAA-CTTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAA
128 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* ** *
121342 TTAGTATTATTTTTTTTTCGAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAA
1 TTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * ** * * * * *
121406 AATGTCATAATGATTTGAAATATATAATCATTCAAAT-GACCATAATTATTTTAAATAATTTGGT
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAGTTTGGT
* * ** * *
121470 AAACA-AGTTTATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAATTTAGGAAAGAATAATAAA
128 AAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* ** * * *
121524 TTATTATTATTTTATTTTGTTTAAGCTTGTATTAACTGAAACACTTGTTTTATGACAAATCAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * ** * * * *
121589 GGTTA-AATTGATTTTG--ATCAGGCAATTGTT-AAATTAATTATAAGTATTT-AAAT-GTGTTC
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** * * * * * * * *
121648 AATAAACATATTTGTTTTTTAGACCTATTTCTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAT
125 GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA
* * * * * * * ** *
121705 TTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCCTGCATAAACT---A-AATTGTTTAATGACTCAATAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * *
121766 GGTTAGAATGATTTGAATTAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-TCATTTAAACT-GATTCGGTA
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTAG-TTTGGTA
* * *
121829 CACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAA
129 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * ** *
121882 TTAGTACTATTTTAGTTTGAATAATCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * ** * * * *
121946 GATCATAACAATTTGAAATAAATAAGTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTGGGCAAT
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAA
* * * ** * ** **
122011 TAGATTTATTTTTAAAATTTCTTGGTTATTAAGTGTCAGAATATTGTTAAA
131 CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA
* * * * *
122062 TTAGTATTATTTTA-TTTCAA-AA------A-CAA---AACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
122115 GGTTC-TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATAGTTTGATAG
66 GG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAA
* * * * *
122179 ACGGATTTACTTTTTAAATCTCATACTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAA
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* * * * ** *
122231 TTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAT
1 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-
* * * * ** * * **
122296 A-GTAATAATGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAGTTATGTGAACTGGTTCAGTAA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAA
** * * * *
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* * * ** * * * *
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* ** * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * *
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* * ** * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * ** * * ** * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * ** *
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* * * * * ** * * *
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** * * * ** * * ** **
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* * * * *
122074 TA-TTT---CAA------A--AACA-AAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTC-TAATG
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* * * ** *
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* *
122189 TTTTTAAATCTCATACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAA
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* * * * * ** *
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* * * * ** * * *
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** * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * **
122547 TTTTTAAA--TCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTTCTAAA
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** * * *
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* ** ** *
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** * * * *
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* *** * * ** * * * * *
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195 ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * ** * * *
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* **
122907 TTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAACTATTAATGGA
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* * * * * * * * *
122942 TTAATATTACTTTATTCTG-CTCAAACATATATGAA--CAAAAGCATTTCTTTTATGACAAAACA
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* * * * * *
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* * *
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* ** * * * ** *
123131 ATTTTA---TGACA-AAAC----A--AA-AG-GTCATATTGATTTGA--AAAAAATAATTGTTCA
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** ** * ** * *
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* *** ** * * *
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* * * ** * * * ** *** *** * *
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* * ** ** ** ** * *** *
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* ** * * ** **
123490 TATA-TAATGAAGCAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTG-ATAA--TTGT-TG-ACATG-GCCAT
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* * ** ** * *
123548 TATTATTTGGATTGATTCGATAAATAAATTTACTTTTTAAATC-ACTTATTAAATTTTGGA-AAT
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* * ** * * * *
123611 TAAT-AAATTAG-CTTTATTTTATTTTGAA-TA-CTCTTATATGAATTGAAATAATTGTTTTATG
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* * ** ** * * * *
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* *** * ** * * * * **
123763 ATCTCTTA-GTTATTAA-TTTTTGGAAT--ATTATTAAATT--AATA-TTAT-TTTATTTTGAAT
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* * ** * * * ** * *
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* * ** * * * *
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176 AATAAATTAGTATTA-TT--TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA-A-TTATTTTATG
* * *** * * ** * * ** **
123929 -TAAATCTCCTA-CTTATTAA-TTTTTGAAATA-TTAA-TA---AATTAGT-ATTATTTTATTCC
236 ACAAAAC-AAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TA-ACTATTTG
* * * * * *** * **
123985 AAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGT-TTTATGACAA-C-AAAAGTTCA-TAACAATTTGA
297 AACTA-G--T-TCTG-T-AAACA-AATT-TATTTTTTA-AATCTCTTACTT-ATTAA-TTTTTGA
*
124046 AATAGATAATTGTTCAAA
351 AATA-TTAA------AAA
* * * ** * * * ** ** * * **
124064 -TGGCCATAATTATTTGA-GCT-AATTCGATT-TTTAAATCT--CTACCTTGTTTTTTAATCTCT
1 TTAG---T-ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAAAAATTGTTTTATGA-C-AA
* * ** ** * *
124123 AACTTATCAA-TTTTTGAAATATTAAT-AAAGTA-ATATTATTTTATTTCAAATATGCTTTTTAT
59 AAC--A-AAAGGTCAT-AACGATT--TGAAA-TAGATA--A--TT-GTTCAAATA-G----TCAT
** * * * * * * *
124185 GAACTGA-AAGAATTGTTTTATGAGAAAACTAAAGGTCATATTTATTTTAAATATATAATAGTTT
107 -AACT-ATTTGAATTG-GTT-CG-GTAAAC-AAA--T-TTA-TT-TTTTAAATCTCT--TA-CTT
* * *
124249 AAATTGTCATAACTATTT-GAACTTATTTGGTAA-ACAGATT-GATTTTTTTTTAATTTCTTGTG
158 --A---T--TAA-TTTTTGGAA--TA--T--TAATA-A-ATTAG-TATTATTTT-A--T-TT-TG
* * * * * *** * * *
124311 TATTA-CTTTTCT-AA-ATGTTAATA-AATTAGTATTATTTTGTTTTAAATAAGCATGT-ATGAA
201 AATAAGCTTGTATGAACA-G--AA-ACAA-T--TATT-TTATG-ACAAAACAA-AAGGTCAT-AA
* *** * * * ** * *
124371 CTA-AAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAATA-TCATAACAATTTGAAATAGATAAT-TGTTCT
255 CGATTTGAAA-TA---GATAATTATTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-T--TCTG---T
* * * * * * **
124433 AATAGTCTCAACTATTTGAATTAGTTTGGAAAACACTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAAT
309 AA-A----CAA--ATTT--ATT--TTT-TAAATCTCTTACTTATT-AAT-TTTTGAAATATTAA-
124497 TTTTATAA
359 ----A-AA
* * * * * * *
124505 -TATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTTTATAAATAGAAATAATT-ATTTGTG
1 TTAGTATT-ATTT-----TA--TT-C--TGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATG
* * * *
124568 ACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAATT
55 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT
* * * * **
124632 GGCTCGATAAATAGATTT-TATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
120 GGTTCGGTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-T
* * * * * *
124692 TA-TATTAGTTTATTCTGAATAA--TTCGTATGAATAGAAA-AATTGTTTTACGATAAAACAAAA
183 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * * *
124753 TGTCACAACTATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAAATTGTTCGGTGA
247 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTGTAA
* ** *
124817 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCCAATTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAA
311 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAA-AAA
* * * * * * *
124869 TTATTAATATTTTATT-TCAAATAAACTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * *
124933 TGATCATAACGATTTCAAATAAATAATTATTCAACTAGTCATAACTATTTGAACTTGCTT-AGTA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTA
* * * *
124997 AATAAATTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTT
129 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * ** * *
125062 TATTTAGAATAAGCTTTTATGAATACAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGCT
194 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * *** * * *** ***
125127 TTGGAATAGAAAATTGCACAAATAGTCATAATTATTTGAA-TGTGTTCAAAAAATGTATTTATTT
259 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCTGTAAACAAATTTATTT
*
125191 TTTAAAT-TTTTACTTATTATTCATTTTT-AGAATATTAATAAA
323 TTTAAATCTCTTACTTATTA---ATTTTTGA-AATATTAA-AAA
** * * * *
125233 TTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAA--CAAAATAATTGTTTTGTAACAAAACAA
1 -TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * **
125295 AAGGCCATAATC-TTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTTAG
64 AAGGTCATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGG
* * * * *** ** *
125358 TAAACAAATTCATTTTTTAATTCACTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTACAATTAG
127 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * ** * * * *
