Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168093.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_34, whole genome shotgun sequence
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Warning! 5000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 4 of 7
Found at i:291889 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 290466--291940 Score: 1031
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290456 AACAAAATTA
* * *
290466 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTACTTGGCATAAGTTTGA-ATGA
1 TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTGAATAAGCTT-ATATGA
* * * *
290530 ACAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATGCCATAAC-AGTTTGAAATATAA-AATTATTCA
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* *
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126 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCG-TAAACA-ATATTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
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1 TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * *
290711 CT-GATACAATTGCTTGATGACGAAACAAAAAGTCATAAGGATTTGAAATAGATAATTATTCAAT
64 -TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* * * * * *
290775 TAGTTATGACTATATAAACTTGTTTGGTAAAC-ATACTTA-TTTTTAGAATCTT
128 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGTAAACAATA-TTATTTTTTA-AATCTC
* * * * * *
290827 TTACTTATTAAGTGTTGAATTATTAATTAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA
1 TTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAA
* * * *
290892 TA-AGAACAATTGTTTTATGA-GAAA-AAAA--TTATAATGATTTCAAATAAATAAATT-TTCAA
64 TAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAT-AATTATTCAA
* * * * *
290951 ATAGTCATAACTATTTAAACTT-ATTCGATAAATAA-ATTTACTTTTTAAATCTT
127 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCG-TAAACAATA-TTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
291004 TTACTTATTAATTGTTTGAATATTGATAAATT--TA-T-TTTTAATTGAAATAAGTTTGTATGAA
1 TTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTG-AATAAGCTTATATGAA
* * * * * * ** *
291065 TAGAAAAAATTATTTTATAAAAAAACAAAAGG-CTACAACAATTTGAAATAGGTAATTAATCAAA
64 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* * * * *
291129 TAGTTATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAGA-GTCAGTTTTTAAA--T-
128 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTC-GTAAACA-ATATTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * *
291178 AT-CTTATTAATTTTTGAACTACTAATAAATTAAAATTATGTTATTTCGAATAAGCTTGTACGAA
1 TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-GAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * *
291242 TAGAAACAATTATTTTCTAACAAAACCAAGGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAC
64 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* ** **
291307 AGTAATAACTA-TTG-ACATTGGTTAGGCCAAC-ATATTCATTTTTTAAATC-C
129 AGTCATAACTATTTGAAC-TT-GTTTCGTAAACAATATT-ATTTTTTAAATCTC
* ** * ** * *
291357 ATTACTTATTAATTTTCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATGAGAC-TATATC
1 -TTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TGAATAAG-CTTATATG
* *
291421 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
62 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAA
* * * * * * *
291486 ATTGTTATAACTAATT-AAATTGGTTTAGTAAATAGAT-TTATGTTTTAAA--TC
127 ATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTCGTAAACA-ATATTATTTTTTAAATCTC
* * *
291537 -T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAACAAACTTATATGAA
1 TTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * *
291600 AAAAAAC-ATT-TTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTAAAATAGATAACTATT-AATA
64 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAA-A
* * * * * *
291662 TAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTT-GGAAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTC
128 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGTAAACAATA-TTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
291714 TTAGTTATTAATTTTCTTAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAA
1 TTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TGAATAAGCTTATATGAA
* * * * * * * *
291779 CATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTGAAAT
64 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* * * * *
291844 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTTCTTATACAATATTGTTTTTTAAATTTC
129 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGTAAACAATATTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
291895 CTACTCATTACGTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTATTATATTATTT
1 TTACTTATTA-ATTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
291941 CCAATGGGCT
Statistics
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0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
172 6 0.01
173 56 0.06
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175 78 0.08
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178 22 0.02
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183 2 0.00
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TTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAATAAGCTTATATGAATA
GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTTGTTTCGTAAACAATATTATTTTTTAAATCTC
Found at i:292003 original size:81 final size:80
Alignment explanation
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291877 TATTGTTTTT
* * *
291887 TAAATTTCCTACTCATTACGTTTTGAAATATTAAAAATTAGTATTATATTATTTCC-AATGGGCT
1 TAAATTTCCTACTCATTAAGTTTTGAAATATTAAAAATTAATATTAT-TTA-TTCCAAATAGGCT
291951 TATACGATGAACAACAC
64 TATACGATGAACAACAC
*
291968 TAAATTTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAAAAATTAATATTATTTATTCCAAATAGGCTTA
1 TAAATTTCCTACTCATTAAGTTTTGAAATATTAAAAATTAATATTATTTATTCCAAATAGGCTTA
*
292033 TATGATGAACAACA
66 TACGATGAACAACA
292047 ATTGTTTTAT
Statistics
Matches: 73, Mismatches: 5, Indels: 3
0.90 0.06 0.04
Matches are distributed among these distances:
79 4 0.05
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TAAATTTCCTACTCATTAAGTTTTGAAATATTAAAAATTAATATTATTTATTCCAAATAGGCTTA
TACGATGAACAACAC
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292976 TAACTATTAG
* * *
292986 ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCA-ATAAATAGA-TT-TTTTTTAATTATCTTACTCATTAA
1 ATAGTCATAACTATTAGAACTTATT-AGATAAACAGATTTATTTTTTAA--ATC--ACTTATTAA
* *** * * *
293048 TTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTACAT-CAAATAAGCTT-ATATGAACTAAAACAA
61 TTGTCAAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCCAAATAAGCTTGA-ATGAACAAAAACAA
* * * * *
293111 CTGCTTTACT-ACATAA-AAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATTACTTAA
124 CTGCTTTA-TAACAAAATAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTACTAAA
* * * *
293164 ATAGTCAT-ATTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
1 ATAGTCATAACTATTAGAACTTATT-AGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTAA
* * * *
293227 TTGTCAAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGAATGAACAAAAACTATT
61 TTGTCAAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAACT
* * **
293292 GTTTTATAACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGGTAAA
126 GCTTTATAACAAAATAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTACTAAA
* * * *
293344 ATAGTCATAACTATTAGAACTTATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTT
1 ATAGTCATAACTATTAGAACTTATTAGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCACTTATTAATTGTC
* * * *
293409 GAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTA
66 AAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTA
293437 TTTTGAACAA
Statistics
Matches: 224, Mismatches: 38, Indels: 23
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
177 60 0.27
178 13 0.06
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180 40 0.18
181 34 0.15
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AAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGAATGAACAAAAACAACTGCTTT
ATAACAAAATAAAAAGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTACTAAA
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292976 TAACTATTAG
* *
292986 ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAATAGA-TT-TTTTTTAATTATCTTACTCATTAAT
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAATAAATAGATTTATTTTTTAA--ATC-TACTTATTAAT
* * **
293049 TTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTACA-TCAAATAAGCTTATATGAACT-AAAACAAC
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* * * *
293112 TGCTTTACTACATAAAAAAGGTCAGAATAATTTGAAATAGATAATTACTTAA
126 TGTTTTA-TACA-AAAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTACTAAA
* * * * * *
293164 ATAGTCAT-ATTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAATC---TACTTATTAAT
* ** * * * * *
293228 TGTCAAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATATGCTTGA-ATGAACAAAAAC-TAT
63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTT-ATATGAATAAAAACAT-T
* * **
293291 TGTTTTATAACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGGTAAA
126 TGTTTTAT-AC-AAA-AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTACTAAA
* *
293344 ATAGTCATAACTATTAGAACTTATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-ACTTATTAATTTT
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTT
* * * ** * *
293408 TGAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTT
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAATAAAAACATTTGTTT
*
293473 TATGACAAAACGAAAGGTCATAATTATTTGAA
131 TAT-ACAAAA--AAAGGTCATAATAATTTGAA
293505 CTGGTTAGGT
Statistics
Matches: 272, Mismatches: 53, Indels: 33
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 4 0.01
177 106 0.39
178 13 0.05
179 74 0.27
180 40 0.15
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TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGAATAAAAACATTTGTTT
TATACAAAAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTACTAAA
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293479 AAAACGAAAG
* ** * *
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1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * * *
293549 TTCAAATATTAATAGATTCA-TTTTATATTATTCCTAATAAGCTAGTATGAACTGAAAAAATTAT
65 TTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGT
* * * *
293613 TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
** * * *
293666 GTGTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTGAATCTCTTAGTTATTAATTTA
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * *
293731 TGAAATATT-ATTGATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTTTATGAACAGAAATAATTTTTT
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAA-TTGTT
* * * * * * *
293795 TTATTATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTATTCAAATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* ** * * * * * *
293847 ATCATAACTATTCAAACCGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * ** * *
293912 TGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATTAAAAATAATTGTTA
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTT
* * * * *
293977 TATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATA
131 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * ** * * * *
294028 GCCATAATTATTTGAA-TCGATT-TGCTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTGATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACT-GGTTCAAC-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
***
294091 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAAGCTTGTATGAATTTAAATAATTG
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTG
* * * *
294155 TTTGATGATAAAACAAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGACAATTGTTCCAATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * ** * *
294209 GTCATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTATTGCTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * *
294273 TTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTT-TGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTG
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAAC-AGAAATAATTG
* ** * * * *
294336 TTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* **** * *
294390 GTCCTAACTATTT-AGACAT--TTTGGTAAACAAATTTATATTTTCAAA-CTTTTACTTATTAAT
1 GTCATAACTATTTGA-AC-TGGTTCAACAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * *
294451 TTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTT-TGAATAAGCTTGTAAGATA-TGAAACAAA
63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGA-ACAGAAATAAT
* * * * * * *
294513 TATTTTATGACTAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAAAAATTATTCTAATA
126 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * * *** * * *
294569 GT-TTAACTGTTAGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATGTCTTATTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * ** * * ** *
294633 T-AGAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTA-ACCAAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGTT
66 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTT
* * * *
294696 TTATGACAAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATA
130 TTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * ** * * * * *
294749 GTCATAATTATTTTAACTGAGTT-AGTAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTCAATAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTG-GTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * * * * * * *
294813 AGGAAATACTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCATCTAAACTTGTATCAGCTGTAACAATTGT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGT
* *** * ** * * *
294877 TTTA-AATCTTTTACTTGTTAATTATCTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATT
129 TTTATGA-C-AAAAC-----AA-AAGGTCA-T---AACAA-TTTG-A--AATAG--ACAATTA--
*
294941 TTCTAACAAAACCAAA
174 -T-T--C--AA--ATA
* * * * * * * * * *
294957 GGTCATAACAATTTGCATTGG-TCAGGCCAACAGATTCATTTTTGAAATAC-ATTATTTATTAA-
1 -GTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTATTAAT
* * * * *
295019 TTTTCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTT-TGAATAAGATTGTATCAATAGAAATAGA
63 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTG--T--AT-G-AACAGA
* ** ** ** * * * *
295083 AACAAAAGTTTTATGACAAAACAAATTGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATT
120 AATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * * ** * *
295145 GTTATAACTAATTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
295205 TGAAAATATTAATAAATTAATATTTTTTTAATTT-GAACAAACTTATATGAACA-AAA-ACATTT
66 TG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATA-ATTG
* * *
295267 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAA-TTAAAATAGATAATTATTCATATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * * * *
295321 GCCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGA-AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
295385 TCT-TAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTA
65 T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTG
* * * * ** * * * *
295448 TTTTATGATAAAGCTAAAGGTTATAATGATTTGAAACATATAATTGTTCAAATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * **** * * * * * * *
295502 GTCATAGCTATTTGAATTGGTTTGGTAGACTATTTTGTTTTTTAAATTTCCTACTCATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * ** ** *
295567 TGAAATATTAA-AAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAGGCTTATATGATGACCAACAATTGTT
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTT
* * * * *
295630 TTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATG
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * * * * * *** **
295682 GCCATAATTTTTTGAATTGATTCTATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTT
* * * ** * ** * *
295746 TTGATATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-GGATAAG-TATTTATGAATTGAAACAACTGT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCT-TGTATGAACAGAAATAATTGT
*** ** * *
295809 TTTATTTTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGTTCAAATA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAA---TT---A--TTCAAATA
* * * * * * * * * *
295870 GTCTTGACTGTTTGAATTTGTTCAATAAACAGA-TT-TTTTTT-AATTTCCTGCTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * * * * *
295932 TTG-AATGTTAATAGAA-TAATATT-TTTT-TTTCAAATAAGCATGTATGAACTA-AAACAATTA
65 TTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAATAATTG
* * * * ** * *
295992 TTTTATGTCTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * * *
296046 GTCTTAACTATTTGAACTGCTT-AGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT
** * * * * * * *
296110 TTTAGAAATATTAAATTAGTTTAGCAATATTTTA-CTCTAAATAAGCTTATATGAATAAAAACAA
64 TTT-GAAATATT-AA-TAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAA
* **
296174 TTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAAC-ATTTGAAGAT-GATCAATTGGCTC-AATA
125 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA-ATAGA-CAATT-ATTCAAATA
* * * * * * * *
296230 GTCATAGCTATTTAAACAGATCCAATAAAC-AATTTAGTTTTTAAATCT-TTA-TTA--ACTTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * ** * * *
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66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTT
* * * * * * *
296351 TTAATGACAAAACAAAATGTCATAACAAATTCAAAAAAATAATTGTTC-AATA
130 TT-ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
*** * * * * *
296403 GTCAT-AC--TTTGAACTCACTCGATA-AAATATCATTTATTATTTAAAAACCTTTTACTTATTA
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTC-A-ACAAACA-AATTTATT-TTT-TAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
296464 ATTTTCTGAAA-AATAATAATTTTA-TATTATTTT-TTTCAAAATTAGCTTGCATGAACTG--AT
61 ATTTT-TGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTC-TAATAAGCTTGTATGAACAGAAAT
* ***** * * * *
296524 -A------TATGACAAAACAAAAGGTCTTTTTGTTTTGAAATAGATAACTATTTAGATA
123 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* ** ** * *
296576 GTCACAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTA-TTCATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATT
* * ** * ** * *
296639 TTTGGAATATTAATAAATTAGTACTATTTTACATCAAATAAGCTTACATGAAACTGAAACAATTG
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATG-AACAGAAATAATTG
* * * * * **
296704 TTTTACT-ATAAAA-GAAAGGTCAGT-ACATAATTGAAATAGA-TATTACTCTGACTCTA
128 TTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCA-TAACA-ATTTGAAATAGACAATTA-T-TCA-AATA
* * ** * *
296760 GTCATGACTA-TTGAA-T--TTTAGTAAA-ATATTTTATATTTTTAAAT-TATTTACTTATTAAT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACA-AATTTAT-TTTTTAAATCT-CTTACTTATTAAT
* ** * * * * *
296819 TGTAAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTA-ATCTAAATATGCTTGTATGAACAAAAACT-AT
63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCT-AATAAGCTTGTATGAACAGAAA-TAAT
** * * * * *
296882 TGTTTTAAAACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTACTCAAATA
126 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* ** * * * *
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1 GTCATAACTATT-TGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * * * * * * * * * *
296998 TCAAAATATCAGTAGATTAGCATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTT
** * *
297063 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * ** *
297115 GTCATAATTATTTGAA-TTGTTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * * ** *
297175 TTCAAATATTAATAGATTCA-TTTTGTGTTATTCCTAATAAACTAGTATGAATTGAAAAAATTGT
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* ** * *
297239 TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGTTAATTGTTCATATA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * ** * *
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1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
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66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAAT-TGTT
* * * * *
297421 TTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGT-GTACAATTGTTCAAATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG-ACAATTATTCAAATA
* ** * * ** * *
297473 GTTATAACTATTCAAATTGGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
297538 TGAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTGT-AATTAAAAACAATTGT
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* * * ** * * * *
297600 TGTATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTGAAATA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * * * * * * * * * * * *
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1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAAC-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * ** *
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* * * * *
297782 TTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAGAGACAATTGA-TCCAATA
130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATT-ATTCAAATA
* * * ** * *
297834 GTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTATTGCTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * ** * *
297898 TTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTT-TGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTAT
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* * * * *
297962 TTTGTGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAAATA
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * **** * *
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1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-CTTATTAA-T
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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** ** *** * *
298193 GTTTTAACTATTTGAACCAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * *** * *
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* * * * *
298321 TTTATGACAAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATG
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* * *** * * * *
298375 GTCATAACTATTTTAAATGAG-TCGGTAAACAAATTTGTTTTTTAAATTTTTTACTTAATAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTG-GTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * * ***** *
298439 AGGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTCCATCTAAACTTGTATTTGTTGAAAAAATTGT
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* * * * *
298503 TTTATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATA
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* ** ** * * * *
298556 AT-ATTAACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGATTTTTAAATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATT
1 GTCA-TAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACA-A-ATTT--ATTTTTT-AAATCTCTTACTTATT
* * *
298620 AATCTTTTG-AATGTTAATAAAGTAGTATTAATTTA-TTCTAAGTAAGCTTGTATGAACTA-AAA
60 AAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAA-TAAGCTTGTATGAAC-AGAAA
* * * * ** * * * *
298682 CAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTTTTCTAATA
122 TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTATTCAAATA
* * ** * * * *
298742 GTCTTAACCATTTGAACTAATTCGATAAATGAAA-TTA-TTTTTAAA--TCTTACTTATTCATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
298803 TTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACAATTGTT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTT
* * * ** *
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130 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAATAGACAATTA-TTCAAATA
* * * * * * * **
298920 GTCTTAACTACTTGAATTGGTTCAGC-AACTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAACAAAC-AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT
298984 TTTG-AATATTA
64 TTTGAAATATTA
298995 TTTTATTTCA
Statistics
Matches: 4094, Mismatches: 972, Indels: 522
0.73 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
170 8 0.00
171 13 0.00
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196 5 0.00
198 10 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
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293479 AAAACGAAAG
* * * * * *
293489 GTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTT-AA-A--TTTCTTACTAATTTT
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* * * * * * * * * *
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66 TGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAAAAACAATTGT
* * * **
293613 TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTGTTAACTATT
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* ** * * *
293678 TGAA-CTGGTTCAAC-AAACAAATTTATTTTTTGAATCTCTTAGTTATTAATTTATGAAATATT-
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** * ** * * * *
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* * * * * *
293804 AACAAAATGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTATTCAAATA
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* ** *
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1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTTT
* * *
293912 TGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATTAAAAATAATTGTTA
66 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTGTTT
* * * * * *
293977 TATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTAAAATAGCCATAATTATTTG
131 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
294042 AATCGATTTGCTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAA
196 AATCGATTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * *
294107 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTTAAATAATTGTTTGATGATAAAACAAA
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294172 AGGTCATAACAACTTT-AAATAGACAATTGTTCCAATA
326 AGGTCATAACAA-TTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
* * * *
294209 GTCATAACTATTTGAATTTGTTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTA--TTGCTTATTAAT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAAATTTA-TTTTTTAAA-TATCTTTCTTATTAAT
* *** * *
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63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAAAAACAATT
* * * * *
294335 GTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCCTAACTA
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
294400 TTT-AGA-C-ATTTTGGTAAACAAATTTATATTTTCAAA-CTTTTACTTATTAATTTTTG-AATG
192 TTTGA-ATCGA-TTTGCTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * *
294460 TTAATAAATTTGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGAC
254 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGA-
* * * * * *
294524 T-AAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAAAAATTATTCTAATA
317 TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
* * * * * ** * * *
294569 GT-TTAACTGTTAGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATGTCTTAT-TTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTT-TCTTATTAATTT
* * ** * *
294632 TT-AGAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTA-ACCAAATAAGCTTCTATGATTAGAAACAATTGT
65 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTGT
* ** *
294695 TTTATGACAAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCATAATTAT
129 TTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * ** *
294760 TTTAA-CTGAGTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTCAATAATTTAGGAAATACT
193 TTGAATC-GA-TTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
** ** * * ** * * *
294823 AATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAACTTGTATCAGCTGTAACAATTGTTTTAAAT-CTT
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT--ATGATA
** * ** * * * *
294887 TTACTTGTTAATTATCTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTCTAACAA-A
319 AAAC-----AA-AAGGTCA-T---AACAA-TTTG-A--AATAG--ACAA-T-TGTTC---CAATA
** * *** * * * **** *** * **** *
294951 ACCA-AAGGTCATAACAATTTGCATT-GGTCAGGCCAACAGATTCATTTTTGAAATACATTAT-T
1 GTCATAA-CT-ATTTGAA-CTG-GTTCGAT-AAATAAATTTATT-TTTTAAATAT--C-TT-TCT
* * * ** *
295013 TATTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGATTGTATCAATAGA
56 TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG--T--AT-G-
* * ** ** * *
