Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168082.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_33, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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Warning! 3000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 2 of 7
Found at i:92025 original size:167 final size:167
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Indices: 91743--92069 Score: 449
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91733 TATTCGAAAT
* * *
91743 AAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATACTAATCTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * *
91808 TACTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAAATATTTATTTCAAA-TAGTTATCATCT
66 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAAATATTGATTTCAAATTA-TTATCACCT
91872 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATCATTTCTATTTAGAATA
130 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATCATTTCTATTTAGAATA
* * ** *
91910 AAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATACTAATCTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * *
91975 TACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAACAATTATTGATTTCAAATTATTATGACCTT
66 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAAATATTGATTTCAAATTATTATCACCTT
* **
92040 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
131 TTGTTTTGTCATAAAAAAATCATTTCTATT
92070 CATTCAAAAT
Statistics
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AAATAATACTAATCTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATT
TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAAATATTGATTTCAAATTATTATCACCTT
TTGTTTTGTCATAAAAAAATCATTTCTATTTAGAATA
Found at i:92100 original size:167 final size:164
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91750 ACTAGTTTAT
* * * * * **
91760 TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAA
1 TAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAAAAGTTCAAA
* * *
91825 TAGTTATGGCTATTTGAACAAATATTTATTTCAAA-TAGTTATCATCTTTTGTTTTGTCATAAAA
64 TAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TTATTTCAAATTA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* ** * * ** *
91889 AAATCATTTCTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAT
127 CAATTGTTTCTATTTACAATAAAATAATACGAATAAAA
*
91927 TAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAA
1 TAATATTTTAAAAATTAATA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-AAGTTCAAA
* * *
91992 TAGTTATGTCCATTTGAACAATTATTGATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
64 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATT-ATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* *
92057 AATTGTTTCTA-TT-CATTCAAAATTATTTA-GAATAAAA
128 AATTGTTTCTATTTACAAT-AAAA-TA-ATACGAATAAAA
* * * ** * *
92094 TAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAGACCTAAATTTGTTTACCAAA
1 TAATA-T--TTTA--AA-A-ATT---AA-TAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
* * *
92159 ATAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTT
55 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTT
92223 GTCATAAAACAATTGTTT
118 GTCATAAAACAATTGTTT
92241 TATGTTCATA
Statistics
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0.79 0.11 0.10
Matches are distributed among these distances:
165 2 0.01
166 10 0.04
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Consensus pattern (164 bp):
TAATATTTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAAGTTCAAATA
GTTATGACTATTTGAACAATTATTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
TGTTTCTATTTACAATAAAATAATACGAATAAAA
Found at i:96176 original size:539 final size:533
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Indices: 88431--116492 Score: 12992
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88421 TTACTGAATA
* * * * * * *
88431 AGTTCAAATTGTTATTACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAATTATTCTAACCTTTTATTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * * * * *
88495 TCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*** * *
88560 TTTTGACAATTAATAAGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAAT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
88624 CATGACTGTTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTCTAATAAAACAATT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * * * * *
88689 ATTTC-AGTTCATATAAGCTTATT-TGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
258 GTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
88752 -A-AAGA-ATCT----GT---T-TGCTTA--ATA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
321 AATAAGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *
88802 TTATCTCTTTTAGAA-CATTATGACCCTTTT-TTTT-TCATAAAACAATTGATTT-TGTTCATAC
386 TTATCTATTTCA-AATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTGTTCATAC
* * * * * * *
88863 AAGCTTATTTTA-AATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAAGAAGTAAAACTT
448 AAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-TT
** *
88926 TAAAAAATAAATTTAT-TTTTTTAACAC
510 TAAAAAA-AAA--TATGTTTACTGAC-C
* * * ** *
88953 A-TTAAAAAAGTTATGACTATTTGGACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * * * * * * * * *
89017 CGTAAACCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATTTAGAATACAATAATATTAATTTGTGAAAAA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *
89082 T-ATAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTTAAAAAA-AAAT-TATTTACCGAGCAAGTTCAAATAG
131 TCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
89144 TTATGA-TGATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA-AAAACAA
192 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** *
89207 TTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACCAATTTATTAATA-TTCTAAAAT
256 ATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * * * * * *
89270 TTAATAAGTTAGAGCTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTCACGTCCATT
319 TTAATAAG--AGA--TTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * * *
89334 TGAACTATTATCTATTTCAAAATCATTATGATATTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATT
379 TGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTT
** * * * *
89399 CATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATGTC-AAAAATTAA-AAAT-AC
443 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATAT-TCTAAAAATTAATAAGTAAG
** **
89461 ATTTAAAAGCTAAACCTGTTTA-TCGAACC
507 ATTTAAAA-AAAAATATGTTTACT-G-ACC
** * * * * *
89490 AACT-AAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* ** * * * * * *
89553 CATAAAACAATTGTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCAT
66 CATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAAT
* *
89617 ATTC-TAAAACT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAG
129 ATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *** *
89677 TGAAGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAATGTAAT
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * * * * *
89740 TGTTTCAATTTATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATTT-AGAAAATT
257 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT
* * * * * *
89804 AATAAGCAAAAAATTTAAAAAAAATAAGTATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-T
321 AATAAG----AGATTT---AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
89868 TGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTC
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTC
* * * * * * * * *
89933 ATAAAAGATTATCCAAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAGTTGG
444 ATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-T-A
* * * *
89997 AGATTTAAAAAATAAAT-TAATTTATTAAATC
505 AGATTTAAAAAA-AAATAT-GTTTACT-GACC
* * * * * * **
90028 AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTCGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* ** * * *
90093 CATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACT-A---ATT--TAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** *
90152 T-----AA-T-A-AA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTATACTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTA
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
90208 TTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTAT
195 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGT
* * * * * * * * * *
90273 TTAC-CTTCATATAAGCTTATTCTA-AATAAAATAGTACTGATCTAGTAATATTATGAAAATTAA
260 TT-CTATTCATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAA--AT
* * * * * * * * * * *
90336 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCCAAACCAATTTAAATACTTAAGACAATATGGA
320 TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
90401 TAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAAAAAAATGTTTTTGTTCATA
383 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTGTTCATA
* ** * * *
90466 TAAATTTATTC-GAA-ATAAA-AATATTAATTTATTAATATT-TCAAAATTTAATAAG--AGATT
447 CAAGCTTATTCAGAATA-AAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGATT
* ** *
90525 TAATAAATAAATCA-GTTTACCAAATC
510 TAA-AAAAAAAT-ATGTTTA-CTGACC
* * * * * * *
90551 AGTTC-AATAAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGATATGACCATTTCTTTTG
1 AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * * ** * *
90615 TCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAATCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * *
90680 TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC--GAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
90744 TATAACTCTTTGAACAATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * * * * * **
90809 ATTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCGGAATAGTATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
258 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-
* * *** * * *
90873 ATAAGTAAGAGATTTAAAGACTTAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT-AGCAATTTG
320 -TAA-TAAGAGATTTAAA-AATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTG
* * ** * * *
90937 AACAATTACCTATTTCCAATCGCTATAACCTTTTCTTTTGTCATGAAATA-AACCTT-TTTCTAT
381 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-ACAA--TTATTTCTGT
* * * *
91000 TCATATAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC-AGACAATTAATAAGCA
442 TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTA-AAAATTAATAAG--
* * * * * **
91062 AAAAATTTTAAAAATAACTCTGTTTA-TCGAAT
503 TAAGA-TTTAAAAAAAAATATGTTTACT-GACC
* * ** * *
91094 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * ** * *
91159 CATAAAAAAATTCTTTTTGTTCATACAAGCATATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * *
91224 TTC-AACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAATTTAAATAGTC
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTT
* * ** * * * *
91288 ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAATAATTA
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * * * * * *
91353 TATT-TGTTCATATAGGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
259 T-TTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * ** ** * * * * * *
91416 ATGAGTTACAGATTTAAAAAATGAATCAATTTACTGAACAAATTCAAATAGTAAGGACTGTTTAA
322 AT-A---AGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
91481 ACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTTCAT
382 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCAT
* * * * *
91546 ACAAGCTTGTTCCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAA
446 ACAAGCTTATT-CAGAATAAAATAATACT-AATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGA
* * * * *
91609 TTTTAAAAATAACTATGTTTTCTAAAC
508 -TTTAAAAAAAAATATGTTTACTGACC
* * * *
91636 ACGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAATAGTTATGTCCTTTTGTTTT
1 A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTT
* * * * *
91700 TTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAG-TGTATTCGAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
91763 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAG
128 TATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
91828 TTATGGCTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATAGTTATCATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAA
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * *
91892 ----TC-ATT--T-C-----TATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTA
257 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *
91944 ATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTG
322 ATA---A-GAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
92008 AACAATTAT-TGATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
381 AACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCA
* ** * * * * * *
92072 TTCAAAATTATTTAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGATT
445 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATT
*** * ** **
92135 TAAGACCTAAATTTGTTTACCAAAAT
510 TAA-AAAAAAATATGTTTA-CTGACC
* * * * * *
92161 AGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* ** * * * * * *
92225 CATAAAACAATTGTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCAT
66 CATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAAT
* *
92289 ATTC-TAAAACT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAG
129 ATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
92349 TGAAGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAA----T-TG------T-TTTAGTCATAAAATAAT
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * * *
92401 TATTTCAATTCATACAA-TCTTATTTAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAT
257 TGTTTCTATTCATACAAGT-TTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* ** ** * * *
92464 TAATGAGCAAGAAATTTAAAAAAATAAATCAATTTACTGAACAATTTCAAATAGATT-TGATTAT
320 TAAT----AAGAGATTT--AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTAT
* * ****
92528 TTGAACAATTATTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAATTGTTTTAATTT-T
378 TTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATT-ATTTCT
* * * * *
92591 G-T-A-A-AAACTTATT-TGAAATAAAATCATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG
440 GTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * *
92650 CAGAGATTTAAAACTAAAGT-T-TTT--TAACT
503 TA-AGATTTAAAA-AAAAATATGTTTACTGACC
* * ** ** * * *
92679 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAATATGAATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * *** * *
92742 TCATAAAATAATTGTTT-TGATCATACAAGCTTATT-TGGATAAAAATAATGCTAATTTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
92805 ATT-ATAAAAATTAGT--G-AA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCTAACCAGTTCAAATAG
129 ATTCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
92865 TTAAGTCTATTAGAATAACTATCTATTTCAAATCATT-CGAACCTTTTGTTTAGTCATATAACAA
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * **
92929 TTGGTTTC-AGTTC-T-TAA--TT-TT--GAATACAAA-AATTTTTGTATATTTGAA-ATAACAA
256 AT-GTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATA-AAATAATATTAATTTA-TT-AATATTTCAA
* ** * * * * * * * *
92984 AAACTAAATATATTGATTGAATAAA-AAATATATAATAGCAAA-TATTTGAAA-ATGTTCCAAAA
316 AAA-TTAATA-AGAGATTTAA-AAATAAATCTGT-TTACCAAACTAGTTCAAATA-GTT----AT
* * * * *
93046 AACAATTTATGTATTGAATAATTATCAATTTC-AATCATT-TGA-CATTTG-TTTATCATAAAAC
372 GAC----TA--T-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * * *
93107 AATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATTAAAACTAAAACTACTTTATTACTATTTTTA
430 AATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAA-TAATACTAATTCATTAATA-TTCTA
* * **
93171 ACAAGTT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTTCTGAATT
491 A-AAATTAATAAGT-A-AGATTTAAAAAA-AAAT-ATGTTTACTG-ACC
* * * *
93218 AGTTCAAAATAATTAT-TC-ATTTTGAAC-ATT-TCTATTTCTCAAATACGTTATGAAC---T-T
1 AGTTC-AAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTA-TT-TCAAAT-TGTTATGACCTTTTAT
* ** *** *
93275 TTTGTCCGTAAAACAATTGTTT-TCATCATACAAG-TCTATTTGGAAGAATAATAA-A-TAATTT
61 TTTGT-CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAA-AATAATACTAATTT
* **
93336 AATTAATATTTCAAAAAA-TAATAAGTAGGAGATATT-AAAAATAAATATACTTACCGAAACCAA
123 -ATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTTA-CG-AA-CAA
* * *
93399 -TT--AATAGTTTATGAACTATTTGAAACACATTA-CTAATTTCAAATCATATAATAAAACCATT
182 GTTCAAATAG-TTATG-ACTATTTG-AACA-ATTATCT-ATTTCAAATCGT-T-AT--GACCTTT
* * * * * * *
93460 TGTTTATAG--ATAAAACAATATTATTTAATCTTATATACAAGGCTTATTTGACAATACAAAATA
238 TGTTT-T-GTCATAAAACAA-A-TGTTT-CTATT-CATACAA-GTTTA-TTCAGAAT--AAAATA
* * * *
93523 CTATATAATAAATATTCATGAAAATTT-AATAAATT-A-AAGATATTTAAAAAATAAATATTGAT
293 --ATAT--T-AAT-TT-ATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAAT-CTG-T
* * * * * * * * *
93585 ATTGCCGAAC-AATTAACAAATTGTTAAGGCGATATGAA-AATTATCTATTTTGAAAATCATTAT
347 -TTACCAAACTAGTT--CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT-CAAATCATTAT
* * ** * * *
93648 GACCTTTTGTTTTG--ATAAAACAATGT-TTT-AGTT-ACTATAATTTTGTT-TGAAATCAAATA
407 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TATTTCTGTTCA-TACAAGCTTATTCAG-AATAAAATA
* * * * *
93707 ATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG--AGATTTAATAAATAAATTTGTTTACTAA
469 ATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGATTTAA-AAAAAAATATGTTTACT-G
93769 ACC
531 ACC
* * * * * * * * * * *
93772 AATTTAATTAGTTATAACAATTCGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA-CTAGTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTATTTTG
** * * ** *** * *
93836 TCATAATGCAATTGTTTCTATTAATACAATTTTATTTGGAATAAACTAATGCTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * ** *
93901 TTCTAAAAGTTAGTAAGTAACAGATTTAAAAAAAAGAATCTGTTGGCCTGACCAA-TAT-AAATA
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATATGTT-TAC-GAACAAGT-TCAAATA
* * * * *
93964 GTTAT-AGCTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCATTTAT-ATCTTTTGTTTTGTCACAAAAC
191 GTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** ** * * * *
94027 ATTTGTTTCTATTTC-TACAACCTGATTCAAAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAA
254 AAATGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAA
* ** * * *
94090 AATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAACAAGTCCAAATAGTTGTGACTA
317 AA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * ** * * * *
94155 CTTGAATAATTACCTATTGCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-AATTTTCTA
377 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTG
* * * *
94219 TTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AAACAACTAAAAAG
441 TTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTCATTAATATTCTAAA-AATTAATAAG
* * **
94281 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATA
503 T--AAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * *
94316 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTATTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* *** * * *
94380 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAACTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * *
94445 TTC-AATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACATGTTCAAATAGTC
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * ** *
94509 ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTG
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * * * * *
94574 TAT-TAGTTCATATAAGCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
259 TTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * ** *
94638 TGAGTTAGAGATTTAAATTATGAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
323 T-A---AGAGATTTAAA-AATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * *
94703 CAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAACTAATTT-TGTTCATA
383 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTATTTCTGTTCATA
** * *
94766 CAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAACTT-ATTAATATTCCAAAAATCAAT-A--AA-A--
447 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AA-TTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATT
** * * * *
94823 -AAAATTAAATTTGTTTTCTAAAC
510 TAAAAAAAAATATGTTTACTGACC
* * * * * *
94846 ATATTCAAATAGTTATGACTGTTTGAAGAATTATCTATTTCAAATAGATATGACCATTTTTCTTT
1 A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC--TTTTATTT
* * * * * *
94911 TATCATAAATCAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
63 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
94976 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAGCAAGTTCATAT
128 TA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
95039 CA-TTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAAT
190 -AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
95103 AATTATTTCTATTCATACAAGTTTGTTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
254 AAATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * *
95166 ATTAATAGTTAGGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCATGCCCAT
318 ATTAATA---A-GAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
95231 TTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTG-TTTGTTATAAAAACAATTATGTCTCT
378 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTGT
* ** * * * *
95295 TCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AG
442 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * ** *
95358 ATTTAAAAACTAAATCTGTTTTCCAAAAC
507 ATTTAAAAA-AAAATATG-TTTACTGACC
* * * ** *
95387 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-GATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * *
95450 TATAAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
95515 TCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAGAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
95580 AGACTATTAGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGC
195 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG-
* * * * *
95645 TTT-TGTCCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAAT
259 TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
** * * *
95709 AAGAGATTTAATAAATAAATCAATTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATT
324 AAGAGATTTAA-AAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
95774 ATTTATTTCAAGTCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTAATACAATCT
388 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCT
* *
95839 TATTCAGAATAAAGTAATGCTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGTATTTAAAAA
453 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-G-ATTTAAAAA
**
95904 AAGAATATGTTGGCTTGACC
516 AA-AATATGTTTAC-TGACC
* * * * * *
95924 AGTACAAGTAGTTATAACTGTTTGAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * ** * ** * **
95989 CACAGAACAACTGTTTCTGTTTGTACAAGCTGATTCGGAATAACATAATTTTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
96054 TCAAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATCAAACAATTTCAAATAGTTA
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
96119 TGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTT
195 TGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * ** * *
96183 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATAGAAATTTATTAATA-TTCGACAATTAA
259 TTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
** * * *
96246 TAAGTAAAAGATTTTTAAA-AAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTCATAA-AGTTATGACTATTTAA
323 TAAG----AGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCA-AATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
96308 ATAATTATTTATTTCAAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCAT
382 ACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCAT
* * * * * *
96373 ACAAGCTTATTC-GGATTAAATAATATTAATTAATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAAA
446 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT--AAGA
* * * * *
96436 TTTTCAAAATAAATATTTTTACCGAACA
508 -TTTAAAAAAAAATATGTTTACTG-ACC
* * * * *
96464 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGGAGAATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * ** *
96529 CATAAAACAA-TGTATT-AGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATA
66 CATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
96592 TTCCAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTAAAATATGAATATGTTTACTGGACAAGTTCAAATGGT
130 TTCAAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
96656 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * ** ** * * * *
96721 GTTTATGTTCATACAAACTTATTTTGAATAAAATAAAATAAATTTATTACTATTTAAAAAATTAA
258 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * **
96786 TAAGCAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTGAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
323 TAAG---AGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
96850 CTATTATCTATTTCAAAT-AGCTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTTTGTTCATA
383 CAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATA
* * * * * *
96914 CAAG-TGTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATT
447 CAAGCT-TATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGA-T
** * * *
96978 TTAAAAGGTAAATCTATTTACTGAGCA
509 TTAAAA-AAAAATATGTTTACTGA-CC
* * * * * * * *
97005 AGTTCATATCGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
** * * * *
97070 CATAAAGTAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
97135 T-ATGAAAATTAATAGGCAGGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
131 TCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
97199 ATGTCCATTTAAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTG
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* ** * * * *
97264 TTTCTATTCATTCAAAATTATTTAGAATAAAA-ATATATTGATATATTAATATTTTAAAAATTAA
259 TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATA-ATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * *
97328 TAAGAGATTTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAAATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
323 TAAGAGA-TTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
97393 TTATCTATTTCAAATCGTTAT-ATC-TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAG
386 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
* ** * * * * *
97456 CTCATTTGGATTAAAATAATTCTAATTCAATAATATTCTAAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAA
451 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TA-AGATTT-AA
* * *
97521 AAAATAAATGTGTTTACCGAACT
513 AAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * * ** * * * * * *
97544 AATTCAAATAATTAAGACTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * *
97609 CATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
97674 TTAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGAT
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAG-T
* * *
97739 T-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * * * * * * *
97802 TGTTTC-AGTTTATAAAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTATATTTCAAAAA-T
257 TGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
97865 AAAAAGCAAGTGATTTAAAAACTAGAGT-TGTTTTCCAAACTAGTTTAAATAGTTATGAATATTT
321 AATAAG--A--GATTTAAAAA-TA-AATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * * **
97929 GAACAAATATCAATATGAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTAATCA
380 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCA
* ** * * * *
97993 TATAAGCCAATT-TGAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG--AGAT
445 TACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAT
* * * * *
98055 TTAAAAAATAAATGTATTTGCCGAATC
509 TTAAAAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * * ** *
98082 AGTTCAAA-A---AT-ACTATTAGAATAATTAT-TATTTTAAATCGCTCTGACCTTTGGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * ** * * *** *
98141 CATACAATAATTGTTTCAATTCAAACAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** ** * * * *
98206 TTGAAATTTTAATAAGTATGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
98271 ATGACTTTTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAATAATT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * * * * ** *
98335 GTAT-TAGTTCA-AAAAATCTTATCCA-AATAAAATAATACTGCTTTATTAATATTTCAAAAGTT
258 GTTTCTA-TTCATACAAGT-TTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** ** * *
98397 AATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCAATTTACTTAA-TCAGTTCAAATAATTATTG-CCATT
321 AATAAG----AGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTA-TGACTATT
* ** * * * * * ***
98460 TG---AA-TATATATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTCGTCTTAAAATAATTATTTTTCAAC
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTC
* * * ** *
98521 ATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATAGTAATTTGTTAATATT-TCAAGAATTAATAAG--AGA
444 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
98583 TTTAAAAAATATATCTATTTACCGAACT
508 TTTAAAAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * * * *
98611 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * ***
98676 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGCCATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * ** ** * *
98741 ACTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATATCCGTTTGTTGAACTAGTTC-AACAGTTA
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
98805 AGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
195 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGT
* * ** * * * *
98870 TT-TAGCTCATACAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAAGTAATTT-TTAATATTTCAAAATTTTAT
260 TTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAA--AT-T
* * * * * * * *
98933 AAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAATTCAAATAATCATTACTATTTGAAT
321 AA-TAAGAGATTTA-AAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * *
98998 AATTATCTATTTCAAATCATTCTTA-CTTTATGTTTTGTCAT--AA-AATGATTTTTGTTAATAT
384 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAC
* * * * * * *
99059 AAGTTTGTTCAAAAGAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATCAA-TATCAAAT
448 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTA-AAAATTAAT-AAGTA--AGAT
** * **
99122 TTACAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACC
509 TTA-AAAAAAAATATGTTTA-CTGACC
* * * * * * * * *
99148 ATTTCTAATAGTTTTGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACATTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * ** *** * *
99213 CATCAAACAATTGGTTT-TGCTCATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTAATAATA
66 CATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** *
99277 TTTC-AAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATGGT
130 -TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGT
* ** * ** *
99337 TAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTG---T-T--T----C--A-
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * * * *
99389 G------TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAATTAATATTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAA
258 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * *
99448 TAACAAAAAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATA
323 T------AA-GAGATTT--AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * *
99513 TGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATAACCATTTT-ACTTGTCATAAAATAATTGTTT-TAGT
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-GT
** * * * *
99576 TTGTACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTC-TTAATATTTTGAAAATTAATCAGTA
442 TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAA-TTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
* * **
99639 AGAGTTTAAACAAAATAAATTTGTTTATTGAATA
505 AGA-TTT-AA-AAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * * * *
99673 AATTCTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* ** * * * *
99738 CATAAAA-ACATTATTTCAATTCATATAAGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATA
66 CATAAAACA-ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * **
99802 TTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAA-ACTACTTACTGAACAAGTTTAAATAAC
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGT
* ** ** * * *
99866 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGGAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AGAT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * ** * **
99930 -TTCATCTTTTCATACAAGCTTATTTTGAATAAGATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGATAA
258 GTT--TCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA-A-AA
* * *
99992 TTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAATAAATCTATTCACCAAA-TAAGTTCAAATCA-TTATGAGTA
319 TTAATAAG----AGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAAT-AGTTATGACTA
* ** * * * *
100055 ATTGAAC----A---A---CAAATTGTTTTGA-C-TTTGTTTTGTCATTAAACAATTGTTTATGT
377 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGT
* * * *
100108 TCATACAAGCTTATT-TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTA
442 TCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-
* * **
100171 AAATATTTAAAAAAATTAATATATTTACTGAATA
504 -AAGATTTAAAAAAA--AATATGTTTACTG-ACC
* * * * * *** * * *
100205 ATTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATAACTGTGACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * * ** *
100270 AATAAAATAATT-TTTTTAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
100334 TTGC-AAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG
130 TT-CAAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
100398 TTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAAT
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * ** * * * *
100463 TGGTTCTATTCATCCAAGCTTATTTTGAAAAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTT
257 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * ** *
100528 ATAAGCAAAAATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CTTGAAC-ATGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
322 ATAAG---AGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
100591 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCATTTGTTTTATCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCA
381 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTTCTGTTCA
* ** * * * *
100655 TACGAA-CGTATTTGGAATAAAATAGTACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAG
445 TAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAG
* * *
100719 ATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-TGGAGCA
507 ATTTAAAAAA-AAATATGTTTACT-GA-CC
* * * * * * ** *
100748 AGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAATAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGGTCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * *** *
100813 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
100878 TCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTAA
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTA
* ** * * * * *
100943 T-ATCCATTTGAATTATCATCTATTTC-TAGCTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATA
195 TGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A
* ** * **
101006 CCAATTATTCAGAATAATTGGTATTCATACAAAATTATTCAAAATTAAAA-AATACCAATTTATT
253 -CAA--A-T--G--T--TT-CTATTCATACAAGTTTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATT
* * * *
101070 ACTATTTCAAAAATTAAT-AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAGTT
306 AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTT
*** ** * * * * * *
101134 AACCCTATGAGAATAATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTG
370 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * * * *
101199 TTTCAGTTCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT
435 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAAT
* * * * ** **
101264 TAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
500 AAGTAAG--ATTTAAAAAA-AAATATGTTTA-CTGACC
101302 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTTGTTATGACCTTTTATTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTA-TTTT
* * * * * * * *
101366 ATCTTAAAACAATTGTTT-TAGTGCATAAAAGCTTATCCAAAGTAAAATAATAGT-ACTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * **
101429 TATTTC-AAAAATTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAATAAAT-TAGTTTATTGAATTAGTTCAAAT
128 TA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTA-CGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * *
101491 AATTTTGGCCATCTAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAATA
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** ** * * * *
101556 ATTGTTTTTCA-TCATACGAGCCTATTTGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAAAA
255 AATGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * *
101620 TTAATAAGCAAGAAATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGAATATT
319 TTAATAAG--AG--AT-TTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * * *
101685 TGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAATAATTATTTTTGTTC
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTC
* * *
101750 ATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGT-AATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGA
444 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT-TCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-A
* * **
101814 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACC
506 GATTTAAAAAA-AAATATGTTT-ACTGACC
* * * * * * * *
101844 AGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCT-TGATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * * * *
101908 TCGTAAAACAATTCTTT-TAGTTCATATTAA-CTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTA
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * * *
101970 ATATTTC-AAAAATGAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAATTTTATTTATCGAACTAGTT-AGAT
127 ATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * *
102033 AATTATAACTATTTGAATAATTGTCTATTTTAAATCATTATTACC----------T--T-AAA-A
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** **
102084 AATGCTTT-TGTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA
255 AATG-TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
102148 TTAAGAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATT
319 TT---AA-TAAGAGATTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * * *
102213 TAAACAATTATTTACTTCACATCATGATGACCATTTGTTTTATCATAAAAGAATTATTACTATTC
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTC
* * * *
102278 ATA-TAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACG
444 ATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA--
** * ** *
102342 GATTTGAAAAATGAATTTGTTGGCCTAACC
506 GATTT-AAAAAAAAATATGTT-TACTGACC
* * * * * * * * *
102372 AGTGCAAATAATTATAATTGTTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * *
102437 C-TCAAAACAATTGCTTCTATTCGTACAAGCTTATCCAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATA
66 CAT-AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * **
102501 TTCCAAAAATTATTAAGTAAGAAATTTAAAAAAGAAATCCGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * ** *
102566 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAAGAGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCA-AAAACCAAT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAA
* * * ** * * *
102630 TGTTTTTGTTCATATAAGCGTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTA
257 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * *
102695 ATAAGTAAAAAGATTTTAAAA-AAATATGTTTACCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGA
322 ATAAG-----AGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
102759 ACAATT-TTTATTT-AGAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTCGTTAGAAAACAATTGTTTCTATTCA
382 ACAATTATCTATTTCA-AATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCA
* * * * *
102821 TACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATA-TAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
445 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-AGA
* * * *
102885 TTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATC
508 TTTAAAAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * ** * * * ** *
102913 A-TTCAAATAATTAAGACTATTAAAACAATTATTTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGCTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
** * * * * * * *
102977 TTTAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATAGTAATTTATTCACAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
103042 TTAAGAAATTTATGAGCAAAAGA--TAAAAAA-AAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAAATT
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAAT-AGTT
* * * * *
103104 -TGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTCATTATTG-CCATTT-TTTTGTCATAAAACAAT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * ** * * * * * **
103165 TATTTC-AGTTCATAAAAACTTA-TCTAAAATAAAATGATACTACTTTACTAATATTTTGAAAAT
257 TGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * *
103228 TAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTCC-AACTAGTTCAAATTA-TTATGATTATT
320 TAAT----AAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAA-TAGTTATGACTATT
* * * * * * *
103291 TGAACAAATATCAATCTCAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCT
379 TGAACAATTATCTATTTC-AA-AT-CA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT
* * * *
103355 GATCATACAAGCTTTTTCA-AATAAAAATAATATTAATTTAATT-ATATT-TCAAAAATTAATAA
440 GTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAA-TTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAA
* *
103417 G--AGATTT--AAAAAAATATGTTTACCGAATC
502 GTAAGATTTAAAAAAAAATATGTTTACTG-ACC
* * * * *
103446 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCT-TTTTGACCTTTTGTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTATTT-T
* * * * *
103510 -TCATACAATAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA-TGAATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * * *
103573 CATTTAAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAAGTAAATCTATTCACCGAACAAGTTTAAATA
128 TATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATA
* * * ** *
103634 GTTATGATTATTTGAATAATTATCT-TTCTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACC
191 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * *** *
103698 ATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTACTACGCTATTAATATTTCAAAAG
255 AATGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
** * * * *
103762 TTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTAAAATAGTTCAAATAATTAT-AGCCAT
319 TT-A-A--TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT
* * * * * * * * * ***
103826 TTGAACAACTACCTATTTTAAGTCATTATTACTTTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCAA
378 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTT
* *
103891 CATACAAGCTTATTCA-AATAAAAT-A-A-T-ATT-AAT-AT-TTC-AAGAATTAATAAG--AGA
443 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * **
103945 TTTAAAAAGTAAATATGTTTGCCAAACC
508 TTTAAAAA-AAAATATGTTT-ACTGACC
* * * *
103973 AGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATGTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * * * * * *
104038 CATAAAATAATTATTTTTGTTTACACAAACTTAGTCAAAATAAAATAATATTACTTTAGTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
104103 TCTACAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAGATAAATCTGTTTGCGAAACCAA-TTCAAACAGTT
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACG-AA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
104167 AAGACTATATGAACAATTATTTATTTCGAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * * * * *
104232 TTT-TAGCTCATACAAGCTTA-TC--CA-AAAAT-AT-TTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAA
259 TTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A
* ** * * *
104290 TACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGA
322 -A--TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
** * * * * **
104354 ACAACAACCTATTTCAAATCATTACT-ACTTTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTT-TGCAACA
382 ACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTG-TTCA
* * *
104417 TACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAGAATTAATAAG--AGA
445 TACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* *
104478 TTTAAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAACC
508 TTTAAAAAA--AAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * *
104507 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * * *
104572 CATAAAACAATTATTTCTGTTCAAATAGGCTTATTCAGAATAAAAGAATACTAATTTAGTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
104637 TCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAGCCAA-TTCAAATAGTT
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGA-ACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
104701 AAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA--
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * *** * *
104763 --T-TATT--T-C-AGCTTA-T-A-TAT-GCTTAATA-T--TTCA--AAAATTT-----A-TAAG
259 TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-
* * * * * * *
104806 CAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCGAAGTAGTTCAAAT-GATTATAACTATTTGAAAAA
323 TAAGAGATTTA-AAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * * *
104870 TTATCAATTTCAAACCATTATTA-CTAATTTATTAATAT-TTAGAA-AATTA-ATCAG-T--T-C
386 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCT--TTTGTT-TTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAC
* * * * * * * *
104927 GAG--AATT---AA-AAAGTAA-A-T--CT-ATT--TA--CCAAACCATT-TTAAAT-AG-TTT-
448 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAGATTTA
** ** * ** * *
104973 --TGACTATTTGAATACTTATCT
512 AAAAAAAATATGTTTACTGA-CC
* * * * **** * **
104994 ATTTCAAATAGTTATAACCTTTTATTTTGTCATCAA--A-C-AATTGGTTTTGTTGATAATATTT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-C---TA-TTTG--AACAATTATCTATTTCAAATTGTT-ATGACCTTT
* * * * * * * * * * * *
105055 TACTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAAAATT-TTGA-AA-CTTAATAACCAAGAAAATTA
58 TATTTTGTCATAAAACAAT--T-GTTT-CT---GTTCAT-ACAAGCTTATTCA-AAATAAAA-TA
* ** * * ** * * * * * *
105116 A-A-AAATAAATCTAATTGTTGAACCAGTTCA-AA-T---AG--TT-AAGACTATATGAATGATT
113 ATACTAATTTAT-TAA-TATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT--ATGTTT
* * * * * * *** * *
105171 ---ATCTATTTCAAATTGTTATGAC-ATTTTG-TC--TTGTC-ATAAAACAATTGTTTTG---TT
174 ACGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTT
* * * * * *
105225 TGTACAAGTTTAT-TCAGATTAAAATAATACTAATTTAGGAATAGTTCA-A-AAATTAATAAATA
237 T-T----GTTT-TGTC--A-TAAAACAA-A-T-GTTT----CTA-TTCATACAAGTT--T-ATTC
* ** * *** *
105287 AGAGATTTAAAA-AATA--AATTTGTTTACCGA-ATCAGATCAAATGGTTAAGA-CTATTAGAAC
282 AGA-A--TAAAATAATATTAATTT-ATTA-ATATTTCA-A--AAATTAATAAGAGAT-TTA-AA-
* * * ** ** * ** * ** *
105347 AAT-TATCTATTT--CAAA-TTGTTCTGA-CCTTTTGTTTAGTCAT-AA-AACAAT-TGTTTCAA
336 AATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA-T-TTGAACAATTATCTATTTCAA
* ** * * * * * * * * *
105404 TTCA-TACAAGC-----TTAT-TCAGAATA-AATTAATACTAATTTAT-TAA-C--ATTCA-AA-
399 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAGAAT
* * * *
105455 AAATTAATA--AA--AAAT-ATATT-TTAAAA--AAT---T---ATTT--------AT-TG---A
463 AAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAAAAATATGTTTA
*
105494 ---ACA
528 CTGACC
* * * * **
105497 AGTTTAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTT-AGAAGCT-TTAAAACCTTTTGA-TT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TTGTTATGACCTTTT-ATTT
* * * * *** * *
105559 TGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAACTTATTTTGAATTAAATAACA-TAAATTTATTA
63 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * *
105623 ATATT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTT--TAAA-AAATATGTTTACCAAACAAGTGCAAAT
127 ATATTCAA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAAT
* ** * * * *
105684 AGTTATGACTATCTGAGTAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * ** * * * *
105749 ATTGTTTTTGTTTATACAAACTTATTCAGATTAAAATAATTTTTATTTATTACTATTTTGACAAT
255 AATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTT--CAA-
* * * * *** * * *
105814 TAATGAATAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATACTCATGACTATTT
316 AAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
105879 GAATAATAATCTATTTCAAATCATTATGACCCTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAT-TTC
380 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-TGTTC
* * * * *
105943 AT-CTAAGCCTATT-TGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAAATAATGAGTAA
444 ATAC-AAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-A
* * * *
106005 GAGAATTAAAAAAGAATATGTTTACTAAACA
505 -AGATTTAAAAAAAAATATGTTTACT-GACC
* * *** * **
106036 AGTTCAAATAGTTATGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTCAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* ** * *
106101 CTTAAAACAACCAG-TTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
66 CATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * ** *
106163 TATTGC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATATTTTCTTAACTTGTTCGAATA
128 TATT-CAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATA
* *
106226 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTA
191 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-A
* * * * * *
106290 ATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTC-GTAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAG
255 AATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * * *
106354 TTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATATATC-GAGTGAGTTCAAATAATTATAACTAT
319 TTAATAAG----AG-ATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
106418 TTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATT
378 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTT
* * ** * * **
106483 CATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT--TA-TATAAGAAACTTAATGGGTTG
443 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAA-AAA-TTAATAAG-T-
* * * * * *
106545 AAGACTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACA
504 AAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * ** * * *
106577 AGTTCAAATAGTCATGTCAATTTGAACTATTACCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTATTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
** * * **
106642 TGTAAAAAAATTGTTT-TATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTTCATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATA
* * * * *
106705 TTTC-AAAAA-T--TAA--AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATTA-
130 -TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAA-TAG
* * * ** *
106763 TTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGTTC-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * * * * ** * *
106827 TATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTCAAATTAA
257 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAA--AA
* * * * * ** * * **
106892 -TAAGTAATACATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAA
319 TTAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * *
106956 ACAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTAGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATA
382 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATA
* * ** * *
107021 CATGCTTATTC-GAAATAAAATAGTACT-ATTTTTTAACATT-TAGAAAATTAATAAGCAAGAAA
447 CAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAG--A
* ** *
107083 TTTAAGAAAATAAATATGTTAACCAAACA
508 TTTAA-AAAA-AAATATGTTTA-CTGACC
* * * * * ** * *
107112 AATTCAAATAGCTATGCCTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATTG-CCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TGACCTTTTATTTTG
* * * * * * * * * *
107176 TAAAAAAATAATTGTTT-TAGTACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATGATATTACTTTA-TAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * *
107239 ATTTC-AAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTATCAAATC-AGTTCAAAT
129 A-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * *
107301 AATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACA
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** * **
107366 ATTGTTTTTCA-TCATATAAGCATATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTTATATTTTGAAAA
255 AATGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
107430 TTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAACAAACTAGATCAAATAATTAT-ACTATT
319 TTAA-TA--A-GAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * * * *
107494 TAAATAATTATATATTTCAATTCGTTATAACCTATTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTT
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTC
* * * * * *
107559 ATACAAGCCTATTC-GAAATAAAATAATACTAA-TCTAATAATATTATGAAAACTAATAACTAAG
444 ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTC-ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
107622 ATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAATC
507 --ATTTAAAAAA-AAATATGTTTACT-GACC
* ** * * * *
107653 AGCTT-AAATAGTTAAGGTTGTATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATCTTG
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
** * * * * * * * * *
107717 TTGTAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCATAA-CAAATAATATTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*** * * *
107781 TTTTGAAAATT-AT---TAAGAGATTTAAAATATAAATATGTTTACTAA-ATCAGTTCAATTAGT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACA--AGTTCAAATAGT
* * * * * ** * *
107841 TAT-AGTAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATT-TGACCATTTGTTTCATCATAAAATAAT
193 TATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * * **
107904 TGTTTTTATTGATAC-ATTCTTATTC-GAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAA
257 TGTTTCTATTCATACAAGT-TTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* ** *** * * * * *
107966 TTAATAAGTAATAGATTTAAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACTAATGCAAATAGTTATAATTGT
319 TTAATAAG----AGATTT--AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * * * * *
108031 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAAAAATTGTTTTTGTT
378 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTT
* * *
108096 TATACAAGCTTATTCAGAATAACATAATTA-TAATTGATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA
443 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-A
** * * * *
108159 GAGATTTAAAAACTGAATCTATTTATTGAACA
505 -AGATTTAAAAA-AAAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * ** * * *
108191 AGTTTAAATAGTTATGACTAATTGAATAATTACCTTTTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * * * *
108256 CATAAAATAATTTTTTCTATTAATACAAGCTTATTTC-AATTAAAGTAATACAAATTTAATAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
*** * * * * *
108320 TTCAGGCAATTATATTAA-TAA-AAATCTAAAAAATAACTATGTTTACCGAATAAATTCAAATAG
130 TTCAAAAAATTA-A-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
108383 TTATGACTACTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCCTAAAACAAT
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * * *
108448 TGTTT-TGGTTCATATAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTCAACAAT
257 TGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
108511 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAA-TAAGTTTAAATAATCATAACTATT
320 TAATAAG----AGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
108575 TGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATATT-AGTT
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTCTGTT
* * * * *
108639 CATATAGGCTTATTC-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAG
443 CATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A-
* * * * *
108703 AGATTTAAAAAATAAATTTATTAACCGAACA
505 AGATTTAAAAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
**
108734 AGTTCAAATAGTTATGA-TATTTTG---TTTTATC-A--T-AAA-----AT-A------A--TTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * **
108777 -----------TT---TCTATTCATAAAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAAAAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* **
108827 ATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACA-TTCAAATA
129 ATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATG-TTTACGAACA-AGTTCAAATA
* * * * * ** *
108889 GTT-TGACTATTTAAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTGTCATAAAA-TA
191 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
108952 ATAGTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAA
256 AT-GTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
109016 TTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACGT-GTTCAAATAGTTATGACTATT
319 TTAATAAG--AGA-TTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
109080 TGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAACCAATTGTTTCTATT
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTT
* * * *
109144 CATAAAAG-TGTATTCAAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAATATT-TCAAAAATT-ATAAAGTA
443 CATACAAGCT-TATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAAT-AAGT-
* * * *
109205 AAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAGCA
504 -AAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTACTGA-CC
* * * ** * * *
109238 AGTTTAAATAGTTATG-CTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
*** * * * ***
109302 TTGCAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTATTGGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
109367 TTCTAAAAATTAA-AAGGT-AGAAGACTTAAAGAATACAT-TAGTTTACCGAATAAGTTCAAATA
130 TTCAAAAAATTAATAA-GTAAG-AGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTA-CGAACAAGTTCAAATA
* * * * * * *
109429 GTCATGTCCATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA
191 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * *
109494 TTGTTTCTATTCTTGCAAAATTATTCAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
256 ATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * *
109559 AATAAGGGAATTAAAAACTAAATCTATTTAACGAAAC-AATTTAAATAGTTATTACCATTTGAAC
321 AATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTT-ACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** * * * * *
109623 AATTATATATCTCAAATCGCTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCAAACA
384 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACA
* * * * *
109687 AGGTTATTCTA-ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG--AGATTT--
449 AGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAA
* *
109747 AAAAAAATGTGTTTGCTGAACC
513 AAAAAAATATGTTTACTG-ACC
* * * * *
109769 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * *
109834 CATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGATAAA-AAAA-AATACTAATTTAATAA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TT-CA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
109897 TATTCCAAAAATTAGT--G-AA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCGAATCAA-TTCAAATA
128 TATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACGAA-CAAGTTCAAATA
* * * * ** * * * * *
109957 GTTAAGACTA-TAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCCGACCTTTTATTTAGTCCTATAATAA
191 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** * *
110021 GTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATGAAAAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAACA-TTCTAAA
256 ATGTTTCTA-TTCATACAAGTTTAT-TCAGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTC-AAA
* * ** *
110083 AATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAGATAAATTTGTTTACTGAAC-AGGTTCAAAGAGTTATGACT
317 AATTAAT----AAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
* * * ** *
110147 ATTTGAACAATTAT-TGATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTCAT-AAATGATTGTTT-T
376 ATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT
* * * * ** * * *
110209 AGTTCAT-CAAAGCTTATCCAAAAGAAAATAATACTATTTTGTTATTGTT-TCAAAAGTTAATAA
440 -GTTCATAC-AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAA
* **
110272 GTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAATTTACTGAATA
502 GT-A-AGATTTAAAAAA-AAATAT-GTTTACTG-ACC
* * * * * *
110308 AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * *** * * *
110373 CATAAAACAATTTTTTTTCAACATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAGTACTAATTTACTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * *
110438 TTC-AAAAATTAATAAG--AG-G-TTTAAAAAA-AACCTA--TTTACCAAACCAGTTCAAATAGT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
110495 TATAACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATAATAAAACAATT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* ** * * *
110560 GTTTCTATTTATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACACT-A---ATT--TA-GT----AA-T-A
258 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* ** * * * * * *
110612 T--GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGGCAAACCAATTCAAACAATTAAGACTATATGAACAAT
323 TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * *
110675 TAAT-TATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAG
387 T-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
** * * * * * *
110739 CTTATTTGGAATAGAGTAAGACTAATTTATTAACATT-TCAAAAATTTATAA--AAGATTTAGAA
451 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGATTTA-AA
* * * **
110801 AATAATTATATTTACCAAACC
514 AAAAAATATGTTTA-CTGACC
* * ** *
110822 AGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-TCCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * * * *
110886 CATAAAACAATTGTTTTTGGTAATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
110951 TTAAAAAATTAATCAGTAAAAGATCTAAAAAGTAAA-ACTGTTTACCAATCTATTTCAAATAGTT
131 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
111015 TTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTCTTTTGTCATCAAACAATTG
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * * * ** * * *
111080 GTTCTATTCATACTATTTTTTTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAAT
259 TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * ** ** * * * *
111145 AACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACTACTTCAAATAGTCAAGA-TAATATG--
324 ----AAG-AGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAA
* * * *
111207 --A--A--T-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATCAAACCATTGTTT-TTTATCATA
383 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGT-TCATA
* * * *
111264 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGCAAGAGAT
447 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TA-AGAT
* * * *
111328 TTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACT
509 TTAAAAAA-AAATATGTTTACTG-ACC
* * * * * * *
111355 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTGTCAATTTC-AATTCGTTAAGATC-TTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTATGACCTTTTATTTTG
* * **** *
111418 TCATAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** * *
111482 ATTTC-AAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAACATACTTGCCAAACTAGTTCAAATAG
129 A-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * * * * * * *
111546 TT-TAAACTATTAGAATAATTATATATTTTAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTTAGAAAATAT
192 TTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** *** *
111610 TTATTTC-ATATC-TAACAA-TCTTATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACA-TTCAAAA
256 ATGTTTCTAT-TCAT-ACAAGT-TTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * * * *
111671 AATTAATAAGGAAAAGATTTGAAGAATTAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATGGTGATGACT
317 AATTAATAA-G---AGATTT-AA-AAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
111736 ATTT-AACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACATTTTGTTTT-TATATAAAATAATTGTTTCA
376 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTATTTCT
* * * ** **
111799 GTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATT-TCAAAAATTAATAACC
440 GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT
* ** *
111863 AAGAGTTAAAAAAATAA-ATTAGTTTATCAAACA
504 AAGATTTAAAAAAA-AATA-T-GTTTA-CTGACC
* ** * * ** *
111896 AATTCAAATAGTTACAACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTATTTTG
* *
111961 TCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
112026 TTCCAAAAATTAATAAGT----GATATAAAAAGTGAATTTGTTTACCAA-ATCAGTTCAAATAAT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACA--AGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
112086 CATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTT-TATTTGGTCATATAACAA
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTT-GTCATAAAACAA
* * * ** * * * *
112150 TTGTTTTTTATT-ATAGAACATTATTC-GAAATAAAATAACAGTAAATTATTAATCTTTCAAAAA
256 ATG-TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
112213 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTTAACTAGTTATAACTATT
319 -T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
112278 TGAACAACTGTATATTTCTAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTC
379 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTC
* * * * * *
112343 AAACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAA--CATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTGA
444 ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTCAT--TAATATTCTAAAAATTAATAAGT-A
* * ** *
112405 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACT
505 -AGATTTAAAAAA-AAATATGTTT-ACTGACC
* * ** * *
112437 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACCGTTATCTTATTT-AAA---TCAT----TTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * ** ** * * *
112494 TCATAAAACAGTTTTTTCAATAGATACTAGCTTATTTC-AAATAAAATAA-AATGAATTTATTCA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * * *
112557 TATT-AAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTCTGTTTACCTAACGAGTTCAAATAA
128 TATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAG
* * ** * * *
112621 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGCTAAAACCTTCTGTTTTATCGTAAAACAAA
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAA
* * * *
112686 TGTTTTTGA-TCATACAAGTTTGTT-TGAAGTAAAATAATACTT-ATCTATTAATATTTCAAAAA
257 TGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAGAA-TAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * **
112748 TTAATAAGAGATTTACAAAATAAA-CTTGTTTATCATACCGGTTCAAATAGTTATGACTATTT-A
319 TTAATAAGAGATTTA-AAAATAAATC-TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** * * * * * *
112811 TGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAA-TAGTTTCTATTCA
382 -ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTGTTCA
* * * * * * ** *
112875 TACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATGAGAAAAAAA
