Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168048.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_3, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
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ACGTcount: A:0.33, C:0.17, G:0.17, T:0.33
Warning! 139000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 190
Found at i:574 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 54--1458 Score: 1093
Period size: 181 Copynumber: 7.8 Consensus size: 179
44 GATAACTAAC
* * * *
54 TATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTGATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTAT
** * ** *
119 TTCATTAAAATAATAGAAATCTATATTAATATTTCAAAAATTAATACGTAGCAAA-ATTTAAAAA
66 TAGAATAAAATAATACTAAT-T-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA--AAAGATTTAAAAA
* * * ** *
183 ATAAGA-TTATTTACCGAATATGTTTAAATAGTTATATGTATTAGAATAATTATT
127 ATAA-ATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATACCTATT-GAAAAATTATT
* * * * * * *
237 TATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTTGTGATAAAATAATTGTTTCTATTTATACAAACTCTT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC-AA-GCTT
** * * *
302 ATTTCAA-AAAA-AA-ATTAAATTTATTAA-AGTTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
64 ATTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * ** * * *
363 TAAATGTGTTTACTGAATATGTTCAAATAGTTTTACCTAGTTGAAAAATTATC
128 TAAATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATACCTA-TTGAAAAATTATT
* * * * * * * * *
416 AATATCAAATTATTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTAT
* * * *
481 TCAGAATTAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAGAAGATTTAAAAAATA
66 T-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
*** * * * * * *
546 AATTTATTTATTTAACAAATTTAAATAGTTATACATATTTAAACAATTATC
130 AATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATACCTATTGAAA-AATTATT
* * * * * *
597 TATATCTAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTATCATATAACAATTGTTTCTACTCATATAAGCCTT
1 TATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG-CTT
* * * * * * *
661 -TTGGATTAAAGTAATACTAATATATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAACATATTTAAAAAAT
64 ATTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* * * *** *
725 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCATATAGTTATGTTTATTTGAACAATTATT
129 AAATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATACCTA-TTGAAAAATTATT
** * * * *
777 TAGATCAAATCCTTATGATCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTA
* * * * *
841 TTCAAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAATTAAAAGATTCAAAAAC
65 TT-AGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
906 T-AATCTGTTTA-CAAATAAGTTCAAATATTTAT-CACTATTTGGACAACTAAT
128 TAAATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAC-CTA-TTGAAAAATTATT
* * * * * * *
957 TATTTAAAATCAATATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAATT-TTTTTCTTCATACAAACTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA
** * * * *
1021 TTAG-GGAAAAT--TACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAAAATACTTAAAAAATA
65 TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
** * * * * *
1083 AATTTGCTT-CCTGAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTACTATT
130 AATTTATTTACC-AAATAAGTTCAAATAGTTATACCTATTGAAA-AATTATT
* * ** * * * * * **
1134 TATTTTATATTGTTATAACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAATTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTAT
* * * *
1199 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTTATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAATATA
66 TAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
1264 AATTTGTTTATCAAACAAATTCAAATACTTTTGA-CTATTTGAACAATTATA
130 AATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAT-ACCTA-TTGAAAAATTATT
* * *
1315 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTCATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAG
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-
* * * * * * *
1380 TTGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAACTAAAAGA-ATAAAATATA
65 TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
*
1444 AAATTATTTACCAAA
130 AATTTATTTACCAAA
1459 CATCACTACA
Statistics
Matches: 975, Mismatches: 210, Indels: 77
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 42 0.04
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Consensus pattern (179 bp):
TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTAT
TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
ATTTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATACCTATTGAAAAATTATT
Found at i:2232 original size:64 final size:65
Alignment explanation
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2150 GCCGAACTCG
** * *
2160 CCTTCAATAAT-CAAATTAATAAATTTTTA-GTTTGGATTATTAAAGGTGATTTTTGTT-AAAAA
1 CCTTCAATAATCCAAA-TAATAAATTTGAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTT-TTCAAAAA
2222 CA
64 CA
* *
2224 CCTTCAATAATCCACATAATAAATTTGAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTTTTCAAAAATA
1 CCTTCAATAATCCAAATAATAAATTTGAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTTTTCAAAAACA
2289 CCTTCAATAA
1 CCTTCAATAA
2299 CATTTTGTTA
Statistics
Matches: 66, Mismatches: 6, Indels: 5
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
64 24 0.36
65 42 0.64
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Consensus pattern (65 bp):
CCTTCAATAATCCAAATAATAAATTTGAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTTTTCAAAAACA
Found at i:2471 original size:61 final size:63
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Indices: 2398--2543 Score: 170
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2388 TTTTTGGCCG
* * *** **
2398 AAAATACCTTCAATAATCCATTCAATTAATTTTTAGTTGGTATTATTGAAGGTGATTTTT-T-
1 AAAATGCCTTCAATAATCCATTCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTA
* * * *
2459 TAAATGCCTTCAATAATCAAATCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGGTTTTTGTCA
1 AAAATGCCTTCAATAATCCATTCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGT-A
2523 AAAATGCCTTCAATAATCCAT
1 AAAATGCCTTCAATAATCCAT
2544 ACACAATATT
Statistics
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0.80 0.16 0.04
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AAAATGCCTTCAATAATCCATTCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTA
Found at i:3354 original size:61 final size:63
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3273 TTTTTGGCTG
* * *** **
3283 AAAATACCTTCAATAATCCATTCAATTAATTTTTAGTTGGTATTATTGAAGGTGATTTTT-T-
1 AAAATGCCTTCAATAATCCATTCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTA
* *
3344 TAAATGCCTTCAATAATCCAATCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTCA
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3408 AAAATGCCTTCAATAATCCAT
1 AAAATGCCTTCAATAATCCAT
3429 ACACAATATT
Statistics
Matches: 71, Mismatches: 11, Indels: 3
0.84 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
61 51 0.72
62 1 0.01
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AAAATGCCTTCAATAATCCATTCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTA
Found at i:3481 original size:885 final size:884
Alignment explanation
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Period size: 885 Copynumber: 2.0 Consensus size: 884
1755 GGCAAACAAC
1765 GCCTTCAATAATCCTCTCATAAAAAAATCTAAGCGATTATTTAAAGCATTTTCTATAAGAAATGC
1 GCCTTCAATAATCCTCTCATAAAAAAATCTAAGCGATTATTTAAAGCATTTTCTATAAGAAATGC
* *
1830 CTTTATAATTCCACCAAAAAATTTTACAGGCTTATTGAAGGCGTTTTTGGTCAAAAACGCCTTCA
66 CTTTATAATTCCACCAAAAAATTTCACAGGCTTATTGAAGGCATTTTTGGTCAAAAACGCCTTCA
*
1895 ATAAATATCATATCAAAATTTTATGATTGTACAGATGTTAACCATAAGGTGGTAGGTTTCATCCC
131 ATAAATATCATATCAAAATTTTACGATTGTACAGATGTTAACCATAAGGTGGTAGGTTTCATCCC
1960 TCCCTTTAGCCTTTTTTAGGTTTTTGCAGAGATTATTTGTAATTAATTATTCTAGGCATTTTTTG
196 TCCCTTTAGCCTTTTTTAGGTTTTTGCAGAGATTATTTGTAATTAATTATTCTAGGCATTTTTTG
2025 TGTAAAAACTCCTTCACCAATTGCTTTAAAAATTTTTGGAGAGAATATTGAAGGTGTTTTTGGTA
261 TGTAAAAACTCCTTCACCAATTGCTTTAAAAATTTTTGGAGAGAATATTGAAGGTGTTTTTGGTA
* * * *
2090 GAGAAATGCCCTTAATAATCTATAGAAAAAATATTAAACCGATTCTTGAAGGCGTTTTTAGCCGA
326 GAGAAACGCCCTTAATAATCCATAAAAAAAATATTAAACCGATTCTTGAAGGCGTTTTTAGCCAA
2155 ACTCGCCTTCAATAATCAAATTAATAAATTTTTAGTTTGGATTATTAAAGGTGATTTTTGTTAAA
391 ACTCGCCTTCAATAATCAAATTAATAAATTTTTAGTTTGGATTATTAAAGGTGATTTTTGTTAAA
* *
2220 AACACCTTCAATAATCCACATAATAAATTTGAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTTTTCAAA
456 AACACCTTCAATAATCCACACAATAAATTTAAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTTTTCAAA
*
2285 AATACCTTCAATAACATTTTGTTATGGATTCTTCAAGACATTTTCGACAGAAAAATGCCCTTAAT
521 AATACCTTCAATAACATTTTGTTATGGATTATTCAAGACATTTTCGACAGAAAAATGCCCTTAAT
** *
2350 AATCTATATGAAAAATATGGAATGGACTGTTAAAGGCATTTTTGGCCGAAAATACCTTCAATAAT
586 AATCTATACAAAAAATATGGAATGGACTATTAAAGGCATTTTTGGCCGAAAATACCTTCAATAAT
2415 CCATTCAATTAATTTTTAGTTGGTATTATTGAAGGTGATTTTTTTAAATGCCTTCAATAATCAAA
651 CCATTCAATTAATTTTTAGTTGGTATTATTGAAGGTGATTTTTTTAAATGCCTTCAATAATCAAA
*
2480 TCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGGTTTTTGTCAAAAATGCCTTCAATAATCCATA
716 TCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTCAAAAATGCCTTCAATAATCCATA
* *
2545 CACAATATTTGGAACGGATATTTGAAGGCGTTTTTATCCCAACACGCCTTTATTATTACACACAA
781 CACAATATTTGGAACAGATATTTGAAGGCGTTTTTATCCCAAAACGCCTTTATTATTACACACAA
*
2610 TATATTTTTAGGTGATGATTATTGAAGGCGTTTTTGGTAT
846 TA-ATTTTTAAGTGATGATTATTGAAGGCGTTTTTGGTAT
* *
2650 GCCTTCAATAATCCTCTCATAAAAAAATCTAAGCGATTATTTAAGGCGTTTTCTATAAGAAATGC
1 GCCTTCAATAATCCTCTCATAAAAAAATCTAAGCGATTATTTAAAGCATTTTCTATAAGAAATGC
*
2715 CTTTATAATTCCACCAAAAAATTTCACAGGCTTATTGAAGGCATTTTTGGTCAAAAACGCCTTTA
66 CTTTATAATTCCACCAAAAAATTTCACAGGCTTATTGAAGGCATTTTTGGTCAAAAACGCCTTCA
*
2780 ATAAATATCATATCAAAATTTTACGATTGTACGGATGTTAACCATAAGGTGGTAGG-TTCGATCC
131 ATAAATATCATATCAAAATTTTACGATTGTACAGATGTTAACCATAAGGTGGTAGGTTTC-ATCC
* * *
2844 CTCCTTTTAGCCTTTTTTAGGTTTTTGCAGAGATTATTTGTAATTGATTATTCTAGGTATTTTTT
195 CTCCCTTTAGCCTTTTTTAGGTTTTTGCAGAGATTATTTGTAATTAATTATTCTAGGCATTTTTT
* *
2909 GTGTAAACACTCCTTCACCAATTGCTTTAAAAATTTTTGGAGAGAATATTGAAGGTGTTTTTTGT
260 GTGTAAAAACTCCTTCACCAATTGCTTTAAAAATTTTTGGAGAGAATATTGAAGGTGTTTTTGGT
2974 AGAGAAACGCCCTTAATAATCCATAAAAAAAATATTAAACCGATTCTTGAAGGCGTTTTTAGCCA
325 AGAGAAACGCCCTTAATAATCCATAAAAAAAATATTAAACCGATTCTTGAAGGCGTTTTTAGCCA
**
3039 AACTCGCCTTCAATAATCCGATTAATAAATTTTTAGTTTGGATTATTAAAGGTGATTTTTGTTAA
390 AACTCGCCTTCAATAATCAAATTAATAAATTTTTAGTTTGGATTATTAAAGGTGATTTTTGTTAA
* * *
3104 AAATACCTTCAATAATCCACACAATAAATTTAAATGGTTGGTTTATTAAAGGCGATTTTTTTCAA
455 AAACACCTTCAATAATCCACACAATAAATTTAAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTTTTCAA
*
3169 AAATACCTTTAATAACATTTTGTTATGGATTATTCAAGACATTTTCGACAGAAAAATGCCCTTAA
520 AAATACCTTCAATAACATTTTGTTATGGATTATTCAAGACATTTTCGACAGAAAAATGCCCTTAA
* *
3234 TAATCTCTACAAAAAATATGGAATGGACTATTAAAGGCATTTTTGGCTGAAAATACCTTCAATAA
585 TAATCTATACAAAAAATATGGAATGGACTATTAAAGGCATTTTTGGCCGAAAATACCTTCAATAA
*
3299 TCCATTCAATTAATTTTTAGTTGGTATTATTGAAGGTGATTTTTTTAAATGCCTTCAATAATCCA
650 TCCATTCAATTAATTTTTAGTTGGTATTATTGAAGGTGATTTTTTTAAATGCCTTCAATAATCAA
3364 ATCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTCAAAAATGCCTTCAATAATCCAT
715 ATCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTCAAAAATGCCTTCAATAATCCAT
* * *
3429 ACACAATATTTGGAATAGAT-TCTTGAAGGCGTTTTTGTCCCAAAATGCCTTTATTATTACACAC
780 ACACAATATTTGGAACAGATAT-TTGAAGGCGTTTTTATCCCAAAACGCCTTTATTATTACACAC
*
3493 AATAATTTTTAAGTGGTGATTATTGAAGG
844 AATAATTTTTAAGTGATGATTATTGAAGG
3522 TAATTTTGGT
Statistics
Matches: 831, Mismatches: 39, Indels: 5
0.95 0.04 0.01
Matches are distributed among these distances:
884 27 0.03
885 804 0.97
ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.14, T:0.38
Consensus pattern (884 bp):
GCCTTCAATAATCCTCTCATAAAAAAATCTAAGCGATTATTTAAAGCATTTTCTATAAGAAATGC
CTTTATAATTCCACCAAAAAATTTCACAGGCTTATTGAAGGCATTTTTGGTCAAAAACGCCTTCA
ATAAATATCATATCAAAATTTTACGATTGTACAGATGTTAACCATAAGGTGGTAGGTTTCATCCC
TCCCTTTAGCCTTTTTTAGGTTTTTGCAGAGATTATTTGTAATTAATTATTCTAGGCATTTTTTG
TGTAAAAACTCCTTCACCAATTGCTTTAAAAATTTTTGGAGAGAATATTGAAGGTGTTTTTGGTA
GAGAAACGCCCTTAATAATCCATAAAAAAAATATTAAACCGATTCTTGAAGGCGTTTTTAGCCAA
ACTCGCCTTCAATAATCAAATTAATAAATTTTTAGTTTGGATTATTAAAGGTGATTTTTGTTAAA
AACACCTTCAATAATCCACACAATAAATTTAAATGGTTGGATTATTAAAGGAGATTTTTTTCAAA
AATACCTTCAATAACATTTTGTTATGGATTATTCAAGACATTTTCGACAGAAAAATGCCCTTAAT
AATCTATACAAAAAATATGGAATGGACTATTAAAGGCATTTTTGGCCGAAAATACCTTCAATAAT
CCATTCAATTAATTTTTAGTTGGTATTATTGAAGGTGATTTTTTTAAATGCCTTCAATAATCAAA
TCAATAAATTTTTAACAGAAATTATTGAAGGTGATTTTTGTCAAAAATGCCTTCAATAATCCATA
CACAATATTTGGAACAGATATTTGAAGGCGTTTTTATCCCAAAACGCCTTTATTATTACACACAA
TAATTTTTAAGTGATGATTATTGAAGGCGTTTTTGGTAT
Found at i:8518 original size:34 final size:34
Alignment explanation
Indices: 8480--8604 Score: 128
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8470 GACATCTCAA
* * *
8480 AGATACAAACACCGCTAAAATAATAGCATTTTCT
1 AGATACAAACACCACTAATATAGTAGCATTTTCT
* ** *
8514 AGATATAAATGCCACTAATATAGCAGCATTTT-T
1 AGATACAAACACCACTAATATAGTAGCATTTTCT
*
8547 CAGATACAAATACCACTAATATAGT-GCCATTTTCT
1 -AGATACAAACACCACTAATATAGTAG-CATTTTCT
* *
8582 AGATTCAAACACCGCTAATATAG
1 AGATACAAACACCACTAATATAG
8605 CGGCGTTTTC
Statistics
Matches: 75, Mismatches: 13, Indels: 6
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
33 2 0.03
34 72 0.96
35 1 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.20, G:0.10, T:0.29
Consensus pattern (34 bp):
AGATACAAACACCACTAATATAGTAGCATTTTCT
Found at i:8600 original size:68 final size:68
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8470 GACATCTCAA
* * **
8480 AGATACAAACACCGCTAAAATAATAGCATTTTCTAGATATAAATGCCACTAATATAGCAGCATTT
1 AGATACAAATACCACTAAAATAATAGCATTTTCTAGATATAAACACCACTAATATAGCAGCATTT
*
8545 TTC
66 TCC
* * * * *
8548 AGATACAAATACCACTAATATAGT-GCCATTTTCTAGAT-TCAAACACCGCTAATATAGCGGCGT
1 AGATACAAATACCACTAAAATAATAG-CATTTTCTAGATAT-AAACACCACTAATATAGCAGCAT
8611 TTTCC
64 TTTCC
*
8616 ACATACAAAT
1 AGATACAAAT
8626 GTCACTATTT
Statistics
Matches: 65, Mismatches: 11, Indels: 4
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
67 2 0.03
68 63 0.97
ACGTcount: A:0.39, C:0.21, G:0.11, T:0.29
Consensus pattern (68 bp):
AGATACAAATACCACTAAAATAATAGCATTTTCTAGATATAAACACCACTAATATAGCAGCATTT
TCC
Found at i:8614 original size:34 final size:35
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Indices: 8480--8624 Score: 118
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8470 GACATCTCAA
* * ***
8480 AGATACAAACACCGCTAAAATAATAGCATTTTCT-
1 AGATACAAACACCACTAATATAGCGGCATTTTCTC
* ** *
8514 AGATATAAATGCCACTAATATAGCAGCATTTT-TC
1 AGATACAAACACCACTAATATAGCGGCATTTTCTC
* * *
8548 AGATACAAATACCACTAATATAGTGCCATTTTCT-
1 AGATACAAACACCACTAATATAGCGGCATTTTCTC
* * *
8582 AGATTCAAACACCGCTAATATAGCGGCGTTTTC-C
1 AGATACAAACACCACTAATATAGCGGCATTTTCTC
*
8616 ACATACAAA
1 AGATACAAA
8625 TGTCACTATT
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 20, Indels: 6
0.77 0.18 0.05
Matches are distributed among these distances:
33 1 0.01
34 86 0.98
35 1 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.21, G:0.11, T:0.28
Consensus pattern (35 bp):
AGATACAAACACCACTAATATAGCGGCATTTTCTC
Found at i:9197 original size:181 final size:180
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Indices: 8767--10729 Score: 1570
Period size: 181 Copynumber: 10.9 Consensus size: 180
8757 TGTAGTGCAT
* * * * ** * * *
8767 GTTCGAATAATTATGACAATTTTAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGGCATTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
8832 ATAAAATATTTGTTTTTGCTTATACATGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTGATTTATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * *
8896 TCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTTAAAACATAATTTTTTTTA-CTAAATAA
131 TCAAAAATTAATAAGTA-AAAGATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAA-AA
* * *
8947 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTTTTTAAAATAC-TTATGACCTTTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-CGTTATGACCTTTTGTTTTGT
9011 CATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC-AATTTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA
9075 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTCAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
* * * * ** * *
9128 ATTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAAATTGTTA-GAAGGTTTTATTTTAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTTGTTTTGT
* * ** *
9192 CATAAAACAATTGTTTCTAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAATAGTA-TAAATTTATTAA
65 CATAAAACAATTGTTT-TTGTTTATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACT-AATTTATTAA
* * *
9255 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-AGTT----GA-AAA--TG----CCGAACAT
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
* * * ** * * *
9298 GTTCAAATTGCTATGACAATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACATTTTTTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * **
9363 ATAAAACAATTGTTTTTGCTTATGCAATATTATTTGAAATACAATAATGTTAATTTATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** **
9428 TCAAAAGTTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-TTAAATAA
131 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAA-AA
* * * * *
9479 TTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATATATATATATCAAATCGTTATGACCATTTGTTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-T-TAT-T-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * * *
9544 TATCATAAAATAACTATTTTTGTTTGTACAAACTTCTTTGAAATAAAAAAAATACTAATTTATTA
62 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
9609 ATATTTCACAAATTAATTAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTAGCGAATAA
126 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
* * * * * * * * * *
9665 GTACAAATATTTAT-ATTAATTAGAATAACTATTCATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
9729 CACAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAATCTTTTTTGAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATTT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
9794 TTCAAAAATTAATAA-TTAAAGATTTAAAAATAAGTCTGTTTACTGAACAA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
* * * **
9844 GTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCAATTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
9909 ATAAAAATAATT-ATTTTGTTCATACAACCTTAATCTG-AATAAAATATTA-TAAATTTATTAAT
66 AT-AAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * *
9971 ATTTTAAAAATTAGTTATTAAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAA
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
* ** * * *
10025 TTTCAAATAACTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * ** * * *
10090 ATAAAATAATTATTTCTGCTTGTACAAATTTATTCTG-AATAAAATAATACAAATCTATTAAAAT
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * **
10154 TTTGAATATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAGTAAATATGTTTTTC-AAATAA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAA-AA
* * * * ** *
10206 GTTCAAAAAGTTATAACTATTTGAACAATTATATAATTCAAATCAG-TATGACC-TTTACTTTAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
10269 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGTTTATTGGAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATTT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** *
10334 TTTAAAAATTAATAAATAAAAGAATTAAAAAATAAAT-TGTTTATGGAACAA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
* * * * * * * * ** *
10385 -TTCAAATAGTTATTACTATTTAAAACAAATATCTATTTTAAGTTGTTACGATATTTTATTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
10449 CATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAACACTAATATATAAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
10513 TTTCAAAAATTATTAAGTAAAAGAATTTAAAAAATATAAT-TATTTATC-AAACAT
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-A-TTAAAAAATA-AATCTGTTTACCGAAA-AA
* * ** * * * *
10567 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAACTATCCATTTGAAATTGTTATAATAC-TTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGT
** *
10631 CATAAAACAATCATTTTT-TATTATACAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGT-TTATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
10694 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATATAAAAAATA
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TAAAAAATA
10730 GTTATGACTA
Statistics
Matches: 1425, Mismatches: 297, Indels: 121
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 40 0.03
170 89 0.06
171 1 0.00
174 3 0.00
175 3 0.00
176 3 0.00
177 1 0.00
178 21 0.01
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184 3 0.00
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186 80 0.06
187 2 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAAAA
Found at i:10089 original size:360 final size:358
Alignment explanation
Indices: 8883--10729 Score: 1502
Period size: 360 Copynumber: 5.1 Consensus size: 358
8873 AAATATACTG
* * * **
8883 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAAT-TTTAAAACATAATTTTTTTTACTAAATAA
1 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAATATTTAAAAAATAA-ATTGTTTACCGAATAA
* * * *
8947 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT-TTTTTTAAAAT-ACTTATGACCTTTTGTTTTG
64 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTT-AAATCA-TTATGACCTTTTATTTTG
* *
9010 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC-AATTTTATTAAT
127 TCATAAAACAATTGTTTTTG-TTATACAATCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAAT
* * * *
9074 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTCAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAA-AAATTCAAAGAG
190 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT-TAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAATAAGTTCAAATAG
* ** ***
9138 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATGTCAAATTGTTA-GAAGGTTTTATTTTATCATAAAACAA
253 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATG-ACCATTTATTTTATCATAAAACAA
* * * *
9202 TTGTTTCTAG-TCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAAATAGTATAA
317 TTATTT-T-GTTCATACAA-CTTAATCTGAAAT-AAAATAATATAA
* * * *
9246 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-AGTT----GA-AAA-TG----CCGAACATGT
1 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTGTTTACCGAATAAGT
* * * * * * * *
9300 TCAAATTGCTATGACAATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACATTTTTTTTTGTCAT
66 TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT
* * * * **
9365 AAAACAATTGTTTTTGCTTATGCAATATTATTTGAAATACAATAATGTTAATTTATTAATATTTC
131 AAAACAATTGTTTTTG-TTATACAATCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * ** * * *
9430 AAAAGTTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATTAAATAATTTTAAATAGTTATGA
195 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
9495 TTATTTGAATAATTATATATATATATCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAATAACTA
259 CTATTTGAACAATTAT-T-TAT-T-TCAAATCATTATGACCATTTATTTTATCATAAAACAATTA
** * * *
9560 TTTTTGTTTGTACAAACTT-CTTTGAAATAAAA-AAAATACTA
320 -TTTTGTTCATAC-AACTTAATCTGAAATAAAATAATATA--A
* * *
9601 ATTTATTAATATTTCACAAATTAATTAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTAGCGAATAAG
1 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCGAATAAG
* * * * * *
9666 TACAAATATTTAT-ATTAATTAGAATAACTAT-TCATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCT-ATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT
* * *
9729 CACAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAATCTTTTTTGAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATTT
128 CATAAAACAATTGTTTTTGTT-ATACAATCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
9794 TTCAAAAATTAATAA-TTAAAGATTTAAAAATAAGTCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTT
192 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
9858 GATTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCAATTGTTTTGTCATAAAAATAATTAT
257 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTTATCAT-AAAACAATTAT
*
9923 TTTGTTCATACAACCTTAATCTG-AATAAAATATTATAA
321 TTTGTTCATACAA-CTTAATCTGAAATAAAATAATATAA
* * * * *
9961 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTTATTAAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAT
1 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCGAATAAG
** * *
10026 TTCAAATAACTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
* * * * * * * *
10091 TAAAATAATTATTTCTGCTTGTACAAAT-TTATTCTG-AATAAAATAATACAAATCTATTAAAAT
130 TAAAACAATTGTTTTTG-TTATAC-AATCTT-TTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
10154 TTTGAATATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAGTAAATATGTTT-TTCAAATAAGTTCAAAAAGTT
192 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
10218 ATAACTATTTGAACAATTATATAATTCAAATCAGTATGACC-TTTACTTTATCATAAAACAATTG
255 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTTATCATAAAACAATT-
* * * *
10282 TTTTTATTCATACAAGTTTAT-TGGAAATAAAATAATACT-A
319 ATTTTGTTCATACAACTTAATCT-GAAATAAAATAATA-TAA
* * * * * * ** *
10322 ATTTTTTAATTTTTTAAAAATTAATAAATAAAAGAATTAAAAAATAAATTGTTTATGGAACAA-T
1 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTGTTTACCGAATAAGT
* * * ** * **
10386 TCAAATAGTTATTACTATTTAAAACAAATATCTATTTTAAGTTGTTACGATATTTTATTTTGTCA
66 TCAAATAGTTATGACTATTT-AAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
* * * * * * * *
10451 TAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAA-GTTTATTCAGAATAAAATAACACTAATATATAAATATT
130 TAAAACAATTGTTTTTGTT-ATACAATCTTTTTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
10515 TCAAAAATTATTAAGTAAAAGAATTTAAAAAATATAAT-TATTTA-TCAAACATGTTCAAATAGT
193 TCAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTT-AAAAATA-AATCTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGT
* * ** * ** ** * *
10578 TATGACTATTTAAACAACTATCCATTTGAAATTGTTAT-AATACTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
254 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTATTTTATCATAAAACAAT
* * * * * *
10642 CATTTTTTATTATACAAGTTTAT-TTAGAATAAAATAATACT-A
318 TATTTTGT-TCATACAACTTAATCTGA-AATAAAATAATA-TAA
* *
10684 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATATAAAAAATA
1 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATA
10730 GTTATGACTA
Statistics
Matches: 1199, Mismatches: 223, Indels: 125
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
350 3 0.00
351 175 0.15
352 7 0.01
353 7 0.01
354 6 0.01
355 75 0.06
356 9 0.01
357 2 0.00
358 3 0.00
359 26 0.02
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364 1 0.00
365 47 0.04
366 14 0.01
367 116 0.10
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTGTTTACCGAATAAGT
TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTTTGTTATACAATCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTGT
TCATACAACTTAATCTGAAATAAAATAATATAA
Found at i:10587 original size:542 final size:535
Alignment explanation
Indices: 8825--10729 Score: 1516
Period size: 542 Copynumber: 3.5 Consensus size: 535
8815 TGGCATTTTG
* * ** * * *
8825 TTTTGTCAT-AAAATATTTGTTTTTGCTT-ATACATGCTTATTCAAAATAAAATATAC-TGATTT
1 TTTTGTCATAAAAATAATT-ATTTTG-TTCATACAACCTTAATCAGAATAAAATA-ACATAATTT
* * * * * * * *
8887 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAA-TTTTAAAACATAATTTTTTTTACTAAATAAGTTC
63 ATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAA-AATTTC
* * *
8951 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT-TTTTTTAAAATAC-TTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
125 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTT-AAAT-CGTTATGACC-TTTGTTTTGTCAT
* * * * **
9014 AAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC-AATTTTATTAATATTT
187 AAAATAATTATTTTTGATTGTACAAATTTATTTG-AATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTT
* * * * * *
9078 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTCAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAA-AAATTCAAAGAGTTAT
250 TAAAAATTAATAAGTAAAAGATT-AAAAAATAAATATGTTTAGC-AAATAAGTACAAAAAGTTAT
* * * * ** * *
9142 GACT-ATTTGAACAATTATT-TATGTCAAAT-TGT-TAGAAGGTTTTATTTTATCATAAAACAAT
313 -ACTAATTAGAACAACTATTCAAT-TCAAATCAGTAT-G-ACCTTTTACTTTATCACAAAACAAT
* * * ** * *
9203 TGTTTCTAGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAATAGTA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
374 TGTTTTTATTCATACAATCTTATTGGAAA-AAAAATAATACT-AATTTATTAATTTTTCAAAAAT
* * * * * * *
9267 TAATAAGTAAAA-AGTT----GA-AAA--TG----CCGAACATGTTCAAATTGCTATGACAATTT
437 TAATAA-TAAAAGA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTT
* * * * * *
9320 GAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGA-CATTTTT
500 AAACAAATATCTATTTCAAATCATTACGACCA-ATTA
* * * ** ** * **
9356 TTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTGCTT-ATGCAATATT-ATTTGAAATACAATAATGTTAATT
1 TTTTGTCATAAAAATAATT-ATTTTG-TTCATACAACCTTAATCAG-AATAAAATAA-CATAATT
* * * * * *
9418 TATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATTAAATAATTTT
62 TATTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAA-AATTTC
* * * * *
9483 AAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATATATATATATCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATC
125 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT-T-T-T-AAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTC
* * * * *
9548 ATAAAATAACTATTTTTGTTTGTACAAACTTCTTTGAAATAAAAAAAATACTAATTTATTAATAT
185 ATAAAATAATTATTTTTGATTGTACAAATTTATTTG-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
9613 TTCACAAATTAATTAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTAGCGAATAAGTACAAATATTTA
248 TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATATGTTTAGCAAATAAGTACAAAAAGTTA
* * * * * * *
9678 TATTAATTAGAATAACTATTCATTTTAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGT
312 TACTAATTAGAACAACTATTCAATTCAAATCAGTATGACCTTTTACTTTATCACAAAACAATTGT
* * *
9743 TTTTGTTCATACAATCTTTTTTGAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATA
377 TTTTATTCATACAATCTTATTGGAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATA
* * * * * *
9808 ATTAAAGATTTAAAAATAAGTCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAACAAT
442 ATAAAAGATTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACAAA
* * *
9873 TATTTATTTCAAATCATTATGACCAATTG
507 TATCTATTTCAAATCATTACGACCAATTA
* **
9902 TTTTGTCATAAAAATAATTATTTTGTTCATACAACCTTAATCTGAATAAAATATTATAAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAAATAATTATTTTGTTCATACAACCTTAATCAGAATAAAATAACAT-AATTTAT
* * * * *
9967 TAATATTTTAAAAATTAGTT-ATTAAAATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAATTTCAA
65 TAATATTTCAAAAATTA-TTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AA-AATTTCAA
**
10031 ATAACTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
127 ATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
10096 TAATTATTTCTGCTTGTACAAATTTATTCTGAATAAAATAATACAAATCTATTAAAATTTTGAAT
191 TAATTATTTTTGATTGTACAAATTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA
* ** *
10161 ATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAGTAAATATGTTTTTCAAATAAGTTCAAAAAGTTATAACT-A
255 ATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAATATGTTTAGCAAATAAGTACAAAAAGTTAT-ACTAA
* * *
10225 TTTGAACAATTATAT-AATTCAAATCAGTATGACC-TTTACTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA
318 TTAGAACAACTAT-TCAATTCAAATCAGTATGACCTTTTACTTTATCACAAAACAATTGTTTTTA
* * *
10288 TTCATACAAGT-TTATTGGAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATTTTTTAAAAATTAATAAATA
382 TTCATACAA-TCTTATTGGAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAAT-AATA
10352 AAAGAATTAAAAAATAAAT-TGTTTA-TGGAACAA-TTCAAATAGTTATT-ACTATTTAAAACAA
445 AAAG-ATTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT-TTGACTATTT-AAACAA
* * ** * *
10413 ATATCTATTTTAAGTTGTTACGA-TATTTTA
506 ATATCTATTTCAAATCATTACGACCA-ATTA
* ** * *
10443 TTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAACACTAATATA
1 TTTTGTCATAAAAATAATTATTT-TGTTCATACAACCTTAATCAGAATAAAATAACA-TAATTTA
*
10507 TAAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAAAGAATTTAAAAAATATAAT-TATTTATCAAACATGTTC
64 TTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATA-AATCTATTTATCAAA-AT-TTC
* * * * * *
10571 AAATAGTTATGACTATTTAAACAACTATCCATTTGAAATTGTTATAATACTTTGTTTTGTCATAA
125 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
10636 AACAATCATTTTTTATTATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
189 AATAATTATTTTTGATTGTACAAATTTATTT-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA
10701 AAATTAATAAGTAAAAGATATAAAAAATA
253 AAATTAATAAGTAAAAGAT-TAAAAAATA
10730 GTTATGACTA
Statistics
Matches: 1113, Mismatches: 204, Indels: 103
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
530 2 0.00
531 42 0.04
532 80 0.07
533 2 0.00
534 1 0.00
535 8 0.01
536 98 0.09
537 131 0.12
538 7 0.01
539 2 0.00
540 113 0.10
541 212 0.19
542 226 0.20
543 7 0.01
544 1 0.00
545 4 0.00
546 162 0.15
547 15 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (535 bp):
TTTTGTCATAAAAATAATTATTTTGTTCATACAACCTTAATCAGAATAAAATAACATAATTTATT
AATATTTCAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAATTTCAAATAG
TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
ATTTTTGATTGTACAAATTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
AAGTAAAAGATTAAAAAATAAATATGTTTAGCAAATAAGTACAAAAAGTTATACTAATTAGAACA
ACTATTCAATTCAAATCAGTATGACCTTTTACTTTATCACAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
TCTTATTGGAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAATAAAAGATTAAAA
AATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACAAATATCTATTTCAAAT
CATTACGACCAATTA
Found at i:11471 original size:162 final size:167
Alignment explanation
Indices: 11275--11589 Score: 401
Period size: 164 Copynumber: 1.9 Consensus size: 167
11265 CTATTTGAAC
** * * * *
11275 AATTATCTATTTTATGTCGTTATAACTTTTTGTTTTATCATAAAAT-AATTATTTTTGTTTGCAC
1 AATTATCTATTTTAAATCATTATAACTATTTGTTTTATCATAAAATGAATTATTTCTGTTTACAC
* * *
11339 AAGCC-TG-TTCAAAATAA-AAAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAATTAAAAGAT
66 -AGCCTTGTTTC-AAATAATAAAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
*
11401 GTAAA-AA-AAAT-TGTTTGCCAAAAACTATATGAACAA
129 GTAAATAATAAATATGTTTACCAAAAACTATATGAACAA
* * * *
11437 AATTATCTATTTTAAATCATTATGACTATTTGTTTTGTCATAAAATGAATTGTTTCTGTTTATAC
1 AATTATCTATTTTAAATCATTATAACTATTTGTTTTATCATAAAATGAATTATTTCTGTTTACAC
* * * *
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AGCCTTGTTTCAAATAATAAAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATGT
AAATAATAAATATGTTTACCAAAAACTATATGAACAA
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12409 TATTTGCTTA
*
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1 ATATATTTAATTGCATGATT
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1 ATATATTTAATTGCATGATT
**
12458 -TAT-TTGCA-T-CAT--TT
1 ATATATTTAATTGCATGATT
*
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1 ATATA-T-TTAATTGCATGATT
* *
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ATATATTTAATTGCATGATT
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12415 CTTAATATAT
*
12425 TTATTTGCATGATTATATATTTAATTGCATGTTTATTTGCATCATTTATATATTG
1 TTATTTGCATGATTATATATTTAATTGCATGTTTATTTGCATCATTTATATATTA
* **
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TTATTTGCATGATTATATATTTAATTGCATGTTTATTTGCATCATTTATATATTA
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* *
12511 TTTATTTGCATGGTTTATATAT
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12501 TAATTGCATG
*
12511 TTTATTTGCATGGTTTATATATTA
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**
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1 T
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TTTATTTGCATGATTATATATTA
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12592 GTTTGCATAG
12602 TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TTA TT
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TTA
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*
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TTATTGCATATTTTATAT
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12665 ATATTTATTG
*
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* * *
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* **
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* * *
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*
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TATATATAATTGCATGAT
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*
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*
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**
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TGATAATTATATATTTACA
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12860 ATATATTTA-CATG
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*
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ATATTTTAGCATG
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*
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TATGATTTATAATATATTGCATGG
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13443 GTTTAAGGAG
* * * * *
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*
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ATCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATAAATATATTTTCTAAA
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13700 AAGAATGAAA
* ** *
13710 AAAATTATTTATGGAACAAATTCTAATAGTTATTGCTATTTAAAACAATTATCTACTTTAAATCA
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* * * *
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*
13839 TCATATTAATTTTCCAAAAATTATTAAGTAAAAAAATTAAAAAAT
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** *
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* * * *
13946 ATTATGACATTTTGTTTTATCACAAAACAAATATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
65 ATTATAACATTTTATTTTATCAAAAAACAAATATTTTTGTTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAA
14011 TAATATTAATTT
130 TAATATTAATTT
14023 ATTAATGTTT
Statistics
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TTATAACATTTTATTTTATCAAAAAACAAATATTTTTGTTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
AATATTAATTTTCCAAAAATTATTAAGTAAAAAAATTAAAAAAT
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Period size: 180 Copynumber: 5.5 Consensus size: 182
13832 AATAAAATCA
* * * * *
13842 TATTAAT-TTTCCAAAAATTATTAAGTAAAAAAATTAAAAAATAA-AA-T-TATTTACTGAA-CA
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* * * ** * *
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63 T-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTAT
* * * * ** * *
13966 CACAAAACAAATATTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
127 TATAAAATAATTATTTCAGGTT-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATT
* * * * * * * * ** *
14022 TATTAATGTTTAAAAAATTAATAAGTAGAAGCTTTAATAAAGA-AA-TTTGCTTATCGAATAAGT
1 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAG-ATTAAAAAAAACAACTATGTTTATTGAACCATT
* ** ** * * * * * *
14085 ACAAGCAATTACAACAATTTGAAA-AATTATCTATATT-AAATCGTTATAACTTTTTGTTTTATC
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* * * * * *
14148 ATAAAATAATTGTTT-ATGTTCGTACAAACTT-TTCCAGAATAAAA-AATACTAATT
128 ATAAAATAATTATTTCAGGTT-ATACAAGCTTATT-CAAAATAAAATAAAACTAATT
* * **
14202 TATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGATA-TTTAAAAAATAA-AACT-T-TTTATCGAATA
1 TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AGA-AGATTAAAAAA-AACAACTATGTTTATTGAACC
* * *** *
14262 AGTTT-AAATAGTTATGACTATATATGTAATTATCTATTTCAAAT-AGT--T-ACGATCTCTTGT
62 A-TTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCA-TCATAAC-AT-T-TTGT
* * * * * *
14322 TTTGTCATAAAACAAATATTTCTA--TTCATACGAACCTT-TT-AAAATAAAATAATACTAATT
122 TTTATTATAAAATAATTATTTC-AGGTT-ATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATT
* ** * * **
14382 TATTAAT-TTTCAAAAAGTCAATAAG-AG--TTTTAAAAAAATA-AATCTA--TTTGTCGAATAA
1 TATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAGAAGATTAAAAAAA-ACAA-CTATGTTTATTGAACCA
* * * **
14440 GTTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTCATAACATTTT-TCTTT-T
63 TTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATCATAACATTTTGT-TTTAT
**** *
14503 TATAAAATAATTATTTCAGGTTATACAAGCTTATTCGGGCTAAAGTAAAACTAATT
127 TATAAAATAATTATTTCAGGTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATT
14559 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTAAAAAAAACAACTATGTTTATTGAACCATT
1 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTAAAAAAAACAACTATGTTTATTGAACCATT
* * * * ** *
14623 TCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTATTAT
65 TCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTATTAT
* * ** * * * *
14688 AAAATATTTTTTTTTGTTTATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
130 AAAATAATTATTTCAGGTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATT
* * * * * * *
14741 TTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATA-AA-TCTGTTTGTCGAACTAGT
1 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGA-TTAAAAAAAACAACTATGTTTATTGAACCATT
* *
14804 TCAAATAGTTATGACCATTTA
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14825 TTATGTCATA
Statistics
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TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTAAAAAAAACAACTATGTTTATTGAACCATTT
CAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATCATAACATTTTGTTTTATTATA
AAATAATTATTTCAGGTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATT
Found at i:15258 original size:177 final size:177
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Indices: 15027--17879 Score: 1273
Period size: 177 Copynumber: 15.8 Consensus size: 177
15017 ATTTATGCAA
* * * * * *
15027 AAAAAAATACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTATTAAGTAGAAGATTTAAAAAAATAAATCTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTA-AGGATTT-AAAAAATAAATTTG
* * * *
15092 TTTACTAAAAAAGTTCAAATAGTCAAGACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTAT-ACC
63 TTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * *
15155 CTTTGTTTTGTCATAAAATAATTAATTT-TGTTCATACAACTTTTTTAAA-
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAACTTTTTTAAAT
* * * * *
15204 AAAATATTAGTAAATTATTAATATTATGAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAACTTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * *
15269 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAATACTCTTT-AATTATTAACTACTTT-AAATCATTTTGACC
64 TTACTAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACC
* * * * * **
15332 -TTT-TTCTGTAATAAAATAATTGGTTT-TATTTATACAAGCTTAATCAAAAT
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAA-CTT-TTTTAAAT
* *
15382 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTCT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * ** *
15446 TTAATGAATAAGTTTAAATAATTATA-ACTATTTAAATGATTATCTATTTCAAATTTTTATGACA
64 TTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
15510 TTTTCTTTTGTCCAT-AAACAATTATTTCTATTTAGACAAGTTTATTTAAATT
128 TTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAACTTT-TTTAAA-T
* ** *
15562 AAAATAATAATAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAAATAAATTTTTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * *
15624 TATTGAATTAGTTCAAATAGTTCAA-ACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTTTGATCT
65 TACTAAATAAGTTCAAATAGTT-AAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * *
15688 TTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAAT
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTTTTTA-AAT
* * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTT
* * * * * *
15801 AACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTACTCCAAATTATTAT-AGCCT
65 TACTAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCT
* * * ** * **
15865 TTTGTTTTAAT-ATAAAACAATTATTTCTGTTCATTTAAGCTTAATCAAAAT
129 TTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTT-TTTTAAAT
* * * * * *
15916 AAAATAATTCTAATTTAATAATATTTTAAACATTAATAAG---GAATTTAAAAAATAAATCTATT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTT
** ** * * *
15978 TGAGGAACCAA-TTCAAATAATTAAGATTATTTGAA-AATT-TCTATTTCAAATCATTCT-ACCA
65 T-ACTAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-
* * *
16039 TTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTAGTTTCAATTCATAC-AGTTTATTTAAAAT
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAACTTT-TTT-AAAT
* * * *
16091 AAAATATTACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAAACTAATAAGTAAGATATTTAAAACATAAATATT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT--AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATAAAT-TT
* * * * * *
16155 -TTTA-TCGAAGAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGTGA
62 GTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * ** * ** *
16218 TCTTTTGTTTTTTTGTAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAGGTTTGTTTGGAAT
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAACTTT-TTT-AAAT
** * * *
16272 AAAATAATAGAAATTTATTAATATTTCGAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * *
16337 TTACTAAATTAGTT-TAATAATTATA-ACTATTTG----ATTATCTATTTTACATCGTTATGATC
64 TTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * ***
16396 -TTTGTTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTT
128 TTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAC--TT-TTTTAAAT
* * * * ** * * ** ** * * * *
16448 CATACAA-GCCGATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAG
1 AAAATAATACTAATTT---AT-TAAT-AT-TTAA-AAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAATA-
**** * * * * * * *
16511 GAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTATTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
57 -A-ATTT-GTTTACTAAATAAGTTCA---AA-TAGTT--AAGA-CTAT------TTGAATAATTA
* * * * * * *
16576 TCTATTTCAAATCAATATGACATTTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCCATTCATAAAAGCTT
106 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTT
* *
16641 ATTCAGAAT
170 TTTTA-AAT
* * * * * *
16650 AAAATAAT-CTTAATTTATTAATACTCAATAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAGTAAATCTG
1 AAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTAA-AAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * * * * * * *
16714 TGTAATAAA-AAGTTCAAATAGTTATGAGTGTTTGAACATTTATCTAATTCAAATCGTTATAACT
63 TTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* ** * * **
16778 TTTTATTTTCACAAAAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATATGGAAA-
128 TTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTT-T-TTTAAAT
** * * * * *
16831 AATGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTGAATAAGTAAAAGATTTAAAAGCATAAATTTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAA-AATAAATTTG
* * * * * ** **
16896 TTTA-TCAAACT-AGATCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTATTTTTAATTGTTATGA
63 TTTACT-AAA-TAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * * **
16959 CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGTTTATACAAAAAT
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAACTTT-T--TTAAAT
* * * *
17014 AAAATAATACTAATTTATTTATATTCTGAAAATTAATTAGT-AGGATATTTAAAAAATAAATCCT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGG--ATTTAAAAAATAAAT-TT
* * ** * * ** *
17078 -TTTA-TCAAACAAGTTCATATAGTTATTACCATTTGAATAATTATCTACTTCAAATTTTTATTA
62 GTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* ** * * * *
17141 CCTTTAT-TTATGTCATAAAATTATTATTTCTATTTATACAAGCTTATTCATAAT
126 CCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTTTTTA-AAT
* * * **
17195 AAAATAATATTAATTGATTAATATTTTAAAAATTGAA-AAATAACATATTTAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATT-AATAAGTAA-GGATTTAAAAAATAAATTTG
* ** * * * * * * * * *
17259 TTTATTGAACCAA-TTCCAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTTATCTCAAATTACTATAAC
63 TTTACT-AAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * *
17323 CTTTTGTTTTGTCATTAAACAAATGATTT-TGTTCACATAAGTTTATTTGGATT
127 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAACTTT-TTT-AAAT
* * * *
17376 AAAATGATACTAATTTAATAATATTTTAAAA--AATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATAAATTTGTT
** * * * * * * ** *
17438 TACTGAACCAA-TTCAAAAAGTTATGAATATTTGAACAAGTATTTATTTCAAATTGTAATGACCT
65 TACT-AAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * **
17502 TTT-CTTTGTCAT-AAATAGTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTT-TTTTAAAT
* * * * * * * *
17551 AAAGTAATAGTAATTCATTAATATTATGAGAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATGAATCTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-GGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * * *
17616 TTACCAAAAAAGTTTAAATACTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAACAT
64 TTACTAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
* * * * * * *
17681 TTTGTCTTATCATAAAACAAATGTCTCTGTTCATACAAGCATATTATGAAA-
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-C-T-TTTTTAAAT
* * * * *
17732 AAAATTATACAAATTAATTAATATTTAGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTA-AGGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * *
17797 TTATTGAACAAGTTCAAACAATTATA-ACTGTTTGAACT-ATTATTTATTT-AATATCATTATCA
64 TTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGA
* * * *
17859 CTTTTTGCTTTATTATAAAAC
126 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
17880 TATTTGTTAG
Statistics
Matches: 2044, Mismatches: 485, Indels: 290
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
173 3 0.00
174 9 0.00
175 160 0.08
176 139 0.07
177 471 0.23
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179 126 0.06
180 162 0.08
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ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
ACTAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAACTTTTTTAAAT
Found at i:15494 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 15458--15499 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 2.4 Consensus size: 17
15448 AATGAATAAG
15458 TTTAAATAATTATAACTA
1 TTTAAATAATTAT-ACTA
*
15476 TTTAAATGATTAT-CTA
1 TTTAAATAATTATACTA
15492 TTTCAAAT
1 TTT-AAAT
15500 TTTTATGACA
Statistics
Matches: 22, Mismatches: 1, Indels: 3
0.85 0.04 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.27
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ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.02, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
TTTAAATAATTATACTA
Found at i:16451 original size:21 final size:20
Alignment explanation
Indices: 16397--16444 Score: 96
Period size: 20 Copynumber: 2.4 Consensus size: 20
16387 GTTATGATCT
16397 TTGTTTTTATCATAAAACAA
1 TTGTTTTTATCATAAAACAA
16417 TTGTTTTTATCATAAAACAA
1 TTGTTTTTATCATAAAACAA
16437 TTGTTTTT
1 TTGTTTTT
16445 GTTCATACAA
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.33, C:0.08, G:0.06, T:0.52
Consensus pattern (20 bp):
TTGTTTTTATCATAAAACAA
Found at i:17159 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 16465--17845 Score: 965
Period size: 181 Copynumber: 7.6 Consensus size: 181
16455 GCCGATTTAG
**
16465 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * **
16530 ATGTTTATTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAATAT
64 CTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * *
16594 GACATTT-TGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCCATTCATAAAAGCTTATTCAG
128 GACCTTTATGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATACAA
* * * *
16647 AATAAAATAAT-CTTAATTTATTAATACTCAATAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAGTAAAT
1 AATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
16711 CTGTGTAAT-AAA-AAGTTCAAATAGTTATGAGTGTTTGAACATTTATCTAATTCAAATCGTTAT
64 CTGT-TTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * * **
16774 -AACTTTTTATTTTCACAAAAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATATGGA
128 GACCTTTATGTTTTCTC-ATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATA-CAA
** * * *
16829 AA-AATGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTGAATAAGTAAAAGATTTAAAAGCATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AATAAAT
* * * * * * ** *
16893 TTATTTATCAAACTAGATCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTATTTTTAATTGTTATG
64 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * *
16958 A-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGTTTATACAAA
129 ACCTTTATGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATAC-AA
* * * ** *
17011 AATAAAATAATACTAATTTATTTATATTCTGAAAATTAATTAGTAGGATATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-
* * * * * ** *
17076 CT-TTTATCAAACAAGTTCATATAGTTATTACCATTTGAATAATTATCTACTTCAAATTTTTATT
64 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * *
17140 ACCTTTAT-TTATGTCATAAAATTATTATTTCTATTTATACAAGCTTATTCAT
129 ACCTTTATGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATACAA
* * * * *
17192 AATAAAATAATATTAATTGATTAATATTTTAAAAATTGAA-AAATAACATATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATT-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * ***
17256 TTGTTTATTGAACCAA-TTCCAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTTATCTCAAATTACTAT
64 CTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * * ****
17320 AACCTTT-TGTTTTGTCATTAAACA-AATGATTT-TGTTCACATAAGTTTATTTGG
128 GACCTTTATGTTTTCTCA-TAAA-ATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATACAA
* * * * * *
17373 ATTAAAATGATACTAATTTAATAATATTTTAAAA--AATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
17435 GTTTACTGAACCAA-TTCAAAAAGTTATGAATATTTGAACAAGTATTTATTTCAAATTGTAATGA
66 GTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * *
17499 CCTTT-T-CTTTGTCAT-AAATAGTTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
130 CCTTTATGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATACAA
* * * * * * *
17548 AATAAAGTAATAGTAATTCATTAATATTATGAGAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATGAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * ** *
17613 TGTTTACCAAAAAAGTTTAAATACTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAA
65 TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * * * * * **
17678 CATTT-TGTCTTATCATAAAACAAATGTCTCTGTTCATACAAGCATATTATGA
130 CCTTTATGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTA-TACAA
* * * * * *
17730 AA-AAAATTATACAAATTAATTAATATTTAGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * * *
17794 TGTTTATTGAACAAGTTCAAACAATTATAACTGTTTGAACTATTATTTATTT
65 TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
17846 AATATCATTA
Statistics
Matches: 943, Mismatches: 219, Indels: 75
0.76 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
174 7 0.01
175 37 0.04
176 11 0.01
177 81 0.09
178 11 0.01
179 77 0.08
180 65 0.07
181 344 0.36
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183 101 0.11
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
GTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
CTTTATGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGCTTATACAA
Found at i:20360 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19599--22387 Score: 2024
Period size: 180 Copynumber: 15.5 Consensus size: 180
19589 TAAGGCTAAC
* * *
19599 ACAATTATTTCTATTCATTCAAGCTTATTCG-GATGAAAATAATACT-ATTTATTAAT-TTT-AA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAA
* * *** ** * * *
19660 CAACTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATC--TTTAATGAGCAAGTTCAAATAGTCACGGC
64 AAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGAC
* * * *
19722 AATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTTTTTTGTCATAAA
128 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * ** * * *
19776 ACAGTTGTTTCTGTTTGTATAA-TCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTGTTAATA-TTCTA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-A
* * * *** * *
19839 AAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTTAAAATAAATTCAAATAGTTATGAC
63 AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGAC
* ** * * * * *
19904 TATTTAAATGGTTATATATTTCAAACCATTAT-ATCCATTTG-TTTATCATAAA
128 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAA
* ** * ** *
19956 ATAATCGTTTCTGTTC-TAACAAGCATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATA-TTCTA
1 ACAATTATTTCTATTCAT-ACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-A
* * * ** *
20019 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-ATATGCTTACCAAACAAGTTTTAATAGTTATG
63 AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTAT--TTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAG
* * * * * * *
20083 ACTATTTGTACT-ATTATTTATTTCTAATAGTTATGACATCTTATTTTGTCATAAA
126 ACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * ** * * * * *
20138 ATAATTATTTATGTTCATACAAACTTAGTCGGATTAAAATAATATGAATTTAATAATATTCCAAA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAA
* * *
20203 ACTTAATAAGGAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTAAGA-TA
65 AATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACT-
*** * * *
20267 ATTTGAATAATTATCTATTTTGCATCGTTCTTACCTTTTGTTTTGTCCTAAA
129 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * ** *
20319 ACAATTGTTTCAACTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGAT
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAA
* * * *
20384 AATTAATAAGTAA-AAGA-TGAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGAC
65 AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTAAGAC
* * *
20446 TATGTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAGA
128 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * *
20499 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATAC-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAA
* * ** * * * * *
20563 AAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAAT-AATTTTTTTGTCGAATCAGTTTAAATTGCTAAGACT
64 AAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACT
* * * ** * * *
20623 ATTTTAACAATTATCCATTTCATCTTGTTATGATCTTTT-TTTTATCATAAA
129 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
20674 ACAATTATTTC-AGTTCATATAAGTTTATT-GAAATAAAATAAGACTAATATATTAATATTTCAA
1 ACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * *
20737 ATATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCTAATAGTTATGTCT
64 AAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACT
* * * * *
20802 ATTTGTACAATTATTTATTTCAAATAGTTATAACCTTCTT-TTTTGTCATAAA
129 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * ** * * * *
20854 ATAATTTTTTTCAATTAATAAAAGCTTATTTGGTATAAAATAACACCAAATTATAAATATTTCAA
1 ACAA-TTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAA
* * * *
20919 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAGAATAAATCTATTTACCCAAAT-AGTTCAAATAATTATGAC
64 AAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGAC
* * *
20983 TATTCGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
128 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
** * * * * * *
21036 TTAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTATTAATATTTAAAA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAA
* ** * *
21101 AATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAACCAGTTGAAATAGTTATGACTA
65 AATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTA
21162 TTTGAATAATTATCTATTTCTAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTG-CTATAAA
130 TTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAA
* * * * * * * * *
21213 ACTATTATTTCTATTCAAACAAGGTTAGTCGGATTAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
21278 AATTGATAAGTATGAAATTTAGAAGAA-AAATCTATTTACTC-AACAAGCTCAAATAGTTAATA-
65 AATTAATAAGTAAGAAATTTA-AAAAATAAATCTATTTAC-CAAATAAGTTCAAATAGTTAAGAC
*** * * *
21340 TAATTTGAATAATTATCTATTTGGTATCATT-CGTACCTTTTGTTTTGTTC-GAAA
128 T-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTTGTTTTG-TCATAAA
* * *
21394 ACAATTATTTC-AGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAA-AATAATAGTTTATTAAT-TTTAAG
1 ACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCA-
** ** *
21456 AAAATTAATAAGTAA-AATATTTTTTAAAA-AAAT-TAGTTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTTG
63 AAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTTAAAAAATAAATCTA-TTTA-CCAAATAAGTTCAAATAGTT-
* * ** * * *
21517 TA-ACCATTCAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-AAGA
123 AAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-A
* * * * *
21574 ATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTGT-AA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TCAA
* * ** * *
21638 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TTTTTGTCAAATCAA-TTCAAATTGTTAAAAC
64 AAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAT-AAGTTCAAATAGTTAAGAC
* * * * * ** *
21700 CATTTTAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCAGTTGTTTTATCATAAAA
128 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA
* * * * ** * *
21754 ATAATTGTTTTTATTCGTACAACCTTATTTTG-AATAAAATCATATAAATTTATTAATATTTCAA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * * *
21818 AAATTAGTTAGTAA-AATATTT-AAAAATAAACCTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTATA-A
64 AAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTA-AGA
* * * * *
21880 CTATTTAAAAAATTATCTGTTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATGAA
127 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * *
21934 ATAATTATTTCTGTTTATACAAGTTTATTTCG-ACTAAACTAATACAAATTTATTAATA-TTCTG
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-A
* * * **** * *
21997 AATATTAATAAGTAA-AAGACTTAAGAAATAAATCTATTTTTTGAATAAGTTAAAAAAGTTATA-
63 AAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTA-AG
* * * * *
22060 ACTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCGTTATAACC-TTCGTTTTATCATAAA
126 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
22114 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTATAAATATTCCAAA
1 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
22179 AATTATTAAGTAA-AAGTATTAAAAAATAAAAT-TGTTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGAC
65 AATTAATAAGTAAGAAAT-TTAAAAAAT-AAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGAC
* * * * * *
22242 TATTTAAACAATTATCCATTTAAAAGT-GTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAA
128 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
*
22295 ACAATTGTTTCTGATT-ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
1 ACAATTATTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAA
*
22359 AAATTAATAAAT-AGAAGATTTAAAAAATA
64 AAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATA
22388 GTTATGACTA
Statistics
Matches: 2083, Mismatches: 426, Indels: 203
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 39 0.02
175 36 0.02
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177 177 0.08
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAA
ATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTAT
TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
Found at i:20551 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 19599--22387 Score: 2286
Period size: 361 Copynumber: 7.8 Consensus size: 361
19589 TAAGGCTAAC
* * * *
19599 ACAATTATTTCTATTCATTCAAGCTTATTCG-GATGAAAATAATACT-ATTTATT-A-ATTTTAA
1 ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA
* * * *** * * * * * *
19660 CAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AA-ATCTTTAATGAGCAAGTTCAAATAGTCACGGCA
65 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
19723 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCT
130 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * ** * ** * *
19788 GTTTGTATAA-TCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTGTTAATATTCTAAAACTTAATAAGT
193 ATTCATACAAGT-TTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * **
19852 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTTAAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATGGTT
257 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * *
19917 ATATATTTCAAACCATTAT-ATCCATTTG-TTTATCATAAA
322 ATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAA
* ** ** * *
19956 ATAATCGTTTCTGTTC-TAACAAGCATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTCTAA
1 ACAATTATTTCTGTTCAT-ACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA
* * * **
20020 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATATGCTTACCAAACAAGTTTTAATAGTTATGAC
65 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * *
20085 TATTTGTACT-ATTATTTATTTCTAATAGTTATGACATCTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTA
129 TATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* ** * * *
20149 TGTTCATACAAACTTAGTCGGATTAAAATAATA-TGAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAAG
192 TATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * *
20213 GAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTAAGA-TAATTTGAATAA
256 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTTGAATAA
*** * * * * *
20277 TTATCTATTTTGCATCGTTCTTACCTTTTGTTTTGTCCTAAA
320 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* *** * * * * *
20319 ACAATTGTTTCAACTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGAT
1 ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
*
20384 AATTAATAAGTAAAAGA-TGAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
66 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* *
20448 TGTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTAT
131 TTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * **
20513 TCATACAAGTTTATACAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG--AG
195 TCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * * *
20576 --ATTTAAAAAAT-AATTTTTTTGTCGAATCAGTTTAAATTGCTAAGACTATTTTAACAATTATC
260 AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATC
* ** ** *
20638 CATTTCATCTTGTTATGATCTTTT-TTTTATCATAAA
325 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * * *
20674 ACAATTATTTCAGTTCATATAAGTTTATT-GAAATAAAATAAGACTAATATATTAATATTTCAAA
1 ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
* * * * * * *
20738 TATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA-TAAGTTCTAATAGTTATGTCT
66 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
20802 ATTTGTACAATTATTTATTTCAAATAGTTATAACCTTCTT-TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTC
130 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTC
* * * * * * * * * *
20866 AATTAATAAAAGCTTATTTGGTATAAAATAACACCAAATT-ATAAATATTTCAAAAATTAATAAG
192 TATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
20930 TAAGAGATTTAAAGAATAAATCTATTTACCCAAAT-AGTTCAAATAATTATGACTATTCGAATAA
256 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAA
* *
20994 TTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
320 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
** * * * * *
21036 TTAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAACTAATACTAATTTATTAATATTTAAAA
1 ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
* * * * *
21101 AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAACCAGTTGAAATAGTTATGACTA
66 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * *
21162 TTTGAATAATTATCTATTTCTAAATGTTATGACCTTTTGTTTTG-CTATAAAACTATTATTTCTA
131 TTTGAATAATTATCTATTTC-AAATATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
21226 TTCAAACAAGGTTAGTCGGATTAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAAGTAT
194 TTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
21291 GAAATTTAGAAGAA-AAATCTATTTACTC-AACAAGCTCAAATAGTTAATA-TAATTTGAATAAT
259 GAAATTTA-AAAAATAAATCTATTTA-TCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTTGAATAAT
*** * * *
21353 TATCTATTTGGTATCATT-CGTACCTTTTGTTTTGTTC-GAAA
321 TATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTT-ATCATAAA
* * * * *
21394 ACAATTATTTCAGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAA-AATAATAGTTTATTAAT-TTTAAGA
1 ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-A
* ** *** * *
21457 AAATTAATAAGTAAAATATTTTTTAAAA-AAAT-TAGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTGTAA
65 AAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * *
21520 CCATTCAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-AAGAATAATTGTTT
128 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGTTT
* **
21584 CTATTCATACAAGTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTGTAAAAATTAATAAG
191 CTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
21649 TAAGAGATTTAAAAAAT-AAT-TTTTTGTCAAATCAA-TTCAAATTGTTAAAACCATTTTAAGAA
256 TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAT-AAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAA
* **
21711 TTATCTATTTCAAATCATTATGATCAGTTGTTTTATCATAAAA
320 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAA
* * * * * ** * * *
21754 ATAATTGTTTTTATTCGTACAACCTTATTTTG-AATAAAATCATA-TAAATTTATTAATATTTCA
1 ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTA
* * * ** * * * * *
21817 AAAATTAGTTAGTAAAATATTT-AAAAATAAACCTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTATAAC
64 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
21881 TATTTAAAAAATTATCTGTTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATGAAATAATTATTTCT
129 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * ** *
21946 GTTTATACAAGTTTATTTC-GACTAAACTAATACAAATTTATTAATATTCTGAATATTAATAAGT
193 ATTCATACAAGTTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * *
22010 AA-AAGACTTAAGAAATAAATCTATTTTTTGAATAAGTTAAAAAAGTTATA-ACTATTTGAACAA
257 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAA
* * * *
22073 TTATCTAATTCAAATCGTTATAACC-TTCGTTTTATCATAAA
320 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * **
22114 ACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTATAAATATTCCAAA
1 ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
*
22179 AATTATTAAGTAAAAG-TATTAAAAAATAAA-ATTGTTTACCAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGA
66 AATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATA-TGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
22241 CTATTTAAACAATTATCCATTTAAAAGTGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC
128 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
22306 TGATT-ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAA
192 T-ATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
22370 T-AGAAGATTTAAAAAATA
256 TAAGAA-ATTTAAAAAATA
22388 GTTATGACTA
Statistics
Matches: 1943, Mismatches: 405, Indels: 164
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
354 44 0.02
355 119 0.06
356 117 0.06
357 77 0.04
358 176 0.09
359 154 0.08
360 313 0.16
361 522 0.27
362 257 0.13
363 161 0.08
364 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (361 bp):
ACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAATAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
CATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA
AATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCT
ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
Found at i:22032 original size:721 final size:712
Alignment explanation
Indices: 19981--22387 Score: 1856
Period size: 721 Copynumber: 3.3 Consensus size: 712
19971 CTAACAAGCA
* * * * *
19981 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
1 TATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAA
* * * * ** ** * * **
20045 AATAAAATATGCTTACCAAACAAGTTTTAATAGTTATGACTATTTGTACTATTATTTATTTCTAA
65 AA-AAATTA-GTTTA-TAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAA
* * * * * * ** * *
20110 TAGTTATGACATCTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAACTTAGTCGGATTAA
127 TA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCA-AAAATAATTGTTTCTATT-ATACAAGTTTATTCGGAATAA
* * * *
20175 AATAATA-TGAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAAGGAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATT
189 AATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATT
* * * ** * * *** * * * * *
20239 TA-CCAAATAAGTTTAAATAGTTAAGATAATTTGAATAATTATCTATTTTGCATCGTTCTTACCT
252 TACCCAAATAA-TTCAAATAATTAAAACCATTCGAAGAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCA
* * * * * * * ** *
20303 TTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTTCAACTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAAT
316 GTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * ** * * *
20368 TTATTAATTTTTTGATAATTAA-TAAGTAAAAGA-TGAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGT
381 TTATTAA-TATTT-A-AA-AAATTAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCAAACAAAT
* * * * *
20431 TCAAATAGTTATGACTATGTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TC
441 TCAAATAGTTATAACTATTTAAAAAATTATCTATTTCTAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGCT-
* * * * * * * *
20494 ATAGAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TACAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
504 ATAAAACTATTATTTCTATTCAAACAAGGTTAGT-CGGACTAAAATAATACAAATTTAATAATAT
** * * * * ** * * ** *
20558 TTTAAAAATTAATAAG---AGATTTAA-AA-AATAAT-TTTTTTGTCGAATC-AGTTTAAATTGC
568 TCCAAAAATTAATAAGTATAAAATTAAGAAGAAAAATCTATTTACTC-AA-CAAGCTAAAAAAGT
* * * ** ** * * ** *
20616 TA-AGACTATTTTAACAATTATCCATTTCATCTTGTTATGATCTTTTTTTTATCATAAAACAATT
631 TATA-AC-ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATAACCTTCGTTTTATCAGAAAACAATT
*
20680 ATTTCAGTTCATATAAGTT
694 ATTTCAGTTCATACAAGTT
* * * * *
20699 TA-TTGAAATAAAATAAGACTAATATATTAATATTTCAAATATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
1 TATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAA
* * ** * *
20763 ATAAATCTA-TTTATCAAA-TAAGTTCTAATAGTTATGTCTATTTGTACAATTATTTATTTCAAA
66 A-AAAT-TAGTTTAT-AAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAA
* * * * * * *
20826 TAGTTATAACCTTCTT-TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCAATTAATAAAAGCTTATTTGGTAT
127 TA-TTATGACCTT-TTGTTTTGTCA-AAAATAA-TTGTTTCTATT-ATACAAGTTTATTCGGAAT
* * * *
20890 AAAATAACACCAAATT-ATAAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAGAATAAATCTA
187 AAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTA
* ** * *
20954 TTTACCCAAATAGTTCAAATAATTATGACTATTCGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACC
250 TTTACCCAAATAATTCAAATAATTAAAACCATTCGAAGAATTATCTATTTCAAAACATTATGACC
** * * * * *
21019 TTTTGTTTTGTCATAAATTAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAACTAATACTAA
315 AGTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
21084 TTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAACCAGTTGAA
380 TTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCAAACAAATTCAA
* * *
21149 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCTAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGCTATAAAA
445 ATAGTTATAACTATTTAAAAAATTATCTATTTCTAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGCTATAAAA
* *
21214 CTATTATTTCTATTCAAACAAGGTTAGTCGGATTAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAA
510 CTATTATTTCTATTCAAACAAGGTTAGTCGGACTAAAATAATACAAATTTAATAATATTCCAAAA
* * * * *
21279 ATTGATAAGTATGAAATTTAGAAGAAAAATCTATTTACTCAACAAGCTCAAATAGTTAATATA-A
575 ATTAATAAGTATAAAATTAAGAAGAAAAATCTATTTACTCAACAAGCTAAAAAAGTT-ATA-ACA
* * *** * * *
21343 TTTGAATAATTATCTATTTGGTATCATTCGT-ACCTTTTGTTTTGTTC-GAAAACAATTATTTCA
638 TTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATT-ATAACC-TTCGTTTT-ATCAGAAAACAATTATTTCA
21406 GTTCATACAAGTT
700 GTTCATACAAGTT
* * * * **
21419 TATTTGAAATAAAA-AATAATAGTTTATTAAT-TTTAAGAAAATTAATAAGTAAAATATTTTTTA
1 TATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAATA-TTTAAA
* * * * *
21482 AAAAAATTAGTTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTGTAACCATTCAAACAATTATCTATTTAAAAT
64 AAAAAATTAGTTTA-TAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAAT
*
21547 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAGAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTGGGAATAAA
128 -ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAA-AATAATTGTTTCTATT-ATACAAGTTTATTCGGAATAAA
*
21612 ATAATACTAATTTAATAATATTGT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAT-T-TTTT
190 ATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATCTATTTA
** ** ** * *
21674 GTCAAATCAATTCAAATTGTTAAAACCATTTTAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCAGT
254 CCCAAAT-AATTCAAATAATTAAAACCATTCGAAGAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCAGT
* *** *
21739 TGTTTTATCATAAAAATAATTGTTTT-TATTCGTACAACCTTATTTTGAATAAAATCATA-TAAA
318 TGTTTTATCAT-AAAATAATT-TTTTCTATTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AA
* * * * *
21802 TTTATTAATATTTCAAAAATTAGTTAGTAAAATATTT-AAAAATAAACCTGTTTATCGAACAAAT
380 TTTATTAATATTT-AAAAA--A-TTAATAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCAAACAAAT
* *
21866 TCAAATAGTTATAACTATTTAAAAAATTATCTGTTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-ATC
441 TCAAATAGTTATAACTATTTAAAAAATTATCTATTTCTAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGCT-
* * * * * * * *
21929 ATGAAA-TAATTATTTCTGTTTATACAAGTTTATTTC-GACTAAACTAATACAAATTTATTAATA
504 ATAAAACT-ATTATTTCTATTCAAACAAGGTTA-GTCGGACTAAAATAATACAAATTTAATAATA
** * * ** * * *
21992 TTCTGAATATTAATAAGTA-AAAGACTTAAGAA-ATAAATCTATTTTTTGAATAAGTTAAAAAAG
567 TTCCAAAAATTAATAAGTATAAA-A-TTAAGAAGAAAAATCTATTTACTCAACAAGCTAAAAAAG
* *
22055 TTATAACTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCGTTATAACCTTCGTTTTATCATAAAACAATT
630 TTATAAC-ATTTGAACAATTATCTAATTCAAATCATTATAACCTTCGTTTTATCAGAAAACAATT
22120 ATTTCTA-TTCATACAAGTT
694 ATTTC-AGTTCATACAAGTT
* * * * *
22139 TATTCGAAATAAAATAACACTAATTTATAAATATTCCAAAAATTATTAAGTAAAAGTATTAAAAA
1 TATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-TATTTAAAA
* *
22204 ATAAAATT-GTTTACCAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCATTTAAAA
65 A-AAAATTAGTTTA-TAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAA
* * * * *
22267 GTGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTGATTATACAAGTTTATTCGAAATAA
127 -TATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-AAAATAATTGTTTCT-ATTATACAAGTTTATTCGGAATAA
* *
22332 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT-AGAAGATTTAAAAAATA
189 AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATA
22388 GTTATGACTA
Statistics
Matches: 1379, Mismatches: 244, Indels: 129
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
713 8 0.01
714 150 0.11
715 7 0.01
716 85 0.06
717 298 0.22
718 68 0.05
719 133 0.10
720 204 0.15
721 390 0.28
722 36 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (712 bp):
TATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAA
AAAATTAGTTTATAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATATT
ATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAATAATTGTTTCTATTATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATA
CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATCTATTTACCCAAAT
AATTCAAATAATTAAAACCATTCGAAGAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCAGTTGTTTTAT
CATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTAAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATAAC
TATTTAAAAAATTATCTATTTCTAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGCTATAAAACTATTATTTCT
ATTCAAACAAGGTTAGTCGGACTAAAATAATACAAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
TAAAATTAAGAAGAAAAATCTATTTACTCAACAAGCTAAAAAAGTTATAACATTTGAACAATTAT
CTAATTCAAATCATTATAACCTTCGTTTTATCAGAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGTT
Found at i:22526 original size:152 final size:153
Alignment explanation
Indices: 22229--22539 Score: 464
Period size: 152 Copynumber: 2.0 Consensus size: 153
22219 AAACATGTTC
22229 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCATTTAAAAGTGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCATTT-AAAGTGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAA
* * *
22294 AACAATTGTTTCTGATTATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
65 AACAAATGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
22359 AAATTAATAAATAGAAGATTTAAA
130 AAATTAATAAATAGAAGATTTAAA
* * * **
22383 AAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-CAGTGATTATGACATTTTGTTTTGTCTTAA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCATTTAAAGTG-TTATGACATTTTGTTTTGTAATAA
* * * *
22447 AACAAATGTTTTTGCTCATACATGCTTATTCG-AATAAGATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
65 AACAAATGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* *
22511 AAATTAATAAGTAGAAGATTTAAT
130 AAATTAATAAATAGAAGATTTAAA
22535 AAATA
1 AAATA
22540 AATCTATTTA
Statistics
Matches: 142, Mismatches: 14, Indels: 4
0.89 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
152 62 0.44
153 48 0.34
154 32 0.23
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (153 bp):
AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCATTTAAAGTGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAA
ACAAATGTTTCTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
AATTAATAAATAGAAGATTTAAA
Found at i:22894 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 22462--23087 Score: 675
Period size: 181 Copynumber: 3.5 Consensus size: 179
22452 ATGTTTTTGC
* * * * *
22462 TCATACATGCTTATTCG-AATAAGATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAG
1 TCATACAAGCTT-TTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAG
*
22525 AAGATTTAATAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAGA-AGTTATGAC--TAT-T--ATTAT
65 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATATGTCAATTAT
* *
22584 CT-ATATCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
128 CTAAT-TCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* * * * * *
22636 TCATACAAGCTTTTTCAAAATAAAAAAATAGTTATTTATTAACA-TTCTAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAGCTTTTT-GAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGGAA
* * *
22700 GAGATTTAAAAAATAAATCTATCTACTAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATATGTGCAATTAT
64 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGT-CAATTAT
*
22765 CTAATTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
128 CTAATTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* * * * *
22817 TCATACAAACTTTTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATTTTTGAAAAGTCAATAAGGAAGA
1 TCATACAAGCTTTTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGA
* * * * * *
22882 GATTTAAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTAGATGAACAATTATT
66 GATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATATG-TCAATTATC
* * * * *
22947 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTTTTTTTCATAAAACAATTATTTCTAT
129 TAATTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
** * * *
22998 TCATACAAGCTTATTTTG-GCTAAAGTAA-AATTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
1 TCATACAAGC-T-TTTTGAAATAAAATAATAA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGA
* *
23061 AGAGATTCAAAAAATAAATTTATTTAC
63 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
23088 CAAACCAATT
Statistics
Matches: 377, Mismatches: 56, Indels: 31
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 2 0.01
174 15 0.04
175 76 0.20
176 2 0.01
177 3 0.01
178 1 0.00
180 43 0.11
181 187 0.50
182 43 0.11
183 5 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TCATACAAGCTTTTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAAGA
GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGTCAATTATCTA
ATTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
Found at i:23150 original size:140 final size:139
Alignment explanation
Indices: 22965--23233 Score: 346
Period size: 141 Copynumber: 1.9 Consensus size: 139
22955 ATTGTTATGA
** *
22965 CCTTTTTTTTTTTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTT-TGGCTAAAGTAAAAT
1 CCTTTTTTTTTTTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTAT-AATAAAATAAAAT
*
23029 TAA-TTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATTTATTTACCAAAC
65 TAAGTTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
23093 CAATTCAATG
130 CAATTCAATG
* * * * *
23103 CCTTTTTGTTTTGTT-ATAAAACAATTTTTTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTATAATAAAATAAT
1 CCTTTTT-TTTT-TTCATAAAACAA-TTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTATAATAAAATAAA
* * * * * *
23167 ATTAAGTTTTTTAATATTTCAACAATTAATAAGTAGGATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAA
63 ATTAAGTTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCAA
23232 AC
128 AC
23234 TAGTTTAAAT
Statistics
Matches: 111, Mismatches: 15, Indels: 7
0.83 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
138 7 0.06
139 13 0.12
140 36 0.32
141 55 0.50
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.43
Consensus pattern (139 bp):
CCTTTTTTTTTTTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTATAATAAAATAAAATT
AAGTTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAAATAAATCTATTTACCAAACC
AATTCAATG
Found at i:23347 original size:689 final size:681
Alignment explanation
Indices: 21771--23329 Score: 1455
Period size: 688 Copynumber: 2.3 Consensus size: 681
21761 TTTTTATTCG
* * * * * * *
21771 TACAACCTTATTTTGAATAAAATCATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTTAGTAAAAT
1 TACAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAG
* * *
21835 ATTT-AAAAATAAACCTGTTTATCGAACA-AA-TTCAA-ATAGTTAT-AACTATTTAAAAAATTA
64 ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAA-ATAAGTTCAAGA-AGTTATGAA-TA-TT-----ATTA
* * * * * * * * *
21895 TCTGTTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATGAAATAATTATTTCTGTTTATACAAGTTT
119 TCTATATCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTT
* * ** *** * * * *
21960 ATTTC-GACTAAACTAATACAAATTTATTAATATTCTGAATATTAATAAGTAAAAGACTTAAGAA
184 -TTTCAAAATAAAAAAATAGTTATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAA
* ** * * *
22024 ATAAATCTATTTTTTGAATAAGTTAAAAAAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATC
248 ATAAATCTATCTACTAAATAAGTTAAAAAAGTTATAACTATATGAACAATTATCTAATTCAAATA
* *
22089 GTTATAACCTTCGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAAT
313 GTTATAACCTTCATTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAACTTTATTCGAAATAAAAT
* * * * *
22154 AACACTAATTTATAAATATTCCAAAAATTATTAAGTAAAAGTATTAAAAAATAAAATTGTTTACC
378 AACAATAATTTATAAATATTCCAAAAATCAATAAGGAAAAGTATTAAAAAATAAAATTATTTACC
* **
22219 AAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCATTTAAAAGTGTTATGACATTTTGT
443 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGATAAACAATTATCCATTTAAAAGTGTTATGACATTTTGT
* * *
22284 TTTGTAATAAAACAATTGTTTCTGATTATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
508 TTTGTAATAAAACAATTATTTCTGATTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATT
* * * *
22349 AATATTTCAAAAATTAATAAATAGAAGATTTAAAAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTA
573 AATATTTCAAAAATTAATAAATAGAAGATTCAAAAAATAG-AAT-ACTATTTAAACAA-TATCCA
*
22414 TTTCAGTGATTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAAATGTTTTTGCTCA
635 ATTC---GA-TATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAACAAATGTTTTTGCTCA
* * *
22465 TACATGCTTATTCGAATAAGATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGAT
1 TACAAGCTTATTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGAT
* * *
22530 TTAATAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAGAAGTTATGACTATTATTATCTATATCAAAT
66 TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATAAGTTCAAGAAGTTATGAATATTATTATCTATATCAAAT
* *
22595 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTTTTCAAAATAAA
131 CATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTTTTCAAAATAAA
* *
22660 AAAATAGTTATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATCTA
196 AAAATAGTTATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATCTATCTA
* * * ** * * *
22725 CTAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATATGTGCAATTATCTAATTCAAATAGTTATGATCTTTT
261 CTAAATAAGTTAAAAAAGTTATAACTATATGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTAT-AACCTTC
* * *
22790 ATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAACTTT-TT-GAAATAAAATAATAATAATTT
325 ATTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAC-AACTTTATTCGAAATAAAATAACAATAATTT
* * ** * * * **
22853 ATTAATTTTTGAAAAGTCAATAAGGAAGAG-ATTTAAAAAA-ATAAATCTATTTGCTGAACAAGT
389 ATAAATATTCCAAAAATCAATAAGGAAAAGTA-TTAAAAAATA-AAAT-TATTTACCAAACAAGT
* * ** * * * * * *
22916 TCAAATAGTTATTACTAGATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTTTTTTTCAT
451 TCAAATAGTTATGACTAGATAAACAATTATCCATTTAAAAGTGTTATGACATTTTGTTTTGTAAT
* ** * * *
22981 AAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTTG-GCTAAAGTAAAATTAATTTGTTAATATT
516 AAAACAATTATTTCTGATT-ATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATT
* * *
23044 TCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTCAAAAAATA-AAT-TTATTT-ACCAA-A-CCAATTC-A-A
579 TCAAAAATTAATAAATAGA-AGATTCAAAAAATAGAATACTATTTAAACAATATCCAATTCGATA
* * * * *
23101 TGCCTTTTTGTTTTGT-TATAAAACAATTTTTTTTTGTTCA
643 TGACATTTTGTTTTGTCT-TAAAACAA-ATGTTTTTGCTCA
