Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168082.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_33, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
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ACGTcount: A:0.39, C:0.11, G:0.11, T:0.39
Warning! 3000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 3 of 7
Found at i:188119 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 188096--188134 Score: 53
Period size: 18 Copynumber: 2.2 Consensus size: 18
188086 AAATATTGCT
*
188096 AAATTAAT-AGTATTCTAA
1 AAATTAATGAGGATT-TAA
188114 AAATTAATGAGGATTTAA
1 AAATTAATGAGGATTTAA
188132 AAA
1 AAA
188135 ATAAATGTGT
Statistics
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0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
18 14 0.74
19 5 0.26
ACGTcount: A:0.54, C:0.03, G:0.10, T:0.33
Consensus pattern (18 bp):
AAATTAATGAGGATTTAA
Found at i:189132 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 188824--190895 Score: 1721
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188814 GTAGAACTAG
* * * * * * * *
188824 TTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
188888 GTAAAATAATT-TTTTTAGTTCTTAGTAA-CTTATTCGAAATAAAATAAAACAAATTTGTTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
188951 TTTTAGAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCGAACCAA
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* * *
189005 TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTAT-TGATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
189069 ATAAAACAAATGTTTTTTTTCAAATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
189134 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACCAA
130 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAACCAA
* * * * *
189186 TTCAATTAGTT-TAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
189250 TAAAATAATTATTTCTATTCATAC-AGTCTTATTTGGAATAAAAGTAATGCTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
189314 TTTGAAAATTATTAAGTAACAAATTTAAAAAAATGAATCTA-TTAGCCTACCTAG
129 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-CCAACC-AA
* * * * * * * * *
189368 TGCAAATATTTATG-TTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAGCTTTTGTGTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * ** * *
189432 CAAATCAATTGTTTTTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAACATAATTCTAGCTTATTAATGTTC
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
189497 CAAAAA-T-A-AA-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAA-CAA
131 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAACCAA
* * * *
189543 GTTTAAATAGCTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * *
189608 ATAAAACAAATT-TTGCTACTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAACACAAATTTATTAATA-
65 ATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
189671 TTCAAACAATTAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-ACATAA
129 TTTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAC-CAA
* * * * * *
189724 GTTCAAACAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTATTTTAAA-CTATTATGA-C-TTT-TTTT-T
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
189784 -ATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTTGGATTACAATAATATTAATTTATTAATAT
64 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
189848 GTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAA
129 -TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AACCAA
* * * * * ** **
189901 TCCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATT-TCTATTTCGAATCGTTATGACCTTTCGTTTCATTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
189965 TAAAACAATTGTATC-AGTTCATATAGGCTTATTCGAAAGAAACTAATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * *
190029 CCAAAAATTAA-AGAATAAGAAATTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAA
130 TTAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAACCAA
* * * * * *
190080 GTTTAAATAGTTATTACTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTGTTTTGTT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
190145 ATAAAACAATTATTTTTTTTCACACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATA-TAAATTTACTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
** * * * * * *
190208 TTCCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATGAATCTATTTTCTAAACACG
128 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAACCA-A
* * * * **
190261 TTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTAATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
190326 TAAACCAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
190391 CAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAGCAA
131 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAACCAA
* * * * * * * * *
190441 GCTCAAATAATTATGACTGTTTAAATAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTT-TC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
190505 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * *
190570 CTAAAAATTAATAGGTCGGAGATTTACAAAATAAATCTATTTACCAAACAAA
130 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AACCAA
* * * * * *
190622 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * *
190687 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTGGATTAAAATAATACTGATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
190752 TGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTATCGAATCAA
131 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAACCAA
* * * * *
190799 TTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * **
190863 TAAAATAATTGTTTCTTTTCATATTAGCTTATT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
190896 CAAATTAAGA
Statistics
Matches: 1517, Mismatches: 320, Indels: 113
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 19 0.01
176 170 0.11
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178 23 0.02
179 18 0.01
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183 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAACCAA
Found at i:190349 original size:361 final size:359
Alignment explanation
Indices: 188824--200232 Score: 4584
Period size: 361 Copynumber: 31.5 Consensus size: 359
188814 GTAGAACTAG
* * * * * * *
188824 TTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCA-TTATGACCATTTGTTTTAT
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * * *
188887 TGTAAAATAATT-TTTTTAGTTCTTAGTAA-CTTATTCGAAATAAAATAAAACAAATTTGTTAAT
64 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * * * * *
188950 ATTTTAGAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCGAACCAA-TTCAAATAA
127 ATTTCAAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCAAATAG
* *
189014 TTATGACTATTTGAATAATTAT-TGATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAA
* * * * **
189078 ATGTTTTTTTTCAAATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
253 TTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * *
189143 AATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACCAA
318 AATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * *
189186 TTCAATTAGTT-TAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
189250 TAAAATAATTATTTCTATTCATAC-AGTCTTATTTGGAATAAAAGTAATGCTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
189314 TTTGAAAATTATTAAG--TAACAAATTTAAAAAAATGAATCTA-TTAGCCTACCTAGTGCAAATA
129 TTCAAAAATTA--AAGAATAAGAAATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
189376 TTTATG-TTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAGCTTTTGTGTTATCACAAATCAA
190 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGT-TTTTCATAAAACAA
* * * * ** *
189440 TTGTTTTTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAACATAAT-TCTAGCTTATTAATGTTCCAAAAAT
253 TTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * *
189504 AAATAAG-AG--ATTTAAAAAATGAATCTGTTTACTGAACAAG
317 TAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * *
189544 TTTAAATAGCTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
189609 TAAAACAAATT-TTGCTACTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAACACAAATTTATTAATA-
66 TAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
189671 TTCAAACAATTAAAAAATAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCACATAAGTTCAAACAGT
129 TTCAAA-AATTAAAGAATAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
189735 TATAACTGTTTGAACAATTATTTATTTTAAACTATTATGA-C-TTT-TTTTT-ATAAAATAATTG
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTTCATAAAACAATTG
* ** * * ** *
189796 TTTTTGTTCATACAAGCATATTTGGATTACAATAATATTAATTTATTAATATGTTGACAAA-TAA
256 TTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT-TCCAAAAATTAA
* * * **
189860 TAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAA
320 TAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * ** **
189901 TCCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATT-TCTATTTCGAATCGTTATGACCTTTCGTTTCATTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
189965 TAAAACAATTGTATC-AGTTCATATAGGCTTATTCGAAAGAAACTAATACTAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
190029 CCAAAAATTAAAGAATAAGAAATTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTAT
130 TCAAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
190094 TACTATTTGAACATTTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATT
195 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAATTGTT
* * * *
190159 TTTTTTCACACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATATAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATA
258 TTTTTTCATACAAGTTTATT-TGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * **
190223 AGTAGAAATTTAAAAAATGAATCTATTTTCTAAACACG
322 AGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * **
190261 TTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTATTTAATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
190326 TAAACCAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
190391 CAAAAATTAATATG--TAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCTAGCAAGCTCAAATAATT
131 CAAAAATTAA-A-GAATAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
190453 ATGACTGTTTAAATAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTTCATAAAACAATTGT
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTTCATAAAACAATTGT
* * * * *
190518 TTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTCTAAAAATTAATA
257 TTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * * *
190583 GGTCGGAGATTTACAAAATAAATCTATTTACCAAACAAA
322 AGT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * *
190622 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * *
190686 GTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTGGATTAAAATAATACTGATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * *
190751 TTGAAAATT----AATAAGAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTATCGAATCAA-TTCAAATAGTTA
130 TCAAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
190811 TGACTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTTGTCATAAAATAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTT-TGTTTTTCATAAAACAATTGT
* ** * ** * * * * * *
190875 TTCTTTTCATATTAGCTTA-TTCAAATTAAGATAATACTAAGTTAATAATA---AAATAAATGTG
257 TTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAA-AAAT-TA
* ** * * *** * * *
190936 TTTTGT--CAATCT-AGTTA-AAAT-AG-TTA--AGAC-TA
319 ATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * ** * * * ** *
190968 TT-AGAATAATTAT--CTATTT-CA-AATCATTCTAACCTTTCATTTAGTCATAAAACAATTATT
1 TTCA-AATAGTTATGACTATTTGAATAATTA-TCT-A--TTTCAAATAGTTAT-GACCTTTTGTT
* * * * *** * * ** * * * **
191028 TTAGTTCGT---ACAA--GCTTAT-TTGA-A-AAAAATAAT-AATAATTTATTAACATTCAA-AA
60 TT-G-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTT
** * * * * * *
191083 ATTTAATA-AGCAAGAGATT-TA-AA-AA-AAA-TTAAT------A--TGTTTACCTAATAAGTT
121 A-TTAATATTTCAA-AAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTT
* * * * * *
191134 CAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCATA
184 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATA
* *** * * **** * * * * *
191199 AAATAATTGTTTCAATTCATAAAAATTTATCCAAAATAAAAAAATACTACTTCATTAATATTTCA
247 AAACAATTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCA
* * * * * * * * * *
191264 AAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCCAAGCCAA
312 AAAATTAATAAG-TAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * * * * * *
191313 TTTAAATAGTAAAGACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATTGCTATGATC-TTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
191377 TAAAAAAAATTGTTTTTGA-TCATACAAACTTAATC-TAATAAAAATAATACTAATTTAATAATA
66 T-AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * ** *
191440 CTTCAAAAATTAACA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCATATTAA-TTCAAATGG
128 TTTCAAAAATTAA-AGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
191503 CTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTTGTTTAGTCATAAAATAC
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACC-TTTTGTTT-TTCATAAAACAA
*** * * * * * ** *
191568 TTGTTTCAGTTCTTACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAAAT
253 TTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* ** * * * * ** *
191633 AATAAGCAAGGGATTTCAGAAAGTAAATATATTTACCGAACAAG
318 AATAAG-TAGAAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * *
191677 CTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTA-TCATGAACTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
191741 ATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
191805 TTAAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTGTACTGAATC-GGTTCAAATAA
129 TTCAAAAATTAA-AGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAC-CAAACAAGTTCAAATAG
* * ** *
191867 TTAT-AGCCAATTGAACAA-TAAATATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
191 TTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAA
* *** * * * *
191930 TTCTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATT
253 TTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * **
191995 -AGAAG-AG--ATTT-AACAATAAATTTGTTTATCGAAATAGC
318 AATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAA
* * * * *
192033 TT-AAATAGTTATGACTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTCTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
192097 TAAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-
66 T-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
192160 TTCTAAAAATTCATA-ATTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TCGTTTGCCAAACCAGTTCAAACAG
129 TTC-AAAAATT-AAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* ** * * *
192223 TTAAGACTATAAGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAGACAAT
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAAT
* **** * * * * * *
192288 TATTTCAGCTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAAT-ATAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTT
254 TGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAT-ATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * * *
192352 TATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA-TCGAACCAG
318 AATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAA
* * **
192395 TTCAAATAATTA-GAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTATTTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
192458 CATAAAAAAATTATTTTTGTTCCTATAAGTTTGCTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAGA
64 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * * * * * *
192522 TTT-AGTAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTGCCAAATC-ATTTCAAATAG
128 TTTCA-AAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAG
* * ** ** * *
192585 TTTTGAC-ATATGAGTAATTATCTATTTCAGTTCATTAT-AACTTATTGTTTTGTCATCAAACAA
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTT-TTGTTTT-TCATAAAACAA
* * * * *** * * *** *
192648 TTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTT
253 TTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
** * ** * * *
192713 AATAACCAAGTAAA-TTAAAAGATAAATCTAATTGCTAAACTAG
318 AATAA-GTAG-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * ** ** *
192756 TTTAAATAGTTAAGACTATATGAA-CATCA-AT-TTTCAAACCGTTATGACAATTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
192818 TAAAATAAATT-TTT-TGTTCGTACAAGCTTATT--AAGATTAAAGTAATACAAATTTGA-TAAT
66 TAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAA-A-TAAAATAATACTAATTT-ATTAAT
* * * * * * *
192878 ATTTCAAAAATT----AATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTTATAT-GA
127 ATTTCAAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-
* * * * * * *
192938 TTAAT-ACTATTAGACCAGTTATCTATTTCAAATCATTCT-AGCCTTTTATTTAGTCATAAATCA
191 TT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGA-CCTTTTGTTT-TTCATAAAACA
**** * * ** * * *
193001 ATTGTTCCAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAGTTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAT
252 ATTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * *
193066 TAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTA-TCAAACAAG
317 TAATAAG-TAGAAATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAA
* * * * * * * *
193111 TTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTGTTTATTTAAAATCGCTATGACCTTTTGTTATT-TC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT-TTGTC
* * * *
193175 ATAAAACAATTG-TTATAGTTAATACAAGTTTATAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * *
193238 TTTTTAAAATTAGTAAGTAA-AAG-AA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATCAA-TT-AAAT
128 TTTCAAAAATTA--AAG-AATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCAAAT
* * * * *
193298 AATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACA
189 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACA
* * * ** * * *
193363 ATTGTTTTTTTTATCATAGAAGCTTATCTAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
252 ATTG-TTTTTTT-TCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * ** * *
193428 ATTAATAAGTACGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTAAACCAG
315 ATTAATAAGTA-GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* ** ** ** * * * *
193474 CTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATTTTTCTAACCATTT-TTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
193538 TAAAATATTTGTTTC-ATATCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATCCTAATATACTAACA-
66 TAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
193600 TTCAAAATATTAATA-AGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGCTCAAATAG
129 TTCAAAA-ATTAA-AGAATAAGAAATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * **
193664 TTATGACTATTTGAACAATTAAT-TACTTAAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
191 TTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAA
* ** * * **** * * *
193728 TTGCTTTAGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTTTTAATATTTCAAAAATT
253 TTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * *
193793 AATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTT-TTAAACAAA
318 AATAAG-TAGA-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* ** * * * * * * * * *
193836 TTTAAATAGTTGCGACTACTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCGTTAAGAAAC-TTTGTTTTCTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
193900 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * * ** *
193965 CCAAAAATT----AATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTACTTACCAAATTAGTTCAAATAATTAT
130 TCAAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
194026 G-CAATTTCAATAATTATTTATTCCAAATCATTATGAACATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
195 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAATTGTT
** ** * *
194090 TTTCATCATACAAGCATATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
258 TTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* *
194155 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC----C--A
323 GT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * * * *
194187 ---AAGTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTACCTATTTTAAATCA-CTATAACCTTTTGTTCTATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
194245 ATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
194308 TTCTAAAAATTAATA-ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAA-ACAGTTTAAACAG
129 TTC-AAAAATTAA-AGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAG
* ** * *
194371 TTAAGACTACATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTTTCATAAAATAAT
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTG-TTTTTCATAAAACAAT
* ** * * * ** *
194436 CGTTTTAGTTCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
254 TGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * *
194501 ATAAGT-G--ATTTAAAAAGTGAATCTCTTTACCAAATC-AT
319 ATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CAAA
* * * * * * * *
194539 TTCAAATAGTTATGGCCATTTCAATAGTTATCTATTTCAAATCGTTATTACATTTTGTTTGGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * * * *
194604 TATAGCAAATGTTTATGA-TCATTTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATCAATCTT
66 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * * * * *
194668 TCAAAAATTAATA-AGTAAGCGA--TAAAAAACAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAATTA
130 TCAAAAATTAA-AGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
194730 TGACTATTAGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAA-ATATT-
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTT-TTTCATAAAACA-ATTG
* * * * *
194793 TATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTA
256 T-TTT-TTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * *
194858 ATAACTAAGAGAA-TT-AAAAATAAATTTGTTTGA-TGAACCAA
319 ATAAGT-AGA-AATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAACAAA
* * * * *
194899 TTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-ATGTTATGACCTTTGGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * *
194963 ATAAAACTAA-T-TTTCAATTCGTATTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATG
65 ATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * ** * * * *
195025 TTTCAAAAATGAATA-AGTAAGAGATTTAAAAGAATATTTTTGTTTACCTAACCAA-TTTAAATA
128 TTTCAAAAATTAA-AGAATAAGAAATTTAAAA-AATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCAAATA
* * * * *
195088 ATTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAA
190 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTTCATAAAACAAT
* * * * * * * * *
195153 TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAGTAATACTAATCTATAAATATTTCAAAAATTA
254 TGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * *
195218 ATAAG-AG--ATTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAG
319 ATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * ** * *
195256 TTCAAATAGTT-TGACTATTTGACA-AATTATTTAGTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTCCTATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
195319 ATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-AAAATTAACATAATACTATTTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * ** * *
195383 TTTGACAATTAATA-AGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGT
129 TTCAAAAATTAA-AGAATAAGAAA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
195446 CATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCGAATCATTATGACTTTTTCTTTTGTCATAAAAGATTT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAATT
** * * **
195511 GTTTTAGTTCATATAAGTTTATTT--AAAAAAATTAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
255 GTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAA-TAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * * *
195574 ATAATGAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACAAG
319 ATAA-GTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * *
195616 TTAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTATAACCTTTTTGTTTTGAC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC-TTTTGTTTTGTC
* * * * * *
195681 ATAAAATAATTTTTTCTTTTTATACAAGTTTATTTC-AAATTAAATAATA-TAAATTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * *** * *
195744 --TCAAGACAATTAATA-AGTAA-AAGATTTAAAAAATCAGTCTATTTATTGAATAAGTTTAAA-
128 TTTCAA-A-AATTAA-AGAATAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * * *
195804 CGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
189 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACA
* ** * *** *
195869 ATTGTTTTTTTTCATACAAGATTATTCAGATTAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTTGACAAT
252 ATTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * *
195933 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAG
317 TAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAA
* * * * * * * * *
195977 TTGAAATAGTCAAGATTTTTTGAATAATTAACTATTTCTAATCA-TTATGACCTTTTGTTTAGTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *** * * * * * *
196041 ATAAAAAAACAATTTCAATTCAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATGTT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * **
196106 CCAAAAATTAATGAGTAAGAGAA--TAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAACCTCAAATAGTTA
130 TCAAAAATTAAAGAATAAGA-AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
196169 TGACTATCTT-AACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
194 TGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTC-AAATATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACAATTG
* * * * * * * * * **
196233 GTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTGATTAATACTAAAAAAATTAAT
256 TTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
* ** *
196298 AAGTA-AGAATTTTAAAAATAAATAAGTATT-CTAAACACA
321 AAGTAGA-AATTTAAAAAATAAATCTGT-TTACTAAACAAA
* * * * *
196337 TTCAAATAGTTATAAAT-TTTAAAAATAAATAAGTATTCTAAACACATTCAAATAGTTAT-AACT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTT--GAAT-AAT---TA-TCT----A-TTTCAAATAGTTATGACCT
* * * * * * * * *
196400 ATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTAATATCTTTTGTTTCCTCATAAACCACTTGTTTTTG
54 -TTTG--T-TTTGT-CA--T-AAA--A-CAAT-T-GTTTCTAT--TCAT--A-CA--AG--CTTA
* * *
196465 TTCATAAAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAA-AATTCTAAAAATTAATA-AGT
97 TTC------G---A-----AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-AGAAT
* * ** * * *
196528 AA-AAGATTTAAAAAGATAAATTTGTTTACTGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAA
146 AAGAA-ATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * ** * * * *
196592 TTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGACTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
209 TTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTG-TTTTTCATAAAACAATTGTTTTTTTTCATACAAG
* * * * *
196657 TTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAA
272 TTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAA
* * *
196722 AAATAAATTTGTTCACTAAACAAG
336 AAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* *** * * * * * ** *
196746 TTCAAATAGTCAACTCTGTTTAAACT-ATTAGCTATTTGAAATCGTTATGATATTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* **
196810 GTAAAACAAATT-TTTCTATTCATACAAAATTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 ATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *** * *
196873 TTTCAAAAATT-AAG---AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGCT
128 TTTCAAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
*** * * *
196934 ATGACTATTTGAACAATTATCTATAAAAAATCATTATGATCTTTT-TTTCTCATAAAATAATTG-
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTTCATAAAACAATTGT
* * * * ** * * * * **
196997 TTTATGTCATATTTAAGCTTAATTCAGAGTAAAAT-ATAGCTAAATTAATAATATTAAAAAAATT
257 TTTTTTTCATA--CAAG-TTTATTTGGAATAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * *
197061 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAG
318 AATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * * *
197104 TTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAAGTAGCTATTTTAAATCA-TTCTGACCTTTTGTTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** **
197168 ATAAAATAATTGTTTCAATAT-ATACAA--TTATT-TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
65 ATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT-A--AT-A-C---TAATTT
*** *** ** * * *
197229 ATCATAAAATAAGTGTTTCAGTTCATTAAATCTTATCCAAA-ATAAAATAATATTACTTTATTAA
121 AT--T--AAT-A---TTTCA-AAAATTAAAGAATA-AGAAATTTAAAA-AATA--AATCTATT--
* * * ** ** * *
197293 TATTTCAAA-AA-TTGATAAGTTGGAGATT-TAAAAAAATAAATCAATTTATCGAATCAATTCAA
171 TA--CCAAACAAGTTCA-AA--T--AG-TTATGACTATTTGAA-CAA-TTATC---T-ATTTCAA
* ** * *
197355 ATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTTAAAGCATTATGAACTTTTGTTTTCTCATAAAA
222 AT-ATTATGACCTTTTG-----TT-T-T-TCATAAAACAAT-TG----TTT-TTTT-TCAT---A
* *
197420 CAATTGCTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
268 CAA--G-------T--T-------TATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAA
* *
197485 ATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-T---CAAA
315 ATTAATAAGTA-GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * *
197527 --C-CA-A--T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTAT-A---ATT-ATCTG--
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * ** * * * * ** ** * *
197576 A-ACAATTATCTCTTTCAAAACATTATAACCAATTTTTTTGTCATAAAATAATTGGTTTTATTCA
65 ATAAAACAAT-TGTTTCTATTCA-TACAAGC---TTATTCGAAATAAAATAA-T--ACTAATTTA
* * ** * * *
197640 TGCAAGTCTATTTCAAATAAAATAATTTA-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGCAAAAA
122 T-TAA---TATTTC-AA-AAATTAA---AGAA--TAAGAA-ATTT-AAAAAAT-A-AATC---TA
** * ** *
197704 TTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACATA-TTCA--AAAAGTTATG-ACTATTTGAACAATTAT
169 TTTACCAAA-CAA---G--TTC--AA-ATAGTT-ATGACTA-TT-TGAAC-A-AT-------TAT
* ** * *
197765 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTACTT-ATAAAAGCT
213 CTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAAC-AATTGTTT-TTTTTCATACAAGTT
* * * * ** *
197828 TATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATGAAAAAACCAAAAATTAATAAGCA-AAAGTTCTAAAA
274 TATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAGAAA-TT-TAAAA
* * ** *
197892 AATAAATTTATTTACCGAACAAG
337 AATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * * * * * * *
197915 TTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTTTCATCTTTTGTTTTTTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
197979 ATAAAATAATTGTTTCTATTCAAACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * ** * * * *
198044 T-TGAAATTTAAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTCA
130 TCAAAAATTAAAGAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
198108 CGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACAC-TTTGTTTTGTCAAAAAATAATTG
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGAC-CTTTTGTTTT-TCATAAAACAATTG
* ** *** * * *
198172 TTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
256 TTTTTTTTCATACAAGTTTATT-TGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * * * * *
198237 T-A--AGATATTTAAAAACTAAATTTGTTT-GTCGAACCAG
320 TAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAACAAA
* * * *
198274 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * ** * *
198337 ATAAAAAAATTGTTTCTATTCTTACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATACTGCTAAAGTAATCATA-
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
198400 TTCTAAAAATT----AATAAGAGATTTAAAAAATAAATGC-ATTT-GCAGAACTAGTTCAAATAG
129 TTC-AAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAAT-CTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * * ** *
198459 TGAAGACT-GTCGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGAACTTTTGTTTAGTCATAGCATAAT
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTT-TTCATAAAACAAT
*** * * * * * * *
198523 TGTGTCAATTT-AT--ATGCTTATTTGAAAT-AAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATT
254 TGT-TTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * * *
198584 AATAAGCAAAAAATTAAAAAA-AAGTCTATTTACCAAACAAG
318 AATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * *
198625 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
198689 ATAAAATAATTGTTTCAATTCATAAAAGCGTATACTAAATAACATAATATTACTTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** *
198754 TCAAAAAATAAA-AAGT-TGAAGATTTAAAAATATGTAAATTTA-TT--GGATC-AGTTCAAATA
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* * * * *
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** ** *** *
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* * * * * * * * * *
198943 AATAAATAAGAGATTTAAATAATAAATATGCTTATTGATCTAG
318 AATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAA
* * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
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65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
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130 -TCAAAAATTAA-AGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * ** *
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* * * * * * *
199242 GTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATGTTTCAAAAATTAA
255 GTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * * *
199307 TAA--A-AGATTTAATAAATAAATCTATTTACCAAACTAA
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* * * * * *
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1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * ** * * * *
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189 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT-TCATAAAACA
* * * * * * * ** *
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252 ATTGTTTTTTTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * *
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* * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
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* * ** * *
199828 A-TTCAGACAATTATTAAG--TAA-AACATTTAAAAAATAACTCTATTTACTTAATAAATTCAAA
127 ATTTCA-AAAATTA--AAGAATAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * *
199889 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTGTCATAAAACA
188 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTTCATAAAACA
* *** * * *** *
199954 ATTGTTTTTGTTT-ATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTCATTAATATTTTGACAA
252 ATTGTTTTT-TTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAA
* * * * * *
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** * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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130 TC-AAAAATTAAAGAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTA
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Statistics
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * * *
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* *** * * * * *
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* * * * *** *
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* *
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* * ** *
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1 AATCAGTTCAAATAGTTAT-GCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
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* * *
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* * ** ** * * *
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* *
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* * * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * **
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1 AATCAGTTCAAATAGTTATG--CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* ** * * * **
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* * * * * * **
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1 AATCAGTTCAAATAGTTATGCCAAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGT
* * ** * ** ** *
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** * ** * * * *
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128 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * * * * * * **
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* * * ** * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * *
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** * * * * *
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* * *
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1 AATCAGTTCAAATAGTTAT-GCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * ** ** * *
194598 TGGTCATATAGCAAATGTTTATGATCATTTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATCA
65 TTGTCATAAAAC-AATTTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
194663 ATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGA--TAAAAAACAAATCT-GTTTA-TCG
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACT-G
* * * * * * ** *
194712 AA-CTAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATGCCAATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * *
194776 TCTATCATAAAA-ATATTTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTA
64 TTTGTCATAAAACA-ATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
194840 ATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGA-TG
126 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTT-ACTG
* * * * * * * *
194893 AACCAATTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTGGT
1 AATCAGTTCAAATAGTTATGCCAAT-TGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGT
* ** ** *
194957 TTTGTCATAAAACTAA---TTTTCAATTCGTATTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTT
64 TTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTT
* * ** *
195018 ATTAATGTTTCAAAAATGAATAAGTAAGAGATTTAAAAGAATATTTTTGTTTACCT-
125 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATTAGTTTA-CTG
* * * * * * * *
195074 AACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-T
1 AATCAGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* ** * * * * * *
195138 TTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAGTAATACTAATCTATAA
65 TTGTCATAAAAC-AATTTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *
195203 ATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTGAAAAAATAAATCTA-TTTAC-C
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * * ** * * *
195249 AAACTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTG-ACAAATTATTTAGTTCAAATTGTTCTAACTTTTTG
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
** * * * ** * * *
195312 TCCTATTATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATTAACATAATACTATTTTA
63 TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTA
** * *
195376 TTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAA-TATGTTTACTG
126 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTG
* * * * * * * * *
195430 AA-CTAGATCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCGAATCATTATGACTTTTTCT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
195494 TTTGTCATAAAA-GATTTGTTTT-AGTTCATATAAGTTTATTT-AAA-AAAATTAATACCAATTT
64 TTTGTCATAAAACAATTT-TTTTCA--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA-TAATACTAATTT
* * *
195555 ATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATGAATCT-GTTTATTG
125 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * * ** *
195610 AA-CAAGTTAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTATAACCTTTTTG
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTG
* * ** * * * *
195674 TTTTGACATAAAATAATTTTTTCTTTTTATACAAGTTTATTTCAAATTAAATAATA-TAAATTTA
63 TTTTGTCATAAAACAATTTTTT-TCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTA
* * * *
195738 TTAATA--TCAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATCAGTCTA-TTTATTG
126 TTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * * * * **
195792 AATAAGTTTAAA-CGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
1 AATCAGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
** * * * *
195856 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTCATACAAGATTA-TTCAGATTAAAATAATATTAA-TTATT
65 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATT
** * *
195919 AATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTA-TCG
128 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACT-G
* * * **** * * *
195971 AA-CAAGTTGAAATAGTCAAGATTTTTTGAATAATTAACTATTTCTAATCATTATGACCTTTTGT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * **** * * *
196035 TTAGTAATAAAA-AAACAATTTCAATTCAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
196099 TAATGTTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGA-ATAAAAAATGAATCT-GTTTAC-C
127 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* ** * * *
196150 AAACAACCTCAAATAGTTATGACTATCTTAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTG
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATGCCAAT-TGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTG
** *
196214 TTTTGTCATAAAACAA-TTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATT
63 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATT
* * ** * *
196276 GATTAATACTAAAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTTAAAAATAAATAAGTATT-CT-
124 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGT-TTACTG
* * * * * *
196330 AAACACATTCAAATAGTTAT--AAATTTTAAAAATAAATAAGTATTCTAAACACATTCAAAT-AG
1 AATCA-GTTCAAATAGTTATGCCAA--TT--GAA-CAAT---TA-TCT----A-TTTCAAATCA-
* * * * *
196392 TTAT-AACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTAATATCTTTTGTTTCCTCATAAACCAC
50 TTATGACCT-TTTG--T-TTTGT-CA--T-AAA--A--CA-A--TTTT-TTTCATCAT--A-CA-
* * * * *
196456 TTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAA-AATTCTAAAAAT
95 -------AG--C--------TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* *
196520 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAGATAAATTTGTTTACTG
142 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATTAGTTTACTG
* * * * * * ** *
196559 -AGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGA
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * *
196623 CTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
196687 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACT-
127 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTG
* * *** * * * * * **
196739 AAACAAGTTCAAATAGTCAACT-CTGTTTAAACTATTAGCTATTTGAAATCGTTATGATATTTTG
1 AATC-AGTTCAAATAGT-TA-TGCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * ** *
196803 TTTTATCGTAAAACAA-ATTTTTCTATTCATACAAAATTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTT
63 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTT
* *
196866 ATTAATATTTCAAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTA-TTTATTG
125 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * *** *
196917 AACCAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATAAAAAATCATTATGATC-TTT-TT
1 AATCAGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** * * * *
196980 TTCTCATAAAATAATTGTTTATGTCAT-ATTTAAGCTTAATTCAGAGTAAAAT-ATAGCTAAATT
65 TTGTCATAAAACAATT-TTT-T-TCATCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA-CTAATTT
* ** *
197043 AATAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTGCTG
125 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * *** * * * * *
197098 AACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAAGTAGCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTT
1 AATCAGTTCAAATAGTTATGCCAATT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * **
197163 TAGTCATAAAATAA-TTGTTTCAATATATACAA--TTATTT-ATTTAAAATCATTATGACCT--T
65 TTGTCATAAAACAATTTTTTTC-AT-CATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT-A--AT-A-CTAAT
* * * * * * * ** *
197222 TTGTT-TTATCATAAAATAAGTGT-TTCAGTTCATTAAATCTTATCCAAAATAAAATAATATTAC
123 TTATTAATAT-TTCAAA-AA-T-TAATAAG-T-A--AGAGATT-T----AA-AAAATAA-ATTAG
*
197285 TTTA-TT
173 TTTACTG
* * * * * *** ** *
197291 AAT-ATTTCAAA-AATTGAT---AAGTTGGAGATTTAAAAAAAT-AAATCAATTTATCGAATCAA
1 AATCAGTTCAAATAGTT-ATGCCAA-TTGAACAATTATCTATTTCAAATC-A-TTAT-G-A-C-C
** * * ** * * * * ***
197350 TTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTTAAAGCATTATGAA-CTTTTGTTTTCTC
58 TT----TTGTTTTG-TCA-TAAAACAA-T-T-T-TTTT-CATCA-TA-CAAGC--TT-ATTTGAA
* * * * * *
197414 ATAAAACAATTGCT--TTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTA-AT
107 ATAAAATAA-TACTAATTT-AT--T--AA---TATTT--CA-AAAAT--TAATAA-GTA--AGAG
** * *
197476 ATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATA
155 ATTT--AAAA--AATAA--ATTAG-TTT----ACTG
* *** * * * *
197512 AATCTA-TTTATCAA-ACCAATTCCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT-A---ATT
1 AATC-AGTTCA--AATAGTTATGCC-AATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * ** * * * * * * ** *
197571 -ATCTG--A-ACAATTATCTCTTTCAAAACATTATAACCAATTTTTTTGTCATAAAATAATTGGT
62 GTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC--ATCA-TACAAGC---TTATTTGAAATAAAATAA-T--A
* * * * * * * * * **
197632 TTTATTCATGCAAGTCTATTTCAAATAAAATAATTTAAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTAAGA
118 CTAATTTAT-TAA---TATTTC-AA-AAATTAA--T-AA-GTA--AGAGATTTAAAAAATAAATT
*** * *
197696 AGCAAAAATTT
171 AG--TTTACTG
* ** * * * *
197707 AA-AAAAT-AAATTTGTT-TTCTAAACATATTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
1 AATCAGTTCAAA-TAGTTATGC----CA-ATTGAACAA-TTAT--CTATTT---C-A--A---A-
* * *
197769 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAA-TTGTTTCTACTTATAAAAGCTTATT
47 -TC--A---TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATT
* * * * *** * *
197832 CGGAATAAAATAATACTAATTTATGAAAAAACCAAAAATTAATAAGCAAAAG-TTCTAAAAAATA
103 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATA
*
197896 AATTTA-TTTACCG
167 AA-TTAGTTTACTG
* * * * * * * *
197909 AA-CAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTTTCATCTTTTGT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * **
197973 TTTTTTATAAAATAA-TTGTTTCTATTCAAACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * ** *
198037 TAATATTTTGAAATTTAAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCG
127 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * *
198090 AATAAGTTCAAATAGTCACGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACAC-TTTGT
1 AATCAGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGT
* * ** ** *
198154 TTTGTCAAAAAATAATTGTTTTT-ATTCATACAAAATTATTCAAAAATAAAATAAAACTAATTTA
64 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-TCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
198218 TTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAACTAAATTTGTTT-GTCG
126 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACT-G
* * * * * *
198268 AACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTT
1 AATCAGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * ** *
198332 TTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTATTCTTACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATACTGCTAAAGTAA
65 TTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
198395 TCATA-TTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGCA-TTTGCAG
127 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * ** * * ** * *
198444 AA-CTAGTTCAAATAGTGAAGACTGTCGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGAACTTTTGTT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATGCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* ** * * * * * * *
198508 TAGTCATAGCATAA-TTGTGTCAAT-TTATATGCTTATTTGAAAT-AAATAATACTATTTTATTA
65 TTGTCATAAAACAATTTTTTTC-ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
198570 ACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAA-AAAATTAAAAAA-AAGTCTA-TTTAC-C
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* * * * *
198618 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
198683 TTTATCATAAAATAA-TTGTTTCAATTCATAAAAGCGTATACT-AAATAACATAATATTACTTTA
64 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTAT-TTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * ** * * *
198746 TTAATATTTCAAAAAATAAAAAGT-TGAAGATTT-AAAAATATGTAAATTTATTG
126 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTG
* * * * *
198799 GATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGAACTTTTGTT
1 AATCAGTTCAAATAGTTAT-GCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* ** *
198864 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTA
65 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
198929 ATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAATAATAAA-TATGCTTATTG
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTACTG
* * * *
198980 -ATCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
199044 TTTATCATAAAACAATTATTTATCTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAGTACTAATCTAAT
64 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * **
199109 AATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCA
128 AATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTG
* * * * * * * * * * ** * **
199161 AACCAATTTAAATATTTAAGACGATATGGATAATTATCTATTCCAAATTTTTATAATTTTTTGTT
1 AATCAGTTCAAATAGTTATGCCAAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * ** * * * * *
199226 TTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTA
65 TTGTCATAAAAC-AATTTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
199291 ATGTTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAATAAATAAATCTA-TTTAC-C
129 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * * * * * ** * *
199337 AAACTAATTC-AATAAGTTATAACTATTTGATCAATTATTTATTTCTAATGGTTATGACCATTTC
1 AATC-AGTTCAAAT-AGTTAT-GCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
** * * * * * * *
199401 TTTTGTCATAAAATGA-TTGTTTCTATTATTGCAATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTA
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* *
199465 TTAATATTAT-GAAAATTAATAAGTAATAGATTT-AAAAA-AAATCT-G-TTAGCTTG
126 TTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-C-TG
* * * ***** * ** * *
199518 -ACCAATGCAAATAGTTATAATTGTTTGAACAGTTATCTATTTCAGGTCATTAAGACCTTTTATT
1 AATCAGTTCAAATAGTTAT-GCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
199582 TTGTCACAAAA-AAATTGTTTCTATTCGTACAGGCTTATTAGGAATAACATAATCCTAATTTATT
65 TTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* *
199646 AATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTA-TTTA-TC
128 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * * * * *
199693 AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAAATCACTATAACCTTTTG
1 AATC-AGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTG
* * * * * *
199758 TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTATTAATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAACTTA
63 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
199823 TTAATA-TTCAGACAATTATTAAGTAAAACATTTAAAAAATAACTCTA-TTTACTT
126 TTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTG
* * * * * * * *
199877 AATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG-T
1 AATCAGTTCAAATAGTTATG-CCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
** * * * * *
199941 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATATTAATTCATT
65 TTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * * *
200005 AATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATACA-T-GTCTACTG
128 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTG
** * * * * * *
200055 AA-CAAGTTTGAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGGT
1 AATC-AGTTCAAATAGTTAT-GCCAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
** * * * * *** *
200119 TTCATCATAAAACAA-TTATATCAATTCATATAGGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *
200183 TAATA-TTCTAAAAATTAATGACTAAGAGATTTAAAAAAT
127 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
200222 GAATCAATTT
Statistics
Matches: 6831, Mismatches: 1654, Indels: 1226
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
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168 4 0.00
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66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * *
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* * * * * * * *** *
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* ** * * * *
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* * * * * **
191438 TACTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCATATT
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* ** * * * * *
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* * * ** * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** *
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* * * * ** * *
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1 AGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
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* * * *
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* ** ** * * *
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1 AG-TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
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65 TCAT-AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
192158 TA-TTCTAAAAATTCATAATTAAGAGATTTAAAAACTAAATTCGTTTGCCAAACC
128 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* ** * *
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1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATA
* * * * *
192341 TTTCAAAATTTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTATCGAACC
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* * * **
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1 AGTTCAAATAGTTAAG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * ** *
192457 TCATAAAAAAATTATTTTTGTTCCTATAAGTTTGCTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAG
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* * * * *
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* ** * ** ** *
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* * * ** * * *
192637 TCATCAAACAATTGGTTT-TGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 TCATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * ** * * * ** * * *
192701 ATTTTGAAACTTAATAACCAAGTA-AATTAAAAGATAAATCTAATTGCTAAACT
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * * ** *
192754 AGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAAC-ATCA-AT-TTTCAAACCGTTATGACAATTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
192816 CATAAAATAAATT-TTT-TGTTCGTACAAGCTTATTAAGATTAAAGTAATACAAATTTGA-TAAT
66 CATAAAA-CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAAT
* *
192878 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACA
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * * * * * *
192927 AATTTATAT-GATTAATACTATTAGACCAGTTATCTATTTCAAATCATTCT-AGCCTTTTATTTA
1 AGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * ** ** *
192990 GTCATAAATCAATTGTTCCAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAGTTAATACTAATTTATTAAC
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* * * * *
193055 A-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCAAACA
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** * * * * **
193109 AGTTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTGTTTATTTAAAATCGCTATGACCTTTTGTTATT-
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTG
* * * *
193173 TCATAAAACAATTGTTAT-AGTTAATACAAGTTTATATGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * *
193237 ATTTTTAAAATTAGTAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * *
193290 AATT-AAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** * * * *
193354 TATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATAGAAGCTTATCTAAAATAAAACAATACTAATTTATTAAT
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* * ***
193419 ATTTCAAAAATTAATAAGTACGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTAAACC
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* * ** * ** * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
193536 CATAAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATCCTAATATACTAACA
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* **
193600 -TTCAAAATATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATA
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* * * * **
193653 AGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAAT-TACTTAAAATCATTATGATATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * *
193717 TCATAAAACAATTGCTTT-AGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTTTTAAT
65 TCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** *
193781 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTT-TTAAACA
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * ** * * * * * * * *
193834 AATTTAAATAGTTGCGACTACTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCGTTAAGAAAC-TTTGTTTTC
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTG
* * * * *
193898 TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** **
193963 TTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTACTTACCAAATT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * * * * *
194011 AGTTCAAATAATTATG-CAATTTCAATAATTATTTATTCCAAATCATTATGAACATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
194075 CATAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCATATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
66 CATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
194138 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AA--
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * * * *
194188 AG------TAGTT---CCTATTTGAATAATTACCTATTTTAAATCACTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
194244 TATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
194308 -TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAAAC
130 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * ** * *
194360 AGTTTAAACAGTTAAGACTACATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
194425 CATAAAATAATCGTTTTAGTTCTTACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
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130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * * * * * * *
194537 ATTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAATAGTTATCTATTTCAAATCGTTATTACATTTTGTTTGGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * * * *
194602 CATATAGCAAATGTTT-ATGATCATTTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATCAATC
66 CATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
194666 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGA--TAAAAAACAAATCTGTTTATCGAACT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * * ** * * *
194716 AGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
194781 CATAAAA-ATATTTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAA
66 CATAAAACA-A-TTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * **
194844 TATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGA-TGAACC
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* * * * *
194897 AATTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTGGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * *
194961 TCATAAAACTAA-T-TTTCAATTCGTATTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAA
65 TCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * ** *
195023 TGTTTCAAAAATGAATAAGTAAGAGATTTAAAAGAATATTTTTGTTTACCTAACC
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * *
195078 AATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * * *
195142 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT-GAAATAAAGTAATACTAATCTATAAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
195206 TTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAACT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * ** * * * ** *
195254 AGTTCAAATAGTT-TGACTATTTG-ACAAATTATTTAGTTCAAATTGTTCTAACTTTTTGTCCTA
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * *
195317 TTATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATTAACATAATACTATTTTATTAAT
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** * * * ** *
195381 ATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACT
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* * * * * * * * * *
195434 AGATCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCGAATCATTATGACTTTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
195499 CATAAAAGATTTGTTTTAGTTCATATAAGTTTATTTA-AA-AAAATTAATACCAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATA
* * * *** *
195562 TTCCAAAAATTAATAA-TGAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACA
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* * * * ** *
195614 AGTTAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTATAACCTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTG
* * * ** * * *
195679 ACATAAAATAATTTTTTCTTTTTATACAAGTTTATTTCA-AATTAAATAATA-TAAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * *** **
195742 TA--TCAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATCAGTCTATTTATTGAATA
128 TATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * **
195796 AGTTTAAA-CGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
*** * * * *
195860 CATAAAACAATTGTTTTTTTTCATACAAGATTATTCAGATTAAAATAATATTAA-TTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
195924 TTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACA
131 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * * * * *
195975 AGTTGAAATAGTCAAGATTTTTTGAATAATTAACTATTTCTAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *** * * * * *
196040 AATAAAAAAACAATTTCAATTCAAATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATG
66 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
196104 TTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGA-ATAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
** *
196155 ACCTCAAATAGTTATGACTATCTT-AACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
196218 GTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTGATTA
64 GTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* ** * ** *
196281 ATACTAAAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTTAAAAATAAATAAGTATT-CTAAACAC
127 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT-TTACCAAAC-C
* * * *
196336 A-TTCAAATAGTTATA-AAT-TTTAAAAATAAATAAGTATTCTAAACACATTCAAAT-AGTTAT-
1 AGTTCAAATAGTTA-AGACTATTT--GAA-CAAT---TA-TCT----A-TTTCAAATCA-TTATG
* * * * * * *
196396 AACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTAATATCTTT-TGTTTCCTCATA-AACCACTTG
52 ACCT-TTTG--T-TTTGT-CA--T-AAA--A-CAAT-TGTTTCAG--T--TCATACAA--GCTT-
* * * * *
196459 TTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAA-AATTCTAAAAATTAA
98 ATTTAG--AATAAA-----------------ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
* ** * *
196523 TAAGTAAAAGATTTAAAAAGATAAATTTGTTTACTGAGCG
143 TAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATTTGTTTACCAAACC
* * * * ** **
196563 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGACTTGT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
196628 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
196691 A-TTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACTAAACA
129 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
* ** * * * * * * ** *
196744 AGTTCAAATAGTCAACTCTGTTTAAACTATTAGCTATTTGAAATCGTTATGATATTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** *
196809 CGTAAAACAAATT-TTTCTA-TTCATACAAAATTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAA
66 CATAAAAC-AATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ***
196871 TATTTCAAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTGAACC
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* * *** * *
196921 AGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATAAAAAATCATTATGATC-TTT-TTTTCT
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* * * * * *
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** * * **
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*
197167 CATAAAATAATTGTTTCA
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197185 ATATATACAA
Statistics
Matches: 4696, Mismatches: 1095, Indels: 526
0.74 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
167 5 0.00
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * ** ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * * * * **
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* * * * * *
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* * ** * *** * *
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507 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGA-ACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* * * ** ** * *
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571 ACCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTT-GTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGC
* ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * ** * * **
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* * * *
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* ** *
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* * * * ** * *
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* * * **** * ** *
191918 ATCATAAAACAATTCTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
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* * * *
191983 ATTTCAAGAA-T--T-AGAAGAGATTT-AACAATAAATTTGTTTATCGAA-ATAGCTTAAATAGT
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** * * * *
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193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * * *
192107 TATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTC
258 T-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* *** * * * *
192172 ATAATTAAGAGATTTAAAAACTAAATTCGT-TTGCCAAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTA-TAA
322 ATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAA-TC-TATTTATAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * * **
192235 GAACAATTATCTATTT-TAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAGACAATTATTTCAGCTC
384 -AACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTC
* * * * * *
192299 ATATAAGTTTATTTAGAATAAAATATAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGTAAGAG
447 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATA-AACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
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* ** * * * **
192427 TATTTCAAATCATTATTATTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTTGTTCCTATAAGTTTGC
574 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAAAA-TGTTTTTGTTCATATAAGCTTAT
* * *
192492 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAGATTT-AGTAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGT
637 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--AGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
192556 AAATTTGTTTGCCAAA-TCATTTCAAATAGTTTTGAC-ATATGAGTAATTATCTATTTC-AGTTC
698 AAATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATATGA-AAATTATCTATTTCAAATT-
* * * * * ** *
192618 ATTATAACTTATTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAA
760 ATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAA
* ** * * * ** *
192683 TAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGTAAA-TTAAAAGATAAATCTAATTG
824 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
*
192747 CTAAACT-
888 CCAAA-TA
* * * * * * * * *
192754 AGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAA-CA---TCAATTTTCAAACCGTTATGACAATTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAA-TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
* * * * * *
192815 TCATAAAATAAATT-TTTT-GTTCGTACAAGCTTATT-AAGATTAAAGTAATACAAATTTGA-TA
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* * * *
192876 ATATTTCAAAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTTATATGA
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* * * ** * * *
192938 TTAAT-ACTATTAGACCAGTTATCTATTTCAAATCATTCTAGCCTTTT-ATTTAGTCAT--AAAT
192 TT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAAT
* * ** ** * *
192999 CAATTGTTCCAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAGTTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAA
255 -AATTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* *
193064 ATTAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATTACT
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* *
193128 ATTTAAACAATTGTTTATTT-AAAATCGCTATGACCTTTTGTTATT-TCATAAAACAATTGTTAT
379 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATT-TT-T
* * * * ** *
193191 -AGTTAATACAAGTTTATAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTTAAAATTAGTAA
441 CAATTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
193254 GTAAAAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATCAA-TTAAATAATTATGGCAATTTGAACAA
504 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAA
* * * * * *
193318 TTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATAGA
569 TTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATG-TTTTTGT-TCATATA
* * * *
193383 AGCTTATCTAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACGAGATTTA
630 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTA
* ** * * ** *
193448 AAAAATAAATGTGTTTGTTAAACCAGCTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTATCTATTTCA
692 AAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCA
* * ** * * * * *
193513 AATTTTTCTAACCATTT-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTTAGAA
756 AATTATTATAACTTTTTGTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * * *
193576 TAAAATAATCCTAATATACTAACA-TTCAAAATATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATT
819 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGCAAGAAATTT-AAAAAATAAATC
193640 TGTTTACCAAATA
882 TGTTTACCAAATA
* * * * * *
193653 AGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAATT--ACTTAAAATCATTATGATATTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT--TTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTT
* * * * * * *
193716 GTCATAAAACAATTGCTTTAGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTTTTAAT
64 GTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * *
193781 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTT-TTAAACAAATTTAAATAG
129 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAA
** * * * * * * * * *
193845 TTGCGACTACTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCGTTAAGAAAC-TTTGTTTTCTCAT-AAAACA
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT-ATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATA
* * * * *
193908 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAAT
256 ATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * ** * * *
193973 TAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTACTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATG-CAATTT
320 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
194033 CAATAATTATTTA-TTCCAAATCATTATGAACATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC-A-
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA---TTTTTCAAT
* **
194095 TCATACAAGCATATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
445 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * *
194160 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-----ACC-A---AAGT-AGT-T-CCTATTTGAATAATTACC
509 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACC
* * * * * * ** * *
194213 TATTTTAAATCACTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAACTTAT
574 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTAT
* * *
194278 TCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT
637 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * *
194342 AAATTTGTTTGCTAAAAC-AGTTTAAACAGTTAAGACTACATGAACAATTATCTATTTCAAATCA
698 AAATCTGTTTGC-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTA
* * * * * *
194406 TTATGAAC-TTTTGTTTTTTCATAAAATAATCGTTTTAGTTCTTACAAGCTTATTTGAAATAAAA
761 TTAT-AACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAA
* * * * *
194470 TAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--TG--ATTTAAAAAGTGAATCTCTTTAC
824 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
*
194531 CAAATC
889 CAAATA
* * * * * * * * *
194537 ATTTCAAATAGTTATGGCCATTTCAATAGTTATCTATTTCAAATCGTTATTACATTTTGTTTGGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * *
194602 CAT-ATAGCAAATG-TTTATGATCATTTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATCAAT
66 CATAAAAG-AATTGTTTTA-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
194665 CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGA--TAAAAAACAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAAT
129 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT
* * * * * *
194728 TATGACTATTAGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAATATT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * *
194793 TATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTA
258 T-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * * * * * *
194858 ATAACTAAGAGAATTAAAAATAAATTTGTTTGATGAACCAATTCAAATATTTAAGACTATATGAA
322 ATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTT-ATAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAA
* * *
194923 CAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACTAA-TTTTCAATTCGTA
386 CAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTCAATTCATA
** * * * *
194986 TTAGCTTATTCAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATGTTTCAAAAATGAATAAGTAAGAGATT
450 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAAACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
** * *
195051 TAAAAGAATATTTTTGTTTACCTAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTACCTATT
514 TAAAA-AATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTATT
* * *
195116 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAA
578 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * *
195181 ATAAAGTAATACTAATCTATAAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTGAAAAAATAAATCTATT
642 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * *
195245 TACCAAACTAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGACAAATTATTTAGTTCAAATTGTTCTAACTTT
707 TGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGA-AAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTT
* * * * *
195309 TTGTCCTATTATAAAACATTTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATTAACATAATACTATT
771 TTGT-TTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAA-TAAAATAATACTAAT
** * * * * *
195373 TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACT-
834 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAATA
* * * * *
195434 AGATCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCGAATCATTATGACTTTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * *
195499 CATAAAAGATTTGTTTTAGTTCATATAAGTTTATTTAAAA-AAATTAATACCAATTTATTAATAT
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
195563 TCCAAAAATTAATAATGAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAACAAGTTAAAATAATTA
131 TTCAAAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTA
*
195628 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTATAACCTTTTTGTTTTGA-CAT-AAAATAAT
195 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTGTTTT-ATCATAAAAATAA-
* * * *
195691 TTTTTCTTTTTATACAAGTTTATTTCA-AATTAAATAATA-TAAATTTATTAATA-T-CAAGACA
257 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAA-A-A
* * * * * * *
195752 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATCAGTCTATTTATTGAA-TAAGTTTAAA-CGTTATGACTA
318 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* ***
195815 TTTAAACAATTATTTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTT
380 TTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAA
* * * ** *
195879 TTCATACAAGATTATTCAGATTAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA
444 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
195943 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTGAAATAGTCAAGATTTTTTGAATAATTA
508 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA
* * * ** *** *
196007 ACTATTTCTAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTAATAAAAAAACAATTTCAATTCAAATAAGCTT
572 CCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAAAAA-TGTTTTTGTTCATATAAGCTT
* * * *
196072 ATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATGTTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGA-ATAAAAAA
635 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--AGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** * * *
196136 TGAATCTGTTTACCAAACAACCTCAAATAGTTATGACTATCTTAACAATTATCTATTTCAAAATA
697 TAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTA
* * * * * * * **
196201 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAAT
761 TTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAAT
* * ** * * * *
196266 AATA-TAAATTGATTAATACTAAAAAAATTAATAAGTAAG-AATTTTAAAAATAAATAAGTATTC
825 AATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAAT--CTGTT-
196329 TAAACACATTCAAATAGTTATAA
886 T----AC---C--A-A---AT-A
* * * * *
196352 ATTTTAAAAATAAATAAGTATTCTAAACACATTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCCA
1 A-GTT-----CAAAT-AG--TTAT-GAC-CATT----T-G-----A--A--T-AAT--TT-TCAA
** ** * * * *
196417 TTTCAAATCATTAAT-ATC-TTTTGTTTCCTCATAAACCACTTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTAT
37 TTTCAAATCATT-ATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTAT
** * * *
196480 TCGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAGA
100 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAA-A
* * * * * * *
196544 TAAATTTGTTTA-CTGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATC
162 TAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* ** ** * * * *
196608 GTTATGATTTTTTGACTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAA
226 GTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAA
* * * *
196671 AATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
289 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTT-AAAAATAAATCTATT
* * *** * * ** * **
196735 CACTAAA-CAAGTTCAAATAGTCAACTCTGTTTAAACTATTAGCTATTT-GAAATCGTTATGATA
352 TA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACC
* * * **
196798 TTTTGTTTTATCGTAAAACAAATTTTTCTATTCATACAAAATTATTCA-AATTAAAATAATACTA
415 TTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA-ACTA
* * * ** *
196862 ATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATTGAACCAG
477 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA
* ** * * *** * *
196923 TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATAAAAAATCATTATGATCTTTT-TTTCTCAT
542 TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCAT
* * * * * * *
196987 AAAATAATTGTTTATG-TCATATTTAAGCTTAATTCAGAGTAAAAT-ATAGCTAAATTAATAATA
607 AAAA-AAATGTTTTTGTTCATA--TAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA
** * ** *
197050 TTAAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTT
667 TTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * *
197115 AAGATTAT-TAGAATAAGTAGCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT
729 ATGACTATAT-GAA-AATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTTGTTTA-TCATAAAACAATT
*** ** * *
197179 GTTTCAATAT-ATACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGT
791 GTTTTTGT-TCATACAA--GCTTATTTAAAAT-A--A--A-----------AT-A-ATACTAA--
* * **
197243 GTTTCAGTTCATTAAATCTTATCCAAAATAAAATAATATTA-CTTTATTAATATTTCAAAAATTG
833 ---T---TT-ATT-AATATT-T-C--AA-AAATTAATA--AGC---AAGAA-ATTT-AAAAA---
* **
197307 ATAAGT-TGGAGATTTAAAAAAATA
875 ATAAATCT---G-TTT-ACCAAATA
* * ** * *
197331 A-ATC-AAT--TTATCGAATCAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTTAAAG
1 AGTTCAAATAGTTAT-G-A-CCATTTGAATAATT-T-TCAATTT---C-A--A---A---T----
* * * * ***
197392 CATTATGA-ACTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAAT
45 CATTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTG-TTTT-AGTTCATATAAGCTTATTCAAAAT
* * *
197454 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
107 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * *
197519 TTATCAAACCAATTCCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAATTATCTGAACAATTA
171 TTATCGAA-CAA-----GTTT--A-AA-TA---A-TT---ATGA--CT-A-T-T-TGAACAATTA
* *** * * *
197584 TCTCTTTCAAAACATTATAACCAATTT-TTTTGTCAT-AAAATAATTGGTTT-TATTCATGCAAG
213 TCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTGTTTTATCATAAAAATAATT--TTTCTATTCATACAAG
* * * * *
197646 -TCTATTTCA-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGCAA-AAATTT
275 CT-TATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * *
197707 AAAAAATAAATTTGTTTTCTAAA-CATATTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
337 -AAAAATAAATCT-ATTTATAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTT
* *
197771 C-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTACTT-ATAAAAGCTTATTC
399 CAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATT-TTTC-AATTCATACAAGCTTATTC
* * * *** * *
197833 GGAATAAAATAATACTAATTTATGAAAAAACCAAAAATTAATAAGCAAAAG-TTCTAAAAAATAA
461 AGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAA
* * * * * * **
197897 ATTTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATT
524 ATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * * * * * **
197961 TTCATCTTTTGTTTTTTTATAAAATAATTGTTTCTATTCAAACAAGTTTATTCAAAATAAAATAA
588 ATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
** * * * *
198026 TACTAATTTATTAATATTTTGAAATTTAAG-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG
651 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAA----GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCA
* * * * * * * *
198090 AA-TAAGTTCAAATAGTCACGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACACTTTGT
712 AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTATTAT-A-ACTTTTT
* * * * ** * *
198154 -TTTGTCAAAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAAATAAAATAAAACTAATTTA
773 GTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * ** * **
198218 TTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGATATTTAAAAACTAAATTTGTTTGTCGAACC
837 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
* * * * * *
198272 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATG--ATCTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTG
* * * * * * * ** * *
198335 TCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCTTACAAGCTTATTCAGAGTAAAATACTGCTAAAGTAATCAT
65 TCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*** * * * *
198399 A-TTCTAAAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAAATAAATGCATTT-GCAGAACTAGTTCAAATAG
129 ATTTC-AAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTTAAATAA
* * * * * * **
198459 TGAAGACT-GTCGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGAA-CTTTTG-TTTAGTCAT-AGCAT
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAAT
* * * * * * *
198520 AATTGTGTCAATT--TATATGCTTATTT-GAA-ATAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAA
255 AATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * * *
198581 ATTAATAAGCAA-AAAATTAAAAA-AAAGTCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA
318 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAA-TCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
198643 TTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAA
380 TTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAA
* * * * * * * *
198707 TTCATAAAAGCGTATACTA-AATAACATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAAATAAAAAGT-
444 TTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
198770 TGAAGATTTAAAAATATGTAAATTT-ATT---GGATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACA
507 AG-AGATTTAAAAA-A--TAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATA
* * * * ** *
198831 ATTATCTATTTCAAATCATCATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAA
568 ATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAA
* ** * *
198896 GCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
631 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAA
* * * **** * * *
198961 ATAATAAATATGCTTATTGATCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAA
693 AAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAA
* * * * * **
199026 ATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATCTTCATACAAGCTTATTCGAAATA
757 ATTATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATA
* * * * * *
199091 AAATAGTACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
821 AAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGC-AAGAAATTTAAAAAATAAATCTG
* *
199154 TTTGCCAAACCA
884 TTTACCAAA-TA
* * * * * * * * * ** * ** *
199166 A-TTTAAATATTTAAGACGATATGGATAATTATCTATTCCAAATTTTTATAATTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * ** * * *
199230 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATGT
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
199295 TTCAAAAATTAAT-A-AA-AGATTTAATAAATAAATCTATTTACCAAACTAA--TTCAATAAGTT
131 TTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAC-AAGTTTAAATAA-TT
* * * * * * * * * *
199355 ATAACTATTTGATCAATTATTTATTTCTAATGGTTATGACCATTTCTTTTGTCAT-AAAATGATT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAATT
* * * * * ***
199419 GTTTCTATT-ATTGCAATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTATGAAAATTA
259 -TTTCTATTCA-TACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * ** * * * * *
199483 ATAAGTAATAGATTTAAAAA-AAATCT-GTTAGCTTGACCAATGCAAATAGTTATAATTGTTTGA
322 ATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTA--TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAA
* * ** * * * * * * *
199546 ACAGTTATCTATTTC-AGGTCATTAAGACCTTTTATTTTGTCACAAAAAAATTGTTTCTATTCGT
385 ACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTCAT
* * *
199610 ACAGGCTTATT-AGGAATAACATAATCCTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA
449 ACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
199670 TTTAAAAATTAAATCTATTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTA
512 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTA
* * * * * * *
199734 TTTCAAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTATTAATACAAGCTTAT
576 TTTC-AAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTT-TGTTCATATAAGCTTAT
* * * * * *
199799 TTCAATTAAAATAATACAAACTTATTAATA-TTCAGACAATTATTAAGTAAAACATTTAAAAAAT
637 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-A-AA--ATTAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * * **
199863 AACTCTATTTACTTAA-TAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCG
698 AAATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTA
* * * * * *
199927 TTATGACTTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCATATTAAAATA
761 TTATAACTTTTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATA
* * ** * * * * * *
199992 ATATTAATTCATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATACA--TGTCTACT
826 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* *
200054 GAACA
890 AAATA
** * * * * * * * **
200059 AGTTTGAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGGTTTCAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
200124 CATAAAACAATTATATCAATTCATATAGGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * *** *
200188 TTCTAAAAATTAATGACTAAGAGATTTAAAAAATGAATCAATTTATCGAGCAAGCTTATTTGAAA
131 TTC-AAAAATTAAT-AAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAG----TTT-AAA
* * *** * ** * **
200253 TAAAATAAT-ACTAATTTATTAAC-ATTCAAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTGAAAAAATAAAT
189 T--AATTATGACT-A-TT-TGAACAATT--ATCTATT--T--CAAATTG--TT-ATAACCT---T
* ** * * * *
200316 TTG-TTTACTGA-AAAAATTTAAAAAGTTATGACTATT-TTAACAA--TTA--TCGATTTCAAAT
237 TTGTTTTA-TCATAAAAA--T---AA-TT-TTTCTATTCAT-ACAAGCTTATTTAGA-ATAAAAT
** * ** ** * * ** ** * *
200374 CGTTACGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGGTTCGTAAAAGCTTATCCACAATAA
292 -AATACTAATTTATTAATAT-TC--CAAA-AA-----TTAATAAGTAAGAGATT-T--A-AA-AA
* * ** * * ** * * *
200438 AATAATACTATTT-TATTATTATTTTAAA-AGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGT
342 TA-AAT-CTATTTATA-AACCAATTCAAATAGTT-AT--G--A-CTATTTAAACAATTATTTA-T
* * * * ** * * * **
200501 TT-ATTGAATTAGTTCAAAT-A-ATTATGGCCATT-TGA-ACAATTATCTA-TTTTAAATTGTTA
397 TTCA---AAATCGTT---ATGACCTT-TTG-TTTTGTCATA-AA--A-CAATTTTTCAATTCATA
* * ** * * * ** *
200560 TGAA-CTTTCGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTCATAATACAAGTCTATTCGAAAGAA--AA
450 -CAAGC-TT-ATTCAG-AATAAAATAAACT-AATTT-AT--T--AA-TAT-TTC-AAA-AATTAA
** ** * ** * ** * * **
200621 TAA-TACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATA-AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATA-TA
501 TAAGTAAGAGATTTA--AA-AAAT--AAATTTGTTTACCG-AACCAATTTAAATAATTATGACTA
* * * * ** ** *
200681 CTTAAAAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTGTAACC
560 TTTGAATAATTACCT-ATT--------------T---C----A-A-A--TC--ATT-ATG--ACC
* * * * *
200746 TTTTGTTTTATCATAAAACAAT-TATTTATCTTCATACAAG-TGTATTTAAAATAAAATAATACT
594 TTTTG-TTTGTCATAAAAAAATGT-TTT-TGTTCATATAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
200809 AATATAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTCAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCA
655 AATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTA
* * * * * *
200874 TTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGA-TATAACCTTTTGTTTTGT
717 GTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAAT-TATTATAACTTTTTG-TTTAT
* * * * * ** *
200938 C-TCAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAA-AAAATAATGTTAATTTATTGATA
779 CAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
201001 TTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAATAAATAAATCTGTTTACAAAATC
843 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
* * * * * * *
201049 AGTTCAATTATTTATAACAATTTGAATAATTATT-TATTTCAAGTCATTATAACCA-TTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTT
* * * ** *
201112 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTAATATAATCTTATTCAAAATAAGGTAA-AGCTAATTTTTTA
64 GTCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTA
* * * ** *** * * **
201175 ATA-GTCTAAAAATTAGTAAGTAACGA-ACTTAAAAAA-AGAATCCGTTGGCCTAGTC-AGTACA
127 ATATTTC-AAAAATTAATAAG-AA-GAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTATCGA-ACAAGTTTA
* * * ** * * *
201236 AATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTATCTTTTGTTTTTTCAT-AA
187 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * * * * *
201300 AACAATTGTTTCTGTGT-GTACAAGCTGATTTGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCA
252 AATAATT-TTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* * * *
201364 AAAA-T--TAA-TAAGAGATGTAAAAACTAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