125423 TTTGTTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATT-GTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATG
192 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * *** *
125487 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATT
257 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTGTAAACAAATTTATT
* **
125552 TCTTAAATCAT-TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA
322 TTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* ** * * * * * *
125593 TTAATATTATTTT-TATCCAAATAAGCTCGTATAAATAGAAACAATCT-TTTTATAACAAAATAA
1 TTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAAT-TGTTTTATGACAAAACAA
** * * * * * *** * * *
125656 AAATTCGTAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAAAGGTTTGAACAT-GTTTGAT
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGT
* * *
125720 GAACAAATTTATTTTTTAGATCT-TTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTA
128 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
125782 TTTTA-TTAGAAATAAGCTTGTAAGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTC-TA
191 TTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATA
* * * * * * * *
125845 GCAATTTCAAATAGATAATTATTAAAATAGTCATAATTATTTAAAATTGTT-TGATAAACAAATT
254 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTG-TAAACAAATT
* * *
125909 GATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
318 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAA
* * *
125953 TGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAATAAATT-TTTTATGACAAAACAA
1 T-TAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * * *
126017 AAGATAATAACAATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTG-ATCTAGTTTGAT
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TGGTTCGGT
* * * *
126081 AAACATATTTATTTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
128 AAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
126145 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACTATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAAC-
192 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * ** * * * *
126209 AGTTTGAAA-AAATACTTGCTCAAACAATCATAACTATTTGAATTGGTT-TGGTAAACAAATTTA
257 A-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCT-GTAAACAAATTTA
*
126272 TTTTTTAAA--T-TT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGA
320 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* * * ** *
126310 TTAGTATTTTTTTTATT-TCGAACAAGCTTATAT-AA-ACAAAAACTTTTGTTTTATGACAAAAC
1 TTAGTA-TTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAA--ATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * **
126372 AAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAATAGGTAAGG
62 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGG
* * ** * *
126437 TAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATCAATAAATTCA-TTTTA
127 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTA
*** * ** * * *
126501 TTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAACAAAA----AT---
191 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * ** * * **
126559 TATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTGTTAATTATTAGAACTAGTT-TAACAAACAAATTT
256 GATTTGAAATAGATAATTATTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCT-GTAAACAAATTT
* * * *
126622 ATTTTTTAAATCTCTTACTTGTTAA-TTTTCAGAATATTATTATA
319 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA-AAAA
* * * * *
126666 TTAGTATTATTTTATTTTG---AA---T-TATGAA--GAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * *
126722 TGTTATAACGATTTGAAATATACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAG-T---T---
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAA
* *
126780 C-AA--TA------AACATCTC---C-TATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTT
131 CAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * ** *
126832 ATTTCGAATAAACTTGTATGATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGAAATAATGATT
195 ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * * *
126897 TGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GACCATAATTTTTTGAACT-GATT-TGGTAAAGTGATTCATT
260 TGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAG-TTCT-GTAAA--CA--AATT
* *
126959 T-TTTTTTAAA--TC--ACTTATTCATTTTTGGAATATTAATAAA
318 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* * * *
126999 TTAGTATCATTTTATT-TCGAATAAGCCTGTATGAACTT-AAAAAATTGTTTTGTAACAAAACAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * ** * * * ** * * *
127062 CAGGTTATAATGATTTTCAATAGACATTTGTTCAAATAATTGTAATTATTTGAATTTGTTTGGTA
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTA
* * *
127127 AA-AAATTTTATCTTTTT---T-TAC-T-CTTATTAATTTTTGAAATGTTAAGAAATTAGTATTA
129 AACAAA-TTTAT-TTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * ** * * *
127185 TTTTATTTTGGATAAGATTTTATTAATTGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAAT
191 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
127250 GATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTT-GGTAAACATATTTC
256 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCTGTAAACAAATTTA
* * * *
127314 TTTTTTCAAATCTTTTGCTTGTTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAA
320 TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATT-A-AAAA
* * * * *
127359 TT-GGATTATTTTATTGTGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAA-TATTTTATGACTACAA-A
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAA-AAATTGTTTTATGAC-AAAACA
* * * ** * * * *
127420 AAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTCAGC
63 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGT
* * * * *
127485 AAACACATTTATATTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTTGTATTTTT
128 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * *
127549 TTA-ACTGAATAACCTTCTATGATCAGAATCAATTA-TTTATGACAAAAC-AAAGAT-ATTAACA
193 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACG
* * * * *
127610 ATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTAGT
257 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTGTAAACAAATTTATT
127675 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
322 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* * * * *
127712 TTAGTATTATTTTATTC-CATCTAAGCTTGTATTAACT-AAAACAATTGTTTTATGAC-AAATAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * * * *
127774 AAGGTTATAAATGATTTTAAATAAAGAAATGTTCAAATAGTAATAGCTATTTGAACTT-ATTCAG
64 AAGGTCAT-AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGG
* * * ** * * *
127838 TAAATACATTTATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGAAATA
127 TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * *
127903 ATTTATTTTGAATAAGCTTGTACAAACTA-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAA
191 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * **
127967 CGATTTCATATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTGTTTGAACT-GATTAGGTAAACAAATTT
255 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCTGTAAACAAATTT
* *
128031 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAA
319 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-AAAA
* * ** *** * *
128075 TTAGTATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTACAAACAAAAAAAATTCTTTTATGACAAAAGAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * ** * * * * * *
128140 GGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATCGTTCATGTTGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAT
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAA
* * * * ** * * *
128205 TAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTCGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
131 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** ** * * * * *
128270 TTTCAAATAAAATAGTATGAACA-AAACCAATT-TTTTGATGACAAAATAAAACGTTATAATGAT
196 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CAATTATTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * *
128333 TTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAAAACTATTTGAAAATTGGTT-TAGTAAACAGATTCAC
259 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG--AACTAGTTCT-GTAAACAAATTTAT
* *
128397 TTTTTAAATTTCTTACTGATTAATTTTAT-AAATATTAATAAA
321 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAA-AAA
* * * * **
128439 TTAGTATTATTTTATT-TCAAACAAACTTGTATTAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * * * * * *
128502 AAAATAATAATGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGTACTAG-TCTGGT
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTC-GGT
* * * * * * * *
128566 AAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAATTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATT
128 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
128631 TTATTTCGAATATA-CTTATATGAACTGAAACAAATATTATATGAGAAAAC-AAATGTCATAATG
193 TTATTTTGAATA-AGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * *** * *
128694 ATTT-AAGATTGATATTTGTTCATATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTTCAAAAAACAATTTTAG
257 ATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTGTAAACAAATTTAT
* *
128757 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAACTATTAGTAAA
321 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTA-AAAA
* * * * *
128799 GTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTCTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTT-GTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * *
128863 AGGTCATAACAACTTTAAATAGTCAGATCTATTCTTCAAATAGTCCA-ATCTATTTGAACTT-GT
65 AGGTCATAACGA-TTTGAA-A-T-AGAT-AATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAA-TTGGT
* * * * *
128926 TCGGTAAATAGATTTATTTTCTTAAATCT-TATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAG
123 TCGGTAAACAAATTTATTTT-TTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* * ** * * * *
128990 TATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGCC
186 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * * *
129055 ATAACAATTTGAAACAAATAATTATTCCAATAGTCTTAACTATTTTAAATTGTTC-GACAAACAC
251 ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTG-TAAACAA
* * *
129119 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTATTTGTACT-TATCAAAA
315 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATAT-TAAAAA