* * * * * * *
23141 TAGAAGCTTATTTATAATAAAATAATATTAAGTTTTTTAATATTTCAACAATTAATAAGTAGGAT
1 TACAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAG
*
23206 ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACT-AGTTTAA-ATAGCTT-TGAATATTTGAACAATTA
64 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAA-TAAGTTCAAGA-AG-TTATGAATA-TT-----ATTA
* * *
23267 TTTATATCAAAT-AGTTTTAACCTTTTGTTTTATCGA-AAAACAATTATTTCTATTCATATAAGC
119 TCTATATCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTATC-ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
23330 CTATTTGGAA
Statistics
Matches: 710, Mismatches: 124, Indels: 72
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
674 1 0.00
675 23 0.03
676 18 0.03
677 19 0.03
678 65 0.09
679 5 0.01
681 5 0.01
682 1 0.00
683 1 0.00
684 61 0.09
685 6 0.01
687 8 0.01
688 221 0.31
689 175 0.25
690 8 0.01
692 1 0.00
693 54 0.08
694 36 0.05
695 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (681 bp):
TACAAGCTTATTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGAT
TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATAAGTTCAAGAAGTTATGAATATTATTATCTATATCAAAT
CATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTTTTCAAAATAAA
AAAATAGTTATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATCTATCTA
CTAAATAAGTTAAAAAAGTTATAACTATATGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTATAACCTTCA
TTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAACTTTATTCGAAATAAAATAACAATAATTTAT
AAATATTCCAAAAATCAATAAGGAAAAGTATTAAAAAATAAAATTATTTACCAAACAAGTTCAAA
TAGTTATGACTAGATAAACAATTATCCATTTAAAAGTGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAAC
AATTATTTCTGATTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
TTAATAAATAGAAGATTCAAAAAATAGAATACTATTTAAACAATATCCAATTCGATATGACATTT
TGTTTTGTCTTAAAACAAATGTTTTTGCTCA
Found at i:23417 original size:177 final size:173
Alignment explanation
Indices: 23137--23571 Score: 403
Period size: 177 Copynumber: 2.4 Consensus size: 173
23127 TTTTTTTTTG
* * ** * *
23137 TTCATAGAAGCTTATTTATAATAAAATAATATTAAGTTTTTTAATATTTCAACAATTAATAAGTA
1 TTCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAA-TTTATTAATATTTTAA-AATTAATAAG-A
*
23202 GGATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGCTT-TGAATATTTGAACAATT
63 -G--ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAG-TTAAGAATATTTGAACAATT
* * * *
23266 ATTTATATCAAATAGTTTTAACCTTTTGTTTTATCGAA-AAA-CAATTATTTCTA
124 ATCTATATCAAATAGTTATAA--TTAT-TTTTAT--AATAAAGCAATTATTTCAA
* *
23319 TTCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAATAAGAGA
1 TTCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGAGA
* * ** * * * * *
23384 TTTAAAAAATAAATCTTTTTGTTGAATTAGTTTAGATTGTTAAGACTATTTTAACAATTATCTAT
65 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGAATATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
23449 TTCAAATCGTTATGATTATTTTTGTAATAAAGCAATTGTTTCAA
130 ATCAAATAGTTATAATTATTTTTATAATAAAGCAATTATTTCAA
* *
23493 TTCATATAAG-CT-TGTTGGAATAAAATGATATTAATTTATTAATATTTCTAATATTAATATGTA
1 TTCATATAAGCCTAT-TTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-TAAAATT-A-A--TA
23556 AGAGATTTAAAAAATA
60 AGAGATTTAAAAAATA
23572 TATATGTTTA
Statistics
Matches: 212, Mismatches: 31, Indels: 25
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
172 3 0.01
173 40 0.19
174 27 0.13
175 4 0.02
176 2 0.01
177 81 0.38
179 1 0.00
180 1 0.00
181 21 0.10
182 32 0.15
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (173 bp):
TTCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGAGAT
TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGAATATTTGAACAATTATCTATA
TCAAATAGTTATAATTATTTTTATAATAAAGCAATTATTTCAA
Found at i:24084 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 23106--26639 Score: 1983
Period size: 181 Copynumber: 19.6 Consensus size: 180
23096 TTCAATGCCT
* * * * * * * *
23106 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTATAATAAAATAATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * *
23171 AGTTTTTTAATATTTCAACAATTAATAAGTAGGATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTA
65 A-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA
* * * * * *
23236 GTTTAAATAGCTT-TGAATATTTGAACAATTATTTATATCAAATAGTTT-T-AACC
128 GTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-CTTTATGAA-C
* * * * **
23289 TTTTGTTTTATCGA-AAAACAATTATTTCTATTCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* ** * **** **
23353 ATTTAATAATATTTTGAAAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTGTTGAATTAGT
65 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGT
* * * * * * *
23415 TTAGATTGTTAAGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-A-
130 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAAC
* * * * * * * * *
23464 TTAT-TTTTGTAATAAAGCAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTGTT-GGAATAAAATGATATTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
23527 TTTATTAATATTTCTAATATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATATATATGTTTACCGAACTAGA
66 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGT
* * * * * * *
23592 T-AAATATTTAGGACTATTTTAGTAATTATCCACTTT-AAAT-TATTTTGACC
130 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCT-TTATGAAC
** * * * * * * * * *
23642 TTTTGTTTT-TACATAAAATGATAGTTTTTGTTCACT-CCAGTTTATTTAAAATAAAATATTATT
1 TTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * *
23705 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-A-A-ATTTGAAAAATGAATCTATTT-TCAAACCAG
64 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * ** * *
23766 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCTTAT-TGT-TGTTAC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATG-AAC
* * * * * *
23817 TCTTTATTTTGTTATAAAATAATTGTTT-TTTTTATACTAGCTTATT-ACGAATAAAATAATACT
1 T-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATACT
* * * * *
23880 AAGTTACTAATAGTTT-GAAAATTAATAAGTAGTAGATTTAAAAAATAAAGCTGCTTACCAAACA
64 AATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * *
23944 AGTTCAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAAC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTATGAAC
* *
23998 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATGATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
** * ** * *
24063 TTTAAGAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAACATAAAAAATAAAT-TCGTTTACCGAACCAG
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* * * * *
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* * * * *
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1 TTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
** * * * * * * *
24242 AATTTATTAACT-TTTTGAACATTAATCAA-TATGAGATTTTAAAAATGAATATTTTTACCGAAT
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* * * * *
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* * * *** *
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1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
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* * * * * **
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* * ** * ** *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA-ATACTA
* * * * * * * ** * *
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* * * * **
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* ** * * * *
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* * ***
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * ** * *
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*
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* * * * * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
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* * * * * *
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** * ** * *
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1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * * * ** *** *
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* * ** * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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** * * * * * ***
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* * * *
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1 T-TT--T-G------TT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAA
* * * *
26221 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTT
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* * * * * *
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* * * * * *
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1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAA-T-AAAATAATAC
* * * * *
26410 TAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTAAAT
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* * * * *
26474 CAA-TTCAAATGGTTAAGACTATTT-AAAAAGTTATCTATTTCAAATCATTCTG-AC
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* * * ** * * * *
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1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
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* ** ** * * * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAA-GAGATT-T--AA-AAAAT-AAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * *
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* * * * **** *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * ** * * *
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* *
31390 TGA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCA-A
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* **
31442 AAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCGGTTCAAATAGTTATGAC
1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* ** * * * * * *
31503 TA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTTATATAATAATTATTTT
66 TATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * *
31567 AGTTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCA-A
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* * * * * * *
31619 AAAATTAATAAGCATGAAATTTGAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAATTTAAATAGTTATGA
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* * * * *
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* * * * *
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* * *** * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * ** *
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* * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * *** ** * ** *
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* ** * * * * * *
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130 ATTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATA
* * * * * * * * * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* ** **
32407 CTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTT
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* * * * *
32471 TTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTGATTAATATT-TCA
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* ** * ** * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * *
32587 TAATTGAACAATTATC-ATTATGAAATCATTAAAATC-TTTGTTTTATCATAAAATAATTG-TTT
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* * ** **** *
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* * * ** * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GA
* ** * * * * *
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* * * * * * * *
32827 CATATCTTACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTC-AATTTTATTGACATTCA-G
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * * ****
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* * * * *
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128 TTA--TTCATACAATCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATA
** * **** * *
33240 CCAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTAAATC-AGTTCAAATAATTATGG
1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * *
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* * **
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* * * *
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* * * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
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66 TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TT
* * * *** * * *
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* * * *** ** *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** * * * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * *
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66 TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA
* * *
34261 GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGCTATTAATATT-TCA
131 -TTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTAT-A
* * * * * * *
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1 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* *** * ** **
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* * *
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* * * ** * ** *
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* * * ** * *
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* * *** * **
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* *
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* * * * * * * * **
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**
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* * * *
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* * **** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * **** *
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* ** * ** *
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* * *
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* * * * * * *
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65 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
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* * * * *
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* * * * * *
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** ** * *
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128 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTC
* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * *** * **
33907 ATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAACCGATTGATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAG
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* * * * ** * * *
33968 ATTCAAAAAATAAATTTATTTATTAAATTAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AAGTAATTATTT
66 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCT
* * * * * * ** **
34032 ATTTCAAA-TCTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATACTTTTTGTTC
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* * * * * ** * *
34083 ACACAAGCTTATTCGAATTAAAATATTACTAATTTGTTAATATTTTTGACAATTAATAAGTAAAA
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * * * * * * *
34148 AATTTTTAAAATAAATATTTTTATCGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCT
65 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
34213 ATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTC
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* * *
34265 ATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGA
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
34329 GATTTAAAAAATGAATCTGCTTA-CTGAACAAATTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATC
65 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * ** **
34393 TATTTGAAATTGCTATAAGATTTTGTTTTGTCATAAAATTATT-TATTCTA-TTC
129 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTC-AGTTC
* *
34446 ATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAACACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAA
* * ** * ** * * **
34508 -AGGATGTAAACAATAAATCCATTTACCAAACAAGTTCATCTTGTTATGGCTATTCAAACAATTA
63 GA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
34572 TTTATTTC-AATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCTA-TTC
127 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTC-AGTTC
* *** * ** * *
34627 ATTCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATGTTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
34692 ATTTAAAAAATAAAT
66 ATTTAAAAAATAAAT
34707 ATTTTTACTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC
Found at i:31742 original size:538 final size:535
Alignment explanation
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* * * ** * * * * *
30921 ATTT-TAAAACAAATGTGTTTGTCGAACCAATTCAAATCGTTAAGACTATAAAAACAATTATCTA
63 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTA
* * * * * * *
30985 TTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTCATCATAAAATAATTATTTCATTTCATAAAAACTTATTT
128 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-ATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * *
31050 AGAATAAAA-AATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAAATAA
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31114 ATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAA-AAGTT-TGACTATTTGAACAATTTTCCATTT-AAAGTTGT
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* * **
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* * * *
31241 ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTA
382 ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTA
* * * * * * *
31306 AACCAATT-AAATAGTTATAACTATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATCTTTGTTT
447 AA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTGTTT
* *
31370 TCTCATAAAATAATTGTTTCTGATC
511 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
*
31395 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAGTAAGAGATT
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAATAAGTAAGAGATT
* *
31459 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCGGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTT
66 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTT
** * * * *
31524 CAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTTATATAATAATTATTTTAGTTTATACAAGCTTATTCAAA
131 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
31589 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAAATTTGAAAAAATAAATC
195 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * * * *
31654 TATTTATCGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA
258 TATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * *
31719 CCATTTATTTTGTCATCAAACAATTGTTTTAGTTCATCA-AACCTTATCCAAAATAAAATAATAC
323 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCAT-ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
** ** * ***
31783 TACTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGCTACCTATTT
386 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TTAAAC
* * * * * * * ** **
31847 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCAATTTTAAATCATTATTTCCTATTGTTTTGT
450 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTGTTTTGT
* *
31912 CATAAAACAATTGCTTT-TCAAC
514 CATAAAACAATTG-TTTCTGATC
* * * * **
31934 ATACAAACTTTTTTCGAAAT-AAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAGAATTAATTCGTAAG
1 ATACAAGC-TTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AA--AATAAGTAAG
* * * * * * * *
31998 AGATTTAAAAACTTAATTTGCTTACCAAACCA-TTGCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTAT
61 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTT-CAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
* * * * * * * * **
32062 TTATTTCAAATCATTTTAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTT-GTTCATACTATTT
125 CTATTTCAAATCATTATGACC-TTTT-GTTTATCATAAAATAATT-ATTTTAGTTCATACAAGCT
* * * * * *
32126 TATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTAATAATATTCCAAAACTTAAT-AGCCAAGAAAATTAAAA
187 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAA
* * * * * * ***
32190 AATAAATCTATTT-GCTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGTTTATCTATTTCAAA
250 AATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * ** * * ** *
32254 TCGCTATGA-CTTTTTTTTTGTTGTAAAACAATTATTTTGTTTGTATAAGCTTATTCAAATTAAA
314 TCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAA
* * *** * * * * * * *
32318 ATAATATTAATTTATTAATATTTTTTATATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAGTAGATCTGTTTA
379 ATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * *
32383 TCGAATCAGTTAAAATAATTGTGGCTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
444 T-TAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTT
* *
32448 GTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTTATC
507 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * *
32476 ATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATAGTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATA
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGA
** ** * * *
32540 GATTTAAACTATAAA-ATAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAATTAATT-GAACAATTATC
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTAGAACAATTATC
* ** * * * * *
32603 -ATTATGAAATCATTAAAATC-TTTGTTTTATCATAAAATAATT-GTTT--CTCATATAAGATTA
126 TATT-TCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
**** *
32663 TT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
189 TTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
32727 TAAATGTATTT-GCTAAACCAGTTCAAATAATT-TAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT
252 TAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * * *
32790 TGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCGAAATAA
315 CGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * * * * * * *
32854 AATAATTCAATTTTATTGACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAAAGAATTGAAAAAATAAATATGT
378 AATAATACTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * *
32918 TTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAACCT
441 TTATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-
* * *
32983 TTTGTTTTGACAT-AAACAATTGTTTCGGTTC
504 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * *
33014 ATAAAAGCTTATCCAAA-ATAAAATAATACTAATTT-CTGAATATTTCAAAAATTAA-TAAGCAA
1 ATACAAGCTTATTCAAATA-AAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTCAAAAAATAAGTAAG--A
* * * * **** * *
33076 GAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACAAATTTTGGTAGTTACT-ACTATTTGAACAATTG
62 GA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTAGAACAATTA
* * * *
33140 TCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTATGATAAAATAATTATATCAGCTT-ATACAAGC
124 TCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAG-TTCATACAAGC
* * * *
33204 TAATTTGAAAAT-AGATAATACTAATTTATTAATATTC--CAATTAATAAGT----GATTTAAAA
186 TTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * *
33262 AATAAATCTATTTTTTAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAA
250 AATAAATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * ** * * * * *
33326 TCATTTTTG-CCTTTTGTTTACTCATATAACAATTGTTTTTGATCATATAAACTTATTCATAATA
314 TC-GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
*
33390 AAATAATACTAATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
377 AAATAATACTACTTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
** * * * * * * *
33454 TTACGGAACCAGTTCAAATAATAATGACTATTTGAACAATTGTATACTTT-AAATTGTTGTAACC
441 TTA-TTAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACC
* * * *
33518 TTT-TTTCTATCATAAAACGATTATATCT-ATTC
504 TTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * *
33550 ATACGAGCTTATTCAAA-ATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGA
1 ATACAAGCTTATTCAAATA-AAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTCAAAA--AATAAGTAAGA
* ** * * * *
33614 GATTTAAAAAGTAAAT-T-TTCTTGCTAGACTAGTTCGAATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTA
62 GATTTAAAAAATAAATATGTT-TACCGA-ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTA
** * * * * *
33676 TCTATTTCAAATCATTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTAATTCATACTAGCA
124 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAA-TAATTATTTTAGTTCATACAAGCT
* *
33740 TATTCGAAAA-AAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTAAAA
187 TATTC-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * *
33799 AAATAATTCTGTTTAACTAACTAGTTCAAATAATTATGACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
249 AAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
33864 -CTGTTATAACCTTTT-TTTTTTCATAAAACAACTATATTT-GTTCATATAAGTTTGTTCAAAAT
314 TC-GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAAT
** * ** * *
33926 AAAATAATACTAAC-CGATTGATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTCAAAAAATAAATTTA
376 AAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * *
33986 TTTATTAAATTAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AAGTAATTATTTATTTCAAA-TCTTATGAC
440 TTTATTAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
* * * * * ** * *
34049 TTTTTGTTCTATTATAAAATAATACTTTTTGTTC
503 -CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * * ** ** *
34083 ACACAAGCTTATTCGAATTAAAATATTACTAATTTGTTAATATTTTTGACAATTAATAAGTAAAA
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATA--TTT--CAAAAAATAAGTAAGA
* ** * * * * * * *
34148 AATTTTTAAAATAAATATTTTTATCGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCT
* * * * * *
34213 ATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTATCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATT
127 ATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT
* * *
34278 CAAAATAAAATAATACT-ATGCTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATG
191 CAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
** * * * * * * *
34342 AATCTGCTTA-CTGAACAAATTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATTGC
254 AATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* ** * * * * *
34406 TATAAGATTTTGTTTTGTCATAAAATTATTTATTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAA
318 TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTT-TAGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAA
* * * * * *
34469 TAACACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA-AGGATGTAAACAATAAATCCATT
380 TAATACTACTTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTATT
** ** ** * ** * * *
34531 TACCAAACAAGTTCATCTTGTTATGGCTATTCAAACAATTATTTATTTC-AATTGTTATGACTTT
442 TATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CT
*
34595 TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCT-ATTC
505 TTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTGA-TC
* *** * ** * *
34627 ATTCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATGTTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AA--AATAAGTAAGAG
* * * * * *** ** * * *
34692 ATTTAAAAAATAAATATTTTTA-CTAAACAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTA-AAAAAGTAAG
63 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCA--AATAGTTATGACTATTAGAACAA-TTAT
** * ** * * * ** * *
34754 AGAATT-AAA--AAAATGA--ATCTGTTTACCAATCAAGTTCACA-TAGTTATGACTATCGGA-A
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTATC-AT-AAAAT-A-ATTA-TT-TTAGT-TC--ATA
** * * * * * * * * ** **
34812 CAATTATCTATTCCAAA-ACATTATTAGCT--TTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTC
181 CAA-GCT-TATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATAT--TCAAA-AATT-AATAAG-T-
* * ** * * *
34873 ATGCAAGCTTAATTTGAATAAAATATTATAAATTTAT-TAA-TA-TTCCAAAAATTAATTAGTAA
237 AAG--AG----ATTT-AA-AAAATA-AATCTATTTATCAAACAAGTT-C--AAA-TAATTA-TGA
** * * * * *
34935 AAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTTCCAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGTACAATTAT
288 CTA-TTTGAACAAT-TATCT-ATTT-C--A-A-A-TC-----GTTATGAC-CTTT-T---A-T-T
* * * * * * * ** * ** *
35000 CTATATCAAATTATTATGACCATTTGTTTTG-TCATAAACCAATTGTTTTTGTTTAAACAAGTTT
332 -T-TGTC--A-TA--A--AACAATTGTTTAGTTCAT--A-TAA--GCTTAT-TCAAAATAAAATA
* * * ** * *
35064 ATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAATTTAATAAGTAA-AGGATTTTAAAAA
382 ATAC-TACTTTATTAATA------T-TTCA-A----AAA-TTAATAAGTAAGA-GA-TTTAAAAA
* ** * * * * *
35128 ATAAATTTGCTTATTGAGCGAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTG-ATCAATTATTTATTTCAAAT
431 ATAAATCTATTTATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAAT
**
35192 TGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTC
494 TGTTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * * *
35235 ATACAAGTTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-TGA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAA--AATAAGTAAG-
* * * * * * * * * * *
35298 AGATTTAAAAAATTAATCTATTTACTGAACAAGTTCAACTAGTCATGTCCATTAGAACTATTATA
61 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
** * * * * * * *
35363 TATTTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTTGA
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTT-A
* * ** * ** * * *
35428 AT-AATTATCTATTTCAAATTGTTA-TGAACTTTTGCTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTTCATC
189 TTCAA--A---A--T-AAAATAATACT-AA--TTT-ATTAAT-ATTCAAA-AA------TTAATA
* * * *
35490 A-TACA-AGCCTATTCAGAATAAA-ATAATACTAATTTAT-TAA-TATTTC-AA-AATTAATGCA
234 AGTA-AGAG---ATTTA-AA-AAATA-AAT-CT-ATTTATCAAACAAGTTCAAATAATT-ATG-A
* * * * * * * * * * ** *
35548 CAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAGTAGTTCA-AACAGTTACGACTATTTGAACAA
288 C----TATTTGAACAAT-TATCTATTT--C-AAATCGTT-ATGAC-CTT-TTA-T-TTTG-TC-A
* * * * * * *
35612 TTATATATGTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAG
338 -TA-A-A--AC-AATTG---------TTTAGTTCAT-AT-AAGC--TT-ATTC-A---AAATAA-
** * * *
35677 CATATTTGGAATAAAATTATAATAATGTAATAATATT-ATGAAAATTAAGAACTAAGAGATTTAA
378 -A-A--T--AATACTACT-T--T-AT-TAAT-AT-TTCA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * * * * * * * *
35741 AAAGTAAATTTGTTTGTCGAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATCAACAATTTTGTATTTCAA
428 AAAATAAATCTATTTAT-TAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
** * * *** * * * *
35806 ATCATTATGACATTTTATTTTGTTGGAAAATAATTTTTTCAGTTC
492 ATTGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * ** * * *
35851 TTACTAA-CTCATTTGGAA-GAAAATAA-AATAAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATCAA-TA
1 ATAC-AAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACTAATTTAA-TAATATTTC-AAAA--AAT-AAGTA
* * * * * * * * * * * *
35912 AAAGATTTGAAAAATAATTCTATTTGCCAAACTAATTCAAATAATTACT-ACTATTTGAATAATT
59 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTAGAACAATT
* ** * * * * *
35976 ATTTATTTCAAATTGTTATGGCATTTTGTTTTGTCATAAACA-AATGT-TTTT-GTTCAAATAAG
123 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAA-ATAAT-TATTTTAGTTCATACAAG
* * *** * * * ** *
36038 TTTGTTTGGAATAAAATATTATTAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAA
185 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * * *
36103 AAATAAATATGTTTA-CTAAACCAA-TTCAATTAGTT-TAACTATTTGAACAATTATTTATTTCT
249 AAATAAATCTATTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * ***
36165 AATTGTTATGACCATTTATCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTATAT-AGTCTTATTTGGA
312 AATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TAGTTCATATAAG-CTTATTCAAA
* * * * * *
36228 TTAAAGTAATGCTTA-TTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATAAGCAATG-GATTTAAAAAATGAA
374 ATAAAATAATAC-TACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAA
* * *** * * * * * ** * *
36290 TTTGTTGCCCTAACCAGTGCAAATAGTTATAAC-AGTTTAAATAATTAAGTACTTCAAATAGTTA
436 TCTATT-TATTAAACAGTTCAAATAATTATGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* * * *
36354 TAAACTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCTGATC
499 T-GACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * * * * * * *
36392 GTACAAGCTTATTCAAAATAACAA-AATTCTAACTTATTGATATTCTGAAACTTAATAAGTAAAA
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAA--AAATAAGTAAGA
* * * ** *
36456 GATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAAGAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCT
*** * * * *
36521 ATTTCAAATTGCTATAACCCTTTTATTTTGTGATAAAATAACTT-TTTCTA--TCAATACAAGCT
127 ATTTCAAATCATTATGA-CCTTTT-GTTTATCATAAAATAA-TTATTT-TAGTTC-ATACAAGCT
** *
36583 TATTTC-AAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
187 TA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * *
36647 AATAAATCTATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAAT
250 AATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* ** * * * * * * *** *
36712 TGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGGTCATACAATCTTATTTGGATTAAA
315 CGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAA
* * ** * * * * *
36777 ATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATA-ATATTTTAAAAATAAATATGTTT
379 ATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
*** * * *
36841 AGCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC---
443 ATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT
*
36903 -TTTTGT--T---TC-A-----T-T-AT-
507 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * *
36917 A-A-AA-C-AATTC-----AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-AA--AATAAGTAAGAG
* * * * * * *
36973 ATTTAAAAAATAAATACGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTA
63 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTA
* * * *
37038 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATCAT---AT-ATGA----A-TTCATATAGGCTTATTC
128 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-ATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * ** * *
37094 GAAATAAAATAATACTAACTTATTACTATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGATTT-AAAAATGAA
192 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
37158 TATATTTA-CTAAACAA-TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
256 TCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * *
37221 TGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATA
320 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TAGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATA
* * * * * * ** * *
37284 ATA-TAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAACTAA-AAATTTAAGCAATAAATCTGTTTGTT
382 ATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATT
* * * * * *
37347 GAACACA-TTCAAATAGTTAT-ACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG
446 -AA-ACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTG
*
37410 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-ATTC
508 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * * *
37438 ATAAAAGCTTATTCGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATCAATAAGTAAGA
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGA
* * * * * * *
37502 GAGTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACGAGTTCAAACAGTTATGATTATTTA-AATAATTATT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATC
* * * * **
37566 TATTTCGAAT-GTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAATTA
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTA
* * ** **
37629 TTCAGAATAAGATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAGCT
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * *
37690 AAATCTGTTTA-CTAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATTTATCTCAAATCA
253 AAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * * * * * * *
37754 ATATGAAC-TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-CTGTCTGTACAAACTTATTTAGAGTAAAA
317 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGT-TC-ATATAAGCTTATTCAAAATAAAA
* ** *** * * * *
37817 TATTGTTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATT--T-A-TAAGAGCTTTAAAAAATAAATGTATTTG
380 TAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
** * ** * ** *
37877 CCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT
444 TTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTT
* * *
37942 GTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTC
507 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATC
* * * * * * *
37971 CTACATGCCTATTCCAAAT-AAAATAATATTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAA-TAAGCAA
1 ATACAAGCTTATT-CAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAA-TAAGTAAG---
* * * * * * * *
38033 AGAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATACTTTTGACTATTTGAATAATTAT
61 AG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
* ** * * * * * * *
38098 CTATTTAAAATTGTTGTGACCTTTT-TATT-T--TAATACAATTGTTTTATTTCGTAAAAGCTTA
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
* * * * ** *
38159 TCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAA-AAGTTGGAAGATTTAAAAC
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATT-AATAAGTAAG-AGATTTAAAAA
* ** ** * * * * * *
38223 ATATATC-AGTTTATTGAATTAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAATAATTATCAATTTCTAAT
251 ATAAATCTA-TTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * *** * * *
38287 CTTTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAAGAAAA
315 CGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAA
* ** * * *
38352 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGGGCGA-TT-----AT---T-TGTTTAC
380 TAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
* * * * * * ** * *
38407 TAAACCAATTCAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATATATTTCAAGTCATTATAAACTTTTG
445 TAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-GACCTTTG
* *
38472 TTTTGTCATAAAACAATTATTTAT-ATTC
508 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * *
38500 ATGCAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATATAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGA
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAA--AATAAGTAAGA
* * * * ** *
38564 GATTTGAAAAATAAATTTG-TTGCTTGAACCAGTTCAAATA---A-GGTTA-T-GAATAATTATC
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
* * * * * * * * * * *
38622 TATTTC-AAGCTATTATGTCCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTG
126 TATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
* * * * *
38686 TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATT
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * * * *
38747 AAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAATTAGTTATAACAATTTAAATAATTATTTATTTCATATCT
253 AAATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * ** **
38811 TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTGAT-GCAGTCTTATTCGGAATAAA
317 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATATAAG-CTTATTCAAAATAAA
* * * * * * *
38874 GTAATGCTAATTTATTACTA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTAGAAAATGAATCTGTT
379 ATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * * * **
38937 GGCTTGACCAGTAT-AAATAGTTATGATTGTTTGAATAATTATCTGTTTCAAATAATTATGACCT
442 -TATTAAACAGT-TCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-
* *
39001 GTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT-ATTC
504 --TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * ** * * * *
39035 ATACAAACTTATTCAAA-ATAAGATAATTTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGG
1 ATACAAGCTTATTCAAATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGA
* * * * * * * * * * * *
39099 GATTTTCAAAACTGAGTTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGATTATCT-GAAC-TTTAC
62 GA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAACAATTAT
*** * * * *
39162 CTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTTTTTATCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCCTACAAGCTTA
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTA
* * * *
39226 TTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATT-ATCATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
189 -TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * *
39289 ATAAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATC
251 ATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* ** * * * * ***
39354 ATTATGATTTTTTATTTTGTCATAAAACTACTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
316 GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * * *
39419 TAATATTAGTTTATTAATATTTCAATAGTTAATAAG-CAGAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA
380 TAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
*** * *
39483 CCGAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTC
444 TTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT-
** * *
39548 GTTTCATCATAAAACAATTGTATT-GGTTC
507 GTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGATC
* * * * ** *
39577 ATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAA-AAAACTAATTTATTAATATTT----TGATGAGTAAGAGA
1 ATACAAGCTTATTC-AAA-TAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAATAAGTAAGAGA
* * * * * * * * *
39637 TTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
64 TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * *
39702 TTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCACACAAGCTTATTC
129 TTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC
* *
39766 TAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATAA
192 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * *
39829 ATATGTTT-TCTGAACATGTTCCAATAGTT-TAGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAACTAGT
255 ATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * * *
39892 TATGACATTTTGTTTTGTCTTAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATA
318 TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * **
39957 ATATTATTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG
382 ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TT
* * * * * * * * *
40022 AGTA-AGTTCAAATAGTTTTAT-A-TGTTTAAACAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTT
446 A-AACAGTTCAAATA--ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTT
* *
40084 GTTTTGTCGTAAAGCAATTGTTTCT-ATTC
507 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * * * * * *
40113 ACATAAGTTTATTCATAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTGAAAATTAATATGTAGGA
1 ATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTCAAAA--AATAAGTAAGA
* * * * * * *
40177 GATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCT
* * * * * ** **
40242 ATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTCTATCACAAAACAATTGTTTCTA-TTCACGCAAAATTAT
127 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTAT
* * * ** * *
40306 TCAAAATAAAATAATACTGATCTATTAAAAGTTTGAAAATTAATAAGT----GCTTTAAAAACTA
190 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
** * *
40367 AATCTATTTA-CTAAA-ATAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCG
254 AATCTATTTATC-AAACA-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * ** * *
40430 TTATGATC-TTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAAT
317 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* ** * *
40494 AATACTAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TT
381 AATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATT
* * * * * * *
40558 GAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTTATCATAA--AAC-ACATTCAAATAGTTATGACTATT
446 -AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA--ATAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGAC----
* ** * *
40620 TAAACAATTATTTATTTGAAATAGTTATGACATTTTGTTT-TG-TC
503 ----C--TT-TGT-TTTGTCATA---A-AACA-ATTGTTTCTGATC
* * * * * * *
40664 ATAAACAAATTGTTTCTATTCATACATGTGTATTTGAAATAA-AATAACACTTATTCATATTCCA
1 AT--AC-AA--G-CT-TATTCA-A-A----TA---AAAATAATACT-A-ATTTAATAATATTTC-
* * * *** * * * *
40728 AAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAGATAAATCCATTTACCCAGCAAGTTCAAATAGTTATGAT
47 AAAA--AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * *
40793 TAATTA-AACAATTATTTTTTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTC
110 T-ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTT
* ** ** * *
40856 TA-TTCATACAAGTTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTTGTATTTTAAAAATTAATAGG
172 TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAG
* * ** ** * * * * *
40919 TAAGAGATCTAAAAAATAAATTTGCTTATTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAAT
236 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
* * * * ** **
40984 TATCTATTTC-AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAAA
301 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGC
* * **
41048 TTATTCAGAATAAAATAATATTTA-TTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAA
365 TTATTCAAAATAAAATAATA-CTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * * *
41108 AACTACATCTGCTTT-TTGAAATAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATCTCAA
429 AAATAAATCT-ATTTATT-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
** * * * * **
41172 ATCATTATGATCTTTATTTGGTTATAAAACAATTGTTTCTTTTC
492 ATTGTTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* *
41216 ATACAAGCTTATTCAGAGT-AAAGTAATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAGTTAATAAGTAAG
1 ATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAA---AATAAGTAAG
* * * * * * *
41279 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAATTCAATTAGTTAAGACAATTAGAACAATTATC
61 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
** * * * * * * * *
41344 TATTTCAAATTGTTCTAACCATTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTCAATTGATACAAGCTTAT
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTAT
* * * * *
41409 TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT-ATGA-TCATGAGATTTAAAAAAA
190 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAA
* * *
41472 TAAATCTGTTTA-CGGAACAAGTT---A-AA--AT--CGATTTG-------A-CTATTT-AAAGT
252 TAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T
* * * *
41519 CATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT-TAAAACTTA-TCAAAATAA
315 CGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAA
* ** * * *
41582 AATAATACTACTTTACTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAACTAAAACTATTT
378 AATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * * * ** * *
41643 GTTTAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATAATCTTT
443 -ATTAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT
* * * *
41708 TTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCAGCTC
507 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * *
41737 ATACAAG-TGCATT-AGGAATATAATAA-AA-ACT-ATTTATTAATATTTCAAAATTTTATAACT
1 ATACAAGCT-TATTCA--AATA-AA-AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA---AATAAGT
* * * * * ** * * * * *
41797 AAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACCAATAGAAATAATTTTAAGTATTTGAACAATT
58 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATT
* * * * * * * *
41862 ATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCT
123 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCT
* * * * *
41927 TGTTCAAATTAAAATAACACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAA
187 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * ** * * *
41992 GTGAATCTATTTACCAAACCATTTTTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
251 ATAAATCTATTTATCAAA-CA--AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * *** ***
42057 ATCGTTACAACATTTTATTTTATCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACACTTTTATTTGGAATA
313 ATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * * ** * ** * * *
42122 AAATAATATTAATTTAATAATATTTGGAAACTTAATAACCAAGAAAATT-AAAAATAAATCTAAT
377 AAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
*** ** * * *
42186 TGCCAAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTG-CCT
442 TATTAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TGACC-
* * * ** * *
42250 TTTCTTTTGTCGTAAAAAAATCATTT-TGTTT
504 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* *** * * * *
42281 GTACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATACTAATTTAATGATATTTTGAAAATTAATAAATAAGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTCAAAA--AATAAGTAAGAG
* * * * * *
42346 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATGTA
63 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTA
* * ** * * * * *
42411 --TGATATTGTTTTGACTTTTTGTTTAATCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT
128 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-ATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * *
42474 AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAGTTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAACAA
192 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
* * * * * * *
42539 ATCTATTTA-CTGAATAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTCTCTATTTAAAATCATT
255 ATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * **
42603 ATAACCTTTTGA-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAAT
319 ATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT
* * *
42666 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
381 AATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATT
* * * * * * *
42727 AAACCAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAATTGTTAAGATCTTTGT
446 AAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTGT
* *
42791 TTTG-CATAAAATAATTGTTTCTAATC
509 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * ** *
42817 ATAAAAGGTTATTTAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGAG
* * * * ** * *
42882 ATTTAAAATATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAAACTGTTAGAATAATTATCTA
63 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTA
* * * * *
42947 TTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATC-TAACAAGCTTAT
128 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAATTATTTTAGT-TCAT-ACAAGCTTAT
* * * * *
43010 TCAGAATAAAATAAT-CCAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAGA-AAGCAAAAGATTTTGAAAA
190 TCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTC-AAAAATTA-ATAAGTAAGAGA-TTT-AAAA
* * * * * * * *
43073 AATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAT
250 AATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * *
43138 CATTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAA
315 CGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * ** *
43203 ATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TAAAAAAAGATTAAAT-TTTT
379 ATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-A-TAAATCTATT
* * * * * * * * ** *** *
43266 TACTGAACAAATGCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCACTATGACCAA
442 TATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-T
* *
43331 TTGTTTTGTTATGAAAA-AATTGTTT-TAGTTC
505 TTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCT-GATC
* * * * *
43362 ATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATGATACTAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAGT
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAA-A--AATAAGTAAGA
* * * * * * * * * **
43426 GATTTAAAAAGTGAATCT-ATTA-CGAAATCAGTTCAAAAAATTATGGCAATTTCAACAATTATC
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
* * * * * * * *
43489 TATTTCAAATCATTATTACATTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATACAAGTTTAT
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTAT
**** *
43554 TTTGGATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATGTT------T
190 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAAT
* ** * ** * * * * *
43609 --A-C-------CGAAGTAGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCAT
253 AAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * * *
43664 TAT-AGCATTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
318 TATGA-CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAA
** * * * * * *
43727 -AATACT-CATAAAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTG
380 TAATACTAC-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * *
43790 TCAAACTAGTTCTAATAATTAAGACTAAATT-AATAATTATCTATTACAAA---TCAT---TTTT
444 TTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT
* * *
43848 GTTTTGTCATATAACAATTTTTTC-AATTC
507 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* ** * * * *
43877 ATACTAGCTTATTTGGAAT-AAAATAA-AATGAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATATGTAAG
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAG
* * * * * * *
43940 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAGCCTGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTCTC
61 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
* * *
44005 TATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTTCTA-CTATAAAATAATAATTTT-GTTCATACAAGCTTA
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TATC-ATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
* * * * * *
44068 TTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAAT
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * * * * *
44133 AAATATGTTTATCAAATTAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAAATATCTATTTCAAATCGT
253 AAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * *
44198 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
318 TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
** * * * * *
44263 ATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACTG
382 ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TT
* * * * * * *
44328 AATA-AGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGT
446 AA-ACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTGT
* ** *
44392 TTTGTCTTAAAATGATT-TTT-TTATTC
509 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * *
44418 ATACAAGCTTATGTCTAAT-AAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAA
1 ATACAAGCTTAT-TCAAATAAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCA-A-AA--AATAAGTAA
* * * * * ** * * * * *
44480 AAAATTTCAAAAATAAATATGTTTATCAAATTAGATCAAATAG-TCTGACTATTTGAATAAATAT
60 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
* * *
44544 CTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTA
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
* *
44608 TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * * * * * *
44673 CAATTTGTTTATTGAATAACTTTAAATAATTATGATTATTTTAACAATTAT-TATTTGAAATCGC
253 AAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * *
44737 TATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAA
318 TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTT-TAGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAA
* * * **
44800 TAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGCT
380 TAATACT-ACTTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* ** ** *
44862 CATCGAACAAGTTCAAATCTTTGTGACTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGACTT
442 TATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGAC--
* * * * * *
44926 TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTT
503 CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * *** * * ** **
44959 GTAAAATCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AT
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTT--CAAAAAATAAGTAAGA-
* * *** ** * * *
45023 GATCTAAAAAATAAATATATTTTTTGAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCT
* * * * * * * * *
45088 ATTTTAAATCTTTGTGACCTTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
127 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT
*** * * * * *
45152 TGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATGAGTAAGGGAATTAAAAAATAA
191 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
45217 ATTTGTTTA-CTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACGTT
255 ATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * ** ** ***
45281 ATGGCCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGGTTATA-TTCATGCAAATTTATTTTGAATAAAATA
319 ATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * *
45345 ATA-TAAATTTTTTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TC
382 ATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-
** * * * * * **
45407 TTGACACGTTCAAATAGTTACGACTAATTGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
445 TAAACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTG
**
45472 TTTCATCAT-AAACTAATTG--T-T--T-
508 TTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGATC
* * * * * *
45494 AT----G----TTC--AT--AAATAATATTGATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAC
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGAG
** * * * * *
45547 ATTTAAAAAATAAATCCGTTTACTGAACGAGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
63 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
45612 CTTT-TAATCTTTATTATCATTTT-TTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTTT
128 -TTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTAT
** * ** *
45674 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATTAAGTTGGACATTTAAAAAATA
190 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * * *
45739 AATTTGTTCACCAAACGAA-TTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAACTATTATTTATTTCAAATAG
254 AATCTATTTATCAAAC-AAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * * * *
45802 TTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAA
317 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * *
45865 A-AGATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATC
379 ATA-ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATT
* * * * * * * * ** *
45924 TATCAAACCAATTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTGTCTCAAATCATTATGATCTT
442 TATTAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT
* *
45989 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTT
506 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * * * * * *
46019 ATGCAAGATTATTTAGAGT-AAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA
1 ATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAA--AATAAGTAAGA
* * * * * *
46083 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAATTCAATTAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCT
* * * * * * * *
46148 AATTCAAATCATTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTGATACATGCGTATT
127 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT
** * * * * *
46213 TGAAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAGAAAAGTAATACA-CAAGAAATTTAAAAAAAT
191 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATA-AGTAAGAGATTT-AAAAAAT
** * * * * ***
46277 AAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAA
253 AAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * **
46342 TATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATA
318 TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * *
46407 ATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTC-AGTTTATT
382 ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATT
*** * * * * * *
46471 GAATTGGTTCGAAA-AATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTA
446 -AAACAGTTC-AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACCTTTG
* * *
46535 TTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTAATC
508 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * *
46563 ATACAAGCCTATTCTGAAT-AAAATATTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGC
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAG-
* * * * ** *
46626 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AA--A---CTAAT--TCCT-A-T-TTTGAACAATTATC
61 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
* ** * * * * * *
46680 TATTTTAAATTGTTAT-AACTTATTATTTTGTTATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTA
126 TATTTCAAATCATTATGACCTT-TT-GTTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
* * *
46744 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTTC-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** ** ** * * * * *
46808 AAAT-TGTTTGTTGAAGTAGTTCAAACGATTAAGACTATATAAACAATTATTTGTTTCAAATCGT
253 AAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * ** *
46872 TATG-GCTTGTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAACTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
318 TATGACCTT-TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * **
46936 AAAACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATT--TAA--AA-AG---T---GAAT---T-TGTTTACC
381 AATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATT
* * * * * ** * *
46985 AAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCG-ACAATTATCAATTTCAAATCATCATTACCTTTTG
446 AAA-CAGTTCAAATAATTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTG
* ** * * *
47049 CTTCATCATATAACAATTGTATT-TAAAC
508 TTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGATC
* * * * *
47077 ATTCAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
1 ATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGA
* * * * * * *
47141 GATTTAAAAAATAAATTTAG-TTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGGGA-AATTGT
62 GATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTAT
** * * ** * ** * * *
47204 AAACTTGAAATTGTTATAAAATTTTGTTCTGTCATAAAAAAAATATTTTTA-TTCATACAAG-TG
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TATCATAAAATAATTA-TTTTAGTTCATACAAGCT-
*** * * * * * *
47267 TATTTGGAATAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAA
187 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * *
47332 ATAAATTTCTTTGTTGAACCAA-TTCAAATATTTAAGTCTATATGACCAATTATCTATTTCAAA-
251 ATAAATCTATTT-ATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * ***
47395 CAATTATGACC-TTT-TGTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACT-AGCTTATTTGGAA
315 C-GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA--TTGTTT-AGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
47457 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAAATAATTTT
375 TAAAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * *
47517 GTGTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTC
439 ATTTA-TTAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
* * *
47582 CTTTTTTTTGTCATAAAACAAATGATTT-TGTTC
503 CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTGATC
* * * * * * *
47615 ATATAAGTTTGTTCAAA-ATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAA-ATGA
1 ATACAAGCTTATTCAAATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAATAAGTAAGA-GA
* * * * * * * * *
47677 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTAT
64 TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTAT
** * * * ** * **** * **
47742 TTCAAATTGTTAT-AACTTTGGTTCTATTATAAAGCAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTTTTTG
129 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
47806 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAAACAAAT
193 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
47867 CTGTTT-GCTGAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
257 CTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
47931 AACCCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
321 GA-CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * * * *
47996 ACAAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAACAACT-A-AGATTTAAAAAATGAATCCATTTGTCAG
384 ACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTA-
* ** * ** * * * * *
48058 ACCAGTTCAAGCACTTAAAACAATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATATTGTTT
447 AACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTGTTT
* * * *
48123 TATCATAAAATAATTATTTC-AACTC
511 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * * *
48148 ATACAAGCTTATTTGAAAT-AGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA---ATAAGTAAGA
* * * * ** ** * * *
48212 GATTTAGAAAATAATTCTATGCACTAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCT
* * * * * * * * * *
48277 ATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTT
127 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT
* * * * * * *
48342 CAAAATAAAATAAAACTAATATATTATTATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAAATTTAAAAAGTAA
191 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * * * * * **
48407 ATCTGCTTACCACACTATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTATTA
255 ATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * ** * ** ***
48471 TAACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCCGTTAATACT-ATTTTATTGGGAATAAAATAA
320 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTAGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * ** * * * ****
48535 TACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTCATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATATAATTGCCCA
383 TACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATTA
* * * ** * * * ** *
48600 ACCAGTTTAAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTT
447 AACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTGTTT
** *
48665 TGTTGTAAAACAAATGTTT-TGATC
511 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * *
48689 ATACAAGATTATTCAAATTAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGAG
* * * * * *
48754 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTA
63 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTA
* * * * * * * * ****
48819 ATTCAAATCGTTCTAACGTTTTATTGAGTCA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
128 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAA-TAAT---T---A-TTTTAGTTCAT--A-
* * * ** * *
48883 CTATTTGCTATAGCTGTC-AAAT-AATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-A
181 C-A--AGCT-TA--T-TCAAAATAAAATAATACTA-AT---TTATTA-ATA-TTCAAA-AATTAA
** *** * * * * * * *
48945 TGACCT-TTTG-TCATAAAACAATTATTTCAGCTATTTA-CTAATAAGTCCAAATCATTATGACT
232 T-AAGTAAGAGAT-TTAAAA-AA-TA---AATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * *
49007 ATTT-AAGCAATTA-CTTATTTCAAATTGTTTTAACTTTTTACTTTGTCATAAAACAATT-TTTT
290 ATTTGAA-CAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTA
* * *** * * * ** *
49069 GCTATTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAA
353 G---TTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
49134 GTAAAAGACTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTTTTTGAATAA
415 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAA
** * * * * * * *
49199 TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTTTTTGTAATAAAATAATTATTTCAGTTC
479 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* ** * * * * *
49256 ATATAAGCTTATT-TGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAA
1 ATACAAGCTTATTCAAAT-AAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGA
* * * * ** * * *
49320 GAATTAAAAAA-AAATCTATTTACTGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATCT-TAATAATTATC
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAACAATTATC
* * * * * * * *
49383 TCTTTTAAAAT-ATTTTGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTTT-GTTCATGCAGGCTT
126 T-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATT-ATTTTAGTTCATACAAGCTT
* *
49446 ATTTC-AAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AA-A-ATTAAAAA
188 A-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * * * *
49503 AATAAATTTGTTT-TCTGAACACGTTCAAATAGTTA-AACTATTAGAACAATAATCTATTTTAAT
250 AATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
49566 TCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTA-TTTATAAAAGCTTATTCAAAATA
314 TCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * * * *
49630 AAATAATACTAATTTA-TGATAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
377 AAATAATACTACTTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * ** *
49694 TTATTGAGCGAGTTCAAATAATTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCT
441 TTATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CC
* * * *
49759 TTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGCTTCT-ATTT
504 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* **
49791 ATACAAG--T-TT---AT-----TAATA-T--TCTAA-AA-ATTT-----AATAAGTTGGAGATT
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAATAAGTAAGAGATT
* * ** * * * *
49835 TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGCCCATTTA-AACTATTATCTATT
66 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATT
* * * * **
49899 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAAATTATTCA
130 TCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATT-ATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
49963 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA--ACTAA-TAAGACATTTAAAAACTAAATT
193 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * * *
50025 TGTTTA-CTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAACTATCCATATCAAATCATTATT
258 TATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * *
50089 A--TATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTG
322 ACCT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
*** * * ***
50152 CTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATGC-ATTTGCCAA
385 CTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTATTAA
* * * * * * *
50215 ACCAGTTCAAATAGTGAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTT
448 A-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTGTTT
* * * * *
50280 AGTCATAAAATAATTGTATC-AATTT
511 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * * * * *
50305 ATACATGCTAAATGT-TAAT-AAAATAATACT-ATTGTATTAACATTTAGAAAATTAATATA-CA
1 ATACAAGCT-TAT-TCAAATAAAAATAATACTAATT-TAATAATATTT-CAAAA--AATA-AGTA
* * * * * *
50366 AGAAATTTTAAAAAATAATTATATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATT-GAACAATT
59 AGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATT
* ** * * * * * * *
50430 ATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTACCATAAAACAACTGTTTCAGTTCATAAAAGCT
123 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCT
* * * * * * * *
50495 TATCCAAAATACAATAGTATTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTGAGAAGTTGAA-A-ATTTAAA
187 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAG-T-AAGAGATTTAAA
* * * * *
50558 AAATAAATC-AGTTTATCAAATTAA-TTCAAATAATTATGTCCATTTGAACAATTATTTATTTTA
249 AAATAAATCTA-TTTATCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
*
50621 AATCGTTATGAGCC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TTCATCATGCAAGCCTATTCAA
312 AATCGTTATGA-CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCAT-AT--AAGCTTATTCAA
* *
50682 AATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAAT
373 AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
50746 ATGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTATTATA
437 CTATTTATTAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * **
50811 ACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATCTTC
501 AC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * * * * *
50847 ATACAAACTTATTAGAAAT-AAAATAGTACTAATCTAATTATATTATGAAAATTAATAACTAAGA
1 ATACAAGCTTATT-CAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAA--AATAAGTAAGA
* * * * * * *
50911 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAATT-AAATAGTTAAGA-TGA-TATGGATAATTAT
62 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTA-GAACAATTAT
** * * * * * * * * * * *
50973 CTATTTCAAATTGTTGTAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTG
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
** * * *
51038 TTTGAAATAAAATAGTATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAATAAAT
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
51099 AAATCTATTTACCAAACTAGTT-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCG
253 AAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * * *
51163 TTATGAACATTTGTTTTGTCAT------A------A----A-ATAA-CTTATTCAGAAA-AACAT
317 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCATATAAGCTTATTCA-AAATAAAAT
* * * * *
51209 AATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTGAATCTATTTATC
381 AATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATT
* * * ** * * * * *
51270 GAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTCAAATAATAACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTAT
446 AAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTGT
* * *
51335 TTTGTGATAAAATAATTTTTTTCT-ATTC
509 TTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTGA-TC
* * *
51363 ATACAAG-TTATTTC-AATTAAAATAATA-TAAATTTATTAACA-TTCAAACAATTATTAAGTAA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAA-AA--A-TAAGTAA
* * * * ** * * *
51424 AAGATTTAAAGAATAACTCTGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTAT
60 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTA-
* * * * * * *
51489 TTTATTTTAAAACATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-GTTCATGCAAGCT
124 TCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCT
** * * ** * * * *
51553 TATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAA
187 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * ** * * *
51618 ATAAATATGTTTACCAAACATGATT-AAATAGTTAAAACTATTCGAATAATTATCTATTACAAAT
251 ATAAATCTATTTATCAAACAAG-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * **
51682 CATTGTGACCTTTT-TGTTTCTTCATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAATA
315 CGTTATGACCTTTTAT-TTT-GTCATAAAACAATTGT-TTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * ** * * * * *
51746 AAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGACTTCAAAAATGAATCAATT
377 AAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * *
51811 TACTGAATA-AGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCGTGATGACAT
442 TA-TTAA-ACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-C
* *
51875 TTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTC
504 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * *
51907 ATACAATCTTATTTCAAAT-AGAATAATA-TATATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACTA-ATTTAATAATATT-TCAAAA--AATAAGTAAG
* * * * * * * *
51969 AAATTAAAAAAATACATTTATTTTCTGAGCACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTA
61 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTA
* * * ** * * *
52032 TCTATTTCAAAT-AGTTATGA-CATTTGTTTTGTCATGAACCAGTTGTTTCTA-TTCATACATG-
124 TCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGC
* * * * * * * *
52093 TGT-TT----TTAAACT-ATACTAGTTTATTAATATTCAAAATTTTGATAAGTAAAAAATCTAAA
186 T-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * * * *
52152 AAATAAATCTATTTATCGAGCAAGTTTAAATAGTTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAA
249 AAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * ** * * * * *
52217 TAGTTATGATCTTTTGTTTTATTGTAAAACAATTATTTCTA-TTTATACCAA-TTTATTCAGAAT
314 TCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAAT
* ** * * * * * * *
52280 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGT
376 AAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * ** *
52345 TTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAGCT
441 TTATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CC
* *
52410 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
504 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* ** * * * ** **
52442 ATGCAATATTATTCAGAAT-AAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAGTTAA-TAAGAGAT
1 ATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * * * * *
52505 TTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAAACAGTTTAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATAATTTATC
65 TTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATT
* * * * **
52570 TCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTATCATAAAACAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTTATTTG
130 TCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * *
52633 GATTAAAATCATACTAATTTA-AATATATTCCAAAATT--TTA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
193 AAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
52694 ATGTTTGCTTAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTCTTTCAAATTGCTT-
257 CTATTT-ATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTA
** * ** * ** * ***
52757 T-AATTTTTAGTTTAACTATATATTAATTGTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATA
320 TGACCTTTTATTTTGTC-ATAAAACAATTG-TTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * *
52820 ATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAAATAAATTTGTTTACT
382 ATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTATT
* * * * * *
52885 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTTG
446 AAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC--TTTG
* *
52950 TTTTGCCATAAAACAATTGTTT-TAGTTC
508 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATC
* * * * * * *
52978 ATAAAAGCTTATCCAAA-ATTAAATAATGCTACTTTATTATTATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGA
1 ATACAAGCTTATTCAAATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA---AATAAGTAAGA
** ** * * * * *
53042 GATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATC
62 GATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
* * * * ** * * *
53106 TATTTCTAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTCTTTTTCA-TT-AGACAAGCCT
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAATAATT-ATTTT-AGTTCATACAAGCTT
* * * ** * * *
53169 ATTCAAAAGAAAATAATACTTATTTAATAATATTTCTCACATTAATAAGTAGGACATTTAAAAAA
188 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
53234 TAAATATACTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAATTATATATTTTAA
252 TAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC----AATTATCTATTTCAA
** * * * * * * * *
53299 ATTATTATAACCTTTTGTTTTATGATAAAACAATTATTTATCTTGATACAAGCTTATTCAAAAT-
313 ATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTA-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * * * * * * *
53363 AAA-AACACTAATCTACTAATATTAT-GAAAATTAA-AATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
377 AAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
*** * ** * * * *
53425 TTTACCCAACA--T--AGTAA--A-GGTTATATGAATAATTATCTCTTTTAAAATGTTATGACCT
440 TTTATTAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
53483 TCTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTC
505 T-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * * *
53515 ATAAAAGTTTGTTCTAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAAATTAA-TAAGAGA
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAA-TAAGTAAGAGA
* * * * * * *
53577 TTTAATAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTAGT-TA
64 TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTA-TCTA
* * * * ** * * * * *
53641 TTTCAAGTCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAATTAATACAATCTTATTT
128 TTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
** * * * *
53706 GGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAACTTAATAAGTAATG-GAATTAAAAAA-AG
192 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATA-
*** ** * * * * * * * *
53769 GAATCTATTGGCCTGACCAGTACAAATAGTGATAACTGTTTAAATAATTATCTATTT-AAATCGT
254 -AATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * ** * ** *
53833 TATGACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCTA-TTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACAT
318 TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * *
53897 AATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATT
381 AATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATT
* * * * * * * * *
53958 GAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAAGCTTTTGT
446 AAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTGT
* *
54023 TTTGTCATAAAATAATTTTTTCT-ATTC
509 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * *
54050 ATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAAGTTATTAATATTT-AGACAACTTAA-AAGTAA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-A-AA---AATAAGTAA
* * ** * *
54112 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
60 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
* ** * * * *
54177 TTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGGTTTTGTCATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACAAACT
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-G-TTTATCATAAAATAATTA-TTTTAGTTCATACAAGCT
** * * ** * * *
54240 TATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAA
187 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * *
54305 ATAAA-C-ATGTAT-----AAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATC
251 ATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * ** * * * * *
54363 -TCAT-AACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTG-CCATAAAAC
316 GTTATGACCT-TTT---ATTTTGTC-A--T-AAA-----AC-A---ATTGTTTAGTTCAT---AT
* * * * * **
54425 AATTGTATTAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAA
361 AA--G-CTTA-TTCA-A-A-----A-T--AAA-ATAATACTACTTTA-TTAAT-AT-TTCAAAAA
* * * * * * * * *
54489 TTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATATGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATT
408 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * *
54554 TGAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGTTC
472 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * *
54619 ATACATGCTTATTTCAAAT-AAAATAATA-TAAATTCATTGATA-TTCGAAGAATTAATAAGTAA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTC-AA-AA--AATAAGTAA
* *** * * *
54681 -AAATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTTTTGAA-CACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
60 GAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATT
* * * ** * *
54743 ATATATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTATTTTATCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
123 ATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGC
* ** *
54807 ATATT--TGA-AAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAA
186 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAA
* * * * * * * ** * * *
54867 AAATAAATTTGTTGACCGAGCAAGTTCATATCGTTATTACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
249 AAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
54932 TAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATA
314 TCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * * *
54996 AAATAATACTGA-TTTATTACTA-TTC-TAAATGAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
377 AAATAATACT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * *
55058 TTACT-AACAAGTTTCAAATTTCATATATTAAACAATTATTATTGAA-AATTAATCTGTTATCAA
441 TTATTAAAC-AG-TTCAAA--TAAT-TA-T-GAC---TA-T-TTGAATAATT-ATC---TAT---
* * ** * * *
55121 AATTCAAATAGTTATGA-TTTTGTATAAACAATTACCTATTTAAATTGCTATAATTTTATTTTGT
487 --TTCAAATTGTTATGACCTTTGT-T------TTGTC-A--TAAA-----ACAATTGT-TTCTG-
*
55185 CATAAA
533 -AT--C
* ** * * * *
55191 ATAAAATTTTATTACATATTATTTTAATTAA-AATAATAAAATTATTAATATTT-AGACAACTAA
1 ATACAAGCTTATT-CA-A--A---TAA-AAATAATACT-AATTTAATAATATTTCA-A-AA--AA
* * * * **
55254 TAAGTAATATTG-TTTAAAAAAT--AT-TTTTTA---AATCA-TTTATAATA-TTATGTTTATCT
53 TAAGTAAGA--GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCA-AATAGTTATGACTAT-T
* * ** * *
55310 A-AA-AATTATTTATTTATAAATC-TTATTGAATTAATTTAATTTATTCATATTCAAA-AATTGT
114 AGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTA-TGACCT--TTT-GTTTA-TCATA---AAATAATTAT
* * *** * * * ** *
55371 TTT-GTTTATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTCATTAATATTTTGATAATTAATA
170 TTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* ** * * * * * * *
55435 AGTAACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
234 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
* * *
55499 AATTATCTATTTAAAATCTCATAACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
298 AATTATCTA--T----T-TC--AA--A-TCG-----TTA-TGA---C----C-TT-TTA--TTTT
* * ** * *
55564 GTTTCATCATAAAACAATTATATTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTA
334 G--TCA---TAAAACAATTGT-TTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTA
* * * * * * ****
55629 TTAATATTTCAACAATTAATGAA-TAACACATTTAAAATATGAATTTATTTACGGGACATGTTCA
393 TTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACA-GTTCA
** * * ** *
55693 AATGGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA
456 AATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAA
* * * *
55758 A-TATTTTTTTTTATC
520 ACAATTGTTTCTGATC
* * * *
55773 ATACATGCTTATTTCAAAT-AAAATAATA-TAAATTTATTACTATTCCAAAAGTTAATAAGTAA-
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAA---AATAAGTAAG
* * * * * * * * * *
55835 AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTAT
61 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
* * * ** *
55899 GTATTTCAAAT-AGTTA-AAGCCTTTTGCTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATACAAGC
125 CTATTTCAAATCA-TTATGA-CCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGC
* * * *
55961 GTATTCAAAATACAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAA
186 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA
* * * * * * ** * * *
56025 ACATAAATTTGTTTA-CTGAGCAAGTTCATATCGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAA
249 AAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * ** * ** * * * * *
56089 ATAGTTATGATCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCTTTATACAAGTTTAGTCAGAATA
313 ATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * * ** *
56154 AAATAATATTATTTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT-T-T
377 AAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * ** *
56216 GT-TT----A--TCGAATAAGTAAT-CCTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCATTATGACTT
441 TTATTAAACAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
* * *
56273 TTGTTTTTTCATAAAACAATTATTT-TTATTC
505 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* ** * * * *
56304 ATGCAAAATTATTCAGAAT-AAAATAATACTGATAT-ATCAATATTTTAAAAATTAA-TAAGAGA
1 ATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTTCAAAAAATAAGTAAGAGA
* * * * * ** * *
56366 TTTAAAAACTAAATCTATTTAACAAAATAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATTA-CTTA
64 TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC-TA
* * ** ** * * *
56430 TCTTC-AATCGTTATGATCTTTAT-TTTGCCATAAAGCAA--ATGTTTATTTTCACACATGCTTA
128 T-TTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTATCATAAAATAATTAT-TTTA-GTTCATACAAGCTTA
* * * * * *
56491 TTCAGATTAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAAAACTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAA
189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAA
* * * ** * * *
56556 ATACATGTGTTTGCCAAACCAA-TTC-AATAGTTAAGACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAA
251 ATAAATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
56618 TCATTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
314 TCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * *
56683 AATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATTAAATTTGT
378 AATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTAT
** * *
56747 TTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGATTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGAT
441 TTATTAAAC-AGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGA-
* * *
56810 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AACTA
502 CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TC
* * * * * * ** * *
56844 AAAAAAAC-TATCCGAAAT-AAAATAATACCACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAA
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGA
* ** * * * * *
56907 TATTTAAAACCTAAAGT-TGTTTTCCAAACCAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATC
62 GATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
* * * * * * * * *
56971 AATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTCTAATAAAATAATTGTTTCT-GATCATATAAGTTTA
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTATCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTA
* *
57034 TTTC-ATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAA
189 -TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA
* * * * * * *
57093 ATAAAT-AATTT-TGCCAAACCAA-TTCAAAGAGTTAAGACTATTAGAAAAATTATCTATTTTAA
251 ATAAATCTATTTAT--CAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * * **
57155 ATTGCTCTGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
313 ATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
* * * * * *
57220 AAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTCGACCAAAAA-AAATCT
377 AAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TA--AAAAATAAATCT
* * * *
57284 ATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTAAAATAT-TTATGA
439 ATTTATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATG-
** * *
57348 AAATTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTC
501 ACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATC
* * * * * * * * *
57383 ATAAAATCTTATCCAAAT-GAAATAATACTACTTTATTAACATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAA
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA---AATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * * *
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63 ATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGA-ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATC
* * * * * * *
57510 TATTTTAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-GTAACATACAAGCTCA
126 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGT-TCATACAAGCTTA
** ** *
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189 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
** * * * *
57635 AAATCTATTTGCCAAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAGCTATTTTAAA---
253 AAATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
** * * * * *
57696 -TA--ACCTTTTGGTCTATCATAAAACAACTGTTTCTA-TTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
317 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAA
* ** ** * ** *
57757 TAATACTAATTTAGGAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATCCGTTT-G
380 TAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
* * * * * * *
57820 TAGAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAGTTAGT-TATTTGAAATTGTTACGACCTTT
445 TA-AA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATTGTTATGACC-TT
* *
57884 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTC
506 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATC
*
57914 ATACAAGCTTATTCAAA-ATAAAATAA-AGCTAACTTT--TAATATTTCAAAAATTTATACGTAA
1 ATACAAGCTTATTCAAATA-AAAATAATA-CTAA-TTTAATAATATTTCAAAAA---ATAAGTAA
* * * ** * * * *
57975 GAGATTTAGAAAATAATTCTACTTACCGAACCA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTAT
60 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
* * * * * * * * *
58039 CTATTTCAAGTC-TTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTT
125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TG-TTTATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTT
* * * * * * *
58102 GTTCGAAAGAAAATAATACTTATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAG
188 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* ** * * * * * *
58167 TAAATTTGCTTA-CTAAACCATTTCAAATAGTTTTGAATATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
252 TAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * ** ***
58231 ATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCT-GTTCATACT-ATTTTATTCTGCATAA
316 GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAA
* * * ** * ** * * *
58294 AATAAGACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT
378 AATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * *
58359 ACTAAACCAATTCAAATAGTT-TAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATT
443 ATTAAA-CAGTTCAAATAATTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CT
* ** *
58423 TTGTTTGGTTGTAAAACAATTGTTT-TGTTC
505 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* *** * * * *
58453 GTACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATA
1 ATACAAGCTTATTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAATAAGTAAGAGATT
* * ** * * *
58517 TAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAATTCAAATGGTT-TAGACTATTAGAATAATTATCTATT
66 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTAGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
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130 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAA
* * ** **
58645 AATAAATTAATACTAATTTATTGACGTTCAAAAAGTTAATAACAAAAAGAGATTT--AAAA-AAA
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* * * * * * * * * *
58707 TATGTTTACCAAATATGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTAT
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* * *** *
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* * * * * * * * **
58835 TCCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAGATAAATTTGTTTACCAA
383 TACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAA
* * * * * * *
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* * *
58965 TATCATAAAACAATTGTTTTTTATC
511 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * *
58990 ATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA---AATAAGTAAGA
* * ** * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
59181 TTC-GATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCATAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
189 TTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
** * * * * ** * * * * * *
59245 TAAATCTGCTTGTGGAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACCATTAGAATAATTATCTATTGCAGATT
252 TAAATCTATTTAT-CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * ** * * * * * * * * * *
59309 GTTCTAATATTTTGTTTAGTTATAAGATATTTATTTCA-TATCTTACAAGCTTATT-AGGAATAA
316 GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGT-TCATATAAGCTTATTCA-AAATAA
* * ** * ** * * * *
59372 AATAATCCAAAGTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCTGTT
378 AATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATT
*** * * * *
59437 TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTA
442 TATTAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-
* * *
59502 TTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TAGTTT
505 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GATC
* * * * ** ** *
59533 ATAAAAGCTTATCCAAA-ATAAAGTGATA-TAAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAA-TAAGCAA
1 ATACAAGCTTATTCAAATA-AAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAAATAAGTAAG--A
* * * * * ** *
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62 GATTT-AAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTAT
* ** * * * * *
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125 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA
** * *
59723 TTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGT
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* * * * * * * *
59784 GAATTTGTTTAACAAATC-AGTTCAAATAATTATTG-CCATTTTAATAATTATCTATTTCAAATT
253 AAATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAATTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * ***
59847 GTTATTACCTTTT-GTTTAT-ATAACA-AATT-TCTT-TTATCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
316 GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT-TTAGT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * * *
59907 ATAATACTAATTTAGTAATTTTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTG
379 ATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
** * * ** * * * *
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444 TTAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC--A--AATT-GTT-----
* * * * * * * * *
60037 ATAAACCTTTCATTTTGTTACAAAATAATTATTTATGTTT
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* * * * *
60077 ATACAAACTTATTCGAAAT-AAAATAATAATAATCTAATAATATTCCAAAAAGTAATAACTAAGA
1 ATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA--AATAAGTAAGA
* * ** * * * * *
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* * ** * * * **
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126 TATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTATTTT-AGTTCATACAAGCTT
* * * *
60267 ATTAAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAA
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* * * * * * * * *
60331 ATAATTCTAGTTACCTAACTAGTTCTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATC
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* * * * * * ** *
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316 GTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * *
60461 TAATACAAATCTATTAATATTGCAAAAATTAATAAG
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Statistics
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TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
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TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTT
TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACAGTTCA
AATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAA
CAATTGTTTCTGATC
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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31753 C
884 C
* * * * **
31754 AT-CAAACCTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGA
1 ATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** *** * * * * *
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* * ** * * *
31881 AATTTTAAATCATTATTTCCTATTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCA-A-CATACAAACTT
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG--TTTCATATCATACAAAC-T
* * * * ** *
31944 TTTTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAGAATTAATTCGTAAGAGATTTAAAAA
190 TATTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAA
* * * * * * * * *
32009 CTTAATTTGCTTACCAAACCA-TTGCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
254 ATAAATCTGTTTATCAAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAT
** * ** *
32073 CATTTTAACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAA
318 TGTTATAACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATT-G-TTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAA
* * * **
32138 AATAATACTAAGTTAATAATATTCCAAAACTTAAT-AGCCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTATT
380 AATAATACTAA-TTTATAATATTTCAAAAATTAATAAG-CAAG-AGTTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * ** *
32202 TGCTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGTTTATCTATTTCAAATCGCTATGACTTT
442 TGCTGAACAAATTTAAATAGTT-ATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTT
* * * * * * * *
32267 TT-TTTTGTTG-TAAAACAATTATTTTGTTTGTATAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATT
506 TTGTTTT-ATGATAAAATAATTATTCTGATTATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATT
* * * * * * *
32330 TATTAATATTTTTTATATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAGTAGATCTGTTTATCGAATCAGTTA
569 TATTAATA---TTCAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGTTC
* * * * *
32395 AAATAATTGTGGCTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
627 AAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAT
* * *
32460 AACAATTTTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATTGATT-AATATTTCAA
692 AACAATTTTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAAT-TTTCAA
* ** * * * * *
32524 AAATTAATAAGTAATAGATTTAAACTATAAA-ATAATTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAATT
755 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
32588 AATTGAACAA-TTAT-CATTATGAAATCATTAAAATCTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTT-T-
819 ATTTGAACAATTTATAC-TT-TAAAATCATTATAACCTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTCTA
*
32649 CTC
882 TTC
* * ****
32652 ATATAAGATTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
1 ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* *
32716 GATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTAAACCAGTTCAAATAATTTAA-ACTATTAGAATAATTATC
65 GATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAAT-AGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
** * * * * *
32780 TATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTAT
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATATCATACAAACTTAT
* * * * *
32845 TCGAAATAAAATAATTCAATTTTATTGACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAAAGAATTGAAAAAA
193 TCGAAATAAAATAATACAA-TTTATTAACATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAG-ATTAAAAAAA
*
32909 TAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTG
255 TAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTG
* * * *
32974 TTATAACCTTTTGTTTTGACAT-AAACAATTGTTTCGGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT
320 TTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT--GTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
33038 AATACTAATTTCTGAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCC
383 AATACTAATTTAT-AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTT-AAAAAATAAATCTATTTGCT
*** * * * *
33103 GAACAAATTTTGGTAGTTACTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTG
446 GAACAAATTTAAATAGTTA-TACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTG
* * * * *
33168 TTTTATGATAAAATAATTATATCAGCTTATACAAGCTAATTTGAAAATAGATAATACTAATTTAT
509 TTTTATGATAAAATAATTAT-TCTGATTATACAAGCTTA-TTCAAAATAAATAATACTAATTTAT
* * * **
33233 TAATATTCCAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTAAATCAGTTCAAATAATTAT
572 TAATATTCAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTAT
* * * *
33298 GGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TTTTG-CCTTTTGTTTACTCATATAACAATTG
637 GGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--TGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATT-
* *
33361 TTTTTGATCATATAAACTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTCAAAAATTAAT
699 TTTTTGATCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTCAAAAATTAAT
* *
33426 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGGAACCAGTTCAAATAATAATGACTATTTGAAC
763 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
** * * *
33491 AATTGTATACTTT-AAATTGTTGTAACCTTT-TTTCTATCATAAAACGATTATATCTATTC
827 AATT-TATACTTTAAAATCATTATAACCTTTATTT-TATCATAAAACAATTGT-TCTATTC
* * * *
33550 ATACGAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
33615 ATTTAAAAAGTAAATTTTCTTGCTAGACTAGTTCGAATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTATCT
66 ATTTAAAAAATAAATTAT-TTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCT
** * * * * * * *
33679 ATTTCAAATCATTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTAAT-TCATACTAGCATAT
129 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-TAATTGTTTCATATCATACAAACTTAT
* * * *
33743 TCGAAAAAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTAAAAAAATA
193 TCGAAATAAAATAATA-CAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATA
* * * * * * * * *
33804 ATTCTGTTTAACTAACTAGTTCAAATAATTATGACAATTTGAACAATTATCTATTTCAAACTGTT
257 AATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTT
* * * *
33869 ATAACCTTTT-TTTTTTCATAAAACAACTATATTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAA
322 ATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAA
*** * ** * * ** *
33933 TACTAACCGATTGATATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-TTCAAAAAATAAATTTATTTATTAAA
385 TACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAA
** * * *
33995 TTAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AAGTAATTATTTATTTCAAATC-TTATGACTTTTTGTTC
449 CAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTT
* * * * * * *
34058 TATTATAAAATAA-TACTTTTTG-TTCACACAAGCTTATTCGAATTAAAATATTACTAATTTGTT
512 TATGATAAAATAATTA--TTCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATTTATT
* * ** * * *
34121 AATATTTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTTAAAATAAATATTTTTATCGAA-CTAGATCAA
573 AATA---TTCA-AATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-AGTTCAA
* * * * * * * *
34185 ATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTTA-TCATAAA
629 ATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTT-GTTTAGTCATATA
* ** * * *
34249 AAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATGCTATT-AATATTTCA
693 ACAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAAAT-TTTCA
* * ** * * * *
34312 AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTACTGAACAAATTTAAATAATTATGAC
754 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *** ** * * * * *
34377 TATTTAAACAATTATCTA-TTTGAAATTGCTATAAGATTTTGTTTTGTCATAAAATTATTTATTC
818 TATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAA-CCTTTATTTTATCATAAAA-CAATTGTTC
34441 TATTC
880 TATTC
* * *
34446 ATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAACACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAA
* * * * * * ** * * *
34508 -AGGATGTAAACAATAAATCCATTTACCAAACAAGTTCATCTTGTTATGGCTATTCA-AACAATT
63 GA-GATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATT-AGAACAATT
* ** * * * * * *
34571 ATTTATTTC-AATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-TATTCATTCAAG
125 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG-TTTCATA-TCATACAAA
* * * ** * * * *
34634 CTTATTTGGATTAAAATAATGTTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
188 CTTATTCGAAATAAAATAAT-ACAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAA
* * * ** ** * * * *
34699 AAATAAATATTTTTA-CTAAACAA-TTTATTAATA-TT-CCAAAAATTAAAAAAGTAAGAGAATT
252 AAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCA--AATAGTTATGACTATTTGAACAA-T-----TATT
* *** * * * * * ** * * *
34760 AAAAAAATGAATCTGTTTACCAATCAAGTTCACATAGTTATGACTATCGGAACAATTATCTATTC
308 TATTTAA--AAT-TG-TTA-TAA-C--CTT---TTA-TTTTGTC-AT-AAAACAATTGTTTGTT-
* * **** * ** ** *
34825 CAAAACATTATTAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTAATTTGA
358 C-ATA-A--A--AG--TTT-ATTCAAAATAAAATAA-TACTAAT-TT-AT--AA---T-ATTTCA
* * * * * ** * ** **
34890 ATAAAAT-ATTA-TAA-A-TTTATTAATATTCCAAAAATTAATTAGT-AA-AAATTTTAAA-AAA
405 A-AAATTAATAAGCAAGAGTTTA--AAAAAT---AAATCTATTTGCTGAACAAA-TTTAAATAGT
* * * * *
34948 TAAATCTGTTTTCCAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGTACAATTATC-TATATCAAATT
463 TATA-CT-ATTT-----GA-A-T---A-A-TTAT--CTA-TT-T-CAA--ATCGT-TAT-GACTT
* ** * * * * * **
35012 ATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTTAAACAAGTTTATTCGGAATAAAA
505 -TT-TG-----TT-TTATG--ATAAAATAATT-ATTCTGATTATACAAGCTTATTCAAAAT-AAA
* *
35077 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAATTTAATAAGTAAAGGATTTTAAAAAATAAATTTGCTTAT
558 TAATACTAATTTATTAATATT-CAAA-TTAATAAGT----GA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
* * * * * * * **
35142 TG-AGCGAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTG-ATCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTT
616 CGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTT
* * * * *
35205 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
679 TGTTTAGTCATATAACAATT-TTTTTGA-TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATT
* * * *
35269 TATT-AATATTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACTGAACAAGT
741 TATTAAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGT
* * * * * * * ** * *
35332 TCAACTAGTCATGTCCATTAGAACTATTATATA-TTTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTATCA
803 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAAC-CTTTATTTTATCA
* *
35396 TAAAATAATTGTT-TCAGATC
866 TAAAACAATTGTTCT-A-TTC
* * * * * * * **
35416 ATAAAAG--T-TT--GAAT--AATTAT-CT-ATTTCA-AAT-TGTT-ATGAACTT--T-TGCTTT
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT-TTCA-AAAATTAATAAG-TAA
** ** * * * * * *
35466 GTCA--TAAAACAAT-TGTT-TTTCATCATACAAGCCTA-TTCAGAATA--AAATAATACTA-AT
63 GAGATTTAAAA-AATAAATTATTT--GC-TA-AA-CC-AGTTCA-AATAGTTAAGACTATTAGAA
** * ****
35523 TTATTA-ATATTTCAAA--ATTAATG-CACAAGAGATTTA---A-AAAATAAATATGTTTACCGA
120 CAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGAC-CTTTTG-TTTAGTCATAAAAT-AAT-TGTTT--C--
* * ** * *
35580 AGTAGTTCAAACAGTTACGAC-TATTTGAACA-ATTATATATGTCAAATTGT-TATAACCTTT--
176 A-TA--TCATACA---A--ACTTATTCGAA-ATAAAATA-AT-AC-AATT-TAT-TAACATTTCA
* ** ** ** * ** *** * * ** *
35640 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCATATTT-GGAATA-AAATT-ATAATAA
227 AAAATTA--AT-AAGTAAGAGATTAAAAAAATA-AATC-TGTTTATCAA-ACAAGTTCA-AAT-A
* * ** ** * ** *
35702 TGTAAT-AATATTATGAA-AATTA-AGAACTAAGAGA-T-TTAAAAAGTAAATTT-GTTTGTCGA
284 -GTTATGACTATT-TGAACAATTATTTATTTAA-A-ATTGTTATAACCT---TTTATTTTGTC-A
* * * * * **
35761 -ACCAATTCAAATAGTTAAGGCTAT-ATCAACAATTTTGTATTTCAAATCATTATGACATTTTA-
341 TA--AA-AC-AATTGTT--TG-T-TCAT-AA-AA-GTT-TA-TTCAAA--A-TA--AAATAATAC
** * **** * * * **
35823 TTTTGTTGGAAAATAATTTTTTCAGTTCTTACTAACTCATTTGGAAG-AAAATAAAATAAAT-TA
388 TAAT-TT-----ATAA-TATTTCAAAAATTAATAA-GCA---AG-AGTTTAA-AAAATAAATCT-
** * * * ** * * **
35886 ATTAATATTTCAA-AAA-TT-AATCA-ATAAAAGATTTGAAAAATAATTCTATTTGCCAAACTAA
439 ATT--T-GCTGAACAAATTTAAAT-AGTTATACTATTTGAATAATTA-TCTATTT--CAAA-TCG
* * ** * * * ** * ** ***
35947 TTCAAAT-AATTACTACTATT-TGA-ATAATTATTTATTTCAAATTGTTA-TGGCATT-TT-GTT
496 TT---ATGACTT-TTTGTTTTATGATA-AAATAATTA-TTCTGATT-ATACAAGC-TTATTCAAA
* ** * * * *
36006 TTGTCATAA-ACAAATGTT-TT--TGTTCAAA-TAAGT--TTG-TTTGGAATAAAATATTAT-TA
553 AT-AAATAATACTAAT-TTATTAATATTCAAATTAA-TAAGTGATTT--AA-AAAATA-AATCT-
* * * * * * * ** * * * * * *
36062 ATTTAT-TACT-ATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACC
610 GTTTATCGAATCA-GTT-CAAA-TAATTA-T-GGCTATTTGAATAAT-TATCTATTT-C---A--
* * * *** * * ** * * * ** * *
36125 AATTCAATTAGTTTAACTATTTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACCAT-TTATCTT-G
663 AATT--GTT--TTGACCT-TTTGTTTAGTCA--TATAAC-AATTTTTTTGATCATACAAGCTTAT
** * * *
36188 TCATAA-AACAATTGTTTCT-ATTTATATAGTCTTATTTGGATTAAAGTAATGCTTATTTATTAA
720 TCA-AATAA-AA-TAATACTAATTTAT-TA----AATTT---TCAAA--AA---TTA---A-T-A
* * * ** * *
36251 TATTCTGAAAATTAATAAGCAATGGATTTAAAAAATGAATTTGTTGCCCTAACCAGTGCAAATAG
764 -A----G--------TAAG--A--GATTTAAAAAATAAATCTATT-TACGAACCAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
36316 TTATAAC-AGTTTAAATAATTAAGTAC-TTCAAAT-AGTTATAAACTTTTGTTTTATCACAAAAC
811 TTATGACTA-TTTGAACAATTTA-TACTTTAAAATCA-TTAT-AACCTTTATTTTATCATAAAAC
36378 AATTGTTTCTGA-TC
872 AATTG-TTCT-ATTC
* * * * * * * *
36392 GTACAAGCTTATTCAAAATAACAA-AATTCTAACTTATTGATA-TTCTGAAACTTAATAAGTAAA
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAA-AATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** * *
36455 AGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAAGAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
64 AGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
*** * * * * *
36520 TATTTCAAATTGCTATAACCCTTTTATTTTGTGATAAAATAACTT-TTTC-TATCAATACAAGCT
128 TATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-TTGTTTCATATC-ATACAAACT
* * * *
36583 TATTTC-AAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
190 TA-TTCGAAATAAAATAAT-ACAATTTATTAACATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTAAAA
* * * * * *
36646 AAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAA
252 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
* ** * * * * *** *
36711 TTGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGGTCATACAA-TCTTATTTGGATTA
317 TTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AA-TTGTTTGTTCATAAAAGT-TTATTCAAAATA
* ** * * * * * *
36775 AAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATA-ATATTTTAAAAATAAATATGT
379 AAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCA-AGA-GTTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * *
36839 TTAGC-GAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
441 TT-GCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT
*
36903 TTTTG--TT-TCAT----T-A-TA-----A--A-AC-A----ATTCAAAAT-AAT-AT--TAATT
504 TTTTGTTTTATGATAAAATAATTATTCTGATTATACAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTAATT
* *
36942 TATTAATATTTCAAGAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAC-GTTTA-CCAAACAAGT
569 TATTAATA-TTC-A-AATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTATCGAATC-AGT
* * ** * *
37005 TCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCA-TCA
625 TCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTT-AGTCA
** * * * *
37069 TATATGAA------T--TCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTACTATTTT
689 TATAACAATTTTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTA-AATTTT
* * * * * * *
37126 -GAAAATTAATGAGTAAGAGATTT-AAAAATGAATATATTTACTAAACAATTCAAATAGTTATGA
752 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGAACCAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * **
37189 TTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTT
817 CTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACC-TTTATTTTATCATAAAACAATTG-TT
*
37253 CTATTA
879 CTATTC
* * * * *
37259 ATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAACTAA-
1 ATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* ** * * * *
37321 AAATTTAAGCAATAAATCTGTTTGTTGAACACA-TTCAAATAGTT-ATACTATCTA-AACAATTA
64 AGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAAC-CAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTA
* * * **
37383 TCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTC-TATTCATA-AAAGC
126 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAA-C
* * * *
37446 TTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATCAATAAGTAAGAGAGTT-AAA
189 TTATTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAA
* * * * * * * **
37510 AAATAAATATGTTTA-CTGAACGAGTTCAAACAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTCGA
252 AAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAA
* * * * * * * *
37574 A-TGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA-ATTATTCAGAAT
316 ATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGTTCATA-AAAGTTTATTCAAAAT
* ** ** *
37637 AAGATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAGCTAAATCTGTT
378 AAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * **
37699 TACTAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATTTATCTCAAATCAATATGAAC--
442 TGCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTT
* * * * * * * * * * **
37762 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTG-TCTGTACAAACTTATTTAGAGTAAAATATTGTTAA
505 TTTGTTTTATGATAAAATAATT-ATTCTGAT-TATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAA
** * * * * * * * * *
37826 ACTAATAATATTCTAAAAATTTATAAGAGCTTTAAAAAATAAATGTATTT-GCCAAACTAGTTCA
567 TTTATTAATATTC---AAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-AGTTCA
* *** * ** *
37890 AATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAA
628 AATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATA
* * * * * * * *
37955 ATAATTGTTTTAGTTCCTACATGCCTATTCCAAATAAAATAATATTATTTTATTAACA--TTCAA
693 ACAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTTC-A
* * * * *
38018 AAAATTAATAAGCAA-AGAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATACTTTTGA
754 AAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * * * *
38082 CTATTTGAATAATTATCTA-TTTAAAATTGTTGTGACCTTT-TTATT-T--TAATACAATTGTTT
817 CTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACCTTTATT-TTATCATAAAACAATTGTTC
38142 TATTTC
880 TA-TTC
* * * * * * * **
38148 GTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAA-AAGTTGGA
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAG-
* * * ** * ** * * * * *
38212 AGATTTAAAACATATATCAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAATAATTATC
64 AGATTTAAAAAATAAATTA-TTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
* * * * * * * * *
38277 AATTTCTAATCTTTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TCATCATACAAGCCTA
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAT-ATCATACAAACTTA
* * * ** *
38340 TTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGGGCGATT------AT
192 TTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAT
* * * * * * *
38399 ---T-TGTTTA-CTAAACCAA-TTCAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATATATTTCAAGTC
256 AAATCTGTTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATT
* * * * * ** * *
38458 ATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATGCAAGCTTATTCGAAATAAAA
319 GTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAA
* * *
38523 TAATACTAATATAATAATATTAT-GAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTGAAAAATAAAT-T-TGT
382 TAATACTAAT-TTATAATATT-TCAAAAATTAATAAGC-AAGAG-TTTAAAAAATAAATCTAT-T
* * * * * * * *
38584 TGCTTGAACCAGTTCAAATAAG--GT--TA--TGAATAATTATCTATTTC-AAGCTATTATGTCC
442 TGC-TGAACAAATTTAAAT-AGTTATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACT
* * * * * * * *
38642 TTTTGTTTTGTCG-TAAAACAAATGT-TTTTG-TTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATAT
504 TTTTGTTTTAT-GATAAAA-TAAT-TATTCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATAC
* * * * * * * * *
38704 TAATTTATTCATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTACCAAACCAATT
564 TAATTTATT-A-ATATT-CAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGTT
* * ** * * * * * * *
38769 CAATTAGTTATAACAATTTAAATAATTATTTATTTCATATCT-TTATGACCATTTGTTTTGTCAT
626 CAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT
* * * * * * * * *
38833 AAAACAATTATTTCT-ATTGATGC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATT-ACTAT
690 ATAACAATT-TTTTTGA-TCATACAAG-CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTT
* * * **
38895 TCTAAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTAGAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACCAGTAT-AAATAG
751 TC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC--GAACCAGT-TCAAATAG
* * * * * * * *
38957 TTATGATTGTTTGAATAA-TTAT-CTGTTTCAAATAATTATGACCTGTTTTATTTTGTCACAAAA
811 TTATGACTATTTGAACAATTTATAC--TTTAAAATCATTATAACC---TTTATTTTATCATAAAA
39020 CAATTGTTTCTATTC
871 CAATTG-TTCTATTC
* * ** * * * *
39035 ATACAAACTTATTCAAAATAAGATAATTTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGGG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * ** * * * * * *
39100 ATTTTCAAAACTGAGTT-TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGATTATCT-GAAC-TTTAC
66 A-TTTAAAAAATAAATTAT-TTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTAT
*** * * * * *
39162 CTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTTTTTA-TCATAAAATAATTTTTTC-TATTCCTACAAGCTT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAACTT
* * * * *
39225 ATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTATCA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
191 A-TTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAA
* * * * * *
39288 AATAAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAAT
253 AATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAT
** * ** * * * * ***
39353 CATTATGATTTTTTATTTTGTCATAAAACTACTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
318 TGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AAT-TGTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAA
* * * * * * *
39418 ATAATATTAGTTTATTAATATTTCAATAGTTAATAAGC-AGAAGATTTTAAAAATAAATATGTTT
381 ATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AG-TTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * * *
39482 ACCGAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT
443 GCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTT
* * * * * * * * * *
39547 CGTTTCATCATAAAACAATTGTAT-TGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAAACTAAT
507 TGTTTTATGATAAAATAATTAT-TCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAA-T-AAATAATACTAAT
*** * * * * * *
39611 TTATTAATATTTTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAA-CAAATTCAAATA
568 TTATTAATATTCAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATA
** * * * * * *
39675 ATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
632 ATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAACAA
* * * * *
39740 TTGTTTCTGTTCACACAAGCTTATTCTAAATAAAACAATA-TAAATTTATT-AATATTCCAAAAA
697 TT-TTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAT-TTTCAAAAA
* * * * *
39803 TTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-CATGTTCCAATAGTT-TAGATTA
758 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCA-GTTCAAATAGTTAT-GACTA
* * * * * * * * * *
39865 TTTGAACAATTATCTA-TTTCAACT-AGTTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAACCAATTGTTTTT
820 TTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCA-TTATAAC-CTTTATTTTATCATAAAACAATTG-TTCT
*
39928 GTTC
881 ATTC
* * * * * * *
39932 ATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** *** * * * *
39997 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGTAAGTTCAAATAGTTTTATA-TGTTTA-AACAATTATT
66 ATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAATAG-TTAAGACT-ATTAGAACAATTATC
* * * * ** * * **
40060 TATTTTAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCGTAAAGCAATTGTTTC-TATTCACATAAGTTT
128 TATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAACTT
* ** * * *
40123 ATTC-ATAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTGAAAATTAATATGTAGGAGATTTAAAAA
191 ATTCGA-AATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAA
* * * * * * *
40187 ATAAATTTGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
254 ATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATT
* * * * * * * * *
40252 ATTTTGACCTTTTGTTCTATCACAAAACAATTGTTTCTATTCACGCAAAA--TTATTCAAAATAA
319 GTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGTTCA--TAAAAGTTTATTCAAAATAA
* * * * * * *
40315 AATAATACTGATCTATTAAAAGTTT-GAAAATTAATAAG--TG-CTTTAAAAACTAAATCTATTT
380 AATAATACTAATTTA-TAATA-TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * *
40376 ACT-AA-AATAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TC
443 GCTGAACAA-A-TTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTT
* * * * * * *
40438 TTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAA
505 TTTGTTTTATGATAAAATAATT-ATTCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAA
** * * *
40502 TTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-TTGAACCAGT
567 TTTATTAATA-TTC--AAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGT
* * * *
40566 TCAAATAGTTAAGACTATTTTATCATAAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
625 TCAAATAATTATGGCTA---T-T--T----GA-A-T---A-A-TTAT--CTATTT---C-A--A-
* * * *
40631 TTATTTGAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATA-AACAAATTGTTTCT-ATTCATACATG-T
664 --A-TTG---T--TT-TGACCTTTTGTTTAGTCATATAAC-AATT-TTTTTGA-TCATACAAGCT
* * * * * * *
40693 GTATTTGAAATAAAATAACACTTATTCA-T--A-TTCCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAA
717 -TA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * * ** *
40754 GATAAATCCATTTACCCAGCAAGTTCAAATAGTTATGATTAATTAAACAA-TTATTTTTTTCAAA
780 AATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTA-TACTTTAAAA
* * * *
40818 T-AGTTATGATA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTCTATTC
843 TCA-TTAT-A-ACCTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTCTATTC
* ** * ** * *
40861 ATACAAGTTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTTGTATTTTAAAAATTAATAGGTAAGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * * * * * * *
40925 ATCTAAAAAATAAATT-TGCTTATTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCT
66 ATTTAAAAAATAAATTAT--TTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCT
** * * * * *
40989 ATTTC-AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTGTTCATGCAAAATTAT
129 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAT-ATCATACAAACTTAT
** * ** * *
41052 TC-AGAATAAAATAATATTTATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACT
193 TCGA-AATAAAATAATA-CAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAT
* * * * * * * * * **
41112 ACATCTGCTTTTTGAAA-TAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCA
256 AAATCTG-TTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTG
* * * * * * * * * *
41176 TTATGATC-TTTATTTGGTTATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAGT
320 TTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
41240 AATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGC
383 AATACTAATTT-ATAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTTGC
* * * * * * * * * * * **
41304 CGAACTAATTCAATTAGTTAAGACAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCATTTG
445 TGAACAAATTTAAATAGTT-ATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG
* * * * *
41369 -TTTAGTTATAAAACAATTATT-TCAATTGATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT
509 TTTTA-TGATAAAATAATTATTCT-GATT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATTT
* * *
41432 ATTAACATTCAAAAAATTATGATCATGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTA-CGGAA-CAAGTT
570 ATTAATATTC---AAATTA--AT-AAGTGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-GAATC-AGTT
* ** * * *
41495 ---A-AA--AT--CGATTTG-------A-CTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTCTTTTGTCAT
626 CAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT
* * ** * * *
41543 AAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAACTTA-TCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTT
690 ATAACAATTTTTTTGA-TCA-TACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTT
* * * * *** *
41606 T-GAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAACTAAAACTATTTGTTTAACCAATTCAAATAGTTAT
751 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACGAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
41666 GACTATTTGAACAA-ATATCAATCTCAAATCATTATAATCTTTTTTTTCTCATAAAACAATTGTT
815 GACTATTTGAACAATTTAT-ACTTTAAAATCATTATAACCTTTATTTTATCATAAAACAATTGTT
*
41730 -TCAGCTC
879 CT-A-TTC
* * * * * * * *
41737 ATACAAG-TGCATT-AGGAATATAATAAAAACT-ATTTATTAATATTTCAAAATTTTATAACTAA
1 ATACAAGCT-TATTCA-AAATAAAAT-AATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * ** * *
41799 GAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCAAACCAATAGAAATAATTTTAAG--TATTTGAACAATT
63 GAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAAT-A-GTTAAGACTATTAGAACAATT
* * * * * * * * *
41862 ATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTAATATAAGC
125 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAT-ATCATACAAAC
* * * * *
41926 TTGTTC-AAATTAAAATAACACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAA
189 TTATTCGAAA-TAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTAAA
* * * * ** * * *
41989 AAAGTGAATCTATTTACCAAACCATTTTTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTT
251 AAAATAAATCTGTTTATCAAA-CA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* * * * * * * ** ***
42054 CAAATCGTTACAACATTTTATTTTATCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACACTTTTATTTGGA
313 AAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-G-TTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAA
* ** * * **
42119 ATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTGGAAACTTAATAACCAAGAAAATT-AAAAATAAATCT
376 ATAAAATAATACTAATTT-ATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AGTTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * * * * * *
42183 AATTGCCAAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTG-
439 ATTTGCTGAACAAATTTAAATAGTT-ATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGA
* * * * * * * * *** *
42247 CCTTTTCTTTTGTCG-TAAAAAAATCATTTTGTTTGTACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATACT
502 CTTTTTGTTTTAT-GATAAAATAATTATTCTGATTATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACT
* * * * * *
42311 AATTTAATGATATTTTGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATCA
565 AATTT-ATTA-ATATT-CAAA-T--T-AATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCA
* * * * * * * *
42376 GTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATGTA--TGATATTGTTTTGACTTTTTGTTTAATC
623 GTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * * *
42439 ATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-T
688 ATATAACAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATT
* * **
42503 TT-AAAAAGTTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAACAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGT
750 TTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAATAGT
* * *
42567 TATTACTATTTGAACAATTCTCTA-TTTAAAATCATTATAACCTTT-TGATTTGTCATAAAACAA
812 TATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACCTTTAT--TTTATCATAAAACAA
* *
42630 TTGTTTTAGTTA
874 TTGTTCTA-TTC
* ** *
42642 ATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * *
42702 GATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCAAACCAGTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTAT
65 GATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTAT
* ** * * * *
42765 CAATCTT-AAATTGTTAAGATC-TTTGTTTTG-CATAAAATAATTGTTTC-TAATCATA-AAAGG
127 CTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAT-ATCATACAAA-C
* ** * * * *
42825 TTATT-TAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA
189 TTATTCGAAAT-AAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAA
* * * * * ** * * * * *
42889 ATATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTAAAACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAA
252 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
* * * * * * * * * *
42954 TCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATC-TAACAAGCTTATTCAGAATA
317 TTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-GT-TCATAA-AAGTTTATTCAAAATA
* * *
43018 AAATAAT-CCAATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAGA-AAGCAAAAGATTTTGAAAAAATAAAT
379 AAATAATACTAA-TTTA-TAATATTTC-AAAAATTA-ATAAGC--AAGAGTTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
43080 CTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATG
437 CTATTTGCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * * *
43145 GCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
501 ACTTTTTGTTTTATGATAAAATAATTATTCTGA-TT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATA
* * ** *
43209 CTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTAAAAAAAGATTAAAT-TTTTTA-CTGA
563 CTAATTTATTAATA-TTC--AAATTAATAAG--TGA-TTTAAAAA-A-TAAATCTGTTTATC-GA
* * * * * * * ** *** * **
43272 A-CAAATGCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCACTATGACCAATTGTT
619 ATC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTT
* * * * * * *
43336 TTGTTATGA-AAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATGATACTAATTTATT
683 TAGTCAT-ATAACAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
43400 -AATATTCCAAATATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTA-TTACGAAATCAGTTCAAA
745 AAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACG-AACCAGTTCAAA
* * * * * * * * * *
43463 AAATTATGGCAATTTCAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATTACATTT-TGTTTAGTCATATA
808 TAGTTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACCTTTAT-TTTA-TCATAAA
*
43526 ACAATTGTT-TTTGATC
870 ACAATTGTTCTAT--TC
* **** * *
43542 ATACAAGTTTATTTTGGATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AGAT
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-
*** * * * * * * *
43605 G-TTT-----ACCGA--A---G-T-----AGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAATAATTGTATA
65 GATTTAAAAAATAAATTATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA
* * * *
43653 CTTCAAATCATTAT-AGCATTTTGTTCTA-TCATAAAATAATTATTTC-TATTCATACAAGCTTA
130 TTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTT-TAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAACTTA
* * ** * * * * *
43715 TTCAAAATAAAA-AATACTCATAAAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAATAGATTTAAAAAAT
192 TTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAT
* * * * * * * * *
43779 AAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCTAATAATTAAGACTAAATT-AATAATTATCTA-TTACAAA--
256 AAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTA-AAATT
* * * * * ** * ***
43840 -TCAT----TTTTGTTTTGTCATATAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAA
319 GTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT--GTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAA
* * * * * *
43900 TAA-AATGAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
382 TAATACT-AATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTT-
* * *** * * * * * *
43964 CCT-AGCCTGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTTAAATCATTATGACTTTT
443 GCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTT
* * * * *
44028 TGTTCTACT-ATAAAATAATAATTTTG-TTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATT
507 TGTTTTA-TGATAAAATAATTATTCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAATT
* * * * * *
44091 TATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATATGTTTATCAAATTAGATC
569 TATTAATA-TTC-A-AATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGTTC
* * * * * * * * *
44156 AAATAGTCATGACTATTTAAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
627 AAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAT
* ** * * * *
44221 AAAAATTATTTCAGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATT-AATATTTCA
692 AACAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAAT-TTTCA
* * * * ** * *
44285 AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAAATAATTATGAC
754 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * * ** * *
44350 TATTTTAACAATTATCTA-TTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCTTAAAATGATTTTTTT
818 TATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTCT
44414 ATTC
881 ATTC
* *
44418 ATACAAGCTTATGTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTA
1 ATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTA
* * * ** ** * * * *
44479 AAAAATTTCAAAAATAAA-TATGTTTATCAAATTAGATCAAATAGTCT--GACTATTTGAATAAA
62 AGAGATTTAAAAAATAAATTAT-TTGCT-AAACCAGTTCAAATAGT-TAAGACTATTAGAACAAT
* * * * * *
44541 TATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAGT-TCATATAAG
124 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCA-TATCATACAAA
* * * * *
44604 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAA
188 CTTATTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAA
* * ** * * * * * * *
44669 AAATCAATTTGTTTATTGAATAACTTTAAATAATTATGATTATTTTAACAATTA-TTATTTGAAA
252 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
* * * * * * * * *
44733 TCGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATA
317 TTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTT-TGTTCATAAAAGTTTA-TTCAAAATA
* *
44797 AAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA--T
379 AAATAATACT-AATTTA-TAATATTTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATCT
* * * ** * *
44857 ATGCT-CATCGAACAAGTTCAAATCTTTGTGACTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATTGTTA
439 AT-TTGC-T-GAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATC-TATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * * *** *
44920 TGACTTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTTGTAAAATCTTATTTGGATTAAAATAA
499 TGAC-TTTTTGTTTTATGATAAAATAATTA-TTCTGATTATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAA
* * * * * * * *
44985 TATTAATTTGTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAATGATCTAAAAAATAAATATATTTTTTGA
561 TACTAATTTATTAATA--TTCA-AATTAATAAG----TGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGA
* * * * * *
45050 ATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCT-TTGTGACCTTTTGTT
619 ATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGTTTTGACCTTTTGTT
* * ** * * ** *
45114 TTGTAATA-AACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATT-
683 TAGTCATATAACAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
45177 AATATTTAAAAAATTAATGAGTAAGGGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CATGTTCAAA
746 AAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCA-GTTCAAA
* * * ** *
45241 TAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTA-TTTCAAAA-CGTTATGGCCTTTTGTTTTATCATAAA
808 TAGTTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTT-AAAATCATTATAACC-TTTATTTTATCATAAA
* *
45304 ATAATTGGTTATATTC
870 ACAATT-GTTCTATTC
* ** *** ** *
45320 ATGCAAATTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTTTTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-A
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * ** * *
45383 AATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTTGA-CACGTTCAAATAGTTACGACTAATT-GAACAATTGT
65 GATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACT-ATTAGAACAATTAT
* *
45446 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCA-TCATAAACTAATTGTTT-ATGT--T-----C--
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-AGTCATAAAATAATTGTTTCATATCATACAAACTT
** * * * *
45500 A-T--AAAT--AAT-AT-TGATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAAT
191 ATTCGAAATAAAATAATACAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAT
* * * * *
45558 AAATCCGTTTA-CTGAACGAGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATTTACTTT-TAATC
256 AAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA-TTTAAAAT-
* * * * * * * **
45621 T-TTATTATCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTTTTTGAAATAAA
318 TGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAA
* *** * * * *
45684 ATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTATTAAGTTGGACATTTAAAAAATAAATTTGTTC
381 ATAATACTAATTTA-TAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGA-GTTTAAAAAATAAATCTATTT
* ** * * * ** * * *
45748 ACCAAACGAATTCAAATAGTCATGTTCATTTGAACT-ATTATTTATTTCAAATAGTTATGACATT
443 GCTGAACAAATTTAAATAGTTATACT-ATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTT
* * * *
45812 TTGTTTTATCG-TAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAAAAGATACTA
506 TTGTTTTAT-GATAAAATAATTA-TTCTGATT-ATAC-AAGCTTATTCAAAATAAATA-ATACTA
* * * * * * * * *
45874 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAACAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATCTATCAAACCAATTT
566 ATTTATTAATA--TT-CAAATTAATAAGTGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTATCGAATCAGTTC
* ** * * * ** * * * *
45938 AAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTGTCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAA
627 AAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAT
* * * * * * * * * * *
46002 AACAATTATTTCT-ATTTATGCAAGATTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAAT-AATATTCT
692 AACAATT-TTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTC-
* * * * * *
46065 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAATTCAATTAGTTAAGA
753 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
46130 CTATTAGAACAA-TTAT-CTAATTCAAATCATTCTAA-CTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTT
817 CTATTTGAACAATTTATACT--TTAAAATCATTATAACCTTTAT-TTTA-TCATAAAACAATTGT
* *
46192 TTTAGTTG
878 TCTA-TTC
* * ** * * * * *
46200 ATACATGCGTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAGAAAAGTAATACA-CAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATA-AGTAAG
* ** * * * *
46263 AAATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTTA-AACAATTA
64 AGATTT-AAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTA
* * * ** * *
46327 TCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTCAGT-TCATA-AAAGC
126 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCA-TATCATACAAA-C
* * * * * * *
46390 TTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAA
189 TTATTCGAAATAAAATAATA-CAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAA
* * ** *** * * * * * *
46455 AATAAGTCAGTTTATTGAATTGGTTCGAAA-AATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
253 AATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
* * * ** **
46519 TTGTTATGAA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTAATCATACAAGCCTATTCTGAATA
317 TTGTTAT-AACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGT--TCATAAAAGTTTATTCAAAATA
* *
46583 AAATATTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAGCAGATTTAAAAAATAAATCTA-
379 AAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AG-TTTAAAAAATAAATCTAT
* * ** * * * * *
46646 TT--T-ATCAAA-CT-AAT--TCCTA-T-TTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACTTA
441 TTGCTGAACAAATTTAAATAGTTATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTT
* * * * *
46702 TTATTTTGTTATAAAATAATTATT-TCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
506 TTGTTTTATGATAAAATAATTATTCTGA-TT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAAT
* * * * *
46766 TTAATATTATTTCAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTTGAAGT-AGTT
568 TTATTAATA-TTC-AAA-T--TAA-TAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-TCAGTT
** * * * * * * * * * * *
46829 CAAACGATTAAGACTATATAAACAATTATTTGTTTCAAATCGTTATG-GCTTGTTGTTTTGTCAT
626 CAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTT-TTGTTTAGTCAT
* * ** * *
46893 AAAACAATTGTTTCAACTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATT-AATATTC
690 ATAACAATTTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTC
* * * * * * *
46957 CAAAATT--TAA--AA-AG---T---GAAT---T-TGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGG
753 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
47007 CCATGTCG-ACAA-TTATCAATTTCAAATCATCATTACCTTT-TGCTTCATCATATAACAATTGT
817 CTAT-TTGAACAATTTAT-ACTTTAAAATCATTATAACCTTTAT--TTTATCATAAAACAATTGT
* **
47069 ATTTAAAC
878 -TCTATTC
* * * * * *
47077 ATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * *
47142 ATTTAAAAAATAAATTTAGTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGGGA-AATTGTA
66 ATTTAAAAAATAAA-TTATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTA-TTAGAACAATTATC
* * * ** * ** * * *
47205 AACTTGAAATTGTTATAAAATTTTGTTCT-GTCATAAAAAAAATAT-TTTTAT-TCATAC-AAGT
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TAGTCAT-AAAATAAT-TGTTTCATATCATACAAACT
* * * * * * * * *
47266 GTATTTGGAATAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATT-AAA
190 -TATTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTAAAA
* * * * * * * * * * * *
47330 AAATAAATTTCTTTGTTGAACCAA-TTCAAATATTTAAGTCTATATGACCAATTATCTATTTCAA
252 AAATAAATCTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAA
*** * * * * ** * ***
47394 ACAATTATGACC-TTT-TGTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAA
316 ATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTG--TTCATAAAAGTTTATTCAAAA
* * * * *
47457 TAAAATAA-AATGAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AG-GTTTAAAAAATAATTTTG
377 TAAAATAATACT-AATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAATAAATCTA
** * * * * * *
47518 TGTACCT-AACCAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTC
440 T-TTGCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * * * *
47582 CTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGATTTTG-TTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAATACT
503 TTTTTGTTTTATGATAAAA-TAATTATTCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAATAAA-TAATACT
* * * *
47645 AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAGTT
565 AATTTATTAATA-TTC--AAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-AGTT
* * * ** * * * * *
47709 CATATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-AACTTTGGTTCTA-TTAT
626 CAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTT-TAGTCAT
* * * * *
47772 A-AAGCAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATT-AATATT
690 ATAA-CAATT-TTTTTGATCATACAAGC-TTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAT-TT
* * * * * *
47835 TCAAGAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAAACAAATCTGTTTGCTGAACCATTTCAAATAGTTAT
751 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * **
47896 GACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATAACCCTTT-TGTTCTATCATAAAACAATT
815 GACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAA-CCTTTAT-TT-TATCATAAAACAATT
* *
47959 GTTTTTGTTC
876 G-TTCTATTC
* * * * *
47969 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAACAACT-A-A
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * ** * * *
48031 GATTTAAAAAATGAATCCATTTG-TCAGACCAGTTCAAGCACTTAAAAC-AATATGAACAATTAT
65 GATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCT-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTAT
* ** * * * *
48094 TTATTTCAAATTGTTATGACATATTGTTTTA-TCATAAAATAATTATTTCA-ACTCATACAAGCT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAACT
* * * * * * * *
48157 TATTTGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAA
190 TATTCGAAATAAAATAATA-CAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAA
* * ** * * * * *
48222 ATAATTCTATGCA-CTAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
254 ATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAAT
** * * * * * *
48286 CATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAA
318 TGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG--TTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * **
48351 ATAAAACTAATATATTATTATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAAATTTAAAAAGTAAATCTGCTT
381 ATAATACTAATTTA-TAATATTTCA-AAAATTAATAAGCAAG-AGTTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * ** * *
48415 AC--CACACTATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTATTATAACCT
443 GCTGAACA-AATTT-AAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTT
* * * * * * * ** ***
48477 TTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCCG-TTAATACTATTTTATTGGGAATAAAATAATACTAA
505 TTTGTTTTATGATAAAATAATT-ATTCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAA
* * ** * * ** ** * *
48541 TTTAATAATATTCCAAAACTTCATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATATAATTGCCCAACCAGT
567 TTTATTAATATT-C-AAA--T--TAA-TAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGT
* * **** * * ** * * * **
48606 TTAAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTTGT
625 TCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT
* * * * * *
48671 AAAACAAATGTTTTGATCATACAAGATTATTCAAATTAAAAGAATACTAATTTAAT-AATATTTC
690 ATAACAATTTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAAT-TTTC
* * * * * *
48735 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAGTTCAAATGGTTAAGA
753 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
48800 CTATTAGAATAA-TTAT-CTAATTCAAATCGTTCTAACGTTT-TATTGAGTCAAAAATTAATAAC
817 CTATTTGAACAATTTATACT--TTAAAATCATTATAACCTTTAT-TTTA-TC----A-TAA-AAC
** ***
48862 TAAGAGATT-TAAAAA
872 -AATTG-TTCT-ATTC
* * * ** *
48877 ATAAATCTATTTGCTATAGCTGTC-AAAT-AATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT
1 AT--A-C-A--AGCT-TA--T-TCAAAATAAAATAATACTA-AT--TTAA-TA-ATATTTCAAA-
* ** *** * ** * *
48940 CATT-ATGACCT-TTTG-TCATAAAACAATTATTTCAGCTATTTACTAATA--AGTCCAAATCA-
50 AATTAAT-AAGTAAGAGAT-TTAAAA-AA-TA----AATTATTTGCTAA-ACCAGTTCAAAT-AG
* * ** * * * * *
48999 TTATGACTATTTA-AGCAATTA-CTTATTTCAAATTGTTTTAACTTTTTACTTT-GTCATAAAAC
105 TTAAGACTA-TTAGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAAT
* ** * * * * * ** *
49061 AATTTTTTGC-TATTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAC
167 AATTGTTT-CATA-TCATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATA-CAATTTATTAACATTTCAAA
* * ** *
49125 AATTAATAAGTAAAAGACTT-AAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACT
229 AATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * * * * *
49189 TTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTTTTTGTAATAAAATAATTATTTCAG
293 ATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT--G
* * ** ** * * *
49253 TTCATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAA
356 TTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAA
* * * * *
49318 AAGAATTAAAAAA-AAATCTATTTACTGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATCTT-AATAATTA
420 GAG-TTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTAT-TTGAATAATTA
* * * * ** * * * * * *
49381 TCTCTTTTAAAAT-ATTTTGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTTTG-TTCATGCAGGC
482 TCT-ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATGATAAAATAATT-ATTCTGATT-ATACAAGC
* ** *
49444 TTATTTC-AAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AA-AAATTAAAAAAA
544 TTA-TTCAAAAT-AAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC--AAATTAATAAGTGATTTAAAAAA
* * ** * * * *
49505 TAAATTTGTTT-TCTGAA-CACGTTCAAATAGTTA-AACTATTAGAACAATAATCTATTT-TAAT
603 TAAATCTGTTTATC-GAATCA-GTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
49566 TCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATA-AATCAATTGTTTCT-ATTTATAAAAGCTTATTCAAAAT
666 T-GTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAA-CAATT-TTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC-AAAT
* * * *
49629 AAAATAATACTAATTTATGATAA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
726 AAAATAATACTAATTTATTA-AATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * * *
49693 TTTATTGAGCGAGTTCAAATAATTATGATTATTTAAACAATTATTTA-TTTCAAATCATTATGAT
790 TTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTAT-AA
* * * * * *
49757 CTTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGCTTCTATTT
852 CCTTTATTTTATCATAAAACAATTG-TTCTATTC
* **
49791 ATACAAG--T-TT----AT----TAATA-T--TCTAA-AA-A--T------TTAATAAGTTGGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * ** * * * * *
49832 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGCCCATTTA-AACTATTATCT
66 ATTTAAAAAATAAA-TTATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCT
* * * * *
49896 ATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAAATTAT
129 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAACTTAT
* * * * * * *
49960 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAA--ACTAA-TAAGACATTTAAAAACTA
193 TCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATA
* * * * * * ** * * **
50021 AATTTGTTTA-CTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAACTATCCATATCAAATCAT
257 AATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGT
* * * * *
50085 TATTA--TATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAAT
321 TATAACCT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTG--TTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAAT
* * * * * *
50148 ATTGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATGC-ATTTG
383 AATACT-AATTTATAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-CTATTTG
** * * * * * * * * *
50211 CCAAACCAGTTCAAATAGTGAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTT
444 CTGAACAAATTTAAATAGT-TATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTT
* * * * * * *
50276 G-TTTAGTCATAAAATAATTGTATC-AATTTATACATGCTAAATGTTAATA-AAATAATACT-AT
508 GTTTTA-TGATAAAATAATTAT-TCTGA-TTATACAAGCT-TAT-TCAAAATAAATAATACTAAT
* * ** * * * * *
50337 TGTATTAACATTTAGAAAATTAATATACAAGAAATTTTAAAAAATAATTATATTTA-CCAAACAA
568 T-TATTAATA-TT--CAAATT-A-AT--AAGTGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-A
* * * * * * * *
50401 ATTCAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTA-C
623 GTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-TTTAGT
* * ** * * * * * * * *
50464 CATAAAACAACTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATACAATAGTATTACTTTATTAATTT
687 CATATAACAA-TTTTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAATT
* * * ** * *
50529 TTCAAAAATTGAGAAGTTGAA-A-ATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATCAAATTAATTCAAATAA
750 TTCAAAAATTAATAAG-T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTA-CGAACCAGTTCAAATAG
* * * * * * *
50591 TTATGTCCATTTGAACAATTATTTA-TTTTAAATCGTTATGAGCCTTT-TTTTGTCATAAAACAA
811 TTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTAT-AACCTTTATTTTATCATAAAACAA
50654 TTGTT-T-TTC
874 TTGTTCTATTC
* * *
50663 ATCATGCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A
1 AT-A--CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
50727 GAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATT
63 G-AGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATT
* * * * * * * * *
50791 ATATATTTCAAATTATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATCTTCATACAAAC
125 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAT-ATCATACAAAC
* * * * * * *
50855 TTATTAGAAATAAAATAGTACTAATCTAATT-ATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
189 TTATTCGAAATAAAATAATAC-AAT-TTATTAACATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAA
* * * * * * * * * *
50918 AAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-TT-AAATAGTTAAGA-TGATATGGATAATTATCTATTTC
251 AAAATAAATCTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATTTATTTA
* * * * * * **
50980 AAATTGTTGTAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAA
314 AAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AAT-TGTTTGTTCATAAAAGTTTATTCAAAA
* * *
51045 TAAAATAGTATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAATAAATAAATCTAT
377 TAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAATAAATCTAT
* ** * * * *
51107 TTACCAAACTAGTTT-AATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAAC
441 TTGCTGAACAAATTTAAAT-AGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-AC
* * * *
51171 -ATTTGTTTTGTCATAAAATAACTTATTC--A-GA-A-AA----A--C---AT-AAT--T-CTAA
503 TTTTTGTTTTATGATAAAATAA-TTATTCTGATTATACAAGCTTATTCAAAATAAATAATACTAA
* * * * *
51217 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTGAATCTATTTATCGAA-CAAGTTTA
567 TTTATTAATA-TTC--AAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-AGTTCA
* * ** * * * * * * * * *
51281 AATAGTTATGACTATTCAAATAATAACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTGATAAA
628 AATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATA
* * *
51346 ATAATTTTTTTCTATTCATACAAG-TTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAACA--TTC
693 ACAATTTTTTT-GA-TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA-ATTTTC
* * * * * ** *
51407 AAACAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAGAATAACTCTGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATG
753 AAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
51472 ACTATTTGAGCAATTATTTTATTTTAAAA-CATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
816 ACTATTTGAACAA-T-TTATACTTTAAAATCATTATAAC--CTTTATTTTATCATAAAACAATTG
* *
51536 TTTTGTTC
877 TTCTATTC
* ** * * * ** * * *
51544 ATGCAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * *
51609 ATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CATGATT-AAATAGTTAAAACTATTCGAATAATTATC
66 ATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCA-G-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
* * ** * * * * **
51672 TATTACAAATCATTGTGACCTTTTTGTTTCTTCATAAAACAATTATATCA-ATTCATATAGGCTT
128 TATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAACTT
* * * ** * *
51736 ATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGACTT-CAAAA
191 ATTCGAAATAAAATAATA-CAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAA
* ** * * * *
51800 ATGAATCAATTTA-CTGAATAAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATT-TTCTATTTCAAA
254 ATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT-TATTTAAAA
* * * * * * * * *
51863 TCGTGATGACATTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA-TCTTATTTC-AAAT
317 TTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGTTCATAAAAGT-TTA-TTCAAAAT
* * * * * * *
51926 AGAATAATA-TATATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTAAAAAAATACATTTA
378 AAAATAATACTA-ATTTA-TAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
51989 TTTTCTGAGCACATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC-
440 TTTGCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT
* * * * ** * * * *
52053 ATTTGTTTTGTCATGAACCAGTTGTTTCT-ATTCATACATG-TGT-TT----TTAAACT-ATACT
504 TTTTGTTTTATGATAAAATAATT-ATTCTGATT-ATACAAGCT-TATTCAAAATAAA-TAATACT
* * * * * *
52110 AGTTTATTAATATTCAAAATTTTGATAAGTAAAAAATCTAAAAAATAAATCTATTTATCG-AGCA
565 AATTTATTAATATTC-AAA--TTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-
* * * * * * * * * *
52174 AGTTTAAATAGTTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTA-
622 AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-TTTAG
** * * * *
52238 TTGTAAAACAATTATTTCT-ATTTATACCAA-TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
686 TCATATAACAATT-TTTTTGA-TCATA-CAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * * *
52301 TATTTT-GAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
747 -ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAATA
* * * * * * * * * *
52365 GTCATGTCCATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
810 GTTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTAT-AACCTTTATTTTATCATAAAACA
* *
52429 ATTGTTTTTGTTC
873 ATTG-TTCTATTC
* ** * * * * ** *
52442 ATGCAATATTATTCAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTT-TGAAAGT--TAA-TAAGAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * * * *
52503 ATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAAACAGTTTAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATAATTTA
66 ATTTAAAAAATAAA-TTATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTA
* * * * * *
52568 TCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATT
130 TTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATATCATACAAACTTATT
* * * * * * * *
52631 TGGATTAAAATCATACTAATTTA--AATATATTCCAAAATT--TTA-TAAGAGATTTAAAAAATA
194 CGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATA
* * * * * * * * *
52691 AATATGTTTGCTTAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTCTTTCAAATTGC
257 AATCTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTG-
* * ** * ** * * * ***
52755 TT-TAA-TTTTTAGTTTAACTATATATTAATTGTTTTCATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
320 TTATAACCTTTTATTTTGTC-ATAAAACAATTG-TTT-GTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * *
52818 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAAATAAATTTGTTTA
382 TAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-T-TTAAAAAATAAATCTATTTG
* * * * *
52883 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTT
444 CTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTT
*** * * * * * * *
52948 TGTTTTGCCATAAAACAATTGTT-TTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATTAAATAATGCTACTT
507 TGTTTTATGATAAAATAATTATTCTGA-TT-ATACAAGCTTATTCAAAA-TAAATAATACTAATT
* * * *
53012 TATTATTATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTC
569 TATTAATA-TTC-AAA-TTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGTTC
* * ** * * * *
53077 AAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCATA-
627 AAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAT
* * * * * * *
53141 AAGCAATTCTTTTTCATTAGACAAGCCTATTCAAAAGAAAATAATACTTATTTAATAATATTTCT
692 AA-CAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTT-T
* * * * * *
53206 C--ACATTAATAAGTAGGACATTTAAAAAATAAATATACTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
752 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
53269 ACTATTTGAACAATTAATTATATATTTTAAATTATTATAACCTTTTGTTTTATGATAAAACAATT
816 ACTATTTGAACAA-T--TTATA-CTTTAAAATCATTATAACC-TTTATTTTATCATAAAACAATT
* *
53334 ATT-TATCTTG
876 GTTCTA--TTC
* * * * *
53344 ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAA-AACACTAATCTACTAATATTAT-GAAAATTAA-AATCTAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAA-GTAAG
* ** *
53405 AGATTTAAAAAATAAATT-TGTT--T--ACC----CAACATAGTAAAGGTTA-TATGAATAATTA
64 AGATTTAAAAAATAAATTAT-TTGCTAAACCAGTTCAA-ATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTA
* * * * * * * * *
53460 TCTCTTTTAAAAT-GTTATGACCTTCTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TTGTTCATA-AAAG
126 TCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAT-ATCATACAAA-
* * * * * * * *
53522 TTTGTTCTAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAT
188 CTTATTCGAAATAAAATAATA-CAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAA
* * * * * * * *
53583 AAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTAGTTATTTCAAG
252 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
* * * * * ** * * ***
53648 TCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAATTAATACAA-TCTTATTTGGAATA
317 TTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGTTCATAAAAGT-TTATTCAAAATA
* * * * * * **
53712 AAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAACTTAATAAGTAATGGAATTAAAAAAAGGAATCTA
379 AAATAATACTAATTTA-TAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAA--GAGTTTAAAAAATAAATCTA
* * * ** * * *
53776 TTGGCCTG-ACCAGTACAAATAGTGATAACTGTTTAAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGAC
440 TTTG-CTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * * * ** *
53839 CTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCT-ATTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACATAATTCT
503 TTTTTGTTTTATGATAAAATAATT-ATTCTGA-TTATACAAGCTTATTCAAAATAA-ATAATACT
* * * * *
53903 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATTGAA-CAAGTT
565 AATTTATTAATATT-C--AAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-AGTT
* ** * * * * * * * *
53967 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAAGCTTTTGTTTTGTCATA
626 CAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATA
* * * * * *
54032 AAATAATTTTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAAGTTATTAATATTTA
691 TAACAATTTTTT-TGA-TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTT
* * * * * * ** *
54096 GACAACTTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATG
752 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * * * * *
54160 ACTATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATTGTTATGACTTTTGGTTTTGTCATAAAACAATAGTT
816 ACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACCTTT-ATTTTATCATAAAACAATTG-T
* *
54224 TTTGTTC
878 TCTATTC
* ** * * * ** * *
54231 ATACAAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
54296 ATTTTAAAAATAAACATGTATAAGTT-CAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAA
66 ATTTAAAAAAT-AA-AT-TAT---TTGC------T-A-AACCAGTT---CAA--A--TAGTTAAG
* ** * * * *
54360 ATCTCATAACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCATAAAAC
110 A-CT-AT---TA---GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAT
** * ** *
54425 AATTGTATT-AGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
167 AATTGT-TTCATATCATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAA
* * * * * * *
54488 ATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATATGTTTA-CTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTA
230 ATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
54552 TTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGT
294 TTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGT
* * * * * * *
54617 TCATACATGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTCATTGATA-TTCGAAGAATTAATAAGT
357 TCATAAAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTA-TAATATTTC-AAAAATTAATAAGC
* * ** **
54679 AAAAATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
418 AAGAGTTTAAAAAATAAATCTA-TTTGCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATT
* * * * ** * *
54743 ATATATTTCAAATAGTTATGACTTTTTATTTTATCATAAACCAATTGTTTTTG-TTCATACAAGC
481 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATGATAAAATAATT-ATTCTGATT-ATACAAGC
* ** *
54807 ATATT-TGAA-AAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA
544 TTATTCAAAATAAATAATACTAATTTATTAATATT-C--AAATTAATAAGT---GATTT-AAAAA
* * * * * ** ** *
54869 ATAAATTTGTTGACCG-AGCAAGTTCATATCGTTATTACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
602 ATAAATCTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
54933 AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGAATAA
666 TGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATT-TTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCA-AATAA
* * * * * *
54997 AATAATACTGATTTATT-ACTATTC-TAAATGAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
728 AATAATACTAATTTATTAAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * *
55060 ACTAACAAGTTTCAAATTTCA-TATATTAAACAATTATTATTGAA-AATTAAT-CTGTTATCAAA
793 ACGAACCAG-TTCAAA--T-AGT-TA-T-GAC---TA-T-TTGAACAATTTATACT-TTA--AAA
** * * *
55122 --ATTCA-AATAGTTATGATTTTGT-AT-AAACAATTACCTATTTAAATTGC
843 TCATT-ATAA-CCTT-T-ATTTTATCATAAAACAATT--GT-TCT--ATT-C
* ** * * *
55169 -TATAATTTTATTTTGTCATAAAATAAAATTTTATTACATATTATTTTAATTAAAATAAT-AAAA
1 ATACAAGCTTA---T-TC--AAAATAAAA---TAATAC-TA--A-TTTAA-TAATAT-TTCAAAA
* *** ** * *
55232 TTATTAATATTTAGACAACTAATAAGTAATATTGTTTAAA-AAA-TATTTTTTAAATCA-TTTAT
51 --ATTAATA---AG-----TAA-GAG--AT-TT-AAAAAATAAATTATTTGCTAAACCAGTTCA-
* ** * * ** * *
55294 AATA-TTATGTTTATCTA-AA-AATTATTTATTTATAAATC-TTATTGAATTAATTTAATTTATT
100 AATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTA-TGACCT--TTT-GTTTAGT
** * * * * * * * *
55355 CATATTCAAA-AATTGTTTTGT-TTATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTCATTAA
159 CATA---AAATAATTGTTTCATATCATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATA-CAATTTATTAA
* ** * * *** * *
55418 TATTTTGATAATTAATAAGTAACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATA
220 CATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATA
* * * *
55482 GTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCTCATAACTATTAGAATAATTATTTATTTCA
284 GTTATGACTATTTG----A--A-C-AATT---AT-T--T-A-T-TT--AA-AATT-GTTA--T--
* * * * * * **
55547 AATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAAT
324 AA-CCTT-TTA--TTTTG-----TCATAAAACAATTGT-TT-GTTCATAAAAGTTTATTCAAAAT
* * * * * * * *
55612 AAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAA-TAACACATTTAAAATATGAATTTA
378 AAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAAT-AAGCAAGA-GTTTAAAAAATAAATCTA
* * * ** * * * * *
55676 TTTACGGGACATGTTCAAATGGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT
440 TTTGCTGAACAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT
* * * * * * * *
55741 TTTTGTTTTGTCATAAAATATTTTTTTTTATCATACATGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAA
504 TTTTGTTTTATGATAAAATAATTATTCTGATTATACAAGCTTA-TTCAAAAT-AAATAATACT-A
* * * *
55804 ATTTATTACTATTCCAAAAGTTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAA-CAC
566 ATTTATTAATATT-C-AAA-TTAATAAGT---GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAATCA-
* ** * * **
55867 ATTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATAG-TTAAAGCCTTTTGCTTT-G
623 GTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGA-CCTTTTG-TTTAG
* * * *
55930 TCATA-AACCAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCGTATTCAAAATACAATAATACTATTTTATT-A
686 TCATATAA-CAATT-TTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
55992 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAACATAAATTTGTTTACTGAGCAAGTTCATAT
747 AT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
56056 CGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTA-TTTCAAAT-AGTTATGATCTTTCGTTTTGTCATAAAA
809 AGTTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCA-TTATAACCTTT-ATTTTATCATAAAA
* * * *
56119 CAATTATTTTTCTTT
871 CAATT-GTTCTATTC
* * * * * * * ** *
56134 ATACAAGTTTAGTCAGAATAAAATAATATTATTTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATTGGTAGGA
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * *
56198 GATTTAAAAAATAAATT-TGTT--T-----A--TCGAATAAG-TAATCCTATTTGAACAATTATT
65 GATTTAAAAAATAAATTAT-TTGCTAAACCAGTTCAAAT-AGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
* ** * * * * *
56252 TATTTGAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTT-TTATTCATGCAAAATTA
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATA-TCATACAAACTTA
* * * * * * *
56315 TTC-AGAATAAAATAATACTGATATATCAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAC
192 TTCGA-AATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAA
* * * * *
56375 TAAATCTATTTAACAAA-ATAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATTACTTATCTT-CAAT
255 TAAATCTGTTTATCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT-TTAAAAT
* * * * * * * * * * * * *
56438 CGTTATGATC-TTTATTTTGCCATAAAGCAAATGTTTATTTTCACACATGCTTATTCAGATTAAA
318 TGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
56502 ATAATACTAATTCAATAATATTCCAAAACTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATACATGTGTT
381 ATAATACTAATT-TATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAAAATAAATCTATT
** * * * * * *
56567 TGCCAAACCAA-TTCAATAGTTAAGACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACAT
442 TGCTGAACAAATTTAAATAGTT-ATACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTT
* * *
56630 TTTG-TTTAGTCATAAAACAATTATT-TTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
505 TTTGTTTTA-TGATAAAATAATTATTCTGA-TT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTA
* * * * *
56693 ATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATTAAATTTGTTTA-CCAAACA
566 ATTTATTAATATTC---AAATT-A--A-TAAGTGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTATCGAATC-
** * * * *
56757 AGTTCAAATAGATT-TGATTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTT
622 AGTTCAAATA-ATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TTGTTTTGACCTTTTGTTTA
* * ** * * * * * * * *
56820 GTCATAAAACAATTGTTTCAACTAAAAAAAAC-TATCCGAAATAAAATAATACCACTTT-TTTAA
685 GTCATATAACAATTTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
* * * ** * * * *
56883 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAATATTTAAAACCTAAAGT-TGTTTTCCAAACCAGTTAAAATA
748 T-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCT-ATTTACGAACCAGTTCAAATA
* * * * * * * * *
56947 GTTATGACTATTTGAACAA-ATATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTCTAATAAAATAA
810 GTTATGACTATTTGAACAATTTAT-ACTTTAAAATCATTATAACCTTTATTTTATCATAAAACAA
57011 TTGTTTCTGA-TC
874 TTG-TTCT-ATTC
* * *
57023 ATATAAGTTTATTTC-ATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGA
1 ATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
57082 GATTTAAAAAAATAAATAATTTTGCCAAACCAATTCAAAGAGTTAAGACTATTAGAAAAATTATC
65 GATTT-AAAAAATAAATTA-TTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
* *** * * * *
57147 TATTTTAAATTGCTCTGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTATTTCAGT-TCATACAAGCTTA
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCA-TATCATACAAACTTA
* * * * *
57211 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTCGACCAAA
192 TTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT--A-AAAA
* * *
57276 AA-AAATCTATTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTAAAA
253 AATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
** * * *
57339 TAT-TTATGAA-AATTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAA-TCTTA-TCCAAA
317 T-TGTTAT-AACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-GTTCATAAAAGT-TTATTCAAAA
* * * * * * * *
57400 TGAAATAATACTACTTTATTAACATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAACAAATC-A
377 TAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTCAAAAATTAATAAG-CAAGAGTTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * * * * * * *
57464 GTTT-AT-CACATCATTTCAAATAATAATGGCCATTTGAACAACTATTTATTTTAAATCGTTATT
440 -TTTGCTGAACA-AATTT-AAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * ** * **
57527 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTGTAACATACAAGCTCATTTGAAATAAAATAATAC
501 ACTTTTTGTTTTATGATAAAATAATTATTCTG-ATTATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATAC
* * * ** * * *
57592 TAATTTATTAATATTTCAGGAATTAATAAGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACCAATT
564 TAATTTATTAATA-TTCA--AATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGTT
* * * * * * * *
57657 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAGCTATTTTAAA------TAACCTTTTGGTCTA-TCAT
626 CAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTT-GTTTAGTCAT
* * * * **
57715 AAAACAACTGTTTCT-ATTTATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGGAATATTT
690 ATAACAA-TTTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTT
* * *
57779 T-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATCCGT-TTGTA-GAACCAGTTCAAACAGTT
751 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-C-TATT-TACGAACCAGTTCAAATAGTT
* * * * * ** ** * *
57840 AAGACTATATGAA-TAGTTAGTTA-TTTGAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
813 ATGACTATTTGAACAATTTA--TACTTTAAAATCATTATAACC-TTTATTTTATCATAAAACAAT
* *
57903 TATTTTAGTTC
875 TGTTCTA-TTC
* *
57914 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AGCTAACTTT--TAATATTTCAAAAATTTATACGTAAG
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAA-TTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** * * *
57976 AGATTTAGAAAATAATTCTACTTACCGAACCA-TTCAAATAATTATA-ACTATTTGAATAATTAT
64 AGATTTAAAAAATAAAT-TATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTAT
* * * * * * * * **
58039 CTATTTCAAGTC-TTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TTGTTAATATAAGTT
127 CTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAT-ATCATACAAACT
* * * * * *
58101 TGTTCGAAAGAAAATAATACTTATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAA
190 TATTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAA
* * * * * * * * * *
58165 AGTAAATTTGCTTA-CTAAACCATTTCAAATAGTTTTGAATATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
253 AATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
** * * * ** * ***
58229 TCATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTCTGCATAA
317 TTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGTTCATAAAAGTTTATTCAAAATAA
* ** * * ** *
58294 AATAAGACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATT
380 AATAATACTAATTT-ATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AGTTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * * * *
58359 ACTAAACCAATTCAAATAGTTTAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTT
443 GCTGAACAAATTTAAATAG-TTATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTT
* * * * *** * *
58424 TGTTTGGT-TG-TAAAACAATTGTTTTG-TTCGTACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATAATAAT
507 TGTTT--TATGATAAAATAATTATTCTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAAT
* * * * * *
58486 TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATATAAAAAATAAATTTGTTTATCAAAT-AATTCAAA
568 TTATTAATA-TTC--AAATTAATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATCAGTTCAAA
** * * ** * *
58550 TGGTT-TAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAA
630 TAATTAT-GGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAA
* ** * * * * **
58614 CAATTGTTTCAATTCATACAACCTTATTTAAAATAAATTAATACTAATTTATT-GACGTTCAAAA
694 CAATTTTTTTGA-TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTTTCAAAA
** * * * ** *
58678 AGTTAATAACAAAAAGAGATTT--AAAA-AAATATGTTTACCAAATATGTTCAAATAGTTATTAC
757 A-TTAAT-A-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACGAACCA-GTTCAAATAGTTATGAC
* * *
58740 TATTTGAACAATTGTCTA-TTTAAAATCATTATAACCTTT-TGATTTGTCATAAAACAATTGTTT
818 TATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACCTTTAT--TTTATCATAAAACAATTGTTC
58803 TAGTT-
880 TA-TTC
*** * * * * *
58808 AGTACAAGCTTAGAGAGAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAAGA
1 A-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * ** * * * * **
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* ** * * ** *
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128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCATATCATACAAACTTA
* * * * **
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* * * * * * *
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256 AAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTT-ATTTAAAATT
* * * * * * * * * *
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319 GTTATA-ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT-TGTTCATAAAAGTTTATTCAAAAT-AA
* * **
59191 AATAATACTAATTTAATAATATTTCATAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTT
380 AATAATACTAATTT-ATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * * * * *
59256 G-TGGAACCAATTCAAATAGTTAAAACCATTAGAATAATTATCTATTGCAGATTGTTCT-AATAT
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* * * * *
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505 TTTGTTTTA-TGATAAAATAATTA-TTC-TGAT-TATACAAGCTTATTCA-AAAT-AAATAATAC
* * * * *
59380 AAAGTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGCAAAAT-ATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA
564 TAATTTATTAATA-TT--CAAATTAATAAG-----TGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAA
* * * * * * *
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620 TC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTT
* * * * * * * * * * *
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684 AGTCATATAACAATT-TTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * *
59572 ATATTTT-GAAAATTAATAAG-CA-ATATTTAAAAAAATAAAATC-GTTTACTGAACAAATTCAA
746 A-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAATCTATTTAC-GAACCAGTTCAA
* ** * ** * *
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807 ATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TATACTTTAAAATCATTATAACCTTTAT-TT-TATCATAA
*
59696 AACAATTGTTTCAATTC
869 AACAATTG-TTCTATTC
** * *
59713 AT-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----G
1 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * ** *
59773 ATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAAC-AAATCAGTTCAAATAATTATTG-CCATTTTAATAATTATC
66 ATTTAAAAAAT-AAATTATTT-GCTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATC
** * * * *
59836 TATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTA-T-ATAACA-AATT-TCTT-TTATCATACAAGCTTA
128 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGT-TTCATATCATACAAACTTA
* * * ** * * *
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192 TTCGAAATAAAATAATAC-AATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAAT
** * * *
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256 AAATCTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATTTA-TT-TAA--
* * * * * * * *
60024 AATTATTTACAAAATAAACCTTTCATTTTGTTACAAAATAATTATTTATGTTTATACAAA-CTTA
