Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167827.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_10, whole genome shotgun sequence
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* * * * * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * **
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319 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTG
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128078 GTATTATTTTA-ATCAGAATAAGCTTGTACAAACAAAAAAAATTC
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128379 TTT-AGTAAACAGATTCACTTTTTAAATTTCTTACTGATTAA-TTTTATAAATATTAATAAATTA
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* * * *
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65 TTGAACAT-GTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTT-AAATATTA
* * * * * *
129339 TTAAATTTGTATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGCATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGAGAAA
127 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAA
* * ** * * *
129403 A-TAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAATTGTTATAACTATTTAAACTGGTT
191 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGTT
* * * * * * * ** * *
129466 TAATAAATAGATTTAGTTTGTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAATTATTAATAGGTCAATAT
254 TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * *
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319 TATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAC-AATTG
* ** ** * * * *
129567 TTTTATGACAAAATAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTC-AATAGACATGACTAT
1 TTTTATGACAAAACA-AAAATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** * *
129631 TTGAACTTGTTCGATAAGTAGATTTATTTTTTAAAT-TTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTA
65 TTGAACATGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT--TACTTATTAATTTTTA-AATATTA
* * * * * *
129695 ATAAATTAATATTATTTTATTCTG-AATAAACTTGTGTGAATAGAAACAATTGCTTTATGAAAAA
127 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAA
* * **
129759 AC-AAA----AT---AA-TTG---T---TCAA--A--C-ACT--T-ATAACTATTTGAACTTACT
191 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTT
* * * * ** * *
129801 T-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA-TTAATT-TTTTGGAATATTGATAAAATA
254 TGA-TAAACAAATTTATTTTTT-AA--ATCT-CTTACTT-ATTAATTTTTAA-AAT-AT-TAATA
* * * ** * * * * * ****
129863 ATATTA-TTTTATTTTGTAT-ACGCT-TG-TATGAACAAAAATAATTGGTT-
310 A-ATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCT-TGTATAAATAGAAACAATTG
* * * * * * * *
129910 TATGAT-AAAACAA-AAGATTC-TAACTATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCCTAACTAT
1 TTTTATGACAA-AACAAAAATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
*
129972 TTGAACATGTTTAGA-AAACATATTTA-TTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
65 TTGAACATGTTT-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTT-AAATATTA
* * * *
130034 ATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAGAATGAGCTTGTATAAACA-AAAACAATTGTTTTATGACA
127 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACA
* ** *
130096 AAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAACTTGT
189 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAA-TTGT
** * * * * * * *
130161 TCAATAAATAGATTCATTTTTT--A-CTC-T-CTTACTCA---TCAGAATATTAATAAATTA--A
253 TTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
** * * * *
130216 -TATTTT-TTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GATACAATTG
318 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTG
* * * * * * *
130255 TTTTATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * **
130320 TTAAACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTGTCAAAATATTA
65 TTGAACATGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TACTTATTAATT-TTTAAATATTA
* * *
130384 ATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAA-AAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAA
127 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
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190 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGT
* * * * *
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253 TTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAAAT-ATTAATAAATTAG
* * ** * *
130573 TATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTAGGAATAGAAAAAATTA
316 TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTG
* * * ** * * *
130616 TTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
130681 TTAAATAT-TTTGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAA
65 TTGAACATGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAA
* * * * * * *
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128 TAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAA
* * ** * * * ** **
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192 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTG-TTTG
*** * * * *
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256 ATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * *
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319 TATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATAAATAGAAACAATTG
* * * * * * *
130978 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGATATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-TTATAACT
1 TTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAACT
* * *
131041 AATTGAAC-TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC--T-CTTAATAATTTTTAAAATATT
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * ** *
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* * ** * * * * * **
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* ** * * * * * * *
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*** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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126 AATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-AAATTGTTTTATGACA
* * * *
131870 -------A----AT--C-ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGT
189 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGT
** * * * * * * *** *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * *
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** * * * *
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* * * * * * * * * *** *
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* * *** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * ** **
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* * * * *
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** * * * *
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192 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTG
* * * * * * * *
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256 A-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
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** * ** * *
132742 TTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
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65 TTGAACATGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAA
* * * * *
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128 TAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
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*
132999 GGTAAACAAATTT
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*
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** * * * *
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* * * *** * * ***
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* * * * * *
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65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
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* ** * * * *
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*** * * * *
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** * * * ** * * * * *
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* * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * *
127999 TAACTGTTTGAACTGATTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
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* * *
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** * ** * * **
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* ** * ** * *
128231 TATTAAGTTTTCGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATGAACAAAA
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* * * *
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* * * *
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** * * *
128478 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * * * *
128543 ATAATTATTTGTACTAGTCTGGTAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAAT
129 AAAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * *
128595 TATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATATA-CTTATATGAACTGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTGTATAAAC-AA
* * * * * * * * *
128659 AACAAATATTATATGAGAAAAC-AAATGTCATAATGATTT-AAGATTGATATTTGTTCATATAGT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** *
128722 C-AAACTATTTGAACTAGTTCAAAAAACA-ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTACT
128 CAAAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * ** * ***
128774 TATTAATTTTCAAACTATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTCTTATGAATTGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTAT-AAACAA
* * ** * * *
128838 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGTCAGATCTATTCTTCAAA
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAA-A-T-AGAT-AATTGTTCAAA
* * ** * *
128903 TAGTCCAATCTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTTAAATCT-TATGCT
124 TAGTCAAAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTT-TTAAATCTCT-TACT
** * ***
128961 TATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT-AAACAA
* * ** ** * * * *
129025 AATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAACAAATAATTATTCCAATAGTC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** * * * * *
129090 TTAACTATTTTAAAT-TGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
129 AAAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* ** ** * * *
129142 TA-TAATTATTT---GTACTT-ATCAAA--AGGTCA-TA-ACTATTTTGAATACGCATGTATGAA
1 TATTAATT-TTTAAAATA-TTAAT-AAATTA-GT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAA
* * * * * *
129198 CAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTCAAATAAATAATTGTTTAAA
61 C-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
** * * * * *
129262 TAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
124 TAGTCAAAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * *
129319 TATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGCATGAAA-AG
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTAT-AAACA-
* * * * * *
129382 AAACAATTGTTTTATGAGAAAA-TAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAATTG
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
129445 TTATAACTATTTAAACTGGTTTAATAAATAGATTTAGTTTGTAAA--TC-T-CT
127 TCAAAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * ** * * * ** * *
129495 TATTAA-TTTTCAATTATTAATAGGTCAATATTATTTTATTAT-GAATAATTTTGCATGAACAGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATAAACA-A
* * * * * *
129558 AACAAATTGTTTTATGACAAAATAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTC-AATAGA
64 AAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * ** * * *
129622 CATGACTATTTGAACT-TGTTCGATAAGTAGATTTATTTTTTAAATTTCCTACC
128 CAAAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * *
129675 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTGTGAATAGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAAACA-A
* * * * * * * *
129739 AACAATTGCTTTATGAAAAAACAAAA---TA-ATTG--TTCAAACACTTATAACTAT-TTGAACT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA--GATAA-T-TGTTCAA-A
* * * * * * *
129797 TACTTAGTAAACAGATTT--A-T-TTT-TTAAATC--TTTTACTTATT-AAT-T-TT--T
124 TAGTCA--AAAC-TATTTGAACTGTTTAGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
** * * * * * *
129845 T-GGAATATTGATAAA-A-TAAT--ATTA-TTTTA-TTT-TGT---ATACGCTTGTATGAACAAA
1 TATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAAC-AA
* * * * * *
129899 AATAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATTCTAACT-ATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * *
129963 CCTAACTATTTGAACATGTTTAGAAAACATATTTA-TTTTTAAAT-TCTTACT
128 CAAAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* *
130014 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAGAATGAGCTTGTATAAACAA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATAAAC-A
* *
130077 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACT
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
130142 CATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTCATTTTTT--A-CTC-T-CT
128 CAAAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * ** * * * * *
130190 TACTCA---TCAGAATATTAATAAATTA--A-TATTTT-TTTTGAATAAGCCTATATGAACTGAT
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAAC-AAA
* * * * ** * * *
130248 ACAATTGTTTTATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
** * * * *
130313 TGACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCT-TCTACT
130 AAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACT
* * * * * *
130364 TATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAA-AAGCTTGTATGAACAAA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATAAAC-AA
* * ** * * * *
130428 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAAAAAAT-ATAAGTTCAAATAGT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGT
* * * *
130492 CATAACTATTTGAACT-TATTTGATAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACT
128 CAAAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * *
130544 TATTAATTATCT-AAATGA-TAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTAGGAATAG
1 TATTAATT-TTTAAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA-TAA-AC
* * **** * *
130607 AAAA-AATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAG
62 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
130671 TCATAACTATTT-AAATATTTTGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCCCTTATT
127 TCAAAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
** * * ** * * *
130724 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTGAATAAGCTCGCATGAACAGAA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAACA-AA
* * * *
130789 ACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * ** *
130854 TAACTATTTGTATTGATCAGGCCAACAGATTCATTTTTTTAAATC-CATTACT
130 AAACTATTTGAACTGTTTA-GTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACT
* * * * * * * *
130906 TATTAGTTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTAAATAAGAC-AGCATTAATAGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATAAACA-A
* * * * * * * * *
130970 AATAGTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAGATATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-T
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGT
* * * * *
131034 TATAACTAATTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA--
128 CAAAACTATTTGAACTG-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * *
131085 -A-TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTAAACAAACTTATATGAACAAA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAAAC-AA
* * * ** * * * *
131147 AACATTTGTTTTACGACAAACCAAAAGGACATAA-CACTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * * * * ** * * *
131211 CTTAACTCTTTAAATTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGT
128 CAAAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * *
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* * * * *
131328 ATAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAAT-AGCTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTC
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** * * * * * *
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129 AAAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * ** *
131434 TATTTATTTATGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATGATGA-A
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTAT-A-AACA
* * *
131497 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCAAAATGATTTGAAAAAGATAATTGTTTAAACT-
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TA
* * ** * * * * *
131560 GCCATAACTATTTGAACTAATTCGATAAACTGATATATGTTTTAAATCTC-CAGCT
126 GTCAAAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CT
* * * * *** * * **
131615 TCTCAATTTTTGAAGTATTAAT-AA--A-TATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAAATGAA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-AAACAAA
* * * * ** * * *
131676 ATAGTTGTTATATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATATTCA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * *
131741 AAAGTATTTGAACTTGTTTCGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TCTTTGCT
130 AAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTC-TTACT
** * * * *
131793 TATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTAT-----GAA
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* * * * * **
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* * * * *
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131 AACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * *** * * * * * * ** *
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* * * *** * * *
132020 ACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCC
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
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130 AAACTATTTGAACTG-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * ** * * * *
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* * * * * * * * * *
132195 AACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATACTAACTTGAAATAAATAATTATTTAAATTGTC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * ** * * * *
132260 ATAATTGTTTGAACTCACTAAGGAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATT
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*** * * * * *
132312 TATTAATTTTGGGAATTTTAATAAATTAG-AGTTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAACA-A
* * *
132376 AACAATTGGTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAAT-AGTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
132440 CATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAAT-TTTTACT
128 CAAAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * ** ** * ** * * *
132492 TGTTAATCTTTGGAATATTGGTAATTTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTTTGAATAGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAACA-A
* * * *
132556 AACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAACAATTGTTC-AA-AGTC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * *
132619 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACT
129 AAAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * ***
132671 CATCAATTTTTGAAATAGTAATAAGTCAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCCTATGTA-AATTGA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CT-TGTATAAACAA
* ** * * *
132734 TACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** * * *
132799 ATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
129 AAAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * * * *
132851 TATTAATTCTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTGATCT-GAATAAGGTAGTATGAACGAA
1 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATAAAC-AA
* * * * * *
132915 AATAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
*
132979 ATAACTATTTGAA
129 AAAACTATTTGAA
132992 ATTATTTGGT
Statistics
Matches: 4655, Mismatches: 1067, Indels: 592
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
159 4 0.00
160 39 0.01
161 2 0.00
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185 13 0.00
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188 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAACAAAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAA
AACTATTTGAACTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
Found at i:128502 original size:545 final size:536
Alignment explanation
Indices: 127396--128814 Score: 1280
Period size: 545 Copynumber: 2.6 Consensus size: 536
127386 GTAAGATATG
* * * * *
127396 AAACAAATATTTTATGACTACAA-AAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
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* * *
127460 TTTTAACTATTTGAACTAGTTCA-GCAAACACATTTATATTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT
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* * * * ** * * **
127523 TGGAATATTATTAAATTTGTATTTTTTTAACTGAATAACCTTCTATGATCAGAATCAATTATTTA
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* * * * *
127588 TGACAAAACAAAGATATTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
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*
127653 TAGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
258 TAGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTA
** ** * * *
127718 TTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAATAAAAGGTTATA
323 TTATTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAATAAAACGTTATA
* * * * *
127783 AATGATTTTAAATAAAGAAATGTTCAAATAGTAATAGCTATTTGAACTTATTCAGTAAATACATT
388 AATGATTTGAAATAAAGAAATATTCAAATAGTAATAACTATTTGAAATTATTCAGTAAACACATT
* * * * * **
127848 TATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGAAATAATTTATTTTG
453 CACTTTTTAAAATCTCTTACTGATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGAAATAATTTATTTCA
* * *
127913 AATAAGCTTGTACAAACTA
518 AACAAACTTGTACAAACAA
* * *
127932 AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAACGATTTCATATAGATAATTATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
*
127997 CTTAACTGTTTGAACT-GATTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
66 -TTAACTATTTGAACTAG-TTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
128061 AAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTACAAACAAAAAAAATTCTTTT
129 GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAA-CAGAATAACCTTCTACAAACAAAAAAAATT-ATTT
* * ** * *
128126 ATGACAAAAGAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGAAAATCGTTCATGTTGTCTTAACTATTTG
192 ATGACAAAA-AAAAGAT-ATTAACAATTTGAAATAGAAAATCGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * * *
128190 AACTAGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTCG-AATATTATTA
255 AACTAGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAA--ATC-T-CTTATTAA-TTTTCGAAATATTAATA
*
128254 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATGAAC-AAAACCAATT-TTTTGATGACAAAAT
315 AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAACTAAAA-CAATTGTTTT-ATGAC-AAAT
* * * * *
128317 AAAACGTTAT-AATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAA-AACTATTTGAAAATTGGT
377 AAAACGTTATAAATGATTTGAAATAAAGAAATATTCAAATAGT-AATAACTATTTG-AAATT-AT
* * *
128380 TTAGTAAACAGATTCACTTTTT-AAATTTCTTACTGATTAATTTTAT-AAATATTAATAAATTAG
439 TCAGTAAACACATTCACTTTTTAAAATCTCTTACTGATTAATTTT-TCAAATATTAATAAATTAG
* * * **
128443 TATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATTAACAA
503 AAATAATTTATTTCAAACAAACTTGTACAAACAA
** * * * *
128477 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AATAATAATGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAA-AACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
* * * * * * * *
128541 TTATAATTATTTGTACTAGTCT-GGTAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAATTATAAATTTT
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* * * * ** * *
128605 TGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTC-GAATATA-CTTATATGAACTGAAACAAA-TA
128 TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA--ACAGAATA-ACCTTCTACAAAC-AAAAAAAATTA
* * ** * * * * *
128667 TTATATGAGAAAACAAATG-TCA-TAATGATTT-AAGATTGATATTTGTTCATATAGTCA-AACT
189 TT-TATGACAAAA-AAAAGAT-ATTAACAATTTGAA-ATAGAAAATCGTTCAAATAGTCATAACT
*** *
128728 ATTTGAACTAGTTCAAAAAACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAACTAT
250 ATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCGAAA-TAT
* *
128792 TAGTAAAGTAGTATTATTTTATT
310 TAATAAATTAGTATTATTTTATT
128815 TTGAATAAGT
Statistics
Matches: 713, Mismatches: 135, Indels: 63
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (536 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
TTAACTATTTGAACTAGTTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAACAGAATAACCTTCTACAAACAAAAAAAATTATTTATGA
CAAAAAAAAGATATTAACAATTTGAAATAGAAAATCGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
TTCGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCGAAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAATAAAACGTTATAAAT
GATTTGAAATAAAGAAATATTCAAATAGTAATAACTATTTGAAATTATTCAGTAAACACATTCAC
TTTTTAAAATCTCTTACTGATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGAAATAATTTATTTCAAAC
AAACTTGTACAAACAA
Found at i:129202 original size:724 final size:712
Alignment explanation
Indices: 128466--131861 Score: 1688
Period size: 710 Copynumber: 4.8 Consensus size: 712
128456 CAAACAAACT
* * * * **
128466 TGTATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATAATAA-TGATTTGAAATAGGTAAT
1 TGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAAATAATAACT-ATTTCAAATAAATAAT
* * ** *
128530 TGTTCAAATAGT-TATAATTATTTGTACTAG-TCTGGTAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCA
65 TGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTAGTTC-GACAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTCA
* * *
128593 ATTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTT-ATTTCGAATATA-CTTATATGAAC
128 ATTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATA-AGCTTACATGAAA
* * * * *
128656 TGAAACAAATATTATATGAGAAAACAAATG-TCATAATGATTTAAGATTGATATTTGTTCATATA
191 AGAAACAAATATTATATGAGAAAACAAA-GATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATA
* *
128720 GTCA-AACTATTTGAACTAGTTCAAAAAACA-ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
255 GTCATAACTATTTAAACTAGTTCAAAAAACAGA-TTTAGTTTGTAAA--TC-T-CTTATTAATTT
* * * **
128783 TCAAACTATTAGTAAAGT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTCTT-ATGAATTGAAAC-AATT
315 TC-AACTATTAAT-AAGTCAATATTATTTTATTATGAATAA-TT-TTCATGAACAGAAACAAATT
* * *
128845 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGTCAGATCTATTCTTCAAATAGTCCA
376 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTAAA-A-T-AGA-CAATTCTTC-AATAG-ACA
* * * *
128910 -ATCTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTCTTAAATCTT-ATGCTTATTAATTTTTT
434 TA-CTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTT-TTAAAT-TTCATACCTATTAATTTTTA
* * * * * *
128973 GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTA
496 GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTTA
**
129038 TGACTAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAACAAATAATTATTCCAATAGTCTTAACTATTTTAA
561 TGAAAAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAACAAATAATTATTCCAATAGTCTTAACTATTTTAA
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626 ATTGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTATTTGTACTTATCAAAAGG
129168 TCATAACTATTTTGAATACGCA
691 TCATAACTATTTTGAATACGCA
** *
129190 TGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTCAAATAAATAATT
1 TGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAAATAATAACTATTTCAAATAAATAATT
* * * * * * * *
129255 GTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
66 GTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAATT
* * * *
129320 ATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGCATGAAAAGAAA
131 ATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTACATGAAAAGAAA
* * * * * *
129385 CAATTGTTTTATGAGAAAATAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATTGTTATA
196 CAAATATTATATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
129450 ACTATTTAAACTGGTTTAATAAATAGATTTAGTTTGTAAATCTCTTATTAATTTTCAATTATTAA
261 ACTATTTAAACTAGTTCAAAAAACAGATTTAGTTTGTAAATCTCTTATTAATTTTCAACTATTAA
*
129515 TAGGTCAATATTATTTTATTATGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAAATTGTTTTATGACAAAA
326 TAAGTCAATATTATTTTATTATGAATAATTTT-CATGAACAGAAACAAATTGTTTTATGACAAAA
* * * ** * *
129580 TAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTCAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCGA
390 CAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGACAATTCTTCAATAGACAT-ACTATTTGAACTTGTTCGA
* *
129645 TAAGTAGATTTATTTTTTAAATTTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAT
454 TAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCATACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTAT
* *
129710 TTTATTCTGAATAAACTTGTGTGAATAGAAACAATTGCTTTATGAAAAAAC-AAA----AT---A
519 TTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTTATGAAAAAACAAAAGGCCATAACA
** * * * *
129767 A-TTG-TTCAAACACTTA-T--AACTA-T-TTGAAC----TT-ACTTAG-T----AAACAGATTT
584 ATTTGAAACAAATAATTATTCCAA-TAGTCTT-AACTATTTTAAATT-GTTCGACAAACACATTT
* * * *
129815 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGGAATA-TTGAT-AAAA--TAATATTATTTTATT
646 ATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTATTT-G--TACTT-ATCAAAAGGTCATA--A--CTATT
* *
129876 TTGTATACGCT
702 TTGAATACGCA
* * * * ** * *
129887 TGTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATTCTAACTATTTGAAATAGATAATT
1 TGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAAATAATAACTATTTCAAATAAATAATT
* * * * * * *
129952 TTTCAAATAGTCCTAACTATTTGAAC-ATGTTTAGA-AAACATATTTATTTT-TAAAT-TCTTAC
66 GTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTA-G-TTCGACAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAA
* * * **
130013 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTCAGAATGAGCTTGTAT-AAAC
129 TTATAAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTACATGAAA-
* * * * * * *
130075 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAAT
191 AGAAACAAATATTATATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * * * *
130139 ACTCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTCA-TTTTTTACTCTCTTACTCA---TCAG
254 AGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAAAAAACAGATTTAGTTTGTAAATCTCTTATTAATTTTCA-
* * * * * * *
130200 AATATTAATAAATTAATA-T-TTTT-TT-TGAATAAGCCTAT-ATGAACTGATAC-AATTGTTTT
318 ACTATTAATAAGTCAATATTATTTTATTATGAATAA--TTTTCATGAACAGAAACAAATTGTTTT
* * * * * * * ** *
130259 ATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATGACTATTTAA
381 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGACAATT-CTTCAATAGACAT-ACTATTTGA
* * * * * * *
130324 ACTTGTTC-AGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTC-TACTTATTAATTGTCAAAATATTAATA
444 ACTTGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCATACCTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * * * *
130387 AATTAATATTATTTTAATCTGAAA-AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
507 AATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTTATGAAAAAACA
* * * * * * * * * * *
130451 AAATGTCATAACAATTTAAAAAAAAT-ATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
571 AAAGGCCATAACAATTTGAAACAAATAATTA-TTCCAATAGTCTTAACTATTTTAAATTGTTCGA
* * * * * * * * * * *
130515 TAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCT-AAATGATAATAAATTTGT-ATT
635 CAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTATTTGTACTTATCA-AAA--GGTCATA
* * *
130577 A-TTTTAATTGAAATAAGCT
696 ACTATT--TTG-AATACGCA
* * ** * * ** * ** * * ** *
130596 TGTAGGAATAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAAC
1 TGTATGAACA-AAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAAATAATAACTATTTCAAATAAATAAT
* * * * * * * * *
130660 TGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATATTTTGATAAACAAATTTAGTTTT-TAAATCCCTTAT
65 TGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTA-TTTTCTAAATCTCTCAA
* * * * * ** *
130723 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTGAATAAGCTCGCATGAACAGA
129 TTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTACATGAAAAGA
* * * * * * * * * * *
130788 AACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTC
194 AACAAATATTATATGAGAAAA-CAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTC
** * * *** * * * *
130853 ATAACTATTTGTA-TTGATCAGGCCAACAGATTCATTTTTTTAAATCCATTACTTATTAGTTTTT
258 ATAACTATTTAAACTAGTTCA-AAAAACAGATTTA-GTTTGTAAAT-C--T-CTTATTA-ATTTT
* * * * ** * * * **** * * * * *
130917 AAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTAAATAAGACAGCATTAATAGAAA-TAGTTTTTT
316 CAACTATTAATAAGTCAATATTATTTTATTATGAATAA-TTTTCATGAACAGAAACAAATTGTTT
* * * * * * * ** *
130981 TATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGATATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-TTATAACTAAT
380 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTAAAATAGACAATT-CTTCAA-TAGACAT-ACTATT
* * * * * * *
131044 TGAAC-TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTAATAATTTTTAAAATATTAA
441 TGAACTTG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCATACCTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * * * * *
131104 TAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAACC
505 TAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTTATGAAAAAAC
* * * * * *
131169 AAAAGGACATAACACTTTGAAATAGATAATTATT-CATATAGCCTTAACT-CTTTAAATTGGTTC
570 AAAAGGCCATAACAATTTGAAACAAATAATTATTCCA-ATAGTCTTAACTATTTTAAATT-GTTC
* * * * * * **
131232 AACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATT-TTCATAATA-TTATTATATTGGT-
633 GACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTATT--T-GTACTTATCA-AAAGGTC
** ** * *
131294 ATTATTTATTTCAAATAAGCT
693 A-TAACTATTTTGAATACGCA
* * * ** * * ** * * * *
131315 TGCATGAACATAAATAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAA-TAGCTTGAAATACATAAT
1 TGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAAATAATAACTA-TTTCAAATAAATAAT
* * * * * * * *
131379 TGTTCAAATAGTCATT-ATTATTTGAATTGGTTCGATAAAC-AGATAATCTCCT--AT-T-T--A
65 TGTTCAAATAGTC-TTAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAA
* * ** *
131436 TT-T--ATTTATGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATGATGAA
129 TTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAG-CTTACATGA-AAA
* * * * * * * * *
131497 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTGAA-AAAGATAATTGTTTAAACT
192 GAAACAAATATTATATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATTCAAA-T
* * * * * * * * *
131560 -GCCATAACTATTTGAACTAATTCGATAAACTGATATATGTTT-TAAATCTCCAGCTTCTCAATT
254 AGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAAAAAACAGATTTA-GTTTGTAAATCT----CTTATTAA-T
* * * * * * *
131623 TTTGAAGTATTAAT-A---AATATTATTTTATTTTGGAT-ATGCTTTTATGAA-ATGAAA-TAGT
313 TTTCAACTATTAATAAGTCAATATTATTTTATTATGAATAAT--TTTCATGAACA-GAAACAAAT
* * * * * ** * *
131681 TGTTATATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATATTCAAAAGT
375 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGACAATTCTTC-AATAGAC-ATACT
* * * * * *
131746 ATTTGAACTTGTTTCG-TAAATAGATTTATTTTTTAAAATTCTTTGCTTATTAATTTTTTGAATG
438 ATTTGAACTTG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTTC-ATACCTATTAATTTTTAGAATA
* * * *
131810 TTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCATGTATGAACT-GAAACAA
501 TTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAA
131862 AATGTTAGAA
Statistics
Matches: 2119, Mismatches: 404, Indels: 312
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (712 bp):
TGTATGAACAAAAACAATTGGTCTATGACAAAACAAAAAATAATAACTATTTCAAATAAATAATT
GTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAATT
ATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTACATGAAAAGAAA
CAAATATTATATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
ACTATTTAAACTAGTTCAAAAAACAGATTTAGTTTGTAAATCTCTTATTAATTTTCAACTATTAA
TAAGTCAATATTATTTTATTATGAATAATTTTCATGAACAGAAACAAATTGTTTTATGACAAAAC
AAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGACAATTCTTCAATAGACATACTATTTGAACTTGTTCGATA
AATAGATTTATTTTTTAAATTTCATACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTT
TATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGCTTTATGAAAAAACAAAAGGCCATAACAAT
TTGAAACAAATAATTATTCCAATAGTCTTAACTATTTTAAATTGTTCGACAAACACATTTATTTT
TTAAATCTCTTACTTATAATTATTTGTACTTATCAAAAGGTCATAACTATTTTGAATACGCA
Found at i:129655 original size:176 final size:178
Alignment explanation
Indices: 129259--129759 Score: 442
Period size: 176 Copynumber: 2.8 Consensus size: 178
129249 ATAATTGTTT
* * * * * * * * * * * *
129259 AAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
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* * *** *
129324 ATTTT-TGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGCATGAAAAGAAACAA
65 ATTTTCAG-AATATTAATAAATCAATATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGCATGAAAAGAAACAA
* *
129388 TTGTTTTATGAGAAAATAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTC
128 TTGTTTTATGAAAAAATAAAGATCATAATGATTTAAGATAGACAATTATTC
* ** * *
129439 AAATTGTTATAACTATTTAAACTGGTTTAATAAATAGATTTAGTTTGTAAA-T-CT-CTTATTAA
1 AAATAGACATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATAGATTTAGTTTGTAAATTCCTACCTATTAA
* ** ** *
129501 TTTTCA-ATTATTAATAGGTCAATATTATTTTATTATGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAAAT
66 TTTTCAGAATATTAATAAATCAATATTATTTTATT-TGAATAAACTTGCATGAAAAGAAAC-AAT
* *
129565 TGTTTTATGACAAAATAGAATG-TCATAATGATTTGAA-ATAGACAATTGTTC
129 TGTTTTATGAAAAAATA-AA-GATCATAATGATTT-AAGATAGACAATTATTC
* * * * * * *
129616 -AATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCGATAAGTAGATTTATTTTTTAAATTTCCTACCTATTA
1 AAATAGACATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATAGATTTAGTTTGTAAA-TTCCTACCTATTA
* * ** *
129680 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTGTGAATAGAAACAAT
65 ATTTTCAGAATATTAATAAATCAATATTATTTTATT-TGAATAAACTTGCATGAAAAGAAACAAT
*
129745 TGCTTTATGAAAAAA
129 TGTTTTATGAAAAAA
129760 CAAAATAATT
Statistics
Matches: 258, Mismatches: 52, Indels: 22
0.78 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
AAATAGACATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAATAGATTTAGTTTGTAAATTCCTACCTATTAA
TTTTCAGAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTGAATAAACTTGCATGAAAAGAAACAATTG
TTTTATGAAAAAATAAAGATCATAATGATTTAAGATAGACAATTATTC
Found at i:130386 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 129902--130543 Score: 437
Period size: 169 Copynumber: 3.7 Consensus size: 169
129892 GAACAAAAAT
* * * * * * * *
129902 AATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATTC-TAACTATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCCT
1 AATTGTTTTATAACAAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCAT
* * * * * * *
129966 AACTATTTGAACATGTTTAGA-AAACATATTTATTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGAAA
65 AACTATTTAAACTTGTTCA-ATAAACAGATTCATTTTTAAATCTCTTACTCA-TCA-----G-AA
* * * * * * ** *
130029 TATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAGAATGAGCTTGTATAAACAAAAAC
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* * **
130081 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCATA
1 AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCATA
* * * *
130146 ACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTCATTTTTTACTCTCTTACTCATCAGAATATTAATAA
66 ACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCATTTTTAAATCTCTTACTCATCAGAATATCAATAA
130211 ATTAATATTTTTTTTGAATAAGCCTATATGAACTGATAC
131 ATTAATATTTTTTTTGAATAAGCCTATATGAACTGATAC
* * * * * *
130250 AATTGTTTTATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTTATG
1 AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCATA
* * * * * *
130315 ACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAATTGTCAAAAT
66 ACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCATTTTT-AAA---TCT-CTTACTCA---TCAGAAT
* * * * ** *
130380 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAAAAGCTTGTATGAACAAAAAC
123 ATCAATAAATTAATATT-TTTT--T-TGAATAAGCCTATATGAACTGATAC
* * * * * * *
130431 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAAAAAAT-ATAAGTTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATACTCAT
* * ** * * *
130495 AACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACT
65 AACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCATTTTTAAATCTCTTACT
130544 TATTAATTAT
Statistics
Matches: 375, Mismatches: 72, Indels: 35
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 104 0.28
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Consensus pattern (169 bp):
AATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCATA
ACTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTCATTTTTAAATCTCTTACTCATCAGAATATCAATAA
ATTAATATTTTTTTTGAATAAGCCTATATGAACTGATAC
Found at i:131357 original size:719 final size:704
Alignment explanation
Indices: 129782--132991 Score: 1676
Period size: 710 Copynumber: 4.5 Consensus size: 704
129772 TCAAACACTT
* ** * * * *
129782 ATAACTATTTGAACTTACTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
1 ATAACTATTTGAAATTA-TTCAACAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATCT
* * * ** * *** * **
129846 GGAATATTGATAAAATAATATTATTTTATTTTGTATACGCTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTT
64 -AAATA-TAATAAATTGGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTT
* * * * * *
129911 ATGATAAAACAAAAGATTCTAACTATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCCTAACTATTTGA
127 ATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-A
* *
129976 ACATGTTTAGA-AAACATATTTA-TTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
191 A-AT-TTTAGATAAACA-ATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
** *
130038 ATTTA-TATTATTTTATTCAGAATGAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
253 A-TTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
130102 AAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAACTTGTTCAATA
316 AAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGATCAACA
* * * *
130167 AATAGATTCATTTTTTACTCTCTTACTCATCAGAATATTAATAAATTAATATTTTTTTTGAATAA
381 AACAGATTCATTTTTTAATCTCTTACTCATCAGAATATTAATAAATTAATATTTATTTTAAATAA
* * * * * * *
130232 GCCTATATGAACTGATACAATTGTTTTATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
446 GACTACATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATATGAAATAAATA
* * *
130297 ATTATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTCTA
511 ATTATTTAAATAGTTATAACTAATTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAA--TTCTA
* * *
130362 CTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAAAAGCTTGTATGAACAA
574 CTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAAAAACTTATATGAACAA
* * * *
130427 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAAAAAATATAAGTTCAAATAGT
639 AAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTAAAAAAAATATAAGTTCAAATAGC
130492 C
704 C
* ** * * * *
130493 ATAACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCTAA
1 ATAACTATTTGAAATTATTCAACAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATCTAA
* * * *
130558 ATGATAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTAGGAATAGAAAA-AATTATTTTAT
66 AT-ATAATAAATTGGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAATAATTATTTTAT
* ** * *
130622 GACAAAGCAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT
129 GACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAT
* *
130687 ATTTTGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
194 -TTTAGATAAAC-AATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * * * *
130752 GAATTATCTTATTTTGAATAAGCTCGCATGAACAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGT
257 GTATTATTTTATTTTGAAT-AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * *
130817 TATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGTA-TTGATCAGGCCAACA
321 TATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGATCA-ACAAACA
* *
130881 GATTCATTTTTTTAAATC-CATTACTTATTAGTTTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTA
385 GATTCA-TTTTTT-AATCTC-TTACTCATCAG-------AATATTAATAAATTA--A-TA-TTTA
* * * * * *
130945 TTTTAAATAAGAC-AGCATTAA-TAGAAATAGTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGA
436 TTTTAAATAAGACTA-CATGAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACA-A
* * **
131007 TATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-TTATAACTAATTGAAC-TGATTTGGTAAACAAATTTAT
498 TATGAAATAAATAATTATTTAAA-TAGTTATAACTAATTAAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTAT
* * * *
131070 TTTTTAAA-TCT-CTTAATAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAACAA
561 TTTTAAAATTCTACTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAA-AA
* * * * * *
131132 ACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACGACAAACCAAAAGGACATAACACTTTGAAATAGATA
625 ACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTAAAAAAAAT-
* *
131197 ATTA-TTCATATAGCC
689 ATAAGTTCAAATAGCC
* * * * *
131212 TTAACTCTTT-AAATTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTC-
1 ATAACTATTTGAAATT-ATTCAACAAACAAATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTATCT
* * * * * *
131275 ATAATATTATTATATTGGTATTA-TTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACATAAATAATTCTTTT
64 A-AATA-TAATAAATTGGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTT
* * ** * * * *
131339 ATAACAAAACAAAAGGTTATAATAGCTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATTATTATTTGA
127 ATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * * *
131404 ATTGGTTCGATAAAC-----AG---AT-AATCTCC-TATTTATTTATTTATGAAATATTAATAAA
192 ATT--TTAGATAAACAATTTAGTTTTTAAATC-CCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
**
131459 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAGTCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
254 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAG-CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
131524 -GTTCAAAATGATTTGAAAA-AGATAATTGTTTAAACTGCCATAACTATTTGAAC-TAATTCGAT
318 GGTT-ATAATGATTT-AAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGA-TCAAC
* * ** *
131586 AAACTGATAT-ATGTTTTAAATCTCCAGCTT-CTCAATTTTTGAAGTATTAATAAA-TATTATTT
380 AAACAGAT-TCAT-TTTTTAATCT----CTTACTC-A--TCAGAA-TATTAATAAATTAATA-TT
** * ** * * * * * *
131648 TATTTTGGATATG-CTTTTATGAAATGAAATAGTTGTTATATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAA
434 TATTTTAAATAAGAC-TACATGAACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAA
* * * * * * * * * *
131712 TTTTAAATAGATAATTATTCAAATA-TTCAAAAGTATTTGAACTTGTTTC-GTAAATAGATTTAT
498 TATGAAATAAATAATTATTTAAATAGTT-ATAACTAATTAAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTA-
* * * *** * * * * *
131775 TTTTTAAAATTCTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTT-ATTTCAAA
560 TTTTTAAAATTC--TACTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAA
* * * ** * * *
131839 TAAGCATGTATGAACTGAAACAAAATG--TT-------------A-GA-AT--C-ATTTGAAATA
623 -AAACTTATATGAACAAAAAC-AATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTAAAAAA
* * * *
131884 GATAATTA-TTCTAATAGTC
686 AAT-ATAAGTTCAAATAGCC
* * ** *** * * * * *
131903 TTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATACATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTATAAATT-TTTA
1 ATAACTATTTGAAATTATTCAACAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATCTA
* *** * * * * * * * * * * * *
131967 GAATATTATTGGTTTAGCAATATTTTACTCCAAATATGTTTGTATGGATAGAAACAATTTTTTTA
65 -AATA-TAATAAATTGGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTA
* * * * * *
132032 TGACAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTTAAA
128 TGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * *
132096 TTGATTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAAT--C-T-CTTATTAA-TTTTCAAGATATTAATAAA
193 TT--TTAGATAAAC-AATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAA
* ** * * * * *
132156 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTTTGTGAATAGAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAA
254 TTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * * ** * * * *
132221 GATCATACTAACTTGAAATAAATAATTATTTAAATTGTCATAATTGTTTGAAC-TCA-CTAAGGA
318 GGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGATC-AA-CA
* * * * * *
132284 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTGGGAATTTTAATAAATTAGAGTTATTT
381 AACAGATTCATTTTTT-AATCTCTTACTCA-TCA------GAATATTAATAAATTA-A--TA-TT
** ** * ** *
132349 TATTCCAAATAAG-CTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATA
434 TATTTTAAATAAGAC-TACATGAACT-GAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACA
* * * * * * * * * * * *
132412 GTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATT
497 ATATGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATAACTAATTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATT
* * ** *** ** * * * *
132477 GTTTAAATTTTTACTTGTTAATCT-TTGGAATATTGGTAATTTTATATTATTTT-ATTTGGAATA
562 -TTTAAAATTCTACTTAATAAT-TGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCT-GAAAA
* * * * * * * * **
132540 AGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAC
624 AACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGACATAACAATTT-AAA-AAA-
*
132605 AAT-T--GTTC-AA-AGTC
686 AATATAAGTTCAAATAGCC
* * * ** * * * * *
132619 ATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATCAATT-TTTG
1 ATAACTATTTGAAATTATTCAACAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATCT-
* ** *** * * *
132683 AAATAGTAATAAGTCAGTATTATTTT-ATTCAAATAAGCCTATGTA--AATTGATACAATTGTTT
64 AAATA-TAATAAATTGGTATTATTTTAATTCAAATAAG-CT-TGTATGAACAAAAATAATTATTT
** * ** * * *
132745 TATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTG
126 TATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-
* * * * ** * * *
132810 AACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTCTTGAAATTTTAATAA
190 AAATT-TTAGATAAACA-ATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * *
132875 ATTAATATTATTTTGA-TCTGAATAAGGTAGTATGAACGAAAATAATTGTTTTATGACAAAA-AA
253 ATTAGTATTATTTT-ATTTTGAAT-AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
132938 AAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA
316 AAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAA
132992 ATTATTTGGT
Statistics
Matches: 1952, Mismatches: 405, Indels: 276
0.74 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
690 1 0.00
691 134 0.07
692 51 0.03
693 4 0.00
694 3 0.00
695 3 0.00
696 15 0.01
697 131 0.07
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699 50 0.03
700 11 0.01
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708 15 0.01
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710 354 0.18
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714 4 0.00
715 36 0.02
716 141 0.07
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723 102 0.05
724 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (704 bp):
ATAACTATTTGAAATTATTCAACAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATCTAA
ATATAATAAATTGGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGA
CAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTT
TAGATAAACAATTTAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTTTGAATAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
TGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAACTTGATCAACAAACAGATTCA
TTTTTTAATCTCTTACTCATCAGAATATTAATAAATTAATATTTATTTTAAATAAGACTACATGA
ACTGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATATGAAATAAATAATTATTTAAA
TAGTTATAACTAATTAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTCTACTTAATAATTGT
CAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAAAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTT
TACGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTAAAAAAAATATAAGTTCAAATAGCC
Found at i:132777 original size:358 final size:359
Alignment explanation
Indices: 129762--133010 Score: 1572
Period size: 359 Copynumber: 9.1 Consensus size: 359
129752 TGAAAAAACA
* * * * *
129762 AAATAATTGTTCAAACACTTATAACTATTTGAACTTACTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
1 AAATAATTGTTC-AA-AGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC
* * * * * * * **** * * *
129827 TTTTACTTATTAATTTTTTGG-AATATTGATAAAATAATA-TTATTTTATTTTGTATACGCTTGT
64 TCTTACTCATCAA--TTTTGGAAATAGTAAT-AAATCAGAGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTAT
* * * * * * *
129890 ATGAACAAAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGATTC-TAACTA-TTTGAAATAGATAATTT
126 ATAAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAA-TAGTTTGAAATAGATAATTA
* * * *
129953 TTCAAATAGTCCTAACTATTTGAACATGTTTAGAAAACATATTTATT-TTTAAAT-TCTTACTTA
189 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAATCTTTTACTTA
* * * * * * * *
130016 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAGAATGAGCTTGTATAAACAAAAAC
254 TTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTTTGAATAGAAAC
*
130081 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
318 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
130123 AGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGATTCATTTTTT-ACTC
1 AAATAATTGTTC-AA-AGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC
* * ***
130187 TCTTACTCATC-A-----G-AATATTAATAAATTA-A--TATTTT-TTTTGAATAAGCCTATATG
64 TCTTACTCATCAATTTTGGAAATAGTAATAAATCAGAGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATAT-
* * * * * * * * *
130241 AACT-GATACAATTGTTTTATAACGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTA
128 AAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * * *
130305 AATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATT-TTTAAAATCTTCTACTTATTA
193 AATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTT-AAATCTTTTACTTATTA
* ** * * * * *
130369 ATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAAAAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
257 ATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAAT
* ** * *
130434 TGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAAA
321 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * *
130473 AAAT-ATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTT-GATAAATAGATTTA-TTTTTAAA
1 AAATAAT-TGTTC-AA-AGTCATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAAATTCATTTTTTAAA
* * * * ** ** * *
130535 TCTTTTACTTATTAATTATCTAAAT-GATAATAAATTTGTA-TTATTTTAATT-GAAATAAGCTT
62 TCTCTTACTCATCAATTTTGGAAATAG-TAATAAATCAG-AGTTATTTT-ATTCCAAATAAGCCT
* ** * ** * * *** * * * *
130597 GTAGGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGGTAACTG
124 ATATAAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAATTA
* * * * ** *
130662 TTCAAATAGTCATAACTATTT-AA-ATATTTTGATAAACAAATTTAGTT-TTTAAATCCCTTATT
189 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGA-AAACAGATTTA-TTGTTTAAATCTTTTACT
* * * * ** *
130724 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGA-ATTATCTTATTTTGAATAAGCTCGCATGAACAGA
252 TATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTTTGAATAGA
* * * *
130788 AACAATTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAAT
315 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** *
130833 AGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGTA-TTGA-TCAGGCCAACAGATTCATTTTTTTAA
1 AAATAATTGTTC-AA-AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTA-GTAAACAAATTCA-TTTTTTAA
* * * ** * * * ** *
130896 ATC-CATTACTTATTAGTTTTTAAAATATTAATAAATTAGCA-TTACTTTATTTTAAATAAGAC-
61 ATCTC-TTACTCATCAATTTTGGAAATAGTAATAAATCAG-AGTTATTTTATTCCAAATAAGCCT
* * * * ** * * *
130958 AGCATTAATAGAAATAGTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-AGATATGAAATAAATAAT
124 A-TATAAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAG-TTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * *
131022 TGTTTAAATTA-TTATAACTAATTGAAC-TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-
187 TATTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACGTG-TTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAATCTTTTA
* * * * * * * * * *
131081 CTTAATAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAACAAACTTATATGAACAA
250 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTTTGAATAG
* * * * *
131146 AAACATTTGTTTTACGACAAACCAAAAGGACATAA-CACTTTGAAAT
314 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAAT
* * * * * * * * ** * *
131192 AGATAATTATTCATATAGCCTTAACTCTTT-AAATTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTCAAAT
1 AAATAATTGTTCA-A-AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAAT
* * * * * * * ** * * **
131256 CTCTTAGTTATTAATTTT-CATAATATTATTATATTGGTA-TTA-TTTATTTCAAATAAGCTTGC
63 CTCTTACTCATCAATTTTGGA-AATAGTAATAAATCAG-AGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTAT
* * * * ** * * * * *
131318 ATGAACATAAATAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAATAGCTTGAAATACATAATTGTT
126 ATAAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * ** *
131383 CAAATAGTCATTATTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAG----A-----T-AATCTCCTATTTAT
191 CAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGA-AAACAGATTTATTGTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
131437 TTATT-TATGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATG-ATGAAAA
255 TAATTCT-TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTGAATAAG-CTTGTTTGAAT-AGAA
* *
131499 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGATTTGAAA-
316 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * ** *
131542 AAGATAATTGTTTAAACTGCCATAACTATTTGAAC-TAATTCGATAAACTGATAT-ATGTTTTAA
1 AA-ATAATTGTTCAAA--GTCATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAAAT-TCATTTTTTAA
* * * * **** * *
131605 ATCTC-CAGCTTC-TCAATTTTTGAAGTATTAATAAAT---A-TTATTTTATTTTGGATATGCTT
61 ATCTCTTA-C-TCATCAATTTTGGAAATAGTAATAAATCAGAGTTATTTTATTCCAAATAAGCCT
* * * * * *
131664 TTATGAAAT-GAAATAGTT-GTTATATGACAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAAT
124 ATAT-AAATAGAAACAATTGGTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * *
131727 TATTCAAATATTCAAAAGTATTTGAACTTGTTTCGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TCTTTG
187 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTT-AAATCT-TTTA
* * * * * *
131791 CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATG--T--AT-
250 CTTATTAA-TTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTTTGAATA
* * * *
131850 G-AAC----------TG---AAACAAAATGTTAGAATCATTTGAAAT
313 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** * * * * * *
131883 AGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATACATTTATTTTTTAAACC
1 AAATAATTGTTC-AA-AGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC
* * * * * *** * * * * ** *
131948 TCTTACTTATAAATTTT-TAGAATATTATTGGTTTAGCA-ATATTTTACTCCAAATATGTTTGTA
64 TCTTACTCATCAATTTTGGA-AATAGTAATAAATCAG-AGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATA
** ** * ** * * * *
132011 TGGATAGAAACAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGAGATAAATAATTGTTC
127 TAAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAATTATTC
* ** * * *
132075 AAATAGTCCTAACTATTT-AAATTGATTTGGTAAACAAATTTAGTT-TTTAAATC---T-CTTAT
192 AAATAGTCATAACTATTTGAACGTG-TTTAGAAAACAGATTTA-TTGTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
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255 TAATTCTTGAA-ATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTT-TGAATAGAAA
* * * * *
132197 CACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATACTAACTTGAAAT
317 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * *
132240 AAATAATTATTTAAATTGTCATAATTGTTTGAACTCACTAAGGAAACAAATTTATTTTTTAAATC
1 AAATAATTGTTCAAA--GTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC
* * * * ** * * * *
132305 TCTTATTTATTAATTTTGGGAATTTTAATAAATTAGAGTTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATG
64 TCTTACTCATCAATTTTGGAAATAGTAATAAATCAGAGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATATA
* *
132370 AATAGAAACAATTGGTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAATTGTTCAA
129 AATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAATTATTCAA
*
132435 ATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTAA-
194 ATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* ** * *
132498 TCTTTGGAATATTGGTAATTTTATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATT
259 TC-TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATT
*
132563 GTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
322 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * *
132601 AAACAATTGTTCAAAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTC
1 AAATAATTGTTCAAAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTC
* * *
132666 TTACTCATCAATTTTTGAAATAGTAATAAGTCAGTA-TTATTTTATT-CAAATAAGCCTATGTAA
66 TTACTCATCAATTTTGGAAATAGTAATAAATCAG-AGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATATAA
* * * **
132729 ATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTCAA
130 ATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAG-TTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * *
132793 ATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
194 ATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * * * *
132858 TCTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTGATCTGAATAAGGTAGTATGAA-CGAAAATAATT
259 TCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTTTGAATAG-AAACAATT
* *
132922 GTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAACGATTTGAAAT
322 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * *
132959 AAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAAATTATTTGGTAAACAAATT
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AAATAATTGTTCAAAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTC
TTACTCATCAATTTTGGAAATAGTAATAAATCAGAGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATATAAA
TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGTTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
AGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAAACAGATTTATTGTTTAAATCTTTTACTTATTAATTC
TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGTTT
TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
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*
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*
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* *
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131 AGGTGGATAACCAATGCATCATAATAATGAAAAAGTTTGGAGGGAAGATCTTCTCTAAATGGCAT
** * * *
137931 AAAGTAATCGCAGCTTGATCTTGAAGTTTGTCTAGCTTTTCCACATTCATACATTTCTGACATAA
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*
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*
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* *
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*
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131 AGGTGGATAACCAATGCATCATAATAATGAAAAAGTTTGGAGGGAAGATCTTCTCTAAATGGCAT
* * *
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196 AAAAAAATCGCAGCTCGATCTTGAAGTTTGTCTAACTCTTCCACATTCATACATTTCTGACATAA
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261 AGATTTAAATATATTACTCAAT
138299 TCA
1 TCA
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TCATATGTTATTTTAAGTAGAGTGGCTTGATCATCAATAAAAACGTAATCAATCTATTAAAAAAT
AATACCTTTCAATAAGATACATCCATCAATAATAAACTAGCCCACCAACTTTTGCTTCATATGAA
AGGTGGATAACCAATGCATCATAATAATGAAAAAGTTTGGAGGGAAGATCTTCTCTAAATGGCAT
AAAAAAATCGCAGCTCGATCTTGAAGTTTGTCTAACTCTTCCACATTCATACATTTCTGACATAA
AGATTTAAATATATTACTCAAT
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142110 ATTTTAGGAT
* * * * *
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* * * * **
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* *
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1 TATTGAAGGCGTCTACTGATAAC
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Statistics
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TATTGAAGGCGTCTACTGATAACAAACACCTTCAATAATTTCTCTTAAATTGTTTACATAAA
Found at i:142194 original size:146 final size:145
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141932 TAACAAATGC
* * * *
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1 CTTTAATAATTTCCCTCTAAAAAATTTTAGGATTATTAAGGCGTCTACTACTGACAAACACCTTC
* *
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142072 AATTTCAACAAACAT
131 AATTTCAACAAACAT
* *
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1 CTTTAATAATTTCCCTCTAAAAAATTTTAGGATTATT-AAGGCGTCTACTACTGACAAACACCTT
* * ** *
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130 TAATTTC
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Statistics
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CTTTAATAATTTCCCTCTAAAAAATTTTAGGATTATTAAGGCGTCTACTACTGACAAACACCTTC
AATAATTCCTTTTAAATTTCCTACATAAATATTAAAGGCATTTATTGATAATAAATGCCTTCAAT
AATTTCAACAAACAT
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142133 TACTACTGAC
* * * *
142143 AAACACCTTCAATAA-TTCTTTTTTAATTTTTTACATAAATATTGAAGGCATTTATTGATAAT
1 AAACGCCTTCAATAATTTC-TCTTAAATTGTTTACATAAATATTGAAGGCATTTATTG--AAT
* *
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*
142264 -AACGCCTTCAGTAATTT
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142281 TCCTTTAAAA
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AAACGCCTTCAATAATTTCTCTTAAATTGTTTACATAAATATTGAAGGCATTTATTGAAT
Found at i:143339 original size:80 final size:80
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Indices: 143205--143455 Score: 324
Period size: 79 Copynumber: 3.1 Consensus size: 80
143195 TTAAATATTG
* * * * *
143205 TGGTTTGCTGAACCTTGTTGTCAGAATGTTGTTTTACTTAATGGTATTGTATGATATTGGGGGGT
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65 TGAATCGTATGCTGAA
* * * **
143286 TGGTTTGCTAAACCTCGTTGTCTAATATTGTTTTGCCGAATGGTATTGTATGATATTAGAAGG-T
1 TGGTTTGCTAAACCTTGTTGTCTAATATTGTTTTGCTGAATGGTATTGTATGATATTGGGGGGTT
* *
143350 GAATCATATGTTGAA
66 GAATCGTATGCTGAA
* * * * *
143365 TGGTTTGTTGAACCTTGTTGTCTGATATTGTTTTGTTGAATGGTTTTGTATGATATTGGGGGGTT
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*
143430 GAATCGTATGCTAAA
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1 TGGTTTGCTAA
143456 TGCTGTTTCT
Statistics
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TGGTTTGCTAAACCTTGTTGTCTAATATTGTTTTGCTGAATGGTATTGTATGATATTGGGGGGTT
GAATCGTATGCTGAA
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Period size: 62 Copynumber: 3.5 Consensus size: 62
143428 TTGAATCGTA
*
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1 TGCTGAATGGTTTGCTGAATGCTGTTTCTAAGTGGTTTACTAAAGGGTATGTCTGGGCACAT
* *
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1 TGCTGAATGGTTTGCTGAATGCTGTTTCTAAGTGGTTTACTAAAGGGTATGTCTG-G-GCA---C
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61 --A----T
* *
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1 -TGCTGAATGGTTTGCTGAATGCTGTTTCTAAGTGGTTTACTAAAGGGTATGTCTGGGCACAT
* * * *
143635 TGCTGATTGGTGTGCTAAATGGTGTTTCT
1 TGCTGAATGGTTTGCTGAATGCTGTTTCT
143664 GTACATAGTA
Statistics
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Found at i:143620 original size:74 final size:74
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Indices: 143499--143657 Score: 309
Period size: 74 Copynumber: 2.1 Consensus size: 74
143489 CTGGGCACAT
143499 TGCTGAATGGTTTGTTGAATGCTGTTTCTAAGTGGTTTACTAAAGGGTATGTCTGAGCACATTGC
1 TGCTGAATGGTTTGTTGAATGCTGTTTCTAAGTGGTTTACTAAAGGGTATGTCTGAGCACATTGC
143564 TGATTGGTG
66 TGATTGGTG
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66 TGATTGGTG
*
143647 TGCTAAATGGT
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143658 GTTTCTGTAC
Statistics
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TGATTGGTG
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Period size: 181 Copynumber: 2.7 Consensus size: 180
148083 TTGTAAATCT
* * * ** ** * * * *
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* * * * *
148158 AAACAATTGTTTTGT-AACACAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTCAAACAA
66 AAACAATTGTTTTATGAA-A-AACAAAAGGACATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * *
148222 TCATAATTGTTCATATTGGTCAGGCCAACAGATATATTTTCTAAATCTGTTA
129 TCATAATAATTCATACTGGTCAGGCCAAAAGATATATTTTCTAAATCTGTTA
* * *
148274 CTTATTAA-TTTTCAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TATATGAAC
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* *
148337 AAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGACATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
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* * ** * * * *
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** *
148454 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAACAA
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* * *
148519 AAA-AATTTGTTTTATGAAAAACAAAAGGTA-ATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAGTAG
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148582 TCA
129 TCA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATAATAATTCATACTGGTCAGGCCAAAAGATATATTTTCTAAATCTGTTA
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Indices: 148652--149056 Score: 451
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148642 CATAGAGCCT
* * * * * * *
148652 TAACTATTTAAATTGGTTCGGCAAACA-ATTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAT
1 TAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATA-TTTATTTTTTAAATCACCTACTTATTAATTTTCAT
* * * * *
148716 AATATTATTAGATTAATATTATTGTATTCCGAATACACTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTAT
65 AATATTAATAAATTAACATTATTGTATTCCAAATACACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTAT
* * * *
148781 GAAAAAAACAAAGGTT-ATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAACAATCA
130 G-AAAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAACCA
*
148833 TAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCACCTACTTATTAATTATTGA-
1 TAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCACCTACTTATTAATT-TTCAT
* * ** **
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* * ***
148962 GACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATGGCCA
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* * * *
149014 TAATTATTTGAACTGATTTGA-TAAACATATTTA-TTTTTAAATC
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149057 TCCAACTCTT
Statistics
Matches: 188, Mismatches: 32, Indels: 9
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Matches are distributed among these distances:
180 22 0.12
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182 8 0.04
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Consensus pattern (181 bp):
TAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCACCTACTTATTAATTTTCATA
ATATTAATAAATTAACATTATTGTATTCCAAATACACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
AAAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAACCA
Found at i:149414 original size:181 final size:177
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Indices: 149060--151208 Score: 1281
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149050 TTAAATCTCC
* * * * * * * *
149060 AACTCTTTGAACGTATTCAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTACTAATTAA-TTTTGGA
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* * * * ** *
149123 ATATTAAGAAAATTA-AATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAACAAAACTAATTGTTTTAT
63 ATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAATGAAAC-AATTATTTTAT
* * * *
149187 GACAAAACAAAA-TTTCATAATG-TTT-AATGATAGTTAATTGTTCAAATAGTCAT
125 GACAAAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAA--ATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * *
149240 AATTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTCT-TTTTTTAATTCTCTAGCTCATTAATTTTTAAA
1 AACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTA--TTATTAATTTTTGAA
* * *
149304 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTTAAATAAGCTTCTACGAACTGAAACAATTATTTTATT
63 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATG
* * **
149369 ACAAAAGAAATGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
126 ACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * *
149421 GACTATTTGAACTTGTTC-ATTAAGCATATTTATGTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCGAA
1 AACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTCTA-TTATTAATTTTTGAA
* ** *
149485 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATG
63 ATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTATTTTATG
* * * * * *
149550 ACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATACTCAT
126 ACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * *
149602 AACGATTTGAACTTGA-TCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-
1 AACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TCTA-TTATTAATT-T-TTG
* *
149665 -AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAAAAAAGCTTGTATGAATAGAAA-ATTTTATT
61 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT--AAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACA-ATTATT
* * * * * *
149727 TTATGACGAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTTTTCAAACAGTCAT
121 TTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
149784 AATTATTTAAACTTATT-TAGTAAAGAGATTCA-TTTGTAAATCTCTTTATTATTAATTTTGTG-
1 AACTATTTGAACTTATTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC--TATTATTAATTTT-TGA
* * * * ** * * *
149846 -TTATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATACGCTTACATAAATTAAAACAATTTTTTTAT
62 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTAT
** * * * *
149910 GATTAAACAAAAAGTTGTAACGATTTGAAATATATAATTTTTCAAATAGTCAT
125 GACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * *
149963 GATTATTTG-ATTTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAAATTCTTTTGTTATTAATTGTTGA
1 AACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAAATTTATTTTT-TAAA-TC-TCTATTATTAATTTTTGA
* * ** * ** *
150027 TATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATTGGAATAAGCTTGTTTGAACAAAAACAATCATTTTA-
62 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTAT
* * * ** * *
150091 GAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTAAAATAGTCAA
125 G-ACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * **
150145 AACTATTTGAAC-TAGTTTGATAAATAGA--T-TTTTTTAAATCTC--TTATTAATTGTCAAAAT
1 AACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTATTATTAATTTTTGAAAT
* * * * * * * ** * *
150204 ATTAATAGATAAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC
65 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGAC
* * * *
150269 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATCAT
128 AAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
150319 AATTATTTGAAC-CAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTAAA
1 AACTATTTGAACTTA-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TCT-ATTATTAATTTTTGAA
* * * * * *
150383 ATATTAATAAATTCA-TTTTACTTTATTCCAAATAAACTAGTATGGATTTAGAAA-AACTTATTT
63 ATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTAT-GA-AT-GAAACAA-TTATTT
* * * * * * * *
150446 TATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATATTTATTCACATAGTCGT
122 TATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * ** ** *
150502 AAATATTTAAAAATGGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAA
1 AACTATTT-GAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TA-TTATTAATTTTTGAA
* ** ** * * * *
150567 ATATTATTGGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAGTAATAAATTTATA
63 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAATGAAA-CAATTATTTTATG
* * * * * ** * * *
150632 ATAAAACAAAAGTTTATAGCCATTTGAAGTTTACAATTGTTTAAATAGTCAT
126 ACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * * *
150684 AACTATTTGAACCAATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC--TTATTAATTTTTGAAAGA
1 AACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTATTATTAATTTTTGAAATA
* * ** * **
150747 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGTTAAAAAAAACAATTGTTACATGA
66 TTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATG---AATGAAACAATTATTTTATGA
** * * * * * *
150812 CCTAATAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGACATAG-CTAT
127 CAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-AT
*** * * * ** *
150863 AACTATTTGAACTCGCTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACACACTAATTTTTGAAA
1 AACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC-TCTA-TTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * **
150928 TTTTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAACCTTTTATTAATAGAAACAATTGGTTTATG
64 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT-AAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTATTTTATG
* * * * *
150993 ACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTGAAAGAGATAATTGTTCATATAGTCTT
126 ACAAAACAAAAGGTTATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * *
151046 AACTATTTGAACTGT-TTTGACAAATACATTTATTTTTTAAATCTC--TTATTAAGTTTTGAAAT
1 AACTATTTGAACT-TATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTATTATTAATTTTTGAAAT
* * * * * * * *
151108 ATTATTAAATTAGTA-TATTTTATTCCAAAACAAGTTTATGTGAATTGAAATAATTATTTTATAA
65 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATT--TAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGA
* *
151172 TAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATT
127 CAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATT
151209 GTTTAAATTG
Statistics
Matches: 1527, Mismatches: 359, Indels: 169
0.74 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
174 126 0.08
175 1 0.00
176 2 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
AACTATTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTATTATTAATTTTTGAAATA
TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTATTTTATGACAAA
ACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
Found at i:149838 original size:362 final size:357
Alignment explanation
Indices: 149122--151661 Score: 1311
Period size: 361 Copynumber: 7.1 Consensus size: 357
149112 TTAATTTTGG
* * *
149122 AATATTAAGAAAATTAA-ATTATTTT-ATTCGAAATAAGCTTGCATGAACAAAACTAATTGTTTT
1 AATATTAA-TAAATTAATATTATTTTAATTCG-AATAAACTTACATGAACAAAAC-AATTGTTTT
** * *
149185 ATGACAAAACAAAATTTCATAATG-TTT-AATGATAGTTAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
63 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAA--ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
* * *
149248 GAACTT-ATTCAATAAACAAATTCT-TTTTTTAATTC-TCTAGCTCATTAATTTTTAAAATATTA
126 GAACTTGA-TCAATAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTT-AAATATTA
* * *
149310 ATAAATTAGTATTATTTTACTTT-AAATAAGCTTCTACGAACT-GAAACAATTATTTTATTACAA
187 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-AATTATTTTATGACAA
* * * * *
149373 AAGAAATGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTT
249 AACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT
* * * *
149438 CA-TTAAGCATATTTATGTTTTAAAT-TTTTTACTTATTAATTGTCGA
314 TAGTAAAG-AGA-TTAT-TTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTGTCGA
** * *
149484 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTACATGAACA-AAACAATTGTTTTAT
* * * **
149549 GACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATACTCATAACGATTTGAAC
65 GACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC
**
149614 TTGATCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAAT
130 TTGATCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTAATAAA-
* * *
149678 TTA-TATTATTTTATTTGAAAAAAAGCTTGTATGAATAGAAAATTTTATTTTATGACGAAACAAA
192 TTAGTATTATTTTATTTG-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-ATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * * * *
149742 AGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTTTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTATTTAGTAA
255 AGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAA
* * *
149807 AGAGATTCATTTGTAAATCTCTTTATTATTAATT-TTGT
320 AGAGATT-ATTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTGTCGA
** * ** * * *
149845 GTTATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATACGCTTACATAAATTAAAACAATTTTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTACATGAA-CAAAACAATTGTTTTAT
** ** * * * *
149910 GATTAAACAAAAAGTTGTAACGATTTGAAATATATAATTTTTCAAATAGTCATGATTATTTG-AT
65 GACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC
* * * * * * *
149974 TTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAAATTCTTTT-GTTATTAATTGTTGATATATTAGTAA
130 TT-GATCAATAAACAAATTTATTTTT-TAAA-TCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAA
* * * * * *
150038 ATTAGTATTATTTTAATTGGAATAAGCTTGTTTGAACAAAAACAATCATTTTA-GAACAAAACAA
191 ATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATTATTTTATG-ACAAAACAA
* * * * ** * *
150102 AAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTAAAATAGTCAAAACTATTTGAAC-TAGTTT-GA
254 AAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTAG-
* *
150165 TAAATAGATT-TTTTTAAATCTC----TTATTAATTGTCAA