295077 AATAGAAACAAAAGTTTTATGACAAAACAAATTGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
114 ATTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * *
295142 ATTGTTATAACTAATTGAATTGGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA
179 ATAGTCATAACTATTTGAATCGATTT-GCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * * * ***
295202 -TTTTGAAAATATTAATAAATTAATATTTTTTTAATTTGAACAAACTTATATGAACAAAAAC-AT
243 TTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAT
* * * * *
295265 TTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAA-TTAAAATAGATAATTATT-CATATA
307 TGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAAC-AATTTGAAATAGACAATTGTTCCA-ATA
* * * * ** *
295321 GCCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGA-AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGG-TTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTT
* * * * ** * *
295385 TCT-TAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTA
65 T-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTG
* * * * * * * *
295448 TTTTATGATAAAGCTAAAGGTTATAATGATTTGAAACATATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTAT
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * * *
295513 TTGAATTGGTTTGGTAGACTATTTTGTTTTTTAAATTTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAA
193 TTGAATCGATTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * *
295578 -AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATG-A-TGACCAACAATTGTTTTATGACAAA
258 TAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGA--AACAATTGTTTTATGATAAA
* * * * *
295640 ACAAAAGTTCATAATAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATG
321 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
* * * * * * ** * ***
295682 GCCATAATTTTTTGAATTGATTCTATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATT-AATTT
* * * ** * * *
295746 TTGATATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-GGATAAG-TATTTATGAATT-GAAACAACTG
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*** * *
295808 TTTTATTTTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTCA-AA-TA
128 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTA
* * * * * *
295870 GTCTTGACTGTTTGAATTTGTTCAATAAACAGA-TT-TTTTTT-AATTTCCTGCTTATTAATTTT
192 -T-TTGA---ATCG-ATTTG--C--TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * * * * * *
295932 TTG-AATGTTAATAGAA-TAATATT-TTTT-TTTCAAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTAT
246 TTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGT
* * * ** * * *
295993 TTTATG-TCTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATA
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* * * ** * * *
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** * * * * *
296111 TTAGAAATATTAAATTAGTTTAGCAATATTTTA-CTCTAAATAAGCTTATATGAATAAAAACAAT
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* *
296175 TGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAAC-ATTTGAAGAT-GATCAATTGGCTC-AATAGTCATA
126 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGAT-AATT-GTTCAAATAGTCATA
* * **** * * *
296236 GCTATTT-AAACAGATCCAATAAAC-AATTTAGTTTTTAAATCT-TTA-TTA--ACTTTTTG-GA
188 ACTATTTGAATC-GATTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * ** * *
296294 TATT-ATAAAATAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTAT-AAATAAAACAATTGTTTTAATG
252 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTT-ATG
* * * * * * *
296357 ACAAAACAAAATGTCATAACAAATTCAAAAAAATAATTGTT-CAATA
316 ATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
*** * * * *
296403 GTCAT-AC--TTTGAACTCACTCGATAAAATATCATTTATTATTTAAAAACCTTTTACTTATTAA
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAT-AAATA-AATTTATTTTTTAAATATC-TTT-CTTATTAA
* * * *
296465 TTTTCTGAAA-AATAATAATTTTA-TATTATTTT-TTTCAAAATTAGCTTGCATG------AAC-
62 TTTT-TGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGATTAAAAACA
* * * *** * * * * * *
296520 --TGATATATGACAAAACAAAAGGTCTTTTTGTTTTGAAATAGATAACTATTTAGATAGTCACAA
124 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * *
296583 CTATTTGAA-CTTATTCAG-TAAACAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTA-TTCATTAATTTTTGG
189 CTATTTGAATC-GATT-TGCTAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTGA
* ** * ** *
296644 AATATTAATAAATTAGTACTATTTTACATCAAATAAGCTTACATGAAACTGAAACAATTGTTTTA
250 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATG-AATTGAAACAATTGTTTTA
* * * * * **
296709 CT-ATAAAA-GAAAGGTCAGT-ACATAATTGAAATAGA-TATTACTCTGACTCTA
314 -TGATAAAACAAAAGGTCA-TAACA-ATTTGAAATAGACAATT-GT-T-CCAATA
* * * * *
296760 GTCATGACTA-TTGAA-T-TTTAG-TAAA-ATATTTTATATTTTTAAATTAT-TTACTTATTAAT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATA-AATTTAT-TTTTTAAA-TATCTTTCTTATTAAT
* ** * * * * ** *
296819 TGTAAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTA-ATCTAAATATGCTTGTATGAACAAAAACTATT
63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATT
** * * * * * **
296883 GTTTTAAAACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTACTCAAATAGTCATAACTA
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * **
296948 TTAT-AACTTG-TTTGATAAATAGATCTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATAT
192 TT-TGAA-TCGATTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * * * * ** * *
297007 CAGTAGATTAGCATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAA
255 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAA
** * *
297072 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
* * * * * * *
297115 GTCATAATTATTTGAATTGTTTAGGTAAACAAAATTATTTTTT-AA-ATC--TCTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTTT
* * * * * * * * * *
297176 TCAAATATTAATAGATTCA-TTTTGTGTTATTCCTAATAAACTAGTATGAATTGAAAA-AATTGT
66 TGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAAAAACAATTGT
* * * * *
297239 TTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGTTAATTGTTCATATAGTCTTAACTATT
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
297304 TGAA-CTAGTTTGAC-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTA
194 TGAATCGA-TTTG-CTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * ** * *
297367 TTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTACGAACAGAAATAATAT-TTTTATGATAGA
257 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAT-TGTTTTATGATAAA
* * *
297431 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGT-GTACAATTGTTCAAATA
321 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG-ACAATTGTTCCAATA
* ** * * *
297473 GTTATAACTATTCAAATTGGTT-TAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTT
* *
297537 TTGAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTGTAATTAAAAACAATTGT
65 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTGT
* * * * * * * * *
297600 TGTATGACCAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAACTGTTGAAATAGCCATAATTTTT
129 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * * *
297665 TTAATTGATTAGCTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAAT
194 TGAATCGATTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * *
297730 TAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGATAAAACA
259 AAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACA
* * * *
297795 AAAGGTCATAACGATTTTAAAGAGACAATTGATCCAATA
324 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
* * * * *
297834 GTCATAACTATTTGAATTTGTT-TAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTA--TTGCTTATTAAT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAAATTTA-TTTTTTAAA-TATCTTTCTTATTAAT
* * *** * *
297896 TTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATT-GAAACAATT
63 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-ATTAAAAACAATT
* * * * * * *
297960 ATTTTGTGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
298025 TTTAAACTTG-TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCT-TTAGCTTATTAATTTTTTG-AAT
192 TTTGAA-TCGATTTGCTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA-CTTATTAA-TTTTTGAAAT
* * * * * * * * *
298087 -GT-A-AATTTA-CATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGA
253 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
298147 CT-AAACAAAAGGTCCTAATAATTTGAAATAAAAAATTATTCTAATA
317 -TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
** ** * ** * * * * *
298193 GTTTTAACTATTTGAACCAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTTT
* ** * ** *
298258 T-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACTAAATAAGCTTCTATGATTGGAAACAATTAT
66 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTGT
* ** *
298321 TTTATGACAAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATGGTCATAACTAT
129 TTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-
* * * * * * * * **
298386 TTTAAAT-GAGTCGGTAAACAAATTTGTTTTTTAAATTTTTTACTTAATAATTTAGGAAATATTA
192 TTTGAATCGATTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* ** ** * *** * * *
298450 ATAAATTAGCATTATTTTATTCCATCTAAACTTGTATTTGTTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAT
257 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAA
* * * *
298515 CAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATA
322 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
* ** * * *
298556 AT-ATTAACTATTTGAACTTATTTGATAAATAGATTTTTAAATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATT
1 GTCA-TAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATA-A-ATTT--ATTTTTT-AAATATCTTTCTTATT
* * * * *
298620 AATCTTTTG-AATGTTAATAAAGTAGTATTAATTTA-TTCTAAGTAAGCTTGTATGAACT-AAAA
60 AAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG-ATTAAAAA
* * * * * * * *
298682 CAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTTTTCTAATAGTCTT
122 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
298747 AACCATTTGAA-CTAATTCGATAAATGAAA-TTA-TTTTTAAA--TCTTACTTATTCATTTTTGA
187 AACTATTTGAATC-GATTTGCTAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * * ** *
298807 AATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAACAATTGTTTTCT
250 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTAT
* * * ** *
298871 GACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTGAAAATTGATTATAGTT-CATATA
315 GATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG-AAATAGACAATTGTTCCA-ATA
* * * * * * *
298920 GTCTTAACTACTTGAATTGGTTC-AGCAACTAGATTTATTTTTT--A-AT-TTTCTTGGTT-A--
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTT-ATTAATT
* * * ** * * ** **
298977 -TT-AAGT-TT--T---TGAATATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATAAACAAAATTAATTGT
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTGT
* * * * * * * * * * * *
299034 TTGATGATAAAATAAAAAGGTTATAATGTTTTGAAACAGTTAATTATTAAAATAGACAAAACTAT
129 TTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
299099 TTGAAAT-GGTTTGATAAACAGATTT-TCATTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCT-AAATAT
193 TTG-AATCGATTTGCTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATAT
* * * * * * * *** * *
299161 TAATAAATTAGTGTTATTTTCTTTGAAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTAAGACAA
255 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAA
* * ** ** *
299226 AACAAAAAGTAATAATGATTTGAAATTTA-AA-TGTTCAAATA
320 AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
* * * * * * * *
299267 GTTATAATTATTTGAACTAGTTC-ATTAAATAGAA-TTATTTTATAAATCTCTTACTTATAAATA
1 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATA-AATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATT
* * * * *
299330 TTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCAATTAAGCTTGTATG-TGCT-AAAATAATT
64 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAT--TAAAAACAATT
* * * * * * * *
299393 ATTTTATAACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTG
127 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
299458 TTTGAA
192 TTTGAA
299464 ATGGTTCCAC
Statistics
Matches: 4245, Mismatches: 1058, Indels: 627
0.72 0.18 0.11
Matches are distributed among these distances:
344 1 0.00
345 53 0.01
346 89 0.02
347 69 0.02
348 13 0.00
349 61 0.01
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352 10 0.00
353 82 0.02
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360 384 0.09
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362 595 0.14
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371 2 0.00
372 6 0.00
373 4 0.00
374 4 0.00
376 9 0.00
378 4 0.00
379 3 0.00
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381 2 0.00
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383 4 0.00
384 7 0.00
385 5 0.00
386 8 0.00
387 3 0.00
389 7 0.00
390 36 0.01
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392 45 0.01
393 2 0.00
394 1 0.00
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397 20 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (362 bp):
GTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATATCTTTCTTATTAATTTT
TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATTAAAAACAATTGTTT
TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
AATCGATTTGCTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
ATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAA
AGGTCATAACAATTTGAAATAGACAATTGTTCCAATA
Found at i:295725 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 295090--299494 Score: 1702
Period size: 181 Copynumber: 24.6 Consensus size: 181
295080 AGAAACAAAA
* * * **
295090 GTTTTATGACAAAAC-AAATTGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACT
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGT-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACT
*
295154 AATTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAA-TTTTGAAAATAT
65 ATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTG-AAATAT
* * * * *
295214 TAATAAATTAATATTTTTTTAATTTGAACAAACTTATATGA--ACAAAAACATT
129 TAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATGACAAACA-ATT
* * * * * * * *
295266 TTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTA
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * * * * * *
295331 TTTGAACTGGTTTAGAAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTCT-TAATATT
66 TTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT-TGAAATATT
* * * * * ** * *
295395 ATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT
130 AATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATGACAAACAATT
* * * * * * * *
295447 ATTTTATGATAAAGCTAAAGGTT-ATAATGATTTGAAACATATAATTGTTCAAATAGTCATAGCT
1 GTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACT
* * * * * *
295511 ATTTGAATTGGTTTGGTAGACTA-TTTTGTTTTTTAAATTTCCTACTCATTAATTTTTGAAATAT
65 ATTTGAATTGGTTTAGTA-AATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * *
295575 TAA-AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATGATGACCAACAATT
129 TAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATGACAAACAATT
* * * * *
295627 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATGGCCATAATTT
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * * *
295692 TTTGAATTGATTCTA-TAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGATATAT
66 TTTGAATTGGTT-TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATT-AATTTTTGAAATAT
* * * *
295755 TAATAAAGTAATATTATTTTA-TTTGGATAAG-TATTTATGAATTG--AAACAACT
129 TAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TATATG-A-TGACAAACAATT
*** * * *
295807 GTTTTATTTTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTCAAATAG
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--C-CATA-
* * * * * * *
295871 TCTTGACTGTTTGAATTTGTTCAATAAACAGA-TT-TTTTTT-AATTTCCTGCTTATTAATTTTT
62 -----ACTATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT
* ** * *
295933 TG-AATGTTAATAGAA-TAATATT-TTTT-TTTCAAATAAGCATGTATGA--ACTAAAACAATT
121 TGAAATATTAATA-AATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATGAC--AAACAATT
* * * * * * * *
295991 ATTTTATGTCTAAACAAAAGGTT-AGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACT
1 GTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACT
* * * * * *
296055 ATTTGAACT-GCTTAGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTTAGAAAT
65 ATTTGAATTGGTTTA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTT-GAAAT
** ** * * * * *
296119 ATTAAATTAGTTTAGCAATATTTTACTCTAAATAAGCTTATATGAAT-AAAAACAATT
127 ATT-AA-TAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG-ATGACAAACAATT
* * * * *
296176 GTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA-CATTTGAAGAT-GATCAATTGGCTC-AATAGTCATAG
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAA-ATAGAT-AATT-GTTCAAATAGCCATAA
* ** * ** * * * *
296237 CTATTTAAACAGATCCAATAAACA-ATTTAGTTTTTAAA--T-CT--TTATTAACTTTTTG-GAT
63 CTATTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTTGAAAT
* * * * ** * *
296295 ATT-ATAAAATAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATAAAT-A-AAACAATT
127 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATAT-GATGACAAACAATT
** * * * * *
296348 GTTTTAATGACAAAACAAAA-TGTCATAACAAATTCAAAAAAATAATTGTTC-AATAGTCAT-AC
1 GTTTT-ATGACAAAACAAAAGT-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAAC
* *** * * * * **
296410 --TTTGAACT-CACTCGATAAAATATCATTTATTATTTAAAAACCTTTTACTTATTAATTTTCTG
64 TATTTGAATTGGTTTAG-T-AAATA-GATTTATT-TTT-TAAATCTCCTACTTATTAATTTT-TG
* * * * ** ** *
296472 AAA-AATAATAATTTTATATTA-TTT-TTTTCAA-AA--TTAGCT--TG-C-ATGAACT
123 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATGACAAACAATT
* * * * ** * * * * * * *
296521 GATATATGACAAAACAAAAGGTCTTTTTGTTTTGAAATAGATAACTATTTAGATAGTCACAACTA
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * * * * *
296586 TTTGAACTT-ATTCAGTAAACAGATTCT-TTTTTTAATTCTCTTA-TTCATTAATTTTTGGAATA
66 TTTGAA-TTGGTTTAGTAAATAGATT-TATTTTTTAAATCTCCTACTT-ATTAATTTTTGAAATA
* * ** ** * *
296648 TTAATAAATTAGTACTATTTTACATCAAATAAGCTTACATGA-AACTGAAACAATT
128 TTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATGAC--AAACAATT
* * * * * * ** *
296703 GTTTTACT-ATAAAA-GAAAGGTCAGTACAT-AATTGAAATAGAT-ATTACTCTGACTCTAGTCA
1 GTTTTA-TGACAAAACAAAAGTTCA-TA-ATGATTTGAAATAGATAATT-GT-TCA-AATAGCCA
* * ** * *
296764 TGACTA-TTGAA-T--TTTAGTAAAATA-TTTTATATTTTTAAAT-TATTTACTTATTAATTGTA
60 TAACTATTTGAATTGGTTTAGT-AAATAGATTTAT-TTTTTAAATCT-CCTACTTATTAATTTTT
* * * * * * * ** * *
296823 AAAATATTAATAAATAAATATTATTTTAATCTAAATATGCTTGTATGAACAAAAACTATT
122 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGATGACAAACAATT
** * ** * * ** *
296883 GTTTTAAAACAAAATAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAAAAAATTACTCAAATAGTCATAACT
1 GTTTTATGACAAAA-CAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACT
* **
296947 ATTAT-AACTT-GTTT-GATAAATAGATCTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTCAAAAT
65 ATT-TGAA-TTGGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * ** ** * * * *
297005 ATCAGTAGATTAGCATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAAT-AAAAACATTT
127 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG-ATGACAAACAATT
* * *
297060 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTA
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * * *
297125 TTTGAATT-GTTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTTCAAATATT
66 TTTGAATTGGTTTA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * * *
297185 AATAGATTCATTTTGTGTTATTCCT-AATAAAC-TAGTATGAATTGA-AAA-AATT
130 AATAAATTAATATTATTTTATT-TTGAATAAGCTTA-TATG-A-TGACAAACAATT
* * ** * * * *
297237 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGTTAATTGTTCATATAGTCTTAACTA
1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * * * * ** *
297302 TTTGAACTAGTTT-GACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTGAAATATT
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* * * ** * * ** * *
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* * ** * * **
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTA
* * *
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* * * * * * * * *
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*** * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * ** * * * * ** * **
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** ** * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * *
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* ** * * *
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* ** * ** *
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* * * ** * * * * * *
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1 GTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACT
* * * * * * * **
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* ** ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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Statistics
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*
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* * * ** * *
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* * * * *** *
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* * * * * * * * *
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** * * * ** *
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* * * * * * * * * *
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* ** * * * * ** * ** * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * * ** * *
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* * *** * * ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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** * * * ** * * *
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*** * ***
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* * * * ** * * * *
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** * * ** *
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* * * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * *
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** * ** * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** ** * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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**** * * * *
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* *** * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * ** *
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* **** * * * *
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* * * * * **
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** * * *** * * * *
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298535 AAATAGACAATTGTTCAAATA-ATATTAACTATTTGAACTTATTT-GATAAATAGATTTTTAAAT
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*** * * *
298598 TTTTTAAAATCTCTTTCTTATT-AATCTTT-TGAATGTTAATAAAGTAGTATTAATTTATTCT-A
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* * * * *
298660 AGTAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATAACTAAA-CAAAAGGTC
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** * * * * *
298836 CAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTTTCTGACAAAAGAAAAGGTCATAAC-AATTTGA
126 TGAACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAA-TT-A
* ** * * * * * * * * * *
298899 AAATTGATTA-TAGTTCATATAGTCTTAACTACTTGAATTGGTTCAGCAACTAGATTTATTTTTT
188 AAATAGAAAATTA-TTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGAAAATAAATTTATTTTTT
** * * * **
298963 -AAT-T-----TTCTT-GGTTAT-T-AAGT-TT--T--TG-AATATTATTTTATTTCAAATAAAA
252 AAATCTCCAACTT-TTCAATTTTCTGAA-TATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-GAATAAGC
* * * * * *
299012 TAGTATAAACAAAATTAATTGTTTGATGATAAA-ATAAAAAGGTT
314 TTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGATAAAGCT--AAAGGTT
* ** * * * * * * *
299056 ATAATGTTTTGAAACAGTTAATTATTAAAATAGACAAAACTATTTGAAATGGTTT-GATAAACAG
1 ATAATGATTTGAAACAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTGGTTTAG-TAAATAG
* ** * * *
299120 ATTT-TCATTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTT-CT
65 ATTTAT-TTTTTAAATCTC-T-C--ATTAATTTTGAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT
* * * * * * *
299183 TTGAAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGTAATAATGATTTG
125 TTG-AACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTA
** * ** * * ** *
299248 AAAT-TTAAA-TGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACT-AGTTCATTAAATAGAA-TTATTTTA
188 AAATAGAAAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGA-TTTAGAAAATA-AATTTATTTTT
** * * * * * * * **
299309 TAAATCTCTTACTTATAAATATT-TGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCAATTAAGC
251 TAAATCTCCAACTTTTCAATTTTCTG-AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTGAA-TAAGC
** * * * * *
299373 TTGTATGTGCTAAAATAATTATTTTATAACAAA-ATAAAAGGTC
314 TTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGATAAAGCT-AAAGGTT
** * * * ** * * *
299416 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAATGGTTCCA-CAAATAG
1 ATAATGATTTGAAACAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTGGTT-TAGTAAATAG
*
299480 ATTTATTCTTTAAAT
65 ATTTATTTTTTAAAT
299495 ATCTTAGTTG
Statistics
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0.70 0.17 0.13
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345 49 0.02
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Consensus pattern (356 bp):
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AAACTTATATGAACAAAAACATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAATTAAAATAGAA
AATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGAAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCA
ACTTTTCAATTTTCTGAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAACAA
AAATAATTATTTTATGATAAAGCTAAAGGTT
Found at i:297895 original size:542 final size:534
Alignment explanation
Indices: 293489--299463 Score: 2620
Period size: 541 Copynumber: 11.0 Consensus size: 534
293479 AAAACGAAAG
* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * **
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128 TTATGA-TAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAAT-GACAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TT
* * ** * * ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * * * ** * * *
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316 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTAG
* * * *
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* * * * * * *
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* **
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* * * * * ** * *
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1 GTCATAACTATTTGAATTG-TTTG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTT
** * * *
294093 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTTAAATAATTGTTT
64 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAAATTATTT
* * * * *
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129 TATGAT-AAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAAT-GACAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTA
* * * * * * *
294223 AATTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAACTATTGCTTATTAATTTTTG-AAATATTAAG
191 AACTTGTTTGA-TAAATAAATTTA-TTTTTTAAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAAATA-TAAT
* * ** * * * * *
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253 AAATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACTAAAC
* * * *
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317 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTGA-TTA
* * * * * * * *
294412 GGTAAACAAATTTATATTTTCAAACTTTTACTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATT
380 GCTAAATAAA-TTAT-TTTTTAAA-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATT
** * * * * *
294476 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAAGTCATA
442 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATA
* * * *
294540 ACGATTTGAAATAAAAAATT-ATTCTAATA
506 ACAATTTGAAATAGATAATTGA-TCCAATA
* * * * * * * * **
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1 GTCATAACTATTTGAA-TTGTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTT
* * ** * * *
294633 T-AGAATATTATTAAATTAGTATTGTTTTA-ACCAAATAAGCTTCTATG-ATTAGAAACAATTGT