* ** * * * ** * *
129166 --GGTCA-TA-ACTATTTTGAATACGCATGTATGAA-CAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAA
1 TTAGT-ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * **
129226 AAGGTCATAACTATTTCAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGACA
64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTA
* * * *
129291 AACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTT
129 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * *
129356 TAATTTGAATAAGCTTGCATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAA-TAAAGATCATAATGAT
194 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * *
129420 TT-AAGATAGATAATTATTCAAATTGTTATAACTATTTAAACTGGTT-TAATAAATAGATTTAGT
259 TTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCT-GTAAACAAATTTATT
* * * **
129483 TTGTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAATTATTAATAGG
322 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* * * ** * ** * *
129519 TCAATATTATTTTATTATGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAAATTGTTTTATGACAAAATAGA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * *
129584 ATGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTC-AATAGACATGACTATTTGAACTT-GTTCGATA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTA
** * * * * * *
129647 AGTAGATTTATTTTTTAAATTTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTT
129 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * ** *
129712 TATTCTGAATAAACTTGTGTGAATAGAAACAATTGCTTTATGAAAAAAC-AAA----AT-A--A-
194 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * *
129768 TTG---T---TCAA--A--C-ACT--T-ATAACTATTTGAACTTACTT-AGTAAACAGATTTATT
259 TTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCTGTAAACAAATTTATT
* *
129818 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTGATAAAA
322 TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATT-A-AAAA
* * * * ** * *
129861 -TAATATTATTTTATTTTGTATACGCTTGTATGAA-CAAAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * ** *
129924 AGATTC-TAACTATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCCTAACTATTTGAACAT-GTTTAGA
65 AG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGT
* *
129987 AAACATATTTA-TTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTAT
128 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTAT
** * * * * * *
130049 TTTATTCAGAATGAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATG
192 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * ** * * *
130114 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTCATT
257 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTGTAAACAAATTTATT
* * *
130179 TTTT-ACTCTCTTACTCA-TCA-----G-AATATTAATAAA
322 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* * * * * * * * *
130212 TTA--A-TATTTT-TTTTGAATAAGCCTATATGAACTGATACAATTGTTTTATAACGAAATAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
130273 GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACTT-GTTCAGTAA
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAA
* * * *** *
130337 ACATATTTATTTTTAAAATCT-TCTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTT
130 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * *
130401 TAATCTGAAAAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAAT
194 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * *
130466 TTAAAAAAAAT-ATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TT-TGATAAATAGATTTA-
259 TTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCTG-TAAACAAATTTAT
* *
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* * * * * *
130569 TTTGTATTATTTTAAT-TGAAATAAGCTTGTAGGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAGCAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* ** * * * * * *
130633 AGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATAT--TTTGATA
65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TGGTTCGGTA
* * * * *
130696 AACAAATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATCT
129 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * *
130761 TATTTTGAATAAGCTCGCATGAACAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTTATAATGAT
194 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * ** * *
130826 TTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGTA-TTGATCAGGCCAACAGATTCATTT
259 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC-TGTAAACAAATTTA-TT
* *
130890 TTTTAAATC-CATTACTTATTAGTTTTTAAAATATTAATAAA
322 TTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* * * * * * * * * * * *
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1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * *
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65 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTA
** *
131059 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTT
129 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * * * *
131120 TATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAACCAAAAGGACATAAC-AC
194 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-
* * * * * * * ***
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258 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTGTAAACAAATTTATTT
* * * * *
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* * * * * * *
131289 TTGGTATTA-TTTATT-TCAAATAAGCTTGCATGAACAT-AAATAATTCTTTTATAACAAAACAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
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* * * * * *
131415 AAAC--A--GA-----T-AATCTCCTATTTATTTATTTATGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
128 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * *
131470 TTATTTTGAAT-AGTCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATG
193 TTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
131639 --A-TATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAAATGAAATAGTTGTTATATGACAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
** * * * * * *
131701 GGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATATTCAAAAGTATTTGAACTTGTTTC-GTAA
66 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAA
* * * * * *
131765 ATAGATTTATTTTTTAAAAT-TCTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATT
130 ACAAATTTATTTTTT-AAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * *
131829 TTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTGAAACAA-AATGTTA-G----------A----AT--C-A
193 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * *
131875 TTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT-TGGCAAATACATTTATT
258 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCT-GTAAACAAATTTATT
* * ****
131939 TTTTAAACCTCTTACTTATAAATTTTT-AGAATATTATTGGT
322 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA-AAAA
* * * ** * * * * * *
131980 TTAGCAATATTTTACTCCAAATATGTTTGTATGGATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * *
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* **
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* ** * * * * * * * *
132169 ATTCTGAATAATTTTTTGTGAATAGAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT-ACTAAC
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* * * * * * ** *
132233 TTGAAATAAATAATTATTTAAATTGTCATAATTGTTTGAACTCA-CTAAGGAAACAAATTTATTT
259 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCTGTAAACAAATTTATTT
* * * *
132297 TTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTGGGAATTTTAATAAA
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** * * * * *
132337 TTAG-AGTTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGGCAAAACAAA
1 TTAGTA-TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * ** *
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* * * * * ** *
132464 AAACAGATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTAATCTTTGGAATATTGGTAATTTTA-TATTAT
128 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA-ATTAGTATTAT
* * * * * *
132527 TTTATTTGGAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATG
192 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * *
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257 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCT-GTAAACAAATTTAT
* * * *
132654 TTTTTAAATCTCTTACTCATCAATTTTTGAAATAGTAATAAG
321 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAA
* * * * **
132696 TCAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCCTATGTA--AATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAA
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* * * * *
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64 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGT
* * * * * *
132822 AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTCTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATT
128 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
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* * *
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Statistics
Matches: 10231, Mismatches: 2491, Indels: 1816
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Found at i:120872 original size:718 final size:714
Alignment explanation
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* * **
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* * * *
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* * *
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* ** *** * * *
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** * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * *
119574 ATGAACTGAAATAATTTTTTTAA-GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTAT
566 ATGAACTGAAATAA-TTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * * *
119638 TCAAATAGTCAATGACTATTTG-ATCTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTT
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* *
119702 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAT
691 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* **
119726 TTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAATTATTGTTTTATAACAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* * * * * *
119791 AGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TGACAA