317 TAAAGAGATTATTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTGTCGA
* * * * * * *
150201 AATATTAATAGA-TAAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAA-TATTATTTTAATTCGAATAAACTTACATGAAC-AAAACAATTGTTTTA
* * * * *
150265 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATCATAATTATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
** * * * *
150330 CCAG-TTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
129 CTTGATCA-ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA
* * ** * * * *
150394 TTCA-TTTTACTTTATTCCAAATAAACTAGTATGGATTTAGAAAAACTTATTTTATGATAAAACA
192 TT-AGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTAT-GA-ATAGAAAAA-TTATTTTATGACAAAACA
* * ** * * * * * * * ** **
150458 AAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATATTTATTCACATAGTCGTAAATATTTAAAAATGGTTCGG
253 AAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-GAACTTATTTAG
* * * * * *
150523 CAAACAAATTTATTTTTTAAT-TCTCTTAGTTATTAATTTTTGA
317 TAAAGAGA-TTATTTTTAAATCTCT-TTA-TTATTAATTGTCGA
* ** * * * * ** * ***
150566 AATATTATTGGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAGTAATAAATTTAT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTACATGAACAAAA-CAATTGTTTTAT
* * * * * * ** * * *
150631 AATAAAAC-AAAAGTTTATAGCCATTTGAAGTTTACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA
65 GACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA
** *** * *
150695 C-CAATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAA
129 CTTGA-TCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA
** * * * * ** ** *
150755 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATGTTAAAAAAAACAATTGTTACATGACCTAATAA
192 TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATG--AATAGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAA
* * ** * * *** * *
150820 AAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGACATAG-CTATAACTATTTGAACTCGCTCAAT
254 AAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTATTTAGT
* ** * * *
150884 AAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACACACTAATTTTTGA
318 AAAGAGA-TTA-TTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTGTCGA
* * ** * * *
150926 AATTTTAATAAATTAATATTATTTT-ATTATGAATAAACCTTTTATTAATAGAAACAATTGGTTT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CGAATAAA-CTTACATGAACA-AAACAATTGTTTT
* * * * * * *
150990 ATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTGAAAGAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTG
63 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
* ** * * * * *
151055 AAC-TGTTTTGACAAATACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAAGTTTTGAAATATTATTA
127 AACTTG-ATCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATA
** * * * * * * * *
151115 AATTAGTA-TATTTTATTCCAAAACAAGTTTATGTGAATTGAAATAATTATTTTATAATAGAACA
190 AATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATTATTTTATGACAAAACA
* * * ** *
151179 AAAGGTTATAACGATTTGAAATAGAT-A--A-T----T-GT-TTAA--ATTGGAA-TTGGTTCGA
253 AAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAG-
* * * *
151231 TAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTC-CTACTTATTAATTTTTGA
317 TAAAGAGA-TTA-TTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTGTCGA
* * * * ** ** * *
151273 AATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGATGAC-AAATAATTATTTTA
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTACATGA--ACAAAACAATTGTTTTA
* * ** * * * *
151337 TGATAAAAC-AAAAGTTTATAATAATTTGAAATGGATAATTATTCTAATAGCCATAATTATTTGA
64 TGACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
** *** * ** *
151401 AC-TGATTGGATAAATTGACTTATTTTTTAAATC-TCAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAA
128 ACTTGA-TCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAA
* * ** * * * * * * *
151464 AGTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAATAGTT-GTTTACGATAAAATAAA
191 ATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAA
* *** * * * ** * * **
151528 AGGTCATATTTATTTCAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTTGTAACTATTCGAACTTGTTCGGTAA
255 AGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAA
* * * *
151593 ACAGATTTATTTTTTTTTTAAATTTCTTGT-TTATTAATTTTCTA
320 AGAGA-TTA-----TTTTTAAATCTCTT-TATTATTAATTGTCGA
* *
151637 AATGTTAATAAATCAATATTATTTT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTT
151662 TTTTAATAAG
Statistics
Matches: 1691, Mismatches: 383, Indels: 206
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
345 62 0.04
346 34 0.02
347 95 0.06
348 62 0.04
349 9 0.01
350 3 0.00
351 2 0.00
352 1 0.00
354 8 0.00
355 59 0.03
356 123 0.07
357 66 0.04
358 10 0.01
359 31 0.02
360 123 0.07
361 381 0.23
362 312 0.18
363 124 0.07
364 61 0.04
365 120 0.07
366 5 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTACATGAACAAAACAATTGTTTTATG
ACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
TGATCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAG
TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTA
TAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAAGAGAT
TATTTTTAAATCTCTTTATTATTAATTGTCGA
Found at i:150102 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 149087--151686 Score: 1253
Period size: 181 Copynumber: 14.5 Consensus size: 181
149077 CAGAAAATAG
* * * *
149087 ATTTATTTTTTAAAATT-TTTACTAATTAATT-TTGGAATATTAAGAAAATTAA-ATTATTTT-A
1 ATTTA-TTTTT-AAATTCTTTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAA-TAAATTAATATTATTTTAA
* * * * *
149148 TTCGAAATAAGCTTGCATGAA-CAAAACTAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAA-TT-TCATAATG
63 TTCG-AATAAGCTTGTATGAATAAAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAAT-
* **
149209 TTTAATGATAGTTAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTA-TTCAATAAACAA
125 TTGAA--ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* ** * * * * *
149267 ATTCT-TTTTTTAATTCTCTAGCTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACT
1 ATT-TATTTTTAAATTCT-TTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
** * * * * * ** *
149331 TTAAATAAGCTTCTACGAACT-GAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAATGGTTATAATAATTTG
64 TCGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTG
* * * * * * *
149395 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTT-GTTCATTAAGCAT
128 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
*
149448 ATTTATGTTTTAAATT-TTTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
1 ATTTAT-TTTTAAATTCTTTT-CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * *
149512 TCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGA
64 TCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGA
* ** * **
149577 AATAAATAATTGTTCAAATACTCATAACGATTTGAACTT-GATCGGTAAACAA
129 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* *
149629 ATTTATTTTTTAAA-TCTTTTACTTATTAATTGTCT-TAATATTAATAAATTTATATTATTTT-A
1 ATTTA-TTTTTAAATTCTTTT-CTTATTAATTGT-TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAA
* * ** * * *
149691 TTTGAAAAAAAGCTTGTATGAATAGAAAA-TTTTATTTTATGACGAAACAAAAGGTTATAGCAAT
63 TTCG--AATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAAT
* * * * * * * * *
149755 TTCAAATAGATAATTTTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTA-TTTAGTAAAGAG
125 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* * * *** *
149811 ATTCATTTGTAAA-TCTCTTTATTATTAATT-TTGTGTTATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTAAATTCT-TTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT
* ** * * * ** * *
149874 CGAATACGCTTACATAAATTAAAACAATTTTTTTATGATTAAACAAAAAGTTGTAACGATTTGAA
65 CGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAA
* * * * *
149939 ATATATAATTTTTCAAATAGTCATGATTATTTG-ATTTAGTTCAATAAACAT
130 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* * * *
149990 ATTTATTTTTAAAAATTCTTTTGTTATTAATTGTTGATATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTT--AAATTCTTTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * * * * *
150055 TGGAATAAGCTTGTTTGAACAAAAACAATCATTTTA-GAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG
64 TCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATG-ACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTG
* * * * ** * *
150119 AAATAAATAATTGCTAAAATAGTCAAAACTATTTGAAC-TAGTTTGATAAATAG
128 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
** * * *
150172 A-TT-TTTTTAAA-TC---TCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAGA-TAAGTATTACTTTATTT
1 ATTTATTTTTAAATTCTTTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAA-TATTATTTTAATT
* * * * * * * * * **
150230 TGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
65 CGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAA
* * * * * *
150295 ATAGATAACTATTCAAATAATCATAATTATTTGAAC-CAGTT-AGGTAAACAA
130 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCA-ATAAACAA
* * * * * * *
150346 AATTATTTTTTAAA-TCTTTTAATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTCATTTTACTTT-AT
1 ATTTA-TTTTTAAATTCTTTT-CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * * * * * * **
150409 TCCAAATAAACTAGTATGGATTTAGAAAA-ACTTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGAT
64 T-CGAATAAGCTTGTAT-GA-ATA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAAT
* * * * * * ** * ***
150473 TTGAAATAAATATTTATTCACATAGTCGTAAATATTTAAAAATGGTTCGGCAAACAA
125 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* ** * * ** * *
150530 ATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTGGATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTAAATTCT-TTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT
* * ** * * * * * *
150595 CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAGTAATAAATTTATAATAAAAC-AAAAGTTTATAGCCATTTGA
65 CGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TTATAACAATTTGA
* ** * * * * * *** *
150659 AGTTTACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-CAATTTGGTAAATAA
129 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* * *
150711 ATTTATTTTTTAAA-TC---TCTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATT
1 ATTTA-TTTTTAAATTCTTTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT
* * * * ** ** * * **
150771 CCAAATAAGCTTGAATGTTAAAAAAAACAATTGTTACATGACCTAA-TAAAAGATAATAATGATT
65 -CGAATAAGCTTGTATG--AATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TTATAACAATT
* * * * * * * *
150835 TGAAATAGATAATTATTGACATAG-CTATAACTATTTGAAC-TCGCTCAATAAACAG
126 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
** * * *
150890 ATTTATTTTTTAAA-TCTTTTACACACTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTT-AT
1 ATTTA-TTTTTAAATTCTTTT-CTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * * * * ** *
150953 TATGAATAAACCTTTTATTAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTT
64 T-CGAAT-AAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAA-TT
* * * * * ** * * *
151018 TGAAAGAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAAC-T-GTTTTGACAAATAC
126 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAG-TTCAATAAACAA
* *
151073 ATTTATTTTTTAAA-TC---TCTTATTAAGTT-TTGAAATATTATTAAATTAGTA-TATTTT-AT
1 ATTTA-TTTTTAAATTCTTTTCTTATTAA-TTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * * * * ** * * * * * *
151131 TCCAAAACAAGTTTATGTGAATTGAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACGATTT
64 T-C-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTT
* * * *
151196 GAAATAGATAATTG------T--T--TAA--ATTGGAA-TTGGTTCGATAAAC-A
127 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* * * * * *
151237 ATTTATTTTTTAAA-TCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATT
1 ATTTA-TTTTTAAATTCT-TTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * * * * *
151301 TCAAATAGGCTTGTATG-ATGACAAATAATTATTTTATGATAAAAC-AAAAGTTTATAATAATTT
64 TCGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TTATAACAATTT
** * * * * ** ***
151364 GAAATGGATAATTATTCTAATAGCCATAATTATTTGAACTGA-TTGGATAAATTG
127 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
* *** * * *
151418 ACTTATTTTTTAAA-TCTCAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-ATT
1 ATTTA-TTTTTAAATTCTTTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT
* * ** * * * * * * * * *** *
151481 CCAAATAAGCTTTTATGAATTGAAATAGTT-GTTTACGATAAAATAAAAGGTCATATTTATTTCA
65 -CGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGA
* * ** * * **
151545 AATAGATAGTTGTTCAAATAGTTGTAACTATTCGAACTT-GTTCGGTAAACAGA
129 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACA-A
* * * * *
151598 TTTATTTTTTTTTTAAATTTCTTGT-TTATTAATT-TTCTAAATGTTAATAAATCAATATTATTT
1 ---A-TTTATTTTTAAA-TTCTTTTCTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTT
**
151661 T--TTTTAATAAGCTTGTATGAATAAAA
60 TAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAA
151687 TGATTTGAAA
Statistics
Matches: 1868, Mismatches: 442, Indels: 218
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
164 16 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATTTATTTTTAAATTCTTTTCTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC
GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAA
TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTAGTTCAATAAACAA
Found at i:150603 original size:539 final size:537
Alignment explanation
Indices: 149353--150770 Score: 1347
Period size: 539 Copynumber: 2.6 Consensus size: 537
149343 CTACGAACTG
* * * ** * ** * *
149353 AAACAATTATTTTATTACAAAAGAAATGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
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* * * * * ** * * * * *
149418 CATGACTATTTGAACTTGTTCATTAAGCATATTTATGTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCG
66 CATAAATATTTAAAATAGTTCAACAAACAAATTTAT-TTTTAAATTCTTTAGTTATTAATTGTTG
* * * * *
149483 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTA
130 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATAATTTTA
* * *
149548 TG-ACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATACTCATAACGATTTGA
195 -GAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * **
149612 ACTTGATCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAA
259 ACTAGTTTGGTAAATAAA-TTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA
* * * *
149677 TTTA-TATTATTTTA-TTTGAAAAAAAGCTTGTATGAATAGAAAATTTTATTTTATGACGAAACA
319 -TTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAAAGCTTATATGAACAGAAAAATTTATTTTATGACAAAACA
* * * * * * *
149740 AAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTTTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTATTTAGT
383 AAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAACTATTCAAACAATCATAATTATTTAAACTCAGTTAGT
* * ** *
149805 AAAGAGATTCATTTGTAAATCTCTTTATTATTAATTTTGTGTTATTAATAAATTAATATTATTTT
448 AAAAAAATTCATTTGTAAATCTCTTTATTATTAATTTTGTAATATTAATAAATTAATATTACTTT
* * **
149870 ATTTCGAATACGCTTACATAAATTA
513 ATTCCAAATAAACTTACATAAATTA
* * ** *
149895 AAACAATTTTTTTATGATTAAACAAAAAGTTGTAACGATTTGAAATATATAATTTTTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGT
* * * ** * * *
149960 CATGATTATTTGATTTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAAATTCTTTTGTTATTAATTGTT
66 CATAAATATTTAAAATAGTTCAACAAACAAATTTATTTTT--AAATTCTTTAGTTATTAATTGTT
* * * * *
150025 GATATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAATTGGAATAAGCTTGTTTGAACAAAAACAATCATTTT
129 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATAATTTT
* * *
150090 AGAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTAAAATAGTCAAAACTATTTGA
194 AGAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
150155 ACTAGTTTGATAAATAGA-T-TTTTTTAAATCTCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAGATAAGT
259 ACTAGTTTGGTAAATAAATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGT
* * *
150218 ATTACTTTATTTTG-AACAAA-CTTATATGAACA-AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
324 ATTATTTTATTTTGAAAAAAAGCTTATATGAACAGAAAA-ATTTATTTTATGACAAAACAAAAGG
** * * *
150280 TCATAATGATTTGAAATAGATAACTATTCAAATAATCATAATTATTTGAAC-CAGTTAGGTAAAC
388 TCATAACAATTTCAAATAGATAACTATTCAAACAATCATAATTATTTAAACTCAGTTA-GTAAA-
* * *
150344 AAAATT-ATTTTTTAAATCT-TTTAATTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTCATTTTACTT
451 AAAATTCA-TTTGTAAATCTCTTT-ATTATTAATTTTGT--AATATTAATAAATTAATATTACTT
* * *
150406 TATTCCAAATAAAC-TAGTATGGATTTA
512 TATTCCAAATAAACTTA-CAT-AAATTA
* *
150433 GAAA-AACTTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT-ATTTATTCACAT
1 -AAACAA-TTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTT-TTCAAAT
* * ** *
150496 AGTCGTAAATATTTAAAAATGGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATT
63 AGTCATAAATATTT-AAAATAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTAAATTCT-TTAGTTATTAATT
* * ** * * ** *
150561 TTTGAAATATTATTGGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAGTAATAAA
126 GTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATAAT
* * * * * * ** * *
150626 TTTATAATAAAAC-AAAAGTTTATAGCCATTTGAAGTTTACAATTGTTTAAATAGTCATAACTAT
191 TTTAGAACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTAAAATAGTCATAACTAT
* * * ** *
150690 TTGAACCAATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAA
255 TTGAACTAGTTTGGTAAATAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA
150755 TTAGTATTATTTTATT
319 TTAGTATTATTTTATT
150771 CCAAATAAGC
Statistics
Matches: 716, Mismatches: 137, Indels: 46
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
534 8 0.01
535 85 0.12
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537 36 0.05
538 21 0.03
539 186 0.26
540 32 0.04
541 6 0.01
542 132 0.18
543 144 0.20
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (537 bp):
AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGT
CATAAATATTTAAAATAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTAAATTCTTTAGTTATTAATTGTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATAATTTTAG
AACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAAC
TAGTTTGGTAAATAAATTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTTTGAAAAAAAGCTTATATGAACAGAAAAATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
TAACAATTTCAAATAGATAACTATTCAAACAATCATAATTATTTAAACTCAGTTAGTAAAAAAAT
TCATTTGTAAATCTCTTTATTATTAATTTTGTAATATTAATAAATTAATATTACTTTATTCCAAA
TAAACTTACATAAATTA
Found at i:151276 original size:168 final size:164
Alignment explanation
Indices: 151073--151376 Score: 400
Period size: 168 Copynumber: 1.8 Consensus size: 164
151063 TGACAAATAC
*
151073 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTAGTAT-ATTTTATTCCAAA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTCC-AA
* * *
151137 ACAAG-TT-TATG-TGAATTGAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
65 ACAAGCTTGTATGATG-A--CAAATAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
151199 ATAGATAATTGTTTAAATTGGAATTGGTTCGATAAACA
127 ATAGATAATTGTTTAAATTGGAATTGGTTCGATAAACA
* *
151237 ATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTC
* * * * *
151302 CAAATAGGCTTGTATGATGACAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAGTTTATAATAATTTGAA
62 CAAACAAGCTTGTATGATGACAAATAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
*
151367 ATGGATAATT
127 ATAGATAATT
151377 ATTCTAATAG
Statistics
Matches: 120, Mismatches: 12, Indels: 12
0.83 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
164 14 0.12
166 1 0.01
167 2 0.02
168 85 0.71
169 11 0.09
170 5 0.04
171 2 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.10, T:0.44
Consensus pattern (164 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTCCAAA
CAAGCTTGTATGATGACAAATAATTATTTTATAATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAG
ATAATTGTTTAAATTGGAATTGGTTCGATAAACA
Found at i:152824 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 152786--152829 Score: 54
Period size: 20 Copynumber: 2.2 Consensus size: 20
152776 GTAAACACAA
* *
152786 TAATTTTTTAAATCTCTTAT
1 TAATTTTTGAAATATCTTAT
152806 TAATTTTTGAAATAT-TTAT
1 TAATTTTTGAAATATCTTAT
*
152825 AAATT
1 TAATT
152830 CATTTTATTT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 3, Indels: 1
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
19 8 0.38
20 13 0.62
ACGTcount: A:0.36, C:0.05, G:0.02, T:0.57
Consensus pattern (20 bp):
TAATTTTTGAAATATCTTAT
Found at i:154321 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 152725--156098 Score: 1485
Period size: 180 Copynumber: 18.7 Consensus size: 179
152715 ATGTTTTTTA
* * * * * *
152725 AATTTAAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATGATTATTTGAACTAGTTATGTA-AA-CACAATA
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TG-ACAATCAC-TTT
* * *
152788 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTTATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTGA
63 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATTTGA
* * ** * * ** * *
152848 GTAAGCTAGTATGAATTGAAA-ACATTATTTGATTCCAAACAAAAGGTAATAAC
127 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAC
* * * * * * ** *
152901 CATTTGAAATTGATAATTGTTGAAAT-GACCATAATTATTTGAACT-GATTCGGTAAACA-TATT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTAG-TTTGACAATCACT-TT
* * ** * *
152963 CACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCA
63 -ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-G
* * * *
153027 AATAAACTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTCATAATG
126 AATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACA-AAAAAAAGGTCATAA-C
** * * * * * * * *
153083 GTTTTG-AATAGAACAACTTGTT--AATAGTC-TAAGTACTAG-A--A-TTTCATAA-AAATTTA
1 AATTTGAAATAG-ATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAATCACTTTA
* * * * *
153139 TTTTCTTTAAA-CTCTTGCTTATTTAATTTTGGGGAAATATTAAGGAAATAAGTATTATTTTATT
64 -TTT-TTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTT--TGAAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTAAT
* * ** ** *
153203 TTGGATAAGGCTTTTATGATATTGAAACAATTGTTTTAATCTCCAAACAAAAGGTCATAAC
123 TTGAATAA-GCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTT-AT-GACAAAAAAAAGGTCATAAC
* * * * * * ** * * * **
153264 AATTTTTAAACAAAATAA-TGTTCAAATGGTAATAACTATTTTAGGTTGGTTCGATAGA-CAGAA
1 AA-TTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTAGTTTGACA-ATCA-CT
* * * * * * *
153327 TTATTTTTTAAATCTTTTGGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTACATAAATTTGGATAAATTT-AT
61 TTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTAAT
* * * * * * * *
153390 TTCGAATAAGCTTTGATAAGATA-TGAAACACACATATTTCATGACTAAACAAGAGGTCAAAAC
123 TT-GAATAAGC-TTG-TATGA-ACAGAAACA-A-TTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAAC
* * * ** * * *
153453 AATTTAAAATAGAT-ATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAA-TGGGTTTGGCAAACACATTTA
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGACAATCAC-TTTA
* **
153516 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAA-CCGAA
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAATTTGAA
** * * * * * **
153580 TAAGCTTCAATGATCAGAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAATGATTTTAAC
128 TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAC
* * * *
153632 AATTT-AGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-GATTTGGTA-AAT-AGATT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTT-G-ACAATCA-CTT
* * * * * * *
153693 TATTTTTTAAATTTGTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAACAAAATAGTATTATTTT-ATTTCA
62 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-G
* *
153757 AATAAGCTTGTATGATCA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAC
126 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAAC
* * * ** * * * * * ** * *
153811 GATTTGTAATAGACAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTAATTCAATAAACA-TATTCA
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAATCACT-TT-A
* * * ** * * **
153875 TTTTTTAAATTTCTTACATAATAA-TTAGGAAATATTAATAAATGAGTATTATTTTATTTTGTCT
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAAT
* * * * * *
153939 ATGCTTGTATTAACTGAAACAATTG-TTTATGACAAATCAAAAGGTTATAAT
129 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-AAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * * * * *
153990 GATTTTAAATTGACAATTGTTCAAATAATAAAAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACATATTTAT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAATCA-CTTTAT
* * * * *
154055 TTTTTAAAATCTCTTTCTTTTTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAAT
65 TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAAT
* *
154120 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAGAAAAAGGTCAGAAC
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* * *
154172 AATTTGAAATATG-TAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTCTGACAATCACTTTAT
1 AATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAATCACTTTAT
** * * *
154236 TTTTTAAATCTCTTACTTACAAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATA
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATA
* * * * * * **
154301 GGCTTTTATGAAAAGAAACAAATGTTTTATAACAAAATAAATATCATAAC
130 AGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
154351 GATTTGAGATAGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTTGTTTGAAAAAT-AGATTTA
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTG-ACAATCA-CTTTA
* ** ** * * *
154415 TTTTTTAAAAT-TTTTA-TATAGATTTGTTTTT-AAA-ATTTTTTACTTA-T-TAACTTTTAAAA
64 TTTTTT-AAATCTCTTACT-T--ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTT--AA
** * * **** ** * *
154474 TATT-AATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGATTAGAAACAATTGGTTTATA
122 T-TTGAATAAGCTTGTATGAACAGA-AAC-AAT-TG-TTTTATG-------AC---------A-A
154538 ACAAAACAAAAGGTCATAAC
165 A----A-AAAAGGTCATAAC
* * * * * *
154558 TATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GTTTAGA-AAACAAATTTA
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GACAATC-ACTTTA
* * * * *
154621 TTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAAGTTTTGCAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTCAGA
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATT-TGA
* * * * *
154683 ATAAGCTTGTATGAATATAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
127 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAAC
* * * *
154737 GATTTGAAATCGATATTTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTTGTTTTGTA-AA-CA-TATT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTG-ACAATCACT-TT
* * * * *
154798 CATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTATATTTTGA
63 -ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA
* * * ** * * * * * * *
154863 ATGAGCCTATATGAATTGATAGAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCGTGAT
127 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAAAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
154917 AATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATCACTATTTGAACTAGTTCAGTA-AA-CATATTT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TG-ACAATCA-CTTT
* * * * * **
154980 ATTTTTAAAATCTTTTTGCTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCA
63 ATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTG
* * * *
155044 AAAAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAAC
126 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAG-GTCATAAC
* *
155099 GATTTG--A-A-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGATAA--AC-TTAT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGACAATCACTTTAT
* * * *
155156 TATTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTTG-AATATTAATAAATTTGAATTATTTTAA-TTGA
65 T-TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTG-
* * * * **
155219 AATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGT
126 AATAAGCTTGTATGAACAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAAC
* * * * ** * * * *
155275 GATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTCTTCGATAAAT-AGATTCA
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-CAATCA-CTTTA
* * *
155339 GTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTA-TTT-ATTCTGAA
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAA
* * ** * * * * *
155402 TTAGCTTATACAAACAGAAACAGTTGTTTTGTGACAAAACAAAGATCATAAT
128 TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAC
* * * * * ** * * *
155454 GATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTATAGCTATTTGTACTAGTCAAGCCAA-CAGATTAA
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT-TTGACAATCA-CTTTA
* * * * * * *
155518 TATTTTAAATCTGTTACTTAGTAATTTTTGGAATATTAACAAATTA-TGATTACTTT-ATTTCAA
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTAATTT-GA
* * * * * *
155581 ATAATAC-AGTATCAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAC
127 ATAA-GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAAC
* * * * * * * * ** * * *
155635 TATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGACCTGGTTTGGTAAACAAATTGAT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAATC-ACTTTAT
* * * * *
155700 ATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCAAAC
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAAT
* * * * * *
155760 AAACTTATATGAACACAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAT
129 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAAC
* * * * * * * * * * *
155812 GATTTGAAATAGATAATTATTCACATAGCCCTAACTATTTGAATTGGTTCGGCAAACAAATTTAT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAATC-ACTTTAT
* * *
155877 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA----T----T-TTCAT--A--A-TATTATTTTATTTTGAATA
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATA
* * * * * * *
155928 AACTTGCATGAACATAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAAT
130 AGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAAC
* * * * *
155979 GATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAGCTA-TTGAACTAGTTT-ACTAAGT-ATATTT
1 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGAC-AA-TCA-CTTT
* * *
156041 ATTTTTTAGATCACCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
63 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
156099 TTACAAATAG
Statistics
Matches: 2417, Mismatches: 577, Indels: 404
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
165 2 0.00
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170 2 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGACAATCACTTTATT
TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAA
GCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAC
Found at i:154456 original size:26 final size:26
Alignment explanation
Indices: 154406--154454 Score: 82
Period size: 25 Copynumber: 1.9 Consensus size: 26
154396 TGTTTGAAAA
*
154406 ATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTAT
1 ATAGATTTAGTTTTTAAAATTTTTAT
154432 ATAGATTT-GTTTTTAAAATTTTT
1 ATAGATTTAGTTTTTAAAATTTTT
154455 TACTTATTAA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 1
0.92 0.04 0.04
Matches are distributed among these distances:
25 14 0.64
26 8 0.36
ACGTcount: A:0.33, C:0.00, G:0.06, T:0.61
Consensus pattern (26 bp):
ATAGATTTAGTTTTTAAAATTTTTAT
Found at i:154622 original size:206 final size:205
Alignment explanation
Indices: 154266--154635 Score: 480
Period size: 206 Copynumber: 1.8 Consensus size: 205
154256 AAATTTTTGG
* * * * * *
154266 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAGGCTTTTATGAAAAGAAACAAATGTTTTAT
1 AATATTAATAAAATAGTATTATTTTAATCTAAATACGCTTGTATGAAAAGAAACAAATGGTTTAT
* * * * * *
154331 AACAAAATAAATATCATAACGATTTGAGATAGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACT
66 AACAAAACAAATATCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTCAACT
154396 TGTTTGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTATATAGATTTGTTTTTAAAATTTTTTACTTA
131 TGTTTGAAAAATAGATTTATTTTTT-AAATTTTTATATAGATTTGTTTTTAAAATTTTTTACTTA
154461 TTAACTTTTAA
195 TTAACTTTTAA
* ** *
154472 AATATTAATAAAATAGTATTATTTT-ATTTCAAATACGCTTGTATGATTAGAAACAATTGGTTTA
1 AATATTAATAAAATAGTATTATTTTAATCT-AAATACGCTTGTATGAAAAGAAACAAATGGTTTA
* *
154536 TAACAAAACAAA-AGGTCATAACTATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGA
65 TAACAAAACAAATA--TCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTCA
*
154600 AC-TGTTTAGAAAACA-A-ATTTATTTTTTTAATTTTTA
128 ACTTGTTT-GAAAA-ATAGATTTATTTTTTAAATTTTTA
154636 CTTATTAAGT
Statistics
Matches: 140, Mismatches: 19, Indels: 11
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Matches are distributed among these distances:
205 12 0.09
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Consensus pattern (205 bp):
AATATTAATAAAATAGTATTATTTTAATCTAAATACGCTTGTATGAAAAGAAACAAATGGTTTAT
AACAAAACAAATATCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTCAACT
TGTTTGAAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTATATAGATTTGTTTTTAAAATTTTTTACTTAT
TAACTTTTAA
Found at i:155484 original size:537 final size:531
Alignment explanation
Indices: 154434--156105 Score: 1516
Period size: 537 Copynumber: 3.1 Consensus size: 531
154424 ATTTTTATAT
* * *
154434 AGATTTGTTTTTAAAAT-TTTTTACTTATTAACTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTA
1 AGATTTATTTTTAAAATCTTTTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * * * * *
154498 TTTCAAATACGCTTGTATGATTAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAA-AGGTCATAACTATT
65 TTTCAAAAAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-GTCATAACTATT
* * *
154562 TAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGTTTAGA-AAACAAATTTATTTTT
129 T-AAA-A-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTTGATAAACAAA-TTA-TTTT
* *
154626 TTAATTTTTACTTATTAAGTTTTGCAATATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTCAGAATAAGCT
188 TAAATTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTCA-AATAAGCT
* * * *
154690 TGTATGAATATAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATCGATATTT
251 TGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
154755 GTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTTGTTTTGTAAACATATTCATATTTTAAATCTCTTACTC
316 GTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATT-TTTCGTAAACAAATTCAT-TTTTAAATCTCTTACTT
* ** ** *
154819 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTATATTTTGAATGAGCCTATATGAATTGATA
378 ATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTATATTCTGAATGAGCCTATACAAACAGAAA
* ** * * * *
154884 GAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCGTGATAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
442 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
*
154949 CA-CTATTTGAACTAGTTC-AGTAAAC
507 -AGCTATTTGAACTAG-TCAAGCAAAC
* *
154974 ATATTTATTTTTAAAATCTTTTTGCTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTT
1 AGATTTATTTTTAAAATCTTTTTACTTATTAATT-T-TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT
* * * *
155038 AATTCAAAAAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAACGATT
64 ATTTCAAAAAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAACTATT
* ** *
155103 T-GAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACTTATTATTTTAAAAT
129 TAAAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTTGATAAACAAATTATTTTTAAA-
*
155167 TTTTTACTTATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTTGA-ATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTA
192 TTTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTT-ATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTA
* * * *
155231 TGAATAGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAATTGTT
255 TGAATA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* *
155296 CAAATAGTCATAACTATTTAAATTTCTTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTATT
319 CAAATAGTCATAACTATTTAAATTT-TTCG-TAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTCTTACTTATT
* *
155361 AAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGA-ATTATT-TATTCTGAATTAGCTTATACAAACAGAAACA
381 AA-TTTTGAAATATTAATAAATTA-ATATTATTATATTCTGAATGAGCCTATACAAACAGAAACA
* * * * *
155424 GTTGTTTTGTGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTATAG
444 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAG
* *
155488 CTATTTGTACTAGTCAAGCCAAC
509 CTATTTGAACTAGTCAAGCAAAC
* * * ** * *
155511 AGATTAATATTTT-AAATC-TGTTACTTAGTAATTTTTGGAATATTAACAAATT-ATGATTACTT
1 AGATTTAT-TTTTAAAATCTTTTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAAT-ATTATTT
* * *
155573 TATTTCAAATAATA-C-AGTATCAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATG-GTCATAAC
63 TATTTCAAA-AA-AGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GAGTCATAAC
* * * * * *
155635 TATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGACCTGGTTTGGTAAACAAATTGAT
125 TATTT--AA-AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTTGATAAACAAATT-AT
* * * * *
155700 ATTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAA
185 -TTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTCAAATAA
* * * * * * *
155762 ACTTATATGAACACAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATA
248 GCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * * *
155827 ATTATTCACATAGCCCTAACTATTTGAATTGGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
313 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-TTTC-GTAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTCTTA
* * ** *
155892 GTTATTAATTTT----CA-TAAT--A-T--TATT-TTAT-TT-TGAAT-AAACT-TGCATGAACA
375 CTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTATATTCTGAATGAGCCTATACA--AACA
* * * * * * *
155942 TAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAG
438 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** **
156007 TCATAGCTA-TTGAACTAGTTTA-CTAAGT
503 TTATAGCTATTTGAACTAGTCAAGC-AAAC
* * * *** * *
156035 ATATTTATTTTTTAGATC-ACCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 AGATTTATTTTTAAAATCTTTTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
*
156099 TTACAAA
65 TTTCAAA
156106 TAGGCTTATA
Statistics
Matches: 938, Mismatches: 150, Indels: 104
0.79 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
522 3 0.00
523 7 0.01
524 91 0.10
525 48 0.05
526 4 0.00
528 1 0.00
529 1 0.00
531 4 0.00
532 1 0.00
535 3 0.00
536 96 0.10
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542 8 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (531 bp):
AGATTTATTTTTAAAATCTTTTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT
TTCAAAAAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAGTCATAACTATTTA
AAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTGATAAACAAATTATTTTTAAATTTT
TACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATA
AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTAAATTTTTCGTAAACAAATTCATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAA
TATTAATAAATTAATATTATTATATTCTGAATGAGCCTATACAAACAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACTA
GTCAAGCAAAC
Found at i:155879 original size:718 final size:708
Alignment explanation
Indices: 154441--184513 Score: 4387
Period size: 719 Copynumber: 42.2 Consensus size: 708
154431 TATAGATTTG
* * *
154441 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAACTTTTAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-TTTT-TAATATTAAT-AAATTG-ATTATTTTA-TTGAAAT
* * * * * * *
154506 ACGCTTGTATGATTAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTAAAATAG
61 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAG
* * * *
154570 ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGTTTAGA-AAACAAATTTATTTTTTTAAT-TT
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGTTT-GATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * **
154633 TTACTTATTAAGTTTTGCAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAGAATAAGCTTGTATGA
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATACAA
* * * * * *
154697 ATATAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATCGATATTTGTTCAAA
251 ACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* *** * * * *
154762 TAGTCAAACTATTTGAACTTGTTTTGTAAACATATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTT
316 TAGTCAAACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTAATTT
* ** * * * * * * *
154827 TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTATATTTTGAATGAGCCTATATGAATTGATAGAATTGTT
381 TTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATATCAATAGAAACAATTATT
** * * * * * *
154892 TTATGATGAAACAAAAGGTCGTGATAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATCACTATTT
446 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTAATT
* *
154957 GAACTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTTGCTTATTAATTGTCTAAATATTAAT
511 GAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATC---TTGCTTATTAATTGTCTAAATATTAAT
*
155022 AAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
573 AAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * *
155087 AAGAGTCATAACGATTTGAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAAC
638 AAAAGTCATAACGATTTGAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAAC
**
155152 TTATTA
703 AAATTA
155158 -TTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTTGAATTATTTTAATTGAAAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-TTT-AATATTAATAAA-TTG-ATTATTTT-ATTGAAAT
* *
155222 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAG
61 AAGCTTGTATGAATAG-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * *
155287 GTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTCTTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAATCTC
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAACTGT-TT-GATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * *
155352 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTATTCTGAATTAGCTTATACAAAC
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTATTCAGAATAAGCTTATACAAAC
* * * *
155417 AGAAACAGTTGTTTTGTGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATA
253 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
155481 GTTATAGCTATTTGTACTAGTCAAGCCAACAGATTAATATTTTAAATCTGTTACTTAGTAATTTT
318 GTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTAATTTT
* *
155546 TGGAATATTAACAAATT-ATGATTACTT-TATTTCAAATAATAC-AGTATCAATAGAAACAATTA
382 TGAAATATTAACAAATTAAT-ATTA-TTATATTTCAAATAAGACTA-TATCAATAGAAACAATTA
* * *
155608 TTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACT-ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTA
444 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTA
* * ** *
155672 ATTGACCTGGTTTGGTAAACAAATTGATATTTT-AAATC-T-CTTATTAATT-TTTAAAATATTA
508 ATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGAT-TTTTAAAATCTTGCTTATTAATTGTCT-AAATATTA
* * * *
155733 ATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAA-CTTATATGAACACAAACATTTGTTTTATGACAAA
571 ATAAATTAATATTATTTTAATTCAAA-AAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * *
155797 ACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCACATAGCCCTAACTATTTGAA-TTGGTT
635 ACAAAAAGTCATAACGATTTG--A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTT-ATT
*
155861 CGGCAAACAAATTTA
695 CGACAAACAAA-TTA
* * * * * *
155876 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTT--CA-TAAT--ATT-ATT-TTATT-TTG-AATAAAC
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAATATTAATAAATTGATTATT-TTATTGAAATAAGC
* * * * * *
155931 TTGCATGAACATAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAAT
65 TTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * *
155996 TATTCAAATAGTCATAGCTATTGAACTAGTTT-ACTAAGTATATTTATTTTTTAGATCACCTACT
130 TATTCAAATAGTCATAACTATTTAACT-GTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * *
156060 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACA-AATAGGCTTATATGATAA-A
193 TATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATT-CAGAATAAGCTTATA-CA-AACA
* * * * * *
156123 -AAA-AATTACTTTAAGACAAAACAAAAGTTTATAATG-TTTG--GTA-A-ACTT-TTCTTAAAT
254 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC--AAA-
* * * * * * * * * * *
156180 TTCTTGCTTATTAATTTTTTGAA-T-GTTAA-TAAA-ATAATATTATTTT--AT-T-TTGAATAA
316 ---TAG-TCA--AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTT-ACTCA
* * * * * * ** * * *
156237 G-CATGTAT-AAA-ATGAA-ACAATT--TTTTATGACTA-AACAAAAGGTTAA-AATGATTTAAA
374 GTAATTTTTGAAATATTAACA-AATTAATATTATTA-TATTTC-AAA---TAAGACT-ATAT-CA
* * * ** * ** * * ** * * * *
156294 ATAG--ATAATTATTCTAATAGTCTTAAC--TATTTGA-ACTTGTTTGACAAACACATTTATTTT
431 ATAGAAACAATTATT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAATAATTT-A-AAATA-AATAATTAT
* * * ** * * ** * * *
156354 TTAAAT-CTCT-T-ACTTATT--A-TTTTTTAG--AATATTTTTA-GTTTAGCAATATTTTGCTC
491 TCAAATAGT-TATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTA--AA-ATCTTGCT-
* * ** * * * *
156410 CGAATAA--G-CT-TGTATGAATAGAA--ACA-ATTATTTT-A-TGACAAAA-C--A-A-AGATC
551 -TATTAATTGTCTAAATATTAATA-AATTA-ATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATA-AAC
* *** * ** * * * * ***
156461 -ATAACAATT-TGAGATAGATAATTGTCCAAACAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCCGCAAATA
612 AAAAACAATTGTTTTAT-GACAA---AACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAATTATTCAAATA
* * * *
156524 G--------ATTT--AGTT-TT-TA-AATC----TC
673 GCCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTA
* * * *** * ** *
156543 TTATT--AATTTTTGGA-ATATTAATAAACTAGCATCATT-TTATTTTGA--A-TAT--T----T
1 TTTTTAAAATTTTT-TACTTATTAAT-TTTTA--AT-ATTAATAAATTGATTATTTTATTGAAAT
* ** * **
156595 ----TTGTATGAATA-AAAACAATT-TTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAAATTT-AAATA
61 AAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATA
* * * * * * *
156653 GATAATTGTTCGAATGGACA-AGACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
124 GATAATTATTCAAATAGTCATA-ACTATTT-AACTGT-TTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAAT
** * * * *
156716 CTCCAACTTATTAAATTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATTTCA-AATAAACTTAT
185 CTCTTACTTATTAAGTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTAT
** * * * ** *
156779 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGATCATAACAATTT-AAATTAAATAATTGT
247 ACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGT
* * * * ** * * * * *
156843 TTAAATAGTTATAACTATTTAAACTCGT-TTGATAAATAGATTTAT-TTTTCAAATCTTTTACTT
311 TCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAG-CAAACAGATTAATATTTT-AAATCTCTTACTC
* * * * * * * * *
156906 ATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATATG-CTTTTATGC-ATAG
373 AGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTC-AAATAAGAC-TATAT-CAATAG
** * * * * * * *
156968 AAACAATTGGTTTATGATAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAGATA-T
435 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * **
157032 TCATAACTATTTGAACGTA-TTCAGAAAATATATTTATTTTTTATATAT-TTATTTATTAATT-T
500 T-ATAACTAATTGAAC-TAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTA-AAATCTTGCTTATTAATTGT
* * * ** * * *
157094 TTGGAATATTAACAAATTTAA-ATTATTTT-ATTCGAAATAAA-CTTGCATGAACAGAACCAATT
561 CT-AAATATTAATAAA-TTAATATTATTTTAATTC-AAA-AAAGCTTATATAAACAAAAACAATT
* * * * * **
157156 GTTTTATGATAAAACTAAATGTCATAATGTTTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTA
622 GTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG----AAATAATTATTCAAATAGCCATAACTA
* ** *
157221 TTTAAACTTATTCAGTA-AAA-GGATTC
683 TTTGAACTTATTC-G-ACAAACAAATTA
** * * *
157247 TTTTTTTAATTTTGTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AATATTGTCTTACTTTAA
1 TTTTTAAAATTTT-TTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTGATTA-T-T-TTA-TTGAA
** * * * *
157311 ATAAGCTTACATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTG-CAAAAGAAAAGGTCATAGTGATTTGAAA
59 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAA
* * * * * *
157374 TTGATAATTATTCAAATAGCCATGATTATTTGAACT-TGTTCAGTAAATATATTTATTTTTTTAA
122 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGT-TTGA-TAAATAAATTTA-TTTTTTAA
* * *
157438 ATCTTTTACTTATTAA-TTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCA-AATAAACTT
183 ATCTCTTACTTATTAAGTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-ATTCAGAATAAGCTT
* * * * * * * ** * *
157501 GTATAAATAGAAACAAGTGTTTTATGTCAAAATAAAA-AGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATT
245 ATACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATT
** * * * * * * * * *
157565 ACTCAAATAGACATAA-TGATTTAAACTTGTTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTA
309 GTTCAAATAGTCA-AACT-ATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTT-AAATCTCTTA
* * ** * ** * * * * *
157628 CTTATTAACTACCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTGTGTGAA
370 CTCAGTAA-T-TTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAA
* * * *** * * * *
157690 TAGAAAAAATTATTTTATGAAAAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTTAAATAGATAATTGTTAAAA
432 TAGAAACAATTATTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAA
* * * * * * * * * * ** *
157755 CAGTCATAATTATTTAAACTTGTTAAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTATTGATT
496 TAGTTATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAAA-ATCTTGCTTATTAATT
* * * * * *
157820 -TTTAGATTATTACCA-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACTAAAACAAT
559 GTCTA-AATATTA--ATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAAT
* * * * * *
157883 TCTTTTATGAAAAAAC-AAAGGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAT
621 TGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTG--A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAAC
* * ** *** *
157947 TACTTGATCTGCTTCGGTGAACATATTTA
681 TATTTGAACTTATTCGACAAACA-AATTA
* ** *
157976 TTTTTAAAATTTTCTACTTATTAATTGTCGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-AAA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-T-TTAATATTAATAAATT-G-ATTATTTT-AT-TGAAA
* * * ** * * *
158040 T-AGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTAAAACAGAACCAAAA-GTCATAACGATTTGAAATA
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* ** * *
158103 AATAATTGCTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTTATTTTTTAAA--
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-GTTTGATAAATA-AATTTATTTTTTAAATC
* * ** * ** * * * **
158166 TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATACTAATAGTTTAGTATTACCTTATTTTGAACAAACATATATG
186 TCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATACA
* * * * * * *
158229 AACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGCT-AC
250 AACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-
* * * * * * * *
158293 AATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTAAGTAAACAGAATT-ATTTTTTAAATCT-TCTACTTATT
314 AATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAG-ATTAATATTTTAAATCTCT-TACTCAGT
* * ** * * * * *
158356 AATTTTTGAAATACTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCA-AAA
376 AATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTA-TATCAA-T-AGAAA
* * * * * *
158419 AAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATAT-GTCT
438 CAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGT-T
* * * * ** *
158483 -TAAATATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAG-TTATTAATT-TT
501 ATAACTAATTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTGA-TTTTTAA-AATCTT-GCTTATTAATTGTC
** * ** * * * * * * * * *
158544 TGGCATATTATTTGATTAGTTTTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTATT
562 T-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-AAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTT
* * * * * * * *
158608 TTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAGTTTACAAATGTTCAAATAGCCATAACTATTT
625 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAA----ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTT
* ** * *
158673 GAAC-TAGTTTGGTAAATAGATTTA
686 GAACTTA-TTCGACAAACA-AATTA
* ** * *
158697 TTTTTCAAATTACTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTATCATTATTTTATTCTG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAA-T-TGATTATTTTA-T-TGAAA
* * * * * * * *
158761 TAAGGTTGAATG-TTCA-AAAACAATTATTATATGACCAAA-AAAAGGTAATAA-CATTTTGAAA
60 TAAGCTTGTATGAAT-AGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAA
* * * * * * * * ** * * * * *
158822 TTA-ATAATTGTTGACAGAGCCATAATTGTTTGAGCTAATTCAGTAAACAGATTCACTTTTTAAA
122 -TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAA
* * * * * * *
158886 TCAC---CTT-GTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTACTT-TGAATAAGGTTG
184 TCTCTTACTTATTAAGTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTA
** ** * * *
158945 TATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACATAAC---A-A--AT--TG--TT--CA-A-AT-A--G-
246 TACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
158992 TC----A-T--AATTATTTAAACTAGTTCGAG-AAATAGATTTAGT-TTTTAAATCTCTTA-T--
311 TCAAATAGTCAAACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGA-TTAATATTTTAAATCTCTTACTCA
* * * * ** *** *
159045 -TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTATATGAATAGAAAC
374 GTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATATCAATAGAAAC
* ** * * * * * * **
159109 AATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCA-TAGCTCAAATAGACAT
439 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTA-TTCAAATAGTTAT
* * * ** * * ** * **
159173 GACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACCAATTTATTTTGT-AAATCTCCAACTTATTAATTTTAAAA
503 AACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTT-TAAAATCT--TGCTTATTAATTGTCTAA
* * ** *
159237 ATATTAATAAATTAGTATTATTTT-A-T-------G---A-AT----AGAAACTTTTGGTTTATG
565 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATG
* * * ** * * *
159285 ATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTGAACA
630 ACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAAT----AATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT
* *
159350 TGTTCAGA-AAACATATTTA
691 TATTC-GACAAACA-AATTA
159369 TTTTTTAAAA--TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTGACATTATTTTATTTGAAA
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTG--ATTATTTTA-TTGAAA
* ** * * ** *
159432 TAAGCTTGCATGAATAG-AGCAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAG
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * *
159496 ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTT-AGTAAACAAATTCATTTCTTAATTCT
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * **
159560 CTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTATATG
187 CTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTATACA
* * * * * * *
159624 AACTGAAACAATT-GTTTATTACAAAATAAAA-AGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCA
250 AACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * *
159687 AATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCAA--AAAAATATTTAT-TTCTTAAATCAT-TTACTTAT
314 AATAGTCA-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATT-TTAAATC-TCTTACTCAG
** * * * * * *
159748 TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAG-CTCATATAAACAGAAAC
375 TAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACT-ATATCAATAGAAAC
* * ** * * * *
159812 AATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTTGTAACAATTTGAAATACAA-AATTCTTCAAATA-TTCC
439 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATA-AATAATTATTCAAATAGTT-A
** * * ** * * * * *
159875 TAAAGATTTGAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTA
502 TAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATC--TTGCTTATTAATTGTCTAA
* ** * * *
159940 ATGTTAATAAATTTGTATTATTTT-ATT-AGAAATAAGCTTTTATGAATAGAAAAACCCA---TT
565 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCA-AAA-AAGCTTATAT-AA-ACAAAAA-CAATTGTT
* * * * * * * *
160000 TTATAACACAAA-AAAAGGTTC-TAGCGATTTCAAATATATAATTGTTAAAATAGTCATAATTAT
625 TTATGACA-AAACAAAAAG-TCATAACGATTT--GA-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTAT
* * * * *
160063 TTAAACTTGTTCAATAAACAGATTGA
684 TTGAACTTATTCGACAAACAAATT-A
* * * * * * *
160089 TTTTTTAAATCTCTTAATTAGTAATTTTTGGAATATTAATAACGTGTTATTATTTTATTTTG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAA-AT-TGATTATTTTA--TTGAAA
* * ** *
160153 TAAGCTTATATGAACAGAAATAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTGAAATA
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * *** * *
160217 GATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGATAAACGTATTTATTTTTGAAATTT
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * **
160282 TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAATCTTATATGA
187 CTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATACAA
* * * * * ** * * *
160347 ACAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAA-AGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAA
251 ACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* *** * * * * *
160411 ATAGTCATAACTATTTGAATTA-TTTGGTAAATAGCTTTAT-TTTTAAAATTTCTTA-T---TAA
315 ATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTT-AAATCTCTTACTCAGTAA
* * * * * * * * * *
160470 TTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTTCAAA-AAAACTTATATGAACA-AAAAAAT
378 TTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAACAA-
* * * * * *
160533 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
441 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAAC
* * * * *
160598 TATTTGAA-TAGGTT-AGGTAAACAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATT-TTTGAA
506 TAATTGAACTA-GTTCA-GTAAAC-AAATTGA-TTTTTAAA-ATCTTGCTTATTAATTGTCT-AA
* * * * * *** * *
160659 ATATCAATAAATTCATTTTATTTT-ATTCCAAATAGGC-TAGTATGAATTGAAAA-GATTTTTTT
565 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAAAAAGCTTA-TAT-AAACAAAAACAATTGTTTT
* * * ** * * * * * *
160721 ACGACAAAACAAAAA-TGAT-ATGAAAT-AGATAATTGTT-AATATAGTCTTAATTATTAGAAC-
627 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAATTATTCAA-ATAGCCATAACTATTTGAACT
*
160781 TAGTTTGACAAACAAATTTA
691 TA-TTCGACAAACAAA-TTA
* * * * * * *
160801 TTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-TT-GAAA
* * * * * * *
160865 TAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACGATTTGAAGTAT
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * *
160930 ACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG---G-T---TCAA--TA------AACATCTT
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAA-ATCTC
* * * **
160980 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATACAAA
* * * * * ** * * *
161045 CAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAA-AGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAA
252 CAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * *** * * * * *
161109 TATTCATAATTATTTGAATTA-TTTGGTAAATAGCTTTAT-TTTTAAAATTTCTTA-T---TAAT
316 TAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTT-AAATCTCTTACTCAGTAAT
* * * * * * * * * *
161168 TTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTAGTTCAAACAA-ACTTATATGAACA-AAAAAAT
379 TTTTGAAATATTAACAAATTAATA-TTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAACAA-
* * * * * * *
161231 TTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
441 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAAC
* * * * *
161296 TATTTGAA-TAGGTT-AGGTAAACAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATT-TTTGAA
506 TAATTGAACTA-GTTCA-GTAAAC-AAATTGA-TTTTTAAA-ATCTTGCTTATTAATTGTCT-AA
* * * * *** *
161357 ATATCAATAAATTCATTTTATTTT-ATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATTGAAAA-GATTGTTTT
565 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAAAAAGCTTA-TAT-AAACAAAAACAATTGTTTT
* * ** * * * * * *
161419 ACGACAAAACAAAAA--CGAT-ATGAAAT-AGATAATTGTT-AATATAGTCTTAATTATTAGAAC
627 ATGACAAAACAAAAAGTC-ATAACGATTTGAAATAATTATTCAA-ATAGCCATAACTATTTGAAC
*
161479 -TAGTTTGACAAACAAATTTA
690 TTA-TTCGACAAACAAA-TTA
* * * * * * * *
161499 TTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-TTGAAAT
* * * * * *
161564 AAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATA
61 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * *
161629 CAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG---G-T---TCAA--TA------AACATCTTT
126 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAA-ATCTCT
* * * * * ** *
161679 TACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-AAAAAACTTGTATGAT
189 TACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATT-CAGAATAAGCTTATACAAA
* * * * * *
161743 CAAAAACAATTATTGTT-TGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAA
252 CAGAAACAATTATT-TTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * *** * * *
161807 T-GGCTATAATTTTTTTAACT-GATTTGGTAAAGAGATTCACT-TTTTAAA----TT--T--G--
316 TAGTC-A-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATT-AATATTTTAAATCTCTTACTCAGTA
* * * * * ** * * * *
161859 ------G-AATATCAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-TAAATAA
377 ATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATATCAA-TAGAAACAA
* * * ** ** * * *
161916 TTGTTTTATAACAAAACAATAGGTCATAACT-ATTTTTAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAA
441 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAA
* * * * * * *** *
161980 CTATTTGGATTTGTTC-GATAAAAAAATTTATCTTTTTTTA-C-T-CTTATTAATT-TTTGAAAT
505 CTAATTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTGAT-TTTTAAAATCTTGCTTATTAATTGTCT-AAAT
* * * * *** * * ** *
162040 GTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACCGAAACAATTGTTTTATGTC
567 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * ** * *
162105 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAACTATTTAAACTTG
632 AAAACAAAAAGTCATAACGA-TTT---GAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTA
* ** * *
162170 TTTGGTAAACAGATTTCTT
693 TTCGACAAACA-A-AT-TA
* ** ** *
162189 TTTTTCAAATCTTTTGGCTCGTTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATTTGATTATTTTATTTTG-A
1 TTTTTAAAAT-TTTTTACTTATTAA-TTTTT-AATATTAAT-AAA-TTGATTATTTTA--TTGAA
* * * *
162253 ATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAA-TATTTTATGACTACAA-AAAAGGTTAGAATGATTTGAA
59 ATAAGCTTGTATGAATA-GAAA-AAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA
* ** ** ** * * *
162315 ATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAACTAG-TACAGCAACACATTTATATTTTAAA
121 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
162379 TCT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATT-TTTA-ACTA-AATAACCTTCTA
184 TCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTATTC-AGAATAAGCTTATA
** * * * * * * *
162440 TGATCAAAAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTC
248 CAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *** ** * * *
162504 AAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTTAACAGATTTATTTTTTAAA--TCTTA-T-ATTA
313 AAATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTA
* * * * ** * * *
162565 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAG-CTTGTATTAACTA-AAAAA
377 ATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAA-TAGAAACA
* * * * * * * * * *
162628 ATTGTTTTATGACAAATCAAATGGTTATAATGATTTTAAATAGAGAATTGTTCAAATAGTAATAA
440 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAA
* * * ** * * * * * *
162693 -TTATTCGAACTTGTTCAATAAACGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAA
505 CTAATT-GAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA--TTTTTAAA-ATCTTGCTTATTAATTGTCTAAA
* * * * ** **
162757 TATTAATAAATT-ATAAATAATTT-ATTCTGAATAAGCTTATACGAATTAAAACAATTGTTTTAT
566 TATTAATAAATTAAT-ATTATTTTAATTC-AAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * *
162820 GACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTACAT-ATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTGTTTAAA
629 GACAAAACAAAAAGTCATAACGATT---TGA-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
* ** *
162884 CTGATTCGGTAAATAAATTTA
689 CTTATTCGACAAACAAA-TTA
* ** * *
162905 TTTTTAAAATCTCCTACTTATTAATTTTAAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-AGAA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATT-G-ATTATTTT-ATTGA-AA
* * * * ** * *
162969 TAAGCTTGTA-CAA-ACAAAAAATTTCTTTTATGACAAAAGAAATTGTCATAACGATTTGAAATA
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
** * * * * * * * * *
163032 GATAATCGTTCATATAGCCTTAACTGTTTGAACTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTT
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
** * ** * * ** *
163097 CTTGGTTATTGAGTTTTTTAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCA-AGTAA-AATAGTAT
187 CTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATT-CAGAATAAGCTTA-TAC
* * * * * * * *
163160 GAACA-AAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTT
249 AAACAGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *** * * * * * *
163224 AAATAGTCAAAACTATTTGAAATTTGGTTTGGTAAACATATTCACT-TTTTAAATCTCTCATTGA
313 AAATAGTC-AAACTATTTG-AA-CTAGTCAAGCAAACAGATT-AATATTTTAAATCTCTTACTCA
* * * * * * *
163288 TTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-ACTTATATTAACA-AA
374 GTAATTTT-TGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGAA
* * * * * * * *
163350 AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
437 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * *
163415 TAATTATTTGTATTGGTCCAATAAATAAAATT-ATTTTCT-AAATCTCT-CAGTTATAAATT-TT
502 TAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAA-CAAATTGATTTT-TAAAATCT-TGC--TTATTAATTGTC
* * * * * * * * * * *
163476 TGAAATATCAATAAATTAGT-TT-TTTTTATTCCAAATATGCTTGTATGAGC-TAAACAAATATT
562 T-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTT
* * * * *
163538 TTATGAGAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTT
625 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGA-A---ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTT
* * * * **
163602 GAACTAATTCAAAAAATAGTTTTA
686 GAACTTATTCGACAAACA-AATTA
* * * * *
163626 GTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAAGTAGTATTCTTTTATTTCG-A
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAA-TTG-ATTATTTTA-TT-GAA
* * * * * *
163689 ATAAG-TTCTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAATGACTTTAAAT
59 ATAAGCTT-GTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAA-
* * * *
163753 AGTCAGATCAATTGTTCAAATAGTCCA-ATCTATTTGAACT-TATTTAGTAAATAGATTTATTTT
121 A-T-AGAT-AATTATTCAAATAGT-CATAACTATTT-AACTGT-TTGA-TAAATAAATTTA--TT
* * * * ** * * *
163816 TTTTAAATCTCATGCTCATTAATTTTTTCAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTACTCTA-AGTA
177 TTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTC-AGAATA
* ** * * * * * **
163880 AGCTTGTACGAATTA-AAATAAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
240 AGCTTATAC-AAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
163944 TAATTTTTC-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTC-AGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCT
304 TAATTGTTCAAATAGTC-AAACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGA-TTAATATTTTAAATCT
* * * ** * * * * * *
164007 CTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAG-CTTGTATA
366 CTTACTCAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATC
* * * * * * *
164071 AAAACAAATAATTGTTTTAT-----AAC-AAA-TTCATAAT-ATTT-AGATAGATAATTA---AA
430 AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAA
* * * * * *
164124 ATAGTTA-AACT-TTTGAA-T-TTTCA-AAAAC-AATTTAGTTTT---A--TT-CATA-TAATT-
495 ATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATCTTGCTTATTAATTG
* * * * * **
164175 T-TTAATA-T-A-AAATAATATATTTATTTT-ATTCTAAATAA--TTTTGTAATGAATTAAACAA
560 TCTAAATATTAATAAATTA-ATA-TTATTTTAATTC-AAAAAAGCTTATATAAACAA--AAACAA
* ** * *
164233 -TGTTTTTATGA-ATATTAAAAAATTATAAC-ATTTGAATAATAATTA-TCAAATA--CAT-A-T
620 TTG-TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG-A-AATAATTATTCAAATAGCCATAACT
* * * *
164290 ATTTGAACTTGTTTGATAAA-TAATT-
682 ATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTA
* ** * * * * *
164315 TTTTT-CAA--TCATAC-TATT-ATTTTAGAATA-TAATAAAATAATTTATTATATTTCAAATTA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTT-TAATATTAATAAATTGA-TTATTTTA-TTGAAA-TA
* * ** * ***
164374 A--TTGTATGAATATAAAAATAATGTTTT-T-ACAAACAAGTTCAAAATTTTA-AATTA-AAAAA
62 AGCTTGTATGAATAGAAAAA-ATTGTTTTATGAC-AA-AA---CAAAAGGTTATAATGATTTGAA
* * * * *
164433 ATTATTATTCAAATTATT-ATGACTTGTTTTTATAACAAATATTTAACTATTTGATTTCAACA-A
121 A-TA-GA-T--AATTATTCA--AATAG---TCATAAC---TATTTAACTGTTTGA--T-AA-ATA
* * * * *
164496 ACCATTTATTTTTTAAATATCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
169 A--ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-
* * * * * * * * **
164561 ATT-TGAATATGCTTGTATGAAA-AGAAATAGTTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAAT
230 ATTCAGAATAAGCTTATA-CAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGAT
* * * * * ** * * *
164623 TTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTT-AAATTGTTTTAGTAAATAGATTTAGT-
294 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGA-TTAATA
* * * ** * * **
164686 TTTTAAATCTCTTA-T---TAA-TTTTCAATTATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
356 TTTTAAATCTCTTACTCAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAA
*** ** * * * * * * *
164746 TTTTGCATGAACAGAAATAATT-GTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATA
421 GACTATATCAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATA
* * ** * * * * * * * * *
164810 ATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAGCAGATTTATTTTTTAAATATCCTA
486 ATTATTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAAA-ATCTTG
* * * * * * * * *
164875 CCTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAA-CTTGTGTGAAT
549 CTTATTAATTGTCTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATTCAAAAAAGCTTATATAAAC
* * * *
164938 AGAAACAATTGCTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
612 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTG----AAATAATTATTCAAAT
** * * * * *
165002 AGTTATAACTATTTGAACTTACTCAATAAATAGATTTA
672 AGCCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAACA-AATTA
* * * * ***
165040 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTGATAAAATAAT-ATTAGTTTATTTTTAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAAT-AAAT--TGATTATTTTATTGAAAT
* * * ** *
165104 ACA-CTTGTATGAACA-AAAATAATTGGTTTATGACAAAAC-AAAGATCCTAACT-ATTTAAAAT
61 A-AGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAAT
* * * * *
165165 AGATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTTGAATGTGTTTAGA-AAACATATTTATTTTTTAAAT
123 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AA-CTGTTT-GATAAATAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
165229 -TCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTGTTTTATTTAGAATAAGCTTGTA
185 CTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT-ATTTATTCAGAATAAGCTTATA
* * * ** * * *
165292 TAAACAAAAACAATTGTTTTATGGTAAAATAAAATG-TTATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
248 CAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
** * * * * * * *
165356 CAAATAGTCATAACTATTTGAGTTTGTTCGA-TAAATAGATTCATTTTTTAACTCTCTTACTCA-
312 CAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAG
* * * * * ** * * *
165419 TCA------AAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTA-ATAC
375 TAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATATCAA-TAGAAAC
* * * * * * *
165477 AATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATG
439 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATA
* * * * * * * * *
165542 ACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAACTATCAAAAT
504 ACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATC-T-TGCTTATTAATTGTCTAAAT
* * * *
165607 ATTAATAAACTAATATTATTTTAA-TCTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGA
567 ATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-AAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
165671 CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAAAAAATATATGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
631 CAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG--AAATAAT-TA--TTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT
* *
165736 TATTGGATAAACAAATTTA
691 TATTCGACAAACAAA-TTA
* *
165755 TTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTGTTTGAAT-TATAATAAATTTGTATTATTTTAATTTTAA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-TTT-AATAT-TAATAAA-TTG-ATTATTTT-A-TTGAA
* * * * * ** *
165818 A-AAGCTTGCAGGAATGGCAAAAATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTTATGGTGGTTTGAAAT
59 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
* * * * * * *
165881 A-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTTTTTATAAACAAATTCAGTTTTTAAATC
123 AGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * **
165945 CCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTCTGAATAAGCTTGTATG
186 TCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTATTCAGAATAAGCTTATACA
* * * * * *
166010 AACA-AAAAAATTTGTTTTGTGACAAAATAAAGGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
250 AACAGAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * * * *
166074 AACAATCATAACTATTTGTATTGGTCAAGCCAACAGATTCATTTTTTAAAATC-CATTACTTATT
314 AATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTT-AAATCTC-TTACTCAGT
* ** ** ** * * *
166138 AATTTTTAAAATATTAACAAATTAGCATTACTT-TATTTTGAATAAGACTGCATCAGTAAAAATA
376 AATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTA-TTATATTTCAAATAAGACTATATCAATAGAAACA
* * * * * * *
166202 ATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAA-AGTTATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-TTAT
440 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATT-TAAAATAAATAATTATTCAAA-TAGTTAT
* * * * * *
166265 AAGTAATTGAACTAGTTTTA-TGAACAAATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTAATT-TTTAAAA
503 AACTAATTGAACTAG-TTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATCTTGCTTATTAATTGTCT-AAA
* * * *
166326 AATTAAAAAATTAATATTATTTT-ATTCTAAATAAA-CTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTAT
566 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-AAA-AAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
166389 GAC-AAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATATATAATTATTCATATAGCCTTAACTTTTTGAAC
629 GACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG--A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAAC
** *
166453 TGGTTCAACAAACAAATTTA
690 TTATTCGACAAACAAA-TTA
* * * * *
166473 TTTTTCAAATCTCTTAGC-TATTAATTTTCATAATATTATTAGATTGGTATTA-TTTATTTCG-A
1 TTTTTAAAATTTTTTA-CTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-TT-GAA
* * * * * * *
166535 ATAAGCTTGCATGAACATAAATAATTCTTTTATGACAAAACAGAAGGTTATAAAGATTTGAAATA
59 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * * *
166600 TATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGT-AA-ACA--GA-----T-AATCT
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * ** * **
166655 CTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATG
187 CTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAG-CTTATACA
** * * * * *
166719 ATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTCAA
250 AACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * **
166784 ATGGCCATAACTATTTGAACTGATTTC-A-TAAACTGA-TATATGTTTTAAATCTCTAACT-TTT
315 ATAGTCA-AACTATTTGAACT-A-GTCAAGCAAACAGATTA-ATATTTTAAATCTCTTACTCAGT
* * * * *** * * *
166845 CAATTTTT-AAAGTTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGAT-ACACTTTTATGAAT-GAAA
376 -AATTTTTGAAA-TATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAA
* * * * * * * *
166907 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAA
438 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
* * * ** * * * * * * *
166972 AAGTATTTGAA-TGTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAATTATTTGCTTATTAATTTTTTG
503 AACTAATTGAACT-AGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAAAA-T-CTTGCTTATTAATTGTCTA
* * * * * * * * ** *
167036 AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAA-CATGTATGAACCGAAACAATTATTTT
564 AATATTAATA-AATTAATATTATTTTA-ATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTT
* * * * * * * * *
167099 ATCACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGA
627 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG--A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGA
** * * *
167164 ACTGGTTTGACAAATACATTTA
688 ACTTATTCGACAAACA-AATTA
* *** * * * *** * ***
167186 TTTTTTAAGCCTCTTACTTATAAATTTTTAGAATATTATTGGTTTAGCAATATTTTACTCCTAAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-TTGAAAT
* * * * * *** * *
167251 AAG-TTCATATGGATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGATATAA
61 AAGCTT-GTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
167314 ATAATTGTTCACATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTG-TTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * ** *
167377 -T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTAATCTGAATAATTTTGTA-AGA
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATACA-A
* * * * * * *
167439 ATAGAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATAATTATTTAAA
251 ACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * *
167504 TAGTCATAACTGTTTGAACTCATTCAA-TAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTGACTTATTAAT
316 TAGTCA-AACTATTTGAACT-AGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTAAT
* * ** * * * * * * *
167568 TTTTGGAATTTTATTAAATTAGTATTGTTTTATTCCAAATAAG-CTTTTATGAATAGAAACAACT
379 TTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAACAATT
** * ** * * *
167632 GGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCA
443 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * * * * * *
167697 TTTAAACGT-GTTCAGAAAACAAATTTATTGTTTAAATTTTTACTTGTTAATCT-T-TGGAATTT
508 ATTGAAC-TAGTTCAGTAAACAAATTGATT-TTTAAAATCTTGCTTATTAAT-TGTCT-AAATAT
** * ** * * * * *
167759 TGGTAAATTTATATTATTTT-ATTCCAAATGAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCA
569 TAATAAATTAATATTATTTTAATT-CAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
167823 AAACAACAAGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
633 AAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAAT----AATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTAT
* *
167888 TC-AGTAAACATATTCA
694 TCGA-CAAACAAATT-A
* * * * *
167904 TTTTTTAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTTCG-A
1 TTTTTAAAATTTTTTACTT-ATTAATTTTT--AATATTAATAAATT--GATTATTTTA-TT-GAA
* * * * * ** ** * **
167967 ATAAGCTTATGTGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATA
59 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
168032 GATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTTTTTGGT-AA-ACATAT-TTTTTTAAA---
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
** * *
168091 --T-CTTATTAA-TTCTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTT-TGATCCGAATAAGC-TAGTA
187 CTTACTTATTAAGTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTAT--TCAGAATAAGCTTA-TA
** * * * ** * ** * * * *
168150 TGAAC---AATAATTGTTCATATAGTTATAACTAATTGA--AT--TGGTTTGGCAAACATATTTA
248 CAAACAGAAACAATTATT-TTAT-GACAAAAC-AAAAGATCATAATGATTT-G-AAATAGA-TAA
* * * * * * * * * * *
168208 TTTTTTAAAT-CTCTTATTTATTAATTTTTGAAATA-TTAA-TAAATTAATATTATTTTATTTCG
307 TTGTTCAAATAGTC--A---A--ACTATTTGAACTAGTCAAGCAAA--CAGATTA--ATATTT--
* * * * ** ** *** ** ** * * * * *
168270 AACAAACTTATGTGAAC-AAAAAAAATTTGTTTTA-TGGCAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGA
359 TA-AATC-TCT-T--ACTCAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATA--TTATTA-TATTTCA
* ** * * * *
168333 AATAA-A-TAATTGTTCAAGTAGTCATAATTATTTGAAATAGTTCTACAAACAAAATTGT--T-A
416 AATAAGACT-A-T-ATCAA-TAGAAACAATTATTT--TAT-G-AC-A-AAACAAAA-GGTCATAA
* * * * * * * * * ** *
168393 T-GTCTAGAAATAGATTATTATTCATATAGCCT-TAACTACTT-ACATTGGTTTGGCAAACAAAT
470 TAATTTA-AAATAAATAATTATTCAAATAG-TTATAACTAATTGA-ACTAGTTCAGTAAACAAAT
* * * * *
168455 TTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTC-ATAATATTATTAGATTAATATTATTTT-ATT
532 TGA-TTTTTAAA-ATCTT-GCTTATTAATTGTCTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT
* * * * * * * * * * * *
168517 CCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAAGTATTTTCTAACAAAATC-AAAGGTTATAACAATTTG
593 -CAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAAGTCATAACGATTTG
* ** ** * ** * ** * *
168581 AAATATATAATTGTTCAAACCGTTATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAATATATTTA
656 --A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAACA-AATTA
*** *
168639 TGTTTT-AAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
1 T-TTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-G-ATTATTTTATT-GAAA
* **
168703 TAGGCTTGTATG-AT-GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACAATTTGAAA
60 TAAGCTTGTATGAATAG-AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAA
* * * * * * *
168765 TAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATTTA-TTTTTAAAT
122 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTG-TTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAAT
** ** * *
168829 CTCCAACTCT-TTGAACATGTTCAGAAAATAAATTTATTTTTTAAATTTCACTAATTAATTTTTG
185 CTCTTACT-TATT--A-A-GTTTTG-AAAT--A-TTA----ATAAA-TT-AGT-ATT-A---TT-
* * *
168893 GAATATTAAGAAAATTAA-ATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAACGAAACCAATTCTTTT
229 ---TATTCAG--AA-TAAGCTTA---TA--C---A-AA-----C----A-GAAA-CAATTATTTT
** * ** ** *
168957 ATGACAAAACAAAATGTCATAATGCTTTGTGATATTTAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
268 ATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGA
*** * * ** * * * * *
169022 ACTTA-TTTGGTAAATAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTACACATTAATTTTT-AGAATATTAATA
332 AC-TAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTAATTTTTGA-AATATTAACA
* * * * * * *
169085 AATTAGTATTATTTTACTTT-AAATAAG-CTTCTATGGACT-GAAACAATTATTTTATTATAAAA
395 AATTAATATTATTATA-TTTCAAATAAGAC-TATAT-CAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA
* * * * * * ** * *
169147 GAAATGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGGACTATTTGAACTTGTTCA
457 CAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTCA
* * * * * *
169212 TTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGTC-AAATTATTAATAAATTAATATT
522 GTAAACAAATTGATTTTTAAAATC--TTGCTTATTAATTGTCTAAA-TATTAATAAATTAATATT
* * * * * *
169276 ATTTTAATCTGAATAAA-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAGTCATA
584 ATTTTAAT-TCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * * * * * ** * *
169338 A-AAGTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-AAATGATTTTAACTTGATT-GGTAAGCAGAT
648 ACGATTTG----AAATAATTATTCAAATAGCCATAACT-ATTTGAACTT-ATTCGACAAACA-AA
169400 TTA
706 TTA
* * *
169403 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAAA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-T-TTAATATTAATAAA-TT-GATTATTTTATT-GAAAT
* * * * * * *
169468 AAGCTTGTATGAACA-AAAAATTATATTTTTTGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAA
61 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
169532 ATAATTGTTCAAACAGTCAGAATTATTTAAACT-TATTTAGTAAAGAGATTCA-TTTTTAAATCT
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGT-TTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
169595 CTTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATAT
187 C-TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTATAC
* * * ** * *
169658 GAACTA-AAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATGATTTGAAATATATAATTTTTC
249 AAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * * * * *
169722 AAATAGT-AATGATTATTTGATCTAGTTTAA-TAAACATATTTATTTTTTTAAT-TTTTAGTTAT
313 AAATAGTCAA--ACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAG
* * * * * * * * * * * *
169784 TGATTGTCGATATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAG-CTTATTTGAATAAAAAC
375 TAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAAC
* * * * ** * *
169848 AATCATTTTA-GAACAGAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTAAAATAGTCAT
439 AATTATTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
* * * * ** * * * *
169912 AACTATTTGAACTAGTT-TGATAAATAGATTTTTTTTTTTAAATC-T-CTTATCAATTTTCAAAA
503 AACTAATTGAACTAGTTCAG-TAAACA-AATTGATTTTTAAAATCTTGCTTATTAATTGTCTAAA
* * * * * * * *
169974 TATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAA-CTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATG
566 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
170038 ACAAAATAAAAGGTCATGATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
630 ACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG--A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT
** * **
170103 GGTTAGGTAAACAAAATTA
691 TATTCGACAAAC-AAATTA
* * * * * * *
170122 TTTTTTAAATCTCTGAATTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTGA--TTATTTTATT-GAAAT
* * * * * *
170187 AAACTAGTATGAATTCA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATA
61 AAGCTTGTATGAA-T-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * * * * *
170251 AATATTTATTCATATAGTCTTAGA-TAGTTAAAATGGATCGACAAACAAATTT-TTTTTTAATTC
124 GATAATTATTCAAATAGTCATA-ACTA-TTTAACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * *
170314 TCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAA
186 TCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTATAC
* * * * * * * * * * *
170378 AAATAAAAATAATAAATTTATAACAAAACAAAA-ATTTATAATGATTTGAAGT--TTACGTTATT
249 AAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATA-ATTGTT
* * * * * * * *
170440 CAAATAGTTATAACTATGTGAACTAGTTC-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
312 CAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAG
* * * * *
170504 TAATTTTTGAAAGATTAA-TAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGAATGTTC-A-A-A
375 TAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-T--AT-ATCAATAGA
* * * * * * * * *** **
170564 AACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGTCATAGCC
436 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTT
** * * * * * * * * *
170629 ATAACTACGTGAACTTGCTCAATAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTTTTT
501 ATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTT-AAA-ATCTTGCTTATTAATTGTCT
* * * *
170694 AAA-ATTTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCTGAATAAGTCTT-TATGAACAAAAA-AATTGGT
563 AAATA-TTAATAAATTAATATTATTTTAATTC-AAAAAAG-CTTATATAAACAAAAACAATTGTT
* * * ** ***
170755 TTATGACAAAACAAAATGT--TCAA--ATATGAATTGGTT-TGGTAA-A--C--AA--ATTT--A
625 TTATGACAAAACAAAAAGTCAT-AACGATTTGAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
** ***
170806 -TT-TTTTA-AAAC-TCCTA
689 CTTATTCGACAAACAAATTA
** * * * ** **
170822 TTTATT--AATTTTTTAAATATTAA----TAA-ATTAGTATAATT--TTATTTGAAAT-AGGTTT
1 TTT-TTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAATATTAATA-AATTGATTATTT-TATTGAAATAA
* * * * * ** * *
170877 G-TATG-ATGAAAA---ATAATTATTTTAGGACAAAACAAAAGTTTATAACAATCTGAAATGGAT
63 GCT-TGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * *
170937 AATTGTTCTAATAGCCATAATTATTTGAA-TCGATTTAATAAACT-GACTTATTTTTTAAATCTC
127 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-G-TTTGATAAA-TAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * * * **
171000 -AACCTATCAATTTTTG-TATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTCTAG-ATAAGCTTTTATGA
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTC-AGAATAAGCTTATACAA
* * * * * * * * *
171062 ACTGAAACAGTT-GTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAGTTGTTCAAA
251 ACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
** * * * * * * * ** * *
171126 TAGTTGTAACTATTTGAACTTGTTC-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAAAATTTCTTGTTTATTA
316 TAG-TCAAACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTT--AAATCTCTTACTCAGTA
* * * *
171190 A-TTTTGTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT----T--G---A-AT--A-AG---C--
377 ATTTTTG-AAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATATCAATAGAAACAA
* * * * * * *
171236 ---TTGTATG----AATAAAA---C-----GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTA-AA
441 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGT-TATAA
* * * * * * * *
171285 CTATTTAAACTAGTTC-GACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAATT-TTTAGAA
505 CTAATTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTGATTTTTAAAATCT--TGCTTATTAATTGTCTA-AA
** * ** * * * * * * * *
171348 TATTCTTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTCTAAACAAAAATAATTATTTTATGA
566 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
171413 CAAAACTAAGA-TCATAATGATTTGAGATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T
631 CAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATA-AT--TA-TTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTT
* * ** *
171476 AGTTCAATAAATGGATTTA
692 A-TTCGACAAA-CAAATTA
* * * *
171495 GTTTTT-AAA---TCT-CTTATTAATTTTCAAACTGTTAATAAATT-ATTATTATTATTTTATTA
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTT-TAA-TATTAATAAATTGATTATT-TTA---T-TGA
** * * * *
171554 CGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAA
58 --AATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA
* * * * * * * * *
171619 ATATATAA-TAGTTGAAATGGACATGACCATTTGAACTTGTATGATGAATAGATTTATTTTTTAA
121 ATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAA
* * * *
171683 ATCT-TCGACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAACA
183 ATCTCT-TACTTATTAAGTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCT
* ** * * * * * * * *
171745 TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGA-CCTTATCAATTTGAAATAAATAAT
244 TATACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT-GATTTGAAATAGATAAT
* ** * * * *
171809 TGTTCAAATAGTCACAACTTTTTGAACTCTCTCAA-TAAAC--ATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
308 TGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACT-AGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTAC
* * * * * * * * * *
171871 TTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAAAATTTTATGAATAG
371 TCAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTC-AAATAAGACTATATCAATAG
** * * * * * *
171935 AAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGT
435 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
172000 CATAACTATTTGAACATA-TTTAGAAAACAGATTTATTTTTCAAATTTTTACTTATTAATT-TTT
500 TATAACTAATTGAAC-TAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTT-AAAATCTTGCTTATTAATTGTCT
* * ** ** * * *
172063 GGAATATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTCAAAATAAATTTGCATGAACAGAACCAATTGTTT
563 -AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAA-AAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTT
* * * * * *
172127 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTG
626 TATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTT--GA-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTG
* * ** * *
172192 AACATGTTCGATGAATAGATTCA
687 AACTTATTCGACAAACAAATT-A
* * * *
172215 TTTTGT--AATTTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
1 TTTT-TAAAATTTTTTACTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-TTGAAA
* * * * * * * * **
172278 TAAGCTTATTTGAATTGGAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGCTCGTAATGATTTGAAATA-
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * ** * * *
172342 ATTAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTCAACTTGTTTCATAAGCATATATA-TTTTTAAATAT
125 A-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * ** ** * * * *
172406 TTTCCTTATTAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAACTCA-AATAATCTTGTAT
187 CTTACTTATTAAGTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-ATTCAGAATAAGCTTATAC
* * * ** *
172469 GAATAGAAACAATTGTTTTATG-CAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
249 AAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
172532 AAATAATCATAA-TGATTTGAACTTGTTCAA-TAAACAGATTTAT-TTTTAAATCTTTTACTTAT
313 AAATAGTCA-AACT-ATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAG
* * ** * *
172594 TAATTGTCTT--AATACTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAG-CTTGTAT-AGATAG
375 TAATT-T-TTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTC-AAATAAGAC-TATATCA-ATAG
* * * * * * * * *
172654 AAAAAATTATTCTATGACAAAA-AAAAGGTTATATTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
435 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * * ** *
172718 CATAATTATTTAAATTTATTTGA-TAAACAAATTCATTTTT-AAATCTTTTAATTATTAATT-TT
500 TATAACTAATTGAA-CTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATC--TTGCTTATTAATTGTC
* * ** * * * * * * *
172780 TGGAATATTAATATATTGGTATTATTCTATTTTGAATAAA-CTTATATAAACTAAAGCAATT-CT
562 T-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTT
* * * *** *
172843 TTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAG-TATGGTTGTTT
625 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG----AAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTT
* * ** *
172907 GATC-TAGTTTGGTAAACATATTTA
686 GAACTTA-TTCGACAAACA-AATTA
*
172931 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-TT-TAATATTAATAAATT-G-ATTATTTT-AT-TGAAA
* * * * * * ** * * *
172995 TAAGCTTATGTGAACATAAACAA----TTT-T-ACTAAACAAAAGACTAAAACGATTTTAAATAG
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* * * *
173054 ATAATTATTCTAATAGTCATGACTATTTAAACT-TGTTCATAAATATATTTATTTTTTTAAATCT
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGT-TTGATAAATAAATTTA-TTTTTTAAATCT
* ** * * * **
173118 TTTACTTATTAA-TTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATG
187 CTTACTTATTAAGTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATACA
* * *** * * * *
173182 AATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAA-AGTCATAGCAATTTGAAACAAATAACTATTCA
250 AACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * * * * *
173246 AATAGTCATAA-TGATTTGAACTTGTTC-GGTACATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
314 AATAGTCA-AACT-ATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGT
* ** * * * * *
173309 AATTATCTTG--ATA-TAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAG-CTTGTATGAACATAA
376 AATT-T-TTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTC-AAATAAGAC-TATATCAATAGAA
* * ** * * * ** * *
173369 AAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTTTAGTGATTTCAAATGGATAATTGTTCAAATCA-TC
437 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAT-AGTT
* * * * * * * * * *
173433 CTAATTATTTTAACTTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAG-TCATTAATT-TTT
501 ATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAAA-ATCTT-GCTTATTAATTGTCT
* ** * * * * * ** * * *
173496 GGAATATTAATAGCTTAGTATTTTTTTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAACTAAAATAGA-T-A
563 -AAATATTAATAAATTA--ATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACA-ATTGT
* * *
173559 ATTAT------TCAAATAG---T--C-A--TG-----ATTATT----T-G--AT--CTA---G--
624 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
*
173591 ----TTC-ACTAAACATATTTA
689 CTTATTCGAC-AAACA-AATTA
* ** *
173608 TTTTTGAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCG-AAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-TTTAATATTAATAAATT-G-ATTATTTT-AT-TGAAAT
* ** * * * * * *
173672 AAGCTTATATGAAT-GAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAA
61 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * **
173736 TAATTGCTT-AAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTCATAAA-CGATTTATTTTTTAAA--TC
126 TAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTG-TTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
173797 -T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTTGTATTATTTTATTTCA-AACAAGCATATATC-
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTATA-CA
* * * * ** *
173858 AACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAA
250 AACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * *
173923 ATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAACAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
315 ATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAAC-AGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTAA
* * * * * * * * * * * *
173987 ATTTTGAAATGTTAATAGATTCATTTTATT-TTTTTCTGAGTAAG-CTAGTATGAATTGAAAAAA
378 TTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTC-AAATAAGACTA-TATCAATAGAAACAA
* * ** * ** * ** * * * ** *
174050 TTATTTGAT-TC-CGACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTCTTGAAATGGCCATAAT
441 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAAC
* ** * * * * *
174113 TATTTGAACT-GATTC-GATAAACATTTTCACCTTTT-AAATCACTTACTTATTAATT-TTTGGA
506 TAATTGAACTAG-TTCAG-TAAACAAATTGA-TTTTTAAAAT--CTTGCTTATTAATTGTCT-AA
* * * * * **
174174 ATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA-CTTGTATGAAC-TGAACAATTGTTTTAT
565 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAA-AAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * *
174237 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGGTCAAATAGTCGTAAGTATTAGAAT
629 GACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATA-ATTA-T--TCAAATAGCCATAACTATTTGAAC
*
174302 TTGTTCAGTA-AAA-AAATTTA
690 TTATTC-G-ACAAACAAA-TTA
* * * * * * * *
174322 TTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTTAATTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTAG
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTA-TTAATTTT--TAATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-TTGAA
* * * * * * ** *
174386 ATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTATATGTCAAAA-AAAA-GTCATAACAATTTTAAATA
59 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * *
174449 AATAATTGTTCAAATGGTAATAATTATTTTATATTGTTTGATATATAGATTTATTTTTTTTTCAA
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTTA-ACTGTTTGATAAATAAATTTA---TTTTTT-AA
* * * * * * ** *
174514 ATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTAATTTATTTTGAATAAGCTTG
183 ATCTCTTACTTATTAA-GTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTATTCAGAATAAGCTTA
* * * * * * * * * * * *
174578 TA-AGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAATAAGAGGTCAGAACGATTTAAAATAGGTAATTA
246 TACAAACA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
** * * * * * * *
174642 TTTTAATAGTTTC-AACTAATTGAATTGATTCGA-CAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
310 TTCAAATAG--TCAAACTATTTGAACT-AGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACT
* * * ** * * *
174705 TATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATT-T-TTAACCAAATAAG-CTCCA-AT-GAT
372 CAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATT--TCAAATAAGACT--ATATCAAT
* * * * ** * * * ** *
174765 CAGAAGCAAGTGTTTTATGACAAAACAATTA--TTTTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAA
433 -AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAA
* * * * ** * * * * *
174828 TAGTCATAACTATTTAAACTAATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTATTGCTTACTAATT
496 TAGTTATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATC--TTGCTTATTAATT
* * * * * ** ** * *
174893 -TTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATAATTAAAAATAA-TA
559 GTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTG
* * *
174956 TTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGTAATAGATAATCAATTCAAATGGCCATAA-T
623 TTTTATGACAAAACAAAAA-GTCATAACGATTTG--A-A-ATAAT-TATTCAAATAGCCATAACT
* * * *
175020 AATTTTAACTGATTC-AGTAAACAGATTTA
682 -ATTTGAACTTATTCGA-CAAACA-AATTA
* * * ** * **
175049 TTTTTTAAATTTCTTACTTAATAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTATCT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTT--TTAATATTAATAAATT-G-ATTATTTTATT-GAAAT
* * * *
175114 AAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAATA-AAAAGGTTATAATGATTTTTAATT
61 AAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAAT
* * * * * * *
175177 A-ACATTTGTTCAAATAATAAAAACTATTTGAACTTGTTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAAA
123 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTT-AAA
* * * * * * * *
175240 TATCTTTCTTTTTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTA
184 TCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTATTCAGAATAAGCTTATA
** * * * * **
175305 TGAACAGAAACAATTGTTTTATGACTAAGCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATATG-TAATTGTT
248 CAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATA-GATAATTGTT
* * * * * * * * *
175369 CTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTC-GGCAATCACATT-TTTTTTTAAATCTCTTACTTAC
312 CAAATAGTC-AAACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAG
* * * * * * * ** * * *
175432 AAATTTTTGGAATATTATA-AAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAGGTTTGTATGAAAAGAAAC
375 TAATTTTTGAAATATTA-ACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATATCAATAGAAAC
* * * * * * * * * * * *
175496 AACTATTTTTTATAACAAAATAAATA--TCGTCATGATTTGAGATAGATATTTGTTCAAATAGTC
439 AA-T-TATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTT
* * * * *
175559 ATAACTATTTGAACTTATTTGGAAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTAAACAGATTTGTTTTT
501 ATAACTAATTGAAC-TAGTT---CAGTA-A---A------CAAA---TT-----GA----TTTTT
* * * * * * *
175624 AAAATTTTTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATACGC
540 AAAA--TCTTGCTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGC
* * * * * * *
175688 TTGTATGAACAAAAACAATGGGTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAACTATTTAAAATAGATAAT
602 TTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTT--GA-A-ATAAT
* * *
175752 TATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TTGTTTAGA-AAACATATTTA
663 TATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTT-ATTCGACAAACA-AATTA
** * * *
175798 TTTTTTTAA-TTTTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTATACTATTTTATTCAAAAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATT-AATTTT-TAATATTAATAAATTGAT--TATTTTATT-GAAAT
* ** * * *
175862 AAGCTTATATGAATAGAACCAATTATTTTAT----------TA---TA-AAT-ATTTGAAATTGA
61 AAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
175912 TATTTGTTCAAATAATCA-AACTATTTGAACTTGTTTTG-TAGACAAATTCATATTTTAAATCTC
126 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TG-TTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *** * * **
175975 TTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTATATTTTTAATGAGCCTATATGAA
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT-TATTCAGAATAAGCTTATACAAA
** * * * ** * * * * *
176040 TTGATAGAATTGTTTTATGATGAAACAAAA-AGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAA
252 CAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * * * * * * *
176104 TAGTTATCACAATTTGAACTAATTC-GGTAAACATATTTAT-TTTTAAAATATTTTGCTTATTAA
316 TAGTCA-AACTATTTGAACT-AGTCAAGCAAACAGATTAATATTTT-AAATCTCTTACTCAGTAA
* ** * * * * * * * * *
176167 TTGTCCAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAAAAAG-CTTGTATGAACAAAAACAAT
378 TTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGAAACAAT
* * * * * *
176231 TATTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATAATGATTT----GAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
442 TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACT
* * * * * * * * *
176292 ATTTGAACTTA-TTC-GATAAACATATTTAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATTTGAATA
507 AATTGAAC-TAGTTCAG-TAAACAAATTGA-TTTTTAAA-ATCTTGCTTATTAATTGTCTAAATA
* * * * * *
176355 TTAATAAATTTGA-ATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA-AATTATTTTATGA
568 TTAATAAA-TTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACA-AAAACAATTGTTTTATGA
* * ** * * * * * *
176418 CAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAACTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTT
631 CAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG-AA-A--TAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTT
* * * *
176483 CTTCGATAAATAGATTCA
692 ATTCGACAAACAAATT-A
* * *
176501 GTTTTT-AAA---TCT-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAAGTATGTTATTCTG-A
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-T-TGAA
* * * * * * *
176560 ATCAA-CTTATACGAACA-AAAACAATTCTTTTGTGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAA
59 AT-AAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAA
* * * * * * * ** ** * *
176622 AAAATAATTGTTCATATAGTTATAACTATTTGTACTGGTCAAGCCAATAGATTCATTTTTTAAAT
122 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTGTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAAT
** * * * * ** * *
176687 CAATTACTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAATACCGTAT
185 CTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAAT-A-AGCTTAT
* * * * *
176752 -CAATA-A-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCACAACT-ATTTGAAATA-ATAATTG
247 ACAA-ACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *** * * * *
176812 TTCAAATTGTTATAACTAATTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-T--
310 TTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCA
* * * * *
176874 -TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAA-AA-ACTTATATGAACA-AA
374 GTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTC-AAATAAGAC-TATATCAATAGAA
* * * ** * * *
176935 AAAATTTGTTTTACT-ACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGC
437 ACAA-TTATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAG-
* * * * * ** * * * *
176999 CT-TAGCTATTTGAATTATTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAG-TTATTAATTTT
499 TTATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAAA-ATCTT-GCTTATTAATTGT
* * ** * * * * *
177062 C-ATAATATTACTAGATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAA-CTTGTATGAACATAAATAATTGT
561 CTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAA-AAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGT
* * * * * * * * *
177125 TTTGTGACAAATCAAAAGGTTATAATGATTTGAAAAATATAATTGTTGAAATAGTCGTAACTATT
624 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG---AA-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATT
* * *
177190 TGAAC-TATTTC-AGTAAGCATATTTA
685 TGAACTTA-TTCGA-CAAACA-AATTA
* **** ** *
177215 TTTTTTAAATCACCTACACATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA-T-TGAAA
* * * * *
177279 T-AGACTTATATG-ATAAAAAAAAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGTTTATAATGTTTTGAAAT
60 TAAG-CTTGTATGAAT-AGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
* * * * * * *
177342 AGGTAATTGTTCAAATGGTTATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACT-GATTTATTTTTTAAAT
123 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACTG-TTTGATAAA-TAAATTTATTTTTTAAAT
* ** * * * * ** ** * *
177406 CACCAACTTCTTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTTGGAA-AAACTTTTA
185 CTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTATA
** * * * * * * * *
177470 TGATCTGAAATAATTGTTTTAGGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTC
248 CAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * *** * * * * *
177535 ACATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC--ATT--T-TTTTAAAAATTTCTTGCTTAT
313 AAATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTT--AAATCTCTTACTCAG
* * * * * *
177595 TAATTTTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTT-GAATAAGCATGTATGATC--T-G
375 TAA--TTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAG-A-CTAT-ATCAATAG
* * * * * * *
177655 AAACAATTTTTTTATTGACTAAAGAAAAGGTTAGAATAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAG
435 AAACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAG
* * * *** * * *
177720 TCT-TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATGCATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATT-ATT-TTT
499 T-TATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATCTTGCTTATTAATTGTCT
* ** ** * ** * ** * * *
177780 AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTGCTCCAATTAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT
563 A-AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTT
* * * * *
177845 ATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTCCAAATTA-TCATAACTATTTG
627 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTT--GA-A-ATAATTATTCAAA-TAGCCATAACTATTTG
* *
177908 AAC-TAGTTTGACGAACAAATTTA
687 AACTTA-TTCGACAAACAAA-TTA
* * *
177931 GTTTTT-AAA---TCT-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAACTAGTATCATTTTATTCTG-A
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAA-TTG-ATTATTTTA-T-TGAA
** * * *
177990 ATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTAAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAT
59 ATAAGCTTGTATGAAT-------A--G----AAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
** * * * * * * *
178055 AACAAATTGAAATAGATAATT-GTGAGAATGGACACT-ACTATTTGAACT-TTTCGGTAAATAGA
110 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATAGTCA-TAACTATTT-AACTGTTT-GATAAATAAA
* * * * *
178117 TTTATTTTTTAAATCTCTAACTT-TTAAATATT-AGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATTT
171 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TT
* ** * *
178180 CA-AATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGA
233 CAGAATAAGCTTATACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGA
* * * * * * * ** *
178244 AATAAATAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGCTCGA-TAAATGGATTTAT-TTTTC
298 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATTTT-
* * * * * * * ** *
178307 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATG-CT
360 AAATCTCTTACTCAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-
* * * * * * * *
178371 TTTATCCACATAAACAA-TAGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAAT
424 TATATCAATAGAAACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAAT
* * * * * * * * *
178435 TGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACGT-GTTC--TAAAAATAGATTTATTTTTTATATTTTTA
488 TATTCAAATAGTTATAACTAATTGAAC-TAGTTCAGTAAACA-A-ATTGA-TTTTTAAAATCTTG
* * * ** *
178497 CTTATTAATT-TTTAAAATATAAATAAATTTAA-ATTATTTT-ATTCAAAATAAACTTGCATGAA
549 CTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAA-TTAATATTATTTTAATTCAAAA-AAGCTTATATAAA
* * * *
178559 -TAAAACCATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCAT-A-GTATTTTGAAACAAATAATTATTCAA
611 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG-A-TTTG----AAATAATTATTCAA
* * * * * * *
178621 ATAGTCATAACTATTTAAACTTATT-TAGTAAATAGATTC
670 ATAGCCATAACTATTTGAACTTATTCGA-CAAACAAATTA
** * * *
178660 TTTTTTTAATTTTGTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAA
1 TTTTTAAAATTTT-TTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT--GATTATTTTA-TTGAAA
* * * * * **
178725 TATA-C-TGATACGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAAATGTCGTAATGATTTGAAA
60 TA-AGCTTG-TATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAA
* * * * * ** * * *
178787 TTGGTAATTACTAAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTTAAA
122 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGATAAATAAATTTA-TTTTTTAAA
* * ** * * **
178852 TCT-TCGAATTA-TAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTCATCCA-AATAAATTT
184 TCTCT-TACTTATTAAGTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-ATTCAGAATAAGCTT
* ** * ** * *
178913 GTATGAACAGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAA-AGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATT
245 ATACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATT
** * * * * * * * * * * *
178977 CCTCAAATAATCATAA-TGAATTAAACTTATTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAAACTTTTTA
309 GTTCAAATAGTCA-AACT-ATTTGAAC-TAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATC-TCTTA
* * * * ** * * * *
179040 CTTATTAATTGCCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAG-CTTGTGTGA
370 CTCAGTAATT--TTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTC-AAATAAGAC-TATATCA
* * * *** * * *
179101 ATAGAAAAAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTTATAGCGATTTTAAATAGATAATTGTT--AA
431 ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAA
** *
179164 -A--TA-AAC------AA--A-TT---T------A-T--TTTTTAAATATCTTTATTATT-ATTT
496 TAGTTATAACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAA-ATCTTGCTTATTAATTG
* * * * * * ** * * *
179203 TTTAGATTATTAATAAATTAGTGTTATTCTATTTTGAATAAGCTTATATAAA-ATGAAACAATTC
560 TCTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACA-AAAACAATTG
* * * * *
179267 TTTTATGACAAAAC-AAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTA
623 TTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTG--A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTA
* * * * *
179331 CTTGATC-TACTTCAATAAACATATTTA
683 TTTGAACTTA-TTCGACAAACA-AATTA
* * ** *
179358 TTTTTAAAATTTTCTACTCATTAATTATCAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-T-TTAATATTAATAAATT-G-ATTATTTT-A-TTGAAA
* * * ** * * * * * * *
179422 T-AGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTAAAATATAGCAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAA
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
** * * *
179486 ATAATTGCTCAAATAATAATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC
125 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * * **
179549 TT--TTATTAATTTTTGAAACATTAATAGATTAGTATTACCTTATTCTGAACAAACTTATATGAA
188 TTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATACAAA
* * * *
179612 CAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCT-ATAA
252 CAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AA
* * * * * * * * * * *
179676 TAATCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAATAGAACT-ATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAAT
316 TAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCAAGCAAACAG-ATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTAAT
* * * ** * * * * **
179740 ATTTGAAATACTAATAAATTTGT-TGTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCCAAA-AA
379 TTTTGAAATATTAACAAATTAATAT-TATTATATTTCAAATAAGACTA-TATCAA-TAGAAACAA
* * *
179802 CTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC--AT-GTCT-TA
441 -TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGT-TATA
* * * * * ** * * *
179863 AATATTTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAG-TTATTAGTT-TTTGGA
504 ACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAA-AATCTT-GCTTATTAATTGTCT-AA
* * * * * * * ** * * *
179926 ATATTATTAGATTAGTTTTATTTT--TTTATGAATAAGCTTCTACGAACAAAAATAATTATTTAA
565 ATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCA--AAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * * * *
179989 TAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAA
628 TGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAA----ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
** *
180054 C-TAGTTCGGTAAACATATTTA
689 CTTA-TTCGACAAACA-AATTA
* *** * *
180075 TTTTTCAAA-TCACTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTATCATTATTTTATTTTG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAA-T-TGATTATTTTA--TTGAAA
* * * * * ** *
180138 TAAGGTTGAATG-TTCA-AAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGAAATAA-CATTTTGAAA
60 TAAGCTTGTATGAAT-AGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAA
* * * * * * * * *
180200 TAGATAATTATTGACAGAGTCATAATTATTTAAGCTAATTCGATAAATAGATTTACTTTGTAAA-
122 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA-CT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAAT
* * **
180264 -TC--ACTT-TGTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCA-AATAAGGTTGC
185 CTCTTACTTAT-TAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTAT
** ** * * *
180324 ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-T-ATAAAGATTTGAAATAGACAATTGTT
247 ACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * * * * * *
180387 CATATAGTCTTAATTATTTAAACT-GCTTC-AGCAAATATATTTATTTTTTATATCTGTTAGTTA
312 CAAATAGTC-AAACTATTTGAACTAG--TCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCA
* * ** * * ** * * *
180450 TTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAG-CTCATATGAATTGAAA
374 GTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACT-ATATCAATAGAAA
* * * * * * * * * *
180514 CAATTAGTATATAATAGAATAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG----
438 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * **
180575 --------GAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAA
503 AACTAATTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAAA-ATCTTGCTTATTAATTGTCTAAA
* * * * * * * ** *
180632 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGATGAAAAGCAATTGTTTTATGA
566 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGA
** * * * * * * * *
180697 TGAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTCAAAAACATAATTGGCCAAAATGGGCAAAATTATTTGAAC
631 CAAAACAAAAAG-TCATAACGATTTGAAATA-ATTATT---C-AAATAGCCATAACTATTTGAAC
** * *
180761 CGATTCAACAAACTAACTTA
690 TTATTCGACAAAC-AAATTA
* * * * ** * *
180781 CTTTTT-AAATCTCTAACTTATAAAAATTTGAAATATTAATAAAGTAAT-ATTATTTTATTTTAG
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTAT--TAATTTTTAATATTAATAAA-T--TGATTATTTTA-TTGAA
* * * * * * * * *
180844 ATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATAATAAAACAGAAGGTTATATTTATTTTAAAT
59 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
* * ** **
180908 TGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACGGAA-TTATTTTTTGAAA
123 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGATAAA-TAAATTTATTTTTT-AAA
* ** * * * * **
180972 TATCTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTC-GAACAAGCACA
184 TCTCTTACTTATTAA-GTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTA
** * * * * ** *
181035 TATGAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAA-AGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTG
246 TACAAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * ** * * * * *
181099 TTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGT-TTGCCAAACACATTTATTTTTTAAACCTCTTACTT
310 TTCAAATAGTC-AAACTATTTGAACTAGTCAAG-CAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTC
** * * * * * * * * * *
181163 AG-AATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGTAATATTTTACTTCGAATAAG-CTTGTATGAACAAA
373 AGTAATTTTTGA-AATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGAC-TATATCAATAGA
* * ** * ** * * * **
181225 AACAATTGTTTTAAGGTAAAAC-AAAGATCATAACGATTTAAGATAGATAATTGTTCAAATAGCC
436 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTT
* * * * * *
181289 ATAATTATTTGAACTAGTTTAAG-AAA-AAATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTAATT-TTTGA
501 ATAACTAATTGAACTAG-TTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATCTTGCTTATTAATTGTCT-A
* * ** ** * ** * * * *
181349 AATATTAGTAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTAC
564 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * ** *
181414 AACAAAACGAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCATAGCTCAAATAAACATGACTATTTGAAC
629 GACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATA-AT--TA-TTCAAATAGCCATAACTATTTGAAC
* * ** *
181479 TTGTTTGGTAAACAGATTTA
690 TTATTCGACAAACA-AATTA
* * * *
181499 TTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AA
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATT-G-ATTATTTTA--TTGAAA
* * * * *
181563 TAAACTTGTATGAATGGAAACAATTGTTTTTATGCCAAAACAAAA---TATAATAACTTTGAAAT
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAAT
* * * * * *
181625 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTCGCTTGATAAATCAATTTATTTTTTAAATA
123 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT-TTAACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * *
181690 TTTTGCTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTA-TAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTTTAT
186 TCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATAC
* * ** * * * * *
181754 GAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAGGGTTATAACGATTTGAAATGGATAATTGTTCA
249 AAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* *** * * * * * *
181819 AATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTA-TG
314 AATAGTCA-AACTATTTGAACT-AGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGT-
* * * * ** * * *
181881 AATTTTAGGAATATTAGA-AAATTTATATTATTTTATTT-AATATAAG-CTCGCATGAACAGAAC
376 AATTTTTGAAATATTA-ACAAATTAATATTATTATATTTCAA-ATAAGACT-ATATCAATAGAAA
* * * * * * * * *
181943 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTATTTTGAATTAGATAATTATTCAGATAGTCAT
438 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
* * * * * ** * * * *
182008 GACTATTTGAA-TATGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAATTTTTTTACTCATTAATT-TTTGA
503 AACTAATTGAACTA-GTTCAGTAAACAAATTGA-TTTTTAA-AATCTTGCTTATTAATTGTCT-A
* * * ** * * *** *
182071 GATATTAATAAGTTAGTATTATTTTCTTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTGTTTTAT
564 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
182136 TACAAAAC-AAAAGTCACAATGATTTGAATAAATAATTAGTCAAATAGTCATGACTATTTGAACT
629 GACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG---AAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT
* * * *
182200 TGTTCCATAAACATATTTA
691 TATTCGACAAACA-AATTA
* * * * * * **
182219 TTTTTTAAATATTTTAATTATTAATTGTTGAAAATTTAATAAATTAATATTATTTTAATCAAAAT
1 TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATT-TTTAATA-TTAATAAATT--GATTATTTT-ATTGAAAT
* * * **
182284 AAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATA
61 AAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * ** ** * * *
182347 AATAATTGTTTAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTCAAATCT
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAC-TGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * *
182412 TTTACTTATTAA-TTGTCT-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGATTGTAT
187 CTTACTTATTAAGTT-T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCAGAATAAGCTTATA-
* * * * * * * ** * *
182475 GAATAGAAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATTCTGATTTCAAATAGATAATTAT
248 CAA-A-CAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
182540 TCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGACTCAGT-TTTTAAATAT-TTGCCT
311 TCAAATAGTCA-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGA-TTAATATTTTAAATCTCTT-ACT
* * * * ** * * *
182602 TA-TCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGA-ATTATGT-TGTTTTGAATAAG-CTTGTATGAAC
372 CAGT-AATTTTTGAAATATTAACAAATTA-ATATTAT-TATATTTCAAATAAGAC-TATATCAAT
* * * *
182663 AGAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACT
433 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAA-T
* * * * ** *** * * * *
182728 A-TCATAATTATTTGCACTAG-TCATGCCAATGGATTCATTTTTTAAATCCGTTACTTTTTAATT
497 AGTTATAACTAATTGAACTAGTTCA-GTAAACAAATTGATTTTTAAAAT-C-TTGCTTATTAATT
* * *** * * * * * *
182791 -TTTAGAATGTTAATAAATTTGCATTACTTTATTTCAAATAAAAC-TGTATCAATAAAAACAATT
559 GTCTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAA-AAAGCTTATATAAACAAAAACAATT
* * ** ** * * **
182854 ATTTTATG--GAAACAAATGGGAATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTA
622 GTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG----AAATAATTATTCAAATAGCCATAACTA
* * * ** *
182917 ATTGAACTGGT-TTAG-TAAAGGATTTA
683 TTTGAACT--TATTCGACAAACAAATTA
* * * * *
182943 GTTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAA
1 -TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTT--TAATATTAATAAATT--GATTATTTTATT-GAAA
* * ** * * * * ** * * ** * *
183004 CAAACTTAAATGAACA-AAACATTTGTTCTACAATAAGAA-AAAAGGTCATAACAATTTAAAAGA
60 TAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAA-AACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* * * ** *
183067 GATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * ** * * * *
183132 CTAAGTTATTCA-TTTTCATAATATTGTTAGATTAGTATTATTTTATTTCA-TATAAGCTTGTAT
187 CTTACTTATTAAGTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCAGAATAAGCTTATAC
* ** * * * * * ** * *
183195 TAACCTAAATAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTTA
249 AAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * ** * * * * * *
183260 AATAATCATAACTATTTGCACCGGTTC-AGTAAATAAATTTAT-TTATTCAATCT-TCTACTCAT
314 AATAGTCA-AACTATTTGAACTAG-TCAAGCAAACAGATTAATATT-TTAAATCTCT-TACTCAG
* ** * * * * *
183322 TAATTTTTGAAATACTAA-AAATTAGCATTATTTTATTTCGAAT-AGGCTAT-TACGATGAAAAA
375 TAATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATAT-CAAT-AGAAA
** ** ** * * * **
183384 CAATTATTTTATGACAAGTCAAAAATTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCAT
438 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * **
183449 AATTACTTGAATTGATTTGA-TAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATT-T-TG
503 AACTAATTGAACT-AGTTCAGTAAACAAATTGATTTTTAAAATCT--TGCTTATT-AATTGTCT-
* * *** * * * * *
183510 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACTGAAAACATTTGTTTT
563 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAAC-AAAAACAATTGTTTT
* * * * * * * * *
183575 ATTATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTTTTCAAATAGACTTGACTATTTAA
627 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA-TTT-GA-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGA
* * *
183640 ATTTGTTCAGA-AAACATATTTATTT
688 ACTTATTC-GACAAACA-A---ATTA
** * ** * * *
183665 TTTGTTTTAATTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGCTAATAGAATAGTATTATGTTATTTCAAA
1 TTT-TTAAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTT-AATATTAATA-AATTG-ATTATTTTA-TTGAAA
* * * * * * **
183730 TAAGCATGTATGAACT-TAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATA
60 TAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA
* ** * ** *
183794 GATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATACATTTATTTTTTAAATCT
124 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AACT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * ** * * * * * *
183859 CTTATTTATTCA-TTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTCCTTCA-AATAAGGTTGTAT
187 CTTACTTATTAAGTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-ATTCAGAATAAGCTTATAC
* * * *
183921 GAACA-AAACAA--A---TAT--CATAAC---A-AT--T--TGA---G--ATAGATAATTATTTA
249 AAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
183965 AATAGTCATAACTATTTGAACAAGT-ATGGTAAACATATTTAGT-TTTTAAATCTCTTA-T---T
314 AATAGTCA-AACTATTTGAACTAGTCA-AGCAAACAGA-TTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGT
* * * * *** * * *
184024 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT-ATGATAATTTTTTATGAATAAAAACA
376 AATTTTTGAAATATTAACAAATTAATATTATTATATTTCA-AATAAGACTATATCAATAGAAACA
* * ** * * *
184087 ATTGTTTTATG--AAAA-AAAATGTTGTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA-TTCATA
440 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTT-ATA
* * * * * * *
184148 ACTATTTGAATTCA-TT-TGTTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATT-TTTG
504 ACTAATTGAACT-AGTTCAG-TAAACAAATTGA-TTTTTAAAATC--TTGCTTATTAATTGTCT-
* * * * ** * *
184210 AAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATCAACAAAACCAATTGTTTTA
563 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * * *
184275 TGACGAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCA-AACTATTTGAA
628 TGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG--A-A-ATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAA
** * *
184339 CTTATTCGGTAAACAGATTC
689 CTTATTCGACAAACAAATTA
* * * *
184359 TTCTTT-TAATTCTTTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-ATTATTTTACATCAAAT
1 TT-TTTAAAATT-TTTTACTTATTAATTTTT--AATATTAATAAATTGATTATTTTA-TTGAAAT
** * * * * * * * * * *
184422 AAATTTATATGAACT-CAAACAATTATTTTATTACAAAAGAAATGGTCAAAATAATTTGAAATAG
61 AAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
* *
184486 ATAATTACTCAAATCA-TCATGACTATTT
125 ATAATTATTCAAAT-AGTCATAACTATTT
184514 TGTCATAACG
Statistics
Matches: 22437, Mismatches: 4883, Indels: 4098
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
649 3 0.00
650 9 0.00
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652 72 0.00
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657 1 0.00
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747 1 0.00
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751 27 0.00
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769 3 0.00
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771 10 0.00
772 2 0.00
773 9 0.00
774 8 0.00
775 9 0.00
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777 2 0.00
778 2 0.00
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783 12 0.00
784 4 0.00
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788 15 0.00
789 12 0.00
790 7 0.00
791 5 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (708 bp):
TTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAATATTAATAAATTGATTATTTTATTGAAATAAGCT
TGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATT
ATTCAAATAGTCATAACTATTTAACTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
TAAGTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTATTCAGAATAAGCTTATACAAACAGAAACAA
TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAACT
ATTTGAACTAGTCAAGCAAACAGATTAATATTTTAAATCTCTTACTCAGTAATTTTTGAAATATT
AACAAATTAATATTATTATATTTCAAATAAGACTATATCAATAGAAACAATTATTTTATGACAAA
ACAAAAGGTCATAATAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTC
AGTAAACAAATTGATTTTTAAAATCTTGCTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAATATTAT
TTTAATTCAAAAAAGCTTATATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACG
ATTTGAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTA
Found at i:157524 original size:182 final size:181
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156159 TTTGGTAAAC
* * * * * *
156169 TTTTCTTAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTTG
1 TTTT-TTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * * * *
156232 AATAAGCATGTAT-AAAATGAAACAATT-TTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAATGATTTAAAA
63 AATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * *
156295 TAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTT-TGACAAACACATTTA
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTA
* * ** ** * * ** **
156350 TTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTTTTAGAATATTTTTAGTTTAGCAATATTTTGCTCCGAA
1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA
* * * *
156414 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAG
65 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
156478 ATAATTGTCCAAACAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCCGCAAATAGATTTA
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
* * * * * * *
156530 GTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATCATTTTATTTTGAAT
1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
*** * * ** *
156591 ATTTTTGTATGAATAAAAACAATT-TTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAAATTT-AAATAG
66 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-GATTTGAAATAG
* * * *
156654 ATAATTGTTCGAATGGACA-AGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
*** * * *
156706 TTTTTTAAATCTCCAACTTATTAAATTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATT-TCAA
1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AA
* * * * *
156769 ATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGATCATAACAATTT-AAATT
64 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-T
* * * * * *
156833 AAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACTCGTT-TGATAAATAGATTTA
128 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTA
* * * *
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1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * * * * * * *
156952 ATGCTTTTATGCATAGAAACAATTGGTTTATGATAAAACTAAAGGTCATAATGATTTGAAATATA
66 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
157017 TAATTGTTCAGATATTCATAACTATTTGAACGTATTCAGAAAATATATTTA
131 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
* * * * * * *
157068 TTTTTTATAT-ATTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTA-AATTATTTTATTCGAAA
1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAA
* * * * * * * * * *
157131 TAAACTTGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATGATAAAACTAAATGTCATAATGTTTTGAAATAA
65 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * *
157196 ATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTATTCAGTAAA-AGGATTCT-
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATA-GATT-TA
* * * * * *
157248 TTTTTT-AATTTTGTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTGTCTTACTT-TAA
1 TTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAA
** * **
157311 ATAAGCTTACATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTG-CAAAAGAAAAGGTCATAGTGATTTGAAA
64 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
157374 TTGATAATTATTCAAATAGCCATGATTATTTGAACTTGTTCAGTAAATATATTTA
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
* * *
157429 TTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAA
1 -TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA
* * * * * * * * *
157494 TAAACTTGTATAAATAGAAACAAGTGTTTTATGTCAAAATAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAA
65 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
** * * *
157559 ATAATTACTCAAATAGACATAA-TGATTTAAACTTGTTCGGTAAATAGATTTA
130 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
** *
157611 TTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAACTACCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-TG
1 TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-T-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-
* * * * * * *
157673 AAATAAGCTTGTGTGAATAGAAAAAATTATTTTATGAAAAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTTAA
62 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * *
157738 ATAGATAATTGTTAAAACAGTCATAATTATTTAAACTTGTTAAATAAACAAATTTA
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* *
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1 TTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA--ATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * *
157855 CAAATAAGCTTATATAAACTA-AAACAATTCTTTTATGAAAAAAC-AAAGGATCATAATGATTTG
62 -AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTG
* * * * * * * *
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* * * * *
157976 TTTTTAAAAT-TTTCTACTTATTAATTGTCGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAA
1 TTTTTTAAATCTTT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA
* * ** *
158040 T-AGCTTGTATGGATAGAAACAATTATTTTAAAACAGAACCAAAA-GTCATAACGATTTGAAATA
65 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * *
158103 AATAATTGCTCGAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAAATAGATTTTA
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* ** ** * * *
158157 TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATACTAATAGTTTAGTATTACCTTATTTTGAAC
1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * * * * * *
158218 AAACATATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
66 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * *
158283 TAATTGCT-ACAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTTAAGTAAACAGAATTA
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* * * * *
158334 TTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAAT
1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * *
158399 AAG-TTAGTATGAATTCA-AAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
66 AAGCTT-GTATGAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * *
158462 TAGATAATTGTTCATAT-GTCTTAAATATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTA
127 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTA
* * * ** * ** * *
158516 TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGCATATTATTTGATTAGTTTTATTTTATTCTGAAT
1 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * * * * * * * * **
158581 AAGCTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAGTTTA
66 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * **
158646 CAAATGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTA
131 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
* * * *
158697 TTTTTCAAAT-TACTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTA-TCATTATTTTATTCTGA
1 TTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCTAA
* * * * * * * *
158760 ATAAGGTTGAATG-TTCAAAAACAATTATTATATGACCAAA-AAAAGGTAATAAC-ATTTTGAAA
64 ATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAA
* * * * * * * ** * *
158822 TTA-ATAATTGTTGACAGAGCCATAATTGTTTGAGCTAATTCAGTAAACAGATTCA
127 -TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
* * ** * *
158877 CTTTTTAAATC----ACCTT-GTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTACTT-TGA
1 TTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAA
* * *
158936 ATAAGGTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACATAACAAA
64 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
158980 TTGTTCAAAT
Statistics
Matches: 2093, Mismatches: 439, Indels: 200
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
175 14 0.01
176 180 0.09
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183 180 0.09
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA
Found at i:159370 original size:164 final size:163
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159086 AATAATTTTA
* * **
159096 TATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCATAGC
1 TATGAATAGAAACAATTGGTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAAAATAGC
* * ** *
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*
159225 TTAATTTTAAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTT
129 TTAATTTTAAAAATATTAATAAATTGA-CATTATTT
** ** * ** *
159260 TATGAATAGAAACTTTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTGC
1 TATGAATAGAAACAATTGGTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAAAATAGC
* * * **
159325 TCAAATAGTCATAATTATTTGAACATGTTCAG-AAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTACTTAT
66 TCAAATAGACATAACTATTTGAACATGTTCAGTAAAACA-ATTTATTTTGTAAAATTCAACTTAT
***
159389 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTGACATTATTT
130 TAATTTTAAAAATATTAATAAATTGACATTATTT
159423 TAT
1 TAT
159426 TTGAAATAAG
Statistics
Matches: 137, Mismatches: 26, Indels: 7
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
163 42 0.31
164 91 0.66
165 4 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (163 bp):
TATGAATAGAAACAATTGGTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAAAATAGC
TCAAATAGACATAACTATTTGAACATGTTCAGTAAAACAATTTATTTTGTAAAATTCAACTTATT
AATTTTAAAAATATTAATAAATTGACATTATTT
Found at i:159584 original size:343 final size:341
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Indices: 158977--159605 Score: 784
Period size: 343 Copynumber: 1.8 Consensus size: 341
158967 ATGACATAAC
* *
158977 AAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCGAGAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCT
1 AAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCGAGAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCT
* * ** *
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* * * *
159107 ACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCATAGCTCAAATAGACA
131 ACAATTATTTTACAACAAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACA
* * * * * *
159172 TGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACCAATTTATTTTGTAAATCTCCAACTTATTAATTTTAAAA
196 TAACTATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATTCATTTTGTAAATCTCCAACTCATTAATTTTAAAA
*
159237 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGAATAGAAACTTTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
261 ATATTAATAAATTAGAATTATTTTATGAATAGAAACTTTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
159302 AATGATTTGAAATAGA
326 AATGATTTGAAATAGA
* * *
159318 AAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-ATGTTC-AGAAAACATATTTATTTTTTAAAATT
1 AAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTA-GTTCGAG-AAACAGATTTAGTTTTT-AAA-T
* * *
159381 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-GACATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGCATG
62 CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-CATTATTTTGATTTG-AATAAGCTTACATG
* ** * *** * * *
159444 AATAG-AGCAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAA
124 AATAGAAACAATTATTTTACAACAAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAA
* * **
159508 ATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATTCATTTCT-TAATTCTCTTACTCATTAA
189 ATAGACATAACTATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATTCATTT-TGTAAATCTCCAACTCATTAA
**
159572 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTAT
253 TTTTAAAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTAT
159606 TTCAAATAAG
Statistics
Matches: 240, Mismatches: 40, Indels: 14
0.82 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
340 3 0.01
341 47 0.20
342 3 0.01
343 135 0.56
344 52 0.22
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (341 bp):
AAATTGCTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCGAGAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCT
TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTGATTTGAATAAGCTTACATGAATAGAA
ACAATTATTTTACAACAAAACAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATAGACA
TAACTATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATTCATTTTGTAAATCTCCAACTCATTAATTTTAAAA
ATATTAATAAATTAGAATTATTTTATGAATAGAAACTTTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT
AATGATTTGAAATAGA
Found at i:159615 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 159260--170770 Score: 5204
Period size: 181 Copynumber: 64.2 Consensus size: 179
159250 AGTATTATTT
** * * * *
159260 TATGAATAGAAACTTTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTGC
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
159325 TCAAATAGTCATAATTATTTGAACATGTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAAAT-T-TTACTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTA
* * *
159388 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-GACATTATTTTATTTGAAATAAGCTTG
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
159440 CATGAATAGAGCAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTT
1 TATGAATAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *
159505 TAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATTCATTTCTTAATTCTCTTACTCATT
66 CAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* *
159570 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
130 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
159620 TATGAACT-GAAACAATTG-TTTATTACAAAATAAAAAGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTA
1 TATGAA-TAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
159683 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCA--AAAAAATATTTATTTCTTAAATCAT-TTACT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATC-TCTTACT
** * * * **
159745 TATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTCA
126 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * ** ** * * *
159799 TATAAACAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTTGTAACAATTTGAAATACAAAATTCT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * * *
159864 TCAAATATTCCTAAAGATTTGAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * ** *
159929 TAATTGTCTT--AATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTAGAAATAAGCTTT
129 TAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* *** * ** * *
159980 TATGAATAGAAAAACCCATTTTATAACACAAA-AAAAGGTTC-TAGCGATTTCAAATATATAATT
1 TATGAATAGAACAA-TTGTTTTATGACA-AAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
160043 GTTAAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTGATTTTTTAAATCTCTTAATT
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * ** ** *
160108 AGTAATTTTTGGAATATTAATAACGT-GTTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * ** * * *
160161 TATGAACAGAAATAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTGAAATAGATATTTA
1 TATGAATAG-AA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * ** * * *
160225 TTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTT-GATAAACGTATTTATTTTTGAAATTTTTTACTT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * *
160289 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAATCTTA
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * * ** * * *
160342 TATGAACAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGC
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * ** *
160407 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTATTTGGTAAATAGCTTTA-TTTTTAAA-AT-TT-CTTATT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
160468 AATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTTCAAAAAAACTTA
130 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * *
160518 TATGAACAAAAAAATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
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* * * * *
160647 TTAATTTTTGAAATATCAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAGGCTAG
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * *
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* * * *
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1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *
160938 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG----GT--TC-AA--TA------AACATCTTTTACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTAT
* * * *
160988 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTA
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * * ** * * *
161039 TATGAACAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGC
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * ** *
161104 TCAAATATTCATAATTATTTGAATTATTTGGTAAATAGCTTTA-TTTTTAAA-AT-TT-CTTATT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
161165 AATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTAGTTCAAACAAACTTA
130 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * *
161216 TATGAACAAAAAAATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
161281 TCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TAGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * *
161345 TTAATTTTTGAAATATCAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAG
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * *
161397 TATGAATTGAAAAGATTGTTTTACGACAAAAC--AA----A-AACGATATGAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
161455 T-AATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTT-GACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTC
65 TCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * *
161518 ATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
161571 TATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTAT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *
161636 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG----GT--TC-AA--TA------AACATCTTTTACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTAT
* * * *
161686 TAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAACTTG
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * *
161737 TATG-ATCAAAAACAATTATTGTT-TGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATT
1 TATGAAT--AGAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
161800 GTTGAAAT-GGCTATAATTTTTTTAACTGATTTGGT-AA-AGA--GA----TT-CA-CT-TT--T
63 GTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTG-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * ** * *
161851 TA--AA--TTTGGAATATCAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCCTA
126 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * ** *
161901 TATGAACTTA-AATAATTGTTTTATAACAAAACAATAGGTCATAACT-ATTTTTAATGGATAATT
1 TATGAA--TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
161964 GTTCAAATAATCATAACTATTTGGA-TTTGTTCGATAAAAAAATTTATCTTTTT---T-TAC-T-
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCT-CTTA
* * *** *
162022 CTTATTAATTTTTGAAATGTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT
124 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* ** * * * *
162078 TATAAACCGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTAT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * *
162143 TCAAATATTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTTCTTTTTTTCAAATCTTTTGGCT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTT-ATTTTTT-AAATCTCTT-ACT
** * * **
162208 CGTTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAATTTG-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
126 TATTAA-TTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
162262 TAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTACAA-AAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATT
1 TATGAATA-G-AACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * ** * ** * * *
162325 ATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAACTAGTACAG-CAACACATTTATATTTTAAATCT-TTACTT
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * ** * *
162388 ATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTA-T-TTTTAACT-AAATAACCTTC
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * *
162438 TATG-ATCAAAAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAACGATTTGAGATTGATAATTG
1 TATGAAT--AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
162501 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTTAACAGATTTATTTTTTAAA--TCTTA--TA
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* **
162562 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTG
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * *
162614 TATTAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAATCAAATGGTTATAATGATTTTAAATAGAGAATTGT
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * ** *
162679 TCAAATAGTAATAATTATTCGAACTTGTTCAATAAACGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * *
162744 TTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTA-TAAATAATTTA-TTCTGAATAAGCTTA
128 TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* * * * * ** *
162796 TACGAATTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTACATATAGATAATTGT
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * ** * * *
162861 TCTAATAGTCTTAACTGTTTAAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTAAAATCTCCTACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
** * *
162926 TAATTTTAAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-AGAATAAGCTTG
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTG
** * * * * ** * *
162977 TACAAACA-AAAAATTTCTTTTATGACAAAAGAAATTGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGT
1 TATGAATAGAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * ** * * * **
163041 TCATATAGCCTTAACTGTTTGAACTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * ** *
163106 TGAGTTTTT-TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAGTAAAATAG
129 T-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
163157 TATGAACAAAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAGAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
163222 TTAAATAGTCAAAACTATTTGAAATTTGGTTTGGTAAACATATTCACTTTTTAAATCTCTCA-TT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTG-AA-CT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * *
163286 GATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTA
127 -ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
163340 TATTAACAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
1 TATGAATAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * ** * * * * * * *
163405 CAAATAGTTATAATTATTTGTATTGGTCCAATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAGTTATA
66 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
163470 AATTTTTGAAATATCAATAAATTAGT-TTTTTTTATTCCAAATATGCTTG
130 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
163519 TATGAGCTA-AACAAATATTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTAT
1 TATGA-ATAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * ** *
163582 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * *
163647 TAATTTTTAAAATATTAGTAAAGTAGTATTCTTTTATTTCGAATAAG-TTCT
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-G
* * *
163698 TATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGTCAGATCA
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAA-A-T-AGAT-A
* * * *
163763 ATTGTTCAAATAGTCCA-ATCTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTTAAATCTC
60 ATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTA--TTTTTTAAATCTC
* * * ** * * *
163827 ATGCTCATTAATTTTTTCAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-CTCTAAGTAAGCTTG
121 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* * * * * ** *
163886 TACGAATTAAAATAAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTT
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * *
163951 TC-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * *
164015 TTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTG
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
164067 TATAAAAACAAATAATTGTTTTAT-----AAC-AAA-TTCATAAT-ATTT-AGATAGATAA---T
1 TATGAATA-GAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
164120 TAAAATAGTTA-AACT-TTTGAA-T-TTTCA-AAAAC-AATTTA-GTTTT--AT-TC--A--TA-
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* **
164170 TAATTTTT--AATA-TAA-AATAATA-TATTTATTTTA-TTCTAAATAATTTTG
129 TAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTA-TTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* ** ** * *
164218 TAATGAATTA-AACAA-TGTTTTTATGA-ATATTAAAAAATTATAA-CATTTG-AATA-ATAATT
1 T-ATGAA-TAGAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * *
164277 -ATCAAATA--CAT-A-TATTTGAACTTGTTT-GATAAA-TAA--T-TTTTTTCAA--TCATAC-
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * *
164329 TATT-ATTTTAG-AATA-TAATAAAATAAT-TTATTATATTTCAAATTAA--TTG
126 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA-TAAGCTTG
* * * * * *
164378 TATGAATATAAAAATAATGTTTT-T-AC-AAAC--AAGTTCA-AA--ATTTTAAATTAAAAAAAT
1 TATGAATAGAACAAT--TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-T-AGATAAT
* * * * * **
164435 TATT---AT--TCA-AATTATTATG-ACTTGTTT-TTATAACAAATATTTAACTATTTGATTTCA
62 TGTTCAAATAGTCATAACTATT-TGAAC-TGTTTAGTA-AAC-AA-ATTT-A-TTTTTTAAATC-
* ** * * * ** * * *
164492 ACAAAC-CATTTATTTTTTAAATATCT--T-GCTTATTAATT-TTTGGAATATTATTAAATTAGT
119 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT-TAATAAATTAGT-ATTATTT----TATT-TCAAATAAG-
* *
164552 ATTA
176 CTTG
* * * * * * * *
164556 TTTTAATTTGAA-TA-TGCTTGTATGA-AAAGA-AATAGTTGTTTTATGACAAAATAAAGATCAT
1 TATGAA-TAGAACAATTG-TTTTATGACAAA-ACAAAAG--G-----T--C---ATAATGAT-TT
* ** * * * * *
164617 AACAATTTGAGATAGATAATT-ATTCAAATAGTTATAACTATTTAAATTGTTTTAGTAAATAGAT
50 GA-AA--T-AGATA-ATTGTTCA----AATAGTCATAACTATTTGAACTGTT-TAGTAAACAAAT
* * * ** **
164681 TTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAATTATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTTG
105 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
**
164741 AATAATTTTG
170 AATAAGCTTG
* * * * *
164751 CATGAACAGAAATAATTG-TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * * *
164815 TCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAGCAGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* ** *
164880 TAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTG
129 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * *
164931 TGTGAATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTG
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *
164995 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-TACTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT--TTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * * **
165059 ATTAATTTTTGGAATATTGATAAAATAATATTAGTTTATTT-TTATACA-CTTG
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTG
* * * * * * *
165111 TATGAACAAAAATAATTGGTTTATGACAAAAC-AAAGATCCTAACT-ATTTAAAATAGATAATTG
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
165174 TTCAAATAGTCCTAACTATTTGAATGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTA
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* *
165238 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTGTTTTATTT-AGAATAAGCTTG
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTG
* * * ** * * * *
165290 TATAAACAAAAACAATTGTTTTATGGTAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
165355 TCAAATAGTCATAACTATTTG-AGTTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAACTCTCTTACTCA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * ** * *
165419 -TCA------AAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCCTA
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * *
165464 TATGAACTA-ATACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGATAAATA
1 TATGAA-TAGA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *
165528 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCT-TCTACTT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTT
* * ** * * * *
165592 ATTAACTATCAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTG
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* * * * * *
165645 TATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA-AAAAATATAT
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA-AT-T
* *
165709 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTGGATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACT
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * *
165772 TATTAATTGTTTGAATTA-TAATAAATTTGTATTATTTTAATTTTAAA-AAGCTTG
126 TATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * ** *
165826 CAGGAATGGCAAAAATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTTATGGTGGTTTGAAATA-AGTAATT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATT
* * * * * * *
165889 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTTTTTA-TAAACAAATTCAGTTTTTAAATCCCTTATTT
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * *
165953 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTA-TTCTGAATAAGCTTG
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* * * * *
166006 TATGAACAAAAAAATTTGTTTTGTGACAAAA-TAAAGGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAATAGAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** ** * *
166070 TTCAAACAATCATAACTATTTGTATTGGTCAAGCCAACAGATTCATTTTTTAAAATC-CATTACT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTC-TTACT
* * * * **
166134 TATTAATTTTTAAAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TG
126 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTG
* * * * * * * * *
166188 CATCAGTAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAAAG-TTATGAAATAAATAATTG
1 TATGAAT-AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTG
* * * * *
166252 TTTAAATTA-TTATAAGTAATTGAACTAGTTTTA-TGAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CT
64 TTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * *
166311 TATTAATTTTTAAAAAATTAAAAAATTAATATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTA
126 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* * * * * *
166365 TATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATATATAATTAT
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * ** *
166429 TCATATAGCCTTAACTTTTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGC-TA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTA
* * * * *
166493 TTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTGGTATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTG
128 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * *
166544 CATGAACATA-AATAATTCTTTTATGACAAAACAGAAGGTTATAAAGATTTGAAATATATAATTG
1 TATG-A-ATAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
166608 TTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAAC--A--GA-----T-AATCTCTTAATTA
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
**
166663 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTG
128 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTG
* * * * * *
166715 TATG-ATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTGAAAAAGATAATTG
1 TATGAAT--AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * ** * * *
166779 TTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTGATTTCA-TAAACTGATATATGTTTTAAATCTCTAACTT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * *** *
166843 -TTCAATTTTT-AAAGTTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATACA-CTTT
127 ATT-AATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTG
* ** *
166896 TATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
166960 TCAAATAGTCAAAAGTATTTGAATGTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TATTTGCTT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT-CTTACTT
* ** * *
167024 ATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATG
127 ATTAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
** * * * * * *
167077 TATGAACCGAAACAATTATTTTATCACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * **
167142 TCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTT-GACAAATACATTTATTTTTTAAGCCTCTTACTTA
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *** * * * * * *
167206 TAAATTTTT-AGAATATTATTGGTTTAGCAATATTTTACTCCTAATAAG-TTCA
128 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-G
* * *** * *
167258 TATGGATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGATATAAATAATTGT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * *
167322 TCACATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * **
167383 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTA-ATCTGAATAATTTTG
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* * * * * *
167434 TAAGAATAGAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATAATTAT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
167499 TTAAATAGTCATAACTGTTTGAACTCATTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTGACTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * *
167564 TAATTTTTGGAATTTTATTAAATTAGTATTGTTTTATTCCAAATAAGCTTT
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * ** * *
167615 TATGAATAGAAACAACTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATTGATAATTGT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * *
167680 TCAAATAGTCATAACCATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * ** * *
167744 TAATCTTTGGAATTTTGGTAAATTTA-TATTATTTTATTCCAAATGAGCTTG
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* *
167795 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAACAA-GTCATAATGATTTGAAATAGACAATTG
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
167859 TTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTA-TTC
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-
* * * *
167923 ATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * ** ** ** *
167976 TGTGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAATAGA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
168041 TCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTTTTTGGTAAAC--ATAT-TTTTTTAAA-----T-CTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* ** * * * *
168097 TAATTCTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGA-TCCGAATAAGCTAG
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTG
* * * ** * * * * * * * * *
168148 TATG-A-ACAATAATTGTTCATATAGTTATAAC-TAA-TTGA-ATTGGTTTGGCAAACATATTTA
1 TATGAATAGAACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-G-AAATAGA-TAA
* * * * ** * * * *
168208 TTTTTTAAAT-CTCTTATTTA-TT-AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT--ATT
61 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTT--AGTA--AACAAATT--TATT-TTTTAAATC
** * * * * *** *** ***
168267 TCGAAC--A--AACTTATGTGAACA-A--AAAAAATTTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTAATAA
119 TCTTACTTATTAA-TT-TTTGAA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAA--TAAGCT
*
168325 CG
178 TG
* * ** * * ** ** * * *
168327 ATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAGTAGTC-ATA-ATTATTTGA-AAT-AGTTCT-ACAA-ACAA
1 -TATG-AATAGAACAATTGTTTTA-T-GACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TT-TGA-AATAGAT
* * * * * * * * * *
168385 AATTGTT---AT-GTCTAGAAATAGATTAT-TATTCATATAGCCTTAACTACTTACATTGGTTTG
59 AATTGTTCAAATAGTC-ATAACT--ATT-TGAACT-GTTTAG--TAAACAAATT-TATT--TTT-
* * * * * *
168445 GCAAA-CAAAT-TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAATAT
113 -TAAATC---TCTTACTTATT-AAT-T-TT--TGA--AA---T-AT--TA--A-TAAATTAGTAT
*
168508 TATTTTATTCCAAATAAGCTTG
158 TATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * ** *
168530 TATGAACATA-AATAAGTATTTTCTAACAAAATC-AAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATT
1 TATG-A-ATAGAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
** * * * * * * *
168593 GTTCAAACCGTTATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAATATATTTATGTTTTAAATCACTTACTT
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* *
168658 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTG
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * **
168711 TATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAAT--AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * **
168775 TTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCAACTCT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-T
* * * * **
168839 -TTGAACATGTTCAGA-A--AATAAATT--TATT-TTTTAAATTTCACTAATTAATTTTTGG
127 ATT-AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--ATTTCA--AA-TAA-GCTT-G
* * * * * * * ** * **
168894 AATATTAAGAAAATTAAATTATTTTATTCGA-AATAAGCTTGCATGAACGAAACCAATTCTTTTA
1 --TATGAATAGAA--CAATTGTTTTA-T-GACAA-AA-----CA-AAAGGTCA-TAA-T-GATT-
* * * ** * * **
168958 TGACAAAACA-AAATG-TCATAAT-GCTTTGTGA-TATTT-AATTGTTCAAATAGTCATAA-TTA
49 TGA-AATAGATAATTGTTCA-AATAG--TCATAACTATTTGAACTGTT----TAGT-A-AACAAA
*
169017 TTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTACACATTAATTTTT-AGAATATT
104 TTT--A-TT-TTT--T--A-A-A-TC---TCTT-A----CTT----ATTAATTTTTGA-AATATT
*
169081 AATAAATTAGTATTATTTTACTTT-AAATAAGCTTC
145 AATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
169116 TATGGACT-GAAACAATTATTTTATTATAAAAGAAATGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTA
1 TAT-GAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
** * * * *
169180 TTCAAATAGTCAGGACTATTTGAACTTGTTCATTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * *
169245 TT-ACTTGTCAAATTATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTGAATAAACTTG
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* * *
169297 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAA-GTCATAA-AAGTTGAAATAAATAATTGT
1 TATGAATAG-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * *
169359 TCAAATAGTCA-AAATGATTTTAACTTGATTGGTAAGCAGATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTA
65 TCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
*
169423 TTAATTATCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAAAAAGCTTG
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* * * * * * * *
169475 TATGAACA-AAAAATTATATTTTTTGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAAATAATTG
1 TATGAATAGAACAA-T-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * *
169539 TTCAAACAGTCAGAATTATTTAAACTTATTTAGTAAAGAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTTA-TT
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTT
* * * *
169602 ATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA
127 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * ** * *
169655 TATGAACTAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATGATTTGAAATATATAATTTT
1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * *
169720 TCAAATAGTAATGATTATTTGATCTAGTTTAATAAACATATTTATTTTTTTAAT-TTTTAGTTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * *
169784 TGATTGTCGATATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTA
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * ** * * ** * *
169835 TTTGAATAAAAACAATCATTTTA-GAACAGAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTG
1 TATGAAT-AGAACAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * *
169899 CTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GATAAATAGATTTTTTTTTTTAAA--TC-T-CT
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* ** * * ** * * *
169959 TATCAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTA
126 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * *
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1 TATGAA-TAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
170078 TCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTGAATTAT
65 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
170143 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAACTAG
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * * *
170194 TATGAATTCAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATATTTA
1 TATGAA-T-AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * ** * * * *
170259 TTCATATAGTCTTAGA-TAGTTAAAATGGATCGACAAACAAATTT-TTTTTTAATTCTCTTAGTT
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* * *
170322 ATTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG
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** * * *** * ** * * * * *
170375 TAAAAATAAAAATAATAAATTTATAACAAAACAAAAATTTATAATGATTTGAAGT--TTACGTTA
1 TATGAAT-AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA-ATTG
* * ** *
170438 TTCAAATAGTTATAACTATGTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
64 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
*
170503 TTAATTTTTGAAAGATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
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* * * * *
170554 AATGTTCAA-A-AACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATT
1 TATG---AATAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* *** * ** * * * * * *
170617 ATTGTCATAGCCATAACTACGTGAACTTGCTCAATAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTACT
63 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACT
* * *
170682 TATTAATTTTTTAAA-ATTTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAAGTCTT-
126 TATTAATTTTTGAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAG-CTTG
* * * *
170736 TATGAACAAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAA
1 TATGAATAGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
170771 TGTTCAAATA
Statistics
Matches: 8655, Mismatches: 1949, Indels: 1453
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
150 9 0.00
151 32 0.00
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Consensus pattern (179 bp):
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ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
Found at i:160197 original size:362 final size:357
Alignment explanation
Indices: 159327--184513 Score: 4951
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159317 AAAATTGCTC
*
159327 AAATAGTCATAATTATTTGAACATGTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTACTTATTA
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* ** * *
159391 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGACATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAG-AGCAAT
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTG-AATAAGCTTATATGAACAGAAACAAT
* * ** * * *
159455 TATTTTATGACCAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACT
128 TATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * *
159520 ATTTGAACATGTTTAGTAAACAAATTCATTTCTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATT
193 ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATT
* * * *
159585 AATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTATTACAAAA
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* * *
159650 TAAAAAGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTC
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* * * *
159686 AAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCAAAAAAATATTTATTTCTTAAATCATTTACTTATTAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAA
*** * *** * *
159751 TTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTCATATAAACAGAAACAATT
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT
* ** ** * * * * * **
159816 ATTTTATAACAAAACAAAAAGTTGTAACAATTTGAAATACAAAATTCTTCAAATATTCCTAAAGA
129 ATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* *
159881 TTTGAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATGTT
194 TTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATT
* * *
159945 AATAAATTTGTATTATTTTATTAGAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAA-AACCCAT-TTTATAAC
257 AATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAA---ATGTTTATAAC
* * * * * *
160007 ACAAA-AAAAGGTTC-TAGCGATTTCAAATATATAATTGTTA
318 A-AAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * *
160047 AAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTGATTTTTTAAATCTCTTAATTAGTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAA-AAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
** * *
160112 ATTTTTGGAATATTAATAACGTGTTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAATAAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAA-CAA
* * *
160177 TT-TTTTATGACAAAACAAAAAATAATAATGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * ** * *
160241 TATTTGATCTAGTTTGATAAACGTATTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATAT
* * * * * * *
160306 TAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAATCTTATATGAACAGAAACTATTAT-TTTATAATA
256 TAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAAC-A-AATGTTTATAACA
* * ** * * ** *
160370 GAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTC
319 AAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * **** *
160409 AAATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTTGGTAA-ATAGCTTTA-TTTTTAAA-ATTT-CTTATTA
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* * * ** * * *
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64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * *
160532 TTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
127 -TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * *
160597 TTATTTGAA-TAGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAAT
191 CTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAAT
* * * * * * * *
160661 ATCAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAGGC-TAGTATGAATTGAAA-AGATTTTTTTAC
254 ATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTA-TATGAACTGAAACAAATGTTTATA-
* * * * *
160723 GACAAAACAAAAA-T------GATATGAAATAGATAATTGTTA
316 -ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * *
160759 ATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * * * *
160824 ATTTTTGGAATATTATTATATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * * * * * *
160888 TTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* *
160953 TATTTAAAC-----TGGT--TC-AA--TA------AACATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATA
* * * * * *
161002 TTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAACAGAAACTATTAT-TTTATAAT
255 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAAC-A-AATGTTTATAAC
* * ** * * ** *
161066 AGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTC
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * **** *
161106 AAATATTCATAATTATTTGAA-TTATTTGGTAA-ATAGCTTTA-TTTTTAAA-ATTT-CTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATA--TTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTA
* * * ** * * *
161166 ATTTTTGAAATATTAATAGATT-AGTATTTTTTTTAGTTCAAACAAACTTATATGAACA-AAAAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TA-TTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * *
161229 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
126 A-TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * *
161294 ATTATTTGAA-TAGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAA
190 ACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * * * *
161358 TATCAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATTGAAA-AGATTGTTT-T
253 TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTA-TATGAACTGAAACA-AATGTTTAT
* * * * * *
161419 -ACGACAA-AACAA---A-AACGATATGAAATAGATAATTGTTA
315 AAC-AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * *
161457 ATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * * * * *
161522 ATTTTTGGAATATTATTATATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * * * * *
161586 TTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * *
161651 TATTTAAAC-----TGGT--TC-AA--TA------AACATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAGA
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATA
* * * * * ** * * * * *
161700 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAACTTGTATGATCAAAAACAATTATTGTTTGACC
255 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATGTT-TATAACA
* * * * * * * *
161765 AAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTG
319 AAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * ** * ** * *
161804 AAAT-GGC-T-ATAATTT----TT-TT----AAC-TGA--T-TTGGTAAAGAGATTCACTTTTTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACAT-ATTTATTTTTTAA-ATCTTTACTTATTA
* * * * ** *
161853 A-ATTTGGAATATCAATAAATT-AGTATCATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTTAAATAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * * ** * * *
161916 TTGTTTTATAACAAAACAATAGGTCATAACT-ATTTTTAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * **
161980 CTATTTGGATTTGTTCGATAAAAAAATTTATCTTTTT---T-TACT-CTTATTAATTTTTGAAAT
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAAT
* * **** * * * * **
162040 GTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACCGAAACAATTGTTTTATGTC
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAAC
* * * ** * * *
162105 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTC
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * *** * * * **
162145 AAATATTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTTCTTTTTTTCAAATCTTTTGGCTCG
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTT-ATTTTTT-AAATC-TTT-ACTTA
* * * * *
162210 TTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATT--TGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGATA-TGA
61 TTAATTTTTGGAATATTAAT-AAATTGAT-ATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGA-ACAGA
* * * * * *
162272 AACAAATATTTTATGACTACAA-AAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGT
122 AACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
** * * *** * * *
162336 TTTAACTATTTAAACTAGTACAG-CAACACATTTATATTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTTG
186 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-
* * * * * ** *
162399 GAATATTATTAAATTAGTA-T-TTTTA--ACTAAATAACCTTCTATGATCAAAAATAATTAT-TT
250 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAA--ATGTT
* * * ** * * * * * *
162459 TATGACAAAACAAAGA-TCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTC
312 TATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* **** *
162504 AAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTTAACAGATTTATTTTTTAAATC-TTA--TATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTT-G-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTA
* ** * * * *
162565 ATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAACTA-AAAAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTATATGAAC-AGAAACA
* * ** * * * * *
162628 ATTGTTTTATGACAAATCAAATGGTTATAATGATTTTAAATAGAGAATTGTTCAAATAGTAATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * *** ** *
162693 TTATTCGAACTTGTTCAATAAACGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTGAA
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTTTAAA
* * * * * * *
162757 TATTAATAAATTA-TAAATAATTTATT-CTGAATAAGCTTATACGAATTAAAACAATTGTTTTAT
253 TATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTAT
* * * * * * * * * *
162820 GACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTACATATAGATAATTGTTC
315 AACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * ** * * * *
162863 TAATAGTCTTAACTGTTTAAAC-TGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTAAAATCTCCTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
*** * * * **
162927 AATTTTAAAAATATTATTAAATT-AGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTTGTACAAACA-AAA-A
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * ** * * ** * * *
162989 ATTTCTTTTATGACAAAAGAAATTGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGCCTTA
126 A-TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** * * ** * *
163054 ACTGTTTGAACTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTT-AATTTTCTTGGTTATTGAGTTTTTTAA
190 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATT-AATTTTTAAA
* * * ** * *
163118 TATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAGTAA-AATAGTATGAAC-AAAACCAATTGTTTGAT
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTA-TATGAACTGAAA-CAAATGTTT-AT
* * * * ** * *
163181 GACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTT
315 AACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * *** * * *
163224 AAATAGTCAAAACTATTTGAAATTTGGTTTGGTAAACATATTCACTTTTTAAATCTCT-CATTGA
1 AAATAGTCATAATTATTTG-AACTT-G-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTAC-TT-A
* * *
163288 TTAATTTTCT-AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATTAACA-AA
61 TTAATTTT-TGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAA
* * * *
163350 AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA
123 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * **** * * * * * * *
163415 TAATTATTTGTA-TTGGTCCAATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAGTTATAAATTTTTGA
188 TAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-A
* * * * * * *
163479 AATATCAATAAATTAGT-TTTTTTTATTCCAAATATGCTTGTATGAGCT-AAACAAATATTTTAT
251 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAAT-GTTTAT
* * * * * ** * * * * *
163542 GAGAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTC
315 AACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* ** *
163584 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAAAAA-ATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATA--TTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
** * * * * **
163648 AATTTTTAAAATATTAGTAAAGT-AGTATTCTTTTATTTCGAATAAG-TTCTTATGAATTGAAAC
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCTT-ATATGAACAGAAAC
* * * * * *
163711 AATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGTCAGATCAATTGTTCAAATAG
125 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGA-TTTGAA-A-T-AGAT-AATTATTCAAATAG
* * * * * ** * *
163776 TCCA-ATCTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTTAAATCTCATGCTCATTAATT
185 T-CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA--TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-T
* * * * * * * * *
163840 TTTTCAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTACT-CTAAGTAAGCTTGTACGAATTAAAATAAATG
246 TTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG
* * * * * * *
163904 TTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-TTT
310 -TTTATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * *
163952 CAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-AAAACATATTTA-TTTTTTAAATCT-TTACTTATT
* * * * * * *
164017 AATTTTTGGAATATTATTAAATT-AGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATAAAAACAAATA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * *
164081 ATTGTTTTAT-----AAC--AAATTCATAAT-ATTT-AGATAGATAATTA---AAATAGTTA-AA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
*** * *
164133 CT-TTTGAA--T-TTTCAAAAAC-AATTTA-GTTTT--A----TT-CATA-TAATTTTT-AATA-
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATAT
* ** * * * *
164182 TAA-AATAATA-TATTTATTTTATT-CTAAATAATTTTGTAATGAA-TTAAAC-AATGTTTTTAT
256 TAATAA-ATTAGTA-TTATTTTATTAC-AAATAAGCTTAT-ATGAACTGAAACAAATGTTTATAA
* * * * * * *
164242 GAATATTAAAAAATTATAAC-ATTT-GAATA-ATAATTA-TC
317 CAA-AATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
** * * * *
164280 AAATA--CAT-A-TATTTGAACTTGTTTGATAA-ATA-AT-TTTTTTCAATC-ATAC-TATT-A-
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAAT
* * * * * * * * *
164334 TTTTAGAATA-TAATAAAATAAT-TTATTATATTTCAAATTAA--TTGTATGAATATAAA-AATA
66 TTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTT-GAA-TAAGCTTATATGAACAGAAACAATT
* * ** * * *
164394 ATGTTT-TTAC-AAACAAGTTCAAAATTTTAA--A-TT-AAAAAAATTATTATTCAAATTATTAT
129 AT-TTTATGACAAAACAA----AAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC--A--A--AT
* * * * ** ** ** *
164453 GACTTGTTTTTATAACAAATATTT-AAC-TATTTGATTTCAACAAA-CCATTTATTTTTTAAATA
183 -A---G---TCATAAC---TATTTGAACTTGTTTG--GTAAACAAATTTA-TT-TTTTAAATCTT
* * * ** * *
164515 TCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATATGCTTGTAT
234 T--TACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTACAAATAAGCTTATAT
** * ** * * * * * *
164579 GAAAAGAAATAGTTGTTTTATGACAAAATAAAGA-TCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTC
295 GAACTGAAACAAATG-TTTATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * *
164642 AAATAGTTATAACTATTT-AAATTGTTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCA-AAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTA
* ** ** ** *
164703 A-TTTT-CAATTATTAATAGGTT-AGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAATA
64 ATTTTTGGAA-TATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * * * * * *
164765 ATT-GTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
*** * * * ** *
164829 CTATTTGAACTTGTTCAATAAGCAGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTTTAGAATA
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATA
* *** * * * * *
164894 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTGTGAA-TAGAAACAATTGCTTTATGAC
255 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAATG-TTTATAAC
* * * * * * *
164958 AAAA-CAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTC
318 AAAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * ** * *
164998 AAATAGTTATAACTATTTGAACTTACTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAA-AAACATATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTA
* * * * ** * * *
165063 ATTTTTGGAATATTGATAAAATAATATTAGTTTATTTTTATACA-CTTGTATGAACAAAAATAAT
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTGAATA-AGCTTATATGAACAGAAACAAT
** * ** * * *
165127 TGGTTTATGACAAAACAAAGA-TCCTAACT-ATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCCTAAC
128 TATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * *
165190 TATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
192 TATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATA
* * * * ** * **
165253 TTAATAAATTTA-TATTGTTTTATTTA-GAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGG
255 TTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAA
* * * * ** * *
165316 TAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
317 CAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* ** * * * * * * *
165357 AAATAGTCATAACTATTTGAGTTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAACTCTCTTACTCATCA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * *
165422 A-------AATATTAATAAATT-AGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTA-ATACA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAAC-AGAAACA
* * * * * * * *
165478 ATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATGA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
*** * * * * **
165543 CTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAACTATCAAAATA
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATA
* * * * * * ** * *
165608 TTAATAAACTAATATTATTTTAAT-CTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
255 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAAC
* * * ** * * *
165672 AAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA-A-AAAATATATGTTC
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAAT-TA--TTA
* * * * *
165713 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTGGATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTT-CAAAAACATATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTA
* * ** * **
165777 ATTGTTT-GAAT-TATAATAAATTTG-TATTATTTTAATTTTAAAAAGCTTGCAGGAATGGCAAA
64 ATT-TTTGGAATAT-TAATAAA-TTGATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAG-AAA
* * ** * *
165839 -AATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTTATGGTGGTTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTC
124 CAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTC
* * ** * * ** *
165901 ATAACTATTT-AAATTTTTTTATAAACAAATTCAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGA
187 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-A
* * * * *
165965 AATATTAATAAATTAGAATTATCTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAAC--AAAAAAATTTGTTT
251 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAA--TG-TT
* * * * ** * * *
166027 TGTGACAAAAT-AAAGGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
312 TATAACAAAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * *
166073 AAACAATCATAACTATTTGTA-TTGGTCAAGCCAACAGATTCATTTTTTAAAATCCATTACTTAT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAA--AAACATATTTATTTTTT-AAAT-CTTTACTTAT
** * * * * *
166137 TAATTTTTAAAATATTAACAAATT-AGCATTACTTTATTTTGAATAAGACTGCATCA-GTA-A-A
62 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAG-CT-TAT-ATGAACAGA
* * ** ** * * * *
166198 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAAAG-TTATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-
122 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAA-TAG
* * * * ** *
166261 TTATAAGTAATTGAACTAGTTTTATGAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT
185 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * * ** **
166322 AAAAAATTAAAAAATTAATATTATTTTATT-CTAAATAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTT
250 -AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TT
* * * * * ** * * *
166386 TATGAC-AAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATATATAATTATTC
312 TATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * *
166431 ATATAGCCTTAACTT-TTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGC-TAT
1 AAATAGTCATAA-TTATTTGAACTTGTTCAA-AAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTA-CTTAT
*** * * * ** * *
166494 TAATTTTCATAATATTATTAGATTGGTATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTGCATGAACATAAATA
62 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * * * *
166558 ATTCTTTTATGACAAAACAGAAGGTTATAAAGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * ** * * *
166623 TTATTTGAACTGGTTCAGTAAAC--A--GA-----T-AATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATA
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATA
*** *
166678 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATG-A-TGAAAAACAATTAT-TTTAT
255 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAG-CTTATATGAACTG--AAACAA--ATGTTTAT
* * * * * * * *
166739 GACAAAA-CAAAAGTTCAAAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTC
315 AACAAAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * *
166782 AAATGGCCATAACTATTTGAAC-TGATTTCATAAAC-TGATATATGTTTTAAATCTCTAACTT-T
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG--TTCAAAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTAT
* * * * * * *
166844 TCAATTTTT-AAAGTTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATACA-CTTTTATGAA-TGAA
62 T-AATTTTTGGAA-TATTAATAAATTGATATTATTTTA-TTTGAATA-AGCTTATATGAACAGAA
* * * * ** * *
166906 ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
123 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * *
166971 AAAGTATTTGAA-TGTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TATTTGCTTATTAATTTTT
188 TAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT-TTTACTTATTAA-TTTT
* * *** * * * *
167034 TGAATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATGTATGAACCGAAACAATTAT-T
249 TAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAA--ATGT
* * * * * * ** * *
167097 TTATCACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
311 TTATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * ** *
167144 TAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATACATTTATTTTTTAAGCCTCTTACTTATAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * *** * * *
167209 ATTTTTAGAATATTATTGGTTTAGCA-A-TATTTTACTCCT-AATAAG-TTCATATGGATAGAAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATT-G-ATATTATTTTA-T-TTGAATAAGCTT-ATATGAACAGAAA
* * * *** * * * *
167270 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATACCAATTTGATATAAATAATTGTTCACATAGTCAT
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * *
167334 AACTATTTGAA-TTGATTCGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAA
189 AACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AA
* * * ** * * **
167394 ATATTAATAAATTGGTATTATTTTAAT-CTGAATAATTTTGTAAGAA-TAGAAACACTTGTTTTA
252 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAATG-TTTA
* * * ** * * *
167457 TGACAAAA-CAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATAATTATTT
314 TAACAAAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * ** * * *
167501 AAATAGTCATAACTGTTTGAACTCATTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTGACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAA-AAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * * ** * *
167566 ATTTTTGGAATTTTATTAAATT-AGTATTGTTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* ** * * ** * * *
167630 CTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * ** * * * ** *
167695 CATTTAAACGTGTTCAGAAAACAAATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTAATCTTTGGAATTT
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-TTTTAAATAT
** * * * * **
167759 TGGTAAATTTA-TATTATTTTATTCCAAATGAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGGC
256 TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAATG-TTTATAAC
* * * ** * * *
167822 AAAACAACAAGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTA
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * *
167862 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTA-TTCATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-AAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTT-ATT
* * * * ** *
167926 AATTTTTGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATGTGAATTGATACAA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* ** * ** * *
167991 TTGTTTTATGATGAAACAAAATA-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAA-AGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * **
168055 CTATTTGAACTTTTTTGGTAAAC--ATAT-TTTTTTAAA-----T-CTTATTAATTCTCAAAATA
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATA
* * * * * *
168111 TTAATAAATTAATATTATTTTGA-TCCGAATAAGC-TAGTATGAAC---AATAATTGTTCATATA
255 TTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTACAAATAAGCTTA-TATGAACTGAAACAAATGTTTATA-A
*** * * * **** * * * * *
168171 -GTTATAACTAATTGA-ATTGGTTTGGCAAACATATTTATTTTTT
317 CAAAATAA-AAAGTCACAACAATTT--CAAATAGA-TAATTATTA
* * * * * * * * * * ** * * *
168214 AAAT-CTCTTATTTA-TT-AA-TTTTTGAAATA-TTAATAAATTAATATTAT-TTTATTTCGAAC
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTA-AATCTTTACTT---AT
* * * * * * * * * *
168273 AAACTTATGTGAACA--AA-AAA--AAT-TTGTTTTA-TGGCAA-AA-C--A-A--AA-GGTAAT
62 TAATTTTTG-GAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTG-AATAAGCTTATATGAACAGAAAC
** * * * *
168323 AACGA--TT-TG----AA-ATAAA-TAAT--TG--TTCAAGTAGTCATAATTATTTGAAATAGTT
125 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAG--ATAATTA-TTCAAATAG-T
**** * * * * * * *
168375 C-T-AC-AAACAAAATTGTTATGTCTAGAA-ATAGA-TTATTATTCATATAGCCTTAAC-TACTT
186 CATAACTATTTGAACTTGTT-TG-GTA-AACA-A-ATTTATT-TT-TTAAATCTTTTACTTA-TT
** * * * *
168434 ACATTGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTA
243 A-ATT--TTT-------AAA--TA-TTAATAAA----TTAG-TATT-ATTTT-ATTACA-AATAA
* * ** * **
168499 GATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAAGTATTTTCTAACAAAATCA
287 GCTT-ATATGAACTGA-AACAAAT--G-TT-TAT-AAC----A-AA--A-----T-----AA--A
* * * * * *
168564 AAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTC
326 AA-GTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
** * * * * *** * * *
168597 AAACCGTTATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAATATATTTATGTTTTAAATCACTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTA
* ** * * ** *
168662 ATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * ** * * *
168726 TTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * *** * *
168790 TTATTTGAAC-TGATTCGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCAACTCT-TTGAACATGTTCA
191 CTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-TATT--A-ATTTTTA
* * ** * *
168852 GA-A--AATAAATT--TATT-TTTTAAATTTCACTAATTAATTTTTGGAATATTAA--GAAAATT
251 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT--A-TT-AC-AAATAA-GCTT---ATATGAACTG-AAA-C
* * * *** * *** * **
168909 AAAT-TATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAACGAAACCAA-TTCTTTTATGACAA--AACA
305 AAATGT-TTATA-ACAAAATAA-AAAG--T-CAC--AA-CAATTTCAAATA-GATAATTATTA
* *
168968 AAAT-GTCATAATGCT-TTGTGATATTTAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTTG
1 AAATAGTCATAAT--TATT-TG--A---ACTTGTTCAAA-A---A-CA-TATTT--A-TT-TTT-
* * *
169031 GTAAATAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTACACATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTATT
47 -T--A-A-A-TC----TTT-ACT-TATT--A-ATT--T--TTGGAATATTAATAAATTGA-TATT
* * * * * * * ** *
169095 ATTTTACTTTAAATAAGCTTCTATGGACTGAAACAATTATTTTATTATAAAAGAAATGGTTATAA
92 ATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAA
* ** *** *
169160 TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGGACTATTTGAACTTGTTCATTAAACATATTTA
156 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * * * *
169225 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGTCAAATTATTAATAAATTAATATTATTTTAAT-CTGAA
221 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAA
* * * * * * *
169289 TAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAGTCATAA-AAGTTGAAATA
284 TAAGCTTATATGAACT-GAAACAAATG-TTTATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATA
* * *
169350 AATAATTGTTC
347 GATAATTATTA
* * * *** * * * *
169361 AAATAGTCAAAATGATTTTAACTTGATTGGTAAGCAGATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTTTACTTATTA
* ** * *
169426 ATTATCTT--AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAAAAAGCTTGTATGAACA-AAA-A
64 ATT-T-TTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * * * * * *
169487 ATTATATTTTTTGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCAG
126 A-T-TATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
169552 AATTATTTAAACTTATTTAGTAAAGAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGGA
189 AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTT-AA
* * * * * * *
169615 TTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTCTTTTATG
252 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAAT-GTTTATA
* * *** ** * * * *
169680 ACAAAACAAAAGGTTGTAATGATTTGAAATATATAATTTTTC
316 ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * *
169722 AAATAGTAATGATTATTTGATCTAGTTTAATAAACATATTTATTTTTTTAATTTTTAGTTATTGA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA
* * * * * *
169787 -TTGTCGATATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTATTTGAATAAAAACAA
65 TTTTTGGA-ATATTAATAAATTGA-TATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * ** * * ** *
169850 TCATTTTA-GAACAGAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTAAAATAGTCATAA
127 TTATTTTATG-ACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * * *
169914 CTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTTTTTTTTTAAATC---T-CTTATCAATTTTCAAAAT
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAAT
* * *** * * ** ** *
169975 ATTAATAGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAAC
* ** ** * * * *
170040 AAAATAAAAGGTCATGATGATTTGAAATATATAATTGTTC
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * *
170080 AAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTGAATTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA--AAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
** * * ** *
170144 AATTTTTAAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATAAAC-TAGTATGAATTCA-AAA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTA-TATGAA--CAGAAA
* * * * *
170207 AAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCAA-AATGATTTGAAATAAATATTTATTCATATAGTCT
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGT-AATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * ** * * *
170271 TAGA-TAGTTAAAATGGATCGACAAACAAATTT-TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGA
188 TA-ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-A
* * * * * * * * *
170334 AATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA-AAAAT-AAAAATAATAAATTT
251 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACA-AAT--GTTT
* * * * ** * * * * *
170397 ATAACAAAACAAAAATTTATAATGATTTGAAGT--TTACGTTATTC
313 ATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATA-ATTATTA
* * * * ** *
170441 AAATAGTTATAACTATGTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * * ** *
170506 ATTTTTGAAAGATTAAT-AATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGA-ATGTTCAAAAACA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCTT-ATATGAACAGAAACA
* * * *** *
170568 ATTGTTATATGACCAAAC-AAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGTCATAGCCATA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
** * *** * *
170632 ACTACGTGAACTTGCTCAATAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTTTTTAAA
190 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAA
* * *
170697 -ATTTAATAAATTAATATTATTTTATT-CTGAATAAGTCTT-TATGAAC--AAAAAAATTGGTTT
253 TA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAG-CTTATATGAACTGAAACAAA-T-GTTT
* * * * * * * * **
170757 ATGACAAAACAAAATGT-TC-A-AATAT-GAATTGGT--TTGGTA
313 ATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * ** ** * * *
170796 AACA-AAT--TTATTTTTTAAAAC----TC--CTATTTATTAATTTTTTAAAT-ATTA---ATAA
1 AA-ATAGTCATAATTATTT-GAACTTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTA
** ** * * * * * * * *** * *
170848 ATTAGTATAATTTTATTTGAAATAGGT-TTGTATGATGAAAAATAA--TTATTTTAGGACA-AAA
64 ATTTTTGGAATATTA-AT-AAATTGATATTATTTTAT-TTGAATAAGCTTA-TAT-GAACAGAAA
* * * * ** * ** *
170909 CAA-AAGTTTATAAC-AATCTGAAA-TGGATAATTG-TTCT--AATAGCCATAATTATTTGAATC
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGT-AATAA-TGATT-TGAAATAG--ATAATTATTCAAATA
* ** * *
170968 GAT-TTAA-TA----AAC-----T-G---AC----TTATTTTTTAAATC-TCAACCTATCAATTT
184 G-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
** * * * * **
171013 TTGTATATTAATAAAGTAATATTATTTTATT-CTAGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAGTTGTT
248 TTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATGTT
* * * * * *** * * * *
171077 TATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATAGATAGTTGTTC
312 TATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
** * ** * * **
171123 AAATAGTTGTAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAAATTTCTTGTTTAT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTT--AAATCT-TTACTTAT
* * * *
171188 TAA-TTTTGTAAATGTTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
62 TAATTTTTG-GAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAA
* * * * * ** * * * *
171250 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTAAACTATTTAA-ACT-AGTTCGACAAACACATT
124 C-AATT---AT--TTTA-TG-AC-AA-A-AC-AAA--AAGTAATAATGA-TTTG--AAATAGA-T
* * * * * * * * *** *
171313 TATTTTTTAAAT-CTCAT-ACT-TATT-AA-TT-TTTAG--AA-TATTCTTAATTTAGCAATATT
171 AATTATTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTTGTTTGGTAAACAAAT-TTATTTTTTAAATCTT
* * * * * * *
171369 TTACTCCAAATAAGCTTGTCT-AA-A-CAA-AAA-TA--ATTATTTTATGACAAAACTAAGATCA
234 TTACT--TATTAA--TT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAA-TAAGCTTA
** * * * ** ** *** * * *
171427 TAATGATTTGAGATAGATAATAGTTCA-AATAGTCATAACTA-TTTGAACTAGTTC-AATAAATG
292 T-ATGAACTGA-A-ACA-AAT-GTTTATAACA-AAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGAT-
* *
171489 GATTTAGTTTTT
350 -AATTA---TTA
* ** * * * * *
171501 AAAT-CTCTTATTAATT-TTCAAAC-TGTT-AATAA-AT-TATTA-TTATT-ATTTTATTAC-GA
1 AAATAGTC--A-TAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATAT-TTATTTTTTAAATCT-TTACTTA
* * * * *** **** * * ***
171557 ATAATTTTGTATGAATA-GAA-ACAATTG-TTTTATGACAAAACAA-AATG-TCATAACGATTTG
61 TTAATTTT-T-GGAATATTAATA-AATTGATATTATTTTATTTGAATAA-GCTTAT-ATGAACAG
* ** ** * *** * * *
171617 AAATATATAATAGTTGAAATGGACATGACCATTTG-AACT--TG-TATGATGAATAGATTTATTT
121 AAACA-AT--TA-TT-TTAT-GACAAAACAAAAAGTAA-TAATGATTTGA--AATAGA-TAATTA
* ** * * *
171678 TTTAAATCTTC--GACT-TATT-AA-TT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--AT-T
176 TTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTTGTTT-G-GTA--AACAAATT--TATT-TTTTAAATCT
** * * * * * * * ** ** *
171734 TCGA-ATA-AACATGTATGAATA-GAA-ACAATT-GTTTTATAATAAAACAAA-AGACCTTATCA
233 TTTACTTATTA-ATTTTTAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTACAAATA-AGCTTAT-A
** * ** * * ** * * ***
171793 --ATTTGAAATAAATAATTGT-TC-AAAT----AGTCACAACTTTTTGAACTCTCTCAA-TA--A
294 TGAACTGAAACAAATGTTTATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGAT-AATTATTA
* * * * * * * *
171847 ACAT--T--T-ATTTTTTAAATCTT-TT-----ACTTATTAATTTTTGAAAT-TTTAATAAATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAA-CTTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACT-TATTA
** * * * * * * * * *
171900 ATATTATTTTATTCTGAATAAA---AT-TT-TATGAATAGAAACAATTGGTT-TATG-ACA-AAA
64 AT-TT-TTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTG-AATAA--GCTTATATGAACAGAAA
* ** * *
171957 CAA--A----A-G------------GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCAT
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
172003 AACTATTTGAACATATTTAGAAAACAGATTTATTTTTCAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAA
189 AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
** ** * * *
172067 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-CAAAATAAATTTGCATGAACAGAACCAATTGTTTTAT
253 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTAT
* * * * *** * *
172130 GACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTATTC
315 AACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* ** * * * * * *
172173 AAATAGTCATAATTATTTGAACATGTTCGATGAATAGATTCATTTTGT-AATTTCTTACTCATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
*** * * ** *
172237 ATTTTCAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTGAATTGGAACAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * ** *
172301 TTGTTTTATTATAAAAC-AAAAGCTCGTAATGATTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCATG
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * * * * * **
172364 ACTATTTCAACTTGTTTCATAAGCATATATA-TTTTTAAATATTTTCCTTATTAATTGTCAAAAT
190 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAAT
** * * * *
172428 ATTAATAAATTAAAATTATTTTAACT-CAAATAATCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTT-TAT
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAATGTTTATA-
* * * * * * *
172490 GCAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
316 ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * *
172532 AAATAATCATAATGATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAA-AAACATATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTA
* ** * *
172596 ATTGTCTT--AATACTAATAAATTTG-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT-AGATAGAAA
64 ATT-T-TTGGAATATTAATAAA-TTGATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGA-ACAGAAA
* * * * * * * *
172657 AAATTATTCTATGACAAAA-AAAAGGTTATATTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAATCAT
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
172721 AATTATTTAAATTTATTTGATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAA
189 AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * * *** * * * * *
172785 TATTAATATATTGGTATTATTCTATTTTGAATAAACTTATATAAACT-AAAGCAATTCTTTATGA
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAA-CAAATGTTTATAA
* * * * * * *
172849 CAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTT
317 CAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
** * * * *** * *
172890 AAATAGT-ATGGTTGTTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTTTACTTATTA
* * * * *
172954 ATTATTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATGTGAACATAAAC-A
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * * *
173017 --A-TTT-T-ACTAAACAAAAGACTAA-AACGATTTTAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATGA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAA-AGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ** * * **
173076 CTATTTAAACTTG-TTCATAAATATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAAT
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAAT
* * *
173140 ATTAATAAATTAATATTATTTTAAT-CTGAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTAT-TTTAT
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAA--ATGTTTAT
* * * * * * * * * *
173202 GATAAAACAAAAAGTCATAGCAATTTGAAACAAATAACTATTC
315 AACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* ***
173245 AAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTTC-GGTACATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACAT--ATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATT
** * *
173309 AATTATCTT-G-ATA-TAATAAATTTG-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACATAAA
63 AATT-T-TTGGAATATTAATAAA-TTGATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAA
* * * ** * * * * *
173370 AAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTTTAGTGATTTCAAATGGATAATTGTTCAAATCA-TCC
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AGTCA
* * * * * * * *
173434 TAATTATTTTAACTTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGA
188 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AA
** * * * * * * * **
173499 ATATTAATAGCTTAGTATTTTTTTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAACTAAAATAGATAATTAT
252 ATATTAATAAATTAGTA--TTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATGTTTAT
* ** ** * ** * *
173564 -TC-AAAT----AGTCATGATTATTTGATCTAG-T--TCACTA
315 AACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * ** * * * * *
173598 AACATA-T--TTATT-TTTGAAATT-TT---TTACTTA-TTAATTGTCAAA----TA-TTAATAA
1 AA-ATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA
* * ** * * *
173649 --ATTAG--TA-T--T--A-T--T-TTA----ATCCGAATAAGCTTATATGAA-TGAAACTATTG
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTA
* * * * * * *
173696 TTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAATTA
130 TTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTA
** *
173760 TTTGAAC-TGATTTCATAAAC-GATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATT
194 TTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATT
* * * * * * ** ** *
173819 AATAGATTTGTATTATTTTATTTCAAACAAGCATATATCAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAA
257 AATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAACAAA
* * * * * *
173884 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTT
321 ATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * *
173921 AAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA--AAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
* * * * * * * * ** *
173985 AAATTTTGAAATGTTAATAGATTCATTTTATTTTTTTCTGAGTAAGC-TAGTATGAATTGAAAAA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTA-TATGAACAGAAACA
* * ** * * * * * * *
174049 ATTATTTGAT-TC-CGACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTCTTGAAATGGCCATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * ** ** *
174112 TTATTTGAAC-TGATTCGATAAAC-ATTTTCACCTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGGAA
191 CTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * * * * *
174175 TATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACTG-AACAATTGTTTTATGA
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAA
* * * * ** *
174239 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGGTC
317 CAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * *
174280 AAATAGTCGTAAGTATTAGAATTTGTTCAGTAAAA-AAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTAT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA--AAAACATATTTA-TTTTTTAAATCT-TTACTTA-
* * * **
174343 TTAA-TTTTGGAAATATTAAGAAATT-AGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAATTGAA
61 TTAATTTTTGG-AATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTATATGAACAGAA
* * * * ** * * * * *
174406 ACAATTGTTATATGTC-AAA-AAAAAGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATGGTAA
123 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * *
174469 TAATTATTTTATA-TTGTTTGATATATAGATTTATTTTTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTT
188 TAACTATTTGA-ACTTGTTTGGTAAACAAATTTA---TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TT
* * * * * *** * * *
174533 TTTGAATGTTAATAAATTTGGATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATAT
247 TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGA-ACTGAAACAAAT-G
* * * * * * * * *
174597 TTTATGACTAAATAAGAGGTCAGAACGATTTAAAATAGGTAATTATTT
310 TTTATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * *
174645 TAATAGT-TTCAACTAATTGAA-TTGATTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
1 AAATAGTCAT-AATTATTTGAACTTG-TTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTAT
* **** * * *
174708 TAATTTTTGGAATATTATTAAATT-AGTATTATTTTTAACCAAATAAGCTCCA-ATGATCAGAAG
62 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTA-TTTTATTTGAATAAGCT-TATATGAACAGAAA
* * ** ** ** * * *
174771 CAAGTGTTTTATGACAAAACAATTA-TTTTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCAT
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* ** * * * * *
174835 AACTATTTAAACTAATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTATTGCTTACTAATTTTTGAAA
189 AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * ** * * * *
174900 TATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCAT-AA-TTAAAAATAATATTTTATG
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACA-AAT-GTTTATA
* * ** ** * *
174963 ACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGTAATAGATAATCAATTC
316 ACAAAATAAAAA-GTCACAACAATTTCAAATAGATAAT-TATTA
* * * * * * * *
175007 AAATGGCCATAATAATTTTAAC-TGATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTAAT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCA-AAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
* * * * *
175071 AA-TTTAGGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCT-ATCTAAGCTTGTATTAACTGAAA
63 AATTTTTGG-AATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATT-TGA-ATAAGCTTATATGAACAGAAA
* * * * * * * * * *
175133 CAATTGTTTTATGACAAATA-AAAAGGTTATAATGATTTTTAATTA-ACATTTGTTCAAATAATA
124 CAATTATTTTATGACAAA-ACAAAAAGTAATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * *
175196 AAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATATCTTT-CTTTTTAATTTTT
187 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT-TTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
175260 CAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
250 -AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TT
* * ** * * * * *
175324 TATGACTAAGCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATATG-TAATTGTTC
312 TATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATA-GATAATTATTA
* * * * ** * * **
175370 TAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGCAATCACATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTACAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
*** * * * *
175434 ATTTTTGGAATATT-ATAAAATT-AGTATTATTTTAATCCAAATAGGTTTGTATGAAAAGAAACA
64 ATTTTTGGAATATTAAT-AAATTGA-TATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * ** * * * *
175497 ACTATTTTTTATAACAAAATAAATA-TCGTCATGATTTGAGATAGATATTTGTTCAAATAGTCAT
126 A-T-TATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* *
175561 AACTATTTGAACTTATTTGGAAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTAAACAGATTTGTTTTTAA
189 AACTATTTGAACTTGTTTGG----TA-A---A------CAAA--TTT------A--T-TTTTT-A
* * * *
175626 AATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTG
228 AATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTA
** * * * * * *
175691 TATGAACAAAAAC-AATGGGTTTATGACAAAA-CAAAGGTCATAACTATTTAAAATAGATAATTA
292 TATGAACTGAAACAAAT--GTTTATAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTA
*
175754 TTC
355 TTA
* * * * *
175757 AAATAGCCATAACTATTTGAA-TTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTTAATTTTTACTTATTAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-AAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA
* * * ** * *
175821 ATTTTGGAATATTAATAAATTTATACTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAATAGAACCAATT
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT
* * * * *
175886 ATTTTAT-----------TA-T-A-AAT-ATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAATCA-AACTA
129 ATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * *
175935 TTTGAACTTGTTTTGTAGACAAATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTA
194 TTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTA
* * *** * * * * * * * **
176000 ATAAATTAGTATAATTATATTTTTAATGAGCCTATATGAATTGATAGAATTGTTTTATGATGAAA
258 ATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAACAAAA
* * * * * * *
176065 CAAAAAGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTATTC
322 TAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * ** ** ** * * *
176101 AAATAGTTATCACAATTTGAACTAATTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATATTTTGCTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAAT-CTTTACTTATTA
* *** * *** * * *
176166 ATTGTCCAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAAT
* * *
176231 TATTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATAATGATTTG--A-A-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
128 TATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * *
176292 ATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATTTGAATATT
193 ATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATT
* * * * * * *
176357 AATAAATTTGAATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAA-AAATTATTTTATGAC
257 AATAAATTAGTATTATTTT-ATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAA-T-GTTTATAAC
* * * * *** * * * * *
176419 AAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAACTGTTT
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * *
176459 AAATAGTCATAACTATTTAAATTTCTTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA
* * * *
176521 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGA-AGTATGTTATTCTGAATCAA-CTTATACGAACAAAAACAA
65 TTTTTGGAATATTAATAAATT-GATATTATTTTATT-TGAAT-AAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * * * * * *
176584 TTCTTTTGTGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCATATAGTTATAAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * *** ** * * * ** *
176648 TATTTGTACTGGTCAAGCCAATAGATTCATTTTTTAAATCAATTACTTAGTAATTTTTGAAATAT
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATAT
* * * *** * ** * * * * *
176713 TAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAATAC-CGTATCAA-TAAAAACAATTGTTTTATGAT
256 TAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAA-GCTTATATGAACT-GAAACAAATG-TTTATAAC
* ** * * * *
176776 AAAACAAATGGTCACAACTATTTGAAATA-ATAATTGTTC
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * *** *
176815 AAATTGTTATAACTAATTGAA-TTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC--T-CTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTT-G-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTA
** * * * *
176876 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAAAAACTTATATGAACA-AAAAAAT
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA-
* * * * * * *
176940 TTGTTTTACT-ACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAG
127 TTATTTTA-TGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * *
177004 CTATTTGAA-TTATTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
191 CTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTA-AA
* * * * * * * * * *
177067 TATTACTAGATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAT-AAATAATTGTTTTGTG
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAAC-TGAAACAAATG-TTTATA
* * * ** * * * * *
177131 AC-AAATCAAAAGGTTATAATGATTTGAAAAATATAATTGTTG
316 ACAAAAT-AAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * ** **
177173 AAATAGTCGTAACTATTTGAACTAT-TTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCACCTACACATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACT-TGTTCA-AAAACATATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATT
* * *
177237 AGTTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAAT-AGACTTATATGATA-AAAAA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATT-TGAATAAG-CTTATATGA-ACAGAAA
* * * * * * * * *
177299 AAATTGTTTTAAGACAAAAC-AAAAGTTTATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATGGTTA
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * ** **** *
177363 TAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCACCAACTTCTTAATTTTTAA
188 TAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-A
* ** ** * * * *
177427 AATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTTGGAAA-AA-CTTTTATGATCTGAAATAATTGTTT-
251 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATGTTTA
* * * * ** * * *
177489 TAGGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTC
314 TA--ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * *** ** * *
177535 ACATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC--ATTT-TTTTAAAAATTTCTTGCTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
* * * * * * * *
177597 ATTTTTTTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTGAATAAGCATGTATGATCTGAAACAAT
64 A-TTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAAT
* * * * * * * * * *
177662 TTTTTTATTGACTAAAGAAAAGGTTAGAATAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAAC
128 TATTTTA-TGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* ***
177727 TATTTGAACTTGTTCGGTAAATGCATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATT-ATTTTTAGAATAT
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATAT
* ** * * ** * * * * * *
177787 TATTAGTTTAGCAATATTTTGCTCCAATTAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
256 TAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAATG-TTTATAACA
* * * ** * * * *
177851 AAACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTCCA
319 AAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTAT-TA
* * * * ** * *
177890 AATTA-TCATAACTATTTGAACTAGTTTGACGAACAAATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA
* * * ** *
177951 TTTTTAGAATATTAATAAACT-AGTATCATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAAT
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATT-TGAATAA-GCT-TAT--AT--GAAC-A-
* * * * ** * * *
178015 TGTTTAAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAAATTGAAATAGATAATT-GTG
120 -G-----AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * *
178079 AGAATGGACACT-ACTATTTGAACTT-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTT-T
179 A-AATAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * * *
178141 TAAATATTAGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAA-TAGAAAC
242 TAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAAC
* * * * ** * * *
178205 AATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTT
305 AAATG-TTTATAACAAAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * *
178259 AAATAGTTATAACTATTTGAACTCGCTCGATAA-ATGGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACAT--ATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATT
* * * * ** *
178323 AATTTTTGAAATTTTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATCCACATAAACA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * *
178387 A-TAGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATA
126 ATTA-TTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
178451 ACTACTTGAACGTG-TT-CTAAAAATAGATTTATTTTTTATAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAA
190 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AA
* * * ** * * *
178513 ATATAAATAAATTTA-AATTATTTTATT-CAAAATAAACTTGCATGAA-TAAAACCATTGTTTTA
252 ATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTA
* * * ** * * * * *
178575 TGACAAAACT-AAAGGTCATAGTATTTTGAAACAAATAATTATTC
314 TAACAAAA-TAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * * *
178619 AAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAATAGATTCT-TTTTTTAATTTTGTTACTCATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-AAAACATATT-TATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
* ** * * *
178683 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTCAAATATA-CTGATACGAACTGAAACA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTA-TTTGAATA-AGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * ** * * * *
178747 ATTGTTTTATTACAAAAGAAAATGTCGTAATGATTTGAAATTGGTAATTACTAAAATAGTCATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* **** * ** * **
178812 CTATTTGAGCTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTCGAATTA-TAATTGTCAAAAT
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAAT
* * ** * * *
178876 ATTAATAAATTAATATTATTTTCA-TCCAAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTAT-TTTATG
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAA--ATGTTTATA
* * * * * * ** *
178939 TCAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTCCTC
316 ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * *
178981 AAATAATCATAATGAATTAAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAACTTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTT-AAA-TCTTTACTTATT
* ** * * *
179046 AATTGCCTT--AATATTAATAAATTTG-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTGTGAATAGAAA
63 AATT--TTTGGAATATTAATAAA-TTGATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAA
* * * * ** * * * *
179108 AAATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTTATAGCGATTTTAAATAGATAATTGTT-AAATA--AAC
124 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* ** *
179170 AA--ATTT--A-TT-TTT--T----AAA--TA-TCTTT--A----TTA-TTATT--TTTTAGATT
189 AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAT
* * *** * * * * *
179211 ATTAATAAATTAGTGTTATTCTATTTTGAATAAGCTTATATAAAATGAAACAATTCTTTTATGAC
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAAT-GTTTATAAC
* * * ** * *
179276 AAAA-CAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
318 AAAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * ** * * *
179316 AAATAGTCATGATTACTTGATCTACTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATTTTCTACTCATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAA-AAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TACTTATTA
* *** * * * *
179381 ATTATCAAAACATTAATAAATT-AGTATTATTTTAATTTGAAT-AGCTTGTATGGATAGAAACAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
** * * * * * * ** * *
179444 TTATTTTAAAATATAGCAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAATAATAAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * * * *
179509 TATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTGAAACAT
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATAT
* ** * * * ** ** *
179570 TAATAGATTAGTATTACCTTATT-CTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACA
256 TAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAACA
* * ** * **
179634 AAA-CAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCTA
319 AAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * ** *
179673 TAATAATCATAATTATTTGAACTAGTT-AGGTAAATAGAACTATTTTTTAAATCTCCTACTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA--AAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
* * * **
179737 AATATTTGAAATACTAATAAATTTG-T-TGTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCCA-
63 AATTTTTGGAATATTAATAAA-TTGATAT-TATTTTATT-TGAATAAGCTTA-TATGAA---CAG
* * *
179798 AAA-ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC--AT-GT
121 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *** * * * *
179859 CTTAAATATTTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTG
186 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-
* * * * * ** * * ** * * *
179924 GAATATTATTAGATTAGTTTTATTTTTTTATGAATAAGCTTCTACGAACAAAAATAATTATTTAA
250 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATGTTT-A
* * * * * * ** * * ** * *
179989 TAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTA
314 TAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * ** * **
180033 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTCAAATCACTACTTATTAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA
* * * ** *
180098 TTTTTGAAAGATTAATAAATT-ATCATTATTTTATTTTGAATAAGGTTGA-ATGTTCAAAAACAA
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTGAT-ATTATTTTA-TTTGAATAAGCTT-ATATGAACAGAAACAA
* * * * * * * * *
180161 TTGTTATATGACCAAACAAAAGGAAATAA-CATTTTGAAATAGATAATTATTGACAGAGTCATAA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* ** * * * * * *
180225 TTATTT-AAGCTAATTCGATAAATAGATTTACTTTGTAAATC----ACTT-TGTAATTTTTGAAA
191 CTATTTGAA-CTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT-TAATTTTT-AAA
* ** * * *
180284 TATTAATAAATTAGTATTATTTTACTT-CAAATAAGGTTGCATGAATTGAAACAATTGTTTTATG
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATA
* * * * * *
180348 ACAAAA-CAAAAGT-ATAA-AGATTTGAAATAGACAATTGTTC
316 ACAAAATAAAAAGTCACAACA-ATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * *
180388 ATATAGTCTTAATTATTTAAAC-TGCTTCAGCAAATATATTTATTTTTTATATCTGTTAGTTATT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCA-AAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
* * * **
180452 AATTTTTGGAATATTATTAAATT-AGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTCATATGAATTGAAACA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * * * * * ** * *
180516 ATTAGTATATAATAGAATAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG------
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* *** * * * *
180575 ------GAACTGGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATA
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATA
* * * * * *
180634 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATG-A-TGAAAAGCAATTGTTTTATGA
255 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTG-AAA-CAAATG-TTTATAA
** * * ** * * ***
180697 TGAAA-CAAAAGTTCATAATGATTTCAAAAACATAATTGGCCA
317 CAAAATAAAAAG-TCACAACAATTTCAAATAGATAATT-ATTA
* * * * * * *
180739 AAATGGGCAAAATTATTTGAAC-CGATTCAACAAAC-TAACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTAT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAA-AAACAT-ATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTAT
* ** * * * * * *
180802 AAAAATTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTGAAACA
62 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * * * * * * *
180867 ATTATTTTATAATAAAACAGAAGGTTATATTTATTTTAAATTGATAATTATTCATATAGTCATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * ** *
180932 CTATTTGAACTTGTTTGGCAAACGGAA-TTATTTTTTGAAATATCTTGTTTATTAATTTTTTGAA
191 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAA
* * * * * **
180996 TGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCACATATGAACTGAAACAATTAT-TTTATA
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAA--ATGTTTATA
* * * * * * *
181060 ACTAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
316 ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * *
181102 TAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGC-CAAACACATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTA-G
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TT-CAAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT
* * * * * * *
181165 AATTTTTAGAATATT-ATTAATTTAGTAATATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * ** * * * * *
181229 ATTGTTTTAAGGTAAAACAAAGA-TCATAACGATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * *
181292 ATTATTTGAACTAGTTTAAG-AAA-AAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAA
190 ACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * *** ** * *
181351 TATTAGTAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTACA
253 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAATG-TTTATA
** * * * * * *
181415 ACAAAACGAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCA-TAGCTC
316 ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTA-TTA
** * * *** * *
181457 AAATAAACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTA
** * * **
181522 ATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATGGAAACAA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * *
181586 TTGTTTTTATGCCAAAACAAAATA-TAATAA--CTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
127 TT-ATTTTATGACAAAACAAAA-AGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
181648 ACTATCTAAACTCGCTTGATAAATC-AATTTATTTTTTAAATATTTTGCTTATTAATTTTTGGAA
190 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * *
181712 TTTTAATAAATTA-TAATTATTTTATT-CAAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTA
253 TATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAAAT-GTTTA
* * ** * * * * * * *
181774 TGACAAAACAAAGGGTTATAACGATTTGAAATGGATAATTGTTC
314 TAACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* ** * *
181818 AAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATGA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACT-TG-TTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTA
* * * *** *
181882 ATTTTAGGAATATTAGA-AAATTTATATTATTTTATTTAATATAAGCTCGCATGAACAGAACCAA
64 ATTTTTGGAATATTA-ATAAATTGATATTATTTTATTTGA-ATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * * * *
181946 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGT-ATTTTGAATTAGATAATTATTCAGATAGTCATGA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * *
182010 CTATTTGAA-TATGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAATTTTTTTACTCATTAATTTTTGAGAT
191 CTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAAT
* * * * * * *
182074 ATTAATAAGTTAGTATTATTTTCTTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTGTTTTATTAC
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATG-TTTATAAC
* ** * * * *
182139 AAAA-CAAAAGTCACAATGATTT-GAATAAATAATTAGTC
318 AAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * *
182177 AAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTAATTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTT-CAAAAACATATTTATTTTTTAAAT-CTTTACTTATTA
* * * *** * *
182242 ATTGTT-GAAAATTTAATAAATTAATATTATTTTAATCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
64 ATTTTTGGAATA-TTAATAAATTGATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * ** * * * *
182306 TTGTTTTATGACTAAACAAATAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* *** * *
182371 GATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATA
192 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAATA
* * * * * *
182435 TTAATAAATTTGTATTATTTTAAT-CAAAATAAGATTGTATGAA-TAGAAAAAAAAATCATTTTA
255 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC-AAATAAGCTTATATGAACT-G--AAACAAAT--GTTTA
* * * * ** * *
182498 TGACAAAACAAAAGGTTA-TTCTGATTTCAAATAGATAATTATTC
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** * * * * * * * *
182542 AAATAGTCATAGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGACTCAGTTTTTAAATATTTGCCTTATCA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTC-AAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTT-ACTTATTA
*
182607 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTGT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATT-GATATTAT-TT-TATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * *
182670 ATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAA-AATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACTA-TCAT
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGT-AATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCAT
* * * * ** *** * ** *
182733 AATTATTTGCACTAGTCAT-GCCAATGGATTCATTTTTTAAATCCGTTACTTTTTAATTTTTAGA
189 AACTATTTGAACTTGT-TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-A
* * * * * * * * * * *
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*** * ** ** * ** * * *
182859 ATGGAAACAAATGGGAATAATGATTTGAAATAAATAATTATTC
315 AACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * **
182902 AAATTGTTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAA-GGATTTAGTTTTTTAAATC-TT--TTATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-AAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTACTTATTA
*** * ** * * *
182963 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTAAATGAACA-AAAC-AT
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* * * * ** * * * * *
183026 T-TGTTCT-ACAATAAGAAAAAAGGTCATAACAATTTAAAAGAGATAATTATTCATATAGCCTTA
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* * * * * * *
183089 ACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTCATTTTCATAAT
190 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AAT
** * * * * * * * *
183154 ATTGTTAGATTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTTGTATTAACCT-AAATAATTGTTTTATGA
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAA-CTGAAACAAATG-TTTATAA
* * * * * * * *
183218 CAAAAGAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTT
317 CAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * ** * * * * * *
183259 AAATAATCATAACTATTTGCACCGGTTCAGTAAATAAATTTATTTATTCAATCTTCTACTCATTA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-AAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TACTTATTA
* * * * * ** *
183324 ATTTTTGAAATACTAA-AAATT-AGCATTATTTTATTTCGAATAGGC-TATTACGATGAAAAACA
64 ATTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATTT-GAATAAGCTTA-TATGAACAGAAACA
** * * * * *
183386 ATTATTTTATGACAAGTCAAAAATTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * * *** *
183451 TTACTTGAA-TTGATTTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTGAAAT
191 CTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTTAAAT
* * **** * ** *
183514 ATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACTGAAAACATTTGTTTTATTA
254 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTG-AAACAAATG-TTTATAA
* * * ** * * *
183579 TAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTTTTC
317 CAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * * * * * * *
183620 AAATAGACTTGACTATTTAAATTTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTTGTTTTAATTTTTTGCTT
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCA-AAAACATATTTA----TT-TTTTAAATCTTTACTT
* ** * * * * * **
183685 ATTAATTTTTTGAATGCTAATAGAATAG-TATTATGTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTTAA
60 ATTAATTTTTGGAATATTAATA-AATTGATATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAACAGAA
* * * * ** * ** *
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123 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * *
183814 TAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTCA-TTTTAGA
188 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-A
* ** * * * * *
183878 ATATTATTAGTTTAGCAATATTTTCCTT-CAAATAAG---GT-TGTA-TG-AAC--A-----A-A
252 ATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATGTTTATA
* * * *
183928 AC-AAAT----A-TCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTT
316 ACAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* ** *** *
183964 AAATAGTCATAACTATTTGAACAAGTATGGTAAACATATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAA
1 AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGT-TCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAA
* ** * * *
184026 TTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTATG-ATAATTTTTTATGAATAAAAACAAT
65 TTTTTGGAATATTAATAAATTGA-TATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAAT
* * ** * * *
184089 TGTTTTATG--AAAA-AAAATGTTGTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACT
128 TATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * *
184151 ATTTGAA-TTCATTTGTTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATA
193 ATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATA
** ** * * * *
184215 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATCAAC-AAAACCAATTGTTTTATGA
255 TTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAA-CAAATG-TTTATAA
* * * ** *** * * *
184278 CGAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTGTTT
317 CAAAATAAAAAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
* * * ** * * * *
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* * ** ** **
184382 AATTTTTGAAATATTAATAAA-T--TATTATTTTACATCAAATAAATTTATATGAACTCAAACAA
63 AATTTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * ** * * *
184444 TTATTTTATTACAAAAGAAATGGTCAA-AATAATTTGAAATAGATAATTACTCAAATCA-TCATG
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGT-AATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AGTCATA
184507 ACTATTT
190 ACTATTT
184514 TGTCATAACG
Statistics
Matches: 18513, Mismatches: 4586, Indels: 3458
0.70 0.17 0.13
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310 8 0.00
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Consensus pattern (357 bp):
AAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAAT
TTTTGGAATATTAATAAATTGATATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTAT
TTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
TGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATA
AATTAGTATTATTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAAATGTTTATAACAAAATAAA
AAGTCACAACAATTTCAAATAGATAATTATTA
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Alignment explanation
Indices: 159561--163523 Score: 2819
Period size: 698 Copynumber: 5.6 Consensus size: 697
159551 CTTAATTCTC
* * * * *
159561 TTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * ** * * * **
159626 CTGAAACAATT-GTTTATTACAAAATAAAAAGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
66 CAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAAT
* * ****
159690 AGTCATGACTATTTGAACTTGTTCAAAAAAATA--TTTATTTCTTAAATCATTTACTTATTAATT
131 AGTCATAACTATTTGAA-TTATT-TGGTAAATAGCTTTATTT-TTAAA--ATTT-CTTATTAATT
** * * * * * * * * * * *
159753 TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTCATATAAACAGAAACAA-TTA
190 TTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTTCAAAAAAACTTATATGAACA-AAAAAATTTG