445 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAAT-A-AGTAAGA
* * * *
112940 TCTTAAAAATAAATATGCTTACCGAACT
508 T-TTAAAAAAAAATATGTTTACTG-ACC
* * * * ** * *
112968 AGATGAAATAGTCATGACTATTTCAATC-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * *** * * * * * *
113032 TCGTAAAAAAATCACTTCTGTTCTTATAAGCTTATTCAAAGTAAAATAATACTAAGTTATTGACA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * * *
113097 TTTTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAGATGAATTTGGTTAACGAACAAGTTTAAATAATT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * ** * *
113162 ATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTGAAATCGCTATAACC-TTTGTTTTGTCGTAAAATGATTT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * * * *
113226 TTTTTATTTATACAAGCTTATTTC-CAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATT
259 TTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATT
* * * * *
113288 AATACGTAAAAGATCTAAAACTAAATTTGTTT---AAA--A--TC---T--TTATGATTATTTGA
321 -A-A--TAAGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* ** ** * * *
113341 ACAAGTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTACCATAAAATAATTGTTTCTATTCATA
382 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATA
* * * * *
113406 CAAGCTTATTCGGATTAAAACAATATTAATTTATTAATATT-TCAACAAA-TAATAAGTAAAAGA
447 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AA-AAATTAATAAGT--AAGA
* * *
113469 TTTAAAAAATAAATAAGTTTA-TCAAAC
508 TTTAAAAAA-AAATATGTTTACT-GACC
* * * * * ** * *
113496 AGATTCAAATAGTCATGAATATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATAATGACCTTTTGTTTTG
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * * * * * ** * *
113561 TAATAAAATAATTGTTTCAGTT-GTATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTGATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
113625 TTCTAAAAATTAATGAGTATGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTGCTGAACATGTTCAAATAGTT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
113690 ATGACTATCTGACCAATTATCTACTTCAAAACATTATGA-CTTTTCGCTTTATCATAAAACAATT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAAAT
* * * * * *
113754 GGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCCAAAATTA
258 GTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * *
113818 ATAAGTAAAAATTTAAAAATAAATATATTTTCTAAA-TACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
322 ATAAG---AGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * ** * * * * *
113882 TAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAA
383 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAC
** * * * *
113947 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATCCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
448 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAGATTT
* * * *
114012 AAAAAATGAATCTATTTA-TCGAGCG
511 AAAAAA-AAATATGTTTACT-GA-CC
** * * * ** * *
114037 AGTTCAAATAGTTATGACCCTATGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-TTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
** * * * * * *
114101 CATAAAACAATTGTTTCCATTCAAATAA-TTTCATTCGAAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** *
114165 TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACACTTTCAAATAGTC
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * ** * ** *
114230 ATGTCTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTCGTTGTAAAACAATTG
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * ** * *
114295 CTTCTATTAATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
259 TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
114360 AAAAGATTTAAAAATTAAATTTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-ATAT
324 AAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-AT
* * *
114424 TATCTATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTAATAGATCTGTTT
387 TATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA----TT-AT--TTCTGTTC
* ** * *
114487 ACTGAACAAGTTTAAATATTCATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTATAATAAATATGACCTT
444 A-T--ACAAG-CT---TATTCA-GA--A-TAAAATAA-TA-CTAATTCAT--T-AATAT--TC-T
***** * * * *** * * **
114551 TTGCTTTATTTTAA--AACAATTAGTAAGTTAAATTTGTTTGTCAAACC
490 AAAAATTA--ATAAGTAAGATTTA--AAAAAAAATATGTTT-ACTGACC
* * * * * ** *
114598 AATT-AAAGTAATTAAAGACTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACC-TTTGTTTT
1 AGTTCAAA-TAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTT
* * * * * * **
114661 GTCATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTCA-ACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAGGAATTTATT
64 GTCATAAAACAA-TTGTTTCTG--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * * *
114725 AATGTTTC-AAAAACTAATAAGTAAGAGATTTATAAAACAATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAA
126 AAT-ATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAA
* * * *
114789 TAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACGTTATGTCCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
189 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * *
114854 AAATGCTTT-TGTTCATATAAGTTTGTTC-GAAATAAAGTAATACTAATCTATTGATATTTCAAA
254 AAATG-TTTCTATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
* * *
114917 AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
317 AATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * * *
114982 AGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCGGTTCAT
381 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCAT
** ** * * * * * *
115047 ACAAGCTTATTTGGGTTAAAATAATACTCATTTATTAATATT-TCGACAATTAATAAATAAAAAA
446 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT--AAGA
* * ** *
115111 TTTAAAAAGTAAATATGGTTACCAAACT
508 TTTAAAAA-AAAATATGTTTA-CTGACC
* * * * ** ** *
115139 AGATCAAATAGTCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACAATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * ** * * *
115204 CATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATATTACTAAGTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
115269 T-ATGAAAACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAGCAAGTTTAAATAATT
131 TCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * **
115333 TTGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCTTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TGAT
194 ATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
* * * * **
115396 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGATAAT
258 GTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA-A-AAT
* * * * * * **
115458 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CGAACAAGTTTAATTCTTTATGACTATTT
320 TAATAAG----AGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * ** * * *
115522 GAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCT-ATCA
380 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCA
* * * * * * *
115585 TGCATGCTTATTCTA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTGGAAG
445 TACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT--AAG
* * *
115649 ATTTATAAAATAAATA-GATTT-TTCGAACA
507 ATTTA-AAAAAAAATATG-TTTACT-G-ACC
* * * * ** * *
115678 AGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * **
115743 AATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * * *
115807 TTCCAAAAATTAATGAGAAAGAAAATTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAATATGTTCAAATAATT
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * **
115872 ATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACATTTG
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
* * ** * * * *
115937 GTTCTGTTCATGTAAGCTTATTTC-GAATAAAAT--TATAAATTTATTCACATTTCAAAAATTAA
259 TTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * ***
115999 TAAGTAAAAATTTAAAAATAAATATATTTTTTTAACACT--TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
323 TAAG---AGATTTAAAAATAAATCT-GTTTACCAA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
116062 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTCCTATTCATAA
383 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAC
* * *
116127 AACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATT-ATTTAA-ATT-AAAAAAGTTAAGTAA--AAGAT
448 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTCA-TTAATATTCTAAAAA-TTAA-TAAGTAAGAT
* * * * *
116187 GTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCA
509 TTAAAAAA-AAATATGTTTACTGA-CC
* ** * * *
116214 AGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTAT-TCATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * * * * ** *
116278 TCTTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTGTTTGAAAT---AGAA-A--AA---ATTAAT-
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * *
116333 TT------ATTAATAAGTTGGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTCACCGAACAAGGTCAAATAGTC
130 TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * ** * *
116391 ATGTCCATTTAAACTATTATCTATTTCAAA-CAGTTATGATATTTTGTTTTGTCATCAAACAATT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
116455 GTTTCTATTCATACGAAAG-TTATTCAGAATAAAA-AATA
258 GTTTCTATTCATAC--AAGTTTATTCAGAATAAAATAATA
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AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACAAGTTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTT
TCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
GAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTAT
TCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAAAAAT
ATGTTTACTGACC
Found at i:98636 original size:18 final size:17
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 3.1 Consensus size: 17
98598 TATTTACCGA
98608 ACTAGTTTAAATAGTTAT
1 ACTA-TTTAAATAGTTAT
*
98626 GACTATTTAAATAATTAT
1 -ACTATTTAAATAGTTAT
*
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1 ACTATTT-AAATAGTTAT
98661 A
1 A
98662 ACCCTTTGTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (17 bp):
ACTATTTAAATAGTTAT
Found at i:103553 original size:534 final size:526
Alignment explanation
Indices: 93697--104764 Score: 3572
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93687 ATTTTGTTTG
* * *
93697 AAATCAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAATAAATTTGT
1 AAATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AAATAAATATGT
* ** * * * * * * * * *
93762 TTACTAAACCAATTTAATTAGTTATA-ACAATTCGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA-C
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* *** * * ** * *** * *
93825 TAGTTGTTT-TATCATAATGCAATTGTTTCTA-TTAATACAATTTTATTTGGAATAAACTAATGC
127 T-TTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAAT-A
* * * * **
93888 TAATTTATTAATATTCT-AAAAGTTAGTAAGTAACAGATTTAAAAAAAAGAATCTGTTGGCCTGA
189 TAATTTATTAACATT-TAAAAATTTA-TGAG-AAAAGA--T-AAAAAAA-AATCTGTT-TACTGA
* * * *
93952 CCAA-TATAAATAGTTAT-AGCTATTTAAACAATTATCTATTTTAAA-TCATTTAT-ATCTTTTG
246 ACAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTAAATAATTATCTA-TTTAAAGT-A-TTATGACCTTTTG
* * * * * * * * *
94013 TTTTGTCACAAAACATTTGTTTCTATTTC-TACAACCTGAT-TCAAAATAACATAATTCTAATTT
307 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAAT-ATACTACTTT
** * ** * *
94076 ATTAATATTCCAAAAATTAATAA-ATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTAAACAAGTCC
369 ATTAATATTTTAAAAATTAATAAGA-AAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAA-TAGTTC
* * * * * * * * *
94140 AAA-TAGTTGTGACTACTTGAATAATTACCTATTGCAA-AT-T-GTTATAACCTTTTGTTTTGTC
431 AAATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTATT-AAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTC
* *
94201 ATAAAATAAAAT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC
493 ATAAAA-CAATTGTTTCTA-TCATACAAGCTT-TTTC
* * * *
94237 AATTAAAATAATATAAATTTATTA-ATATTCAAACAACTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATAT-AATTTAATATAT-TTCAAA-AA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAA
* * * * * * * **
94301 TTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTTAAATCGTTAT
58 TATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * * * ** * *** *
94365 GACTTTTTGTAT-TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAAT
123 GACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * *
94429 ATTAACTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAA
188 A-TAATTTATTAACATTT-AAAAATTTATGAG-AAAAGA--TAAAAAA-AAATCTGTTTACTGAA
* * * * * *
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247 CAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGT-ATTATGACCTTTTGTTT
** * * *
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310 TGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTAT-CTAAAATAAAAT-ATACTACTTTATTA
* * ** * * * *
94622 ATATTTCAAAAATTAATGAGTTAGAGATTTAAATTATGAATCTATTTACTGAACA-AGTTCAAA-
373 ATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAA-AATAAATCTGTTTAC-CAA-ATAGTTCAAAT
* ** * **
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435 TA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTATTAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAA
* * *
94747 ATAACTAAT-TTTGT-TCATACAAGCTTATTTT
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* * * * * * *
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1 AAATAAAATAATAT-AATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATATGTT
* * * * * * * * *
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64 TGCCGAATCA-GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACC
* * * * *
94901 ATTTT-TCTTTTATCAT-AAATCAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAAT
127 -TTTTGT-TTATATCATAAAAT-AATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAAT
* * * *
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188 A-TAATTTATTAACATTT-AAAAATTTATGAG-AAAAGA---TAAAAAA-AAATCTGTTTACT-G
* * * * * * * *
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245 AACAAGTTTAAAT-AGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTA-TTATGACCTTTTG
* * * * * * * *
95089 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTGT-TCAGAATAAAATAAACTAATTTA
307 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATATACTACTTTA
* * * * * *
95152 TTAATATTCTAAAAATTAAT-AGTTAGGTGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCA
370 TTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAA-TAGTTCA
* * * * * * *
95216 AA-TAGTCATGCCCATTTGAACAATTATCTATTTGAA-AT-CA-TTATGACTTTTTGTTTGT-T-
432 AATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTA-TTAAATATATAGTTATGA-TCTTTGTTT-TCTC
* * **
95275 ATAAAAACAATTATGTCTCT-TCATGCAAAATTATTT-
493 AT-AAAACAA-T-TGTTTCTATCATACAAGCTT-TTTC
* ** *
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1 A-AATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATATG
* * * * * * * * * *
95376 TTTTCCAAAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-GATCTCAAATCATTATGATC
62 TTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * ** * * *
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127 TTT-TGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA-T
* * * * * * * * * *
95502 AATTTAATAATATTCCAAAAA-TTAGTAAGTAAGAGATTTAAGAAATAAATGTGTTTGCTAAACC
190 AATTTATTAACATT-TAAAAATTTA-TGAG-AAAAGA--TAA-AAAAAAATCTGTTTACTGAACA
* * * * *
95566 AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAAAAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTATTTT
249 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTATCTATTT-AAAGT-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
95629 GTCATAAAACAAATGCTTTT-GTCCATATAAGTTTGT-TCAGAATAAAATAATATTAATTTGTTA
311 GTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAAT-ATACTACTTTATTA
* **
95692 ATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAATAAATAAATCAATTTACCAAACTAGTTC-AATT
373 ATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAA-AAATAAATCTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATT
* * * * * * * * *
95752 AGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAA-GT-CA-TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAA
436 A-TTATGACTATTTGAACAAATATCTA-TTAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAA
* * * *
95814 ACAATTATTTCTATTAATACAATCTTATTC
498 ACAATTGTTTCTA-TCATACAAGCTTTTTC
* * * * *
95844 AGAATAAAGTAATGCTAATTCATTA-ATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGTATTTAAAAAAAGA
1 A-AATAAAATAAT-ATAATTTAATATAT-TTC-AAAAATTAATAAG--A-G-ATTTAAAAATA-A
* * * * * * * * * *
95908 ATATGTTGGCTTG-ACCAGTACAAGTAGTTATA-ACTGTTTGAATAATTAGCTATTTCAAATTGT
57 ATATGTTTGC-CGAATCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTAT
* * * * * * * * ** * * ** *
95971 TATGACCTTTTATTT-TGTCACAGAACAACTGTTTCTGTTTGTACAAGCTGATTCGGAATAACAT
120 TATGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAAT
* * * * * * **
96035 AATTTTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTA-T
185 AA-TATAATTTATTAACATT-TAAAAATTTATGAG-AAAAGA--TAAAAA-AAAATCTGTTTACT
* * * ** *
96099 CAAACAA-TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTGAAA-TCGCTATAACCTT
244 -GAACAAGTTT-AAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATC-TATTT-AAAGT-ATTATGACCTT
* * * * * * * ** *
96161 TTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATAGAAAT
304 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACT
** * ** * *
96225 TTATTAATA-TTCGACAATTAATAAGTAAA-AGATTTTTAAA-AAATTTGTTTACCGAATAAGTT
367 TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAAT-AGTT
* * * * *
96287 CATAA--AGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAA-AT-TA-TTATGACTTTTTGTTTT
430 CA-AATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTA-TT-AAATATATAGTTATGA-TCTTTGTTTT
* * * * * *
96347 GTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC
490 CTCATAAAACAATTGTTTCT-ATCATACAAGCTTTTTC
** * * * *
96385 GGATTAAATAATATTAA-TTAATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTCAAAATAAA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTAA-T-ATATTTCAAAAATTAATAAG----AGA-TTTAAAAATAAA
* * * * * * *
96449 TATTTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGGAGAATTATCTATTTCAAATTGTT
58 TATGTTTGCCGAATC-AGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATT
* * * * * * * **
96512 ATGGCCTTTTATTT-TGTCATAAAACAATGTA-TT-AGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAAT
121 ATGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAAT-TATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAAT
* * * * ** *
96574 AATACTAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATGA-ATAAGAGATTTAAAATATGAATATGTTTAC
185 AATA-TAATTTATTAACATT-TAAAAATTTATGAGA-AA-AGA--TAAAA-AAAAATCTGTTTAC
* * * * *
96638 TGGACAAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAA-TCATTATGACCTTTT
243 TGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTA-TTTAAAGT-ATTATGACCTTTT
* * * ** * * *
96702 GTTGTGTCATAAAATAATTG-TTTATGTTCATACAAA-CTTATTTTGAATAAAATAAAATAAATT
306 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATA-AAAGCTTATCTAAAATAAAATATACT-ACTT
* * * * *
96765 TATTACTATTTAAAAAATTAATAAGCAAA-A-ATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTGAACAT-GT
368 TATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTAC-CAA-ATAGT
* * ** * ** *
96827 TCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACTATTATCTATTTCA-A-ATAGCTATGGCCTTTTGTTTTGT
429 TCAAATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTATTAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCT
* * * *
96889 CATAAATCAATTGTTTTTGTTCATACAAG-TGTATTC
492 CATAAAACAATTGTTTCT-ATCATACAAGCT-TTTTC
* * * * *
96925 AAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAGGTAAA
1 -AAATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAA-ATAAA
* * * * * * * * * * * *
96990 TCTATTTACTG-AGCAAGTTCATATCGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TAGTT
58 TATGTTTGCCGAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TT
* * * * *
97053 ATGATCTTTTGTTT-TGTCATAAAGTAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAAT
121 ATGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAAT
* * * * ** *
97116 AATACTATTTTATTAATATTATGAAAATTAAT-AGGCAGGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTAC
185 AATA-TAATTTATTAACATT-TAAAAATTTATGA-G-AAAAGA--TAAAAAA-AAATCTGTTTAC
* * * * * *
97180 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTAAACAATTATCTATTTGAAA-TCATTATGACTTTTT
243 TGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGT-ATTATGACCTTTT
* * * * *
97244 GTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATTCAAAA--TTATTTAGAATAAAAATATATTGA-
306 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCA-T-AAAAGCTTATCTAAAAT-AAAATATACT-AC
* *
97305 TATATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAAATAGT
366 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACC-AAATAGT
* * * ** * * * *
97367 TCAAA-TAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-A-ATCGTTAT-ATCTTTATTTTGTT
429 TCAAATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTATTAAATATATAGTTATGATCTTTGTTTTCTC
* * *
97428 ATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTCATTTG
493 ATAAAACAATTGTTTC-TATCATACAAGCT-TTTTC
* * * * *
97464 GATTAAAATAATTCTAATTCAATA-ATATTCTAAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAA
1 AAATAAAATAA-TATAATTTAATATAT-TTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT--AAAAATAA
* * * * * * *
97528 ATGTGTTTACCGAA-CTAATTCAAATAATTAAGACTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT
57 ATATGTTTGCCGAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATT
* * * * * * *
97592 CTAACTTTTTGTTTA-GTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATA
121 ATGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATA
* * * *
97656 ATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTATTTACC
186 ATA-TAATTTATTAACATTT-AAAAATTTATGAG-AAAAGA--TA-AAAAA-AAATCTGTTTACT
* * *
97721 GAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAGTTGTTATGACCTTTTG
244 GAACAAGTTTAAATAG-TTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAG-TATTATGACCTTTTG
* * ** * *
97785 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTT
307 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTTTAT
* * * * * * * *
97850 TTATATTTCAAAAA-TAAAAAGCAAGTGATTTAAAAACTAGAGT-TGTTTTCCAAACTAGTTTAA
371 TAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAA-TA-AATCTGTTTACCAAA-TAGTTCAA
* * * *
97913 A-TAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAATATGAA-AT-CA-TTATGATCTTTGTTTTCTCATA
433 ATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTAT-TAAATATATAGTTATGATCTTTGTTTTCTCATA
* * **
97974 AAACAATTGTTTTTAATCATATAAGCCAATTT-
496 AAACAATTGTTTCT-ATCATACAAG-CTTTTTC
* * * *
98006 GAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTA
1 AAAT-AAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATATG
* * * *** *
98071 TTTGCCGAATCAGTTC-AA-A---AATACTATTAGAATAATTAT-TATTTTAAATCGCTCTGACC
62 TTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * * * * ** ***
98130 TTTGGTTTA-GTCATACAATAATTGTTTCAATTCAAACAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTA
127 TTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA-TA
* * * * ** * *
98194 ATTTATTAAAATTTGAAATTTTAATAAGTATGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAA
191 ATTTATTAACATTTAAAAATTT-ATGAG-AAAAGA--T-AAAAAA-AAATCTGTTTACTGAACAA
* * * * *
98259 GTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA-CTATTTGTTTTGT
250 GTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAGT-ATTATGACCT-TTTGTTTTGT
* * * * * *
98323 CATAAAATAATTGTATTAGTTCAAAAAATCTTATC-CAAATAAAATAATACTGCTTTATTAATAT
313 CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTTTATTAATAT
* * * ** ** *
98387 TTCAAAAGTTAATAAGTAAA-ATATTTAAAAAATAAATCAATTTACTTAATCAGTTCAAATAATT
377 TTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAT-AGTTCAAATTATT
* * * * * * * *
98451 ATTG-CCATTTG-A-ATATATAT-TTCAA-AT-T-GTTATTACCTTT-TGTTTCGTCTTAAAATA
439 A-TGACTATTTGAACAAATATCTATTAAATATATAGTTATGATCTTTGT-TTTC-TCATAAAACA
* * *
98508 ATTATTTTTCAACATACAAGCTTTTTC
501 ATTGTTTCT-ATCATACAAGCTTTTTC
** * * * *
98535 AAAATAAAATAATAGTAATTTGTTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATATATCTA
1 -AAATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATATG
* * * * * *
98600 TTTACCGAA-CTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA
62 TTTGCCGAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * *
98663 CCCTTTG-TTCTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
125 CCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA
*** * * * * * * * * * **
98726 CTAATTTAGCCATATACTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATATCCGTTTGTTGAAC
189 -TAATTTATTAACAT-TTAAAAATTTATGA-GAAAAGA--TAAAAAA-AAATCTGTTTACTGAAC
* * * * * * * * * *
98791 TAG-TTCAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
248 AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * * * *
98855 TCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTGGAATAGAATAAAAGTAATTT-TTAATA
312 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTTTATTAATA
* * * * * * * * * *
98919 TTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAATTCAAATAATC
376 TTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTA-AAAATAAATCTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATTATT
* * * * * * *
98984 ATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT-T-CTTACT--T-TATGTTTTGTCATAAAAT
439 ATGACTATTTGAACAAATATCTA-TT-AAAT-ATATAGTTA-TGATCTTTGTTTTCTCATAAAAC
* * * *
99044 GATT-TTTGT-TAATATAAG-TTTGTTC
500 AATTGTTTCTATCATACAAGCTTT-TTC
* * * * *
99069 AAAAGAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAATATCAAATTTACAAAGTAA
1 -AAATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCA-AAAATTAAT--A-A-GAGATTTA-AAAATAA
* * * * * * ** * * **
99133 AT-TGCTTACCAAACCATTTCTAATAGTTTTGACTATTTA-AATAATTATTTATTTCAAATCGTT
57 ATATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATT
* * * * * * * * * * ** * ***
99196 ATAACATTTTATTT-TGTCATCAAACAATTGGTTT-TGCTCATACTATTTTATTTGGAATAAAAT
121 ATGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATT-ATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAAT
* * * * ** * *
99259 AATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAA
185 AATA-TAATTTATTAACATTT-AAAAATTTATGAGAAAAGATAAAAAA-AAATCTGTTTACTGAA
* * * * * *
99322 -ATTAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTG--
247 CA--AGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTATTATGACCTTTTGTT
* * * * *
99384 -T-T--T----C---------AGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAATTAATATTAATTTATTA
309 TTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTTTATTA
* * * * * *
99432 ACATTTCAAAAATTAATAACAAAAAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCA
373 ATATTTTAAAAATTAAT-A-AGAAA-GAGATTT--AAAAATAAATCTGTTTACCAAA-TAGTTCA
* * * * * ** ** *
99497 AA-TAGTTATTACTATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCAT-TA-TAACCAT-TTT-ACTTGTC
432 AATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTA-TT-AAAT-ATATAGTTATGATCTTTGTTTTCTC
* ** **
99557 ATAAAATAATTGTTT-TAGTTTGTACAAGCTTAGAT-
493 ATAAAACAATTGTTTCTA--TCATACAAGCTT-TTTC
** ** *
99592 AGAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATCAGTAAGAGTTTAAACAAAATAA
1 A-AATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTT--A-AAAATAA
* *** * * * * * * * * * **
99657 ATTTGTTTATTGAATAAATTCTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCGTTA
57 ATATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * *
99722 TGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAA-ACATTATTTCAATTCATATAAGCTTACTCGAAATAAAATA
122 TGACCTTTTGTTTATATCATAAAATA-ATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATA
* * * * * * * * **
99785 ATACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTACTTACTG
186 ATA-TAATTTATTAACATT-TAAAAATTTATGA-GAAAAGA--TAAAAAA-AAATCTGTTTACTG
** * * * * *
99850 AACAAGTTTAAATAACTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTGGAA-TCACTATAACCTTTTAT
245 AACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGT-ATTATGACCTTTTGT
* * ** * * *
99914 TTTGTCATAAAA-AGATT-TCATCTT--TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAGATAATACAAATT
308 TTTGTCATAAAACA-ATTGT--T-TTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTT
* *
99975 TATTAATA--TTAAGATAATTAATAAGTAAA-AGATTTGAAAAATAAATCTATTCACCAAATAAG
368 TATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAG-AAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAAT-AG
* * * * *
100037 TTCAAATCATTATGAGTAATTGAAC--A-A-C-----AA-AT-T-GTTTTGA-CTTTGTTTTGTC
428 TTCAAATTATTATGACTATTTGAACAAATATCTATTAAATATATAGTTATGATCTTTGTTTTCTC
* * * *
100089 ATTAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTTG
493 ATAAAACAATTGTTTCT-ATCATACAAGCTT-TTTC
* * * * *
100125 AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAATTAA
1 AAATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT--AAAAATAAA
* * * * * * * * * * * *
100190 TATATTTACTGAATAATTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATAACTG
58 TATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * * * * * * ** *
100254 TGACATTTTGTTT-TGTAATAAAATAATTTTTTTAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAA
122 TGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAA
* * * * * *
100318 TACTAATTTATTAATATTGCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATTTGTTTACCG
187 TA-TAATTTATTAACATT-TAAAAATTTATGAG-AAAAG-A-TAAAAAAA--AATCTGTTTACTG
* * **
100383 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTT
245 AACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTA-TTTAAAGTATTATGACCTTTTGTT
* * * ** * * *
100448 TTGTCAAAAAATAATTGGTTCTA-TTCATCCAAGCTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TAAATTTA
309 TTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAAT-ATACT-ACTTTA
** * * *
100510 TTAATATTCCAAAAATTTATAAGCAAA-A-ATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CTTGAACAT-GTT
370 TTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAC--CAA-ATAGTT
* * ** * *
100571 CAAA-TAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-A-ATCGTTATGATCATTTGTTTTATC
430 CAAATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTATTAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTC
* *
100633 AT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACGAA-CGTATTTG
493 ATAAAAC-AATTGTTTCTA-TCATAC-AAGC-TTTTTC
* * * * *
100669 GAATAAAATAGTACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAATAAAT
* *** * * * * * * * * * **
100734 -TTTTTTATGGAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTTTTTGAATAGTTATTTATTTCAAATCGTTAT
59 ATGTTTGCCGAATC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
** * * * * * * *** *
100798 GGTCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATCA
123 GACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAA
* * * * * * *
100861 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTATCT-
187 TA-TAATTTATTAACATT-TAAAAATTTATGAG-AAAAGA--TAAAA-AAAAATCTGTTTA-CTG
* * * * * * ** *
100925 AACAAGTTCAAATAGTAAT-ATCCATTTGAATTATCATCTATTTCTAGCTATTATGACATTTTGT
245 AACAAGTTTAAATAGTTATGA-CTATTTAAATAATTATCTATTTAAAG-TATTATGACCTTTTGT
*
100989 TTTGTCATAAAATAATACCAATTATTCAGAATAATTGGTA-TTCATACAAA-ATTAT-TCAAAAT
308 TTTGTCAT---A-AA-A-C-A--ATT--G--T--TT--TAGTTCATA-AAAGCTTATCT-AAAA-
* * * * * *
101051 TAAAAAATACCAATTTATTACTATTTCAAAAATTAAT-----AGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
353 TAAAATATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGT
* * *** ** * * * * *
101111 TTATCAAACCAGTTCAAA-TAGTTAACCCTATGAGAATAATTATCTACTTCAA-AT-CA-TTCTG
417 TTACCAAA-TAGTTCAAATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTA-TTAAATATATAGTTATG
* ** * *
101172 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATG-TTTATTC
479 ATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTA--TCATACAAGCTTT-TTC
* * * *
101222 AAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ACATTCAAAAAATTAATTAGCAAGAAATTAAAAAAATAA
1 -AAATAAAATAATA-TAATTTAATATA-TTTC-AAAAATTAA-T---AAGAGATT-TAAAAATAA
* * * * * * *
101286 ATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTTGTT
57 ATATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAA-TTATT
* * * * * * * * *
101350 ATGACCTTTTATTTTTATCTTAAAACAATTGTTTTAGTGCATAAAAGCTTA-TCCAAAGTAAAAT
121 ATGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGT-CAAAATAAAAT
* * * * * * * *
101414 AATAGT-ACTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAATAAAT-TAGTTTATT
185 AATA-TAATTTATTAACATTT-AAAAATTTATGAG-AAAAGA--TAAAAAAAAATCT-GTTTACT
** * * * * * * *
101477 GAATTAGTTCAAATAATTTTGGCCATCTAAATAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGAACTTTTG
244 GAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTA-TTATGACCTTTTG
* * *** ** * * *** * *
101541 TTTTATCATAAAATAATTGTTTTTCATCATACGAGCCTATTTGGTATAAAATAATACTAATTTAC
307 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTTTAT
* * * * **
101606 TAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAAATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAA
371 TAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGAT-TTAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAATAGTTCAAA
* * * * * * * * *
101671 -TAGTTATGAATATTTGAATAATTATATATTTCAA-AT-T-GTTATAACCTTTTGTTATGTCATA
434 TTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTA-TTAAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATA
* * * *
101732 AAATAATTATTTTTGTTCATACAAG-TTTATTC
496 AAACAATTGTTTCT-ATCATACAAGCTTT-TTC
*
101764 AGAATAAAATAATACTAATGTAATA-ATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
1 A-AATAAAATAATA-TAATTTAATATAT-TTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAA
* * * * * * **
101828 ATTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTCT-TGATTTTAAATCGT
57 ATATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCT-ATTTCAAATTAT
* * * * * * * * *
101891 TATGACATTTTGTTT-TGTCGTAAAACAATTCTTTTAGTTCATATTAA-CTTATTCAGAATAAAA
120 TATGACCTTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATA-CAAGCTTAGTCAAAATAAAA
* * ** * * * * *
101954 TAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATGAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAATTTTATTTA-
184 TAATAT-AATTTATTAACATTT-AAAAATTTATGAG-AAAAGA--T-AAAAAAAAATCTGTTTAC
* * * * * * *
102018 TCGAACTAG-TTAGATAATTATAACTATTTGAATAATTGTCTATTTTAAA-TCATTATTACC---
243 T-GAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTA-TTTAAAGT-ATTATGACCTTT
* * * ** * *
102078 -------T--TAAAA-AA-TGCTTTT-GTTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATT
305 TGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTT
* * * * * *
102131 TATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACTAAACCAGTTC
368 TATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCAAA-TAGTTC
* * * * * * * *
102196 -AATTAGTTATAACTATTTAAACAATTATTTACTTCACAT-CAT-G--ATGACCATTTGTTTTAT
431 AAATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTA-TT-AAATATATAGTTATGATC-TTTGTTTTCT
* * * * *
102256 CATAAAAGAATTATTACTATTCATA-TAGTCTTATTC
492 CATAAAACAATTGTTTCTA-TCATACAAG-CTTTTTC
* * *
102292 AAAATAAAATAATGCTAATTTATTA-ATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTGAAAAATGA
1 -AAATAAAATAAT-ATAATTTAATATAT-TTC-AAAAATTAATAAG--A--GATTT-AAAAATAA
* * * * * * * * * * **
102356 ATTTGTTGGCCTAACCAGTGCAAATAATTATA-ATTGTTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTT
57 ATATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATT
* ** * *
102420 ATGACCTTTTGTTT-TATC-TCAAAACAATTGCTTCTA-TTCGTACAAGCTTA-TCCAAAATAAG
121 ATGACCTTTTGTTTATATCAT-AAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTAGT-CAAAATAAA
* * * * *
102481 ATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAA-TTATTAAGTAAGAA-ATTTAAAAAAGAAATCCGTT
183 ATAA-TATAATTTATTAACATT-TAAAAATTTA-TGAG-AA-AAGA--TAAAAAA-AAATCTGTT
* *
102544 TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAAG-AGTTATGACCT
240 TACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTA-TTTAAAGTA-TTATGACC-
* * *
102608 TTTTGTTTTGTCA-AAAACCAATTGTTTTTGTTCATATAAGCGTAT-TCAAAATAAAATAATACT
302 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAAT-ATACT
* * * * * *
102671 AGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAGATTTTAAAA-AAATATGTTTACCGAATTA
364 ACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACC-AAATA
* * * * *
102735 GTTCAAA-TAGTTATGACTGTTTGAAC-AATTTTTATT-TAGA-ATAGTTATGATCTTT-TGTTT
427 GTTCAAATTA-TTATGACTATTTGAACAAATATCTATTAAATATATAGTTATGATCTTTGT-TTT
* * *
102795 CGTTAGAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-TTTATTT
490 C-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TCATACAAGCTTT-TTC
*
102834 AGAATAAAATAATATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 A-AATAAAATAATATAATTTAAT-ATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAT
* * * * *
102899 GTGTTTGCCGAATCA-TTCAAATAATTAAGACTATTAAAACAATTATTTATTTCAAATTATTCTG
59 ATGTTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * *
102963 ACCTTTTGCTTAGT-T-TTAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAAT
124 ACCTTTTGTTTA-TATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAAT
*
103026 AGTAATTTATTCACATTTAAGAAATTTATGAGCAAAAGATAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAA
188 A-TAATTTATTAACATTTAA-AAATTTATGAG-AAAAGATAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAA
* *
103091 GTTTAAATAAATT-TGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAGTCATTATTG-CCATTT-TTTTG
250 GTTTAAAT-AGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAGT-ATTA-TGACCTTTTGTTTTG
* * * *
103153 TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAATGATACTACTTTACTAATA
312 TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAAT-ATACTACTTTATTAATA
* * * * *
103218 TTTTGAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTCCAACTAGTTCAAATTATTA
376 TTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAATAGTTCAAATTATTA
* *
103283 TGATTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATATATAGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
440 TGACTATTTGAACAAATATCTAT-T-AAATATATAGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
103348 TGTTTCTGATCATACAAGCTTTTTC
503 TGTTTCT-ATCATACAAGCTTTTTC
103373 AAATAAAAATAATATTAATTTAATTATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAA-AAATATGT
1 AAAT-AAAATAATA-TAATTTAA-TATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATATGT
* * *
103436 TTACCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCT-TTTTGACC
63 TTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT-TATTATGACC
* * *
103500 TTTTGTTTAT-TCATACAATAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATATGA
127 TTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATAT-A
* * * * * * *
103564 ATTTATTAACATTTAAAAAATTA--ATAAGAGATTTGAAAAAGTAAATCTATTCACCGAACAAGT
191 ATTTATTAACATTTAAAAATTTATGAGAAAAGA--T-AAAAA-AAAATCTGTTTACTGAACAAGT
* * *
103627 TTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATCT-TTCTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
252 TTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATT-T-AAAGTATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * **
103691 TAAAACCATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTACTACGCTATTAATATTT
315 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATA-TACTACTTTATTAATATTT
* * * * ** * *
103756 CAAAAGTTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTAAAATAGTTCAAATAATTAT-
379 TAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAC-CAAATAGTTCAAATTATTATG
* * * * * *
103820 AGCCATTTGAACAACTACCTATTTTAAGTCAT-TA-TTACT--T-TTTGTTTTGTCTTAAAACAA
442 A-CTATTTGAACAAATATCTA--TTAAAT-ATATAGTTA-TGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAA
* * *
103880 TTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTC
502 TTGTTTCT-ATCATACAAGCTTTTTC
*
103906 AAATAAAAT-A-AT-A-TT-A-ATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGTTT
1 AAATAAAATAATATAATTTAATATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATATGTTT
* * * * * * * *
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65 GCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTT
* ** * * * *
104030 TATTT-TATCATAAAATAATTATTTTTGTTTACACAAACTTAGTCAAAATAAAATAATATTACTT
130 TGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA-TAATT
* * * * * * * * * *
104094 TAGTAATATTCTACAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAGATAAATCTGTTTGC-GAAACCAA-T
194 TATTAACATT-TAAAAATTTATGA-GAAAAGA--TAAAA-AAAAATCTGTTTACTG-AA-CAAGT
* * * * * * * * * *
104157 TCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCGAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
252 TTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
104222 AAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATC---CA-AAAATAT-TTACTCTATTAATATTTCA
316 AAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATATACTACTTTATTAATATTTTA
* * ** * * * *
104282 AAAGTTAATACGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAACAGTTCAAATAATTATGG
381 AAAATTAATAAG-AAAGAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTAC-CAAATAGTTCAAATTATTATGA
* * * *
104346 CTATTTGAACAACA-ACCTATTTCAAATCAT-TA-CTACT--T-TTTGTTTTGTCTTAAAACAAT
443 CTATTTGAACAA-ATATCTA-TT-AAAT-ATATAGTTA-TGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAAT
* *
104405 TGTTT-TGCAACATACAAGCTTATTTG
503 TGTTTCT--ATCATACAAGCTT-TTTC
* * *
104431 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTG
1 AAATAAAATAATA-TAATTTAAT-ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAA-TAAATATG
* * * * * * * *
104496 TTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATTGTTATAACC
62 TTTGCCGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * * * * * * *
104561 TTTTG-TTCTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCAAATAGGCTTATTCAGAATAAAAGAATACTA
127 TTTTGTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA-TA
* * * * * * * *
104625 ATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTCGAGCCA
191 ATTTATTAACATT-TAAAAATTTATGA-GAAAAGA--TAAAAAA-AAATCTGTTTACT-GA-ACA
* * * * * * * *
104689 A-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
249 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT-AAAGTATTATGACCTTTTGTTTTGT
104753 CATAAAACAATT
313 CATAAAACAATT
104765 ATTTCAGCTT
Statistics
Matches: 8338, Mismatches: 1557, Indels: 1272
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
515 33 0.00
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559 6 0.00
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GTTTATATCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATATAATTTA
TTAACATTTAAAAATTTATGAGAAAAGATAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGT
TATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAGTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
AGAAAGAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAGTTCAAATTATTATGACTATTTGAACAAA
TATCTATTAAATATATAGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATCATACAAGC
TTTTTC
Found at i:104765 original size:534 final size:531
Alignment explanation
Indices: 88773--104768 Score: 6451
Period size: 542 Copynumber: 29.8 Consensus size: 531
88763 TTGCTTAATA
* * * * * * * **
88773 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTCTTTTAGAACATTATGACCCTTTT-TTTT-
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCA-AATATTATTA-TATTTTGTTTTG
* ** * * *
88836 TCATAAAACAATTGATTTTG-TTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATTTAAATTTACTAAT
63 TCTTAAAACAATTG-TTTTGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAAT
* * * * * **** * *
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126 ATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAAC-CAGTTCAAATAGT
* ** * * **
88964 TATGACTATTTGGACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAACCAATT
186 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATT
* * * * * * * * * * * * *
89029 GTTTCTATTTATAAAAGCTTATTTAGAATACAATAATATTAATTTGTGAAAAATATAAAAATTAA
250 ATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * *
89094 TAAGTAAGAGATTTTTAAAAAA-AAAT-TATTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTTATGA-TGATTT
315 TAACTAAGAGA--TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTT
* * ** * *
89156 AAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA-AAAACAATTGTTTCTA-TTC
376 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTC
* * * * * * * *
89219 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATA-TTCTAAAATTTAATAAGTTAGA
440 ATAAAAGCTTA-TC-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTC-AAAAGTTAATAAGTAAAA
* ** *
89283 G-CTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATA-
502 GATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAA-AC
* * * * * ** * * *
89312 AGTTCAAATAGTCACGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAAATCATTATGATATTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-AAAACCTATTTC-AAAT-ATTATTATATTTTGTTTTG
* * **
89377 T-TATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAAATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
63 TCT-TAAAACAATTGTTTTGCA-ACATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * * ** ** **
89439 ATATGTCAAAAATTAAAAATACATTTAAAAGCTAAACCTGTTTATCGAACCAACT-AAATAGTTA
124 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAA-ATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
89503 TGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
188 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATT-A
* ** * * * * * * *
89567 TTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCATATTCT-AAAACT--
251 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * *
89628 TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTGAAGACTA-TTAA
315 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *** * * * *
89690 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAATGTAATTGTTTCAATTTATA
378 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATA
* * * * * * * * *
89754 CATGCTTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAAAAAT
443 AAAGCTTA-TC-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCA-AAAGTTAATAAGTAAAAGAT
* *
89818 TTAAAAAAAATAAGT-ATGTTTA-TCG-AAC
505 TT--AAAAAATAAATCA-ATTTACT-GAAAC
* * * * * ** *
89846 AAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTGTTTTG
* * * * * *
89910 TCATAAAACAATTG-TTT-CAGTTCATAAAAGATTA-TCCAAAAATAAAATAATATTACTTTATT
63 TCTTAAAACAATTGTTTTGCA--ACATACAAGCTTATTTC--AAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * **** *
89972 AATATTTCAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAATTTATTAAATCAGTTCAAA
123 AATATTTCAAAAATTAATAA----GAGATTT-AAAAATAAATAT-GTTTGCCGAACCAGTTCAAA
* * * * * * * * *
90036 TAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTCGTTTTGTCATAAAAC
182 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAAT
* * ** * * *
90101 AATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACT-A---ATT--TA-T-T---AA
246 AATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * ** * *
90155 -T-A-AA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTATACTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATTACTATT
311 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * * *
90216 TGAATAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTA-TTTACCTT
375 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTA-GTT
* * * * *
90280 CATATAAGCTTATTCTAAATAAAATAGTACTGA-TCTAGTAATATTATGAAAA-TTAATAACTAA
439 CATAAAAGCTTA-TC-AAATAAAATAATACT-ACTCTATTAATATT-TCAAAAGTTAATAAGTAA
* ** * *
90343 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGC-CAAACC
500 AAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAA-C
* * * * * * * * * * * **
90375 AATTTAAATACTTAAGACAATATGGATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTGTTTTGT
* * * ** * **
90440 CGTAAAAAAAAATGTTTTTG-TTCATATAAATTTA-TTCGAAAT-AAA-AATATTAATTTATTAA
64 C-TTAAAACAATTG-TTTTGCAACATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * *
90501 TATTTCAAAATTTAATAAGAGATTTAATAAATAAATCA-GTTTACCAAATCAGTTC-AATAAGTT
125 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AAATAAAT-ATGTTTGCCGAACCAGTTCAAAT-AGTT
* * * * * * *
90564 ATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGATATGACCATTTCT-TTTGTCATAAAACAATT
187 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTT-TGTTTATCATAAAATAATT
* * * * ** * *
90628 GTTTCTATTAATACAATCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
250 ATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * ** * * * *
90693 TAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGTTATAACTCTTTGA
315 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC--GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* ** * * *
90757 ACAATTATCTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTCGTA
378 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATA
* * ** * * * * *
90822 CAAGCTTATTCGGAATAGTATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
443 AAAGCTTA-TC-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATT
* * * ** *
90887 TAAAGACTTAATCTGTTTATTG-AAC
506 TAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * * ** * ** *
90912 AAGTTTAAATAGTTAT-AGCAATTTGAACAATTACCTATTTCCAATCGCTATAACCTTTTCTTTT
1 -AGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTGTTTT
* * * *** * * * *
90976 GTCATGAAATAAACCTTTTTCTATTCATATAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAATTTATTAA
62 GTCTTAAAACAATTGTTTTGC-A-ACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAATTTATTAA
* * * * ** * *
91041 TA-TTCAGACAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAATAACTCTGTTTATCGAA-TAATTCAAATA
125 TATTTCA-AAAATTAATAAG----AGA-TTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA
* ** * * *
91104 GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
184 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAA
* * * ** * * *
91169 TTCTTTTTGTTCATACAAGCATATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAACAAT
248 TTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * * * * * * *
91233 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAATTTAAATAGTCATAACTATTT
312 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * ** * *
91298 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAATAATTATATTT-GTTC
376 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTTAGTTC
* * * * * * * * * *
91362 ATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTTACAG
440 ATAAAAGCTTA--TCAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAG
*
91427 ATTTAAAAAATGAATCAATTTACTG-AAC
503 ATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * * * *** * *
91455 AAATTCAAATAGTAAGGACTGTTTAAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTGTTTTG
* * **** * *
91520 TCATAAAATAATTGTTTCTATTTCATACAAGCTTGTTCCAAATAAAATAATATAAATTTATTAAT
63 TCTTAAAACAATTGTTT-TGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAAT
* * * * * * *
91585 ATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAATTTTAAAAATAACTATGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGT
126 ATTTCAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCA-GTTCAAATAGT
* * * * **
91649 TTTGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAATAGTTATGTCCTTTTGTTTTTTCATAAACCAAT
186 TATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAAT
* * * *
91713 TGTTTCTATTCATACAAG-TGTATTCGAAAT-AAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATT
249 TATTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * * *
91776 AATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTG
313 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
91841 AACAAATATTTATTTCAAATAGTTATCATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA--A--TCATTTC-T
377 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCAT
* * * * **
91900 ---A--TT-T-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATT
442 AAAAGCTTATCA-AATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATT
* * *
91958 TAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAATA
506 TAAAAAATAAATCAATTTACTGAAA-C
* * * * * * **
91984 AGTTCAAATAGTTATGTCCATTTGAACAATTA-TTGATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCT-ATTTCAAA-TATTATTATATTTTGTTTTG
* * * ** *
92048 TCATAAAACAATTG-TTT-CTATTCATTCAAAATTATTT-AGAATAAAATAATATTGATTTATTA
63 TCTTAAAACAATTGTTTTGC-A-ACATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTA
** ** * * * ** *
92110 ATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAGACCTAAATTTGTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTA
124 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
92175 TAACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
188 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATT-A
* ** * * * * * * *
92239 TTTATGTTCATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATATTGCCAAACTTA-TCATATTCT-AAAACT--
251 TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * *
92300 TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTGAAGACTA-TTAA
315 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * *
92362 ATAATTATCTATTTCAAA----T-TG------T-TTTAGTCATAAAATAATTATTTCAATTCATA
378 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATA
* * * * * * * * * *
92415 CAATCTTATTTAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAA-A
443 AAAGCTTA-TCA-AATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTC-AAAAGTTAATAAGTAA-AAGA
92478 TTTAAAAAAATAAATCAATTTACTG-AAC
504 TTT-AAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * ** * **
92506 AATTTCAAATAGATT-TGATTATTTGAACAATTATTTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTGTTT
1 -AGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAA-T-ATTATTATATTTTGTTT
* * ** * * * * *
92569 TATC---ATA-AATTGTTTT--AATTTTGTAAAAACTTATTTGAAATAAAATCATACTACTTTAT
61 TGTCTTAAAACAATTGTTTTGCAA---CATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTAT
* * *
92628 TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAGAGATTTAAAACTAAAGT-T-TTT---TAACTAGTTCAAAT
122 TAATATTTCAAAAATTAAT-A--AGAGATTTAAAAATAAA-TATGTTTGCCGAACCAGTTCAAAT
* * ** ** * *
92688 AGTTATGATTATTTGAACAAATATGAATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAT
183 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAAT
* * *** * * *
92751 AATTGTTT-TGATCATACAAGCTTATT-TGGATAAAAATAATGCTAATTTAATAATATTATAAAA
246 AATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* * * * * * * * *
92814 ATTAGT---GAA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCTAACCAGTTCAAATAGTTAAGTCTAT
310 ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * ** * * * * *
92875 TAGAATAACTATCTATTTCAAATCATT-CGAACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGGTTTCAG
374 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTAG
* ** ** ** * ** * * *
92939 TTC-T-TAA--TT-TTGAATACAAA-AATTTTTGTATATTTGAA-ATAACAAAAACTAAATATAT
437 TTCATAAAAGCTTATCAAATA-AAATAATACTACTCTA-TT-AATATTTC-AAAAGTTAATA-AG
* ** * *
92997 TGATTGAATAAAAAATATATAATAGCAAATATT--TGAAA-
497 TAAAAGATTTAAAAA-ATA-AAT--C-AAT-TTACTGAAAC
* * * * * * *
93035 ATGTTCCAAAAAACAATTTATG--TA-TTGAATAATTATCAATTTC-AATCATT-TGACA-TTTG
1 A-GTT-C---AAATAA-TTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTG
* * ** * * * * *
93094 -TTTATCATAAAACAATTGTTTTAG-TTCATAAAAACTTA-TCCAAAATTAAAACTAAAACTACT
58 TTTTGTCTTAAAACAATTGTTTT-GCAACATACAAGCTTATTTC-AAA-TAAAA-TAATA-TAAT
* * * * * **
93156 TTATTACTATTTTTAACAAGTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTTCTGAATTAG
118 TTATTAATA-TTTCAA-AA-AT-TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAT-ATGTTTGCCGAACCAG
* * * * *
93220 TTCAAAATAATTAT-TC-ATTTTGAAC-ATT-TCTATTTCTCAAATACGTTATGAACTTTT-TGT
176 TTC-AAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTA-TT-TCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * ** *** *
93280 -CCGTAAAACAATTGTTT-TCATCATACAAG-TCTATTTGGAAGAATAATAA-A-TAATTTAATT
236 ATCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAA-AATAATACTAATTT-ATT
* * * * **
93340 AATATT-TCAAAAAATAATAAGTAGGAGATATT-AAAAATAAATATACTTACCGAAACCAA-TT-
298 AATATTCT-AAAAATTAATAACTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTA-CG-AA-CAAGTTC
* * * ** *
93401 -AATAGTTTATGAACTATTTGAAACACATTACTAATTTCAAATCATATAATAAAACCATTTGTTT
358 AAATAG-TTATG-ACTATTTG-AACA-ATTATTTATTTCAAAT--TGT--TATGACCTTTTGTTT
* * * *
93465 ATAG--ATAAAACAA-TATTATTTAATCTTATATACAAGGCTTATTTGACAATACAA-AATACTA
415 -T-GTCATAAAACAATTA-T-TTTAGT-TCATA-A-AA-GCTTA--TCA-AATAAAATAATACTA
* * * * * * *
93526 -TATAATAAATATTCATGAAAATTTAATAAATTAAAGATATTTAAAAAATAAAT--ATTGATATT
469 CTCT-ATTAATATT--TCAAAAGTTAAT-AAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCAATT--TACT
*
93588 GCCGAAC
527 G--AAAC
* ** * * * * * * * *
93595 AATTAACAAATTGTTAAGGCGATATGAA-AATTATCTATTTTGAAA-ATCATTATGACCTTTTGT
1 AGTT--CAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTA-TTTCAAATATTATTAT-A--TTTTGT
* ** * ** * * *
93658 TTTG--ATAAAACAA-TGTTTTAGTTAC-TATAATTTTGTTTGAAATCAAATAATATTAATTTAT
59 TTTGTCTTAAAACAATTGTTTT-GCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTAT
* * ** * * *
93719 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAATAAATTTGTTTACTAAACCAATTTAATTAGT
122 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGT
* * * * * * ***
93784 TATAACAATTCGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA-CTAGTTGTTTTATCATAATGCAAT
186 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTG-TTTATCATAAAATAAT
* * * ** *** * * *
93848 TGTTTCTATTAATACAATTTTATTTGGAATAAACTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAGTTA
249 TATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * ** *
93913 GTAAGTAACAGATTTAAAAAAAAGAATCTGTTGGCCTGACCAA-TAT-AAATAGTTAT-AGCTAT
314 ATAACTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTT-TAC-GAACAAGT-TCAAATAGTTATGA-CTAT
* * * * * * *
93975 TTAAACAATTATCTATTTTAAATCAT-TTAT-ATCTTTTGTTTTGTCACAAAACATTTGTTTCTA
374 TTGAACAATTATTTATTTCAAAT--TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TA
* * * * * * * * * * *
94038 TTTC-TACAACCTGATTCAAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAATA
436 GTTCATAAAAGCTTA-TC-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTA
* * * *
94102 AGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TTAAAC
499 AAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * * * * * * **
94134 AAGTCCAAATAGTTGTGACTACTTGAATAATTACCTATTGCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAA-TATTATTATATTTTGTTTTG
* * ** * *
94199 TCATAAAATAA-AATTTT-CTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATAAATTTATTAA
63 TCTTAAAACAATTGTTTTGC-A-ACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAA
* * * * **
94262 TA-TTCAAACAACTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATA
125 TATTTCAAA-AA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA
* * * * * *
94326 GTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTTTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTATTGTCATAAAACAA
184 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT-TTATCATAAAATAA
* * *** * * * *
94390 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAACTTATTAATATT-TCAATAAT
248 TTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * * * * *
94454 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACATGTTCAAATAGTCATAACTATTT
312 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * ** * ** * *
94519 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTAGTTCA
376 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCA
* * * * * * *
94584 TATAAGCTTATGCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTTAGAGA
441 TAAAAGCTTAT-C-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGA
** * *
94649 TTTAAATTATGAATCTATTTACTG-AAC
504 TTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * ** *
94676 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTAGT
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAATATTATTATATTTTGTTTTGT
* * ** ** ** *
94741 CATAAAATAACTAATTTTG-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAACTTATTAATA
64 CTTAAAACAA-TTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATA
* * * * * * * *
94805 TTCCAAAAATCAATAA-A-A---AAAATTAAATTTGTTT-TCTAAACATATTCAAATAGTTATGA
127 TTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
94864 CTGTTTGAAGAATTATCTATTTCAAATAGATATGACCATTTTTCTTTTATCAT-AAATCAATTGT
191 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC--TTTT-GTTTATCATAAAAT-AATTAT
* * * *
94928 TTCTATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT
252 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT
* * * * * *
94992 AAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAGCAAGTTCATATCA-TTATGATTATTTGA
316 AACTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGA
* * * * *
95055 ATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCAT
378 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCAT
* * * * * * ***
95119 ACAAGTTTGTTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAAT-AGTTAGGTG
442 AAAAGCTT-ATCA-AATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTC-AAAAGTTAATAAG-TAAAAG
** *
95181 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAAC
503 ATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * * * * * *
95209 AAATTCAAATAGTCATGCCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACT-TTTTG-TTT
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTA-TATTTTGTTTT
* * ** * **
95272 GT-TATAAAAACAATTATGTCT-CTTCATGCAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTAT
62 GTCT-T-AAAACAATTGT-TTTGCAACATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTAT
** * * * * *
95334 TAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTTCCAAAACAGTTTAAATAGT
122 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGT
* * ** * * *
95399 TATGACTATTTGAACAATTAT-GATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTGTTATAAAATAATT
186 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT-TGTTTATCATAAAATAATT
* * * * * * *
95462 GTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAG
250 ATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * * * * * *
95527 TAAGTAAGAGATTTAAGAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA
315 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * ** *
95592 AAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGCTTTT-GTCCATA
379 CAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTTTAGTTCATA
* * * * * * * *
95656 TAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATT
443 AAAGCTT-ATCA-AATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATT
* *
95717 TAATAAATAAATCAATTTAC-CAAAC
506 TAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * * ** * * *
95742 TAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTCATTATGACCA-TTTGTTTT
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTA-TATTTTGTTTT
* * *** * * * *
95806 GTCATAAAACAATTATTTCTATTA-ATACAATCTTA-TTCAGAATAAAGTAATGCTAATTCATTA
62 GTCTTAAAACAATTGTTT-TGCAACATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAAT-ATAATTTATTA
* * * * *
95869 ATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACGTATTTAAAAAAAGAATATGTTGGCTTG-ACCAGTACAAG
124 ATATTTC-AAAAATTAATAAG--A-G-ATTTAAAAATA-AATATGTTTGC-CGAACCAGTTCAAA
* * * * * * * * *
95932 TAGTTATAACTGTTTGAATAATTAGCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCACAGAAC
182 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAAT
* * ** * ** * ** *
95997 AACTGTTTCTGTTTGTACAAGCTGATTCGGAATAACATAATTTTAATTTATTAATATTCAAAAAA
246 AATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * * *
96062 TTAATAAGTAACAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATT
311 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
96127 TGAACAATTACTTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTTTTTCTA-TT
375 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTT
* * ** * * *
96191 CATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATAGAAATTTATTAATA-TTCGACAA-TTAATAAGTAAA
439 CATAAAAGCTTA--TCAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTC-AAAAGTTAATAAGTAAA
** *** *
96254 AGATTT-TTAAA-AAATTTGTTTACCGAATA-
501 AGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAA-AC
* * * * **
96283 AGTTCATAA-AGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAA-ATTATTATGACTTTTTGTTT
1 AGTTCA-AATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAATATTATTAT-A--TTTTGTTT
* * * ** ** * *
96346 TGTCATAAAATAATTTTTTTTG-TTCATACAAGCTTA-TTCGGATTAAATAATATTAATTAATTA
61 TGTCTTAAAACAA-TTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * * *
96409 ATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTCAAAATAAATATTTTTACCGAACAAGTTCAAATA
124 ATATTTCAAAAATTAATAAG----AGA-TTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA
* * * * * * * *
96474 GTCATAACTATTTGGAGAATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTATTTTGTCATAAAACAA
184 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAATAA
* * * ** * *
96539 TGTA-TT-AGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTCCAAAAAT
248 T-TATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * * *
96602 TAATGAA-TAAGAGATTTAAAATATGAATATGTTTACTGGACAAGTTCAAATGGTTATGACTATT
312 TAAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * *
96666 TGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATT-GTTTATGTT
375 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTA-GTT
** * * * * * * *
96730 CATACAAA-CTTATTTTGAATAAAATAA-AATAAATTTATTACTATTTAAAAAATTAATAAGCAA
439 CATA-AAAGCTTA--TCAAATAAAATAATACT-ACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAA
* *** *
96793 AA-ATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCTG-AAC
500 AAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* ** * * ****
96823 ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATAGCTATGGCCTTTTGTTTTG
1 A-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-AAAACCTATTTCAAATA-TTATTATATTTTGTTTTG
* * ** *
96888 TCATAAATCAATTGTTTTTG-TTCATACAAG-TGTA-TTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTA
63 TCTTAAAACAATTG-TTTTGCAACATACAAGCT-TATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * * * * * * * * * *
96950 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAGGTAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCATATC
124 ATATTTCAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAA-ATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA
* * * * * * *
97015 GTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGTAA
184 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAA
* * * * *
97080 TTATTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTATGAAAATT
248 TTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * *
97145 AATAGGC-AGGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTT
313 AATA-ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * ** * * * *
97209 AAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTA-TTC
376 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTC
* * * * *
97273 ATTCAAAA--TTATTTAGAATAAAA-ATATATTGA-TATATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--
440 A-T-AAAAGCTTA-TCA-AATAAAATA-ATACT-ACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTA
* ** ** *
97332 --AGATTTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAT
499 AAAGA-TTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * * * * *
97364 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TAT-CTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTGTTTTGT
*** * ** * * * *
97427 -TATAAAACAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTCATTTGGATTAAAATAATTCTAATTCAATAAT
64 CT-TAAAACAATTGTTT-TGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAA-TATAATTTATTAAT
* * * * *
97490 A-TTCTAAAAATTAGTAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAATTCAAATA
126 ATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT--AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA
* * ** * * * * *
97554 ATTAAGACTATGAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
184 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAA
* * *
97619 TTATTTCAGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAAAT
248 TTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAAT
* * *
97683 TAATGAGTAAGAGATTTAGAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTAT
312 TAATAACTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTAT
* * * *
97747 TTAAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
374 TTGAACAATTATTTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGT
* ** * * * * * * *
97811 TTATAAAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTTATATTTCAAAA-ATAAAAAGCAAG
438 TCATAAAAGCTTAT-C-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAA
* * * ** * *
97875 TGATTTAAAAACTAGAGT-TGTTTTC-CAAAC
501 AGATTTAAAAAATA-AATCAATTTACTGAAAC
* * * * * * * * * *
97905 TAGTTTAAATAGTTATGAATATTTGAACAAATATCAATATGAAATCATTATGAT-CTTTGTTTTC
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAA-ACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTGTTTTG
* * * ** * *
97969 TCATAAAACAATTGTTTT-TAATCATATAAGCCAATTT-GAATAAAAATAATACTAATTTAATAA
63 TCTTAAAACAATTGTTTTGCAA-CATACAAGCTTATTTCAAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * *
98032 TATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCGAATCAGTTCAAA-A---AT
125 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * *
98093 -ACTATTAGAATAATTAT-TATTTTAAATCGCTCTGACCTTTGGTTTAGTCATACAATAATTGTT
189 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAATTATT
** * * *** * **
98156 TCAATTCAAACAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-TGAAATTTTAATA
253 TCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATA
* * * * *
98220 AGTATGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAAC
317 ACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** * * * *
98285 AATTATCTATTTAAAATCATTATGA-CTATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTATTAGTTCAAAA
380 AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAA
* * * *
98349 AATCTTATCCAAATAAAATAATACTGCTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAATATTTA
444 AAGCTTAT-CAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTA
* *
98414 AAAAATAAATCAATTTACTTAATC
508 AAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * ** *
98438 AGTTCAAATAATTATTG-CCATTTGAA-TATA--TATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTCGT
1 AGTTCAAATAATTA-TGACTATTTGAACAAAACCTATTTCAAA-TATTATTATATTTTGTTTTGT
* * * *
98499 CTTAAAATAATTATTTTTCAACATACAAGCTT-TTTCAAAATAAAATAATAGTAATTTGTTAATA
64 CTTAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
* * * * * * *
98563 TTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGA
127 TTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
98628 CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCCTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTTC
191 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT-TATCATAAAATAATTATTTC
* * * *** * *
98693 TATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGCCATATACTGAAAATTAATAACT
255 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACT
* * ** * * * *
98758 AAGAGATTTAAAAAATATATCCGTTTGTTGAACTAGTTC-AACAGTTAAGACTATATGAACAATT
320 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *
98822 ATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCT
384 ATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCT
** * * * * * * * * *
98887 TATTTGGAATAGAATAAAAGTAAT-TTTTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATTTAGAAA
449 TA--TCAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * *
98951 ATAATTCTATTTAC-CAAACC
512 ATAAATCAATTTACTGAAA-C
* * * * * * * *
98971 AATTCAAATAATCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTTACT-TTATGTTTTG
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTA-TATTTTGTTTTG
* ** ** * *
99035 TCATAAAATGA-T-TTTTGTTA-ATATAAG-TT-TGTTCAAAAGAAAATAATATTAATTTATTAA
63 TCTTAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTAT-TTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * * * * * *
99095 TATTT-AGAAAATTAATCAATATCAAATTTACAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACCATTTCTAATA
125 TATTTCA-AAAATTAAT--A-A-GAGATTTA-AAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA
* * * * * * * * * * *
99158 GTTTTGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAA
184 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAATAA
* * * ** *** * *
99223 TTGGTTT-TGCTCATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATT-TCAAAAA
248 TT-ATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAA
* * * ** * *
99286 -T--TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATTAGTTCAAATGGTTAAGACTATT
311 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
** * * * *
99347 AAAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTG---T-T--T----C---------AGTTC
375 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTC
* * * * * * * * **
99393 ATACAAGCTTATTTAAAATAAATTAATATTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAACAAAAAG
440 ATAAAAGCTTA--TCAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAA-GTAAA-
***
99458 GAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAAC
501 -AGATTT-AAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * *** * * **
99490 AAGTTCAAATAGTTATTACTATATGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATAACCATTTT-ACTT
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTA-TATTTTGTTTT
* * **** ** *
99554 GTCATAAAATAATTGTTTTAG-TTTGTACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTCTTA
62 GTCTTAAAACAATTGTTTT-GCAACATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTA
** * * *** ** * *
99617 ATATTTTGAAAATTAATCAGTAAGAGTTTAAACAAAATAAATTTGTTTATTGAATAAATTCTAAT
124 ATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTT--A-AAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAAT
* * * * * *
99682 AGTTATGACTATTTGAATAATTGTTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
183 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATA
** * * * * *
99746 CATTATTTCAATTCATATAAGCTTACTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCCAAAAA
247 -ATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * ** * **
99811 TTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTACTTACTGAACAAGTTTAAATAACTATGACTATT
311 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** *** * * *
99876 TAAACAATTATCTATTTGGAATCACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AGATTTCATCTT--
375 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-A-TT-ATTTTAG
* ** * * * * *
99938 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAGATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAGT
437 TTCATAAAAGCTTA--TCAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAA-A-AGTTAATAAGT
* * * * *
100001 AAAAGATTTGAAAAATAAATCTATTCAC-CAAATA
498 AAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAA-C
* * * * * * *
100035 AGTTCAAATCATTATGAGTAATTGAAC--AA-C-A----AATTGTT-TT-GACTTTGTTTTGTCA
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAAACCTATTTCAAATATTATTATATTTTGTTTTGTC-
** * *
100090 TT-AAACAATTGTTTATG-TTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
65 TTAAAACAATTGTTT-TGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * * * * ** * *
100153 TTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAATTAATATATTTACTGAATAATTTCAAATAGTC
128 TTCAAAAATTAATAAG----AGATTT--AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTT
* * * *** * * * *
100218 ATAACTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATAACTGTGACATTTTGTTTTGTAATAAAATAATT-
187 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAATTA
* * * * ** *
100282 TTTTTAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTGC-AAAAATTA
251 TTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTA
* * * * * * * *
100346 ATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTA
314 ATAACTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *** * * * *
100411 AATAATTATCTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTA-TTCA
377 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTAGTTCA
** * * * * * * *
100475 TCCAAGCTTATTTTGAAA-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTTATAAGCAAAA
441 TAAAAGCTTA---TCAAATAAAATAATACT-ACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAA
* ***
100538 -ATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CTTG-AAC
502 GATTTAAAAAATAAATCAATTTAC-TGAAAC
* * * * * *
100566 ATGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCA-TTTGTTTT
1 A-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTAT-ATTTTGTTTT
* * * * ** *
100630 ATCAT-AAACTAATTG-TTT-CTATTCATACGAA-CGTATTTGGAATAAAATAGTACTAATTTAT
62 GTCTTAAAAC-AATTGTTTTGC-A-ACATAC-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTAT
* * * * *** * * *
100691 TAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATGGAGCAAGTTTAAA
122 TAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAA
* * * * * ** * *
100756 TAGTTATGACTTTTTGAATAGTTATTTATTTCAAATCGTTATGGTCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
182 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAAT
* * * * *** *
100821 AATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
246 AATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
* * * * * * *
100886 TTAATAAGTTAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTATCTAACAAGTTCAAATAGTAAT-ATCCAT
311 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTAT
** * * * ** * *
100950 TTGAATTATCATCTATTTCTAGCTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATACCAATTATT
374 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-CAATTA-T
* * * * * *
101015 CAGAATAATTGGTATTCATACAAA-ATTATTCAAAATTAAAA-AATACCAATTTATTACTATTTC
432 -----T--TTAG--TTCATA-AAAGCTTA-TC-AAA-TAAAATAATACTACTCTATTAATATTTC
* *** *
101078 AAAAATTAAT-AG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-TCAAACC
484 AAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAA-C
* *** ** * * * * * * ** *
101121 AGTTCAAATAGTTAACCCTATGAGAATAATTATCTACTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTATATTTTGTTTTGT
* * * * *
101186 CATAAAATAATTG-TTT-CAGTTCATACATGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 CTTAAAACAATTGTTTTGCA--ACATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * * * * **
101248 CA-TTCAAAAAATTAATTAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATA
125 TATTTC-AAAAATTAA-T---AAGAGATT-TAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATA
* * *
101312 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTTGTTATGACCTTTTATTTTTATCTTAAAAC
184 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGACC-TTT-TGTTTATCATAAAAT
* * * * * * *
101376 AATTGTTT-TAGTGCATAAAAGCTTATCCAAAGTAAAATAATAGT-ACTTATTAATATT-TCAAA
246 AATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAA
* * * * ** * * * *
101438 AATTGATAAGTTAGAGATTT-AAAAATAAAT-TAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTTTGGCC
309 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * **
101501 ATCTAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTTTC
372 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAG
* ** * *** * * * * * *
101566 ATCATACGAGCCTATTTGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAAAATTAATAAGCAA
437 TTCATAAAAG-CT-TATCAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAA
* ** *
101631 GAA-ATGTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACC
500 -AAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * ** * * ** *
101663 AGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAA-TATTATTATATTTTGTTTTGT
* * * ** * * *
101728 CATAAAATAATTATTTTTG-TTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATGTAATAAT
64 CTTAAAACAATT-GTTTTGCAACATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAAT
* * *
101791 A-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATAG
126 ATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
101855 TTAAGACTATATGAACAATTCT-TGATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAA
185 TTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAATAA
* * * *
101919 TTCTTT-TAGTTCATATTAA-CTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATT-TCAAA
248 TTATTTCT-GTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAA
* * * * * * * * * * *
101980 AATGAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAATTTTATTTATCGAACTAGTT-AGATAATTATAACTA
309 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * ** * **
102044 TTTGAATAATTGTCTATTTTAAATCATTATTACC----------T--TAAAA-AATGCTTTT-GT
373 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGT
* * ** * * * * *
102095 TCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTAAGAAGTAA
438 TCATAAAAGCTTA--TCAAATAAAATAATACTACTCTATTAATA-TTTCAAAAGTTAATAAGTAA
* * ***
102159 GAGATTTAAAATATAAATTTGTTTACT-AAACC
500 AAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAA-C
* * * * * ** * * * * * *
102191 AGTTCAATTAGTTATAACTATTTAAACAATTATTTACTTCACATCATGATGACCA-TTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTA-TATTTTGTTTTG
* * * * * * *
102255 TCATAAAAGAA-T-TATTACTATTCATA-TAGTCTTA-TTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATT
63 TCTTAAAACAATTGTTTTGC-A-ACATACAAG-CTTATTTC-AAATAAAATAAT-ATAATTTATT
* * * * *
102316 AATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTGAAAAATGAATTTGTTGGCCTAACCAGTGCAAA
123 AATATTTC-AAAAATTAATAAG--A--GATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAA
* * * * * *
102380 TAATTATAATTGTTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC-TCAAAA
182 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTATCAT-AAAA
* ** * * * * * *
102444 CAATTGCTTCTATTCGTACAAGCTTATCCAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAA
245 TAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* * * * *
102509 ATTATTAAGTAAGAAATTTAAAAAAGAAATCCGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
310 ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * ** * *
102574 TTAAACAATTATCTATTTTAAAGAGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCA-AAAACCAATTGTTTTTG
374 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTTAG
* * * * *
102638 TTCATATAAGCGTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
437 TTCATAAAAGCTTA-TC-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGT-A
* * * **
102703 AAAGATTT-TAAAA-AAAT-ATGTTTACCGAATT
499 AAAGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACTGAAAC
* * **** * * *
102734 AGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTTTTATTT-AGAATAGTTATGATCTTTTGTTTCGT
1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAAACCTATTTCA-AATA-TTATTATATTTTGTTTTGT
* * * *
102798 -TAGAAAACAATTG-TTT-CTATTCATACAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATATAATTTAATAA
64 CT-TAAAACAATTGTTTTGC-A-ACATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATATAATTTATTAA
* * * *
102859 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAATCA-TTCAAATAA
125 TATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAG
* ** * * * * **
102923 TTAAGACTATTAAAACAATTATTTATTTCAAATTATTCTGACCTTTTGCTTAGTTTTAAAATAAT
185 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAAT
* * * * *
102988 TATTTCAGTTCATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATAGTAATTTATTCACATT-TAAGAAATT
249 TATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAATT
* * * * *
103052 TATGAGC-AAAAGA--TAAAAAA-AAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAAATT-TGACTATT
313 AAT-AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-GAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATT
* * * ** * *
103112 TAAATAATTATCTATTT-AAAGTCATTATTG-CCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGT
375 TGAACAATTATTTATTTCAAA-TTGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGT
* * * * * *
103174 TCATAAAAACTTATCTAAAATAAAATGATACTACTTTACTAATATTTTGAAAA-TTAATAAGCAA
438 TCATAAAAGCTTATC--AAATAAAATAATACTACTCTATTAATA-TTTCAAAAGTTAATAAGTAA
* * * ** **
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500 AAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * * *
103268 TAGTTCAAATTATTATGATTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATATATAGTTATGATCTTTGTT
1 -AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAA-ACCTATTTCAAATAT-TA-TTAT-AT-TTTGTT
* * *
103333 TTCTCATAAAACAATTGTTTCTG-ATCATACAAGCTT-TTTCAAATAAAAATAATATTAATTTAA
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* *
103396 TT-ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAA-AAATATGTTTACCGAATCAGTTCAAATAGT
121 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGT
* * * * *
103458 TAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCT-TTTTGACCTTTTGTTTATTCATACAATAAT
186 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAATAAT
* * * * *
103522 TGTTTCAGTTTATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATA-TGAATTTATTAACATT-TAAAAA--
249 TATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * * * * *
103583 ATTAA-TAAGAGATTTGAAAAAGTAAATCTATTCACCGAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTT
313 AATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
103647 GAATAATTATCTT-TCTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCATTGTTTTAGTTC
376 GAACAATTAT-TTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTC
* * * *
103711 ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTACTACGCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAGGTAAGAG
440 ATAAAAGCTTAT-C-AAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAG
* *
103776 ATTTAAAAAATAAATCAATTTACTAAAAT
503 ATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAAAC
* * * *
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1 AGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTA-TATTTTGTTTT
*
103868 GTCTTAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTA-TTCAAAT---A-AA-ATAA--TATTAATA
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* * *
103925 TTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGCTATGA
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* * * *
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191 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAATAATTATTTC
* * * * * * * * *
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* * * * *
104120 AAGAGATTTAAAAGATAAATCTGTTTGCGAAACCAA-TTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAAT
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* * *
104184 TATTTATTTCGAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGC
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* * *
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* *
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1 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-AACCTATTTCAAAT-ATTATTA-TATTTTGTTTTG
*
104393 TCTTAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
63 TCTTAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
* * * *
104458 TTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATG
127 TTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAA-TAAATATGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * *
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190 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT-TATCATAAAATAATTATTT
* * * * * *
104588 CTGTTCAAATAGGCTTATTCAGAATAAAAGAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAAC
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* * * *
104653 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAGCCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAA
319 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
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TAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTC
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TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGA
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TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCAAA
TAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAA
TTTACTGAAAC
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AATATTCTCAAATTAAT
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* * * * * * * *
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** * * * ** **
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* * ** *
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* * * ** * * * ** *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * ** * ** * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
105618 TATTAATA-TT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAT--ATGT-T-TACCAAACAAG
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* ** * * ** * * * ** * * *
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* * * * ** * * * * ** *
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** * **
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* * * * *
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1 TTAAAAAATAAATCA-ATTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAAT-ATCTAT
** * * ** *
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* * * *
105957 GAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATGAGTAAGAGAATTAAAAA-AGAA
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* * *
106021 TATGTTTACTAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAACATTA
185 TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
** * ** * * * *
106085 TGACCTTTTGTTTCATCTTAAAACAACCAGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAA
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* * * * * *
106149 TATAAATTTATTAATATTGCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATATATTTTCTTAA
312 TCTAAA-TTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTGCTAAA
** * * ** * * *
106214 CTTGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTT
375 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTTTA
* * *
106279 GTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGTAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
440 GTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
* * * * * *** * *
106344 ATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATATATCGAGTGAGTTCAAATAAT
505 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAATTCAAATAAC
* * * * *
106409 TATAACTATTTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATCATAAAATAATT
570 TATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATAAAAAAATAATT
* * **** *
106474 GTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTTATATAAGAAACTTAAT
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* *
106539 GGGTTGAAGAC
700 GAGTTGAAGAT
* * * * * * *
106550 TTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCAATTTGAACTATTACCTATT
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* ** *
106615 TCAAATCATTATGACATTTTGTATTGTTGTAAAAAAATTGTTTTATTCATACAAAATTATTCAAA
65 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAAA-TATTCAAA
* *
106680 ATAAAATAATACT-ATTTCATTAATATTTCAAAAATTAAAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTT
129 ATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAAAAGAGATTTAAAAA-TAAATATGTTT
* * **
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* * *
106809 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTA
257 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAAATTA
* * * *
106874 ATAATATTCTCAAATTAATAAGTAATACATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAA
321 ATAATATTCTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTTGCTAAACCAGTTCAAA
* *
106939 TAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATCATTTTGACCTTTAGTTTAGTCATAAAAT
385 TAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTTTAGTCATAAAAT
* * * *
107004 AATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAGTACT-ATTTTTTAACATTT-AGAA
450 AATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCA-AA
* * * **
107066 AATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAGAAAATAAATATGT-TAACCAAACAAATTCAAATAGCTATGC
513 AATTAATAAGCAA-AAGAATTAA-AAAATAAATATATAT-ACCAAACAAATTCAAATAACTATAA
* ***
107129 CTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATTGCCTTTTGTTTTATAAAAAAATAATTGTTT-
575 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATAAAAAAATAATTGTTTC
* * * *
107193 TAGTACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATGATATTACTTTATAATATTTCAA-AAA-TTAA-GA
640 TA-TACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTAT-ATATAT-AAGAAACTTAATG-
*
107255 AGTTGGAGAT
701 AGTTGAAGAT
* * * *
107265 TTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTAT
1 TTAAAAAATAAATCAATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCTAT
** * * *
107329 TTCAAATTGTTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TCATCATATAAGCATATT
64 TTCAAATCATTATGACA-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAA-AATATT
* * * **
107392 CAGAATAAAATAATATTAATTTATTTATATTTTGAAAATTAATTAGTAGGAGATTTAAAAAATAA
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* * * * * * * * * * *
107457 ATTTGTTTAACAAACTAGATCAAATAATTAT-ACTATTTAAATAATTATATATTTCAATTCGTTA
184 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATTATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
107521 TAACCTATTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTTATACAAGCCTATTC-GAAATAAAATAA
249 TGACCT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA
* * * * * *
107585 TACT-AATCTAATAATATTATGAAAACTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTA
312 T-CTAAAT-TAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTTGCTA
* * * * **
107649 AATCAGCTT-AAATAGTTAAG-GT-TGTATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
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** * * * * * * * *
107711 A-TCTT-GTTGTAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTC-ATAA-CAAATAATATTAAT
434 AGT-TTAGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAAT
* ** * * * * * * *
107772 TTATTAATATTTTGAAAATTATTAAG----AGATTTAAAATATAAATATGTTTACTAAATC-AGT
497 TTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAA-CAAAT
* ** * * * * * * * * *
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* * ** * * * * * *
107895 TAAAATAATTGTTTTTATTGAT-ACATTCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATT
625 AAAAATAATTGTTTCTATACATAAAAGT-TTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATA-T
* * *
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686 ATAAGAAACTTAATGAGTTGA-AGAT
* ** ** * * * * * ***
107982 TTAAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACTAA-TGCAAATAGTTATAATTGTTTGAACAATTATCT
1 TT-AAAAAATAAATCAATT-TATCGAAC-AAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCT
** * * * * * * * **
108045 ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAAAAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATT
62 ATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAA-AATATT
* * * *
108110 CAGAATAACATAATTA-TAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTG
125 CAAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA--AAGAGATTTAAAAA-TA
* * *** * * * * * *
108174 AATCTATTTATTGAACAAGTTTAAA-TAGTTATGACTAATTGAATAATTACCTTTTTCAAATCAT
183 AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * * *
108238 TATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTAATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAGT
247 TATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAAT
* * * *
108302 AATAC-AAATTTAATAATATTC-AGGCAATTATATTAA-TAAAAATCTAAAAAATAACTATGTTT
310 AAT-CTAAA-TTAATAATATTCTA--AAATTA-A-TAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATATTT
* ** ** * * * * * ** *
108364 ACCGAATAAATTCAAATAGTTATGACTACTT-GAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTT
369 GCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * * *
108428 TTGTTTTGTCCTAAAACAATTGTTT-TGGTTCATATAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATATTAA
433 TAGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAA
* * * * * * * * * * *
108491 TTTATTAACATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGT
496 TTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAAT
* * * * * * *
108556 TTAAATAA-TCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCCTTTGTTTTGTC
561 TCAAATAACT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATA
* * * * * * * * * * *
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* *
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685 TATAAGAAACTTAATGAGTTGA-AGAT
** * * * * * * *
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1 TTAAAAAATAAATCAATTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAATATCTATTT
* * * *
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66 CA-AATCATTATGACATTTTGTTTTGTAAT-AAAACAATTGTTTTATTCATACAAAATATTCAAA
* *
108808 AT--AATAA-A--AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAAATAAATATG
129 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAG--AGA-TTT-AAAAATAAATATG
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** * * * * *
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* * * * * * *
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314 TAAA-TTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTGCTAAACC
* * ** * *
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* ** * * * *
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441 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAA
* * * * * * * * * *
109185 ATTTCAAAAATT-ATAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAGCAAGTTTAAATAG
505 ATTTCAAAAATTAAT-AAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAATTCAAATAA
* * * * * * * * *** *
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569 CTATAAC-TATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATAAAAAAATAA
* ** **** *
109313 TTGTTTCTATTCATGCAAGTTTATTGGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-AAA-
633 TTGTTTCTATACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATA-TATAAGAAAC
* * *
109376 TTAA-AAGGTAGAAGAC
695 TTAATGA-GTTGAAGAT
* * * * * * * * * *
109392 TTAAAGAATACATTAGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCATGTCCATATGAACAATTATCTATT
1 TTAAAAAATAAATCAATTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCTATT
* * * *
109457 TCAAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCTTGCAAAATTATTCA
65 TCAAATCATTATGACA-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAAA-TATTCA
* * * * * * *
109521 GAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGGGAATTAAAAACTAAATCTAT
127 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGAGATTTAAAAA-TAAATATGT
* * * ** * * ** *
109586 TTAACGAAACAA-TTTAAA-TAGTTATTACCATTTGAACAATTATATATCTCAAATCGCTATGAT
190 TT-ACCAAACAAGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
109649 CTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCAAACAAGGTTATTCTA-ATTAAAATAATACTA
253 CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAAT-CTA
* * * * * *
109713 ATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG---AGATTT--AAAA-AAATGTGTTTGCTGAACCAGT
316 AATTAATAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTGCTAAACCAGT
* * ** *
109772 TTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCAT
380 TCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTTTAGTCAT
* * * * * *
109837 AAAACAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGGATAA-AAAAAAATACTAATTTAATAATAT
445 AAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
* * * * * * * * **
109900 TCCAAAAATTAGT--G--AAAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCGAATC-AATTCAAATAGTT
507 TTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATAT-ACCAAACAAATTCAAATAACT
* * * *** * * *** * *
109960 A-AGACTA-TAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCCGACCTTTT-ATTTAGTCCTATAATAAG
571 ATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTA-TAAAAAAATAAT
* * * ** * * *
110022 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATGAAAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAACATTCTAA-AAA
634 TGTTTCTA-TACATAAAAGTTTAT-CCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATA-TATAAGAAA
* **
110085 -TTAATAAG-CAAGAGAT
694 CTTAATGAGTTGA-AGAT
* * *** * * * * *
110101 TTGAAAGATAAATTTGTTTA-CTGAACAGGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TGA
1 TTAAAAAATAAATCAATTTATC-GAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCT-A
* * * * * ** * *
110164 TTTAAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTCAT-AAATGATTGTTTTAGTTCAT-CAAAGCTTATC
63 TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAA--ATATT
* * * * * *
110227 CAAAAGAAAATAATACTATTTTGTTATTGTTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
125 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAA--AAGAGATTT-AAAAATAA
* ** * * ** * * **
110292 AT-TAATTTACTGAATAAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATTGTT
184 ATAT-GTTTACCAAACAAGTTCAAATTATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * *** * * *
110356 ATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCAACATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAG
248 ATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * ** ** * *
110421 TACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGGTTT-AAAAA-AAACCTATTTACCAAA
312 T-CTAAATTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTGCTAAA
** * ** * *
110481 CCAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTC
375 CCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTT-
* * * * * * *
110545 TA-TAATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACACTAA--T-TT-
438 TAGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * ** * *
110605 --A-GT----AA-T-AT--G----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTGGCAAACCAATTCAAACA
503 AAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAATTCAAATA
* * * ** * * * * * *
110655 ATTA-AGACTATATGAACAATTAAT-TATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
568 ACTATA-ACTATTTGAACAATT-ATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATAAAAAAAT
* * * **** * * * * *
110718 AATTATTTC-AGCT-CATACAAGCTTATTTGGAATAGAGTAAGACTAATTTATTAACATTTCAA-
631 AATTGTTTCTA--TACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATATAT-AAG
**
110780 AAA-TT--T-A-TAAAAGAT
691 AAACTTAATGAGTTGAAGAT
* * * * * * * * *
110795 TTAGAAAAT-AATTATATTTACCAAACCAGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
1 TTAAAAAATAAATCA-ATTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCTAT
* * * * * * ** *
110859 TTCAAATCATTAT-TCCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGGTAATATAAGTTTGTTC
64 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAA-AATATTC
* * * *
110922 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAAAGATCTAAAAAGTAAA
126 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A--AAGAGATTTAAAAA-TAAA
* * * * * * *
110987 -ACTGTTTACCAATCTATTTCAAA-TAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
185 TA-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** * * * ** * **
111050 ATAACCTTTTCTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTTTTGGGAATAAAATAA
248 ATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* ** * * *
111115 TACTAATTTAATAATATT-TCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTG-TC
312 T-CTAAATTAATAATATTCT-AAAA-TTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTTGCT-
* * * * * * *
111178 AAACTACTTCAAATAGTCAAG---A-T--AA-TATGA-AT-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
372 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGT
* * ** * **
111234 TTTGTCATCAAACCATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
437 TTAGTCATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * *
111298 TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACTAGTTCAAA
501 TAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAATTCAAA
** * * * * * * * * * *
111363 TAGTTATAACTATTTGAGCAATTGTCAATTTCAATTCGTTA-AGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAA
566 TAACTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACT-TTTGTTTTATAAAAAAA
* * * ***** *
111426 CAATTGTTTCTGAT-CATAGAAGCTTAT-TTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA
630 TAATTGTTTCT-ATACATAAAAGTTTATCCAAAAT-AAAATAATACTAATTT-AT-ATATAT-AA
* * *
111489 -AAA-TTTATAAG-TAAGAGAT
690 GAAACTTAATGAGTTGA-AGAT
* ** * * * * * * * * *
111508 TTAAAAAATAAA-CATACTTGCCAAACTAGTTCAAATAGT-TTAAACTATTAGAATAATTATATA
1 TTAAAAAATAAATCA-ATTTATCGAACAAGTTCAAATAATCAT-GACAATTTGAACAA-TATCTA
* * * * * * * * * * * * **
111571 TTTTAAATCATTCTAACCTTTTATTTAGTTAGAAAATATTTATTTCATATC-TAACAATCTTATT
63 TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAT-TCAT-ACAA-AATATT
*** * * * *
111635 TGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAGAATT
125 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-AA-G---AGATTT-AA-AAAT
* * ** * * * *
111699 AAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATGGTGATGACTATTT-AACAATTATTTATTTAAAATCAT
182 AAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATTATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * *
111763 TATGACATTTTGTTTT-TATATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAA
247 TATGAC-CTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAA
* ** * ** * * * *
111826 TAATACTAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAACCAAGAGTTAAAAAAATAAAT-TAGTTT-A
309 TAAT-CTAAATTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATA-TTTGC
* * * *
111889 TCAAACAAATTCAAATAGTTACA-ACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTT
371 T-AAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TT
* * * * *
111953 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
433 TAGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * * *
112017 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG----TG-ATATAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATC-AG
497 TTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAAT-TAAAAAATAAATATATATACCAAA-CAAA
** * * * * * *
112076 TTCAAATAA-TCATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTT-TATTTGG
560 TTCAAATAACT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGT-TTT-A
* * * * * * * ** * * * * *
112139 TCATATAACAATTGTTT-TTTATTATAGAACATTATTCGAAATAAAATAACAGTAAATTATTAAT
622 TAAAAAAATAATTGTTTCTATA-CATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-AT
* * * *
112203 CTTTCAA-AAA-TTAATAAG-TAAGAGAT
684 ATAT-AAGAAACTTAATGAGTTGA-AGAT
* * * * * * * * * * *
112229 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTTAACTAGTTATAACTATTTGAACAACTGTATATT
1 TTAAAAAATAAATCAATTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCTATT
* * * * * * * * ** **
112294 TCTAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAAGTTTATTTGA
65 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAA-AATATTCAA
** ** * *
112359 AATAAAATAATACTAACATAAAAATATTCCAAAAATTAATAACTGAGAGATTTAAAAAATAAATT
128 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AA---AGAGATTT-AAAAATAAATA
* * * * * **
112424 TGTTTGCCAAACTAGTTCAAA-TAGTTAAGACTATATGAACCGTTATCTTATTT-AAATCA-T-T
187 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTAT
* * * ** * *
112485 ----TTTGTTTTGTCATAAAACAGTTTTTTCA-ATAGATACTAGCTTATTTCA-AATAAAATAAA
250 GACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAT
* * * * ** * * * * * * *
112544 ATGAATTTATTCATATTAAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTCTGTTTACCT-AA
313 CT-AAATTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTT-GCTAAA
* * * * ** **
112608 CGAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGCTAAAACCTTCT-GTTT
375 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TAG-TT
* * * * * * * * * *
112672 TA-TCGTAAAACAAATGTTTTTGA-TCATACAAGTTTGTTTGAAGTAAAATAATACTTATCTATT
438 TAGTCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * ***
112735 AATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTACAAAATAAACT-TGTTTATCATACCGGTTCAAA
502 AAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAA-TATATATACCAAACAAATTCAAA
** * * * * ** * * * *
112795 TAGTTATGACTATTT-ATGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-GACTTTTTGTTCTATTATAAA
566 TAACTATAACTATTTGA-ACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTATAAAAAA
* * * * ** * * **
112858 ATAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTTGA
629 ATAATTGTTTCTATACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATAT-ATA-TAAGA
*** *
112922 CAA-TTAATGAGAAAAAAAT
692 -AACTTAATGAGTTGAAGAT
* * * * * * * *
112941 CTT-AAAAATAAAT--ATGCTTACCGAACTAGATGAAATAGTCATGACTATTTCAATCATTATCT
1 -TTAAAAAATAAATCAAT--TTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAA-CAATATCT
* * * * * * ***
113003 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAAAAATCACTTCTGTTCTT-ATA-AGCTTA
62 ATTTCAAATCATTATGACATTTTG-TTT-T-GTAATAAAA-CAATTGTTTTATTCATACAAAATA
* * * * *
113066 TTCAAAGTAAAATAATACTAAGTTATTGACATTTTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAGAT
123 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA--AAGAGATTTAAAA-AT
* * * * * * * * * * * **
113131 GAATTTGGTTAACGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTGAAATCGC
182 AAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATTATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * ** * * * * *
113196 TATAACCTTTGTTTTGTCGTAAAATGATTTTTTTTATTTATACAAGCTTATTTC-CAATAAAATA
247 TATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATA
* * * * * *
113260 ATATAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATACGTAAAAGATCT-AAAACTAAAT-T-TGTT--
311 ATCTAAA-TTAATAATATTCTA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATAT-TTGC
* * ** * ** *
113319 TAAA--A--TC---T--TTATGATTATTTGAACAAGTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
371 TAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAG
* * * * *
113375 TTTTA-CCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAACAATATTAATTTA
436 -TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
113439 TTAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA-AGTTTATCAAACAGATTC
500 TTAAAATTTCAA-AAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATA-TATACCAAACAAATTC
* * * * * * * * * *
113502 AAAT-AGTCATGAA-TATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATAATGACCTTTTGTTTTGTAAT
563 AAATAACT-AT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATAAA
** * ** *** * * *
113565 AAAATAATTGTTTC-AGT-TGTATAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTC
626 AAAATAATTGTTTCTA-TACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATA-TA
*
113628 TAA-AAA-TTAATGAGTATG-AGAA
687 TAAGAAACTTAATGAGT-TGAAGAT
* *** * * * * * * * *
113650 TTAAAAAATTAATTTGTTT-GCTGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGACCAATTATCTAC
1 TTAAAAAATAAATCAATTTATC-GAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCTAT
* * * * * * * **
113714 TTCAAAACATTATGAC-TTTTCGCTTTATCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTT
64 TTCAAATCATTATGACATTTT-GTTTTGTAATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAA-AATA-TT
* *
113778 C-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAATAAA
125 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAG---AGATTTAAAAATAAA
* * * * * * * **
113841 TATATTTTCTAAATACA-TTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAATTGTT
185 TATGTTTACCAAACA-AGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * **
113904 ATGACCTTTTGTTTTCTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
248 ATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * * * * * *
113969 TACTAATTTATTAAAATCCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATCTATTT-ATCG
312 T-CTAAATTAATAATAT-TCTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTGCT-A
* * * * * * * *
114033 AGCGAGTTCAAATAGTTATGACCCTA-T-GAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-TTTTTG
373 AACCAGTTCAAATAGTTAAGA--CTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAG
* * * * * * * *
114095 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCATTCAAATAA-TTTCATTCGAAATAAAATAATGCTAGTTTA
436 TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* ** * * * * * **
114159 TTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACACTTTCA
500 TTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAATTCA
* ** ** * * ** ***
114223 AAT-AGTCATGTCTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGATA-TTTTGTTTCGTTGTA
564 AATAACT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-AAACTTTTGTTTTATAAAA
* * * ** * *
114286 AAACAATTGCTTCTATTA-ATACAAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
627 AAATAATTGTTTCTA-TACATA-AAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTA-T-ATATAT
*
114349 CAA-AAA-TTAAT-A---AAAGAT
688 -AAGAAACTTAATGAGTTGAAGAT
* ** * * * *
114367 TTAAAAATTAAATTTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-ATATTATCTAT
1 TTAAAAAATAAATCAATTTATCGAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACA-A-TATCTAT
* * *
114431 CTT-AAATCATTATG--ATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTAATAGATCTGTTTACTGAA
64 -TTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTG--T--T---T-TATTCA-T--A
* ** *
114493 CAAGTTTAAATATTCATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTATAATAAATATGACCTTTTGCTT
116 C-A----AAATATTCA--A--AATAAAATAA-TA-CTAATTTAT--T--A-AT-A---TTT-C-A
* ** * ** * ** * * *
114557 TATTTTAAAACA-A-TTAGTAAGTTAAATTTGTTTGTCAAACCAA-TT-AAAGTAATTAAAGACT
159 AAAATTAAAAGAGATTTA--AAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAA-TTATT-ATGATT
* * * * *
114618 ATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTG
219 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTATTTATG
* *** * * * * *
114683 AATTCA-ACTAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAGGAATTTATTAATGTTTCAAAAACTAATAAGT
283 --TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAT-AATCTAAATTAATAAT-ATTCTAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * * **
114747 AAGAGATTTATAAAACAATTCTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAAT
344 AA-AAATTTAAAAAATAAATATATTT-GCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAAT
* * * * * * * * *
114811 TATCTATTTCAAAACGTTATGTCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAG
407 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTTTAGTCATAAAATAATTG-TTTCTATTCATACAAG
* * * * * * *
114875 TTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATCTATTGATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAA
471 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAA
* * * * * ** * * * *
114936 AAATAAATCTATTTATCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAA
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** * * * * * ** * * * ******
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* ** * * ** *
115065 AAATAATACTCATTTAT-TAATATTTCGACAA-TTAATAAATAAAAAAT
665 AAATAATACTAATTTATAT-ATA-TAAGA-AACTTAATGAGTTGAAGAT
* * * * * * * * *
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* * * * * * **
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* * * *
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126 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA--AAGAGATTT-AAAAATAAA
* * * * * * * * * *
115305 TCTATTTGCCAAGCAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCTTTA
185 TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATTATTATGATTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * ** *
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* * * *
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* * * * ** * * * ** * *
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372 AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAG
* * * * * *
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436 TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* ** * *** * * * * ** * * *
115621 TAATATTTTGACAATTAATAAGTGGAAGATTTATAAAATAAATAGATTTTTCGAACAAGTTCAAC
501 TAAAATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAATTCAAA
* * * * * * * *
115686 T-AGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA
566 TAACT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATAAAAAAA
* * * * ***
115750 CAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCCAA
630 TAATTGTTTCTA-TACATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATAT-ATA-T--AA
** *
115813 -AAA-TTAATGAGAAAGAA-AA
690 GAAACTTAATGAG-TTGAAGAT
* ** * * * * * *
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1 TTAAAAAATAAATCAATTTATC-GAACAAGTTCAAATAATCATGACAATTTGAACAA-TATCTAT
** * * * ** **
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64 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTAATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAA-AATA-TTC
* * * * *
115961 -GAATAAAATTATA--AATTTATTCACATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAATAAATA
126 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAG---AGATTTAAAAATAAATA
* **** ** *
116023 TATTTTTTTAACACTTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
187 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATTA-TTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * ** * * * *
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251 ACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-C
* ** * * * * ** * *
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314 TAAATTA-ATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTGCTAAACC
** ** * * * *
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* * * * *
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AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCA
AACAAGTTCAAATTATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTT
TGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATCTAAATTAATAAT
ATTCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA
AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTTTAGTCATAAAATAATTGT
TTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATA
AGCAAAAGAATTAAAAAATAAATATATATACCAAACAAATTCAAATAACTATAACTATTTGAACA
ATTATCTATTTAAAATCATTATAAACTTTTGTTTTATAAAAAAATAATTGTTTCTATACATAAAA
GTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATATATATAAGAAACTTAATGAGTTGAAGAT
Found at i:107500 original size:17 final size:16
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*
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* *
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* * **
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* * *
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*
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* * * * * *
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* * * *** * * **
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* * * * *
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* * * * **
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * * * * * *
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1 TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-
** * * * * * *
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63 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* *
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* * * ** *
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1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATT
* * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC
* * * * *
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* * ** * * *
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130 TTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * **
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1 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * *
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TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
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* * * * *
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* * * *
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*
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* * **
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* * * * *
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* * *
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Matches are distributed among these distances:
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CTTATTTGGAATAAAATAACACTAATTTAG
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CTATTTCAAATCATTAT
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113150 GTTTAAATAA
* * * * ** * *
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* * * * *
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*
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* * * *
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* * * *
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*
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TAAGTAAAAGATCTAAAACTAAATTTGTTTAAAATCT
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* * ** * ** *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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190 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGT
* * * *
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* * * * ** *
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** * * * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * * * * *
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66 TGTTTCTGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATTATAC-AATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * * ** ** * *
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192 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTC
**
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256 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGAAAGA
* * * * * *
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1 TTATGACTATTTGAACA-ATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * * * * ** * *
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** * * * *** *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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350 TTCAAATAA
* * * * * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
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* * *
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* * ** * * **
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*** * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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* * * * ** *
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*
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* * * * * * **
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* * ** *
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* ** * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * *
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* * * *
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1 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
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* ** **
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* *
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195 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTAGTTCATA
* * ** * * * * *
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*
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323 -TAAAAAATAAATCTATTTACCGA--ATAGTTCAAATAA
* * * *
116225 TTATTACTATTTGAACAATTAT-TCATTTCAAATCATTATTATC-TTTTGTTTTGTCTTAAAATA
1 TTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACA
*
116288 ATTGTTTCTATTCATA
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** * *
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* * * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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*
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* *
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* * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * *
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** * * *
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* * * * *
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*** * * * * * * *
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* *
120952 TAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTGTT-G
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* * * ** * *
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1 -TTATTAATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC-
* * * * * * *
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* * * ** * ** * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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255 -TTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
* * * * * *
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318 TTGAACTGATTCAGA-AAACATA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA
* * * *
121360 ATAAATTGATATTATTTTATTTTGAATAA-TTTGTATGAATAAAAACAACTGTTTTATGATA-AA
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* * * * * * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
121839 A-TGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
322 ACTG-ATTCAGAAAACATA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
* * ** **
121902 ATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGGTTACATGAATAGAACGAATTATTTTATG-ACAAAACAA
385 A-TTAT-TT-TTTTTTTTG-AATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTATTTTATGAAC-AAACAA
* * * * * *
121966 AATGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACAT-ATTC-AG
444 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGATTCGA-
* * * *
122029 TAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTAC
507 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * ** *
122058 TCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTAAAATAAGCTTATATGAACTGA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAA
* * * *
122123 AACAATTATTTTATTAA-AAAACAAAAGATCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGT
66 AACAATTATTTTA-TAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
** * * * * * * * * *
122187 CAGGACTATTTGAGCTTGTTCTAAAAAAAATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTGATTGTC
130 CATAACTATTTGA-CTTGTT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
122252 AAAATATTAATAAATTAATATTATTGTAGTTT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
193 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTG-TT
* * * * *
122316 TATGATAAAAAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-GATTT
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
** *
122379 GAACTTG-TTCAGTAAATGGAT-TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA--TTT---ATATT-A
320 GAAC-TGATTCAG-AAA-ACATATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * *
122436 T---TTA-------TTTGGAATAAGCTTATACGAACAGAAA-AATCATTTTATG-ACAAGACAAA
382 TAAATTATTTTTTTTTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTATTTTATGAACAA-ACAAA
* * * * * * *
122489 AGGT--TGAAGCAATTTCAAAAAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTG-TTTGA
445 AGGTCAT-AA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GACTTGATTCGA
* * * *
122551 TAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTAA
507 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * * * **
122580 TTATTAATTTTTGTAATATTGATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATGAGCTTAT-TGAATTGT
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAA
* * * * * * *
122644 AATAACTT-TTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
66 AACAA-TTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* *** * * * * * * * *
122708 CATGACTATTTGA-TCCAATTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTAATTATTAATTATT
130 CATAACTATTTGACT-TGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * *
122772 GAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTATGAATCAAAACAATTATTT
193 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATT-GTT
* * * ** * ** *
122836 TATAACAAAACAAAAAG-CCTAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
* * * *
122900 AACTCATTTTATAAATAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TT-ATTTTT-GAAATATTAAT
321 AACTGA-TTCAGAAA-ACATATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT
* * *** * * * * *
122959 AGATTAGTCTTACTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAA-ACATTTGTTTTATG-ACAAAA
383 AAATTA-T-TT--TTTTTTTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAATA-A-TTATTTTATGAAC-AAA
* * * * * * *
123022 CAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTTTG
441 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACTTGATTCG
* * * * *
123087 GTGAACAAAATTAATTTTTAAATCTCTTAC
506 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * *** *
123117 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATTC
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA-TATGAACT-
* * * * * * *
123181 AAAAAAACTTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC--ATA
64 AAAACAA-TTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * ** * * * * *
123244 -T--TAAATATTTGAATTGGTTTGGCAAACAAATTTATATTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTT
128 GTCATAACTATTTGACTT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * **
123306 T-AGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTGTGAACAAAATTAATTGTT
192 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTG-T
* ** * * * * * *
123370 TTATAACGGAACAAAAGGTTATAACGATTT-AAAGTTTG-CAATTGTTCAAATAATTAT-A-TAT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA--TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
* * * *
123431 TTGAACT-AGTTCAGTAAATAGATA-TATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATT
318 TTGAACTGA-TTCAG-AAA-ACATATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
* * * * ** *
123494 AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAGGCTTGAATG-ATCAAAAACAATTATGATATGACCA
380 AATAAATTA-T-TT-TTTT-TTTTGAATAAGCTTGTATGAAT--AAAATAATTATTTTATGAACA
* * * * * * * * *
123558 AACAAAAGGCCATAA--TTTTCAATAAACAGATAATTGTTTATATAGTCTTAATTGTTTGAAC-T
439 AACAAAAGGTCATAACGATTT---GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTT
* ** * *
123620 -ACTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
500 GA-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * ** * *
123656 TTTTTAATTTTTGGAATATTATTAAATTATTATTATTTTA-TTCCAACTAAGCTTATATAAACTG
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTATATGAACTA
* * * * * *
123720 AAATAGTTATTTTATAA-TAAACAAAAGGTTATAATTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-
65 AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
**
123783 -A-AAC----TG----GTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGA
130 CATAACTATTTGACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * *
123834 AATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAGGCATGTATG-ATGAAAACAATTATTTTA
195 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATT-GTTTA
* * * ** * * * * *
123897 TAACAAAATAAAAGTTTGTAATGATTTAAAATAGAAAATTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAA
258 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG--
* *
123962 AAC-GATT--GATAAAC-TGACTTCTTTTTTAAATCT-TTAACTT-TACAATTTTT-GAAATATT
321 AACTGATTCAGA-AAACAT-A-TTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTAT-TAATTTTTAG-AATATT
* * * * * ** *
124020 AATAAAGTAATATTATTTTATTTCGGATAAGCTTTTATGAACTGAACCAATCATTTTATGATA-A
380 AATAAA-T--TATT-TTTTTTTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAATAATTATTTTATGA-ACA
* ** *
124084 AACAAAATGTCATAA-TTTTTATAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-A
439 AACAAAAGGTCATAACGATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGA
* * * ** * *
124147 TTTGGTAAACATATTTATTTTTTATTTTTTCTTAT
502 TTCGATAAACAAATTTATTTTTTA-AATCTCTTAG
* * ** * * * *
124182 TTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTACGAATTGA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-A
* * * * * * *
124247 AAA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
65 AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * *
124311 CTTAACTATTTGAAC-TGGTCAATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-
130 CATAACTATTTG-ACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * *
124374 AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTT-GAAGAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG--T
194 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTT
* ** * * * * *
124436 -TGA-AATAGTCATAAATAT-TTGAACTAATTTGATAAATAGATTTAGTT-TTTAAAT-CTCTTA
257 ATGACAA-A-ACA-AAAGGTCAT-AA-TGATTTG--AAATAGA--TAATTGTTCAAATAGTC--A
* * *
124496 TTAATT-TTTGAAAT-ATT-A-ATAAA-TTAGTATTATTTT--AT-T-TTGA---A-TAA-TTTT
311 -TAATTATTTGAACTGATTCAGA-AAACATATTATT-TTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTT
* * * * *** * *** * *
124547 -G--TATAAATAGAAATAATTGTTTTGCGGTAA-AA-C----A-AAATGTCATAACTATTTGA--
372 AGAATATTAATA-AATTATTTTTTTTTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAAAATAATTATTTTATG
* * * * * * * * * ** * *
124600 AATAGATAATAGCTTA-AATGGACTTG-ACTATTTAAACTTGTTC----GGT--GAACATATTT-
435 AACAAACAAAAGGTCATAA-CGATTTGAAATAGAT-AA-TTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTG
* * * * * *
124656 A-TT--TT---T----TAA---A-TCTTCAACT-TATTAA
496 ACTTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* ** ** *
124681 TTTTT-A------GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAA-TAG
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTA-
* * * * * *
124738 AAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAATATCATAA-AGATTTGAAATAAGTAATTATTCAAAGAG
65 AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * *
124801 TCATAACTATTTGAACTTG-CTCAGTAAATAGATTTACTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
129 TCATAACTATTTG-ACTTGTTTGA-TAAATAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-T
* * * *
124865 TTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTG
189 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATT-
* * * * *
124929 GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTAT
253 GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
* * * *
124994 TTGAA-TGTGTTCAGAAGATATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTT-GAAATATT
318 TTGAACTG-ATTCAGAAAACATA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATT
*** * * ** *
125056 AATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGTTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGATA-A
380 AATAAA-TTAT-TT-TTTT-TTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTATTTTATGA-ACA
* * * * ** *
125120 AACAAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCTGATAGTCATAACTATTTGAACATG-
439 AAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGA
* * * **
125184 TTC-AGTAAACAGATTAATTTTTTAATTCTCTTTC
502 TTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * * *
125218 TCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGTTAAATATA-CTTATATGAACTG
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTATATGAACTA
* * * * * * *
125282 AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTGAAAATAGATAATTATTCAAATAG
65 AAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTG-AAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * *
125346 TCAAAACTATTTGAACTTGCTCGATAAATATATTGATTTTTTAAATCTTTTTTATTTTTTACATC
129 TCATAACTATTTG-ACTTGTTTGAT-AA-ATA--GA---TTT--A--TTTTTTA------A-ATC
* * * *
125411 TTTTACTTATT-ATTTGTTGAAATATTTATAAATTAATATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTA
175 TCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTA
* * * * ** *
125474 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCACAACAATTTGAAATAAAATAATTGTT
238 TGAATAAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTT
* ** * * * * * *
125539 CAATTAGTCATAAAGATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAATTTTACTTTTTAAATCTTTTACCTAT
301 CAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGATTCAGAAAAC-ATATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * *
125603 TAATTGTCTT--AATATTAATAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACCGAAAA
364 TAATT-T-TTAGAATATTAATAA-AT-TATTTTTTTTTTTG-AATAAGCTTGTATGAA--TAAAA
* ** * * * * *
125666 -AATCATTTGGTG-ACAAAACAAAAGATTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCA
422 TAATTATTTTATGAAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
125729 TAATTATTTAAACTT-ATTCAATAAACAAATTCATTTTTTAAATATCTTAA
486 TAACTATTT-GACTTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
** * * *
125779 TTATTAATTTTCAGAATATTAA-AACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGGTGATATGAACTAA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAA
* * * * * * * * * *
125843 AATAATTTTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAAGAATTTGGAATAAATACTTATTCAAATAGTG
66 AACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* * *** * * * * * * **
125908 ATGACTATTTAATCTAAATTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCA
131 ATAACTATTTGA-CTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * **
125973 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTCAATTCGAATAAGCTAT-TATGAACAAAAATTATTGTTTT
194 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT-TGTATGAATAAAAACAATTG-TTT
* * * * ** ** *
126037 CTAATAGAACAAAAAAT-ATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
257 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
* * * *
126101 ACT-AGTT-AGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCATATTAATTTTT-GAAATATTAAT
322 ACTGA-TTCA-GAAAACA-TATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT
**
126163 AAATTCATTTTATTTTATTTTGAATAAGCAGGTATGAATTGAAAA-AATTATTTTATG-ACAGAA
383 AAATT-A-TTT-TTTT-TTTTGAATAAGCTTGTATGAA-T-AAAATAATTATTTTATGAACA-AA
* * ** ** * *
126226 CAAAA----AT---GATTTGAAATATATAATTGATCGTATAGTTTTAACTATTTGAACTAG-TTT
441 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGATTC
** *
126283 GGCAAACAAATTT-TTTTTTAAATCTCTTAA
505 GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
** * * * * *
126313 TTATTAATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAACAAA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAA
* * * * * * * * *
126378 AATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAACAGTC
66 AACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
126443 ATAACTATTTGAATTTGTTT-AGTAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTCATTAATTTTTT
131 ATAACTATTTG-ACTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTT
* * * * * * * * *
126504 GAATTATTAAGAAATTAGTATTTTTTTATTTTGGATAAGGTTTTATGTACT-AAAACAATTAATT
193 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-AATAAAAACAATT-GTT
* * * * * * *
126568 TATGTCAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTC-AATAATCATCACTATTTG
256 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
* * * *
126632 AACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCAT-TTCCTTATTAATTTTTTGAATGTTAA
321 AAC-TGATTCAGAAAACATA-TTATTTTTT-AAATC-TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * * *
126695 TAAATTTAGATTATTTTATTTTGAAAAAGCTTGTAAGATATGAAACAAATATTTTATG-ACTAAA
382 TAAA-TT--ATT-TTTTTTTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATAAAATAATTATTTTATGAAC-AAA
* * * * * ** * **
126759 CAAAATGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAATTGGCTCG
441 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACTTGATTCG
** * * * *
126824 GCAAACACATTTGTTTTTTAAATCTCATAC
506 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * ***
126854 TCATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTA-ACCGAATAAGCCTCTATAAT-AA-
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CT-TAT-ATGAAC
* *
126915 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATC--------TT--AAT---T-A---TTCAAATA
63 TAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
126961 GTCATAAGTATTTGAAC-TGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTC
128 GTCATAACTATTTG-ACTTGTTTGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
*
127025 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAACAATTGT
191 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTG-
* * * * * *
127089 TTTATGACAGAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCAAATGGTGATAATTATT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
* * ** * * * * * * * * *
127154 TTAACTAATTTGGTAAACAAATTTTTTTTTAAGTTTCTTACATACT-A-TTTCAGTAAGTACTAA
319 TGAACTGATTCAGAAAACATATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA-TATTAA
* * ** * * * * *
127217 TAAATTACTATTAGTTTATTCCATCTAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATG-ACAAAT
382 TAAATTA-T-TT-TTTTTTTTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAAAATAATTATTTTATGAACAAA-
* * * * * * *
127281 CAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTTTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTA
441 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ACTTGATTC
* * **
127346 G-TAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTC
505 GATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAG
* * * * * * * *
127377 TTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGCATGAATTTATTTTGAATAGGCTTGTATAAACTGA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAA
* * ** * * ** * * * * * *
127442 AACAATTTTTTTATGATTAAATAAAAGGTCGA-AACGATGTCAAATAGATAATTTTTCTAATAAT
66 AACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATC-ATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * * ** * * * *
127506 CTTAACCATTTGAATTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
130 CATAACTATTTGACTTG-TTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * *
127571 AAATATTATTAAATTTGCATTATTTTA-ATCAGAA-AAGCCTGTACGAAT-AAAACAATTGTTTT
194 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTG-TTT
* * * * * ** *
127633 ATGACAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGGAATTGATAATCGTTCATATAGTTTTAACTATTTG
257 ATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
* ** * * * * ** * * * *
127698 AACTGGTTTGGTAATTAGAT-TTATTTTTAAAATTTTCTTGGTTATTAA-GTTTCGAAATAATAT
321 AACTGATTCAG-AA-AACATATTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAA
** * * * ** *
127761 TAAATTAGTATTTTTTTATTTTGAATAAAATAGTATAAACAAGACCAATTATTTGATG-ACAAAA
382 TAAA-T--TATTTTTTT-TTTTGAATAAGCTTGTATGAATAA-AATAATTATTTTATGAAC-AAA
* * * * * * ** * *
127825 TAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTT-T
441 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACTTGATTCG
* * *
127889 AGTAAACAGATTTACTTTTCAAATCTCTT-G
506 A-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
** * * ** * * * *
127919 TTGATTAATTTTCTAAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTGTTTCAAACAAACTTATATTAACA
1 TT-ATTAATTTT-TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * * *
127984 AAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATA
64 AAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGA-TCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * ** * * *
128048 GTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAA-TTT
128 GTCATAACTATTTG-ACTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
128112 TCAGAATATTACTAAATTATTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTGTT
192 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTG-T
* * * ** * *
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* * *
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320 GAACTGA-TTCAG-AAA-ACATATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTA
* ** * * * * *
128300 GTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTAT-ATTGAAAAGCAATTGTTTCATGAGA-A
381 ATAAATTA-T-TT-TTTT-TTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAA-TAATTATTTTATGA-ACA
* * * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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192 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-AGCTTGTATGAA-TAAAAACAATT-G
* * * * * * * * * *
128715 TTTATGA-ATAAAGAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATTA-AAAACTATTCTAATA-TCCTTAACT
254 TTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGT-CATAATT
* * * * *
128777 ATTTGAACTGGTTCAACAAATACAT-TTATTCTTTAAATCTCTTAC-TACT--TTTTGA-AATAT
316 ATTTGAACTGATTC-AGAAA-ACATATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
* * * * * * **
128837 TATTAAATTAGTATTAGTTTTGTCTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAGTA
379 TAATAAATTA-T-TT--TTTTTTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-AAATAATTATTTTATGAACA
* * * * *
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439 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
128952 TGCTTTTTAA
Statistics
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* * *
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* * * * *
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* ***
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * **** * * * ** * *
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* * * * *
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130 TCATAACTATTTGAATT-GTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* **
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* * * * * * * *
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65 A-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * * *
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*
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* * * * * * *
120332 CTGAAATAATTGTTTTATGA-ACAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAACTGTTCATA
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* * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* *
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* * * * * ***
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* * * * * * *
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66 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* *** * ** * *
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131 CATAACTATTTGAA-TTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
120800 CTTATCAAATTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATG-ATTA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTA
* * * * * * * * *
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66 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
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131 CATAACTATTTGAA-TTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA
* * * ** * *
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1 CTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC-
* * *
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64 TAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** ** * **
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128 AGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *** *
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* * * * *
121226 ACAAACAATTGTGTTATGATAAAACAAATA--TCATAATGA-TTGAGATAGATAATTATTCAAAT
65 A-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
121288 AATCATAACTATTAGAACTGATTCGATAAATAGATTTAGTTTTT-AAT-TC-T-
128 AGTCATAACTATTTGAATTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * *
121338 CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT-GATATTATTTTATTTTGAATAA-TTTGTATGAA-T
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* * * * * * * * * * *
121400 AAAAACAACTGTTTTATGATAAAACAAAATGCCATAAGGATATG-AATAGGTAATAGCTCAAATG
65 -AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * **
121464 GACACAATTGTTTTAACTTGTT-TAGTGAACAAATTTATTTTTTAAATTTCCAA
129 GTCATAACTATTTGAA-TTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *
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* * * * *
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66 -AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
121645 CCATAACTATTAGAACTTGCTT-GTTAAA-AAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTA
130 TCATAACTATTTGAA-TTG-TTCGATAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** *
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1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTATATGAACT
** ** *
121759 AGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 A-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
121824 GTCATAACTATTTGAATGTGTTTAGA-AAACATATTTATTTTTTAAAT-TTTTG
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* * *
121876 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGGTTACATGAA-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAAC
* * * * *
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64 TAAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
122003 AGTCATAACTATTTGAACATATTC-AGTAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTA
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* * **
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1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * * * * * *
122121 GAAACAATTATTTTATTAAAAAACAAAAGATCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAG
65 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * * * *
122186 TCAGGACTATTTGAGCTTGTTCTAAAAAAAATATTTATTTCTTAAATCTTTTA
130 TCATAACTATTTGA-ATTGTTCGATAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * * * *
122239 CTTATTGATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTGTAGTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTA
* * * * *
122303 GAAACAATTGTTTTATGATAAAAAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
66 -AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* *** *
122367 GTCATAA-GATTTGAACTTGTTC-AGTAAATGGATTTATTTTTTAAATCTTTTA
129 GTCATAACTATTTGAA-TTGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *** *** * * *
122419 CTTATTAATTTAT--ATTATTTATTTGGAATAAG-CTTATACGA-ACAGAAAAATCATTTTATG-
1 CTTATTAATTTTTGAAATA-TTA-AT-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-TTATATGA
* *** * ** * ** * *
122479 AC-AAGACAA--AAGGT-TG---AAGC--AATTTCA-AA--A----AGATA-ATTGTTG--AAAT
62 ACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
122525 -AGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTA
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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130 TCATAACTATTTGAAT--TGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
122759 ATTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA-TC
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-
* * * ** * **
122823 AAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAG-CCTAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAG
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** ** * *
122887 TCATAACTATTTGAACTCATTTTATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
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* * * *** * * *
122939 --T-TT-ATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTCTTACTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAA
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* * *
123000 AAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
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* * *** *
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* * *
123180 CAAAAAAACTTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC--AT
65 -AAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * ** * *
123243 A-T--TAAATATTTGAATTGGTTTGGCAAACAAATTTATATTTTAATTCTCTTA
128 AGTCATAACTATTTGAATT-GTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *** * *
123294 GTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTGTGAAC-
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* * * ** * * * *
123357 AAAATTAATTGTTTTATAACGGAACAAAAGGTTATAACGATTT-AAAGTTTG-CAATTGTTCAAA
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* * * * * * *
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* * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * *
123782 G--A-AAC----TG----GTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-
129 GTCATAACTATTTGAATTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
123819 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAGGCATGTATG-A-TG
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* * * ** * * * *
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65 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** ** * *
123947 CCATAATTATTTGAAAACGATT-GATAAACTGACTTCTTTTTTAAATCT-TTAA
130 TCATAACTATTTG-AATTG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-A
* * * * * *
123999 CTT-TACAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGGATAAGCTTTTATGAACT
1 CTTAT-TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * * * * * *
124063 GAACCAATCATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAAT-TTTTATAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** *
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* * ** * * * *
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1 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT
* * *
124245 GAAAA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATA
65 -AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
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129 GTCATAACTATTTGAATTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
124361 CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTTGAAGAAGCTTGTATGAA-T
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* * * ** * ** **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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**** ** * **** * * * * *
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** * * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * *
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185 AATAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATCAAAAACAATTATTTTATGACA-
** * * * * * * * * *
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249 AAACAAAAGG-CCTAA--TTTTAAAAAAGATAATTGTT-AAATAGTCTTAAATATTTGAACT-CT
* * * * * *
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* ** * * *
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** * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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256 AG-GCCTAAT--TTTAAAAAAGATAATTG-TTAAATAGTCTTAAATATTTGAACTCTTTGGCAA-
* * * * * * * *
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* * * * *** * ** *
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* * * * * * * * * * *** *
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** ** * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* ** * ** * * *
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* * * * * * * *
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1 AATATTATTAGA-TTAGTATTATTTTATTCCAACTAAGCTTATATGAACA-AAATAATTGTTTTA
* * * * * * *
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* * **
121303 AACTGATTC-GATAAATAGATTTAGTTTTT-AAT-TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
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* * * * * *
121363 AATTGATATTATTTTATTTTGAATAA-TTTGTATGAAT-AAAAACAACTGTTTTATGATAAAACA
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* *** * * * * * * * ** * * * * * **
121426 AAATGCCATAAGGATATGAATAGGTAATAGCTCAAATGGACACAATTGTTTTAACTTGTTTAGTG
254 AAAGGCC-TAATTTTA-AAAAAGATAATTG-TTAAATAGTCTTAAATATTTGAAC-TCTTTGGCA
* * * ** * ** *
121491 AACAAATTTATTTTTTAAATTTCCAACTCATTAA-TTTTAG
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* * ** * * * *
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* * * * * * * * *** *
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* * * * * *
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* * * * **
121722 ATTAGTATTATTTTATTC-CAATTAAGCTTTTATGAAT-AGAAACAATTGGTTTATGACAAAACA
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * ** * * * * ** *
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* * ** * * * *
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* * * * * *
122019 ACAT-ATTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAATA
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* * * * ** * *
122082 AATTAGTATTATTTTCTT-TAAAATAAGCTTATATGAA-CTGAAACAATTATTTTATTAAAAAAC
189 AATTAATATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * * *** * * *
122145 AAAAGATCAC-AATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCAGGACTATTTGAGCTTGTTCT
253 AAAAG-GC-CTAAT--TTTAAAAAAGATAATTGTT-AAATAGTCTTAAATATTTGAAC-TCTT-T
*** * * * * * * * * ***
122209 AAAAAAAATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTGATTGTCAA
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* * * * ** * * *
122254 AATATTAATAAATTAATATTATTGTAGTTTGAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
1 AATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCCAACTAAGCTTATATGAACA-AAATAATTGTTTTA
* * * * * * * * * *
122318 TGATAAAAAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAGATTTGAA
64 TAACAAAACAAAAGGTTATAATG-ATTTGAAATTAGTAATTGTTCAAATAATTAT-ATATTTGAA
* *
122382 CTTGTTCAGTAAATGGATTTATTTTTT-AA-ATCTT--TTACTT-A---TT--AAT-TT-AT--A
127 CTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * *
122433 TT-AT-TTA---T-TT-GGAATAAGCTTATACGAA-CAGAAAA-ATCATT-TTATGA---CAAGA
191 TTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATCA-AAAACA--ATTATT-TTATGACAAAA
* * * * * * *
122485 CAAAAGG-TTGAAGCAATTTCAAAAAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTT
252 CAAAAGGCCT--A--ATTTTAAAAAAGATAATTGTT-AAATAGTCTTAAATATTTGAAC-TCTTT
** * * * * * *
122549 GATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGT
311 GGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTTGG
** * ***
122594 AATATTGA-TA-ACTTAGTATTATTTTATTTTGAA-TGAGCTTAT-TGAATTGTAATAACTT-TT
1 AATATT-ATTAGA-TTAGTATTATTTTA-TTCCAACTAAGCTTATATGAA-CAAAATAA-TTGTT
* * * * * *
122654 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATT
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* *** * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * **
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* *
122911 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA---TTT-ATTTTTGA
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* * * *
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* * * *
123013 ATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTG
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* ** * *
123142 ATTAATTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCAAAAA-AACTTATTTTATGACAAAAG
190 ATTAATATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TCAAAAACAA-TTATTTTATGACAAAAC
* * * * * *
123206 AAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-CATA---TTAAATATTTGAATTGGTTTGGC
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* * * * * *
123267 AAACAAATTTATATTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAG
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* * *
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** * * *
123374 AACGGAACAAAAGGTTATAACGATTT-AAAGTTTGCAATTGTTCAAATAATTATATATTTGAACT
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* * * *
123438 AGTTCAGTAAATAGATATATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTA
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* * * ** *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * *
123850 TATTATTTTATTCTGAATAGGCATGTATG-AT-GAAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAGTT
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** * * * * * * ** * **
123913 TGTAATGATTTAAAATAGAAAATTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAAAACGATTGATAAACT-
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* * * ** *
123977 GACTTCTTTTTTAAATCT-TTAACTTTACAATTTTTGA
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* * * * ** * * ** **
124014 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGGA-TAAGCTTTTATGAACTGAACCAATCATTTTA
1 AATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCCAACTAAGCTTATATGAAC-AAAATAATTGTTTTA
* * * * * * * *
124078 TGATAAAACAAAATGTCATAAT--TTTTATAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
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** ** * * ** * * *
124141 AACTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTTATTTTTTCTTATTTATTAATTTTTTG-AATGTTAAT
125 AACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTA-AATATCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAT
* * * * ** *
124205 AAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCATGTACGAATTGAAAA-AATTATTTTATGACTAAA
188 AAATTAATATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAA
** * * * * ** ***
124268 CAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTCAA
252 CAAAAGG-CCTAAT--TTTAAAAAAGATAATTGTT-AAATAGTCTTAAATATTTGAACTCTTTGG
* * * * * *
124333 TAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG
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ATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGCC
TAATTTTAAAAAAGATAATTGTTAAATAGTCTTAAATATTTGAACTCTTTGGCAAATAGATTTAT
TTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTTGG
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123618 CTACTTTGGC
* * *
123628 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTTGGAATATTATTAAATTATTATTATT
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* * * * *
123693 TTATTCCAACTAAGCTTATATAAACTGAAATAGTTATTTTATAATAAACAAAAGGTTATAATTAT
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*
123758 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGAAACTGGTTCAAT
128 TTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGAAACTGGTTCAAT
123796 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* * * * * * *
123860 TTCTGAA-TAGGCATGTAT-GA-TGAAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAGTTTGTAATGAT
66 TTC-CAACTAAGCATATATAAACTG-AAACAATTATTTTATAA-AAAACAAAAGGTTATAATGAT
*
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128 TTAAAATA-AATAATTGTTCAAAT
123945 GGCCATAATT
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AAATAAATAATTGTTCAAATAGAAACTGGTTCAAT
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*
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TTATTTATTAATTTTTTC
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123995 TTAACTTTAC
* * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
124395 TATTTTACTTTGAAGAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTGAAATAGTCATAAATATTTGAAC
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* * * * *
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1 AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTT-TATGAAAT-GAAAC
** * * * *
124561 AATTGTTTTGCGGTAAAACAAAATGTCATAACTATTT-GAAATAGATAATAGCTT-AAATGGACT
64 AATCATTTTACGATAAAACAAAATGTCATAA-TATTTAGAAATAGATAATAG-TTCAAATAGACA
* * *
124624 TGACTATTTAAACTTGTTCGGTGAACATATTTATTTTTTAAATCTTC-AACTTATTAATTTTTAG
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* *
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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TCATTTTACGATAAAACAAAATGTCATAATATTTAGAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAAC
TATTTAAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTCTAACTTATTAATTTTTAGAATA
TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGAATGTACGAATAGAAAAAATTATTTTATGACA
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TATTTTACTTTGAAGAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTGAAATAGACATAAAGATATGAAC
TAATTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATT
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* * * * *
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* * *
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** ** * *
124562 ATTGTTTTGCGGTAAAACAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAA-TAGCTT-
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA--TTC
* * * * * * * **
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
** ** *
124680 ATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAATAA
66 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAA
** *
124744 TT-TTTTATGACAAAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATA-AGTAATTATTC
130 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTATTC
* * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA--TTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * *
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64 TAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTTGTATGAATAGAAA
* *
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* *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAA-ACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
*** * *
125040 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGTTTGCATGAATAGAACC
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* * * *
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** * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATT
* * * *
125223 AATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGTTAAATATA-CTTATATGAACT-GAAA
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* * *
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127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG-AAATAGATAATTATTC
* * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATC---------TT
* * * * *
125404 TTACATCTTTTACTTATTATTTGTTGAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGC
56 TT--A-C--TTA-TTA--ATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGT
* * * * *
125469 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCACAACAATTTGAAATAAAATAA
112 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAA
*
125534 TTGTTC
176 TTATTC
* ** * * *
125540 AATTAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTCGGTAAACA-ATTTTACTTTTTAAATCTTTTACCTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * **
125604 AATTGTCTT--AATATTAAT-AATTTGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAACCGAAA
65 AATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGTTTGTATGAATAGAAA
* ** ** * * * * *
125665 AAATCATTTGGTGACAAAACAAAAGATTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * * * *
125720 AAACAGTCATAATTATTTAAACTTATTCAATAAACAAATTCATTTTTTAAATATCTTAATTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * *
125785 A-TTTTCAGAATATTAA-AACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-GTGATATGAACTA-AAAT
66 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTG-TATGAA-TAGAAAC
* * * * *
125846 AATTTTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA-GAATTTGGAATAAATACTTATTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTATTC
* * ** *
125900 AAATAGTGATGACTATTT-AATCTAAATTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAA-CT-TGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* ** * * * * * * *
125964 TAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCAATTCGAATAAGCTAT-TATGAACAAAAAT
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTTGTATGAATAGAAAC
* * * * * ** * * *
126028 TATTGTTTTCTAATAGAACAAAAAAT-ATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * *
126081 AAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTT-AGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCATATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* *** * *
126145 AATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTGAATAAGCAGGTATGAATTGAAAAA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACA
* * *
126209 ATTATTTTATGACAGAACAAAA----AT---GATTTGAAATATATAATTGA-TC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTC
** ** * ** * * * *
126255 GTATAGTTTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTT-TTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* ** * * * * * * *
126319 ATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAATAAT
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * * *
126384 TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAATGATTTTAAATATACAATTGTTC
131 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * *
126435 AAACAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTCATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * *
126497 ATTTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTTTTTTATTTTGGATAAGGTTT-TATGTACTA-AAAC
66 A-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-GTTTGTATG-AATAGAAAC
** * * * * * *
126560 AATTAATTTATGTCAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * *
126614 -AATAATCATCACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTCAAATCATTTCCTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATT
* * * *
126678 AATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTTTGAAAAAGCTTGTAAG-ATATGAAA
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* * * * * *
126740 CAAATATTTTATGACTAAACAAAATGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
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* ** * * * * * ** *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * *** ** * *
126859 AATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATT-TTTTA-ACCGAATAAGCCTCTAT-AATAAAAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAAT-AGAAACA
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129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * *
126956 AAATAGTCATAAGTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAA
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* * *
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* * **
127085 TTGTTTTATGACAGAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTC
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* * * * ** ** * * * *
127137 AAATGGTGATAATTATTTTAACTAATTTGGTAAACAAATTT-TTTTTTAAGT-TTCTTACATACT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATT
** * * * * ** * * * *
127200 -ATTTCAGTAAGTACTAATAAATTACTATTAGTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATTAATTGAAAC
65 AATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGTTTGTATGAATAGAAAC
* * * * *
127263 AATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTTTTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * *
127317 AAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTT-CTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCT-TTTACTTAT
* * * * * *
127381 TAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGCATGAATTTATTTTGAATAGGCTTGTATAAACT-GAAA
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* ** * * * *
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127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * *
127499 TAATAATCTTAACCATTTGAA-TTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * * ** ** *
127563 AATTTTTTAAATATTATTAAATTTGCATTATTTTAATCAGAA-AAGCCTGTACGAATA-AAACAA
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* * * * **
127626 TTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGGAATTGATAATCGTTC
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* ** * ** ** * * * **
127679 ATATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTAAAATTTTCTTGGTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATT
* * * * * ** * *
127744 AAGTTTCGAAATAATATTAAATTAGTATTTTTTTATTTTGAATAAAATAGTAT-AA-ACAAGACC
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAA-A-C
* * * * * *
127807 AATTATTTGATGACAAAATAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
128 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * * *
127861 AAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGTAAACAGATTTACTTTTCAAATCTCTT-GTTGATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATT
* * * ** * ** * * * *
127925 AATTTTCTAAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTGTTTCAAACAAACTTATATTAACAAAAACA
65 AATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACA
* * * * *
127990 ATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * ** *** * *
128043 ATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * * *
128108 A-TTTTCAGAATATTACTAAATTATTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTATATGAACAAAAACA
66 ATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACA
* * * *
128171 ATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * *
128224 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC--TT--TTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * ** * * *
128285 ATTCTAGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTAT--ATTGAAAAGCA
66 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAG-AAA-CA
* * * * * * *
128348 ATTGTTTCATGAGAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTT
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * ** * *
128401 AAAT-GGCAATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAAC-TGATTTATTTTTTAAATCTCTCACTTAT
1 AAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
128464 TAACTTTTGAAATATTAATACAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTT-TATGAACTA-AAA
64 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-TTTGTATGAA-TAGAAA
** * * * *
128527 CAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCCA-AATAATTTTAAATTGATTATTGTTC
127 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * *
128581 AAATAGTAATAGCTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTCAAGTCTCTTGCTTATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATT
* ** * *
128646 AATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAAATAGCTTGTATGAACTA-AAA
65 AA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGTTTGTATGAA-TAGAAA
* * * * * * * * *
128708 TAATTATTTTATGA-ATAAAGAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATTA-AAAACTATTC
127 CAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTATTC
* * * ** * * * *
128763 TAATA-TCCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAATACATTTATTCTTTAAATC---T-CTTACT
1 AAATAGT-CATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
* * * * * *
128823 ACTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAGTTTT-GTCTGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACA
65 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACA
** * * * *
128887 ATTGTTTTATGAGTAAAC-AAAGATCATAAGGA-TT-AAGATTGATAGTTATTC
129 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTATTC
128938 AAATAGTCATAACT
1 AAATAGTCATAACT
128952 TGCTTTTTAA
Statistics
Matches: 3425, Mismatches: 713, Indels: 400
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
161 83 0.02
162 6 0.00
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165 1 0.00
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169 1 0.00
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201 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACAAT
TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
Found at i:125948 original size:561 final size:559
Alignment explanation
Indices: 124676--125957 Score: 1259
Period size: 561 Copynumber: 2.3 Consensus size: 559
124666 TCTTCAACTT
* * *
124676 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAAATTG-TATGAA-TAG
1 ATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGTT-AAAT-ATACTGATATGAACTA-
* ** * * *
124738 AAATAATT-TTTTATGACAAAACAAAATATCATAAAGATTTG-AAATAAGTAATTATTCAAAGAG
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTGAAAATAAATAATTATTCAAATAG
* ** *
124801 TCATAACTATTTGAACTTGCTC-AGT-AA-ATA--GA---TTT--A-----CT-TTTTTTAAATC
127 TCAAAACTATTTGAACTAACTCGA-TAAACATATTGATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTTAAATC
* * * * *
124850 TTTTACTTATTAATTTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATG
191 TTTTACTTATTAATTTGTTGAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATG
* * * *
124915 AACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAA
256 AACAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAA
** * * *
124980 ATAATCATAACTATTTGAATGTGTTCAGAAGATATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATT
321 ATAATCATAAAGATTTGAATGTGTTCAGAAGAAATATTTACTTTTTAAATTTTTACCTATTAATT
* * ** **
125045 TTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGTTTGCATGAATAGAACCAATTGT
386 TTT-AAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACAGAAAAAATCAT
* * * * * ** *
125110 TTTATGATAAAACAAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTATTCTGATAGTCATAACTAT
450 TTGATGACAAAACAAAAATGTCATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTAT
* * * * * * **
125175 TTGAACATGTTCAGTAAACAGATTAATTTTTTAATTCTCTTTCTC
515 TTAAACATATTCAATAAACAAATTAATTTTTTAAATATCTTAATC
* * *
125220 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGTTAAATATACTTATATGAACTGAAA
1 ATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGTTAAATATACTGATATGAACTAAAA
* * *
125285 CAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTTATAATGATTGAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAA
66 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTGAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAA
** * *
125350 AACTATTTGAACTTGCTCGATAAATATATTGATTTTTTAAATCTTTTTTATTTTTTACATCTTTT
131 AACTATTTGAACTAACTCGATAAACATATTGATTTTTTAAAT-TTTTTTATTTTTTAAATCTTTT
125415 ACTTATT-ATTTGTTGAAATATTT-ATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA
195 ACTTATTAATTTGTTG-AAT-TTTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * *
125478 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCACAACAATTTGAAATAAAATAATTGTTCAAT
258 CAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTTAAAAT-AAATAATTATTCAAA
* *
125543 TAGTCATAAAGATTTGAACT-TGTTCGGTAA-ACAAT-TTTACTTTTTAAATCTTTTACCTATTA
322 TAATCATAAAGATTTGAA-TGTGTTCAG-AAGA-AATATTTACTTTTTAAAT-TTTTACCTATTA
* ** * *
125605 ATTGTCTT-AATATTAAT-AATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACCGAAAAAA
383 ATT-T-TTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACAGAAAAAA
* * *
125668 TCATTTGGTGACAAAACAAAAGAT-T-ATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATA
446 TCATTTGATGACAAAACAAAA-ATGTCATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATA
* * * *
125731 ATTATTTAAACTTATTCAATAAACAAATTCATTTTTTAAATATCTTAATT
510 ACTATTTAAACATATTCAATAAACAAATTAATTTTTTAAATATCTTAATC
* * * *
125781 ATTAATTTTCAGAATATTAA-AACTTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGGTGATATGAACTAAA
1 ATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGTTAAATATA-CTGATATGAACTAAA
* * * * *
125844 ATAATTTTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA-GAATTTG-GAATAAATACTTATTCAAATAGT
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-A-TTGAAAATAAATAATTATTCAAATAGT
* ** * *
125907 GATGACTATTT-AATCTAAATTC-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTT
128 CAAAACTATTTGAA-CT-AACTCGA-TAAACATATTGATTTTTTAAATTTTTT
125958 ACTTATTAAT
Statistics
Matches: 604, Mismatches: 96, Indels: 60
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
543 3 0.00
544 59 0.10
545 68 0.11
546 3 0.00
547 3 0.00
549 2 0.00
552 3 0.00
554 1 0.00
559 4 0.01
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565 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (559 bp):
ATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATGTTAAATATACTGATATGAACTAAAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTGAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAA
AACTATTTGAACTAACTCGATAAACATATTGATTTTTTAAATTTTTTTATTTTTTAAATCTTTTA
CTTATTAATTTGTTGAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAA
AAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAAT
CATAAAGATTTGAATGTGTTCAGAAGAAATATTTACTTTTTAAATTTTTACCTATTAATTTTTAA
ATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACAGAAAAAATCATTTGATG
ACAAAACAAAAATGTCATAACGATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAAC
ATATTCAATAAACAAATTAATTTTTTAAATATCTTAATC
Found at i:126066 original size:361 final size:362
Alignment explanation
Indices: 125429--126229 Score: 828
Period size: 361 Copynumber: 2.2 Consensus size: 362
125419 ATTATTTGTT
* * * * * * *
125429 GAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTG-TATGAA-TAGAAACAATTGTT
1 GAAATATTAATAAATTCATATTATTTTATTTTGAATAAGC-AGATATGAACT-GAAAAAATTATT
* ** * * * * * * * * **
125492 TTATGACAAAAGAAAAAGTCACAACAATTTGAAATAAAATAATTGTTCAATTAGTCATAAAGATT
64 TTATGACAAAACAAATGGTCATAAGAATTTGGAAT-AAATACTTATTCAAATAGTGATGACTATT
** * **
125557 TGAA-CT-TGTTCGGTAAACAATTTTACTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCTTAATATTA
128 T-AATCTAAATTCAGTAAACAATTTTACTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTA
* * * * *
125620 ATAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACCGAAAAAATCATTTGGTGACAAAAC
192 ATAATTAGTATTATTTAATTCGAAATAAGCTTGTATGAACCGAAAAAATCATTTGCTAACAAAAC
* * *
125685 AAAAGATTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTA-TTCA
257 AAAAGAATATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAAC-TAGTT-A
125749 -ATAAACA-AATTCATTTTTTAAATATCTT-AATTATTAATTTTCA
320 GATAAACAGAATT-ATTTTTTAAATATCTTGAA-TATTAATTTT-A
* ** *
125792 G-AATATTAA-AACTT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGGTGATATGAACT-AAAATAATTTTT
1 GAAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTTTGAATAAGCAGATATGAACTGAAAA-AATTATT
125853 TTATGACAAAACAAATGGTCATAAGAATTTGGAATAAATACTTATTCAAATAGTGATGACTATTT
64 TTATGACAAAACAAATGGTCATAAGAATTTGGAATAAATACTTATTCAAATAGTGATGACTATTT
* * *
125918 AATCTAAATTCAGTAAAC-ATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA
129 AATCTAAATTCAGTAAACAAT-TTTACTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTAA
** * *
125982 TAAATTAGTATTATTTCAATTCG-AATAAGCTAT-TATGAA-C-AAAAATTATTGTTTTCTAATA
193 T-AATTAGTATTATTT-AATTCGAAATAAGCT-TGTATGAACCGAAAAA--ATCATTTGCTAACA
* * *
126043 GAACAAAA-AATATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGT
253 AAACAAAAGAATATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTAGT
* * * *
126107 TAGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCATATTAATTTTT
318 TAGATAAACAGAATTATTTTTTAAATATCTTGAATATTAATTTTA
* * *
126152 GAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTTGAATAAGCAGGTATGAATTGAAAAAATTATTTT
1 GAAATATTAATAAATTCATATTATTTTATTTTGAATAAGCAGATATGAACTGAAAAAATTATTTT
*
126217 ATGACAGAACAAA
66 ATGACAAAACAAA
126230 AATGATTTGA
Statistics
Matches: 363, Mismatches: 55, Indels: 41
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
359 2 0.01
360 42 0.12
361 201 0.55
362 107 0.29
363 11 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (362 bp):
GAAATATTAATAAATTCATATTATTTTATTTTGAATAAGCAGATATGAACTGAAAAAATTATTTT
ATGACAAAACAAATGGTCATAAGAATTTGGAATAAATACTTATTCAAATAGTGATGACTATTTAA
TCTAAATTCAGTAAACAATTTTACTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCAAAATATTAATAA
TTAGTATTATTTAATTCGAAATAAGCTTGTATGAACCGAAAAAATCATTTGCTAACAAAACAAAA
GAATATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTAGTTAGATAAA
CAGAATTATTTTTTAAATATCTTGAATATTAATTTTA
Found at i:128239 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 126947--128951 Score: 1473
Period size: 182 Copynumber: 11.1 Consensus size: 181
126937 ACAAAGATCT
* * * *
126947 TAATTATTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTGGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * *
127012 TAGTTATAAATTCTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAAGCTTGTATGA
66 TACTTATTAATT-TTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGA
* *
127075 TA-AAAAACAATTGTTTTATGACAGAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
129 -ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
** * * * * * ** * * * *
127128 TAATCGTTCAAATGGTGATAATTATTTTAACTAATTTGGTAAACAAATTT-TTTTTTAAGTTTCT
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * *
127192 TACATACT-A-TTTCAGTAAGTACTAATAAATTACTATTAGTTTA-TTCCATCTAAGCTTGTATT
66 TACTTATTAATTTTCAG-AA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTA-ATAAGCTTGTATG
*** * * * *
127254 AATTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGA
128 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * *
127308 TAATTTTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTC
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTC
* ** * * * * *
127373 TTTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGCATGAATTTATTT-TGAATAGGCTTGTATAA
65 TTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGA
** * ** * * *
127437 ACTGAAACAATTTTTTTATGATTAAATAAAAGGTCGA-AACGATGTCAAATAGA
129 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * * *
127490 TAATTTTTCTAATAATCTTAACCATTTGAA-TTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * * *
127554 TTACTTATTAATTTTTTA-AATATTATTAAATTTGCATTATTTTA-ATC-AGAAAAGCCTGTACG
65 TTACTTATTAA-TTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTA-ATAAGCTTGTATG
* * * * *
127616 AA-TAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTGGAATTGA
128 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
** * ** * ** * * *
127670 TAATCGTTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAATTAGATTTATTTTTAAAATTTTC
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA-TCTC
** * * * * ** * *
127735 TTGGTTATTAAGTTTC-GAAATAATATTAAATTAGTATTTTTTTATTT-TGAATAAAATAGTATA
65 TTACTTATTAATTTTCAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATG
* * * * * * * *
127798 AACAAGACCAATTATTTGATGACAAAATAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGA
128 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
127852 TAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGTAAACAGATTTACTTTTCAAATCTCT
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * * * *
127917 T-GTTGATTAATTTTCTAAAATATTAATAAATTAGTATCATTTTGTTTCAAACAAACTTATATTA
66 TACTT-ATTAATTTTC-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGA
* * * *
127981 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAA
129 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * ** *
128034 TAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCT
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
128099 TATTTATTAATTTTCAGAATATTACTAAATTATTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTATATGAAC
66 TACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAAC
* * * *
128164 AAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGA
131 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
*
128215 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCT
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *
128278 T--TTATTAATTCT-AGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTAT-AT
66 TACTTATTAATTTTCAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGA-
** * * * * *
128339 TGAAAAGCAATTGTTTCATGAGAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGA
129 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
128392 TAGTTGTTTAAAT-GGCAATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATCT
1 TAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
128455 CTCACTTATTAACTTTTGA-AATATTAATACAGTAGTATTATTTTATTT-TGGATAAGCTTTTAT
64 CTTACTTATTAA-TTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTAT
* ** * *
128518 GAACTAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCCA-AATAATTTTAAATTGA
127 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * *
128572 TTATTGTTCAAATAGTAATAGCTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTCAAGTCTC
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTC
* ** * * *
128637 TTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAAATAGCTTGTATGA
65 TTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATA-AGCTTGTATGA
* * * * * * * *
128701 ACTAAAATAATTATTTTATGA-ATAAAGAAAAAGTTAGAATGATTTGAAATTA-A
129 ACAAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGA
* * * * * ** * *
128754 AAACTATTCTAATA-TCCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAATACATTTATTCTTTAAATCTC
1 TAATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
128818 TTAC-TACT--TTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTAGTTT-TGTCTGAATAAGCTTGTATGA
65 TTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGA
** * ** * * *
128878 TTAGAAACAATTGTTTTATGAGTAAAC-AAAGATCATAAGGA-TT-AAGATTGA
129 ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGA
*
128929 TAGTTATTCAAATAGTCATAACT
1 TAATTATTCAAATAGTCATAACT
128952 TGCTTTTTAA
Statistics
Matches: 1435, Mismatches: 327, Indels: 130
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.00
175 20 0.01
176 15 0.01
177 200 0.14
178 9 0.01
179 36 0.03
180 293 0.20
181 400 0.28
182 424 0.30
183 31 0.02
184 4 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
TACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAAC
AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
Found at i:130074 original size:181 final size:174
Alignment explanation
Indices: 129653--130107 Score: 483
Period size: 174 Copynumber: 2.6 Consensus size: 174
129643 TAATTTTCAA
* *
129653 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTAC
1 AATATTAATAAATTA-TATT-TTTTA-TTCGAATAAACTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTAT
* * *
129718 GATAAAAC-AAAAGATCATAACTATTTAAAATAAATAATTGTTCAAACAGGCATAATAACTATTT
63 GACAAAACAAAAAG-TCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACA-G-ATAATAACTATTT
* * * *
129782 AAACTTTCTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTTATTAATTTTTGG
125 AAACTGTCTCAATAAATAGATTTATTTTCTAAAATCTTATTAAGTTTTGG
* * ** * *
129832 AACATTAATAAACTTAT-TTTATT-TT-GAATATGCTTGTATGAACAAAAATAATTAGTTTATGA
1 AATATTAATAAA-TTATATTTTTTATTCGAATAAACTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGA
* * * * *
129894 CAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATA-TTCATAACTATTTGAACA
65 CAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGATAATAACTATTTAAAC-
129958 TGT-TCAGA-AAATAGATTTATTTTCTAAAATTTTACTTATTAAGGTTTTGG
129 TGTCTCA-ATAAATAGATTTATTTTCTAAAA---T-CTTATTAA-GTTTTGG
* * *
130008 AATATTAATAAATTTATATTCTTTTATTCAAAATAAACTTGTATGAAGAGAAACAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAA-TTATATT-TTTTATTC-GAATAAACTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTAT
* *
130073 GACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAT
63 GACAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGAT
130108 TCATTTTTAA
Statistics
Matches: 230, Mismatches: 32, Indels: 26
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
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172 3 0.01
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178 5 0.02
179 14 0.06
180 3 0.01
181 61 0.27
ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (174 bp):
AATATTAATAAATTATATTTTTTATTCGAATAAACTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGAC
AAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGATAATAACTATTTAAACTG
TCTCAATAAATAGATTTATTTTCTAAAATCTTATTAAGTTTTGG
Found at i:130347 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 130100--131152 Score: 989
Period size: 181 Copynumber: 5.8 Consensus size: 180
130090 TAACGATTTG
* * * *
130100 AAATAGATTCA-TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTCAAAACATTAATAAACTAGTATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** *
130164 TTATTTTGAATAAG-TCTATATGAACTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAATG
65 TTATTTTGAATAAGCT-TATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATG
* * * * * * *
130228 ATTTAAAAGAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTCAACTTGTTTTGT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGT
* * * * ** *
130280 AAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATCGATAAATTAATATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* *** * ** * * *
130345 TTAATCCAAATAAGCTTCTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGA
65 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA
* * *
130410 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTAATTCAGT
130 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTAGT
* * * *
130461 AAATAGAGTTATTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCTAAATATTAATAAATTTGTATTA
1 AAATAGA-TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
130526 TTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAA-T-AGAACAAATTATTTTAAGACAAAATAAAAAGTTAT
63 TTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAACTGA-AAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
* * * *
130588 AGTGATTTGAAATAGGTAATCGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGAT
125 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-T
* * * * * * *
130644 AAATAGATTCAATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTGCATTACT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * *** * *
130709 TTATTCTGAACAAACTTATATGAAGAAAAACATTTGTTTT-TCGACAAAACAAAAGGTTATAACG
65 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTTATAATG
* * * * * * * * *
130773 ATTTGAAATAGATAATTATTCATAGAGCCTTAAGTATTTGAGCTGGTTTAGC
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGT
* * * * * * *
130825 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTAATAATATTATTAGATTAATATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTCAA-AATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
130890 TTATTTCGAATAACCTTGTATGAACAT-AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATG
65 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATG
* * *
130954 ACTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTT-GAT
129 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-T
* * *
131006 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTCTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTC-AAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * *
131071 TTATTTTGAATAGGCTTATATG-A-TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTTATAAG
65 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAT
131134 GATTTGAAATCA-ATAATTG
128 GATTTGAAAT-AGATAATTG
131153 ATAATGATTT
Statistics
Matches: 701, Mismatches: 146, Indels: 51
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
180 19 0.03
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184 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGAT
TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGT
Found at i:131479 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 131182--131759 Score: 617
Period size: 181 Copynumber: 3.2 Consensus size: 180
131172 ACAAAAACTC
* * *
131182 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACT-AGTTCGATAAA-AA
1 ATAACGATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGATAAACAA
* * * ** *
131245 ATTTATTTTTTAAACCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTTTTAGATTAGTATTATTTTATTT
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * *
131310 TGAATAAGCTAATATGAATGGAAATAATTGTTTTATGACAGAGCAAAAGGTT
130 TGAATAAGCTTATATGAATAAAAATAATTGTTTTATGACA-AACAAAAGGTA
* * * * * * * *
131362 ATAACGATTTCAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTTGGTAAACATA
1 ATAACGATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAA
*
131427 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
66 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * *
131492 GAATACGCTTTTTTG-ATAAAAAAAAATTGTTATATGACCAAACAAAAGATA
131 GAATAAGCTTATATGAAT-AAAAATAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGGTA
* * * * * * * * *
131543 ATAACAATTTGAAATAGATAATTTTTGAAAT-GGCGATAATTTTTTGAGCTGATTCGATAAACAG
1 ATAACGATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAA
* * **
131607 ATTCAATTTTTAAATCAT-TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
65 ATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
131671 TTGAATAAGCTTGTATAAATCAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTC
129 TTGAATAAGCTTATATGAATAAAAATAATTGTTTTATGA-CAAACAAAAGGTA
* *
131724 ATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCA
1 ATAACGATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCA
131760 ACTATTCATT
Statistics
Matches: 323, Mismatches: 67, Indels: 15
0.80 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
180 53 0.16
181 263 0.81
182 7 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATAACGATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAA
TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
GAATAAGCTTATATGAATAAAAATAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTA
Found at i:131804 original size:139 final size:139
Alignment explanation
Indices: 131629--131898 Score: 400
Period size: 139 Copynumber: 1.9 Consensus size: 139
131619 AATCATTTAC
*
131629 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAATCAA
1 TTATTAATTTTCAAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAATCAA
* * * *
131694 AATAATTGTTTTATGAT-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGT
66 AACAATTGTTTTAT-ATCAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGT
131758 CAACTATTCA
130 CAACTATTCA
* * * * **
131768 TTATTAATATTT-GAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTG
1 TTATTAAT-TTTCAAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAATCA
*
131832 AAACAATTGTTTTATATCAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
65 AAACAATTGTTTTATATCAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGT
131897 CA
130 CA
131899 TAACTATTTG
Statistics
Matches: 117, Mismatches: 12, Indels: 4
0.88 0.09 0.03
Matches are distributed among these distances:
138 2 0.02
139 112 0.96
140 3 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (139 bp):
TTATTAATTTTCAAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATAAATCAA
AACAATTGTTTTATATCAAAACAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTC
AACTATTCA
Found at i:132220 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 132034--133312 Score: 427
Period size: 180 Copynumber: 7.1 Consensus size: 181
132024 TTTTATAATG
* ** *
132034 AAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAAGA-T-AAAATTATTCTAAA-GTTTTAATTATTTGAACTG
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAGATTGAAAATTATTC-AAACGTCATAACTATTTGAACTG
* * * *
132096 GTTCGATAAACACATTTATGTTTTAAATATT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTA
65 ATTCGATAAACACATTTATGTTTTAAAT-TTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* *
132160 GCATTA-TTT-TTAACCAAAT-AAGCTTCTATAACTAGAAACAATTGTTTTAGGACA
129 GCATTAGTTTATT--CCAAATCAA-CTTATATAA-TAAAAACAATTGTTTTAGGACA
* * *
132214 AAAC-AAAGATCT-TAACGATTTG--GGATTGATAATTATTCAAAGCGTCATAACTATTTGAACT
1 AAACAAAAGGT-TATAACGATTTGAAAGATTGAAAATTATTCAAA-CGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
132275 GATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
64 GATTCGATAAACACATTTATGTTTTAAATTTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
* * * * *
132340 GTATTAGTTTATTTCAAATCAACTTATATGATAAAAATAATTGTTTTATGACA
129 GCATTAGTTTATTCCAAATCAACTTATATAATAAAAACAATTGTTTTAGGACA
* * * *** * * * * *
132393 AAATAAAAGGTCATAACGATTTG-AA-A-TCAATAAACGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAATT
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAGATTGAA-AATTATTCAAA-CGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * ** *
132455 GATTTGTTAAACAAATTTACT-TTTTAAATTTCTTACTTATTAATCTAGGAAATATTAATTAATT
64 GATTCGATAAACACATTTA-TGTTTTAAATTTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * *
132519 AGTATTATTTTATT-CTATTTAAGCTTGTATTAACT-GAAACAA-----TT--G---
128 AGCATTAGTTTATTCCAAATCAA-CTTATA-TAA-TAAAAACAATTGTTTTAGGACA
* * * * *
132564 AATCAAAAGGTTATAACGATTCT--AA-ATAGACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACT
1 AAACAAAAGGTTATAACGATT-TGAAAGATTGAAAATTATTCAAA-CGTCATAACTATTTGAAC-
* * * * * *
132626 TG-TTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCCTT-CTTACTAATTTTCT-AAATGTTAATA
63 TGATTCGA-TAAACACATTTA-TGTTTTAAAT-TTCTTACATATTAATTTT-TGAAATATTAATA
* * *** * * * * * *
132687 AATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAACACTTGTGA-ACT-CAAACAATTGTTTTATGACT
124 AATTAGCATTAGTTTATTCCAAAT-CA-ACTTAT-ATAATAAAAACAATTGTTTTAGGACA
* * * ** * * * *
132746 AAACAAAATGTCAGAGTGATTT-AAA-A-TAAATAATTGTTCTAATA-GT-TTAACCATTTGAAC
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAGATTGAA-AATTATTC-AA-ACGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
132806 TGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATT
63 TGATTCGATAAACACATTTATGTTTTAAATTTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
** * * * * * * * * *
132871 ATTATTATTTTAATT-CAAAT-ATGCTTGTACGAA-CAAAATAATTATTTTACGATA
128 AGCATTAGTTT-ATTCCAAATCA-ACTTATA-TAATAAAAACAATTGTTTTAGGACA
* * * * * * * *
132925 AAACAAAGGGTCATAACGATTTG-AA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAAGTATTTGAA-TC
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAGATTGAAAATTATTCAAA-CGTCATAACTATTTGAACT-
* * ** * * * ** * * * *
132987 GGTTC-AGCAATTAAATTTATTTTTTAATTTTCTT-GGTCATTAAATTTTGGATTATTATTAAAT
64 GATTCGA-TAAACACATTTATGTTTTAAATTTCTTACAT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * *** ** * * * * *
133050 TAGTATTATTTTATTATGAAT-AAAATAGTGTGAATAGAACCAATTGTTTCATGACA
127 TAGCATTAGTTTATTCCAAATCAACTTA-TAT-AATAAAAACAATTGTTTTAGGACA
* * * * * * *
133106 ACATAAAAGGTTATAACGATTTG-AA-ATCGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATG
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAGATTGAAAATTATTCAAA-CGTCATAACTATTTGAACTG
* * * * * * *
133169 GTTTGGTAAACAAATTTAAT-TTTTAAATCTCTTAC-TGATTAATTTTTTAAATATTCATAAATT
65 ATTCGATAAACACATTT-ATGTTTTAAATTTCTTACAT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * *
133232 AGTATTATTTTATTTCAAA-CAAACTTATACTAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
128 AGCATTAGTTTATTCCAAATC-AACTTATA-TAATAAAAACAATTGTTTTAGGACA
* * **
133287 AAACAAAAAGTAATAATAATTTGAAA
1 AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAA
133313 TGGTTTGGTA
Statistics
Matches: 833, Mismatches: 196, Indels: 138
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
171 57 0.07
172 54 0.06
173 7 0.01
174 7 0.01
175 2 0.00
176 2 0.00
177 6 0.01
178 12 0.01
179 110 0.13
180 327 0.39
181 206 0.25
182 40 0.05
183 2 0.00
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAAGATTGAAAATTATTCAAACGTCATAACTATTTGAACTGA
TTCGATAAACACATTTATGTTTTAAATTTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGC
ATTAGTTTATTCCAAATCAACTTATATAATAAAAACAATTGTTTTAGGACA
Found at i:132944 original size:712 final size:713
Alignment explanation
Indices: 131854--133245 Score: 1551
Period size: 712 Copynumber: 2.0 Consensus size: 713
131844 TATATCAAAA
* * * *
131854 CAAAAAGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACTTGCTTAA
1 CAAAAAGTCATAACGATTCTAAATAAACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGACTTGCTTAA
* * * * * *
131919 TAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTAGTAATTTTTTGAAGTTAATAAATTTGGATTTT
66 TAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTACTAATTTTCTAAAGTTAATAAATTT-GAGTAT
** * * *
131984 TTTTTTATTCTGAATAAGCTTGTAAAATATGAAACAATTATTTTATAATGAAACAAAAGGTTAGA
130 TAATTTATTCTGAATAAACTTGTAAAATATCAAACAATTATTTTATAATGAAACAAAAGGTCAGA
** * *
132049 ACGATTTGAAAGATAAAATTATTCTAAAGTTTTAATTATTTGAACTGGTTCGATAAACACATTTA
195 ACGATTTGAAAGATAAAATTATTCTAAAGTTTTAACCATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTA
* *
132114 TGTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGCATTATTTTTAACCAAAT
260 TGTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATTTTTAACCAAAT
* * * * ** *
132179 AAGCTTCTATAACTAGAAACAATTGTTTTAGGACAAAACAAAGATCTTAACGATTTGGGATTGAT
325 AAGCTTCTAGAACTAGAAACAATTATTTTACGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGAT
* ** * *
132244 AATTATTCAAAGCGTCATAACTATTTGAA-CTGATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTCT
390 AATTATTCAAAGAGTCATAACTATTTGAATC-GATTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCT
* **
132308 TACAT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAGTTTATT-TCAAATCAACTTA-TATG
454 T-CATCATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAGTTTATTAT-AAAT-AAAATAGTATG
* * *
132370 -ATAAAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATCAATAAACGTTCAA
516 AATAAAAACAATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATCAATAAACATTCAA
* * * * * * * * *
132434 ATGGCCATAATTATTTTAATTGATTTGTTAAACAAATTTACTTTTTAAATTTCTTACTTATTAAT
581 ATAGCCAAAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTACTGATTAAT
*
132499 CTAGGAAATATTAATTAATTAGTATTATTTTATTCTATTTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTG
646 CTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTATTTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTG
132564 AAT
711 AAT
* * *
132567 CAAAAGGTTATAACGATTCTAAATAGACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTG-TTC
1 CAAAAAGTCATAACGATTCTAAATAAACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTG-ACTTGCTT-
* *
132631 AGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCCTT-CTTACTAATTTTCTAAATGTTAATAAA-TT-AG
64 AATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCT-CTTGCTTACTAATTTTCTAAA-GTTAATAAATTTGAG
* * * * * *
132693 TATTAATTTATTTTGAATAAACACTTGT-GAA-CTCAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAT
127 TATTAATTTATTCTGAAT-AA-ACTTGTAAAATATCAAACAATTATTTTAT-AATGAAACAAAAG
** * * *
132755 GTCAGAGTGATTT-AAA-ATAAATAATTGTTCTAATAG-TTTAACCATTTGAACTGATTTGGTAA
189 GTCAGAACGATTTGAAAGAT-AA-AATTATTCTAA-AGTTTTAACCATTTGAACTGATTCGATAA
* * **
132817 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTATTATTA-TTT
251 ACAAATTTATGTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATTTT
* * * * * *
132881 TAATTCAAATATGCTTGTACGAAC-A-AAATAATTATTTTACGATAAAACAAAGGGTCATAACGA
316 TAA-CCAAATAAGCTTCTA-GAACTAGAAACAATTATTTTACGACAAAACAAA-GATCATAACGA
* * * * * **
132944 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAAGTATTTGAATCGGTTCAGCAATTAAATTTATTT
378 TTTGAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCATAACTATTTGAATCGATTCAGCAAACAAATTTATTT
* ** * * * * *
133009 TTTAATTTTCTTGGTCATTAAATTTTGGATTATTATTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAA
443 TTTAAATTTCTTCATCATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAGTTTATTATAAATAAA
* * * * * *
133074 ATAGTGTGAATAGAACCAATTGTTTCATGACAACATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATCGATAA
508 ATAGTATGAATAAAAACAATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATCAATAA
** * *
133139 TTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAC
573 ACATTCAAATAGCCAAAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAC
* *** *
133204 TGATTAATTTTTTAAATATTCATAAATTAGTATTATTTTATT
638 TGATTAATCTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
133246 TCAAACAAAC
Statistics
Matches: 556, Mismatches: 105, Indels: 36
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
710 2 0.00
711 38 0.07
712 255 0.46
713 199 0.36
714 51 0.09
715 11 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (713 bp):
CAAAAAGTCATAACGATTCTAAATAAACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGACTTGCTTAA
TAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTACTAATTTTCTAAAGTTAATAAATTTGAGTATT
AATTTATTCTGAATAAACTTGTAAAATATCAAACAATTATTTTATAATGAAACAAAAGGTCAGAA
CGATTTGAAAGATAAAATTATTCTAAAGTTTTAACCATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTAT
GTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATTTTTAACCAAATA
AGCTTCTAGAACTAGAAACAATTATTTTACGACAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATA
ATTATTCAAAGAGTCATAACTATTTGAATCGATTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTC
ATCATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAGTTTATTATAAATAAAATAGTATGAATAA
AAACAATTGTTTCATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATCAATAAACATTCAAATAGC
CAAAACTATTTGAAATGATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTACTGATTAATCTAGG
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTATTTAAGCTTGTATTAACTGAAACAATTGAAT
Found at i:133277 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 132567--133313 Score: 580
Period size: 181 Copynumber: 4.1 Consensus size: 178
132557 ACAATTGAAT
* * * *
132567 CAAAAGGTTATAACGATTCT-AAATAGACAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTC
1 CAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAA-AACTATTTGAAATGGTTC
* * *
132631 AGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCCTT-CTTACTAATTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGT
64 AGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTATTAAATTAGT
* * * **
132694 ATTAATTTATTTTGAATAAACACTTGT-GAACTCAAACAATTGTTTTATGACTAAA
126 ATTATTTTA-TTTCAATAAA-ACTTATCGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA
* * ** * * * * ** * * * **
132749 CAAAATGTCAGAGTGATTTAAAATAAATAATTGTTCTAATAGTTTAACCATTTGAACTGATTTGG
1 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAAACTATTTGAAATGGTTCAG
*
132814 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTATTATTAT
66 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAT
* ** * * * * *
132879 TTTAATTCAA-ATATGCTTGTACGAAC-AAAATAATTATTTTACGATAAAA
131 TTTATTTCAATA-AAACTTAT-CGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAA
* * ** *
132928 CAAAGGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAAGTATTTG-AATCGGTTC
1 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-AAAACTATTTGAAAT-GGTTC
* ** * * ** * * * *
132992 AGCAATTAAATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTCATTAAATTTTGGATTATTATTAAATTAGTATT
64 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT
* * * * * *
133057 ATTTTATTATGAATAAAA--TAGTGTGAATAGAACCAATTGTTTCATGACAACA
129 ATTTTATT-TCAATAAAACTTA-T-CGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA-A
* * * **
133109 TAAAAGGTTATAACGATTTGAAATCGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTG
1 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-AAAACTATTTGAAATGGTTCA
* * *
133174 GTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTCA-TAAATTAGTATT
65 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-ATTAAATTAGTATT
*
133238 ATTTTATTTCAA-ACAAACTTATACTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
129 ATTTTATTTCAATA-AAACTTAT-CGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA
* * **
133290 CAAAAAGTAATAATAATTTGAAAT
1 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
133314 GGTTTGGTAA
Statistics
Matches: 438, Mismatches: 107, Indels: 41
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
178 6 0.01
179 65 0.15
180 133 0.30
181 193 0.44
182 41 0.09
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTAAAACTATTTGAAATGGTTCAG
TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAT
TTTATTTCAATAAAACTTATCGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
Found at i:133976 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 133290--136326 Score: 1265
Period size: 181 Copynumber: 16.9 Consensus size: 179
133280 TATGACAAAA
* * * * *
133290 CAAAAAGTAATAATAATTTGAAATGGTTTGGTAAA-TAGATTTATTTTCTAAATCTCTTAACTT-
1 CAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTA
** * * * * *
133353 ATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTAT-GAGTAAGCTTGTATGAGCTGAA
64 AT-AA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTTTATGAAC-AAA
* * * * * * * *
133417 ATAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAAC-AATTGCAAATAAATAATTGTT
125 ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTG-AAATAAGTAATTGTT
* * * ** * * * *
133472 CATATA-TCTTAACTGTTTGAACTAGTTCAGCAAA-TGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAA
* ** *
133535 TAATTTTTAGAATATTACCAAATTAGTC-TTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACGAAAAC
65 TAATTTTGA-AATATTAATAAATTAG-CATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAAC-AAAAC
** * * *
133599 AATTGTTTTAT-ATATGACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT
127 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAGTAATTGTT
* * * * *
133651 CAAATAATCACAATAATTTTAACTGGTTTGGTAAA-TAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTAA
1 CAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAA
* * * *
133714 T--TTATGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATATTG-A-AAAAC
65 TAATTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-T-TA-TGAACAAAAC
* * *
133775 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGAAATAACGATTTGAAATAAGTAGTTGTT
127 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAGTAATTGTT
* * *
133828 CAAATGGCCATAATCATTTGAACTAATTTGGTAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAA
1 CAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAA
* * *
133892 TAACTTTTGAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACA
65 TAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAAC-AAAACA
* * * * *
133957 ATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT-AGATAATTGTT
128 ATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
* * * *
134009 CAAATAGTCATAATTTTTGAACTTGTTTGGTAAAC-AGATTTAATTTTTCAAATCTCTTGCTATT
1 CAAATAGTCATAATATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTAC--TT
* * * * * * * * *
134073 AAT-TTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGATTGTATGAACTGAAAC
63 AATAATTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAAC-AAAAC
* * * * * * * *
134136 AATTATTATATGACT-AGACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAAT-AGATAAATATT
127 AATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
* * * * * *
134189 -ATAATAGTCTTAACTATTTGAAACTGGTTCGGCAAAC-ACATATATTTTTT-AAT-TCTT--TT
1 CA-AATAGTCATAA-TATTTG-AACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * ** * * *
134248 ATTAATTTTAAGAATATTATTAAATTATTATTAGTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATAAAAA
63 AATAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGCATTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTTTATG--AACAA
* * * * * * * *
134312 AACAATTGTTTTATGA-GAAACAAAA-ATCATAACTATTTGAGAT-TGCTATTTTTTT
124 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TA-ATTGTT
* * * * ** * * * *
134367 CAAATAGTTATAACTATTTG-ATTGGGTT-CAAAAGC-A-ACTTTAATTTTCAAATTTTTTACTT
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAA-CTAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * ** * * *
134428 ATTAATTTTTGAAATATTAGTAACGTAGCATTATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGAATCTAAA
63 AATAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAA-CAAAA
* * ** * *
134493 CAATTGTTTTATGA-CAAATAAAAGGCCATAA--A-TAGAAAATATATTTGAACTTGTT
126 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTG-AAATA-A-GT-AA-TTGTT
* ** * *** * * * * * * * * * *
134548 C-ACTAAACATATTTATTT-TTTTAAATCT-CT-TACT-CA-TTACTTTCTCAAA--TGTTAATA
1 CAAATAGTCATA-ATATTTGAACT-AGTTTGGTAAACTAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTT
* ** * * ** *
134605 AATTAGATT-ATATTTTTTTAAA-T---ATTATTTTA-TTCTACATAA--TTTTGCATGAAC---
63 AATAATTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTTT--ATGAACAAA
* * ** *
134659 AG-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTCAAAT-AGATAATTGTT
125 ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
* * * * * * * * * *
134713 CAAATAGACATGACTATTTAAATTTG-TTAGTTAGC-AGATTTATTTTTTAAATAT-TCTACCTA
1 CAAATAGTCAT-AATATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTA
* * * * * * *
134775 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAAC
64 ATAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAACA-AAAC
* * * * *
134840 AATAGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAAT-AGATAATTGTT
127 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
** * * * * * * *
134893 CAAGCAGTCATAACTATTTCAACTTGCTTGCTAAA-TAGATTTGTTTTTTAACTCTTTTACTT-A
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAA
* * * * * * *
134956 TCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTACTATTTTATTTCGAATATGCTTGTATGAATAGAATC
65 T-AA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAACA-AAAC
* * * * *
135021 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAAT-AGATAATTGCT
127 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
*** * * *
135074 CAAATAGTCATAACTATTTGAAC--GTGTTCAAAAAATGGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTA
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGT-TTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * * *
135136 TTGATTTTTGGAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
64 AT-AATTTTGAAATATTAATAAA-TTAGCATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTTTATGAACA-AA
* * * *
135199 ACAATTGTTTTATGACAAAATC-AAAGGTCATAACAATTTGAAAT-AGATAATTATT
125 ACAATTGTTTTATGATAAAA-CAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
* *
135254 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTGAG-AAAATAG-TTTCATTTTTTAAATCTCTTACTT
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTG-GTAAACTAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * ** * * * ** *
135316 ATTATTTTTTAGAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATTGATA
63 AATAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAA-CAAAA
* * * * * **
135381 CAACTGTTTTATGAT-GAACAAAAGGTCATAACTATTTTAAAT-AGATAATTACT
126 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
* ** * ** * ** * *
135434 CAAATAGTTATTTTTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-ATATTTATTTTAAAAATCTTTTACTTAT
1 CAAATAGTCA-TAATATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAA
** ** * * * *
135498 TAATTGTCAAAATATTAA-AAAGTTAATAATATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTATGAAGAAAAA
65 TAATT-TTGAAATATTAATAAA-TTAGCATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTTTATGAA-CAAAA
* * ** * *
135561 CAATTGGTTTATGACAAAACAAAATCTCATAAC-AGTTTGAAATAAATAATTGTT
126 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGA-TTTGAAATAAGTAATTGTT
* * * *
135615 CAAATAGTTATAACTATTTGAATTTA-TTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTCAAATCT-TTAACTT
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGAA-CTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTT
* * * * ** * *
135677 ATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTT-GAAATATTCTTGTATGACTAGA
63 AATAATT-T-TGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTTTATGA--A-C
* * * * * *
135740 AAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTAT-ATGATTTAAAAT-AGATAATTGTT
122 AAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAG-TAATTGTT
* * * * * *
135797 CAAATAGTGATAACTATTTGCACTTA-TTCGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATTTGTTATTTA
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * *
135860 TTAATTTT-ATGAATACTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTTTGAATAAGCTTTTACGAATAGAA
64 ATAATTTTGA--AATATTAATAAATTAGCA-TTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAACA-AA
* * * * * ** *
135923 ACAGTTGCTTTGTGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAAAAATTATT
125 ACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAGTAATTGTT
* ** * *
135978 CAAATAGTCATAACTATTT-ACACTGGTCAAGCT-AA-TAGATTCATTTTTTAAAT-TCGTTACT
1 CAAATAGTCATAA-TATTTGA-ACTAGT-TTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACT
* * * * * * * *
136039 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTA-TTCTTAATAAGATTGTATGAATAGA
62 TAATAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTTTATGAACA-A
** * * *
136103 AACAATTGTTTTATGCCAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAAG-AATTGTT
124 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAAT-AAGTAATTGTT
* * * * * * * *
136159 CAAATAGTTATAAT-TGATTAAACTGGTTTCGTAAAC-AGATTTATTCTTGAAATCTCTTACGTC
1 CAAATAGTCATAATAT--TTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * ** * * * * * *
136222 TTAATTTTCAAAATATGAGTAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATTAACAACAAC
64 ATAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAACAA-AAC
* ** ** * *
136287 ATTTGTTTTCGGACGAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
127 AATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAA
136327 CTAGTGTAAC
Statistics
Matches: 2238, Mismatches: 453, Indels: 329
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
165 7 0.00
166 27 0.01
167 30 0.01
168 4 0.00
169 17 0.01
170 6 0.00
171 26 0.01
172 1 0.00
174 1 0.00
175 34 0.02
176 73 0.03
177 115 0.05
178 83 0.04
179 132 0.06
180 678 0.30
181 799 0.36
182 163 0.07
183 42 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
CAAATAGTCATAATATTTGAACTAGTTTGGTAAACTAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAAT
AATTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAACAAAACAATT
GTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAAGTAATTGTT
Found at i:134909 original size:704 final size:704
Alignment explanation
Indices: 133953--135231 Score: 1509
Period size: 704 Copynumber: 1.8 Consensus size: 704
133943 TATGAACTAA
* * * *
133953 AACAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
1 AACAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGAC
* * * ** *
134018 ATAATTTTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTCTTGCTATTAATTTTTTGA
66 ATAATATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTCTACCTATTAATTTTTAGA
* *
134083 ATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGATTGTATGAACTGAAACAATTATTATATG
131 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGAATTGTATGAACTGAAACAATTATTATATG
* * * * * *
134148 ACTAGACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAAATATTATAATAGTCTTAACTATTTGAAAC
196 ACAAAACAAAAGATCAGAATGATTTGAAATAGATAAATATTATAACAGTCATAACTATTT-AAAC
* * *
134213 -TGGTTCGGC-AAACACATATATTTTTTAATTCTTTTA-T-T-AATTTTA-AGAATATTATTAAA
260 TTGCTT--GCTAAACACATATATTTTTTAACTCTTTTACTATCAATTTTAGA-AATATTAATAAA
* * * *
134272 TTATTATTAGTTTTA-TCCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGA-GAAACAA
322 GTAGTACTA-TTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA-AAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * ** * **
134335 AAA-TCATAACTATTTGAGATTGCTATTTTTTTCAAATAGTTATAACTATTTGATTGGGTTCAAA
385 AAAGTCATAACTATTTGAAATAGATA-ATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGGGTTCAAA
* **
134399 AGCAA-CTTTAATTTTCAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT-AGTAACGTAGCATTAT
449 A--AAGATTTAATTTTCAAA-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAACGTA-CATTAT
* * * **
134462 TTTATTTCG-GATAAGTTTTTATGAATCTAAACAATTGTTTTATGAC-AAATAAAAGGCCATAAA
510 TTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAAA
134525 TAGAAAATATATTTGAACTTGTTCACTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTACTT
574 TAGAAAATATATTTGAACTTGTTCACTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTACTT
134590 TCTCAAATGTTAATAAATTAGATTATATTTTTTTAAATATTATTTTATTCTACATAATTTTGCAT
639 TCTCAAATGTTAATAAATTAGATTATATTTTTTTAAATATTATTTTATTCTACATAATTTTGCAT
134655 G
704 G
*
134656 AACAGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGA
1 AACA-ATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGA
* * * * * *
134721 CATGACTATTTAAATTTG-TTAGTTAGCAGATTT-ATTTTTTAAATATTCTACCTATTAATTTTT
65 CAT-AATATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTAATTTTTCAAAT-CTCTACCTATTAATTTTT
***
134784 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AACTTGTATGAA-TAGAAACAA-TAGT
128 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGAA-TTGTATGAACT-GAAACAATTA-T
* * * * *
134846 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AGCAGTCATAACTA
190 TATATGACAAAACAAAAGATCAGAA-TGATTTGAAATAGATAAATATT-ATAACAGTCATAACTA
* * * * * *
134909 TTTCAACTTGCTTGCTAAATAGATTTGTTTTTTAACTCTTTTACTTATCAATTTTTGAAATATTA
253 TTTAAACTTGCTTGCTAAACACATATATTTTTTAACTCTTTTAC-TATCAATTTTAGAAATATTA
* * * * *
134974 ATAAAGTAGTACTATTTTATTTCGAATATGCTTGTATGAATAGAATCAATTGTTTTATGACAAAA
317 ATAAAGTAGTACTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
*
135039 CAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCA
382 CAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGGGTTCA
* * * * ** *
135104 AAAAATGGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTGATTTTTGGAATATTAACAAATTTATATTAT
447 AAAAA--GATTTAATTTTCAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAACGTACATTAT
* *
135169 TTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATCAAAGGTCATAA
510 TTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAA
135232 CAATTTGAAA
Statistics
Matches: 474, Mismatches: 78, Indels: 43
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
702 2 0.00
703 43 0.09
704 189 0.40
705 15 0.03
706 28 0.06
707 147 0.31
708 50 0.11
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (704 bp):
AACAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGCCATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGAC
ATAATATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTCTACCTATTAATTTTTAGA
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGAATTGTATGAACTGAAACAATTATTATATG
ACAAAACAAAAGATCAGAATGATTTGAAATAGATAAATATTATAACAGTCATAACTATTTAAACT
TGCTTGCTAAACACATATATTTTTTAACTCTTTTACTATCAATTTTAGAAATATTAATAAAGTAG
TACTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTC
ATAACTATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGGGTTCAAAAAAGATT
TAATTTTCAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAACGTACATTATTTTATTCGAAA
TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGCCATAAATAGAAAATATAT
TTGAACTTGTTCACTAAACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTACTTTCTCAAATGTTA
ATAAATTAGATTATATTTTTTTAAATATTATTTTATTCTACATAATTTTGCATG
Found at i:135338 original size:361 final size:360
Alignment explanation
Indices: 133320--136260 Score: 2105
Period size: 361 Copynumber: 8.2 Consensus size: 360
133310 AAATGGTTTG
* * * *
133320 GTAAATAGATTTATTTTCTAAATCTCTTAACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTT
1 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
133385 ATTCTATTAT-GAGTAAGCTTGTATGAGCT-GAAATAATTATTTTATAACAAAATAAAAGGTCAT
65 ATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
133448 AACAA-TTGCAAATAAATAATTGTTCATATA-TCTTAACTGTTTGAACTAGTTCAGCAAATGGAT
128 AACAATTTG-AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-GGAAAATAG-T
* ** *
133511 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACCAAATTAGTCTTATTTTATTTCG
190 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * ** * *
133576 AATAAGCTTATATGAA-CGAAAACAATTGTTTTAT-ATATGACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA
255 AATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAA
* * * * * **
133639 TAAATAATTGTTCAAATAATCACAA-TAATTTTAACTGGTTTG
319 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCA
* * *
133681 GTAAATAGATTTACTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTATGAAAGATTAATAAATTAGTATTA
1 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * **
133742 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-ATTGAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGAAATAA
66 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * *
133806 CGATTTGAAATAAGTAGTTGTTCAAATGGCCATAA-TCATTTGAACTAAT-TTGGTAAACTAATT
130 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACT--TGTTGG-AAAATAGTT
* * * * *
133869 TATTTTTTAAATCTCTTACTTAATAACTTTT-GAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTG
191 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * *
133933 GATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTGATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTTAA
255 AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAA
* **
133996 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TTTTTGAACTTGTTTG
318 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* * * * *
134038 GTAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTCTTGC-TATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTAT
1 GTAAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * * * *
134101 TATTTTATTCCAAATAGGATTGTATGAACT-GAAACAATTATTATATGACTAGACAAAAGGTTAG
64 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * * * *
134165 AATGATTTGAAATAGATAAATATT-ATAATAGTCTTAACTATTTGAAACTGGTTCGGCAAACACA
128 AACAATTTGAAATAAATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTG-AACTTGTT-GG-AAA-ATA
* * * *
134229 -TATATTTTTT-AAT-TCTT--TTATTAATTTTAAGAATATTATTAAATTATTATTAGTTTTA-T
188 GTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT
* * * * *
134288 CCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATGA-GAAACAAAA-ATCATAACTATTTG
252 TCGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTG
* * * * * *
134351 AGATTGCTATTTTTTTCAAATAGTTATAACTATTTG-A-TTGGGTTCA
316 AAATAGATA-ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT--GTTCA
* * * * * ** *
134397 --AAAGCA-ACTTTAATTTTCAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAACGTAGCAT
1 GTAAA-TAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * ** * *
134459 TATTTTATTTCGGATAAGTTTTTATGAATCTAAACAATTGTTTTATGAC-AAATAAAAGGCCAT-
64 TATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
134522 A-AA-TAGAAA-ATAT-A-T-TTGAACTTGT--TCACTA----AAC----------ATA-TTTAT
129 ACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGAAAATAGTTTA-
* * * * **
134564 TTTTTTAAATCTCTTACTCATTACTTTCTCA-AATGTTAATAAATTAG-ATTATATTT-TTTTAA
193 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCGA
*** * * *
134626 ATATTATTTTATTCTACATAATTTTGCATGAACAGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAA
256 ATAAGCTTGTA-T-GA-AT-A----G-A--AACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
134691 CGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATGACTATTTAAATTTGTT-A
309 CTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* ** * * *
134742 GTTAGCAGATTTATTTTTTAAATATTCTACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT
1 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
134806 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
65 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ** * ** *
134871 CTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAGCAGTCATAACTATTTCAACTTGCTTGCTAAATAGATTTG
130 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTGGAAAATAG-TTTA
* * * * *
134936 TTTTTTAACTCTTTTACTTATCAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAGTACTATTTTATTTCGAA
193 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * *
135000 TATGCTTGTATGAATAGAATCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACTATTTGAAATAG
257 TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAG
* *
135065 ATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCA
322 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
** * * * *
135104 AAAAATGGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTGATTTTTGGAATATTAACAAATTTA-TATT
1 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT
135167 ATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATC-AAAGGTCAT
65 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCAT
* *
135230 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGAGAAAATAGTTT
128 AACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTG-GAAAATAGTTT
* * * *
135295 CATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTTAGAATTTTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGA
192 -ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * ** *
135360 ATAAGCCTATATGAATTGATACAACTGTTTTATGA-TGAACAAAAGGTCATAACTATTTTAAATA
256 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATA
** * ***
135424 GATAATTACTCAAATAGTTATTTTTATTTGAACTTGTTCA
321 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* * ** * ** * *
135464 GTAAACATATTTATTTTAAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA-AAAGTTAATAAT
1 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * * * **
135528 ATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTATGAAGAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATCTCATA
65 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
135592 ACAGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTTATTCGGTAAATAGATTT
129 ACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-GGAAAATAG-TTT
* * * *
135657 ATTTTTCAAATCT-TTAACTTATTAATTGTCTA-AATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTT-G
192 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
** * * * * *
135719 AAATATTCTTGTATGACTAGAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTAT-A-TGATTTA
255 -AATAAGCTTGTATGAATAG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTG
* * * *
135782 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGCACTTATTCG
316 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
* *
135827 GTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTGTTATTTATTAATTTTATG-AATACTAATAAATTAG-AT
1 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTA-
* * * * * * * *
135889 TTATGTTATTTTGAATAAGCTTTTACGAATAGAAACAGTTGCTTTGTGATAAAACAAAAGGTCAT
63 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * * ** **
135954 AATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-ACACTGGTCAAGCTAATAGAT
128 AACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGT-TGGAAAATAG-T
* * ** *
136018 TCATTTTTTAAAT-TCGTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTA-TTC
190 TTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * *
136081 TTAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGCCAAAACAAATGGTCATAA-TGATTTGA
254 -GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGA
* * * * * *
136145 AATAAAGAATTGTTCAAATAGTTATAATTGA-TTAAACTGGTTTC-
317 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTG-TTCA
* * * * * * ** * * *
136189 GTAAACAGATTTATTCTTGAAATCTCTTACGTCTTAATTTTCAAAATATGAGTAAATTAATATTA
1 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
136254 TTTTATT
66 TTTTATT
136261 CCAAACAAAC
Statistics
Matches: 2019, Mismatches: 421, Indels: 279
0.74 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
330 5 0.00
331 6 0.00
332 3 0.00
333 5 0.00
334 16 0.01
335 22 0.01
336 4 0.00
337 1 0.00
342 1 0.00
343 3 0.00
344 4 0.00
345 14 0.01
346 117 0.06
347 30 0.01
348 8 0.00
349 1 0.00
350 11 0.01
351 5 0.00
352 2 0.00
353 4 0.00
354 12 0.01
355 3 0.00
356 104 0.05
357 174 0.09
358 191 0.09
359 31 0.02
360 102 0.05
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362 162 0.08
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364 18 0.01
365 1 0.00
369 1 0.00
370 2 0.00
371 5 0.00
372 40 0.02
373 19 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (360 bp):
GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGGAAAATAGTTTATTT
TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG
CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAA
TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA
Found at i:136636 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 136345--140506 Score: 2937
Period size: 181 Copynumber: 23.1 Consensus size: 180
136335 ACAAACAGAA
* * *
136345 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * ** * * * *
136410 AACAAG-TTACTAGGAATTGGAAA-ATTTATTTTACGACCAAACAAAAGGTCTTAACGATTTGAA
65 AATAAGCTT-GTATGAA-CAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * * * *
136473 ATAAAGAATTATTCATATTGCCTTAACTATTTAAACTAGTTCAGCAAATAAAT
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* * *
136526 TTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTACAA-TAGTATTATTTTATTTT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * *
136590 GAATAAACTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * *
136655 TATATAATTATTCAAATAGTAATAACTATTTGAAC-TGATT-TGATAAACAAAT
129 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAATAGAT
* *
136707 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGA-AAATTAGTTTTATTTTATTTC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * *
136771 GAATAGGCTTGTATGATCA-AACACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGGTTTGAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACAGAA-ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
** * *
136835 ATAGATAATTGCTCAAATGGTCATAACTATTTGAAC-TGATT-TGATAAACTA-AT
128 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAAA-TAGAT
* * * * **
136888 TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT-AAGTAATATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * *
136952 AATAAGCTTTTTTGCACTGAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * *
137017 ATATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAATTGAT
130 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* * * * * * * *
137068 TTCTTTTTTTAGTTTATTGCTTATTAATTTTTTGACTGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * *
137133 AATAGGCATGTATGAGCTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAA
65 AATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * *
137197 TAGATAATTGTTCTAATAGTC-TCAACTATTTCAACTGGTTCCTA-CAAACACAT
129 TAGATAATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGTT-C-AGTAAATAGAT
* * * *
137250 TTATTTTGTAGA----TT-CTTATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTGGTATTATTTTA-TTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
** * * *
137309 AAATAATTTTGTATGAATACCAGTTATTCTAAATAATTAGTATTATTTTATAACAAAACAAAATG
64 AAATAAGCTTGTATG-A-A-CAG---------A-AA-CA--ATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * *
137374 TCATAACGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC
113 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAT
*
137438 AAAT
177 AGAT
** * *
137442 TTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTTATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * ** *
137507 AATAAACTTTTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAATATCATAATGATTTGAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * *
137572 AAATATTTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGCTCAGTAATTAGAT
130 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* *
137623 TTATTTTTTAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAA-T--TATTATTATATTTC
1 TTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * *
137684 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGA-TTTATAACAAAA-AAAATGATCATAACAATTT-A
64 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
137746 AACTAAATAATTATTTAAATAATCATAACTATTTAAACGTGTTCAGAAAAATAAAT
127 AA-TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGAT
* * * * * *
137802 TTATTGTTTAAAT-TATTATTTATAAATTTTTGGAATA-CAAGTAAATTTA-CATTATTTTA-TT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAA-TAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* * ** ** * * * **
137863 CAAAATAAGCTT-TCATGAATATATCCAATTGCTTTCTGACAAAACAAAAAGTTATAA-TTTGTT
63 C-AAATAAGCTTGT-ATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT-TT
* * * * * *
137926 GAAATAAATAATTATTCAGATAGTCTTTAACTATTTAAACTTTTTAAGTAAATAGAT
125 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* * * *
137983 TCATTTATTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTC
1 TTATTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * *
138048 AAATAAACTTATATTAACTA-AAACAACTATTTTATTACAAAATCAAAAGGTCACAATGATTTGA
64 AAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * *
138112 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCCGTAAACATAT
127 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* * *** * * *
138166 TTACTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * *
138231 AATATGCTTGT-TGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG---T
65 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * ** * *
138292 ---T--GT-TT-AAATAATCATAACAATTTGAATTTGTTTGGTAAACATAT
130 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* * * * *
138336 TTATTTTTAAAATTTTTATACTTATTAATTGTCTT-AACATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT
1 TTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * ** * * * * * *
138400 GAAATAAACTTGCCTGAGCAGAAGA-AA-TATTTTTATGACAAAATAAAGGGTTATAGCGATTTC
63 CAAATAAGCTTGTATGAACAGAA-ACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * ** *
138463 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAAACTTGTTTGGTAAACAGAT
126 AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-GAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* * * *
138519 TCATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* ** * * **
138584 AATAAGCTTATACAAACTA-AAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATAATTTGAAA
65 AATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * *
138647 TAGATAATCATTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAATTAGAT
129 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* * * * ** *
138699 ATATATTTTT--ATTTTTTTCATTATTAAGTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT
1 TTAT-TTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * * * * *
138762 CAAATAAAATAGTATGAATAGAACCAA-CAGTTTGATGACAAAATAAAAGG-CTATAACGATTTG
63 CAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTG
* * * ** * **
138825 AAATAAATAATTATTCAAATAGTGAAAACTATTCAAAATTGTTTGGTAAATAGAT
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* ** * * * **
138880 TTACTTTTTAAATCTCTTACAGATTAGTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * * ** * *
138945 ACAAACTTATACGAACAAAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAAGAAATAACAATTTAAAATA
66 ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * *
139010 TAT-ATTTTTCAAATGGTTATAATTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAAAA
131 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAATAGAT
* * * * **
139059 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTTTG
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* * * * * *
139124 AATAAACTTGTATGAGCTGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
139189 AGATAATTGTTCATATTGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAAG-AAATGGAT
130 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTC-AGTAAATAGAT
* * * * * **
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * * * * * *
139301 ATAAACTTGTATGGGCAATAGAAATAATT-TATTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGA
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** * ** ** * *
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* *
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* *** * * * *
139480 AATAAGCTTCTATGTTGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAAGGATTTGAAAT
65 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * ** **
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130 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA-TAGAT
* * * * **
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * * * *
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65 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * **
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* * *
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1 TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * ** * * *
139842 GAATAATCTTGTATGAA-TGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAATCTTAGAACAATTTGAAA
64 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * ** ** * * *
139906 TAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGCAAACACAT
129 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGAT
* *
139958 TTATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTTGAAATATTATTAAATTATTATTATTTT-TATTC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTC
* * * * * * ** *
140018 GAATAAGCTTATATGATCATAAAAAATT-TTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAGTGATTTGAGA
64 AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * * * ** *
140081 TTGATATTTGTTCAAATGGTTATAATTATTT-AAATTGTTCAAAAAACA-ATT
129 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGA-T
* * * * *
140132 TTAATTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-TTAAA
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* * * * ** *
140196 CAAATAAGTTTTTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAA
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* * ** *
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128 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTCAGTAAA-TAGAT
* *
140314 TTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTATTTTCTTGAA-AGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
140378 CGAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAA
63 CAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
** * * * *
140443 ATAGATAATTATTGTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGCTCAGCTAAATACAT
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* *
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*
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* * * *
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* * * * * ***
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** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * ** *
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* *** ** * * *
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* * * * * * * * * ** ** *
137081 TTATTGCTTATTAATTTTTTGACTGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCATGTAT
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* * * * * * * *
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* * * ** ** * *
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * * ** * **
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** * * * *
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** * * * * * * **
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* * * * * * * ** ** *
137568 AAATAAATATTTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTC-GCTCAGTAATTAGAT
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* * * * *
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* * * * *
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* * *** * * * * * * *
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* ** * * * * * * *** *
137811 AA-ATTATTATTTATAAAT-TTTTGGAATA-CAAGTAAATTTA-CATTATTTTATTCAAAATAAG
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* * * * * **
137872 CTT-TCATGAA-T-ATATCCAATTGCTTTCTGACAAAACAAAAAGTT-ATAA-TTTGTTGAAATA
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* ** * * * ** * *
137932 AATAATTATTCAGATAGTCTTTAACTATTTAAA-CTTTTTAAGTAAATAG-A
305 GATAATTGCTCAAATAATC-ATAACTATTTAAACCAGTTT-GGTAAACAGAA
* * *
137982 TTCATTTATTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTT
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* * ** * * * * * **
138047 CAAATAAACTTATATTAACTAAAACAACTATTTTATTACAAAATCAAAAGGTCACAATGATTTGA
59 CGAATAAACTTGTATGGA--GAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTAATAACAATTTGA
* * * ** ** *
138112 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCCGTAAACAT-ATTTACTTTTTA
121 AATAGATAATTATTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTAAGTAAAC-TGATTTATTTTTTA
* * ** * * * * *** **
138176 A-ATCTTTTACTTATTAAT-TATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCT
185 ATATC--TTGCTTATGAATCT-TTTAAATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACT
* * * * *
138239 TGT-TGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAACAATTTG---T---T-G
247 TGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAA
* * *** * *
138294 TT--T-AAATAATCATAACAATTTGAATTTGTTTGGTAAACATAT
310 TTGCTCAAATAATCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA
* * * * * * *
138336 TTATTTTTAAAATTTTTATACTTATTAATTGTCTTAACATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT-
1 TTATTTTTTAAATCTCT-TACTAATT--TTG---AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
** * * * * * *
138400 GAAATAAACTTGCCTGAGCAGAAGA-AA-TATTTTTATGACAAAATAAAGGGTTATAGCGATTTC
60 G-AATAAACTTGTATG-G-AGAA-ACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTG
* * * * * * ** ** * *
138463 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTT
120 AAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAACTATTT-GAACTAATTAAGTAAACTGATTTATTTTTT
** * * ** * ** *
138528 AA-ATCTTTTAATTATTAAT-TTTTGGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
184 AATATC--TTGCTTATGAATCTTTT-AAATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAAC
* ** * * * * *
138591 TTATACAAACTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATAATTTGAAATAGATAAT
246 TTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAAT
*** * * * ** * **
138655 CATTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAATTAGATA
311 TGCTCAAATAATCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGA-A
*** * * * * * *
138700 TATATTTTTATTTTTTTCATTATTAAGTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
1 T-TATTTTT-TAAATCTC-TTACTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * * * *
138765 ATAAAATAGTATGAATAGAACCAA-CAGTTTGATGACAAAATAAAAGGCT-ATAACGATTTGAAA
62 ATAAACTTGTATG--GAGAAACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGG-TAATAACAATTTGAAA
* * ** * ** * ** ** *
138828 TAAATAATTATTCAAATAGTGAAAACTATTCAAAATTGTTTGGTAAA-TAGATTTACTTTTTAA-
123 TAGATAATTATTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTAAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAT
* * * * * * *
138891 ATC-T-CTTACAGATTAGTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTA
187 ATCTTGCTTA-TGAAT-CTTT-TAAATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACTTG
* ** * * * * ** * * * *
138954 TACGAACAAAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAAG-AAATAACAATTTAAAATATAT-ATTT
249 TATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAATTG
* ** * * * ** ** * *
139017 TTCAAATGGTTATAATTATTTGAA-TTGATTCAGTAAATAAAA
313 CTCAAATAATCATAACTATTTAAACCAG-TTTGGTAAACAGAA
* * *
139059 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTAC---T--AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * *
139124 AATAAACTTGTATGAGCTGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
61 AATAAACTTGTATG-G-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAAT
* * * * * * **
139189 AGATAATTGTTCATATTGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCAAG-AAA-TGGATTTATTTTTTAA-
124 AGATAATTATTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATT-AAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAT
* *
139251 ATC-T-CTTATGAA-CTTTTAGAATATT-ATTAATTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACTTGTA
187 ATCTTGCTTATGAATCTTTTA-AATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACTTGTA
* * *
139312 TGGGCAA-TAGAAATAATT-TATTTATGATAGAACAAAATGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAA
251 T--G-AACT-GAAATAATTGT-TTTATGACAAAAC-AAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAA
*
139374 TTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA
310 TTGCTCAAATAATCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA
* *
139419 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * ** *
139484 AGCTTCTATGTTGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAAGGATTTGAAATATAT
65 AACTTGTATG--GAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGAT
* ** *
139549 AATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTGGGTAAACTGATTTATTTTTTAATTCTCTT
128 AATTATTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTAAGTAAACTGATTTATTTTTTAA-TATCTT
* * * * * *
139614 GCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT
192 GCTTATGAATCTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACT
** * *
139679 GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCACAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAA
257 GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAA
* ** * * *
139744 TCATAACTATTTGAACTTGTTTTGTAAATAGAT
322 TCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA
* * *
139777 TTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTATTATTATTTTATTT
1 TTATTTTTT-AAA--TC-T-CTTACTAA--TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * ** * *
139841 CGAATAATCTTGTATGAATGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAATCTTAGAACAATTTGAAA
59 CGAATAAACTTGTATGGA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAA
* * * * * * ** * **
139906 TAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGCAAACACATTTATTTTTTAA-A
123 TAGATAATTATTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTAAGTAAACTGATTTATTTTTTAATA
* * * * *
139970 TC-T-CTTACT-AAT-TTTTGAAATATTATTAAATTATTATTA-TTT-TTATTCGAATAAGCTTA
188 TCTTGCTTA-TGAATCTTTT-AAATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATT-TT-GAATAAACTTG
* * ** * *** * * *
140029 TATGATCAT-AAAAAATT-TTTTATGACAAAACAAA-AATCATAGTGATTTGAGATTGATATTTG
249 TATGAAC-TGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAATTG
* ** * * ** **** *
140091 TTCAAATGGTTATAATTATTTAAA-TTGTTCAAAAAACA-ATT
313 CTCAAATAATCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGA-A
* * * *
140132 TTAATTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-TTAAA
1 TTATTTTTTAAA--TC-T-CTTACTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT--T
* ** * ** * * *
140196 CAAATAAGTTTTTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAA
59 CGAATAAACTTGTATGGA--GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAA
* * * * ** ** *
140261 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTT-AAGCTTGTTTGGTAAACTTATTTATTTTTTTA
122 ATAGATAATTATTCAAATGGCCATAACTATTTGAA-CTAATTAAGTAAACTGATTTA-TTTTTT-
* * * * * * * *
140325 AATCTCTTGCTTAT-TATTTTCTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
184 AATATCTTGCTTATGAATCTT-TT-AAATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACT
* * * * *
140388 TGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTT-AGAACGATTTGAAATAGATAAT
247 TGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAAT
** ** * * * * *
140452 TATTGTAATAGTCTTAACTATTTGAA-C---TAGCT---CAG--
311 TGCTCAAATAATCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA
* ** * * * * *
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* * *** * * * * * * *
140538 AGCTAATATAAAAAGAAACAATTGTTCTATGAC-AAACTAAAGATCATAACGATTTGAGATAGAT
65 AACT--TGTATGGAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * * ** *
140602 AATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAA-TAGATTTAGTTTTTAA-ATC-T
128 AATTATTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTAAGTAAACT-GATTTATTTTTTAATATCTT
* * * * * * *
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** * ** * * ** **
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* * * **
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319 T-AATCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA
* *
140825 TTTATTTTTTAAATCTCCTACCTACTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
1 -TTATTTTTTAAATCT-CT---TACTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * *
140890 GAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTGATCACAAAACAAAAG
60 GAATAAACTTGTATG--GAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
140938 ATCATAACTA
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Consensus pattern (354 bp):
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TATTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTAAGTAAACTGATTTATTTTTTAATATCTTGCTT
ATGAATCTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAACTGAAA
TAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCACAACAATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAATCAT
AACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA
Found at i:140276 original size:537 final size:535
Alignment explanation
Indices: 136345--140937 Score: 3352
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136335 ACAAACAGAA
* * *
136345 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * * * *
136410 AACAAG-TTACTAGGAATTGGAAA-ATTTATTTTACGACCAAACAAAAGGTCTTAACGATTTGAA
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* * * * * * * * * *
136473 ATAAAGAATTATTCATATTGCCTTAACTATTTAAACTAGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAA
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* **
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* * * *
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257 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTAT
* *
136666 TCAAATAGTAATAACTATTTGAACT-GATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA
322 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTA
* *
136730 TTAATTTTTGAAATATTAGA-AAATTAGTT-TTATTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGATCA-AA
382 CTAATTTTTGAAATATTA-ATAAATTA-TTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGATCATAA
* * * * *
136792 CACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGGTTTGAAATAGATAATTGCTCAAATGGTC
444 -AAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTC
* * * *
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* * * * **
136888 TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT-AAGTAATATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * *
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66 AATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * *
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131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * ** *
137082 TATTGCTTATTAATTTTTTGACTGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCATGTATG
196 TCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATG
* * * * * * * *
137147 AGCTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCT
261 A-ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCA
* * ** * * * *
137211 AATAGTC-TCAACTATTTCAACTGGTTCCT-ACAAACACATTTATTTTGTAGAT-TCTTATTAAT
325 AATAGTCAT-AACTATTTGAACTAGTT--TGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAAT
* ** * **
137273 TTTTGAAATAGTAATAAATTGGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATACCAGTTATTC
387 TTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATG-AT--CA--TA---
* * *
137338 TAAATAATTAGTATTATTTTATAACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTC
443 -AAA-AATT-G-----TTTTATGACAAAACAAAA-ATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
137403 AAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAAT
499 AAATGGTCATAATTATTT-AAATTGTTCAGTAAAC-AAT
** *
137442 TTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-ATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * **
137506 AAATAAACTTTTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAATATCATAATGATTTGAA
65 AAATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * * *
137570 ATAAATATTTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTCGCTCAGTAATTAGATTTATTTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * *
137635 TCAT-TTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAA-T--TATTATTATATTTCAAATAAGCTTGT
194 TC-TCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGT
* * *
137696 ATGAATAGAAACAATTGA-TTTATAACAAAA-AAAATGATCATAACAATTT-AAACTAAATAATT
258 ATGAATAGAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAA-GGTTATAACAATTTGAAA-TAAATAATT
* * * * ** * * *
137758 ATTTAAATAATCATAACTATTTAAACGT-GTTCAGAAAAATAAATTTATTGTTTAAAT-TATTAT
320 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTT-TGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-
* * * * *
137821 TTATAAATTTTTGGAATA-CAAGTAAATT-TACATTATTTTATTCAAAATAAGCTT-TCATGAAT
382 --CT-AATTTTTGAAATATTAA-TAAATTAT-TATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGT-ATG-AT
*** * * * ** * * *
137883 -ATATCCAATTGCTTTCTGACAAAACAAAAAGTTATAA-TTTGTTGAAATAAATAATTATTCAGA
439 CATAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TCATAACGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
137946 TAGTCTTTAACTATTTAAACTTTTTAAGTAAATAGAT
502 TGGTC-ATAATTATTTAAA-TTGTTCAGTAAACA-AT
* * * * *
137983 TCATTTATTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTC
1 TTATTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * *
138048 AAATAAACTTATATTAACTAAAACAACTATTTTATTACAAAATCAAAAGGTCACAATGATTTGAA
65 AAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * *
138113 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCCGTAAACATATTTACTTTTTAAA
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * * * * **
138178 TCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGT-
194 TCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTA
* * *
138242 TGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTG---T---T--GT-TT-
259 TGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTC
* * * * * * * * *
138297 AAATAATCATAACAATTTGAATTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTATACTTATT
324 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTAATT
** * * * ** * * *
138362 AATTGTCTTAACATTAATAAATT-TGTATTATTTTATTTGAAATAAACTTGCCTGAGCAGAAGAA
388 --TT-T-GAAATATTAATAAATTAT-TATTATTTTATTCG-AATAAGCTTGTATGATCATAAAAA
* ** * * * * *
138426 ATAT-TTTTATGACAAAATAAAGGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATA
447 AT-TGTTTTATGACAAAACAAA-AATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATA
**
138490 ATTATTTAAAACTTGTTTGGTAAACAGAT
510 ATTATTT-AAA-TTGTTCAGTAAACA-AT
* * * * *
138519 TCATTTTTTAAATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* ** * * * *
138584 AATAAGCTTATACAAACTAAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATAATTTGAAAT
66 AATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * *
138648 AGATAATCATTCATATAATCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGTAATTAGATATATATTTTT--AT
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTAT-TTTTTAAAT
* * * * * * * *
138711 TTTTTTCATTATTAAGTTTCAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTA
195 CTCTTGC-TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTA
* * * * * *
138776 TGAATAGAACCAA-CAGTTTGATGACAAAATAAAAGGCTATAACGATTTGAAATAAATAATTATT
259 TGAATAGAAACAATTA-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATT
* * ** * * * * *
138840 CAAATAGTGAAAACTATTCAAAATTGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTAC-AGAT
323 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTA-AT
* * * * * * * *
138904 TAGTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATACGAACA-AAAACA
387 T--TTT-GAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGATCATAAAA-A
* * ** * * * * *
138968 ATTATTTTATTACAAAACAAAAAGAAATAACAATTTAAAATATAT-ATTTTTCAAATGGTTATAA
447 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAA
* * *
139032 TTATTTGAATTGATTCAGTAAATAAAA
511 TTATTTAAATTG-TTCAGTAAA-CAAT
* * * * **
139059 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * **
139124 AATAAACTTGTATGAGCTGAAATAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
66 AATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * *
139189 AGATAATTGTTCATATTGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCAAG-AAATGGATTTATTTTTTAAA
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTC-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * **
139252 --TC-T-CTTATGAACTTTTAGAATATT-ATTAATTAGTATTAGTTTATTTTGAATAAACTTGTA
194 TCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTA
* * * * *
139312 TGGGCAATAGAAATAATT-TATTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATT
259 T--G-AATAGAAACAATTAT-TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATT
** * *
139376 GCTCAAATAGTCATAACTATTTAAACCAGTTTGGTAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACT
320 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* ** * * * * * *
139440 AATTCTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGTTGAGAAACAA
384 AATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGATCATAAAAAA
** * * * * *
139505 TTGTTTTATGACAAAACGAAAGGTAATAAGGATTTGAAATATATAATTATTCAAATGGCCATAAT
448 TTGTTTTATGACAAAAC-AAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAAT
* ** ** *
139570 TATTTGAACTAATTGGGTAAACTGAT
512 TATTT-AAATTGTTCAGTAAAC-AAT
* * * * **
139596 TTATTTTTTAATTCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * * *
139661 GATAAGCTTTTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGTTCACAATGATTTTAAAT
66 AATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * **
139726 AGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTTTGTAAATAGATTTATTTTTTCAAAT
131 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAAT
* * * * *
139791 CTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTATTATTATTTTATTTCGAATAATCTTGTAT
195 CTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTAT
* ** * *
139856 GAAT-GAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAATCTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCT
260 GAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCA
* * * * *
139920 AATAGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTTT
325 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTTT
* *
139985 TGAAATATTATTAAATTATTATTATTTTTATTCGAATAAGCTTATATGATCATAAAAAATT-TTT
390 TGAAATATTAATAAATTATTATTA-TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGATCATAAAAAATTGTTT
** * * * *
140049 TATGACAAAACAAAAATCATAGTGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGGTTATAATTATTTAA
454 TATGACAAAACAAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTAA
**
140114 ATTGTTCAAAAAACAATT
519 ATTGTTCAGTAAACAA-T
* * * * *
140132 TTAATTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-TTAAA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT--T
* * * *
140196 CAAATAAGTTTTTATAAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTAA
64 CAAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * ** *
140261 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTT-AAGCTTGTTTGGTAAACT-TATTTATTTTTTT
129 ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTCAGTAAA-TAGATTTA-TTTTTT
* * *
140324 AAATCTCTTGCTTATT-ATTTTCTTGAA-AGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
191 AAATCTCTTGCTTATTAATTTT-TAGAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAC
* * * * * * *
140387 TTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAA
254 TTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAA
** * ** * * *
140451 TTATTGTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGCTCAGCTAAATACATTTATTTTTT--A-----T-
318 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * ** * ** * *
140508 -T-A---TT--AA-ATTAGT--ATTA-TCTTAATCTA----AATAAGCTAATATAAAAAGAAACA
