Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168082.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_33, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 671528
ACGTcount: A:0.39, C:0.11, G:0.11, T:0.39
Warning! 3000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 7
Found at i:433 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 1--1614 Score: 1191
Period size: 181 Copynumber: 9.1 Consensus size: 181
* * * * * * *
1 ACAATTATCTACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATA
1 ACAATTATCTA-TTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
*
66 CAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TGAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-A
65 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA
* * *
128 TTTTAAAAATAAATATATTT-TCTAAAC-AGTTCAAATA-ATTGTGACTATTTGA
128 TTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
* * * * * *
180 GCAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTCTGTTTTATTATAAACCAATTGTTTCTGTTCATA
1 ACAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* *
245 CAAACTTATTTAAAATAAAATAATA-TAAATATATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
65 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* **
309 TTAAAAAATAAATCTACTTATCAAACGGGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGA
129 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
* * * *
361 ACAATTATTTATTTAAAGTCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA
1 ACAATTATCTATTTAAA-TCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * * * *
426 AAAACTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAGGCAAAGAGAT
65 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGAT
* * * ** * *
491 TTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTCAAATA-TTTATGACTATTTGA
129 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
* * * * *
543 ACAAATAT-TAATCTCAAATCATTATG--ATCTTTGTTTTACCATAAAACAATTATTTCTGATT-
1 ACAATTATCT-AT-TTAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTG-TTC
** * *
604 ATACAAGCTTATTT-GGATAAATATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATT-A-AA--AAG
62 ATACAAGCTTATTTAAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* * ** ** *
663 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAG-TTAAAAAC-ATTAGA
125 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGATT-ATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
719 ATAATTATCTCTTTTAAATCGTTCTAACCTTTTG-TTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGCTCAT
1 ACAATTATCT-ATTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT
* * * * ** *
783 ATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAACAAGAGAT
64 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* ** * * * * *
848 TGAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTTAAACAG-TTATGATTATTTTA
129 T-TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
* * * * *
901 GCAATTATCAATTTAAAATTGTTATGAC-CTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTTAT
1 ACAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCAT
* ** * * * * * *
964 AAAAGCTTATAAAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATATTTTAGAAGTTAATAAGTAAGAGAT
64 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
** * * * *
1029 TTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATTAGTTTAAATA-ATTATGGCCATTTGA
129 TTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
* * * * * *
1081 ATAACTATCTATTTCAAATCGTTATTATC-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-T-TAACA
1 ACAATTATCTATTT-AAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGT-TCA
* * *
1143 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAAAGA
63 TACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
* * * *
1204 TTTAAAAATTAAATCTATTTACCATACTAGTT----TA-A--AT-AGT-TTTG-
128 TTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
* * * * *
1248 AC---TATCTATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCGTA
1 ACAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * *
1310 CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-GTCTAAAAATTAATAAATAAGAGAT
65 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * * * ** *
1374 TTAAAAAATAAATCCATTTGTCGAACCAATTAAAACA-ATTAAAACTATATGA
129 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
* ** * * * * *
1426 ATAGCTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAATAATTATTT-TGTTTATA
1 ACAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * *
1490 CAAG-TCTATTCAGAATAATATAATATTTATTTATTAGTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAAAGAT
65 CAAGCT-TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * *
1550 TTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACATA-TTCAAATAG-TTATAACTATTTGA
129 TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAC-TAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
*
1602 ACAGTTATCTATT
1 ACAATTATCTATT
1615 CTATTTCAAA
Statistics
Matches: 1143, Mismatches: 229, Indels: 129
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
163 1 0.00
164 46 0.04
165 44 0.04
166 2 0.00
167 1 0.00
168 7 0.01
169 30 0.03
170 2 0.00
172 3 0.00
173 2 0.00
175 1 0.00
176 149 0.13
177 75 0.07
178 13 0.01
179 114 0.10
180 182 0.16
181 347 0.30
182 120 0.10
183 4 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
ACAATTATCTATTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC
AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
AAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA
Found at i:776 original size:358 final size:357
Alignment explanation
Indices: 1--1544 Score: 1028
Period size: 358 Copynumber: 4.3 Consensus size: 357
* * **
1 ACAATTATCTAC-TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCAT
1 ACAATTATCT-CTTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA-CAATTGTTTCAGTTCAT
* * * *
65 ACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATGAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAA-A-
64 AAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAGAG
* * * *
127 ATTTTAAAAATAAATATATTTTCT-AAACAGTTCAAATAATTGTGACTATTTGAGCAATTATCT-
128 A-TTTAAAAATAAATCTATTTTTTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTAT-TA
* * *
190 ATTTCAAATAGTTATGACCTTCTGTTTTATTATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATT
191 ATTTCAAATA-TTATGACCTT-TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTT-ATACAAGCTTATT
*
255 TAAAATAAAATAATATAAATATATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
253 TAAAATAAAATAATATAAATATAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAA
* * ** *
320 ATCTACTTATCAAACGGGTTCAAATAGATTTGACTATTTGA
317 ATCTACTTACCAAACGAGTTCAAATAGATTAAACTATTAGA
* * *
361 ACAATTAT-T-TATTTAAAGTCGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA
1 ACAATTATCTCT-TTTAAA-TCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCAGTTCA
* * * * *
424 TAAAAACTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAGGCAAAGAG
63 TAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGAG
* * * *
489 ATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAAATATTAA
128 ATTTAAAAA-TAAATCTATTTTTTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATTAA
* * * *
554 TCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTACCATAAAACAATTATTTCTGATTATACAAGCTTATTT-
192 TTTCAAAT-ATTATGACCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTG-TTATACAAGCTTATTTA
** * *
618 GGATAAATATAATACT-AATTTAATAATA-TTCTAAAAATT-A-AA-AAGAGATTTAAAAAATAA
255 AAATAAA-ATAATA-TAAATATAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAA
* ** * *
678 ATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAG-TTAAAAAC-ATTAGA
317 ATCTACTTACCAAACGAGTTCAAATAGATT--AAACTATTAGA
* * * * *
719 ATAATTATCTCTTTTAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGCTCATA
1 ACAATTATCTCTTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA-AACAATTGTTTCAGTTCATA
* * * * * *
784 TAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAAC-AAGAGAT
65 AAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGAGAT
* * * * * * * * *
848 TGAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTTAAACAGTTATGATTATTTTAGCAATTATCAAT
130 T--TAAAAATAAATCTATTTTTTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATTAAT
* * * **
913 TTAAAATTGTTATGACCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGCTTATAAA
193 TTCAAA-TATTATGACCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-G-TTATACAAGCTTATTTA
* * * * * * *
977 AAATAAAATAATA-ATACTTTATTAATATTTTAGAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
255 AAATAAAATAATATA-AATATAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAA
* *** ** * ** * *
1041 TC-AGTTTATTGAATTAGTTTAAATA-ATTATGGCCATTTGA
318 TCTA-CTTACCAAACGAGTTCAAATAGATTA-AACTATTAGA
* * * * * * *
1081 ATAACTATCTATTTCAAATCGTTATTATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT---TTAACA
1 ACAATTATCTCTTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCAGTT--CA
* * * * *
1143 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAAT----AAA-AG
63 TAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGAG
*** * *
1203 ATTTAAAAATTAAATCTA-TTTACCATACTAGTT----TAA--AT-AGT-TTTGA-C---TATCT
128 ATTTAAAAA-TAAATCTATTTTTTGA-ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTAT-T
* * * * * *
1255 -ATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTAT
190 AATTTCAAA-TATTATGAC-CTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTT-ATACAAGCTTAT
* * * *
1319 TTAGAATAAAATAATACT-AATTTAGTAATA-GTCTAAAAATTAATAA-ATAAGAGATTTAAAAA
252 TTAAAATAAAATAATA-TAAATATAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGA-AA-AGATTTAAAAA
* * ** * * * * *
1381 ATAAATCCATTTGTCGAACCAATTAAAACA-ATTAAAACTA-TATGA
313 ATAAATCTACTTACCAAACGAGTTCAAATAGATT-AAACTATTA-GA
* ** * * * * * * * * *
1426 ATAGCTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAATAATTATTT-TGTTTATA
1 ACAATTATCTCTTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATA
* * * * * *
1490 CAAG-TCTATTCAGAATAATATAATATTTATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATAA
65 AAAGCT-TATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
1545 AAGATTTAAA
Statistics
Matches: 951, Mismatches: 174, Indels: 131
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
343 1 0.00
344 25 0.03
345 205 0.22
346 3 0.00
347 3 0.00
348 4 0.00
349 2 0.00
350 2 0.00
352 1 0.00
355 8 0.01
356 14 0.01
357 17 0.02
358 250 0.26
359 30 0.03
360 98 0.10
361 75 0.08
362 159 0.17
363 53 0.06
364 1 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
ACAATTATCTCTTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCAGTTCATAA
AAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGAGATT
TAAAAATAAATCTATTTTTTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATTAATTTC
AAATATTATGACCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTATACAAGCTTATTTAAAATAA
AATAATATAAATATAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATCTACTTA
CCAAACGAGTTCAAATAGATTAAACTATTAGA
Found at i:1363 original size:165 final size:167
Alignment explanation
Indices: 1084--1392 Score: 412
Period size: 165 Copynumber: 1.9 Consensus size: 167
1074 CATTTGAATA
* * *
1084 ACTATCTATTTCAAATCGTTATTATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTAACATACAAG
1 ACTATCTATTTCAAATCGTTATTAACTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTTTAACATACAAG
* *
1149 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAAT-A-AA-AGATTTAAAA
66 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATCTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAA
* *
1211 ATTAAATCTATTTACCATACTAGTTTAAATAGTTTTG
131 AATAAATCCATTTACCATACTAGTTTAAATAGTTTTG
* * ** *
1248 ACTATCTATTTCAAATTGTTA-TAACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACA
1 ACTATCTATTTCAAATCGTTATTAAC-TTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTTT-AACATACA
* * *
1312 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAGTCT-AAAAATTAATAAATAAGAGATTT
64 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATA-TCTCAAAAATTAAT-AATAAGAGATTT
1376 AAAAAATAAATCCATTT
127 AAAAAATAAATCCATTT
1393 GTCGAACCAA
Statistics
Matches: 123, Mismatches: 15, Indels: 9
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
163 3 0.02
164 46 0.37
165 48 0.39
166 2 0.02
167 1 0.01
168 2 0.02
169 21 0.17
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (167 bp):
ACTATCTATTTCAAATCGTTATTAACTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTTTAACATACAAG
CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATCTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAA
AATAAATCCATTTACCATACTAGTTTAAATAGTTTTG
Found at i:1570 original size:345 final size:344
Alignment explanation
Indices: 906--1571 Score: 836
Period size: 345 Copynumber: 1.9 Consensus size: 344
896 TTTTAGCAAT
* * *
906 TATCAATTTAAAATTGTTATGACCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAAAGCT
1 TATCAATTTAAAATTGTTATAACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT
* * * * * * *
971 TATAAAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATATTTTAGAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
66 TATAAAAAATAAAATAATAATAATTTAGTAATAGTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAA
* ** * * * *** *
1036 ATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATC
131 ATAAATCAGTTTATCGAACCAATTAAAACAATTAAAACCATATGAATAACTATCTATTTCAAATC
* *
1101 GTTATTATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
196 GTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* *
1166 AATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAATAAAAGATTTAAAAATTAAATCTATTTACCATAC
261 AATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCATAC
1231 TAGTTTAAATAGTTTTGAC
326 TAGTTTAAATAGTTTTGAC
* * * * * *
1250 TATCTATTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGC
1 TATCAATTTAAAATTGTTATAAC-CTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGC
** * *
1315 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATAGTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAA
65 TTATAAAAAATAAAATAATAATAATTTAGTAATAGTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAA
* * *
1380 AATAAATCCA-TTTGTCGAACCAATTAAAACAATTAAAACTATATGAATAGCTATCTATTTCAAA
130 AATAAAT-CAGTTTATCGAACCAATTAAAACAATTAAAACCATATGAATAACTATCTATTTCAAA
* ** *
1444 TCGTTATGA-CATTTTGTTTTGTAATAAAATAATTATTTTGT-TTATACAAG-TCTATTCAGAAT
194 TCGTTATGATC-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTT-TAACATACAAGCT-TATTCAAAAT
* * * * * *
1506 AATATAATATTTATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAC
256 AAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
1571 C
321 C
1572 GAACATATTC
Statistics
Matches: 270, Mismatches: 47, Indels: 9
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
344 22 0.08
345 245 0.91
346 3 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (344 bp):
TATCAATTTAAAATTGTTATAACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT
TATAAAAAATAAAATAATAATAATTTAGTAATAGTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAA
ATAAATCAGTTTATCGAACCAATTAAAACAATTAAAACCATATGAATAACTATCTATTTCAAATC
GTTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTTTAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
AATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCATAC
TAGTTTAAATAGTTTTGAC
Found at i:2669 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1652--4691 Score: 2148
Period size: 181 Copynumber: 16.8 Consensus size: 180
1642 TTTGTCATAG
* * * **
1652 GAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAAAAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
1 GAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * ** * *
1717 AATAGTCAAAACTATTTGCACTGGTT-AGGCCAATAGATTCATTTTTTTAAATC-CATTACTTAT
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTAT
* * * * **
1780 TAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGCATTACTATATTCTGAATAAAATTGTAT
127 TAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * * *
1834 TAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG-GCT
1 GAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-
* * * * * ** * *
1898 AAATTGTTATAACTAATTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTGTTA
64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * * * * ** *
1959 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAATGTTATTTTATTCTGAACAAAATTATAT
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * * *
2011 GAAAGAAAACATTTTTTTTATAACAAAAGAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAAAAATTATTC
1 GAATG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * ** * * *
2075 ATATAGCCTTAACTATTTTAA-TTGGTTTGGGAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATT
64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
2139 AA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTATAT
128 AATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
2192 GAACAT-AAATAGTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATACAATTGTTT
1 G-A-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
2256 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTGCTCATTA
64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
2321 ATTTTTGAAATATTAATAAATTATTACTATTTTATTCTAAATAAGCCTATAT
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* *
2373 G-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
1 GAATG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * ** ** * *
2437 AATTTGCCATAATTATTTGAAC-TGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTC
64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
2501 AACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTTGGATAAGCTTTTAT
128 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * *
2554 GAACTGAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTC
1 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
2619 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTCCCTATT
64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATT
* * * ** * *
2684 AATTTTCT-AAATGTTAATAAAATAGTGTTATTTTATTTCAAATAACCATGTAT
128 AATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
2737 GAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGCTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT
1 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
2802 AATAGTCTTCACTACTTGAAC-TGCTTC-GTCAAACACATGTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGT-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * ** * * * *** * *
2865 AATTTTAG-AATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAACAAGCTCGTAT
128 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* *
2917 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC--AAGGATCAAAATGATTTGAGATAGATAAATT-TT
1 GAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGAT-AATTGTT
* * * * *
2979 CAAAAAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAT
63 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * *
3043 TATTTTTTGAAATATTAGTAAAGTGGCATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTAT
127 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
** *
3097 GAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGCTAATTGTTC
1 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * *
3161 AAAAACTGA-AATCTATTTGACCTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATT
64 AAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
3225 AATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTGTAT
128 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * * *
3278 GAACTGAAATAA-TGTTTTATGACTAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCT
1 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * ** * * * *
3342 AATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCATGCTTATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
3407 ATTTTTGGAATATTATTGAATTGGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTAT
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * ** * *
3459 GAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGGGATAGATAATTATTTA
1 G-AATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * *
3523 AATAGTCATAACTATTTGAACTATTTTCCA-TGAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATT
65 AATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT-CAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** * *
3583 AATTTTCAAAATATTATTGATAGATTAGTATTATTTTATTATGAATAA--TT-T-T
128 AATTTTTGAAATATTA---ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* *
3635 GAATG-AACAGATTG--TT-T------------GGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTAA
1 GAATGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
3684 AATGGACATGACTATTTGAACTTGTTC-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * *
3748 ATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAACAAACTTATAT
129 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
** * * ** * *
3800 GAACAAAAGCATTTGTGTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTTA
1 GAATGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
** * * * * *
3865 AATAGTCATAGTTTTTTGAAC-TGTTTAGGTAAATAGAATTA-TTTTTAATTCTCTTACTTATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* ** *
3928 ATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTAT
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * ** * * *
3980 GAATTGAAAAAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGACAATTGTTCG
1 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * * *
4045 TATAATCTTAACTATTTAAACTGGTTC-GACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * *
4109 ATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTAGTAT
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
** * * * * * * * * * *
4161 GAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTCAAGTATACAATTGTTTA
1 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * *
4226 AATAGTTA-ATACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTGCTAAATAAATTTATT
65 AATAGTCATA-ACTA-T-TTGAACTTGT--T--C-A-GTAAAC-----AG---ATT-----TATT
* * * **
4290 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
108 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
*
4355 GTTTGTAT
173 GCTTGTAT
* * * * *
4363 G-ATCAGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAAGGTAAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTA
1 GAAT--GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
4427 AAAT-GACCATAATTATTT-AAGC-TGATTC-GATAAACAGATTCATTTTTTAAATCAT-TTCCT
64 AAATAG-TCATAACTATTTGAA-CTTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACT
*
4487 TATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATAT
124 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * ** * *
4544 GAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAACGTTATAGCGATTTTAAATGGATAATTGTTCA
1 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
4609 AATAGTCA-AACTATTTGAATTTATTC-GATAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTCCTTATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
*
4671 ATTTTTGAAATATTAAGAAAT
129 ATTTTTGAAATATTAATAAAT
4692 AGATAATTAT
Statistics
Matches: 2239, Mismatches: 488, Indels: 265
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
159 1 0.00
160 20 0.01
161 69 0.03
162 2 0.00
163 4 0.00
164 19 0.01
165 4 0.00
166 5 0.00
167 2 0.00
168 2 0.00
169 1 0.00
172 1 0.00
173 2 0.00
174 4 0.00
175 7 0.00
176 9 0.00
177 148 0.07
178 11 0.00
179 114 0.05
180 392 0.18
181 923 0.41
182 266 0.12
183 85 0.04
184 1 0.00
185 1 0.00
186 2 0.00
187 1 0.00
189 4 0.00
194 5 0.00
196 1 0.00
197 2 0.00
198 1 0.00
199 3 0.00
200 3 0.00
201 3 0.00
202 120 0.05
203 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
GAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
Found at i:3280 original size:361 final size:358
Alignment explanation
Indices: 1657--4691 Score: 2166
Period size: 361 Copynumber: 8.4 Consensus size: 358
1647 CATAGGAATA
* * * *
1657 GAAACAATTGTTTTGTGACAAAAAAAAAGGCCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** *** * * *
1722 TCAAAACTATTTGCACTGGTT-AGGCCAATAGATTCATTTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCA-ATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT
** * * * * * ** * * *
1785 TTTTGAATATTAATAAATTAGCATTACTATATTCTGAATAAAATTGTATTAATAGAAAAAATTAT
127 TTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGT
* * ** * *
1850 TTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG-GCTAAATTGTTATAACTAA
191 TTTATGACAAAAC-AA-GGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAAAAGTCATAACTAT
* * * * **
1914 TTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTG----TTAATTTTCAAAATATTAA
253 TTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * ** *
1975 TAAATTAATGTTATTTTATTCTGAACAAAATTATATGAA-A
318 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * * * * * * *
2015 GAAAACATTTTTTTTATAACAAAAGAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAAAAATTATTCATAT
1 G-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTT-AAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * **** *
2079 AGCCTTAACTATTTTAA-TTGGTTTGGGAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-T
63 AGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * *
2142 TTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTATATGAACAT-AAATAGTT
127 TTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATG-A-ATGAAACAATT
* * * * * *
2206 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATACAATTGTTTAAATAGTCATAACTA
189 GTTTTATGACAAAAC--AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTA
* * * * * *
2271 TTTGAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTGCTCATTAATTTTTGAAATATTA
252 TTTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * *
2336 ATAAATTATTACTATTTTATTCTAAATAAGCCTATATG-A-T
317 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * *
2376 GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATT
1 G--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *** ** * * *
2441 TGCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAACTT
63 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * ** *
2506 TTGAAATATTAATAAAGTAATATAATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTT
128 TTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTT
* * * *
2571 TTATTATAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
192 TTATGACAAAAC---AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATT
* * * * * *
2636 TGAACTTGTTC-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTCCCTATTAATTTTCT-AAATGTT
254 TGAACTGGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTT-TGAAATATT
* * ** * * * *
2699 AATAAAATAGTGTTATTTTATTTCAAATAACCATGTATGAATT
316 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * * * * * *
2742 GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGCTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * * *
2807 TCTTCACTACTTGAACTGCTTC-GTCAAACACATGTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCAAT-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * * * ** * *
2870 T-AGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCCAAACAAGCTCGTATGAATAGAAACAATTGTT
129 TCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTT
* *
2934 TTATGACAAAACAAGGATCAAAATGATTTGAGATAGATAAATT-TTCAAAAAGTCATAACTATTT
192 TTATGACAAAACAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTT
* * * *
2998 GAACTGGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTATTTTTTGAAATATTAGTA
255 GAACTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * *
3063 AAGTGGCATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAACT
320 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * *
3102 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGCTAATTGTTCAAAAAC
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
3167 TGA-AATCTATTTGACCTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTT
65 TCATAA-CTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
3231 TCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTGTATGAACTGAAATAA-TGTTT
129 TCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTT
* * * * * * *
3295 TATGACTAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCTAATAGTCTTAACTATTTG
193 TATGAC-AAA-ACAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTG
* * ** * * * * *
3360 AACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCATGCTTATTAATTTTTGGAATATTATTG
256 AACTGGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * **
3425 AATTGGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAAAA
320 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * ** * *
3464 GAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGGGATAGATAATTATTTAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
3528 TCATAACTATTTGAACTATTTTCCATGAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTT
65 TCATAACTATTTGAACT-TATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
3588 TCAAAATATTATTGATAGATTAGTATTATTTTATTATGAATAA--TT-T-TGAATG-AACAGATT
129 TC-AAATATTA---ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATGAAACA-ATT
* * * *
3648 G--TT-T----------GGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTT-AAAATGGACATGACTAT
189 GTTTTATGACAAAACAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAA-AGTCATAACTAT
* * * * *
3699 TTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTAATTTTT-AGAATATTA
253 TTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * *
3763 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAACAAACTTATATGAAC-
317 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * * *
3804 AAAAGCATTTGTGTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATA
1 GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * * *
3869 GTCATAGTTTTTTGAACTGT-TT-AGGTAAATAGAA-TTA-TTTTTAATTCTCTTACTTATTAAT
64 GTCATAACTATTTGAACT-TATTCA-ATAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * *
3930 TTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATT
126 TTTTCAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATT
* ** * * * * *
3994 GTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGACAATTGTTCGTATAA-TCTTAACT
189 GTTTTATGACAAAAC--AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAAAAGTCATAACT
* * * *
4058 ATTTAAACTGGTTCGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTTGAAATAT
251 ATTTGAACTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTTGAAATAT
* * *
4122 TATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAC-TAGTATGAACA
315 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA-TATGAACT
* * * * *
4166 AAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTCAAGTATACAATTGTTTAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-G-------G---TC-A-TA-ACGA---TTTAAATAG
* * ** *** *
4231 TTAATACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTGCTAAATAAATTTATTTTTTAA
49 ---AT--AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * *
4296 ATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGT
109 ATCTCTTACTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGT
* * *
4361 ATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAAGGTAAAAATGATTTGAAATAGATAATTGT
174 ATGAAT--GAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
4425 T-AAAATGACCATAATTATTT-AAGCTGATTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAATCAT-TTCCT
235 TCAAAAAG-TCATAACTATTTGAA-CTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTGCT
*
4487 TATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATT
297 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * * *
4549 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAACGTTATAGCGATTTTAAATGGATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
4614 TCA-AACTATTTGAATTTATTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAA-CTCTTCCTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* *
4677 GAAATATTAAGAAAT
130 CAAATATTAATAAAT
4692 AGATAATTAT
Statistics
Matches: 2120, Mismatches: 428, Indels: 256
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
340 10 0.00
341 114 0.05
342 105 0.05
343 5 0.00
344 17 0.01
345 8 0.00
346 6 0.00
347 3 0.00
348 2 0.00
349 1 0.00
354 1 0.00
355 5 0.00
356 3 0.00
357 15 0.01
358 166 0.08
359 82 0.04
360 207 0.10
361 415 0.20
362 341 0.16
363 140 0.07
364 153 0.07
365 2 0.00
366 2 0.00
367 8 0.00
369 3 0.00
370 2 0.00
371 1 0.00
372 3 0.00
373 1 0.00
374 2 0.00
375 5 0.00
377 9 0.00
380 2 0.00
381 5 0.00
382 43 0.02
383 226 0.11
384 6 0.00
385 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (358 bp):
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTC
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTAT
GACAAAACAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTG
GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG
TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
Found at i:3804 original size:161 final size:159
Alignment explanation
Indices: 3508--3804 Score: 339
Period size: 161 Copynumber: 1.8 Consensus size: 159
3498 ACGATTTGGG
* * * *
3508 ATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTTCCATGAACAAATTTAGTTTTTAA
1 ATAGATAATTATTAAAATAGACATAACTATTTGAACTATGTTCCATAAACAAATTTAGTTTTTAA
* * **
3573 ATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTATTGATAGATTAGTATTATTTTATTATGAATAATTTTGAA
66 ATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTA-T-ATAAATTAGTATTATTTTATTATGAACAAACTTGAA
3638 TGAACAGATTGTTTGGTCATAATGATTTTAA
129 TGAACAGATTGTTTGGTCATAATGATTTTAA
* * * * * * *
3669 ATAGATAATTGTTAAAATGGACATGACTATTTGAACT-TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAA
1 ATAGATAATTATTAAAATAGACATAACTATTTGAACTATGTTCCATAAACAAATTTAGTTTTTAA
* * * *
3733 ATCTCCTACATATTAATTTTTAGAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAACAAACTT-
66 ATCT-CT---TATTAATTTTCAAAATATTATATAAATTAGTATTATTTTATTATGAACAAACTTG
3796 ATATGAACA
127 A-ATGAACA
3805 AAAGCATTTG
Statistics
Matches: 112, Mismatches: 19, Indels: 10
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
160 26 0.23
161 68 0.61
164 18 0.16
ACGTcount: A:0.38, C:0.07, G:0.09, T:0.45
Consensus pattern (159 bp):
ATAGATAATTATTAAAATAGACATAACTATTTGAACTATGTTCCATAAACAAATTTAGTTTTTAA
ATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTATATAAATTAGTATTATTTTATTATGAACAAACTTGAATG
AACAGATTGTTTGGTCATAATGATTTTAA
Found at i:4239 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 4213--4252 Score: 80
Period size: 21 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
4203 GATTTCAAGT
4213 ATACAATTGTTTAAATAGTTA
1 ATACAATTGTTTAAATAGTTA
4234 ATACAATTGTTTAAATAGT
1 ATACAATTGTTTAAATAGT
4253 CATAACTATT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 19 1.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.05, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (21 bp):
ATACAATTGTTTAAATAGTTA
Found at i:4425 original size:202 final size:202
Alignment explanation
Indices: 4053--4430 Score: 508
Period size: 202 Copynumber: 1.9 Consensus size: 202
4043 CGTATAATCT
* *
4053 TAACTATTTAAACTGGTTCGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAA
1 TAACTATTTAAACTGGTTCGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* * ** *
4118 ATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTAGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
66 AGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
4183 ATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTCAAGTATACAATTGTTTAAATAGTTAATACAATTGTTTAA
131 ATAGAACAAAAGGTAAAAACGATTTCAAATAGACAATTGTTAAAATAGTTAATACAATTGTTTAA
4248 ATAGTCA
196 ATAGTCA
* * *
4255 TAACTATTTAAACTGGTTTG-CTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAA
1 TAACTATTTAAACTGGTTCGAC-AAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
** * * *
4319 AAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTTAT
65 AAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * *
4384 GACTA-AATAAAAGGTAAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTAAAAT
130 GA-TAGAACAAAAGGTAAAAACGATTTCAAATAGACAATTGTTAAAAT
4431 GACCATAATT
Statistics
Matches: 150, Mismatches: 24, Indels: 4
0.84 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
201 1 0.01
202 147 0.98
203 2 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.06, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (202 bp):
TAACTATTTAAACTGGTTCGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
AGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATG
ATAGAACAAAAGGTAAAAACGATTTCAAATAGACAATTGTTAAAATAGTTAATACAATTGTTTAA
ATAGTCA
Found at i:5001 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 4687--6529 Score: 1295
Period size: 181 Copynumber: 10.3 Consensus size: 178
4677 GAAATATTAA
* * ** * * **** * *
4687 GAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAATTTGTTCAACAAACATATTTATATTTT
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * **
4752 AAATCTCTT-GTTA-T--TTATTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCGAATACA-C
66 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATA-AGC
* * *
4811 TTCTATGATAAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCTTAACGATTT
129 TTGTATGA-AAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCTTAACGATTT
* * * * * *
4863 GAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAGCAGATTTATTTTTT
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTT
* * * *
4928 TAAATTTCTTACTTATGAATTTTTGAAATATGAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACT
65 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
* * * *
4993 TGTATGATAAAAAATAATTGTTTTAT-AGCAAAAAAAAAGGTCATAATGATTT
130 TGTATG--AAAAAACAATTGTTTTATGA-C-AAAACAAAGGTCTTAACGATTT
* ** * * * *
5045 GAAATCGATAATCATTCAAATA-TATATAATTATTTTAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTT
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTT
* * ** * * *
5109 TAAATTTCTTACTTATTTATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCATGTAAGT
65 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGC
* **
5173 TTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAGTCAAAAGGT-TATAACGATTCT
129 TTGTATGAA--AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCT-TAACGATT-T
* * * * * * *
5227 -AAATAAACAAATT-TTCAAATAGTAATAACTATTTAAACT--TTTCGATAAATAGATTTATTTT
1 GAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-GGTAAACAAATTTATTTT
* * * * *
5288 TTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTAATTTA-TTCTAAATA
64 TT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
* * * ** *
5351 AGCATGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCCAAATGATTT
126 AGCTTGTATGAA--AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCTTAACGATTT
* * * * * * ** * * *
5407 GAAATA-ATAATTGCTCTAATAGTCTTAACCATGTGAACTGATTCAGTAAAGAAACTTATGTTTT
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * *
5471 AAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAATATTATTAAA-T--TATTATTTTAATTT-GAATAAGGT
66 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCT
* * ** * *
5532 TGTACGAACAAAATAATTGTTTTGCGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTT
130 TGTATGAA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCTTAACGATTT
* * * **** **
5583 GAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACCGGTTCACCAATTAAATTTATTTTTT
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * ** * * * ** *
5648 AATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTACGAATAAAATA
66 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
* * * *
5713 GTATGAAAAGAACCAATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGT-TACAATGATTT
131 GTATGAAAA-AA-CAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGGTCT-TAACGATTT
* * * * * * * *
5764 CATATCGATAATTATTCAAATAGT--GAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAACATATTTACTTTTT
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * *
5827 AAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAAC
66 AAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
* * * * * *
5890 TTATATTAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-CAATAACAATTT
129 TTGTA-TGA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTC-TTAACGATTT
* * * * *
5943 AAAATAGATAATTGCTT-AAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAGAA-TTATTTT
1 GAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACA-AATTTATTTT
* * * *
6006 TTAAATCTCTTA--TA--AATTTTGGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTA-TTCTAAATAAG
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAG
* * * * *
6066 CTTGCATGACCCAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCGTAAC-AATT
128 CTTGTATGA--AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTCTTAACGATTT
* * * * * * * ***
6119 GCAAAGATATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGCAAACGGTTTTATTTTT
1 G-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTT
* * *
6184 TAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
65 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
* *
6248 TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGT-TATAACAATTT
129 TTGTATG-A-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCT-TAACGATTT
* * * * ** *
6301 GAAATAGATAGTTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTGCTTTTG
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
* * *
6366 AAA--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
66 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
* * * ** *
6427 GTATGTTGAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTT
131 GTATG--AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTCTTAACGATTT
* * * * * *
6478 GAAATAGGTAGTTATTCAAATGGCCATAA-TCATTTGAACTGATTTGGTAAAC
1 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTTGGTAAAC
6530 TTTTGAAATA
Statistics
Matches: 1322, Mismatches: 269, Indels: 151
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.00
176 96 0.07
177 370 0.28
178 10 0.01
179 152 0.11
180 105 0.08
181 489 0.37
182 96 0.07
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT
AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
GTATGAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTCTTAACGATTT
Found at i:5678 original size:177 final size:176
Alignment explanation
Indices: 5281--5692 Score: 409
Period size: 177 Copynumber: 2.3 Consensus size: 176
5271 ATAAATAGAT
* * * * * * *
5281 TTATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTC
1 TTATGTTTT-AAATCTCTTACTTATT-AGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT--TTAATT-
* ** * * * * *
5345 TAAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCCAAATGATTTGAA
61 TGAATAAGGTTGTACGAAC-AAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCCAAATGATTTGAA
* **
5410 ATAATAATTGCTCTAATAGTCTTAACCATGTGAACTGATTCAGTAAAGAAAC
125 ATAATAATTGCTCTAATAGTCTTAACCATGTGAACCGATTCACCAAAGAAAC
*
5462 TTATGTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAATATTATTAAATTATTATTTTAATTTGAAT
1 TTATGTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTAATTTGAAT
* *
5527 AAGGTTGTACGAACAAAATAATTGTTTTGCGACAAAACAAAGGGT-CATAATGATTTGAAATAGA
66 AAGGTTGTACGAACAAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCCA-AATGATTTGAAATA-A
* * * * ** *
5591 TAATTGTTC-ATATAGTCTTAACTATTTGAACCGGTTCACCAATTAAAT
129 TAATTGCTCTA-ATAGTCTTAACCATGTGAACCGATTCACCAAAGAAAC
* * * **
5639 TTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAG-TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT
1 TTATGTTTTAAATCTCTTACTTATT-AGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT
5693 ATTTTATTAC
Statistics
Matches: 193, Mismatches: 33, Indels: 14
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.01
176 40 0.21
177 97 0.50
178 7 0.04
179 7 0.04
180 32 0.17
181 8 0.04
ACGTcount: A:0.37, C:0.09, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (176 bp):
TTATGTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTTTAATTTGAAT
AAGGTTGTACGAACAAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCCAAATGATTTGAAATAATA
ATTGCTCTAATAGTCTTAACCATGTGAACCGATTCACCAAAGAAAC
Found at i:6515 original size:358 final size:357
Alignment explanation
Indices: 4741--6529 Score: 1399
Period size: 358 Copynumber: 5.0 Consensus size: 357
4731 CAACAAACAT
* * * * * **
4741 ATTTATATTTTAAATCTCTT-GTTATT-TATTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAAC
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TT
* * * * *
4802 CGAATACA-CTTCTATGATA-AAAAGCAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCT-TAACGATTT
65 TGAATA-AGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-TATAACGATTT
* * * * ** *
4863 GAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAGCAGATTTATTTTTT
127 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTT-TTTTTT
* * *
4928 TAAATTTCTTACTTATGAATTTTTGAAATATGAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAAC
191 TAAA--TCTT-CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGC
* * *
4992 TTGTATGATAAAAAATAATTGTTTTAT-AGCAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATCGATAA
251 TTGTATGATAAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* *** * * *
5056 TCATTCAAATATATATAATTATTTTAACTGATTTGGTAAACAA
315 TTATTCAAATAGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAACGA
* *
5099 ATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATT-TATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTA-G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * **
5163 CCATG--TAAGTTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAGTCAAAAGGTTATAACGATTC
64 --TTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATT-
* * * * * *
5226 T-AAATAAACAAATT-TTCAAATAGTAATAACTATTTAAACT-TTTCGATAAATAGATTTATTTT
126 TGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTT-TTTT
* * * * *
5288 TTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTAATTTATTCTAAATAA
189 TTTAAA--TC-TTCTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA
* ** *
5352 GCATGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCCA-AATGATTTGAAATA-A
249 GCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAATGATTTGAAATAGA
** * * * * * **
5414 TAATTGCTCTAATAGTCTTAACCATGTGAACTGATTCAGTAAA-GAA
312 TAATTATTCAAATAGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAACG-A
* * * *
5460 ACTTATGTTTTAAATCTCTTACTTATTAGTTTTT-GAAATATTATTAAA-T--TATTATTTTAAT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-TTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * ** * * *
5521 TTGAATAAGGTTGTACGAAC-AAAATAATTGTTTTGCGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGA
64 TTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGA
* * * * * *
5585 AATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACCGGTTC-ACCAATTAAATTTATTTTTTA
129 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAAATTTTTTTTTTA
* * * ** *
5649 ATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTAC-GAATAAAATA
193 A--ATCTT-CTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CTGAATAAGCTT
* * * * * * * *
5713 GTATGA-AAAGAACCAATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGTTACAATGATTTCATATCGATAATT
253 GTATGATAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
** * * *
5777 ATTCAAATAGTGA-ACT-ATTTGAAATGGTTTGGTAAAC-A
317 ATTCAAATAGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAACGA
*
5815 TATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 -ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATT-ATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * ** *
5878 TTTTGAAAAAACTTATATTAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGCAATAACAATTT
62 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTT
* * * * *
5943 AAAATAGATAATTGCTT-AAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAGAA-TTATTTT
127 GAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATA-AATTTTTTTT
* * * *
6006 TTAAATC-TCTTATAAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCTAAATAAGCTTG
190 TTAAATCTTCTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG
* *** * * * * * * * *
6070 CATGACCCAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCGTAA-CAATTGCAAAGATATAATTG
254 TATGATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTA
* * * * * *
6134 TTCATATAGCCTTAA-CTATTTGAATTGGTTTGGCAAACGG
318 TTCAAATAGCCATAATC-ATTTGAACTGATTTGGTAAACGA
* * *
6174 TTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* *
6239 TGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAA
65 TGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
* * * * * * * ** *
6304 ATAGATAGTTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTGCTTTTGAAA
130 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTTTTTTTTAAA
* * *
6369 TC-TCTTATTAATTCTTGAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGT
195 TCTTCTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA
* * * * ** * *
6433 TGAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGGTAGTTATTCAAA
259 TAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
*
6498 TGGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAAC
324 TAGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAAC
6530 TTTTGAAATA
Statistics
Matches: 1127, Mismatches: 240, Indels: 128
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
355 11 0.01
356 153 0.14
357 163 0.14
358 370 0.33
359 44 0.04
360 86 0.08
361 75 0.07
362 161 0.14
363 58 0.05
364 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (357 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAA
TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTTTTTTTTAAAT
CTTCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGATA
AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
GCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAACGA
Found at i:6806 original size:326 final size:325
Alignment explanation
Indices: 6210--6810 Score: 732
Period size: 326 Copynumber: 1.8 Consensus size: 325
6200 TAATTTTTAG
* * *
6210 AATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * *
6275 GATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAAT
66 GACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTGAAT
* *
6340 TGGTTTGGTAAACAAATTTGCTTTTGAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATAAATAAATTAGTA
131 TGGTTT-GTAAACAAATTTGCTTTTCAAATCTATTATTAATTCTTGAAATATAAATAAATTAGTA
*** * * *
6405 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAAGTAAT
195 TTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGCTGAAAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAAGTAAG
6470 AACAATTTGAAATAGGTAGTTATTCAAATGGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAACTTTTG
260 AACAATTTGAAATAGGTAGTTATTCAAATGGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAACTTTTG
6535 A
325 A
* * * *
6536 AATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAGTTGTTTTAT
1 AATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
* ** * *
6601 GACAAAACAAAAGGTTATGATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTACTTGAAC
66 GACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTGAA-
** ** * * *
6665 TT-G-TT-TAAA-TGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGATTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAA
130 TTGGTTTGTAAACAAATTT-GCTTTTCAAATC---T-ATTATTAA-TTCTTGAAATATAAATAAA
*
6725 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACT-AAAAA-AATTATTATATGACTAAACAA
189 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG--CTGAAAAACAATTATTATATGACAAAACAA
* * **
6788 AAGGTCAGAATGATTTGAAATAG
252 AAAGTAAGAACAATTTGAAATAG
6811 ATAAATATTC
Statistics
Matches: 230, Mismatches: 36, Indels: 18
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
321 4 0.02
322 13 0.06
324 2 0.01
325 11 0.05
326 189 0.82
327 10 0.04
328 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.12, T:0.40
Consensus pattern (325 bp):
AATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTACTTGAAT
TGGTTTGTAAACAAATTTGCTTTTCAAATCTATTATTAATTCTTGAAATATAAATAAATTAGTAT
TATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGCTGAAAAACAATTATTATATGACAAAACAAAAAGTAAGA
ACAATTTGAAATAGGTAGTTATTCAAATGGCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAACTTTTGA
Found at i:6882 original size:503 final size:510
Alignment explanation
Indices: 5635--8584 Score: 1443
Period size: 537 Copynumber: 5.6 Consensus size: 510
5625 TTCACCAATT
* * * * * *
5635 AAATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
1 AAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ATTATTAATTTTTAG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
*** ** * * * * * * * *
5699 TTACGAATAAAATAGTATGAA--AAGAACCAATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGTTACAATGAT
64 TTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAA-AA-AAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGAT
* * * * * * * *
5762 TTCATATCGATAATTATTCAAATAG--TGAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAACATATTTACTTT
127 TTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACACATTTATTTT
* * * *
5825 TTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAA
192 TTAAATCTC---TT-ATTAATTTT-TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAG
* * * *
5889 CTTATAT-TAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGCAATAACAATTTAAAATAGATA
252 CTTGTATGT-A-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TAATAACAATTTGAAATAGATA
* * ** * ** *
5953 ATTGCTT-AAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTT
314 GTT-ATTCAAATAGCCATAAGTATTTGAAC----T-GG---A-AG--TT-TAGTGTAAATCT-TT
* * ** * * ** * *
6017 ATAAATTTTGGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTA-TTCTAAATAAGCTTGCATGACCCAAA
365 ATTAA---T---AATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTC-AGATAAGCTTTTATGAACTAAA
* * * * * * * * * *
6081 ACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCGTA-ACAATTGCAAAGATATAATTGTTCATATAGCC
423 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGA-ACTT-TAAATAAAAAATTATTCAAATAGTC
* *
6145 TTAA-CTATTTGAA-TTGGTT-TGGCAAAC
486 -AAATCTACTTGAACTT-GTTAT---AAAC
*** * *
6172 GGTTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTAT
1 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * **
6237 TTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTTATAACAATT
65 TTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAA-AATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAAAATGATT
* * * * * **
6300 TGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTTGGTAAACAAATTTGCTTTT
128 TGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACACATTTATTTTT
* * * * *
6365 GAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA
193 TAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTA
* * *
6430 TGTTGAAAAACAATTGTTATATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAGGTAGTTATTC
258 TG-TAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TAATAACAATTTGAAATAGATAGTTATTC
* *
6495 AAATGGCCATAA-TCATTTGAACT-G-A-TTT-G-GTAAA-C-TT-TTGA-AATATTAATAAAGT
321 AAATAGCCATAAGT-ATTTGAACTGGAAGTTTAGTGTAAATCTTTATTAATAATATTAATAAAGT
** * *
6550 AGCATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAGTTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
385 AGCATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * *
6615 TTAT-GATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAA-CTACTTGAACTTGTT-TAAA-
450 TCATAGA--ACTTTAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCAAATCTACTTGAACTTGTTATAAAC
** * *
6674 TGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGATTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 AAATTTATTTTTT-AAATCTCTT-ATTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * *
6739 TTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTT
64 TTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTT
* * *
6804 GAAATAGATAAATATTCTAATAGTCTTAACTATTCGAATTGGTTTGGTAAACGCATTTATTTTTT
129 GAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACACATTTATTTTTT
* *
6869 AAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATGAGCTTGTA
194 AAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAT-TATGAATAAGCTTGTA
* * * * * * * * * * * *
6933 TAATCAAAAATAATTGTTTTACGAGAAAACAAAGATCATAACTATTTGAGATTGATATTTGTTCA
258 T-GTAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATAATAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCA
* *
6998 AATAGTCATAAGTATTTGAACTGGTTCAAAAATGGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTTATTAA
322 AATAGCCATAAGTATTTGAACTGG------AA--G-TTTAG--TGTAAA-----T-CTTTATTAA
* * *
7063 TTTTTGAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTA
370 ----T-AATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTA
* *
7128 TTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAGCAACTTTAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCAAATCTAT
430 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG-AACTTTAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCAAATCTAC
7193 TTGAACTTGTTCAGTAAAC
494 TTGAACTTGTT-A-TAAAC
* *
7212 AAATTTATTTTTTTAAATCTCTTATCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATTAGCATTATTTTA
1 AAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTT-AGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * *
7276 TTTTAAATAAGCTTGTATGAACTGACATAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTCAAAATGATTT
64 TTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTT
* * * **
7341 GAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAAACACATTTATTTTTT
129 GAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACACATTTA-TTTTT
* * * *
7406 TAAATCTCATGCTTATTACTTTTTGGAAT-TTATTGAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCT
193 TAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCT
* * * * * * ** * * *
7470 TTTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCACAATGATTTGAGATAGATAATTG
254 TGTATGTAAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATAATAACAATTTGAAATAGATAGTTA
* * * * *
7535 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTTCATGAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAA
318 TTCAAATAGCCATAAGTATTTGAA-------C-TG--GAAGTTTAG--TGTAAATCT-TTATTAA
*** * * *
7600 TTTTCAAAATATTAATAGCTTAGCATTATTTTACTATGA-ATAA---TTT-TGAA-T-GAACATA
370 ---T---AATATTAATAAAGTAGCATTATTTTA-TTTCAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACA-A
* * * * * * * * *
7658 TTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATA-ATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGA
427 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGA--ACTTTAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCA-AA
* * * *
7722 -CTATTTGAACCTGTTCGAAAAAT
489 TCTACTTGAACTTGTT--ATAAAC
* * * * * * * *
7745 AGATTTATTTTTAAAATATCTTACCTATTAATTTTTAGAGTATTAAGAAATTAGTACTATTTTTA
1 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTA-TTTTA
** * * * * *
7810 TTCCAAATAACCTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTATT
64 TTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATT
* * * * *
7874 TGAAATA-ATTAATTGTTC-AAGTAGTCATAACTATTTGAAATT-GCTTGTTAAATGA-ATTTAT
128 TGAAATAGA-TAATTATTCTAA-TAGTCTTAACTATTTG-AATTGGTTTGGTAAA-CACATTTAT
* ** * * * * *
7935 TTATTATCTCTTTTAGTTATCAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTACTATTTTATT-TCGAAT
189 TTTTTAAATCTCTTA--T-T-AATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAAT
* * * ** * *
7999 ACGCTTGTATG-AACATAAGCAATTAG-TTTATGATAAAACTAAAGGTCATAACTATTTGAAATA
249 AAGCTTGTATGTAA-A-AAACAATT-GTTTTATGACAAAAC-AAAAATAATAACAATTTGAAATA
* * * * * * *
8062 GATAATTGTTCAAAAAGTCAT-AGCTATTTGAACATGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAACT
310 GATAGTTATTCAAATAGCCATAAG-TATTTGAAC-TG-------GA-AG-TTTA--GTGTAAA--
* * * * * * *
8126 TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAACTTGTAC
360 TCT--TTATTAA----T--AATATTAATAAA-GTAGCATTATTTTATTTC-AGATAAGCTTTTAT
* * * * *
8189 GAAC-AGACACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ATGA-TTTGAAATAGATAATTTT
415 GAACTA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGA--ACTTT-AAATAAAAAATTAT
* * *
8251 TCAAATATTTATAA-CTATTTGAACTTGTT-TAGAA-
476 TCAAATAGTCA-AATCTACTTGAACTTGTTATA-AAC
* * * * *
8285 AATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTTGGAATATTAACAAATTAGTATTATT
1 AA-A-TTT-ATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTA-ATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTATT
** * * * * * * * * * **
8350 TTATTTCCAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGA-TGAAAAAAAAGGTCATAACA
61 TTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAAAATG
* * * * ** *
8414 ATTTTAAATAGATAATTACTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACATATTTA
125 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAACACATTTA
* * * ** *
8477 TTTTTAAAATCTTTTACTTGTTAGTTTTTGAAATATTAAAAAATTAATATTATTTTAATT-TGAA
188 TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-ATTATGAA
* * *
8541 TAAGCTTGTATGGAGAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAA
248 TAAGCTTGTATGTA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
8585 TGTCATAATG
Statistics
Matches: 1928, Mismatches: 334, Indels: 297
0.75 0.13 0.12
Matches are distributed among these distances:
502 53 0.03
503 236 0.12
504 7 0.00
506 14 0.01
507 87 0.05
508 5 0.00
510 1 0.00
514 5 0.00
515 3 0.00
517 1 0.00
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520 1 0.00
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529 4 0.00
530 1 0.00
531 5 0.00
532 20 0.01
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546 1 0.00
547 2 0.00
548 1 0.00
549 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (510 bp):
AAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGA
AATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAA
ATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGT
AAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATAATAACAATTTGAAATAGATAGTTATTCAAATA
GCCATAAGTATTTGAACTGGAAGTTTAGTGTAAATCTTTATTAATAATATTAATAAAGTAGCATT
ATTTTATTTCAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAG
AACTTTAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCAAATCTACTTGAACTTGTTATAAAC
Found at i:7315 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 6530--9174 Score: 2036
Period size: 181 Copynumber: 14.7 Consensus size: 181
6520 TTTGGTAAAC
* * * * *
6530 TTTTGAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAGTTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * ** * *
6595 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATGATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTAC
66 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** *
6659 TTGAACTTGTT---TAAA-TGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGA-TTATTAATT
131 TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTT-ACTTATTAA-T
* *** * *
6708 TTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTA
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * * ** * * * *
6772 TTATATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAAATATTCTAATAGTCTTAACTAT
66 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** **
6837 TCGAA-TTGGTTTGGTAAACGCATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAAT
131 TTGAACTT-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * *
6884 TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATGAGCTTGTAT-AATCAAAAATAAT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAA-CTAAAACAAT
* * * * * * * *
6947 TGTTTTACGAGAAAAC-AAAGATCATAACTATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAAGT
64 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * **** * *
7011 ATTTGAACTGGTTCA-AAAATGGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTTATTAAT
129 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAAT
* * * * *
7064 TTTTG-AATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTA-TTTCAGATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATT
* * * * * *
7127 ATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAGCAACTTT-AAATAAAAAATTATTCAAATAGTCA-AATC
65 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-C
*
7190 TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTA-TCATTAAT
128 TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * * *
7244 TTTTCAAATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTGACATAATTA
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * * ** * * *
7309 TTTTATGACTAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTAT
66 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
7374 TTGAACTAGTTC-GACAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCATGCTTATTACT
131 TTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * *
7426 TTTTGGAAT-TTATTGAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTTTATGAA-AAGAAACAATT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * ** *
7489 GTTTTATGACAAAA-TAAAGATCACAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
65 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *
7553 TTTGAA-TTGTTTTCA-TGAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAAT
130 TTTGAACTTG--TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
** ** * * * *
7601 TTTCAAAATATTAATAGCTTAGCATTATTTTACTATGAATAA--TT-T-TGAA-T-GAACATATT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA-ATT
* ** * * * *
7660 GTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTA
65 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
7725 TTTGAACCTGTTC-G-AAAAATAGATTTATTTTTAAAATATCTTACCTATTAAT
130 TTTGAACTTGTTCAGTAAACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * *** *
7777 TTTT-AGAGTATTAAGAAATTAGTACTATTTTTATTCCAAATAACCTTGTATGAA-TAAAAACAA
1 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAA
* * ** *
7840 TTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATA-ATTAATTGTTCAAGTAGTCATAA
63 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAA
* ** * ** * * *
7904 CTATTTGAAATTGCTT--GTTAAATGAATTTATTTATTATCTCTTTTAGTTATCAAT
127 CTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * *
7959 TTTTGGAATATTAATAAACTAGTACTATTTTATTTCGAATACGCTTGTATGAAC-ATAAGCAATT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT
* * * * *
8023 AG-TTTATGATAAAACTAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAGCT
65 -GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* ** * * *
8087 ATTTGAACATGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAA-CTTTTACTTATTAAT
129 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* *** * * *
8139 TTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAACTTGTACGAAC-AGACACAAT
1 TTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAAT
** * * *
8202 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATATTTATAACT
64 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * *
8267 ATTTGAACTTGTTTAG-AAA-ATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTT
129 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACA-AATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-AT
* * ** * * * * *
8321 TTTTGGAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * ** * *
8386 TTTTATGATGAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTACTCAAATAGTTATGACTA
66 TTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
8450 TTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTGTTAGT
130 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * ** *
8502 TTTTGAAATATTAAAAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGGAGAAAAAAAATTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
* * *** * * * *
8567 TTTTATGACAAAATAAAATGTCATAATGGTTTGAAATAAATAAGTG-TCTAAATATTTATAACTA
66 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTA
* ** * * * *
8631 TTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TTTGTATTTATTAAT
130 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCT-TACTTATTAAT
* * * * * *
8684 TGTCT-AAAGATTAATAAATTTGTATAATTTTA-TTTGAAATAGGCTTGTAT-AAATAGAAA-AT
1 T-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACTA-AAACA-
* * * * * * *
8745 TTTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAATCATAA
62 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * *
8810 TTATCTGAACTTGTTC-GTTAAACAGATTCATTTTTTAAATATCTTACTTATTAA-
127 CTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * *
8864 TTTTAAGAATATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAA
1 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAA
* * * * *
8927 TTGCTTTGTGATAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
63 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * *
8992 TATTTGCACTAG-TCAGGCT-AACAAATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAAT
128 TATTTGAACTTGTTCA-G-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAAT
* * * * * * *
9046 TTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGATTGCATGAACAAAAACAATTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
** ** * * *
9111 TTTTATGACAAAACAATTGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTTATAACTA
66 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
9175 ATTAAATCTC
Statistics
Matches: 1967, Mismatches: 402, Indels: 193
0.77 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
170 7 0.00
171 20 0.01
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173 3 0.00
174 4 0.00
175 32 0.02
176 107 0.05
177 177 0.09
178 23 0.01
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTG
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
Found at i:8091 original size:363 final size:359
Alignment explanation
Indices: 6530--9166 Score: 1982
Period size: 363 Copynumber: 7.3 Consensus size: 359
6520 TTTGGTAAAC
* * * * * * *
6530 TTTTGAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAGTTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-ATAACAATTG
* * * * *
6595 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATGA-TGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTA
65 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTA
* * * * * *
6658 CTTGAACTTGTT---TAAAT-GATTTATTTTTTCAAATCTTTTGA-TTATTAATTTTTTGAATGT
129 TTTGAACCTGTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTT-ACTTATTAA-TTTTTGAATAT
* * *
6718 TAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAA-AATTATTATATGAC
192 TAAGAAATTAGTATTATTTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * *
6781 TAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAAATATTCTAATAGTCTTAACTATTCG-AATTG
256 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATT-
*
6845 GTTTGGTAAACGCATTTATTTTTTAAATCTC---TTATTAAT
320 GTTT-GTAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAAT
* * * * *
6884 TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATGAGCTTGTAT-AATCAAAAATAAT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-C-ATAACAAT
* * * * * *
6947 TGTTTTACGAGAAAAC-AAAGATCATAACTATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAAG-
63 TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AGC
* * * *
7010 TATTTGAA-CTGGTTC-AAAAATGGCTTTAGTTTTT-AAATCTCTTGCTTTATTAATTTTTGAAT
127 TATTTGAACCT-GTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTAC-TTATTAATTTTTGAAT
* * * * * *
7072 ATT-AGTAAAGTAGTATTA-TTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGAACT-AAAACAATTATTTTAT
190 ATTAAG-AAATTAGTATTATTTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTAT
* *** * *
7134 GACAAAATAAAAGGTCATAGCAACTTT-AAATAAAAAATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTTGA
253 GACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGA
* * *
7197 ACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTATCATTAAT
316 AATTGTT-TGTAAAC-AATTTA-TTTTTTAAATCTCTTATTATTAAT
* * * ** *
7244 TTTTCAAATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAC-TGACATAATT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAT-A-ACAATT
* * * * * * *
7308 ATTTTATGACT-AAACAAAAAGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAAC
64 GTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGC
* * * * * * *
7371 TATTTGAA-CTAGTTCGACAAACACATTTATTTTTTTAAATCTCATGCTTATTACTTTTTGGAAT
127 TATTTGAACCT-GTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAT
* * * *
7435 -TTATTG-AATTAGTATTATTTTAATAT--GAATAAGCTTTTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTA
190 ATTA-AGAAATTAGTATTATTTTTAT-TCCAAATAAGCTTGTATGAATAA-AAACAATTGTTTTA
* * * * *
7495 TGACAAAA-TAAAGATCACAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-A
252 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
*
7558 ATTGTTT-TCATGAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC---TTATTAAT
317 ATTGTTTGT-A--AAC-AATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAAT
** ** * * ** *
7601 TTTCAAAATATTAATAGCTTAGCATTATTTTACTAT-GAATAATTTTGAATGAACAT----ATTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAACAATTG
** * * *
7661 TTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACAT-GACT
65 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAG-CT
* * *
7724 ATTTGAACCTGTTCGAAAAATAGATTTA-TTTTTAAAATATCTTACCTATTAATTTTTAGAGTAT
128 ATTTGAACCTGTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATAT
* * *
7788 TAAGAAATTAGTACTATTTTTATTCCAAATAACCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACA
192 TAAGAAATTAGTATTATTTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
7853 AAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATA-ATTAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAAATTG
257 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTG
* * * ** * *
7917 CTTGTTAAATGAATTTATTTATTATCTCTTTTAGTTATCAAT
321 TTTG-TAAA-CAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAAT
* * * *
7959 TTTTGGAATATTAATAAACTAGTACTATTTTATTTCGAATACGCTTGTATGAACATAAGCAATTA
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAA-CAATT-
* *
8024 G-TTTATGATAAAACTAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAGCTA
64 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTA
* * *
8088 TTTGAACATGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTT-AAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATT
129 TTTGAACCTGTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATT
* * * * * * *
8151 AATAAATTTA-TATTA-TTTTATTCAAAATAAACTTGTACGAACAGACACAATTGTTTTATGACA
193 AAGAAA-TTAGTATTATTTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
8214 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATATTTATAACTATTTGAACTTGT
257 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGT
* * * * *
8279 TTAGAAAATAGTTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTT
322 TT-GTAAACAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTA-AT
* * * * * *
8321 TTTTGGAATATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCCAATAAGCCTATATGAA-TTGATACAATT
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAT-A-ACAATT
* * ** *
8385 GTTTTATGATGAAAA-AAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTACTCAAATAGTTAT-GAC
64 GTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAG-C
* * * * *
8448 TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAT--ATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTGTTAGTTTTTGAAA
127 TATTTGAACCTGTTC-G-AAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AA
* * * ** * * *
8510 TATTAAAAAATTAATATTATTTTAATT-TGAATAAGCTTGTATGGAGAAAAAAAATTGTTTTATG
189 TATTAAGAAATTAGTATTATTTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * * *
8574 ACAAAATAAAATGTCATAATGGTTTGAAATAAATAAGT-GTCTAAATATTTATAACTATTTGAAC
254 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAACTATTTGAAA
* * *
8638 TTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TTTGTATTTATTAAT
318 TTGTTT-GTAAACA-ATTTATTTTTT-AAATCTCT-TA-TTATTAAT
* * * * * *
8684 TGTCT-AAAGATTAATAAATTTGTATAATTTTATTT-GAAATAGGCTTGTAT-AA-ATAGAAAAT
1 T-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACATA-ACAA-
* * * * * * *
8745 TTTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAATCATAA
62 -TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAG
* * * ** * * * *
8810 TTATCTGAACTTGTTCGTTAAACAGATTCATTTTTT-AAATATCTTACTTATTAATTTTAAGAAT
126 CTATTTGAACCTGTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAT
* * *** * * * *
8874 ATTAATAAATTAG-ATT-TATGTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGCTTTGTG
190 ATTAAGAAATTAGTATTAT-TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATG
* * ** * *
8937 ATAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGCACT
254 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAAT
* ** *
9002 AGTCAGGCT-AACAAATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAAT
319 TGT-TTG-TAAAC-AATTTATTTTTTAAATCTC-TTA-TTATTAAT
* * * * * *
9046 TTTTAAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGATTGCATGAACAAAAACAATTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-ATAACAATTG
* ** * *
9111 TTTTATGACAAAACAATTGGTCATAA-TGATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGT
65 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
9167 TATAACTAAT
Statistics
Matches: 1821, Mismatches: 343, Indels: 230
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
351 28 0.02
352 92 0.05
353 79 0.04
354 136 0.07
355 15 0.01
356 126 0.07
357 87 0.05
358 51 0.03
359 2 0.00
360 93 0.05
361 232 0.13
362 348 0.19
363 480 0.26
364 50 0.03
365 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (359 bp):
TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAACAATTGT
TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATT
TGAACCTGTTCGAAAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAAG
AAATTAGTATTATTTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGTTTGT
AAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAAT
Found at i:10042 original size:360 final size:361
Alignment explanation
Indices: 9247--11286 Score: 1098
Period size: 363 Copynumber: 5.6 Consensus size: 361
9237 ATATGTACAA
* *
9247 AAACATTTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * *
9312 CATAATTATTTGAATTGGTTCGACAAACATAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * **
9377 AAATATTAATAAATTTGTTTT-TTTTTTTATTCCAAATAAG-TTACTAAGAACTGAAAA-TTTTG
131 AAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATT-TT--AAATAAGCTT-GTATG-ACTGAAAACAATTG
* * * * *
9439 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATATAGAATTGTTCACATAGCCTTAACTAT
191 TTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAACTAT
* * * ** * *
9504 TCAAATTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTAGTAATTAATTTTTAGCACATTAT
255 TCAAATTAGTTTGACAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTAACTAACCAAATTTTAGCACAATAT
* *
9569 TACAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTGCAATCAG
320 TACAATAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATGCAATCAG
* * * * **
9611 AAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA-ATATAATTGTT-AAAGTAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAA-TAG
* *
9674 TC-TAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACATATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
65 TCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
9738 GAAATATTAGTAAATTAGTTTTATTTTATTTTGATTAGGCTTGTATGA-TGAAAAACAATTGTTT
130 GAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGACTG-AAAACAATTGTTT
* * * * *
9802 TATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTCGAAATAGATAATTGTTTAAAT-GACTGTAATTATTT
194 TATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACT-TAACTATTC
* * * * *
9866 GAATT-GATTTGATAAACT-TATTT-TTTTTTAAATCTCTAACTTACCAAATTTT-G-A-AATAT
257 AAATTAG-TTTGACAAA-TAAATTTATTTTTTAAATATCTAACTAACCAAATTTTAGCACAATAT
* * *
9925 TAATAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGC-A-CTG
320 T-ACAA-TAATATTATTTTATTTTGAATAAAC--TTATGCAATCAG
* * * * *
9969 AAACAATTGTTTTATGACACAATAAAAAGTCATAATGATTTTAAATATAAAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
10034 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-TAATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTA
66 CATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-
* * * *
10098 TG-AATGTTAAATAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAGCTG-AAACAATTAT
129 TGAAATATT-AATAAATTAGTTTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-CTGAAAACAATTGT
* * * * * *
10161 TTTATGACTAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTGAAAAAGTCTTAACTA
192 TTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-T-TGTTCAAATAGACTTAACTA
** * * * * * * * ** * * * *
10226 TTTGAACTATTTTGGC-AATCACATTTATTTTTTAAAT-CCTTA-TTA--ATGTTTGA-AATAGT
254 TTCAAATTAGTTTGACAAAT-AAATTTATTTTTTAAATATCTAACTAACCAAATTTTAGCACAAT
* ** * * * ** *
10285 AATA-AATTGGTTTTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATACCAATTATTCTG
318 ATTACAA-TAATATTATTTTATTTTGAATAA-ACT-TATG-----C-A--A-TCAG
* * * * * *
10340 AATA-AATGGTATTATTAT-ACAATAAAACAAAATGTTATAATGATTTAAAATAGATAATAGTTC
1 AA-ACAAT--TGTT-TTATGAC---AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTC
* * * * * * * * **
10403 AAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTA
59 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* ** * * *
10468 ATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAATAGAAAA-A
124 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGACT-GAAAACA
* * * * * *
10531 ATTGTTTTATGACCAAAGAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATATTTGTTCAAATAGTCATAA
187 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAA
* * * * * * * * * * ** * * *
10596 CTATTTAAA-CATGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATTTTATTTATTAATTTTTAGAAT
251 CTATTCAAATTA-GTTTGACAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTAACTAACCAAATTTTAGCAC
** * *** *** *
10660 TTTAATA-AATTAATATTATTTTATTCCAAATGTGCTTTTATG-AA-AAG
315 AATATTACAA-TAATATTATTTTATTTTGAATAAAC--TTATGCAATCAG
* * * ** * *
10707 AAACAATTGATTTATCACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
* * **** * * * * * * *
10772 CATAACTATTT-AAATGTATTAAAAAAAAAACAAATTTGTTGTTTAGAT-T-ATATTTATTAATA
66 CATAACTATTTGAACTG-GTT---CGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * ** * * **
10834 TTTGTAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTT-TCGTGAAT-AGATCCAAT
127 TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTTTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGT-ATGACTGA-AAACAAT
* * * * * * *
10896 TGCTTTCTGACAAAATGAAAAGTCATAATG-TGTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAAC
189 TGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAAC
* * * * * * * * * * *** * * *
10960 TATTTGAACTT--TTTAAGTAAATAGATTCATTTTTTTAATTCTCTTACTCATTGATTTTTGGAA
252 TA-TTCAAATTAGTTTGA-CAAATAAATTTA-TTTTTTAAATATCTAACTAACCAAATTTTAGCA
* * * * ** ** *
11023 TATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAAT-TG
314 CAATATTACAA-TAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTAT-GCAATCAG
* * * *
11071 AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
11136 CATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATCTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTGTTG
66 CATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
*** * * *
11201 AAATATTAATAAATTAAAAATTATTTTAATTCAAATAAG-TT-TATTGAAT-AGAAACAATTGTT
131 AAATATTAATAAATT-AGTTTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTA-TGACTGA-AAACAATTGTT
11263 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
193 TTATGACAAAAC-AAAAGTCATAA
11287 CAATTTTTTG
Statistics
Matches: 1311, Mismatches: 271, Indels: 189
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
356 5 0.00
357 4 0.00
358 64 0.05
359 50 0.04
360 170 0.13
361 103 0.08
362 154 0.12
363 229 0.17
364 213 0.16
365 26 0.02
366 1 0.00
367 6 0.00
369 2 0.00
371 9 0.01
372 2 0.00
373 45 0.03
374 16 0.01
375 77 0.06
376 97 0.07
377 5 0.00
378 32 0.02
379 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (361 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
AAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGACTGAAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAACTATTCAAAT
TAGTTTGACAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTAACTAACCAAATTTTAGCACAATATTACAAT
AATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATGCAATCAG
Found at i:10270 original size:539 final size:530
Alignment explanation
Indices: 9215--15692 Score: 2221
Period size: 543 Copynumber: 12.1 Consensus size: 530
9205 TATGTTAATA
* * * * * * * * *
9215 TTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGTACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAT
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT
* * * *
9280 AATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAAT-AGTCATAATTATTTGAATTGGTTCGACAAACATAA
66 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACT-GTAATTATTTGAATT-GTTTGACAAAC-TAA
* * * * * * * *
9344 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGT-TTTTTTTTTTATT
128 TTTTTTTTTAAATCTCTAAC-TTATAAATTTTGAAATATTAATAAA---GTAATATTATTTTATT
* * * * * *
9408 CCAAATAAG-TTACTAAGAACTGAAAATTTTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATAATTT
189 TCGAATAAGCTT-TTATG-ACTGAAAA-ATTGTTTTATGACACAAA-AAAA-GTCATAATGATTT
* * * * * * *
9471 GAAATATAGAATTGTTCACATAGCCTTAACTATTCAAA-TTAGTTTGGCAAA-TAAATTTATTTT
249 GAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCGGTAAACT-AATTTATTTT
* * * **
9534 TTAAATATCTTAGTAATTAATTTTTAGCACA-TTATTACAA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAA
312 TTAAATTTCTT-GTTATTAATTTTTAG-A-ATTTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
* * * *
9597 ACTTG--TGCAATCAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA-ATA
373 GCTTGTATG-AA-CAGAAACAATTATTTTATGACA-AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * *
9659 TAA-TTGTTAAAGTAGTCTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACATATTTATTTCTTAAATCTCT
435 TAATTTTTTAAA-TAGTCTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAA-CTC-
* * *
9723 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTT
497 T-CTTATTAATGTTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
* * * *
9758 TTATTTTATTTTGATTAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
* * * * *
9822 TAACGATTCGAAATAGATAATTGTTTAAATGACTGTAATTATTTGAATTGATTTGATAAACTTAT
65 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACTGTAATTATTTGAATTG-TTTGACAAACTAAT
* *
9887 TTTTTTTTAAATCTCTAACTTACCAAATTTTGAAATATTAAT-AAGTAATATTATTTTATTTTGA
129 TTTTTTTTAAATCTCTAACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGA
*
9951 ATAAGCTTTTATGCACTGAAACAATTGTTTTATGACACAATAAAAAGTCATAATGATTTTAAATA
193 ATAAGCTTTTATG-ACTGAAA-AATTGTTTTATGACACAA-AAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* *
10016 TAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACTAATTTATTTTTTTAATTT
255 TAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACTAATTTATTTTTTAAATTT
*
10081 CTTGCTTATTAA-TTTTATGAATGTTAAATAAATTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
320 CTTG-TTATTAATTTTTA-GAAT-TT-AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * **
10145 GAGCTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTTT
381 GAACAGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-TTTT
* * * *
10210 GAAAAAGTCTTAACTATTTGAACTATTTTGGCAATCACATTTATTTTTTAAA-TC-CTTATTAAT
444 -AAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAACTCTCTTATTAAT
*
10273 GTTTGAAATAGTAATAAATTGGTT
507 GTTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
** *
10297 TTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATACCAATTATTCTGAATAAATGGTATTATTAT-ACA
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA--AA--A-AC--AAT---T-G--TT-TTATGAC-
* *
10361 ATAAAACAAAATGTT-ATAATGATTTAAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATG--ATTATTTGA
51 --AAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GAC-TGTAATTATTTGA
* * * * *
10423 ACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA
111 A-TTGTTTGACAAACTAATTT-TTTTTTAAATCTCTAACTTATAAATTTTGA-AATATTAATAAA
* * * *
10488 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGAC-CAAAGAAA
173 GTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGACT-G-AAAAATTGTTTTATGACACAAA-AAA
* * *
10552 AGATCATAATGATTTGAAATA-AATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTCGATA
235 AG-TCATAATGATTTGAAATATAA-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTA
* *
10616 AAC-AGATTTATTTTTTAAATATT-TTATTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAATATTAT
298 AACTA-ATTTATTTTTTAAAT-TTCTT-GTTATTAATTTTTAGAA-TTTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * *
10679 TTTATTCCAAATGTGCTTTTATGAAAAGAAACAATTGA-TTTATCACAAAACAAATGGTCATAAC
359 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT-ATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAAC
* * *** *
10743 AATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AAAT-GTATTAAAAAAAAAACAAA
422 AATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGT-TT----GGCAAACACA
* * * * * * * * *
10806 TTTGTTGT-TTAGATTATATTTATTAATATTTGTAATATTAATAAATTTA-TA
481 TTTATT-TCTTAAACTCT-CTTATTAATGTTTGAAATAGTAATAAA-TTAGTT
* * * ** * * *
10857 TTATTTTATTCGAAATAAGCTT-TCGTGAATAGATCCAATTGCTTTCTGACAAAATGAAAAG-TC
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT-ATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTTC
* * * * * * *
10920 ATAATG-TGTTGAAATAGATAATTGTTTAGAT-AGTCATAACTATTTGAACTT-TTTAAGTAAA-
64 ATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACT-GTAATTATTTGAA-TTGTTTGA-CAAAC
* * * * * * * *
10981 TAGATTCATTTTTTTAATTCTCTTACTCATTGATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
125 TA-ATT--TTTTTTTAAATCTCTAACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT
* * * * * * *
11046 ATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATTACA-AAACAAAAGGTCACAATGAT
186 ATTTCGAATAAGCTTTTA-TGACTGAAA-AATTGTTTTATGACACAAA-AAAA-GTCATAATGAT
* * * * * *
11110 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-ATATTTATCT
247 TTGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACTA-ATTTATTT
* * * ** *
11174 TTTAAATCTT-TTACTTTTTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAAAAATTATTTTAATTCAAAT
311 TTTAAAT-TTCTT-GTTATTAATTTTTAG-AAT-TTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAAT
* * *
11237 AAG-TT-TATTGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAA-TT----T--
371 AAGCTTGTA-TGAACAGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * * * *
11293 -T--TTGTTCAAATAATCATAA-TGATTTGAACTTA-TTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATC
434 ATAATTTTTTAAATAGTC-TAACT-ATTTGAAC-TAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAA-C
* * * * *
11353 TTTAACTTATTAATTGCCTT--AATATTAATAAATTTGTA
495 TCT--CTTATTAA-TG-TTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
* * * * *
11391 TTATTTTATTCGAAATAAACTTGTATGAATAGAAGA-AATCT-TTTTATG-----A-TAAGGTT-
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGTTC
* * * * * * * * * * *
11447 ATAGTTATTTCAAATAGATAACTATTTAAAT-AGTTGTAATTATTTAAACTTG-TTCAGTAAACA
64 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGA-CTGTAATTATTTGAA-TTGTTTGA-CAAACT
* * ** *
11510 AATTTATTTTTTAAATCTCTTAA-TTATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTAT
126 AATTT-TTTTTTAAATCTC-TAACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTAT
** * * * **
11574 TTCGAATGTG-TTTATACGAACTGAAATAA-TCTTTTATGACA-AAAAAAGGGTCATAACAATTT
188 TTCGAATAAGCTTT-TATG-ACTGAAA-AATTGTTTTATGACACAAAAAA-AGTCATAATGATTT
* * * * * * * * * *
11636 GAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAAC-ATATTTGTTTTT
249 GAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACTA-ATTTATTTTT
* * ** * *
11700 TTAATTTTTTACCTATTAATTGTT-GAGATATTAAT-AATTAGTATTATTTTA-ATCAGAATAAG
313 TAAATTTCTT-GTTATTAATTTTTAGA-AT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAG
** * * * * * *
11762 CTTGTATGAATGGAAACTATTGTTTATAAT-A-AAACAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAAATA
374 CTTGTATGAACAGAAACAATTATTT-T-ATGACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
** * * *
11825 ATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-G-ATA-A-A---A------AGA---T-TT
437 ATTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAACTCTCTT
* * *
11873 A-T--T-TTTGAAATATTCATAAATTAGTA
501 ATTAATGTTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
* * * * * *
11899 TTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTA-G-----------G-TCAT
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT
* * * * * * * * **
11951 AATGATTTGAAATAAACAATTATTCAAAT-AGTCATAATTATTAGAACTGGTTAGGTAAA-TAGA
66 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACT-GTAATTATTTGAA-TTGTTTGACAAACT--A
* * * * ** * *
12014 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCCTTTTATTTTATTTT
127 ATTTTTTTTTAAATCTCTAACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTC
** *
12079 GAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGACA-AAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAA
191 GAATAAGCTTTTATG-ACTG-AAAAATTGTTTTATGACACAAA-AAAA-GTCATAATGATTTGAA
*** * * * * ** *
12143 ATAGGTAATTGTTC--AT--T--TGAACTTTTTGAACTGGCTCGACAAACAAATTT-TATTTTTA
252 ATATAAAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACTAATTTAT-TTTTTA
* * * * * * *
12201 AATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTACTATTATATTATTTCAAATAAGCTTG
315 AATTTCTT-GTTATTAATTTTTAGAAT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * * * * * *
12266 TATAAACATAAATAATTGTTTTATGATAGAAC-AAAGGTCTATTTTTTAAATAATTCATTTGAAG
378 TATGAACAGAAACAATTATTTTATGACA-AACAAAAGGTC-A-----T-AA-CA---ATTTGAAA
* * * * ** **
12330 TATACAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACTGATTTATTT-TTAAA-
431 TAGATAATTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAAC
* * * * * *
12393 TCACTTATTAATTTTTGAAAGATTAAGAAATTAGTA
495 TCTCTTATTAATGTTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
* * * * * * *
12429 TTATTTTATT-TCGAACAACCTTGTATG-ATAAAAAACAATTGTTATATGACTAAGCAAAAGGT-
1 TTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTC
* * ** * ** *
12491 ATTAATGATTTGAATTAGATAATTGTT-AAGATGGCCAT-ATCTATTT-AAGCATGTTCAATAAA
64 A-TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATGACTGTAAT-TATTTGAA--TTGTTTGACAAA
** * * * * *
12553 -TATATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATCTTAATAAATTAGTATTGTT
124 CTA-A-TT-TTTTTTTAAATCTCTAACTTA-TAA-ATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATT
* * * * * * *
12616 TTATTTTGAATAAGCTTGTATTAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAAAAAAAAGTCAGAACGA
184 TTATTTCGAATAAGCTTTTA-TGACTGAAA-AATTGTTTTATGAC-ACAAAAAAAGTCATAATGA
* * * * * * *
12681 TTTGAAATAGATAATCGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAAA--ACA--CA-
246 TTTGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCGGTAAACTA-ATTTAT
* * *
12740 --TTT--A----TT-TT-TT-A---TT---A--T--TAAATTAGTATTATCTTA-ATCGAATAAG
309 TTTTTAAATTTCTTGTTATTAATTTTTAGAATTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG
* * * * * * * * *
12783 CATATATGAAAAGAAACAATTGTTCTATGACATAA-TAAAGAT-ATAACAATTTGAGATATATAA
374 CTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACA-AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAA
* * * * ** * * *
12846 TTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTAATTCAGTAAACAGATTTA-GTCTTTAATA-T-TCT
438 TTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTC-TTAA-ACTCTCT
* ** * * * *
12908 TATTAAT-TTTCAAAATCTTAATGAATCAATA
500 TATTAATGTTT-GAAATAGTAATAAATTAGTT
* * *
12939 TTATTTTATTCTAAATAA-TTATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCT-TGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
** * * * *
13003 TAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATTGACATG--ATTATTTAAACTTATTTTG-TAAAC-
65 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TGAC-TGTAATTATTTGAA-TT-GTTTGACAAACT
* * * * * * **
13064 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATCAATTTTTAGAATATTAATAGATTTGTATTATTTTA-
126 A-ATTT-TTTTTTAAATCTCTAACTTATAAATTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATTTTAT
* * * * **
13128 TTCAGAACAAACTTATATGAGC-AAAAACATT-TATTCTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACAA
188 TTC-GAATAAGCTTTTATGA-CTGAAAA-ATTGT-TT-TATGACACAAA-AAAA-GTCATAATGA
* * * * * * * * **
13190 TTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-CGATTAGGTAAACAAAACTATT
246 TTTGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCGGTAAACTAATTTATT
* ** * * *
13254 TTTTAAATCTCTTACATATT-ATTTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAAT
310 TTTTAAATTTCTT-GTTATTAATTTTTAG-AAT-TTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAAT
* *** * * *
13317 AAGCTAGTATGAGTTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA----AT---GATTTGAAATAGA
371 AAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * *
13375 TAATTGTTTATATAGTCTTAACTATTTGAACAAGTTTAGCAAACAAATTTATTT-TCTAAA-TCT
435 TAATTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCT-TAAACTC-
* * * ** * *
13438 TAGTTATTAATTTTTGAAATATTTTTATATTAGTA
497 T-CTTATTAATGTTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
* * * * * *
13473 TTATTTAATT-TCAAAGAAGCTTGTATTAACAAAAATAATTGTTTTATGACAGAACAAAAGGTT-
1 TTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTC
* * * * * * * * * * * * *
13536 ATAACGATTTGAAGTATACAATTATTCAAAT-AGTTATAACTATTTAAACTGGTTCAGTAAACAT
64 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGA-CTGTAATTATTTGAATTGTTTGA-CAAAC-T
* * * * * * *
13600 ATTTATTTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATT
126 AATT-TTTTTTTAAATCTCTAACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATT
* * * * *** * * *
13665 TTGAATAAACATATATGAAAAAAAACAATTGTTATATGAC-CAAACAAAAGGTAATAATAATTTG
189 TCGAATAAGCTTTTATG-ACTGAAA-AATTGTTTTATGACACAAA-AAAA-GTCATAATGATTTG
* * * * * * * * * * *
13729 AAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATTATTATTTGAA-TTGATTCGATAAA-TAGATTCACTTTT
250 AAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCGGTAAACTA-ATTTATTTTT
* * * * * ** *
13792 TAAATTAC---TTATTAA-TTTTGGAATAGTAATCAATTAGTATAATTTTATTTTGACTAAGCTT
313 TAAATTTCTTGTTATTAATTTTTAGAAT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
*** * * * ** *
13853 GTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAATGATTTTAAATAGAT-ATTT
377 GTATGAACAGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTT
* * * * * ** * *
13917 GTTCAAATAGTCATAACAATTTGAATTTGTTCGATAAACAAATTTA-TT-TTAAACTCTTGTTAT
441 -TTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAACTC-TCTTAT
* * * *
13980 TAATTTTTTGAATTATTAAGT-AATTAGTA
503 TAA-TGTTTGAAATAGTAA-TAAATTAGTT
* * *** * * * * *
14009 TTATTTAATTTTGGGTAAGCTTTTATGAACT-AAAACAATTG-TTTATGTCCAAACAAACGGTCA
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
* * * ** *
14072 TAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAAT-AGT-TATCATTATTTGAACTTGTTTG-GTAAGTA
65 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACTGTA--ATTATTTGAA-TTGTTTGACAAACTA
** * ** * * * *
14134 GATTTATTTTTTCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTTTTTTTAATGTTAATAAATTTAGATTATTT
127 -ATTT-TTTTTT-AAATC-TCTAACTTA-TAA--ATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTT
* * * * * * * * *
14198 TA-TTCGATATAAGCTTGTAAGATATGAAACAAATATTTTATGACTA-AATAAAAGGTTAGAACG
185 TATTTCGA-ATAAGCTTTTATGA-CTGAAA-AATTGTTTTATGAC-ACAA-AAAAAGTCATAATG
* * * * ** * * * *
14261 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTGTAACTATTTGAA-TTGGCTCAGCAAAC-ACATTTT
245 ATTTGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCGGTAAACTA-A-TTT
* * * * * **
14324 ATTTTTTAAATCTT-TTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTTTTTTA-ACCAA
307 ATTTTTTAAAT-TTCTT-GTTATTAATTTTTAGAAT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * ** *
14387 ATAAGCTTCTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGATAAA-ACAAAGATCTTAATGATTTGAGATT
369 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAACA-AAAGGTCATAACAATTTGA-AAT
** * * * * * *
14451 A-ATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTGGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC
432 AGATAATTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAA-C
* * *
14515 TCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
495 TC--TCTTATTAA-TGTTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
* * * * *
14554 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-GTCAAAAACAATTCTTTTATTACAAAACAAAA-TGTC
1 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGT-TC
** * * * ** *
14617 ATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCTATAATTATTTTAACTAATTTGATAAA-TAG
64 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACTGTAATTATTTGAA-TTGTTTGACAAACTA-
* * * * * * * ** * *
14681 ATTTATTTTATAAGTTTCTTACCTAT-TATTTTAATAAGTGCTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
127 ATTT-TTTTTTAAATCTCTAACTTATAAATTTTGA-AA-TATTAATAAAGTAATATTATTTTATT
* * * * * * *
14744 TCCATCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACA-AATCAAAAGATTATAACGATTT
189 TCGA-ATAAGCTTTTA-TGACTGAAA-AATTGTTTTATGACACAA-AAAAAG-TCATAATGA-TT
* * * * * * *
14808 TG-AATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAAATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTT
248 TGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACTAATTTA-TTTT
* * *
14872 TTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAA-AAATTAGTATTGA-TTTA-TTCTAAATAA
312 TTAAATTTC-TTGTTATTAATTTTTAGAAT-TTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTC-AAATAA
* * * * * * * *
14934 GCTTGAATGAAC-TAAACAACTGTTTTACGACTAAACAAAAGGTTATAACAATTTCAAACAGATA
373 GCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * *
14998 ATTGTTT-AATAATCTTAACCATTTGAA-TTGATTTGGTAAACA-ATTT-TTT-TTAAA-TCTCT
437 ATTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAG-TTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAACTCTCT
* * * ** * **
15057 TATTAATTTTTTAATTTTTATTAAATTAGCA
500 TATTAATGTTTGAAATAGTAATAAATTAGTT
* ** * *
15088 TTATTTTAATC-AGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAACAATTGTTTTACAACAAACAAAAAAGGTC
1 TTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGTTC
** * * * * * * * * *
15151 ATAACAATTTGGAATAGATAATCGTTCATATAATTTTAACTATTTGAATTGGTTTGGC-AATTAG
64 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGACTGTAATTATTTGAATT-GTTTGACAAACTA-
* * * * * * * *
15215 ATTTATTTTTTTTAATTTTTCTTGA-TTATTAACTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTC
127 A--T-TTTTTTTTAA-ATCTC-TAACTTA-TAAATTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATTT
* * ** * * * * *
15278 TA-TTCTAAATAAATAG-TTTCA--ACATGACCAATAGTTTGATGACAAAATAAAAAGTTATAAC
185 TATTTC-GAAT--A-AGCTTTTATGAC-TGAAAAATTGTTTTATGACACAA-AAAAAGTCATAAT
* * * * * * * * *
15339 AATTTGAAATAGATAATTATGCAGATAGTCAAAACTATTTGAAA-TGGTGT-AGTAAAC-ATATT
244 GATTTGAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTTGT-TCGGTAAACTA-ATT
* * * * *
15401 TACTTTTTAAA--TC-TCTTACTAATTTTCTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
306 TATTTTTTAAATTTCTTGTTATTAATTTT-TAGAAT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * *
15463 ATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAA-TTGAAATA
369 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACA-AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * * * *
15527 AATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAACTAGTTCGGTAAATA-ACTTTATTTTTTAAA-T
433 GATAATTTTTTAAATAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACA-TTTATTTCTTAAACT
* *
15590 CTCTTATTAATTTTTGAAATA-TCAATAAATTAGTA
496 CTCTTATTAATGTTTGAAATAGT-AATAAATTAGTT
* *
15625 TTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
1 TTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTC
15688 ATAAT
64 ATAAT
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Statistics
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AATTATTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCTAAC
TATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTCTTAAACTCTCTTATTAATGTTTGAAATAGTAA
TAAATTAGTT
Found at i:10680 original size:181 final size:180
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* * * * * * * * *
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* * * **
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * *
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* * *
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* * * ** * * *
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1 TATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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65 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAT
* * *
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* * * * * * * *
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1 TATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * *
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65 CATAATGATTTGAAATAGATAA-T-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAA
* * * *
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* * * *
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1 TATTATTTTATTTCGAATA-AACTTT-TATGAATA-GAA--A--C--AAT---T-G--TT-TTAT
* * * * * * * *
10358 -ACAATAAAACAAAATGTTATAATGATTTAAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGATTATTTG
50 GAC---AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ***
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112 AACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAA
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176 ATTAG
* * * *
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1 TATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
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66 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATA
* * * *
10622 TTTATTTTTTAAATATTTTATTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAA
131 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAG
* * *** * * * *
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1 TATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * ***
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66 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TT----GGTAA
* * * * * * *
10801 ACAAATTTGTTGTTTAGA--TTATATTTATTAATATTTGTAATATTAATAAATTTA-
126 ACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA-TTAG
* ** ** * * *
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1 TATTATTTTATTTCG-AATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGG
* * *
10918 TCATAATG-TGTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTT-TTTAAGTAAA
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* * * * * * *
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127 CATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAG
* * * * *
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1 TATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
11102 ACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA
66 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATA
* * * *
11167 TTTATCTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAAA
131 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AG
* * * * *
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1 TATTATTTTATTTCGAATAAACTTTTA-TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * *
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65 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * *
11336 GATTTATTTTTTAAATCTTTAACTTATTAATTGCCTT-AATATTAATAAATTTG
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* *
11389 TATTATTTTA-TTCGAAATAAACTTGTATGAATAGAAGA-AATCT-TTTTATG-------ATAAG
1 TATTATTTTATTTCG-AATAAACTTTTATGAATAGAA-ACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * ** * * **
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63 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC
* * * *
11509 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAG
128 ATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAG
*** * * * *
11563 TATTATTTTATTTCGAAT-GTGTTTATACGAACT-GAAATAA-TCTTTTATGACAAAA-AAAGGG
1 TATTATTTTATTTCGAATAAACTTT-TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
** * * * * *
11624 TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACA
64 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
* * * * *
11689 TATTTGTTTTTTTAATTTTTTACCTATTAATTGTTGAGATATTAAT-AATTAG
129 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-ATATTAATAAATTAG
* * * * * * * *
11741 TATTATTTTA-ATCAGAATAAGCTTGTATGAATGGAAACTATTG-TTTATAATAAAACAAAAAGT
1 TATTATTTTATTTC-GAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * * *
11804 AATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAAAAG
65 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAT
*
11869 ATTTATTTTTGAAAT
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Statistics
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* *
10730 AAATGGTCATAACAATTT
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* *
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1 AAAT
10787 GTATTAAAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAGTCATAACTATTT
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9203 AATATGTTAA
* * * * *
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* * **
9276 TCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGGTTCGACAAAC
64 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAAC
* * * * * *
9340 ATAATTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTTTTTTTT
128 ATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * *
9405 ATTCCAAATAAG-TTACTAAGAACT-GAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA
193 -TTCGAAATAAGCTTTC-ATGAA-TAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAATG
* * * * * * * * * * *
9467 ATTTGAAATATAGAATTGTTCACATAGCCTTAACTA-TTCAAATTAGTTTGGCAAATAAATTTA-
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* * * * * * *
9530 TTTTTTAAATATCTTAGTAATTAATTTTTAGCACATTATTACAA-TAG
316 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA-AATTAG
** * ** * * * *
9577 TATTATTTTATTTTGAATAAACTTGT-GCAATCAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGT
1 TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* ** * * *
9641 TATAACAATTTGAAA-ATATAATTGTT-AAAGTAGTC-TAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACA
65 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACA
* * * *
9703 TATTTATTTCTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTTTTATTTTATT
129 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
9768 TTG-ATTAGGCTTGT-ATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATT
194 TCGAAATAAGCTT-TCATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAG-TCATAATGATT
* * * * *
9830 CGAAATAGATAATTGTTTAAAT-GACTGTAATTATTTGAA-TTGATTT-GATAAACT-TA-TT-T
256 TGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT--TTTAG-TAAA-TAGATTTAT
* ** * * * *
9889 TTTTTTAAATCTCTAACTTACCAAATTTTGAAATATTAAT-AAGTAA
316 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
** * * ** * * * *
9935 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGCACTGAAACAATTGTTTTATGACACAATAAAAAGTC
1 TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
10000 ATAATGATTTTAAATATAAAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC-TA
66 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAT-
* * * *
10064 ATTTATTTTTTTAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTATG-AATGTTAAATAAATTAGTGTTATTTTA
130 ATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TGAAATATT-AATAAATTAGTATTATTTTA
* * * *
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192 TTTCGAAATAAGCTT-TCATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAAGTCATAATGA
* * * ** *
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254 TTTGAAATAGATAATT-GTTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTTAGTAAAT-AGATTTA
* * * *
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* ** * *
10295 TTTTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATACCAATTATTCTGAATA-AATGGTATTATTAT
1 TATTATTTTATTTC-AAATAA---ACT-T--AT----ATTAAT-TGAA-ACAAT--TGTT-TTAT
* * * * * * * *
10358 -ACAATAAAACAAAATGTTATAATGATTTAAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGATTATTTG
50 GAC---AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * ***
10422 AACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATA
112 AACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATA
* * * * *
10486 AATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAACTTTTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGACCAAAGA
176 AATTAGTATTATTTTATTTCGAAATAAGCTTTCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAA
* * * * * * *
10550 AAAGATCATAATGATTTGAAATAAATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTCGAT
241 AAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTAG-T
* * * * * * *
10615 AAACAGATTTA-TTTTTTAAATATTTTATTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAA
304 AAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* *** * * ** * * *
10673 TATTATTTTATTCCAAATGTGCTTTTATGAAAAGAAACAATTGATTTATCACAAAACAAATGGTC
1 TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * * ****
10738 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AAATGTATTAAAAAAAAAA
66 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT---CGGTAAA
* * * * * * * *
10802 CAAATTTGTTGTTTAGA--TTATATTTATTAATATTTGTAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT
127 CATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT
* ** * * *
10864 A-TTCGAAATAAGCTTTCGTGAATAGATCCAATTGCTTTCTGACAAAATGAAAAGTCATAATG-T
191 ATTTCGAAATAAGCTTTCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAATGAT
* *
10927 GTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTAAGTAAATAGATTCATTT
255 -TTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTT-AGTAAATAGATTTATTT
* * *
10992 TTTTAATTCTCTTACTCATTGATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
318 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
*
11037 TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTC
1 TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
11102 ACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA
66 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA
* * * ** *
11167 TTTATCTTTTAAATCTTTTACTTTTTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAAAAATTATTTTAATT
131 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT
* *
11232 C-AAATAAG-TTT-ATTGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-CAATT-
195 CGAAATAAGCTTTCA-TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAATGATTTG
* * * *
11292 ---T---T--TTGTTCAAATAATCATAA-TGATTTGAACTTATTTGGCAAATAGATTTA-TTTTT
258 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTT-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTT
* *
11347 TAAATCT-TTAACTTATTAATTGCCTT--AATATTAATAAATTTG
321 TAAATCTCTT-ACTTATTAATT--TTTGGAATATTAATAAATTAG
* * * *
11389 TATTATTTTA-TTCGAAATAAACTTGTATGAATAGAAGA-AATCT-TTTTATG-------ATAAG
1 TATTATTTTATTTC-AAATAAACTTATATTAATTGAA-ACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * ** * * *
11444 GTTATAGTTATTTCAAATAGATAACTATTTAAATAGTTGTAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAAC
63 GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC
* * * * *
11509 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTAT
128 ATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * ** **