* ** ** * * * * * * **
159817 TTTTATAACAAAACAAAAAGTTGTAACAATTTGAAATACAAAATTCTTCAAATATTCCTAAAGAT
254 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
* * * * * * *
159882 TTGAACT-TGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATGT
319 TTGAA-TAGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATT-T-TTGAAATAT
* ** * ** ** * * * *
159944 TAATAAATTTGTATTATTTTATTAGAAATAAGCTTTTATGAATAGAAAAACCCATTTTATAAC-A
381 CAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTG-AAAA--GATTTTTTTACGA
* * * * * * *
160008 CAAAA-AAAGGTTCTAGCGATTTCAAATATATAATTGTTAAAATAGTCATAATTATTTA-AACTT
443 CAAAACAAA------AACGATATGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCTTAATTA-TTAGAACTA
** * * * * * * * *
160071 GTTCAATAAACAGATTGATTTTTTAAATCTCTTAATTAGTAATTTTTGGAATATTAATA-ACGT-
501 GTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATA-TTA
* * * * * *
160134 GTTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAGAAATAAATT-TTTTATGACAAAACAAAAA
565 G-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT-AATTGTTTTATGATAGAACAAAAT
* * * * * * * * * * *
160198 ATAATAATGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGATAAAC
628 GTTATAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-G---GTTCAA-
* *
160263 GTATTTATTTTTGAAATTTT
688 -TA---A------ACATCTT
*
160283 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAATCTTATATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA
160348 CAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAAT
66 CAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAAT
160413 AGTCATAACTATTTGAATTATTTGGTAAATAGCTTTATTTTTAAAATTTCTTATTAATTTTTGAA
131 AGTCATAACTATTTGAATTATTTGGTAAATAGCTTTATTTTTAAAATTTCTTATTAATTTTTGAA
160478 ATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTTCAAAAAAACTTATATGAACAAAAAAATTTGTTTTATG
196 ATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTTCAAAAAAACTTATATGAACAAAAAAATTTGTTTTATG
*
160543 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATA
261 ACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATA
160608 GGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTC
326 GGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTC
* *
160673 ATTTTATTTTATTCCAAATAGGCTAGTATGAATTGAAAAGATTTTTTTACGACAAAACAAAAATG
391 ATTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAGATTTTTTTACGACAAAACAAAAACG
160738 ATATGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATT
456 ATATGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATT
160803 TTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
521 TTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
*
160868 GCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACGATTTGAAGTATACA
586 GCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATACA
160933 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAACATCTT
651 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAACATCTT
160980 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA
161045 CAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAAT
66 CAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAAT
* *
161110 ATTCATAATTATTTGAATTATTTGGTAAATAGCTTTATTTTTAAAATTTCTTATTAATTTTTGAA
131 AGTCATAACTATTTGAATTATTTGGTAAATAGCTTTATTTTTAAAATTTCTTATTAATTTTTGAA
*
161175 ATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTAGTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAAAATTTGTTTTAT
196 ATATTAATAGATTAGTA-TTTTTTTAGTTCAAAAAAACTTATATGAACAAAAAAATTTGTTTTAT
*
161240 GACAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAT
260 GACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAT
161305 AGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATCAATAAATT
325 AGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATCAATAAATT
*
161370 CATTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAGATTGTTTTACGACAAAACAAAAAC
390 CATTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAGATTTTTTTACGACAAAACAAAAAC
161435 GATATGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTTGACAAACAAATTTAT
455 GATATGAAATAGATAATTGTTAATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTTGACAAACAAATTTAT
*
161500 TTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
520 TTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
161565 AGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATAC
585 AGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATAC
161630 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAACATCTT
650 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAACATCTT
* * * * * * *
161678 TTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAACTTGTATGAT
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA
* * ** * ** * * * * *
161743 CAAAAACAATTATTGTT-TGACCA-AACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAA
66 CAGAAACTATTATT-TTAT-AATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAA
* * * * * * * *
161806 AT-GGCTATAATTTTTTTAACTGATTTGGTAAAGAG----A---TT-CACTTT-TTA--AA--TT
129 ATAGTC-ATAACTATTTGAA-TTATTTGGTAAATAGCTTTATTTTTAAAATTTCTTATTAATTTT
* * * ** * ** * * * * *
161857 TGGAATATCAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTTAAATAA-TTGTT
192 TGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTTCAAAAAAACTTATATGAAC-AAAAAAATTTGTT
* * * ** * * *
161921 TTATAACAAAACAATAGGTCATAACT-ATTTTTAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATT
256 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
* ** * * ** * *
161985 TGGATTTGTTCGATAAA-AAAATTTATCTTTTTTTA-CTC-T---TATTAATTTTTGAAATGTTA
320 TGAATAGGTTAGGTAAACAAAA-TTAT-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATCA
* * **** ** * ** * * *
162044 AGAAATT-AGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACCGAAACA-ATTGTTTTATGTCAA
383 ATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAA-AGATTTTTTTACGACAA
* * * * * * *
162107 AAC-AAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAA-ATATTCATAACTATTTA-AACTT
446 AACAAAAACG--AT-ATG-----AAATAGATAATTGTT-AATATAGTCTTAATTA-TTAGAACTA
** * * * * * * * * *
162169 GTTTGGTAAACAGATTTCTTTTTTTCAAATCTTTTGGCTCGTTAATTTTTTGAATGTTAATAAAA
501 GTTTGACAAACAAATTT-ATTTTTT-AAATCTCTTAG-TCATTAATTTTTGGAATATT-ATTATA
* * * * * * *
162234 TTTG-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTACAA-AA
562 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAATAATTGTTTTATGA-TAGAACAA
* * * * * * ** *
162296 AAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAACTAGTACAGCA
625 AATGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-G----G-T
* *
162361 ACACATTTATATTTTAAATC-T
684 TCA-A--TA-A----ACATCTT
* * ** * * *
162382 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTA-T-TTTTAA-CTAAATAACCTTCTATGAT
1 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * * * ** *
162444 CA-AAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAA
66 CAGAAACT-ATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAA
* * * * * *
162507 TAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTTAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-ATATTAATTTTT
130 TAGTCATAACTATTTGAATT-ATTTGGTAAATAGCTTTATTTTTAAAAT-TTCTTATTAATTTTT
* * *** * * *
162571 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAACTAAAAAAA-TTGTT
193 GAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTT-CAAAAAAACTTATATGAAC-AAAAAAATTTGTT
* ** * * * * *
162634 TTATGACAAATCAAATGGTTATAATGATTTTAAATAGAGAATTGTTCAAATAGTAATAATTATTC
256 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
* * ** * * * *
162699 GAACT-TGTTCA-ATAAACGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATATT
321 GAA-TAGGTT-AGGTAAACAAAATTA-TTTTTTAAATCTCTTACATATTAA-TTTTTGAAATATC
** * ** * *
162761 AATAAATT-ATAAATAATTTATTCTGAATAAGCTTA-TACGAATT-AAAACAATTGTTTTATGAC
382 AATAAATTCAT-TTTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATTGAAAA-GATT-TTTT-T-AC
* *
162823 TAAACAAAAGGTC-AAAACGAT-T-ACATATAGATAATTGTT-CTAATAGTCTTAACTGT-TTA-
441 --GACAAAA---CAAAAACGATATGA-A-ATAGATAATTGTTAAT-ATAGTCTTAA-T-TATTAG
* ** * * * * * ***
162882 AACT-GATTCGGTAAATAAATTTATTTTTAAAATCTCCTACTTATTAATTTTAAAAATATTATTA
496 AACTAG-TTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTA
* * * * * * * * * *
162946 AATTAGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTTGTA-CAA-ACAAAAAATTTCTTTTATGACAAAAGA
560 TATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA-TTGTTTTATGATAGAACA
* * * * * * ** * * * * * *
163009 AATTGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGCCTTAACTGTTTGAACTGGTTTGGT
624 AAATGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGG-TT--C
** *
163074 AATTAGATTTATTTT
686 AA-TA-A-ACATCTT
* * * *
163089 TTAATTTTCTTGGTTATTGAGTTTTT-TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCC-AAGTAA
1 TT-A----C----TTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAA-TAA
** * * * * * * * * ** ** * *
163152 -AATAGTATGAACA-AAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA
55 GCTTA-TATGAACAGAAA-CTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAA
** * * * * ** *
163215 TAATTATTTAAATAGTCAAAACTATTTGAAATTTGGTTTGGTAAACATATTCACTTTTT-AAATC
118 TAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTG-AA-TT-ATTTGGTAAATAGCTTTA-TTTTTAAAAT-
* * * * *
163279 TCTCATTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATAT
178 T-TC-TT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTTCAAAAAAACTTATAT
* * *
163343 TAACAAAAAAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
239 GAACAAAAAAATTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * * ** *
163407 AATAGTTATAATTATTTGTATTGGTCCA-ATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAGTTATAA
304 AATAGTCATAATTATTTGAATAGGT-TAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTA
* *
163471 ATTTTTGAAATATCAATAAATT-AGTTTT-TTTTATTCCAAATATGCTTGTATGA
368 ATTTTTGAAATATCAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGA
163524 GCTAAACAAA
Statistics
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GCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATACA
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Found at i:162586 original size:19 final size:20
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* * *
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1 ATT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTTTTGAAATATTATATAA
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161850 TTAAATTTGG
* * * * * * * *
161860 AATATCAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTTAAATAATTGTTTTAT
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* * ** * * * * *
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* * * * *
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** * ** *** * *
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187 AATTAGTATTATTTTATTCTAAG-TAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * *
162111 AAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGT
251 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGT
** * ** **
162176 AAACAGATTT-CTTTTTTTCAAATCTTTTGGCTCGTTAATTTTTTG
316 AAACAGATTTAC--TTTTT-AAATCTCCT-ACTTATTAATTTTTAA
* * * * ** * *
162221 AATGTTAATAAAATTTG-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGATATGAAACAAA-TATTTT
1 AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGT-A-TTAACAAAAAAATTGTTTT
* * * * * * * * *
162284 ATGACTACAA-AAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTA
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* * ** * * * * *
162348 AACTAGTACAGCAACACATTTATATTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAA
125 AACTTGTTCAATAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
* * * * * * *
162412 TTAGTA-T-TTTTA-ACTAAATAACCTTCTATG-ATCAAAA-ATAATTATTTTATGACAAAAC-A
189 TTAGTATTATTTTATTCTAAGTAAGCTTATACGAATTAAAACA-AA-TGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * *
162471 AAGATCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTT
252 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTA
* *
162536 AACAGATTTATTTTTTAAATCT--TA--TATTAATTTTTGA
317 AACAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* *
162573 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAACTAAAAAAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-ATAAGCTTGTATTAAC-AAAAAAATTGTTTTAT
* * * * *
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*
162703 TTGTTCAATAAACGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAAT
128 TTGTTCAATAAA-G-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAAT
* * * *
162768 TA-TAAATAATTTATTCTGAA-TAAGCTTATACGAATTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAA
190 TAGT-ATTATTTTATTCT-AAGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAA
* ** * * * * * * *
162831 AGGTCAAAACGATTACATATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTGTTTAAACTGATTCGGTAA
253 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAA
* * *
162896 ATAAATTTA-TTTTTAAAATCTCCTACTTATTAATTTTAAA
318 ACAGATTTACTTTTT-AAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* * ** * *
162936 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTTGTACAAACAAAAAATTTCTTTTATG
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATTAACAAAAAAATTGTTTTATG
* ** * * * * * *
163001 ACAAAAGAAATTGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGCCT-TAACTGTTTGAAC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAG--TATAATTATTTGAAC
* *** * * * * *
163065 TGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTGAGTTTTTT-AATATTATTAAAT
128 TTGTTCAATAA--AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATT-AATTTTTTGAATATTAATAAAT
* ** * * * * *
163129 TAGTATTATTTTATTCCAAGTAA-AATAGTATGAA-CAAAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAA
190 TAGTATTATTTTATTCTAAGTAAGCTTA-TACGAATTAAAA-CAAATGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * *
163192 AGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAAAACTATTTGAAATTTGGTTTGGT
253 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-AA-CTGGTTCGGT
* *
163257 AAACATATTCACTTTTTAAATCT-CT-CATTGATTAATTTTCT-A
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* *
163299 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATTAACAAAAAAATTGTTTTATG
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* * * *
163364 ACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGTA-T
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAG-TATAATTATTTGAACT
* * * * * * *
163428 TGGTCCAATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAG-TTA-TAAATTTTTGAAATATCAATAAA
129 T-GTTCAAT-AA-AGATTTATTTTTTAAATCTCT-TGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * * * ** * *
163491 TTAGT-TTTTTTTATTCCAAATATGCTTGTATGAGCT-AAACAAATATTTTATGAGAAAAC-AAA
189 TTAGTATTATTTTATTCTAAGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * ** ***
163553 GATCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAAAAAA
254 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAA
* * * *
163618 TAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
319 CAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * ** *
163657 AATATTAGTAAAGTAGTATTCTTTTATTTCGAATAAG-TTCTTATGAATTGAAACAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTT-GTATTAA-CAAAAAAATTGTTTTA
* **
163721 TGACAAAGCAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGTCAGATCAATTGTTCAAATAGTCCAATCTA
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAG--AG---AATTGTTCAAATAGTATAAT-TA
* * * * * * *
163785 TTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTTAAATCTCATGCTCATTAATTTTTTCAATGT
121 TTTGAACTTGTTCAAT-AA-AGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATAT
* * * *
163850 TAATAAATTAGTATTATTTTACTCTAAGTAAGCTTGTACGAATTAAAATAAATGTTTTATGACTA
182 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAA
* * *
163915 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTC-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT
247 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
* * * * **
163979 CAGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGG
312 CGGTAAACAGATTTA-CTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* *
164026 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTA-TAAAAACAAATAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATTAACAA-AAA-AATTGTTTTA
* * * * *
164090 T-----AAC-AAA-TTCATAAT-ATTT-AGATAGATAA---TTAAAATAGT-TAAACT-TTTGAA
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAGTAT-AATTATTTGAA
* * * *
164141 -TT-TTCAA-AAACAATTTA-GTTTT--A----TT-CATA-TAA-TTTTT-AATA-TAA-AATAA
127 CTTGTTCAATAAA-GATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAA-AT
* ** * * * **
164190 TA-TATTTATTTTATTCTAAATAATTTTGTAATGAATT-AAAC-AATGTTTTTATGA-ATATTAA
190 TAGTA-TTATTTTATTCTAAGTAAGCTTAT-ACGAATTAAAACAAATG-TTTTATGACAAAACAA
** * * * *
164251 AAAATTATAAC-ATTTG-AATA-ATAATTA-TCAAATA--CAT-A-TATTTGAACTTGTTTGATA
252 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTA
* * * *
164308 AATA-A-TT--TTTTTCAA--TCATAC-TATT-A-TTTTAG
317 AACAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * *
164340 AATA-TAATAAAATAAT-TTATTATATTTCAAATTAA--TTGTATGAATATAAAAATAATGTTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA-TAAGCTTGTATTAACA-AAAAA-ATTGTTTT
** * * * * * ***
164401 -T-ACAAACAAGTTCAAAATTTTAAATTAAAAAAATTATTATTCAAATTATTATGACTTGTTTTT
62 ATGAC-AA-AA---CAAAA-GGT-CA-T-----AATGA-T-TTGAAA-TA-GA-GAATTGTTCAA
* * * * *
164464 ATA--ACAAATATTT-AACTATTTGATTTCAACAAACCATTTATTTTTTAAATATCTTGCTTATT
109 ATAGTATAATTATTTGAAC---TTG--TTCAATAAA-GATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATT
* * * * * *
164526 AATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAA-TATGCTTGTATGAA-AAGAAA
168 AATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCT-AAGTAAGCTTATACGAATTA-AAA
* ** * * * * *
164588 TAGTTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
230 CAAATGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * ** * * *
164652 AACTATTTAAATTGTTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAA-TTTTCA
295 AACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* ** * ** * * *
164710 ATTATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAATAATTG-TTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATTAACA-AAAAAATTGTTTTAT
* * * * * * *
164774 GACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAAC
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAG-TATAATTATTTGAAC
* * * * *
164839 TTGTTCAATAAGCAGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
128 TTGTTCAATAA--AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATT
* * * * ** * *
164904 AATATTATTTTATTTTGAA-TAAACTTGTGTGAA-TAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAA
191 AGTATTATTTTATTCT-AAGTAAGCTTATACGAATTA-AAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *** **
164967 GATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTACTCAATAAA
254 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAA
* * ** **
165032 TAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGG
319 CAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* * * * *** * *
165071 AATATTGATAAAATAATATTAGTTTATTTTTATACA-CTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATA-AGCTTGTATTAACAAAAA-AATTGTTTTAT
* * * * * *
165135 GACAAAAC-AAAGATCCTAACT-ATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTTGAA
64 GACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAGT-ATAATTATTTGAA
* * * * *
165198 -TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
127 CT-TGTTCA-ATAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
* * * ** ** * ** *
165261 TTTA-TATTGTTTTATT-TAGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGGTAAAATAA
189 -TTAGTATTATTTTATTCTA-AGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAA
* * * ** * *
165324 AATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGTTTGTTCGATA
252 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTA
* * * * * *
165389 AATAGATTCA-TTTTTTAA-CT-CT-CTTACTCA---TCAA
317 AACAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * *
165423 AATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTAATACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATTAAC-AAAAAAATTGTTTTAT
* * * * * * * *
165488 GATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
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* * * * * *** *
165553 TTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCT-TCTACTTATTAACTATCAAAATATTAATAAAC
128 TTGTTCAAT-AA-AGATTTATTTTTTAAATCTCT-TGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAAT
* * * ** ** *
165617 TAATATTATTTTAATCTGAA-TAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
190 TAGTATTATTTTATTCT-AAGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * **
165681 TGTCATAATGATTTGAAA-A-AAAATATATGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-GGA
254 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT-TA--TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGG-
* ** *
165743 TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTGA
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* * ** * * ** *** *
165786 ATTA-TAATAAATTTGTATTATTTTAATTTTAAAAAGCTTGCAGGAATGGCAAAAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATTAA-CAAAAAAATTGTTTTAT
* ** * *
165850 -ATCAAAACAAAAGGTTATGGTGGTTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-A
64 GA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAG-AATTGTTCAAATAGT-ATAATTATTTGA
* * ** * * * * **
165912 AATTTTTTTATAAACAAATTCAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAA
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* * * * * *
165976 ATTAGAATTATCTTATTCTGAA-TAAGCTTGTATGAA-CAAAA-AAATTTGTTTTGTGACAAAA-
188 ATTAGTATTATTTTATTCT-AAGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAA--TGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
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250 AAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-
* ** * * *
166101 AGCCAACAGATTCATTTTTTAAAATC-CATTACTTATTAATTTTTAA
313 GGTAAACAGATTTACTTTTT-AAATCTC-CTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * **
166147 AATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TGCATCAGTAAAAATAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAG-CTTGTATTAACAAAAA-AATTGTTTTA
* * * * * * * * *
166211 TGACAAAACAAATGGCCATAAAG-TTATGAAATAAATAATTGTTTAAATTATTATAAGTAATTGA
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGAGAATTGTTCAAA-TAGTATAATTATTTGA
* ** * ** * *
166275 ACTAGTTTTATGAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAAAATTAAAAAA
126 ACTTGTTCAAT-AA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
* * * * ** **
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189 TTAGTATTATTTTATTCTAAGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * ***
166400 GGACATAATGATTTGAAATATATAATTATTCATATAGCCTTAACTTTTTGAACTGGTTCAACAAA
254 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAA
* * * *
166465 CAAATTTA-TTTTTCAAATCTCTTAGC-TATTAATTTTCAT
319 CAGATTTACTTTTT-AAATCTCCTA-CTTATTAATTTTTAA
* * * * * * *
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* * * * *
166568 GACAAAACAGAAGGTTATAAAGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC
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* * * * **
166633 TGGTTCAGTAAACA--GA-----T-AATCTCTTAATTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA
128 TTGTTCAATAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTA
* * * * * *
166689 GTATTATTTTATTTTGAA-T-AGTCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
192 GTATTATTTTATTCT-AAGTAAG-CTTATACGAAT-TAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * *
166751 GTTCAAAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTGATTTC-ATAA
254 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGGTAA
* *
166815 ACTGATATA-TGTTTTAAATCT-CTAACTT-TTCAATTTTTAA
318 ACAGATTTACT-TTTTAAATCTCCT-ACTTATT-AATTTTTAA
* * * * * * * * ** *
166855 AGTTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATACA-CTTTTATGAATGAAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATA-AGCTTGTATTAACAAAAAAATTGTTTTAT
* ** * * * *
166919 GATAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAAGTATTTGAA-
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAGT-ATAATTATTTGAAC
*** * * *
166983 TGTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TATTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAG
128 T-TGTTCAAT-AA-AGATTTATTTTTT-AAATCT-CTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATA-
* * * * * *** * * * *
167047 AA-TAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAACATGTATGAACCGAAACAATTATTTTATCACTAAACA
187 AATTAGTATTATTTTATTCT-AAGTAAGCTTATACGAATTAAAACAAATGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * **
167110 AAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGAC
251 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGT
* * * ** * * *
167175 AAATACATTTATTTTTTAAGCCTCTTACTTATAAATTTTTAG
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* *** * * * * * ** * *
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1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTT-GTATTAACA-AAAAAATTGTTTTA
* *** * * * * *
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** * **
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* * ** * * **
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* ** * * * ** **
167468 AAGATCATAATTATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTGTTTGAACTCATTCAATA
252 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTA
* * **
167533 AACAGATTCATTTTTTAAATCT-CTGACTTATTAATTTTTGG
317 AACAGATTTACTTTTTAAATCTCCT-ACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * * * * *
167574 AATTTTATTAAATTAGTATTGTTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAACTGGTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATTAACA-AAAAAATTGTTTTAT
** * * * ** *
167639 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAAC
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAGT-ATAATTATTTGAAC
* * * * * * * * * * **
167704 GTGTTCAGAAAACAAATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTAATCTTTGGAATTTTGGTAAATT
128 TTGTTCA-ATAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-T
* * * * * * *
167768 TA-TATTATTTTATTCCAAATGAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAACA
190 TAGTATTATTTTATTCTAAGTAAGCTTATACGAATTA-AAACAAATGTTTTATGACAAAACAA-A
* * * * * *
167831 A-GTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAA
253 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAA
* * * * *
167895 ACATATTCATTTTTTAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTTGA
318 ACAGATTTACTTTTTAAATCTCCTACTT-ATTAATTTTTAA
* * * * * ** * *
167935 AATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATGTGAATTGATACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATTAA-CAAAAAAATTGTTTTAT
** ** ** * * * *
168000 GATGAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAAC
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAG-TATAATTATTTGAAC
168065 TT
128 TT
168067 TTTTGGTAAA
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TTCAATAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTAT
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ACTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAA
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*
163214 ATAATTATTT-AAATAG
1 ATAATGATTTGAAATAG
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATAATGATTTGAAATAG
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Alignment explanation
Indices: 159029--168145 Score: 3421
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159019 ATAGATTTAG
* *
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** * * ** * * * *
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* * * * * * * * ** *
159154 TCATAGCTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACCAATTTATTTTGTAAATCTC
127 TAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TGATTCAGTAAACAAATTTATTTT-TAAATCT-
* ** * *
159218 CAACTTATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-A-TGAAT-A----G-A--AAC
189 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTAATTAAATAAGCTTGTATGAAC
** ** * * * * * * *
159273 ----TTTTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTGCTCAAATAGT
253 AAAAAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * * * *
159334 CATAATTATTTGAACAT-GTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTACTTATTAATTTTTG
317 CATAACTATTTGAAC-TGGTT-TGGTAATAGATTTATTTTTTAATATCTT--TTATTAATTTTTA
* * ** * * * * * * *
159398 GAATATTAATAAATT-GACATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAGCAATTATTTTA
378 AAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTA-TTCCAATAAGATAGTATGAACAAAACAATTGTTTTA
* * * * *
159462 TGACCAAACAAAAGGCCATAATG-TTTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGA
441 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGA
* *
159526 ACATGTTTAGTAAACAAATTCA-T
505 ACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * *
159549 TTCTTAATTCTCT-TACTCATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAA
1 TTTTTAAATCTCTCT--TGATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
* * * * * * * * * **
159612 TAAGCTTATATGAACTGAAACAAT-TGTTTATTACAAAATAAAAAGTCACAATAATTTGAAATAG
62 TAAGCTTATACGAATTAAAAAAATGT-TTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
159676 ATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTG-TTCA--AAAAAATATTTATTTCTTAAATC
126 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TGATTCAGTAAACAA-ATTTATTT-TTAAATC
* ** * * * ** *
159738 ATTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTCATATA
188 -TCTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTAAT-TAAATAAGCTTGTATG
* * ** * * ** * *
159803 AACAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTTGTAACAATTTGAAATACAAAATTCTTCAA
250 AACA-AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAA
* * ** * * *
159868 ATATTCCTAAAGATTTGAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTTTTACTTATTAA
312 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGT-AATAGATTTATTTTTTAATATC--TT--TTATTAA
* * ** * ** *
159932 TTGTCTT--AATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTAGAAATAAGCTTTTATGAATAGAAA-AA
372 TT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CCAATAAGATAGTATGAACA-AAACAA
*** * ** * * * * *
159994 CCCATTTTATAACACAAA-AAAAGGTTC-TAGCGATTTCAAATATATAATTGTTAAAATAGTCAT
433 -TTGTTTTATGACA-AAACAAAAGG-TCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAA
* * * * *
160057 AATTATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTGA-T
495 AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * ** *
160090 TTTTTAAATCTCT-TAATTAGTAATTTTTGGAATATTAATAACGT-GTTATTATTTTATTTTGAA
1 TTTTTAAATCTCTCT--TGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTA-TTCGAA
* * * * ** *
160153 TAAGCTTATATGAA-CAGAAATAAATTTTTTATGACAAAACAAAAAAT-AATAATGATTTGAAAT
62 TAAGCTTATACGAATTA-AAA-AAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAA-AACGATTTGAAAT
* * * * * * * * * **
160216 AGATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGA-TAAACGTATTTATTTTTGAAAT
124 AGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACT-GATTCAGTAAACAAATTTATTTTT-AAA-
* * * ** * *
160280 TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAATCTTATAT
186 TCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTAAT-TAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * * * ** *
160345 GAACAGAAACTATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCA
249 GAACA-AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCA
** * *
160410 AATAGTCATAACTATTTGAA-TTATTTGGTAAATAGCTTTA-TTTTTAAAAT-TTCTTATTAATT
311 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGT-AATAGATTTATTTTTTAATATCTT-TTATTAATT
* * * * * *
160472 TTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTAGTT-CAAAAAAACTTA-TATGAACAAAAAAATTT
374 TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATAAGA--TAGTATGAACAAAACAA-TT
* * * *
160535 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA
435 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTA
* * *
160600 TTTGAA-TAGGTTAGGTAAACAAAATT-A-T
500 TTTGAACTTGTTTA-GTAAAC-AGATTCATT
* * * *
160628 TTTTTAAATCTCTTACAT-ATTAA-TTTTTGAAATATCAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAA
1 TTTTTAAATCTC-T-CTTGATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CGA
* * * * * * * *
160690 ATAGGC-TAGTATGAATTGAAAAGAT-TTTT-TTAC--GACAAAA---CAAAAATGATATGAAAT
61 ATAAGCTTA-TACGAATTAAAAAAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTC-AAAACGATTTGAAAT
* * * * *
160747 AGATAATTGTT-AATATAGTCTTAATTA-TTAGAACTAGTTTGA-CAAACAAATTTATTTTTTAA
124 AGATAATTGTTCTA-ATAGTCTTAACTATTTA-AACT-GATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAA
* * * * * *
160809 ATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGT
185 ATCTC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTAATT-AAATAAGCTTGT
* * * * * *
160874 ATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAA-ATGTTATAACGATTTGA-AGTAT-ACAATT
247 ATGAACA-AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAGA--TCATAACGATTTGAGA-T-TGATAATT
* * * ** *
160936 ATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGG-TT--CAATA-A-ACA-TCTTT--TA-C--TTATTA
306 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAATAGATTTATTTTTTAATATCTTTTATTA
* * * *
160990 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTTA-TATGAACAGAAACTA
371 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC-AATAAG-ATAGTATGAACA-AAACAA
* * * * * * ** * * ** * * *
161054 TTATTTTATAATAGAACAAAAAGTCGTAACAATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATATTCATAAT
433 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAAC
* * * * *
161119 TATTTGAA-TTATTTGGTAAATAGCTTTA-T
498 TATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * *
161148 TTTTAAAAT-T-TCTT-ATTAA-TTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTAGTTCAAAC
1 TTTTTAAATCTCTCTTGATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTA-TTCGAAT
* * * * * * * *
161209 AAACTTATATGAA-CAAAAAAATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTAAAATAG
63 AAGCTTATACGAATTAAAAAAA--TGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
161273 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TAGGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATC
126 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACT-GATTCA-GTAAACAAATTTA-TTTTTAAATC
* * * * *
161336 TCTTACATATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTCA-T-TTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTA
188 TC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATT-AGTATTT-TTTAATT--AAATAAGCTTGTA
* * * * * * *
161399 TGAATTGAAAAGATTGTTTTACGACAAAAC--A-A--A-AACGATATGAAATAGATAATTGTT-A
248 TGAA--CAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCA
* * * * ** * *
161457 ATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTAGTCATT
311 A-ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTG-GTAATAGATTTATTTTTTAATATCT-TT--T-ATT
** * * * * * * *
161521 AATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA
370 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATAAGATAGTATGAACA-AAACAA
* * * * * * * * *
161586 TTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAAC
433 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAAC
* * * *
161651 TATTTAAACTGGTTCAATAAAC--A-TC---
498 TATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * *
161676 -TTTT--A-----CTT-ATTAA-TTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAA
1 TTTTTAAATCTCTCTTGATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATA
* * * * * *
161731 AACTTGTATG-ATCAAAAACAAT-TATTGTTTGACCAAACAAAAGGT-AATAACGATTTGAAATA
64 AGCTTATACGAATTAAAAA-AATGT-TT-TATGACTAAACAAAAGGTCAA-AACGATTTGAAATA
** * * * * ** * *
161793 GATAATTGTTGAAAT-GGCTATAATTTTTTTAACTGATTTGGT-----AA---A----GAGAT-T
125 GATAATTGTTCTAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATCT
* * * * * * * * * *
161844 C-ACTTTTTAA-ATTTGGAATATCAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAA
189 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTAT-TTTTTA-ATTAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * *
161907 CTTAAATAATTGTTTTATAACAAAACAATAGGTCATAACTATTTTTA-ATGGATAATTGTTCAAA
252 C--AAAAAATTATTTTATGACAAAACAA-AGATCATAACGA-TTTGAGATTGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * * * *
161971 TAATCATAACTATTTGGATTTGTTCGATAAAAAAATTTATCTTTTT-TTA-CTCTTATTAATTTT
313 TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGT-AATAGATTTAT-TTTTTAATATCTTTTATTAATTTT
* * * *** * ** * *
162034 TGAAATGTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACCGAAACAATTGTTT
376 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATAAGATAGTATGAA-CAAAACAATTGTTT
* * * * *
162099 TATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATATTCATAACTATTTA
439 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTG
*
162164 AACTTGTTTGGTAAACAGATTTC-TT
504 AACTTGTTTAGTAAACAGA-TTCATT
* * * * *
162189 TTTTTCAAATCTTTTGGCTCG-TTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATTTG-ATTATTTTATTTTG
1 TTTTT-AAATC-TCT--CTTGATTAATTTTTTGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA-TTCG
* * * * * * * *
162252 AATAAGCTTGTAAGATATGAAACAAATATTTTATGACTACAA-AAAAGGTTAGAATGATTTGAAA
60 AATAAGCTTATACGA-ATTAAAAAAATGTTTTATGACTA-AACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAA
* * * * *
162316 TAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAACT-AGTACAG-CAACACATTTATATTTTAAA
123 TAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGA-TTCAGTAAACAAATTTAT-TTTTAAA
* * * * *
162379 TCTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTA-TTTTTAACTAAATAACCTTCTATGA
186 TCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTTTAATTAAATAAGCTTGTATGA
* *
162443 TCAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAAT
251 AC-AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAAT
* * * *
162508 AGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGGTTAACAGATTTATTTTTTAA-ATCTTATATTAATTTTTG
314 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGG-TAATAGATTTATTTTTTAATATCTTTTATTAATTTTTA
* * * * *
162572 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAACTAAAAAAATTGTTTTA
378 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA-ATAAGATAGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
162637 TGACAAATCAAATGGTTATAATGATTTTAAATAGAGAATTGTTCAAATAGT-AATAATTATTCGA
441 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAA-AACTATTTGA
* * *
162701 ACTTGTTCAATAAAC-GCATTTATT
505 ACTTGTTTAGTAAACAG-ATTCATT
* *
162725 TTTTTAAATCTCTTTCTT-ATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTA-TAAATAATTTATTCTGAA
1 TTTTTAAATCTC--TCTTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTC-GAA
* ** *
162788 TAAGCTTATACGAATTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTACATATAG
62 TAAGCTTATACGAATTAAAA-AAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAG
* * *
162853 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTGTTTAAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTAAAATCTC
126 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTT-AAATCT-
** **
162918 CTACTTATTAATTTTAAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTAGAATAAGCTTGTACAAA
189 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTAATTA-AATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
162983 CAAAAAATTTCTTTTATGACAAAAGAAATTG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCATAT
252 CAAAAAA-TTATTTTATGACAAAACAAA--GATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
163047 AGCCTTAACTGTTTGAACTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTGAGTT
314 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAA-TAGATTTATTTTTTAA-TATCTT--TTATT-AATT
* * *
163112 TTT-TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAGTAAAATAGTATGAACAAAACCAATTGT
374 TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA-TAAGATAGTATGAACAAAA-CAATTGT
* * * * *
163176 TTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCAAAACTATT
437 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATT
* * * *
163241 TGAAATTTGGTTTGGTAAACATATTCA-C
502 TG-AACTT-GTTTAGTAAACAGATTCATT
* *
163269 TTTTTAAATCTCTCATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
1 TTTTTAAATCTCTC-TTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATA
* ** * * * *
163334 AACTTATATTAA-CAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGT-AATAATGATTTGAAATAGA
64 AGCTTATACGAATTAAAAAAA-TGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAA-AACGATTTGAAATAGA
* * ** * * * * * *
163397 TAATTGTTCAAATAGT-TATAATTATTTGTATTGGTCCAATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTC
127 TAATTGTTCTAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTT-TAAATCTC
* * * * * * *
163461 TCAGTTATAAATTTTTGAAATATCAATAAATTAGT-TTTTTTTATTCCAAATATGCTTGTATGAG
190 T-ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTTTAATT--AAATAAGCTTGTATGAA
* * * *
163525 CTAAACAAA-TATTTTATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATA
252 C-AAA-AAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATA
** **** * * *
163589 GTCATAACTATTTGAACTAATTCAAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
315 GTCATAACTATTTGAACTGGTT-TGGTAATAGATTTA-TTTTTTAATATCTT--TTATTAATTTT
* * * * * ** **
163654 TAAAATATTAGTAAAGTAGTATTCTTTTATTTCGAATAAGTTCTTATGAATTGAAACAATTGTTT
376 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATAAGATAGTATGAA-CAAAACAATTGTTT
* * * * *
163719 TATGACAAAGCAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGTCAGATCAATTGTTCAAATAGTCCAATCT
439 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTTAA-A-T-AGAT-AATTATTCAAATAGTCAAAACT
* * *
163784 ATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTATTT
499 ATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCA-TT
* * * * *
163815 TTTTTAAATCTCATGC-TCATTAATTTTTTCAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTACTCTAAGT
1 TTTTTAAATCTC-T-CTTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAA-T
* * *
163879 AAGCTTGTACGAATTAAAATAAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
63 AAGCTTATACGAATTAAAA-AAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGA
* * * *
163944 TAATTTTTC-AATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTTAAATCTC
127 TAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTA--TTTTTAAATCTC
* *
164008 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTAT-AA
190 -TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTAATT-AAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * *
164072 -AAACAAATAATTGTT-T--TATAACAAA-TTCATAA-TATTT-AGATAGATAA---TTAAAATA
252 CAAA-AAATTATT-TTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATA
* ** * * * *
164127 GTTA-AACT-TTTGAA-T--TTT-CAAAAACAATTTA-GTTTT-AT-TC--ATA-TAATTTTTAA
315 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAATA-GATTTATTTTTTAATATCTTTTATTAATTTTTAA
* * * ** * **
164180 TATA-AAAT-AA-TA-TATTTATTTTATTCTAAATAATTTTGTAATGAATTAAACAA-TGTTTTT
379 AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTC-CAATAAGATAGT-ATGAACAAAACAATTG-TTTT
* ** ** * * * *
164240 ATGA-ATATTAAAAAATTATAA-CA-TTTGAATA-ATAATTA-TCAAATA--C-ATA-TATTTGA
440 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGA
* *
164296 ACTTGTTT-G-ATA-A-A-TAATT
505 ACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * * * *
164315 TTTTTCAATCAT-AC-T-ATT-A-TTTTAGAATA-TAATAAAATAAT-TTATTATATTTCAAATT
1 TTTTTAAATC-TCTCTTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA-T
* * * ** *
164373 AA--TTGTATGAATATAAAAATAATGTTTT-T-AC-AAAC--AAGTTCAAAA-TTTTAAATTAAA
63 AAGCTTATACGAAT-TAAAAA-AATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATT---TGAAA
* * * * * * **
164430 AAAATTATTATTCAAATTATTATGACTTGTTTTTATAACAAATATTTAACTATTTGATTTCAACA
123 TAGATAATTGTTC----TA--AT-A---G--TCT-TAAC---TATTTAA--A-CTGA-TTCAGTA
* * * *
164495 AAC-CATTTATTTTTTAAATATCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTT
168 AACAAATTTA-TTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTT
* * * * *
164559 TAATTTGAATATGCTTGTATGAA-AAGAAATAGTTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAACAAT
230 TAA-TTAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAA-A-TTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGAT
* * * * * * * *
164623 TTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAATTGTTTTAGTAAATAGATTTAGTTT
291 TTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGT-AATAGATTTATTTT
* * * ** ** ** *
164688 TTAA-ATCTCTTATTAA-TTTTCAATTATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTG
355 TTAATATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATAAGATAG
* * * * * *
164751 CATGAACAGAAATAATTG-TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGT
419 TATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTAT
* * ** * * * *
164815 TCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAGCAGATTTA-T
483 TCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * *
164860 TTTTTAAATATCCTACCT-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAAT
1 TTTTTAAATCT-CT-CTTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * ** * * * * * * *
164924 AAACTTGTGTGAA-TAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAA
63 AAGCTTATACGAATTA-AAA-AAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAG
* * * * * * *
164988 ATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTACTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
126 ATAATTGTTCTAATAGTCT-TAACTATTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATC-
* * * * * * **
165052 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTGA-TAAAATAATATTAGTTTATTTTTATACA-CTTGTATG
188 TCTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATTAAATTAGTATT-TTTTAATTAAATA-AGCTTGTATG
** * * * * *
165115 AACAAAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAGATCCTAACTATTTAAAATAGATAATTGTTCAAA
250 AAC-AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAA
* ** * *
165180 TAGTCCTAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAA-ATTCTTACTTATTAAT
313 TAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTT-GGTAATAGATTTATTTTTTAATA-TCTT--TTATTAAT
** * ** * * *
165243 TTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTGTTTTATTTAGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATT
373 TTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCCAATAAGATAGTATGAAC-AAAACAATT
** * * * * *
165307 GTTTTATGGTAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
435 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTA
** * *
165372 TTTGAGTTTG-TTCGATAAATAGATTCA-T
500 TTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTCATT
* * *** * *
165400 TTTTT-AA-CTCTCTT-ACTCA---TCAAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTTTGAATAA
1 TTTTTAAATCTCTCTTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAA
* * * * * * * **
165459 GCCTATATGAACTAATACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGAT
65 GCTTATACGAATTAA-AAAAATGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGAT
* * * * * * *
165523 AAATATTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTT
128 AATTGTTCTAATAGTCT-TAACTATTTAAAC-TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTT-AAATC-T
* * ** * * * * *
165586 CTACTTATTAACTATCAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATAAA
189 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTAAT-TAAATAAGCTTGTATGAA
* * *** *
165651 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAATGATTTGA-AAAAAAATATATGTTCA
252 C-AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAGA--TCATAACGATTTGAGATTGATA-AT-TGTTCA
* * * * *
165714 AATAGTCATAACTATTTGAACT--TATTGGATAAACAAATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTA
311 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-TTGG-T-AATAGATTTATTTTTTAATATCTT--TTATTA
* * * ** * * * * *
165777 ATTGTTTGAATTA-TAATAAATTTGTATTATTTTAATTTTAAAAAGCTTGCAGGAATGGC-AAA-
371 ATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAATAAGATAGTATGAA---CAAAAC
* * ** * * *
165839 AATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTTATGGTGGTTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCA
431 AATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * *
165902 TAACTATTTAAATTTTTTTA-TAAACAAATTCA-G
494 AAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * *
165935 TTTTTAAATCCCTTATTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTCTGAAT
1 TTTTTAAATCTC-TCTTGATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAT
* * * * * *
165999 AAGCTTGTATGAA-CAAAAAAATTTGTTTTGTGAC-AAA-ATAAAGGTTCATAATGATTTGAAAT
63 AAGCTTATACGAATTAAAAAAA--TGTTTTATGACTAAACA-AAAGG-TCAAAACGATTTGAAAT
* * * * ** * * ** * *
166061 AGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGTATTG-GTCAAGCCAACAGATTCATTTTTTAAAA
124 AGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGATTC-AGTAAACAAATTTA-TTTTT-AAA
* ** * * * *
166125 TC-CATTACTTATTAATTTTTAAAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TG
186 TCTC--TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTA-ATTAAATAAG-CTTG
* * * ** * * **
166188 CATCAGTAA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAAAG-TTATGAAATAAATAATT
246 TAT--G-AACAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAA-GATCATAACGATT-TGAGATTGATAATT
* * * * * ** * * *
166251 GTTTAAATTA-TTATAAGTAATTGAACTAGTTTTATGAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTCTTAT
306 GTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGT-AATAGATTTATTTTTTAATATCTTTTAT
* * * *
166314 TAATTTTTAAAAAATTAAAAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAA-ACTTA-TATGAACAAAAA
369 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-CAATAAGA--TAGTATGAAC-AAAA
* * * * * * **
166377 CATTTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATATATAATTATTCATATAGCCTT
430 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAA
* * * ** * *
166441 AACTTTTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTA-T
495 AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * * *
166474 TTTTCAAATCTCT-TAGCTATTAATTTTCAT-AATATTATTAGATTGGTATTA-TTTATTTCGAA
1 TTTTTAAATCTCTCTTG--ATTAATTTT-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
** * * * * * * * *
166536 TAAGCTTGCATGAACATAAATAATTCTTTTATGACAAAACAGAAGGTTATAAA-GATTTGAAATA
62 TAAGCTTATACGAA-TTAAAAAAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCA-AAACGATTTGAAATA
* * * * * * *
166600 TATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAAC--A--GA----T-AATCTC
125 GATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTC
* * * *
166656 TTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATGA
190 -TACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTA-ATTAAATAAG-CTTGTATGA
* * * **
166720 TGA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTCAA
251 --ACAAAA-AATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAA
* * * ** * *
166784 ATGGCCATAACTATTTGAACTGATTTCATAA-ACTGATATATGTTTTAA-ATCTCTAACTT-TTC
312 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAATA--GATTTATTTTTTAATATCT-T---TTATT-
* * * * *** * ** **
166846 AATTTTTAAAGTTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATACA-CTTTTATGAATGAAACAA
370 AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATA-AGATAGTATGAACAAAACAA
* ** * *
166910 TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAAG
433 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAAC
* * * *
166975 TATTTGAA-TGTGTTTGGTAAATATATTTATT
498 TATTTGAACT-TGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * *
167006 TTTTAAAATTATTTGCTT-ATTAATTTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTGAA
1 TTTTTAAA-TCTCT-CTTGATTAATTTTTTGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
* * * * ** * * * * * * *
167069 TAAACATGTATGAACCGAAACAATTATTTTATCACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAG
62 TAAGCTTATACGAA-TTAAAAAAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * **
167134 ATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT-TGACAAATACATTTATTTTTTAAGCCT
126 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGATTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT
* *** * * * *
167198 CTTACTTATAAATTTTT-AGAATATTATTGGTTTAGCAATATTTTACTCCT-AATAAG-TTCATA
189 C-TACTTATTAATTTTTGA-AATATTATTAAATTAG-TATTTTTTAAT--TAAATAAGCTT-GTA
* * * * * * **
167260 TGGATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATACCAATTTGATATAAATAATTGTTCA
248 T-GA-ACAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCA
* * * * * * *
167325 CATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGGTAAACAGATTTAGTTTTTAA-ATCTCTTATTAATTT
311 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGT-AATAGATTTATTTTTTAATATCTTTTATTAATTT
* * * ** * * * *
167389 TTAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTAATCTGAATAATTTTGTAAGAATAGAAACACTTGTT
375 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-CAATAAGATAGTATGAACA-AAACAATTGTT
* * * * * * *
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438 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTT
** * *
167519 GAACTCATTCAATAAACAGATTCA-T
503 GAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* * * * *
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1 TTTTTAAATCTCT--CTTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAAT
* * * * * * * * *
167608 AAGCTTTTATGAA-TAGAAACAACTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATTG
63 AAGCTTATACGAATTA-AAA-AAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAG
* * * * *
167672 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACGTG-TTCAGAAAACAAATTTATTGTTTAAATTT
126 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TGATTCAGTAAACAAATTTATT-TTTAAATCT
* * * * * ** *
167736 TTACTTGTTAATCTTTGGAATTTTGGTAAATTTA-TATTATTTT-ATTCCAAATGAGCTTGTATG
189 CTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAA-TTAGTATT-TTTTAATT--AAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * *
167799 AATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAACA-AGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTAA
250 AACA-AAA-AATTATTTTATGACAAAACAA-AGA-TCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCA
* ** * *
167863 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAA-ACATATTCATTTTTTAAATCTCTTATTCATTA
311 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAATAGAT-TT-ATTTTTT-AATATCTT-TT-ATTA
* * * * * * ** *
167927 ATTTTTGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTA-TGTGAATTGATACAA
371 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAATAAG-ATAGTATGAA-CAAAACAA
** ** ** * * **
167991 TTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTAC
433 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAAC
* *
168056 TATTTGAACTTTTTTGGTAAAC--A-T-ATT
498 TATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATT
* *** * *
168083 TTTTTAAA----TCTT-ATTAATTCTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGATCCGAATAA
1 TTTTTAAATCTCTCTTGATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAA
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65 GCT
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Statistics
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CTTATACGAATTAAAAAAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAAT
TGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTACTTA
TTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTTTAATTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAATT
ATTTTATGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTGGTTTGGTAATAGATTTATTTTTTAATATCTTTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
TTAGTATTATTTTATTCCAATAAGATAGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
TCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA
GATTCATT
Found at i:167496 original size:17 final size:16
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1 ATAATTATTTAAATA
167506 GTCATAACTG
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
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ATAATTATTTAAATAA
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* * * *
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* * * * * * * * * ** *
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* * *** * *
161114 ATAATTATTTGAA-TTATTTGGTAAATAGCTT-TATTTTTAAA-AT-TT-CTTATTAATTTTT-G
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* * * ** * * * *
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* * * *
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254 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * * *
161302 AA-TAGGTT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATCAAT
319 AACT-TGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* ** * * * *
161365 AAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA-GATTGTTTTACGACAAAA
383 AAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
161428 C---A-A--A-AACGATATGAAATAGATAATTGTT-AATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTT
446 CAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
* * *
161485 GA-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
510 CAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * * * * * * *
161515 GTCATTAATTTTTGGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG
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* * * * * * * *
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* * *
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129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-A
* *** * * * * *
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193 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT-TTAT
* * ** * * * * *
161761 GACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT-GGCTATAATTTTTTTAA
257 GACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA
* * * * ** *
161825 C-TGATT-TGGT-AA-AGA--GA----TT-CA-C-TTT--TTA--AA--TTTGGAATATCAATAA
321 CTTG-TTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * * * *
161871 ATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-TAAATAATTGTTTTATAACAAAACAA
385 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * ** * * * *
161935 TAGGTCATAACTATTTTTAATGGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGGATTTG-TTC-GA
449 AAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCAG-
* * **
161998 TAAAAAAATTTATCTTTTTTTA-CTC--
513 TAAACATATTTAT-TTTTTAAATCTCTA
* * * * * * * * *
162023 TTATTAATTTTTGAAATGTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACCGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAGA
* * * *
162088 AACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATATT
65 AACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *** * * * **
162152 CATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTTCTTTTTTTCAAATCTTTTGGCTCGTTAATTT
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TT-ATTTTTT-AAATCTCTT-ACTTATTAATTT
* * * * * * *
162217 TTTGAATGTTAATAAAATTTG-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATA
188 TTAGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTG
* * * * * * **
162280 TTTTATGACTACAA-AAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTA
251 TTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * **
162344 TTTAAACTAGTACAG--CAACACATTTATATTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTTGGAATATT
315 TTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* * * * * * *
162406 ATTAAATTAGTA-T-TTTTA-ACTAAATAACCTTCTATG-ATCAAAAATAATTATTTTATGACAA
380 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * *
162467 AAC-AAAGATCTTAACGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGT
444 AACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GT
* * *
162530 TT-GGTTAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TA
508 TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTA
* * * * * *
162560 -TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAACTA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGA-ATAA-CTTATGTGAAC-A
* * * * * * * * *
162623 -AAAAAATTGTTTTATGACAAATCAAATGGTTATAATGATTTTAAATAGAGAATTGTTCAAATAG
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
162687 TAATAATTATTCGAACTTGTTCAATAAACGCATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTT
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAA--CA-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
162752 TTGAATATTAATAAATTA-TAAATAATTTATTCTGAATAAGCTTATACGAATTA-AAACAATTGT
189 TAGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAACAATTGT
* * ** ** * * * *
162815 TTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTACATATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTGTT
252 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * ** *
162880 TAAAC-TGATTC-GGTAAATAAATTTATTTTTAAAATCTCCTACTTATTAATTTTAAAAATATTA
317 TGAACTTG-TTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * ** * * *
162943 TTAAATTAGTATTATTTTAATT-AGAATAAGCTTGTACAAACAAAAA-ATTTCTTTTATGACAAA
381 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * *
163006 AGAAATTG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATAGCCTTAACTGTTTGAACTGGTT
445 ACAAA-AGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* ** * * * *
163070 T-GGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGG
509 TCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-T-A
* * * * * ** *
163102 TTATTGAGTTTTT-TAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAGTAAAATAGTATGAACA
1 TTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAA-TAACTTA-TGTGAACA
* * * * * *
163165 -AAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATA
63 GAAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * *** * *
163229 GTCAAAACTATTTGAAATTTGGTTTGGTAAACATATTCACTTTTTAAATCTCTCA-TTGATTAAT
127 GTCATAACTATTTG-AACTT-GTTCAATAAAC--ATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAAT
* * * * *
163293 TTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATTAACA-AAAAAATT
186 TTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT
* * * * *
163356 GTTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTA
250 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * * * * * *
163421 TTTGTA-TTGGTCCA-ATAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTCAGTTATAAATTTTTGAAATAT
315 TTTGAACTT-GTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
* * ** * * * * *
163484 CAATAAATTAGT-TTTTTTTATTCCAAATATGCTTGTATGAGCT--AAACAAATATTTTATGAGA
379 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * **
163546 AAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAA
443 AAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* *
163609 TTCA--AAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTA
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* * * * * * * * **
163642 CTTATTAATTTTTAAAATATTAGTAAAGTAGTATTCTTTTATTTCGAATAAGTTCTTATGAATTG
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* * * * *
163707 AAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGTCAGATCAATTGTTCAA
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAT-AATTTGAA-A-T-AGAT-AATTATTCAA
* * * * * * * *
163772 ATAGTCCA-ATCTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTTAAATCTCATGCTCATT
124 ATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTCAAT-AA-ACA-TTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** * * * * * *
163836 AATTTTTTCAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTACTCT-AAGTAAGCTTGTACGAATTA-AAAT
183 AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAA-CAGAAAC
* * * * *
163899 AAATGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTC-AATAGTCTTA
246 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * **
163963 ACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGA
311 ACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAA
* * *
164027 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTAT-AAAAACAAATAATTGTTTTA
375 ATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAA-AAACAATTGTTTTA
* * * * *
164090 T-----AAC-AAA-TTCATAA-TATTT-AGATAGATAA---TTAAAATAGTTA-AACT-TTTGAA
438 TGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* *
164141 --T-TTTCA-AAAACA-ATTTA-GTTTT--AT-TC-A
503 CTTGTTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTA
* * *
164168 -TA-TAATTTTT--AATA-T-A-AAATAATATATTTATTTTA-TTCTAAATAA-TTTTGTAATGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-ATA-TTATTTTATTTC-GAATAACTTATG---TGA
** * * *
164224 A-TTAAACAA-TGTTTTTATGAATATTAA-AAAA--TTATAA-CATTTG-AATA-ATAATTA-TC
60 ACAGAAACAATTG-TTTTATG-ATA-AAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTC
** * * * *
164280 AAATA--CAT-A-TATTTGAACTTGTTTGATAAATAAT-TTTTTTCAA--TCATAC-TATT-A-T
122 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** * *
164335 TTTAGAATA-TAATAAAATAAT-TTATTATATTTCAAATTAA--TTGTATGAATATAAA-AATAA
187 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAACAGAAACAAT--
* * * * * * *
164395 TGTTTT-T-AC-AAAC--AAGTTCAAAATTTTAAATT-AAAAAAATTATTATTCAAATTATTATG
249 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA---TAATTTGAAATAGATAATTGTTC--A--A--AT-
* * * *
164454 ACTTGTTTTTATAACAAATATTT-AACTATTTGATTTCA-ACAAAC-CATTTATTTTTTAAATAT
304 A---G---TCATAAC---TATTTGAAC---TTG--TTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * ** * *
164516 CTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATATGCTTGTATG
355 TTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
164580 AA-AAGAAATAGTTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTATTCA
419 AATAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
164643 AATAGTTATAACTATTT-AAATTGTTTTAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTC--
483 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTA
* * ** * * *
164697 TTATTAA-TTTTCAATTATTAATAGGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-TTTTGCATGAACAG
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAACTTATG--TGAACAG
* * * * * *
164760 AAATAATTG-TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGA
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * *
164824 CATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAGCAGATTTATTTTTTAAATATCCTACCTATTAATTTTTA
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAA--ACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * *
164889 GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTGTGAATAGAAACAATTGCTTTA
191 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
* * *
164954 TGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA
256 TGACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
** * ** *
165018 ACTTACTCA-ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTGATAA
320 ACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * ** * * *
165082 AATAATATTAGTTTATT-TTTATACA-CTTGTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGACAAAAC-A
385 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * *
165144 AAGATCCTAACTATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTATTTGAA-TGTGTTT-AG
449 AAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTCAG
*
165207 AAAACATATTTATTTTTTAAAT-TCTTA
513 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * * * * * *
165234 CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTGTTTTATTTAGAATAAGCTTGTATAAACAA
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAG
* * * * *
165299 AAACAATTGTTTTATGGTAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
** * * * * *
165364 CATAACTATTTGAGTTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAACTCTCTTACTCA-TCA-----A
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAAT-AA-ACATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * *
165423 -AATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACTA-ATACAATTGTTTT
191 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTT
* * * * * *
165486 ATGATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATGACTATTTGA
255 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
165551 ACTTGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTCTACTTATTAACTATCAAAATATTAATAA
320 ACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * *
165615 ACTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
385 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * **
165680 ATG-TCATAATGATTTGAAA-AAAAATATATGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTGGA
450 A-GATCATAACGATTTGAAATAGATA-AT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCA
* *
165743 -TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
512 GTAAACATATTTATTTTTTAAATC-TCTA
* ** * *
165770 CTTATTAATTGTTTGAATTA-TAATAAATTTGTATTATTTTAATTT-TAAAAAGCTTGCA-G-GA
1 -TTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCGAATAA-CTT--ATGTGA
** * * ** ** *
165831 ATGGCAAA-AATTATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTTATGGTGGTTTGAAATA-AGTAATTGTTC
60 ACAG-AAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGA-TAATTATTC
* * ** * * *
165893 AAATAGTCATAACTATTT-AAATTTTTTTATAAACAAATTCAGTTTTTAAATCCCTTATTTATTA
122 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--ATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * *
165957 ATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAA
184 ATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
* * * * *
166020 TTTGTTTTGTGACAAAA-TAAAGGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATA
248 -TTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * ** * **
166084 ACTATTTGTA-TTGGTCA-AGCCAACAGATTCATTTTTTAAAATCCATTACTTATTAATTTTTAA
311 ACTATTTGAACTTGTTCAGA-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * * * *
166147 AATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAC-TGCATCAGTAAAAATAATTGTTTTA
374 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA
* ** * * * * * *
166211 TGACAAAACAAATGGCCATAAAG-TTATGAAATAAATAATTGTTTAAATTA-TTATAAGTAATTG
438 TGACAAAACAAAAGATCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTG
* * * *
166274 AACTAGTTTTA-TGAACAAATTTATTTTTTAAATCTC--
501 AACTTGTTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTA
* * * * * *
166310 TTATTAATTTTTAAAAAATTAAAAAATTAATATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTATATGAACAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAAT-AACTTATGTGAACAG
* * * * * * *
166374 AAACATTTGTTTTATGA-CAAACAAAAGGACATAATGATTTGAAATATATAATTATTCATATAGC
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
166438 CTTAACTTTTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGC-TATTAATTTTC
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTT
* * * * * * * * *
166502 ATAATATTATTAGATTGGTATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTGCATGAACATAAATAATTCTTTT
190 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * *
166566 ATGACAAAACAGAAGGTTATAA-AGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
255 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
166630 AACTGGTTCAG-TAAACAG----A-----T-AATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATA
319 AACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* *
166684 AATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGTCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
384 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
166747 AAAAGTTCAAAACGATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAAC-TGATTTC
447 AAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTC
* *
166811 A-TAAAC-TGATATATGTTTTAAATCTCTAA
511 AGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTCT-A
* * * * * *
166840 CTT-TTCAATTTTT-AAAGTTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATACACTTTTATGAA-
1 -TTATT-AATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATA-ACTTATGTGAAC
* * * *
166902 TGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAAAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
62 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * *** * * *
166967 GTCAAAAGTATTTGAA-TGTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TATTTGCTTATTAAT
127 GTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAAT-AA-ACA-TTATTTTTT-AAATCT-CTTACTTATTAAT
* * * * *
167030 TTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATGTATGAACCGAAACAATT
186 TTTTAGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT
* * * * * * * * *
167094 ATTTTATCACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTA
250 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * ** * * *
167159 TTTGAACTGGTT-TGACAAATACATTTATTTTTTAAGCCTCTTACTTATAAATTTTTAGAATATT
315 TTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* *** * * * * * *
167223 ATTGGTTTAGCAATATTTTACTCCT-AATAAG-TTCATATGGATAGAAACAATTGTTTTATGACA
380 AATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTT-GTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * *
167286 AAAC-AAAGATCATACCAATTTGATATAAATAATTGTTCACATAGTCATAACTATTTGAA-TTGA
443 AAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * *
167349 TTCGGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC--
508 TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTA
* ** * * *
167379 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTGGTATTATTTTA-ATCTGAATAA-TTTTGTAAGAATA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAACTTATGT--GAACA
* * * * * *
167442 GAAACACTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAG
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** *
167507 TCATAACTGTTTGAACTCATTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTGACTTATTAATTTTT
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--ATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *** * * * *
167572 GGAATTTTATTAAATTAGTATTGTTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAACTGGTTT
190 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * *
167637 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAA
255 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * ** * **
167702 ACGTGTTCAGA-AAACAAATTTATTGTTTAAAT-TTTTACTTGTTAATCTTTGGAATTTTGGTAA
320 ACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
** * * *
167765 ATTTA-TATTATTTTATTCCAAATGAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAA
385 A-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * *
167829 CAAG-TCATAATGATTTGAAATAGACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG
449 -AAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCAG
*
167892 TAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTA
513 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* **
167920 TTCATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATGTGAATTG
1 TT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAG
* * ** *
167985 ATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *** * * *
168050 TATTACTATTTGAACTTTTTTGGTAAACA-TATTTTTTTAAA-----T-CTTATTAATTCTCAAA
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGA
* ** * * *
168108 ATATTAATAAATTAATATTATTTTGA-TCCGAATAAGCTAGTATGAAC---AATAATTGTTCATA
193 ATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT-TTA
** * * * * * ** * * * * * *
168169 TAGTTATAAC-TAA-TTGA-ATTGGTTTGGCAAACATATTTATTTTTTAAAT-CTCTTATTTATT
256 T-GACAAAACAAAAGGTCATAATAATTT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTC--A--TA--
* * * * * * **
168230 AATTTTTGAA-ATATT-A-ATAAATTA-ATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATGTGAACAAAA
311 ACTATTTGAACTTGTTCAGATAAA-CAGAT-TTA-TTT-TTT---A-AATCTT-T-T--AC-TTA
** ** *** ** * *** ** *
168291 AAAATTTGTT-TTATGGCAA-AACAAAAGGTAATA-ACGATT-TGAAATAAATAATTGT-TCAAG
363 TTAATTT-TTAAAATATTAATAA-ATTA-GTATTATTTTATTCTG-AAT-AA-GCTTGTATGAA-
*** * * * * ** * * * * *
168351 TAGTCATAATTATTTGAAATAGTTCTACAAAC-AAA-ATTGTTATG-TCTAGAAATAGATTATTA
421 TAAAAACAATTGTTT--TAT-G-AC-A-AAACAAAAGATCATAACGAT-TTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
168413 TTCATATAGCCTTAACTACTT--ACATTGGTTT-GGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
479 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TT-GTTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * * * * *
168474 GTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA
1 -TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACA
* * * * * * * * * * * **
168538 TAAATAAGTATTTTCTAACAAAATC-AAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAACC
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAAA-CAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * *** * * *
168602 GTTATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAATATATTTATGTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTT
127 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAAT-AA-ACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
*** * ** *
168667 T-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTT
189 TAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* * * * *
168731 TTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
*** * * * *
168796 GAAC-TGATTC-GATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCAACTCT-TTGAACATGTTCAGA-A-
318 GAACTTG-TTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACT-TATT-AA-TTTTTAAAATAT
** * *
168855 -AATAAATT--TATT-TTTTAAATTTCACT-AATTAATTTTTGGAATATTAAGAAAATTA-AATT
379 TAATAAATTAGTATTATTTT--A-TT--CTGAA-TAA-GCTT-G--TATGAATAAAA--ACAATT
* * * * ** *
168914 ATTTTATTCGA-AATAAGCTTGCATGAACGAAACCA-ATTCTTTTATGACAAAACAAAATGTCAT
432 GTTTTA-T-GACAA-AA-----CA--AA--AGATCATA-ACGATT-TG-----A-AATA-G--AT
* * * * * * * *
168977 AATGCTTTGTGAT-ATTTAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTT-GGTAAATAGA
474 AA----TTGT--TCA---AATAG-TCATA-ACT-ATT------TGAACTTGTTTCAGTAAACATA
*
169040 TTCT-TTTTTTAATTCTCTTA
521 TT-TATTTTTTAAATCTC-TA
** * * * * *
169060 CACATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTT-AAATAAGCTTCTATGGAC
1 -TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCGAATAA-CTTATGTGAAC
* * * * * *
169123 TGAAACAATTATTTTATTATAAAAGAAATGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
62 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** * * * *
169188 GTCAGGACTATTTGAACTTGTTCATTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGT
127 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
169253 CA-AATTATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
189 TAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* * *
169317 TTATGACAAAA-AAAA-GTCATAA-AAGTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA-AAATGATT
253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATT
* * * * *
169378 TTAACTTGATT--GGTAAGCAGATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTATCTT--AATAT
317 TGAACTTG-TTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAAATAT
** * * * * *
169439 TAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAAAAAGCTTGTATGAACAAAAA-ATTATATTTTTTGAC
379 TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAAT-TGTTTTATGAC
* * ** * * * * * * *
169502 AAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCAGAATTATTTAAACTTA
442 AAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * *
169567 TTT-AGTAAAGAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTTA
507 TTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC--TA
* * * *
169600 TTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTA-
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAAC-AG
* * ** * * *
169664 AAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTGTAATGATTTGAAATATATAATTTTTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * * * * * *
169729 AATGATTATTTGATCTAGTTTAATAAACATATTTATTTTTTTAAT-TTTTAGTTATTGA-TTGTC
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * **
169792 GATATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTATTTGAATAAAAACAATCATTTT
191 GA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
169857 A-GAACAGAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGCTAAAATAGTCATAACTATTTG
255 ATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
169921 AACTAGTT-TGATAAATAGATTTTTTTTTTTAAATC---T-CTTATCAATTTTCAAAATATTAAT
319 AACTTGTTCAGATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * * *
169981 AGATTAGTATTACTTTATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAATA
383 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
170046 AAAGGTCATGATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGGTT-AG
448 AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCA-
* *
170109 GTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTGAA
512 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT--A
* * * * * *
170139 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATAAAC-TAGTATGAATTC
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAT-AACTTA-TGTGAA--C
* * * * * * * * *
170203 A-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAAATATTTATTCATATA
62 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * * * * *
170267 GTCTTAGA-TAGTTAAAATGGATCGACAAACAAATTTTTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTT
127 GTCATA-ACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * ** * * * ***
170331 T-GAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAAAATAAAAATAATAAAT
189 TAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* ** * * * * * * * *
170395 TTATAACAAAACAAAAATTTATAATGATTTGAAGT--TTACGTTATTCAAATAGTTATAACTATG
253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATA-ATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
170458 TGAACTAGTTC-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAA
317 TGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * *
170522 T-AATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGAATG-TTCAAAAACAATTGTTATATGACCAA
382 TAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * *** * ** *
170584 ACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGTCATAGCCATAACTACGTGAACTTG-CT
445 ACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
* * *
170648 CAATAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTA
510 CAGTAAACATATTTATTTTTT-AAAT-CTCTA
* *
170680 CTTATTAATTTTTTAAA-ATTTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAAGTCTT-TATGAA
1 -TTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAA--CTTATGTGAA
* * * * * * * *
170742 CA-AAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAATGTTCAAATATGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTA
61 CAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GGTCATA-AT-AA----TTT-G-AAATAGA-TAA
* * * * ** * * * * * * **
170806 TTTTTTAAA-ACTCCTATTTA-TT-AATTTTTTAAATATTA-ATAAATTAGTATAAT-T-TTA-T
116 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATA-AACATTATTTTTTA-AATCTCTTACT
* * * * ***** * * * **
170864 T-TGAAATAGGTTT-GTATGATGAA-AAA-TA--ATTATTTTAGGACAAAACAAAAGTTTATAAC
179 TAT-TAAT--TTTTAGAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTTTGA-ATAAGCTTGTATG
* * * * ** *** * *
170923 AATCTGAAATGGATAATTGTTCTAATAGCCATAATTATTTGAATCGAT-TTAA--T-AAACT-GA
237 AA-CAG-AA---ACAATTGTT-TTAT-GACA-AAACAAAAG-GTC-ATAATAATTTGAAA-TAGA
* * * * * * * * * *
170983 CTTATTTTTTAAAT-CTCA-ACCTA--TCAA-TTTTTGTATATTAATAAAGTAATATTATTTTAT
291 -TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-CAGA-TAA-ACAG--AT-TTA-TTT-T
* * * ** * *
171043 TCTAGATAAGCTTTTA-TGAACTGAAACAGTTGTTTATGATA-AAACAAA--AGGTCA-TA-TTT
347 T-T--A-AATCTTTTACT-TA-T--TA-A-TT-TTTAAAATATTAATAAATTA-GT-ATTATTTT
* * * ** * * **
171102 ATTTTAAATAGATAG-TTGT-TCAAATAGTTGTAACTATTTGAACTTGTT-CG-GTAAACAAATT
399 ATTCTGAAT--A-AGCTTGTAT-GAATA---AAAAC-AATTG---TT-TTATGACAAAACAAA--
** ** ** * * * **
171163 TATTTTTTAAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTG-TAAATGTTAATAAATTAGT-ATTATTTTATT
450 -AGATCATAACGA--T-TTG---A--AA--TAGATAATTGTT--CAAA-TAGTCA-TA-ACTA-T
* * * * * *** * *
171226 TTGAATAAGCTTGTATGAATAAAACGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCTA
498 TTG---AA-CTTGTTTCAGT-AAAC-ATATT-TATTTTTTAAAT-CTCTA
* * * ** **
171275 ATAGTCTAAACTATTT-AAACTAGTTCGACAAACACATT--TATT-TTTTAAATCTCAT-ACTTA
1 TTA-T-T-AA-TTTTTGAAA-TA-TT--A-ATA-A-ATTAATATTATTTTATTTCGAATAACTTA
* * *
171335 T-T-AATTTTTAGAATATTCTTAATTTAGCAATATTTTACTCCA-AATAAGCTTGTCTAAACA-A
55 TGTGAA----CAGAA-A--C--AA-TT-G-----TTTTA-T-GATAA-AA------C-AAA-AGG
** * * * * * *
171396 AAATAATTATTTTATGACAAAACTAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATAGTTCAAATAGTC
93 TCATAA-TA-ATT-TG---AAA-T-AG---ATAATTA-TTCAAATAG-T--CA--T-AACTA-T-
* * * *
171461 AT-AACTATTTGAACTAGTTCAATAAATGGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCA
138 TTGAAC----T----T-GTTCAATAAA--CA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * ** *
171521 -AACTGTTAATAAATTATTATTATTATT-TTATTACGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTG
191 GAA-TATTAATAAATTAGTATTATT-TTATT-TT--GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG
* ** * * * * * * *
171584 TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATATATAATAGTTGAAATGGACATGACCAT
251 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** *
171649 TTGAACTTG-T-ATGATGAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCGACTTATTAATTTTTAGAATATT
316 TTGAACTTGTTCA-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* * * * *
171712 AATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAACATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAATAA
380 AATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * * * *
171776 AACAAAAGACCTTATCAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAACTTTTTGAAC-TCTC
444 AACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* *
171840 TCAATAAAC--ATTTATTTTTTAAATCTTTTA
509 TCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATC-TCTA
* * * * *
171870 CTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAAAATTTTATGAATA
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAAT-AACTTATGTGAACA
* * * * * *
171934 GAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAG
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * *
171999 TCATAACTATTTGAACATATTTAGA-AAACAGATTTATTTTTCAAAT-TTTTACTTATTAATTTT
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* *** ** * *
172062 TGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAATTTGCATGAACAGAACCAATTGTT
189 TAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
** * * *
172126 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
172191 GAACATGTTC-GATGAATAGATTCATTTTGT-AAT-TTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAA
318 GAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * *** * *
172253 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTATTTGAATTGGAACAATTGTTTTATTATAAAA
382 TAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
172317 CAAAAGCTCGTAATGATTTGAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTCAACTTGTTT
446 CAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
* * * * *
172381 CA-TAAGCATATATA-TTTTTAAATATTTTCC
510 CAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT-CTCT-A
* ** * ** * * * *
172411 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTAACTCAAATAATCTTGTATGAATAGA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAGA
* * * * * *
172476 AACAATTGTTTTATG-CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATC
65 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
*
172540 ATAA-TGATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATT-TATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT
130 ATAACT-ATTTGAACTTGTTCAATAAAC--ATTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-T
* * *** * * *
172603 T--AATACTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT-AGATAGAAAAAATTATT
189 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTT
* * * * * * *
172665 CTATGACAAAA-AAAAGGTTATATTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * **
172729 AAATTTATT-TGATAAACAAATTCA-TTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAAT
318 GAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * * *
172792 ATATTGGTATTATTCTATTTTGAATAAACTTATATAAACT-AAAGCAATT-CTTTATGACAAAAC
383 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *** * * *
172855 AAAATG-TCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGT-ATGGTTGTTTGATCTAGTTT-
447 AAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC
* * * *
172917 GGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTA
511 AGTAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTCTA
* * *
172947 CTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTATGTGAACA
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAA-CTTATGTGAACA
* * * * * *
173011 TAAACAA---TTTTA--CT-AAACAAAA-GAC-TAAAACGATTTTAAATAGATAATTATTCTAAT
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATA--ATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * *
173068 AGTCATGACTATTTAAACTTGTTC-ATAAATATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
126 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAAT-AA-ACA-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * * * *
173132 ATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTAT
187 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* * ** * * * *
173197 TTTATGATAAAACAAAAAGTCATAGCAATTTGAAACAAATAACTATTCAAATAGTCATAA-TGAT
252 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-AT
* * * * *
173261 TTGAACTTGTTC-GGTACATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCTT--GATA-
316 TTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAAATAT
* ** * **
173322 TAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACATAAAA-AATCATTTTATGACA
379 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACA
* ** ** * * * * *
173386 AAACAAAAGGTTTTAGTGATTTCAAATGGATAATTGTTCAAATCA-TCCTAATTATTTTAACTTG
443 AAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTG
* *
173450 TTT-AGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTA
507 TTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * ** * * **
173483 GTCATTAATTTTTGGAATATTAATAGCTTAGTATTTTTTTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAAC
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA--ATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAAC
* * * * ** * * ** * * *
173548 --TAA-AATAG----ATAATTATTCAAATA-GTCATGATTATTTGATCTAG-T--TCACT-AAAC
62 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA-AGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * *** * * * * * **
173601 A-T-ATTTA-TTTTTGAAATT-TT--TTACTTATTAATTGTCAAA--TATTA---ATAAATTAGT
126 AGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
** * * * * * * * * * * *
173655 ATTATTTTAATCCGAATAAG-CTTATATGA--ATGAAACTATTG-TTTTAT-AATAG-AACAAAA
190 AGAATATTAAT--AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AA-TA-AGCTTGTATGAACAGAAAC-AAT
* * * *** * *** * * * *
173714 AGTCATAATGATTTGAA-ATAA----ATAATTGCTT-AAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTT
249 TGT-TTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAG--ATAATT-GTTCAAAT-A-GT
* * * * ** ** * * * * *
173773 CATAAACGATTT--A-TTTTTTAAAT-CTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATT-TGT-AT
307 CAT-AACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTA-CTTAT-TAAT
** * * * * * * * * * **
173832 TATTT----TATT--TCAAACAAGCA-TATATCA-AC-AAAAACA-TTTGTTTTATGACAAAACA
368 T-TTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AGCTTGTATGAATA-AAAACA
** * * * *** ** * * *
173887 AAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGAT-A-ATTG-TTT-AAATAGTCATAATTATTTGAACTAGT
429 ATTGTTTTATGACAA-AACAAA-AGATCATAACGATTTGAAATAG--ATAATT-GTTCAAATAGT
* *
173947 --T----------A---G-----GTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA
489 CATAACTATTTGAACTTGTTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * * * * * *
173979 CTTATTAAATTTTGAAATGTTAATAGATTCATTTTATTTT-TTTCTGAGTAAGC-TAGTATGAAT
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAA-CTTA-TGTGAAC
* * * * *** * ** * * * *
174042 TGAAAAAATTATTTGAT--TCCGACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTCTTGAAATG
62 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * *
174105 GCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACATT-TTCACCTTTTAAATCACTTACTTATTAATT
127 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACATTATT----TTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * ** * *
174168 TTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACTG-AACAATTGT
187 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* * * * *
174232 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGGTCAAATAGTCGTAAGTATT
252 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * **
174297 AGAATTTGTTCAG-TAAAAAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTTAATTTTGGAAATATT
317 TGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTA-TTAATTTTTAAAATATT
* * * ** * *
174360 AAGAAATTAGTATTATTTTATT-TTAGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTATATGTCAA
380 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
174424 AA-AAAAG-TCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATGGTAATAATTATTTTATA-TTGT
444 AACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGT
* * * *
174486 TTGA-TATATAGATTTATTT-TTTTTTCAAATCTTTTGC
508 TTCAGTA-A-ACA--TATTTATTTTTT-AAATC-TCT-A
* *** * * * *
174523 TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTAATTTATTTTGAATAAGC-T-TGTAAGATA
1 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGA-ACA
* * * * * ** * * **
174585 TGAAACAAATATTTTATGACT-AAATAAGAGGTCAGAACGATTTAAAATAGGTAATTATTTTAAT
63 -GAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* *
174649 AGT-TTCAACTAATTGAA-TTGATTCGACA-AACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
126 AGTCAT-AACTATTTGAACTTG-TTC-A-ATAA-ACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * **** *** * * *
174711 TTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTCCAATGATCAGAAGCAAG
185 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAAT
* ** * * *
174775 TGTTTTATGACAAAACAATTA--TTTTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
249 TGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* ** * * * * * * *
174838 TATTTAAACTAATT-TGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTATTGCTTACTAATTTTTGAAATA
313 TATTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* * * * *
174902 TTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGCAT-AATTAAAAATAA-TATTTTATGA
378 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGA
* * * ** * * *
174964 CAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGTAATAGATAATCAATTCAAATGGCCATAA-TAATTTTAA
441 CAAAAC-AAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA
* * *
175028 C-TGATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTA
503 CTTGTTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* ** * * * * * * *
175065 CTTAATAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTATCTAAGCTTGTATTAACT
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGA-ATAA-CTTATGTGAACA
* * * * * * * *
175129 GAAACAATTGTTTTATGACAAATA-AAAAGGTTATAATGATTTTTAATTA-ACATTTGTTCAAAT
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAA-ACAAAAGGTCATAAT-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * * *
175192 AATAAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATATCTTTCTTTTTAATT
126 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAAT-AA-ACA-TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT
* * *
175257 TTTCA-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG
187 TTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG
* * * * *
175321 TTTTATGACTAAGCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATATG-TAATTGTTCTAATAGTCTTAACTA
251 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** * * * ** **
175385 TTTGAACTAGTTC-GGCAATCACATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTACAAATTTTTGGAATATT
315 TTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* ** * * * *
175448 -ATAAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAGGTTTGTATGAA-AAGAAACAACTATTTTTTATAA
380 AAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAA-AAACAA-T-TGTTTTATGA
* * * * * * *
175511 CAAAA-TAAATATCGTCATGATTTGAGATAGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
441 CAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * *
175575 ATTTGGAAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTAAACAGATTTGTTTTTAAAATTTTTTA
506 GTTT------CAG---TA------AACATATTT------A--T-TTTTT-AAA-TCTCTA
* * * * * *
175635 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAA
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATA-ACTTATGTGAACAG
* * * *
175700 AAACAATGGGTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAACT-ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * *
175763 CCATAACTATTTGAA-TTGTTTAGA-AAACATATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAAATTT
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *** * * * *
175825 TGGAATATTAATAAATTTA-TACTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAATAGAACCAATTATT
189 TAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* * * *
175889 TTAT----------TA--T-A-AAT-ATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAATCA-AACTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * * * * **
175938 GAACTTGTTTTG-TAGACAAATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAT
318 GAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * ** * * **
176002 AAATTAGTATAATTATATTTTTAATGAGCCTATATGAATTGATAGAATTGTTTTATGATGAAACA
383 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * ** *
176067 AAA-AGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTTATCACAATTTGAAC-TAATTCG
448 AAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCA
* * * *
176130 GTAAACATATTTATTTTTAAAATATTTTGC
512 GTAAACATATTTATTTTTTAAAT-CTCT-A
* ** * * * * * * *
176160 TTATTAATTGTCCAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTGTATGAACAAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAGA
* * * * *
176225 AACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATAATGATTTG--A-A-ATAATTGTTCAAATAGTC
65 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * *
176286 ATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATTT-
130 ATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTA
* * * * * * *
176350 GAATATTAATAAATTTGAATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTATTTT
191 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
176414 ATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAACTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAA
255 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * **
176479 ATTTCTTC-GATAAATAGATTCAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
320 ACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * * * * *
176539 ATTAGAAGTATGTTATTCTGAATCAA-CTTATACGAACAAAAACAATTCTTTTGTGACAAAAC-A
385 ATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
176602 AAGATCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCATATAGTTATAACTATTTGTAC-TG-GTCAAG
449 AAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-AG
** * * *
176665 CCAATAGATTCATTTTTTAAATCAAT-TA
513 TAAACATATTTATTTTTTAAATC--TCTA
* * ** * * * * *
176693 CTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAA--TACCGTATCAAT
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAACTTA---TGTGAAC
* * * *
176756 AAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCACAACT-ATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAAT
62 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * ***
176819 TGTTATAACTAATTGAA-TTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATT
126 AGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * *
176879 TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAAAAACTTATATGAACA-AAAAAATTTG
187 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA-TTG
* ** * * * * *
176943 TTTTACT-ACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAGCTA
251 TTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* ** ** * * * *
177007 TTTGAA-TTATTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTATTAATTTTCATAATAT
315 TTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATAT
* * * * * * * * *
177070 TACTAGATTTGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTGTGACA
379 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * * *
177134 AATCAAAAGGTTATAATGATTTGAAAAATATAATTGTTGAAATAGTCGTAACTATTTGAAC-TAT
443 AAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* *
177198 TTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCACCTA
508 TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATC-TCTA
** * * *
177231 CACATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAGACTTATATGATA-
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATA-ACTTATGTGA-AC
* * * * * * ** * * *
177294 AAAAAAAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAGTTTATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATG
62 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * ** *
177359 GTTATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCACCAACTTCTTAATTT
127 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * ** * * * * *
177423 TTAAAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTTGGAA-AAACTTTTATGATCTGAAATAATTGT
188 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* * * * *
177487 TTTAGGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCACATAGTCATAACTATT
252 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** * ** *
177552 TGAACTTGTT-TGGTAAAC--ATTT-TTTTAAAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTTTGAATGTT
317 TGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTAAAATATT
* * * ** * *
177612 AATAAAATAATATTATTTTATT-TGAATAAGCATGTATG-ATCTGAAACAATTTTTTTATTGACT
380 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTA-TGACA
* * * * ** * * * *
177675 AAAGAAAAGGTTAGAATAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTTG-
443 AAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* ***
177739 TTCGGTAAATGCATTTATTTTTTAAATCTC--
508 TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTA
* ** ** * ** * * * * *
177769 TTATT-ATTTTT-AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTT-GCTCCAATTAAGCTTGTATAAATA
1 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAA-TAA-CTTATGTGAACA
* * * * * *
177831 GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTCCAAATTA
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TA
* * * *
177895 -TCATAACTATTTGAACTAGTTTGACGAACAAA-TTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTT
127 GTCATAACTATTTGAACTTG-TT--C-AATAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * **
177954 TTAGAATATTAATAAACTAGTATCATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTT
188 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG------AAC-A--G--
* * * * *
178019 TAAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAAATTGAAATAGATAATTG-TGAGAA
242 ---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AA
* * * * * *
178083 TGGACACT-ACTATTTGAACTT-TTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTT-TTAA
303 TAGTCA-TAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * * * * * * *
178144 ATATTAGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATT-TCAAATAAACTTATATGAATAGAAACAAT
367 TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAAT
* * * * *
178208 TGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATAACT
431 TGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * *** * *
178273 ATTTGAACTCG-CTC-GATAAATGGATTTATTTTTCAAATCTTTTA
496 ATTTGAACTTGTTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATC-TCTA
* * * * * * ** *
178317 CTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATCCACAT
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATA-ACTTATGTGAACAG
* * * * * *
178382 AAACAATAGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
178447 CATAACTACTTGAACGTGTTCTAAAAATAGATTTATTTTTTATAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
129 CATAACTATTTGAACTTGTTC-AATAA-ACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * *** * * * *
178511 AAATATAAATAAATTTA-AATTATTTTATTCAAAATAAACTTGCATGAATA-AAACCATTGTTTT
191 GAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
178574 ATGACAAAACTAAAGGTCATAGTATTTTGAAACAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA
255 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * **
178639 ACTTATTTAG-TAAATAGATTCT-TTTTTT-AATTTTGTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAT
320 ACTTGTTCAGATAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * *
178701 AAATTAATATTATTTTACTTC-AAATATA-C-TGATACGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAA
383 AAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATA-AGCTTG-TATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * ** * *
178762 AAGAAAATG-TCGTAATGATTTGAAATTGGTAATTACTAAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTG-
444 AACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
** *
178825 TTCAAAAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTCGAA
508 TTCAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATC-TC-TA
* ** * * *
178860 TTA-TAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTCA-TCCAAATAAATT-TGTATGAACA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCGAATAACTTATG--TGAACA
* * * * * **
178922 GAAACAATTATTTTATG-TCAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTCCTCAAATA
63 GAAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
178986 ATCATAA-TGAATTAAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAACTTTTTACTTATTAATT
127 GTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATT
* * *** * * *
179050 GCCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTGTGAATAGAAAAAATT
187 --TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT
* * *
179113 ATTTTATGACCAAACAAAAGGT--T-AT-A---G----CG---ATT-TT-AAATAG--------A
250 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
179154 --T-AA-TTGTT-AAATAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTTA-TTATTATTTTTTAGATTAT
315 TTTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
* * * * *
179213 TAATAAATTAGTGTTATTCTATTTTGAATAAGCTTATAT-AA-AATGAAACAATTCTTTTATGAC
379 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAA--AAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * *
179276 AAAACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTACTTGATC-TA
442 AAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * *
179340 CTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATTTTCTA
507 TTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAA-TCTCTA
* * ** * * * * * * *
179374 CTCATTAATTATCAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAGCTTGTATGGATAG
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTCGAATAACTTATGTGAACAG
* ** * * * ** * ** *
179438 AAACAATTATTTTAAAATATAGCAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAAT
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** *
179503 AATAACTATTTAAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTT-
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAAT-AA-ACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * ** * * * * * *
179563 GAAACATTAATAGATTAGTATTACCTTATTCTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTT
191 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * *
179628 ATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCT-ATAATAATCATAATTATTTG
255 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTG
* * * ** ** * * *
179692 AACTAGTT-AGGTAAATAGAACTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATATTTGAAATACTAATA
319 AACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* ** *
179756 AATTTGT-TGTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCCAAAAAC--TTATTTTATGACAA
384 AATTAGTAT-TATTTTATTCTGAATAAGCTT-GTATGAA-T--AAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
179817 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC--AT-GTCTTAAATATTTGAAC-TGGT
444 AACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * *
179878 TCAATAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTA
509 TCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * * * * * * **
179910 GTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAGATTAGTTTTATTTT-TTTATGAATAAGCTTCTACGAACA
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-CGAATAA-CTTATGTGAACA
* * * * * * * * * ** * * *
179974 AAAATAATTATTTAATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTAAAATAG
63 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** * *
180039 TCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTCAAATCAC-TACTTATTAATTTTT
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** *
180103 -GAAAGATTAATAAATTA-TCATTATTTTATTTTGAATAAGGTTGAATGTTCAAAAACAATTGTT
190 AG-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* * ** * * * * * * *
180166 ATATGACCAAACAAAAGGAAATAACATTTTGAAATAGATAATTATTGACAGAGTCATAATTATTT
253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * *
180231 -AAGCTAATTC-GATAAATAGATTTACTTTGTAAATC----ACTT-TGTAATTTTTGAAATATTA
318 GAA-CTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT-TAATTTTTAAAATATTA
* * * **
180289 ATAAATTAGTATTATTTTACTTC-AAATAAGGTTGCATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAA
381 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * *
180353 ACAAAAG-T-ATAAAGATTTGAAATAGACAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTAAAC-TGCTT
445 ACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
* * * *
180415 CAGCAAATATATTTATTTTTTATATCTGTTA
510 CAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT-CTA
* * * * * * * **
180446 GTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTCATATGAATTG
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAG
* * * * * * * *
180511 AAACAATTAG-TATATAATAGAATAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG
64 AAACAATT-GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** * * * *
180575 ---GAACTGGTTCAA-----TAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGA
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-
* * **
180630 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGATGA-AAAGCAATTGTTTTA
192 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CAATTGTTTTA
** * * * * * ** * * * *
180694 TGATGAAACAAAAGTTCATAATGATTTCAAAAACATAATTGGCCAAAATGGGCAAAATTATTTGA
256 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * * ** *
180759 AC-CGATTCA-ACAAACTA-ACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATAAAAATTTGAAATATTAAT
320 ACTTG-TTCAGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * *
180821 AAAGTAATATTATTTTATT-TTAGATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATAATAAAA
383 AAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *** * * * *
180884 CAGAAGGTTATATTTATTTTAAATTGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-
446 CAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC
* * ** * * *
180948 GGCAAACGGAATTATTTTTTGAAATATCTTGT
511 AGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTC-T-A
* * * * ** * *
180980 TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCACATATGAACTG
1 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAG
* * * * * * * *
181044 AAACAATTATTTTATAACT-AAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAG
64 AAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * *
181108 TCTTAACTATTTGAACTGGTTTGCCAA-ACACATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTA-GAATTTT
128 TCATAACTATTTGAACTTG-TT--CAATAAACA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
181171 TAGAATATTATTAATTTAGTAATATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTT
189 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* ** * ** * *
181236 TAAGGTAAAAC-AAAGATCATAACGATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTT
254 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
181299 GAACTAGTTTAAGA-AAA-A-ATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAG
318 GAACTTG-TTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * ** * * **
181357 TAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAAC
382 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * ** *
181422 GAAATG-TCATAACAATTTGAAATAGATCATAGCTCAAATAAACATGACTATTTGAACTTGTTT-
447 -AAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC
* *
181485 GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAA
511 AGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT-A
* * * * * **
181515 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATGG
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAT-AACTTATGTGAACAG
** * *
181580 AAACAATTGTTTTTATGCCAAAACAAAA--T-ATAATAACTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
64 AAACAATTG-TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
181642 GTCATAACTATCTAAACTCGCTT-GATAAATCAATTTATTTTTTAAATATTTTGCTTATTAATTT
127 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAA-C-A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *** * * *
181706 TTGGAATTTTAATAAATTA-TAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGG
188 TTAGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
* * ** *
181770 TTTATGACAAAACAAAGGGTTATAACGATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
252 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * *
181835 TGAA-TGTGTTTGGA-AAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATGAA-TTTTAGGAATATT
317 TGAACT-TGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AAATATT
* * * * * *
181896 AGA-AAATTTA-TATTATTTTATT-TAATATAAGCTCGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATGAC
380 A-ATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * *
181958 AAAACAAAAGGTTAT-A-GTATTTTGAATTAGATAATTATTCAGATAGTCATGACTATTTGAA-T
442 AAAACAAAAGATCATAACG-A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
182020 ATG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAATTTTTTTA
505 -TGTTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAA-ATCTCTA
* * * * * * * **
182056 CTCATTAATTTTTGAGATATTAATAAGTTAGTATTATTTTCTTTCAAATAAGCTTATATGAATTG
1 -TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAG
* * * * * * *
182121 AAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAA-GTCACAATGATTTG-AATAAATAATTAGTCAAATAGT
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
182184 CATGACTATTTGAACTTGTTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTAATTATTAATTGTT-
129 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--A-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* * * *** *
182248 GAAAATTTAATAAATTAATATTATTTTAATCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTT
191 GAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * **
182313 ATGACTAAACAAATA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAAGATTTG
255 ATGACAAAACAAA-AGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *
182377 AACTTGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAA
319 AACTTGTTCAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAA
* * ** * * **
182439 TAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGATTGTATGAATAGAAAAAAAAATCATTTTATGACAA
382 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT---AAAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
182504 AACAAAAGGTTAT-TCTGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTTG-
444 AACAAAAGATCATAAC-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * * * * * *
182567 TTC-GATAAACAGACTCAGTTTTTAAATATTTGCC
508 TTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT--A
* * * * * * *
182601 TTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTGTTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTTCGAATAA-CTTATGTGAACAG
* * * *
182665 AAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACTA-
64 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAG
* * * ** *
182729 TCATAATTATTTGCACTAG-TC-ATGCCAATGGATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTTTTAATT
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAAT---AA-ACATT-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT
* * * * ** * * * * *
182791 TTTAGAATGTTAATAAATTTGCATTACTTTATTTCAAATAAAAC-TGTATCAATAAAAACAATTA
187 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTG
* * ** * * * * * *
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251 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
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316 TTGAACTTGTTCAGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* ** * * ** * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * ** * * * * *
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** * * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * ** * *
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188 TTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TGTATGAACAGAAACAATTG
** ** ** * * * * *
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* *** *
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* * * * * * * * *
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378 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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* ** * * ** ** *
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188 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* * * *
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253 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * *
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318 GAACTTGTTCA-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* ** *
184041 TAAATTAGTATTATTTTATTATG-ATAATTTTTTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGA-AAAA-
382 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** * * * *
184103 AAATG-TTGTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAA-TTCATTT-
447 AAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTC
* *
184165 -GTTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTTTGC
511 AG-TAAACATATTTA-TTTTTTAAATC-TCT-A
* *** *
184197 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATCAACA-
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCG-AATAA-CTTATGTGAACAG
** * ** * * *
184260 AAACCAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAG
64 AAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** * * * *
184325 TCA-AACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTCTTCTTTTAATTCTTTTACTAATTAATTTTT
128 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC--ATTATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
** ** ** * ** *
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* * * * ** *
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TAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATA
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AAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
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TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCAGTAAACATA
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* *
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* **
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* * * * * ***
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* ** * *
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* ** * * * *
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* * * * * ** * * *
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**
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* * * * * * * * ** *
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127 T-AAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
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* *
171850 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTGAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTC
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* ** * * ** *
171914 TGAATAAAATTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
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* * * * * *
171968 AACAATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACATAT-TTAGA-AAACAGA
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*
172031 TTTATTTTTCAAAT-TTTTACTTATTAATTT-TTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
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* ** ** * *
172093 CAAAATAAATTTGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
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* * * * * * *
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* * * ***
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* ** * * * * * *
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128 AAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
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* * * *** ** *
172391 TATA-TTTTTAAATATTTTCCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTA-ACT
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* * * * *
172454 CAAATAATCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG-CAAAACAAAAAGTCAT
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
172686 ATTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAATTTATTTGATAAACAAATT
1 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATT
* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * * *
172865 AACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGT-ATGGTTGTTTGATCTAGTTTGGTAAACATATT
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* * * * *
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66 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTTG--ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * *
172993 AATAAGCTTATGTGAACATAAAC-A--A-TTT-T-ACTAAACAAAA-GACTAA
129 AATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC-AT
* * * * * * *
173039 AACGATTTTAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATGACTATTTAAACTTGTTC-ATAAATATATT
1 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATT
*** * * *
173103 TATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTG
66 TA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TCTTGATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * *
173168 AATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCAT
129 AATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * *
173220 AGCAATTTGAAACAAATAACTATTCAAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTTCGGTACATAAATT
1 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATT
* *
173285 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCTTGATA-TAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAA
66 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TCTTGATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA
* * * * **
173349 ATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTTT
130 ATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * *
173400 AGTGATTTCAAATGGATAATTGTTCAAATCA-TCCTAATTATTTTAACTTGTT-TAGTAAACAAA
1 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAAA
* * * * ** *
173463 TTCATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTT-TTGGAATATTAATAGCTTAGTATTTTTTT
64 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTT-G-ATATTAATAAATTAGTATTATTTT
173523 TTATTTCGAA
Statistics
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0.77 0.16 0.07
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATT
TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTTGATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA
TAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
Found at i:174004 original size:496 final size:498
Alignment explanation
Indices: 173048--174004 Score: 1226
Period size: 496 Copynumber: 1.9 Consensus size: 498
173038 AAACGATTTT
* * * *
173048 AAATAGATAATTATTCTAATAGTCATGACTATTTAAACTTGTTCATAAATATATTTATTTTTTTA
1 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAACTAGTTCATAAACATATTTATTTTTTGA
*
173113 AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTA
66 AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTA
* *
173178 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAGCAATTTGAAACAAATAACTAT
131 TATGAATAGAAACAATTATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAACAAATAACTAT
173243 TCAAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTTCGGTACATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
196 TCAAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTT--GTACATAAATTTATTTTTTAAATC--TTACTTAT
* * * *
173308 TAATTATCTTGATATAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAA
257 TAATTATCTTGATATAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAACAAGCATATATCAACATAAAAAA
** *** * *
173373 TCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTTTAGTGATTTCAAATGGATAATTGTTCAAATCATCCTAAT
322 TCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATCATCATAAT
* * * * *
173438 TATTTTAACTTGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATAT
387 TATTTGAACTAGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAATTTTGAAATAT
173503 TAATAGCTTAGTATTTTTTTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAACTA
452 TAATAGCTTAGTATTTTTTTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAACTA
* * *
173550 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCACTAAACATATTTA-TTTTTG
1 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAACTAGTTCA-TAAACATATTTATTTTTTG
* * *
173614 AAATTTTTTACTTATTAATTGTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAGCTT
65 AAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTT
* * * ** * *
173678 ATATGAAT-GAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
130 ATATGAATAGAAACAATTATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAACAAATAACT-
* *
173742 CTT-AAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATT-T-CATAAACGATTTATTTTTTAAATC-T-CTT
194 ATTCAAATAGTCATAATGATTTGAACTTG-TTGTACAT-AA--ATTTATTTTTTAAATCTTACTT
*
173801 ATTAATT-T-TTGAAATATTAATAGATTTGTATTATTTTATTTC-AAACAAGCATATATCAACA-
255 ATTAATTATCTTG--ATA-TAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAACAAGCATATATCAACAT
* ** * *
173862 AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT-A
316 AAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATCA
*
173926 GTCATAATTATTTGAACTAG-TTAGGTAAACAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAAT
380 -TCATAATTATTTGAACTAGTTTA-GTAAAC-AAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAAT
*
173989 TTTGAAATGTTAATAG
442 TTTGAAATATTAATAG
174005 ATTCATTTTA
Statistics
Matches: 395, Mismatches: 46, Indels: 34
0.83 0.10 0.07
Matches are distributed among these distances:
493 3 0.01
494 1 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (498 bp):
AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAACTAGTTCATAAACATATTTATTTTTTGA
AATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTA
TATGAATAGAAACAATTATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAACAAATAACTAT
TCAAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTTGTACATAAATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAAT
TATCTTGATATAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAACAAGCATATATCAACATAAAAAATCAT
TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATCATCATAATTATT
TGAACTAGTTTAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAAATTTTGAAATATTAAT
AGCTTAGTATTTTTTTTTATTTCGAATAAGCTTATACGAACTA
Found at i:174928 original size:725 final size:724
Alignment explanation
Indices: 174144--175601 Score: 1710
Period size: 725 Copynumber: 2.0 Consensus size: 724
174134 CATTTTCACC
* * *
174144 TTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
1 TTTTAAATCACTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAA
* * *
174209 ACTTGTATGAACTGAACAAT-TGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTT-TAAATAGA
66 ACTTGCAT-AA-TGAAAAATATATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAACAATTTGT-AATAGA
** * * *
174271 TAAT-TGGTCAAATAGTCGTAAGT-ATTAGAATTTG-TTCAGTAAAAAAATTTATTTTTTTAAA-
128 TAATCAAGTCAAATAGCCATAA-TAATTAGAA-CTGATTCAGTAAAAAAATTTA-TTTTTTAAAT
* * * * *
174332 CTCTTGCTTATTTAATTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTA
190 CTCTTACTTA-ATAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCTAGATAAGCTTGTA
* * *
174397 TGAATTGAAACAATTGTTATATGTCAAA-AAAAA-GTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTC
254 TGAACTGAAACAATTGTTATATGACAAATAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTC
** * * * * **
174460 AAATGGTAATAATTATTTTATA-TTGTTT-GATATATAGATTTATTTTTTTTTCAA-ATCTTTTG
319 AAATAATAAAAACTATTTGA-ACTTGTTTAG-TAAATAGATTTA--TTTTTTAAAATATC-TTT-
** * * *
174522 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGATA-T
378 CTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGA-ACA
* * * *
174586 GAAACAAATATTTTATGACTAAATAAGAGGTCAGAACGATTTAAAATAGGTAATTATTTTAATAG
442 GAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTAAAATAGGTAATTATTCTAATAG
* **
174651 T-TTCAACTAATTGAA-TTGATTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
507 TCTT-AACTAATTGAACTAG-TTCGACAAACACATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTACAAATTT
* ** * *
174714 TTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAA-CCAAATAAGCTCCAATGATCAGAAGCAA-GTG
569 TTGGAATATTATAAAATTAGTATTA-TTTTAATCCAAATAAGCTCCAATGAAAAGAAACAACATG
* * ** *
174777 TTTTATGACAAAACAATTATTTTAACAATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
633 TTTTATAACAAAACAAATATCGTAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
*
174842 TAAACTAATTTGGTAAATAGATTTATT
698 TAAACTAATTTGGAAAATAGATTTATT
*
174869 TTTTAAATCTA-TTGCTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATA
1 TTTTAAATC-ACTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * **
174933 AGCTTGCATAATTAAAAATAATATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGTAATAGAT
65 AACTTGCATAATGAAAAAT-ATATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAACAATTTGTAATAGAT
* * ** * * *
174998 AATCAATTCAAATGGCCATAATAATTTTAACTGATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCT
129 AATCAAGTCAAATAGCCATAATAATTAGAACTGATTCAGTAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** *
175063 TACTTAATAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTATCTAAGCTTGTATTAAC
194 TACTTAATAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCTAGATAAGCTTGTATGAAC
* * ** * * *
175128 TGAAACAATTGTTTTATGACAAATAAAAAGGTTATAATGATTTTTAATTAACATTTGTTCAAATA
259 TGAAACAATTGTTATATGACAAATAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATA
*
175193 ATAAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATATCTTTCTTTTTAATTT
324 ATAAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATATCTTTCTTATTAATTT
* * * *
175258 TTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
389 TTCAAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGAACAGAAACAAATATT
* * * * * *
175323 TTATGACTAAGCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATATGTAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT
454 TTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTAAAATAGGTAATTATTCTAATAGTCTTAACTAATT
* *
175388 GAACTAGTTCGGCAATCACATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTACAAATTTTTGGAATATTATAAA
519 GAACTAGTTCGACAAACACATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTACAAATTTTTGGAATATTATAAA
* * *** * *
175453 ATTAGTATTATTTTAATCCAAATAGGTTTGTATGAAAAGAAACAACTATTTTTTATAACAAAATA
584 ATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTCCAATGAAAAGAAACAAC-ATGTTTTATAACAAAACA
* ** * * *
175518 AATATCGTCATGATTTGAGATAGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGAA
648 AATATCGTAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAATTTGGAA
175583 AATAGATTTATT
713 AATAGATTTATT
175595 TTTTAAA
1 TTTTAAA
175602 ATTTTTAAAC
Statistics
Matches: 614, Mismatches: 99, Indels: 39
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
723 12 0.02
724 72 0.12
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726 212 0.35
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729 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (724 bp):
TTTTAAATCACTTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAA
ACTTGCATAATGAAAAATATATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAACAATTTGTAATAGATAA
TCAAGTCAAATAGCCATAATAATTAGAACTGATTCAGTAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
CTTAATAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCTAGATAAGCTTGTATGAACTG
AAACAATTGTTATATGACAAATAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAAT
AAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATATCTTTCTTATTAATTTTT
CAAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTAAGAACAGAAACAAATATTTT
ATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTAAAATAGGTAATTATTCTAATAGTCTTAACTAATTGA
ACTAGTTCGACAAACACATTTTTTTTTAAATCTCTTACTTACAAATTTTTGGAATATTATAAAAT
TAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTCCAATGAAAAGAAACAACATGTTTTATAACAAAACAAAT
ATCGTAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAATTTGGAAAAT
AGATTTATT
Found at i:175272 original size:182 final size:182
Alignment explanation
Indices: 173603--183862 Score: 2636
Period size: 181 Copynumber: 57.1 Consensus size: 182
173593 CACTAAACAT
* * * * * * *
173603 ATTTATTTTTGAAATTTTTTACTTATTAA-TTGTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATC
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * *
173667 -CGAATAAGCTTATATGAA-TGAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAA-GTCATAATGATTTG
66 TC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * *
173729 AAATAAATAA-TTGCTT-AAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTTCA-TAAA-CG
130 TAATAGATAATTTG-TTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTG-TTT-AGTAAATAG
* * *
173781 ATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTTGTATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * ** * **
173841 TCAAACAAGCATATATCAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTG
66 TC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * * *
173905 AAATAGATAA-TTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTAG-TTAGGTAAACAA
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTA-GTAAATAG
* * * * * * * *
173958 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATGTTAATAGATTCA-TTTTATTTTTTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * ** * *
174022 CTGAGTAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTATTTGAT-TC-CGAC-AAAAGGTAATAACGATTTG
65 CTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * **** * * * *
174084 AAATTGATAA-TTCTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACA-
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAG-TAAATAG
* ** * * *
174136 TTTTCACCTTTTAAATCA-CTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAT
1 ATTT-ATTTTTTAAAT-ATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * **
174200 T-TCAAATAAACTTGTATGAACTG-AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATT
64 TCTC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * ** * * * * * *
174262 T-TAAATAGATAA-TTGGTCAAATAGTCGTAAGTATTAGAATTTGTTCAGTAAAAAA
128 TGT-AATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATT-TAACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * *
174317 ATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTTAATTTTGGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTAT
1 ATTTA-TTTTTTAAATATCTTACTTA-ATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * **
174381 T-TTAGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTATATGTC-AAA-AAAAA-GTCATAACAATT
64 TCTCA-ATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* ** * *
174442 T-TAAATAAATAA-TTGTTCAAATGGTAATAATTATTTTATA-TTGTTT-GATATATAG
128 TGT-AATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTA-TTTA-ACTTGTTTAG-TAAATAG
* * * * * * * *
174497 ATTTATTTTTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTAATT
1 ATTTA---TTTTTT-AAATATCTTACTTAATAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * ** * * * * * * *
174561 TATTTTGAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAA-TAAGAGGTCAGAACG
61 TATTCTCAATAAGCTTGTATTA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATG
** * * * * * * * * * *
174624 ATTTAAAATAGGTAATTAT-TT-TAATAGT-TTCAACTAATTGAA-TTGATTCGACAAACAC
125 ATTTGTAATAGATAATT-TGTTCAAATAATAAT-AACT-ATTTAACTTGTTTAG-TAAATAG
* * * * *
174682 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAA
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
*** * * * * * ** ** **
174746 C-CAAATAAGCTCCAATGATCAGAAGCAAGTGTTTTATGACAAAACAATTA--TTTTAACAATTT
65 CTC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * ** *
174808 G-AGATTGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAATTTGGTAAATAG
129 GTA-ATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * *
174862 ATTTATTTTTTAAATCTATTGCTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * *
174926 TCAAATAAGCTTGCA-TAA-TTAAA-AATAATATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
66 TC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAAT--TGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
*** * * *
174988 TGTAATAGATAATCAATTCAAATGGCCATAATAA-T-TTTAAC-TGATTCAGTAAACAG
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAAT---AATAATAACTATTTAACTTG-TTTAGTAAATAG
* **
175044 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTAATAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * *
175109 T-ATCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGAC-AAATAAAAAGGTTATAATGATTTT
66 TCA-ATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* *
175172 TAATTA-A-CATTTGTTCAAATAATAAAAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAG
130 TAA-TAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* ** * * *
175225 ATTTATTTTTTAAAATATCTTTCTTTTTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATT
1 ATTTATTTTTT-AAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * **
175290 CTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACTAAGC-AAAAGGTCATAACAATTTG
65 CTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * ** * * ** *
175354 AAATATG-TAA-TTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAG-TTCGGCAATCAC
130 TAATA-GATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAAT-AG
* * *
175407 ATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTACA-AATTTTTGGAATATT-ATAAAATTAGTATTATTTTAA
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTA-ATAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAT
* * * ** * * * * * *
175469 TC-CAAATAGGTTTGTATGAAAAGAAACAACTATTTTTTATAACAAAATAAATA--TCGTCATGA
64 TCTC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAA-T-TGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGA
* * * * *
175531 TTTG-AGATAGAT-ATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGAAAATAG
126 TTTGTA-ATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * ** * * *
175588 ATTTATTTTTTAAA-AT-TT--TTAAACAGATTTGTTTTTAAA-ATTTTTTACTTATTAATT-TT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTT-AATA-A--T-TTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATT
* * * * * ** * ** * *
175647 TGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATGGGT
60 T-TATTCTCAATAAGCTT-GTATTAACTGA-AAC-AAT-TG-TTTTATG-------ACAA-----
** ** * ***
175711 TTATGACAAAACAAAGGTCATAACTATTTAAAATAGATAA-TTATTCAAATAGCCATAACTATTT
107 --A--AC--AA-AAAGGTCATAATGATTTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT
* * *
175775 GAA-TTGTTTAGAAAACAT
165 -AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * *
175793 ATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTA-TACTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
** * * * * *
175856 CAAAATAAGCTTATATGAA-TAGAACCAATTATTTTAT-----------TA--T-A-AAT-ATTT
65 CTCAATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * *
175904 GAAATTGAT-ATTTGTTCAAATAATCA-AACTATTTGAACTTGTTTTGTAGACAA
129 GTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * * * * *
175957 ATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTATATTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * * * ** * *
176022 TTAATGAGCCTATATGAATTGATAGAATTGTTTTATGATGAAACAAAAA-GTTATAACGATTT-T
66 TCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGT
* * * * * * ** ** * *
176085 AAATAGACAA-TTATTCAAATAGTTATCACAATTTGAACTAATTCGGTAAACAT
131 -AATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * ** * *
176138 ATTTATTTTTAAAATATTTTGCTTATTAATTGTCCAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATC
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * ** * *
176203 -CAAAAAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAA-GTCATAATGATTTG
66 TC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * *
176266 --A-A-ATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCGATAAACAT
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAG-TAAATAG
* * * * * *
176315 ATTTAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATTTG-AATATTAATAAATTTGAATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
** * * * * *
176379 T-GAAATAAGCTTGTA-TAAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATAGTGATT
64 TCTCAATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * * * *
176441 TGAAATAGGTAA-CTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATT-TCTTCGATAAATAG
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTAACTTGT-TTAG-TAAATAG
* * * * * * *
176496 ATTCAGTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAAGTATGTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * ** ** * * *
176557 TGAATCAA-CTTATACGAACAAAAACAATTCTTTTGTGACAAAAC--AAAGATCATAATGATTTG
66 TCAAT-AAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * * * ** **
176619 AAAAAAATAA-TTGTTCATATAGTTATAACTATTTGTACTGGTCAAGCCAATAG
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * *
176672 ATTCATTTTTTAAATCA-ATTACTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAAT-ATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * *
176736 TTGAATAATAC-CGTATCAA-TAAAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAATGGTCACAACT-AT
65 CTCAATAA-GCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAA-TGAT
* ** * * * * *
176797 TTGAAATA-ATAA-TTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGAA-TTGGTTTGGTAAACAA
127 TTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACT-ATTTAACTT-GTTTAGTAAATAG
* * *
176852 ATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
176912 TCGAAAAAACTTATATGAAC-AAAAAAATTTGTTTTACT-ACAAAACAAAAA-GTCATAACGATT
66 TC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAA-TTGTTTTA-TGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * **** * * * * * *
176974 TGAAATAGATAA-TTATTCATATAGCCTTAGCTATTTGAA-TTATTTTGGCAAACAA
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTT-GTTTAGTAAATAG
* * * * * * *
177029 ATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTACTAGATTTGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
177093 -TCAAATAAACTTGTATGAACAT-AAATAATTGTTTTGTGACAAATC-AAAAGGTTATAATGATT
65 CTC-AATAAGCTTGTATTAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * ** * ** *
177155 TGAAAAATATAA-TTGTTGAAATAGTCGTAACTATTTGAACTAT-TTCAGTAAGCAT
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACT-TGTTTAGTAAATAG
* ** * *
177210 ATTTATTTTTTAAATCA-CCTACACATTAGTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAAT-ATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * *
177274 CTGAAT-AGACTTATATGATAA--AAAAAAATTGTTTTAAGACAAAAC-AAAAGTTTATAATGTT
65 CTCAATAAG-CTTGTAT--TAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGAT
* * ** * * * *
177335 TTGAAATAGGTAA-TTGTTCAAATGGTTATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACT-G
127 TTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAG-TAAA-TAG
** ** * * **
177391 ATTTATTTTTTAAATCA-CCAACTTCTTAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAAT-ATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * *
177455 TTGGAA-AAACTTTTATGATCTGAAATAATTGTTTTAGGATAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTT
65 CT-CAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * *
177518 -TAAATAGATAA-TTGTTCACATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGT-AA-AC
129 GT-AATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
** * * * * * *
177570 ATTT-TTTTAAAAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAA--TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * * *
177633 T-TGAATAAGCATGTATGATCTGAAACAATTTTTTTATTGACTAAA-GAAAAGGTTAGAATAATT
64 TCTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * ** **
177696 TGAAATAAATAA-TTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAT-G
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * ** * * **
177750 CATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TT-AT--TTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTTGCT
1 -ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* *
177810 C-CAATTAAGCTTGTA-TAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC--AAAGATCATAATGATT
65 CTCAA-TAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * *
177871 TG-AGATAGATAA-TTGTCCAAATTATCATAACTATTTGAACTAGTTTGACG-AACA-A-
128 TGTA-ATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTT-A-GTAA-ATAG
* * * * *
177926 ATTTAGTTTTTAAATCTCTTA-TTAAT--TTTTAG-AATATTAATAAACTAGTATCATTTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* ** * *
177987 TGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTAAAAACAAATGTTTTATGACAAAAC-AAAATG
66 TCAATAAGCTTGTAT---T---AAC---TG-----AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGG
** * * * * * * **
178051 TCATAACAAATTGAAATAGATAA-TTG-TGAGAATGGACACT-ACTATTTGAACTT-TTCGGTAA
117 TCATAATGATTTGTAATAGATAATTTGTTCA-AAT-AATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAA
178112 ATAG
179 ATAG
* * * * * * *
178116 ATTTATTTTTTAAATCTCTAACTT-TTAAATATT-AGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * *
178179 -TCAAATAAACTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAATGATT
65 CTC-AATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * * * *
178241 TGAAATAAATAATTAT-TT-AAATAGTTATAACTATTTGAACTCG-CTCGATAAATGG
128 TGTAATAGATAATT-TGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAG-TAAATAG
* * * * * *
178296 ATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * ** * *
178361 TGAATATGCTTTTATCCACAT-AAACAATAGGTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTG
66 TCAATAAGCTTGTATTAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * *
178424 AAATACATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACGTGTTCTA-AAAATAG
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTA-TTTAACTTGTT-TAGTAAATAG
* * * * * *
178477 ATTTATTTTTTATAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATAAATAAATTTA-AATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
** * * * * * * *
178540 CAAAATAAACTTGCATGAA-TAAAACCATTGTTTTATGACAAAAC-TAAAGGTCATAGT-ATTTT
65 CTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGA-TTT
* * * * * * *
178602 GAAACAAATAA-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATTTAGTAAATAG
129 GTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * * *
178656 ATTCT-TTTTTTAATTTTGTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTACT
1 ATT-TATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
* ** * * * *
178720 TC-AAATATA-C-TGATACGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAA-GAAAATGTCGTAATGAT
64 TCTCAATA-AGCTTG-TATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGAT
* * * ** * * * * * ** * *
178781 TTGAAATTGGTAA-TTACTAAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTCAAAAAACAT
127 TTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * ** *
178837 ATTTATTTTTTTAA-ATCTTCGAATT-ATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTCA
1 ATTTATTTTTTAAATATCTT--ACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-A
** * * * * ** *
178900 -TC-CAAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGTCAAAACAAAAA-GTCATAACAAG
63 TTCTC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGAT
* * ** * * * * * *
178962 TTGAAATAAATAA-TTCCTCAAATAATCATAA-TGAATTAAACTT-ATTCGATAAACAA
127 TTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACT--ATTTAACTTGTTTAG-TAAATAG
* * * *
179018 ATTTATTTTTTAAA-ACTTTTTACTTATTAATTGCCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTT
1 ATTTATTTTTTAAATA--TCTTACTTAATAATT--TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * * * * **
179080 ATTCAAAATAAGCTTGTGTGAA-TAGAAAAAATTATTTTATGACCAAAC-AAAAGGTTATAGCGA
62 ATTCTCAATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGA
* *
179143 TTT-TAAATAGATAA-TTGTT-AAAT-A-AACAA--ATTT-A-TT-TTT--TAAATAT
126 TTTGT-AATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTAACTTGTTTAGTAAATAG
* *** ** * *
179189 CTTTATTATTATTTTTTAGATTA-TTAATAA------A------------TTAGTGTTATTCTAT
1 ATTTATT-TT-TTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * *
179235 TTTGAATAAGCTTATATAAAATGAAACAATTCTTTTATGACAAAAC-AAAAGATAATAATGATTT
64 TCTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * * ** * * * *
179299 GAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATGATTACTTGATCTACTTCAATAAACAT
129 GTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTA-TTTAACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * ** *
179353 ATTTATTTTTAAAAT-TTTCTACTCATTAATTATCAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATATCT-TACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* ** * ** * * * *
179417 T-TGAAT-AGCTTGTATGGA-TAGAAACAATTATTTTAAAATATAGCAAAAA-GTCATAACGATT
64 TCTCAATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * *
179478 TGAAATAAATAA-TTGCTCAAATAATAATAACTATTTAAACTAGTTT-GATAAATAG
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAG-TAAATAG
* * * **
179533 ATTTATTTTTT-AA-ATCTT--TTATTAATTTTTGAAACATTAATAGATTAGTATTACCTTATTC
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * ** * * *
179594 TGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAATGATTTGA
66 TCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGT
* * * *
179658 AATAGATAA-TTGCT-ATAATAATCATAATTATTTGAACTAG-TTAGGTAAATAG
131 AATAGATAATTTGTTCA-AATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTA-GTAAATAG
** * * * * * *
179710 AACTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATATTTGAAATACTAATAAATTTGT-TGTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT-TATTTTATT
* * * *
179774 C-CAAATAAG-TTAGTATGAATTCCAAA-AACTTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGA
65 CTC-AATAAGCTT-GTATTAACT-GAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGA
* * * ** * * * * * *
179835 TTTGAAATAGATAA-TTATTC--AT-GTCTTAAATATTTGAACTGGTTCAATAAACAA
126 TTTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * * * * * * *
179889 ATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAATATTATTAGATTAGTTTTATTTTTTTA
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * ** ** * * * * * * *
179954 TGAATAAGCTTCTACGAACAAAAATAATTATTTAATAATAGAAC-AAAAGGTTATAATGATTTG-
66 TCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGT
** * * * * * ** * *
180017 AAGTTTACAA-TTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAT
131 AA-TAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * *
180070 ATTTATTTTTCAAATCA-C-TACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTA-TCATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAAT-ATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTAT
* * * * * ** * * ** *
180132 TTTGAATAAGGTTGAATGT-TCAAAAACAATTGTTATATGACCAAAC-AAAAGGAAATAA-CATT
64 TCTCAATAAGCTTGTAT-TAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGA-T
* * * * * * * * ** *
180194 TTGAAATAGATAA-TTATTGACAGAGTCATAATTATTTAAGC-TAATTCGATAAATAG
127 TTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTAA-CTTGTTTAG-TAAATAG
* * **
180250 ATTTACTTTGT-AA-ATC--ACTTTGTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* * * * * *
180311 C-AAATAAGGTTGCATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAA-GT-ATAAAGATTTG
65 CTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * ** * * * *
180372 AAATAGACAA-TTGTTCATATAGTCTTAATTATTTAAAC-TGCTTCAGCAAATAT
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTG-TTTAGTAAATAG
* * * * * * * *
180425 ATTTATTTTTTATATCTGTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * ** * * * * * * * * ** *
180490 TGATTAAGCTCATATGAATTGAAACAATTAG-TATATAATAGAA-TAAAAGGTTATAACAATTTA
66 TCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* ** * * *
180553 AAATAGATAA-TTGTTC--------A-AA-TA-GGAACTGGTTCAATAAATAG
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTAACTTGTTTAGTAAATAG
* * *
180594 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * ** *
180658 TCGAATAGGCTTGTA-TGA-TGAAAAGCAATTGTTTTATGATGAAAC-AAAAGTTCATAATGATT
66 TC-AATAAGCTTGTATTAACTG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
** * * ** *** * * * **
180720 TCAAAAACATAA-TTGGCCAAAATGGGCAA-AATTATTTGAAC-CGATTCAACAAACTA-
128 TGTAATAGATAATTTGTTC-AAAT-AATAATAACTATTT-AACTTG-TTTAGTAAA-TAG
* * * * ** * *
180776 ACTTACTTTTTAAATCTCTAACTT-ATAAAAATTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAAT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * *
180840 -TTAGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATAATAAAAC-AGAAGGTTATATTTATTT
65 CTCA-ATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * **
180903 -TAAATTGATAA-TTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACGG
129 GT-AATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* ** * * *
180957 AATTATTTTTTGAAATATCTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTT-AAATATCTTACTTAATAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* *** * * * * * **
181021 T-TCGAACAAGCACATATGAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAA-GTCAAAACAATT
64 TCTC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * ** * * * *
181084 TGAAATAAATAA-TTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTT-GCCAAACAC
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAG-TAAATAG
** * * * *
181139 ATTTATTTTTTAAACCTCTTACTT-AGAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGTAATATTTTACT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * ** * ** * *
181202 TC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAAGGTAAAAC--AAAGATCATAACGATTT
64 TCTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* *** * * *
181264 -AAGATAGATAA-TTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAGTTTAAG-AAA-AA
129 GTA-ATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTT-AGTAAATAG
* * * *
181317 ATTTATTTTTT-AA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTGTTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* ** * * ** * * **
181378 TGAATAATTTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTACAACAAAAC-GAAATGTCATAACAATTTG
66 TCAATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * *
181441 AAATAGATCA-TAGCTCAAATAA-ACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAG
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATA-ATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * *
181494 ATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * *
181559 TGAATAAACTTGTATGAA-TGGAAACAATTGTTTTTATGCCAAAAC-AAAA--T-ATAATAACTT
66 TCAATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGA-TT
* * * * * * *
181619 TGAAATAAATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTCGCTT-GATAAATCA-
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTAT-TTAACTTGTTTAG-TAAAT-AG
* * * * *
181674 ATTTATTTTTTAAATATTTTGCTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTA-TAATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATT
** * * * * * *
181738 CAAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAC-AAAGGGTTATAACGATTT
65 CTCAATAAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * *
181801 GAAATGGATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTGGAAAACAT
129 GTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACT-TGTTTAGTAAATAG
* * *
181855 ATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTT-ATGAATTTTAGGAATATTAGA-AAATTTA-TATTATTTTA
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAAT-AATTTTTGAAATATTA-ATAAA-TTAGTATTATTTTA
* * * * * * * *
181916 TT-TAATATAAGCTCGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATAGT-AT
63 TTCTCA-ATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGAT
* * * * * ** *
181978 TT-TGAATTAGATAA-TTATTCAGATAGTCATGACTATTTGAA-TATGTTCGGTAAACAG
127 TTGT-AA-TAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACT-TGTTTAGTAAATAG
* * * * * * * *
182035 ATTTATTTTTTAATTTTTTTACTCATTAATTTTTGAGATATTAATAAGTTAGTATTATTTTCTT-
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * *
182099 TCAAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTGTTTTATTACAAAAC-AAAA-GTCACAATGATTTG
66 TC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * * *
182162 -AATAAATAATTAG-TCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCCA-TAAACAT
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTT-TAGTAAATAG
* * * * * *
182214 ATTTATTTTTTAAATATTTTAATTATTAATTGTTGAAA-ATTTAATAAATTAATATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * ** * * **
182278 CAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAATA-GTCATAACAATTTG
65 CTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * ** * * * *
182342 AAATAAATAA-TTGTTTAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTCAATAAACAT
130 TAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * *
182395 ATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAA
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * ** * **
182458 TCAAAATAAGATTGTATGAA-TAGAAAAAAAAATCATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATTCTG
64 TCTCAATAAGCTTGTATTAACT-G---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATG
** * * * * * *
182521 ATTTCAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAG
125 ATTTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAG-TAAATAG
* * * * * * * *
182579 ACTCAGTTTTTAAATAT-TTGCCTT-ATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTGT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTT-ACTTAAT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * *
182642 TTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAA-GAAAAGGTCAAAATAATTT
64 TCTCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
* * * * * * * ** *
182706 GAAATAGATAA-TTATTCAAACT-ATCATAATTATTTGCACTAG-TCATGCCAATGG
129 GTAATAGATAATTTGTTCAAA-TAATAATAACTATTT-AACTTGTTTA-GTAAATAG
* * ** * * * *
182760 ATTCATTTTTTAAAT-CCGTTACTTTTTAATTTTT-AGAATGTTAATAAATTTGCATTACTTTAT
1 ATTTATTTTTTAAATATC-TTACTTAATAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * **
182823 T-TCAAATAAAAC-TGTATCAA-TAAAAACAATTATTTTATG--GAAAC-AAATGGGAATAATGA
64 TCTC-AAT-AAGCTTGTATTAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGA
* * * ** * * * *
182882 TTTGAAATAAATAA-TTATTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAA-GG
126 TTTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACT-ATTTAACTTGTTTAGTAAATAG
* ** *
182938 ATTTAGTTTTTT-AA-ATCTT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
1 ATTTA-TTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * ** * * * * ** * * **
182999 C-CAAACAAACTTAAATGAAC-AAAACATTTGTTCTACAATAAGA-AAAAAGGTCATAACAATTT
65 CTC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
** * * * **** * * * * *
183061 AAAAGAGATAA-TTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAA
129 GTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * * ** *
183115 ATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTCA-TTTTCATAATATTGTTAGATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * **
183179 -TCATATAAGCTTGTATTAACCT-AAATAATTGTTTTATGACAAAA-GAAAAGGTTATAACAATT
65 CTCA-ATAAGCTTGTATTAA-CTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * ** * *
183241 TGAAATATATAA-TTGTTTAAATAATCATAACTATTTGCACCGGTTCAGTAAATAA
128 TGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * * *
183296 ATTTATTTATTCAATCT-TCTACTCATTAATTTTTGAAATACTAA-AAATTAGCATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCT-TACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * ** * *
183359 -TCGAATAGGC---TATT-ACGATGAAAAACAATTATTTTATGACAAGTCAAAAA-TTCATAACG
65 CTC-AATAAGCTTGTATTAAC--TG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATG
* * **** * *
183418 ATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATGGCCATAATTACTTGAA-TTGATTT-GATAAACTA-
125 ATTTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTA-TTTAACTTG-TTTAG-TAAA-TAG
* ** * * *
183476 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAA-TTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAAT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
183539 TTGC-ATAAGCTTTTATGAACTGAAAACATTTGTTTTATTATAAAACAAAAA-GTCATAATGATT
65 CT-CAATAAGCTTGTATTAACTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * *
183602 T-TAAATAGATAATTT-TTCAAATAGACT--TGACTATTTAAATTTGTTCAGAAAACAT
128 TGT-AATAGATAATTTGTTCAAATA-A-TAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
* * * * * ** *
183657 ATTTATTTTTTGTTTTAATTTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGCTAATAGAA-TAGTATTATG
1 ATTTA---TTT-TTTAAATATCTTACTTAATAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATT
* * * * * * * *
183720 TTATT-TCAAATAAGCATGTATGAACTTAAACAATTATTTTATGACTAAAC-AAAAGGTTAGAAC
60 TTATTCTC-AATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAAT
* * ** * ** * * * *
183783 AATTTGAAATAGATAA-TTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAC
124 GATTTGTAATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTT-AACTTGTTTAGTAAATAG
*
183842 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