315 AATT-GTT-----AT-AACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TGTTCATA-AAAGTTTA
* * * * * *
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* * * * * * * * ** * * * *
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432 TAAATCTATTTGCT-GAACAAATTTAAATAGTT-ATACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * ** *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* *
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ATAAATCTATTTACGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTATACTTTAAAATCA
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Found at i:34966 original size:427 final size:425
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* * * * * *
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** ** ***
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** *
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* * ** * *
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* * * **
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** * * ** *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * ** *
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192 --AAGACAATTAATAAGTAAAGAA-TGTAAAAAATAAATCCATTTACCAAACACATTCAAATAGT
*** * *
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* * * *
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*
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35134 TTGCTTATTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (425 bp):
TATTAATATTCCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTGCTTACTCAACAAATTC
AAATAATTATGACTATCGAAACAATTATCTATTCCAAAACACTATAAGATTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGATTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAACACAAATTTATTAATATTAAGA
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ATTCAAACAATTATCTATATCAAATTATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
TTCAAACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAAA
AGATTTTAAAAAATAAATATTTTTACTAAACAATT
Found at i:35408 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 34720--35425 Score: 688
Period size: 181 Copynumber: 3.9 Consensus size: 179
34710 TTTACTAAAC
* * * * *
34720 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAAAAAAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATCTGTTTAC-CAAT
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* ** * * *** *
34784 CAAGTTCACATAGTTATGACTATCGGAACAATTATCTATTCCAAAACATTATTAGC-TTTTGTTT
62 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTT
* * *
34848 TGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTAATTTGAATAAAATATTA-T
126 TGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAG-TTTATTTGAATAAAATAATACT
* * * **
34902 AAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATTAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTTCCAAACA
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* * * *
34967 CA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGTACAATTATCTATATCAAATTATTATGACCA-TTTGTTTT
64 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTT
* * * * *
35030 GTCATAAACCAATTGTTTTTGTTTAAACAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACT
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATT-TGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
35084 AATTTATTAATATTCCAAATTTAATAAGTAAAGGATTTTAAAAAATAAATTTGCTTATTGAGCGA
1 AATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAA-GATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAA
* * * **
35149 GTTCAAATAGTTTTGACTATTTGATCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTC
65 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTC
*
35214 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACT
130 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTG-AATAAAATAATACT
* * *
35265 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGA-TTTAAAAAATTAATCTATTTACTGAACA
1 AATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * * * * *
35329 AGTTCAACTAGTCATGTCCATTAGAACTATTATATATTTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTAT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGT
* * * *
35394 CATAAAATAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTT
129 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTT
35426 GAATAATTAT
Statistics
Matches: 432, Mismatches: 79, Indels: 26
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
180 26 0.06
181 356 0.82
182 24 0.06
183 26 0.06
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTGAATAAAATAATACT
Found at i:35663 original size:254 final size:255
Alignment explanation
Indices: 35175--35664 Score: 648
Period size: 254 Copynumber: 1.9 Consensus size: 255
35165 CTATTTGATC
* ** *
35175 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * ***
35240 AGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTA
66 AGCCTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACAAGAAGATTTA
* * * * * * *
35305 AAAAATTAATCTATTTACTGAACAAGTTCAACTAGTCATGTCCATTAGAACTATTATATATTTCA
131 AAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAACTAGTCACGACCATTAGAACAATTATATATGTCA
* *
35370 AATTGTTATGACATTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTTGAAT
196 AATTGTTATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTTGAAT
*
35430 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* *
35494 AAGCCTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATGCACAAG-AGAT
65 AAGCCTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AACAAGAAGAT
* ** * * *
35556 TTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAGTAGTTCAAAC-AGTTACGACTATTTGAACAATTATATAT
128 TTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTC-AACTAGTCACGACCATTAGAACAATTATATAT
*
35620 GTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC
192 GTCAAATTGTTATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC
35665 TATTTATACA
Statistics
Matches: 202, Mismatches: 29, Indels: 9
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
254 103 0.51
255 97 0.48
256 2 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (255 bp):
AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
AGCCTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACAAGAAGATTTA
AAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAACTAGTCACGACCATTAGAACAATTATATATGTCA
AATTGTTATAACATTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTTGAAT
Found at i:35805 original size:435 final size:435
Alignment explanation
Indices: 34994--35826 Score: 996
Period size: 435 Copynumber: 1.9 Consensus size: 435
34984 CTATTTGTAC
* * * ** *
34994 AATTATCTATATCAAATTATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTTAAACA
1 AATTATCTATATCAAATTATTATGAACATTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCAAACA
** * * *
35059 AGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAATTTAATAAGTAAAGGATTTTA
66 AGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAAT-AGCAAAGGATTTTA
* ** * ** * * *
35124 AAAAATAAATTTGCTTATTGAGCGAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGATCAATTATTTATTTCA
130 AAAAATAAATATGCTTACCGAGCGAGTTCAAACAGTTACGACTATTTGAACAATTATATATGTCA
* ** * * **
35189 AATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAAT
195 AATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAAT
* * * * * * * *
35254 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCTAT
260 AAAATAATAATAATGTAATAATATTATAAAAATTAAGAACTAGAAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * **
35319 TTACTGAACAAGTTCAACTAGTCATGTCCATTAGAACTATTATATATTTCAAATTGTTATGACAT
325 TTACTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGGCCATTACAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACAT
35384 TTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTTGAAT
390 TTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTTGAAT
* * * *
35430 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACA
1 AATTATCTATATCAAATTATTATGAACATTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCAAACA
*
35495 AGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAAT-GCACAAGAGA-TTT
66 AGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAGCA-AAG-GATTTT
* *
35558 AAAAAATAAATATGTTTACCGAAG-TAGTTCAAACAGTTACGACTATTTGAACAATTATATATGT
129 AAAAAATAAATATGCTTACCG-AGCGAGTTCAAACAGTTACGACTATTTGAACAATTATATATGT
* *
35622 CAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCATATTTGGA
193 CAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAA
* * * *
35687 ATAAAATTATAATAATGTAATAATATTATGAAAATTAAGAACTA-AGAGATTTAAAAAGTAAATT
258 ATAAAATAATAATAATGTAATAATATTATAAAAATTAAGAACTAGA-AGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
35751 TGTTT-GTCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTA-TATCAACAATTTTGTATTTCAAATCATTA
322 TATTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTCAAGGCCATTA-CAACAATTATATATTTCAAATCATTA
35813 TGACATTTTATTTT
384 TGACATTTTATTTT
35827 GTTGGAAAAT
Statistics
Matches: 329, Mismatches: 61, Indels: 15
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
434 6 0.02
435 216 0.66
436 107 0.33
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (435 bp):
AATTATCTATATCAAATTATTATGAACATTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCAAACA
AGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAGCAAAGGATTTTAA
AAAATAAATATGCTTACCGAGCGAGTTCAAACAGTTACGACTATTTGAACAATTATATATGTCAA
ATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAATA
AAATAATAATAATGTAATAATATTATAAAAATTAAGAACTAGAAGATTTAAAAAATAAATCTATT
TACTGAACAAGTTCAAATAGTCAAGGCCATTACAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACATT
TTATTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGATCATAAAAGTTTGAAT
Found at i:36107 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 35423--36910 Score: 1104
Period size: 181 Copynumber: 8.2 Consensus size: 181
35413 ATCATAAAAG
* * * * *
35423 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-ACTTTTGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC
1 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * ** * * * *
35487 ATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATGCA-CA
65 TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AAGTA
** * * **
35550 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAGTAGTTCAAACAGTTACGACTA
129 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * * * * *
35603 TTTGAACAATTATATATGTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAT
1 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGT
* * * * * * * * *
35668 TTATACAAGCATATTTGGAATAAAATTATAATAATGTAATAATATTATGAAAATTAAGAACTAAG
66 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAG
* * ** *
35733 AGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTGTCGAACCAATTCAAATAGTTA-AGGCTA
131 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTA
* * ** * *** *
35784 TATCAACAATT-TTGTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTTGGAAAA-TAAT-TTTTTC
1 TTTGAACAATTATT-TATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT-
* * * * * * **
35846 AGTTCTTACTAA-CTCATTTGGAAGAAAATAAAATAAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATCAA
64 -GTTCATAC-AAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AA
* * * * * * * * *
35910 -TAAAAGATTTGAAAAATAATTCTATTTGCCAAACTAATTCAAATAATTACT-ACTA
126 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTA-TAACTA
* *
35965 TTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGGCATTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATGTTTTTGT
1 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGT
* * * * * *
36029 TCAAATAAGTTTGTTTGGAATAAAATATTATTAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAGTAAG
66 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAG
* ** *
36094 AGAATTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCAATTCAATTAGTT-TAACTA
131 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * *
36144 TTTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACCA-TTTATCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
1 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTG
* * * * * * *
36208 TTTATA-TAGTCTTATTTGGATTAAAGTAATGCTT-ATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGC
65 TTCATACAAG-CTTATTTGGAATAAAATAAT-ATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT
* * ** * * *
36271 AATG-GATTTAAAAAATGAATTTGTTGCCCTAACCAGTGCAAATAGTTATAAC-A
128 AA-GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATAACTA
* * ** * * * * * * *
36324 GTTTAAATAATTAAGTACTTCAAATAGTTAT-AAACTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCT
1 -TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT
* * *** * * * *
36388 GATCGTACAAGCTTATTCAAAATAACAA-AAT-TCTAACTTATTGATATTCTGAAACTTAATAAG
64 GTTCATACAAGCTTATTTGGAATAA-AATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
* * * * * *
36451 TAAAAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAA-GAAGTTCAAATAGTTATGACTA
127 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * * * *
36506 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCCTTTTATTTTGTGATAAAATAACT-TTTTCT
1 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-T
* ** ** **
36570 -ATCAATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAATAAG
64 GTTC-ATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAA-AATTAATAAG
* * * * * *
36633 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGACTA
127 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTA
* ** * *
36688 TTTGAACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGG
1 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGT
* * *
36753 TCATACAATCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATA
66 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTA-A
* * * *
36818 -ATATTTTAAAAATAAATATGTTTAGCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATAACTA
130 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTA
* * *
36869 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
1 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTT
36911 CATTATAAAA
Statistics
Matches: 1019, Mismatches: 245, Indels: 87
0.75 0.18 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
179 56 0.05
180 274 0.27
181 526 0.52
182 162 0.16
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGT
TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAG
AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATAACTA
Found at i:36679 original size:363 final size:361
Alignment explanation
Indices: 35423--36894 Score: 884
Period size: 363 Copynumber: 4.1 Consensus size: 361
35413 ATCATAAAAG
* * *
35423 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-C-TTT-TGCTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTAT-AACCATTTAT-C-TTGTCATAAAACAATTGTTTC
* ** *
35485 TCATC-ATACAAG-CCTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAAT-
63 T-ATCAATA-AAGTCTTATTTCA-AATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* * * ** * * ** *
35545 -GCACAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAGTAGTTCAAACAGTTACGACTATTTGAA
125 AGCA-AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTGACCGAACAAGTGCAAATAGTTATAACTATTTAAA
* * * * *
35609 CAATTATA-TA-TGTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAAC-AATTGTTTCT-ATTT
188 CAATTA-AGTACT-TCAAATAGTTATAAACTTTTGTTTTATCACAAAACAAATT-TTTCTGA-TC
* *** * * * * * * *
35670 ATACAAGCATATTTGGAATAAAATTATAATAA-TGTAATAATATTATGAAAATTAAGAACTAAGA
249 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAACT-TATTAATATTTTG-AAATTAATAAGTAAAA
* * * *
35734 GATTTAAAAAGTAAATTTGTTT-GTCGAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGGCTA
312 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTA
* * * * *** * * *** * *
35784 TATCAACAATTTTGTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTATTTTGTTGGAAAATAATTTTTTC-A
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCA-TTTATCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * ** * *
35847 GTTC-TTACTAA--CTCATTTGGAAGAAAATAA-AATAAATTAATTAATATT-TCAAAAATTAAT
65 --TCAATA--AAGTCTTATTTCAAATAAAATAATAA-AAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT
* * * * * *
35907 CAA-TAAAAGATTTGAAAAATAATTCTATTTG-CCAAACTAA-TTCAAATAATTACT-ACTATTT
124 -AAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTGACCGAAC-AAGTGCAAATAGTTA-TAACTATTT
* * ** * * ** * * *
35968 GAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-GGCATTTTGTTTTGTCA-TAAACAAATGTTTT-TGTT
185 AAACAATTAAGTACTTCAAATAGTTATAAAC-TTTTGTTTTATCACAAAACAAAT-TTTTCTGAT
* * * * *** * * * *
36030 CAAATAAGTTTGTTTGGAATAAAATATTATTAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAGTAAGA
248 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAACTTATTAATATTTTG-AAATTAATAAGTAAAA
* * *
36095 GAATTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCAA-TTCAATTAGTT-TAACTA
312 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * *
36144 TTTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACCATTTATCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCATTTATCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * ** * * **** * *
36209 TTATATAGTCTTATTTGGATTAAAGTAATGCTTATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGCAAT
66 CAATAAAGTCTTATTTCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAA
* * * * * * * *
36274 GGATTTAAAAAATGAATTTGTTGCCCTAACCAGTGCAAATAGTTATAAC-AGTTTAAATAATTAA
131 AGATTTAAAAAATAAATCTATTGACCGAACAAGTGCAAATAGTTATAACTA-TTTAAACAATTAA
*
36338 GTACTTCAAATAGTTATAAACTTTTGTTTTATCACAAAAC-AATTGTTTCTGATCGTACAAGCTT
195 GTACTTCAAATAGTTATAAACTTTTGTTTTATCACAAAACAAATT-TTTCTGATCATACAAGCTT
* *
36402 ATTCAAAATAACAA-AAT-TCTAACTTATTGATATTCTGAAACTTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
259 ATTCAAAATAA-AATAATAT-TAACTTATTAATATTTTGAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * *
36465 AATGAATCTGTTTACTGAAGAAGTTCAAATAGTTATGACTA
321 AATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
* * * *
36506 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCCTTTTATTTTGTGATAAAATAACTT-TTTCT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAA-CCATTTATCTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT
36570 ATCAATACAAG-CTTATTTCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTC-AAACAATTAATAAG
64 ATCAATA-AAGTCTTATTTCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAG
* * * ** * *
36633 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
127 CAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTGACCGAACAAGTGCAAATAGTTATAACTATTTAAACAAT
** * * * * ** * * * * *
36698 TATTTATTTGAAATTGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGGTCATACAATC
192 TAAGTACTTCAAATAGTTATAAACTTTTGTTTTATCACAAAACAAATTTTTCTGATCATACAAGC
*** * * * * *
36763 TTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATAATATTTTAAA
257 TTATTCAAAATAAAATAATATTAACTTATTAATATTTTGA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
*
36828 AATAAATATGTTTAGC-GAACAAGTTCAAATAGTCATAACTA
321 AATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
*
36869 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
36895 TTATGACCTT
Statistics
Matches: 854, Mismatches: 202, Indels: 108
0.73 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
358 1 0.00
359 11 0.01
360 172 0.20
361 247 0.29
362 133 0.16
363 276 0.32
364 14 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (361 bp):
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCATTTATCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
CAATAAAGTCTTATTTCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAA
AGATTTAAAAAATAAATCTATTGACCGAACAAGTGCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTAAG
TACTTCAAATAGTTATAAACTTTTGTTTTATCACAAAACAAATTTTTCTGATCATACAAGCTTAT
TCAAAATAAAATAATATTAACTTATTAATATTTTGAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
ATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA
Found at i:36982 original size:153 final size:153
Alignment explanation
Indices: 36774--37066 Score: 487
Period size: 153 Copynumber: 1.9 Consensus size: 153
36764 TATTTGGATT
** * * * *
36774 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTATAATATTTTAAAAATAAATATGT
1 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATACGT
* * * *
36839 TTAGCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT
66 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
36904 TTTGTTTCATTATAAAACAATTC
131 TTTGTTTCATTATAAAACAATTC
*
36927 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATACGT
1 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATACGT
36992 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
66 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
37057 TTTGTTTCAT
131 TTTGTTTCAT
37067 CATATATGAA
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 11, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
153 129 1.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (153 bp):
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TTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
TTTGTTTCATTATAAAACAATTC
Found at i:37615 original size:180 final size:181
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36917 AAAACAATTC
* * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTG
* * *
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* * ** * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* *
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66 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * *
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* * * * * **
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1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
** * * * * *
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65 TTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * **
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129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
37457 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATCAATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATAAATATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
37522 TTACTGAACGAGTTCAAACAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTCGAAT-GTTATGATCT
66 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * ** *
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131 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* ** **
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * ** *
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66 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * *
37762 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT-GTCTGTACAAACTTATTTAGAGT
131 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAGCTTATTCAAAAT
* ** ** * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * ** * * *
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65 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
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* * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * *
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* * * * *
38118 CTTTT-TATT-T--TAATACAATTGTTT-TATTTCGTAAAAGCTTATCCAAAAT
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * ** * * *
38167 AAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAA-AAGTTGGAAGATTTAAAACATATATCA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCT
* * ** * * * * * * *
38231 GTTTATTGAATTAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAATAATTATCAATTTCTAATCTTTTTGAA
64 GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* *
38296 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTCAAAAG
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
** *
38348 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGGGCGA-TT-----AT---T-TGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * *
38403 TTACTAAACCAA-TTCAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATATATTTCAAGTCATTATAAAC
66 TTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * *
38467 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATGCAAGCTTATTCGAAAT
130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
38519 AAAATAATACTAATATAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * * *
38583 -TTGCTTGAACCAGTTCAAATA---A-G-GT-TATGAATAATTATCTATTTC-AAGCTATTATGT
65 TTTAC-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGA
* * * * * * * *
38640 CCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAAT
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
38694 AAAATAATATTAATTTATTCATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
38755 TTACCAAACCAA-TTCAATTAGTTATAACAATTTAAATAATTATTTATTTCATATCTTTATGACC
66 TTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * **
38819 ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTGATGC-AGTCTTATTCGGAAT
130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAAT
* * * * *
38871 AAAGTAATGCTAATTTATTACTA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTAGAAAATGAATCT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCT
** ** * * * * **
38934 GTTGGCTTGACCAGTAT-AAATAGTTATGATTGTTTGAATAATTATCTGTTTCAAATAATTATGA
64 GTTTACTAAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * *
38998 CCTGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAAT
128 CC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* ** * * * * * * * *
39054 AAGATAATTTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGGGATTTTCAAAACTGAGTTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTG
* * * * ** *
39119 TTTA-TCAAACAAGTTCAAATAATTATGATTATCTGAACT--TTACCTATTTCAAATCGCCATAA
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* * * * *
39181 CCTTTT-TTTTATCATAAAATAATTTTTTCTATTCCTACAAGCTTATTTC-AATT
128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAAT
* * *
39234 AAAATAATACAAATTTATT-ATCA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
1 AAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * *
39297 ATTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCATTATGAT
64 GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * ***
39362 TTTTTATTTTGTCATAAAACTACTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAAT
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * * *
39415 AAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAATAGTTAATAAG-CAGAAGATTTTAAAAATAAATATG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTG
** * * * *
39479 TTTACCGAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
65 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* ** ** * *
39544 TTTCGTTTCATCATAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATT
130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA-T
* * * * * *
39597 AAAAAAAAACTAATTTATTAATA-TT------TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * **
39655 TTA-TCGAACAAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
66 TTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * *
39719 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCACACAAGCTTATTCTAAAT
130 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *
39771 AAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATAAATATG
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * * *
39834 TTTTCTGAACATGTTCCAATAGTT-TAGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAACTAGTTATGAC
65 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * *
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129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
** ** * * * * * * *
40016 TTACCGAGTAAGTTCAAATAGTTTTAT-A-TGTTTAAACAATTATTTATTTTAAATAGTTATGAT
66 TTACTAAACAAGTTCAAATAG--TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * *
40079 CTTTTGTTTTGTCGTAAAGCAATTGTTTCTATTCACATAAGTTTATTCATAAT
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* ** * * * *
40132 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTGAAAATTAATATGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * ** *
40197 TTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCT
66 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * ** **
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* * * * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * *
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65 TTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * *
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129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
** *
40489 AAAATAATACTAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
40554 TT-TTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTTATCATAA--AAC-ACATTCAAATAGTTATGA
66 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA--ATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGA
** * * * *
40615 CTATTTAAACAATTATT-TATTTGAAATAGTTATGACATTTTGTTT-T-GTCATAAACAA-ATTG
128 C--------C--TT-TTGT-TTTGTCATA---A-AACA-ATTGTTTCTATTCAT--ACAAGCTT-
* *
40676 TTTC--TAT
173 ATTCAAAAT
** * * * * ** *** * * * * *
40683 -TCATACAT-GTGTATTTGAAATAAAATAACACTTATTCAT-ATTCCAA-A-AATTAATAAGTAA
1 AAAATA-ATACT-AATTT--ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGAGATTTAAAAAAT-A
* * * * * * *
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59 AATCTGTT--TA-CTAAA-CAAGTT---CA-AATAGTT-ATGACTA-TT-TG---AA-T----AA
* * * ** *
40804 TTATTTTTTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTCTATTCATACAAG
105 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* **
40868 TTTATTTGAAAT
170 CTTATTCAAAAT
** * * * * *
40880 -AAATAATACTAATTTATTTGTATTTTAAAAATTAATAGGTAAGAGATCTAAAAAATAAATTTGC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
40944 TTATTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTC-AATTGTTATGACCT
66 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * ** *
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131 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * ** * *
41059 AAAATAATATTTATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTACATCTGC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-
* * * * * *
41120 TTT-TTGAAA-TAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAT
65 TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * *
41183 C-TTTATTTGGTTATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGAGT
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
41235 AAAGTAATACTAATTTAATAATATTAT-AAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* ** * * * * * * * *
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65 TTTACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * * *
41363 CATTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTCAATTGATACAAGCTTATTTAGAAT
129 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *
41416 AAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATT-ATGA-TCATGAGATTTAAAAAAATAAATC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATAAATC
** * *
41478 TGTTTACGGAACAAGTTAAAATCGATT-TGACTATTT
63 TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTT
41514 AAAGTCATTA
Statistics
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Found at i:38692 original size:175 final size:171
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38425 TATGATTGTT
*
38435 TGAACAATTATATATTTCAAGTCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTC
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*
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127 ATTT-AAAAATTAAATTTGTTGCTTGAACCAGTTCAAATAAGGTTA
* * *** * * * *
38610 TGAATAATTATCTATTTCAAG-CTATTATGTCCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTT
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* * * * * * * * *
38674 CATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTAAAAATTAATAAGAGATT
65 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTGAAAAAATAATAAGAGATT
38739 TAAAAATTAAATTTGTT
130 TAAAAATTAAATTTGTT
38756 TACCAAACCA
Statistics
Matches: 124, Mismatches: 20, Indels: 8
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Matches are distributed among these distances:
170 5 0.04
171 20 0.16
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (171 bp):
TGAACAATTATATATTTCAAGTCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTATATTC
ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTGAAAAAATAATAAGAGATTT
AAAAATTAAATTTGTTGCTTGAACCAGTTCAAATAAGGTTA
Found at i:39790 original size:717 final size:717
Alignment explanation
Indices: 38966--55061 Score: 1988
Period size: 717 Copynumber: 22.5 Consensus size: 717
38956 GTTATGATTG
* *
38966 TTTGAATAATTATCTGTTTCAAATAATTATGACCTGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACC-GTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
39031 ATTCATACAAACTTATTCAAAATAAGATAATTTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
65 ATTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
* * * * * * *
39096 AGGGATTTTCAAAACTGAGTTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAA-TTATGATTATCTGAAC-T
130 A--GAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACAA
* * * *
39158 TTACCTATTTCAAATCGCCATAACCTTTT-TTTTATCATAAAATAATT-TTTTCTATTCCTACAA
191 TTACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAA
* *
39221 GCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATT-ATCATT-CAGACA-ATTAATAAGTAAAAGAT
255 GCATA-TTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATTCCA-A-ATATTAATAAGTAAAAGAT
* *
39282 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTTAAATAG-TTATGACTATTTGAACAAATATTTAT
316 TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTAT
* * * * * *
39346 TTCAAATCA-TTATGATTTTTTATTTTGTCATAAAACTACTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT
379 TTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTC
* * * * * *
39410 GGAATAAAATAATATTAGTTTATTAATA-TTTCAATAGTTAATAAGCAGAAGATTTTAAAAATAA
443 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAA-AATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAA
* * * *
39474 ATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA
507 ATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
*
39539 TGACCTTTCGTT-TCATCATAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAA
572 TGACCTTTCGTTCT-ATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAA
39603 AAACTAATTTATTAATATTTTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAAAT
636 AAACTAATTTATTAATATTTTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAAAT
39668 TCAAATAATTATAACTA
701 TCAAATAATTATAACTA
* * * * *
39685 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTG
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * *
39749 TTCACACAAGCTTATTCTAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA
* * * * * *
39814 GAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACATGTTCCAATAGTTTAGATTATTTGAACAATTATC
131 GAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTTAGATTATCTGAACAATTACC
* ** * * * * *
39879 TATTTCAACTAGTTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATAT
196 TATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCATAT
** *
39944 TCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
261 TCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * *
40009 AATCTATTTACCGAGTAAGTTCAAATAGTTTTATATGTTTAAACAATTATTTATTTTAAATAGTT
326 AATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAG-TTTATATATTTAAACAAATATTTATTTCAAATAGTT
* * * * * * *
40074 ATGATCTTTTGTTTTGTCGTAAAGCAATTGTTTCTATTCACATAAGTTTATTCATAATAAAATAA
390 ATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * *
40139 TACTAATTTATTAAAATTTTGAAAATTAATATGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAA
455 TACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAA
* ** * *
40204 ACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTC
520 ACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTCGTTC
** *** *** * * * *
40269 TATCACAAAACAATTGT-TTCTATTCACGCAAAATTATTCAAAA-TAAAATAATACTGATCTATT
585 TATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAAACTAATTTATT
* * * * * * * * ** * **
40332 AAAAGTTTGAAAATTAATAAGTGCTTTAAAAACTAAATCTATTTA-CTAA-AATAGTTCAAATTG
649 AATATTTTG---ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAA-A-TTCAAATAA
*
40395 TTATGACTA
709 TTATAACTA
* * ** * * * * *
40404 TTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC--TTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * ** * *
40467 TTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACT-AATTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
*
40531 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTT-TGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTTATCATAAA
130 AGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCT-AA--A---C--A-AGTT----C-A----A--AT---
* * ** * ** *
40595 ACACATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTGAAATAGTTATGACATTTTGTTT
171 --A-ATT----TAG--AT---TATCTGAACAATTACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTT
* * * ** ** * *
40660 TGTCAT-AAACAAATTGTTTCTATTCATACATGTGTATTTGAAATAAAAT-A-AC--ACTTATTC
224 TATCATAAAAC-AATTGTTTTTATTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTA
* * * * * **
40720 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAGATAAATCCATTTACCCAGCAAGTTCAAATA
288 ATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATA
* * * * * *
40785 G-TTATGATTAATTAAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATA
353 GTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACA
* * * * *** *
40849 ATTG-TTCTATTCATACAAGTTTATT-TGAA-ATAAATAATACTAATTTATTTGTATTTTAAAAA
416 ACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAA
* * * * *** * * ** *
40911 TTAATAGGTA-AGAGATCTAAAAAATAAATTTGCTTATTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCAT
480 TTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTAT
* * * * * * * *
40975 TTGAACAATTATCTATTTC-AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTT
544 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATTGGTT
** *** * * * * * * *
41039 CATGCAAAATTATTCAGAA-TAAAATAATATTTATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGAT
609 CATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAAACTAATTTATTAATATTTTG---ATGAGTAAGAGAT
* * * * * * *
41103 TTAAAAACT-ACATCTGCTTTTTGAA-ATAGTTCAAATAGTTATGATTA
671 TTAAAAAATGA-ATCTGCTTATCGAACA-AATTCAAATAATTATAACTA
* * * * * * * *
41150 TTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC--TTTATTTGGTTATAAAACAATTGTTTCTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * ** * ** * *
41213 TTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAGTAATACT-AATTTAATAATATTATAAAAGTTAATAAGTA
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
* * ** * * * **
41277 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAA-TTCAATTAGTTAAGACAAT-TAGAACAAT
130 AGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAAC-AAGTTCAAATAATTTAGATTATCT-GAACAAT
* * * * * ** *
41340 TATCTATTTCAAATTGTTC-TAACCA-TTTG-TTTAGTTATAAAACAATTATTTCAATTGATACA
192 TACCTATTTCAAATAG-CCATAA-CATTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * * * * * * **
41402 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT-ATGA-TCATGAGATTT
254 AGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGT-AAAAGATTT
* ** * ** *
41465 AAAAAAATAAATCTGTTTACGGAACAAGTT--AA-A----ATCGATTT-GAC---TATTTA----
318 -AAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTATATATTTAAACAAATATTTATTTC
* * * * * * * *
41515 AAGTCA-TTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAACTTA-TCAA
382 AAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCA-CACAAGCTTATTCAG
* * * * * *
41577 AATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTTGAAAATTAAT-A--AG-ATATTTAAAAACTAAAAC
445 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAAT-AAA-
* * * * * * * * *
41638 TATTTG-TT--TAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATT
508 TA--TGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATT
* * * * * * * * * *
41699 ATAATCTTT-TTTTTCTCATAAAACAATTGT-TTCAGCTCATACAAGTGC--ATT-AGGAA-TAT
571 ATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATA-TAG-GCTTATTCA-AAATTA-
* * * * **
41758 AATAAAAACT-ATTTATTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTAT
631 AAAAAAAACTAATTTATTAATA--T-----TTTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA-TCTGC
* * * ** * *
41821 TTACCAAACCAATAGAAATAATTTTAAGTA
688 TTATCGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * * * * * *
41851 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * * * * * *
41915 TTAATATAAGCTTGTTCAAATTAAAATAACACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATTAGT
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAAT
* * * * * * ** * * * * *
41978 AAGAGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCAAACCATTTTTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATA
129 AAGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAA-CA--AGTTCAAATAATTTAGATTATCTGAACA
* * ** * * * * * *
42043 ATTATCTATTTCAAATCGTTACAACATTTTATTTTATCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACAC
190 ATTACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
*** *** ** * ** * ** *
42108 TTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTGGAAA-CTTAATAACCAAGAA-AATT
255 GCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCCAAATATTAATAAGTAA-AAGATTT
* * ** * * * * * * *
42171 -AAAAATAAATCTAATTGCCAAACCAGTTCAAATTGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC
318 AAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTATA-TATTTAAACAAATATTTATTTC
* * * * * * ** **
42235 AAATTGTTATTG-CCTTTTCTTTTGTCGTAAAAAAATCAT-TTTGT-TT-GTACAAGCTTATTTT
382 AAATAGTTA-TGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-C-TGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCA
* * * * * **
42296 GATTAAAATAATACTAATTTAATGATATTTTGAAAATTAATAAATA-AGAGATTTAAAAAATAAA
444 GAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
42360 TTTGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAATTA-AGACTATTAGAATAATTATGTA--TGATATTGTT
508 TATGCTTACC-AAACAAGTTCAAATAATCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATT
* * * * * * * * * * * **
42421 TTGACTTTTTGTT-TAATCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAATT
571 ATGACCTTTCGTTCT-ATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAA
* * * * * ** **
42484 AATACTAATTTATTAACATTTAAAAAGTTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAACAAATCTATTTA-
635 AAAACTAATTTATTAATA-TT------TTGATGAGTAAGAGATTT-AAAAAATGAATCTGCTTAT
* * * *
42548 CTGAATAAGTTCAAATAGTTATTACTA
692 C-GAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * * * *
42575 TTTGAACAATTCTCTATTTAAAATCATTATAACC-TTTTGA-TTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTT-ATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT
* * * * ** * *
42637 AGTTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A
65 A-TTCACACAAACTTA-TTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * * *
42699 A-GAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACCAGTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACA
127 ATAAGAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAATT-TAGATTATCTGAACA
* * * * * * * * * *
42760 ATTATCAATCTT-AAATTG--TTAAGATCTTTGTTTT-GCATAAAATAATTGTTTCTAATCATAA
190 ATTACCTAT-TTCAAATAGCCATAACAT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
** * ** * * * * * *
42821 AAGGTTATT-TAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
253 AAGCATATTCAAAAT-AAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * ** * * * * *
42885 TAAAATATAAATGTGTTTATCGAACCAGTTCAAATA-ATTA-AAACTGTTAGAATAATTATCTAT
317 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTATATA-T-TTA-AACAAATATTTAT
* * * * * * **
42948 TTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTA-ACAAGCTTATT
379 TTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTAT-TC-ACACAAGCTTATT
* * *** *
43011 CAGAATAAAATAAT-CCAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAGA-AAGCAAAAGATTTTGAAAAA
442 CAGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAAAATTTTCAAAATTA-ATAAGCAGAAGA-TTT-AAAAA
* * * * * * * * * * *
43074 ATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATC
503 ATAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * *
43139 ATTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA-TAA
568 ATTATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAA
* * * ** * * ** * **
43202 AATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTAAAAAAAGATTAAAT-TTTT
632 AAAAAAACTAATTTATTAATATTT---TGATGAGTAAG--AGA-TTTAAAAA-A-TGAATCTGCT
* * * *
43266 TA-CTGAACAAATGCGAATAGTTATGACTA
689 TATC-GAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* ** * * ** * * *
43295 TTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCACTATGACC-AATTGTTTTGTTATGAAAA-AATTGTTT-T
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCA-CAAAACAATTGTTTCT
* * ** ** * *
43357 AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATGATACT-AATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAG
65 A-TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAA
* * * * * * * * *
43421 TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCT-ATTACGAAATC-AGTTCAAAAAATTATGGCAATT-TC--AA
128 TAAG-AATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAA-CAAGTTCAAATAATT-TAG--ATTATCTGAA
* ** * *
43481 CAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTACATTTTG-TTTAGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCA
188 CAATTACCTATTTCAAAT-AGCCATAACATTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCA
** **** * * * *
43543 TACAAGTTTATTTTGGATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG----AGA
250 TACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGA
* * * * * * * * *
43604 TGTT------T--A-C------CGAAGT-AGTTTAAATAG-CTATGACTATTTGAATAATTGTAT
315 T-TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTT
* * * * * * * * *
43652 ACTTCAAATCA-TTAT-AGCATTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA
377 ATTTCAAAT-AGTTATGATC-TTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTA
* * ** * *
43715 TTCAAAATAAAA-AATACTCATAAAATAATA-TTTCAAAAATTAATAA-CTA-ATAGATTTAAAA
440 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTC-AAAATTAATAAGC-AGA-AGATTTAAAA
* * ** * * * * * *
43776 AATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCTAATAATTA-AGACTAAATT-AATAATTATCTATTACAA
502 AATAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATA-ACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * ** ***
43839 ATCA-T-T----TTT-GTTTTGTCATATAACAATT-TTTTCAATTCATACTA-GCTTATTTGGAA
565 ATTATTATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATA-TAGGCTTATTCAAAA
* * * *
43895 -TAAAATAAAA-TGAATTTATTGATATTTCAAAAATTAAT-ATGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
628 TTAAAAAAAAACT-AATTTATTAATA-TT------TTGATGA-GTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
* * * * * *** *
43957 TTGTTTACCTAGCCTGTTCAAATAATTATGACTA
684 CTGCTTATCGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * * * * * * **
43991 TTTGAACAATTCTCTATTTTAAATCATTATGA-C-TTTT-TGTTCTACTATAAAATAATAATTT-
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGT-C-ACAAAACAATTGTTTC
* * * * * * * * *
44052 TGTTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAG
64 TATTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAA
* * ** * * * * * * *
44116 TAAAAAATTTCAAAAATAAATATGTTTATC-AAATTAGATCAAAT-AGTCATGACTATTTAAATA
128 T-AAGAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACA
* * * ** * * * * * * * *
44179 AATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-ATTTCAGTTAATATA
190 ATTACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * * * * * *
44243 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTA
254 AGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * ** * * * * * *
44308 AAAAATCAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAAATA-ATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTG
319 AAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTATTTC
* * * * * * ** * * * *
44372 AAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCTTAAAATGA-TTTTTTTATTCATACAAGCTTATGTC-TA
382 AAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTAT-TCAGA
* *** * * * * *
44435 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATA
446 ATAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATA
* * ** * * * * * *
44499 TGTTTATCAAATTAGATCAAATAGTC-TGACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCATTATGA
510 TGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * * * * * * *
44563 -CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAA-TAAAATAATAC
575 CCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAAAC
* * * * * * * * *
44626 TAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTATTGAATA
640 TAATTTATTAATA-TT------TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACA
* * * *
44691 ACTTTAAATAATTATGATTA
698 AATTCAAATAATTATAACTA
* * *** * * ** *
44711 TTTTAACAATTAT-TATTTGAAATCGCTATAACC-TTTTATTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
44774 TTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT--AAGACAATTAATAAG
66 TTCACACAAACTTA-TTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAA
* ** * * * * * *
44836 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGCTCATC-GAACAAGTTCAAAT-CTTTGTGACTATTTGAATA
128 TAAGA-ATTTAAAAAATAAATATG-TTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTT-AGATTATCTGAACA
* * ** * * * * * * ** *
44899 ATTACTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTTGTAAA
190 ATTACCTATTTCAAATAGCCATAAC-ATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * *** * ** * ** * * *
44964 ATCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTTGACA-ATTAATAAGTAAATGATCT
254 AGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTT
* **** * * * * *
45028 AAAAAATAAATATATTTTTTGAATAAGTTCAAATAG-TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
318 AAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTATTT
* ** * * * * * * * **
45092 TAAATCTTTGTGACCTTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGG
381 CAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTA-TTCACACAAGCTTATTCAG
* * ** * * * *
45155 AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATGAGTA-AGGGAATTAAAAAATAAAT
445 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * * ***
45219 TTGTTTACTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACGTTATG
509 ATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * ** *** *** *
45284 GCCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGGT-TAT-ATTCATGCAAATTTATTTTGAA-TAAAATAA
574 ACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATT-GTAT-TGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAA
* * * * * * * * *
45346 TA-TAAATTTTTTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATG-TTTTCTT
637 AACT-AATTTATTAATATTTT---GATGAGTAAG---AGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATC--
** * **
45409 G-ACACGTTCAAATAGTTACGACTA
693 GAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * * * ** *
45433 ATTGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTCATCA-TAAACTAATTG----T
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAAC-AATTGTTTCT
* * ** * * *
45492 -TT-------A--TGTTC---AT-AAATAATATTGATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTA
65 ATTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
* ** * * * * *
45543 AAACATTTAAAAAATAAATCCGTTTACTGAACGAGTTCAAAT-ATTTATGACTATTTGAACAATT
130 AGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACAATT
** * **** * * * *
45607 ATTTACTTT-TAATCTTTATTATCA-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG
193 ACCTA-TTTCAAATAGCCA-TAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAG
** * ** * * * * *** *
45669 TTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTATTAAGTTGGACATTTAAA
256 CATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * * * *
45734 AAATAAATTTGTTCACCAAACGAA-TTCAAATAG-TCATGTTCATTTGAACTATTATTTATTTCA
321 AAATAAATCTATTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTTAT-AT-ATTTAAACAAATATTTATTTCA
* * * * * * *
45797 AATAGTTATGA-CATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAAC-TATTCAGA
383 AATAGTTATGATC-TTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACAC-AAGCTTATTCAGA
* * *
45860 ATAAAA-AGATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA-CA--AG-AGATTTAAAAACA-AAAT
446 ATAAAATA-ATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAA-ATAAA-
* * * * * * * * *
45919 CTAT-C-TATCAAACCAA-TTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTGTCTCAAATCATT
508 -TATGCTTACCAAA-CAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATT
* * * * * ** * ** * * * * * *
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571 ATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAA
*** * * * * * *
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635 AAAACTAATTTATTAATA-T-T-----TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTAT-
* * *
46106 CTGAACCAATTCAATTAGTTA-AGACTA
692 C-GAACAAATTCAAATAATTATA-ACTA
* * * * * * * * * * *
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* * ** * ** * * *
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* * * * * ** * *
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128 TAAG-AATTT-AAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAAC
* * *** * * * * * *
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189 AATTACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATAC
* ** ** * * * * * *
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253 AAGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTT
* *** ** * ** * *
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318 AAAAAATAAATCTA-TTTACCAAATAAGTTC-AAATAGTTTAT--ATATTTAAACAAATATTTAT
* * ** * * * * *
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379 TTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCA
* * * *
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* ** * * * *
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508 TATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* ** * * * * * * * * *
46696 -AACTTATTATTTTGTTATAAAATAATTAT-TTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAA-TAAAATA
573 GACCTT-TCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAA
* * * * * * * * * *
46758 ATACTAATTTAATATTATTTCAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTTGA
636 AAACTAATTTATTAATA-TT-----TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGA
** * **
46822 AGTAGTTCAAACGATTA-AGACTA
695 ACAAATTCAAATAATTATA-ACTA
* * * * ** * * * *
46845 TATAAACAATTATTTGTTTCAAATCGTTATG-GC-TTGTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTT-TTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
46908 ACTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACT-AATTTATTAATATTCC-AAAATT--TAAA-
65 ATTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT
* * * * *
46968 AAG----T---GAAT---T-TGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCA-TGTC-G-ACA
129 AAGAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAA-CAAGTTCAAATAATT-TAG--ATTATCTGAACA
* * * * * * * * * ** *
47018 ATTATCAATTTCAAATCA-TCATTACCTTTTGCTTCATCATATAACAATTGTATTTAAACATTCA
190 ATTACCTATTTCAAAT-AGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * * * * *
47082 AGCTTATTTAGAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
254 AGCATATTCAAAATAAAATAATACA-AATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTT
* * *** *
47146 AAAAAATAAATTTAGTTACCAAACT-AGTTCAAATAG-TTATAACTATTT-GGGAAAT-TGTAAA
318 AAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATAT-T-TA
* * * * ** * * * * * * *
47207 CTTGAAATTGTTATAAAATTTTGTTCTGTCATAAAAAAAATATTTTTATTCATACAAG-TGTATT
378 TTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCT-TATT
** * * * * * * *
47271 TGGAATAAAATAACACTAATCTAATAATA-TTCCAAAAACTAATAA-CTA-AGAGAATTAAAAAA
442 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTC-AAAATTAATAAGC-AGA-AGATTTAAAAAA
* *** * * * *
47333 TAAAT-TTCTTTGTTGAACCAA-TTCAAAT-AT-TTAAGTCTATATGACCAATTATCTATTTCAA
504 TAAATATGC-TT-ACCAAACAAGTTCAAATAATCATAA--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * * * ***
47394 ACAATTATGACCTTTTG-T-TGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACTA-GCTTATTTGGA
565 ATTATTATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAA-TTGTATTG-GTTCATA-TAGGCTTATTCAAA
* * ** * * * *
47456 A-TAAAATAAAA-TGAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGGTTTAAAAAAT-AATTTTG
627 ATTAAAAAAAAACT-AATTTATTAATATTT---TGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA-TCTG
* * * * * *
47518 -TGTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGACTA
687 CT-TATCGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * ** * * *
47549 TTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTCC-TTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGATTT-T
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTG-TTTCT
* * * ** * ** * *
47611 GTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAT
65 ATTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAT
* * * * * * * *
47675 --G-ATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAGTTCATAT-AGTTATGACTATTTGAGCAAT
129 AAGAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACAAT
** * ** * * * * *
47735 TATTTATTTCAAATTGTTATAAC-TTTGGTTCTATTATAAAGCAATTGTTTTTCA-ACATACAAG
192 TACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAG
* * ** ** * *
47798 CTTTTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGA-ATTAATAAG----ACATTTAA
256 CATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAA-ATATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * ** ** * * * * *
47858 AAAACAAATCTGTTTGCTGAACCATTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
320 AAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTATTTCA
* * * * * * * * * *
47922 AATTGTTATAACCCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAA
383 AATAGTTATGA-TCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAA
* * * * * * * *
47987 TAAAATAATACAAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAACAA-C-TAAGATTTAAAAAATGAATCCA
447 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAAT--A
** * * ** * * * * * * *
48050 T--TTGTCAGACCAGTTCAAGCACTTAAAACAATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
510 TGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * *** * * ** * *
48113 CATATT-GTTTTATCATAAAATAATTAT-TTCAACTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAGAATAAA
575 CCT-TTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAA
* * * * *
48175 ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAAT-AAT-T-C-TAT-GCA
638 ACTAATTTATTAATA-TT------TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAA
48235 CTAAACCAGTTCAAATAATTATAACTA
696 C--AA--A-TTCAAATAATTATAACTA
* * * * * * *
48262 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * ** * * * * * * * *
48326 TTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACT-AATATATTATTATT-TAGAAAATTAATCAGT
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAAT
* * * * * * * * * * * *
48389 AAGAAATTTAAAAAGTAAATCTGCTTACCACACTATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-T
129 AAG-AATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTTAGATTATCTGAACAATT
* ** * * * * *** * * **
48453 ATCTATTTCAAATTA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCCGTTAATACTATT
193 ACCTATTTCAAA-TAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGC
* *** * * * ** *
48517 TTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAA-ACTTCATAACCAAGAA-AATTAA
257 ATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATA-TTAATAAGTAA-AAGATTTAA
* * * * ** * * * * * * *
48580 AAAATAAATATAATTGCCCAACCAGTTTAAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCTATTTCAA
320 AAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT-TATATATTTAAACAAATATTTATTTCAA
* * ** * * *
48645 ATCA-TTATGACCTTTTCTTTTGTTGTAAAACAAATGTTT-TGA-TCATACAAGATTATTCA-AA
384 AT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCT-ATTCACACAAGCTTATTCAGAA
* * * *
48706 TTAAAAGAATACTAATTTAATAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAAT
447 -TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTC-AAAATTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * ** *
48769 TTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATGGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTAATTCAAATCGTTC
509 ATGCTTACCAAA-CAAGTTCAAATAATCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * ** * * ** * * * **
48832 TAACGTTTTATT-GAGTCA-AAAATTAATAACTA-AGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTGCTA
572 TGACCTTTCGTTCTA-TCACAAAA-CAAT-TGTATTG-G--TT--CATATAGGCT-TA-TT-C-A
** * ** * ** * * * **
48893 TAGCTGTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTCA
625 -AAAT-T-AAA-AA--AAAACTA-AT---TTATTA-ATATTT-TGATGAGTAAGA---GAT-T--
* * * * * * * * * *
48958 TAAAACAATTATTTCAGCTATTTACTAATAAGTCCAAATCATTATGACTA
672 TAAAA-AATGA-ATCTGCT-TAT-CGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
** * * * * * *
49008 TTT-AAGCAATTA-CTTATTTCAAATTGTT-TTAACTTTTTACTTTGTCATAAAACAATTTTTTG
1 TTTGAA-CAATTATC-TATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTT-
* ** *** * * * *** * *
49070 CTATTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG
63 CTATTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAA
* * * * * * *
49135 TAAAAGACTTAAAAAATAAATATGTTTAT-TGAACAAGTTCAAAT-AGTCATGACTT-TTTGAAT
128 TAAGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GA-TTATCTGAAC
* ** * * * * * * *
49197 AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC-TTTTTTTTTGTAATAAAATAATT-ATTTCAGTTCATA
189 AATTACCTATTTCAAAT-AGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATA
* * ** ** * * * *
49259 TAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAAT
252 CAAGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATT
** * * *
49324 TAAAAAA-AAATCTATTTACTGAATAAATTCAAATAG-TTATGACTATCTT-AATAATTATCTCT
317 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TAT-TTAAACAAATAT-T-T
* * * * * * * * ** *
49386 -TTTAAAATA-TTTTGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAGGCTTAT
377 ATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACT-GTTTCTATTCACACAAGCTTA-
* * *
49448 TTCA-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATA-TTTCAAAAATT-A-AA--A-AA-ATTAAAAAA
440 TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTTTC-AAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAA
* * * ** * * * * * *
49504 ATAAATTTGTTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTA-AACTATTAGAACAATAATCTATTT-TAATT
503 ATAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * * ** * * *
49567 CGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGT-TTCTATTTATAAAAGCTTATTCAAAA-TA
568 -ATTATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTA
* * * * * * * *
49630 AAATAATACTAATTTATGATAAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
631 AAAAAAAACTAATTTAT--TAATATT------TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGC
* * * * * *
49694 TTATTGAGCGAGTTCAAATAATTATGATTA
688 TTATCGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * * * * ** *
49724 TTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTG---C--
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
49783 TT--------C-TATT-----T------ATACAAGTTTATTAATATTCTAAAAATTTAATAAGTT
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAA-TTAATAAATA
* * * * * * * *** * * *
49828 GGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAAT-AGTCATGCCCATTTAAACTATT
130 AGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACAATT
* ** * * *
49892 ATCTATTTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA-A
193 ACCTATTTCAAAT-AGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGC
* * * *
49955 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA-A--ACTAA-TAAGACATTTAAA
257 A-TATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * * * * ** *
50016 AACTAAATTTGTTTACTGAACT-AGTTTAAATAG-TTATGACTATTTGAATAACTATCCATATCA
321 AAATAAATCTATTTAC-CAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTATTTCA
* * * * * * *
50079 AATCA-TTATTAT-ATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAG
383 AAT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAA
* * ** * * * * * *
50142 TAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTGAAAAAT-AA-AT
447 TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * * * ** *
50204 GCATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTGA-AGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTT
511 GC--TTACCAAACAAGTTCAAATAATCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * *** * * * * * *** *
50268 GACCTTTTGTT-TAGTCATAAAATAATTGTATCAATTTATACATGCTAAATGTTAA-TAAAATAA
573 GACCTTTCGTTCTA-TCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAA
* * * * * * * ** *
50331 TACT-ATTGTATTAACATTTAGAAAATTAATATACAAGAAATTTTAAAAAAT-AATTATATTTAC
637 AACTAATT-TATTAATATTTTG---A-TGA-GT--AAGAGA-TTTAAAAAATGAA-TCTGCTTAT
* * *
50394 CAAACAAATTCAAATAGTTATGACTA
692 CGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* ** * * ** * *
50420 -TTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTACCATAAAACAACTGTTTC-A
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * * * * * * *
50482 GTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATACAATAGTATTACTTTATTAATTTTTCAAAAATTGAGAAGT
66 -TTCACACAAA-CTTATTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-A
* * *
50546 TGAA-AATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATC-AAATTAA-TTCAAATAA-TTATG-TCCATTTGA
128 T-AAGAATTTAAAAAATAAAT-ATGTTT-TCTAAA-CAAGTTCAAATAATTTA-GAT-TATCTGA
** * * ** * * *
50605 ACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGAGC-CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCA
187 ACAATTACCTATTTCAAATAGCCAT-AACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCA
* * ** * * *
50667 TGCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGA
250 TACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGA
* * * ** * * * * *
50732 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCAGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAATAATTATATA
315 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTA
* * * * * * *
50796 TTTCAAATTA-TTAT-AACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATCTTCATACAAACTTAT
378 TTTCAAA-TAGTTATGATC-TTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTAT
* * * * *
50859 T-AGAAATAAAATAGTACTAATCTAATT-ATATTATGAAAATTAATAA-CTA-AGAGATTTAAAA
441 TCAG-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGC-AGA-AGATTTAAAA
* * * * * * * * * *
50920 AATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-TT-AAATAGT--TAAGATGATATGGATAATTATCTATTTCA
502 AATAAATATGCTTAC-CAAACAAGTTCAAATAATCATAA-CT-ATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * ** * * * * * * **
50981 AATTGTTGTAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAA-
564 AATTATTATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAAT
* ** * ** * * * * **
51045 TAAAATAGTATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTA
629 TAAAAAAAAACTAATTTATTAATATTT---TGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTA
* * * * *
51110 CCAAACTAGTT-TAATAAGTTATAACTA
691 TCGAACAAATTCAAATAA-TTATAACTA
* ** * * * * * *
51137 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAAC-ATTTGTTTTGTCATAAAATAA----CT-TA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
51196 TTCAGA-AAA---A--C---AT---A-ATTCT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-GA
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA
* * * * * * * * * * *
51245 G-ATTTAAAAATTGAATCTATTTATC-GAACAAGTTTAAAT-AGTTATGACTAT-TCAAATAATA
131 GAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCT-GAACAATT
* * * * * * * *
51306 ACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTGATAAAATAATTTTTTTCTATTCATACAAG-
193 ACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGC
* * * * * *
51370 TTATTTC-AATTAAAATAATATAAATTTATTAACATT-CAAACAATTATTAAGTAAAAGATTTAA
257 ATA-TTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAA-TATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * * * *
51433 AGAATAACTCTGTTTACCGAATAAATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAGCAATTATTTTATTTT
320 AAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATA-TTTATTTC
* * * * * * ** *
51497 AAA-ACATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATT-TG
382 AAATA-GTTATGA-TCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAG
* * * * * * * *
51559 AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAAT
445 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
51624 ATGTTTACCAAACATGATT-AAATAGTTAAAACTATTCGAATAATTATCTATTACAAATCATTGT
509 ATGCTTACCAAACAAG-TTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * *** ** *
51688 GACCTTTTTGTTTCT-TCATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAA-TAAAATA
573 GACC-TTTCG-TTCTATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAA
* * * * ***
51751 ATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGACTTCAAAAATGAATCAATTTA-CT
636 AAACTAATTTATTAATATTTTG-------ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATC-
* * * *
51815 GAATAAGTTCAAATACTTATGACTA
693 GAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* ** * * * * * *
51840 TTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCGTGATGA-CATTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTCTA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
51904 TTCATACAATCTTATTTC-AAATAGAATAATATATATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
66 TTCACACAAACTTA-TTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
* * * * * * * * * * *
51968 AAAATTAAAAAAATACATTTATTTTCTGAGCACA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTAAACAATT
130 AGAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACA-AGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACAATT
* ** * * * * * * *
52031 ATCTATTTCAAATAGTTATGACA-TTTGTTTTGTCATGAACCAGTTGTTTCTATTCATACATG--
193 ACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCA
* ** * * * * * * * *
52093 TGTT---TTTAAACT-ATACTAGTTTATTAATATTCAAAATTTTGATAAGTAAAAAATCTAAAAA
258 TATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * ** * * * *
52154 ATAAATCTATTTATCGAGCAAGTTTAAATAG-TTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAAT
323 ATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT--ATATTTAAACAAATATTTATTTCAAAT
* * ** * * * * *
52218 AGTTATGATCTTTTGTTTTATTGTAAAACAATTATTTCTATTTATACCAA-TTTATTCAGAATAA
386 AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACA-CAAGCTTATTCAGAATAA
* * * * * * * * * *
52282 AATAATACTAATTTATTAATATTTTGAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTT
450 AATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATATGCTT
** * ** * * * *
52347 ACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAGCTTT
515 ACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTT
* * * * * * ** *** * * * * *
52412 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAATATTATTCAGAA-TAAAATAATATTGATT
580 CGTTCTATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAAACTAATT
* * * * * * * *
52476 TATTAATATTTTGAAAGTTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CCAA-AACAGTTTAA
645 TATTAATATTTTG--A-TGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAA-A-TTCAA
* **
52539 ATAGTTATGGCTA
705 ATAATTATAACTA
* * * * * * * * *
52552 TTTGAATAATAATTTATCTCAAATCATTATGATC--TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTT
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * *** * * *
52615 TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATC-ATACT-AATTTA-AATATATTCC-AAAATT--T-TA
66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAA-CAATA-TAAATTTATTA-ATATTCCAAAAATTAATAAA
* * * * *
52673 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTTAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACA
128 TAAGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTC-TAAACAAGTTCAAATAATTTAGATTATCT-GAACA
* * * ** * * * ** *
52736 ATTATCTCTTTCAAATTGCTTTAA-TTTTTAG-TTTAACTATATATTAATTGTTTTCATTCATAC
190 ATTACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTT-GTTTTATC-ATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
* *** * * ** * *
52799 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATCT
253 AAGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGAT-T
* * * ** * * * **
52864 AAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCAATT
317 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTATT
* * * * * * * * *
52928 TCAAATCGTTATTACCTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCC
380 TCAAATAGTTATGATC-TTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTA-TTCACACAAGCTTATTC
* * * * ** *
52992 AAAATTAAATAATGCTACTTTATTATTA-TTTCAAAAGTTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATA
443 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAA-TTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATA
* *** ** * ** * * * *
53055 AATCA-GTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCAT
506 AAT-ATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTAT
* ** * * * * * * *
53119 TATGAACTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTCT-TT--TTCAT-TAGACAAGCCTATTCAAAA-GA
570 TATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAG----GCTTATTCAAAATTA
* * * * * * * * * *
53179 AAATAATACTTATTTAATAATATTTCTCACATTAATAAGTAGGACATTTAAAAAATAAATATACT
631 AAAAAAAACTAATTTATTAATATTT-T--GATGAGTAAG-A-G--ATTTAAAAAATGAATCTGCT
* * * * * *
53244 TACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA
689 TATCGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * * * * * * * *
53273 TTTGAACAATTAATTATATATTTTAAATTATTATAACC-TTTTGTTTTATGATAAAACAATTATT
1 TTTGAAC----AATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTT
* * * * * * * * ***
53337 TATCTTGATACAAGCTTATTCAAAATAAAA-ACA-CT-AATCTACTAATATTATGAAAATTAA-A
62 TCTATTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACA-ATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * ** * * * *
53398 ATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAAC-A--T--AGTAA---AGGTTATATGAAT
126 A-ATAAGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTTAGATTATCTGAAC
* ** * * * * * *
53455 AATTATCTCT-TTTAAAAT-GTTATGACCTTCTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATA
189 AATTA-C-CTATTTCAAATAGCCATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATA
* ** * * ** ** *
53518 AAAGTTTGTTCTAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAG----AGATT
252 CAAGCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATT
* * ** * * * * *
53579 TAATAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAG-TTATAACAATTTGAACAATTAGTTATT
317 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTTAT-A-TATTTAAACAAATATTTATT
* * * * * * * * * * * * **
53643 TCAAGTCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAATTAATACAATCTTATTTGG
380 TCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAG
* * * * * * *
53708 AATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCT-AAAACTTAATAAGTA-ATGGAATTAAAAAA-AGG
445 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAA-TTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATA--
* * * ** * * * * * * * **
53770 AATCT-ATTGGCCTGACCAGTACAAATAGTGATAACTGTTTAAATAATTATCTATTT-AAATCGT
506 AATATGCTT-ACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTAT
* * ** ** * * ** *
53833 TATGACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGT-TTCTATTTGTATAAGCTGATTCGGAA-TAACA
570 TATGACCTTTCGTTCTATCACAAAACAATTGTATT-GGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAA
* ** *** * * * *
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* *
53961 CAAGTTCAAATAGTTATAACTA
696 CAAATTCAAATAATTATAACTA
* *** * * * * * *
53983 TTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAAGC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * * * *
54047 TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAAGTTATTAATATT-TAGACAACTTAA-AAG
66 TTCACACAAACTTA-TTCAAAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCA-A-AAATTAATAAA
* * * ** * * *
54109 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAA
128 TAAGA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACAA
** * ** * * * *
54173 TTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAA
191 TTACCTATTTCAAATAGCCATAACATTTT-GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * ** * ** *** *
54237 ACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTT
255 GCATATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAAT-ATTAATAAGTAAAAGATTTA
* *
54301 AAAAATAAA-C-ATGTATAAGTTCAAAT-AG-TCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAAT
319 AAAAATAAATCTAT-T-T-A--CCAAATAAGTTCA-AA-TA---G--T--TTATATATTT-AAA-
* * * * *
54362 CTCATAACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAA
368 --C--AA--A--T-----A-T-T-TATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
54427 TTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAA
417 CTGTTTCTA-TTCACACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTCAAAA
* * * * * ** * * * *
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480 TTAATAAGCAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATAACTAT
* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
54617 TCATACATGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTCATTGATATTCGAAGA-ATTAATAAGTA
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* * * * * ** * * *
54680 A-AAATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTA
665 AGAGATTTAAAAAATGAATCT-GCTTATCGAACAAATTCAAATAATTATAACTA
* * * * * * * * *
54732 TTTGAATAATTATATATTTCAAATAGTTATGA-CTTTTTATTTTATCATAAACCAATTGTTTTTG
1 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCGTTTTATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA
* * * ** *
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66 TTCACACAAACTTATTCAAAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
* * ** ** * * ** * * * *
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130 AGAATTT-AAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAAGTTCAAATAATTTA-GATTATCTGAACAATT
** ** * * * * *
54920 ATTTATTTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGT
193 ACCTATTTCAAATAGCCAT-AACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGC
* * ** * * * * *
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TGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAACTGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
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ATCACAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAAACTAATTTATTAA
TATTTTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAAATTCAAATAATTATAAC
TA
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* *
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1 AAATAGTTAT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAGTTATTATATGTTT
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36917 AAAACAATTC
* * * * *
36927 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATACGT
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* * * * * * *
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* * ** * * * **
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* * *
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* *
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* ** * * * ** *
37278 AAAATAATA-TAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAACTAA-AAATTTAAGCAATAAATCTG
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* ** * * * * * *
37341 TTTGTTGAACACATTCAAATAG-TTATACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC
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* * * * *
37405 TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
37470 TTTATTAAAATTCCAAAAATCAATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACGAGT
194 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGT
* * * * * * * * *
37535 TCAAACAG--TTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTCGAATGTTATGATCTTTTGTTTTATCA
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* ** *
37598 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAAT
323 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * ** *
37637 AAGATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * *
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* * * * * * * * **
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** * * * * *
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191 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* * * * * * *
37883 TAGTTCAAATAG-TTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTA
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* * * *
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* * * ** * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * * * * *
38054 TTTACCAAACAAGTTCAAATACTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTGTGACC
65 TTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACA
* * * * * * *
38119 TTTT-TATT-T--TAATACAATTGTTTTAT-TTCGTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * ** * * ** *
38179 CTTTATTAATATTTCAAAATTTGAA-AAGTTGGAAGATTTAAAACATATATC-AGTTTATTGAAT
193 ATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAAC
* * * * * * * * *
38242 TAGTTCAAATAG--TTATGGCCATTTGAATAATTATCAATTTCTAATCTTTTTGAACTTTTGTTT
255 AAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTT
* * *
38305 TGTCATAAAACAATTGTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTCAAAAG
318 TGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* ** *
38348 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGGGCGA-TT-----AT---T-TGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * *
38403 TTACTAAACCA-ATTCAAATA-ATTATGATTGTTTGAACAATTATATATTTCAAGTCA-TTAT-A
66 TTTC-GAA-CATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* * * * *
38464 AACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATGCAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATA
127 CA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
38647 TTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGA-AAT
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-ATAAT
* * * *
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* * * * * * * * * **
38755 TTACCAAACCA-ATTCAATTAGTTATA-ACAATTTAAATAATTATTTATTTCATATCTTTATGAC
66 TT-TCGAA-CATGTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-
* * * * * * * *
38818 CA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTGATGC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGC
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATAC
* * * * ** *
38881 TAATTTATTACTA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTAGAAAATGAATCTGTTGGCTTG-
191 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CGA
* * * * *
38943 ACCAGTAT-AAATAG--TTATGATTGTTTGAATAATTATCTGTTTCAAATAATTATGACCTGTTT
253 ACAAGT-TCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACC--TTT
* * * *
39005 TATTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAAT
313 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* ** ** * * * * * * *
39054 AAGATAATTTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAGGGATTTTCAAAACTGAGTTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * * * ** *
39119 TTTATCAAACAAGTTCAAATA-ATTATGATTATCTGAAC-TTTACCTATTTCAAATCGCCATAAC
65 TTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
39182 CTTTT-TTTTATCATAAAATAATT-TTTTCTATTCCTACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATAC
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATAC
* * * *
39244 AAATTTATT-ATCA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
191 TAATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * * ** *
39307 TAAGTTTAAATAG--TTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTATT
254 CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTT
* * * * ***
39370 TTGTCATAAAACTACTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAAT
317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * * *
39415 AAAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAATAGTTAATAAG-CAGAAGATTTTAAAAATAAATATG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * *
39479 TTTACCGAACAAGTTCAAATAATCATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
65 TTT-TCGAACATGTTCAAATAGT-TTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * * * * * *
39543 CTTTCGTTTCATCATAAAACAATTGTATTGGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAAAAAAACT
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACT
* * * ** *
39608 AATTTATTAATA-TT------TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * *
39666 ATTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
257 GTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
39730 CATAAAATAATTGTTTCTGTTCACACAAGCTTATTC-TAAAT
321 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAT-AAT
* **
39771 AAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATAAATATG
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * *
39834 TTTTCTGAACATGTTCCAATAGTTTAGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAACTAGTTATGACA
65 TTTTC-GAACATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACA
* * * * * *
39899 TTTTGTTTTGTCTTAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATATTAT
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * **
39964 TTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGTAAGT
194 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGT
* * * * * *
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259 TCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
40093 TAAAGCAATTGTTTCTATTCACATAAGTTTATTCATAAT
323 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * *
40132 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTGAAAATTAATATGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG-
** * * * * *
40197 TTACCAAACAAGTTCAAATAG-TCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTTTGAC
65 TTTTCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGAC
* * * * * * ** ** * *
40260 CTTTTGTTCTATCACAAAACAATTGTTTCTATTCACGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTG
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * * *
40325 ATCTATTAAAAGTTT-GAAAATTAATAAGT----GCTTTAAAAACTAAATCTATTTA-CTAAAAT
193 ATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA-
* * * * * * *
40384 AGTTCAAAT--TGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTCT
256 AGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* *
40446 ATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCA-AATT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAA-T
** * *
40489 AAAATAATACTAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * *
40554 TTTTGAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTTATC-ATAAAAC-ACATTCAAATAGTTATGAC
66 TTTCGAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAAT-TATCTA-TTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
40616 TATTTAAACAATTATTTATTTGA-AATAGTTATGACATTTTGTTTTG-TCATAAACAAATTGTTT
128 -A-TT------TTGTTT-TGTCATAA-A---A-CA-ATTGT-TTTTGTTCAT--AC-AA--G-CT
* * * * *
40679 CTATTCATACATGTGTATTTGAAATAA-AATAACACTTATTCATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
171 -TATTCAGA-A----TA----AAATAATACT-A-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
40743 AATATTTAAAAGATAAATCCATTTACCCAGCAAGTTCAAATAG--TTATGATTAATTAAACAATT
224 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATT
* * ** * *
40806 ATTTTTTTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTCTATTCATACAAGTT
288 ATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT
*
40870 TATTTGA-AAT
352 TA-TTCATAAT
** * * *
40880 -AAATAATACTAATTTATTTGTATTTTAAAAATTAATAGGTAAGAGATCTAAAAAATAAATTTGC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG-
* * * * * *
40944 TTATT-GAACAAGTTTAAATAG-TCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTC-AATTGTTATGAC
65 TT-TTCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * *
41006 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATATTT
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
** * * * **
41071 ATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTACATCTGCTTT-TTGAA-AT
193 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCGAACA-
* * * * * *
41130 AGTTCAAATAG--TTATGATTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTG
256 AGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
41192 GTTATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGAGT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * *
41235 AAAGTAATACTAATTTAATAATATTATAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * *
41300 TTGCCGAAC-TAATTCAATTAGTTAAGACAATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACC
66 TT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-C
* * * *** * *
41364 A-TTTGTTTAGTTATAAAACAATTATTTCAATTGATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * *
41428 ATTTATTAACA-TTCAAAAAATT-ATGA-TCATGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACGGAAC
193 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* *
41490 AAGTT--AA-A-----AT-CGATTTG-------A-CTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTCTTT
255 AAGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T-ATTATGACCTTTTGTTT
* * *
41537 TGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAACTTA-TCAAAAT
318 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TACAAGCTTATTCATAAT
* * * * *
41580 AAAATAATACTACTTTACTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAACTAAAACTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAA-TAT
* * * * *
41641 -TTGTT-TAACCA-ATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCA-TTAT
64 GTT-TTCGAA-CATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT
* * ** * * *
41701 -A-ATCTTTTTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATACAAG-TGCATT-AGGAATATAATA
125 GACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-TATTCA-GAATAAAAT-
* * * * *
41762 AAAACT-ATTTATTAATATTTCAAAATTTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACC
186 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
* ** * * * *
41826 AAACCAA-TAGAAATAATTTTA-AGTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTT
251 GAA-CAAGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTT
* * * * *
41889 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTGTTCA-AATT
314 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAA-T
* * * * * *
41937 AAAATAACACTAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTGAATCTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * **
42001 TTTACCAAACCATTTTTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACA
65 TTT-TCGAA-CA--TGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * * *** ** *
42066 ACATTTTATTTTATCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACACTTTTATTTGGAATAAAATAATAT
126 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* ** * ** * * * * * *
42131 TAATTTAATAATATTTGGAAACTTAATAACCAAGAAAATT-AAAAATAAATCTAATTGCCAAACC
191 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
* * * * * *
42195 AGTTCAAATTG-TTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTG-CCTTTTCTTTT
256 AGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTA-TGACCTTTTGTTTT
* * ** * ** * *
42258 GTCGTAAAAAAATCATTT-TGTTTGTACAAGCTTATT-TTGATT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAT-AAT
* * * * *
42300 AAAATAATACTAATTTAATGATATTTTGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * * * *
42365 TTACCGAATCA-GTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATGTA--TGATATTGTTTTGACT
66 TT-TCGAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACA
** * * * *
42427 TTTTGTTTAATCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAA
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * * *
42492 TTTATTAACATTT-AAAAAGTTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAACAAATCTATTTACTGAATAA
194 TTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * *
42556 GTTCAAATAGTTAT-TACTATTTGAACAATTCTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGT
257 GTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
42620 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAGCTTA--GATGGAAT
321 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAT--AAT
* *
42661 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * *
42722 TTATCAAACCA-GTTTAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAATTGTTA--A
66 TT-TCGAA-CATGTTCAAATAGTT-TAGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATAGTTATGA
* * * ** * * * *
42782 GATCTTTGTTTTG-CATAAAATAATTGTTTCTAATCATAAAAGGTTATTTAG-TTAAAAATAATA
127 CAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATA
* * * * * *
42845 CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAATATAAATGTGTTTATCGAAC
190 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* * * * * * * * * *
42910 CAGTTCAAATA-ATTAAAACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTA
255 AAGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * *
42974 GTCATAAAATATTTGTTTC-ATATC-TAACAAGCTTATTCAGAAT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCAT-ACAAGCTTATTCATAAT
* * ** * *
43017 AAAATAAT-CCAATTTTATTAACATTCAAAAAATTAGA-AAGCAAAAGATTTTGAAAAAATAAAT
1 AAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTTAAAAATTA-ATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * *
43080 CTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAG-TTATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TTA
62 ATGTTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA
* * ** * *
43143 TGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
124 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * ** * *
43208 ACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TAAAAAAAGATTAAAT-TTTTTACTG
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-A-TAAATCTATTTACCG
* * * * ** * **
43271 AACAAATGCGAATAG--TTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTGAAAATCACTATGACCAATTG
252 AACAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTG
* *
43334 TTTTGTTATGAAAA-AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AAT
315 TTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCATAAT
* ** * * * * * *
43381 AAAATGATACTAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCT-A
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* ** * * * *
43445 TTACGAA-ATCAGTTCAAA-AAATTATGGCAATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTA
66 TTTCGAACAT--GTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* * * * ** *
43507 CATTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTGATCATACAAGTTTATTTTGGATAAAATAATACT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * **
43572 AATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAG-------------A--TGTTTACCGAAGTA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * * * * *
43618 GTTTAAATAG--CTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCATTAT-AGCATTTTGTTCT
257 GTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * * *
43680 ATCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* ** * * * * *
43723 AAAA-AATACTCATAAAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAATAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * *
43787 TTGTCAAAC-TAGTTCTAATAATTAAGACTAAATT-AATAATTATCTATTAC-AA-A-TCAT---
66 TT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTTAGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* ** * ** *
43844 -TTTTGTTTTGTCATATAACAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AAT
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
43906 GAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAGCC
192 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
* * * * * *
43971 TGTTCAAATA--ATTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTTTAAATCATTATGACTTTTTGTTCT
256 AGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * *
44034 -ACTATAAAATAATAATTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGA-ATT
319 GTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-ATAAT
* * * * *
44076 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * *
44141 TTATC-AA-ATTAGATCAAATAG-TCATGACTATTTAAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATGA
66 TT-TCGAACA-T-GTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * ** * * *
44203 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAGTTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
44268 AAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACTGAATAA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * ** *
44333 GTTTAAATA--ATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTG
257 GTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** *
44396 TCTTAAAATGATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATGTC-TAAT
320 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCATAAT
* * *
44437 AAAATAATA-TAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATA
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
* * * *
44499 TGTTTATC-AA-ATTAGATCAAATAGTCT-GACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCA-TTA
63 TGTTT-TCGAACA-T-GTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA
* * * * *
44560 TGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
124 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * * * * **
44624 ACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTATTGAA
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * * * * * ** * *
44689 TAACTTTAAATA--ATTATGATTATTTTAACAATTAT-TATTTGAAATCGCTATAACCTTTTATT
254 CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTT
** *
44751 TTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAAT
317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCATAAT
*
44796 AAAATAATA-TAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
** * * * * *
44858 TGCTCATCGAACAAGTTCAAAT-CTTTGTGACTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATTGTTAT
63 TG-TTTTCGAACATGTTCAAATAGTTT-AGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTAT
* * * ** * * ** *
44921 GACTTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTTGTAAAATCTTATTTGGATTAAAATAAT
125 GAC-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * ** * * * ***
44986 ATTAATTTGTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-ATGATCTAAAAAATAAATATATTTTTTGA
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGA
* * * * * *
45050 ATAAGTTCAAATAG--TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCTTTGTGACCTTTTGT
253 ACAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGT
* * ***
45113 TTTGTAAT-AAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGGAAT
316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
45158 AAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATGAGTAAGGGAATTAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * * **
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * ** *
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66 TTTC-GAAC-ATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATAGTTATGA
* * * * **
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* ** * * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTCATAAT
* *
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1 AAAATA-ATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATAT
* * * * * *
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64 GT-TTTCGAA-C-ATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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188 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCATAAT
* * * * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATA-AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATA
* * * * * * **
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63 TGTTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * ** * *
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126 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* * * * * **
46410 TTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTC-AGTTTATTGAA
190 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAA
*** * * * * * * *
46474 TTGGTTCGAAA-A--ATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTAT
254 CAAGTTC-AAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGT
* * * *
46536 TTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTAATCATACAAGCCTATTC-TGAAT
316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAT-AAT
* * *
46582 AAAATATTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGCAGATTTAAAAAATAAATCT-
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * *
46645 ATTT-----A---TCAAACTA-ATT--CCTATTTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAAC
65 TTTTCGAACATGTTCAAA-TAGTTTAGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * ** * *
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128 ATT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * *** **
46763 AATTTAATATTATTTC-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTTGAAGTA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * * * * * * *
46826 GTTCAAA-CGATTAAGACTATATAAACAATTATTTGTTTCAAATCGTTATG-GCTTGTTGTTTTG
257 GTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTT-TTGTTTTG
* * *
46889 TCATAAAACAATTGTTTCAACTCATACAAGCTTATTCAAAAT
320 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* ** *
46931 AAAATAAAACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATT--TAA--AA-AG---T---GAAT---T-TGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * *
46980 TTACCAA-ATCAGTTCAAATA-ATTATGGCCATGTCG-ACAATTATCAATTTCAAATCA-TCATT
66 TTTCGAACAT--GTTCAAATAGTTTA-GACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG
* * ** * * *** * * *
47041 ACCTTTTGCTTCATCATATAACAATTGTATTTAAACATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAA
126 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* * * * *
47106 TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTAGTTACCAAACT
191 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
* * * ** * * * * ** *
47171 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGGGA-AATTGTAAACTTGAAATTGTTATAAAATTTTGTTCT
256 AGTTCAAATAGTTTTATACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * ***
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319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCATAAT
* * * ** * * * * *
47277 AAAATAACACTAATCTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTCT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * *
47342 TTGTTGAACCA-ATTCAAATA-TTTAAGTCTATATGACCAATTATCTATTTCAAACAATTATGAC
66 TT-TCGAA-CATGTTCAAATAGTTT-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * **
47405 CTTTTG--TTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-A
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTTG--TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
* * * * * * *
47466 ATGAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAAATAATTTTGTGTACCTAA
190 CT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * * * * *
47527 CCAGTTTAAATA--ATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTCCTTTT-TT
254 CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
47589 TTGTCATAAAACAAATGATTT-TGTTCATATAAGTTTGTTCAAAAT
317 TTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
47634 AAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-TGATTTAAAAAATAAATCTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * *
47695 TTATCAAAC-TAGTTCATATAG-TTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATAAC
66 TT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *** ** *
47758 -TTTGGTTCTATTATAAAGCAATTGTTTTTCAACATACAAGCTT-TTTTGAAATAAAATAATATT
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACT
* * * * * * *
47821 AATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAAACAAATCTGTTTGCTGAACCA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * *
47882 TTTCAAATAG--TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTTGTTCT
257 GTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * * *
47945 ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
47988 AAAATAATACAAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAACAACT-A-AGATTTAAAAAATGAATCCAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT--AT
* * ** * * * * * * *
48051 -TTGTCAGACCA-GTTCAAGCACTTAAAACAATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC
64 GTTTTC-GAACATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * **** * * * *
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128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACT
* * * ** ** *
48178 AATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATGCACTAAACCA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * *
48243 GTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGT
257 GTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
48307 CATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAAT
321 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * * *
48348 AAAATAAAACTAATATATTATTA-TTTAGAAAATTAATCAGTAAGAAATTTAAAAAGTAAATCTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
48412 CTTACCACACTAT-TTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTA-TTATAA
65 TTTTCGA-AC-ATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGA
* * * ** * * ** **
48474 CCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCCGTTAATACTATTTTATTGGGAATAAAATAATACT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * ** * * * * * * *
48539 AATTTAATAATATTCCAAAACTTCATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATATAATTGCCCAACCA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * * *
48604 GTTTAAATAG-TTAAAAATATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGT
257 GTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * *
48668 TGTAAAACAAATGTTT-TGA-TCATACAAGATTATTCA-AATT
321 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCATAA-T
* * * *
48708 AAAAGAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * * * *
48773 TTACCAA-ATCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTAATTCAAATCGTTCTAACG
66 TTTCGAACAT--GTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACA
* ** ** * ***** *
48837 TTTTATTGAGTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTATAGCTGTCA
129 TTTTGTTTTGTC----A-TAA-AAC-AATTGTTTTTGTTCAT--A-C-A--AGCT-TA--T-TCA
* * ** * * ** *** *
48902 -AAT-AATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCT-TTTG-TCATAAA
177 GAATAAAATAATACTA-AT---TTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-AAGTAAGAGAT-TTAAA
* * * * *
48962 ACAATTATTTCAGCTATTTA-CTAATAAGTCCAAATCA---TTATGACTATTT-AAGCAATTA-C
234 A-AA-TA---AATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTTTAT-ACTATTTGAA-CAATTATC
* * * * ** * *
49021 TTATTTCAAATTGTTTTAACTTTTTACTTTGTCATAAAACAATTTTTTGCTATTCATACAAGTTT
291 -TATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTT
*** *
49086 ATTTGGATT
353 ATTCATAAT
* * * * *
49095 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
49160 TTATTGAACAAGTTCAAATAG-TCATGACTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
66 TT-TCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC
* * * * ** * * *
49223 -TTTTTTTTTGTAATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATT-TGATGTAAAATAATACT
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACT
* * * * * *
49286 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AAATCTATTTACTGAATAA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * * *
49350 ATTCAAATAG--TTATGACTATCTT-AATAATTATCTCTTTTAAAATATTTTGACCATTTGTTTT
257 GTTCAAATAGTTTTAT-ACTAT-TTGAACAATTATCT-ATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
49412 ATCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAGGCTTATTTCA-AAT
319 GTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCATAAT
* * * *
49455 AAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA--AA-A-ATTAAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
49513 TTTTCTGAACACGTTCAAATAG-TTAAACTATTAGAACAATAATCTATTTTAATTCGTTATGATC
65 TTTTC-GAACATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-C
* * * * * *
49577 -TTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * ** * *
49641 ATTTA-TGATAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAGCGA
193 ATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * *
49705 GTTCAAATA--ATTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTG
257 GTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
49768 TCGTAAAATAATTGCTTCTATTTATACAAG--T-TT-AT--T
320 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* ** *
49804 --AAT-ATTCT-A---A--AA-A---T-----TTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * *
49851 TTACCAA-ATAAGTTCAAATAG-TCATGCCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA
66 TTTCGAACAT--GTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* ** *
49913 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
49978 AATTTATTAATA-TTCCAAAA--ACTAA-TAAGACATTTAAAAACTAAATTTGTTTACTGAACTA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * * * *
50039 GTTTAAATAG--TTATGACTATTTGAATAACTATCCATATCAAATCATTATTA--TATTTATTTT
257 GTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCT-TTTGTTTT
* * * *
50100 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * ** * * *
50143 AAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATGCAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT--AT
** * ** * * * * *
50208 -TTGCCAAACCA-GTTCAAATAGTGAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGAC
64 GTTTTCGAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * *** * * * * ***
50271 CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTATCAATTTATACATGCTAAATGTTAATAAAATAATACT-
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * * * * *
50335 ATTGTATTAACATTT-AGAAAATTAATATA-CAAGAAATTTTAAAAAATAATTATATTTACCAAA
193 ATT-TATTAATATTTCA-AAAATTAATA-AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * *
50398 CAAATTCAAATAG--TTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTT
254 CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTT
** * * * *
50460 TTACCATAAAACAACTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
50505 ACAATAGTATTACTTTATTAAT-TTTTCAAAAATTGAGAAGTTGAA-A-ATTTAAAAAATAAATC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAAATTAATAAG-T-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-
* * * * * * *
50567 A-GTTTATC-AA-ATTAATTCAAATA-ATTATGTCCATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTT
62 ATGTTT-TCGAACA-T-GTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTT
* ** * * *
50628 ATGAGC-CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAAGCCTATTCAAAATAAAATA
123 ATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA
* * * *
50691 ATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
187 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
* * ** * * * * *
50755 AAACCAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTATTATAACTTTTTA
251 GAACAAGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTG
* * * * *
50819 TTTTGTCATAAAACAATTATTTATCTTCATACAAACTTATT-AGAAAT
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-TAAT
* * * * * *
50866 AAAATAGTACTAATCTAATT-ATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * * * *
50930 TTTGCTGAACCA-ATT-AAATAGTTAAGA-TGATATGGATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTAA
65 TTTTC-GAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * * *
50992 CCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAGTAT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATAC
* * *
51056 TAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTACCAAACT
191 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
* * * * * *
51117 AGTT-TAATAAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACATTTGTTTT
256 AGTTCAAAT-AGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
*
51180 GTCAT-----AA--------A---AT--AA-CTTATTCAGAA-
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
51203 AAACATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTGAATCTA
1 AAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * ** * * * * * *
51264 TTTATCGAACAAGTTTAAATAG-TTATGACTATTCAAATAATAACCTATTTCAAATTGCTATAAC
65 TTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
51328 CTTTTATTTTGTGATAAAATAATTTTTTTCTATTCATACAAG-TTATTTCA-ATTAAAATAATA-
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATAC
* * * * * *
51390 TAAATTTATTAACA-TTCAAACAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAGAATAACTCTGTTTACCGAA
191 T-AATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * * * * *
51454 TAAATTCAAATAG--TTATGACTATTTGAGCAATTATTTTATTTTAAAACATTATGACTTTTTTG
254 CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTA-TCTA-TTTCAAATATTATGAC-CTTTTG
* * *
51517 TTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATT--TGAATT
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAT-AA-T
* * * * * *
51563 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * *
51628 TTACCAAACATGATT-AAATAGTTAAAACTATTCGAATAATTATCTATTACAAATCA-TTGTGAC
66 TT-TCGAACATG-TTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-
* * * *** * * *
51691 CTTTTTGTTTCT-TCATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTTATT-TGAAATAAAATAATA
127 CATTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* ** * * * * * * *
51754 TTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGACTTCAAAAATGAATCAATTTACTGAAT
190 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* * * * *
51819 AAGTTCAAATA--CTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCGTGATGACATTTTGTTT
255 AAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTT
* * *
51882 TCTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATCTTATTTCA-AAT
318 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCATAAT
* * * * * * *
51926 AGAATAATA-TATATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTAAAAAAATACATTTA
1 AAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* ** *
51989 TTTTCTGAGCACATTCAAATAG-TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
65 TTTTC-GAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
52053 A-TTTGTTTTGTCATGAACCAGTTGTTTCTATTCATACATG-TGT-TT----TTAAACT-ATACT
128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-TATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
52110 AGTTTATTAATA-TTCAAAATTTTGATAAGTAAAAAATCTAAAAAATAAATCTATTTATCGAGCA
192 AATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
* * * * * *
52174 AGTTTAAATAG--TTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTT
256 AGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTT
* ** * * * *
52237 ATTGTAAAACAATTATTTCTATTTATACCAA-TTTATTCAGAAT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTCATAAT
* * * * * * *
52280 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * *
52345 TTACTGAACAAGTTCAAATAG-TCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAG
66 TTTC-GAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-
* ** *
52408 C-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAATATTATTCAGAATAAAATAATATT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* ** * * * * *
52472 GATTTATTAATATTT-TGAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACC-AAAAC
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA-
* * * * * * * *
52532 AGTTTAAATAG--TTATGGCTATTTGAATAATAATTTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTT
256 AGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * *** *
52594 ATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* ** *
52637 AAAATCATACTAATTTA--AATATATTCCAAAATT--TTA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
52697 TTTGCTTAACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTCTTTCAAATTGCTT-T-A
65 TTTTC-GAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TTATGA
** * ** ** **
52759 -ATTTT-TAGTTTAACTATATATTAATTGTTTTCATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
127 CATTTTGT--TTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * * * * *
52822 ACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATCTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGA
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTACCGA
* * *
52887 ACAAGTTCAAATAG--TTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTTG
253 ACAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACC-TTTTG
* * * *
52950 TTTTGCCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
315 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
52997 TAAATAATGCTACTTTATTATTATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-G
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATG
* * * * * * *
53061 TTTATTGAA-TTAGTTCAAATA-ATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCA-TTATG
65 TTT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATG
* * * * * * * *
53123 A-ACTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTCTTTTTCATT-AGACAAGCCTATTCAAAAGAAAATAAT
126 ACA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * ** * * * * * *
53186 ACTTATTTAATAATATTTCTCACATTAATAAGTAGGACATTTAAAAAATAAATATACTTACCAAA
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * *
53251 CCAGTTCAAATAG--TTATGACTATTTGAACAATTAATTATATATTTTAAATTATTATAACCTTT
254 CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAAC----AATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTT
* * * * * * *
53314 TGTTTTATGATAAAACAATTATTTATCTTGATACAAGCTTATTCAAAAT
313 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * * *
53363 -AAA-AACACTAATCTACTAATATTATGAAAATTAA-AATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * *
53425 TTTACCCAACATAG-T--AA-AGGTT--A-TA--TGAATAATTATCTCTTTTAAA-ATGTTATGA
65 TTT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGA
* * * * * * *
53480 CCTTCTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGTTTGTTCTA-AATAAAATAATAT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATAC
* * * * *
53544 TAATTTATTAATATTT-AAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAATAAATAAATCTGTTTACCAAACC
191 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
* * * * * *
53605 AGTTCAATTAGTTATA-ACAATTTGAACAATTAGT-TATTTCAAGTCGTTATGACCATTTGTTTT
256 AGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ***
53668 GTCATAAAATAATTGCTTCAATTAATACAATCTTATTTGGAAT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
53711 AAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAACTTAATAAGTAATG-GAATTAAAAAA-AGGAATC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATA--AATA
* ** * * * * * * *
53774 TATTGGCCTGACCA-GTACAAATAGTGATA-ACTGTTTAAATAATTATCTATTT-AAATCGTTAT
63 TGTT-TTC-GAACATGTTCAAATAGT-TTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTAT
* * * * * ** * * * * *
53836 GACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCTATTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACATAATT
125 GACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA
* * * * **
53901 CTAATTTATTAATATTCCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATTGAAC
190 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* * ** * *
53962 AAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAAGCTTTTGTTTT
255 AAGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * *
54026 GTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATT
319 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCATAAT
* * * * *
54069 AAAATAATACAAAGTTATTAATA-TTTAGACAACTTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-A-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * *
54132 GTTTACCGAATAAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
64 GTTT-TCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
54196 C-TTTTGGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAACTTATTCGGATTAAAATAATAT
127 CATTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
** * * * * *
54260 TAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAA-C-A--T---GTATA
191 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
** * * * * * *
54318 AGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCTCAT-AAC---T-ATTTG-
256 AGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * ** * * * ** *
54376 -A-AAAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCAT
321 CATAAAACAAT-TGTTTC-TATTCATACAAGCTTAT-TCAT--AAT
* ** * * *
54420 AAAACAATTGT-A-TTAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATAT
1 AAAATAATACTAATTTA-TT-A-ATA---TT-TT----A-AAAAT--TAATAA-GTA--AGAGAT
* * * * * * * *
54482 TTCAAAATTAATGAGTAAGA-GATTT--AAAAT-AT-GAATATGTTTACTGAACAAGTTTAAATA
49 TT-AAAA--AAT-A--AATATGTTTTCGAACATGTTCAAATA-GTTTA--G-ACTA-TTTGAACA
* * ** ** * * *******
54542 GTTATGACTATTTGAACAACTA-TCTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAAT
103 ATTAT--CTATTT---CAAATAGT-TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG---------
* * *
54605 AATTGTTTATGTTCATACATGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTCATTGATA-TTCGAA
153 ---T-TTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AA
* * *** * *
54667 GAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTTTTGAACACGTTTAAATAG--TTATG
210 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTTTAT-
* * * * * *
54728 ACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATAGTTATGACTTTTTATTTTATCATAAACCAATTGTTT
273 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
54793 TTGTTCATACAAGCATATT--TGA-
337 CTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
** * *
54815 AAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATG
** * * * * * * *
54878 TTGACCGAGCAAGTTCATATCG-TTATTACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAT
65 TT-TTCGAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-
* * * *
54942 C-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * * * *
55006 GATTTATTACTA-TTC-TAAATGAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACAA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* *
55068 GTTTCAAATTTCA-TATATTAAACAATTATTATTGAA-AATTAATCTGTTATCAAA-ATTCAAAT
257 G-TTCAAA--T-AGT-T-TTATAC---TA-T-TTGAACAATT-ATCTATT-TCAAATATT---AT
* * * * ** ** *
55130 -A-GTTATGATTTTGT-AT-AAACAATTACCTATT-TAAATTGC-TATAATTTTATTTTGTCAT
306 GACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATT--GT-TTCT--ATT-CATACAAGCTTA-TTCATAAT
* * * *
55188 AAAATAA-A--ATTTTATTACATATTATTTTAATTAAAATAATAAAATTATTA-ATATTTAGACA
1 AAAATAATACTAATTTATT--A-A-TATTTTAA--AAATTAAT--AAGTA--AGAGATTTA-A-A
*** * * * * * *
55249 ACTAATAAGTAATATTGTTTAAAAAATATTTTTTAAATCA-TTTATAATATTATGTTTATCTAAA
54 A--AAT-A--AATA-TGTTT-TCGAACA-TGTTCAAAT-AGTTTAGACTATT-TG-------AAC
* * * *
55313 AATTATTTATTTATAAAT-CTTATTGA-ATTAATT-TAATTTATTCATATTCAAA-AATTG-TTT
102 AATTATCTATTT-CAAATAGTTA-TGACATT--TTGT--TTT-GTCATA---AAACAATTGTTTT
* * ** * * * ** *
55373 TGTTTATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTCATTAATATTTTGATAATTAATAAGT
157 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* ** * * * ** *
55438 AACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAAT
222 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAAT
* * * * * * **
55502 TATCTATTTAAAATCTCATAACTATTAGA-ATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
287 TATCTATTTCAAA--T-AT---TA-T-GACCT--TT-TGT-TTT---GTCA-TA-AAACAATTGT
* *
55566 TTCATCATAAAACAATTATATTAG-TTCATATAGGCTTATTTGAAAT
335 TTC-T-AT---TC-A-TACA--AGCTT-AT-T---C--A--T--AAT
* * * * * * * * *
55612 AAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAA-TAACACATTTAAAATATGAATTTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * *
55676 TTTACGGGACATGTTCAAAT-GGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA
65 TTTTC-GAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* * * *
55739 CTTTTTGTTTTGTCATAAAA-TATT-TTTTTTTATCATACATGCTTATTTCA-AATAAAATAATA
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATA
* * * * * * *
55801 -TAAATTTATTACTATTCCAAAAGTTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAA
190 CT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * * * *
55864 CACA-TTCAAATAATTATA-ACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATAGTTA-AAGCCTTTTGC
254 CA-AGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGA-CCTTTTGT
* * *
55926 TTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTCAAAAT
316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
55972 ACAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAACATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * * *
56036 TTTACTGAGCAAGTTCATATCG-TTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAT
65 TTTTC-GAACATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-
* * * * * * *
56100 C-TTTCGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCTTTATACAAGTTTAGTCAGAATAAAATAATATT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * ** * * * *
56164 ATTTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCG---A
192 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
* * * * *
56225 A--T---A-AG--TAATCCTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTT
256 AGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** *
56281 TCATAAAACAATTATTTTTATTCATGCAAAATTATTCAGAAT
320 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
56323 AAAATAATACTGATATATCAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * *
56384 TTAAC-AAAATAGTTCAAATAG-TTAGGACTATTTGAACAATTA-CTTATCTTC-AATCGTTATG
66 TT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATC-TAT-TTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
56445 --ATCTTTATTTTGCCATAAAGCAAATGTTTATT-TTCACACATGCTTATTCAGATTAAAATAAT
126 ACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
* * * * * * * * * *
56507 ACTAATTCAATAATATTCCAAAACTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATACATGTGTTTGCCA
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTACCG
* * * * *
56572 AACCAA-TTC-AATAG-TTAAGACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACATTTT
252 AA-CAAGTTCAAATAGTTTTATACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTT
* * *
56633 GTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
314 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATAAT
* ** * *
56681 AAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATTAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATATG
* * * * *
56746 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTT-GATTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGA
65 TTT-TCGAACATGTTCAAATAG-TTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGA
**** * * * * *
56809 TC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAACTAAAAAAAAC-TA-TCCGAAATAAAATAATA
127 -CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* * * * * * ** * * *
56871 CCACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAATATTTAAAACCTAAAGT-TGTTTTCCAAA
190 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACCGAA
* * * * * * *
56935 CCAGTTAAAATAG--TTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTATT
254 CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
56997 TTCTAATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATATAAGTTTATTTCAT-A-
317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTCATAAT
* *
57041 AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAATAAATAAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-AT
* * * * * * * * * * *
57102 -TTTGCCAAACCA-ATTCAAAGAGTTAAGACTATTAGAAAAATTATCTATTTTAAATTGCTCTGA
64 GTTT-TCGAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * * ** *
57165 CCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATAC
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATAC
* * * * * **
57229 TAATTTATTAACATTTGAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTCGACCAAAAA-AAATCTATTTACTAA
191 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TA--AAAAATAAATCTATTTACCGA
* * * ***
57293 ACAAGTTCAAATAG--TTATGACTATTTGAATAATTATATATTTAAAATATTTATGAAAATTTGT
253 ACAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGT
* * * *
57356 TTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAATCTTATCCA-AAT
316 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * * * *
57401 GAAATAATACTACTTTATTAACATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAACAAATCA-G
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATG
* * * * * * * * *
57465 TTTATC-ACATCAT-TTCAAATA-ATAATGGCCATTTGAACAACTATTTATTTTAAATCGTTATT
65 TTT-TCGA-A-CATGTTCAAATAGTTTA-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * * *
57527 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTGTAACATACAAGCTCATT-TGAAATAAAATAAT
126 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT
** * * *
57590 ACTAATTTATTAATATTTCAGGAA-T--TAA-TAAGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTGCCAAA
189 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA
* * * *
57651 CCAA-TTTAAATAG--TTATGACTATTTGAACAATTAGCTATTT-TAA-A-TA--ACCTTTTGGT
254 -CAAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
57708 CTATCATAAAACAACTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCAAAAT
317 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAAT
** * * **
57753 AAAATAATACTAATTTAGGAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATCCGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * * * *
57817 TTGTAGAACCA-GTTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAGTTAGT-TATTTGAAATTGTTACGAC
66 TT-TCGAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
57880 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AGCT
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* * * * * * *
57944 AACTT-TTAATATTTCAAAAATTTATACGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTACTTACCGAACCA
192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAA
* * * * * *
58008 -TTCAAATAATTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTCTTATTA-CTTTATGTTTTGT
257 GTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTT-TGTTTTGT
* * * * * * * *
58070 CATAAAAAAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCGA-AAG
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* * * *
58111 AAAATAATACTTATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
58175 CTTACTAAACCAT-TTCAAATAGTTTTGAATATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAA
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* * * * * * ** * * *
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* ** * ** * * * **
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192 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CA
* * ** * * *
58368 A-TTCAAATAG-TTTAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTGG
256 AGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * *
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* * * * *
58472 AAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATATAAAAAATAAATTTGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
58533 TTATC-AA-ATAATTCAAATGGTTTAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGAC
66 TT-TCGAACAT-GTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC
* * * *** * * * *
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128 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* ** ** * * * *
58660 ATTTATTGA-CGTTCAAAAAGTTAATAACAAAAAGAGATTT--AAAA-AAATATGTTTACCAAAT
193 ATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAAT-A-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* * * * * *
58721 ATGTTCAAATAGTTAT-TACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTT
255 AAGTTCAAATAGTTTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
*** *
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* * * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * * * ** * *
58893 TTACCAA-ATTAGTTAAAATA-ATTATGGCTATTTAAATGATTATCTATTTGAAATTGTTATGAT
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* *
58956 C-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATA
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATA
* * * * **
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190 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* * * * * * * * *
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255 AAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
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* * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG-
* * * * * * * * * * * * * *
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65 TTTTCGAA-CATGTTCAAATAGTTTAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACA
* * * * ** * *
59318 TTTTGTTTAGTTATAAGA-TATT-TATTTCATATCTTACAAGCTTATT-AGGAATAAAATAATCC
129 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTGT-TCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATAC
* * * ** * * * *
59380 AAAGTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
191 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
* * * *
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255 AAGTTCAAATAGTTTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTT
* * * * *
59508 TGACATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAAT
318 TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCATAAT
* * * * * *
59552 AAAGTGATA-TAAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATAAG-CA-ATATTTAAAAAAATAAA-AT
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATAT
* ** * * * *
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* * * * *** *
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* * * * * * *
59740 CTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAACAAAT
190 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-
* * * * * * * *
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* * * ***
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* * * *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * * ** * * *
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* * * * * ** * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * ** *
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* *
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Statistics
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* ** *
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** * * * * * * *** *
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * ** ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * *
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* * * *
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** ** ** * * *
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* * * * ** *
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* * * * *
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** * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTAGAAAATTA-ATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATA
* * * * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * **
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * ** * *
44021 GACTTTTTGTTCT-ACTATAAAATAATAATTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCG
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* * *
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65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGT-TAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
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* * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
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* ** ** * * **
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130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * *
44793 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
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65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTAT
* * * * ** ** * * *
44921 GACTTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTGTTTGTAAAATCTTATTTGG
129 TAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * * *
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAAT
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65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
* * * * * * *
45104 ACCTTTTGTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGG
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * * *
45155 AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATGAGTAAGGGAATTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * *
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* * * * * * * ** *
45284 GCCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGGTTATATTCATGCAAATTTATTTTG
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* *
45336 AATAAAATAATA-TAAATTTTTTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *** * * * *
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64 TCTATTTACCAAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* ** ** *
45462 TGACCTTTTGTTTCATCATAAACTAA-----TTGTT--T--ATG-TTCA--TA-
128 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTTTGTTAATACAAGCTT-ATTTAG
* * * *
45503 AAT--AAT-AT--TGATTTATTAAAATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** ** * * * * * *
45562 CCGTTTACTGAACGAGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATTTACTTT-TAATCTTTAT
65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTAT
* * * ** * * * *
45626 TATCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-TTTTTTTG
129 TACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* ** *
45677 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTATTAAGTTGGACATTTAAAAAATAAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * * *
45741 TTTGTTCACCAAACGAATTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAACTATTATTTATTTCAAATAGTTA
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * ** * * * *
45805 TGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAAC-TATTCAG
128 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATAC-AAGCTTATTTAG
*
45859 AATAAAA-AGATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAA-T--TAA-CAAGAGATTTAAAAACA-AA
1 AATAAAATA-ATACTAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAA
* * * * * * * * *
45917 ATCTATCTATCAAACCAATTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTGTCTCAAATCATTA
63 ATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * ** * * * *
45982 TGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTTATGCAAGATTATTTAG
128 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * *
46035 AGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * * * * *
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65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
* * * ** * * *
46164 ACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTGATACATGCGTATTT-G
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTTT-GTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * * *
46215 AAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAGAAAAGTAATACA-CAAGAAATTTAAAAAAATAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATA-AGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
*** * * * * * ***
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63 ATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * ** * * *
46344 TGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATTT-G
128 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * *
46397 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAG
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
*** *** * * * * * *
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64 TCTA-TTTACCAAACCAGTTC-AAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * * * *
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127 ATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTTTGT--TAATACAAGCTTATT-TAG
*
46579 AATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT-AGCAGATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAA
* * * *
46642 TCTATTTATCAAA-C---T---A-A-TT---CCTATTTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTA
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * ** * * * * *
46695 -TAACTTATTATTTTGTTATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAA
128 TTACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * *
46749 AATAAAATAATACTAATTTAATATTATTT-CAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* **** ** * * * * *
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66 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
** * * *** * * *
46875 GGCTTGTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAACTCATACAAGCTTATTCAA
130 ACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* ** *
46928 AATAAAATAAAACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATT--TAA--AA-AG---T---GAAT---T-
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * * *
46977 TGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCG-ACAATTATCAATTTCAAATCATCATT
66 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
* ** * * * ** *
47041 ACCTTTTGCTTCATCATATAACAATTGTATTT-AAACATTCAAGCTTATTTAG
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGT-TTTGTTA-ATACAAGCTTATTTAG
* *
47093 AATAAAATAATAATAATTTATTAATCTTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** * * *
47157 TTAGTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGGGA-AATTGTAAACTTGAAATTGTTA
65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* ** * ** * * *
47220 TAAAATTTTGTTCTGTCATAAAAAAAATATTTTTATTCATACAAG-TGTATTTGG
128 TTACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAAAAATGGTTTTGTTAATACAAGCT-TATTTAG
* * * * * * *
47274 AATAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCA-AAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * **** * * * * * *
47338 TTCTTTGTTGAACCAATTCAAATATTTAAGTCTATATGACCAATTATCTATTTCAAA-CAATTAT
65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTAT
* * ** * * *
47402 GACCTTTTG--TTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGG
129 TACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTG--TTAATACAAGCTTATTTAG
* * *
47455 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATCTTTCA-AAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAAATAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
47514 TTTGTGTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
47579 GT-CCTTTT-TTTTGTCATAAAACAAATGATTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAA
129 -TACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * *
47631 AATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-A--AA-TGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
47691 CTATTTATCAAACTAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTA-T
65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
* * * * * ** * * *
47755 AACTTTGGTTCTATTATAAAGCAATTGTTTT-TCAACATACAAGCTT-TTTTG
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTTTGT-TA-ATACAAGCTTATTTAG
* * * *
47806 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AGAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAAACAAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * *
47866 TCTGTTTGCTGAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
47931 AACCCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG
129 TA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * *
47985 AATAAAATAATACAAATTTAGTAATATTCTA-AAAATTAACAACT-A-AGATTTAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * ** * * * * * * *
48047 CCATTTGTCAGACCAGTTCAAGCACTTAAAACAATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
* * * * ** *** *
48112 ACATATTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGCTTATTT-G
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * * *
48163 AAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** * * *
48227 TCTATGCACTAAACCAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * *
48291 TTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAA
128 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * * *
48345 AATAAAATAAAACTAATATATTATTATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAAATTTAAAAAGTAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * ** * * ** *
48410 TGCTTACCACACTATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTATTATAA
66 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA
* * ** * ** **
48474 CCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCCGTTAATACTATTTTATTGGG
131 CCTTTTGTTTTGTCAT-AAAAAAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * ** * *
48525 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA-AAACTTCATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
48589 ATAATTGCCCAACCAGTTTAAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
65 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT
* ** * * * *
48654 ACCTTTTCTTTTGTTGTAAAACAAAT-GTTTTGATCATACAAGATTATTCA-
130 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* *
48704 AATTAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
48768 TTTGTTTACCAAATCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTAATTCAAATCGTTCT
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * **** * *
48833 AACGTTTTATTGAGTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTGCTATAG
129 TACCTTTTGTTTTGTCATAAA--AA-AA-T--G-G-TTTTGTTAATACAAGCT-TAT--T-TAG
** * ** * * * * * *** * * * * **
48896 CTGTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTCATAA
1 -AATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTAGAAAATT--AATAAGTAAGA---GAT-T--TAA
* * * * *
48961 AACAATTATTTCAGCTATTTACTAATA--AGTCCAAATCA-TTATGACTATTT-AAGCAATTA-C
56 AA-AA-TA---AATCTATTTACCAA-ACCAGTTCAAAT-AGTTAAGACTATTTGAA-CAATTATC
* * * * *
49021 TTATTTCAAATTGTT-TTAACTTTT-TACTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTGCTATTCATACAAG
113 -TATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGT--TTTGTCATAAAAAAATGGTTTTG---TTAATACAAG
* *
49083 TTTATTTGG
172 CTTATTTAG
* * * * * * *
49092 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* *** * * * * * * *
49157 TGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
66 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA
* * * ** * * *
49222 -CTTTTTTTTTGTAATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTT-G
131 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * * *
49271 ATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AAA
1 A-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
** ** * * * * * *
49334 TCTATTTACTGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATCTT-AATAATTATCTCTTTTAAAAT-ATT
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTT
* * * * * *
49397 -TTGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAGGCTTATTTCA-
127 ATT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTT-AG
* *
49452 AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A-AA--AA-A-ATTAAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * * *
49509 TTTGTTTTCTGAA-CACGTTCAAATAGTTAA-ACTATTAGAACAATAATCTATTTTAATTCGTTA
64 TCTATTTACCAAACCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * ** * * * * * *
49572 TGATCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTCAA
128 TTACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGTTT-TGTTAATACAAGCTTATTTAG
* *
49626 AATAAAATAATACTAATTTATGATAAT-TTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTTAT--TAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *** * * * * * * * *
49689 TATGTTTATTGAGCGAGTTCAAATAATTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT
64 TCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * * * *
49754 GATCTTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGCTTCTATTTATACAAGTTTA-TT--
129 TACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
*** * * * * * * * **
49804 AATATTCTAA-A--AATTTAAT-A-AGTTGGAGATTTAAAAAATAA-ATTTG-TTTACCAAATAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGA---GATTTAAAAAATAA
* ** * ** * *
49862 GT-TCAAATAGTCATGCCCA-TTTAAACTA-TT-A-TCTATTT---CAA--ATC-A-TT---AT-
63 ATCT-ATTTA-CCA-AACCAGTTCAAA-TAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * ** * *
49911 G-----ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAA
124 GTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
** * * * *
49964 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAA--ACTAA-TAAGACATTTAAAAACTAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * * * *
50025 TGTTTACTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAACTATCCATATCAAATCATTATTA
66 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA
* * * * *
50090 --TATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG
131 CCT-TTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGGTTTTGTTAATACAAGCTTATTTAG
* * * ** * *
50140 AGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
50204 GC-ATTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTGAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-T
65 -CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * *** * * *
50267 TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTATCAATTTATACATGCTAAATGTT--
129 T-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATGGT-TTTGTTAATACAAGCT-TAT-TTAG
* * *
50321 AATAAAATAATACT-ATTGTATTAACATTTAGAAAATTAATATA-CAAGAAATTTTAAAAAATAA
1 AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTAGAAAATTAATA-AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAA
* * * * * * *
50384 TTATATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTA
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* * ** * * * * ** *
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* * * * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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*
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* * * * * * **
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* * * * ** * * *
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* * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** ** * ** ** * * *
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* * * * * * ** ** **
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** * * * * *** ** *
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*
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* * * * * * * ** * * **
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** *
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* * *
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* * * * *
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*
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* ** ** * *
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*
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* *
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*
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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321 TAAG-AA--GATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
43603 ------------A-TGTTTACCGAAGT-AGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAATAATTGTATAC
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* * * *
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* ** * *
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636 CAGAATAAAATAAT-C-CAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAA
** *
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* * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTA-AAATCATTATGCCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * * *
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* * * **
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** * * * * * *
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* *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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382 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-ATCAT
* * ** * *
44240 ATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGA
445 AAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGA
* * * *
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* * * * * *
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* ** * * * *
44432 C-TAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATA
636 CAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAA-AAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATA
* * **
44495 AATATGTTTATCAAATTAG
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* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGCCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
44578 AAAAAAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTC
66 AAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * *
44643 AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTATTGAATAACTTTAAATAATTATGA
131 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * *
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196 CTATTTGAACAATTCTCTA-TTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
*
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260 -TAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAA
* * * * ** *
44832 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGCTCATCGAACAAGTTCAAATCTTTGTGACTATTTGAA
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* * * * * * ** **
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* * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * ** *
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** *
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* * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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** * * * * *
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* * * * **
46575 TCTGAATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGCAGATTTAAAAAAT
635 TCAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT
* * *
46639 AAATCTATTTATCAAAC---
698 AAATTTGTTTACCAAACAAG
** * ** ** * *
46656 -T--AAT--TCCT-A-T-TTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACTTATTATTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGCCTT-TTGTTTTGTCA
* * * * * * *
46713 TAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTT
65 TAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * ** ** ** *
46778 C-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTGTTGAAGTAGTTCAAACGATTAAG
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATG
* * * * * ** ** ** *
46841 ACTATATAAACAATTATTTGTTTCAAATCGTTAT-GGCTTGTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
195 ACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTT-TTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
* ** * * *
46905 TCAACTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATT--TA
259 TTAGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * *
46966 A-AA-A-GT---GAAT---T-TGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCG-ACAAT
323 AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAAT
* * * ** * * ** * * * **
47020 TATCAATTTCAAATCATCATTACCTTTTGCTTCATCATATAACAATTGTATT-TAAACATTCAAG
387 TATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTCTAATCATAAAAG
* * * *
47084 CTTATTTAG-AATAAAATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
450 CTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
* * * * * * ** *
47148 AAAATAAATT-TAGTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGGGA-AATTGTAAACTT
515 AAAATAAATTGT--TTATCGAA-TAAGTTCAAATAATTATGACTATTT-GAATAATTATCTATTT
* * * ** *
47210 GAAATTGTTATAAAATTTTGTTCT-GTCATAAAAAAAATATT-TTT-ATTCATACAAG-TGTATT
576 CAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TAGTCAT--AAAATAT-TTGTTTCATTCATACAAGCT-TATT
** * * * * * *
47271 TGGAATAAAATAA-CACTAATCTAATAATATTCCAAAAACTAATAA-CTAAGAGAATTAAAAAAT
636 CAGAATAAAATAATC-C-AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTTAAAAAAT
* *** *
47334 AAATTTCTTTGTTGAACCAA-
698 AAATTTGTTT-ACCAAACAAG
* * * * * *
47354 TTCAAATATTTAAGTCTATATGACCAATTATCTATTTCAAA-CAATTATGACCTTTTG--TTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC-ATTATG-CCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * *
47416 ATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAAT
64 ATAAAA-AA-ATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * *
47480 CTTTCAAAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAAATAATTTTGTGTACCT-AACCAGTTTAAATAA
126 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAA
* * * ** ** ** * *
47540 TTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTCCTTTT-TTTTGTCATAAAACAAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * *
47604 TGATTTT-GTTCATATAAG-TT-TGTTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA
255 TG-TTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
47666 TTAATAA-ATGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCATATAGTTATGACTATTTGA
317 TTAATAAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
47730 GCAATTATTTATTTCAAATTGTTATA-A-CTTTGGTTCTATTATAAAGCAATTGTTTTTCAA-CA
382 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-AGATCTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-AATCA
* * ** * * *
47792 TACAAGCTT-TTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AATAAGAC
444 TAAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAG
* * ** * *
47852 ATTTAAAAAACAAATCTGTTT-GCTGAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
509 ATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATC-GAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * **
47916 ATTTCAAATTGTTATAACCCTTTTGTTCTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
572 ATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTT-TAGTCATAAAATATTTG-TTTCATTCATACAAGCTTA
* * * * *
47980 TTCAGAATAAAATAATACAAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAACAA-C-TAAGATTTAAAAAAT
634 TTCAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT
* *** ** * *
48043 GAATCCATTTGTCAGACCAG
698 AAATTTGTTTACCAAACAAG
** * ** * * * * ** * * *
48063 TTCAAGCACTTAAAACAATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATATTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * *
48128 TAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGCTTATTT-GAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATT
65 TAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** * *
48192 TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATGCACTAAACCAGTTCAAATAATTA
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTA
* * ** * * * *
48256 TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
193 TGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * * *
48321 TTTTGTTAATATAAG-TT-TGTTCAAAATAAAATAAAACTAATATATTATTATTT-AGAAAATTA
258 TTTAGTTCATACAAGCTTAT-TTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTA
* * * * * * * * * *
48383 ATCAGTAAGAAATTTAAAAAGTAAATCTGCTTACCACACTATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGA
320 ATAAG-AAG--ATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* ** * * ** *** *
48448 ATAA-TATCTATTTCAAATTATTATA-ACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCCGTTAAT
382 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-AGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCAT
** ** * ** * * * * ** *
48511 ACTATTTTA-TTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTCATAACCAAGAAA
445 AAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGA
* ** ** * ** * * ** * * *
48575 ATTAAAAAATAAATATAATTGCCCAACCAGTTTAAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCTAT
510 TTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * ** * ** * *
48640 TTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTTGTAAAACAAATGTTTTGA-TCATACAAGATTATTCA
574 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
48704 -AATTAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
638 GAA-TAAAATAAT-CCAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAA
48767 ATTTGTTTACCAAATC-AG
700 ATTTGTTTACCAAA-CAAG
* * * * * * * * * * * **
48785 TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTAATTCAAATCGTTCTAACGTTTTATTGAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-GCCTTTTGTTTTGTCA
* * **** * * *
48850 AAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTGCTATAGCTGTCA-AAT-AATTAAG
65 TAAA--AA-AA-T---TG-TTTCAGTTCATAAA---A---GCT-TA--T-TTAGAATAAAATAAT
** * * ** ** ** * *
48912 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTCA-TAAAACAAT-TATTTCA
112 ACTA-AT---TTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-A-AGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTT--
* * * ** ***
48974 GCTATTTACT-AATAAGTCCAAATCATTATGACTATTT-AAGCAATTACT-TATTTCAAATTGTT
167 G---TTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATT-CTCTATTGAAAATCACT
* * ** * * * * *
49036 TTAACTTTTTACTTTGTCATAAAACAATTTTTTGCTA-TTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAAT
227 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT--TAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAAT
* ** * * *
49100 AATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATATGTTTATT
290 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC
* * * * * * * *
49165 GAACAAGTTCAAATAGTCATGACTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTT
352 AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGT
* * * * * *
49229 TTTGTAATAAAATAATTATTTC-AGTTCATATAAGCTTATTT-GATGTAAAATAATACTAATTTA
416 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-ATCATAAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * *
49292 TTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AAATCTATTTA-CTGAATAAATTCA
480 TTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATC-GAATAAGTTCA
* * * * * *
49355 AATAGTTATGACTATCTT-AATAATTATCTCTTTTAAAAT-ATTTTGACCATTTGTTTTA-TCAT
543 AATAATTATGACTAT-TTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCAT
* * ** * * **
49417 AAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAGGCTTATTTCA-AATAAAATAATTTAAATTTATTAATATTT
605 AAAA-TATTTGTTTCATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAA-TCCAATTTATTAATA-TT
* * ** *
49481 C-AAAAA-T--TAA--AAAA-ATTAAAAAAATAAATTTGTTTTCTGAACACG
666 CAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
49526 TTCAAATAGTTA-AACTATTAGAACAATAATCTATTTTAATTCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
** * * * *
49590 TAAATCAATTGTTTCTA-TTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-TGATAAT
65 TAAAAAAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-AT
* * * * * *
49653 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAGCGAGTTCAAATAATTA
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTA
* * * * ** * * * *
49718 TGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGC
193 TGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-
* * * * *
49783 TTCTA-TTTATACAAGTTTA-TT--AAT---AT--T-CT-A---A--AA-ATTT-AATAAGT--T
257 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * ** * * * * *
49828 --GGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATGCCCATTTAAACTAT
322 AAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
49891 TATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAA
387 TATCTATTTCAAATCGTTAAGATC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCATA-AAA
* * ** * * *
49955 -ATTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAA--ACT-AATAAGACATTTA
449 GCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTA
* * * * * *
50014 AAAACTAAATTTGTTTA-CTGAACT-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAACTATCCATAT
514 AAAAATAAA-TTGTTTATC-GAA-TAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * * **
50077 CAAATCATTATTA--TATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG
576 CAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTCAG
* * * ** * * * * * *
50140 AGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATG
639 AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATT
** * *
50205 CATTTGCCAAACCAG
703 TGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * * *
50220 TTCAAATAGTGAAGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
50285 TAAAATAATTGTATCAATTTATACATGCTAAATGTT--AATAAAATAATACT-ATTGTATTAACA
65 TAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCT-TAT-TTAGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATA
* * * * ** *
50347 TTT-AGAAAATTAATATA-CAAGAAATTTTAAAAAAT-AATTATATTTACCAAACAAATTCAAAT
127 TTTCA-AAAATTAATA-AGTAAGAGA-TTAAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACAAGTTCAAAT
* * * *** * * ** *
50409 AGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTACCATAAAACA
188 AATTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * * * * * *
50473 ACTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATACAATAGTATTACTTTATTAATTTTTCAAAAA
253 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * ** * * * *
50537 TTGAGAAGTTGAAAATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCAAATTAATTCAAATAATTATGTCCAT
317 TTAATAA---GAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
50601 TTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGAGCCTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAT
378 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAAT
** * * ** * *
50665 CATGCAAGCCTATTCA-AAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AG
442 CATAAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
* * * *
50728 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAA-ACCAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATT
507 -AGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCGAATA--AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* ** * * * * * *
50791 ATATATTTCAAATTATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAT-TTATC-TTCATACAAA
568 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-TATT-TGTT-TCATTCATACAAG
* * * * *
50854 CTTATT-AGAAATAAAATAGTACTAATCTAATT-ATATT-ATGAAAATTAATAA-CTAAGAGATT
630 CTTATTCAG-AATAAAATAAT-CCAAT-TTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGC-AAAAGATT
* * *
50915 TAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-
690 TAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAG
* * * * * ** * *
50943 TT-AAATAGTTAAGA-TGATATGGATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTAACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-GCCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * * *
51006 GTAAAACAAA-TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT-GAAATAAAATAGTATTAATTTATTAATA
64 ATAAAA-AAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * *
51069 TTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTT-TAATAAGT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAA-T
* * * ** ** *
51129 TATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAA-CATTTGTTTTGTCATAAAATAA-
191 TATGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * *
51192 ---CTTA--T--T-C-AG---A-----AA-AACATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
255 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * ** *
51239 ATAAG-AGATTTAAAAATTGAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTCAAATA
320 ATAAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * * * *
51303 ATAACCTATTTCAAATTGCTATA-ACCTTTTATTTTGTGATAAAATAATTTTTTTCTATTCATAC
385 ATTATCTATTTCAAATCGTTA-AGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTATTTCTAATCATAA
* * * * *
51367 AAG-TTATTTCA-AT-TAAAATAATA-TAAATTTATTAACA-TTCAAACAATTATTAAGTAAAAG
447 AAGCTTATTT-AGTTATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAATAAGAG
* * * * * ** *
51427 ATTTAAAGAATAACTCTGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTT
509 ATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA-TCT
* * * * * * ** *
51492 ATTTTAAAACATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTGTTCATGCAAGCTTATT
572 ATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATTCATACAAGCTTATT
* ** *** * * * *
51557 -TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAAATA
636 CAGAA-TAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATA
* *
51621 AATATGTTTACCAAACATG
699 AATTTGTTTACCAAACAAG
** * * *
51640 ATT-AAATAGTTAAAACTATTCGAATAATTATCTA-TTACAAATCATTGTGACCTTTTTGTTTCT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA-AAATCATTATG-CC-TTTTGTTT-T
* * * * * * *
51703 -TCATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTTATTT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
61 GTCATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * *** *
51766 TATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGACTT-CAAAAATGAATCAATTTACTGAATAAGTTCAAATA
125 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
* * ** * * * *
51830 CTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATC-GTGATGACATTTTGTTTTCTCATAAAATA
189 ATTATGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACT-ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * *
51894 ATTGTTTCTA-TTCATACAATCTTATTTCAAATAGAATAATA-TATATTTATTAATA-TTCTAAA
253 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTC-AAA
* * * * * * *
51956 AATTAATAAGTAAAAATTAAAAAAATACATTTATTT-TCTGAGCACA-TTCAAATAGTTATGACT
315 AATTAATAAG--AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAAC-CAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
52019 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CATTTGTTTTGTCATGAACCAGTTGTTTCTA
376 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA
* * * * * * * * *
52083 TTCATACATG--T-GTT--TT-TAAACT-ATACTAGTTTATTAATA-TTCAAAATTTTGATAAGT
440 ATCATAAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAAT
* * * * ** * * * * * *
52140 AAAAAATCTAAAAAATAAATCTATTTATCGAGCAAGTTTAAATAGTTATGCCTGTTTGAACAAAT
504 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* * * ** * * * *
52205 ATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTA-TTGTAAAACAATTATTTCTATTTATACCAA-
568 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATTCATA-CAAG
* * *** * * * * **
52268 TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAA
630 CTTATTCAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAA
* **
52333 AAATAATTTTGTTTACTGAACAAG
694 AAATAAATTTGTTTACCAAACAAG
* * * * * *
52357 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
* ** ** ** * * *
52422 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAATATTATTCAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTT
65 TAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * * * * * *
52487 -TGAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTAC-CAAAACAGTTTAAATAGTTAT
130 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAATTAT
* * ** * * * * * * * *
52547 GGCTATTTGAATAATAATTTATCT-CAAATCATTATGATC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGT
194 GACTATTTGAACAATTCTCTAT-TGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * * * * *
52610 TTCT-TTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATCATACTAATTTA--AATATATTCCAAAATTTT
258 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TT-CAAAAATTA
* * * * *
52672 ATAAG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTTAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC
320 ATAAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * ** * ** * *
52735 AATTATCTCTTTCAAATTGCTTTA-ATTTTTAG-TTTAACTATATATTAATTGTTT-TCATTCAT
384 AATTATCTATTTCAAATCG-TTAAGATCTTT-GTTTTGTC-ATAAAACAATTATTTCT-AATCAT
* ** * * *
52797 ACAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGA
445 AAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGA
* * * * *
52861 TCTAAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCA
510 T-TTAAAAAATAAA-TTGTTTATC-GAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * * * *
52925 ATTTCAAATCGTTATTACCTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTAT
572 ATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TTCATACAAGCTTAT
* * * * * * * * *
52990 CCAAAATTAAATAATGCTACTTTATTATTATTTC-AAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
635 TCAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT
** *** **
53054 AAATCAGTTTATTGAATTAG
698 AAATTTGTTTACCAAACAAG
* * * * ** * *
53074 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * * *
53139 TAAAGCAATTCTTT---TTCATTAGACAAGCCTATTCAAAAGAAAATAATACTTATTTAATAATA
65 TAAAAAAATTGTTTCAGTTCA-TA-A-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * ** ** * *
53201 TTTCTCACATTAATAAGTAGGACATTTAAAAAATAAATATACTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT
127 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATT
* * ** * * * * *
53266 ATGACTATTTGAACAATTAATTATATATTTTAAATTATTATAACCTTTTGTTTTATGATAAAACA
192 ATGACTATTTGAAC----AATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * * * *
53331 ATT-ATTTATCTTGATACAAGCTTA-TTC-AA-AATAAAAACACTAATCTACTAATATTAT-GAA
253 ATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTTCGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA
* * * * *
53391 AATTAAAATCTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAACATAG-T--AA-AGGT-T-A-
315 AATT--AA--TAAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAAC-CAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
53448 TA--TGAATAATTATCTCTTTTAAAAT-GTTATGACCTTCTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT
375 TATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTAAGATCTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
** * * * * *
53510 TGTTCATAAAAGTTTGTTCTA--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT--AAAA--AATTA
438 TAATCATAAAAGCTTATT-TAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * ** * * * * *
53569 ATAAGAGATTTAATAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAA
502 ATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAA
* * * * * *
53634 TTAGT-TATTTCAAGTCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAATTAATACAA
566 TTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATTCATACAA
* ** * * * * * ** *
53698 TCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAACTTAATAAGTAATGGAATTAA
629 GCTTATTCAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAA
* * ** ** *
53763 AAAA-AGGAATCTATTGGCCTGACCAG
693 AAAATA--AATTTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
53789 TACAAATAGTGATAACTGTTTAAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * ** * *
53853 CAAAACAATTGTTTCTA-TTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATT
65 TAAAAAAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
53917 CCAAAAA-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTAT
* ** * * *
53978 AACTATTTGAACAATTAC-CTATTTCAAATCGCTATAAGCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTT
194 GACTATTTGAACAATT-CTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * *
54042 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAAGTTATTAATATTT-AGACAACTT
258 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-A-AAATT
* * * ** *
54104 AA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
319 AATAAG---AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * **
54168 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGGTTTTGTCATAAAACAA-TAGTTTTTGTTC
381 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTAATC
** * * ** * * *
54231 ATACAAA-CTTATTCGGAT-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAA
443 ATA-AAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
* *
54294 AGATTTTAAAAATAAACATGTATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAA
507 AGA-TTT---AA-AAA-A--TA-AA--T----T-GT--T---TA-TCGAATAAGT-TC-A---AA
* * * * * *
54359 -AATCTCATAACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCATAAA
545 TAAT-T-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAA
* * * * *
54423 ACAATTGTATT-AGTTCATATAGGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-
608 ATATTTGT-TTCA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA-TTCA
* * * * * * **
54485 -AAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATATGTTTACTGAACAAG
668 AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG
* * * ** *
54534 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
54599 TAAAATAATTGTTT-ATGTTCATACATGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTCATTGATA
65 TAAAAAAATTGTTTCA-GTTCATAAAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * ** * * *
54661 -TTCGAAGAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTAGTTTTTTGAACACGTTTAAATAGT
127 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAAT
* * * ** * * * * * **
54724 TATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT-AGTTATGACTTTTTATTTTATCATAAACCAAT
191 TATGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCA-CTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * *
54788 TGTTTTTGTTCATACAAGCATATTT-G-A-AAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
255 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * * * *
54849 ATAAGTAAAAATTTAAAAAAATAAATTTGTTGACCGAGCAAGTTCATATCGTTATTACTATTTGA
320 ATAAG--AAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
54914 ATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATA
382 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCATA
* * * * * * * * **
54979 CAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATACTGATTTATTACTA-TTC-TAAATGAATAGGTAAGAGAT
446 AAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGAT
* * * * *
55041 TTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAGTTTCAAATTTCATATATTAAACAATTATTATTGAA-
511 TTAAAAAATAAAT-TGTTTATCGAATAAG-TTCAAA--TAAT-TA-T-GAC---TA-T-TTGAAT