382 CTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGATCATAAAAA
* * * * *
140558 ATTGTTCTATGAC-AAACTAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAA
447 ATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAA
* * * ** *
140622 CTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGAT
511 TTATTTAAATTG-TTCAGTAAACA-AT
* **
140649 TTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-
** * ** * * *
140709 AAATAA--TTATGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACAACAACACAAAATGTCATAATTATTTGA
65 AAATAAGCTT-T-TATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * ** * *
140772 AATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAA
128 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAA
* * * * * * * *
140837 ATCTCCTACCTACTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAACTTGT
193 ATCTCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGT
* * *
140902 ATGAATAGAAACAATTGTTTGATCACAAAACAAAAG
258 ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
140938 ATCATAACTA
Statistics
Matches: 3254, Mismatches: 643, Indels: 338
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
510 3 0.00
511 88 0.03
512 100 0.03
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514 1 0.00
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521 4 0.00
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526 2 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (535 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
AATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC
TCTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATG
AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTT
GAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGATCATAAAAAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCATAATTATTTAAAT
TGTTCAGTAAACAAT
Found at i:140836 original size:177 final size:178
Alignment explanation
Indices: 140505--140945 Score: 493
Period size: 181 Copynumber: 2.5 Consensus size: 178
140495 ATTTATTTTT
* * * * * *
140505 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCTAAATAAGCTA-ATAT-AAAAAGAAACAATTGTTCTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA-CTATGTATGAAAAA-AAACAATTGTTTTAC
* * * * * *
140568 GACAAACTAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACT
64 AACAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACT
* * *
140633 GATTTGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCT-CT-TATTAATTTTCAAAA
129 GATTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCCTCTACTAATTTTCAAAA
* *
140681 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTATGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAACTATGTATGAAAAAAAACAATTGTTTTACAA
** * *
140746 CAACACAAAATG-TCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACT
66 CAA-ACAAAA-GATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAAC-
*
140810 TG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTACTAATTTTCAAAA
128 TGATTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCCT--CTACTAATTTTCAAAA
** * * *
140862 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAACT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTGATC
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT-AACTATGTATGAAAAAAAACAATTGTTTTA-C
140926 -ACAAAACAAAAGATCATAAC
64 AAC-AAACAAAAGATCATAAC
140946 TATAGCTTTT
Statistics
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0.82 0.11 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.01
176 51 0.23
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178 5 0.02
180 1 0.00
181 80 0.36
182 6 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (178 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAACTATGTATGAAAAAAAACAATTGTTTTACAA
CAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTGA
TTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCCTCTACTAATTTTCAAAA
Found at i:140905 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 140505--140921 Score: 468
Period size: 177 Copynumber: 2.3 Consensus size: 177
140495 ATTTATTTTT
* * * * * * * *
140505 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCTAAATAAGCTA-ATAT-AAAAAGAAACAATTGTTCTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA-CTATGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTAC
* * ** * * * *
140568 GACAA-ACTAAA-GATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA
64 AACAACACAAAATG-TCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAA
* * *
140631 CTGATTTGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAA
128 CTGATTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTCAAAA
* *
140681 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTATGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAACTATGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACAA
* *
140746 CAACACAAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTT
66 CAACACAAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAAC-T
*
140811 G-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTACTAATTTTCAAAA
130 GATTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCT-CT---TACTAATTTTCAAAA
* * *
140862 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAACT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT-AACTATGTATGAACAAAAACAATTGTTT
140922 GATCACAAAA
Statistics
Matches: 204, Mismatches: 27, Indels: 15
0.83 0.11 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 2 0.01
176 51 0.25
177 78 0.38
178 5 0.02
181 65 0.32
182 3 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAACTATGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACAA
CAACACAAAATGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTG
ATTTGGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTAATTTTCAAAA
Found at i:142971 original size:145 final size:145
Alignment explanation
Indices: 142708--142987 Score: 397
Period size: 145 Copynumber: 1.9 Consensus size: 145
142698 CTTACTTGGT
* * *
142708 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTTTT
1 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTATTGGAATATTAATAAATTAGTATTTTT
* * *
142773 TATTTCAAATAAGCTTGTATAAACATAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACTAT
66 TATTTCAAATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAACGAT
142838 TTGAACGTGTTCAAA
131 TTGAACGTGTTCAAA
142853 AAATAAATTTAGTTTTTT-AAT-TTCTACTTATTAATTATTGGAATATTAATAAATTTA-TATTA
1 AAATAAATTTA-TTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTATTGGAATATTAATAAA-TTAGTATT-
* * ** *
142915 TTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGGCAAAATAAAAGGTCAAAA
63 TTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAA
142979 CGATTTGAA
127 CGATTTGAA
142988 ATAGATAATT
Statistics
Matches: 120, Mismatches: 11, Indels: 8
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
144 37 0.31
145 77 0.64
146 6 0.05
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (145 bp):
AAATAAATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTATTGGAATATTAATAAATTAGTATTTTT
TATTTCAAATAAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAACGAT
TTGAACGTGTTCAAA
Found at i:143133 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 142827--143493 Score: 713
Period size: 181 Copynumber: 3.7 Consensus size: 181
142817 AAAACAAAAG
* * * * *
142827 GTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAAATAAATTTAGTTTTTT-AATTTC-TACTTATTAATTA
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* ** * *
142890 TTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTG
65 TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAATTA-AAACAATTG
* * * *
142953 TTTTATGGCAAAATAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * *
143007 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
143072 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATTAATACAATTGTTT
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAATTAAAACAATTGTTT
* * * * *
143137 TATTACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATA
131 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * *
143188 GTTATAACTATTT-AGACTTGTTCAATAAACATA-TTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTT
1 GTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * * * ** *
143250 GTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATATGCTTGTATGAACAAAAATAATTGT
65 -TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAATTAAAACAATTGT
*
143315 TTTATGACAAAACCAAAA-GTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATA
129 TTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* ** * * * *
143368 GTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAATTTTTTACTTTTTAATTGT
1 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* * * * * *
143433 CTG-AATATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTCAAACAATT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAATTAAAACAATT
143494 ATTAATAAAC
Statistics
Matches: 400, Mismatches: 76, Indels: 21
0.80 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
179 10 0.03
180 181 0.45
181 201 0.50
182 7 0.02
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.08, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAATTAAAACAATTGTTT
TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
Found at i:143499 original size:55 final size:55
Alignment explanation
Indices: 143438--143546 Score: 200
Period size: 55 Copynumber: 2.0 Consensus size: 55
143428 ATTGTCTGAA
143438 TATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTCAAACAAT
1 TATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTCAAACAAT
* *
143493 TATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCTAATAAGCTTACATGAATTGAAACAA
1 TATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTCAAACAA
143547 CTGTTTTATT
Statistics
Matches: 52, Mismatches: 2, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
55 52 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (55 bp):
TATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATGAATTCAAACAAT
Found at i:143813 original size:179 final size:181
Alignment explanation
Indices: 143522--143921 Score: 454
Period size: 179 Copynumber: 2.2 Consensus size: 181
143512 TTTTATTTCT
** * * * * * * *
143522 AATAAGCTTACATGAATTGAAACAACTGTTTTATTACAAAACAAAATGTCACAACGATTTGAAGT
1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAACACAAAAAGTCACAACGATTTGAAAT
** * ** *
143587 TGATAATTATTCAAATAGTCATTACTATTTGAACATGTTTGGTAAACATATTT-TTTAT-AAATC
66 AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAGTAAACAGATTTATTTATGAAATC
* *
143650 TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAAT-TAATATTCTTTTAATCCG-
131 TTTTACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAATAT-ATATTATTTT-ATCCGA
*
143701 AATAAGCTTGTAT-AGATAGAAACAATTATTTTATGACAACACAAAAAGTCATAA-GAATTTGAA
1 AATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTATTTTATGACAACACAAAAAGTCACAACG-ATTTGAA
* * ** *
143764 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGT-TTTGAATTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTGAA
64 ATAAATAATTATTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACATGTTCAGTAAACAGATTTATTTATGAA
** *
143828 ATCTTTTACTTATTAACTGTCTTAATATTAATAAATATATATTATTTTATTCGA
128 ATCTTTTACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAATATATATTATTTTATCCGA
* *
143882 AATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAC
1 AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAC
143922 CTAAAAGGTT
Statistics
Matches: 185, Mismatches: 28, Indels: 14
0.81 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 2 0.01
179 91 0.49
180 10 0.05
181 80 0.43
182 2 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAACACAAAAAGTCACAACGATTTGAAAT
AAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAGTAAACAGATTTATTTATGAAATC
TTTTACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAATATATATTATTTTATCCGA
Found at i:143857 original size:415 final size:416
Alignment explanation
Indices: 143077--143890 Score: 1083
Period size: 415 Copynumber: 2.0 Consensus size: 416
143067 ATTTTTGAAA
* * *
143077 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATTAATACAATTGTTTTATTA
1 TATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTACATGAATTAATACAACTGTTTTATTA
* * * *
143142 CAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATAACTATTTAGACTT
66 CAAAACAAATGGTCACAACGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTCATAACTATTTAGACAT
*
143207 GTTCAATAAACATATTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTATTTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
131 GTTCAATAAACATATTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
** * * * *
143272 ATTATTTTAATTTGAATATGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACCAAAAGTCA
196 ATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCA
*
143337 TAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAAAT
261 TAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAAT
** * * * * *
143402 TTATTTTTTTAATTTTTTACTTTTTAATTGTCTGAATATTAATAAACTA-GTGTTATTTTATTTC
326 TTATTTTTGAAATCTTTTACTTATTAACTGTCTGAATATTAATAAA-TATATATTATTTTA-TTC
143466 -AAATAAGCTTACATGAATTCAAACAAT
389 GAAATAAGCTTACATGAATTCAAACAAT
* *
143493 TATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCT-AATAAGCTTACATGAATTGAA-ACAACTGTTTTAT
1 TATTAATAAACTAGTATTATTTTATTT-TGAATAAGCCTACATGAATT-AATACAACTGTTTTAT
* ** * *
143556 TACAAAACAAAAT-GTCACAACGATTTGAAGTTGATAATTATTCAAATAGTCATTACTATTT-GA
64 TACAAAAC-AAATGGTCACAACGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTCATAACTATTTAG-
***
143619 ACATGTTTGGTAAACATA-T-TTTTTATAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA
127 ACATGTTCAATAAACATATTATTTTTA-AAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA
* * * *
143682 TTAATATTCTTTTAATCCGAATAAGCTTGTAT-AGATAGAAACAATTATTTTATGACAACACAAA
191 TTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * *
143746 AAGTCATAA-GAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGT-TTTGAATTTGTTCAGT
255 AAGTCATAACG-ATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTATTCAGT
* *
143809 AAACAGATTTATTTTTGAAATCTTTTACTTATTAACTGTCTTAATATTAATAAATATATATTATT
318 AAACAAATTTATTTTTGAAATCTTTTACTTATTAACTGTCTGAATATTAATAAATATATATTATT
143874 TTATTCGAAATAAGCTT
383 TTATTCGAAATAAGCTT
143891 GTATGAATAG
Statistics
Matches: 346, Mismatches: 42, Indels: 21
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
414 13 0.04
415 208 0.60
416 118 0.34
417 7 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (416 bp):
TATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTACATGAATTAATACAACTGTTTTATTA
CAAAACAAATGGTCACAACGATTTGAAATAAATAACTATTCAAATAGTCATAACTATTTAGACAT
GTTCAATAAACATATTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAAT
ATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCA
TAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAAT
TTATTTTTGAAATCTTTTACTTATTAACTGTCTGAATATTAATAAATATATATTATTTTATTCGA
AATAAGCTTACATGAATTCAAACAAT
Found at i:144059 original size:86 final size:87
Alignment explanation
Indices: 143961--144133 Score: 258
Period size: 87 Copynumber: 2.0 Consensus size: 87
143951 TCAAATGGTC
* * * *
143961 ATAATTATTTAAATTTGTTCAGTAAATAAATTCATTTTT-AAATCTCTTCATTATTAATTTTCGA
1 ATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAAATTCATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAA
144025 AATATGAATAACATAGTATTAT
66 AATATGAATAACATAGTATTAT
** **
144047 ATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATTGATTCATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAA
1 ATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAAATTCATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAA
*
144112 AATATTAATAACATAGTATTAT
66 AATATGAATAACATAGTATTAT
144134 TTTATTTCAA
Statistics
Matches: 77, Mismatches: 9, Indels: 1
0.89 0.10 0.01
Matches are distributed among these distances:
86 34 0.44
87 43 0.56
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.06, T:0.47
Consensus pattern (87 bp):
ATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAAATTCATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAA
AATATGAATAACATAGTATTAT
Found at i:144581 original size:625 final size:621
Alignment explanation
Indices: 143493--144662 Score: 1307
Period size: 625 Copynumber: 1.9 Consensus size: 621
143483 TTCAAACAAT
* * * * * *
143493 TATTAATAAACTAGTGTTATTTTATTTCTAATAAGCTTACATGAATTGAAACAACTGTTTTATTA
1 TATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTACAAGAATCGAAACAACTGTTTTATGA
* *
143558 CAAAACAAAATGTCACAACGATTTGAAGTTGATAATTATTCAAATAGTCATTACTATTTGAACAT
66 CAAAACAAAATGTCACAACGATTTGAAATTGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAT
* * * *
143623 GTTTGGTAAACATATTTTTTATAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATA
131 GTTCGATAAACATATTTTTTATAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAAAATTAATAAATTAATA
* * * * * *
143688 TTCTTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAGATAGAAACAATTATTTTATGACAACACAAAAAGTCAT
196 TTATTTTAATCCAAACAAGCTTGTATAGATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGACAT
* * * * *
143753 AAGAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGTTTTGAATTTGTTCAGTAAACAGATT
261 AAGAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAACTTTTGAACTGGTTCAGTAAAAAAATT
*
143818 TATTTTTGAAATCTTTTACTTATTAACTGTCTTAATATTAATAAATATATATTATTTTATTCGAA
326 TATTTTTGAAATCTTTTACTTATT-A-TGTCTAAATATTAATAAATATATATTATTTTATTCGAA
* * **
143883 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAACCTAAAAGGTTATAGTGATTTCGAATC
389 ATAAGCTTATATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAACCTAAAAGGTCATAACGATTTCGAATC
* * * * *
143948 CATTCAAATGGTCATAATTATTT-AAATTTGTTC-AGTAAATA-AATTCA-TTTTTAAATCTCTT
454 AATTCAAATAGTCATAATTATTTGAAATAT-TTCGA-CAAACAGAATT-ATTTTTTAAATCTCTT
144009 CATT-ATTAATTT-TCGAAATATGAATAACATAGTATTATATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAA
516 -ATTGATTAATTTATCGAAATATGAATAACATAGTATTATATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAA
144072 ATTGATTCATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAAAA
580 ATTGATTCATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAAAA
* * *
144114 TATTAAT-AACATAGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTATAAGAATCGAAA-TACTTTTTTTAT
1 TATTAATAAAC-TAGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTACAAGAATCGAAACAAC-TGTTTTAT
* * * * *
144177 GACAAGACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAT-ATAATTATTCAAATCGTCATGACTATTTGAT
64 GACAAAACAAAATGTCACAACGATTTGAAAT-TGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAA
*
144241 C-TAGTTCGATAAACATATATATATTTTTTAAAAT-TCTTACTTATTAATTGTCAAAAAATTAAT
128 CAT-GTTCGATAAAC--ATAT-T-TTTTAT-AAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAAAATTAAT
* * * *
144304 AAATTAGTATTATTTTAATCTAAACACA-CTTGTAT-GAATAGAAACTATTGTTTTATAACAAAA
187 AAATTAATATTATTTTAATCCAAACA-AGCTTGTATAG-ATAGAAACAATTATTTTATAACAAAA
* *
144367 CAAAAAGACATAATAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCAT-AACTATTTGAACTGGTT
250 CAAAAAGACATAAGAATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATAGTCATAAACT-TTTGAACTGGTT
* *
144430 -TGATAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA-TTAATT-T-T-TGAAATATTAATAAAT-TAGT
313 CAG-TAAAAAAATTTATTTTTGAAATCTTTTACTT-ATTATGTCT-AAATATTAATAAATATA-T
* * * ** *
144489 ATTATTTTATTTTGAACA-AA-CTTATATGAATA-AAAGCATTTGTTTTGTGTA-AA-C-AAAAG
374 ATTATTTTA-TTCGAA-ATAAGCTTATATGAATAGAAA-AAATCATTTTATG-ACAACCTAAAAG
*
144548 GTCATAACGATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAATATTTCGACAAA
435 GTCATAACGATTTCG-AAT---CAA---TTCAAATAGTCATAATTATTTGAAATATTTCGACAAA
* *
144612 CAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTATTGAAATATTAATAA
493 CAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTATCGAAATATGAATAA
144663 ATTTGTTTTA
Statistics
Matches: 456, Mismatches: 59, Indels: 62
0.79 0.10 0.11
Matches are distributed among these distances:
618 1 0.00
619 18 0.04
620 13 0.03
621 157 0.34
622 11 0.02
623 5 0.01
624 8 0.02
625 191 0.42
626 39 0.09
627 13 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (621 bp):
TATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTACAAGAATCGAAACAACTGTTTTATGA
CAAAACAAAATGTCACAACGATTTGAAATTGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAT
GTTCGATAAACATATTTTTTATAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAAAATTAATAAATTAATA
TTATTTTAATCCAAACAAGCTTGTATAGATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAAGACAT
AAGAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAACTTTTGAACTGGTTCAGTAAAAAAATT
TATTTTTGAAATCTTTTACTTATTATGTCTAAATATTAATAAATATATATTATTTTATTCGAAAT
AAGCTTATATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAACCTAAAAGGTCATAACGATTTCGAATCAA
TTCAAATAGTCATAATTATTTGAAATATTTCGACAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTGA
TTAATTTATCGAAATATGAATAACATAGTATTATATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATTGAT
TCATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAAAA
Found at i:144804 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 144080--145150 Score: 871
Period size: 181 Copynumber: 5.9 Consensus size: 177
144070 AAATTGATTC
* * ** **
144080 ATTTTTAAAATCGCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAA
1 ATTTTTTAAATCTCTT-ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * * * * **
144144 ATAACCTTATAAGAATCGAAATACTTTTTTTATGACAAGACAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
64 ATAA-GTTATATGAAT-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * * * * * *
144209 TATAATTATTCAAATCGTCATGACTATTTGATCTAGTTCGATAAACATATATAT
126 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGA-CAA-ATAAATTT
* ** * * * *
144263 ATTTTTTAAAAT-TCTTACTTATTAATTGTCAAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAA
1 ATTTTTT-AAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * ** * * *
144327 ACACACTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGACATAATAATTTGAAATA
64 ATA-AGTTATATGAAT-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACAATTTGAAATA
* * *
144392 AATAATTGCTT-AAATATTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAAATTT
126 AATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTT
144444 ATTTTTTAAA--TCTT-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAC
1 ATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-
* * * * * * *
144506 AAACTTATATGAAT-AAAAGCATTTGTTTTGTG--TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
65 TAAGTTATATGAATGAAAA--AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAA
* * * *
144568 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAAT-ATTTCGACAAACAGAA-TT
127 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-GACAAATA-AATTT
* *
144619 ATTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTATTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTTTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTATT-ATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * *
144684 ATAAGTTAGTAAGAACTGAAAAAATTGTTTTA-CACAAAACAAAATGTCATAACAATTTCAAATA
64 ATAAGTTA-TATGAA-TGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACAATTTGAAATA
* * * *
144748 AAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTCT-ACAAATAAATTT
126 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TGACAAATAAATTT
* * *
144800 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCG-
1 ATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
* * * * *
144863 ATAAAGCTT-TCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGTCAGAACAAAAGCTTATTACAATTTGAAA
64 AT-AAG-TTAT-ATGAAT-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAA
** * * *
144927 TGTATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTT
124 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTT
* ***
144981 ATTTTTTAAATCTCCTATATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTAT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * * * * *
145046 TAGGCTTCTATG-ATGAAAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGTTAATAATAATTTGACATT
65 TAAG-TTATATGAATG--AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACAATTTGAAATA
* * * * *
145110 GATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTTGA
126 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGA
145151 ATATTAATAA
Statistics
Matches: 726, Mismatches: 121, Indels: 84
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 9 0.01
175 68 0.09
176 2 0.00
177 63 0.09
178 3 0.00
179 23 0.03
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181 299 0.41
182 16 0.02
183 125 0.17
184 11 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
ATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
AAGTTATATGAATGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTT
Found at i:145119 original size:362 final size:354
Alignment explanation
Indices: 144098--145150 Score: 967
Period size: 362 Copynumber: 2.9 Consensus size: 354
144088 AATCGCTTAA
** * * * * *
144098 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAACCTTATAAGAATCG
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAAT-A
* * * * ** * * *
144162 AAA-TACTTTTTTTATGACAAGACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATC
64 AAAGCAATTGTTTTATG-TAA-ACAAAA-GCTCATAACAATTTGAAATGTATAATTGTTCAAATA
* * * * *
144225 GTCATGACTATTTGATCTAGTTCGATAAACATATATATATTTTTTAAAAT-TCTTACTTATTAAT
126 GTCATAACTATTTGAACT-GTTTGAT-AA-ATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-TTATTAAT
* ** * * * **
144289 TGTCAAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAACACA-CTTGTATGAAT-AGAAACTAT
186 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATA-AGCTTGTATGAATGA-AAAAAAT
**
144352 TGTTTTATAACAAAACAAAAAG--ACATAATAATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCATA
249 TGTTTTATAACAAAAC-AAAAGTTA-ATAATAATTTGAAATAAATAATTG-TTCAAATAGCCATA
*
144414 ACTATTTGAACTGGTTTGATAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTT
311 ACTATTTGAACTGGTTTGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTT
*
144458 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAATAAA
1 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAATAAA
* * * *
144523 AGCATTTGTTTTGTGTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCA
66 AGCAATTGTTTTATGTAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAAT-GTATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * *
144587 TAATTATTTGAAATATTTCGACAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTATTGA
130 TAACTATTTGAACTGTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATT-ATTAATTT-TTGA
* * * * *
144652 AATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTAGTAAGAACTG-AAAAAATTGTTTT
192 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTT-GTATGAA-TGAAAAAAATTGTTTT
* * * * * * *
144715 A-CACAAAACAAAA-TGTCATAACAATTTCAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTG
255 ATAACAAAACAAAAGT-TAATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTG
*
144778 AACTGGTTCT-ACAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
319 AACTGGTT-TGACAAAAAAATTTATTTTTTAAA--TCTT
* * *
144816 AGTTATTAATTTTT-AGAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCGATA-AAGCTT-TCATGA
1 --TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ACAAACTTAT-ATGA
* * *
144878 ATAGAAA-TAATTGTTTTATGTCAGAACAAAAGCTTATTACAATTTGAAATGTATAATTGTTCAA
61 ATA-AAAGCAATTGTTTTATGT-A-AACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATGTATAATTGTTCAA
* *
144942 ATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTATATATTAAT
123 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAT-TATTAAT
* * *
145007 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTCTATG-ATGAAAAAAAATT
186 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATG-AAAAAAATT
* * * ** * *
145071 GTTTTATGATAAAACAAAAGTTAATAATAATTTGACATTGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTA
250 GTTTTATAACAAAACAAAAGTTAATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
*
145136 TTTGAACTGATTTGA
315 TTTGAACTGGTTTGA
145151 ATATTAATAA
Statistics
Matches: 564, Mismatches: 93, Indels: 70
0.78 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
355 12 0.02
356 97 0.17
357 54 0.10
358 56 0.10
359 10 0.02
360 127 0.23
361 59 0.10
362 144 0.26
363 5 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (354 bp):
TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAATAAA
AGCAATTGTTTTATGTAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATGTATAATTGTTCAAATAGTCAT
AACTATTTGAACTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATA
TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATGAAAAAAATTGTTTTATAACA
AAACAAAAGTTAATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGGT
TTGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTT
Found at i:146029 original size:116 final size:116
Alignment explanation
Indices: 145909--146131 Score: 299
Period size: 116 Copynumber: 1.9 Consensus size: 116
145899 TAAATCTCTA
* *
145909 ACTTATCAATTTT-TATAATATTAATAAAGTAATATTATGTTATTTCGAATAAGCTTTTATAAAC
1 ACTTATCAATTTTCTA-AATATTAATAAAGTAATATTATGTTATTTCGAATAAGCATGTATAAAC
*
145973 TGAAA-CAACTATTTTATGA-TAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAATTTCTT
65 T-AAAGCAACTATTTTATGACTAAAA-AAAAGGTCAAAATGATTTTAATTTCTT
* * * * * * *
146025 ACTTATCAATTTTCTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCATGTATGAGCT
1 ACTTATCAATTTTCTAAATATTAATAAAGTAATATTATGTTATTTCGAATAAGCATGTATAAACT
*
146090 AAAGCAATTATTTTATGACTAAAAAAAAGGTCAAAATGATTT
66 AAAGCAACTATTTTATGACTAAAAAAAAGGTCAAAATGATTT
146132 GAAATAGATG
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 11, Indels: 6
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
115 3 0.03
116 83 0.89
117 7 0.08
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (116 bp):
ACTTATCAATTTTCTAAATATTAATAAAGTAATATTATGTTATTTCGAATAAGCATGTATAAACT
AAAGCAACTATTTTATGACTAAAAAAAAGGTCAAAATGATTTTAATTTCTT
Found at i:146732 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 146023--147224 Score: 873
Period size: 180 Copynumber: 6.7 Consensus size: 177
146013 TTTTAATTTC
* * * *
146023 TTACTTATCAATTTTCTA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCATGTATGA
1 TTACTTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * *
146087 GCTA-AAGCAATTATTTTATGACTAAAAAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATGATTATTCTA
64 -ATAGAAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAA
* * ** * * *
146151 ACAATCTTAACTATTTAAACTGGTT-TAGTAAACATGTTTATTTTTTAAATC--
127 ATAGTAATAACTATTTAAACT-GTTCGA-TAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTT
* * * * * *
146202 ---CTTATTAATGTTTAGAATATTATTAATTTCA-TAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGA
1 TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * * * * * *
146263 ATAGAAATAAATGTCTTAGGACAAAATAAAGATCATAACGATTTCAGATAGATAATTGTTCAAAT
64 ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* * * * * *
146328 AGTCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAAAAGATTTA-GTTTTAAATC--
129 AGTAATAACTATTTAAACT-GTTCGATAAATA-ATTTATTTTTTAAATCTT
* * * *
146376 -T-CTTATTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTAGTATTACTTTATTCTGAAT-AGTTTTGTATGA
1 TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAG-CTTGTATGA
* * *
146438 ATAGAAA-AATTGTTTTATGAGAAAA-AAATGTCAT-ATCGATTTGAAATAAATAA-TAGTTCAA
64 ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAAATAATTA-TTCAA
* * * *
146499 ATAG-ACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTAATTTTTTAAATCTT
127 ATAGTA-ATAACTATTTAAAC-TGTTCGATAAAT-AATTTATTTTTTAAATCTT
** * * *
146552 CAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTACGAATAAACTTGTATTAA
1 TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAA
* *
146617 TAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAGGATCATAATGAATTGAAATAAATAATTATTCAAAT
65 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
** * *
146682 AGTAATAACTATTTAAACTCACTCGATAAACAATTTTATTTTTAAAATCTT
129 AGTAATAACTATTTAAACT-GTTCGATAAATAA-TTTATTTTTTAAATCTT
* * * * *
146733 TTACTTCTTAA-TTGTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATAGT-GAATAAGGTTTTTTGA
1 TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT--TCGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * *
146796 ATAGAATCAATTAGTTTACGACAAAACAAATGGCCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAA
64 ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-GGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* * *
146861 TAGTCATAACTATTTAAACGTGTTCAAAAAATTAATTTATTTTTTAAAT-TT
128 TAGTAATAACTATTTAAAC-TGTTCGATAAA-TAATTTATTTTTTAAATCTT
* * * *
146912 TTACTTATTAATTTTTGGAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGA
1 TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCG-AATAAGCTTGTATGA
* * * * * *
146976 ACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAATAAA-ATACATAAT-ATTTTGAAATAAATAATTATTCAG
64 ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGT-CATAATGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAA
* * ** ** *
147039 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCCG-CCAATAGATTTATTTTTTTATTTCTC
127 ATAGTAATAACTATTTAAAC-TGTT-CGATAAATA-ATTTA-TTTTTTAAATCTT
* * **
147093 TTACCCT-TTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTACATG
1 TTA-CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
147155 AATTA-AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAAGGATTTGAAGTAGATAATTATTCA
63 AA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCA
147219 AATAGT
126 AATAGT
147225 TATTTTCATA
Statistics
Matches: 819, Mismatches: 154, Indels: 98
0.76 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
172 2 0.00
173 55 0.07
174 39 0.05
175 115 0.14
176 58 0.07
177 1 0.00
178 61 0.07
179 84 0.10
180 258 0.32
181 136 0.17
182 10 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAAT
AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
TAATAACTATTTAAACTGTTCGATAAATAATTTATTTTTTAAATCTT
Found at i:147182 original size:360 final size:354
Alignment explanation
Indices: 146013--147224 Score: 1017
Period size: 360 Copynumber: 3.4 Consensus size: 354
146003 GTCATAATGA
* * *
146013 TTTT-AATTTCTTACTTATCAATTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATA
1 TTTTAAATCTCTTACTT-T-AATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * *
146076 AGCATGTATGAGCTA-AAGCAATTATTTTATGACTAAAAAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGA
63 AGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * *
146140 TGATTATTCTAACAATCTTAACTATTTAAACTGGTTTAGTAAACA-T-GTTTATTTTTTAAA---
126 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-GTTTA--AAAAATTAATTTATTTTTTAAATTT
* * * * * *
146200 TCCTTATTAATGTTTAGAATATT-ATTAATTTCATAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGAA
188 TACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTT-ATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * * * *
146264 TAGAAATAAATGTCTTAGGACAAAATAAAGATCATAACGATTTCAGATAGATAATTGTTCAAATA
252 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAA-TATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
* * * *
146329 GTCATAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAAAAGATTTA--G
316 GTCATAACTATTTGAACTCGTTCCG-AAAAAGATTTATTT
* * *
146367 TTTTAAATCTCTTA--TTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTAGTATTACTTTA-TTCTGAAT-AG
1 TTTTAAATCTCTTACTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAG
* * * *
146428 TTTTGTATGAATAGAAA-AATTGTTTTATGA-GAAAAAAATGTCAT-ATCGATTTGAAATAAATA
65 -CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAGATA
* * *** * * *
146490 A-TAGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTAATTTTTTAAATCTTCA
128 ATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TGTTTAAAAAATTAATTTATTTTTTAAAT-TT-T
* * *
146554 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTCATTACG-AATAAACTTGTATTAA
189 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-CGAAATAAGCTTGTATGAA
* * * *
146617 TAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAGGATCATAATGAATTGAAATAAATAATTATTCAAAT
252 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAA-GATCATAAT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* * **
146682 AGTAATAACTATTTAAACTCACT-CGATAAACA-ATTT-TATT
315 AGTCATAACTATTTGAACTCGTTCCGA-AAA-AGATTTAT-TT
* * * * *
146722 TTTAAAATCTTTTACTTCTTAATTGTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATAGT-GAATA
1 TTTTAAATCTCTTAC-T-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATA
* * * * * * * *
146785 AGGTTTTTTGAATAGAATCAATTAG-TTTACGACAAAACAAATGGCCATAATGATTTTAAATAGA
63 AGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* *
146849 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTGTTCAAAAAATTAATTTATTTTTTAAATTTTT
126 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-TGTTTAAAAAATTAATTTATTTTTTAAA-TTTT
* * * * *
146914 ACTTATTAATTTTTGGAACATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACA
189 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAATA
* *
146979 GAACCAATTGTTTTATGACAAAATAAA-ATACATAATATTTTGAAATAAATAATTATTCAGATAG
254 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGAT-CATAATA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
* * *
147043 TCATAACTATTTGAACTTGTTCCGCCAATAGATTTATTT
317 TCATAACTATTTGAACTCGTTCCG-AAAAAGATTTATTT
** *
147082 TTTTATTTCTCTTACCCTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTTCAAATAA
1 TTTTAAATCTCTTA--CTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
** * * * *
147146 GCTTACATGAATTA-AAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAAGGATTTGAAGTAGAT
64 GCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
147210 AATTATTCAAATAGT
127 AATTATTCAAATAGT
147225 TATTTTCATA
Statistics
Matches: 673, Mismatches: 132, Indels: 100
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
346 2 0.00
347 4 0.01
348 60 0.09
349 1 0.00
350 20 0.03
351 42 0.06
352 3 0.00
353 76 0.11
354 55 0.08
355 20 0.03
358 43 0.06
359 69 0.10
360 183 0.27
361 90 0.13
362 5 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (354 bp):
TTTTAAATCTCTTACTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
ATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGTTTAAAAAATTAATTTATTTTTTAAATTTTACTTATT
AATTTTTAGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
TTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAATATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
TTTGAACTCGTTCCGAAAAAGATTTATTT
Found at i:147742 original size:17 final size:18
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147706 GCCTATTTAG
*
147716 AAATTCTTTTT-ATTTTT
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18 6 0.29
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AAATTTTTTTTAATTTTT
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*
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*
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GCCAAAAACTAGGGAGCTG
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149857 GGTTTCACAT
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* *
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* * *
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* *
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* *
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1 ---CTCAAAGATTCTCATTTGAAGA
* * *
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* *
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*
150115 CTCAAAGCTTCTCATTTGAAAGCA
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*
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* * *
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CTCAAAGATTCTCATTTGAAGA
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*
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1 AAAGATTCTTATTT
* *
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1 AAAGATTCTTATTT
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1 AA
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AAAGATTCTTATTT
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Indices: 149870--150213 Score: 332
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149860 TTCACATCTC
* *
149870 AAAGATTCTCATTTGAAGGACTCAAAGATTCTTATTTGAAAA---CTC
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*
149915 AAAGATTCTCATTTGAA-ACTCAAAGATTCAT-ATTTG-AAA---CTC
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* *
149957 AAAGATTCAT-ATTTGAA-ACTCAAAGATTCTCATTTGAAGATTTTTTTT
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* * **
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* * * *
150051 AAAGTTTCTCATTTAAGACTCAAAGTTTCTTATTTGAAAATGTCTT
1 AAAGATTCTCATTTAAGACTCAAAGATTCTCATTTGAAAATTTCTT
* * ***
150097 AAAGCTTCTCATTTAAGACTCAAAGCTTCTCATTTGAAAGCATCTT
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* * **
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150214 ACTTCATCAA
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AAAGATTCTCATTTAAGACTCAAAGATTCTCATTTGAAAATTTCTT
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151387 CTTTTTCATC
*
151397 CTTT CTATT TTTT CATTT -TTT CTTT CTTT -TTT C-TT -TTT CTTT CTATT
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*
151444 -TTT -TTT CTTT CTTT CATT CTTT C
1 CTTT CTTT CTTT CTTT CTTT CTTT C
151467 ACTCATTATT
Statistics
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Consensus pattern (4 bp):
CTTT
Found at i:151428 original size:11 final size:11
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Indices: 151407--151457 Score: 61
Period size: 11 Copynumber: 4.6 Consensus size: 11
151397 CTTTCTATTT
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*
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1 TTTCTTT
151458 CATTCTTTCA
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TTTCTTTTTTC
Found at i:151428 original size:19 final size:18
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Indices: 151404--151458 Score: 69
Period size: 19 Copynumber: 3.0 Consensus size: 18
151394 ATCCTTTCTA
151404 TTTTTTCATTTTTTCTTTC
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TTTTTTCTTTTTTCTTTC
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Indices: 151834--151867 Score: 50
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151824 TTCTTTTCTC
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*
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1 TTTTTTCCT
151862 TTTTTT
1 TTTTTT
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Statistics
Matches: 22, Mismatches: 2, Indels: 2
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TTTTTTCCT
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Indices: 152856--152889 Score: 50
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*
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*
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1 GTAAGTTGGT
152890 TGTGGATATG
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 3, Indels: 0
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Consensus pattern (12 bp):
GTAAGTTGGTGA
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Indices: 155275--155487 Score: 324
Period size: 114 Copynumber: 1.9 Consensus size: 116
155265 AAATACATCT
155275 AATTATTCCACCATTTAGGCCAAATTAGAAATATTTTCTTATTTTGAATTTCTAAATTCTCCACC
1 AATTATTCCACCATTTAGGCCAAATTAGAAATATTTTCTTATTTTGAATTTCTAAATTCTCCACC
*
155340 ATTTAGACCTATTTAGAAATTCTTTTTATTTCTTCCTTTTTTTTTTTTCTA
66 ATTTAGACCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTTCCTTTTTTTTTTTTCTA
* * * * *
155391 AATTTTTCCACCATTTGGGTCAATTTAGAAA-ATTTT-TT-TTTTGAAATTTCTAAATTTTCCAC
1 AATTATTCCACCATTTAGGCCAAATTAGAAATATTTTCTTATTTTG-AATTTCTAAATTCTCCAC
* *
155453 CATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTT
65 CATTTAGACCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTT
155488 TTTCTTTTGG
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 8, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
113 5 0.06
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AATTATTCCACCATTTAGGCCAAATTAGAAATATTTTCTTATTTTGAATTTCTAAATTCTCCACC
ATTTAGACCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTTCCTTTTTTTTTTTTCTA
Found at i:155492 original size:51 final size:50
Alignment explanation
Indices: 155376--155492 Score: 139
Period size: 51 Copynumber: 2.3 Consensus size: 50
155366 TATTTCTTCC
*
155376 TTTTTTTTTTTTCTAAATTTTTCCACCATTTGGGTCAATTTAGAAAATTT
1 TTTTTTTTTTTTCTAAATTTTTCCACCATTTGGGCCAATTTAGAAAATTT
** *
155426 TTTTTTTGAAATTTCTAAA-TTTTCCACCATTTGGGCCTATTTAG-AAATTAT
1 TTTTTTT--TTTTTCTAAATTTTTCCACCATTTGGGCCAATTTAGAAAATT-T
155477 TTTTATTTCTTTTTCT
1 TTTT-TTT-TTTTTCT
155493 TTTGGAAAGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTTTTTTTTTCTAAATTTTTCCACCATTTGGGCCAATTTAGAAAATTT
Found at i:155567 original size:102 final size:102
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Indices: 155449--155655 Score: 396
Period size: 102 Copynumber: 2.0 Consensus size: 102
155439 TCTAAATTTT
155449 CCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGA
1 CCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGA
*
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*
155551 CCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTCTTTTTATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGA
1 CCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGA
155616 CAATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATTCCA
66 CAATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATTCCA
155653 CCA
1 CCA
155656 TTTGGGACAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTTATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGA
CAATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATTCCA
Found at i:155676 original size:102 final size:99
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Indices: 155421--155661 Score: 393
Period size: 102 Copynumber: 2.5 Consensus size: 99
155411 CAATTTAGAA
*
155421 AATT-TTTTTTTTGAAATTTC---TAAATT-TTCCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTT
1 AATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATTCCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTT
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66 ATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGAC
* *
155515 AATTATTTTTATTTAAATTTCATTTAAATTATTCCACCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTCTT
1 AATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATT---CCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATT
155580 TTTATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGAC
63 TTTATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGAC
155617 AATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATTCCACCATTTGGG
1 AATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATTCCACCATTTGGG
155662 ACAAATGTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (99 bp):
AATTATTTTTATTGAAATTTCATTTAAATTATTCCACCATTTGGGCCTATTTAGAAATTATTTTT
ATTTCTTTTTCTTTTGGAAAGAAAATAATATGAC
Found at i:156102 original size:24 final size:24
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* *
156099 AACGACTCAGCTTAAGACATAGAT
1 AACGGCTCGGCTTAAGACATAGAT
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1 AACGGCTCG
156132 TAGGCATGAC
Statistics
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AACGGCTCGGCTTAAGACATAGAT
Found at i:156515 original size:19 final size:20
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Indices: 156491--156536 Score: 69
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156481 GAGATGTGAT
*
156491 GCCAAAAACTAGGTAGCT-A
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156510 GCCAAAAACTAGGGAGCTCA
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1 GCCAAAAA
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Statistics
Matches: 25, Mismatches: 1, Indels: 2
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GCCAAAAACTAGGGAGCTCA
Found at i:156902 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 156890--156941 Score: 52
Period size: 7 Copynumber: 7.3 Consensus size: 7
156880 AGGATAAATC
156890 AAAATAA
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156897 AAAATAA
1 AAAATAA
*
156904 AAGATAA
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* *
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1 AAAATAA
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1 AA-AATAA
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1 AA
156942 CTCTAAAAAA
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 6, Indels: 6
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Matches are distributed among these distances:
6 4 0.11
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Consensus pattern (7 bp):
AAAATAA
Found at i:157351 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 157142--157550 Score: 448
Period size: 181 Copynumber: 2.2 Consensus size: 181
157132 TTGGTAAACA
* *
157142 TATTTTTATAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAAT-TAATATTATTTTAATCC
1 TATTTTT-TAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATGT-ACATTATTTTAATCA
* * * **
157206 AAATAAG-TCTGTATGGATAGATACAATTGTTTTATGACAACACAAAAAAGTCATAG-GAATTTG
64 AAATAAGCT-TGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAC-CAAAAAAGTCATAGTGAATTTG
*
157269 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACTTGTTC-AGTAAACATATT
127 -AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACTTGTTCGA-TAAACAGATT
* ** * *
157325 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATGTGCATTATTTTATTCAAA
1 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATGTACATTATTTTAATCAAA
* * * * *
157390 ATAAGCTTGTTTGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAACCCAAAAAGTTATAGTGAGTTTGAATC
66 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAACCAAAAAAGTCATAGTGAATTTGAATA
* * ** * *
157455 AATAATTGTTTAAATGGTCATAATTATTTAAATTTGTTCGATAAATAGATT
131 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACTTGTTCGATAAACAGATT
** * * * * * *
157506 CCTTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAAAATATGAATAAA
1 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAA
157551 ATAGTCTTAT
Statistics
Matches: 188, Mismatches: 34, Indels: 10
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
181 92 0.49
182 87 0.46
183 9 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATGTACATTATTTTAATCAAA
ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAACCAAAAAAGTCATAGTGAATTTGAATA
AATAATTGTTCAAATAGTCATAACCATTTAAACTTGTTCGATAAACAGATT
Found at i:157620 original size:87 final size:87
Alignment explanation
Indices: 157474--157647 Score: 251
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157464 TTAAATGGTC
* * **
157474 ATAATTATTTAAATTTGTTCGATAAATAGATTCCTTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAA
1 ATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTCGAA
*
157539 AATATGAATAAAATAGTCTTAT
66 AATATGAATAAAATAGTATTAT
* *
157561 ATAATTATTTAAACTTGTAT-GGTAAATTGATTCATTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTCGA
1 ATAATTATTTAAACTTGT-TCGATAAATAGATTCATTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTCGA
* *
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65 AAATATGAATAAAATAGTATTAT
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ATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTCGAA
AATATGAATAAAATAGTATTAT
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157584 AAATTGATTC
* * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * **
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65 A-AAGCTTGTATGAAT-GAAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * *
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*
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1 ATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA-
* * * * *
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65 AAAGCTTGTATGAATGAAAATA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA
* * * * *
158079 ATAATTTTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTAGTTCAATAAACAAAATT
129 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAAATTT
* *
158130 ATTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTG
1 ATTTTTTAAATCTCTTATT-ATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG
* * * * **
158194 AATAAG-TTAGTAAGAATTGAAAATATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCTAA
63 AAAAAGCTT-GTATGAA-TGAAAATATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * * **
158258 TAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAGCTAGTTCGGTAAATAAATTT
126 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAAATTT
* * * *
158312 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTACTACATTAGAATTATTTTATTTTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * *
158376 TAAAAGCTTGTATGAAT-ATAAATAATTGTTTTAGGTCATAACCAAAGG-CGACAATAATTTGAA
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* * * * *
158439 ATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATTT
125 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAAATTT
*
158494 ATTTTTTAAATCTCCTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AA
1 ATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * *
158558 ATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTAATAACGATTTAAAAT
65 A-AAGCTTGTATGAATG-AAAA-TATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
*
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ATTTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAA
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AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAATAAATAAATTT
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158468 TTTGAATTGG
* * * * *
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* * * *
158543 ATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTTA
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*
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129 ATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTGAACTAA
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1 TTCGATAAA-TAGATTTATGTTTTAAATCTCCT-ACTTATCAATTTTTGA-AATATTAATAAAGT
*** * *
158703 AATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG-AAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAA
63 AATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-A-TGAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAA
* *
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126 GGTATAACGATTTAAAATAAATAATT
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ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATGAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGGTAT
AACGATTTAAAATAAATAATTATTTGAACTAA
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158614 TTTAAAATAG
* ** * * * *
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* * * * *
158688 TAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG-GATAAGCTTTTATGAACT-GAAAC-AATTATT
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* * * *
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* * * *
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1 ATAACTATTTGAAC-TTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTT
* * * **
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64 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAA-CTAATTGTT
* * * * *
158926 TTATGACTATACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGGTAATTGTTCTAATAGTC
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* * * * * * *
158981 TTAACTATTTAAACTGGTTC-AGCAAACACATTTGTTTTTTAAA--TC---CTTATTAATGTTT-
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * * * *
159039 AGAATATT-ATTAATTAGCAATATTTTACTTTG-AGTAAGTTTGTTTGAACATAAATAAATGTTT
65 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTT
* * * * * * * * *
159102 TA-GTATAGAAC-AAAGATCATAACGATTTCAGATAAATAATTGTTTAAATAGTT
128 TATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * **
159155 ATAACTTTTTGAA-TTGGTTCGGTAAAGAGACTTAGTTTTTAAA--TC-T-GTTAGTAATGTTCA
1 ATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** *
159215 AAATAGTAATATATTAATATTATTTTATTCT-AAATAATTTTATATGAATAGAAAC-AATTGTTT
65 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AACTAATTGTTT
* ** * * * * * *
159278 TACGACAAAACAAAATCTTATAATGATTTGAAATAGACAATAGCTC-AATGGAC
128 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
159331 ATGATTATTTGAATTTGTTTGGTAAACAGATTAATTTTTTGAATCT-TTAACTTATTAATTTTT-
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTG
*
159394 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAACTTGTATGAATAGAAAC-AATTGTT
65 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AACTAATTGTT
* * * * *
159457 TTATGACAAAAC-AAAGGACTATAATGATTTGAAAGAAATAGTTTTTCAAATAGTC
127 TTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** ** * *
159512 ATAACTATTTGAACTCATTCGGCAAA-TGAATTTATTTTTAAAATCAT-TTACTTATTAA-TTTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTT
* * *
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64 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAA-GCTTGT-ATG-AATAGAACTAATTG
* * *
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125 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * ** *
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1 ATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
** * * *
159756 GGGACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATACA-CTTGCATGAATAGAGCTAATTGTT
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* * * * *
159819 TTATGACTAAACAAAAGGT-TTAATGTTTTGAAATAGATAACTGTTCAGATAGTC
127 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * *
159873 ATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTT
* ** * * *
159937 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTACATGAATTGAAATAATTATTTT
64 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTTT
* * * * * *
160002 ATTACAAAACAAAAGGTCACAAAGATTTGAAGTAGATAATTATTAAAATAGTC
129 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * **
160055 ATGATTATTTGAACTTATTCGGTAAAC--ATATATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * ** *
160118 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAAA-AAGCTCATATGGATCA-AAC-AATTGTTTT
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAACTAATTGTTTT
* *
160180 ATGACAAAACAAAAAAGTCATAA-GAATTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTT
129 ATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
160234 ATAACGATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAGATCTTTTACTTATTAATTGTCT
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-T
* ** * * ** **
160299 T--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAACAAGCTTTTATGAATAGAAAAAATCATTT
63 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTT
* * * * *
160362 TATGACAAATCAAAAGGTTATAGTGATTCT-AAATCGATAATTGTTCAAAGAGTC
128 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
160416 ATAATTATTTAAACTTGTTC-AGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTG
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * * *
160480 GAATATTAATAACA-TAATATTATTTTATTTCG-AGTAACCTTATTTCAACT-GAAATAATTATT
65 AAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAACTAATT-GT
** * * *
160542 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTC
126 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * ** ** * * * * **
160598 ATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATTTTTATTTTAAAAATTTTTTGCTTATTAATTATCAA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * *
160663 AATATTAATAAATTAGTATTATATTAATCTG-AATAAGCTTGTGTGAATAGAAACT-ATTGTTTT
66 AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAG-AACTAATTGTTTT
* * * * *
160726 ATAACAGAA-TAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTC
129 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTC
* * * *
160777 ATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * ** * * * * *
160838 AATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAACTAA-TTTATACAAACAAAAATATTTTTTTTA
66 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTTTA
* * **
160902 TGACAAAACAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
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* * * *
160954 ATAATTATTTGAAC-TGATTC-AGTAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTT
1 ATAACTATTTGAACTTG-TTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
** * * * **
161017 GAAATAGCAATAAAATT--TTTTATTTTATTTCAAATAAG-TTAGTAAGAACT-GAAAAAATTTG
64 GAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAACTAA-TTG
* * * ** * *
161078 TTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAAGGATTGTTCATATAGCC
125 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
161135 TTAACTATTTGAA-TTGGCTC-AGCAAATAAATTTATATTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT
1 ATAACTATTTGAACTT-GTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
161198 -ATAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTTTATGAATAGAATTAATTGTG
64 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTT
* * * ** * *
161261 TTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAACTGTTCAAATAGTC
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* * * * *
161316 ACAA-TATTTGAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTATTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTG
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* ** * ** *
161379 AAATATTAATAAATTAGTAATATTTTATTCAAAATAGGCTTGTATG-AT-GAAAAGAAATGTTTT
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* * * *
161442 ATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-GGC
129 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
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1 -ATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
161557 T-ATAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG-GATAAGTTTTTATGAACT-GAAATAATTA
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * *
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* * * *
161853 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ACTTTTGA
1 ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
** * * * *
161917 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGGTTTTTTGAATAGAAAC-AATTGGTTTA
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** * *
161981 TGACAAAACAAATTGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGTC
130 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
162033 ATAACTATTTGAA-TGTGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTG
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* * * * *
162096 GAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATGTGAAATATGCTTGAATGAATAGAACCT-ATTGTTT
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* * * *
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128 TATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTC
* * ** *
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* * * ** *
162278 GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAGTAAGCTTACATGAATTGAAAC-AATTGTTT
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* * * * * *
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* * *
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Statistics
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ATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAACTAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
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Indices: 157594--162424 Score: 3298
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157584 AAATTGATTC
* * ** * *
157594 ATTTTTAAAATCTCTTAATTATTAATTTCGAAAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTAATTTGA
* * * *
157658 ATAACCTTATATGAATTGAAATAATT-TTTTATGACAAAAAAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
65 ATAAGCTTATATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAAATA
* * * ** ** * * *
157722 GATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAATTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATTT
128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
*** * * * *
157787 TTTACTTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTATATTAATCTAAACAAGCTTGTATGA
193 TTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGA
** * * * * * * *
157852 ATAGAAACTATTGTTTTATAATAGAATAAAAAGACATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTT-AA
257 ATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG-TTCAA
* * * * * ** *
157916 ATATTCATAATTGTTTGAGCTGGTTCAATAAAAAGATTT
321 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGT--AAACATTT
*
157955 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAGATTAGTATTATTTT-ATTTCG
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-G
* ** * * *
158014 AACAAATTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGAC--AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
64 AATAAGCTTATATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAAAT
* * ** * *
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127 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * ***
158141 CTCTTA-TTGATTAATTTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTA
191 CTTTTACTT-ATTAA-TTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTT-
* * * * ** *
158203 GTAAGAATTGAAAATATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTCTAATAAAGAATTG
251 GTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
* * * * * *
158268 TTCATATAGCCTTAACTATTTGAGCTAGTTCGGTAAATAAATTT
316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGT-AA-ACATTT
* * * * *
158312 ATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTACATTAGAATTATTTTATTTTGAT
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA-
* * * * * * * * * *
158377 AAAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTAGGTCATAACCAAAGG-CGACAATAATTTGAAAT
65 ATAAGCTTATATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAA-GATTTGAAAT
* * * *
158441 ATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAAT
127 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
** * *
158505 CTCCTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAGGCTTGTA
191 CTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTA
* * * *
158569 TG-AT-GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTAATAACGATTT---A-AAAT-A--G-
254 TGAATAG-AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGT
** *
158624 ----ATA---AT---TATTTGAACTAATTCGATAAACTGATTT
317 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC--ATTT