1 ATTTATTTTTTAAATATCTTA
183863 TTTATTCATT
Statistics
Matches: 7659, Mismatches: 1802, Indels: 1239
0.72 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
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208 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (182 bp):
ATTTATTTTTTAAATATCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
TCAATAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGT
AATAGATAATTTGTTCAAATAATAATAACTATTTAACTTGTTTAGTAAATAG
Found at i:176038 original size:165 final size:163
Alignment explanation
Indices: 175730--176040 Score: 356
Period size: 165 Copynumber: 1.9 Consensus size: 163
175720 AACAAAGGTC
* * *
175730 ATAACTATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTGTTTAGAAAACATAT
1 ATAAATATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAACCATAACTATTTGAATTGTTTAGAAAACAAAT
* * * * * *
175795 TTATTTTTTTAATTTTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTATACTATTTTATTCAAA
66 TCATATTTTAAATTCTTACTCATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTATAC-ATTATATTCAAA
*
175860 ATAAGCTTATATGAATAGAACCAATTATTTTATT
130 ATAAGCCTATATGAATAGAACCAATTATTTTATT
* * * * * * * *
175894 ATAAATATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAATCA-AACTATTTGAACTTGTTTTGTAGACAAA
1 ATAAATATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAACCATAACTATTTGAA-TTGTTTAGAAAACAAA
* *
175958 TTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATA-ATTATATTT
65 TTCATATTTTAAAT-TCTTACTCATTAAATTTTGGAATATTAATAAATT--TATACATTATATTC
** *
176022 TTAATGAGCCTATATGAAT
127 AAAATAAGCCTATATGAAT
176041 TGATAGAATT
Statistics
Matches: 120, Mismatches: 23, Indels: 7
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.07, T:0.45
Consensus pattern (163 bp):
ATAAATATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAACCATAACTATTTGAATTGTTTAGAAAACAAAT
TCATATTTTAAATTCTTACTCATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTATACATTATATTCAAAA
TAAGCCTATATGAATAGAACCAATTATTTTATT
Found at i:176239 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 176047--176510 Score: 488
Period size: 177 Copynumber: 2.6 Consensus size: 179
176037 GAATTGATAG
* ** * * * *
176047 AATTGTTTTATGATGAAACAAAAAGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTTATC
1 AATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAG--AATTATTCAAATAGTCATA
* * *
176112 ACAATTTGAACTAATTCGGTAAACATATTTA-TTTTTAAAATATTTTGCTTATTAATTGTCCAAA
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*
176176 TATTAATAAA-TTAATATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTGTATGAACA-AAAA
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* *
176227 CAATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAT--AATTGTTCAAATAGTCATAA
1 -AATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGAATTATTCAAATAGTCATAA
* * * ***
176290 CTATTTGAACTTATTCGATAAACATATTTAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATTTGAATA
65 CAATTTGAACTAATTCGATAAACATATTTAGTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTATCCAAATA
* ** * *
176355 TTAATAAATTTGAATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA
130 TTAATAAATTTAAATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTGTATAAACAGAAAA
* * * * * *
176405 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAACTGTTTAAATAGTCATA
1 AATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATA-G-AATTATTCAAATAGTCATA
* * * ** * * *
176470 ACTATTTAAATTTCTTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAAT
64 ACAATTTGAACTAATTCGATAAACATATTTAGTTTTTAAAT
176511 CTCTTATTAA
Statistics
Matches: 240, Mismatches: 36, Indels: 14
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
177 140 0.58
178 12 0.05
181 88 0.37
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AATTATTTTATGAAAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGAATTATTCAAATAGTCATAAC
AATTTGAACTAATTCGATAAACATATTTAGTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTATCCAAATAT
TAATAAATTTAAATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTGTATAAACAGAAAA
Found at i:176782 original size:180 final size:176
Alignment explanation
Indices: 176491--176959 Score: 407
Period size: 180 Copynumber: 2.6 Consensus size: 176
176481 TTCTTCGATA
* * *
176491 AATAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAAGTATGTTATT
1 AATAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGAAGTATGTTATT
* * * *
176556 CTGAATCAACTTATACGAACAAAAACAATTCTTTTGTGACAAAACAAA-GATCATAA-TGATTTG
66 CTGAATAAACGTATACGAACAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAATGATCACAACT-ATTTG
*
176619 AAAAAAATAATTGTTCATATAGTTATAACTATTTGTACTGGTCAAGCC
130 -AAAAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGTACTGGTCAAGCC
* * *
176667 AATAGATTCATTTTTTAAATCAATTACTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGCATTACT-
1 AATAGATTCAGTTTTTAAATC---T-CTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGAAGTA-TG
* * * * *
176731 TTATTTTGAATAATACCGTAT-C-AATAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCACAAC
61 TTATTCTGAATAA-A-CGTATACGAACAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAATGATCACAAC
* * * * * *** **
176794 TATTTGAAATAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGAATTGGTTTGGTA
124 TATTTGAAAAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGTACTGGTCAAGCC
* * * * * * * * *
176847 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTAT
1 AATAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGA-AGTATGTTAT
* * * *
176911 T-TCGAAAAAACTTATATGAACAAAAA-AATTTGTTTTACT-ACAAAACAAA
65 TCT-GAATAAACGTATACGAACAAAAACAA-TTCTTTTA-TGACAAAACAAA
176960 AAGTCATAAC
Statistics
Matches: 239, Mismatches: 38, Indels: 32
0.77 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
174 4 0.02
175 5 0.02
176 85 0.36
177 2 0.01
179 1 0.00
180 123 0.51
181 14 0.06
182 5 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
AATAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTAGTAATTTTTGAAATATTAACAAATTAGAAGTATGTTATT
CTGAATAAACGTATACGAACAAAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAATGATCACAACTATTTGA
AAAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGTACTGGTCAAGCC
Found at i:178572 original size:360 final size:358
Alignment explanation
Indices: 174897--184513 Score: 5128
Period size: 360 Copynumber: 26.9 Consensus size: 358
174887 CTAATTTTTG
* * * * *
174897 AAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGCAT-AATTAAAA-ATAATATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACA-ATTGTTTT
* ** * *
174960 ATGACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGTAATAGATAATCAATTCAAATGGCCATAA-TAATT
63 ATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACT-ATT
* * **
175024 TTAAC-TGATTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTAATAATTTAGGAAATATT
125 TGAACTTG-TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * *
175086 AATAAATTAGTATTATTTTATTCT-ATCTAAGCTTGTATTAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACA
187 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATAGTTTTATGACA
* * * * * * * *
175149 AATA-AAAAGGTTATAATGATTTTTAATTA-ACATTTGTTCAAATAATAAAAACTATTTGAACTT
250 AA-ACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T
* * * *
175212 GTT-TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATATCTTT-CTTTTTAATTTTTC
312 GTTCGA-AAAATAGATTTATTTTTT-AAAT-T-TTTACTTATTAATTTTTA
* * * * *
175261 AAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
* * ** * *
175326 TGACTAAGCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATATG-TAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * ** *
175390 ACTAGTTCGGCAATCACATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTACAAATTTTTGGAATATT-ATAAA
128 ACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA
* *** * * * * * * *
175453 ATTAGTATTATTTTAATCCAAATAGGTTTGTATGAAAAGAAACAACTATTTTTTATAACAAAATA
192 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TA-GTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
175518 AATA--TCGTCATGATTTGAGATAGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGG
255 AA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T-GTTCG
*
175581 AAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTAAACAGATTTGTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTT
317 --AA-A-A---A-----T-AGA--TTT------A--T-TTTTT-AAA-TTTTTACTTATTAATTT
*
175646 TTG
356 TTA
** * * *
175649 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATGGGTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTA
* * *
175714 TGACAAAAC-AAAGGTCATAACT-ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
175777 A-TTGTTTAGA-AAACATATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAA
128 ACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* *** * * * *
175839 ATTTA-TACTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAATAGAACCAATTA-TTTTAT---------
192 A-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TAGTTTTATGACAAAACA
* * * * *
175893 -TA--T-A-AAT-ATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAATCA-AACTATTTGAACTTGTTTTGT
255 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTCG-
* * * * * * *
175951 AGACA-A-ATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTG
317 AAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * ** * * * * * * *
175992 GAATATTAATAAATTAGTATAATTATATTTTTAATGAGCCTATATGAATTGATAGAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTA
** * * * * * * * * *
176057 TGATGAAACAAAAAGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAGTTATCACAATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** * * * * * * **
176122 CTAATTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATATTTTGCTTATTAATTGTCCAAATATTAATAAAT
129 CTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * *** * * *
176187 TAATATTATTTTAATCCAAAAAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTA-TTTTATGAAAAAACAAAA
194 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TAGTTTTATGACAAAACAAAA
* * *
176251 AGTCATAATGATTTG--A-A-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAA
258 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGAAAAA
* * *
176312 CATATTTAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATTT-
322 TAGATTTATTTTTTAAA-TTTTTACTTATTAATT-TTTA
* * * * * * * *
176350 GAATATTAATAAATTTGAATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
* * * * * *
176415 TGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAACTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
176480 TTTCTTCGATAAATAGATTCAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT
129 CTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * * * ** *
176541 TAGAAGTATGTTATTCTGAATCAA-CTTATACGAACAAAAACAATTCTTTTGTGACAAAAC-AAA
194 TAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * *
176604 GATCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCATATAGTTATAACTATTTGTACTGGTC-AAGCCA
258 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGAA--AA
* ** * *
176668 ATAGATTCATTTTTTAAATCAATTACTTAGTAATTTTTG
321 ATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * ** * *
176707 AAATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAATAC-CGTATCAATAAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAA-ACTTGTATGAAT-AAAACAATTGTTTT
* * * * * *
176771 ATGATAAAACAAATGGTCACAACT-ATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTG
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
176834 AA-TTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
127 AACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * *
176894 AATTAATATTATTTTATTTCGAAAAAACTTATATGAACA-AAAAAATTTGTTTTACT-ACAAAAC
191 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TAGTTTTA-TGACAAAAC
* * * * * * * * * * *
176957 AAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAGCTATTTGAATTATTTTGG
254 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGA
* * * * *
177022 CAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTCA
318 AAAATAGATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
177064 TAATATTACTAGATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTG
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
* * * * * *
177129 TGACAAATCAAAAGGTTATAATGATTTGAAAAATATAATTGTTGAAATAGTCGTAACTATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * *** ** *
177194 CTAT-TTC-AGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCACCTACACATTAGTTTTTGAAATATTAATAA
129 CT-TGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * *
177257 ATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AGACTTATATGATA-AAAAAAAATTGTTTTAAGACAAAACA
192 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGA-ACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * *
177320 AAAGTTTATAATGTTTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATGGTTATAATTATTTGAACTGATTCGAT
255 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCGA-
* **** *
177385 AAACT-GATTTATTTTTTAAATCACCAACTTCTTAATTTTTA
318 AAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* ** ** * * * *
177426 AAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTTGGAA-AAACTTTTATGATCTGAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTCAAATAAACTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTT
* * * *
177490 AGGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCACATAGTCATAACTATTTGA
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * ** * *
177555 ACTTGTTTGGTAAAC--ATTT-TTTTAAAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTTTG-AATGTTAAT
128 ACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA--TTTTTGAAATATTAAT
* * * * ** *
177615 AAAATAATATTATTTTA-TTTGAATAAGCATGTATGATC-TGAAACAATTTTTTTATTGACTAAA
190 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATAGTTTTA-TGACAAAA
* * * * * * * *
177678 GAAAAGGTTAGAATAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTCG
253 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCG
** *
177743 GTAAAT-GCATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATT-ATTTTTA
317 AAAAATAG-ATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTA
* * ** * * * * * * *
177781 GAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTGCTCCAATTAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
* * *
177846 TGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTCCAAATTA-TCATAACTATTTGA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGA
* * ** * *
177909 ACTAGTTTGACGAACAAATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAA
128 ACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAA
* * * **
177969 ACTAGTATCATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTAAAAACAA-ATGTT
192 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG------AAC-A-----T--AAACAATA-GTT
* ** * * * *
178033 TTATGACAAAACAAAATGTCATAACAAATTGAAATAGATAATTG-TGAGAATGGACACT-ACTAT
242 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCA-TAACTAT
* ** * * * *
178096 TTGAACTTTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTT-TTAAATATTA
305 TTGAACTGTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * *
178150 GAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
* * * * *
178215 TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * ** * *
178280 CTCGCTCGATAAATGGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAAT
129 CTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * ** *
178345 TAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTTTATCCACATAAACAATAGGTTTATGACAAAACAAAAG
194 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * *
178410 GTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACGTGTTCTAAAAAT
259 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGAAAAAT
*
178475 AGATTTATTTTTTATATTTTTACTTATTAATTTTTA
323 AGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * *
178511 AAATATAAATAAATTTA-AATTATTTTATTCAAAATAAACTTGCATGAATAAAACCATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-AAATAAACTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
178575 TGACAAAACTAAAGGTCATAGT-ATTTTGAAACAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
178639 ACTTATT-TAGTAAATAGATTCT-TTTTTT-AATTTTGTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAT
128 ACTTGTTCGA-TAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * ** * * *
178701 AAATTAATATTATTTTACTTCAAATATA-C-TGATACGAAC-TGAAACAATTGTTTTATTACAAA
190 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTG-TATGAACAT-AAACAATAGTTTTATGACAAA
* * * * * ** * *
178763 AGAAAATGTCGTAATGATTTGAAATTGGTAATTACTAAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTC
252 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTC
* * * ** * * *
178828 AAAAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTCGAATTA-TAATTGTCA
316 GAAAAATAGATTTA-TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * *
178872 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTCATCCAAATAAATTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
* * ** * * ** * * *
178937 TGTCAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTCCTCAAATAATCATAA-TGAATTAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGA
* * * *
179001 ACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAACTTTTTACTTATTAATTGCCTT--AATATTAAT
128 ACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TTTTACTTATTAATT--TTTGAAATATTAAT
* *** * * * * *
179064 AAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTGTGAATAGAAAAAATTA-TTTTATGACCAAAC
190 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TAGTTTTATGACAAAAC
* ** *
179128 AAAAGGTTATAGCGATTTTAAATAGATAATTG------T--T-A-AA-TA----AA-----C---
254 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGAA
*
179170 --A-A-ATTTATTTTTTAAATATCTTTA-TTATTATTTTTTA
319 AAATAGATTTATTTTTTAAAT-T-TTTACTTATTAATTTTTA
* * * * ** * * * * *
179207 GATTATTAATAAATTAGTGTTATTCTATTTTGAATAAGCTTATATAAAATGAAACAATTCTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTAT-GAATAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
179272 TGACAAAACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTACTTGAT
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** * * * * * ** *
179337 CTACTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTCTACTCATTAATTATCAAAACATTAATAAA
129 CTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * ** * * *
179401 TTAGTATTATTTTAATTTGAAT-AGCTTGTATGGATAGAAACAATTA-TTTTAAAATATAGCAAA
193 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TAGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * *
179464 AAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAATAATAACTATTTAAACTAGTTTGATAA
257 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGAAAA
* *
179529 ATAGATTTATTTTTTAAA-TCTT--TTATTAATTTTTG
321 ATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTA
* * ** * * * * *
179564 AAACATTAATAGATTAGTATTACCTTATTCTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTA
* * * *
179629 TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCT-ATAATAATCATAATTATTTGA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGA
* * * * ** ** * *
179693 ACTAGTTAGGTAAATAGAACTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATATTTGAAATACTAATAAA
128 ACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* *** * *
179758 TTTGT-TGTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCCAAAAAC-TTA-TTTTATGACAAAA
193 TTAGTAT-TATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAA---CATAAACAATAGTTTTATGACAAAA
* * *
179819 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC--AT-GTCTTAAATATTTGAACTGGTTC-
253 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCG
* * * * *
179880 AATAAACAAATTTATTTTTT-AATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTG
317 AA-AAATAGATTTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * * * * * * *
179924 GAATATTATTAGATTAGTTTTATTTT-TTTATGAATAAGCTTCTACGAACAAAAATAATTATTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA--AATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTT
* * * * * ** * *
179988 ATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGA
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * ** *
180053 ACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTCAAATC-ACTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAA
128 ACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * ** * * * *
180117 TTA-TCATTATTTTATTTTGAATAAGGTTGAATGTTCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAA
193 TTAGT-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAA
** * * * * * * * *
180181 AGGAAATAA-CATTTTGAAATAGATAATTATTGACAGAGTCATAATTATTT-AAGCTAATTCGAT
257 AGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CT-GTTCGAA
* * * *
180244 AAATAGATTTACTTTGTAAA---TCACTT-TGTAATTTTTG
319 AAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTAT-TAATTTTTA
** * *
180281 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAGGTTGCATGAATTGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
180346 TGACAAAACAAAA-GT-ATAAAGATTTGAAATAGACAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTAAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * *
180409 C-TGCTTC-AGCAAATATATTTATTTTTTATATCTGTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAA
129 CTTG-TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* ** * * * * * *
180472 ATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTCATATGAA-TTGAAACAATTAG-TATATAATAGAATA
192 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAA-TAGTTTTATGACAAAACA
* ** * *
180535 AAAGGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG---GAAC----TG----GTTC-AAT
255 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGAA-
*
180588 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTA
319 AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* **
180628 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAGCAATTGTTT
1 -AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAAT-AAAA-CAATTGTTT
** * * * * ** * * * *
180692 TATGATGAAACAAAAGTTCATAATGATTTCAAAAACATAATTGGCCAAAATGGGCAAAATTATTT
62 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * * **
180757 GAAC-CGATTCAACAAACTA-ACTTACTTTTTAAATCTCTAACTTATAAAAATTTGAAATATTAA
126 GAACTTG-TTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
180820 TAAAGTAATATTATTTTATTTT-AGATAAGCTTTTATGAAC-TGAAACAATTA-TTTTATAATAA
189 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAA-TAGTTTTATGACAA
* * * * * * * *
180882 AACAGAAGGTTATATTTATTTTAAATTGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
251 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT
* ** ** * * ** *
180947 TGGCAAACGGAATTATTTTTTGAAATATCTTGTTTATTAATTTTTT
315 CGAAAAATAGATTTATTTTTT-AAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *** * *
180993 GAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCGAACAAGCACATATGAACTGAAACAATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTA
* * * * ** * * *
181058 TAACTAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * ** * * * * * *
181123 CTGGTTTGCCAAACACATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTA-GAATTTTT-AGAATATTATTAAT
129 CTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAA
* * * * * * **
181186 TTAGTAATATTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAAGGTAAAAC-AAA
193 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * *
181250 GATCATAACGATTT-AAGATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAGTT-TAAGA
258 GGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGAA-A
* * *
181313 AA-AAATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTG
320 AATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTA
* * ** ** *
181348 AAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAATTTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTA
** * * ** * * * ** *
181413 CAACAAAACGAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATCATAGCTCAAATAAACATGACTATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
181478 CTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT
129 CTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* *** * *
181543 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATGGAAACAATTGTTTTTATGCCAAAACAAAA
194 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAG-TTTTATGACAAAACAAAA
* * * * *
181608 --T-ATAATAACTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATCTAAACTCGCTT-GATA
258 GGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTCGAAA
* *
181669 AATCA-ATTTATTTTTTAAATATTTTGCTTATTAATTTTTG
320 AAT-AGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * *
181709 GAATTTTAATAAATTA-TAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTC-AAATAAACTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTT
* * * *
181773 ATGACAAAACAAAGGGTTATAACGATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
181838 A-TGTGTTTGGA-AAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATGAATTTTAGGAATATTAGA-
128 ACT-TG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-AT
* * * * * *
181899 AAATTTA-TATTATTTTA-TTTAATATAAGCTCGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAA
190 AAA-TTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
181962 CAAAAGGTTATAGT-ATTTTGAATTAGATAATTATTCAGATAGTCATGACTATTTGAATATGTTC
253 CAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTC
** * * * *
182026 GGTAAACAGATTTATTTTTTAATTTTTTTACTCATTAATTTTTG
316 GAAAAATAGATTTATTTTTTAA-ATTTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
182070 AGATATTAATAAGTTAGTATTATTTTCTTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAATAAACTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTA
* * * *
182135 TTACAAAACAAAA-GTCACAATGATTTG-AATAAATAATTAG-TCAAATAGTCATGACTATTTGA
64 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
182197 ACTTGTTCCATAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTAATTATTAATTGTTGAAA-ATTTAATAA
128 ACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATA-TTAATAA
* * *** * * *
182261 ATTAATATTATTTTAATCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAA
192 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAA
** * * **
182326 TA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTC-AAT
257 -AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTCGAA-
* * *
182389 AAACATATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-
319 AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTA
* * * **
182431 -AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATCAAAATAAGA-TTGTATGAATAGAAAAAAAAATCAT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAA-ACTTGTATGAAT----AAAACAATTGT
* ** * * *
182494 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATTCTGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAGCTATT
60 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * ** * *
182559 TGAACTTGTTCGATAAACAGACTCAGTTTTTAAATATTTGCCTTATCAATTTTTGGAATATTAAT
125 TGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
182624 AAATTAGAATTATGTTGTTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTA-TTTTATGACAAAAG
190 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TAGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
182688 AAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACTA-TCATAATTATTTGCACTAG-TC-
254 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCG
** * * ** *
182750 ATGCCAATGGATTCATTTTTTAAATCCGTTACTTTTTAATTTTTA
317 A--AAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * * * *
182795 GAATGTTAATAAATTTGCATTACTTTATTTCAAATAAAAC-TGTATCAATAAAAACAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAAT-AAACTTGTATGAAT-AAAACAATTGTTTT
* * ** * * * * *
182859 ATG--GAAACAAATGGGAATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTAATTGA
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * **
182922 ACTGGTT-TAGTAAA-GGATTTAGTTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATA
128 ACTTGTTCGA-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* *** * * ** * * * ** *
182981 AATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTAAATGAACA-AAACATTTGTTCTACAATAAGAA-A
191 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAA-AACA
** * * * * * * * **
183044 AAAGGTCATAACAATTTAAAAGAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGC
255 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGAA
* * * * * * *
183109 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTCATTTTCA
319 AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* ** * * * * *
183150 TAATATTGTTAGATTAGTATTATTTTATTTCATATAAGCTTGTATTAACCT-AAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAA--TAAAACAATTGTTTT
* * ** * * * *
183214 ATGACAAAAGAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGC
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
** * * * * * * *
183279 ACCGGTTC-AGTAAATAAATTTATTTATTCAATCTTCTACTCATTAATTTTTGAAATACTAA-AA
128 ACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * ** * **
183342 ATTAGCATTATTTTATTTCGAATAGGCTAT-TACGATGAAAAACAATTA-TTTTATGACAAGTCA
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** * * * * * * * *
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255 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTCGA-
* *** *
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318 AAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATT-AATTTTTA
* * *** * * *
183510 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGCATAAGCTTTTATGAACTGAAAACATTTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAA-T-AAAACAATTGTTTT
* * * * * * * * *
183575 ATTATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTTTTCAAATAGACTTGACTATTTAA
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * **
183640 ATTTGTTCAGA-AAACATATTTATTTTTTGTTTTAATTTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGCT
128 ACTTGTTC-GATAAACAGATTTA---TTT-TTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATT
* ** * * *
183703 AATAGAA-TAGTATTATGTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTTAAACAATTA-TTTTATGACT
187 AATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA-TAGTTTTATGACA
* * ** ** *
183766 AAACAAAAGGTTAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGT
250 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GT
* ** * * * *
183831 TTGGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTCA-TTTTA
314 TCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * ** * * * ** * *
183876 GAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTCCTTCAAATAAGGTTGTATGAACAAAACAA-----ATAT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAAATAAACTTGTATGAATAAAACAATTGTTTTAT
* * *
183936 --CATAAC--AA--T--T--TGA---G--ATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC
65 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** * * *
183986 AAGTAT-GGTAAACATATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
130 TTGT-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* ** * * * * *
184046 TAGTATTATTTTATTATG-ATAATTTTTTATGAATAAAAACAATTGTTTTATG--AAAA-AAAAT
194 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAAG
** * * * * * ** *
184107 GTTGTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTCATAACTATTTGAATTCATTTGTTAAAC
259 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTCGAAAAAT
* * *
184172 ATATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTG
323 AGATTTA-TTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTA
* * * * *
184210 AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATCAACAAAACCAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTGTATGAATAAAA-CAATTGTTTT
* * * * *
184274 ATGACGAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCA-AACTATTTGA
63 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
184338 ACTTATTCGGTAAACAGATTCT-TCTTTTAATTCTTTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAA
128 ACTTGTTCGATAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
** ** ** * * *
184402 A-T--TATTATTTTACATCAAATAAATTTATATGAAC-TCAAACAATTA-TTTTATTACAAAAGA
192 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAA-TAGTTTTATGACAAAACA
* * * ** *
184462 AATGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTACTCAAATCA-TCATGACTATTT
255 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTT
184514 TGTCATAACG
Statistics
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ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTCGAAAAATAGA
TTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTA
Found at i:178686 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 176047--184513 Score: 2983
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176037 GAATTGATAG
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* * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
176289 ACTATTTGAACT-TATTCGATAAACATATTTAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTATTTG-A
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* * * * * * *
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* * * ** * * *
176405 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAACTGTTTAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
176582 AATTCTTTTGTGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAAAAAAATAATTGTTCATATAGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** ** * *** *
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* * * *** ** *
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129 ATTAATAAATTA-AATTATTTTACTTCAAAATAA-ACTTATATGAAT-AAAAC
* * * * * *
176762 AATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCACAACT-ATTTGAAAT-AATAATTGTTCAAATTGTTAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * * *
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* * * *
176887 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAAA-AAACTTATATGAACAAAAA
129 ATTAATAAATTAA-ATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAATAAAAC
* * * * * *
176937 AATTTGTTTTACT-ACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCT
1 AA-TTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * * *
177001 TAGCTATTTGAATTATTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAA-TTTTCAT
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* * ** * * * *
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* * * * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAA-ATAATTATTCAAATAGTCAT
** * **** ** *
177183 AACTATTTGAACTATTTCAGTAAGCATATTTATTTTTTAAATCACCTACACATTAGTTTTTGAAA
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* ** * * *
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* * * * ** * * *
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1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ***** * *
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* * *** * * * *
177428 ATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTTGGAA-AAACTTTTATGATCTGAAAT
127 ATATTAATAAATTAA-ATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGA-ATAAAAC
* * * * * *
177481 AATTGTTTTAGGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCACATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * ** * *
177546 ACTATTTGAACTTGTTTGGT-AA-ACATTT-TTTTAAAAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTTG-A
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* * ** * * * * *
177607 ATGTTAATAAAATAATATTATTTTA-TT-TGAATAAGCATGTATGATCTGAAAC
127 ATATTAATAAATTAA-ATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGA-ATAAAAC
* * * * * * * *
177659 AATTTTTTTATTGACTAAAGAAAAGGTTAGAATAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTT
1 AATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* * *
177724 AACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAAT-GCATTTATTTTTTAA--ATCT-CTTATT-ATTTTT-AG
65 AACTATTTGAACTAT-TT-AGTAAATAG-ATTTATTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGA-
* ** * * * * * *
177782 AATATTATTAGTTTAGCAA-TATTTTGC-TCCAATTAAGCTTGTATAAATAGAAAC
126 AATATTAATAAATTA--AATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAATA-AAAC
* * * * *
177836 AATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTCCAAATTA-TCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-TAGTCAT
* * *
177899 AACTATTTGAACTAGTTTGACG-AACA-A-ATTTAGTTTTTAA--ATCT-CTTATTAATTTTT-A
65 AACTATTTGAACTA-TTT-A-GTAA-ATAGATTTATTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTTGA
* * * ** ** *
177957 GAATATTAATAAACTAGTATCATTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATGAATAAAAAC
126 -AATATTAATAAATTA-AATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAAT-AAAAC
* ** * *
178012 AATTGTTTAAAAACAAATGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAAATTGAAATAGATAATT-
1 AA-----T---------TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTA
* * * * * * * *
178076 GTGAGAATGGACACT-ACTATTTGAACT-TTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACT
52 TTCA-AATAGTCA-TAACTATTTGAACTATTT-AGTAAATAGATTTATTTTTT-AATTTTTTACT
* * * * * *
178139 T-TTAAATATT-AGAATATTACTAAATTAGTATAATTTTATTTC-AAATAAACTTATATGAATAG
113 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-AATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAATA-
178201 AAAC
175 AAAC
* * *
178205 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
*** * * * *
178270 ACTATTTGAACTCGCTCGATAAATGGATTTATTTTTCAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
66 ACTATTTGAACTATTTAG-TAAATAGATTTATTTTT-TAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * *** ** * *
178335 TTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTTGAATATGCTTTTATCCACAT-AAAC
129 ATTAATAAATTA-AATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATAT-GA-ATAAAAC
* * * *
178386 AATAGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
178451 ACTACTTGAACGTGTTCTA-AAAATAGATTTATTTTTT-ATATTTTTACTTATTAATTTTTAAAA
66 ACTATTTGAAC-TATT-TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAT-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
* **
178514 TATAAATAAATTTAAATTATTTTA-TTCAAAATAAACTTGCATGAATAAAAC
128 TATTAATAAA-TTAAATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAATAAAAC
* * * *
178565 CATTGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAGT-ATTTTGAAACAAATAATTATTCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* * *
178629 AACTATTTAAACTTATTTAGTAAATAGATTCT-TTTTTTAATTTTGTTACTCATTAATTTTTGGA
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* * * *
178693 ATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTC-AAATATACTGATACGAACTGAAAC
127 ATATTAATAAATTAA-ATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAA-TAAAAC
* * * * *** * *
178746 AATTGTTTTATTACAAAAGAAAATGTCGTAATGATTTGAAATTGGTAATTACTAAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * * * ** * * **
178811 ACTATTTGAGCT-TGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTTAAATCTTCGAATTA-TAATTGTCAAA
66 ACTATTTGAACTAT-TT-AGTAAATAGATTTA-TTTTTT-AATTTTTTACTTATTAATTTTTGAA
* * * * *
178874 ATATTAATAAATTAATATTATTTT-CATCCAAATAAATTTGTATGAACAGAAAC
127 ATATTAATAAATTAA-ATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAATA-AAAC
* * * ** * ** *
178927 AATTATTTTATGTCAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTCCTCAAATAATCATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
178992 A-TGAATTAAACT-TATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAACTTTTTACTTATTAATTGCCTT
66 ACT-ATTTGAACTAT-TTAG-TAAATAGATTTATTTTTT--AATTTTTTACTTATTAATT--TTT
** * * * *
179055 --AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTGTGAATAGAAAA
124 GAAATATTAATAAA-TTAAATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAATA-AAAC
* * * ** * * * * *
179109 AATTATTTTATGACCAAACAAAAGGTTATAGCGATTTTAAATAGATAATTGTT-AAATA--AACA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* ** * *
179171 A--ATTT--A-T-TTT-TTAAATATCTTTA-TTATT-ATTTTTTAGATTATTAA----T--AA-A
66 ACTATTTGAACTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTTTTA-CTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * * *
179220 TTAGT--GTT--ATTCTATT--TT--GAATAAGCTTATATAAAATGAAAC
130 TTAATAAATTAAATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATAT-GAATAAAAC
* * * * *
179262 AATTCTTTTATGACAAAACAAAAGATAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * * * * * * ** *
179327 ATTACTTGATCTACTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATTTTCTACTCATTAATTATCAAAAC
66 ACTATTTGAACTA-TTTAGTAAATAGATTTATTTTT-TAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * ** * * *
179392 ATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAAT-AGCTTGTATGGATAGAAAC
129 ATTAATAAATTA-AATTATTTTACTTCAAAATAAACTTATATGAATA-AAAC
* ** * * * * * ** * *
179442 AATTATTTTAAAATATAGCAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAATAATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
179507 ACTATTTAAACTAGTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAA-ATCTT--TTATTAATTTTTGAAAC
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* * ** ** * *
179568 ATTAATAGATTAGTATTACCTTA-TTCTGAACAAACTTATATGAACAAAAAC
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* * * ** *
179619 ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGCT-ATAATAATCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCA-AATAGTCAT
* * ** * ** *
179683 AATTATTTGAACTAGTTAGGTAAATAGAACTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATATTTGAAA
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* *** * *
179748 TACTAATAAATTTGTTGTATTTTA-TTCCAAAT-AAGTTAGTATGAATTCCAAAA-
128 TATTAATAAATTAAAT-TATTTTACTTCAAAATAAACTTA-TATGAA-T--AAAAC
* * * *
179801 ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC--AT-GTCTTA
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* * * * * * * * * *
179863 AATATTTGAACTGGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAGTTTTTGGAAT
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* * ** * * * * * * *
179928 ATTATTAGATTAGTTTTATTTT--TTTATGAATAAGCTTCTACGAACAAAAAT
129 ATTAATAAATTA-AATTATTTTACTTCA-AAATAAACTTATATGAA-TAAAAC
* * * * * * * ** * * *
179979 AATTATTTAATAATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTAAAATAGTCATA
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* *** ** *
180109 TTAATAAATTATCATTATTTTA-TTTTGAATAAGGTTGA-ATG-TTCAAAAAC
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* * ** * * * * *
180159 AATTGTTATATGACCAAACAAAAGGAAATAA-CATTTTGAAATAGATAATTATTGACAGAGTCAT
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* * * * * * *
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* ** ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *** * * * *
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* * * * * * ** * * * *
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1 AATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * *
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* * * ** *
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** * * *** * *
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* * * * ** * * * * * * **
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* ** * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * ** * * * **
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* * * * * ** * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *** **
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** * * ** * * * **
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* * * * * * * *
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* *** * *
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* * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * **
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* * ** * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * ** * * * *
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* ** * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* *** * *
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* * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * * **
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* * * * * *
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* * ** * *
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* ** ** ** * * * *
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* * * *
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* * ** * * * **
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* * * * ** * **
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* * * *
194663 AACAAAATGTCATAACAATTTGATATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
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* * * * *
194714 TATTTGAACTCGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATAT
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** * * * * * *
194779 TAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAACCTTGCATCAATAGAAGCAATTGTTTTATGACA
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* * * * * *
194843 AAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATTGATAATTGTTTAGATAGTCATAAC
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*** * * * * * * * *
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* * * * *
194958 TTAATAAATTAGTATTATTTTACATC-AAATAAGCTTATATGAA-TTGACACAATTGTTTTACT-
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTA-TG
** * * * * ** *
195020 ATGAAAGAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCATGAC
126 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * **
195075 TATTAGAACTTGTTTGATAAA-AATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATA
1 TATTTGAACTAGTTTGGTAAATAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTGAAATA
* * * * * * * * *
195139 TTAGTAAATTAATATTATTTTAATCTGAATATA-CTTGTATGAGCAGAAGCTATTATTTTATAAC
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA-AGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGAC
* * *
195203 ATAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAAC
128 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * *
195255 TATTTGAAAT-GTTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTAGAAATA
1 TATTTGAACTAG-TTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATA
* * * ** * * * * ** *
195315 TTAGTAGATTAGTAGTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACTTTTATTTTATGACA
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACA
* * *
195380 AAACAAAAACTTTTAGGTCGTAACGATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
129 AAAC--AAA-----AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
** * * * *
195439 TATTTGATTTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTCACTTATTAATTTTTGAAATAT
1 TATTTGAACTAGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATAT
* * * * * ***
195504 TAATTAATTCA-TTTTATTTTATTCCT-AATAAACTAGTATGAA-TTGAAA-AAAAATTTTATGA
65 TAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGA
* * * *
195565 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAATCTTAAC
127 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * *
195619 TATTTGAATTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATAT
1 TATTTGAACTAGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATAT
* * * * * *
195684 TATTATATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGTTTGTATGAACAAAAATAATT-TTTTATGATA
65 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * *
195747 GAACAAAAGGTTATAATGATTTG--ATATACAATTGTTCAAATAGTCATAAC
129 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* ** * * *
195797 TA-TTAAACCGGTTCGGTAAATGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTGAAAGAT
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* * ** * * * * *
195860 TAATAAATTAGCATTATTTT-TTTTGAATAAGCTTGTATGGTCAAAAACAACTATTATATGACCA
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
196039 TTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAA
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA
196071 TATAACAAAA
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Consensus pattern (180 bp):
TATTTGAACTAGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATT
AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGACAAA
ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
Found at i:194076 original size:178 final size:179
Alignment explanation
Indices: 193710--194181 Score: 434
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193700 TAATTTTCAT
* * * * * * *
193710 AATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATCAACAAAAACAATTGTTTTAT
** * * * *
193775 GACAAAATAAAATGTTTTAATGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATAATCATAACTATTTGAAC
66 GACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAAAAGATAATTCTCCAAATAACCATAACTATTTGAAC
* * * * **
193840 CGATTCAGTAAACAAATTCGTTTTTTAAATCTCCTACTCTTTAATTTTTGA
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*
193891 AATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGACTTATA-CAATGAAAAACAATTGTTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTATATCAA-CAAAAACAATTGTTTT
* * ** *
193953 TTGACAAAATAAAA-TCATAATGATTTGAAAAAGATAATTGTCCAAATGGCCATAATTATTTGAA
64 ATGACAAAATAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAGATAATTCTCCAAATAACCATAACTATTTGAA
* * * *
194017 CTAATTCAATAAACTAATT-TATTTTAAACATCTTCAACTTTTTAATTCCTGA
129 CCAATTCAATAAACAAATTCT-TTTTAAA-ATCTCCAACTCTTTAATTCCTGA
* * * * * * *
194069 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTT-CATAAGCTTTTATGAACTAGAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATCAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * *
194133 TATAAAAACAAAAGGCCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATA
66 GA-CAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAAAAGATAATTCTCCAAATA
194182 GACTTGACTA
Statistics
Matches: 234, Mismatches: 47, Indels: 20
0.78 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 1 0.00
177 6 0.03
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181 35 0.15
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
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AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATCAACAAAAACAATTGTTTTAT
GACAAAATAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAGATAATTCTCCAAATAACCATAACTATTTGAACC
AATTCAATAAACAAATTCTTTTTAAAATCTCCAACTCTTTAATTCCTGA
Found at i:195490 original size:364 final size:352
Alignment explanation
Indices: 193312--196062 Score: 1488
Period size: 356 Copynumber: 7.7 Consensus size: 352
193302 ACTAGTTTGA
* *
193312 TAAAAATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
1 TAAAAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
* ** * * * * * * *
193377 TTTAATCCAAATATGCTTGTATGAACAGAAACTATTGTTTTATAACAAACCAAAAAGTCA-AACA
65 TTTATTCTGAATA-ACTTGTATGAGCAG-AACAAATATTTTATAACAAA-CAAAAGGTCATAACG
* ** * ** * * *
193441 ATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATACTCATAACTATTT-ATGTTTG-TTTGATATACAGA-TT-
127 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA--AATGATTCGATAAATAGATTTA
* * * * * * * ***
193502 TTTTTAAAATCTCTTATTAATTTTTTACATATTAGTAGATTAGCATTATTTTATTTTGAACAAAC
190 TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAACAAAC
* * * * * *
193567 TTATATGAAGAAAAA-CATTTGCTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTAAAATAGATAA
255 TTATATGAACAAAAATAATTT--TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATAA
* * * * * * * *
193631 TTATTTATATAGCCTTAATTATTTGAACTAGTTTGG
318 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTAGG
* * * * * *
193667 CAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTA
1 TAAA-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTA
* * * * * * **
193731 TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAA-ATAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTTTTAA
64 TTTTATTCTGAATAA-CTTGTATGAGCAGAACA-AA-TATTTTATAAC-AAACAAAAGGTCATAA
* * * * ** * * *
193795 TGATTTGAAATATATAATTCTTCAAATAATCATAACTATTTGAACCGATTC-AGTAAACAAATTC
125 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGA-TAAATAGATTT
* * * ***
193859 GTTTTTTAAATCTCCTACTCTTTAATTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
189 ATTTTTTAAATCT-CT--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAA
* * * * * * * * *
193923 TAGACTTATA-CAATGAAAAACAATTGTTTTTTGACAAAATAAAA--TCATAATGATTTGAAAAA
250 CAAACTTATATGAA-CAAAAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * ** *
193985 GATAATTGTCCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCA-A
313 CATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTT-AGG
* * ** *
194026 TAAACTAATTTA--TTTTAAA-CATCTTCAACTTTTTAATTCCTGAAATATTAATAAAGTAATAT
1 TAAA-AAATTTATTTTTTAAATC-TCTT--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATAT
** * * * * * *
194088 TATTTTATT-TTCATAAGCTTTTATGAACTAGAACAATTGTTTTATTATAAAAACAAAAGGCCAT
62 TATTTTATTCTGAATAA-CTTGTATGAGC-AGAACAAATATTTTA-TA-ACAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * *
194152 AATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGACTTGACTA-TT----T--TT-GGTAAACAAATT
123 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGATAAATAGATT
** * *
194209 TATTTTTTCAAATTTCTTGCTTATTAATTTTCTG-AATGCTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTT
188 TATTTTTT-AAA--TC-T-CTTATTAATTTT-TGAAATATTAATA-AATTAGTAGTATTTTATTC
*** * * * * ** * * * * * *
194272 TGGATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTACTTTATGAACTAAATAAAAGGTCAAAACAATTTGA
246 CAAACAAACTTATATGAACAAAAATAATT-TTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * *
194337 AATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGTTTTGG
309 AATACATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTAGG
* ** * * * ** *
194382 CAAATGCAGTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-ACAATATTATTAGTTTAGCTA-T
1 TAAA-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA-ATATT
** ** * * * * ** *
194444 ATTTTGCTCCAAATAAACTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTACGACAAA-ACAAAGATCATAA
63 ATTTTATTCTGAAT-AACTTGTATGAGCAG-AACAAATATTTTATAACAAACA-AAAGGTCATAA
* * * * *
194508 TGATTT----TAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTT-AAACTGGTCCGA-AAACAGATTT
125 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAA-TGATTCGATAAATAGATTT
** * * * * *** ** *
194567 AGCTTTTAAATCTCCTATTAA-TTTTGAAATATTTATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATTAT
189 ATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAACAAA
* * ** * * * *
194631 TTTGTAT-AA-ATAAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGATATAAATA
254 CTTATATGAACA-AAAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATA
* *
194694 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCGG
317 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTAGG
* * * *
194731 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTAT
1 TAAA-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
** * * ** * * * * *
194796 TTTATTCAAAATAACCTTGCATCAATAGAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATG
65 TTTATTCTGAATAA-CTTGTATGAGCAGAA-CAAATATTTTATAAC-AAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * * * * *
194861 TTTTGAAATTGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACATA-CTCTT
127 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGATAAATAGATTTATT
* * * * *
194925 TTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACAT-CAAATA
192 TTTTAA--ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTA-TTCCAAACA
* *** * * ** * * * * *
194989 AGCTTATATGAATTGACACAATTGTTTTACT-ATGAAAGAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAGA
252 AACTTATATGAACAAAAATAATT-TTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACA
** * * * *
195053 TAATTACTCAAATAGTCATGACTATTAGAACTTGTTTGA
315 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTAGG
* * ** *
195092 TAAAAATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAGTAAATTAATATTAT
1 TAAAAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
* * *
195157 TTTAATCTGAATATACTTGTATGAGCAGAAGCTATTATTTTATAACATAACAAAA-GTCATAACG
65 TTTATTCTGAATA-ACTTGTATGAGCAGAA-CAAATATTTTATAACA-AACAAAAGGTCATAACG
* ** * *
195221 ATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGTTTTGATAAATAGATTTATT
127 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGATAAATAGATTTATT
* * *
195286 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAGTAGATTAGTAGTATTTTATTCCAAACAAACTT
192 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAACAAACTT
* *
195351 ATATGAACAAAAACT-TTTATTTTATGACAAAACAAAAACTTTTAGGTCGTAACGATTTGAAATA
257 ATATGAACAAAAA-TAATT-TTTTATGACAAAAC--AAA-----AGGTCATAACGATTTGAAATA
* *
195415 CATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGATTTAGTTAGG
313 CATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTAGG
* * * * *
195456 TAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATTAATTCATTTTAT
1 TAAA-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
* *** * * *
195521 TTTATTCCT-AATAAACTAGTATGAATTGAAAAAAAATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
65 TTTATT-CTGAAT-AACTTGTATGAGCAGAACAAATATTTTATAAC-AAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * *
195585 ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAATCTTAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAAATTTATT
127 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGATAAATAGATTTATT
* * * * * *
195650 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
192 TTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAACAA
** * * * * * *
195715 GTTTGTATGAACAAAAATAATTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAATGATTTGATATAC--AA
253 ACTTATATGAACAAAAATAATTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATAA
* ** *
195778 TTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTAAACCGGTTCGG
318 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTAGG
* * **
195813 TAAATGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGCATTAT
1 TAAA-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
* * * * * *
195877 TTT-TTTTGAATAAGCTTGTATG-GTCAAAAACAACTATTATATGACCAAACAAAAGGTAATAAC
65 TTTATTCTGAATAA-CTTGTATGAG-C-AGAACAAATATTTTAT-AACAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * *
195940 GATTTGAAATAGATAATTTTTGAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATTCAC
126 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGATAAATAGATTTAT
196005 TTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-GTTATTTTATT
191 TTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAG-TATTTTATT
196063 TTGAATAATA
Statistics
Matches: 1861, Mismatches: 414, Indels: 241
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
349 95 0.05
350 96 0.05
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352 27 0.01
353 44 0.02
354 48 0.03
355 165 0.09
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (352 bp):
TAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
TTATTCTGAATAACTTGTATGAGCAGAACAAATATTTTATAACAAACAAAAGGTCATAACGATTT
GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGATTCGATAAATAGATTTATTTTTT
AAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAGTATTTTATTCCAAACAAACTTATAT
GAACAAAAATAATTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATACATAATTGTTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAATTGTTAGG
Found at i:197445 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 196190--203218 Score: 3164
Period size: 181 Copynumber: 38.6 Consensus size: 181
196180 ATTTTTGAAA
* * * * * *
196190 TATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTAAGGCAAAA-AAAA-ATCAT
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * ** *
196252 GATGATTTTG-AATAAATAATTGTGCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTTGTAAATAGAT
65 AACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAAT
* * * * *
196316 TTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAACT-TTAATAAATTTGGAT
129 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
** * * * * * * *
196369 TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATACTTTATGACTAAACAAAATGTCAA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ** * * * * *
196433 AAAGATTAGAAATAGAAAATTATTCTAATAGTTTTTACTATTTGTACTGGTTCGGCAAACACATT
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATT
* *
196498 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATAATATTAAATTAGTAT
130 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
*** * * * *
196550 TAGTTTTA-ACCAAATAAGCTTCTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCA
1 TA-TTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * **
196612 TAATGATTTGAAATGGATAATCATTCAAATAGCCATAATTATTTTAACTAAG-TCGATAAGCAAA
64 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCGGTAAATAAA
* * * * **
196676 TTTA-TTTTTACATTTTTTTTACTTAATAATTTGGGAAATATTAATAAATTAGTAT
128 TTTATTTTTTA-A-ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * * * *
196731 TATTTTATTCTATCTAAGCTTGTATTAACTA-AAACGATTATTTTATAACAAATCAAAAGGTTAT
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * ** * * * *
196795 AATAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACAGATT
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATT
* * *
196860 TATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTAT
130 TA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
196913 TAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAAGCTCA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA
* * * * * * * ** * *
196977 AAACGATTTAAAATAGATAATTTTTC-TATTGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGTAAACAAAT
64 TAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAAT
*
197041 TTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTAT
129 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
** * * * * *
197090 TATTTTAATTCGAAA-AAACTTGTATGAACA-AAACAATT-GTTTATGACAAAAGAAAAGATTAT
1 TATTTT-ATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * ** * * * *
197152 ATTGATTTGAAATAGATTATTGTT-AATATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAATTAGAC
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAAT
* * * ** * * * *
197216 TTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTAA-GTTTCAGAAGATTATTAAATTAGTAT
129 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
** ** * * * * * * *
197269 TATTTTATTTTAAATAAAATAATATGAGCAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGCTTATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
197334 ACGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAGA-AAATT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAA-ATAAATT
* * * * *
197398 TACTTTTTCAATCTCTTACTAATTAATTTTTTAAATATTGATAAATTAGTAT
130 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * *
197450 TATTTTATTTCAAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTATTTTATGGCAAAAC-AAAGAGTAAT
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-GTCAT
* * * * * * *
197514 AATGATTTGAAATACATAATTATTCAAATAATTATAATTATTTGAACTAGTTCGATAAATAGAA-
65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATA-AAT
* * * * * * *
197578 TTATTTTCTAAACCACTTACTAATAAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTTT
129 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * *** * * *
197631 TATTCTATTTTAAAGAAGCTTGTATGAGTTGAAATAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTCATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * ** * * *
197696 ACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAATCTTAACTGTTTGAACTAATTTGGCAAATGAATTT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATTT
* * **
197761 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATTTTGCTAAATTAGTAT
131 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
*** * * * * * * *
197812 TATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATT-TTTTGTGATAGAACAAAAGGTTATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** *
197876 ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGTAA-TGGTTCAATAAATAGATT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTGGTTCGGTAAATAAATT
* * * *
197940 TATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTTCAAATAATAATAAATTAGGAT
130 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * *** * * * * *
197988 TATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTAATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* ** * * * * ** *
198053 ACGATTTGAAATAGATAGTTGCTCAAATGGCCATAATTATTTGAATTGAG-TCAATAAACT-GAT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGGTAAA-TAAAT
* *
198116 TTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAATTATTAATAAAGTAGTAT
129 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
** * * *
198165 TATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCGT
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * * * * *
198229 AATGATTTTAACTTGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAGACACATT
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* * * *
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130 TATTTTTT-AAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
198347 TATTTTATTTCAAGTAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTTAGA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * ** * *
198412 ATGATTTCAAATAGATTATTATTCTAATACTCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAAACACATTT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATTT
* *
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131 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
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1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * ** * *
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66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATTT
* * *
198652 AGTTTTTGAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGA-TAGTAT
131 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTAT
* * * * *
198703 TATTTTATTTTGAATAAG-TTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
198767 ATGGCTTT-AAACAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGCTCGATAAATAGAT
66 A-CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAAT
* * * * *
198830 TTATTTGTTTAAATCTTTTGCTCATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGTAT
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* *** * * * *
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1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * *
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66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATTT
* * * * * *
199014 ATTTCTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATTTTATTAAATTAATAT
131 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * ** * * *
199065 TATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAACAAAA-TAAAGATCATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * *
199129 ACGATTTGAAATAAATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTTGGTAAATAGATTT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATTT
* * * * ** * * * *
199194 AGTTTTCAAATATC-T--TT-TTACTTTTCAAAATATTATTATATCAGAAT
131 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * ** * * *
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1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * *
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65 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAA-AT
* * *
199368 TTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTAT
129 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
199420 T-TTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATCACAAAACAAAAGATCATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * **
199484 ACTAGTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTTGCTTC-GT-AATTTATT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGGTAAATAAATT
* * *
199547 TATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAT
130 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * *
199599 TATTTTATTTTGAATATGCTTGTATTAACAAAAACAATTAGTTTATAATAAAACAAAAGGTCATG
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * * *
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66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGGTAAATAAATT
*
199728 TATTTTTTAAAT-T-TT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TAT
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* * * * *
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* * * * * * **
199838 A-TAGTTTGACAAT-GATAACTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACCAAT
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* * * * * * *
199901 TCATATTTTAAATCTCTTA-TACAATAATTTTTGAAAAATTATTCAATTAGTAT
129 TTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * *
199954 TATTTTATTTTTAATAAGGC-TATATGAACCGATACAATT-GTTTATGACGAAACAAAAGGTCAT
1 TATTTTATTTTAAATAA-GCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
200017 AACGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATT
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* * * * * ** *
200082 TATTTTTAAAATATTTTACTTACTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATAT
130 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* *** * * * * *
200134 TATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTCATA
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * **
200199 ATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGT-AA-AGGTTT
66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATTT
** * *
200262 CCTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTA-TAT
131 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTAT
** * * * * *
200313 TATTTTAATTATTCAAATAGTAATAATTATTTGAATTGGTTTGATAAACATATTTATTTT-T--T
1 TATTTT-ATT-TT--AA-A-TAA-GCTTGTATGAA-------CAGAAACA-A-TTATTTTATGAC
* *** * * * ** * * ** * *
200375 AAATCTCTTA-CTTATTACTTTTTGAAATA-TTAA-TA---AAGTAGT-ATTATTTTATTTCAAA
50 AAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TA-ACTATTTGAAC
* * * *** ** * * *
200433 TAAGCTT-GAATGATCAAAAACAATTT-TTTTATAACAAAACAAAAGGTCA-TAATGATTTGAAA
112 T--GGTTCG---G-T-AAATA-AATTTATTTTTTAA-ATCTC-TTA-CTTATTAAT-TTTTGAAA
* *
200495 TAGCAATTATTCAAA-TGGCCATAAT
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* ** * * * * * * *
200520 TATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATAACAAAACAAAAGGTTGA-
1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCAT
* * * * * * * *
200584 AACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACAATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATT
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* ** *
200649 TACTTTTTAAATCTCTTACTGCTTAATTTTCT-AAATATTAAAAAATTAGTAT
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* * * * * * * ** *
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1 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * *
200766 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAAAATT
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** * * * * * *
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130 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * *** * *
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1 TATTTTATT-TTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * ** * ***
200946 AACAATTTGAAATTGATAATTGTTCATATAGTCCTAACTATTTGAACTAATTTGGTAAACGTATT
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* * * * *
201011 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAA-TTTTCAGACTATTATTAAATTAGTAT
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** * * * * * *
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1 TATTTTATTT-TAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * *
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** ** * * * * *
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*
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* *** * * * *
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* ** * * * ** * **
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** * * * * * * **
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* * *
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* * ** * * ** *
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* * * * * * *** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * **** * * * * * * *
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*
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177 AGTAT
* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * ** * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* *
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* * **
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* * * * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * ** * * * *
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66 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAAT-
* * *
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* * *** * * *
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* * *
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251 -AAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAA-AAACATTTATTTT
* * * * * ** * *
196683 TTACATTTTTTTTACTTAATAATTTGGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTATCTA
313 TTA-A-ATCTTATGCTTATTAATTT-TTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-A-ATA
* * * * * * ** * *
196747 AGCTTGTATTAACTAAAACGATTATTTTATAAC-AAATCAAAAGGTTATAATAATTTTAAATAGA
373 AGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACTAAA-CAAAAGGTCAAAACGATTTCAAATAAA
* * * * * ** * ** * * * *
196811 CAATTGTTCAAATAATAATAACTATTTGAACTTATT-TGATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCT
436 TAATTATTCTAACACTCTTAACTATTTGAAATGGTTCAG-CAAACAAATTTA-TTTCTTAAA-CT
* * * * * *
196875 CTTTCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGT
498 C-TACTTACTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAAT
* * * * * * * ** * *
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1 ATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGCATGAA-AAGAAACAACTACTTTATAAC-AAA-ACAAAGAT
* * * * * * * * * ** *
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** * * *
197039 ATTTA-TTTTTTAA-ATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCG
128 ATTTAGTTTTCAAATATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTTATTTTG
* * * * * * * *
197102 AAAAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTG-TTTATGACAAAAGAAAAGATTATATTGATTTGAAAT
192 -AATAAGTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-AAAC
* * * ** * ** * * *
197165 AGATTATTGTT-AATATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAATTAGACTTATTTTTTAATT
255 AGATAATTATTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAAACATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * * ** **
197229 TTTTTGGTTATTAAGTTTCAGAA-GATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAAATAATA
319 CTTATGCTTATTAATTTTTA-AATG-TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTA
* * * * * * * * * **
197293 TGAGCA-GAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGCTTATAACGATTTGAAATAGTTAATTATT
381 TGA--ATGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTCAAATAAATAATTATT
* * * ** ** * * *
197357 CAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAGA-AAATTTACTTT-TTCAATCTCTTACTAA
444 CTAACACTCTTAACTATTTGAAATGGTTCAGCAA-ACAAATTTA-TTTCTT-AAACTC-TACTTA
* * *
197420 TTAATTTTTTAAATATTGA-TAAATTAGT
505 CTAATTTTTGAAATATT-ATTAAATTAAT
* * * * ** * * * ** *
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1 ATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGCATGAA-AAGAAACAACTACTTTATAACAAAACAAAGA-TC
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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129 TTTAGTTTTC-AAA-TATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAGTATTATTTTATT
* * * ** * * * * * **
197640 TTAAAGAAGCTTGTATGAGTTGAAATAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGA
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* * * * * * ** * * *
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* ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * * *
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* * * * * **
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505 CTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAAT
* * * * ** * ** * * *
197986 ATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGTTGAA-AAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTA
1 ATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGCATG-AAAAGAAACAACTACTTTATAACAAAAC-AAAGATC
* * * * * * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * * *
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* *
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*** ** * * * *
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* ** * * * * * *
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** * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* ** *
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* * *
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* * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *** * * * *
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* * *
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509 TTTTTGAAATATTATTAAATTAAT
* *** * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
199845 GACAA-TGATAACTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTGAACTTGTTCAGT-AAACCAATTCATATT
251 -A-AACAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAAAC-ATTTATTTT
* * ** * * *
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* * * * * * *
199971 GGC-TATATGAACCGATACAATT-GTTTATGACGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAT
374 -GCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTCAAATAAAT
* * * * * * * ** * *
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* * ** *
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* * * * ** *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * * **
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* * * * * * *
204991 TCATATAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTGATAACTAA
63 TCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAAA
* * * * *** * * * * *
205055 GAGATTTAAAAAGTGAATCGGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGA-TTA
127 GAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTA
* * ** * * ** *
205107 TTTGAATAATTTTCTATTTGAAATCGCTAGAACCTTTTGCTTT-GTCATAAAATGATTTTTTCTG
1 --TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TG
* * *
205171 TTCATACAAGCTTATCTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAG
62 TTCATACAAGCTTAT-TTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAA-A-AATTAATAA-
* * * ** * * * * *
205233 TAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCA-ATATGACTATT
123 CAAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAAT-AGTTAAGACT-TA
* * * ** ** * **
205290 TAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-TTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTT-TTTAGTCATAAAACAATTG-TTTTGTT
* * * * * * *
205354 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTTATAAGTAAA-
64 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA-CAAAG
* * * * ** * *
205418 AGATTTGAAAAATAAA--T-A-T--------GTT--TATCTTTGA-ACTATT
128 AAAATTAAAAAATAAATCTAATTCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-TA
*** * * **
205455 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTA-TAATAAAATAATTGTTTCAATT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TGTT
* * ** * * * * **
205519 TATATAAGCCCATTT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAG
64 CATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAAAG
* * * ** * * * *
205583 AGAATTAAAAAAATGAATTTGCTTACCAATCAAGTTGAAATAGTTATGAC-TA
128 AAAATT-AAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTA
* * ** * * * * *
205635 TCTAAGTAATTATCTATTT-AAAACATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCTA
1 T-GAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTT-TTTAGTCATAAAACAAT-TGTTTTG
* * * * * **
205698 TTCATGCAAGCATATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
62 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAA
** * * * * * *
205762 A-AATTTTAGAAAATAAAGCTATTTTCTGAATA-C-GTTCAAATAGTTATGA-TATT
126 AGAAAATTAAAAAATAAATCTA-ATTC-CAA-ACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-TA
* ** *
205815 TGAAATAATGATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTT-GTCAT-AAACTAATTGTTTCTG
1 TG-AATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACC-TTTTTTTTAGTCATAAAAC-AATTGTTT-TG
* * * * * ** *
205878 TTCAAACAAGATTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAA
62 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA-CAA
* * * ** ** * * *
205942 A-ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAGCCAGTTCAAATAGTTATGA-TTGCT
126 AGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTT--A
* * * ** * *
205996 TGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTTTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TGTT
* * * * * ***
206060 CATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAA-GTTGA