315 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTAT-AAACCAA-TTCAAATAGTTATGA
* * *
201424 CTATTTAAATAATTATCTATTTC-AAATC------A-C--TTGTTTTGTCATAAAATAATTCTTT
377 CTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT
* * * * ** * * * *
201479 CTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAACACAAATTTAATAATAATTGGACAACTGAAAA
441 CAATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * *
201543 AATAAAAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
503 AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAA
** ** * * * **
201607 TAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTTTGTTCATGC
566 TAATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAAAAT-GTTTTTGTTCATAT
* * * * *
201672 AAGCTTA-TTCATATTAAAATAATATTAATTTATTAATAGTTCATCAATTAA-TAAGTAAAAGAT
629 AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT--TCAA-AAATTAAGTAAGAGAT
* * *** * * * *
201735 TTTAAAAATAAATATGTTTATAGAAAAT-GTTCAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTAT
689 TTAAAAAATAAATCTGTTT-GCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTAT
* ** * * * * * * * *
201799 TTCGAACCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAAAAATTGTATTAGTTCATA-TAGAATTA-CT
752 TTCAAATTATTATAACTTTTTGTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTT
* * * * * * *
201862 CAAA-AAATTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAA
815 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * *
201926 TATATTTACCGAACA
880 TCTGTTTACCAAATA
* * * * * *
201941 AGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AATACT-A-ATTTAT-TAAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTA-TGACATTT-TGT--T
* * * * *** * * * * *
202002 AT-TCAAAAAATTAATGAGTAAGATTTA-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
62 TTGTCATAAAA-GAAT---T--GTTTTAGTTCATAT-AA---GCTTATTCAA-AA--TAAAATA-
* * * ** * *** * *
202065 ATTTGAC-AATTTAAACAATTATCTATTTC--TAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-
113 A--T-ACTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGA---AGAG-ATT-T-AAAAAAT
* * * * * * * * *
202126 CAA-TTGTTTTAATTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAATAAT-ACTATTTTTTTAATATTTCAA
163 AAATTTG-TTT-A-TC-GAACAA-GT-T-T-AAAT--AATTATGACTA---TTTGAACAATT-AT
** * ** * *** **
202189 AAATTAGCAAGCAAGAGATT-TAGAGACTAAAGCTATTT-TCCA-AACCAGTTTAAATTGTTATG
214 CTATT-TC-A--AATTG-TTATA-A-CCTTTTG-T-TTTAT-CATAA--A-AAT-AATT-TT-T-
* * * *** * *
202251 ACTATTTGAACGAATATCAATCTCAAATTTTTATGATCTTTCTTTTCCTATAAAAC-AATTGTTT
262 -CTA-TT---C--ATA-CAAGCT----TATTTA-GA--------ATAAAATAATACTAATT-TAT
* ** * * * * * ** *
202315 CTAATCATAT-GAGTTTATTTGGATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAA-AAATTAATAA
305 -TAAT-AT-TCCA--AAAATT-AAT-AAGTAAGA--GATTTAA-AA-A-T-AAATCTATTTATAA
* * * * *
202378 GA-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTTTAGAATATTTA
357 -ACCAATT--CAAAT--A---G-TT-ATG-A-C---T---AT--TTAA-AC---A-----A-TTA
* * * *
202442 TCTATTTC-AAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTGTTTCAATTCATACAAGC
392 TTTATTTCAAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTCATACAAGC
** * * * * * *
202505 TTATTTGGAATAAAACAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAA
455 TTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
** * * * * * * * *
202569 AAATAAAACTATTTA-CTAAACAATGTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAA
518 AAATAAATTTGTTTACCGAACCAAT-TTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAA
* * * * * **
202633 ATCATTATGACCATTTAT-TTTGTCATAAAGTAATTGTTTTAGTTCATAAAATCTTA-TCCAAAT
582 ATCATTATGACC-TTT-TGTTTGTCATAAA-AAAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT
* * * **
202696 AAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAAT
644 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * * * *
202760 TTACCAAAAC-AGTCCAAATAATTATGGCCATTTGAACA--A-CTA--TC----TA-T-T-ACCT
706 TTGCC-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTT
* * *** *
202812 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
770 TTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
202877 TTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG--AG--TTTTAAAAAATATATTTATTTATCGAACT-
834 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAATA
* * ** ** * * *
202934 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA-TTACTTTTTCAAATTGTTATGACCTTTTTGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTG
* * * *
202998 TCATAAAATAATTG-TTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAT
65 TCATAAAAGAATTGTTTTA-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * * * *
203062 TTTTGAAAAA-TAATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACCAA-TTCAAACA
129 ATTTCAAAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-CAAGTTTAAATA
* ** * * * * * * *
203124 ATTAAGACTAGATGAACCATTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTAT-AAAACA
191 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATA
* * * * * * * * *
203188 ATTATTTC-AGCTCATATAAGCTTATTCAAAATATAATAAAACTAGTTT-TTAATATTTCAAAAT
256 ATT-TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
** ** * * * *
203251 TTTTTAAGTAAGAGATTTAGAAAATAGTTCTATTTACCAAACCAGTTCAAATACTTATAACTATT
319 TTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * ***
203316 TAAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTATTA-CTTTAT-TTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTGT
382 TAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAAT
* * * * * * * **
203378 TAATATAAGTTTGTT-TGAAAGAAAATTATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCTGTA
445 TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAA-TAAACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
203441 AGAGATTTAAAAAGTAAATATGCTTATCAAACC-ATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAAAAATT
507 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTT-AAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* ** * * * * * * **
203505 ATCTATTTCAAATTGTTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACT-ATT
571 ACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTGTCAT-AAAAAAATGTTTTTGTTCATA-TAAGC
* * * * * *
203569 TTA-TTCAGAATAAAGTAATATTAATTTAATAATATTT-TAAACTTAAGT-A-A-A-TTAAAAAA
633 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAAA
** * * * * * *
203628 TAAATCTAATTACCGAA-TCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAACT
697 TAAATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATT
* ** * * * * *** * *
203692 ATTATGACCTTTTAATTTGTCGTAAAACAATTG-TATTGTTCCTACAAGCTTATTCGGATTTAAA
760 ATTAT-AACTTTTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAA
* * * * * **
203756 TAATACTAATTTAATAATATTTCACAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGT
824 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
** *
203821 TGAATT
889 CAAATA
* * * * * * * * ** * * * *
203827 AGTTCAAATGGATAAGACTATTAGTATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTATTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * *
203892 TATAAAACAATTGTTTTAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
203956 TTCAAAAAATTAATAACAAAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAATCAAGTTTAAATA
131 TTC-AAAAATTAAT---AAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATA
** * * * * * * *
204020 GCTATTACTATTTGAACAATTGTC----T--AATCGTTATAACCATTTGATTTGTCAT-AAAACA
191 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATA
* * *** * * ****
204078 ATTGTTTCAATT-AGCACAAGCTTAGACAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATCTTTTTGAAA
256 ATT-TTTCTATTCA-TACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
* * * * * * *
204142 TTAATAAGTAAGAAATTTAAACAATAAATCTATTTACTAAATCATTTAAAATAATTATGGCCATT
319 TTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * ** **
204207 TGAATGATTATCTATTT-GAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGA-T
382 TAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATT
*
204270 CATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
446 CATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * **
204334 AGAATTAAAAACTAAATCTGTTTACCGAGCCAATTCAAAT-AGTATGACTATTTGAACAATTTTC
509 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACC
* * * * * * * *
204398 -AGTCTCAAATCATTAAGATCTTTT-TTTTTACCATAAAACAATTTGTTTCTATTCATAAAAGCT
574 TA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGT--CATAAAA-AA-ATGTTTTTGTTCATATAAGCT
** * *
204461 TATTTG-GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
634 TATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAAAA
* * ** * * ** * *
204525 AATAAATGTGCTTGCGGAACCAGTTTAAATAGTTAAAACCAT-TAGAATAATTATCTATTTCATA
695 AATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAA-AATTATCTATTTCAAA
** * * ** * * *
204589 TCGTTATAA-TATTTTATTTAGTCATAAAA-TATT-TATTTCATATCTTACAACCTTATTTAGAA
758 TTATTATAACT-TTTTGTTTA-TCATAAAACAATTGT-TTTTGT-TCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * ** *
204651 TAAAATAATCCAAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCT
819 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTT-AAAAAATAAATCT
** *
204716 GTTTACTGAACA
883 GTTTACCAAATA
* * ** * * * ** * *
204728 AGTTTAAATAGATATGATTATTTGAACAATTATT-TATTTAAAATTGTTATGACCTTTCGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
* * ** * * * *
204792 ACATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATA
65 TCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * *
204857 TTTTGAAAATTAATAAGAA-AGAGTTTAAAATATTAATTTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTT
130 TTTCAAAAATTAATAAGAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATT
* * *
204921 ATGACTATTTG----A--A-C-A--T----TTGTT-T-ACCTTTTGTTTTGTTAT-AAAACAATT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAATT
* * * *
204969 GTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
259 -TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * ** * * * *
205034 TAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCGAATCGGTTTAAATAATTATTG-CCATTTCA
323 TAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTAT-AAACCAATTCAAATAGTTA-TGACTATTTAA
* * * * *
205094 ATAATTATCTGTTTC-AAATCGTTGTTACCTTTTG-TTTG---T------A----T--A-TCATA
385 ACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCAATTCATA
* *
205141 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
450 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
205206 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTCTGACTATTTGAAGAATTGTATACT-
514 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAA-T-TA-CCTA
** * * ** * *
205270 TTAAATCAATTATTTACAAAATAAACCTTTTGTTCTATTGTAAAATAAT-TATTTATGTTCATAC
576 TT---TCAA--A--T-CATTAT-GACCTTTTGTT-TGTCATAAAAAAATGT-TTT-TGTTCATAT
* * *
205334 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTT
629 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * * * *
205399 AAAAATTAAATTTGTTTGTCGAACTAGCTCAAATTGTTAAGACTATACGAACAATTTTTTTATTT
691 AAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AA-TTATCTATTT
* * * * * *** * * *
205464 TAAATTATTATGACCTTTTGGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTCAATTCATACTAGCGTATTCAA
754 CAAATTATTAT-AACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAA
* * *
205528 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAT-AA-
817 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAAT
205590 ----TT--C-----
881 CTGTTTACCAAATA
* * * *
205593 ---T---AT--TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
205650 CATAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATACAAATCTATTAATAT
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
205715 TTCAGAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAAATAAGTCTT-TTTATC-AAGGCAA-TTCAAATATT
131 TTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAA--CAAGTTTAAATAAT
*** * * * * * * *
205774 TATGACTATTTGAGTGATTAAT-TATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTCTCTTAT-AAAATAA
193 TATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAA
* * * * *
205837 TAGTTTCTATTCATACAACCTTATTCAG-ATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAACAATT
257 T-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * * *
205901 AATAAGTAAAAAAATTTAAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTT
321 AATAAGT-AAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTA-TAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
205965 GAATAATTATCTATTTC-AAATTGTTATAGA--TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTATTTTAGTT
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATT
* * * * *
206026 CATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGA
446 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
206091 GATTTAAAAAATGAAA-CTATTTACC-AAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
510 GATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTAC
* ** * * * * *
206154 CTTTTTGGAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT-TTCATCTATTCATACAAGCTT
573 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAAAATGTT--TTTGTTCATATAAGCTT
* * *
206218 ATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTATGATAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAA
635 ATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TCA-AA--AATTAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * *
206281 AATAAATCTGTTTACC-AACAACTTCAAATCGTCATGACTATCTG---A--A-C-A--ACAAATT
695 AATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAAATTATCTATTTCAAATT
** * * * * **
206336 ATTATGGCTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAGCTTAAA
760 ATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAA-AATAAA
* * * * *
206400 ATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAAATAAATATATT
823 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAA-A-TTTAAAAAATAAATCTGTT
*
206464 TACCAAACA
886 TACCAAATA
* * * *** * * * * *
206473 ATTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATAAGCATCCATTTCAAATGACTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * ** * *
206538 AATAAAACAATTGTTTCAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATAAC-AATTTATTAGTA
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * * *
206602 TTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT
*
206667 TATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-----AT-A----TTG--TT-TC-------T-A-
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * *
206710 --TTC-A-TC---CAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTAATTAATATTCCAAAAAATA
258 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * *
206767 ATAAGCAA-A-ATTTTCAAAAATAAA-CTTATTTTTTGAA-CACATTCAAATAGGTATGACTATT
322 ATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAATAAATC-TA-TTTATAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * **
206828 TGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCATTTATTTTGTCAT-AACCAATTGCTTT-TGT
382 TAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--TTTCAAT
** * *
206890 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
445 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * *
206955 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-AGCGAGTTCAATGAGTTATGACTATTTGATTAATTAT
509 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAAT-AATTATGACTATTTGAATAATTAC
* ** * * * * * * *
207019 TTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTA
573 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTA
* * ** * *
207084 TTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAATT
636 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
** * * * ** * * *
207149 AAATCAATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCGTTTGAACTATCATCTATTTCAAACCGT
698 AAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAA---T
* * * *** * *
207214 TATGAT-A-TTTTAT-TTTGTCATAAAATAA-TGTCAAT-TT-AT--TA-C-TATTT-CAA-AAA
759 TATTATAACTTTT-TGTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAA
* *** ** * ** * * ** **
207267 TTAATAAGGATTTAAAAACCAGTTT-AAGTAGT--TAAGCCTATGAGAACAATTATCTATTTCAA
823 ATAATACTAATTTATTAA-TA-TTTCAAAAATTAATAAG-C-A--AGAA-ATTTA-AAAAAT-AA
* * *
207329 AT-TGTTCTGACCTTTTATTT
879 ATCTGTT-T-ACC---AAATA
* * * ** * * * ** *** *
207349 AGTTATAAAATAATTGT-TTCAGTT-CATAAATGCTT--A-TTCAAAAT-AAAAT-A-AAACT-A
1 AG-T-TCAAATAGTTATGACCATTTGAAT-AAT-TTTCAATTTC-AAATCATTATGACATTTTGT
* * ***** * * * * * *
207405 ATT-T-AT-AAA-CATTCAAAAAATT-A-ATAAGC--A-TGAAACTAAAA-AA-AATAAATCTGT
61 TTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * ** * * * * *
207459 T--TA--TCGAACAAGTTTAA-ATAGCTATGCCTATTTGAACAAT-TATTTATTTA---AA-ATT
125 TAATATTTC-AA-AA-ATTAATA-AG--AAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA-A
** * *** ** * ** * * * * * *
207514 GTTATGACCT-TTTATTTTTA-TCAAAAAACAAT-TGTTTC--AGTG-CATGAAAGC--TT-ATC
182 GTT-T-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT--AACCTTTTGTTT
* ** * * * ** *
207570 CAAAAT-AAAATAATATTACTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGTGATTTAAAA-AATA
243 TATCATAAAAATAATTTTTC-TATTCATA---C-AAGCTT-AT---TTA--GA-ATAAAATAAT-
* * * * ** * * *
207633 AATCAGTTTATCGAATCAGTT-C--AAA-TAATTA-T-AGCCATTTGAATAAT-TATCTATTT-C
295 ACT-AATTTAT-TAAT-A-TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTAT
* * * * * * * * ** *
207690 AAATC-ATT-ATGA-ACTT-TTA-TTTTGTCATAA-AATAATTTTTTTC---ATC-ATACAAGTC
355 AAACCAATTCA-AATAGTTATGACTATT-T-A-AACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGA-CC
* * *** ** * ** ** *
207745 TATTTGGTATAAAATAATAATTATTTAGT-AATATTTTA-AAAATTAATAAGT-AGGAGATGTAA
415 T-TTTGTTTTGTCATAA-AACAATTT-TTCAAT-TCATACAAGCTT-AT---TCA-GA-AT-AAA
* * * * * * * * * * *
207807 A-AAA-TAAATTTGTT--TA-CTGAACCAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATAT
469 ATAAACT-AATTTATTAATATTTCAA-AAATT-AATA-AG-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATTT
* *** * ** * ** ** * *
207865 ATTT--CGAA-TTGTTATAACCTTTTGTTATGTC-A-TAAAATAATTATTTTTGTTCATA-CAAG
528 GTTTACCGAACCAATT-TAA---ATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTAT-TTCAAATC-A-
** ** ** ** * ** * * *** * *
207924 TATATTCGAAATAAAATAATACTAATGTAATAAT-ATTTTGAAAATTAGTAACCATGAGATTT--
586 T-TA-T-GACCT--TTTGTTTGTCATAAAAAAATGTTTTTGTTCA-TA-TAAGC-T--TATTTGA
* * ** * * * * * * *
207986 AA-AAAATAA-ATTTATTTACCGAACCAATTC--AAA-T-AGTTA-AGA-CTATAAGAACAATTC
641 AATAAAATAATACTAATTTA-TTAA-TATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATC
*** * * * * *** * * * * *
208043 T-TTATTTTAAA-TTGTT-ATGAT-CTTTTCTTTTGTCAT-AAAATAAT-TTTTTC-AGTTCTTA
703 TGTT-TGCCAAACTAGTTCA-AATAGTTAT-GACTAT-ATGAAAATTATCTATTTCAAATTATTA
** ** * * *
208101 GTAACTTATTTAGAATAAAATAAAACAAATT-TATTAATGTTTCA-A-AA-ATTAATAACTAAGA
764 -TAACTT-TTT-GTTTATCATAAAAC-AATTGT-TT-TTG-TTCATACAAGCTT-AT--TTAA-A
* ** *** * * * * ** * *
208162 GATTTAAA-AA-A-TAATTCTATTTGTCGATC--GAACTAGT--TCAA-ATAA-TT-ATGACTAT
818 -A-TAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGA-AATTTAAAAAATAA
* *
208217 ATGACTATTTGAACAATTATA
879 AT--CTGTTT-ACCAA--ATA
* * * ** *
208238 TATTTCAAGTCA-TTATTACTTTTTG--T--TTTGTC-A--T-AAA-CA-AATG-C-TTTTG---
1 -AGTTCAAAT-AGTTATGACCATTTGAATAATTT-TCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTT
* ** * * * * * *
208287 T-TCATATAAG--TTCATTT-G--GA-ATAA----AAT-AATAT-TAAT-TTATTAA--TA-T--
63 TGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
208333 TA--T-GAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACCTA-TTCAATT
128 TATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAA-CAAGTTTAAAT
* * * * * * * * *
208393 AGTTATAACAATTTTAACAATTATTTACTTT-AAATCGTGATGA-CTATTTGTTTTGTCAT-AAA
190 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATAACCT-TTTGTTTTATCATAAAA
* * * * * * * * * **
208455 AGAATTATTTCTGTTCATAC-TGTTTTATTTGGAATACAGTATTGCTAATTTATTAATATTCTGA
253 ATAATT-TTTCTATTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA
* * * * ** * * * * *
208519 AAATTAAT-A--ACG-GATTTAAAAAATGAATATGTTGGCCT-GACTAGTAT-GAATAGCTATGA
316 AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATT--TATAAACCAAT-TCAAATAGTTATGA
* * * * * * * * * * *
208578 TTGTTTGAATAATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAATTGCTC
377 CTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT
* * * * * * *
208642 CTATTCAGACAAGCTTATCCAAAATAATATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG
441 CAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
208707 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
505 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * * *
208771 TTATCTATTTCAAATCACTAT-AACTTTATATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTAATACAA
569 TTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-T-GTTTGTCATAAAAAAATGTTTT-TGTTCATATAA
* * * * * *
208835 GCTGATTTTAAATAAAATAATACAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAA-TAAGTAAAAATTTAA
631 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAG---AGATTTAA
** * * * *
208899 AAAATAAATAAGTTTTCTGAACAC-A-TTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
693 AAAATAAATCTGTTTGC-CAA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTC
* * * ** * *
208962 AAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCGTATTCAAA
755 AAATTA-TTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAA
* * * * *
209026 ATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATC
818 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATC
* * **
209090 TATTTACCGAGCA
882 TGTTTACCAAATA
* * ** * * * * *
209103 AGTTTAAATAATTA-GACTGTTTGAACAATTATTTAA-TTAAAAT-AGTTATAATC-TTTTATTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCA-TTATGA-CATTTTGTTT
* * * * *
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63 TGTCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
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127 ATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTTAAA
* * * * * * * *
209290 TAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAACA
189 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAA-A
* * * ** * * * * * ***
209355 AT--TGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATGCTAATCTATTGATATTTTGAAA
253 ATAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * * *
209418 ATTAATAA-T---AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-AGGGAA-CAATTCAAACAATTATGACT
318 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTATA---AACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
209477 ATTTAAACAATTATCTATGTC-AAATCGTTATGATC-TTTATTTTATCAAAAAACAATTGTTTCT
379 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCA
* * * ** * *
209540 TTTCATATAAGCTTATTC-GAATTAAAACAATACTAACGTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT
443 ATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
209604 AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT---G-A-CAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATT
506 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
** * * * * ** *
209664 ATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCACCAAAATAAT-TATTTCAATTCATACAAG
571 ACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-GTCA-TAAAAAAATGT-TTT-TGTTCATATAAG
** * * * *
209728 CTTATTCAAAATAAAATAATAGTACTTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGTAAGAGA-TT-AA
632 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--AGTAAGAGATTTAAA
* **** * * * *
209791 AAA-AAATATGTTTATTGAACAAGTTCTAATAGATT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AA
694 AAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAA
* * * * * ** * * **
209853 AGTCATCA-AGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATCCAAAA
757 A-TTATTATA-ACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAA
** * * * * *
209917 TAAAATAATACTACCTTACTAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTG
819 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTG
* **
209982 TTTTA-CGAACC
884 -TTTACCAAATA
* * * * * * * *
209993 AGTTCTAATAGTTATGACTACTTGAACAAATATGAATCTCAAAT-AGTTATGATCA--TTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCA-TTATGA-CATTTTGTTTT
* * * * * * *
210055 CTCAT-AAAGCAATTATTTT-TTATCATACAAGCCTT-TT-TAGATAAAAATAATATTAATTTAT
64 GTCATAAAAG-AATTGTTTTAGT-TCATATAAG-CTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* ** * *
210116 TAATA-TTCAAAAAATTAAT--G-AGAGATTT-AAAAATATATGTATGTTTGCCAAACCAG-TTA
125 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTATCGAACAAGTTTA
* ** * * * * * *
210175 AATAGTTAAAAGTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACATTTTG-TTTAGTCAT-A
187 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAA
* * * * * * * * * *
210238 TAATAATTATT-TAGTTTACACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACCAATTTATCAACATTCAA
251 AAATAATTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* * * *
210302 AAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG
315 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATCTATTTAT-AAACCAA-TTCAAATAGTTATG
* * * *
210366 ACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACCATCTTT
376 ACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTT
* * * * * * * * ** *
210430 TTAGTCCTTAAAAGCTCT-TCCAAAACAAAATAATACTACCTTATTAATATTTCAAAATTTAATA
440 TCAATTCATACAAGCT-TATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * *
210494 AGTAAGAGATTTAAAAAA-AAATTAGTTTACCAAAACAGTTCAAATAATTATG-CTCATTCGAAT
503 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACT-ATTTGAAT
** * * * * * * *** *
210557 AGCTACCTATTTCAAATCGTTGTTACTTTTTGGTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCAACATACA
567 AATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATA
* *
210622 AGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAA-TAAGAGATTTAAAA
630 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * *
210686 AGTAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-C-----CAAAT
695 AATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAAT
* * * * *
210745 TGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC-----T----T---
759 TATTATAACTTTTTGTT-TATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAA
* * *
210798 ATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTT
823 ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGC-AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTT
* *
210860 TGCCAAACCA
886 TACCAAA-TA
* * * * * ** *
210870 A-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATT-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
* * * * * * * * *
210933 TCATAAAACAATTATTTTAGCTCGTAAAAGCTTATCCAAGA-AAAATAATATTACTTTATTAATA
65 TCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
210997 TTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAA-ACAGTTCAAATAAT
130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACA-AGTTTAAATAAT
* * * * * *** * * * * *
211061 TATGGCCATTTAAAC-ACTACCTATTTCAAAGCATTATTACTTTTTGTTTTGTC-TTAAAACAAT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * * * * *
211124 TGTTAT-TCA-ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTTCAAGAA-
258 T-TT-TCT-ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * *
211186 T--TAA-TAAGAGATTTAAATAGTAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTTTGACTATTT
320 TAATAAGTAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
211248 AAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTC
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTC
** * ** * * * **
211312 ATGTAAGCCTATTTTGAATAAAATAATATTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAGTAACCAAGA
447 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * * * * * **
211376 TATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTT
510 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCT
* ** * * * * *
211441 ATTTCACATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAAT-TATTTTAGCTCATACAAGGTTA-
575 ATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAAAAATGT-TTTT-GTTCATATAAGCTTAT
** * * *
211504 -TCCAA-AAAA-AAT--TACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATA
637 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * * *
211564 AAT-TAATTTACCGAAAC-AATTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCA
699 AATCT-GTTTGCC-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTA
* * * * *** * **
211627 TTATTACTTTTTGTTTTGTCTTAAAATAATTGTTTTTCAACATACAAGCCTATTCGAAATAAAAT
761 TTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAAT
* * * * *
211692 AATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAG--AG--ATTTAAATAGTAAATCTATTTACC
825 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
**
211753 AAACC
890 AAATA
* * * * ** * * * *
211758 AGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * * *
211823 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTAGTAATA-
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
211887 TTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTATTGAACTAA-TTCAAATAGT
131 TTC-AAAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAC-AAGTTTAAATAAT
* * ** * * * * *
211951 TAAGACTATATGAACAACCATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
** * * *
212015 TATTTC-AGCTT-ATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
258 T-TTTCTA--TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
** * * * * * *
212078 TTGTAACTAAAAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTCAAAT-GATTATAACTATT
320 TAATAAGTAAGAGATTTA-AAAATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAG-TTATGACTATT
* ** * * * * * **
212142 TGAACAATTATCAATTTC-AAATCATTATTA-CTAATTT-ATTAGT-ATTTAGAA-AATTAATCA
382 TAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCT--TTTGTTTTGTCA--TAAAACAATTTTTCA
* * * ** * * *
212202 A-T-A-A-AA---AATT--TAA-AAAGTAAATCT-ATTTACCAAATCATTTCAAATAGTT-TTGA
443 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAA-CTAATTTA-TTAAT-ATTTCAAA-AATTAATAA
* * ** * ** * * * *
212255 GTATTTGA-ATAATTATCAATTTCAAA-TCGTTATAACCTG--TTATTTTATCATCAAACTATTA
504 GTA--AGAGAT--TTA-AAAAAT-AAATTTGTT-T-ACC-GAACCAATTTA-AAT--AATTATGA
* * * * * ** *** ** ** * ** * *
212316 GT-TTT-ATTGA-TA-CTATTT-TATTCAAAAT-A--AAATAATACTAATTTAATAAT-ATTTTG
557 CTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAAAAATGTTTTTG
** * ** * *
212372 AAACTTAATAA-C-TA-AGGAAATTAAAA-AATA--AATTTAGTTGCAGAACAAGTTCAAATAAT
622 -TTCAT-ATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTA-TT----AA-TATTTCAAA-AAT
** * * ** * * * * * * * *
212431 TAAG--ACTG-TATGAACGAT-TATCTATTT--CAAA-TTGTT---ATGACCTTTTG-TTTTGTT
677 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAAT-A-GTTATGACTAT-AT
** ** ** * * ** * **
212485 GTAAAACAAT-TATTT--TGTTCGTACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATT-TAATAAA
739 G-AAAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CTT-TTT-GTTTATCATAAAAC-AATTGT--T-TT
* * * * * * *
212546 AGTTCA-A-AA-ATTAATAAGAAATTTAAA-AA-GC-AATTT-TT--T-TTTACCAAATTATTTC
796 TGTTCATACAAGCTTATTTA-AAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--CAAA--AATT-
* * * * * * *
212601 AA-ATGGTTAAG-ACTATTAAACAAT-TATCTATTT--CAAATC
854 AATA-AG-CAAGAAAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
** * * * * ** * *
212640 A-TTCTGACCTTTTGTTTAGTCATTAAAACAATTGTCTCAATTCATACAAGATTATTCAGAATAA
1 AGTTC--A-------AATAGTTA-T-GACCATTTGAAT-AATT--TTC-A-A-T-TTCA-AAT-C
** ** ** ** * * *
212704 ATTAAAAAGCAATTTTAATAAGAAATTTAAAAAGCAATT-TTTT--TT-TTACCAA-ATTAGTTC
46 ATT-ATGA-C-ATTTTGTTTTGTCA--T-AAAAG-AATTGTTTTAGTTCATA-TAAGCTTA-TTC
* * * * *** * * ** ***
212764 -AAATGATTAAGACTATTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAG-TCATT
102 AAAAT-A-AAATAATACTAATTTATTA-ATATTTCAAA--AAT-TAA---TAAGAAGAGAT--TT
* * * ** * * *
212827 AAAACAATTGTCTCAATTCATACAAGATTATTC-AAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTC
156 AAAA-AA-----TAAATT--T----GTTTA-TCGAACA-AGTTTAA-A-TAA-TTATGACTATTT
* * * **** * * ** * * ** *
212891 AAAAAATTA-ATAAGAAAGAGATT-TAAAAAAATAAATTTGTTTGCAAAACAAGTTCAAATAGTT
204 GAACAATTATCTATTTCA-A-ATTGTTATAACCT---TTTGTTT---TATC-A-TAAAAATAATT
** * * * ** * ** **
212954 ATCACTATTTAAACAA--TTATCTA-CTTAAAAGCTTCAAAACCT--TTTGATTTGTCA-TAAAA
259 -TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAA---T-AATA-CTAATTT-ATTAAT-ATTCCAA
* ** *
213013 AAATTGTTTCAATCAA-TACA-AGCTTATTTCAAGTAAA-ATAATACAAATTTATTAATATTAAG
316 AAA----TT-AAT-AAGTA-AGAG---ATTT-AA--AAATA-AAT-C-TATTTA-TAA-ACCAAT
* * * * * ** * * * * ** * * * *
213075 ACAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGTTCA-AATCATTATG
363 TCAAATAGTTA-T-GACTATTT-AAACAAT-TATTTATTT-CAAAAT-CGTT-ATGA-CCTTTTG
** ** * * **** * *
213139 ACTATTTG--AGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTTTTGTCATAA-AACAATTATT
420 --T-TTTGTCATAAAACAATT-TTTCAA--T-TCAT-ACAAGCTTAT-TCAGAATAA-AA-TA--
* *
213201 TATATTCATACAAACTTATTCAA-A-TTAAAATAATTTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAAT
472 -A-A--C-T---AATTTATT-AATATTTCAAA-AA-TT--A---A-T-A-A----G--------T
* * * * *
213264 AAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAA
506 AAG---A-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * * *
213328 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAT
566 TAATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATAT
* * * **
213393 GA-CTTATTTGAAGTAAAATAATACTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAAAT
629 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--AGTAAGAGATTT
* * * * *
213457 AAAAAA-AGAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAGACAATTGTCTATT
691 AAAAAATA-AATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAAAATTATCTATT
** * * * * *
213520 TCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATC-TCAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTT
753 TCAAATTATTATAACTTTTTG-TTTATCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTA
* * * * *
213584 GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAG-TACAAATTTTAAAAATAAA
816 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * *
213647 TATGTTTTCTTAACT-
880 TCTGTTTAC-CAAATA
* * ** * * *
213662 CGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
** * * * *** * *
213727 CATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTTGTAATAAAATAATAATAATTTATTAAAAT
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * *
213792 TCCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAGTGAGTTCAAATAGTT
131 TTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATAATT
* * * * * * * * *
213856 ATAACTATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATTATTATAAACTTTTGTTTTGTTAT-AAAATAGTT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAATT
* * * *
213920 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATGTATTAATA-T-AATAAAATTA
259 -TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAATTA
** * * * * * *
213983 ATAAGTTGGAGACTTAAAAAATTAATTTATTCATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTA
322 ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTAT-AAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * * * ** **
214047 AACTATTATCTGTTTC-AAATCATTATGACATTTTTTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCA
384 AACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTCA
** *
214111 TACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA
448 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * *
214172 TTTAAAAACTAAATTTGCTTACC-AGACC------ACT--TCA--A--A-TTG------T---TA
512 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGA-ACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTA
* * * * *
214214 --T--GATC-TT-TG------T-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
576 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTG
* * * ** * * * *
214266 AAGTAAAATATTGCTAAACTAATAGTA-TTCTAAAATTAA-TAAGAATAGATTTAAAAAATAAAA
640 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAG---AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** *
214329 GTGTTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTAAT-ACTAT-TAGAACAATTACCTATTTCAAATCGTTC
702 CTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATAT-GAA-AATTATCTATTTCAAATTATTA
* * ** * *
214392 TAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAAT
764 TAACTTTTTGTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAAT
* * * * *
214457 ACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCG
828 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
*
214521 AACA
891 AATA
* * * * * * * * *
214525 AATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * *
214590 AACAAAACAATTCTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATAAAACAATATTACTTTATTAATAT
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** **** * * *
214655 TTCAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAACAATTTATCAAATC-AGCTCAAATAATT
131 TTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATAATT
* * * * ** * *
214719 ATGGCCATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCGT-AAAATAAT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * * * **
214782 TATTTTTCA-TCATATAAGCCTATTT-GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
258 T-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
** * * * ** *
214845 TAATGCGTAGGAGATTGAAAAAATAAATCTGTTTAGCAACCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
320 TAATAAGTAAGAGATT-TAAAAATAAATCTATTTATAAACC-AATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
214910 GAACAATTATATATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATGAGACAATTATTT-ATGTT
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCA-ATT
* * * *
214973 CATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAA
446 CATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * * *
215036 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTAG
508 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTAC
* * * * * * *
215101 CTATTTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATCTTTTTGCTCATATAAGTTTG
573 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTA
* * ** * * *
215166 TTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-ATTAAGATATTTAAAACATAAA
636 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * **
215230 TCTATTTACCAAACGAATTCAATTAGTTAT-AATAGTTTGAATAATTATTTATTTTAAATCGTTA
701 TCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA-TATGAA-AATTATCTATTTCAAATTATTA
* ** * * * * * *** *
215294 TGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTAGTCGGAATAAAGTAA
764 TAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTTAAAATAAAATAA
** * * * * **
215358 TGTTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAACAAGTAATG-GATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCC
827 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAA-GAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* *
215421 TGACT-
890 -AAATA
* * * * * * * * * * * *
215426 AGTGCAACTAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTGC
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * ** *
215490 CACAAAACAATTGTTTCT-CTTCGT-TCAAGCTTATTCAAAATATCATAATTCTAATTTATTAAT
66 CATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
215553 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGT
129 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT
* * * * * *
215618 TATGATTATTTGAACAATTACCTAATTCAAATCGCTATAACCTTTTG-TTTGTCAT-AAAATAAT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAA-
* * * * *
215681 TTTTTCTATTCATACAAGCTTGTTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAAT
257 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AAAAT
* * * * * * **
215744 TAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAACTATGTTTACCAAAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTT
320 TAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
215809 GAACAATTATTTATTTC-AAATCATTATGA-CTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTC
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTC
* *
215872 ATACAAGCTTATTCA-AAT----TAAA-TAA--TATT-A-GTTT-----ATTAA-CA-T------
447 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * * * *
215914 TTTTAAAAATAAATATGTTTA-TGAAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTA
512 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTA
* * * * * *
215978 TTTCAAACCGTTATGACTTTTTAGTTTGTCATAAAATAAT-TATATTAGTTCATATAGGCTTATT
576 TTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAAAAATGT-T-TTTGTTCATATAAGCTTATT
* * * ** *
216042 CGAACTAAAATAACACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAAAAA
638 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--AGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * ** * * * * * * **
216107 ATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTTTCTATTTTAAATCGTTA
700 ATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * *
216172 TGA-TTTTTGTATTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT
764 TAACTTTTTGT-TTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAAT
* * * * * ****
216236 A-TACATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AATTTTAAAATATAAATATGTTTTTTGA
828 ACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAA
**
216299 ACG
892 ATA
* * ** * * * * * *
216302 TGTTTAAATAGTTATGAATATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTG
** * * * * *
216366 TCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCGTATTCAAAAT-AAATAATATTAGTTTATTAATA
65 TCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
216430 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCAAGTTCAAACAGT
130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT
* * * * * * * * *
216495 TATG-CTTGTTTGAACAATTATTTATTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCGTAAGACAT-
193 TATGAC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAA-AAATA
* * ** * ***
216558 -TTGTTTTTGTTCATGGAAGTTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGAAAA
256 ATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
* * * * ** * * * *
216621 TTAAT-AGTTAGGGGATTTAAACAATTGTTTCAATTCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAG-C
319 TTAATAAG-TAAGAGATTTAAA-AA-----T-AAATC-TAT-T-TATAAACCAATTCAAATAGTT
* * * * **
216684 ACTGATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGT-GAATCTATTTACCAA
373 A-TGA-CTATT--TA----AACAATT-AT---T---T-ATTTCAAAA-TCG--T-TA-TGACCTT
* *** * *** * ** ** * *
216748 AT-CAGT-TCA-AATAACTA-TAGCCATTTCA-ACAATTATCTATTTCA-AATCATTATTACCTT
417 TTGTTTTGTCATAA-AACAATTTTTCAATTCATACAA-GCT-TA-TTCAGAAT-AAAATAAAC--
** * ***** * *** **
216807 TTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATTATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAGTAATT
475 -TAATT--T-AT-TAA-TATT-TCAAAAATTA-ATAAG--TAAGAGATTTAAAA-AATA--AATT
* * **
216872 TGTTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAA-GATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTACTT
527 TGTTTA-C---C------------G-AACCA-ATTT---AAAT-AA-----TTA--TGACTA-TT
* * * * * *
216936 TAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTGTATACTTCAAACCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATA
562 TGAATAATTA--CCTATTT----CA----A-A--TC--A---TTATGACCTTTTGTT-TGTCATA
* * * * * * ** *
217001 AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGTAATAAAATAATACTAA-TAAAAAATATTTTG
608 AAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC
* * * * *
217065 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAATTAGTTCAAATAGTTAAGAC
671 AAAA--ATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
** * * * *
217130 TATATGAACCGTTATCTA-TTC-CA--A--ATCA-TTTTTGTTCTGTCATAAAATAATT-TTTTC
734 TATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTTGTT-TATCATAAAACAATTGTTTT-
** ** * * * * * *
217187 AATTCATACTGGCTTATTTAGAACAAAATAA-AATGAATTTATTCATA-TTAAAAAATTAATACG
796 TGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * ** **
217250 TAAGAGATTTAAAATATAATTATGTTTACTTAACC
860 CAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
* * * * * * *** *
217285 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATTGCTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
217350 CATAAAACAAATGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAAGAATACTAATCTATTAATAT
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
217415 TTCAAAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTAT
131 TTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTAT
* * * * * * * *
217477 GA-TATTTGATCAATTTTTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTAT--TACAAAACAATAG
196 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATA-AAAATAAT-T
* * * * * *
217539 TTTCTGTTCATGCAAG-TATATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAA
259 TTTCTATTCATACAAGCT-TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * ** ** * * *
217603 TAAGTAA-ACAATTTAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGA
323 TAAGTAAGA-GATTTAAAAATAAATCTATTTA-TAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTAA
* * * * * * * *
217666 ATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCCTTTGTTTTATCATAAAAAAATCATTTCAGTTCAT
385 ACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTCAATTCAT
* * ** * * *
217730 ATAAACTT-TTTTGAAAGAAAATAATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAG
449 ACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * **
217793 ATTTAAAAAATGAATTTGTTTAATGAA-CAAGTTTAAATAATTATGACTTTTTGAACAATTATTT
511 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCT
* ** * * *
217857 ATTTGAAATCGCTA-GAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA
575 ATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTT-TGTTCATATAAGCTTA
* * * * *
217921 TTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTA-T-ATATATTAAAACAATTAATAAATAAAAGATCTAAAA
636 TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TTCAAA-AA-T--TAAGTAAGAGAT-TTAAA
* **** ** * *
217983 AAATAAATATGTTTATTGAA-TAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
694 AAATAAATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAA
* * * * * * *
218047 ATT-TTATGACCTTTAGTTTTATCATAAAAAAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAATTA
757 ATTATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATA
* * * *
218111 AAA-AATATTAATTTATTAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
821 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGT
* * *
218174 TTATCGAACA
885 TTACCAAATA
* ** * * *
218184 AGTTCAAATAGTCATGAGTATTTGAATAATTATT-TATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
* * * * ** *
218248 TAATAAAACAATCGTTTTAGTTCGTATAAG-TTCATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAAT
65 TCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** ** * * * * * * * * * * *
218312 ATTTTGAAAATTAATGACTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATGTACCAAATATGTTCAAATAGT
129 ATTTCAAAAATTAAT-AAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT
* *** * * *** * * ** *
218377 TATGGCTATCAAAATAATTATCTAATTCAAAACATTATGA-CATTTCATTT-TCAT-AAAACAAT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * * * * * *
218439 TGGTTCTGTTAATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-GTAAATTTATTAATATTCCAAACATT
258 T-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * *
218503 AATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTTTTTGAA-CACATTCAAATAGTTATGACTATTT
321 AATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTTATAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
218566 GAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTTTCAT-AAACTAATTGTTTCTATT
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATT-TTTCAATT
* ** * * *
218629 CATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA
446 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * ** * * * ** * *
218694 GATTTGAACAATAAATCTATTCACC-AAGTGAGTTTAAATAGTTATGA-TCCTTCAAACAATTAT
510 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CCAATTTAAATAATTATGACT-ATTTGAATAATTAC
* * * ** * * * **
218757 TTATTTCAAATAATTTTGATATTTTGTTTTGTTA-AAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAATTTT
573 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAA-AA-TGTTTTTGTTCATATAAGCTT
** * *
218821 ATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTATTATTAT-AAAAATTAA-TAAGTTTGAGATTTAAAA
635 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGTAA----GAGATTTAAAA
* * ** * * * * ** * *
218884 AATAAATATGTTTACTTAACAAGTTCAAATGGTCAAGTTTATTTGAATTATTATCTATTTCAAAT
695 AATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAAT
** * * * * ** *
218949 CCTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAA
759 TATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAA
* **
219014 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAG--AG--ATTTAAAATTTAAATCTGTTT
822 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT
** **
219075 ATTGAACCA
887 A-CCAAATA
* * * * ** * *
219084 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGTTATGTC--TTTGTTTTGC
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * ** * * * * *
219146 CATAAAATAATTACTTTT-GCTCATATAAACTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA
66 CATAAAAGAATT-GTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
219210 -TTCTAAAAAATAATAAAAATGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACCA-TTTCAAATAG
130 TTTC-AAAAATTAATAAGAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTT-AAATAA
* * * ** * *
219273 TTAAGACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAGTCATTCTTACCTTTTG-TTTAGTCAT-AAAATA
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAATA
* *
219336 ATTGTTT-TAATTCATACATGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-CAGAA
256 ATT-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AA
** * * * * *
219398 AATTAATAAACAAG-GAAGTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAATCATGA
317 AATTAATAAGTAAGAG-A-TT-TAAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGA
* * * *** * *
219461 CTATTTGAACAATTATCTATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTCTTATCATAAAACAATTGTTT
377 CTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT
* * * * * *
219525 CCATTAATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
441 CAATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* ** * * ** * *
219589 GTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGAATCGGTTCAAATAATTATGACCATTTGAATA
504 G-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATA
* ** ** * * *** *
219653 ATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCATCATACAA
568 ATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAA
* * * * *
219718 GCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTTAAAAAATTAATATGTAAGATATTTAA
631 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A-GTAAGAGATTTAA
* * * * * *
219783 AAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTC--CTA-TT-TG-----A--ACAATTATCTATTTC-AA
693 AAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAAATTATCTATTTCAAA
* * * ** * **
219836 TTCATTATAA-TCTTTTGTTATGTTATAAAATAATT-TTTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAA
758 TT-ATTATAACT-TTTTGTT-TATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTAAAA
* * * * * *
219899 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAAATTGATAA-CAAGGAGATTTAAAAAAAAAAACC
819 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAA-GAAATTT-AAAAAATAAATC
* * *
219963 TGTTTGGCGAAACA
882 TGTTT-ACCAAATA
* * * * * * * * *
219977 A-TTCAAAATA-TTAAGACTATATGAACAA-TTACATGTTTAACAAA-AATTATGGCCTTTTGTT
1 AGTTC-AAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCA-ATTT--CAAATCATTATGACATTTTGTT
* *
220038 TGGTCATACAAA-AATTGTTTTCA--TCAT-TCAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
62 TTGTCATA-AAAGAATTGTTTT-AGTTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
220099 TTAATCTTTC-AAAA--AATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT-TCTAACCTAGTTCAA
124 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAA
* ** * ** * * *
220160 AT-A-TATGACTATTTGAACAATCATAAACTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTGTCAT-AAA
188 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* * * * * * * * ***
220222 ACAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATCTAATAATATTTTGAA
253 ATAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * *
220287 AATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACCAATTCAAATATTTAAAGACT
317 AATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTT-ATGACT
* * * * * *
220352 ATATGAACAATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGTTTTTTT
379 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA---TTTTT
* ** * *
220416 GAATTCATATTAGCTTATTTAGAATTAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
441 CAATTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAAACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
220481 GTAAGAGATTT-AAAAA-ACATTTCAGTTTACCTAACTAATTCAAATAATTATGATTATTTGAAT
504 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT--GTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAAT
* ** *
220544 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATA
567 AATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATA
* * * *
220609 AGTTTGTTT-AGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAA
630 AGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAA
* ** * * * *
220672 AAATAAATCTATTTATCAAACAAACTT-AAATAGTTATGACTAT-TTAAGTAATTATTTATTTCA
694 AAATAAATCTGTTTGCCAAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA--AATTATCTATTTCA
* * * * * * ** *
220735 AATCATTATGACTTTTTATTCTATTATAAAACAAGTGCTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATT
756 AATTATTATAACTTTTTGTT-TATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAAT
* * * * * * *
220800 AAAATAATTCTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAGTAAATATGT
820 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGT
220865 TTACCAAACT-
885 TTACCAAA-TA
* * * ** * * * * *
220875 GGATCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * *
220940 CATAAAAAAATTATTTCAATTTATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTACA-TTATTAATA
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA
* * * * * ** *
221004 -TTAAGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTGCCAAACAAGTTTAAATAAT
130 TTTCA-AAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT
* * * * * *
221068 TTTGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACTTTTTGTTTTGTCAT-AAAATGA
193 TATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAAT-A
* * * * * *
221131 TTTTTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT--AAGACA
256 -ATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAA-A-A
* * ** **
221194 ATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATCTTTATGACTA
318 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* * *
221258 TTTGAAA-AATTATTTATTTC-AAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT--
380 TTT-AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCA
* * * * * * *
221319 ATGTTATACATGCTTATTTC-GATTAAAATATTATTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAAG
443 AT-TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATA-AACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * ** ** * * * * * *
221383 T-AGAAGATTTAAAATATAAATATGTTTTTC-AAAAAAGTTCAACTAGTCATAACTATTTAAATA
505 TAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATA
* * * * * *
221446 ATCATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTT-T-ATAATAAAATAGTTGTTTCTATTCATAT
568 ATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGTCATAA-AAAA-A--TGTTTTTGTTCATAT
* * * * * *
221509 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAAAAAATT
629 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--AGTAAGAGATTT
* * * * * * *
221574 AAAAAATGAATAAT-TAT-CCAAAAATTATCGAACATGTTCAAATAGTTAGGACTATCTAAATAA
691 AAAAAATAAAT-CTGTTTGCC---AA--A-C---TA-GTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AA
** * * * * * * * * * *
221637 TTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAATATTTTGGTTCTATTCATGCAA
744 TTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACA-ATTGTTTTTGTTCATACAA
* * *
221702 GCTTACTTT-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-AATTT
807 GCTTA-TTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTT
* * * * ** *
221764 -AAAAACAAATATATTTTCTGAACA
870 AAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
** * * * * * * * *
221788 CTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * ** * * *
221853 CACAAAAAAATTGTTTCT-CTTCATAAAAGCTTATTCGGAACAAAATAATACTAACTTATTAAAA
66 CATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * ** *
221917 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAAGCGAGTTCGAATAGT
130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATAAT
* *
221981 TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTC-AA-----AT---C----G--TTATC------AT-A-
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * *
222023 -----T-TT-ATACAAG-TTTTTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
258 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
** * * * * * * ** * *
222080 ATAAGTTGGAGATTCAAAAAATAAATTTGTTCATCGAA-CAAGCTCAAATAGCCAT-ATTCAATT
322 ATAAGTAAGAGATT-TAAAAATAAATCTATTTAT-AAACCAA-TTCAAATAGTTATGACT-ATTT
* * * ** * *
222143 GAACTATTATCTATTTC-AAATCGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTC
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTC
** * *
222207 ATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAG
447 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * * * * * * * ** *
222268 ATTGAAAAACTAAACCTGTATATCAAACTAGTTCAAATAATTATGATTTTTTGAGCAATTATCTA
511 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTA
* * * * * * *
222333 TTTCAAATCGTTGTGA--TATTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATT
576 TTTCAAATCATTATGACCT-TTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATT
* * * * * * *
222396 CGGAGTAAAATATTGCTAAATTACTAATA-TTCTAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAA
638 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAA
** * * * * *
222459 GGTCTTTGCCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTC
701 TCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATAT-GAA-AATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * * *** *
222523 TGACCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATAT-TTTCAATTCATACATA-CTTATTCAAAATAAAATA
764 TAACTTTTTGTTTA-TCATAAAACAAT-TGTTTTTGTTCATACA-AGCTTATTTAAAATAAAATA
* * * * * * *
222586 ATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATAAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTCTTTAT
826 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
222650 CAAATA
889 CAAATA
* * * * * * * ******
222656 AGTTTAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT-ACTTATGAACATTCAAAAAA
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCA-TTATG-ACATT-TTGTTT
* * * *** * * *
222720 T-TAATAAACAATAAAT-TTTT-GAAAATA-AATCTATTTATTGAAGAAGTTTAAATATTTATGA
63 TGTCAT-AA-AAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGC---TTATTCAA-AA---TAAA-A-TAAT-A
** ** * *** * * *
222781 CT-ATTTGAACAATTATCTATTTAAAA-TATATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
116 CTAATTT-ATTAA-TAT-T-TCAAAAATTA-ATAAGA---AGAGATTTA--A-AAAATAA--ATT
* ** * * * * * * *
222844 TCAGTTCATAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAAAATTGATAT
168 T--GTTTATCGAA-CA-A---G--TTTAAAT-A-ATTA--TGACT-AT--TTGAACAATT-ATCT
* ** * *** ** * ** * * *
222909 GTTAGAGA-T-TTA-AAAAATAAGTCAATTTACCA-AATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTAA
216 ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGT---TTTATCATAA-------AAATAATT-TTTCTATTCAT
** **** ** ** * * *** *** * *
222970 ACAATTATCTATTTCA-AATTGTTTCAACTTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTTTCATCA-
270 ACAA-GCT-TATTT-AGAATAAAAT-AA-TACTAATTTATTAATATTCCAA---AAATTAATAAG
* * ** * * * *
223033 TACA-AGCCTATTT-AGAATAAATCAATATTTCAAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAA
327 TA-AGAG---ATTTAAAAATAAATC--TATTT-ATAAACCAAT--TCA-AATAGTT-----AT-G
* * *
223096 ATCTATTTATTCAACCAGTTCATATTCAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTT
376 A-CTATTTA---AA-CAATT-AT-TT------ATT-TC-A----AAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
223161 CTATTATAAAATAATTATTTCAATTTATATAAGCTTATTTAGTATAAAATAATACTAATTTAATA
422 TTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTA
* * * * *
223226 ATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAA-AAATTTAAATA
485 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATA
* * * * * *
223290 GTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
550 ATTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AA
* ** **
223355 TTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATT
613 ATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *** * * * * *
223420 AA-TAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTATTAAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCAA
678 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA
** * * * * ** *
223483 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATATAACAATT-TTATTTGAACATT
742 -AATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTT-TTTGTTCATA
* ** * ** *
223547 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACCCTTT-AAAAATAAATAAATAAGCGAA
804 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAATAAGCAAG-AAA
* * *
223611 -TTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAACT-
867 TTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAATA
* * * * * * * * *
223638 ATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
223703 CATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-
66 CATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
223767 TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAATC-AGTTCAAATATT
131 TTC-AAAAATTAATAA-GAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATAAT
* * * * * *
223831 TAAGACTATATGAACAATTAT-TATTTCAAGTCGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAAG
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAA-
* * * * *
223894 TTTTTTTTGAATTC-T-CAATAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATATTTCAA
257 -TTTTTCT--ATTCATAC-A-AGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAA
* * * * * *
223956 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGATT
316 AAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTAT-AAACCAATTCAAATAGTTATGACT
* * ** * *
224021 ATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATTATTAGGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTT-
379 ATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TTTTC
** * * * * *
224084 TGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC--AAA-TATTAA-T
442 AATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * ** *
224145 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATC-AAACTAGTTAAAT-GTTACAACTATTT-AAGCAAT
506 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAA-TAAT
** * * * * * * * * * * *
224207 TATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTATTCTATTATGAAACAATTGTTTCTATTTATACATGC
570 TACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TGTCAT-AAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGC
* * * * * **
224272 TTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGGTAATTAA-TAAGTAAAAGATTTTT
633 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT--CAA-AAATTAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * * *
224335 AAAATAAATATATTTACTC-AACTAGATCAAATAATCATGATTTTTTAAATAATTATCTATTTCA
693 AAAATAAATCTGTTTGC-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCA
** * * * * * *** * **
224399 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAAGAAATGTTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAAT
756 AATTATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAAT
* * * * * ** * * *
224464 AAAGTAATGCTAATTTATTAGTAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
820 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGT
* *
224529 TTACTAAACA
885 TTACCAAATA
* * * *
224539 AGTTTAAATAATTAT--CTATTTG----A-----AATTGC---T-A-TA--ACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* * * * *
224586 CATAAAAGAATTTTTTCTA-TTCATACAATCTTATT-----T----CAAGAC--A---ATT-A-A
66 CATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
224634 ---C----A--AGTAA-AAGAG--TTAAAAAGTAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAATCATTA
130 TTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTA
* * * * * * *
224687 TAACTATTT--ACGTAATTATTTATTTC-AA---CTATGACTTTTTGTTTTGTCGT-AAAATAAT
195 TGACTATTTGAAC--AATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAAT
* * * * * * *
224745 TGTTTCTATTCAAACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTA
258 T-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * ** * * * *
224810 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-TAAGTTAAAATAGTCATGATTATTT
322 ATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
224874 AAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTTTTTAGTTCA
383 AAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCAATTCA
* * * * *
224938 T-CTAAGTTTATT-TGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTGAGTAAGA
448 TAC-AAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * * * * * * *
225001 AAACTAAAAAA-AGAATCTATTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTAT
510 GATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTAC
* ** * * ** *
225064 CTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTTCCATAAAACAAT-TGTTTTGTTCATGCAACCTTA
573 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTGT-CATAAAAAAATGT-TTTTGTTCATATAAGCTTA
* * *
225128 TTTTG-AATAAAATAAT-TTAAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAA-TAAGA-A---AAAAAAT-
636 -TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * *
225185 -GT-T-TTCTG---AGC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTA
699 AATCTGTT-TGCCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTA
* * * * * * ***
225243 TTATTA-TCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTATGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAA
761 TTATAACT-TTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAAT-AAA
* * * * **
225307 ATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTATTAAGTAA-AAGATTTCAAAAATAAATCAATT
823 ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTT
*** ***
225370 TAATGAGCG
886 TACCAAATA
** * * *
225379 AGTTCAAATAAATATGACTATTTGAACAATTATT-TATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTT
* * * *
225442 ATCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATA-AAACTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
64 GTCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** * *
225505 A-AATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C---C------AAAT
127 ATATTTC-AAAAATTAATAAGAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAAT
* ** * * *
225559 -A--AT-ACTAATTTGAA-ATATTATTTATTTCAAATCATTA-AGACATTTTATTTTATCGT-AA
190 AATTATGACT-ATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATTGTTATA-ACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * ** * * *
225617 AACAA-TTGT-TATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAA
252 AATAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * * * * *
225679 AA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAGTTTGTTTACTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTA
317 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * **
225741 TTTCAACAATTATCTATCTCAAATTAG-TATGATC-TTTATTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTG
380 TTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAA
* ** ** *
225804 TTCATACGAGCTTATTCA-AAGTAAAATAATGTTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT
444 TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* ** * * * * * *
225867 AAGACATTTAAAAAATAAAAGTGTTTACTGAACC-AGTTATAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT
506 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTA-AATAATTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * ** * * *
225931 TATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTTTTTTGCCATAAAAATTTTTTTTTAGTTCATACAAGG
570 TACCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTGTCATAAAAAAATGTTTTT-GTTCATATAAGC
* * *
225996 TAATTTGAAATAAAATAATAC-AATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAA
633 TTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * * * * *
226059 AAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTTAA
692 AAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCA
* * * ** * * **
226124 AATTGA-TATGACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTTCAGTTAATAAAAGCTTATCCAAAA
756 AATT-ATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAA
** * * * * * * * *** * *
226188 TAAAATCGTATTACTCTATTAATATTTCAAAAGTTGAGAGGTTGGAGATTTAAAAAGTAAAT-TA
819 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCT-
* *
226252 GTTTATCGAATCA
883 GTTTACCAAAT-A
* * * * * *
226265 A-TTTAAATAATTATGGCCATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACA-TTTTGTTTTG
* * *** * * *** *
226328 TTATAAAATAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
226393 TTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACCACTTTAAATAGTT
130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATT
* * * *
226458 ATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATAA-CTTTT-TTTT-T-AT-AAAATAATT
194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAATT
* * * * ** ***
226518 ATTTATGTTCATACAAACTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATATAACAATATTATGAAAATTA
259 -TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * ** * ** *
226582 ATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGTTA-TAAG
322 ATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTT-ATAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTA-
* * * * * ***
226646 AATAATTATCTATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAAATGTTTTTTGTTC
384 AACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTCAATTC
* * * ** * * **
226710 ATATAAGTTTGTTTTGACTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT--G--AGAG
447 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * **
226771 ATTT-TAAAA-AAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAGTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTA
511 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACCTA
* * * * *
226834 TTTCAAATCATTATGACCATTTAT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTGATACAATCTTATT
576 TTTCAAATCATTATGACC-TTT-TGTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATT
** * * *
226898 CAAAATAAAGGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATGAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT
638 TGAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT---TAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** *
226962 AAATCTGTTGGGCTGACTAGTAC-AA-AG--A-G--T-TATG----------A--T----TT-TT
698 AAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAAATTATCTATTTCAAATTATT
* * ** * *
227002 -T---GTTTTG-TTA-C--AAAACAATTGTTTCTGTTTGCAT--AAG-TTAACTAGGAATAACAT
763 ATAACTTTTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG-TT-CATACAAGCTTATTTA-AAATAAAAT
* * * * * *
227056 AATTCTAATTTATTAGTATTTAGTATTTTAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCT
825 AATACTAATTTA-T--TA---A-TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCT
* * *
227121 GTTTTATCGAACA
883 G-TTTACCAAATA
* * * * * * * * *
227134 AGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TTCTATAACCTTTTGTTTCA
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCAT-TATGACATTTTGTTT-T
* * * **
227198 G-CATAAAATATATT-TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATAAAAATTTATT
64 GTCATAAAAGA-ATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * * * * *
227259 AATA-TTCAACAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAAG
126 AATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAAT
* * * * * * *
227322 AGTTATGACTATTTGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAAAT
190 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAAT
* * * * * * **
227385 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAGTAA
255 AATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
* * * * * * * * *
227450 TTAATTAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTCATAACCAC
319 TTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * ** * * *
227514 TTGAATAATTATCTATTTC-AAATGGTTATAACTTTTTATTTCATCACAAAACAATTGTATCAGT
381 TTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAAT
* * * * *
227578 TCATATAGGCTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCCAAAAATTAATGAGTAA
445 TCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
227642 GAGATTTAAAATATAAATCTCTTGACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTA
508 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA
* * * ** * *
227706 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCAT-TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTACTT-GTACAAGC
572 CCTATTTCAAATCATTATGACCTTT--TGTTTGTCATAAAA-AAATGTTT-TTGTTCATATAAGC
* * *
227769 TTATTTAAAATAAAAAAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGTAAAAGTTTAAA
633 TTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAG--AGA-TTTAAA
* * * * * *
227832 AAATAAATATGTTTTCTGAATAC-A-TTCAAATAG-T-CGGCTATTTGAACAATTATCTA-TTCT
694 AAATAAATCTGTTTGC-CAA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTC-
* * * * * * * * *
227892 AAA-TAGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATATAAACATATTCAA
755 AAATTA-TTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAA
* * * * * *
227955 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAGTAAATT
817 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATC
* **
228019 TTTTTACCAAGCA
882 TGTTTACCAAATA
*** * * * **
228032 AGTTCAAATAGTTATGATTGTTTAAACAATTATT-TATTTCAAAT-AGTTATGATGTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTT
* * * * * ** * *
228095 GTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATAAAAGTTTTTTCGGAACAAAATAATAGTAATTTATTAA
64 GTCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * * * *
228159 TATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAAGTTCAAATA
128 TATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-GAACAAGTTTAAATA
* * * * * * ** * * *
228223 CTCAT-ATCCATTTCAACAACTATCTACTTCATGTCT-TTATGACCTTTTGTTTTGTTAT-AAAA
191 ATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAA
* * * ** * * * * * ***
228285 CAATTATTTCCATTCATGCAAAATTATTCATAATAAAATAATATTGATCTATTAATATTTTGAAA
254 TAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * ** * * *
228350 A-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTATGGCTAT
318 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * **
228411 TTAAACAATTATCTATTT-TAAATCGTTATGATCCTTTT-TTTT-TCACAAAACAATTGTTTCTC
381 TTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAA
* * *
228473 TTCATACAAGCCTATTC-GAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTA
444 TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * ** *
228537 AGAGATTT-AAAAA-AAATGTGTTTGCCGAACCAATTCAAATCGTTAAGACTATTAAAACAATTA
507 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * *
228600 TCTATTTCAAATCATT-TCAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAAT-TATTTCAGTTCATACAAAC
572 CCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTT-GTCATAAAAAAATGT-TTT-TGTTCATATAAGC
* * * *
228663 TTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAATAGATTTAA
633 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--AGTAAGAGATTT-A
* ** * * * * *
228726 AAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTTAACAATTATCTATTT-
692 AAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGT-TATGACTATATGAA-AATTATCTATTTC
* * * *** ** * *
228789 AAAGTCATTATGACATTTTT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AAAATTTTTTGAA
755 AAA-TTATTATAAC-TTTTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAA
* * * * * * *
228852 ATAAAATACTACT--TTT-TTAATATTTCAAAAACTAACAAGCAAGAGATTTATAAACTAAAGCT
818 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCT
* * *
228914 ATTTTCCAAACCA
883 GTTTACCAAA-TA
* * * * * * ** *
228927 A-TTCAAATAGTTGTAACTATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTGTTATG--ATCTTTGTTTTC
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTG
* * * ** *
228989 TCATAAAATAATT-TTTTATGGTCATACAAGCTTATTC-GGATAAAAATAATACTAATTTAATAA
65 TCATAAAAGAATTGTTTTA-GTTCATATAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * ** * * * *
229052 -AATTCTAAAAATTAAT---AAGATATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCA-TTCAAATAG
128 TATTTC-AAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAA
* * * * * *
229112 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-TTTAGTCAT-ATAATA
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAATA
** * * ** * * * *
229175 ATTGTTTCGGTTTACACAAGCTTATTCGGAATAATATAGTACTAATTTATTAACATTCGAAAAAT
256 ATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * * ** * *
229240 TAATAAGCATGAGATTTAAAACAATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGACTAT
320 TAATAAGTAAGAGATTT-AAA-AATAAATCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTAT
** * * * * * * *
229304 TTAAACAATTATCCACTT-AAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAATAATTGTTTTAGT
381 TTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAAT
** * * * * * *
229368 TTGTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
445 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * ** * * * * * * *
229433 AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTGAATCGGTTCAAATAATTATGGGC-GTTTAAACAACTAT
509 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTAT-GACTATTTGAATAATTAC
* ** * * * * ***
229497 CTATTTCAAATCATTTTTTCCTATCGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCAACATATAAGCTT-
573 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTA
* * * *
229561 TTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTTATATTTCAAGAATTTATTAGTAAGAGATTTAAAAAGT
636 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTA--AGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * *
229626 AAAT-TGCTTACCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATGACCTATTTCAAATTAT
698 AAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTAT
* * * * ** *
229690 TATAACCTTTTAT-TTTGTCATCAAACAATTGGTTCTT-TTCATACTATTTTATTCAAAATAAAA
762 TATAA-CTTTT-TGTTTATCATAAAACAATT-GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAA
* * * * * * * ** *
229753 CAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAA-AGGCCAA-AAAATTAAAAAATAAAACTAATTG
824 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-CAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
*
229816 CCTAACT-
888 CC-AAATA
* * * * *
229823 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAAATATTATATAATTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGAT
1 AGTTCAAATAGTTATGAC--CAT----T-TGA-ATAATT-TTCAA-T--TTC-AA-A--T--CA-
* * * * * * *
229888 TATATGAACAATTATCTATT-TCA-AATCATTATGACCTTTTCTTGTATCGTAAAACAATTATTT
47 T-TATG-AC-ATTTTGTTTTGTCATAA--A--A-GA-ATTGT-TT-TA--GT---TC-A-TA-TA
* * * * * * * * *
229951 TGTTTGTACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT---A
93 AGCTTATTCAA----AAT--AA-AATAATACTA---ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGA
* * * * * * *
230013 AGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAATC-A-TTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAAT
148 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * * *
230076 TATCTATTTGAAATCATTTTGACATTTT-ATTTAGTCAT-AAAACAATTGTTT-TAGTTCATACC
211 TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAATAATT-TTTCTA-TTCATACA
* * ** * * *
230138 AGCTTATTTAGAA-AAAATTGATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATT-ATAAGAAAGATAGTA
273 AGCTTATTTAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* * * * * * * * * *
230201 AAAAAATAAATCTATTTATTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAATAGTTGTCTATTT
336 TAAAAATAAATCTATTTA-TAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTT
* * * * * * * * *
230265 -AAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAGCAATTGTTTCAATTAATATAAACTTAGAT-G
399 CAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCA
* ** * * *
230328 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAGAG
462 GAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * *
230393 CTGTTTACCGAATTAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCC-ATTTCAAATCATTAT
526 TTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA-CCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
230457 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTTTGCTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
590 GACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
* * * * *
230522 CTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAACAATAAATCTATTTACCAAAC
653 CTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAC
* * * ** * *
230587 TAGTTCAAATATAGTTATGACTA-ATTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTA-AAATCTTTGTT
715 TAGTTC-AA-ATAGTTATGACTATA-TGAA-AATTATCTATTTCAAATTATTATAACTTTTTG-T
* * * * **** * *
230650 TTGTCATAAAACAA-T-TATTTCTT-ATATAAGCTTA-TTCGGTTAAAAATAATAATAATTTAAT
775 TTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATT
* * * * ** * **
230711 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACC
839 AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
** * * * * * ** * ** *
230767 AGTTTGAATAGTTA-AAACTTTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT-TTA-A-CCT-TTTAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTT-GAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
* * * * * *** * * *
230827 TCATAAAATATTTGTTTCA-TATCTTA-AAGCCTATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAAC
65 TCATAAAAGAATTGTTTTAGT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * * * * *
230890 A-TTCAAAAAATTAATGGGCAAAAGATTTGAAAAATAAATCTATTTAGCAAATAAGTTCAAATAG
129 ATTTC-AAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAA
* * * * * *
230954 TTATGATTATTTAAATAATTATTTATTT-AAATTCATTATGAA-CTGTTGTTTTGA-CAT--AAA
192 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTAT-AACCTTTTGTTTT-ATCATAAAAA
* * * * * * * *
231014 CAATTGTTATAGTTTATAAAAGCTTA--TA-AAAAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAA
254 TAATTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * * * * * * *
231076 ATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAGAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTTAGATAGTTACGACTAT
318 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTA-TAAACCAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
231140 TTTAACAATTGTCTATTT-AAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTGTTTCAAT
381 TTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAAT
* * * * * * * *
231204 TTACACATGCTTATTCAAAATAATATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTATTAAGTAAG
445 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** ** * * * * * * *
231269 TGATTTACAAAATGAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATC
509 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTACC
* * * *
231334 TATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGATCATATAACAATTGTTTTT-TATCATTTAAGCTTA
574 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTG-TCATA-AAAAAATGTTTTTGT-TCATATAAGCTTA
** * *
231398 TTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
636 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * * * * *
231463 AAATCTATTTACCGAACCAATTCAAACAGTAATGACTATTTCAACAATTGTATACTTCAAATCAT
698 AAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTCAAATTAT
* * * * **
231528 TATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
762 TATAACTTTTTGTT-TATCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAAT
* * * * * * *
231593 AATACTTATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTGCC
825 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
**
231657 AAACC
890 AAATA
* * * * ** * * * ** *
231662 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATGATCTATTTCAAACCGTTATGACCCTTTGTTTTGC
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
* ** ** * *
231727 CATAAAACAATT-TTTTCAACTCATACT-AGCTTAATT-GGAATAAAATAAAACAAATTTATTAA
66 CATAAAAGAATTGTTTT-AGTTCATA-TAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
231789 TATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGA-TTAAAAAAT-AATTATATTTACCTAACTAGTTCAAATA
128 TATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCGAACAAGTTTAAATA
** *
231852 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-
191 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AT
* * * * * *** ***
231915 AATGTTTT-TATTCATATAAGTTTGTCT-GAAATAAAATAATAATAGCATATTAATATTTTGAAA
255 AAT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
* * ** * *
231978 A-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA--T-CAAATTAGTTCAAATAGTTATAACTATT
318 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATT
* * **
232036 TAAGCAATTATTTATTTC-AAATC-TTATGA-CTTTT-TTCTG-CTATAAAACAATAGTTTT-TG
382 TAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAAT--TTTTCAA
* * * * ** *
232095 TTCACACAAGCTTATACA-AATTAAAATATTACTAATTTATTAGTATTTTGACAATTAATAAGTA
444 TTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATA-AACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** * * * *
232159 AAAAATTTTAAAAATAAATATATTTATTGAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATT
507 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCA-ATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* *
232223 ATCC-ATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT-TATTTCAGTTCATATAAG
571 A-CCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAAAATGT-TTT-TGTTCATATAAG
** * * * *
232286 CTTATTCAAAATAAAATAATAC-GATGCTATTAATATTCCAAAAATTAATAGTTAAGAAATTTAA
632 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATT-A-AG-TAAGAGATTTAA
* * * * * * *
232350 AAAATCAATCTGTTT-ACAGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAAAATTATCTATTTGAA
693 AAAATAAATCTGTTTGCCA-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAAAATTATCTATTTCAA
*** * * *** * * * *
232414 ATCCCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGCTT-TATTCTATTCATACAAGTTTATTTCAAAT
757 ATTATTATAACTTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAAT
* * *
232478 AAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAACAATAAATC
820 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATC
* **
232540 TGTTTATCAAACC
882 TGTTTACCAAATA
* * * * * * * * * *
232553 AGTTTAACTCGTTAAGACCATTTGAACAATTATT-TATTTCAAATTATTATGACTTTTTATTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATT-TTCAATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
* * * *** * *
232617 TCATAAAACAATTATTTTTGTTTC-T-TCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
65 TCATAAAAGAATTGTTTTAG-TTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * ** * *
232680 -ATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAA-AAATATGTTTATCAAACAA-TTTATTAAT
128 TATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTA--AA-
* * * * *
232742 GTTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAATTGGAAAAATGAATCTGTTCATCGAACAGGTTCAAATAG
189 ----T---AATT-ATGACT------ATTTGAACAAT-TATC---T-AT--------TTCAAATTG
* * * *
232807 TTATGA-CTATCTAAATAATTATCTATTCCAAAAACATTATTACATTTTGT-TTTATCATAAAAC
227 TTATAACCT-T-T---T-GTT-T-TA-T-CATAAA-A--A-TA-ATTTT-TCTAT-TCAT---AC
* * * * * *
232870 AATCGGTTTTGTTCATGCAAGCTTAATTCAAATA-AAATATTATAAATTTATTAATATTCCAAAA
272 AA--GCTTAT-TT-A-G-AA--TAAAAT--AATACTAAT-TTAT-TA-------ATATTCCAAAA
* * * * * * *
232934 GTTAATAAGTAA-AAATTGAAAAAATAGATATGT-TTTTTGAA-C-ATGTCCAAATATTTATGAC
318 ATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAATA-A-ATCTATTTATAAACCAAT-T-CAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
232995 TATTTGAACAATTATCTATTTC-TAATCATTATGACCATATGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTC
378 TATTTAAACAATTATTTATTTCAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTC
* * * *
233059 TATTCAAACAAACTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAA-
442 AATTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * **
233121 CAAAATATTTTAAAAAATAGATATATTTA-CTAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
505 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATA
** * * * * *
233185 ATTATTTATTTC-AATCACTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTGTTCAGATAA
568 ATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAA
* ** * *
233249 GTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA-TAAGTTGAAGATTTA
631 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAA---G-AGATTTA
* * ** * * * ** * * * * *
233313 AAAAATTAATCTATTTATCGAACAAGTT-AAACTAGTCATGTTTGTTTTAACTATTATATATTTC
692 AAAAATAAATCTGTTTGCCAAACTAGTTCAAA-TAGTTATGACTATATGAA-AATTATCTATTTC
* * * * * * * ** *
233377 AAATCATTATGACATTCTAT-TTTATCGTAAAACAATTCTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGA
755 AAATTATTATAAC-TT-TTTGTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAA
* ** * * *
233441 ATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTTGAAAATTATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAA
818 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA--A-TA----AGCAA-GA--AATTTAAA
* ** * * * *
233506 ATCATTGTGACCTTTTATTTTATCATAAAA
873 A--A--AT-A-AATCT-GTTTACCA-AATA
* *** ** * * * * **
233536 CAATT-GTTTCAGTTCAT-AAAAGCTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-ACTTTTGT
1 -AGTTCAAAT-AGTT-ATGACCA-TTTGAATAATTTTCAATTTCAAATCATTATGACA-TTTTGT
* * *** ** * *** * *
233598 TTTATCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAAGCCTATTTGGAGTAGAATAATACTAATTTATT
61 TTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
233663 AATATTTCAAAAATTAATACGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGTAA-TAGTTAAA
126 AATATTTCAAAAATTAATAAGAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-G-AACAAGTTTAA
** * * * *
233726 ATAGCTATGACTTTTTGAACAATTATATATTTCAAATT-TGTATAACCTTTTGTTCTGTCAT-AA
188 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT-TATAACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * * * *
233789 AACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GTAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTA
252 AATAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* * * * * * * * * * *
233853 AAAATTAAGAACTAACAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAATTAAGGC
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * **
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* * ** * * * * * *
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**
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* * ** * * * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * *** * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * ** ** * *
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* ** * * * * *** *
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* * **
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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** ** * * *
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* * * * * * * * * **
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* ** * * * **
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * *
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** * * * *
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* * *
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* *
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* * * *
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* * * *
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*
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* * * *
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* * ** * ** * **
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** * * * * *
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*
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* * * * * * **
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60 AAATAAATATGTTTAC--AAAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCA
* ** * * *
200371 AATCGTTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGGTTCGTAAAAGCT-
123 AATCGATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT-CTTCATACAAG-TG
** * * * * *
200426 TATCCACAATAAAATAATACTATTTTATTATTATTTTAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAA-TAAGAGATTTAAAAA
*** ** * ** * * * *
200491 ATAAAT-TAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT
62 ATAAATAT-GTTTACAAAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT
* * * * * * *
200555 TGTTATGAA-CTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATAATACAAGTC
126 CGATAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGTG
** *
200607 TATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAA
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAA
** * *
200672 ATAAATATACTTA-AAAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT
62 ATAAATATGTTTACAAAAAC-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT
* * * * *
200736 TGTTGTAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATCTTCATACAAGTG
126 CGATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGTG
* * * * *
200788 TATTTAAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTCAAAAA
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * *
200853 ATAAATTTGTTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTA-AGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAAT
62 ATAAATATGTTTACAAAAACAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT
* * * * *
200917 CGATATAACCTTTTGTTTTGTC-TCAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTT
126 CGATATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGTG
* * ** * *
200969 TGTTTAGAA-AAAATAATGTTAATTTATTGATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAATAA
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
201033 ATCTGTTTACAAAATCAGTTCAATTATTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAGTC-ATT
66 ATATGTTTACAAAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGA-T
* * * * * *
201097 ATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATATAA-TCT
130 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGT-G
* ** * * * *
201145 TATTCAAAATAAGGTAA-AGCTAATTTTTTAATA-GTCTAAAAATTAGTAAGTAACGAACTTAAA
1 TATTTAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--A-G-ATTTAAA
** ** ** ** * *
201208 AAA-AGAATCCGTTGGCCTAGTCAGTACAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
60 AAATA-AATATGTTTACAAAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAA
* * * * * *
201272 ATC-ATTATTATCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCTGTGT-GTACAAGCTG
124 ATCGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCT-TCATACAAG-TG
** * * * * *
201327 -ATTTGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATGTAAAAACTAA
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * *
201391 ATATGTTTATCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATC---
66 ATATGTTTA-CAAAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGAT
* * * *
201452 ---A-C--TTGTTTTGTCATAAAATAATTCTTTCTATTCATACAAGCT-
130 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAG-TG
* * * * * * * * *
201494 TATTTCAATTAAAATAACACAAATTTAATAATAATTGGACAACTGAAA-AAATAAAAAATTTTAA
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT--TCAA---AAATTAATAAGAGA-TTTAA
* * * * *
201558 AAAATAAATCTGTTTATCGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCA
59 AAAATAAATATGTTTA-CAAAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCA
* * * * * * *
201622 AATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTTTGTTCATGCAAGCT-
123 AATCGATATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAG-TG
* * * * * ** *
201677 TATTCATATTAAAATAATATTAATTTATTAATAGTTCATCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAA
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAA
* * * * *
201742 ATAAATATGTTTATAGAAAA-TGTTCAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTATTTCGAA-
62 ATAAATATGTTTACA-AAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT
* * ** * * * *
201805 CCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAAAAATTGTATTA-GTTCATATAGAAT-
126 CGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTATCTTCATACA-AGTG
* * * *
201858 TA-CTCAAA-AAATTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAT
1 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAA
* * ** * * * *
201921 ATGAATATATTTAC-CGAACAAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
62 ATAAATATGTTTACAAAAAC-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAAT
201985 AATACTAATT
Statistics
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0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
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TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAA
ATATGTTTACAAAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGATA
TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATCTTCATACAAGTG
Found at i:201598 original size:174 final size:175
Alignment explanation
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Period size: 183 Copynumber: 2.4 Consensus size: 175
201371 ATAAGAGATG
*
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1 TAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT
* *
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*
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* * *
201555 TAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTT
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* * *
201620 CAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTCATA
65 CAAA----TATAAC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATA
* ** * * * * * *
201685 TTAAAATAATATTAATTTATTAATAGTTCATCAATTAATAAGTAAAAGATTT
124 TTAAAATAACACAAATTTAATAATAATTCATCAATGAAAAAATAAAAAATTT
* * *
201737 T-AAAAATAAATATGTTTATAGAAAATGTTCAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTATTT
1 TAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT
201801 C
65 C
201802 GAACCATTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (175 bp):
TAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTC
AAATATAACTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAAT
AACACAAATTTAATAATAATTCATCAATGAAAAAATAAAAAATTT
Found at i:201729 original size:532 final size:532
Alignment explanation
Indices: 201021--201984 Score: 1130
Period size: 532 Copynumber: 1.8 Consensus size: 532
201011 TAATAAGAGA
* * * *
201021 TTTAATAAATAAATCTGTTTACAAAATCAGTTCAATTATTTATAACAATTTGAATAATTATTTAT
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAATAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTAT
* * * *
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** * * *
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* * ** * *
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* * ** * * * * *
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* *
201339 A-TAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-A-A-TAAGAGATGTAAAA-ACTAAATATGTTT
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* *
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201464 ATAAAATAATTCTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAACACAAATTTAATAATAAT
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201529 TGGACAACTGAAAAAATAAAAAAT
509 TGGACAACTGAAAAAATAAAAAAT
* * *
201553 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTA
1 TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAAATAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTA
** ** * * * *
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65 TTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTCTATTAATACAAGCTTATTC
* * * ** ** *
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130 AAAATAAAATAA-AGCTAATTTATTAATAGTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGAACTTAAAAAAA
* * * *
201745 AATATGTTTATAGAAAATGTTCAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTATTTCGAACCATT
193 AATACGTTCATAGAAAATGTACAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAACCATT
201810 ATGACCTTTTGTTTCATCATAAAAAAATTGTATTAGTTCATATAGAATTACTCAAAAAATTAATA
258 ATGACCTTTTGTTTCATCATAAAAAAATTGTATTAGTTCATATAGAATTA-TCAAAAAATTAATA
* * *
201875 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATATATTTACCGAAC
322 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-GAGTAAGAGATGTAAAATATAAATATATTTACCGAAC
* *
201940 AAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
386 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
201985 AATACTAATT
Statistics
Matches: 355, Mismatches: 60, Indels: 32
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (532 bp):
TTTAAAAAATAAATCTGTTTACAAAATAAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTAT
TTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTCTATTAATACAAGCTTATTCA
AAATAAAATAAAGCTAATTTATTAATAGTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGAACTTAAAAAAAAAT
ACGTTCATAGAAAATGTACAAATAGTTATAACTATTTCAATAATTATCTATTTCAAACCATTATG
ACCTTTTGTTTCATCATAAAAAAATTGTATTAGTTCATATAGAATTATCAAAAAATTAATACTAA
TTTATTAATATTCCAAAAATTAAGAGTAAGAGATGTAAAATATAAATATATTTACCGAACAAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCACTTGTTTTGTCATAAAATAATTC
TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAACACAAATTTAATAATAATTGGACAACTGAA
AAAATAAAAAAT
Found at i:202084 original size:113 final size:114
Alignment explanation
Indices: 201870--202093 Score: 321
Period size: 113 Copynumber: 2.0 Consensus size: 114
201860 CTCAAAAAAT
* *
201870 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATATATTTAC
1 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC
* * *
201935 CGAACAAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
66 CGAACAAGTTCAAATGATTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
* *
201984 TAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAGT-A-AGATTTAAAAAAATAAATTTGTTT
1 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATGAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATATTT
*
202046 ACTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACAATTTAAACAATTATCTATTTC
64 ACCGAACAAGTTCAAAT-GATTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTC
202094 TAGTTGTTAT
Statistics
Matches: 99, Mismatches: 8, Indels: 7
0.87 0.07 0.06
Matches are distributed among these distances:
112 6 0.06
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TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC
CGAACAAGTTCAAATGATTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTCAAA
Found at i:202623 original size:18 final size:18
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Indices: 202596--202649 Score: 58
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202586 AAACAATGTC
*
202596 AAATAGTTATGACTATTT
1 AAATAATTATGACTATTT
202614 AAATAATTAT--CTATTT
1 AAATAATTATGACTATTT
* *
202630 AAAATCATTATGACCATTT
1 -AAATAATTATGACTATTT
202649 A
1 A
202650 TTTTGTCATA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 3, Indels: 6
0.77 0.08 0.15
Matches are distributed among these distances:
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AAATAATTATGACTATTT
Found at i:202626 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 201981--212169 Score: 3242
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201971 TATCTATTTC
* * *
201981 AAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAGT-A-AGATTTAAAAAAATAAATTTGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAT
* * * * *
202044 TTACTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACAATTTAAACAATTATCTATTTCTAGTTGTTATGACC
64 TTACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
202108 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATCTAAAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * ** * * * * *
202161 AAATAATACTATTTTTTTAATATTTCAAAAATTAGCAAGCAAGAGATTTAGAGACTAAAGCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * ** *
202226 TTCCAAACCAGTTTAAATTGTTATGACTATTTGAACGAA-TATCAATCTCAAATTTTTATGATC-
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* * ** * *
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* * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * *
202402 GCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-TTTAGAATATTTATCTATTTCAAATCGCTT-TGACCT
66 ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCT
* * * *
202465 TTTGTTTAGTCATACAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * *
202582 TACTAAACAA-TGTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCA
65 TACTAAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* ** * * * * **
202646 TTTATTTTGTCATAAAGTAATTGTTTTAGTTCATAAAATCTTATCCA-AATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * *
202762 ACCAAA-ACAGTCCAAATAATTATGGCCATTTGAAC-A--A-C----T---ATC--TATTACCTT
66 ACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
202813 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCAA--CATACAAGCTTATTT-GAAATA
130 TTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATA
* * * *
202864 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGTTTTAAAAAATATATTTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
202925 TA-TCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATGACCT
65 TACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-
* * * * *
202988 TTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * *
203041 AAATAATACTAATTTAGTAATTTTTGAAAAA-TAATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * ** * * * * *
203105 TTCTGAACCAA-TTCAAACAATTAAGACTAGATGAACCATTATTTATTTGAAATTGTTATGACCT
65 TACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * ** * * *
203169 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCAGCTCATATAAGCTTATTCAAAATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * ** * **
203221 TAATAAAACTAGTTT-TTAATATTTCAAAATTTTTTAAGTAAGAGATTTAGAAAATAGTTCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
203285 TACCAAACCAGTTCAAATACTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTA-CTT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* *** * * * * *
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130 T-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATA
* * ** * * **
203400 AAATTATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCTGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGCT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
203465 TA-TCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAAA-AATTATCTATTTCAAATTGTTATAACA
65 TACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * ** *
203528 TTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTT-TGTTCATACTATTTTATTCAGAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * ** * *
203581 AAGTAATATTAATTTAATAATATT-TTAAACT--TAAGT-A-A-A-TTAAAAAATAAATCTAATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * *
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66 A-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCT
** * * * ** * *
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129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * *
203753 AAATAATACTAATTTAATAATATTTCACAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * ** * * * * * * * *
203818 TGTTGAATTAGTTCAAATGGATAAGACTA-TTAGTATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACTT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * ** * *
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129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * ** * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAT-A-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * *
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63 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * ***
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128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA-TACAAGCTTATTTAGAATA
* * *** * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * ** * **
204176 TACTAAATC-ATTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTGAAATCGTTATGATTT
65 TACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
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129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATA
* * *
204291 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAACTAAATCTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* ** * * * * * *
204356 TACCGAGCCAA-TTCAAATAG-TATGACTATTTGAACAATTTTC-AGTCTCAAATCATTAAGATC
65 TA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACC
* ** * * **
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128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-A
* * **
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* ** * * ** * * * * **
204537 TGCGGAACCAGTTTAAATAGTTAAAACCA-TTAGAATAATTATCTATTTCATATCGTTATAATAT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * *
204601 TTTATTTAGTCATAAAATATTTATTTC-ATATCTTACAACCTTATTTAGAATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAT-TCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * * *
204653 AAATAATCCAAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * *
204718 TTACTGAACAAGTTTAAATAGATATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCT
64 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * * ** *
204783 TTCGTTTTGACATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* ** * * * * *
204835 AAATAATACTAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAAGAG-TTTAAAATATTAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * *
204899 TA-TCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTT----GA--A-C-A-TT----T-GTT-T-ACCT
65 TACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * *
204947 TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* *
204999 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * * * *
205060 TATCGAATC-GGTTTAAATAATTATTG-CCATTTCAATAATTATCTGTTTCAAATCGTTGTTACC
65 TA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* *
205123 TTTTG-TTTG---T------A-----T--A-TCATACAAGCTTATTCAAAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
*
205158 AAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
205223 TACCAAACCAGTTTAAATAGTTCTGACTATTTGAAGAATTGTATACT-TTAAATCAATTATTTAC
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAA-T-TAT-CTATT---TCAA--A--T-C
*** * * * ** * * *
205287 AAAATAAACCTTTTGTTCTATTGTAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATA
119 GTTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTTAG-AATA
* * * * * *
205350 AAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * *** * * * **
205415 T-GTCGAACTAGCTCAAATTGTTAAGACTATACGAACAATTTTTTTATTTTAAATTATTATGACC
65 TACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
205479 TTTTGGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTCAATTCATACTAGCGTATTCAAAATA
128 TTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * *
205532 AAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAATTCTAT
1 AAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * ** * *
205596 TTA-T-GACTA-TTTGAATAATTAT--CTATTT---CAA--ATC-A-TT---A-C-----GACAT
64 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * *** * * * * *
205640 TTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * * *
205692 AACTAATACAAATCTATTAATATTTCAGAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAGTCTTTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * *** *
205753 TA-TCAAGGCAA-TTCAAATATTTATGACTATTTGAGTGATTAAT-TATTTCAAATCGTTTTGAC
65 TACT-AA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * * * * *
205815 TTTTTGTTCTCTTATAAAATAATAGTTTCTATTCATACAACCTTATTCAG-ATA
127 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * * *
205868 AAATAATAATAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAAATATGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * *
205932 TTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAGA--
64 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACC
* * * * * * *
205995 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * *
206047 AAATAACACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAA-CTAT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTAT
* * * * * ** ** *
206111 TTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTGGAATCACTATAACCT
64 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * *
206176 TTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TCATCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAATTCATACAAGCTTATTT-AGAATA
* * *
206228 AAATAATA-TAAATTTATTAATATT-ATGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
1 AAATAATACT-AATTTATTAATATTCA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * * ** * *
206291 TTTAC-CAACAACTTCAAATCGTCATGACTATCTGAAC----A---A---CAAATTATTATGGCT
63 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * **
206345 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGCTTA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * *
206398 AAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATAT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * ** * * *
206463 TTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATAAGCATCCATTTCAAAT-GACTGTGACC
64 TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACC
* * * * *
206527 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTAACATAAGCTTATTT-GAAGTA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAA-TA
* * * * * *
206580 AAATAATAAC-AATTTATTAGTATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATCTG
1 AAATAAT-ACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTA
* * * *
206644 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAATATTGTTTCT
63 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC--AA-ATCG--T-T
* ** * * * * * * * * **
206709 ATTCATCCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAA---TATAAATTAAT-TAA---TA-TTCCAA-A
122 A-TGA-CC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * * * *** * * * ** *
206762 AAATAATAAGCAAAATTT-TCAAAAAT--AAACTTATTTTTTGAACACATTCAAATAGGTATGA-
1 AAATAAT-A-C-TAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAA-AAATA-AAT
* * * *** * * * * *
206823 CTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTATTTTGTC-ATAACCAATTGC-T
60 CTATTT--ACTAA--A-CAAGTTCAAATAGTTATGA-C---TATTTAAACAATTATCTATTTCAA
* * *** *** * * *
206885 TTTGTTCAT-ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATT-TATTAAAATTTCA-A-AA-ATT
116 ATCGTT-ATGAC---C-T-TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGT-TT-CAA-TTCATACAAGCTT
* *
206945 AATAAGTAA-A
171 ATTTAG-AATA
* * * * * ** * * * * * **
206955 AGATTTAAAAAATAAATCTATT--TA-CCGAGCGAGTTCAATGAGTTATGACTATTTGATTAAT-
1 A-A-AT-AATACT-AATTTATTAATATTC-A-AAAATT-AATAAG-TAAGA-GATTTAAAAAATA
* * ** * * * ** * *
207016 TATTTATTT-C-AAA-TTGTT-ATGAT-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
57 AATCTATTTACTAAACAAGTTCA-AATAGTTATG-ACTAT--TTAAACAA-T-TATCTATTTCA-
** *** *** ** * * ** * *
207075 AAAAGTT-T-A---TTTGGAATAAAATAATATTAATT-TATT-AATATTA-AAAAAATTAATAAG
115 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGT-TTCAAT-TCATACAAGCTTATTTAG
*
207132 -TTA
177 AATA
* * ** * * * * * **
207135 GAGAT-TTAAAAATTAAATCAAT-TTACCAAACAAGTTCAA-ATAGTTATGTCCG-TTTGAACTA
1 -AAATAATACTAATT-TATTAATATT--CAAA-AA-TT-AATA-AG-TAAG--AGATTTAAAAAA
* * * * * ** *
207196 T-CATCTATTT-C-AAAC-CGTT-ATGATATTTTATTTTGTCATAAAATAATGTCAATTTATTAC
55 TAAATCTATTTACTAAACAAGTTCA-AATA-GTTA---TGAC-T-ATTTAA--ACAA-TTA-T-C
** ** ** * * * *
207256 TATTTCAAA-AATTA--A---TAAGGATT-T-A-AAAACCA--GTTT-AAGT-AGT-TAAGCCTA
108 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA-TACAAGCTTA
* *
207307 -TGAGAACA
172 TTTAGAATA
* * * * * * ** * * ** ****
207315 ATTATCTATTTCAAATTGT-TCTGACCT-TTTATTTAGTT-ATAAAATAATTG-TTTCAGTTCAT
1 A--A-ATAATACTAATT-TAT-T-A-ATATTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTT-AAAAAAT
* * ** * * * * * * **
207376 AAATGCT-TATT-CAAAATAAAATAAAACTAATTTATAAAC-ATTCAAAAAATTA-ATA-AGCAT
56 AAAT-CTAT-TTACTAAACAAGTTCAAA-T-AGTTAT-GACTATTTAAACAATTATCTATTTCA-
* * ** ** * * * ** * *
207436 GAAAC-TAAAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAGCTA-TGCCT-ATTTGA-ACA
115 -AATCGT-TATGACCT---TTTGTTT-T-G-TC-A---TAAA-A-CAATTGTTTCAATTCATACA
**
207497 A--TTATTTA-TTTA
166 AGCTTATTTAGAATA
* ** ** * * * **
207509 AAATTGTTATGACCT--TTTATTTTTA-TCAAAAAACAATTGTTTCAGTGCATGAAAGCTTATCC
1 AAA---TAAT-A-CTAATTTATTAATATTC---AAA-AATT-AATAAGT--A--AGAGATT-TAA
* * * * * *
207571 AAAATAAAAT-AATATTACTTATTAA-TATTTCAAA-AATTGATAAGTTAGTGATTTAAAAAATA
51 AAAAT-AAATCTAT-TTAC-TA--AACAAGTTCAAATAGTT-AT--G--ACT-ATTTAAACAAT-
* * * * * * ** *
207633 AATC-AGTTTATCGAATCAGTTCAAAT-A-ATTATAGCCATTTG--A-ATAATTATCTATTTCAA
104 TATCTA--TT-TCAAATC-GTT---ATGACCTT-TTG--TTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCAA
* * * *
207692 ATCATTATGAA-CTTTTATTTTGTCATA
158 TTCA-TA-CAAGC--TTATTTAG-AATA
** * * *
207719 AAATAAT--TTTTTTCATCATACAAGTCTATTTGGTATAAAATAATAATTATTTAGTAATA-TTT
1 AAATAATACTAATTT-AT--T--AA---TA-TT--CA-AAAAT--TAA-TA---AGTAAGAGATT
*** * ** * ** *
207781 TAAAAATTAATAAGTAGGAGATGTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAAT-AGTTAT
48 T-AAAA--AATAA--A-TCTATTTACTAAA-CAA---G-TT-C--AAATAGTT---ATGA-CTA-
* * * * * * * *
207845 GACTATTTGAACAATTATATATTTCGAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAATAATTATT
94 -----TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
*** *
207910 TTTGTTCATACAAG--TATATTCGAAATA
154 TCAATTCATACAAGCTTAT-TTAG-AATA
* * ** * ** * *
207937 AAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTAGTAACCATGAGATTTAAAAAATAAATTTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * *
208002 TACCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTA-TAAGAACAATTCTTTATTTTAAATTGTTATGATC
65 TA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
208065 TTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCAGTTCTTAGTAA-CTTATTTAGAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-CAAGCTTATTTAGAATA
* * * * *
208118 AAATAAAACAAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
208183 TGTCGATCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGT
65 T-AC--T-AAACAAGTTC--A-AA-TA-G--T-TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * ** * *
208248 CATTATTACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAG-TTCATTTGGAATA
118 CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTT-ATTTAGAATA
* * * *
208310 AAATAATATTAATTTATTAATATT-ATGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * *
208374 TTACTAAACCTA-TTCAATTAGTTATAACAATTTTAACAATTATTTACTTT-AAATCGTGATGA-
64 TTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGAC
* * ** * * *
208436 CTATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTCTGTTCATAC-TGTTTTATTTGGAATA
127 CT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAG-CTTATTTAGAATA
* * * * * * * * *
208491 CAGTATTGCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAAT-A--ACG-GATTTAAAAAATGAATATGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * * * * * *
208552 GGCCT-GACTAGTAT-GAATAGCTATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
65 -TACTAAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * ** *
208615 TTTTGTTTTATCACAAAATAATTGCTCCTATTCAGACAAGCTTATCCAAAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * *
208668 ATATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * ** *
208733 TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTAT-AACTT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * *
208797 TATATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTAATACAAGCTGATTTTA-AATA
130 T-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTTAGAATA
* * * *
208849 AAATAATACAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT-AAGT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-T
* * * * *
208912 TTTCTGAACACA-TTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC
64 TTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** *** * * *
208976 TTTTGTTTTGTCATAAGCCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCGTATTCAAAATA
128 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * *
209029 AAATAATATTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * * * * * * * *
209094 TACCGAGCAAGTTTAAATAATTA-GACTGTTTGAACAATTATTTAATTAAAATAGTTATAATCTT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * *
209158 TTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-TTTATTCATAATA
130 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * *
209208 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAGGTATGATATTTAAAAAATAAATCTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
209273 TACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACATT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* ** * ** * *
209338 TTGTTTTATCAT-AAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATA
130 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * ** * * *
209388 AAATAATGCTAATCTATTGATATTTTGAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAACTAAATTTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
*** * * * *
209449 TAAGGGAACAA-TTCAAACAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATGTCAAATCGTTATGATC-
65 T-ACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * ** * *
209512 TTTATTTTATCAAAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTA-TTCGAATTA
129 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAA-TA
* ** * * *
209564 AAACAATACTAACGTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * *
209628 T--T-GACAA-TTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * * *
209688 TTTGTTTAGTCACCAAAATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
129 TTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * * * *
209741 AAATAATAGTACTTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGTAAGAGA-TT-AAAAA-AAATATGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
209803 TATTGAACAAGTTCTAATAGATT-TGACTATTTAAACAATTATCTATTT-AAAGTCATCAAGACC
65 TACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACC
* * * * ** *
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** * * * * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-AT
* * * * * * ** * * *
209984 TTAC-GAACCAGTTCTAATAGTTATGACTACTTGAACAAATATGAATCTCAAATAGTTATGATC-
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* * * * **
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* * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA--
* * * ** * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * ** * *
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** *
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* * ** * ** * * *
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* * *
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127 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAG-AATA
* * * *
210637 AAATAATGCTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * *
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* * * *
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* * * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * *
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* * ** * * **
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* * *
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1 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-T
* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * ** * *
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* * * ** *
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* * * * * * * * * * *
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* * * ** * **
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * *** * *
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* * ** *
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* * * * * ** * * *
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* * **
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* * ** * * * *
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* * * * * *
212111 TACCAAACCAGTTCAAAT-GATTATAACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTAT
65 TACTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
212170 TACTAATTTA
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* * * *
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* *
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** * * * * * *
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** * ** *
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** * *
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*
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* *
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**
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* * * *
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* ** * *
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** * *
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* * * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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*
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* * ** *
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* * * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** **
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* * * ** * * * **
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257 TAATTATGACTATTTGAACAA-TATCTA-TT-AACCT-TTA-T-GTTTCTTGTCCT-ATAAAACA
* * ** * * * * * * * * * *
203367 GTTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTGAAAGAAAATTATACTAATTTATTAATATTTAGAAAAT
315 ATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTTG-AATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAAT
* * * * * **
203432 TAATCTGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGCTTAT-C-AAACCATTTCAAATAGTTTTGACTAT
379 TAA----TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-ATT-TGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACT-T
* * * * * * * * *
203495 TT-GAAAAATTATCTATTTCAAATTG-TTATAACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTT-T
437 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-GTTTCA
* * ** **
203557 GTTCATACTATTTTATTCAGAATAAAGT
500 ATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAC
* * ** * * * *
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* * * * * * * * **
203643 AATCAAT-TCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAACTATTATGACCTTTTAA
65 AAACAATGTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * * * ** * * * *
203707 TTTGTCGTAAAACAATTGTATT-GTTCCTACAAGCTTATTCGGATTTAAATAATACTAATTTAAT
130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTA-TCAAAATAAAATAATACTACTTT-TT
* * * * **** **
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193 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAAT
* * * * * ** * * * **
203836 GGA-TAAGACTATTAGTATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTATTTAGTTATAAAAC
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* ** * *
203900 AATTGTTT-TAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAA
314 AATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAA
* * * * * * **
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* * * * *
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* ** *
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* * **** * *
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* * * * * * ** * * **
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* * * ** *
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* * * * *
204307 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTA-AAAACTAAATCTGTTTACCGAGCCAATTCA
191 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAAA-TAAATCTATTTACCAAACCAGTTCA
* * * * * * *
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* * ** *
204433 AAACAATTTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCC
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* ** * * *
204498 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCGGAACCAGTTTAAATAGTTAAAA
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** * * ** * * *
204563 CCATTAGAATAATTATCTATTTCATATCG-TTATAATATTTTATTTAGTCATAAAATATTTATTT
434 CTTTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT
* * * *
204627 C-ATATCTTACAACCTTATTTAGAATAAAAT
498 CAAT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAC
* * * * * *
204657 AATCCAAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAC
1 AATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGC-TGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * * *
204722 TGAACAA-GTTTAAATAGATATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTC
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* ** * * *
204786 GTTTTGACATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATACTAATTTC
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** * * * * * * * *
204851 TTAATATTTTGAAAATTAATAAGAAAGAG-TTTA-AAATATTAATTTGTTTATCGAACAAATTCA
191 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAA-ATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCA
* * *
204914 AATAGTTATGACTATTTGAAC-AT-T-TGTTTACCTTT-TG-TT-TTGT--TATAAAACAATTGT
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** * * *
204971 TTC-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
320 TTCTAA-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAAT
*
205035 AAGTGATTTAAAAA
383 AAGAGATTTAAAAA
205049 GTGAATCTAT
Statistics
Matches: 1988, Mismatches: 424, Indels: 245
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
522 4 0.00
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Consensus pattern (527 bp):
AATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTA
AACAATGTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCAAAATAAAATAATACTACTTTTTAAT
ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAAT
TATGACTATTTGAACAATATCTATTAACCTTTATGTTTCTTGTCCTATAAAACAATTGTTTCTAA
TCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTAATAACATTCAAAAAATTAATAAGAGATT
TAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTTTTAGAATAATTATCTATTT
CAAATCGCTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGA
ATAAAAC
Found at i:203267 original size:180 final size:175
Alignment explanation
Indices: 202808--206615 Score: 895
Period size: 180 Copynumber: 21.5 Consensus size: 175
202798 ACTATCTATT
* * **
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* * * * *
202872 CTAATTTATTAATATTTCAAGAA-TTAATAAGAGTTTTAAAAAATATATTTATTTATCGAACTAG
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* * * ** *
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128 TTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTACTTTTTCAAATTGTTATG
* * * * *
202984 ACCTTTTTGTTCTATCATAAAATAATTGTTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
1 ACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCA-G-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * *
203048 ACTAATTTAGTAATTTTTGAAAAATAATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTGAA
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* * *
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124 CCAATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTACTT-TTTCAAATTGTTATG
* * * *
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1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * ** * *
203230 TAGTTT-TTAATATTTCAAAATTTTTTAAGTAAGAGATTTAGAAAATAGTTCTATTTACCAAACC
65 TAATTTATTAATATTTCAAAA---TTTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACC
* * * ** * * *
203294 AGTTCAAATACTTATA-ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATT
126 AATTCAAACAATTA-AGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
* * ** * * * * ** * *
203345 A-CTTTAT-TTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTTGAAAGAAAATTATA
1 ACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * ** *
203408 CTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCTGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGCTTATCAAA
64 CTAATTTATTAATATTTCA-AAATTTAA----TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* * * ** ** * * *
203472 CCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
124 CCAATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
* * * * * * ** * *
203525 ACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTT-TGTTCATACTATTTTATTCAGAATAAAGTAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * * *
203589 TTAATTTAATAATATTT-TAAACTTAAGT-A-A-A-TTAAAAAATAAATCTAATTACCGAATCAA
64 CTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAA
* * * * * * *
203649 TTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAACTATTATG
128 TTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
** * * * ** * *
203698 ACCTTTTAATTTGTCGTAAAACAATTGTATT--GTTCCTACAAGCTTATTCGGATTTAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * *
203761 CTAATTTAATAATATTTCACAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAAT
64 CTAATTTATTAATATTTCA-AAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC
* * ** * * * * *
203826 TAGTTCAAATGGA-TAAGACTA-TTAGTATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTG
125 CAATTCAAA-CAATTAAGACTAGAT-GAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
* * * * * * *
203878 ACTTTTTATTTAGTTATAAAACAATTGTTTTAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
203943 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAACAAAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTA
65 TAATTTATTAATATTTC--AAAATT--T---AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGA
* * * ** ** ** * * * *
204006 ATCAAGTTTAAATAGCTATTACTATTTGAAC-A--A--TTGTCTAATCGTTATA
123 ACCAA-TTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTACTTTTTCAAATTGTTATG
* * * * * * ** * *
204055 ACCATTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAGCACAAGCTTAGACAGAATAAAATAACAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* ** * * * *
204120 TAATTTATTAATCTTTTTGAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAACAATAAATCTATTTA-CTAAAT
65 TAATTTATTAAT-ATTTCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAAC
* * * * * * ** ** * * *
204184 CATTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTGAAATCGTTATG
125 CAATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
** * * **
204236 ATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
204300 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAACTAAATCTGTTTACCGAGCC
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACC
* * * ** * ** * ** *
204365 AATTCAAA-TAGTATGACTATTTGAACAATTTTCAGTCTCAAATCATTAAG
126 AATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAA-TTACTTTTTCAAATTGTTATG
* * ** * * * ****
204415 ATCTTTTTTTTTACCATAAAACAATTTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT-TGGTTAAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTATTTC-AGTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAAT
* * * ** *
204479 ACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTT-GCGGA
63 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GA
* * * * * * * * * * * *
204543 ACCAGTTTAAATAGTTAAAACCA-TTAGAATAATTATCTATTTCATATCGTTATA
123 ACCAATTCAAACAATTAAGACTAGAT-GAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
** * * * * * * * * * *
204597 ATATTTTATTTAGTCATAAAATATTTATTTCATATCTTACAACCTTATTTAGAATAAAATAATCC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCA-GTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * ** * *
204662 AAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAA
65 TAATTTATTAATATT-TCAAAATT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATC-GAA
* * * * ** * *
204726 -CAAGTTTAAATAGA-TATGATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATG
124 CCAA-TTCAAACA-ATTAAGACTAGATGAACAATTACTT-TTTCAAATTGTTATG
* * * * * * *
204779 ACCTTTCGTTTTGACATAAAACAATTGTTCCAGTTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
204844 TAATTTCTTAATATTTTGAAAA-TTAATAAGAAAGAGTTTAAAATATTAATTTGTTTATCGAACA
65 TAATTTATTAATA-TTTCAAAATTTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACC
* * * **
204908 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC----A-----T----TTGTT-T-
126 AATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTACTTTTTCAAATTGTTATG
* * *
204943 ACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * **
205008 TAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTATCGAATCGGT
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAATTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAAT
* * * * ** * * * * * *
205072 TTAAATAATTATTG-CCATTTCAATAATTATCTGTTTCAAATCGTTGTT
129 TCAAACAATTA-AGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
* * * * *
205120 ACCTTTTG-TTTGT-AT--ATC-A-TA---CAAGCTTATTCAA----AAT-AAAATAATACTAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAA-AATAAT
* * * ** * *
205171 --TTA-TTAAT-CT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
63 ACTAATTTATTAATATTTCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC
* * * * ** ** * * * *
205231 CAGTTTAAATAGTTCTGACTATTTGAAGAATTGTATACTTTAAATCAATTATT-TACAAAATAA
125 CAATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAA---T-TACTTT--TTCAA--ATTGT----TAT-G
* * ** * **
205294 ACCTTTTGTTCTATTGTAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCA-G-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * *
205358 CTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCGAAC
64 CTAATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC
* ** *** * * ** * *
205423 TAGCTCAAATTGTTAAGACTATACGAACAATTTTTTTATTTTAAATTATTATG
125 CAATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAA-TTACTT-TTTCAAATTGTTATG
* * * *
205476 ACCTTTTGGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTCAATTCATACTAGCGTATTCAAAATAAAATAA-A
1 ACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * *
205539 ATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAATTCTATTTAT-G-A
64 CT-AATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* ** * * ** ***
205602 -CTATTTGAATAATT-A-TCT--AT-TTCAA--A-----TC--ATT-ACG--
124 CCAATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTACTTTTTCAAATTGTTATG
* * * * ** * * * *
205636 ACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
205701 AAATCTATTAATATTTCAGAAA-TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAGTCTTTTTATC-AAGGCAA
65 TAATTTATTAATATTTCA-AAATTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CCAA
* * * ** *** * * *
205764 TTCAAATATTTATGACTATTTGAGTGATTAATTATTTCAAATCGTTTTG
128 TTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTACTT-TTTCAAATTGTTATG
* * * * * * * *
205813 ACTTTTTGTTCTCTTATAAAATAA-TAGTTTCTATTCATACAACCTTATTC-AGATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTC-AGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * * *
205876 ATAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAA
64 CTAATTTATTAATATTTCAA-AATT--TAA-T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* * * * * ** * *
205940 CTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAG
124 CCA-ATTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTAT-G
* * * *
205994 A--TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAACAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
206056 TAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAA-CTATTTA-CCAAA
65 TAATTTATTAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTATCGAAC
* * * ** ** *** *
206119 CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTGGAATCACTATA
125 CAA-TTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTGTTATG
* * *
206172 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TCATCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT-TTC-AGTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAT
* * * * *
206235 A-TAAATTTATTAATATTATGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCA
63 ACT-AATTTATTAATATT-TCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGA
* * * ** *
206298 A-CAACTTCAAATC-GTCATGACTATCTGAAC-A--A------CAAATTATTATG
123 ACCAA-TTCAAA-CAATTAAGACTAGATGAACAATTACTTTTTCAAATTGTTATG
* * * * * **
206342 GCTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAGCTTAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATA
* * * *
206406 TTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATATTTA-CCAA
64 CTAATTTATTAATATTTCAA-AATT--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* * * * * ** * ** ** * *
206470 ACAATTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATAAGCATCCATTTCAAA-TGACTGTG
124 CCAA-TTCAAACAATTAAGACTAGATGAACAATTA-CTTTTTCAAATTG-TTATG
* * * ** *
206524 ACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTA-ACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTCATAC--AAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-
* * *
206588 AC-AATTTATTAGTATTCCAAAAATTAAT
63 ACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAAT
206616 GAGTAAGAGA
Statistics
Matches: 2733, Mismatches: 665, Indels: 466
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
156 26 0.01
157 4 0.00
159 30 0.01
160 54 0.02
161 43 0.02
162 15 0.01
163 59 0.02
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165 11 0.00
166 10 0.00
167 2 0.00
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169 12 0.00
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189 7 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAATTC
AAACAATTAAGACTAGATGAACAATTACTTTTTCAAATTGTTATG
Found at i:203450 original size:360 final size:355
Alignment explanation
Indices: 202808--204531 Score: 851
Period size: 353 Copynumber: 4.8 Consensus size: 355
202798 ACTATCTATT
* ** *
202808 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-CATTTCAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAAC
* * * * *
202873 TAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGTTTTAAAAAATATATTTATTTATCGAACTAGTT
65 TAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAACCAGTT
* * * * *
202938 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACTTTTTCAAATTGTTATGACCTTTTTGTTCTATCATA
130 CAAATACTTATAACTATTTAAACAATTACTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTGTTCTATCATA
* * * *
203003 AAATAATTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATTTTTGA
195 AAACAATTGTTTATGTTAATACAAGCTTATTCAGAAGAAAATAATACTAATTTAGTAATTTTAGA
203068 AAAATAATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACCAATTCAAACAATTAAGACT
260 AAAATAAT-ACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACCAATTCAAACAATTAAGACT
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* * * *
203165 ACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-ATTTCAGCTCATATAAGCTTATTCAAAATATAATAAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCATTTCA--ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAA
* *
203229 CTAGTTT-TTAATATTTCAA-AATTTTTTAAGTAAGAGATTTAGAAAATAGT-TCTATTTACCAA
64 CTAATTTATTAATATTTCAAGAA----TTAA-TAAGAGATTTAAAAAATA-TATCTATTTACCAA
*
203291 ACCAGTTCAAATACTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTA-CTTTATT-T
123 ACCAGTTCAAATACTTATAACTATTTAAACAATTA-CTATTTCAAATTGTTATGACCTTT-TTGT
* * * * * * * * *
203354 T-TGTCATAAAACAGTTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTT-TGAAAGAAAATTATACTAATTTAT
186 TCTATCATAAAACAATTGTTTATGTTAATACAAGCTTATTCAG-AAGAAAATAATACTAATTTAG
* * * * * * *
203417 TAATATTTAGAAAATTAAT-CTGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGCTTATC-AAACCATTTCA
250 TAAT-TTTAGAAAAATAATACT-T-AGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTTCTGAACCAATTCA
* * ** ** ** * * *
203480 AATAGTTTTGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
311 AACAATTAAGACTAGATGAACCATTATTTATTTGAAATTGTTATG
* * * ** *** * ** * * * *
203525 ACATTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTCAGAATAAAGTAATAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-CATTTCAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAAC
* * * * * * * *
203590 TAATTTAATAATATTTTAA-ACTTAAGT-A-A-A-TTAAAAAATAAATCTAATTACCGAATCAAT
65 TAATTTATTAATATTTCAAGAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAACCAGT
* * * * * * ** *
203650 TCAAATAGTTA-AGACTATATGAACGATTATCTATTTCAAACTATTATGACCTTTTAATT-TGTC
129 TCAAATACTTATA-ACTATTTAAACAATTA-CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTGTTCTATC
* * ** * *** *
203713 GTAAAACAATTGTAT-TGTTCCTACAAGCTTATTCGGATTTAAATAATACTAATTTAATAATATT
192 ATAAAACAATTGTTTATGTTAATACAAGCTTATTCAGAAGAAAATAATACTAATTTAGTAAT-TT
* * * * * * ** * **
203777 TCA-CAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGT-TGAATTAGTTCAAATGGA-
256 T-AGAAAAATAAT-ACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACCAATTCAAA-CAAT
* * ** * * *
203839 TAAGACTA-TTAGTATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTG
317 TAAGACTAGAT-GAACCATTATTTATTTGAAATTGTTATG
* * * * * * * * *
203878 ACTTTTTATTTAGTTATAAAACAATT-GTTTTAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCATTTCA--ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAA
* * * * * *
203942 CTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAACAAAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTA
64 CTAATTTATTAATATTTC-AAGAATTAAT------AAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCA
* * * * * * * * * *
204006 ATCAAGTTTAAATAGC-TATTACTATTTGAAC-A--A-T-TGTCTAATCGTTATAACC-ATTTGA
122 AACCAGTTCAAATA-CTTATAACTATTTAAACAATTACTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTG-
* * ** ** * *
204064 TT-TGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTAGCACAAGCTTAGACAGAATAAAATAACACTAATTTA
185 TTCTATCATAAAACAATTGTTT-ATGTTAATACAAGCTTATTCAGAAGAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * * * * *
204127 TTAATCTTTTTG-AAATTAATAAGTAAGAAATTTAAACAATAAATCTATTTACTAAATCATTTAA
249 GTAA--TTTTAGAAAAATAAT-ACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACCAATTCA
* * * * ** ** * *
204191 AATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTGAAATCGTTATG
311 AACAATTAAGACTAGATGAACCATTATTTATTTGAAATTGTTATG
** ** * * ** *
204236 ATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCATTTCAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACT
* * * * * * *
204301 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAACTAAATCTGTTTACCGAGCCA
66 AATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAACCA
* * * * * * ** * * *
204366 ATTCAAATA-GTATGACTATTTGAACAATT-TTCAGTCTCAAATCATTAAGATCTTTTT-TTTTA
127 GTTCAAATACTTATAACTATTTAAACAATTACT-A-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTTGTTCTA
* * * * * ** * *
204428 CCATAAAACAATTTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGTTA-AAAATAATACTAATTTAATAA
190 TCATAAAACAA-TTGTTTATGTTAATACAAGCTTATTCAG-AAGAAAATAATACTAATTTAGTAA
* ** * *
204492 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
253 TTTTAGAAAAA-TAAT-ACTTAGAGATTTAAAAAATAAAT
204532 GTGCTTGCGG
Statistics
Matches: 1052, Mismatches: 239, Indels: 148
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
351 3 0.00
352 7 0.01
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354 44 0.04
355 45 0.04
356 15 0.01
357 139 0.13
358 135 0.13
359 71 0.07
360 216 0.21
361 103 0.10
362 6 0.01
363 39 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (355 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCATTTCAACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACT
AATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTACCAAACCAGTTC
AAATACTTATAACTATTTAAACAATTACTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTGTTCTATCATAA
AACAATTGTTTATGTTAATACAAGCTTATTCAGAAGAAAATAATACTAATTTAGTAATTTTAGAA
AAATAATACTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACCAATTCAAACAATTAAGACTAG
ATGAACCATTATTTATTTGAAATTGTTATG
Found at i:206067 original size:179 final size:181
Alignment explanation
Indices: 205596--206697 Score: 845
Period size: 182 Copynumber: 6.2 Consensus size: 181
205586 ATAATTCTAT
*
205596 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-CGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
1 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
* * * * * * * * * *
205660 ATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATACAAATCTATTAATATTTCAGAAATT
65 TTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * * *
205725 AATAAG-----AGATTTAAAAAATAAGTCTTTTTATCAAGGCAA-TTCAAATAT
129 AATAAGTAAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA-ACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
205773 TTATGACTATTTGAGTGATTAAT-TATTTCAAATCGTT-TTGACTTTTTGTTCTCTTATAAAATA
1 TTATGACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATAGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAAAA
* * * * *
205836 ATAGTTTCTATTCATACAACCTTATTC-AGATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAACAAT
64 ATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
*** * *
205900 TAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAG
128 TAATAAGTAAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* ** *
205953 TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAGA-TTTTGTTTTATCAT-AAAAAAT
1 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAGACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
* * * *
206016 TATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTA
66 TGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
* * * * *
206081 ATAA-TTAAGAGATTTAAAAAATGAAACTA--TTTACCAAACAAGTTTAAATAA
130 ATAAGTAAAAAAATTTAAAAAAT-AAA-TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * ** *
206132 TTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTGGAATCACTATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
1 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
* *** *
206196 TT-TCATCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTATGATA
65 TTGT--TTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAA
* * * *
206258 ATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AACAACTTCAAATCG
126 ATTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
206312 TCATGACTATCTG----A--A-C-A--ACAAATTATTAT-GGCTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
1 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
** * * *
206366 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAGCTTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAAT
65 TTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * *
206430 TAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAATTTCAAATAG
128 TAATAAGTAAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* ** * * * * * *
206484 TTATGTCTATTTGAATAAGCATCCATTTCAAATGACTGT-GACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
1 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
* * * * ** * *
206548 TTGTTTCAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATAAC-AATTTATTAGTATTCCAAAAAT
65 TTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCCAAAAAT
* * * * * * *
206612 TAATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
128 TAATAAGTAAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* *
206666 TTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA
1 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
206698 ATATTGTTTC
Statistics
Matches: 732, Mismatches: 144, Indels: 93
0.76 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
169 5 0.01
170 82 0.11
171 26 0.04
172 23 0.03
173 1 0.00
174 1 0.00
176 41 0.06
177 68 0.09
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180 97 0.13
181 88 0.12
182 153 0.21
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAGACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
TGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
TAAGTAAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
Found at i:206279 original size:359 final size:357
Alignment explanation
Indices: 205598--206702 Score: 928
Period size: 352 Copynumber: 3.1 Consensus size: 357
205588 AATTCTATTT
* * * *
205598 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATG
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTA-TAGATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
* * * * *
205663 TTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATAC-AAATCTATTAATATTTCAGAAA-T--
65 TTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAAT-TATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * * **
205724 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAGTCTTTTTATCAAGGCAATTCAAATATTTATGACTATTTGAGT
129 TAATAAGAGATTTAAAAAATAA-ACTATTTACCAA-ACAATTTAAATAATTATGACTATTTGAAC
* ** * * * *
205789 GATTAATTATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTCTCTTATAAAATAATAGTTTCTATTCATACA
192 AATTAATTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTCTCATAAAATAATAGTTTCTATTCATACA
* *
205854 ACCTTATTCAGATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAACAATTAATAAGTAAAAAAATTT-
257 ACCTTATTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTACAACAATTAATAAGTAAAAAAATTTA
** * *
205918 AAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTC
322 AAAAATAAATATGTTTA-CCAACAACATCAAATAGTC
* * *
205955 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAGATTTTGTTTTATCAT-AAAAAATTAT
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAGATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGT
* * *
206019 TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
66 TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAATA
206084 ATTAAGAGATTTAAAAAATGAAACTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACA
131 A-TAAGAGATTTAAAAAAT-AAACTATTTACCAAACAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACA
* ** * * *
206149 ATT-ATCTTTTTGGAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-ATTTCATCTATTCATA
193 ATTAAT-TATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTCTCATAAAATAATAGTT--TCTATTCATA
* ** * *
206211 CAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTATGATAATTAATAAGT-AAAAGA
255 CAACCTTA-TTCAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTACAACAATTAATAAGTAAAAAAA
* * *
206274 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAACAACTTCAAATCGTC
318 TTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACAACATCAAATAGTC
* * * *
206314 ATGACTATCTG----A--A-C-A--ACAAATTATTATGGCTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAG-ATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
* ** * * *
206369 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAGCTTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTA
65 TTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAAATTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * *
206432 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGTCTATTTG
128 ATAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAA-CTATTTACCAAACAATTT-AAATAATTATGACTATTTG
* ** * * * * * * * * * *
206497 AATAA-GCATCCATTTCAAATGACTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTA
189 AACAATTAAT-TATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTCTCATAAAATAATAGTTTCTA-TTC
* * * * * * * * * * * *
206560 ACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATAACAATTTATTAGTATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAG
252 ATACAACCTTA-TTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTACAACAATTAATAAGTAAAAA
* * * * ** *
206625 AACTAAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
316 AATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACAACATCAAATAGTC
* * *
206668 ATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAATATT
1 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATT
206703 GTTTCTATTC
Statistics
Matches: 605, Mismatches: 106, Indels: 67
0.78 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
349 11 0.02
350 15 0.02
351 75 0.12
352 132 0.22
353 27 0.04
354 26 0.04
355 56 0.09
356 19 0.03
357 37 0.06
358 11 0.02
359 127 0.21
360 59 0.10
361 1 0.00
362 1 0.00
364 8 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (357 bp):
ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATAGATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGT
TTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAATA
ATAAGAGATTTAAAAAATAAACTATTTACCAAACAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
AATTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTCTCATAAAATAATAGTTTCTATTCATACAACCT
TATTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTACAACAATTAATAAGTAAAAAAATTTAAAAA
ATAAATATGTTTACCAACAACATCAAATAGTC
Found at i:206584 original size:352 final size:347
Alignment explanation
Indices: 205639--212163 Score: 1145
Period size: 358 Copynumber: 18.5 Consensus size: 347
205629 CATTACGACA
* * * * * * * * **
205639 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAA-AATAAACTAATACAA
1 TTTTGTTTTATCAT-AAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AAGAATAAAATAATATTA
* * * * * * * *
205703 ATCTATTAATATTTCAGAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAGTCTTTTTATCAAGGCAA
64 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAA-ACAA
* *** * * * * *
205764 -TTCAAATATTTATGACTATTTGAGTGATTAAT-TATTTCAAATCG-TTTTGACTTTTTGTTCTC
128 TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAAT-GACTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
205826 TTATAAAATAATAGTTTCTA-TTCATACAACCTTA-TTCAGATAAAATAATA-ATAATTTATTAA
191 TCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGA-ATAAAATAATATA-AATTTATTAA
* * * * *** * *
205888 TATTCCAACAATTAATAAGTAAAAAAATTT-AAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATA
253 TATT-TAAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
* * * *
205952 GTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAG-A
316 GTTATGACTATATG---AA--A---A---CAAATTATTAT-GCT
* * * *
205995 TTTTGTTTTATCATAAAAAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAA-AATAAAATAACACTA
1 TTTTGTTTTATCATAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AAGAATAAAATAATATTA
* * * *
206058 AGTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAA-CTATTTACCAAACAA
64 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATATTTACCAAACAA
* * ** * *
206122 GTTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTGGAATCACTATAACCTTTTGTTTTGT
128 -TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGACTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
206186 CATAAAAAAATT-TCATCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAAT
192 CATAAAACAATTGT-TTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATATAAATTTATTAAT
* * * *
206249 ATTATGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AACAACTTCAAATCGT
254 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* *
206313 CATGACTATCTGAACAACAAATTATTATGGCT
318 TATGACTATATGAA-AACAAATTATTAT-GCT
* **
206345 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGCTTAAAATAATATTAA
1 TTTTGTTTTATCAT-AAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATATTAA
* *
206410 TTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAT
65 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAT
* * ** * * *
206475 TTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATAAGCATCCATTTCAAATGACTGTGACCTTTTGTTTTGTAA
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGACTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
206540 TAAAACAATTGTTTCAGTTAACATAAGCTTATTTGAAGTAAAATAATA-ACAATTTATTAGTATT
194 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAA-TAAAATAATATA-AATTTATTAATATT
* * * * * *
206604 CCAAAAATTAATGAGTAAGAGAACTAAAAAAATGAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
257 -TAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
206669 TGACTATATG--AAC--A--ATTAT-C-
320 TGACTATATGAAAACAAATTATTATGCT
* * * ** *
206689 -----TATT-TC--AAAATATTGTTTCTATTCATCCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATATAAAT
1 TTTTGTTTTATCATAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATATTAAT
* * * * * ****
206746 TAATTAATATTCCAAAAAATAATAAGCAAAA-TTTTCAAAAATAAACT-TATTTTTTGAACACA-
66 TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATATTTACCAAACA-AT
* * * *
206808 TTCAAATAGGTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCATTTATTTTGTC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GACTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
206872 AT-AACCAATTGCTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAA
193 ATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
* * * *
206934 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCGAGTTC-AATGAGT
255 TTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGT
* * *
206998 TATGACTATTTGATTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAT
318 TATGACTA--T-ATGAA--A---A---CAAATTATTATGCT
* * **
207039 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTA
1 -TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATATTA
** * * *
207104 ATTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAATTAAATCA-ATTTACCAAACAA
64 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTACCAAACAA
* * ** * * * * ** *
207168 GTTCAAATAGTTATGTCCGTTTGAACTATCATCTATTTCAAACCG-TTATGATATTTTATTTTGT
128 TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGACTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * ** *
207232 CATAAAATAA-TG--TCAATT--TATTA-C-TATTTCAA-AAATTAATA-AGGATTTAAAAACCA
192 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATA-AATTTATTAA-TA
** * *** * * * * * ** ** *
207288 GTTTAAGTAGT--TAAGCCTATGA---GAACAAT-TATCTATTT--CAAA-TTGTTCTGACCT-T
255 -TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTC--AAATAG
* * * * *
207343 TTATTTAGT-TAT-AAAA-TAATTGTTTCAGTTCAT
317 TTA-TGACTATATGAAAACAAATT-ATT-A-TGC-T
*** * * **** *
207376 AAATG-CTTATTCA-AAATAAAATAAAACTAATTTATA-AA-C--ATTCAA-AA-AATTAATAAG
1 TTTTGTTTTA-TCATAAA-AAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-AAGAATAA--AATAA-
* * ** ** * * ** * * ** ****
207433 CATGAAACTAAAAAAAAT--AAATCTGT-TTATCG-AACAAG-TTTAAATAGCTATGCCTATTTG
59 TATTAATTTATTAATATTCCAAAAAT-TAATA-AGTAA-AAGATTTAAA-AAATAAATATATTT-
* ** * * * * ** * * *
207493 AACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTTATCAAAAAACAATTGTTTC-AGTG-
119 ACCAA--A-CAATTTCAAATAGTTATGA-C---TA-TTTGAACAATTATC---TATTTCAAATGA
**** * ***** * * * * *
207556 C-ATGAAAGCTT-ATCCAAAATAAAATAA-T-ATT-ACTT-AT-TAA---TATTT-CA-AAAAT-
173 CTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATA
* * * * * * * * * * *
207608 -TGAT-AAGTTAGTGAT-TTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAATCAG-TTCAAATAATTATAGCC
238 AT-ATAAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAG--TA---AA--AGATTTAAA-AAATAAATCT
* ** * *
207669 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATG-----A--A---C---TT-TTA----
294 GTTT-ACCAA--A-CAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATATGAAAACAAATTATTATGCT
* ** *
207709 TTTTG-----TCATAAAATAATT-TTTTTCA-TCATACAAG-TCTATTTGGTATAAAATAATAAT
1 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCT-ATTCATACAAGCT-TATTAAGAATAAAATAAT-AT
* ** ** * * * ** *
207766 T-ATTTAGTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGAGATGTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACC
62 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACA
* * * * * *
207830 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCGAATTG-TTATAACCTTTTGTTATG
127 ATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATGACTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * *
207894 TCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAG-TATATTCGAAATAAAATAATACT-AATGTAATAA
191 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT-TATTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
* * ** ** * * *
207957 TATTTTGAAAATTAGTAACCATGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAA-TTCAAATA
253 TA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATA
* * * *
208021 GTTAAGACTATAAGAACAATTCTTTATTTTAAATTGTTATGAT
316 GTTATGACTATATGAA-AA--C--------AAATTATTATGCT
* * * * * * * *
208064 CTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCTTAGTAA-CTTATTTAGAATAAAATAAAAC
1 -TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTAAGAATAAAATAATAT
* * * * * * * * *
208127 AAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTGTCGATCG
62 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TT-T--ACCA
* * * * * * *
208192 AACTAGTTCAAATAATTATGACTATATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGTCATTATTAC
123 AACAATTTC--A-AA-TA-G--T-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGACTATGAC
* * * *
208257 TTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAG-TTCATTTGGAATAAAATAATAT
180 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTT-ATTT-GAATAAAATAATAT
* * * * * *
208319 TAATTTATTAATATTATGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACC
242 AAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-C
* * * * * * * *
208384 TA-TTCAATTAGTTATAACAATTTTAACAATTATTTACTTTAAATCGTGATGACT
305 AAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAA-AA-CA---A-ATT--AT--T-ATG-CT
* * * * * * ** * * * **
208438 ATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTCTGTTCATAC-TGTTTTATTTGGAATACAGTATTGCTA
1 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTAAGAATAAAATAATATTA
** * * ** **
208502 ATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAACG-----GATTTAAAAAATGAATATGTTGGCCTGACTA
64 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAAC-A
* * * * * * * * *
208562 GTAT-GAATAGCTATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TTATGACCTTTTGTTTTA
127 ATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGACTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *** * *
208625 TCACAAAATAATTGCTCCTA-TTCAGACAAGCTTATCCAAAATAATATAAT-TCTAATTTATTAA
191 TCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTAT-TTGAATAAAATAATAT-AAATTTATTAA
* * * **
208688 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
253 TATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * * *
208753 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATAACT
317 TTATGACTATATG---AA--A---A---CAAATTATTAT-GCT
* * * * * * * **
208796 TTATATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTAATACAAGCTGATTTTA-AATAAAATAATACAA
1 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAAGAATAAAATAATATTA
* * **
208860 ATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATA-AGTTTTCTGAACAC
64 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TTTACCAAACA-
* *
208923 A-TTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
127 ATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGA-CTATGACCTTTTGTTTTG
** ** * ** * *
208986 TCATAAGCCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCGTATTCAAAATAAAATAATATTAGTTTATTAATA
191 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATATAAATTTATTAATA
* * * * * * *
209051 TTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTTAAATAATT
255 TT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * **
209116 A-GACTGTTTGAACAATTATTTAATTAAAATAGTTATAAT
319 ATGACTATATGAA-AA-CA---AA-T----TA-TTATGCT
* * * * *
209155 CTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-TTTATTCATAATAAAATAATACTA
1 -TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATATTA
** * ** * * * * *
209219 ATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAGGTATGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAG
64 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAT
* * * * * * *
209284 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCG-TTATGACATTTTGTTTTATC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-GACTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** ** * * *
209348 AT-AAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATGCT-AATCTATTGATAT
193 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATA-
* * * *** * *
209411 TTTGAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTAAGGGAACAA-TTCAAACAATT
255 TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* *
209471 ATGACTAT-T-TAAACAATTATCTATGTCAAATCGTTAT
319 ATGACTATATGAAAACAA--AT-TAT-T---AT-G--CT
* * * * * *
209508 GATCTTTATTTTATCAAAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATT-CGAATTAAAACAATA
1 --T-TTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGAA-TAAAATAATA
* ** * * * * *
209572 CTAACGTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT----GAC
61 TTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAAC
* * * * * * * * *
209633 AA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAG
126 AATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGACTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** *
209697 TCACCAAAATAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAGT-ACTTTATTAA
191 TCA-TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
* * * * *** *
209761 CATTTGAAAAATTAATGAGTAAGAGA-TT-AAAAA-AAATATGTTTATTGAACAAGTTCTAATAG
253 TATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* *
209823 ATT-TGACTAT-T-TAAACAATTATCTATTTAAAGTCATCAAGACC
317 -TTATGACTATATGAAAACAA--AT-TA--T----T-AT---G-CT
* * * * *
209866 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAATTCATAAAAACTTATCCAA-AATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTATCAT-AAAAAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTAT-TAAGAATAAAATAATATT
** * ** * * * * *
209929 ACCTTACTAATATTTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTGT-TTTA-CGAAC
63 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA--TATATTTACCAAAC
* * * * * ** * * * *
209992 CAGTTCTAATAGTTATGACTACTTGAACAAATATGAATCTCAAAT-AGTTATGATC-ATTGTTTT
126 AATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGA-CTATGACCTTTTGTTTT
* * * ** *
210055 CTCATAAAGCAATTATTT-TTTATCATACAAGCCTT-TTT-AGATAAAAATAATATTAATTTATT
190 GTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAG-CTTATTTGA-AT-AAAATAATATAAATTTATT
* * ** * * *
210117 AATATTCAAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAATATATGTATGTTTGCCAAACCAGTT-AAA
251 AATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAA
** * **
210177 TAGTTAAAAGTAT-TAGAATAA-TTATCTATTTCAAATCGTTCT
314 TAGTTATGACTATAT-GAA-AACAAAT-TA-TT---AT-G--CT
* * * *
210219 AACATTTTG-TTTAGTCATATAATAATT-ATT-TAGTTTACACAAGCTTAGTTAA-AATAAAATA
1 ----TTTTGTTTTA-TCATA-AAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAAGAATAAAATA
** * * * * * * * *
210280 ATACCAATTTATCAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATC
58 ATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACC
* * * * *
210345 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGT
122 AAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGACTATGACCTTTTGT
* * * * * *** * **
210410 TTTGTCATAAAACCATCT-TTTTAGTCCTTAAAAGCTCT-TCCAAAACAAAATAATACT-ACCTT
187 TTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCAGTTCATACAAGCT-TAT-TTGAATAAAATAATA-TAAATTT
* *
210472 ATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAAT-TAGTTTACCAAA-ACAGTT
248 ATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACA-AGTT
* * *
210534 CAAATAATTATG-CTCAT-TCGAATAGCTACCTATTTCAAATCGT-TGTTACT
310 CAAATAGTTATGACT-ATAT-GAA-A---A-CAAATT---AT--TATG---CT
* * * * * * **
210584 TTTTGGTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATGCT
1 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTAAG-AATAAAATAATATT
* * * * * * *
210647 AATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCGAACCA
63 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAA
* * * * *
210708 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-C-----CAAATTG-TTATAACCTTTTGTTCTAT
128 TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGACTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
210766 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGC----TT--AT--AAT-A-CT-AATTTAATAATAT
192 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATAT
* * * *
210819 TCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTT
256 T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * *
210882 AAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC
319 ATGACTATATG---AA--A---A---CAAATTATTATG-CT
* * * * * *
210923 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGCTCGTAAAAGCTTATCCAAG-A-AAAATAATATT
1 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAAGAATAAAATAATATT
* * * *
210985 ACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAAAC
63 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TTTACC-AAAC
* * * * * * * * * *
211049 -AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAAC-ACTACCTATTTCAAA-GCATTATTACTTTTTGTTTT
126 AATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATG-ACTATGACCTTTTGTTTT
* * ** *
211111 GTCTTAAAACAATTGTTATTCA--ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATG
190 GTCATAAAACAATTG-T-TTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATA-TAAATTTATT
* * * * *
211173 AATATTTCAAGAATTAATAAG----AGATTTAAATAGTAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAAT
251 AATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT
* ** * * *
211234 AGTTTTGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
315 AGTTATGACTA--T-ATGAA--A---A---CAAATTATTAT-GCT
* * ** * **
211279 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATGTAAGCCTATTTTGAATAAAATAATATTAA
1 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATATTAA
* * * ** * * * * *
211344 TTTAGTAATATTCTAAAAATTAGTAACCAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACTAGT
65 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAAC-AAT
* * * * * * *
211409 TT-AAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCACATTG-TTATGACCTTTTCTTTTGTC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATGACTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
211472 ATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGGTTA-TCCAA-AAAA-AAT-T-ACTTTATTAATATTT
193 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
* * * * *
211532 CAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-TAATTTACCGAAACAA-TTCAAATAATTA
258 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
211595 TGGCCATTTGAACAACTACCTATTTCAAATCATTATTACT
320 TGACTATATG---AA--A---A---CAAATTATTA-TGCT
* * * * * * *
211635 TTTTGTTTTGTCTTAAAATAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCCTATT-CGAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTAAG-AATAAAATAATATT
** * * * * *
211698 AATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAG----AGATTTAAATAGTAAATCTATTTACCAAACCA
63 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAA
* * * * * * * *
211759 GTTAAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTG-TTATAACTTTTTGTTCTAT
128 TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TGACTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * *
211823 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-TCTAATTTAGTAATA
192 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATA
* * * ***
211887 TTCTAAAAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTATTGAACTAA-TTCAAATAG
255 TT-TAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AAGTTCAAATAG
* * *
211950 TTAAGACTATATGAACAACCATTTATTTCAAATTGTTATGAT
317 TTATGACTATATG---AA--A---A---CAAATTATTATGCT
* * ** * * *
211992 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGCTT-ATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAAC
1 -TTTTGTTTTATCATAAAA-AATTGTTTCTA--TTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATAT
* ** * * * * *
212055 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTTGTAACTAAAAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACC
62 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACA
* * *
212120 AGTTCAAAT-GATTATAACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAAT
127 ATTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
212164 CATTATTACT
Statistics
Matches: 4600, Mismatches: 1059, Indels: 1015
0.69 0.16 0.15
Matches are distributed among these distances:
318 5 0.00
320 3 0.00
321 13 0.00
322 12 0.00
323 1 0.00
324 2 0.00
325 4 0.00
326 27 0.01
327 9 0.00
328 8 0.00
329 16 0.00
330 38 0.01
331 62 0.01
332 83 0.02
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335 94 0.02
336 17 0.00
337 32 0.01
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340 15 0.00
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343 11 0.00
344 4 0.00
345 17 0.00
346 9 0.00
347 58 0.01
348 16 0.00
349 21 0.00
350 23 0.00
351 180 0.04
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361 306 0.07
362 201 0.04
363 7 0.00
364 6 0.00
365 9 0.00
366 13 0.00
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373 177 0.04
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (347 bp):
TTTTGTTTTATCATAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATAATATTAAT
TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAATTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATGACTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTAAA
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TATGAAAACAAATTATTATGCT
Found at i:211712 original size:533 final size:533
Alignment explanation
Indices: 207380--212173 Score: 3457
Period size: 533 Copynumber: 8.9 Consensus size: 533
207370 GTTCATAAAT
* * * * **
207380 GCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATAAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAAACTAA
1 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-A-G--A-TTT
* * * * * * * * * * *
207444 AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAGCTATGCCTATTTGAACAATTATTTATTTA
60 AAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
207509 AAATTGTTATGACCTTTTATTTTTATCAAAAAACAATTGTTTC-AGTGCATGA-AAGCTTATCCA
125 AAATTGTTATAACCTTTT-GTTCTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCAT-ACAAGCTTATTCA
* * * * *
207572 AAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATT-TCAAAAATTGATAAGTTAGTGATTTAAAAAATAAA
187 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
207635 TCAGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
251 TCTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * **
207698 ATGAACTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-TTTT-TCATCATACAAGTCTATTTGGTATAAAATA
314 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGC-TCATACAAG-C---TT-ATCCAAAATA
* * * * ** *
207761 ATAATTA-TTTAGTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGAGATGTAAAAAATAAATTTGTTTACT
373 A-AATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAATAAATTAATTTACC
* * * * * ** * *
207825 GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCGAATTGTTATAACCTTTTGT
436 GAAACAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGT
* * * ***
207890 TATGTCATAAAATAATTATTTTTGTTCATACAA
501 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAA
* * ** *
207923 G-TATATTCGAAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTTTGAAAATTAGTAACCATGAGATTTA
1 GCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-GAGATTTA
* * * * * * * * *
207987 AAAAATAAATTTATTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTA-TAAGAACAATTCTTTATTTT
61 AAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTA-AACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * * *
208051 AAATTGTTATGATCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCTTAGTAA-CTTATTTAG
125 AAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTCAA
* * * * *
208114 AATAAAATAAAACAAATTTATTAATGTT-TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATT
188 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
208178 CTATTTGTCGATCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATATGACTATTTGAACAATTATATATTT
252 CT-GTT-T--ACCAAACAAGTTC--A-AA-TA-G--T-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * ** * *
208243 CAAGTCATTATTACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATGCTTTT-GTTCATATAAGTTCATTTGG
305 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTTTAGCTCATACAAG--C--TT--
* * * *
208306 AAT--AAAATAATATTAATTTATTAATATTAT-GAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
363 -ATCCAAAATAAAATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAA
** * * * * * * * * *
208368 ATTTGTTTA-CTAAACCTA-TTCAATTAGTTATAACAATTTTAACAATTATTTACTTT-AAATCG
425 ATTAATTTACCGAAA-C-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAACTATCTA-TTTCAAATCA
* * * * * * *** *
208430 TGATGACTATTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTCTGTTCATAC-T
487 TTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAA
* * * * * * * *
208476 GTTTTATTTGGAATACAGTATTGCTAATTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATAACG-GATTTAAA
1 G-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-GAGATTTAAA
* * * ** ** * * * * * * * *
208539 AAATGAATATGTTGGCCTGACTAGTAT-GAATAGCTATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAA
63 AAGTAAATCTGTTTACCAAACCAGT-TCAAATAGTTAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA
* * * * ** * * *
208603 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAATAATTGCTCCTATTCAGACAAGCTTATCCAAAATA
127 ATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * *
208668 ATATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT
192 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
** ** *
208733 TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTAT-AACTT
257 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * * ***
208797 TATATTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTAATACAAGCTGATTTTAAATAAAATAATACAAA
322 T-TGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGCTCATACAAGCTTATCCAAAATAAAAT--TAC---
* * * * *
208861 TTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAA-TAAGTTTTCTGAACACA
380 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTAA-TTTACCGAA-ACA
** * * *
208924 -TTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
442 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCA-TTATTACTTTTTGTTTTGT
** ***
208987 CATAAGCCAATTGTTTTTGTTCATACAA
506 CATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAA
* * * * * *
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1 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * *
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* ** ** ** * *
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* * * * * * * * * *
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** *
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* * ** * *
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1 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
* * * *
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** * * * *
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* * * *
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* *** * * * *
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* * * ** * *
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* * * * **
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* * * * * ** * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
179 85 0.08
180 493 0.49
181 234 0.23
182 148 0.15
183 49 0.05
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAACTTATTCAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATATG
Found at i:213382 original size:361 final size:362
Alignment explanation
Indices: 212748--214168 Score: 1329
Period size: 361 Copynumber: 3.9 Consensus size: 362
212738 CAATTTTTTT
* * * * *
212748 TTTACCAAATTAGTTCAAAT-GATTAAGACTA-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAAC
1 TTTACCGAATAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * *
212811 CTTTTGTTTAGTCATTAAAACAATTGTCTCA-ATTCATACAAGA-TTATTCAAAATAAATTAATA
65 CTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGT-TTATATTCATACAA-ACTTATTC-AAATAAAATAATA
** * *
212874 CTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCAAA
126 CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTGCCAA
* * * * * * ** * *
212938 ACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTAAACAATTATCTACTTAAAAGC-TTCAAAACCTTTTGAT
190 ACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACATTTTGTT
* * *
213002 TTGTCATAAAAAAATTG-TTTCAATCAATACAAGCTTATTTCAAGTAAAATAATACAAATTTATT
254 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC-ATACAAGCTTATTTCAAGTAAAATAATACAAATTTATT
213066 AATATT-AAGACAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAAATAAATATG
318 AATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAAATAAATATG
* * * ** *
213112 TTTACCGAATAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGA-
1 TTTACCGAATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* **
213175 CTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAACTTATTCAAATTAAAATAATTTTA
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAACTTATTCAAA-TAAAATAATACTA
* * *
213239 ATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCGAACAA
129 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACAA
* * * *
213303 GTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTA
194 GTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTC
** *
213368 ATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATATGA-CTTATTTGAAGTAAAATAATACTAAA-TTATTAATA
259 ATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAGTAAAATAATAC-AAATTTATTAATA
* ** * *
213430 TTTCAAAAATTAATGAGT-AAGAGAAATAAAAAAA-GAATCTG
322 -TTCAAAAATTAATAAGTAAAG-GATTTAAAAAAATAAATATG
* * * *
213471 TTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCT-AGACAATTGTCTATTTCAAAACATTATGAC
1 TTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * * **
213535 CTTTTGTTTTATC-TCAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-
65 CTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT-GTTTATATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATAC
* * * * * **
213597 TAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTACA-A-ATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTTAA
127 T-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAA
** * * *
213660 CTCGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTT
191 CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTT
* ** *
213725 GTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTTGTAA-TAAAATAATA-ATAATTTATTA
256 GTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTT-CAAGTAAAATAATACA-AATTTATTA
* * * *
213788 AAATTCCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTTG
319 ATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAAATAAATATG
* * * * * * *
213832 TTTACC-AAGTGAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATTATTATAAA
1 TTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * * **
213896 CTTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTA
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAACTTATTCA-AATAAAATAATACTA
* ** ** * * * * ***
213961 ATGTATTAATATAAT-AAAATTAATAAGT-TGGAGACTTAAAAAATTAATTTATTCATCAAACAA
129 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACAA
* * * * *
214024 GTTCAAATAGTTATGTCCATTTAAACT-ATTATCTGTTTCAAATCATTATGACATTTTTTTTTGT
194 GTTCAAATAGTCATGACTATTTAAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
** ** * *
214088 TGTAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
258 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTC-AAGTAAAATAATACAAATTTATTAATA
214152 TTTCAAAAATTAATAAG
322 -TTCAAAAATTAATAAG
214169 AGATTTAAAA
Statistics
Matches: 863, Mismatches: 151, Indels: 89
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
358 2 0.00
359 60 0.07
360 193 0.22
361 454 0.53
362 89 0.10
363 11 0.01
364 31 0.04
365 23 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (362 bp):
TTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAACTTATTCAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACAAGT
TCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTCAAGTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCA
AAAATTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAAATAAATATG
Found at i:213593 original size:541 final size:535
Alignment explanation
Indices: 212785--214168 Score: 1401
Period size: 541 Copynumber: 2.5 Consensus size: 535
212775 ACTATTAAAC
* * * **
212785 AATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATTAAAACAATTGTCTCAATTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT-AATAAAACAATTGT-TTTATTCAT--
* * * * *
212850 AAGATTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT
62 AAGATTATT-AGAATAAAATAATACTAAATTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATT
* * * *
212915 AAAAAAATAAATTTGTTTGCAAAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTAAACAATTATCTACTT
125 AAAAAAA-AAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT
** * * * *
212980 -AAAAGC-TTCAAAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAATT-GTTTCAATCAATACAAGCTTATTT
189 CAAAA-CATT-ATGACCTTTTGTTTTGTC-TAAAACAATTGGTTTTATTC-ATACAAGCTTATTT
* * *
213042 CAAGTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGTA-AAGGATTTAAAAAAAT
250 TAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAA-A-AACTAATAAGTACAA--ATTT-AAAAAAT
* * * * *
213105 AAATATGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTT
310 AAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAAT-AGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
*
213168 GTTATGAC-TTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAACTTA-TTCAAATTAAA
373 GTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATACTCATACAAACTTATTTCAAA-TAAA
** * ** * *
213230 ATAATTTTAATTTATTAATATTTTGACAA-TTAATAAGTAAAGGATTTAAAAAATAAATATGTTT
437 ATAATAATAATTTATTAA-AATTCCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* *
213294 GCCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAAT
501 ACC-AAGCAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
* * *
213329 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATG
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTA-TTCATAAG
* * *
213394 ACTTATTTGAAGTAAAATAATACTAAATTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGAAATAA
65 A-TTATTAGAA-TAAAATAATACTAAATTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAA
* * * * * * *
213459 AAAAAGAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAGACAATTGTCTATTTCAA
127 AAAAAAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA
* * * *
213524 AACATTATGACCTTTTGTTTTATCTCAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATA
192 AACATTATGACCTTTTGTTTTGTCT-AAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAAATA
* *
213589 AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAGTACAAATTTTAAAAATAAATATGTTT
256 AAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAAAAACTAATAAGTACAAATTTAAAAAATAAATATGTTT
* ** * * *
213654 TCTTAACTCGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTT
320 ACCGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTT
* * * * * **
213719 TGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGCTCATACAAGCTTATTTGTAATAAAATAATAATAATTT
385 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATACTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATAATAATTT
* **
213784 ATTAAAATTCCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAGTGAGTTCA
450 ATTAAAATTCCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAGCAAGTTCA
*
213849 AATAGTTATAACTATTTGAAT
515 AATAGTCATAACTATTTGAAT
* * * * * * *
213870 AGTTATTTATTTCAAATTATTATAAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TATTCAT--A
* * ** *
213935 AGTTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATGTATTAATA-TAATAAAATTAATAAGTTGGAGACTT
63 AGATTATT-AGAATAAAATAATACTAAAT-TATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAATT
** * * * * * * *
213998 AAAAAATTAATTTATTCATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGTCCATTTAAACTATTATCTGTTTC
125 AAAAAAAAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** **
214063 AAATCATTATGACATTTTTTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAA
190 AAAACATTATGACCTTTTGTTTTG-TCTAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAAA
* *
214128 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
254 TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAAAAACTAATAAG
214169 AGATTTAAAA
Statistics
Matches: 692, Mismatches: 123, Indels: 53
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
538 1 0.00
539 62 0.09
540 20 0.03
541 442 0.64
542 105 0.15
543 28 0.04
544 34 0.05
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTATTCATAAGA
TTATTAGAATAAAATAATACTAAATTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAA
AAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAACA
TTATGACCTTTTGTTTTGTCTAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATA
ATACAAATTTATTAATATTCAAAAACTAATAAGTACAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA
CTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTT
GTCATAAAACAATTATTTATACTCATACAAACTTATTTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAAA
ATTCCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAGCAAGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAAT
Found at i:215318 original size:177 final size:178
Alignment explanation
Indices: 214202--216626 Score: 1404
Period size: 181 Copynumber: 13.6 Consensus size: 178
214192 ACCAGACCAC
** * * * ** *
214202 TTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTTG
* * * ** * * * * * **
214266 AAGTAAAATATTGCTAAACTAATAGTATTCT-AAAATTAATAAGAATAGATTTAAAAAATAAAAG
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
214330 TGTTTGCCTAACTAGTTCAAATAATTAATACTATTAGAACAATTACCTAT
130 TGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTT-ATACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * ** * * *
214380 TTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTTG
* * *** * * *
214445 AAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-A-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * *
214510 TATGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT
128 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * * * ***
214562 TTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAACAAAACAATTCTTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTTG
* * * * **
214627 AAATAAAACAATATTACTTTATTAATA-TTTCAAAATTTGAGA-AGTTGGAGATTTAAAAAATAA
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TT-A-ATA-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * * * *
214690 AACAATTTATCAAA-TCAGCTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAGTTATCTAT
127 ATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * *
214743 TTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTATTTTT-CATCATATAAGCCTATTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGC-TCATATAAGCTTATTT
* * * * *
214807 GAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGCGTAGGAGATTGAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT--ATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
214872 TCTGTTTAGCAACCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATAT
128 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * *
214924 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATGAGACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTTG
* * *
214989 AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
215054 TTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AGGCTATATGAATAATTAGCTAT
129 CTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATA--CTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * *
215105 TTCAAACCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATCTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTTG
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTTG
* * * *
215170 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT-AT-TAAGATATTTAAAACATAAATCT
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
215233 ATTTACCAAACGAATTCAATTAGTTATAATAGTTTGAATAATTATTTAT
131 GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATACTA-TTTGAATAATTATCTAT
* * * * * ** * * * *
215282 TTTAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATA-CAGTCTTAGTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAG-CTTATTT
* * ** * * * *
215346 GGAATAAAGTAATGTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAGTAATG-GATTTAAAAAATGA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA-TA-TAA-GAGATTTAAAAAATAA
** ** * * * *
215410 ATCTGTTGGCCTGACTAGTGCAACTAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTAT
127 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * *
215463 TTTAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTGCCACAAAACAATTGTTTCT-CTTCGT-TCAAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGC-TCATAT-AAGCTTATT
** ** * ** * *
215525 CAAAATATCATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTGA
64 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAA
*** * * * * *
215590 ATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTACCTAA
127 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
** * * ** * *
215643 TTCAAATCGCTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTGTTT
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TGCTCATATAAGCTTATTT
* * * * * * *
215706 CAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAC
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT--ATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * *
215771 TATGTTTACCAAAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
128 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * *
215823 TTCAAATCATTATGA-CTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTTG
* * * * * * * ** *
215886 AAATTAAATAATATTAGTTTATTAACATTTTTAAAAATAA-AT-A-TG-TTTATGAAA-CAA---
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * *
215943 GTTT---AAA-TAG-TCATAACTA-TT-TGAGTAATT--AT--CTATT---
131 GTTTACCAAACTAGTTCA-AA-TAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * * *
215980 -TCAAACCGTTATGACTTTTTAG-TTTGTCATAAAATAATTATATTAGTTCATATAGGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTT
* * *
216043 GAACTAAAATAACACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
216108 TTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTTTCTAT
128 TCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * *
216160 TTTAAATCGTTATGA-TTTTTGTATTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTTG
*** *
216224 AAATAAAATAATA-TACATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAATATAA
66 AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-A-TAAGAGA-TTTAAAAAATAA
* **** * * *
216286 ATATGTTTTTTGAACGT-GTTTAAATAGTTATGAATATTTAAATAATTATCTAT
127 ATCTGTTTACCAAAC-TAGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * *
216339 TTCAAAT-AGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCGTATTC
1 TTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTT
* * * ** *
216403 AAAAT-AAATAATATTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-A-TAAGAGA-TTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * *
216467 ATTTATTTACCGAGCAAGTTCAAACAGTTATGCTTGTTTGAACAATTATTTAT
127 ATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATAC-TATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * ** *
216520 TTTAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCGTAAGACATTTGTTTTTGTTCATGGAAGTTTATTT
1 TTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGCTCATATAAGCTTATTT
*
216584 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGAAAATTAATA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
216627 GTTAGGGGAT
Statistics
Matches: 1749, Mismatches: 417, Indels: 159
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
156 12 0.01
157 38 0.02
158 33 0.02
160 5 0.00
161 1 0.00
162 2 0.00
163 1 0.00
164 17 0.01
165 7 0.00
166 5 0.00
168 3 0.00
169 4 0.00
171 4 0.00
172 7 0.00
173 16 0.01
174 1 0.00
175 2 0.00
176 6 0.00
177 138 0.08
178 16 0.01
179 210 0.12
180 433 0.25
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* *
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* * *
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* *
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TAGCACTGA
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* * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * ** **
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* * * * * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * ** * *
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* *** *
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** * * * ** * *
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* * * *
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* * * ** * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * *
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** * * * *
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* * * ** * * * *
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* * **
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* * * *
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* * ** **
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* * * *
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* * * *
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1 AATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-
* * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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*** * * * * ** *
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* * * ** * *
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1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* * * *** *
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** * **
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* * * *
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1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
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* ** * * * ** *
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* * ** ** * *
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** ** * * * * **
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** * * *
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* **
218978 AATTGTTTTCTA-TTCATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
1 AATTG-TTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* ** * ** * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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1 AATT-GTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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** * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * * **
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* * * * ** * * * *
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* ** *
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* * * * * * *
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* ** * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * ** *
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* * * * **
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* * ** * *
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* * * * * * *
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* ** * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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** * ** *
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* * * * *
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* * * *
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66 TTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * ** * *
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** * * * *** * **
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1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAA--AATAA-TACTA-ATT-TATTAAT--A
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * * * * * * * *
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1 AATTGTTTCAG-TTCATATAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATA-TTTCA
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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112 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
*
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** * * * * * * * * ** ** * * *
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1 AATTGTTTC--AGTTCATATA-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTCA
* * ** ** * * *
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62 AAAATTAATAA-G----T---AAA-GA-TTTAAA-AAATAA-A-TATGTTTACCGA--A-CTAGT
* ** * * * *
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111 TCAAAT-AGTTATGA-CTATTTG---AACAAT--TAT-CTA-TTTCAAATCAT-TATGACCTTTT
*
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166 GTTTTGTCATAAA-AA
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1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATA-AAATAATAC--TAATTTATTAATATTTCA
** * * ** * * * * * *
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62 AA--AATTAAT-AAGTAAAGATTTAAA-AAATA--AATATGTTTACCGA--A-CTAGTTCAAATA
* ** * ** ** ** * * * * *
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* **
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* * * * ** ** * *
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1 AATTGTTTCAGT-TC-ATAT-AAGC--TTATTTGAAATAAAATA-ATACT-AATTTATTAATATT
** * * * **
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* * * ** * * * * *** * **
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105 ACTAGTTC--AAATAGTTATG--A-CTATTTGAACAATTA-TCTATTT--CAAATCATTATGACC
** * * *
222953 TAAT-TATGGCCATTTAAACAA
162 TTTTGTTTTGTCA--TAAA-AA
* * * * * ** * ** *
222974 TTATCTATTTCAAATT-GTTTCAA-CTT-TTTGTTTTTTCATAAAACAATTGT-TTTTCATCATA
1 -AAT-TGTTTC-AGTTCATAT-AAGCTTATTTG-----AAATAAAATAATACTAATTT-AT--T-
* * ** * ** ** *
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53 -AA---TATTT-CAA-AAATTAATAAGT-AAAGATT--TAA--A-AA-A--TAAATATGTTTACC
* ** ** * ** * ** *
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* * * *
223160 TCTATTATAAAAT
168 TTTGTCATAAAAA
* * * * *
223173 AATTATTTCAATTTATATAAGCTTATTT-AGTATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * *
223237 ATTAATAACTAAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAA-AAATTTAAATAGTTAAGACTAT
65 ATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * *
223301 ATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
**
223353 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * ** * * * * *
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66 TTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
223479 TCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATATAAC
130 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
** ** ** **
223530 AATT-TTATTTGAACAT-TCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACCCTTT-AA
1 AATTGTT-TCAGTTCATAT-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTCAA
* * * * * * * * *
223592 AAATAAATAAATAAGCGAATTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAACTATTTTAAATAGTTATGACT
63 AAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * *
223657 ATTTGAACAATTGTAAATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
127 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* ** * * *** * *
223711 AATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * ** * * *
223775 ATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTC-AAATCAGTTCAAATATTTAAGACTA
65 ATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
223839 TATGAACAATTAT-TATTTCAAGTCGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
* * * * * * *
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1 A--ATTGTTTCAGTTCAT-ATA-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* * * * * *
223954 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGA
61 AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * *
224019 TTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAGGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
125 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
** * *
224076 AA-TGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTAT-TTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * **
224138 TATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACTAGTT-AAAT-GTTACAACTAT
64 AATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
224198 TT-AAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTATTCTATTATGAAAC
129 TTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * * * ****
224250 AATTGTTTCTA-TTTATACATGCTTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGGT
1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
** * * * * *
224313 AATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATATTTACTC-AACTAGATCAAATAATCATGATT
64 AATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
224377 TTTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAAGA
127 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
* * * * * * *
224432 AA-TGTTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAGTAATCCAAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * ** * * *
224496 TTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTTAAATAATTAT--CTAT
66 TTAATAAGT-AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* *
224558 TTG-A-AATT-GCTA--T--AA-C------A--TTTTGTTTTGTCATAAAAG
129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * * * * * * * * *
224594 AATTTTTTCTA-TTCATACAATCTTATTT-CAAGACAATTA-AC-AA-GTA-AAAGAGTT-AAAA
1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * * ** * * ** *
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65 ATTAATAAGTAAAGATTTA---AA-AA-ATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * **** ** ** * ** * * *
224706 TTATTTCAACTATGA-CT-TTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTG-TTTCT-ATTCAAACA
125 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCA-T-AAAAA
* * * ** * * * * * *
224761 AGTT-TATTCAGATTAAAATAATATTAATTT-ATTAATATTTCAACAATTAATAA-GTA-AAAGA
1 AATTGT-TTCAG-TTCATATAAGCTT-ATTTGA--AATA---AAATAA-TACTAATTTATTAATA
* * *** *
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57 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAG-TT
* ** ** * *
224870 AT--TTAAAT-AATTATCTA--T-TT-CAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAAT-A-AAACAA
121 ATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTT-T-GTCATAAA-AA
** * * * * ** * * * **
224926 TTTTTTAGTTCA-TCTAAGT-TTA-TTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
1 AATTGT--TTCAGT-TCA-TATAAGCTT-ATTTGAAATAA-AATAA--TACTAAT-TT--ATTAA
* * * * *** *** * *
224988 TTAGTGAGTAAGAAAACTAA-AA--AAAGAATCTATTTACCGAATAAG-TT--C-AAATAGTT--
55 -TA-T--TTCA-AAAATTAATAAGTAAAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCA
* * * * * * **
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114 AAT-AGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-CAT
*
225099 AAAAC
176 AAAAA
* ** * * * *
225104 AATTGTTT-TGTTCATGCAACCTTATTTTG-AATAAAATAAT-TTAAAGTTATTAATATTCCAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* * *
225166 AA-T--TAA-T-AAG------AAAA-AAA-ATGTTTTCTGAGC-ACGTTCAAATAGTTATGACTA
64 AATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * **
225217 TTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAACC
128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * * *
225270 AATTATTT-ATGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAA
1 AATTGTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
* * * ** * * **
225333 AAATTATTAAGTAAAAGATTTCAAAAATAAATCA-ATTTAATGAGCGAGTTCAAATAAATATGAC
63 AAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
225397 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAAT
126 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * ** *
225452 AATTATTTCTA-TTCATA-AAACTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAA
1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGC-TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
* * * *
225514 AAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AA--A--T--AATA---CT-A--
63 AAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
225566 ATTTGAA-ATATTATTTATTTCAAATCATTAAGACATTTTATTTTATCGTAAAAC
127 ATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* ** ** *
225620 AATTG-TT-A-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
225682 TTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAGTTTGTTTACTGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTT
66 TTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
225744 CAACAATTATCTATCTCAAATTAGTATGATC-TTTATTTTGCCATAAAAC
131 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* ** * ** ** *
225793 AATTGTTTCTGTTCATACGAGCTTA-TTCAAAGTAAAATAATGTTAAACTAATAATA-TTCTAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * * *
225856 AATTAATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAA-AGTGTTTACTGAACCAGTT-ATAATAGTTAAGAC
64 AATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACCGAACTAGTTCA-AATAGTTATGAC
* * * * *
225919 TATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTTTTTTGCCATAAAAA
126 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
** * * * * * *
225974 TTTTTTTTTAGTTCATACAAGGTAATTTGAAATAAAATAATAC-AATTTTATTAACA-TTCAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTC-AAA
* * * *
226037 AATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACT
64 AATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
226102 ATTTAAACAATTATCTATTTAAAATTGA-TATGACCTTTTGTTTTATCTTAAAAC
127 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * *** ** * * * *
226156 AATTGTTTCAGTTAATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATCGTATTACTCTATTAATATTTCAAAAG
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * ** * * * * * * *
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66 TTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
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128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * *
226337 AATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
1 AATTG--TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
226400 AATTAATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATGCTTACCGAACCACTTTAAATAGTTATTACTA
64 AATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
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128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * * ** *
226514 AATTATTT-ATGTTCATACAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAACAATATTAT-GAA
1 AATTGTTTCA-GTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA
* * * * * * * * **
226577 AATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGTTA
64 AATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
** * * *
226642 TAAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGCCATAAAACA
128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
** * * * * **
226696 AA-TGTTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTTG-ACTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAA
1 AATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * * * *
226759 AATTAAT--G-AGAGATTT-TAAAA-AAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAGTAGTTATAACAAT
64 AATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
226819 TTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAAC
129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * * ** * *
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1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * * ** * * * *
226935 AATGAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTGGGCTG-ACTAGTACAAAGAGTTATGATT
64 AATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTT-TACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
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127 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAAA
* *** * * * * ** * * *
227037 AGTTAACT-AG--GA-ATAA-CATAATT---CTAATTTATTAGT-ATTTAGT-AT-TTT-AAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * *
227090 TTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTAT
66 TTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * *
227155 TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TTCTATAACCTTTTGTTTCAG-CATAAAATA
129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAA-A
* * * * ** *
227208 TATT-TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TTCAACA
1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
227270 ACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACC-AAATAAGTTCAAAGAGTTATGACTA
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* * * ** * *
227333 TTTGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAT
128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
** * * * * **
227385 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAGTAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * * *
227450 TTAATTAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACCACT
66 TTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * ** * *
227515 TGAATAATTATCTATTTCAAATGGTTATAACTTTTTATTTCATCACAAAAC
130 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * *
227566 AATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCCAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
227630 ATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATAAATCTCTTGACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAT
65 ATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** *
227695 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAAT
129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * * *
227747 AATTGTTTCTACTT-GTACAAGCTTATTTAAAATAAAAAAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAA
1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* * * * *
227810 AATTAATAAGTAAA-AGTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-TACATTCAAATAG-T-CGGCT
64 AATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACT
* * **
227871 ATTTGAACAATTATCTA-TTCTAAAT-AGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCATAAACT
127 ATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * ** *
227925 AATTGTTTCTA-TTCATATAAACATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
1 AATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * *
227989 ACTAATAAGTAAAAATTTTAAAAGTAAATTTTTTTACC-AAGCAAGTTCAAATAGTTATGATTGT
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* * * * *
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* * * * *
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129 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
** * * * * *
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1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * *
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** * * * *
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* * * * *
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1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * * * * *
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* * *
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126 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* ** * *
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1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * * * * * * *
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1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * *
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* * * * * * *
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1 AATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
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* * * * ** * * *
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127 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * * *
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1 AATTG--TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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128 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* ** ** ** * * *
229716 AATTGGTTCTTTTCATACT-ATTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTCCAAAA
1 AATTGTTTCAGTTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * ** * * *
229780 CTTAA-AGGCCAAAAAATTAAAAAATAAA-ACTAATTGCCTAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA
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* * * * * ** * * *
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128 TTTGAACA-ATTATCT-A-T-TTCAA--A--TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA-AAA
* * ** * * * ** * * ** * *
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* * * * * *
229965 -TATTC--GAATTAA-AA-TAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT-TAATA-AGAGA-T--T
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** * * * * * * * *
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* * *
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171 GTC-A--TAAAAA
* * * * * * * ** ** * *
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1 AATTGTT-TCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA--A---TATTT
* * * * * ** **
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* * * * ** * * * *
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112 CAAA--TAGTTA-TGACT-ATTTGAACA-A-TTATCTA-T-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
*** **
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169 TTGTCA-TA-AAAA
** * * *
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* ** * * ** *
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*
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172 TCATAAAAA
* ** * * * *
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** * ** * *
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**
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232725 TCAAACAATT
Statistics
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * **
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* *
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* * * * * * *
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*** * * * * *
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* * * *
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* * * * * **
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* * * * * * * * * * *
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*
217573 ATACTA
886 ATACAA
* * * * ** **
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* * * ** *
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* ** * * * *
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* * * *** * *
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* * * * * *** * * *
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* * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * * *** * *
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**
218470 AAATAATGTAA
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* *
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* * * * * * * *
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194 CAAAAATTAATAAGT-AAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATTATG
* * * * * * *
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257 ACT-ATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTG-TAATAAAACAATTGT
* ** * * *
218803 TTCTGTTCATACAATTTTATTCA-AAATAAAATAACACTAATTTATTATTATTAT-AAAAATTAA
320 TTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAA
* * * * * * **
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* * *
218931 TTATTATCTATTTCAAATCCTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCTATTCATA
443 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTT-TATTCATA
** * *
218996 CAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAA--AATAA-TAAGAGATT
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* * ** * *
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* * * * *** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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*
219377 CTA
889 CAA
* * ** * * *
219380 ATTTATTAACATTCAGAAAATTAATAAACAAGGAAGTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAA
1 ATTTATTAATATTAAGAAAATTAATAAGTAAAG-A-TTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACAA
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64 -TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATTGTTATGACCTTTTGTTTTAT
* *** * * *
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* * * **
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192 TTCAAAAATTAATAAG-TAAAGATTT-AAAAATAAAT-ATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATT
* * * ** * *
219638 ATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
254 ATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG
* * * * *
219703 TTTTCCA-TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTTAAAAAATTA
319 -TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-
* *
219766 ATATGTAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTAC--CGAAC--C----AG-T-T-CCTATTTGAA
382 A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAAC-AACTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
219820 CAATTATCTATTTCAATTCATTATAATC-TTTTGTTATGTTATAAAATAATT-TTTTCAATTCAT
443 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTT-TATTCAT
* * * * * *
219883 ATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAAAAAATTGATAA-CAAGGAG
506 ACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-GAG
* * * * * * *
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569 ATTTAAAAATAAATA--TGTTT-ACCAAACAA-TC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* ** * * * *
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* **
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* * * * * * ** *
220132 AATAAATTTATTTTCTAACCTAGTTCAAATA--TATGACTATTTGAACAATCATAAACTTCAAAT
753 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * ***
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**
220260 ATAATATTA
883 ATAATACAA
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* *
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* ** * * *
220399 ATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATATTAGCTTATTTAGAATTAAAATAAAATAAATTTATTAA
128 ATAAAATAA-TTGTTTATG--TTCATAAAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * *
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189 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAATAAATAT--GTTTACC-AAATAAGTTCAAAT
* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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*
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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321 TCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-
* * * ** *
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* *
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* * * * ** *
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562 GTAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTAC-CAA-ACAATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * ** *
221818 TATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAAAAATTGTTTCTCTTCATAAAAGC
625 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGC
* * * * * *
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* * * * *
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* * * ** ** * * * *
222013 CGTTATCATA-TTTATACAAGTTTTTTCGA-AATAA-AATAATACTAATTTAT-TAA---TATTC
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*
222071 T-AA-AAATTAAT--AA
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* * * * * ** * *
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* * * * ** * *
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** * ** * * ** * *
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* * * * * * * * *
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** * * *
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556 TAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAA--TCAAATAGTTATGACTATT
* * * ****** *
222678 TGAACAATTATCTATTTAAAATAC-TTATGAACATTCAAAAAAT-TAATAAACAATAAATT-TTT
617 TGAATAATTATCTATTTCAAAT-CGTTATG-ACCTT-TTGTTTTGTCAT-AA-AA-AAATTATTT
* * * *** * * * *
222740 GAA--AATA-AATCTATTTATT-GAAGA-AGTTTAA-A-T-ATTTATGACTATTTGAACAATTAT
676 CAATTCATATAAGC---TTATTCGAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAAAATTA-
* * * * * ** ** ** * * * * *
222797 CTATTTAAAATATATATGACCT-TTTGT-TTTATCATAA-AA---C-AATTGTT-T--C-AGTTC
735 ATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** * * * * ** **
222851 ATAAAAGCATATCCGAAATAAAAT-AATATTACTTTATTAATACT-TCA-AAAATTGATATGTTA
798 A-ACAA--TTAT-CTATTTCAAATCATTATAACTTT-TT-GTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTT-
** * * * * ** * ** *
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854 ----TTTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAA
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222952 ATAATTATGGCCAT-TTAA-ACAATTATCTATTTCAAATTG-TTTCAACTTTTTGTTT-TTT-CA
1 AT--TTAT--TAATATTAAGAAAATTA-ATAAGT-AAA--GATTTAAAAAATAAATTTATTTAC-
*** ** * * * * *
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57 T-AAACAA----TTCAAAT-ATTTATGACTATTT-GAACAATTATC--TATTTC-AAATTGTTAT
* * **** * * *
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112 GACCTTTTGTTTTATCATAAAAT-AAT-TGTTTA-T------GTTCATA---AAAGC--TTATTT
** * ** ** * * *
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163 GAAATAAAATAATAT-TAA--TTTAT-TAATATT-TCAAA-AATTA-AT-AA---GTA-AAG---
* * * *
223197 ATTTAGTATAAA-ATAATACTAATTTA--ATAAT-ATTTCAAA-AATTAATAACTAAGAGATTAA
213 ATTTA--A-AAATA-AATA-T-GTTTACCA-AATAAGTTCAAATAATT-ATGACT-----ATTTA
* * * * * ** * ** * *
223257 AAAAATAAATTTGTTTGCTGAAA-AATT-T-A--AATAGTTAAG-ACTATATGAACAA-T-TATC
265 AATAAT-TATCTATTT-C--AAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTA--ATA-AAACAATTGTTTC
* * * ** * ** * *
223314 TATTTCAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTAT
323 TA-TTCATA-CA--A-G--C--TTATTTAGAAATAAAATAA-T-ACT-AATTTAT-TAA---TAT
* * ** ** * *** * *
223379 TTGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTTGAAAAT-TA-ATA-AGTGA-TTTAAAAAGT
372 TT-CAA-AAATTAATAAGAGATTTA--AA-A-AAT--AAATCTATTTACAACAACTTCAAATAGT
* * * * * *** *
223439 GA--ATCTATTT-ATTAA--ATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTATCTATT-TC
429 TATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACAT-T---TTGTT-T-TGTTAT-
* * ** *
223497 AAATCGTTATTACCTTCTGTTTTA-TCATATAACAATTTTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAA
485 AAAAC---A--A--TTGT-TTTTATTC--AT-ACAAGCTTA--T-----TT--AG---AAT-AAA
** * * * * * *
223561 ATAAAATAATACTAATTTATTAACCCTTT-AAAAATAAATAAATAAGCGAATTAAAAAATTAATC
526 AT--AAT--T-CTAATTTATTAA-TATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAATAAATA
** * * * * ** *
223625 TGTTTACTGAACTATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAATTTCAAATCGTTATAA
584 TGTTTACCAAAC-A-ATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* *** * * * *
223690 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACT
647 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
* * * * * * **
223755 AATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAATC-
712 AATTTATTAATATT-AAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CA
* * * * * * *
223819 AGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTAT-TATTTCAAGTCGTTTTAACCTTTTGTTTTGT
774 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGT
* * * * **
223883 CATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTC-T-CAATAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGA
839 CATAAAACAA-TTGTTTTT--ATTCATAC-A-AGCTTATTTTGAATAAAATAATACAA
* * * *
223939 ATTTATTCATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTGTTTATCTAACC
1 ATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATT-TATTTA-CTAAAC
* * * * * *
224002 AGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAGGACCTTTTGTTTTGT
62 AATTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAT
* * * * * *
224067 CATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAAT
127 CATAAAATAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTAT-TTGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * *
224130 ATTTCAAATATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACT-AGTT-AAAT-GT
190 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAA-TAAGTTCAAATAAT
** ** * * * * *
224189 TACAACTATTTAAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT-TATTCTATTATGAAACAA
253 TATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGT-TT-TGTAATAAAACAA
* * * * * ****
224252 TTGTTTCTATTTATACATGCTTATTCA-TATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGGTAAT
316 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
** * * * * * *
224316 TAATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATATTTAC-TCAACTAGATCAAATAATCATGATTTTT
381 TAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAACAACT---TCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * **
224380 TAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAAGAAATGTTTCAATTC
439 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * * * * **
224445 ATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAGTAATCCAAAAATTAATAA-TAAAG
504 ATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGT-AAG
* * * *
224508 AGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-C-TA-AA-C--A-AG-T-T---TA----AATAATTATCTA
567 AGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * * * * * * *
224557 TTTGAAATTGCTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTCTATTCATACAA---TCTT-
631 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTC
* * * * * *
224618 ---AT----T--T-C-AA--GA--CA-ATT--AACA--AGTAA-AAGAG--TTAAAAAGTAAATT
696 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
224660 TGTTTACCGAATAAGTTTAAATCA-TTATAACTATTT--ACGTAATTATTTATTTC-AA-C--TA
761 TATTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAAC--AATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * ** *
224718 TGACTTTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTATTCAAACAAGTTTATTCAGATTAAAATAAT
823 TAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT
**
224783 ATTA
888 ACAA
* * * * ** *
224787 ATTTATTAATATTTCA-ACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAATA
1 ATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAATAAGT-AAAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTACTAAACA
* * * * * * ** * *
224851 AGTTAAAATAGTCATGATTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGT
63 A-TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAT
* * * ** * * *
224916 AATAAAACAATTTTTTA-GTTCATCTAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
127 CATAAAATAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* * * * ** * * * * *
224980 TCCAAAAATTAGTGAGTAAGAAAACTAAAAAAAGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTA
192 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAATA-AATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATTA
* * ** * ** *
225045 TGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTT-TCCATAAAACAATTG
255 TGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGT-AATAAAACAATTG
* * * * * * *
225109 TTT-TGTTCATGCAACCTTATTTTG-AATAAAATAAT-TTAAAGTTATTAATATTCCAAAAATTA
319 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * *
225171 ATAAGA-A---AAAAAAT--GT-T-TTCT-GAGC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
383 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TACAACAAC-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * *
225226 TTATCTATTTCAAATTATTATTATC-TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTATGTTCATAAAA
446 TTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
** * * * *
225290 GCTTATTCGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCT-AAAAATTATTAAGTAAAAGATTT
510 GCTTATTTAGAAT-AAAATAATTCTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* *** * * ** * *
225354 CAAAAATAAATCA-ATTTAATGAGCGAGTTCAAATAAATATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
573 -AAAAATAAAT-ATGTTTACCAAAC-A-ATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * * *
225418 CAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTATTCATA-AAACTTTATTCAA
634 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGC-TTATTCGA
* * *
225482 AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATAAAT
698 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAAATTAATAA-TAAG-AGATTTAAAAAATAAAT
* *
225546 CTATTTACC--A-AA--T--AATA---CT-A--ATTTGAA-ATATTATTTATTTCAAATCATTA-
760 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * ** ***
225596 AGACATTTTATTTTATCGTAAAACAATTG---TTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAAT
824 A-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT
*
225658 ACTA
888 ACAA
* * * * *
225662 ATTTATTAATATTTAA-AAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAGTTTGTTTACTGAACTAG
1 ATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAAC-AA
* * * * * * **
225723 TTTAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATCTCAAATTAG-TATGATC-TTTATTTTGCC
64 TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * ** * * ** *
225786 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACGAGCTTA-TTCAAAGTAAAATAATGTTAAACTAATAATA-
128 ATAAAATAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* ** ** *
225849 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAA-AGTGTTTACTGAACCAGTT-ATAATAG
192 TTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAATAAATA-TGTTTACCAAATAAGTTCA-AATAA
* * * * * * * ** *
225912 TTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTTTTTTGCCATAAAA-AT
252 TTATGACTATTTA-AATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
* * * * *
225975 TTTTTTTTAGTTCATACAAGGTAATTT-GAAATAAAATAATAC-AATTTTATTAACA-TTCAAAA
316 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTC-AAA
* * * * *
226037 AATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACT
378 AATTAATAAG--AG--ATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-C-AACAACTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
226102 ATTTAAACAATTATCTATTTAAAATTGA-TATGACCTTTTGTTTTATCT-TAAAACAATTG-TTT
436 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACATTTTGTTTTGT-TATAAAACAATTGTTTT
* * * ** * ** * * * * * * *
226164 CAGTTAATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATCGTAT-TACTCTATTAATATTTCAAAAGTTGAGAG
499 TA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAA
** * * * * * *
226228 GTTGGAGATTTAAAAAGTAAAT-TAGTTTATCGAATCAATTTAAATAATTATGGCCATTTGAATA
562 GTAAGAGATTTAAAAA-TAAATAT-GTTTA-CCAAACAA-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * *
226292 GTTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTC-A-TCATAC
623 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT-TATTTCAATTCATAT
* * * * * * *
226355 AAGCCTATTTGGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGAATT
686 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT
* ** * * * * * * *
226420 AAAAAATAAATATGCTTACCGAACCACTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTC
749 AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
226485 AAATCGTTATAAC-TTTT-TTTT-T-ATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAACTTA-TTTGAA
814 AAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTG-A
*
226545 ATAAAATAATACTA
878 ATAAAATAATACAA
* ** * * * * * *
226559 ATATAACAATATTATGAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAA
1 ATTTATTAATATTAAGAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAA-CAA
* * ** ** * ** * **
226624 TTCAAATAGTTAAGGTTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGCCA
64 TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
* * * * * * *
226689 TAAAACAAATGTTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTTG-ACTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
129 TAAAATAATTG-TTTATGTTCATAAAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
226753 TTTGAAAATTAAT--G-AGAGATTTTAAAA-AAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAGTAGTTAT
192 TTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAA-TAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * *
226813 AACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
256 GACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
226878 TCTGTTGATACAATCTTATTCA-AAATAAAGGTAATGCTAATTTATTAATA-TTC-TAAA--AAT
321 TCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * *
226938 --GA-A--T---AAATAAGA--GATTTA-AA-AA-AT-AAATCTGTT-GGGC----TGACT-AGT
385 AAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTATTTACAACAACTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATT
* ** *
226983 A-C-A----AAGA--GTTATGATTTTTTGTTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTGT-TTGCAT--A
448 ATCTATTTCAA-ATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-T-TATT-CATACA
** * * *
227037 AG-TTAACTAGGAATAACATAATTCTAATTTATTAGTATTTAGTATTTTAAAAATTAAAAAGTAA
509 AGCTTATTTA-GAATAAAATAATTCTAATTTA-T--TA---A-TATTTAAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
227101 GAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTA
566 GAGATTTAAAAA-TAAATATG-TTTACCAAACAA--TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
227166 TCTATTTCAAAT-TTCTATAACCTTTTGTTTCAG-CATAAAATATATT-TTTCTATTCATACAAG
627 TCTATTTCAAATCGT-TATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAA-AAATTATTTCAATTCATATAAG
* ** * * * *
227228 CTTATTTC-AATTAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCAACAACTAATAAGTAAAAGATTT-AA
689 CTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAA
* * * * *
227291 AAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAATAA-TATTTATTTTAAA
752 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * *
227355 TTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAA
817 TCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAA
**
227420 AATAATATTA
882 AATAATACAA
* * * * * * *
227430 ATTTATTAATATTTCAG-TAATTAATTAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
1 ATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * * * *
227494 GTTCAAATAGTCATAACCACTTGAATAATTATCTATTTCAAATGGTTATAACTTTTTATTTCATC
64 -TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * * * * *
227559 ACAAAACAATTGTATCA-GTTCATATAGGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATG
128 ATAAAATAATTGT-TTATGTTCATAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
227622 TTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATAAATCTCTTGACCGAACAAGTTCAAATAGTT
191 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAA-ATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATT
* * ** * ** * *
227687 ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAATAATTG
254 ATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG
* *
227752 TTTCTACTT-GTACAAGCTTATTTA-AAATAAAAAAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
319 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * *
227814 AATAAGTAAAAGTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-TACATTCAAATAG-T-CGGCTATTTG
382 AATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAC--AACAAC-TTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
227876 AACAATTATCTA-TTCTAAAT-AGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATT
441 AATAATTATCTATTTC-AAATCA-TTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAAC-AATTGTTTTTATT
* * * * * * ** *
227938 CATATAAACATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAA-A
503 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * * *
228002 AATTTTAAAAGTAAATTTTTTTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTAAACAATTATTT
568 GA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAA--TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
* ** * * * * *
228067 ATTTCAAATAGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAAGTTTTTT
630 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATT
* * * ** * *
228132 CGGAACAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAA
695 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * ** *
228197 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATACTCAT-ATCCATTTCAACAACTATCTACTTCATGTCTTT
758 ATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * ** * ** *
228261 ATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCCATTCATGCAAAATTATTCAT-AATAAAATA
822 ATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATT-TTGAATAAAATA
***
228325 ATATTG
886 ATACAA
* ** * * *
228331 ATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-ATAG
1 ATTTATTAATATTAAGAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACA-A-
* * * * * *
228392 TTTAAATAGTTATGGCTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGATCCTTTT-TTTT-TC
64 TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTTATC
* * * * * * * * * *
228455 ACAAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAGCCTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT
128 ATAAAATAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
* * * ** ** *
228520 TCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAA-AAATGTGTTTGCCGAACCAA-TTCAAATCGTTAA
193 TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAATAAATATGTTTACC-AAATAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * *
228583 GACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TCAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTAT
256 GACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT-GATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
* * *
228647 TTC-AGTTCATACAAACTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTA
320 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * * *
228709 ATGAGCAATAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTT
383 AT----AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-C-AACAACTTCAAATAGT-TATGACTATTT
* * * **
228773 TAACAATTATCTATTT-AAAGTCATTATGACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
440 GAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTC
** * * * * * * *
228836 ATA-AAAATT-TTTTGAAATAAAAT-A--CTACTTTTTTAATATTTCAAAAACTAACAAGCAAGA
504 ATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * *
228896 GATTTATAAACTAAAGCTAT-TTT-CCAAACCAATTCAAATAGTTGTAACTATTTGAATAAATAT
568 GATTTA-AAAATAAA--TATGTTTACCAAA-CAA-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * *
228959 CAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATT-TTT-TATGGTCATACAAGCT
628 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAAT--TCATATAAGCT
* * * * *
229021 TATTCG-GATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAA-T--TAATAAGATATTTAAAAA
691 TATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAA
* ** * * * * * *
229082 ATAAATGTGCTTGCCAAACCA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATT
754 ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * *** * * ** *
229146 GTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCGGTTTACACAAGCTTATTCGGAATAATA
819 ATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAA
* *
229211 TAGTACTA
884 TAATACAA
* * * * * ** *
229219 ATTTATTAACATT-CGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAACAATAAATTTGTTTACCGAATA
1 ATTTATTAATATTAAG-AAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAA-AATAAATTTATTTACTAAACA
* * * * * * ** * *
229283 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCACTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGT
63 A-TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAT
* ** *** * *
229348 CATCAAATAATTGTTT-TAGTTTGTAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATA
127 CATAAAATAATTGTTTAT-GTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
* ** **
229412 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAATCGGTTCAAATAAT
191 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAATAAATAT-GTTTACCAAATAAGTTCAAATAAT
* * * * * ** * * *
229476 TATGGGC-GTTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATT-TTTTCCTATCGTTTTGTCATAAAACAA
253 TAT-GACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAT-CTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
* * * *
229539 TTGCTTT-TCA-ACATATAAGCTT-TTT-GAAATAAAATAACACTAATTTATTTATATTTCAAGA
316 TTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A
* * ** * * *
229600 ATTTATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTAT
378 A---ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-AACAACTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
229664 TTGAATAATGACCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTT-T
438 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-GTTTTTAT
* ** * * * * * ** * * *
229728 TCATACTATTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAA-AGGCCAA
502 TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAG-TAA
* * * ** * * * * *
229792 AAAATTAAAAAATAAA-ACTAATTGCCTAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAAATATTAT
566 GAGATTTAAAAATAAATA-TGTTTACCAAAC-A-ATCAAATAGTTATGACTATTTG-AATA--AT
* *
229856 ATAATTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
625 -T-A----T---CTATTTC-AA-A--T-CG--T-TATG-------A-C-----C---T--TT-TG
* * ** ** * *
229921 ACCTTTTCTTGTATCGTAAAACAATTATTT-TGTTTGTACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATAC
654 -----TT-TTG--TCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
* * * *
229985 TAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAATC-
711 TAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CA
* * * * * * * * * *
230046 ATTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTTTGACATTTTATTTAGT
774 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGT
* * * *
230111 CATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACCAGCTTATTTAGAA-AAAATTGATACTA
839 CATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAA-TAATACAA
* * * * * * *
230164 ATTTATTAACATT-TGAAAAATT-ATAAG-AAAGATAGTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAATA
1 ATTTATTAATATTAAG-AAAATTAATAAGTAAAGAT--TTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACA
* * * * * * * ** * * *
230226 AGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAATAGTTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGT
63 A-TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAT
** * * ** *
230291 CATAAAGCAATTGTTTCA-ATTAATATAAA-CTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
127 CATAAAATAATTGTTT-ATGTTCATA-AAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
** * * ** * * *
230354 ATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAGAGCTGTTTACCGAATTAGTTAAAATAAT
190 ATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAAT
* * * * * * * *
230419 TATGGCCATTTGAATGATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
253 TATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT
* * ** * *
230484 CTTTTTGCTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTA
318 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * *
230548 ATAAGTAATAGATTTAAACAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATATAGTTATGACTAATT
383 ATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-AACAACTTC-AA-ATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
230613 GAACAAATATCAATCTCAAATCGTTA--AAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTTA-T
440 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT-TTATT
* ** ** * *
230675 -AT--AAGCTTA-TTCGGTTAAAAATAATAATAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG
503 CATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * ** **
230736 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTTGAATAGTTAAAACT-TTTAGAATAATTAT
567 AGATTT-AAAAATAAATATGTTT-ACCAAACA-ATCAAATAGTTATGACTATTT-GAATAATTAT
* * * * * * * * *
230800 CTATTTCAAATTGTTTTAACC---T-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTA-AAGCCT
628 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAAT-TCATATAAGCTT
* * * * * *** * *
230859 ATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGGGCAAAAGATTTGAAAAA
692 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
230924 TAAATCTATTTAGCAAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTT-AAATTC
755 TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TC
* * * * * * *
230988 ATTATGAAC-TGTTGTTTTGACAT-AAACAATTG-TTATAGTTTATAAAAGCTTA---TAAAAAA
819 ATTAT-AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAA
*
231047 AATAATACTA
882 AATAATACAA
* * * * * *
231057 ATTTCTTAATATTTCA-AAAATTAATAAG-CAAGAGTTTAAAGAATAAATTTGTTTACCAAACAA
1 ATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAAC-A
* * * * * * * ** * *
231120 ATTTAGATAGTTACGACTATTTTAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTC
63 ATTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * * ** * *
231185 ATCAAATAATTGTTTCAAT-TT-ACACATGCTTATTCAAAATAATATAATACTAATTTATTAATA
128 ATAAAATAATTGTTT--ATGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * * * *** *
231248 TTCCAAAAAGTATTAAGTAAGTGATTTACAAAATGAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAATT
191 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTA-AAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAATT
* * * * * * * * *
231313 ATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTG-TTTGATCATATAACAATT
254 ATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTG-TAATAAAACAATT
* ** * * *
231377 GTTT-TTTATCATTTAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATT
318 GTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T
* *
231440 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAA-TTCAAACAGTAATGACTATTT
381 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-AA-CAACTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * * * * * *
231504 CAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAACAATTATTTCTATTC
440 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTAT-AAAACAATTGTTTTTATTC
* * * * * *
231569 ATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTTATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
504 ATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
231633 GATTTAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATGATCTA
568 GATTTAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CA-ATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * * *
231698 TTTCAAACCGTTATGACCCTTTGTTTTGCCATAAAACAATTTTTTCAACTCATACT-AGCTTAAT
631 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATA-TAAGCTT-AT
* * * * *
231762 T-GGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGA-TTAAAAAATA
694 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * *
231825 ATTATATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATT
757 AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * *
231889 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAG-TT-TGTCTGAAATAAAAT
822 ATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTAT-TTTG-AATAAAAT
231952 AATA-ATA
885 AATACA-A
*** ** * *
231959 GCATATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAAT-AATTCTA--T-C-AAATTAG
1 ATTTATTAATATTAAGAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTACTAAA-CAA
* * * * * *
232016 TTCAAATAGTTATAACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAA-TCTTATGA-CTTTT-TTCT-GC
64 TTCAAATATTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * * * ** * * *
232076 TATAAAACAATAGTTTTTGTTCACACAAGCTTA-TACAAATTAAAATATTACTAATTTATTAGTA
128 -ATAAAATAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATA
** * * * ** * * *
232140 TTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATATTTATTGAACT-AGATCAAATAGT
191 TTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTA-CCAAATAAGTTCAAATAAT
* * * * * *
232204 CATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
253 TATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT
* * * * * *
232269 ATTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATAC-GATGCTATTAATATTCCAAAAAT
318 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
232331 TAATAGTTAAGAAATTTAAAAAATCAATCTGTTTACAGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTT
381 T-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC--AACAACTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** * * * *** *
232396 GAA-AATTATCTATTTGAAATCCCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGCTT-TATTCTATTC
440 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGT-TTTTATTC
* * * * *
232459 ATACAAGTTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAA
504 ATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAA-AAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * * *
232522 AGATTTAAACAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTTAACTCGTTAAGACCATTTGAACAATTATT
567 AGATTTAAA-AATAAATATGTTTACCAAA-CA-ATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
** * * * * ***
232587 TATTTCAAATTATTATGACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTTC-T-TCAAGCTT
629 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTA-TTTCAATTCATAT-AAGCTT
* * * * ** * * **
232650 ATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA-ATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAA
692 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * ** * *
232714 -AAATATGTTTATCAAACAATTTATTAATGTTCTGAAAATTAATGAGTAAGAGAATTGGAAAAAT
755 TAAATCTATTTA-C---CAA---A-CAA-GTTC---AAA-T-A-G-TTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** *
232778 GAATCTGTTCATCGAACAGGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTCCA-AAAAC
804 -TATCTATT--TC-AA-A---TC----A-TTATAACT-T-T---TTGTT-T-T-GT-CATAAAAC
* * * * * *
232842 ATTATTACATTTTGTTTTATCATAAAACAATCGGTTTTGTTCATGCAAGCTTAATTCAAATA-AA
847 A--ATT---GTTT-TTAT-TCAT---ACAA--GCTTAT-TT--TG-AA--TAAAAT--AATACAA
* ** * * * * *
232906 ATATTATAAAT-TTATTAATATTCCAA-AAGTTAATAAGTAAAAATTGAAAAAATAGATATGTTT
1 AT-TTATTAATATTAAGAAAATT--AATAAG-T-A-AAG----ATTT-AAAAAATAAATTTATTT
** * * ** *
232969 TTTGAAC-ATGTCCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCTAATCATTATGACCAT
55 ACTAAACAAT-T-CAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT
* * ** * * * * *
233033 ATGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCA-AACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
118 TTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTATGTTCATAA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAT
* ** * * * * **
233097 TTATTAATA-TTCCAAAATTAATAACAAAATATTTTAAAAAATAGATATATTTACTAAGCAAGTT
182 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTT
* * ** * * * *
233161 CAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTC-AATCACTATGATCTTTTGTTTTGTCATA
245 CAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATA
* * * * * * * *
233225 AAACAATTGTTTGTGTTCAGATAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
310 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
233289 AAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTATCGAACAAGTT-AAACTAGTCATG
375 AAAAATTAATAA---G-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-AACAACTTCAAA-TAGTTATG
** * * * * * * ** *
233353 TTTGTTTTAACT-ATTATATATTTCAAATCATTATGACATTCTATTTTATCGTAAAACAATTCTT
433 ACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTT
* ** * * **
233417 TCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTTGAAAATTATGAC
497 TTTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA--A-
* * ** * ****
233482 TATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATCATTGTGACCTTTTAT-TTTATCATAAAACAATTGTTTC
559 TA----AGTAA-GA--GATTTAAAA--A---T-A---AATATGTTTA-C--CAAACAATCAAAT-
** * * * * *
233546 AGTTCAT-AAAAGCTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAA
604 AGTT-ATGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * *
233610 CAATTGTTT---TTCATCATGCAAGCCTATTTGGAGTAGAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
667 AAATTATTTCAATTCAT-AT--AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTAA
* * * ** * * *
233672 AAAATTAATACGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGTAA-TAGTTAAAATAGCTATG
728 AAAATTAATA-ATAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
233735 ACTTTTTGAACAATTATATATTTCAAAT-TTGTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATT
790 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* *
233799 TTTGTTCATACAAGCTTA-TTTGTAATAAAATAATACTA
854 TTTATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACAA
* * * * * * * *
233837 ATGTAATAATATTCTA-AAAATTAAGAACTAACAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCA
1 ATTTATTAATATT-AAGAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAA-CA
* * * * * * * * *
233901 GTTCAAATAATTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGCTTTGT-
63 ATTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * * * * * ** *
233965 ATTAAACAATCTTTTTA-GTTCTTACTAA-CTTA-TTCAATATAAAATAAAACAAATTTATTAGT
128 ATAAAATAAT-TGTTTATGTTCATA-AAAGCTTATTTGAA-ATAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * * * ** * *
234027 ATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATCTAAAAAATAATTCTATTTGCCAAACCAGCTCAAATAAC
190 ATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGAT-TTAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAAT
* * ** * * *
234092 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAAT
253 TATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT
* * * * * * * * * *
234156 CTTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTAAAATTTA
318 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA---A
* * * * * * * * * *
234220 ATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTTAATTAATT-TAACTATTAGA
380 TTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC--AACAACTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** ** * *
234284 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCA-TTT-TTTTGTCCTCAAACAATTGTTTCTATTCAT
442 ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * ** * * *
234347 GCAATCTTATTTGGAATAAATTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAGTAACAAAT
506 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * * * *
234412 TTCAAAAATGAATTTGTTGT-CCTGATCAATGCAAACAGTTATGACTGTTTAAACAATTATGTAC
571 TT-AAAAATAAATATGTT-TACC-AAACAAT-CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * * * *
234476 TTCACATCATTATAACCTTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTC
632 TTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTC
* * * ** * * * * *
234541 AAAATAACATAAGT-CTAACTTATTAATATTTCGAAACTTAACGAGTAAGGGATTTAAAAAATGA
696 GAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAA-TAATAAGAGATTTAAAAAATAA
* *
234605 ATCTATTTA-CAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATCACT
758 ATCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** *
234669 ATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAGAATA
822 ATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATA
234734 ATACAA
886 ATACAA
* * * * *
234740 ATTTATTAATATTCAA-ATAATTAATAAGTAAAAGATTTAATAAATAAATATGTTTATCGAATA-
1 ATTTATTAATATT-AAGAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTAA-AC
* * * * * * * *
234803 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTTGTTTTG
62 AATTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTA
* * * * *
234868 TCATAAAACAATTGCTTT-TGTTCATACAAGATTATTTGTATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
126 TCATAAAATAATTG-TTTATGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * * * * ** * * **
234932 ACTACAACAATTAATAAGAAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGGACAAGTCCAAATTGT
190 ATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAGA-TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAAT
* * * * * ** *
234997 CATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATT
253 TATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT
* * * * * * **
235062 GTATCAATTCATATAGGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATATATTCATATTTTGAAAATTA
318 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** * *
235126 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTACCGAACAAGCTT-AAATAGTTAAGGCTATTTGAATG
383 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-AACAA-CTTCAAATAGTTATGACTATTTG-A--
* ** *
235190 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAATTTTTTTGACCGTTTGTTTTGTC
442 A--T---A-A-TTAT--CTATTT---CAA--ATC-A--TT-A------TGACATTTTGTTTTGTT
* * *
235255 AT-AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCT-GAATATAATAATAT-AAATTTATTAATA
483 ATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAATA
* * * * * *
235317 -TTACAAATATTAATCAGT-GGAAATTTAAAAAATAAATCAAT-TTT-CTAAACACGTTCAAATA
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* * * * * ** * **
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* * * * * * *
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796 TGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATA-A-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
** *** *
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858 TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAA
* * *** * * *
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* * * ** * ** *
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57 -T-AAACAATTCAAATATTTATGACTATT-TGA-ACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTA-TGACC
* * * ** * **
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* * ** * * * * *
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* * ** * * * * ** *
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217 AAAAATAAATATGTTTACCA-AA-TAAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAATAATTATCTATTT
* * * * ** * * * * * *
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280 CAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG
* *
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344 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
236098 ATGTTTACTGAACAAGC-TCAAATAGATATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTAT
405 CTATTTAC--AACAA-CTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * * *
236162 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAAAAAT
467 GACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * * * ** *
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531 -TCTAATTTATTAATATTT-A--AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATATGTTTAC
*** * * * * * * **
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591 CAAACAA--TCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATA-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * *
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652 TGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC-AATTCATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAAT
* ** * * * **
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715 TTATTAATA-TTAAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTT
* * * ** * * * * *
236479 CAAATGGTTAAGACTATTAGAGTAATTTTCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATA
778 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATA
* * ** * *
236544 AAATAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTAGTCAGAATAAATTAATACTA
843 AAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAA
* * * *
236593 ACTTATTAATATTTAA-AAAATTAATAAG-CAAG-----------AGA--T-TTGA--AAA-AA-
1 ATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACAAT
* * * * * * *
236638 T---A-A-TTGTGATTATTTGAACAGTTATTTATTTAAAATTGTTATGAACTTTAGTTTTATCAT
65 TCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
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236698 AAAACAATTATTTAAGTTCAAAAAAACTTATCCAAAATAAAATATTACTACTTTTTTAATATTTC
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*
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* * * * * * *
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320 TTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAAT-AATACTA-ATTT-ATTAATAT-TTCAAA-AA
* * *
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* * * * * * * * * * *
237015 ATTAG-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATATGTTTACAAAACTAATT-T-A-A-ATAGTTTTGACT
424 A-TAGTTATGACTATTTGAATAAT-TATCTATTT-C-AAA-TCATTATGACATTTTGTTTTG-TT
** * * ** * ** * **
237074 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA-ACATTTTGTTCTATCATAAAATAATTATTTCT
483 A-TAAAACAATTGT-T-TTT---A-T-TCATACA-AGCTTATT-TAGAATAAAATAATT-CTAAT
* * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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1 ATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAAT-AAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAAC-
* * * * * ** *
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* * * * ** ** * * *
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** * * ** * * * ** * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * * *
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316 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAA-
* * * * * **
237868 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAA-TTCATATGGTTAACACTATT
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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566 GAGATTTAAAAATAAA-T-A--TGTTTACCAAAC-A-ATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * * *
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* * **
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* * * * *
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* * * * ***
238312 AATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACATTTGCTTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAA
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**
238377 AATAAAATAATATTA
877 AATAAAATAATACAA
* * *** * ***
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* * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** ** * **
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436 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTT
238894 CAGTTCATTA
Statistics
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ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
CAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAA
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* *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * *
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66 TT--CAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA--T
* * * *
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127 ATTTGTTTTGTAATAAAACAATTATTTT-TATTCATACA-ACTTATTCAG
* * * * *
222577 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATAAATAAACAACAAATTTTAAAAAAT-AAA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT---T-AATAAGAGA-TTTAAAAAATAAAA
* * *
222641 TTTCTTTATCAAA-TAAGTTTAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAC-TT
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* *
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*
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * **** * *
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** * * * * * * * * * * * *
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* * * * ***
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* * * * * ** *
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257 TCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAAT-AT-TTAAAA-T-ATAAT-AAGAGATTTAAAAAATA
* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * * **
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*** * * ** * * * * *
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129 ATTTAAAAAATAA-TTCT--GT--TTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
**** ** ** * ** * * * * *
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** * * * * *
224779 TAA---TATT---AATTTATTAATA-T-TTC-A--ACA-ATTAATAA-GT-A-AA-AGATTTAAA
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* * * * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * **
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATAAAACAATTTTATTTGAACAT
* * * * * *
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** * * * * * * * *
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* ** ** *
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*** * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * * **
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** ** * * * *
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* * ** * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * ** * * * *
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* ** * * *
225632 TACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--AAAA--AATTAATAAGAGA
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* * * *
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* * * * * * * **
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* ** * * *
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** * * * * * *
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* * * * * ** * * **
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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127 AGATTT-AAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * ** * *
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191 CTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTT
* ** * * **
226180 ATCCAAAATAAAATCGTATTACTCTATTAATATTTCAAAAGT-TGAGAGGTTGGAGATTTAAAAA
255 ATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTT-AAAA-TAT-A-A--TAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * **
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* ** *
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* ** * * * *** **
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* * * * ** **
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATAAAAC-AAT-TTTATTTGAAC
* * * * * ** *
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* ** * * * * * * *
226770 GATTTTAAAAA-AATT-TGTTTACCAAACCAATTCAAGTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTT
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* * * * * *
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* * *
226898 CAAAATAAAGGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATGAATAAATAAGAGATTTAAAAAATA
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* * *** ** * * * *
226963 AATCTGTTGGGCTGA-CTAGTACAAAGAGTTATG---AT-T-
317 AATTTATTTATCAAATC-AGTTCAAATAATTAAGACCATATC
***** * * * * ** * *** *** *
226999 TTTTGTT-T-TGTTACAAAAC--AATT-GTTTCTG-TTT-GCATAAGTTAACTAGGA-AT-AACA
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* * ** * ** ** * ** *
227055 TAATTCTAA-TTTA-TTAGTATTTAGT-ATTTTAA-AAATTAAAAAGT-AAGAGATTTAA-AAAC
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* *** * *** * * * * * * * *
227114 TAA-ATCTGTTTTATCGAACAAGTTC-AAATAGTTATCACTATTTGAACAATTAT--CTATTT-C
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* * * *
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* * ** * * *
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246 TATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTAA-AA-T-ATAA-TAAGAGA
* * * * * * * * *
227286 TTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTG
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* * * * * * * * * **
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* * * * ** * * *
227400 TACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAGTAATTAATTAGTAAAAGA
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* * * * * * * * * *
227465 TTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACCACTTGAATAATTATCTAT
130 TTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * ** * * ** * *
227530 TTCAAATGGTTATAACTTTTTATTTCATCACAAAACAATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATTCT
195 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCA
* * * * *
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* * * * * * * * *
227660 CTCTTGACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
320 TTATTTATCAAATC-AGTTCAAATAATTA-AGACCATATC
* * * * * *
227698 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TCATTTTGTCATAAAATAATTGTT-TCT--AC
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* * * *
227759 TTGTACAAGCTTATTTAAAATAAAAAAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
64 AT-T-CAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAA
* * * * * * * * *
227823 AAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATACATTCAAATAG-T-CGGCTATTTGAACAATTAT
126 GAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * *
227885 CTA-TTCTAAAT-AGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATATAAAC
191 CTATTTC-AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATATAAGC
* * * * *
227947 ATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA-ACTAATAAGTAAAAATTTTAAA
253 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT-TAAAATA-TAATAAG---AGATTTAAAA
* * * * * * *** * *
228011 AGTAAATTTTTTTA-CCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTA
313 AATAAATTTATTTATCAAATC-AGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* * * ** * * * * *
228056 AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATAA--TTATTTCTATTC
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** * * * * ** ** *
228119 ATAAAAG-TTTTTTCGGAACAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGA
64 ATTCAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGA
* * * * * * * * * *
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128 GATTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATC
* ** * * * *** ** **
228247 TACTTCATGTCTTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCCATTCATGCAAAATTAT
192 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTAT
* * *
228312 TCATAATAAAATAATATTGATCTATTAATATTTTGAAAAT-TAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
257 TCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTT-AAAATATAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
228376 CTGTTTACCAAAAT-AGTTTAAATAGTTATGGCTATTTA
320 TTATTTATC-AAATCAGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* * * * * ***
228414 AACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGATCCTT-T-TTTTTTCACAAAACAATTGTT-TCTCTTC
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* * * * * *
228476 ATACAAGCCTA-TTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGA
64 ATTCAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGA
* * * * * * * **
228540 GATTTAAAAAA-AA-TGTGTTTGCCGAACCAATTCAAATCGTTAAGACTATTAAAACAATTATCT
128 GATTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * ** * *
228603 ATTTCAAATCATT-TCAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAACTTAT
193 ATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTAT
* * * * * *
228667 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAATAGATTTAAAAAAAT
257 TCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTAAAATA-TAAT----AAGAGATTT-AAAAAAT
* * * * * *
228732 AAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATATATT-TGACTATTTT
316 AAATTTATTTATCAAATC-AGTTCAAATA-ATTAAGACCATATC
* * * * * * *
228774 AACAATTATCTATTT-AAAGTCATTATGACATT-TTTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAATT
1 AACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATAAAACAATTTTATTTGAA--
* ** * * * * **
228835 CA-TAAAAATT-TTTTGAAATAAAATACTACT--TTT-TTAATATTTCAAAAACTAACAAGCAAG
63 CATTCAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
* * ** * * ** * * * * * *
228895 AGATTTATAAACTAAAGCTATTTTCCAAACCAATTCAAATAGTTGTAACTATTTGAATAAATATC
127 AGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** * * * * *
228960 AATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATT-TTTTATGGTCATACAAGCTTA
192 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATATAAGCTTA
** * * * *
229023 TTC-GGATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAA-ATTAATAAGATATTTAAAAAATAA
256 TTCAAAAT-AAAATAATACTAATCTATTAATATT-TAAAATA-TAATAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** ** * * * *
229086 ATGTGCTTGCCAAACCA-TTCAAATAGTTAAGACTAT-TAG
318 ATTTATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTAAGACCATAT-C
* * * * *
229125 AATAATTATCTATTTCAAATTGTT-TTGACCTTTTG-TTTAGTCATATAATAATTGTT-TCGGTT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATT-ACCTTCTGTTTTA-TCATAAAACAATT-TTAT---TT
* ** * * * **
229187 -TACA--CAAGCTTATTCGGAATAATATAGTACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGC
60 GAACATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAAT
* * * * *
229248 ATGAGATTTAAAACAATAAATT-TGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAA
124 AAGAGATTTAAAA-AAT-AATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * ** *
229312 TTATCCACTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAATAATTGTTTTAGTTTGTAAAAG
187 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAG
* * * *
229377 CTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
252 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTT-AAAA-T-ATAA-TAAGAGATTTAAA
* * * ** * * *
229442 AAATAAA-TTAGTTTA-CTGAATCGGTTCAAATAATTATGGGCGTTTA
312 AAATAAATTTA-TTTATC-AAATCAGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* * * * * * *
229488 AACAACTATCTATTTCAAATCATTTTTTCCTATC-GTTTTGTCATAAAACAATTGCT-TTTCAAC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCT-TCTGTTTTATCATAAAACAATT-TTATTTGAAC
* * * * * *
229551 ATAT-AAGCTT-TTT-GAAATAAAATAACACTAATTTATTTATATTTCAAGAATTTATTAGTAAG
64 AT-TCAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
* * * ** * * * * *
229613 AGATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACCAAAC-TATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATGAC
127 AGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * **
229676 CTATTTCAAATTATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTT-TTCATACT-ATTT
191 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTGTTCATA-TAAGCT
* * * * * * *
229739 TATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACT-TAA-AGGCCAAAAAATTAAAA
254 TATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT-TAAAA-TATAATA----AGAGATTTAAAA
** * ** * * * *
229802 AATAAAACTAATTGCCTAA-CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG
313 AATAAATTTATTTATCAAATC-AGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* * * * * * ** * *
229847 AA-ATATTATATAATTGTTGAACTAGTTCAAATA-GTTAAG-ATTAT-AT-GAACAATTATCTAT
1 AACA-ATTATCT-A-T-TTCAAATCGTT--ATTACCTTCTGTTTTATCATAAAACAATT-T-TAT
* * * * * * ** * *
229907 TTCAAATCATT-ATGACCTT-TTCTTGTATCGTAAAACAATTATTTTGTTTGTACAAGCT-TATT
58 TT-GAA-CATTCA--AGCTTATT-TAG-A--ATAAAATAA-TA-CTAATTTAT-TAA--TAT-TT
* * ** * * *** * * * **
229969 C--GAATTAAAATAATACTA-ATTT-AATAATATTTCAAAAATTAAT-AAGAGATTTAAA-AAAT
109 CAAAAATTAATA-AATAAGAGATTTAAAAAATAATTC--TGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTT
* * * * * * * * * ***
230028 A-AATTTTTTTACCAA--ATC-ATTTCAAAT-AGTTAAGA-CTATTAGAATAATTATCTATTTGA
171 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG--T-TTTGTC-ATAAAA
** * * * * * * ** ** * ** *
230087 -AA-TCATTTTG-ACATTTTA-TTTAGTCATAAA-ACAATTGTTTTAGTTCATACCAGCTTATTT
230 CAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTA-ATC-TATTA--ATATTT
* * ** ** * * ** * *
230147 AGAAAAAATTGATACTA-ATTTATTAACATTTGAAAAATTA-TAAGAAAGAT-AG-T-AAAAAAA
290 --AAAATA-TAATAAGAGATTTA--AA-AAAT--AAATTTATTTATCAA-ATCAGTTCAAATAAT
* *
230207 TAA-ATCTATTTATTG
346 TAAGA-CCA--TA-TC
* ** * * * ** * * * *
230222 AATAAGTTCAAATAGTTATTATTAT--TTGAATAGTTGTCTATTTAAAATCATTATAAC-CTTTT
1 AACAA-TT-ATCTA-TT-TCA-AATCGTT-ATTACCT-TCTGTTT--TATCA-TAAAACAATTTT
* *
230284 GATTTGTCATAAAGCAATTGTTTCAA-TTAATATAAACTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTT
56 -ATTTG-----AA-C-A----TTCAAGCT--TAT----TT--A--GAATAAAATAATACTAATTT
** * * * * ** * *
230348 ATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAGA-GCTGTTTACCGAATTAGTTA
99 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATA-ATTCTGTTTACTGAACAAATTT
* * * ** *
230412 AAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
163 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * *
230477 AACAATTCTTTTTGCTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT-TGATTAATATTTCA
228 AACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCT-ATTAATATTT--
* * * * *
230541 AAAATTAATAAGTAATAGATTTAAACAATAAATCTATTTACCAAA-CTAGTTCAAATATAGTTAT
290 AAAA-T-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAATC-AGTTCAAATA-A-TTAA
* *
230605 GACTA-ATTG
349 GACCATA-TC
* * * ** * * *
230614 AACAAATATCAATCTCAAATCGTTAAAATCTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTATT-TCTT--AT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATAAAACAATT-TTAT-TTGAAC
* ** * * * *
230675 A-T-AAGCTTA-TTCGGTTAAAAATAATAATAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA
64 ATTCAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGA
* * * * * * ** *
230737 GATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAACCAGTTTGAATAGTTAAAACT-TTTAGAATAATTAT
128 GATTTAAAAAATAATTCTGTTTACT-GAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTAT
** * * * * * * * * *
230800 CTATTTCAAATTGTTTTAACC---T-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCTTA-AAGCCT
191 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATATAAGCTT
*** * * * * * * * *
230859 ATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGGGCAAAAGATTTGAAAAA
255 ATTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTAAAATA-TAAT----AAGAGATTTAAAAAA
* * * * * ** * *
230924 TAAATCTATTTAGCAAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTA
315 TAAATTTATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* * * * * * *
230967 AATAATTATTTATTT-AAATTCATTATGAACTGT-TGTTTTGA-CAT-AAACAATTGTTA-TAGT
1 AACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATTACCT-TCTGTTTT-ATCATAAAACAATT-TTATTTGA
** ** * * **
231027 TTATAAAAGCTTA--TA-AAAAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG
62 ACATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAG
* ** * * * *
231089 AG-TTTAAAGAATAAATT-TGTTTACCAAACAAATTTAGATAGTTACGACTATTTTAACAATTGT
127 AGATTTAAAAAAT-AATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * *** * * * *
231152 CTATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTGTTTCAATTTACACATGCTTA
191 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTA
* * * * *
231217 TTCAAAATAATATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTATTAAGTAAGTGATTTACAAAAT
256 TTCAAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT--TAAAA-TA-TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * * *
231282 GAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTC
316 AAATTTATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* * * * * * *
231324 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGATCATATAACAATTGTT-TTTTATCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATAAAACAATT-TTATTTGAACA
* * * * * *
231388 TTTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 TTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGA
* * * * * * * * * * *
231453 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAATTCAAACAGTAATGACTATTTCAACAATTGTATAC
130 TTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
231518 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC
195 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTC
* * *
231583 GAAATAAAATAATACTTATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAA
259 AAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTT--AAAA-T-ATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * *
231647 TTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG
319 TTTATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* * * ** *
231686 AACAATGATCTATTTCAAACCGTTATGACCCTT-TGTTTTGCCATAAAACAA-TTT-TTTCAACT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CCTTCTGTTTTATCATAAAACAATTTTATTTGAA--
* * * * * * * *
231748 CATACTAGCTTAATTGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGTAAGA
63 CATTCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGA
* * * * * *
231813 GA-TTAAAAAATAATTATATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
128 GATTTAAAAAATAATTCTGTTTA-CTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
231876 TATTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAG-TT-T
192 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTAT
* * *
231938 GTCTGAAATAAAATAATAAT-AGCATATTAATATTTTGAAAAT-TAATAAGAGATTTAAAAAAT-
257 -TC-AAAATAAAATAATACTAATC-TATTAATA-TTT-AAAATATAATAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * *
232000 AA--T-TCTATCAAATTAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT-TT
317 AATTTATTTATCAAATCAGTTCAAATAATTA-AGACCATATC
* * * * *
232037 AAGCAATTATTTATTTCAAATC-TTATGA-CTT-T-TTTCT-GCTATAAAACAATAGTT-TTTGT
1 AA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTT-TATC-ATAAAACAAT-TTTATTTGA
* ** ** * * ** * *
232096 TCACACAAGCTTATACA-AATTAAAATATTACTAATTTATTAGTATTTTGACAATTAATAAGTAA
62 ACATTCAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAA
* * * * * * * * * * *
232160 AAAATTTTAAAAATAAATATATTTATTGAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA
126 GAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAAC-AAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * **
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190 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTT
* * * *
232289 ATTCAAAATAAAATAATAC-GATGCTATTAATATTCCAAAAATTAATAGTTAAGAAATTTAAAAA
255 ATTCAAAATAAAATAATACTAAT-CTATTAATATT--TAAAA-T-ATA-ATAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * *
232353 ATCAATCTGTTTA-CAGAA-CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTG
314 ATAAATTTATTTATCA-AATC-AGTTCAAATAATTAAGACCATATC
* ** * * * *** *
232397 AA-AATTATCTATTTGAAATCCCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TGCTTTATTCT-ATTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATAAAACAATTTTATT-TGA-AC
* * * *
232459 ATACAAGTTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA
64 ATTCAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAATAA
* * * * * * * * * *
232521 AAGATTTAAACAATAAATCTGTTTA-TCAAACCAGTTTAACTCGTTAAGACCATTTGAACAATTA
126 GAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACT-GAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
232585 TTTATTTCAAATTATTATGACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTT
190 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
232639 TCTTCAAGCT
Statistics
Matches: 6759, Mismatches: 1758, Indels: 1278
0.69 0.18 0.13
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTCTGTTTTATCATAAAACAATTTTATTTGAACAT
TCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGAT
TTAAAAAATAATTCTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAA
AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTAAAATATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
ATCAAATCAGTTCAAATAATTAAGACCATATC
Found at i:224367 original size:539 final size:535
Alignment explanation
Indices: 223124--229458 Score: 1428
Period size: 539 Copynumber: 11.9 Consensus size: 535
223114 TTCATATTCA
* * * * *
223124 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTCAATTTAT
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* * *
223189 ATAAGCTTATTTAGTATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTCA-TATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGAT
* * * * *
223254 TAAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAA-AAATTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATT
130 TTAAAAAATAAATTTGTTT-CTCAATAGA-TCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATT
* * *
223318 TCAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA
193 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATATAAGCTTATTTGA
* ** *
223383 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATT
258 AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATGAATCTATT
* * * **
223448 TATTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTT
323 TATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTAGGACCTT
* * * *
223513 CTGTTTTATCATATAACAATTTTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
388 CTGTTTTATCATAAAAAAATGTTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATC
* * * * * *
223578 TATTAACCCTTTAAAAATAAATAAATAAGCGAATTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAACTATTTT
453 TATTAACCATTTAAAAAT-AATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTATGTT
**
223643 AAATAGTTATGACTATTTG
517 AAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * *
223662 AACAATTGTAAATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTTAT
1 AACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTATTTAT
* * * * *
223727 ACAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAA
66 ACAAGCTTATTC-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGAT
* * *
223792 TTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAATCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTAT-TATT
130 TTAAAAAATAAATTTGTTTCTC-AAT-AGATCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATT
* * * * * *
223856 TCAAGTCGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTCTCA-AT-AGCTTA
193 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA---TTGTTT-AAGT-TCATATAAGCTTA
* *
223919 TTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
253 TTTGAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAA
* ** * *
223983 T-AATTCTGTTTATCT-AACCAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
313 TGAA-TCTATTTAT-TAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * ** * * *
224046 TATTAGGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTT-TTTGTTCATAT-AAGTTTGTTCAGAATA
376 CATTAGGACCTTCTGTTTTATCATAAAA-AAATGTTATTTGAACAT-TCAAGCTTATTCAAAATA
* * * * *
224109 AAATAATACTAATCTATTAA-TATTT-CAAAT-ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
439 AAATAATACTAATCTATTAACCATTTAAAAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTT
224171 A-TCAAACTA-GTTAAAT-GTTACAACTATTT-
504 ACT-AAACTATGTTAAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * *
224200 AAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTATTCTATTATGAAACAATTGTTTCTATTTA
1 AA-CAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTATTTA
* * *** * *
224265 TACATGCTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGGTAATTAATAAGTAAAAGA
65 TACAAGCTTATTCATA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGA
** * * * * * * * * *
224330 TTTTTAAAATAAATATATTTACTCAACTAGATCAAATAATCATGATTTTTTAAATAATTATCTAT
129 TTTAAAAAATAAATTTGTTT-CTCAA-TAGATCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTAT
* * * *
224395 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAAGAAATGTTTCAA-TTCATATAAGCTTATTC
192 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATATAAGCTTATTT
* ** * * * *
224459 GAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAGTAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAA
256 GAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAT-AAGTGATTTAAAAAATGAA
* * * * ** *
224524 TCTATTTACTAAACAAGTTTAAATAATTAT--CTAT-TTGA-AATT-GCTA--T--AA-CA-T--
317 TCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTAG
* * *
224576 ----TT-TGTTTTGTCATAAAAGAAT-TT-TTT---CTATTC-A---TA--C--AAT---CT--T
382 GACCTTCTGTTTTATCATAAAAAAATGTTATTTGAAC-ATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * * **
224618 A-T-TTC-A--AGA-CAATT-AACA-AGT-AA-AAGAG--TTAAAAAGTAAATTTGTTTACCGAA
446 ACTAATCTATTA-ACCATTTAAAAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA
* *
224671 -TAAGTTTAAATCA-TTATAACTATTT-
510 CTATG-TTAAAT-AGTTACAACTATTTG
* *** * *
224696 -ACGTAATTATTTATTTCAACTAT-GACTT-T-TTGTTTTG-TCGTA--A-AATA-ATTGT-TTC
1 AAC--AATTATATATTTCAA--ATCG--TTATAACCTTTTGTTC-TATTATAAAACAAT-TATT-
* * * * * * * * *
224751 TAT-TC-AAACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAA
57 TCTATTTATACAAGCTTATTCATA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAA
* * * * * * * * * * * *
224814 GTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTAC-CGAATAAGTTAAAATAGTCATGATTATTTAAAT
121 CTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTT-CTC-AAT-AGATCAAATAATTAAGACTATATGAAC
* * * * *
224878 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATT-TTTTAGTTCATCTA
182 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATATA
* * * * ** **
224942 AGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTGAGTAAGAAAACTA
247 AGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTA---A-TAAGTGATTTA
* *** ** * * * * *
225007 AAAAAAGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCA
308 AAAAATGAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCA
* * * * ** * * ***
225072 AAACATTATGACCTTTCAT-TTTT-CCATAAAACAAT-TGT-TTTGTTCATGCAACCTTATTTTG
373 AATCATTAGGACC-TTC-TGTTTTATCATAAAAAAATGT-TATTTGAACATTCAAGCTTATTCAA
* * *
225133 AATAAAATAAT-TTAAAGT-TATTAA-TATTCCAAAAAT--T-AAT-A-AG-----AAAAA-AAA
435 AATAAAATAATACT-AA-TCTATTAACCATT-TAAAAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAA
* * * * ** *
225184 TGT-TTT-CTGAGC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
497 TCTATTTACTAAACTATGTT-AAATAGTTACAACTATTTG
* * ** * * * * * * * * *
225221 AATAATTATCTATTTCAAATTATTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTATTTATGTTCAT
1 AACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTATTTAT
* * * * * * *
225286 AAAAGCTTATTCGGA-ATAAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTATTAAGTAAAAG
66 ACAAGCTTATTC--ATAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAG
* *** * * ** * * * * *
225350 ATTTCAAAAATAAATCAATTTAATGAGCGAGTTCAAATAAATATGACTATTTGAACAATTATTTA
128 ATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CTCA-ATAGATCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTA
* * * * * * *
225415 TTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATA-AAACTTTAT
191 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATATAAGC-TTAT
** * *
225478 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAAT
254 TTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-T---GATTTAAAAAAT
* * * *
225542 AAATCTA--T-TT--A-C----CAAATAA-TACT-A--ATTTGAA-ATATTATTTATTTCAAATC
314 GAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTA-TGACCATGTCAACA-ATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * **
225592 ATTAAGACATTTTATTTTATCGTAAAACAATTGTTA-TT---CATACAAAATTATTCAAAATAAA
377 ATTAGGACCTTCTGTTTTATCATAAAA-AAATGTTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
225653 ATAATACTAATTTATTAA-TATTT-AAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAGTTTGTTTAC
441 ATAATACTAATCTATTAACCATTTAAAAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTAC
* ** *
225715 TGAACTA-GTTTAAATAGTTATGACTATTTC
506 TAAACTATG-TTAAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * *** * * *
225745 AACAATTATCTATCTCAAATTAG-TATGATCTTTAT-TT-TGCCATAAAACAATTGTTTCTGTTC
1 AACAATTATATATTTCAAA-TCGTTATAACCTTT-TGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTATTT
* * ** ** * * *
225807 ATACGAGCTTATTCAAAGTAAAATAATGTTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAC
64 ATACAAGCTTATTCATA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAG
** * * * *
225872 ATTTAAAAAATAAAAGTGTTTACTGAACCAG-TTATAATAGTTAAGACTAT-TAGAACAATTATC
128 ATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CTCAA-TAGATCA-AATAATTAAGACTATAT-GAACAATTATC
* * * * * * * * * * *
225935 TATTTCAAATCATTCTAACCTTTTTTTTTGCCATAAAA-ATTTTTTTTTAGTTCATACAAGGTAA
189 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTAAGTTCATATAAGCTTA
* *
225999 TTTGAAATAAAATAATACA-ATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAA
253 TTTGAAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT--G--ATTT-AAAA
* * * *** * * * * * * * *
226062 AATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAAT
311 AATGAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAA-
* * * * * * ** *
226127 TGA-TATGACCTTTTGTTTTATCTTAAAACAATTGTTTCAGTT--A-ATAAAAGCTTATCCAAAA
375 TCATTAGGACCTTCTGTTTTATCATAAAA-AAATG-TT-ATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAA
** * * * * * * ** ** * *
226188 TAAAATCGTATTACTCTATTAA-TATTTCAAAAGTTGAGAGGTTGGAGATTTAAAAAGTAAAT-T
437 TAAAATAATACTAATCTATTAACCATTT-AAAA-ATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCT
* * * * *** *
226251 AGTTTATCGAATCAAT-TTAAATAATTATGGCCATTTG
500 A-TTTA-CTAAACTATGTTAAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * * * * *
226288 AATAGTTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCA-TC
1 AACAATTATATATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCT-ATTT
* * * * * * *
226351 ATACAAGCCTATTTGGA-ATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGA
64 ATACAAGCTTA-TT-CATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGA
* * * * ** * * ** * * *
226415 GAATTAAAAAATAAATATGCTTAC-CGAACCACTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATA
127 GATTTAAAAAATAAATTTG-TTTCTC-AA-TAGATCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATC
* * * * * *
226479 TATTTCAAATCGTTAT-AACTTTT-TTTT-T-ATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAACTTAT
189 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATATAAGCTTAT
* * ** * *
226540 TTGAAATAAAATAATACTAATATAACAATATTAT-GAAAATTAATAACTATGAGATTTAAAAAAT
254 TTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT-A--A-GTGATTTAAAAAAT
* * * *** * * * *** *** *
226604 AAATTTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGTTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
314 GAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCAT
** * ** * ** * * *** *
226669 TATAACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAAATGTTTTTTGTTCATAT-AAGTTTGTTTTGACTAAAA
379 TAGGACCTTCTGTTTTATCATAAAA-AAATGTTATTTGAACAT-TCAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * ** * *
226733 TAATATTAATTTATTAA-TATTTTGAAAAT--T-AATGAGAG-ATTTTAAAA-AAATTTGTTTAC
442 TAATACTAATCTATTAACCA-TTTAAAAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * *
226792 CAAACCAAT-TCAAGTAGTTATAACAATTTG
506 TAAA-CTATGTTAAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * * * * * * *
226822 AATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTGAT
1 AACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTATTTAT
* * * * * * * *
226887 ACAATCTTATTCAAAATAAAGGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATGAATAAATAAGAGA
66 ACAAGCTTATTC-ATATAAA-ATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGA
* * * * * * * * * * *
226952 TTTAAAAAATAAATCTGTTGGGCTGACTAG-TACAAAGAGTTATGATTTTTTG-----TT-T-TG
129 TTTAAAAAATAAATTTGTT--TCTCAATAGAT-CAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTA
* * ** * ** * *
227009 TTACAAAACAAT-TG---TTTCTG-TTTG-CAT-----AA--G-TTAACTAGGA-ATAA-CATAA
191 TTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGT-TCATATAAGCTTAT
* ** * * * * * *
227058 TT---CTAATTTATTAGT-ATTTAGT-AT-TTT-AAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAACTA
254 TTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGTGATTTAAAAAATG
* ** * * * * * * *
227116 AATCTGTTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TT
315 AATCT-ATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCAT
** * * * * * * *
227180 CTATAACCTTTTGTTTCAGCATAAAATATAT-TT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTC-AATTA
379 -TAGGACCTTCTGTTTTATCATAAAA-AAATGTTATT-TGA-ACATTCAAGCTTA-TTCAAAATA
** * * * * * * *
227241 AAATAATAAAAATTTATTAA-TATTCAACAACTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAATAAATCTATT
439 AAATAATACTAATCTATTAACCATTTAA-AAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATT
* * * **
227304 TACCAAA-TAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTG
503 TACTAAACTATGTT-AAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * * * * * * * * *
227337 AATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCAT
1 AACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTATTTAT
* * * * ** * * *
227401 ACAAGCTTATTTGGAT-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAGTAATTAATTAGTAAAAGA
66 ACAAGCTTA-TT-CATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGA
* * * * * * * * *
227465 TTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACCACT-TGAATAATTATCT
129 TTTAAAAAATAAATTTGTTT-CTCAA-TAGATCAAATAATTA-AGACTA-TATGAACAATTATCT
* * * * ** * * * *
227528 ATTTCAAATGGTTATAACTTTTTATTTCATCACAAAACAATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATT
190 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATATAAGCTTATT
* * * * * *
227593 CT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATA
255 -TGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGTGATTTAAAAAATG
* * *** * * * * * * * *
227657 AATCTCTTGACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
315 AATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * *
227722 ATGACCTT-TCATTTTGTCATAAAATAATTGTT-TCT--ACTTGTACAAGCTTATTTAAAATAAA
380 AGGACCTTCT-GTTTTATCATAAAA-AAATGTTATTTGAACAT-T-CAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
227783 AAAATA-TAAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTT
441 ATAATACT-AATCTATTAACCATTT-AAAAA-TAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATT
* * **
227845 TTCTGAATAC-AT-TCAAATAG-T-CGGCTATTTG
503 TACT-AA-ACTATGTTAAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * * * * *
227876 AACAATTATCTA-TTCTAAATAGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTC
1 AACAATTATATATTTC-AAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAAC-AATTATTTCTATTT
* * * * * ** * * *
227939 ATATAAACATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAACTAATAAGTAA-AA
64 ATACAAGCTTATTC-ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAG
* * * * * * * * * * * *
228003 ATTTTAAAAGTAAATTTTTTTAC-CAAGCAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTAAACAATTATTT
128 ATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CTCAA--TAGATCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCT
* ** * * * * *
228067 ATTTCAAATAGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATAAAAG-TTTT
190 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATATAAGCTTAT
* * * ** *
228130 TTCGGAACAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAT
254 TT-GAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA---A-GTGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * ** *
228195 AAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATACTCAT-ATCCATTTCAACAACTATCTACTTCATGTCT
314 GAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGA-CCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * ** *
228259 TTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAA--TTATTTCCATTCATGCAAAATTATTCATAATAAA
378 TTAGGACCTTCTGTTTTATCATAAAAAAATGTTATTT-GA-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * *
228322 ATAATATTGATCTATTAA-TATTTTGAAAAT--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
441 ATAATACTAATCTATTAACCA-TTTAAAAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTA
* * *** *
228383 CCAAAATA-GTTTAAATAGTTATGGCTATTTA
505 CTAAACTATG-TTAAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * *
228414 AACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGATCCTTTT-TT-T-TTCACAAAACAATTGTTTCTCTTC
1 AACAATTATATATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTCTATT-ATAAAACAATTATTTCTATTT
* * * *
228476 ATACAAGCCTATTCGA-ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGA
64 ATACAAGCTTATTC-ATA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGA
* * ** *
228540 GATTT-AAAAA-AAATGTGTTTGC-CGAACCA-ATTCAAATCGTTAAGACTAT-TAAAACAATTA
127 GATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CTC-AA-TAGA-TCAAATAATTAAGACTATAT-GAACAATTA
* * * * * * * *
228600 TCTATTTCAAATCATT-TCAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAACT
187 TCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATATAAGCT
* * * *
228664 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAATAGATTTAAA
251 TATTTGA-AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A--AGT-GATTT-AA
* * * ** * * * *
228727 AAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATATATT-TGACTATTTTAACAATTATCTATTT-A
309 AAAATGAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATA-ATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * ** * **
228790 AAGTCATTATGACATT-TTTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAATTCA-TAAAAATTTTTTGA
373 AA-TCATTAGGACCTTCTGTTTTATCATAAAAAAATGTTATTTGAA--CATTCAAGCTTATTCAA
* * * * ** * * * *
228851 AATAAAATACTACT--T-TTTTAA-TATTTCAAAAACTAACAAGCAAGAGATTTATAAACTAAAG
435 AATAAAATAATACTAATCTATTAACCATTT-AAAAA-TAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAAT
* * * * **
228912 CTATTTTCCAAACCAAT-TCAAATAGTTGTAACTATTTG
498 CTATTTACTAAA-CTATGTTAAATAGTTACAACTATTTG
* * * * * * * * * *
228950 AATAAATATCA-ATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATT-TTT-TATGGT
1 AACAATTAT-ATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTAT--T
* * *
229011 CATACAAGCTTATTCGGATA-AAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAA-T--TAA-TAAG
63 TATACAAGCTTATTC--ATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAG
* * * * * *
229071 ATATTTAAAAAATAAATGTGCTTGC-CAA-ACCATTCAAATAGTTAAGACTAT-TAGAATAATTA
126 AGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTCTCAATA-GA-TCAAATAATTAAGACTATAT-GAACAATTA
* * * * * ** * * *
229133 TCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCGGTTTACACAAGCTT
187 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATATAAGCTT
* * * * * *
229198 ATTCGGAATAATATAGTACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAAC
252 ATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--T--GATTTAAAA-
* * * *** ** * * * * * * * *
229262 AATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCACTTAAAAT
311 AATGAATCTATTTATTAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
229327 CATTATGACCATT-TGTTTTGTCATCAAATAATTGTTTTAGTTTGTA-A---AAGCTTATCCAAA
376 CATTAGGACC-TTCTGTTTTATCAT-AAAAAAATG--TTA-TTTGAACATTCAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
229387 ATAAAATAATAATACTTTATTAA-TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-
436 ATAAAATAATACTAATCTATTAACCA-TTTAAAAA-TAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATC
229450 TAGTTTACT
499 TA-TTTACT
229459 GAATCGGTTC
Statistics
Matches: 4425, Mismatches: 968, Indels: 808
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
489 2 0.00
491 2 0.00
492 152 0.03
493 93 0.02
494 31 0.01
495 10 0.00
496 37 0.01
497 12 0.00
498 10 0.00
499 4 0.00
500 2 0.00
501 3 0.00
502 4 0.00
503 1 0.00
504 1 0.00
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509 1 0.00
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519 30 0.01
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535 149 0.03
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537 241 0.05
538 277 0.06
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
AACAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTCTATTTAT
ACAAGCTTATTCATATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGATT
TAAAAAATAAATTTGTTTCTCAATAGATCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCA
AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT
AAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATGAATCTATTTAT
TAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATGTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTAGGACCTTCTG
TTTTATCATAAAAAAATGTTATTTGAACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAT
TAACCATTTAAAAATAATAAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTATGTTAAAT
AGTTACAACTATTTG
Found at i:225235 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 225199--225246 Score: 53
Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 17
225189 TCTGAGCACG
*
225199 TTCAAATAGTTATGACTAT
1 TTCAAATAATTAT--CTAT
225218 TT-AAATAATTATCTAT
1 TTCAAATAATTATCTAT
*
225234 TTCAAATTATTAT
1 TTCAAATAATTAT
225247 TATCTTTTGT
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Consensus pattern (17 bp):
TTCAAATAATTATCTAT
Found at i:225422 original size:182 final size:181
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Indices: 225198--225552 Score: 514
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225188 TTCTGAGCAC
** * * * *
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1 GTTCAAATAAATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* * **
225263 ATAAACCAATTATTTATGTTCATAAAAGC-TTATTCGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAAAA
66 ATAAAACAATTATTTATATTCATAAAA-CTTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAAA
* *
225327 TTCTAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTCAAAAATAAATCAATTTAATGAGCGA
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* *
225380 GTTCAAATAAATATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
1 GTTCAAATAAATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
* *
225445 ATAAAATAATTATTTCTATTCATAAAACTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
66 ATAAAACAATTATTTATATTCATAAAACTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
** *
225510 CTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
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225553 CCAAATAATA
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GTTCAAATAAATATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATC
ATAAAACAATTATTTATATTCATAAAACTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT
CTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTAATGAGCGA
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224846 GAATAAGTTA
*
224856 AAATAGTCATGATTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAA
1 AAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAA
* ** * * *
224921 AACAATTTTTTAGTTCATCTAAGTTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA
66 AACAATTATTTAGTTCATAAAAGCTTATTGGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAA
* * * * **
224986 AATTAGTGAGTAAGAAAACTAAAAAAAGAATCTATTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
131 AATTAGTAAGTAAGAAAACTAAAAAAAGAATCAATTTAACGAACAAGTTCAAATAAATATGACTA
* * *
225051 TCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTT-TCCATAAAACAATTGTTT-TG
196 TCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTAT-CATAAAACAATTATTTCTA
** *** * *
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260 TTCATAAAACCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AAGTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGAA
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324 AAAAAATGTTTTCTGAGCACGTTC
* * * * * *
225202 AAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTATTATTATCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAA
* *
225267 ACCAATTATTTATGTTCATAAAAGCTTATTCGGAA-TAAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCT
66 AACAATTATTTA-GTTCATAAAAGCTTATT-GGAAGT-AAAATAATACTAATTTATTAAAATTCC
* ** * * * *
225331 AAAAATTATTAAGTAA-AAGATTTCAAAAATA-AATCAATTTAATGAGCGAGTTCAAATAAATAT
128 AAAAATTAGTAAGTAAGAA-AACT-AAAAAAAGAATCAATTTAACGAACAAGTTCAAATAAATAT
* * * * ** *
225394 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATT
191 GACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTATCATAAAACAATTATT
* * *
225459 TCTATTCATAAAACTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAA
256 TCTATTCATAAAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAA
225524 G
321 G
225525 TTGAAGATTT
Statistics
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.40
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AAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAA
AACAATTATTTAGTTCATAAAAGCTTATTGGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAA
AATTAGTAAGTAAGAAAACTAAAAAAAGAATCAATTTAACGAACAAGTTCAAATAAATATGACTA
TCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTATCATAAAACAATTATTTCTAT
TCATAAAACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGAAAA
AAAATGTTTTCTGAGCACGTTC
Found at i:227604 original size:359 final size:357
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Indices: 227079--235173 Score: 3078
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227069 TAGTATTTAG
* * *
227079 TATTTTAAAAATTAAAAAGTAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTGTTTTA-TCGAACAAGTTCAAA
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* * * *
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* * * ** *
227206 TATATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCAACA
127 CA-ATTATTTC-ATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAA
* * *
227270 ACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAAGAGTTATGACTATT
189 ACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
227335 TGAATAA-TATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTC
254 TAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCTTC
* *
227399 ATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
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** * *
227439 TATTTCAGTAATTAATTAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
227504 TCATAACCACTTGAATAATTATCTATTTCAAATGGTTATAACTTTTTATTTCATCACAAAACAAT
66 TCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAAT
* * * ** * *
227569 TGTATCAGTTCATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCCAAAAATTA
131 TATTTCA-TTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAACTA
* * * * * * *
227634 ATGAGTAAGAGATTTAAAATATAAATCTCTTGACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA
193 ATAAGTAAAAGATTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAA
* * * *
227699 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTACTT-GT
257 ACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTT-TTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT-CTTCAT
* * *
227763 ACAAGCTTATTTAAAATAAAAAAATATAAATTTATTAA
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* * * *
227801 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATACA-TTCAAATA
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACA-AGTTCAAATA
** * * * * **
227864 GTC--GGCTATTTGAACAATTATCTA-TTCTAAATAGTTGTGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAACT
65 GTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAAC-
* * *
227925 AATTGTTTCTATTCATATAAACATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAA
128 AATTATTTC-ATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAA
* * * * * *
227990 CTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAGTAAATTTTTTTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGATTGTT
190 CTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * ** * *
228054 TAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTC
254 TAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCTTC
* * * * *
228119 ATAAAAG-TTTTTTCGGAACAAAATAATAGTAATTTATTAA
318 ATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
** * * * * * * *
228159 TATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAC
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * ** * * ** *
228224 TCATATCCATTTCAACAACTATCTACTTCATGTCTTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAT
66 TCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAAT
* * * * * **
228289 TATTTCCATTCATGCAAAATTATTCATAATAAAATAATATTGATCTATTAATATTTTGAAAA-T-
131 TATTT-CATTCATACAAACTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAACTA
* * *
228352 -TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-ATAGTTTAAATAGTTATGGCTATTTA
193 ATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* *
228414 AACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGATCCTTTTTTTT-TCACAAAACAATTGTTTCTCTTCAT
256 AACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGA-CCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCTTCAT
* * * * *
228478 ACAAGCCTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAA
320 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * *
228516 TATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGA-TTTAAAAA-AAATGTGTTTGCCGAACCAA-TTCAAATC
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATA
* ** * *
228578 GTTA-AGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAATCATT-TCAACCTTTTATTT-AGTCATAAAA
65 GTCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTCA-TCATAAAA
*
228640 CAATTATTTCAGTTCATACAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAA
127 CAATTATTTCA-TTCATACAAACTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAA
* * * * * * * *
228705 ATTAATGAGCAATAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATA-TATTTGACT
189 ACTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACT
* * * * **
228769 ATTTTAACAATTATCTA-TTTAAAGTCATTATGACATTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAA
251 ATTTAAACAATTATCTATTTTAAA-TCGTTATGACCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTC
** * * *
228833 TTCATA-AAAATTTTTTGAAATAAAATACTACT--TTT-TTAA
315 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * **
228872 TATTTCAAAAACTAACAAGCAAGAGA-TTTATAAACTAAAGCTAT-TTT-CCAAACCAA-TTCAA
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAA--TATGTTTACTGAA-CAAGTTCAA
** * * * * * * *
228933 ATAGTTGTAACTATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTC-TCATAAA
62 ATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTCATCATAAA
* * * ** * *
228996 ATAATT-TTTTATGGTCATACAAGCTTATTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAA
126 ACAATTATTTCAT--TCATACAAACTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AA
* * * * * * *
229060 AAA-T--TAA-TAAGATATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCA-TTCAAATAGTTAAGACT
187 AAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
229120 A-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCG
251 ATTTA-AACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * * * * * * *
229184 GTTTACACAAGCTTATTCGGAATAATATAGTACTAATTTATTAA
314 CTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * * * * *
229228 CA-TTCGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAAACAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAAT
1 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAA-AATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAAT
* * * * * * * * * ** * *
229292 AGTTATGACTATTTAAACAATTATCCACTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAATA
64 AGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACA
* * ** * * * *
229357 ATTGTTTTAGTTTGTA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATATTTTAAAAA
129 ATTATTTCA-TTCATACAAA-CTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * * * * *
229421 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTGAATC-GGTTCAAATAATTATGGGC-
190 CTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-GTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACT
* * * * * ** ** *
229483 GTTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTTTTTCCTATCGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-T
251 ATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCT-TTTTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCT
** * * * *
229547 CAACATATAAGCTT-TTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTTA
314 CTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * ** * *
229590 TATTTCAAGAATTTATTAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACTATTTCAAATA
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
** * * * * ** * ** *
229653 GTTTTGACTATTTGAATAATGACCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAA
65 GTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA
** * * ** * * *
229718 TTGGTTCTTTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTT
130 TTATTTC-ATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAC-T
* * * * * ** * * * * *
229783 AA-AGGCCAAAAAATTAAAAAATAAAACTAATTGCCTAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG
192 AATAAG-TAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TT
* * * * ** ** * *
229847 AAA-TATTATATAATTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCA
255 AAACAATTATCT-ATT-TT-AAATCGTT---AT-G---ACCTT-T-T----TTTTGTC-A--TAA
* * * * *** * ***
229911 AATCATTATGACCTTTTCTTGTATCGTA-AAACAATTATTTTGTTTGTACAAGCTTATTCGAATT
301 AAT-AAT-TG----TTTC-TCT-TCATACAAGC--TTA-TTTG-AAATAAAATAATATT--AATT
* *
229975 AAAATAA
352 -TATTAA
* * * * **
229982 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAATC
1 TA-T--TTCAA-AA-A-TT----AA-TAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAA-C
* * * * * * * * * *
230046 -ATTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCATTTTGACATTTTATTT-
54 AAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTC
* * * * * *
230108 AGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACCAGCTTATTTAGAA-AAAATTGATACTAATTTATTA
118 A-TCATAAAACAATTATTTCA-TTCATACAAACTTATTCA-AATAAAA-TAATACTAATTTATTA
* * * * * *** *
230172 ACATTTGAAAAA-TTATAAG--AAAGATAGTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAA
179 ATA-TTCAAAAACTAATAAGTAAAAGAT--T-TAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAA
* * * * * * * * * * **
230234 TAGTTATTATTATTTGAATAGTTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAGC
240 TAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAAT
** * * * ** *
230299 AATTGTTTCAATTAATATAAACTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTTATTAA
304 AATTGTTTCTCTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
** * * * ** * ** * *
230353 TATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAGAGCTGTTTACCGAATTAGTTAAAATAA
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* ** * ** * * * **
230418 TTATGGCCATTTGAATGATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
66 TCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAAT
* * * * *
230483 TCTTT-TTGCTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATT
131 TATTTCAT--TCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAACT
* * * *
230547 AATAAGTAATAGATTTAAACAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATATAGTTATGACTAAT
192 AATAAGTAAAAGATTTAAA-AATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTC-AA-ATAGTTATGACTATT
* * * * * ** * * * *
230612 TGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTAAAATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATT-TCTT-A
254 TAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCTTCA
* * ** * *
230674 TATAAGCTTATTCG-GTTAAAAATAATAATAATTTAATAA
319 TACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * * **
230713 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAACCAGTTTGAATA
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATA
* * * * * *
230777 GTTAAAACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACC---T-TTT-AGTCATAAAAT
65 GTCATAACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCA-TCATAAAAC
* * * * * ** * * *
230836 ATTTGTTTCATATCTTA-AAGCCTATTTGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAAAAAA
128 AATTATTTCAT-TCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA
* ** * * * * *
230900 TTAATGGGCAAAAGATTTGAAAAATAAATCTATTTAGCAAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATT
190 CTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
230965 TAAATAATTATTTA-TTTAAATTCATTATGAACTGTTGTTTTGACAT-AAACAATTGTTATAGT-
254 TAAACAATTATCTATTTTAAA-TCGTTATGACCT-TTTTTTTGTCATAAAATAATTGTT-T-CTC
* * * *
231027 TT-ATAAAAGCTTA--T-AAAAAAAATAATACTAATTTCTTAA
315 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * ** * * *
231066 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG--TTTAAAGAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTTAGATA
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAA-AATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
* ** * * * * * * ** * *
231129 GTTACGACTATTTTAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATCAAATAA
65 GTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA
* * * ** * *
231194 TTGTTTCAATTTACACATGCTTATTCAAAATAATATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGT
130 TTATTTC-ATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAACT
* ** * *** ** * * * *
231259 ATTAAGTAAGTGATTTACAAAATGAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTC
192 AATAAGTAAAAGATTTA-AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
* * * * * * *
231324 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATCACCTTTTGTTTGATCATATAACAATTGTTT-TTTATCA
256 AACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTTTTTG-TCATAAAATAATTGTTTCTCT-TCA
** ** *
231388 TTTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAA
319 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * * *
231427 TCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAA-TTCAAACA
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATA
* * * * * * *
231491 GTAATGACTATTTCAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTG-TTCTATCATAAAAAC
65 GTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTC-ATCAT-AAAAC
* * * *
231555 AATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTTATCTAATAATATTTCAAAAA
128 AATTATTTC-ATTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * *
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* * * * **
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65 GTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAAC-A
* * ** * * * *** **
231916 ATGT-TTTTATTCATATAAGTTTGTCTGAAATAAAATAATAATAGCATATTAATATTTTGAAAA-
129 AT-TATTTCATTCATACAAACTTAT-TCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAC
* * * ** *
231979 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAA-ATAA--T-TCTATCAAATTAGTTCAAATAGTTATAACTATTT
191 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAATA-AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
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255 AAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTTTTTGTC-ATAAAATAATTGTTTCTCTTCA
* ** * * *
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319 TACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAA
** * * * * * * *
232138 TATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATATTTATTGAACTAGATCAAATAG
1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * ** *
232203 TCATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAT
66 TCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAAT
* * * * *
232268 TATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC-GATGCTATTAATATTCCAAAAATT
131 TATTTCA-TTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT-CAAAAACT
* * *
232332 AAT-AGTTAAGAA-ATTTAAAAAATCAATCTGTTTA-CAGAACAAGTTTAAATAATTATGACTAT
192 AATAAG-TAA-AAGATTT-AAAAATAAATCTGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * ** *
232394 TTGAA-AATTATCTATTTGAAATCCCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGCTT-TATTCTAT
253 TTAAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCTCT
* * **
232457 TCATACAAGTTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAA
316 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * *
232499 TA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAACAATAAATCTGTTTA-TCAAACCAGTTTAA
1 TATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAA-AATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAA
* * * * * ** * * * *
232560 CTCGTTA-AGACCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACTTTTTATTTTATCATAAA
62 ATAGTCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAA
** * * ** * * **
232624 ACAATTATTTTTGTTTC-TTCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA-ATTTTGA
126 ACAATTA--TTTCATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAA
* * * * * * *
232687 TAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAA-AAATATGTTTATCAAACAA-TTTATTAAT-GTTCTGA
187 AAACTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCA--AATAGTTATG-
* * * *** *** * * * * *
232749 AAATTAATGAGTAAGAGAATT-GGAAAAATGAATCTGTTCATCGAACAGGTTCAAATAGTTATGA
248 --ACT-AT--TTAA-ACAATTATCTATTTTAAATC-GTT-AT-G-AC--CTT----T-TTTTTGT
* * * ** * * * * *
232813 CTATCTAAATAATTATCTATTCCAAAAACATT-ATTAC-ATTTTGTTTTATCATAAAACAATCGG
296 C-AT-AAAATAA-T-TGT-TT-C----TC-TTCA-TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAAT--A
* *
232876 TT-TTGTTCATGCAA
346 TTAAT-TT-AT-TAA
* * * * ** * * *
232890 GCTTAATTCAAATAAAATATTATAAATTTATTA-ATATTCCAAAAGTTAATAAGTAAAAATTGAA
1 ---TATTTC--A-AAAAT-TAAT-AA-GTA--AGAGATTTTAAAAATAAATATGT-----TT--A
*** * * *
232954 AAAATAGATATGTTTTTTGAACAT-GTCCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCT
48 CTGA-ACA-A-G----TTCAA-ATAGT-C----A--TA--ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * ** * * *
233018 AATCATTATGACCATATGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAAACAAACTTATTCGAAAT
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* * * * * * *
233083 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAA-CAAAATATTTTAAAAAATAGATATAT
159 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAACTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAATAAATCTGT
* * * * * * ** *
233147 TTACTAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTA-TTTCAATCACTATGATCT
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* * * * * * **
233211 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTGTTCAGATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAAT
287 TTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTCTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAAT
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351 TTATTAA
* * * * * *
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1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTTAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAA-
*** * * * * * * * * * * *
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* * * * *
233410 AATTCTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTTGAAAA
128 AATTATTTC-ATTCATACAAACTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTA--ATATT-CAAA
* * ** ** * * *
233475 TTATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATCATTGTGACCTTTTATTTTATCATAAAACAA-
188 --A--ACTA-ATAAGTAA--A-AGATTTAAAA--A---T-A-AATCT-GTTTA-C--CAAACAAG
*** ** * * * * * *
233539 TT-GTTTCAGTTCAT-AAAAGCTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTA
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * ** * *
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126 ACAATTA-TTTCATTCATACAAACTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAA
* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * **
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * * * * *
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1 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATGTT-TACTGAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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** ** * *
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* ** * * * *
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* * * **
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* * *
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* * * * * * **
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* ** ** * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * *
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** * ** *
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Statistics
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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249 ATTAGAATAATTATCTA-TTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAACAATTG-TTTAG
* * * * * ** * *
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* * * * * * * * * * * *
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* ** * * * ** * * * * *
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436 TCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATC-AAACAATTGTTTCAATTTATAAAAGCT
* * * * *
227589 TATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAT
500 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * ** * * *
227654 ATAAATCTCTTGACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
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* * ** * * ** **
227718 CGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCTACTTGTACAAGCTTATTTAAAATAA
629 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTTC-A-TCATACAAGCTTATTCGAAATAA
* * * *
227782 AAAAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAATATGTT
692 AATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * ** * * * *
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1 TATTTCAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAG
* * * * * * ** * * *
228043 TTATGATTGTTTAAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
66 TTA-AACTATTTGAATAAATATCAATTTCAAATTGTTATGAT-CTTTGTTTTCTCATAAAATAAT
* * * * * * * *
228108 TAT-TTCTAT-TCATAAAAGTTTTTTCGGA-ACAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTGAAAA
129 T-TCTT-TATGTCATACAAGCTTATTCGGATA-AAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAA
* * * * * *
228170 TTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-CAAGTTCAAATACTCATA-TCCA
191 TTAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAATC-AGTTCAAATAGTTA-AGACTA
** * * * * * * * *
228233 TTTCAACAACTATCTACTT-CATGTCTTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCCA
250 TTAGAATAATTATCTATTTAAAT-TATTT-TGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAACAATTGTTT--A
* * ** * * * * * * *
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310 GTTTATACAAGCTTATT--GAA-AAAATAGTACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGC
* *
228357 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAAATAGTTTAAATAGTTATGGCTATTTAAACAATT
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* * ** * *
228421 ATCTATTTTAAATCGTTATGATCCTTTT-TTTT-TCA-CAAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAG
435 ATCTATTTAAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATC-AAACAATTGTTTCAATTTATAAAAG
* * * * *
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* * * * ** * * * *
228547 AAA-AAATGTGTTTGCCGAACCAATTCAAATCGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTCAAA
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* * * *
228611 TCATT-TCAACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATT-ATTTCAGTTCATACAAACTTATTC-AGAA
628 TCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTTCA--TCATACAAGCTTATTCGA-AA
* * * * *
228673 TAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAATAGATTTAAAAAAATAAATT
689 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * * * * *
228737 TGTTTATCGAACAAGTTCAAATA-TATTTGACTATTTTAACAATTATCTATTTAAAGTCATTATG
752 TATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTCAAA-TCATTATA
* * * *
228801 ACATTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AAAATTTT-TTGAAATAAAATACTA
816 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTTTGTTGAAATAAAATAATA
*
228863 CTTTTTTAA
881 CTTTTATAA
* * * * *
228872 TATTTCAAAAACTAACAAGCAAGAGATTTATAAACTAAAGCTATTTTCCAAACCAATTCAAATAG
1 TATTTCAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAG
* *
228937 TTGTAACTATTTGAATAAATATCAATCTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAATAATT
66 TT-AAACTATTTGAATAAATATCAATTTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAATAATT
229002 T-TTTATGGTCATACAAGCTTATTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAATTA
130 TCTTTAT-GTCATACAAGCTTATTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAATTA
* * ** *
229066 ATAAGATATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAA
194 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAA
* * * *
229130 TTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCGGTTTACACAAG
259 TTATCTATTT-AAATTATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATA-AACAATTGTTT-AGTTTATACAAG
*
229195 CTTATTCGGAATAATATAGTACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAAA
321 CTTATT--GAA-AAAATAGTACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCA-GAGATTTAAA
* * *
229260 ACAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCCACTTAAA
382 A-AATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAA
* * * * * *
229325 ATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAATAATTGTTTTAGTTTGTAAAAGCTTATCCAAAATA
446 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTATTCAAAATA
* * *
229390 AAATAATAATACTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGT
511 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GT
* * * * * * **
229454 TTACTGAATCGGTTCAAATAATTATGGGCGTTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTTTTTCCT
575 TTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
* * * * * *
229519 ATCGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTCAACATATAAGCTT-TTTGAAATAAAATAACACTAAT
640 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-CTTTTCATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * ** *
229583 TTATTTATATTTCAAGAATTTATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT-TGCTTACCAAACTATTT
704 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTT
* * * * * *
229647 CAAATAGT-TTTGACTATTTGAATAATGACCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTATTTTGTCAT
769 CAAATAGTATTTGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * * *
229711 CAAACAATTGGTTCTTTTCATAC--TATTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAA
833 AAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTTTGTT-GAAATAAAATAATACT--TTT-ATAA
* * * * * * * *
229770 TA-TTCCAAAACTTAA-AGGCCAA-AAAATTAAAAAATAAAACTAATTGCCTAACTAGTTCAAAT
1 TATTTCAAAAAC-TAATAAG-CAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTGCCAAACCAGTTCAAAT
* * * *
229832 AGTTAAGACTATATGAAATATTATATAATTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGAT-TATATGAA
64 AGTTAA-ACTATTTG-AATA--A-AT-A----TCAA-T--TTCAAATTGTTATGATCT-T-TG--
*
229896 CAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTGTATCGTAAAACAATTATTTTGTTTGTAC
112 ---TTTTCTCA--T-AAA--A-TA--A---TTTCTT-TAT-GT----C----A---------TAC
* * *
229960 AAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
144 AAGCTTATTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCT-AAAAATTAATAAGAGATTTAAA
* * * *
230024 AAATAAATTTTTTTACCAAATCATTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAA
208 AAATAAATCTATTTGCCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTT-AAA
* * * * *
230089 TCATTTTGACATTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACCAGCTTATTTAGAAAAA
272 TTATTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAACAATTG-TTTAGTTTATACAAGCTTA-TT-GAAAAA
* * * * *
230154 ATTGATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATT-ATAAG-AAAGATAGTAAAAAAATAAATCTATT
333 ATAG-TACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAGAGAT--TTAAAAAATAAATCTGTT
** * * * * * * * *
230217 TATTGAATAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAATAGTTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTT
395 TACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTT
* * * ** *
230282 TTGATTTGTCAT-AAAGCAATTGTTTCAATTAATATAAA-CTTAGAT-GGAATAAAATAATATTA
460 TTGTTTTGTCATCAAA-CAATTGTTTCAATTTATA-AAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTA
** * * * *
230344 ATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAGAGCTGTTTACCGAATTAG
522 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAG
* * ** * *
230409 TTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
587 TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA
*
230474 TAAAACAATTCTTTTTGC-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATT
652 TAAAACAATTC-TTTT-CATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
230538 TCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAACAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATA-TAGT
715 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTA-T
* * * *
230602 TATGACTAATTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTA-AA-ATCTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
779 T-TGACTATTTGAACAATTATCTAT-TCAAATCATTATAACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
230665 TATTTC--TT-ATATAAGCTTATTCGGTT-AAA-AATAATAATAATTTAATAA
841 TATTTCTATTCATACAAGATT-TT--GTTGAAATAA-AATAATACTTTTATAA
* * * * * * **
230713 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG-TGTTTGTCGAACCAGTTTGAATA
1 TATTTCAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-GCTATTTGCCAAACCAGTTCAAATA
* * * * * **
230777 GTTAAAACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT-TTAAC-CT-TTTAGTCATAAAAT-A
65 GTT-AAACTATTT-GAATAAATATCAATTTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAATAA
* * * * * * * * * *
230837 TTTGTTTCATATCTTA-AAGCCTATTTGGA-ATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAAAAAA
128 TTTCTTT-ATGTCATACAAGCTTATTCGGATA-AAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAA
* * * * *
230900 TTAATGGGCAAAAGATTTGAAAAATAAATCTATTTAG-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGATTAT
191 TTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-GCCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-
* * * * * *
230964 TTA-AATAATTATTTATTTAAATTCATTATGAACTGTTGTTTTGACATAAACAATTGTTATAGTT
250 TTAGAATAATTATCTATTTAAATT-ATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAACAATTGTT-TAGTT
* ** * * *
231028 TATAAAAGCTTATAAAAAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCA-AGAG
313 TATACAAGCTTATTGAAAAAATAGTACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGCAGAGA-
* * * * * * * * *
231091 TTTAAAGAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTTAGATAGTTACGACTATTTTAACAATTGTCTAT
376 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT
* * * * *
231156 TTAAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTGTTTCAATTTACACATGCTTATTCA
441 TTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTATTCA
* * * * * * *
231221 AAATAATATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAGTATTAAGTAAGTGATTTACAAAATGAAT
506 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * *
231286 CTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATC
571 CTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * ** *
231351 ACCTTTTG-TTTGATCATATAACAATTGTTTTTTATCATTTAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
636 ACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-CTTTTCATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
* * *
231415 GTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC
699 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
* * * * * * * * *
231480 CAATTCAAACAGTA-ATGACTATTTCAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCT
764 TAGTTCAAATAGTATTTGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATAACATTTTGTTTT
* * * *
231544 ATCATAAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTTATCTAATA
828 GTCAT-AAAACAATTATTTCTATTCATACAAGATTTTGTTGAAATAAAATAATACTT-T-T-ATA
231608 A
889 A
* * ** *
231609 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAG
1 TATTTCAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTGCCAAACCAGTTCAAATAG
* * * ** * *
231673 TTAAGACTATATGAA-CAATGATCTATTTCAAACCGTTATGACCCTTTGTTTTGC-CATAAAACA
66 TTAA-ACTATTTGAATAAAT-ATCAATTTCAAATTGTTATGA-TCTTTGTTTT-CTCATAAAATA
** * * * * *
231736 ATTT-TTTCAACTCATACTAGCTTAATT-GGA-ATAAAATAAAACAAATTTATTAATATT-TCAA
127 ATTTCTTT-ATGTCATACAAGCTT-ATTCGGATA-AAAATAATACTAATTTAATAAAATTCT-AA
* * * * * *
231797 AAATTAATCAGTAAGAGA-TTAAAAAATAATTATATTTACCTAA-CTAGTTCAAATAATTATGAC
188 AAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAATC-AGTTCAAATAGTTAAGAC
* * * * * * *
231860 TATTTGAACAATTATCTATTTAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTA
248 TATTAGAATAATTATCTATTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTAGTCAT-AAAC-AAT-TGTTTA
* * * * * * *** * *
231925 -TTCATATAAGTTTGTCTGAAATAAAATAATAATAGCATATTAATATTTTG-AAAATTAAT-A--
310 GTTTATACAAGCTTAT-TG-AA-AAAATAGTACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGC
* * * * * * *
231985 AGAGATTTAAAAAAT-AA--T-TCTATCAAATTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAGCAATTA
371 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTA
* * * * * *** * * *
232046 TTTATTTCAAATC-TTATGA-CTTTT-TTCTG-CTATAAAACAATAGTTTTTGTTCACACAAGCT
436 TCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATCAAACAATTGTTTCAATTTATAAAAGCT
* * * * ** * * * *
232107 TATACAAATTAAAATATTACTAATTTATTAGTATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAA
500 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * ** * * * * * * * *
232172 ATAAATATATTTATTGAA-CTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAAT
565 ATAAATCTGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
232236 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-ATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAA
629 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTTCA--TCATACAAGCTTATTCGAAATAA
* * * * * *
232300 AATAATAC-GATGCTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AGTTAAGAAATTTAAAAAATCAATCTGT
692 AATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * **
232363 TTA-CAGAACAAGTTTAAATA--ATTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTGAAATCCCTATAA
755 TTACCA-AACTAGTTCAAATAGTATT-TGACTATTTGAACAATTATCTA-TTCAAATCATTATAA
* * *
232424 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATGC-TTTA-TTCTATTCATACAAG-TTTAT-TTCAAATAAAATAA
817 CATTTTGTTTTGTCATAAAA--CAATTATTTCTATTCATACAAGATTT-TGTTGAAATAAAATAA
*
232485 TACAAATTTATTAA
879 TAC--TTTTA-TAA
* * * * * * ** * *
232499 TA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAACAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTTAACT
1 TATTTCAA-A-AACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTGCCAAACCAGTTCAAAT
* * * * ** * * * * *
232562 CGTTAAGACCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACTTTTTATTTTATCATAAAACA
64 AGTTAA-ACTATTTGAATAAATATCAATTTCAAATTGTTATGA-TCTTTGTTTTCTCATAAAATA
* * * * * * * * * * *
232627 ATTATTTTTGTTTC-TTCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTT-ATTAAATTTTGATAA
127 ATT-TCTTTATGTCATACAAGCTTATTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAA
232690 TTAATAAG
191 TTAATAAG
232698 TAAAAGATTT
Statistics
Matches: 3719, Mismatches: 746, Indels: 522
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (889 bp):
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TTAAACTATTTGAATAAATATCAATTTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAATAATTT
CTTTATGTCATACAAGCTTATTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAAAATTCTAAAAATTAAT
AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATT
ATCTATTTAAATTATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAACAATTGTTTAGTTTATACAAGCTTAT
TGAAAAAATAGTACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCAGAGATTTAAAAAATAAATC
TGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA
CCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCA
GTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTCTTTTCATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTATTT
GACTATTTGAACAATTATCTATTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
CTATTCATACAAGATTTTGTTGAAATAAAATAATACTTTTATAA
Found at i:233100 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 232731--236640 Score: 1849
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232721 TTTATCAAAC
* * * ** * * *
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* * * * * * * * *
232794 CAGGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATCTATTCCAAAAACATTATTACATTTTGTTT
63 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * * *
232859 TATCATAAAACAATCGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTAATTCAAATAAAATATTA-T
127 TGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * **
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1 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-
* * ** *
233155 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTC-AATCACTATGATCTTTTGTTTT
63 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** *
233219 GTCATAAAACAATTGTTTGTGTTCAGATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATT
128 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * *
233273 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTA-TCGAAC
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAAC
* ** * * * * * * * *
233336 AAGTT-AAACTAGTCATGTTTGTTTTAACTATTATATATTTCAAATCATTATGACATTCTATTTT
64 AAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * **
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* ** * * *
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1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTA--A-TA----AGTAA-GA--AATTTAAAA--A--AT-A---
** * *** ** *
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* * * * * * * *
233580 ATTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATGCAAGCCTATTTGGAGT
107 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAAT
*
233644 AGAATAATACT
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*
233655 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATACGT-AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGTAA-
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTG-AAC
* * * * * * * *
233718 TAGTTAAAATAGCTATGACTTTTTGAACAATTATATATTTCAAAT-TTGTATAACCTTTTGTTCT
64 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT-TATGACCTTTTGTTTT
* * * *
233782 GTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGTAATAAAATAATACT
128 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * *
233836 AATGTAATAATA-TTCTAAAAATTAAGAACTAACAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACC
1 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * * * *
233900 AGTTCAAATAATTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGCTTTGT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
233965 -ATTAAACAATCT-TTT-TAGTTCTTACTAA-CTTA-TTCAATATAAAATAAAACA
130 CATAAAACAAT-TGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTTGAA-ATAAAATAATACT
* * * * * * * * ** *
234016 AATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATCTAAAAAATAATTCTATTTGCCAAACCA
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* **
234081 GCTCAAATAACTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
234146 AT-AAACAAATCTTTTTGTTCAAATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATT
131 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
234196 AATTTATTCATATTTTAAAATTTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACC
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-AATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA
* * * * * * * *
234260 AGTTTAATTAATT-TAACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTT-TTTTGT
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
234323 CCTCAAACAATTGTTTCTATTCATGCAATCTTATTTGGAATAAATTAATGCT
130 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
** * * * * * * *
234375 AATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAGTAACAAATTTCAAAAATGAATTTGTTGTCCTGATCA
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTT-TACTGAACA
* * * * * * * * * *
234440 A-TGCAAACAGTTATGACTGTTTAAACAATTATGTACTTCACATCATTATAACCTTTTTGTTTTA
65 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTG
* * ** *
234504 TCACAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTCAAAATAACATAAGT-CT
129 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA-TACT
* * * ** ** * * * *
234557 AACTTATTAATATTTCGAAACTTAACGAGTAAGGGATTTAAAAAATGAATCTATTTACAGAACAA
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* ** * *
234622 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTA
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
234687 ATAAAACAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAGAATAATACA
131 ATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
*
234739 AATTTATTAATA-TTCAAATAATTAATAAGTAA-AAGATTTAATAAATAAATATGTTTA-TCGAA
1 AATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAA
* * * * *
234801 TAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTTGTTT
63 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTT
* * * * *
234866 TGTCATAAAACAATTGCTTT-TGTTCATACAAGATTATTTGTATTAAAATAATATT
127 TGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
234921 AATTTATTAATACTACAACAATTAATAAG-AAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGGAC
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAAC
* * * * * * **
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64 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
235049 TTATAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
129 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * ** ** *
235102 AATATATTCATATTTTGAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATCCGTTTACCGAACAA
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* * * **
235163 GCTT-AAATAGTTAAGGCTATTTGAATGAGTTCAAATAGTTATAACTATTT-GAATAATTAT--C
66 G-TTCAAATAGTTATGACTATTTG-A--A---C--A-A-TTAT--CTATTTCAAATCGTTATGAC
* * ** * ** * * * *
235224 TATTTTAATTTT-T--TTGACCGTTTGTTT-T-GTCATAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
118 -CTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT--ACAA--GCTTAT-TT--GA-AA---
*
235284 TATTCTGAATATAATAAT
170 TA-----AA-ATAATACT
* * * * *
235302 ATAAATTTATTAATATTACAAATATTAATCAGT-GGAAATTTAAAAAATAAATCAAT-TTT-CTA
1 ---AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT--ATGTTTACTG
* * * * * * * **
235364 AACACGTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATAGTTTTGACCTTTCATT
61 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
235429 TTGCCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAG-TGCATTTGAAATAAAAATAATACT
126 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTTGAAAT-AAAATAATACT
* *
235486 AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT--AT
1 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC
* * * * * * * * *
235547 AAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAATAATTATTTATTTCGAATAGTTAAGATCTTTCAG-TTT
64 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTT
** **
235611 GTCATAAAACAATTGCTTT-TATTCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACT
128 GTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* *** * * *
235665 AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGT-ATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTA
1 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAA--A-AAT-A-AATATG-TTTA
* * * * ** * **
235728 TCAT-AA-AA---C-AATTGTTTTTG--T-TTAT-ACAGAATTATTTAGAATAAAAT-AATATTG
58 -C-TGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATT-TGA-ACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTA-TG
* * * * * * *** *
235782 A-TTTATTAATATT-TCA-AAAATTAATAAGAAATT-TAAAAACTA-AATC-TATTCATTGAACC
116 ACCTT-TT-GTTTTGTCATAAAA-CAAT-TG--TTTCTATTCA-TACAAGCTTA-T--TTG-A--
*
235841 AATTCAAATAGTTATGATCT
168 AA-T-AAA-A-TAAT-A-CT
* * ** * * * * * *
235861 --TTTCACATAAGCTTATTTGGATTAAGATAAT-ACTAATGTAATAATAAAAAATCAATGTGTTT
1 AATTT-A-TTAA---TATTT-CAAAAAT-TAATAAGTAA-GAAAT-TTAAAAAATAAATATG-TT
* * * * * * * * *
235923 TGCAGAACTACTTCAGATAGTTAAGACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTT
56 TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* ** * * * * **
235988 TTATTAAGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTAATTCAAAATAAAATAATACT
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* * *
236049 AATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-ATATATGTTTACTGAACAA
1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* * * * * *
236113 GCTCAAATAGATATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
236178 ATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAAAAATATT
131 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * ** * *
236229 ACTTTATTAATATTTCAGCAAAAGTTATTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGGTGTTT-TTGTA
1 AATTTATTAATATTTCA--AAAA-TTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA
* * * * * **
236293 CAAGTTCATATAGTTAT-AATCATTTGAACAGA-TATCAATCTCAAATCGTTGTGGTC-TTTGTT
63 CAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * *
236355 TTATCATAAAA-AAGTTTTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTCG-AATAAAAATAATACT
126 TTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACT
* ** * * ** **
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1 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* * * ** * * * *
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66 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
236541 ATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-GTCAGAATAAATTAATACT
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* * * *
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236641 TTGTGATTAT
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ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * *
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* *
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252 ATTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAGAACTAACAAATTTAAAAAA
* * * * * * * * * **
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* * ** * *
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* * *
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*
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* *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTTTATT
* * * * * * * * *
234165 CAAATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTAAAATTTAATAAGTAAGA
66 CATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
234230 GAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTTAATTAATTTAACTATTAGAACAATTATTTA
131 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAA--AGTTTAAATAATTTGACTATTTGAACAATTATTTA
* * * * *
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194 TTTCAAATTGTTATGACC-TTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTG
* * * * * ** * * *
234360 GAATAAATTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTATTAAGTAACAAATTTCAAAAATGAAT