* * * * * * * *
158657 ATGTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTATAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAA
* * * * *
158722 TAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAAGGT-ATAATGATTTTAAATA
66 TAAGCTTATATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAA-GATTTGAAATA
* * * *
158786 AATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTTTTTTC-GTAAATAG----ATTTTTT-AAT-
128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
** *
158844 TTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCATGTAT
192 TT-TTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT
* ** * * * * **
158909 GAGCTA-AAGCAATAATTTTATGACTATACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAGGTAATTGTTC
255 GA-ATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * **
158973 TAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAGCAAACACATTT
319 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GGTAA-ACATTT
* * * * * * *
159014 GTTTTTTAAA--TC---CTTATTAATGTTTAGAATATT-ATTAATTAGCAATATTTTACTTTGAG
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAA
* * * * * * * * * *
159073 TAAGTTTGTTTGAACAT-AAATAAATGTTTTA-GTATAGAAC-AAAGATCATAACGATTTCAGAT
66 TAAGCTTATATG-A-ATGAAACAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAAAT
* * * * * * *
159135 AAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTTTTTGAA-TTGGTTCGGTAAAGAGACTTAGTTTTTAAAT
127 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * *** * * * * ** *
159199 C---T-GTTAGTAATGTTCAAAATAGTAATATATTAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTATAT
191 CTTTTACTTATTAAT-TTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT
* * * ** * * * * *
159260 GAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATCTTATAATGATTTGAAATAGACAATAGCTC-
255 GAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCA
* * * * * * *
159324 AATGGACATGATTATTTGAATTTGTTTGGTAAACAGATTA
320 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAAC--ATTT
* *
159364 ATTTTTTGAATCT-TTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGA
* * * *
159428 ATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGACTATAATGATTTGAAAG
65 ATAAGCTTATATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAA-GATTTGAAAT
* * * ** * * *
159492 AAATAGTTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCATTCGGCAAA-TGAATTTATTTTTAAAAT
127 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAG-ATTTATTTTTTAAAT
* * *
159556 CATTTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGGTT-T-
191 CTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTA
* * ** * * *
159617 TTAA-GGCAAAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTG
254 TGAATAG--AAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
* * *** *
159681 TTCAAATAGTCATAACTATTTGACCGTGTTCAAAAAAGATAGATTT
316 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC--GGTA-A-ACATTT
** * * * *
159727 ATTTTAAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGGACATTAATAAATTTA-TATTATTTT-ATTTGA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATTTG-
** * * * *
159789 AATACA-CTTGCATGAAT-AGAGCTAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGT-TTAATGTTTTGAA
64 AATA-AGCTTATATGAATGA-AAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAA
* * * * * *
159851 ATAGATAACTGTTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTTAA
125 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAA
* * ** *
159916 TTCTCTTACTCT-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTA
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* * * * * * * * *
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252 TATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * *
160045 TAAAATAGTCATGATTATTTGAACTTATTCGGTAAACATAT
317 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATTT
* * * * * *
160086 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAA
* * * * *
160151 AAAGCTCATATGGATCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAAGTCATAAGAATTTGAAATA-
66 TAAGCTTATATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAAG-ATTTGAAATAG
* * * *
160215 AGTAATTGTTCAAATAGTTATAACGATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAGATC
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* * *
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* * * * **
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* * * * * *
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* * *
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1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTAATTT-G
* * * * * * * *
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* * * * * * ** **
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* * *** * * ** *
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** * * * *
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* * * * *
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* *
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* * ** * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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* * * * **
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* * * * ** *
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* * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * ** * ** *
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*
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* * * *
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1 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GA
* * * * ** *
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65 ATAAGCTTATATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAAATA
* *** *
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128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
162077 TTTTGCTTATTAATTTTTGGAACATTAATAAATTTA-TATTATTTTATGT-GAAATATGCTTGAA
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*** * * * * *
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254 TGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTT
* * * *
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* * *
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1 A-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTG
* * * * *
162310 AAGTAAGCTTACATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAATAAAAAGGTTACAATGATTTGAA
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* * * *
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*** * * * * **
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* * * *
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* * **
162739 ATAGATTTACTTTTTAAATCTTTTACTTACTAATTGTCTTAATATTAATAA
129 ACAGATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAA
* * * * * * ** * *
162790 ATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAGAAAAAAAAATCATTTTATGACAAACCAA
1 ATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGAAAAACAAA
*** * * * * * * * *
162855 AAGGTTATAGCAATTAT-AAATAAAAAATTGTTCATATGGTCATTATTATTTAAACTTGTTCAAT
65 AAAAATA-AG-AATT-TGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTCAGT
* * * * * * ***
162919 AAATAGATTCATCTTTTAACTCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
127 AAACAGATTTAT-TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAA
* * * * * *
162972 CA-TAGTATTATTTTATTTCAAACAACCTTATATGAATTGAAATAATT-TATTTATGACAAAACA
1 -ATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGA-AAAACA
*** * * * * * *
163035 AAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAGGACTATTT-AA-TCTAGTTCG
63 AAA-AAAATAAGAATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACT-TA-TTCA
* *
163098 GTAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAAAA
125 GTAAACAGATTTA-TTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAA
* * * * *
163153 ATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTTTATGAATCGAAACTATTG-TTTTAT-AACGAACAA
1 ATTAGTATTATTTT-ATTTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGAA-AAACAA
** * * * * * *
163216 AAAGTCATAACG-ATTTGAAATAAATAATTGCTT-AAATATTCATAACTATTTGAGC-TAGTT-T
64 AAA-AAATAA-GAATTTGAAATAAAAAATT-ATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTA-TTCA
*
163277 GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
125 G-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCT
163303 CTTATTAATT
Statistics
Matches: 538, Mismatches: 126, Indels: 61
0.74 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
179 9 0.02
180 134 0.25
181 236 0.44
182 155 0.29
183 4 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
ATTAGTATTATTTTATTTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGAAAAACAAAA
AAAATAAGAATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTATTCAGTAAAC
AGATTTATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAA
Found at i:163421 original size:176 final size:179
Alignment explanation
Indices: 162779--163521 Score: 486
Period size: 176 Copynumber: 4.2 Consensus size: 179
162769 TAATTGTCTT
* * * * * * * * *
162779 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAAGAAAAAAAAATCATTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAAGCAAAAATATTTA-TTTA
* * * * * * * *
162844 TGACAAACCAAAAGGTTATAGCAATTAT-AAATAAAAAATTG-TT-CATATGGTCATTATTATTT
65 TGACAAA-CAAAAAGTCATAACAATT-TGAAATAGATAATTGATTAAATAT--TCATAACTATTT
* * * * * * * * * * *
162906 AAACTTGTTCAATAAATAGATTCATCTTTT-AACTCTCTTAATTATTAATTTTTGG
126 GAGCTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TC-TACTTATTAATTTTTGA
* * *
162961 AATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAAACAACCTTATATGAATTG-AAATA-ATTTATT
1 AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAA--GCAAAAATATTTATT
* **
163023 TATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTT-AGGACTATT
63 TATGAC-AAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGATT-AAATA-TTCATAACTATT
* * * * * * **
163086 TAATCTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCAA
125 TGAGCTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAA-TTCTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * * * * *
163142 AATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTTTATGAATCGAAACTATTGT-TTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAAGCAAAAATATT-TATTTA
* * * * *
163206 TAACGAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATATTCATAACTATTTGAGC
65 TGACAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGATTAAATATTCATAACTATTTGAGC
*
163271 TAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTT-AAA-TCT-CTTATTAATTTTTGA
130 TAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTGA
** * * *
163318 AATATTAATAGGTTATTATTACTTTATTCCAAACAAAATTATAT-AAGCAAAAATATTTATTTAA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAAGCAAAAATATTTATTT-A
* * * *
163382 TGACAAAGCAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGA-
65 TGACAAA-CAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGATTAAATATTCATAACTATTTGAG
* * * * * *
163445 ATTGGTAGGTAAATAGAA--T-TTTTTT--AATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
129 CTAGTTCGATAAACA-AATTTATTTTTTAAAAT-TC-TACTTATTAATTTTTGA
*
163494 AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATT
1 AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
163522 TTAAATAAGC
Statistics
Matches: 443, Mismatches: 92, Indels: 58
0.75 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
172 2 0.00
173 6 0.01
174 4 0.01
175 23 0.05
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179 5 0.01
180 73 0.16
181 126 0.28
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183 9 0.02
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAAGCAAAAATATTTATTTAT
GACAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGATTAAATATTCATAACTATTTGAGCT
AGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTGA
Found at i:163670 original size:357 final size:356
Alignment explanation
Indices: 162947--163846 Score: 777
Period size: 353 Copynumber: 2.5 Consensus size: 356
162937 ACTCTCTTAA
* * * * **
162947 TTATTAATTTTTGGAATATTAATA-ACATAGTATTATTTTATTTCAAACAACCTTATATGAATTG
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAGA-TTATTATTACTTTATTCCAAACAAAATTATATGAA-TG
* *
163011 AAATAATTTATTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
64 AAAAAATTTATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * ** *
163076 TAGGACTATTTAATCTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTCA
129 CAGAACTATTTAATCTAGGTAGGTAAACATATGAATTTTTTAAAATTCTTACTTATTAATTGTCA
** * *
163141 AAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTTTATGAATCGAAACTATTGTTTTA
194 AAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTAGTATAAATCGAAACAATTGTTTTA
* * *
163206 TAACGAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTTAAATATTCATAACTATTTGAGC
259 TAACGAACAAAAAGTCATAACGATCTGAAATAAATAATTGCTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC
*
163271 TAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
324 TAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* *
163304 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGTTATTATTACTTTATTCCAAACAAAATTATAT-AA-GCA
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTATTATTACTTTATTCCAAACAAAATTATATGAATG-A
* * *
163367 AAAATATTTATTTAATGACAAAGCAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAG
65 AAAA-ATTTATTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
163431 TCATAATTATTTGAAT-T-GGTAGGT-AA-ATA-GAATTTTTT-TAATCTCTTACTTATTAATTT
128 TCAGAACTATTT-AATCTAGGTAGGTAAACATATGAATTTTTTAAAAT-TCTTACTTATTAATTG
** * * * * *
163490 TTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTTAAATAAGCTAGTATAAATTGAGAA-AATTG
191 TCAAAATATTAAAAAATT-AGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTAGTATAAATCGA-AACAATTG
* * * *** ** *
163553 TTTTATGAC-ATGACAAAAGGTCATAACGATCTGAATTGGTTAATTG-TTCATTTAGTCTTAACT
254 TTTTATAACGA--ACAAAAAGTCATAACGATCTGAAATAAATAATTGCTT-AAATAGTCATAACT
* * *
163616 ATTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTTG
316 ATTTGAACTAGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATC----TC
* * * * * **
163661 TTATTAATTTTTGGAAGATTATTAGATTATTGTT--TATT-TT--GAATAAGCTTATATGAATAG
1 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTATTATTACT-TTATTCCAAACAAAATTATATGAAT-G
* * * ** * * *
163721 AAATAA-TTATTTTGTGACATAAA-AAAAGGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATA
64 AAAAAATTTA-TTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * **
163784 ATCATAACTATTTGAA-CT-GGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATGTCTTACTTATTAAT
127 GTCAGAACTATTT-AATCTAGG-TAGGTAAACATATGAATTTTTTAAAAT-TCTTACTTATTAAT
163846 T
189 T
163847 TTTGAAAGAT
Statistics
Matches: 438, Mismatches: 78, Indels: 53
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
351 4 0.01
352 78 0.18
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355 20 0.05
356 49 0.11
357 105 0.24
358 25 0.06
ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (356 bp):
TTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTATTATTACTTTATTCCAAACAAAATTATATGAATGAA
AAAATTTATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
GAACTATTTAATCTAGGTAGGTAAACATATGAATTTTTTAAAATTCTTACTTATTAATTGTCAAA
ATATTAAAAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTAGTATAAATCGAAACAATTGTTTTATA
ACGAACAAAAAGTCATAACGATCTGAAATAAATAATTGCTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
GTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
Found at i:163708 original size:177 final size:177
Alignment explanation
Indices: 162932--163858 Score: 453
Period size: 177 Copynumber: 5.2 Consensus size: 177
162922 TAGATTCATC
* * * * * * * * *
162932 TTTTAACTCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAACATAGTATTATTTTATTTCAAACAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATT-ATTAGAT--TATT-GTTTATTTTAAATAA
* * * * * * * *
162997 CCTTATATGAATTGAAATAATT-TATTTATGACA-AAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGA
62 GCTTATATAAATAGAAATAATTAT-TTTATGACATAAA-AAAAGGTCATAACGATCTGAAGTATA
* * * ** * * ** *
163060 TAATTATTCAAATAGTTAGGACTATTT-AATCTAGTTCGGTAAACATATTTATT
125 CAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAA-CTGGTTTGACAAACAAATTTATT
* * ** * * *
163113 TTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAAAAATTAGTATTA-T-TTTAATCTAAA
1 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATT-----ATTAG-ATTATTGTTTATTTTAAA
* * * * * * * *
163175 TAAGCTTTTATGAATCGAAACT-ATTGTTTTATAACGA-ACAAAAA-GTCATAACGATTTGAAAT
59 TAAGCTTATATAAATAGAAA-TAATTATTTTATGAC-ATAAAAAAAGGTCATAACGATCTGAAGT
* * * * * * *
163237 AAATAATTGCTT-AAATATTCATAACTATTTGAGCTAGTTTGATAAACAAATTTATT
122 ATACAATT-ATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTATT
* * * ** *
163293 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGGTTATTATTACTTTATTCCAAACAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTATTA-G--ATTATT-GTTTATTTTAAATAA
** ** * * * * * * * *
163354 AATTATATAAGCAAAAATATTTATTTAATGACA-AAGCAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGAT
62 GCTTATATAAATAGAAATAATTATTTTATGACATAA-AAAAAGGTCATAACGATCTGAAGTATAC
* * * * * * ** *
163417 AATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTGG-TAGGTAAATAGAA--T-TT
126 AATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACA-AATTTATT
* * * *
163466 TTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTTTAAATAA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTATTAGATT-A--TT-GTTTATTTTAAATAA
* * * * * *
163530 GC-TAGTATAAATTGAGAA-AATTGTTTTATGACATGACAAAAGGTCATAACGATCTGAATTGGT
62 GCTTA-TATAAATAGA-AATAATTATTTTATGACATAAAAAAAGGTCATAACGATCTGAAGT-AT
* * ** * * *
163593 -TAATTGTTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAAATTTATT
124 ACAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTATT
* ** * *
163646 TTTTAAATCTTTTTGTTATTAATTTTTGGAAGATTATTAGATTATTGTTTATTTTGAATAAGCTT
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTATTAGATTATTGTTTATTTTAAATAAGCTT
* * * * *
163711 ATATGAATAGAAATAATTATTTTGTGACATAAAAAAAGGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTA
66 ATATAAATAGAAATAATTATTTTATGACATAAAAAAAGGTCATAACGATCTGAAGTATACAATTA
** *
163776 TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATT
131 TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTATT
*
163823 TTTTAAATGTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTA
1 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTA
163859 AAAATAGTTA
Statistics
Matches: 581, Mismatches: 124, Indels: 86
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
171 3 0.01
172 3 0.01
173 14 0.02
174 5 0.01
175 15 0.03
176 163 0.28
177 180 0.31
178 12 0.02
179 4 0.01
180 69 0.12
181 96 0.17
182 8 0.01
183 1 0.00
184 2 0.00
185 4 0.01
186 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (177 bp):
TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTATTAGATTATTGTTTATTTTAAATAAGCTT
ATATAAATAGAAATAATTATTTTATGACATAAAAAAAGGTCATAACGATCTGAAGTATACAATTA
TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTATT
Found at i:164301 original size:157 final size:156
Alignment explanation
Indices: 164007--164326 Score: 446
Period size: 157 Copynumber: 2.0 Consensus size: 156
163997 AATAAATTAG
* *
164007 AATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTC
1 AATT-TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTC
* *
164072 ATAACAATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAA
65 ATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACAAA
*
164137 TTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATT
130 TTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
164163 GATTTTTTAATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTTTTTTTAT-ATAAAAACAAAAGG
1 AATTTTTT-ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA-TTATTTTATGA-AAAAACAAAAGG
* * *
164227 TCATAACAATTTTACATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTTGGTAAACA
63 TCATAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACA
* *
164292 AATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATT
128 AATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATT
164321 AATTTT
1 AATTTT
164327 CCAAATGTTC
Statistics
Matches: 143, Mismatches: 17, Indels: 6
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
155 4 0.03
156 31 0.22
157 93 0.65
158 15 0.10
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (156 bp):
AATTTTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCA
TAACAATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTCGGTAAACAAAT
TTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATT
Found at i:164562 original size:177 final size:179
Alignment explanation
Indices: 164317--164894 Score: 402
Period size: 182 Copynumber: 3.2 Consensus size: 179
164307 ATCTTTTGCT
** * * * * * * * * * *
164317 TATTAATTTTCCAAATGTTCATAAATTTGGATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTAAGACATGA
1 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAACTC-GAATAAGCTTCTATGATAAGA
* * *
164381 AACAAATATTTTATTACTAAACAAAAGGTTTGAACAATATG-AAATAGATAATTATTCTAATAAT
65 AACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTTGAACAATATGAAAAT-GATAATTATTCAAATAAT
** * * * * *
164445 TTTAACTATTTGAATTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTTAAA-TCT-CT
129 CATAACTATTTAAACTAGTTCAACAAACACATTTATTGTTTAAATTCTACC
*
164494 TATTAATTTTTGAAATA-TAATTAAATTAGTATTATTTTTAACT-GAATAAGCTTCTATGATTAG
1 TATTAATTTTTGAAATATTAA-TAAATTAGTATTA-TTTTAACTCGAATAAGCTTCTATGATAAG
* * * * * * * *
164557 AAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AAAGATTTTAACGATTTGAAAATGATAATTGTTCAAATAGT
64 AAACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTTGAACAATATGAAAATGATAATTATTCAAATAAT
*** * *
164621 CATAACTATTTAAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTGTTTAAATTTGTGACC
129 CATAACTATTTAAACTAGTTCAACAAACACATTTATTGTTTAAA-TTCT-ACC
* ** * *
164674 TATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAAAA
1 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAACTCGAATAAGCTTCTATGATAAGAA
* * * * ** * * * **
164739 AAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCAT-AATGATTTG-AAATAGATAATCATTTAAATGG
66 ACAAA-TATTTTATAACAAAACAAAAGGT-TTGAACAATATGAAAAT-GATAATTATTCAAATAA
* * * ** * * * * *
164802 CCATAATTATTTTAACT-GATTTGATAAACAAATTTAATTTTTTAATTTCCTACT
128 TCATAACTATTTAAACTAG-TTCAACAAACACATTT-ATTGTTTAAATT-CTACC
**
164856 TATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
1 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
164895 GTCCATCTAA
Statistics
Matches: 317, Mismatches: 67, Indels: 29
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 65 0.21
177 62 0.20
178 6 0.02
179 8 0.03
180 52 0.16
181 21 0.07
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183 10 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAACTCGAATAAGCTTCTATGATAAGAA
ACAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTTTGAACAATATGAAAATGATAATTATTCAAATAATCA
TAACTATTTAAACTAGTTCAACAAACACATTTATTGTTTAAATTCTACC
Found at i:165053 original size:174 final size:173
Alignment explanation
Indices: 164756--165068 Score: 396
Period size: 174 Copynumber: 1.8 Consensus size: 173
164746 ATTTTATGAC
* * ** * * *
164756 AAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTTAAATGGCCATAATTATTTTAACTGA
1 AAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATCATTCAAATAACAATAACTATTTAAACTGA
* *
164821 TTTGATAAACAAATTTAATTTTTTAATTTCCTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGT
66 TTCGATAAACAAATTTAATTTTTTAATCTCCTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGT
*
164886 ATTATTTTAGTCCATCTAAGCTTGTAATAACTGAAGCAATTGT
131 ATTAATTTAGTCCATCTAAGCTTGTAATAACTGAAGCAATTGT
* * * * *
164929 AAAATTAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAATAATAACTATTTAAACTT
1 AAAA-TAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATCATTCAAATAACAATAACTATTTAAACTG
* * * * * *
164994 ATTCGGTAAACATATTT-ATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGG-AATGTTAATAAATT
65 ATTCGATAAACAAATTTAATTTTTT-AATCTCCTACTTATTAA-TTTAGGAAATATTAATAAATT
165057 AGTATTAATTTA
128 AGTATTAATTTA
165069 TTTTAAATAA
Statistics
Matches: 116, Mismatches: 21, Indels: 5
0.82 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
173 11 0.09
174 100 0.86
175 5 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (173 bp):
AAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATCATTCAAATAACAATAACTATTTAAACTGA
TTCGATAAACAAATTTAATTTTTTAATCTCCTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGT
ATTAATTTAGTCCATCTAAGCTTGTAATAACTGAAGCAATTGT
Found at i:165215 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 164179--167814 Score: 1486
Period size: 181 Copynumber: 20.5 Consensus size: 181
164169 TTAATTTTGG
* * * * * * ** * *
164179 ATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTTTTTTTAT-ATAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTACA
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAA-TTGTTTTATGA-CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * * *
164243 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAA
64 TAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTTTAGCAAATAATTTTATTTTTT-AA
* * ** * * * * *
164307 ATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAAATGTTCATAAATTTGGATTATTTTATTCTAA
127 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * * * ** *
164362 ATAAGCTTGTA-AGACAT-GAAACAAATATTTTATTACTAAACAAAAGGT-TTGAACAATATGAA
1 ATAAGCTTGTATA-A-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCAT-AATGATTTGAA
* * * * * *
164424 ATAGATAATTATTCTAATAATTTTAACTATTTGAATTGGTTCAACAAACACA-TTTATTTTTTAA
63 ATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATA-ATTTTATTTTTTAA
** *
164488 A--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATA-TAATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTGA
127 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAA
* * * * * *
164539 ATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAGAT-T-TTAACGATTTGAAA-
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-ATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * ** * * *
164601 ATGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTAGTTCGGTAAACAGA-TTTATTGTTTAA
65 A-GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTTTAGCAAATA-ATTTTATTTTTTAA
* * * * * **
164664 ATTTGTGACCTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTCGA
127 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * *
164719 ATAAGCTTGTATGATAA-AAAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
1 ATAAGCTTGTAT-A-AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * * * * *
164783 TAGATAATCATT-TAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTT-GATAAACAAATTTAATTTTTT-
64 TAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAG-CAAA-TAATTTTATTTTTTA
* * ** * ** *
164845 AATTTCCTACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTCCAT
126 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * ** * * *
164901 CTAAGCTTGTAATAACT-GAAGCAATTG-----T-A-AAATTAAAAGGTTATAATGATTTTAAAT
1 ATAAGCTTGT-ATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * ** ** ** * *
164958 AGACAATTATTCAAATAATAATAACTATTT-AAACTTATTCGGTAAA-CATATTTATTTTTTAAA
65 AGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTTTAGCAAATAAT-TTTATTTTTTAAA
* * * *
165021 TCTCTTTCTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTAA
128 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * * *
165075 ATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAGTA
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
165140 TATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATATGAAATGATTCAGCAAATAATTTTATTTTTGAAATCT
66 GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATAATTTTATTTTTTAAATCT
* * **
165205 CTTACTTATTAGTTTTTGAAATATT-ATGAAATTAGTATTATTTTAATCCAA
131 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * *
165256 ATAAGCTTGTACAAACA-AAACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAATTATCATAATGATTTGAAAT
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-TGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * ** *
165320 AGATAATCA-TATATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTAGCAATTAGTTTTGCTTTTTAATT
65 AGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATAATTTTATTTTTTAAAT
* * * * * * * *
165384 TTCTT-CGTTATTAAGTTTTGGAGTATTATTAAATTTGCATTATTTTATTTTGA
129 CTCTTAC-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
** * * * * * * *
165437 ATAAAATAGTATAAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTAAAATA
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
* ** * * *** *
165502 GATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATGGTTTGGCAGGCAAATTTATTTTTTAAATCT
66 GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATAATTTTATTTTTTAAATCT
* **
165567 CTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
131 CTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * * * * *
165618 ACAAACTT-TATTAAA-A-AAATAATTATTTTATGATAAAACAAAA-G-AATAACGGTTTGAAAT
1 ATAAGCTTGTA-TAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * *
165678 AGATAATTGTGT-AAATAGT-TATAATTATTTGAACTGGTTCA-TAAATAGA-GTTATTTTCTAA
65 AGATAATTAT-TCTAATAGTCT-TAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATA-ATTTTATTTTTTAA
* * * * * **
165739 ATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTCTTTCGA
127 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* ** * * * *
165794 ATAAGCTTATATGAGCT-GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAAT
1 ATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * *** *
165858 AAATAATTGA-TC-ATATAGTATTAATTGTTT-AAACTGGTACGGCAAACGAA-TTTATTTTTTA
65 AGATAATT-ATTCTA-ATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTTTAGCAAA-TAATTTTATTTTTTA
* * * * * *
165919 AATCTCATAGTTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAATATTACTTTATTCT-A
126 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
** * * * * * *
165974 ATAATTATTTTAT-GATAG-AACAA-AG-GTTAT-----AAC--AATTTGA-AAT-A---GATAA
1 ATAA-GCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGA-AA
* * * * * * * *
166023 TTGTTCAA--A---TAG---TCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAATAGA-TTT-CTTTTTAA
64 TAGAT-AATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATA-ATTTTATTTTTTAA
** * *
166078 AT-TCTTGAAATATTAA----T--AA-ATTAAT--ATTA-TTTTA-TTTA---GAA
127 ATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * * * *
166119 A-AAGCTTGTAT-ATTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAAT
1 ATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * * * * *
166182 AGATAGTTGTT-TAAATGGCCATGATTATTT-AATTGATTTCA-TAAACTGA-TTTATTTTTCAA
65 AGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTT-AGCAAA-TAATTTTATTTTTTAA
* * * **
166243 AT-TTTTCGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGG
127 ATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * *
166298 ATAAGCTTATATGAACTA-AACCAATTTTTTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTTAA
1 ATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTGAA
* * ** * * ** * *
166361 ATAGCTAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTT-AAATTTGTTCGGTAAATAGA-TTTATTGTTTC
63 ATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTTTAGCAAATA-ATTTTATT-TTTT
* * * * * **
166424 AGATCTCATGCTTATTAATTTTTTG-AATGTCAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
125 AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * * *
166481 ATAAGCTTGTATGAACTA-AAATAATTATTATATGACTAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAAT
1 ATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * *
166545 AGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTT-AAACTGATTTGGTAAACACA-TTTATTTTTTTAA
65 AGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTTTAGCAAATA-ATTTTA-TTTTTTAA
* * *
166608 A--T-TT-CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TGTCTAA
127 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAA
* * * * ** * *
166659 ATAAGCTTTTAT-GATGAAAAATAATTGTTTTATGGGAAAAC-AAA-GAACATAATGATTTGAGA
1 ATAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAA
* * * * ** * *
166721 TTGAT-ATT-TGCTTAAATAGTCATAACTATTT-AAAGTGGTTCAAAAAATAGCTTTT-GTTTTT
64 TAGATAATTATTC-T-AATAGTCTTAACTATTTGAAA-TGGTTTAGCAAATA-ATTTTATTTTTT
* * *
166782 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAG
125 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * *
166839 ATAAG-TCTCTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATTATGACTTT-AA
1 ATAAGCT-TGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGA-TTTGAA
* * ** * * * *
166901 ATAGATAATTATTCAAATAGTC-AAATCTATTTCGACCT-GCTTGGTAAACAGA-TTTATTTTTT
63 ATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-CTATTT-GAAATGGTTTAGCAAATA-ATTTTA-TTTTT
* * ** **
166963 TAAACCTCTTACTCATTAATTTTTTTG-AACGTTAATAAATTAGTATTATTTTATACTAA
124 TAAATCTCTTACTTATTAA--TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * * * *
167022 ATAAGCTTGTATGAACA-AAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAATGATTTGAAATA
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * *
167086 GATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTAGAACTAGTTTGGCAAA-CATGTTTATTTTTTAAATC
66 GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATAAT-TTTATTTTTTAAATC
* * * **
167150 TCTTACTTACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATTCGA
130 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAA
** * * * *
167202 ATAAGCTCATATGAAA-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAAAGATTTGAGAT
1 ATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * *
167265 AGATAATTGTT-TAAATAGTCATAAATATTTGAACT-ATTTTGATAAATAGATTTT-GTTTTTAA
65 AGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAG-CAAATA-ATTTTATTTTTTAA
* ** * * * * *
167327 A--TC-T-CTTATTAATTATCAAAATATTAATATATCAATATTATTTTATTCTGA
127 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
* * * * **
167378 AT-AGTTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC--AACAAAATGTCATTACAATTTGAAAT
1 ATAAG-CTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * *
167440 AGATAA-CAGTTCAAATGGAT-ATGACTATTTGGACTTGTTTAGTAAATAGA-TTTATTTTTTAA
65 AGATAATTA-TTCTAATAG-TCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATA-ATTTTATTTTTTAA
** * * *
167502 ATCTCAAACTTATTAATTTTT-ACAATACTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAA
127 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
** ** * *
167557 ATAA-AAT-TAT--AT-G-AGTAGTTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATAATTTGAAAT
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * ** * ** *
167615 AAATAATTATT-TAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCAATAAACAGGTTTATTTTTTAATT
65 AGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATAATTTTATTTTTTAAAT
* ** *** * * *
167679 CTTTTTTTTATTAATTTTTGGGCTTTTAATAAATTAGTATTATTTCATTTCGAA
129 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAA
** * * * * *
167733 A-AAGCTTAAATGAACA-AAACAATTGGTTTAAGACAAAACAAAA-GCTTATAATGATTTGAAAT
1 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAAT
* *
167795 AGATAATTTTTCAAATAGTC
65 AGATAATTATTCTAATAGTC
167815 AGTAAACATA
Statistics
Matches: 2611, Mismatches: 629, Indels: 429
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
143 6 0.00
144 3 0.00
145 7 0.00
147 8 0.00
148 4 0.00
149 4 0.00
151 5 0.00
152 5 0.00
154 5 0.00
155 2 0.00
156 1 0.00
157 4 0.00
158 22 0.01
159 22 0.01
160 2 0.00
161 1 0.00
162 1 0.00
163 1 0.00
164 14 0.01
165 30 0.01
166 4 0.00
167 2 0.00
168 1 0.00
169 4 0.00
170 4 0.00
171 2 0.00
172 11 0.00
173 29 0.01
174 130 0.05
175 178 0.07
176 215 0.08
177 183 0.07
178 101 0.04
179 89 0.03
180 356 0.14
181 593 0.23
182 402 0.15
183 143 0.05
184 17 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATA
GATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAATAATTTTATTTTTTAAATCT
CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
Found at i:166905 original size:358 final size:352
Alignment explanation
Indices: 166077--170469 Score: 1743
Period size: 362 Copynumber: 12.3 Consensus size: 352
166067 TTTCTTTTTA
* * * * *
166077 AATTCTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-AGAAAAAGCT-TGT-ATATTGAAAAA
1 AATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAG-ATAAGCTCTATGA-ACT--AAAA
* * * * * * * * *
166139 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAGTTGTT-TAAATGGCCA
61 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTC-
* * * ** * *
166203 TGATTATTT-AATTGATTTCATAAACTGATTTA-TTTTTCAAATTTTTCGCTTATTAATTTTT-G
123 TAACTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA--TTT--CTTATTAATTTTTAG
* * ** ** * ** *
166265 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTATATGAACTAAACCAATTTTTTTT
184 -AATATTAATAAATTAATATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAATAA-TTGTTTT
* ** * * * *
166330 ATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGCTAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTAA
246 ATGACAAAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAA
* * ** * * * *
166395 ATTTGTTCGGTAAATAGATTTATTGTTTCAGATCTCATGCTTATT
311 ACTGGTTC-AAAAATAG-TTTATT-TTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * *
166440 AATTTTTTGAATGTCAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAA
1 AA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGC-TCTATGAACTAAAACAA
* * * * *
166505 TTATTATATGACTAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAAC
64 TTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TAAC
* * *
166570 TATTTAAACTGATTTGGTAAACACATTTATTTTTTTAAATTTCTTATTAATTTTTAGAATATTAT
127 TATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATTTCTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * **
166635 TAAATTAATATTATTTT-TGTCTAAATAAGCTTTTATGATGA-AAAATAATTGTTTTATGGGAAA
192 TAAATTAATATTATTTTAT-ACTAAATAAGCTTGTATGA--ACAAAATAATTGTTTTATGACAAA
* * * * *
166698 AC-AAAGAACATAATGATTTGAGATTGATATTTGCTT-AAATAGTCATAACTATTTAAAGTGGTT
254 ACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTT
166761 CAAAAAATAGCTTT-TGTTTTTAAATCTCTTACTTATT
318 C-AAAAATAG-TTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATT
*
166798 AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGTCTCTATGAACTAAAACAA
1 AATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAG-CTCTATGAACTAAAACAA
* * *
166863 TTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATTATGACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAT
64 TTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTAA-
* * * *
166927 CTATTTCGACCTG-CTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAACCTCTTACTCATTAATTTTTTTGA
126 CTATTT-GAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAA-TTTTTAGA
** *
166991 ACGTTAATAAATTAGTATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAACAAAATAATTGTTTTATGA
185 ATATTAATAAATTAATATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAACAAAATAATTGTTTTATGA
* *** * *
167056 CTAAACAAAAGGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTA-TTAGAACT
250 CAAAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA-AACT
* * *
167120 AGTTTGGCAAACAT-GTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTACT
314 -GGTT--CAAAAATAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* *
167161 AATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATTC-GAATAAGCTCATATGAA-AAGAAA
1 AATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAG-ATAAGCTC-TATGAACTA-AAA
* * * *
167223 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAAATCATAAAGATTTGAGATAGATAATTGTT-TAAATAGTCAT
61 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTC-T
* * * * * * * *
167287 AAATATTTGAACT-ATTTTGATAAATAGATTT-TGTTTTTAAATCTCTTATTAATTATCAAAATA
124 AACTATTTGAACTGA-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATTTCTTATTAATTTTTAGAATA
* * * * * * * *
167350 TTAATATATCAATATTATTTTATTCTGAAT-AGTTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
188 TTAATAAATTAATATTATTTTATACTAAATAAG-CTTGTATGAACA-AAATAATTGTTTTATGAC
* ** ** ** * * **
167414 --AACAAAATG-TCATTACAATTTGAAATAGATAACAGTTCAAATGGAT-ATGACTATTTGGACT
251 AAAACAAAA-GAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTAAACT
* * * **
167475 TGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCAAACTTATT
314 GGTTCA-AAAATAG-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * ** * ** *
167516 AATTTTTACAATACTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAAAT-TAT--A-T-GAGTAGT
1 AATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGCTCTATGAACTAAAACAAT
* * *
167576 TGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTATT-TAAATAGTCATAAC
65 TGTTTTATGACAAAATAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTC-TAAC
* *** * * * * **
167640 TATTTGAACTTG-CTCAATAAACAGGTTTA-TTTTTTAATTCTTTTTTTTATTAATTTTTGGGCT
127 TATTTGAAC-TGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAA----ATTTCTTATTAATTTTTAGAAT
* * * * * ** * * *
167703 TTTAATAAATTAGTATTATTTCATTTCGAAA-AAGCTTAAATGAACAAAACAATTGGTTTAAGAC
187 ATTAATAAATTAATATTATTTTA-TACTAAATAAGCTTGTATGAACAAAATAATTGTTTTATGAC
*** * *
167767 AAAACAAAAGCTTATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAG---T--C-------A---G
251 AAAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGG
* * * *
167817 -T-AAACATA--TTCTTTTTTAATTCTCTTACTCATT
316 TTCAAAAATAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
167850 AATATTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTACTTT-AAATAAGCTTATATGAACTGAAACA
1 AAT-TTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAGATAAGC-TCTATGAACTAAAACA
* * * * *
167914 AGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TATTCAAATAGTCATGA
63 ATTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TAA
* * * * * *
167978 CTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACGTATTAATTGTCAAAA
126 CTATTTGAAC-TGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA---TTT-CTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
168041 TATTTATAAATTAATATTATTTTA-ATTTGAATAAACTTGCATGAACAGAAATAATTGTTTTATG
186 TATTAATAAATTAATATTATTTTATA-CTAAATAAGCTTGTATGAACA-AAATAATTGTTTTATG
* * * ** * * * *
168105 ATAAAACAAGAAG-TCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA-TGATTTGAA
249 ACAAAACAA-AAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTAAA
* * *
168168 CTTGTTTGGTAAACAA-A-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
312 C-TGGTT--CAAA-AATAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
168211 AATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAGGCT-TGGATGAACAAAAA
1 AATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AGATAAGCTCT--ATGAACTAAAA
* * * * * * * *
168273 AAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCT-ATTTCAAATAGATAATTATTCAAACAGTCA
61 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-
* * * * * * * * *
168337 TAATTATTTAAATATG-TTTAGTTAACAAATTCA-TTTTTTAAATCTCTTTGTTATTAATTTTTG
123 TAACTATTTGAA-CTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAA----TTTCTTATTAATTTTTA
* * ** * * * * *
168400 GATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTTTA
183 GAATATTAATAAATTAATATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAATAATTGTTTTA
** * ** * * * * * * * *
168465 TGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTAAAATATATAATTATTCAAATAGTCATGATTGTTTGAT
247 TGACAAAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
* * * *
168530 CTAGTTCAGTAAACATA-CTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATT
312 CTGGTTCA--AAA-ATAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
*** * * * * * *
168573 AATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAACAAGATTGTATGAA-TAGAAACA
1 AATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAG-CTCTATGAACTA-AAACA
* * * * * * * ** *
168637 ATAGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCTTAATGATTTAAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAA
63 ATTGTTTTATGACAAAA-TAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TAA
* * ** * **
168702 ATATTTGAA-TTAGTTTAATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCACTTATTAATTTTT-GAAATAT
126 CTATTTGAACTGA-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATTTCTTATTAATTTTTAG-AATAT
* * ** * * ** * * * *
168764 TAGTAGATTTGTATTACTTTATTCCGAACAAACTTATATAAACAAAA-ACATTTGTTTTATGACA
189 TAATAAATTAATATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAACAAAATA-A-TTGTTTTATGACA
** * * * * * *
168828 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTGCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGT
252 AAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGT
**
168893 T-AGGTAAACA-AAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
317 TCA---AAA-ATAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
168931 AATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTT-TTTCCAAATAAGCTAGTATGAATTAAGAC
1 AATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT-CAGATAAGCT-CTATGAACTAAAAC
* * * * * * *
168994 AAACCTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-ATACAGTT
62 -AA-TTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTA-ATAGTC
* ** * *
169058 TAAAATATTTGAACT-AGTTCAGCAAACAAATTTA-TTTTTT-AATTCTCTTAGTTATTAATTTT
123 T-AACTATTTGAACTGA-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATT-TC----TTATTAATTTT
* * * * * ** * * * *
169120 TGGAATATTATTATA-TAAGTGTTATTTTATTCCGAATAAACTTGAATAAACAAAAATAATTATT
181 TAGAATATTAATAAATTAA-TATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAATAATTGTT
* * *** * * * ** * * *
169184 TTATGATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTTTACAATTGTTTAAAT-GCTCATAACTATC
244 TTATGACAAAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATT
* * * *** *
169248 TGAATTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
308 TAAACT-GGTTCAAAAATAG-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * ** ** ** *
169295 AATTTTTAAAAGATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAATTGAATGTTC-AAATGCAA
1 AATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGCTCTATGAACTAAA-ACAA
* * * * * * ** * * *
169359 ATCTTATATGACAAAACAAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTTATAATTGTTGACT--TAGCCAC
64 TTGTTTTATGACAAAA-TAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT--CTAATAGTC-T
* * * * *** * * *
169422 AATTATTTGATCTAACTACATAAACAG-TTTCA-CTTTTTAAATCACTTACTTATTAAATTTCAG
124 AACTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTT-ATTTTTTTAAAT---TT-CTTATTAATTTTTAG
* * * ** * * * *
169485 AATATTAATAAATTAGTTTTAATTTATTTTGAATGAGCTTGTATGAACTGAAATGATTGTTTTAT
184 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAATAATTGTTTTAT
* * ** * * * *
169550 GACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAA
248 GACAAAACAAAAGA-ACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
** * * * *
169614 CTACTTTGGCAAACA-GGTTTATTTTTTAAATCTCCTAGTTATT
312 CT-GGTT--CAAAAATAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
169657 AATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCT-TATACGAATTGAAAC
1 AATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAG-ATAAGCTCTAT--GAACTAAAAC
* * * * * * * * * *
169720 AATTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATATTTGTTCAAATAG--GAA
62 AATTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTAA
** * * *
169783 CTAGTTTG-A-T-AAATGG---AC----TTA-TTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATGTTTAAAA
126 CTA-TTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAAT-T--T-CTTATTAATTTTTAGAA
** * * * *
169837 TATTAATAAA-TAAGTATTATTTTATTTTGAAT-AGGTATGTATGATA-AAAACAATTATTTTAT
186 TATTAATAAATTAA-TATTATTTTATACTAAATAAGCT-TGTATGA-ACAAAATAATTGTTTTAT
*** * ** * * * *
169899 GACAAAACAAAATTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC
248 GACAAAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* * * * * * *
169964 CGATTTGATAAACT-GACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATC
313 TG-GTTCA-AAAATAG-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * * **
170006 AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCATAT-AGTTTTTGTGAATTGGAACAA
1 AATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAG-CTCTATGAACTAAAACAA
* * * * * * *
170070 TTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-TTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAAC
64 TTGTTTTATGACAAAATAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TAAC
* * * *
170134 TATTTAAACTTATTTAGTAAATAGATTTATGTTTTTTAAATTTCTTGTGTATTAACTTTTT-GAA
127 TATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTTAAATTTC---T-TATTAA-TTTTTAGAA
* * * ** * * * * * * *
170198 TGTTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAAGCATGCATAAATTGAAAA-AATTATTTTACG
186 TATTAATAAATTAATATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAA--CAAAATAATTGTTTTATG
* * * *** * * ** * **
170262 GCTAAAGAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGCACT
249 ACAAAACAAAAGAACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
*
170327 GGTTTGGCAAAAATA-TTTATATTTTAAATCTCTTACTTATT
314 GG-TT--CAAAAATAGTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* ** ** * * * *
170368 AATTTTTGGAATATTATTAGTTTACCAATATTTTA-CTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAC
1 AATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAG-ATAAGC-TCTATGAACTA-AAAC
* * * *
170431 AATTTTTTTATAACAAAACAAAAATCATAATGATTTGAA
62 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTCATAATGATTTGAA
170470 CTAGTTCAAT
Statistics
Matches: 3111, Mismatches: 678, Indels: 482
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
334 52 0.02
335 7 0.00
336 3 0.00
337 4 0.00
338 7 0.00
339 88 0.03
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341 4 0.00
343 2 0.00
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352 6 0.00
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365 29 0.01
366 5 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (352 bp):
AATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGCTCTATGAACTAAAACAATT
GTTTTATGACAAAATAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTAACTATT
TGAACTGATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATTTCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA
TTAATATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAACAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
AACAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTCAAAAATA
GTTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
Found at i:167049 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 166086--167815 Score: 1200
Period size: 180 Copynumber: 9.7 Consensus size: 180
166076 AAATTCTTGA
* * *
166086 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TAGAAAAAGCTTGTATATTG-A--AAAACAATTATT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGC-T-TATA-TGAACTAAAACAATTGTT
* * * * * * * * *
166147 TTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTAAAATAGATAGTTGTTTAAATGGCCATGATTATTT
62 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTT
* ** * * * *
166212 -AATTGATTTCATAAACTGATTTA-TTTTTCAAAT-TTTTCGCTTATTAA-TTTTTG
126 AAACTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTTG
* * ** * *
166265 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTATATGAACTAAACCAATTTTTTTT
1 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAA-TTGTTTT
* * * *
166330 ATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTTAAATAGCTAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTAA
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTAA
* * * * * * * *
166395 ATTTGTTCGGTAAATAGATTTATTGTTTCAGATCTCATGCTTATTAATTTTTTG
128 A-CTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
* * * * * * *
166449 AATGTCAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTATAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
166514 GACTAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC
66 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAACTATTTAAAC
* *
166579 TGATTTGGTAAACACATTTATTTTTTTAAA--T-TT-CTTATTAATTTTTAG
130 TG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
* * * *** *
166627 AATATTATTAAATTAATATTATTTT-TGTCTAAATAAGCTTTTATGATGAAAAATAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTA
** ** * * *
166691 TGGGAAAAC-AAAGAACATAATGATTTGAGATTGATATTTGCTT-AAATAGTCATAACTATTTAA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCA-AACTATTTAA
* **** * * *
166754 AGTGGTTCAAAAAATAGCTTT-TGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTG
128 ACT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
* * *
166806 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-TCAGATAAG-TCTCTATGAACTAAAACAATTGTTT
1 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCT-TATATGAACTAAAACAATTGTTT
* * *
166869 TATGACAAAATAAAAGGTCATTATGACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAATCTATTT
63 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAA-CTATTT
* * * * *
166933 CGACCTGCTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAACCTCTTACTCATTAATTTTTTTG
126 -AAACTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTTG
** * * *
166990 AACGTTAATAAATTAGTATTATTTTATACTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAATAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
167054 GACTAAACAAAAGGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTA-TTAGAA
66 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAACTATTTA-AA
* * *
167118 CTAGTTTGGCAAACATG-TTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTACTAATTTTTGG
129 CT-GTTTGGTAAACA-GATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
* * * *
167170 AATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTC-GAATAAGCTCATATGAA-AAGAAACAATTGTTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTGTTTT
* * * * * * *
167233 ATGACAAAATAAAA-ATCATAAAGATTTGAGATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAATATTTGA
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTAA
* * * * * ***
167297 ACTATTTTGATAAATAGATTT-TGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTATCAA
128 ACT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
* * * * *
167346 AATATTAATATATCAATATTATTTTATTCTGAAT-AG-TTTTGCATGAA-TAGAAACAATTGTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTAT--ATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * ** ** * *
167408 TATGAC--AACAAAATGTCATTACAATTTGAAATAGATAACAGTTCAAATGGAT-ATGACTATTT
63 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCA-AACTATTT
** * * ** **
167470 GGACTTGTTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCAAACTTATTAATTTTTAC
126 AAAC-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
* * ** * *
167525 AATACTAATAAATTGGTATTATTTTATT-TCAAATAAAATTATATG-AGT-----AGTTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
167583 TGACAAAACAAAAGATCATAATAATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AACTATTTAAA
* *** * * * ** *
167648 CTTGCTCAATAAACAGGTTTA-TTTTTTAATTCTTTTTTTTATTAATTTTTGG
129 C-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
** * * * * *
167700 GCTTTTAATAAATTAGTATTATTTCATTTCGAAA-AAGCTTAAATGAAC-AAAACAATTGGTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * *
167763 AGACAAAACAAAAGCTTATAATGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
167816 GTAAACATAT
Statistics
Matches: 1219, Mismatches: 259, Indels: 144
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 13 0.01
174 9 0.01
175 182 0.15
176 73 0.06
177 57 0.05
178 84 0.07
179 54 0.04
180 258 0.21
181 172 0.14
182 194 0.16
183 107 0.09
184 16 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAACTATTTAAACT
GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG
Found at i:168190 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 167828--170469 Score: 1805
Period size: 181 Copynumber: 14.7 Consensus size: 179
167818 AAACATATTC
* * * ** * *
167828 TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATATTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATCTTACTTTAAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAT
* * * * * * *
167893 AAGCTTATATGAACTGAAACAAGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * *
167958 TAA-TATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATATATTTA
130 TAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * * * *
168008 TTTTTTAAATCTTTTACGTATTAATTGTCAAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATTTGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAT
* * * * * *
168073 AAACTTGCATGAACAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAGAA-GTCATAACAAGTTGAAATAA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* *
168137 ATAATTGCTCAAATAGTCATAATGATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA
129 ATAATTGTTCAAATAGTCATAAT-ATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * *
168189 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTG-A
** * * * * * * * *
168252 ATAGGCTTGGATGAACAAAAAAAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCTATTTCAAATA
63 ATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * *
168317 GATAATTATTCAAACAGTCATAATTATTT-AAATATGTTTAGTTAACAAATTCA
128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTA-GTTTGGTAAACAAATTTA
** ** *
168370 TTTTTTAAATCTCTTTGTTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAT
* * * * * * * *
168435 AAGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTAAAATATA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * ** * *
168500 TAATTATTCAAATAGTCATGATTGTTTGATCTAGTTCAGTAAACATACTTA
130 TAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * * * **
168551 TTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAA-A
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATA
* * * * * * * * * *
168615 CAAGATTGTATGAATAGAAACAATAGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCTTAATGATTTAAAATAA
66 -AA-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * ** * *
168680 ATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTGAATTAGTTTAATAAATAGATTTA
129 ATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * * * * *
168732 TTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAGATTTGTATTACTTTATTCCGAAC
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAT
* * * * * *
168793 AAACTTATATAAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * *
168858 TAATTGTGCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAACAAAATTA
130 TAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * *
168909 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTT-TTTCCAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTT--GA
* * * ** *
168972 ATAAGCTAGTATGAATTAAGACAA-ACCTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
63 ATAAACTTGTATGAA--CAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * ** *
169036 ATAGATAATTGTTCATACAGTTTAAAATATTTGAACTAGTTCAGCAAACAAATTTA
125 ATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * ** * * * * *
169092 TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTATATAAGTGTTATTTTATTCCGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAT
* * * * * * * * * **
169157 AAACTTGAATAAACAAAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTTTA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * *
169222 CAATTGTTTAAAT-GCTCATAACTATCTGAATTAGTTTGGTAAACAGATTTA
130 TAATTGTTCAAATAG-TCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * *
169273 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAAA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATA
* * ** * * * * * **
169338 AAATTGAATGTTCA-AATGCAAATCTTATATGACAAAACAAAAAGGTAATAACGATTTGAAATTT
66 AACTTGTATGAACAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* ** * * * ** *** *
169402 ATAATTGTTGACTTAGCCACAATTATTTGATCTAACTACATAAAC-AGTTTCA
129 ATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTT-A
* * * * * * *
169454 CTTTTTAAATCACTTACTTATTAAATTTCAGAATATTAATAAATTAGTTTTAATTTATTTTGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAT
* * * ** * *
169519 GAGCTTGTATGAACTGAAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * **
169584 TAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTACTTTGGCAAACAGGTTTA
130 TAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * ** * *
169635 TTTTTTAAATCTCCTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAT
* * * ** * * * * * *
169700 AAGCTTATACGAATTGAAACAATTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * *** *
169765 TATTTGTTCAAATAG-----------GAACTAGTTTGATAAATGGACTTA
130 TAATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * *
169804 TTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATGTTTAAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAT
** * ** *
169869 -AGGTATGTATGATA-A-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATTTCATAACAATTTGAAATA
65 AAACT-TGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * ** *
169931 GATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC-CGATTTGATAAACTGACTTA
128 GATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAG-TTTGGTAAACAAATTTA
* * * * * *
169984 TTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-CATA
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATA
** * * ** * * *** *
170048 TAGTTTTTGTGAATTGGAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-TTTATTTTAAATAGA
66 -AACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA
* * * * * *
170112 TAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTTAGTAAATAGATTTA
130 TAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAAC-TAGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * * *
170163 TGTTTTTTAAATTTCTT-GTGTATTAACTTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTT
1 --TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTT
* * * * ** * * * * * * * *
170226 GAATAAGCATGCATAAATTGAAAAAATTATTTTACGGCTAAAGAAAAGGTTAGAACGATTTGAAA
61 GAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
** * * * *
170291 TAGATAATTGTTTTAATAGTCTTAACTATTTGCACTGGTTTGGCAAA-AATATTTA
126 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAACTAGTTTGGTAAACAA-ATTTA
* ** * ** ** * **
170346 TATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGTTTACCAATATTTTACTCCGAAT
1 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAT
* * * * * *
170411 AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTATAACAAAACAAAA-ATCATAATGATTTGAA
65 AAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
170470 CTAGTTCAAT
Statistics
Matches: 1911, Mismatches: 474, Indels: 154
0.75 0.19 0.06
Matches are distributed among these distances:
168 57 0.03
169 75 0.04
170 4 0.00
176 2 0.00
177 133 0.07
178 8 0.00
179 66 0.03
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181 1005 0.53
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183 191 0.10
184 8 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATA
AACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
AATTGTTCAAATAGTCATAATATTTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTA
Found at i:170224 original size:711 final size:659
Alignment explanation
Indices: 169780--171078 Score: 1317
Period size: 683 Copynumber: 1.9 Consensus size: 659
169770 GTTCAAATAG
** * * *
169780 GAACTAGTTTGATAAATGGACTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATGTTTAAAATATTAATA
1 GAACTAGTTCAATAAATAGACTTAGTTTTTAAA--T-CT-CTTATAAATGTTTAAAATATTAAAA
* * * **
169845 AATAAGTATTATTTTATTTTGAATAGGTATGTATG-ATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
62 AATAAGTATT-TTTTATTCTAAATAAGTATGTATGAATAAAAACAATTATTTTACAACAAAACAA
* * * * * *
169909 AATTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACCGATTTGATA
126 AATATCATAACAATTTCAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACCGATTTGATA
** *
169974 AACTGACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATT
191 AACAAACTTATTTTTTAAATCTCCAACTTA-CAATTTTTGAGAATATTAATAAAGTAATATTATT
* * ***
170038 TTATTTCATATAGTTTTTGTGAATTGGAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-TTTAT
255 TTATTTC----A---------AA-T---A-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAAT
* * * *
170102 TTTAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTAAACT-TATTTAGTAAATAGATTTATGT
302 TTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAAC-ATTTAAACTCT-TTCAGTAAACAGATTTA--T
* * *
170166 TTTTTAAAT-TTCTT-GTGTATTAACTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAA
363 TTTTTAAATCTT-TTACT-TATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * * * * * * * * *
170229 TAAGCATGCATAAATTGAAAAAATTATTTTACGGCTAAAGAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAG
425 TAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
170294 ATAATTGTT-TTAATAGTCTTAACTATTTGCACTGGTTTGGCAAAAATATTTATATTTTAAATCT
490 ATAATTATTCAT-ATAGTCTTAACTATTTGAACT-ATTTGGCAAAAATATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
170358 CTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATT-AGTTTACCAATATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATG
553 CTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTGA-ATTA-TATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTATACG
*
170422 AATAGAAACAATTTTTTTATAACAAAACAAAAATCATAATGATTT
615 AATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAATCATAATGATTT
* * * *
170467 GAACTAGTTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAAAAAATT
1 GAACTAGTTCAATAAATAGACTTAGTTTTTAAATCTCTTATAAATGTTTAAAATATTAAAAAATA
* * * *
170532 AGTATTTTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATAT
66 AGTATTTTTTATTCTAAATAAGTATGTATGAATAAAAACAATTATTTTACAACAAAACAAAATAT
* * * * *
170597 CATAACAATTTCAAATAGATGATAGTTCAAATAGACATGACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAA
131 CATAACAATTTCAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACCGATTTGATAAACAA
* * * * *
170662 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACTATTTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
196 ACTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACAATTTTTGAGAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT
* * *
170727 CAAATAAATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
261 CAAATAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACA
*
170792 GTCATAACCTTTAAACTCTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
326 GTCATAACATTTAAACTCTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
170857 GAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAAC-AAAAACAATTGATT