66 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATAA
* * * *
119855 ACATATTTATTTTTTAAATCTCTTATTACTTTTTGAAATATTAATAGATTAGTACTATTTTATTT
131 ACATATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * ** * * * *
119920 TGAACAAACTTGTATGAACT--AAACGTTTGTTTTATG-ACAACAAAAGGTTATAACCATTTGAA
196 CGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAA
* *
119982 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTTAA
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* * * * *
120047 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-AAACTTCATT-TTATTTTATTCTAAATAATCTAA
323 ACTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TT-ATTATTATTTTATT-TGAATAAGCT-T
* * * *
120110 T-ATGAA-TTGAAAAAATTATTTTATGACAAGACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATT
384 TGATGAACTT-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAGATAATT
* ** * * * *
120173 GTTCATATAGTTTTAACTATTTGAATTAGTTCGGCAAACAAATTAATTTTTTGAATCTCTTAGTT
448 GTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAATCTCTTAGTT
* * * *
120238 ATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAA
513 ATTAATTTTTAGAATATTAATA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAA
* * * * *
120303 TAATTATTTAATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCAA
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* *
120368 AACTATTTGAATTGGTTCTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAA
641 AACTATTTGAATTGGTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* *
120433 GATTAGTAAA
705 TATTAATAAA
* * * *
120443 TTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATTGTTTTATAACCAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* * * * * **
120508 GGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGGCATAATTATTTGAACTAATTCTG-TAA
66 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATAA
* * * * *
120572 ACAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTT
131 ACATATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * ** *
120637 CAAATAAGCTTGTCTGAATTGAAACAATCATTTTATGAAAAACAAAATGTCATAACAATTTTAAA
196 CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAA
* ** * *
120702 TAGACAATTGTTCAAATAGTTGTAATTATCTAAATTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA
261 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTT-AGTAAACAAA-TTATTTTTTTAAA
* * *
120767 CTTTTGCTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTATTATT-TTTTAATTTGGATAAGCTTTGAT
324 CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTTGAT
* * * * *
120831 GAACTTAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCA
388 GAACTTAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCA
* ** *
120896 AATAGTCATAAATATTTAAACTTA-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTCAAATAAT-TT-GCTTAT
453 AATAGTCATAAATATTTAAA-TTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAAT-CTCTTAG-TTAT
* * * * * * * *
120958 TAATTTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAA
515 TAA-TTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGA-ACTGAAA
* * * * * * * ***
121022 CAAATATTTTATGATTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCCAACAATTTT
577 TAATTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAA
* * * * *
121087 AACTACTTAAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGGAA
641 AACTATTTGAATTGGTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAA
*
121152 TATTATTAAA
705 TATTAATAAA
* * * ** * * *
121162 TTAGTATTATTTT-TAACCGAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAA
1 TTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
** * * * * *
121225 AGGTTTTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATA-GCTATGACTATTTGAATTGGTTC-GAT
65 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGC-ATAACTATTTGAACTGGTTCTGAT
* * * *
121288 AAATAGATTTATTTTTTAAACTTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATT
129 AAACATATTTATTTTTTAAA----TCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-T
* * * *
121353 TTTTTTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAT
189 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAAC
* * ** * * *
121417 GATTTGAAATATATAATCATTCAAAT-GACCATAATTATTTTAAA-TAAT-TTGGTAAACAAGTT
252 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAATTA-TTTAAACT--TGTTAGTAAACAAATT
* * ** * *
121479 -TATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAATTTAGGAAAGAATAATAAATTATTATTATTTTATTTTG
313 AT-TTTTTTAAACTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTTG
** * * * * * * * * **
121543 TTTAAGC-TTGTATTAACTGAAACACTTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTA-AATTGATTT-TG
375 AATAAGCTTTG-ATGAACTTAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTCAA
** * * * *** * **
121605 ATCAGGCAATTGTT-AAATTAATTATAAGTATTTAAATGT-GTTCAATAAACATATTTGTTTTTT
438 AT-AGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAAATATTTAAAT-TAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTT
* * ** * * * * *
121668 -AGACCTATTTCTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAATTTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCC
500 GA-ATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
** * * * * * * * *
121732 TGCATAAACT---A-AATTGTTTAATGACTCAATAAAAGGTTAGAATGATTTGAATTAGATAATT
563 TATATGAACTGAAATAATTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* ** * * * * *
121793 ATTCTAATAGTCTTAA-TCATTTAAACTGATTCGGTACACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
627 ATTCAAATAGTCAAAACT-ATTTGAATTGGTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACT
*
121857 TATTAATTTTTGAAATATTATTAAA
690 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * *
121882 TTAGTACTATTTTAGTT-TGAATAATCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAA
1 TTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
* ** * * * * *** * **
121945 AGATCATAACAATTTGAAATAAATAAGTGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTT-GGGCA
65 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATA
** * * ** * * * **
122009 ATTAGATTTATTTTTAAAATTTCTTGGTTATTAA-GTGTCAGAATATTGTTAAATTAGTATTATT
130 AACATATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * **
122073 TTATTTC-AA-AA------A--CA-A-AACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTC-TAATG
190 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATG-TCATAACA
* * * * * * **
122125 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAA-TAGTTTGATAGACGGATT-TA
253 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT-AAACTTGTTAG-TAAACAAATTAT-
* ** * *
122188 CTTTTTAAATCTCATACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
315 TTTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTTGAA
* * * * * * * * * *
122252 CAAACTTAT-ATTAAC-AAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATA-GTAATAATGGTTTGAAA
377 TAAGCTT-TGATGAACTTAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTCAAA
* ** * * * * ** ** * * *
122314 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAGTTATGTGAACTGGTTCAGTAAATGGAATT-AGTTTCTAAA
439 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAGTTTGGTAAA-CAAATTAATTTTTTGAA
* * * * ** *
122378 TCTCTTA--TA--AATTTTT-GAAATAGTAATAAATAAATGTTATTCCATTTTGAATAAGCTTGT
503 TCTCTTAGTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTAT
* * * * * * *
122438 ATGCACTGAAATAATTATTTTATGACAAAAAAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATT
566 ATGAACTGAAATAATTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* ** * * * *
122503 CATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACGGAA-TTATTTTTT-AA-ATCTTAGTTAT
630 CAAATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTCG-TAAAC-AAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAT
* **
122565 TAA-TTTTCAGAATATTTCTAAA
693 TAATTTTTGA-AATATTAATAAA
** * * * * *
122587 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* * * * * *
122652 GGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTT-T-AGC
66 -GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGA-T
* * *
122715 AAACATGTTAATTTTTTAAATGC-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
129 AAACATATTTATTTTTTAAAT-CACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
122779 TTTTGAAAAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAGTTGCTTTAT-AATAGAACAAAAAGTCATAACAAT
193 TTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGAA-A-AACAAAATGTCATAACAAT
* * * ** * * * * *
122842 TTGTAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATT-TATTT
255 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTAGTAAACAAATTAT-TTT
* * ** * * * *
122906 TTTAAA---TCACTTATTAATTTTTGAACTATTAATGGATTAATATTACTTTATTCTG-CTCAAA
318 TTTAAACTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATT-TGAAT-AAG
* * * * * *
122967 CATAT-ATGAAC--AAAAGCATTTCTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAACTAGA
381 C-TTTGATGAACTTAAAA--AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAGA
* * * * * * *
123029 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAATAGAATT-ATTTTTTAAACCTC
443 TAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAGTTTGGTAAACA-AATTAATTTTTTGAATCTC
* * * * * * **
123093 TTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAA--A-T-TCATTTCATTTT--ATGA-C-AAAACAAA
507 TTAGTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA
** ** * * ** * ** **
123149 AGGTCAT-ATTGATTTGAA--AAAAATAATTGTTCATATA-G-TCTT-AAATATTTGAACTGGTT
571 CTGAAATAATT-ATTT-AATGATAAACAAAAGGTCATA-ACGAT-TTGAAATAGAT-AA-TTATT
** * ** ** * *
123208 CGACAA-AG--AAATTTATTT--TTTAATTC-T---CTTAGTTATTAGTTTTGGAATA--TTACT
630 C-A-AATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTCGTAAACAAATTTATT--TTTT-AAATATCTTACT
* * ** * ***
123262 AGATTAGTGTTATTTTATTCCAAATAAA
690 -TATTAAT-TT-TTGAAATATTAATAAA
* *** *** * * ** **
123290 CTT-GTATGA-ACAAAAGT-AAT-TGTCTTATGATAGAAC---AA-AA--G-GTTATAA-TGATT
1 -TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTAT-AT-GAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
** ** * *
123343 TTAA-GT--T--TGCAATTTCTAA-A-ATAGTTA-T---A-A--C-----TATTTGAACTAGTTC
62 AAAAGGTCATAATG--ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTC
* ** * *
123389 -GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAATATTATT
125 TGATAAACATATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * * * * *
123453 TTATTTCAAATAAGCTTAAATG-TTCA-AATACAAATGTTATAT-AATGAAGCAAAAGGTAATAA
190 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTATGAA--AAACAAAATGTCATAA
* * * * * * * ** * *
123515 CGATTTGAAATTGATAATTGTTGACATGGCCATTATTATTTGGA-TTGATTCGATAAATAAATT-
251 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTAG-TAAACAAATTA
* * * * *
123578 TACTTTTTAAA---TCACTTATTAAATTTTGGAA-ATTAATAAATTAGCT-TTATTTTATTTTGA
314 T-TTTTTTAAACTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TTATTATTTTA-TTTGA
** * * * * * *
123638 ATACTCTTAT-ATGAA-TTGAAATAATTGTTTTATGA-AAAACAATAGGTAATAATGATTTGAAA
376 ATAAGCTT-TGATGAACTT-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAA
* * * * * ** * * * *
123700 TAGATAATTGTTCATACAGTCTTAACTATTTGAGCT-GCTTTGGCAAAGAAATTTATTTTTTAAA
439 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAG-TTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAA
* * * *
123764 TCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA
503 TCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATA
* * * * * * * * * * * **
123829 TGAACTGAAACAATTCTTTTATAACATAATAATAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAGTTGGTC
567 TGAACTGAAATAATTATTTAATGATA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * *
123894 AAATAG---AAAC---------TGGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTA
631 AAATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTA
123947 ATTTTTGAAATATTAATAAA
695 ATTTTTGAAATATTAATAAA
** * * ** *
123967 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGAC--AACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* ** * * * **
124030 GTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GGCCATAATTATTTGAGCTAATTC-GATT
66 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGG-CATAACTATTTGAACTGGTTCTGA--
* * * * * * *
124093 TTTAAATCTCTACCTTGTTTTTTAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATA
128 --TAAA-C-ATA-TTTATTTTTTAA-ATC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *
124158 TTATTTTATTTCAAATATGCTTTTTATGAACT-GAAAGAATTGTTTTATGAGAAAACTAAAGGTC
185 TTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTC
*** * * * * * * * * * *
124222 ATATTTATTTTAAATATATAATAGTTTAAATTGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGA
247 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-GTTAGTAAACAAA
* ** * * *
124287 TTGATTTTTTTTTAA-TTTCTTGTGTATTACTTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTG
311 TT-A-TTTTTTTAAACTTT-TACT-TATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-
* * * * * ** *
124350 TTTTAAATAAGC-ATGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAATATCATAACAATT
370 ATTTGAATAAGCTTTG-ATGAACTTAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * *
124414 TGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTC-TCAACTATTTGAATTAGTTTGGAAAAC-ACTT-ATTTT
434 TCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AAATATTTAAATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTT
* * * * * * *
124476 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTATAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGC
498 TTGAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * * * * *
124541 TTTTAT-AAATAGAAATAATTATTT-GTGACAAA-ACAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAA
562 TTATATGAACT-GAAATAATTATTTAATGATAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * *
124603 TTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAATTGGCTCGATAAATAGATTT-TATTTTT-AA-ATC-T-
625 TTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTCG-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATATCTTA
*
124663 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
688 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * ** *
124690 TTTA-TATTAGTTTATTCTGAATAA--TTCGTATGAATAGAAA-AATTGTTTTACGATAAAACAA
1 -TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTT-ATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * *
124751 AATGTCACAACT-ATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAAT-GGACATGACTATTTGAAATTGTTC-
64 AAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGG-CATAACTATTTGAACTGGTTCT
* * * * * *
124812 GGTGAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCAATTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTATTAA
126 GATAAACATATTTATTTTTTAAA--T-C-ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
* * *
124876 TATTTTATTTCAAATAAACTTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGATCAT
186 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATG-TCAT
* * * * * * * *
124940 AACGATTTCAAATAAATAATTATTCAACTAGTCATAACTATTTGAACTTGCTTAGTAAATAAATT
249 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTAGTAAACAAATT
* * * *
125005 -TATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAG
313 AT-TTTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTT-G
* ** * * **
125069 AATAAGCTTTTATGAA--TACAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGCTTTGGA
375 AATAAGCTTTGATGAACTTA-AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAA
* ** * * **** *** * *
125132 ATAGAAAATTGCACAAATAGTCATAATTATTTGAATGT-GTTCAAAAAATGTATTTATTTTTTAA
438 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAAT-TAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGA
* * ***
125196 ATTTTTACTTA-TTATTCATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGC
502 A--TCT-CTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
** * * ** * * * *
125259 TTGCATGAAC-AAAATAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGCCATAATC-TTTTGAAATAGATAA
562 TTATATGAACTGAAATAATTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * * *
125322 TTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAATTCA-CTTA
625 TTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAA-TTGGTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-ATCTTA
* **
125386 CTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAA
688 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
** * *** * *
125413 TTACAATTAGTTTGT-TTC-AAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTG-TTTATTACAAAAGAA
1 TTAGTATTA-TTT-TATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * *
125475 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTC-AAA
64 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGAT
* ** *
125539 AAACATATTTATTTCTTAAATCATTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
129 AAACATATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
125604 TT-TATCCAAATAAGCTCGTATAAATAGAAACAATCT-TTTTATAACAAAATAAAAAT-TCGTAA
190 TTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT-TGTTTTATGA-AAAA-CAAAATGTCATAA
* * * *** * * * *
125666 CAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAAAGGTTTGAACATGTTTGATGAACAAATT-T
251 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTAG-TAAACAAATTAT
* *
125730 ATTTTTTAGA-TCTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATT-TGTATTATTTTATTAG
315 -TTTTTTAAACT-TTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTTATTTG
* * * * *
125791 AAATAAGC-TTGTAAGAA-TAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTC-TAGCAATTTC
375 -AATAAGCTTTG-ATGAACT-TAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTC
* * * * *
125853 AAATAGATAATTATTAAAATAGTCATAATTATTTAAAATT-GTTTGATAAACAAATTGATTTTTT
436 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTT-AAATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTT
* *
125917 AAATCTCTTAATTATTAATTTTT-GAAATATTAATAATGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
500 GAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAT-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * *
125981 TATATGAACTGAAATAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAGATATT
563 TATATGAACTGAAAT-AATTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
** * * * *
126045 TATTCAAATAGTCATGACTATTTG-ATCTAGTTTGATAAACATATTTATTTTTTTAAAT-TTTTA
626 TATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAT-TGGTTCG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATATCTTA
*
126108 CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAA
688 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * *
126135 TTAGTATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACTATTGTTTTATAATAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
* * * * ** * ** * *
126199 AAGTCATAA-CAGTTTGAAA-AAATACTTGCTCAAACAATCATAACTATTTGAATTGGTT-TGGT
65 AGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGAT
* ** * *
126261 AAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTA
129 AAACATATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTA
* * * * * ** * **
126325 TTTCGAACAAGCTTATATAAACAAAAACTTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
193 TTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAACAATTT
* * * * *
126390 AAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAA-TAGGTAAGGTAAACAAAATTA-TTTT
257 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT-TGTTA-GTAAAC-AAATTATTTTT
* * * * **
126453 TTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATCAATAAATTCATT-TTATTTTATTCCAAATAAG
319 TTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATTATTATTTTATT-TGAATAAG
* * * * *
126517 C-TAGTATGAA-TTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAACAAAA----AT---TATTTGAAATAGAT
381 CTTTG-ATGAACTT-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAGAT
** * * *** * *
126573 AATTGTT-AATATAGTGTTAATTA-TTAGAACTAGTTTAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
444 AATTGTTCAA-ATAGTCATAAATATTTA-AATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAATCTC
* * * *
126636 TTACTTGTTAATTTTCAGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTTG---AA---T-TATGAA
507 TTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * *
126694 --GAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACGATTTGAAATATACAATTATTCAAAT
571 CTGAAATAATTATTTAATGATA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * *
126757 AGTCATAACTATTTAAACTAG-T--T---C--A---A-----TAAACATC-T-CCTATTAATTTT
635 AGTCAAAACTATTTGAATTGGTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTT
*
126804 TGAAAGATTAATAAA
700 TGAAATATTAATAAA