11574 TTCG-AATGTG-TTT-ATACGAACT-GAAATAA-TCTTTTATGACAAAAAAAGGGTCATAACAAT
193 TTCGAAATAAGCTTTCAT--GAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGTCATAATGAT
* * * * * * * * * *
11634 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTGTTTT
255 TTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTTAGTAAATAGATTTATTTT
* * * *
11699 TTT-AATTTTTTACCTATTAATTGTT-GAGATATTAAT-AATTAG
319 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGA-ATATTAATAAATTAG
* * * * * * * * *
11741 TATTATTTTA-ATCAGAATAAGCTTGTATGAATGGAAACTATTG-TTTATAATAAAACAAAAAGT
1 TATTATTTTATTTCA-AATAAACTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * * * *
11804 AATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAAAAG
65 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAT
*
11869 ATTTATTTTTGAAAT
130 ATTTATTTTTTAAAT
11884 ATTCATAAAT
Statistics
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Consensus pattern (362 bp):
TATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA
TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
GAAATAAGCTTTCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
TAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAT
CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
Found at i:13175 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 12749--15691 Score: 1570
Period size: 181 Copynumber: 16.5 Consensus size: 179
12739 ATTTATTTTT
* * * * * *
12749 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGAATAAGCATATATGAA-AAGAAACAATTGTTCTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAACTTATATGAACAA-AAACAATTGTT-TATGA
* * * * * * * * *
12813 CATAA-TAAAGAT-ATAACAATTTGAGATATATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTA
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG
* * * * * **
12876 ATTCAGTAAACAGATTTAGTCTTT-AA--TATT-CTTATTAATTTTCAAAA
129 ATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * *
12923 TCTTAATGAATCAATATTATTTTATTCTAAAT-AA-TTATGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAACTTA--TATGAACAAAAACAATTG-TTTAT
* * * *
12986 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATTGACATGATTATTTAAAC
62 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* * * * *
13051 TTATTTTGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATCAATTTTT-AGAA
127 TGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * * *
13104 TATTAATAGATTTGTATTATTTTATTCAGAACAAACTTATATGAGCAAAAACATTTATTCTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA-AATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTT-TATGA
* * * * *
13169 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACCG
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG
** * *
13234 A-TTAGGTAAACAAAACTATTTTTTAAATCTCTTACATATTATTTTTTGAAA
129 ATTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ***
13285 TATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAGTTGAAAA-AATTGTTTTA
1 TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-CAAATAAACTTA-TATGA-ACAAAAACAATTG-TTTA
* * * *
13347 TGACAAAACAAAA----AT---GATTTGAAATAGATAATTGTTT-ATATAGTCTTAACTATTTGA
61 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-TTTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * * *
13404 AC-AAGTTTAGCAAACAAATTTATTTTCTAAA--TCTTAGTTATTAATTTTTGAAA
125 ACTGA-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
** * * * * * * *
13457 TATTTTTATATTAGTATTATTTAATTTCAAAGAAGCTTGTATTAACAAAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTG-TTTATGA
* * * * * * * *
13522 CAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTG
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG
* * * *
13587 GTTCAGTAAACATATTTATTTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
129 ATTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ** * *
13639 GATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAAAAAAAACAATTGTTATATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTT-TATGA
* * * * * * * * * * *
13704 CCAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATTATTATTTGAATTG
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG
* * * * * *
13769 A-TTCGATAAATAGATTCACTTTTTAAA----TTACTTATTAA-TTTTGGAA
129 ATTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * ** * * * ***
13815 TAGTAATCAATTAGTATAATTTTATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTG-TTTATGA
* * ** * * *
13880 CAAAACAAAAGTTTATAATGATTTTAAATAGAT-ATTTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAA-T
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTT-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * * *
13943 -TTGTTCGATAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTT-GTTATTAATTTTTTGAAT
128 GAT-TTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAA
* **** * * * *
13993 TATTAAGT-AATTAGTATTATTTAATTTTGGGTAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTATGT
1 TATTAA-TAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTATGA
* * ** * * * * * * *
14057 CCAAACAAACGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATCATTATTTGAACTT
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-T
* ** * * **
14122 G-TTTGGTAAGTAGATTTATTTTTTCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTTTTTTTAA
128 GATTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATC-TCTTACTTATTAA--TTTTTGAAA
* * * * * **
14176 TGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCGATATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAATAT-TTTA
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-AAATAAACTTATATGA-ACAAAAAC-AAT-TGTTTA
* * * * * * * ** *
14238 TGACTAAATAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTGTAACTATTTGAA
61 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* ** * * * * * *
14303 TTGGCTCAGCAAACACATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGGAA
126 CTGATTTAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ** * * * * *
14358 TATTATTAAATTAGTATTTTTTTAACCAAATAAGCTTCTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTG-TTTATGAC
* * ** * ** * *
14423 AAAAC-AAAGATCTTAATGATTTGAGATTA-ATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
65 AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA-AATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG
** * *
14486 ATTGGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAA
129 ATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAA
** * * ** * *
14538 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGGTCAAAAACAATTCTTTTATTA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATT-GTTTATGA
* ** ** * * *
14603 CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAAT-GGCTATAATTATTTTAACT
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTC-ATAACTATTTAAACT
* * * * * * * *
14667 AATTT-GATAAATAGATTTATTTTATAAGTTTCTTACCTATT-ATTTTAAT-AAG
128 GATTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT--TGAAA
** ** * * * **
14719 TGCTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTG-TTTATGA
* * * * * * * * *
14784 CAAATCAAAAGATTATAACGATTTTG-AATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAAATATTTGAACT
64 CAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-
* *
14848 TG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AA
127 TGATTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAA
* * * * *
14901 TGTTAA-AAATTAGTATTGA-TTTATTCTAAATAAGCTTGA-ATGAAC-TAAACAACTGTTTTAC
1 TATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTC-AAATAAACTT-ATATGAACAAAAACAATTG-TTTAT
* * * * * * * *
14962 GACTAAACAAAAGGTTATAACAATTTCAAACAGATAATTGTTT--AATAATCTTAACCATTTGAA
62 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-TTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * *
15025 TTGATTTGGTAAAC-AA-TT-TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTTAAT
126 CTGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * * **
15072 TTTTATTAAATTAGCATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTACAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA-AATAAACTTATATGAACAAAAACAATTG-TTTATGA
* * ** * * ** * *
15136 CAAACAAAAAAGGTCATAACAATTTGGAATAGATAATCGTTCATATAATTTTAACTATTTGAATT
64 CAAA-ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
* * * ** * * * *
15201 GGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTTTAATTTTTCTTGA-TTATTAACTTTT-AGAA
128 GATTTAGTAAACAAATTTA--TTTTTTAA-ATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * ** * *
15256 TATTATTAAATTAGTATTATTCTATTCTAAATAAA--TAGTTTCAACATGACCAATAGTTTGATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAACTTA-TATGAACAAAAACAATTGTTT-ATG
* * * * * * *
15319 ACAAAATAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATGCAGATAGTCAAAACTATTTGAAA-
63 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAAC
* * * * *
15383 TGGTGTAGTAAACATATTTACTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTCTAAAA
127 TGATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAA
* * * *
15433 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATT-GTTTATGA
* * * * * **
15498 TAGAACAAAAGGTTATAACAA-TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAACT-
64 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTG
** * *
15561 AGTTCGGTAAATAACTTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAA
129 A-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * *
15609 TATCAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAACTTATATGA-ACAAAAACAATTG-TTTATG
15673 ACAAAACAAAAGGTCATAA
63 ACAAAACAAAAGGTCATAA
15692 TTATATTAAT
Statistics
Matches: 2147, Mismatches: 476, Indels: 290
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
170 5 0.00
171 20 0.01
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174 109 0.05
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTATGACA
AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGAT
TTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
Found at i:15369 original size:899 final size:890
Alignment explanation
Indices: 13513--15684 Score: 2083
Period size: 899 Copynumber: 2.4 Consensus size: 890
13503 AAAAATAATT
* * * * *
13513 GTTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTTATAACTA
1 GTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATA-ATAATTA-TCAAATAGTCATAACTA
* * * *
13578 TTTAAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTTAAAACTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAGAT
64 TTTGAACT-GTTGAGTAAACATATTTA-TTTTTT-AAACTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATAT
* * *
13642 TAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAAAAAAAACAATTGTTATATGACCA
126 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAAAAAAAACAATTCTTATATGACAA
** * * * *
13707 AACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATTATTATTTGAATTGATT
191 AACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATT
*
13772 CGATAAATAGATTCACTTTTTAAATTACTTATTAATTTTGGAATAGTAATCAATTAGTATAATTT
256 CGATAAATAGATTCACTTTTTAAATTACTTATTAATTTT-GAATAGTAATAAATTAGTATAATTT
** * * *
13837 TATTTTGACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAATGAT
320 TATTTCCACTAAGCTTGTATGAACTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACGAT
* * * *
13902 TTTAAATAGATATTTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAATTTGTTCGATAAACAAATTTATTTT
385 TTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACAATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTT
* * * *** *
13967 AAACTCTTGTTATTAATTTTTTGAATTATTAAGTAATTAGTATTATTTAATTTTGGGTAAGCTTT
450 AAACTCTTCTTATTAATTTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTAATTCTAAATAAGCTTG
* * * * * ** *
14032 TATGAACTAAAACAATTGTTTATGTCCAAACAAACGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTGTT
515 AATGAACTAAAACAACTGTTTACGACCAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAACAAATAATTGTT
* * ** * *
14097 CAAATAGTTATCATTATTTGAACTTGTTTGGTAAGTAGATTTATTTTTTCAAATCATTTCCTTAT
580 CAAATAATTATAACCATTTGAACTTGTTTGGTAAG-ACAATTATTTTTTCAAATC--TTCCTTAT
* *
14162 TAATTTTTTTTTAATGTTAATAAATTTAGATTATTTTATTCGATATAAGCTTGTAAGATATGAAA
642 TAA--TTTTTTTAATGTTAATAAATTTAGATTATTTTAATCGATATAAGCTTGTAAGATATAAAA
** * * * * * *
14227 CAAATATTTTATGACTAAATAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTGT
705 CAAATATTTTACAACAAAAAAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATCATTCTAATAATTGT
* *
14292 AACTATTTGAATTGGCTCAGCAAACACATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGGA
770 AACTATTTGAATTGGCTCAGCAAACACATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTACTAACTTTTAGA
* * * * * * *
14357 ATATTATTAAATTAGTATTTTTTTAACCAAATAAGCTTCTATGATCAGAAACAATT
835 ATATTATTAAATTAGTATTATTCTAACCAAATAAGATACTATCAACAGAAACAATA
* * * * *
14413 GTTTTATGATAAAACAAAGA-TCT-TAATGATTTGAGATTAATAATTGCTCAAATAGTCATAACT
1 GTTTTATGACAAAACAAAAAGT-TATAACGATTTGA-AATAATAATT-ATCAAATAGTCATAACT
* *
14476 ATTTGAACTAATTGGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATAT
63 ATTTGAACT-GTTGAGTAAACATATTTATTTTTTAAA-CTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATAT
* * * *** * *
14541 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGGTCAAAAACAATTCTTTTATTACAA
126 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAAAAAAAACAATTCTTATATGACAA
* * * * *
14606 AACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCTATAATTATTTTAACTAATT
191 AACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATT
* * * * *
14671 TGATAAATAGATTTA-TTTTATAAGTTTCTTACCTATTATTTT-AATAAGTGCTAATAAATTAGT
256 CGATAAATAGATTCACTTTT-TAAATTACTTA--T-TAATTTTGAAT-A--G-TAATAAATTAGT
* * * *
14734 ATTATTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGATT
313 ATAATTTTATTTCCA-CTAAGCTTGTATGAACTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATT
* * *
14798 ATAACGATTTTGAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAA-ATATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA
377 ATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACA-ATTTGAACTTGTTCGATAAACAA
*
14862 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAA-TGTTAA-AAATTAGTATTGATTT-A
441 ATTTA---TTTTAAA-CTC-TTCTTATTAATTTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATT-ATTTAA
* *
14924 TTCTAAATAAGCTTGAATGAACT-AAACAACTGTTTTACGACTAAACAAAAGGTTATAACAATTT
500 TTCTAAATAAGCTTGAATGAACTAAAACAACTG-TTTACGACCAAACAAAAGGTCATAACAATTT
* * *
14988 CAAACAGATAATTGTT-TAATAATCT-TAACCATTTGAA-TTGATTTGGTAA-ACAATT-TTTTT
564 AAAACAAATAATTGTTCAAATAAT-TATAACCATTTGAACTTG-TTTGGTAAGACAATTATTTTT
* *
15048 T-AAATC-T-CTTATTAA-TTTTTTAATTTTTATTAAA-TTAGCATTATTTTAATCAGA-ATAAG
627 TCAAATCTTCCTTATTAATTTTTTTAA-TGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTAATC-GATATAAG
* * * * *
15107 CTTGTATGA-ATAAAACAATTGTTTTACAACAAACAAAAAAGGTCATAACAATTTGGAATAGATA
689 CTTGTAAGATATAAAACAAATATTTTACAACAAA-AAAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATA
* * * ** ** * * * *
15171 ATCGTTC-ATATAATTTTAACTATTTGAATTGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTTTAATTTTT
753 ATCATTCTA-ATAATTGTAACTATTTGAATTGGCTCAGCAAACACATTT-TATTTTTTAAATCTT
* * * * *
15235 CTTGA-TTATTAACTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTCTATTCTAAATAA-ATAGTTTC
816 -TT-ACTTACTAACTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTCTA-ACCAAATAAGATACTATC
*
15298 AACATG-ACCAATA
878 AACA-GAAACAATA
* * * * *
15311 GTTTGATGACAAAATAAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATGCAGATAGTCAAAACTA
1 GTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACGATTTGAAATA-ATAATTAT-CAAATAGTCATAACTA
* * * * * *
15376 TTTGAAATGGTGTAGTAAACATATTTACTTTTTAAA-TC--TCTTACTAATTTTCTAAAATATTA
64 TTTGAACTGTTG-AGTAAACATATTTATTTTTTAAACTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTA
*** * * * * * * * *
15438 ATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAA
128 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAAAAAAAACAATTCTTATATGACAAAA
* * * * * * * * *
15503 CAAAAGGTTATAACAA-TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTCGAACTAGTTCG
193 CAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCG
* * * *
15567 GTAAATA-ACTTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTGAAATA-TCAATAAATTAGTATTAT
258 ATAAATAGA-TTCACTTTTTAAAT-TACTTATTAA-TTTTG-AATAGT-AATAAATTAGTATAAT
* * ** *
15629 TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
318 TTTATTTCCACTAAGCTTGTATGA-ACTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
15685 GTCATAATTA
Statistics
Matches: 1040, Mismatches: 184, Indels: 106
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
889 1 0.00
890 58 0.06
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Consensus pattern (890 bp):
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TGAACTGTTGAGTAAACATATTTATTTTTTAAACTCTTTCTTATTAATTTTTTGAAATATTAATA
AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAAAAAAAACAATTCTTATATGACAAAACAA
AAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCGATA
AATAGATTCACTTTTTAAATTACTTATTAATTTTGAATAGTAATAAATTAGTATAATTTTATTTC
CACTAAGCTTGTATGAACTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACGATTTTAAA
TAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACAATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTAAACTC
TTCTTATTAATTTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTAATTCTAAATAAGCTTGAATGAA
CTAAAACAACTGTTTACGACCAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAACAAATAATTGTTCAAATA
ATTATAACCATTTGAACTTGTTTGGTAAGACAATTATTTTTTCAAATCTTCCTTATTAATTTTTT
TAATGTTAATAAATTTAGATTATTTTAATCGATATAAGCTTGTAAGATATAAAACAAATATTTTA
CAACAAAAAAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAGATAATCATTCTAATAATTGTAACTATTTGAA
TTGGCTCAGCAAACACATTTTATTTTTTAAATCTTTTACTTACTAACTTTTAGAATATTATTAAA
TTAGTATTATTCTAACCAAATAAGATACTATCAACAGAAACAATA
Found at i:16146 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 15784--17635 Score: 1211
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15774 TTTATACCAT
* ** * ** * * * *
15784 TTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAGTGGA-CATAACTAT
1 TTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AATTATGACTAT
* ** * *
15848 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTCATCATAAAGCAATTGTATC-AGT
64 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * * * *
15912 TCTTATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAA
128 TCATAAAAGCTTATTCTAAATAAAATAA-AATAAATTATTAATATTCAAAAAA
* *
15965 TTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
1 TTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * *
16030 TGAATAATTTTATATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTT-TCATAAAACAATTGTTTCTATTC
65 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
*
16094 ATAAAAGCTTATTCTAAATAAAATAAAATAAAATTATTAATATTAAAAAAA
130 ATAAAAGCTTATTCTAAATAAAATAAAAT-AAATTATTAATATTCAAAAAA
* * * *
16145 TTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTGAACATGTTCAAATAATTATGACTATT
1 TTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * * *
16209 TGAACAGTTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAACTTTTATTTTGTTAT-AAACTAATTGTTTTTGT
65 TGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTAT
* * * ** * *
16272 TCATACAAG-TATATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTAATAATATTCCAAAAA
128 TCATAAAAGCT-TATTCTAAATAAAATAA-AATAAATTATTAATATTCAAAAAA
* * *
16325 TTAAGAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTG--T----------TT-AAATAATTATGA-TAG
1 TTAA-TAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTA-
* * *
16376 TTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTA
63 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
16440 TTTATAAAAGTTTATTC-ACAATAAAATAATACT-AATTATTAATATTCTAAAAA
127 TTCATAAAAGCTTATTCTA-AATAAAATAA-AATAAATTATTAATATTCAAAAAA
* ** ** * * *
16493 TTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCTATTTATTGAACAAGTTCTTATAATCATGTCCATT
1 TTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * *
16558 TGAATAATTATCTATTTTCAAATTATTATGACC-CTTGTTTTGTCATAAAGCACTTGTTTCTATT
65 TGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
** * * ** ***
16622 CA-AGAAAAATTA-T-TAAA-AAGATAATATTGATCTATTAATATTTTGAAAA
129 CATA-AAAGCTTATTCTAAATAAAATAAAATAAAT-TATTAATATTCAAAAAA
* * * * * * *
16671 CT-A-A-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTACC-AAAATAATTCACATAGTTATGACTATT
1 TTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * * * * *
16732 TGAACAATTATCTATCTGAAA-CTGTTATGATC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTTTT
65 TGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCTA
* * * * * * *
16795 TTTATAAAAGCTTATTCGAATTAAAA-AAATATTAATCTAATAGTATTC-CAAAA
127 TTCATAAAAGCTTATTCTAAATAAAATAAA-ATAAAT-TATTAATATTCAAAAAA
* *** * * *
16848 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATT
1 TTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * ** *
16913 AGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTCTTTACTCATAAAACAATTATTTC-AGTT
65 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * ** *
16977 CATACATGCTTATT-TAGAAT-AATTAATGCT-AATTGATTAACATTCAAAAAAA
129 CATAAAAGCTTATTCTA-AATAAAATAA-AATAAATT-ATTAATATTC-AAAAAA
* * ** *
17029 TTAATGAGCAAGTGATTTAAAAAAAATAAAACTGTTTACCAAACAAGTTCAAATATATT-TGACT
1 TTAAT-AGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA-ATTATGACT
* * * * *
17093 ATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTC-
62 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * **
17156 AGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-AAAAA
126 A-TTCATAAAAGCTTATTCTAAATAAAATAA-AATAAATTATTAATA-TTCAAAAAA
* * * ** ** * * *
17212 TTAATAAGCAAGAGATTTATAAACTAAAGCTGTTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTATCACTATT
1 TTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * * *
17277 TGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAACAATTGTTTTTGA-
65 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCT-AT
* ** * * * *
17340 TCATACAAGCTTATT-TGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTACAAAA
128 TCATAAAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAA-AATAAATTATTAATATTC-AAAAAA
* * * * * *
17394 TT-A-A-TAAGAGATTTAAAACATAAATGTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTA
1 TTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * * * * *
17456 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTATTATTTAGACATATAATAATTGTTT-TAGTTC
66 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * * *
17520 ATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAA
130 ATAAAAGCTTATTCT-AAATAAAATAA-AATAAATTATTAATATTCAAAAAA
* * * * *
17571 TTAATAATAAGAGATTTGAAAATATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGA-TATT
1 TTAATAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATT
17635 T
65 T
17636 TGTTTTGTCA
Statistics
Matches: 1320, Mismatches: 268, Indels: 167
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 14 0.01
167 9 0.01
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Consensus pattern (179 bp):
TTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
TAAAAGCTTATTCTAAATAAAATAAAATAAATTATTAATATTCAAAAAA
Found at i:16398 original size:169 final size:166
Alignment explanation
Indices: 16187--16520 Score: 456
Period size: 169 Copynumber: 2.0 Consensus size: 166
16177 TTTCTGAACA
*
16187 TGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTATTTTGT
1 TGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTATTTTGT
* * * *
16252 TAT-AAACTAATTGTTTTTGTTCATACAAGTATATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTAATAATA
66 TATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATAAAAGTATATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTAATAATA
16316 TTCCAAAAATTAAGAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATC
129 TTCCAAAAATTAA-AAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATC
* * * * *
16356 TGTTTAAATAATTATGA-TAGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTG
1 TGTTCAAATAATTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTATTTTG
* * * *
16420 TTATAAAACAATTGTTTCTATTTATAAAAGTTTATTCACAATAAAATAATACTAATTATTAATAT
65 TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTATATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATAATAT
* * *
16485 TCTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
130 TCCAAAAATTAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
16521 TCTATTTATT
Statistics
Matches: 146, Mismatches: 17, Indels: 7
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
166 14 0.10
167 8 0.05
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169 98 0.67
170 4 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (166 bp):
TGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTATTTTGT
TATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTATATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATAATATT
CCAAAAATTAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
Found at i:17125 original size:364 final size:364
Alignment explanation
Indices: 16685--17355 Score: 802
Period size: 364 Copynumber: 1.8 Consensus size: 364
16675 TAAGAGATTT
* * *
16685 AAAAACTAAATCTGTTTACCAAAATAATTCACATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTG
1 AAAAAATAAAACTGTTTACCAAAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTG
* * *** * * * *
16750 AAACTGTTATGATC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTTTTTTTATAAAAGCTTATTCGA
66 AAACTGTTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAA-T-TATTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAA
* * * * *
16814 ATTAAAAAAATATTAATCTAATAGTA-TTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG
129 AATAAAAAAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-G
* * * * * *
16878 -TGTTTGTT-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTT
193 CTGTTT-TTCGAACTAGTTCAAATAGTTAACACTATTAGAACAAATATCAATCTCAAACCATTAT
* *
16941 GACCTTT-TCTTTACTCAT-AAAACAATTATTTCAGTTCATACATGCTTATTTAGAATAATTAAT
257 GACCTTTGT-TTT-CTCATAAAAACAATTATTTCAGATCATACAAGCTTATTTAGAATAATTAAT
17004 GCTAATTGATTAACATTCAAAAAAATTAATGAGCAAGTGATTTAA
320 GCTAATTGATTAACATTCAAAAAAATTAATGAGCAAGTGATTTAA
* *
17049 AAAAAATAAAACTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATA-TATTTGACTATTTGAACAATTATCTAT-
1 AAAAAATAAAACTGTTTACCAAA-ATAATTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATC
* * * *
17111 TTAAAGTCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATCCA
64 TGAAACT-GTTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATCCA
* * * * * *
17176 AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTATAAACTAAAG
128 AAATAAAAAAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAG
* *
17241 CTGTTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATG
193 CTGTTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTAACACTATTAGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATG
* * * **
17306 ATCTTTGTTTTGTCATAAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTT
258 ACCTTTGTTTTCTCATAAAAACAATTATTTCAGATCATACAAGCTTATTT
17356 GGATAAAAAT
Statistics
Matches: 254, Mismatches: 44, Indels: 18
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
363 51 0.20
364 183 0.72
365 20 0.08
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (364 bp):
AAAAAATAAAACTGTTTACCAAAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTG
AAACTGTTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAA
TAAAAAAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTG
TTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTAACACTATTAGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATGACC
TTTGTTTTCTCATAAAAACAATTATTTCAGATCATACAAGCTTATTTAGAATAATTAATGCTAAT
TGATTAACATTCAAAAAAATTAATGAGCAAGTGATTTAA
Found at i:17545 original size:364 final size:360
Alignment explanation
Indices: 16844--17605 Score: 817
Period size: 359 Copynumber: 2.1 Consensus size: 360
16834 ATAGTATTCC
* *
16844 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGAC
1 AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAACAC
* * * * *
16909 TATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTCTTTACTCATAAAACAATTATTTCA
66 TATTAGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATGACCTTTTCTTTACTCATAAAACAATTATTTCA
* * * * * *
16974 GTTCATACATGCTTATTTAGAATAATTAATGCTAATTGATTAACATTCAAAAAAATTAATGAGCA
131 GATCATACAAGCTTATTTAGAAAAAATAATACTAATTGAATAACATTCAAAAAAATTAAT--G-A
* * *
17039 AGTGATTTAAAAAAAATAAAACTGTTTACCAAACAAGTTCAAATATATTTGACTATTTGAACAAT
193 AGAGATTT-AAAAAAATAAAACTGTTTACCAAACAAGTTCAAATATATTAGACTATTAGAACAAT
* * * *
17104 TATCTATTTAAAGTCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAAC
257 TATCTATTTAAAGTCGTTATAACCTATTGATTTAACATAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAAC
*
17169 TTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCA
322 TTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCA
* * *
17208 AAAATTAATAAGCAAGAGATTTATAAACTAAA-GCTGTTT-TTCGAACTAGTTCAAATAGTTATC
1 AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATG-TGTTTGTT-GAACTAGTTCAAATAGTTAAC
* * * *
17271 ACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATGATCTTTGT-TTT-GTCATAAAAACAATTGT
64 ACTATTAGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATGACCTTT-TCTTTACTCAT-AAAACAATTAT
** * * * * *
17334 TTTTGATCATACAAGCTTATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTACAAAATTAAT
127 TTCAGATCATACAAGCTTATTTAGA-AAAAATAATACTAATTGAATAACATTCAAAAAAATTAAT
* ** * * * *
17399 -AAGAGATTT-AAAACATAAATGTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA-ATTAAGACTATTAGAATA
191 GAAGAGATTTAAAAAAATAAAACTGTTTACCAAACAAGTTCAAATATATT-AGACTATTAGAACA
* * * * *
17461 ATTATCTATTTCAAA-TCGTTCTAACCTATT-ATTTAGACATATAATAATTGTTTTAGTTCATAC
255 ATTATCTATTT-AAAGTCGTTATAACCTATTGATTTA-ACATAAAATAATTATTTCAGTTCATAA
* *** * *
17524 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAA
318 AAACTTATACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-A
* * *
17567 AAAATTAATAA-TAAGAGATTTGAAAATATAAATTTGTTT
1 AAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTGTTT
17606 ACCAAATAAG
Statistics
Matches: 330, Mismatches: 57, Indels: 27
0.80 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
358 19 0.06
359 141 0.43
360 3 0.01
361 8 0.02
363 7 0.02
364 120 0.36
365 32 0.10
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (360 bp):
AAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAACAC
TATTAGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATGACCTTTTCTTTACTCATAAAACAATTATTTCA
GATCATACAAGCTTATTTAGAAAAAATAATACTAATTGAATAACATTCAAAAAAATTAATGAAGA
GATTTAAAAAAATAAAACTGTTTACCAAACAAGTTCAAATATATTAGACTATTAGAACAATTATC
TATTTAAAGTCGTTATAACCTATTGATTTAACATAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTAT
ACAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCA
Found at i:17760 original size:146 final size:146
Alignment explanation
Indices: 17506--17777 Score: 359
Period size: 146 Copynumber: 1.9 Consensus size: 146
17496 GACATATAAT
* * *
17506 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAATCAAAAAA
* * * * *
17571 TTAATAATAAGAGATTTGAAAATATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGATATTT
66 TTAATAATAAGAAATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAATTATGATATTT
17636 TGTTTTGTCATAAAAG
131 TGTTTTGTCATAAAAG
* * * *
17652 AATTGTTTCAGTTCGTATAAGCTTATTCGAACTAAAATAATACTAATTTATTAATAAT-ATAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAATCA-AAAA
* *** *
17716 ATTAATAATAAAGAAATTT-AAAAAATTAATCTATTTATTGAATAAGTTTAAATAATTATGAT
65 ATTAATAAT-AAGAAATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAATTATGAT
17778 TGTTGAACAA
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 17, Indels: 4
0.84 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
145 1 0.01
146 98 0.92
147 8 0.07
ACGTcount: A:0.46, C:0.06, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (146 bp):
AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAATCAAAAAA
TTAATAATAAGAAATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAATTATGATATTT
TGTTTTGTCATAAAAG
Found at i:17999 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 17616--23306 Score: 2994
Period size: 181 Copynumber: 31.5 Consensus size: 178
17606 ACCAAATAAG
* ** * * * * * *
17616 TTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCGTATAAGCTTA-TTC
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTT
* * *
17680 GAACTAAAATAATACTAATTTATTAATAATAT-AAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAATT
65 GAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAATA
* * * * * * * *
17743 AATCTATTTATTGAATAAGTTTAAATAATTATGA-T-TGTTGAACAATCACCTAT
125 AATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTAT
* ** * ** * * * *
17796 TTAAAATCACTATAATGTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTTTTTCTATTCACAAAAGCTTATTTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTT
*
17861 GAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TT-AAGATAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAA
65 GAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAA
* * * * *
17924 TTTGTTTACTAAACAAGTTTTAAA-CGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTAT
127 TCTGTTTACTAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * **
17976 TTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGACATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCG
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * ** * ** *
18041 GATTAAAACAATATTAACGTATTAATTTTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-AATAT
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAA-AT
* * * * * * * ** *
18105 ATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCACGCCTAATTGAATGATTATCAAT
128 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
18156 TTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTA-TTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTT
* ** * *
18220 GAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGGAGTAACAA-AATTAAAAAAAGA
65 GAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAATA-A
* * * * * *
18284 ATATGTTTAC-AGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATATAT
126 ATCTGTTTACTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
18337 TTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTTATGCAAGTTTATTTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * *
18402 GAATAAAATAATTTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTAAAAAAATAAAT
65 GAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT-TAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
18466 TTGTTTTCTGAGCACGTTCAAATAGCTACGACAATTTGAACAATTATATAT
128 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * **
18517 TTCAAATCGTTATGACCTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATGCATAAAATCATATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * *
18582 AAATAAAATAATACTAATTTATCAA-AATTCTAAAAATTAATTAGTAAAAGATTTGAAAAATAAA
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAA
** * * * * * * *
18646 TCCATTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAATAATTATTTAT
127 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** ** * * **
18698 TTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGCTTTTATTCATACAAGTTTATTGA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * ***
18763 AAATACAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAA
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAA
* * * * *
18827 TTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGTCCATTTGAACTATTATCTAT
127 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * ** **
18879 TTCAAATCGTTATGAAATTTTATTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTATTTATACAAAATTATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * * *
18944 AAAGAAAATAATACTAGTTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGAA-A--TAAAAACTAAAT
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAAT
* * * * * *
19005 CTATTTACCAAACTAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGGATAATTATCTAT
128 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
19056 CTT-AAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGTTTA-TT
1 -TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT
** * * ** * * *
19118 CAAAGTAAAATATTGGTAAACTAATAATA-TTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATA
64 TGAA-TAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATA
* * * * * * * * * * * *
19182 TATGTATTCACCGAACCAA-TT-TAATAGATAAGACTATTAGAATAATTATCTAA
125 AATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
19235 TTCAAATTGTTCT-AGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTA-TT
1 TTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTT
* * * *
19298 TGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAAT
64 TG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAT
* * * * * *
19362 AAACCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTAT
124 AAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * ***
19417 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * * * ***
19482 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAT
* ** * * * * * * *
19547 CAGTTTA-TCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACCATTATTTGT
128 CTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
19598 TTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCAAACAAACCTA-TT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-ATTCATACAAGCTTATTT
* * *** *
19661 TGAAAAAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGACTTAAAAAATAA
64 TG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAA
* * * * * * * * * **
19726 ATATGCTTATTGAACCAGTTCAAATAGTAATGAGTGTTTGAATAATTATAGAT
126 ATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * **
19779 TTCAAATCGATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * * * * *
19844 AAATAAAATAATACAAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAA
* * * * * * * * * *
19908 TTTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATGGTTAAGGCTATATGAATAATTATTTGT
127 TCTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
19960 TTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTG
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * *
20024 GAATAAAATAATGTTAATTTAGTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAT
65 GAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAT
* * * * * * * *
20085 CTGTTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGACCAATTATTTAA
128 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * ***
20136 TTCATATCATTGTGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATACATTATTA-TTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * * * * ** *
20200 GAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATA-TACTAAAAATTACTAGGTAATGGATTTAAAAAATGA
65 G-AATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
** * * * * * * *
20264 ATCTGTTGGCCTGATC-AGTCCAAATAGTTATAACTGTATGAACAGTTATCTAT
126 ATCTGTT-TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * ** *
20317 TTCAAATCGTTATGA--TATTTGTTTTGTCACAAAATAATTGATTCTGTTTGTATAAGCTTA-TT
1 TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT
* * *
20379 TGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAA-ATTTAAAAACTA
64 TG-AATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAA-TA
* * * *
20443 AATCTATTTA-TCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTAT
125 AATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * *
20497 TCCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTA-T
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTTTTT-TATTCATACAAGCTTATT
* * *
20561 TTCAATTAAAATAAT-TCAAATTTATTAATAATT-AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
63 TTGAA-TAAAATAATAT--AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAA
* * *
20624 TAAATATGTTTA-TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
123 TAAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
20680 TT-AAATTGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTTCATTCATAGAAGCTTATTC
1 TTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATT-
* * * * *
20744 AT-ATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATA
63 TTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATA
* * * * * *
20807 AATATGTTTA-TCAAACAACTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTAT
125 AATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * *
20861 TT-AAAACATTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTATTAGTTTATATAGGCTTA-TTC
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTT
* * *
20924 GAAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATGAGTAAGAA-ATTTAAAATATAA
65 G-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAA-ATAA
* * *
20988 ATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCATATAGTTCA--ACTATTTGAACAAATATCTAT
126 ATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * * **
21040 ATCAAATTATTATGACCCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGGTTCCATTCATACAAGCTTATTTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* *
21105 GAATAAAATAATATAAATTTA-TAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTCAAA-ATTAAAAAATAAAT
65 GAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAAT
* * *
21167 ATGTTTTCTGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
128 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * **
21217 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAACGTATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * *
21282 AAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAATAAA--
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATC
** * ** * * * ** * *
21345 TGTTTAAAAATTTTAAAAAAT-AAATTTATTTTTTGAACAAGTTCAAATAATTATGACCAT
129 TGTTTACTAA----ACAAGTTCAAA--TA-GTTATG-ACTA-TTTGAACAATTAT--CTAT
* ** *** * *** * * * * *
21405 TTGAACAAAT-ATCTATCTCAAATTG--TTGTGAT--ATTTATTTTGTCA-TAAAACAATTGTTT
1 TT---CAAATCGT-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAA--GCTT
* * * * **
21464 CTTTTCAA-AGAAGTTTATTTGAATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGCAA
60 ATTTTGAATA-AA--ATA-AT--A-T--AAT--T--T-A-TTAAT-AT-TT-CAAAAATTAATAA
* * * * * *
21528 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
107 GTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
21592 ATTA-CATAT
170 ATTATC-TAT
* * * * * *
21601 TTTAAATCGTTCTGACCTATTT-CTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTGATTT
1 TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTT
* * * * * *
21665 AGAATAAATTAACACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATAAAAAG-AAAGAGATTTTAAAAAAT
64 TGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGA-TTT-AAAAAT
* * * * * * * *
21728 ATATCTATTTACGAAATAAGTTCAAATAATTATTATTATTTGAACAATTGTC-ATT
124 AAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-T
* * * * * * * * ** *
21783 TTAAAATTGTTATAACTTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATG
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTT
* * * * * *
21848 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTTC-TATATTATTAAATAATAGATTTAAAAAATGAA
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAA
* * * ** * * * * ** *
21912 TATATTTACTGAATGAGTTGAAATAATTATG-GTGATTTCAATGATTTTCTAT
127 TCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
21964 TACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTT-TACCATACAAGCTT-GTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAT-TCATACAAGCTTATTT
* * *
22027 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGGCAACAGATTTAAAAAATAA
64 TG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
* * * * * * *
22092 ATCTATTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACTATTATCAAT
126 ATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * * * * * *
22145 CTT-AATTTGTTAAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAATCATAGAAGCATA-TT
1 -TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTT
* ** * * * *
22207 CGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAGATTAAT-A-T----G---CAAAAATAAA
64 TGAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAA
* * * * ** * *
22263 TGTATTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTAT
127 TCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
22315 TTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-TATTTGTTTCATAACTTACAAGCTTA-TT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTT-TTTTAT-TCATACAAGCTTATTT
* * * *
22378 TGAAATAAAAGAATCTGAATTTATTAACA-TTCAAAACATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAAT
64 TG-AATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAT
* * * ** * * *
22442 AAATTTGTCTA-TCGAACAACCTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATTTAT
124 AAATCTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * **
22497 TTAAAATTGCTT-TGACCTTTTATTTTGACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCC
1 TTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTT
** * * * * *
22561 AAAATGAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAATATAA
64 TGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAA-ATAA
* * * * * *
22625 ATTTGTTTAC-AGAACAAATTCTAATAGTTACGACTATTTAAACAATTGTCTAT
126 ATCTGTTTACTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * ** * *
22678 TTAAAATCATTATGACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATTTA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
* * *** *
22743 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTATGTGATTTAAAAAGTGAAT
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAAT
* * ** * * * *
22808 ATGTTTACTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCTATTTCAAAAATTATCTAT
128 CTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * **
22859 TTCAAATCATTATTACCTTTTATTTAG-AAT-AAATAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTT
* * ** *
22922 GAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAATT
65 GAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAT
* * * *
22987 TTGTTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
128 CTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * * *
23038 CTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACATTTTTGTTCATATACG-TT-TGTT
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTATTCATACAAGCTTAT-TT
*
23101 TGCAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTTAAAAATAA
64 TG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAA
** * * * *
23162 AT-AATTTA-TCAAATC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAAGTAATTATTTAT
126 ATCTGTTTACT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTAT
* * * * * * * * * *
23215 TTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTTATTCATACAAGCTTATTTT
*
23280 GATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
23307 AGTAAAAAAT
Statistics
Matches: 4233, Mismatches: 1028, Indels: 503
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.00
170 65 0.02
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172 2 0.00
174 2 0.00
175 10 0.00
176 199 0.05
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185 10 0.00
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191 12 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTG
AATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTG
TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:18442 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 17616--23306 Score: 2948
Period size: 361 Copynumber: 15.8 Consensus size: 357
17606 ACCAAATAAG
** * * * * * *
17616 TTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCGTATAAGCTTATTC
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* * * * * * *
17680 GAACTAAAATAATACTAATTTATTAATAATATAAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAATTA
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAAAT-
* * *** * * * * ** * * * **
17744 ATCTATTTATTGAATAAGTTTAAATAATTATGA-TTGTTGAACAATCACCTATTTAAAATCACTA
127 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* ** * * * *
17808 TAATGTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTTTTTCTATTCACAAAAGCTTATTTTG-AATAAAATAA
192 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAA
* * * * *
17872 TATAAATTTATTAATA-TT-AAGATAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACTA
255 TATTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAAAAATCTGTTTACCA
* * * *
17935 AACAAGTTTTAAA-CGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTAT
317 AACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * **
17976 TTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGACATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGTTTATTTA
* * * ** * * * *
18041 GATTAAAACAATATTAACGTATTAATTTTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATATA
65 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATATA
* * * ** * *
18106 TGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCACGCCTAATTGAATGATTATCAATTTCAAATCATTATGA
130 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * *
18171 CCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATATT
195 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATT
* ** * * *
18236 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGGAGTAACAAAATTAAAAAAAGAATATGTTTA-CAGAATA
259 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAA-AATCTGTTTACCA-AACA
* * * *
18300 AGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATATAT
321 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
18337 TTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTTATGCAAGTTTATTTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGTTTATTTA
* * *
18402 GAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-A-TTAAAAAAATAA
65 AAATAAAATAATATT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAT--
* * ** * * * *
18464 ATTTGTTTTCTGAGCACGTTCAAATAG-CTACGAC-AATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGT
127 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTC-ATGACTAA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* ** * * * * **
18527 TATGACCTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATGCATAAAATCATATTCAAAATAAAATA
190 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * * **
18592 ATACTAATTTATCAA-AATTCTAAAAATTAATTAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATCCATTTACC
254 ATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAAAAAATCTGTTTACC
* * * * * *
18656 AAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAATAATTATTTAT
316 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** ** * *
18698 TTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGCTTTTATTCATACAAGTTTATTGA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGTTTATTTA
* * *** *
18763 AAATACAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
65 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-ATAT
* ** * * * * *
18828 TTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCTTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTATG
129 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
** * * * * * ** ** * *
18893 AAATTTTATTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTATTTATACAAAATTATTCAAAAGAAAATAATAC
194 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAT
* * * * * *
18958 TAGTTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGAAA--TAAAAACTAAATCTATTTACCAAACTA
258 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAA-AAAATCTGTTTACCAAACAA
* * *
19020 GTTCAAAAAGTTATGACTATTTGGATAATTATCTAT
322 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
19056 CTT-AAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGTTTATTC
1 -TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGTTTATTT
* * ** ** * * * *
19119 AAAGTAAAATATTGGTAAACTAATAATATTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTT-GAAAAATAT
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAT
* * * * * *
19183 ATGTATTCACCGAACCAA-TT-TAATAGAT-AAGACT-ATTAGAATAATTATCTAATTCAAATTG
129 ATGT-TT-ACC-AAACAAGTTCAAATAG-TCATGACTAATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCG
* * *
19244 TTCT-AGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAA
189 TTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * *
19308 TAATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAACCTATTT
252 TAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAA-TTTAAAAAA-AAATCTGTTT
** * * *
19372 ACTGAACAAGTTTAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTAT
313 ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * ** * * **
19417 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTTA
* * * * *** *
19482 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTT-AAAAAATAA
65 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAT
* ** * * * * * * * * *
19545 ATCAGTTTATCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACCATTATTTGTTTCAAATCGTTA
129 AT--GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * *
19610 TGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TCATCAAACAAACCTATTTGAAAAAAAATAA
192 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAT--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* *** * * * ***
19674 TATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGACTTAAAAAATAAATATGCTTATTGA
255 TATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACCAA
* * * * * **
19739 ACCAGTTCAAATAGTAATGAGTGTTTGAATAATTATAGAT
318 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
19779 TTCAAATCGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTC
1 TTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTT
** * * * * * * *
19843 AAAATAAAATAATACAAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-ATA
* * * * * * * * * *
19908 TTTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATGGTTAAGGCT-ATATGAATAATTATTTGTTTCAAATTGTT
128 TATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTAAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * *
19971 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACA-AA-TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATA
191 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * *
20034 ATGTTAATTTAGTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
254 ATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACCAA
* * * * * * *
20096 ACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGACCAATTATTTAA
318 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
20136 TTCATATCATTGTGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-ATTATTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGT-TTATTT
* * ** * * * * **
20200 GAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATATACTAAAAATTACTAGGTAATGGATTT-AAAAAATGA
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAT--
* ** * * * * * * *
20264 ATCTGTTGGCCTGATC-AGTCCAAATAGTTATAACT-GTATGAACAGTTATCTATTTCAAATCGT
127 ATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * ** * *
20327 TATGA--TATTTGTTTTGTCACAAAATAATTGATTCTGTTTGTATAAGCTTATTTGAAATAACAT
190 TATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
* * * *
20390 AAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAACTAAATCTATTTAT
253 AATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAA-AAAATCTGTTTAC
* * *
20454 CGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTAT
315 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
20497 TCCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTT-TGTTCATACAAGTTTATT
* * * * *
20562 TCAATTAAAATAAT-TCAAATTTATTAATAAT-TAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
63 TAAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-
* * * * * * *
20625 AAATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAATTGT
125 ATATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* ** * * * *
20689 TATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTTCATTCATAGAAGCTTA-TTCATATTAAAA
190 TATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA
* * * * *
20753 TAATATTAATTTATTAATA-TTCTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA
252 TAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-A-TTTAAAAAAAAATCTGTTTA
* * * * * *
20817 TCAAACAACTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTAT
314 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * **
20861 TT-AAAACATTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTATTAGTTTATATAGGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGTTCATACAAGTTTATTTA
* * *
20925 AAATACAATAATACTAATTTATTAATATT-TGAAAAATTAATGAGTAAGAA-ATTTAAAATATAA
65 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAA-A-AA
* * * * * * * **
20988 -ATCTGTTTATCGAACAAGTTCATATAGTTCA--ACTATTTGAACAAATATCTATATCAAATTAT
126 TATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * **
21050 TATGACCCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGGTTCCATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAAT
190 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAAT
* * * * *
21114 AATATAAATTTA-TAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTCAAAA-TTAAAAAATAAATATGTTTTCT
253 AATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACC
*
21176 GAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
316 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* *** *
21217 TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAACGTATTC
1 TTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTT
* * * * *
21281 AAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT--AAAAATAA
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAT
* * * * **** * * * **
21344 ATGTTT---AAA-AATTTTAAA-A--AAT-A--AATTTATTTTTTGAACAAGTTCAAATAATTAT
129 ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * ** *
21399 GACCATTTGAACAAATATCTATC-TCAAATTGTTGTGATATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
193 GACCTTTTG------T-TTTGTCAT-AAAATAAT-TG-T-TTTA---T-TCAT---ACAA--GCT
* * * * * * **
21463 TCTTTTCAAAGAAGTTTATTTGAATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGCAA
238 T-ATTTGAAATAA----A-AT-AA-T--ATTAAT--TTA-TTAAT-AT-TT-CAAAAATTAATAA
* * * * *
21528 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
287 GTAA-AAATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
21592 ATTA-CATAT
349 ATTATC-TAT
* * * * * * *
21601 TTTAAATCGTTCTGACCTATTT-CTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTGATTT
1 TTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACAAGTTTATTT
* * * * * * * *
21665 AGAATAAATTAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATAAAAAG-AAAGAGATTTTAAAAAATA
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-AGA-TTTAAAAAA-A
* * * * * * * * * * * *
21729 TATCTATTTACGAAATAAGTTCAAATAATTATTATTATTTGAACAATTGTC-ATTTTAAAATTGT
126 TATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGT
* * * * * * ** *
21793 TATAACTTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATA
190 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * * * * * * * * *
21858 ATACTAATTTATTAATACTTTC-TATATTATTAAATAATAGATTTAAAAAATGAATATATTTACT
254 ATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACC
* ** * * * * ** *
21922 GAATGAGTTGAAATAATTATG-GTGATTTCAATGATTTTCTAT
316 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
21964 TACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTT-TTACCATACAAGCTTGTTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTT--CATACAAGTTTATTT
* * * * * *
22028 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAGGCAACAGATTTAAAAAATAA
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-AT
* * * * * * * * * * *
22092 ATCTATTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACTATTATCAATCTT-AATTTGTT
127 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTT
** * * * * * **
22156 AAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAATCATAGAAGCATATTCG-GTTAAAAATA
191 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATA
* * * * * * * * * *
22219 ATACTAATTTAATAATATTCCAAAGATTAATATGCAAAAA--T------AAATGTATTTGCTGAA
254 ATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAAAATCTGTTTAC-CAA
* ** * *
22276 CCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTAT
318 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * ** * * * *
22315 TTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATAACTTACAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATACAAGTTTATTTA
* * * * * *
22380 AAATAAAAGAATCTGAATTTATTAACATTC-AAAACATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAA
65 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAA-ATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAA-AT
* * * * ** * * * * * * *
22444 ATTTGTCTATCGAACAACCTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGCTT
127 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TT
* * * * * *** *
22509 -TGACCTTTTATTTTGACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATGAAATAA
191 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * * * * *
22573 TACTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAATATAAATTTGTTTA-CAG
255 TATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAA-A-AAATCTGTTTACCA-
* * * * *
22637 AACAAATTCTAATAGTTACGACTATTTAAACAATTGTCTAT
317 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * ** * *
22678 TTAAAATCATTATGACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATTTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGTTTATTTA
* * *** *
22743 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTATGTGATTT-AAAAAGTGAA
65 AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAT--A
** ** * * * * * * *
22807 TATGTTTACTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCTATTTCAAAAATTATCTATTTCAAATCATTAT
128 TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * *
22872 TACCTTTTATTTAG-AAT-AAATAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAATAA
193 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT--ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAA
* * * * * * * *
22933 AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTA
255 TATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAA-AAATCTGTTTACCAA
* * *
22998 ACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
318 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * *
23038 CTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACAT-TTTTGTTCATATACGTTTGTTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA-TTGTTTTGTTCATACAAGTTTATTT
** * *
23102 GCAATAAAATAATACTAATTGATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG----AGATTTTAAAAATAA
64 AAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAA-AA
* * * * * * * * *
23162 -ATA-ATTTATCAAATC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAAGTAATTATTTATTTCAAATCA
126 TATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * * * *
23224 TTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGGATTAAAAT
189 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
*
23289 AATACTAATTTATTAATA
253 AATATTAATTTATTAATA
23307 AGTAAAAAAT
Statistics
Matches: 4085, Mismatches: 996, Indels: 502
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
345 5 0.00
346 23 0.01
347 1 0.00
349 1 0.00
350 10 0.00
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353 87 0.02
354 10 0.00
355 53 0.01
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367 2 0.00
369 6 0.00
370 1 0.00
371 3 0.00
372 3 0.00
373 1 0.00
374 5 0.00
376 2 0.00
378 9 0.00
379 4 0.00
381 19 0.00
382 3 0.00
383 27 0.01
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387 7 0.00
388 8 0.00
389 2 0.00
390 8 0.00
391 4 0.00
392 7 0.00
393 1 0.00
395 2 0.00
396 2 0.00
397 17 0.00
398 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAA
AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATATAT
GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAAAATCTGTTTACCAAACAAGTTC
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:19450 original size:900 final size:888
Alignment explanation
Indices: 17616--26589 Score: 3878
Period size: 900 Copynumber: 10.0 Consensus size: 888
17606 ACCAAATAAG
* ** * * *
17616 TTCAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCGTATAAGCTTATTC
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC
* * * * *
17680 GAACTAAAATAATACTAATTTATTAATAATAT-AAAAATTAATAA-TAAAGAAATTTAAAAAATT
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAATA
* ** * * * * * ** * *
17743 AATCTATTTATTGAATAAGTTTAAATAATTATGA-T-TGTTGAACAATCACCTATTTAAAATCAC
127 AATCCATTTA-CCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTCT-TTAAACAATTATTTATTTCAAATCAT
* * * ***
17806 TAT-AATGTTTTGTTTTCTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCACAAAAGCTTATTTTGAATAAAA
190 TATGAA--TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTGAAAATAAAA
* ** *
17869 TAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGATAGTTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATTTGTTT
252 TAATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* * * * * * * * **
17931 ACTAAACAAGTTTTAAA-CGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTT
314 A-TGAACAAG-TTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGAAATT
* * * * * ** * * * **
17995 TTGTTTTGACATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAACAATATTAACG
376 TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * ** * * * *
18060 TATTAATTTTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-AATATATGTTTACCAAACAAGTTT
441 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGAA-A--TAAAAATAA-ATATGTTTACCAAACAAATTC
* * * * * * * * * * * *
18124 AAATAGTCACGCCTAATTGAATGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAA
501 AAAAAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * ** * *
18189 AATAATTG-TTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCA
565 AACAATTGTTTTTA-TTCATATAAGTTTA-TTCAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTT-A
* ** * * * * * * * * *
18253 AAAATTAAGGAGTAACAAAATTAAAAAAAGAATATGTTTACAGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGA
627 AAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAATA-AATCTGTTTACCGAACCAA--TTCAATAGTTA-AA
* * * * * **
18317 CTATCTGAATAATTATATATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT
688 CTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT
* * * * * * *
18382 TGTTTATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAG
753 TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG
* * * * * **
18446 -TAAAAATTAAAAAAATAAATTTGTTTTCTGAGCACGTTCAAATAGCTACGACAATTTGAACAAT
818 CAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACA-GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAAT
*
18510 TATATAT
882 TATCTAT
* * * * *
18517 TTCAAATCGTTATGACCTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATGCATAAAATCATATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA
* * *
18582 AAATAAAATAATACTAATTTATCAA-AATTCTAAAAATTAATTAGTAAAAGATTTGAAAAATAAA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAA
* *
18646 TCCATTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTAT
129 TCCATTTACCAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT
* * * *
18711 GATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGCTTTTATTCATACAAGTTTATTGAAAATACAATAATA
193 GA-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTGAAAATAAAATAATA
* *
18776 CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAC
257 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TGAAC
* * * *
18841 AAGTTCAAATAGTCTTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTATTTTG
320 AAGTTCAAATAGT-TTGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTG
* * * * *
18906 TCGTAAAACAATTATTTTTATTTATACAAAATTATTCAAAAGAAAATAATACTAGTTTAATAATA
384 TCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * *
18971 TTTCAAAAATTAATAAGAGAAATAAAAACTAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAAAAGTTATGA
449 TTTCAAAAATTAATAAGAGAAATAAAAA-TAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAAAAGTTATGA
* *
19036 CTATTTGGATAATTATCTATCTTAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTT
513 CTATTTGAATAATTATCTAT-TTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * **
19100 TATTCATACAAGTTTATTCAAAGTAAAATATTGGTAAACTAATAATATTCTAAAAAATAATAAGT
577 TATTCATATAAGTTTATTCAAA-TAAAATAATGCTAATTTAATAATATT-TAAAAAATAATAAGT
* * * * * * * *
19165 AAGAGATTTGAAAAATATATGTATTCACCGAACCAATTTAATAGATAAGACTATTAGAATAATTA
640 AAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAATAGTTAA-ACTATTTGAACAATTA
* * * * *
19230 TCTAATTCAAATTGTTCT-AGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-GTTTTAGTTCATACATGC
703 TCTAATTCAAATTATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA-TTCATACAAGC
* *
19293 TTA-TTTGAAATAAAATAATACT-ATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTA
766 TTATTTTG-AATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAA-TTTA
* * * *
19356 AAAAATAAACCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTAT
829 AAAAATAAATCTGTTTTCTGAAC-AGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
19417 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA
* * * * * ***
19482 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAAT
* * * * * *
19547 -CAGTTTATCAA-ATTAGTTCAAATAATTATGGC-CATTTAAACCATTATTTGTTTCAAATCGTT
130 CCA-TTTACCAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTC-TTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATT
* * * *
19609 ATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCAAACAAACCTATTTGAAAA-AAAAT
191 ATGAA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTA-TTGAAAATAAAAT
* * * * *
19672 AATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGACTTAAAAAATAAATATGCTTATT
253 AATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-T
* * * * * * *
19737 GAACCAGTTCAAATAGTAATGAGTGTTTGAA-TAATTATAGATTTCAAATCGATAT-AACCTTTT
316 GAACAAGTTCAAATAGT-TTGACTATTTGAACT-ATTATATATTTCAAATCGTTATGAA-ATTTT
* * * * *
19800 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACAAATCTA
378 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** * * *
19865 ATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAATTCAA
443 ATAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGAAAT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAA
** * * * * * *
19930 ATGGTTAAGGCTATATGAATAATTATTTGTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAA
503 AAAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * ** * * *
19994 CAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGTTAATTTAGTAATATTTTAAAA
567 CAATTGTTTTTATTCATATAAGTTT-ATTCAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTAAAAA
* * * *
20059 AT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATT
631 ATAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAA-TAGTTA-AACTATT
* * * * * * *
20121 TGACCAATTATTTAATTCATATCATTGTGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATT
693 TGAACAATTATCTAATTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TATT
* *** * * * * * * * *
20185 GATACATTATTA-TTTGAAATAAAGTAATGCT-AATTTTTTAATATACTAAAAATTACTAGGTAA
757 CATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAA
*** * ** * * ** * *
20248 TGGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCCTGATCAGTCCAAATAGTTATAACTGTATGAACAGTTAT
821 AAAATTTAAAAAATAAATCTGTT-TTCTGAACAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTAT
20313 CTAT
885 CTAT
* * * * ** * *
20317 TTCAAATCGTTATGA--TATTTGTTTTGTCACAAAATAATTGATTCTGTTTGTATAAGCTTATTT
1 TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC
* * * *
20380 GAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAA-ATTTAAAAACTAA
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAA-TAA
* * * * * ** * *
20444 ATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTCCAAATCACTA
128 ATCCATTTA-CCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTA
* ** *
20509 T-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAAT
192 TGAA--TTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTGAAAATAAAAT
* * * * **
20573 AATTCAAATTTATTAATAATTAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC
253 AATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-
* * * * * **
20638 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT-AAATTGTTATGACTTTTTTG
316 GAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGA-AATTTTG
* * * * * * * *
20702 TTTTGTCATAAACCAATTATTTTCATTCATAGAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTAT
379 TTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAA
* * * * *
20767 TAATA-TTCTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCAAACAACTTCAA
444 TAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AGAA-A---TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAA
* * * * * *
20831 ATAA-TCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAACATTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
503 A-AAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * * *
20895 TAATT-CTATTAGTTTATATAGGCTTATTCGAAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAA
567 CAATTGTTTTTA-TTCATATAAGTTTATTC-AAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTT-AAA
* * * * *
20959 AATTAATGAGTAAGAAATTTAAAATATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCATATAGTTCAACTA
629 AAATAATAAGTAAGAGATTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTCA-ATAGTTAAACTA
* * * * **
21023 TTTGAACAAATATCT-ATATCAAATTATTATGACCCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGGTTCCA
691 TTTGAACAATTATCTAAT-TCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTA
21087 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTA-TAATATTCAAAAAATTAATAAGTC
755 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-C
* * *
21150 --AAAA-TTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
819 AAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTA
21212 TCTAT
884 TCTAT
* * * *
21217 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAA-CGTATTC
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTC
* *
21281 AAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAATAAAT
65 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---------T----A-AAA-
** *** * *
21346 GTTTAAAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAAGTTCAAATAATTATGAC-CATTTGAA
115 G-------A-TTT-AAAAATAAATCCA-TTTACCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTC-TTTAAA
* * * ** * * * *
21410 CAAATATCTATCTCAAATTGTTGTG-ATATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCAAA
169 CAATTATTTATTTCAAATCATTATGAAT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TTATTCATA
* * * * * * ** *
21473 GAAGTTTATTTG-AATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGCAAGTAAGAGAT
232 CAAGCTTA-TTGAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAGGAGAT
* *** * * * *
21537 TTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTACATAT
295 TTAAAAAATAAATATGTTT-ATGAAC-AAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACTATTATATAT
* * ** * * * * *
21601 TTTAAATCGTTCTGACCTATTT-CTTAGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTGATT
357 TTCAAATCGTTATGAAAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAGATTATT
* * * * * * * * *
21664 TAGAATAAATTAACACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATAAAAAGAAAGAGATTTTAAAAAAT
420 CAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAG--AGA-A--AT-AAAAAT
* * * * * * * * * * *
21728 ATATCTATTTACGAAATAAGTTCAAATAA-TTATTATTATTTGAACAATTGTC-ATTTTAAAATT
478 AAATATGTTTACCAAACAAATTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTT-AAATC
* * * * * * * **
21791 GTTATAACTTTTTGATTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAA
540 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATAAGTTTA-TTCAAATAAA
* * ** * * * * * * * *
21855 ATAATACTAATTTATTAATACTTTCTATATTATTAAATAATAGATTTAAAAAATGAATATATTTA
603 ATAATGCTAATTTAATAATA-TTTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTA
* ** * * * *** * ** * **
21920 CTGAATGAGTTGAAATAATTATGGTGATTTCAATGATTTTCT-ATTACAAATCGTTATGACCTTT
666 CCGAACCAATT-CAATAGTTAAACT-ATTTGAACAATTATCTAATT-CAAATTATTATGACCTTT
* *
21984 TGTTTTGTTATAAAACAATT-GTTTT-TTACCATACAAGCTT-GTTTGAAATAAAATAATACT-A
728 TGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATT--CATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAA
* * * * * **
22045 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAGGCAACAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA
790 ATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAA-CA
* * ** * *
22109 GTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACTATTATCAAT
853 GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTAT
* * ** * * * * *
22145 CTT-AATTTGTTAAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAATCATAGAAGCATATTC
1 -TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTC
*** * * * *
22208 -GGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAGATTAAT-A-T----G---CAAAAATAAA
65 AAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAA
** * * ** * * * **
22263 TGTATTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACT-ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT
129 TCCATTTAC-CAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTA-AACAATTATTTATTTCAAATCATT
* * * * * *
22326 CT-AACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCATAACTTACAAGCTTATTTG-AAATAAAA
191 ATGAA--TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTAT-TCATACAAGCTTA-TTGAAAATAAAA
* * * * ** * *
22388 GAAT-CTGAATTTATTAACATTCAAAACATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTCT
252 TAATACT-AATTTATTAATATTTAAAA-ATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTT
** * * * * * * **
22452 ATCGAACAACCTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGCTT-TGACCTT
314 AT-GAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCG-TTATGAAATT
* * * * * * * *
22516 TTATTTTGACATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATGAAATAATACTAAT
376 TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
** * ** *
22580 TTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAATATAAATTTGTTTA-CAGAACAAAT
440 TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-AAT-AAAA-ATAAATATGTTTACCA-AACAAAT
* * * * * * * * * * *
22644 TCTAATAGTTACGACTATTTAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTCTATCAT
499 TCAAAAAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
** * * * * * * *
22709 AAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
563 AAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTA-TTCAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATT-T
* * * * * * ** * * **
22774 AAAAATTAATAAGTATGTGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACTGAATTAGTTCAAATAATTATGG
626 AAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACCAATTC-AATAGTTA-AA
* * * * * * * * *
22839 CTATTTCAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTAG-AAT-AAATAATT--TTT
688 CTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT
* ** * * *
22900 TCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATTCAT
753 T--ATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAAT
* ** * * * * * * *
22963 AAGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
815 AAGCAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTGAAC-AGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAA
*
23027 TAATTATCTAT
878 CAATTATCTAT
* * *** * * * * * * **
23038 CTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACATTTTTGTTCATATACGTTTGTTTG
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA
* *
23103 CAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTTAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAAT
* * * * *
23164 -AATTTATCAA-ATCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAAGTAATTATTTATTTCAAATCATTA
130 CCATTTACCAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAA-CAATTATTTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * *
23227 TGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTG-GATTAAAATAA
192 TGA-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTGAAAATAAAATAA
* * * **
23291 TACTAATTTATT-A-A--T---AAGT-A-AA--A--A-ATTTCAAAAATAACTATGTTTACCAAA
255 TACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TGAA
* * ** * ** *
23342 CTAA-ATCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCA-ATTTTAGTTC-ATAT--AAGCTT-A
319 C-AAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACT-ATTAT-ATATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGT
* ** * * * * * * * * ** *
23400 TTCGAAATAAAATAA-TA---CTATGC-TATTAATATT-TTGAAAAT-TAATGACTAAGAGATTG
380 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATA-CAAGATTATTCAAAATAAAAT-AATACTA-ATTT
* * * * ** * *** * ** * * *
23458 AA-AACA--T-GAATATGT--TTA-CCAAACAAGTTTAAATA--ATTA--GGACAATTTGAACAA
442 AATAATATTTCAAAAAT-TAATAAGAGAAATAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAAAA
* * * ** * * ** ***
23512 -TTAT--CTATTTG-A-AATCA-CTA--T-AA-CCTTTTG-C--TTTG--TCATAAAATGATTTT
506 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * ** * * * * * * * *
23562 TCTTTTCATACAAGCTTATTTTGAAT-AAA-ATAAT-A--CCAATTTATTAATA-TCAAGACAAT
571 TGTTTTTATTC-ATATAAGTTT-ATTCAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTAA-A-AAA
* * * * *
23621 TAATAAGTAAAAGATTTAATAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATCGTTATGACTATT
632 TAATAAGTAAGAGATTTAA-AAATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTC-AATAGTTA-AACTATT
* * * * * * * *
23685 TGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
693 TGAACAATTATCTAATTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTC
* ** * * ** * *
23750 ATATAAGCTTATTCAGATTAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTTTGATAAA-TAATAAGTAAA
758 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAA
* * * * * * *
23813 ATA-TTAAAAAATAAATATATTTATC-G-A-A---CAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATC
822 AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTGAACAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATC
*
23871 TCT
886 TAT
* * * * * * * **
23874 TTCAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA
* ** * * * *
23939 AAATAAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATAAAAAAAAGA
66 AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAATA-A
*** * * * ** * * * *
24003 ATTTGTTTATGCAACAAGTTTAAATAGTTAAGTGTATCTAAA-AGATTATCTATTTCAAAACATT
128 ATCCATTTA-CCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAACA-ATTATTTATTTCAAATCATT
* * *** * ** **
24067 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCACTTTTGTTCATGTAAGCTTATTTCAAATAAAATAA
191 ATGA-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTGAAAATAAAATAA
* * * * *
24132 TA-TAAATTTATTAATATTCCAAAACTTAATAAGTA-AAAATTAAAAAAATAAATCTAT-TTTAT
255 TACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTTAT
* ** * * * * * * **
24194 AAACACCTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTACGACCATTTCC
316 GAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGA-AATTTTG
* * * * *
24259 TTTT-TCATAAACCAATGT-TTTTTGTTCAAACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTA
379 TTTTGTCATAAAACAAT-TATTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * * *
24322 TTAATA-CTCCAAAATTAATAATTAAAAGATTAAAAA-AAAAATCTAATTACCGAGCGAGTTCAA
443 ATAATATTTCAAAAATTAATAA-GAGAA-A-TAAAAATAAATATGT--TTACCAAACAAATTCAA
* * *
24385 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAGTCGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAA
503 AAAGTTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTT-AAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * *
24448 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTATTATTCTAA
565 AACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTATTCA-AATAAAATAATGCTAATTTAATAATATT-TAA
* * * * ** *
24513 AAATTAACAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCAATTTACCAATACCAAACAAGTTCAAATAGT
628 AAAATAATAAGTAAG-AGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGA-A-C---CAA-TTC-AATAGT
** * * * * * * * *
24577 TATGTCCATTTGAACTATTATTTATTTTAATTTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
684 TA-AACTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** * * * * *
24642 -ATTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTATTAAA-TTAATAATATTCTAAAAATT
748 GGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATT
** ** * * *** * *
24705 AATAAG-TGAGGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAACCAACACAAATAGTTA-AGACTATTA
812 AATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAA-CAGTTCAAATAGTTATA-ACAATTT
*
24768 GAATAATTAT-TAT
875 GAACAATTATCTAT
** * * * * * * *
24781 TTTGAATCATTTTGGCCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCA
* * ** * *
24846 TATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAATAAAA-ATTTTAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAAT
*** ** * * ** ** * * * **
24910 ATGTTTATTGAACTAGATCAAACGGCCATGACTATTTCAAA-TATTATCTATTTCAAATTGTTAT
130 CCATTTA-CCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTT-AAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * **
24974 GACCTTTTGTTATGTCATAAAAGAATTG-CTTTAGTTCATATAAGTTTATTCTAAATAAAATAAT
193 GA-ATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTGAAAATAAAATAAT
* * * * * *
25038 A-TCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTAA
256 ACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TGA
* * * * * * *** * ** *
25102 ACAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTACTATTACCTTTTGGTT
318 ACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTT
* * * *** * *
25167 TGTCATAAAATAAATT-TTTTT-GTCTATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATT
382 TGTCATAAAA-CAATTATTTTTATTC-ATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * * * * * * *
25230 AATATTAT-GACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTT-AAA
445 AATATT-TCAAAAATTAATAAG-AGAA-A--T-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAA
* * * * * **
25293 ATCGCTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
504 A-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * ** * * *
25358 CAATTGCTTCTATTCACACAAGATTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACA
567 CAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTA-TTCAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATA-TTTAAAA
* * * * **
25423 ATTAATAAGTAA-AGTATTTAAAAAATAAATATGTTTACGGAA-CAAGTTAAAATAGTCATTGAC
630 AATAATAAGTAAGAG-ATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAA-TT-CAATAGT--TAAAC
* * * * ** *
25486 TATTTGAATAATTAAT-TAGTTTAAATTATTTTGACAATTTGTTTTGTAATAAAACAATT-GTTT
689 TATTTGAACAATT-ATCTAATTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT
* * * * * *
25549 CAACTCAAATAAGCTTA-TTTGAAATAAAAT-ATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATG
753 -TATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA
* * * * *** * * ** *
25611 AGTAAGAGAA-TTAAAAAATGAATCTATTCAATGAACATGTTCAAATAATTATGATTATCTGAAC
816 AGCAA-AAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACA-GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAAC
25675 AATTATCTAT
879 AATTATCTAT
* * * * * * **
25685 TTCAAAACATTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGATTCTATTCATGCAAGCTTATCTC
1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAT-TC
* * *
25750 -AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTTAAAAAATAA
65 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
* * * * * * * * * **
25812 ATCTATTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA
128 ATCCATTTAC-CAACAAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTA
* ** * * * * *
25877 T-AACCTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
192 TGAA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTGAAAATAAAATAAT
* * * ** **
25941 ATTAATTTATTAAAATTGCAAAAATTAATAAG-AAAAGGATTTAAAAAATAAAT-TCATT-TGCT
256 ACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAGGA-GATTTAAAAAATAAATATGTTTATG--
* * * ** * *** **
26003 AAGCGAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAAGAATTATTTATTTCAAATTAATATGATCTTTTGT
317 AA-CAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACTATTATATATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGT
* * * * * * *
26068 TTTGTTATAAAATAATTATTTCTATTCATGCATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
380 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * * * *
26133 AATA-GTCTAAAAATAAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAA
445 AATATTTC-AAAAATTAATAAG--AGA-A-AT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAA
* * * * * *
26197 TAGTCATG-TTCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TATTTTGTTTTATCGTAA
504 AAGTTATGACT-ATTTGAA-TAATTATCTATTT-AAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** ** * ***
26259 AATAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCATAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTGG
565 AACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTATTCA-AATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTAAA
* * * * *
26324 AAAT--TAA-TAATAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAATTCAAATAGTCATGACTA
629 AAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCGAACCAATTC-AATAGTTA-AACTA
* * * **
26386 TTTGAATAATTATCT-ATCTCAAATTGTTATGA--TATTT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTTT
691 TTTGAACAATTATCTAAT-TCAAATTATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTT
* * * * * * * * ** * **
26447 GTTTAAACAAGCTTATGTAGAGTAAAATATTGCTAAA-TTAAGAATATTCTAAAAATTAATAATT
754 ATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGC
* * * * * * * *
26511 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGT-TAAACTAGTTCAAATAGCTA-AGGCTATTAGAACAA
819 AAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTGAAC-AGTTCAAATAGTTATA-ACAATTTGAACAA
26574 TTATCTAT
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Statistics
Matches: 6194, Mismatches: 1460, Indels: 842
0.73 0.17 0.10
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AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATC
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AATTAATAAGAGAAATAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAATTCAAAAAGTTATGACTATTTGA
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AAGTTTATTCAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAA
AAATAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAATAGTTAAACTATTTGAACAATTATCTAATTCAAATT
ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAA
TAATACTAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTT
CTGAACAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:19540 original size:719 final size:710
Alignment explanation
Indices: 17813--26592 Score: 3053
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17803 CACTATAATG
* * * *
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* * ** *
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* * * * * * * * ** *
17937 CAAGTTTTAAA-CGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTT
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* * ** * ** * * * **
18001 TGACATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAACAATATTAACGTATTAA
189 TGTCATAAAACAATTG-TTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * * *** * * ** *
18066 TTTTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-ATATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAG
253 TATTTCAAAAATTAA-GAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAG
* ** * * * * ** * * * *
18130 TCA-CGCCTAATTGAATGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAA
316 TTATAACC-ATTTGAA-CATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
18194 TTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAAT
379 TTATTTCTA-TTCATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
** * * * * * *
18258 TAAGGAGTAACAAAATTAAAAAA-AGAATATGTTTACAGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATC
443 TAATAAGT-A-GAAATTAAAAAATA-AATATATTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * *
18322 TGAATAATTATATATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTT
504 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * *** * * * * *
18387 ATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATTTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AA
569 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATTCAAATCTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * ** * * * * * * *
18451 ATTAAAAAAATAAATTTGTTTTCTGAGCACGTTCAAATAGCTACGACAATTTGAACAATTATATA
632 ATTTAAAAAAT--ATATGTTTACCAACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAT-TA
* * *
18516 TTTCAAATCGTTATGACC
693 ATTCAAATTGTTATGACT
* * * * * * **
18534 TTTGGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TGCATAAAATCATATTCAAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
18598 ATTTATCAAAATTCTAAAAATTAATTAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATCC-ATTTACCAAGCGA
64 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAA-CCTATTTACTAAACAA
* ** * * * * **
18662 GTTCAAATAGTTATGACTCTTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTC
128 GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * *
18727 ATAAAATGATTGCTTTTATTCATACAAGTTTATTGAAAATACAATAATACTAATTTATTAATA-T
193 ATAAAACAATTG-TTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
18791 TCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCT
257 TC-AAAAATTAA-GAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TGAACAAGTTCAAATAGT-T
** * *
18856 -TGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTATTTTGTCGTAAAACAATTA
318 ATAACCATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * * *
18920 TTTTTATTTATACAAAATTATTCAAAAGAAAATAATACTAGTTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
382 TTTCTATTCATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
18985 AAG-AGAAA-TAAAAACTAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGGATAA
447 AAGTAGAAATTAAAAAATAAATATATTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * *
19048 TTATCTATCTT-AAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
511 TTATCTAT-TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * *
19111 GTTTATTCAAAGTAAAATATTGGTAAA-CTAATAATATTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTG
575 GCTTATTCAAAATAAAATATT--CAAATCTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* *
19175 AAAAATATATGTATTCACCGAACCAATT-TAATAGATAAGACTATTAGAATAATTATCTAATTCA
637 AAAAATATATGT-TT-ACC-AACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAT-TAATTCA
* *
19239 AATTGTTCT-AGCC
698 AATTGTTATGA-CT
* * *
19252 TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
19317 TTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAACCTATTTACTGAACAAG
65 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGA-TTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACAAG
* * *
19382 TTTAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
129 TTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
19447 TAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTT
194 TAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
19512 CAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCAA-ATTAGTTCAAATAATTAT
258 CAAAAATTAAG-AGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATGAACA--AGTTCAAATAGTTAT
** * * * * *
19576 GGCCATTTAAACCATTATTTGTTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
320 AACCATTTGAA-CATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * *
19641 TTTCA-TCAAACAAACCTATTTGAAAA-AAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
384 TCT-ATTCATACAAACTTATTT-AAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
* * ** ** * * * *
19704 AAGTAGGTGACTTAAAAAATAAATATGCTTATTGAACCAGTTCAAATAGTAATGAGTGTTTGAAT
447 AAGTA-G-AAATTAAAAAATAAATATATTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
** * * * *
19769 AATTATAGATTTCAAATCGATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACA
509 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * *
19834 AGTTTATTCAAAATAAAATAATACAAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
574 AGCTTATTCAAAATAAAAT-ATTCAAATCTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * **
19899 AAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAATTCAAATGGTTAAGGCTA-TATGAATAATTATTTGTTTC
637 AAAAAT--ATATGTTTACC-AACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAATAATTA-TTAATTC
19963 AAATTGTTATGACT
697 AAATTGTTATGACT
* * * * * **
19977 TTTTGTTTTGTCATAAACAAA-TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGTTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
20041 TTTAGTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGT
65 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACAAGT
* * * * * * * * *
20102 TCAATTAGTTATAACAATTTGACCAATTATTTAATTCATATCATTGTGATCATTTGTTTTGTCAT
130 TCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *** ** * * * *
20167 AAAACAATTGTTTCTATTGATACATTATTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATA-TAC
195 AAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** * *
20231 TAAAAATTACTAG-GTAAT-G-GATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCCTGATC-AGTCCAAATAGT
259 -AAAAATTA--AGAGT--TGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT--TATGAACAAGTTCAAATAGT
** * * * *
20292 TATAACTGTATGAACAGTTATCTATTTCAAATCGTTATGATA-TTTGTTTTGTCACAAAATAATT
317 TATAACCATTTGAACA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* ** * * * * * *
20356 GA-TTCTGTTTGTATAAGCTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
381 -ATTTCTATTCATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
* * * * *
20420 ATAAATAAGAAATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGA
445 ATAAGT-AGAAA-TTAAAAAATAAATATATTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** * *
20485 ACAATTACCTATTCCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCA
507 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT-TATTCA
* * * * * *
20550 TACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATTCAAATTTATTAATAATTAGACAATTAATAAGTAAAAG
570 TACAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT-ATTCAAATCTAATAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * * *
20614 ATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
632 ATTTAAAAAAT--ATATGTTTACCAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTAA
*
20679 TTTAAATTGTTATGACTT
694 TTCAAATTGTTATGAC-T
* * * * * *
20697 TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTTCA-TTCATAGAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATATT
1 TTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT
* * * ** *
20760 AATTTATTAATATTCTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACA
63 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACT-AAACA
* * * * * *
20824 ACTTCAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAA-CATTACGACCTTTTGTTTTGT
127 AGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
20888 CATAAAATAATTCTATTAGTTTATATAGGCTTATTCGAAATACAATAATACTAATTTATTAATAT
192 CATAAAACAATTGT-TTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * *
20953 TTGAAAAATTAATGAGTAAGAAATTTAAAATATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCATATAGTT-
256 TTCAAAAATTAA-GAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-GAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * ** *** * * **
21017 CAACTATTTGAACAAATATCTATATCAAATTATTATGACCCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGG
319 TAACCATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * **
21082 TTCCATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTT-ATAATA-TTCAAAAAATTAA
383 TTCTATTCATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTC-AAAAATTAA
* * *
21144 TAAGTCA-AAATTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
446 TAAGT-AGAAATTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
21208 ATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAA
510 ATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * * * * * * *
21273 ACGTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAA
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* ** * *
21338 AAATAAATGTTTAAAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAA-CAAGTTCAAATAATTATGAC
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* * * * *
21402 CATTTGAACAAATATCT-ATCTCAAATTGTTGTGA-T
676 TATTAGAATAATTAT-TAAT-TCAAATTGTTATGACT
* * * * * * * *
21437 ATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-TTTCAAAGAAGTTTATTTGAATTAAAATAATAATA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * ** * * ** * * *
21501 ATTTAATAATATTCCAAAAATTAGCAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAA
64 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAAC-AA
* * * * * * *
21566 -TTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTA-CATATTTTAAATCGTTCTGACCTATTT-CTTA
128 GTTCAAATAGTTATA-ACAATTTGAACAATTATC-TATTTAAAATCATTATGACCT-TTTGTTTT
* * * * * * *
21627 GTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTGATTTAGAATAAATTAACACTAATTTATTAAC
190 GTCATAAAACAATTG-TTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *** * * * *
21692 A-TTCAAAAAAATAAAAAGAAAGAGATTTTAAAAAATATATCTATTTACGAAATAAGTTCAAATA
254 ATTTC--AAAAATTAAGAGTTGGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATG-AACAAGTTCAAATA
* * ** * * * * *
21756 ATTATTATTATTTGAACAATTGTC-ATTTTAAAATTGTTAT-AACTTTTTGATTTGTCATAAAAC
315 GTTATAACCATTTGAAC-ATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGAA-ATTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** ** *
21819 AATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTTTCTAT
377 AATTATTTCTA-TTCATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTTC-A-
** * * * * * * *
21883 ATTATTAAATAA-TAG-ATTTAAAAAATGAATATATTTACTGAATGAGTTGAAATAATTATG-GT
438 AAAATT-AATAAGTAGAAATTAAAAAATAAATATATTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * *
21945 GATTTCAATGATTTTCTATTACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTT
501 -ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * ** * * * * * *
22010 -TACCATACAAGCTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGGC
565 AT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATTCAAATCTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
22074 AACAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAACT-AT
627 AAGAGATTTAAAAAAT--ATATGTTTACC-AACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA-TAAT
* * * * *
22138 TATCAATCTTAATTTGTTA-AAAT
688 TATTAAT-TCAAATTGTTATGACT
* * * * * **
22161 CTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-ATCATAGAAGCATATTCG-GTTAAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACT
* * * * * * *
22224 AATTTAATAATATTCCAAAGATTAATATGCAAAA-A--T---AAAT----GTATTTGCTGAACCA
63 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACT-AAACA
* * * * * ** * * *
22279 A-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGT
127 AGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** * *
22343 CATAAAATATTTGTTTCATAACTTACAAGCTTATTTGAAATAAAAGAAT-CTGAATTTATTAACA
192 CATAAAACAATTGTTTAAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* **** * * ** *
22407 -TTCAAAACATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATTTGTCTATCGAACAACCTAAAATAG
255 TTTCAAAA-ATTAA-GAGTTGGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * * ** * *
22471 TTATTACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGCTT-TGACCTTTTATTTTGACATAAAACAA
316 TTATAACCATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCG-TTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * ** *
22535 TTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATGAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCCAAAA
379 TTATTTCTA-TTCATACAAA-CTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA
* ** * * * * * *
22598 TTAATAAGCAAGAGTTTAAAAATATAAATTTGTTTACAGAACAAATTCTAATAGTTACGACTATT
442 TTAATAAG-TAGAAATTAAAAA-ATAAATATATTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * ** *
22663 TAAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCAATTT
504 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * * * * * *
22728 ATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTATGTG
569 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATTCAAATCTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * * * ** *
22793 ATTTAAAAAGTGAATATGTTTACTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCTATTTCAAAAATTATCTA
632 ATTTAAAAAAT--ATATGTTTAC-CAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAT-TA
* ** * *
22858 TTTCAAATCATTATTACC
693 ATTCAAATTGTTATGACT
* * * * * * * *
22876 TTTTATTTAG-AATAAATAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAATAA-AATG
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-
* * ** *** *
22937 AATTTATTAATATT-TCAAAAATTCATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT-AAC
63 AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTA-CTAAAC
* * * * * * * **
23000 TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
126 AAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *** *
23065 TCATAAAACAAACATT-TTT-GTTCATATACGTTTGTTTGCAATAAAATAATACTAATTGATTAA
191 TCATAAAAC--A-ATTGTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * ** * *
23128 TATTTCAAAAATT-A-A-TAAGAGATTTTAAAAATAAAT-AATTTATCAA-ATCAGTTTAAATAG
253 TATTTCAAAAATTAAGAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATGAACA--AGTTCAAATAG
* * * * * * ** * * * *
23188 TTATGACTATTTAAAGTAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAA
316 TTATAACCATTTGAA--CATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * * *
23253 -TAGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAA--T--T--TA-TT-AATAAG
379 TTA-TTTCTATTCATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
* * * * * **
23309 T-A-AA--A-AATTTCAAAAATAACTATGTTTACCAAACTAAATCAAATAGTTATGACTATTTGA
443 TAATAAGTAGAAATTAAAAAATAAATATATTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** * * * * ** * ** ** *
23369 ATAATTATCAATTTTAGTTC-ATATAAGC--TT-ATTCGAAATAAAATAATACTATGCTATTAAT
507 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTATTCAT
*** *** * * * * * *
23430 ATTTTGAAAATT-AATGACTAAGAGATTGAAAACATGAAT-ATGTTTACCAAACAAGTTTAAATA
571 A-CAAGCTTATTCAA--AATAAAATATTCAAATC-T-AATAATATTT---AAA-AA--TT-AATA
* * * * * * ** * * * *
23493 ATTAGGACAATTTGAACAAT-TATCTATT--TGA--AA-TC-ACTA--TAA-CCT-TTTG-CT--
624 AGTAAGA-GATTTAAAAAATATATGT-TTACCAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAA
* *
23544 TT-GTCA-T-AAA-----ATGA-T
687 TTATTAATTCAAATTGTTATGACT
* * ** * * ** ** * * *
23559 TTTT-CTTT-TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATA-ATA-CCAATTT--ATTAATATCAAGAC
1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGTTTT-AGT-TCATACA-AGCTTATTTGAAATAAAAT-AATAC
* * ** * * **
23618 -AA-TTAATAAGTA----AAAGATTTAATAAATAAATTTG-TTTATCGAACAAGTTCAAA--TCG
62 TAATTTATTAA-TATTCTAAA-AATTAATAAGCAAA--AGATTTA---AA-AA-AT-AAACCTAT
* * ** * ** * * * * *
23674 TTA-T-GACTA-TTTGAATAATTAT--TTATTT-TA-AATTGT-TA--T--GA-CTTTTTG---T
117 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
** * * **** * * * * *
23723 TTTG--TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA-T-AT--AAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAA
182 TTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGT-TTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
23782 TTTATTAATATTTTGATAAA-TAATAAG-T-AAAATATTAAAAAATAAATATATTTAT---CGAA
245 TTTATTAATA-TTTCAAAAATTAA-GAGTTGGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTATGAAC-AA
* * * * * * * ** *
23841 ---CAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTCTTTCAAATCATTGTGATCTTTTGTTTTGTA
306 GTTCAAATAGTTATAACCATTTGAA-CATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTC
* * * * * *
23903 ATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAAAAAATACTAATTTATTAATAT
370 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAACTTATTTAAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATAT
** * * * * *
23968 TTTGAAAATTAA-AGAGTAAGAGAA-TAAAAAAAAGAATTTGTTTA-TGCAACAAGTTTAAATAG
434 TTCAAAAATTAATA-AGT-AGA-AATTAAAAAATA-AATATATTTACCG-AAC-AGTTCAAATAG
* ** * * * * *
24030 TTAAGTGTATCT-AAAAGATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
493 TTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
*** * ** * * * *
24094 TCACTTTTGTTCATGTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTCCAAAAC
557 TTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT-AT-TCAAATCTAATAATATT-TAAAAA
* * * * * *
24157 TTAATAAGTAA-AAATTAAAAAAATAAATCTAT-TTTA-TAAACACCTTCAAATAGTTATGACTA
618 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT--A--TATGTTTACCAACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTA
* * * * ** * *
24219 TTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTACGACCA
678 TTAGAATAATTAT-TAATTCAAATTGTTATGA-CT
** * * * **
24254 TTTCCTTTT-TCATAAACCAA-TGTTTTTTGTTCAAACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * ** * * * ** * *
24317 ATTTATTAATACTC-CAAAATTAATAATTAAAAGA-TTAAAAAAAAAATCTAATTACCGAGCGAG
64 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACAAG
* * * * * *
24380 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAGTCGTTATGATCTTTTGTTTTGTC
129 TTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATC-TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
24444 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTATTA-T
193 ATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** *
24508 TCTAAAAATTAACAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCAATTTACCAATACCAAACAAGTTCAAA
257 TC-AAAAATTAA-GAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT----AT---GAACAAGTTCAAA
** * * * * *
24573 TAGTTATGTCCATTTGAACTATTATTTATTTTAATTTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAC
313 TAGTTATAACCATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAAC
*** * * * *
24638 AATTATTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTATTAAATTAATAATA-TTCTAAA
377 AATTATTTCTATTCATACAAA-CTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAA
* * * * * *** *
24701 AATTAATAAGTGAGGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAACCAACACAAATAGTTAAGACTAT
440 AATTAATAAGT-AGAAATTAAAAAATAAATATATTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * * ** * * * *
24766 TAGAATAATTAT-TATTTTGAATCATTTTGGCCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTCTATT
503 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * * * * * * * *
24830 CATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAATAA-A
568 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATTCAAATCTAATAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * ** ** *
24894 AATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGA-TCAAACGGCCATGACTATTTCA-AAT-ATTA
631 GA-TTTAAAAA-ATATATGTTTA-CCAACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTA-TT-AGAATAATTA
* *
24956 TCTATTTCAAATTGTTATGACC
690 T-TAATTCAAATTGTTATGACT
* * * *
24978 TTTTGTTATGTCATAAAAGAATTGCTTTAGTTCATATAAGTTTATTCT-AAATAAAATAATA-TC
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACT-
* ** * * * *
25041 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTAAACAA
63 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACAA
* * * ** * * * * *
25106 GTTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTACTATTACCTTTTGGTTTGTC
128 GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *** *
25171 ATAAAATAAATT-TTT-TTGTCTATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA
193 ATAAAA-CAATTGTTTAAT-TC-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *** * * * * *
25234 TTAT-GACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTTAAAATCGC
255 TT-TCAAAAATTAAGA-GTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * ** **
25298 TATGACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
317 TATAACCATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * * * * * ** *
25363 GCTTCTATTCACACAAGA-TTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTA
381 ATTTCTATTCATACAA-ACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
* * * *
25427 ATAAGTA-AAGTATTTAAAAAATAAATATGTTTACGGAACAAGTTAAAATAGTCATTGACTATTT
445 ATAAGTAGAA--A-TTAAAAAATAAATATATTTACCGAAC-AGTTCAAATAGTTA-TGACTATTT
* ** * * ** * ** *
25491 GAATAATTAAT-TAGTTT-AAATTATTTTGACAATTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAACT
505 GAACAATT-ATCTA-TTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * ** * * * * *
25554 CAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAG
568 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATATTCAAATCTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * *
25619 AATTAAAAAATGA-ATCTATT-CAATGAACATGTTCAAATAATTATGATTATCT-GAACAATTAT
632 ATTTAAAAAAT-ATATGT-TTACCA--ACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAATAATTAT
* *** * *
25681 CTATTTCAAAACATTATAACA
691 -TAATTCAAATTGTTATGACT
* * * * *
25702 TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGATTCTA-TTCATGCAAGCTTATCTCAAATAAAATAATA-TA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-
* * * * * * *
25765 AATTTATTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTTAAAAAATAAATCTATTTTCTAAACAT
63 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACAA
* * * ** *
25829 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTTTGTC
128 GTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * *
25893 ATAAACCAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATT
193 ATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *** ** * * *
25958 GCAAAAATTAATAAG-AAAAGGATTTAAAAAATAAAT-TCATT-TGCTAAGCGAGTTTAAATAAT
257 TCAAAAATTAA-GAGTTGGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATG--AA-CAAGTTCAAATAGT
* * * * *** ** * *
26020 TATGACTATTTGAAGAATTATTTATTTCAAATTAATATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT
317 TATAACCATTTGAA-CATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* *** * * * *
26085 ATTTCTATTCATGCATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-GTCTAAAAATAA
381 ATTTCTATTCATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTA
* * * * * *
26149 ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATG-TTCATTTG
445 ATAAG-TAGA-AATTAAAAAATAAATATATTTACCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG
* * * ** * * * *
26213 AACTATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTATCGTAAAATAATTGTTTCTATTCAT
506 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
** * * * * * **
26278 ACAAAATTATTCATAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTGGAAATTAATAA-T---AGAT
571 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATATTCA-AATCTAATAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * *
26339 TTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAATTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCT-AT
634 TTAAAAA--ATATATGTTTA-CCAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTAT-TAAT
26403 CTCAAATTGTTATGA-T
695 -TCAAATTGTTATGACT
* * * * * * * * *
26419 ATTT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGTTTAAACAAGCTTATGT-AGAGTAAAATATTGCTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTA
* ** ** * ** * ** *
26482 AATTAAGAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTTAAACTAG
64 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACAAG
* * * * *
26547 TTCAAATAGCTA-AGGCTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
129 TTCAAATAGTTATA-ACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATT
26593 CTAAGCTTAT
Statistics
Matches: 6133, Mismatches: 1461, Indels: 934
0.72 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
659 65 0.01
660 33 0.01
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737 4 0.00
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745 3 0.00
746 30 0.00
747 132 0.02
748 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (710 bp):
TTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACTAAACAAGTT
CAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
AAATTAAGAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATGAACAAGTTCAAATAGTTATAACCAT
TTGAACATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
ATACAAACTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAAA
TTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAA
ATAAAATATTCAAATCTAATAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATGTTT
ACCAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTAATTCAAATTGTTATGACT
Found at i:19651 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 19617--19653 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
19607 TTATGAACTT
19617 TTGTTTTGTCATAAAACAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAA
*
19636 TTGTTTT-TCATCAAACAA
1 TTGTTTTGTCATAAAACAA
19654 ACCTATTTGA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
18 10 0.59
19 7 0.41
ACGTcount: A:0.35, C:0.14, G:0.08, T:0.43
Consensus pattern (19 bp):
TTGTTTTGTCATAAAACAA
Found at i:21513 original size:203 final size:203
Alignment explanation
Indices: 21154--21551 Score: 512
Period size: 203 Copynumber: 2.0 Consensus size: 203
21144 TAAGTCAAAA
* * * * *
21154 TTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
1 TTAAAAAATAAATATATTTTCTGAACAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAAATATCTATCT
* * *
21219 CAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAACGTATTCAAA
66 CAAATAGTTATGA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAAACAAACGTATTCAAA
* * * *
21284 ATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATGT
130 ATAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATGT
21348 TTAAAAATT
195 TTAAAAATT
* *
21357 TTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAAATATCTATC
1 TTAAAAAATAAATATATTTTCTGAAC-AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAAATATCTATC
* * * * *** **
21422 TCAAATTGTTGTGA-TATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCAAAGAAGTTTATTTGA
65 TCAAATAGTTATGACT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAAACAAACGTATTCAA
* * * *
21486 ATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGCAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG
129 AATAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATG
21551 T
194 T
21552 GTTTGCCAAA
Statistics
Matches: 165, Mismatches: 27, Indels: 5
0.84 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
202 1 0.01
203 106 0.64
204 58 0.35
ACGTcount: A:0.44, C:0.09, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (203 bp):
TTAAAAAATAAATATATTTTCTGAACAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAAATATCTATCT
CAAATAGTTATGACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAAACAAACGTATTCAAAA
TAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATGTT
TAAAAATT
Found at i:22860 original size:16 final size:18
Alignment explanation
Indices: 22824--22871 Score: 64
Period size: 16 Copynumber: 2.7 Consensus size: 18
22814 ACTGAATTAG
22824 TTCAAATAATTATGGCTAT
1 TTCAAATAATTAT-GCTAT
22843 TTCAAA-AATTAT-CTAT
1 TTCAAATAATTATGCTAT
*
22859 TTCAAATCATTAT
1 TTCAAATAATTAT
22872 TACCTTTTAT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 4
0.84 0.03 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 10 0.37
17 5 0.19
18 6 0.22
19 6 0.22
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.04, T:0.44
Consensus pattern (18 bp):
TTCAAATAATTATGCTAT
Found at i:23808 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 23386--26588 Score: 2343
Period size: 181 Copynumber: 17.8 Consensus size: 182
23376 TCAATTTTAG
* * * *
23386 TTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACT-ATGCTATTAATATTTTG-AAAATTAATGAC
1 TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * * *
23448 TAAGAGATTGAAAACATGAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAATTAGGACAATTTGAACAAT
64 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * * ** *
23513 TATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGCTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTT
129 TATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** * *** *
23566 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACCAATTTATTAATATCAAG-ACAATTAATAAGTA
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* * *
23630 AAAGATTTAATAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTA
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * *
23695 TTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
131 TCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
23747 TTCATATAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAAA-TAATAAGTA
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* * * *
23811 AAATA-TTAAAAAATAAATATATTTATCG---AA---CAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
23869 TCTCTTTCAAATCATTGTGA-TCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTCAA
131 TCTATTTCAAATTATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * *
23921 TTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTTG-AAAATTAA-AGA
1 TTCATACAAGCTTATTCAG-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATA-A
* * * * * * ** * *
23983 GTAAGAGA-ATAAAAAAAAGAATTTGTTTAT-GCAACAAGTTTAAATAGTTAAGTGTATCT-AAA
63 GTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
** * ** *
24045 AGATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCACTTT-TG
126 A-ATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTA
** ** *
24103 TTCATGTAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCCAAAACTTAATAAG
1 TTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAG
* * * ** *
24165 TAAAA-ATTAAAAAAATAAATCTATTTTAT-AAACACCTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
64 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * ** * * *
24228 TTATCTATTTTAAATCATTACGACCATTTCCTTTT-TCATAAACCAA-TGTTTTTTG
128 TTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA
* * * * ** *
24283 TTCAAACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--CTCCAAAATTAATAATTA
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* ** * * * *
24346 AAAGA-TTAAAAAAAAAATCTAATTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* **
24410 -CTTATTTCAAGTCGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
131 TC-TATTTCAAATTATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
24462 TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTATTATTCT-AAAAATTAACAAGTT
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * *
24526 GAAGATTTAAAAAATTAATCAATTTACCAATACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAA
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT----AT--CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
24591 CT-ATTATTTATTTTAATTTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA
125 -TAATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * * *
24649 TTCATAAAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTATTAAATTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* * * * ** * *
24712 GAGGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCTGAACCAA-CACAAATAGTTAAGACTATTAGAATAAT
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
** * * * * * * *
24775 TAT-TATTTTGAATCATTTTGGCCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTCTA
129 TATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
24828 TTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG-ATAATTAATAAATA
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** ** *
24892 AAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAACGGCCATGACTATTTCAA-ATATT
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA-ATT
* * * * *
24955 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTATGTCATAAAAGAATTGCTT-TA
130 ATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * **
25007 GTTCATATAAGTTTATTCTA-AATAAAATAATA-TCAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAA
1 -TTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
25069 TTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATGATTATTTGAACA
63 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * *
25133 ATTATCTATTTGAAATTACTATTACCTTTTGGTTTGTCATAAAATAAATT-TTT-T-
127 ATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTA
* ** * * * *
25187 TGTCTATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTATG-ACAATTAATAGG
1 T-TC-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
25251 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAATAAGTTAAAATCGCTATGACTATTTAAACAAT
64 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * *
25316 TATTTATTTTAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTCTA
129 TATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
25370 TTCACACAAGATTATT-TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTG-ACAATTAATAAGT
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGT
* * *
25433 -AAAGTATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGGAACAAGTTAAAATAGTCATTGACTATTTGAATA
65 AAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAATA
* ** * *
25496 ATTAAT-TAGTTT-AAATTATTTTGACAATTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
127 ATT-ATCTA-TTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
25552 CTCAAATAAGCTTATT-TGAAATAAAAT-ATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATGAGT
1 TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * *
25614 AAGAGAATTAAAAAATGAATCTATTCAAT-GAACATGTTCAAATAATTATGATTATCTGAACAAT
65 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
** * * * *
25678 TATCTATTTCAAAACATTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGATTCTA
129 TATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * **
25732 TTCATGCAAGCTTATCTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-CTCCAAAAATTAATAAG
1 TTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAG
* * * * *
25794 TAAAA-TTTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
64 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * *
25857 TTATCTATTTCAAATTGTTATAAC-CTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTCTG
128 TTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
25911 TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAA-A-ATTGCAAAAATTAATAAG-
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
25973 AAAAGGATTTAAAAAATAAAT-TCATTT-GCTAAGCGAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAAGA
65 AAAA-GATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * *
26036 ATTATTTATTTCAAATTAATATGA-TCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCTA
127 ATTATCTATTTCAAATTATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * * *
26092 TTCATGCATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAGTCT-AAAAATAAATAAGTT
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
26156 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAACT-AT
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAA-TAAT
* * * *
26219 TATCTATTTCAAATCATTATGA-TATTTTGTTTTATCGTAAAATAATTGTTTCTA
129 TATCTATTTCAAATTATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** * * *
26273 TTCATACAAAATTATTCATAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTG-GAAATTAATAA-T-
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
* * *
26335 --AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAA-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATT
66 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
26397 ATCTATCTCAAATTGTTATGA-TATTT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTTTG
130 ATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * ** * *
26448 TTTAAACAAGCTTATGT-AGAGTAAAATATTGCTAAATTAAGAATATTCT-AAAAATTAATAATT
1 TTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * * * *
26511 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTTAAACTAGTTCAAATAGCTAAGGCTATTAGAACAATT
65 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
26576 ATCTATTTCAAAT
130 ATCTATTTCAAAT
26589 CATTCTAAGC
Statistics
Matches: 2408, Mismatches: 491, Indels: 249
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 2 0.00
174 87 0.04
175 109 0.05
176 15 0.01
177 71 0.03
178 29 0.01
179 415 0.17
180 601 0.25
181 746 0.31
182 170 0.07
183 14 0.01
185 1 0.00
186 20 0.01
187 128 0.05
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (182 bp):
TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTA
AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
TCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
Found at i:27657 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 27035--28496 Score: 954
Period size: 181 Copynumber: 8.1 Consensus size: 181
27025 ACCAGTTTCA
* * ** * * * ***
27035 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCAA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTATTTTTG
* * *
27100 TTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAATT-A-A-TAAG
66 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATTAAG
* * * * *
27161 AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTGCCAAAAC-AGTTCAAACAGTTAAGACT
131 AGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACC-GAACTAGTTCAAATATTTATGACT
* * * * * ** * * *
27211 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTATTTTGTTATAAAACAATCATGTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTATTTTT
* * *
27275 GTTCATACAAGCTTATTCAAAATGAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCTGAAAATT-A-A-T
65 GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATATT
* * * * * * * * *
27335 AAGCA-ATTTAAAAAGTGAATCTA-TTTATC-AAATCATTTTAAATAATTATGGCC
128 AAG-AGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACT-AGTTCAAATATTTATGACT
* * * * * ** * * ** * *
27388 ATTTCATCAGTTATTTATTTCAAATTGTTATT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTATTTTT
* * * *
27452 GATCATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTA
65 GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAT-TA
*
27517 AGCGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACTAGTTCAAATATTTATGACT
129 AGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACTAGTTCAAATATTTATGACT
** * *
27569 ATTTGAACAA-TAGTAAACTTT-AAATCATTTTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATTATTATTTT
1 ATTTGAACAATTA-TCTA-TTTCAAATCGTTTTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTATTTT
* * *
27632 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTTCAAAAATTAATAACT
64 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-ATT
* ** * * * * * *
27697 AAGAGAATTAAAAAATAAAT-TTTTTTGCTGAACCATTTTAAATATTTAAGACT
128 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACTAGTTCAAATATTTATGACT
* * * * * * * * * *
27750 ATATGAATAAATATCTATTTTAAGTCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCACAAAATAAGTT-TGTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATGA-TTATTTT
* * ** * **
27813 TGAATTCATACTAGTTTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT
64 TG--TTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * *
27877 AATTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGATT
125 -ATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACTAGTTCAAATATTTATGACT
* * * * *
27934 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACT-AATATTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAATATTTTGTTTTGTCATAAAA-TGATTATTTTT
* ** * * * *
27998 GTTCATATAAATTTGA-TCAAAATCAAGTAATACTAATATATTAATATTT-AGAAAATT-A-A-T
65 GTTCATACAAGCTT-ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATATT
* * * * *
28058 AAGAGATTTAAAATATAAATCTA-TTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACT
128 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACTAGTTCAAATATTTATGACT
* * * * * * * ** *
28111 ATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTTGGTCTAAT-ATAAAATGATTGA-AT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTAATATTTT-GTTTTGTCATAAAATGATT-ATTT
* * * * * * *
28174 TTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATATCGACAATTAAGGAC
63 TTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAT
* * * *
28239 TAA-AAATTTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACAAGATCAAATAGTTT-TGACT
127 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACTAGTTCAAATA-TTTATGACT
* * * ** * *
28293 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATGACCTTTTGATTTGTAATAAAA-GATT-TGTTTC
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTAT-TTT-
* * * * * * * *
28355 AGTTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTGATAATCCAAAAATTAATAATA
64 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-ATT
* ** * * * *
28420 AAGAGATTT-AAAAACAAATCT-GTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGATT
128 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACTAGTTCAAATATTTATGACT
* *
28472 ATTTGAATAATTATCTATTTGAAAT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
28497 AACCTTTTGT
Statistics
Matches: 998, Mismatches: 232, Indels: 109
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.01
176 90 0.09
177 210 0.21
178 66 0.07
179 72 0.07
180 74 0.07
181 252 0.25
182 84 0.08
183 15 0.02
184 127 0.13
185 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAATATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTATTTTTG
TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATTAAG
AGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTACCGAACTAGTTCAAATATTTATGACT
Found at i:28847 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 28530--31048 Score: 1762
Period size: 181 Copynumber: 14.1 Consensus size: 181
28520 AAATCATATA
* * * * *
28530 AATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAGTGAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
1 AATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAC
* * ** * * ** ***
28593 AAGTTTAAATCGTTATGTTTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGATTTTTTGTTTT
64 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTT
* * * * ** * *
28657 GTCATAAAATAATTGTTTCTATTCTTACAAGTTTAGTCGGATTAAAATAATATT
128 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * **
28711 AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAACTATGTTTAATGAACAA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
* * * *
28776 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTCTTTTGTA
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTC
* * * * *
28841 ATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTTAAAGTAAAATAATACT
131 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * ** *
28892 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--ATA-A-TTAAAAAA-GAATTTGTTTATTGAATAA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
* ** * **
28952 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTATCACAAAACATTAT-AATATTTTGTTTTGT
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGT
* * * ***
29016 CATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT--T
130 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* ** * * * * *
29066 AAGATTTCTT-A-ATTCCAAAAATTAATTAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATATT-CTGAA
1 -A-ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT-TTACCGAA
* * * * * * * *
29127 CATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTAATATATTTGAAATCGTTA-GTACCTTTTGTTT
63 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCATTTGTTT
* * * * *
29191 TGTCAT-AAACTGATTGCTTT-TATTTATAAAAGCTTATTCATAATAAAATAATAAT
127 TGTCATAAAAC-AATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * **
29246 AATGTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTACCGAGTA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACA
* * * * *
29310 AGTTCAAATAGTTGTGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAA-CAGTTATGA-TATTTTGTTTT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCA-TTTGTTTT
* * * * *
29373 ATCATAAGAC-ATATGTTTCTATTCACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATT
128 GTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * *** * ** *
29427 AATTTATTAATAGTGTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAGTCCGTTTACCAAACAA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
** * * * ** *
29492 GTTTGAATAGTCATGTCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATG-CCATTTCATTTT-T
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTT-GTTTTGT
** * * * **
29555 TGTAAAACAATTCTTTTTATTCATATAAAATTATTCAAAATAAAATAATACT
130 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * *
29607 GATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACA-AAATCTGTTTACCAAATC
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATATGTTTACCGAA-C
* * * * * * *
29667 AA-TTCAAAGA-AT-TGACTATTTAAACAAATATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTCTTG
64 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTG
* ** * * *
29728 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCT
129 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
** * * * * *
29781 AAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACCA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CA
* * * * *
29846 A-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTAGT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGT
* * * *
29910 -AGTAAAATAATTGTTT-TCAGTTCGTACATGCTTAATT----AT-TAAT-A-ACT
130 CA-TAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACT
* * ** * * * **
29957 ATTTTATTAACATTCAAAAAACTAATAAGTAAGAA-A-TAAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACA
* * * * ** * *
30020 AGTTTAAATAGTTATGA-TAATTTGAATAATTATATATTTAAAATTGTTATAACC-TTTATTTCT
65 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTT-T
* * * *
30083 ATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATT
128 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * *** * *
30137 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-GAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCGAAG
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATT-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAAC
* * * * * *
30200 TAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTT
64 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTT
* * *
30264 GTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACT
128 GTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * *** * *
30318 AATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACCA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
* * * *
30383 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTTGT
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTG-TTTTGT
* * * * * **
30448 CAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGTTTAGTT-GGAATAAAATAATACT
130 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * ***
30500 AATTGAATAATATTATGAAAATTAATAACTACAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTTGAACTA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAC-A
* * * * *
30565 A-TTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
65 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTG
** * * * * * * * *
30628 TCATAAAACAAAAGTTT-TGTGCACATAAGTTTATTCAGAATAAAATACTATT
129 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * *
30680 AATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AG---GAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
* * ** * * * *
30741 GTTTAATTAGTTACAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACCATTTGTTTTGTC
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTC
* * * *** * *
30806 ATAAAAAAATTGTTTTTATTGATA-AAGTCTTATTTGGAATAAAGTAACACT
131 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * ** * *** ** *
30857 AATTTATTAAAATTTTATAAGTTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATCCATTGGCCTAACCA
1 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CA
* * **
30922 A-TACAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTG
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTG
* * * * * * * *
30985 TCACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCGAAGTGAAATAATACA
129 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
31038 AATTTATTAAT
1 AATTTATTAAT
31049 TTGAAATAGA
Statistics
Matches: 1843, Mismatches: 405, Indels: 180
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 5 0.00
174 136 0.07
175 82 0.04
176 266 0.14
177 71 0.04
178 139 0.08
179 16 0.01
180 212 0.12
181 730 0.40
182 176 0.10
183 10 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAA
GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
Found at i:29348 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 29327--29359 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
29317 ATAGTTGTGA
29327 TTATTT-AAACAATTAT
1 TTATTTCAAACAATTAT
*
29343 TTATTTCAAACAGTTAT
1 TTATTTCAAACAATTAT
29360 GATATTTTGT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.03, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
TTATTTCAAACAATTAT
Found at i:29417 original size:354 final size:354
Alignment explanation
Indices: 28549--30635 Score: 1000
Period size: 354 Copynumber: 5.8 Consensus size: 354
28539 ATATTAAGAC
* * * * *
28549 AATTAATAAGTGAAATATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACAAGTTTAAATCGTTATGTTT
1 AATTAATAAGT-AAA-ATTTAAAAAATAAATC-AGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATT
* * *
28613 ATTTAAGCAATTATTTATTTC-AACTTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTGTTTC
63 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAAC-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACAT-A-TGTTTC
* * *** * *
28676 TATTCTTACAAGTTTAGTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAATT
125 TATTCATACAAGTTTA-T----TTAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
* * *
28741 AAAAGATTTAAAAAATAACTATGTTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
185 AAAAGATTTAAAAAATAACTATGATTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATA
* * *
28806 ATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCT
250 ATATATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCT
* * * *
28871 TATTTAAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
315 TATTCAAAGTAAAATAATAATAATGTATTAAAATTTCAAA
* * ** ** *
28911 AATTAATAAG-ATAA-TTAAAAAA-GAATTTGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
1 AATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATT
* ** ** * *
28973 TGAACAATTAACTATCACAAAACA-TTATAATATTTTGTTTTGTCATAAAACAGT-TGGTTCTAT
66 TAAACAATTATTTATTTC-AAACAGTTATGATATTTTGTTTTGTCAT-AAACA-TATGTTTCTAT
* * * *
29036 TCATGCAAGCTTATTTTGAATAA-AATAATTAAGATTTCTT-A-ATTCCAAAAATTAATTAGTAA
128 TCATACAAGTTTA-TTT-AA-AATAAT-A-TAA-ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
29098 AA-ATTTTAAAAATAAATCTAT-ATT-CTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTA
187 AAGATTTAAAAAAT-AA-CTATGATTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATA
* * * * * * * * *
29160 ATATATTTGAAATCGTTA-GTACCTTTTGTTTTGTCATAAACTGATTGCTTT-TATTTATAAAAG
250 ATATATTTCAAATCATTATG-ACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTG-TTTCAATTCATAAAAG
29223 CTTATTCATAA-TAAAATAATAATAATGTATTAAAA-TTCTAAA
313 CTTATTCA-AAGTAAAATAATAATAATGTATTAAAATTTC-AAA
* *
29265 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAGTAAGTTCAAATAGTTGTGATTA
1 AATTAATAAGT-AAA-ATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTA
*
29330 TTTAAACAATTATTTATTTCAAACAGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAGACATATGTTTCTAT
64 TTTAAACAATTATTTATTTCAAACAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAA-ACATATGTTTCTAT
* * * ** ***
29395 TCACACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAGTGTAAAAATTAATAAGTTGG
128 TCATACAAGTTTATT-----TAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAA
* ** * *** ** * * * ** * *
29460 AGATTTAAAAAATAAGTCCGTTTACCAAACAAGTTTGAATAGTCATGTCCATTTGAATTATTATC
188 AGATTTAAAAAATAACTATGATTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATAATA
** * * ** *
29525 TATTTCAAATCATTATG-CCATTTCATTTT-TTGTAAAACAATTCTTTTTATTCATATAAA-ATT
253 TATTTCAAATCATTATGACCATTTC-TTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATA-AAAGCTT
* * * * *
29587 ATTCAAAATAAAATAATACTGATTTATTAATATTTCAAA
316 ATTCAAAGTAAAATAATAATAATGTATTAAAATTTCAAA
* * * * * *
29626 AATTAATAAG--AGATTTAAAAACA-AAATCTGTTTACCAAATCAA-TTCAAAGA-AT-TGACTA
1 AATTAATAAGTAAAATTTAAAAA-ATAAATCAGTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATGATTA
* * * * * *
29685 TTTAAACAAATATCTATCTCAAATCA-TTATGAT-CTTTGTCTTGTCATAAAACA-ATTATTTCT
64 TTTAAACAATTATTTATTTCAAA-CAGTTATGATATTTTGTTTTGTCAT-AAACATA-TGTTTCT
* * * * * *
29747 ATTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAA-CTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT
126 ATTCATACAAGTTTATT-----TAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
* * * **** * *
29811 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT
185 AAAAGATTTAAAAAATAACTATGATTAATGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * * * *
29875 TATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTAGTAGTAAAATAATTGTTTTCAGTTCGTACATG
249 AATATATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTG-TTTCAATTCATAAAAG
* * *
29940 CTTAATT---A-T----TAATAACTATTTTATTAACA-TTCAAAA
313 CTT-ATTCAAAGTAAAATAATAA-TAATGTATTAAAATTTC-AAA
* * * * ** * * *
29976 AACTAATAAGTAAGAAATAAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGATAAT
1 AATTAATAAGTAA-AATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTAT
* * * * ** * * *
30041 TTGAATAATTATATATTTAAAATTGTTAT-A-ACCTTTATTTCTATCATAAAACA-ATTGTTT-T
65 TTAAACAATTATTTATTTCAAACAGTTATGATA-TTTTGTTT-TGTCAT-AAACATA-TGTTTCT
* ** * * * *
30102 AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-GAG
126 A-TTCATACAAG-TT-T---ATTTAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATT-AATAAG
*** * * ** * * *
30166 TTGGAGATTTAAAAAATAA--ATCAGTTTATCGAAGTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGA-
184 TAAAAGATTTAAAAAATAACTATGA-TTAAT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-AC
* * * * * * *
30228 AATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC-A-TCATA
246 AATAATATATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTG--TTTCAATTCATA
* * * *
30291 CAAGCCTATTCGAAA-TAAAATAATACTAAT-TGATTAATATTTCAAA
309 AAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATAATAATGT-ATTAAAATTTCAAA
** * ** * *
30337 AATTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAAT-ATGCTTACCGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
1 AATTAATAAGTA--AAATTTAAAAAATAAATCA-GTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATT
* * * ** * *
30401 ATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTTGTCAAAAAACA-ATTATTT
63 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAA-CAGTTATGATATTTTG-TTTTGTC-ATAAACATA-TGTTT
* * * * ***
30464 ATGTTCATACAAGTTTAGTTGGAATAAAATAATACT-AATTGAATAATATTATGAAAATTAATAA
124 CTATTCATACAAGTTTA-TT----TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * ** * *
30528 CTACAAGATTTAAAAAATAAAT-TTATTTGTTGAACTAA-TTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAA
183 GTAAAAGATTTAAAAAATAACTATGA-TTAATGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAA
* * * * * * *
30590 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
245 CAATAATATATTTCAAATCATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAA
30636 CAAAAGTTTT
Statistics
Matches: 1317, Mismatches: 297, Indels: 221
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
349 8 0.01
350 22 0.02
352 4 0.00
353 34 0.03
354 277 0.21
355 133 0.10
356 156 0.12
357 128 0.10
358 37 0.03
359 97 0.07
360 13 0.01
361 108 0.08
362 152 0.12
363 136 0.10
364 12 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (354 bp):
AATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATT
TAAACAATTATTTATTTCAAACAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACATATGTTTCTATTCA
TACAAGTTTATTTAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
AAAATAACTATGATTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATAATATATTTCAA
ATCATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAGTA
AAATAATAATAATGTATTAAAATTTCAAA
Found at i:30885 original size:539 final size:541
Alignment explanation
Indices: 29585--31041 Score: 1191
Period size: 539 Copynumber: 2.7 Consensus size: 541
29575 TCATATAAAA
* * * *
29585 TTATTCAAAATAAAATAATACTGATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A-TAAGAGATTTAAAAA
1 TTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAGTAGGAGATTTAAAAA
** * * * * * * * *
29647 CA-AAATCTGTTTACCAAATCAATTCAAAGAATT--GACTATTT-AAACAAATATCTATCTCAAA
66 -ATAAATCAATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTACAACAATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * *
29708 TCATTATGATC-TTTGTCTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAGTA
129 TCATTATGAACATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGAAATA
*** *
29771 AAATATTGCTAA---ACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAT-
193 AAATAACACTAATTGATTAA-AAT-TTC-AAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
29831 ATGTTTG-CCAAACCAATTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
254 A---TTGACCGAACCAATACAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * *
29894 TGACCTTTTGTTTAGT-AGTAAAATAATTGTTT-TCAGTTCGTACATGCTTAATT---A-T-TAA
315 TAACATTTTGTTTTGTCA-AAAAACAATTATTTAT--GTTCATACAAGCTT-ATTCGAAGTAAAA
* * * * * * * * * * * *
29952 T-A-ACTATTTTATTAACATTCA-AAAAACTAATAAGT--AAGAAATAAAAAAATAAATCTGTTT
376 TAATACAAATTGAATAATATT-ATGAAAATTAATAACTACAAG-ATTTAAAAAATAAATTTATTT
* * * * * *
30012 ATTGAAC-AAGTTTAAATAGTT-ATGATAATTTGAATAATTATATATTTAAAATTGTTATAACCT
439 GTTGAACTAA-TTCAAATAGTTAAAGCT-ATATGAATAATTATATATTTAAAATCGTTATAACCT
** * *
30075 TTATTTCTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGC
502 TTATTTCTATCATAAAACAAAAGTTTTAGTGCACAAAAGC
* *
30115 TTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAAGAGTTGGAGATTTAAAA
1 TTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AAGAGTAGGAGATTTAAAA
* * * ** *** *
30180 AATAAATCAGTTTATCGAAGTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGAAATTATCTATTTCAAAT
65 AATAAATCAATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTACAACAATTTGAGAAATTATCTATTTCAAAT
* *
30245 CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCGAAATAAA
130 CATTATGAACATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCGAAATAAA
* * *
30310 ATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGGTGATTTAAAAAATAAAT-ATGCT
195 ATAACACTAATTGATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATAAATCAT--T
* * * * *
30373 TACCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTT
257 GACCGAACCAATACAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACATT
* * *
30438 TTGTTTTTGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGTTTAGTTGGAA-TAAAATAATACTAA
322 TTG-TTTTGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAGTAAAATAATACAAA
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385 TTGAATAATATTATGAAAATTAATAACTACAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTTGAACTAAT
* * * * *
30567 TCAAATAGTTAAAGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCA
450 TCAAATAGTTAAAGCTATATGAATAATTATATATTTAAAATCGTTATAACCTTTAT-TTCTATCA
* *
30631 TAAAACAAAAGTTTT-GTGCACATAAGT
514 TAAAACAAAAGTTTTAGTGCACAAAAGC
* * * **
30658 TTATTCAGAATAAAATACTATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-A-A-TAGGAGATTTAAAAA
1 TTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAGTAGGAGATTTAAAAA
* * * *
30720 ATAAAT-ATATTTACCAAACCAGTTTAATTAGTTACAACAATTTGA-ACAATTATTTATTTCAAA
66 ATAAATCA-ATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTACAACAATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAA
* * * * *
30783 TCGTTAT-AACCATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTT-ATTGATA-AAGTCTTATTTGGAA
129 TCATTATGAA-CATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTCA-TCATACAAG-CCTATTCGAAA
* * * * * *
30845 TAAAGTAACACTAATTTATTAAAATTTTATAAGTTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATGAATCCA
191 TAAAATAACACTAATTGATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATAAAT-CA
* * * * ** *
30910 TTGGCCTAACCAATACAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACA
255 TTGACCGAACCAATACAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACA
* * * * *
30975 TTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCGAAGTGAAATAATACAAA
320 TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATAATACAAA
31040 TT
385 TT
31042 TATTAATTTG
Statistics
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TTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAGTAGGAGATTTAAAAA
ATAAATCAATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTACAACAATTTGAGAAATTATCTATTTCAAATC
ATTATGAACATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCGAAATAAAA
TAACACTAATTGATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATAAATCATTGACC
GAACCAATACAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACATTTTGT
TTTGTCAAAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATAATACAAATTGAAT
AATATTATGAAAATTAATAACTACAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGTTGAACTAATTCAAAT
AGTTAAAGCTATATGAATAATTATATATTTAAAATCGTTATAACCTTTATTTCTATCATAAAACA
AAAGTTTTAGTGCACAAAAGC
Found at i:31491 original size:180 final size:177
Alignment explanation
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31095 TGGCAAACAC
*
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * *
31166 TGAATAAACTTGTATGATCAAAATCAATTATTTTATAACAAAACGAAAGGTCATAATGATTTGAA
65 TGAATAAACTTGTATGAACAAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA--ATTTTAA
* * ** * * ** *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * *
31345 TGTATAAACTTGTATTAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGAATTTTAAA
65 TGAATAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-AATTTTAAA
* * *
31410 TAGACAATTGTTAAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAG
128 TAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAG
* * *
31460 ATTTATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-
1 ATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * *
31523 CTTGTATAAAC-----TG--C--AACAATTACTTTATGACTAAACAAAATGTCA-AAATCATTTC
63 TTTGAATAAACTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAT--TTT-
* * * * * ** * *
31578 AAATTGATAATTGTTCTAATAGTATTGA-TCATATGAACAAGTTTGGTAAATAA
125 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACT-ATTTGAACTGGTTCGGTAAATAG
* * * * *
31631 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTATTAAATTTGTATTATTTTAATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * * * * *
31696 TGAATAAGCTTGTACAAACAAAAAAATTATTTTATAACGAAAC-AAA--T--T--GTTTGAAATA
65 TGAATAAACTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAATTTTAAATA
* * * ** * * * *
31754 -A-AATCGTTTAAATAATCTTAACTCTTTGAACTGGTTCAGCAATTAG
130 GATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAG
* * ** * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * ** *
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65 TGAATAAACTT-GTATGAACAAAA-CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA--ATTTTA
* * *
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126 AATAGATAATTGTTCAAATAGT-AATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAG
* * * * *
31981 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * *
32046 TGAACAAACTTATATGAACAAAAACAAATGT-TTTTATGACAAAA-AAAAAGTAAT-AATGGTTT
65 TGAATAAACTTGTATGAAC-AAAAC-AAT-TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAT--TTT
* *
32108 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAG
125 -AAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAG
* * * * * *
32162 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATATTGAAATATTAATAAATTATTTTTATTTTATTA
1 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-TAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * *
32227 TGAATAAACTTGTATGAACTTAAATATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
65 TGAATAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
32280 AATCAAATTT
Statistics
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
GAATAAACTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAATTTTAAATAG
ATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAG
Found at i:31648 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 31352--31664 Score: 409
Period size: 170 Copynumber: 1.8 Consensus size: 170
31342 TTTTGTATAA
* *
31352 ACTTGTATTAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGAATTTTAAATAGACAA
1 ACTTGTATAAACTGAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGAATTTTAAATAGACAA
* ** * *
31417 TTGTTAAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTT
66 TTGTTAAAATAGTAATAACTATATGAACAAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATCTCTTA
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* * * *
31522 ACTTGTATAAACTGCAACAATTACTTTATGACTAAACAAAATGTCA-A-AATCATTTCAAATTGA
1 ACTTGTATAAACTGAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGAAT--TTT-AAATAGA
* ** * * *
31585 TAATTGTTCTAATAGTATTGA-TCATATGAACAAGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCT
63 CAATTGTTAAAATAGTAATAACT-ATATGAACAAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATCT
31648 CTTACTTATTAATTTTT
127 CTTACTTATTAATTTTT
31665 AAAAGATTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (170 bp):
ACTTGTATAAACTGAAACAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGAATTTTAAATAGACAA
TTGTTAAAATAGTAATAACTATATGAACAAGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAAATCTCTTA
CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTT
Found at i:32522 original size:17 final size:19
Alignment explanation
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32476 GGCAAGATCT
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*
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32522 A
1 A
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Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 2
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AGATGATTATATTTACTTG
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Indices: 32512--32541 Score: 51
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32502 TTGAGATATT
32512 ATTTTATTTGAAAAC
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*
32527 ATTTTCTTTGAAAAC
1 ATTTTATTTGAAAAC
32542 TAATTTTTAA
Statistics
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ATTTTATTTGAAAAC
Found at i:32769 original size:7 final size:7
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*
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1 TTTAGGG
*
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1 TTTAGGG
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1 TTTAGGG
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1 TTTAGGG
*
32714 ATTAGGG
1 TTTAGGG
*
32721 TTTATGG
1 TTTAGGG
*
32728 TCTAGGG
1 TTTAGGG
*
32735 -TTAGGT
1 TTTAGGG
*
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1 TTTAGGG
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1 TTTAGGG
*
32754 ATT--GG
1 TTTAGGG
32759 TTTAGGG
1 TTTAGGG
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1 TTTAGGG
32772 -TTAGGG
1 TTTAGGG
32778 -TTAGGG
1 TTTAGGG
32784 TTTAGGG
1 TTTAGGG
32791 TTTAGGG
1 TTTAGGG
* *
32798 -TAAAGG
1 TTTAGGG
32804 TTTAGGG
1 TTTAGGG
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1 -TT-TAGGG
* *
32820 -GTAAGG
1 TTTAGGG
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1 TTTAGGG
32833 TTTA-GG
1 TTTAGGG
*
32839 TTTAGGC
1 TTTAGGG
32846 TTTAGGG
1 TTTAGGG
*
32853 TTTAGAG
1 TTTAGGG
*
32860 TTTA-GA
1 TTTAGGG
32866 TTTAGGG
1 TTTAGGG
**
32873 TACAGGG
1 TTTAGGG
* *
32880 TTT-TGA
1 TTTAGGG
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1 TTTAGGG
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1 TTTAGGG
*
32899 TTTGGGG
1 TTTAGGG
32906 TTT
1 TTT
32909 CACAAAATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (7 bp):
TTTAGGG
Found at i:32769 original size:25 final size:25
Alignment explanation
Indices: 32730--32873 Score: 78
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32720 GTTTATGGTC
* * *
32730 TAGGGTTAGGTTTTAAGGTTTGGGAT
1 TAGGTTTAGGGTTTAAGGTTAGGG-T
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1 TAGGTTTAGGGTTTAAGGTTAGGGT
* * *
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1 TA-GGTTTAGGGTTTAAGGT-TAGGGT
*
32806 TAGGGTTTATAGGG-GTAAGGTTTAGGGTT
1 TA-GG-TT-TAGGGTTTAAGG-TTAGGG-T
* * *
32835 TAGGTTTAGGCTTTAGGGTTTAGAGTT
1 TAGGTTTAGGGTTTAAGG-TTAG-GGT
*
32862 TAGATTTAGGGT
1 TAGGTTTAGGGT
32874 ACAGGGTTTT
Statistics
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TAGGTTTAGGGTTTAAGGTTAGGGT
Found at i:32788 original size:13 final size:13
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*
32712 -GGATTAGGGTTTA
1 GGGTTTAGGG-TTA
* *
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1 GGGTTTAGGGTTA
* * *
32738 GGTTTTAAGGTTT
1 GGGTTTAGGGTTA
* *
32751 GGGATT-GGTTTA
1 GGGTTTAGGGTTA
32763 GGGTTTA-GGTTA
1 GGGTTTAGGGTTA
32775 GGG-TTAGGGTTTA
1 GGGTTTAGGG-TTA
*
32788 GGGTTTAGGGTAA
1 GGGTTTAGGGTTA
*
32801 AGGTTTAGGGTTTATA
1 GGGTTTAGGG--T-TA
* * *
32817 GGGGTAAGGTTTA
1 GGGTTTAGGGTTA
*
32830 GGGTTTAGGTTTA
1 GGGTTTAGGGTTA
*
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1 GGGTTTAGGG-TTA
*
32857 GAGTTTAG
1 GGGTTTAG
32865 ATTTAGGGTA
Statistics
Matches: 114, Mismatches: 28, Indels: 20
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Matches are distributed among these distances:
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GGGTTTAGGGTTA
Found at i:32805 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 32689--32898 Score: 121
Period size: 20 Copynumber: 10.7 Consensus size: 20
32679 GCATGAATGA
* * *
32689 TTTAAGGTTTGGGGTTTAGG
1 TTTAGGGTTTAGGGTTAAGG
* *
32709 -TTA-GGATTAGGGTTTATGG
1 TTTAGGGTTTAGGG-TTAAGG
* *
32728 TCTAGGG-TTAGGTTTTAAGG
1 TTTAGGGTTTAGG-GTTAAGG
* * *
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1 TTTAGGGTTTAGGGTTAAGG
*
32766 TTTA-GG-TTAGGGTTAGGG
1 TTTAGGGTTTAGGGTTAAGG
*
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1 TTTAGGGTTTAGGGTTAAGG
*
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*
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1 TTTAGGGTTTAGGGTTAAGG
* * *
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** ** *
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1 TTTAGGGTTTAGG
32899 TTTGGGGTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (20 bp):
TTTAGGGTTTAGGGTTAAGG
Found at i:33938 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 33624--37954 Score: 1412
Period size: 181 Copynumber: 24.2 Consensus size: 175
33614 GTTGAATAAG
* *
33624 TAATTGTTCAAATAGT-TATAAC-AGTTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAAT
1 TAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTA-TTTGAA-CTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAA-
* * * * *
33686 CTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTA
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* * * *
33750 TGATATGAAACAAATATTTTATGACTAAA-AAAAGATCAGAACTATTTGAAATAGA
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* * * * * * *
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* * * ** *
33870 TATTAACTTTTGAAATATCATTAAATTAGTATTATTTTTAACCAAATAAGCTTCTATGATTAGAA
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* * * *
33935 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-ATTATAAC-AGTTTTAGATTGA
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** ** *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-
* ** *
34046 TAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGATGAGCTTGTATGATAA
65 ---TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTAAATAAGCTTGTATGAT-A
* * * * *
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* *
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* * **
34219 CTTATTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGCTTGTATTA
64 C----TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTAAATAAGCTTGTA-T-
* * * *
34284 GCTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AAATGGA
122 GATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGA-TTTGAAATAGA
** * * * *
34337 TAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAA--TC
* * * *
34402 TTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAGATAAGCTTGTATGA
63 --TCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TAAATAAGCTTGTATGA
* * ** *
34466 -ACGTAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAA-AGTCAGGACAATTTGAAATAGA
124 TA-G-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGA
* ** * * * * *
34519 TAATTGTT-ATAATAGTCTTAACCACATGACCTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTCAAATCTC
1 TAATTGTTCA-AATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC
* * *
34583 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA
63 -T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-TTAAATAAGCTTGTATG-A
* * *
34648 TA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTGA
124 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
** * * ** **
34699 TAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAATTAAATTTATTTTTTATTTTCTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA-AATC-T
* * * * * * * ** *
34764 GGTTATTAA-GTTTCAGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAATAGTATGAAT
64 -CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TAAATAAGCTTGTATG-AT
* * * * * * *
34828 AGAACCAATTGTTTGATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTAAAATAGA
125 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * ** * * * * *
34879 TAATTATTTAAATAGCCAAAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAACAGATTTA-CTTTTAAATCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-
* * * * *
34943 TACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAAC
65 T--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-AAATAAGCTTGTATG-AT
* * ** * * * *
35008 AAAAAAAATTGCTTTATCACAAACCAAAA-AGCAATAACAATTTGAAATAGA
125 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATC-ATAACGATTTGAAATAGA
* **
35059 TAATTGTTCAAATAGTTATACTTAACAAATTAGTTTTATTTTA-TTCTGAATAAAC---TTGTAT
1 TAATTGTTCAAATAG---T-CTTAAC----TA-TTTGA-ACTAGTTC-G-ATAAACAAATT-TAT
*** * ** * * * ** * * ** * * *
35120 GAGCTGAAAT-AATT-GTCA--TATGACAA-AACAAAAAATCA-TAACGATTTGAAATAGATAA-
53 -TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTAATTAAATAAG
* * * * ** * ** **
35178 -TTGTTCAT-ATAGTCTTAACAGTTTAAACTGGTT-TGGCAAATGAATTTATTTTTTAA--ATCT
115 CTTG-T-ATGATAG---AAACA-ATT--A-T-TTTATGACAAAACAA--AAGATCATAACGAT-T
* * *
35238 CT-TAGT-TA
167 -TGAAATAGA
* * * *** ** * * * ******
35246 TGAATT-TTCAGATACTGTTAATTAAGTATATTTCTCTTAGTTATATGAACTAGTTTAAGCAAAA
1 T-AATTGTTCAAATA--G-T-CTTAACTAT-TTGAAC-TAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTA
** ** * * * * *
35310 ACATCAT-TTATTTTTTATTATTTAAT-TTAGT--ATTA-TCTTACTTTGAA-TAAGGTTTA--T
59 A-ATC-TCTTATTAATT-TT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAATTAA--ATAAGCT
** * * * * * * * * * *
35367 ATG-AAAAAAAACACAATTGTTTTATGACAA-A-ATAAGATTAAAATGATTTGAGATAAA
117 -TGTATGATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
35424 TAATTGTTCAAATAGT-TTAACTATTTTGAATTGGTTTTGGTAAATAGATTAAGTTTTTTAATTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTA-TTTGAACTAG-TTCGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC
* * ** * * **
35488 TTTTTATTAATTTTTCAAAATATTAATAAATCGGTATTATTTTATTTTTAATAATTTTGTAATGA
63 -TCTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTAAATAAGCTTGT-ATG-
* * * * **
35553 ACAAAAAACAATTATTTTAACGACAAAAC-AAAGGTCATAATTATTTTGAAATAGAA
123 A-TAGAAACAATTATTTT-ATGACAAAACAAAAGATCATAACGA-TTTGAAATAG-A
* * * * * * * * *
35609 GAATTGCTCAAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTC
1 TAATTGTTCAAATAG-TCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-
** * *
35672 CTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCAAACAAACTTGTATGA
64 CT---TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT--AAATAAGCTTGTATG-
* * * *
35736 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCTTAACTATTTGAAATAAA
123 ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
35789 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTCGGTAAACAAATTTATTTCTTAAATCTTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC---
* * * * * ** *
35854 TACATATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAAC
63 T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTAAATAAGCTTGTATG-AT
* ** * * * ** *
35919 AAAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAAATATTTAAAATAGA
125 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * *
35970 TAAGTGTTTAAATAGTCATAACTAATTGAACGT-GTTC-A-AAAAAATATTTA-TTTTTAAATTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTCGATAAACAA-ATTTATTTTTTAAA--T
* * * **
36031 CTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTA-TACTATTTTGTTTAGAATAAGCTTGTATGA
62 CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATTA-AATAAGCTTGTATG-
* * * *
36095 ATAGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAA-AGTCATAATGATTTAAAATAGA
123 ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * ** * *
36148 TATTTATTAAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTT-TAGGAAACTTATTCATATTTTAAATCTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATC--
* * * * * *
36212 TTTCTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATT-GATATTAATTTATTTCAAATAACCCTATATA
63 --TCTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG-TATTATTTTAATT-AAATAAGCTTGTAT-
* * * * * ** * * * *
36275 AACTGGTAA-AATTGTTTTATAATGAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAGTATA
122 GA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * **
36329 TAATTATTCAAATAGT-TATGACTATTTGGACTTGCTT-GATAAACATATTTGTTTTAAAAATCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC-
* ** *
36392 TTTACTTATTAATTGTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATG
63 --T-CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TAAATAAGCTTGTATG
* * * * * **
36456 AACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAATG-GCTATAGTGATTTGAAATAGA
123 -ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATC-ATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
36510 TAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTATTTAGCA-AAA-AAAATCATTTTTTAAATTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTCG-ATAAACAAATTTATTTTTTAAA---
* * * * * * *
36573 TTTACTTATTACTTTTTTG-AATATTAACAAATTTGCATTATTTTATTTGAAATAAGCTTTTATG
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* * * *
36637 AATAGAATA-ATTTATTTTATGACAAAACAAAAG-GCTATAGCAATTTGAAATAGA
123 -ATAGAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATC-ATAACGATTTGAAATAGA
* * * * *
36691 TAATTGTTCAAATAATC-AAACTATTTGAACTTGTTC-AGTGAACAAATTCATTTTTTAAATCTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
** * * *
36754 TTATTAA-TTTCAAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTTCAAATAAGC-T-TATGCAAAT
65 TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-AAATAAGCTTGTATG---AT
* * * * * *
36816 AGAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAATGGTTATAACGATTTGAAATAGA
125 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
36867 GAATTGTTCAAACAGT-TATAACTATTT-ATATTGGTTGGGAT-AATAGATTCATTTTTTAAATC
1 TAATTGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGA-ACTAGTT-CGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-
** *
36929 CATTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAACA-TACTTT-ATTATGAATAAGAC-TGT
62 C--T-CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTA--AATAAG-CTTGT
* * * * *
36990 ATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACATAACAAATAG-TCATAACGATTTGAAATAAA
120 ATG-ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * *
37047 TAATTGTTCAAATAGT-TAAACTAATTGAACTAGTT-TAGTAAACATATTTATTTTTTAATTCTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
37110 TTACTT-ATTAATTTGCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTCCAAACAAACTTATTTG
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* * * * * * *
37173 AACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAACAATTTGAAATTAGA
123 -ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAA-TAGA
* * * * * * *
37228 TAATTATTCAAATAATCATAATTATTTCAACTAGTTCAACAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTG
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-AATTTATTTTTTAAATC--
* * * * *
37292 TTATTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTAGTAAG
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* * * * * *
37355 AACTA-AAAAAATTATTTTATGATAAAGCAAAATG-TCATAACAATTTAAAATAAA
123 -A-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
37409 T-ATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTT-TAGCAAAGAAATTTATTTTTTAAATCTA
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * ** * * * *
37472 TTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTGCATTAATATTATTTTATTCTTAATAAACTTGTATGAA
65 TTA-TTA--ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TAAATAAGCTTGTATG-A
* * *** ** * * *
37537 CAGAAATAATGGCTTTATGGTAGAACAAAATG-TTAT-A--A---GAAATTGA
124 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
37583 -AA---TACAAATAGTCATAAGTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTGAATCTCC
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AA-AT-C
* * * *
37644 TACTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTATGAATAGGCTAGTATGAT
63 T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTA--AATAAGCTTGTATGAT
* * * *
37708 GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAAAGATTTGAAATAGA
125 -AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
* * ** * *
37760 TAAATGTTCAAAT-GGC----C-A--TG----A-TTCGATAAACTGATTTATGTTTTAAAGCTTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TCT
* * * * * * * *
37812 AGCTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGACT
64 --CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-AAATAAGCTTGTATGA-T
* * * * * * *
37877 TGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAATGACTTT-AGATAGA
125 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGA-TTTGAAATAGA
* *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTT
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Statistics
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TAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTAAATAAGCTTGTATGATAGAAAC
AATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGA
Found at i:34165 original size:180 final size:181
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Period size: 180 Copynumber: 8.1 Consensus size: 181
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* * *
33624 TAATTGTTCAAATAGTTATAAC-AGTTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAA-CTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATC
* * * * *
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** * * * * * *
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* * ** * * * *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * **** * *
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* * * * * * * *
33930 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-ATTATAAC-AGTTTTAGATTGA
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* ** *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* *
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66 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-A
* *
34110 -AAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGA
130 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
*
34161 TAATTGTTCAAATAGTCAT-A--A-TT-AAC-CGATTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
34219 CTTATTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGCTTGTATTA
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* * *
34284 GCTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AAATGGA
129 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGA
* * * * *
34337 TAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTC
* * * *
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** * * ** *
34465 AACGTAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTCAGGACAATTTGAAATAGA
128 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * ** * * * * *
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1 TAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * *
34583 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAA
65 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* * *
34648 TAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATTGA
130 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
** * * * ** * *
34699 TAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGACAATTAAATTTATTTTTT-ATTTTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
** * * * * * ** *
34763 TGGTTATTAA-GTTTCAGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAAATAGTATGAA
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* * * * * * *
34827 TAGAACCAATTGTTTGATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTAAAATAGA
130 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * * *
34943 TACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAAC
66 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * *
35008 AAAAAAAATTGCTTTATCACAAACCAAAAAG-CAATAACAATTTGAAATAGA
131 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATAGA
35059 TAATTGTTCAAATAGT
1 TAATTGTTCAAATAGT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC
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Found at i:35864 original size:181 final size:181
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Period size: 181 Copynumber: 14.4 Consensus size: 181
35369 GAAAAAAAAC
* * * * * *
35379 ACAATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAGATTA-AAATGATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGT-
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
35440 TTAACTATTTTGAA-TTGGTTTTGGTAAATAGATTAAGTTTTTTAATTC-TTT--TTATTAATTT
65 ATAACTA-TTTGAACTT-G-TTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TT
*** * ** * *
35501 TTCAAAATATTAATAAATCGGTATTATTTTATTTTTAATAATTTTGTAATGAACAAAAA
125 TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGT-ATGAA-TAGAA
* * * * * *
35560 ACAATTATTTTAACGACAAAAC-AAAGGTCATAATTATTTTGAAATAGAAGAATTGCTCAAATGG
1 ACAATTGTTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACTA-TTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAG
* * ** *
35624 AT-ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTT
63 -TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* ** *
35687 CAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTGTATGAATAGAA
127 CAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * *
35742 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCTTAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
35807 TAACTATTTGAGCTTGCTCGGTAAACAAATTTATTTCTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAA
66 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTCAA
* * * *
35872 AA-ATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAAAA
130 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * * * * *
35923 ACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAAATATTTAAAATAGATAAGTGTTTAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * ** * * *
35988 TAACTAATTGAACGTG-TT-CAAAAAAATATTTA-TTTTTAAAT-TTCTACTTATTAAATTTT-G
66 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTCA
* * * * *
36048 GAATATTAATAAATTTATACTATTTT-GTTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAA
129 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTA-AATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * * * * * *
36101 ACAATTATTTTATAACAAAATAAAAAGTCATAA-TGATTTAAAATAGATATTTATTAAAATAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * * * * *
36165 ATAAATATTTGAACTTGTTTAGG-AAACTTATTCATATTTTAAATCTTTTTCTCATTAATTTTTA
65 ATAACTATTTGAACTTGTTT-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA
* * * * * * * * * *
36229 GAATATTAATAAATTGATATTAATTTATTTCAAATAACCCTATATAAACTGGTA
129 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAA
* ** * * * * * *
36283 A-AATTGTTTTATAATGAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAGTATATAATTATTCAAATAGTTA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * ** *
36347 TGACTATTTGGACTTGCTTGATAAACATATTTGTTTTAAAAATCTTTTACTTATTAATTGTT-TA
66 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTCAA
* *** *
36411 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAACAGAA
130 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * *
36463 CCAATTGTTTTATGACAAAACAAATGG-C-TATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * **
36526 CATAACTATTTGAACTTATTTAGCAAAAAAAATCATTTTTTAAATTTTTTACTTATTACTTTTTT
64 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA
* * *** * * *
36591 GAATATTAACAAATTTGCATTATTTTATTTGAAATAAGCTTTTATGAATAGAA
129 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * * *
36644 TA-ATTTATTTTATGACAAAACAAAAGG-CTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAT
1 -ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * *
36707 CA-AACTATTTGAACTTGTTCAGTGAACAAATTCATTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTTCA
64 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA
* * *
36766 AGAATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTTCAAATAAGC-T-TATGCAAATAGAA
129 A-AATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATG--AATAGAA
* * * * * * * *
36820 ACAATTGTTTTGTGATAAAACAAATGGTTATAACGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAACAGTTA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * ** *
36885 TAACTATTT-ATA-TTGGTTGGGATAATAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTTA
66 TAACTATTTGA-ACTTGTTTGGTA-AACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCA
* * * * * * *
36948 GAATATTAATAAATTAACA-TACTTTATTATGAATAAGAC-TGTATGAACAAAA
129 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAA-ACTTGTATGAATAGAA
* * * *
37000 ACAATTGTTTTATGACATAACAAATA-GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
37064 A-AACTAATTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTGCAA
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAA
** * * * * *
37128 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATTTGAACAAAA
130 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * * *
37180 ACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAACAATTTGAAATTAGATAATTATTCAAATAATC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * **** * *
37245 ATAATTATTTCAACTAGTTCAACAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTGTTA-TTGATTAATTTTT
65 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTC
* * * * *
37308 GAAATATTAATAAAATT-ATTTTATTTTATTTTGAAT-AAGTTAGTAAGAACTA-AA
128 AAAATATTAAT-AAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTT-GTATGAA-TAGAA
* * * * * * * * * * *
37362 AAAATTATTTTATGATAAAGCAAAATGTCATAACAATTTAAAATAAAT-ATTGTTCATATAGCCT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
37426 TAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAAGAAATTTATTTTTTAAATCTATTAGTTATTAATTTTCATA
66 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAA
* ** *
37491 ATATTATTGCATTAATATTATTTTATTCTT-AATAAACTTGTATGAACAGAA
131 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * ** * * * * *
37542 ATAATGGCTTTATGGTAGAACAAAATGT--T-A-TA--AGAAATTGA-AA---TACAAATAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * ** *
37597 TAAGTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTGAATCTCCTACTTATTAATTCTT-G
66 TAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTCA
* * ** * *
37660 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAGGCTAGTATG-ATGAAAA
129 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAAT-AGAA
* ** * *
37713 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAAAGATTTGAAATAGATAAATGTTCAAAT-GGC-
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * ** * * * *
37776 ---C-A--TG-A----TTCGATAAACTGATTTATGTTTTAAAGC-TTTAGCTTATCAATTTTTAA
66 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATTTTCAA
* * * ** * * *
37829 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGACTTGAA
130 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* * * *
37881 ACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAA-TGACTTT-AGATAGATAATTATTCAAATAGT
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
37944 CATAACTATTT
64 CATAACTATTT
37955 TAAAATTGTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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186 8 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAA
ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAATAGAA
Found at i:36926 original size:540 final size:529
Alignment explanation
Indices: 35374--37538 Score: 1578
Period size: 540 Copynumber: 4.0 Consensus size: 529
35364 TATATGAAAA
* * * *
35374 AAAACACAATTGTTTTATGACAAAATAAGAT--TAAAATGATTTGAGATAAATAATTGTTCAAAT
1 AAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAA-ATGGTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
35437 AGT-TTAACTATTTTGAATTGGTTTTGGTAAATAGATTAAGTTTTTT-AATTCTTT--TTATTAA
64 AGTCATAACTA-ATTGAACT--ATTTAGCAAAAAAAAT-A-TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA
* *** * * * *
35498 TTTTTCAAAATATTAATAAATCGGTATTATTTTATTTTTAATAA-TTTTGTAATGAACAAAAAAC
124 TTTTT-AGAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTT-T-ATGAA-TAGAAAC
* * * ** *
35562 AATTATTTTAACGACAAAAC-AAAGG-TCATA-ATTATTTTGAAATAGAAGAATTGCTCAAATGG
184 ATTTATTTT-ATGACAAAACAAAAGGCT-ATACA--A-TTTGAAATAG-ATAATTATTCAAAT-A
* ** * *
35624 AT-ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTT
242 ATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCT-CT---TATTAA-TTT
* * *
35687 CAA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTGTATG-AATAGAAACAATTGT
302 CAAGAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTATTTCAAATAAAC-T-TATGAAATAGAAACAATTGT
* * * *
35750 TTTATGACAAAACAAAAGATCT-TAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
364 TTTATGATAAAACAAAAGGT-TATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * * *
35814 TTGAGCTTGCTCGGTA-AACAAATTTATTTCTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAAAATTA
428 TT-AGATTGCTTGGGATAA-AAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTA
* *
35878 ATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAAC
489 ATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAACTTGTATGAAC
* * * * * *
35919 AAAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAAAT-ATTTAAAATAGATAAGTGTTTAAAT
1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGG-TAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
35983 AGTCATAACTAATTGAACGT-GTT--CAAAAAAATATTTATTTTTAAA-TTTCTACTTATTAAAT
64 AGTCATAACTAATTGAAC-TATTTAGCAAAAAAA-ATAT-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATT
* * * * *
36044 TTTGGAATATTAATAAATTTATACTATTTTGTTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT
126 TTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTA-AATAAGCTTTTATGAATAGAAACATTTAT
* * * * * * * *
36109 TTTATAACAAAATAAAAAG-TCATA-ATGATTTAAAATAGATATTTATTAAAATAGTCATAAATA
190 TTTATGACAAAACAAAAGGCT-ATACA--ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTA
* * ** * * **
36172 TTTGAACTTGTTTAGGAAACTTATTCATATTTTAAATCTTTTTCTCATTAATTTTTAGAATATTA
252 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATC----TCTTATTAATTTCAAGAATATTA
* * * * *
36237 ATAAATT-GATATTAATTTATTTCAAATAACCCTATAT-AAACTGGTAA-AATTGTTTTATAATG
313 ATAAATTAGA-ATT-ATTTATTTCAAATAA-ACT-TATGAAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATA
* * * * * *
36299 AAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAGTATATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGC
373 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAGA-TTGC
*
36364 TT--GATAAACATATT-TGTTTTAAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTAAATATTAATAAATTA
437 TTGGGATAAA-A-ATTAT-TTTT-TAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTA
* **
36426 ATATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAAC
497 ATATTATTTTATTATGAATAAACTTGTATGAAC
* * *
36459 AGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGG-TATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
36524 ATCATAACTATTTGAACTTATTTAGCAAAAAAAATCATTTTTTAAATTTTTTACTTATTACTTTT
65 GTCATAACTAATTGAAC-TATTTAGCAAAAAAAAT-ATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTT
* * **
36589 TTGAATATTAACAAATTTGCATTATTTTATTTGAAATAAGCTTTTATGAATAGAATA-ATTTATT
128 TAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT-AAATAAGCTTTTATGAATAGAA-ACATTTATT
*
36653 TTATGACAAAACAAAAGGCTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCA-AACTATTT
191 TTATGACAAAACAAAAGGCTATA-CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT
*
36717 GAACTTGTTCAGTGAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTCAAGAATATTAATAAATT
255 GAACTTGTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTCAAGAATATTAATAAATT
* * *
36782 AGAATTATGTTATTTCAAATAAGCTTATGCAAATAGAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAATGG
320 AGAATTAT-TTATTTCAAATAAACTTATG-AAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGG
* * * * * *
36847 TTATAACGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAACAGTTATAACTATTTATATTGGTTGGGATAATA
383 TTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAGATTGCTTGGGATAA-A
* ** * *
36912 GATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAACA-TACTTTATT
447 AATT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
36976 ATGAATAAGAC-TGTATGAAC
510 ATGAATAA-ACTTGTATGAAC
* * * *
36996 AAAAACAATTGTTTTATGACATAACAAATAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
1 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** *
37061 GTTA-AACTAATTGAACTAGTTTAGTAAACATATTTATTTTTT-AATTCTCTTACTTATTAATTT
65 GTCATAACTAATTGAACTA-TTTAGCAAA-AAAAATATTTTTTAAATT-TTTTACTTATTAATTT
** * * * * * * * *
37124 GCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATT-TGAACAAAAACATTTGT
127 TTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT-TAAATAAGCTT-TTATGAATAGAAACATTTAT
*
37188 TTTATGACAAAACAAAAGGTCGTA-ACAATTTGAAATTAGATAATTATTCAAATAATCATAATTA
190 TTTATGACAAAACAAAAGG-C-TATACAATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAATCATAACTA
* * ** * **
37252 TTTCAACTAGTTCAACAAACAGAATT-ATTTTTTAAATCTGTTATTGATTAATTT-TTGAAATAT
252 TTTGAACTTGTTCAGTAAACA-AATTCATTTTTTAAATC---TCTT-ATTAATTTCAAG-AATAT
** ** * * * *
37315 TAATAAAATTA-TTTTATTTTATTTTGAAT-AAGTTAGTAAGAACTA-AAAAAATTATTTTATGA
311 TAAT-AAATTAGAATTA-TTTATTTCAAATAAACTTA-T--GAAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
37377 TAAAGCAAAATGTCATAACAATTTAAAATAAAT-ATTGTTCATATAGCCT-TAACTATTT-GAAC
371 TAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG-TTATAACTATTTAG-A-
* * * * * * * * **
37439 TAGTTTAGCA-AAGAAATTTATTTTTTAAATCTATTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTGCAT
433 TTGCTTGGGATAA-AAA-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAAT
* *
37503 TAATATTATTTTATTCTTAATAAACTTGTATGAAC
495 TAATATTATTTTATTATGAATAAACTTGTATGAAC
37538 A
1 A
37539 GAAATAATGG
Statistics
Matches: 1299, Mismatches: 236, Indels: 173
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
535 7 0.01
536 117 0.09
537 125 0.10
538 185 0.14
539 67 0.05
540 264 0.20
541 115 0.09
542 169 0.13
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544 42 0.03
545 5 0.00
546 30 0.02
547 10 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (529 bp):
AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTAATTGAACTATTTAGCAAAAAAAATATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAG
AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACATTTATTTTATG
ACAAAACAAAAGGCTATACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTT
GTTCAGTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTCAAGAATATTAATAAATTAGAATT
ATTTATTTCAAATAAACTTATGAAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACG
ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAGATTGCTTGGGATAAAAATTATTTT
TTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTATGAATAAACT
TGTATGAAC
Found at i:37486 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 33664--37772 Score: 1246
Period size: 180 Copynumber: 22.9 Consensus size: 177
33654 CTTGTTCGGT
* * * * * *
33664 AAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTAT
1 AAACAAATTTATTTTTT-AAATCTATTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTA-TATTAT
* ** * * *
33729 TTTATTCTGAATAAGCTT-GTATGATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAA-AAAA-GATCAGA
63 TTTATTATGAATAAG-TTAGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATG-TCATA
* * * * * *
33790 ACTATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTT-GAC
124 ACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAG-C
* * * * *
33845 AAACACAGTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAACTTTTGAAATATCATTAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTA-TATTATT
* ** * ** * *
33906 TT-TAACCAAATAAGCTT-CTATGATTAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAT-T-ATAA
64 TTATTA-TGAATAAG-TTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAC-AAAATGTCATAA
* * * ** ** ** * * *
33967 CAGTTTTAGATTGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTCAAACT-GGTTCGAT
125 CAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAG-C
* *
34021 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTA-TATTATT
* * * *
34086 TTATTTTG-ATGAGCTT-GTATGATA-AAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAAC
64 TTATTATGAATAAG-TTAGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATAAC
* * * * * * *
34148 GATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAG--TCA-TAATT-AAC-CGATTCAGT
126 AATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTTAACTATTTGAACTAG-TTTAGC
* * *
34196 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTA-TATTATT
* * * * * *
34261 TTATTTTGTATAAGCTT-GTATTAGCTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
64 TTATTATGAATAAG-TTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATAAC-
* ** * * **
34325 ACTTT-AAATGGATAATTGTTCAAATAG-TAATAACTATTTGAACTTGTTCAAT
126 AATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCT--TAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* * * * * * *
34377 AAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAA
1 AAACAAATTTATTTTTT-AAATCTATTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTA-TATTAT
* ** * **
34442 TTTATTCT-AGATAAGCTT-GTATGAACGTAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAAGTCAGGA
63 TTTATTATGA-ATAAG-TTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATAA
* * * ** * * * *
34505 CAATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCTTAACCACATGACCTGGTTTGGT
125 CAATTTAAAATAAATAATTGTTCA-AATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* * * *
34559 AAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTATATTATT
* * *
34624 TTAATT-TGAATAAGCTT-GTATGAATAAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
64 TT-ATTATGAATAAG-TTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATAAC
* * ** ** * *
34686 GATTTGAAATTGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAG-TTCGAC
126 AATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAG-C
** * * * ** * * * *
34739 AATTAAATTTATTTTTT-ATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAGAATATTATTGAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTA-TATTATT
* ** * * * * * * * *
34803 TTATTCTGAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGATAAAACAAAAGGTTATAACGA
64 TTATTATGAATAAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAATGTCATAACAA
* * * ** * * *
34868 TTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGCCAAAACTATTTGAATTAGTTTGGT
128 TTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* * * *
34919 AAACAGATTTA-CTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTA-TATTATT
* * * * * * *
34983 TTATT-TCAAACAAACTTA-TATGAACAAAAAAAATTGCTTTATCACAAACCAAAAAG-CAATAA
64 TTATTAT-GAA-TAAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA-CAAAATGTC-ATAA
* * * **
35045 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TT-A-TACTT-AAC-AAATTAG-
125 CAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
**** * ** * * * * ** *
35092 -TTTTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAGCTGAAATAATTGTCATATGACAA-AACAAAAAA
1 AAACAAATTTATT-T-TTTAAA--TCTATTA-CT-TATTAATT-T--T-T-A-AATATTAATAAA
* ** * * *** * * *
35155 TCATAACGATTTGA-AAT-AGATAATTGTTCA-TATAGTCTTAACAGTTTA-AACTG-GTT-TGG
54 TTAT-ATTATTTTATTATGA-ATAA--GTT-AGTAT-G----AACA-AAAACAATTGTTTTATGA
* * ** * * * * * * **
35214 CAAATGAATTTAT-TTTTTA-AATCTCT-TAGT-TATGAATT-TTCAGATA-CTGTTAATTAAGT
108 CAAA-CAA--AATGTCATAACAAT-T-TAAAATAAAT-AATTGTTCAAATAGC--TTAACTATTT
* ** *
35273 -ATATTTCTCTTAGTT
165 GA-ACTAGT-TTAG-C
* ** * * * * ** * * * * * *
35288 ATATGAA-CTA--GTTT-AAGCAAAAACATCATTTATTTTTTATTATT--TAATTTAGTATTATC
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTAC-TTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTA-TATTATT
*
35347 TTACTT-TGAATAAGGTTTA-TATGAAAAAAAACACAATTGTTTTATGACAAA-ATAAGAT-T-A
64 TTA-TTATGAATAA-G-TTAGTATG-AACAAAA-ACAATTGTTTTATGACAAACA-AA-ATGTCA
* ** * * * * * * *
35407 AAATGATTTGAGATAAATAATTGTTCAAATAGTTTAACTATTTTGAATTGGTTTTGGT
122 TAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTTAACTA-TTTGAACTAG-TTTAGC
* * * * **
35465 AAATAGATTAAGTTTTTTAATTCT-TT--TTATTAATTTTTCAAAATATTAATAAATCGGTATTA
1 AAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT--AAATATTAATAAAT-TATATTA
* * * * * * *
35527 TTTTATTTTTAATAATTTTGTAATGAACAAAAAACAATTATTTTAACGACAAA-ACAAAGGTCAT
62 TTTTATTATGAATAAGTTAGT-ATGAAC-AAAAACAATTGTTTT-ATGACAAACA-AAATGTCAT
* * * * * * * * * * *
35591 AATTATTTTGAAATAGAAGAATTGCTCAAATGGATATGACTATTTGAACTTGTTTGGT
123 AA-CAATTTAAAATA-AATAATTGTTCAAATAGCT-TAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* ** * *
35649 AAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTA-TATTATT
*** * * * * *
35713 TTATTCCAAACAAACTT-GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCTTAAC
64 TTATTATGAA-TAAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATG-TCATAAC
* * * * * * * ** *
35776 TATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTCGGT
126 AATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* * * *
35829 AAACAAATTTATTTCTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATT-ATATTATT
* * * * * * *
35894 TTATTTTGAATAAATTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAA-AT
64 TTATTATGAATAAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATAACA-
* * * * * *
35958 ATTTAAAATAGATAAGTGTTTAAATAGTCATAACTAATTGAACGT-GTTCA--
127 ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAAC-TAGTTTAGC
* ** *
36008 AAAAAATATTTA-TTTTTAAAT-T-TCTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATTTATACTA
1 AAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTAT-TACTTATT-AATTTTTAAATATTAATAAA-TTATATTA
* * * * * * *
36070 TTTTGTT-TAGAATAAGCTT-GTATGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAAGTCATA
62 TTTTATTAT-GAATAAG-TTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATA
** * * * * * * * *
36133 ATGATTTAAAATAGATATTTATTAAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTTAGG
124 ACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
** * * * * * *
36188 AAACTTATTCATATTTTAAATCTTTTTCTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTGATATTAAT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATT-ATATTATT
* ** * *** * * * *
36253 TTATT-TCAAATAACCCTA-TATAAACTGGTAA-AATTGTTTTATAATGAAATAAAAGGTCATAA
64 TTATTAT-GAATAA-GTTAGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAATGTCATAA
* * * * * * * * *
36315 CGATTTGAAGTATATAATTATTCAAATAG-TTATGACTATTTGGACTTGCTT-GAT
125 CAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTTA--ACTATTTGAACTAGTTTAG-C
* * ** *
36369 AAACATATTTGTTTTAAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATT-ATATTATT
* ** * * * * **
36434 TTAATCCGAATAAACTT-GTATGAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAA-ACAAATGGCTATAGT
64 TTATTATGAAT-AAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAATGTC-ATAAC
* * * * *
36497 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTA-TTTAGC
126 AATTTAAAATAAATAATTGTTCAAAT-AGCTTAACTATTTGAAC-TAGTTTAGC
* * * * * * * *
36550 AAAAAAAATCATTTTTTAAATTTTTTACTTATTACTTTTTTGAATATTAACAAATT-TGCATTAT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTA-ATTTTTAAATATTAATAAATTAT--ATTAT
* * * * * *
36614 TTTATT-TGAAATAAGCTT-TTATGAATAGAATA-ATTTATTTTATGACAAAACAAAA-GGCTAT
63 TTTATTATG-AATAAG-TTAGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTC-AT
* * * * * * * *
36675 AGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-ATCAAACTATTTGAACTTGTTCAGT
123 AACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCT-TAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* * ** * *
36730 GAACAAATTCATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTCAAGAATATTAATAAATTAGAATTATG
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTA-TATTATT
* * * * *
36791 TTATT-TCAAATAAGCT--TATGCAA-ATAGAAACAATTGTTTTGTGATAAA-ACAAATGGTTAT
64 TTATTAT-GAATAAGTTAGTATG-AACA-A-AAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAT-GTCAT
* * * * * * * * * *
36851 AACGATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAACAGTTATAACTATTT-ATA-TTGGTTGGG
123 AACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCT-TAACTATTTGA-ACTAGTTTAGC
* * * * * *
36906 ATAATAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-ACATAC
1 A-AACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTATA-TTAT
*
36970 TTTATTATGAATAAGACT-GTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACATAAC-AAATAGTCATAA
63 TTTATTATGAATAAG-TTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA-AACAAAAT-GTCATAA
* * * *
37033 CGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TTAAACTAATTGAACTAGTTTAGT
125 CAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTT-AACTATTTGAACTAGTTTAGC
* * * **
37086 AAACATATTTATTTTTTAATTCTCTTACTTATTAATTTGCAAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTT-TTAAATATTAATAAATT-ATATTATT
*** * * * * * *
37151 TTATTCCAAACAAACTTA-TTTGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAACA
64 TTATTATGAA-TAAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATGTCATAACA
* * * * * * * * *
37215 ATTTGAAATTAGATAATTATTCAAATAATCATAATTATTTCAACTAGTTCAAC
127 ATTT-AAAATAAATAATTGTTCAAAT-AGCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* *
37268 AAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTGTTA-TTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATTATTTTA
1 AAACA-AATTTATTTTTTAAATCTATTACTT-ATTAATTTTT-AAATATTAAT-AAATTATATTA
* * * *
37331 TTTTATTTTGAATAAGTTAGTAAGAACTAAAAA-AATTATTTTATGATAAAGCAAAATGTCATAA
62 TTTTATTATGAATAAGTTAGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAA-CAAAATGTCATAA
*
37395 CAATTTAAAATAAAT-ATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
125 CAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-CTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
* * * * **
37448 AAAGAAATTTATTTTTTAAATCTATTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTGCATTAATATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATT-ATATTATT
* * * * * * * ** * *
37513 TTATTCTTAATAAACTT-GTATGAACAGAAATAATGGCTTTATGGTAGAACAAAATGTTATAAGA
64 TTATTATGAAT-AAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA-AACAAAATGTCATAACA
* * * * * * * * *
37577 AATTGAAATACA-AATAG-TC----A---TAAGTATTTGAA-TTGGTTCGAT
127 ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTTAACTATTTGAACTAGTTTAG-C
* * ** *
37619 AAACAGATTTATTTTTTGAATCTCCTACTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATT-ATATTATT
* * **
37684 TTATTATGAATAGGCTAGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAA-A
64 TTATTATGAATAAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAATG-TCATAACA
* * *
37747 GATTTGAAATAGATAAATGTTCAAAT
127 -ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAAT
37773 GGCCATGATT
Statistics
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0.71 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
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196 2 0.00
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Consensus pattern (177 bp):
AAACAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTATATTATTTT
ATTATGAATAAGTTAGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAATGTCATAACAATTT
AAAATAAATAATTGTTCAAATAGCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGC
Found at i:37891 original size:168 final size:167
Alignment explanation
Indices: 37613--37940 Score: 385
Period size: 168 Copynumber: 2.0 Consensus size: 167
37603 TTTGAATTGG
* * * * * *
37613 TTCGATAAACAGATTTATTTTTTGAATCTCCTACTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAAT
1 TTCGATAAACAGATTTATGTTTTAAAGCTCCTACTTATCAATTCTTAAAATATTAATAAAGTAAT
* * *
37678 ATTATTTTATTATGAATAGGCTAGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCA
66 ATTATTTTATTATCAATAAGCTAGTATGATG-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
*
37743 TAAAGA-TTTGAAATAGATAAATGTTCAAATGGCCATGA
130 TAAAGACTTT-AAATAGATAAATATTCAAATGGCCATGA
* * *
37781 TTCGATAAACTGATTTATGTTTTAAAGCT-TTAGCTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAA
1 TTCGATAAACAGATTTATGTTTTAAAGCTCCTA-CTTATCAATTCTTAAAATATTAATAAAGTAA
* ** * *
37845 TATTATTTTATT-TCAGATAAGTTTTTATGACTTG-AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGG
65 TATTATTTTATTATCA-ATAAGCTAGTATGA--TGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * *
37908 TCATAATGACTTTAGATAGATAATTATTCAAAT
127 TCATAAAGACTTTAAATAGATAAATATTCAAAT
37941 AGTCATAACT
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 21, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (167 bp):
TTCGATAAACAGATTTATGTTTTAAAGCTCCTACTTATCAATTCTTAAAATATTAATAAAGTAAT
ATTATTTTATTATCAATAAGCTAGTATGATGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
AAAGACTTTAAATAGATAAATATTCAAATGGCCATGA
Found at i:38248 original size:65 final size:67
Alignment explanation
Indices: 38136--38271 Score: 206
Period size: 65 Copynumber: 2.1 Consensus size: 67
38126 TATCTATTTC
* *
38136 AAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCAACATACAAGTTTA-TT-AAA
1 AAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCAACATAAAAGCTTATTTGAAA
38199 TA
66 TA
* *
38201 AAATCATTATTATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTGTTT-CAACATAAAAGCTTATTTGAA
1 AAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTCCAACATAAAAGCTTATTTGAA
38265 ATA
65 ATA
38268 AAAT
1 AAAT
38272 AATACTAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.38, C:0.11, G:0.07, T:0.43
Consensus pattern (67 bp):
AAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCAACATAAAAGCTTATTTGAAA
TA
Found at i:39700 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 39121--39743 Score: 526
Period size: 182 Copynumber: 3.5 Consensus size: 180
39111 TTTGTTTGTA
* * * * * *
39121 CAAGCTTGTTCGAATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTGT-GAAAA-T--T-AATAAGAGAT
1 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAATAAGAGAT
* * * * * ** ** *
39181 TT-AAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCATATGGTTAAGAC-AATTAGAATAATTATCTAT
65 TTAAAAAATAAATTAGTTTACCAAACAAGTTAAAATAATTATTACTATTTA-AATAATTATCTAT
* * * * * **
39244 TTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAGACAATT-ATTTCAATTCATAT
129 TTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTTA-TCAT-T
** * *
39298 -AAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGA-AAGAGA
1 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-ATAAGAGA
* * * *
39360 TTTAACAAAATAAATCTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTGTCT
64 TTTAA-AAAATAAAT-TAGTTTACCAAACAAGTTAAAATAATTATTACTATTTAAATAATTATCT
** * * * *
39424 -TTGAAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTA--ATA
127 ATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTT--TTATCATT
* * * *
39478 CAAGCTTATATGGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAATAAGAGATT
1 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
*
39543 TAAAAAATAAATTAGTTTACCAGATCAA-TTAAAATAATTATGGT-C-ATTTAAATAATTATCTA
66 TAAAAAATAAATTAGTTTACCA-AACAAGTTAAAATAATTAT--TACTATTTAAATAATTATCTA
* *
39605 TTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGGTTTTTTATCATT
128 TTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-GTTTTTTATCATT
* * * *
39660 CAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATT
1 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
*
39725 TAAAAAATAAATTTGTTTA
66 TAAAAAATAAATTAGTTTA
39744 TCGAACCGAT
Statistics
Matches: 358, Mismatches: 61, Indels: 49
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Matches are distributed among these distances:
174 1 0.00
175 1 0.00
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179 3 0.01
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183 5 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (180 bp):
CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
TAAAAAATAAATTAGTTTACCAAACAAGTTAAAATAATTATTACTATTTAAATAATTATCTATTT
CAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTTATCATT
Found at i:39763 original size:362 final size:355
Alignment explanation
Indices: 39073--39781 Score: 763
Period size: 362 Copynumber: 2.0 Consensus size: 355
39063 AAACCAATTC
* * ** *
39073 AAATAGTTATGACCATTTGTTTTGGCTTAAAATAATTTTTTGTTTGTACAAGCTTGTTCGAATTA
1 AAATAGTTATGACCATTTGTTTTAGCATAAAATAATTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCGAATTA
*
39138 AAATAATACAAATTTAATAATATTGTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTTGTTTACCG
66 AAATAATACAAATTTAATAATATTGTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTAGTTTACCG
* * * ** ** * *
39203 AACTAGTTCATATGGTTAAGACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTT
131 AACTAATTAAAATAATTAAGACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATT
* * * *
39268 TAGTTATAAGACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTA
196 TAGTTATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATGTATTA
* *
39333 ACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAAT
261 ACATTCAAAAAAGTAATAAGAAAGAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTGCAAAT
* *
39398 AGTTATTACTATTTAAACAATTGTCTTTGA
326 AGTTATTAATATTCAAACAATTGTCTTTGA
* * *
39428 AAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTAGTTAATACAAGCTTATATGGA
1 AAATAGTTATGACCA-TTTGTTTTAGCATAAAATAATT-TTTT-GTTAATACAAGCTTAT-TCGA
* *
39492 A-TAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TCTAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
62 ATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTGT-GAAAA-T--T-AATAAGAGATTT-AAAAATAAAT
* * * *
39555 TAGTTTACCAGATC-AATTAAAATAATTATGGTCATTTA-AATAATTATCTATTTCAAATCATTA
121 TAGTTTACC-GAACTAATTAAAATAATTA-AGACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** **
39618 TGATCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGGTTT-TTTATCAT-TCAAGCATATTTGAAATAAAAT
184 TGACCTTTTATTTAGTTATAAAACAATT-ATTTCAAT-TCATAT-AAGCATATTCAAAATAAAAT
* * * *
39681 AATACTAATGTATTAATATTTC-AAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTA
246 AATACTAATGTATTAACA-TTCAAAAAAGTAATAAGAAAGAGATTTAACAAAATAAATCTATTTA
* * * * *
39744 TCGAAC-CGATGCGAATAGTTATTAATATTCAGACAATT
310 CCAAACAAG-TGCAAATAGTTATTAATATTCAAACAATT
39782 AATAAGTAAA
Statistics
Matches: 289, Mismatches: 48, Indels: 27
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
354 2 0.01
355 30 0.10
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357 42 0.15
358 5 0.02
360 1 0.00
361 13 0.04
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363 71 0.25
364 3 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (355 bp):
AAATAGTTATGACCATTTGTTTTAGCATAAAATAATTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCGAATTA
AAATAATACAAATTTAATAATATTGTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTAGTTTACCG
AACTAATTAAAATAATTAAGACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATT
TAGTTATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATGTATTA
ACATTCAAAAAAGTAATAAGAAAGAGATTTAACAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTGCAAAT
AGTTATTAATATTCAAACAATTGTCTTTGA
Found at i:39983 original size:254 final size:253
Alignment explanation
Indices: 39508--40002 Score: 567
Period size: 254 Copynumber: 2.0 Consensus size: 253
39498 TAATACAAAT
* * *
39508 TTATTAATATTTCTAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCAGATCAATT
1 TTATTAATATTTCTAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAAAAATTAGTTTACCAAATCAATT
* *
39573 AAAATAATTATGGTCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTTATA
66 AAAATAATTATGCTCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTTGTTATA
* * *
39638 AAACAATTGGTTTTTTATCATTCAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATATTTC
131 AAACAATTGATTTTTTATCATACAAGCATATTAGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATATTTC
* *
39703 AAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCGATGCGAATAG
196 AAAAAGTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTATCGAACCGATGCGAATAG
* *
39762 TTATTAATA-TTC-AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAAAATCTA-TTTGCCAAAT-A
1 TTATTAATATTTCTA-A-AATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAAAAAT-TAGTTTACCAAATCA
* * * ** * * *
39823 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTTA-CTATTTGTTTT
63 A-TTAAAATAATTATG-CTCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCT-TTTATTTT
* * * *
39886 GTTATAAAACAATT-ATTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAG-ATTAAAATAATATTAATTTATT
125 GTTATAAAACAATTGATTTTT-TATCATACAAGCATATT-AGAAATAAAATAATACTAATGTATT
** * * * *
39948 AATATTTTGACAATTAGTAAGTAAAATACTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAAC
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AAACAATTGATTTTTTATCATACAAGCATATTAGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATATTTC
AAAAAGTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACCGATGCGAATAG
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* * * * * ** *
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* * ** * * * * *
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* * * * * * * *
39972 AATACTTT-AAAAATAAATATGTTTAT-CGAACAAGTTCAAATAGTTATAACCACTTGCATAATT
194 AAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTT-TCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * ** * * *
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* * * *
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* * *
40139 AATTATTGAGTAAGAGA-TTTAAAATATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA-ATAAATC-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
40203 ATTTGAACAGTTATCTATGTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTCCTG
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* *
40268 TTCATACAAGCTTATTCTGAAGAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-A
129 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* *** * *
40331 AAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
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* * * * * *
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*
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* * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * *
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66 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* * * * * * * *
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130 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * * *
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194 AAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
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* * * * **
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**
40860 AATTAATAAGT----GA-TTTAAAAACTAAATTTTTTACTGAA-ATAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATCGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
40919 ATTTGAA-ATATTATCTATCTCAAATCATTATG--ATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTC
64 ATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* ** * * * * *
40981 T-TTCCATACATGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTA-AACAAATTCCAAAAAATAGTAA
127 TGTT-CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * * * * *
41044 GTAAGAGATTTTTAAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACTAGTTCAAATATTTAAGAATATTAGAA
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* * ** * * * * * **
41109 TAATTATCCATTTCAAATCATTCTAACCATTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATAC
252 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * * * *
41174 AAGCTCATTTAGAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTAAAA
317 AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAA
* * * * * * *
41220 AATTAATGAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAGTTGAAATAGATT-TGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTT-AAAAATAAATC-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGAC
* * *
41284 TATTTGAACAGTTACCTATTT-AAAGTCATTATGAGC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATT
63 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * **** * *
41347 CAGTTCATA-AAACTTATT-TGAAATAAAATAATACTGCCCTATTAATATTTCAAAAATTAATAT
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* * * ** ** * * * * *
41410 GTAAGATATTCAAAAGCTAAAGCTATTTTTCAAACTAGTTCAAATAGTTATAAATATTTGAA-AA
190 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * * **
41474 ATATCAATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAGTTATTTTTAATCATACAA
255 TTATCTAT-TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
*
41537 GCTTATTC-AAATAATAATAATACTAATTTA-ATAATATTCCAAA
319 GCTTATTCGAAATAA-AATAATACTAATTTATA-AATATTTCAAA
* * * ** * * *
41580 AATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATGCGCTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGAATA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-CGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * **
41641 TTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAAT
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* * * * *
41706 AT-ATACAAGCTTACTCAGAATAAAATGATACTAATTTATTAACATGT-GAAAAATTAATAAGCA
130 -TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCCAAAAATTAATAAGTA
** * * * * *
41769 TGAGATTTGAAAAAATAAATATGTATACCATACAAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
193 AAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** * * * *
41834 ATCAATTTAAAATCATCATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCT
257 ATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * * * *
41899 TATCCAAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCACA
322 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAA
* * * *
41939 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAACAATAAATCAGTTTATTGAATCAA-TTCCATTAATTAT-AG
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAA-AATAAATC-GTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-
* * * * *
42001 CCATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
62 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
*** * * * **
42066 TCAGCATACAAGCTTATT-TGAAGTAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTCAAGGATTAATAAG
127 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
42130 ----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-TTACAACTAGTTATGACTATTTGAATAA
191 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCCAAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * ** * * *
42190 TTATCTACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCACGAAACAATTGTTTCTATTTATACAAG
255 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* *
42255 CTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAA-ATTTTAAA
320 CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTA-TAAATATTTCAAA
* * * * * ** * * * *
42297 AGTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGCCAAATCAA-TTGAAACAATTAAGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-CGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * * *
42361 ATATGAATAATTATTTATTTCAATTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCAT
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-T
* * * * * **
42426 -ATCATACAAGCTTTTTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTTTGAAAAATT--T-A-
128 GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCCAAAAATTAATAAG
* * * * * ** * * *
42486 TAAGAGGTTTAGAAAAT-AATTCTATTTACGGAACTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAA
191 TAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
42550 TTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAG
255 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * *
42615 TTTGTTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAAT-TTGT-AGAA
320 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATT-TCA-AA
* * * ** ** *
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1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAAT-CGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
** * * * * * *
42721 TATTTGAGTAATTAACTATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCT
63 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
** ** * * * ** * **
42786 GTTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATTATACTAATTTAATAATATTCTGAAACTTAATAACCA
128 GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
* * * * ** * * * * ** *
42851 AAAAAATTAAAAAATAAGTCTAATTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATAA
193 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
42916 TCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTT
258 TCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* * * *
42978 ATTTGGATTAAAATAATACAAATTTA-ATAATATTTTC-AA
323 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATA-AATA-TTTCAAA
** ** * ** * * *
43017 AA-T--TAA-TAAGAGATTGAAAAAATAAATTTTTTTACCGAATTAGTTCAAATGGTTAAGACAA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAA-TCGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * * * *
43078 TTAGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTTACAAAACAATTGTTT-TAG
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-G
* * * * *
43142 TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAATTAATATTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AA
129 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
43206 AGAGATTTAGAAAAAT-AATTAT-TTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAA
194 A-AGATTTA-AAAAATAAATT-TGTTTT-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * ** * *
43269 TTGTCTGTTT-AAAATGTTATAACATTTTGATTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATATAAG
255 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * **
43333 CTTAGATAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTA
320 CTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAA
* * * * * * * * * * * *
43375 CATTATTAAGTAAAAAAATGTAAAAAATAATTTTGTTTAC-CAACTCAA-TTAAAATAATTATGG
1 AATTAATAAGT-AAGAGATTTTAAAAATAA-ATCGTTTACTGAA--CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
43438 CCATTTGAAC----A---A--T----T-GTTATGACCTTATGTTTTGTCATAAAATAGTTGTTTC
62 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * ** * * **
43489 TGATCACAAAAGCTTATT-TGGTTAAAAATGATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG
127 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * ** * * * * ** * *
43553 TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTGGCTGAACCAA-TTGAAATAGCTAAAACTATTAGAATAA
191 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * *
43617 TTTTCTATTTCAAATCT-TTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGATTTATATT-TTATA
255 TTATCTATTTCAAAT-TGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCATACA
* * * * * *
43680 AGCTTATTCGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACA-TTCAGA
318 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAA
* * * * * * *
43723 AATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTA-TAAAATAAGTTTAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAAATAAAT-CGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * **
43787 TATTTGAACAATTATTTATTT-AAAACTATTATGACCTTGTGTTTTGCCATTGAACAATTGTTT-
63 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * **
43850 TAGTTCACAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTAAAAATTAATAAG
127 T-GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
* ** * * * * * *
43915 CATGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAATTCAGATAGTTACT-ACTATTAGAATA
191 TAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACA
* *
43978 ATTGTCTATTTAAAATTGTTAT
254 ATTATCTATTTCAAATTGTTAT
44000 GACTATGTGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (361 bp):
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ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
CGAAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCAAA
Found at i:41882 original size:182 final size:180
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39752 ATGCGAATAG
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39762 TTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAAAATCTATTTGCCAAATAAGT
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* * * * * *
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* ** * *
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** * * * * * *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
* * * * * * * * **
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* **
40072 AAAACAATTATATT-AGTT--TACATAGCCTT-TTTTGAAATAAAATAATACTAAT
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* * * * * * * * **
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * * *
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* * * * *
40253 AAATAATTGTTCCTGTTCATACAAGCTTATTCTGAAGAAAATAATA-TAAAT
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* * * * **** * *
40304 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAAAAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTGAACACGTTT
1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTC
* * * *
40369 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTCATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
66 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
* ** * *
40434 ACCAATTGTTTTTGTTCATACAAACATATTC-GAAATAAAATAATACTAAT
131 AACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * *** *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * ** *
40548 CAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATTTTTTGTTTTTTCATA
65 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
40613 AAACAATTATTTCTA-TTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAA-AATA-TGAAT
130 AAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AAT
* * * * * * * * *
40663 TTATTAACA-TTCTAAAAATTAGTAGGTAGGAGACTTGAAAACTAAATCT-TATTACCGAACAAG
1 TTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGT-TTACCAAACAAG
* * * * *
40726 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAGTGTTA-AGACCTTTTGTTTTGTC
63 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATA-ACCTTTTGTTTTGTC
** * * * *
40790 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCACACATA-ATTATTTAGAATAAAATAA-ACTTGAT
127 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA-AGCTTATTCAGAATAAAATAATAC-TAAT
* ** * * * * *
40844 ATATTAATATTTTGAAAATTAAT---AAGTGATTTAAAAACTAAAT-TTTTTACTGAAA-TAGTT
1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAAACAAGTT
* ** * * *
40904 CAAATAGTTATGACTATTTGAA-ATATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCAT
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* * * ** *
40967 AAAACAATTATTTC-TTTCCATACATGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAAT
129 AAAACAATTGTTTCAGTT-CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * *
41019 TTA-AACAAATTCCAAAAAATAGTAAGTAAGAGATTTTTAAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACT
1 TTATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGA--TTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * ** * * *
41083 AGTTCAAATATTTAAGAATATTAGAATAATTATCCATTTCAAATCATTCTAACCATTTGTTTAGT
61 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
41148 CATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTCATTTAGAAATAAAATAATATTAAT
126 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *** *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
* * * * ** * *
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* * * ***
41332 ATAAAACAATTGATTCAGTTCATA-AAACTTATT-TGAAATAAAATAATACTGCC
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* * * * ** * *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
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* * * * *
41510 ATAAAATAGTTATTTTTA-ATCATACAAGCTTATTCA-AATAATAATAATACTAAT
127 ATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAA-AATAATACTAAT
* * * ** * * *
41564 TTAATAATATTCCAAAAATTAAT---AAGTGATTTAAAAAATAAATGCGCTTGCCAAACTAGTTC
1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTC
* * * * ** * * * * *
41626 AAATAGTTAAGAATATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTCTGACATTTTGTTTAGTCATAT
66 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
41691 AATAATTGTTTCAATAT-ATACAAGCTTACTCAGAATAAAATGATACTAAT
131 AACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
* * * ** * *
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64 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
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129 AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * ** *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CCAAACAAG
* * * * * * ** *
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* *
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** * * *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTT-
* * * * **
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* *
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* * * * * *** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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64 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
** * * * * * *
42589 AAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAACACTAAT
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* * * * *
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* * * * ** * *
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* * * ** ** * *
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* * * * * * * * * ** * *
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* * * *
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* ** * *
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* * * * * **
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1 TTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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** * * * * * * * *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA-ACAAG
* * * * * *
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* * * * * * * ** *
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128 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAAT
* * * ** * *
43527 TTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTGGCTGAACCAA-T
1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAAACAAGT
* * ** * * * *
43591 TGAAATAGCTAAAACTATTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCT-TTATGACCTTTTGTTTAGTCA
64 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * *
43655 TAAAATATTTGATTT-A-TATTTTATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATCCAAAT
128 TAAAACAATTG-TTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * * ** *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
* * * * * * * * *
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64 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
** * * * * *
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* * * * * *
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1 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
* * * *
43953 TCAGATAGTTACT-ACTATTAGAATAATTGTCTATTTAAAATTGTTAT
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* * * * ***
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* * * * * * *
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** *** * * * * ** *
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* ** * * * ** ** * * *
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* * * * * *** ** * * * * **
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* * * * * * * * * * * *
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* **
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* * * ** * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * * * *
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**** * * * * * * * * * *
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* * * ** * ** *
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* * * * * *
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*** **** * * * * * * * * * **
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* *
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* * * ***** * *
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* * ** ** ** * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * * * * * * * * ** *
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* *
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* **** * * * * * *
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* * * ** * * * * *
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* ** *** *
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* **
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* * * * **
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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*
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
42808 TAAAAT--TATACTAATTTAATAATATTCTGAAACTTAATAACCAAAAAAATTAAAAAATAAGTC
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* * * * *
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* **
42936 CCTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTG
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* * *
42965 TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTTTCAAAATTAATAAGAGA
1 TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAGA
* * ** * *
43030 TTGAAAAAATAAATTTTTTTACCGAATTAGTTCAAATGGTTA-AGACAATTAGAAAAATTATCTA
66 TTGAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATA-ACAATTTGAACAATTATCTA
* * * *
43094 TTTCAAATTGTT-TTGACCTTTTGTTTAGTTACAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGTTTA-T
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* * ** *
43157 TCAGAATAAATTAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGA
194 TGA-AATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGA
43205 AAGAGATTTA
Statistics
Matches: 1902, Mismatches: 386, Indels: 225
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
533 5 0.00
534 3 0.00
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Consensus pattern (531 bp):
TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAGA
TTGAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAACAATTTGAACAATTATCTAT
TTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTG
AAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAAC
TTACCAAACCATTACAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAACTACTTCAAATCATTATAACCT
TTTATTCTATCACGAAACAATTGGTTCTATTCATAACTTATTTAGAATAAAATAATATACTAATT
TAATAAAATTCTAAAACTTAATAACCAAAAAAATTAAAAAATAAATCCAATTGCCAAACCAATTC
AAACAATTAAGACTATATGAATAATAATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTTTTGTCATAAAA
CAATTATTTCA
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Period size: 530 Copynumber: 1.9 Consensus size: 523
42915 ATCTATTTCA
* * *
42925 AATTGTTATAACCTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAA
1 AATTGTTATAACCTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCACAAAAGCTTATTTGGATTAAA
* * * *
42990 ATAATACAAATTTAATAATATTTTCAAAATTAATAAGAGATTGAAAAAATAAATTTTTTTACCGA
66 ATAATACAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTGAAAAAATAAATGTGTTGACCGA
** * * * * *
43055 ATTAGTTCAAATGGTTAAGACAATTAGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTT
131 ACCAATTCAAATAGCTAAAACAATTAGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
* * * **
43120 AGTTACAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAATTAATATTAATTTATTAA
196 AGTCACAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTATTAA
* * *
43185 CATTCAAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTT-AGAAAAATAATTATTTTTATCAAACAAATTCAAA
261 CATTC-AAAAATTAATAAGCAAA-AGATTTGA-AAAAATAAATATGTTTATAAAACAAATTCAAA
* * * * * * * *
43248 TAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTGTTTAAAA-TGTTATAACATTTTGATTTGTCATAAAAT
323 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAACTATTATAACATTGTGATTTGCCATAAAAC
* * * *
43312 AATTGTTTCAGTTAATATAAGCTTAGATAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTACA
388 AATTGTTTCAGTTAACAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTACA
43377 TTATTAAGTAAAAAAATGTAAAAAATAATTTTGTTTACCAACTCAATTAAAATAATTATGGCCAT
453 TTATTAAGTAAAAAAATGTAAAAAATAATTTTGTTTACCAACTCAATTAAAATAATTATGGCCAT
43442 TTGAAC
518 TTGAAC
* * *
43448 AATTGTTATGACCTTATGTTTTGTCATAAAATAGTTGTTTCTGATCACAAAAGCTTATTTGG-TT
1 AATTGTTATAACCTT-T-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGATCACAAAAGCTTATTTGGATT
* * *
43512 AAAAATGATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
63 -AAAATAATACAAATTTAATAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTGAAAAAATAAATGTG
* * * * * *
43577 TTGGCTGAACCAATTGAAATAGCTAAAACTATTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCT-TTATGAC
123 TTGACCGAACCAATTCAAATAGCTAAAACAATTAGAAAAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGAC
* * * * * * *
43641 CTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGATTTATA-TT-TTATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATCC
187 CTTTTGTTTAGTCACAAAACAATTG-TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* *
43704 AAATTTATTAACATTCAGAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTATAAAATA
250 AAATTTATTAACATTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTATAAAACA
* * * * * *
43769 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAACTATTATGACCTTGTGTTTTGC
315 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAACTATTATAACATTGTGATTTGC
** * * ** *
43834 CATTGAACAATTGTTTTAGTTCACAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAT
380 CATAAAACAATTGTTTCAGTTAACAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
43899 TT
445 TT
43901 TAAAAATTAA
Statistics
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532 2 0.01
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AATTGTTATAACCTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCACAAAAGCTTATTTGGATTAAA
ATAATACAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTGAAAAAATAAATGTGTTGACCGA
ACCAATTCAAATAGCTAAAACAATTAGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
AGTCACAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACAAATTTATTAA
CATTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATATGTTTATAAAACAAATTCAAATAG
TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAACTATTATAACATTGTGATTTGCCATAAAACAAT
TGTTTCAGTTAACAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTACATTA
TTAAGTAAAAAAATGTAAAAAATAATTTTGTTTACCAACTCAATTAAAATAATTATGGCCATTTG
AAC
Found at i:44896 original size:358 final size:356
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Period size: 358 Copynumber: 10.2 Consensus size: 356
44210 AAAAAAAAGG
* * * * * *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * *
44283 CTTATT-ACTTTT--AATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTACT-AATA
64 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATA-TGAA-C
* * * * * * *
44344 AAAACAATTAT-TTTCTGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAGATTATTATTCAAA-A
127 AAAAC-ATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** *
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191 GTCATAACTATTTGAACTAGTTC-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT
* * * *** * ** *
44470 TGCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAATAATGTATCAGTAGAAACAATTGT
254 TTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGT
* * * *
44535 TTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAA
318 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * *
44574 TAATTGTTCAAATTGTTATAACTAGTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
*** * *
44639 TATTAATTTGCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAAAA
66 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAA
* * * * * *
44704 GCATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAATGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCT
131 -CATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
44769 TAACCATTTGAAGTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTATTTTTCATA
195 TAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-A
* * * * *
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259 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATG
* * *
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324 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* *
44932 TAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAA--T-
* *
44996 CTACTCATTAATTTTTTAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAAT-AGACTTATACG
62 CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAG-CTTAT---
* * * *
45058 ATGAACAACA-ATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTC
121 ATGAACAAAACATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *** **
45121 AAATGGTCATAATTATTTGAACT-GATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TT
186 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
45184 CAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTCT-TATGAAC-TGAAA
250 -AA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCT-TGTATGAACAT-AAA
* * * *
45247 CAATTGTTTTATTATAAAACAAAATGTCATAAAGATTT-AAATAGA
311 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * **
45292 TAATTGTTCAAACAGTCATGACTATTTGAATTTGTTTAGTAAAT--ATTTTTTTTTTATTTCTTG
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-T-
* * *
45355 CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATATATAAAC
64 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAAC
* * * * * *
45418 TGAAACATTTAT-TTTATGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTCTTCTAAT
127 -AAAACATTT-TGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * ** ***
45482 AGTCTTAAGTATATGAATTGGTTTGACAAATGCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
190 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** ** * * * * * * *
45547 T-ACAAT-TTTTTAGTTTAGCAATATTTTACTT-TGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTAT
255 TCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGT
* * *
45609 TTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATATA
318 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * ** * *
45647 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTCCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * * *
45712 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATAAATAAA
66 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTATATGAA-CAA
* * * * * * * *
45776 AACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAA-CATTTTGCAATAAATAATTGTTCAAATATT
129 AACATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
45840 TATAACTATTTGAACTCA-CTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTT
193 CATAACTATTTGAACT-AGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT
* * ** * *
45903 AAAAAATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATA-AAACCAATTGTT
256 CAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAA-CAATTGTT
* * *
45966 TTATGACAAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGA
319 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
46004 TAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTGGTAAACAGATTCT-TTCTTTAATTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAATAGATT-TATTTTTTAAATCT
* ** * *
46067 CTTACTCATTAGTTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATT-AAATAAGCTTATATG
64 C-T--T-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTATATG
* * * **
46131 AACTAAAACA-ATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTACTC
124 AAC-AAAACATTTTG-TTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
46194 AAATAGTCATGACTACTTGAACTTGTTCAGTGAAGATATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTA
186 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * *
46259 ATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTCTAATCTGATTAGGCTTGTATGAACAAAAACTAT
251 ATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAAT
* * ** * * *
46324 TATTTTATAACTGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
315 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* *
46366 TAATTGCTT-AAATAGTCATAACTATTAGAACAT-GTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATC
1 TAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * *
46428 TCTTATTAATTTTTGGAATATTAGTAGATTAGTATTTTTTTGTTTTGAACAAACTTATATGAACA
63 TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAAC-
* *
46493 AAAACA-TTTGTTTAAAGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
127 AAAACATTTTGTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * *
46557 GTCATAATTATTTAAACTGGTTAAGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTT
191 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* ** * * * * * *
46622 TGAAATATTAATTGATTCA-TTTTATTTTATTCTTAATAAGCTAGTATTAA-TTGAAAAAATTGT
255 TCAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACAATTGT
* *
46685 TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
318 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
46724 TAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGCTTCAGGAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-
* * *
46789 TAGTTATTAAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
65 ---TTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * * * *
46854 TAGAAATAATTTTTTTTATAATC-GAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTGTTCAA
126 CA-AAA-CATTTTGTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
** ** * * * * *
46918 ATAGTCATAACTATTCAAACTAGTTCAATAAATAGATTTCTTTTTTAAATATCTTAATTATTAAC
188 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-
* * * * *
46983 TTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATT
252 TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ACATAAACAATT
* * * *
47047 GTTATATG-CCAAGCAAAAGGT-ACTAACAATTTGAAATAGA
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** * * * * * * * *
47087 TAATTACTGAAATAG-CTATAATTATCT-AATTCG----CTAAATAAATTCACTTTTTAAATCAC
1 TAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT--C
* * * * *
47146 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAGCATGTATGAA
63 -T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * ** ** * * *
47211 CTGAAACAATTGGTCTATGATAAAATAGAATTTCATAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCCAAT
126 C-AAAACATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
47276 AGTCGTAACTATTTGAATTTA-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATT
190 AGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *
47340 TTCAAAATATTAAGAAACTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCCTT-TATGAAC-TAAAACAATT
254 TTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAACAT-AAACAATT
* * * * *
47403 GTTTTATGTCAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAAA
316 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * ** * *
47444 TAATTGTTGAAATGGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCGGTAAACCA-ATATT-TTTTTCAAATC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAA-TAGAT-TTATTTTTTAAATC
* * ** * * * *
47506 TTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATAA
63 ---T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATAT
** * * * * * *
47570 GATATGAAACAAATAT-TTTATGACCAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATTATTC
123 GA-ACAAAAC-ATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* ** * * * * * *
47634 TAATAGTTTTAACTATTTAAATTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TA--A
186 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * *
47696 GTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAACAAGCTTCTATCATCAGAAACAA
251 ATTTTCA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAA
* * * *
47759 TTGTTTTATGACAAAAACAAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAAA
314 TTGTTTTATGAC-AAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
** * * * ** ** * *
47804 TAATCATTCAAATGGTCA-AATTATTTTAACTAAG-TGGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
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65 TTAT-TAATTT
47878 AATTTAGGAA
Statistics
Matches: 2613, Mismatches: 552, Indels: 277
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
353 2 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (356 bp):
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CATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
Found at i:44904 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 44220--47863 Score: 2487
Period size: 181 Copynumber: 20.3 Consensus size: 179
44210 AAAAAAAAGG
* * * * * * *
44220 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAA--T-A
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* * * ** *
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66 TACTTATTATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTA-TGAACA
* * * * * *
44344 AAAACAATTATTTTCTGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAGA
130 TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * ** ** * *
44394 TTATTATTCAAA-AGTAATAACTATTTGCACTAATCAGGCCAACAAATTCATTTTTTAAATC-CA
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-
** * * *** * *
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65 TTACTTATT-ATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
44522 TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAA
128 CATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
44574 TAATTGTTCAAATTGTTATAACTAGTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
** * * *
44639 TA-TTA--ATTTGCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCGAATAAACTTATATGAAC
66 TACTTATTATTT-TTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAC
* * *
44700 A-AAAGC-ATTTTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAATGATTTAAAATAGA
129 ATAAA-CAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
44751 TAATTATTCATATAGCCTTAACCATTTGAAGTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
44816 TAGTTATTATTTTTCATAATATTATTATATTAGTATCATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAC
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* * * *
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* * * * * * * *
44932 TAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
44997 TACTCATTAATTTTTTAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AGACTTATACGAT
66 TACTTATT-A-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAA
* * *
45060 GA-ACAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTGAAATAGA
128 CATA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * **
45112 TAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAACT-GATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
** * * * * *
45176 CAACTT-TTCAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTCT-TATG
65 TTACTTATT--A-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCT-TGTATG
* * * *
45239 AAC-TGAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAATGTCATAAAGATTT-AAATAGA
126 AACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
45292 TAATTGTTCAAACAGTCATGACTATTTGAATTTGTTTAGT-AA-ATATTT-TTTTTT-TATTTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * *
45353 TGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCATATATAA
66 TACTTATT-A-TTTTTAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
45416 AC-TGAAACATTTATTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGA
127 ACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * ** *
45469 TAATTCTTCTAATAGTCTTAAGTATATGAATTGGTTTGACAAA-TGCATTTATTTTTTAAATCTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTC
* ** ** * * * *
45533 TTACTTATTAATTTTACAAT-TTTTTAGTTTAGCAATATTTTACTT-TGAATAAACTTGTATAAA
65 TTACTTATTATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * *
45596 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATATA
128 CATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
*** *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * *
45712 TA-TTA--ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATAAATA
66 TACTTATTATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * *
45774 AAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAA-CATTTTGCAATAAA
130 TAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGA
* * * * * *
45824 TAATTGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACTCA-CTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* ** *
45887 TTACTTATTAATTTTTAAAAAATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGA
65 TTACTTATT-ATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA
* * *
45951 ATA-AAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAGA
127 ACATAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * *
46004 TAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGGTAAACAGATTCT-TTCTTTAATTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATCT
* * * * *
46067 CTTACTCATTAGTTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACAT-TAAATAAGCTTATATG
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* *
46131 AAC-TAAAACAATTGTTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGA
126 AACAT-AAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
** * * * ** * * * * *
46185 TAATTACTCAAATAGTCATGACTACTTGAACTTGTTCAGTGAAGATATTTATTTTTTAAATATTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
** * * * * *
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* * * * ** * ** *
46315 AAAAACTATTATTTTATAACTGAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
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* * *
46366 TAATTGCTT-AAATAGTCATAACTATTAGAAC-ATGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
1 TAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * * *
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64 CTTACTTATTATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
46491 CAAAAACATTTGTTTAAAGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
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* * * ** * * *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
** * * * *
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* * * **
46672 -TTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
128 CAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * *
46724 TAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACT-GCTTCAGG-AAACAAATTTATTTTTTAAATCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * *
46787 CTTAGTTATTAAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTAT
64 CTTACTTATT--ATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * * * *
46851 GAATAGAAATAATTTTTTTTATAATC-GAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATA
125 GAACATAAACAA-TTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* ** *** * * *
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1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
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* * * * * **
47037 -AAAAATAATTGTTATATG-CCAAGCAAAAGGT-ACTAACAATTTGAAATAGA
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** * * * * * * * * * * *
47087 TAATTACTGAAATAG-C-T-A-TAATT-ATCTAATTCGCTAAATAAATTCACTTTTTAAATCACT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
47147 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCAAACAAGCATGTATGAA
66 TACTTATT-ATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * ** ** *
47211 C-TGAAACAATTGGTCTATGATAAAATAGAATTTCATAACAATTTTAAATAGA
128 CAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
47263 CAATTGTTCCAATAGTCGTAACTATTTGAATTTA-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
47327 TTGCTTATTAATTTTCAAAATATTAAGAAACTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCCTT-TATGA
65 TTACTTATT-ATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGA
* * * *
47391 AC-TAAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAAA
127 ACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * *
47444 TAATTGTTGAAATGGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACCA-ATATT-TTTTTCAAATCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAA-CAGAT-TTATTTTTTAAATCT
* * * * * ** ** * * *
47507 TTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATAAG-
64 CTTACTTATT-A-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA
* * * * *
47571 ATATGAAACAAATATTTTATGACCAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
127 ACAT-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * ** * * * * *
47625 AAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAATTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * *
47690 TAC-TA--AGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTGAACAAGCTTCTATCATC
66 TACTTATTATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAAC
* * ** * *
47751 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAACAAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAAA
129 ATAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
** * * * * *
47804 TAATCATTCAAATGGTCA-AATTATTTTAACTAAG-TGGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
47864 TTTTTATATA
Statistics
Matches: 2721, Mismatches: 615, Indels: 264
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Matches are distributed among these distances:
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174 17 0.01
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184 2 0.00
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Consensus pattern (179 bp):
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TACTTATTATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
Found at i:45964 original size:892 final size:889
Alignment explanation
Indices: 44220--47863 Score: 2492
Period size: 897 Copynumber: 4.1 Consensus size: 889
44210 AAAAAAAAGG
* * ** *
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* * * *** *
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* * * * * * *
44342 -TAAAAACAATTATTTT-CTGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAGATTATTATTCAA
127 CT-AAAACAATTGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAA
* * * * ** * * * ***
44405 A-AGTAATAACTATTTGCAC-TAATCAG-GCCAACAAATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTA
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* ** * ** * * ** * *
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* * ** * ** * *
44530 ATTGTTTTATGA-TAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATTGTTAT
316 ATTATTTTATAACT-AAACAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCAT
* * * *
44593 AACTAGTT-GAA-TTGGTTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATT-AATTTGCAAAA
379 AACTA-TTAGAACAT-GTTTGA-CAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTT-TACAA
* * ** * * * * *
44654 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCGAATAAACTTATATGAACAAAAGC-ATTTTGTTTAT
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* * * * * * * *
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** * * * *
44782 TAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTATTTTTCATAATATTATTATATT
568 TAGTTAAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTGA-AATATTAATAAATT
* * * *
44847 AGTATCATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAATAACTGTTTTATGACAAAACAAAAG
629 AGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT-AA-ATAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * * * * *
44911 GTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTAGGTAAAT
692 GTCATAA-CATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACT-CTTCGGTAAAC
* * *
44976 AGATTTATTTTTTAAATTTCCTACTCATTAATTTTTTAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTAT
755 AGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * *
45040 TCTGAAT-AGACTTATACG-ATGAACAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATT
820 TC-GAATAAG-CTTGTATGAAT-AA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATT
45103 TGAAATAGA
881 TGAAATAGA
* * * *
45112 TAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCC
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTGATAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCT
* * *
45177 AACTTTTCAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTCT-TATGAA
64 AACTTTT-AACTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TATATGAA
* * * * **
45241 CTGAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAATGTCATAAA-GATTT-AAATAGATAATTGTTCAAA
127 CTAAAACAATTGTTTTACTACAAAACAAAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAA
* * * * *
45304 CAGTCATGACTATTTGAATTTGTTTAGT-AA-ATATTT-TTTTTT-TAT-TTCTTGCTTATTAAT
191 CAGTCATGACTACTTGAACTTGTTCAGTGAAGATATTTATTTTTTAAATATT-TTACTTATTAAT
* *** * * * * **
45364 TTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTATT-TTATTTCGAATAAGCATATATAAACTGAAAC-AT
255 TGTCAAAATATTAATA-AATTAATATTATTCTAATCT-GAATAAGCATATATAAACAAAAACTA-
* * ** * * *
45426 TTATTTTATGACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATT-CTTCTAATAGTCTTAA
317 TTATTTTATAACTAAACAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAA
* *
45490 GTA-TATGAA-TTGGTTTGACAAAT-GCATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTACAA
381 CTATTA-GAACAT-GTTTGACAAATAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--AATTTTACAA
** * * * * *
45552 T-TTTTTAGTTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGA
440 TATTAGTAGATTAGCAATATTTTACTTTGAACAAACTTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGA
* * * *
45616 CAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
505 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
** * *
45680 GTCCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
570 GTTAAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * *
45745 ATTTTATTCTAAATAATTTTGTATAAATAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAA
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* *
45810 CATTTTGCAATAAATAATTGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACTCACTCGGTAAACAGATTTA
699 CA-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACTC-TTCGGTAAACAGATTTA
* * *
45875 -TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTAAAAAATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAA
762 TTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-GAA
* * * *
45938 TAAGCTTGCATGAATAAAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATTATGTTTTGAAATAG
825 TAAGCTTGTATGAATAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAG
46003 A
889 A
* * * * * *
46004 TAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTCTTTCTTTAATTCTCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TATTTGATAAATAGATT-TTTTTTTAAATCTCT
* * * * ** *
46069 TACTCATT-AGTTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATTAAATAAGCTTATATGAA
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* *
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192 AGTCATGACTACTTGAACTTGTTCAGTGAAGATATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTG
* * * * *
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257 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTCTAATCTGAATAAGCATATATAAACAAAAACTATTATT
* *
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* * **
46393 GAACATGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTAGTAGATT
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* * * ** * * * * * *
46458 AGTATTTTTTTGTTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTAAAGGCAAAACAAAAGG
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* * *
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* ** *
46588 AAATTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATTGATTCA-TTTTATTTTAT
582 AATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTAT
* * * * *
46652 TCTTAATAAGCTAGTATTAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTG
642 TCTAAATAAGCTTGTA-TAAATAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTG
* * * *
46717 AAATAGATAATTGTTCATATAGTCT-TAACTATTTGAACTGCTTCAGG-AAACAAATTTATTTTT
705 AAATAAATAATTGTTCAAATA-TTTATAACTATTTGAACT-CTTC-GGTAAACAGATTTATTTTT
* * * * *
46780 TAAATCTCTTAGTTATTAAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
767 TAAATTTCTTACTTATT-AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGC
* * * * * * *
46845 TTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTTATAATC-GAACAAAAGGTT-ATAACGATTTGAAGTATA
830 TTGTATGAATA-AAACAA-TTGTTTTATGA-CAAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGA
* ** ** *
46907 CAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTAGTTCAATAAATAGATTTCTTTTTTAAATATCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-TTTGATAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTC-
* *
46972 TAA-TTATTAACTTTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT
63 TAACTT-TTAACTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGA-
* * * * * * * *
47036 A-AAAAATAATTGTTATA-TGCCAAGCAAAAGGTACTAACA--ATTTGAAATAGATAATTACTGA
126 ACTAAAACAATTGTTTTACTACAAAACAAAAGGT-C-AAAATGATTTGAAATAGATAATTACTCA
* * * ** * * * * * *
47097 AATAG-C-T-A-TAATT-ATCTAATTC-GCTAAATAAATTCACTTTTTAAATCA-CTTACTTATT
189 AACAGTCATGACTACTTGAACTTGTTCAG-TGAAGATATTTATTTTTTAAAT-ATTTTACTTATT
* ** * * * * * * ** *
47155 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATT-TTATTTCAAACAAGCATGTATGAACTGAAACA
252 AATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTCTAATCT-GAATAAGCATATATAAACAAAAACT
** * * ** * * * * * *
47219 ATTGGTCTATGA-TAAA-ATAGAATTTCATAACAATTTTAAATAGACAATTG-TTCCAATAGTCG
316 ATTATTTTATAACTAAACA-A-AAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCA
* ** * * ** * * *
47281 TAACTATTTGAATTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTGCTTATT-AATTTTCAA
378 TAACTATTAGAACATGTTTGACAAATAGATTTATTTTTT-AAA-TC-T-CTTATTAAATTTT-AC
* * * * * * * * * * *
47345 AATATTAAG-AAACTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCCTT-TATGAACTAAAACAATTGTTTT
438 AATATT-AGTAGATTAGCAATATTTTACTTTGAACAA-ACTTATATAAACAAAAACAATTATTTT
* * * * * * *
47408 ATGTCAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAACTATTTAA
501 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * *
47473 ACTTGTTCGGTAAACCAATATT-TTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATA
566 ACTAGTTAAGTAAACAAAT-TTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA
* ** * * * *
47536 AATTTGGGTTATTTTATTCCAAATAAGC--CTATAAGATATGAAACAAA-TATTTTATGACCAAA
625 AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATAA-ATA--AAA-AAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
47598 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAA-AATTATTCTAATAGTTT-TAACTATTTAAATTGGTT
686 CAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATA-TTTATAACTATTTGAACT-CTT
* * * * * * *
47661 TGGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTACTAAGTTTTAGAATATTATTAAATTAGTAT
747 CGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
47722 TATTTT-TAACTGAACAAGCTTCTAT-CATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAACAAAAAGGT
812 TATTTTAT-TC-GAATAAGCTTGTATGAAT-A-AAACAATTGTTTTATGAC-AAAAC-AAAA-GT
** * *
47785 T-ATAACAATTTAAAATAAA
870 TCATAATGATTTGAAATAGA
** * * * * * *
47804 TAATCATTCAAATGGTCA-AATTATTTTAACTAAGTGGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTTGATAAATAGATTT-TTTTTTAAAT
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ATGACTACTTGAACTTGTTCAGTGAAGATATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTCAA
AATATTAATAAATTAATATTATTCTAATCTGAATAAGCATATATAAACAAAAACTATTATTTTAT
AACTAAACAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATAGTCATAACTATTAGAAC
ATGTTTGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAAATTTTACAATATTAGTAGATTAGCA
ATATTTTACTTTGAACAAACTTATATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTAAGTAAACAAATT
TATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
GCTTGTATAAATAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACATTTGAAATAAATAAT
TGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACTCTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTT
ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAACA
ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGA
Found at i:46650 original size:539 final size:538
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* * * * * * *
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* * * *** *
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* * * * * *
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* * ** * **
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* * * *** * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * *
44722 AACAAAAGGTCGTAATGATTTAAAATAGA
510 AACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
* * * * * * ** * *
44751 TAATTATTCATATAGCCTTAACCATTTGAAGTAGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-C
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTAC
* * * * *
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66 TTA-TTA--ATTTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *
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* * * * * * *
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192 AGTCATAACTATTTGAACTGGTT-GGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *
45010 TTTAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAAT-AGACTTATACG-A-TGAACAACAAT
256 TTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTACTT-TAAATAAG-CTTATATGAACT-AA-AACAAT
* * * *
45070 TGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATT
316 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* *** * * *
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* * * **
45196 TATTAATAAAGTAATATTATTTT-ATTTTGGATAAGCTCT-TATGAACTGAAACAATTGTTTTAT
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* * *
45259 TATAAAACAAAATGTCATAA-AGATTT-AAATAGA
505 GATAAAACAAAAAGTCATAACA-ATTTGAAATAAA
* * * * * **
45292 TAATTGTTCAAACAGTCATGACTATTTGAATTTGTTT-AGTAAAT--ATTTTTTTTTTATTTCTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC-T
* ** * * * * *
45354 GCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAGAA-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATATATAAAC
64 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC
** * * * * * * *
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128 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * ** *** *
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193 GTCATAACTATTTGAACTGG-TTGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** ** * * * * * * *
45547 T-ACAAT-TTTTTAGTTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTAT
257 TGA-AATATTAATAAATTA-TATTATTTTACTTTAAATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTGT
* * * *
45609 TTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
319 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * **
45673 TGAACTAGTCCAGTAAACAGATTTAGTTTTT-AAAT-CT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
384 TGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCCTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
* * ** * * *
45735 AATTAGTATTATTTT-A-TTCTAAATAATTTTGTATAAATAAAAACAATTGGTTTATGATAAAAC
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* * *
45798 AAAATGTCATAACATTTTGCAATAAA
513 AAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
* * * * * *
45824 TAATTGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACTCA-CTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTTT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA---T
* * *** *
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62 CTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * *
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126 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
** * * * * *
46016 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAAC-AGATTCTTTCTTTAATTCTCTTACTCATTAGT
191 TAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTGGTAAACAAAATTATTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAAT
** *
46080 TTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACATTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTG
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* * ** ** *
46145 TTTTACT-ACAAAAGAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCATGACTA
318 TTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * ** *
46209 CTTGAACTTGTTCAGTGAAGATATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTA
382 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-ATCCTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
* * * * * * * *
46274 ATAAATTAATATTATTCTAATCT-GATTAGGCTTGTATGAACAAAAACTATTATTTTATAACT-G
446 ATAAATTAATATTATTTTAATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-TAA
46337 AACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
510 AACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
*
46366 TAATTGCTT-AAATAGTCATAACTATTAGAAC-ATGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
1 TAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
** * * * * * * *
46429 -CTTATTAATTTTTGGAATATTAGTAGATTAGTATTTTTTTGTTTTGAACAAACTTATATGAACA
64 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * *
46493 AAAACATTTGTTTAAAGGCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
129 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
46558 TCATAATTATTTAAACTGGTTAAGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT
194 TCATAACTATTTGAACTGGTT-GGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
** * * * *
46623 GAAATATTAATTGATTCATTTTATTTTA-TTCTTAATAAGC-TAGTATTAATTGAAAA-AATTGT
258 GAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTACTT-TAAATAAGCTTA-TATGAACT-AAAACAATTGT
* * *
46685 TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATT
319 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * **
46750 TGAAC-TGCTTCAGGAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAGTTATTAAATTTTTGAAATATT
384 TGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATC-C-TACTTATT-AATTTTCAAAATATT
* * * * * * * * *
46813 ATTAGATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTTATAATC
445 AATAAATTAATATTATTTTAATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA-TTGTTTTATGATA
* * * * * *
46877 GAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATA
509 AAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
* ** ** *
46907 CAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACTAGTTCAATAAATAGATTTCTTTTTTAAATATCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTT-AA-ATC-
* *
46972 TAATTATTAACTTTTGAAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAT
63 TACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-
* * * * ** * *
47036 A-AAAAATAATTGTTATATG-CCAAGCAAAAGGT-ACTAACAATTTGAAATAGATAATTACTGAA
126 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * *
47098 ATAG-CTATAATTATCT-AA-T--TCGCTAAA-TAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAA
190 ATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTGGTAAACAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * *
47157 TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCAAACAAGCATGTATGAACTGAAACAAT
253 TTTTTGAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTACTTT-AAATAAGCTTATATGAACTAAAACAAT
* * * * * ** * * * *
47221 TGGTCTATGATAAAATAGAATTTCATAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCCAATAGTCGTAACT
316 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * *
47286 ATTTGAATTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTCAAAATATT
381 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAA-TCCTACTTATTAATTTTCAAAATATT
* * * * * *
47351 AAGAAACTAGTATTATTTT-ATTTTGGATAAGCCTT-TATGAACTAAAACAATTGTTTTATG-TC
445 AATAAATTAATATTATTTTAATTTCGAATAAG-CTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAT-
** *
47413 AAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAAA
508 AAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
* * * * * * * *
47444 TAATTGTTGAAATGGTCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACCA-ATATT-TTTTTCAAATCT
1 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAA-TAGAT-TTATTTTTTAAATC-
* ** * * ** *** * * *
47507 TTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGGTTATTTTATTCCAAATAAGCCTATAAGA
63 --TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
** * * * * * *
47572 TA-TGAAACAAATATTTTATGACCAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATTATTCTA
126 -ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
** * * * * * *
47636 ATAGTTTTAACTATTTAAATTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TA--AGT
190 ATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * *
47698 TTTAG-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAAC--TGAACAAGCTTCTATCATC-AGAAACAA
254 TTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTA-TTTT-ACTTTAAATAAGCTTATATGAACTA-AAACAA
* * * ** *
47759 TTGTTTTATGACAAAAACAAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAAATAATCATTCAAATGGTCA-A
315 TTGTTTTATGAC-AAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* *
47823 ATTATTTTAACT
378 ACTATTTGAACT
47835 AAGTGGGTAA
Statistics
Matches: 2416, Mismatches: 535, Indels: 257
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
530 7 0.00
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533 7 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (538 bp):
TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTAC
TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTGGTTGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
ATATTAATAAATTATATTATTTTACTTTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCCTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAAT
ATTATTTTAATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTC
ATAACAATTTGAAATAAA
Found at i:47262 original size:720 final size:714
Alignment explanation
Indices: 44220--47654 Score: 2051
Period size: 720 Copynumber: 4.8 Consensus size: 714
44210 AAAAAAAAGG
* * * * * * *
44220 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATATCT
1 TAATTACTGAAATAGTCATAACTA-TT-AAC-AGTTCGATAAATAAATTCACTTTTTAAATCTCT
* * * * * *
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** * * * * * * *
44345 AAACAATTATTTTCTGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAAAGATTATTATTCAAA-AGT
126 AAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAA-CATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * *
44409 AATAACTATTTGCACT-AATCAGGCCAACAAATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTG
190 CATAACTATTTGAACTCATTC-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTT
* * * * *
44472 CATAATATTAATAAATT-AGCATTACTTTATTCTGAATAATAATG-TATCA-G--TAGAAACAAT
253 TAAAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTC--AA-AATAA-GCTAGCATGAATA-AAACAAT
* * ** * * * *
44532 TGTTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACT
312 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACT
* * * * * * *
44597 AGTTGAATTGGTTTA-GTAAATAGATT-TATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTGCAAAATA
377 ATTTGAACT-GATTAGGTAAACAAATTCT-TTCTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATA
* * * * *
44656 TTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTCGAATAAACTTATATGAAC-AAAAGC-ATTTTGTTTA-T
440 TTAATAAATTAGTATTATTTTACATT-AAATAAGCTTATATGAACTAAAA-CAATTGT-TTTACT
** * * * * * * * * * * *
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502 -ACAAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGACAATTACTCAAATAGTCATAACTACTTAAAC
**** * * * * * * * * *
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* * * * * * * ** *
44847 AGTATCATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAA-TAACTGTTTTATGACAAAACAAAAG
631 AATATTATTCTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACT-A-TATTTTATAACTGAACAAAAA
* ** *
44911 GTTATAATGATTTGAAATATA
694 GTCATAACAATTTGAAATAAA
* * ** * * * * *
44932 TAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCC
1 TAATTACTGAAATAGTCATAACTA-TT-AA-CAGTTCGATAAATAAATTCACTTTTTAAA--T-C
* * * * * * *
44997 TACTCATTAATTTTTTAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAGACTTATACG-A
60 T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAACAAACTTGTATGAA
* * * *
45059 -TGAACAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
123 CT-AA-AACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATG-TCATAA-CATTTTAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *** **
45122 AATGGTCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCA
184 AATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-A
* * * * **** *** *
45186 ACTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTCTTATGAACTGAAACAAT
248 ATTTTTAAAATATTAATAAATTCATATTATTTTATTCAAAATAAGCTAGCATGAA-TAAAACAAT
* * * * * *
45251 TGTTTTATTATAAAACAAAATGTCATAA-AGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATGAC
312 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAAC
* * * ** * * * *** *
45314 TATTTGAATTTGTTTA-GT-AA-ATATT-TTT-TTTTTATTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATG
376 TATTTGAA-CTGATTAGGTAAACAAATTCTTTCTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATA
* * * * * * *
45374 TTAATAGAA-TAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCATATATAAACTGAAACATTTATTTTA-TG
440 TTAATA-AATTAGTATTATTTTACATT-AAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTACT-
* * * * * * * * *
45436 ACTAAACAAAATGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATT-CTTCTAATAGTCTTAAGTA-TATGAA
502 ACAAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGACAATTAC-TCAAATAGTCATAACTACT-TAAA
* * ** * * * * * * ** **
45499 TTGGTTTGACAAATG-CATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTACAAT-TTTTTAGT
565 CTAGTTCAATAAA-GAGATTTATTTTTTAAATATCTTAATTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA
** * * * * * * * * * * ** *
45561 TTAGCAATATTTTACTTTGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAG
629 TTAATATTATTCTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACTA-TATTTTATAACTGAACAAAA
* * *
45626 A-TCATAACGATTTGAGATATA
693 AGTCATAACAATTTGAAATAAA
** * * * * * *
45647 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TCCAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC
1 TAATTACTGAAATAGTCATAACTA-TT-AAC-AGTTCGA-TAAATAAATTCACTTTTTAAATCTC
* ** *
45711 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTAT-AAATA
62 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAACAAACTTGTATGAACT-
* * *
45774 AAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAACATTTTGCAATAAATAATTGTTCAAATAT
125 AAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAACATTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
45839 TTATAACTATTTGAACTCACTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTT
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* * *
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* *** *
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318 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
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383 ACTGATTAGGTAAACAAATTCTTTCTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAA
*
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* * * * * * *
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* * *
46228 GATATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTCTA
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* *
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707 GAAATAAA
* * * * * *
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1 TAATTACTGAAATAGTCATAACTATT--AACA-GTTCGATAAATAAATTCACTTTTTAAATCTCT
* * * * * ** * *
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63 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAACTAAA
* * ** * * *
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* * ** ** * * *
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** * ** * *
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* * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * **
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* * * * *
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570 TCAATAAAGAGATTTATTTTTTAAATATCTTAATTATTAA-TTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
* * * *
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*
47066 GT-ACTAACAATTTGAAATAGA
694 GTCA-TAACAATTTGAAATAAA
* *
47087 TAATTACTGAAATAG-CTATAATTATCT-A-A-TTCGCTAAATAAATTCACTTTTTAAATCACTT
1 TAATTACTGAAATAGTC-ATAACTAT-TAACAGTTCGATAAATAAATTCACTTTTTAAAT--C-T
* * *
47148 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAGCATGTATGAACT
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* * * * * * *
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125 AAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAATGTCATAAC-ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
47278 TCGTAACTATTTGAATTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAACTCTTGCTTATTAATTTTC
189 TCATAACTATTTGAACTCATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * **** **
47343 AAAATATTAAGAAACT-AGTATTATTTTATTTTGGATAAGCCT-TTATGAACTAAAACAATTGTT
254 AAAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTCAAAATAAG-CTAGCATGAA-TAAAACAATTGTT
* * ** * * * * *
47406 TTATGTCAAAACAAAAAGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTGAAATGGTCATAACTATTT
316 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *** *
47471 AAACTTG-TTCGGTAAACCAATATT-TTT-TTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTA
381 GAAC-TGATTAGGTAAA-CAA-ATTCTTTCTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTA
* ** * * * * *
47533 ATAAATTTGGGTTATTTT--ATTCCAAATAAGCCTATAAGATA-TGAAACAAATATTTTA-TGAC
443 ATAAATTAGTATTATTTTACATT--AAATAAGCTTATATGA-ACTAAAACAATTGTTTTACT-AC
* * * * * ** *
47594 CAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAA
504 AAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGACAATTACTCAAATAGTCATAACTACTTAAA
47655 TTGGTTTGGC
Statistics
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TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAACTTGTATGAACTAAAACA
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ATTTTACATTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTACTACAAAACAAAAGGTCAAAA
CGATTTGAAATAGACAATTACTCAAATAGTCATAACTACTTAAACTAGTTCAATAAAGAGATTTA
TTTTTTAAATATCTTAATTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTCTAATCTGAAT
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Found at i:49843 original size:181 final size:180
Alignment explanation
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * *
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** * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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128 GTCATAACTATTTGAATTGGTTCAG-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAG
* * * * * **
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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64 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * * *
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128 GTCATAA-CTATTTGAA-TTGGTTCAGCAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTAG
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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128 GTCATAACTATTTGAATTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TAG
** * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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65 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
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130 CATAACTATTTGAA-TTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TAG
* * * ***
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* * *
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** * * * *
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** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * ***
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* * * * * * *
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** * * ** **
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* * * * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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** * * * * * *
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** * * * * **
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1 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* ** * * *
53643 AAAAGATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGACAATTATTCATATAGT
66 AACA-ATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * * *
53708 CTTAACTATTTGAACTACTTCAGTAAAAAGATTTATTTTTTATATCTTTTAG
130 CATAACTATTTGAATTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTAG
* * * * *
53760 TTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTATACGAACTG
1 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * *
53824 AAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-G-
65 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
53887 -------A---GAATTGGTTCGGTAAACA-AATT-TTCTTAAAATCTCCTAC
130 CATAACTATTTGAATTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTAG
* * * * * *
53927 TTATAAATGTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATGCATGAACT-A
1 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* * * * ** * *
53991 AAAAATTTATTTTATGATTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
66 AACAA-TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
54056 CTTAATTATTTGAAATGGTT-TGTCAAACACATTTATATTTTAAATCTCTTAC
130 CATAACTATTTGAATTGGTTCAG-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TAG
* * * ** *
54108 TTATTGATTTTTAGAATATT-ATCAATTTACCAATATTTTACTTT-GAATAAGCTTGTATGAAC-
1 TTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
* * *
54170 AAAAGTAATTGTTTTATGACAAAA
64 GAAA-CAATTGTTTTATGATAAAA
54194 TAACGATCAT
Statistics
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Consensus pattern (180 bp):
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AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAATTGGTTCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTAG
Found at i:50499 original size:362 final size:361
Alignment explanation
Indices: 49612--54193 Score: 3370
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49602 TTCTAAATGT
* * * * * **
49612 CTTA-TAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATT-TCGAATAAGCTTCTATGAGC
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* * * * * * * ** * * * *
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64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * ** * ** * *
49740 GTCTTAACTGTTTGAATTGGTTCAGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCATAGTTATTAATTTT
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* * **** *
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* * * * * * * *
49869 TTATGATAGAA-TAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCAAAACTATTA
258 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * *
49933 AAACTGGTTCAACAAACCA-ATTTCTTCTTTAAA--TCT-
323 AAACTGGTTCAGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTA
* ** * **
49969 CTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAGAAAAAGCTTGTATGTTGA
1 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATG-AAA
* * * * * * * * *
50033 A-AAATAGTTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATG
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
50097 GCCATGATTATTTGAA-TTGATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATT
129 GTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** *
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* * * * *
50225 TTTATGGCAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGAT-ATTGTTGAAATAGTCATAACTATT
257 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** *
50289 TAAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCAA
322 TAAACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTA
* * * *
50330 GCTTATTAATTTTTTGAATGTCAATTAATTAGCATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
1 -CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAA
* * * * * * * *
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65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * ** * *
50460 CCTTAACTATTTGAACTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAGTTTTT
130 TCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * ** * * *
50521 AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATTCGAATAAGCTTGTACGATCAAAAACAATTGTTT
195 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
50585 TATGAGAAAAC-AAAGATGATAACGACTT-AAGATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTT
259 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * *
50648 GAAA-TGGTTCAAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTG
323 -AAACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * *
50688 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTC--ATATAAGTTTTTATGAAC
1 CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAAA
* ** *** * * *
50750 TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAGCAACTTT-AAATAGATAGTTGTTTAAAT
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * *
50814 AGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAA
128 AGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * * *
50878 TTTTTCAAATGTTGATAAATAAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTTGTATGAACTAAAATAATT
190 TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATT
* * * * * *
50943 TTTTTATAACTAAACAAAAGGTTA-AATCGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACT
255 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * *
51007 ATTTGAACTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA
319 ATTTAAACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * *
51051 CTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAAAAG
1 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAG
* * * * *
51116 AGACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAAAGATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * ***
51180 TATAAATATTTTAACTATTTTGGTAAATAGATTT-TGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTACC
131 CATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * ** ** *
51240 AAAATATTAATAGATCAATATTGTTTTATTCTAAATAATTTTACATGAACAAAAACAATTGTTTT
195 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
51305 ATGACAAAACAAAATGTCATTATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATGACTA-TTAG
260 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA-
* * * *
51369 AACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCACAAA
324 AACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* * * * *** *
51408 TTTATTAATTTTTAGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAAAGTGTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAAA
* * * *
51472 GAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATCCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * ** *
51537 TCATAACTATTTAAACTTGTTCAAG-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
130 TCATAACTATTTGAACTAGTT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * * * *
51601 TGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGT
194 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * *
51665 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATCTGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATACCTATAT
258 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
51730 GAA-TGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTA
323 AAACTG-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTA
* * * * *
51769 ATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATGAAC
1 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAAA
* * * *
51832 AGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** * * *
51897 GTCATAACTATTTGAACTTA-TTAAGTAAACATATTCT-TTTTTTAACTCTCTTACTCATTAATT
129 GTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * * * * *
51960 TTCAAAATATTAATAAATTATTATTATCTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACGAGTAT
192 TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGT
* * * * * * * *
52025 TTTATTACAATAGAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATGACTATT
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* * ** * * *
52090 TGAACTTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTA
322 TAAACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTA
* *** * * * *
52131 CTTATTAATTGTCAAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTATGAAGAA
1 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-AA
* * * ** * * **
52196 -AAATAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * *
52260 TCATAACAATTTGAACTTA-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAGTTGT
130 TCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* * * * *
52324 CTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGGAT-AAATAGAAAAAAATT
193 -TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATT
* * * * * * * *
52386 CTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCTATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTA
255 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
52451 TTTAAA-TATGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA
320 TTTAAACT-GGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC--TA
* * * * * ** **
52495 -TTATTAA-TTTTGGATTTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTCATATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAG
* * * *
52558 AAACAATTCTTTTATAACAAAACAAAATGTCATAATGATTAGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * ** * * * * *
52623 CATGATTATTTGATCTAGTTCGGTAAACATTTTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTG
131 CATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
* ** *
52688 AAATATTAAT-AATATAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAGTTGTTT
196 AAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * * *
52751 TAT-AGCAGAGCAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAACTATT
259 TATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
52814 TGAACTAGTT-TGATAAATAGATTTATTTTTTACA--TC-A
322 TAAACTGGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTA
* * * * ** *
52851 CTTACTAA-TTTTTGAAATATTAATAGATTAATATTACTTTATTCCAAATGAA-CTTATATGAAC
1 CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AAGCTTGTATGAA-
** * * * *
52914 AA-AGGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGCCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAAT
63 AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * *
52978 AGTCAAAATTATTTGAATTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT
* * * ** ** * * *
53043 TTTGAAATATTTATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCCAGTATGAATTCAAACAAACC
192 TTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC-AA-T
* * * * * * * ** *
53107 TATTTTATGACAAAACAAAAGAT-GTAACAATTTCAAATAGATAACTGTTCATATAGTTTTAAAT
254 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* ** * * *
53171 ATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAATTCTTTTA
319 ATTTAAACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTA
* * ** * ** *
53215 GTTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAGGTTAGTGTTATTTTATTCCAAATAAACTTGTAT-AAAC
1 CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAA-
* * * * * * ** * ** * *
53278 AAAAATAATTGTTTTACGACAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTTTACAATTATTCAAACA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
*
53343 GTCATAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTT
129 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * ** * ** *
53408 TTGCAAGATTAATAAACTAGTATTATTTTATTCAAAAAAAGCTT-TAATGTTC-AAATACAATTC
193 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGT-ATGAACTAAA-ACAATTG
* * * * * * *
53471 TTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAATTGTTGACATAGCCATAATTAT
256 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * *
53536 TTAAACTAATTCAGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTA
321 TTAAACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TA
* ** * *
53578 CTTATTAAATTTCAGAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA
1 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA--A
* * * * *
53643 A-AAA-GATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGACAATTATTCATATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * ** * * * *
53706 GTCTTAACTATTTGAACTACTTCAGTAAAAAGATTTATTTTTTATATCTTTTAGTTATTAATTTT
129 GTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
53771 TGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATACGAACTGAAACAATTATTT
194 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
* * * * * *
53836 TATAATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-G--A-GA--A--T-
259 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
* * * *
53892 ---TGGTTCGGTAAACA-AATT-TTCTTAAAATCTCCTA
324 AACTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTA
* * * * *
53926 CTTA-TAAATGTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCATGCATGAAC
1 CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-
* * ** * * * * *
53989 TAA-AAA-ATTTATTTTATGATTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAA
63 -AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * * * *
54052 TAGTCTTAATTATTTGAAATGGTTT-GTCAAACACATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTGAT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGT-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * ** * * * *
54116 TTTTAGAATATT-ATCAATTTACCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAGTAAT
191 TTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAAT
54179 TGTTTTATGACAAAA
254 TGTTTTATGACAAAA
54194 TAACGATCAT
Statistics
Matches: 3349, Mismatches: 751, Indels: 259
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
347 14 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (361 bp):
CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAAAG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
CTGGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTA
Found at i:52526 original size:904 final size:897
Alignment explanation
Indices: 49706--70335 Score: 6285
Period size: 901 Copynumber: 23.0 Consensus size: 897
49696 AAATAAAATG
* * * * ** * * * * * *
49706 TTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATTGTCTTAACTGTTTGAATTGGTTCAGCAAATG
1 TTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAATT-GTTTAGTAAATA
* * * * *
49771 GATTTATTTTTTAAATCTC-ATAGTTATTAATTTTTAAAATATTACTAAATTATTATTATTTTAT
65 GATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
**** * * * * * * * *
49835 CCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACCATTGTTTTATGATAGAA-TAAAGGTTATAACAATTTG
130 TTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATCTG
* * * * ** * *
49899 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCAAAACTATTAAAACTGGTTCAACAAACCA-ATTTCTTCTTT
195 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAA-CATATTTATTTTTT
* *
49963 AAA-TCT-CTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAAA-AAGCTTG
259 AAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTG
* * * * * * *
50025 TATGTTGA-AAAATAGTTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGATAATTG
323 TATG--AACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
50089 TTTAAATGGCCATGATTATTTGAA-TTGATTCGATAAACTA-ATTTATTTTTTAAAACTCTTACT
386 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTAG-TAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
** * * *** * *
50152 TATTAATTTTCAAAATATTAACAAACTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAA
448 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAACTGAA
* * * * * *
50217 ACAATTGTTTTATGGCAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGAT-ATTGTTGAAATAGTCA
512 ACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* ** ***
50281 TAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTCAAGCTTATTAATTTTTTG
576 TAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTA-CTTATTAATTTTCAA
* * * ** * *
50346 AATGTCAATTAATTAGCATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAATAATTATTATA
639 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAATAATTATTTTA
* ** * * * * * * *
50410 TGACTAAACAAAGGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGCCTTAACTATTTGAA
703 TGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAA
* * * *
50475 C-TAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAGTTTTTAGAATATTATTAAA
768 CTTA-TTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAA
* * * * *
50535 TTAGTATTATTTTTATT-CGAATAAGCTT-G-TACGATCAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-
831 TTAGTATTA-TTTTATTCCAAATAAACTTGGATA-AAT-AAAAACAATTGTTTTACGACAAAACA
50596 AAAGA
893 AAAGA
* * * * * * * * **
50601 TGATAACGACTT-AAGATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATGGTTCAAAAAAT
1 TTATAACTATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAAT
* * * *
50665 AGTTTTAGTTTTTAAATCTC-TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTA
64 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * ** * *
50729 -TTCATATAAGTTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAGC-AAC
129 TTTTAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
* * * * ** * *
50791 TTTAAATAGATAGTTGTTTAAATAGTCA-AATCTATTTCAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTT
193 -TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTA--T
* * * * * * *
50855 TTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTGATAAATAAGTATTATTTTATTTTG-ATT
254 TTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAAT
* * * * *
50919 AAGCTTGTATGAACTAAAATAATTTTTTTATAACTAAACAAAAGGTTA-AATCGATTTGAAATAG
316 AAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAG
* * ** * * *
50983 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
379 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *
51048 TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGA
443 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT-TCAAATAAGCTTATATGA
** * * *
51112 AAAGAGACAATTGTTTTATGACAAA-ATAAAGATCATAAAGATTTGAGATAGATAATTATTCAAA
506 ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * *
51176 TAGTTATAAATATTTTAACTAT-TTTGGTAAATAGATTT-TGTTTTTAAATC--T-CTTATTAAT
570 TAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTACTTATTAAT
** * * * ** ** * *
51236 TACCAAAATATTAATAGATCAATATTGTTTTATTCTAAATAATTTTACATGAACAAAAACAATTG
633 TTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTA
* * ** * * * *
51301 TTTTATGACAAAACAAAATGTCATTATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATGACTAT
698 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAAT
* * ** **** * *
51366 TAGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCACAAATTTATTAATTTTTAGAATACTAA
763 TTGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAA
* ** * * *
51431 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAAGTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAAC
827 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAAC
51496 AAAAGA
892 AAAAGA
* * * * *
51502 TCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTATCCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAAG-AAA
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAA-TTGTT-TAGTAAA
* * *
51565 CAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT
63 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * *
51629 ATTTTGATTAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
128 ATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
* * * * *
51694 TGAAATAGATAATTCTTCAAATAGTCATACCTATATGAA-TGTGTTCAGAAAACATATTTATTTT
193 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-TGTTCAGTAAACATATTTATTTT
* ** *
51758 TTAAAATTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTATTTGAAATAAGC
257 TT-AAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGC
* * * *
51822 TTGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATATATAAT
320 TTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* *
51887 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAAGTAAACATATTCT-TTTTTTAACTCTCTTAC
384 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-AGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTAC
* ** * *
51951 TCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATTATCTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACTGA
447 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAACTGA
* * * * * *
52016 AACGAGTATTTTATTACAATAGAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTC
511 AACAATTGTTTTATGACAA-ACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * *
52081 ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAA
575 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTCAA
* * * * * *
52146 AATATTTATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTATGAAGAAAAATAATTGTTTTAT
639 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTAT
* * * *
52211 GAGAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACAATTTGAAC
704 GACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAAC
* ** * * *
52276 TTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAGTTGTCTT-AATATTAATAAAT
769 TTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTAATAAAT
* ** * * * *
52340 TTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGGATAAATAGAAAAAAATTCTTTTATGACAAAACAAAA
832 TAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATA-AAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAA
*
52405 GG
896 GA
* * *
52407 TTATAGCTATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTTAAATATGTTTAGTAAATA
1 TTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAAT-TGTTTAGTAAATA
* * * *
52472 GATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAA-TTTTGGATTTTTAATAAATTAGTATTATTTTAT
65 GATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * *
52535 TTTAAATAAGCTCATATGAACT-GAAACAATTCTTTTATAACAAAACAAAATGTCATAATGAT-T
130 TTTAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATCT
* * * * * * * *
52598 AGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATCTAGTTCGGTAAACATTTTTATTTTT
194 -GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTT
* * * * **
52663 AAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAAT-AATATAGTATTATTTTAATCCAAATAAGC
258 TAAA--TTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTGAAATAAGC
* * * * * *
52727 TTGTATGAATAGAAACAGTTGTTTTAT-AGCAGAGCAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
320 TTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * *
52791 TTGCTT-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTACA--TC--
383 TTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * *
52850 ACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAATATTACTTTATTCCAAATGAA-CTTATATGAAC
445 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAAAT-AAGCTTATATGAAC
* * *
52914 --AAAGGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAATG-CCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAA
508 TGAAA--CAATTGTTTTATGAC-AAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * *
52976 ATAGTCAAAATTATTTGAA-TTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
569 ATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAA
** * * * * **
53040 TTTTTTGAAATATTTATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATAAGCCAGTATGAATTCAAACAA-
632 -TTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAA--CAAA-AAT
** * * * * **
53104 ACCTATTTTATGACAAAAC-AAAAGAT-GTAACAATTTCAAATAGATAACTGTTCATATAGTTTT
693 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
** * * * *
53167 AA-ATATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAATTCTTTTAGTTATTAATTTTTGAA
757 AACA-ATTTGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AA
* ** * * * *
53231 ATATTATTAGGTTAGTGTTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATAAACAAAAATAATTGTTTTACG
820 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACG
* * *
53296 ACAGAATAAAAGG
885 ACAAAACAAAAGA
* * ** * * * *
53309 TTATAACAATTTGAAGTTTACAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAACA
1 TTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAATT-GTTTAGTAAATA
* * *
53374 GATTTATTTTTTAAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGCAAGATTAATAAACTAGTATTATTTTA
65 GATTTATTTTTT-AAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * * * * * *
53438 TTCAAAAAAAGCTTTAATG-TTCA-AATACAATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAACGAT
129 TTTTAAATAAGCTTTTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * ** * * *
53501 TTAAAATAGATAATTGTTGACATAGCCATAATTATTTAAACTAATTCAGTAAACAAATTCACTTT
192 CTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTT
* * * * *
53566 TTAAATCACTTACTTATTAAATTTCAGAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTG-AATAAG
257 TTAAAT--TTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAG
* * *
53630 CTTGTATGAACTAAAA-AGATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGACA
319 CTTGTATGAAC-AAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * *
53694 ATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAAC-TACTTCAGTAAAAAGATTTATTTTTTATATCTTTT
382 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * *
53758 AGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATACGAACT
445 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAACT
* * * * * ** *
53823 GAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-G
509 GAAACAATTGTTTTATGACA-AACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
53887 --A-GA--A-TTG-----GTTCGGTAAACA-AATT-TTCTTAAAATCTCCTACTTATAAATGTTT
573 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAAT-TTT
* * * * * * *
53939 -GAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCATGCATGAACTAAAAA-ATTTAT
636 CAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAATAATTAT
** * * * * * * **
54001 TTTATGATTAAACAAAAGGTCAGAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAATTATT
699 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
* ** * * * * * *
54066 TGAAATGGTTTGTCAAACACATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTGATTTTTAGAATATT-AT
764 TGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAAT
* ** * ** * * * * ** *
54130 CAATTTACCAATATTTTACTT-TGAATAAGCTTGTATGAACAAAAGTAATTGTTTTATGACAAAA
828 -AAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAA
* *
54194 -TAACGA
891 CAAAAGA
* * * * * * * * *
54200 TCATAACAATTT-AAACT-GGT--TTGA-T-AAACA--AATTTAGTTTTTAAATCT-CTTA-TTA
1 TTATAACTATTTGAAA-TAGATAATT-ATTCAAACAGTCA-TAACTATTTAAAT-TGTTTAGTAA
* * * ** * * * * * *
54255 AT--TTTTGAAATATTTAAA---AATTA-GTATT-A-TTTT--ACT-CTAAGTAATTTTGTATGA
62 ATAGATTT--ATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-TAAATTAGTATTA
** * * * * * * * *
54309 ----A-TAGAAACAATTG-TTTTA-CAACA-AAACAAAATG--TCATAACAATTTAA-AATAGAT
124 TTTTATTTTAAATAA--GCTTTTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAA---AACAAAAGGT
* * * * * * ** *
54363 GAT-A-G-T-TCAAAT--ATACA-TG----ACTA-T-TTGAACTATTT---C--GGTAAACAAAT
183 CATAACGATCTGAAATAGATA-ATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTAAACTTGTTCAGTAAAC
* * ** * * * *
54410 TTATTTTTTTCAATCTCCAACTTATTAATT-TT-T-----AGAATATTAATAAATTAGTATTATT
246 ATA-TTTATT---T-TTTAAATT-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
** ** * *
54468 TTATTATG-AATAAAATTGTATGAGTAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACATAAGATCATAATG
305 TTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * **
54532 CTTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA---ATT-CT-CTCAG--TTATT
368 ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGTAAACAGATTTATT
* * * * * * *
54588 TTTTCAATCTTTTATTTATTAATTATTGGAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAA
432 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAA
* *
54653 GC-TATTATGAACAT-AAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
496 GCTTA-TATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * *
54716 TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCT
558 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTT
* ** * * * * * **
54781 TACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTT-TTTTCGAATAATCTAATATGAA
622 TACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAA
*** * * * * *
54845 TTGAAA-AATTGTTTGATGACAAAAC-AAAA---AT---GATTTGAAATAGATAATAGTTCATAT
686 CAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
54902 AGTCTTAACTAGTGGAA-TTAATTAGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAAT
751 AGTCATAACAATTTGAACTT-ATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * *
54966 GTCAAA-A-T-AT---TT--TATTA---TATT---AGT--A--T-G---AATAAAAACAATTATT
815 TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTT
* * * *
55009 TTATGATAGAACAAAAGG
880 TTACGACAAAACAAAAGA
* * * * * * * * * * * *
55027 TTATAACAATTTGAAGTATACAATTATTTAAATAGTCATAATTGTTTAAACTGGTTCAATAAACA
1 TTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAA-TTGTTTAGTAAATA
* * * ** * *
55092 GATTTATTTTTTAAATCTC-ATGCTAATTAAAATTTGAAAGATTAATAAATCAGTATTATTTTAT
65 GATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * * * * * *
55156 TCCAAATAAACTTGTATGATAAAAAAATAATTGTTATATGAC-AAACAAAACGTAATAACGATTT
130 TTTAAATAAGCTTTTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATCT
* * * * * ** ** *** * *
55220 GAAATAGATAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAATGGATTCACTTTTT
194 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTT
* **
55285 AAA--TTAGTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTG
259 AAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTG
* * * *
55346 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGT
323 TATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * * * *
55411 TCATATTGTCTTATCTATTT-AAATTGCTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTA
387 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT--ATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * *
55475 TTAATTTTTGGAATATTATTAAAATAGTATTATTTTATT-ATGAATAAACTTATACGAAGTAAAA
450 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA--AATAAGCTTATATGAACTGAAA
* * * * * * *
55539 TAATTATTTTAT-ATTAAAATAAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC--A-A---
513 CAATTGTTTTATGA--CAAA-CAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * **
55597 AT-A--A---GAACTAGTCTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCATATTTATTTTTGA
575 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTCAA
* * * * * * *
55656 AATATTAATAAACTATTATTATTTTTTTC-GAATAGGCTTGTATGATGA-AAAAAAAATTGTTTT
639 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA--ACAAAAATAATTATTTT
* ** ** * * * * **
55719 ATGATAAAAC-AAAAGTTTGTAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTG
702 ATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTG
* * ** ** * * * *
55783 AA-TCGATTCGATAAAGTG-TCTTATTTTAAAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAAT
766 AACT-TATTCGACAAACAGAT-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT-TAATTTTTAAATATTAAT
* * * ** ** * ** * * *
55846 AAAGTAATATTGTTTTATTTTGAAA-AAACTTTTATGAATTGAAACTATTATTTTATGACAAAAC
828 AAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAAC
*
55910 AAAAGG
892 AAAAGA
* * * * * * * * **
55916 TCTAT--TTATTTTAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAAT
1 T-TATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAAT
* * *
55979 AGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGT--GTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATT
64 AGATTTATTTTTT-AAATCTCTT-TACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * **** * * *
56041 TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAGTA-AAAAAAAAAATTTATGACTAAACAAAAGGTTATAATG
126 TTATTTTAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * *
56105 ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAGCAAACACATTTAT
190 ATCTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCAGTAAACATATTTAT
* * * * * * * *
56169 TTGTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTT-TAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCTG-AAT
254 TTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAAT
* *
56232 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAACTAG-
316 AAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * ** ** * **
56295 T--TTGAT-AAACA--AATTTAGT-TTTTAAATCTCTTA-T-AA-ATTTTTGAAATATTAAA-AA
380 TAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACT-TATTAGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCT
* ** * * * * * * ** ** * *
56350 ATTA-GAATT-A-TTTT--ATTCTTAATAATTTTGTATGAATAAAAAC-AAT-TG-TTTTATG-A
442 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTATATGAA
* **
56406 C---AA-AA-----------C--A-AAATG-TCATAATGATTTGAAATAGAT-GGTAGTTCAAAT
507 CTGAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT
** * * * * * *
56451 ACACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAAATATATTTTTTAAATCTCATAGTTATTAATTT
571 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTT
* * * * ** ** * * * *
56516 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGCCGAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTT
635 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATT
*** * *
56581 TTATGACAAAAC-AAAAGATCATAATGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
700 TTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
* * * * **
56645 TAAACTTGCTTTG-TAAGTAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA-ATTTA
764 TGAACTT-ATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATA-TTA
** ** * * * *
56708 ATAAATTAGTA-TATTTTATGTAGAAA-AAACTTTTATGAATAGAAACAATTGATTTATGA-AAA
826 ATAAATTAGTATTATTTTAT-TCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAA
* *
56770 AGAAAAAGG
890 A-CAAAAGA
* * * *
56779 TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACA-TGTTTAGAAAA
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AA-ATTGTTTAGTAAA
* * ** * * *
56842 CATATTCGTTTTATAAAT-T-TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTA-TATTATTT
63 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTT
** ** * * * * * *
56904 TATTCAAAATAAGCTTACATGAACA-AAGCTAATTGTTTTATCACAAAACAAAAGGTTATAATGT
127 TATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * * * *
56968 TTTGAAATGGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAATAGATTTATTT
191 TCTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTT
* * ** *
57033 TTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTTG-AATAA
256 TTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAA
** * * * * * * *
57097 AATTATATAAACTAAAACAATTGTTTTATTG-CAAAACAAAAAGTTACAGTGATTTAAAATAGAT
318 GCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * *
57161 AATTATTCGAGTAGTTATGATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTT
381 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * * *
57226 ACTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAGTCCAAATAAGCTTGTAT-AAT
445 ACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAAC
* * ** * * * *
57289 TAGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACAATTTAAAATAAAAAATTGTTCAAA
508 T-GAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* ** ** *
57353 TAGTCCTAAAGATTTGAACTTGTTCAGTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
570 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATT
* ** ** * * * *
57418 GTCTTAATATTAATAAATTTGTATTA-TTTA-TCTGAAATAAGCTTGCATAAATAGAAAA-AATC
634 TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACA-AAAATAATT
* * * * * * * **
57480 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTGAAATAGTTATAATTA
697 ATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAA
* * * * * * * * *
57545 TTTAAACTTGTTC-AGTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATT
762 TTTGAACTTATTCGA-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATT
* *** ** ** * * ** * * *
57609 AATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAATTTTATATGAGTTGAAATAATT-TTTTATGATAAA
825 AATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAA
57673 ACAAAATG-
890 ACAAAA-GA
* * * * * *
57681 TCATAA-TAATTTGAAATAGATATTTATTCAAACAGTCATGACTATTT-GATCTAGCTTGGTAAA
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAAT-T-GTTTAGTAAA
* * * * *
57744 CATATTTATTTTTTTAAT-TTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
63 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * ** * * * * * * * * *
57808 AATCTGAATGGGCTTGTATGAACAGAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAGTTCATAACAATT
128 ATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
* * ** * * * * *
57873 TGAAATAAATAATTCTTTGAATAGTTATAACTAATTGAA-TTGGTT-TGATAAACATATTTACCT
193 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTCAG-TAAACATATTTA-TT
* * * * *
57936 TTTTAAA-TCT-CTTACTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTATTTTG-AATAA
255 TTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTA-TTTGAAATAA
* ** * * * ** * * *
57998 ACTCATAAGAACAAAAACATTTATTTTACAATAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATA
318 GCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * ** * *
58063 ATTATTCAAACAGTCATAATTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA
382 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
58128 CGTAGTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTGAATAAGC-AAGTATGAAT
446 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTA-TATGAAC
* * * * *
58191 TGAAAAAATTGTTTTATGGC-AA-AATA-A--A-AATGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAG
508 TGAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
58250 TCTTAATTATTTGAACTAGCTTGGT-AACAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATTT
573 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATT-AATTT
** * * * * * * *
58314 T-GGAATATTATTATATTAATA-TATTTTATT-TCGAATAGGCTTATATGAACATAAATAATTGT
635 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTAT
** * ** * * ** * *
58376 TTTATGACAAAACAAAGGGTTATAATGATTTGAAGTATACGATTATTCAAATAGTCATAACTATT
699 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
* * * ** * * * *
58441 TAAACTAATTTGTTAAACAAATTTATTTTATAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAAT
764 TGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAAT
* *
58506 AAATTAGTATTA-TTTATTCCAAATAAACTT-G-TACAATCAAAAA-AATTGTTATATGATC-AA
828 AAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATA-AAT-AAAAACAATTGTTTTACGA-CAAA
* *
58566 ATAAAAGG
890 ACAAAAGA
* * * * * * * * * * *
58574 TAATAACAATTTGAAATATATAATTGTTGAAA-TGTTCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAGAT
1 TTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAG-TCATAACTATTTAAATTG-TTTAGTAAAT
* * * *
58638 AGATTCACTTTTTAAATCAC-TTAATTATTAATTTTT-AGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTT
64 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* ** * * * * *
58700 ATTTTGAATAAAATTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAATT
128 ATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
** * * * * *
58765 TTCAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTT-TGCTAAAAAAATTTATTTT
193 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAG-TAAACATATTTA-TTT
* * ** * * * *
58829 TTTGAACTCTTGTTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTG-GATTAG
256 TTT-AAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAG
* *
58893 CTTTTATGAA-ATGAAACAATTG-----T----AAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-ATT
319 CTTGTATGAACA--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-T
* * **
58947 GATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-A---ATT--T-----G-TTTA----GTAAA--T-GGA
381 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
58993 --T-TTATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTTTAAATAAGCATGTAAGATA-
446 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGA-AC
* * * * * * *
59052 TGAAACAAATATTTTATAACTAAACAAAAGATTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA
508 TGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** ** * * * * *
59117 GTTTTAACTATTT-AAAATGGTTGGACAAATAAATTTCTTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTT
572 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTT
*** * * * * * * * *
59178 TGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATGATCAGAAATAATTGTT
636 CAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATT
* * * * * * *
59242 TTACGATAAAACAAAGA-T-ATTAACGATTTGAGACTA-ATAATTGTTCTAATAGTCATAACTAT
700 TTATGACAAAACAAAAAGTCA-TAACAATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAAT
* * * *
59304 TTGAACTAGATT-GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
763 TTGAACT-TATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTA
* * * * ** * * *
59368 AAAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-GTTCAAAAATAATTATTTTATGACAAA
826 ATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAAT-AAAAACAATTGTTTTACGACAAA
*
59432 ACAAAAGG
890 ACAAAAGA
* * * ** * * * *
59440 TCT-TAA-TGATTTGAAATGGATAATCATTTAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCAGTAAA
1 T-TATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAATTG-TTTAGTAAA
* * *
59503 CATATTTATTTTTTAAA----TTT-CTTATTAA-TTTAGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
63 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** ** * * * * * * * *
59562 TATTGCATCTAAG-TTTGTATTAACT-TAAATAATTTTTTTATAACAAATCAAAAAGTTATAACG
127 TATTTTAAATAAGCTTT-TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * *
59625 A-CT----T---TAA---AT--AA-A--C--AATTGTTTAAA--TG----GTAAACAGATTTATT
190 ATCTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTA-T
* * ** * * *
59666 TTTTTAAAGCTCTTT--TCATTAATTCTCCAAATGTTAATAAATTATTATTAATTTATTCT-AAA
254 TTTTTAAA--T-TTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAA
** * * * * * * *
59728 TAAGCTTGTATGAACTGGAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGATCAGAATGATTTCAAATAA
315 TAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * *
59793 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAA-TTGATTCGCTAAACAAACTTATATTTTAAA--T
379 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* ** * * * *
59855 C-T-CTTATTAACTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCATAAAAAGCTTGTATGA
442 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA-AATAAGCTTATATGA
* ** * ** * ** *
59918 AC-AAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGATCATAACAATTTAAAATAGATAATCGTTCATA
506 ACTGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * ** * * **
59982 TAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGT
570 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAA-T
** ** * * ** * * ** *
60047 TTT-GGAATATTGTTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAACAGAACCAATTG
633 TTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTA
* * * * * *** * * **
60111 TTTGATGACAATATAAAAGGTTATATTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAAGTAT
698 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAAT
* ** * ** * * *
60176 TTGAAATGGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAA
763 TTGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAA
*
60241 TAAATTAGCATTATTTTACTTCGAACAAACTTATCTTAACAAAAACAATTTTGTTTTTAGTATTA
827 TAAATTAGTATTATTTTA-TTC---C-AA---A---T-----AAAC----TTG------G-A-TA
* ** ** * * *
60306 TTTTACTTTTTAGTATTATTTTGTTTTATGGCAAAACAAAA-A
864 ----A----ATAAAAACA-ATTGTTTTACGACAAAACAAAAGA
* * * * * * * ** *
60348 GTAATAA-TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTTATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAA
1 -TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAA
* * * * * **
60412 TAGAATTATTTTCTAAATCTC-TTACTTATAAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTTTTATCCT
63 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* *** * * * * * * * *
60476 ACTCCGAACATGCTTGTATGAGCT-GAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAGGGTCATAGA-TA
128 ATTTTAAATAAGCTTTTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ACGA
* * * * * * ** *
60539 TTTGAAATAAATAATTGTTCATATAATCTTAACTGTTTGAATGAAATG-TC-CT-AAC--A---A
191 TCTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AA--ACTTGTTCAGTAAACATATTTA
* * *
60596 ---TTTGAA----A--TA--AA----T-AAATGTTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTG-AATA
253 TTTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATA
* * * * *
60644 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGAT
317 AGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * *
60709 AATTATTCTAATAGTCTTAAC-ATTTGAACTTGTTCAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC--
381 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** *
60771 -C-TATT-A---TTG------T--TAAATTAGTATTATTTT-TATCGAAATAAGCTTGGATGATC
445 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TC-AAATAAGCTTATATGAAC
* * * * * * * *
60821 AT-AAACAATTATTTTATGAGAAA-ACAAAGATTAGAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAAT
508 -TGAAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * ** * * *
60884 AGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAACTT
571 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAA-TT
* * * * * * *
60949 TT-GAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGTTTTTAGGAACTAAAAAAAATT
634 TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAATAATT
* * * * * * * *
61012 GTTTTATGAGAAAAC-AAAAGCTTATAACAACTTAAAATTGTTAGAATGATTGTTCAAAAAGTTA
697 ATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAA----TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCA
** * * * * * ** * *
61076 -AATCTTTTTGAAATTTTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCGTGCTCATTAATTTTTC
756 TAA-CAATTTGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTT-
* *** * * * *
61140 AACTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATTAAAATAATTGTTTTA
818 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTA
* *
61205 TGACTAAATA-AAAAGG
883 CGAC-AAA-ACAAAAGA
* * * * * * * * * * * *
61221 TCA-AAATGATTTGAAATAGACAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAAC
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAAT
* * * * * *
61285 ACATTTATTTTTTAAATTTC-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTACTAAATTAGTAATGTTTTA
64 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * * * * * *
61349 ATCCAAATAAG-TTTGTATGAAAAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAATGTTT
129 TTTTAAATAAGCTTT-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
* * * * * * * * * *
61412 TGAGATAGACAATTGTTCAAATTGTTATAATTATTTGAAC-TGTCTCGGAAAACAAATTTAGTTT
193 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT-TCAGTAAACATATTTATTTT
* * * * * **
61476 TTAAA-TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTAATCTG-AATAATTT
257 TTAAATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCT
* * * * * ** *
61538 TGCATGAATAGAAACAATTATTTTAGGATAAAACAAAAAATCATAATGATTTAAAATAGATAATA
321 TGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-
* * * * * * * * **
61603 T-TTCAAATGGGCATGACTACTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACT
384 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
** *
61667 TATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAA-TAG
448 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAACT-G
* * * ** *
61730 AAACAATTGTTTTAGGACAAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTTAAATAGT
510 AAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* ** * *
61795 CATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA
574 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTCA
* * * * * * *
61860 GAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTTTTATGAACAGAAACAATTAGTT
638 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGC-TTGTATGAACAAAAATAATTATTT
* ** * * * *
61924 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TCGAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATATCTATTT
701 TATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTT
* * * * * *
61988 GAA-TGAGTTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATA
765 GAACTTA-TTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATA
*** * * * * * * *
62051 AATTTA-TATTATTTTATTTGTAATAAGCTTGCATGAATATAACCAATTGTTTTATGACAAACCA
829 AA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACA
62115 AAATG-
893 AAA-GA
* * ** * * * ** **
62120 TCATAA-TGTTTTGAAATAGATAACTGCTT-AGATAGTCATAATTATTTGAACA-CATTCGGTAA
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AA-ATTGTTTAGTAA
* * * * * *
62182 ACA-ATTTCATTTTTTAATTCTC-TTACTCATTCATTTTT-AGAATATTAAAAAATTAATATTAT
62 ATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
62244 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATG
125 TTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * *
62309 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATT
190 ATCTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATT
* * * **
62374 TTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATA
255 TTTTAAA--TTTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATA
* * * * * * * *
62438 AGGTTGTATGGATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTAAAATA-AT
317 AGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-
* ** * * *
62502 TAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAC---TT-GT------ATTTAGTTTTGAAATCTTTT
380 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
62557 ACGTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAC
445 ACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAA
* ** * * * *** * *
62620 CAAGAAA-AATCATTTTATGACAAAAAAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT
507 C-TGAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * *
62684 AGTCATAATTATTTAAACTTGTATGGTAAACATATTCAATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATT
571 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT-TATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATT
*** ** * * * ** * ** * *
62749 TTTGGAATATTAATAGCTTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTAG-ATTAACTGAAATATTTT
634 TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTT-GTATGAACAAAAATAATTA
* * ** * * * * * *
62813 TTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAATCTTAACTAT
698 TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAAT
* * * * *
62878 TTG-A-TTGGTTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTAGAATATTT
763 TTGAACTT-ATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATATTA
* ** * * ** ** * ** *
62937 TTAGTTTAGCAATATTTTACTT-CAAATAAGTTTATATGAATAGAAAA-TTTTGTTTTATGACAA
826 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAACTTGGATAAATA-AAAACAATTGTTTTACGACAA
*
63000 AATAAAA-A
889 AACAAAAGA
* * * * * * *
63008 TCAT-ACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAAT-ATAACTATTTGAACTAGTCT-GATAA
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-CAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAG-TAA
* * * ** *
63070 ACAGATTTAGTTTTTGAA--TC--T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTATTT
62 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * ** *
63130 TATTTTGAATAA-TTTTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTATGACAAGACAAAATATCATAATGA
127 TATTTTAAATAAGCTTT-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * ** * * * * *
63194 TTTGCAATAGATAATAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTT
191 TCTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTT
** * * * *
63259 TTTAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAGATTAATAAATTAGTACTATCTTATTTCG-AATAA
256 TTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAA
* * * * ** * *
63323 ACTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT-ATAACAATTTCAAATAAATA
318 GCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * *
63387 A---TT---AT--T--TAA--ACTCG--C---TTAGTAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTAC
382 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * * * **
63435 TTATTAATTTTTGAAGTTTTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCCAATAAGACTT-TACGGACAA
447 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAG-CTTATATGAACTG
* * * * *
63499 AAATAATTAG-TTTATGACAAA-AAAAGGGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATA
510 AAACAATT-GTTTTATGACAAACAAAA--GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * *
63562 GTTATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATGTTTACTTATTAATCTT
572 GTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAAT-TT
** * ** * * * * *
63626 T-GGAATATTAGTAAATTTGTATTATTTTATTCGAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTT
635 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATT
* ** *
63690 TTATAACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
700 TTATGACAAAACAAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
* * * * * * * * *
63755 TGAATTTGTT-TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATTAA
764 TGAACTTATTCGA-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAA
* * * ** * * * * *
63819 TAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTAATACTATT-TTTTATGACAAAAC
827 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAAC
63883 AAAAGA
892 AAAAGA
* * * ** * * * * * * *
63889 TTATAACAATCTAAAATAGATAATTATTCAAGTAGTTATTATTATTTGAACTTGTTCAATAAACA
1 TTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAATA
* * * * * *
63954 TACTTA-TTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAA
65 GATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * *
64017 TTCGAATAAGTTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA----AT-A-G-T-TG
130 TTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATCTG
* * * * **
64074 ---T---T--TTATT--AATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTTGAAATAAG
195 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTT---AT-TT
* * * ** ** ** ** * * * ***
64129 CTCATATGAATA-GAAAGAATTTTT-TTATGATAAAGCAAA--AG-GTTATAGCAATTTGAAAT-
256 TTTAAAT-TTTACTTATTAATTTTTAAAAT-ATTAA-TAAATTAGTATTAT-TTTATTTGAAATA
* * * * ** * **** * * * * *
64188 AG-ATG-ATTATTCAAATAGCTATAACTATT-TGAACTTGTTCAATAGAT-ATATTCATTTTTTA
317 AGCTTGTATGA-ACAAA-A-CAAT-TGTTTTATG-AC-AAAACAAAAGGTCATAATGA--TTTGA
*** * ** * * * * ** *
64249 AATCTTTACTTGTT--AATTTTTAGAA-T-GTT-AA-TAAATTAG--AA-TTATGTTATTTTGAA
374 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTAGTAAACAGAT-TTATTTT--T
* ** ** ** * ** *
64305 TAAGAT-TGTATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAA-AACAA-AAGGTTA-TAACAATTTGAA
435 TAA-ATCTCT-T--AC-TTATTAA---TTTT-TGA-AATATTAATAA-ATTAGT-ATTATTT-TA
* * ** * * * *
64366 AT-AAATAA--TTACTCA--AACAGTCATAAATGTTTGCACTAGTCATAAAGGCTAACAA-ATAC
487 TTCAAATAAGCTTA-T-ATGAACTGAAACAATTGTTT----TA-TGACAAA--C-AA-AAGAT-C
** ** * * *
64425 ATTTTCTAAATCCTTT-ACTTA-TTAATT-TT-AAATTAG-CATTACTTTATTCTGAATAAGATT
540 A-----T-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAAC--TATT-TG---AA-CTT
* * * **** ** * * *
64485 GTATGAATAGAAACA-ATTGT-TTTATGATAAAAAAAATGGTCA-TAACATTT-GAAATA--AAT
591 GTTTG-GT--AAACAGATT-TATTT-T--TTAAATCTTTACTTATTAA-TTTTCAAAATATTAAT
* ** * *
64544 AATTGTTCAAATAGTTATAACTAATC-AAACT-AGCTTGGTA--AAC--ACAT--TTATCTTT-T
648 AA--ATT--AATA-TTAT-TTTATTCTAAA-TAAGCTT-GTATGAACAAAAATAATTAT-TTTAT
* * ** * * * * ***
64600 ---AAATC------TCTTATTAATTTTCAAGATA-TTAATAAGTT--AATA-TTAT-TTTATTCT
704 GACAAAACAAAAAGTCATAACAA-TTTGAA-ATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACAATT-T
* * * * *** ** * **
64651 GAACAAATTTATAT-GAACAAAAACATTTGTTTTATAATAAAAC-AAAAGGTAATAACAATTTAA
765 GAAC----TTAT-TCG-ACAAACAGATTTATTTT-T--TAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAA
* * * * * * * **
64714 A-A-TAGATAACTGTTCAAATATTCATAATTATT-TAAACT--AGTTCAGCT-AAT-AAAATTAT
820 ATATTA-ATAA--ATT--AGTATT-AT-TTTATTCCAAA-TAAACTT-GGATAAATAAAAACAAT
* ** * * *
64772 T-TTTTAAATC-TCTTACCTATTAA-T
876 TGTTTT--A-CGACAAAAC-A-AAAGA
* * * * * ***
64796 TTTTGAAATATTAAT-AAATTCA-ATTTATTTTATTCCAAATAAGTTAGTAAGAGCTGAAAAAAA
1 TTAT-AACTATT--TGAAA-T-AGA--TA-ATTATT-CAAA-CAGTCA-T-A-A-CT-ATTTAAA
* * * * * * * * *
64859 TTATTTTGCAATAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCATAAAGCCTTAAC
51 TT-GTTT--AGT-AAAT-AGAT-T--T-A-TTTTTTAAAT--CT-CTT-TAC-T-TA---TTAA-