391 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAA-AATTGTTT
* * * * *
170921 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAATCGTAACTATTTG
454 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTG
* * * *
170986 AAC-ATGTTCAG-AAAATATATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAAT
519 AACTAT-TT-GGCAAAA-ATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATT
171048 GAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTT
581 GAA-TTATATTATTTTATTCG-AATAAGCTT
171079 GCATGAACAG
Statistics
Matches: 512, Mismatches: 85, Indels: 55
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
661 4 0.01
662 59 0.12
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670 2 0.00
679 1 0.00
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685 1 0.00
687 28 0.05
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (659 bp):
GAACTAGTTCAATAAATAGACTTAGTTTTTAAATCTCTTATAAATGTTTAAAATATTAAAAAATA
AGTATTTTTTATTCTAAATAAGTATGTATGAATAAAAACAATTATTTTACAACAAAACAAAATAT
CATAACAATTTCAAATAGATAATAGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACCGATTTGATAAACAA
ACTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACAATTTTTGAGAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT
CAAATAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACA
GTCATAACATTTAAACTCTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAAAAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAA
CTATTTGGCAAAAATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTGAATT
ATATTATTTTATTCGAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAATCA
TAATGATTT
Found at i:170883 original size:161 final size:162
Alignment explanation
Indices: 170571--170886 Score: 422
Period size: 162 Copynumber: 2.0 Consensus size: 162
170561 GAATAGAAAC
* * *
170571 AATTGTTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAGATGATAGTTCAAATAGACATG
1 AATTGTTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAAATAATAGTTCAAATAGACATA
* * * *
170636 ACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACTATTTTTTAGAAT
66 ACTATTTAAACTGCTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACTATTTTTGAGAAT
170701 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
131 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
** * * *
170733 AATTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
1 AATTGTTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAAATAATAGTTCAAATAGACATA
* * *** *
170798 AC-CTTTAAACT-CTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-A
66 ACTATTTAAACTGCTTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACT-ATTTTTGAGA
*
170860 ATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
170887 CTGAATAAGC
Statistics
Matches: 133, Mismatches: 19, Indels: 5
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
160 3 0.02
161 64 0.48
162 66 0.50
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (162 bp):
AATTGTTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAAATAATAGTTCAAATAGACATA
ACTATTTAAACTGCTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACTATTTTTGAGAAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
Found at i:170914 original size:161 final size:161
Alignment explanation
Indices: 170574--170886 Score: 407
Period size: 161 Copynumber: 1.9 Consensus size: 161
170564 TAGAAACAAT
** * * *
170574 TGTTTTACAACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAGATGATAGTTCAAATAGACATGACT
1 TGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAAATAATAGTTCAAATAGACATAACT
* * * *
170639 ATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACTATTTTTTAGAATATT
66 ATTTAAACTGCTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACTATTTTTGAGAATATT
170704 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA
131 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA
* * *
170735 TTGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
1 -TGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAAATAATAGTTCAAATAGACATAAC
* * *** *
170800 -CTTTAAACT-CTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AAT
65 TATTTAAACTGCTTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACT-ATTTTTGAGAAT
*
170862 TTTAATAAATTAGTATTATTTTATT
128 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
170887 CTGAATAAGC
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 19, Indels: 5
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
160 3 0.02
161 64 0.49
162 63 0.48
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (161 bp):
TGTTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTCAAATAAATAATAGTTCAAATAGACATAACT
ATTTAAACTGCTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTACTATTTTTGAGAATATT
AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA
Found at i:171061 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 170739--172025 Score: 1035
Period size: 181 Copynumber: 7.2 Consensus size: 179
170729 AATAAATTGT
** ** * *
170739 TTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-CTT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* *
170803 TAAACTCT-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAA
66 TGAACT-TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * *
170867 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGA
129 TAATTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-A
* * *
170919 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAATCGTAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
170984 TGAACATGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAATG
66 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-
* * *
171049 AATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAAC-AGAAC-----
130 AATTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTA
* * * * * * * *
171092 --CA--AC-TAACAAAAGGTAATAATGTTTTAAAATAGAAAATTGTTCAGATAGTCAGAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * *
171152 AGAACAAGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTT-AATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAA
66 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * ** *
171216 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTTT
129 TAATTTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA-TTA
* * * * * * *
171268 TTTATTACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTGTT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * * * * *
171333 TGAACTTGTTTGGAAAAAATATTTATTTTTAAAATTTTTTTAATTATTAATTGTTGAAATATTAA
66 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA--TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
171398 TAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACACAAACAATTA
129 TAATTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTA
* * ** * **
171449 TTTTATGA-AAAACCAAAATGTCTTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGA
1 -TTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
171513 TTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATCTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCTT--AATAG
64 TTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATAT
* * *
171576 TAATAAATTT-GTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATCA
126 TAAT-AATTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTA
* * * * * * *
171630 TTTTATGACAAAACAAAATGTTAT-A-GCACTTTCAAATAGATAATTGTTGAAATAATCTTAATT
1 -TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * *
171693 ATTTAAACTTGTTCAATAAACAGATTGA-TTTTTAAACCTCTTAATTACTAATTTTTGAAATATT
63 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * ** * *
171757 AATAACTTAGTATTATTTTATTTTAAAT-AGACTTATATGAACTGAAATAATTTT
127 AATAATTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CTTGTATGAACAAAAACAA-TTA
* * * *
171811 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATATTCATGACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * ** * * * * **
171876 GGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTAGTTATTAACTATCAAAATATTAAT
66 TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * * *
171941 AAATTAGTATTATTTAAATCCT-AATAAACTTGTATGAATAGAAACTATTA
130 AATTTAGTATTATTT-TATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTA
* * * *
171991 TTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAACT-ATTTGAA
1 -TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAA
172026 CTGGTTTGAT
Statistics
Matches: 875, Mismatches: 184, Indels: 95
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.00
168 77 0.09
169 55 0.06
170 3 0.00
171 1 0.00
178 3 0.00
179 14 0.02
180 236 0.27
181 317 0.36
182 159 0.18
183 4 0.00
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
TGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
ATTTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTA
Found at i:171182 original size:168 final size:169
Alignment explanation
Indices: 170929--171247 Score: 423
Period size: 168 Copynumber: 1.9 Consensus size: 169
170919 TTTATGACAA
* * * * *
170929 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAATCGTAACTATTTGAACATGTT
1 AACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGAAAATTCTTCAAATAATCGTAACTATTAGAACAAGTT
* * * * * *
170994 CAGAAAATATATTTATTTTTTAAATT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAATGAATTTA-T
66 CAGAAAACAGATTCATTTTTT-AATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAT-AAATTAGT
171056 ATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAACAGAACCAACT
129 ATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGCATGAACAGAACCAACT
* * * *
171097 AACAAAAGGTAATAATGTTTTAAAATAGAAAATTGTTCAGATAGTCAG-AACTATTAGAACAAGT
1 AACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGAAAATTCTTCAAATAATC-GTAACTATTAGAACAAGT
*
171161 TCAGTAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA
65 TCAGAAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA
171226 TTATTTTATTTCAAATAAGCTT
130 TTATTTTATTTCAAATAAGCTT
171248 ATATGAACTG
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 16, Indels: 9
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.03
168 77 0.59
169 46 0.35
170 3 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.11, T:0.40
Consensus pattern (169 bp):
AACAAAAGGTAATAATGATTTAAAATAGAAAATTCTTCAAATAATCGTAACTATTAGAACAAGTT
CAGAAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGAACAGAACCAACT
Found at i:171924 original size:361 final size:362
Alignment explanation
Indices: 170733--171984 Score: 941
Period size: 361 Copynumber: 3.5 Consensus size: 362
170723 ATTTCAAATA
* ** *
170733 AATTGTTTTATGACAAAA-CAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
1 AATTATTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
** ** ** * * * * **
170797 -AACCTTTAAACTCTTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
65 AAAGATTGGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATCTTTTAAATCTTTTGCTTATTAACTATCAAAA
* * * * *
170861 TTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAACA-AAAACAATTGA-TTTAT
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AA-TCATTTTAT
* * * * * * *
170924 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTCTTCAAATAATCGTAACTATTTGAAC
192 GACAAAACAAATGGTTATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAATTATTTAAAC
* * * * * * * * * * *
170989 ATG-TT-CAGAAAATATATTTATTTTTTAAAT--TTTTACTTATTAATTTTTGGAATGTTAATGA
257 TTGTTTGCA-AAAA-AGATTGATTTTTAAAATCCTCTTAATTACTAATTGTTGAAATATTAATAA
* ** ** *
171050 ATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCATGAACA-GAAC
320 ATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACACAAAC
* * * *** * * * *
171092 CA--A----CT----AA-CAAAAGGTAATAATGTTTTAAAATAGAA-AATTGTTCAGATAGTCAG
1 AATTATTTTATGAAAAACCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-AATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * * * * * * * * * ***
171145 AACTATTAGAACAAGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAA
65 AAAGATTGGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATCTTTTAAATCTTTTGCTTATTAACTATCAAAA
* * ** *
171210 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTTTTTTATT
130 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATCATTTTATG
* * * * *
171274 ACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGATTGTTTGAACT
193 ACAAAACAAATGGTTATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAATTATTTAAACT
* * * ** * *
171339 TGTTTGGAAAAAATATTTATTTTTAAAATTTTTTTAATTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATT
258 TGTTTGCAAAAAAGATTGATTTTTAAAATCCTCTTAATTACTAATTGTTGAAATATTAATAAATT
* *
171404 AATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACACAAAC
323 AATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACACAAAC
* * *
171444 AATTATTTTATGAAAAACCAAAATGTCTTAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
1 AATTATTTTATGAAAAACCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * **
171509 AAGATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATCTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCTTAAT
66 AAGATTGGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATCTTTTAAATCTTTTGCTTATTAACTATCAAAAT
* *
171574 AGTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGAC
131 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGAC
* * *
171639 AAAACAAAAT-GTTAT-A-GCACTTTCAAATAGATAATTGTTGAAATAATCTTAATTATTTAAAC
195 AAAAC-AAATGGTTATAATG-A-TTTCAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAATTATTTAAAC
*
171701 TTG-TT-CAATAAACAGATTGATTTTT-AAA-CCTCTTAATTACTAATTTTTGAAATATTAATAA
257 TTGTTTGCAA-AAA-AGATTGATTTTTAAAATCCTCTTAATTACTAATTGTTGAAATATTAATAA
* * ** *
171762 CTTAGTATTATTTTATTTTAAAT-AGACTTATATGAACTGAAAT
320 ATTAATATTATTTTATTTTAAATAAG-CTTATATGAACACAAAC
* ** * * *
171805 AATTTTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATATTTATTCAAATATTCAT
1 AATTATTTTATGA-AAAACCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* ** * ** * *
171869 GACTATTGGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTAG-TTATTAACTATCAA
65 AAAGATTGGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATCTTTT-AAATCTTTT-GCTTATTAACTATCAA
* * * *
171932 AATATTAATAAATTAGTATTATTTAAATCCTAATAAACTTGTATGAATAGAAA
128 AATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
171985 CTATTATTTT
Statistics
Matches: 716, Mismatches: 142, Indels: 68
0.77 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
348 37 0.05
349 172 0.24
350 12 0.02
351 60 0.08
352 4 0.01
353 1 0.00
354 1 0.00
358 1 0.00
359 1 0.00
360 2 0.00
361 198 0.28
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363 193 0.27
364 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (362 bp):
AATTATTTTATGAAAAACCAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
AAGATTGGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATCTTTTAAATCTTTTGCTTATTAACTATCAAAAT
ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACA
AAACAAATGGTTATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAATTATTTAAACTTGT
TTGCAAAAAAGATTGATTTTTAAAATCCTCTTAATTACTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAAT
ATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAACACAAAC
Found at i:172581 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 172004--174591 Score: 1800
Period size: 181 Copynumber: 14.5 Consensus size: 180
171994 TATAATAGAA
* * * * * * *
172004 CAAAAAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGATAAACAAATTTGTTTTTTAAATCTC---C-TATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
172065 AATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTA-T-TTTT-TTCTGAACAAACTTATATGAACAAAA-ACA
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAATA-A
* *
172126 TTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
130 -TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * *
172178 CAAATAGTCATAATTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCT-TGTACATAT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTAT
* * ** * *
172242 TAATTTCTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAA
65 TAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA--CAAAA
* * *
172306 T--TTGTTTTATGACAAAGC---AA---A-AATGATTTGAAATAGATAATTATT
127 TAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
** * * * * * * * * * * *
172351 CGTATAGTCTTAACTATTGGAATTAGTTAGGCAAAAAAAATTATTTTTTAAATATCTTAGTTATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
172416 AATTTTTGTAATATT-TTATATTAGCATGATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAGTAA
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAA-TAA
* * * * * *
172480 TTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTAAAATGATTTGAAGTATATAATTGTT
130 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * *
172531 CAAATAGTCATAATTATTTAAACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
172596 AATTTTTGTAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAAGAAACTTGTATGGTAA-AAAATA
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-G-AACAAAATA
* * * *
172660 ATTATTATATGAC-AAACAAAATGTAATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTT
129 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * ** ** * * *
172711 GAAATGGCCATAATTATTTGAACT-GATTCAATAAATGGATTCACTTTTTCAATCAT-TT-C---
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTA
* * *
172770 TTAATTTTTGAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGATTAAGTTTATATGAACTAAAAT
64 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAT
* *
172834 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
128 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * *
172887 CAGATAGTCTTATTTATTTAAAC-AGCTTGGGCAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* ** * * * * * *
172951 TAATTTTTGGAATAGCAGTAAATTAGTATTTTTTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTAGAAT
65 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAT
* * * *
173016 AATTATTTTATAACAGAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
128 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * *
173069 CAAATAG------------GAGCTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATGCATATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** * * * **
173122 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTAAATTGAAATAA
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAATAA
* * ** * *
173187 TTGTTTTATTACAAAACAAAAAGGTTGCAATGATTTAAAATAGATAATTATT
130 TTATTTTATGACAAAACAAAAA-GTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * ** * * *
173239 CGAATAGTCATGACTATTTAAACTTGCTCTATAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
173304 -ATTTGTTAAAATATTAATACATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTAT-AATCAAAAAC
66 AATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-C-AAAAT
* * * ** * * *
173367 AATTGTTTTATCACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTTTT
128 AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* ** * * * *
173420 CTAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* *** *
173485 AATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTAT-ATATAGAAA
66 AATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACA-AAA
* * * * * ** * *
173547 AAATCATTTTATGGCAAAATAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATT
127 TAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * * *
173601 GACATAGTTATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTCATTTTTTAATTTTCTTA-TTCAT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-AT
* * *** * * *
173665 TAATTTTCT-AAATGTTAATAAATTAG-ATTATTTAATTACAAATAAGCTTATATGAATAGAAAC
65 TAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAT
* * * * * * * *
173728 AATTGTTTTACT-AGAAAACAAAAGGTCACAATAATTTAAAATAGATAATTATT
128 AATTATTTTA-TGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * *** * *
173781 CAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * *
173846 -ATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAAGAAGCTTGTATGAATAATAACA
66 AATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAA-AATA
* * ** * * *
173910 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAAAAATT-TT
129 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
** * * * *
173961 CAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
*** *
174026 AATTGTCTT--AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGAATGAACAAAAA
66 AATT-T-TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-----
* ** * * *** *
174088 AAAAAAAACATTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTT
123 AAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * *
174146 CAAATAGTTATAATTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAAC-TAT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTAT
* ** * ** * * *
174210 T-ATTTTTGGAATATTAATAGCTTAGTATTATTTGATTTCAAATAA-TTTCATATTAACTGAAAA
65 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAAC--AAAA
* * * * *
174273 TAATTTTTTTATGATAAAAC-AAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATATTTATT
127 TAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTT-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * ** * * * *
174327 CAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGGTCAATAAACATATTTATCTTTTAAATTTTTTACTTATT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
174392 AATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACATCAACT-
66 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA--AAATA
* * * * * *
174456 ATTATTTTATAACTAAATAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTT
129 ATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* ** * *
174508 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTAT-AATAAATAGATTTAATTTTTAAATCTC--A--TAT
1 CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGT-TCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
*
174568 TAA-TTTTGAAATATTAATAGATTA
65 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
174592 TGATAAAACA
Statistics
Matches: 1917, Mismatches: 403, Indels: 186
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
169 46 0.02
170 93 0.05
171 4 0.00
172 30 0.02
173 103 0.05
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175 47 0.02
176 112 0.06
177 8 0.00
178 26 0.01
179 11 0.01
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183 17 0.01
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186 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
CAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAATAAT
TATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
Found at i:173211 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 172919--173245 Score: 419
Period size: 170 Copynumber: 1.9 Consensus size: 170
172909 CAGCTTGGGC
* * * *
172919 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATAGCAGTAAATTAGTATTTTT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATAGATATTAATTTTTGAAATAGCAATAAATTAGTATTTTT
* * * * *
172984 TTTATTCTAAATAAGCTTATATGAACTAGAATAATTATTTTATAACAGAATAAAAGGTTATAATG
66 TATATTCTAAATAAGCTTATATAAACTAGAATAATTATTTTATAACAAAAAAAAAGGTTACAATG
* *
173049 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGGAGCTAGTTTGGT
131 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGGAGCTAGTTTGGT
**
173089 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCAT-GCATATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATAG-ATATTAATTTTTGAAATAGCAATAAATTAGTATT-T
* * * * *
173153 TTTAT-TTC-AAATAAGCTTATTTAAA-TTGAAATAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGGTTGC
64 TTTATATTCTAAATAAGCTTATATAAACTAG-AATAATTATTTTATAACAAAA-AAAAAGGTTAC
*
173215 AATGATTTAAAATAGATAATTATTCGAATAG
127 AATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAG
173246 TCATGACTAT
Statistics
Matches: 134, Mismatches: 19, Indels: 8
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
168 2 0.01
169 34 0.25
170 93 0.69
171 5 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (170 bp):
AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATAGATATTAATTTTTGAAATAGCAATAAATTAGTATTTTT
TATATTCTAAATAAGCTTATATAAACTAGAATAATTATTTTATAACAAAAAAAAAGGTTACAATG
ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGGAGCTAGTTTGGT
Found at i:175799 original size:183 final size:180
Alignment explanation
Indices: 174852--176456 Score: 1236
Period size: 179 Copynumber: 9.0 Consensus size: 180
174842 CAATAAAAAT
* * ** **
174852 AATCTCCTACTTCTTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTCCAAATTGGCTT
1 AATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-TT
* * * *
174916 GTATG-ATGAAAAACAATTATTTTAGGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
64 TTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
174980 ATTCAAATGGCCATAACTATTTGAAC-TGATTTGATAAAC-TAATTT-TGTTTT-
128 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAT-ATTTATTTTTTA
* * * * * * * *
175031 AATCTCCAACTTTTTAGATTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAACTT
1 AATCTCCTACTTATTA-ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AAGTT
* * * * *
175095 TTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTTAAATAGATAATT
64 TTATGAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
175159 GTTCAAATTGTCATAATTATTTGAACTTATTCGGCAAATAGATTAATTTCTTTG
128 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTT-TTTA
* * * * * *
175213 AAT-TCCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAATATTATTATTTTATTGC-AAATAAGTA
1 AATCTCC-TACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CTGAATAAGT-
** * * * *
175276 TGCATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATT
63 TTTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * **
175341 GTTCTAATAGTCTTAACTATTTG-A-TTGGTTGAACAAATACATCTATTT-TTTTTTA
128 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG--GTAA-ACA--TATTTATTTTTTA
* * * ** * * *
175396 TATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGTTTA
1 AATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTT-
* ** * **
175461 TATGAATGGAAACAATTATTTTACAACAAAAC-AAAGATCATACCGATTTGAAATAGATAATTGT
65 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * * *
175525 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTG
130 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * *
175576 AA--T-CT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTGTTCTAAATAATTTTG
1 AATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTT-
* ** * * *
175637 TATGAATAGAAACAATTGTTTTACAAAAAAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATA
65 TATGAATAGAAACAATTATTTT--ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
175702 GTTCAAATGGACATGACTTTTTGAACTTGTTTGGCAAACATATTTATTTTTTA
128 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * * *
175755 AATCTCCAAGTTATTAATTTTTAGAATAGTAATAAATTAGTATTATCTTATTTTGAATAAACTTA
1 AATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AAGTTT
* * * * * *
175820 TATGAATAGAAACTATTATTTTATTAC-AAA-AATA--TCACAATGATTTGAAATAAATAATTAT
65 TATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
** ***
175881 TTGAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTTGGTAAACA-A---A---TTT-
130 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
* * * * * *
175924 -AT-T-TTAGTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCCT
1 AATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAG-TT
** * * * *
175985 TTATGAATAGAAACAATTGGTTTATAATAAAAAGAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATT
64 TTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
176050 GTTGAAATAGTCATAACTATTTGAACTTCTTCGGTAAACAAATTCATTTTTTAA
128 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTT-A
* * * * * *
176104 AATCTCTTACTCATTAATTTTTGGGATATTAATAAGA-TAGTTTTATTTTATT-TCGAATAAGCC
1 AATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAG-T
* * * * * *
176167 TATATGAATTGATACAATT-TTTTATGACAAAACAAATGATCAAAATGATTTGAAATAGATAATT
63 TTTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * *
176231 ATTCAAATAGTTATTACTAATTGAACTTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAA
128 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTT-A
** * * *
176285 AATCTTTTACTTATT-ATTGTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTT
1 AATCTCCTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-TT
* * * * *
176348 TTATGAATAAAAAAAACTATTTTATGACAAAACAAACGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
64 TTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
176413 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTCGGTGAACATATTT
129 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTT
176457 GAAATAAGCT
Statistics
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184 13 0.01
185 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AATCTCCTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTTT
ATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTA
Found at i:175921 original size:543 final size:539
Alignment explanation
Indices: 174926--175902 Score: 1156
Period size: 543 Copynumber: 1.8 Consensus size: 539
174916 GTATGATGAA
** * * *
174926 AAACAATTATTTTAGGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGC
1 AAACAATTATTTTACAACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGC
* * * * * *
174991 CATAACTATTTGAACTGATTTGATAAACTAATTTTGTTTTAATCTCCAACTTTTTAGATTTTGAA
66 CATAACTATTTGAACTGAGTTCATAAACAAATTTAGTTTTAATCT---ACTTATTAGATTTTAAA
* * ** **
175056 ATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATG
128 ATATTAATAAAATAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTAAA
* * * * * * *
175121 ATAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATTGTCATAATTATTTGAACT
193 AAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATAATTATTTGAACT
* * ** *
175186 TATTCGGCAAATAGATTAATTTCTTTGAATTCCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAAAT
258 TATTCGGCAAACAGATTAATTTCTTTAAATTCCAAGCTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAAAT
* * *
175251 ATTATTATTTTATTGCAAATAAGTATGCATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGG
323 AGTATTATCTTATTGCAAATAAGTAT-CATGAATAGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAA-G
* * * *
175316 TCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGATTGGTTGAACAAATAC
386 TCAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGATTGGTTAAACAAATAC
175381 ATCTATTTTTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTA
451 ATCTATTTTTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTA
175446 CTCTGAATAAGTTTATATGAATGG
516 CTCTGAATAAGTTTATATGAATGG
* * *
175470 AAACAATTATTTTACAACAAAAC-AAAGATCATACCGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTATTTTACAACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGC
175534 CATAACTATTTGAACT-AGTTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTGAATCT-CTTATTA-ATTTTCAA
66 CATAACTATTTGAACTGAGTTCA-TAAACAAATTTAG-TTTT-AATCTACTTATTAGATTTT-AA
* * *
175596 AATATTAATAAAATAGTATTATTTTGTTCTAAAT-AATTTTGTATG-AATAGAAACAATTGTTTT
127 AATATTAATAAAATAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTT-TATGAAAT-GAAACAATTGTTTT
* *
175659 ACAAAAAAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTT-TT
190 --AAAAAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACAT-AATTATT
* * * *
175723 TGAACTTGTTTGGCAAACATATTTATTT-TTTAAATCTCCAAG-TTATTAATTTTTAGAATAG-T
252 TGAACTTATTCGGCAAACAGATTAATTTCTTTAAAT-TCCAAGCTTATTAATTTTTAGAAT-GTT
* *** * * *
175785 AATAAATTAGTATTATCTTATTTTGAATAAACTTAT-ATGAATAGAAACTATTATTTTATTAC-A
315 AATAAAATAGTATTATCTTATTGCAAAT-AA-GTATCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACTA
* * *
175848 AA-AATA-TCACAATGATTTGAAATAAATAATTATT-TGAATAGTCATAACTATTTGA
378 AACAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAAATAATTATTCT-AATAGTCATAACTATTTGA
175903 ACTCACTTGG
Statistics
Matches: 362, Mismatches: 57, Indels: 34
0.80 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
537 1 0.00
538 42 0.12
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545 5 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (539 bp):
AAACAATTATTTTACAACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGC
CATAACTATTTGAACTGAGTTCATAAACAAATTTAGTTTTAATCTACTTATTAGATTTTAAAATA
TTAATAAAATAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTAAAAAA
AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATAATTATTTGAACTTAT
TCGGCAAACAGATTAATTTCTTTAAATTCCAAGCTTATTAATTTTTAGAATGTTAATAAAATAGT
ATTATCTTATTGCAAATAAGTATCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGTCAAA
ACGATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGATTGGTTAAACAAATACATCTA
TTTTTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCTG
AATAAGTTTATATGAATGG
Found at i:175963 original size:166 final size:170
Alignment explanation
Indices: 175763--176099 Score: 427
Period size: 166 Copynumber: 2.0 Consensus size: 170
175753 TAAATCTCCA
* **
175763 AGTTATTAATTTTTAGAATAGTAATAAATTAGTATTATCTTATTTTGAATAA-ACTTATATGAAT
1 AGTTATTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTAGTATTATCTTATTTCAAATAAGACTT-TATGAAT
* * * * *
175827 AGAAACTATT-ATTT-TATTACAAA-AATA-TCACAATGATTTGAAATAAATAATTATTTG-AAT
65 AGAAACAATTGATTTATAATAAAAAGAAAAGTCACAATGATTTGAAATAAATAATT-GTTGAAAT
*
175887 AGTCATAACTATTTGAACTCACTT-GGTAAACAAATTTATTTT
129 AGTCATAACTATTTGAACT-ACTTCGGTAAACAAATTCATTTT
** * *
175929 AGTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTTTATGAATA
1 AGTTATTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTAGTATTATCTTATTTCAAATAAGACTTTATGAATA
* ** *
175994 GAAACAATTGGTTTATAATAAAAAGAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATA
66 GAAACAATTGATTTATAATAAAAAGAAAA-GTCACAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATA
*
176059 GTCATAACTATTTGAACTTCTTCGGTAAACAAATTCATTTT
130 GTCATAACTATTTGAACTACTTCGGTAAACAAATTCATTTT
176100 TTAAAATCTC
Statistics
Matches: 145, Mismatches: 18, Indels: 11
0.83 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
166 62 0.43
167 6 0.04
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170 6 0.04
171 61 0.42
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (170 bp):
AGTTATTAATTTTTAAAATAGTAATAAATTAGTATTATCTTATTTCAAATAAGACTTTATGAATA
GAAACAATTGATTTATAATAAAAAGAAAAGTCACAATGATTTGAAATAAATAATTGTTGAAATAG
TCATAACTATTTGAACTACTTCGGTAAACAAATTCATTTT
Found at i:176373 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 176029--176444 Score: 514
Period size: 181 Copynumber: 2.3 Consensus size: 181
176019 AAAAGGTCTT
* * *
176029 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATAGTCATAACTATTTGAACTTCTTCGGTAAACAAATT
1 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTCTTCGATAAACAAATT
* ** * * *
176094 CATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGGATATTAATAAGATAGTTTTATTTTATTTCG
66 CATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTGTTGAAATATTAATAAGATAATATTATTTTATCTCG
** * * * *
176159 AATAAGCCTATATGAATTGATACAATTTTTTATGACAAAACAAATGATCAA
131 AATAAGCCTATATGAATAAAAAAAATATTTTATGACAAAACAAACGATCAA
* * * * * *
176210 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTAATTGAACTTGTTTGATAAACATATT
1 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTCTTCGATAAACAAATT
* * *
176275 TATTTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTGTTGAAATATTAATAA-ATTAATATTATTTTAATCT
66 CATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTGTTGAAATATTAATAAGA-TAATATTATTTT-ATCT
* * * *
176338 -GAATAAGCTTTTATGAATAAAAAAAACTATTTTATGACAAAACAAACGGTCAT
129 CGAATAAGCCTATATGAATAAAAAAAA-TATTTTATGACAAAACAAACGATCAA
* *
176391 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTCG
1 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTCTTCG
176445 GTGAACATAT
Statistics
Matches: 198, Mismatches: 34, Indels: 6
0.83 0.14 0.03
Matches are distributed among these distances:
179 1 0.01
180 46 0.23
181 151 0.76
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTCTTCGATAAACAAATT
CATTTTTTAAAATCTCTTACTCATTAATTGTTGAAATATTAATAAGATAATATTATTTTATCTCG
AATAAGCCTATATGAATAAAAAAAATATTTTATGACAAAACAAACGATCAA
Found at i:176384 original size:20 final size:21
Alignment explanation
Indices: 176346--176384 Score: 53
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 21
176336 CTGAATAAGC
*
176346 TTTTATGAATAAAAAAAACTA
1 TTTTATGAACAAAAAAAACTA
*
176367 TTTTATG-ACAAAACAAAC
1 TTTTATGAACAAAAAAAAC
176385 GGTCATAATG
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 2, Indels: 1
0.84 0.11 0.05
Matches are distributed among these distances:
20 9 0.56
21 7 0.44
ACGTcount: A:0.54, C:0.10, G:0.05, T:0.31
Consensus pattern (21 bp):
TTTTATGAACAAAAAAAACTA
Found at i:176551 original size:119 final size:120
Alignment explanation
Indices: 176339--176563 Score: 310
Period size: 119 Copynumber: 1.9 Consensus size: 120
176329 TTTTAATCTG
* * * **
176339 AATAAGCTTTTATGAATAAAAAAAACTATTTTATGACAAAACAAACGGTCATAATGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTATATGAATAAAAAAAACTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
**
176404 AAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTCGGTGAACATATTTGA
66 AAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTATTCGGTGAACATATTTGA
** * *
176459 AATAAGCTTATATGAATTGAAAAAA-T-TGTTTACGACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAA
1 AATAAGCTTATATGAATAAAAAAAACTAT-TTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* *
176522 TAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTGTTCG
65 TAAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTATTCG
176564 ATAAATAGAT
Statistics
Matches: 91, Mismatches: 13, Indels: 3
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
118 1 0.01
119 68 0.75
120 22 0.24
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.12, T:0.34
Consensus pattern (120 bp):
AATAAGCTTATATGAATAAAAAAAACTATTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
AAATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTATTCGGTGAACATATTTGA
Found at i:176701 original size:300 final size:300
Alignment explanation
Indices: 176159--176734 Score: 773
Period size: 300 Copynumber: 1.9 Consensus size: 300
176149 TTTTATTTCG
* * * * **
176159 AATAAGCCTATATGAATTGATACAATTTTTTATGACAAAACAAATGATCAAAATGATTTGAAATA
1 AATAAGCCTATATGAATTGAAAAAATTGTTTACGACAAAACAAATGATCAAAACAATTTGAAATA
** * * * *
176224 GATAATTATTCAAATAGTTATTACTAATTGAACTTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAAATC
66 GATAATTATTCAAATAGCCATAACTAATTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAAATC
* * *
176289 TTTTACTTATTATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTTTATGA
131 TCTTACTTATTATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATGTTAATCTGAATAAGCTTTTACGA
* * **
176354 ATAAAAAAAACTATTTTATGACAAAACAAACGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
196 ACAAAAAAAACTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
* *
176419 TAGTTATAACTATTTGAACTTATTCGGTGAACATATTTGA
261 TAGTCATAAATATTTGAACTTATTCGGTGAACATATTTGA
* * *
176459 AATAAGCTTATATGAATTGAAAAAATTGTTTACGACAAAACAAAATG-TTATAACAATTTGAAAT
1 AATAAGCCTATATGAATTGAAAAAATTGTTTACGACAAAAC-AAATGATCAAAACAATTTGAAAT
* * *
176523 AGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTT-AAAT
65 AGATAATTATTCAAATAGCCATAACTAATTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAAAT
* * *
176587 CTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGA-ATTATGTTATTCTGAATAAG-TTTGT
130 CTCTTACTTATT-ATTGTTGAAATATTAATAAATTA-ATATTATGTTAATCTGAATAAGCTTT-T
* * * * *
176650 ACGAACAAAAACAATTGTTTTGTGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT
192 ACGAACAAAAAAAACTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTT
176715 CAAATAGTCATAAATATTTG
257 CAAATAGTCATAAATATTTG
176735 CACTAGTTAG
Statistics
Matches: 237, Mismatches: 35, Indels: 8
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
299 18 0.08
300 213 0.90
301 6 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (300 bp):
AATAAGCCTATATGAATTGAAAAAATTGTTTACGACAAAACAAATGATCAAAACAATTTGAAATA
GATAATTATTCAAATAGCCATAACTAATTGAACTTGTTCGATAAACAGATTCATTTTTTAAAATC
TCTTACTTATTATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATGTTAATCTGAATAAGCTTTTACGA
ACAAAAAAAACTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
TAGTCATAAATATTTGAACTTATTCGGTGAACATATTTGA
Found at i:177410 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 176785--177833 Score: 763
Period size: 180 Copynumber: 5.8 Consensus size: 181
176775 TTATTAATTT
* * * * *
176785 TAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAGAC-TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-ACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAA
* * * * * * * *
176849 CAAATGGTTAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG-TTATAACTAATTGAATTGGTTT
65 CAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACT-TAACTATTTGAACTGGTTT
* * * *
176913 AACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC---G-TATTAATTTTCAAGATATTAA
129 GACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * * * * * * * *
176962 TAAATTACTATTATTTTATTTTG-ATCAAATTTATAGGAACAAAAACATTTATTTTATGACAACA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAA
* * * *
177026 CAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAGATAATAGTTCAAA-A-A-TTAA-TAATTATAAAACTAGT
65 CAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAACT-ATT-T-GAACTGGT
* * * * * * * * *
177087 TCGGCTAACAAAATTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAG
127 TTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * * * * *
177142 TAAATTTG-ATT-TGTTTTTTTTTAACT--AGTTAGTAAAGAGCT-GAAAAAAATT-TTTTATAA
1 TAAATTAGTATTAT-TTTATTTTGAA-TAAACTT-GT-ATGA-ATAG-AAATAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
177201 TAAAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAAGTG
60 TAAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAACTATTTGAACTG
* * * *
177266 GTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTAT
125 GTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAA
** * *
177323 TAGGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * * * * * **
177388 AAAAGGTTACAACAATTTGAAATATATAATTGTTTAAATA-ATTATAATTATTTAAATTGGTTCA
66 AAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACT-TAACTATTTGAACTGGTTTG
* * * * * *
177452 ATAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATAAATTTTTGAAATATTAA
130 ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * * * * *
177503 TAAATTAGTTTTATTTTATTATGAATAAACTTGGAT-AAGTTGAAATAATTGTTTTATAACAAAA
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGATAAAA
* * ** * * ** * * *
177567 CAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGACAATTATTCGTATAGTCTTAACTAATTGAACTAGTTTG
65 CAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAACTATTTGAACTGGTTTG
* * * * *
177632 ACAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATTTTAT
130 ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * ** * * * *
177684 TAATTTAATATTATTTTATTTCAAATAAATTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAAC
1 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * ** *
177749 AAAAGGTAATAACAATTTG-AATAGCTAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTATTTGG
66 AAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAACTATTTGAACTGGTTTGA
*
177813 TAAACAAATTTATTTTTTAAA
131 CAAACAAATTTATTTTTTAAA
177834 ATAAAACAAC
Statistics
Matches: 660, Mismatches: 180, Indels: 61
0.73 0.20 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
174 5 0.01
175 2 0.00
176 31 0.05
177 79 0.12
178 4 0.01
179 13 0.02
180 266 0.40
181 231 0.35
182 17 0.03
183 10 0.02
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAAC
AAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACTTAACTATTTGAACTGGTTTGA
CAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTAA
Found at i:177832 original size:361 final size:356
Alignment explanation
Indices: 176864--177833 Score: 944
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176854 GGTTAGAACA
* * * * *
176864 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT-TATAACTAATTGAATTGGTTTAACAAACAGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCT-TAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTAT
* * **
176928 TTTTTAAATCTC---G-TATTAATTTTCAAGATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGATCA
65 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAA-ATATTATTAAATTAATATTATTTTATTTAAAT-A
* * * * * * *
176989 AATTTATAGGAACAAAAACATTTATTTTATGACA-ACACAAAAGGTAATAACAATTTAAAATAGA
128 AATTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGA-ACAAAAGGTAATAACAATTT-GAATAGA
* * *
177053 TAATAGTTCAAA-AATTAATAATTATAAAAC-TAGTTCGGCT-AACAAAATTATTTTTTAAATCT
191 TAATTGTTCAAATAA-TAATAATT-T-TAACTTA-TTCGG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
** * * * * * * * *
177115 TTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTGATTTGTTTTTTTTTAACTAGTTAGTAAAGA
251 CCTACTGATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGATTTATTTTTTATGAACTACTTAGGAAAGA
* * *
177180 GCTGAAAAAAATTTTTTATAATAAAATAAAATGTCATAACT
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* * * * *
177221 ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAAGTGGTTTGGCAAACAAATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTATT
* ** * *
177286 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTATTAGGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
66 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTC-AAATATTATTAAATTAATATTATTTTA-TTTAAATAA
** * * * * *
177351 GCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTACAACAATTTGAAATATATA
129 ATTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTAATAACAATTTG-AATAGATA
* * * * ** *
177416 ATTGTTTAAATAATTATAATTATTTAAATTGGTTCAATAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTCCTA
193 ATTGTTCAAATAATAATAA-T-TTTAACTT-ATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTA
* * *
177480 CTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTATGAA-TAAACTT-GGATA-AG
255 CTGATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGATTTATTTT-TTATGAACT--ACTTAGGAAAGAG
* *
177542 TTG-AAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA-T
317 CTGAAAAAAATT-TTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACT
* * *
177581 GATTTGAAATAGACAATTATTCGTATAGTCTTAACTAATTGAACTAGTTTGACAAACAAATTTAT
1 -ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTAT
* * * * *
177646 TTTTCAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATTTTATTAATTTAATATTATTTTATTTCAAATA
65 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCA-AATATTATTAAATTAATATTATTTTATTT-AAATA
*
177711 AATTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTAATAACAATTTGAATAGCTA
128 AATTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTAATAACAATTTGAATAGATA
* * *
177776 ATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
193 ATTGTTCAAATAATAATAA-T-TTT-AACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA
177834 ATAAAACAAC
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ATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACAAATTTATT
TTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTTAAATAAAT
TTATATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTAATAACAATTTGAATAGATAATT
GTTCAAATAATAATAATTTTAACTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTGATA
AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGATTTATTTTTTATGAACTACTTAGGAAAGAGCTGAAAAAA
ATTTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACT
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177875 ATTGTTTCAA
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*
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AATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTAG
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177899 AACTTATTAC
* * *
177909 TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGTTAAGAGACTTAAAAA
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* * *
177974 TAAATCTACTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
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*
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** *
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1 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAA
* * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
178265 TA-CCAGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATATCAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATA
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178329 AAT
64 AAT
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TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAA
TCTACTTACCAAAAAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAT
GACCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAACAAAAT
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178459 TTGCTGAAGT
** * * * * * *
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* * * *
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* *** * * *
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* * * *
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* * * *
178714 TCATAAGACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA
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* **
178779 TTCAAAAAATTAATAAAAAAAGATTTAAAAAATAACTCTGTTTACTGAACA
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* ** * *
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1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATTTAG
* * * * * * * *
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66 TCATAAAACAATTGTTTT--GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-AATAA
* * * ** * **
178953 C-TTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCCTAAAATAATAAGTAAGAAATTT--
128 CATT-CA---AA-AAATTAATA--AA---A-AAAGA-TT--TAAAA-AATAAATCTG---TTTAC
179015 -AAA-A
175 CAAACA
* * * * * * *
179019 AG--TAAATCTGTTTATTGAATCAATTAAAATAATTATGGCCATTT-GAAT-GATTAT---CTAT
1 AGTTTAAAT-AG-TTA-AG-A-CTATTAGAACAATTAT--CTATTTAAAATAG-TTATAACCT-T
* * * * * * * ** * * ** *
179077 TTCA---AATCTTATGACCATTTGTTTTG-TCATAAAATAATTGTTT-G--T--GATCGTACAAA
57 TTGATTTAGTCATA-AAACAATTGTTTTGTTCATACAA-GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAA
* * * * ** * * *
179133 ATTATTCGAA-A-T-AAAATAA-TACTAACTTATTAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCTAAT
120 TTTAAT--AACATTCAAAA-AATTAATAA--AAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAA
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179 CA
* * * * * * * ** * *
179195 GGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCA-TTAGGATC-TTTG-TTTT
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAAT-AGTTATAACCTTTTGATTTA
* * **** * * *
179257 GTTATAAAATAATTGTCTCCAATCATAGAAGGTTATTTAG-TTAAATATAATACTAATTTAAT-A
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* ** * * * * ** *
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* * * * * * **
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* * * * ** * ** * * * *
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* * * * *
179502 ATCCGAGAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAA-A
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* * * * *
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* * * * * * **
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* ** * * * *
179683 TATTTC-AAAAATTAAT-AAGGAAGAGTTTAAAAGAATAATTTTTTTTACCGAACA
128 CA-TTCAAAAAATTAATAAAAAAAGA-TTTAAAA-AATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * * * ** *
179737 AATTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTGTCCATTAAAAATCA-TTATGTCATTTTG-TTT
1 AGTTTAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAAT-AGTTATAACCTTTTGATTT
* * * * * * * *
179799 TGTTACAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 AGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAA
* * ** * * * *
179864 TATTCCAAAAA-T--T-AAAAGTGATTTAACAAGTAAATTTGTTTGCCAAATC-
128 CATTCAAAAAATTAATAAAAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CA
* * * * ** * * * * * * *
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1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAAT-AGTTATAACCTTTTGATTTA
*** * * * *
179975 GTCATTTCACAATTGTTTTTTATCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
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* *
180040 CTTTC-AAAAATTAAT-----AAG-----------AGA--TGTTTACCAAACTA
128 CATTCAAAAAATTAATAAAAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-A
* * * * *
180075 A-TTTAAATAGTTATGACTATATA-AACAATTGTATACTTT-AAATTGTTATAATCTTTTG-TTC
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTA-TTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATT-
* * * * *
180136 TA-TCATATAACAATTATTTT-TACTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAT
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* * * * * * *
180199 AATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGACATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACT
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* * * * *
180255 AGTTCT-AATAATTAAGGCTA-TATTAACAATTATCTATTT-CAA-A-TTGT----TTTTG-TTT
1 AGTT-TAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATTT
* * * * * * * *
180310 TGTCATAAAATAATT-TTTTCAATTCATACTAGCATATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATT
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* ** * * * * * *
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126 AACA-TTCAAAAAATTAATA-AAAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * * * *
180429 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCA-TTATGACCTTTTG-TTTT
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAAT-AGTTATAACCTTTTGATTTA
* * * * * * * * *
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* * * *
180555 ATTTC-AAAAATTAAT---AAGAGATTT-AAAACTAAATTTGTTTACTAAATC-
129 A-TTCAAAAAATTAATAAAAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CA
* * * ** * * * * * *
180603 AGTTCAAACAGTTATGACTATTTA-AGTAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACATTTTG-TTCT
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATT-T
* * * * * ** *
180666 A-TTATAAAACAATAGTTGCTATTTATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAA-TT--T--
64 AGTCATAAAACAATTGTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * * * * * *
180725 -ATT---AATATT--T-TAACAA-TTTTCAAAAGTAAATATGTTTATCAAACC
128 CATTCAAAAAATTAATAAAAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * * * * * * ** * * *
180770 AGATCAAACAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTGAAATCTTTATGACCTATTG-TTTTG
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATTTAG
* * * * * * * * * *
180834 TCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATA
66 TCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAACA
* *
180899 TTTC-AAAAATTAA-AAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACA
130 -TTCAAAAAATTAATAAA--AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * ** * * * ** *
180951 AGTTTAAATAATTATGATTATTTTAACAATTATCTATTTGAAGTTGCCATAACCTTTTG-TTTTG
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATTTAG
* * * * ** * * *
181015 TCATAAAATGATTTTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTCTAAT-AAATAATACAAATTTATTAATA
66 TCATAAAA-CAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAACA
* * * * * * *
181079 TT-AAGACAACTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAA-AAAT-TCGTTCATCGAACA
130 TTCAA-AAAATTAATAA-AAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACA
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181131 AGTTTAAGTCTTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTAAGGACTTTTTG-TTTT
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* * * * * * * * * *
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** * * * *
181259 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTTCCGAACA
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* * * * * * * * *
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1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT-AAAATAGTTATAACCTTTTGATTTA
* ** * *
181374 GTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
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* ** * * * * * *
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* * * * ** *
181491 TGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACA-TTATGGCCTTTTCATTT-
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT-AAAATAGTTATAACCTTTTGATTTA
* * * * * *
181554 GTTATAAAACAATTGGTTCTATTCATATAAGCTTCTTTTA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTA
65 GTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTAATA
* * * * * *
181617 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAA-ATTT-GAAAATAAATATATTTTCTAAACA
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* * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * **
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1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT-AAAATAGTTATAACCTTTTGATTTA
* * * *
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* * ***** * **
181974 TATTCTAAAAATTAATAAGTTGGTGATTTAAAAAATAAATTTGTACACCAAACA
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* * * * *
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* ** * * ** * *
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* * * * *
182508 AACATGCAGAACATTAATACACAAGAA-ATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
126 AACATTCAAAAAATTAATA-A-AAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * ** * ** * *
182564 AGTTCAAATAGTTATGAAGATTTA-AATAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTA
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATTTA
* * * ** * * *
182628 -TCA-AGAAAAAATT-TTTTCAGTTTATAAAAGCTTGGTT-GAAATAAAATAATATTACTTTATT
65 GTCATA-AAACAATTGTTTT--GTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAAT
* * ** * * *
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126 AACA-TTCAAAAAATTAATAA-AAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAA-CA
* * * * * * *
182745 AGTTCAAATAATTATGGCCTTTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAA-CTTTT-TTT
1 AGTTTAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAAT-AGTTAT-AACCTTTTGATT
* * * * *
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* * * * ** *
182870 TATATTTC-AAAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTGAACC
126 AACA-TTCAAAAAATTAATAAAAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * * *
182922 AG--T---T-CTT---A-T-TTA-AATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTATT-ATTTTG
1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATTTAG
* * * * * *
182974 TTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTAGAAAAAAATAATACTAATTTAATAATA
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* * * * * *** *
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* * * * * * * * * *
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1 AGTTTAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATTATCTATTTAAAATAGTTATAACCTTTTGATTTA
* * *
183154 GTCATAGAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAA-ATCTAATTTATTA
65 GTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA-CTAATTTAATA
* * *
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127 ACATTCAAAAAATTAATAA
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TCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAACAT
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* * * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* *
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CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACA
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* * * *
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** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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*
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* * * *
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* * *
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180911 AAAATTAAGA
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CAAAACTAAATATGTTTACTAAACCAGATCAAACAGTC
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* * * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** * * * * **
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* *
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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*
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128 TAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * *
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* * * * * * *
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66 AAT-ATTATGACCTTTTATTTGTT-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
** * * **
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129 AAAATAATAATAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
** ** * *
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1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * *
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66 AATA-TTATGACCTTTTA-TTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
****
181953 AAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGTGATTTA
129 AAAATAATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* ** * * * * * * * *
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1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * *
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* *
182131 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAAAGGTTT-
128 TAAAATAATAATAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * *
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1 AAAAAT-AAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * *
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* ** * * * *
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* ** * * * * * *
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1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * *
182423 AAATCACTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATACATGCTTATTTGA
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* * ** * * *
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126 AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATA-AGTAA-AAGATTTA
* ** * *
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1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * * **
182605 AATAAATATGACCTTTT-GTT-TTATCAAGAAAAAATTTTTTC-AGTTTATAAAAGCTTGGTTGA
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* * * * *
182667 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTTAGAGATTTA
126 AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * *
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1 AAAAATAAATAT-GTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * **
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63 TCAAAT-ATTATG-ACCTTTTATTTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTG
* *
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** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *** * * * ** ** * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * ** * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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172 AGATTTA
* * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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129 AAAATAATAATAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * * * * * *
183629 AAAAATAAATTTCTTTGCCAAGCCAGTTCAAATATTTATGATTATATGAACAATTATCTATTTCA
1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * *
183879 AATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAACAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAA
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* * * *
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* * * * * ** *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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123 TGA-A-ATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTAA-AAATT-AATA-AG-TA-AAAGATTTA
* * * * ** *** * ** * * * *
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* * ** ** * *
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* * * * * *
184291 TAACTAAG---ATTT--AA-AAAATGAAT-CT-GTTTGTTGAACCAGTTCAAATAGTTAA-AACT
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* * *
184347 ATATAAACAATTA
167 GTA-AAAGATTTA
** ** * * * * * *
184360 TTTATTTCAAAT-TG-TTA-TAAGC---TT----TTGTCTATAACTATTTGAACAATTGTCTATT
1 -AAAAAT-AAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * * * * * * *
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* *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * **
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* * ** ** *
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* * ** * ** * ** *
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* * * * * * * *** *
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* * * *
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* * ** * * ** *
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* * * * * * *
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* ** * ** * *
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* * **** * * * * *
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* * * * * * ****
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* * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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128 TAAAATAATAATAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTA
* ** * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** ** * * * *
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1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
** * * * **
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* *
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* * * * * * *
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1 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * ** * * * * * **
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* *
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*
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** * * *
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* * * *
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**** * * *
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*
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* *
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** ** ** ** ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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Done.