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* * * * * * ** *
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127 TTTATG--ATAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAAT-GACAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-
* * * * * * * * * * *
294760 TTTAACTGAGTTAG-TAAACATATTTATTTTTTAAATTTTTTACTCAATAA-TTTAGGAAATACT
188 TTAAACT-TGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATTTTTGAAAATA-T
* * ** * **
294823 AATAAATTAGTATTATTTTATTCCATCTAAACTTGTATCAGCTGTAACAATTGTTTTAAATCTTT
250 AATAAATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAACTTG--T-A--TG-AATAA-------AAA-CAAT
* ** * ** * * * * *
294888 TACTTGTTAATTATCTTATTCCGAATAAGCTTGT-ATGAATAGAAACA-ATTATTTTCTAACAAA
301 TA-TT-TT-ATGA-C-TA-AAC-AA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C--A
* * * * * * * * * * *
294951 ACCAAAGGTCATAACAATTTGCATTGGTCAGGC-CAACAGATTCATTTTTGAAATACATTATTTA
353 A--ATA-GTCATAACTATTTGAACTGATTA-GCTAAATAAATT-ATTTTTTAAAT-C-TTACTTA
* * * * ** *
295015 TTAA-TTTTCATAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGATTGTATCAATAGAAA
411 TTAATTTTTGA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG--T--AT-G-AA
* * * ** ** * * *
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469 TTGAAACAATTA-TTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGATCCAA
*
295143 TT
533 TA
* * * *
295145 GTTATAACTAATTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAA-TTT
1 GTCATAACTATTTGAATT-GTTT-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTT
* * * * *
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64 TG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAA-ATAAGCTTGTATGAATTGAAAAA-ATT
* * * * * * * * *
295266 TTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAA-TTAAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACT
125 ATTTTATGA-TAAACAAAAGGTTATAAC-AATTTTAAAT-GACAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * *
295330 ATTTGAACTGGTTTAGA-AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTTTTAATTTTCTTAATAT
187 A-TTAAACTTGTTT-GATAAATAAATTTATTTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATTTT-TGAAAAT
* * * * * * *
295394 -TATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTTATGA-T
248 ATAATAAATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACT
* * * * * * *
295457 AAAGCTAAAGGTTATAATGATTTGAAACATATAATTGTTCAAATAGTCATAGCTATTTGAATTGG
313 AAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA
* * * ** * * * *
295522 TTTGGTAGACTATTTTGTTTTTTAAATTTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTA-AAAATTAGT
377 TTAGCTA-AATAAATTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGT
** * * * * *
295586 ATTATTTTATTTTGAATAGGCTTATATG-A-TGACCAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTT
439 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGA--AACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGT
* * * * *
295649 CATAATAATTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATG
502 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGATCCAATA
* * * * *** ****
295682 GCCATAATTTTTTGAATTGATTCTATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTT
1 GTCATAACTATTTGAATTG-TT-TGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATT-AATTT
* * * ** * * * *
295746 TTGATATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTT-GGATAAG-TATTTATGAATTGAAACAACTGT
63 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATGAATTGAAAAAATTAT
** * ** *
295809 TTTATTTTAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTTCA-AA-TAG
127 TTTATGAT-AAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAAT-GACAATTGTTCAAATAG-TCATAACTA-
** * * * ** * *
295871 TCTTGACTGTTTGAATTTGTTCAATAAACAGATT-TTTTTTAATTTCCTGCTTATTAATTTTTTG
188 T-TAAAC---TTG--TTTGATAAAT-AA-A-TTTATTTTTTAAAATCTTACTTATTAA-TTTTTG
** ** * * *
295935 AATGT-TAATAGAA-TAATATT-TTTTTTTC-AAATAAGCATGTATGAACT-AAAACAATTATTT
243 AAAATATAATA-AATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTT
* * * * * *
295995 TATGTCTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTG
306 TATGACTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *
296060 AACTGCTTAGGC-AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTTTAGAAATATTAA
371 AACTGATTA-GCTAAATAAA-TTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAA-TTTTT-GAAATATT--
** * * * * ** *
296124 ATTAGTTTAGCAATATTTTA-CTCTAAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAA
428 ATTAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACAA
* * *
296188 AA-CAAAGATCATAAC-ATTTGAAGAT-GATCAATTG-GCTCAATA
492 AAGAAAAGGTCATAACAATTTGAA-ATAGAT-AATTGATC-CAATA
* * ** *** *
296230 GTCATAGCTATTTAAACAGATCCAATAAAC-AATTTAGTTTTTAAATC---T--TTATTAACTTT
1 GTCATAACTATTTGAATTG-T-TTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAA-TTT
* * ** * *
296289 TTG-GATATT-ATAAAATAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTAT-AAAT-AAAACAATTG
63 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATTGAAAA-AATTA
* * * ** ** *
296349 TTTTAATGACAAAACAAAATGTCATAACAAATTCAAAAAAATAATTGTTC-AATAGTCAT-ACT-
126 TTTT-ATGA-TAAACAAAAGGTTATAAC-AATTTTAAATGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *** * * * *
296411 TTGAACTCACTCGATAAAATATCATTTATTATTTAAAAACCTTTTACTTATTAATTTTCTGAAAA
188 TTAAACTTGTTTGAT-AAATA-AATTTATT-TTTTAAAA--TCTTACTTATTAATTTT-TGAAAA
* * * * * * * * *
296476 -ATAATAATTTTA-TATTATTTTTTTCAAAATTAGCTTGCATG------AAC--TGA-TATATGA
247 TATAATAA-ATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGA
* * ** * * * * * * *
296530 CAAAACAAAAGGTCTTTTTGTTTTGAAATAGATAACTATTTAGATAGTCACAACTATTTGAACTT
311 CTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG
* * * * * *
296595 ATTCAG-TAAACAGATTCTTTTTTTAATTCTCTTA-TTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
376 ATT-AGCTAAATAAATT-ATTTTTTAA--ATCTTACTT-ATTAATTTTTGAAATATTATTAAATT
* ** ** * * *
296658 AGTACTATTTTACATCAAATAAGCTTACATGAAACTGAAACAATTGTTTTACT-ATAAAAG-AAA
436 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-AATTGAAACAATTATTTTA-TGACAAAAGAAAA
*
296721 GGTCAGT-ACATAATTGAAATAGATATTACTCTGA-CTC--TA
499 GGTCA-TAACA-ATTTGAAATAGATA--A-T-TGATC-CAATA
* * * * *
296760 GTCATGACTA-TTGAATT-TTAGTAAA-ATATTTTATATTTTTAAAT-TATTTACTTATTAATTG
1 GTCATAACTATTTGAATTGTTTGTAAACA-AATTTAT-TTTTTAAATCT-TTTGCTTATTAATTT
** * * * * *
296821 TAAAAATATTAATAAATAAATATTATTTTA-ATCTAAATATGCTTGTATGAA--CAAAAACTATT
63 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATTGAAAAA--ATT
* ** * * * * * * * **
296883 GTTTTAAAACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAAAAATTACTCAAATAGTCATAACTA
125 ATTTTATGA-TAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAAT-GACAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *
296948 TTATAACTTGTTTGATAAATAGATCTATTTTTT-AAATC-T-CTTATTAA-TTTTCAAAATATCA
188 TTA-AACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAAATAT-A
* * * * * * *
297009 GTAGATTAGCATTATTTTATT-TCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAA
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* * *
297073 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGTTTA
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * *
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* * * ** *
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* * *
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190 -AAACTT-GTTTGA-TAAATAAATTTATTTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATTTTTGAAAATATA
* * * * * *
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* * *
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* * * *
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*
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* * *** * *
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* * * * *
297963 TTGTG-TCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
128 TTATGAT--AAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAAT-GACAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-T
* * * *
298027 TAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTAGCTTATTAATTTTTTG--AATGT-
189 TAAACTTGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAAATC-TTA-CTTATTAA-TTTTTGAAAATATA
* * * * *
298089 A-AATTTA-CATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAA
251 ATAAATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATA-AAAACAATTATTTTATGACTAA
* * * * * * ** * *
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* * * *
298216 GGC-AAACACATTTATTTTTTATATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTA
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** *
298279 TTATTTT-TAACTAAATAAGCTTCTATG-ATTGGAAACAATTATTTTATGACAAAAAGAAAAGGT
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* * * *
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502 CATAACAATTTGAAATAGATAATTGA-TCCAATA
* * ** * * * * *
298375 GTCATAACTATTTTAAATGAGTCGGTAAACAAATTTGTTTTTTAAATTTTTTACTTAATAATTTA
1 GTCATAACTA-TTTGAAT-TGTTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTT
* * * ** * *** *
298440 GGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCATCTAAACTTGTATTTGTTGAAAAAATTGTTT
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* * *
298505 TATGACAAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAAT-ATTAACTATTT
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* * * * **
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190 AAACTTGTTTGATAAATA-A-ATTT--ATTTTTTAAAA--TCTTACTTATTAAT-TTTTGAAAAT
* * * * * *
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* * * * * *
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312 TAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGA
* * * *
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* ** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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** * **
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* * * ** * ** * * * *
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124 TATTTTATGAT-AAA-CAAAAGGTTATAACAATTTT-AAA-TGACAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * *
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185 CTA-TT-AAACTTGTTTGATAAATAAATTTAT-TTTTTAAA-ATCTTACTTATTAATTTT-TGAA
** * * * * * *
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245 AATA-TAATAAATTAGCATTATTTTATTCT-AAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTA
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *** * * * *
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* *
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* *
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ATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCA
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TAATTGATCCAATA
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* * * ** * * ** * * *
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* * * * * * ** **** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** ** * * ** *
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* * * ** ** * * *
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* * * ** *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * ** * * *** * *** *
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* * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * ***
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* * * *
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* * *
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* * * *
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** * * *
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* * * * * *
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*
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* *
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319 -TTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGATT-GAAACAATTATTTTATGAC-AAAAGAAAAGGTCATA
* * * * *
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381 ACGATTTGAAAGAGACAATTCA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAATATG-GTCAGTAAACAAAT
* * *
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** *** *
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* * * * * *
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*
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* * * *
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128 AAAGTAGCATTAATTTATTCTAAGTAAACTTGTAAGAACTAAAACAAATATTTTATAACTAAACA
* * * * * *
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* * * *
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*** * * *
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388 GAAA
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Statistics
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TATTTGATAAATAGATTTTAATTTTTTAAAATCTCTTGCTTATTAATCTTTTGAATGTTAATAAA
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GGTCATAATAATTTGAAATAAAAAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACCAATTCGACAAA
TCAAATTATTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
TCAAATAAGCTTGTATGATTGAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAA
AGAGACAATTCATCAAATAGTCATAACTATTTGAATATGGTCAGTAAACAAATTTAGTTTTTTAA
ACTATTACTTAATAATTTAGGAAATATTAAGAAATTAGCATTATTTTATTCCAGATAAACTTGTA
TGAATTGAAAAAATTATTTTATG
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* *
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* *
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1 TAATTATTTGAAATAGT
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1 T
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TAATTATTTGAAATAGT
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*
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* *
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*
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* * *
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* * *
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* * *
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* *
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*
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*
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Statistics
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299526 ATATTTTAAA
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* ** * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
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*
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* * *
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* * * * * * * * *
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* *
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* ** *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
300381 TAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACTGAAATAA-TTATTATATGACTAAACAAAA
123 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAGCTAAAACAATTTGTTTTATAACAAAACAAAA
* * * * * * * *** * *
300445 TGTTAGAA-AGATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTTATAATTATTTAAACTAGTTCAACAA
188 AGTCATAACA-ATTTAAAATAAATAATTCTTCAAATAGCCGTAATTATTTAAAATGGTTCAACAA
* * * * * * ** **
300509 ACACATTTATGTTTTAAA-T-C-T-CTAATTAATTTTTGGAATATT-AGTAATCTAGTATTTTTT
252 ATAGATTTATTTTTTAAATTCCTTACTTATTAATTTTTAGAAT-TTGACTAAAGTAGTATTACTT
* *
300569 TATTCA--AATAGGCTTGTATG-ATCA-AACACAGTTGTTTTAT
316 TATT-ATGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * *
300609 GAGAAAACAAATA-TCATAACGATTTGACATTGATATTTGTTCAAGTA-TTCGTAATTATTTGAG
1 GATAAAACAAA-AGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTT-ATAATTATTTGAA
* * * * * * * * * **
300672 CTAGTTAAAAAAATAG-TTGTAATTTTTAAATCTCTCGCTTATAAATTTTTGAAATATTGATAGG
64 AT-GTTCAATAAACAGATT-TATTTTTTAAA--TCT--CTTATTAACTTTTG-AATGTTAATAAA
* * * * * *
300736 GTAGTATTGTTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAACTAGAACAATTT-TTTTCA-AACAAAACA
122 TTAGTATTATTTTA-TTTTGAATAAGCTTGTATGAGCTAAAACAATTTGTTTT-ATAACAAAACA
* * * * * * * *
300798 AAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTGTTC-AATAGTC-AAATTTATTCAAACTTGTTT
185 AAAA-GTCATAACAA-TTTAAAATAAATAATTCTTCAAATAGCCGTAA-TTATTTAAAATGGTTC
* * * * * * * * *
300860 GATAAACAGATTTATTTTTTTAAATGT-TTTTCTCATTAATTTTTTGAATGTT-AATAAATTAGT
247 AACAAATAGATTTA-TTTTTTAAAT-TCCTTACTTATTAATTTTTAGAAT-TTGACTAAAGTAGT
* * *
300923 ATTA-TTCTATTTTGAATAAGCTTTGTATGAGAT-GAAATAATTATTTTAT
309 ATTACTT-TATTATGAATAAGC-TTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTAT
* * * *
300972 GACT-AAACAAAA-TATCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGCCT-TAACTATTT-
1 GA-TAAAACAAAAGTA--ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TTATAATTATTTG
** *
301032 AAACCTGGTTCAGCAAACACATTTATTATTTTAAATCTCTTA
62 AAA--T-GTTCAATAAACAGATTTATT-TTTTAAATCTCTTA
301074 CTATTAGTAA
Statistics
Matches: 922, Mismatches: 189, Indels: 135
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
355 12 0.01
356 109 0.12
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358 200 0.22
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362 11 0.01
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365 14 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (356 bp):
GATAAAACAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAAAT
GTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAGCTAAAACAATTTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA
CAATTTAAAATAAATAATTCTTCAAATAGCCGTAATTATTTAAAATGGTTCAACAAATAGATTTA
TTTTTTAAATTCCTTACTTATTAATTTTTAGAATTTGACTAAAGTAGTATTACTTTATTATGAAT
AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
Found at i:300468 original size:182 final size:177
Alignment explanation
Indices: 299540--301020 Score: 821
Period size: 182 Copynumber: 8.3 Consensus size: 177
299530 TTTAAAGATA
* * * * *
299540 AAACAAAATGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTA-AATTATTTGAAATAGT
1 AAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTATAATTATTTGAACTAGT
* * ** * * *
299604 TCAATAAATAGAATTATTTTTT-AAA-TCTCTTA-TAAACTTTTGAAATATTATTAGATTAGTTT
66 T-AATAAACAGATTTATTTTTTAAAACTCTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTAT
* ** * * * * * *
299666 TATTCTA-TTCCAATTAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTTTTTTTATAACA
129 TATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGA-ATGAAACAA-TTGTTTTATGACT
* ** * * * * * * * *
299717 AAATAAAAGGTCATAACA-ATTTAAAATAAATAATTCTTCATATAGTCT-TAATTGTTTAAAATG
1 AAACAAAATATCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-CTATAATTATTTGAACTA
** * ** * * *
299780 GTTCAGCAAATAGATTTATTTTTT-AAGTTC-CTTAGTTATTGATTTTTAGAATTTTACTAAATT
64 GTT-AATAAACAGATTTATTTTTTAAAACTCTCTTA-TTA---ATTTTTTGAATATTAATAAATT
* *
299843 AGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT-AAT
124 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACT
* * * * * *
299897 AGAAGAAAA-ATTATAACA-ATTTGAAATAGATAAATATTCAAATAGTTATAATTATTTGAAAT-
1 A-AACAAAATATCATAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTATAATTATTTGAACTA
* * *
299959 GGTAAGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAA-TCTCTTATTAA-TTCTTGAATTGTTAATAAATTA-
64 GTTAA--TAAACAGATTTATTTTTTAAAACTCTCTTATTAATTTTTTGAA-TATTAATAAATTAG
* * *
300020 TGATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATG-TTGTAAAACAATTGTTTTATGACA
126 T-ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG--AAACAATTGTTTTATGACT
* * * * ** *
300074 AAACAAAA-ATTACTAACA-ATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGCCGTAATTATTT-AAATG
1 AAACAAAATATCA-TAA-AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTATAATTATTTGAACT-
* ** * * * *
300136 GATTTAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTGATAAAGTA
63 -AGTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAAACTC-T-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTA
* * ** * *
300201 TTATTACTTTATTTTGGTTAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGA-T
125 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACT
* ** * * * * **
300254 AAAATAAAAGGTCATAATGATTTTATATAGATAATTGTTCAAATAGCTATAACTATTTGAACTTT
1 -AAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTATAATTATTTGAACTAG
*
300319 TTCAATAAACAGATTTATTTTTTCAAAACTCATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAG
65 TT-AATAAACAGATTTATTTTTT-AAAACTC-T-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAG
* * * * *
300384 TATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATAAACTGAAATAATTATTATATGACT
126 TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACT
* * * * * * *
300437 AAACAAAATGTTAGAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTTATAATTATTTAAACTAGT
1 AAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTATAATTATTTGAACTAGT
* * * * * *
300502 TCAACAAACACATTTATGTTTT-AAA-TCTCTAATTAATTTTTGGAATATTAGT-AATCTAGTAT
66 T-AATAAACAGATTTATTTTTTAAAACTCTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAAT-TAGTAT
* ** * * **
300564 TTTTTTA-TTCAAATAGGCTTGTATG-ATCAAACACAGTTGTTTTATGAGA
129 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATGAAACA-A-TTGTTTTATGACT
* * * * * * * *
300613 AAAC-AAATATCATAACGATTTGACATTGATATTTGTTCAAGTA-TTCGTAATTATTTGAGCTAG
1 AAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCT-ATAATTATTTGAACTAG
* * * * * * ***
300676 TTAA-AAAAATAGTTGTAATTTTTAAATCTCTCGCTTA-TAAATTTTTGAAATATTGATAGGGTA
65 TTAATAAACAGA-TT-TATTTTTTAAAACTCT--CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTA
* * * * * *
300739 GTATTGTTTTATTTTTG-ATAAGTTTTTATGAACT-AGAACAATTTTTTTCA-AACA
125 GTATTATTTTA-TTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TGA-AACAATTGTTTT-ATGACT
**
300793 AAACAAAA-AGGTCATAACA-ACTTT-AAATAGATAATTGTTC-AATAG-TCA-AATTTATTCAA
1 AAACAAAATA--TCATAA-AGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCT-ATAA-TTATTTGA
* * ** * * *
300852 ACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTTAAATGTTTTTCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAA
60 ACTAG-TTAATAAACAGATTTA-TTTTTTAAA--ACTCTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAA
* * *
300917 ATTAGTATTATTCTATTTTGAATAAGCTTTGTATGAGATGAAATAATTATTTTATGACT
121 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-TTGTATGA-ATGAAACAATTGTTTTATGACT
* *
300976 AAACAAAATATCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGC
1 AAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGC
301021 CTTAACTATT
Statistics
Matches: 1004, Mismatches: 220, Indels: 154
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
173 5 0.00
174 12 0.01
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184 6 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (177 bp):
AAACAAAATATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCTATAATTATTTGAACTAGT
TAATAAACAGATTTATTTTTTAAAACTCTCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACT
Found at i:300730 original size:538 final size:538
Alignment explanation
Indices: 299558--301071 Score: 1327
Period size: 538 Copynumber: 2.8 Consensus size: 538
299548 TGTAATAATG
* * * * *
299558 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--TTAAATTATTTGAAATAG-TTCAATAAATAGAATTA
1 ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCGT-AATTATTT-AAATAGATTAAAAAAATAGATTTA
* * * * * ***
299620 TTTTTTAAA--TCT--CTTATAAACTTTTGAAATATT-ATTAGATTAGTTTTA-TTCTA-TTCCA
64 ATTTTTAAATCTCTCACTTATAAATTTTTGAAATATTGA-TAAAGTAGTATTACTT-TATTTTGG
* * * * * *
299678 ATTAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTTTTTTTATAACAAAA-TAAAAGGTCATAACAA-TTTAA
127 A-TAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTCA-AACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTT-A
* * * * * * * * ** *
299741 AATAAATAATTCTTCATATAGTCTTAAT-TGTTTAAAATGGTTCAGCAAATAGATTTATTTTTT-
189 AATAGATAATTGTTCA-ATAGTC-AAATCTATTCAAACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTC
** * * * * *
299804 -AAGTTCCTTAG-TTATTGATTTTTAGAATTTTACTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGC
252 AAAACT-CAT-GCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGC
* * * * * *
299867 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT-AATAGAAGAAAA-ATTATAACA-ATTTGAAATAGATA
315 TTGTATAAAT-GAAATAATTATTTTATGACTA-AACAAAATATTAGAA-AGATTTGAAATAGATA
* * * * * *
299929 AATATTCAAATAGTTATAATTATTTGAAA-TGGT-AAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
377 ATTATTCCAATAGTTATAATTATTT-AAACTGTTCAA--CAAACACATTTATATTTTAAATCTCT
* * ** * * *
299992 TATTAATTCTTGAATTGTTAATAAATTATGATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGTTGTAAA
439 AATTAATTCTTGAATTATTAATAAATTATGATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATGCAAA
*
300057 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTACTAACA
504 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATCACTAACA
* * * * * * *
300092 ATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGCCGTAATTATTTAAATGGATTTAATAAATTGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCGTAATTATTTAAATAGATTAAAAAAATAGATTTAAT
* * * * *
300157 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTGATAAAGTATTATTACTTTATTTTGGTTAA
66 TTTTAAATCTCTCACTTATAAATTTTTGAAATATTGATAAAGTAGTATTACTTTATTTTGGATAA
* * * ** * *
300222 GCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTT-ATGATAAAA-TAAAAGGTCATAATGATTTTATATAGA
131 GCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTCA-AACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGA
**
300285 TAATTGTTCAAATAG-CTATAA-CTATTTGAACTT-TTTCAATAAACAGATTTATTTTTTCAAAA
195 TAATTGTTC-AATAGTC-A-AATCTATTCAAACTTGTTT-AATAAACAGATTTATTTTTTCAAAA
*
300347 CTCATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAT
256 CTCATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTAT
* *
300412 AAACTGAAATAATTATTATATGACTAAACAAAATGTTAGAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCC
321 AAA-TGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAATATTAGAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCC
* *
300477 AATAGTTATAATTATTTAAACTAGTTCAACAAACACATTTATGTTTTAAATCTCTAATTAATTTT
385 AATAGTTATAATTATTTAAACT-GTTCAACAAACACATTTATATTTTAAATCTCTAATTAATTCT
* * * *
300542 TGGAA-TATTAGT-AATCTA-GTATTTTTTTA-TTCAAATAGGCTTGTATGAT-CAAACACAGTT
449 T-GAATTATTAATAAAT-TATG-ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATGCAAA-ACAATT
* * *
300602 GTTTTATGAGAAAACAAATATCA-TAACG
510 GTTTTATGACAAAACAAAAATCACTAACA
* * * * ** **
300630 ATTTGACATTGATATTTGTTCAAGTATTCGTAATTATTTGAGCTAG-TTAAAAAAATAG-TTGTA
1 ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCGTAATTATTT-AAATAGATTAAAAAAATAGATT-TA
* ** ** *
300693 ATTTTTAAATCTCTCGCTTATAAATTTTTGAAATATTGATAGGGTAGTATTGTTTTATTTTTGAT
64 ATTTTTAAATCTCTCACTTATAAATTTTTGAAATATTGATAAAGTAGTATTACTTTATTTTGGAT
* * *
300758 AAGTTTTTATGAACTAGAACAATTTTTTTCAAACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAG
129 AAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTCAAACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAG
* * * ** *
300823 ATAATTGTTCAATAGTCAAATTTATTCAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTTAAATGTT
194 ATAATTGTTCAATAGTCAAATCTATTCAAACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTCAAAACTC
* * * * *
300888 TTTCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTCTATTTTGAATAAGCTTTGTATGA
259 ATGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGC-TTGTAT-A
* * * *
300953 GATGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAATATCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-CAA
322 AATGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAATATTAGAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCCAA
* * *
301017 TAGCCT-TAACTATTTAAACCTGGTTCAGCAAACACATTTATTATTTTAAATCTCT
387 TAG-TTATAATTATTTAAA-CT-GTTCAACAAACACATTTA-TATTTTAAATCTCT
301072 TACTATTAGT
Statistics
Matches: 802, Mismatches: 137, Indels: 76
0.79 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
534 29 0.04
535 31 0.04
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539 302 0.38
540 117 0.15
541 5 0.01
542 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (538 bp):
ATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCGTAATTATTTAAATAGATTAAAAAAATAGATTTAAT
TTTTAAATCTCTCACTTATAAATTTTTGAAATATTGATAAAGTAGTATTACTTTATTTTGGATAA
GCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTCAAACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGAT
AATTGTTCAATAGTCAAATCTATTCAAACTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTCAAAACTCAT
GCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATAAATG
AAATAATTATTTTATGACTAAACAAAATATTAGAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGT
TATAATTATTTAAACTGTTCAACAAACACATTTATATTTTAAATCTCTAATTAATTCTTGAATTA
TTAATAAATTATGATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGATGCAAAACAATTGTTTTATGACA
AAACAAAAATCACTAACA
Found at i:301570 original size:14 final size:15
Alignment explanation
Indices: 301551--301581 Score: 55
Period size: 14 Copynumber: 2.1 Consensus size: 15
301541 TGTTTAGAGA
301551 AAATATTTA-TTTTT
1 AAATATTTACTTTTT
301565 AAATATTTACTTTTT
1 AAATATTTACTTTTT
301580 AA
1 AA
301582 TGTTTGGAAT
Statistics
Matches: 16, Mismatches: 0, Indels: 1
0.94 0.00 0.06
Matches are distributed among these distances:
14 9 0.56
15 7 0.44
ACGTcount: A:0.39, C:0.03, G:0.00, T:0.58
Consensus pattern (15 bp):
AAATATTTACTTTTT
Found at i:301601 original size:175 final size:179
Alignment explanation
Indices: 301224--301616 Score: 405
Period size: 175 Copynumber: 2.2 Consensus size: 179
301214 TCTTCAACTC
* * *
301224 ATTAAT-TTTATAATATTAATAAATTACTATTATTCTATTCTAAATAAACTTGTACGAATAGAAA
1 ATTAATGTTTAGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCT-AATAAACTTGTACGAACAGAAA
* * ** *
301288 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAGTGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
64 CAATTGGTTTACGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* * ** *
301353 AACTATTTGAACTCGCTTGTTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTCTATTT
129 AAATATTTCAACTCGCTTGAGAAATAGATTTATTTTTTAAATATTCTATTT
* * * *
301404 ATTACTTTTTAGAATA--AATAAATTATTATTATTTTATTCT-A-AGA-TTGTATGAACAGAAAC
1 ATTAATGTTTAGAATATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCTAATAAACTTGTACGAACAGAAAC
* * * *
301464 AATTGGTTTACGACGAAACAAAATG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCCAATAGTCAT
65 AATTGGTTTACGACAAAACAAAA-GATCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
* *
301528 AAATATTTCAACAT-GTTTAGAGAAA-ATATTTA-TTTTTAAATATT-TACTTT
129 AAATATTTCAAC-TCGCTT-GAGAAATAGATTTATTTTTTAAATATTCTA-TTT
* *
301578 -TTAATGTTTGGAATATTAATAAATTCATATTACTTTATT
1 ATTAATGTTTAGAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATT
301617 AAAAATAAGT
Statistics
Matches: 178, Mismatches: 27, Indels: 21
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 14 0.08
174 14 0.08
175 105 0.59
176 9 0.05
177 1 0.01
179 22 0.12
180 5 0.03
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
ATTAATGTTTAGAATATTAATAAATTATATTATTTTATTCTAATAAACTTGTACGAACAGAAACA
ATTGGTTTACGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA
ATATTTCAACTCGCTTGAGAAATAGATTTATTTTTTAAATATTCTATTT
Found at i:302187 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 301857--305109 Score: 2493
Period size: 181 Copynumber: 18.1 Consensus size: 180
301847 CATAAATTTG
* * * * * * *
301857 AAATAGTTATAATTATTTGAACTAG-TTCGATAAATAGAATTATTTTATAAATCTCTTACTTATA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
301921 AAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTT-TCTTGAATAAACTTGTAT-AAGTTGAAA
64 AATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAA
* * * *
301983 TAATTATTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTC
126 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * * * *
302038 ATATACTC-TGAATTATTTGAACTGATTTGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATT
1 AAATAGTCAT-AACTATTTGAACTG-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *** * *
302102 AATTTTTAGAATTTTACTAAATTAGCATTATTTTAATCCAAATAGGCTTGTTTGAATTGAAACAA
64 AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAA
* * * * *
302167 TTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
129 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * *
302219 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCACTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* *
302280 ATTCTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTAT--ATTGAAAAAC
65 ATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTG--AAAC
* * * * * * * *
302342 AAATGTTTTATGACAAAACACATGGTAATAACGATTTAAAATAGATAGTTGTTC
127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * * ** *
302396 AAATGGCCATAATTATTCGAACTGATTTAGCAAATTGATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * * *
302461 ATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAACTAAAATAAT
65 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAAT
*
302526 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AGATTTTG-AATAGATAATTGTTC
130 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA-A-TTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * *
302577 AAATAGTCATAATTATTTGAACT-TGTTCGACAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
302641 TAATTTTTTGAATGTTAATAAATTA--ATTTTTTTATTTCGAATAAAGCTTGTATGAACTGAAAC
63 TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT-AAGCTTGTATGAATTGAAAC
* * * * * ** * *
302704 AATTATTATATGACCAAACAAAAGATCAAAATGATTTTAAATAGATAATT-TTC
127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* ** **
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65 ATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAAC
* * * * * ** *
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127 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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126 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * * * * * *
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* * * ** * * **
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* * * ** *
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* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTAT
* * ** * *
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* ** * *
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* * * ** **
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * * * * * * ***
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* * *
304147 TTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTC
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* * *
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* * * * *
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** * * * * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * *
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* ** * *
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* * * *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGTAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** ** * * * * **
304623 AATCCTCCGAATATTAGTAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAAACTTATATGAA-CAAAAG
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* * * **
304686 CAACTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AATAATTGTTC
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* * ** * * ** *
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1 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** ** *
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* * * **
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305099 AAATAGTCATA
1 AAATAGTCATA
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Statistics
Matches: 2438, Mismatches: 527, Indels: 217
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Alignment explanation
Indices: 299539--305105 Score: 3276
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299529 TTTTAAAGAT
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * **
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* ** * * * *
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* * * * *** * * * * ***
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** * * * * ** *
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* * * *
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* * * *
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1 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTT
* * * * * ** *
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* * * * * * * * ** *
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127 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAG
* * * * * * * * *
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192 GTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAAT
* * *
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257 A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT-TA--ATTTTTTTA
* * * * * * * *
300571 -TTCAAAT-AGGCTTGTATG-A-TCAAACACAGTTGTTTTATGAGAAAAC-AAATATCATAACGA
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* * ** * * * * * * * * * * *
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381 TTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATA-TT-TAT
* * * *** * ** *
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444 TTTTTAAATCT-T-ACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TCCTAAT
* * * * * * *
300758 AAGTTTTTATGAACTAG-AACAATTTTTTTCA-AACAAAACAAAAAGGTCATAACAACTTT-AAA
505 AAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTT-ATGA-GAAA-ATAAAGATCATAACAA-TTTGAAA
* ** ** * * *
300820 TAGATAATTGTTC-AATAGTCAA-ATTTATTCAAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTTAA
565 TAAATAATTGTTCAAATAGT-AATAACTATTTGAAC-TGCTTCATAAACAAATTTA-TTTTTTAA
* * * * * * *
300883 ATGTTTTTCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTCTATTTTGAATAAGCTTTG
627 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-TTG
* *
300948 TATGAGATGAAATAATT-ATTTTATGAC
691 TATGA-TTGAAACAATTGA-TTTATGAC
* ** * * * * * * *
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1 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTT
* ** * * * *
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65 GTTTAATAAATAGATTTATT-TTTAAAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAATATTAATAAATTA
** * * * * * * * *
301088 GTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAACAAAAACAACTATTATACG-ACAAACAAAATGT
129 GTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGT
* * * * * * *
301152 CATAACGATTTGAAATAGATTA-TAGTTCTAATGGACA-AGACTATTTGAACTTGTTC----AGT
194 CATAAAGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATA-ATTATTTGAACTTGTTCGATAAAT
* * * * *
301211 AA---A--TCTTCAA---C-T-C--ATTAA-TTTTATAATATTAATAAATTACTATTATTCTA-T
257 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA--ATTTTTTTATT
* * * * ***
301262 TCTAAATAAA-CTTGTACGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAGTGATT
320 TC-GAATAAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATT
* * * * * *
301325 TAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTT-GTTAAATAGATTTATTTT
383 TAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACATATTTATTTT
* * * * *
301389 TTAAATCTTCTATTTATTACTTTTTAGAATA--AATAAATTATTATTA-TTTTAT--T-CTAAGA
447 TTAAATC-T-TACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCCTAATAAGC
* * * * *
301448 TTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTACGACGAAACA-AAATG-TCATAACGATTTGAAATAGATA
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* * * * * * * *
301511 ATTATTCCAATAGTCATAAATATTTCAACATG-TTTAGAGAA-AATATTTA-TTTTTAAATAT-T
571 ATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAAC-TGCTTCATA-AACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * *** * * *
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*
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* * * *** *
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1 AAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACT
* * * * * * ** * *
301720 T-TTT-GT-GACAGATTCT-TTTTT-TAATTTTCTTACTTGTTTATTCTCGAAATATTAATAAAT
64 TGTTTAATAAATAGATT-TATTTTTAAAAATCTCTTACTCATTAATTTTC-AAATATTAATAAAT
* * * ** * * * * * *
301780 TAGTGTTGTTTTACTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACGATTGTTTTATTACAAAAGAAAAG
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*
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192 GTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAAT
* * * * * * *
301892 AGAATTATTTTATAAATCTCTTACTTATAAAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTT
257 A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAATTTTTTTATT
* * * *
301956 TCTTGAATAAA-CTTGTAT-AAGTTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACAAT
320 TC--GAATAAAGCTTATATGAA-CTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAAT
* * * * * * * *
302019 TTGAAATAAATAATTATTCATATACTCTGAATTATTTGAAC-TGATTTGGCAAACAGATTTATTT
382 TTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTTG-TTTAGTAAACATATTTATTT
* * * * * * *
302083 TTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTAGAATTTTACTAAATTAGCATTATTTTAATCCAAATAGG
446 TTTAAATC--TTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCCTAATAAG
* * * * * * *
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* *
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* * *
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* *
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* * * * * * * * * * *
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1 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
** * * * * *
302420 ATTTAGCAAATTGATTTATTTTT-TAAATATCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTA
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* * * *
302484 GTATTATTTTATTTTGGATAAACTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
129 GTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGT
* *
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194 CATAAAGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAATA
* * *
302613 GATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATTTTTTTATTT
258 -ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATTTTTTTATTT
* * * * ** *
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* * * *
302743 AATAGATAATT-TTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACATATTTATTTTTTAA
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*
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * * ** **
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* *
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* * *
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** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * **
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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C
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* **
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Statistics
Matches: 2330, Mismatches: 449, Indels: 227
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Matches are distributed among these distances:
353 1 0.00
354 4 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (360 bp):
AAATAGTCATAACTATTTGAACCTGGTTCAGTAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
ATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAATAAAACAATTGTTTTATGACAAAA
AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
Found at i:305632 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 305140--306598 Score: 923
Period size: 181 Copynumber: 8.1 Consensus size: 179
305130 AACAGATTTG
* * * * * * * * * *
305140 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTAAA
1 AAATAAGATTGTATGAACATAAATAATTATTTTA-GAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* ** * * * * *
305204 ATAGATAATTGCTCAAATAGCCATAACTCTTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAA
65 ATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
305269 TCTCTTACTTATTAATGTTTGAAATATTAATAAATTAGAACTGTGTTATTCT
130 TC-CTTACTTATTAAT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
* * * * * *
305321 AAATAAGTTTATACGAACAGAAATAATTATTTT-G--TAACAGACAAATGGTCATAACAATTTGA
1 AAATAAGATTGTATGAACATAAATAATTATTTTAGAATAA-A-ACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * * * * * ** *
305383 AATAAATAATTATTCAAACAGTTATAACTGTTTGCATTGGTTAGGCCAACAAATACATTTTCTAA
64 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAA
* * *
305448 ATCCGTTACTTATTAATTTTAAGAATATTAATAAGTTAGCATTACTTTATTCC
129 ATCC-TTACTTATTAATTTTAA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
* * * * * *
305501 AAATAAGATTGTATGAGCATAAACAATTATTTTAGGATAAAACCAATGGTCATAATGATTTGAAA
1 AAATAAGATTGTATGAACATAAATAATTATTTTAGAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * *
305566 TAAATAAATGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGGCAAATAGATTTATCTTTTAAAT
66 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAAT
* *
305631 CC---CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCT
131 CCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
* * * * * * **
305678 GAACAA-ACTTATATGAACAAAAAT-ATTTTTTTATGATAAAATAAAAAACAAAAGGTAATATTG
1 AAATAAGA-TTGTATGAACATAAATAATTATTTTA-G----AAT--AAAACAAAAGGTCATAACG
* * * *
305741 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAATAGAATTATT
58 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATT
* * *
305805 TTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTG-ATTTATTTTATTCC
123 TTTTAAA-TCCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCC
* ** * * * * **
305864 AAATAAG-TTAGTAAG-AGTTGAAAAAATTATTTTACAACAAAATAAAATATCATAACGATTTGA
1 AAATAAGATT-GTATGAACAT-AAATAATTATTTTAGAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * *
305927 AATAGAAAATTATTCATATAGCCT-TAACTATCTGTAA-TGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTT
64 AATAGATAATTGTTCAAATAG-TTATAACTATTTG-AACTGGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTT
* * * ** * *
305990 AAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTATTTGATTAATATTATTTTATTTC
127 AAATC-CTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
* * * * * **** * *
306045 GAATAAGCTTGTAAGAATAAAAATAATTATTTTATTGCAAAA-AAAAGGTTATAACAATTTGAAA
1 AAATAAGATTGTATGAACATAAATAATTATTTTAGAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * *
306109 TATATAATTGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTAGTTT-GCTAAATAGAATTATTTTTTAAA
66 TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGC-AAATAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
306173 TCTCTTGCTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTAATTTATTAC
130 TC-CTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
* *** * * * * * * *
306225 AAATAAAACTTAG-ATGAGTTTAAAAAATTGTTTTATAACAAAGCAAAAGTTCATAATGATTTGA
1 AAATAAGA-TT-GTATGAACATAAATAATTATTTTAGAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * ** *
306289 AATAGATAATTCTTCATATAATCT-TAACTGTTTGAACTGGTTTTACAAATGGATTTATTTTTTA
64 AATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTA
** * * * * * *
306353 AATATTTTAGTTATGAATTTTCATAATATTATTAATTTAATATTATTTTATTCC
128 AAT-CCTTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
* * * * * * *
306407 AAATAA-ACTTATATGAATAGAAATAATTTTTTTATG-ATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGA
1 AAATAAGA-TTGTATGAACATAAATAATTATTTTA-GAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
* * * * * * **
306470 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTGTTTGAATTGGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTGT
64 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAA
* * * * * *
306535 AT-C-T-CGTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTGTTATTTGATTTC
129 ATCCTTACTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
*
306584 AAATAAGCTTGTATG
1 AAATAAGATTGTATG
306599 TTCAAAAACA
Statistics
Matches: 985, Mismatches: 243, Indels: 104
0.74 0.18 0.08
Matches are distributed among these distances:
176 9 0.01
177 96 0.10
178 7 0.01
179 12 0.01
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185 4 0.00
186 44 0.04
187 12 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AAATAAGATTGTATGAACATAAATAATTATTTTAGAATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTAAAT
CCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC
Found at i:305870 original size:363 final size:357
Alignment explanation
Indices: 305361--306598 Score: 1066
Period size: 363 Copynumber: 3.4 Consensus size: 357
305351 TTTGTAACAG
* * * * * * * * *
305361 ACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTTATAACTGTTTGCATTGGTTA
1 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTT-
* * * * * * * *
305426 GGCCAACA-AATACATTTTCTAAAT-CCGTTACTTATTAA-TTTTAAGAATATTAATAAGTTAGC
65 TGCAAATAGAAT-TATTTTTTAAATATC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAG-
* * ** * * *
305488 A-TTACTTTATTCCAAATAAGATT-GTATGAGCATAAACAATTATTTTAGGATAAAACCAATGGT
126 ATTTATTTTATTCCAAATAAGATTAGTATGAGCATAAAAAATTATTTTACAACAAAACAAATGAT
* * * *
305551 CATAATGATTTGAAATAAATAAATGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAGTTTGGCAAATAG
191 CATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTT-TAACT-ATTGAACTGGTTTGGCAAATAG
* *
305616 ATTTATCTTTTAAATCCCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAA
254 ATTTATTTTTTAAATCCCTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCTGAA
* *
305681 CAAACTTATATGAACAAAAATATTTTTTTATGATAAAATAAAAA
319 TAAACTTATATGAATAAAAATATTTTTTTATGAT---AT--AAA
* *** * *
305725 ACAAAAGGTAATATTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGAACTAGTTT
1 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTT
* *
305789 GGCAAATAGAATTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGATTT
66 -GCAAATAGAATTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGATTT
* * *
305854 ATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTAAGAG-TTGAAAAAATTATTTTACAACAAAATAAAAT-ATCA
130 ATTTTATTCCAAATAAGATTAGTATGAGCAT-AAAAAATTATTTTACAACAAAA-CAAATGATCA
* * * *
305916 TAACGATTTGAAATAGAA-AATTATTCATATAGCCTTAACTATCTGTAA-TGGTTTGGCAAACAA
193 TAATGATTTGAAATA-AATAATTATTCATATAG-TTTAACTAT-TG-AACTGGTTTGGCAAATAG
* * **
305979 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTGTCAAAATATTATTTGATTAATATTATTTTATT-
254 ATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTC
* * * * **
306043 TCGAATAAGCTTGTAAGAATAAAAATAATTATTTTAT--TGCAAA
315 T-GAATAAACTTATATGAATAAAAAT-ATTTTTTTATGATATAAA
* * *
306086 A-AAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTAGTTT
1 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTT
* * * *
306150 GCTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTT
66 GC-AAATAGAATTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGATTT
* * * ** * * * * *
306215 AATTTATTACAAATAAAACTTAG-ATGAGTTTAAAAAATTGTTTTATAACAAAGCAAAAGTTCAT
130 ATTTTATTCCAAATAAGA-TTAGTATGAGCATAAAAAATTATTTTACAACAAAACAAATGATCAT
* * * * ** *
306279 AATGATTTGAAATAGATAATTCTTCATATAATCTTAACTGTTTGAACTGGTTTTACAAATGGATT
194 AATGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGT-TTAACT-ATTGAACTGGTTTGGCAAATAGATT
*** * * **
306344 TATTTTTTAAATATTTTAGTTATGAATTTTCATAATATTATTAATTTAATATTATTTTATTCCAA
257 TATTTTTTAAATCCCTTA--T-T-AATTTTCAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCTGA
* *
306409 ATAAACTTATATGAATAGAAATAATTTTTTTATG--ATAGA
318 ATAAACTTATATGAATAAAAAT-ATTTTTTTATGATATAAA
* * *
306448 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTGTTTGAATTGGTTT
1 ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTT
* * * * * *
306513 AGTAAATAGATTTATTTTTT--GTATC-T-CGTACTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAG-TGT
66 -GCAAATAGAATTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAT-T
* * *
306573 TATTTGATTTCAAATAAGCTT-GTATG
129 TATTTTATTCCAAATAAGATTAGTATG
306599 TTCAAAAACA
Statistics
Matches: 709, Mismatches: 127, Indels: 82
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
357 1 0.00
358 9 0.01
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367 57 0.08
368 9 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (357 bp):
ACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTT
GCAAATAGAATTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGATTTA
TTTTATTCCAAATAAGATTAGTATGAGCATAAAAAATTATTTTACAACAAAACAAATGATCATAA
TGATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTTTAACTATTGAACTGGTTTGGCAAATAGATTTATT
TTTTAAATCCCTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTAATATTATTTTATTCTGAATAAACTT
ATATGAATAAAAATATTTTTTTATGATATAAA
Found at i:306383 original size:362 final size:364
Alignment explanation
Indices: 305634--306589 Score: 1023
Period size: 362 Copynumber: 2.6 Consensus size: 364
305624 TTTAAATCCC
* * * * ** * * *
305634 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAACAAA
1 TTATGAATTGTCAAAATATTATTAATTTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATAAGAATAAA
* * * ***
305699 AAT-ATTTTTTTATGATAAAATAAAAAACAAAAGGTAATATTGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
66 AATAATTATTTTATG-----AT--AGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * *
305763 AAT-GTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGC-AAATAGAATTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTA
124 AATAGTCATAACTATTTGAATTAGTTTAGCTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTTA-TA
* * * * *
305826 ATTTTTGAAATATTAATAAATTTGATTTATTTTATTCCAAAT--AAGTTAGTAAGAGTTGAAAAA
188 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTAATTTATTACAAATAAAACTTAGTAAGAGTTGAAAAA
* *
305889 ATTATTTTACAACAAAATAAAATATCATAACGATTTGAAATAGAAAATTATTCATATAGCCTTAA
253 ATTATTTTACAACAAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAGAAAATTATTCATATAACCTTAA
* *
305954 CTATCTGTAATGGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
318 CTATCTGTAATGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTAG
* * * * * *
306001 TTATTAATTGTCAAAATATTATTTGA-TTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAAGAATAA
1 TTATGAATTGTCAAAATATTA-TTAATTTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATAAGAATAA
* *
306065 AAATAATTATTTTATTGCA-A-AA-AAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGCTCAAATA
65 AAATAATTATTTTA-TG-ATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
*
306127 GTTATAACTATTTGAATTAGTTT-GCTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATAAATTT
128 GTCATAACTATTTGAATTAGTTTAGCTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTTAT-AATTT
* * *
306191 TTGAAATATTAATAAATTAGTTTTAATTTATTACAAATAAAACTTAG-ATGAGTTTAAAAAATTG
192 TTGAAATATTAATAAATTAGTTTTAATTTATTACAAATAAAACTTAGTAAGAGTTGAAAAAATTA
* * * * * * *
306255 TTTTATAACAAAGCAAAAGT-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTCTTCATATAATCTTAACTG
257 TTTTACAACAAAACAAAA-TATCATAACGATTTGAAATAGAAAATTATTCATATAACCTTAACTA
* * *** *
306319 TTTG-AACTGGTTTTACAAATGGATTTATTTTTTAAATATTTTAG
321 TCTGTAA-TGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTAG
* * * *
306363 TTATGAATTTTCATAATATTATTAATTTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAATAGA
1 TTATGAATTGTCAAAATATTATTAATTTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATAAGAATAAA
* *
306428 AATAATTTTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
66 AATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * ** *
306493 ATAACTGTTTGAATTGGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTGTATCTC--G--TACTAATTCTTG
131 ATAACTATTTGAATTAGTTTAGCTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTTA-TAATTTTTG
* *
306553 AAATATTAATAAATTAGTGTT-ATTTGATTTCAAATAA
195 AAATATTAATAAATTAGTTTTAATTT-ATTACAAATAA
306590 GCTTGTATGT
Statistics
Matches: 501, Mismatches: 71, Indels: 42
0.82 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
358 4 0.01
359 39 0.08
360 38 0.08
361 99 0.20
362 166 0.33
363 86 0.17
364 1 0.00
365 1 0.00
367 55 0.11
368 10 0.02
369 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (364 bp):
TTATGAATTGTCAAAATATTATTAATTTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATAAGAATAAA
AATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAATTAGTTTAGCTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTTATAATTTTTGA
AATATTAATAAATTAGTTTTAATTTATTACAAATAAAACTTAGTAAGAGTTGAAAAAATTATTTT
ACAACAAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAGAAAATTATTCATATAACCTTAACTATCTGT
AATGGTTTGACAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTAG
Found at i:307380 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 307064--309431 Score: 1733
Period size: 181 Copynumber: 13.1 Consensus size: 181
307054 TTTGAAATAG
** * * * * *
307064 ATTATCTATTTCAAATCGCTATGA-ATTTTTTATTTGTCATAAAAAAAATTGTTTTTCATT-GTA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCT-ATTCATA
* * ** *
307127 TAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATT-TCAAAAATTAATGAGT-AGAAGA
63 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-AGA
* * *
307189 TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACCAATGCAAATAGTTATAACTATTTAAACA
126 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* ** * * * * * *
307245 ATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTAATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * * * * *
307310 GCTTATTTGGAATTAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTTATAACTTAGAGATTTTA
66 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * ** * * * * * * *
307375 AAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAAGA
131 AAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* * * * * * * **
307426 ATTATCTATTTTTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGCCATAGAACAAATGTTTTTGTTCATTTA
1 ATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * *
307491 AGTTTGTTTGGAATAAAATAATATTAATATATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTA
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
307551 AAAAATAAATCTCTTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTAAATA
130 AAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* * ** * *
307603 ATTATTTATGTCAAATCATTATTCCCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-A
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * *
307667 GTCTTATTT-AGAATAAAGTAATGCCAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACG-GATT
66 G-CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATT
* * * * *
307730 TAAAAAATGAATCTG-TTAGCCT-AACCAATGCAAATAATTATAAC-AGTTTAAATA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTA--CTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA-TTTAAACA
* * * * * *
307784 ATTACCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTT-TTATTGTCCTAAAATAATTGTTTCTATTCGTACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * * * * *
307848 AGCTTATTCAAAACAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGGTAA-ATATTT
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTT
* * * *
307912 AAAAACTAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACA
129 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* * * * * ** *
307965 ATTATCTATTTGAAAT-AGGTATAAACTTTTGTTTTGTCACAAAATGATTTTTTCTATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * *
308029 AGCCTATTTGAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATT
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATT
* * * **
308092 TGAAAAATAAATATGTTTACCT-AA-CAAGTTCAAATCA-TTAGGACTATTTAAGTA
128 TAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTAAACA
* ** * * * *
308146 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTATTTGTTTAGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * * * *
308210 AGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAA-TAATAAGTAAAATATTTA
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
308274 AAAAATAAATATGTTTACAGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTT-GACTC
130 AAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAAC-A
* * * * * * *
308326 ATTATTTA-TTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA-TATT-TTTTTAATTTATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * *
308388 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTA
65 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
308453 AAAAATGAATCTATTTAC-CAAACATATTCAAATAGTTATGACTATCTGAATA
130 AAAAATAAATCTGTTTACTGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* * * * * *
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1 ATTATCTATTTC-AAATCA-T-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* **
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * **
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64 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * *
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129 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AA--A-CA
* * **
309056 ACTATGAACTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATA
1 A-T-T-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* ** ** *
309121 TAAAATTATTCAAAATGAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
63 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
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127 TTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
* * * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * * *
309300 GCTTA-TACAAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTACTAAGTAAGAGGTTTA
66 GCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAAT
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Statistics
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AAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
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* * * *
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* * ** ***
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* * ** * ** * *
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* * * * * * * **
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* *
309489 TTTAAAAA-TAAATATGTTTAC-CGAACTAGATCAAGTAATCATGACTATTTGAATAATTATCTA
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* * *
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* * *
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* * ** * ** *
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* * *
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTTAAAAACTAAATATGTTTCTCGAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCTAT
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AATAAAATAATACTAAATTAATAATAAGCCAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
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CCATTTGTTAGTAATAAAATAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAAT
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Alignment explanation
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Period size: 852 Copynumber: 1.9 Consensus size: 852
308611 CTAAAATTCC
* * * * *
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* * * * * ***
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*** * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * ***
308946 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATC
325 AATAAAATAATACAAATTTATCAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* *
309011 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATAAACTATGAACTATTTCAAATC
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*** * *
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452 ATTATGACATTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAA
* * * * *
309141 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTCTCGAA
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* * ** * * *
309206 CTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTGTCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTG
582 CAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTCTTTTA
** * * *
309271 TCTTAAAACAATTTTTTCTGTTCATATAAGCTTATACAAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATA
647 TAGTAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATACAAAGTAAAATAATACTAAATTAATAATA
* * * * *** * * * * * *
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777 AAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACCATTTGTTAGTAATAAAATAATATT
309466 TTGATAATTAA
842 TTGATAATTAA
* * *
309477 TAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA-GATCAAGTAATCATGACTATTTGA
1 TAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAC-ACGATCAAATAATCATGACTATTTGA
* * * * * *
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64 ACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCCCTTTGTTCTGTCATAAAACAATCGTTTCAACTCAT
*
309605 ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAA-GCCAAAAATTAAGAAT-AAAGAG
129 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATGCCAAAAATTAA-AATCAAA-AG
* ** *
309668 ATTT-TAAAAA-AAATCTATTTATTTAAC-AAGTTTAAATACTTATGACTATTTTAACAATTATT
191 ATTTATAAAAATAAATCTATCTATCGAACGAA-TTTAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * *
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*
309791 TATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATCAATA-TTAAGGCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAA
318 TA-TTCGAAATAAAATAATACAAATTTATCAATATTTAA--AAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAA
* * * * * **
309854 AAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATCA-TTATGACTATTTG-T-GAAA-T-T-ATTTA
379 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTCATGACCATTTGATAGAAACTATGAACTA
* ** * * * **
309913 TTTCAATTTGTTATGACTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATT-
443 TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTC
* *
309977 AAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGACAATTACTAAGTAAAAGATTTTAAAAAATA
508 AAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-A-AA-AACTAA-TAAAAGA-TTTAAAAAATA
* * * *
310042 AATATGTTTAC-CAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATCAT
567 AATATGTTT-CTCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCAT
* *
310106 TATGATCTTCTCTTTTATAGTAAAACAATTGTTTCAGTTCATGTAAGCTTATTTC-AAGTAAAAT
631 TATGATCTT-TCTTTTATAGTAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TACAAAGTAAAAT
* * * * * *
310170 AATATTAATTTATTAATATGCCAAAAATTAATGAGCAATAAAATTAAAAAA-AGAATCTATTTAT
694 AATACTAAATTAATAATATGCCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATA-AATCTATTTAC
* ** * * * *
310234 TGAATAAATTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
758 TGAACAAATCCAAATAGTCAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAA
310283 ACACTATGAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (852 bp):
TAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACACGATCAAATAATCATGACTATTTGAAC
AATTATCCATTTCAAATCATTATGACCCCTTTGTTCTGTCATAAAACAATCGTTTCAACTCATAA
AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATGCCAAAAATTAAAATCAAAAGATTTA
TAAAAATAAATCTATCTATCGAACGAATTTAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTA
AAATCACTATCATACTTTGTTTTGTCATAAAAACAATTGTTTTCATTCACAAAAGCTTATTCGAA
ATAAAATAATACAAATTTATCAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGATAGAAACTATGAACTATTTCAAATCATTA
TGACATTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAAT
ACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTCTCAAACAAG
TTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTCTTTTATAGT
AAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATACAAAGTAAAATAATACTAAATTAATAATATGCC
AAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATCCAAATAGTCAAGA
CTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTAACCATTTGTTAGTAATAAAATAATATTTTGA
TAATTAA
Found at i:310452 original size:18 final size:17
Alignment explanation
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310412 TCTGAACATG
*
310422 TTCAAATAGTTATCACTAT
1 TTCAAATAATTAT-A-TAT
310441 TT-AAATAATTATATAT
1 TTCAAATAATTATATAT
*
310457 TTCAAATCATTAT
1 TTCAAATAATTAT
310470 GATCTTTTGT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 2, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
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19 2 0.08
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.02, T:0.46
Consensus pattern (17 bp):
TTCAAATAATTATATAT
Found at i:310482 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 309471--312767 Score: 2041
Period size: 181 Copynumber: 18.3 Consensus size: 179
309461 ATATTTTGAT
* * * * * * * * *
309471 AATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATCAAGTAATCATGACTA
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* * * * * *
309536 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTCTGTCATAAAAGAATCGTTTCAAC
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* * * * **
309601 TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAAGCCAAA
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* * * * * *
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* * * * ** * * * * *
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** * ** * *
309778 ATTCGCAAAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATCAATATT--AAGGC
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* *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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1 AATTAATAAGTAAAA-A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
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64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTA
** * *
310142 GTTCATGTAAGCTTATTTCA-AGTAAAATAATATTAATTTATTAATATGCCAAA
128 -TTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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127 ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATT-AATTTATTAATATTCCAAA
* * * *
310376 AATTAATAAGTAAAAATTTGAAAAATAAATCTATTTTCTGAACATGTTCAAATAGTTATCACTAT
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
310441 TTAAATAATTATATATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTCTCATAAACCAATTGTTTTTATG
66 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATT
* * * * * * *
310506 CATAAAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAA
130 CATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * * *
310556 AATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAGATAAATACAT-TTAT-TGAGCGAGTTCAAATAATTATGAC
1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAAT-C-TGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
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63 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * *
310684 ATTCATACAAGTTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
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* * * * * * * * * *
310737 AATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACTAAACAAGTTCAAATAATCT-GGTCC
1 AATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGT-TATGACT
** * * * ** ** * ** * *
310801 ATTCAAACAATTATTTATTTCAATTTGTTATGA-CATTTCATTTTTTTGTAAAATAATTATTTTT
64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTT
** * * * * *
310865 ATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATGATACTAGTTTATTAATATTTCAAA
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* * * * ** *
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1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
310974 TTGGACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATT
66 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATT
* ** ** * *
311038 CATACAAGCTTATTT-GAAGTAAAATATTCCTAAACTAATAATATTCTAAA
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* * * ** **
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* ** * * *
311152 ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTT-TTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTA
64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
311216 GTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACATTATTTTATTAAGATTCAAAA
128 -TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * * ** *
311269 AATCAATAAGCAAGAAATTT--AAAA-AAATATGTTTACTGAACAAGTTTACCTACTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* ** * * * *
311331 TTTGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTATCCTAAAACAATTATTTCAA
65 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* * ** * **
311395 ATCATAAAAAGCTTATCCA-ATATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAA
128 TTCAT-ACAAGCTTATTTAGA-ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * **** * * ** *
311448 AATTGAGAAGTTGGTGACTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATC-AAATTAGTTCAAATAATTATGA-
1 AATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCT-GTTT-TCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
311510 TCATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT-ATTATAAACTTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTT
63 T-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * **
311574 TTATCATATAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAA
127 AT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
*** * * *
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1 AATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATCTG-TTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * *
311692 ATTTGAACAACTATATATTTCAAGTCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTATG
64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA
* * * ** * * ***
311757 TTTATACAAGTTTGTTT-GAAATAAAATAATACAAATCTAATAATATTATGAA
128 TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * * * * * *
311809 AATTAATAACT-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACCAA-TTTAGATAGTTAAGGCTA
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * *
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65 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTA
* * ***
311936 TTCATATAAG-TT-TGTTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAA
128 TTCATACAAGCTTAT-TTAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * ** * * * *
311988 AATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCAGTTTAATTAGTTATCA-TAA
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-A
* * * * * *
312049 TTTGAA-AATTTATTTTATTTCAAATCATTTTCACCATTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTT
65 TTTGAATAA-TTA-TCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT
* * * * * ** * * *
312113 ATTGATAC-AGTATTATTCAAAATAAAGTTAATGCTAATTTGTTATTATTCTAAA
127 ATTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAA-ATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * ** * * *
312167 AATTACTAAGTAATGGAAA--TAAAAAATTAATCTGTTGGCCTG-ACCAGTACAAATAGTTATAA
1 AATTAATAAGTAA---AAATTTAAAAAATAAATCTGTT-TTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
312229 CTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTC
62 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-
* * ** * * *
312293 TGTTCGTGTAAGCTAATTTGGAATAACATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAA
126 TATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTCCAAA
* * * * *
312347 AATTAATAAGTAACAAATTTAAGAACTGAATCTGTTTGTC-GAACAAATTTAAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * * *
312411 TAATTGAATAATTACCTATTTCAAATCCCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCT
63 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
* * * *
312476 ACTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAAT-TCAAATTTATTAATATT-CAGAC
127 ATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTCCA-AA
* * * * * *
312529 AATTAATGAGTAAAATATTTAAAAACTAAATATGTATAT-TGAATAAGTTTAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGT-TTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
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64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTA
* ** * * *
312657 TTCATAAAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAC
128 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAA
* * * ** *
312709 AATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTAATGAACTAGTTCAAATAGTTA
1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTA
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Statistics
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * ** * * * **
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* * *
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* * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * **
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* * **
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* * * * * * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAATA-AATAC-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATGAC
* * *
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* * * * *
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* * * * *
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190 TAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
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*
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* * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATACGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTA
* * * * * * *
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* *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * ** * * *
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257 CTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATA-AAAGCTT
* * *
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320 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * *
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* * * *
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64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * ** ** *
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* * * ** ** *
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193 -AAATTTAAAAAATAAATATATTTTCTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * *
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* * * *
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* * * * ** *
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1 AATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAATAAATACGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAATTATGACT
* ** * * * *
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64 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * ** * * * *
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**** * * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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*** * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATACGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTA
* * * * * * * * * *
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* * ** * * * * *
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130 TCATACAAGTTTATTT-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * **
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** * * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATACGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATGACT-
* * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * ** * * * * *
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189 GTAA---AAATTTAAAAAATAAATATATT-TTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * **
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250 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAA
* *** * * *
312302 AAGCTAATTTGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAA
314 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
312347 AATTAATAAGTAACAA-ATTTAAGAACTGAAT-CTGTTTGTCGAACAAATTTAAAATAGTTATGA
1 AATTAATAAGTAA-AAGATTTAA-AAATAAATAC-GTTTATCGAAC-AAGTTCAAATAATTATGA
* * ** * * * *
312410 CTAATTGAATAATTACCTATTTCAAATCCCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTC
62 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
312475 TACTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAAT-TCAAATTTATTAATATTC-AGACAATTAATGA
127 TATTCATACAAGTTTATTT-AAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAA
* * * * *
312538 GTAAAATATTTAAAAACTAAATATGTATAT-TGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATA
189 GTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATAT-TTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * ** *
312602 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTTTTTGTCATAAAATAATTACTTTTGTTCATAAAAG
252 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAG
** * * *
312667 CTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAC
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* * *
312709 AATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTAAT-GAACTAGTTCAAATA
1 AATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATACGTTT-ATCGAACAAGTTCAAATA
312764 GTTACTAATT
Statistics
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Consensus pattern (358 bp):
AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATACGTTTATCGAACAAGTTCAAATAATTATGACTAT
TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATT
CATACAAGTTTATTTAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAA
TTTAAAAAATAAATATATTTTCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
TTCAAATCGTTATGACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGCTTATTCAA
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
Found at i:312825 original size:80 final size:79
Alignment explanation
Indices: 312689--312846 Score: 203
Period size: 80 Copynumber: 2.0 Consensus size: 79
312679 AAAATAATAT
*
312689 TAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTT-AATGAAC
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*
312753 TAGTTCAAATAGTTAC
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* * * * *
312769 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGA-TTTAAAATATGAATTTGTTTCCAAAAC
1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAA-ATAAATATGTTT-CAAAAC
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64 AAGTTCAAATAGTT
312847 TTGACTATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (79 bp):
TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTCAAAACAA
GTTCAAATAGTTAC
Found at i:313074 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 312766--313164 Score: 496
Period size: 179 Copynumber: 2.2 Consensus size: 179
312756 TTCAAATAGT
* * * * * * * * ****
312766 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATTTGTTTCCAAA
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*
312831 ACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAACAAATATCTATTGCAAATCATTATGACATTTTGTTT
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* **
312896 TGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATTCAAGCTTATTTAGA-ATAAAATAA
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*
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* * * * * ** *
313011 ACAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATGGTTATGACCTTTTGTTTT
65 ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCTATTGCAAATCATTATGACATTTTGTTTT
* *
313076 GTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGAGTATTTGACATAAAATAA
130 GTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATACAAGAGTATTTGACATAAAATAA
*
313126 TACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAA
1 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAA
313165 AATTTTAAAA
Statistics
Matches: 186, Mismatches: 29, Indels: 8
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
178 2 0.01
179 131 0.70
180 22 0.12
181 31 0.17
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTAAAAAAATAAATCTATTTTTTGAA
CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCTATTGCAAATCATTATGACATTTTGTTTTG
TCATAAAATAATTGGTTCTATTCATACAAGAGTATTTGACATAAAATAA
Found at i:313201 original size:26 final size:25
Alignment explanation
Indices: 313162--313212 Score: 75
Period size: 26 Copynumber: 2.0 Consensus size: 25
313152 TAATAAGTAA
*
313162 AAAAATTTTAAAAACAATTTTGTTT
1 AAAAATTTTAAAAACAAATTTGTTT
*
313187 AAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTT
1 AAAAATTTT-AAAAACAAATTTGTTT