* * *
55104 AATTAATCTGTTATCAAAATTCAAATAGTTATGA--TTTTGTATAAACAATTACCTATTTAAATT
564 AATT-ATC---TAT-----TTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-T----TAGT--C-A--TAAA--
* ** * ** * *
55167 GCTATAATTTTATTTTGTCATAAAATAAAATTTTATTACATATTATTTTAATTAAAATAAT-AAA
608 ---AT-A--TT-TGTT-TCAT-TCATACAAGCTTATT-C-----A---GAA-TAAAATAATCCAA
* * * * * * * *
55231 ATTATTAATATTTAGACAACTAATAAGTAATATTG-TTTAAAAAAT--ATTT-TTTA--AATC-A
654 TTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAA-A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAA
55289 -
717 G
* ** * * * **
55289 TTTATAATA-TTATGTTTATCT-AAAAATTATTTATTTATAAATC-TTATTGAATTAATT-TAAT
1 TTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA-AAATCATTA-TGCCTT--TTGT--T
* * * * * * * * *
55350 TTATTCATATTCAAAAATTGTTT-TGTTTATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTCA
59 TT-GTCATA--AAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTA
** * * *** *
55414 TTAATATTTTGATAATTAATAAGTAACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAA
121 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAA
* * *
55479 ATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCTCATAACTATTAGAATAATTATTTATT
186 ATA---AT---TA--TGACT-ATT-T-GA---ACAAT-TC-T--CTATT-G---AA--A---A--
* ** * * * * *
55544 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATATTAGTTCATATAGGCTTATTT-G
222 TC--A-C--TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCG
* * * * * *
55608 AAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAATAACACATTTAAAATATGAAT
282 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AA-GA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * *
55673 TTATTTA-CGGGA-CATGTTCAAATGGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
343 ATGTTTATC-AAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * * * * *
55736 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-TATTTTTTTTTATCATACATGCTTATTTCA--AATAAAATA
406 AGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCATAAAAGCTTATTT-AGTTATAAAATA
* * * * * * *
55798 ATA-TAAATTTATTACTATTCCAAAAGTTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TC
469 ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATC
* * * * *
55860 TGAACACA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATAGTTA-AAGCCTTT
532 -GAATA-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTT
** * * * * * *
55923 TGCTTT-GTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTCAAAATACAATAATACTATTT
594 TG-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CCAATT
* * ** *
55987 TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAACATAAATTTGTTTACTGAGCAAG
656 TATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
56049 TTCATATCGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTCGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATG-CCTTTTGTTTTGTC
* * *** * * * * * * *
56113 ATAAAACAATTATTTTTCTTTATACAAGTTTAGTCAGAATAAAATAATATTATTTTATTAATA-T
64 ATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * *
56177 TCTGAAAATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-T---C--G----AATAAGTA
129 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAA-TT
* * * * * * *
56232 AT-CCTATTTGAACAATTATTTATTTG-AAATCATTATGA-CTTTTGTTTTTTCATAAAACAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTCTCTA-TTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * ** * * * *
56294 ATTTTTA-TTCATGCAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACTGATATATCAATATTTTAAAAATT
256 -GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * ** *
56357 AATAAG-AGATTTAAAAACTAAATCTATTTAACAAAATAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAAC
319 AATAAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * ** * *
56421 AATTA-CTTATCTTC-AATCGTTATGATCTTTATTTTGCCATAAAGCAAATGTTTATTTTCACAC
384 AATTATC-TAT-TTCAAATCGTTAAGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAATCATAA
* * * * * * * * *
56484 ATGCTTATTCAGAT-TAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAAAACTTAGTAAGTAAGAGATT
447 AAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
* ** * * * *
56548 TAAAAAAAATACATGTGTTTGCCAAACCAA-TTC-AATAGTTAAGACT-TTTAGAATAATTATCT
512 T--AAAAAATAAAT-TGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAATTATGACTATTT-GAATAATTATCT
* * * * * * *
56610 ATTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATT
572 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATT
* * * * * *
56675 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATTA
636 CAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAA-TA
56740 AATTTGTTTACCAAACAAG
699 AATTTGTTTACCAAACAAG
* * ** *
56759 TTCAAATAGATT-TGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * ** * * *
56823 ATAAAACAATTGTTTCAACTAAAAAAAAC-TA-TCCGAAATAAAATAATACCACTTTTTTAATAT
64 ATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * * ** * * *
56886 TTCAAAAATTAATAAGCAAAATATTTAAAACCTAAAGTTGTTTTCCAAACCAGTTAAAATAGTTA
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTA
* * * * * * * * * *
56951 TGACTATTTGAACAAATATCAATCT-CAAATCATTATGATC-TTTATTTTCTAATAAAATAATTG
193 TGACTATTTGAACAATTCTCTAT-TGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * *
57014 TTTCT-GATCATATAAGTTTATTTC--ATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
257 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** * * * *
57076 ATAAG-AGATTTAAAAAAATAAATAAT-TTTGCCAAACCAATTCAAAGAGTTAAGACTATTAGAA
320 ATAAGAAGATTT-AAAAAATAAAT-ATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * ** * * * * *
57139 AAATTATCTATTTTAAATTGCTCTGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTATTTC-AGTTCATA
383 CAATTATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-ATCATA
* ** * * * **
57203 CAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAAGTAATAAGCAAGAGAT
446 AAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGAT
* * * * * *
57267 TCGACCAAAAA-AAATCTATTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATA
511 T-TA--AAAAATAAAT-TGTTTATC-GAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATC
* ** *** * * * * * * *
57330 TATTTAAAATATTTATGAAAATTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAATCTTAT
571 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TTCATACAAGCTTAT
* * * * * * * * *
57395 CCA-AATGAAATAATACTACTTTATTAACATTTC-AAAAGTTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAC
635 TCAGAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT
** * * *
57458 AAATCAGTTTATCACATC-AT
698 AAATTTGTTTACCA-AACAAG
* * * * * * * * *
57478 TTCAAATAATAATGGCCATTTGAACAACTATTTATTTTAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA-TGCCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
57543 TAAAACAATTATTT-TGTAACATACAAGCTCATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 TAAAAAAATTGTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * ** * *
57606 TTCAGGAA-T--TAA-TAAGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACCAA-TTTAAATAGTT
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAATT
** * * * * * * *
57666 ATGACTATTTGAACAATTAGCTATT-----TTA-AATAACCTTTTGGTCTATCATAAAACAACTG
192 ATGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * ** **
57725 TTTCTA-TTTATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGGAATATTTTGAAAATTA
257 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** * * * *
57788 ATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATCCGTTTGT-AGAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATG
320 ATAA--GA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCA-AACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
57851 AATAGTTAGT-TATTTGAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTC
381 AACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-ATC
* * ** * * **
57914 ATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAA-AGCTAACTT-TTAATATTTCAAAAATTTATACGTAAG
443 ATAAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
* * * ** *
57976 AGATTTAGAAAAT-AATTCTACTTACCGAACCA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTAT
507 AGATTTAAAAAATAAATTGT--TTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * ** * * *
58039 CTATTTCAAGTC-TTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTT
570 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCATTCATACAAGCTT
* * ** * * * * *
58102 GTTC-GAAAGAAAATAATACTTATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAA
633 ATTCAG-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAA
* * * * *
58166 GTAAATTTGCTTACTAAACCAT
696 ATAAATTTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
58188 TTCAAATAGTTTTGAATATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-GCCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** ** * * *
58253 TCAAATAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTCT-GCATAAAATAAGACTAATTTAATAATATT
65 TAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * ** * * ** * *
58317 TTGAAACTTAATAACCAAGAAAATT-AAAAAATAAATCTAATTACTAAACCAA-TTCAAATAGTT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAATT
* ** * ** *** * * * ** *
58380 -TAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTGGTTGTAAAACAATT
192 AT-GACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * *
58444 GTTTT-GTTCGTACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA
256 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * *
58508 TAAG-AGATATAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-TAATTCAAATGGTT-TAGACTATTAGAATA
321 TAAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACA
* ** * * * * *
58570 ATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTTC-AATTCATACA
385 ATTATCTATTTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAA-TCATAAA
* ** * * ** *
58634 ACCTTATTTA-AAATAAATTAATACTAATTTATTGA-CGTTCAAAAAGTTAATAACAAAAAGAGA
448 AGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAAT-A-AATAAGAGA
* * * * * * * *
58697 TTTAAAAAA-ATA-TGTTTACCAAATATGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATT
510 TTTAAAAAATAAATTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * ***
58760 TAAAATCATTATAACCTTTTGATTT-GTCATAAAACAATTGTTTTAGTT-AGTACAAGCTTAGAG
575 TCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TTCA-TACAAGCTTATTC
** ** *
58823 AGAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAAGAA-ATTTAAAAGATAA
637 AGAATAAAATAATCC-AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAA-AAGATTTAAAAAATAA
**
58887 ATTTGTTTACCAAATTAG
700 ATTTGTTTACCAAACAAG
* * * * ** * ** * *
58905 TTAAAATAATTATGGCTATTTAAATGATTATCTATTTGAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
* ** * *
58970 TAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTGATTAATAT
65 TAAAAAAATTGTTTCAGT-TCATAAAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * * * *
59033 TTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACTAAACTAGCTCAAATAGTTA
128 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTA
* * * * * ** * *
59098 TGACTATTTGCATAATT-TTTAATCT-CAAATC-GT-TAAGATCTTTGTTTTGTTAAAAAATAAT
193 TGACTATTTGAACAATTCTCT-AT-TGAAAATCACTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * *
59159 TGTTTCT-GATCATAGAAGCTTA-TTCGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCATAAAT
255 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTCGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * ** * *
59222 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTGTGGAACCAATTCAAATAGTTAAAACCATTA
318 TAATAAG--A-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * * * *
59287 GAATAATTATCTATTGCAGATTGTTCTAATAT-TTTGTTTAGTTATAAGATATTTATTTC-ATAT
380 GAACAATTATCTATTTCAAATCG-T-TAAGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-AT
* * ** * * * * ** ** *
59350 CTTACAAGCTTA-TTAGGAATAAAATAATCCAAAGTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGCAAA
442 CATAAAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
* * * * *
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507 AGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * * * * *
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570 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TTCATACAAGCTTA
* * * * * *** *
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* * ** *
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696 ATAAATTTGTTTACCAAACAAG
* ** ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
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65 TAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
59756 TCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAAC-AAATC-AGTTCAAATAATT
129 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTT-ACTGAA-CAAGTTCAAATAATT
* * * * ** *** * * *
59815 ATTG-CCATTTTAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTG-TTTAT-ATAACAA-ATT
192 A-TGACTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA-AATAAT
* * * * *
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255 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** *
59939 ATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG-
320 ATAAG-AAG--ATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
60003 ACGAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTACAAAATAAACCTTTCATTTTGTTACAAAATAATTA
382 AC-AATTATCTATTTCAAATC-----GTT--AAGAT----CTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTA
* ** * * ** * * * * *
60068 TTTATGTTTATACAAA-CTTA-TTCGAAATAAAATAATAATAATCTAATAATATTCCAAAAAGTA
434 TTTCTAATCATA-AAAGCTTATTTAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * ** * **
60131 ATAACTAAGAGATTT-AAAATTAAATTTGTTTGTCAAACT-AGTTCAAATTGTTAAGACTACATG
498 ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * *
60194 AACAATTATCAATTTAAAATTGTTACT-ACATTTTGCTTT-GTCATAAAATAATTT-TTTCAATT
561 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAAT-ATTTGTTTC-ATT
** * * * ** ** *
60256 CATATTAGCTTATTAAAAATAAAATAAAAT-GAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAG
622 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT--AATCCAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAA
* *
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* * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-GCCTTTTGTTTTGTCA
** * * ** * * *
60418 TAAAACAAA-TGTTTTTGTTCATAGAAGTTTGCTCAGAATAAAATAATACAAATCTATTAATATT
65 TAAAA-AAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
*
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AAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGA
CTATTTGAACAATTCTCTATTGAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT
AGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGA
AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
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TAGTTATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATA
AATTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATC
CAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
AG
Found at i:45883 original size:181 final size:179
Alignment explanation
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45492 TTATGTTCAT
* * * * * *
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** * * * * * * ** * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * ****
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* * * ** * *
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*** * ** * * * * *
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* * *
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* * * * *
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*** **** * * *** * * ** *
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* * * * * * ***
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* *
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* * * * ** *
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* * * * * ** * *
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* * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--GAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
**** ** * * * * * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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128 -T-TTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATA
* * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCT
* * * * *** * * * * * *
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* * * * ** * **
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* * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT--GAGATTTAAAAAATAAATCT-G
* * * * * * * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--GAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
**** * * * * * * *
47343 -TGTTGAACCAATTCAAATATTTAAG-TCTATATGACCAATTATCTATTTCAAA-CAATTATGAC
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* * * * * ** *
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127 CTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTATTTCT--ATTCATACAAAATTATTTAGAATA
* * * * *
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1 AAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * * * * * *
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64 CTACCAAACCAATTCAAATAGTCATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAT-C
* * * * * ** * * *
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128 TTTGTTTTATCATAAAAC-AATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATA
* * * *
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* * * * * * * * * ** *
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* * * * * * ** *
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* * * *
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* ** * * * * * ** * *
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65 TACCAAACCAATTCAAATAGTCATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TC-
* * * * ** *
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* * * * * * **
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCT
** * * ** * * ** ** * * * **
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* * * **
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* * * * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT--GAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * * *
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* * * * * * * ** * * *
48296 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATA
127 CTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATA
* * * * * * *
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* * * ** * * * * *
48413 T-TACCACACTATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTATTATAACC
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* * ** ** * * ** **
48476 TTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCCGTTAATACTATTTTATTGGGAATA
128 -TTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATA
* * * * ** * * * **
48529 AAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTCATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATATAAT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA--GTGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * ** * * * *
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* * ** * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
48773 T-TACCAAATCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTAAT-TCAAATC
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Statistics
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AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCT
ACCAAACCAATTCAAATAGTCATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTT
GTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATA
Found at i:46222 original size:357 final size:360
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Indices: 45576--48558 Score: 945
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45566 TTACTGAACG
* ** * *
45576 AGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTACTTTTAATCTTTATTATCATTT-TTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTT-C-TAAAATCATTATGATCATTTGTTTTG
*
45639 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
45704 TTCTAAAAATTATTAAGTTGGACATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACGAATTCAAATAGTC
128 TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTCACCAAACCAATTCAAATAGTC
* * * * * * * *
45769 ATGTTCATTTGAACTATTATTTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAACAATTA
193 AAGCTCATTAGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTA
* *
45834 TTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAA-AGATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAA-T-
258 TTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAACA-ATACTAATTTATTAACA-TTCAGAAAAGTA
* *
45895 TA-ACAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATCTATCAAACCA
321 TACACAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATCTATCAAA-CA
* * *
45934 A-TTTAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTGTCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-TCTAAAATCATTATGATCATTTGTTTTGT
* * * * * * *
45997 CATAAAACAATTATTTCTATTTATGCAAGATTATTT-AGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA
65 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** ** * *
46061 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAATTCAATTAGTT
128 TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTCACCAAACCAATTCAAATAGTC
* * *
46126 AAGACT-ATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCA-TTCTAACTTTTTG-TTTAGTCATAAAATAA
193 AAG-CTCATTAGAACAATTATCTAATTCAAAT-AGTTATAACATTTTGTTTTA-TCATAAAACAA
* * ** *
46188 TT-TTTTTAGTTGATAC-ATGCGTATT-TGAAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAGAAA
255 TTATTTCTA-TTCATACAAAAC-TATTCAG-AATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAGAAA
* **
46250 AGTAATACACAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACA
317 AGT-ATACACAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATCTATCAAACA
* * * * * * * *
46295 AGTTCAAATAGTTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTCT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-TCTAAAATCATTATGATCATTTGTTTTGT
* * *
46360 CATAAAACAATTATTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
65 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAG-TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * *** **** *
46424 TT-TCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATTGAATTGGTTCGAAA-AA
128 TTCT-AAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTCACCAAACCAATTC-AAATAG
* * * * * *
46487 TTATGGC-CATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAAC
191 TCA-AGCTCA-TTAGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTAT-AACATTTTGTTTTATCATAAAAC
* * * * ** * * * *
46549 AGTTGTTTTTAATCATACAAGCCTATTCTGAATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTCA-AAA
253 AATTATTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCAGAAA
* ** * *
46613 ATTAATA-AGTAGCAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAAC-
317 AGT-ATACACAAG-AAATTTAAAAAAATAAATCTATCTATCAAACA
** * * ** * * *
46656 ---T--AAT--TCCT-A-T-TTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTAT-AACTTATTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-TCTAAAATCATTATGATCAT-TTGTTTTG
* * * ** * *
46710 TTATAAAATAATTATTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATATT
64 TCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAG-TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ***** ** * *
46774 ATT-TCAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTGTTGAAGTAGTTCAAA-CGA
127 ATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTCACCAAACCAATTCAAATAG-
* * ** * ** *
46836 TTAAGACT-ATATA-AACAATTATTTGTTTCAAATCGTTATGGC-TTGTTGTTTTGTCATAAAAC
191 TCAAG-CTCAT-TAGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTATAACATT-TTGTTTTATCATAAAAC
* * * * * * *
46898 AATTGTTTCAACTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATT-A-A-T------
253 AATTATTTCTATTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAGAAA
* * * * * *
46953 A-T-T-C-C-A-AAATTT-AAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATC-
317 AGTATACACAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATCTATCAAA-CA
* * * * * * * * * * *
46990 AGTTCAAATAATTATGGCCATGTCG-ACAATTATCAATT-TCAAATCATCATTACCTTTTGCTTC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATC--TTCTAAAATCATTATGATCATTTGTTTT
* * * ** * *
47053 ATCATATAACAATTGTATT-TAAACATTCAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATAATAATTTATTA
63 GTCATAAAACAATTAT-TTCTATTCATACAAG-TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
47116 ATCTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTAGTT-ACCAAACTAGTTCAAA
125 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTCACCAAACCAATTCAAA
* * * * * * * * * * *
47179 TAGTTATAACT-ATTTGGGA-AATTGT-AAACTTGAAATTGTTATAAAATTTTGTTCTGTCATAA
188 TAGTCA-AGCTCA-TTAGAACAATTATCTAA-TTCAAATAGTTATAACATTTTGTTTTATCATAA
* * * *** ** * * * * *
47241 AAAAAATATTTTTATTCATACAAGTGTATTTGGAATAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCA-
250 AACAATTATTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACATT-CAG
* * * * *
47305 AAAACTAATA-ACTAAGAGAA-TT-AAAAAATAAATTTCTTTGT-TGAACCA
314 AAAAGT-ATACAC-AAGA-AATTTAAAAAAATAAA--TCTATCTATCAAACA
* * * * * * * * *
47353 A-TTCAAATATTTAAGTCTATATGACCAATTATCTATTTCAAA-CAATTATGA-CCTTT-TGTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-TCTAAAATC-ATTATGATCATTTGTTTTG
* * * * *
47414 TCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATT
64 TCATAAAACAA-TTATTTCT--ATTCATACAAG-TTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * * *
47477 AATCTT-TCAAAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAAATAATTTTGTGT-ACCTAACCAGTTTAA
124 AATATTCT-AAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT-TCACCAAACCAATTCAA
* * * * * * ** * *
47536 ATAATTATGACT-ATTTA-AAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTCCTTTT-TTTTGTCATAA
187 ATAGTCAAG-CTCA-TTAGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTATAACATTTTGTTTTATCATAA
* * * *** * * ** * *
47598 AACAAATGATTT-TGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCA
250 AAC-AATTATTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACA-TTCA
* * * *
47662 -AAAA-T-TA-ATAA-ATGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACT
313 GAAAAGTATACACAAGA-AATTTAAAAAAATAAATCTATCTATCAAACA
* * * * * ** * * *
47705 AGTTCATATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-AAC-TTTGGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-TCTAAAATCATTATGATCATTT-GTTTTG
* * * * * * *
47768 TTATAAAGCAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAG-TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** ** *
47832 ATT-TCAAGAATTAAT-A---AGACATTTAAAAAACAAATCTGTTTGCTGAACCATTTCAAATAG
127 ATTCT-AAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTCACCAAACCAATTCAAATAG
* * * * * * * *
47892 TTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTTGTTCTATCATAAAACA
191 TCAAG-CTCATTAGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTATAA-CATTTTGTTTTATCATAAAACA
* * * * * * * *
47956 ATTGTTTTTGTTCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTAGTAATATTCTA-AAA
254 ATTATTTCTATTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTC-AGAAA
* * * * * * *
48019 A-T-TA-ACAACTAAGATTT-AAAAAATGAATCCATTTGTCAGACC
317 AGTATACACAA-GAA-ATTTAAAAAAATAAATCTATCTATCAAACA
** * ** * * * * * ** *
48061 AGTTCAAGCACTTAAAACAATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CATATTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-TCTAAAATCATTATGATCAT-TTGTTTTG
* * * * * *
48125 TCATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * * *
48190 TT-TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATGCACTAAACCAGTTCAAATAAT
128 TTCT-AAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTCACCAAACCAATTCAAATAGT
* * * * * * *
48254 TATAACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
192 CA-AGCTCATTAGAACAATTATCTAATTCAAAT-AGTTATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAA
* * * * * *** * * * * * ** * *
48317 TTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATATATTATTATTTAGAAAATT
255 TTATTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAGAAAAGT
* * * * * *
48382 A-ATCAGTAAGAAATTT-AAAAAGTAAATCT-GCTTACCACACT
320 ATA-CA-CAAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATC-TATCAAACA
* * * * * * * * * *
48423 ATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-TCTAAAATCATTATGATCATTTGTTTTGT
* ** ** * ** * * *
48487 CATCAAACAATTGGTTCCGTTAATACTATTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 CATAAAACAATTATTTCTATTCATAC-AAGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
48552 TCCAAAA
129 TCTAAAA
48559 CTTCATAACC
Statistics
Matches: 2025, Mismatches: 451, Indels: 295
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
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343 1 0.00
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Consensus pattern (360 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTTCTAAAATCATTATGATCATTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
TAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTCACCAAACCAATTCAAATAGTCAAG
CTCATTAGAACAATTATCTAATTCAAATAGTTATAACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT
CTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAACAATACTAATTTATTAACATTCAGAAAAGTATACAC
AAGAAATTTAAAAAAATAAATCTATCTATCAAACA
Found at i:46782 original size:170 final size:169
Alignment explanation
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Period size: 179 Copynumber: 2.7 Consensus size: 169
46490 TGGCCATTTA
* * *
46500 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTAATCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGATTTCAATCAT
** * * *
46565 ACAAGCCTATTCTGAATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGCAGA
66 ACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAACTAAG-AGA
46629 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAATTCCTATTTTG
129 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAATTCCTATTTTG
* * * *
46670 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTAT-AACTTATTATTTTGTTATAAAATAATT-ATTTCAGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTT-TTATTTTGTCATAAAACAATTGATTTCA-ATC
* * *
46733 ATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTTCAAAATTAATAACTAAGAGA
64 ATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAATTAATAACTAAGAGA
* * ** * *
46798 TTTAAAAAATAAATTGTTTGTTGAAGTAGTTCAAACGATTAA-GACTA-TATA
129 TTTAAAAAATAAA---TCTATT----TA--TCAAAC---TAATTCCTATTTTG
* * * * *
46849 AACAATTATTTGTTTCAAATCGTTATG-GCTTGTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAACTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTT-TTATTTTGTCATAAAACAATTGATTTCAA-TC
* * * *
46912 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAATT
64 ATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAATT
46964 TAAAAAGTGA
Statistics
Matches: 240, Mismatches: 36, Indels: 27
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Matches are distributed among these distances:
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AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGATTTCAATCAT
ACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAATTAATAACTAAGAGATT
TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAATTCCTATTTTG
Found at i:48937 original size:113 final size:114
Alignment explanation
Indices: 48733--48940 Score: 285
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48723 TAATAATATT
* * * * **
48733 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAGTTCAAATGGTTAA
1 TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAGCAGTTCAAATAATTAA
*
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66 GACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCGTTCTAACGTTTTATTGAG
* * * *
48847 TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTATAGCTG-TCAAATAATTAA
1 TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAGCAGTTCAAATAATTAA
*
48911 GACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAATC
66 GACTATTA-GAACAATTATCTAATTCAAATC
48941 ATTATGACCT
Statistics
Matches: 81, Mismatches: 12, Indels: 3
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
112 2 0.02
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ACGTcount: A:0.45, C:0.11, G:0.10, T:0.35
Consensus pattern (114 bp):
TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAGCAGTTCAAATAATTAA
GACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCGTTCTAACGTTTTATTGAG
Found at i:49736 original size:18 final size:20
Alignment explanation
Indices: 49706--49756 Score: 60
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49696 ATTGAGCGAG
49706 TTCAAAT-AATTATGATTAT
1 TTCAAATCAATTATGATTAT
49725 TT-AAA-CAATTAT--TTAT
1 TTCAAATCAATTATGATTAT
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1 TTCAAATCAATTATGAT
49757 CTTTTGTTTT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 0, Indels: 10
0.73 0.00 0.27
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.22
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TTCAAATCAATTATGATTAT
Found at i:49843 original size:157 final size:154
Alignment explanation
Indices: 49649--49953 Score: 369
Period size: 157 Copynumber: 2.0 Consensus size: 154
49639 TAATTTATGA
*** * *
49649 TAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAGCGAGTTCAAATA
1 TAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* ** * * *
49714 ATTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCGTAAAATA
66 ATCATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACA
*
49778 ATTGCTTCTATTTATACAAGTTTAT
130 ATTGCTTCTATTCATACAAGTTTAT
*** * *
49803 TAATATTCTAAAAATTTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAA
1 TAAT-TTC-AAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAA
* * *
49868 ATAGTCATGCCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA
63 ATAATCATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA
* *
49933 CAATTGTTTTTATTCATACAA
128 CAATTGCTTCTATTCATACAA
49954 AATTATTCAA
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 22, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
154 4 0.03
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TAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
ATCATGACCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
TTGCTTCTATTCATACAAGTTTAT
Found at i:50900 original size:181 final size:180
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Indices: 49798--60496 Score: 3932
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49788 TTTATACAAG
* * * **
49798 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAA-TTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCA
* ** * * * *
49862 GTTCAAATAGTCATGCCCATTTAAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTGTTTTGT
* **
49926 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCA-AAATAAAATAATACTAA
127 CATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** *
49980 TTTATTAATATTCCAAAAACTAAT-A--AG-ACATTTAAAAACTAAATTTGTTTACTGAACTAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* * * * * * * *
50041 TTAAATAGTTATGACTATTTGAATAACTATCCATATCAAATCATTATTA-TATTTATTTTGTCAT
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* * * *
50105 AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AGTAAAATATTGCTAA
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** * * *** *
50156 ACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTGAAAAATAAATGCATTTGCCAAACCA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCA
* * * * * *
50219 GTTCAAATAGTGA-AGACTGTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGT
64 GTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGT
* * *** * * * * *
50283 CATAAAATAATTGTATCAATTTATACATGCTAAAT-GTTAATAAAATAATACT-A
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* ** * *
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* * * * * * * *
50399 AAATTCAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGTTTTA
62 CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTGTTTTG
* * *** * * * * * *
50463 CCATAAAACAACTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCA-AAATACAATAGTATTAC
126 TCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTAT-TAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * ** *
50518 TTTATTAATTTTTCAAAAATTGAGAAGTTGAAAATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCAAATTAA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCAAACCAG
* ** * * * * * *
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65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCA
* * * *
50646 TAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAAGCCTATTCA-AAATAAAATAATAGTAA
129 TAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
*
50698 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* * ** *
50763 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTATTATAACTTTTTATTTTGTCAT
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTGTTTTGTCAT
* * * *
50828 AAAACAATTATTTATCTTCATACAAACTTATTAGAAATAAAATAGTACTAA
130 AAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * **
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1 T-TTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACC
* * * * *
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63 AGTTCAAATAGTTATA-ACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
51003 GTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAGTATTAA
125 GTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
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1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* * * *
51120 T-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACATTTGTTTTGTCA
66 TCAAAT-AGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * ** * * * **
51184 TAAAATAA-----CTTATTCAGAAAAACATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAA
129 TAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGC-TTATTAGAA-ATA-AAATA-AT-ACTAA
* * * * *** ** ** **
51236 TTAATAAGAGATTT-AAAAATTGAAT--CTA-TTTATCGAACAAGTTTAAATA-G-TTA--TGAC
1 TTTATTA-ATATTTCAAAAATT-AATAAGTAGAAGATTTAA-AA-AATAAATATGTTTACCAAAC
* * * *
51293 TA-TTCAAATA---ATAACCTATTT-CA-AATT-GCTA--T--AA-C-------CTTTTATTTTG
62 CAGTTCAAATAGTTATAA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTGTTTTG
* * ** *
51339 TGATAAAATAATT-TTTTTCTATTCATACAAG-TTATTTCAATTAAAATAATA-TAAA
126 TCATAAAACAATTGTTTTTC--TTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACT-AA
* * * * * * * ** *
51394 TTTATTAACA-TTCAAACAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAGAATAACTCTGTTTACCGAATAAA
1 TTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAG
* ** * * * * *
51458 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTTATTTTAAAACATTATGACTTTTTTGTTTTGT
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATAAC--TTTTGTTTTGT
* * * * * *
51523 CATAAAATAATTG-TTTTGTTCATGCAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAA
127 CATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
** * * * *
51576 TTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CATG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCA-G
* * * * * *
51640 ATT-AAATAGTTAAAACTATTCGAATAATTATCTATTACAAATCATTGTGACCTTTTTGTTTCT-
65 -TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AAC-TTTTGTTT-TG
* * *** * * * *
51703 TCATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA
126 TCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
** * * * * * ** **
51758 TTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTA-AGAGACTTCAAAAATGAATCA-ATTTACTGAATAA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCAAACCA
* * * * * * *
51821 GTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCGTGATGACATTTTGTTTTCTC
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
51886 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAGAATAATA-TATA
128 ATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTA-A
* * * * * * ** *
51939 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTA-AAAATTAAAAAAATACATTTATTTTCTGAGCACA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-CA
* * * * * *
52002 -TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTGTTTTGTCA
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
52066 TGAACCAGTTGTTTCTATTCATACATG-TGT-TT----TTAAACT-ATACTAG
129 TAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCT-TATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * * * *
52112 TTTATTAATA-TTCAAAATTTTGATAAGTAAAAAATCTAAAAAATAAATCTATTTATCGAGCAAG
1 TTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAG
* ** * * * * * * * **
52176 TTTAAATAGTTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTATTG
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
52241 TAAAACAATTATTTCTATTTATACCAA-TTTATTCAG-AATAAAATAATACTAA
129 TAAAACAATTGTTTTTCTTCATA-CAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
** * * * * * * ** *
52293 TTTATTAATATTTTGAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACTGAACAAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* ** * * *
52358 TCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCAT
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * *
52423 AAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAATATTATTCAG-AATAAAATAATATTGA
130 AAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
** * * * *
52474 TTTATTAATATTTTGAAAGTTAAT-A--AG-AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAAACAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* ** * * * * * * *
52535 TTAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATAATTTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTATTTTATCAT
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACT-TTTGTTTTGTCAT
* * * *
52599 AAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATCATACTAA
130 AAAACAATTGTTT-TTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * **
52650 TTTA--AATATATTCCAAAATT--TTA-TA-AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTTAACCA
1 TTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCA
* * * * * * *
52709 ATTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTCTTTCAAATTGCTT-TAATTTTTAG-TTTA
64 GTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG-TTATAACTTTT-GTTTTG
* * ** * *
52771 ACTATATATTAATTG-TTTTCATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
126 TC-ATAAAACAATTGTTTTTC-TTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * ** *
52827 TTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGTA-AGAGATCTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCA
* * * * *
52891 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACCTTTTTGTTTTGC
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TAAC-TTTTGTTTTGT
** * * * * *
52956 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCA-AAATTAAATAATGCTAC
127 CATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTAT-TAGAAATAAAATAATACTAA
* * *** **
53010 TTTATTATTATTTCAAAAGTTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATTGAATTA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCAAACCA
* ** * * * *
53073 GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCATTATGAACTTTTATTTTGTC
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
53138 ATAAAGCAATTCTTTTTCATT-AGACAAGCCTATTCA-AAAGAAAATAATACTTA
128 ATAAAACAATTGTTTTTC-TTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * **
53191 TTTAATAATATTTCTCACATTAATAAGTAGGACATTTAAAAAATAAATATACTTACCAAACCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* * * ** *
53256 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAATTATATATTTTAAATTATTATAACCTTTTGTTTTA
66 TCAAATAGTTATAACTATTTG---AA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTG
* * * * *
53321 TGATAAAACAATTATTTATCTTGATACAAGCTTATTCA-AAAT-AAA-AACACTAA
126 TCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
53374 TCTACTAATATTAT-GAAAATTAA-AATCTA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCCAACA
1 TTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-GTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-
* * * * * *
53436 TAG-T--AA-AGGT-T-A-TA--TGAATAATTATCTCTTTTAAAAT-GTTATGACCTTCTGTTTT
62 CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTT
* * * * * ** *
53491 GTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATAAAAGTTTGTTCTAAATAAAATAATATTAA
125 GTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * *
53547 TTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-A--AG-AGATTTAATAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* * * * * *
53608 TCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTAGT-TATTTCAAGTCGTTATGACCATTTGTTTTGTCA
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCA
* * *** * * * * * *
53672 TAAAATAATTGCTTCAATTAATACAATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAA
129 TAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * ** **
53724 TTTATTAATA-TTCTAAAACTTAATAAGTA-ATGGAATTAAAAAA-AGGAATCTATTGGCCTGAC
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATA--AATATGTTTACCAAAC
* * * * * *
53786 CAGTACAAATAGTGATAACTGTTTAAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA
62 CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTG
* * * ** * * * * * *
53850 TCACAAAACAATTGTTTCTATTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACATAATTCTAA
126 TCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *** *
53905 TTTATTAATATTCCAAAAATTAGT-A--AG-AGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATTGAACAAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* * *
53966 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAAGCTTTTGTTTTGTCAT
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-CTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * *
54031 AAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAA
130 AAAACAATTGTTTT-TCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * **
54082 GTTATTAATATTT-AGACAACTTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAA
1 TTTATTAATATTTCA-A-AAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCA
* * * * * *
54145 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGGTTTTGTC
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTT-GTTTTGTC
* * * * * * *
54210 ATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAA
128 ATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
** * * * * *
54263 TTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAACATG--T---ATA--AGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
* * * ** *
54321 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATC-TCATAACTATTTGAAAAATTAT
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACT-TTTG---TTTTGT
* * * * * * * *** *
54385 CTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAA-TTGTATTAGTTCATATAGGCTT
127 C-A--T-AAA-----AC-A---ATTGTTTT-TCTTCATACAAGCT-TATTAG---AAATAAAATA
* *
54449 ATTCGAA
174 ATACTAA
* * * * ** ** ** * * *
54456 -ATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AA-A-TTAATGAGTAAGAGAT-TTAAAATATG
1 TTTATTAATATTTC-AA-AAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAA-ATATGTT----TA-C
* * * * * *
54515 AATATGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGTT
57 CA-A-----AC----C-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * **
54580 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGTTCATACATGCTTATTTCAAATAAAATAA
111 ATAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAA
54645 TA-TAAA
175 TACT-AA
* * * * ****
54651 TTCATTGATA-TTCGAAGAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTTTTGAA-CA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCAAACCA
* * * * * * *
54712 CGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATAGTTATGACTTTTTATTTTAT
64 -GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTGTTTTGT
* * * *
54777 CATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTTG--A-AAAA-AATACTAA
127 CATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
54827 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAAATAAATTTGTTGACCGAGCAAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAG
* * * * * *
54891 TTCATATCGTTATTACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCA
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
54956 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATACTGA
129 TAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
55008 TTTATTACTA-TTC-TAAATGAATAGGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAG
* * *
55069 TTTCAAATTTCA-TATATTAAACAATTATTATTGAA-AATTAATCTGTTATCAAAAT--TCAAAT
65 -TTCAAA--T-AGT-TA-T-AAC---TA-T-TTGAATAATT-ATCTATT-TC-AAATCGTTATA-
* * * ** * ** * **
55130 AGTTATGATTTTGT-AT-AAACAATTACCTATTTAAATTGC-TATAATTTTATTTTGTCATAAAA
114 ACTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATT--GT-TTT-TCTT-CATACAAGCTTA-TTAGAAATAAAA
*
55192 TAA-A--AT
172 TAATACTAA
* * * * *
55198 TTTATTACATATTATTTTAATTAAAATAATAAAATTATTAATATTTAGACAACTAATAAGTAATA
1 TTTATT--A-A-TATTTCAA--AAATTAAT--AAGTA-GAAGATTTA-A-AA--AAT-A--AATA
* ** * * * * *
55263 TTGTTTA-AAAAATATTTTTTAAATCATTTATAA-TATTATGTTTATCTAAAAATTATTTATTTA
50 -TGTTTACCAAACCA--GTTCAAAT-AGTTATAACTATT-TG-------AATAATTATCTATTT-
* * * *
55326 TAAATC-TTATTGAATTAATTTAATTTAT-TCATATTCAAA-AATTGTTTTGT-TT-ATATAAGC
102 CAAATCGTTA-T-AACT--TTT-GTTT-TGTCATA---AAACAATTGTTTT-TCTTCATACAAGC
* * * *
55386 TTATTTGGATTAAAATAATATTAA
157 TTATTAGAAATAAAATAATACTAA
* ** * ** ** *
55410 TTCATTAATATTTTGATAATTAATAAGTA-ACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGAACAAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAG
* * * *
55474 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATC-TCATAACTATTAGAATAATTA
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACT-TTTG--T--TT-
* * * * * * * * ** *
55538 T-TTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTCATCATAAAAC-AATT--ATATTAGTTCATA-T
124 TGTCA--T-AAAACAAT-TG---TTTT-TCTTCAT-A-CAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACT
*
55597 AGG
179 A-A
* * * * * * * * * ** *
55600 CTTATTTGAA-A--T-AAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACAAT-TA-ATGAATA--ACA
1 TTTA-TT-AATATTTCAAAA-ATTAATAA-GTA-GAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA
* * * ** **** * *
55657 -CATTTAAAATA-TGA-ATTTATTT--A-CGGGA-C-ATGTTCAAATGGTTATGACTGTTTGAAC
61 CCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATAACT-TTTG---
** * * * * * ** **** **
55714 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATATT-TT-TTTTTATCATAC
121 TTTTGTC-A--T-AAAACA--AT---TGTTT-TTCT-TCATACAAGCTTATTAGAAATAAAATA-
* *
55777 ATGCTTA
174 ATACTAA
* * * * **
55784 TTTCAAATAAAATAATAT-AAATTTATTACTATTCCAAAAGTTAATAAG-TAAAAATTTTAAAAA
1 TTT---AT-TAAT-ATTTCAAA--AATTA--A-T----AAG-T-AGAAGAT-TT-A----AAAAA
* * * ** * * *
55847 TAAATCTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATA
44 TAAATATGTTTACCAAAC-CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
55911 GTTA-AAGCCTTTTGCTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTCA-AAATAC
108 GTTATAA--CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAA
*
55974 AATAATACTAT
170 AATAATACTAA
* * * ** * *
55985 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTTAAAACATAAATTTGTTTACTGAGCAAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAG
* * * * * * * * * *
56049 TTCATATCGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTCGTTTTGTCA
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
56114 TAAAACAATTATTTTTCTTTATACAAGTTTAGTCAG-AATAAAATAATATTAT
129 TAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTA-TTAGAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * *
56166 TTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GA--A-
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAG
* * * * * * * *
56226 -T---A-AGTAAT-CCTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCATTATGACTTTTGTTTTTTCAT
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** *
56285 AAAACAATTATTTTTATTCATGCAAAATTATTCAG-AATAAAATAATACTGA
130 AAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * **
56336 TATATCAATATTTTAAAAATTAAT-A--AG-AGATTTAAAAACTAAATCTATTTAACAAAATAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGT
** * * * *
56397 TCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATTA-CTTATCTTC-AATCGTTATGA-TCTTTATTTTGCC
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATC-TAT-TTCAAATCGTTATAACT-TTTGTTTTGTC
* * * * *
56459 ATAAAGCAAATGTTTATT-TTCACACATGCTTATTCAG-ATTAAAATAATACTAA
128 ATAAAACAATTGTTT-TTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
56512 TTCAATAATATTCCAAAACTTAGTAAGTA-AGAGATTTAAAAAAAATACATGTGTTTGCCAAACC
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGA-AGATTT--AAAAAATAAATATGTTTACCAAACC
* * * * *
56576 AATTC-AATAGTTA-AGACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTA
63 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTGTTTT
* **
56638 GTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAA
125 GTCATAAAACAATTGTTTTTCTTCATACAAGCTTATT-AGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
56694 TTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGTA-AGAGATTTAAAAAATTAAATTTGTTTACCAAACA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACCAAACC
* * * * *
56757 AGTTCAAATAGATT-TGATTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTT
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** * * * * ** * *
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* * * * ** *
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* * * * * * * * * * *
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* * ** * * ** *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * ** **
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* ** * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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* ** * *
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** * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* **
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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* *
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AAATAGTTATGACTATTTC
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* *
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* *
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** * *
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* * * ** * *
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* * *** * * *
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* * * **
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* * *
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* * * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* **** * * * * * * * * ** *
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* ** * *
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1 ATTTATTTTTTAAA-TCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* ** * * * * * *
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65 TTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * ** * *
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129 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
* * * * * *
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1 ATTTAT-TTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
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64 TTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * *
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129 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAA-AAA
* ** * *
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* * * * * *** * *
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* * * * * **
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* ** ** * *
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** * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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* * * **** * * *
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* * * * * ***
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* * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
** * * * * *
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65 TTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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64 TTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * * * * *
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129 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
* *
63237 ATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAAATATT-ATAAATTAGTATT-TTTTA-T
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * **
63299 TCAAACAAGCTTGTATGATCAC-AAAAAAATT-TTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTT
66 TCAAATAAGCTTGTATGA--ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * *
63361 GAGAGT-GATATTTGTTCAAATGGTCGTAACTATTTAAATTAGTTCA--AAAAACA
129 GA-AATAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAA-A
* * * *
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1 A-TTTAT-TTTTTAAATC-TCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTA-ATAAATTAGTATTATTT
* * * * * *
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62 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * *
63540 TTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAGCTTGTTC-G-ATAAACA
127 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTA-AAAAA
* * * * * *
63595 TTGTTATTTTTTAAAATATCATGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTAGTATTTTA
1 AT-TTATTTTTT-AAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * ** * * * * **
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* * * * * *
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* * * ** * * * *
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1 ATTTATTTTTTA-AATCT--CTT--T-CT-TATTAAT-T--TTTTG-AAATATTAATAA-ATTAG
* * * ** * ** ** * ** **
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* *** * ** ** *
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* *
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* * * ** * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAA-A-TCTCT-T-T---C-TTAT-TAATTTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT-
* * * ** * ** * * **
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* * * **** * * * * * * *
64102 GA-TTTATTTTTTATTTCG-AATA-A-ACTTATAT-GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
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* *
64162 AAAAGATCA-TAACTATTTAAA
167 --TAGTTCAGTAA--A---AAA
* * ** ** * * * * * **
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1 AT---TTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATT--TTTTGAAAT-ATTAATAA--ATTAGTATT
* * * * ** **** * *
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** * * * *** * * * *
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* *
64364 TAACTATTTGAACGTATTTAGAAAATA
164 -AACTAGTT---C--A-GTA-AAAA-A
* * *
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* * * ** * * *
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* * *
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* *
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** * * * * * * **
64635 TTTGGAATAAGCTTGAATG-ACCAGAACCAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAAAATGATT
64 TTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
* * * *
64699 TGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAAGTTCGGTAAACAA
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* * * * *
64755 ATTTATTTTTTAAA--TC--TCTTATTAA-TTTTTGAAAGA-T--T-AATGAGGATCATTTCATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * **
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * ** * *
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* * * * * * ** * *
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** * *
65109 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAA-TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATGATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * ** * * * ** * * **
65173 CCAAATAAAATTATACAAACTAAAACAATTATTTTATAATAGTACAAAATGTTATAATGATTTGA
66 TCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* ** * * * * *
65238 AATAGGTAATTACTCAAATAG--GAAC----TG--GT--TTGA-TAAATAG
131 AATAGATAATTGTTCAAATAGTATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
* * * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
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66 TCAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * *
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1 ATTTA--TTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
*** * * * * * **
65698 TTTTGGATAAGTTTTTATGAATTAAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
64 TTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * ** *
65763 TAAATA-AGTAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCTTGTTTGGTAAACAA
129 GAAATAGA-TAATTGTTCAAATAG-TATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
* * * * **
65817 ATTTATTTTTTCAAATTTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGCGTTATTTTAT
1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * *
65881 TCCAAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAA-AATAGTTTAGAACAATTT
65 TTCAAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * * * * * ** * **
65944 GAAGTAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTACTTGAA-TTGATTTGGCAAAACC
129 GAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAAAAA
* * *
65998 ATTTATTTTTTAAA--TC--TCTTATTAA-TTTTAGGAATATTATTAAATTAGT-TTAATTTT-T
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTAT
* * * * * * *
66056 AATGAACAT--GTTTTTATGATC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAAT-TTAACAA
65 -TTCAA-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACAA
* * * * * * *
66116 TTTGAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACT-GATTTAGTAAATAG
126 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAAAAA
* ** *
66173 ATTTA-GTTTTAAA--TC--TCTTATTAA-TGCTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * **
66232 TCAAATAAGCTTGTATG-A-TAAAA-AGTAGTTG-TTTAT-A-AAAA-AAAATTTCGTAACGGTT
66 TCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA--A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
** * * * ** *
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128 TGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAAAAA
* * *
66345 ATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTAATTAA-TTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* ** * * * * ** *
66409 TCCGTATAAGCTTGTATTAACCAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTT
65 TTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * *
66474 AAATAGATAATT-TTTAAATAGCAATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAG
130 AAATAGATAATTGTTCAAATAG-TATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
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1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * ** * * *
66579 TCCAAATAAGTTTGTATGAACTTAAACAATTGTTTTATGATTATACAAAAGGTCAGAACGATTTG
65 TTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* * * * * *
66644 AAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCA--T----TA-TTCAATAAACAA
130 AAATAGATAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
* *
66690 ATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTT-AACTATTATTAAATTTA-TATTATTTTA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
* * * * * *
66752 -ATCAAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAAAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAAAAATT
64 TTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
* ** *** * * * * *
66815 TGAAATTGATAATCATTTTTATAGTATTAACTATTTCAACTGGTTCAGTAGATAG
128 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTA-TAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
* * ** ** * * * *
66870 ATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAA-ACTTTGGAATATTATTAAATCAATATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
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66 TCAAATAA
66942 AATAGTATGA
Statistics
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ATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
AATAGATAATTGTTCAAATAGTATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAAAAA
Found at i:62851 original size:18 final size:17
Alignment explanation
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62800 ATAAAAAGGT
*
62810 GATAACTATTTGAAATA
1 GATAATTATTTGAAATA
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1 GATAATTATTTGAAATA
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1 G--ATAATTATTTGAA
62859 CTGATTCAAT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 1, Indels: 4
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GATAATTATTTGAAATA
Found at i:64398 original size:158 final size:157
Alignment explanation
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64096 TAAACAGATT
* *
64106 TATTTTTTATTTCGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA
1 TATTTTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGATCA
* ** * * * *
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66 TAACTATTTAAAATAAATAATTGTTCAAACAATCACAACTACTTGAACGTACTCAGTAAAAAGAT
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131 TTATTTTTTGGAATAATAATAAATTAG
* * * * * ** *
64263 TATTATTTTATTTTGAATCAGCTTGTATGACCAGAAACAATTGTTTTACGATGAAACAAAAGGTC
1 TATT-TTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGATC
* * * * * * * *
64328 ATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTATTTAG-AAAATAG
65 ATAACTATTTAAAATAAATAATTGTTCAAACAATCACAACTACTTGAACGTACTCAGTAAAA-AG
64392 ATTTATTTTTT
129 ATTTATTTTTT
64403 AAATTACTAC
Statistics
Matches: 113, Mismatches: 25, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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TATTTTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGATCA
TAACTATTTAAAATAAATAATTGTTCAAACAATCACAACTACTTGAACGTACTCAGTAAAAAGAT
TTATTTTTTGGAATAATAATAAATTAG
Found at i:65406 original size:169 final size:169
Alignment explanation
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Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 169
65093 CTACTTTGGC
* *
65103 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATGATT
1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATGATT
* * * ** *
65168 TTATTCCAAATAAAATTATACAAACTAAAACAATTATTTTATAATAGTACAAAATGTTATAATGA
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*
65233 TTTGAAATAGGTAATTACTCAAATAGGAACTGGTTTGAT
131 TTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGGAACTGGTTTGAT
* * * * *
65272 AAATAGATTTCTTTTTTAAATCTCATACTTATTGATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATGATT
*** * * * * *
65337 TTATCCCAAATAGGCTTGTA-TAA-TGAAAACTAATTGTTCTATGACAAAATAAAA-GTTCATAA
66 TTATCCCAAATAAAATTATACAAACT-AAAAC-AATTATTCTATAACAAAACAAAATGTT-ATAA
65399 CGATTTGAAATAGATAATTA
128 CGATTTGAAATAGATAATTA
65419 TTGATATGGC
Statistics
Matches: 122, Mismatches: 22, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (169 bp):
AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCATAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATGATT
TTATCCCAAATAAAATTATACAAACTAAAACAATTATTCTATAACAAAACAAAATGTTATAACGA
TTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGGAACTGGTTTGAT
Found at i:65946 original size:708 final size:690
Alignment explanation
Indices: 64247--66569 Score: 1993
Period size: 708 Copynumber: 3.3 Consensus size: 690
64237 TATTTTTTGG
* *
64247 AATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATCAGCTTGTATG-ACCAGAAACAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACCA-AAACAATTGTTTTA
* * *
64311 CGATGAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
65 TGATAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA
* * * *
64375 ACGTATTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TAC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
129 ACTTGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
* * * *
64438 ATTTATTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAA-ATAATTTTTTTATGATGAAACA
193 A-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAACA-AA-TATTTTATGAT-AAA-A
* * * * * * *
64502 ATAGGTCATTACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA
253 ATA-GTTATAACAATTTGAAATAG------G-T-AATTACTCA-AA-TA--GGAACTGGTTT-GA
* * *
64567 AAATAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTATTATTATC
304 AAATAGATTTATTTTTTAAA-TTCTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATT
*** * * * * * * * *
64632 TTATTTGGAATAAGCTTGAATGACCAGAACCAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAAAATGA
366 TTATAACGAATAAGCTTGTATGATCA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGA
* * * *
64697 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAAGTTCGGTAAACAAATTTATT
430 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGA-TTTGGTAAACAAATTTA-T
* * * * * *
64762 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAAGATTAATGAGGATCATTTCA-TTT-CG--AATAAGCTT
493 TTTTAAATCTCTTATTAATGTTTGAAACATTAAT-A-AATTATTTTATTTTATGTTAATAAGCTT
* * * * *
64823 GAATGATTAAAAACATTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTG
556 GTATGA-T-AAAACAATTGTTTTATG-CCAAA-AAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
64888 CTGAAATGGCCATAATTATTTGAAATGATTTGATAAACATATTGA-CTTTTTAAATCACTTACTT
617 TTCAAAT-GACATAATTATTTGAATTGATTTGA-AAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTT
* *
64952 ATTAATTTTTAG
680 AATAA-TTTTAA
* * ** ** *
64964 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAATGATTTTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
65029 GACAAAACAAAAGGTCAT-ATCAATTTGAAATCGATAATTGTTCATATAGTCT-TAACTGTTTAA
66 GATAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGA
** * * *
65092 ACTACTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
129 ACTTGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
* ** * ** * *
65157 TTAGTATGATTTTATTCCAAATAAAATTATACAAACTAAAACAATTATTTTATAATAGTACAAA-
194 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAAATATTTTATGATA--A-AAAT
** *
65221 ATGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTACTCAAATAGGAACTGGTTTGATAAATAGATTTCTTT
255 A-GTTATAACAATTTGAAATAGGTAATTACTCAAATAGGAACTGGTTTGA-AAATAGATTTATTT
* ** * *
65286 TTTAAATCTCATACTTATTGATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCCCAAATAGG
318 TTTAAAT-TC-TACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATAACGAATAAG
* * * *
65351 CTTGTATAATGAAAACTAATTGTTCTATGACAAAATAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAA
380 CTTGTATGATCAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * * *
65416 TTATTGATATGGCCATAATTATTTGAATTGATTTGGTTAACAAATTCACTTTTTAAATCACTCAT
444 TTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTAT
*
65481 TAATGTTTGAAATATTAATAAATTATTTTTATTTTATGTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
508 TAATGTTTGAAACATTAATAAATTA-TTTTATTTTATGTTA-ATAAGCTTGTATG-A-TAAAACA
* * * *
65546 ATTGTTTTATGCCAAAAAAATGTCATAATGATTTTAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
569 ATTGTTTTATGCCAAAAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACATAATT
*
65611 ATTTGAATTTG-TTTAGAAAACATATTTATTTTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAACTTTTAA
633 ATTTGAA-TTGATTT-GAAAACATATTTA-TTTTTTTAAATCTCTTACTTAATAA-TTTTAA
* * * ** *
65672 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTAAAACAATTTTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTAT
* * *
65737 GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-AGTAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAG
66 GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * * * * *
65801 CTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATTTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATA
130 CTTGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
** *
65866 TTAGCGTTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAAAATAG
194 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAACAAATATTTTATGA-TAAAAATAG
* * * * * *
65931 TTTAGAACAATTTGAAGTAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTACTTGAATTGATTTGGCAAAA
257 -TTATAACAATTTGAAATAGGTAATTACTCAAATAG----GA--AC-TG----G-TTT-G-AAAA
** * *
65996 -CCATTTATTTTTTAAA-TCT-CTTATTAATTTTAGGAATATTATTAAATTAGT-TTAATTTT-T
307 TAGATTTATTTTTTAAATTCTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTAT
* * * * * * *
66056 AATGAACATGTTTTTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGAATT--TAACAATTT
370 AACGAATAAGCTTGTATGATCA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTTCATAACGATTT
* * * * * * * *
66119 GAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGATTTAGTAAATAGATTTAGTTTTA
433 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTA
* *
66184 AATCTCTTATTAATGCTTGAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTAT
498 AATCTCTTATTAATGTTTGAAACATTAATAAATTA-TTTTATTTTATGTT--AATAAGCTTGTAT
** * * * *
66248 GATAAAA-AGTAGTTG-TTTAT-AAAAAAAAATTTCGTAACGGTTTGAAATAGATAATTGTTCAA
560 GATAAAACA--A-TTGTTTTATGCCAAAAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * *
66310 ATGACAATAATTATTTTAATTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCTTAC-TAATTA
622 ATGAC-ATAATTATTTGAATTGATTT-GAAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTAA-TA
66374 ATTTTAGA
684 ATTTTA-A
** * *
66382 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGTATAAGCTTGTATTAACCAAAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTAT
* * * **
66447 GATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAGATAATT-TTTAAATAGCAATAACTATTTGAAC
66 GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * *
66511 TTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATATTA
131 TTGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA
66570 TTAATTTATT
Statistics
Matches: 1311, Mismatches: 232, Indels: 134
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
702 3 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (690 bp):
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACCAAAACAATTGTTTTAT
GATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
TTGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAACAAATATTTTATGATAAAAATAGTTAT
AACAATTTGAAATAGGTAATTACTCAAATAGGAACTGGTTTGAAAATAGATTTATTTTTTAAATT
CTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATAACGAATAAGCTTGTATGATC
AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
TCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTAAATCTCTTATTAATGTTTGAAAC
ATTAATAAATTATTTTATTTTATGTTAATAAGCTTGTATGATAAAACAATTGTTTTATGCCAAAA
AAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACATAATTATTTGAATTGATTTGAAA
ACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTAA
Found at i:67659 original size:24 final size:23
Alignment explanation
Indices: 67614--67660 Score: 58
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67604 CAAATCTCTT
*
67614 ATTAATTTTTTGAATGTTAATAA
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* *
67637 ATTAATATTTTTTATTGTGAATAA
1 ATTAAT-TTTTTGAATGTGAATAA
67661 GTTTTTATGA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 3, Indels: 1
0.83 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
23 6 0.30
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Consensus pattern (23 bp):
ATTAATTTTTTGAATGTGAATAA
Found at i:68797 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 68335--76257 Score: 4462
Period size: 181 Copynumber: 43.9 Consensus size: 180
68325 TATTTATTTT
* * ** * * * *
68335 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATTTGAATAAGCTTACATGAAAAAAAAAAACAACTGTTCTA
1 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTGAATAAGCTTGTATG---AATAGAAACAATTGTTTTA
* * * *
68400 TGACAAAATGAAAA--TCATTATGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
62 TGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
68463 ACTTGTTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAAT-T-TTA--TATCAATTTTCAAAA
126 ACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * ** * * * * * **
68514 TATTAGTAAATCAATATTATTTTACTTTGAATAATTTTATAAGAACAAAAACAATTGCTTTACAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
68579 TAAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATGATTATTTGAACTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* *** * *
68644 TTTTGGTAAATTGATTTACTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAA
130 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* *
68695 TATTAATAAATTATTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
68760 CAAAACAAAAGATCGTAACT-ATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTT-AAGC
65 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C
* * *
68823 TTGCTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT-GAAA
128 TTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
68877 TATTAATAAATTAATGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
68942 CAAAACGAATGGTCATAACT-ATTTGAAATAGACAGTTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACG
65 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * **
69006 TGTTT-AAAAACATATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTGGGAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
69056 TGTTAAAAAAATTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATG
1 TATT-AATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* **
69120 ACAAAACAAAATGTTTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * * * *
69185 TGTTCAGTAAAGAAATTCATTTTTTAAGTCTTTTACTCATTAATTTTT-GAAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* ** * *
69237 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTAAATGAACTAG-TACAATTGTTTTATA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
** * * * * * *
69301 ATGAAACAAACGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAAATATTTGGACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * * *
69366 TGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTAAAATTCTTTTACTTATTAATTGTCT--AA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAA
* * * * * * * *
69417 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATAAATAAAAATAGTTATTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
69482 CAAAATGAAAA-GTCTTAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAACTAGTCATAACTATTTGAACT
65 CAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
69546 TATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTT-GAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAA
* * * * * * *
69598 TATTAACAAATTTGTATTGTTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAAAATAGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* *
69663 CAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * * *
69728 -TTTCGATGAACAGATTCAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTT-GAAA
130 GTTT-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
69779 TATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGTTTTGTGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
69844 -TAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATCA-ATAATTGTTTAAACAATCAT--CTATTTGTACT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* *** *** * * * *
69905 GGTCAAGCCGACAGATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTCATAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
69957 TATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATAAATAAAAACAAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTAT
** * * * * *
70021 GACAAAATGAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATGCAAATAGTTATAACTATTTGAA-
63 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * *
70085 TTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAATTCAC-TAGCTTATTAATTTTTAAAA
128 TT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * *
70139 TATTAATAATTTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAACA-AAACCATTTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATG
* ** * * * *
70203 CCACAAGA-AAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTAATAATTATTTGAA
64 --ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * ** * * *
70267 CTGGTTCGACAAATAGAA-TTATTTTCTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT-GAAA
127 CTTGTTTGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * ** * *
70321 TATTAATAAATTTA-TCTTATTTTCTTCTGAATAAG-TTAGTAAAAACTA-AAAAAATTATTTTA
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * *
70383 TGAC--AACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTATT--TATAGCCTTAACTATTTGAA
62 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * *
70444 -TTAGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAA
127 CTT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * *
70498 TATTATTACATTAGTATAATTTTATTTTGAATAAACTTGAATGAATAGAAATAATTGTTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
70563 TAAAACAAAAGGTTATAA-GAAATTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTGAA-T
65 CAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
70625 TGGTTCT-ATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCCTACTTATTATTTTTTTA-AA
129 T-GTT-TGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATTTTTAGAA
* * * *
70678 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTAT-TATG-ATGAAAAACAACTGCTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCT-TGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
70741 GATAAGACAAAAGCTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAA
63 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAA
** *** * * * * *
70805 C-TGATTCAGTAAATTGATTTATGTTTTAAATC-CCTAATTGATCAATTTTTAAAA
127 CTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTAGAA
* * * * *
70859 TATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
70923 ATAAAATAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTC-AATAGTCATAATTATTTAAAC
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
70987 TTATTTGATAAACAGATTT-TTTTCTAAATTTCTTACTTATTAAATTTTT-GAA
128 TTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTAGAA
* * * * * * *
71039 TGTTAATAAATTAGTATTAGTTTATTTCGAGTAAGCATGCATAAACT-GAAATAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * * * *
71103 ACTAAATAAAAGGCCAAAATAATTTTAAATAGATAATTGCTCTAATAGTCTTAATTATTTGAA-T
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* ** * * *
71167 TGGATACGCAAA-AACATTTATTTTTTAAA-GTCTTACCTATTAATTTTTAGAA
129 T-GTTTGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *** * * *
71219 TATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTT-TAAATGAATAGAAAAAAATGTTTTAG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGT--ATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
71283 GACAAAAGAAAA-ATCATAATGATTTGACATACATAATTGTTTAAATAGTCATAACTAATTGAAC
63 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * *
71347 TAGTTGGGTAAAGAGATTTAGTCTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-GAA
128 TTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * ** * *
71395 -ATTGTAATAATTTAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTTGCAT-AACTAGAAACAACTGTTTT
1 TA-T-TAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAA-GCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTT
* ** * * *
71458 ATGGCAAAA-AAATA--TCATAACAATTTGAAATAAATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTG
61 ATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *
71520 AACTTGTTTAGTAAACAAATTAATTTTTTAAATCT-TTAACTTATTAATTTTTAGAA
125 AACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAGAA
** * * *
71576 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAACTTGCATGAATAGAAACAGTTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * **
71641 CAAAACAAAAAATCATAATGATTTGAAAAAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * *
71706 GCTCGGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAA
130 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * *
71756 TGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
71821 CAAAACAAATGGTCATAATGATTTCAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAA-TG
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
**** * * * *
71885 TGTTCAAAAAATAACTTTATTTTCTAAAAT-TC-TAATTATTAATTTTTAGAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
71936 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGATTGCATGAATA-TAACAAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTAT
* * *
71999 GGCAAAACAAAAGGTCATAATG-TCTTGAAAT---T-A---TTCATATAGTCATAACTATTAGAA
63 GACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
72056 CTTGTTCGGTAAGCAAATTCATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTCAAAA
127 CTTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
72111 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTATTTGAACT-GAAACAATTGTTTTATT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
72175 ACAAAACAAAAGGTCACATTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * *
72240 TGTTCGATGAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** * *
72292 TATTAATAAA-T--TA-T-TTTT-TTTG-AT---CCAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATAAC
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* ** *
72347 AAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAACTT
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTT
* ** *
72411 ATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT-TTAACTTATTAATTGTCTT--AA
130 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-T-TTAGAA
** ** ** * **
72462 TATTAATAAATTTTTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCGTGAATAGAAAAAATCATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* *** * *
72527 CAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGTTAATTGTTCAAATAGT--T-A-TA----AACTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
72584 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATATCTTAATTATTAATTTTTAGAA
130 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
72635 TAATAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTA-AAATAATT-TTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * * * * *
72698 ACAAAAGAAAAATTTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * ** * * * *
72763 TGTTTGGTAAACATACTTATTTTAAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCAAAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* *
72814 TATTAATAAATTTA-TGTTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * * * * *
72878 ACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAATAAAAAATTATTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * * ** *
72943 TGTTCAGTAAA-TAGTTTCATTTTTTAAATTTCTTAGATATTAATTTTTGGAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
72995 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAGTTGATACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
73060 CGAAACAAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATTATTACTATTTGAACT
65 CAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
73125 TGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTAAAATTTTTTTACTTATTAATTGTT-GAAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * * ** * *
73177 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAG-TCTGTCTGAACAAAAACTGTTATTTTAAG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * *
73241 ACAAAACCAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG-ACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * *
73305 TATTTGGTAAACATATTTA-TTTTTAAATATTTTACTTAGTACTTGTCTAG-A
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAA
** * * * * * *
73356 TACAAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAACAAGCTTGTATGGATAGAAAAAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* *** *
73421 CAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
*** * * *
73486 GTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAA
130 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * ** * *
73532 TATTAATAAATTAGAATTACGTTATTCTGAATCAGCTTGTACAAACAAAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
73597 CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTA-TTGTAC-T
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* ** * * *
73660 GTCAT-GCCAACAAATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATGTTTAAAA
130 GT-TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAA
* * ** * **
73711 TGTTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAA-TTTTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
73774 ACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAAGTAATTGAACT
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
73839 GGTTTGGTAAAAAAAATTATTTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * *
73888 TATAAATAAATTAATATTATTTTATTCGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGAC
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * ** *
73953 AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAACCTTAACTATTTGAA-TTG
66 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-
**** * * * *
74017 GTTCAACAAATAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTATAA
130 GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
74068 TATTATTAGATTAGTATTACTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * * * * *
74133 CAAAACAAAATATTATAGCT-ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAGT
65 CAAAACAAAAGGTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * ** * ** * * * **
74197 GGTTCGATAGGC-AATTTATGTTGGATAAGCTTTTATAAACTAAAACAATTGTTTTATTGTAA
129 TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTA-AATC-TCT-T--ACT-TATTAA-T-TTTTA--G-AA
** ** * * ** * * * * * **
74259 -AGCAAT-TGTTCGGTAAATAGATTGAACTTTTAA-AA--TTTTTTG-CT--TATTAATT-TTTT
1 TATTAATAAATT-AGT--AT-TATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
** * * * * ** * *
74315 GAATGTTAATAA-AATA-GT-ATTATTTTATTTCAAATA-AGCA-TGTATGAACT-G--A-AAC-
61 --ATGACAA-AACAAAAGGTCA-TA-ATGATTTGAAATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAACT
* * ** * *** * * * *
74370 AATT--A-TT-TTATGATAAAACAAATGGTCATAACGATTTAAAAT-AGATAATTGTT-CTATTT
120 ATTTGAACTTGTT-TGGT-AAACAAAT--T--T-A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
74429 -GAA
177 AGAA
* ** * * ** * *
74432 CTGGTTCGGTAAA-CA-TATT-TATTT-TTTAAAT-CTCTTGCTTATTAAATTTTA-AAATATTA
1 -T-ATT-AATAAATTAGTATTAT-TTTATTTGAATAAGCTTG--TA-TGAA---TAGAAACA--A
* * ** *** * ** *
74491 TTATTTTA-G-CAATATTTTACCTCGAATAAGCTTGT-ATGAAAAGAAAGA-ATTTTTTTATGAC
54 TTGTTTTATGACAA-A----A---C-AA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C
* * ** ** * * * * * * *
74552 AAAAAATCATAA-TGATTTAAGATAAATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTAAATTGGTTC
106 AAATAGTCATAACT-ATTT--GA-ACTTGTTTGGT-AAACAAAT--TTATTTTTTAAA-T--CTC
* **
74615 AGTAAGCAAATTTAATTTTT-GAA
161 --TTA-CTTA-TTAATTTTTAGAA
* * * * ** *
74638 TCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTGATGTTATTTTATTTTGAATAATT-T-TGCAT-
1 -----TATTAA----T--AA-ATTAGT--ATT-ATTTTATTTGA--AT-AAGC-TTGTATGAATA
* ** * * * * * *
74700 GAATAAAAACAGTTGTTTTAC--GACAAAA---CAAAAT-ATTAT-AACGATTTGAAATAGATAA
47 G-A-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAA--A--T-AGATA-AT--
* * * * * *
74758 TAGTTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAATTTGTTCGGTAAA-AAGATTTATTTTTCAAATTTC-T
101 T-GTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTT
*
74820 AGCTTATTAAATTTTAGAA
163 A-CTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
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* *
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*** * *** * * *
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* * * * * * *
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* *
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65 CAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * * * *
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* * * * *
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* *
75263 GACAAAACAAAATGT--T-TTG--TT---ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
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* ** * * * * *
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* *** * ** *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
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65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACT
** * * * * * *
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* * ** * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* ** ** *** * * ** *
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** * * * *
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* * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATG
* * * * * * * *
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** * * *
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* * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
75977 ACAAACCAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT-AATC
64 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C
* *** * * * * * * *
76041 TAGTTCATTTAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTT-GTTA
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* * * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * * * * * ** *
76159 CTGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAGTAAATAATTGTTTAAATGGAT-GTAACTGCTTGAATT
65 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT
** * * *
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76258 TTAATTTTTG
Statistics
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68325 TATTTATTTT
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* *
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* * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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**
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* * *
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** *
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* * * * *
69184 TTG-TTCAGTAAAGAAATTCATTTTTTAAGTCTTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
128 TTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * ** * * * * ** *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
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* * *** * * ** *
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** * * * **
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192 TTAATATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATAAATAGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * *
70031 ATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATGCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TTGGTTTAGT
255 ATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTA-T
* * *
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* * * * * *
70139 TATTAATAATTTAATATTATTTTATTTTGAACA-AA-CTTATTTGAACA-AAACCATTTGTTTTA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTA
* * * * * * * *
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* ** * * * *
70265 AAC-TGGTTCGACAAATAGAA-TTATTTTCTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAAT
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* * * * * *
70328 AAATTTATCTTATTTT-CTTCTGAATAAG-TTAGTAAAAACTA-AAAAAATTATTTTATGACAAC
189 AAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTT-GTATAAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
70390 A-AAAT-GTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTATT--TATAGCCTTAACTATTTGAA-TTAGTT
251 ACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT
* * * *
70450 TAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAA
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* * * * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
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* ** * * ** * *
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129 TGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * *
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* * * * * * *
70752 AGCTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAAC-TGATTCAGT
256 TGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTTA-T
* * ** * * *
70815 AAA-TTGATTTATGTTTTAAATCCCTAATTGATCAATTTTTAAAA
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* * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
70923 ATAAAATAAAA-AGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTTC-AATAGTCATAATTATTTAAA
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* * * * *
70986 CTTATTT-GATAAACAGATTT-TTTTCTAAAT-TTCTTACTTATTAAATTTTTG-AATGTTAATA
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* * * * * * * *
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190 AATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * ** * * * **
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* * * * *
71175 CAAAAACATTTATTTTTTAAA-GTCTTACCTATTAATTTTTAGAA
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* * * * * ** * * *
71219 TATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTT-TAAATGAATAGAAAAAAATGTTTTAG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGT--ATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
71283 GACAAAAGAAAA-ATCATAATGATTTGACATACATAATTGTTTAAATAGTCATAACTAATTGAAC
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71347 TAG-TTGGGTAAAGAGATTTAGTCTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAAT-TGTAATAAT
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* ** * * * * *
71406 TTAATATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTTGCATAACTAGAAACAACTGTTTTATGGCAAAA-AA
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* ** * *
71469 AT-ATCATAACAATTTGAAATAAATAA-TAGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGT
255 ATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-T
* *
71532 AAACAAATTAATTTTTTAAATCTT-TAACTTATTAATTTTTAGAA
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* * * * *
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* * **
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* * * * *
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* * * * * *
71769 GTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTTTGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGT
195 ATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGT
* * * * *
71834 CATAATGATTTCAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAA-TGTGTTCA-AAAAAT
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* * *
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* * * * * * *
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255 ATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TATA
* * * *
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** * *
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* *
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* * *
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* * * * *
72635 TAATAATAACTTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCCTATATGAACTA-AAATAATT-TTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
72697 GACAAAAGAAAA-ATTTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
64 GACAAAACAAAAGA-TCATAAT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * ** * **
72761 CTTGTTT-GGTAAACATACTTATTTTAAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA
127 CTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * *
72824 TTTATGTTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
192 TTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAA
** * * * * *
72889 T-GTCATAACAATTTAAAATAAAAAATTATTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGT-A
256 TGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-TAA
** *
72952 A-ATAGTTTCATTTTTTAAATTTCTTAGATATTAATTTTTGGAA
320 ACATA-TTT-ATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
72995 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCCTATATGAGTTGATACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * * *
73059 ACGAAACAAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATTATTACTATTTGAAC
65 ACAAAAC-AAAAGATCATAAT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * *
73124 TTGTTT-GGTAAACATATTTA-TTTTAAAATTTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAA
128 TTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * ** * *
73187 TTAATATTATTTTAATAT-GAATAAG-TCTGTCTGAACA-AAAACTGTTATTTTAAGACAAAACC
192 TTAATATTATTTT-ATTTCGAATAAGCT-TGTATAAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAA-C
* * * * *
73249 AAAT-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG-ACTTATTTGG
253 AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-A
* * * *
73312 TAAACATATTTA-TTTTTAAATATTTTACTTAGTACTTGTCTAG-A
317 TAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATT-TTTAGAA
** * * * * * *
73356 TACAAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAACAAGCTTGTATGGATAGAAAAAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * **
73421 CAAAACAAAAGGTTATAGCA-ATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
66 CAAAACAAAAGATCATA--ATATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * *
73485 TG-TTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT
129 TGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
** * * *
73544 AGA-ATTACGTTA-TTCTGAATCAGCTTGTACAAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
194 A-ATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAAC-AA
* * * *
73606 AT-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTA-TTGTAC-TG-TCATGC
255 ATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAT--
* * * * * *
73667 CAACAAATTCATTTTTTAAA-TCCATTACTTATTAATGTTTAAAA
318 AAACATATTTATTTTTTAAATTTC--TACTTATTAATTTTTAGAA
* * ** * **
73711 TGTTAATAAATTAGTATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAA-TTTTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
73774 ACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAAGTAATTGAACT
65 ACAAAACAAAAGATCATAAT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
73839 GGTTT-GGTAAAAAAAATTATTTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATAAATAAAT
129 TGTTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * * *
73899 TAATATTATTTTA-TTCGAACAAACTTATATGAACA-AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAA
193 TAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAT
* * * ** * * *
73962 GGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAACCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAACAA
257 GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT-TATAA
* * * * * *
74026 ATAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTATAA
320 ACATATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
74068 TATTATTAGATTAGTATTACTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * **
74132 ACAAAACAAAATATTATAGCTATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT-AAAG
65 ACAAAACAAAAGATCATA-ATATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * ** * ** * * * *** *** *
74196 TGGTTCGATAGGC-AATTTATGTTGGATAAGCTTTTA-TAAACTAAAACAATTGTTTTATT-GTA
129 TGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTA-AATCTTTTACT-TA-T-TAATTTTTGAAATATTAATA
** ** ** * * * * * **
74258 AAGCAAT-TGT-TCGGTAAATAGATTGAA-CTTTTA-AAATTTTTTGCTTATTAATT-TTTTGAA
190 AATTAATAT-TAT-TTTATTTCGAAT-AAGCTTGTATAAA----TAG--AAAAAATTGTTTT--A
** * * * * * ** * * ** * *
74318 TGTTAATA-AAATAGT-ATTATTTTATTTCAAATA-AGCATGTA-TGAACT-GAAACAATTATTT
244 TGACAAAACAAATGGTCA-TA-ATGATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** * *** * * * *
74378 -TA--TG-ATA-AAACAAATGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTGTT-CTATTT-GAA
306 GAACTTGTTTATAAACATAT--T--T-A-TTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * ** * *
74432 CTGGTTCGGTAAA-CA-TATT-TATTT-TTT-AAAT-CTCTTGCTTATTAAATTTTA-AAATATT
1 -T-ATT-AATAAATTAGTATTAT-TTTATTTGAAATAAGCTTG--TA-TGAA---TAGAAACA--
* * **** ** * * *
74490 ATTATTTTA-G-CAATATTTTACCTCGAATAAGCT-TGTATGAAAAGAAAGAATTTTTTTATGAC
54 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATC--ATAA--TAT-T-TG-AAATAAATAA---TTGT-T--C
* * * * *
74552 AAAAAATCATAA-TGATTTAAGATAAATAAT-TGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTAAATTGGTT
106 AAATAGTCATAACT-ATTT--G--AACT--TGT-TTC----GGT-A-AACAAATTT--ATT--TT
* * * *
74614 CAGTAAGCAAATTTAATTTTTGAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTGATGTTATT
153 ---T---TAAA--T--CTTTT--A---CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
* ** * * * * * * *
74679 TTATTTTGAATAATTTTGCATGAATA-AAAACAGTTGTTTTACGACAAAACAAAAT-ATTATAAC
203 TTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAAT
* * * ** * *
74742 GATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAATTTGTTCGGTAAAAAGATTT
266 GATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTT-TATAAACATATTT
* *
74805 ATTTTTCAAATTTCTAGCTTATTAAATTTTAGAA
328 ATTTTTTAAATTTCTA-CTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
74839 TATTAATAAATTAGTATTATTTAATTTTG-AATAAACTTGTGTAAATAGAAAC-TTATATTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT-TGTTTTAT
* *
74902 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC
64 GACAAAACAAAAGATCATAAT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
*** *** * * *
74967 -TCACTCGGTAAATTGACTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAAT
128 TTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * * * *
75031 CAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAG
193 TAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATG
* * * * *
75096 GAT-ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATGTGAA-TGTGTTCAGAAA
258 G-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTATAAA
* *
75159 -ATAATTTTATTTTTTAAATTTTTATTTATTAATTTTT-GAAA
321 CAT-A-TTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
75200 TATTAACAAATTTA-AATTAATTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAATCAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTAT
* ** *
75263 GACAAAAC--AA-A--AT-GT-TTTGTTATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
64 GACAAAACAAAAGATCATAATATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * *
75321 T-ATTCAGTAAAC-ATTTTTTTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
129 TGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * * ** * * *
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194 AATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACA-AATG
* * *
75448 GTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAA-TAGTTTGAACTTGTTCAGTAAA
258 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTTGTTTA-TAAA
* * * * *
75512 CATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAA
321 CATATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTAGAA
* * ** * *
75553 TATTAATCAATTAATATTATTTTACTCCG-AATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * ** * ** *
75617 ACAAAATAAAAAAATTGTACCA-AGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAACGATTTGAA
65 ACAAAA-CAAAAGATCATA--ATATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * *
75681 CTTG-TTCAGTAAATAGA--T-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATA
127 CTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATA
** * * * *
75740 AATTTGTATTATTTTAGTT-GAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTTATTTTATGACAAAAC
190 AATTAATATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAA-TTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * *
75803 AAAAT-GTTATAGTGATTTCAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCA
253 -AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA
* * * *
75867 GTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTAGAT
317 -TAAACATATTTATTTTTTAAAT-T-TCTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
75913 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTCTTTAAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
75976 GACAAACCAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT-AAT
64 GACAAAACAAAAGATCATAA-TATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-
* ** * * * * * **
76040 CTAG-TTCATTTAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGTTATATTAATAAA
127 CTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * * * * **
76104 TTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTTGTGTGAACAGAAACAATTATTTTATAACTGAACAAA
192 TTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAA
** * *
76168 AAGTCATAATGATTTGAAGTAAATAATT
256 TGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
76196 GTTTAAATGG
Statistics
Matches: 5837, Mismatches: 1221, Indels: 884
0.73 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
342 2 0.00
343 51 0.01
344 1 0.00
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380 2 0.00
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389 3 0.00
390 1 0.00
391 6 0.00
393 16 0.00
394 1 0.00
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
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CAAAACAAAAGATCATAATATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
TTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAA
TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTC
ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTATAAACATAT
TTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAGAA
Found at i:69961 original size:178 final size:176
Alignment explanation
Indices: 68580--74176 Score: 1848
Period size: 180 Copynumber: 31.2 Consensus size: 176
68570 GCTTTACAAT
* * * *
68580 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGA-CATGATTATTTGAACTT
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** * * ** * * * * *
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** * * *
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126 GAATTA-TTTATTTCG-AATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* ** * *
68760 CAAAACAAAAGATCGTAACT-ATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTT-AAGC
1 -AAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTG-AAATAATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAA-C
* * * * * *
68823 TTGCTTGGTA-AACAAATTTATTTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAA
61 TTG-GTCGAAGAACAGATTCA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAT--AATATTAATAA
* *
68886 ATTA-ATGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGGTTTATGA
122 ATTAGA-ATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * * *
68942 CAAAACGAATGGTCATAACT-ATTTGAAATAGACAGTTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACG
1 -AAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACT
** * * * * ** * *
69006 T-GTTTAAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTGGGAATGTTAAAAAAATT
62 TGGTCGAAGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-ATAATATT-AATAAATT
* * * *
69069 A-TATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATGA
125 AGAATTA-TTTATTTCG-AATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* * * *
69121 CAAAACAAAATGTTTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * * * *
69186 GTTCAGTA-AAGAAATTCATTTTTTAAGTCTTTTACTCATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATT
63 GGTC-GAAGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAT--AATATTAATAAATT
* * * ** * * *
69249 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTAAATGAACTAG-TACAATTGTTTTAT-A
125 AGAATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * *
69301 ATGAAACAAACGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAAATATTTGGACT
1 A--AAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACT
* * * * * * *
69366 TGTTCAGTA-AACATATTTA-TTTTAAAATTCTTTTACTTATTAATTGTCTAATATTAATAAATT
62 TGGTC-GAAGAACAGATTCATTTTTTAAA-TCTTTTACTTATTAATTTTATAATATTAATAAATT
* * * *
69429 A-ATATTATTT-TAATCTGAATAAGCTTGTATAAATA-AAAATAGTTATTTTATAA
125 AGA-ATTATTTAT-TTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA-AATTGTTTTATGA
* * * * *
69482 CAAAATGAAAA-GTCT-TAACGATTTAAAATAAATAATTATTC-AACTAGTCATAACTATTTGAA
1 -AAAA-CAAAAGGT-TATAATGATTTGAAAT-AATAATTGTTCAAAC-AATCAT-ACTATTTGAA
** * * *
69544 CTTATTCGATA-AATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-TGAATATTAACAA
60 CTTGGTCGA-AGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTAT-AATATTAATAA
* * * * * * *
69607 ATTTGTATTGTTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAAAATAGGTTTATGA
122 ATTAGAATT-ATTTATTTCG-AATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* * *
69663 CAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
** * * *
69728 TTTCGATGAACAGATTCAGTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTA
63 GGTCGAAGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAT--AATATTAATAAATTA
* *
69792 GAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTGTTTTGTGA
126 GAATTAT-TTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* * *
69844 TAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATCAATAATTGTTTAAACAATCAT-CTATTTGTAC-TGG
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* **
69907 TC-AAGCCGACAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAG
65 TCGAAG--AACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-ATAATATTAATAAATTAG
* * *
69971 CATTACTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATAAATAAAAACAAATTGTTTTATGA
127 AATTA-TTTATTTCGAATAAG-CTTGTATAAATAGAAA-AAATTGTTTTATGA
** * * * * * * *
70023 CAAAATGAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATGCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TT
1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT-AATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
** * * * ** * *
70087 GGT-TTAGTAAACAAATTTATTTTTTAATTC-ACTAGCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAATT
63 GGTCGAAG--AACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAA-TTTTATAATATTAATAAAT
* * * * * * * * *
70150 TA-ATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAACA-AAACCATTTGTTTTATGCCA
124 TAGA-ATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAA-AAATTGTTTTATG--A
* * ** * * * * * *
70206 CAAGA-AAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATAGTAATAATTATTTGAAC-T
1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * *
70269 GGTTCGACA-AATAGAATT-ATTTTCTAAATCTCTTACTAATTAATTTT-TGAAATATTAATAAA
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** * *
70331 TTTA-TCTTATTT-TCTTCTGAATAAG-TTAGTAAAAACTA-AAAAAATTATTTTATG-
123 -TTAGAATTATTTAT-TTC-GAATAAGCTT-GTATAAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * * * *
70385 ACAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTATTTATAGC-CTTA-ACTATTTGAA-TTA
1 AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT-AATAATTGTTCA-AACAATCATACTATTTGAACTTG
** * * * * * * *
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64 GTCGAAG--AACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTATAATATTAATAAATTA
* * * * * * * *
70511 GTATAATTTTATTTTGAATAAACTTGAATGAATAGAAATAATTGTTTTATAA
126 GAATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* * * *
70563 TAAAACAAAAGGTTATAA-GAAATTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCAAACTATTTGAA-TT
1 -AAAACAAAAGGTTATAATG-ATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCATACTATTTGAACTT
* ** * *
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63 GG-TCGA-AGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAT-AATATTAATAAATT
* * * *
70690 A-ATATTATTTTATTTTGAATAAGCTAT-TAT-GAT-GAAAAACAACTGCTTTATGA
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* * * * ** * *
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1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * ** * * ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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** * *
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* * * * *
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* * ** * * * * * * * * *
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1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * * * *
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63 GG-T-CG-AAGAACAGATTCATTTTTTAAA-TCTTTTACTTATTAA-TTTTATAATATTAATAAA
* * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * * * * * *
71349 GTTGGGTA-AAGAGATTTAGTCTTTAAATC---T-CTTATTAATTTT-TGAA-ATTGTAATAATT
63 GGT-CGAAGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAT-AATA-T-TAATAAAT
* ** * * * * *
71407 TA-ATATTATTT-TATTCTAAATAATTTTTGCATAACTAGAAACAACTGTTTTATGG
124 TAGA-ATTATTTAT-TTC-GAATAA-GCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
* ** * ** * *
71462 CAAA-AAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATAGTTCAAATAGA-CATAACTATTTGAACTT
1 AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT-AATAATTGTTCAAACA-ATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * * * * *
71525 GTTTAGTA-AACAAATTAATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
63 G-GTCGAAGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTATAATATTAATAAATTA
* * * * * * * *
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126 GAATTA-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAAAAATTGTTTTATGA
** * * ** * *
71641 CAAAACAAAAAATCATAATGATTTGAAAAAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTG-AAATAATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * * * * ** *
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63 GGTC-GAAGAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTATAATATTAATAAATTAG
* * * * * *
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* * * * * * *
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1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACT-
* * * * * * * * * *
71885 TGTTCAAAAAATA-ACTTTATTTTCTAAA-ATTCTAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 AAAACAAAAGGTTATAATGAT-TTGAAATAATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTTG
* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * * * *
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** * * * *
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* * ** * * *
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1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCATACT-ATTTGAACTT
** * * * * *
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*** * ** * **
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*** * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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* * * ** *
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*** * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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1 -AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATA-ATAATTGTTCAAACAATCAT-ACTATTTGAACTT
* * * * * * * * *
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* * * * *
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** *
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* * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * ** * * *
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* * *** * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * *
83649 ATAGATAATTATTGACATAGCCTTAA-TCATTTGAACTGA-TTCGATAAATAG
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* * **
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* * * * ** * *
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* * * * *
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* *
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83940 TTTGAATAGG
Statistics
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Found at i:83970 original size:181 final size:180
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* * * * * *** * *
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* * * * * *
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* ** ** * * *
83145 AACTGCTCAGGTAAACAGAATTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
129 AACT-ATTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
83198 AAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTGTTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCAAAAAAGCTTAT
1 AAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAATTGAAACAA--TTAT
* * *
83261 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTCCTAGA-TAT
62 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTA-ACTAT
* * * * * * * *
83325 TTAAACTGGTTT-AGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCACTTAGTTATTAA-TTTTC
126 TTGAACT-ATTTGA-CAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * ** *
83380 AGAATATT-ATGAGATTAGTATT-TTTTATTACAAATAAGTTTGTATGAA-CAAAATAATTATTT
1 A-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTT
* * * * * ** * * * *
83442 TATGAGAGAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTG
64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTG
* * *
83507 AACTA--TAAC-CAT--ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
129 AACTATTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * *
83554 AAAGATTAAAAAAATAGTATTATTTTATCCTGAAA-AAGATTGA-ATG--TTCAAAAACAATTGT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTT-ATATGAATT--GAAACAATTAT
* * * * * * *
83615 TATATGACCAAACAAAAGGTAATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTGACATAGCCTTAA-TCA
62 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACT-A
* * *
83678 TTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAGTTTTTG
125 TTTGAACT-ATTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* ** * * *
83731 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATATGCTTCTATGAACTGAAACAATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTA
* * * * *
83796 TAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATACAGTCTTAACTGTTTGAA
66 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA
*
83861 CTACTTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTG
131 CTA-TTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* ** *
83912 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTA
* * * * * * * *
83977 TAATAGAACAAAATGTTATAACGATTTGCAAT--CT-A------AT-T-GT-TTAA--ATTGGAA
66 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA
* ** * * * **
84028 CTGGTTCAATAAACAGATTTTTTTTTTAAATCTCTTTTTTATTAATTTTTG
131 CT-ATTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
84079 AAATATTAATAAGTTAGTAATATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTG--AAACAATTATTT
* * ** * * * * * *
84142 TATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGCCATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTG
64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTG
* * * * * * * *
84207 AACCAATTTGATAAATTGACTTATTTTTTAAATCTC-AAATTATCAATTTTTA
129 AA-CTATTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * ** * * * * * *
84259 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGGATAAGCTTTTATAAACTGAAATAGTTATTTTG
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTA
*
84324 TGATAAAACAAAA
66 TGACAAAACAAAA
84337 AGTTTTATAA
Statistics
Matches: 884, Mismatches: 194, Indels: 123
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
165 2 0.00
166 1 0.00
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169 5 0.01
170 2 0.00
172 2 0.00
173 39 0.04
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183 109 0.12
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA
CTATTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
Found at i:84238 original size:525 final size:532
Alignment explanation
Indices: 83060--84336 Score: 1301
Period size: 525 Copynumber: 2.4 Consensus size: 532
83050 ACAAACTTAT
* * *
83060 ATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGACTTT-AAATAGATAATTGT
1 ATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * *
83124 TCAAATAGTCATAATTATATGAACTGCTCAGGTAAACAGAATTACTTTTTAAATCTCTTACTTAT
66 TCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGAATTATTTTTTAAA-CTC-TACTTAT
* * * * * * * *
83189 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTGTTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTCAAAA
129 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-CTATGAACTGAAAA
** * *
83253 AAGCTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTCATATAGTCC
193 AA--TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCATACAGTCC
** *
83318 TAGATATTTAAACTGGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCACTTAGTTATTAATTTTCAGA
256 TAGATATTTAAACTACTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCACTTAGTTATTAATTTTCAGA
* * * * *
83383 ATATTATGAGATTAGTATTTTTTATTACAAATAAGTTTGTATGAACAAAATAATTATTTTATGAG
321 ATATTATGAAATTAGTATTTTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACAAAACAATTATTTTATAAG
* * * *
83448 AGAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAT
386 AGAACAAAAGGTTAAAACGATTTGAAGTCTA-AATTGTTCAAAT-ATCAGAACTAGTTCAACTAT
* *
83513 AACCATATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAAAAAAATAGTATTATT
449 AACCAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAAAAAAATAGTAATATT
*
83578 TTATCCTGAAAAAGATTGA
514 TTATCCTCAAAAAGATTGA
* * * * * * *
83597 ATGTTCAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAA-CATTTTGAAATAGATAATTAT
1 ATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
83661 TGACATAGCCTTAATCATTTGAACTGATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAA-TC-ACTTATTA
66 TCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGAATTATTTTTTAAACTCTACTTATTA
* * * *
83724 GTTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATATGCTTCTATGAACTGAAACAAT
131 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACTGAAAAAAT
* * *
83789 TATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATACAGTCTTA-AC
196 TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCATACAGTCCTAGA-
* * * * * *
83853 TGTTTGAACTACTTT-GACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTT-TGAAAT
260 TATTTAAACTACTTTAG-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCACTTAGTTATTAATTTTCAG-AAT
* *** * ** *
83916 ATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATGAATTGAAACAATTATTTTATAAT
323 ATTATGAAATTAGTATT-TTTTATTACAAATAAGCTTATATGAA-CAAAACAATTATTTTATAAG
* * * * *
83981 AGAACAAAATGTTATAACGATTTGCAA-TCT-AATTGTTTAAAT-T-GGAACTGGTTCAA-TA-A
386 AGAACAAAAGGTTAAAACGATTTG-AAGTCTAAATTGTTCAAATATCAGAACTAGTTCAACTATA
** ** * * **
84040 A-CAGATTTTTTTTTTAAATCTCTTTTTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAGTTAGTAATATTT
450 ACCAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAAAAAAATAGTAATATTT
* * * *
84104 TAT-TTCAAATAGGCTTGT
515 TATCCTCAAA-AAGATTGA
* * ** *
84122 ATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGA-TTTGCCATAGATAGTTGT
1 ATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTGAAATAGATAATTGT
* ** * * * * * *
84186 TCAAATGGCCATAATTATTTGAACCAATTTGATAAATTGACTTATTTTTTAAATCTCAAATTATC
66 TCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGAATTATTTTTTAAA-CTCTACTTATT
* * * * * * *
84251 AATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGGATAAGCTTTTATAAACTGAAATAG
130 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACTGAAAAAA
* *
84316 TTATTTTGTGATAAAACAAAA
195 TTATTTTATGACAAAACAAAA
84337 AGTTTTATAA
Statistics
Matches: 603, Mismatches: 124, Indels: 35
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
524 4 0.01
525 155 0.26
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534 4 0.01
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536 4 0.01
537 89 0.15
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (532 bp):
ATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGACTTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTAGATAAATAGAATTATTTTTTAAACTCTACTTATTA
ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTCTATGAACTGAAAAAAT
TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCATACAGTCCTAGAT
ATTTAAACTACTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCACTTAGTTATTAATTTTCAGAATATT
ATGAAATTAGTATTTTTTATTACAAATAAGCTTATATGAACAAAACAATTATTTTATAAGAGAAC
AAAAGGTTAAAACGATTTGAAGTCTAAATTGTTCAAATATCAGAACTAGTTCAACTATAACCAGA
TTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAAAAAAATAGTAATATTTTATCCT
CAAAAAGATTGA
Found at i:85019 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 84473--86827 Score: 1787
Period size: 181 Copynumber: 13.1 Consensus size: 180
84463 AAACAGAACA
* * * * * *
84473 ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT-AAATTGATTTGACAAGC-GCATTTA
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAG-ATTTA
* * *
84536 TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
64 -TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAAT
* * *
84597 ATGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACT-
128 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAA-TG
* * * *
84650 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACGTGTCTAGA-AAACATATTTAG
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCGATAAACAGATTTA-
* ** * * **
84714 TTTTTATAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATA
* * * * * *
84778 AGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATGAAACAAAAGGTCATGACG
129 AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * * * *
84830 AATTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * *
84895 TTTAAAATATTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAA
66 TTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAA
* * ** * * *
84960 ACTTGCATGACCAAAAACAATTGTTTCATGATAGAACAAAAAGTCATAATG
130 GCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * * **
85011 GTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATCA-TCATAACTCTTTGAACTTATTCGATAAGTAGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTAT
* * * *
85075 TTTGTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTGA-ATTATTTTAAT-TGAA
65 TTT-TAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAA-TTAATATTATTTTATTCTG-A
* * * *
85137 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAG--GT--T-
126 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * *
85186 A--TGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCAGG
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-T
* * * *
85249 TTTTAAAT-TTGTTACTTATTAATTTTTGACATATTAATAAATTAGA-ATTGTGTTATTCTGAAT
65 TTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCTGAAT
* * * *
85312 TAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTGTGATAAAAC-AAAGGTCATAATG
128 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * * * *
85364 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAGCT-GTTATAACTATTTGTAC-TGGTC-AAACCAACAGATTC
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATA--AACAGATT-
* * ** *
85426 ATTTTTTTAAAT-TTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCT-
62 -TATTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTG
* ** ** *
85489 AAGTAAGAC-TGTATCG-ATAGAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAATGGTCATAAAG
125 AA-TAAG-CTTGTAT-GAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * * ** * * *
85546 ATTTGAAATAAATAATT-TTTAAATTGTTATAA-TAAGTGAA-TTGGTTTGGTAAATAGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTA-
* *
85608 TTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC-CAATC
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAAT-
* * * * * * ** * **
85668 AAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTGACAAGAAAACAAAAAGTCATAACA
128 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * * *
85721 ATTTGAAATTA-ATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGT-GAGACAA-ATGAATT
1 ATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATA-AACA-G-ATT
* * * * * ** * * *
85782 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTGGACTAGTATTATTTTATTTTGA
62 TA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGA
* * * * * * * *
85847 ATAAGCTTGTGTGAACATAAATAGTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATA
126 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * * * *
85902 ATTTGAAATATATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTT-AGACTAGTTTGATAAGCATATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCGATAAACAGATTTA-
** * *
85966 TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATA
* * * * **
86031 GGCTTATATG-ATGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTTATAACA
129 AGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAG-TCATAATG
* * * **
86083 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAATTGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTA-
** * * ** * *
86147 TTTTTAAATCTTCAACTTCTCAATTTTTGGAAT-TTCAATAAAATAATATTATTTTATT-TTAGA
64 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATT-AATAAATTAATATTATTTTATTCTGA-A
* * * * * *
86210 TTAGATTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAAGTTATAATG
127 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * *
86264 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCGTAACTAGTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-T
* ** * * *
86329 TTTTAAAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCGAA
65 TTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-GAA
*** * * * * *
86392 TAAGCACCTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACT-AAACAGAAGGTCAGAATG
127 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAAGTCATAATG
* ** * * *
86446 ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGGGT-AACATG-TTTA
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACA-GATTTA
* * * * * * * * *
86509 TTTTTAAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAGAATATT-ATTAGTTTATCAATATTTTACTCTAAA
64 TTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAAT-ATTATTTTATTCTGAA
* * * **
86573 TAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAA-TCATAACA
127 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
* * * *
86626 ATTT-AAGATAGAT-ATATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTGT-GGTAAATAGATTT
1 ATTTGAA-ATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCGATAAACAGATTT
* * *
86688 AGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
63 A-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAA
** * * * *
86749 TAATTTTGTATGAATA-AAAGCAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTAATAATG
127 TAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
*
86803 ATTTGAAATAGATAATAGTTCAAAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
86828 GGATTTAAAA
Statistics
Matches: 1747, Mismatches: 335, Indels: 192
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
172 7 0.00
173 130 0.07
174 8 0.00
175 96 0.05
176 84 0.05
177 108 0.06
178 16 0.01
179 30 0.02
180 280 0.16
181 790 0.45
182 186 0.11
183 12 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAG
CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATG
Found at i:85966 original size:891 final size:893
Alignment explanation
Indices: 84548--86827 Score: 2191
Period size: 891 Copynumber: 2.5 Consensus size: 893
84538 TTTTAAATCT
* * * * * ***
84548 CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAAATAGCATTACTTTATTTCGAATAAGCACCTATGAATA
** * * * ** * * *
84612 GAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAA
65 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAGAAGGTCAGAAAGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAG
* ** * * ** * ** *
84677 TCATAACTATTTGAACGT-GTCTAGAAAACATATTTAGTTTTTATATTTTTACTTATTAATTTTT
130 TTATAACTAAGTGAAC-TAGTTTGGGTAACATGTTTA-TTTTTA-AAATCT-CTTATTAATTTTT
* * *
84741 GGAATGTTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTT
191 AGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTT
* * * * *
84806 ATGATG-AAACAAAAGGTCATGACGAA-TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTT
256 A-CAAGAAAACAAAAAGTCATAAC-AATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * *
84869 GAACTTGTTCGGTAAACAT-ATTTATTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT
319 GAA-TTGGT-GG-AAA-ATAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * * * * * *
84933 AAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGCATGACCAAAAACAATTGTTTCATGATAGAACA
379 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGATAAAACA
* * *
84998 AAAAGTCATAATGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATCATCATAACTCTTTGAACTTATTCGAT
443 AAAAGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATCATCATAACTATTTGAACTTATTCGAT
* ** *
85063 AAGTAGATTTATTTTGTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTGAATTAT
508 AAGCAGATTTATTTTGTAAATCTCCTACTTATTAATT-TCTGAAATATTAATAAATTAGAATTAT
*
85127 TTTAAT-TGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-GT-T-A
572 TTTAATCTG-AATAAGCTTATATG-ATGAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTGTATAA
* * *
85187 -TGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTCAGGT
635 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAAC-TGATTCGATAAACAGATTCAGGT
** * * *
85250 TTTAAAT-TTGTTACTTATTAATTTTT-GACATATT-AATAAATTAGA-ATTGTGTTATTCTGA-
699 TTTAAATCTT-CAACTTATCAATTTTTGGA-AT-TTCAATAAAATA-ATATTATGTTATT-TGAG
* * *
85310 ATTAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTGTGATAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATA
759 ATTAGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
85374 TATAATTGTTCAAGCT-GTTATAACTATTTGTAC-TGGTCAA-ACCAACAGATTCATTTTTTTAA
824 GATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTAGTTGAACTTGGTCAATA--AACAGATTCATTTTTTAAA
*
85436 ATTTGTTA
886 ATTTCTTA
* * *
85444 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTA-TTCTAAGTAAG-ACTGTATCG-A
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGCATTACTTTATTTCGAA-TAAGCAC-CTAT-GAA
* *
85506 TAGAAACAATTATTTTATGGCAAAACA-AATGGTCATAAAGATTTGAAATAAATAATT-TT-TAA
63 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAGAA-GGTCAGAAAGATTTGAAATAAATAATTGTTCT-A
* * * *
85568 ATTGTTATAA-TAAGTGAATTGGTTT-GGTAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTT
126 ATAGTTATAACTAAGTGAACTAGTTTGGGTAACAT-G-TTTATTTTTAAAATCTCTTATTAATTT
* * * * * * * *
85630 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC-CAATCAAACTTATATGAACAAAAACATTTGT
189 TTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAAT-AAGCTTATATGAACAGAAACAATTAT
* *
85694 TTGACAAGAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATTA-ATAATTATTCATATAGTCT-TAACTA
253 TTTACAAGAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGT-TATAACTA
*
85757 TTTGAATTGGTGAGACAAATGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTA
316 TTTGAATTGGTG-GA-AAAT-AATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTCAAAATATTA
* ** * * * * *
85822 TTGGACTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTGTGAACATAAATAGTTGTTTTATGATAAAA
377 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGATAAAA
* * * * *
85887 CAAAAGGTTATAATAATTTGAAATATATAATTGTTCAGAT-AGTCATAACTATTT-AGAC-TAGT
441 CAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATCA-TCATAACTATTTGA-ACTTA-T
* * * * *
85949 TTGATAAGCATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
503 TCGATAAGCAGATTTATTTTGTAAATCTCCTACTTATTAATTTCTGAAATATTAATAAATTAGAA
* * * * *
86014 TTATTTTATTCTGAATAGGCTTATATGATGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTAT
568 TTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGATGAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTGTAT
* * **
86079 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAATTGATT
633 ---AA-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATT
* ** * * *
86144 TATTTTTTAAATCTTCAACTTCTCAATTTTTGGAATTTCAATAAAATAATATTATTTTATTTTAG
694 CAGGTTTTAAATCTTCAACTTATCAATTTTTGGAATTTCAATAAAATAATATTATGTTATTTGAG
* * * * * *
86209 ATTAGATTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAAGTTATAATGATTTTAAATA
759 ATTAGATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * *
86274 GATAATTGTTCAAATAGTCGTAACTAGTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAAATT
824 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAGTTGAACTTGGTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAAATT
*
86339 TCTTG
889 TCTTA
* * * * *
86344 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCACCTATGAATTG
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGCATTACTTTATTTCGAATAAGCACCTATGAATAG
* * *
86409 AAACAATTATTTTATGACTAAACAGAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
66 AAACAATTATTTTATGACAAAACAGAAGGTCAGAAAGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGT
* **
86474 TTTAACTATTTGAACTAGTTTGGGTAACATGTTTATTTTTAAAATCTCTTATTTATTAATTTTTA
131 TATAACTAAGTGAACTAGTTTGGGTAACATGTTTATTTTTAAAATCTC----TTATTAATTTTTA
* * * * * *
86539 GAATATT-ATTAGTTTATCAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTT
192 GAATATTAATAAATTTAT-ATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTT
** * *
86603 ATGACAAAACAAAAA-TCATAACAATTT-AAGATAGAT-ATATGTTCAAATAGTTATAACTATTT
256 ACAAGAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAA-ATAGATAAT-TATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * *
86665 GAACTAGTGTGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTC---TTATTAATTTTAAAAATATTAATAA
319 GAA-TTG-GTGGAAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
** * * *
86727 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAAAAGCAATTGTTTTACGACAAAACAAA
381 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTTTATGATAAAACAAA
* * *
86792 ATGTAATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAAT
445 AAGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
86828 GGATTTAAAA
Statistics
Matches: 1127, Mismatches: 191, Indels: 127
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
889 4 0.00
890 24 0.02
891 345 0.31
892 11 0.01
893 10 0.01
894 13 0.01
895 16 0.01
896 92 0.08
897 3 0.00
898 7 0.01
899 125 0.11
900 167 0.15
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904 10 0.01
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906 66 0.06
907 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (893 bp):
CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGCATTACTTTATTTCGAATAAGCACCTATGAATAG
AAACAATTATTTTATGACAAAACAGAAGGTCAGAAAGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGT
TATAACTAAGTGAACTAGTTTGGGTAACATGTTTATTTTTAAAATCTCTTATTAATTTTTAGAAT
ATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATTATTTTACAAG
AAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGG
TGGAAAATAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTAATAATG
ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATCATCATAACTATTTGAACTTATTCGATAAGCAGATTTATT
TTGTAAATCTCCTACTTATTAATTTCTGAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTAATCTGAATAA
GCTTATATGATGAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTGTATAATTGAAATAGATAATTG
TTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATTCAGGTTTTAAATCTTCAACTTA
TCAATTTTTGGAATTTCAATAAAATAATATTATGTTATTTGAGATTAGATTGTATGAATAGAAAC
AATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTAGTTGAACTTGGTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAAATTTCTTA
Found at i:86838 original size:27 final size:27
Alignment explanation
Indices: 86802--86866 Score: 112
Period size: 27 Copynumber: 2.4 Consensus size: 27
86792 ATGTAATAAT
86802 GATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATG
1 GATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATG
* *
86829 GATTTAAAATAGATAATAGTTCGAATG
1 GATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATG
86856 GATTTGAAATA
1 GATTTGAAATA
86867 ATCTTATATG
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 3, Indels: 0
0.92 0.08 0.00
Matches are distributed among these distances:
27 35 1.00
ACGTcount: A:0.45, C:0.03, G:0.18, T:0.34
Consensus pattern (27 bp):
GATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATG
Found at i:87465 original size:653 final size:654
Alignment explanation
Indices: 86218--87480 Score: 1404
Period size: 653 Copynumber: 1.9 Consensus size: 654
86208 GATTAGATTT
* * ** * * *
86218 TATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAAGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGT
* * ** * *
86283 TCAAATAGTCGTAACTAGTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTA
66 TCAAATAGTCATAACTAGTTAAACTTGCACAATAAACAGATTTATTTTCTAAAATCTCTTGCTTA
* *
86348 TTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCACCTATGAATTGAAAC
131 TTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCACCTACGAATAGAAAC
* * * * *
86413 AATTATTTTATGACTAAACAGAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTA
196 AATTAGTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATAGTATTA
* ** * * *
86478 ACTATTTGAACTAGTTTGGGTAACATGTTTATTTTTAAAATCTCTTATTTATTAATTTTTAGAAT
261 ACTATTTGAACTAGTTTAGAAAACATATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGTTAGAAT
* * *
86543 ATTATTAGTTTATCAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGAC
326 ATTATTAATTGA-CAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAC
* *
86608 AAAACAAAAATCATAACAATTTAAGATAGATATATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAGT
390 AAAACAAAAATCATAACAATTTAAGATAGATATATGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGT
* * * * *
86673 GTGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
455 GTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAAAAATATCAAAAAATTAATATTAT
* * *** * *
86738 TTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAAAAGCAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTAATAATG
520 TTTATCTTCAATAAGCATATATGAATAAAAGCAATTGTTTTACGACAAAACAAAAAGTAATAATG
86803 ATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGATTTAAAATAGATAATAGTTCGAATGGATTTGAAATA
585 ATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATGGATTTAAAATAGATAATAGTTCGAATGGATTTGAAATA
86867 ATCTTA
649 ATCTTA
* *
86873 TATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAGTAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGT
* * * *
86938 TTAAATAGTCATAACTATTTAAAC-T-CACATAGTAAACATATTTGTTTTCT-AAATCT-TTGAC
66 TCAAATAGTCATAACTAGTTAAACTTGCACA-A-TAAACAGATTTATTTTCTAAAATCTCTTG-C
* * *** *
86999 TTATTAA-TTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTTTACGCATA
128 TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCACCTACGAATA
* * *
87062 GAAATAATTGGTTTATGAC-AATACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATA
191 GAAACAATTAGTTTATGACTAA-ACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATA
* * *
87126 GTCATT-ACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT
255 GT-ATTAACTATTTGAACT-AGTTTAGAAAACATATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATT
* * *
87188 GTTAGAATATTCA-TACATTGA-AATTATTTTA-TTTGAAATAAGTTTGTGTGAAAAG-AACAAA
318 GTTAGAATATT-ATTA-ATTGACAA-TATTTTACTCT-AAATAAGCTTGTATGAAAAGAAAC-AA
* ** *** * *
87249 TTGTTTTATGACAAAACATAAGGTC-TAATGCTTTGAA-ATAGATA-ATTGTTTAGATAATCCA-
378 TTATTTTATGACAAAACA-AAAATCATAACAATTT-AAGATAGATATA-TGTTCAAATAAT-CAT
* * * * *
87310 AACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAACAAATTCT-TTTTTTAATTGC-CTTATTAATTTTCATAAT
439 AACTATTTGAAC-TAGTGTGGTAAACAAATT-TAGTTTTTAAAT-CTCTTATTAATTTTAAAAAT
* **
87372 ATCAAAAAATTAATATTATTTTA-CTTCAACTAAGCATATATGAACT-GAAGCAATTGTTTTATT
501 ATCAAAAAATTAATATTATTTTATCTTCAA-TAAGCATATATGAA-TAAAAGCAATTGTTTTACG
* *
87435 ACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
564 ACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
87481 AGTCATGACT
Statistics
Matches: 503, Mismatches: 82, Indels: 48
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
652 12 0.02
653 239 0.48
654 159 0.32
655 93 0.18
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (654 bp):
TATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTAGTTAAACTTGCACAATAAACAGATTTATTTTCTAAAATCTCTTGCTTA
TTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCACCTACGAATAGAAAC
AATTAGTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATAGTATTA
ACTATTTGAACTAGTTTAGAAAACATATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGTTAGAAT
ATTATTAATTGACAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATGACA
AAACAAAAATCATAACAATTTAAGATAGATATATGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTAGTG
TGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAAAAATATCAAAAAATTAATATTATT
TTATCTTCAATAAGCATATATGAATAAAAGCAATTGTTTTACGACAAAACAAAAAGTAATAATGA
TTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGATTTAAAATAGATAATAGTTCGAATGGATTTGAAATAAT
CTTA
Found at i:87515 original size:356 final size:360
Alignment explanation
Indices: 86862--88238 Score: 906
Period size: 356 Copynumber: 3.9 Consensus size: 360
86852 AATGGATTTG
* * * * * * **
86862 AAATAATCTTATATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTAT-AGCGATTTGAA
1 AAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAG-TTTGAA
* * * * * * * * * * * *
86926 GTAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACAT-AGTAAACATATTTGTTTTCTAA
65 ATAAATAATTATTCAAATAATCATAACAATTTGAACTTA-TTCGGTAAACAAATTTATTTT-TTA
* * * * * * * * * ** * *
86990 ATCTTTGACTTATTAATTTTTGA-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTT
128 ATATTAGACTTATGAA-TTGTCATAATATCAAAAAATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGCATA
* * * * * * * *
87054 TACGCATAGAAATAATTGGTTTATGACAATACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
192 TATGAATAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * *
87119 TCGAATAGTCATTACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTAT
257 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTAT
* * * * * **
87183 TAATTGTTAGAATATTCATACATTGAA-ATTATTTTATTTG
321 TAATTGTCAAAATATTAATAAATT-AATATTATTTTAATCC
** * * * *
87223 AAATAAGTTTGTGTGAAA-AG-AACAAATTGTTTTATGACAAAACATAAGGTC-TAAT-GCTTTG
1 AAATAAACTTGTAT-AAATAGAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAG-TTTG
* * * * * *
87284 AAATAGATAATTGTTTAGATAATCCA-AACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTCT-TTTTT
63 AAATAAATAATTATTCAAATAAT-CATAACAATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATT-TATTTTT
* * * *
87347 T-A-ATT-GCCTTATTAATTTTCATAATATCAAAAAATTAATATTATTTTACTTC-AACTAAGCA
126 TAATATTAGACTTATGAATTGTCATAATATCAAAAAATTAATATTATTTTA-TTCAAAATAAGCA
** * * *
87408 TATATGAACT-GAAGCAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
190 TATATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
*
87472 TATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTT
254 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTT
*
87537 ATTAATTGTCAAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
319 ATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
*
87579 AGATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAGTTTGAAA
1 AAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAGTTTGAAA
* * *
87644 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTGAAT
66 TAAATAATTATTCAAATAATCATAACAATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAT
* * * * ** * *
87709 ATTATACTTATGAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT
130 ATTAGACTTATGAATTGTCATAATATCAAAAAATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGCATATAT
* * * * *
87774 GAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGTGA-TTCAAATAGATGATTATTCA
195 GAATAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * * * * *
87838 AACAGTTATAATTATTTAAACTTATTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATC----CCT-TT-A-
260 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAAT
* * **
87896 --T-----TATTAATAAATTATTATTATTTTATTTT
325 TGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* * * * * * * * * *
87925 GAATTAGCTTATATGAACT-GAAATAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
1 AAATAAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAGTTTGAA
* * * * ** * * *
87989 ATAGATAATTATTCAAGTAGTCATGATTATTTGATC-TAGTTTGGTAAACATAA-TTATTTTAAA
65 ATAAATAATTATTCAAATAATCATAACAATTTGAACTTA-TTCGGTAAACA-AATTTATTTT--T
* * ** * * * * * * * *
88052 AAATTTTTTAATTATTAATTGTC-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCT
126 TAATATTAGACTTATGAATTGTCAT-AATATCAAAAAATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGCA
* * * * * ** * *
88116 TGTATGAATCA-AAACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAAT-ATAATGATTTAAAATACATAAT
190 TATATGAAT-AGAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * *
88179 TGCTT-AAATACTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GATAAATAGATTTTATTTTTTAAATCT
254 T-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACATA-TTTATTTTTTAAATCT
88239 CCTATTAAAT
Statistics
Matches: 822, Mismatches: 159, Indels: 82
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
345 1 0.00
346 127 0.15
347 130 0.16
348 17 0.02
351 1 0.00
354 1 0.00
355 12 0.01
356 218 0.27
357 68 0.08
358 2 0.00
359 3 0.00
360 121 0.15
361 119 0.14
362 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
AAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAGTTTGAAA
TAAATAATTATTCAAATAATCATAACAATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAATA
TTAGACTTATGAATTGTCATAATATCAAAAAATTAATATTATTTTATTCAAAATAAGCATATATG
AATAGAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATT
GTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
Found at i:87643 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 86862--88602 Score: 1032
Period size: 180 Copynumber: 9.8 Consensus size: 180
86852 AATGGATTTG
* * * * * ** *
86862 AAATAATCTTATATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAG
1 AAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
* * * * **** * *
86927 TAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCACATAGTAAACATATTTGTTTTCTAAAT
66 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* ** * * * *
86992 CTTTGACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
131 CTTT-ACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* * *** * * * * *
87043 GAATAAGCTTTTACGCATAGAAATAATTGGTTTATGACAATACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
1 AAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
* * * *
87108 TAGATAATTGTTCGAATAGTCATTACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAA
66 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* * * * * * **
87172 TTTTTACTTATTAATTGTTAGAATATTCATACATTGAA-ATTATTTTATTTG
130 TCTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT-AATATTATTTTAATCC
* * * * *
87223 AAATAAGTTTGTGTGAAA-AG-AACAAATTGTTTTATGACAAAACATAAGGTC-TAATGCTTTGA
1 AAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGA
* * * * * * *
87285 AATAGATAATTGTTTAGATAATCCA-AACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTCT-TTTTTT
64 AATAGATAATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATT-TATTTTTT
** * * * * * *
87348 -AA--TTGCCTTATTAATTTTCATAATATCAAAAAATTAATATTATTTTACTTC
127 AAATCTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* * * * * * *
87399 AACTAAGCATATATGAACT-GAAGCAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAA
1 AAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
*
87463 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAA
65 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAA
*
87528 TCTTTACTTATTAATTGTCAAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
130 TCTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* * *
87579 AGATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAT-AGTTTGAA
1 AAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGA-TTTGAA
* * ** * *
87643 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTGAA
65 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAA
* * ** ** * *
87708 TATTATACTTATGAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCA
130 TCTT-TACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* * * * * * * *
87760 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGTGA-TTCAAA
1 AAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * * * *
87824 TAGATGATTATTCAAACAGTTATAATTATTTAAACTTATTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAAT
66 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
* * * **
87889 C----CCT-TT-A---T-----TATTAATAAATTATTATTATTTTATTTT
131 CTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* * * * * * * **
87925 GAATTAGCTTATATGAACT-GAAATAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
1 AAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
* * * * * * * **
87989 ATAGATAATTATTCAAGTAGTCATGATTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATAATTATTTTAAAAA
65 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTT-TTAA
* * * * *
88054 ATTTTTTAATTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT
129 A-TCTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* ** * * * *
88107 AAATAAGCTTGTATGAATCA-AAACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAAT-ATAATGATTTAAA
1 AAATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
88170 ATACATAATTGCTT-AAATACTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GATAAATAGATTTTATTTTTT
65 ATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACATA-TTTATTTTTT
* ** ** * ** * **
88233 AAATC--T-CCTATTAAATT-TTGAAATATT-ATCTTATTAGTATTACCTTATTTT
127 AAATCTTTACTTATT-AATTGTCAAAATATTAAT-AAATTAATATTATTTTAATCC
* * * ** * * * * * *
88284 GAACAAACTTAAATGAACA-AAACCATATGTTTAATGACAAAATAAAAAGTCATAACGATTTGAA
1 AAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
* * * *
88348 ATAGAT-A--ATT---ATA---AT---TATTTGAA-TTGGTCAGGTAAACAGAATTATTTTTTAA
65 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-GTAAACATATTTATTTTTTAA
* ** * * *
88400 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCC
129 ATCT-TTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
* * * * * * *
88453 AAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAAAACAACTTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATT
1 AAATAAGCTTGTAT-AA---ATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATT
* ** * * * * * *
88518 TTAAATAGATAATTGCTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAGTTT-GCAAACAAAATTTA-TTT
61 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAAC-ATATTTATTTT
* *
88581 TTAATTCTCTTAGTTATTAATT
125 TTAAATCT-TTACTTATTAATT
88603 TCCCTAATAT
Statistics
Matches: 1203, Mismatches: 282, Indels: 146
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
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168 6 0.00
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172 4 0.00
173 5 0.00
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186 13 0.01
187 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAT
CTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
Found at i:87885 original size:537 final size:525
Alignment explanation
Indices: 86871--88236 Score: 1347
Period size: 537 Copynumber: 2.6 Consensus size: 525
86861 GAAATAATCT
* * * * *
86871 TATATGAA-TAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAGTAAATAAT
1 TATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * ** * *
86935 TGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTCA-CATAGTAAACATATTTGTTTTCTAAATCTTTGAC
65 TATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACT-AGTTTAGTAAACATATTTATTTTATAAATCTTT-AC
* ** * * * * * *
86999 TTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTTTTACGCATAG
128 TTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAG-ATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * *
87063 AAATAATTGGTTTATGACAATACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATAGT
192 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* * * * * *
87128 CATTACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTGTTA
257 CATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTATACTTATGAATTGTTA
* * ** * * * *
87192 GAATATTCATACATTGAAATTATTTTATTTGAAATAAGTTTGTGTGAAAAGAACAAATTGTTTTA
321 GAATATTAATAAATTGAAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAAAAATTATTTTA
* * * * * * * * *
87257 TGACAAAACATAAGGTCTAATGCTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAATCCAAACTATTTGAAC
386 TAACAAAACAAAAGGTCTAATGCATTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCCAAACTATTTAAAC
** * * *
87322 TTATTTGGTAAACAAATTCTTTTTTTAATTGCCTTATTAATTTTCATAATATCAAAAAATTAATA
451 TTATTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAAT-CCCT-TT-A---T--T-AT-T-AAAAAATTAATA
87387 TTATTTTA-CTTCAACTAAGCA
505 TTATTTTATCTTCAA-TAAGCA
* * * *
87408 TATATGAACTGAAGCAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
1 TATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* *
87473 ATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTACTTA
66 ATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTATAAATCTTTACTTA
* * * *
87538 TTAATTGTCAAAATGTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAGATAAACTTGTATAAATAGAAAC
131 TTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAGATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
*
87603 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAT-AGTTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
196 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * *
87667 AACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTGAATATTATACTTATGAATTGTCT-TA
260 AACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTATACTTATGAATTGT-TAGA
* *
87731 ATATTAATAAATTTG-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTAT
323 ATATTAATAAA-TTGAAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAAAAATTATTTTAT
* * * *
87795 AACAAAACAAAAGGT-TATAGTG-ATTCAAATAGATGATTATTCAAACAGT-TATAATTATTTAA
387 AACAAAACAAAAGGTCTA-A-TGCATTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCCA-AACTATTTAA
* * * *
87857 ACTTATTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCCCTTTATTATTAATAAATTATTATTATTTTAT
449 ACTTATTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCCCTTTATTATTAAAAAATTAATATTATTTTAT
* * * *
87922 TTTGAATTAGCT
514 CTTCAATAAGCA
* * * *
87934 TATATGAACTGAAATAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
1 TATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
87999 ATTCAAGTAGTCATGATTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATAATTATTTTAAAAAATTTTTTAAT
66 ATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTT-ATAAA-TCTTTACT
* * *
88064 TATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAATCA-A
129 TATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAGATAAGCTTGTATGAAT-AGA
** * * * * * * *
88128 AACAATTGTTTTAAAATAGAACAAAAAAT-ATAATGATTTAAAATACATAATTGCTT-AAATACT
193 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAGT
* * *
88191 CATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTTATTTTTTAAAT
257 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAAT
88237 CTCCTATTAA
Statistics
Matches: 685, Mismatches: 126, Indels: 45
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
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529 2 0.00
531 1 0.00
534 1 0.00
535 3 0.00
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538 7 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (525 bp):
TATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
ATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTATAAATCTTTACTTA
TTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAGATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTATACTTATGAATTGTTAGAATA
TTAATAAATTGAAATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAAAAATTATTTTATAACA
AAACAAAAGGTCTAATGCATTCAAATAGATAATTATTCAAACAATCCAAACTATTTAAACTTATT
CAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCCCTTTATTATTAAAAAATTAATATTATTTTATCTTCAAT
AAGCA
Found at i:89174 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 88715--91188 Score: 1395
Period size: 180 Copynumber: 13.8 Consensus size: 180
88705 ATTGGTTCAA
* * * *
88715 TAAACAAATATATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAA-CTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * *
88780 TTTATTTTGAATAAACTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAAC
65 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * *
88844 GATTTAAAATAGATAATTATTGAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTTGG
129 GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* * ** * * * * *
88896 TAAATAGA-TTAACTTTTTAAATC--ACTTATTAATTTTTTTAAATATTAATAAGTTGGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAACTCTTACTTA-TAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *
88958 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
65 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * *
89023 ATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGCCATGATTATTTGAATTTG-TTTGG
130 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAA-CTGATTTGG
* * ***
89074 TAAGCAAATTTATTTTTTTAACTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAACGTTATT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAACTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * * *
89139 TTATTTTGGATAAGCTCT-TGTGAACCGAAACAATTGTTTTACGTCAAAACAAAAGGTCATAATG
66 TTATTTTGAATAAGCT-TGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * ** ***
89203 ATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAAGAATTTGAACTTG-TTCAA
130 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAAC-TGATTTGG
** ** * * * * * *
89254 TAAA-TGATTTAATTTTTCAAAATTTTTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTTAG-ATT
1 TAAACAAATTT-ATTTTT-TTAACTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * * * ** * * * *
89317 ATTTTATTCTAAATAAACTTGTAAGATA-TGAAACAAATATTTTATGACAAAATAAAAGGTCAGA
63 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* ** * * *** *
89381 ATGATTGAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTT-TTTGAACT-AGTTTGA
127 ACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAA-TTATTTGAACTGA-TTTGG
* * * *
89435 CAAA-TAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAAATTAGTATTA
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAA-CTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTA
** * * * * * *
89498 TTTT-TAACTGAATAAGCTTCTAT-AATCATAAATAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCTTA
64 TTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
89560 AC-AATTTAAGATTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTGG
127 ACGATTTTAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* * *
89613 TAAACAGATTTATTTTTTATATCTCTTACTTA-ATAATTTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAAATTTATTTTTT-TAACTCTTACTTATA-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
89677 TTTTATTTCT-AAAAAGCTTGTATGATAAAAAAATAATTGTTTTATGAC--AACAAAAGGTCATA
64 TTTTATTT-TGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** ** * * * * *
89739 ACGATTTGAAATACATAATCCTTTGAATGGCTATAATTATTTTAACTGATTCGA
127 ACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* ** * * * * ** *
89793 TAAACATATTTATTTTTAAAATTTTCTAATTATTAATTTAGGAAACATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAACTCT-TACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * *
89858 TTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAGCTAAAAA-AATTGTTTTATGACAAATC-AAAGGTTATAA
65 TTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** * * *
89920 CGATTTTAAATAGACAATTGTTTACATAGTAAAAACTATTTGAATTTG-TTTGG
128 CGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAA-CTGATTTGG
* * *
89973 TAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTT--TT-T--CTTATTTG-----TTAATAAATTAGTATTAA
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAACTCTTACTTATAAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * * * * **
90028 TTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTGCTTTATAACTAAATAAAAAGTCAGAATA
65 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * ** * *** * * *
90093 ATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTTAGCCATTTGAACTAATTCGA
130 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* * * * *
90144 TAAACAAATTT-CTTTTTTAACTATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTGTTA
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAAC--TCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * ** * *
90208 TTTTAATCAT-AAAAAGCTTATACAAAC-AAAACAATT-CTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAA
64 TTTT-ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * *** *
90270 CAATTTGAAATAGATAATCGTTTATATAGTCTTAGCCATTTGAACTG-GTTGG
128 CGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* **** * ** * * * * *
90322 CAATTGGATTTA-TTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT-AGAATGTTATTGAATTAG-ATT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAA--CTCTTACTTATAAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTA-T
** ** * * * * * * * *
90384 TATTTTATTTCAAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAATGTTATA
62 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * *
90449 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAAT-AGTTTAG
127 ACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGA-TTTGG
* * * * *
90503 TAACCAAATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAA-CTCTTACTTATAAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * *
90567 TTTTATTTAGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTCTTATGACAAAACAAAAAGTAATAAA
64 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
** ** * * * *
90632 GATTTGGAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAGTTATTTAAATTGGTTTGG
129 GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* * * * *
90684 TAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTTAATTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TTAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAA-CTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
90748 TCTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAGCTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAC
65 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * * * * * *
90812 AATTTAAAATAAATAATTTTTTATATAGTCTTAACTGTTTGAATTGCTTTGG
129 GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* * * * * * * * ** * *
90864 CAAACGAATTTGTATTTTAAATCTCCTAATTATTAATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATAAT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAA-CTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * **
90929 TTTATTCTGAGTAAGCTTGGATGAGCAGAAACAATTGTTTTATGACATAACAAAAGATTATAATA
65 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
** * * * * *
90994 ATTCAAAACAGATAATTGCTT-AAATAGTCATAACTATGT-AACTGGTTTGG
130 ATTTTAAATAGATAATTG-TTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
* * * * * *
91044 TAAACAAATTTA-ATTTTTAAATC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATT-AGAAATTAGCATTATT
1 TAAACAAATTTATTTTTTTAACTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * *** * ** *
91105 TTATTTCAAATAAGCTTATATGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGAAATAATGA
66 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* *
91170 TTTGAAATAGATAGTTGTT
131 TTTTAAATAGATAATTGTT
91189 AACTTTGTAT
Statistics
Matches: 1752, Mismatches: 460, Indels: 169
0.74 0.19 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.00
170 57 0.03
171 55 0.03
172 4 0.00
174 6 0.00
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182 20 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TAAACAAATTTATTTTTTTAACTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTGATTTGG
Found at i:89501 original size:361 final size:358
Alignment explanation
Indices: 88717--90984 Score: 866
Period size: 361 Copynumber: 6.3 Consensus size: 358
88707 TGGTTCAATA
* * *
88717 AACAAATATATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTT
* *
88782 TATTTTGAATAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACGAT
66 TATTTTGAATAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATACGACAAAACAAAAGGTAATAACGAT
* * * * ** ***
88847 TTAAAATAGATAATTATTGAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTAACTTT
131 TTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAAGAATTTGAACTGATTCAATAAATAGATTAACTTT
* * * * *
88912 TTAAATCACTTATTAATTTTTTTAAATATTAATAAGTTGGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
196 TTAAATCACTTATTAATTTTTTCAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTG
* * * ** *
88977 TATAAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGACAATTGT
261 TATAAACTAAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAATTGAAAATAGACAATTAT
* * * **
89042 TCAAATAGCCATGATTATTTGAATTTGTTTGGT
326 TCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAGTTTGAC
* * ***
89075 AAGCAAATTTATTTTTTTAA-CTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAACGTTATT
1 AA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATT
* * * ** * * * *
89139 TTATTTTGGATAAGCTCT-TGTGA-ACCGAAACAATTGTTTTACGTCAAAACAAAAGGTCATAAT
65 TTATTTTGAATAAACT-TGTATGATA-AAAAACAATTGTTATACGACAAAACAAAAGGTAATAAC
* *
89202 GATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAAAAGAATTTGAACTTG-TTCAATAAAT-GATTTA
128 GATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAAGAATTTGAAC-TGATTCAATAAATAGA-TTA
** * *
89265 A-TTTTTCAAAATTTTTGCTTATTAA-TTTTTCAAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCT
191 ACTTTTT--AAA---TCACTTATTAATTTTTTCAAATATTAAT-AAGTTAGTATTATTTTATTCT
* * **
89327 AAATAAACTTGTA-AGATA-TGAAACAAATATTTTATGACAAAATAAAAGGTCAGAATGATTGAA
250 AAATAAACTTGTATA-A-ACTAAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAATTGAA
* * ***
89390 AATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTT-TTTGAACTAGTTTGAC
313 AATAGACAATTATTCAAATAGCCATAA-TTATTTGAACTAGTTTGAC
89436 AA-ATAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATA-AAATTAGTATTAT
1 AACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-AGAAATTAGTATTAT
** * * * * * * * * * * **
89499 TTT-TAACTGAATAAGCTTCTATAATCATAAATAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCTTAAC
64 TTTAT-TTTGAATAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATACGACAAAACAAAAGGTAATAAC
* * ** * ** * ** * * *
89562 AATTTAAGATTGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-GGTAAACAGATTTAT
128 GATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAAGAATTTGAACTGATTCAATAAATAGATTAAC
* * * * *
89626 TTTTTATATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAAA-
193 TTTTTAAATCACTTA-TTAAT--TTTTTCAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTA-TTCTAAAT
* * * * * * *
89690 AAGCTTGTATGATAA-AAAAATAATTGTTTTATGAC--AACAAAAGGTCATAACGATTTG-AAAT
254 AAACTTGTAT-A-AACTAAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAAC-AATTGAAAAT
* * ** ** * * * * *
89751 ACATAATCCTTTGAATGGCTATAATTATTTTAACT-GATTCGATA
316 AGACAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAG-TTTGA-C
* * * * ** * *
89795 AACATATTTATTTTTAAAAT-TTTCTAATTATTAATTTAGGAAACATTAATAAATTAGTATTATT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATT
** * * * * * * *
89859 TTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAGCT-AAAAA-AATTGTTTTATGACAAATC-AAAGGTTATAA
65 TTATTTTGA-ATAAACTTGTA-T-GATAAAAAACAATTGTTATACGACAAAACAAAAGGTAATAA
* * * * * * * ** * *** * *
89920 CGATTTTAAATAGACAATTGTTTACATAGTAAAAACTATTTGAATTTG-TTTGGTAAACAAATTT
127 CGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAAGAATTTGAA-CTGATTCAATAAATAGA-TT
** * * * * *
89984 ATTTTTTTAAAT--CTT-TT--TCTTATT----TGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAAT
190 AACTTTTTAAATCACTTATTAAT-TTTTTCAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * * ** * * * * * *
90040 AAGCTTGTATAAACTGAAACAATTGCTTTATAACTAAATAAAAAGTCAGAATAATTTAAAATAGA
254 AAACTTGTATAAACTAAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAATTGAAAATAGA
* * * ** * *** * * *
90105 TAATTGTTCTAATAATCTTAGCCATTTGAACTAATTCGATA
319 CAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAGTTTGA-C
* * * * ** *
90146 AACAAATTTCTTTTTTAACTATCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTGTTATTT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTT
** * * * * * *
90211 TAATCAT-AA-AAAGCTTATA-CA-AACAAAACAATTCTT-TATGACAAAAGAAAAGGTCATAAC
66 T-ATTTTGAATAAA-CTTGTATGATAA-AAAACAATTGTTATACGACAAAACAAAAGGTAATAAC
* * * ** * * ** * * *
90271 AATTTGAAATAGATAATCGTTTATATAGTC-TTAGCCATTTGAACTGGTTGGCAAT---TGGATT
128 GATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAAG-AATTTGAACTGATT--CAATAAATAGATT
* * * ** * * *
90332 TATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAA-GTTTT-AGAATGTTATTGAA-TTAG-ATTTATTTTATT
190 AACTTTTTAA--ATC--ACTTATTAATTTTTTCA-AATATTAAT-AAGTTAGTA-TTATTTTATT
* * * * * * * * * * *
90393 -TCAAATAAAATAGTATGAA-TAGAACCAAT-TGTTTGATGACAAAATAAAATGTTATAATGATT
248 CT-AAATAAACTTGTATAAACTAAAACAAATAT-TTT-ATGACAAAACAAAAGGTCAGAA-CAAT
* * * * * *
90455 TG-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATAGTTTAGTA-
309 TGAAAATAGACAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAGTTT-G-AC
* * * *
90505 ACCAAATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAAGAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
90569 TTATTTAGAACAAACTTATATTA-ACAAAAACAATTGTCT-TATGACAAAACAAAAAGTAATAAA
65 TTATTTTGAATAAACTTGTATGATA-AAAAACAATTGT-TATACGACAAAACAAAAGGTAATAAC
** * * * * * * * * *** *
90632 GATTTGGAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAGTTATTTAAATTGGTTTGGTAAATAAAATT-
128 GATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAAG-AATTTGAACTGATTCAATAAAT-AGATTA
* * * * * *
90695 A-TTTTCTAAATCTCTTAATTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-TTATTCTATT-TCG
191 ACTTTT-TAAATCACTT-A-T-TAATTTTTTCAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTCT-A
* * * * * * * *
90757 AATAAGCTTGTATAAGCTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAAT
251 AATAAACTTGTATAAACTAAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAATTGAAAAT
* * * * * * * * * * *