* * * * * *
126819 TTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAACTTGTATGATCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
** * * * * * * *
126883 AGGAAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GACCATAATTTTTTGAACTGATT-TGGT
65 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-GCATAACTATTTGAACTGGTTCTGAT
* * * *
126946 AAAGTGATTCATTT-TTTTTTAAATCACTTATTCATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATCATT
129 AAA--CA-T-ATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
127010 TTATTTCGAATAAGCCTGTATGAACTTA-AAA-AATTGTTTTGTAACAAAACAACAGGTTATAAT
190 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA--TAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAAC
* ** * * * ** * * *
127073 GATTTTCAATAGACATTTGTTCAAATAATTGTAATTATTTGAATTTGTTTGGTAAA-AAATT-TT
252 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTAGTAAACAAATTATT
* * * * *
127136 ATCTTT----TTTTACTCTTATTAATTTTTGAAATGTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGA
316 -TTTTTAAACTTTTA--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTTGAA
* * * * * * * *
127197 TAAGATTTTATTAA-TTGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATA
377 TAAGCTTTGATGAACTT-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATA
* * * * * ** *
127261 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GCTTGGTAAACATATTTCTTTTTTCAAAT
441 GATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTT-AAATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTT-GAAT
* * * * * * *
127325 CT-TTTGCTTGTTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATT-GGATTATTTTATTGTGAATAAGCTTGT
504 CTCTTAG-TTATTAATTTTTAGAATATTAAT--AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTAT
* * * * *
127388 AAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTACAA-AAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTA
566 ATGA-ACTGAAATAATTATTTAATGA-TA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* *** * * * * * *
127451 TTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACACATTTATATTTTAAATCT-TTACTTA
628 TTCAAATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTA
* *
127515 TTAATTTTTGGAATATTATTAAA
692 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * * * * *
127538 TTTGTATTTTTTTA-ACTGAATAACCTTCTATGATCAGAATCAATT-ATTTATGACAAAAC-AAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* ** * * * * * *
127600 GAT-ATTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC-GGTA
66 GGTCA-TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATA
* * *
127663 AACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
130 AACATATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
127727 TCCATCTAAGCTTGTATTAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAATAAAAGGTTATAA-ATGATT
195 TCGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAAAAACAAAATGTCATAACA--ATT
* * * * * ** * * * *
127790 TTAAATAAAGAAATGTTCAAATAGTAATAGCTATTTGAACTTATTCAGTAAATACATTTATTTTT
256 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTT-AGTAAACA-AATTATTTTT
* * * ** * *
127855 TAAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGAAATAATTTATTTTGAATAAG
319 TTAAA-CT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTTGAATAAG
** * * * * *
127919 C-TTGTACAAAC-TAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAACGATTTCATATAGAT
381 CTTTG-ATGAACTTAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAGAT
* * * * * * * * * *
127982 AATTATTCTAATAGTCTTAACTGTTTGAACT-GATTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
444 AATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAG-TTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAATCTCT
* * * * ** * **
128046 TACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTACAAAC
508 TAGTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC
** * * * * * * ** ** *
128111 AAAAAAAATTCTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATCGTTCATGTT
572 TGAAATAATTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** * * * ** * * * **
128176 GTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTT
636 GTCAAAACTATTTGAA-TTGGTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAA-TTT
* *
128241 TCG-AATATTATTAAA
699 TTGAAATATTAATAAA
* ** * * *
128256 TTAGTATTATTTTATT-TCAAATAA-AATAGTATGAACAAAACCAATT-TTTTGATGACAAAATA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTA-TATGAACAAAAACAATTGTTTT-ATAACAAAACA
* * * * * *
128318 AAACGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAAAACTATTTGAAAATTGGTT-T
63 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTG--AACTGGTTCT
* * * *
128382 -AGTAAACAGATTCACTTTTTAAATTTCTTACTGATTAATTTTAT-AAATATTAATAAATTAGTA
126 GA-TAAACATATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * ** *
128445 TTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATAAT
185 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCAT
** * * ** * * *
128510 AATGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGTACTAGTCTGGTAAATAAAAT
249 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGT-TAGTAAA-CAAAT
* * * * *
128575 TA-TTTTCTAAATCTCTCAATTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTT-TTATTTTATTTC
312 TATTTTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TTATTATTTTATTT-
* * * * *
128638 GAATATA-CTTAT-ATGAACTGAAACAAA-TATTATATGAGAAAAC-AAATGTCATAATGATTT-
374 GAATA-AGCTT-TGATGAACTTAAA-AAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTC
* * * * * * **** * * *
128698 AAGATTGATATTTGTTCATATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTTCAAAAAACAATTTTAGTTTTT
436 AA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTT
* * * * *
128762 AAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AACTATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-T
500 GAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAA-TATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * * * * * *
128825 TCTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGTCAGA
563 T-ATATGAACTGAAATAATTATTTAATGAT-AAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAA-A-T-AGA
* * * * * *
128890 TCTATTCTTCAAATAGTCCAATCTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTT-AA-A
622 T-AATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAA-TTGGTTC-GTAAACAAATTTATTTT-TTAAATA
*
128952 TCTTATGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAA
683 TCTTA--CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA
* * *** * * *
128986 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* ** * * * * * * * * *
129051 GGCCATAACAATTTGAAACAAATAATTATTCCAATAGTCTTAACTATTTTAAATTGTTC-GACAA
66 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATAA
* *
129115 ACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTATTTG---TACTT-ATCAAA--AGGTCA-TA
131 ACATATTTATTTTTTAAATCACTTA--T-TAATT-TTTGAAATA-TTAAT-AAATTA-GT-ATTA
** * * * * * * * *
129173 -ACTATTTTGAATACGCATGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
188 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAAC
* * * * * * * * * *
129237 TATTTCAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCGACAAACACATT-T
252 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-GTTAG-TAAACAAATTAT
* *
129300 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATT-TGTATTATTTTAATTTGA
315 -TTTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTT-ATTTGA
*** * * * * * *
129364 ATAAGC-TTGCATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAA-TAAAGATCATAATGATTT-AAGA
376 ATAAGCTTTG-ATGAACTTAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAA-A
* * * * * * ** * * * * * *
129426 TAGATAATTATTCAAATTGTTATAACTATTTAAACTGGTTTAATAAATAGATTTAGTTTGTAAAT
439 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAAT
* * * * * * ** **
129491 CTC----TTATTAATTTTCA-ATTATTAATAGGTCAATATTATTTTATTATGAATAATTTTGCAT
504 CTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATAT
* * * * * * * * *
129551 GAACAGAAACAAATTGTTTTATGACAAA-ATAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTT
568 GAACTGAAA-TAATTATTTAATGATAAACA-A-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT
* ** ** * * * *
129615 C-AATAGACATGACTATTTGAACTT-GTTCGATAAGTAGATTTATTTTTTAAATTTCCTACCTAT
630 CAAATAGTCAAAACTATTTGAA-TTGGTTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAT
129678 TAATTTTT-AGAATATTAATAAA
693 TAATTTTTGA-AATATTAATAAA
* * * * * * *
129700 TTAATATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTGTGAATAGAAACAATTGCTTTATGAA-AAAAC-AA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTAT-AACAAAACAAA
* * * *
129763 A----AT-A--A-TTG---T---TCAA--A--C-ACT---TATAACTATTTGAACT--TACTTAG
65 AGGTCATAATGATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGA-
* * * * *
129804 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTGATAAAATAATATTA
128 TAAACATATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
129869 TTTTATTTTGTATACGCTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAAA-GATTC-TA
188 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATG--TCATA
* * * * * * * *
129932 ACTATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCCTAACTATTTGAACATGTTTAGAAAACATATT-
250 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTAGTAAACAAATTA
* *
129996 TATTTTTAAA-TTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-TATATTATTTTATTCAGA
314 TTTTTTTAAACTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTTATT-TGA
* * * * * * *
130059 ATGAGC-TTGTATAAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAA
376 ATAAGCTTTG-ATGAACTTAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAA
* * * *** * * *
130122 TAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAACTT-GTTCAATAAATAGATTCATTTTTT--A
439 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAA-TTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAA
* * * * *
130184 -CTC-T-CTTACTCA---TCAGAATATTAATAAATTA--A-TATTTT-TTTTGAATAAGCCTATA
503 TCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATA
* * * * * * * * *
130239 TGAACTGATACAATTGTTTTATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTT
567 TGAACTGAAATAATTATTTAATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* ** * *
130304 AAATAGTTATGACTATTTAAACTT-GTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTAAA-ATCTTCTACTTA