257 TAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAGAACTAACAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
234425 TTGTTGTCCT-GATCAATGCAAACAGTTATGACTGTTTAAACAATTATGTACTTCACATCATTAT
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* *
234489 AACCTTTTTGTTTTATCACAAAACAAT-TGTTTCTA-TTCGTAC-AAGCTTATTCAAAATAACAT
386 AACC-TTTTGCTTTAT-ACAAAACAATCT-TTT-TAGTTCGTACTAA-CTTATTCAAAATAAAAT
** * * * * *
234551 AAGTCTAACTTATTAATATTTCGAAACTTAA-CGAGTAAGGGATTTAAAAAATGAA-TCTATTTA
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* **
234614 CAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
509 CAGAACAAGCTCAAATAACTATGACTAT
* ** * * *
234642 TTGAACAATTATCTTTTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTTTTTTCTAT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTT-TAT
* *
234707 TCATACAAGCTTATTTAAAATAGAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAAATAATTAATAAGTAA
65 TCATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAA
* * * *
234771 AAGATTTAATAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
129 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAA-AAGTTTAAATAATT-TGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
234836 TTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTGTTCATACAAGATT
191 TTATTTCAAATTGTTATGAC--CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTT
* *
234901 ATTTGTATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
252 ATTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
234933 CTACAACAAT
Statistics
Matches: 674, Mismatches: 132, Indels: 48
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (536 bp):
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTTTATT
CATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAAAGTTTAAATAATTTGACTATTTGAACAATTATTTATT
TCAAATTGTTATGACCTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGTAAT
AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAGAACTAACAAATTTAAAAAATAAATTTGT
TTCCTAAACCAATGCAAACAATTAAGACTATATAAACAATTATGTACTTCAAATCATTATAACCT
TTTGCTTTATACAAAACAATCTTTTTAGTTCGTACTAACTTATTCAAAATAAAATAAAACAAACT
TATTAATATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATCTAAAAAATAATTCTATTTACAGAACAAGCTC
AAATAACTATGACTAT
Found at i:234636 original size:182 final size:182
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Indices: 233559--235689 Score: 907
Period size: 182 Copynumber: 11.7 Consensus size: 182
233549 TCATAAAAGC
** * *
233559 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-C-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTC
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* * *** * * * * *
233622 A-TCATGCAAGCCTATTTGGAGTAGAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATACGT
64 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTATTAATA-TTCAAATAATTAACAAGT
* * * * * *
233685 AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGTAA-TAGTTAAAATAGCTATGACTTT
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-G-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
233740 TTGAACAATTATATATTTCAAAT-TTGTATAACC-TTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTG
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
*** * * * * *
233803 TTCATACAAGCTTATTTGTAATAAAATAATACTAA-TGTAATAATATTCTAAA-AATTAAGAACT
65 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACT-TATTAATATTC-AAATAATTAACAAGT
* * * * * * * *
233866 AACAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTAT
128 AA-AAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * ** * * *
233921 ATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGCTTTGT-ATTAAACAATCT-TTT-TA
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTA
* * * * * *
233982 GTTCTTACTAA-CTTATTCAATATAAAATAAAACAAATTTATTAGTATTTCAAA-AATTAATC-A
65 -TTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTATTAATA-TTCAAATAATTAA-CAA
* * * * ** * * * **
234044 GTAAGAGATCTAAAAAATAATTCTATTTGCCAAACCAGCTCAAATAACTATGACTAT
126 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
234101 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATCTTTTTGT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * ** * ** * * * * *
234164 TCAAATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTAAA-ATTTAATAAGTAA
66 TCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTATTAATA-TTCAAATAATTAACAAGTAA
* * * * * * * * * *
234228 GAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACCAGTTTAATTAATT-TAACTAT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * * * *
234280 TAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC-ATTT-TTTTGTCCTCAAACAATTGTTTCTAT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * *** * * * ** **
234343 TCATGCAATCTTATTTGGAATA-AATTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAA-AATTATTAAGTA
66 TCATACAAGCTTATTCAAAATAGAA-TAATACAAACTTATTAATA-TTCAAATAATTAACAAGTA
* * * * * * *
234406 ACAA-ATTTCAAAAATGAAT-T-TGTTGTCCTGATCAA-TGCAAACAGTTATGACTGT
129 A-AAGATTTAAAAAATAAATATAT-TTAT-C-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
234460 TTAAACAATTATGTACTTCACATCATTATAACCTTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTCTAT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * *
234525 TCGTACAAGCTTATTCAAAATA-ACATAAGT-CTAACTTATTAATATTTCGAA-ACTTAACGAGT
66 TCATACAAGCTTATTCAAAATAGA-ATAA-TACAAACTTATTAATA-TTCAAATAATTAACAAGT
** * *
234587 AAGGGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-CAGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
128 AAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
234642 TTGAACAATTATCTTTTTCAAATCACTATAACC-TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTTTTTTCTA
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTA
* * *
234706 TTCATACAAGCTTATTTAAAATAGAATAATACAAATTTATTAATATTCAAATAATTAATAAGTAA
65 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTATTAATATTCAAATAATTAACAAGTAA
* * * *
234771 AAGATTTAATAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTAT
130 AAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
234824 TTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-TG
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA
* *** * * ** * * * * *
234888 TTCATACAAGATTATTTGTATTAAAATAATATTAATTTATTAATACT-ACAACAATTAATAAGAA
65 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTATTAATATTCA-AATAATTAACAAGTA
* * * * * * *
234952 AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGGACAAGTCCAAATTGTCATAACTAT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * ** * * *
235006 TTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATCAAT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * ** * * * **
235070 TCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TATATTCATATTTTGAA-AATT---AA-TA
66 TCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACT-TATTAATA-TTCAAATAATTAACAAGTA
* *** * * *
235129 AGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTACCGAACAAGCTT-AAATAGTTAAGGCTAT
129 AAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTAT
* * **
235183 TTGAATGAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAATTTTTTTGACCGTTTG
1 TTG-A--A---C--A-A-TTAT--CTATTT---CAA--ATC-ATTATAACCTT--------TTTG
* * ** * * *
235248 TTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCTGAATATAATAATATAAATTTAT
40 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTAT
** * *
235312 TAATATTACAAAT-ATTAATC-AGTGGAA-ATTTAAAAAATAAATCA-ATTT-TCTAAACACGTT
105 TAATATT-CAAATAATTAA-CAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTATC-GAACAAGTT
*
235372 CAAATAGTTTTGACTAT
166 CAAATAGTTATGACTAT
* * * * * ** * * * *
235389 TTAAATAATTATCTATTTTAAAT-AGTTTTGACC-TTTCATTTTGCCATAAACCAATTGTTTTTG
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * * *
235452 TTCATACAAG-TGCATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAG
65 TTCATACAAGCT-TATTCAAAAT-AGAATAATACAAACTTATTAATATTC-AAATAATTAACAAG
* * * * * *
235515 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C-TATAAGTTCAAATAGTTATGATTGT
127 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * **
235569 TTGAATAATTATTTATTTCGAAT-AGTTA-AGATCTTTCAG-TTTGTCATAAAACAATTGCTTT-
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATA-ACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTC
** * * *
235630 TATTCATACAAATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAA
63 TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTATTAATATTC-AAATAATTAA
235690 TAGGTATCTA
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TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
TCATACAAGCTTATTCAAAATAGAATAATACAAACTTATTAATATTCAAATAATTAACAAGTAAA
AGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
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236847 TTTCAAATTG
* * *
236857 TTATTACCTTTCATTTTGTCGTAAAACAATGGTCATTCGACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATTACCTTTCATTTTATCATAAAACAATGGTCATTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
236922 CA
66 CA
* * ** *
236924 TTATTACCTTTCATTTTATCATAAAATAATTGTTTTTCAACATACAAGTTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATTACCTTTCATTTTATCATAAAACAATGGTCATTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
236989 AATACTAATT
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TTATTACCTTTCATTTTATCATAAAACAATGGTCATTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
CA
Found at i:237889 original size:177 final size:179
Alignment explanation
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237322 ACTAATTTGT
* * *
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1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCA-AACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTG
* * * * **
237394 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-TACTTTT-TATTTTATCACAAAACAATTGTTTTTGTTC
64 AACAATTATCAATTTCAAATCATTATGAACTTTTGT-TTTGAT---AAAACAATTGTTTCAGTTC
* * * * * *
237457 ATATAAGTTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTCATATTTAAAAAATTAA
125 ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* ** * * * * * **
237512 TCAA-TAAGCGATTTAAAAGGTAAATATGTTTACCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGT
1 T-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG-
* ** * * * * * *
237576 AATAATTAT-ATATTTCAAATTTTTATAAAATTATGTTTTCTCATCAAACAATTGGTTTGA-TTC
64 AACAATTATCA-ATTTCAAATCATTATGAACTTTTG-TTT-TGATAAAACAATT-GTTTCAGTTC
* ** * * * * * *
237639 ATACTATTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTGAAACTTGA
125 ATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
** * * * *
237694 TAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAA
1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
** * ** *
237759 TGATTATCAATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTATTG-TAAAAC-ATT-TTTTTGTTCGTACA
66 CAATTATCAATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTT-TTGATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
* * * * *
237821 AGCTTGTTCAGATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTTTGAAAATTAA
130 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * * *
237871 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAATTCATATGGTTAACACTATTAGAA
1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
* * * * * * *
237936 TAATTATCTATTTGAAATCGTTCT-AACCTTTTCTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA
66 CAATTATCAATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTT--TGATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA
* * * *
238000 CAAGCTTATT-TGAAATAAGATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAA
128 CAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * *
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1 TAAGTA-AGAGATTT--AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTT
* * * * *
238113 GAACAATTGTCTAA-TTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGGCATAAAACAATTGTTTCAATTA
63 GAACAATTATC-AATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTT-G-ATAAAACAATTGTTTCAGTTC
* *
238177 ATACAAGCTTATACAGAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-AAAATTAA
125 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAA
* * * * *
238232 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATCAGTTAAAATAATTATAG-CTATTTGA
1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGA
* * * ***
238296 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACATTTGCTTTTTTTATC
65 ACAATTATCAATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTG--ATAAAACAATTG-TTTCAGT-TC
* * *
238361 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
125 ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * *** * *
238416 TAAGTATA-AGATTTAAAAAATAGATGC-GTTTATCGAGTTAGTT-AAATAGTTAAAACTATTAG
1 TAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG
* * ** * * * *
238478 AATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTT-TTTAGTCG-T-AAACTACTTCTTTCA-TAT
64 AACAATTATCAATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTT--T-GATAAAAC-AATTGTTTCAGT-T
** * * *
238539 CATACAAATTTATT-GGAATAAAATAAT-CATAATATATTAATA--TTCAAAA--AA
124 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * ** * *
238590 TACA-TAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCCAATAAGCTT-AAATAGTTATGACTGTTT
1 TA-AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTT
* * * * * * * *
238653 GAACAATTA-CTTATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAACTGTTTCAATAC
63 GAACAATTATC-AATTTCAAATCATTATGAACTTTTG-TTT-TGATAAAACAATTGTTTCAGTTC
* * * * *
238717 ATAAAAGCCTATT-TGAATTAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
125 ATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAA
* * * * * * * * *
238773 TAAGCAAGAGATTTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTGAAA-AAATTTAAATAGTTATGATTATTT
1 TAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATC--AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTT
* ** ** *
238836 GAATAATTAT-ATATTGAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCAGTTC
63 GAACAATTATCA-ATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTG--ATAAAACAATTGTTTCAGTTC
238900 AT
125 AT
238902 TAATATTCGA
Statistics
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0.74 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
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185 5 0.00
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TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
CAATTATCAATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA
GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
Found at i:238328 original size:361 final size:360
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Indices: 237473--238895 Score: 987
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237463 GTTTGTTTGA
* ** * **
237473 AATAAAATAATACTAATTTATTCATATTTAAAAAATTAATCAA-TAAGCGATTTAAAAGGTAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * **
237537 ATGTTTACCAAA-CTATTTCAAATAGTT-TTGACTATTTGTAATAATTATATATTTCAAATTTTT
65 TTGTTTATCAAATC-AGTT-AAATAGTTATAG-CTATTTG-AACAATTATCTATTTAAAATCATT
* ** * * ** * * * **
237600 ATAAAATTATGTTTTCTCATCAAACAATTGGTTT-GATTCATACTATTTTATTTGAAATAAAATA
126 ATGACCTTTTCTTTAGTCATAAAACAATT-GTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATA
* * ** * * ** * * * * *
237664 ATACTAATCTAATAATATTTTGAAACTTGATAACCA-AGAAAATTAAAAAATA-AATCTAATTAT
190 ATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGAATAGATATTTAAAAAAAATAATCT-TTTAC
* * * * * * * *
237727 C-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATC-AATTTCAAATCGTTATGAACTTT
254 CGAAA-AAGTTTAAATAGTT-A-ATTATTTGAATAATTATCTAA-TTAAAATTGTTATGACCTTT
*** ** *
237790 TGTTATTG---TAAAAC-ATT-TTTTTGT-TCGTACAAGCTTGTTCAG
315 TGTT-TTGCCATAAAACAATTGTTTCAATATAATACAAGCTT-ATCAG
* * *
237832 ATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTT-TGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * *
237896 TTGTTTATCGAACCAATTCATATGGTTA-ACACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATCGTTCT
65 TTGTTTATCAAATCAGTT-AAATAGTTATA-GCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * *
237960 AACCTTTTCTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAGATAATA
128 GACCTTTTCTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
*
238025 CTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAG-ATAGATATTTAAAAAAAATTAATCTATTTACCG
193 CTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGAATAGATATTTAAAAAAAA-TAATCT-TTTACCG
** * * **
238089 AACGAGTTTAAATAGTT-ATTATTTGAACAATTGTCTAATTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
256 AAAAAGTTTAAATAGTTAATTATTTGAATAATTATCTAATTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT
*
238153 GGCATAAAACAATTGTTTCAAT-TAATACAAGCTTATACAG
321 GCCATAAAACAATTGTTTCAATATAATACAAGCTTAT-CAG
*
238193 AGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
* *
238258 TGTTTATCAAATCAGTTAAAATAATTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
66 TGTTTATCAAATCAGTT-AAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA
* * * * *** **
238323 CCTTTTTGTTTTGTTATAAAACATTTGCTTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
130 CC-TTTTCTTTAGTCATAAAACAATTG-TTTCAAT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
* * * * * *
238388 ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATA-AGATTT--AAAAAATAGATGCGTTTATC
192 ACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGAATAGATATTTAAAAAAAATA-AT-CTTTTACC
*** * * * * *
238450 GAGTTAG-TTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTT-T
255 GAAAAAGTTTAAATAGTT--AATTATTTGAATAATTATCTAATTAAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * ** **
238513 TTAGTCGT-AAACTACTTCTTTC-ATATCATACAAATTTATTGG
318 TTTGCCATAAAAC-AATTGTTTCAATATAATACAAGCTTATCAG
*
238555 AATAAAATAAT-CATAATATATTAATA-TTC-AAAA--AATACA-TAAGAGATTTGAAAAAATAA
1 AATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATA-AGTAAGAGATTT-AAAAAATAA
* * * * * * *
238614 ATCTATTTACCCAATAAGCTTAAATAGTTAT-GACTGTTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATTAT
63 ATTTGTTTATCAAATCAG-TTAAATAGTTATAG-CTATTTGAACAATTATC-TATTTAAAATCAT
* * * * * *
238677 TATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAACTGTTTCAATACATAAAAGCCTATTTGAATTAAAAT
125 TATGACCTTTT-CTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
* * * *
238741 AGTACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTTAAAAATAAAT-ATGTTT
189 AATACTAATTTATTAATATTT-AAAAAATTAATAAG-AATAGATATTTAAAAA-AAATAATCTTT
* * *
238805 T-CTGAAAAAATTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATAT-ATTGAAAATTGTTATGACCT
251 TACCGAAAAAGTTTAAATAGTTA--ATTATTTGAATAATTATCTAATT-AAAATTGTTATGACCT
238868 TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCA
313 TTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCA
238896 GTTCATTAAT
Statistics
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0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
TGTTTATCAAATCAGTTAAATAGTTATAGCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC
CTTTTCTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
ATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGAATAGATATTTAAAAAAAATAATCTTTTACCGAAAAA
GTTTAAATAGTTAATTATTTGAATAATTATCTAATTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGCCAT
AAAACAATTGTTTCAATATAATACAAGCTTATCAG
Found at i:238822 original size:183 final size:181
Alignment explanation
Indices: 237332--238895 Score: 938
Period size: 183 Copynumber: 8.7 Consensus size: 181
237322 ACTAATTTGT
* * * ** * * * *
237332 TAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAGTCTATTTA-CAGAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAA
1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAAAAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTGA
* * * * * * *** *
237395 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTTATTTTATCACAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
64 ACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATACATA
* * * *
237460 TAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTCATATTT-AAAAAATTAA
129 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
* ** * ** *
237512 TCAA-TAAGCGATTTAAAAGGTAAATATGTTTA-CCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTG
1 T-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAATTT-AAATAGTTAT-ACTATTTG
* * * ** * ** * * * * *
237575 TAATAATTATATATTTCAAATTTTTATAAAATTATGTTTTCTCATCAAACAATTGGTTT-GATTC
63 -AACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-GTTTCAATAC
* ** * * ** * *
237639 ATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTT-TGAAACTTGA
126 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
** * * * ** * * * * *
237694 TAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGA
1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAA-AAATTTAAATAGTT-ATACTATTTGA
** * * * * ** *** * *
237758 ATGATTATCAATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG--TTATTGTAAAAC-ATT-TTTTTGTTCGTA
64 ACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATACATA
* * * * * **
237819 CAAGCTT-GTTCAGATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTT-TGAAAATTAA
129 CAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
* ** * * * * *
237871 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAATTCATATGGTTAACACTATTAGAA
1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAATTTAAATAGTT-ATACTATTTGAA
* * * * * * * *
237936 TAATTATCTATTTGAAATCGTTCTAACCTTTT-CTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATA
65 CAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAATACATA
* *
238000 CAAGCTTATTTGAAATAAGATAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAAATTAA
129 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
* * * * * ** *
238052 TAAG-ATAGATATTTAAAAAAAATTAATCTATTTACCGAACGAGTTTAAATAGTTAT--TATTTG
1 TAAGTA-AGAGATTT--AAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAATTTAAATAGTTATACTATTTG
* * **
238114 AACAATTGTCTAATTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGGCATAAAACAATTGTTTCAATTA-A
63 AACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAA-TACA
** * *
238178 TACAAGCTTA-TACAGAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-TAAAATTAA
127 TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
* * * * *
238232 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATCAGTTAAAATAATTATAGCTATTTGA
1 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAA-AAATTTAAATAGTTATA-CTATTTGA
* * * * ***
238296 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTTATAAAACATTTGCTTTTTTTATC
64 ACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTCAATA-C
** *
238361 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
126 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
* ** *** * * *
238416 TAAGTATA-AGATTTAAAAAATAGATGCGTTTATCG-AGTTAGTTAAATAGTTAAAACTATTAGA
1 TAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAAAAATTTAAATAGTT-ATACTATTTGA
* * ** * * * *
238479 ATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACC-TTT-TTTTAGTCGT-AAACTACTTCTTTC-ATATC
64 ACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAAC-AATTGTTTCAATA-C
** * *
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* * * * * * ** *
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* *
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* * * *
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128 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAA
* * *
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1 TAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAAAAAATTTAAATAGTTAT-ACTATTTG
* * * ** **
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*
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*
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AAAATATTAATAGTTTATTAATATTC
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * **
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* ** *
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* * * * * * *
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* *
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TAACATTTCAAAAATGAAGAAATAAGAGATTTAAAAAAGAAATCGGTTTA
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*
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243889 AGATGAAAAT
* *
243899 AATAA TAATAA TAATAA TATAA ATATAA AAGTAA AATGAA AATAA AATAG
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* * *
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AATAA
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* * * * *
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* *
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* *
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245246 TTTTCAATAT
* * ** * *
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* * * *
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* ** * * *
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**
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* * * **
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* * * ** * * **
245561 GTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATACAATAATACTACTTTATTAATGT
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* * * * * * *
245614 TTCAAAAATTAAAAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTGCTAAATGAA-TTCAAATAATT
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* * * * * *
245678 ATGGCCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTT
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* * * *
245742 GTTTTTCAA--CATACAAGCTTATTAAAAATAAAATAATACTAGTGTATTAATAT
127 G--TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AA
* * * * * * * *
245795 TTCAAGAATTAGTAAG--AGATTTAAAAAAAAAATCTATTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTATG
1 TTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
245858 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACTTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTGTT
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** * *
245922 TCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAAA
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* * * * * *
245971 TTCCAAAAATTAATAA-ATAAGGGATTTTAAAAATAAATTTGTTTGCTAAATTAA-TTCAAACAG
1 TT-CAAAAATTAATAAGA-AA--GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
246034 TTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTACTTTA-TCATAAAGTAA
61 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAATAA
* ** * * ** * * *
246098 TTATTTCAGCTCACACAAGTTTATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAACAT
125 TTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AA
* *
246153 TTCAAAAGTTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAAA-AAAT
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246190 TCTATTTATT
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ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT
CAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA
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245259 AAAAATTAAC
** ** ** * * *
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1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTGCT-AAATAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * ***
245334 ATCTATTTGAAATCATT-TAGACTTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAATTCATACAAGC
65 ATCTATTTCAAATCATTATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* *** * * *
245398 CTATTTGGAATAAAATAATACAAATTCATTAACA-TTCGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAA
129 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AGATTT-AA
* * * * ** * * * *
245462 AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTTGAATAGTTATGACTA-TGGAATAATTATCAATTTAAA
188 AAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** *
245526 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
253 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAAT
* * * * * *
245590 ACAATAATACTACTTTATTAATGTTTCAAAAATTAAAAAAT
317 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * *
245631 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTGCTAAATGAATTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAACT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTGCTAAAT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ***
245696 ATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAGTTGTTTTTCAACATACAAGC
65 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * *
245760 TTATTAAAAATAAAATAATACTAGTGTATTAATATTTCAAGAATTAGTAAGAGATTTAAAAAAAA
129 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATA
* * * *
245825 AATCTATTTATCGAGCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCT
194 AATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* *
245890 ATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAA
259 ATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAA
* * ** *
245955 TACTAATTTAGTAAAATTCCAAAAATTAATAAAT
324 TACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * ** * * *
245989 AAGGGATTTTAAAAATAAATTTGTTTGCTAAATTAATTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTGCTAAA-TAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * ** * ** * ** * * *
246054 ATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTACTTTATCATAAAGTAATTATTTCAGCTCACACAAGTT
65 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * * *
246119 TATTCGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAACATTTCAAAAGTTTATAAGTAAGAGATTTAGAAA
130 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA--AT-TAA-TAAGAGATTTA-AAA
** * *
246184 AA-AAATTCTATTTATTAAATTATTTCAAATA---AT---TA--T-----A--A-CTATTTCAAA
190 AATAAA-TCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
246232 TCATTATGACTTTTTCTTTTGTAATAAGACAATCGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTT-GAAAT
254 TCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAG-AAT
* *** * *
246295 AAAATAATACTAATTTATTAATGTTCCGAGAATTAATGAGT
317 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* ** * * *
246336 AAGAGAATTAAAAAA-AGAATTTGTTTACCT-AATAAGTTCAAATAATTATGACTATCTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATA-AATCAGTTT-GCTAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
246399 TTAACTATTTCAAAACATTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTTATGCAAG
63 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * *
246463 CTTTTTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
128 C-TTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
* * * * **
246526 AAAATAAATATATTT-TCTGAAC-ACGTTTAAATAGTTATGTCTATTTAAATTATTATCTATTT-
188 AAAATAAATCTATTTATC-GAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
246588 AAATCATTATGACATTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-GAA
251 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG-A
* * *
246652 ATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTAT-AAAATTAATGAGT
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** * * * * * * * *
246694 TGGAGATTTAAAAAATAAAGCTGTTTACTAAATAAGTTCGAATCGTCAT-ATCCATTTGAACTAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTGCTAAATAA-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAT
** ** * *
246758 TATCTATTTCAAATTGTTATGAA-AATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAA
64 TATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * *
246822 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTTCAAAAACTAATAAGAAATTTAAAAACT
128 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * *
246887 AAATTTGTTTCTCGAACTAGTTCAAATAGTTGTTACTATTTGAACAATGACCTATCTCAAATTGT
193 AAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * ** *
246952 TATGA-TCTTTGCTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCGGAGTAAAATA
258 TATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATA
* * ** * *
247016 TTTCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT
323 ATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * *
247051 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-AGATTTGCCAAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAT-AATAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAG-TTTGCTAAAT-AATTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAA
* * * * ** * *
247114 TTATCTTTTTTAAATCATTCTGAACTTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATA-AA
63 TTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* ** * * *
247178 CTCTTATTTGAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATTT-AGAAAATTAATAAGCAAGAAATTT
127 -GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG--AG--A-TT
* * * * *
247242 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
185 TAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * ** *
247306 TAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTTTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAA
249 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * *
247371 AATAAAAGTAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAAT
314 AATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
247416 -TGTAGATTTAAAAGATAAAAT-AGTTT-ATCGAATCAATTCAAATAATTATGGCTATTTGAACA
1 AAG-AGATTTAAAAAAT-AAATCAGTTTGCT-AAAT-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * ** *
247478 ATTATCTATTTC-AAGCTGTTATGAA-CATTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCGTAC
62 ATTATCTATTTCAAATC-ATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * *
247541 AAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
125 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT
* * * * * *
247606 AAAAAATATATCTGTTTA-CTGAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTT
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* * * * * * * * *
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250 CAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * * * *
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*
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** * * * ** * * *
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* * * * * * **
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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314 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGT
* * * * * *
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1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTT-TGCTAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * **
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* * * * *
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129 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATA
* * *
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* * ** * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTT-TGCTAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * *
248900 TATTTATTTCAAATTGTTGTAACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTGTTTTTGTTCGTACAAAC
64 TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
** * * * *
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129 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAA
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 AAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTT-TGCTAAATAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** *
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* * ** * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * *
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** * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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186 AAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTT
* *
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* * *
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** * * * ** * * *
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* * ** * * ** * **
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*** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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254 TCGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * *
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* * * ** * * * * * *
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* * **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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** * **** * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * ** * * * * *
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*
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* * * * *
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* * * * * ***
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* * * ** *
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* * * * * *
252230 AATAAATCTATTTATTGAACAAGCTCAAATAGATATGACTTTTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
190 AATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * *
252295 TGTTATGACCTATT-TTTTGTCATAAAACAACTGTTT-TAGTACATAAAAACTTATCT-GAAATA
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* * * * *
252357 AAATAATACTACTTTATTAGTATTTGAAAAATTATTAAGC
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* * * * * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
252523 TTTATTC-GAATAAATATAATACTAATTTAATAATCTTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
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*
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1 T
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Statistics
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* * * * * *
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* * ***
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* ** * **
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1 CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* * * * *
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66 TTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
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* * * * * * * * *
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1 CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
** * * * ** * *
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* * ** * *
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* * * * ** * * *
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1 CTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA-GCT
* * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTT
** * * * * * *** *
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* * *
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* * * ** * *
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1 CTATTTCAAATC-GTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
*
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65 ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* * * *
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* * * * * * * *
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1 CTATTTCAAATCGTTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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1 CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* * *
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* * * * * * *
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* * * ** **
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** ** * * * * *
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* * * * * * * **
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1 CTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
** * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* *
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* *
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* * * * * * *
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*
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * * *
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* *
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*
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* *
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*
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**
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TTTTTTCATAAAACAATTGTTTTCAAAATACAAGCTTATTTGAAATAGAATTGTTATTACCTTTC
T
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252995 TTTGGTTTTG
* * * ** * * * *
253005 TCATAGAACAATTGTTTTCAAAATACAAGCTTATTTGAAATAGAATTGTTATTACCTTTCTTTTT
1 TCATAAAACAATTGTTTGCAAAATACAAGCTTATTTGAAATAGAAATAATACTACATTTATTTAT
253070 T
66 T
* ** * * * *
253071 TCATAAAACAATTGTTTGCAAAATACAAGCTTATTTGAAATAGAATTGTTATTACCTTTCTTTTT
1 TCATAAAACAATTGTTTGCAAAATACAAGCTTATTTGAAATAGAAATAATACTACATTTATTTAT
253136 T
66 T
* **
253137 TCATAAAACAATTGTTTTTCAACCTACAAGCTTATTTGAAATA-AAATAATACTA-ATTTATTAA
1 TCATAAAACAATTG-TTTGCAAAATACAAGCTTATTTGAAATAGAAATAATACTACATTTATT--
253200 TATT
63 TATT
253204 TCA
1 TCA
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TCATAAAACAATTGTTTGCAAAATACAAGCTTATTTGAAATAGAAATAATACTACATTTATTTAT
T
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Period size: 181 Copynumber: 16.5 Consensus size: 181
253108 AAATAGAATT
* * * * * **
253118 GTTATTACCTTTCT-TTTTTTCATAAAACAATTGTTTTTCAACCTACAAGCTTATTTGAAATAAA
1 GTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
** * * * * *
253182 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAGGAA-T--T-GGTAAAAGCTTTAAAAAATAAATCTGTTTA
65 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA
* * *
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1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * **
253359 ATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTCATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTCGTTT
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* * * * * *
253423 GTTGAACCAGTTCAAA-AATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC
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* ** * * ***
253475 GTTATGACC-TTTGGTTT-TCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * *
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* * *
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130 TCGAACCAA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
253650 GTTATTA--TTAT-TTTTGTCATATAACAATTGTTTTTGTTTATATAAGTTTGTTCTAAATAAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * **
253712 TAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGGTTTAAAAGATAAATCCATTTA
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* * * *
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130 TCGAACCAATTCAAATAG--TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * ** *
253828 ATTATAACCTTTTGTTTTGACATCAAATAGTTGGTTCT-ATTCATA-ATAATTTATTCGAAATAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACA-AGCTTATTCAAAATAA
* * * * * ** ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
254008 GTTATAACCATTTGTTTGGTCATTAAACAATT-TTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCAAATTAAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
** * * * *
254072 TAATAAAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTGAAAAATAAATTTGTTTAT
66 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAT
** * ** * * *
254137 CGAATTAGTTCATTTGGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATT
131 CGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * ** * * *
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1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * *
254253 TAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTA
66 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTA
* * * * * *
254318 CCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATT
130 TCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * ** ** * * **
254370 ATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT-ACTTCAATTAGTACAAGGTTATGT-GGAATAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCA-TACAAGCTTAT-TCAAAATAA
* * * *
254433 ACTAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATATAAATTTATTT
64 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
* ** * * * *
254498 ACCGAATTAATTAAAATAATTAGGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
129 ATCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
254551 GTTATGA-CTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTTTGATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAA
* *
254615 ATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
65 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA
** * ** * * *
254680 TTAAACCAGTTTGAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATCAATCTCAAATC
130 TCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * **
254732 ATTATGATC-TTTGTTTTGTTATAAAACATTTGTTTTTGAACATAGAAGCTTATTC-AGTTGAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAA
* * * * *
254795 ATAATAGTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA
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** * * *
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130 TCGAACC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
254908 GTTATGACCTTCT-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCATACAAGCTTATT-AGGAATAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGATCATACAAGCTTATTCA-AAATAA
* * * * *
254970 AATAATTCTAATATATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGT
64 AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTAT
* * * * *
255034 TTA-CCAAACAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTAAAATT
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* * * * * *
255089 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTTAGTTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * *
255154 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATCTATTTTT
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** * ** * * *
255219 TAAACAAATTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTTTATATTTAAAATC
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* * * ** *
255270 GTTATGACCTCTTGTTTTGTCATAAAATAGTTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAA-AAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
** * * * *
255333 T-A-A-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAATCTACTTAC
66 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAT
* * * * *
255391 CG-ACTCAGTTCAAATAATTATTG-CCATTTTAACAATTATATATTTCAAATC
131 CGAAC-CAATTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * **
255442 ATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * *
255507 TAATACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
66 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAT
* * *
255572 CGAACCAATTC---------T---TATTCGAATAATTACCTATTTCAAAT-
131 CGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * ** * * *
255610 GTTATAACCTTTTGTTCTT-TTATAAAATAATTG-TTTCAATTCATACAAGTTTGTTCAGAATAA
1 GTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * * *
255673 AGTAATACTAATTTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACT-A-AGATTTAAAAAATAATTTTGTT
64 AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATT
* * ** * * ** *
255735 T-GCTAAAGTAGTTCAAATAGTTGA-AACTACATGAACAATTATCTATTTCAAATT
128 TATC-GAACCAATTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * ** * **
255789 GTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAG-TTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * *
255853 ATGATA-TAAATTTATTAATATTAT-GAAAATTAATAAGT----GATTGAAAAAGTGAATTTGTT
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* * * * * *
255912 TA-CTAAATCATTTCAAATAATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATC
128 TATC-GAACCAATTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * ** * *
255966 GTTATTACTTTTTG-ATTGTTCATATAACAAATACTTTTTTATCATTCAAGCTTATTCAAAATAA
1 GTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAAC-AATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAA
** *
256030 AATTCTATTAATTTATTAAT
64 AATAATACTAATTTATTAAT
256050 CTTATCTATT
Statistics
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0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
165 1 0.00
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TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAT
CGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
Found at i:255068 original size:719 final size:714
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Indices: 253132--256032 Score: 522
Period size: 719 Copynumber: 4.1 Consensus size: 714
253122 TTACCTTTCT
* * * * * * *
253132 TTTTTTCATAAAACAATTGTTTTTCAACCTACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAATAATTTAA
** * * * *
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** * *
253256 A-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTAT-AACCTTT-TGTTCTA-TC
128 ATATAGTTAAAACTATTAGAACAATTACCTATTTC-AAATCGTTATGAA-CTTTCT-TT-TAGTC
* * * * * *
253316 ATAAAACAATTATTT-ATATTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
189 ATAAAACAAATGTTTCA-AATCATACAAGCTTATT-AGGAATAAAATAATACTAATATATTAACA
* * *** * *
253379 TTCTAAAAATTCATAACTAAA-AGA-TTT-AAAAAATAAAT-TCGTTTGTTGAACCAGTTCAAA-
252 TTC-AAAAAAT--TAA-TAAAGAGATTTTAAAAAAATAAATAT-ATTTACCGAACAAGCTCAAAT
* * * * * ** *
253439 AATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTGGTTT-TCATAAAACA
312 AGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
*** * * *** * * *
253502 ATTGTTTCAGCTCA-TACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAAACTAATGTGTTAATATTTC-AAAA
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* * * * * * * *
253565 TT--TTA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATCG-AACAAGTTCAAATAAGTATAACTAT
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* * * * * * * * **
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** * ** * * *
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* * * * * * * *
253752 AGGTTT-AAAAGATAAATCCATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTATG-TATTTGAATAATTA
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* *
253815 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
689 TCAATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * * * * * ** *
253842 TTTTGACATCAAATAGTTGGTTCT-ATTCATA-ATAATTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACA-AGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTT
* * * ** ** ** * ** *
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* * * * * * *
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126 CAATATAGTTAAAACTATTA-GAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATGAA-C-TTTCTTTTAGT
* * **** ** ** * * *
254028 CATTAAAC-AATTTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCA--AATTAAAATAATAAAAATTTAATAAT
188 CATAAAACAAATGTTTCAAATCATACAAGCTTATT-AGGAA-TAAAATAATACTAATATATTAAC
* * * * ** * **
254090 ATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAAGATATTT-GAAAAATAAATTTGTTTATCGAATTAGTTCATTT
251 A-TTCAAAAAATTAATAAAG--AGAT-TTTAAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGCTCAAAT
* * * * * * * *
254152 GGTTAAGACTATTAT-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGAACTTTTGTTTAGTCATAAAAC
312 AGTTATGACTATT-TGAACAATTACCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** * * * * * * *
254216 AAAT-GTTTAAGTTCA-TACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTAAAA
376 -AATCACTTCAG-TCAGTAAAAGGTTATCCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * **
254279 AATTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATTAC
438 AATTAATAAGTAAGA-AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAACAA-TTAAAATAATTACAAC
* * * * ** * * *
254343 TATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTA-CTTC
501 CATTTGAACAATTATATATTTAAAATCGTTATGA-CTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTC
* ** * ** * **
254407 AAT-TAGTACAAGGTTATGTGGAATAAACTAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAG
565 AATCCA-TACAAGCCTAT-T-CAA-AAAAAAATAATAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG
* * * ** * * * *
254471 TAAGAAATTTAAAATA-TAAATTTATTTACCGAATTAATTAAAATAATTA-GGACCATTTGAACA
626 T--G--ATTTAAAA-AGTAAATCTACTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATTG-CCAATTGAACA
* *
254534 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTG
685 ATTATCAATTTCAAATCATTATGACTTTTG
* * * * * *
254564 TTTTGTTATAAAATAATTATTTTTGATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAAATAATACTAGTTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAAT-AAAATAATAATAATTTA
* * ** * **
254629 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACC-AGTTTG
64 ATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCCAACCTA-ATCA
** * * * * * * *
254693 A-ATAGTTATGACTAATT-GAACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTT-GTTATA
128 ATATAGTTAAAACT-ATTAGAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTCTTTTAGTCATA
** ** * * * * * *
254755 AAACATTTGTTTTTGAA-CATAGAAGCTTATTCA-G-TTGAAAATAATAGTAATTTAATAATATT
192 AAACAAATG-TTTCAAATCATACAAGCTTATT-AGGAAT-AAAATAATACTAATATATTAACATT
* * * * *
254817 CCAAAAATTAAT-AAGAGA-TTT-AAAAAATAAATGTGTTTATC-AACCTAA-TTCAAATAGTTA
254 CAAAAAATTAATAAAGAGATTTTAAAAAAATAAATATATTTACCGAA-C-AAGCTCAAATAGTTA
** * * * ** * * * * ***
254877 AAACTATTAGAATAATTACCTATTTCAAATCGTTATGACCTTCT-TTTAGTCATAAAATATTTGT
317 TGACTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCAC
* * * * * * *
254941 TTCATATCA-TACAAGCTTAT-TAGGAATAAAATAATTCTAATATATTAACA-TTCAAAAAATTA
382 TTCA-GTCAGTAAAAGGTTATCCA--AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * * * * * ** *
255003 ATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGCTCAAATAGTTATGACTATTT
443 ATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAAACAA-TTAAAATAATTACAACCATTT
* * * ** * *
255067 GAACAATTACT-TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCGTTTT-AGTT
506 GAACAATTA-TATATTTAAAATCGTTATGA-CTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTCAATC
* ** * *
255130 CATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAG
569 CATACAAGCCTATTC-AAA-AAAA-AATAATAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT---
* * * *** * * * *** * * *
255194 AGATTTAAAAAATATATCTATTTTTTAAACAAATTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAATT-TT
627 -GATTTAAAAAGTAAATCTACTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATTGCCAATTGAACAATTATC
* * *
255258 ATATTTAAAATCGTTATGACCTCTTG
691 A-ATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * ** * *
255284 TTTTGTCATAAAATAGTTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC--A-AAAA-AATAATAATTTATT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATAATAATTTAAT
** * ** * *
255345 AATATTTTGAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAATCTACTTA-CCGA-CTCAGTTCAA
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCCAACCT-A-ATCAA
* *** * ** ** * *
255404 -ATAATTATTGCCATTTTAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTT-TGTTTTGTCATAA
129 TATAGTTAAAACTATTAGAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTCT-TTTAGTCATAA
* * *** * * * * *
255467 ACCAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTC-A
193 AACAAATGTTTCAAATCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTAATATATTAACA-TTCAA
* * * * *
255531 AAATTTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCG---AA-C-C--A-A-TTCT-
257 AAAATTAAT-A--AAGAGATTTTAAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGCTCAAATAGTTATG
* * * * * * * ***
255584 --TATTCGAATAATTACCTATTTCAAA-TGTTATAACCTTTTGTTCTT-TTATAAAATAATTGTT
319 ACTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATCACT
* * * * * * * *
255645 TCAATTCA-TACAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATACTAATTTAATAATATTAT-GAAAATTAAT
383 TC-AGTCAGTAAAAGGTTATCCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT
* * * * * * * * * * * **
255708 AACTAAG--ATTTAAAAAATAATTTTGTTT-GCTAAAGTAGTTCAAATAGTTGA-AACTACATGA
445 AAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAA-CAATTAAAATAATT-ACAACCATTTGA
* * * * * * *
255769 ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TAGTTTCAATTCAT
508 ACAATTATATATTTAAAATCGTTATG-ACTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTCAATCCAT
* * ** * *
255833 ATAAGCTTATTTGAAATAAAATGATATAAATTTATTAATA-TTATGAAAATTAATAAGTGATTGA
572 ACAAGCCTATTCAAAAAAAAAT-A-AT-AATTTATTAATATTTA-GAAAATTAATAAGTGATTTA
* * ** * * * * * * * *
255897 AAAAGTGAATTTGTTTACTAAATCATTTCAAATAATTATGGTCATTTCAACAATTATCTATTTCA
633 AAAAGTAAATCTACTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATTGCCAATTGAACAATTATCAATTTCA
* *
255962 AATCGTTATTACTTTT-
698 AATCATTATGACTTTTG
* * ** * *
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1 T-TTTG-TCATAAAAC-AATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAT
256033 TCTATTAATT
Statistics
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AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCCAACCTAATCAATA
TAGTTAAAACTATTAGAACAATTACCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTCTTTTAGTCATAAAAC
AAATGTTTCAAATCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTAATATATTAACATTCAAAAAA
TTAATAAAGAGATTTTAAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTATTT
GAACAATTACCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCACTTCAGTCAG
TAAAAGGTTATCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAAT
TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAACAATTAAAATAATTACAACCATTTGAACAATTATATATT
TAAAATCGTTATGACTCTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTCAATCCATACAAGCCTATTCAA
AAAAAAATAATAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTACTTAC
CAAACCAGTTCAAATAATTATTGCCAATTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACTTTTG
Found at i:255095 original size:538 final size:536
Alignment explanation
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253122 TTACCTTTCT
* *** * *
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** ** * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * **** * *
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* * *
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* *** * * * *
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* * *
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450 ATTTAAAAAATAAATT-TATTTATCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATAACTAATTGAACAATTATC
* * * *
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513 AATTTCAAATCGTTATGATCTTTG
* * * * *
253661 TTTTGTCATATAACAATTGTTTTTGTTTATATAAGTTTGTTCTAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
253726 TAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGGTTTAAAAGATAAATCCATTTACCAAACCATTTCAA
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* ** * * *
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* * ** * * * * *
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* * * ** * ** **** * *
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* * * * * * *
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317 AT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA
** * ** *
254045 GTTTGTACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATAAAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
381 GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * ** ** * *
254110 AGATATTTGAAAAATAAATTTGTTTATCGAATTAGTTCATTTGGTTA-AGACT-ATTATAACAAT
446 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAATT-GAACAAT
* * * *
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509 TATCAATTTCAAATCGTTATGATC-TTTG
* * ** *
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1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
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* * * * * *
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124 AATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
** * * * *
254396 ATAATTACTTCA-ATTAGTACAAGGTTATGT-GGAATAAACTAATACTAATTTATTAATATTTCT
189 ATAATTGTTTCATATCA-TACAAGCTTAT-TAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCA
* * * * ** * *
254459 AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAATATAAATTTATTTACCGAATTAA-TTAAAATAATTAGGA
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* * * *
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315 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * *
254587 TGATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
380 AGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * ** *
254652 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACCAGTTTGAATAGTTATGACTAATTGAACAAT
444 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACAAT
* *
254717 TATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTG
509 TATCAATTTCAAATCGTTATGATCTTTG
* * ** * ** * *
254745 TTTTGTTATAAAACATTTGTTTTTGAACATAGAAGCTTATTCAGTTGAAAATAATAGTAATTTAA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* * * *
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65 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CTAATTCAAATAG
* * * * * * *
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129 TTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * *
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * * * * * *
255197 TTTAAAAAATATATCTATTTTTTAAACAAATTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAATT-TTATA
451 TTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACAATTATCA-A
* *
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* * **
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** * * * * *
255345 AATATTTTGAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTACTTACCG-ACTCAGTTCAAATAAT
66 AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AATTCAAATAGT
** * * * * * **
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130 TATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * *
255474 GTTT-TTCATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTA
195 GTTTCAT-ATCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTA
* * * * *
255538 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAAC-----C----AATT----CTTATTCG
258 ATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAATTAAGAC-TATTTG
* * * * * * *
255590 AATAATTACCTATTTCAAAT-GTTATAACCTTTTGTTCTT-TTATAAAATAATTGTTTCAATTCA
322 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA
* * * * * * *
255653 TACAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATACTAATTTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACT-A-AG
386 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * **
255715 ATTTAAAAAATAATTTTGTTT-GCTAAAGTAGTTCAAATAGTTGA-AACTACA-TGAACAATTAT
450 ATTTAAAAAATAAATTTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTT-ATAACTA-ATTGAACAATTAT
* * *
255777 CTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTG
512 CAATTTCAAATCGTTATGATC-TTTG
* *** * * *
255803 TTTTGTCATAAAACAATAGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATGATA-TAAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTA
* * *
255867 TTAATATTAT-GAAAATTAATAAGTGATTGAAAAA
64 TTAATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA
255901 GTGAATTTGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAATTCAAATAGTT
ATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
TTTCATATCATACAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATA
AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAATTAAGACTATTTGAACA
ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAA
GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
AAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACAATTATCAATTTCAA
ATCGTTATGATCTTTG
Found at i:256432 original size:18 final size:18
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*
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1 ATTTAAATAATTATGACT
**
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1 ATTT-AAATAATTATGACT
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Statistics
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ATTTAAATAATTATGACT
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* *** * * * * *
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* * * *
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* *
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** * * * * * * ** * * *
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* * * *
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* * *
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* *
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*** * * * * * * * *
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* * ** * * ** **
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* * * * * * * * * *
256819 TTTTTGTTTTGTCATAAAAGAACTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAA-AAAATTA
* * * * * * *
256884 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTT-AAAAAATGAATT-TGTTTACTAGA-C
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* * * * * *
256946 AAGTTTAAATAATTATGACAATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAAC
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* * * *
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1 TTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTT
257048 CAAATAAAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (176 bp):
TTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAAAAAATTAA
TTTATTAATTTTTCAAAAACAAAAAGAGATTTAAAAAAATAATTCTATTAACCAAACCAATTTAA
ATAATTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
Found at i:256982 original size:181 final size:178
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256276 AATTATCTAT
* * *** *** * * *
256286 TTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTATTTCAACTCATACT-AGCTTATTTGGGATGAAATAACATG
1 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATA-TAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATT
*
256350 AATTTATTAATATTTCAAAAA-T-A-AA-AAGAGATTTAAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCA
65 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTT-AAAAAATAATT-TGTTTA-CTAA-CA
* *
256411 A-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
126 AGTTTAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * **
256463 TTTTT-TTTTGCCAT-AAATCAAATGTTTTTGTTTATATAAG-TT-TGTTCAGAATAAAGCAATA
1 TTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTAT-TTCA-AATAAAATAATA
* * * * ** * * *
256524 TTAGTCTATTAATTTTTCAAAAA--CA-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTAATCAAACC
63 TTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTA-CTAACA
* * *
256586 AGTTTAAATAGTTATGATTACTTG-ATAAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC
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* * * ** * *
256639 TTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAA-AAAATTA
1 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTA
** * * * * * * *
256703 ATTTATTAATATTTTGACAATTAATAGGTAAAACATTTTAAGAATAAGTATGTTTACATAACTAA
66 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAA-TTTGTTTAC-TAAC-AA
* * ** * ** *
256768 -ATCAGTTAGTCATGACTAGATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
127 GTTTAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * * * * *
256819 TTTTTGTTTTGTCATAAAAGAACTGTTTCAGTTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTA
*
256884 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTAGACAAG
66 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACTA-ACAAG
* * * * * ** *
256949 TTTAAATAATTATGACAATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTATAAC
128 TTTAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * *
257000 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTGTTCAT-TCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATA
1 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATAT-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATT
* * * *
257064 AATTTATTAA-AATT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAA-AA-TTGTTTATCAAATA
65 AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTA-CTAACA
* * * * *
257124 AGTTCAAATCGTTATGACTACTTGAAGAATTATTTATCTT-AAATTGTTATGAC
126 AGTTTAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGAC
* *
257177 TTTTTGCTTTGCCATAAAATAA
1 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
257199 ACAATTTGAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
174 1 0.00
175 13 0.02
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182 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAATTTGTTTACTAACAAGTTT
AAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
Found at i:257020 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 256423--257097 Score: 818
Period size: 361 Copynumber: 1.9 Consensus size: 357
256413 TTAAATAATT
** *
256423 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTTTTTGCCATAAATCAAATGT
1 ATGACTAGATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTTTTTGCCATAAAACAAATGT
** * * * * * * *
256488 TTTTGTTTATATAAGTTTGTTCAGAATAAAGCAATATTAGTCTATTAATTTTTCAAAAACAAATA
66 TTCAGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAACAATACTAATCTATTAATATTCCAAAAAAAAATA
* * **
256553 AGAGATTTAAAAAATAAATTCATTAATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGATTACTTGATAAATTA
131 AGAGATTTAAAAAATAAATTCATTAATCAAACAAGTTTAAATAATTATGACAACTTGATAAATTA
* * * * *
256618 TTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
196 TCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
** * * * ** *
256683 ATTTGGATTAAAA-AAAATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAGGTAAAACATTTTAAGAA
261 ATTTCAAATAAAATAAAATAAATTTATTAAAATTAAGACAATTAATAAGTAAAACATTTTAAGAA
256747 TAAGTATGTTTACATAACTAAATCAGTTAGTC
326 TAAGTATGTTTACATAACTAAATCAGTTAGTC
* * * *
256779 ATGACTAGATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAACTG
1 ATGACTAGATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTT-TTTTGCCATAAAACAAATG
* * * *
256844 TTTCAGTTCATATAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
65 TTTCAGTTCATATAAGTTTGTTCAG-AATAAAACAATACTAATCTATTAATATTCCAAAAA--AA
* ** * * *
256908 TAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA-CTAGACAAGTTTAAATAATTATGACAATTTGA
127 -AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTAATC-AAACAAGTTTAAATAATTATGACAACTTGA
* * *
256972 -ACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTGTTCAT
189 TA-AATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCAT
* *
257036 TCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAAAATTAAGACAATTAATAAGTAAAA
253 ACAAGCTTATTTCAAATAAAATAAAATAAATTTATTAAAATTAAGACAATTAATAAGTAAAA
257098 GATTAAAAAA
Statistics
Matches: 262, Mismatches: 48, Indels: 12
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
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362 34 0.13
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (357 bp):
ATGACTAGATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTTTTTGCCATAAAACAAATGT
TTCAGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAACAATACTAATCTATTAATATTCCAAAAAAAAATA
AGAGATTTAAAAAATAAATTCATTAATCAAACAAGTTTAAATAATTATGACAACTTGATAAATTA
TCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT
ATTTCAAATAAAATAAAATAAATTTATTAAAATTAAGACAATTAATAAGTAAAACATTTTAAGAA
TAAGTATGTTTACATAACTAAATCAGTTAGTC
Found at i:257488 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 257202--259089 Score: 1625
Period size: 181 Copynumber: 10.5 Consensus size: 181
257192 AAAATAAACA
* * * * * * * *
257202 ATTTGAAATAGGTAGTTGTTCTAATGGCCATAA-TCATTTGAAC-TGATTTGGTAAACTGATTTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGA-TTT
* * * * *
257265 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-CTTTTGAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGG
63 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA
* * *
257329 ATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATGATG
127 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * *
257384 ATTTTAAATAGATAATTATTCAAACAGTCA-AACTACTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
* ** *
257448 TTTTCAAATCTTTTGGTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
66 TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATA
* * * * *
257513 ATCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATATAACTAAACAAAAGGTCATAATG
130 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * * * *
257565 ATTTGAAATAGATAAATATTCTAATGGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAACACATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTAT
* *
257629 TATTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAA
65 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAA
* * ** * *
257688 TAAGCTTGTATGATC-AGAAATAATTGTTTTACAAGAAAAC-AAAGATCATAACT-
128 TAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TG
* * * * * * * * * *
257741 ATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTTAACTGGTTC-AAAAATAGCTTTAGT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * *
257805 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTTGAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATT-TCAGATA
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATA
* * * *
257868 AGTTTTTATGAACTAAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAGA-G
130 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ATG
* * * *
257920 ACTTT-AAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTATTC-AGTAAATATATTT
1 A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTT
* ** * * *
257982 ATTTTTTTAAATCTCTTA-TCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAA
63 A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA
* * * * * * *
258046 ATAAGCTTGTATGAACTGACATAATTGTTTTGTGACTAAACAAAAAGTCAAAATG
127 ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * ** *
258101 ATTTGAGATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACACATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA--
* * * * * * * * *
258166 TTTTTTACATCTCATGCTTATTACTTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTAATATGAAT
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
* * * * *
258231 AAGCTTTTATGAA-AAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAATG
129 AAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * *
258283 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTTTC-CTGAACAGATTTA
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG--TTCGATAAACAGATTTA
* *** ** * * *
258346 GTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGCTTAGCATTATTTTACTATGAAT
64 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
* * * *
258407 AA--TT-T-TGAA-T-GAACATATTGTTTTTTGGCAAAACAAAAGGTCATAACG
129 AAGCTTGTATGAACTAAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * *
258455 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * *
258520 TTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAA
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA
* * * *
258585 ACTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATT
131 GCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * *
258636 ATTTGGAATA-ATTAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAAATTGCTT-GTTAAAC-GAATTT
1 ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAG-ATTT
* ** * * * * * *
258698 ATTTCTTATCTCTTTTAGTTATCAATTTTTTGAATATTGATAAACTAGTACTATTTTATT-TCGA
63 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GA
* * * *
258762 ATACGCTTGTATGAAC-ATAAACAATTGGTTTATCACAAAACTAAAGGTCATAACT-
127 ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TG
* * * * *
258817 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACATGTTCAAAAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
* * * **
258882 TTTTTAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATA
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATA
* * *
258945 ATCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
130 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * * * * * * *
258997 ATTTTAAATTGACAATTGTTCAAATACTCGTAACTATATGAATTTGTTTGGTAAACAAATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
* *
259062 TTTTTAATCTCTTGCTTATTAATTTTTT
66 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTT
259090 TTATTTTGGA
Statistics
Matches: 1362, Mismatches: 279, Indels: 131
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
170 3 0.00
171 18 0.01
172 70 0.05
173 4 0.00
174 4 0.00
175 16 0.01
176 135 0.10
177 73 0.05
178 62 0.05
179 62 0.05
180 194 0.14
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182 145 0.11
183 72 0.05
ACGTcount: A:0.37, C:0.09, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (181 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATT
TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAA
GCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
Found at i:258830 original size:716 final size:711
Alignment explanation
Indices: 257262--259074 Score: 1808
Period size: 716 Copynumber: 2.5 Consensus size: 711
257252 GTAAACTGAT
* * * * *
257262 TTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAA-CTTTTGAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATT
1 TTTATTTTCTTAAATCTCTTA-TCATCAATTTTTTG-AATATTAATAAACTAGTATTATTTTATT
* * * * *
257325 TTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATGATGATTTTA
64 TTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * *
257390 AATAGATAATTATTCAAACAGTCAAACTACTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTCAA
129 AATAGATAATTATTCAAAAAGTCTAACTATTTGAACTAGTTCGAAAAACAGATTTATTTTTT-TA
* * * *
257455 ATCTTTTGGTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATCTTGT
193 ATCTTTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAATCTTGT
* * * * * *
257520 ATGAACTA-AAACAATTATTATATAACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATAT
258 ATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * **
257584 TCTAATGGTCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAACACATTTATTATTTAAATCTCTTATTAAT
320 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTTCCTAAACACATTTATTATTTAAATCTCTTATTAAT
** * * *
257649 TTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTATGATCAGAAATAATTG
385 TTTCAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTTATATGAATAA-CTTGTATGAT-AGAAATAATTG
* * * * * *
257714 TTTTACAAGAAAACAAAGATCATAACTATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAAGTATT
448 TTTTACAAGAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATT
* * * * *
257779 TTAACTGGTTCAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAATATTAGTAA
513 TGAACTGGTTCAAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTGAATATTAATAA
* ** * * *
257844 AGTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGGTTTATGACAAAATAAA
578 AGTAGTATTATTTTATTCCAGATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAA
* *
257909 AGGTCATAGAGACTTTAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAACTTATTCAGTAA
643 AGATCATAGAGACTTTAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAAATTATT-AGTAA
*
257974 ATATA
707 AGATA
* * ** * *
257979 TTTATTTTTTTAAATCTCTTATCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
1 TTTATTTTCTTAAATCTCTTATCATCAATTTTTTGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * * * *
258044 AAATAAGCTTGTATGAACTGACATAATTGTTTTGTGACTAAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAGA
66 GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
* * ** *
258109 TAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTTTAC
131 TAGATAATTATTCAAAAAGTC-TAACTATTTGAACTAGTTCGAAAAACAGATTTA-TTTTTTTA-
** * * * * * *
258174 ATCTCATGCTTATTACTTTTTGGAATATTATTGAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTTT
193 ATCTTTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAATCTTGT
* * *
258239 ATGAAAAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTC
258 ATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* *
258304 AAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTTCCTGAACAGATTTAGTT-TTTAAATCTCTTATTAATT
322 AAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTTCCTAAACACATTTA-TTATTTAAATCTCTTATTAATT
**
258368 TTCAAAATATTAATAGCTTAGCATTA-TTTTACTATGAATAA-TT-T-TGA-ATGAACAT-ATTG
386 TTCAAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTTA-TATGAATAACTTGTATGATA-GAA-ATAATTG
*** * * * *
258427 TTTT-TTGGCAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTA
448 TTTTACAAG-AAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTA
* ** * *
258491 TTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTAGAGTATTA
511 TTTGAACTGGTTC-AAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTT-GAATATTA
* *
258556 ATAAATTAGTATTATTTTATTCC-GAATAAACTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAA
574 ATAAAGTAGTATTATTTTATTCCAG-ATAAACTTGTATGAACT-AAAACAATTAGTTTATGACAA
* * * *
258619 AACAAAAGATCATA-ATTA-TTTGGAATA-ATTAATTGTTCAAGTAGTCATAA-CTATTTGAAAT
637 AACAAAAGATCATAGA-GACTTT-AAATAGA-AAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAAAT
*
258680 TGCTT-GTTAAACGA-A
698 T-ATTAG-TAAA-GATA
** * * * *
258695 TTTA-TTTCTTATCTCTTTTAGTTATCAATTTTTTGAATATTGATAAACTAGTACTATTTTATTT
1 TTTATTTTCTTAAATCTCTTA-TCATCAATTTTTTGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTT
* * * * *
258759 CGAATACGCTTGTATGAAC-ATAAACAATTGGTTTATCACAAAACTAAAGGTCATAACT-ATTTG
65 TGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTG
* * *
258822 AAATAGATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAAC-ATGTTCAAAAAATAGATTTATTTTTT
128 AAATAGATAATTATTCAAAAAGTC-TAACTATTTGAACTA-GTTCGAAAAACAGATTTATTTTTT
* *
258886 TAA-CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCA-AAATAATC
191 TAATCTTTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-ATGAATAATC
** * * * *
258948 TTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATTGACAAT
254 TTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * ** * * *
259013 TGTTCAAATACTCGTAACTATATGAATT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAATCTCTT
317 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGT-TTTCCTAAACACATTTATTATTTAAATCTCTT
259075 GCTTATTAAT
Statistics
Matches: 895, Mismatches: 167, Indels: 71
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
712 2 0.00
713 89 0.10
714 135 0.15
715 67 0.07
716 241 0.27
717 123 0.14
718 158 0.18
719 80 0.09
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (711 bp):
TTTATTTTCTTAAATCTCTTATCATCAATTTTTTGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTT
GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA
TAGATAATTATTCAAAAAGTCTAACTATTTGAACTAGTTCGAAAAACAGATTTATTTTTTTAATC
TTTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAATCTTGTATG
AAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
AGTCATAACTATTTGAATTGTTTTCCTAAACACATTTATTATTTAAATCTCTTATTAATTTTCAA
AATATTAATAAATTAGCATTATTTTTATATGAATAACTTGTATGATAGAAATAATTGTTTTACAA
GAAAACAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTGG
TTCAAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACCTATTAATTTTTGAATATTAATAAAGTAGTAT
TATTTTATTCCAGATAAACTTGTATGAACTAAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
GAGACTTTAAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAAATTATTAGTAAAGATA
Found at i:259200 original size:156 final size:158
Alignment explanation
Indices: 258951--259244 Score: 362
Period size: 156 Copynumber: 1.9 Consensus size: 158
258941 AATAATCTTG
*
258951 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATTGACAATTGT
1 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATTGACAATTGT
* * * * * ** * *
259016 TCAAATACTCGTAACTATATGAATTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT-TAATCTCTTGCTTA
66 TCAAACACTCATAACCATATAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTAA
259080 TTAATTTTTTTTATTTTGGATAAGATTT
131 TTAATTTTTTTTATTTTGGATAAGATTT
* * * * *
259108 TATGAATTGAAACAA-TGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATAATTTTACATAT-ATAATT-
1 TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAAT-TGACAATTG
* * * * *
259170 TATCAAACAGTCATAACCATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCT
65 T-TCAAACACTCATAACCATATAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCT
259235 AATTAATTTT
129 AATTAATTTT
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TCAAACACTCATAACCATATAAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTAA
TTAATTTTTTTTATTTTGGATAAGATTT
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259516 GAACTGGCTC
* * ** *
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1 GGTAAACAAATTTATTGTTTAAATCTCTTACCTATTAATATAGGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
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*
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* * * *
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1 GGTAAACAAATTTATTGTTTAAATCTCTTACCTATTAATATAGGAAATATTAATAAATTAGTATT
** * ** * ** *
259752 ATTTTATTCCATCTAAGCTTATATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAATTAAAAGGTTATAA
66 ATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAGGAAAAGGTCATAA
*
259817 TGATTTAAAATAGATAATT
131 TGATTTAAAATAGAAAATT
259836 GTTCAAATAA
Statistics
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ATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAGGAAAAGGTCATAA
TGATTTAAAATAGAAAATTTTTAATTGATTT
Found at i:259992 original size:181 final size:179
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259677 TAATTGATTT
* * * **
259687 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTTTCTTACTTATTAATATAGGAAATATTAATAAATTAGTATT
1 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
** ** * * *
259752 ATTTTATTCCATCTAAGCTTATATTAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAATTAAAAGGTTATAA
66 ATTTTATTTTAAATAAGCTTGTA-TAAATGAAACAATTGTTTTATGACAAA-CAAAAGGTTATAA
* * * * **
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* * *
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1 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
259932 TAATTTATTTTAAATAAACTTGCATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTA-A
65 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTAT-AAATGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATA
* * * * * **
259996 ACTGATTTGAAGTATACAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAATAATTC
128 A-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATAATAACCATTTGAAATAATTC
* * *
260049 GATAAACAAATTTATTTTTGAAATCTCTTACTTATTAGTTTTTGAAATATT-ATGAAATTAGTAT
1 GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTAT
* * ** ** ** * *
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65 TATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATAAATGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAA
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129 TGATTTGAAATAGATAAT
260196 CATCTATATA
Statistics
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GGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATAAATGAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTTATAATG
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATAATAACCATTTGAAATAATTC
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260351 ATGAACAGAC
* * * * *** * * * *
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1 CAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCAT
* ** * * *
260426 AACT-ATTTCAACTTGTTTGGTAACCAAATTCATTTTTTTTAAT-TCTCTACTCT-TTAATT-T-
66 AA-TGATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATT-A-TTTTTTAAATCT-TTTACT-TATTAATTGTC
* * *
260486 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-ATAGACTTATATGAAC-TAAAA
126 TT--AATATTAATAAATTAATATTATTTTATCTGAATA-AG-CTTATATGAACATAAAA
* * *
260543 CAATTATTTTAT--TACAAA-AAAAGGTCACAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
1 CAATTATTTTATGATA-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCA
* * * * *
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* *
260668 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAA
127 TAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATCTGAATAAGCTTATATGAACATAAAA
* * * *
260722 CAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAGTCAT
1 CAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCAT
* *
260787 AATGATTTGAACTTATTTGGTAAATAGATTAATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAAT
66 AATGATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAAT
* * ** * *
260852 ATTAATAAATTTACATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA
131 ATTAATAAATTAATATTATTTTA-TCTGAATAAGCTTATATGAACATAAAA
* * * * * * * *
260903 -AATCATTTTATGATAAAGCAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAATCAT
1 CAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCAT
* * * * * * *
260967 AATTATTTAAATTTGTTTAGTAAA-CGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT-T-TTAG
66 AATGATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--
* * * * * *
261029 AATATTAATAACTTAATAATATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAA-GTGAAA
128 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATCT-GAATAAGCTTATATGAACATAAAA
* * * * * * *
261082 TAATTTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCA
1 CAA-TTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCA
261147 T
65 T
261148 GACTGTTTGA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGAGTCAT
AATGATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAAT
ATTAATAAATTAATATTATTTTATCTGAATAAGCTTATATGAACATAAAA
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*
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* *
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1 AAAAACCAAAGTTACTGTAGAATGAAAGAACCCCCCAAGGGAGGCATC
265487 AA
1 AA
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Statistics
Matches: 47, Mismatches: 3, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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AAAAACCAAAGTTACTGTAGAATGAAAGAACCCCCCAAGGGAGGCATC
Found at i:266899 original size:24 final size:24
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Indices: 266872--266919 Score: 96
Period size: 24 Copynumber: 2.0 Consensus size: 24
266862 AAGGGGAGAA
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1 ATATTGGTATGAAAATTTGATGAT
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATATTGGTATGAAAATTTGATGAT
Found at i:267565 original size:21 final size:21
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*
267536 TAAATGATCGATCACCTAAGG
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* **
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1 TAAAGGATCGATCACCTAAGG
* **
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1 TAAA-GGATCGATCACCTAAGG
* *
267597 TAAGGGATCGATCACTTAAGG
1 TAAAGGATCGATCACCTAAGG
* *
267618 TAAGGGATTGATC