313213 TCCAAACAAG
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 2, Indels: 1
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
25 9 0.39
26 14 0.61
ACGTcount: A:0.51, C:0.02, G:0.04, T:0.43
Consensus pattern (25 bp):
AAAAATTTTAAAAACAAATTTGTTT
Found at i:314546 original size:362 final size:357
Alignment explanation
Indices: 313408--315182 Score: 1074
Period size: 357 Copynumber: 4.9 Consensus size: 357
313398 CTAGTTAAGA
* ** * * * * *
313408 CTATTAGAACAATTACATATTTCAAATCAG-TCTGACCTTTTGCTTAGTTATAAAACAATTGTTT
1 CTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAAAAATTGTTT
* * * * *
313472 TACT-TCATACAGGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAAAA
64 CA-TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAA
* * *
313536 GAAAGAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACA
128 GAAA-AGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACA
* * * * *
313601 ATTGTCTATATAAAATTGTTATAATCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAA
192 ATTATCTATATAAAATTGTTATAA-CTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAA
* * * * * * *
313666 GCTTA-CACAAAATAAAATACTATTAATTTATTAATATTTCTAAAATTATTAAGTAAGAAATTAA
255 GCTTATC-CAAAATAAAATAATACTAA-TTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * ** * *
313730 AAAAATGAATCTATTTACTGAATCAGTTAAAATAATTATAG
318 AAAAATAAATATGTTTA-TGAAAAAATTCAAATAATTATAG
* * * **
313771 CCATTCA-AATGATTATTTA-TTACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTG-T
1 CTATT-AGAATAATTATTTATTTA-AAATCGTTATGACCTTTTG-TTTATCATAAAAAAATTGTT
** * * *
313833 T-ATTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTTATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
63 TCA-T-ATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAT
* * * * * * * *
313897 AAGTAACAGA-TTGAAAAAATAAATCTATTTACCCAACCAGTTTAAACAGCTATGACTATTTGAA
126 AAG-AAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAA
* * * * * * **
313961 CAATTATCAATCTCAAATTGTTA-AAATTATTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGATCATTG
190 CAATTATCTATATAAAATTGTTATAACTT-TT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAA
* ** *
314025 AAGCTTATTC-AGTTAAAATAATACTAA-TC-TAATAATATTCTAAAAATTAACAAGTAAGAGAT
253 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTCTTAAT-AT-TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
314087 TTAAAAAATAAATATG--TATGCCAAACTAATTCAAATAGTTAAAA
315 TTAAAAAATAAATATGTTTATG--AAA-AAATTCAAATAATTATAG
* * * * * * *
314131 CTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTCTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC
1 CTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTA-TCATAAAAAAATTGTTTC
* * * *
314196 ATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGC
65 ATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAG-
* * * * ** * *
314261 AAAAGATTTGAAAAAGTAAATTTGTCTATCAAACAACCTAAAATAGTTATTACTACTTGAATAAT
129 AAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAAT
* * * *
314326 TATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTGACATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGC
194 TATCTATATAAAATTGTTAT-AACTTTTT-TTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGC
* * *
314391 TTATCCAAAATAAAATAATACTAATTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAGTTTTAAAAA
257 TTATCCAAAATAAAATAATACTAATTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * *
314456 ATAAATTTGTTTATTGAAAAAATTCTAATACTTATGG
322 ATAAATATGTTTA-TGAAAAAATTCAAATAATTATAG
* * * * *
314493 CTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTGTTTC
1 CTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TATCATAAAAAAATTGTTTC
* * ** *
314558 A-ATTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAA
65 ATA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATT-TAAAAAATTAATAA
* * * * * * * * * ** * *
314621 G---TGATTT-TAAAAGTGAATATGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACA
128 GAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACA
* * * * * * ** * * * * **
314681 ATTATCAATTTCAAATTGTTAATACCTATTGTTTGGAATAAAATAGTTTTTTCAATTCATACTAG
192 ATTATCTATATAAAATTGTT-ATAACTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAG
* * * * * *
314746 GTTA-CTCGAAATAAAATAA-AATGAATT-TATCAATATTTCAAAAATCAATAAGTAACAGGTTT
256 CTTATC-CAAAATAAAATAATACT-AATTCT-T-AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * ** * *
314808 AGAAAATAATTATATTTACCT-AATTAGTTCAAAAAATTAT-G
317 AAAAAATAAATATGTTTA--TGAAAAAATTCAAATAATTATAG
* * * * * * *
314849 ACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATAT-T
1 -CTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTATCATAAAA-AAAT-TGT
* * * * * *** * * * * * *
314913 GTT-GT-TCATATATGTTTGTTTGGAACAAAATAATAATAATCTACTAATATTTTAAAAATTAAT
62 -TTCATATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAT
* * * *
314976 AAG---AGATTT-AAAAAATAAATC-GTTT-CTCAAATCAA-TTCAAATAATTATGATTATTT-A
126 AAGAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAA-CAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGA
* * * * * * *
315033 AGCAATTATTTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAA-TAGTTTCTA-TTC
189 A-CAATTATCTATATAAAATTGTTATAAC-TTTT-TTTTGTCATAAAACAATTA-TTTC-AGTTC
* * * * ** * *
315096 ATATAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTCATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AA
249 ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTC-TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* *
315160 ATTTTCAAAAATAAATATTTTTA
313 A-TTTAAAAAATAAATATGTTTA
315183 GCCAACTAGA
Statistics
Matches: 1104, Mismatches: 249, Indels: 124
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
355 13 0.01
356 95 0.09
357 305 0.28
358 27 0.02
359 13 0.01
360 155 0.14
361 105 0.10
362 253 0.23
363 121 0.11
364 11 0.01
365 6 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (357 bp):
CTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTATCATAAAAAAATTGTTTCA
TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGAA
AAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTA
TCTATATAAAATTGTTATAACTTTTTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTAT
CCAAAATAAAATAATACTAATTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
ATATGTTTATGAAAAAATTCAAATAATTATAG
Found at i:314584 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 313191--315230 Score: 845
Period size: 181 Copynumber: 11.4 Consensus size: 178
313181 TTGTTTAAAA
* * * * *
313191 ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTTC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATC
1 ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * ** * * * * * ** *
313255 TCTCTCAAATCATTATGA--TATTTATTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCCTTTCA-ACAAGCTTA
65 TATTTAAAATTGTTATGACCT-TTTGTTCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA
* * * *
313317 TTTGAATTAAAATAATACTAA-T-TTAATAATATTCTAAAATT-TTGGGAGTAAG
129 TTTGAAATAAAATAATACTAATTCTTAAT-AT-TTCAAAAATTAAT--AAG-AAG
* * * *
313369 ATATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-T----CGAA--C---TAGTTAAGACTATTAGAACAATTA-
1 AT-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * * *
313423 CATATTTCAAATCAG-TCTGACCTTTTGCTT-AGTTATAAAACAATTGTTTTACTTCATACAGGC
64 C-TATTTAAAAT-TGTTATGACCTTTTG-TTCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGC
* * * * * *
313486 TTA-TTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAAAAAGAAAGAG
126 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-AG
* * * * * *
313543 ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTC
1 ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * *
313607 TATATAAAATTGTTATAATCTTTTGATT-TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTA
65 TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTG-TTCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA
**** * * * * *
313671 CACAAAATAAAATACTATTAATTTATTAATATTTCTAAAATTATTAAGTAAG
129 TTTGAAATAAAATAATACTAA-TTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAG
* * * * * * * * * ** **
313723 AAATTAAAAAAATGAATCTATTTACTGAATCAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTCAAATGATTAT
1 -ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAATTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTAT
* * * ** ** *
313787 TTA-TTACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTATTGA-TCATACAAGCT
64 CTATTTA-AAATTGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTGTT-TCAATTCATAAAAGCT
* *
313850 TATTTGAAATAAAATAATACTTATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAG
127 TATTTGAAATAAAATAATAC-TAATTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-AG
* * * ** * * * * ** *
313906 A-TTGAAAAAATAAATCTATTTACCCAACCAGTTTAAACAGCTATGACTATTTGAACAATTATCA
1 ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * ** * * * * **
313970 ATCTCAAATTGTTA--AAATTATTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGA-TCATTGAAGCTTA
66 ATTTAAAATTGTTATGACCTT-TTGTTCTGTCATAAAAAAATTGTTTC-AATTCATAAAAGCTTA
* ** *
314032 -TTCAGTTAAAATAATACTAA-TC-TAATAATATTCTAAAAATTAACAAGTAAG
129 TTTGAAATAAAATAATACTAATTCTTAAT-AT-TTC-AAAAATTAATAAG-AAG
* * * * * * ** * *
314083 AGATTTAAAAAATAAATATGTATGC-CAAACTAATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT
1 A-TTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAAC-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
* * ** * * * * * * *
314147 TTATTTCAAATCATTTTGATCTCTTGTT-TAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCT
64 CTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCT-GTCATAAAAAAATTGTTTCAAT-TCATAAAAGCT
** * * * * **
314210 TATTCAAAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCAAAAG
127 TATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AAG
* * * * * * * * * * *
314266 ATTTGAAAAAGTAAATTTGTCTA-TCAAACAACCTAAAATAGTTATTACTACTTGAATAATTATT
1 ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
314330 TATTTAAAATTGTTATGACCTTTT-TCTTTGACATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTA
65 TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGT-TCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA
*** *
314394 TCCAAAATAAAATAATACTAATTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAG
129 TTTGAAATAAAATAATACTAATTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAG
* * * * * *
314445 AGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAAAAAATTCTAATACTTATGGCTATTTGAACAATTGTC
1 A-TTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC
* *
314510 TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTAT
65 TATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTAT
* *
314575 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAG-TG
130 TTGAAATAAAATAATACTAA-TTCTTAATATTTC-AAAAATTAATAAGAAG
* * * * * * * * *
314624 ATTTT-AAAAGTGAATATGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCA
1 ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * ** * * * ** * *
314688 ATTTCAAATTGTTAAT-ACCTATTGTT-TGGAATAAAATAGTTTTTTCAATTCATACTAGGTTAC
66 ATTTAAAATTGTT-ATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTAT
* * * *
314751 TCGAAATAAAATAA-AATGAATT-TATCAATATTTCAAAAATCAATAAGTAAC
130 TTGAAATAAAATAATACT-AATTCT-T-AATATTTCAAAAATTAATAAG-AAG
* * * ** * *
314802 AGGTTTAGAAAAT-AATTATATTTACCT-AATTAGTTCAAAAAATTATGACTATTTGAACAATTA
1 A-TTTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
314865 TCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATAT-TGTT--GTTCATATATG
63 TCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAA-AAAT-TGT-TTCAATTCATAAAAG
* * * * * *
314927 TTTGTTTGGAACAAAATAATAATAA-TCTACTAATATTTTAAAAATTAATAAG-AG
125 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCT--TAATATTTCAAAAATTAATAAGAAG
* * *
314981 A-TTTAAAAAATAAA-TCGTTT-CTCAAATCAATTCAAATAATTATGATTATTT-AAGCAATTAT
1 ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAA-CAATTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTAT
* * * * * * * * * *
315042 TTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATAGTTTCTATTCATATAAGCTTA
64 CTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA
* * ** * *
315107 -TTCAGATTAAAATAATACTAATTCATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAA
129 TTTGA-AATAAAATAATACTAATTC-TTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAG
* * * * * *
315160 ATTTTCAAAAATAAATATT-TTTA--GCCAACTAGA-TCAAATAATCATGACTACTTGAATAGTT
1 ATTTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACTG-AAAC-A-ATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
315221 ATCTATTTAA
62 ATCTATTTAA
315231 GTTCATACAA
Statistics
Matches: 1419, Mismatches: 333, Indels: 217
0.72 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 32 0.02
171 26 0.02
172 27 0.02
173 30 0.02
174 12 0.01
175 20 0.01
176 173 0.12
177 89 0.06
178 23 0.02
179 121 0.09
180 266 0.19
181 344 0.24
182 236 0.17
183 16 0.01
184 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (178 bp):
ATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAACAATTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
ATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATT
TGAAATAAAATAATACTAATTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAG
Found at i:314763 original size:176 final size:179
Alignment explanation
Indices: 314331--315182 Score: 470
Period size: 176 Copynumber: 4.8 Consensus size: 179
314321 ATAATTATTT
* * * * *
314331 ATTTAAAATTGTTATGACCT-TT-TTCTTTGACATAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTA
1 ATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTC-TAGA-ATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTA
* * * *
314394 -TCCAAAATAAAATAATACTAA-TTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAGTTTTAAAAAA
64 CT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--TGAGTTTTAAAAAA
* * * * * * * *
314457 TAAATTTGTTTATTGAAAAAATTCTAATACTTATGGCTATTTGAACAATTGTCT
126 TAAATATGTTTACTGAAAAAATTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCA
* ** * *
314511 ATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTATT
1 ATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTCTAGAATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTACT
* * *
314576 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTGA-TTTT-AAAAGTGAA
66 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTGAGTTTTAAAAAATAAA
** *
314638 TATGTTTACTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCA
130 TATGTTTACTGAAAAAATTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCA
* * * * * **
314688 ATTTCAAATTGTTAAT-ACCTATTGTT-TGGAATAAAATAGTTTTTTCAATTCATACTAGGTTAC
1 ATTTAAAATTGTT-ATGACCTATTGTTCTAGAATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTAC
* * * * * *
314751 TCGAAATAAAATAA-AATGAATTTATCAATATTTCAAAAATCAATAAGTAACAGGTTTAGAAAAT
65 TCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--GAGTTTTAAAAAAT
* * ** * * * * * *
314815 AATTATATTTACCT-AATTAGTTCAAAAAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
127 AAATATGTTTA-CTGAAAAAATTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCA
* * * * * * * * *
314868 ATTTTAAATTGTTATGACCTTTTATT-TTGTCATAAAACAAATAT-TGTT--GTTCATATATGTT
1 ATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTCTAG-AATAAAA-AAAT-TGT-TTCAATTCATAAAAGGT
** * * * * * * * *
314929 TGTTTGGAACAAAATAATAATAATCTACTAATATTTTAAAAATTAATAA--GAGATTTAAAAAAT
62 TACTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGAGTTTTAAAAAAT
* * * *** **
314992 AAAT-CGTTT-CTCAAATCAATTCAAATAATTATGATTATTT-AAGCAATTATTT
127 AAATATGTTTACTGAAA-AAATTCAAATAATTATGGCCATTTCAA-CAATTATCA
* * * * * * * * * * * *
315044 ATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTT-TTGTTATAAAATAATAGTTTCTATTCATATAAGCTTAT
1 ATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTCTAG-AATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTAC
* * ** * * * *
315108 TC-AGATTAAAATAATACTAATTCATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAATTTTCAAAAAT
65 TCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--GAGTTTTAAAAAAT
*
315172 AAATATTTTTA
127 AAATATGTTTA
315183 GCCAACTAGA
Statistics
Matches: 525, Mismatches: 115, Indels: 62
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 4 0.01
175 10 0.02
176 174 0.33
177 84 0.16
178 7 0.01
179 7 0.01
180 149 0.28
181 78 0.15
182 9 0.02
183 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
ATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTCTAGAATAAAAAAATTGTTTCAATTCATAAAAGGTTACT
CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGAGTTTTAAAAAATAAAT
ATGTTTACTGAAAAAATTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCA
Found at i:316356 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 315232--318596 Score: 2393
Period size: 181 Copynumber: 18.8 Consensus size: 179
315222 TCTATTTAAG
* * * ** * ***
315232 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATGATACTAAACTATTAATATTCCAAAAATTAATGTCTA
1 TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
315296 AGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTCACTGAACAAGTTTAAATAATTAGGACTATTTAAACAATTA
64 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * *
315361 TCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTGTTT-TCATAAAATGATTTTTTTTTG
129 TCTATTTCAAATCATTAT-GCCTTTTGT-TTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTA
* *
315414 TTCATACAAGCTTACTTT-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TCAAGACAATTAATAAGT
1 TTCATACAAGCTTA-TTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGT
* * * * *
315477 AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATT
63 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * ** *
315542 ATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTTATTTTGTCATAAAACAACTAATTT-TG
128 ATCTATTTCAAATCATTATG-C-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTA
* * ** * * * *
315596 CTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGATAATTAATAAGTAA
1 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAA-TATTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
315661 AAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA
65 AAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
315726 TCTATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTT-TAATAAAATAATTGTTTC-A
129 TCTATTTCAAATCATTAT-GCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * *
315776 GTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA-AGAGT
1 -TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATA-AGT
* * * * * * *
315840 AAGAGAATTAAAAAAAATGAATTTG-TTACCCAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAAAAA
63 AAAAG-ATT-TAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * *
315904 TTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGATTT-TG
126 TTATCTATTTCAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTA
* * * *
315959 TTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAC
1 TTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
316023 AA-ATTT-AAAAATAAATATGTTATA-TGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTA
65 AAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
316085 TCTATTTCAAATTATTATGACCATTTCTTTTTTCATAAACCAATT-TGTTCTG
129 TCTATTTCAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTA
* * * * * * * ** *
316137 TTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTGTTAATACTCCAAAATTAATAATTAAA
1 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * *
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66 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
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* * * *
316316 TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAACATTAATTT-TGT--TATTCTAAAAATTAACAAGTT
1 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTAT-TAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
316378 GAAGATTTAAAAAATTAATCTTTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGTCCATTTGAACTATTA
64 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * *
316443 TTTATTTTAAATTGTTATGACATTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA
129 TCTATTTCAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * ** * *
316495 TTCAGACAAAATTATTCAAAATAAAATAATGCTAA-TTATTACTCTTTCAAAAATTAAT--G--A
1 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * **
316555 CACATTTAAAAACTAAATCTCTTTATCGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
65 AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * *
316620 CTATCTAAAATCATTACGATCTATT-TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTATG
130 CTATTTCAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
316670 TTCATACAAGCTTA-TTCGAAGTAAAATATTATTAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG--
1 TTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTA
* ** * * * **
316732 ---CATTTAAAAAATAAATAAGTTTACTGAAGC-AGTGCAAATAGTTGA-CACTATAAGAACAAT
64 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAAT
** * * * *
316792 TATCTATTTTGAATC-TTTTGGTCTTTTGTTTAGT-AGTAAAATAATTGTTT-T-
127 TATCTATTTCAAATCATTAT-GCCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTA
* *
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1 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAA-AATTAATAAGT-A
* ** * * * * * ***
316908 AAA-TTTTTTAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAACAACCATGACTATTTGAA-AAGTT
64 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TT
* *
316971 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGCTTC-A
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* * * ** * * *
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1 -TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * * *
317087 CAGATATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGAATAAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
63 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** *
317152 ATCTATTTGAAATTGA-TATAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATAT-TTTCTA
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* * *
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* * *
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* * ** * *
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* * * *
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1 TTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
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* *
317504 TAAT-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAA
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* * *** * * *
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1 TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * ** * *** *
317622 AGAA-AATTAAAAAATGAATCTATCCACCAAACATCTTCAAATAATTATGACTATCCAAATAATT
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* * *
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* * *
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1 TTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
317803 AAA-TTTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACA-TTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAATT
64 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
317866 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCA-AAAACTAGTTGTTTTTG
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* *
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1 TTCATACAA-GCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * *
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* * ** * * *
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* * *
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*** * * ** * * *
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62 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
* * * * **
318226 TTATCTATTTCAAATCGTTAAGACATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTA
126 TTATCTATTTCAAATCATTATG-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** * * * * * *
318281 TTCATACAAAATTATTCATAATGAAGTAATAATAATTTATTAATATTAAAAAATTAATAAG----
1 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * ** * *
318342 AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAACCAA-TTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTAT
66 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
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130 CTATTTCAAATCATTATGCCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * ** * **
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1 TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA
* * *** * * *
318521 GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATGGTT-TAGACTATTAGAACAATTA
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* *
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* * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * **
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* ** * * * *
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* * *** * * * *
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* * * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* *
315776 GTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA-AGAGT
1 GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATA-AGT
* ** * * * * *
315840 AAGAGAATTAAAAAAAATGAATTTG-TTACCCAACAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAAAAA
64 --GAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * ** *
315904 TTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGATTTTGTTCATGCAAG
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* ** * *
315969 CTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTACA-AATTT-A
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* *
316030 AAAATAAA--TATGTTATATGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
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* * * * * * *
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* * ** * * *
316157 ATAAAATAATACTATTTTGTTAATACTCCAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG
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** * * * * *
316222 TTTGCCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAGTCGTTATGGC
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* ** * *
316286 -TTTAGTTTTGTCCTTAAACAATTGTTTCT
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* * * * *
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1 GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATT-TAAAAATTAATAAG-
* * * * * * * *
316377 TGAAGA-TTTAAAAAATTAATCTTTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGTCCATTTGAACTAT
63 TGAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** * * * * **
316441 TATTTATTTTAAATTGTTATGACATTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCAGACAAAA
128 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGT
* * * * * * * * *
316506 TTATTCAAAATAAAATAATGCTAA-TTATTACTCTTTCAAAAATTAATGA--CA-CATTTAAAAA
192 TTTTTCGAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTCAGAATTTAAAAA
* * * ** * *
316567 CTAAATCTCTTTATCGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCT-AAAAT
257 ATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * * * **
316631 CAT-TACGATCTATT-TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTATGTTCATACAAGCTTAT-TCG-AAGT
322 GATATA--A-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATAAAGTAA-T
* * *
316692 AAAATATTATTAA-ATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGCATTTAAAAAATAAAT-AAGTTTA
382 AAAAT-TTATTAATATTAA-AA-A--TTAATAAGTAA-AAG-ATTTAAAAAATAAATCTA-TTTA
* * * * ** ** * *
316755 CTGAAGC-AGTGCAAATAGTTGA-CACTATAAGAACAATTATCTATTTTGAATC-TTTTG-GTCT
439 -TCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-T
* *
316816 TTTGTTTAGTAGTAAAATAATTGTTT-T
501 TTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCT
*
316843 -TTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGTG
1 GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAA-AATTAATAAGTG
** * * * * ***
316907 AAAATTTTTTAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAACAACCATGACTATTTGAA-AAGTT