631 AAATAGTCAAAACTATTTGAA-TTGGTTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATATC-T-TACTTA
* **
130366 TTAATTGTCAAAATATTAATAAA
692 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * *
130389 TTAATATTATTTTAATCTGAAAAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* ** * * * * * **
130454 TGTCATAACAATTTAAAAAAAAT-ATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGATA
66 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATA
* * * *
130517 AATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCT-AAATGA-TAATAAATTTGTATTAT
130 AACATATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAATT-TTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * **
130579 TTTAATT-GAAATAAGCTTGTAGGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATGGC
189 TTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAAC
* * * *
130643 AATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TAT-TTTGATAAACAAATT-T
252 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT-TGTTAG-TAAACAAATTAT
* ** * * ** *
130705 AGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTGAA
315 -TTTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTTGAA
* ** * * * * * * *
130770 TAAGC-TCGCATGAACAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATA
377 TAAGCTTTG-ATGAACTTAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATA
* * ** ** ** * * *
130834 GATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGTATT-GATCAGGCCAACAGATTCATTTTTTTAAAT
441 GATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAATTAG-TTTGGTAAACAAATT-AATTTTTTGAAT
* * * * * *
130898 C-CATTACTTATTAGTTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTAAATAAGAC--AG
504 CTC-TTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTA-
* * * * * * * * *
130960 CATTAA-TAGAAATAGTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATATGAAATAAATAATTG
565 TATGAACT-GAAATAATTATTTAATGAT-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * *
131024 TTTAAATTA-TTATAACTAATTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTT
628 TTCAAA-TAGTCAAAACTATTTGAATTG-GTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTT
* *
131084 AATAATTTTTAAAATATTAATAAA
691 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * ** *
131108 TTAATATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAACCAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAA
* * * * * * * * * *
131173 GGACATAA-CACTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTCTTTAAATTGGTTC-AACA
66 GGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATA
* * * * * * * *
131236 AACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTATATTGGTATTA-TT
130 AACATATTTATTTTTTAAATCACTTA-TTA--ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * * * **
131300 TATTTCAAATAAGCTTGCATGAACATAAATAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATAGC
191 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAACAAT
* * * * * * *
131365 TTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATTATTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGA-TAATCT
255 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-GTTAG-TAAACAAATTATTTT
** * *
131428 CCT--A--TTTA--T-TT-ATTTATGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGT
318 TTTAAACTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTTGAATAAG-
* * * * * * *
131484 CTTGTATGATGAA---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTGAAAAAGA
381 C-T-T-TGATGAACTTAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATAGA
* * * * * * * * ** * *
131546 TAATTGTTTAAACT-GCCATAACTATTTGAACTAATTCGATAAACTGA-TATATGTTTTAAATCT
443 TAATTGTTCAAA-TAGTCATAAATATTTAAATTAGTTTGGTAAACAAATTA-ATTTTTTGAATCT
* * * * * *
131609 C-CAGCTTCTCAATTTTT-GAAGTATTAATAA--A-TATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATG
506 CTTAG-TTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG
* * * * ** *
131669 AAATGAAATAGTT-GTTATATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTATTCA
569 AACTGAAATAATTATTTA-ATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * *
131733 AATATTCAAAAGTATTTGAACTTGTTTCGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-ATTCTTTGCTTATT
632 AATAGTCAAAACTATTTGAA-TTGGTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATA-TC-TTACTTATT
*
131797 AATTTTTTG-AATGTTAATAAA
694 AA-TTTTTGAAATATTAATAAA
* * * *
131818 ATAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCATGTATG------AAC---TG----------AAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
* * * * * * * **
131863 ATGTTAGAATCATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT-TGGCA
65 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGATA
* * * * *** * *
131927 AATACATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTATAAATTTTT-AGAATATTATTGGTTTAGCAATATT
130 AACATATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
131991 TTACTCCAAATATGTTTGTATGGATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAA-GATCATACCA
190 TTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATG-TCATAACA
* * * * *
132054 ATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTTAAA-TTGATTTGGTAAACAAATT-TA
253 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG--TTAGTAAACAAATTAT-
* * * *
132117 GTTTTTAAA--TCT-CTTATTAA-TTTTCAAGATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
315 TTTTTTAAACTTTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAATTATTATTATTTTATT-TGAAT
** * * * * * *
132178 AATTTTTTG-TGAA--TAGAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT-ACTAACTTGAAA
378 AA-GCTTTGATGAACTTA-AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-GATTTCAAA
* * * * * * * * * ** * *
132239 TAAATAATTATTTAAATTGTCATAATTGTTTGAACTCACTAAGG-AAACAAATTTATTTTTTAAA
439 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTT-AAATTAGTTTGGTAAACAAATTAATTTTTTGAA
* ** * *** *
132303 TCTCTTATTTATTAATTTTGGGAATTTTAATAAATTAG-AGTTATTTTATTCCAAATAAGCTTTT
503 TCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGCTTAT
* * *
132367 ATGAA-TAGAAACAATTGGTTT-ATGGCA-AAACAAAAGGTCATAA-TAGTTTGAAATAGATAAT
566 ATGAACT-GAAATAATT-ATTTAAT-G-ATAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * *
132428 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAAT-TTTTACT
626 TATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAA-TTGGTTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTACT
* * * ** *
132492 TGTTAATCTTTGGAATATTGGTAATT
690 TATTAATTTTTGAAATATTAATAA-A
* * * * **
132518 TTA-TATTATTTTATT-TGGAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
* * * * *
132581 AGGTCATAATGATTTGAAATAAACAATTGTTC-AA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTT-T-AGT
65 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTGGTTCTGA-T
* * * * *
132642 AAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATCAATTTTTGAAATAGTAATAAGTCAGTATTATT
129 AAACATATTTATTTTTTAAATCACTTA-T--T-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * *
132707 TTA-TTCAAATAAGCCTATGTA--AATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAAT
190 TTATTTCGAATAAG-CT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-AAAACAAAATGTCATAAC
* * * * * * * *
132769 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATT-TA
252 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTAGTAAACAAATTAT-
* * * *
132833 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTCTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTGATCTGAAT
315 TTTTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTT-ATTTGAAT
* * * * * *
132898 AAG-GTAGTATGAAC-GAAAATAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAACGATTTGAAATA
378 AAGCTTTG-ATGAACTTAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCAAATA
* * *
132960 AATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAATTA-TTTGGTAAACAAATT
441 GATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTT-AAATTAGTTTGGTAAACAAATT
133011 TGAAATAAGC
Statistics
Matches: 10280, Mismatches: 2201, Indels: 1614
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
674 5 0.00
675 98 0.01
676 55 0.01
677 195 0.02
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681 9 0.00
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * **
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
* *
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** * * ** * * *
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* *** * * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * *** *
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** * *
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** * * * * * *
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* * * *
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1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT-TAGAATT
** * * * * *
125962 ATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-GAAATAAATTTTTTATGACAAAACAAAAGATAATA
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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65 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
** * * * *
126560 -ATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTGTTAATTATTAGAACTAGTTTAA
129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * * * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
* * * * * * *
126676 TTTATTT----TGAA---T-TATG-A-AGAAATAATTTTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAAC
66 TTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * *
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129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
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126783 TAAAC--ATCT-CCTATT-AAT-TTTTGAAAGATTAATAAATT--AGTATTATTTTATTTCGAAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAAT-TTTTAAAATATTA-ATAAATTAGAAT
* * * * ** * **
126841 AAACTTGTATGATCAAA-AA-C-------AATTG---TTA-----TATGACCAAACAAAAGGAAA
63 -TA-TTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * ** * * * ** * * *
127067 TATAATGATTTTCAATAGACATTTGTTCAAATAATTGTAATTATTTGAATTTGTTTGG
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* * * *
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1 TAAACAAA-TTTAT-TTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAAT
*** * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * *
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* * *
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* ** * * ** * *
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* * * ** * * * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
** * * * * * * *
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* * * **
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* * *
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* ** * * *
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* * * * * * * * *
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* ** ** * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * **
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
* * * * * *
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* * * * * * *
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128 TAATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * * * * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
** * * * *
128809 TTTATTTTGAATAAG-TTCTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAC
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* * * * **
128873 AACTTTAAATAGTCAGATCTATTCTTCAAATAGTCCA-ATCTATTTGAACTTGTTCGG
129 AA-TTTGAA-A-T-AGAT-AATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * ** * *
128930 TAAATAGATTTATTTTCTTAAATCT-TATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
1 TAAACAAATTTATTTT-TTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATT
* * * *
128994 ATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGCCATA
64 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * *
129058 ACAATTTGAAACAAATAATTATTCCAATAGTCTTAACTATTTTAAATTG-TTCG
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * *
129111 ACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTATTT---GTACTT-ATCAAA--AG-G
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* ** ** * * * * *
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62 TTAT-TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * *
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* * * * * *
129288 ACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTA
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * *
129821 TAAATC--TTTTACTTATT-AAT-T-TT--TT-GGAA-TATT--GATA-AAAT-AA-T---ATTA
1 TAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTA
*** * * * * * *
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65 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAA
* * *
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128 -TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGAATTA
* * * * *
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65 TTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
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128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * * * *
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1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
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* * * *
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* * * * * *
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127 ATAATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
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130641 GCAATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATAT-TTT-G
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTAG
* * * **
130693 ATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTA
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65 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * *
130823 GATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGTA-TTGATCAGG
129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-G
** * * * *
130875 CCAACAGATTCATTTTTTTAAATC-CATTACTTATTAGTTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATT
1 TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATT
* * * * * * * * *
130939 ACTTTATTTTAAATAAGAC-AGCATTAATAGAAATAGTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
131003 A-AGATATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-TTATAACTAATTGAAC-TGATTTGG
127 ATA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAG
131057 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATATTA
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGA-ATTA
* * * * * * * * *
131117 TTTTA-TTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAACCAAAAGGACATAA
65 TTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
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131181 CACTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTCTTT-AAATTGGTTCAA
128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAG
* * * * * * * * *
131234 CAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTATATTGGTATTA-
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
* * * * * * *
131298 TTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACATAAATAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATA
66 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA
** * * * * *
131363 GCTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATTATTATTTGAA-TTGGTTCG
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * * * *
131413 ATAAAC--A--GA-----T-AATCTCCTATTTATTTATTTATGAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTA
** * * *
131468 TTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAA
65 TTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAAT-AGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** *
131531 ATGATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAACT-GCCATAACTATTTGAAC-TAATTCG
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
** * * * * * * *
131584 ATAAACTGATATATGTTTTAAATCTC-CAGCTTCTCAATTTTTGAAGTATTAATAAA-T---ATT
1 -TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATT
*** * * * *
131644 ATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAA-ATGAAATAGTTGTTATATGACAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
131708 AAAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATATTCAAAAGTATTTGAACTTGTTTCG
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * ** * * *
131762 TAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TCTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATT
1 TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATT
* * * *
131826 ATTTTATTTCAAATAAGC----ATGTAT-G-AAC---------TG---AAACAAAATGTTAGAAT
64 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * *
131873 CATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGG
129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * * * * ***
131925 CAAATACATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTATAAATTTTTAGAATATTATTGGTTTAGCAA-TA
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-AATTA
* * * * * * * **
131989 TTTTACTCCAAATATGTTTGTATGGATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATACC
65 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * *
132053 AATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTT-AAATTGATTTGG
129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAG
* * * *
132105 TAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
* ** * * * * *
132166 TTTA-TTCTGAATAATTTTTTGTGAATAGAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATACT
66 TTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * *** *
132230 AACTTGAAATAAATAATTATTTAAATTGTCATAATTGTTTGAACTCACTAAG
129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * *** * *
132282 GAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTGGGAATTTTAATAAATTAGAGTTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
* * *
132347 TTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATA
66 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA
* *
132412 GTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAG
130 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * * * ** ** * *
132463 AAAACAGATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTAATCTTTGGAATATTGGTAATTTTA-TATTA
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA-ATTAGAATTA
** * *
132526 TTTTATTTGGAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAAT
65 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * *
132591 GATTTGAAATAAACAATTGTTC-AA-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
129 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * * * * * *
132641 TAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATCAATTTTTGAAATAGTAATAAGTCAGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
* * **
132706 TTTA-TTCAAATAAGCCTATGTA--AATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAA
66 TTTATTTCAAATAAG-CT-TGTATGAATAGAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
132768 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTTGG
128 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* * * * *
132821 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTCTTGAAATTTTAATAAATTA-ATATTA
1 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGA-ATTA
* * * * * * *
132885 TTTTGATCT-GAATAAGGTAGTATGAA-CGAAAATAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATA
65 TTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * *
132947 ACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAATTATTTGG
127 ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
133001 TAAACAAATTT
1 TAAACAAATTT
133012 GAAATAAGCT
Statistics
Matches: 6916, Mismatches: 1535, Indels: 935
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
159 4 0.00
160 45 0.01
161 10 0.00
162 109 0.02
163 91 0.01
164 11 0.00
165 46 0.01
166 34 0.00
167 17 0.00
168 31 0.00
169 115 0.02
170 59 0.01
171 101 0.01
172 49 0.01
173 36 0.01
174 174 0.03
175 221 0.03
176 263 0.04
177 825 0.12
178 236 0.03
179 464 0.07
180 1311 0.19
181 1401 0.20
182 610 0.09
183 309 0.04
184 64 0.01
185 70 0.01
186 68 0.01
187 93 0.01
188 49 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGAATTAT
TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAA
TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
Done.