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Statistics
Matches: 58, Mismatches: 12, Indels: 8
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Found at i:267586 original size:20 final size:20
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*
267557 TAAA-GGATCGATCCCCTTT
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1 TAAAGGGATCGATCCCCTTA
*
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1 TA-AAGGGATCGATC
267610 ACTTAAGGTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:267607 original size:61 final size:61
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267522 ATCAATCCTC
* *
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1 TACATAAAGGATCGATCACCTAAGGTAAAGGATCGATCCCCTCTTAAAGGGATCGATCCCT
* * * *
267593 TACATAAGGGATCGATCACTTAAGGTAAGGGATTGATCCCCTCTTAAAGGGATC
1 TACATAAAGGATCGATCACCTAAGGTAAAGGATCGATCCCCTCTTAAAGGGATC
267647 AATCAATTGT
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 6, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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TACATAAAGGATCGATCACCTAAGGTAAAGGATCGATCCCCTCTTAAAGGGATCGATCCCT
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Indices: 268501--272432 Score: 2483
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* * * * * * * *
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1 ATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTC
* * * * *
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* * * ***
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* * **** *
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1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAA-TAAA-TTGTTTACCAAACAAGTTC
* * * * * * * * *
268742 AAATAGTTATAAATATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTCATCA
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* ** * * *
268806 AATAGCTGTTTCT-GATCATACAAGCTTATTCATATAAAAATAATACTAATTT
128 AACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTGAAAT-AAAATAATACTAATTT
* * * * ** *
268858 AATAATATTCCAAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACTGAACCAGCTT-A
1 ATTAATATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAG-TTCA
* * * * * * * * *
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64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
268984 ATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTACTTGGAATAAAATAATATTAATTT
129 ACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
269035 ATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAA-TGTCTACCCAGCAATTTTA
1 ATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCA
* * * * *
269099 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCAATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAA
64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
269164 GCAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTACCTAAAATAAAATAATACTACTTT
129 ACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTT
* **
269215 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATTAAATCAA-TTC
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATT-GTTTACCAAA-CAAGTTC
* * * * * * * * *
269279 CAATAATTATGGCCATTTGAA-CACTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAA
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
**** * *
269343 AACAATTGTTTTTCAACATACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTT
128 AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
269395 ATTAATATTTCAAGAATTAAT----AAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-TTAC
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTT-C
* * * * * *
269454 AAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCACAA
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
269519 AAC-ATTGTTTCT-GTTTATAGAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT
128 AACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * ** * * * *
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1 ATTAATATTC-AAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTC
* * * * * *
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63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * * *
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128 AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
269751 ATTAATATTTCAAAAATTTATAAGCAAGAG-GTTAGAAAATAATTTTATTTACTAAACCAGTTCA
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAA-ATTGTTTACCAAACAAGTTCA
* * * * * * * *
269815 AATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTATTTTGTCATAAC
64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * *
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129 ACAATTGTT-TTAGTTCATAC-AAGCTT-ATTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
269931 ATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATATGCTTACCAAACCA-TGTC
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGT-TC
* * * * * *
269995 AAATAGTTTTGACAATTTGAAGAATGAACTATTTCAAATCATGTTA--ACCTTTTATTTTGTCAT
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC--GTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** ** *
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126 AAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * * * ** * ** * *
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1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATT-TAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * * * *
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62 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* *
270241 AAATAATT-TTTT-GTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTT
127 AAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGAAA-TAAAATAATACTAATTT
* * *
270292 AATAATGTTTCAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAATC-AGTTC
1 ATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACC-AAACAAGTTC
* * * * * * * * *
270352 AAATGGTTAAGACAATTAGAAAAATTATCCATTTACAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGGT-AT
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCAT
** * *
270416 AAAACAATTGTTTTAGTTTGTACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTT
126 AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
270470 ATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAAGCGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCA
1 ATTAATATT-CAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCA
* * * * * * * * *
270535 AATAGTTATTATTATTTGAATAGTTATTTATTTAAAATCATTATAATCTTTTGATTTGTCATAAA
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* * * * * *** *
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* * * * * * * * * *
270651 ATTAATATTTCATAAATTATTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTATC-GACTCAGTTA
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAAC-AAGTTC
* * * * ** *
270715 AAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTAAGTTTTGTCATAG
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* **
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* * * ** *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
270961 AATATTTGTTTCA-TATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCAAATTT
128 AACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
271013 ATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTTGAAAAATTAAATCTGTTTA-TAGAACAAGTT
1 ATTAATATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTACCA-AACAAGTT
* * * * * *
271077 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGCTATGACCTTTTGTTTTGCCATA
62 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* ** **
271142 AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAATATTATCCAAAATAAAATAATACTAATTT
127 AAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * *** *
271195 CTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCATGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGGTTATTGAACAAATTC
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACAAGTTC
* ** * * * * *
271259 AAATAGTTACT-ACTATTAGACCAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGCTTTGTTATA
63 AAATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
** ** *
271323 AAACAATTGTTACAGTTTGTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
127 AAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * * *
271376 ATTAATATTTCAAAACTTAATAAGTAAGAAATTTAATAAGTGAGTCTATTTACTGAATC-AGTTC
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTAC-CAAACAAGTTC
* * * * * * * * * *
271440 AAATAATTATGACCATTTCAACATTTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTATTTGGTCATAT
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* *
271505 AACAATTATTTT-TTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
128 AACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTT
* * ** *
271557 ATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTACCAAACCAG-TCT
1 ATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTC-
* * * * * * *
271621 AAATTGTTATGACTATTTGAACAA-T-TCTATATCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAA
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * *
271684 AAAAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAGTAATACTAATCT
128 AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *** *
271736 AATAATATTTAAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAGAAAATAAATTTCTTTGTTGAACCAA-TT
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTT-ACCAAACAAGTT
* * * *
271799 CAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATA
62 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * *
271864 AAACAATT-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTAGGAATAAAATAA-AATGAATTT
127 AAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * **
271917 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAATTCTGTTTACCTAACCACAT-A
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCA
* * * * * *
271980 AATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGCTACGATACGACCTTTTGTTTTTTC
64 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AA-A--T-CGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
272045 ATAAAA-AA-AGTTTTTGTTCGTATAAGTTTGTCT-AGAATAAAATAATACTAATCT
124 ATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGA-AATAAAATAATACTAATTT
* * * **
272099 ACTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGAGATCTAAACAATAAATTTGTTTATTAAA-ATAGTTC
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACA-AGTTC
* * ** * * * * *
272159 AAATACTTATGACTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAA
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
272224 AACAATAGTTTCCA-TTCCTACAAGCATATTTGGATTAAAATAATATTAATTT
128 AACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *
272276 ATTAATATTTTAATAATTCATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-CCTAAACAAGTTC
1 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACC-AAACAAGTTC
** * * * * * *
272340 AAATAGCAATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTCT-AACTTTTCTTTTGTAAT-A
63 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* *
272403 AACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATT
128 AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT
272433 TGTTTACTGA
Statistics
Matches: 2912, Mismatches: 682, Indels: 317
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Matches are distributed among these distances:
173 1 0.00
174 7 0.00
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Consensus pattern (178 bp):
ATTAATATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGAAATAAAATAATACTAATTT
Found at i:271352 original size:544 final size:536
Alignment explanation
Indices: 268588--272434 Score: 2199
Period size: 544 Copynumber: 7.1 Consensus size: 536
268578 CTATTTTAAC
* * *
268588 AATTATCTATTT-AAAGCCATTATGACCTTTTG--TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTCATG
1 AATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTCAATTT-AT-
* * * *** *
268650 A-AAACTTATTTGAAATAAAATAATAATACCCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-
62 ACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * * * *
268709 TTAAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATA-A-ATATTTGAACAAATATC
127 TTAAAAAA-TAAATCTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTA-AGACA-ATTAGAA-AATTTTC
* * * * * * * ** *
268771 AATCTCAAATCGTTATGATCTTTGT-TTT-CTCATCAAATAGCTGTTTCTGATCATACAAGCTTA
187 TATTTCAAATCTTTATGACCTTT-TATTTAGTCATAAAACAATTGTTT-T-ATCTTACAAGCTTA
* * * * *
268834 TTC-ATATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAATTTAATAAG---AGATTTAAAAAAT
249 TTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * ** *
268895 AAATGTATTTACT-GAACCAGCTTAAATAGTTAAGAATATTAGAATAATTATCAATTTCAAATCA
313 AAATCTGTTTA-TAGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA
* * * * * ** ***
268959 TTCTAACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTACT-TGGAATAAAA
377 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAAAATATTA-TACAAAATAAAA
* * *
269023 TAATATTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAA--TGTCT
441 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT-AAAAAATAAATTTGTTT
*** * * * *
269085 A-CCCAGCAATTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC
503 ATTGAACCAA-TTCAAATAGTTAT-ACTATTAGAAT
* * * * * * * * *
269120 AATTGTCAATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTAGTTCATAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTCAATTTATACA
** ** * *
269185 AGCTTACCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
65 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * * * * *
269250 AAAAATAAAT-TAGTTTATTAAATCAATTCCAATAATTATGGCCATTTGAACACTATCTATTTCA
130 AAAAATAAATCT-GTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTAAGACAATTAGAAAATTTTCTATTTCA
* * * * * * **
269314 AATCATTATTACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCCTATTTGAAA
194 AATCTTTATGACCTTTT-ATTTAGTCATAAAACAATTG-TTTT-ATCTTACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
269378 TAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAGAATTAATAAG---AGATTT-AAAAATAAATCTA
256 TAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * * **
269438 TTTACCA-AACCA-TTACAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA
320 TTTA-TAGAACAAGTT-TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATAA
* * * * * * ** ****
269501 CCTTTTGTTCTATCA-CAAAACATTGTTTCT-GTTTATAGAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
383 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATAAAATATTATACAAAATAAAATAATAC
* * * *** **
269564 TAATTTAGTAA-AATTCTAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCCATTTGCT-AC
447 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGC-AAGAG-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGA-
* * * *
269626 ACTAGTTCAAACAGTTAAGACTATGT-GAAT
508 ACCAATTCAAATAGTT-ATACTAT-TAGAAT
* * * * * * * *
269656 AATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTCAATTTATACA
** * * * * * *
269721 AGCTTATTCAGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGCAAGAG-GTTA
65 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * * *
269785 GAAAATAATTTTATTTACTAAACCAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTC
130 AAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTA-AGACAATTAGAA-AATTTTCTATTTC
* * * * * * * * **
269849 AAATCATTATTACTTTTTATTTTGTCATAACACAATTGTTCTTAT-TAATCTAAGTTTGTTTGAA
193 AAATCTTTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTT-TTATCTTA-C-AAGCTTATTCAAA
* * * * * * *
269913 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATAT
255 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * ** *
269978 GCTTACCA-AACCA-TGTCAAATAGTTTTGACAATTTGAAGAATGAACTATTTCAAATCATGT-T
319 GTTTA-TAGAACAAGT-TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCAT-TAT
* * * * * ** * *
270040 AACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTGGGTCTA-TT-ATATTATTTTATTCAAAATAAAATAAT
381 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-GTTTTAGTTCATAAAATATTATACAAAATAAAATAAT
* ** * * * * * * * ** **
270103 ACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAAAAAATTAAAAAAAATAAGTCTAATTGCTG
445 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC--AAGAGTT-TAAAAAATAAATTTGTTTATTG
* * * *
270168 AGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TATGAGT
507 AACCAATTCAAATAGTT-ATACTATTA-GAAT
* * * * * * *** *
270199 GATAATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTGTTCATACAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCAATTTATACAA
** *
270263 GCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATGTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
66 GCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* ** * *
270323 AAAAATAAATTTGTTTACCT-AATCAGTTCAAATGGTTAAGACAATTAGAAAAATTATCCATTTA
130 AAAAATAAATCTGTTTA-CTGAATCAGTTCAAATAATTAAGACAATTAG-AAAATTTTCTATTT-
* *
270387 CAAATCATTT-TGACCTTTTGTTTAGGT-ATAAAACAATTGTTTTAGTTTGTACAAGCTTATTCA
192 CAAATC-TTTATGACCTTTTATTTA-GTCATAAAACAATTGTTTTA-TCT-TACAAGCTTATTCA
* * * * *
270450 GAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAAGCGATTTAAAAAAAAAAT
253 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAA-AGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
270515 CTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAATAGTTATTTATTTAAAATCATTATA
317 CTGTTTATAGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATA
* * * * * * * *
270580 ATCTTTTGATTTGTCATAAAAGAATTGTTTAAGTTAATAAAAGCA-TAGACATAATAAAATAATA
382 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAAAA-TATTATACAAAATAAAATAATA
* * * * * * * *
270644 ATAATTTATTAATATTTCATAAATTATTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTATCG-AC
446 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-CAAGAGTTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAAC
* * * * * *
270708 TCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAAT
510 -CAATTCAAATAGTTAT-ACTATTAGAAT
* ** * * *
270737 GATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTAAGTTTTGTCATAGACCAATTGTT--TTTTATCACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCAATTTAT-ACA
* *
270800 TGAGCTTATTTGG-TTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
65 --AGCTTATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
270864 TTAAAAAATAAATGTGTTTACTGTATCAATTCAAATACTTAAAACTATTAGAATAATTTTCTATT
127 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTAAGACAATTAGAA-AATTTTCTATT
* *
270929 TCAAATCTTTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAA
191 TCAAATCTTTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTT--TATCTTACAAGCTTATTCAA
* * * *
270994 AATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGTTTTGAAAAATTAAAT
254 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AAAAGATTT-AAAAAATAAAT
** *
271059 CTGTTTATAGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGCTATG
317 CTGTTTATAGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATA
* * *
271124 ACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAATATTATCCAAAATAAAATAATAC
382 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAAAATATTATACAAAATAAAATAATAC
* * * *
271189 TAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCATGAGTTTAAAAAAATAAATTTGGTTATTGAACA
447 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTT-AAAAAATAAATTTGTTTATTGAACC
**
271254 AATTCAAATAGTTACTACTATTAGACC
511 AATTCAAATAGTTA-TACTATTAGAAT
* * * * * * *
271281 AATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGCTTTGTTATAAAACAATTGTTACAGTTTGTACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-CAATTTATACA
*** * * *
271346 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAACTTAATAAGTAAGAAATTTA
65 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * ** *
271411 ATAAGTGAGTCTATTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGACCATTTCAACATTTATCTATTTCA
130 AAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTAAGACAATTAGAAAATTT-TCTATTTCA
* * * * * *
271476 AAT-TGTTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAA
194 AATCT-TTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAA-T-TGTTTTATCTTACAAGCTTATTCAAAA
* * *
271540 TAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCC
256 TAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
271604 ATTTACCA-AACCAGTCTAAATTGTTATGACTATTTGAACAA-T-TCTATATCAAATCATTATAA
319 GTTTA-TAGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATAA
* * * * * *** *
271666 CCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTTTGTTCATACAAGT-TTATTTGAAATAAAGTAATAC
383 CCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATA-AAATATTATACAAAATAAAATAATAC
* * * * * *
271730 TAATCTAATAATATTTAAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAGAAAATAAATTTCTTTGTTGAAC
447 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAGAG-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAAC
*
271794 CAATTCAAATAGTTAAGACTA-TATGAAT
510 CAATTCAAATAGTT-ATACTATTA-GAAT
* * * * *
271822 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACT
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTCAATTTATACA
* * *
271887 AGCTTATTAGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
65 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * *
271951 -AAAAATAATTCTGTTTACCT-AACCACAT-AAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATT
129 AAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAATCAGTTCAAATAATTAAGAC-AATTAGAA-AATTTTCTATT
* * * ** * * *
272012 TCAAATAGCTACGATACGACCTTTTGTTTTTTCATAAAAAAAGTT-TTTGT-TCGTATAAG-TT-
191 TCAAAT--CT---TTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAA-TTGTTT-TATCTTACAAGCTTA
* * * * * *
272073 TGTCTAGAATAAAATAATACTAATCTACTAATATTTC-AAAAATTAATAAG---AGATCTAAACA
249 T-TC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAA
* * * * * *
272134 ATAAATTTGTTTATTA-AA-ATAGTTCAAATACTTATGACTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAA
311 ATAAATCTGTTTA-TAGAACA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAA
* * * * * * * * * * **
272197 TCGTTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAACAATAGTTTCCA-TTCCTACAAGCATATT-T--GGA
374 TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATA-AA--ATATTATACAAA
* * * * * * * *
272258 TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAATAATTCATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
435 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAATAAATTT
** * ** * *
272323 GTTTCCT-AAACAAGTTCAAATAGCAATGACTATTTGAGT
499 GTTTATTGAACCAA-TTCAAATAGTTAT-ACTATTAGAAT
* * * * * * * *
272362 AATTATCTATTTCAAATCATTCT-AACTTTTCTTTTGTAAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTCAATTTATACA
272425 AGCTTATTTG
65 AGCTTATTTG
272435 TTTACTGAAT
Statistics
Matches: 2621, Mismatches: 552, Indels: 278
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
532 24 0.01
533 45 0.02
534 37 0.01
535 121 0.05
536 311 0.12
537 120 0.05
538 223 0.09
539 219 0.08
540 268 0.10
541 403 0.15
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544 498 0.19
545 11 0.00
546 7 0.00
547 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (536 bp):
AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCAATTTATACAA
GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
AAAATAAATCTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTAAGACAATTAGAAAATTTTCTATTTCAAA
TCTTTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAATTGTTTTATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAA
TAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATA
GAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGT
TTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAAAATATTATACAAAATAAAATAATACTAATTTATT
AATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACCAATTCAAATA
GTTATACTATTAGAAT
Found at i:272930 original size:176 final size:174
Alignment explanation
Indices: 272627--274720 Score: 497
Period size: 180 Copynumber: 11.8 Consensus size: 174
272617 ATCGAATTAG
* * * **
272627 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACAATTTTTCTTGTTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-ATTTTTCTTGTCA
* * * * * *
272692 TAAAATAATTGTTTTATTTATACAAAATTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
65 TAAAACAATTGTTTTATTAATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCT
*
272757 AGAAATTACTAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
130 A-AAATTAATAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
*
272803 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTT-TTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CATTT-TTCTTGTC
* ** ** * *
272866 ATAAAACAATTGTTTGTGTTAATACAAGCTTATTTGGAGT-AAATTATAACTCAA-CTAATAATA
64 ATAAAACAATTGTTT-TATTAATACAAAATTATTCAGAATAAAATAAT-ACT-AATCTAATAATA
* * ** ****
272929 TTCTAAAATTAATAAGTAAGAAATTTCAAAA-ATAAATGTGTTTGCCAAACCAA
126 TTCTAAAATTAATAAG--AG--ATTT-AAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
* * * * * * * * *
272982 TTCAAATAGTTAAGGCTATTAGAATAATTATGTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGT-TCAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACATTTT-TCT-TGTC
* * *** * * * * *
273046 ATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATCCAAAAT-AAATAATACTATTCTATTAAAATT
64 ATAAAACAATTGTTTTA-TTAATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT
* ** * * ** *
273110 CAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAA
128 C-TAAAATTAATAAG--AG--A-TTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
* * * * * * * * * * *
273163 TTCAAATAGTCAAGTCTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACATTTT-TCTTGTCA
* * * * * * * *
273228 TAAAACATTTGTTTTAGTTTATA-AAAGCTTATGCAAAATAAAATAATATTACT-TAATTCATAT
65 TAAAACAATTGTTTTA-TTAATACAAA-ATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAA-TAATA-
* * ** *
273291 TTCAAAAATTAAGAAGTCAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-----TC-A
126 TTCTAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
* * * ** *
273338 ---AATTAGTTCA--A--A--T-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-ACTTTTATTTTGT
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACA-TTTT-TCTTGT
* * * *** * **
273392 CATAAAGCAATTGATTTTCATT-GTATAAGCCTATTCGGAATAAAATAATACTAAT-TTTTAATA
63 CATAAAACAATTG-TTTT-ATTAATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
* * * ** * * **** *
273455 TTTCAAAAATGAATGAGTCGGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTA-CTAAACTAG
126 -TTCTAAAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTC-AA
* * * * *
273509 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAATC-TTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CATTTT-TCTTGTC
* * * ** * * * *
273573 ATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATTACACGAATCTAACAATATT
64 ATAAAACAATTGTTT-TATTAATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT
* * ** * ** *** *
273638 ATGAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAATCAC
128 CT-AAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
* * * * * *
273691 TTCAAATAATTAAGGCTATATGAATAATTATCTAT-TTAAATCATTATGACCATTTTT-TTGTCC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CATTTTTCTTGTCA
* ** * * * * *
273754 TAAAACAAATGTTTT-TTTTTTCAGATAAGTTTGTTCGGAATAAAATAATACTAATCTACTGATA
65 TAAAACAATTGTTTTATTAATACA-A-AA--TTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
* ** * * ****
273818 TGTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTATATCAAACCAA
126 T-TCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
* * * * ** * * *
273868 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTTTTTGTTAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACATTTTTCTTGTCAT
* * * ** * * *
273933 AAAATAATAT-TTTCTGTTCATACATGCA-TATTC-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
66 AAAACAAT-TGTTT-TATTAATACA-AAATTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATCTAATAATAT
* * * * * **
273995 TTTGACAATTAATAAGTA-A---AAAAACAATAAATATGTTTAT-TGAACAA
127 TCT-AAAATTAATAAG-AGATTTAAAAGC--TAAATCTGTTTATCGGGTCAA
* * * * * * * * *
274042 GTTCCAATAGTCATTAATATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTTTT-TTGTA
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CATTTTTCTTGTC
** * ** * * * *
274105 ATAAAACAATTGTTTTAGTTCTTATAAGCTTATT-TGATGTAAAATAATACTAAT-TTATTATAT
64 ATAAAACAATTGTTTTA-TTAATACAAAATTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATCTAATAATAT
* * * * * **
274168 TCTAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAA--AAGAATCTATTT-GCTGAAT-AA
127 TCT-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAGCTA-AATCTGTTTATC-GGGTCAA
* * * * * * * * * * *
274219 GTTCAAATAGCTATGAGC-ATCTAAACAATTATTTATTTCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTAT
1 -TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACATTTT-TCTTGT
* * * * ** * * * * *
274283 CATAAAACAATTGGTTCTGTTGATGCAAGCTTATTTTA-AATAAAATAACACAAATTTATTAATA
63 CATAAAACAATT-GTTTTATTAATACAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
** * * **
274347 TT-TAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CCGAACAA
126 TTCT--AAAATTAATAAG----AGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
** * * ** * *
274400 GTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAAACATTTATTTCAAAATTGTTATAACATTTTGTTTTG
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT-AATTATCTATCTC-AAATCATTATGACATTTT-TCTTG
* * * * * *
274464 TCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATA
62 TCATAAAACAATT-GTTTTATTAATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
* * * * * * * *
274529 TTTCAAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAACTAAATATGTTTA-CTAGATTAG
126 -TTCTAAAATTAATAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATC-GGGTCAA
* * *
274579 TTCAAATAGTTATGACTCTTTGAGTAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTT-TTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CATTT-TTCTTGTC
* * * ** ** * * * * *
274642 ACAAAACAATTGCTTCTGTTCGTACAAGCTTATT-TGAAGTAACATATTGCTAAACTAATAATAT
64 ATAAAACAATTG-TTTTATTAATACAAAATTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATCTAATAATAT
274706 TCTAAAATTAATAAG
127 TCTAAAATTAATAAG
274721 CAAGAGATTT
Statistics
Matches: 1446, Mismatches: 345, Indels: 255
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
161 1 0.00
162 2 0.00
165 36 0.02
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167 9 0.01
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185 3 0.00
186 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (174 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGACATTTTTCTTGTCAT
AAAACAATTGTTTTATTAATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTA
AAATTAATAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTATCGGGTCAA
Found at i:273350 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 272933--273351 Score: 418
Period size: 181 Copynumber: 2.3 Consensus size: 181
272923 ATAATATTCT
* * * * * ** ** *
272933 AAAATTAATAAGTAAGAAA-TTTCAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGG
1 AAAATTAAGAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAATTCAAATAGTCAAGG
* * * * * *
272997 CTATTAGAATAATTATGTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTCAGTCATAAAATAATTGTTTT
66 CTATTAGAACAATTATATATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTCAGTAATAAAACAATTGTTTT
* * *
273062 AGTTCATACATGCTTATCCAAAATAAATAATACTATTCTATTAAAATTCAA
131 AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAATAATACTATTCAATTAAAATTCAA
* ** *
273113 AAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAATTCAAATAGTCAAGT
1 AAAATTAAGAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAATTCAAATAGTCAAGG
* ** ** *
273178 CTATTTGAACAATTATATATTTAAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTAATAAAACATTTGTTTT
66 CTATTAGAACAATTATATATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTCAGTAATAAAACAATTGTTTT
* * * * *
273243 AGTTTATAAAAGCTTATGCAAAATAAAATAATATTACTT-AATTCATATTTC-A
131 AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAATAATACTA-TTCAATT-AAAATTCAA
* * *
273295 AAAATTAAGAAGTC-AGAGA-TTTAAAAAATAAATC-AGTTTATCAAATTAGTTCAAATA
1 AAAATTAAGAAG-CAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAATAAATTCAAATA
273352 ACAATTATCT
Statistics
Matches: 195, Mismatches: 38, Indels: 11
0.80 0.16 0.05
Matches are distributed among these distances:
180 19 0.10
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183 8 0.04
ACGTcount: A:0.45, C:0.10, G:0.08, T:0.37
Consensus pattern (181 bp):
AAAATTAAGAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAATTCAAATAGTCAAGG
CTATTAGAACAATTATATATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTCAGTAATAAAACAATTGTTTT
AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAATAATACTATTCAATTAAAATTCAA
Found at i:274509 original size:711 final size:715
Alignment explanation
Indices: 273354--274638 Score: 1496
Period size: 711 Copynumber: 1.8 Consensus size: 715
273344 TTCAAATAAC
* * *
273354 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGATTTTCATTGTATA
1 AATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTATTTTGTAATAAAACAATTGATTTTCATTGTATA
*** *
273419 AGCCTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTTTAATATTTCAAAAATGAATGAGTCGGAGATTTAA
66 AGCCTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTTTAATATTTCAAAAATGAATGAGTAAAAGAATTAA
* * * *
273484 AAAATGAATATGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAA
131 AAAATGAATATATTTACTAAACTAGTTCAAATAGCTATGACTATCTAAACAATTATATATTTCAA
* * * * * *
273549 ATCATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTCAGAATA
196 AACATAATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAGTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
* * * * *
273614 AAATTACACGAATCTAACAATATTATGAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGT
261 AAATAACACAAATCTAACAATATTATAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTAT
* * ** *
273679 TTGCCAAATCACTTCAAATAATTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTAAATCATTATGACCAT
326 TTACCAAATCACTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAAACATCTATTTAAATCATTATGAACAT
* * * * ** * **
273744 TTTTTTGTCCTAAAACAAATGTTTTTTTTTTCAGATAAGTTTGTTCGGAATAAAATAATACTAAT
391 TTTTTTGTCATAAAACAAATGTATTTTTATTCAGACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * *
273809 CTACTGATATGTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTATA-TCAAACCAATTCAA
456 CTACTAATATGTCAAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAATATGTATACT-AAACCAATTCAA
* * * *
273873 ATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTTTTTGTTATAAAA
520 ATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTTGTTATAAAA
273937 TAATATTTTCTGTTCATACATGCATATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACA
585 TAATATTTTCTGTTCATACATGCATATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACA
274002 ATTAATAAGTAAAAAAACAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCCAATAGTCATTAATATTTGAG
650 ATTAATAAGTAAAAAAACAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCCAATAGTCATTAATATTTGAG
274067 T
715 T
* * *
274068 AATTATCTATTTCAAATTATTCTGATC-TTT-TTTTGTAATAAAACAATTG-TTTT-AGTTCTTA
1 AATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTATTTTGTAATAAAACAATTGATTTTCA-TT-GTA
* * * *
274129 TAAGCTTATT-TGATGTAAAATAATACTAATTTATT-ATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAAAGA
64 TAAGCCTATTCGGA-ATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTC-AAAAATGAATGAGTAAAAGA
* * * *
274191 ATTAAAAAA-GAATCTATTTGCTGAA-TAAGTTCAAATAGCTATGAGC-ATCTAAACAATTATTT
126 ATTAAAAAATGAATATATTTACTAAACT-AGTTCAAATAGCTATGA-CTATCTAAACAATTATAT
* * * * *
274253 ATTTCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTGTTGATGCAAGCTTATT
189 ATTTCAAAACATAATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAGTTATGTTCATACAAGCTTA-T
* * **
274318 TTA-AATAAAATAACACAAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGC-AAAAGATTT-AAAAA
253 TCAGAATAAAATAACACAAATCTAACAATATTAT-AAAAATTAATAA-CTAAAAGATTTAAAAAA
* * * * * *
274379 ATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATCAAACATTTATTTCAAA
316 ATAAATCTATTTACCAAATC-ACTTCAAATAATTAAGACTATATGAAT-AAACATCTATTT--AA
** *
274442 ATTGTTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TATTTTTATTCATACAAAATTATTCAAA
377 ATCATTATGAACA-TTT-TTTTGTCATAAAACAAATGTATTTTTATTCAGACAAAATTATTCAAA
* * * * * *
274504 ATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAACTAAATATGTTT
440 ATAAAATAATACTAATCTACTAATATGTCAAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAATATGTAT
* ** * * * **
274569 ACTAGATTAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAGTAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTT
505 ACTAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTT
274634 GTTTT
570 GTTTT
274639 GTCACAAAAC
Statistics
Matches: 467, Mismatches: 86, Indels: 38
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
709 3 0.01
710 50 0.11
711 272 0.58
712 100 0.21
713 18 0.04
714 24 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (715 bp):
AATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTATTTTGTAATAAAACAATTGATTTTCATTGTATA
AGCCTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTTTAATATTTCAAAAATGAATGAGTAAAAGAATTAA
AAAATGAATATATTTACTAAACTAGTTCAAATAGCTATGACTATCTAAACAATTATATATTTCAA
AACATAATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAGTTATGTTCATACAAGCTTATTCAGAATA
AAATAACACAAATCTAACAATATTATAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTAT
TTACCAAATCACTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAAACATCTATTTAAATCATTATGAACAT
TTTTTTGTCATAAAACAAATGTATTTTTATTCAGACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
CTACTAATATGTCAAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAATAAATATGTATACTAAACCAATTCAAA
TAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTTGTTATAAAAT
AATATTTTCTGTTCATACATGCATATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAA
TTAATAAGTAAAAAAACAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCCAATAGTCATTAATATTTGAGT
Found at i:274523 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 273351--274949 Score: 954
Period size: 182 Copynumber: 8.9 Consensus size: 181
273341 TAGTTCAAAT
* * * *
273351 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGATTTTCATT-
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTTATTC
* * * * * * * **
273414 GTATAAGCCTATTCGGAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATGAATGAGTC-GGA
64 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAG-CAAAA
* * ** *
273477 GATTTAAAAAATGAATATGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
273531 AACAATTATATATTTCAAATCATTATAATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCA
* * * * * ** *
273595 TACAAGTTTATTC-AGAATAAAATTACACGAATCTAACAATA-TTATGAAAATTAATAA-CTAAA
65 TACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAAATTAATAAGC-AAA
* * * * * * * *
273657 AGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAATC-ACTTCAAATAATTAAGGCTATATG
127 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
273713 AATAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCA-TTT-TTTTGTCCTAAAACAAATGTTTTTTTTTT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TATTTTTATT
* * * * * * * * * *
273775 CAGATAAGTTTGTTCGGAATAAAATAATACTAATCTACTGATATGTCAAAAATTAATAAG----A
63 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAA
* * * * *
273836 GATTTAAAAAATAAATTTGTATATCAAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTA
128 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
273890 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTTTTTTGTTATAAAATAA-TATTTTCTGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT-TATTCA
* * * * ** * *
273953 TACATGCATATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG-TAAA-A
65 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAGA
* * ** * * * *
274016 ---AAACAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCCAATAGTCATTAATATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * *
274065 AGTAATTATCTATTTCAAATTATTCT--GATCTTT-TTTTGTAATAAAACAATT-GTTTTAGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTC
* * * ** * *
274126 TTATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATT-ATATTCT-AAAAATTAATGAGTAAAA
64 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGCAAAA
* * * * * * * * *
274189 GAATTAAAAAA-GAATCTATTTGCTGAATAAGTTCAAATAGCTATGAGC-ATCTA
128 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTG
* ** * * * * ** * * *
274242 AACAATTATTTATTTCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTGTTGAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCAT
* ** * *
274307 GCAAGCTTATTTTAAATAAAATAACACAAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAGAT
66 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAGAT
*
274372 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
131 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * *
274423 ATCAAACATTTATTTCAAAATTGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCA
1 AACAATTATCTATTTC-AAATTATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCA
** * * *
274488 TACAAAATTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGA
65 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAAAAGA
* * * * ** *
274549 GTTAAAAACTAAATATGTTTA-CTAGATTAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * ** * * ** * * *
274601 AGTAATTATCTATCTCAAATCGTTAT--GATCTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGCTTCTGTTCG
1 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCA
* * * * * ** * *
274664 TACAAGCTTATTTGAAGTAACATATTGCTAAACTAATAATATTCT--AAAATTAATAAGCAAGAG
65 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGCAAAAG
* * ** * * *
274727 ATTTAAAAAATAAATGC-ATTTGCTTAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACCATTAG
129 ATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * **
274780 AACAATTATCTATATCAAAAATT-TT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTC
1 AACAATTATCTATTTC--AAATTATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTC
* * * *
274843 ATACATGCTTA-TCTAAAATAAAAATAATACT-ATTCTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAA
64 ATACAAGCTTATTC-GAAAT-AAAATAATACTAATT-TATTAATATTTAAAAAATTAATAAGCAA
* * *
274906 GAA-ATTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGT
126 -AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
274950 CAAGTCTTTA
Statistics
Matches: 1084, Mismatches: 268, Indels: 132
0.73 0.18 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 16 0.01
174 58 0.05
175 80 0.07
176 105 0.10
177 116 0.11
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * *
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*
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** * * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * ** **
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***** * * * ** *
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* *
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* ** * * *
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1 GA--AT-AA--AATAATACT-AATTTAT-TAA---TATTC----TAAAA-ATTAATAA-GTA--A
* * * *** * * * * * *
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* * * * * ** ***
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**** * * **
276774 AACAATTGT-TTCTATTCATAAAAGCTTATTCT-
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* * * * *
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* * * * *
276869 ATTGTTT-TCTGAACATGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT-AGTT
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* * * * * **
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* * * * * * *
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1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * ** * *
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* * * * * * * **
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*
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** ** * * * * * * *
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* * ** * **
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* * * * * * * *
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1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * ***
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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*
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1 GAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAATAAA
* ** ** * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA-ATTT-AAAAAATAA
* * * * * * * * *
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* * * * * * * * **
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*
278420 AA
180 -G
* * * * ** *
278422 AAATAAATTAGTTTACTAATTT-TATAATATT-T--CAATTAATTTGTTAA-TATTTCAAAATAA
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* * * * *
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** * * * * *
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*
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * ** * * *
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* * * ** * * * * **
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* * * *
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* * * * * ** * * *
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* * **
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* * ** * *
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* * * * * * * **
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* * * * ** * *
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* * *
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** * * * * * *
279988 AAGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTTTATCATAAAAGCTTA-TT-
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*
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* * * * * * * * *
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* * * *
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** * *
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275292 GCCTATTCAG
* * * * *
275302 AATAAAATAATGCTAATTT-TTGATATTTCAAAATTTAATGAGTAGAAG-ATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG--GAAGAATTTAAAAAATAAAT
* ** * * **
275365 CTATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATA
64 TTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * * * ** *
275430 ACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATAATTTATGTTAATACAAGCTTATTCAA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCGTACAAGCTTATT--T
* * *** ****
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1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGGAAGA-ATTTAAAAAATAAATT
* ** * * * * * * *
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* * * ** * **
275611 A-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTA-TT-TGTTCATTTAAGTTTGATCA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAAT-TATTTCTATTCGTACAAGCTT-ATTT
* ** *
275661 AATTAGAAA-AATATTAATTTATTAATATTTTAAAATTTAATAA-G-AG-ATTT-AAAAATAAAT
1 AA-TA-AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGGAAGAATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
275721 TTATTTA-CTAAACCAA-TTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATAATTTTATTTCAAATCATT
64 TTATTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATT
** * * * ** *
275784 ATTCCCATTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTCTATTAATACAATCTTATTT
126 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCGTACAAGCTTATTT
* * *
275837 GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGAATTTAAAAAATGAA
1 --AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGGAA-GAATTTAAAAAATAAA
** * * * * *
275902 --TATGTTGGCTAACCAGTGCAAATAATTATGAC-AGGTTT-AATAATTATCTATTTCAAATCAT
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* *
275963 TTTAACCTTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCTATTCGTACAAGCTTATTT
125 TATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCGTACAAGCTTATTT
* * * *
276018 AGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGGCAGATATTTAAAAACTAAA
1 --AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGGAAGA-ATTTAAAAAATAAA
* * * *
276083 TTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAAACACTAT
63 TTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
*
276148 AACC-TTTGTTTTGTCATAAATTAACTT-TTTCTATTCGTACAAGCTTATTT
128 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTATTTCTATTCGTACAAGCTTATTT
* * * *
276198 CAATTAAAATAAAACAAATTTATCAATATT-CAAACAATTAATAAGTAA-AATGTTTAAAAAATA
1 -AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAA-AATTAATAAGGAAGAA--TTTAAAAAATA
* * * * * **
276261 AATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
61 AATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * * *
276326 ACAACTTTTTGCTCTATCATAAAATAATTGTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT
126 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-T-TATTTCTATTCGTACAAGCTTATTT
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1 --AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
276411 TTGATAATTA
Statistics
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ATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCGTACAAGCTTATTT
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** *
275670 AATAT-TAATTTATTAATATTTTAAAATTTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTTATTTACTAAAC
1 AATATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTTATTTACTAAAC
* * * * * **
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* * * * *
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131 GTCACAAAATAATTGTTTCTATTAATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAAAACAAATTTATCAAT
* * * *
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* * * * * * *
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* *
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276028 AAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGGCAGATATTTAAAAACTAAATTTATTTA-
1 AATATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-G-AG--ATTTAAAAA-TAAATTTATTTAC
* * * *
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* * **
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* *
276216 TTTATCAATATTC-AAACAATTAATAAGTAA-AATGTTTAAAAAATAAATCTAT-TTATCGAATA
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* * *
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247 AGTGCAAATAATTAAGAC-AGTTT-AACAATTATCTATTTCAAATATGTTA-AACTTTTTGCTCT
* * *
276341 ATCATAAAATAATTGTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
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276391 AATATC-AATTTATTAATATT
1 AATATCTAATTTATTAATATT
276411 TTGATAATTA
Statistics
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AATATCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTTATTTACTAAAC
CAATTCAAATAGCTATAACAATTTGAACAATAATTCTATTTCAAAACACTATAACCATTTGTTTT
GTCACAAAATAATTGTTTCTATTAATACAAGCTTATTTGCAATAAAATAAAACAAATTTATCAAT
ATTCTAAAAATTAATAAGTAACAATTTAAAAAATAAATATGTTAGCGAACAAGTGCAAATAATTA
AGACAGTTTAACAATTATCTATTTCAAATATGTTAAACTTTTTGCTCTATCATAAAATAATTGTA
TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
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276387 AAATAATATC
* * * *
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1 AATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTT
276515 ACCAAACAAG
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AATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTTGACAA
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276055 TTAATAAGGC
* * *
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* ** ** * * *
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* *
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131 TTTCAAATAAAATAAAACAAATTTATCAACATTCAAACAATTAATAAGTAAAATGTTTAAAAAAT
* * **
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* * * * *
276324 TTACAACTTTTTGCTCTATCATAAAATAATTGTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAA
260 TTACAACATTTTGCTCTATCATAAAACAATTG--TTTCTATTCATAAAAGCTTATTCT-AAATAA
* * *
276388 AATAATATCAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATATGTTT
322 AATAAAATAAAATTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATATGTTT
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* * * *
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1 AGATATTTAAAAACTAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-CTATAACTATTTGAACAATT
* * * *
276554 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAGCAA-TTGTATCAATTCATATAAGC
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* * * *
276618 TTA-TTCAAAATAAAATAATAA-TAATTTATTAACATTCCAAA-AATTAATGAGTAAGA-GATTT
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* * * * *
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189 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTTTATATTTC
** * * *
276744 AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCTAAA
254 AAATCATTACAACATTTTGCTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCTAAA
276809 TAAAATAAAATAAAATTATTAATATT
319 TAAAATAAAATAAAATTATTAATATT
276835 CAAAAATTTA
Statistics
Matches: 287, Mismatches: 47, Indels: 21
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TCTATTTCAAAACACTATAACCTTTGTTTCATCATAAAGCAACTTTATCAATTCATACAAGCTTA
TTTCAAATAAAATAAAACAAATTTATCAACATTCAAACAATTAATAAGTAAAATGTTTAAAAAAT
AAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTTTATATTTCAAATCAT
TACAACATTTTGCTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCTAAATAAAATA
AAATAAAATTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAATATTTTTAAAATAAATATGTTTTGAC
AAAATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAGTAAA
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* *
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1 AAAA
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Statistics
Matches: 17, Mismatches: 2, Indels: 0
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AAAAATTTAAAAAAT
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** * * *
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* *
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* * * * *
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* * * *
276723 ATTTGAATAATTTTATATTTTAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
*
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130 TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTCAAA
* * * * *
276839 AATTTAATAACTAA-AAATTTAAAAAATAAAAT-TGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGTTATGTC
1 AA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
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* * * * * *
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* *
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1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
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65 TA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
277135 TATTTATAAAAGTTTATTCACAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
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* * ** * * *
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1 AATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * *
277251 CCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTC
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* * * * ***
277316 TATTCATGCAAAA--TTATTCAAA-AAAAAAATATTGATCTATTAATATTTTGA
128 TATTCAT--AAAAGCTTATTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCAAA
* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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278031 GA-CCATACAAGCTTATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAA
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* * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
278208 AGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAA
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* * * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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49 TTCA-AATAG-TT---AT-G-----ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTT
* * * * * * *
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* **
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* * * * * * *
278656 AATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
278720 ATATGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTGTGTTTTGTCATAAAATAAATATTTC-A
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
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130 TTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAA-TAATTTATTAATATTCAAA
* * * * ** *
278832 AATTTTATAAGTAAAAGATTTAGAAAAT--AAT-TATATTTATGAA-AGCAGTTCAAATAATTAT
1 AA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGT-TTTCCGAACA--AGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * *
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62 GACTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
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125 TTCTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCA-AA
* * ** * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
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65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT-GTTT
* * ** ** * *
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127 CTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
** * * * * *** * * *
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1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * *
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65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * *
279321 GTTTC-TACTAGCTTATTCTAATTAAAATAATACTAATTT-TATAATATTTCAAA
129 -ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTAT-TAATA-TTCAAA
* ** ** * *
279374 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTAACGAATTAGTTCAAATGGTTAAGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * ** *
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66 ATTTGAATAATTAT-CTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *
279501 AGTTCATACAAGCTTATT-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAAAATTCAAAA
129 A-TTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAA
* * * * * *
279554 AATTAATAAGAAAGAGATTT-AAAAATATAAATATGTTTAT-AGAATAAATTCAAATAGTTATTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AAATCTGTTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * * * * *
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64 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * ** * **
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128 TA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATAT-TCAAA
* * * * * * * * * *
279736 TATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAAT-AAATTTGCTTACCGAATCAA-TTAAAATAATTAAGCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
279799 CATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGA-C------ATT-T-ATAAAACAATTGTTTCT
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
** * *
279855 GGTCATACAAA-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
129 ATTCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * *
279908 AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGCTTAT-CAAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTG-TTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
279967 TA-TT--ATCA--ATC----CCAAATCATTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTT
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
280022 TTATCATAAAAGCTTATTCAATTAAAAATAATACTAATTT-TATAATATTTCAAA
129 AT-TCATAAAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATAATAATTTAT-TAATA-TTCAAA
* * * * * * * **
280076 AATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAT-AAATGTGTTTGCCAAACTAGATCAAATAGGTAAAACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
280140 ATTAGAATAATTATTTATTTCCAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCCTAAAATATTTGTTT-GA
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
280204 TATCTTACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATCCA-AATTTATTAACATTCAAA
130 T-TCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAAT-AATAATTTATTAATATTCAAA
* * * * *
280256 ATATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAAAAT-AAATCTATTTAT-TGAATAAGTTCAAATAATTATG
1 A-ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAATCTGTTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * *
280319 ACTATTTGAATAGTTGAATAGTTATTTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAA
63 ACTATTTG-A-A--T--A-A-TTA--TCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * *
280384 ACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAAACTTA-TCAAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATAGTTT
117 ACAATTGTTTCTA-TTCAT-AAAAGCTTATTC--AAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTC
*
280447 GAA
177 AAA
* ** * * * * * * **
280450 AATTATTAAACAAGAG-TTAAAAAAAT-AAATTTGTTTACCGAATAAATTC-AATACTTACAACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
280512 ATTTCAACAATTGTATGTTTAAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTTCATAAAA-ATATTATTTC
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACA-ATTGTTTC
* * * * ** *
280575 AATTTATACAAGCTTATTC----AAAATGAAT-AT-GTTTACCGAATCAATTGAAA
128 TATTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAAT-AATAATAATTTA-TTAAT--ATTCAAA
** * * * * * ** * ****
280625 CAATT-AT--G---GCCATTTCAACAAT--TATCTATTTTAAATCGTTATTACGTTTTGTTTAGT
1 -AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTT---CCG--AACAAG-TTCAAATAGT
* * * ** * ****
280682 CATATAACAATTGTTTTCGATCATACA--AGTTTA-TTCGAAAGCTTATCGAACCAATTCCGGTT
59 --TATGAC---T-ATTT-GA--ATA-ATTA-TCTATTTC-AAATATTAT-G-ACC-TTTTGTTTT
* * ** * * * * ** *** *
280744 -TGA-ACAATTATCTATTT-TAAATCATTATAATCTT-TT-ATTCTGTTATAA-ACTAATTGT-T
109 GTCATAAAACAAT-TGTTTCT-ATTCA-TAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAATAATT-TAT
*
280802 TCA-ATTCATATA
169 TAATATTCA-A-A
* * * * ** * ** ** * * * ** *
280814 AGCTTATTTAG-AATA-AAATAATACTAATTTAAT-AATATT-CTAA-AAATT--AATAACTAAG
1 A-ATTAATAAGTAAGAGATTTAA-A-AAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * ** ** * *
280872 A-GATTTAAAAAATAAATCTATTTAATGAAGTAATT-TAAAC-AATG--AAGACTATATGAACAA
63 ACTATTTGAATAAT-TATCTATTTCA--AA-T-ATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATA-AAAC-A
* * ***** * *** * ** * * *
280932 TTATCTATTTCAATTGTCATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAATC
120 --AT-TGTTTCTA-T-TCAT-AAAAGCT-TATTCAAATAAAATAA-T-AAT-AATTTAT-TAA--
280997 TTATTCAAAGTA
172 -TATTC-AA--A
* * * * * * *** *
281009 AAATTATACTAATTTATTA-ATATTTTGAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTGT
1 A-ATTA-A-TAA-GTA--AGAGA-TTTAAAAAATAAA-A-T--CTGTTTTCCGAA--CAA---G-
* * * * * * * * *
281073 TTACTAAATTAGGTA-AAATAATTATGGCTTTATCAACAGTTATCTATTTTAAATTGTTATTACC
49 TT-C-AAA-TAGTTATGACT-ATT-T-G---AATAAT----TATCTATTTCAAA-TATTATGACC
* * * ** * ** *
281137 TTTTG-TTTGCTCATATAACAATTGTTTTTGA-ACATTCAACCTTATTTGGAATAAAATAATGAT
100 TTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAAT
*
281200 AATTTATTAATCTTTCAAA
162 AATTTATTAAT-ATTCAAA
*
281219 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTAT-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
281282 TATTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT
65 TATTTGAATAATTATC-TATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
281346 TGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACCTAATATAATAATATTCCAAA
128 TATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATT-CAAA
* * * * *
281400 AATTAAT-AGCTAAGAGAATTAAAAAAT-AAATC-GTTTACC-ATACCAGTTCAAATATTTAAGA
1 AATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
281461 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG--TTG--AT------TTTTTTTT
64 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
** **
281516 TAATTCAATCTAA-CTTATTTGGAAT-AAA-AA-AATGAATTTATTAATATTTCAAA
128 T-ATTC-ATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * *
281569 AATTAATAAGT-AGCAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGAC
1 AATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
281632 TA-TTGTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTG-CAATAAAACAAATGTTT
65 TATTTG-AATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT
* ** * * * ** * *
281695 TTCCTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAGGTAATATTAATCTATTAATATTTCAAA
127 CTATTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * *
281750 AA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAA-AAAATCTATTTAT-CAAACTAGTTCAAATAGTTATGAT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* ** * * * * * * **
281808 TATTCGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAACAATTGTTTCT
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * * ** *
281873 ATCCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAT
129 ATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * * * * * *
281926 AGTTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATC--TTTACCGAACTAGATCAAGTAATCATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-ATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** *
281989 TATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTGATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
282053 AGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCTAAA
129 A-TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAA
* * * * * * * *
282107 AACTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAAT-GAATCTATTTAT-TGAATAAATTTAAATAATTATGA
1 AATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
282169 -T-TGTTGAAAAATCATCTATTTAAAATCATTATAACGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTT
64 CTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * **
282232 CTATTCACATAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATT-AAGA
127 CTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTCAA-A
* * * * * * * *
282286 TAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAA-CGTCATGAC
1 -AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
** * * * * * *
282349 TATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGA-CTTTT-TTTTGACATAAAATAATTGTTTTT
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAA-ATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * * ** *
282412 GTTCATACAAGTTTATTCGAATTAAAACAATATTAACTTATTAATTTTTTGAC
129 ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTATTAA-TATTCAAA
* * * * * * *
282465 AATTAATAAGTAATAGATTT-AAAAA-AAAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGCCT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
282528 AATTGAATGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTATTT-TA
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
282592 GTTCAT-ATA---T-TTGAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAA
130 -TTCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * * * * * *
282639 AATTAATGAGTAATAAAATTAAAAAA-AGAATATGTTTACTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * *
282703 ATCTGAATAATTATAAATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTG
66 ATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** * ** * **
282768 TTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTAAGAATATTCCAAA
130 TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATT-CAAA
* * * * * * * *
282820 AATTAATAAGTAA-AAATTAAAAAAAT-AAATTTGTTTTCTGAGCACGTTCAAATAGCTATGACA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
282883 ATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * *
282948 TGCATGAAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTATAAA
130 TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-CAAA
* * ** * *
283000 AATTAATTAGTAA-AGTATTTGAAAAAT--AATCCATTTACC-AAGCGAGTTCAAATAGTTATGA
1 AATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * **
283061 CTCTGTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGCTTT
64 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT
* * * *
283126 -TATTCATACAAGTTTATTGAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
127 CTATTCATAAAAGCTTATT-CAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAA
** * * *
283180 AATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGTC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGT-TATGAC
* * * * * * *
283243 CATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTTTCGTAAAACAATTATTTT
65 TATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
283307 TATTTATACAAA-ATT-TTCCAAAAGAAAATAATACTAGTTTAATAATATTTCAAA
128 TATTCATA-AAAGCTTATT-C-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * *
283361 AATTAATAAG--AGA-A-ATAAAAACT-AAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
283421 ATTTGGACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * ** ** *
283485 TTCATACAAGTTTATTCGGAGTAAAATATTGGTAAACTAATAATATTCTAAA
130 TTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAA
* * * * * * ** * * *
283537 AAATAATAAGTAAGAGTTTTGAAAAAT-ATATGTATTCACCGAACCAA-TT-TAATAGATAAGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
283599 TATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGCTCTGGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTC
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAT--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
283663 -AGTTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAA
128 TA-TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC--AAA
* * * * * * *
283718 AATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
283782 AATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGA-C-TTTGTTTTATCATAAAAC-ATTATTTCA
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *
283844 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTGAAA
129 ATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
** * * ** * * * *
283897 TTTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAAT-AAATCAG-TTT-------A--TCAAATAATTATGGCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
283951 ATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* * * * * *
284016 A-TCA-AACAAACCTATTAAAAAAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAA
129 ATTCATAA-AAGCTTATTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *
284067 AATTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATATGCT-TATT--GAACGAGTTCAAATAGTAATGA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-AT-CTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
284129 GTGTTTGAATAATTATATATTTCAAATCGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT
64 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
284193 ATGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAACATAATACA-AATCTAATGATATT-ATGAA
127 CTATTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATTCA--AA
* * * * * * * *
284248 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTGCCAAACCAA-TACAAATGGTTAAGGC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
284311 TATATGAATAATTTTATTTGTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCAT-AAACAAATGTTT
65 TATTTGAATAA--TTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * ** *
284375 TTGTTCGTATAAGTTTGTTTCAAATAAAATAATGTTAATTTATTAATATTTTAAA
127 CTATTCATAAAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * ** * * *
284430 AA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAT-AAATATGTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAAC-
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * * * *** *
284488 ATTTGACCAATTATTTAATTCATATCGTTGTGATAATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
66 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** *** * * ** * *
284553 TTGATGCATTATTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATATACTAAA
130 TTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAA
* * * * ** * * *
284605 AATTACTAGGTAATG-GATTTAAAAAAT-GAATATGTTGGCCTAATC-AGTCCAAATAGTTATAA
1 AATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTTCCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
284667 CTGTATGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTT
64 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* ** * * * * **
284731 TGTTTGTATAAGTTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCAAA
128 TATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCAAA
* * * * *
284784 AATTAATAAATAAGAAATTTAAAAACT-AAATCTATTTAT-CGAACAAGTTTAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
284847 TATTTGAACAATTACCTATTCCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTT
65 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTT
** * * *
284912 CTATTCATGCAAGCTTATTTCAATTAAAATAATTCA-AATTTATTAATAATT-AGAC
127 CTATTCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAA-TAATAATTTATTAAT-ATTCA-AA
* * * *
284967 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTAT-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGAC
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*
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TCATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCAAA
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276874 TTTCTGAACA
* * * * * * * *
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* * * * * *
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*
277117 TTATAAAACAATTGTTTCTATTTATAAAAGTTTATTCACAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
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* * * * * *
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* * * *
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52 A-CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCAT--AAAAGTTTATTCAAATAAAATAATA
* * * * * *
277347 TTGATCTATTAATATTTTGAAAAA-TAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATC
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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AAAAATTAAGAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATC
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* * * * * * ** *
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* ** * *
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* * ** * * *
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* * * * *
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186 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAAT
* * ** * * *
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* * *
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* * * * *
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1 AA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAT-TTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* *
276901 CTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTG-C-TATAAACTAATTGT
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* ** * * *
276963 TTCTGTTCATACAAG-TATATTCAAAACAAAATAATACTAGTTTAATAATATTC-CAAAAATTAA
124 TTCTGATCATACAAGCT-TATT-TGAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATT--
* *
277026 GAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTG--T---------TT-AAATAATTATGAC-AGATTGA
184 -AA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAGTTCAAATAATTATGACTA-TTTGA
* ** * * *
277078 ATAATTATTTATTTTAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTG-TTATAAAACAATTGTTTCTA-TTT
245 ATAATTATCTATTCCAAATCA-TTATGA-CCTTTG-TTTGATTAT--AATAATTGTTT-TAGTTC
*
277140 ATAAAAGTTTATTC-ACAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
304 ATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAA
* ** * * *
277189 AATTAA-AAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATT-GAACAAGTTCTTATAATCATGTC
1 AATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTT-TTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
277252 CATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCCTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** ** * * * * * *
277317 -ATTCATGCAAAATTATTCAAAAAAAAAATATTGATCTATTAATATTTTGAAAAA-TAATAAGAG
128 GA-TCATACAAGCTTATTTGAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAAGAG
* * * *
277380 ATTTAAAAACTAAATCTATTTACCGAAACAA-TTC-ATTAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
192 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * ** *
277443 A-TCTCAAA-CTATTATGATCTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTTTTTTTATAAAAGCTTAT
255 ATTC-CAAATC-ATTATGACCTTTGTTTGATTAT--AATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTAT
* * * * * *
277506 TCGAATTAAAAAAATACTAATCTAATAGTATTCCAA
316 TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA
* ** *
277542 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATG-TGTTTGCCGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-GCTATTTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
277605 TATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTT-TCTTTACTCATAAAACAATTATTTC
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * * * *
277669 AGTTCATACATGCTTATTTAGAATAATTAATGCTAATTTATTAACATTCAAAAAAAATAATGAAC
127 TGATCATACAAGCTTATTT-GAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAAAAT--T-AAT
* * * *
277734 AAGTGATTTAAAAAA-AAAACTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAAT
187 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAATAAT
* * * *
277797 TATCTATT-AAAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTATTTCAGTTCATAAAA
250 TATCTATTCCAAA-TCATTATGACC-TTTG-TTTGAT--TATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAA
* * * *
277860 ACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAA
310 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * *
277903 AATTAATAAGTAAGAGATTTATAAAACTAAAGCTATTTTTCGAACTAGTTCAAATAGTTATCACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAAGCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
277968 ATTTGAACAAATATCAATCTCAAACCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA
* *
278033 CCATACAAGCTTATTTGGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAAATTAATAAGAGA
130 TCATACAAGCTTATTT-GA-AAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAAGAGA
* * * * *
278098 TTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAATTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTAT
193 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * *
278163 TCCAAATCGTTCTGACCTATTGTTTAGATGTATAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCG
257 TCCAAATCATTATGACCT-TTGTTT-GAT-TATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCG
* *
278228 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAA
319 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * ** * ** * * *
278262 AATAAATAAATAAGAGATTTGAAAATATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAGCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *** *
278327 ATTTGAACAATTATATTTTTAAAATCCTTATGACCTTTTGTTTTATTAATGCTACTATATTAATA
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTT-GTCATAAAAC-A-A-T--TG
* * * ** * * * * *
278392 TTTCAAAAGTTAATAAGCAAG-AGATTT-AAAAAATAA-ATTAGTTTACTAATTTTATAATATTT
123 TTTC---TGATCAT-A-CAAGCTTATTTGAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A---
* ** * * **
278454 CAATTAATTTGTTAATATTTCAAAATAAAATAATACTAATTTGCTAATATTTCAAGAATTAATAA
179 AAATTAATAAG---AGA-TT-----TAAAA-AATA--AA--T-C---TGTTT-----ACCAA-AA
* * * * ** * *
278519 GAGATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTGTTCT-
220 -AG-TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTGTT-TG
* * * *
278583 ATCATAAAATAATTGTTTCT-GTTTATACAAA-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTA
282 AT--TATAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
**
278646 ATATTTTGAA
343 ATA-TTCAAA
* * * * *
278656 AATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAT-TTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
278719 TATATGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTGTGTTTTGTCATAAAATAAATATTTC-
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * *
278783 -A--GTACAAGCTTAATCAGAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTTTATAAGT
128 GATCATACAAGCTT-ATTTGAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA--AT-TAA-T
* * * * * ** * *
278844 AAAAGATTTAGAAAATAATTATATTTATGAAAGCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATT
187 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * * * * * *
278909 ATTTTATTCCAAATCTTTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAAGAATTGGTTTA-TTAATATAAGT
251 A-TCTATTCCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTGAT--TATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGC
* *
278973 TTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAA
312 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AA
* * ** * * * * * *
279014 AATTAATCAGTAAAAGATTTAAAATGTAAATCTA-TTTACAAATC-ATTTTAAATAGTTTTGACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* *
279077 ATTTG-ACTAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAAA-AATTGGTTT
65 ATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCAT-AAAACAATT-GTTT
* * ** ** ** * *
279140 -TGTTTATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATAAC-AATTTAATAATATT-TCAAACCTTAA-T
126 CTGATCATACAAGCTTATT-TGAA-AAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCT-AAA---AAATT
* * * *** * * * *
279201 AACTAAGAAAATTAAAACATAAATCCAATTACCTAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAA
184 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AA-AAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* ** * * * * *
279265 TGATTATCTATTTGAAATCATTTTGACTTTTTCTTTTG-TCGTA-AGACAATTATTTT-GTTTC-
246 TAATTATCTATTCCAAATCATTATGAC-CTTT-GTTTGAT--TATA-ATAATTGTTTTAG-TTCA
** * *
279326 TACTAGCTTATTCTAATTAAAATAATACTAATTT-TATAATATTTCAAA
305 TAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATA-TTCAAA
** * ** ** * *
279374 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAACGAATTAGTTCAAATGGTTAAGACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * ** * *
279439 TTAGAACAATT-TCCTACTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTACTCATAAAATAATTGTTTCAG
66 TTTGAACAATTAT-CTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * *
279503 TTCATACAAGCTTATTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAAAATTC-AAAAAATTAATAAGAAA
129 ATCATACAAGCTTATTTGAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAAT----AA
* * * * * * ** *
279567 GAGATTTAAAAATATAAATATGTTTA-TAGAATAAATTCAAATAGTTATTATTATTCAAACAATT
189 GAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCA-AA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* ** * * * * *
279631 GTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTG-TCATAAAATAATTGTTTCAGTTAATACAAGC
251 ATCTATTCCAAATCATTATGACC-TTTG-TTTGAT--TATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGC
* * * * **
279695 TTAGAT-GGAATTAAATAATAATAATTTATTAATATCTCCCA
312 TTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCAAA
* * * ** ** ** * * * * *
279736 TATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCGAATCAA-TTAAAATAATTAAGCCC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * *
279800 ATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGA-C-----ATT-T-ATAAAACAATTGTTTCTGG
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA
* *
279857 TCATACAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGAGA
130 TCATACAAGCTTATTT-GAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAAGAGA
* * * * * *
279921 TTTAAAAAATAAATTTGCTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT--ATCA--ATC---
193 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * **
279978 -CCAAATCATTAAGATCTTTGTTTTG-TCATAAAACAAATGTTTTTTTATCATAAAAGCTTATTC
257 TCCAAATCATTATGACCTTTG-TTTGAT--TATAATAATTGTTTTAGT-TCATAAAAGCTTATTC
*
280041 -AATTAAAAATAATACTAATTT-TATAATATTTCAAA
318 GAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATA-TTCAAA
* * ** * * * * **
280076 AATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATG-TGTTTGCCAAACTAGATCAAATAGGTAAAACT
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-GCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * *
280140 ATTAGAATAATTATTTATTTCCAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCCTAAAATATTTGTTTGAT
65 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CT
* * * * * *
280205 -ATCTTACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTC-AAAATATTAATAAGT
128 GATCATACAAGCTTATTT-GAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAAG-
* ** *
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190 ---AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG-A-A--
* ** * * * *
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246 T--A-A-TTA--TCTATTCCAAATCATTATGACC-TTTG-TTTGA-TTATAATAATTGTTTTAGT
* * * * **
280398 TCATAAAAAACTTA-TCAAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATAGTTTGAA
302 TCAT-AAAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* ** * ** * ** * * * **
280450 AATTATTAAACAAGAG-TTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAATTC-AATACTTACAACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * ** * * *
280513 TTTCAACAATTGTATGTTTAAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTTCATAAAA-ATATTATTTC-A
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTG-TCATAAAACA-ATTGTTTCTG
* * * ** * * *
280576 ATTTATACAAGCTTA-TT--CAAAATGAATA-T-GTTTACCGAATCAATT-GAAACAATT-AT-G
129 A-TCATACAAGCTTATTTGAAAAAAT-AATACTAATTTA-TTAAT--ATTCTAAAAAATTAATAA
** * * * * * ** * **** * * *
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189 GAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTT--A-C--CAAAAAG-TTCAAATAAT--TATGAC---T-AT
* * * * * *
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241 TT-GA--ATA-ATTA-TCTATTCCAAATCATTAT-G-ACC--TT--TGTTTGATTATAATAAT-T
* ** * * ** * ** *
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294 GTTTTAGTTCA-TAAAAGC--TTATTC-GAAATAAAATAA-T-ACT-AATTTAT-TAA---TA-T
*
280822 TAGAATAA
347 T--CA-AA
* * * * ** *
280830 AATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
1 AAT--TAATAA-GTAA-GAGATT-T-AAAA--AAT-A--AAGCTATTT------T---TC----G
* * * * * * * ** * *
280895 AATGAAGTAATTTAAACAATGAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AATTGTCATGATCTTT
42 AA-CAAG---TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTT
* * * ** *
280959 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAATCTTATTCAAAGTAAAATTATACTAATTT
102 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGAA--AAAATAATACTAATTT
* * * * * * * *
281024 ATTAATATTTTGAAAATTAA-AAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAATTAGGTA
165 ATTAATATTCT-AAAA--AATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTC
* * * * ** ** * *
281088 AAATAATTATGGCT-TTATCAACAGTTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGCTCATA
225 AAATAATTATGACTATT-TGAATAATTATCTATTCCAAATCATTATGACC-TTTGTTTGAT--TA
* * ** ** * * * *
281152 TAACAATTGTTTTTGAACATTCAACCTTATTTGGAATAAAATAATGA-TAATTTATTAATCTTTC
286 TAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAAT-ATTC
281216 AAA
349 AAA
* * * *
281219 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
281284 TTTGAACAATT-GCAAACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTG
66 TTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * * *
281348 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA-ACCTAATATAATAATATTC-CAAAAATTAATAGCT
129 ATCATACAAGCTTATT-TGAA-AAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAAATT-A-A--T
* ** * * *
281411 AAGAGAATTAAAAAATAAATC-GTTTACCATACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAATAATT
187 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA-AAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
* * **
281475 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTGATT-T--T--TT-TTTTAATTCAATCTAA-CTT
251 ATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTGT-TTGATTATAATAATTGTTTTAGTTC-ATAAAAGCTT
* *
281532 ATTTGGAATAAAA-AA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAA
314 ATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAA
** ** * * *
281569 AATTAATAAGT-AGCAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACT
1 AATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
281633 A-TTGTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTG-CAATAAAACAAATGTTTT
65 ATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTC
** * * * * ** * * *
281696 TCCTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAGGTAATATTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG
127 TGATCATACAAGCTTATT-TGAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAAG
* * * * * * ** *
281760 AGATTTAAAAAA-AAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGATTATTCGAGCAATTATT
190 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATC
** ** * * * * *
281824 TATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTCT-ATTTTAAAACAATTGTTTCTA-TCCATACAAGCTT
254 TATTCCAAATCATTATGAC-CTTTGTT-TGA--TTATAATAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTT
* * * ** *
281887 ATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAT
314 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * * * * * *
281926 AGTTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAA--TATCTTTACCGAACTAGATCAAGTAATCATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAT-TTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** *
281989 TATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTGATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
282053 AGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCTAAAAACTAATAATA
127 TGATCATACAAGCTTATTTG-AA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA--ATTAAT-
* * ** * *
282118 AAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATTGAATAAA-TTTAAATAATTATGA-T-TGTTGAAAAA
187 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAA-AAAGTTCAAATAATTATGACTAT-TTGAATAA
* ** * * * * * *
282180 TCATCTATTTAAAATCATTATAACGTTTTGTTTTG-TCATAAAATAATTTTTTCTA-TTCACATA
249 TTATCTATTCCAAATCATTATGAC-CTTTG-TTTGAT--TATAATAATTGTTT-TAGTTCATAAA
*
282243 AGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-AAGA
309 AGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAA-A
* * * * * * *
282286 TAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACAAGTTTAAA-CGTCATGAC
1 -AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * * *
282349 TATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGA-CTTTTTTTTGACATAAAATAATTGTTTTTG