* * *** ** * ** * *
64924 TATTTGAAATGGTTTGGCAAACAAAT-TTA-TTT-TTTTAAAT-CTCTTAGTTATTAATTGTCAA
96 TTTTTGAAAT--ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTT--TTATGAA---T-AG
* * * * *** ** **
64985 AATACTATTAGGTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGT-ATGAACAGAAAT-AATTATTTT
153 AA-AC-A--A--TT-GT-TT-TATGA--CAAAACAA-AAGGTCAT-AAC-GATCTGAA--A-TAG
* * ** * * * *
65048 ATGATAGAACAAA-AGGTTATAACAATTTGAAA-TATGTAAT-TGTTCAA-ATAGTTATAATTAT
201 ATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTT-AAACT-TGT--TCAG-TAAACATA-TT-T-ATT-T
* * * * * *
65109 TTGAACTGGTTCGATAAATAAAATT-ATTTTTTAAATCACTTACATATAAAATTTTGAAATATTA
256 TTTAAAT--TT---T-ACT--TATTAATTTTTAAAAT-A-TT--A-AT-AAA--TT--AGTATT-
* * * * * * * * *
65173 ATAAATTAGTTTTATTTTATTATGAATAAACTTGGATGAGC-TAA-AATAAGTGTTT-T-ATAAC
302 AT--TTTA-TTTGAA----------ATAAGCTTGTATGAACAAAACAAT-TGT-TTTATGACAA-
* * * ** * * * * * * *
65234 AAAACAAAAG--GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTTATATAATCTTAACTATTTGAACT
351 AACA-AAAGGTCAT-A-ATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * * * ** * * *
65297 GGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTTGTTATGAATTTTT-AGAATATTATTAATTT
412 TATTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATT
** ** * *
65361 AGTATTATTTTATTTCAAATAAATTTATATGAACAAAAATAATTATTTTATGTTA-AAACAAAAG
475 AGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATG--ACAAACAAAAG
* ** * * * *
65425 -GCTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAA
537 ATC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA
* * * ** * * * *
65489 CAAATTTGTTTTTTGAATC--T-CGAACTAATTCTT-AAAATATTAATAAATTAGTGTTGTTTTA
601 CAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATT-TTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * * * *
65550 TT-TCAAATAAACTTGTAT-ATTA-AAAAATAATTGTTTTATAACAAAACGAAAGGT-ACTAACA
665 TTCT-AAATAAGCTTGTATGA--ACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCA-TAACA
* ** * * ** *
65611 ATTTTACTTGAAATAGGCTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTC-TAACAAAATGAAAGGTAATA
726 A---T--TTGAAATA-GATAAT-TGTT----CA-AATAG---TCATAACAATTTG-AA-CT--TA
* * * * * * * * *
65675 AT-GATTTGAAATAGA-TAATTGTTTAAATGATCGTAATTATTTGAACTGATTTATTAAATTGAT
772 TTCGA---CAAACAGATTTATT-TTTTAA--ATC-T-TTTACTT--ATTAATTT-TTAAA-T-A-
* ** * * ***
65738 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TT-CAAA-ATA-TT-AATAAAGTACTATTATTTTA
823 TTA----ATAAAT-TAGTA-TTATT--TTATTCCAAATAAACTTGGATAAA-TA--A--A-AACA
* ** * **
65798 TTTTGGATAAACTTTTGTGAAATGAAACAATTG-
874 -ATT-G------TTTTACGACA--AAACAAAAGA
* * * * *
65831 TTTTAGGACAAAATAAAAATTCATAATGAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
1 TTATA--AC----T---ATTTGA-AAT-AGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTG
* * * * *
65896 TTTGGTAAAAAAATTTATTTTTTCAAATCTC-TTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATT
54 TTTAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * *
65959 AGCATTATTTTCTTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAA
117 AGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAA
* * * * ** * * *
66023 AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAATCTTAACTATTTGAAC-TGATTC-GTAA
180 GGTCATAACGATCTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCAGTAA
* * *
66086 ATATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATGATTAAATTAGTATTATTTT
244 ACATATTTATTTTTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * * *
66151 -TATCCAAATCAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGATCATAATAAT
307 AT-TTGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
* * * * * *
66214 TTGAGATTA-ATATTTGTTCAAATAGTCCTAACTATTAGAAC-TACTTCAGAAAACA-ATTTTAG
370 TTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TT-AGTAAACAGA-TTTAT
* *
66276 TTTTTAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATA
431 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATA
* * * * * * ** *
66341 AGTTTTTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAAAAATTTTAAATAGAT
495 AGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * ** * *
66406 AATTATTCAAATAGTCATATCTATTTTAAATTATTCAGTAAACATATTTCTTTTTTTAAATCTCT
559 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCT-T
*** * * * * *
66471 TACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT
622 TACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * * * ** * * * *
66536 AGAAATAATTGTTATATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATGGATAACTATTCTAATA
687 AAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * *
66601 ATC-TGAACTATTTAAAC-TACTTCGACAAACATCTTTATTTTTTAAATCTATTACTTATAAATT
752 GTCAT-AACAATTTGAACTTA-TTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * * * * *
66664 TTTGGAATATTATTAAATTAGTATCATTTCAATT-CAAATAAGCTTGTATGAAA-AGAAACAATT
815 TTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTCCAAATAAACTTGGAT-AAATAAAAACAATT
* * *
66727 GTTGTATGACAAAA-TAAAGA
877 GTTTTACGACAAAACAAAAGA
* ** * * * * * ** *
66747 TCAT-TTTGATTTTAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAAC
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAAT
* **
66811 AGATTTAGTTTTTAAA--TC--T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
64 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
66871 TTTTGAATAA--TTCTATATGAATAGAAAAAAGTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCTTAAAGAT
129 TTTTAAATAAGCTT-T-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * ** * * *
66934 TTG-AATGGATAATTGTTCAAATA-ACATGACTATTTGGACTTGTT-TGATAAACAAATCTATTT
192 CTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTT
* * * * *
66996 TTTAAATCTCATACCTATTAATTTGTAGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCT-AAATAA
256 TTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAA
* * * *
67060 ACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAAT
318 GCTTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGAT
* * * *
67124 -ATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT-AAGCTTACTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTT
381 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTA-TTAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTC
* ** * *
67187 TTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGG
443 TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGA
* * * * * *
67251 ACAGAAATAATTAG-TTTATCACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGCAATAGATAATTGTTCA
506 ACTGAAACAATT-GTTTTATGAC-AAACAAAAGATCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * ** * * * *
67314 AATACTCAGAACTATGCGAA-TGTGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAA
568 AATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATT-A
** * ** * *
67378 ATTTT-GGAATATTAATAAATTTA-ATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAAT
631 ATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAAT
* * * *
67441 TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-AAATTAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
696 TATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * * * * * *
67505 TATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTCATGTTTTGAATCTTTTAATCATTAATTTTTAGAATAT
760 AATTTGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTA-AATAT
* * * ** * * *
67570 TAATAAATTAGTGA-TGTTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GATACAATTGTTTT-CTGA
824 TAATAAATTAGT-ATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGAT-AAATAAAAACAATTGTTTTAC-GA
* * *
67632 TAAAACAATAGG
886 CAAAACAAAAGA
* * * * * * * *
67644 TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC
1 TTATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAAT
* * * * * * * *
67708 ATATTCA-GTTTAAAATCT-TTTACTTATTGATGTTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTA
64 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT
* * * * * * * * * * * * * * *
67770 AATCTGAATAGGCTTATAGGAAGAAAAACAATCGTGTCATGACAAAATAAAAAGTCATAACTATT
128 ATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
* * * * * *
67835 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC-GATAAACAGATATATCTT
193 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTT
* * *
67899 TTAAATCTTTTACTTATTAGTTGTTT-GAATATTAATAAATTTAG-ATAATTTTATTTGAAATAA
257 TTAAA--TTTTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAA
* * * * *
67962 GCTTGTATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTTATAGTGATTCGAAATAGA
318 GCTTGTATGAACA-AAACA-ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * ** * * *
68026 TAATTGTTCAAATAGTCTTAATTATTTGTATTTTTTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCT
380 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AACTTATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * * *
68091 TACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAATAGAATTATGTTATTTCTAATGAGCTTGTACGAA-
444 TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAAC
* * * * * * ** *
68155 TAGAAATAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGCTCACAT
508 T-GAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * ** ** * * * *
68220 AGTCATAACTATTTGCACTAGTCAGGCCAATAGATTCATTTTTTAAATCCGTTACTTGTTAATTT
571 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTTTACTTATTAATTT
* * * * * * * *
68285 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATT-TCGAATAAGATTGTATGAATAGAAA-AA--AT
635 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTAT
* *** ** * * * **
68346 TGT-T-------CAATTGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCACAATTATT
699 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
* * * * * * *
68403 TGAAC-TAGTTAGGCAAACAAAATTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAA
764 TGAACTTA-TTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAA
* * * * * * *
68467 TAGATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAGTCAC-T-AAGAACTAAAAA-AATTATTTTACGACAA
827 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA---ACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAA
*
68529 AACAAAAGG
889 AACAAAAGA
* * * * * * * * ** * * *
68538 TCATAA-TAATTTGAAAT-GAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTAATTCAGCAAG
1 TTATAACT-ATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAGTAAA
* * * * * *
68601 TAAATTTATTTTTAAAATCTC-TTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTATTACATTAGTATTATTT
63 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * * * * * * * *
68664 TATTTCGAATAAAC-TTTGTGAACAAAAATAATTGTTTTATGAGATAATAAAATGTTATAACAAT
127 TATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * * *
68728 CTAAAATATATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GATAAATAGATTAACTT
192 CTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTT
* *
68792 TTTGAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGCA-AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AAT
256 TTTAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTA--ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAAT
** * * *
68855 -AGCCTTGTATGATGTAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAG
316 AAG-CTTGTATGA-ACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * * * * *
68919 ATGATTGTTCAACTGGCCATAATTATTTGAACTAATTTGATCAACTGACTTATTTTTTAAATATC
379 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * ** * * * * * *
68984 TAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGAAATATTATTTTATTTTAGATAAACTTTTATGTA
443 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * *
69049 CTAAAATAGTTGTTTTATGATAAAATAAAATG-TCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAA
507 CTGAAACAATTGTTTTATGA-CAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * *
69113 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTATTATTTTTTTAAAT-TTCTAAGTTATT
570 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGA-T-TTA-TTTTTTAAATCTT-T-ACTTATT
*** * * * * * * * *** *
69177 AATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGAACAAGCATGTATGAATTGAAACAA
630 AATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAA
* * * * * *
69242 TTATTTTTTGACTAAAC-AAAAGATCAAAACAATTTGGAATAGATAATTGTTCTAATAGTCCTAA
695 TTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * **
69306 CTATTTGAAC-TAGTTTAGA-AAACTCATTTA-TTTTTAAATC-----CTTATTAATTTTTGAAA
759 CAATTTGAACTTA--TTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * * *** ** * * * ** * *
69363 TAGTAATAAATTGGTGTTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAATGATTATTTTATGA
821 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGA
69428 CAAAACAAAATG-
886 CAAAACAAAA-GA
* * ** ** * * * * *
69440 TCATAACGATTTGAAATAGATAACAATTCAAATGGACAAAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAAC
1 TTATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTT-AAATTGTTTAG-TAAAT
* * *
69504 ATATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTT-AGAATAATAATAAATTAGTGTTATTTT
64 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * * * *
69567 ATTCCAAATAAACTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATT
128 ATTTTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATC
* * * * * * * * *
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193 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTT
* * *
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258 TAAAT-TT-TACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGC
* * **
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320 TTGTATGAACA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * ** * *
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384 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * ** *
69887 TATTAATTTTAGGAATTTTAATAAATTTA-TATGATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAACAG-
448 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTATATGAACTGA
* * * * * *
69950 AACTAATTATTATATGACCAAACAAATGGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAG
511 AAC-AATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
70014 TCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTTAATTCTCTTACTCATGAATTTT
573 TCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTT
** ** * ** *
70079 CAGTATATTAATAAATTAGA-ATTATTTTATT-TCAAATAAGCTAATATTAACTGAAACAATTAT
636 CAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTAT
* * * * * * * * * * *
70142 TTTATTACAAAAC---AGGTCACAATAATTTGAAATATATAACTATTTAAATAATCATGACTATT
699 TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
* ** * * *
70204 T-AACTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAAT
764 TGAACTTATTCGACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAAT
* * * * * * * *
70268 AAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATG-TGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
828 AAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTT-GGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAAC
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892 AAAA
70336 AGTCATAACA
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ATTTATTTTTTAAATCTCTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TTAAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATCTGA
AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAA
ATTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTAT
GAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTT
TTATGACAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
AACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA
TTAATATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAA
AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTATTCGACAAA
CAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
TCCAAATAAACTTGGATAAATAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGA
Found at i:54555 original size:182 final size:177
Alignment explanation
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54238 TTTTAAATCT
* **
54248 CTTATTAATTTTTGAAATATTTAA-AAATTAGTATTATTTTACTCTAAGTAATTTTGTATGAATA
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** ** * * *
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* * *
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*
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* *
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* **
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126 GTCATAACTATTTAACTATT-TCGGTAAACAAAATTATTTTTTCAATCTCCTA
* * * * * ** *
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1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT--AATAAAAT-TGTATGAATA
* *
54666 TAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
63 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * *
54731 TCATAATTATTTAAACTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATC-CCTTA
127 TCATAACTATTT-AACTATTTCGGTAAACAAAATTATTTTTTCAATCTCC-TA
* * * ** ** *
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1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT--AATAAAATTGTATGAATA
* * *
54847 GAAA-AATTGTTTGATGACAAAAC--AA---A-AATGATTTGAAATAGATAATAGTTCATATAGT
63 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * * * * * * *
54905 CTTAACTAGTGGAATTAATTAGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
128 CATAACTA-TTTAACTATTTCGGTAAACAAAATTATTTTTTCAATCTCCTA
*
54956 GTTATTAA
1 CTTATTAA
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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172 130 0.30
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAATAAAATTGTATGAATAGAA
ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
AACTATTTAACTATTTCGGTAAACAAAATTATTTTTTCAATCTCCTA
Found at i:55239 original size:16 final size:17
Alignment explanation
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55208 TAATAACGAT
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55252 TT
1 TT
55254 TGAACTAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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18 9 0.50
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Consensus pattern (17 bp):
TTGAAATAGCATAATTA
Found at i:55709 original size:527 final size:530
Alignment explanation
Indices: 55086--56130 Score: 1183
Period size: 532 Copynumber: 2.0 Consensus size: 530
55076 ACTGGTTCAA
55086 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCATGCTAATTAAAATTTGAAAGATTAATAAATCAGTATTAT
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*
55151 TTTATTCCAAATAAACTTGTATGATAAAAAAATAATTGTTATATGA-CAAACAAAACG-TAATAA
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* * *
55214 CGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAA-CTAATTTGGTAAA-TGGATT
129 CGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAATC-AATTCGATAAAGTGGATT
* * * * * * *
55277 CACTTTT-TAAA-T-T-AGTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTCGA
193 -A-TTTTAAAAACTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGA
* * *
55337 ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATA
256 AAAAACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTC-TAACGATTTGAAATA
* * * * * * *
55402 GATAA-TCGTTCATATTGTCTTATCTATTT-AAATTGCTTTGGCAAATAGATTTATTTTTT-AAA
320 AATAACT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATT-ATTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAAAA
* *
55464 TCTT-TTAGT-TATTAATTTTTGGAATATTATTAAAATAGTATTATTTTATTAT-GAATAAACTT
383 T-TTCTT-GTGTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTT
* ** * *
55526 ATACGAAGTAAAATAATTATTTTAT-ATTAAAATAAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAAT
445 ATACGAAGTAAAAAAAAAAATTTATGACT-AAA-AAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAAT
55590 TATTCAAATAAGAACTAGTCTAG
508 TATTCAAATAAGAACTAGTCTAG
* * ** * *
55613 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGC-ATATTTATTTTTGAAATATTAATAAA-CTATTATT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCATGCTA-ATTAAAATTTGAAAGATTAATAAATC-AGTATT
* * ** * **
55676 ATTTT-TTTCGAATAGGCTTGTATGATGAAAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTTGTA
64 ATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAT-AAAAAAAAATTGTTATATGATAAAACAAAAGTTAATA
* * * * **
55740 ATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAATCGATTCGATAAAGTGTCTT
128 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAATCAATTCGATAAAGTGGATT
* *
55805 ATTTTAAAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTGTTTTATTTTGAA
193 ATTTTAAAAA-CTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGAA
* * * * *** *
55870 AAAACTTTTATGAATTGAAACTATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCTATTTATTTTAAATAAA
257 AAAACTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCTAACGATTTGAAATAAA
* *
55935 TAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTC
322 TAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTATTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTC
* * * * * *
56000 TTGTGTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
387 TTGTGTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATACGAA
* * * *
56065 GTAAAAAAAAAAATTTATGACTAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
452 GTAAAAAAAAAAATTTATGACTAAAAAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
56130 A
517 A
56131 GTCTTAACTA
Statistics
Matches: 429, Mismatches: 69, Indels: 36
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
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530 1 0.00
531 117 0.27
532 138 0.32
533 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (530 bp):
TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCATGCTAATTAAAATTTGAAAGATTAATAAATCAGTATTAT
TTTATTCCAAATAAACTTGTATGATAAAAAAAAATTGTTATATGATAAAACAAAAGTTAATAACG
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAATTATTTGAATCAATTCGATAAAGTGGATTATT
TTAAAAACTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGAAAAAA
CTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCTAACGATTTGAAATAAATAAC
TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTATTCGGCAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGT
GTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATACGAAGTAA
AAAAAAAAATTTATGACTAAAAAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAGA
ACTAGTCTAG
Found at i:55818 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 55613--56290 Score: 481
Period size: 181 Copynumber: 3.8 Consensus size: 181
55603 ACTAGTCTAG
* * * *
55613 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTGCATATTTATTTTTGAAATATTAATAAACTATTATTAT
1 TAAATAGATTTATTTTTAAAATCTCTTGCATATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAATATTAT
* * *
55678 TTT-TTTCGAATAGGCTTGTATGATGAAAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTTGTAAT
66 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATGAAAAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAG-TTATAAT
* * *
55742 GATTTGAAATATATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TCGATTCGA
130 GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACT-GATTCGA
* ** * * * *
55794 TAAAGT-G-TCTTATTTTAAAAATCTCTAACTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATT
1 TAAA-TAGAT-TTATTTTTAAAATCTCTTGCATATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAATATT
* * * * * ** * * *
55857 GTTTTATTTTGAAAAAACTT-T-T-ATGAATTGAAACTATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCT
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATGAA--AAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGTTAT
* * * * * * * *
55919 ATTTATTTTAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGG
127 AATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGA
* ** * * *
55974 TAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGTGTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATT
1 TAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCTCTTGCATATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAACTAATATT
* * *
56038 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAGTAAAAAAAAA--AATTTATGACT-AAACAAAAGGTTA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATG-AAAAAAAAATTATTTTATGA-TAAAACAAAA-GTTA
* * * * * * *
56100 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTC-A
126 TAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGA
* * * *** * * ** ** *
56155 GCAAACACATTTATTTGTT-AAATCTCTTATTTATTAATTTTT-TAATATTATTAATTTAGCAAT
1 -TAAATAGATTTATTT-TTAAAATCTCTTGCATATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAATATT
* * * * *
56218 ATTTTA-CTCTGAATAAGCTTGTATGA--ACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGTCAT
64 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGATGA-AAAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGTTAT
56280 AATGATTTGAA
127 AATGATTTGAA
56291 CTAGTTTGAT
Statistics
Matches: 386, Mismatches: 87, Indels: 50
0.74 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
177 1 0.00
178 7 0.02
179 24 0.06
180 109 0.28
181 163 0.42
182 73 0.19
183 5 0.01
184 2 0.01
185 2 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
TAAATAGATTTATTTTTAAAATCTCTTGCATATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAATATTAT
TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATGAAAAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGTTATAATG
ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTCGA
Found at i:56273 original size:180 final size:183
Alignment explanation
Indices: 55887--56290 Score: 432
Period size: 182 Copynumber: 2.2 Consensus size: 183
55877 TTATGAATTG
* * * *
55887 AAACTATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCTAT--TTATTTTAAATAAATAACTGTTCAAATAG
1 AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGT-TATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAG
* * * * * * *
55950 TCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGTGTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTTATTCAGCAAACACATTTATTTGTTAAAATCTCTTATGTATTAATTTT
* * * * *
56015 TTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAGTAA
130 TTGAATATTAATAAATTAGCAATATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAAGCAA
** * * * *
56069 AAA-AAAAAATTTATGACT-AAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG
1 AAACAATTATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAG
* * *
56132 TCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAGCAAACACATTTATTTGTT-AAATCTCTTATTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAACTT-ATTCAGCAAACACATTTATTTGTTAAAATCTCTTATGTATTAATTT
* * *
56195 TTT-AATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-CTCTGAATAAGCTTGTATGAA-CAA
129 TTTGAATATTAATAAATTAGCAATATTTTATCTC-AAATAAGCTTGTATGAAGCAA
* *
56248 AAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAA
1 AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA
56291 CTAGTTTGAT
Statistics
Matches: 182, Mismatches: 33, Indels: 17
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
179 27 0.15
180 53 0.29
181 43 0.24
182 59 0.32
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (183 bp):
AAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTTATTCAGCAAACACATTTATTTGTTAAAATCTCTTATGTATTAATTTTT
TGAATATTAATAAATTAGCAATATTTTATCTCAAATAAGCTTGTATGAAGCAA
Found at i:56397 original size:141 final size:143
Alignment explanation
Indices: 56157--56432 Score: 364
Period size: 141 Copynumber: 1.9 Consensus size: 143
56147 TTGGTTCAGC
* * ** *
56157 AAACACATTTATTTGTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTTAATATTATTAATTTAGCAATATTT
1 AAACAAATTTATTTGTTAAATCTCTTA-TTA-TAATTTTTAAATATTAAAAAATTAGCAATATTT
*
56222 TACTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-AAAGGTCATAATGAT
64 TACTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
56286 TTGAACTAGTTTGAT
129 TTGAACTAGTTTGAT
56301 AAACAAATTTAGTTT-TTAAATCTCTTA-TA-AATTTTTGAAATATTAAAAAATTAG-AATTATT
1 AAACAAATTTA-TTTGTTAAATCTCTTATTATAATTTTT-AAATATTAAAAAATTAGCAA-TATT
* * ** * *
56362 TTATTCTTAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGA
63 TTACTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
56427 TTTGAA
128 TTTGAA
56433 ATAGATGGTA
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 12, Indels: 10
0.84 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
140 9 0.08
141 61 0.53
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144 22 0.19
145 3 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (143 bp):
AAACAAATTTATTTGTTAAATCTCTTATTATAATTTTTAAATATTAAAAAATTAGCAATATTTTA
CTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT
GAACTAGTTTGAT
Found at i:56811 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 56275--59002 Score: 2049
Period size: 180 Copynumber: 15.2 Consensus size: 180
56265 TAAAACAAAG
* *
56275 GTCATAA-TGATTTGAACTAGTTTGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTA--TA--AATTT
1 GTCATAACT-ATTTGAACTTGTTTG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * ** *
56335 TTGAAATATTAAAAAATTAGAATTATTTTATTCTT-AATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTGT
64 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* ** *
56399 TTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATGGTAGTTCAAATA
128 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * * * *
56452 CACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAAATATATTTTTTAAATCTCATAGTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
***
56517 T-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGCCGAATAAAA-TTGTATGAATAGAAACAATTGT
65 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * *
56580 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
128 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * *
56633 GTCATAACTATTTAAACTTGCTTTGTAAGTAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
56698 TGAAA-ATTTAATAAATTAGTA-TATTTTATGTAGAAAAAACTTTTATGAATAGAAACAATTGAT
65 TGAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* *
56761 TTATGA-AAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATA
129 TTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * *
56813 GTCATAACTATTTGAACATGTTTAGAAAACATATTCGTTTTATAAAT-TTTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * ** * *
56877 TGGAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTA--TTCAAAATAAGCTTACATGAACA-AAGCTAATT
65 TGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAAAA-AA-CTTGTATGAATAGAAAC-AATT
* * * * * *
56938 GTTTTATCACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATGGATAATTGTTTAGATA
126 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
56993 GTCATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
57058 TGGAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAA-TTATATAAACTA-AAACAATTGT
65 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGT
* * * * * * * *
57121 TTTATTG-CAAAACAAAAAGTTACAGTGATTTAAAATAGATAATTATTCGAGTA
128 TTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
57174 GTTATGATTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTG
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-
** * * ** * * *
57238 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-GTCCAAATAAGCTTGTAT-AATTAGAAACAACTA
64 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
* ** * * *
57301 TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAAAATAAAAAATTGTTCAAATA
127 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * *
57355 GTCCTAAAGATTTGAACTTGTTCAGTAAA-AAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTG
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-
* * * * * * *
57419 TCTT--AATATTAATAAATTTGTATTA-TTTA-TCTGAAATAAGCTTGCATAAATAGAAAAAATC
63 T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAACTTGTATGAATAGAAACAATT
* * ** * *
57480 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTGAAATA
126 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
57535 GTTATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * ** * * * *
57600 TGGAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAATTTTATATGAGTTGAAATAATT-TTT
65 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
* * * * * *
57664 TATGATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGATATTTATTCAAACA
130 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
57715 GTCATGACTATTTGATCTAGCTTGGTAAACATATTTATTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTGT
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * **** * *
57780 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATGGGCTTGTATGAACAGAAACTATTGTTT
65 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
* * * * ** * * **
57845 TATAATAGAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCTTTGAATA
130 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
57896 GTTATAACTAATTGAA-TTGGTTTGATAAACATATTTACCTTTTTAAATCTCTTAC----TAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTT-GTTTG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * ** * * * * *
57956 TTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTTATTTTGAATAAACTCATAAGAACAAAAACATTTA
63 TTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTG
** * * * * *
58021 TTTTACAATAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACA
127 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
58075 GTCATAATTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACGTAGTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * ** * *
58140 TGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTGAATAAGCAAGTATGAATTGAAAAAATTGTT
65 TGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * *
58204 TTATGGC-AAA-ATAA----A-AATGATTTAAAATAGATAATTATTCATATA
129 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
58249 GTCTTAATTATTTGAACTAGCTTGGT-AACAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGTAAAC-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * ** * * * *
58313 TTGGAATATTATTATATTAATA-TATTTTATTTCGAATAGGCTTATATGAACATAAATAATTGTT
64 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * ** *
58377 TTATGACAAAACAAAGGGTTATAATGATTTGAAGTATACGATTATTCAAATA
129 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** *
58429 GTCATAACTATTTAAACTAATTTGTTAAACAAATTTATTTTATAAATCTCTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * *
58494 TGAAAGATTAATAAATTAGTATTA-TTTA-TTCCAAATAAACTTGTA-CAATCA-AAAAAATTGT
65 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAACTTGTATGAAT-AGAAACAATTGT
* * * ** * *
58555 TATATGATC-AAATAAAAGGTAATAACAATTTGAAATATATAATTGTTGAAAT-
128 TTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
58607 GTTCATAATTATTTGAAC-TGATTTGGTAGATAGATTCACTTTTTAAATCACTTAATTATTAATT
1 G-TCATAACTATTTGAACTTG-TTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
*
58671 TTT-AGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAA-TTGTATGAATTGAAACAATT
63 TTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAAACTTGTATGAATAGAAACAATT
* ** ** *
58733 GTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATA
126 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * **
58788 GTCATAACTATTTAAATTTGTTTGCTAAAAAAATTTATTTTTTTGAA-CTCTTGTTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTG-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * ** * *
58852 TTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATTAGCTTTTATGAA-ATGAAACAATTG-
64 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATA-GAAACAATTGT
* *
58915 ----T----AAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-ATTGATTGTTCAAATA
128 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATA
* ***
58960 GTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAATGGATTTATTTTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTT
59003 GAATGTTAAT
Statistics
Matches: 2040, Mismatches: 416, Indels: 196
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
171 7 0.00
172 68 0.03
173 43 0.02
174 94 0.05
175 5 0.00
176 1 0.00
177 41 0.02
178 64 0.03
179 279 0.14
180 734 0.36
181 637 0.31
182 56 0.03
183 9 0.00
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
GTCATAACTATTTGAACTTGTTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAAAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
Found at i:57727 original size:722 final size:706
Alignment explanation
Indices: 56548--70349 Score: 3210
Period size: 722 Copynumber: 19.1 Consensus size: 706
56538 TTATTTTATG
* * * *
56548 CCGAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGGTTTG
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTG
* * * **
56612 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGCTTTGTAAGTAGATTTATTTTTTA
64 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TTAGTAAAAAGATTTATTTTTTA
* * *
56677 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAAATTTAATAAATTAGTA-TATTTTATGTAGAAA-AAACTT
128 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATCT-GAAATAAGCTT
* * * *
56740 TTATGAATAGAAACAATTGA-TTTATGA-AAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
191 GTATGAATAGAAA-AAATCATTTTATGACAAAA-AAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAAT
* * * * * * * * *
56803 TTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTTAGAAAACATATTCGTTTTATAAAT-TTTTACT
251 TATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTG-TTAGTAAA-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTAAT
* * * * *
56867 TATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTACATGAACAAAG
314 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAT-TTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATG-ATAAA-
* * * * * *
56932 CTAATTGTTTTATCACAAAACAAAAGGTTATAATGTTTTGAAATGGATAATTGTTTAGATAGTCA
375 -TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTCA
* * * * *
56997 TAACTATTTGAACATGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGA
438 TAACTATTTGAACATGTT-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
* * *
57062 ATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTATATAAACTAAAACAATTGTTTTATT
502 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATT
* * * * *
57127 GCAAAACAAAAAGTTACAGTGATTTAAAATAGATAATTATTCGAGTAGTTATGATTATTTGAACT
567 GCAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTTGAACT
*
57192 TGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTGTCAAAATATTAATAAATTA
632 TGTTT-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTGT-AAAATATTAATAAATTA
*
57257 ATATTATTTTAGT
695 GTATTATTTTA-T
* * * * *
57270 CCAAATAAGCTTGTATAATTAGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTAA
1 CCGAATAAACTTGTATAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * *
57335 AATAAAAAATTGTTCAAATAGTCCTAAAGATTTGAACTTGTTCAGTAAAAAGATTTATTTTTTAA
65 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTT-AGTAAAAAGATTTATTTTTTAA
*
57400 ATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTA-TTTATCTGAAATAAGCTTG
129 ATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCTTG
* * * * *
57463 CATAAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGT
192 TATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGG-TATA--GATTTAAAATAGATAATTAT
* *
57528 TGAAATAGTTATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTAT
254 TCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGTAAA-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTAT
* **
57593 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAATTTTATATGAGTTGAAATA
317 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATGA--T-AAATA
* * * * * *
57658 ATT-TTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATAATTTGAAATAGATATTTATTCAAACAGTCATGA
377 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATA-TTATTCAAATAGTCATAA
* * * * * *
57722 CTATTTGATC-TAGCTTGGTAAACATATTTATTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAAT
441 CTATTTGAACAT-G-TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * **** * **
57786 ATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATGGGCTTGTATGAAC-AGAAACTATTGTTTTATAA
504 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTG
* * ** * * * * *
57850 TAGAAC-AAAAGTTCATAACAATTTGAAATAAATAATTCTTTGAATAGTTATAACTAATTGAA-T
568 CAAAACAAAAAGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTTGAACT
* * *
57913 TGGTTTGATAAACATATTTACCTTTTTAAATCTCTTACTAATT-TTTG--AAATATTAATAGATT
632 T-GTTTG-TAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTGTAAAATATTAATAAATT
*
57975 AGTATTTTTTTTATT
694 AGTA-TTATTTTA-T
** ** * * * * ** *
57990 TTGAATAAACTCATAAGAACAAAAACATTTATTTTACAATAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
1 CCGAATAAACTTGT-ATAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
58055 AATAGATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAA-AATTATTTTTTA
65 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTA-GTAAA-AAGATTTATTTTTTA
* * * * *
58119 AATCTCTTACGTAGTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCTG-AATAAGCA
128 AATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTA-TCTGAAATAAGCT
* * ** * *
58182 AGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAATAAAA---AT-GATTTAAAATAGATAATTATT
190 TGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGTATAGATTTAAAATAGATAATTATT
* * * * * *
58243 CATATAGTCT-TAATTATTTGAACTAGCTTGGTAACAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
255 CAAATAGT-TATAATTATTTGAACTTG-TTAGTAA-AATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTAT
* * * * * *
58307 TAAATTTTGGAATATTATTATATTAATATATTTTATTTCGAATAGGCTTATATGAACATAAATAA
317 TAATTTTTGGAATATTAATAAATT-ATTTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATG---ATAAATAA
* * * *
58372 TTGTTTTATGACAAAACAAAGGGTTATAATGATTTGAAGTATACGATTATTCAAATAGTCATAAC
378 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA-TATTATTCAAATAGTCATAAC
* * * *
58437 TATTTAAACTAAT-TTGTTAAACAAATTTATTTTATAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGA
442 TATTTGAAC--ATGTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
*** * * * *
58501 TTAATAAATTAGTATTA-TTTATTCCAAATAAACTTGTA-CAA-TCAAAAAAATTGTTATA-TG-
505 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATTGC
* * * ** * * * *
58561 ATCAAATAAAAGGTAATAACAATTTGAAATATATAATTGTT-GAA-ATGTTCATAATTATTTGAA
569 A--AAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATA-GTT-ATGACTATTTGAA
* * * * * * * * *
58624 C-TGATTTGGTAGATAGATTCACTTTTTAAATCACTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT-AA
630 CTTG-TTT-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTGTAAAATATTAATAAA
58687 TTAGTATTATTTTATT
692 TTAGTATTATTTTA-T
** * * * * * * **
58703 TTGAATAAAATTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTC
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
58768 AATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTTGCTAAAAAAATTTATTTTTTTG
65 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTAG-TAAAAAGATTTA-TTTTTT-
* * * * * *
58833 AACTCTTGT--TTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTG-GATTAGCT
127 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCTGAAATAAGCT
* * * * * *
58895 TTTATGAA-ATG---AAA-CA--AT-TG--TAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA-ATTGA
190 TGTATGAATA-GAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGA-TAA
* * * * * * *
58949 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGT-AAATGGATTTATTTTTTGAA--TGTTA
250 TTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTG-TTAGTAAAAT--ATTCATTTTTTAAATCTCTTA
* *
59011 A-TA--AA--TTT---AGA-T--T--A-T-TTTA---T-TTTA-AATAAGCATGTAAGAT-ATGA
312 ATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTATTTATTTTATTTAGAATAAGC-T-T-ATATGAT-A
* * * * * * * * * *
59055 AACAAATATTTTATAACTAAACAAAAGATTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTT
373 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTC
* * * * *
59120 TTAACTATTT-AAAATGGTTGGACAAATAAATTTCTTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTG
437 ATAACTATTTGAACAT-GTTGG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * **** ** * * *
59180 GAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATGATC-AGAAATAATTGTTT
500 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAAATTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * * * * * * *
59243 TA-CG-ATAAA-ACAAAGATATTAACGATTTGAGACTA-ATAATTGTTCTAATAGTCATAACTAT
563 TATTGCA-AAACAAAAAGTTA-TAATGATTTGA-AATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTAT
* * * *
59304 TTGAACTAGATTGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
625 TTGAACTTGTTTG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTGTAAAATATTAA
*
59369 AAAATTAGTATTATTTTATT
688 TAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * ** * * * * *
59389 TCAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATGATTTGA
1 CCGAATAAACTTGTATAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
** ** * * * * * * *
59454 AATGGATAATCATTTAAATGGCCATAATTATTTTAA-TTGATTCAGTAAACATATTTATTTTTTA
65 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TT-AGTAAAAAGATTTATTTTTTA
* ** *
59518 AA---TTT-CTTATTAA-TTTAGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TGCATCTAAGTT
128 AATCTTTTACTTATTAATTTTTG--AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTG-AAATAAGCT
* * * ** * * * *
59577 TGTATTAACT-TAAATAATTTTTTTATAACAAATCAAAAA-GT-T--A--T--AA-CG---ACT-
190 TGTATGAA-TAGAAAAAATCATTTTATGACAAA-AAAAAAGGTATAGATTTAAAATAGATAATTA
* * * * * * *
59628 TT-AAATA--AACAATTGTTT-AA-ATG---GTAAACAGATTTATTTTTTTAAAGCTCTT--TTC
253 TTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTTAGTAAA-ATATTCA-TTTTTTAAATCTCTTAATT-
* *** * * * *
59683 ATTAATTCTCCAAATGTTAATAAATTATTATTAATTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAACTGGA
315 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATT-TAGAATAAGCTTATATG-A-T-AA
* * * * * * * * * *
59747 ATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGATCAGAATGATTTCAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCT
374 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * **
59812 TAACCATTTGAA-TTGATTCGCTAAACAAACTTATATTTTAAA--TC-T-CTTATTAACTTTCAA
438 TAACTATTTGAACATG-TT-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* ** *
59872 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCAT-AA-AAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTT
501 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTGAATAAA-ATTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
*** * * ** * ** *
59934 ACAACAAAA-GAAAAGATCATAACAATTTAAAATAGATAATCGTTC-ATATAGTCT-TAACTATT
564 ATTGCAAAACAAAAAG-TTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGA-ATAGT-TATGACTATT
* * * ** * * * ** ** **
59996 TAAACTGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTT-TGGAATATTGT
626 TGAACTTGTTT-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-A-TTTGTAAAATATTAA
60060 TAAATTAGTATTATTTTATT
688 TAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * * * * * * * * * **
60080 CCAAATAAAATAGTATGAACAGAACCAATTGTTTGATGACAATATAAAAGGTTATATTGATTTGA
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * * *
60145 AATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAAGTATTTGAAATGGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAA
65 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TTAGTAAAAAGATTTATTTTTTAA
* * *
60210 ATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTACTTCGAACAAACTTAT
129 ATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAG---TA--TTA-TT---------TTAT
* * * * ** ** ** *
60275 CTTAACAAAAACAATTTTGTTTTTAGTATTATTTTACTTTTTAGTATTATTTTGTTTTATGGCAA
178 C-T----GAAATAA----G--CTT-GTATGA----A-----TAG-AAAAAATCATTTTATGACAA
* ** * *
60340 AACAAAAA-GTAATA-ATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATATTTATAATTATTTGAACTAA
221 AA-AAAAAGGT-ATAGAT-TTAA--AATAGATAATTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT--
* * * * * * *
60403 T-TTGGTAAATAGAATT-ATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAGTAAATTA
279 TGTTAGTAAA-A-TATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
** * ** * * * * *
60466 GTTTTATCCTACTCCGAACATGCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAGGGT
342 --TTTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATGA--T-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * **
60531 CATAGAT-ATTTGAAATAAATAATTGTTC----A-T-ATAA-T-CTT-AAC-TGTTTG-AATGAA
402 TATA-ATGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTGGTAAACAA
* ** * * * * * *
60584 A--T-GTCCTAACAAT-T-TGA---AATAA---AT-AAATGTTAATAGATTAGTATTATTTTATT
465 ATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * * * *
60637 CTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA-TGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTG
529 TTGAATAAAATTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATTG-CAAAACAAAAAGTTATAATGATTTG
* * * * *
60701 AAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAAC-ATTTGAACTTGTTCAGCAAACACATTTATTTTTT
593 AAATAGATAATTATTCGAATAGT-TATGACTATTTGAACTTGTT-TGTAAACATATTTATTTTTT
60764 AAATCTC---C-TATTA-TTG--------T--TAAATTAGTATTATTTTTAT
656 AAATCTCTTACTTATTATTTGTAAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAT
* * * * * * *
60801 -CGAAATAAGCTTGGATGATCATAAACAATTATTTTATGAGAAAACAAAGAT-T-AGAATGATTT
1 CCG-AATAAACTTGTATAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAACGATTT
* ** * * * * * *
60863 GAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAATAGTTTTATTTTTT
63 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTAGTAAAA-AGATTTATTTTTT
* * * * * * *
60928 AAATCTCTTGCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTT
127 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCTT
* * * ** * * * * *
60993 TTAGGAACTAAAAAAAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGCTTATAACAACTTAAAATTGTTAGAA
191 GTATGAA-TAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAG-GTAT-A-GATTTAAAA----TAG-A
* * * * * * * * *
61058 TGATTGTTCAAAAAGTTA-AATCTTTTTGAAATTTTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAAATCT
247 TAATTATTCAAATAGTTATAAT-TATTTGAACTTGTT-AGTAAA-ATATTCATTTTTT-AAATCT
* ** * * * * *
61122 CGTGCTCATTAATTTTT-CAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATG
308 CTTAATTATTAATTTTTGGAA-TATTAATAAATTA-T-TTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATG
* * * *
61186 AATTAAAATAATTGTTTTATGACTAAATA-AAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGACAATTGTTC
370 -A-T-AAATAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGA-TATTATTC
* * * * *
61250 TAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATT
429 AAATAGTCATAACTATTTGAACAT-G-TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *** ** * *
61314 AATTTTTGGAATATTACTAAATTAGTAATGTTTTAATCCAAATAAGTTTGTATGAA-AAGAAAAA
492 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTA-AAACA
* * * * * * * * *
61378 ATTGTTTTA-TGACAAAATAAAAA-TCATAATGTTTTGAGATAGACAATTGTTCAAATTGTTATA
556 ATTGTTTTATTG-CAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATG
* * * * *
61441 ATTATTTGAAC-TGTCTCGGAAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTT-TCAAAA
620 ACTATTTGAACTTGT-T-TGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTGT-AAAA
* *
61501 TATTAATAGATCAGTATTATTTTAAT
682 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* ** * * * ** * *
61527 CTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTAGGATAAAACAAAAAATCATAATGATTTAA
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * * *
61592 AATAGATAATAT-TTCAAATGGGCATGACTACTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTA
65 AATAAATAAT-TGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TTAGTAAAAAGATTTATTTTTTA
*** * * **
61656 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTG
128 AATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCTTG
* ** * * * * **
61721 TATGAATAGAAACAATTGTTTTAGGACAAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATCGT
192 TATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAATTAT
* * * * * * * *
61786 TTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
254 TCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGTAAA-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTAT
* * * *
61851 TAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTTTTATGAACAGAAA
317 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATTT-AGAATAAGC-TTATATG---ATAAA
* * * * *
61915 CAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TCGAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
375 TAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTG-AAATAGAT-ATTATTCAAATAGTC
* * *** * * *
61978 ATATCTATTTGAATGA-GTTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTTG
437 ATAACTATTTGAA-CATGTT-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * *
62040 AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTTGTAATAAGCTTGCATGAA-TATAACCAATTGTT
500 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAAATTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * ** * * * *
62102 TTA-TGACAAACCAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAACTGCTTAG-ATAGTCATAATTAT
562 TTATTG-CAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAA-TTATTCGAATAGTTATGACTAT
*** * * * * *
62165 TTGAACACATTCGGTAAACA-ATTTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTCATTTTTAGAATATTA
625 TTGAACTTGTT-TGTAAACATATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTGTAAAATATTA
* *
62229 AAAAATTAATATTATTTTATT
687 ATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * * * * * *
62250 TCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGA
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * *
62315 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAA
65 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TTAGTAAAAAGATTTATTTTTTAA
* * * *
62380 ATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATC-CAAATAAGGTT
129 ATCTTTTACTTATTAATTT-TTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATCTGAAATAAGCTT
* * * *
62443 GTATGGATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAA-GTCATAATAATTTAAAATA-ATTAAT
191 GTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAA-AAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGA-TAAT
* ** * * * **
62506 TATTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAC---TT-GT---AT-TT-AGTTTTGAAATCTTTTACGTA
251 TATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTTAGTAAAATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA
* * *
62562 TTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGACCAAGA
316 TTAATT-TTTGGAATATTAATAAA-TTAT-TTATTTTATTTAG-AATAAGCTTATATGA--TA-A
* ** *** * *
62625 AAAATCATTTTATGACAAAA-AAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
374 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
62689 TAATTATTTAAACTTGTATGGTAAACATATTCAATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGG
438 TAACTATTTGAACATGT-TGGTAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
** ** * * * * *
62754 AATATTAATAGCTTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTAG-ATTAACTGAAATATTTTTTTTA
501 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATT-GTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
62818 -CGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAATCT-TAACTATTTG
565 TTG-CAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGT-TATGACTATTTG
* * * * * ** *
62881 -A-TTGGTTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTA-TTA--ATTTTTAGAATATTTTTAG
628 AACTT-GTTTG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTGTAAAATATTAATAA
* * *
62941 TTTAGCAATATTTTACT
691 ATTAGTATTATTTTA-T
* * ** * * * * * *
62958 TCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCAT-ACTAATTT
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACA-ATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAAC-GATTT
* * * * * *
63020 GAAATAGATAATTGTTCAAATAAAT-ATAACTATTTGAACTAGTCT-GATAAACAGATTTAGTTT
63 GAAATAAATAATTGTTCAAAT-AGTCATAAATATTTGAACTTGT-TAG-TAAAAAGATTTATTTT
* ** * * *
63083 TTGAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTG-AATAAT
125 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCTGAAATAAG
* * ** * * ** **
63143 TTTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTATGACAAGACAAAATATCATAATGATTTGCAATAGATAA
188 CTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAA
* * ** * * * * * **
63208 TAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATAT-GAAA
250 TTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGTAAA-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTAA
* * * * * * *
63272 CTTATTAATTTTTAGAAGATTAATAAATTAGTACTATCTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAG
313 -TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATG-ATA-
* ** * *
63337 AA-ACTATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATATAACAATTTCAAATA-A-ATAATT---AT--T
373 AATA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATATTATTCAAATAGT
* * * * * * *
63393 --TAA--ACTCG--C---TTAGTAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA
436 CATAACTATTTGAACATGTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * ** * * * * *
63449 AGTTTTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCCAATAAGACTT-TACGGACAAAAATAATTAG-TTT
501 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-AATTGTATGAACTAAAACAATT-GTTTT
** * * * *
63512 A-TGACAAAA-AAAGGGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTT
564 ATTG-CAAAACAAA-AAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTT
* * * * ** *
63575 GAA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATGT-TTACTTATTAATCTT-TGGAATATTAG
627 GAACT-TGTTT-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AT-TTGTAAAATATTAA
*
63637 TAAATTTGTATTATTTTAT
688 TAAATTAGTATTATTTTAT
* *** * * * * * * *
63656 TCGAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT
1 CCG-AATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAATGTCATAACGATTT
* * *
63721 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAA-ATTTATTTTT
63 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TTAGTAAA-AAGATTTATTTTT
* * * * * *
63785 TAAATCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
126 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCT
* * ** * * * * *
63850 TATATGAATTA-ATACTAT-TTTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACAATCTAAAATAGATAAT
190 TGTATGAA-TAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAG-GTAT-A-GATTTAAAATAGATAAT
* * * * *
63913 TATTCAAGTAGTTATTATTATTTGAACTTGTTCAATAAACATACTT-A-TTTTTAAATCTTTTAC
251 TATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGTAAA-ATA-TTCATTTTTTAAATCTCTTAA
* * * * * * * *
63976 TTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGTTTTTATGAACAAA
313 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AT-TTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATG---ATA
* * * *
64041 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA----ATAGTTG-TTTTATTAATAGTCATAACTATTTGAA
373 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA-ATGATTTGA--AATAG--AT-ATTA-TTCAA
* * * *
64101 CTTATTCAGTAAACAGATTTGAA-ATAAGCTCATATGAATAGAA-AGAATTT-TTTTATGATAAA
431 -ATAGTCA-T-AAC-TATTTGAACAT--G----T-TG-GTA-AACA-AATTTATTTT-T--TAAA
* *** * * *** * *
64163 GC-AAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATGATTATTCAAA-TAGCTATAACTATTTGAACTTGT
479 TCTCTTA-CTTAT--TAATTTTTGA-A-AT-ATTAAT-AAATTAG-TAT---TATTT-TA-TT-T
* * **** * * * *** * *
64226 TCAATAGATATATT-CATTTTTTAAATC--TT-TACTTGTT--AATTTTTAGAATGTTAATAA--
530 TGAATA-A-A-ATTGTATGAACTAAAACAATTGT-TTTATTGCAA--AACAAAAAGTT-ATAATG
* * * * ****
64283 ATTAGAATTATG-TTATT-TT-GAATAAGATTGTATGAACAAAAACAA-TTGTTTTGTGACAAAA
588 ATTTGAAATA-GATAATTATTCGAAT-AG--T-TATG-ACTATTTGAACTTG-TTTGT----AAA
* * * ** * * ** * * *
64344 CAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAACAGTCATAAATGTT-TGCACTAGTCA
642 C-ATA--TT-T----ATTT----T--TTAAAT-CTCTTAC--TTAT-TAT-TTGTAAAATATTAA
* ** * *
64408 TAAAGGCTAACAAATACATTT-T
688 TAAA---TTAGTATTA-TTTTAT
** ** * ** * * * ** * * *
64430 CTAAATCCTTTACTTAT-TAATTTTAAATTAGCATTACTTTAT-TCTGAATAAGATTGTATGAAT
1 CCGAA---TAAACTTGTATAA-TAGAAA-CA--ATTATTTTATGACAAAACAA-AATG--T-CAT
* * * * * * * ** * * *
64493 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAATGGTCATAACATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
55 ---AACGA---TTTGA-AAT-AAATAATTGTTC--AA-A-TAGTCATAAAT-A-T-TTGAACTTG
** * ** * * * *
64558 TTA-TAACTAATCA-AACTAGCTTGGTAAACACATTTATCTT-TTAAATCTCTTATTAATTTTCA
105 TTAGTAA--AA--AGATTTA-TTTTTTAAA-TCTTTTA-CTTATT-AAT-T-TT-TGAATATT-A
* * * * * * ** * * * * **
64620 AGATATTAATAAGTTAATAT-TATTTTATTCTGAA-CAAATTTATATGAACA-AAAACATTTGTT
158 ATAAATTAGT-A-TTATTTTAT-CTGAA--AT-AAGC----TTGTATGAATAGAAAA-AATCATT
* * * * * *
64682 TTATAATAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAGATAACTGTTCAAATA-TTCATAATTATT
212 TTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTT-ATAATTATT
* * * ** *
64746 TAAACTAGTTCAGCTAATAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAA
273 TGAACTTGTT-AG-TAA-AATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAA
* * * * *** *
64810 TAAATTCAATTTATTTTATTCCA-AATAAG-TTAGTAAGAGCTGAAAAAAATTATTTTGCAATAA
335 TAAATT--ATTTATTTTATT-TAGAATAAGCTTA-TATGA--T--AAATAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
64873 AATAAAATGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCATAA-AGCCTTAACTATTTGAA-ATG
392 AACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGAT-ATTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACAT-
* * * ** * * **
64935 GTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATACTATTAGGTTA
453 G-TTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * ** * *
65000 GTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAATAATTATTTTA-TG-ATAGAACAAAA
516 GTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATTGCA-A-AACAAAA
* ** * * * * * *
65062 GGTTATAACAATTTGAAATATG-TAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGATAA
578 AGTTATAATGATTTGAAATA-GATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTG-TAA
* * * * ** * *
65126 ATAAAATTATTTTTTAAATCACTTACATATAAAATTT-TGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTT
641 ACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-T-TATTATTTGTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
65190 TATT
704 TA-T
** * * * * * * * *
65194 ATGAATAAACTTGGATGAGCTA-AAATAAGTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
1 CCGAATAAACTTGTAT-A-ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTG
* * * * * * * * * *
65258 AAATAGATAATTATTTATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTCG-ACAAACAAATTTATTTTTT
64 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTAGTA-AAA-AGATTTATTTTTT
** * * * * * **
65322 AAAT-TTCTTTGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATT
127 AAATCTT-TTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCT
* * * ** * *
65386 TATATGAACA-AAAATAATTATTTTATGTTAAAACAAAAGGCTATAACAATTTAAAATAGATAAT
190 TGTATGAATAGAAAA-AATCATTTTATGACAAAAAAAAAGG-TAT-A-GATTTAAAATAGATAAT
* * * * * * ** * *
65450 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTGTTTTTTGAATCTC--GA-
251 TATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGTAAA-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTAAT
* * ** * * * *
65512 -ACTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTGTTGTTTTATTTCA-AATAAACTTGTATATTAAAA
314 TATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATTT-AGAATAAGC-T-TATA-TGATA
* * * * * * *
65575 AATAATTGTTTTATAACAAAACGAAAGGTACTAACAATTTTACTTGAAATAGGCT-TGTATGTTG
373 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT--T-ATAA--TGATTTGAAATA-GATAT-TA--TTC
* * * * ** * * *** * *
65639 AAA-A---ACAATTGTTTTCTAACAAAATGAAAGGTAATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGT-T
429 AAATAGTCATAACT-ATTT-GAAC---ATG-TTGGTAA-ACA-AATTT--ATTTTTTAAATCTCT
* * * * * *
65698 TAAATGATCGTAATTATTTGAACTGATTTATTAAATTGATTTATT-TTTTAAATCTCTT-ACTTA
484 T-ACTTAT--TAATT-TTTGAAAT-A-TTAATAAATT-A-GTATTATTTT--AT-T-TTGA-ATA
* * * * * *
65761 TTAATTTTCAAAAT-ATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTGTGAAATGAAA
536 -AAATTGT----ATGA--ACTAAA--ACAATTGTTTTA--TTGCA-AAAC------------AAA
* * * * * * *
65825 CAATTGTTTTAGGACAAAATAAAAATTCATAATGAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
577 -AA--G--TT-----ATAAT--GATTTGA-AAT-AGATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
65890 AACTTGTTTGGTAAAAAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAAT
628 AACTTGTTT-GTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATT-A-TTTGTAAAATATTAAT
* *
65954 AAATTAGCATTATTTTCTT
689 AAATTAGTATTATTTT-AT
** * * * *
65973 TTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAAGTCATAATGATTT
1 CCGAATAAACTTGTAT-AA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAATGTCATAACGATTT
* * ** * * * * * *
66037 GAAATAGATAATTATTTTAATAATCTTAACTATTTGAAC-TGATTCGTAAATATATTTATTTTTT
63 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TTAGTAAAAAGATTTATTTTTT
* * * * * *
66101 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATGATTAAATTAGTATTATTTTTATC-CAAATCAGCT
127 AAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATCTGAAATAAGCT
* ** * * * * * * *
66165 TGTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAGATCATAATAATTTGAGATTA-ATAT
190 TGTATGAAT-AGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTT-AAAATAGATAA
* ** * * ** * * *
66227 TTGTTCAAATAGTCCTAACTATTAGAACTACTTCAG-AAAACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTA
250 TTATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGTAAAA-TA-TTCATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
66291 CTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGTTTTTATTAATT
312 ATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATTT-AGAATAAGCTTATA-TGA-T
* * * ** *
66355 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAAAAATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
372 -AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAG
* * * * * *
66420 TCATATCTATTTTAA-ATTATTCAGTAAACATATTTCTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
435 TCATAACTATTTGAACA-TGTT-GGTAAACAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT
* ** *
66484 TTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTG
496 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTA-AAACAATTG
* * * * * * * * *
66547 TTATA-TGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATGGATAACTATTCTAATA-ATCTGAACT
560 TTTTATTG-CAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATG-ACT
* ** * * * * * * **
66610 ATTTAAACTACTTCGACAAACATCTTTATTTTTTAAATCTATTACTTATAAATTTTTGGAATATT
623 ATTTGAACTTGTTTG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-TATTTGTAAAATATT
* * *
66675 ATTAAATTAGTATCATTTCAAT
686 AATAAATTAGTATTATTT-TAT
* * * * * * * *** *
66697 TCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTGTATGACAAAA-TAAA-GATCATTTTGATTTT
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTG
* * * * * * * *
66760 AGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTAGTTTTTA
64 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTT-AGTAAAAAGATTTATTTTTTA
** * *
66825 AATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAA-TTC
128 AATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCTGAAATAAGCT-
* * * * * * * *
66884 TATATGAATAGAAAAAAGT-GTTTTACGATAAAACAAAAGGTCTTAAAGATTT-GAATGGATAAT
190 TGTATGAATAGAAAAAA-TCATTTTATGACAAAAAAAAAGG---TATAGATTTAAAATAGATAAT
* ** * * * * * * *
66947 TGTTCAAATA-ACATGACTATTTGGACTTGTTTGATAAACA-AATCTATTTTTTAAATCTCATAC
251 TATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTTAG-TAAA-ATATTC-ATTTTTTAAATCTCTTAA
* * * * * *
67010 CTATTAATTTGTAGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAACTTGTATGAATAG
313 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATT-TAGAATAAGCTTATATG-AT--
* * * * *
67074 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATATTGTTCAAATAGT
372 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGATATTATTCAAATAGT
* * * ** * * *
67138 TATAACTATTT-AAGCTTACTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTT
436 CATAACTATTTGAA-CAT-GTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * *
67202 T-AGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGGAC-AGAAATAATTAG
498 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTA-AAACAATT-G
** * * * * * * *
67265 -TTTATCACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGCAATAGATAATTGTTCAAATACTCA-GAACT
560 TTTTATTGCAAAACAAAAAGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATG-ACT
** * * * **
67327 ATGCGAA-TGTGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAATTT-TGGAATA
623 ATTTGAACT-TGTTT-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT--ATTTGTAAAATA
67389 TTAATAAATT--TAATTATTTTATT
684 TTAATAAATTAGT-ATTATTTTA-T
* * * * * *
67412 CCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-A
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * *
67476 AATTAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTCATGTTTTG
65 AA-TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTT-AGTAAAAAGATTTATTTTTTA
* * * * *
67541 AATCTTTTAATCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTGA-TGTTTTATTTCAAATAAGCTT
128 AATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATCTGAAATAAGCTT
* * * ** * * * * *
67605 ATATGAACT-GATACAATTGTTTTCTGATAAAACAATAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
191 GTATGAA-TAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAATT
* * * * * * *
67669 ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTCA-GTTTAAAATCTTTTACTT
252 ATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGTAAA-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATT
* * ** * * * * *
67733 ATTGATGTTTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTAAATCT-GAATAGGCTTATAGGAAGAAAA
315 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAT-TTATTT-TATTTAGAATAAGCTTAT---ATGATAA
* * * * * * * * *
67797 ACAATCGTGTCATGACAAAATAAAAAGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
374 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * *
67861 ATAACTATTTGAACTTATTCGATAAACAGATATATCTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTGTTTG
437 ATAACTATTTGAACATGTT-GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTG
* ** *
67926 -AATATTAATAAATTTAG-ATAATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-ATTTTGT
500 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAAATTGTATGAACTA-AAACA-ATTGT
* * * * * *
67986 TTTA-TGACAAAACAAAAAGGTTATAGTGATTCGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCT-TAATT
561 TTTATTG-CAAAACAAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGT-TATGACT
* * * * * * *
68049 ATTTGTATTTTTTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATCAATTTTTAAAATATT
623 ATTTGAACTTGTTT-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-TATTTGTAAAATATT
* * *
68114 AATAAAATAGAATTATGTTATT
686 AATAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * * * * * * * * **
68136 TCTAATGAGCTTGTACGAATAGAAATAATTGTTTTGTGATAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGA
1 CCGAATAAACTTGTA-TAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGA
* * * * * * ** * *
68201 AATAAATAATTGCTCACATAGTCATAACTATTTGCACTAGTCAGGCCAATAGATTCATTTTTTAA
65 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTA-GTAAAAAGATTTATTTTTTAA
** * * * *
68266 ATCCGTTACTTGTTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCG-AATAAGATTG
129 ATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCT-GAAATAAGCTTG
* ** * * *
68330 TATGAATAG-AAAAA--ATTGT-T--C-----AATTGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGT
192 TATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAATTAT
* * * * * * * *
68384 TCAAACAGTCACAATTATTTGAACTAGTTAGGCAAACAAAATT-GTTTTTTAAATCTCTTACTTA
254 TCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTTA-G-TAA-AATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA
* * * * * * *
68448 TTAAGTTTTGAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTATTCCA-AATAAG-TCACTAAGAACTAAA
316 TTAATTTTTGGAATATTAATA-AATT-ATTTATTTTATT-TAGAATAAGCTTA-TATG-A-T-AA
* * * * * * * *
68511 AAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATGAAGA-ATTGTTCATATAGCC
374 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT--AGATATTATTCAAATAGTC
* ** * ** * * *
68575 TTAACTATTTGAACTAAT-TCAGCAAGTAAATTTATTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTC
437 ATAACTATTTGAAC--ATGTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
68638 AGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTT-TGTGAACAAAAATAATTGTTTT
500 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * ** * * * * * * * *
68702 A-TG-AGATAATAAAATGTTATAACAATCTAAAATATATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTT
564 ATTGCA-A-AACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * * *
68765 GAACTGGTTCGATAAATAGATTAACTTTTTGAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGCA
627 GAACTTGTTTG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTGTAAAATATTA--A
68830 -AAATTAGTATTATTTTATT
688 TAAATTAGTATTATTTTA-T
** ** * **
68849 TTGAATAGCCTTGTATGAT-GTAAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACGATTT
1 CCGAATAAACTTGTATAATAG--AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTT
* * * * * * ** * * ** *
68912 GAAATAGATGATTGTTCAACTGGCCATAATTATTTGAACTAATTTGATCAACTGACTTATTTTTT
63 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTAG-TAAAAAGATTTATTTTTT
* * * * ** * * * * *
68977 AAATATCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGAAATATTATTTTATTTTAGATAAACTT
127 AAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCTT
* * * * ** * * * * *
69042 TTATGTACTA-AAATAGTTGTTTTATGATAAAATAAAATGTCATAATGATTTTAAATTGATAATT
191 GTATG-AATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAATT
* * * * * *
69106 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTATT-ATTTTTTTAAATTTC-T
252 ATTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTTGTT-AGT-AA-A-A-TATTCA-TTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
69169 AAGTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGAACAAGCATGTATGAAT
311 AA-TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA-T-TTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATG-A-
* * * * * * * ** * * *
69234 TGAAACAATTATTTTTTGACTAAACAAAAGATCAAAACAATTTGGAATAGATAATTGTTCTAATA
371 T-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATA
* * * **
69299 GTCCTAACTATTTGAAC-TAGTTTAGAAAACTCATTTA-TTTTTAAA--TC---CTTATTAATTT
434 GTCATAACTATTTGAACAT-G-TTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * ** ** *
69357 TTGAAATAGTAATAAATTGGTGTTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAGAAATGATTAT
497 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTA-AAACAATTGT
* * * ** * * ** **
69421 TTTA-TGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAACAATTCAAATGGACAAAACTAT
561 TTTATTG-CAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTAT
* * * *
69485 TTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATAATAA
625 TTGAACTTGTTTG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-ATTTGTAAAATATTAA
*
69550 TAAATTAGTGTTATTTTATT
688 TAAATTAGTATTATTTTA-T
* * * * *
69570 CCAAATAAACTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTG
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAACGATTTG
* * * * * * * *
69634 AAATATATAGTTGTTCAAATA-TCATAACTATTTGAATTTGCTCAGTAAATAGAATTATTATTTA
64 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTG-TTAGTAAAAAGATTTATTTTTTA
* * * * * *
69698 AATCTTCTACTTTTTAACTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
128 AATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCTTG
* * * ** * *
69763 TATGAATAGAAACAATTGA-TTTATGACAAAACAAATTGTCATAATGATTT-GAATAGATAATTG
192 TATGAATAGAAA-AAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGT-AT-A-GATTTAAAATAGATAATTA
* * * * * * * *** * * *
69826 TTTAAATAATCATAACTATTTGAACAAT-TCAGAAAACATATTTGCTTTTAAAAT-TTTTACTTA
253 TTCAAATAGTTATAATTATTTGAAC-TTGTTAGTAAA-ATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTA
* * * * ** *
69889 TTAATTTTAGGAATTTTAATAAATTTATATGATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAACAGAAC
316 TTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAT-TTATTTTATTTAG-AATAAGCTTATATG-ATA-AA-
* * * * * * *
69953 TAATTATTATATGACCAAACAAATGGTCATAAT-ATTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCA
375 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGAT-ATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * * *
70017 TAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTCATTTTTTTAATTCTCTTACTCATGAA-TTTTCA
438 TAACTATTTGAACATG-TTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * ** ** ** * * *
70081 GTATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTCAAATAAGCTAATATTAACTGAAACAATTATTTTA
501 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * ** * *
70146 TTACAAAAC---AGGTCACAATAATTTGAAATATATAACTATTTAAATAATCATGACTATTT-AA
565 TTGCAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
70207 CTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAAT
630 CTTGTTT-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTG-TAAAATATTAATAAAT
*
70272 TAATATTATTTTAAT
693 TAGTATTATTTT-AT
* * * * * * * *
70287 CCAAATAAGCTTATGTGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTT
1 CCGAATAAACTTGTAT-AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTT
70350 TTTTTGCAAA
Statistics
Matches: 9853, Mismatches: 2252, Indels: 1955
0.70 0.16 0.14
Matches are distributed among these distances:
667 7 0.00
668 10 0.00
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Consensus pattern (706 bp):
CCGAATAAACTTGTATAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAA
ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTGAACTTGTTAGTAAAAAGATTTATTTTTTAAAT
CTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCTGAAATAAGCTTGTATG
AATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAAAAAAAGGTATAGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATA
GTTATAATTATTTGAACTTGTTAGTAAAATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTG
GAATATTAATAAATTATTTATTTTATTTAGAATAAGCTTATATGATAAATAATTGTTTTATGACA
AAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTT
GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATTGCAAAACAAAAAGTTATAA
TGATTTGAAATAGATAATTATTCGAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTTGTAAACATATTTAT
TTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTGTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
Found at i:59397 original size:180 final size:177
Alignment explanation
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59139 GGACAAATAA
* * * * *
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* * * *
59213 ATAAGCTTCTATGATCAGAAATAATTGTTTTACGATAAAAC-AAAGATATTAACGATTTGAGACT
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** * *
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129 GAATAATCATT-TAAATAGCCATAACTATTTGAA-TAGATTCAGTAAACAT
* *
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1 ATTTATTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * *
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* * * * *
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127 ATGAATAATCATTTAAATAGCCATAACTATTTGAATAGATTCAGTAAACAT
*
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59566 GCATCTAAGT
Statistics
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TAAGCTTCTATGATCAAAAATAATTATTTTACGACAAAACAAAAGATATTAACGATTTGAAATGA
ATAATCATTTAAATAGCCATAACTATTTGAATAGATTCAGTAAACAT
Found at i:59649 original size:177 final size:180
Alignment explanation
Indices: 59149--59651 Score: 408
Period size: 177 Copynumber: 2.8 Consensus size: 180
59139 GGACAAATAA
* * * ** **
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* * * ** * * *
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65 CAAATAAGCTTGTATGTA-CAAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCTTAACGATTTGA
* * ** * * * * * *
59273 GACT-AATAATTGTTCT-AATAGTCATAACTATTTGAACTAGATTGA-TAAACAT
129 -AATAAACAATCATT-TAAATGGCCATAATTATTTTAA-TTGATTCAGTAAACAT
* *
59325 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTG
* * * *
59390 CAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATGATTTGAA
65 CAAATAAGCTTGTATGTACAAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCTTAACGATTTGAA
** *
59455 ATGGATAATCATTTAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCAGTAAACAT
130 ATAAACAATCATTTAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCAGTAAACAT
*
59506 ATTTATTTTTTAAA-T-TT-CTTATTAA-TTTAGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTG
1 ATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTAG-AAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTG
** * ** * *
59567 CATCTAAGTTTGTAT-TAACTTAAATAATTTTTTTATAACAAATCAAAAAGT-TATAACGACTTT
65 CAAATAAGCTTGTATGT-ACAAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCT-TAACGA-TTT
**
59630 -AAATAAACAATTGTTTAAATGG
127 GAAATAAACAATCATTTAAATGG
59652 TAAACAGATT
Statistics
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0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 19 0.07
177 97 0.36
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179 2 0.01
180 86 0.32
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (180 bp):
ATTTATTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTGC
AAATAAGCTTGTATGTACAAAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCTTAACGATTTGAAA
TAAACAATCATTTAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCAGTAAACAT
Found at i:59807 original size:691 final size:694
Alignment explanation
Indices: 59004--60258 Score: 1517
Period size: 691 Copynumber: 1.8 Consensus size: 694
58994 TTATTTTTTG
* *
59004 AATGTTAATAAATTTAGATTATTTTATTTTAAATAAGCATGTAAGATATGAAACAAATATTTTAT
1 AATGTTAATAAATTTAGATTAATTTATTCTAAATAAGCATGTAAGATATGAAACAAATATTTTAT
* * * * *
59069 AACTAAACAAAAGATTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTAAAA
66 AACTAAACAAAAGATCAGAACGATTTCAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTAAAA
* * * * * * * ***
59134 TGGTTGGAC-AAATAAATTTCTTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGT
131 TGATTCG-CTAAACAAACTTATATTTTAAATCTCTTATTAACTTTCAAAATATTATTAAATTAGT
* * * * * *
59198 ATTATTTTTAACCA-AATAAGCTTCTATGATCAGAAATAATTGTTTTACGATAAAA-CAAAGAT-
195 ATTA-TTTTAACCATAAAAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGATC
* * * * * *
59260 ATTAACGATTTGAGACTA-ATAATTGTTC-TAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATTGATAAAC
258 A-TAACAATTT-AAAATAGATAATCGTTCAT-ATAGTCATAACTATTTAAACTAGATTGACAAAC
* *
59323 ATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAT
320 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAT
* ** * ** * *
59388 TTCAAATAAGCTTGTATGTTCAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCT-TAATGATTT
385 TCCAAATAAAATAGTATGAACAAAAACAATTATTTGATGACAAAACAAAAGGT-TATAATGATTT
* * * * * * * * *
59452 GAAATGGATAATCATTTAAATGGCCATAATTATTTTAATTGATTCAGTAAACATATTTATTTTTT
449 GAAATAGATAATCATTCAAATAGCCAGAAGTATTTGAAATGATTCAGTAAACAGATTTACTTTTT
* * *
59517 AAA-T-TT-CTTATTAATTTAGAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTGCATCTAAGTTTG
514 AAACTCTTACTAATTAATTTACAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTGCATCTAAGTTTG
59579 TATTAACTTAAATAATTTTTTTATAACAAATCAAAAAGTTATAACGACTTTAAATAAACAATTGT
579 TATTAACTTAAATAATTTTTTTATAACAAATCAAAAAGTTATAACGACTTTAAATAAACAATTGT
59644 TTAAATGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAAGCTCTTTTCATTAATTCTCCA
644 TTAAATGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAAGCTCTTTTCATTAATTCTCCA
* * * * * * *
59695 AATGTTAATAAA-TTATTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ACTGGAATAATTGTTTT
1 AATGTTAATAAATTTA-GATTAATTTATTCTAAATAAGCATGTAAGATA-TGAAACAAATATTTT
* * *
59758 ATAACTAAACAAAAGATCAGAATGATTTCAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGA
64 ATAACTAAACAAAAGATCAGAACGATTTCAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTAA
*
59823 ATTGATTCGCTAAACAAACTTATATTTTAAATCTCTTATTAACTTTCAAAATATTATTAAATTAG
129 AATGATTCGCTAAACAAACTTATATTTTAAATCTCTTATTAACTTTCAAAATATTATTAAATTAG
* *
59888 TATTATTTTAATCATAAAAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGATCA
194 TATTATTTTAACCATAAAAAGCTTCTATGAACAAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGATCA
* * * * **
59953 TAACAATTTAAAATAGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTGGCAATTAGAT
259 TAACAATTTAAAATAGATAATCGTTCATATAGTCATAACTATTTAAACTAGATTGACAAACAGAT
* * ** * ***
60018 TTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTGTTAAATTAGTATTATTTTATTCCA
324 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCCA
* * * * * *
60083 AATAAAATAGTATGAACAGAACCAATTGTTTGATGACAATATAAAAGGTTATATTGATTTGAAAT
389 AATAAAATAGTATGAACAAAAACAATTATTTGATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
* * * **
60148 AGATAATTATTCAAATAGTCAGAAGTATTTGAAATGGTTTGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATC
454 AGATAATCATTCAAATAGCCAGAAGTATTTGAAATGATTCAGTAAACAGATTTACTTTTTAAA-C
* *
60213 TCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA
518 TCTTACTAATTAATTTACAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA
60259 CTTCGAACAA
Statistics
Matches: 460, Mismatches: 91, Indels: 22
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
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691 382 0.83
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693 1 0.00
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695 36 0.08
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (694 bp):
AATGTTAATAAATTTAGATTAATTTATTCTAAATAAGCATGTAAGATATGAAACAAATATTTTAT
AACTAAACAAAAGATCAGAACGATTTCAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTAAAA
TGATTCGCTAAACAAACTTATATTTTAAATCTCTTATTAACTTTCAAAATATTATTAAATTAGTA
TTATTTTAACCATAAAAAGCTTCTATGAACAAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGATCATA
ACAATTTAAAATAGATAATCGTTCATATAGTCATAACTATTTAAACTAGATTGACAAACAGATTT
ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
TAAAATAGTATGAACAAAAACAATTATTTGATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAG
ATAATCATTCAAATAGCCAGAAGTATTTGAAATGATTCAGTAAACAGATTTACTTTTTAAACTCT
TACTAATTAATTTACAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTGCATCTAAGTTTGTATTAAC
TTAAATAATTTTTTTATAACAAATCAAAAAGTTATAACGACTTTAAATAAACAATTGTTTAAATG
GTAAACAGATTTATTTTTTTAAAGCTCTTTTCATTAATTCTCCA
Found at i:60247 original size:181 final size:176
Alignment explanation
Indices: 59649--60258 Score: 510
Period size: 181 Copynumber: 3.4 Consensus size: 176
59639 ATTGTTTAAA
* * * * *
59649 TGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAAGCTCTTTTCATTAATTCTCCAAATGTTAATAAATTATTAT
1 TGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTT-ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * *
59714 TAATTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGGAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGATCAGA
63 TATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAAC-AGAACAATTGTTTTATAAC-AAACAAAAGATCATA
* * * * * *
59779 ATGATTTCAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAATTGATT
126 ATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTT
* * * * * * *
59830 CGCTAAACAAACTTATATTTTAAATCTC-TTATTAACTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
59894 TTTAAT-CATAA-AAAGCTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTACAACAAAAGAAAAGATCATAAC
66 TTTATTCCA-AATAAA-CTTGTATGAACAGAACAATTGTTTTATAAC-AAACAAAAGATCATAAT
* * *
59957 AATTTAAAATAGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTT-AAACTGGTT
128 GATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTT
* ** * * ** **
60006 TGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT-GGAATATTGTTAAATTAGTA
1 TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
60070 TTATTTTATTCCAAATAAAATAGTATGAACAGAACCAATTGTTTGATGACAATATAAAAGGTTAT
62 TTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAGAA-CAATTGTTTTATAACAA-ACAAAAGATCAT
* * * ** *
60135 ATTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAAGTATTTGAAATGGTT
125 AATGATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTT
* * *
60187 TGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGCAT
1 TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT--T-ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTAT
60252 TATTTTA
63 TATTTTA
60259 CTTCGAACAA
Statistics
Matches: 334, Mismatches: 78, Indels: 34
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.01
176 87 0.26
177 45 0.13
178 3 0.01
180 66 0.20
181 128 0.38
182 3 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (176 bp):
TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTCCAAATAAACTTGTATGAACAGAACAATTGTTTTATAACAAACAAAAGATCATAATGAT
TTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTT
Found at i:60332 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 60288--60332 Score: 72
Period size: 18 Copynumber: 2.6 Consensus size: 17
60278 AACAAAAACA
60288 ATTTTGTTTTTAGTATT
1 ATTTTGTTTTTAGTATT
*
60305 ATTTTACTTTTTAGTATT
1 ATTTT-GTTTTTAGTATT
60323 ATTTTGTTTT
1 ATTTTGTTTT
60333 ATGGCAAAAC
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 2, Indels: 2
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
17 9 0.36
18 16 0.64
ACGTcount: A:0.18, C:0.02, G:0.09, T:0.71
Consensus pattern (17 bp):
ATTTTGTTTTTAGTATT
Found at i:60829 original size:164 final size:163
Alignment explanation
Indices: 60620--60934 Score: 397
Period size: 164 Copynumber: 1.9 Consensus size: 163
60610 ATGTTAATAG
* *
60620 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATGACTAAACAAA
1 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGGATGAACTAAAACAATTATTATATGACAAAAC-AA
* * * *
60685 AGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAAC-ATTTGAACTTGTTCAGCAA
65 AGATTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-G-AA
*
60749 ACACA-TTTATTTTTTAAATCTCCTATTATTGTTAA
128 AAACAGTTTATTTTTTAAATCTCCTATTATTGTTAA
* * *
60784 ATTAGTATTATTTT-TATC-GAAATAAGCTTGGATGATC-ATAAACAATTATTTTATGAGAAAAC
1 ATTAGTATTATTTTAT-TCTG-AATAAGCTTGGATGAACTA-AAACAATTATTATATGACAAAAC
* * * *
60846 AAAGATTAGAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAA
63 AAAGATTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAA
*
60911 AAATAGTTTTATTTTTTAAATCTC
128 AAACAG-TTTATTTTTTAAATCTC
60935 TTGCTTATTA
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 15, Indels: 12
0.83 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
162 5 0.04
163 44 0.34
164 81 0.62
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Consensus pattern (163 bp):
ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGGATGAACTAAAACAATTATTATATGACAAAACAAA
GATTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAA
CAGTTTATTTTTTAAATCTCCTATTATTGTTAA
Found at i:61703 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 60781--64067 Score: 2372
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60771 CTATTATTGT
* * * * * * *
60781 TAAATTAGTATTATTTTTA-TCGAAATAAGCTTGGATG-ATCATAAACAATTATTTTATGAGAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGTTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
60961 TAAAGTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGTTTTTAGGAACTAAAAAAAATTGTTTTATGAGAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* ** * * * * * *
61025 AC-AAAAGCTTATAACAACTTAAAATTGTTAGAATGATTGTTCAAAAAGTTA-AATCTTTTTGAA
64 ACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAA----TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA
* * ** * ** * * *
61088 ATTTTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCGTGCTCATTAATTTTTCA-ACTATTAA
122 CTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAA
* ** * *
61149 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATTA-AAATAATTGTTTTATGACTAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
61213 TAAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGACAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTT
65 CAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * *
61278 GGCAAACACATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAC
129 GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * *** * * *
61331 TAAATTAGTAATGTTTTAATCCAAATAAGTTTGTATGAAAAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAT
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
61396 AAAAA-TCATAATGTTTTGAGATAGACAATTGTTCAAATTGTTATAATTATTTGAAC-TGTCTCG
66 AAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCG
* * * * *
61459 GAAAACAAATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAA
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* * * * * * * *
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1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * *
61572 AAAAAATCATAATGATTTAAAATAGATAATAT-TTCAAATGGGCATGACTACTTAAACTTGTTTG
66 AAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * ***
61636 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
130 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* ** *
61688 TAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAGGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
61752 -AAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTC
65 CAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * *
61816 AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAA
129 GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * *
61869 TAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTTTTATGAACAGAAACAATTAG-TTTATGACAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAG-TTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAA
* * * * *
61932 AACAAAAGGTCATAATGA-TCGAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATATCTATTTGAA-TGAG
63 AACAAAAAGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TG
*** * *
61995 TTCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTGA-AATATTAA
126 TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * *
62049 TAAATTTA-TATTATTTT-ATTTGTAATAAGCTTGCATGAATATAACCAATTGTTTTATGACAAA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * ***
62112 CCAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAACTGCTT-AGATAGTCATAATTATTTGAACACATT
64 ACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * *
62176 CGGTAAACA-ATTTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTCATTTTTAGAATATTAA
128 CGGTAAACATATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * *
62230 AAAATTAATATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * **
62294 CAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTTA
65 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
*
62359 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATATTAA
130 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAA
* *** * * * *
62411 TAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGGTTGTATGGATAGAAATAATTATTTTATGACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * **
62476 AAAAAGTCATAATAATTTAAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGAAC---TT--
66 AAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* * * *
62535 G------TATTTAGTTTTGAAATCTTTTACGTATTAATTGTCT-GAATATTAA
130 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAA
* **
62581 TAAATTTA-TATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGACCA-AGAAA-AATCATTTTATGACA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGTTTGTATGA--ATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * *** * * *
62642 AAA-AAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGT
62 AAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * *
62706 AT-GGTAAACATATTCAATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAA
127 -TCGGTAAACATATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
** * * * * * * *
62762 TAGCTTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTAG-ATTAACT-GAAATATTTTTTTTACGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTT-GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
62825 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAATCTTAACTATTTG-A-TTGGTT
64 ACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT
* * **
62888 CGATAAATATATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTAGAATATTTT
128 CGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
** * * * ** * *
62938 TAGTTTAGCAATATTTTACTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
63002 TAAAAA-TCATACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAAT-ATAACTATTTGAACTAG-TC
65 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * * *
63064 TGATAAACAGATTTAGTTTTTGAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAA
129 -GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * *
63114 TAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTATGACAAGAC
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** * * *
63179 AAAATA-TCATAATGATTTGCAATAGATAATAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCG
66 AAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG
* *** *
63243 GTAAACATATTTATTTTTTAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAGATTAA
130 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * ** *
63295 TAAATTAGTACTATCTT-ATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
63359 C----A---A-AA-GA--T---ATA-ACAA-T-TTCAAATA--AATAATTATTTAAACTCGCTT-
65 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTC
* * * * *
63404 AGTAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAGTTTTAA
129 GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAA
* * * * * * * *
63457 TAAATTAGTATTACTTT-ATTTCCAATAAGACTT-TACGGACAAAAATAATTAG-TTTATGACAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAG-TTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAA
** * * * * *
63519 AA-AAAGGGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TGTG
63 AACAAA-AAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TG
** * * * * * * *
63582 TTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-GTTTACTTATTAATCTTTGGAATATTAG
126 TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * * *
63637 TAAATTTGTATTATTTT-ATTCGAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* *
63701 CAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTT
65 CAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * * *
63766 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATTAA
129 GGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * *
63819 TAAGTTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTATATGAATTA-ATACTATT-TTTTATGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGTTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* ** * * * * * * *
63881 AC-AAAAGATTATAACAATCTAAAATAGATAATTATTCAAGTAGTTATTATTATTTGAACTTGTT
64 ACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
** * * *
63945 CAATAAACATACTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTCGAAATATTAA
128 CGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAA
* * * * * *
63998 TAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGTTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
64063 AAAAA
66 AAAAA
64068 TAGTTGTTTT
Statistics
Matches: 2484, Mismatches: 478, Indels: 289
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
161 3 0.00
162 99 0.04
163 6 0.00
164 7 0.00
166 3 0.00
167 3 0.00
169 49 0.02
170 80 0.03
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174 2 0.00
175 43 0.02
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189 9 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
TAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
AAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGG
TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
Found at i:62126 original size:361 final size:362
Alignment explanation
Indices: 60781--64066 Score: 2549
Period size: 361 Copynumber: 9.2 Consensus size: 362
60771 CTATTATTGT
* * * * *
60781 TAAATTAGTATTATTTT-TATCGAAATAAGC-TTGGATG-ATCATAAACAATTATTTTATGAGAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * *
60843 AAC-AAAGATTAGAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGT
64 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * * *
60906 TCG-AAAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGT
129 TAGTAAACATA--TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
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** * * * * * * * * ** *
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255 ATAATGATTTGAAA----TAG-ATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTCGTTCAGTA
* ** * * *
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314 AACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAA
** * *
61149 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAC-TTGTATGAATTA-AAATAATTGTTTTATGACTAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AA
* * * *
61212 ATA-AAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGACAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGT
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* * * * *
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* * * * * * * * *
61340 AATGTTTTAATCCAAATAAGTTTGTATGAAAAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAAATCAT
192 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCAT
* * * * * * * * * *
61405 AATGTTTTGAGATAGACAATTGTTCAAATTGTTATAATTATTTGAACT-GTCTCGGAAAACAAAT
257 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGT-TCAGTAAACATAT
* * *
61469 TTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAA
321 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * * * * *
61507 TAGATCAGTATTATTTTA-ATCTGAATAA-TTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTAGGATAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
** * * * * * * *
61570 ACAAAAAATCATAATGATTTAAAATAGATAATAT-TTCAAATGGGCATGACTACTTAAACTTGTT
65 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * ***
61634 TGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTA
129 TAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTA
** * * *
61698 TTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAGGACAAAAAAAAAGATCAT
193 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCAT
* ** * * *
61763 AATGATTTGAAATAAATAATCGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAATAGATT
257 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAACATATT
*
61828 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAA
322 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* *
61869 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTTATGAACAGAAACAATTAG-TTTATGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAA
* * *
61933 ACAAAAGGTCATAATGA-TCGAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATATCTATTTGAA-TGAGT
65 ACAAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGT
* ** *
61996 TCAAAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTTA-T
128 TTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGT
** * * ** *
62058 ATTATTTTATTTGTAATAAGCTTGCATGAATATAACCAATTGTTTTATGACAAACCAAAATGTCA
192 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCA
* ** * * * * *
62123 TAATGTTTTGAAATAGATAACTGCTT-AGATAGTCATAATTATTTGAACACATTCGGTAAACA-A
256 TAATGATTTGAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAACATA
* * * *
62186 TTTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTCATTTTTAGAATATTAA
320 TTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * *
62230 AAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGC-TTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
62294 CAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTTA
66 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTA
* *
62359 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATT
131 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
62423 ATTTTAATCCAAATAAGGTTGTATGGATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
195 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAA
* * **
62488 TAATTTAAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGAA--C-TT--G------TATTT
259 TGATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAACATATTT
* * * *
62541 AGTTTTGAAATCTTTTACGTATTAATTGTCT-GAATATTAA
323 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAA
* **
62581 TAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGC-TTGTATGACCA-AGAAA-AATCATTTTATGACA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGA--ATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* *** * * * *
62642 AAA-AAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGT
63 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
* * * * * **
62706 ATGGTAAACATATTCAATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAGCTTAGT
128 TTAGTAAACATATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
** ** * * * *
62771 ATTATTTTATTTTGAATAATTTTAG-ATTAACT-GAAATATTTTTTTTACGACAAAACAAAAGGT
192 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GT
* * * * * * *
62834 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAATCTTAACTATTTG-ATTGGTTC-GATAAATA
254 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAG-TAAACA
**
62897 TATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTAGAATATTTT
318 TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
** * * * * *
62938 TAGTTTAGCAATATTTTACTTCAAATAAG-TTTATATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
63001 ATAAAA-ATCATACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAAT-ATAACTATTTGAACTAGTC
65 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * ** *
63064 T-GATAAACAGATTTAGTTTTTGAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTA
129 TAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
** ** * * *
63124 TTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTATGACAAGACAAAATATCAT
193 TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT
* * * * * * *
63189 AATGATTTGCAATAGATAATAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATT
257 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAACATATT
* *** *
63254 TATTTTTTAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAGATTAA
322 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * *
63295 TAAATTAGTACTATCTTATTTCGAATAAAC-TTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
63359 C---A----A-AA-GA--T---ATA-ACAA-T-TTCAAATA--AATAATTATTTAAACTCGCTTA
66 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTA
* * * * *
63405 GTAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAGTTTTAATAAATTAGTATTA
131 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
63470 CTTTATTTCCAATAAGACTT-TACGGACAAAAATAATTAG-TTTATGACAAAA-AAAGGGGTTAT
196 TTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAATAATT-GTTTTATGACAAAACAAA--AGTCAT
* * * * * * * *
63532 AACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAGAT
257 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-CGTTCAGTAAACATAT
* * * *
63596 TTATTTTTTAAAT-GTTTACTTATTAATCTTTGGAATATTAG
321 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * *
63637 TAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAAATATG-TTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* *
63700 ACAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTT
65 AC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTT
* * * * * *
63765 TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTAT
129 TAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * *
63830 TATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAT--TAATACTATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATTA
194 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCA
** * * * * * * * * *
63892 TAACAATCTAAAATAGATAATTATTCAAGTAGTTATTATTATTTGAACTTGTTCAATAAACATAC
256 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAACATAT
* *
63957 TTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTCGAAATATTAA
321 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAA
* * * * * * *
63998 TAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAG-TTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
64062 CAAAA
66 CAAAA
64067 ATAGTTGTTT
Statistics
Matches: 2335, Mismatches: 454, Indels: 266
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
339 34 0.01
340 2 0.00
341 10 0.00
342 75 0.03
343 135 0.06
344 5 0.00
346 1 0.00
347 1 0.00
349 1 0.00
350 69 0.03
351 198 0.08
352 139 0.06
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355 1 0.00
356 23 0.01
357 339 0.15
358 138 0.06
359 9 0.00
360 135 0.06
361 364 0.16
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363 138 0.06
364 5 0.00
368 53 0.02
369 34 0.01
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371 4 0.00
372 5 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (362 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTA
GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATG
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTCAGTAAACATATTTATT
TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
Found at i:62246 original size:542 final size:535
Alignment explanation
Indices: 60613--64066 Score: 2569
Period size: 542 Copynumber: 6.5 Consensus size: 535
60603 TAAATAAATG
* * * * * *
60613 TTAATAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTATATGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
60676 CTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAAC-ATTTGAACT
65 CAAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
60739 TGTTCAGCAAACACATTTATTTTTTAAATC---T-CCTATT-A---TT-G-----T--TAAATTA
129 CGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
* * ** * * * *
60788 GTATTATTTTTA-TCGAAATAAGCTTGGATGATCATAAACAATTA-TTTTATGAGAAAAC-AAAG
194 GTATTATTTTAATTC-AAATAAGTTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * * *
60850 ATTAGAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAAT
258 -TCATAATGA-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TAGTTCAAAAAAC
* * *
60915 AGTTTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAA-GTAGTATTATTTTA
320 AGATTTA-TTTTTAAAT-T-TTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
* * * * * * * * * ** *
60979 TTTCAAATAAGTTTTTAGGAACTAAAAAAAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGCTTATAACAACT
380 TTTGAAATAAGTTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGA-CAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * * **
61044 TAAAATTGTTAGAATGATTGTTCAAAAAGTTA-AATCTTTTTGAAATT-TTTCAATAAACAAATT
443 TGAAA----TAG-AT-AATGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTT-GGTAAAC-AATT
* * *
61107 TATTTTTTAAAATCTCGTGCTCATTAATTTTTCA-ACTA
499 TATTTTTT-AAATCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATA
** *
61145 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATTA-AAATAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * *
61209 TAAATAAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGACAATTGTTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAACT
66 -AAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* ** * * * *
61273 AGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTACTAAATT
129 CGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT
* * * * * * * *
61337 AGTAATGTTTTAATCCAAATAAGTTTGTATGAAAAGAAAAAATT-GTTTTATGACAAAATAAAAA
193 AGTATTATTTTAATTCAAATAAGTTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * **
61401 TCATAATGTTTTGAGATAGACAATTGTTCAAATTGTTATAATTATTTGAACT-GTCTCGGAAAAC
258 TCATAATG-ATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TAGT-TCAAAAAAC
* * * * *
61465 AAATTTAGTTTTTAAA-TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGA-TCAGTATTATTTTAAT
320 AGATTTA-TTTTTAAATTTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTT-AT
* * * * * ** *
61527 CTG-AATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTAGGATAAAACAAAAAATCATAATGATTTA
381 TTGAAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * *
61591 AAATAGATAATATTTCAAATGGGCATGACTACTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTA
445 AAATAGATAAT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-ATTTATTTTTTA
** *
61656 AATCTCCAACTTATTAATTTTTAGAATA
508 AATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* *
61684 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAGGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGAC
* **
61748 AAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG
66 AAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG
* * *
61813 TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGT
131 TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
* *
61878 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTTATGAACAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGT
196 ATTATTTTAATTCAAATAAG-TTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAACAAAA-GT
* * * *
61942 CATAATGATCGAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATATCTATTTGAATGAGTTCAAAAAACAT
259 CATAATGATTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-AGTTCAAAAAACAG
*
62007 ATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGT
322 ATTTATTTTT-AAA-TTTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGA
* * * * * * *
62072 AATAAGCTTGCATGAATATAACCAATTGTTTTATGACAAACCAAAATGTCATAATGTTTTGAAAT
385 AATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * *** * *
62137 AGATAACTGCTT-AGATAGTCATAATTATTTGAACACATTCGGTAAACAATTTCATTTTTTAATT
449 AGATAA-TG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAATTT-ATTTTTTAAAT
*
62201 CTCTTACTCATTCATTTTTAGAATA
511 CTCTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * * *
62226 TTAAAAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATTAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
62290 AAAACAAAATG-TCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTT
66 AAAA-AAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTC
* *
62354 GTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATATTAATAAATTA
130 GTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTA
* * * * * *
62418 ATATTATTTTAATCCAAATAAGGTTGTATGGATAGAAATAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAAG
194 GTATTATTTTAATTCAAATAAGTTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAAC-AAAAG
* * * ** *
62482 TCATAATAATTTAAAATA-ATTAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTG-A-ACTT---------
258 TCATAATGA-TTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAGTTCAAAAAACA
* *
62535 GTATTTAGTTTTGAAATCTTTTACGTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTATATTATTTTA
321 G-ATTTA-TTTTTAAA--TTTTACTTATTAATT-T-TGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTA
* * * * ***
62599 TTTGAAATAAGCTTGTATGACCA-AGAAA-AATCATTTTATGACAAAAAAAAGGTTATAGCAATT
380 TTTGAAATAAGTTTGTATGA--ATAGAAACAATTATTTTATGACAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * * *
62662 TTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTATGGTAAACATATTCAATTTT
443 TGAAATAGATAA-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-ATT-TATTTT
* * * *
62727 TTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATA
505 TTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATA
** ** ** * * * * * *
62758 TTAATAGCTTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTAG-ATTAACT-GAAATATTTTTTTTACGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTT-GTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
62821 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACA-A-TCTTAACTATTTG-AT
