Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: NW_019168056.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_306, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  36646

Tables:   1   2   

This is table  1  of  2  ( 126 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1725--1785
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1
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4
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24
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5
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2
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0
0
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20.4
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72
14
4
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4624--4677
19
2.8
19
74
2
54
12
3
7
75
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
141
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0
0
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2.1
33
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2.3
23
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10316--10354
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13385--13453
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1
0
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.00
22019--22059
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46
1.00
22006--22064
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0
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0
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
23935--24002
27
2.5
27
77
13
68
48
0
2
48
1.16
24257--24346
37
2.5
35
77
13
87
47
1
1
50
1.15
24278--24330
26
2.1
25
86
10
72
49
0
0
50
1.00
24803--24856
22
2.3
25
81
9
69
55
1
0
42
1.10
24802--24865
27
2.6
24
78
14
69
51
1
0
46
1.10
25552--25617
9
7.1
9
75
19
57
57
3
0
39
1.14
25637--25682
24
1.9
23
82
8
56
60
0
0
39
0.97
25644--25710
22
3.0
22
84
8
73
55
0
1
43
1.09
25651--25698
11
4.3
11
76
12
53
54
0
0
45
0.99
26115--26155
7
5.7
7
82
5
55
78
2
14
4
1.03

Tables:   1   2