64 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAAAGA
* * * * * * *
206124 AGATTTAAAAAATTAATC-AGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATT-
129 A-AATTAAAAAATAAATCTA-ATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAG-AC-TTA
** ** ** * * *
206177 TGAACT-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTGGTCGTAAAAC-ATT-TTTTGCTA
1 TGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTG-T-
* ** * * * *
206239 TTATACAAAATTATTTATAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAAT----AAG
63 TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAAAG
* ** ** * * *
206300 -AGATCTAAAAGCTAAATCTCTTTACCAAACCAGTTTAAATATTTATA-ACTATT
128 AAAAT-TAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACT-TA
* * * * ** ** * * * * *
206353 TAAACAACTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTT-GTCCTAAAACATTTGTTTCTATTC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTC
* * * ** * * **
206417 ATACAAGCTTATTCA-AAGTGAAATATTGTTAAGTTAATATTATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
65 ATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTAATA--ATATTTTAAAAATTAATAACAAA
* * * ** *** * * * *
206481 G-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGATCTAGCTC-AA-AGTTAAAAC-TA
127 GAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTA
* * * * *
206530 TTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATT-CTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAG
1 -T-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTAC-AACCTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TG
* * * * * * * *
206594 TTCATACATGCTTGTTCCA-AAT-AAATAATTA-TAATTTATTAACA-ATCAGAAAATTAATGAG
62 TTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAA-TACTAATTTAATAATATTTTA-AAAATTAAT-AA
* * ** * ** * *
206655 C-AAGAAATTTAAAAAATAAATTTGGTTTACAGAATAAG-TCAAATAGTTTATGACTATTT
123 CAAAGAAAATTAAAAAATAAATCT-AATTCCA-AACCAGTTCAAATAG-TTAAGAC--TTA
* * * * **
206714 TGAATAATTATATTATCTAAAATCAACTAGTACCTTTTTATTTTA-TCATTAAAACAATTGTTTC
1 TGAATAATTAT-CTATTTCAAATC-ATTACAACC-TTTT-TTTTAGTCA-TAAAACAATTGTTT-
* * * * ** * * *
206778 AGATCAGAAAAGC-TATCCCA-AAT-AAATAATATTAACTTAATTTAATATTTTAAAAATTGATA
60 TGTTCATACAAGCTTAT-TTAGAATAAAATAATACTAATTTAA--TAATATTTTAAAAATTAATA
* * * * * * * * *
206840 ATTTAAAG--ATTTACAAACAATAAATC-AGTTTATCAGATATCAGTGTTAAATAATTATGGCCA
122 A--CAAAGAAAATTA-AAA-AATAAATCTA-ATT-CCA-A-ACCAGT-TCAAATAGTTA-AGAC-
206902 TT-
176 TTA
* * * *
206904 TGAACATTTAATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTTGTT-GTCATAAAACAATTG-TTT-TT
1 TGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTA-CAACCTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTGTT
* * *
206965 CATATACTAGCCTGA-TTCGTAATAAAATGAATA-TAATTTAATTATATATTTTAAAAATTAATA
64 C--ATACAAG-CTTATTTAG-AATAAAAT-AATACTAATTTAA-TA-ATATTTTAAAAATTAATA
** * * * ** * * *
207028 AGTAGGAGATTTAAAAAAATAAAT-TTGTTACCGAACTAATTC-AA-A--T-AG--TTA
122 ACAAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTA
* * * * * * *
207079 TGACT-ATT-TGTATTTCAATTTC-TTATAACCTTTTGTTCTA-TCATAAAATAATTATTTTTGT
1 TGAATAATTATCTATTTCAA-ATCATTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATT-GTTTTGT
* * * * * * * * * *
207140 TCAAACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATAATTTGAAATTTAATAACTAAT
63 TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAAAG
* * * * ** * ** *
207205 AGATTTAAAAAATAATTTTTTTTGCTAAACTGGTTCAAATAGTTAAGGCTATA
128 AAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-TA
* * * * ** ** * ** *
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1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTGTTTT--GT
* * * * *
207321 TCTTACTAA-CTTATTTAGAATAAAATAA-A-AAATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAA-T
63 TCATAC-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAA-TTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-AACA
* * * * * ** ** * * * * *
207382 AAGAGATTTAATAAATAATTTTGTTTACTGAACCGGTTGAAATAATTATGACTATT
125 AAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-TA
* ** ** *
207438 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAAATGTTTTTGTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTG-TTTTGTT
* * * * * * **
207502 CAAATAAGTTTGTTT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
64 CATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAAAG
* * ** * * * *
207566 AGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAATTAGTTATA-ACTATT
128 AAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACT-TA
** * * * ** * * *
207619 TGAGCAATCATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTATTTGTTT-GTTATAAAATAATTGTTTTTGTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCT-TTTTTTTAGTCATAAAACAATTG-TTTTGTT
* * * * * * * * *
207682 CATACTATCTTATTTAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAATG
64 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA-CAAAG
* * * * * * * * * *
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128 AAAATTAAAAAATA-AATCTAATT--CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-TA
* * * * * * *
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1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACC-TTTTTTTTAGTCATAAAACAATT-GTTTTGTT
* * * * *
207863 CGTACAAGCTTATTT-GAAATAATATAATTCTAATTT-ATCAATATTCTAGAAATTAAT----AA
64 CATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTTAAAAATTAATAACAAA
* * * * * * *
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127 GAAAATTAAAAAATAAATCTAATTC-C-AAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTTA
* * * * * *
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1 --TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGT-TT-TG
* ** ** *
208037 TTCATAGAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCAAAAAATTAATAAGT
62 TTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA-C
* ** * ** * * *
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124 AAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTA
* * * ** ** * * *
208154 GTTGAA-CATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-TTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTG
1 --TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTT-TTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TG
* * * * * **
208217 TTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAAT-ATATTAATTTATTAATA-TTTAGATAATTAATAAGTA
62 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTA-AAAATTAATAACAA
* * * * * ** * * * *
208280 A-ATATTTTAAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTCCAAATAGTTCATAAACTATT
126 AGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTT-A-AGACT-TA
* * * * * ** * * **
208336 TAAATAACTATCAACTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTTAT-AAATAATTGTATCGGTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTGT-TTTGTT
* * * *
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64 CATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT-AACAAA
* * * * * * * * *
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127 GAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-TA
* * * * ** * * * *
208514 TG-ACAATTGTTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTTTAT-GCCAT-AAACAATTGTTTCTATTC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAACCTTTTTTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTC
* * * * * * **
208576 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATTAATA-TAAATTATTAAT-TTTCCAAAATTTATTAAGTAA-
65 ATACAAGCTTATTTAGAATAAAA-TAATACTAATTTAATAATATTT-TAAAAATTAATAACAAAG
* * * **** * * *
208638 AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTTTGA-CACGTTTAAATAGTTATGACTATT
128 AAAATTAAAAAATAAATCTAATTCCAAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACT-TA
* * ** * * *
208690 TGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTTATGACCTTTTGTTTT-GTCGTAAACCAATTGTTTCTAT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTACAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TGT
* * * * *
208753 TCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATA
63 TCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATA
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TACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACAAAGAAA
ATTAAAAAATAAATCTAATTCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTA
Found at i:203725 original size:180 final size:181
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * ** * * *
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* * * ** * * * *
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* * *
203550 ATTTTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT-GCCAAACCAGTTCAAATAG
65 ATTTTAAAAATTAATAACAAAGAAAATTAAAAAATAAAT-TAATTAACCAAACCAGTTCAAATAG
* * *
203614 TTAAGACTCTA-T-GAATGATTATCTATTTCAAATC-ATCATGACCTTTTCTTTTAA
129 TTAAGA-T-TATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGATC-TAACATTTT-TTTTAA
* * * *
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* * * ** * * *
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* * *
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* * *
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1 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
**
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66 TTTTAAAAATTAATA
203927 GGAAAAAGAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
TTTTAAAAATTAATAACAAAGAAAATTAAAAAATAAATTAATTAACCAAACCAGTTCAAATAGTT
AAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGATCTAACATTTTTTTTAA
Found at i:205921 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 204031--208917 Score: 2437
Period size: 181 Copynumber: 27.3 Consensus size: 178
204021 TGGCCATTTC
* * * * * * * *
204031 AATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCATTTGTTTGGTCATATGACAATTATTTTTGATCAT
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* * * *
204096 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAGTAAGTAAGATA
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* * * ** *
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** * * * * * * * * * *
204212 AGCAATTGTATACTTT-AAATTGTTATAACATTTTATTGTATCATAAAACAATTATTTCTATTCA
1 AATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCA
** * ** * * * * *
204276 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCCAATAATATTTTGAAAATCAATAACTAAGAGA
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-A
* * * *
204341 TTTAAAAAATAAAAT-TATTT-TTCGAACTA-GTTCAAATAGCTAAGACTATATGA
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* * * * **
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAT-TGTTTCTGTTCA
* * * * * *
204457 TGCTAGCTTATTT-AGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAAGAG
64 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAAT-AATTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-
* * * *
204521 ATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT-AAT-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
125 ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAATAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* ** * * * *
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1 -AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * * * *
204638 TATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG--CAAT
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAT
* * **
204700 TTAAAAATTAAATCTATTTA-TCAA-ACTGATTC-AA-A-TTAAAACTATTT-A
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAC-G-TTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * *
204748 AGTAATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCA
1 AATAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * *** * * *
204812 TTCAAGCTTACTCGAATTAAAATAACACAAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAA
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA-TTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAAA
* * * * * * * *
204877 TGTAAAAAAATAAATATGTATATTGAACTA-GATT-AAACAATCATGACTATTTG-
126 T-TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TACG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * **
204930 AATAATTATCTATTAT-AAATCGTTATGACCTTTTCTTCTATCATAAAAAAATTATTTCAATTCA
1 AATAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * *
204994 TATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTGATAACTAAGAGA
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-A
* * ** * * * * * *
205059 TTTAAAAAGTGAATCGGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGATTATTTG-
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
205111 AATAATTTTCTATTTGAAATCGCTA-GAACCTTTTGCTTTGTCATAAA-ATGATTTTTTCTGTTC
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAACA--ATTGTTTCTGTTC
* * **
205174 ATACAAGCTTATCTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAA
63 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGT-AA
* * * * *
205237 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCA-ATATGACTATTT-A
124 A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGA
* * * ** * *
205292 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * * *
205357 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTTATAAGTAAAAGAT
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAA-AT
* * * *
205422 TTGAAAAATAAA--TATGTT--T--AT-CTTTGAACTA-TT-TGA--A--T--
127 TTAAAAAATAAATCTAT-TTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * ** *
205460 AATTATCTA--T-TT-CAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAATTTA
1 AATAAT-TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCA
* ** *
205521 TATAAGCCCATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAAAAGTAAGAG
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-A-A-
* * * ** * * * *
205585 AATTAAAAAAATGAATTTGCTTAC-CAATCAAGTTGAAATAGTTATGACTATCT-A
124 AATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAT-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * *
205639 AGTAATTATCTATTT-AAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCTATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * *
205703 GCAAGCATATTTTG-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATT
65 ACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-T
* * *
205767 TTAGAAAATAAAGCTATTTTCTGAATACGTTCAAATAGTTATGA-TATTTGA
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * *
205818 AATAATGATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTGTTCAA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAC-AATTGTTTCTGTTCAT
* * *
205883 ACAAGATTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTC-CAAAATTAATAAGTAAAATAT
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATT-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAA-AT
* * ** * **
205947 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTG-AGCCAGTTCAAATAGTTATGATTGCTTG-
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * *
205998 AACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * * *
206063 ACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGAT
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-T-AAAAT
* ** * * * * *
206128 TTAAAAAATTAATC-AGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGA
127 TTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** * * * *
206180 ACT-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTGGTCGTAAA-ACATTTTTTGCTATT-A
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACA-ATTGTTT-CTGTTCA
** * * *
206242 TACAAAATTATTT-ATAATAAAATAATACTAATTTATTACTATT-TCAAAAATTAATAAG--AGA
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* ** * * * * *
206303 TCTAAAAGCTAAATCTCTTTAC-CAA-ACCAGTTTAAATATTTATAACTATTT-A
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATA-C-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * *
206355 AACAACTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCTATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * *
206419 ACAAGCTTA-TTCAAAGTGAAATATTGTTAAGTTAATATT-ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
65 ACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAAT-TTAA-TT--TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-
* * * ** * * ** *
206482 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGATCTA-GCTC-AA-AGTTAAAACTA-TTAA
124 AATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA-ATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * *
206534 AATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * ** * * * *
206599 ACATGCTTGTTCCAAAT-AAATAATTATAATTTATTAACAATC-AGAAAATTAATGAGCAAGAAA
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATT-TAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAG-TA-AAA
* * * *
206662 TTTAAAAAATAAATTTGGTTTACAGAATAAG-TCAAATAGTTTATGACTATTTTG-
126 TTTAAAAAATAAATCT-ATTTACTGAATACGTTCAAATAG-TTATGACTA-TTTGA
* * * ** * * *
206716 AATAATTATATTATCTAAAATCAACTA-GTACCTTTTTATTTTATCATTAAAACAATTGTTTCAG
1 AATAATTAT-CTATTTCAAATC-GTTATG-ACC-TTTTGTTTTGTCA-T-AAACAATTGTTTCTG
* * * *** * * * *
206780 ATCAGAAAAGC-TATCCCAAAT-AAATAATATTAACTTAATTTAATATTTTAAAAATTGATAATT
60 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAA-TTTA-TTAATATTCTAAAAATTAATAA-G
* * * * *
206843 TAAAGATTTACAAACAATAAATC-AGTTTA-TCAGATATCAGTGTTAAATAATTATGGCCATTTG
121 TAAA-ATTTA-AAA-AATAAATCTA-TTTACTGA-ATA-C-GT-TCAAATAGTTATGACTATTTG
206906 A
178 A
* * * * **
206907 ACAT--TTAATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTT-TGTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAT-
1 A-ATAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTC
* * * * * *
206968 ATACTAGCCTGATTCGTAATAAAATGAATATAATTTAATTATATATTTTAAAAATTAATAAGTAG
63 ATACAAG-CTTATTTGAAATAAAAT-AATTTAATTT-ATTA-ATATTCTAAAAATTAATAAGTA-
* * *
207033 GAGATTTAAAAAAATAAAT-T-TGTTACCGAACTA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTG-
123 -AAATTT-AAAAAATAAATCTAT-TTACTGAA-TACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * *
207089 --T-ATT-TC-AATT----TC-TTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCAA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* ** * * * * * *
207144 ACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATAATT-TGAAATTTAATAACTAATAGA
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-A
* * * * * * *
207208 TTTAAAAAATAATTTTTTTTGCT-AA-ACTGGTTCAAATAGTTAAGGCTATATG-
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAC--GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * ** * * * *
207260 AACAATTCTTTATTTTAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATTGTAAAATAATTTTTTCAGTTCTT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
**
207325 ACTAA-CTTATTT-AGAATAAAATAA-AAAATTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATCAA-TAAG
65 AC-AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATTTAA-TTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT-AAGTAA-
* * * * * * *
207385 AGATTTAATAAATAATTTTGTTTACTGAA-CCGGTTGAAATAATTATGACTATTTG-
124 A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
207440 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * * *
207505 ATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAA
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-A-AT
* * * * *
207570 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTA-GTTCAATTAGTTATAACTATTTG-
127 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
** * * * * *
207621 AGCAATCATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTATTTG-TTTGTTATAAAATAATTGTTTTTGTTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCA
* * * * * *
207684 TACTATCTTATTTAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAATGGA
64 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA--AA
* * * * * *
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126 TTTAAAAAATA-AATCTATTTA--CTGAATAC-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * *
207866 ACAAGCTTATTTGAAATAATATAATTCTAATTTATCAATATTCTAGAAATTAATAAG--AGATTT
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATT-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATTT
* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * *
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** ** * * * *
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126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * ** *
208158 AA-CATTATTTATTTTAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * *
208222 ACAAGCTTA-TTCAGATTAAAAT-ATATTAATTTATTAATATT-TAGATAATTAATAAGTAAATA
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* * * * * *
208284 TTTTAAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTCCAAATAGTTCATAAACTATTT-A
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAATAGTT-AT-GACTATTTGA
* * * * * * *
208338 AATAACTATCAACTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAATAATTGTATCGGTTCATA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * *
208403 TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATGAGCAGAGATTT
66 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA-AAATTT
* *
208467 AAAAAATGAATCTATTTAC-GAA-ACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTG-
129 AAAAAATAAATCTATTTACTGAATAC--GTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
208516 -ACAATTGTTTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTATGCCATAAACAATTGTTTCTATTCATA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * *
208579 CAAGCTTATTTTG-AATAAAATTAATATAAATTATTAATTTTCCAAAATTTATTAAGTAAAAATT
66 CAAGCTTA-TTTGAAATAAAA-TAATTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAAATT
* ** * *
208643 TTAAAAATAAATCTATTTTTTG-ACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTG-
128 TAAAAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** * *
208692 AACAATTATTTATTTCAAATATTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAACCAATTGTTTCTATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTGTTTCTGTTCAT
* * *
208757 ATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATT-TCAAAAATTAATATGTAAAAGA
65 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-AAA-A
* * * ** * * *
208820 TTTAAGAAATAAATTTGTTTACTGAGCAAGCTCAAATAGTTATGACTGGTTT--
126 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGA
* * * *
208872 AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
208918 CTATTTGACA
Statistics
Matches: 3667, Mismatches: 769, Indels: 541
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
164 1 0.00
165 88 0.02
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167 4 0.00
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170 14 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCTGTTCATA
CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATTTAA
AAAATAAATCTATTTACTGAATACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
Found at i:206192 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 204035--208917 Score: 3050
Period size: 361 Copynumber: 13.6 Consensus size: 361
204025 CATTTCAATA
** * * ** * * * *
204035 ATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCATTTGTTTGGTCATATGACAATTATTTTTGATCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAA
* * * * * * *
204100 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAGTAAGTAAGATAGTTAA
66 GCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * *
204165 AAAATAAATATGTTTACCAAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTGTATACTTT-
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* * * * * * * * **
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* ** * * * * * *
204293 TAAAATAATACTAATCCAATAATATTTTGAAAATCAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAATTA
259 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAAT-AAATCA
* * * * * * * *
204358 TTTTTC-GAACTAGTTCAAATAGCTAAGACTATATGAAGT
322 GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * ** *
204397 ATTATCTATTTTAAATCATTATGACC-TTTCGTTTTGTCATAAAACAATAT-TTTCAATTCATGC
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTT-GTTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTCTGTTCATAC
* * * * * *
204460 TAGCTTATTT-AGAATAAAATAAAAT-AAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAAGAGAT
64 AAGCTTATTTGA-AATAAAAT-AATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * * * *
204523 TTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAATC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCATTTATCTAT
127 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTAT
** * * * * * * *
204587 TTCAAATTATTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TTGTTCGTATAAGTTTGTTC
191 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTT
* * * *
204651 GAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG--CA-ATTTAAAAATTAAA
255 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAA
* ** *
204712 TCTA-TTTA-TCAAAC-TGATTC-AA-A-TTAAAACTATTT-AAGT
319 TC-AGTTTACT-AAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
** ** * * * * * * *
204751 AATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATTC
1 -ATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATAC
* * * ** * ** * *
204815 AAGCTTACTCGAATTAAAATAACACAAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATGT
64 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-T
* * * ** * * * * * * * *
204880 AAAAAAATAAATATGTATATTGAACTAGATT-AAACAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATT
128 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATT
* * * * * ** * *
204944 AT-AAATCGTTATGACCTTTTCTTCTATCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTAG
192 -TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTG
* * * * *
205008 AAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAAAAAGTGAAT
256 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
205073 CGGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAA-T
320 CAGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * ** * * * *
205114 AATTTTCTATTTGAAATCGCTA-GAACCTTTTGCTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATAC
1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATAC
* * * *
205178 AAGCTTATCTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGAT
64 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGAT
* ** * * * *
205241 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCA-ATATGACTATTTAAACAATTATTTAT
127 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTAT
* ** *
205305 TTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTT
191 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTT
* * * * * *
205369 GGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTTATAAGTAAAAGATTTGAAAAATAAA
255 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAA
205434 T-ATGTTTA-T---C---TT----T-G--A--ACTATTTGAA-T
319 TCA-GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * ** * *
205460 AATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAATTTATATA
1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACA
** * *
205525 AGCCCATTTGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGAATT
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* * * * * * * * *
205589 AAAAAAATGAATTTGCTTACC-AATCAAGTTGAAATAGTTATGACTATCT-AAGTAATTATCTAT
128 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAA-CAATTATTTAT
* * * * * * * * *
205652 TT-AAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCTATTCATGCAAGCATATTTT
191 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTT
* *
205716 G-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-ATTTTAGAAAATAAA
255 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * *
205779 GCTA-TTTTCTGAATACGTTCAAATAGTTATGA-TATTTGAAAT
319 TC-AGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * *
205821 AATGATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACTAATTGTTTCTGTTCAAACA
1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACA
* * * *
205886 AGATTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAAATATTTA
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * *
205950 AAAAATAAATTTGTTTACTGAGCCAGTTCAAATAGTTATGATTGCTTGAACAATTATTTATTTCA
130 AAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCA
* * *
206015 AATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGTTTATTTGGAAT
195 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * * *
206080 AAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCAGT
260 AAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCAGT
* * * *
206145 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACT
324 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
** * * * * * *
206183 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-TATTTTGTTTGGTCGTAAAA-CATTTTTTGCTATT-ATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-CTGTTCATAC
** * * *
206245 AAAATTATTT-ATAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG----AGATC
64 AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
** * * * * * * * * * * * * *
206305 TAAAAGCTAAATCTCTTTACCAAACCAGTTTAAATATTTATAACTATTTAAACAACTATCTATCT
128 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTT
* * * * * *
206370 CAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAA
193 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * *
206433 AGTGAAATATTGTTAAGTTAATATT-ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAA
258 A-TAAAATAATATTAA-TT--TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAA
** ** * * * * ** * *
206497 TGTGTTTGTTGATCTAGCTC-AA-AGTTAAAACTA-TTAAAAT
319 TCAGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * *
206537 AATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACA
1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACA
* * ** * * * * *
206602 TGCTTGTTCCAAAT-AAATAATTATAATTTATTAACA-ATCAGAAAATTAATGAGCAAGAA-ATT
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATT
* * *
206664 TAAAAAATAAATTTGGTTTACAGAATAAG-TCAAATAGTTTATGACTAT-TTTGAATAATTATAT
128 TAAAAAATAAATTT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGA-T-TGTTTGAACAATTAT-T
* * ** * * *** * *
206727 TATCTAAAATCAACTA-GTACCTTTTTATTTTATCATTAAAACAATTGTTTCAGATCAGAAAAGC
188 TATTTCAAATC-GTTATG-ACC-TTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGC
*** * * * *
206791 -TATCCCAAAT-AAATAATATTAACTTAATTTAATATTTTAAAAATTGATAATTTAAAGATTTAC
249 TTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTTA-TTAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAAGATTTA-
* * * *
206854 AAACAATAAATCAGTTTA-TCAGATATC-AGTGTTAAATAATTATGGCCATTTGAAC-
310 AAA-AATAAATCAGTTTACT-A-A-A-CAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * **
206909 ATTTAATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTT-TTGTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAT-ATA
1 A-TT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTT-TTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * * **
206971 CTAGCCTGATTCGTAATAAAATGAA-TATAATTTAATTATATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGA
63 CAAG-CTTATTTGAAATAAAAT-AATTCTAATTT-ATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
*
207035 GATTTAAAAAAATAAATTTG-TTACCGAACTAA-TTCAAATAG-T-T-A-----TG-ACTATT-T
124 GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTAT
* * * * * * * * *
207088 GTATTTCAATTTC-TTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTT-TTGTTCAAACAAGTT
187 TTATTTCAA-ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCT
** * * * * * *
207151 TATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATAATT-TGAAATTTAATAACTAATAGATTTAAAA
250 TATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAA
* *** * ** * * * *
207215 AATAATTTTTTTTGCTAAACTGGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAACA
313 AATAAATCAGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * ** * ** * * *
207264 ATTCTTTATTTTAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTATTGTAAAATAATTTTTTCAGTTCTTACT
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATAC-
** *
207328 AA-CTTATTT-AGAATAAAATAA--AAAATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAA-TAAGAGA
64 AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATTCTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAAAGA
* * * ** * * * * *
207388 TTTAATAAATAATTTTGTTTACTGAACCGGTTGAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
126 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTAT
* * * * * *
207453 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TTGTTCAAATAAGTTTGTTT
191 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTT
* *
207517 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAA
255 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAA
** * * * * *
207582 TTTGTTTACTAAACTAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAGCA
319 TCAGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * * * *
207625 ATCATTTATTTCAAATCGTTATGACTATTTG-TTTGTTATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACTA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAA
* * * * **
207689 TCTTATTTAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTA
66 GCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * *
207753 AAAAA-AGAATCT-TTTAGCCTAACCAA-TGCAAATAGATATGATTGTTTGAACAATTATCTATT
130 AAAAATA-AATTTGTTTA-CCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATT
* * * * * * *
207815 TTAAATCGTTATAACCATTTGTTTTATCACAAAACAATTATTT-TTGTTCGTACAAGCTTATTTG
192 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
207879 AAATAATATAAT-TCTAATTTATCAATATTCTAGAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATGAAT
256 AAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * **
207940 CTGTTCACTGAACAAGTTTAAATAGTTATAATTATTTAAAAA
320 CAGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * * * *
207982 ATTATCTATTTCAAATCACTATAACC-TTTGTTTTATCATAAAACAATT-TATTCTATTCATAGA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCTGTTCATACA
* * * *
208045 AGCTTATTTCAAATAAAATAATAT-AAATTTGTTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAAATT
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATT
** * * * * * * *
208108 TTTAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAAAAGTTATGACTAG-TTGAAC-ATTATTTATT
128 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-TTGTTTGAACAATTATTTATT
* * ** * * *
208171 TTAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCA
192 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * *
208235 GATTAAAAT-ATATTAATTTATTAATATT-TAGATAATTAATAAGTAAATATTTTAAAAATAAAT
257 -AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
208298 -ATATTTACTGAACAAGTCCAAATAGTTCATAAACTATTT-AAAT
320 CA-GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTT-AT-GACTATTTGAACT
* * * * * * * * *
208341 AACTATCAACTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTAT-AAATAATTGTATCGGTTCATATA
1 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACA
* * * * *
208405 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATGAG-CAGAGATTTA
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * * *
208468 AAAAATGAATCTATTTA-CGAAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTG-ACAATTGTTTATTTC
130 AAAAATAAATTTGTTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTC
* * * *
208531 AAATCGTTATGACATTTT-TTATGCCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG-A
194 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTTGAA
* * * * * * *
208593 ATAAAATTAATA-TAAATTATTAATTTTCCAAAATTTATTAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCT
258 ATAAAA-TAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATC-
* ** * * *
208657 A-TTT-TTTGACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
321 AGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * * ** * *
208696 ATTATTTATTTCAAAT-ATTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAACCAATTGTTTCTATTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACA
* *
208760 AGCTTATTCGAAATAAAATAATAT-TAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTT
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * *
208823 AAGAAATAAATTTGTTTACTGAGCAAGCTCAAATAGTTATGACTGGTTT-AACAATTATTTATTT
129 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-TTGTTTGAACAATTATTTATTT
* *
208887 CAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAA
193 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
208918 CTATTTGACA
Statistics
Matches: 3517, Mismatches: 778, Indels: 455
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
344 1 0.00
345 17 0.00
346 193 0.05
347 60 0.02
348 3 0.00
350 12 0.00
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357 382 0.11
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360 363 0.10
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363 120 0.03
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368 1 0.00
369 2 0.00
370 2 0.00
371 11 0.00
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373 38 0.01
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375 29 0.01
376 15 0.00
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Consensus pattern (361 bp):
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GCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAA
ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
AAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTT
ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
Found at i:208152 original size:718 final size:711
Alignment explanation
Indices: 204034--208917 Score: 3409
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204024 CCATTTCAAT
* * * * ** * * *
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* * *
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* * * * * *
204163 AAAAAATA-AATATGTTTACCAAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTGTATACTT
127 AAAAAA-AGAATCTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * **
204227 TAAATTGTTAT-AACATTT-TATTGTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
191 TAAATCGTTATGACCATTTGT-TT-TATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* ** * *
204290 AAATAAAATAATACTAATCCAATAATATTTTGAAAATCAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAA
254 AAATAAAATAATTCTAAT-TTATAATATTCT-AAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AAA
* * * * ** *
204355 T-TATTTT-TCGAACTAGTTCAAATAGCTA-AGACTATATGAAGTATTATCTATTTTAAATCATT
313 TCTATTTTCT-GAACAAGTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATT
* * *
204417 ATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATATTTTCAATTCATGCTAGCTTATTT-AGAATAAAATA
376 ATGACCTTT-GTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATA
* * * * *
204481 AAATAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT
438 ATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CT
* * * * * *
204546 AATC-AGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAGCATTTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
501 AAACAAGTTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTG
* * * * * * * *
204609 CTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCGTATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATCTAT
565 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * *
204674 TAATATTTCAAAAATTAATAAG--CA-ATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACT-GATTC-AA
630 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-AAACTAG-TTCAAA
* *
204734 -A-TTAAAACTATTT-AAGT
693 TAGTTATAACTATTTGAA-C
* * * * *
204751 AATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATTC
1 AATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACTATTTGTT-TGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * * * * * * ** *
204815 AAGCTTACTCGAATTAAAATAACACAAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATGT
64 TAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT-AAGGATTT
* * * *** * * * * *
204880 AAAAAAATAAATATGTATATTGAACTAGATT-AAACAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATT
127 AAAAAAA-GAATCTGTTTACCAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
204944 ATAAATCGTTATGACCTTTTCTTCTATCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTAGA
190 TTAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA
* * *
205009 AATAAAATAATAT-TAAGTTATTAATATTCTAAAAATTGATAACTAAGAGATTTAAAAAGTGAAT
255 AATAAAATAAT-TCTAATTTA-TAATATTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * * * * **
205073 CGGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAATAATTTTCTATTTGAAATCGCTA-G
314 CTATTTTCTGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * *
205137 AACCTTTTGCTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATCTCAAATAAAATAATA
379 -ACC-TTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA
* *
205202 CAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
441 TAAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
* *
205266 CAAGTTCAAATCAA--TATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTT
504 CAAGTTCAAA--AAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTT
* * *
205329 TTCTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTA
567 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTA
* * * * *
205394 ATATTTTGACAATTTATAAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATATGTTTAT---C---TT----T-G
632 ATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATAAACTAGTTCAAATAG
*
205448 ----AACTATTTGAAT
696 TTATAACTATTTGAAC
* * * *** *
205460 AATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCT-TTTGTTT-TATAATAAAATAATTGTTTCAATTTATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTATTTGTTTGT-T-ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
** * * *
205523 -TAAGCCCATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGAA
63 CT-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG-GAT
* * * * * *
205587 TTAAAAAAATGAATTTGCTTACC-AATCAAGTTGAAATAGTTATGACTATCT-AAGTAATTATCT
125 TTAAAAAAA-GAATCTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCT
* * ** * * *** * *
205650 A-TTTAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCTATTCATGCAAGCATATT
187 ATTTTAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-T
* * *
205714 TTG-AATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAGAAAATA
251 TTGAAATAAAATAAT-TCTAATTTA-TAATATTCTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATA
* * * * * *
205777 AAGCTATTTTCTGAATACGTTCAAATAGTTATGA-TATTTGAAATAATGATCTATTTCAAATCAT
311 AATCTATTTTCTGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAAA-AATTATCTATTTCAAATCAT
* * * **
205841 TATGACCATTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTGTTCAAACAAGATTATTTGGAATAAAAT
375 TATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAAT
* * *
205905 AAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT
437 AATAT-AAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT
* * * * * ** *
205969 GAGCCAGTTCAAATAGTTATGATTGCTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGT
501 AAACAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGT
* *
206034 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
566 TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * * *
206098 TAACATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCAGTTTACCAAACAAGTTCAAA
630 TAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TAAACTAGTTCAAA
* ** *
206163 TAGTCATGTCCATTTGAAC
693 TAGTTATAACTATTTGAAC
* * ** *
206182 TATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-TATTTTGTTTGGTCGTAAAAC-A-T-TTTTTGCTATTAT
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTA-TTTGTTT-GTTATAAAACAATTGTTTTTG-T-TCAT
* ** *
206243 ACAAAATTATTT-ATAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG--A-GAT
62 ACTAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGGAT
* ** * * * * * * *
206304 CTAAAAGCTA-AATCTCTTTACCAAACCAGTTTAAATATTTATAACTATTTAAACAACTATCTAT
125 TTAAAA-AAAGAATCTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
206368 CTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTC
189 TTTAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
* * *
206431 AAAGTGAAAT-ATTGTTAAGTTAATATTATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATA
254 AAA-TAAAATAATT-CTAA-TT--TATAATATTCTAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
206495 AATGTGTTTGT-TGATCTAG-CTCAA-AGTTAAAACTA-TTAAAATAATTATCTATTTCAAATCA
311 AATCTATTT-TCTGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAAA-AATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
206556 TTCTGACCTTT-TATTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTGTTCCAAAT-AA
374 TTATGACCTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATT-TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAA
* * * *
206618 ATAAT-TATAATTTATTAACAATCAGAAAATTAATGAGCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGGT
435 ATAATATA-AATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTT-GT
* * * * * ***
206681 TTAC-AGAATAAG-TCAAATAGTTTATGACTATTTTGAATAATTATATTATCTAAAATCAACTA-
496 TTACTA-AACAAGTTCAAAAAG-TTATGACTA-TTTGAACAATTAT-TTATTTCAAAT-TGTTAT
* * * ** * * * * ***
206743 GTACCTTTTTATTTTATCATTAAAACAATTGTTTCAGATCAGAAAAG-CTATCCCAAAT-AAATA
556 G-ATC-TTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATA
* * * *
206806 ATATTAACTTAATTTAATATTTTAAAAATTGATAATTTAAAGATTTACAAACAATAAATCAGTTT
618 ATATTAA-TTTA-TTAATATTTTAAAAATTAATAA-GTAAAGATTTA-AAA-AATAAATCTGTTT
* * ** *
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* * * * **
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1 AATT-ATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTATTTGTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * *
206972 TAGCCTGATTCGTAATAAAATGAATA-TAATTTAATTATATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGAG
64 TAG-CTTATTTGAAATAAAAT-AATACTAATTT-ATTA-ATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAG-G
* * * * *
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123 ATTTAAAAAAA-GAATCTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * * *
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187 ATTTTAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT
** * * *
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* * * ** * * * * * * * *
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310 AAATCTATTTT-CTGAACAAGTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATC
* * * ** * *
207281 GTTATGACATTTTGTTTTATTGTAAAATAATTTTT-TCAGTTCTTACTAA-CTTATTT-AGAATA
373 ATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCT-A-TTCATAC-AAGCTTATTTCA-AATA
* * *
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433 AAATAATATAAA-TTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG
* ** * * *
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495 TTTACTAAACAAGTTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAT
* * * *
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* *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * *
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* * *
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* ** * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * **
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1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTATTTG-TTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* *
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64 T-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG-GATT
* * * * * *
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* *
208529 TCAAATCGTTATGA-CA-TT-TTTTATGCCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT
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* * * * * *
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252 TGAAATAAAA-TAATTCTAATTTA-TAATATTCTAAAA---ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * *
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311 AATCTATTTTCTGAACAAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCA-T
* * *
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375 TATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAAT
* * *
208779 AATATTAA-TTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAGAAATAAATTTGTTTACT
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* * * * * *
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208907 TTTTGTCATAA
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208918 CTATTTGACA
Statistics
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* * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* ** * * * * * * * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * *
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* * *
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* * ** * * *
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** * *** * * * *
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* * * *
205430 T--A---A---A-T--AT--GTTT--AT-CTT-TGAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
251 TAAATCTATTTACTAAATAAGTTTAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATT
* * * * * ** * ** **
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315 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACT-AGCTTATTCAAAATAAA
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379 AT-A-ATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA-TGATTTAAAAAAA--AATATATTT
* ** * * * ** * * * * * * *
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* * * ** **
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* * *
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* * * * * * * * * *
205762 AAATTTTAGAAAATAAAGCTATTTTCTGAATACGTTCAAATAGTTATGA-TATTTGAAATAATGA
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* * * * *
205826 TCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTGTTCAAACAAGAT
123 TCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTATCATAAAAC-AATT-TTTCTATTCATACAAGCT
** * * * *
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205953 AATAAATTTGTTTACTGAGCCAGTTCAAATAGTTATGATTGCTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
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* * * * * ***
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* * *
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** * ** * * * * * * * *
206145 TTACCAAACAAGTTCAAATAG-TCAT-GTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-
436 TTACTGAACAAGTCCAAATAGATCATAAACTATTTAAACAACTATCAACTTCAAATCGTTATAAC
* ** * * * *
206207 TATTTTGTTTGGTCGTAAAAC-ATT-TTTTGCT
501 CA-TTTGTTTTATC-AAAAACAATTATATCGGT
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206302 ATCTAAAAGCTAAATCTCTTTACCAAACCAGTTTAAATATTTATAACTATTTAAACAACTATCTA
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* * * * * *
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206494 AAATGTGTTT-GTTGATCTAG-CTCAA-AGTTAAAACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCA
252 AAATCTATTTACTAAAT-AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTG
* * * * * * *
206556 TTCTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAC-ATGCTTGTTCCAAAT-AAA
316 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACTA-GCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * *
206619 TAATTATAATTTATTAACAATCAGAAAATTAATGAGCAA-GAAATTTAAAAAATAAATTTGGTTT
380 TAA-T-TAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAATG--ATTTAAAAAA-AAATAT-ATTT
* * * * * * * * * **
206683 ACAGAATAAGT-CAAATAGTTTAT-GACTATTTTGAATAATTAT-ATTA-TCTAAAATCAACTAG
438 ACTGAACAAGTCCAAATAGATCATAAACTA-TTTAAACAACTATCA--ACT-TCAAATC-GTTA-
* * * * * *
206744 T-ACCTTTTTATTTTATCATTAAAACAATTGTTTCAGA
497 TAACC-ATTTGTTTTATCA--AAAACAATTATATCGGT
* * *** * * * *
206781 TCAGAAAAGC-TATCCCAAAT-AAATAATATTAACTTAATTTAATATTTTAAAAATTGATAATTT
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* * * * * * *
206844 AA-AGATTTACAAACAATAAATCAGTTTATCAGATATC-AGTGTTAAATAATTATGGCCATTTGA
58 AAGAGATTTA-AAA-AATGAATCTGTTTA-CTGA-A-CAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTT-A
* * * * *
206907 ACATTTAATCTATTTCAAATCATTATGAACTTT-TTGTTGTCATAAAACAATTGTT-T-TTCATA
116 ACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTGTT-TTATCATAAAACAATTTTTCTATTC--A
* * * **
206969 TACTAGCCTGA-TTCGTAATAAAATGAATAT-AATTTAATTATATATTTTAAAAATTAATAAGTA
177 TACAAG-CTTATTTC-AAATAAAAT-AATATAAATTT-ATTA-ATATTCAAAAAATTAATAAGTA
** * * * * *
207032 GGAGATTTAAAAAAATAAAT-T-TGTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTG-----
237 AAAAATTT-TAAAAATAAATCTAT-TTA-CTAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * * *
207089 -----TATTTCAATTTCTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTTTGTTCAAACAAG
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* * * * * *
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* * * * * ** * * * * * * ** * *
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* * ** * * * *
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* * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * * * * *
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* *
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* *
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*
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* * ** * *
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* * * * *
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** *
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*
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AAACCCTAAAATCTAAACCTTAAACACTCAAAACCCTAAAAACG
Found at i:223201 original size:182 final size:180
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222786 NNNNNNTTAT
* * * * **
222796 TTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTCTTCAAATAATAATAAATTAGGATTATTTTATTTCAAATA
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* **** * * * * *
222858 AGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTAT-A-ATAA-AAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGAT
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* ** * * * * ** **
222920 AGTTGCTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGAGTCAATAAACTGATTTA
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* * *
222970 TTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTGAATTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATA
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * **
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66 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* * *
223097 AATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAGACACATTTA
131 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACACATTTA
* * * * *
223147 TTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACTATTATTTTA-TTTCAA
1 TTTTTT-AAATCTT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * * * *
223211 GTAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTCAAATA
64 -TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * **
223276 GATTATTATTCTAATACTCTTAACTATTTGAAC-TGATTTGACAAACACATTTA
128 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACACATTTA
* *
223329 TTTTTTAAATC---ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAACTTAGTATTATTTTA-TTTGAATA
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * * * * **
223390 AGCTTGCATGATC-AGAAACAACTATTTTATGAGAAGAC-AAAGATCATAACGATTTGATATTGA
66 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAA
* * * * * * * ** *
223453 TATTTGTTTAAATATTTTATAACTATTTGAACTGGTTTGAAAAAACAGCTTTTA
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* *
223507 GTTTTTGAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGAA-TAGTATTATTTTATTTTGA
1 TTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA--AATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * * *
223571 ATAAG-TTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACCAAAAGGTTATAATGGCTTT-AAA
63 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAA
* * * * * *
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126 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACACATTTA
* * * * * *
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1 TTT-TTTAAATC-TTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * * * * **
223753 ATAAGCTTGTATGAAGTTAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATA
63 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
223818 AATAATTGTTCTAACAGTCTTAAGTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAAATTTA
128 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACACATTTA
* * * * * * * ***
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1 TTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* ** * * * *
223936 AAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGCTTTATAACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAAATAA
65 AAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAA
* * * *
223999 ATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TTTGCGTAAATAGATTTA
129 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCG-GTAAACACATTTA
* * * * * ** * * * * * * *
224052 GTTTTCAAA--TAT-CTTTTTACTTTTCAAAATATTATTATATCAGAATAATTTTATTCTAAATA
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * *
224114 A-TTTGCATGAAC-AAAAGCAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATTAG
66 AGCTTGTATGAACTAAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAA
* * * * * *
224176 AGAATTATTCAAATGGGACATGGGACTA-TTGAACTTGTTCGCGTAAAAATATTTA
129 ATAATTATTCAAAT-AGTCAT--AACTATTTGAACTTGTTCG-GTAAACACATTTA
* * *
224231 TTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT-TTTTATTTTGAAT
1 TTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * *
224294 AAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTTATCACAAAACAAAAGATCATAACT-AGTTGAAAT
65 AAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAAT
* * * ***
224357 AAATAATTGGTTTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTATGCTTC-GT-AATTTATTTA
127 AAATAATT--ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TG-TTCGGTAAACACATTTA
*
224413 TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
1 TTTTTTAAA-TCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * * *
224477 ATGCTTGTAT-AACAAAAACAATTAGTTTATAATAAAACAAAAGGTCATGACT-ATTTAAAATAA
65 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAA
* * * * * * * * *
224540 ATAATTATTTAAAAAGTTATAATTATTTGAACATGTTCAGAAAATAAATTTA
129 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACACATTTA
* *
224592 TTTTTTAAAT-TTT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-CTTTGAAA
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AA
* *
224653 AAAGCTTGTATGAA-T---ACAATTATTTTATGACAAAAACAAAATGTCATAAT-AGTTTGGACA
64 TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGA-TTT-GA-A
* * * * * *
224713 AT-GATAACTGTTCAAATAGTCGTAAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-CAATTCA
125 ATAAATAATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAC-ATTTA
* * * * * * *
224769 TATTTTAAATCTCTTA-TACAATAATTTTTGAAAAATTATTCAATTAGTATTATTTTATTTTTAA
1 TTTTTTAAATCT-TTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* ** * * * *
224833 TAAGGC-TATATGAACCGATACAATT-GTTTATGACGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
64 TAA-GCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * *
224896 AATAACTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA
128 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACACATTTA
* * * * ** * * **
224949 TTTTTAAAATATTTACTTACTAATTGTCAAAATA-TAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATA
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * *
225013 AGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAAT
66 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAT
* * ** *
225078 AATTATTATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGT-AA-AGGTTTC
131 AATTA-T-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACACATTTA
* *
225128 CTTTTTAAATCTTTACTTA-TAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
1 TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
225183 ATTATTTCAA
Statistics
Matches: 1748, Mismatches: 364, Indels: 197
0.76 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 92 0.05
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Consensus pattern (180 bp):
TTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
AGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAT
AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACACATTTA
Found at i:223363 original size:18 final size:20
Alignment explanation
Indices: 223328--223366 Score: 55
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223318 AAACACATTT
*
223328 ATTTTTTAAATCACTTATTA
1 ATTTTTGAAATCACTTATTA
223348 ATTTTTGAAAT-A-TTATTA
1 ATTTTTGAAATCACTTATTA
223366 A
1 A
223367 CTTAGTATTA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
18 7 0.39
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Consensus pattern (20 bp):
ATTTTTGAAATCACTTATTA
Found at i:223938 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 223684--225108 Score: 448
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223674 CGATAAATAG
* * * * * ** *
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1 ATTTATTTGCTTAAATCTCTTACTCACTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* *** * * * *
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* * * *
223813 AAATAAATAATTGTTCTAACAGTCTTAAGTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAA
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* * *
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* *
223930 CCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAA
66 CCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAACAAAATAAAGATCAAAACAATTTGAA
* * * *
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* * * * *** * * * * *
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* * * * * * * * *
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64 ATCCAAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGCTTTATAACAAAATAAAGA-TCAAAACAATT
* * * ** * * * * *
224167 TGAAATTAGAGAATTATTCAAATGGGACATGGGACTA-TTGAACTTGTTCGCGTAAA-AA
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* * * * * *
224225 TATTTATTT-TTTAAATCTCCTAC-CTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTA
1 -ATTTATTTGCTTAAATCTCTTACTC-ACTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTA
* *** * * ** * * * * *
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64 ATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATT-GCTTTATAACAAAA-TAAAGATCAAAACAATT
* * * ***
224351 TGAAATAAATAATTGGTTTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTATGCTTC-GT-AATTT
127 TGAAATAAATAATT--CTTCAAACAGTCATAACTATTTGAA--ATGGTTCAGTAAACAA
* * * * * * * *
224408 ATTTATTT-TTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTGCTTAAATCTCTTACTCACTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAAT
*** * * * * ** *
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66 CCAAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATT-GCTTTATAACAAAA-TAAAGATCAAAACAATTT
* * * * * * * *
224533 AAAATAAATAATTATTTAAAAAGTTATAATTATTTGAACAT-GTTCAGAAAATAA
128 GAAATAAATAATTCTTCAAACAGTCATAACTATTTGAA-ATGGTTCAGTAAACAA
* * * * * * * **
224587 ATTTATTT-TTTAAAT-T-TT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTCTT
1 ATTTATTTGCTTAAATCTCTTACTCACTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAAT
** * * ** * * * * *
224648 TGAAAAAAGCTTGTATG---A-ATACAATTATTTTATGACAAAA-ACAAAATGTCATAATAGTTT
66 CCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAACAAAATA-AAGA--TCAAAACAATTT
* * * * * * * *
224708 GGACAAT-GATAACTGTTCAAATAGTCGTAAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACCA
128 -GA-AATAAATAATTCTTCAAACAGTCAT-AACTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAA
* * * ** * * *
224764 ATTCATATT--TTAAATCTCTTA-TACAATAATTTTTGAAAAATTATTCAATTAGTATTATTTTA
1 ATTTAT-TTGCTTAAATCTCTTACT-CACTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTA
* *** * ** * * * * *
224826 TTTTTAATAAGGC-TATATGAACCGATACAATTG-TTTATGACGAAACA-AAAGGTCATAACGAT
64 ATCCAAATAA-GCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAAC-AAA-ATAAAGATCAAAACAAT
* * * * * * * **
224888 TTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
126 TTGAAATAAATAATTCTTCAAACAGTCATAACTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAA
* * * *** *
224944 ATTTATTT--TTAAAATAT-TTACTTACTAATTGTCAAAAT-ATAATAAATTAATATTATTTTAA
1 ATTTATTTGCTT-AAATCTCTTACTCACTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAA
* * * * * * **
225005 TCCGAATAAGCTTGTAT-AAACAAAAACAATTGTTTTA-AGACAAAACAAAAAGTCATAATGATT
65 TCCAAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGCTTTATA-ACAAAATAAAGA-TCAAAACAATT
* *
225068 TGAAATAAATAATTATTATCAAATAGTCATAACTATTTGAA
127 TGAAATAAATAATT-CT-TCAAACAGTCATAACTATTTGAA
225109 CTTATTTGGT
Statistics
Matches: 964, Mismatches: 206, Indels: 147
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
172 1 0.00
173 2 0.00
174 18 0.02
175 9 0.01
176 75 0.08
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATTTATTTGCTTAAATCTCTTACTCACTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAAT
CCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAACAAAATAAAGATCAAAACAATTTGAA
ATAAATAATTCTTCAAACAGTCATAACTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAA
Found at i:224232 original size:542 final size:537
Alignment explanation
Indices: 222983--225110 Score: 1457
Period size: 542 Copynumber: 3.9 Consensus size: 537
222973 TTTAAATCTC
** * * * * ** *
222983 TTATTAATTTTTGAATTATTAATA-AAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA
1 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAA-TAGAATAATTTTATTCTAAATAAG-TTTCATGAACTA
* * * * * * * *
223047 AAACAATTATTTTATGACAAAA-TAAAAGGTCGTAAT-GATTTTAACTTGATAATTGTTCAAATA
64 AAACAATTGTTTTATAACAAAACCAAAAGGTCATAATCGATTTAAAC-AGAGAATTATTCAAATA
** * * *
223110 CTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAGACACATTTATTTTTTCAAATCTTATGCTTATTAATTT
128 GACA-AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAAACATTTATTTTTT-AAATCTTATGCTCATTAATTT
* *
223175 TTCA-AATGTTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAGTAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTAT
191 TT-AGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTAT
* * * ** * * * * * *
223239 TATATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTCAAATAGATTATTATTCTAATACTCTTAACTATT
253 TTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAACAGTCTTAACTATT
* * * * *
223304 TGAACTGATTTGACAAACACATTTATTTTTTAAA-TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
318 TGAAATGATTCG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTA
* * ** * * * *
223366 ACTTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGCATGATCAGAAACAACTAT-TTTATGAGAAGACA
382 AATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAA-T-TGTTTATAACAAAAAA
* ** * * * *
223429 AAGATCATAACGATTTGATATTGATATTTGTTTAAATATTTTATAACTATTTGAACTGGTTTGAA
445 AAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATA-GTTATAACTATTTGAACTAGTTTGAA
* ** *
223494 AAAACAGCTTTTAGTTTTTGAATCTCTTA
509 AAAACAGCATTTAGTTTTCAAATATCTTA
** * * * * * *
223523 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTATGAACTG
1 -TTATTAATTTTCAAAATATTAATA-GAATAGAATAATTTTATTCTAAATAAGTTTCATGAACTA
* * * * *
223588 AAACAATTGTTTTATGACAAAACCAAAAGGTTATAATGGCTTTAAACAGATAATTATTCAAATAG
64 AAACAATTGTTTTATAACAAAACCAAAAGGTCATAATCGATTTAAACAGAGAATTATTCAAATAG
* * * * * *
223653 TCAAATCTATTTCAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTGTTTAAATCTTTTGCTCATTAATTTT
129 ACAAA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAAAACATTTATTT-TTTAAATCTTATGCTCATTAATTTT
* * * * *
223718 TTGAATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAGTTAAATAATTGTTT
192 TAGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTT
*
223783 TATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAACAGTCTTAAGTATTTG
255 TATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAACAGTCTTAACTATTTG
* * * *
223848 AAATGGTTCAGTAAACAAATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATTTTATTAA
320 AAATGATTC-GTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAA
* *** *
223913 ATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAACAAAATAAA
383 ATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTG-TTTATAACAAAAAAAA
* * * * ***
223978 GATCATAACGATTTGAAATAAATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTTGCGTAA
447 GATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGAAAAA
*
224043 ATAG-ATTTAGTTTTCAAATATC-T-
512 ACAGCATTTAGTTTTCAAATATCTTA
* * *
224066 TT-TTACTTTTCAAAATATTATTA-TATCAGAATAATTTTATTCTAAATAA-TTTGCATGAAC-A
1 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAAT-AGAATAATTTTATTCTAAATAAGTTT-CATGAACTA
*
224127 AAAGCAATTGTTTTATAACAAAA-CAAAA-GTCATAA-CGATTTGAAATTAGAGAATTATTCAAA
64 AAA-CAATTGTTTTATAACAAAACCAAAAGGTCATAATCGATTT-AAA-CAGAGAATTATTCAAA
* * * *
224189 TGGGACATGGGACTA-TTGAACTTGTTCGCGTAAAAATATTTATTTTTTAAATCTCCTA-CCT-A
126 T-AGACA---AACTATTTGAACTTGTTCG-GTAAAAACATTTATTTTTTAAATCT--TATGCTCA
* * *
224251 TTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAAC
184 TTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAAC
* * * * * * *
224314 AATTATTTTTATCACAAAACAAAAGATCATAACTAGTTGAAATAAATAATTGGTTTCAAACAGTC
247 AATTA-TTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATT-G-TTCTAACAGTC
* * * *** *
224379 ATAACTATTTAAACTATGCTTCGT-AATTTATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTT-
309 TTAACTATTTGAA--ATGATTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TTCTTACTTATTAATTTTTG
* * *
224442 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTAT-AACAA-AAACAATTAGTTT
371 GAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATT-GTTT
* * * * * * *
224505 ATAATAAAACAAAAGGTCATGACTATTTAAAATAAATAATTATTTAAAAAGTTATAATTATTTGA
434 ATAACAAAA-AAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGA
* * * * *
224570 AC-ATGTTCAGAAAATA-A--ATTTATTTTTTAAAT-T-TTT
498 ACTA-GTT-TGAAAAAACAGCATTTAGTTTTCAAATATCTTA
** ** * * *
224606 TTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTTATATTATTTTCTT-TGAAAAAAGCTTGT-ATGAA-
1 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAATAGA-ATAATTTTATTCT-AAATAAG-TT-TCATGAAC
* * * * * ** * * *
224667 T---ACAATTATTTTATGACAAAAACAAAATGTCATAATAG-TTTGGACAATGATAACTGTTCAA
62 TAAAACAATTGTTTTATAACAAAACCAAAAGGTCATAATCGATTTAAAC-A-GAGAATTATTCAA
* * * * * * *
224728 ATAGTCGTAAACTATTTGAACTTGTTCAGT-AAACCAATTCATATTTTAAATCTCTTAT--ACAA
125 ATAGAC--AAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAAAC-ATTTATTTTTTAAA--TCTTATGCTCAT
** * * * * * *
224790 TAATTTTT-GAAAAATTATTCAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAGGC-TATATGAACCGATA
185 TAATTTTTAG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAA-GCTTGTATGAA-TGAAA
* * * * * * * *
224853 CAATT-GTTTATGACGAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGT-TA
246 CAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAACAGTCT-
* * * * * * * ***
224916 TGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATAT-TTACTTACTAATTGTCAAA
310 TAACTATTTGAA-ATGATTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TCTTACTTATTAATTTTTGGA
* * ** *
224980 ATA-TAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAT-AAACAAAAACAATTGTTT-TA
373 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTAT-
* *
225042 AGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTATCAAATAGTCATAACTATTT
436 A-ACAAAA-AAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAAATAATTATT-T-AAATAGTTATAACTATTT
225106 GAACT
496 GAACT
225111 TATTTGGTAA
Statistics
Matches: 1276, Mismatches: 231, Indels: 162
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (537 bp):
TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGAATAGAATAATTTTATTCTAAATAAGTTTCATGAACTAAA
ACAATTGTTTTATAACAAAACCAAAAGGTCATAATCGATTTAAACAGAGAATTATTCAAATAGAC
AAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAAACATTTATTTTTTAAATCTTATGCTCATTAATTTTTAGA
ATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTATTTTATGAC
TAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCTAACAGTCTTAACTATTTGAAATGA
TTCGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTAT
TATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTATAACAAAAAAAAGATCATAAC
GATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGAAAAAACAGCATTT
AGTTTTCAAATATCTTA
Found at i:225179 original size:357 final size:357
Alignment explanation
Indices: 222964--225182 Score: 1451
Period size: 357 Copynumber: 6.2 Consensus size: 357
222954 TCAATAAACT
* *
222964 GATTTATTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTGAATTATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTACTTA-TAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
** * * * * * * * *
223026 TGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCGTAATGATTTTAA
64 TAAATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* ** * * * * * *
223091 CTTGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAGACACATTTATTTTTTCAA
129 ATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AA
* * * * * * *
223156 ATCT-TATGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACTATTATTTTATTTC-AAGTAAGCTT
193 ATCTCT-TACTTACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAA-TAAGCTT
*** * * * * * * * * * *
223219 GTATGAACTGAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTCAAATAGATTATTA
256 GTAT-AAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTT
* * * * ** *
223284 TTCTAATACTCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAAACA
320 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTG-GTAATA
* * *
223323 CATTTATTTTTTAAATC---ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAACTTAGTATTATTTTATT-
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTACTTA-TAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * * * *
223384 TGAATAAGCTTGCATG-ATCAGAAACAACTATTTTATGAGAAGAC-AAAGATCATAACGATTTGA
64 TAAATAAGCTTGTATGAACCA-AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* ** * * * * * * ** ** *
223447 TATTGATATTTGTTTAAATATTTTATAACTATTTGAACTGGTTTGAAAAAACAGCTTTTAGTTTT
128 AATAAATAATTATTCAAATA-GTTATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACA-AATTTATTTTT
* * * * * **
223512 TGAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGAA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
190 TAAATCTCTTACTTACTAATTTTTAAAATATTAATA--AATTAATATTATTTTAATCCGAATAAG
* *** * * * * *
223576 -TTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACCAAAAGGTTATAATGGCTTT-AAACAGAT
253 CTTGTAT-AAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAAGTCATAAT-GATTTGAAATAAAT
* * * * *
223639 AATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTCGATAAATA
315 AATTTTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTATTTGGT-AATA
* * * *
223683 GATTTATTTGTTTAAATCTTTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGTATTATTTTAT
1 GATTTATTT-TTTAAATC-TTTACTTA-TAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
*** * * * * *
223748 TCTAAATAAGCTTGTATGAAGTTAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTG
62 TCTAAATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * * *
223813 AAATAAATAATTGTTCTAACAGTCT-TAAGTATTTGAAATGGTTCAGTAAACAAATTTATTTCTT
127 AAATAAATAATTATTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT
** * * *
223877 AAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATTTTATTAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTT
191 AAATCTCTTACTTACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTT
* * * * * * *
223942 GTATGAAAAGAAACAATTGCTTTATAACAAAATAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAAATAATTC
256 GTAT-AAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTT
224006 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTTTGCGTAAATA
320 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTG-GT-AATA
* * * * ** * * * * *
224046 GATTTAGTTTTCAAATATCTT--TT-TACTTTTCAAAATATTATTATATCAGAATAATTTTATTC
1 GATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* *
224108 TAAATAA-TTTGCATGAA-CAAAAGCAATTGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGA
64 TAAATAAGCTTGTATGAACCAAAA-CAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * ** * *
224170 AATTAGAGAATTATTCAAATGGGACATGGGACTA-TTGAACTTGTTCGCGTAAA-AATATTTATT
128 AA-TAAATAATTATTCAAAT-AGTTAT--AACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACAA-ATTTATT
* * * * * * **
224233 TTTTAAATCTCCTACCTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTATTTTGAATAA
187 TTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAA
* * * * * *
224296 ACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTTATCACAAAAC-AAAAGATCATAACT-AGTTGAAATAA
252 GCTTGTAT-AAAAAAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATAA
* * * *
224359 ATAATTGGTTTCAAACAGTCATAACTATTTAAAC-TATGCTTCGTAATT
313 ATAATT--TTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAT--TTGGTAATA
* * *
224407 TATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 GATTTATTTTTTAAA-TCTTTACTTA-TAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * *
224472 TGAATATGCTTGTAT-AACAAAAACAATTAG-TTTATAATAAAACAAAAGGTCATGACTATTTAA
64 TAAATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATT-GTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * *
224535 AATAAATAATTATTTAAAAAGTTATAATTATTTGAACATGTTCAGAAAATAAATTTATTTTTTAA
128 AATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * * ** *
224600 AT-T-TT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTT-CTTTGAAAAAAGCTTG
193 ATCTCTTACTTACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCG-AATAAGCTTG
* * * * * *
224661 TAT---GAATACAATTATTTTATGACAAAAACAAAATGTCATAAT-AGTTTGGACAAT-GATAAC
257 TATAAAAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAAGTCATAATGA-TTT-GA-AATAAATAAT
* * * **
224721 TGTTCAAATAGTCGTAAACTATTTGAACTTGTTCAGTAA-A
318 TTTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTATTTGGTAATA
* * * * * * *
224761 CCAATTCATATTTTAAATCTCTTA-TACAATAATTTTTGAAAAATTATTCAATTAGTATTATTTT
1 --GATTTATTTTTTAAATCT-TTACT--TATAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * *
224825 ATTTTTAATAAGGC-TATATGAACCGATACAATTG-TTTATGACGAAACAAAAGGTCATAACGAT
60 ATTCTAAATAA-GCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * **
224888 TTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTT
124 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTT
* * * *
224953 TAAAATAT-TTACTTACTAATTGTCAAAATA-TAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGC
189 TTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGC
*
225016 TTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
254 TTGTATAAA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAAT
225081 TATTATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAA-A
318 T-TT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAATA
* ** *
225122 GGTTTCCTTTTTAAATCTTTACTTATAATTGTCTGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
1 GATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATAATT-TTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
225183 ATTATTTCAA
Statistics
Matches: 1461, Mismatches: 308, Indels: 184
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
355 29 0.02
356 73 0.05
357 236 0.16
358 180 0.12
359 224 0.15
360 168 0.11
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362 119 0.08
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
GATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
AATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
AAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
TCTTACTTACTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATA
AAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAA
TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAATA
Found at i:225284 original size:107 final size:104
Alignment explanation
Indices: 225077--225289 Score: 238
Period size: 104 Copynumber: 2.0 Consensus size: 104
225067 TTGAAATAAA
* ** *
225077 TAATTATTATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAAGGTTTCCTTTTTAAATCTTT
1 TAATTATTATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACATTTCATTTTTAAATCTTT
*
225142 ACTTATAATTGTCTGAATATTAATAAATTTATATTATTT
66 ACTTATAATTGTCTGAATATTAATAAATGTATATTATTT
* * *
225181 TAATTATT-TCAAATAGTACATAATTATTTGAA-TTGGTTTGATAAACATATTTATTTTTAGAAT
1 TAATTATTATCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTT-ATTTGATAAACAT-TTCATTTTTA-AAT
*
225244 CTCTTACTTATTACTT-T-TGAAATATTAATAAA-GTAGTATTATTT
62 CT-TTACTTA-TAATTGTCTG-AATATTAATAAATGTA-TATTATTT
225288 TA
1 TA
225290 TTTCAAATAA
Statistics
Matches: 92, Mismatches: 9, Indels: 13
0.81 0.08 0.11
Matches are distributed among these distances:
103 11 0.12
104 30 0.33
105 8 0.09
106 9 0.10
107 30 0.33
108 4 0.04
ACGTcount: A:0.36, C:0.08, G:0.08, T:0.49
Consensus pattern (104 bp):
TAATTATTATCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGATAAACATTTCATTTTTAAATCTTT
ACTTATAATTGTCTGAATATTAATAAATGTATATTATTT
Done.