65 CAAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAA-ATAGTCATAACTATTTGAAC
* * ** **
62883 TGGTTC-GATAAATATATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTAATTTTTAGAATATTTTTAGTT
128 TCGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT
* * * * * * * *
62943 TAGCAATATTTTACTTCAAATAAGTTTATATGAATAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAATAAAA
192 TAGTATTATTTTAATTCAAATAAGTTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
63007 ATCATACTAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAAAT-ATAACTATTTGAACTAG-TCTGATAA
257 GTCATAATGA-TTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAA-TAGTTC-AAAAA
* * * *
63070 ACAGATTTAGTTTTTGAA-TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-ATAGTATTATTTTA
318 ACAGATTTA-TTTTTAAATTTTACTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
* * * **
63132 TTTTG-AATAATTTTGTATGAATAGAAATAATTTTTTTATGACAAGACAAAATATCATAATGATT
380 -TTTGAAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAA-ACAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * *
63196 TGCAATAGATAATAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTT
443 TGAAATAGATAAT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-ATTTATTTTT
* *** * *
63261 TAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAGA
506 TAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * *
63291 TTAATAAATTAGTACTATCTTATTTCGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACTATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGAC
* ** * *
63355 AAAACAAAAGAT-ATAACAATTTCAAATAAATAATTATTT-AA-A--C-T--C-----G----C-
66 AAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG
* * * *
63402 TT-AGTAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAGTTTTAATAAATTAG
131 TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAG
* * * ** * * * *
63465 TATTACTTTATTTCCAATAAGACTTTACGGACAAAAATAATTAG-TTTATGACAAAA-AAAGGGG
195 TATTATTTTAATTCAAATAAGTTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAACAAA--AG
* * * * * * * * *
63528 TTATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATGTGTTTAGAAAATA
258 TCATAATGA-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-AGTTCAAAAAACA
* * * *
63593 GATTTATTTTTTAAATGTTTACTTATTAATCTTTGGAATATTAGTAAATTTGTATTATTTTATTC
321 GATTTA-TTTTTAAAT-TTTACTTATTAAT-TTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT
* * * * * *
63658 GAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTGA
383 GAAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGAC-AAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGA
* *
63723 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAA
446 AATAGATAA-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AATTTATTTTTTAA
* *
63788 ATCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATA
509 ATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATA
* * * * *
63815 TTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTA-ATACTATT-TTTTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * ** * * * * * * * *
63878 AAAACAAAAGATTATAACAATCTAAAATAGATAATTATTCAAGTAGTTATTATTATTTGAACTTG
66 AAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG
* * * * *
63943 TTCAATAAACATACTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTCGAAATATTAATAAATTAA
131 TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAG
* *
64006 TATTATTTTAATTCGAATAAGTTTTTATGAACAAAAATAATT-GTTTTATGACAAAACAAAA
195 TATTATTTTAATTCAAATAAGTTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAACAAAA
64067 ATAGTTGTTT
Statistics
Matches: 2343, Mismatches: 433, Indels: 284
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
515 21 0.01
516 3 0.00
517 2 0.00
518 6 0.00
519 61 0.03
520 63 0.03
521 1 0.00
522 5 0.00
523 84 0.04
524 163 0.07
525 6 0.00
526 45 0.02
527 64 0.03
528 9 0.00
529 6 0.00
530 12 0.01
531 105 0.04
532 267 0.11
533 203 0.09
534 101 0.04
536 1 0.00
537 14 0.01
538 137 0.06
539 126 0.05
540 94 0.04
541 179 0.08
542 334 0.14
543 23 0.01
545 41 0.02
546 43 0.02
547 4 0.00
548 2 0.00
549 2 0.00
550 112 0.05
551 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (535 bp):
TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATTAGAAACAATTGTTTTATGAC
AAAAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG
TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
ATTATTTTAATTCAAATAAGTTTTTATGAACAGAAATAATTAGTTTTATGACAAAACAAAAGTCA
TAATGATTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAGTTCAAAAAACAGATTT
ATTTTTAAATTTTACTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAG
TTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCA
TTAATTTTTAGAATA
Found at i:63520 original size:162 final size:162
Alignment explanation
Indices: 63253--63555 Score: 357
Period size: 162 Copynumber: 1.9 Consensus size: 162
63243 GTAAACATAT
*
63253 TTATTTTTTAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAGATTAATAAATTAGTACTATCTTATTTCG
1 TTATTTTTTAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAGATTAATAAATTAGTACTATCTTATTTCC
* * *
63318 AATAAACTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGATATAACAATTTCAAAT
66 AATAAACTTGTACGAACAGAAAATATTGTTTTATGACAAAA-AAAGAGATATAACAATTTCAAAT
63382 AAATAATTATTTAAACTCGCTTAGTAAATAGAC
130 AAATAATTATTTAAACTCGCTTAGTAAATAGAC
* *** * *
63415 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAGTTTTAATAAATTAGTATTA-CTTTATTT
1 TTATTTTTTAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAG-ATTAATAAATTAGTACTATC-TTATTT
* * * *
63478 CCAATAAGACTT-TACGGACA-AAAATAATTAG-TTTATGACAAAAAAAGGGGTTATAACGATTT
64 CCAATAA-ACTTGTACGAACAGAAAAT-ATT-GTTTTATGACAAAAAAA-GAGATATAACAATTT
* *
63540 GAAATATATAATTATT
125 CAAATAAATAATTATT
63556 CAAATAGTTA
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 16, Indels: 13
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
161 12 0.10
162 76 0.64
163 30 0.25
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (162 bp):
TTATTTTTTAAATATGAAACTTATTAATTTTTAGAAGATTAATAAATTAGTACTATCTTATTTCC
AATAAACTTGTACGAACAGAAAATATTGTTTTATGACAAAAAAAGAGATATAACAATTTCAAATA
AATAATTATTTAAACTCGCTTAGTAAATAGAC
Found at i:63981 original size:884 final size:876
Alignment explanation
Indices: 60781--64066 Score: 2595
Period size: 884 Copynumber: 3.7 Consensus size: 876
60771 CTATTATTGT
* * * * * *
60781 TAAATTAGTATTATTTT-TATCGAAATAAG-CTTGGATGATCATAAACAATTATTTTATGAGAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGACTTGTAGGA-CA-AAAAAATTAGTTTATGACAAA
* * * * * ** * * *
60844 ACAAAGATTAGAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTC
63 AAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA
* * * * * * *
60908 GAAAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATT
128 G-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
60973 ATTTTATTTC-AAATAAGTTTTTAGGAACTAAAAAAAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGCTTAT
192 ATTTTATTTCGAAATATGTTTGTATGAAC-ATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * * * *
61037 AACAACTTAAAATTGTTAGAATGATTGTTCAAAAAGTTA-AATCTTTTTGAAATTT-TTCAATAA
256 AATGATTTGAAA----TAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTG-AATTTGTTTAGTAA
* ** * *
61100 ACAAATTTATTTTTTAAAATCTCGTGCTCATTAATTTTT-CAACTATTAATAAATTAGTATTATT
314 ACATATTTATTTTTT-AAATCT--TTAT-ATTAATTTTTGGAA-TATTAATAAGTTAGTATTATT
** * * * * * *
61164 TTATTTTGAATAAACTTGTATGAATTAAAATAATTGTTTTATGACTAAATA-AAAAGGTCAAAAT
374 TTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTAAACT-ATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAAGATCATAAC
* * * * * **
61228 GATTTGAAATAGACAATTGTTCTAA-TAGTCT-TAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTT
436 AATTTGAAATAGATAATTATTC-AAGTAGT-TATAATTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-ATTT
* * *** * * * * * * * *
61291 ATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTACTAAATTAGTAATGTTTTAATCCAAA
498 AGTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCGAA
* * * * * * *
61356 TAAGTTTGTATGAAAAGAAAAAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAATGTTTTGAGATAG
562 TAA-TTTTTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCACAATGATTTGAAATAG
* ** * ** * * * * * * *
61420 ACAATTGTTCAAATTGTTATAATTATTTGAAC-TGTCTCGGAAAACAAATTTAGTTTTTAAATCT
626 ATAATAATTCAAATAGACATCACTATTTGAACTTGT-TCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATAT
* * * * * * ** ** *
61484 ----CTTATTAATTT-TCA-AAATATTAATAGATCAGTATTATTTTAATCTGAATAATTTTGCAT
690 GAAACTTATT-ATTTGT-AGAAAGATTAATAAATTAATACTATCTTAATCCAAATAAACTTGTAT
* * * * ** *
61543 GAATAGAAACAATTATTTTAGGATAAAACAAAAAATCATAATGATTTAAAATAGATAA-TATTTC
753 GAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTA-TTC
* ***
61607 AAATGGGCATGACTACTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTA
817 AAAT----A-G--T-C----A--------GTAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
61672 ATTTTTAGAATATTAA
862 ATTTTT-GAATATTAA
* * *
61688 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-AATTGTATGA-ATAGAAACAATT-GTTTTAGGACAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGACTTGTAGGACA-A-AAA-AATTAG-TTTATGAC-A
* * * * * *
61750 AAAAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATCGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTT
61 AAAAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * *
61815 CAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTAT
126 TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
61880 TATTTTATTTC-AAATAAGCTTTTTATGAACAGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTC
191 TATTTTATTTCGAAATATG-TTTGTATGAACATAAATAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * ** * **
61943 ATAATGA-TCGAAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATATCTATTTGAATGAGTTCAAAAAACAT
254 ATAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAT
* * * *
62007 ATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT
318 ATTTATTTTTTAAATCTTTA--TATTAATTTTTGGAATATTAAT-AAGTTAGTATTATTTTATTT
** ** * * * ***
62070 GTAATAAGCTTGCATGAATATAACCAATTGTTTTATGACAAACCAAAATG-TCATAATGTTTTGA
380 CAAATAAGCTTATATGAAT-TAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGA
** * * * *
62134 AATAGATAACTGCTT--AGATAGTCATAATTATTTGAAC-ACATTCGGTAAACAATTTCATTTTT
443 AATAGATAA-TTATTCAAG-TAGTTATAATTATTTGAACTA-GTTCGATAAACAATTT-AGTTTT
* * * * * * *
62196 TAATTCTCTTACTCATTCATTTTTAGAATATTAA-AAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGC
504 TAAATCT-TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAA-TAATATTATTTTATTTCGAATAA-T
* * * *
62260 TTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCACAATGATTTGAAATAGATAAT
566 TTTTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCACAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * ***
62325 TATTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACT
631 AATTCAAATAGACATCACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATGAAACT
* * * ** *
62390 TATTATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGGTTGTATGGATAGAA
696 TATTATTTGTAGAAAGATTAATAAATTAATACTATCTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
* *
62455 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTAAAATAATTAATTATTCAAATAGTCA
761 ATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA
* * *
62520 -TAAAGATTTGAACTTGTATTTAGTTTTGAAATCTTTTACGTATTAATTGTCTGAATATTAA
826 GT-AA-A-TAG-AC-T-TA-TT--TTTT-AAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAA
* * * *
62581 TAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTGTATGACCAAGAAAAATCATTTTATGACAAA
1 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGACTTGTAGGA-CAA-AAAAATTAGTTTATGACAAA
* * * * * * * *
62644 AAAAAGGTTATAGCAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTATG
63 AAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTA
* * * * **
62709 GTAAACATATTCAATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAGCTTAGTATT
128 GTAAATAGATT-TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
62774 ATTTTATTTTG-AATAAT-TTTAG-ATTAAC-TGAAATATTTTTTTTACGACAAAACAAAAGGTC
192 ATTTTATTTCGAAAT-ATGTTT-GTATGAACAT-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * *
62835 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAATCTTAACTATTTG-A-TTGGTTCGATAAATAT
254 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAG-TAAACAT
* * * * * *
62898 ATTTATTTTTTAAATCTTT-TATTAATTTTTAGAATATT-TTTAGTTTAGCAATATTTTACTTCA
318 ATTTATTTTTTAAATCTTTATATTAATTTTTGGAATATTAATAAG-TTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * *
62961 AATAAGTTTATATGAATAGAAAATTTTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCAT-ACTAATTTGAAA
382 AATAAGCTTATATGAAT-TAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC-AATTTGAAA
* * ** * *
63024 TAGATAATTGTTCAAATAAATATAACTATTTGAACTAG-TCTGATAAACAGATTTAGTTTTTGAA
445 TAGATAATTATTCAAGTAGTTATAATTATTTGAACTAGTTC-GATAAACA-ATTTAGTTTTTAAA
* *
63088 TC--T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTAT
508 TCTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCGAATAATTTT-TAT
* * * *
63150 GAATAGAAATAATTTTTTTATGACAAGACAAAATATCATAATGATTTGCAATAGATAATAATTCA
572 GAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCACAATGATTTGAAATAGATAATAATTCA
* * *
63215 AATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATATGAAACTTATTAA
637 AATAGACATCACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATGAAACTTATT-A
* * * * *
63280 TTTTTAG-AAGATTAATAAATTAGTACTATCTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACT-A
701 TTTGTAGAAAGATTAATAAATTAATACTATCTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAA-TAA
* * * * *
63343 TTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGAT-ATAACAATTTCAAATAAATAATTATTTAAACTCGCTTAG
765 TTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAA-TAG-TCAG
*
63406 TAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAGTTTTAA
827 TAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAA
* *
63457 TAAATTAGTATTACTTTATTTCCAATAAGACTT-TACGGACAAAAATAATTAGTTTATGACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGACTTGTA-GGACAAAAA-AATTAGTTTATGACAAAA
* * * *
63521 AAAGGGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TGTGTTT
64 AAA-AGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTT
* * * * *
63585 AGAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-GTTTACTTATTAATCTTTGGAATATTAGTAAATTTGTATT
127 AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
*
63649 ATTTTA-TTCGAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGGTCAT
192 ATTTTATTTCGAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCAT
*
63713 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATT
256 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACATATT
63778 TATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAA
321 TATTTTTTAAATCT-TT-AT-ATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAA
* * *
63843 ATAAGCTTATATGAATTAATACTATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACAATCTAAAATA
383 ATAAGCTTATATGAATTAA-ACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATA
* * * *
63907 GATAATTATTCAAGTAGTTATTATTATTTGAACTTGTTCAATAAACATACTTA-TTTTTAAATCT
447 GATAATTATTCAAGTAGTTATAATTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-ATTTAGTTTTTAAATC-
* * * *
63971 TTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGTTTTTATGA
510 TTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCGAATAA-TTTTTATGA
* *
64036 ACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
574 ATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
64067 ATAGTTGTTT
Statistics
Matches: 1929, Mismatches: 345, Indels: 233
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
874 6 0.00
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878 8 0.00
879 2 0.00
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Consensus pattern (876 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGACTTGTAGGACAAAAAAATTAGTTTATGACAAAAAA
AAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTA
AATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTTCGAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACATATTTATTT
TTTAAATCTTTATATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
ATATGAATTAAACTATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
TCAAGTAGTTATAATTATTTGAACTAGTTCGATAAACAATTTAGTTTTTAAATCTTTACTTATTA
ATTTTCAAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTCGAATAATTTTTATGAATAGAAATAATT
GTTTTATGACAAAACAAAATATCACAATGATTTGAAATAGATAATAATTCAAATAGACATCACTA
TTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATATGAAACTTATTATTTGTAGAAAGATTA
ATAAATTAATACTATCTTAATCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAA
CAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAGTAAATAGACTTATTTTTTA
AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAA
Found at i:64059 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 63413--64066 Score: 694
Period size: 180 Copynumber: 3.6 Consensus size: 180
63403 TAGTAAATAG
* * * *
63413 ACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAGTTTTAATAAATTAGTATTACTTTATTT
1 ACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
* ** * * *
63478 CCAATAAGACTTTACGGACAAAAATAATTAG-TTTATGACAAAA-AAAGGGGTTATAACGATTTG
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* * *
63541 AAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATGTGTTTAGA-AAATAG
129 AAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAAT-TGTTTA-ATAAACAA
* * * * * *
63594 ATTTATTTTTTAAAT-GTTTACTTATTAATCTTTGGAATATTAGTAAATTTGTATTATTTT-ATT
1 ACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
* * * * * *
63657 CGAAATATGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGGTCATAATGATTTG
66 CG-AATAAGTTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTTATAACGATTTG
* * *
63722 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAA
129 AAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TTGTTTAATAAACAA
* * * * * * *
63775 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTT
1 ACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
* * * * * * * * * *
63840 CAAATAAGCTTATATGAATTAATACT-ATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACAATCTAA
66 CGAATAAGTTTTTATGAA-CAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGA
* * * * *
63903 AATAGATAATTATTCAAGTAGTTATTATTATTTGAACTTGTTCAATAAACAT
130 AATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TTGTTTAATAAACAA
* * *
63955 ACTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATT
1 ACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
64019 CGAATAAGTTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
66 CGAATAAGTTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
64067 ATAGTTGTTT
Statistics
Matches: 385, Mismatches: 77, Indels: 23
0.79 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
178 4 0.01
179 72 0.19
180 147 0.38
181 99 0.26
182 57 0.15
183 6 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
ACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT
CGAATAAGTTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
ATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGTTTAATAAACAA
Found at i:65253 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 64133--65614 Score: 954
Period size: 181 Copynumber: 8.3 Consensus size: 178
64123 AATAAGCTCA
* * * * * * * *
64133 TATGAA-TAGAAAGAATTTTTTTATGATAAAGCAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATGATTA
1 TATGAACTA-AAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG
* * ** * * * * *
64197 TTCAAATAGCTATAACTATTTGAACTTGTTCAATAGATATATTCATTTTTTAAATCT-TTACTTG
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-AT-
* * * * * * *
64261 TTAATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGAATTATGTTATTTTGAATAAGA-TTG
128 ATAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA-ACTTG
* * * * * * * **
64313 TATGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTAC
1 TATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * ** *
64378 TCAAACAGTCATAAATGTTTGCACTAGTCATAAAGGCT-AACAAATACATTTTCTAAATC-CTT-
66 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGT--T--CGG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
64440 -TACT--TATT--AAT-TT--TAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAGA-TTG
126 ATA-TAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA-ACTTG
* * *
64486 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-AAAATGGTCATAAC-ATTTGAAATAAATAATT
1 TATGAACTA-AAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAA-GGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
* ** * * *
64548 GTTCAAATAGTTATAACTAATCAAACTAGCTT-GGTAAACACATTTATCTTTTAAATCTCTT-AT
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-GGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAAT
* * * * * * *
64611 -TAATTTTCAAGATATTAATAAGTTAATATTATTTTATTCTGAACAAATTTA
128 ATAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTG
* * * * * *
64662 TATGAACAAAAACATTTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAGATAACTGT
1 TATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
64727 TCAAATA-TTCATAATTATTTAAACTAGTTCAGCTAATA-AAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACC
66 TCAAATAGTT-ATAACTATTTGAACTGGTTC-GGTAA-ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-A
* * * *
64789 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCAAT-TTATTTTATTCCAAAT-AAGTTAG
127 TA-TAA-TTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTAAATAAACTT-G
* * * * ** * * *
64843 TAAGAGCTGAAAAAAATTATTTTGCAATAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAACT-AAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
64908 TTCATAA-AGCCT-TAACTATTTGAAATGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTAG
65 TTCA-AATAG-TTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTA-
* * * * ** *
64971 TTATTAATTGTCAAAATACTATTAGGTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTG
126 ATA-TAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTG
* * * *
65026 TATGAAC-AGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATG-TAATT
1 TATGAACTA-AAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-GATAATT
* * * * *
65089 GTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAAATTATTTTTTAAATCACTTACAT
64 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-AT
* * * *
65154 ATAAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTATGAATAAACTTG
128 AT--AATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTG
* * * * *
65207 GATGAGCTAAAATAAGTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
1 TATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
* * * ** * **
65272 TTATATAATCT-TAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTTGTTA
66 TCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTAATA
* * * * *
65336 TGAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAATTTA
129 T-AA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTG
* * ** *
65388 TATGAACAAAAATAATTATTTTATGTTAAAACAAAAGG-CTATAACAATTTAAAATAGATAATTG
1 TATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTC-ATAACAATTTGAAATAGATAATTG
* ** * * * *
65452 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTGTTTTTTGAATCTC-GAA-CT
65 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATAT
* *
65515 AATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTGTTGTTTTATT-TCAAATAAACTTG
130 AATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTTG
* * *
65565 TAT-ATTA-AAAAATAATTGTTTTATAACAAAACGAAAGGT-ACTAACAATTT
1 TATGA--ACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTT
65615 TACTTGAAAT
Statistics
Matches: 1020, Mismatches: 216, Indels: 135
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
167 1 0.00
168 19 0.02
169 3 0.00
170 4 0.00
171 1 0.00
172 39 0.04
173 66 0.06
174 2 0.00
175 3 0.00
176 70 0.07
177 135 0.13
178 11 0.01
179 2 0.00
180 85 0.08
181 335 0.33
182 163 0.16
183 58 0.06
184 22 0.02
185 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TATGAACTAAAATAATTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAATATA
ATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTG
Found at i:66361 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 65641--70349 Score: 3501
Period size: 181 Copynumber: 26.2 Consensus size: 180
65631 GTATGTTGAA
* * ** * * *
65641 AAACAATTGTTTTCTAACAAAATGAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT-GA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-
* * * * ***
65705 TCGTAATTATTTGAACT-GATTTATTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAG-TTCA-GAAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * *** * * *
65769 CAAAATATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTGTGAA-ATG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA-G
* * * * *
65822 AAACAATTGTTTTAGGACAAAATAAAA-AT--TCATAA--TG----AGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * *
65878 CATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAG-AAAACAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTT
* * * **
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128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * * ** *
65995 AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
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65 TCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGAAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
66123 TAAAATATGATTAAATTAGTATTATTTT-TATCCAAATCAGCTTGTATG-ATCAG
128 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AG
* * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
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* **
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* * * * * * * * * * *
66538 AAATAATTGTTATATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATGGATAACTATTCTAATAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
66603 C-TGAACTATTTAAACTACTTC-GACAAACATCTTTATTTTTTAAATCTATTACTTATAAATTTT
66 CAT-AACTATTTGAACTAGTTCAGA-AAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
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* * * ** * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * **
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** * *
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* * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
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* *
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* *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
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* ** * *
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* * *
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1 AAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * * * *
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* * * *
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* * *
67434 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTT-AAATTAGATAATTATTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
67498 TCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACAGATTCATGTTTTGAATCTTTTAATCATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAGA-AAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* *
67562 T-AGAATATTAATAAATTAGTGA-TGTTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-G
128 TGA-AATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
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66 CATAACTATTTGAACTAGTTCAGA-AAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* ** * * * * * *
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129 GAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * *
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1 AAACA-ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** ** * * *
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* * * * * * *
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** *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
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** * * * * * *
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* * *
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* * * ** **
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** * * ** *** * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* ** * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* *
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* * * *
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** * * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** ** * * * * * * * *
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** * * * * * * * * *
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** * * * * * * * * ****
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815 ATTCCAAATAAGTC-ACTAAGAATAGAAAAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * **
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* * * ** *
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* * *** * *
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* * * * * ** ** *
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128 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACA-ATCTAAAATATATAATTGTTCAAATAT
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* * * * * *
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255 GA-AATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATGTA-AAACAATTGAT
* * ** *
67085 TTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAAT-ATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
317 TTATGACAAAACAAAAGTTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAATTATT
* * * * * * * *
67148 T-AAGCTTA-CTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-ATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
381 TGAA-CTAATTTGA-TAAACAGACTTATTTTTTAAATATC--TAACTTATCAATTTTTAAAATAT
* ** * * * * * * *
67210 TAGTAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGGACA-GAAATAATTAG-TTTATCA
442 TAATAAAGAAATATTATGTTATTTTAG-ATAAACTTGTACGTA-ATAAAATAATT-GTTTTATGA
* * * * * * **
67272 CAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGCAATAGATAATTGTTCAAATACTCAGAACTATGCGAA-T
504 TAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * * * * * *
67335 GT-GTTTAGAAAACAAATT-T-A-TTTTTTAAATT-TTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATA
568 -TAG-TCGGCAAATAGATTATCATTTTTTTAAATTCCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * * * *
67395 AATT--TAATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACA
631 AATTAGT-ATTATTATATTTCGAACAAGCATGTATGAATAGAAACAA---TATT-TGAT--AACA
* * * * * * * *
67458 AAAGGTCATAACAATTT-AAATTAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-
689 AAAGATCAAAACAATTTGAAA-TAAATAATTGTTCAAACAGTCCTAACTATTTGAACTAGTTTAG
* * * * * * * *
67521 ATAAACAGATTCATGTTTTGAATCTTTTAATCATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTGAT
753 A-AAACAAATTTAT-TTTTAAATC--CT--T-ATTAAGTTTTGA-AATAGTAATAAATTGGTGTT
* * * * * * * * *
67585 GTTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAACT-GATACAATTGTTTT-CTGATAAAACAATAGGTCA
810 ATTTTATTCCAAATAAG-TCACTAAGAA-TAGAAAAAATTATTTTAC-GACAAAACAAAAGGTCA
** * **
67647 TAATGATTTGAAATAGATAATT
872 TAACAATTTGAAATAGAGAACA
** ** ** * * * * * *
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1 ATTCAAATAGACAAAACTATTTGAACTAATTCGACAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTT
* * * * * ** ** * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* **
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* * * * *
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314 GATTTATGACAAAAC-AAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAT
* * ** * * *
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377 TATTTGAACTAATTTGATAAACAGACTT-ATTTTTTAAATATCTAACTTATCAATTTTTAAAATA
* * *
68112 TTAATAAA-ATAGA-ATTATGTTATTTCTA-ATGAGCTTGTACG-AATAGAAATAATTGTTTTGT
441 TTAATAAAGA-A-ATATTATGTTATTT-TAGATAAACTTGTACGTAATA-AAATAATTGTTTTAT
* *
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* * *
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* * **
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630 AAATTAGTATTA-TTATATTTCGAACAAGCA-TGTATGAATAGAAACAATATTTGATAACAAAAG
* * ** * *
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* * * *
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*
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**
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* * * ** ** *
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1 ATTCAAATAGACAAAACTATTTGAACTAATTCGA-CAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACT
* * * * * *
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* * * * *
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* *
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193 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTAACTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTGA
*
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* * * *
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* * *
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384 ACTAATTTGATAAACAGACTTATTTTTTAAATATCTAACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * * * *
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* * * ** * * *
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514 GGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTAGTCGGCAAA
* * * * *
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* *
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* * * * **
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* *** * ***
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768 TTAAATCCTTATTAAGTTTTGAAATAGTAATAAATTGGTGTTATTTTATTCCAAATAAGTCACTA
* ** * * * *
69404 TGAATAGAAATGATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAACA
833 AGAATAGAAAAAATTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAGAACA
* ** * * *
69465 ATTCAAATGGACAAAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
1 ATTCAAATAGACAAAACTATTTGAACTAATTCGACAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTT
* * *
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* * *
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* * * * *
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196 ACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAATAG-ATTAACTT-TTTAAATCTT-TACTTATTAATTTTTGA
** *
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257 AATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATGTA-AAACAATTGATTTA
* * ** *
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ATTAATTTTCAGAATAATAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAACAAAAA
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TTAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATGTAAAACAATTGATTTATGACAA
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TATGTTATTTTAGATAAACTTGTACGTAATAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA
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TCATTTTTTTAAATTCCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTATATTTC
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ATTGTTCAAACAGTCCTAACTATTTGAACTAGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTAAATCCTTATT
AAGTTTTGAAATAGTAATAAATTGGTGTTATTTTATTCCAAATAAGTCACTAAGAATAGAAAAAA
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*
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*
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Statistics
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ACTATTTCAAATAACTAT
Found at i:70811 original size:179 final size:180
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** * * *
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* * * * * * *** * ** *
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* * * ** * * * *
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* * ** ** * * * ** *
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* * * *
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** * * * ** *
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*
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* * * *
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* * *
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* * ** * * * *
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1 CAAATAATTATGACTA-TCAAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
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Statistics
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AAATAAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAGCTATTGAATGAACAAGTG
Found at i:71457 original size:181 final size:181
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71025 TTAAAAAATT
* *
71035 ATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA
1 ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * * ** *
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* *
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* * *
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* * * *
71282 TATCAATTCATATAGGCTTATTCGAAA-TGAAATAAAACTAACTTATTACTATTTCAAAAATTAA
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* * * * * * * * * *
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** * * * * *
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*
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71491 CTATTTACTA
Statistics
Matches: 228, Mismatches: 41, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (181 bp):
ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
TTTCTATTCATATAGCTTATTCAAATTAAAATAAAACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
AGTAAAAGATTTAAAAAAAGAAATATGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTA
Found at i:71460 original size:483 final size:479
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Period size: 483 Copynumber: 2.9 Consensus size: 479
70547 AATTAGTTAA
* ** * * *
70557 AACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCATTATGACCATTTG-TTTGATCATAAAACAATTGT
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* * * * ** *
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* ** ** ** ** * * * * * *
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129 AAGTAAAG-ATTTA-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGA
* * ***
70746 AAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTTTGTTCATA
192 AAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA
* * * * * * *
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**
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* *
70940 TCAAATTGCTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTTATTTCG
384 TCAAATTGTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGC-TTATTTCA
* * *
71005 AATATGTTTACTGAATAATTTTAAAAAATTAT
448 AATATATTTACTAAATAATTTCAAAAAATTAT
71037 AACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATT
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* *
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*
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131 GT-AAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGAAAA
*
71232 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTATCAATTCATATAG
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* * *
71297 GCTTATTCGAAATGAAATAAAACTAACTTATTACTATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAA
260 GCTTATTCAAAAT-AAATAATACTAACTTATTACTATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
71362 GAAAGGAATTTGCTTATCGAATAAGTTTAAATAGTTATCGCTATTTGCACAATTGTCTATTTCAA
324 AAAATGAATCTGCTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GCTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
*
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388 ATTGTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAA-TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATA
* *
71492 TATTTACTAAATAATTTCAAATAGTTAT
452 TATTTACTAAATAATTTCAAAAAATTAT
* * *
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* * * *
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*
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* ** ** * *
71714 AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATATT
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* * *
71844 AAAAAATGAATCCGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
322 AAAAAATGAATCTGCTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * *
71909 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAA
386 AAATTGTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA
71974 CAAAATAATA
Statistics
Matches: 819, Mismatches: 104, Indels: 24
0.86 0.11 0.03
Matches are distributed among these distances:
479 10 0.01
480 114 0.14
481 30 0.04
482 5 0.01
483 517 0.63
484 143 0.17
ACGTcount: A:0.39, C:0.11, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (479 bp):
AACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATT
TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA
GTAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGAAAAA
TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAGG
CTTATTCAAAATAAATAATACTAACTTATTACTATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAA
AATGAATCTGCTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
GTTATAACCTTTTGTATTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATATATT
TACTAAATAATTTCAAAAAATTAT
Found at i:71594 original size:120 final size:119
Alignment explanation
Indices: 71381--71609 Score: 302
Period size: 120 Copynumber: 1.9 Consensus size: 119
71371 TTGCTTATCG
** *
71381 AATAAGTTTAAATAGTTATCGCTATTTGCACAATTGTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTA
1 AATAAGTTTAAATAGTTATCGCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTA
* *
71446 TTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATCTATTTACTA
66 TTGCCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCCTA-TTCAAATCTATTTACTA
* *
71501 AATAA-TTTCAAATAGTTAT-GACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
1 AATAAGTTT-AAATAGTTATCG-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG
* * * *
71564 TTTTGCCATAAAATAATTATTTT-TGTTCATACCAGCCTATTCAAAT
64 TATTGCCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCCTATTCAAAT
71610 TAAAATAATA
Statistics
Matches: 95, Mismatches: 11, Indels: 7
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
119 11 0.12
120 80 0.84
121 4 0.04
ACGTcount: A:0.34, C:0.14, G:0.07, T:0.45
Consensus pattern (119 bp):
AATAAGTTTAAATAGTTATCGCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTA
TTGCCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCCTATTCAAATCTATTTACTA
Found at i:71829 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 71487--73097 Score: 1548
Period size: 182 Copynumber: 8.9 Consensus size: 181
71477 AGCTTATTTC
* * * * * *
71487 AAATCTATTTACTAAATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGT
1 AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
* * * * * * * *
71552 TATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACCAGCCTATTCAAATTAAAATA
66 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * *
71617 ATATTAATTTATTAATATAT-CAATAATTAATAAGTGAAAGATTTAAAAAAAT
131 ATACTAATTTATTAATAT-TCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTT-AAAAAAT
* * * * *
71669 AAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGAACAATTATTTATTTCAAATCAT
1 AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
** * * ***
71734 TATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATATTGGCTTATTCAAAATAAAATA
66 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * *
71799 ATACTAACTTATTACTATTCCAAAAATTAATTGAGT-AAGAGATTTAAAAAAT
131 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-TAAGTCAA-AGATTTAAAAAAT
* * * * *
71851 GAATCCGCTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
1 AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
* * * *
71916 TATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTC-AAACAAAAT
66 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT
* *
71980 AATA-TAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAATAAGT-AAA-ATTTTAAAAAAT
130 AATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGA-TTTAAAAAAT
* * * * * *
72031 AAATCTGTTTTCTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCACATTGT
1 AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
* * * *
72096 TATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAACTAATTGTTTCTCTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAAT
66 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
*
72160 AATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAAT
130 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAAT
* * *** * * *
72212 AAATCCGTTTATCAAGTGAGCTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAAATTATTTATTTCAAATCG
1 AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATTTATTTCAAATCG
* * ** * *
72277 TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAAT
65 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
*** *
72342 AATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACT
130 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAAT
* * ** * *
72390 AAATTTATTTACTGGACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TTCTATCTCAAATC
1 AAATCTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT-TATTTCAAATC
* * * ** ** *
72453 GGTATGATC-TTAGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TCTATACAAATTTATTCGGAGTAAA
64 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * ** * * ** *
72516 ATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTTCTAAG-CAAGAGATTTAAAAAGT
128 ATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAA-AGATTTAAAAAAT
* * * * * * *
72570 AAATGTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
1 AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
* * * *
72635 TTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAAT
66 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* * * *
72699 AATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-CACAAAATTTTAAAAAAAT
130 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCA-AAGA-TTT-AAAAAAT
* * * * *
72753 AAATCTATTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTT-TTTAAAATCA
1 AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTCAAATCG
** * * *
72817 TTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAATAATTGTTTC-ATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA
65 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * ***
72881 TAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGA-TTAAAAACAT
129 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAA-AT
* * * * * *
72934 AAAT-TAGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATC
1 AAATCT-GTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC
* * * * *
72997 GTTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACCAACCTT-TTCAGAATAA
64 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAA
*
73060 AATAATACTAATCTATTAATAATT-C-AAAATTAATAAGT
127 AATAATACTAATTTATTAAT-ATTCCAAAAATTAATAAGT
73098 AGGAGATTAT
Statistics
Matches: 1174, Mismatches: 216, Indels: 80
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.00
176 75 0.06
177 24 0.02
178 40 0.03
179 13 0.01
180 231 0.20
181 235 0.20
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184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAAT
Found at i:72658 original size:539 final size:537
Alignment explanation
Indices: 71487--73096 Score: 1700
Period size: 544 Copynumber: 3.0 Consensus size: 537
71477 AGCTTATTTC
* * * *
71487 AAATCTATTTACTAAATAATTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATTTATTTCAAATTG
1 AAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTG
* * * * *
71551 TTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACCAGCCTATTCAAATTAAAAT
65 TTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAAT
* * * * *
71616 AATATTAATTTATTAATATAT-CAATAATTAATAAGTGAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTA
128 AATACTAATTTATTAAAAT-TCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * *
71680 CCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTACTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
192 TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* *** *
71745 GTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATATTGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTA
257 GTTTCATCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATA-AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * **** *
71810 TTACTATTCCAAAAATTAATTGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCCGCTTAC-CAAACAAGTTC
320 TTAATATTTCAAAAATTAA---AGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTACTGAAACAA-TTC
* * *
71874 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAA
381 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
71939 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCAAACAAAATAATATAAATTTACTAATATTCCAA
446 AACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTCAAACAAAATAATATAAATCTAATAATATTCCAA
* *
72004 AGATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAAT
511 AAATTAATAAGCAAAATTTTAAAAAAT
* * *
72031 AAATCTGTTTTCTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCACATTGT
1 AAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * *
72096 TATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAACTAATTGTTTCTCTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAAT
66 TATGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAAT
*
72160 AATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTT-AAAAAATAAATCCGTTTAT
128 AATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTAT
*** * * * * *
72224 CAAGTGAGCTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTT
193 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
** * * * *
72289 GTTTTGTCATAAAACATTTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTA
257 GTTTCATCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATA-AAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
** * *
72354 TTAATATTTTGAAAATT-AA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTACTGGACCAATTCAAAT
320 TTAATATTTCAAAAATTAAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTACTGAAACAATTCAAAT
* * * * *
72417 AGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATCTCAAATCGGTATGATC-TTAGTTTTGTCATAAAACA
385 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * * *
72481 ATTGTTTCTA-TCTATACAAATTTA-TTCGGAGTAAAATATTGCTAAA-CTAATAATATTCTAAA
450 ATTGTTTCTATTC-ATACAAACTTATTTC-AAACAAAATAAT-ATAAATCTAATAATATTCCAAA
** *
72543 AATTTCTAAGCAAGAGA-TTTAAAAAGT
512 AATTAATAAGCAA-A-ATTTTAAAAAAT
* * * * *
72570 AAATGTATTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCG
1 AAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTG
* *
72634 TTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAAT
65 TTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTT-GTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAT
* * * * *
72699 AATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-CACAAAATTTTAAAAAAATAAATCTATTT
128 AATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTCA-AAGA-TTTAAAAAAATAAATCTGTTT
* *
72763 ATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTT-TTTAAAATCATTATGACCTT
191 ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * *
72827 TTGTTTCATCATAAAATAATTGTTTCATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTT
255 TTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATAAAA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
** * *
72892 TATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGA-TTAAAAACATAAA-TTAGTTTA-TCGAATCAG
318 TATTAATATTTCAAAAATT-A-AAGTAAGAGATTTAAAAAC-TAAATTTA-TTTACT-GAAACAA
* * * *
72954 TTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTTTGAACTTTTGTTTTGTCA
378 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
73019 TAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACCAACCT-TTTCAGAATAAAATAATACT-AATCTATTAATA
443 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAACTTATTTCA-AACAAAATAATA-TAAATCTAATAAT-
73081 ATT-C-AAAATTAATAAG
504 ATTCCAAAAATTAATAAG
73097 TAGGAGATTA
Statistics
Matches: 880, Mismatches: 150, Indels: 72
0.80 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
537 5 0.01
538 71 0.08
539 227 0.26
540 103 0.12
541 43 0.05
543 59 0.07
544 308 0.35
545 58 0.07
546 6 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (537 bp):
AAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
TATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAAT
ACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
CATCATAAAACAATTGTTTCATTCATAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
TTTCAAAAATTAAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTACTGAAACAATTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
TCTATTCATACAAACTTATTTCAAACAAAATAATATAAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAA
GCAAAATTTTAAAAAAT
Found at i:73347 original size:17 final size:16
Alignment explanation
Indices: 73325--73359 Score: 52
Period size: 17 Copynumber: 2.1 Consensus size: 16
73315 TAAATTGATG
73325 AACTATAAGCAAATATA
1 AACTATAAGCAAA-ATA
*
73342 AACTATAATCAAAATA
1 AACTATAAGCAAAATA
73358 AA
1 AA
73360 GAGATATGGA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
16 5 0.29
17 12 0.71
ACGTcount: A:0.63, C:0.11, G:0.03, T:0.23
Consensus pattern (16 bp):
AACTATAAGCAAAATA
Found at i:75625 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 74873--76532 Score: 1266
Period size: 181 Copynumber: 9.2 Consensus size: 179
74863 TTAACATTTG
* * * * * * * *
74873 TTTTGTCATAAAAAAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAAGAAAATAATACTAATCTAA
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTCTAATTTAT
* * * * * *
74938 TAATATTAC-GAAAATTAATAATTAAGAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTGTAGAACTAGTTCAA
66 TAATATT-CTGAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAA
* * * * * ** * *
75002 ATAGTTAAGGCTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGTCCTTTTG
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * * * * * * *
75054 TTTTATCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-TAGAATAAAATAATAT-TAATTT
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAT-TCTAATTT
* * * * * * *
75117 ATTAATATTTTGCAAATTAATAAG----AGA-TAAAAAATAAATTTATTTACCAAACCAGTTCAA
64 ATTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAA
* * * * ** * * * ** * *
75177 TTAGGTATAACAATTAAAAAAATTATTTATTTCATATCATTATGACCATTTG
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * * * *
75229 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTGATA-TAGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATTCTAATTTA
* * ** ** ** * *
75293 TTTATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTAAAAATTGAATTTGTTGGCTTAACCA-TTACA
65 TTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAAATTT-TTATC-GAACAAGTT-CA
* *
75357 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AATTCATTATGACTTTTTA
127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTATGACCTTTTA
* * * * *
75410 TTTTGTCACAAAATAATTATTTCCATTCATACAAGCTTATTGGGAATAACATAATTCTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTCTAATTTAT
* * *
75475 TAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAAATTTTTATCGAGCAAGTTCAAAT
66 TAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAAATTTTTATCGAACAAGTTCAAAT
* * * ** *
75540 AGTAATGACTATTTGAACAAATACCTATTTCAAATTGCCATAACCTTTTA
130 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * * *** *
75590 TTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCCTACAAGCTTATTCCAATTAAAATAA-AAAAAATTAT
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTCTAATTTAT
* * * * * *
75654 T-ATCATT-TAGACAATTAATAAGTAAAATATATAAAAATAAATTTGTTTATTGAATAAGTTCAA
66 TAAT-ATTCT-GAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAA
* * * * * * *
75717 ATAGTTATGATTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCGTTTTGACGTTTTG
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * * * * * * *
75769 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAACTTATTCGGATTAAAATAATAT-TAGTTTA
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-TCTAATTTA
* * * * *
75833 TTAATATTTTGATAGTTAATAAGTAGAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTCA
65 TTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAA-ATTTTTATC-GAACAAGTTCA
* * * *
75897 AATAGTCATAAGTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
127 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * ** *** * *
75950 TTTTGTCATAAAACAATTGTATAAATTCATATGGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTCTAATTTAT
* * * * *
76015 TAATACTCTGAAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAA-ATGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAA
66 TAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATA-AAAT-T-TTTATCGAACAAGTTCAA
* * *
76079 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * *
76131 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATACTAAATAAAATAATAT-AAATTTA
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-TCTAATTTA
** * *
76195 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTAAAA-TTTTAAAAATAAATCTATTTTT-T-GAACATGTTC
65 TTAATATTCTGAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAATAAA---ATTTTTATCGAACAAGTTC
* * * *
76257 AAATTGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTG
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * * * * * * *
76311 TTTTGTCATAAACTAATTGTTTTTGTTCAAATAAGCGTATTTGAAATAAAATAA-TATAATTTTA
1 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATTCTAA-TTTA
* *
76375 TTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTATTGAGA-AAGTT
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* *
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*** * * *
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* * *
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* *
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * ** * * *
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** * * * * ** * *
77974 ATTTTTTTATTTCA-AA-T---TG--TTATAACGT---TTTG-TT--CAAAC-AGTT---A-AG-
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* * * *
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* * *
78072 -A-TA---C-A---AT-C-A---TATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATT-TCAAAA
375 AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * ** * * *
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439 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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568 TC-ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCT-GAAAATTAATAAAT
* * * * * ** *
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* * * *
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692 TATCTATTTCAAATTGTCATGAC-CT
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** * * * * ** * * *
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* * ** * * ** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * ** * ** *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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* ** * * *
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* * *
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208 TCATATAACTTA-T-TCGGATT-AAAATAATAT-TAATTTA-TT---AATATTTTGATAATT-A-
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80725 TTTGTTTTGTTATAAAA-AATTATTTC-AGCTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAGTAAAACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAA--AA
* * * * * * *
80788 -GTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAATTAAGAGAT-TTAAAAAATGAATCTGTTAACTGAACA
63 TATTATT-ATATT-TAGAAAATTAATAAGTAA-A-ATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATA
* * * * ** * * *
80850 AGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGT
123 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTAT
* ** * * * * * ** *
80915 CAAAAAATGATT-TTTTCTATTCATACATGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAAT
188 CATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATATA-ACTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
** * * * * * * **
80978 ATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTCACCAAACAAGTTCAAATCTT
250 ATTTTGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AG
* * * ** * * * *
81043 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAAAAAAT
314 TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT
* * * * ** * **
81108 GA-TTCTATTTATACAAGCGTATTCGGATTAAAATAAGTA--AA---A--GGT-TT-T---AA--
378 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* *
81158 AA-AA-T-A-A-A--T-----AT--GT-T-TTT--TGAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTG
442 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * * * *
81205 AATAACTATCTATTTCAAAAT-ATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCA
507 AACAATTATCTATTTC-AATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCA
* * * * * *
81269 TATAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTG-AAATTAATGAGTAAGAG
571 TACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAG
* * * * * *
81332 AATTAAAAA-ATGAATCTGTTTA-CCAAGCATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
635 ATTTAAAAATA-AAAT-T-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
81395 TATTTCAAA-AGATTATGGCCT
696 TATTTCAAATTG-TCATGACCT
* ** * * *
81416 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTATGTTCATGCAAGCTTATGTC-AAATAAAATAATATAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAA-A-AAA
* * * * *
81480 T-TTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATG
63 TATTATT-ATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAAATA-TTAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAG
* * ** * **
81542 TTCAAATA-TTATGCCCATTTGAACAATTATCGT-TTT-AAATCATTACAACCTTTTGTTTTGCC
125 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* * * * * * *
81604 ATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATA
189 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT-ATAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT
*** * *** **
81669 CCAAAAATTAATAAGTTA-AAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGTC-AA-AGAGTTCAAATAGTT
253 TTGATAATTAATAAG-TAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAG-T
* * * ** * *
81731 ATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTA
315 ATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * *
81796 TTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAGAGTTAAT
380 TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
* ** * * * * * *
81861 ATGTTGGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTCACTAAACAAGTTTAAATAGTTATGGC-ATTTTGT
445 AAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGA
* * ** * ** * **** * * *
81925 TCTATCGTAAAATAATT-GTTTCTATTAAT-ACAAAACTATTTAG-AATAAAATAATACTAATT-
508 ACAAT--T-ATCTATTTCAATTC-GTT-ATGAC-TTTTTATTTTGTCATAAAATAAT--TATTTC
* ** * * ** * *
81986 TATTAATAGTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AA-TCAAAATCTATT--TA-TC-GAACCAAT
565 TATTCATA---C-AAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATTC-TAATTTATTAATATTCTGAA--AAT
** * * * * * * * * * ** ** *
82045 TCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAAT--TATCTATCTCAAATCATTATGATC--TTTTTTTTGT
622 T--AATAAATAAGAG-ATTT-AAAAATAAAATTTTTATCGAA-CA--A-GTTCAAATAGTAATGA
** * * * ***
82106 C-A-TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCA--AAGG
679 CTATTTGAACAA-T-TATCTATT--T-CAAA-TT-GTCATGACCT
**** * * ** ** * *
82147 AAAATATTG-C-T---A-AATTATTAATATTC-TA-AAAATTAAT-AAGAGATTTAAAA-AATAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA-A-A--TAAAATAAAAA
* *** ** * *
82202 ATGTGT-TTGATAAACATGCAAAACATTAATACACAAGAAAT-TTCAAAAAATAAATCTATTTAC
62 ATAT-TATT-ATATTTA-G--AAA-ATTAATA-AGTA-AAATATT--AAAAATAAATCTGTTTAT
* * * * * * *
82265 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTTAAACAATTATCTATTT-AAACTAAATATGACCTTTT
117 TGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGATCTTTT
* * * * * ** * *
82329 CTTTTGTCATAAAAGAATT-TTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTA
181 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTA
** * ** * * *
82393 TTAATATTTCAAAAATTGGTAAGTTAG-AGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCGAATC-GGTT
245 TTAATATTTTGATAATTAATAAG-TAGAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAA-CAAG-T
* * * * * * * *
82455 TCAAATAATTATAGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTCTTTTGTCAT
306 TCAAAT-AGTATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *** *
82520 AAAACAATTCCTTT-ACA-TCATACAATCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATT
370 AAAACAATT-ATTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
82583 -TCAAAAACTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-T---T--G---AACTAG-T-
433 CT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * **
82636 T-CCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTT-GTTATAACTTATTGT-TTTTGTTGTAAAATAAT
497 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-TTCGTTATGACTT-TT-TATTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * *
82698 TGTTT-TAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTATGAAAATT
559 TATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATT
* ** * *
82762 AATAACTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATTTGTT-TGCTGAAGTAGTTCAAACGACTAA-GACTAT
623 AATAAATAAGAGATTTAAAAATA-AAATTT-TTAT-C-GAACAAGTTCAAA-TAGTAATGACTAT
* * *
82824 AT-AACAATTATCTGTTTCAAATTGTTATGACCT
683 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
*
82857 TTTGTTTTGTCATAAAACT-ATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAATAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAA-AA
* * * * * ***
82920 -ATTTATTAATATTTCA-AAATTTAATAAG-GAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACCAAAT
63 TA-TTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAAAT-A-TTAAAAA-TAAATCTGTTTATTGAAT
* * * * * * * *
82982 CAA-TTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAATGATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTT-TCTT
122 -AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGT-TT
* * ** * * ** ** *
83045 CATCATATAACAATTGCATTTGAACATTCAAGCTCTAACTGCCAAACCAATTTAAATGGTTAAGA
185 TATCATAAAACAATTGTTTTTG----TTC-A--TATAACT--TATTCGGA-TTAAA---AT-A-A
* *** * * ** ** * * *** * * *
83110 CTACATAAACGATTATCTATTTTAAATCGTTACGACCATTTG-TTTTGTTATAAAAT-AATTTTT
235 -TA-TTAATTTATTA-ATATTTT-GATAATTA--ATAAGTAGAAGAT-TTAAAAAATAAATATGT
**** * * * * * * * * * *
83173 TTGTTTATACAAGCTT--ATTCAG-ATTAA-AATAATACCAATTTAATAATTTTTAAAAATTAAT
293 TTACCGA-ACAAG-TTCAAAT-AGTA-TAACTATTAGAACAA-TT-AT-CTATTT-CAAATCATT
* ** ** * * * * *
83234 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT-TTACCAAACCAGTTTATAT-GATTAATACTATTAAAGCAA
350 ATGACCTTT------T-GTTTTGTCATA--AAA-CA-ATTATTTCAATTCATAC-----AAGC--
* ** * ** * *** * * ** * *
83297 TTA-TCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTT-TGCTTAGTCATAAAGCAGTTGTTTCAGTTCATACA
397 TTATTCAAAATAAAATAATACTAA--TTTATTAATATTC-TAAA--AATT-AATAAG-T-A-AGA
* * * * * **
83360 -ATCTTATTCGTAATAAATTAATACTAATTTA-TTAA-CA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGA
453 GAT-TTA-----AA-AAATAAAT-CT-ATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTT-AT--G--A-CTA
* ** * * **
83421 TTT-AAAAAAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATT
503 TTTGAACAATTATCTATTT------CAA-TTC-----GTTATGACT-TTT-TA-TTTTGTC-A--
* * * *
83485 TCAAATCACTATGACATTTTATTT-T-TTCATA-AAACAATTGTTTCA-ATTAATATAAGTTTAT
550 T--AA--A--AT-A-A--TTATTTCTATTCATACAAGC--TT-ATTCAGAATAAAATAA---T-T
* * * * * *
83546 ACAGAATAAAATATTACTAAT-TTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
598 -C----T--AAT-TTATTAATATTCTGAA-A-AT-T--AATAAATAAGAGATTT-AAAAATAAAA
* * * * *
83610 TTGTTTACCGAATC-AGTT-AAATAATTACT--CTAGTTTGAACAATTATCTATTTCAAACTGTT
649 TT-TTTATCGAA-CAAGTTCAAAT-AGTAATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTC
83671 ATGACCT
710 ATGACCT
* * ** *
83678 TTTATTTTGTTATAAAAATAATTCTTTT-TGA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
1 TTTGTTTTGTCAT-AAAATAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-A
* * * * * *
83741 AAT-TTATTAATATATCA-AAATTTTATAAG--AAAT-TTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACC
61 AATATTATT-ATAT-TTAGAAAATTAATAAGTAAAATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAA-T
** ** * * * * * * * **
83801 AA-TTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTATTTATTTCAATTCGTTCT-AACCTTT-TCATA
122 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA
* * * * * * * * * * *
83863 GTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAGAATCTTAATATATTAA
187 -TCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
*** * * *
83927 TATTCAAAAAATTAATAAGCA-AGAGATTTAAAGAAATGAATATGTTTACC-AACTAAGCTT-AA
249 TATTTTGATAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAA-AAATAAATATGTTTACCGAAC-AAG-TTCAA
* * * *
83989 ATAGT-T-A-T-TTA-AAGAATTAGT-TATTTGAAATCATTATAACCTTTTGTTTTTTCATAAAA
310 ATAGTATAACTATTAGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * * * * * *
84048 CGATTGCTTCAGTTCACAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTT-TCAAA
374 CAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAA
* * * * * * * * **
84112 AATTAATAAGCAAGAGATTTAAACAAGTAAATATGTTTTCAGAAAAAATTCAAATAGTTACAACT
438 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
84177 ATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TA
502 ATTTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA
* * * ** ** *
84241 GTTCATAAAAGGTTATT-TGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
567 -TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAAT
* * * * * * ** * *
84305 AAGTGATTTAAAAAGT-GAATCTGTTTATCAAATC-AGTTTAAATAAT-TTGGTTATTTCAATAA
630 AAGAGATTTAAAAA-TAAAAT-T-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAA
* * * *
84367 TTATCTATTTCAAATCGTTATGAACA
691 TTATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * *
84393 TTTGTTTTGTCATAGAACAATTGCTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAAGAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT--TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AA
*
84456 AT-TTATTA-ATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATC----TATT---T
62 ATATTATTATAT-TTA-GAAAATTAATAAGTAA-A-ATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAAT
* * * * * * * *
84511 -A-TTGAAATAG-T-T-CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTA
122 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA
* * * * ** * ** ** * ** *
84571 TTATAATATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTCGTTCAAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATA
187 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
** * * * * * * * *
84636 -TTCCAAAAGTTAATAACTA-AGAGATTTAAAATATAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAACA
251 TTTTGATAA-TTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATA
* * * * *
84698 AT-TAAGACTA-AATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTAGTCATAAAAC
313 GTAT-A-ACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * * ** * *
84761 AATCGTTTTAGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-TAAATTCATTAATATTCCAAAA
375 AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAA
* * * * * * * * * * *
84825 ATTAATAAGT----GATCTAAAAAGTGAATCTGTTTACCGAATCATTTTAAATAATTATGGCCAT
439 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * *
84886 TTCAACAATTATCTATTTCAAATCAG-TATTACCTTTTGTTTGGTCATATAATAAATGTTTTTGA
504 TTGAACAATTATCTATTTCAATTC-GTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-A
* * * * * *
84950 -TCATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-T-CAAA--AATTAATAA
567 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAA
** * * * *
85010 GCA-ATTTAAAAA-AAGTTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTAT
632 G-AGATTTAAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * *
85073 ATACTTCAAATTGTTATAAGCT
695 CTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * * * *
85095 TTTGTTCTATCGTAAAACAATTATTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATGAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAA
* * * * * * * * * *
85159 TCTAATAATATTTAGAAAATTAATAACTAAGAGA-ATTACAAATAAATTTATTGGA-CGAACCAA
63 TATTATTATATTTAGAAAATTAATAAGTAA-A-ATATTAAAAATAAATCTGTT-TATTGAA-TAA
* * * * * * * *
85222 -TTCAAATATTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATAACCTTTT-TTTTGT
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGATCTTTTGTTTTAT
* *** * * * *
85284 CATAAAA-AAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCGAAATAAAATAA-ATGAATTTATTAATAT
188 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-TAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
** * * * ** * *
85346 TTCAAAAATTAATAACTA-AGGGATTTAAAAAATTATTTCTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAA
252 TTTGATAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAAT-A
* * * *
85409 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
313 GTATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA
** ** * * * ** * * *
85473 TGCTTT-TGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAGTAATGCTAATCTATTAATA-T-TACAAAAT
377 TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAAT
* * *
85535 TAAT-AG---CAGATGTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAA-ACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
441 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATA--AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * * *
85594 TTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCGTTCTAACTTTTTGTCTTGTTATAAAACATTTGTTTCTGT
504 TTGAAC-AATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* ** * * * * *
85658 T-A-GC---CTT-TTTGGATTAAAATAATACTAATTGATTAATATT-TCGACAATTAATAAGTAA
568 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCT-GAAAATTAATAAATAA
* * * * * * *
85716 -AAATTTAAAAA-AATATATGTTTATAGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
632 GAGATTTAAAAATAA-A-ATTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTAT
*
85779 CTATTTCAAATTGTTATGACCT
695 CTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * *
85801 TTTCTTTTGTCATAAAA-GATTTGTTTC-AGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACCA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTT-TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AA
* * * * ***
85864 AT-TTATTACTATTCCA-AAAATTAATAATTAACAGAT-TTAGAACAA-GAATTTGTTTACCAAA
62 ATATTATTA-TATT-TAGAAAATTAATAAGTAA-A-ATATTA-AA-AATAAATCTGTTTATTGAA
* * * * * * ** * * *
85925 CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATCGCTATAACCTTTTATTTT
121 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTT
* * * * * *
85990 GA-CATAAAATAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCTGAATAGAATAATATAAATTTATTAA
186 -ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
** * * * *
86053 TATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-G
249 TATTTTGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * *** **
86117 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
314 -TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * * ***
86182 TGTTTCTATTCATACAAGGC-TATTTAGATTAAAATGATATTAA-TTATTAATATTTTGGCAATT
378 TATTTCAATTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * *
86245 AATAAGTAAAAGATCTAAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATT
442 AATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * * * *
86309 TGAATAATTAACAATTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTAATAAAATGACTGTTTCAATTC
505 TGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTC
* * ** * * * *
86374 AAATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAAGA
570 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCT-GAAAATTAATAAATAAGA
* * * * ** *
86438 GAATTAAAAAATGAATTTGTTTACCGAA-AAGCCCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
634 G-ATTTAAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCT
*** * *
86502 ATTTCAAAACCTTATGACTT
697 ATTTCAAATTGTCATGACCT
** ** * * *** *
86522 TTTGTTTTGTCATAAAGCAATTAGTTATATTCATGCAAGCTTATTTTGAATGAAATAATATAAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAAT
* * * * * * *
86587 -TGATTA-ATCTTACAAAAATTAATAGGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACG
64 ATTATTATAT-TTA-GAAAATTAATAAGTAAAATA-TT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAG
* * *
86649 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
125 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCA
* * * * * * * *
86714 TAAACCAATTGTTTTTGTTCTTAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTT
190 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
** * * * * ***
86779 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AGTGAGTTCAAATAGTTA
254 TGATAATTAATAAGTAGAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CGAACAAGTTCAAATAG-TA
* * * * * * * * *
86843 TGACTTTTTGAACAATTATTTATTTTAAAT-GTTAAGATCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATTAT
316 TAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * *
86907 TTCTATTCATACAAGTTTCTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
381 TTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* * * * * * * * * *
86972 AAT-TGAAGCTTTAAAAAATAAATATGTTCACTGAATAAGTTCAAATAGTCAAGTCTATCTGAAC
446 AGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * *
87036 TATTAGCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACA
510 AATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACA
*** * * * * * *
87101 AAAGTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAA--AATTAATAAGAGATTCA
575 AGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAGATTTA
* * ** * * * * * * *
87162 AAAGCT-AAATCTGTTTATCAAACCTGTTCAAATAGTTATGATTAGTTCAACAATTATATATCTA
640 AAA-ATAAAAT-T-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* *
87226 AAATTGTTATGATCT
702 AAATTGTCATGACCT
* * * *** * **
87241 TTT-TTCTCTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA---AAAAA
* * * * * **** *
87305 T-TAATAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATGTATTTGCCAAACCA
63 TATTATTATATT-TAGAAAATTAATAAGTAA-A-ATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAA-TA
* * * * **
87367 A-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTAGCTATTTCAAATCATTCT-AACATTTTGTTTGG
123 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTA
* * * * * * ** * * * *
87430 TCATAAAATAATTGTTTCTATTTATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACA
187 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATA-ACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * *
87495 TTTAGAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTTAAAAAATAAGTCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAA
251 TTTTGATAATTAATAAG-TAGAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-A
* * * * * * * *
87559 TTATGAA-TATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCACTATGATCTTTTGTTTTATCCTAAAATAA
313 GTAT-AACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
87623 TTGTTTTAGTTCATAAAATCTTA-TCCAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAAT
377 TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * ** * * * * * *
87686 TGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAA-AAATCATTTTTA-TCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCAT
441 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TATTTACT-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
87749 TTGAATAATTATCTTTTTCAAATCATTATGAAC-TTTTATTTTGTGATAAAAAAATTGTTTTTA-
504 TTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATG-ACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* * * *
87812 TCATACAAGCCTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA
568 TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCT-GAAAATTAATAAATA
* *
87875 AGAGATTTAAAAA-ATAAATTTGCTTATTGAAC-----C--A-A-T--T-CCTATTTGAACAATT
631 AGAGATTTAAAAATA-AAATTT--TTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATT
* * *
87927 ATCTATTTTAAATTGTTATAACCTT
693 ATCTATTTCAAATTGTCATGACC-T
* * * * * * *** *
87952 TTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTTGGT-TT-ATATAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTT-CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AA
* ** * ** ** * * *
88015 AT-TTAATAATACTCCA-AAAATTGATACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATCATAC
62 ATATT-ATTATA-TTTAGAAAATTAATAAGTAAAATAT-T-A-AAAATAA--------ATC-T--
* ** * * * * * * ** *
88078 AAGCTTATTCAGAATAAAAT-AATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA-ATAAGT-AAGA-G
111 --GTTTATT--GAATAAGTTCAA-A-T-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATC
** ** * * * * ** ***
88139 ATTTAAAAAATAAATTTG-TTTATC--GAACCAATTCCTATTTGAAC-TATTTTTTTATTTCAAA
168 A-TT--ATGAT-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTTTGTTCATA-TAACTTA-TTC---
** * ** * * * * * * * *
88200 TCATTATAACCATTTGCTCAGTTATAAACTAATTGTT-TTAGTTCAT-A-TA-AACTTATTTGGA
223 GGATTAAAATAATAT--TAATTTATTAA-T-ATT-TTGATAATTAATAAGTAGAA--GATTT--A
* ** * * * * * *
88261 ATAAAAT-AATACTAATTTA-ATAA-TACTTCAAAAATTGATAACTAAGAGATTTA-AAAAATAA
279 A-AAAATAAATA-T-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT-ATAACT-----A-TTAGAACAAT-T
* ** * * *** * ** * *
88322 AACTATTTGTTGAAGCA--AT-TCAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTAACTTTTTCAAATCG
333 ATCTA-TT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATA-AAACAATT-A---TTTCAATTC-
* ** * * * * ** * * * *
88384 TTATGACCTTTTGTCATAAA-ACAATTATTTTAGCCGTTTACTGAATAAGTTC---AAATT-GTT
389 ATACAAGCTTAT-TCA-AAATAAAATAATACTA---ATTTA-TTAAT-A-TTCTAAAAATTAATA
* ** ** * * * * * * ** *
88444 A-TTA-CTATTTAAGCAAT-TATTTATTT-C-AAATTA-TTCTAACCT-TTTAT-TTTATCAT-A
446 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTC-AA-ATAGTTATGACTAT-TTGA
* * ** ** * *
88500 A-AATAAT-TGTTT---TT-GTTCAT-ACAAGTTTATTCAG--ATTAAAATAA-TA-TT-AATTT
508 ACAATTATCTATTTCAATTCGTT-ATGAC-TTTTTATTTTGTCA-TAAAATAATTATTTCTATTC
* ** * * * * * *
88553 AT-TAA---TATTTTG-A-CAATTAA---TAA-GTA-GAAGATT-T-AAAA--AATAAATATG--
570 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAG
* * * * *
88601 ----------------TTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACTGTTTCAATAATTATCTATT
635 ATTTAAAAATAAAATTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * *
88650 TCAAATCATTATAACCT
700 TCAAATTGTCATGACCT
* * * * * * ** * * *
88667 TTTCTTTTCTAATAAAACAATTATTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAAT-AATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAAAATA
*** * *
88730 --ATT-TA-TT----AA-T-AT-TCCAAAA-ATT--AAA-GAATCTGTTTGCTT-AATAAGTTCA
65 TTATTATATTTAGAAAATTAATAAGTAAAATATTAAAAATAAATCTGTTT-ATTGAATAAGTTCA
* * *
88779 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTCTTTTAGAA-CATTATGACCCTTTT-TTTT-TCATA
129 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGA-TCTTTTGTTTTATCATA
* * *** * * **
88841 AAACAATTGATTTTGTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCC
192 AAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATT-AATTTATTAATATTTT
* * * * * **** * *
88905 AAAAATTAAGAAGTA-AA-ACTTTAAAAAATAAATTTATTTTTTTAACACA-TTAAAAAAGTTAT
255 GATAATTAATAAGTAGAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAG-TAT
* * * * * *
88967 GACTATTTGGACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAACCAATTGTT
317 AACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * * * * * * *
89032 TCTATTTATAAAAGCTTATTTAGAATACAATAATATTAATTTGTGAAAAATATAAAAATTAATAA
382 TCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
* ** *
89097 GTAAGAGATTTTTAAAAAA-AAAT-TATTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATGA-TGATTTAAA
447 GTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAA
* * * * * * *
89159 TAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTCA-AAAACAATTGTTTCTATTCATA
509 CAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATA
* * * * * *
89222 CAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCT-AAAATTTAATAAGTTAGAGC
573 CAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAA-TTAATAAATAAGAGA
* * * * * * * * *
89285 TTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCACGTCCATTTGAACTATTATCTATT
636 TTTAAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * **
89350 TCAAAATCATTATGATAT
700 TC-AAATTGTCATGACCT
* * * ** *
89368 TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAA
* * * * * * *
89432 T-TTATTAATATGTCA-AAAATTAA-AAAT-ACAT-TTAAAAGCTAAACCTGTTTATCGAACCAA
63 TATTATT-ATAT-TTAGAAAATTAATAAGTAAAATATTAAAA-ATAAATCTGTTTATTGAA-TAA
* * * * *
89492 -CT-AAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTC
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* * * *** * *
89554 ATAAAACAATTGTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCATA
189 ATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAAT-ATTAATTTATTAATA
* *
89618 TTCT-AAAACTTAAT-A--AG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAG
251 TTTTGATAA-TTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * ***
89677 TGA-AGACTATTA-AATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAATGTAA
314 T-ATA-ACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
89739 TTGTTTCAATTTATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATT-TAGAAAAT
377 TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAAT
* * * * * * *
89803 TAATAAGCAAAAAATTTAAAAAAAATAAGTATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
441 TAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTACT-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * *
89867 -TTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AG
503 TTTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-
* * * * * * * *
89930 TTCATAAAAGATTATCCAAAAATAAAATAATAT-TACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAG
567 TTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCT-GAAAATTAATAAA
** ** * * * * *
89993 TTGGAGATTTAAAAA-ATAAATTAATTTATTAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATA
629 TAAGAGATTTAAAAATA-AAATT--TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACA
* * *
90056 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACT
690 ATTATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * * *
90083 TTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TCA-TCATACAAGCCTATTTAGAATAAAAT-AATACT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAAAAT
* * * * ** * **
90145 A--ATT-TA-TT----AATAAATAAG--AGAT-TTAAAAAATAATTATACTTACTGAACCAGTTC
64 ATTATTATATTTAGAAAATTAATAAGTAAAATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAGTTC
* * * * * *
90199 AAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCATAA
128 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAA
* *** ** * * * * * * *
90264 AACAATTATTTACCTTCATATAAGCTTATTCTAAATAAAATAGTACTGATCTAGTAATATTATGA
193 AACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGA
* * * * * * * *
90329 AAATTAATAACTA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCCAAACCAA-TTTAAATACT-TAAG
257 TAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTAT-A-
* * * * * * * *
90391 AC-AATATGGATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAAAAAAATGT
318 ACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTAT
*** * ** * * *
90455 TTTTGTTCATATAAATTTATTCGAAAT-AAA-AATATTAATTTATTAATATT-TCAAAATT--TA
381 TTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* ** * * *
90515 A-TAAGAGATTTAATAAATAAATC-AGTTTACCAAATCAGTTC-AATAAGTTATAACAATTTGAA
446 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAA
* * * ** * * * *
90577 CAATTATTTATTTCAAATCGATATGACCATTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATAC
509 CAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAC
* * * * * * *
90642 AATCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTT
574 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAGATTT
* ** * * * * * *
90707 AAAAA-ATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGTTATAACTCTTTGAACAATTATCTATT
639 AAAAATA-AAAT-T-TT-TATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** *
90770 TCAAACCGTTATGACCT
700 TCAAATTGTCATGACCT
* * * * ** ** **
90787 TTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTT-TGTTCGTACAAGCTTATTCGGAATAGTATAATTCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA--AAAA
* * *
90851 T-TTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAGACTTAATCTGTTTATTGAACA
63 TATTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAAGTAA-A-ATATTAAA-AATAAATCTGTTTATTGAATA
* * * * ** * * * *
90913 AGTTTAAATAGTTAT-AGCAATTTGAACAATTACCTATTTCCAATCGCTATAACCTTTTCTTTTG
123 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA
* * *
90977 TCATGAAATA-AACCTT-TTTCTATTCATATAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAATTTAT
187 TCAT-AAA-ACAA--TTGTTTTTGTTCATATAA-CTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAATTTAT
** * * * * * * * * *
91038 TAATATTCAGACAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAACTCTGTTTATCGAATAA-TTCAAA
246 TAATATTTTGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAA
* * * * *
91102 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAA
311 TAG-TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* *** * ** * * *
91167 AATTCTTTTTGTTCATACAAGCATATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAACA
375 AATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * * * * *
91231 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAATTTAAATAGTCATAACTA
439 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * ** * *
91295 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAATAATTATATT-TG
503 TTTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTAT-TTCTA
* * * * ** * * *
91359 TTCATATAGGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTT
567 TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATA
* * * * *
91423 ACAGATTTAAAAAATGAATCAA--TTTA-CTGAACAAATTCAAATAGTAAGGACTGTTTAAACAA
631 AGAGATTT-AAAAAT-AA--AATTTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAA
* ** * *
91485 TTTTCTATTTCAAATCATTATGACAT
691 TTATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * *
91511 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTTGTTCCAAATAAAATAATATAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAA
* * * * * * * *
91576 T-TTATTAATATTCCA-AAAATTGATAAGTAAAAATTTTAAAAATAACTATGTTT-TCTAAACAC
63 TATTATT-ATATT-TAGAAAATTAATAAGT-AAAATATTAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAATAA
*
91638 GTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAAT-AGTTATG-TCCTTTTGTTTT
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCA-TTATGAT-CTTTTGTTTT
* * * * * * * * * *
91700 TTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGTGTATTCGAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAAT
186 ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAACT-TATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * * * * * * *
91764 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAGT
250 ATTTTGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-
** * * * * *
91829 TATGGCTATTTGAACAAATATTTATTTCAAAT-AGTTATCATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-
314 TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
91891 -A--TC-ATT--T-----C-TATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTA
378 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * ** * *
91944 ATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGA
443 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
92009 ACAATTAT-TGATTTCAAATT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
508 ACAATTATCT-ATTTC-AATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCA
* ** * * *
92072 TTCAAAATTATTTAGAATAAAATAATAT-TGATTTATTAATATTTTGAAAA-T--T-AATAAGAG
571 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAG
** * * * * * *
92132 ATTTAAGACCTAAATTTGTTTA-CCAAAATAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT
635 ATTTAA-AAATAAAATT-TTTATCGAACA-AGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * *
92196 ATCTCAAATTATTATGATC-
697 ATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * ** * **
92215 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA---AAAA
* * * * * ** *
92280 A-CTTATCATATTCTA-AAACTTAATAAG--AGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
62 ATATTATTATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAAATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAA-TAA
* * * * *
92340 -TTCAAATAGTGAAGACTA-TTAAATAATTATCTATTTC-AA--A-T-TG-T-TTTAG-----TC
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* * *** * ** * * *
92391 ATAAAATAATTATTTCAATTCATACAATCTTATTTAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACATT
189 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT
*** * * * * * *
92456 CAAAAAATTAATGAGCAAGAA-ATTTAAAAAAATAAATCA-ATTTACTGAACAATTTCAAATAGA
253 TTGATAATTAATAAG-TAGAAGATTT-AAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-
* * * * * *
92519 TTTGATTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT---A-AAT
314 TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * ** * * ** * *
92579 TGTTTTAATTTTGTAAAAACTTATTTGAAATAAAATCATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAAT
378 TATTTCAA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * *
92643 TAATAAG-CAGAGATTT-AAAACTAAAGT-T-TTT--T-AACT-AGTTCAAATAGTTATGATTAT
441 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * * * * *
92700 TTGAACAAATATGAATCTT-AAATCATTATGA-TCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTT-TGA
504 TTGAACAATTATCTAT-TTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-A
* * * * * * * *
92762 -TCATACAAGCTTATT-TGGATAAAAATAATGCTAATTTAATAATATTATAAAAATTAGT---GA
567 TTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATA
** * * * * * *
92822 A-AGATTTAAAAA-ATAAATGTATTTGCCTAACCAGTTCAAATAGTTAA-GTCTATTAGAATAAC
631 AGAGATTTAAAAATA-AAAT-T-TTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TAATGACTATTTGAACAAT
92884 TATCTATTTCAAA---TCATTCGAACCT
692 TATCTATTTCAAATTGTCA-T-G-ACCT
* * * * * * *
92909 TTTGTTTAGTCATATAACAATTGGTTTC-AGTTC-T-TAA--TT-TT--GAAT---A-CAAAAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAAAAT
* ** * * * * *
92962 -TTTTGTATATTT-GAAATAACAAAAACTAAATATATTGATTGAATAAAAAATATATAATAGCAA
64 ATTAT-TATATTTAGAAA-ATTAATAAGTAAA-ATATT-A---AA-AATAAATCTGT--T-----
* * * *
93025 ATATTTGAA-AATGTTCCAAAAAACAATTTATG--TA-TTGAATAATTATCAATTTC-AATCATT
114 -TA-TTGAATAA-GTT-C---AAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * **
93085 -TGA-CATTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATTAAAACT
171 ATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT-ATAACTTATTC-GGATTAAAA-T
* * * * * *
93147 AAAACTACTTTATTACTATTTTTAACAAGTT-ATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTT
233 AATATTAATTTATTAATA-TTTTGATAA-TTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAAT-ATGTT
* * ** * * * *
93209 TTCTGAATTAGTTCAAA-A-TAATTATTCATTTTGAAC-ATT-TCTATTTCTCAAATACGTTATG
294 TACCGAACAAGTTCAAATAGT-ATAACT-A-TTAGAACAATTATCTA-TT-TCAAAT-CATTATG
* * * *** *
93270 AAC---T-TTTTGTCCGTAAAACAATTGTTTTC-A-TCATACAAG-TCTATTTGGAAGAATAATA
353 ACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATT-ATTTCAATTCATACAAGCT-TATTCAAAATAA-AATA
* * * *
93328 A-A-TAATTTAATTAATATT-TCAAAAAATAATAAGTAGGAGATATT-AAAAATAAATATACTTA
414 ATACTAATTT-ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * *
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476 CTGAATA--AGTTCAAATAG-TTATG-ACTATTTG-AACA-ATTATCT-ATTTCAATTCGT-T-A
* ** * * * * * * *
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532 T--GACTTTTTATTT-T-GTCATAAAA-TA-ATTATTT-CTATT-CATACAA-GCTTA-TTCAGA
* * * * *
93513 ATACAA-AATACT-ATATAATAAATATTCATGAAAATTTAATAAATTAAAGATATTTAAAAAATA
587 ATAAAATAATTCTAAT-TTATTAATATTC-TGAAAA-TTAATAAA-T-AAGAGATTT-AAAAATA
** * * * * *
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646 AA-ATT--T-TTATCGAACAAGTT--CAAATAG-TAATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT-C
** *
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702 AAATTGTCATGACCT
* * * ** * ** * *
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* * * * *
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62 ATATTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAAATATTAA-AAATAAATCTGTTTATTGAA-TA
* * * * * * * ** *
93773 A-TTTAATTAGTTATAACAATTCGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA-CTAGTTGTTTTA
123 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCT-TTTGTTTTA
** * * * * * * * * **
93836 TCATAATGCAATTGTTTCTATTAATACAATTTTATTTGGAATAAACTAATGCTAATTTATTAATA
187 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * ** *
93901 TTCT-AAAAGTTAGTAAGTA-ACAGATTTAAAAAAAAGAATCTGTTGGCCTGACCAA-TAT-AAA
251 TTTTGATAA-TTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATA-AATATGTTTACC-GAACAAGT-TCAAA
* * * *
93962 TAGTTATAGCTATTTA-AACAATTATCTATTTTAAATCATTTAT-ATCTTTTGTTTTGTCACAAA
311 TAG-TATAACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * *
94025 ACATTTGTTTCTATTTC-TACAACCTGATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAA
373 ACAATTATTTC-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
* * * * * * *
94089 AAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAACAAGTCCAAATAGTTGTGACT
437 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
94154 ACTTGAATAATTACCTATTGCAAATT-GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-AATTTTC
502 ATTTGAACAATTATCTATTTC-AATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTA-TTTC
* * * *
94217 TATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTC-AAACAACTAA-A
565 TATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAA-AATTAATA
* * * * *
94278 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
627 AA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAAC
* * * * *
94343 AATTAT-TTTTTTAAATCGTTATGACTT
689 AATTATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * *** * *
94370 TTTGTATTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAA
* * * * ** * *
94434 -CTTATTAATATTTCA-ATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAT
63 TATTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAAATA-TT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATAA
* * * * * *
94497 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTCATC
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* * * ** * *
94562 ATAAAACAATTGTATTAGTTCATATAAGCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
189 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT
** * * ** * * * *
94627 TCAAAAATTAATGAGTTAG-AGATTTAAATTATGAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
253 TTGATAATTAATAAG-TAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TA
* * * * *
94691 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAACTAA
316 TAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTA
** *** * *
94755 TTT-TGTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAACTTATTAATATTCCAAAAA-T--
380 TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * * * * * *
94815 CAA-T-A-A-A---AAAAATTAAATTTGTTTTCTAAACATA-TTCAAATAGTTATGACTGTTTGA
444 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
94872 AGAATTATCTATTTCAAATAGATATGACCATTTTTCTTTTATCAT-AAATCAATTGTTTCTATTC
508 ACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGA-C-TTTTTATTTTGTCATAAAAT-AATTATTTCTATTC
* * * * *
94936 ATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-
570 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCT-GAAAATTAATAAATAAG
* * * * * * *
94998 AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAGCAAGTTCATATCA-TTATGATTATTTGAATAATTA
633 AGA-TTT-AAAAATAAA-ATTTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTAATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
95062 TTTATTTCAAATAGTTATGATCT
694 TCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * *
95085 TTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTGTTCAGAATAAAATAAACTAAT-
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAA-AAATA
* ** *** * *
95149 TTATTAATATTCTA-AAAATTAAT-AGTTAGGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAA
65 TTATT-ATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAAAT-A-TT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAG
* * * *
95212 TTCAAATAGTCATGCCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTGT-T
125 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTT-TAT
* * * * * ** * *
95275 -ATAAAAACAATTATGTCTCTTCATGCA-AAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
188 CAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCAT--ATAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * * *
95338 ATTTTGAAAATTAAT-A--AG-AGATTTAAAAACTAAATCTGTTTTCC-AAAACAGTTTAAATAG
250 ATTTTGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAG
* * * * * * * *
95398 TTATGACTATTTGAACAATTAT-GATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTTATAAAATAAT
314 -TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* ** * * * *
95461 TGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTA
378 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * * * ** * *
95526 GTAAGTAAGAGATTTAAGAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGA
443 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * ** * *
95591 AAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGCTTT-TGTCCAT
508 ACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAA-TAATTATTTCTATTCAT
* * * * * *
95655 ATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATAT-TAATTTGTTAATATT-T-CAAA--AATTAATAAGAGA
572 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAGA
* * * * * * * * *
95715 TTTAATAAAT-AAATCAATTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTA
636 TTTAA-AAATAAAAT--TTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTA
* ** * *
95779 TTTCAAGTCATTATGACCA
698 TTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * * **
95798 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTAATACAATCTTATTCAGAATAAAGTAATGCTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA--AAAAT
* ** * * ** **
95863 -TCATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAACGTATTTAAAAAAAGAATATGTTGGCTTG-ACCA
64 ATTATT-ATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAAATA-TTAAAAATA-AATCTGTT-TATTGAATAA
* * * * * * ** * * *
95925 GTACAAGTAGTTATAACTGTTTGAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTC
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* * * * ** * * * * *
95990 ACAGAACAACTGTTTCTGTTTGTACAAGCTGATTCGGAATAACATAATTTTAATTTATTAATATT
189 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT
*** * * * * * * *
96055 CAAAAAATTAATAAGTA-ACAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATCAAACAATTTCAAATAGTTA
253 TTGATAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TA
* * * ** * * * *
96119 TGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTT
316 TAACTATTAGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * ** * *
96183 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATAGAAATTTATTAATATTC-GACAATTAA
380 TTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* ** * * * *
96246 TAAGTAAAAGATTT-TTAAA-AAATTTGTTTACCGAATAAGTTCATAA-AGTTATGACTATTTAA
444 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
96308 ATAATTATTTATTTCAAAATT-ATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCA
508 ACAATTATCTATTTC--AATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCA
* * * * * *
96372 TACAAGCTTATTC-GGATTAAATAATAT-TAATTAATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAA
571 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAA-AATTAATAAATAAGA
* * * * * * *
96434 AATTTTCAAAATAAATATTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAGAATTATCT
634 GA-TTTAAAAATAAA-ATTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCT
* *
96499 ATTTCAAATTGTTATGGCCT
697 ATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * * ** *
96519 TTTATTTTGTCATAAAACAA-TGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAA
* * * * * * *
96582 T-TTATCAATATTCCA-AAAATTAATGAA-TAAGAGAT-TTAAAATATGAATATGTTTACTGGAC
63 TATTAT-TATATT-TAGAAAATTAAT-AAGTAA-A-ATATTAAAA-ATAAATCTGTTTATTGAAT
* * * * *
96643 AAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTGTG
122 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA
* * * ** * * * *
96708 TCATAAAATAATTGTTTATGTTCATACAAACTTATTTTGAATAAAATAAAATAAATTTATTACTA
187 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-TAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
** * * * * * * * *
96773 TTTAAAAAATTAATAAGCA-AAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGTT
251 TTTTGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-T
* * * * * *
96837 ATGACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAAT-AGCTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATT
315 ATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* *** * * *
96901 GTTTTTGTTCATACAAG-TGTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTCCAAAAATTA
379 ATTTCAATTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* ** ** * * * *
96965 ATAAGTAA-AAATTTTAAAAGGTAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCATATCGTTATGATTGTTTG
443 ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
97029 AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAGTAATTATTTCTATTCA
507 AACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCA
* * * * * *** *
97093 TACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTATGAAAATTAATAGGCAGGAGA
571 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAGA
* * * * * *
97158 TTTAAAAA-ATAATTCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTAAACAATTATCTA
636 TTTAAAAATA-AAAT-T-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTA
* ** * *
97222 TTTGAAATCATTATGACTT
698 TTTCAAATTGTCATGACCT
* * * ** * * * * *
97241 TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATTCAAAATTATTTAGAATAAAA-ATATATTGA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAAAAT-A
* * ** *
97305 TATATTAATATTTTA-AAAATTAATAAG--AGATTTTGAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAAATAG
65 T-TATT-ATA-TTTAGAAAATTAATAAGTAAAATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATA-AG
* * * * * *
97366 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ATC-TTTATTTTGTTA
125 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCA
* * * * *
97429 TAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTCATTTGGATTAAAATAAT-TCTAATTCAATAATAT
190 TAAAACAATTGTTT-TTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATAT-TAATTTATTAATAT
* * * * * * *
97492 TCTAAAAATTAGTAAGCA-AGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATAA
252 TTTGATAATTAATAAGTAGA-AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAG
* * ** * * * *
97555 T-TAAGACTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
314 TAT-A-ACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *
97619 TTATTTCAGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAAAT
377 TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * *
97683 TAATGAGTAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTAT
441 TAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAG-TTATGACTAT
* * * * * *
97747 TTAAACAATTATCTATTTAAAGTT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AG
504 TTGAACAATTATCTATTTCAA-TTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-
* * ** * * * * * * * * *
97810 TTTATAAAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTATATT-TCAAAAATAA-AAAGCA
567 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAA-TA
* * * * * * * * *
97873 AGTGATTTAAAAACTAGAGTTGTTT-TCCAAACTAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAACAAAT
631 AGAGATTTAAAAA-TAAAATT-TTTAT-CGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATT
* * * ** * *
97937 ATCAATATGAAATCATTATGATC-
693 ATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * ** ** *
97960 TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTT-TAATCATATAAGCCAATT-TGAATAAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAA-A-AA
* * * * * *** *
98023 AT-TTAATAATATTCCA-AAAATTAATAAG--AGAT-TTAAAAAATAAATGTATTTGCCGAATCA
62 ATATT-ATTATATT-TAGAAAATTAATAAGTAAAATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATAA
* * * ** * * *
98083 GTTCAAA-A---AT-ACTATTAGAATAATTAT-TATTTTAAATCGCTCTGA-CCTTTGGTTTAGT
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA-T
* * *** * * * * * * *
98141 CATACAATAATTGTTTCAATTCAAACAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AA
188 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * **
98205 TTTGA-AATTTTAATAAGTATG-AGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATA
252 TTTGATAA--TTAATAAGTA-GAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * * * *
98268 GTTATGACTTTTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAATA
313 G-TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * **
98332 ATTGTATT-AGTTCAAAAAATCTTA-TCCAAATAAAATAATACTGCTTTATTAATATT-TCAAAA
376 ATTAT-TTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * * * *
98394 GTTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCAATTTACTTAATCAGTTCAAATAATTATTG-CCA
439 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTA-TGACTA
* * * * * * *
98458 TTTG---AA-TATATATTTCAAATT-GTTATTACCTTTTGTTTCGTCTTAAAATAATTATTTTTC
503 TTTGAACAATTATCTATTTC-AATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-
* * * ** * *
98518 A-ACATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATAGTAATTTGTTAATATT-TCAAGAA-T--T-AAT
566 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAA-AATTAATAAAT
* * * * * * *
98577 AAGAGATTTAAAAA-ATATATCTATTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAAT
630 AAGAGATTTAAAAATA-AAAT-T-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAAT
* * *
98641 TATCTATTTCAAATTGTTATAACCC
692 TATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * *
98666 TTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAAT
** * * * * *
98731 -TTAGCCATATACT-GAAAATTAATAACTAAGAGAT-TTAAAAAATATATCCGTTTGTTGAACT-
64 ATTA-TTATAT-TTAGAAAATTAATAAGTAA-A-ATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAA-TA
* * * * ** * *
98792 AGTTC-AACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
123 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTAT
* * * * * * * * *
98856 CATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAAGTAATTT-TTAATA-
188 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
98919 TTTCAAAATTTTATAAGTA-AGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAA
252 TTTGATAA-TTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * **
98982 TCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAATGA
314 T-ATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
99046 TT-TTT--GTTAATATAAGTTTGTTCAAAAGAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGAAAAT
377 TTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAAT
** * * * ** ** ** * * *
99107 TAATCAA-TATCAAATTTACAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACCATTTCTAATAGTTTTGACTATT
441 TAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * * **
99170 TAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTT-TGCT
505 TGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-ATTTCTATT
* ** ** * * *
99234 CATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATAT-TAATTTAATAATATT-T-CAAA--AATTAATAAG
569 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAG
* * * ** * ** *
99294 AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATGGTTAA-GACTATTAAAATAATTAT
633 AGATTT-AAAAATAAAATT-TTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TAATGACTATTTGAACAATTAT
*
99358 CTATTTCAAATTATTC-TGACCT
695 CTATTTCAAATT-GTCATGACCT
* * * *
99380 TTTG--TT-TC--------A--------GTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAATTAATATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAAT
* ** * * * *
99426 -TTATTAACATTTCA-AAAATTAATAACAAAAAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
64 ATTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAA-GTAAA--ATA-TT--AAAAATAAATCTGTTTATTGAA
* * * * * * **
99489 CAAGTTCAAATAGTTATTACTATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATAACCATTTT-ACT
121 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTT
* * * ** * * * * * *
99553 TGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTTGTACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTCTTA
185 TATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTA
* * * ** * * *
99617 ATATTTTGAAAATTAATCAGT--AAGAGTTTAAACAAAATAAATTTGTTTATTGAATAAATTCTA
248 ATATTTTGATAATTAATAAGTAGAAGA-TTT-AA-AAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAA
* * * * * * *
99680 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
310 ATAG-TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
99745 -ACATTATTTCAATTCATATAAGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAA
374 CA-ATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
* * * * * **
99809 AATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTACTTACTGAACAAGTTTAAATAACTATGACTA
438 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * *
99874 TTTAAACAATTATCTATTTGGAA-TCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AGATT-TCATC
503 TTTGAACAATTATCTATTT-CAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATA-ATTAT-TTC
* ** * * * ** * *
99936 TTTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAGATAATACAAATTTATTAATATTAAGATAATTAATAAGT
565 TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAAT
* * * * * * * *
100001 AAAAGATTTGAAAAAT-AAATCTATTCACCAAATAAGTTCAAATCA-TTATGAGTAATTGAAC--
630 AAGAGATTT-AAAAATAAAAT-T-TTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTAATGACTATTTGAACAA
**
100062 --A---A---CAAATTGTTTTGA-C-
691 TTATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * ** * *
100078 TTTGTTTTGTCATTAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAAT
* * * * *
100143 -TTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAATTAATATATTTACTGAATAA
64 ATTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAAATA-TT--AAAAATAAATCTGTTTATTGAATAA
* * * * * * * * *
100206 TTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATAACTGTGA-CATTTTGTTTTGT
124 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTAT
* * * * * * * *
100270 AATAAAATAATT-TTTTTAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATA
188 CATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
*** * * * * * *
100334 TTGCAAAAATTAATGAGTA-AGAGAACTAAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
251 TTTTGATAATTAATAAGTAGA-AG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
100398 TTATGACTATCTA-AATAATTATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAA
314 -TATAACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * * ** *