90822 AAATAATTTTTTATATAGTCTTAACTGTTTGAA-TTGCTTTGGC
316 AGACAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAG-TTTGAC
* * * * * ** ** *
90865 AAACGAATTTGTATTTTAAATCTCCTAATTATTAATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATAATT
1 -AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATT
* * * * ** * * * *
90930 TTATTCTGAGTAAGCTTGGATGAGCAGAAACAATTGTTTTATGACATAACAAAAG
65 TTATTTTGAATAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATACGACAAAACAAAAG
90985 ATTATAATAA
Statistics
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0.71 0.18 0.11
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (358 bp):
AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTT
TATTTTGAATAAACTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATACGACAAAACAAAAGGTAATAACGAT
TTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAAGAATTTGAACTGATTCAATAAATAGATTAACTTT
TTAAATCACTTATTAATTTTTTCAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTG
TATAAACTAAAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAACAATTGAAAATAGACAATTAT
TCAAATAGCCATAATTATTTGAACTAGTTTGAC
Found at i:91700 original size:179 final size:180
Alignment explanation
Indices: 91193--91977 Score: 701
Period size: 179 Copynumber: 4.4 Consensus size: 180
91183 GTTGTTAACT
* * ** * * * *
91193 TTGTATGAATAGAAACACTTATTTTATGCCAAAAC-AATGATCATACCAA-TTGAGATAGATAAT
1 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAAT
* * * *
91256 TGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTGATCCT-GTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TCT-CT
66 TGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACT
* * * **
91317 AATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAATT
130 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
* * * * * * *
91368 TTGTGTGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATAAT-ATAACGATTTGAAATGAATAA
1 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAAATAA
* * * * * * * * * * *
91432 TAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTG-CTCAATAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCCAA
65 TTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTA
* *
91496 CTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAC
128 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
* * *
91549 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGATCATAACAACTTGAGATAAATAAT
1 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAAT
*
91614 TGTTTAAATAGTCAT-A-TATTTGAATTCG-CTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTTAC
66 TGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TTTCTAC
* * * *
91676 TTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTGGTATTATTGTATTCTAAATAAGC
129 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
* * **
91728 TTTTTAT-AATAGAAACAATTAG-TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATA
1 -TTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATA
* * * * * * *
91791 ATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACGTGT-TCA-AAAGAAAGATTTATTTTTTAAATATT-
64 ATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTCTTAGTAA-ACAGATTTATTTTTTAAAT-TTC
* *** *
91853 TGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTAGGAATATGA-
126 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAATA-AAC
** * * *
91908 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAGGCCATAACAAATTAAAATAGATAA
1 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAA
91972 TTGTTT
65 TTGTTT
91978 GGTAAAAAAA
Statistics
Matches: 495, Mismatches: 88, Indels: 49
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
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182 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAAT
TGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTCTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTT
ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
Found at i:92290 original size:179 final size:177
Alignment explanation
Indices: 91972--92312 Score: 411
Period size: 179 Copynumber: 1.9 Consensus size: 177
91962 AAATAGATAA
* * *
91972 TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTA
1 TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTA
* ** * * * **
92037 TTATTTTATTTCAAATAAGCCTACATGAACTTATACAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTTCT
66 TTATTTTATCTCAAATAAGCCTACATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGACTCT
* *
92102 AATGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTTATTGCTATTTGAAC
131 AACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATTGCTATTTGAAC
* * *
92148 TTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT
1 TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATC----ACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT
* * ** *
92213 A-TATTATTTTAATCT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-
62 AGTATTATTTT-ATCTCAAATAAGCCTACATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
92275 ACTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
126 ACTC-TAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
92313 CATAAATATT
Statistics
Matches: 137, Mismatches: 21, Indels: 10
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
176 28 0.20
178 2 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTA
TTATTTTATCTCAAATAAGCCTACATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGACTCT
AACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATTGCTATTTGAAC
Found at i:92325 original size:180 final size:176
Alignment explanation
Indices: 91972--92329 Score: 407
Period size: 180 Copynumber: 2.0 Consensus size: 176
91962 AAATAGATAA
* * *
91972 TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTA
1 TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTA
* ** * * * **
92037 TTATTTTATTTCAAATAAGCCTACATGAACTTATACAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTTCT
66 TTATTTTATCTCAAATAAGCCTACATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGACTCT
* * * ***
92102 AATGATTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTGCTATTTGAAC
131 AACGATTTGAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAAC
* * *
92148 TTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT
1 TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATC----ACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT
* * ** *
92213 A-TATTATTTTAATCT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA-
62 AGTATTATTTT-ATCTCAAATAAGCCTACATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
92275 ACTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAAC
126 ACTC-TAACGATTTG-AATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAAC
92328 TT
1 TT
92330 ATTCAGTAAA
Statistics
Matches: 150, Mismatches: 25, Indels: 10
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
176 28 0.19
178 2 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (176 bp):
TTGTTTGGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTA
TTATTTTATCTCAAATAAGCCTACATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGACTCT
AACGATTTGAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAAC
Found at i:92379 original size:120 final size:120
Alignment explanation
Indices: 92229--92447 Score: 298
Period size: 120 Copynumber: 1.8 Consensus size: 120
92219 TTTTAATCTG
* *
92229 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAACTCATAACGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAACTCATAACAATTTGAAAT
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66 AAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTGA
* ** * *
92349 AATAAGCTT-TATGGATAGAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAA
1 AATAAGCTTGTAT-GA-ACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAACTCATAACAATTTGAA
* * * * *
92412 CTAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
64 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAAC
92448 GTGTTGAGAA
Statistics
Matches: 85, Mismatches: 12, Indels: 4
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
119 3 0.04
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ACGTcount: A:0.47, C:0.09, G:0.11, T:0.33
Consensus pattern (120 bp):
AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAACTCATAACAATTTGAAAT
AAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTGA
Found at i:92590 original size:299 final size:298
Alignment explanation
Indices: 92073--93249 Score: 1102
Period size: 299 Copynumber: 3.8 Consensus size: 298
92063 GAACTTATAC
* * * ** **
92073 AATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTTCTAATGATTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTG
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAA
*
92138 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
66 CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
* *
92203 TTAATAAATTATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAA
131 TTAATAAATTATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGTCAA
* ** *
92268 AATAAAAACTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATT
196 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATT
*
92333 CAGTAAACAGATTTGAAATAAGCTTTATGGATAGAAAAA
261 CAGTAAA-AGATTTGAAATAAGCTTTATGAATAGAAAAA
* *
92372 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAACTAGATAATTGTTCAAATAGTTATA
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA-TAGATAATTATTCAAATAGTTATA
* * * * * **
92437 ACTATTTGAACGTG-TTGAG-AAAAAGATTTATTTTTTAAATC-TTTGCTTTTTAATTTTTGAAA
65 ACTATTTGAACTTGTTTG-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAA
* * ** ** * *
92499 TATTAGTAAATTTATATTATTTTATTAGGAATATTCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGT
129 TATTAATAAA-TTATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGT
* * * * *
92564 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTGTTTGGTAAAAAAATCATTTTTTAAATC
193 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAA----TTGTTCAAATAGTCA-----TAAAT-
* * * * * *
92629 ACTTATTAA-TT-TTCAAAATGTTAATAAG-TTAG-TATTA-TTTTATTTCAAATAAGCCTACAT
248 A-TT-TGAACTTATTC---A-G-TAA-AAGATTTGAAATAAGCTTTA--T-GAAT-AG---A-A-
92689 GAACTTA
296 -AA---A
* * * * * ** *
92696 TACAATTGTTTTATGACGAAACAAAATGTTCTAATGATTTGAATAGATAAGTATTCAAATAGTTA
1 -A-AT-TATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTTA
* * *
92761 TTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCAAA
63 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAA
** *
92826 ATATTAATAAATTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGC
128 ATATTAATAAATTATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGT
* * * *
92890 CAAAACAAAA-ATGCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCGAATAGTCATAAATATTTGCACT
193 CAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACT
* *
92954 TATTCAGTAAATAGATTTGAAGTCAGCTTGTATGAATAG-AAAA
257 TATTCAGTAAA-AGATTTGAAATAAGCTT-TATGAATAGAAAAA
* *
92997 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAACTAGATAATTATTCAAATAGTCATA
1 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA-TAGATAATTATTCAAATAGTTATA
* * * * * * ***
93062 ACTATTTAAACTT-TTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAAT
65 ACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAAT
* * * * *
93126 ACTAATAAATTAGAATTATGTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGAT
130 ATTAATAAATTA-TATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATG-T
* * * * * *
93191 -AAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTG
193 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTG
93250 CACTAATGAG
Statistics
Matches: 699, Mismatches: 126, Indels: 105
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
298 107 0.15
299 194 0.28
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301 2 0.00
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319 1 0.00
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325 2 0.00
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327 81 0.12
328 24 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (298 bp):
AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAA
CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
TTAATAAATTATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGTCAA
AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATT
CAGTAAAAGATTTGAAATAAGCTTTATGAATAGAAAAA
Found at i:92995 original size:626 final size:626
Alignment explanation
Indices: 91720--93608 Score: 2335
Period size: 626 Copynumber: 3.0 Consensus size: 626
91710 ATTGTATTCT
* * * * ***
91720 AAATAAGCTTTTTAT-AATAGAAACAATTAGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
1 AAATAAGC--TTTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAA
* * * * *
91784 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACGTGTTCAAAAGAAAGATTTATTTTTTAAA
64 CTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTGAGAA-AAAGATTTATTTTTTAAA
* *
91849 TATTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTAGGAATATGATTGTAT
128 TCTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTAGGAATATGCTTGTAT
* * *
91914 GAATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGCCATAACAAATTAAAATAGATAATTGTTTG
193 GAATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAAATTAAAATAAATAACTGTTTG
91979 GTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTT
258 GTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTT
92044 ATTTCAAATAAGCCTACATGAACTTATACAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTTCTAATGATT
323 ATTTCAAATAAGCCTACATGAACTTATACAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTTCTAATGATT
* *
92109 TGAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTGCTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTT
388 TGAATAGATAAGTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTT
* **
92174 AAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTG
453 AAATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTG
*
92239 TATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAACTCATAACGATTTGAAATAAATAATTAT
518 TATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAACTCATAACGATTTGAAATAAATAATTAT
92304 TCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTG
583 TCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTG
*
92348 AAATAAGCTTTATGGATAGAAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAC
1 AAATAAGCTTTATGAATAG-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAC
* *
92413 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACGTGTTGAGAAAAAGATTTATTTTTTAAATC
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTGAGAAAAAGATTTATTTTTTAAATC
* * *
92478 TTTGCTTTTTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTATATTATTTTATTAGGAATATTCTTGTATGA
130 TTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTAGGAATATGCTTGTATGA
* *
92543 ATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTGTTTGGT
195 ATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAAATTAAAATAAATAACTGTTTGGT
92608 AAAAAAA-TCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTAT
260 AAAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTAT
*
92672 TTCAAATAAGCCTACATGAACTTATACAATTGTTTTATGACGAAACAAAATGTTCTAATGATTTG
325 TTCAAATAAGCCTACATGAACTTATACAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTTCTAATGATTTG
92737 AATAGATAAGTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
390 AATAGATAAGTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAA
92802 ATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTA
455 ATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTA
* * * *
92867 TGAAC-AAAACAATTGTTTTATGCCAAAACAAAAA-TGCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTT
520 TGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAACT-CATAACGATTTGAAATAAATAATTATT
* * *
92930 CGAATAGTCATAAATATTTGCACTTATTCAGTAAATAGATTTG
584 CAAATAGTCATAAATATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTG
* *
92973 AAGTCAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAC
1 AAATAAGCTT-TATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAC
* * * *
93038 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TTTTCG-GTAAATAGATTCATTTTTTAAA
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTT-GAG-AAAAAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * ** *
93101 TCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATACTAATAAA-TTAGAATTATGTTATTCTGAATAAGCTTGT
128 TCT-TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTAGGAATATGCTTGT
* * * * * *
93165 ATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGAT-AAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGT
191 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATG-TCAAAACAAAAGGTCATAA-CA----AATTA-A-AA----
* * * *
93229 TCAAACAGTCATAACTATTTGCACTAATGAGGCTAACAAATACATTTTCTAAATCCATTACTTAT
244 T---A-A---ATAACTGTTTG--GT-A--A----AA-AAATTCATTTTTTAAAT-C---ACTTAT
* * * * * * * *
93294 TAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-CATTACTTTATTTCGAATAAGACTATC-TGAA--TAGA-
288 TAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTA-CATGAACTTATAC
* * * * *
93354 AATGGTTGTTTTATGAC-AAA-AAAATGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
352 AA---TTGTTTTATGACGAAACAAAA-GGTTCTAATGATTTG-AATAGATAAGTATTCAAATAGT
* * * * * *
93417 TATAACTAATTGAACTAT-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTC
412 TATTACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTC
* * * * *
93477 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTT
476 AAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTT
* * ** * *
93542 ATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGA
540 ATGACAAAACAAAAACTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAATATTTGA
93606 ACT
605 ACT
93609 AGTTCAACAA
Statistics
Matches: 1104, Mismatches: 105, Indels: 77
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
624 5 0.00
625 201 0.18
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631 2 0.00
632 1 0.00
633 2 0.00
637 1 0.00
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641 1 0.00
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658 96 0.09
659 30 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (626 bp):
AAATAAGCTTTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAACT
AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTGAGAAAAAGATTTATTTTTTAAATCT
TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTAGGAATATGCTTGTATGAA
TAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAAATTAAAATAAATAACTGTTTGGTA
AAAAAATTCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAGTTAGTATTATTTTATT
TCAAATAAGCCTACATGAACTTATACAATTGTTTTATGACGAAACAAAAGGTTCTAATGATTTGA
ATAGATAAGTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAA
TCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTAT
GAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAACTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCA
AATAGTCATAAATATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTG
Found at i:93632 original size:176 final size:179
Alignment explanation
Indices: 92984--93683 Score: 645
Period size: 176 Copynumber: 3.9 Consensus size: 179
92974 AGTCAGCTTG
* * * * *
92984 TATGAATAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAACTAGATAATTA
1 TATGAACA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * *
93048 TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-TTTCGGTAAATAG-ATTCATTTTTTAAATCTCTTACTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGCAAATAGAATT-ATTTTTTAAA--TCTTACTT
** * * * * *
93111 ATTAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTCTGAATAAGCTTG
127 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCCGAATAAACTTA
* * * * * * *
93164 TATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGATAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGT
1 TATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
93229 TCAAACAGTCATAACTATTTGCACTA-ATGAGGCTAACA-AATACATTTTCTAAATCCATTACTT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCA-GCAAATAGAAT-TATTTTTTAAAT-C-TTACTT
* * *
93292 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-ACATTACTTTATTTCGAATAAGAC-TA
127 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAA-ACTTA
* * * *** * * *
93344 TCTGAATAGAAATGGTTGTTTTATGACAAAA-AAATGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGT
1 TATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * *
93408 TCAAATAGTTATAACTAATTGAACTATTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGCAAATAGAATTATTTTTTAAATCTTACTTATTA
* * *
93471 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTA
131 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAACTTA
* * * *
93520 TATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATTGATAATTGT
1 TATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
93585 TCAAAT-GTCATAATTATTTGAACTAGTTCAACAAGTAGAATTATTTTTTAAATC-T-CTTATTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGCAAATAGAATTATTTTTTAAATCTTACTTATTA
* ** *
93647 ATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTC
131 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
93684 TAAATAAGTT
Statistics
Matches: 415, Mismatches: 91, Indels: 32
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 30 0.07
176 121 0.29
177 34 0.08
178 1 0.00
179 70 0.17
180 114 0.27
181 45 0.11
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGCAAATAGAATTATTTTTTAAATCTTACTTATTA
ATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCGAATAAACTTA
Found at i:94354 original size:356 final size:353
Alignment explanation
Indices: 93790--97698 Score: 2099
Period size: 361 Copynumber: 10.8 Consensus size: 353
93780 CAAATTTATT
* * * * * * * * *
93790 TTTTTTAAATCTCTTTGTAATTAGTTGT-AAGAATCTTATTAGATTAGTACAATTTTTTTCCAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAA-AATATTATTAAATTAGTATAATTTATTT-CGAA
* ** * * *
93854 TAAGCTTCTACGA-ACAAAAATAATTA-TTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATA
64 TAAGCTTATTTGATA-GAAAA-AATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTTATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
93917 TATAATTGTTCAAATAGT-TTAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCT
126 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTCAGTAAACAG-ATTTTTTTTTAAATCT
* * * *
93981 CTTA-TAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTAGAATAAGCTTGGATGAGCT
189 CGTACT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
94045 GAAATAAATATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAACTAGATAATTCTTCATATAG
253 GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
94110 TCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAATGAATTTA
318 TCATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAATGAATTTA
** ** *
94146 TTTTTTAAATCTCTTAGTTAAGAATTTTCAAAATATTATTAGTTTGGTATAATTTATTTCGAATA
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATAATTTATTTCGAATA
* * * * **
94211 AACTTATTTGAATAGAAAAAATTATTTTAAGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGAT
66 AGCTTATTTG-ATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGAT
* * * ** *
94276 AATTGTTCAAGTAGTCATAACTATGTGAATTGATTTGGTAAACAGATTTTTTTTTGAATCTCGTA
129 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTCAGTAAACAGATTTTTTTTTAAATCTCGTA
* * * * * *
94341 CTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCGAATAAACTTCTATG--TTGAAAA
193 CTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACTG--AA
* * ** * * * *
94404 ATAATTGTTTTATTACAAAATGAAAGGT-AAAAATGATTTGAAATAGATATTTGTTCAAATGGCC
256 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAA-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * *
94468 ATAATTATTTAAACTAATTCAGTAAATTG-ATTTA
320 ATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAA-TGAATTTA
* * * * * *
94502 TTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATCTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGA
1 TTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTA-TAATTTATTTCGAA
* * * * * * * **
94566 TAAGTTTTTATTGGCTA-AAACAATT-GTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATGATTTTATGTA
64 TAAG--CTTATTTGATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTT-ATAATGATTTGAAATA
*
94629 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAATAGATTTACTTTTTTAAATC
126 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAGTAAACAGATTT--TTTTTTAAATC
* *
94694 TCTTGCTTATTAATTTTTTGAAAGA-TAATAAATTAGTATTAATTTT-TTTAGAATAAGCTTGTA
188 TC--G--TACTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTAGAATAAGCTTGTA
* * * * * * * * *
94757 TGAATTGAAACAATTA-TTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGACATATATAATTATTC
247 TGAACTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
94821 TAATAGTCTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAAA-CACATTTA
312 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAATGA-ATTTA
* * ** *
94863 TTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTT-TTATCTGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATAATTTATT-TC-GAA
* * * * * * * *
94927 TCAGCTTGTATGATCAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATA-TCATAATGATTTCAGATTG
64 TAAGCTTATTTGAT-AGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTTATAATGATTTGAAATAG
** * * * *
94991 ATTTTTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAACA-ATTTTAATTTTTAAATCT
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTCAGTAAACAGATTTT--TTTTTAAATCT
* * * *
95055 CTTACTTAATAATTTTGAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAG-ATAAGTTTTTATG
189 CGTAC-TAAT--TTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AGAATAAGCTTGTATG
* * * *
95119 AACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAA
249 AACTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * *
95184 ATAGTCATATCTATTTGAACTTATTCAGCAAATAAATTTA
314 ATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAATGAATTTA
* * * * *
95224 TTTTTTTAAATCTCTT-GTTTATTAATTTTTC-AAATTTTAATAAATTAGTATTATTT-TACTCC
1 -TTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAA-TTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATAATTTAT-TTCG
* * * * ** * * * **
95286 AGATAAG-TTGGTATGA-ACTGAAATAATTGTTTTATGAGTAAACAAATGGTCAGAACAATTTGA
62 A-ATAAGCTT-ATTTGATA--GAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTTATAATGATTTGA
* * * * * * * *
95349 AATATATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGCAAACATATTTATTTTTAAT
122 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTCAGTAAACAGATTTTTTTTTAA-
* * * * * *
95414 TTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT-GAATATGCTTGT
185 -ATC-T-CGTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAGAATAAGCTTGT
** * * * * ** * *
95478 ATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACTATTTGAGATAGATAATTGTC
246 ATGAACTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * ** * *
95542 CAAGTAGTCATAACTATTTAAATTGGTT-TGATAAAT-AGATTTA
311 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAG-CAAATGA-ATTTA
* * * * **
95585 GTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTCAAAATAATAATAAATTAGTATTATCTTATTTTTAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATAAT-TTATTTCGAAT
** * * * * * * * * *
95646 AATTTTGTATGCATGGAAACATTTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTTACAACGATTTGAAATAGA
65 AAGCTTATTTG-ATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * **
95711 TAAATGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTC-GATAGATGGATTTATTTTTTAAATATT
128 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAG-TAAACAGATTT-TTTTTT-AA-A-T
* * * * * *
95775 CTACGTATTAATTTGT-AGAATATTAATTAATTAGTATAATTTTATTTCGAATAAACTTGTAT-A
187 CT-CGTACTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * ** ** * *
95838 AATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAAGAACATAATTATTTGAAATAAATAATTATTCAA
250 ACT-GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * *
95903 ACAATCATAACTATTTGAGCTTACTT-GGTAAAT-AGATTTA
314 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TAATTCAGCAAATGA-ATTTA
* *** * *
95943 TTTTTTAAATCT-TTAACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTCTGA
1 TTTTTTAAATCTCTT-AGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATAATTTAT-TTC-GA
* ** * * * *
96006 ATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTAGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACT-ATTTAAAAT
63 ATAAGCTTAT-TTGATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGTTATAA-TGATTTGAAAT
* * * *
96070 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAAAAGATTTATTTTTAAAATT
125 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAGTAAACAGATTT-TTTTTTAAA--
* * * * * * *
96135 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATG
186 TCT-CGTACTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * *
96199 AACAGCAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATAT-TTCA
249 AACTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCA
* * * ** ** *
96263 CATAGTCATAACAATTTGACCTTGTTCAATAAA-CAGATTCT-
313 AATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAATGA-ATT-TA
* ** * * * *
96304 TTTTTCTAAATCCCTTA-TTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGA
1 TTTTT-TAAATCTCTTAGTT-ATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTA-TAATTTATTTCGA
** * * * * *
96368 ATAAGCTTATATAAATTGACATAAAATT-TTTATAATGA-AATAC-AAGGTCATAACGATTTGAA
63 ATAAGCTTAT-TTGATAGA-A-AAAATTATTT-T-ATGACAAAACAAAAGTTATAATGATTTGAA
* * * * ** * *
96430 ATAGATAATTATTATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA
123 ATAG---------ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAGTAAACAGATTTT
* ** * * * * * * *
96495 TTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTGCCAAAATATTGAGAAATTAATATTATTTTAATCTA-AAT
178 TTTTTAAATCTCGTACTAATT-TTTG---AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAGAAT
* * *** * * * ** * *
96559 AAGCTGGCATGAAGAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATATGGGTTTGAAATAAA
238 AAGCTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGA
* * * * *
96624 TAATTGTTCAAATAGTCTTAATTATTTGACCTTATTCAGTAAAT-AGATTTA
303 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAATGA-ATTTA
* * * * * * * * * **
96675 -TTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGT-AGAATATTAATAAATTTGTATGATTTTTTTTTTAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTAT-A-ATTTATTTCGAA
* * * ***
96738 TTAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGCTTATAGCAATTTGAAATAG
64 TAAGCTTATTTG-ATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-TTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * *
96803 GTAATTGTTTAAATAGTTATAATTATTTGAACT-TGCTTAGT-AATAGATTTATTTTTTAAATCT
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAT--TCAGTAAACAGATTT-TTTTTTAAATCT
* ** ** * * *
96866 CTTACTTATTAATTTTAAAAATATTAATAAATTAAAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTATAA
189 CGTAC----TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * *
96931 AC-AAAAGCAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTCAA
250 ACTGAAA-TAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * ** * *
96995 ATAGTTATAACTATTTGCACT-CGTCAGGCCAAT-AGATTCA
314 ATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCA-GCAAATGA-ATTTA
* * * * *
97035 TTTTTTAAAT-TCATTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTA-TTCTGAA
1 TTTTTTAAATCTC-TTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATAATTTATTTC-GAA
* * * * * *
97098 TAAAAC-TATATGA-ACACAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAAT
64 T-AAGCTTATTTGATAGA-AAA-AATTATTTTATGACAAAACAAA-AGTTATAATGATTTGAAAT
* ** * * * *
97161 AAATAATTGTTCAAATAGTTGTAACTAATTAAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC
125 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTCAGTAAACAGATTT-TTTTTTAAATC
* * ** * * * * *
97226 T-TTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTA-AACAAACTTATATAAA
188 TCGTAC-TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAGAATAAGCTTGTATGAA
** * * * *
97289 CAAAAACATTTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
251 CTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* *
97354 AGTCATAATTATTTGAACTAGTTCAGCAAATAGAA-TTA
316 AGTCATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAAT-GAATTTA
* * ** * * * * *
97392 TTTTTTTAATCTCTTAGTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATTTTATTTTATTTTGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAA-TTAGTATAATTTATTTCGAAT
** * * * * * * *
97457 AAG-TTACTAAGAATTGAATAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAACTAA
65 AAGCTTA-TTTG-ATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAG
* * * * * ** * *
97521 AGAACTGTTCATATAG-CATTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTTTATTTTTTAAATC
127 ATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACT-ATTCAGTAAACAGA-TTT-TTTTTTAAATC
* * * * * *
97585 TCTTAGTTATTAA-TTTTGATAATATCATTACATTGGTATTATTTTATTCTA-AATAAACTTGTA
188 TC---G-TACTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAGAATAAGCTTGTA
* * * **
97648 TGAACAT-AAATAATTGTTTTATGACATAACACAAGGTCATAACTATTTGAA
247 TGAAC-TGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAA
97699 CTAGTTTGGT
Statistics
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TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTCAGTAAACAGATTTTTTTTTAAATCTCGTACTA
ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAAT
TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
ATTTGAACTAATTCAGCAAATGAATTTA
Found at i:94593 original size:181 final size:180
Alignment explanation
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93870 AAAATAATTA
* * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * ** *
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** * * * * * ** * *
94185 TAGTTTGGTA-TAATTTATTTCGAATAAACTTATTTGAATAGAAAAAATTAT
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* * * * ** * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** *
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* * * * *
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** * **
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * ** *
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66 TGAACTAATTCAGCAAATAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTCAAAATATTA
* ** * *
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* * * * * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * ** ** *
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* * * *
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* * * ** *
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1 TTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * * * * * *
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* * * * * *
95082 TAAAATAGTATTATTTTATTTC-AGATAAGTTTTTATGAACTGAAATAATTGT
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* * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
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* * * * *
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** * * ** * * *
95316 TTTATGAGTAAACAAATGGTCAGAACAATTTGAAATATATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * * * * * ** *
95381 TGAACTGGTTTAGCAAACATATTTA-TTTTTAATTTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATT
66 TGAACTAATTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * ***
95445 AAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGT
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* * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * ** * * * * *
95559 TTAAATTGGTT-TGATAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATAATA
65 TTGAACTAATTCAG-CAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTA
* ** ** * * *
95619 ATAAATTAGTATTATCTTATTTTTAATAATTTTGTAT-GCATGGAAACATTTTT
129 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGGC-T-AAAACAATTGT
* * * * * * * *
95672 TTTATGATAAAACAAAAGGTTACAACGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATGGACATGACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** ** * * * *
95737 TGAACTTGTTC-G-ATAGATGGATTTATTTTTTAAATAT-TCTACGTATTAATTTGT-AGAATAT
66 TGAACTAATTCAGCA-A-ATAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TGCTTATTAATTT-TCAAAATAT
* * * ***
95798 TAATTAATTAGTATAATTTTATTTCGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGT
127 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGGCTA-AAACAATTGT
* * ** * * * * *
95853 TTTACGACAAAAGAAAAGAACATAATTATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * ***
95918 TGAGCTTACTT-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TTAACTTATTAATTTTTGGAATATTA
66 TGAAC-TAATTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTCAAAATATTA
*** *
95981 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAATTAG-
129 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGGCTA-AAACAATT-GT
* *
96034 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACT-ATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * ***
96098 TTGAACGT-GTTCAG-AAAAAAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATT
65 TTGAAC-TAATTCAGCAAATAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATT
* * * *
96160 AATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTATATGAAC-AGCAACAATTGT
128 AATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-GCTA-AAACAATTGT
* * * * * *
96214 TTTATGATAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATAT-TTCACATAGTCATAACAAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** ** * * * * **
96278 TTGACCTTGTTCAATAAACAGATTCT-TTTTTCTAAATCCCTT-ATTCATTAATTTTTGAAATAT
65 TTGAACTAATTCAGCAAATAAATT-TATTTTT-TAAATCTCTTGCTT-ATTAATTTTCAAAATAT
* * * ***
96341 TAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATTGACATAA-AATT-T
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* * *
96397 TTATAATGA-AATAC--AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTATAATTATTCAAATAG
1 TT-T-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG---------ATAATTGTTCAAATAG
* * ** ** * * * * * ** **
96459 TTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTGCC
55 TCATAACTATTTGAACTAATTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTC
* * * * * * * * *
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120 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG--GCTAAAACAATTGT
* * * * * *
96585 TTTATGATAAAACAAAAAGTCAT-ATGGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAATTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * *
96649 TTGACCTTATTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGT-AGAATATTAA
65 TTGAACTAATTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAA
* * * ** * ** * *
96712 TAAATTTGTATGATTTTTTTTTTAAATTAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTAT
130 TAAATTAGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGGCTA-AAACAATTGT
* * *** * * * *
96765 TTTATGACAAAACAAAAGCTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTTAAATAGTTATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * * *
96830 TGAACTTGCTT-AG-TAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAAATATTAA
66 TGAAC-TAATTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAA
** * **
96893 TAAATTAAAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAAC-AAAAGCAATTGT
130 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GGCTAAAA-CAATTGT
* * * * *
96945 TTTGTGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * * * *
97010 TGCACT-CGTCAGGCCAATAGATTCATTTTTTAAAT-TCATTACTTATTAATTTTCAGAATATTA
66 TGAACTAATTCA-GCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTGCTTATTAATTTTCAAAATATTA
* * * *
97073 ATAAATTAGCATTA-TTTA-TTCTGAATAAAAC-TATATGAAC-ACAAACAATTGT
129 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAAT-AAGCTTGTATG-GCTA-AAACAATTGT
* * ** *
97125 TTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTGTAACTAAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
97190 TAAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTCTTAATTTTCAAAATATTAAT
66 TGAACTAATTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* ** * * * ** * * *
97251 AAATTAATATTATTTTATTTTAAACAAACTTATATAAACAAAAACATTTCT
131 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GGCTAAAACAATTGT
*
97302 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * **
97367 TGAACTAGTTCAGCAAATAGAA-TTATTTTTTTAATCTCTTAG-TTACTAATTTTTGAAATATTA
66 TGAACTAATTCAGCAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTCAAAATATTA
* * * * ** * *
97430 ATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAATTGAATA-AATTAT
129 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATG-GCT-AAAACAATTGT
* * * * * * *
97483 TTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAACTAAAGAACTGTTCATATAG-CATTAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTAT
* ** ** * * * *
97547 TTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTGATAATATC
65 TTGAACTAATTCAGCAAATAAA-TTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTCAAAATATT
* * * * * * *
97611 ATTACATTGGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATGAAC-ATAAATAATTGT
128 AATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG-GCTA-AAACAATTGT
* *
97665 TTTATGACATAACACAAGGTCATAACT-ATTTGAA
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAA
97699 CTAGTTTGGT
Statistics
Matches: 2875, Mismatches: 611, Indels: 308
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 22 0.01
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
TGAACTAATTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGGCTAAAACAATTGT
Found at i:95200 original size:542 final size:541
Alignment explanation
Indices: 93753--97678 Score: 3033
Period size: 542 Copynumber: 7.3 Consensus size: 541
93743 TTAAAATTGC
* * * * ** * * *
93753 CTTAACTATTTGAAGTGGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTTTAAATCTCTTTGTAATT-AGTTG
1 CTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTT
* * * * ** * ** * * * *
93817 TAAGAATCTTATTAGATTAGTACAATTTTTTTCCAAATAAGCTTCTACGAACAAAAATAATT-AT
64 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTT
* * * * * *
93881 TTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT-TTAATTATTT
128 TTATGACAAAACAAAAA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * **
93945 GAACTAGTTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTA--TA--AATTTTTGAAATATTAATA
192 AAACTGGTTCAGAAAATAGATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
* ** * * * *
94006 AATTAGTTTTATTTTA-TTTAGAATAAGCTTGGATGAGCTGAAATAAATATTTTATGACAAAACA
257 AATTAGTATTATTTTATTTTA-AATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
94070 AAAGGTCATAAAGATTTGAACTAGATAATTCTTCATATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTCAA
321 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAG
* ** ** * ** *
94134 CAAAT-GAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTAAGAATTTTCAAAATATTATTAGTTTGGTA-T
385 TAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
94196 AATTTATTTCGAATAAACTTATTTGAATAGAAAAAATTATTTTAAGA-TAGAACAAAAGGTTATA
448 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTA-TTTATGACTA-AACAAAAGGTCATA
*
94260 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAGTAGT
511 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA-TAGT
* * * * * * * * *
94291 CATAACTATGTGAATTGATTTGGTAAACAGATTT-TTTTTTGAAT--C-T-CGTACTAATTCTTG
1 CTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTG
* * *** *
94351 AAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATT-TC-GAATAAACTTCTATGTTGAAAAATAATTGTTT
66 AAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-TTATCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTT
* * ** * * * * * *
94414 TATTACAAAATGAAAGGTAAAAATGATTTGAAATAGATATTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTA
129 TATGACAAAA-CAAAAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
** * * * * *
94479 AACTAATTCAGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATCTTCAAAATATTAATAA
193 AACTGGTTCAGAAAATAGATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
* ** * * *
94544 AGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATTG-GCTAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAA
258 ATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTA-TGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * **
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322 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTA
*
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387 AATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-A
* * * *
94736 TTTT-TTTAGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATG
449 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACG
* * *
94800 ATTTGACATATATAATTATTCTAATAGT
514 ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
** * * *
94828 CTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCCCTTATTTATTAATTTTTG
1 CTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
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66 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTA
* * * * ** * *
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131 TGACAAAACAAAAATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* * * * *
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196 TGGTTCAGAAAATAGA-TTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAT
* * * *
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260 TAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * *
95152 GTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAACTTATTCAGCAAAT
325 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAAT
* * * *
95217 AAATTTATTTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAATTTTTCAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA
390 AGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * * *
95282 -CTCCAGATAAG-TTGGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGAGTAAACAAATGGTCAGAACAAT
454 TTTCGA-ATAAGCTT-GTATGAATTGAAACAATT-ATTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGAT
*
95345 TTGAAATATATAATTGTTCTAATAGT
516 TTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
* * * **
95371 CTTAACTATTTGAACTGGTTTAGCAAACATATTTA-TTTTTAATTTTCTTACTTATTAATTTTTG
1 CTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
95435 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATATGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTA
66 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTA
* * * * *
95500 TGACAAAATAAAGATCATAACT-ATTTGAGATAGATAATTGTCCAAGTAGTCATAACTATTTAAA
131 TGACAAAACAAAAATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * *
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195 CTGGTTCAGA-AAATAGATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA
* * * * * * *
95624 TTAGTATTATCTTATTTTTAATAA-TTTTGTATGCA-TGGAAACATTTTTTTTATGATAAAACAA
259 TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTT-TATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
95687 AAGGTTACAACGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTC-GAT
322 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAG-T
* * * * * * * *
95751 AGATGGATTTATTTTTTAAATAT-TCTACGTATTAATTTGT-AGAATATTAATTAATTAGTATAA
386 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TGCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * ** *
95814 TTTTATTTCGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAAGAACATAAT
449 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATT-ATTTATGACTAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
95879 TATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAAT
513 GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
* * *** * * *
95908 CATAACTATTTGAGCTTACTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-CTTTAACTTATTAATTTTT
1 CTTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCCCTT-ACTTATTAATTTTT
* * *
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65 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATT-GTT
*
96035 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAACT-ATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
128 TTATGACAAAACAAAAA-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * ***
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191 TAAACTG-GTTCAGAAAATAGATTTAATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
** * * * *
96161 ATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTATATGAACAGCAACAATTGTTTTATGATAAA
254 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
96225 ACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATAT-TTCACATAGTCATAACAATTTGACCTTGTT
318 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT
* * * * *
96289 CAATAAACAGATTCT-TTTTTCTAAATCCCTT-ATTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAA
382 CAGTAAATAGATT-TATTTTT-TAAATCTCTTGCTT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
* * * * * * *
96352 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAATTGACATAAAATT-TTTAT-AATGAAATACAAGG
444 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGA-A-ACAATTATTTATGACT-AAACAAAAGG
* * *
96415 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTATAATTATT
506 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA-TAGT
* * * * ** *
96452 CAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTA-TTTTAAAATCTTTTATTTATT
1 C------TTA--ACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATT
**** * * * * * * * * *
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* * * *
96581 TTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCAT-ATGGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCTTAA
123 TTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * ** * * * * *
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186 CTATTTAAACTGGTTCAGAAAATAGATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATA
* * * * * * *
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251 TTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
96772 CAAAACAAAAGCTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTTAAATAGTTATAATTATTTGAACTT
314 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * **
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379 -ATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
** * *** * * *
96900 AAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAACAAAAGCAATTGTTTTGTGA-TAAAACAAAAA
443 GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATT-ATTTATGACT-AAACAAAAG
* * *
96963 GTCATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTCAAATAGT
505 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
* * ** * * * * *
97000 -TATAACTATTTGCACTCGTCAGGCCAATAGATTCATTTTTTAAATTCATTACTTATTAA-TTTT
1 CT-TAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * *
97063 CAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTAT-TCTGAATAAAAC-TATATGAACACAAACAATTGTT
65 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCTGAAT-AAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTT
** * ** *
97126 TTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTGTAACTAATT
128 TTATGACAAAACAAA-AATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
97191 AAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTCTTAATTTTCAAAATATTAATA
192 AAACTGGTTCAGAAAATAGATTTAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
* * * * * ** * *
97252 AATTAATATTATTTTATTTTAAACAAACTTATATAAACAAAAACATTTCTTTTATGACAAAACAA
257 AATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * *
97317 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TAGTTCAGC
322 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAGT
* * * *
97381 AAATAGAATTATTTTTTTAATCTCTTAG-TTACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTA
386 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * * *
97444 TTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAATTGAATA-AATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATA
449 TTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAATTGAA-ACAATTA-TTTATGACTAAACAAAAGGTCATA
* * * *
97507 ACGATTTGAACTAAAGAACTGTTC-ATATAG-
511 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTA-ATAGT
* * * *
97537 CATTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAAACAAATTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTT
1 C-TTAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
97601 TGATAATATCATTACATTGGTATTA-TTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAACATAAATAATTGT
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*
97665 TTTATGACATAACA
127 TTTATGACAAAACA
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TCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
ATAGATAATTGTTCTAATAGT
Found at i:98641 original size:182 final size:181
Alignment explanation
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98224 CTGATTTGAT
* * * * * * *
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* * ** * *** * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * *
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66 TTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATG
* * * * * *** * *
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* * * * * * *
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* ** * * *
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* * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * *
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128 ATGATTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGA
* * * * *
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1 AAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
99199 TTTTATTTCGTATAAACTTGTATTAACTGAAACAATTACTTTATGACAAAATAAAAAGGCCATAA
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129 TGA-TTTAAATAGA
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AAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTCGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGGTCATAATG
ATTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGA
Found at i:99300 original size:32 final size:33
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* *
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* *
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GACAAAATAAAAAGACCATAATGATTTGAAATA
Found at i:99458 original size:214 final size:214
Alignment explanation
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99052 TCATTTTATA
** * * *
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* * * *
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* ** * *
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131 AGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAACTGAAACAATTACTTTATGACAAAA-AAAAAG
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195 GCCATAATGATTTTAAATAG
* * * * *
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* * * * * *
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** * ** *
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130 TAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAACT-GAAACAATTACTTTATGACAAAAAAAAA
*
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194 GGCCATAAT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAACTGAAACAATTACTTTATGACAAAAAAAAAGG
CCATAATGATTTTAAATAG
Found at i:99699 original size:20 final size:20
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*
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99694 GAATAATTGATATTATTTTA
1 GAATAATTGATATTATTTTA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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GAATAATTGATATTATTTTA
Found at i:100241 original size:182 final size:178
Alignment explanation
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* * ** * * * * *
99716 ACAAAACAAAATGTCATAATGGTTTGAAATCA-ATGATAGTTCAAATGGACAT-GCTATTTGAAC
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* * * * *
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* * * *
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** * ** * * *
99896 ACAAAACGAAAATATCATGACGATTTGAAATAAATAATT-ATCAAATTGTCATAACTATTTGAAC
1 ACAAAA-GAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
99960 TCGCTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATT
65 TTGTTCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
** * *
100025 GGTATTATTTCATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATG
128 TATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
** ** * **
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--ATAACTATTTGAA
*** * * *
100142 CTTGTTCAAAAAACAAATTTAGTTTTCAAATTTTTGCTTATGAATTTTTGAAATATTACTAAATT
64 CTTGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTT-AAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * *
100207 TATATTATTTTATTCAAAATAAGTTTGGATGAATAGAACCAATTATTTTTTG
128 TATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * ** *
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* * *
100570 ATATTATTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTATG
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** ** * **
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--ATAACTATTTGAA
* *** * * *
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* * * * * *
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128 TATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * *
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66 TGTTCGGTAAACAAATTTA--GTTTTAAATT--TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
** * * * * * *
100930 TGGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTTTATTAATTGAAACAATTTTTTTATT
127 TTATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
** * * * * *
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * ** * ** *
101048 TATTCGGTAAACATATTTA-TTTT---TTAATACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
66 TGTTCGGTAAACAAATTTAGTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTAT
* * * *
101109 ATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTATG
131 ATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
** ** * *
101157 ACAAAAGAATTGGTCATACCAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATAAATATTTGAA
1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--ATAACTATTTGAA
** * *
101222 -TGTGTTC-AAAAAGCAAATTTAGTTTTCAAATTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAA
64 CT-TGTTCGGTAAA-CAAATTTAGTTTT-AAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * *
101285 TTTATATTATTTTATTCAAAATAAGTTTGGATGAATAGAACCAATTGTTTTCTC
126 TTTATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
101339 ACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTATTCAGAGAGTCATAACTATTTGAACT
1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
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66 TGTTCGGTAAACAAATTTA--GTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * *
101467 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTTTTTTATT
127 TTA-TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
101521 ACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAAT
1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * ** * *
101586 TATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATTAATTGTCCAAATATTAACAAATTA
66 TGTTCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTT
* * * *
101651 ATATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATG
129 ATATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * * *
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1 ACAAAAGAA-AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--ATAACTATTTGA
**** *
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* * * * * *
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126 TTTATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* *
101883 ACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAATAGATAATTGTTCAGAA-AGTCATAACTATTTGAAC
1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAAC
* ** * * * *
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65 TTGTTCGGTAAACAAATTTA--GTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * *
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128 TA-TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * *
102126 TATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTA
66 TGTTCGGTAAACAAATTTA-GTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTT
* * * * *
102191 ATATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATG
129 ATATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* *
102241 ACAAAAAGAAAATGTCATAACAA-TT----T-G-T--TT-TTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAA
1 AC-AAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA
* ** * * * *
102295 CTTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTGTCTT--AATATTAATAA
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** * * * * * *
102358 ATTTGCATTATTTTATTTGAAATAAACTTGTATAAAAAGATGA-AATTTTTTTATG
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* * * * * ** * *
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1 ACAAAAGAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
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66 TG-TTCGGTAAACAAATTT-A--GTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * *
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1 A
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Statistics
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Found at i:101904 original size:544 final size:544
Alignment explanation
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* ** * * *
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* * * * * **
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* ** ** * * * *
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* *** * * * *** *
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** * ** *
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* * *
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* *
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*
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* *
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*
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*
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*
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*
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* *
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*
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261 ATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTATGACAAAAGAATTGGTCAT
* ** *
101174 ACCAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATAAATATTTGAATGTGTTCAAAAAGCAAA
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391 TTTAGTTTTCAAATTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA
* * *
101304 AATAAGTTTGGATGAATAGAACCAATTGTTTTCTCACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAAT
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*
101369 AGATAATTATTCAGAGAGTCATAA
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* *
101393 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTGTTTTACTTCTCTTACTCACTAATTTTAGGAAT
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* *
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196 TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
* *
101653 ATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAGAATTAGTCAT
261 ATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTATGACAAAAGAATTGGTCAT
* * *
101718 ACCAATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATATAACTATTCGAATGTGTTAAAAAAACAAA
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*
101783 TTTAGTTTTCAAATTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA
391 TTTAGTTTTCAAATTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA
101848 AATAAGTTTGGATGAACAGAACCAATTATTTTCTGACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAAT
456 AATAAGTTTGGATGAACAGAACCAATTATTTTCTGACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAAT
*
101913 AGATAATTGTTCAGAAAGTCATAA
521 AGATAATTGTTCAGAGAGTCATAA
101937 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTGTTTTAGTTCCC-T--T-ACTAATTTTAGGAAT
1 CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTGTTTTAGTTCCCTTACTCACTAATTTTAGGAAT
* *
101998 ACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATCGAAACTATTTTTTTATTAC
66 ACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTTTTTTATTAC
*
102063 AAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAATTA
131 AAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAATTA
*
102128 TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAAT
196 TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
*
102193 ATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATT-ATTTTATGACAAAA
261 ATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGA-TTTATGACAAAA
102247 AGAAAATGTC
Statistics
Matches: 1825, Mismatches: 93, Indels: 36
0.93 0.05 0.02
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (544 bp):
CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTGTTTTAGTTCCCTTACTCACTAATTTTAGGAAT
ACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTTTTTTATTAC
AAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAAATTA
TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCATTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
ATTATTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTATGACAAAAGAATTGGTCAT
ACCAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATAACTATTCAAATGTGTTCAAAAAACAAA
TTTAGTTTTCAAATTTTTGCTTATTAATTTTTGAAATACTAATAAATTTATATTATTTTATTCAA
AATAAGTTTGGATGAACAGAACCAATTATTTTCTGACAAAATAAAAGGTCATAATATTTTGAAAT
AGATAATTGTTCAGAGAGTCATAA
Found at i:102756 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 102735--102770 Score: 56
Period size: 16 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
102725 TCATAACGAT
102735 TTCAAATAG-ATAATTA
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102751 TTCAAATAGTCATAATTA
1 TTCAAATAG-CATAATTA
102769 TT
1 TT
102771 AGAACTGGTT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.50
18 9 0.50
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.06, T:0.42
Consensus pattern (17 bp):
TTCAAATAGCATAATTA
Found at i:103573 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 102608--107008 Score: 2400
Period size: 181 Copynumber: 24.4 Consensus size: 180
102598 GAAAAATTAA
* *
102608 AAACA-ATTTAATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTTGTATTATT
1 AAACAGATTT-ATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * ** * * *
102669 TTA-TTCAGAGCAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
65 TTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * *
102733 ATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTAGAACTGGTTAGGT
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* * * *
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* ** * * * * *
102849 TTTATTTCGAATAAGCTAATATGAATTGAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGAT-AGTAAT
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAAT
* * * * * * * * * * *
102913 AATTTCAAATAGATGATTGCTCATATTGTCTTAGCAATTTAAACTGGTTCGAC
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * * * * *
102966 CAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTATTAGATTAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
103030 TTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAT-AAATAATTTTTTTATAACACAACAAAAGGTTTATTT
64 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-G-------
* * * * *
103094 TGTAAATAATTGATTT-AAAGTATACAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTC-AG
120 -GT-CATAA-TGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-
103157 T
180 T
* * *
103158 AAACA-ATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAATTTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAA-ACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * * *
103222 TTATTCCAAATAAGTTTGTATG-A-TAAAAAGCACTTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAACAAC
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * * * * *
103285 GATTTGAAATATATAATTATTGAAATGGTAATAATTATTTAAACTGATTCGAT
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * ** *
103338 AAACAGATTCACTTTTTAAA-TC--ACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTACTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
*
103400 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGATAGAAA-AAAAGGTCATAATGA
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGA
* * * ** *
103464 TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAATTTTTTCAAT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * ** *
103515 AAACAAATTTATGTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTAAAAATATTAAAAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTAT-TTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
*** * * *
103580 TTATTTTGGATAAGCTTTTATAAACTGAAACAATTGTTTTAT-ATCAAAATAGAAA-GTCATAAT
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACA-AAAGGTCATAAT
* * * * *
103643 GGTTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTCGGT
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* *
103696 AAATAGATTTATTTTTTAAA-T-TT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * *
103758 TATTTTGAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATAGGTAATAACG
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * ** *
103821 ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTC-AGG
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-T
** * * * * * *
103873 AAATTGATTTATTTTTTAAATATTTTGCTTATTAACTCTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * *
103938 TTATTT-GGATAAGATTTTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAA-AAAATGTCATAATGA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * *
104001 TTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTAGGT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * * * * *
104052 AAATAGATTTATTTTTGCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTG-ATTGTTAATAAATTAGCATTA
1 AAACAGATTTATTTTT-TAAA-CTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
104116 TTTT-TTTCCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTGTATGACTAAACAAAAGGTCA-AA
63 TTTTATTT-CAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** * * * *
104179 GCGATTCAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCCTAACTATTTGAATTGGTTCGAT
127 -TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* *
104234 AAACACATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * * * *
104296 T-TATTGGAATAAGCTTATATGATCAGAAACAATTATTTTATGAGAAAGCAAATA--TCTTAATG
66 TAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATG
** * * * *
104358 ATTTGAGGTTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGA-
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCGAT
* * * * * *
104410 AAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAATAGCATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * *
104475 TTA-TTCTAGATAAGTTTTTCTAAACT-AAACAAATTGTTTCATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
65 TTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * * *
104538 AACTTT-AAATAAATAATTGTTCAAATTGTCA-AATCTATTTAAACTTGTTCGAT
128 GA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * *
104591 AAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTTATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTT-AAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
104656 TTTATTGT-GAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTCTTTTATGACTAAACAAAAAGGTTAGAA
64 TTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAA
** * * *
104720 CAATTTGAAATAG---A----T--AATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGAC
127 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * * * *
104765 AAACACATGTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * * *
104830 TTA-ATCTAGATAAGCTTGT-TGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGTTCATAACG
65 TTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * *
104892 ATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTGTTTC-AGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-T
* * * * ** *
104944 AAACAAATTTAGTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTGATGGATCAGTATTATTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** ** * * *
105006 TATTTTGAATAATTTTGCATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAAGTCATAATGA
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * ***
105070 TTTCAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTACTCGAT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * *
105121 AAATAGATTTATTTTTTAAATATCATACTTATTAATTTTTAGAAAT-TTAATAAAATAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * ** * *
105185 TTTA-TTCTAACTAAACTT-TATGAAGAGAAATAATTGAGTTATGACAAAATAAAAGATCATAAC
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* * * * * * * * * *
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127 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGAT
* * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTT-AAACTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** *
105364 TATT-TTT-TAATACA-CTTGTGTGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
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* * *
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127 -TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGAT
* * * ** * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAAT---TTT-TGAAATATTAAT--AAATTAGTA
* ** ** * ** * * ** * * * ** *
105544 TTGTGTGAACAT-AAACAAATATTTTATG-AC-AAAACAAAAAGTCATAATGATATGA-AATA-G
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* * * * * * * *
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105661 ---T
177 CGAT
* * * * * ** * ** * * * *
105662 AAATC---TCTTACTTATT-AATTTTTGGA-ATATTAATAAATT--AGTATTGTTTTATTTCGAA
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* *** * * * ** * * *
105720 TAAGCCTA-TACAAACTAATACAATTGTATTATGA-TGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
60 TTATTTTATTTCAAA-TAA-GC--TTGTATGA--ACTGAAAC-AATTGT-TTTATGA---CAAA-
* ** * * * * * *
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113 ACA-AA--AGGT-CATA---AT--GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *
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* * * * *
105860 AAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * *
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* * * * * *
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** * * * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * * * *
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* * * * * ** * * *
106351 TATTTGAAATAGGTAATTGTTTAAACAGTTATAACTATTTTTATTGGTTAGGCT
128 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-CGAT
* *
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* * * * * *
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61 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA--TGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * * *
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124 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * * **
106585 AAATAAATTTATTTATTAAA-TC-T-CTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAACATTATTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * * *
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66 TATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * *
106711 TTTGAAATAGATAATTTTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTT-TAGC
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-T
* * * * *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * ** * * * * *
106827 TTAATTCGAATAAACTTGTATAAAAAGAAACAATCGTTTTATGACCAAA-TAAAGATTATAATGA
65 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * ** *
106891 TTTGATATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTAGTTGAACTATTTCGGT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * *
106942 AAACAAATTTAGTTTTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATATATTAGTATTATTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
107004 TATTT
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Statistics
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171 1 0.00
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Alignment explanation
Indices: 102608--107007 Score: 2708
Period size: 358 Copynumber: 12.2 Consensus size: 357
102598 GAAAAATTAA
* *
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** * * ** * *
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* * * * *
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* * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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118 -GT-CATAA-CGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGT
* * *
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*** * * * * * *
103222 TTATTCCAAATAAG-TTTGTATG-A-TAAAAAGCACTTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAACAA
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* * * * * * * * *
103284 CGATTTGAAATATATAATTATTGAAATGGTAATAATTATTTAAACTGATTCGAT
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* * ** *
103338 AAACAGATTCACTTTTTAAATC--ACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTACTTT
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* *
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* * * ** *
103465 TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAATTTTTTCAATAAACAAATTTATGTT
129 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTAT-TT
* ** * *
103530 TTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTAAAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGC
193 TTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * *
103595 TTTTATAAACTGAAACAATTGTTTTAT-ATCAAAATAGAAA-GTCATAATGGTTTTAAATAAATA
258 TTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAA-A-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* *
103658 ATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTCGGT
320 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* *
103696 AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
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** * * *
103759 ATTTTGAATAAGCTTGTATG--TTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAATAGGTAATAACGA
66 A-TTCAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * ** * ***
103822 TTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCAGGAAATTGATTTATTT
128 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTT
* * * * * * *
103887 TTTAAATATTTTGCTTATTAACTCTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTA-TTTGGATAAG
193 TTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
* * * * *
103951 ATTTTATGAACTAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAAAAATGTCATAATGATTTTAAATAGATAAT
257 CTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * *
104016 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTAGGT
322 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * * * *
104052 AAATAGATTTATTTTTGCAAATCTCATGCTTATTAATTTTTTG-ATTGTTAATAAATTAGCATTA
1 AAACAGATTTATTTTT-TAAATCT--TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
104116 TTTTTTTCCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTGTATGACTAAACAAAAGGTCA-AAG
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** * * * * *
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* *
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* * * * * ** ** * ** *
104305 TAAGCTTATATGATCAGAAACAATTATTTTATGAGAAAGCAAATATCTTAATGATTTGAGGTTGA
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* * *
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318 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCGAT
* * * * * *
104410 AAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAATAGCATTATT
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* * * * * * *
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64 TTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * *
104539 ACTTT-AAATAAATAATTGTTCAAATTGTCA-AATCTATTTAAACTTGTTC-GATAAACAAATTT
127 A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTT
* * * *
104601 ATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTTATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGTGA
189 ATTTTTT-AAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * * * * **
104666 ATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTCTTTTATGACTAAACAAAAAGGTTAGAACAATTTGAAAT
252 ATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * *
104731 AG---A----T--AATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGAC
315 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * * * *
104765 AAACACATGTATTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** * *
104830 TTAATCTAGATAAGCTTGT-TGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGTTCATAACGA
64 TTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * *
104893 TTTGAGATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAGCTGTTTCAGTAAACAAATTTAGTT
128 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTT
* * ** *
104958 TTTAAA-TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTGATGGATCAGTATTATTTTATTTTGAATAA--
193 TTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
*
105018 TTTTGCATGAACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAA-GTCATAATGATTTCAAATAGA
258 TTTT--ATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAA--AAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * ***
105081 TAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTACTCGAT
318 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * *
105121 AAATAGATTTATTTTTTAAATATCATACTTATTAATTTTTAGAAAT-TTAATAAAATAGTATTAT
1 AAACAGATTTATTTTTT-AA-ATCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * ** * * *
105185 TTTATTCTAACTAAACTT-TATGAAGAGAAATAATTGAGTTATGACAAAATAAAAGATCATAACT
63 TTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * * * * *
105249 ATTTAAAACAAATAATTGTTCAAACAGTTATTACGATATGAACTTGCTT-GGTAAATAGATTTAT
127 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCAGTAAACAAATTTAT
* * *
105313 TTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAA-AAAATAGTATTATTATT-TTTT-AA
191 TTTTT-AAACTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTTGAA
* * ** *
105374 TACA-CTTGTGTGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAAT
253 TA-AGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAA-TGATTTGAAAT
* * *
105437 AGATAATTGTTCAAATAGGCATAACTATTTGAACGTGTTTAGA-
315 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGAT
* *
105480 AAACATATTTATTTTTTAAAT-TT--TTACTT-A---TT--AATA--AAT---TTA-TGTTATTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * *
105530 TATTCGAAATAAGCTTGTGTGAACAT-AAACAAATATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGA
65 TATTC-AAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * * * *
105594 TATGAAATAGATAACTGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTTGTCCAGTAAATAGATTCATAT
128 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTT
* * *
105659 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTATTTCGAATAAG
193 TTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
* * ** * * *
105724 CCTATACAAACT-AATACAATTGTATTATGATGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
257 CTTTTATGAACTGAA-ACAATTGTTTTATGA-CAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * * *
105788 ATTATTTAAATAGTTATGA-GATTTGAAATAGATAAT-TATT
320 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGT--TCGA-T
* * * * * * *
105828 AAA-ATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTCTATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTAT
1 AAACAGA-TT-T-ATTTTTTAAA-----TCT-T--ACTTATTAATTTTTGAAA--TATTA---AT
* * * * ** * *
105892 TAATT-GTTGAAATATTAATAAATT-AATATTATTTTAATTCAAAT-AAGCTTGTATGAACAAAA
50 AAATTAG-T--ATTATT--T-TATTCAA-ATAAGCTT--GT---ATGAA-C-TGA---------A
* * * * * *
105954 ACAATTGTTTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAACAATTATTCAAATAGTC
92 ACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * ** * * * * *
106019 ATAATTATTTAAACAT-ATTCAGTAAGTAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAGTAGTTGTCT
156 ATAACTATTTGAAC-TGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATT-TTT
* * * * * *
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218 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTT
* * *** * * * *
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*
106210 GAACTTGTTCGAT
345 GAACTGGTTCGAT
* * * * ** *
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1 AAACAGATTTATTTTTTAAAT--CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * * * * *
106288 TTATTTGGAGTCAA-CTTTTA-CAAATAGAAAGAGTTGTTTTGTGACAAAATAAAAGGTTATAAT
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* * * * * ** * *
106351 TATTTGAAATAGGTAATTGTTTAAACAGTTATAACTATTTTTATTGGTT-AGGCT-AATAAATTC
126 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-G-TAAACAAATT-
* * *
106414 T-TTTTTTAAA-TCCGTTACTTATTAAATTTT-AGAATATTAATGAATTAGTATTATTTTATTTC
188 TATTTTTTAAACT-C-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * * * * *
106476 AAACAAGATTGTATTTGTA--GAAACAATTGTTTGATGACAAACCAAATGGTCATAATAACTTGA
250 GAATAAGCTT-T-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * * *
106539 AATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGGACTGGTTTGGT
312 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * * **
106585 AAATAAATTTATTTATTAAATC-T-CTTATTACTTTTTGAAATATTAATAAATTAACATTATTTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * *
106648 ATTTCAAACAAACTTATATGAA-TAAAAACATTTGTTTTACGACAAAATAAAAGATCAAAATGAT
66 A-TTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * *
106712 TTGAAATAGATAATTTTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAACACATTTATTTT
129 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTT
* * * * * * *
106777 TTAAACCTCTTACTTACTAATTCTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTCGAATAAAC
194 TTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * ** * * * * * *
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258 TTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * ** *
106907 ATTCAAATAATCATAACTAGTTGAACTATTTCGGT
323 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
* * * *
106942 AAACAAATTTAGTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATATATTAGTATTATTTT
1 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
107005 ATT
66 ATT
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TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT
Found at i:103988 original size:20 final size:21
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*
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TTTTATGAACAAAAAAAATTG
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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** *
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*
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* ** * *
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* * * * *
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131 AT
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AAGCTTGTTGAAAAGAAACAATTCTTTTATGACAAAAAAAAGTTCAGAACAATTTGAAATAGATA
ATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACAAATGTAT
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105368 TTTTAATACA
* * * *
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* * ** * * * *
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* *
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* * * *
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65 ACTGTTCAAATAGGCATAACCATTTGAACGTGTCCAGAAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTA
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130 CTTATTAAT
105681 TTTTGGAATA
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 18, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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CTGTTCAAATAGGCATAACCATTTGAACGTGTCCAGAAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTAC
TTATTAATAAATTTATGTTATTTTATTCGAAATAAG
Found at i:105800 original size:16 final size:17
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Indices: 105768--105823 Score: 62
Period size: 17 Copynumber: 3.3 Consensus size: 17
105758 ACAAAAGGTC
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*
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*
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1 ATAAT
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Statistics
Matches: 31, Mismatches: 4, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (17 bp):
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Done.