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * * * * * * *
282413 TTCATACAAGTTTATTCGAATTAAAACAATATTAACTTATTAATTTTTTGACAATTAA-TAAGTA
129 ATCATACAAGCTTATTTGAA--AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A-AA-AAATTAA-TA
* * * * * * * *
282477 ATAGATTTAAAAAA-AAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGCCTAATTGAATGATTA
188 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
282541 TCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTATTTTAGTTCAT---A---T
252 TCTATTCCAAATCATTATGACC-TTTGTTTGAT--TATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTT
* * * *
282600 ATTTGAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAA
314 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * * *
282639 AATTAATGAGTAATAAAATTAAAAAA-AGAA--TATGTTTACTGAATAAGTTTAAATAGTTATGA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AAGCTAT-TTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * * *
282701 CTATCTGAATAATTATAAATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTC
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * ** *
282766 TGTTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTAAGAATATTC-CAAAAATTAATAA
127 TGATCATACAAGCTTA-TTTGAA-AAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAA
* * * * * ** * ** *
282829 GTAAAAATTAAAAAAATAAATTTGTTTTCTGAGCACGTTCAAATAGCTATGACAATTTGAATAAT
189 G---AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * * *
282894 TATATATTTCAAATCATTATGAACTTTGGTTTTG-TCATAAACCAATTGTTTCTA-TGCATGAAA
250 TATCTATTCCAAATCATTATGACCTTT-G-TTTGATTAT-AA-TAATTGTTT-TAGTTCATAAAA
* * * *
282957 GCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTATAAA
310 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAA
* * * * * * *
283000 AATTAATTAGTAA-AGTATTTGAAAAAT-AATCCA-TTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * **
283062 TCTGTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGCTTT-
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTC
*
283126 T-ATTCATACAAGTTTA-TTGAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATA
127 TGA-TCATACAAGCTTATTTG--AA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATA
* * * * *
283188 AGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGTCCATTTGAAC
188 A----GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAAAAGTTCAAATAAT-TATGACTATTTGAA-
* * * ** * * * *
283252 T-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTTTCGTAAAACAATTATTTTTA-TTTATA
246 TAATTATCTATTCCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTGAT--TATAATAATT-GTTTTAGTTCATA
* * * * *
283315 CAAA-ATT-TTCCAAAAGAAAATAATACTAGTTTAATAATATTTCAAA
307 -AAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *
283361 AATTAATAAG--AGA-A-ATAAAAACTAAA--TATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAT-TTT-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * **
283420 TATTTGGACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * * ** ** *
283484 ATTCATACAAGTTTATTCGGAGTAAAATATTGGTAAACTAATAATATTCTAAAAAATAATAAGTA
129 A-TCATACAAGCTTATT-TGA-AAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAAT--TAA-TA
* * * * * * * * * *
283549 AGAGTTTTGAAAAATATATGTATTCACCGAACCAA-TT-TAATAGA-TAAGACTATTAGAATAAT
188 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AA-AAAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAATAAT
* *** * * * * * * *
283611 TATCTATTTCAAATTGCTCTGGCCTTTTGTTT-AGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACATG
250 TATCTATTCCAAATCATTATGACC-TTTGTTTGA-T--TATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAG
* * *
283675 CTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAA
311 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC--AAA
* * * * * *
283718 AATTAATAAGCAAAAAATTTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAGCTATTTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * *
283782 AATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGA-CTTTGTTTTATCATAAAAC-ATTATTTC-A
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* *** * * * **
283844 ATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TGAAATTTTGAGAAGT
129 A-TCATACAAGCTTAT-TTGAA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATT---AA-T
** * * * *
283908 TGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTT-------A--TCAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTA
187 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *** *
283964 TCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTCATCA-AACAAAC
252 TCTATTCCAAATCATTATG-ACCTTTG-TTTGAT--TATAATAATTGTTTTAGTTCATAA-AAGC
* * * * *
284027 CTATT-AAAAAAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAA
312 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * *
284067 AATTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAA--TATGCTTATT-GAACGAGTTCAAATAGTAATGA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAT--TT-TTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
284129 GTGTTTGAATAATTATATATTTCAAATCGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * * * * *
284193 ATGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAACATAATACAAATCTAATGATATTATGAAAATTAA-TAA
126 CTGATCATACAAGCTTATTTGAAA-AA-ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA--AATTAA
* * * ** * * *
284257 CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAA-TACAAATGGTTAAGGCTATATGAATA
186 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA--AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
* * * ** * * * * * * * *
284321 ATTTTATTTGTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAACAAATGTTTTTGTTCGTATA
248 A--TTATCTATTCCAAATCATTATGAC-CTTTGTTTGATTAT-AATAATTGTTTTAGTTCATAAA
* * ** *
284386 AGTTTGTTTC-AAATAAAATAATGTTAATTTATTAATATTTTAAA
309 AGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *
284430 AA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAA--TATGTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAAC
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTAT-TTTTC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * ** *
284488 -ATTTGACCAATTATTTAATTCATATCGTTGTGATAATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *** * * *
284552 -ATTGATGCATTATTATTTGAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATATACT-AAAAATTACTAGG
128 GA-TCATACAAGCTTATTTGAAA-AAA-TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTA--A--
* * ** ** * * * * *
284615 TAATG-GATTTAAAAAATGAATATGTTGGCCTAATCAGTCCAAATAGTTATAACTGTATGAATAA
186 TAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAA
** * * * * * ** *
284679 TTATCTATTTTAAATCGTTATGATCTTTGTTTTG-TCACAAAATAATTGTTTTTGTTTGTATAAG
249 TTATCTATTCCAAATCATTATGACCTTTG-TTTGAT--TATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAG
* * * *
284743 TTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCAAA
311 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA
* * * * * *
284784 AATTAATAAATAAGAAATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
284849 TTTGAACAATTACCTATTCCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCT
66 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCT
* * * * * * *
284914 -ATTCATGCAAGCTTATTTCAATTAAAATAATTCAAATTTATTAATAAT-TAGACAATTAATAAG
128 GA-TCATACAAGCTTATTTGAA--AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAAG
* * * *
284977 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTG
190 ----AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
285036 TTTTGTCATA
Statistics
Matches: 6150, Mismatches: 1435, Indels: 1223
0.70 0.16 0.14
Matches are distributed among these distances:
339 30 0.00
340 118 0.02
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Consensus pattern (351 bp):
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CATACAAGCTTATTTGAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTAATAAGAGATTT
AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTCCA
AATCATTATGACCTTTGTTTGATTATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAA
ATAATACTAATTTATTAATATTCAAA
Found at i:281479 original size:361 final size:358
Alignment explanation
Indices: 280744--285030 Score: 2549
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280734 AATTCCGGTT
* * * * * * * **
280744 TGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAATCTTTTATTCTGTTAT-AAACTAATTG-TTTCAAT
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* *
280807 TCATAT-AAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACT
63 TCAT-TCAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
280869 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAATGAAGTAATTTAAACAATGAAGACTATATGAACAATT
125 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * * *
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189 ACT-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGT
* * * * *
280996 CTTATTCA-AAGTAAAATTATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAA
253 -TTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT-AATAGTAAGAGATTTAA
* * * ** * * * * *
281060 AAAGTAAATCTGTTTACTAAATTAGGTAAAATAATTATGGCTTTA
315 AAAATAAATC-GTTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * * * * * *
281105 TCAACAGTTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGCTCATATAACAATTGTTTTTGAAC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTGATC
* * *
281170 ATTCAACCTTATTTGGAATAAAATAATGA-TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
65 ATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * **
281234 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCAA
129 GATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACTT
* * * * *
281299 ACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATT
193 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATT
* * * *
281364 CAGAATAAAATAA-ACCTAATATAATAATATTCCAAAAATTAATAGCTAAGAGAATTAAAAAATA
258 CAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAG-TAAGAGATTTAAAAAATA
* *
281428 AATCGTTTACCATACCAGTTCAAATATTTAAGACTATA
321 AATCGTTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * *
281466 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTG--AT------TTTTTTTTTAATTC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TC
* *
281522 AATCTAA-CTTATTTGGAATAAAA-AA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AG
65 ATTC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * *
281582 CAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGACTA-TTGTAACAATTA
128 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTA
* * * * ** *
281646 -TCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTG-CAATAAAACAAATGTTTTTCCTCATATAAGT
190 CT-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGT
* ** * *
281709 TTGTTCAGAATAAGGTAATATTAATCTATTAATATT-TCAAAAATT-A-A-TAAGAGATTTAAAA
253 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * *
281770 AA-AAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGATTAT-
317 AATAAATC-GTTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
** * * * * * ** *
281811 TCGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAACAATTGTTTCT-AT
1 T-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTTGAT
* * * ** * * *
281875 CCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAGTTAATAAGTAAA
64 -CATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * * * *
281940 AAATTTTAAAAATAAATATCTTTACCGAACTAGATCAAGTAATCATGACTATTTGAATAATTATT
128 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACT
* ** * * * *
282005 TATTTCAAAT-AGTGATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA
192 TATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTA
* * *
282069 TTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCTAAAAACTAATAATAAAGAGATTTAAAAAA
256 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGT-AAGAGATTTAAAAAA
* * ** * * * * *
282133 TGAATCTATTTATTGAATA--AATTTAAATAATTATGATTGT-
319 TAAATC-GTTTA--CCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * * * * *
282173 TGAAAAATCATCTATTTAAAATCATTATAACGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCT-AT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGA-
* *
282236 TCACAT-AAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGATAGTTAATAA
63 TCA-TTCAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA
* * * * * *
282296 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAA-CGTCATGACTATTTGAGCAA
123 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * ** * * *
282360 TTATTTATTTCAACTTGTTATGA-CTTTT-TTTTGACATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAG
187 TTACTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* * * * * * * *
282423 TTTATTC-GAATTAAAACAATATTAACTTATTAATTTTTTGACAATTAATAAGTAATAGATTTAA
252 TTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
282487 AAAA-AAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGCCTA-A
315 AAAATAAAT-CGTTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * * * * * * * *
282530 TTGAATGATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTATTTTAGTT
1 -TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGAT
* * * * *
282595 CA-T--A---TATTTGAAGTAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAATA
64 CATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
282654 AAATTAAAAAA-AGAATATGTTTACTGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTA-
129 GATTTAAAAAATA-AATCTATTTAC-GAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAC
* * * * *
282716 TAAATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGTTT
191 T-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTT
** * ** * * *
282781 ATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTAAGAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTAAAAAA
255 ATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * *
282844 ATAAATTTGTTT-TC-TGAGCACGTTCAAATAGCTATGACAATT
318 ATAAA-TCGTTTACCAT-ACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * * * *
282886 TGAATAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-ATG
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGAT-
** * ** * *
282950 CATGAAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAT-AAAAATTAATTAGTAA-
64 CATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * * *
283013 AGTATTTGAAAAAT-AATCCATTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTCTGTAAACAATTAT
128 AG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAC
* ** *
283077 TTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGCTTT-TATTCATACAAGTTT
191 TTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGTTT
* * **
283141 ATTGAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAA
255 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * *
283206 TAAATATGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTCT-TGTCCATT
319 TAAAT-CGTTTACC-ATACCAGTTCAAATAGT-TATGACTATA
* * * * * *
283247 TGAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTTTCGTAAAACAATTATTTTT-AT
1 TGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-
* * ** ** * * *
283310 TTATACAAAATT-TTCCAAAAGAAAATAATACTAGTTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
63 TCATTCAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
283372 GA-A-ATAAAAACTAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGACAATTA-
127 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAC
* * * *
283434 TCTATCTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTT
191 T-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTT
* * * ** ** * * * *
283498 ATTCGGAGTAAAATATTGGTAAACTAATAATATTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGTTTTGAAAAA
255 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * *
283563 TATAT-GTATTCACCGA-ACCAATT-TAATAGATAAGACTAT-
319 TAAATCGT-TT-ACC-ATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * * * * ** *
283602 TAGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTT
1 T-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTGAT
* * * * *
283667 CATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATAAGCAA
64 CATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
283731 AAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTA
127 GAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * ** * *
283796 -TCTATTTAAAATTGTTATGA-C-TTTGTTTTATCATAAAAC-ATTATTTCAATTCATAAAAGCT
190 CT-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTT
* * * * ** **
283857 TATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TGAAATTTTGAGA-AGTTGGAGATTTAAA
254 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT-A-ATAGTAAGAGATTTAAA
* * * *
283920 AAATAAATCAG-TT----T---A--TCAAATAATTATGGCCATT
316 AAATAAATC-GTTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * *
283954 TAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATC
** * * * * * * * *
284019 AAACAAACCTA-TTAAAAAAAAATAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTG
65 ATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * * * * *
284083 ATTTAAAAAATAAATATGCTTATTGAACGAGTTCAAATAGTAATGAGTGTTTGAATAATTA-TAT
130 ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACT-T
* * * *
284147 ATTTCAAATCGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGTTTAT
193 ATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTAT
* * * * * * * * *
284211 TCAAAATAACATAATACAAATCTAATGATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATA
257 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
284276 AATTTGTTTGCCAAACCAATACAAATGGTTAAGGCTATA
321 AA-TCGTTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * * * * *
284315 TGAATAATTTTATTTGTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCAT-AAACAAATGTTTTTGT
1 TGAATAA--TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA
* * * * ** *
284379 TCGTAT-AAGTTTGTTTCAAATAAAATAATGTTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAA
63 TCAT-TCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
284439 GAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAAC-ATTTGACCAATTAT
127 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAC
* * * * *** * * * * *
284502 TTAATTCATATCGTTGTGATAATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATGC-ATTATT
191 TTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGT-TT
* * * * * *
284566 ATT-TGAAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATATACTAAAAATTACTAGGTAATG-GATTTAAAA
255 ATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA-GTAA-GAGATTTAAAA
** * * * *
284629 AATGAATAT-GTTGGCC-TAATCAGTCCAAATAGTTATAACTGTA
317 AAT-AA-ATCGTTTACCAT-ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
* * * * * *
284672 TGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTTTGTTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATC
* * * * *
284736 GTAT-AAGTTTATTTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGA
65 AT-TCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
284799 AATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCT
129 GATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACTT
* * * * * * * *
284864 ATTCCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATGCAAGCTTA
193 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTGTTCATACAAGTTTA
* * * * * *
284929 TTTCA-ATTAAAATAATTCAAATTTATTAATAAT-TAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
256 -TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAA
* * * **
284992 ATAAATATGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
318 ATAAAT-CGTTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACT
285031 TTTTGTTTTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCA
TTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
TTTAAAAAATAAATCTATTTACGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACTTATT
TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTCAG
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCG
TTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATA
Found at i:282663 original size:174 final size:175
Alignment explanation
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282415 CATACAAGTT
* * ** * * *
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1 TATTCGAAGTAAAACAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAAAATTAAAAA
* * * *
282490 AA-AATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGCCTAAT-TGAATGATTATCAATTTCAAAT
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*
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* * *
282599 TATTTGAAGTAAAATAATATT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAATAAAATTAAAA
1 TATTCGAAGTAAAACAATATTAAC-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAAAATTAAAA
** * * *
282663 AAAGAATATGTTTACTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATAAATTTTAAAA
65 AAAGAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATCTGAATAATTATAAATTTCAAAA
* * *
282728 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
130 CATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAACAATT
282761 GGTTCTGTTC
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 23, Indels: 5
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.44, C:0.08, G:0.08, T:0.40
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TATTCGAAGTAAAACAATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAAAATTAAAAA
AAGAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATCTGAATAATTATAAATTTCAAAAC
ATTATGACCTTTTCTTTTATAATAAAACAATTATTTTAGTTCATA
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Alignment explanation
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280733 CAATTCCGGT
* * * * * * * *
280743 TTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTAT-AATCTTTTATTCTGTTATAAACTAATTGTTTCAAT
1 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* * * * * *
280807 TCATATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAG
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* * * * * * *
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128 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
280936 CTATTTC-AATTGTCATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAA-TCT
192 TTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATTTTA-TTCATACAAGT-T
* * * * * * ** *
280998 TATTCAAAGTAAAATTATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAAAGTAAGTGATTTAAAAA
254 TATTGAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * * * *
281063 GTAAATCTGTTTACTAA-ATTAGGTAAAATAATTATGGCTTTATCAACAGTTATCTATTTTAAAT
318 ATAAATATGTTTACCAACA--A-GTTAAATAGTCATGCCATT-TGAATAATTATCTATTTCAAAT
** * * * ** * * ** * ** ** *
281127 TGTTATTACCTTTTGTTTGCTCATATAACAATTGTTTTTGAACATTCAACCTTATTTGGAATAAA
379 CATTATGACATTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTT-ATTATACAA-AAT-TTTAAAAGAAA
* ** *
281192 ATAATGA-TAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
441 ATAAT-ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AG-GAAAT-AAAAATAAATATGTTT
* * ** * * * *
281256 ATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGCAAACTTCAAATCATTATAACCTTT
502 ACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* * * * * **
281321 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAACCT-AATA
567 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAAT--ATTTAAAT-
* * * * * *
281385 TAATAATATTCCAAAAATTAAT-AGCTAAGAGAATTAAAAAATAAATC-GTTTAC-CATACCAGT
629 TAATAATATTCTAAAAAATAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACTGA-ACCAAT
* ** *
281447 TCAAATATTTAAGACTA
691 T-TAATAGATATGACTA
* * *
281464 TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG--TTG--AT----T--TTTTTTTTAA
1 T-TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-A
** * *
281519 TTCA-ATCTAA-CTTATTTGGAATAAAA-AA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
64 TTCATA-C-AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA-AATTAAAAAATTAATAAG
* * * * *
281579 TAGCAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGACTA-TTGTAACA
125 TA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTG-AACA
* * * * * ** *
281642 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTG-CAATAAAACAAATGTTTTTCCTCATATA
187 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGTC-ATAAAATAATTGATTTTATTCATACA
* * * ** *
281706 AGTTTGTTCAGAATAAGGTAATATTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA----GAGATTTA
250 AGTTTATTGAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTTGGAGATTTA
* * * * * ** * ** * *
281767 AAAAA-AAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGATTATTCGAGCAATTATTTATTTTA
314 AAAAATAAATATGTTTA-CCAACAAGTT-AAATAGTCATG-CCATTTGAATAATTATCTATTTCA
** * * * ** * * * ** ** **
281831 AATTGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTTGGATT
376 AATCATTATGACATTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTAT-TATACAA-AAT-TTTAAAAG
* ** * * ** *
281896 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAGTTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATCT
438 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAAA---TAAAAATAAATATGT
* * * * * * * **
281961 TTACCGAACTAGATCAAGTAATCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTGATGATAT
500 TTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCT
* * * * *
282026 TTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
565 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAAT-AT-TTAA
* * * * * **
282090 TTTATTAATAATCTAAAAACTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATTGAATAAA
627 ATTAATAATATTCTAAAAAATAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACTGAACCAA
* *
282154 TTTAAATA-ATTATGATTG
690 TTT-AATAGA-TATGACTA
* * * *
282172 TTGAAAAATCATCTATTTAAAATCATTAT-AACGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTAT
1 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* * ** * * *
282236 TCACATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAGATAGTTAATAAGTAA
65 TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTAA-AAAATTAATAAGT-A
* * *
282300 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAA-CGTCATGACTATTTGAGCAATTAT
127 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
282364 TTATTTCAACTTGTTATGACTTTT-TTTTGACATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTAT
192 TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATTTTATTCATACAAGTTTAT
* * * * * * ***
282428 TCG-AATTAAAACAATATTAACTTATTAATTTTTTGACAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAA-
257 T-GAAAATAAAATAATATTAATTTATTAA-TATTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAT
* * *
282491 AAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGCCTAATTGAATGATTATCAATTTCAAATCAT
320 AAATATGTTTACC-AACAAG-TTAAATAGTCATGCC-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * *
282556 TATGACCTTTTCTTTTATAATAAAATAATTA-TTTTAGT-T-C-ATATATTT-GAAGTAAAATAA
382 TATGACATTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTATTATACAAAAT-TTTAAAAG-AAAATAA
* * ** * *
282616 TATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAATAAAATTAAAAAAAGAATATGTTTACTGA
445 TATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGGAAA-TAAAAATA-AATATGTTTACCGA
* * * * * *
282681 A-TAAGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATAAATTTTAAAACATTATGACCTTTTGTT
507 ACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * ** *
282745 TTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATTTAAATTTAAGA
571 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAAT-ATTTAAA-TTAATA
* * * * * * * * * *
282810 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTAAAAAAATAAATTTGTTTTCTG-AGCACGTTCAAAT
634 ATATTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACTGAACCA-ATT-TAAT
* *
282873 AGCTATGACAA
696 AGATATGACTA
* * ** *
282884 TTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTAT
1 -TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTAT
* * * *
282949 GCATGA-AAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTATAAAAATTAATTAGTAA
65 TCAT-ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTA-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
283013 AGTATTTGAAAAAT-AATCCATTTAC-CAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTCTGTAAACAATTA
128 AG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** * *
283076 TTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGCTTTTATTCATACAAGTTT
191 TTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATTTTATTCATACAAGTTT
*
283141 ATTGAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAA
255 ATTGAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAA
*
283206 TAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCTTGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATC
319 TAAATATGTTTACC-AACAAGTT-AAATAGTCATG-CCATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATC
* *
283270 ATTATGACATTTTATTTTTTCGTAAAACAATTATTTTTATTTATACAAAATTTTCCAAAAGAAAA
380 ATTATGACATTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTA-TTATACAAAATTTT--AAAAGAAAA
* * * *
283335 TAATACTAGTTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-A-GAAATAAAAACTAAATATGTTTACCA
442 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAAATAAAAA-TAAATATGTTTACCG
* * * * *
283398 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TTTTTGTT
506 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* *
283462 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAGTAAAATATTGGTAAACTAATA
571 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATATT--TAAATTAATA
* * * * *
283527 ATATTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGTTTTGAAAAATATATGTATTCACCGAACCAATTTAATAG
634 ATATTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-ATCTATTTACTGAACCAATTTAATAG
*
283592 ATAAGACTA
698 ATATGACTA
*** * ** *
283601 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGGCCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTC-AG
1 TT-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-
* * * * *
283665 TTCATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAAATTAATAAGCA
64 TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT--AAAAAATTAATAAG-T
* *
283730 AAAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACAATTTGAACAATT
126 AAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
283795 ATCTATTTAAAATTGTTATGAC-TTTGTTTTATCATAAAA-CATT-ATTTCAATTCATAAAAGCT
190 ATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATTT-TATTCATACAAGTT
** * ** * *
283857 TATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTGAAATTTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAA
254 TATTGAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAA
* * *
283922 ATAAATCA-GTTTATC-A-AA--T-AAT--T-ATGGCCATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCG
318 ATAAAT-ATGTTTACCAACAAGTTAAATAGTCAT-GCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * *
283978 TTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCATCAAACAAACCTATTAAAAAAAAAT
381 TTATGACA-TTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTT-ATTATACAAA-ATTTTAAAAGAAAAT
* ** * **
284042 AATATTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATATGCTTATT
443 AATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-G-GAAAT-AAAAATAAATATGTTTACC
* * * * * *
284107 GAACGAGTTCAAATAGTAATGAGTGTTTGAATAATTATATATTTCAAATCGATATAACCTTTTGT
505 GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * ** * **
284172 TTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAACATAATACAAATCTAAT
570 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAAT-ATTTAAAT-TAAT
* * * * * * * * ** **
284237 GATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAATACAAAT
633 AATATTCTAAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACTGAACCAAT-TTAAT
* * * *
284302 GGTTAAGGCTA
696 AGATATGACTA
* * ** *
284313 TATGAATAATTTTATTTGTTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTTATCATAAACA-AATGT-TT
1 T-TGAATAA--TTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAA-ATAAT-TATT
* * * * * * ** * *
284375 T-TGTTCGTATAAGTTTGTTTCAAATAAAATAATGTTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
60 TCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTAAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
284439 G---AGATTT-AAAAATAAATATGTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAAC-ATTTGACCAAT
124 GTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
284499 TATTTAATTCATATCGTTGTGA-TAATTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTATTGATGC-A
189 TATTTATTTCAAATTGTTATGACT--TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATTT-TATTCATACAA
* * ** * * * *
284561 TTATTATTTG-AAATAAAGTAATGCTAATTTTTTAATATACTAAAAATTACTAGGTAAT-G-GAT
251 GT-TTA-TTGAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAATAAGT--TGGAGAT
* ** * * **
284623 TTAAAAAATGAATATGTTGGCCTAATC-AGTCCAAATAGTTATAAC-TGTATGAATAATTATCTA
311 TTAAAAAATAAATATGTTTACC-AA-CAAGT-TAAATAGTCATGCCAT-T-TGAATAATTATCTA
* * * * * * * * * * **
284686 TTTTAAATCGTTATG--ATCTTTGTTTTGTCACAAAATAATTGTTTTTGTTTGTATAAGTTTATT
371 TTTCAAATCATTATGACAT-TTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTT-ATTATACAA-AAT-TT
* * * * *
284749 TGAAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAACTA
432 TAAAAGAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAAA--TAAAAA-TA
* * * * * * ** * **
284812 AATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTCCAAATCACT
493 AATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTT
* * * * *
284877 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC--AATTAAA
558 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCGGAA-TAAA
* * * * * *
284940 ATAATTCAAATTTATTAATAAT-TAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA---A--TA
619 AT-ATTTAAA-TTAATAATATTCTA-AAAAATAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATCTATTTA
284999 -TG--------T--T---TAT--C--
681 CTGAACCAATTTAATAGATATGACTA
* *
285007 ----A-AA-TA---AGTTCAAAT-AGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TC
1 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-
* *** * * ** * *
285060 ATTCATACAAGCTTATTCATGTTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTGACAATTAATAAGCA
63 ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-AAAAAATTAATAAG-T
* * * * * * * * *
285125 AAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATT
126 AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** ** ** * * * * * * *
285189 ATCTATTTAAAATCATTACAACCTTTTGTTTCATCATAAAATAATT-CTATCAGTTTATATAGGC
190 ATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATTTTA-TTCATACAAGT
* * * * **
285253 TAATTCG-AAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAA
253 TTATT-GAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAA
* * * * * * * * * * *
285317 ATATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAGATAGTTC-TAACTATTTGAACAAATATCTATATCAA
316 AAATAAATATGTTTA-CCAACAAGTT-AAATAG-TCAT-GCCATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* ** * * * ** * * * *
285381 ATTATTATGACCCTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTATTTT-GAAT
377 ATCATTATGACATTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTATT-ATACAA---AATTTTAAAAG
* *
285445 AAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCA--AAATTAAAAAATAAATATGT
438 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGGAAA-T-AAAAATAAATATGT
* * * * * *
285508 TTTCTGAA-TAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT
500 TTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCT
* *
285572 TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAA
565 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
285610 ACGTATTCAA
Statistics
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CATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTAAAAAATTAATAAGTAAAGA
TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
TTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATTTTATTCATACAAGTTTATTGAA
AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATAT
GTTTACCAACAAGTTAAATAGTCATGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATT
TTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTATTATACAAAATTTTAAAAGAAAATAATATTAATTTAT
TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAAATAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAG
TTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATATTTAAATTAATAATATTCTAAAAAATAAT
AAGTAAGAGATTTAAAAAATAATCTATTTACTGAACCAATTTAATAGATATGACTA
Found at i:284022 original size:18 final size:19
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
283978 TTATGAACTT
283988 TTGTTTTGTCATAAAACAA
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*
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TTGTTTTGTCATAAAACAA
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283781 CAATTTGAAC
* *
283791 AATTATCTATTTAAAATTGTTATGACTTTGTTTTATCATAAAACATTATTTCAATTCATAAAAGC
1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACTTTGTTTTATCATAAAACATTATTTCAATTCATAAAAAC
* * * ** * *
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* * *
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1 AATTATCTATTTAAAATCGTTATG-AC-TTTGTTTTATCATAAAAC-ATTATTTCAATTCAT--A
* * *
284021 ACAAACCTAT-TAAAAAAAAATAATATTAAC-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGA
61 A-AAACCTATCCAAAAAAAAATAATATT-ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAGGAGA
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124 TTTAAAAAATAAAT
284098 ATGCTTATTG
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Matches are distributed among these distances:
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AATTATCTATTTAAAATCGTTATGACTTTGTTTTATCATAAAACATTATTTCAATTCATAAAAAC
CTATCCAAAAAAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAGGAGATTTAAAA
AATAAATCAGTTTATCAAATAATTATGGCCATTTAAAT
Found at i:285087 original size:146 final size:148
Alignment explanation
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Period size: 146 Copynumber: 2.0 Consensus size: 148
284873 CACTATAACC
* * *
284883 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAATTAAAATAAT-TC
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTATTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATAT-
*
284947 AAATTTATTAATAATT-AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAA-
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*
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTATTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATAT
* * *
285093 TAATTTATTAATATTCTGACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCAAACT
65 AAATTTATTAATATTCAGACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACT
285158 AGTTCAAATAGT
130 AGTTCAAATAGT
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Consensus pattern (148 bp):
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTATTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATATA
AATTTATTAATATTCAGACAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACTA
GTTCAAATAGTTATGACT
Found at i:285607 original size:178 final size:179
Alignment explanation
Indices: 285014--285689 Score: 672
Period size: 181 Copynumber: 3.8 Consensus size: 179
285004 ATCAAATAAG
* *
285014 TTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TCATTCATACAAGCTTATTC
1 TTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT-
* * * ** * *
285078 ATG-TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTGACAATTAATAAG-CAAAAGATTTTAAAAATA
63 TTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTC-AAAGATTTAAAAAATA
* * *
285141 AATATGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAT
127 AATATGTTTATCGAA-TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** ** * * * * * * *
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* * * * *
285258 CGAAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGT-AAGAGATTTAAAATATA
64 TG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAA-AGATTTAAAAAATA
* * * * * *
285322 AATCTATTTATCGAAAAAGTTCAGATAGTTCTAACTATTTGAACAAATATCTAT
127 AATATGTTTATCG-AATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
285376 ATCAAATTATTATGACCCTTTGTTTTTTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTATTTT
1 TTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTT
285441 GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAA-A-TTAAAAAATAAA
65 GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAATAAA
**
285503 TATGTTT-TCTGAATAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTAT
129 TATGTTTATC-GAATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * **
285554 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAACGTATTCA
1 TTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTT
* * * * *
285619 AAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-TAAAATAAAT
65 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAATAAAT
285683 ATGTTTA
130 ATGTTTA
285690 AAAACTTTAA
Statistics
Matches: 400, Mismatches: 76, Indels: 39
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTCAAAGATTTAAAAAATAAATA
TGTTTATCGAATAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:285683 original size:23 final size:24
Alignment explanation
Indices: 285651--285701 Score: 59
Period size: 24 Copynumber: 2.2 Consensus size: 24
285641 TAATATTCCA
* *
285651 AAAATTAATAAG-TAAAAAATTTT
1 AAAATAAATAAGTTAAAAAACTTT
* *
285674 AAAATAAATATGTTTAAAAACTTT
1 AAAATAAATAAGTTAAAAAACTTT
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1 AAAA
285702 AATAAAATTA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 4, Indels: 1
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Matches are distributed among these distances:
23 10 0.43
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ACGTcount: A:0.61, C:0.02, G:0.04, T:0.33
Consensus pattern (24 bp):
AAAATAAATAAGTTAAAAAACTTT
Found at i:285852 original size:205 final size:205
Alignment explanation
Indices: 285491--285894 Score: 490
Period size: 205 Copynumber: 2.0 Consensus size: 205
285481 TAAGTCAAAA
* * * * * * * *
285491 TTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAATAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT
1 TTAAAAAATAAATATATTTTCTGAAAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAAATATCTATCT
* *
285556 CAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAACGTATTCAAA
66 CAAATAGTTATGA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACGTATTCAAA
* ** * * *
285621 ATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-TAAAATAAATAT
130 ATAAAATAATAATAACTTAATAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATAT
285685 GTTTAAAAACT
195 GTTTAAAAACT
285696 TTAAAAAATAAA-ATTATTTTCTGAAAAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAAATATCTAT
1 TTAAAAAATAAATA-TATTTTCTG-AAAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAAATATCTAT
* * * *** **
285760 CTCAAATTGTTGTGA-TATTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGTTTATTTG
64 CTCAAATAGTTATGACT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAACGTATTCA
* * * *
285824 AATTAAAATAATAATAACTTAATAATATTCCAAAAATTAGCAAGTAATAGATTTAAAAAATAAAT
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*
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* *
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* *
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TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTACGAACAAAAAAATTA
TTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
Found at i:288310 original size:353 final size:355
Alignment explanation
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Period size: 356 Copynumber: 6.5 Consensus size: 355
287298 TAATTTTTGG
* * * * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* * ** * *
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* * *
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*
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* *
287663 AATATTATTAAACTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAAATTATTTTA
1 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAG-AAAAAATTATTTTA
* * * *
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65 TGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
** * *
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130 ACTTGTTCAATAAACAGATTCAA-TTTTTAA-ATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * *
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193 TTAGAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTACAAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAA
* *
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** * *
287988 TATTTTTTAAAGCTTTTGCTTATTAAATTTCTA
323 TATTTTAAAAATCTTTTGCTTATTAAATGTCTA
* * * **
288021 AATGTTAATAAATTTGCATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTACGAAGAGAAAATTTTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAATTATTTTAT
* ** *
288086 GACAAAACAAATGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
66 GATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * *
288151 CTTGTTCAATAAACAGATTCAGTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTA
131 CTTGTTCAATAAACAGATTCAATTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
*
288214 GAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTACAAACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGT
196 GAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTACAAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGT
* * *
288279 CACAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAATCATAGCTATTTGAACTTATTCGATAACTAT
261 CACAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGATAACTAT
*
288344 TTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATGTCTA
326 TTTAAAAATCTTTTGCTTATTAAATGTCTA
*
288374 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTAAAATAAGCTTTGTATGAAGAGAAAAAATTATTTTA
1 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGC-TTGTATGAAGAGAAAAAATTATTTTA
* * *
288439 TGATGAAACAAAACGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGA
65 TGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
288504 ACTTATTCAATAAACAAATTCAATTTTTAAATCTTACTAATTAATTATTGAAATATTAATAAATT
130 ACTTGTTCAATAAACAGATTCAATTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * * * *
288569 AGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTATTTTGTGAAAAAATAAAAGT
195 AGAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTACAAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGG
* * * * * * ****
288634 TCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATTAATAAC-ATTTTATGCTGGTCAGGCCAA
260 TCACAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAA-TCATAACTATTTGA-ACT--T-A-TTTGA
* * ** ** * * *
288698 CAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATT-AATTTTTAA
319 TA-ACT-A-TTTTAAAAATCTTTTGCTTATTAAATGTCT-A
* * * ** * * * *
288738 AATATTAATAAATTAGTATTACTTTACTCCAAATAAGATTGTGTCAA-TGAAAAAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAATTATTTTAT
* * * * * * *
288802 GATAAAACAAATAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTAT-TT-AAATTGTTATAACTAATTG-
66 GATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * * *
288864 ATTTGATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TT-CCTATTAA-TTTTCAAGATATTAATAAA
130 ACTTG-TTCAATAAACAGATTCAATTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAA-ATATTAATAAA
* * * * * ** * * *
288926 TTA-ATATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATAAGAAAACAAA
193 TTAGA-ATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTACAAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAA
* * * * * * * * ** * ***
288990 AGCTTATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAC-TA-AACA-AA
257 AGGTCACAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGATAA
* ** * * *
289052 TTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTC-A
322 -CTATTTTAAAAATCT-TTTGCTTATTAAATGTCTA
* * * * * * * * * * * *
289086 TGATATTATTAGATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAAAACTTGTATGAATATAAATAATTGTTT
1 -AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-ATTGAA-ATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAATTATTT
* * * * * * *
289151 TATGACAAAATAAAAGGCTATAACGATATGAAATATATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
63 TATGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
289215 GAAATGGTTCAGTAAACAGATAT-ATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTCAT
128 GAACTTGTTCAATAAACAGAT-TCAATTTTTAAATC--TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * ** * * *
289279 AAATTAGTATTATTTTA-TTCAAAATAGGCTTGTACGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAAC
190 AAATTAGAATTATGTTATTTC-GAATAAGCTTGTACAAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAAC
* * * ** * * *** *
289343 AAAAGTTCATAACGGCTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTTG
254 AAAAGGTCACAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAATCATAACTATTTGAACTT-ATTTG
* **** * * *
289407 ATAAACTATTTTATCTTTTAAATC-TACAATT-TCTCAATTTTTGA
318 AT-AACTATTTTA-----AAAATCTTTTGCTTAT-TAAATGTCT-A
* * * * * * ** *
289451 AATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTG-GATAAGCTTTTATGAACTGAAAAAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAATTATTTTA
* * * ** * * *
289515 TAATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAA-TTATTCAAATAGTCATAACTATTTCA
65 TGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
289579 ACTTCTTCAGTAAACA-ATTTATTTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATA
130 ACTTGTTCAATAAACAGATTCA-ATTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATA
289642 AA
191 AA
289644 ATAATATTAA
Statistics
Matches: 1611, Mismatches: 303, Indels: 127
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
348 1 0.00
349 37 0.02
350 11 0.01
351 16 0.01
352 80 0.05
353 213 0.13
354 117 0.07
355 47 0.03
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365 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAATTATTTTAT
GATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
CTTGTTCAATAAACAGATTCAATTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTA
GAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTACAAACAAAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGT
CACAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAATCATAACTATTTGAACTTATTTGATAACTAT
TTTAAAAATCTTTTGCTTATTAAATGTCTA
Found at i:288565 original size:534 final size:530
Alignment explanation
Indices: 287713--288840 Score: 1115
Period size: 534 Copynumber: 2.1 Consensus size: 530
287703 GTATGAAGAG
* * * * * * * *
287713 AAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTTGTTTAAATA
1 AAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAATAGTCACAACGATTTGAAATAAATAA-TTGTTCAGATA
* * * * ** * *
287778 ATCATAACTATTTAAACTTGTTTGATAAACAGATTCAATTTT-TTAATCTCTTACTTATT-AATT
65 ATCATAGCTATTTGAACTTATTCGAT-AAC----T--ATTTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATG
* * * **
287841 TTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATATTATTTCGAATAAGTTTGTACGAACAAAAACAATTAT
123 TCT-AAATATTAATAAATTAGAATTATATTAATTAAAATAAGTTTGTACGAACAAAAACAATTAT
* * * *
287906 TTTGTGATAAAACAAAAGGTTACAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAGATAATCATAACTATT
187 TTTATGATAAAACAAAACGTTACAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATT
** * * * * * *
287971 TGAACTTATTTGATAACTATTTTTTAAAGCTTTTGCTTATTAAATTTCTAAATGTTAATAAATTT
252 TGAACTTATTCAATAACTAATTTTTAAA-CTCTTACTAATTAAATTTCTAAATATTAATAAATTA
* * * * * * *
288036 GCATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTACGAAGAGAAA-ATTTTATTTTATGACAAAACAAATG
316 GAATTATGTT-ATTCCAAATAAGCTTGTACAAAGAGAAACA-ATTATTTTATGAAAAAACAAA-A
* * * * *
288099 GTT-ATAGTGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTCA-A
378 GTTCACAATGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAACAAGTAATAAC-ATTTGATAC-TGGTCAGA
* **
288160 TAAACAGATTCA-GTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTAGAATTA-
440 CAAACAGATTCATGTTTTTAAATCCGTACTTATTAATTTTTAAAATATTAACAAATTAGAATTAC
* * * *
288220 TGTTATTTCGAATAAGCTTGT-ACAAAC
505 T-TTACTCCAAATAAGATTGTGAC-AAC
*
288247 AAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA-AGGTCACAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGAT
1 AAAAA-AATTATTTTATGATAAAACAAATA-GTCACAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGAT
288311 AATCATAGCTATTTGAACTTATTCGATAACTATTTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATGTCTAAA
64 AATCATAGCTATTTGAACTTATTCGATAACTATTTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATGTCTAAA
* * * * *
288376 TATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTAAAATAAGCTTTGTATGAAGAGAAAA-AATTATTTTAT
129 TATTAATAAATTAGAATTATATTAATTAAAATAAG-TTTGTACGAACA-AAAACAATTATTTTAT
* * * * * * *
288440 GATGAAACAAAACGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGAA
192 GATAAAACAAAACGTTACAACGATTTGAAATAAATAA-TTATTCAAATAATCATAACTATTTGAA
288505 CTTATTCAATAAACAAATTCAATTTTTAAA-TCTTACTAATT-AATTAT-TGAAATATTAATAAA
256 CTTATTCAAT-AAC----T-AATTTTTAAACTCTTACTAATTAAATT-TCT-AAATATTAATAAA
* * *
288567 TTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTATTTTGTGAAAAAATAAAA
313 TTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAAGAGAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAA
* * * * *
288632 GTTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATTAATAACATTTTATGCTGGTCAGGCCA
378 GTTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAAGTAATAACATTTGATACTGGTCAGACAA
* * *
288697 ACAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTACTT
443 ACAGATTCATGTTTTTAAATCCG-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAACAAATTAGAATTACTT
* *
288762 TACTCCAAATAAGATTGTGTCAAT
507 TACTCCAAATAAGATTGTGACAAC
* *
288786 GAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAATAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT
1 AAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAATAGTCACAACGATTTGAAATAAATAATT
288841 ATTTAAATTG
Statistics
Matches: 485, Mismatches: 80, Indels: 54
0.78 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
527 5 0.01
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (530 bp):
AAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAATAGTCACAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAA
TCATAGCTATTTGAACTTATTCGATAACTATTTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATGTCTAAATA
TTAATAAATTAGAATTATATTAATTAAAATAAGTTTGTACGAACAAAAACAATTATTTTATGATA
AAACAAAACGTTACAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTAT
TCAATAACTAATTTTTAAACTCTTACTAATTAAATTTCTAAATATTAATAAATTAGAATTATGTT
ATTCCAAATAAGCTTGTACAAAGAGAAACAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGTTCACAATGATT
TGAAATAGATAATTGTTCAAACAAGTAATAACATTTGATACTGGTCAGACAAACAGATTCATGTT
TTTAAATCCGTACTTATTAATTTTTAAAATATTAACAAATTAGAATTACTTTACTCCAAATAAGA
TTGTGACAAC
Found at i:289264 original size:715 final size:708
Alignment explanation
Indices: 287532--289380 Score: 1797
Period size: 715 Copynumber: 2.6 Consensus size: 708
287522 AGCATGTATG
* * * * * * *
287532 AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTC
1 AACAAAAACAATTATTTTATAAGAAAACAAAA-GCTC-ACAACGATTTAAAATAAATAATTATTC
* * *** * *
287596 AGATAATCATAACTATTTAAACTTATTTGATAACT-TTTTAAAAAATTTTTTGCTTATTAAATGT
64 AGATAACCATAACTATTTGAACTTAAACGATAACTATTTT-AAAAATCTCTTGCTTATTAAATGT
* * * *
287660 CTAAATATTATTAAACTT-GTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAAGAGAAAAAAATTAT
128 CTAAATATTAATAAA-TTAGTATCATTTTAATTAAAATAAACTTGTATGAAGA-AAAAAAATTAT
* * *
287724 TTTATGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTTGTTTAAATAATCATAACTAT
191 TTTATGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
287789 TT-AAACTTGTT-TGATAAACAGATTCAATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATAT
256 TTGAAA-TTGTTCAG-TAAACAGATTC-ATTTTTTAAATCT-TTACTAATTAATTTTTGAAATAT
* * * * *
287851 TAATAAATTAGAATTATATTATTTCGAATAAGTTTGTACGAACAAAAACAATTATTTTGTGATAA
317 TAATAAATTAGAATTATATTATTCCAAATAAGCTTGTAC-AATAAAAACAATTATTTTGTGAAAA
* * * * * *
287916 AACAAAAGGTT-ACAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAGATAATCATAACTATTTGAACTTAT
381 AACAAAA-GTTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATAATAACTATTTGAACTTAG
*** * ** * * * *
287980 TTGATAACTATTTTTTAAAGCTTTTGCTTATTAAATTTCTAAATGTTAATAAATTTGCATTATTT
445 CCAACAACTATTTTTTAAAGCCGTTACTTATTAAATTTCTAAATATTAATAAATTAGCATTACTT
** * * * * **
288045 TAATTGAAATAAGCTTGTACGAAGAGAAAATTTTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAGTGAT
510 TAATCCAAATAAGATTGTACGAAGAGAAAATATTATTTTATGACAAAACAAATAGTCATAACGAT
* *
288110 TTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTCAGTT
575 TTGAAATAAATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTCAGTT
* ** * * * *
288175 TTTAAATCTCTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTAGAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTG
640 TTTAAATCTCCTATTAATTTTAAGAATATTAACAAATTAGAATTATGTTATTTCAAACAAACTTA
288240 TACA
705 TACA
* * * * * *
288244 AACAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCACAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAG
1 AACAAAAACAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGCTCACAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAG
* * **
288309 ATAATCATAGCTATTTGAACTTATTCGATAACTATTTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATGTCTA
66 ATAACCATAACTATTTGAACTTAAACGATAACTATTTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATGTCTA
* * * *
288374 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTAAAATAAGCTTTGTATGAAGAGAAAAAATTATTTTA
131 AATATTAATAAATTAGTATCATTTTAATTAAAATAAAC-TTGTATGAAGAAAAAAAATTATTTTA
* * *
288439 TGATGAAACAAAACGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTGATAACTATTTGA
195 TGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
288504 ACTTATTCAATAAACAAATTCAATTTTTAAATC-TTACTAATTAATTATTGAAATATTAATAAAT
260 AATTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * *
288568 TAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTGTACAAATAGAAACAATTATTTTGTGAAAAAATAAAAG
325 TAGAATTATATTATTCCAAATAAGCTTGTAC-AATAAAAACAATTATTTTGTGAAAAAACAAAAG
* *
288633 TTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATTAATAAC-ATTTTATGCTGGTCAGGCCA
389 TTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAA-TAATAACTATTTGA-ACT--T-A-GCCA
* * * *
288697 ACAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATT-AATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTACT
448 ACA-ACT-A-TTTTTTAAAGCCGTTACTTATTAAATTTCT-AAATATTAATAAATTAGCATTACT
* * *
288761 TTACTCCAAATAAGATTGTGTC-AATGA-AAAA-ATTATTTTATGATAAAACAAATAGTCATAAC
509 TTAATCCAAATAAGATTGT-ACGAA-GAGAAAATATTATTTTATGACAAAACAAATAGTCATAAC
* * * ** *
288823 GATTTGAAATAAATAATTAT-TT-AAATTGTTATAACTAATTG-ATTTGATTTGATAAATAGATT
572 GATTTGAAATAAATAATT-TGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTG-TTCAATAAACAGATT
* * * * *
288885 TATTTTTTAAATTTCCTATTAATTTTCAAG-ATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTTCAAAC
635 CAGTTTTTAAATCTCCTATTAATTTT-AAGAATATTAACAAATTAGA-ATTATGTTATTTCAAAC
**
288948 AAACTTATATG
698 AAACTTATACA
* * * * *
288959 AACAAAAACATTTATTTTATAAGAAAACAAAAGCTTATAACGATTTAAAATAGATAATTATTCAT
1 AACAAAAACAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGCTCACAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAG
* * * ** * *
289024 ATAGCCTTAACTATTTGAAC-TAAAC-A-AATTTATTTTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTC
66 ATAACCATAACTATTTGAACTTAAACGATAA-CTATTTTAAAAATCTCTT-GCTTATTAAATGTC
* * * * * * * *
289085 -ATGATATTATTAGATTAGTATCATTTTATTTTGAATAA-AAACTTGTATGAATATAAATAATTG
129 TA-AATATTAATAAATTAGTATCATTTTA-ATT-AA-AATAAACTTGTATGAAGAAAAAAAATTA
* * * * * * *
289148 TTTTATGACAAAATAAAAGGCTATAACGATATGAAATATATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTA
190 TTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *
289212 TTTGAAATGGTTCAGTAAACAGATAT-ATTTTTTAAATCTTTTACTCATTAATTTTTGAAATATT
255 TTTGAAATTGTTCAGTAAACAGAT-TCATTTTTTAAATC-TTTACTAATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * * * * * *
289276 CATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAGGCTTGTACGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAA
318 AATAAATTAGAATTATATTATTCCAAATAAGCTTGTACAAT-AAAAACAATTATTTTGTGAAAAA
* * **
289341 ACAAAAGTTCATAACGGCTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
382 ACAAAAGTTCACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
289381 TGGCCATAAT
Statistics
Matches: 947, Mismatches: 156, Indels: 65
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
708 3 0.00
709 117 0.12
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716 54 0.06
717 60 0.06
718 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (708 bp):
AACAAAAACAATTATTTTATAAGAAAACAAAAGCTCACAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAG
ATAACCATAACTATTTGAACTTAAACGATAACTATTTTAAAAATCTCTTGCTTATTAAATGTCTA
AATATTAATAAATTAGTATCATTTTAATTAAAATAAACTTGTATGAAGAAAAAAAATTATTTTAT
GATAAAACAAAAAGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
ATTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
AGAATTATATTATTCCAAATAAGCTTGTACAATAAAAACAATTATTTTGTGAAAAAACAAAAGTT
CACAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATAATAACTATTTGAACTTAGCCAACAACTAT
TTTTTAAAGCCGTTACTTATTAAATTTCTAAATATTAATAAATTAGCATTACTTTAATCCAAATA
AGATTGTACGAAGAGAAAATATTATTTTATGACAAAACAAATAGTCATAACGATTTGAAATAAAT
AATTTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTCAATAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCC
TATTAATTTTAAGAATATTAACAAATTAGAATTATGTTATTTCAAACAAACTTATACA
Found at i:289651 original size:29 final size:29
Alignment explanation
Indices: 289619--289687 Score: 86
Period size: 29 Copynumber: 2.4 Consensus size: 29
289609 ATTTCTTGCT
*
289619 TATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAAATAA
1 TATTAATTTT-TGAAATATTAATAAAATAA
* *
289648 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAG
1 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAA
*
289677 TATTATTTTTT
1 TATTAATTTTT
289688 TTTGATAAGT
Statistics
Matches: 35, Mismatches: 4, Indels: 2
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
28 1 0.03
29 34 0.97
ACGTcount: A:0.42, C:0.01, G:0.06, T:0.51
Consensus pattern (29 bp):
TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAA
Found at i:289817 original size:210 final size:211
Alignment explanation
Indices: 289442--289867 Score: 583
Period size: 210 Copynumber: 2.0 Consensus size: 211
289432 ACAATTTCTC
289442 AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAAAAA
1 AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAAAAA
* ** * * *
289507 TTGTTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
66 TTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATAATTACTCAAATACTCATAAC
* *
289572 TATTTCAACTTCTTCAGTAAACAATTTATTTTTTT-AAATTTCTTGCTTATTAATTTTCTAAATG
131 TATTTCAACTTCTTCAGTAAACAATTTATTTTTTTAAAATCTCTTGCTCATTAATTTTCTAAATG
289636 TTAATAAAATAATATT
196 TTAATAAAATAATATT
* * * *
289652 AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTA-TTTTTTTTTGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAA
1 AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAAAAA
* *
289716 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAACAACTTTAAATAGATAATTGCTCAAATACTCA-AA
66 TTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCAT-AACAACTTTAAATAGATAATTACTCAAATACTCATAA
* ** ** * *
289780 TCTATTTCAACTTGTTTGGTAAGTAGATTTA-TTTTTTAAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTGA
130 -CTATTTCAACTTCTTCAGTAAACA-ATTTATTTTTTTAAAATCTCTTGCTCATTAATTTTCTAA
* *
289844 ATGTTAATAAATTAGTATT
193 ATGTTAATAAAATAATATT
289863 -ATTTT
1 AATTTT
289868 ATTATAAATA
Statistics
Matches: 189, Mismatches: 23, Indels: 8
0.86 0.10 0.04
Matches are distributed among these distances:
209 57 0.30
210 88 0.47
211 44 0.23
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (211 bp):
AATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTACTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAAAAA
TTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATAATTACTCAAATACTCATAAC
TATTTCAACTTCTTCAGTAAACAATTTATTTTTTTAAAATCTCTTGCTCATTAATTTTCTAAATG
TTAATAAAATAATATT
Found at i:290425 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 289648--293666 Score: 2561
Period size: 181 Copynumber: 22.5 Consensus size: 179
289638 AATAAAATAA
* *** * *
289648 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-TTTTTGATAAGTTTTTATGAACT-GA
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
** * *
289711 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAACAACTTT-AAATAGATAATTGCTCAAATAC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT-AATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * *
289775 TCA-AATCTATTTCAACTTGTTTGGTAAGTAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTGCT
126 TCATAA-CTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACT
* *
289830 CATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT-AAATAAGCTTGTATGAATAGA
1 TATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * * * *
289894 AATAGTTGTTTTATGACTAAAGAAAAGGTTAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
289959 TTTCACTATTT-AAATTGGTTTGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-
128 -ATAACTATTTGAACTT-ATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * *
290011 ---TAATTTTTGGGATATT-ATAAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAATGAGCTTGTATGAAAAG
1 TATTAATTTTT-GAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * *
290071 AAACAACTGTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAAAGATATGAGATAAATAATTGTTCAAATAGT
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * *
290135 CATAAATATTTGAACTGT-TTCAGTAAATAGATTT-TCTTTTTAAA--TC-T-CT
127 CATAACTATTTGAACT-TATTTAGTAAACATATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACT
*** * * * ** *
290184 TATTAATTATCAAAATATTAATAGATTTGTATTGTTTTA-TTCTAAATAATTTTGAATGAATAGA
1 TATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * ** * * * *
290248 AACAATTGATTTACGATAAAA-AAAATGTCATTACAATTTGAAATATATAATAGTTCAAATGGAC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * **
290312 ATGATTATTTGGACTTATTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCAAACT
128 ATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
**
290364 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAA
1 TATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * *
290429 ACAATTATTTTATGACAAAACTAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * * *** * *
290494 GAACTATTTGAACTTGCTCAATAAATGGATTTATTTTTTAAATATTTTACT
129 TAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * *
290545 TAGTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAA-AAGCTT-TAATGAATAG
1 TATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGT-ATGAATAG
* * * *
290608 AAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAATATCATAATGATTTCAAATAGATAATCT-TTTAAATAG
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAG
* * *
290672 TCATAACTATTTGAA-TATGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-T-TTACT
126 TCATAACTATTTGAACT-TATTTAGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACT
* * * * * * ** *
290725 TATTAATTTTTGGATTGTTAATAAATT-TTAATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGCACAAAAAGA
1 TATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * *
290789 ACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * *
290854 ATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACATATTCT-TTTTTCAATTCTCTTACT
128 ATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATT-TATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * *
290906 CATTAATTTTTGGAA-ATTAATAAATTAGTATTATCTTACTTCAAATAAGCTTATATAAACT-GA
1 TATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
* * * * *
290969 AACAAGTGTTTTATTACAAAAGAAAAGTTATAATGATTTG-AATAGATAATTATTCAAATAGTCA
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *
291033 TGACTATTTGAACTTATTTGGTAAA-ATATTTATTTTTTTAAATCTTTTACT
129 TAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT
**** * * * * * *
291084 TATTAATTGCCAAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAACAGAA
1 TATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * **
291149 ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATAAGTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCAT
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * ** *
291214 AACGATTTGAACTTGTTTGGTAAACGGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACT
130 AACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT
* * * *
291265 TATTAATTGTCTT-AATATTAACAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGGATGAATTG
1 TATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * * * *
291328 AAAAAAATTCTTTTCTGACAAAACAAAAGGTTATAGCT-ATTTCAAATAGATAATTATTTAGACA
63 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
291392 ATCATAATTATTT-AAATATGTTTAGCAAACAAATTCAGTTTTTAAATCTCTCTA-T
125 GTCATAACTATTTGAACT-TATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT-TACT
* *** *
291447 TATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTATATGAACT-GA
1 TATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
* * ** * * *
291511 AAGAATTCTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATAGTT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * *
291576 ATGATTATTTGATCTAACTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTAAT
128 ATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * *
291627 TATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * *
291692 ACAATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* *
291757 TAACTATTTGAAC-TAGTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--ACT
129 TAACTATTTGAACTTA-TTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * * * * *
291804 TATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTGGTATTACTTTATTCCAAACAAACATATATGAACAAAA
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * *
291869 ACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAATCA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
291934 TAATTATTTGAAC-TAGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACT
129 TAACTATTTGAACTTATTTA-GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * **
291985 TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA--ATTTTTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTCA
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * *
292048 AACAAACCTATTTTATGACAAAATAAATGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAG
64 AAC-AA-TTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * ** * * * * *
292113 TTTTAAATATTTGAAC-TAGTTCGGCAAACAAATTTAATTTTTAATTCTCTTAGT
126 TCATAACTATTTGAACTTA-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * * *
292167 TATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTGTTATTTTA-TTCTGAGTAAACTTGTATGAACAAA
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * * * * *
292231 AATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAAAGATTTGAAGT-GTACAATTGTTCAAGTAGT
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGT
292295 CATAACTATTTGAA-TTAGTTT-GATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
127 CATAACTATTTGAACTTA-TTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* ** * *
292348 TATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGGAA-AAGCTTGAATG-TTCA-
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAAT-AG
* * * * *
292410 AATACAATTCTTATATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGACATAG
63 AA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
292475 -CTGTAA-TCATTTAAAC-GATTCAGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACT
126 TC-ATAACT-ATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * ** *
292528 TATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTTTGAATGAGCTTGTATGAACT-G
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
** * *
292591 AAATGATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGT
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
292656 CTTAACTGTTTAAAC-TACTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT
127 CATAACTATTTGAACTTA-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
** * * **
292709 TATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGCTAT-TATGAAT-GA
1 TATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATGAATAGA
* * * * * * *
292772 AACAATTATTTTATAATAGAAA-AAAACATTATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAG-
64 AACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
** * * * * *
292835 -----------GAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACA
127 CATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * ** * *
292877 TATAAATGTTTGAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTCCAAATTGGCGTGTATG-ATAAAA
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
** ** * ** ** * *
292940 ACAATTGTTTTATGACAAAA-AAATTTCATAATG----GCGATA-ATTATTAGAACTGAT-TTGA
65 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCA
* * * * * *
292998 TAATTATTAGAACTGATTT-GATAAAC-TGACTTATTTTATAAATCTCTAACT
129 TAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * *** *
293049 TATGAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAG-
1 TATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
* * * * * * * *
293113 AACTATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATATATAATTATTTAAATAGTC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * *
293178 ATAACTATTTGAACTTGTTT-GATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTCTT-GT
128 ATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * *
293229 GTATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAG---TA--TTATTT----T-A---TG-A--ACTAG-
1 -TATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGA
* * * * * * * * *
293277 AACTATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATATTTATTTTAAATATATAATTATTTAAATAGTC
64 AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
293342 ATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTCTT-GT
128 ATAACTATTTGAACTTATTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * ** *
293393 GTATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACT-G
1 -TATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * * * * * * **
293457 AAAAAATTATTCTACGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGACAATTATTCTGATAGT
63 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
293522 CTTAACTATTT-AAC-TAGTTTGGCAAACACACTTATATTTTAAA--TC-T-CT
127 CATAACTATTTGAACTTA-TTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
* * * ** * * ** * *
293570 TATTAATTTTAGAATATTATTAATTTACCAATATTTTATTTCGAATAAGCTCATATGAACAAAAA
1 TATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* *
293635 CAATTTTTTTTATGGCAAAAC-AAAGATCATAA
66 CAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA
293667 CAATTTTAAC
Statistics
Matches: 3033, Mismatches: 629, Indels: 357
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
160 5 0.00
161 7 0.00
163 2 0.00
164 140 0.05
165 11 0.00
166 9 0.00
167 46 0.02
168 48 0.02
169 6 0.00
171 2 0.00
172 51 0.02
173 28 0.01
174 25 0.01
175 62 0.02
176 182 0.06
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178 136 0.04
179 110 0.04
180 699 0.23
181 815 0.27
182 294 0.10
183 153 0.05
184 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAACTTATTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACT
Found at i:293001 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 292975--293021 Score: 94
Period size: 21 Copynumber: 2.2 Consensus size: 21
292965 TCATAATGGC
292975 GATAATTATTAGAACTGATTT
1 GATAATTATTAGAACTGATTT
292996 GATAATTATTAGAACTGATTT
1 GATAATTATTAGAACTGATTT
293017 GATAA
1 GATAA
293022 ACTGACTTAT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
21 26 1.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.04, G:0.15, T:0.40
Consensus pattern (21 bp):
GATAATTATTAGAACTGATTT
Found at i:293274 original size:164 final size:164
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Indices: 293100--293433 Score: 650
Period size: 164 Copynumber: 2.0 Consensus size: 164
293090 TTGGATAAGC
293100 TTTTATGAACTAGAACTATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATATATAAT
1 TTTTATGAACTAGAACTATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATATATAAT
*
293165 TATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTCTTGTG
66 TATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTCTTGTG
293230 TATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAGTATTA
131 TATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAGTATTA
*
293264 TTTTATGAACTAGAACTATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATATTTATTTTAAATATATAAT
1 TTTTATGAACTAGAACTATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATATATAAT
293329 TATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTCTTGTG
66 TATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTCTTGTG
293394 TATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAGTATTA
131 TATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAGTATTA
293428 TTTTAT
1 TTTTAT
293434 TTTGAATAAG
Statistics
Matches: 168, Mismatches: 2, Indels: 0
0.99 0.01 0.00
Matches are distributed among these distances:
164 168 1.00
ACGTcount: A:0.37, C:0.06, G:0.09, T:0.48
Consensus pattern (164 bp):
TTTTATGAACTAGAACTATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATTTTAAATATATAAT
TATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAAATTAATTTTTTTAATTTCTTGTG
TATTAATTTTTTGAGTGTTAATAAATTAGTATTA
Found at i:293787 original size:141 final size:141
Alignment explanation
Indices: 293558--293813 Score: 302
Period size: 141 Copynumber: 1.8 Consensus size: 141
293548 CACACTTATA
** *
293558 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAATATTATTAATTTACCAATATTTTATTTCGAATAAGCTCA
1 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAATATTAAAAAATTACCAATATTTTATTTCGAATAAGCTCA
* ***
293623 TATGAACAAAAACAATTTTTTTTATGGCAAAACAAAGA-TCATAACAATTTTAACTGGTTCGATA
66 TATGAACAAAAACAATTTGTTTTACAACAAAACAAA-ATTCATAACAATTTTAACTGGTTCGATA
293687 AACAAATTTAGT
130 AACAAATTTAGT
* ** * **
293699 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAATTT
1 TTTTAAATCTCTTATTAATTTTAG-AATATTAAAAAATTACCAATATTTTATTTC-GAATAAGCT
** * * *
293763 TGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTACAACAAAACAAAATTCATAGCAATTT
64 CATATGAACAAAAACAATTTGTTTTACAACAAAACAAAATTCATAACAATTT
293814 CAAATAGATG
Statistics
Matches: 94, Mismatches: 18, Indels: 6
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
140 1 0.01
141 53 0.56
142 40 0.43
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (141 bp):
TTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAATATTAAAAAATTACCAATATTTTATTTCGAATAAGCTCA
TATGAACAAAAACAATTTGTTTTACAACAAAACAAAATTCATAACAATTTTAACTGGTTCGATAA
ACAAATTTAGT
Found at i:294185 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 293888--295080 Score: 748
Period size: 180 Copynumber: 6.8 Consensus size: 170
293878 TAAATCTCCA
* ** * *
293888 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAAATTCTAT-AAGT
1 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAA-C
* * * * *
293952 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
65 AAAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAGG-TAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* *
294017 GTCATAACTATTTAAACCCTCTTGGTAAACAGA-TTTATTTTT
129 GTCATAACTATTTAAA-CATCTTAGTAAACAGATTTTATTTTT
* * * * *
294059 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTA-TATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACA
1 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACA
* * *
294123 AAAACAATTGATTTATGACAAAACCAAAGGTGATAATGATTTGAAATAGACAATTCTTCAAATAG
66 AAAACAATTGATTTATGACAAAA-CAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * *
294188 TCATAACTATTTAAATGTGTTCAGAAAACATATTTACTTTTTAAATTTTT
130 TCATAACTATTTAAACATCTT-AGTAAAC--A--GA--TTTT--ATTTTT
* * * * ** *
294238 ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATGACTCTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC
* * * * *
294302 AAAACCAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGTTTTGAAATAGAAAATTGTTCAGAT
65 AAAAACAATTGA-TTTATGACAAAAC-AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
294366 AGTTATAACTATTTGAACATATTTAGTCAACAGATTCATTTTTTAGTTATCTT
128 AGTCATAACTATTTAAACAT-CTTAGTAAACAG----A--TTTTA-TT-T-TT
* * * * *
294419 ACTCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTTCAAATAAGCTTATATAAACT
1 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACA
* * * * *
294484 AAAATAATTGTTTTAT-ACAAAACAAATGGTTATTATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
66 AAAACAATTGATTTATGACAAAACAAA-GGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * *
294548 TCATGACAACTTGTTTGGAAAGCATTTTTTTTAA-A-A---T-CTTTT
130 TCAT---AAC-TATTT--AAA-CATCTTAGTAAACAGATTTTATTTTT
* * * * * ** *
294590 ACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
1 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACA
* * * *** *
294655 AAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
66 AAAA-CAATTGATTTATGACAAAAC-AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** *
294720 GTCATTAA-GATTTGAAGTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAATTATCTT
129 GTCA-TAACTATTTAAACATCTT-AGTAAACAG----A--TTTT-ATT-T-TT
* * * *
294772 ACTCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATCAACT
1 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC-
* * * * *
294837 AAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAATGGTTATTATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
65 AAAAACAATTGATTTATGACAAAACAAA-GGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *** **
294902 GTCATGATAACTTGTTTGAAA-AAC--A-TATTTATTTTTTAAATCTTTT
129 GTC---ATAAC-TATTT-AAACATCTTAGTAAACAGATTTT--AT-TTTT
* * * * * *
294948 ACTTGTTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAAC
1 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAAC
* * * * * ** * *
295012 AAAAAGAAATTGCTTTATGACGAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTGTTCAAAT
65 AAAAA-CAATTGATTTATGACAAAAC-AAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
295077 AGTC
128 AGTC
295081 TTAAAGATTT
Statistics
Matches: 803, Mismatches: 152, Indels: 129
0.74 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
166 3 0.00
167 5 0.01
168 1 0.00
169 6 0.01
170 93 0.12
171 100 0.12
172 13 0.02
173 41 0.05
174 5 0.01
175 9 0.01
176 107 0.13
177 10 0.01
178 4 0.00
179 40 0.05
180 151 0.19
181 70 0.09
182 111 0.14
183 9 0.01
184 7 0.01
185 2 0.00
186 11 0.01
187 5 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (170 bp):
ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACA
AAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTAAACATCTTAGTAAACAGATTTTATTTTT
Found at i:294376 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 294053--295198 Score: 916
Period size: 180 Copynumber: 6.4 Consensus size: 180
294043 AAACAGATTT
* * * * *
294053 ATTTTTACTTATTAACTTTT-GGAATTTTAATAAATTAGTA-TATTTTATTCCAAATAAGCTTTT
1 ATTTTTACTTATTAA-TTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* * * * * *
294116 ATGAAC-AAAAACAATTGATTTATGACAAAACCAAAGGTGATAATGATTTGAAATAGACAATTCT
65 ATGAACTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTAT
294180 TCAAATAGTCATAACTATTTAAATGTGTTCAGAAAACATATTTACTTTTTAA
130 TCAAATAGTCATAACTATTTAAATGTGTTCAGAAAACATATTTA-TTTTTAA
** * * * *
294232 ATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATGACTCT-ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGC
1 ATTTTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAAT-TAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
* * * * *
294296 ATGAA-TAAAACCAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAATGTTTTGAAATAGAAAATTGT
65 ATGAACTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTAT
* * * ** * * *
294360 TCAGATAGTTATAACTATTTGAACATAT-TT-AGTCAACAGATTCATTTTTTA
130 TCAAATAGTCATAACTATTT-AA-ATGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAA
* * * * *
294411 GTTATCTTACTCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTTCAAATAAGCTTA
1 ATT-T-TTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * ** * * *
294476 TATAAACT-AAAATAATTGTTTTAT-ACAAAACAAATGGTTATTATGATTTGAAATAGATAATTA
64 TATGAACTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTA
* * ** * *
294539 TTCAAATAGTCATGAC-----AACT-TGTTTGGAAAGCAT-TTT-TTTTAAA
129 TTCAAATAGTCATAACTATTTAAATGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAA
* * * **
294583 ATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTGT
1 AT-TTTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT
***
294648 ATGAAC-AAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAGCAATTTGAAATA-AATAATT
65 ATGAACTAAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAA-AATT
* * * * * * *
294711 GTTCAAATAGTCATTAA-GATTTGAA-GTTGTTCAGTAAACAGATTCATTTTTTA
128 ATTCAAATAGTCA-TAACTATTTAAATG-TGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAA
* *
294764 ATTATCTTACTCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
1 ATT-T-TTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* * ** * * *
294829 TATCAACTAAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAATGGTTATTATGATTTGAAATAGATAATTA
64 TATGAACTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTA
* ** *
294894 TTCAAATAGTCATGA-TA---ACTTGT-TTGA-AAAACATATTTATTTTTTAA
129 TTCAAATAGTCATAACTATTTAAATGTGTTCAGAAAACATATTTA-TTTTTAA
* * *
294941 ATCTTTTACTTGTTAATTATCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTG
1 AT-TTTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTG
* * * ** *
295005 TATGAAC-AAAAAGAAATTGCTTTATGACGAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATA-AATAAC
64 TATGAACTAAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAA-AAT
* * ** * ** * * * *
295068 TGTTCAAATAGTCTTAAAGATTTGAACT-TGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTA
127 TATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAA
** ** * ** *
295122 ATCTTTTGTTTATTAATTGTT-TTATTATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTG
1 AT-TTTTACTTATTAATT-TTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
* *
295186 TGTGAACAAAAAA
64 TATGAACTAAAAA
295199 AAAGGTTATA
Statistics
Matches: 760, Mismatches: 160, Indels: 91
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
171 60 0.08
172 20 0.03
173 46 0.06
174 8 0.01
175 9 0.01
176 115 0.15
177 13 0.02
178 7 0.01
179 47 0.06
180 153 0.20
181 145 0.19
182 131 0.17
183 6 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATTTTTACTTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA
TGAACTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAAAATTATT
CAAATAGTCATAACTATTTAAATGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAA
Found at i:295040 original size:176 final size:177
Alignment explanation
Indices: 294079--295197 Score: 899
Period size: 182 Copynumber: 6.3 Consensus size: 177
294069 TTTTGGAATT
* * * *
294079 TTAATAAATTAGTA-TATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGATTTATGACA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * * * *
294143 AAACCAAAGGTGATAATGATTTGAAATAGACAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTAA-ATGTG
66 AAACAAAAAGTCATTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT---GATTGAACTTGT-
* * * * ***
294207 TTCAGAAAACATATTTACTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATA
127 TTGA-AAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
* * * * * * *
294258 TTAATGACTCT-ATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAAAACCAATTATTTTATGAC
1 TTAATAAAT-TAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * *
294322 AAAACAAAAAGTAATAATGTTTTGAAATAGAA-AATTGTTCAGATAGTTATAACTATTTGAACAT
65 AAAACAAAAAGTCATTATGATTTGAAATA-AATAATTATTCAAATAGTCAT---GA-TTGAACTT
* ** * ** * * * * *
294386 ATTT-AGTCAACAGATTCATTTTTTAGTTATCTTACTCATTAATTTTCAGAATA
125 GTTTGA-AAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
* * * * * *
294439 TTAATAAATTAGTATTATTTCATTTCAAATAAGCTTATATAAACTAAAATAATTGTTTTAT-ACA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
** * * * *
294503 AAACAAATGGTTATTATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGA--CAACTTGTTTGG
66 AAACAAAAAGTCATTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGATTGAACTTGTTTGA
* *
294566 AAAGC--ATTT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
131 AAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
* **
294610 TTAATAAATTAATATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAGCAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-CAATTGTTTTATGAC
* *
294675 AAAACAAAAAGTCA-TA-GCAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATTAAGATTTGAAGT
65 AAAACAAAAAGTCATTATG--ATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-T--GA-TTGAACT
* * * * * * * * *
294738 TG-TTCAGTAAACAGATTCATTTTTTAATTATCTTACTCATTAATTTTCAGAATA
124 TGTTTGA-AAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
* * *
294792 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATCAACTAAAAACAATTGTTTTATTAC
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGAC
** * *
294857 AAAACAAATGGTTATTATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGA-T-AACTTGTTTG
65 AAAACAAAAAGTCATTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGATTGAACTTGTTTG
* * *
294920 AAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTGTTAATTATCAAAATA
130 AAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
* *
294968 TTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAGAAATTGCTTTATGA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-CAATTGTTTTATGA
* * ** * * *
295032 CGAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCTTAAAGATTTGAACTT
64 CAAAACAAAAAGTCATTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC---ATGA-TTGAACTT
** * ** *** *
295097 GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AATCTTTTGTTTATTAATTGTTTTATTA
125 GTTTGAAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
** * *
295149 TTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTGTGAACAAAAA
1 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
295198 AAAAGGTTAT
Statistics
Matches: 750, Mismatches: 154, Indels: 70
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
171 69 0.09
172 16 0.02
173 41 0.05
174 10 0.01
175 8 0.01
176 132 0.18
177 5 0.01
178 2 0.00
179 23 0.03
180 146 0.19
181 140 0.19
182 150 0.20
183 7 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (177 bp):
TTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACA
AAACAAAAAGTCATTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGATTGAACTTGTTTGA
AAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATA
Done.