100462 TTGGTTCTATTCATCCAAGCTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAA
377 TTATTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * * * * * *
100525 TTTATAAGCAA-AAATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CTTGAACATGTTCAAATAGTTATAACTAT
440 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-TGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
100588 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TCATTTGTTTTATCATAAACTAATTGTTTCTAT
504 TTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* ** * * * ** *
100652 TCATACGAA-CGTATTTGGAATAAAATAGTACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAA
568 TCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAA
* * * * * * * * *
100716 AAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATGGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAATAGTTAT
632 GAGATTT-AAAAATAAA-ATTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTAT
* * * **
100781 TTATTTCAAATCGTTATGGTCT
695 CTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * *** **
100803 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATCATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-A-AAAAAT
* * *
100868 -TTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTTAGAGAT-TTAAAATATAAATCTATTTATCT-AACA
64 ATTATT-ATATT-TAGAAAATTAATAAG-TA-AAATATTAAAA-ATAAATCTGTTTAT-TGAATA
* * ** * * *
100929 AGTTCAAATAGTAAT-ATCCATTTGAATTATCATCTATTTC-TAGCTATTATGA-CATTTTGTTT
123 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGATC-TTTTGTTT
* * * * **
100991 TGTCATAAAATAATACCAATTATTCAGAATAATTGGTATTCATACAAAATTATTCAAAATTAAAA
185 TATCAT---A-AA-A-CAATTGTT-----T--TT-G--TTCATA-TAACTTATTC-GGATTAAAA
** * * *
101056 -AATACCAATTTATTACTA-TTTCA-AA--AATTAA-TAG-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA
232 TAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAA-TAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
* * * * * * *
101114 TCAAACCAGTTCAAATAGT-TAACCCTATGAGAATAATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTT
296 CCGAACAAGTTCAAATAGTATAA--CTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * * * *
101178 TGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
359 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * **
101243 ATTAACATTCAAAAAATTAATTAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCA
424 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCA
* * * * *
101308 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAATTTGTTATGACCTTTTATTTTTATCTTAA
489 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTA-TTTTGTCATAA
* * * * * ** *
101373 AACAATTGTTT-TAGTGCATAAAAGCTTATCCA-AAGTAAAATAATAGT-ACTTATTAATATT-T
553 AATAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCT
* * * * * ** * **
101434 CAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAT-AAATTAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTTTG
616 -GAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAATAAAATT--TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATG
* * * * * * * *
101498 GCCATCTAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACT
678 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * **** *
101537 TTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTT-TCA-TCATACGAGCCTATTTGGTATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AA
* * * *
101600 AT-TTACTAATATTTTA-AAAATTAATAAGCAAGAA-ATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC
62 ATATTA-TTATA-TTTAGAAAATTAATAAGTAA-AATAT-T-AAAAATAAATCTGTTTATTGAAT
* * * * ** * * * *
101662 CAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATG
122 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA
* * * * * * * * *
101727 TCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAATA
187 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * * * *
101792 TTCTAAAAATTAATAACTA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATAGT
251 TTTTGATAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
101856 -TAAGACTA-TATGAACAATTCT-TGATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACA
315 AT-A-ACTATTA-GAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
101918 ATTCTTTTAGTTCATATTAA-CTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATT-TCAAA
376 ATTATTTCAATTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAA
* * * * * * * *
101980 AATGAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAATTTTATTTA-TCGAACT-AGTT-AGATAATTATAAC
438 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA-TAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * ** * **
102042 TATTTGAATAATTGTCTATTTTAA------AT--C--ATTA--TTACCTTAAAA-AATGCTTT-T
501 TATTTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCT
* * * ** * * *
102093 GTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGT
566 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAAT
* * * * * * *
102157 AAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTA-CTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTAAACAAT
630 AAGAGATTTAAAA-ATAAAATT-TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * *
102221 TATTTACTTCACATCATGATGACCA
692 TATCTATTTCAAATTGTCATGACCT
* * * * * **
102246 TTTGTTTTATCATAAAAGAATTATTACTATTCATA-TAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAA--AAAA
* * * *** *
102310 T-TTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAACGGAT-TTGAAAAATGAATTTGTTGGCCT-AAC
63 TATTATT-ATATT-TAGAAAATTAATAAGTAA--AATATT-AAAAATAAATCTGTT-TATTGAAT
* * * * * * * * *
102371 CAGTGCAAATAATTATAATTGTTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA
122 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA
* * * * * * ** * *
102436 TC-TCAAAACAATTGCTTCTATTCGTACAAGCTTATCCAAAATAAGATAAT-TCTAATTTATTAA
187 TCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATAT-TAATTTATTAA
*** * * * ** *
102499 TATTCCAAAAATTATTAAGTAAGAA-ATTTAAAAAAGAAATCCGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
249 TATTTTGATAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
* * *
102563 GTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTTAAA-GAGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCA-AAAA
313 G-TATAACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAA
* *** * * *
102625 CCAATTGTTTTTGTTCATATAAGCGTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATT-TCAA
374 -CAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AA
* * * * * *
102689 AAATTAATAAGTAAAAAGATTT-TAAAA-AAATATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAGTTATGAC
437 AAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * * *
102752 TGTTTGAACAATT-TTTATTT-AGAATAGTTATGA-TCTTTTGTTTCGTTAGAAAACAATTGTTT
501 TATTTGAACAATTATCTATTTCA-ATTCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTT
* * * * ** *
102814 CTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAA-TATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
564 CTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAA
** * **
102878 TAAGAGATTTAAAAA-ATAAATGTGTTTGCCGAATC-A-TTCAAATAATTAA-GACTATTAAAAC
629 TAAGAGATTTAAAAATA-AAAT-T-TTTATCGAA-CAAGTTCAAAT-AGTAATGACTATTTGAAC
* *
102939 AATTATTTATTTCAAATTATTC-TGACCT
689 AATTATCTATTTCAAATT-GTCATGACCT
* * ** * * *
102967 TTTGCTTAGTTTTAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATAGTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AAA
* * * * * * * *
103031 T-TTATTCACATTTA-AGAAATTTATGAGCAAAAGA-TAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGT
63 TATTATT-ATATTTAGA-AAATTAATAAGTAAAATATTAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAGT
* * * * * * *
103093 TTAAATAAATT-TGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTCATTATTG-CCATTT-TTTTGT
126 TCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA-TGATCTTTTGTTTTAT
* ** * ** * * * * *
103154 CATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTA-TCTAAAATAAAATGATACTACTTTACTAATA
188 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT-ATAACTTATTC-GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * ** * * *
103218 TTTTGAAAATTAATAAGCA-AGAGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTCC-AACTAGTTCAAATTAT
251 TTTTGATAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAA-TAG
* * * * * * * * *
103281 TATGATTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAC
314 TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTC-AA-AT-CA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
103345 AATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTTTTC-AAATAAAAATAATATTAATTTAATT-ATATT-TCA
375 AATTATTTC-AATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTT-ATTAATATTCT-A
* * * * *
103406 AAAA-T--TAA-TAAGAGATTT--AAAA-AAATATGTTTACCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGAC
436 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * *
103464 TATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTTTGACCTTTTGTTTAT-TCATACAATAATTGTTTC
501 TATTTGAACAATTATCTATTTCAATTCGTTATGACTTTTTATTT-TGTCATAAAATAATTATTTC
* * * * * *
103528 -AGTTTATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATAT-GAATTTATTAACATT-T-AAAA--AATTA
565 TA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAA
* * * * * *
103587 ATAAGAGATTTGAAAAAGT-AAATCTATTCACCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAAT
628 ATAAGAGATTT-AAAAA-TAAAAT-T-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAAC
* * *
103651 AATTATCT-TTCTAAAATTATTATGACCT
689 AATTATCTATT-TCAAATTGTCATGACCT
** * * * ** *
103679 TTTGTTTTGTCATAAAACCATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAT-AGTACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAAAATA
* * * ** * *
103742 CGCTATTAATATTTCA-AAAGTTAATAGGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCAATTTACT-AAAA
65 --TTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAAGTAA-A-ATATT-AAAAATAAATCTGTTTATTGAATA
* * * * * * *
103804 TAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAACTACCTATTTTAAGTCATTATTA-CTTTTTGTTT
123 -AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTT
* * *** * *
103867 TGTCTTAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTC------AAATAA-AATAA--TATTAA
185 TATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAA-CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
** * * * * *
103923 TATTTCAAGAATTAAT-A--AG-AGATTTAAAAAGTAAATATGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAG
249 TATTTTGATAATTAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
* * * ** * * * *
103984 CTATGACTATTTGAACAATTATGTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAATAAT
314 -TATAACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
*** * * * * * * * * *
104049 TATTTTTGTTTACACAAACTTAGTCAAAATAAAATAATATTACTTTAGTAATATTCTACAAACTA
378 TATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * * * * *
104114 ATAACTAAGAGATTTAAAAGATAAATCTGTTTGC-GAA-ACCAATTCAAACAGTTAAGACTATAT
443 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
104177 GAACAATTATTTATTTCGAATT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGCT
506 GAACAATTATCTATTTC-AATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TT
* * * * ** *
104240 CATACAAGCTTA-TC--CA-AAAAT-ATT-TACTCTATTAATATT-TCAAAAGTTAATACGTAAA
569 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAA-TTAATAAATAAG
* * * * **
104298 AGATTTAAAAA-ATAAATCAATTTA-CTGAA-ACAGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAACA
633 AGATTTAAAAATA-AAAT--TTTTATC-GAACA-AGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATT
* ** * *
104360 ACCTATTTCAAATCATTACT-ACTT
693 ATCTATTTCAAATTGTCA-TGACCT
* * * ** *
104384 TTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTGC-A-ACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTT-CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-A-AA
* * ** *
104447 AT-TTATTAATATTTCA-AGAATTAATAAG--AGAT-TTAAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAACC
62 ATATTATT-ATATTT-AGAAAATTAATAAGTAAAATATT-AAAAA-TAAATCTGTTTATTGAA-T
* ** * * *
104507 AA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTA
122 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTA
* * * * * * * * *
104571 TCATAAAACAATTATTTCTGTTCAAATAGGCTTATTCAGAATAAAAGAATACTAATTTAGTAATA
187 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATA-ACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * ** *
104636 TTCTAAAAATTAATAACTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAGCCAA-TTCAAATAG
251 TTTTGATAATTAATAAGTAGA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAG
* **
104699 T-TAAGACTA-TATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
314 TAT-A-ACTATTA-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
104762 ATTATTTCA
376 ATTATTTCA
104771 GCTTATATAT
Statistics
Matches: 21764, Mismatches: 5217, Indels: 4410
0.69 0.17 0.14
Matches are distributed among these distances:
648 1 0.00
649 1 0.00
650 4 0.00
651 8 0.00
652 2 0.00
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TATTATATTTAGAAAATTAATAAGTAAAATATTAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAAC
AATTGTTTTTGTTCATATAACTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAAT
TAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTATAACTATTAG
AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCAT
ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
TCAATTCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAG
AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAATAAAATT
TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTCATGACC
T
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Alignment explanation
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Period size: 156 Copynumber: 2.0 Consensus size: 156
76362 TAATATAATT
* **
76372 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAGAAAGTT
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* * * * * * *
76437 CAAATAGTTATTAACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTTAT
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*
76502 AAAGCAATTGTTTCTATTCAAACAAG
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** * ** * *
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*
76592 TCAAATAATCATT-TCCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCA-ATATGATCTTCTGTTTTGTC
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* *
76655 ATAAAATAATTGTTTCTGTTCA
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TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCGAGAAAGTT
CAAATAATCATTAACCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATAGATATGATCTTCTGTTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAG
Found at i:76899 original size:176 final size:175
Alignment explanation
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76518 TTCAAACAAG
* * *
76528 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTACCG-AACA-AG
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA--GTAAAACAG
* * ** * * * *
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* * ** *
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* * *
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1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGTAAAACAGTTCAAA
* * * **
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66 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTT-TTTTATCATAAAATA
* * * *
76839 ATTGTTTTTATTCATATAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
130 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* *
76885 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG-AATA-AG
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA--GTAAAACAG
* * * ** * * *
76948 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTC-AATTGTTCTGACCTTTTGTTTTGTCA
60 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTT-TTTTATCA
* * * * * * *
77012 TAAAACAATTGCTTCTATTTATGCAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTTAT
123 TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * ** *
77065 CTATTAAT-TTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAGCA-AAATCTGTTTTTTGAAAATAGTTCA
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTAGT-AAAACAGTTCA
* * * * *
77128 AATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATTATCTTTATTTTTTTATAAAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTT-TTTTATCATAAAA
* * * * *
77193 AAATTGTTTCTTTTCATATAATCTTATT-AGAATTAAAATAATACTAAT
128 TAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAAT
* * * ** * * ** ** *
77241 TAAATACTA-TTCCAAATATTAAAAAGTAAAACATTTAAAAAATAAAAGTGTTT-GCCGAACCAG
1 TTATTAATATTTTGAAA-ATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAG-TAAAACAG
* * *
77304 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-CATTTTGTTTAGTC
60 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTT-TTTA-TC
* * * * * * *
77368 ATAAAACAATTATTTCAACTCATACAAGCTAATTCATAATAAAATAGTACTAAT
122 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* ** * *
77422 TTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAACAAATCTGTTTACTAAATA-AG
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAGTAAA-ACAG
* *
77486 TTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTGATCTAACTATTTAAAGTCATTATGACCTTTTGTT
60 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATT-ATCT-A-T-TTCAAA-TCATTATGATCTTTT-TT
* * * * ** * *
77550 CTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAGAAACTTAACCAAAATAAAACAATACTACT
118 -TATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
** ** * * ** * *
77609 TTACAAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTGTTTTTTAAACCAATT
1 TTATTAATATTTTGAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGTAAAACAGTT
* * * * * *
77674 CAAATAGTTACGACTATTAGAACAAATATCAATCTC-AATGCATTATGATCTTTGTTTTCTCATA
62 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CATTATGATCTTT-TTTTATCATA
* * * * * **
77738 AAATAATAGTTTTTGA-TCATCCAAGTTTA-TGAGGATAAAAATAATACTAAT
125 AAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAAT
* ** * * * *
77789 TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATCTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAACCTA-TTCA
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGT-AAAAC-AGTTCA
* * * * * * *
77852 AATAGTTAAGACTATTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTTTGAACTTTTATTTAGTCATATA
64 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTT-TTTA-TCATAAA
77917 ATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
127 ATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
*
77966 TTATTAACATTTT
1 TTATTAATATTTT
77979 TTTATTTCAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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189 1 0.00
191 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (175 bp):
TTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGTAAAACAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTTTTATCATAAAATAA
TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
Found at i:77200 original size:356 final size:354
Alignment explanation
Indices: 76528--77978 Score: 1195
Period size: 356 Copynumber: 4.0 Consensus size: 354
76518 TTCAAACAAG
* *
76528 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTACCGAACAAGTT
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
* * * * * *
76593 CAAATAATCATTTCCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCAATATGATCTTCTGTTTTGTCATA
66 CAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTA-TTTCAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
76658 AAATAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTTAAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTTTG
130 AAACAATTGTTTCTATTCATGCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATTAAT-TTTTG
* * * * *
76723 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTAGTAAAACAGTTCAAATATTTATGACTATT
194 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACAAAATCTGTTTACTAAAATAGTTCAAATAGTT-TGACTATT
* ** *
76788 TGAATAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATCTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTT-TTATTC
258 TGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTT-TTC
76852 ATATAAGT-TTATTCAGAA-TAAAATAATACTAAT
322 ATATAA-TCTTATT-AGAATTAAAATAATACTAAT
* *
76885 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTT
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
** *
76950 CAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAATTGTTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAA
66 CAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * *
77015 AACAATTGCTTCTATTTATGCAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTTATCTATTAATTTTTGAA
131 AACAATTGTTTCTATTCATGCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATTAATTTTTGAA
* **
77080 AATTAATAAGAGATTTAAAAGCAAAATCTGTTTTTTGAAAATAGTTCAAATAGTTGTGACTATTT
196 AATTAATAAGAGATTTAAAAACAAAATCTGTTTACT-AAAATAGTTCAAATAGTT-TGACTATTT
* * *
77145 GAACAATTATCTATCTCAAATCATTATTATCTTTATTTTTTTATAAAAAAATTGTTTCTTTTCAT
259 GAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTTTTCAT
77210 ATAATCTTATTAGAATTAAAATAATACTAAT
324 ATAATCTTATTAGAATTAAAATAATACTAAT
* * * ** * * ** * ** * *
77241 TAAATACTA-TTCCAAATATTAAAAAGTAAAACATTTAAAAAATAAAAGTGTTTGCCGAACCAGT
1 TTATTAATATTTTGAAA-ATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGT
* * * * * * * *
77305 TCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACATTTTGTTTAGTCAT
65 TCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTC-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * * * *
77370 AAAACAATTATTTCAACTCATACAAGCTAATTCATAATAAAATAGTACTAATTTATTAACATTTA
129 AAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATTAA-TTTTT
* *
77435 AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAACAAATCTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGATTT
193 GAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAACA-AAATCTGTTTACTAAAAT-AGTTCAAATAG-TTT
* * * *
77499 GACTATTTGAACAATTGATCTAACTATTTAAAGTCATTATGACCTTT-TGTTCTATCATAAAACA
251 GACTATTTGAACAATT-ATCT-A-T-CTCAAA-TCATTATGATCTTTAT-TT-TATCATAAAAAA
** * * ** * * *
77563 ATTGTTTCAATTCATAGAAACTTAACCA-AAATAAAACAATACTACT
309 ATTGTTTCTTTTCATATAATCTT-ATTAGAATTAAAATAATACTAAT
** ** * * * * ****
77609 TTACAAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACTGTTTTTTAAACCAA-T
1 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGT
* * * * * * * * * *
77673 TCAAATAGTTACGACTATTAGAACAAATATCAATCTCAATGCATTATGATC-TTTGTTTTCTCAT
65 TCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAT-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * ** * ** * *
77737 AAAATAATAGTTTTTGA-TCATCCAAGTTTA-TGAGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
129 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATGCAAACTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATATATTAAT-TT
** * * * * ** *
77800 TCAAAAATTAATAAGAGATCTAAAAA-ATAAATGTGTTTGTCGAACCTA-TTCAAATAGTTAAGA
191 TTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTGTTT-ACTAAAATAGTTCAAATAGTT-TGA
* * * * * * * *
77863 CTATTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTTTGAACTTT-TATTTAGTCATATAATAATTGTTT
253 CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTA-TCATAAAAAAATTGTTT
** * * *
77927 CAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAAT
316 CTTTTCATATAATCTTATT-AGAATTAAAATAATACTAAT
*
77966 TTATTAACATTTT
1 TTATTAATATTTT
77979 TTTATTTCAA
Statistics
Matches: 894, Mismatches: 167, Indels: 66
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
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360 1 0.00
361 9 0.01
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365 1 0.00
366 9 0.01
367 80 0.09
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369 10 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (354 bp):
TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
CAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCTATTCATGCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATTAATTTTTGAA
AATTAATAAGAGATTTAAAAACAAAATCTGTTTACTAAAATAGTTCAAATAGTTTGACTATTTGA
ACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTATCATAAAAAAATTGTTTCTTTTCATAT
AATCTTATTAGAATTAAAATAATACTAAT
Found at i:78214 original size:17 final size:16
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.8 Consensus size: 16
78158 ATTGAACCAG
78168 TTTAAATAATTATAACTA
1 TTTAAATAATTAT--CTA
78186 TTTAAATAATTATCTA
1 TTTAAATAATTATCTA
*
78202 TTTCAAATCATTAT
1 TTT-AAATAATTAT
78216 TACTTTTTTT
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 1, Indels: 3
0.88 0.03 0.09
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.21
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ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (16 bp):
TTTAAATAATTATCTA
Found at i:78395 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 78346--78396 Score: 52
Period size: 17 Copynumber: 2.9 Consensus size: 18
78336 TAACCAAACC
*
78346 ATTTCAAATAGTTTTGACT
1 ATTTCAAATAGTTAT-ACT
* *
78365 ATTT-GAATAATTAT-CT
1 ATTTCAAATAGTTATACT
78381 ATTTCAAATAGTTATA
1 ATTTCAAATAGTTATA
78397 ACTTTTTTAT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 5, Indels: 5
0.71 0.14 0.14
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.24
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Consensus pattern (18 bp):
ATTTCAAATAGTTATACT
Found at i:81142 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 80448--81143 Score: 607
Period size: 181 Copynumber: 3.8 Consensus size: 179
80438 ATATTTTAAA
* * * * *
80448 AATAAATAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAACTATGACTATTT-
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * ** * * *
80512 AAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAATTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTCTATTCA
65 AA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAAT-GATTCTATTCA
* * * * * *
80577 TACAAGCTTACTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGACAGTG
128 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTAAGACAATT
* * * * * * * * * * *
80629 AATAAGTAAAA-ACTTTCAAAAGTAAATATGCTTATCTAACTAGATCAAATAGTCATGATTGTTT
1 AATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTG-TTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * *
80693 GAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTAT-AAAAAATTATT-TCAGCTC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATGATTCT-A-TTC
* * * * *
80756 ATATAAGCTTATTCAAAATAAAGTAAAACTAAGTTATTAATATTCCAA-A-AATT
127 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATT--AAGACAATT
* * * ** * *
80809 AATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTAACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTT
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-ACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * * * **
80874 AACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCA-AAAAATGATTTTTTCTATTCA
65 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAAA--AATGATTCTATTCA
* *
80938 TACATGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTAAGACAATT
128 TACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTAAGACAATT
* **
80990 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTCACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTG
1 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-ACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * *
81055 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAAAAAATGATTCTATTTAT
65 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTAT-AAAAAAATGATTCTATTCAT
* * *
81120 ACAAGCGTATTCGGATTAAAATAA
129 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
81144 GTAAAAGGTT
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AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAAAAATGATTCTATTCATAC
AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTAAGACAATT
Found at i:81874 original size:180 final size:180
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Period size: 180 Copynumber: 4.2 Consensus size: 180
81129 TTCGGATTAA
* * * ** * * * *
81139 AATAAGTAAAAGGTTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTT
1 AATAAGTTAAA-GATTTAAAAAATAAATCTG-TTTTCAAAGATGTTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * *
81204 GAATAACTATCTATTTCAAAATATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCA
64 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * ***
81269 TATAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTGAAATT
129 TACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * *
81320 AATGAG-TAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAGCATGTTCAAATAGTTATAACTATTT
1 AATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCAAAG-ATGTTCAAATAGTTATAACTATTT
** * * * *
81384 GAACAATTATCTATTTCAAAAGATTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTATGTTCA
64 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
*
81449 TGCAAGCTTATGTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATT
129 TACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * ** * ** *
81501 AATAAG-TAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTCAAATA-TTATGCCCATTTG
1 AATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTTCAAAGATGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
* ** * * * *
81563 AACAATTATCGT-TTT-AAATCATTACAACCTTTTGTTTTGCCATAAACCAATTGTTTTTGTTCA
65 AACAATTATC-TATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * * * *
81626 TAAAAACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATACCAAAAATT
129 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
**
81678 AATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGTCAAAGA-GTTCAAATAGTTATAACTATTTG
1 AATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCAAAGATGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * * *
81742 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
65 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * *
81807 ACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAGAGTT
130 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* **
81858 AATATGTTGGAGATTTAAAAAAATAAATCT
1 AATAAGTTAAAGATTT-AAAAAATAAATCT
81888 ATTCACTAAA
Statistics
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
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AATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCAAAGATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA
ACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
Found at i:82511 original size:181 final size:179
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82226 ATTAATACAC
* * * * * *
82236 AAGAAATTTCAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACAATTTAAACA
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*** * * *
82299 ATTATCTATTT-AAACTAAATATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTTA-TTCATAAA
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* * **
82362 AGCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGGTAAGT
125 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* *
82417 TAGAGATTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATCGAATCGGTTTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATCGAAT--G-TTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAA
** * *
82481 TTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTCCTTTACATCATACAAT
63 TTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTACTTCATACAAG
* *** * *
82546 CCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAACTAATAAGT
127 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
82599 AGGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTAT----TG---AACT-AGT-T--CCTATTTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATCGAATGTTCAAATAATTATAGCC-ATTTGAACAATT
* * * ** * * * *
82652 ATCTATTTCAAGTTGTTATAACTTATTGTTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTTAATTCATATAAGC
65 ATCTATTTCAAATCGTTATAACTT-TT-CTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTACTTCATACAAGC
* * *
82717 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACT
128 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGT
* * ** * * *
82769 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTT-GCTGAAGTAGTTCAAACGACTA-AGACTATAT-AACA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATC-GAA-T-GTTCAAATAATTATAG-CCATTTGAACA
* * * * * * * *
82830 ATTATCTGTTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTGTTTCAGTTCATACAA
62 ATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTACTTCATACAA
* * *
82895 GCTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGG
126 GCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
82949 AAGTGATTTAAAAAGTGAATCTA-TTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATCGAAT--GTTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAAT
* *
83013 GATCTATTTCAAATCATTAT
64 TATCTATTTCAAATCGTTAT
83033 TACCTTTTTC
Statistics
Matches: 482, Mismatches: 98, Indels: 72
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Matches are distributed among these distances:
168 7 0.01
169 31 0.06
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.09, T:0.39
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AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATCGAATGTTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAATTA
TCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTACTTCATACAAGCTTA
TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
Found at i:84465 original size:180 final size:180
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Indices: 83121--99386 Score: 8227
Period size: 181 Copynumber: 91.2 Consensus size: 180
83111 TACATAAACG
* * * * * * ** *
83121 ATTATCTATTTTAAATCGTTACGACCATTTGTTTTGTTATAAAATAATT-TTTTTGTTTATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAA
* * * *
83185 GCTTATTC-AGATTAAAATAATACCAATTTAATAAT-TTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
66 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * *
83244 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTTATATGATTAAT-ACTA-TTAAAGCA
130 AAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATT-ATGACTATTTGAA-CA
* * * * * *
83296 ATTATCTATTTCAAATTGTTCT-AACCTTTTGCTTAGTCATAAAGCAGTTG-TTTCAGTTCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATAC
* * * * *
83359 AATCTTATTCGTAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
83423 T-AAAAA-AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * *
83475 ATTGTCTATTTCAAATCACTATG-ACATTTTATTTTTTCATAAAACAATTG-TTTCAATTAATAT
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
* * * *
83538 AAGTTTATAC-AGAATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
64 AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
83598 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATCAGTT-AAATAATTACT--CTAGTTTGAACA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTA-TGACTA-TTTGAACA
* * * * * *
83651 ATTATCTATTTCAAA-CTGTTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAAATAATTCTTTTTGA-TCATA
1 ATTATCTATTTCAAATC-GTTATGAACTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT-GTTTTCATTCATA
* * * *
83714 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATATC-AAAATT--TTA-TAAGAAATT
63 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * ** ** *
83775 TAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAATTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATA
128 TAAAAAATAAATCTGTTT-ATCAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * ** * * *
83829 ATTATTTATTTCAATTCGTTCT-AACCTTTT-CATAGTCATAAAATATTTG-TTTCATATCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAT-TCATAC
* * * *
83891 AAGCTTATTTGAAATAAAAGAAT-CTTAATATATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGAT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
83954 TTAAAGAAATGAATATGTTTA-CCAACTAAGCTT---A-AA-TA-G-TTATTTAAAGA
127 TTAAA-AAATAAATCTGTTTATCAAAC--AG-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
84004 ATTAGT-TATTTGAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTTTCATAAAACGATTG-CTTCAGTTCACA
1 ATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATA
* * * * * *
84066 AAAGGTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
63 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * **
84131 TAAACAAGTAAATATGTTT-TCAGAAAAAATTCAAATAGTTACAACTATTTGAACA
128 TAAA-AAATAAATCTGTTTATC--AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
84186 ATTGTATATTTAAAATCATTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-AGTTCATAA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATAC
* * * * *
84249 AAGGTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * ** * *
84314 AAAAAGTGAATCTGTTTATCAAATCAGTTTAAATAATT-TGGTTATTTCAATA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* *
84366 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTTGTTTTGTCATAGAACAATTGCTTTTCA-TCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATTCATACA
* * * *
84430 AGCCTATTCAAAATAAAAGAATACTAATTTATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
84495 AAAAATAAATCT-ATT-T-----A-TTGAAAT-AGT-T-CCTATTTGAATA
130 AAAAATAAATCTGTTTATCAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
84535 ATTACCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTATTCTATTATAATATAATT-ATTTCAGTTCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATAC
** * * * * * *
84598 AAGCTCGTTCAAAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTCCAAAAGTTAATAACTAAGAGATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * **
84663 AAAATATAAATCTATTTGCCAAAGCAGTTCAAACAATTAAGACTAAATGAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * *
84716 ATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATCGTTTT-AGTTTATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACA
* * * *
84780 AGCTTATTTGAAATAAAATAATA-TAAATTCATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATCT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * *
84840 AAAAAGTGAATCTGTTTACCGAATCATTTTAAATAATTATGGCCATTTCAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
84893 ATTATCTATTTCAAATCAG-TATTACCTTTTGTTTGGTCATATAATAAATGTTTTTGA-TCATTC
1 ATTATCTATTTCAAATC-GTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATTCATAC
* * *
84956 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG---CA-ATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * *
85017 -AAAAA-AAGTTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * **
85068 ATTATATACTTCAAATTGTTAT-AAGCTTTTGTTCTATCGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACA
* * * * *
85132 AGCTTATTCGAAATGAAATAATACTAATCTAATAATATTT-AGAAAATTAATAACTAAGAGAATT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
85196 -ACAAATAAATTTATTGGA-CGAACCAATTCAAATATTTAAGACTATATAAACA
129 AAAAAATAAATCTGTT-TATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
*
85248 ATTATCTATTTCAAAAT-GTTAT-AACCTTTT-TTTTGTCATAAAA-AA--ATTTTCAATTCATA
1 ATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATA
* * *
85307 CTAGCTTATTCGAAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGGGAT
63 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
** * * *
85370 TTAAAAAATTATTTCTGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
127 TTAAAAAA-TAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
85426 ATTATCTATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGCTTTT-GTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATTCATACA
* * * * * * * * *
85489 AGTTTGTTTGAAATAAAGTAATGCTAATCTATTAATATTAC-AAAATTAAT-AG---CAGATGTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* *
85549 AAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAA
130 AAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-A
* * * * *
85601 ATTATTTATTTCAAATCGTTCT-AACTTTTTGTCTTGTTATAAAACATTTG-TTTC-TGT--T--
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAT-TCATAC
* * * * * * *
85659 -AGCCTT-TTTGGATTAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCGACAATTAATAAGTAA-AAATT
64 AAG-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
85721 TAAAAAA-ATATATGTTTAT-AGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATCA-AAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
85774 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAAGATTTG-TTTCAGTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACA
* * * * * * * *
85838 AGTTTGTTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTACTATTCCAAAAATTAATAATTAACAGATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
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130 -AAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * **
85955 ATTATCTATTTAAAATCGCTAT-AACCTTTTATTTTGACATAAAATAATT-TTTTTGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACA
* *
86018 AGCTTATTCTG-AATAGAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGA
65 AGCTTATTC-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGA
* * *
86079 TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACA
126 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * **
86134 ATTATTTATTTCAAATTGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * **** *
86198 AGGC-TATT-TAGATTAAAATGATATTAA-TTATTAATATTTTGGCAATTAATAAGTAAAAGATC
65 A-GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-
* * * * * * *
86260 TAAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * ** * * *
86315 ATTAACAATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTATTTTGTAATAAAATGACTG-TTTCAATTCAAAT
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
* * *
86378 AAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAAT
64 AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * ** *
86442 TAAAAAATGAATTTGTTTACCGAAA-AGCCCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * *
86495 ATTATCTATTTCAAAACCTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTAGTTAT-ATTCATGC
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTCATTCATAC
* * * * * * *
86558 AAGCTTATTTTG-AATGAAATAATA-TAAATTGATTAATCTTACAAAAATTAATAGGTAA-AAAT
64 AAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * *
86620 TTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * ** * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAA
* * *
86740 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTA
* *** * *
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* * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * * *
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65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATT
* * * * * * * * *
86983 TAAAAAATAAATATGTTCACTGAATA-AGTTCAAATAGTCAAGTCTATCTGAACT
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* * * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
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64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * *
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* ** * * * * *
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65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
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130 AAAAATAAATC-TGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAA
*
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* * ** *
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131 AAAATAAATCTGTTTATCAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * ** * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-C-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATAC
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* * * * * **
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128 T-AAAAAATAAATCTG-TTT-ATCAAAC-AG----TTCA-AATAATTATGACTATTTGAA-CA
* *** * ** ** * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGAACTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATAC
** * ** * * * * ** *
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64 -AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAA--GTAAG-A
* * * * * * * *
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124 GATTTAAAAAATAAATCTG-TTTA--TC----AAAC--AGTT-CAA-ATAATTATGACT-ATTTG
*
88279 AATA
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** *** **** * **
88283 A-TA-C---TTCAAA-AATTGAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTGTTGAAGCAAT
1 ATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGAACT-TTTG-TTT-TGTCATAAAAC-AATTGTT--TTC-AT
* ** * * ** * * * * *
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* ** * * *** ** * * *
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111 TTAA-TAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAGTTCA--AATAATTATGACT
*
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** * * * * **
88462 AT--T-TATTTCAAATTATTCT-AACCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACA
* * * ** *
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65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATT
* * * * * *
88586 TAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACTGTTTCAATA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
88640 ATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTCTTTTCTAATAAAACAATT-ATTTCAGTTCATAT
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATAC
* * * **
88703 AAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-A-AAG-AATCTG-TT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATT
**** * * *
88764 TGCTTAAT-AA---G--T-TCAAATAGTT-ATGACT-ATT-TGAAC-AATT-----
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAGTTCA--AATAATTATG-ACTATTTGAACA
* * * *
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1 ATTATCTATTTCA-AATCGTTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATTCATA
** * * * *
88862 CAAGCTTATTTTAAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAAGAAGTAA-A-AC
63 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-
* * * * * *
88924 TTTAAAAAATAAATTTATTTTTTTAACACA-TT-AAAAAAGTTATGACTATTTGGACA
126 TTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCAA-ACAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * * * *
89044 AGCTTATT-TAGAATACAATAATATTAATTTGTGAAAAATAT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA--
* * * * * * *
89107 TTTAAAAAA-AAAT-TATTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATGA-TGATTTAAATA
126 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAACA
* * *
89161 ATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA-AAAACAATTG-TTTCTATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * *
89224 AGTTTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATA-TTCTAAAATTTAATAAGTTAGAG-CTT
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* * * * * * * * *
89287 AAAAAATAAATTTATTTACCGAATA-AGTTCAAATAGTCACGTCCATTTGAACT
129 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AA-ACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
89340 ATTATCTATTTCAAAATCATTATGATA-TTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
1 ATTATCTATTTC-AAATCGTTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATAC
** * * * *
89404 AAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGTCAAAAATT-A-AA--AATACATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
** * * ** * *
89465 AAAAGCTAAACCTGTTTATCGAACCAACT-AAATAGTTATGATTATTTGAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** *
89517 ATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-ATGTTCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA--TTCATAC
* * * * * * * * *
89580 AAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCATA-TTCTAAAACT--TAA-TAAGAGATT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * *
89640 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTGAAGACTA-TTAAATA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * *** *
89693 ATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAATGTAATTG-TTTCAATTTATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * * * * *
89756 TGCTTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAAAAATTT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * *
89820 AAAAAAAATAAGTATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAACA
129 --AAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * *
89874 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACA
* * * * * * **
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65 AGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * *
90003 AAAAAATAAAT-TAATTTATTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATA
129 AAAAAATAAATCT-GTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
*
90056 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATTCATACA
* *
90120 AGCCTATT-TAGAATAAAATAATACT-A---ATT--TA-TT----AA-T-A-AA-TAAGAGATTT
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * * * *
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129 AAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACA
* * * * * * *
90286 AGCTTATTCTAAATAAAATAGTACTGATCTAGTAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * * * * * * *
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129 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * ** *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTCATTCATAC
** *
90467 AAATTTATTCGAAAT-AAA-AATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * *
90526 AATAAATAAATCAGTTTACCAAATCAGTTC-AATAAGTTATAACAATTTGAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
90579 ATTATTTATTTCAAATCGATATGACCATTTCTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTAATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * *
90643 ATCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** ** * * * * * *
90707 AAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAATGCAAATAGTTATAACTCTTTGAACA
129 AAAAAATAAATCTGTT-TATCAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * ** *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAA
* ** *
90825 GCTTATTCGGAATAGTATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * ** * * *
90890 AGACTTAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT-AGCAATTTGAACA
131 AAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACA
* * * * *
90941 ATTACCTATTTCCAATCGCTAT-AACCTTTTCTTTTGTCATGAAATA-AACCT-TTTTCTATTCA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCAT-AAA-ACAA-TTGTTTTC-ATTCA
* * * * *
91003 TATAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGCAAAA
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* * * * * * *
91065 AATTTTAAAAATAACTCTGTTTATCGAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
124 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * **
91122 ATTATTTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTCTTTTTGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACA
* * * * * *
91186 AGCATATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
91251 AAAAATAAATATGTTTATCAAACAAATTTAAATAGTCATAACTATTTGAATA
130 AAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * *
91303 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAATAATTATATTT-GTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTCATTCATACA
* * * * * *
91367 GGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTTACAGATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* ** * * * * * * *
91432 AAAAATGAATCAATTTA-CTGAACAAATTCAAATAGTAAGGACTGTTTAAACA
130 AAAAATAAATCTGTTTATC-AAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * *
91484 ATTTTCTATTTCAAATCATTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTATTTCATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-A-TTCATA
* * * * *
91547 CAAGCTTGTTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAA-AAAT
63 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
91610 TTTAAAAATAACTATGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * *
91665 ATTA-CTTATTTCAAATAGTTATGTCCTTTTGTTTTTTCATAAACCAATTG-TTTCTATTCATAC
1 ATTATC-TATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
* * *
91728 AAG-TGTATTCGAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAAT
64 AAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
91790 TTTAAAAATAAATCTATTTA-CTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
91845 AATATTTATTTCAAATAGTTATCATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-----ATCATT--T-CTA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACAA
* * * * *
91901 ---T-TTAG-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
91961 AAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAACA
131 AAAATAAATCTGTTTATCAAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * *
92012 ATTAT-TGATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATTC
1 ATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
** * * * **
92075 AAAATTATT-TAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
64 AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * * * * *
92135 TAAGACCTAAATTTGTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** *
92189 ATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-ATGTTCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA--TTCATAC
* * * * * * * * *
92252 AAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCATA-TTCTAAAACT--TAA-TAAGAGATT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * *
92312 TAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTGAAGACTA-TTAAATA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * *
92365 ATTATCTATTTCAAA----T-TG------T-TTTAGTCATAAAATAATT-ATTTCAATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * * * *
92417 ATCTTATT-TAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAAATT
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * * *
92480 TAAAAAAATAAATCAATTTA-CTGAACAATTTCAAATAGATT-TGATTATTTGAACA
128 T-AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAAC-AGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACA
* * * * * ** *
92535 ATTATTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT---A-AATTGTTTTAATTTTGTAA
1 ATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATAC
* * * * *
92595 AAACTTATTTGAAATAAAATCATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-CAGAGATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * *
92659 -AAAACTAAAGT-T-TTT-T--AACTAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACA
129 AAAAAATAAA-TCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * *
92707 AATATGAATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTTGA-TCATACA
1 ATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACA
* * * * *
92769 AGCTTATTTG-GATAAAAATAATGCTAATTTAATAATATTAT-AAAAATTAGT--G-AA-AGATT
65 AGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** * * * * * *
92828 TAAAAAATAAATGTATTTGCCTAACCAGTTCAAATAGTTAAGTCTATTAGAATA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
92882 ACTATCTATTTCAAATCATT-CGAACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGGTTTCAGTTC-T-T
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATAC
** ** * ** * * * **
92944 AA--TT-TT-G-AATACAAA-AATTTTTGTATATTTGAA-ATAACAAAAACTAAATATATTGATT
64 AAGCTTATTCGAAATA-AAATAATACTAATTTA-TT-AATATTTCAAAAA-TTAATA-AGTAAGA
* * ** * *
93002 GAATAAAAAATATATAATAGCAAATATT-TGAAA-ATGTTCCAAAAAACAATTTATG--TA-TTG
124 GATTTAAAAA-ATA-AAT--C-TGT-TTATCAAACA-GTT-C---AAATAA-TTATGACTATTTG
*
93062 AATA
177 AACA
* * * * *
93066 ATTATCAATTTC-AATCATT-TG-ACATTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATAAA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACA
* * * * * * * *
93126 AACTTATCCAAAATTAAAACTAAAACTACTTTATTACTATTTTTAACAAGTT-ATAAGTAAGAGA
65 AGCTTATTCGAAA-TAAAA-TAATACTAATTTATTAATA-TTTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGA
* ** *
93190 TTTAAAAAATAAATCAGTTT-TCTGAATTAGTTCAAAATAATTAT-TC-ATTTTGAAC-
126 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC--AAACAGTTC-AAATAATTATGACTA-TTTGAACA
*
93245 ATT-TCTATTTCTCAAATACGTTATGAAC---T-TTTTGTCCGTAAAACAATTGTTTTCA-TCAT
1 ATTATCTA-TT-TCAAAT-CGTTATGAACTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTTCATTCAT
* * * * *
93304 ACAAG-TCTATTTGGAAGAATAATAA-A-TAATTTAATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAGGA
62 ACAAGCT-TATTCGAAATAA-AATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * * *
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124 GAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAA-CAGTTCAAATA-ATTATG-ACTATTTG-AACA
* * * *
93426 CATTA-CTAATTTCAAATCATATAATAAAACCATTTGTTTATAG--ATAAAACAATAT-TATTTA
1 -ATTATCT-ATTTCAAATCGT-T-AT-GAA-CTTTTGTTT-T-GTCATAAAACAAT-TGT-TTTC
* * * * *
93487 ATCTTATATACAAGGCTTATTTGACAATACAA-AATACT-ATATAATAA-ATATTCATGAAAATT
56 A--TT-CATACAA-GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCA--AAAA-T
* * * ** * * ** * *
93549 TAATAAATTAAAGATATTTAAAAAATAAATATTGATATTGCCGAACAATTAACAAATTGTTAAGG
112 TAAT-AAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTG-T-TTATCAAACAGTT--CAAATAATTATGA
* *
93614 CGATATGAA-A
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* * *
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1 ATTATCTA-TTT-CAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCA-T
* ** * * * *
93684 ATAATTTTGTTTGAAATCAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
62 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * * *
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* * * * * ** *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
** * * * * * * *
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* *** * * * * *
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* * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATC-GTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-A-TTCATA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * **
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
* * * *
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* * *
94288 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
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* * * **
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATACA
* * * * * * *
94407 AGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
94472 AAAAATAAATATGTTTA-CAGAACATGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATA
130 AAAAATAAATCTGTTTATCA-AACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * ** * *
94524 ATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATT-AGTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACA
* * * *
94588 AGCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTTAGAGATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
** * * * *
94653 AATTATGAATCTATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
130 AAAAATAAATCTGTTTATC-AAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * ** *
94705 ATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAACTAATTTT-GTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTCATTCATACA
* * * *
94768 AGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAACTTATTAATATTCCAAAAA-T--CAA-T-A-A-A--
65 AGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
94822 -AAAAATTAAATTTGTTT-TCTAAACATATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAAGA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
94875 ATTATCTATTTCAAATAGATATGACCATTTTTCTTTTATCATAAATCAATTG-TTTCTATTCATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGA--ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATA
* * * * *
94939 TAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATT
63 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * * * * *
95003 TTAAAAAATAAATATGTTTATCGAGCAAGTTCATATCATTATGATTATTTGAATA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
95058 ATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-ATTTCTATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * *
95122 AGTTTGTTC-AGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAT-AGTTAGGTGAT
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGAT
* * * * * *
95183 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGCCCATTTGAACA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
95238 ATTATCTATTTGAAATCATTATG-ACTTTT-TGTTTGTTATAAAAACAATTATGTCTC-TTCATG
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGT-TTTGTCAT-AAAACAATTGT-TTTCATTCATA
** * **
95300 CAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
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* * *
95360 TTAAAAACTAAATCTGTTT-TCCAAAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTAT-C-AAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
95415 ATTAT-GATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTTATAAAATAATTG-TTTCTTTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * *
95477 AGCTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTT
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * *
95541 AAGAAATAAATGTGTTT-GCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAAA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAA-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
95594 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGCTTTT-GTCCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATTCATACA
* * * *
95658 AGTTTGTTC-AGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** * * * * *
95718 AATAAATAAATCAATTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
95771 ATTATTTATTTCAAGTCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTATTAATACA
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* * * * *
95835 ATCTTATTC-AGAATAAAGTAATGCTAATTCATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACG-TAT
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* ** ** * * * * * * *
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127 TTAAAAAATA-AATCTGTT-TATCAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * **
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * ** *
96016 AGCTGATTCGGAATAACATAATTTTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAACAGATTT
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* * * *
96080 AAAAACTGAATCTGTTTATCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
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1 ATTATC-TATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATA
* ** * * *
96195 CAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATAGAAATTTATTAATA-TTCGACAATTAATAAGTAAAAGAT
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** * * * * *
96258 TT-TTAAA-AAATTTGTTTACCGAATA-AGTTCATAA-AGTTATGACTATTTAAATA
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AA-ACAGTTCA-AATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * **
96311 ATTATTTATTTCAAAATTATTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCATAC
1 ATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCATTCATAC
* * * * * * *
96375 AAGCTTATTCG-GATTAAATAATATTAATTAATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
** * * * * * * * * *
96439 TCAAAATAAATATTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAGA
129 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * *
96492 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TGTATT-AGTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATACA
* * * *
96555 GGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTT
* * * ** **
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129 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAAC-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
96672 ATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTTAT-GTTCATACA
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* * * * * * *
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* * * * *
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128 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * ** * **
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* * * * *
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** * * * * ** * *
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* * * ** *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATAC
** * * * * * *
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64 AAGCTTATTCGA-AATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
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* * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
* * * * * * * * *
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65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
97700 AGAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTAAACA
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* * * * *
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** * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATACA
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* ** * *
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* ** * * * *
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* * ** * ** *
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** * *
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Statistics
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * *
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** * *** * * * *
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** * * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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129 A--GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * *
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124 T-AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * ** * *
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* * * * *** * *
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* * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
*
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* * * ** *
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*** * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * *
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* * * *** * *
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125 AAAAA-GAATTTGTTTA-TCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * * *
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* ** * * * * * *
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*** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* ** * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* *
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* * * *
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125 AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * * * ** * *** **
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* * * * **
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125 A-AAAAGAATTTG-TTT-ATCGA-ACCAG----TTCA-AATAATTATGACTATTTGAA-CA
* * * * * ** ** * * * *
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1 ATTATCTATTT-CAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTC-AT
* * * * * ** * ** ***
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62 A-CAA-GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAAT-ATT-TAAAAATTAATAAGCAGA
* * * * * * * *
88221 TTATAAACTAATTG-TTTTAGTTCATAT-AAACTTATTTGGAATAAAATAAT-ACTAATTT-AAT
122 TT-TAAA--AA--GAATTT-GTT--TATCGAAC-CAGTT-CAA-ATAATTATGACT-ATTTGAAC
88282 A
175 A
*** ** ** * * *** * *
88283 A-TA-CT-TCAAAAATTG--ATAA-C-TAAGAGATT-T-AAAAAATAAAACTATTTG-T--T-GA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* *** ** * * ***
88335 AGC-AATTC-AAATAGTTAAGACT-ATA-TAAACAATTAACT-TTTTCAAATCGTTATGA-CCTT
65 AGCTTATTCGAAATA---AA-A-TAATACTAATTTATTAA-TATTTAAAAAT--TAATAAGCAGA
* ** ** *
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122 TT-T-A-AAAAGAATT-TGTTTA------T-C-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-
88457 CA
174 CA
* * * * * *
88459 ATTATTTATTTCAAATTATTCTAACCTTTTATTTTATCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
88524 GTTTATTC-AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAGAAGATTTA
66 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT-A--AGCAGATTT-
* * * * * * *
88588 AAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACTGTTTCAATA
125 AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * * * * ** *
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* * * *
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* *
88761 G--TTTGCTTA---ATA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
130 GAATTTGTTTATCGA-ACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * ** * *
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1 ATTATCTATTTCA-AATTGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
** * * * * * *
88863 AAGCTTATTTTAAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAACTTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-CAGA-TTT
* * * ** * *
88927 AAAAAATAAATTTATTTTTTTAACACA-TT-AAAAAAGTTATGACTATTTGGACA
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* * * * * * * *
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* * * * *
89225 GTTTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCTAAAATTTAATAAGTTAGAGCTTAAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-CAGA--TTTAA
* * * ** * * * * * *
89290 AAATAAATTTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCACGTCCATTTGAACT
127 AAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * ** * * *
89340 ATTATCTATTTCAAAATCATTATGATATTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
1 ATTATCTATTTC-AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * * ** *
89405 AAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGTCAAAAATTAA-AAATACATTT-AAA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGCAGATTTAAAA
** ** * *
89468 AGCTAAACCTGTTTATCGAACCAACT-AAATAGTTATGATTATTTGAACA
129 AG---AATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
89517 ATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACA
* * * * * * * *
89581 AGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCATATTCTAAAACTTAATAAG-AGATTTAAA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGCAGATTT-AA
* * * * * * * * *
89644 AAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTGAAGACTA-TTAAATA
127 AAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *** *** * *
89693 ATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAATGTAATTGTTTCAATTTATACAT
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * *
89757 GCTTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGCAAAAAATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGC---AGATTTAA
* * *
89822 AAAAAATAAGTATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAACA
127 AAAGAAT---T-TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * ** *
89874 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * * *
89939 GATTATCCAAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTA
66 GCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAA---GCAGATTT-
* ** ** * * * *
90004 AAAAATAAATTAATTTATTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATA
125 AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * **
90056 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* *
90120 AGCCTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATT-A-A--T----A--AATAAG-AGATTTAAAA
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGCAGATTT-AAA
* ** * * *
90173 AATAATTATACTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAATA
128 AAGAATT-TGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * *** *
90222 ATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTACCTTCATATAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
90287 GCTTATTCTAAATAAAATAGTACTGATCTAGTAATATTATGAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGC----AGATTT-
* * ** * * * * * * * * *
90351 AAAAATAAATTTATTTGCCAAACCAATTTAAATACTTAAGACAATATGGATA
125 AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * * * *
90403 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * *
90468 AATTTATTCGAAAT-AAA-AATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAG-AGATTTAATA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGCAGATTTAA-A
* ** * * * * *
90530 AATAAATCAGTTTACCAAATCAGTTC-AATAAGTTATAACAATTTGAACA
128 AA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAA-TTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
90579 ATTATTTATTTCAAATCGATATGACCATTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * *
90644 TCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG---CAGATTT-A
* ** * * * * * *
90709 AAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACCAATGCAAATAGTTATAACTCTTTGAACA
126 AAAA-GAATTTGTT-TATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * * * *
90760 ATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTCGTACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* ** * *
90825 GCTTATTCGGAATAGTATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGATTTAA
** * * * * * *
90890 AGACTTAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT-AGCAATTTGAACA
127 A-A-AGAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACA
* * * * * * *
90941 ATTACCTATTTCCAATCGCTATAACCTTTTCTTTTGTCATGAAATA-AACCTT-TTTCTATTCAT
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-ACAA--TTGTTTTTGTTCAT
* * * * *
91004 ATAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCAGACAATTAATAAGCAAAAAA
62 ACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGC---AGA
* * * * *
91067 TTTTAAAAATAACTCTGTTTATCGAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
122 -TTTAAAAAGAA-TTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * *
91122 ATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTCTTTTTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
91187 GCATATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGATTT-A
* * * * * * * * * *
91252 AAAATAAATATGTTTATCAAACAAATTTAAATAGTCATAACTATTTGAATA
126 AAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * ** * * * * * *
91303 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAATAATTATATTTGTTCATATAG
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * *
91368 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTTACAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG---CAGATTT-A
*** * * * * * * *
91433 AAAATGAATCAATTTA-CTGAACAAATTCAAATAGTAAGGACTGTTTAAACA
126 AAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * *
91484 ATTTTCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TTCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TGTTCATAC
* * * * * *
91548 AAGCTTGTTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG--CAGA-TT
* * * * * *
91612 TAAAAATAACTATGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACA
124 TAAAAAGAA-TTTGTTTATCGAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * *
91665 ATTA-CTTATTTCAAATAGTTATGTCCTTTTGTTTTTTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACA
1 ATTATC-TATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * *
91729 AG-TGTATTCGAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT
65 AGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG---CAGA-TT
* * * * * * *
91792 TAAAAATAAATCTATTTA-CTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACA
124 TAAAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * **
91845 AATATTTATTTCAAATAGTTATCATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA---ATCAT-TTC-T---A
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * *
91901 ---T-TTAG-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATA---AGCAGATTT-A
* * * * * ** * * *
91961 AAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAACA
126 AAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * *
92012 ATTAT-TGATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATTCA
1 ATTATCT-ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * * * *
92076 AAATTATT-TAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-AGATTTAAG
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGCAGATTTAA-
* * * ** * * *
92139 ACCTA-AATTTGTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACA
127 A--AAGAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
92189 ATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACA
* * * * * * * *
92253 AGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCATATTCTAAAACTTAATAAG-AGATTTAAA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGCAGATTT-AA
* * * * * * * * *
92316 AAATAAATATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTGAAGACTA-TTAAATA
127 AAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * ** * * *
92365 ATTATCTATTTCAAATTGTTTTAGTCATAAAATAATTATT-TCAATTCATACAATCT-TATTTAG
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATA-ACCT---TTTGTT-TTGTC-A-TAAAACAAT-TGT-TTTTG
** * * * **
92428 AATAAAATA-ATAGTAATTTATT--AACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAAATTTA--AAAAAA
57 --T-TCATACA-AG---CTTATTCGAA-A-T---AAAA-TAAT-A-C---TAATTTATTAATATT
* * * * * ** *
92488 TAAATCAATTTACTGAA-CA-ATTTCAAATAG-ATTTGATTATTTGAA-CAATT-ATTTATTTA-
104 TAAA--AA-TTAAT-AAGCAGATTT-AAAAAGAATTTGTTTA-TCGAACCAGTTCAAATAATTAT
* *
92547 AAGTCATTATG-AC-
163 GACT-ATT-TGAACA
* * * * * * ** ****
92560 CTTTTGTTTTATCATAAATTGTTTTAA-------TTTTGT-A-AAAACTTATTTGAAATAAAATC
1 ATTATCTATT-TC--AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC--AATTG-TTTTTGTTC
* * * ** * * *
92616 ATACTA-CTTTATT--AATATTTCAAA-AAT--TAA-TAAGCAGAGATTT-AAAACT-A-AAG-T
60 ATACAAGC-TTATTCGAA-A--TAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTAAAAATTAATAAGCA
** ** * * ** * * *
92670 TTTTTAACTAGTTCAAATAG-TTAT-G-ATTATTTGAACA-AA-TATGA--ATCTTAAATC-
120 GATTTAAAAAG---AATTTGTTTATCGAACCAGTTCAA-ATAATTATGACTAT-TTGAA-CA
* **** * * ** * * * * **
92724 ATTAT-GATCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTTGATCATACAAGC--TT-ATTTGGATAAA
1 ATTATCTAT-TTCAAATTGTTATAACCT-TTTGTTTTG-TCATA-AAACAATTGTTTTTG-TTCA
* * * * * * * * * *
92785 AATAATGCTAATT--TAATAATATTATA-AAAATTAGTGAAAGATTT-AAAA--AAT-A--A-A-
61 TACAA-GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA-T-TAATATTTAAAAATTAATAAGCAGAT
* * * * * * * *
92839 -T-----GTATTTG----CCTAACCAGTTCAAATAGTTAAGTCTATTAGAATA
123 TTAAAAAGAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** ** * * ** *
92882 ACTATCTATTTCAAATCATTCGAACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGGTTTCAGTTC-T-TA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTGTTCATACA
** ** * ** * **
92945 A--TT-TT-G-AATACAAA-AATTTTTGTATATTTGAA-ATAACAAAAACTAAATATA-TTGATT
65 AGCTTATTCGAAATA-AAATAATACTAATTTA-TT-AATAT-TTAAAAA-TTAATA-AGCAGATT
** * * *
93002 GAATAAAAA-ATATATAATAGCAAATATTTGAA-AATGTTCCAAAAAACAATTTATG--TA-TTG
124 ---TAAAAAGA-AT-T--T-G--TTTA-TCGAACCA-GTT-C---AAATAA-TTATGACTATTTG
*
93062 AATA
172 AACA
* ** * * * * *
93066 ATTATCAATTTC-AATCATT-TGA-CATTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * * *
93127 ACTTATCCAAAATTAAAACTAAAACTACTTTATTACTATTTTTAACAAGTTATAAGTAAG-AGAT
66 GCTTATTCGAAA-TAAAA-TAATACTAATTTATTA--ATATTTAA-AA-AT-TAA-TAAGCAGAT
* ** ** *
93191 TTAAAAAATAAATCAGTTT-TCTGAATTAGTTCAAAATAATTAT-TC-ATTTTGAAC-
123 TT-AAAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTC-AAATAATTATGACTA-TTTGAACA
* * **
93245 ATT-TCTATTTCTCAAATACGTTATGAA-C---T-TTTTGTCCGTAAAACAATTG-TTTTCATCA
1 ATTATCTA-TT-TCAAAT-TGTTAT-AACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * *
93303 TACAAG-TCTATTTGGAAGAATAATAA-A-TAATTTAATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAGG
61 TACAAGCT-TATTCGAAATAA-AATAATACTAATTT-ATTAATATTT-AAAAATTAAT-A--AGC
* * ** * * *
93365 AGATATTAAAAATAAATATACTTACCGAAACCAATT--AATAGTTTATGAACTATTTGAAACA
119 AGAT-TTAAAAA-GAATTTGTTTATCG-AACCAGTTCAAATA-ATTATG-ACTATTTG-AACA
* * *
93426 CATTA-CTAATTTCAAATCATATAATAAAACCATTTGTTTATAG--ATAAAACAATAT-TATTTA
1 -ATTATCT-ATTTCAAAT--TGT--TATAACCTTTTGTTT-T-GTCATAAAACAAT-TGT-TTT-
* * * * * *
93487 ATCTTATATACAAGGCTTATTTGACAATACAAAATACTATATAATAAATATTCATGAAAATTTAA
55 -TGTT-CATACAA-GCTTATTCGA-AAT---AAA-A-TA-ATACT-AAT-TT-ATTAATATTTAA
* * ** * ** *
93552 TAAATT-A-AAG-ATATTTAAAAAATAAATATTGATATTGCCGAA-CAATTAACAAATTGTTAAG
107 -AAATTAATAAGCAGATTT-AAAAA-GAAT-TTG-T-TTATCGAACCAGTT--CAAATAATTATG
* * *
93613 GCGATATGAA-A
164 ACTATTTGAACA
* ** * *
93624 ATTATCTATTTTGAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG--ATAAAACAA-TGTTTTAGTT-ACTA
1 ATTATCTA-TTT-CAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA-TA
* ** * * * *
93685 TAATTTTGTTTGAAATCAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTAA
63 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGCAGATTTAA
* * * * * * * * *
93749 TAAATAAATTTGTTTA-CTAAACCAATTTAATTAGTTATAACAATTCGAACA
127 -AAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * ** * * *
93800 ATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA-CTAGTTGTTTTATCATAATGCAATTGTTTCTATTAATACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * * * * * *
93864 ATTTTATTTGGAATAAACTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAGTTAGTAAGTAACAGATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG---CAGATTT-
* *** * * *
93929 AAAAAAAGAATCTGTTGGCCTG-ACCAATAT-AAATAGTTAT-AGCTATTTAAACA
125 --AAAAAGAATTTGTTTATC-GAACCAGT-TCAAATAATTATGA-CTATTTGAACA
* * * *
93982 ATTATCTATTTTAAATCAT-TTAT-ATCTTTTGTTTTGTCACAAAACATTTGTTTCTAT-TTC-T
1 ATTATCTATTTCAAAT--TGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TGTTCAT
* * * * * *
94043 ACAACCTGATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAG-AGA
62 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAA-T--T-AATAAGCAGA
* * * ** * * * * * *
94107 TTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAACAAGTCCAAATAGTTGTGACTACTTGAATA
122 TTTAAAAA--GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
94163 ATTACCTATTGCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAAT-TTTCTATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACA
* * * * *
94227 AGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAACAACTAAAAAGTAAAAGATT
65 AGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAA-AATTAATAAG---CAGATT
* * ** *
94290 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
124 T-AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
94344 ATTAT-TTTTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTATTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * * *
94408 GCTTATTTGGATTAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGATTT-A
* * * * * *
94473 AAAATAAATATGTTTA-CAGAA-CATGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATA
126 AAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * * ** * * *
94524 ATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTAGTTCATATAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* *
94589 GCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTTAG-AGATTTA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT-A---AGCAGATTTA
* * * * *
94653 AATTATGAATCTATTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
126 AA--AAGAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * **
94705 ATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAACTAATTTTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * *
94769 GCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAACTTATTAATATTCCAAAAATCAATAA--A-A---AAA
66 GCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGCAGATTTAAA
* * * * * *
94826 ATTA-AATTTGTTT-TCTAAACATATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAAGA
128 A--AGAATTTGTTTATCGAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
94875 ATTATCTATTTCAAATAGATATGACCATTTTTCTTTTATCATAAATCAATTGTTTCTATTCATAT
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * * *
94940 AAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG--CAGA-TTT
* * * * * * * *
95005 AAAAAATAAATATGTTTATCGAGCAAGTTCATATCATTATGATTATTTGAATA
125 -AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
95058 ATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * **
95123 GTTTGTTC-AGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGTTAGGTGATTTA
66 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATA---AGCAGATTT-
* * * * * * * * * *
95186 AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGCCCATTTGAACA
125 AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * * * * *
95238 ATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTG-TTTGTTATAAAAACAATTATGTCTCTTCATGCA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * *
95302 AAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-AGATTTAAA
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGCAGATTTAAA
* * * * * *
95365 AACTAAATCTGTTT-TCCAAAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
128 AA--GAATTTGTTTAT-CGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * ** * * * * *
95415 ATTAT-GATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTT-TTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACA
* * *
95477 AGCTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAG-AGATT
65 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAA-T--TAA-TAAGCAGATT
* * * * * * * *
95540 TAAGAAATAAATGTGTTT-GCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAAA
124 TAA-AAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
95594 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGCTTTTGTCCATATAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * *
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66 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGCAGATTTAA-A
* *** * * * * * * *
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* * ** * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * *
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66 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-CA-G-ATTT-
* ** * * * * * * *
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125 -AAAAAGAATTTGTT-TATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * **
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * ** *
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66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG---CAGATTTAA
* * * * *
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127 AAA--GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
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1 ATTATC-TATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATAC
* ** ** * *
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* * ** * * *
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124 TAAAAAGAATTTGTTTATCGAACCAGTTCA-AATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
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1 ATTATCTATTTC-AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * * * * * *
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65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGA-TTT
* * * * * * *
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125 -AAAA-AGAAT-TTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * *
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66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAA-T--T-AATAAGCAGATTTA
* * * **
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126 AAA-A-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * *
96672 ATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTTATGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * *
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66 GCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGC--AGA-TTT
* * *
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125 AAAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * ** *
96852 ATTATCTATTTCAAATAGCTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTTTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
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66 GCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG--CAGA-TTTA
* * * * * * ** * *
96981 AAAGGTAAATCTATTTA-CTGAGCAAGTTCATATCGTTATGATTGTTTGAACA
126 AAAAG--AATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * ** * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * *
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* * * * * * *
97163 AAAATAATTCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTAAACA
126 AAAAGAATT-TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * * * *
97214 ATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATTCAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
** * * * *
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66 GCTTATTCGA-AATAAAATA-ATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGCAGA-TTT-A
* * * * ** * * *
97341 AAAATAAATCTGTTTACCAAAATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATA
126 AAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
97392 ATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ATC-TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACA
* * * * * * * *
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* * * * ** *
97519 AAAA-AATAAATGTGTTTACCGAACTAATTCAAATAATTAAGACTATGAGAATA
126 AAAAGAAT---T-TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * **
97572 ATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAA
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* * *
97637 GCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATGAGTAAG-AGATTTA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATT-A--A-TAAGCAGATTT-
* * * * * *
97701 GAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTAAACA
125 -AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACA
* ** * *
97754 ATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAA
1 ATTATCTATTTCAAA-TTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * * * * * *
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65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGC-A--GATTTA
* * * * * * *
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126 AAAA-GA-ATTTGTTTAT-CGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * ** * * * ** *
97934 AATATCAATATGAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTAATCATATAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
** * * *
97998 GCCAATTTG-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG-AGATTTAAAA
66 GCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGCAGATTT-AAA
* * * ** * * *
98061 AATAAATGTATTTGCCGAATCAGTTC-AA-AA--AT-ACTATTAGAATA
128 AA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * * *** *
98105 ATTAT-TATTTTAAATCGCTCTGACCTTTGGTTTAGTCATACAATAATTGTTTCAATTCAAACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * ** *
98169 GCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTGAAATTTTAATAAGTATGAGATTTGA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGATTT--
* * * * * * *
98234 AAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACA
125 AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * * *
98286 ATTATCTATTTAAAATCATTATGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTATTAGTTCAAAAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * ** * * *
98350 ATCTTA-TCCAAATAAAATAATACTGCTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAATATTTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGATTT-
* *** * * *
98414 AAAAATAAATCAATTTA-CTTAATCAGTTCAAATAATTATTG-CCATTTG---A
125 AAAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTA-TGACTATTTGAACA
* * * * * * ***
98463 A-TATATATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTCGTCTTAAAATAATTATTTTTCAACATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * *
98527 GCTTTTTCAAAATAAAATAATAGTAATTTGTTAATATTTCAAGAATTAATAAG-AGATTTAAAAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGCAGATTTAAAAA
* * * * * * *
98591 -ATATATCTATTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATA
130 GA-AT-T-TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
98639 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* *** * *
98704 GCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAGCCATATACTGAAAATTAATAA-CTAAGAGATTT
66 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGC----AGATTT
* * * * * * * *
98767 AAAAA-ATATATCCGTTTGTTGAACTAGTTC-AACAGTTAAGACTATATGAACA
125 AAAAAGA-AT-T-TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * *
98819 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
98884 GCTTATTTGGAATAGAATAAAAGTAATTT-TTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAG-AGATTTA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAA--AT-TAA-TAAGCAGATTTA
* * * * * * * *
98947 GAAAATAATTCTATTTACCAAACCAATTCAAATAATCATTACTATTTGAATA
126 -AAAAGAATT-TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * * * *
98999 ATTATCTATTTCAAATCATTCTTA-CTTTATGTTTTGTCAT--AA-AA-TGATTTTTGTTAATAT
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCATAC
* * * * * * *
99059 AAGTTTGTTCAAAAGAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAATATCAAATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAAT--A-AGCAGATTT
* * * * * * * * * * *
99124 ACAAAGTAAATTGCTTACCAAACCATTTCTAATAGTTTTGACTATTTAAATA
125 AAAAAG-AATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
99176 ATTATTTATTTCAAATCGTTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTTTGCTCATACTA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
** * * * * *
99241 TTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAATTTAAAAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGCAGATTT-AAAA
* * ** ** * ** *
99305 ATAAATTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATA
129 A-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
99353 ATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGTTTCAGTTCAT---ACAA--GCTTAT-TTAAAAT
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTT-TG-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * ** * * ** ** *
99412 AA-ATTAAT---ATTAATTTATTA--ACATTTCA--AAAATTAATAACAAA--AAGGAG-ATTTA
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTT-ATTAATATT--TAA-AAATTAATAAGCAGATT
* * * * * * *
99466 AAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATATGAACA
124 TAAAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** ** * * **
99519 ATTGTCTATTTCAAATCATTATAACCATTTT-ACTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTTGTACA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * * * * *
99583 AGCTTAGATAG-AATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATCAGTAAGAGTTTA
65 AGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAG-CAGA-TTT-
* * ** * * * *
99647 AACAAAATAAATTTGTTTATTGAATAAATTCTAATAGTTATGACTATTTGAATA
125 -A-AAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *** *
99701 ATTGTTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-ACATTATTTCAATTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTTTGTTCATACA
* * *
99765 AGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAG-AGATTT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAA-T--TAA-TAAGCAGATTT
* ** ** * * * *
99829 AAAAAATAAAACTACTTA-CTGAACAAGTTTAAATAACTATGACTATTTAAACA
125 -AAAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** *** * *
99882 ATTATCTATTTGGAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AGATT-TCATCTT-TTCATA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGT--TTTTGTTCATA
* * * *
99944 CAAGCTTATTTTG-AATAAGATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGATAATTAATAAGTAAAAGA
63 CAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAG---CAGA
* * * * * * ** * * *
100007 TTTGAAAAATAAATCTATTCACCAAATAAGTTCAAATCATTATGAGTAATTGAAC-
122 TTT-AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
100062 ---A---A---CAAATTGTTTTGA-C-TTTGTTTTGTCATTAAACAATTGTTTATGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
100116 GCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGATTTAA
* ** * * * * *
100181 AAA-AATTAATATATT-TACTGAATAATTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATA
127 AAAGAATT--TGT-TTAT-C-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* *** * * * * * * * *
100233 ATTATCAATTTCAAATAACTGTGACATTTTGTTTTGTAATAAAATAATT-TTTTTAGTTAACATA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACA
* * *
100297 AGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAATGAGTAAG-AGAACT
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATT-A--A-TAAGCAG-A-T
** * * * * * *
100361 AAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATA
123 TTAAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* *** * * * * * * *
100415 ATTATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTATTCATCCAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * *
100480 GCTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTTATAAGCAAAAATTTG
66 GCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGC--AGATTT-
* * * * *
100543 AAAAATAAATTTGTTTCTTGAA-CATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
125 AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
100595 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTATCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACG
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATAC-
* * * * * * *
100659 AA-CGTATTTGGAATAAAATAGTACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
64 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG---CAGATTT
* * * * * * * * *
100723 AAAAAATAAATTTTTTTATGGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAATA
125 -AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *** * * *
100776 GTTATTTATTTCAAATCGTTATGGTCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * *
100841 GTTTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG---CAGATTTAA
* * * * * * * * **
100906 AATATAAATCTATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTAAT-ATCCATTTGAATT
127 AA-A-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACA
* * ** * * * *
100957 ATCATCTATTTCTAGCTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATACCAATTATTCAGAATA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-CAATTGTT-----T-
** * * *
101022 ATTGGTATTCATACAAAATTATTCAAAATTAAAA-AATACCAATTTATTACTATTTCAAAAATTA
54 -TT-G--TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTA
* * * * *** ** *
101086 AT-AG-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAACCCTATGAGAATA
113 ATAAGCAGATTT-AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * ** *
101149 ATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAT
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
101214 GTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATTAGCAAGAAATTAAA
66 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGC-AG-ATTTAAA
* * ** *
101279 AA-AATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
128 AAGAAT---T-TGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
101330 ATTATCTATTT-AAATTTGTTATGACCTTTTATTTTTATCTTAAAACAATTGTTTTAGTGCATAA
1 ATTATCTATTTCAAA-TTGTTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * * *
101394 AAGCTTA-TCCAAAGTAAAATAATAGT-ACTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATT
64 AAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGATT
* * * ** * * * * * *
101457 TAAAAATAAATTAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTTTGGCCATCTAAATA
124 TAAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * ** *
101510 ATTATCTATTTCAAATAGTTATGAA-CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACG
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * ** * *
101574 AGCCTATTTGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAAATGTA
65 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGC-AG--AT-TT
* * * * *
101639 AAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATA
125 AAAAA-GAATTTGTTTATC-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * *
101691 ATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * *
101756 GTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTT
66 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGC----AGATTT
* ** * * * * *
101819 AAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACA
125 -AAAAA-GAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
101872 ATTCT-TGATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTCTTTTAGTTCATATT
1 ATTATCT-ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-C
* * *
101936 AA-CTTATTC-AGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATGAATAAGTAAAAGAT
64 AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG---CAGAT
* * * * * *
101998 TTCAAAAATAATTTTATTTATCGAACTAGTT-AGATAATTATAACTATTTGAATA
123 TT-AAAAAGAA-TTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* * ** * * * * * *
102052 ATTGTCTATTTTAAATCATTATTACCTTAAAAAATGCTTTTGTTCAT-ATA-AGTT-TATTTG-G
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTT-----TTG-TTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * *** ** * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * * * * * ** * *
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* * *
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*** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * * ** * ** *
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66 AAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTC
* * * *
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* * * *
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** * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
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65 TAAAACAATTGTTTT-ATTTCATACAAGATTATTCGAAAT-AAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * * * *
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127 TCTAAAAATTAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
92856 TTCAAATAGTTAAG-TCTA-TTAGAATAACTATCTATTTCAAATCATT-CGAACCTTTTGTTTAG
1 TTCAAATAGTTATGAT-TATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ATC-TTTGTTTTG
* * * * ***
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62 TCATAAAACAATT-GTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATA-AAATAATCCAAT-T-TA-TT
* * ** * ** **
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122 -AATAT-TCTAAAAA-TTAATA-AGAGATT---TAAAAAATAAAT-AT-G--TTTA-CCGAACCA
93035 A
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* *** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* * **
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* * *
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1 TTCAAATAG-TTATG-ATTATTT-AAACA-ATTATCT-ATTTCAAATCAT-T-AT--GATC-TTT
* * * *
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56 GTTT-T-GTCATAAAACAAT-TGT-TTT-AT-TT-CATACAA-GATTATTCGA-AATAAAATAAT
* * * * * *
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*
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1 TT--CAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTA-TTT-CAAATCATTATGATC-TTTGTTTT
* * ** * * * **
93661 G--ATAAAACAA-TGTTTTAGTT-ACTATAATTTTGTTTGAAATCAAATAATATTAATTTATTAA
61 GTCATAAAACAATTGTTTTATTTCA-TACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAA
* * **
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124 TATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** ** * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCT--TTGTTTTGTC
** * ** * * * *
93838 ATAATGCAATTGTTTCTA-TTAATACAATTTTATTTGGAATAAACTAATGCTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * **
93902 TCTAAAAGTTAGTAAGTAACAGATTTAAAAAAAAGAATCTGTTGGCCTG-ACCAA
127 TCTAAAA---ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTACC-GAACCAA
* *
93956 TAT-AAATAGTTAT-AGCTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTTAT-ATCTTTTGTTTTG
1 T-TCAAATAGTTATGA-TTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTG
* * ** * * * *
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62 TCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAA-TCCAATTTATTAAT
* * * * ** *
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125 ATTCTAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * ** * *
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1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * **
94201 ATAAAATAAAATT-TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATATAAATTTATTAAT
64 AT-AAA-ACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAAT
* * * *
94263 ATTC-AAACAACTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TAA
125 ATTCTAAA-AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * *
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1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
94381 ATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAACTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * *
94445 T-TCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAA-CATG
127 TCT-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * * * **
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
94563 TAAAACAATTGTATTAGTTCATATAAGCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTC
** * * * *
94627 TCAAAAATTAATGAGTTAGAGATTTAAATTATGAATCTATTTACTGAA-CAA
129 T-AAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * *
94678 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTAGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* ** * * * ** *
94742 ATAAAATAACTAATTTT-GTTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATATAAACTTATTAATA
64 ATAAAACAA-TTGTTTTATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * * * *
94805 TTCCAAAAATCAAT-A-A-A---AAAAATTAAATTTGTTT-TCTAAACATA
126 TTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * * * *
94849 TTCAAATAGTTATGACTGTTTGAAGAATTATCTATTTCAAAT-AGATATGACCATTTTTCTTTTA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATG---ATCTTTGTTTTG
* * * * **
94913 TCATAAATCAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
62 TCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAAT
* * *
94977 ATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCG-AGCAA
125 ATTCT-AAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
95031 GTTCATATCA-TTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTG
1 -TTCAAAT-AGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTG
* * * * * *
95094 TCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAAACTAATTTATTAAT
62 TCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAATCCAATTTATTAAT
* * * *
95157 ATTCTAAAAATTAATAGTTAGGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAA
125 ATTCTAAAAATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* *** * * * *
95212 TTCAAATAGTCATGCCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGT-TTTGTCA
* * * * * * *
95276 TAAAAACAATTATGTCT-CTTCATGCAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 T-AAAACAATTGT-TTTATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * * * * *
95339 TTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTTCCAAAACAG
126 TTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * *
95389 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-GATCTCAAATCATTATGATCTTTATTTTGTTAT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
95453 AAAATAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT
66 AAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * ** *
95516 CCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAGAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAG
128 CTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
95568 TTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * * ** *
95632 ATAAAACAAATGCTTTT-GTCCATATAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATA
64 ATAAAACAATTG-TTTTATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * *
95695 TT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAATAAATCA-ATTTACCAAACTAG
126 TTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACCAA
* * ** * * * *
95745 TTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTCATTATGACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * ** * * *
95810 TAAAACAATTATTTCTA-TTAATACAATCTTATTC-AGAATAAAGTAATGCTAATTCATTAATAT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
** * *
95873 TCTAAAAATTAATAAGTAACGTATTTAAAAAA-AGAATATGTTGGCTTG-ACCAG
127 TCTAAAAATTAATAAG--A-G-ATTTAAAAAATA-AATATGTTTAC-CGAACCAA
* * * * * * * * ** * *
95926 TACAAGTAGTTATAACTGTTTGAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * * **
95991 CAGAACAACTGTTTCTGTTT-GTACAAGCTGATTCGGAATAACATAATTTTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAA-TCCAATTTATTAATATT
* * * * * *
96055 CAAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATC-AAACAA
128 CTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** * * *
96106 TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTAT
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * * **
96170 CATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATAGAAATTTATTAAT
63 CATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAAT
* * ** * *
96233 ATTCGACAATTAA-TAAGTAAAAGATTT-TTAAA-AAATTTGTTTACCGAA-TAA
125 ATTCTA-AA--AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
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1 -TTCA-AATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGA-TCTTTGTTTTG
* * * * * ** *
96348 TCATAAAATAATT-TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCG-GATTAAATAATATTAATTAATTAAT
62 TCATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAAT
* * ** *
96411 ATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTCAAAATAAATATTTTTACCGAA-CAA
125 ATTCT-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** * ** ** *
96465 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAGAATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTATTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
96530 ATAAAACAA-TGTATTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * *
96594 CCAAAAATTAATGAATAAGAGATTTAAAATATGAATATGTTTACTGGA-CAA
128 CTAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
96645 GTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * *
96710 ATAAAATAATTG-TTTATGTTCATACAA-ACTTATTTTG-AATAAAATAAAAT-AAATTTATTAC
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGA-TTA-TTCGAAATAAAAT--AATCCAATTTATTAA
* * * * * *
96771 TATT-TAAAAAATTAATAAGCAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTGAA-CATG
124 TATTCT-AAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * **
96826 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAAT-AGCTATGGCCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * ** *
96890 ATAAATCAATTGTTTT-TGTTCATACAAG-TGTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATA
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGAT-TATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * ** * * * *
96953 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAGGTAAATCTATTTACTG-AGCAA
126 TTCTAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
97006 GTTCATATCGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGT
** * * * * *
97070 CATAAAGTAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATA
63 CATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * *
97134 TTATGAAAATTAATAGGCAGGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCGAA-CAA
126 TTCTAAAAATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * *
97187 GTTCAAATAGTTATG-TCCATTTAAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTTAT
1 -TTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGT
* * * * ** *
97251 CATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATTCAAAATTATT-TAGAATAAAAATATAT-TGATATATTAA
63 CATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AAT-AAAATA-ATCCAATTTATTAA
* * * * ** *
97313 TATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAAATAG
124 TATTCTAAAAATTAATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * *
97366 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ATCTTTATTTTGTTAT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
97430 AAAACAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTCATTTGGATTAAAATAATTCTAATTCAATAATATTC
66 AAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAA-TCCAATTTATTAATATTC
* * *
97494 TAAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAA
129 TAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * ** * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTC
* * * * * *
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* *
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* ** *
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1 -TTCAAATAG-TTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGATC-TTTGTTTTG
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * *** * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTT-GTTTTGTC
* * * * * * * * * * *
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64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
** * * **
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128 CT-AAAAATTAAT-A--A-GAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * *
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1 -TTCAAATAGTTATGA-TTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGT
* * * * * ** * ***
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* * * ** * *
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* ** * * ** * * *
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1 TTCAAATAGTTA-TGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * ** * * * ** *
98500 TTAAAATAATTATTTT-TCAACATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATAGTAATTTGTTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * * *
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127 TCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** * * * *
98613 TTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTGTTCTATCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
* * * * ***
98678 TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAGCCATAT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * ** *** * *
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127 TCT-AAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* ** * * * * ***
98858 TAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAAGTAATTT-TTAATATT-
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAAT-AATCCAATTTATTAATATTC
* * * * * *
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* * * * * * * *
98973 TTCAAATAATCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTA-CTTTATGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TT-TGTTTTGTC
** * * * * * * * **
99037 ATAAAATGA-T-TTTT-GTTAATATAAGTTTGTTCAAAAGAAAATAATATTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * * * *
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128 CTA-AAAATTAAT--A-A-GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTGTTTTGTC
* ** * ** * * ** *
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64 ATAAAACAATT-GTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * ** *
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127 TCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
99327 TTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGTTTCAGTT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTT-TG-T
* * * * * *** ** * *
99392 CAT---ACAA--G-CTTATTTAAAATAA-ATTAATATTAATTTATTAA--C-ATTTCA--AAAAT
63 CATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTT-ATTAATAT
* * * * * *
99445 TAATAACAA--AA-AGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACAA
127 T-CTAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * *
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1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGT-TTTGT
* * * * * * *
99556 CATAAAATAATTGTTTTAGTTT-GTACAAGCTTAGATAG-AATAAAATAATACTAATTTCTTAAT
63 CATAAAACAATTGTTTTA-TTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAAT
* * * * ** **
99619 ATTTTGAAAATTAATCAGTAAGAGTTTAAACAAAATAAATTTGTTTATTGAATAAA
125 ATTCTAAAAATTAATAAG--AGA-TTT-AA-AAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
99675 TTCTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
99740 TAAAA-ACATTATTTCAATTCATATAAGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATT
65 TAAAACA-ATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* ** *
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128 CTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACCGAACCAA
* ** * ** * * * *
99855 GTTTAAATAACTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGGAATCACTATAACCTTTTATTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * *
99920 ATAAAA-AGATT-TCATCT-TTTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAGATAATACAAATTTATTAA
64 ATAAAACA-ATTGT--TTTATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAA
* * * * **
99981 TA-T-TAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATCTATTCACC-AAATAA
124 TATTCTAA-A-AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** *
100036 GTTCAAATCA-TTATGAGTAATTGAAC----A---A---CAAATTGTTTTGA-CTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAAT-AGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTC
* * * * **
100089 ATTAAACAATTG-TTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * * *
100153 T-TCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAATTAATATATTTACTGAA-TAA
127 TCT-AAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
100206 TTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATAACTGTGA-CATTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTGTTTTGT
* * * * * * * * * * *
100270 AATAAAATAATTTTTTTAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
63 CATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * *
100335 TGC-AAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATTTGTTTACCGAA-CAA
127 T-CTAAAAATT-A--A-TAAGAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
100388 GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * * **
100453 AAAAAATAATTGGTTCTA-TTCATCCAAGCTTATTTTGAAA-AAAATAATATAAATTTATTAATA
64 ATAAAACAATT-GTTTTATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * * * *
100516 TTCCAAAAATTTATAAGCAAAAATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CTTGAA-CATG
126 TTCTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CGAACCA-A
* * * * *
100569 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * *
100634 T-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATACGAACG--TATTTGGAATAAAATAGTACTAATTTATTAAA
65 TAAAAC-AATTGTTT-TATTTCATAC-AA-GATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAAT
* * * * * *
100695 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-TGGAGCAA
125 ATTCTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * *
100749 GTTTAAATAGTTATGACTT-TTTGAATAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGGTCTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGA-TTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * * * *
100813 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATA
63 CATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * *
100877 TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTATCTAA-CAA
126 TTCTAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** * * *
100930 GTTCAAATAGTAAT-ATCCATTTGAATTATCATCTATTTC-TAGCTATTATGA-CATTTTGTTTT
1 -TTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGATC--TTTGTTTT
* *
100992 GTCATAAAATAATACCAATTATTCAGAATAATTGGTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATTAAAA
61 GTCAT---A-AA-A-C-A--ATT--G--T--TT--TATTTCATACAAGATTATTCGAAA-TAAAA
* * * *
101056 -AATACCAATTTATTACTATT-TCAAAAATTAAT-AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCAA
108 TAAT-CCAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGA
*
101118 ACCAG
171 ACCAA
**** * * * * * *
101123 TTCAAATAGTTAACCCTA-TGAGAATAATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
101187 ATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * **
101252 CAAAAAATTAATTAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAATAA
128 CTAAAAATTAA-T---AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * ** * * *
101303 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTTGTTATGACCTTTTATTTTTA
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGATC-TTT-GTTTTG
* * * * * * *** *
101367 TCTTAAAACAATTGTTTTAGTGCATAAAAGCTTA-TCCAAAGTAAAATAATAGTACTTATTAATA
62 TCATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAA-TAAAATAATCCAATTTATTAATA
* ** ** *
101431 TT-TCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAATAAAT-TAGTTTATTGAATTAG
126 TTCT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACCAA
* * *** * * * *
101484 TTCAAATAATTTTGGCCATCTAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAACTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * ** * ** * *
101548 ATAAAATAATTGTTTT-TCATCATACGAGCCTATTTGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * *
101612 TTTAAAAATTAATAAGCAAGAAATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAG
127 TCTAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * ** * * *
101665 TTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * *
101730 TAAAATAATTATTTT-TGTTCATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATGTAATAATAT
65 TAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * *
101793 TCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAG
127 TCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * *
101846 TTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCT-TGATTTTAAATCGTTATGA-CATTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGATC--TTTGTTTTGT
* * * * * *
101909 CGTAAAACAATTCTTTTAGTTCATATTAA-CTTATTC-AGAATAAAATAAAAT-AAATTTATTAA
63 CATAAAACAATTGTTTTATTTCATA-CAAGATTATTCGA-AATAAAAT--AATCCAATTTATTAA
* * * * * * * *
101971 TATT-TCAAAAATGAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAATTTTATTTATCGAACTAG
124 TATTCT-AAAAAT---TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * * *
102027 TT-AGATAATTATAACTATTTGAATAATTGTCTATTTTAAATCATTATTACCTTAAAAAATGCTT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTT------TG-TT
* * * * * ** *
102091 TTGTTCAT---ATAA--G-TTTATTTGGAATAAAATAATATT---AATTTATTAAT---ATTT-T
59 TTG-TCATAAAACAATTGTTTTATTT--CATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTTAT
* * * * * * ** *
102143 GAA-AAT-T-AAGA--AGTAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACTAAACCAG
121 TAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
102193 TTCAATTAGTTATAACTATTTAAACAATTATTTACTTCACATCATGATGACCATTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
102258 TAAAAGAATTATTACTA-TTCATA-TAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATAT
65 TAAAACAATTGTT-TTATTTCATACAAG-ATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * ** * *
102321 TCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTGAAAAATGAATTTGTTGGCCTAACCAG
127 TCTAAAAATTAATAAG--A--GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * *
102374 TGCAAATAATTATAATTGTTTGAAA-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * * *
102438 -TCAAAACAATTGCTTCTA-TTCGTACAAGCTTATCCAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATA
64 AT-AAAACAATTG-TTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAA-TCCAATTTATTAATA
* * * ** *
102501 TTCCAAAAATTATTAAGTAAGAAATTTAAAAAAGAAATCCGTTTACTGAA-CAA
126 TT-CTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * *
102554 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAA-GAGTTATGACCTTTTTGTTTTG
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA--TCTTTGTTTTG
* ** * * *
102618 TCA-AAAACCAATTGTTTT-TGTTCATATAAGCGTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAA
62 TCATAAAA-CAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAA
* ** *
102681 TATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAAGATTT-TAAAA-AAATATGTTTACCGAATTAG
124 TATTCT-AAAAATTAATAAG-----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
102736 TTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATT-TTTATTT-AGAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTCGT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCA-AATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * * ** *
102798 TAGAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATATAATTTAATAATA
63 CATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAATCCAATTTATTAATA
* * * *
102861 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATC-A
126 TTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * * * **
102914 TTCAAATAATTAAGACTATTAAAACAATTATTTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGCTTAGTTT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * ** ** * *
102979 TAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATAGTAATTTATTCACATT-
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTC
* * * ** * *
103043 TAAGAAATTTATGAGCAAAAGATAAAAAA-AAATCTGTTTACTGAA-CAA
129 TAA-AAATTAATAAG--AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
103091 GTTTAAATAAATT-TGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTCATTATTG-CCATTT-TTTT
1 -TTCAAAT-AGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA-TGATC-TTTGTTTT
* * * * * * * * *
103152 GTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATA-AAAACTTA-TCTAAAATAAAATGATACTACTTTACTA
61 GTCATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGA-TTATTC-GAAATAAAATAAT-CCAATTTATTA
* * * ** * * *
103215 ATATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTCC-AACTAG
123 ATATTCTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
103271 TTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATATATAGTTATGATCTTTGTTTT
1 TTCAAA-TAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTC-AA-AT-CA-TTATGATCTTTGTTTT
* * * **
103335 CTCATAAAACAATTGTTTCTGA--TCATACAAGCTTTTTC-AAATAAAAATAATATTAATTTAAT
61 GTCATAAAACAATTGTTT-T-ATTTCATACAAGATTATTCGAAAT-AAAATAAT-CCAATTT-AT
* *
103397 T-ATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTT--AAAA-AAATATGTTTACCGAATCAG
121 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
103448 TTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTTTGACCTTTTGTTTAT-T
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTT-TGT
* * * * * * ** *
103511 CATACAATAATTGTTTCAGTTT-ATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATATGAATTTATTAACA
63 CATAAAACAATTGTTTTA-TTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * *
103575 TT-TAAAAAATTAATAAGAGATTTGAAAAAGTAAATCTATTCACCGAA-CAA
126 TTCT-AAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
103625 GTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCT-TTCTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * * * * * * ***
103689 CATAAAACCATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTACTACGCTATTAATAT
63 CATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * ** ** *
103754 T-TCAAAAGTTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACTAAAATAG
127 TCT-AAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACCAA
* ** * * * * * * *
103807 TTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAACTACCTATTTTAAGTCATTATTACTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGA-TTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTC
* ** * *
103871 TTAAAACAATTGTTTT-TCAACATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAAT---A-TTAAT-AT-TT
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTTATTAATATT
* * * * *
103928 C-AAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGTTTGCCAAACCAG
128 CTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * ** * * * *
103975 TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATGTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** * *
104040 TAAAATAATTATTTT-TGTTTACACAA-ACTTAGTCAAAATAAAATAATATTACTTTAGTAATAT
65 TAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGA-TTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * *
104103 TCTACAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAGATAAATCTGTTT-GCGAAACCAA
127 TCTA-AAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-AACCAA
* * * * * * * ** *
104156 TTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCGAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* ** * * ** * *
104221 TAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTA-TC--CA-AAAAT-ATTTACTCTATTAATATT-T
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTTATTAATATTCT
* * * * * *
104280 CAAAAGTTAATACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACTGAAACAG
130 -AAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACCAA
* ** * ** * *
104331 TTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAACAACCTATTTCAAATCATTACT-ACTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGA-TCTTTGTTTTGTC
* **** * * *
104395 TTAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* *
104460 -TCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAACCAA
128 CT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** * * * *
104509 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
104574 TAAAACAATTATTTCT-GTTCAAATAGGCTTATTC-AGAATAAAAGAATACTAATTTAGTAATAT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* ** *
104637 TCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAGCCAA
127 TCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * ** *
104690 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
104755 TAAAACAATTATTTCAGCTT-ATATATGCTTAATATTTC-AAA-AATTTATAAGCAAGAGATTTA
65 TAAAACAATTGTTTTA-TTTCATACAAG---ATTA-TTCGAAATAA--AATAATC--CA-ATTTA
** * * * * *
104817 GAAAATAATTCTATTTACCGAAGTAGTTCAA-ATGATTATAACTATTTGAAA-AATTATCAATTT
120 -TTAAT-ATTCTA---A--AAATTA-AT-AAGA-GATT-TAA--A----AAATAAATAT--GTTT
*
104880 --CAAACCATTA
166 ACCGAACCA--A
* * * * * ** * ** * *
104890 TTACTAAT--TTATTAATATTTAGAA-AATTAATC-AGTTCGAGAATTAAAAAGTAAATCT-ATT
1 TT-CAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATT-ATCTATTTC-A-AATCATTATG-ATCTTTGTTT
** * * ** **
104950 TACCA-AACCATTTTA-AATAGTTTTGACTATTTGAATAC-TTATCTATTTC-AAATAGTTATAA
60 TGTCATAA--A----ACAATTG-TTT---TATTT-CATACAAGAT-TA-TTCGAAATA-AAATAA
* * * * ***** ** *
105011 -CC-TTTTATT--T-TGTC-ATCAAA-CAAT-TG-G-TTTTGTTGAT-AATAT-TTTA-CTTA-G
111 TCCAATTTATTAATAT-TCTA-AAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACC
105062 AA
174 AA
* * * * ** * * * *** ***
105064 -T-AAA-A-TAAT-ACTAATTTAATAAAATTTTGAAACTTAATAACCA--A-GA---AAATTAAA
1 TTCAAATAGTTATGA-TTATTTAA-ACAATTAT-CTATTTCA-AATCATTATGATCTTTGTTTTG
** * ** * * * * ** * *
105118 AAATAAATCTAATTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATAT-GAATGATTATCTATTTCAA
62 TCATAAAAC-AATTGTT---TTATTTC--ATA--CAAGATTAT-TCGAA--ATAAAATA-ATCCA
* * **** * ****** ** * * * *
105182 ATTGTTATGACATTTTGTCTTGTCA-TAA-AACA-ATTGTTTTGTTTGTACAAGTTTATTCAGAT
115 A-T-TTATTA-A-TAT-TCTAAAAATTAATAAGAGATT-TAAAAAATAAATATGTTTA--CCGAA
**
105244 TAAA
172 CCAA
* * * * * * ** * ** *
105248 AT-AATACTAATTTAGGAATAGTTCAAA-AATTA-ATAAAT-AAGA-GATTTAAAAAATAAATTT
1 TTCAA-A-T-AGTTATGATTA-TTTAAACAATTATCTATTTCAA-ATCA-TT--ATGAT--CTTT
* * * * * ** * * ****
105308 GTTTACCG-AATCAGATCAAATGGTTAAGACTATT-AGAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTCT
56 GTTT--TGTCAT-AAAAC-AATTGTT-TTA-T-TTCA-TACAA-GAT-TA-TTCGAAA-TAAAAT
* * * * * * *
105370 GA-CC-TTTTGTT--TAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATT
109 AATCCAATTTATTAATATTC-T-AAA-AA----TT-AA-T-A-A-GAG---ATTTA-AA-AAATA
* **
105431 AATACTAATTTA-TTAA-C-A
157 AATA-T-GTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * ** *
105449 TTCAAAAAATTAATAAAAAATATATTTTAAAAAATTATTTATTGAACAAGT--TTA-AATAGTTA
1 TTCAAATAGTT-AT----GAT-TA-TTTAAACAATTATCTATT--TCAAATCATTATGATCTTTG
* ** * * * * * ** *
105511 TTAT-T-ATTTGAACAATT-ATCTATTT-AGAAGCTTTAAAACCTTTTGATTTGTTATAAAACAA
57 TTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTATTTCA-TA-C---AAGA----TT-ATTCGAAATAAAATAA
** * * ** * * **
105572 T--TGTTTCAGTTAATA--C--AAACTTATTTTGA-A-TTAAATAACATAAATTTATTAATA-TT
111 TCCAATTT-A-TTAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAA-AA-ATAAATATGTT--TACCG
**
105628 AAGATAA
170 AA-CCAA
* * * * * ** * *
105635 TT--AATAAGTAAAAGA-T-TTTAAA-AAATATGT-TTACCAAA-CA--AGTGCA-AATAGTTAT
1 TTCAAAT-AGT-TATGATTATTTAAACAATTATCTATT-TCAAATCATTA-TG-ATCTTTGTTTT
* ** ** * * * *** *** **
105690 GACTATCTGAGTAATT-ATTTATTTCA-ACTTGTTATGACTT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT
61 GTC-AT-AAAACAATTGTTTTATTTCATAC-----AAGA-TTATTCGAAATAAAATAATCCAATT
* ** * * ** *** * *
105752 GTTTTTGT-TTATACAAACTT-AT-TCAGA-TTAAAATAATTTTTATTTATTA-CTATTTTGA-C
118 -TATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGAGATTTAAAA-AATAAATATGT-TTACCGA-----ACC
105811 AA
174 AA
* * ** * * ** * *
105813 TT--AAT-G-AATAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT-TTATTGAA-CAAGTTCA-AATACTCAT
1 TTCAAATAGTTAT-GATTATTTAAACAAT---TATCTATT-TCAAATC-A-TT-ATGAT-CT-TT
* * *** *** * * * *
105871 GACTATTTG-AATAATAATCTATT-TCAAATCATT-ATGAC-CCTTTCTTTTGTAATAAAACAAT
56 G--T-TTTGTCATAA-AA-CAATTGTTTTAT--TTCAT-ACAAGATT-ATTCGAAATAAAATAA-
* * ** *
105932 TGTTTC-ATTTCATCTAAGCCTATT-TGAAGTAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAA
111 ---TCCAATTT-AT-TAA---TATTCT-AA--AAATTAATAAGAGATTTA--AA-A----AATAA
** * *
105994 ATAATGAGTA-AG-A-GAA
158 AT-ATGTTTACCGAACCAA
* * * * * ** * * * * * *
106010 TTAAAAAAGAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGATTATTA-GAACAATTATCTA
1 TTCAAATAG-TTATGATTATTTAAACAA-TT-ATCTATTTCA-AATCATTATGATC--TT-TGTT
* * * * *
106072 TT-TC--AAAACATTATGACCTTTTGTTTCATCTTAAAACAACCAGTTCTATTCATGCAAGCTTA
59 TTGTCATAAAACAAT-TG---TTTTATTTCA---T---AC-A--AGAT-TATTC--G-AA-ATAA
** ** * * * * * * * *
106134 TTTCAAATAAAATAATATAAAT-TTATTAATATTGCAAAAATTA-ATAAGTAAAAATTTTAAAAA
106 AAT--AATCCAAT-TTATTAATATTCTAAAAATT--AATAA-GAGAT--TTAAAAA----A----
* * ** ***
106197 TAAATATATTTTCTTAACTTG
155 TAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * **
106218 TTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * *
106283 T-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCGTAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
65 TAAAAC-AATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * * * *** *
106346 T-TCAAAAGTTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATATATCGAGTGAG
127 TCT-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
106399 TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * *
106464 TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT--TA-T
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* ** * * * *
106525 ATAAGAAACTTAATGGGTTGAAGACTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAA-CAA
128 CTAA-AAA-TTAAT---AAG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
106578 GTTCAAATAGTCATG-TCAATTTGAACTATTACCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTATTG
1 -TTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTGTTTTG
** * * * * *
106641 TTGTAAAAAAATTGTTTTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTATTTCATTAATA
62 TCATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTT-ATTAATA
* * * * *
106705 TT-TCAAAAATTAA-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACCAG
126 TTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * *
106754 TTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGTTCTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAA-TAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
106818 TAAAACAATTATTTT-TGTTCATACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATAT
65 TAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * * * *
106881 TCTCAAATTAA-TAAGTAATACATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAG
127 TCT-AAA--AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * *
106933 TTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTAGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTT-GTTTTGTCA
* * * * * * * * * *
106998 TAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAGTACTATTTTTTAACATT-T
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTTATTAATATTCT
* * *
107062 AGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAGAAAATAAATATGTTAACCAAACAAA
130 A-AAAATTAATAAG--AG--ATTTAA-AAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* ** * * * * * *
107114 TTCAAATAGCTATGCCTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATTG-CCTTTTGTTTTATA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
107178 AAAAAATAATTGTTTTAGTACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATGATAT-TACTTTA-TAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAAT-A-ATCCAATTTATTAATAT
* * * * * *
107241 T-TCAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTATCAAATCAG
127 TCT-AAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACCAA
* *** * * ** *
107294 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * ** *
107359 TAAAACAATTGTTTT-TCATCATATAAGCA-TATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTTATA
65 TAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAG-ATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * * *
107421 TTTTGAAAATTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAACAAACTAGA
126 TTCTAAAAATTAA-TA--A-GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * * * *
107476 -TCAAATAATTAT-ACTATTTAAATAATTATATATTTCAATTCGTTATAACCTATTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCT-TTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
107539 TAAAATAATT-ATTTATGTTTATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT
65 TAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * * ** * *
107603 ATGAAAACTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAATCAGC
128 CT-AAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * * ** * *
107656 TT-AAATAGTTAAGGTTGTATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT-TATCTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGT-T-TTGTC
* * * * * * **
107719 GTAAAACAAATGTTTT-TATTCATATAAGTTTGTTC-ATAA-CAAATAATATTAATTTATTAATA
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * ** * *
107781 TTTTGAAAATTATTAAGAGATTTAAAATATAAATATGTTTACTAAATCAG
126 TTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * **
107831 TTCAATTAGTTAT-AGTAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATT-TGACCATTTGTTTCATC
1 TTCAAATAGTTATGA-TTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * *** * *
107894 ATAAAATAATTGTTTT-TATTGATACATTCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * ** * *
107958 TCTAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACTAA
127 TCTAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTAC-CGAACCAA
* * * * ** * *
108012 TGCAAATAGTTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * ** *
108077 CAAAAAAATTGTTTT-TGTTTATACAAGCTTATTC-AGAATAACATAATTATAATTGATTAATAT
65 TAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAA-TCCAATTTATTAATAT
* * * * **
108140 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTATTTATTGAA-CAA
127 TCT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
108192 GTTTAAATAGTTATGACTAATTGAATAATTACCTTTTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
108257 ATAAAATAATT-TTTTCTATTAATACAAGCTTATTTC-AATTAAAGTAATACAAATTTAATAATA
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * **
108320 TTC-AGGCAATTATATTAATAA-AAATCTAAAAAATAACTATGTTTACCGAATAAA
126 TTCTA---AA--A-ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * ** * *
108374 TTCAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
** * * ** *
108439 TAAAACAATTGTTTTGGTTCATATAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATATTAATTTATTAACATT
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAA-TAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * *
108503 -TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA-TAA
128 CT-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
108554 GTTTAAATAATCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCCTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTC
* * * * * * **
108619 ATAAAACAATTATATTAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * *
108684 CTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTAACCGAA-CAA
128 CTAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
**** * * * *
108735 GTTCAAATAGTTATGA-TATTT--TGTTTTATC-A--T-AAA--ATAAT--TGTTT-CTAT-TCA
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* ** * * * * *
108787 TAAAAGC--TTATTTCAAATAAAATAATA-AAAATTTATT--AATATTCCAAA-AAT-TAA-TAA
65 TAAAA-CAATTGTTT----T-ATTTCATACAAGA-TTATTCGAA-A-T-AAAATAATCCAATTTA
* * * * * *** * * *
108844 GTAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACATTCAAATA-GTTT---G-A-CTA
120 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTT-AA-AAAAT-AAATATGTTTACCGAACCAA
* *
108898 TTTAAATAATT-T--TCTATTT---CAA--ATC-A-TT---AT-A--AT-AT-TTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* * * * **
108945 TAAAATAATAGTTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATAT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * ** ***
109008 TCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACGTG
127 TCTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * *
109060 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * *
109124 ATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATAAAAG-TGTATTCAAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAATA
64 ATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGAT-TATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * *
109186 TT-TCAAAAATTATAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCG-AGCAA
126 TTCT-AAAAA-T-T-AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * *
109239 GTTTAAATAGTTATGCTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTGTT
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
** * * * * *
109304 GCAAAACAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGTTTATTGGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * *
109368 TCTAAAAATTAAAAGGTAGAAGACTTAAAGAATACAT-TAGTTTACCGAA-TAA
127 TCTAAAAATTAATA---AG-AGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACCAA
* * * * * *
109420 GTTCAAATAGTCATG-TCCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTAT
1 -TTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * * *
109484 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCTTGCAAAATTATTC-AGAACAAAATAATACTAATTTATTAAT
63 CATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAAT
* * * * * * * *
109547 ATTTTAAAAATTAATAAGGGAATTAAAAACTAAATCTATTTAACGAAACAA
125 ATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * ** * * * ** *
109598 TTTAAATAGTTATTACCATTTGAACAATTATATATCTCAAATCGCTATGATCTTTATTTTGTCAT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
109663 AAAACAATTGTTTCT-TTTCAAACAAGGTTATTCTAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
66 AAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTC
* * * * *
109727 CAAAAATTAATAAGAGATTT--AAAA-AAATGTGTTTGCTGAACCAG
129 TAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** * *
109771 TTTAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
109835 ATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGATAA-AAAAAAATACTAATTTAATAATA
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTA-TTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * ** *
109899 TTCCAAAAATTAGTGAA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCGAATCAA
126 TTCTAAAAATTAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * ** *
109949 TTCAAATAGTTAAGACTA--TAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCCGACCTTT-TATTTAGT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGT-TTT-GT
* * * * * * *** * *
110011 CCTATAATAAGTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATGAAAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAACA
63 CATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTAT-TCGAAATAAAATAA-TCCAATTTATTAATA
* * * * *
110076 TTCTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAGATAAATTTGTTTACTGAA-CAGG
126 TTCTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * * *
110130 TTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TGATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
** * * * * * * * * * *
110194 AT-AAATGATTGTTTTAGTTCAT-CAAAGCTTATCCAAAAGAAAATAATACTATTTTGTTATTGT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATAC-AAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * *
110257 T-TCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAATTTACTGAA-TAA
127 TCT-AAAA---ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACCAA
* ** * * * ** * *
110309 GTTCAAATAATTATGACCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * ** * * *
110374 ATAAAACAATT-TTTT-TTCAACATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTTACTAATA
64 ATAAAACAATTGTTTTATT--TCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * *
110437 TT-TCAAAAATTAATAAGAGGTTTAAAAAA-AACCTA--TTTACCAAACCAG
126 TTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAA-ATATGTTTACCGAACCAA
* * * * ** * * * * *
110485 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATAA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * *
110550 TAAAACAATTGTTTCTATTT-ATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAA-CACTAATTTAGTAATAT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATC-C-AATTTATTAATAT
* * *** *** ** *
110613 GAGATTTAAAAAAT-A-AATCTATTTGGCAAA-CCA-A---TT--C-AAACAA
127 ----TCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
** * ** * * * **
110656 TT-AAGACTA--TATGAACAATT-AATTATT-TCAAATTT----TTATGA-CCT-TTTGTTTTGT
1 TTCAA-A-TAGTTATGATTATTTAAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGT
* * ** * * * * * * * *
110710 CATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTATTTGGAATAGAGTAAGACTAATTTATTAACAT
63 CATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAA-TCCAATTTATTAATAT
* * * * * * *
110775 T-TCAAAAATTTATAAAAGATTTAGAAAATAATTATATTTACCAAACCAG
127 TCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
110824 TTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT--TCCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAT-C-TTTGTTTTGTC
* * * * * *
110887 ATAAAACAATTGTTTT-TGGTAATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * *
110951 T-TAAAAAATTAATCAGTAAAAGATCTAAAAAGTAAA-ACTGTTTACC-AATCTAT
127 TCT-AAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACCGAA-CCAA
* * * * * * * *
111004 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTCTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * ** * * * * *
111069 TCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTTTTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
65 TAAAACAATT-GTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * ** ** * * *
111133 -TCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACTAC
128 CT-AAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * *
111185 TTCAAATAGTCA--A-GA--T-AA-TATGA-AT-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * ** *
111241 TCAAACCATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTTATT-TCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * *
111305 -TCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTAG
128 CT-AAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
111357 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTGTCAATTTCAATTCGTTAAGATCTTTGTTTTGTCAT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * ** * *
111422 AAAACAATTGTTTCTGA--TCATAGAAGCTTATTTG-GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATAT
66 AAAACAATTGTTT-T-ATTTCATACAAGATTATTCGAAAT-AAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* ** * * * *
111484 T-TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAACATACTTGCCAAACTAG
127 TCT-AAAAA--T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * *
111537 TTCAAATAGTT-TAAACTA-TTAGAATAATTATATATTTTAAATCATTCTAACCTTT-TATTTAG
1 TTCAAATAGTTAT-GATTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGT-TTT-G
* * * * * * * ** * * *
111599 TTAGAAAATATTTATTTCATATC-TAACAATCTTATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAAC
62 TCATAAAACAATTGTTTTATTTCAT-ACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCC-AATTTATTAAT
* * * * * *
111663 ATTCAAAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAGAATTAAATCTGTTTATC-AAACAA
125 ATTCTAAAAATTAATAA-G---AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
111718 GTTCAAATGGTGATGACTATTT-AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGA-CATTTTGTTTT-T
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTGTTTTGT
* * * * * * * * * *
111780 ATATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATA
63 -CATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * *
111845 TT-TCAAAAATTAATAACCAAGAGTTAAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAACAAA
126 TTCT-AAAAATTAATAA--GAGA-TTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACCAA
** * * *
111898 TTCAAATAGTTACAACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA--TCTTTGTTTTGTC
* ** * * *
111963 ATAAAACAATTGTTTCAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * * * * * *
112028 CCAAAAATTAATAAGTGATATAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATCAG
128 CTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * *** * * * * *
112076 TTCAAATAATCATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTTATTTGGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGT-TTT-GTC
* * * * * * *
112141 ATATAACAATTGTTTT-TTATTATAGAACATTATTCGAAATAAAATAA-CAGTAAATTATTAATC
64 ATAAAACAATTGTTTTATT-TCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATC--CAATTTATTAATA
* * *
112204 TT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAG
126 TTCT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * * * * * * *
112258 TTTAACTAGTTATAACTATTTGAACAACTGTATATTTCTAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * ** **
112323 TAAAACAATTATTTCTA-TTCAAACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACATAAAAATATT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * * *
112387 CCAAAAATTAATAACTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAG
128 CTAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * **
112439 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACCGTTATCTTATTT-AAATC---AT--T-TTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * *
112497 TAAAACAGTT-TTTTCAATAGATACTAGCTTATTTC-AAATAAAATAAAAT-GAATTTATTCATA
65 TAAAACAATTGTTTT-ATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAAT--AATCCAATTTATTAATA
* * * * * * *
112559 TT-AAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTCTGTTTACCTAACGAG
126 TTCTAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * ** ** * * *
112612 TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGCTAAAACCTTCTGTTTTATCG
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTT-TGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
112677 TAAAACAAATGTTTT-TGATCATACAAGTTTGTTTGAAGTAAAATAATACTTATCTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * **
112741 -TCAAAAATTAATAAGAGATTTACAAAATAAACT-TGTTTATC-ATACCGG
128 CT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCGA-ACCAA
* ** * ** * * * *
112789 TTCAAATAGTTATGACTATTTATGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
112854 TAAAATAATAGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * * * *
112917 TTTGACAATTAATGAGAAAAAAATCTT-AAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGA
127 TCTAAAAATTAAT----AAGAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * *
112971 -TGAAATAGTCATGACTATTTCAATC-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * ** * * * * * * * * *
113034 GTAAAAAAATCACTTCT-GTTCTTATAAGCTTATTC-AAAGTAAAATAATACTAAGTTATTGACA
64 ATAAAACAAT-TGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAA-TAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * * *
113097 TTTTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAGATGAATTTGGTTAACGAA-CAA
126 TTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * * * * ** * * *
113150 GTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTGAAATCGCTATAACCTTTGTTTTGTCG
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* * * * * **
113215 TAAAATGATTTTTTTTATTT-ATACAAGCTTATTTC-CAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-
65 TAAAA-CAATTGTTTTATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * *
113277 T-TAAGACAATTAATACGTAAAAGATCT-AAAACTAAATTTGTTT----AA--AA
127 TCTAA-A-AATT-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * ** * **
113324 -TC---T--TTATGATTATTTGAACAAGTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTACCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * **
113383 TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAACAATATTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * *
113447 -TCAACAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAAGTTTATC-AAACAGA
128 CT-AA-AAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * * *
113499 TTCAAATAGTCATGAATATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATAATGACCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * ** * ***
113564 TAAAATAATTGTTTCAGTT-GTATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTC
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATTC
* * * * * *
113628 TAAAAATTAATGAGTATGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTGCTGAA-CATG
129 TAAAAATTAAT-A--A-GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * * * * *
113679 TTCAAATAGTTATGACTATCTGACCAATTATCTACTTCAAAACATTATGA-CTTTTCGCTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTT-GTTTTGTC
* * * * **
113743 ATAAAACAATTGGTTCT-GTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATA
64 ATAAAACAATT-GTTTTATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * * **
113806 TT-TCCAAAATTAATAAGTAAAAATTT-AAAAATAAATATATTT-TCTAAATACA
126 TTCT-AAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * ** * *
113858 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
113923 TAAACCAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATC
65 TAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
113987 CCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAGCGAG
128 CTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
*** * * * * *
114039 TTCAAATAGTTATGACCCTATGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTGTTTTGTCAT
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
114104 AAAACAATTGTTTCCA-TTCAAATAA-TTTCATTCGAAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATT
66 AAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATT-ATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * *
114167 CTAAAAATTAATAAGTTAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACACT
128 CTAAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * ** * * *
114219 TTCAAATAGTCATG-TCTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTCGTT
1 TTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAT-CTTTGTTTTGTC
* * * * * *
114283 GTAAAACAATTGCTTCTA-TTAATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
64 ATAAAACAATTG-TTTTATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * * *
114346 TT-TCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAATTAAATTTATTTATCGAACCAG
126 TTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* *
114396 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAA-TATTATCTATCTT-AAATCATTATGATCTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTT-AAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTC
* * ** * * * * * *
114459 ATAAAACAATTG-CTTAATAGAT-C-TGTTTACT-GAACAAGTTTAAATATTCATGACTATTTGA
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCG-A-AA---TAAA-A-TAAT-CCAATTT-A
* * * *
114520 ATAAT-TATCTATTTATAATAAATATGACCTTTTGCTTTATTTTAAAACAATTAGTAAGTTAAAT
120 TTAATAT-TCTA---AAAATTAATAAGA------G----AT-TTAAAA-AA-TA--AA--T--A-
** *
114584 TTGTTTGTCAAACCAA
161 -TGTTTACCGAACCAA
* * * * * * *
114600 TT-AAAGTAATTAAAGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTC
1 TTCAAA-TAGTT-ATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTC
* * * * * ***
114664 ATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTCA-ACTAGCTTATTC-AGAATAAAATAAAAGGAATTTATTAA
64 ATAAAACAA--TTGTTTT-ATTTCATACAAGATTATTCGA-AATAAAAT-AATCCAATTTATTAA
* * * * * * * * *
114727 TGTT-TCAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTATAAAACAATTCTATTTACCTAACTAG
124 TATTCT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * *
114783 TTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACGTTATG-TCCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAT-C-TTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
114847 ATAAAACAAATGCTTTT-GTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATCTATTGATAT
64 ATAAAACAATTG-TTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATAT
* * * * * *
114911 T-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGAG
127 TCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * ** * *
114960 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
*** * * ***
115025 TAAAACAATTGTTTCGGTTCATACAAGCTTATTTGGGTTAAAATAATACTC-ATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-C-CAATTTATTAATA-T
* * * * * * * *
115089 TCGACAATTAATAAATAAAAAATTTAAAAAGTAAATATGGTTACCAAACTAGA
127 TCTA-AA--AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * *
115142 -TCAAATAGTCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CAATTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
115205 ATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATATTACTAAGTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * * *
115270 ATGAAAACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCC-AAGCAA
128 CT-AAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * ** * * * * *
115321 GTTTAAATAATTTTGACTATTTTGACAATTATCTATTTGAAATCTTTATAACCTTTTATTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
** * *
115386 ATAAAATGATT-TTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA
64 ATAAAACAATTGTTTTAT-TTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* *
115448 -T-TAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CGAA-CAA
126 TTCTAA-A-AATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * ** * * ** *
115500 GTTTAATTCTTTATGACTATTTGAAA-AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGT
* * * * **
115564 CAT-AAACAATTGTTTCTA--TCATGCATGCTTATTCTAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
63 CATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATA
* * * * **
115626 TTTTGACAATTAATAAGTGGAAGATTTATAAAATAAATA-GATTTTTCGAA-CAA
126 TTCTAAAAATTAATAA---G-AGATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCGAACCAA
* * * * * * * * *
115679 GTTCAACTAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTA
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * *
115744 ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
115809 CCAAAAATTAATGAGAAAGAAAATTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAA-TATG
128 CTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * * * *
115861 TTCAAATAATTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC--TTTGTTTTGTC
* * * * ** * * *
115925 GTAAAACATTTGGTTCT-GTTCATGTAAGCTTATTTCG-AATAAAATTAT-AAATTTATTCACAT
64 ATAAAACAATT-GTTTTATTTCATACAAGATTA-TTCGAAATAAAATAATCCAATTTATT-A-AT
* * **** *
115987 -TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTT-AAAAATAAATATATTTTTTTAA-CACT
125 ATTCTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCA-A
* * *
116038 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
116103 TAAACCAATTGTTCCTA-TTCATAAAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTATTTAA-AT
65 TAAAACAATTGTT-TTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAAT-CCAATTTA-TTAATAT
* * * * * *
116166 T-AAAAAAGTTAAGTAAAAGATGTAAAAAATAAATCTATTTACCG-AGCAA
127 TCTAAAAA-TTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * *
116215 GTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTAT-TCATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * * * * *
116279 CTTAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTGTTTGAAATAGAA-AA---AATTAATT--TA-
63 CATAAAACAATTGTTT-TATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTTATTAATAT
* * * * *
116336 T-TAATAAGT--T-GGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTCACCGAA-CAA
127 TCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
* * * * *
116379 GGTCAAATAGTCATG-TCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAA-CAGTTATGATATTTTGTTTTG
1 -TTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAT-CTTTGTTTTG
*
116442 TCATCAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
62 TCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATAC
116469 GAAAGTTATT
Statistics
Matches: 20813, Mismatches: 4649, Indels: 4121
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AAAACAATTGTTTTATTTCATACAAGATTATTCGAAATAAAATAATCCAATTTATTAATATTCTA
AAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA
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89986 TAAGAAGTTG
* * * *
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* * * * * **
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131 TTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAAATAA
* * * *
90162 GAGATTTAAAAAAT-AATTATACTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATTA-ACTTACTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAATAATTA
* * * *
90226 TATATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTACCTTCATATAAGCT
65 TATATTTCAAATCATTATGAA-CTTTCATTTTATCATAAAACAATTATTTACCATCATACAAGCC
*
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129 TATTCTAAATAAAATAATACT
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Statistics
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ATATTTCAAATCATTATGAACTTTCATTTTATCATAAAACAATTATTTACCATCATACAAGCCTA
TTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAATAA
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90140 ATACTAATTT
* * * ** * * *
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1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
90215 TTGAATAATTATATATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTAC-C
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* * * * * * * *
90278 TTCATATAAGCTTATTCTAAATAAAATAGTACTGATCTAGTAATATTATGAAAATTAATAACTAA
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* * * ** * * * * * * *
90343 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCCAAACCAA-TTTAAATACTTAAGACAATATGGATAATTA
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
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256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAAG
*
90470 TTTATTCGAAAT-AAA-AATATTAATTTATTAATATTTCAAAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * *
90511 TTTAATAAG---AGA-TTTAATAAATAAATCA-GTTTACCAAATC-AGTTC-AATAAGTTATAAC
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAA-AAATAAAT-ATGTTTACTAAA-CAAGTTCAAAT-AGTTATGAC
* * * * * *
90569 AATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGATATGACCATTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
62 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
90634 ATTAATACAATCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
127 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * *
90699 ACAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGTTATAACTCTTTGAACAATT
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
90763 ATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTT-T-TGTTCGTACAAG
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAAG
* ** *
90826 CTTATTCGGAATAGTATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
90869 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAGACTTAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT-AGCA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAA-AATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CT
* * * * * *
90932 ATTTGAACAATTACCTATTTCCAATCGCTATAACCTTTTCTTTTGTCATGAAATA-AACCTT-TT
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-ACAA--TTGTT
* * * *
90995 TCTATTCATATAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCAGACAATTAATA
124 TCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATA
* * * * * *
91058 AGCAAAAAATTTTAAAAATAACTCTGTTTA-TCGAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
187 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
91121 AATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTCTTT-T-TGTTCATA
251 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATA
* * * *
91184 CAAGCATATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACA
315 CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
91231 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACAAATTTAAATAGTCATAACTA
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * * *
91295 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAATAATTATATT-TG
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTA
* * * * * *
91359 TTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTTA
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * * * * *
91424 CAGATTTAAAAAATGAATCAATTTACTGAACAAATTCAAATAGTAAGGACTGTTTAAACAATTTT
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* *
91489 CTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTT
257 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTT
* * *
91554 GTTCCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAA
322 ATTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
91594 ATTGATAAGTAAAAATTTTAAAAATAACTATGTTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTTTGACTATT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *
91659 TGAACAATTA-CTTATTTCAAATAGTTATGTCCTTTTGTTTTTTCATAAACCAATTGTTTCTATT
66 TGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* *
91723 CATACAAG-TGTATTCGAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
130 CATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
91786 AAATTTTAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAAATATT
193 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
91851 TATTTCAAAT-AGTTATCATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA----ATC-ATTTC-T---A---T
258 TATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTT
* * *
91902 -TTAG-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAA
322 ATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * *
91940 ATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGTCCAT
1 ATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
92005 TTGAACAATTAT-TGATTTCAAATTA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
65 TTGAACAATTATCT-ATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * * *
92068 TTCATTCAAAATTATT-TAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TA
128 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTA
* ** * * * * *
92128 AGAGATTTAAGACCTAAATTTGTTTAC-CAAAATAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *
92192 ATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATGTTCATACAAG
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAAG
* * * * *
92255 CTTATTCGGAGTAAAATATTGCCA-AACTTA-TCATA-TTCTAAAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAAT---ATAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * *
92298 CTTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTGAAGACTA-
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
92358 TTAAATAATTATCTATTTC-AA-A--T-TG------T-TTTAGTCATAAAATAATTATTTCAATT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * * *
92411 CATACAATCTTATT-TAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAG
130 CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* ** * *
92475 AAATTTAAAAAAATAAATCAATTTACTGAACAATTTCAAATAGATT-TGATTATTTGAACAATTA
193 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * *
92539 TTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT---A-AATTGTTT-TAATTTTGTAAAAA
256 TCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTTCATACAAG
* * *
92598 CTTATTTGAAATAAAATCATACTACTTTATTAATATTTCAAAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
92641 ATTAATAAGCAGAGA-TTTAAAACTAAAGT-T-TTT--T-AACTAGTTCAAATAGTTATGATTAT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAA-TATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * *
92700 TTGAACAAATATGAATCTT-AAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTT-TG
65 TTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* * * * *
92761 A-TCATACAAGCTTATTTG-GATAAAAATAATGCTAATTTAATAATATTATAAAAATTAGT--G-
127 ATTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
92821 AA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCT-AACCAGTTCAAATAGTTAAGTCTATTAGAATAAC
190 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
92884 TATCTATTTCAAATCATT-CGAACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGGTTTC-AGTTC-T-TA
254 TATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTTCATACA
** **
92945 A--TT-TT-G-AATACAAA-AAT-TTTTGTATATTTGAA-ATAACAAAA
317 AGCTTATTCGAAATA-AAATAATATAAT-T-TA-TT-AATATTTCAAAA
* ** * * ** * *
92986 ACTAA-ATA-TATTGATTGAATAAAAAATATATAATAGCAAATATTTGAAA-ATGTTCCAAAAAA
1 ATTAATA-AGTAAAGATT---TTAAAAATAAAT-AT-G--TTTA-CT-AAACAAGTT-C---AAA
* * * * * *
93048 CAATTTATG--TA-TTGAATAATTATCAATTTC-AATCA-TT-TGA-CATTTG-TTTATCATAAA
52 -TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * *
93105 ACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATTAAAACTAAAACTACTTTATTACTATTTT
115 ACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAA-TAATACTAATTTATTA--ATATT
* * * ** *
93169 TAACAAGTT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTTCTGAATTAGTTCAAAATAATTA
175 TAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTC-AAATAGTTA
* * * *
93233 T-TC-ATTTTGAAC-ATT-TCTATTTCTCAAATACGTTATGAAC---T-TTTTGTCCGTAAAACA
238 TGACTA-TTTGAACAATTATCTA-TT-TCAAAT-CATTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACA
* * *
93290 ATTGTTT-TCA--TCATACAAG-TCTATTTGGAAGAATAATAA-ATAATTTAATTAATATTTCAA
298 ATTGTTTCT-ATTTCATACAAGCT-TATTCGAAATAA-AATAATATAATTT-ATTAATATTTCAA
93350 AA
359 AA
* * * ** *
93352 AATAATAAGTAGGAGATATTAAAAATAAATATACTTACCGAAACCAA-TT--AATAGTTTATGAA
1 ATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTAAA-CAAGTTCAAATAG-TTATG-A
* *
93414 CTATTTGAAACACATTA-CTAATTTCAAATCA-TATAATAAAACCATTTGTTTATAG--ATAAAA
61 CTATTTG-AACA-ATTATCT-ATTTCAAAT-AGT-T-AT--GACCTTTTGTTT-T-GTCATAAAA
* * * * * * * *
93475 CAATATTATTTAATCTTATATACAAGGCTTATTTGACAATACAA-AATACT-ATATAATAAATAT
116 C-A-ATTGTTT-CTATT-CATACAA-GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAATAT
* * * * * *
93538 TCATGAAAATTTAATAAATTAAAGATATTTAAAAAATAAATATTGATATTGCCGAACAA-TTAAC
174 T--T-AAAAATTAAT-AAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTG-T-TTACTGAACAAGTT--C
* * * * * *
93602 AAATTGTTAAGGCGATATGAA-AATTATCTATTTTGAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG--AT
229 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * ** * * *
93664 AAAACAA-TGTTT-TAGTT-ACTATAATTTTGTTTGAAATCAAATAATATTAATTTATTAATATT
292 AAAACAATTGTTTCTATTTCA-TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
93726 TCAAAA
355 TCAAAA
* * * * *
93732 ATTAATAAG---AGA-TTTAATAAATAAATTTGTTTACTAAACCAA-TTTAATTAGTTATAACAA
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAA-AAATAAATATGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * **
93792 TTCGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA-CTAGTTGTTTTATCATAATGCAATTGTTTCTA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * * * * *
93856 TTAATACAATTTTATTTGGAATAAACTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAGTTAGTAAGTAA
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * *
93921 CAGATTTAAAAAAAAGAATCTGTTGGCCTGACCAA-TAT-AAATAGTTAT-AGCTATTTAAACAA
192 GAGATTTAAAAAATA-AATCTGTT-TACTGAACAAGT-TCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
* * * *
93983 TTATCTATTTTAAATCATTTAT-ATCTTTTGTTTTGTCACAAAACATTTGTTTCTATTTC-TACA
253 TTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACA
* * * * * *
94046 ACCTGATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAA
317 AGCTTATTCGAAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
94091 ATTAATAAATAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAACAAGTCCAAATAGTTGTGACTA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * *
94155 CTTGAATAATTACCTATTGCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAAAT-TTTCTA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTA
* * * *
94219 TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAACAACTAAAAAGT
128 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAA-AATTAATAAGT
* * * *
94282 AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
190 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
94347 AT-TTTTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTATTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TGTTCATACAAG
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAAG
* * * * *
94409 CTTATTTGGATTAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAATA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
94452 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-AGAACATGTTCAAATAGTCATAACTA
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** *
94516 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTGTGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTAT-TA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
94579 GTTCATATAAGCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTT
128 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTA
** * *
94644 AGAGATTTAAATTATGAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** *
94709 TCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAACTAATTT-T-GTTCATACAAGC
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTTCATACAAGC
* * *
94771 TTATTTTG-AATAAAATAATATAAACTTATTAATATTCCAAAA
320 TTA-TTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
94813 A-T--CAA-TAAA-A----AAAATTAAATTTGTTTTCTAAACATA-TTCAAATAGTTATGACTGT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
94868 TTGAAGAATTATCTATTTCAAATAGATATGACCATTTTTCTTTTATCATAAATCAATTGTTTCTA
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
94933 TTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
94998 -AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAGCAAGTTCATATCA-TTATGATTATTTGAATAAT
192 GAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
95060 TATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATACAA
254 TATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA
* *
95123 GTTTGTTC-AGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
318 GCTTATTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * * * * * *
95166 ATTAAT-AGTTAGGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGCCCA
1 ATTAATAAG-TA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
95230 TTTGAACAATTATCTATTTGAAATCA-TTATGACTTTTTG-TTTGTTATAAAAACAATTATGTCT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCT
* * ** * *
95293 CTTCATGCAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-T
127 ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT
* * * * *
95353 AAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTTC-CAAAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
190 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
95417 TAT-GATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCT-TTTCATACAAG
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* * *
95479 CTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA
319 CTTATTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
95522 ATTAGTAAGTAAGAGA-TTTAAGAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAA-AAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
95586 TTAGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGCTTT-TG
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA
* * * * * *
95650 TCCATATAAGTTTGTTC-AGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TA
128 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTA
* ** ** * * * *
95710 AGAGATTTAATAAATAAATCAATTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
95775 TTTATTTCAAGTCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTAATACAATCT
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * *
95839 TATTC-AGAATAAAGTAATGCTAATTCATTAATA-TTCTAAAA
321 TATTCGA-AATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * ** ** * * * * *
95880 ATTAATAAGTAACG-TATTTAAAAAAAGAATATGTTGGCTTGACCAGTACAAGTAGTTATAACTG
1 ATTAATAAGTAAAGAT-TTTAAAAATA-AATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * *
95944 TTTGAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCACAGAACAACTGTTTCTGT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * * * ** * *
96009 TTGTACAAGCTGATTCGGAATAACATAATTTTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAC
129 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
96074 AGATTTAAAAACTGAATCTGTTTA-TCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-
193 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * *
96137 CTTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCT
257 C-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * * *
96201 TATTTC-AATTAAAATAATAGAAATTTATTAATA-TTCGACA
321 TA-TTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * ** *
96241 ATTAATAAGTAAAAGATTTT-TAAA-AAATTTGTTTACCGAATAAGTTCATAA-AGTTATGACTA
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCA-AATAGTTATGACTA
* * * * * * *
96303 TTTAAATAATTATTTATTTCAAAATTA-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTT
64 TTTGAACAATTATCTATTTC-AAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
96367 GTTCATACAAGCTTATTCG-GATTAAATAATATTAATTAATTAATATTTCAACAATTAATAAGTA
127 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * * * * *
96431 AAAAATTTTCAAAATAAATATTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAGAATTA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** * * * * * *
96496 TCTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TGTAT-TAGTTCATATAGGCT
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * *
96559 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTCCAAAA
321 TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* ** *
96600 ATTAATGAA-TAAGAGA-TTTAAAATATGAATATGTTTACTGGACAAGTTCAAATGGTTATGACT
1 ATTAAT-AAGTAA-AGATTTTAAAA-ATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
96663 ATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCA-TTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTTAT
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
96727 GTTCATACAAACTTATTTTG-AATAAAATAA-AATAAATTTATTACTATTTAAAAAATTAATAAG
127 ATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
96790 CAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTAT
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
96854 TATCTATTTCAAAT-AGCTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTT-T-TGTTCATACA
254 TATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACA
* * *
96916 AG-TGTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTCCAAAA
317 AGCT-TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * * *
96961 ATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAGGTAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCATATCGTTATGATTGT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAA-ATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** *
97026 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGTAATTATTTCTATT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * * *
97091 CATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTATGAAAATTAATAGGCAGGA
130 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
97156 GATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTAAACAATTATCT
194 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * **
97221 ATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATTCAAAATTAT
259 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTTAT
* * * *
97285 T-TAGAATAAAA-ATATATTGATATATTAATATTTTAAAA
324 TCGA-AATAAAATA-ATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * *
97323 ATTAATAAG---AGATTTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-ATAGTTCAAATAGTTATAACTA
1 ATTAATAAGTAAAGATTTT-AAAAATAAATATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
97384 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-ATC-TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTTT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * * * *
97447 TCATACAAGCTCATTTGGATTAAAATAATTCTAATTCAATAATATTCTAAAAATTAGTAAGCAAG
129 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** *
97512 AGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATAATTAAGACTATGAGAATAATTA
193 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** * * * * * * *
97576 TCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCA
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * *
97640 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAA
321 TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * **
97681 ATTAATGAGTAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTT-TAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACT
* *
97745 ATTTAAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * * * * * * *
97808 AGTTTATAAAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTATATTTCAAAAA-TAAAAAGC
127 A-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * * *
97872 AAGTGATTTAAAAACTAGAGT-TGTTTTCCAAACTAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAACAAA
190 AAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
97936 TATCAATATGAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTA-ATCATATAAG
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
** * * *
97999 CCAATTTG-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA
319 CTTATTCGAAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
98042 ATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCGAATC-AGTTCAAA-A---AT-ACTAT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTT-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * * *
98098 TAGAATAATTAT-TATTTTAAATCGCTCTGACCTTTGGTTTAGTCATACAATAATTGTTTCAATT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * ** *
98162 CAAACAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTGAAATTTTAATAAGTATGA
130 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * *
98227 GATTTGAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATC
194 GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * *
98292 TATTTAAAATCATTATGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTAT-TAGTTCAAAAAATCTT
258 TATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTT
* **
98355 A-TCCAAATAAAATAATACTGCTTTATTAATATTTCAAAA
322 ATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
98394 GTTAATAAGTAAA-ATATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACTTAATC-AGTTCAAATAATTATTG-
1 ATTAATAAGTAAAGAT-TTT-AAAAATAAAT-ATGTTTAC-TAAACAAGTTCAAATAGTTA-TGA
* * * * * * * * *
98455 CCATTTG---AA-TATATATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTCGTCTTAAAATAATTATTTT
61 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
98516 TCA-ACATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATAGTAATTTGTTAATATTTCAAGAA-T--TAA-
126 T-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
98576 TAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAAT
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * * * * *
98641 TATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* *** * *
98705 CTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAGCCATA-TACTGAAA
319 CTTATTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * ** ** * * * *
98748 ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATATCCGTTTGTTGAACTAGTTC-AACAGTTAAGACTAT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
98812 ATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGC
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * * * *
98876 TCATACAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAAGTAATTT-TTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAG
129 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * ** * * * *
98940 AGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAATCATTACTATTTGAATAATTAT
193 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** * * * *
99004 CTATTTCAAATCATTCTTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAATGA-T-TTT-T-GTTAATATAAGTT
257 CTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * *
99064 TGTTCAAAAGAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGAAA
321 TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCA-AAA
* * * * * * *
99105 ATTAATCAA-TATCAA-A-TTTACAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACCATTTCTAATAGTTTTGAC
1 ATTAAT-AAGTA--AAGATTTTA-AAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
99166 TATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTT-
62 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTC
** * ** * * * *
99230 TGCTCATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-
126 TATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT
* * * * ** *
99294 -A-A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAA-ATTAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAA
190 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *
99354 TTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTG---T-T--T----C-A--G-------TTCATACAA
253 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA
** * *
99399 GCTTATTTAAAATAAATTAATATTAATTTATTAACATTTCAAAA
318 GCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
** * * *
99443 ATTAATAACAAAAAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATTA
1 ATTAAT-A-AGTAA--AGATTT-TAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * ** *
99508 CTATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCA-TTATAACCATTTT-ACTTGTCATAAAATAATTGTT
61 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * *
99571 T-TAGTTTGTACAAGCTTAGATAG-AATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAAT
124 TCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* * * * * *
99634 CAGTAAGAG-TTTAAACAAAATAAATTTGTTTATTGAATAAATTCTAATAGTTATGACTATTTGA
186 AAGTAAGAGATTT-AA-AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
99698 ATAATTGTTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-ACATTATTTC-AATTCA
249 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTATTTCA
* * * *
99761 TATAAGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAAA
313 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * ** * * **
99810 ATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA-ACTACTTACTGAACAAGTTTAAATAACTATGACTA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATA-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * *
99874 TTTAAACAATTATCTATTTGGAATCA-CTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AGATT-TCATC
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGT-TTC
* * * *
99936 TTTTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAGATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGATAATTAATAA
126 TATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAA
* * * * ** * * *
99999 GTAAAAGATTTGAAAAATAAATCTATTCACCAAATAAGTTCAAATCA-TTATGAGTAATTGAAC-
188 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACA
** * *
100062 ---A---A---CAAATTGTTTTGA-C-TTTGTTTTGTCATTAAACAATTG-TT-TATGTTCATAC
252 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATAC
* * *
100114 AAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACA
316 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
100160 ATTAATAAGTAAA-ATATTTAAAAAAATTAATATATTTACTGAATAATTTCAAATAGTCATAACT
1 ATTAATAAGTAAAGAT-TTT--AAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * * * *
100224 ATTTGAATAATTATCAATTTCAAATAACTGTGACATTTTGTTTTGTAATAAAATAATT-TTTTTA
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
100288 GTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAATGAGTA
128 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
100353 AGAGAACTAAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATT
191 AGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
100418 ATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTA-TTCATCCAAGC
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGC
* *
100482 TTATTTTGAAA-AAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAA
320 TTA-TTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
100524 ATTTATAAGCAAAAATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CTTGAACATGTTCAAATAGTTATAACTAT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTAC-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
100588 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTATCAT-AAACTAATTGTTTCTAT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTAT
* * * * * *
100652 TCATACGAA-CGTATTTGGAATAAAATAGTACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAA
129 TCATAC-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
100716 AAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-TGGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAATAGTTA
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * *
100780 TTTATTTCAAATCGTTATGGTCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTT
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * *
100844 TATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
321 TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * *
100885 ATTAATAAGTTAGAGA-TTTAAAATATAAATCTATTTATCT-AACAAGTTCAAATAGTAAT-ATC
1 ATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAA-ATAAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-C
* ** * ** *
100947 CATTTGAATTATCATCTATTTCTAGCTA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATACCAAT
62 TATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-C-A-
* ** * * *
101011 TATTCAGAATAATTGGTATTCATACAAAATTATTCAAAATTAAAA-AATACCAATTTATTACTAT
118 -ATT--G--T--TT-CTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
101075 TTCAAAAA-T--TAA-T-AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-TCAAACCAGTTCAAATAGTT
174 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT
*** ** * * * * *
101134 AACCCTATGAGAATAATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG
237 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * *
101199 TTTC-AGTTCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAA
302 TTTCTATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * ** * * *
101258 ATTAATTAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
101323 TTGAACAATTATCTATTT-AAATTTGTTATGACCTTTTATTTTTATCTTAAAACAATTGTTT-TA
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
101386 GTGCATAAAAGCTTA-TCCAAAGTAAAATAATAGT-ACTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGT
128 -TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT
* * ** * * * * * * *
101449 TAGAGATTT-AAAAATAAAT-TAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTTTGGCCATCTAAATAAT
190 AAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
101512 TATCTATTTCAAAT-AGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTT-T-TCATCATACG
254 TATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACA
* * ** * *
101574 AGCCTATTTGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAAA
317 AGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
101619 ATTAATAAGCAAGAAATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAATAT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
101684 TTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAATAATTATTTTTGTT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * *
101749 CATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAG
130 CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* * ** * * * * *
101813 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCT-
193 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * *
101877 TGATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTCTTT-TAGTTCATATTAA-CT
258 T-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATA-CAAGCT
*
101940 TATTC-AGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAA
321 TATTCGA-AATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * * *
101981 ATGAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAATTTTATTTA-TCGAACTAGTT-AGATAATTATAACTA
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
102044 TTTGAATAATTGTCTATTTTAAATCA-TTATTACC----------T--TAAAA-AA-TGCTTT-T
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT
* * * * * * * *
102093 GTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGTA
127 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
102158 AGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTAAACAATTA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * * *
102223 TTTACTTCACATCATGATGACCATTTGTTTTATCATAAAAGAATTATTACTA-TTCATA-TAGTC
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG-C
* *
102286 TTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
320 TTATTCGAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * ** * * * * * *
102328 ATTAATAAGTAACGGATTTGAAAAATGAATTTGTTGGCCT-AACCAGTGCAAATAATTATAATTG
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTT-TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
102392 TTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC-TCAAAACAATTGCTTCTA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
102456 TTCGTACAAGCTTATCCAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAAGTAA
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
102521 GAAATTTAAAAAAGAAATCCGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
102586 CTATTTTAAA-GAGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCA-AAAACCAATTGTTT-T-TGTTCATATAA
257 CTATTTCAAATCA-TTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTAT-TTCATACAA
* * *
102647 GCGTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAA
318 GCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
** ** *
102691 ATTAATAAGTAAAAAGATTTT-AAAA-AAATATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTG
1 ATTAATAAGT--AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
102754 TTTGAACAATT-TTTATTT-AGAATAGTTATGATCTTTTGTTTCGTTAGAAAACAATTGTTTCTA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCA-AATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
102817 TTCATACAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATA-TAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
128 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * * **
102880 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATC-A-TTCAAATAATTAAGACTATTAAAACAATT
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * ** * * *
102943 ATTTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGCTTAGTTTTAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGC
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGC
** * *
103007 TTATTAAAAATAAAATAATAGTAATTTATTCACATTT-AAGAA
320 TTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAA-AA
* * * * * * * *
103049 ATTTATGAGCAAAAGA---TAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAAATT-TGACTA
1 ATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTA
* * * *
103110 TTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTCA-TTATTG-CCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTC
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T-AGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * *
103171 -AGTTCATAAAAACTTA-TCTAAAATAAAATGATACTACTTTACTAATATTTTGAAAATTAATAA
126 TA-TTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA
* * * * * * *
103234 GCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTC-CAACTAGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACA
188 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
103297 AATATCAATCTCAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTGA--TC
252 ATTATCTATTTC-AA-AT-CA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTTC
*
103359 ATACAAGCTTTTTC-AAATAAAAATAATATTAATTTAATT-ATATTTCAAAA
312 ATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATA-TAATTT-ATTAATATTTCAAAA
* * *
103409 ATTAATAAG---AGA-TTT-AAAA-AAATATGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTAT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * * *
103467 TAGAATAATTATCTATTTCAAATCTTTTTGACCTTTTGTTTAT-TCATACAATAATTGTTTC-AG
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-
* * * * *
103530 TTTATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA-TGAATTTATTAACATTTAAAAA--ATTAA-TAA
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
103591 GAGATTTGAAAAAGTAAATCTATTCACCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTA
192 GAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * *
103656 TCT-TTCTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCATTGTTT-TAGTTCATAAAAGC
256 TCTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGC
* * * ***
103719 TTATCCAAAATAAAATAGTACTACGCTATTAATATTTCAAAA
320 TTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
103761 GTTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACTAAA-ATAGTTCAAATAATTAT-AGC
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAAT-ATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGA-C
* * * * * * * * *
103823 CATTTGAACAACTACCTATTTTAAGTCA-TTATTACTTTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTT
62 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* *
103887 TCA-ACATACAAGCTTATTC-AAAT---A-AA-A-TAA--TATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-
126 T-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG
* * * ** * *
103938 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAAT
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * * * * * *
104003 TATGTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTATCATAAAATAATTATTTTTGTTT-ACACAAA
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* * * * *
104067 CTTAGTCAAAATAAAATAATATTACTTTAGTAATA-TTCTACAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * *
104110 ACTAATAACTAAGAGA-TTTAAAAGATAAATCTGTTTGCGAAACCAA-TTCAAACAGTTAAGACT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAA-ATAAATATGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
104173 ATATGAACAATTATTTATTTCGAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TA
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
104237 GCTCATACAAGCTTA-TC--CA-AAAAT-AT-TTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATACGTA
128 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTA
* ** * * **
104296 AAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAA-ACAGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAACA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ****
104360 ACCTATTTCAAATCATTACT-ACTTTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTT-TGCAACATACAAG
255 ATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* *
104423 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
104466 ATTAATAAG---AGATTTAAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
104527 TTTGAACAATTATCGATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTGT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * *
104592 TCAAATAGGCTTATTC-AGAATAAAAGAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAA
129 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
104656 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTCGAGCCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATT
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * *
104719 ATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGCTT-ATATATG
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTCATACAAG
* * * * *
104782 CTTAATATTTC-AAA-AATTTATAAGCAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGAAGTA
319 C-T--TA-TTCGAAATAA--AATAA--TATA-ATTT----ATTAA---TATTT--C-AA-AA
* * * * * * * *
104842 GTTCAAATGATTATAACTATTTGAAAAAT-TATCA-ATTT-C-AAACCATTA-TTACTAAT--TT
1 ATT--AATAAGTA-AA-GATTTTAAAAATAAAT-ATGTTTACTAAA-CA--AGTT-CAAATAGTT
* * * *** * * *******
104900 ATTAATATTTAGAA-AATTAATC-AGTTCGAGAATTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTT
57 ATGACTATTT-GAACAATT-ATCTATTTC-A-AA-TAGTTA-T-GACCT-TTTGTTTTGTCA--T
* * * * * * * ** * *
104963 TAAATAGTT-TTGACTATTTGAATACTTATC-TATTTC-AAATAGTTATAA-CCT--TTTATT-T
112 AAAACAATTGTT-TCTA-TT-CATAC-AAGCTTA-TTCGAAATA-AAATAATACTAATTTATTAA
* * ** ** * * * *
105021 TGTCATCAAACAATTGGTTTTGTTGATA-ATATTTTACTTAGAATAAAATAATACTAATTTAAT-
171 TAT--TTAAA-AATT-AATAAG-T-A-AGAGA-TTTA---A-AA-AATA-AAT-CT-GTTTACTG
* ** * * * * * * * *
105084 AA-AATTTTGAA-ACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTTGAACCAGTTCAA
220 AACAAGTTCAAATAGTT-ATGA-C----TATTTGAACAAT-TATCT-A-T-TTCAA--A--TC--
* * * * *** * * *
105147 ATAGTTAAGA-CTATATGAATGATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTCTTGTCATAA
269 --A-TTATGACCT-TTTG--T-TTTGTCATAAAAC-AATTGTT-T--C-TATT-TC--AT-ACAA
** * * *** * * * * *
105210 AACAATTGTTTTGTTTGTACAAGT-TTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAGGAATA
318 GC---TT-ATTCG-AAATA-AAATAATA-T-A-ATT-TATTAATA-T--TTCA--AA-A
* * * * * * * *
105268 GTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC-AGATCAAATGGT
1 ATT-----A---ATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
105332 TAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
56 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
105397 GTTTCAATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTA
121 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTA
** * * * * * * * *
105461 ATAAAAAATATATTT--TAAA-AAAT-TATTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATTATTATTTGA
184 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** * * * *
105522 ACAATTATCTATTT-AGAAGCTTTAAAACCTTTTGATTTGTTATAAAACAATTGTTTC-AGTTAA
249 ACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCA
* * * *
105585 TACAAACTTATTTTG-AATTAAATAACATAAATTTATTAATA-TT-AAGATA
313 TACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAA-A-A
* *
105634 ATTAATAAGTAAAAGATTTT--AAA-AAATATGTTTACCAAACAAGTGCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * * * * *
105696 CTGAGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * ** * * * *
105761 TATACAAACTTATTC-AGATTAAAATAATTTTTATTTATTACTATTTTGACAATTAATGAA-TAA
130 CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT-AAGTAA
* * * * * * *
105824 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATACTCATGACTATTTGAATAATAAT
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
105889 CTATTTCAAATCATTATGACCCTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-ATTTCAT-CTAAGCC
257 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATAC-AAGCT
* *
105952 TATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
321 TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
105993 AATAATGAGTAAGAGA-ATTAAAAA-AGAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATA-AATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * **
106056 TTAGAACAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACCTTTTGTTTCATCTTAAAACAACCAG-TTCT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT
* *
106119 ATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTGCAAAAATTAATAAG
127 ATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG
* * * * * * ** *
106182 TAA-AAATTTTAAAAATAAATATATTTTCTTAACTTGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* *
106246 TATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATATAA
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTTCATACAA
* *
106309 GCTTATTCGTAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAA
318 GCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *** * *
106353 GTTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATATA-TCGAGTGAGTTCAAATAATTATAACTA
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
106417 TTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCA-TTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * **
106481 TTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT--TATATAAGAAACTTAATGGGT-
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-AAA-TTAATAAGTA
* * * * * * * * *
106543 TGAAGACTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCAATTTGAACTATT
191 AG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ** * **
106608 ACCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTATTGTTGTAAAAAAATTGTTT-TA-TTCATACAAAA
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGC
*
106671 TTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTCATTAATATTTCAAAA
320 TTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTT-ATTAATATTTCAAAA
* * * * *
106713 ATTAA-AAG---AGA-TTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATTA-TTATGATTA
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTA
* ** * * *
106772 TTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGTTC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTG
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
106835 TTCATACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCT-CAAATTAATAAGTA
128 TTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * **
106898 ATACATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
106963 TCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTAGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCT
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * *
107027 TATTCGAAATAAAATAGTACT-ATTTTTTAACATTT-AGAAA
321 TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCA-AAA
* * * * * * * *
107067 ATTAATAAGCAAGAAATTTAAGAAAATAAATATGTTAACCAAACAAATTCAAATAGCTATGCCTA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTA-AAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
107132 TTTGAATAATTATCTATTTAAAATCA-TTATTG-CCTTTTGTTTTATAAAAAAATAATTGTTT-T
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * * *
107194 AGTACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATGATATTACTTTA-TAATATTTCAAAAATTAAGAAGT
127 A-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGT
** ** * * * *
107258 TGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-TCAA-ATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAA
190 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * * *
107321 CTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TCATCATATA
253 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACA
* * **
107384 AGCATATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTTATATTTTGAAA
317 AGCTTATTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
107429 ATTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAAC-AAACTAGATCAAATAATTAT-ACTA
1 ATTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTT-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * * * *
107492 TTTAAATAATTATATATTTCAATTCGTTATAACCTATTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * *
107557 TTATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAACTAATAACTAAG
129 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * ** * * *
107622 ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAATC-AGCTT-AAATAGTTAAGGTTGTATGAATAATTA
193 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** * * ** * * * *
107685 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATCTTGTTGTAAAACAAATGTTTTTA-TTCATATAAGTT
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* * **
107749 TGTTC-ATAA-CAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAA
321 TATTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * *
107789 ATTATTAAG---AGA-TTTAAAATATAAATATGTTTACTAAATC-AGTTCAATTAGTTAT-AGTA
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAA-ATAAATATGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-
* * * ** * *
107848 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA-TT-TGACCATTTGTTTCATCATAAAATAATTGTTTTT
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * *
107911 ATTGATACATTCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
127 ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * *
107976 ATAGATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACTAA-TGCAAATAGTTATAATTGTTTGAACAA
191 AGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTAC-TGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
** * * * * *
108039 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAAAAATTGTTTTTGTTT-ATACAA
253 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA
* *
108103 GCTTATTC-AGAATAACATAATTATAATTGATTAATATTTCAAAA
318 GCTTATTCGA-AATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
108147 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAACTGAATCTATTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * *
108211 ATTGAATAATTACCTTTTTCAAATCA-TTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * **
108275 TTAATACAAGCTTATTTC-AATTAAAGTAATACAAATTTAATAATATTCAGGCAATTATATTAA-
128 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTA-A-TAAG
* * * * * * * * *
108338 TAA-AAATCTAAAAAATAACTATGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTACTTGAATAAT
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * ** *
108402 TATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTT-TGGTTCATATAAG
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* *
108466 CTTATTC-AAATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTCAACA
319 CTTATTCGAAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
108509 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAATAAGTTTAAATAATCATAACTA
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
108573 TTTGAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATAT-TA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
108636 GTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTA
128 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * **
108701 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTAACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-TATTTTG---TTTT
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATT
* * * * * *
108762 ATC-A--TAAAAT-AAT-TG----TTT-CTAT-TCATAAAAGC--TTATTTC-A---AATA-AA-
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* * ** ** * ** **
108808 -ATAATAAAAATTTATTAATATTCCAA-AAATTAATAAGT-AAAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-T--AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
108850 TTTTAAAAAAT-AA-A---T----AT--GT-T-TTT--TGAACACA-TTCAAATAGTT-TGACTA
1 -ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * ** * *
108898 TTTAAATAATTTTCTATTTCAAATCA-TTATAATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATAGTTTCTA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* *
108962 TTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
128 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGT
* * * **
109025 AA-A-ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACGTGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
190 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
109088 TATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATAAAA
254 TATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA
* *
109151 G-TGTATTCAAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAA
318 GCT-TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * ** * *
109194 ATT-ATAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAGCAAGTTTAAATAGTTATG-CTT
1 ATTAAT-AAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC-T
* * * * * ***
109257 GTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTA
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
109322 TTCATGCAAGTTTATTGGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGGT-
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAA-GTA
* * * * * * * * *
109385 AGAAGACTTAAAGAATACAT-TAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATATGAACAAT
191 AG-AGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
109449 TATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCTTGCAAA
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* * *
109513 ATTATTC-AGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA
319 CTTATTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
109556 ATTAATAAG---GGA-ATTAAAAACTAAATCTATTTAACGAAACAA-TTTAAATAGTTATTACCA
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTT-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
109616 TTTGAACAATTATATATCTCAAATCGCTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * *
109680 TCAAACAAGGTTATTCTAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAG
129 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
109741 AGATTT--AAAA-AAATGTGTTTGCTGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATC
193 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** * * *
109803 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTA
258 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTTA
* * * *
109867 TTTGGATAA-AAAAAAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA
323 -TTCGA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
109907 ATTAGT--G-AAAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCGAATCAA-TTCAAATAGTTAAGACTA-
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTT-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * * * * * *
109967 TAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCCGACCTTTTATTTAGTCCTATAATAAGTGTTT-TAG
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-
*** * * *
110030 TTCATACAAGCTTATGAAAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGCA
128 TTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
110095 AGAGATTTGAAAGATAAATTTGTTTACTGAACAGGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * ** *
110160 T-TGATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTCAT-AAATGATTGTTT-TAGTTCAT-CAAAG
256 TCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATAC-AAG
* * * * * * *
110221 CTTATCCAAAAGAAAATAATACTATTTTGTTATTGTTTCAAAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
110264 GTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAATTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATGACCA
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATAT-GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
110328 TTTGAATAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-A
* ** * *
110393 -ACATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * ** * *
110455 G-G-TTT-AAAAA-AAACCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * * *
110516 CTGTTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTCTATTT-ATACAAGTTT
257 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTT
* * * * * *
110580 ATTTGGAATAAAATAACACTAATTTAGTAATA--T--GAG
322 ATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * * *
110616 ATT--TAA--AAA-A---T--AAAT--CTAT-TTGGC-AAACCAA-TTCAAACAATTAAGACTAT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** *
110666 ATGAACAATTAAT-TATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AG
65 TTGAACAATT-ATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-
* * * * * * *
110729 CTCATACAAGCTTATTTGGAATAGAGTAAGACTAATTTATTAACATTTCAAAAATT--T-A-TAA
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * ** * * *
110790 AAGATTTAGAAAATAATTATATTTACCAAACCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTAT
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *
110855 CTATTTCAAATCATTAT-TCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TGGTAATATAAGTT
257 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAAGCT
* *
110917 TGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAA
321 TATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
110958 ATTAATCAGTAAAAGA-TCTAAAAAGTAAA-ACTGTTTACCAATCTATTTCAAATAGTTTTGACT
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAA-TAAATA-TGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
111021 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTCTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * * * * **
111086 TTCATACTATTTTTTTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAA
128 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
111151 GAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-C-AAACTACTTCAAATAGTCAAGA-TAATATG----A-
192 GAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAAT
* *
111208 -A--T-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATCAAACCATTGTTT-T-TTATCATACAA
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT-TCATACAA
**
111267 GCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
318 GCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * ** * *
111311 ATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATAACTAT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
111376 TTGAGCAATTGTCAATTTCAATTCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AT
* * ** * *
111439 TCATAGAAGCTTATTTG-GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTTATAAGTAA
129 TCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
** * ** * * * *
111503 GAGATTTAAAAAATAAA-CATACTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTT-TAAACTATTAGAATAATT
192 GAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * * * * * *
111566 ATATATTTTAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTTAGAAAATATTTATTTC-ATATC-TAACAAT
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCAT-ACAAG
* * *
111629 CTTATTTGGAATAAAATAATCCA-AATTTATTAACA-TTCAAAAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAAT--ATAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * *
111672 ATTAATAAGGAAAAGATTTGAAGAATTAAATCTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATGGTGATGACT
1 ATTAATAA-GTAAAGATTTTAA-AAATAAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
111736 ATTT-AACAATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACATTTTGTTTT-TATATAAAATAATTGTTTC
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
111798 -AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAC
126 TA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG
* * * * ** *
111862 CAAGAG-TTAAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TCAAACAAATTCAAATAGTTACAACTATTTAAACA
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* **
111924 ATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGCTCATAC
252 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATAC
* *
111988 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
316 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
112034 ATTAATAAGT---GA-TATAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAATCATGGCCA
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
112094 TTTCAACAATTATCTATTTTAAATCA-TTATTACCTTTT-TATTTGGTCATATAACAATTGTTTT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTG-TTT
* * * * * *
112157 TTATT-ATAGAA-CATTATTCGAAATAAAATAACAGTAAATTATTAATCTTTCAAAAATTAATAA
125 CTATTCATACAAGC-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAA
* * * * * *
112220 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTTAACTAGTTATAACTATTTGAACAA
188 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * *
112285 CTGTATATTTCTAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCAAACAA
253 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA
* * ** ** *
112349 GTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACATAAAAATATTCCAAAA
318 GCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
112393 ATTAATAACTGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * * *
112458 ATGAACCGTTATCTTATTT--AA-A-TCAT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTTTTTCAAT
65 TTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * * * * *
112515 AGATACTAGCTTATTTC-AAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATATTAAAAAATTAATATGTAA
129 TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
112578 GAGATTTAAAAAGTAATTCTGTTTACCT-AACGAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTA
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** ** * * * * * *
112642 TCTATTTCAAATCGCTAAAACCTTCTGTTTTATCGTAAAACAAATGTTT-T-TGATCATACAAGT
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAAGC
* * * * *
112705 TTGTTTGAAGTAAAATAATACTTATCTATTAATATTTCAAAA
320 TTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* **
112747 ATTAATAAG---AGA-TTTACAAAATAAACT-TGTTTA-TCATACCGGTTCAAATAGTTATGACT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTA-AAAATAAA-TATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
112806 ATTT-ATGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATAGTTTCT
63 ATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
112870 ATTCATACAAGCTTATT-TAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATGAGA
127 ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * *
112934 AAAAAATCTT-AAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGATGAAATAGTCATGACTATTTCAATC-A
190 AAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAA
* * * *** * * *
112997 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAAAAATCACTTCT-GTTCTTATAA
253 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA
* * * *
113061 GCTTATTC-AAAGTAAAATAATACTAAGTTATTGACATTTTAAAA
318 GCTTATTCGAAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
113105 ATTAATAATTAAGAGA-TTTAAAAGATGAATTTGGTTAAC-GAACAAGTTTAAATAATTATGACT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAA-ATAAATAT-GTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * ** * *
113168 ATTTGAACAATTATTTTTTTGAAATCGCTATAACC-TTTGTTTTGTCGTAAAATGATTTTTTTTA
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * *
113232 TTTATACAAGCTTATTTC-CAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATACG
128 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAG
* * * * * *
113294 TAAAAGATCT-AAAACTAAATTTG-TT--T-AA-AA--TC---T--TTATGATTATTTGAACAAG
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** ** *
113346 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTACCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* * *
113410 CTTATTCGGATTAAAACAATATTAATTTATTAATATTTCAACAA
319 CTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAA-AA
* * * *
113454 A-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAAGTTTA-TCAAAC-AGATTCAAATAGTCATGAAT
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
113516 ATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCA-TAATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC-
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * *
113579 AGTT-GTATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGT
127 A-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
113643 ATGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTGCTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGACCAATT
190 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
113708 ATCTACTTCAAAACATTATGA-CTTTTCGCTTTATCATAAAACAATTGGTTCT-GTTCATGCAAG
255 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
*
113771 CTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCCAAA
319 CTTA-TTCGAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
113814 ATTAATAAGTAAA-AATTTAAAAATAAATATATTTTCTAAATACA-TTCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
113877 TTGAATAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAACCAATTGTTTCTATT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * ** *
113942 CATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATCCCAAAAATTAATAAGTAAAA
130 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * ** * * *
114007 GATTTAAAAAATGAATCTATTTA-TCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACCCTATGAATAATTATT
194 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
114071 TATTTCAAATCATTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCA-TTCAAATAA-TTTC
258 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTT-
* *
114133 ATTCGAAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATA-TTCTAAAA
322 ATTCGAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * ** * *
114173 ATTAATAAGTTAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACACTTTCAAATAGTCATGTCTAT
1 ATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** ** * ** *
114238 TTGAATTATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATATTTTGTTTCGTTGTAAAACAATTGCTTCTAT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** *
114302 TAATACAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA
129 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * *
114363 -AGATTTAAAAATTAAATTTATTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-ATATT
192 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATT
* * * ** *
114425 ATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-CT-TAATAGAT-C-TG
255 ATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* * * * * ** *
114484 TTTACT-GAACAAGTTTAAATATTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTATA
319 CTTATTCG-A-AA--TAAAATAAT-AT-A--ATTT-ATTAA-TAT-T-TCAAAA
* * *** * * * * *** *
114537 ATAAATATGACCTTTTGCTTTATTTT-AAAACAATTA-G-TAAGTTAAATTTGTTTGTCAAACCA
1 ATTAATA--A-GTAAAG----ATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAG--T-TCAAA-TA
* * * ** * * * ** * * * * *
114599 ATTA-AAGTAATTAAAGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCTTTGTTTTGT
54 GTTATGACT-ATTTGA-AC-A-ATTATCTATT-TC-AAAT--AGTTATGA--CCTTTTGTTTTGT
* * * * * **
114663 CATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTCA-ACTAGCTTATTC-AGAATAAAATAAAAGGAATTTATTA
109 CATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
114726 ATGTTTCAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTATAAAACAATTCTATTTACCT-AACTAGTTCAAAT
170 ATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAAT
* * * * *
114790 AATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACGTTATGTCCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
233 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * *
114855 AATGCTTT-T-GTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATCTATTGATATTTCAAAA
298 ATTG-TTTCTATTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
114918 ATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * **
114979 TTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCGGTT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* *** * * * * *
115044 CATACAAGCTTATTTGGGTTAAAATAATACTCATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAATAAAA
130 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * ** * * * * *
115109 AATTTAAAAAGTAAATATGGTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATTACTATTTGAATAATTATCT
194 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
** * * * *
115174 ATTTCAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC-AATTCATATAAGCTTAT
259 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTTAT
* * * *
115238 TCAAAATAAAATATTACTAAGTTATTAATATTAT-GAAA
324 TCGAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TCAAAA
* * * * * * * * * * *
115276 ACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAGCAAGTTTAAATAATTTTGACTAT
1 ATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-
* ** * * ** * *
115341 TTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCTTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATT-TTTTTGT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
*
115404 TCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGATAATTAATAAGTA
129 TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTA
* * * * * ** *
115467 AAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAC-GAACAAGTTTAATTCTTTATGACTATTTGAAAAATTA
191 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * *
115531 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTA--TCATGCATGCT
256 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCT
* ** *
115593 TATTCTAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACA
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* * * * * *
115634 ATTAATAAGTGGAAGA-TTTATAAAATAAATA-GATTT-TTCGAACAAGTTCAACTAGTCATAAC
1 ATTAATAAGT-AAAGATTTTA-AAAATAAATATG-TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
115696 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-
62 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
115759 TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAG
126 TA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
115824 AAAGAAAATTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAATATGTTCAAATAATTATGACTATCTGAATAAT
189 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * **
115889 TATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACATTTGGTTCT-GTTCATGTAAG
254 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAG
* * *
115953 CTTATTTCG-AATAAAATTATA-AATTTATTCACATTTCAAAA
319 CTTA-TTCGAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * ** * **
115994 ATTAATAAGTAAA-AATTTAAAAATAAATATATTTTTTTAACACTTTCAAATAGTTATGACTATT
1 ATTAATAAGTAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* *
116058 TGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTCCTATT
66 TGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * * *
116122 CATAAAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTATTTAA-ATTAAAAAAGT--TAAGTAAAA
130 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
116184 GATGTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTAT-T
194 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
116248 CATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTTGTCTTAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTG
259 -ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTTA
* *
116312 TTTGAAAT---AGAA-A-AA---ATT-A-ATTT-----
323 TTCGAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAA
** * * ** * * * *
116335 ATTAATAAGTTGGAGA-TTTAAAAATAAATTTGTTCACCGAACAAGGTCAAATAGTCATGTCCAT
1 ATTAATAAG-TAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * ** *
116399 TTAAACTATTATCTATTTCAAACAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTTCTATT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
116464 CATACGAAAG-TTATTC-AGAATAAAA-AATACTA
130 CATAC--AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTA
116496 TTGTTAGCCT
Statistics
Matches: 20104, Mismatches: 4373, Indels: 3035
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (360 bp):
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ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTTATTC
GAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAA
Done.