65 AAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TT
* * *
316971 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGCTTCAGTTCATATAAGTT
129 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGTT
317036 TTTTCGAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTCAGATATTTAAAAA
193 TTTTCGAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTCAGA-ATTTAAAAA
* * * * * * *
317101 ATGAATCTGTTTATTGAATAAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATT
257 ATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* *
317166 GATATAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATATTTTCTA-TCTATAGAAGCTTATAAAGTAATACA
322 GATATAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTCTATTC-ATACAAGCTTATAAAGTAATA-A
*
317230 AATTTATTAATATTAAGACAATTACTAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATCAAACAA
384 AATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAA
*
317294 GTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
447 GTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
**
317358 TGTAAAATAATTGTTTCT
511 AATAAAATAATTGTTTCT
* * * * *
317376 GTTCATACAAGATTATTT-GAATTAAAA-AATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGC
1 GTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
317439 AAAATATTTTAAAAAAGAAATATGTTTA-CGAAACAAGTTGAAATAATCATGACTATTTGAATAA
64 GAAA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * *
317503 TTAAT-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCACATAA
127 TT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAA
* * *** * * * *
317567 GCTTATTT-GAAATAAAATAATGCC-ACTTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAAAATT
190 G-TTTTTTCGAAATAAAATAATACCAAC-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTCAG-AATTT
* ** *** ** * *** * *
317630 AAAAAATGAATCTATCCACCAAACATCTTCAAATAATTATGACTATCCAAATAATTACCTATTTC
252 AAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
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* *
317760 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-TTTTAAAAAATAAATCTA
373 TAAAGTAATA-AAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * *
317824 TTT-TCTGAACACA-TTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
435 TTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * *
317887 CCTTTTGTTTTGTCAA-AAACTAGTTGTTTTT
498 CTTTTTGTTTTGT-AATAAAATAATTGTTTCT
* * *
317918 GTTCATA-AAGGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTCAAAAATTAATAAGT-
1 GTTCATACAA-GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTG
* * * * ** * *
317981 AAAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTATTGAGCAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
65 AAAA-TTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * *
318046 GTTTATTTCAAATCGA-TAAGA-TTTTTATTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACATGT
129 ATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGT
* * ** * * *
318109 TTATTCTAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTCTAAAAAAATTAATAAGTT-GGAGATTTA
192 TTTTTCGAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTC--CAAAAATTAATAA-TTCAGA-ATTTA
* * * * *
318173 AAAAATAAATCTATTCAATGAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTATTATCTATTTC
253 AAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * ** **
318237 AAATCGTTA-AGACATTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCATA
317 AAATTGATATA-AC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCTATTCATAC--AA-GCTT-AT-
* * *
318301 ATGAAGTAATAATAATTTATTAATATTAAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTG
374 A--AAGTAATAA-AATTTATTAATATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
318362 TTTATTGAACCAA-TTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-
435 TTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
318425 TCTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTTT
499 TTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCT
* * * * * * * * **
318455 GTTCAAACGAGCATATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAAGAATATTCTAAAAATTAATAAGT-
1 GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTG
* *** * * *
318519 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATGGTT-TAGACTATTAGAACAA
65 AA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAA
318582 TTATCTATTTCAAAT
127 TTATCTATTTCAAAT
318597 TGTTTTATTC
Statistics
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0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (528 bp):
GTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTGA
AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTCATACAAGTTTTT
TCGAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTCAGAATTTAAAAAATAA
ATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGATA
TAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATAAAGTAATAAAATTTAT
TAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATA
GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAA
TTGTTTCT
Found at i:321433 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 320454--323662 Score: 1943
Period size: 181 Copynumber: 17.9 Consensus size: 180
320444 AGATTTAGGT
* ** * * * * * * * *
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* * * * ** * *
320519 TTATGACTACGTT-AATAATTATCTATTTCAAATCGA-TATTACCTTTTCTTTGGTCATATAACA
66 TTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAATA
* * * * *
320582 ATTGCTTT-TGA-ACATTCAAGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTAA
128 ATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
320635 TCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAA
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
* * * ** * ** * * *
320696 TTATAACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTT-TTATAAAATTA
66 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTATCA-AAAATAA
* * * * *
320760 TTATTTTTGTTCATACAAGC----T-----T-AAATAATACTAATCTAATAA
129 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * ** * *
320802 TATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAAAAAAT-TGTTTGTTGAACTATTTTAAATA
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATA
* * * * * * * *
320865 TTTAAGACTATATGAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
65 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAATAA
* * * * * * ** *
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129 -TTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * * *
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1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
* * * *
321049 TTATGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAATAGA
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* * * * * * * *
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129 TTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
321165 TATTTCAAAAATTAA-AA--GAAA-ATTT-GAAAA-AAATTTATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
* * * * * * * *
321224 TTATGACTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTAGGAAATGAT
66 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAATAAT
* *
321289 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATGCTAATTTATTAA
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* * * * *
321340 TATAT-AACAATTAATAACTAAAAAATTTAGAAAATAAATATATTTATCAAACTAGATCAAATAA
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
* * * ** * * * *
321404 TCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAAT
66 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAATAAT
* * *
321469 TGTTTC-AGTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAA
130 TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * *
321520 TAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTT-AAAAATGAATCTCTTTA-CTAAACAATTTTAAAT
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-AAACTAGTTCAAAT
* * * * * *
321582 AATTATGACTATTTGAACAATTGTCTAATTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
64 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAAT-
* * * *
321647 AAAT-TTTCTGTTCATACAAGCTTTTGTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAG
127 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * * * *
321700 TA-TT--AAGATGATTAA-T--AAG---TAAAAGATTAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATCA
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
* * * ** * *
321756 TTATGACCATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTT-TGTTGTCATAAAATAAT
66 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAATAAT
* * * * *
321819 TGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA
130 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *
321870 TATTTTAAAAATTAAT-ACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTAAT-AAGA-AAGTTCAAA
1 TATTTCAAAAATTAATAAC-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTT-ATCAA-ACTAGTTCAAA
* * * * * * * *
321932 TAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAAT
63 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAAT
* * ** * *
321997 AATTTTTTCAATTCATAGGAGCTTATT-TAAAGTAAAATAGTACTAATTTATTAA
127 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * **
322051 TA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAA-TAAGTTCAAA-
1 TATTTC-AAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACT-AGTTCAAAT
** * ** * * *
322113 AAGTTATGGTTATTTGAACAATTAACTATCACAAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA
64 AA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAA
* * * * *
322178 CAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAA-AAT-TTAAATTTCTTAA
126 TAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * *
322232 TATTCCAAAAATTAATTAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACATA-TTCAAAT
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-AAAC-TAGTTCAAAT
* * * * * * *
322294 AGTTCTAACTATTTGAGCAATAATCTATTTGAAAT-ATT-TAGTACCTTTTGTTTTATCATAAAC
64 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-G-ACCTTTTGTTTTATCA-AAAA
* * * * * *
322357 CAATTGTTTTTATTCATAAAAGTTTTATTCGGAATAAAATAATAATAATTTATTAA
126 TAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ** ** *
322413 AATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTTA-CTGAGTGAGTTCAAATA
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACT-AGTTCAAATA
* * * * *
322477 GTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATACCTT-TAGTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
65 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CATTAT-G-ACCTTTTGTTTTATCA-AAAA
* * *
322541 -CATATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
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* * ** **
322596 TA-TTCTAAAAATTAATAAGCT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTATCAAA-TAAGTTTGAA
1 TATTTC-AAAAATTAATAA-CTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACT-AGTTCAAA
* * * * ** * ** *
322658 TAGTCATGTCTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATTGTAAAAC
63 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCAAAAAT
* * ** *
322723 AATTGTTTTTATTCATATAAAATTATTC-AGAATAAAATAATACTAGTTTATTAA
127 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
322777 TATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAT
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
* * * ** * *
322838 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATAATC-TTTGGTTTGCCTTAAAACAA
66 TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATC-AAAAATAA
* * ** *
322901 TTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTATTC-AAAGTAAAAT-ATAGCTAAACTAATAA
129 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATA-CTAATTTATTAA
* * * * * * *
322953 TA-TTCTAAAAACTAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GCTAAACCAATTCAAA
1 TATTTC-AAAAATTAATAA-CTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-AAACTAGTTCAAA
* * * * * *
323015 TAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAA
63 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCA-AAAA
* * * * * *
323079 TAATTGTTTC-AGTTTATGCATGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTATTTTATTAA
126 TAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ** * *
323134 CA-TTCAGAAAATTAATAAGC-AAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTAAA
1 TATTTCA-AAAATTAATAA-CTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAA
* *
323196 TAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAA
63 TAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTATCA-AAA
* * * * * * *
323260 ACAATTGTTTCGATTCATA-AATGCTGATTCAAAATAAAATTATATTACTTTATTAA
125 ATAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * ** * *
323316 TATTTCAAAAATTGAGAAATTGAAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCGAA-TCA-TTCAAAT
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCAAACT-AGTTCAAAT
* * * * * *
323378 AATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAACTTTTGTTTTATTATAAAA-A
64 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-AAAATA
* * * * * *
323442 ATTGTTTTTCA-ACATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAACACTAATTTATTAA
128 ATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *** * * *
323495 TGTTTCAAAAATTAATAAATAGGTGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTGAACCAGTTTAAATA
1 TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATC-AAACTAGTTCAAATA
* * * * * * * * *
323559 GTTA-AACTGTTTAAACCATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTAT-TTTTGTCATAAAATA
65 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTATCA-AAAATA
* * * * *
323622 ATTATTTATGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
128 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA
323663 TTATGAAAAT
Statistics
Matches: 2382, Mismatches: 502, Indels: 289
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
167 26 0.01
168 2 0.00
169 7 0.00
170 127 0.05
171 27 0.01
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173 8 0.00
174 15 0.01
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAA
TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCAAAAATAATT
GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
Found at i:321989 original size:531 final size:525
Alignment explanation
Indices: 320974--323662 Score: 1511
Period size: 542 Copynumber: 5.0 Consensus size: 525
320964 CCATAAAATG
* *
320974 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTTGTTTACCT-AA
1 AATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAATGAA-TCTCTTTA-CTAAA
* * * * * * ** *
321036 CTAGTTCAAATAA-TTATGACTATATGAATAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACATTTTGTT
61 CAAGTTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTA-TACAAAAACACTATAACATTTTGTT
* * * * * * *
321099 TTATCATAAAATAGA-TGTTTTTGTTTC-TATAAG-TT-TGTTCAAAATAAAGTAATACT-AATC
124 TTGTCATAAAA-AAATTG-TTCT-ATTCATACAAGCTTAT-TTC-AAATAAA-AAATA-TAAATT
* * *
321159 TATTAATATTTCAAAAATTAA-AAG--AAAATTTGAAAAAAATTTATTTATCAAACTAGTTCAAA
182 TATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTT--AAATAA--TCTTTATCAAACAAGTTCAAA
* * *
321221 TAATTATGACTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCT-ATTAGGAAA
242 T-ATTATGACTATTTAAGCAATTATTTATTTCAAAT-TTTATGACTTTTTGTTATCA-TA--AAA
* * * * ** * *
321285 TGATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATGCTAATTTATTAATA-TATAACA
302 TAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCGGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAA
* * * * * *
321349 ATTAATAAC-TAAAAAATTTAGAAAATAAATATATTT-ATCAA-ACTAGATCAAATAATCATGAT
367 ATTAAT-ACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTAAT-AAGA-AAGTTCAAATAGTCATGAC
* ** *
321411 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCA
429 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA-AATTGTTTCA
* *
321476 GTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT
493 -TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * *
321510 AATATATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAATGAATCTCTTTACTAAACAAT
1 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAT-AAGAGATTTAAAAATGAATCTCTTTACTAAACAAG
* ** ** * *
321575 TTTAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTGTCTA-ATTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGT
65 TTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTATA-CAAAAACACTATAACATTTTGTTTTGT
* *
321638 CATAAAATAAAATT-TTCTGTTCATACAAGCTT-TTGTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAGT
128 CAT-AAA-AAAATTGTTCTATTCATACAAGCTTATT-TCAAATAAAA-AATATAAATTTATTAAT
* *
321701 ATT-AAGATGATTAATAAGTAAAAGA-TT-AAT-ATGTTTATCAAACAAGTTCAAATCATTATGA
189 ATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAATAATCTTTATCAAACAAGTTCAAAT-ATTATGA
* * *
321762 CCATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
250 CTATTTAAGCAATTATTTATTTCAAATT-TTATGACTTTTTGTTATCATAAAATAATTGTTTCTA
*
321827 TTCATAAAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATACGTAA
314 TTCATAAAAGTTTATTCGGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATACGTAA
321892 AAGATTTAAAAAATAAATATATTTAATAAGAAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
379 AAGATTTAAAAAATAAATATATTTAATAAGAAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
* * * **
321957 CTATTTCAAATTATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTTTTTCAATTCATAGGAGCTTA
444 CTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA-AATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTA
* * *
322022 TTTAAAGTAAAATAGTACT
507 TTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
322041 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAATAA
1 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT-AATAAGAG-ATTTAAAAATGAATCTCTTTACTAAACAA
** * *
322106 GTTCAAAAAGTTATGGTTATTTGAACAATTAACTATCACAAAAACATTATGACATTTTGTTTTGT
64 GTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTAT-ACAAAAACACTATAACATTTTGTTTTGT
* * * * *
322171 CATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAAAATTTAAATTTCTTAATATT
128 CATAAAAAAATT-GTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAAAATATAAATTTATTAATATT
* * *
322236 CCAAAAATTAATTAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAACATA-TTCAAATAGTTCT
192 -CAAAAATTAATAAGTAAAAA-TTT--AAAT-AATCT-TTATC-AAACA-AGTTCAAATA-TTAT
* * * * * * **
322300 AACTATTTGAGCAATAATCTATTTGAAATATTTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGT
248 GACTATTTAAGCAATTATTTATTTCAAAT-TTTATG-A-CTTTT-TGTTATCATAAAATAATTGT
* * * *
322364 TTTTATTCATAAAAGTTTTATTCGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAAT
309 TTCTATTCATAAAAG-TTTATTCGGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
* ** * * ** * * *
322429 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTTACTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAC
373 ACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTAATAAGAAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAAT
* * *
322494 AATTATTTATTTCAAA-TACCTT-TAGTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATATGTTTCTATTCA
438 AATTATCTATTTCAAATTA--TTAT-G-ACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAT-TGTTTC-ATTCA
* *
322557 TACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT
497 TAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* *
322586 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCT-AGAGATTTAAAAAATAAATCTGC-TTA-TCAAA
1 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAA--TAAGAGATTT-AAAAATGAATCT-CTTTACT-AAA
* ** * * * * * * **** *
322648 TAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTATTATCTATTTC-AAATTGTTATGACATTTTGTTT
61 CAAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTA-TACAAAAACACTATAACATTTTGTTT
* ** * * * ** *
322712 TATTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AGTTTATT
125 TGTCATAAAAAAATTG-TTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAA-AATA-TAAATTTATT
* * * * *
322775 AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-CTAAAT-TTATTTACCAAACTAGTTCAAATAT
186 AATA-TTCAAAAATTAAT-A-AG---TAAAAATTTAAATAATCTTTATCAAACAAGTTCAAATA-
* * * * * *
322838 TTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATCTT-AAATCATTAT-AATCTTTGGTT-TGCCTTAAAAC
244 TTATGACTATTT-AAGCAATTATTTAT-TTCAAAT-TTTATGACT-TTTTGTTAT--CATAAAAT
* ** * ** * * ** * *
322899 AATTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTATTCAAAGTAAAAT-ATAGCTAAACTAATAATATTCTAAAA
303 AATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCGGATTAAAATAATA-ATAATTTATTAATATTTTAAAA
* * * * * * ** * *
322963 ACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAA-ACCAA-TTCAAATAGTTAAGACT
367 ATTAATACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTAATAAGA--AAGTTCAAATAGTCATGACT
* * * * * * * *
323026 ATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAG
430 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAA-AATTGTTTCA-
* ** * ** *
323091 TTTATGCATGCTTATTTGAAATAAAATAAAACT
493 TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * * *
323124 ATTTTATTAACATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAA
1 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAA-TAAGAGATTT-AAAAATGAATCTCTTTACTAAACAA
* * * ** * * * * *
323189 GTTTAAATAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTA
64 GTTCAAAAAGTTATGACT-ATTTGAACAATTAACTATACAAAAACACTATAACATTTTG-TTTTG
* * * * * *
323253 TCATAAAACAATTGTTTCGATTCATA-AATGCTGA-TTCAAAATAAAATTATATTACTTTATTAA
127 TCATAAAAAAATTG-TTCTATTCATACAA-GCTTATTTC-AAATAAAA-AATATAAATTTATTAA
* * * *
323316 TATTTCAAAAATTGAGA-AATTGAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAATC-A-TTCAAAT
188 TA-TTCAAAAATT-A-ATAAGTAAAAATTT---AAAT-AATC--TTTATC-AAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
323378 AATTATGGCCATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTT-TGAACTTTTGTTTTATTATAAAA
243 -ATTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAAAT--TTTATG-ACTTTT-TGTTATCATAAAA
* * * ** * * * * * *
323441 -AATTGTTTTTCA-ACATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAACACTAATTTATTAATGTTTCAAA
302 TAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGTTTATTCGGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAA
** *** * * * *
323504 AATTAATAAATAGGTGATTTAAAAAATAAATATATTTACT--GAACCAGTTTAAATAGTTA-AAC
366 AATTAATACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTAATAAGAA--AGTTCAAATAGTCATGAC
* * ** * ** * * *
323566 TGTTTAAACCATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTAT-TTTTGTCATAAAATAATTATTT-
429 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTT-TGTTTTGTAATAAAA-AATTGTTTC
*
323629 ATGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
492 A--TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
323663 TTATGAAAAT
Statistics
Matches: 1717, Mismatches: 313, Indels: 241
0.76 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
530 56 0.03
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534 15 0.01
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547 2 0.00
548 1 0.00
550 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (525 bp):
AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAATGAATCTCTTTACTAAACAAGT
TCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTATACAAAAACACTATAACATTTTGTTTTGTCAT
AAAAAAATTGTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAAAATATAAATTTATTAATATTCAAA
AATTAATAAGTAAAAATTTAAATAATCTTTATCAAACAAGTTCAAATATTATGACTATTTAAGCA
ATTATTTATTTCAAATTTTATGACTTTTTGTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGTT
TATTCGGATTAAAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATACGTAAAAGATTTAAAAA
ATAAATATATTTAATAAGAAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATT
ATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAATTGTTTCATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA
ATACT
Found at i:322307 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 320782--323662 Score: 1712
Period size: 361 Copynumber: 8.0 Consensus size: 361
320772 ATACAAGCTT
* * * * * * *
320782 AAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAAAAAT-TGTT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * * ** *
320846 TGT-TGAACTATTTTAAATATTTA-AGACTATATGAATAAATATCTATTTCAAATCGTTATGACT
65 T-TCTAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * * *** * * ** *
320909 TTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATCCTAGTTTATTTGGAATACCATAA-AAT
128 ATTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTT-AATTCATAGAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACT
* * *
320973 GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT-AAC
190 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAA-
* * * * * *
321037 T-AGTTCAAATAATTATGACTATATGAATAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACATTTTGTTT
252 TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGACATTTTGTTT
* * * * * * *
321100 TATCATAAAATAGA-TGTTTTTGTTTC-TATAAGTTTGTTCAAAATA
317 TGTCATAAAACA-ATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * *
321145 AAGTAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAA-AAG--AAAATTT-GAAAA-AAATTTATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * **
321204 TATC-AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTT
65 T-TCTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCA
* * ** ** * * * *
321268 TTTGTTCTATTAGGAAATGATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATGCTAA
129 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAGAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
321332 TTTATTAATATAT-AACAATTAATAACTAA-AAAATTTAGAAAATAAATATATTTA-TCAA-ACT
192 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA--
* * * * * * * **
321393 AGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTACAATC-TTTTGTTTT
254 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGA-CATTTTGTTTT
* * * * *
321456 GTAATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATAAAAACTTATTCGAAATA
318 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * *
321500 AAATAATACTAATATATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTT-AAAAATGAATCTCT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * * * * * * * *
321563 TTACTAAACAATTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTAATTGAAATCACTATAACCT
64 TTTCTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCA
* * * * *
321628 TTTGTTTTGTCATAAAATAAAATT-TTCT-GTTCATACAAGCTT-TTGTCAAATAAAATAATA-T
129 TTTGTTTTATCAT-AAA-ACAATTGTTTTAATTCATAGAAGCTTATT-T-AAATAAAATAATACT
* * * *
321689 AAATTTATTAGTA-TT-AAGATGATTAATAAGTAAAAG-ATT----AAT--A--TGTTTA-TCAA
190 -AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GA
* * * * * ***
321742 ACAAGTTCAAATCA-TTATGACCATTTAAACAATTATTTATTTC-AAATTGTTATGAC-TTTT-T
251 ATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGACATTTTGT
* * * * ** *
321803 GTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCGGATTA
315 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * *
321850 AAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTATT
** * *
321915 TAATAAGA-AAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCA
65 TTCTAA-ACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCA
* * * * * *
321979 TTTCTTTTGTAATAAAATAATT-TTTTCAATTCATAGGAGCTTATTTAAAGTAAAATAGTACTAA
129 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-AATTCATAGAAGCTTATTTAAA-TAAAATAATACTAA
* * *
322043 TTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATTGAATAAG
192 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAG
* ** * *
322107 TTCAAAAAGTTATGGTTATTTGAACAATTAACTATCACAAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTC
256 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTC
* * *
322172 ATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-GAATA
321 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATA
* * * * *
322213 AAA-AAT-TTAAATTTCTTAATATTCCAAAAATTAATTAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATT
1 AAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATT
* * *
322276 TTCTAAACATA-TTCAAATAGTTC-TAACTATTTGAGCAATAATCTATTTGAAA-TATT-TAGTA
65 TTCTAAACA-AGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT-G-A
* * * * * ** *
322337 CCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTTTATTCATAAAAGTTTTATTCGGAATAAAATAATAA
126 CCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAGAAG-CTTATT-TAAATAAAATAATAC
* * * * *
322402 TAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTACTGAGT
189 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTG-TTTACTGAAT
* * * * * * *
322466 GAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATACCTT-TAGTACCTTTTGTT
253 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTAT-G-ACATTTTGTT
*
322530 TTGTCATAAAAC-ATATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATA
316 TTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * *
322576 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCT
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCT-AT
* * ** ** * *
322641 TATC-AAATAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CA
64 TTTCTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCA
** * * ** * *
322704 TTTTGTTTTATTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAG
129 -TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAGAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAA
* * * **
322769 TTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAACT-AG
192 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAG
* * * * *
322829 TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCT-TAAATCATTAT-A-ATCTTTGGTTTGC
256 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGACAT-TTTGTTTTGT
* * * *
322891 CTTAAAACAATTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTATTCAAAGTA
320 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
** * * * * * *
322933 AAAT-ATAGCTAAACTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
1 AAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * * *
322997 TTGCTAAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAAC
64 TTTCTAAA-CAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
* * * * * * *
323060 CTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTTAT-GCATGCTTATTTGAAATAAAATAAAAC
127 CATTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAG-AAGCTTATTT-AAATAAAATAATAC
* * * * *
323123 TATTTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAGA-AATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAA
189 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA
* * * * *
323186 CAAGTTTAAATAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTAT-TTAAAATCATTATGACCTTTTGTT
252 TAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGACATTTTG-T
* * *
323249 TTTATCATAAAACAATTGTTTCGATTCATA-AATGCTGATTCAAAATA
315 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTCAAAATA
* * * * * *
323296 AAATTATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGAGA-AATTGAAGATTTAAAAAATAAATC-A
1 AAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATT-A-ATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * ** * * * *
323358 GTTTATCGAATC-A-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGA
63 -TTT-TCTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * * *
323421 ACTTTTGTTTTATTATAAAA-AATTGTTTTTCAA--CATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAACA
126 CCATTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTT-AATTCATAGAAGCTTATTT-AAATAAAATAATA
* * * * * * * *
323483 CTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAAATAGGTGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAAC
188 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAAT
* * * * * * * * * * * *
323548 CAGTTTAAATAGTTA-AACTGTTTAAACCATTATATATTTC-AAATCGTTATAACCTTTAT-TTT
253 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGACATTT-TGTTT
* * * * *
323610 TGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATATAAGCTTATTCAAAATA
317 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
323655 AAATAATA
1 AAATAATA
323663 TTATGAAAAT
Statistics
Matches: 1984, Mismatches: 405, Indels: 262
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
349 8 0.00
350 83 0.04
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352 53 0.03
353 6 0.00
354 10 0.01
355 141 0.07
356 60 0.03
357 199 0.10
358 80 0.04
359 72 0.04
360 245 0.12
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363 208 0.10
364 83 0.04
365 90 0.05
366 8 0.00
367 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (361 bp):
AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTT
TCTAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATT
TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAGAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTA
TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAA
ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA
ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
Found at i:322625 original size:726 final size:716
Alignment explanation
Indices: 320610--323512 Score: 1861
Period size: 726 Copynumber: 4.1 Consensus size: 716
320600 AGCTTATTTG
* * * * *
320610 GAATAAGATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAATTAAAAAATAAATTTAT
* * * * ***
320675 TTATCGAACTAGTTCAAATAA-TTATAACTATTTGAATAATTGTAAACT-T-C-AAATTGTTATA
66 TTACCAAACTAGTTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAACAA-T-T-AACTATCCAAAAACATTATA
* * *** ** ** * * *
320736 ACCTTTTGTTCTTTTATAAAATTATTATTTTTGTTCATACAAGC---TT-AAA-T---A-ATA-C
127 ATCTTTGGTT-TGCCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTCAAAGTAAAATATAGC
* * * * * * *
320791 TAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAA-CTAAGAAAATTAAAAAAAAAAT-TGTTTGTTGAAC
191 TAAACTAATAATATTCCAAAAACTAATAAGC-AAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAAC
* * * * * * * * *
320854 TATTTTAAATATTTAAGACTA-TATGAATAA-ATATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTT
255 CAATTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAATA-ATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTT
* * * * * *** * * * **
320917 TGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATCCTAGTTTATTTGGAATACCATAAAA-TGAATTTAT
318 AGTCATAAAACAA--TTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACT-AATTTAT
* ** * * ** *
320981 TAATATTTCA-AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCT-AACTAGTTCA
380 TAA-AATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATACGTTTA-CTGAACAAGTTCA
* * * * * * * *
321044 AATAATTATGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAAT-CGTTATGACATTTTGTTTTATCATAA
443 AATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATACTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
321108 AATAGA-TGTTTTTGTTTC-TATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTC
508 AACA-ATTGTTTCT-ATTCATA-AAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-
* * * * * * *
321171 AAAAATTAA-AAG-A-AAATTT-GAAAA-AAATTTATTTATCAA-ACTAGTTCAAATAATTATGA
569 AAAAATTAATAAGTAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-AAGA-AAGTTCAAATAGTCATGA
* ** * * * * * * ** **
321230 CTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTAGGAAATGATTGTTTC
632 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTCTTTTATAATAAAACAATTGTTT-
* **
321295 T-ATTCATACAAGCTTATTC-
696 TAATTCATAGAAAATTATTCA
* * * * * *
321314 GAATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATAT-AACAATTAATAACTAAAAAATTTAGAAAATAAA
1 GAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AGAGAA-TTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
321378 TATATTTATCAAACTAGATCAAATAA-TCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATT
61 TTTATTTACCAAACTAGTTCAAA-AAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTA-TCCAAAAACATT
* * ** * * ** *
321441 ACAATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATAAAAACTTATTCGAAA-TAAAAT
124 ATAATC-TTTGGTTTGCCATAAAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTC-AAAGTAAAAT
* * * ** * * * *
321504 AATA-CTAATA-TATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTT-AAAAATGAATCTCTTTA
186 -ATAGCTAA-ACTAATAATATTCCAAAAACTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTG
* * * * ** * * * *
321566 CTAAA-CAATTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTCTAATTGAAATCACTATAACCTTT
249 CTAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATAATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTT
* * * * * * *
321630 TGTTTTGTCATAAAATAAAAT-TTTCTGTTCATACAAGCTTTTGTC-AAATAAAATAATA-TAAA
313 TGTTTAGTCATAAAA-CAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAAAACT-AA
** * ** * *
321692 TTTATTAGTATTAAGATGATTAATAAGTAA-AAGA-TT----AAT--AT--GTTTA-TCAAACAA
375 TTTATTAAAATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATACGTTTACT-GAACAA
* *
321746 GTTCAAATCA-TTATGACCATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT--TGTTATGA-CTTTT-TGTT
438 GTTCAAAT-AGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATACT-TTATGACCTTTTGTTTT
* ** *
321806 GTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
501 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-AAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
* * *
321871 ATTTTAAAAATTAATACGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTAATAAGAAAGTTCAAATAGT
565 A-TTTAAAAATTAATAAGT-AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATAAGAAAGTTCAAATAGT
* *
321936 CATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCA-TTTCTTTTGTAATAAAATAAT
627 CATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CATTTTCTTTTATAATAAAACAAT
* ** *
322000 T-TTTTCAATTCATAGGAGCTTATTTA
691 TGTTTT-AATTCATAGAAAATTATTCA
* *
322026 -AAGTAAAATAGTACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGA
1 GAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAAGAGAATTAAAAAATAA
* *** **
322089 ATTTGTTTATTGAA-TAAGTTCAAAAAGTTATGGTTATTTGAACAATTAACTATCACAAAAACAT
60 ATTTATTTACCAAACT-AGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTATC-CAAAAACAT
* * *
322153 TATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCGAA-TAAAA
123 TAT-A-ATCTTTGGTTTGCCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTA-TTCAAAGTAAAA
** * ** * * * * *
322216 -A-ATTTAAATTTCTTAATATTCCAAAAATTAATTAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTT
185 TATAGCTAAA-CTAATAATATTCCAAAAACTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTG
* * * *
322278 CTAAA-CATATTCAAATAGTTCTA-ACTATTTGAGCAATAATCTATTTGAAAT-ATT-TAGTACC
249 CTAAACCA-ATTCAAATAGTT-AAGACTATTAGAACAATAATCTATTTCAAATCATTCTA--ACC
* * * *
322339 TTTTGTTTTA-TCATAAACCAATTGTTTTTA-TTCATAAAAGTTTTATTCGGAATAAAATAATAA
310 TTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAAAAG-CTTATTCGAAATAAAATAA-AA
*
322402 -TAATTTATTAAAATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAT-CGATTTACTG
371 CTAATTTATTAAAA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTAAAAAATAAATACG-TTTACTG
***
322463 AGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATACCTTTA-GTACCTTTT
433 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATA-CTTTATG-ACCTTTT
*
322527 GTTTTGTCATAAAAC-ATATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
496 GTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATA-AAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * *
322591 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTATCAA-ATAAGTTT
559 ATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-AAGA-AAGTTC
* * * * **
322655 GAATAGTCATGTCTATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATTGTA
620 AAATAGTCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTCTTTTATAATA
* *
322719 AAACAATTGTTTTTATTCATATAAAATTATTCA
684 AAACAATTGTTTTAATTCATAGAAAATTATTCA
* * *
322752 GAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTAT
1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAATTAAAAAATAAATTTAT
* * * ** *
322817 TTACCAAACTAGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATAATCT
66 TTACCAAACTAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTATCCAAAAACATTATAATCT
* * * *
322882 TTGGTTTGCCTTAAAACAATTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTATTCAAAGTAAAATATAGCTAAAC
131 TTGGTTTGCCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTCAAAGTAAAATATAGCTAAAC
* * * *
322947 TAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAATTC
196 TAATAATATTCCAAAAACTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACCAATTC
* *
323012 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAA
261 AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATAATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAA
* * ** * * * *
323077 AATAATTGTTTCAGTTTATGCATGCTTATTTGAAATAAAATAAAACTATTTTATTAACATTCAGA
326 AACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAAAATTCAGA
* * *
323142 AAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA-T
391 AAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATACGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
323206 AATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT-CATTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAACAATTGTTT
456 -ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATACTTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
323270 CGATTCATAAATGCTGATTCAAAATAAAATTATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAA
519 CTATTCATAAA-GTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAG
* * * * * *
323335 TTGAAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTAT-CGAATCA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATA
582 TAG-AGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTATAAGAA--AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
* * * *
323397 ATTATCTATTTCAAATCATTTTGA-ACTTTTGTTTTATTATAAAA-AATTGTTTTTCAA--CATA
643 ATTATCTATTTCAAATTATTATGACA-TTTTCTTTTATAATAAAACAATTG-TTTT-AATTCATA
* *** **
323458 CAAGCCTATTTG
705 GAAAATTATTCA
* *
323470 GAATAAAATAACACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAA
1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
323513 ATAGGTGATT
Statistics
Matches: 1742, Mismatches: 319, Indels: 262
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (716 bp):
GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAATTAAAAAATAAATTTAT
TTACCAAACTAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAACAATTAACTATCCAAAAACATTATAATCT
TTGGTTTGCCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTCAAAGTAAAATATAGCTAAAC
TAATAATATTCCAAAAACTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACCAATTC
AAATAGTTAAGACTATTAGAACAATAATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAA
AACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAAAATTCAGA
AAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATACGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
ATTTAAACAATTATTTATTTCAAATACTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
ATTCATAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAGA
GATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAGAAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTA
TTTCAAATTATTATGACATTTTCTTTTATAATAAAACAATTGTTTTAATTCATAGAAAATTATTC
A
Found at i:322980 original size:357 final size:360
Alignment explanation
Indices: 320885--323662 Score: 1023
Period size: 360 Copynumber: 7.7 Consensus size: 360
320875 TATGAATAAA
* * * * ***
320885 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATCCT
1 TATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTTT--ATTCATAAA
* ** ** * *
320949 AGTTTATTTGGAATACCATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTT
63 AGATTATTCAGAATAAAATAATAAT-AATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAA--GA-AGATTT
* * * * * * *
321013 AAAAAATAATTTTG-TTTACCTAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATATGAATAATTATCTATT
124 AAAAAATAA-ATCGATTTA-CAAACTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
* * * ** * * * * * * *
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187 TCAAATACATTTA-GACCTTTTGGTTTGCCATAAAACATATGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT
* * * * *
321138 CAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAA-AAG-AA-A-ATTT-GAAAA-A
250 CAAAATAAAATAATACTAAACTAATAATATTCT-AAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATA
* ** ** * * * * * *
321196 AATTTATTTATCAAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTTAGCAAT
314 AATCTGCTTATCAAA-TAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTAT
* ** * * * ** ** * * *
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1 TATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGA
** * * * * * *
321308 TTATTC-GAATTAAAATAATGCTAATTTATTAATATAT-AACAATTAATAACTAAAAAATTTAGA
66 TTATTCAGAA-TAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAAT-A--AGAAGATTTAAA
** * * * * * *
321371 AAATAAATATATTTATCAAACT-AGATCAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
127 AAATAAATCGATTTA-CAAACTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA
* * * ** * * * *
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191 ATACATTTA-GACCTTTTGGTTTGCCATAAAACATA-TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * ** *
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253 AATAAAATAATACTAA-ACTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
321559 CT-CTT-TACTAAACAATTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
317 CTGCTTAT-C-AAATAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTAT
* * * *** * * * * * * * *
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1 TATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTATTCATAAAAG
* * ** * * * *
321667 CTTTTGTCA-AATAAAATAAT-ATAAATTTATTAGTA-TT--AAGATGATTAATAAG---TAAAA
65 ATTAT-TCAGAATAAAATAATAAT-AATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGAAGATTTAAAA
* * * *
321724 GATTAATAT-G-TTTATCAAAC-AAGTTCAAATCA-TTATGACCATTTAAACAATTATTTATTTC
128 -AATAA-ATCGATTTA-CAAACTGAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * * * *
321785 AAAT---TGTTATGA-CTTTTTG-TTGTCATAAAATA-ATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTC
189 AAATACAT-TTA-GACCTTTTGGTTTGCCATAAAACATA-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
** * * ** * * * * * *
321844 GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATACGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
251 AAAATAAAATAATACTAAACTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** ** *
321909 TATATTTAAT-AAGA-AAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-TAAT
316 TCTGCTT-ATCAA-ATAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACT-AT
* * * * * * **
321954 TATCTATTTCAAATTATTATGACCA-TTTCTTTTGTAATAAAATAATT-TTTTCAATTCATAGGA
1 TATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATAAAA
* * * * * * *
322017 GCTTATTTA-AAGTAAAATAGTACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAATT
64 GATTATTCAGAA-TAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAG--A-AGATTT
* * ** * * ** * * *
322080 AAAAAATGAATTTG-TTTATTGAA-TAAGTTCAAAAAGTTATGGTTATTTGAACAATTAACTATC
124 AAAAAAT-AAATCGATTTA-CAAACTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATT
* * * * * * *
322143 ACAAAAACA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATT
187 TCAAATACATTTA-GACCTTTTGGTTTGCCATAAAACATA-TGTTTCTATTCATACAAGCTTA-T
* * * ** * * * * * *
322206 TC-GAATAAAA-AAT-TTAAATTTCTTAATATTCCAAAAATTAATTAGTAA-AAATTTTAAAAAT
249 TCAAAATAAAATAATACTAAA-CTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** ** * *
322267 AAATCT-ATTTTCTAAACATA-TTCAAATAGTTC-TAACTATTTGAGCAAT
313 AAATCTGCTTATC-AAATA-AGTTTGAATAG-TCATGTCTATTTGAACTAT
* * * *
322315 AATCTATTTGAAATAT-TTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTTTATTCATAAAA
1 TATCTATTTCAAAT-TGTTATG-ACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAA
* *
322378 GTTTTATTCGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
64 G-ATTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAG---AAGATTTA
** * *
322443 AAAAATAAATCGATTTACTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCA
125 AAAAATAAATCGATTTACAAACTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCA
* * * *
322508 AATACCTTTAGTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAA
190 AATACATTTAG-ACCTTTTGGTTTGCCATAAAACATATGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
** * * *
322573 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAGAGATTTAAAAAATAAATCT
254 ATAAAATAATACTAAACTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
322638 GCTTATCAAATAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTAT
319 GCTTATCAAATAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTAT
**
322680 TATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATTGTAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAA-
1 TATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATA-AAAG
* * * *
322744 ATTATTCAGAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AGATTTAAAAAC
65 ATTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGAAGATTTAAAAAA
** * *
322808 TAAATTTATTTACCAAACT-AGTTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAAT
130 TAAATCGATTTA-CAAACTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTAT-TTCAAAT
* * * * *
322871 -CATTATA-ATC-TTTGGTTTGCCTTAAAACA-ATTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTATTCAAAGT
193 ACATT-TAGACCTTTTGGTTTGCCATAAAACATA-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
*
322932 AAAAT-ATAGCTAAACTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
256 AAAATAATA-CTAAACTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG
* ** * * * * *
322996 -TT-TGCTAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT
320 CTTAT-C-AAA-TAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTAT
* ** * * * * * * ** *
323037 TATTTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTG-TTTCAGTTTATGCAT
1 TATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATAAAA
* * * *
323100 GCTTATT-TGAAATAAAATAA-AACTATTTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAATT
64 GATTATTCAG-AATAAAATAATAA-TAATTTATTAAAATTTCA-AAAATTAATAAG-AAG--ATT
* ** * * *
323162 TAAAAAATAAATATG-TTTATTGAAC-AAGTTTAAATAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTA
123 TAAAAAATAAAT-CGATTTA-CAAACTGAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTAAACAATTATCTA
* * ** *
323224 TTTAAAAT-CA-TTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAACA-ATTGTTTCGATTCATA-AATGCT
185 TTTCAAATACATTTA-GACCTTTTG-GTTTGCCATAAAACATA-TGTTTCTATTCATACAA-GCT
* * * *** * * *
323285 GATTCAAAATAAAATTATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TGAGAAATTGAAGATTTA
246 TATTCAAAATAAAATAATACTAAACTAATAATATTCT-AAAAACTAATAAGCAA--G-AGATTTA
* * * * ** * * * *
323346 AAAAATAAATCAGTTTATCGAATCA-TTCAAATAATTATGGCCATTTGAA-TAAT
307 AAAAATAAATCTGCTTATCAAATAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACT-AT
** * * * *
323399 TATCTATTTCAAATCATTTTGA-ACTTTTGTTTTATTATAAAA-AATTGTTTTTCA-ACATACAA
1 TATCTATTTCAAATTGTTATGACA-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATAAAA
** ** * * **
323461 GCCTATTTGGAATAAAATAACACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATAA-ATAGGTGATTTA
64 GATTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGA-A---GATTTA
** * * * * * * *
323525 AAAAATAAATATATTTACTGAAC-CAGTTTAAATAGTTA-AACTGTTTAAACCATTATATATTTC
125 AAAAATAAATCGATTTAC-AAACTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
323588 AAAT-CGTTATA-ACCTTTAT-TTTTGTCATAAAATA-ATTATTTATGTTCATATAAGCTTATTC
189 AAATACATT-TAGACCTTT-TGGTTTGCCATAAAACATA-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC
323649 AAAATAAAATAATA
251 AAAATAAAATAATA
323663 TTATGAAAAT
Statistics
Matches: 1900, Mismatches: 375, Indels: 289
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
350 87 0.05
351 107 0.06
352 58 0.03
353 5 0.00
354 15 0.01
355 148 0.08
356 62 0.03
357 204 0.11
358 53 0.03
359 71 0.04
360 256 0.13
361 256 0.13
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366 8 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
TATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAAAAGA
TTATTCAGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGAAGATTTAAAAAAT
AAATCGATTTACAAACTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATACA
TTTAGACCTTTTGGTTTGCCATAAAACATATGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
AATACTAAACTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTATC
AAATAAGTTTGAATAGTCATGTCTATTTGAACTAT
Found at i:323790 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 323766--323811 Score: 51
Period size: 18 Copynumber: 2.6 Consensus size: 18
323756 TATTTGCAGA
323766 ACTATTTCAAAAAATTAT
1 ACTATTTCAAAAAATTAT
* *
323784 GACTATTT-GAACAATTAT
1 -ACTATTTCAAAAAATTAT
323802 -CTATTTCAAA
1 ACTATTTCAAA
323812 TCATTATTAC
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 4
0.77 0.10 0.13
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.26
17 2 0.09
18 8 0.35
19 7 0.30
ACGTcount: A:0.43, C:0.13, G:0.04, T:0.39
Consensus pattern (18 bp):
ACTATTTCAAAAAATTAT
Found at i:324351 original size:177 final size:176
Alignment explanation
Indices: 323754--324347 Score: 540
Period size: 177 Copynumber: 3.3 Consensus size: 176
323744 TCATAACAAT
* * * * * *
323754 TCTATTTGCAGAACTATTTCAAAAAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
1 TCTATTTACAGAACAAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * *
323819 TACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATCATA
66 CACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAAT-AAATAAT-
* *
323884 T-AAATTTATTAATATTTCAAAAACTAAT-AGGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
129 TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGGT-----ATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
323935 -CATGTTTACCA-AACCAGTTGAATTAGTTATAACTA-TTGAAATAATTATTTATTTCAAATCGT
1 TC-TATTTA-CAGAACAAGTTCAAATAATTATAACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * *
323997 TATCACCATTTGTATTATCATAAAACAATTTTTTCTGTTCATAT-AGTCTTATTCGAAATAAAGT
63 TATCACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGT-TTATTTGAAATAAA-T
* * * *
324061 AATGCTAATTTGTTAATA-TTCTAAAAATTAATAACGG-ATTTAGAAAATATA
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* * * * *
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*
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** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * ** *
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** * * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * *
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*
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180 AG
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52 -CTT--T-TGT--TTTGTCATAAAA--CAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTT--ATTTGAAATA
* * * * * * * *** * ** *
330164 AACTATTTGAATAA-TTATT--TATTTC-AAATTGTTATGACT-TTTG-TTT-TATCATAAA-AC
106 AAATA-AT-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * *
330221 GATT-GT-ATC-AG
168 GTTTACTAAACAAG
* * * * * ** * * **
330232 TGC--ATA--TA-GCCTCATTTGAAATAAAATAATACTAATT-AAATAAAATTCTAAAAATTATT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTG--A-ACAATTAT-CTATTTCAAAT--CGTTAT-GACCTT-TT
* ** ** * * *** * *
330291 GAGTAAGAGATTTAGAATATGAATTTGTTTACCAAAGAAGTTCAAATGGTTATGACTAGTTG-AA
57 G-TTTTGTCA--TA-AA-A-CAA-TTGTTT--CTATTCA-TAC-AA--GCT-T-A-T--TTGAAA
* * * * * *
330355 TAATTATCTATGTCAAATCATTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAA-TAAT-TGTTTCTATCCAC
104 TAA-AAT-AAT-ACTAAT--TTATTA-A-----TATT-TCA-AAAATTAATAAG------T--A-
** * *
330418 ACAAGCTTATTTTGAAGAAAATAATATAAATTTA-TTAA-TA-
147 A-AAG---A-TTT-AA-AAAATAA-ATATGTTTACTAAACAAG
* * * ** * * * * * ***
330458 TTTAAAAAATTCATAAGAAAAAAATTGAAAAAGCAAATT-TGT-TTTCTGAA-C-ATAT-TCAAA
1 TTCAAATAGTT-AT--G--ACTATTTG---AA-C-AATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTT
* * * ** * * * **
330518 TAGTTATGACTATTTGAACAA-T-TATCTATATCAAATAGTCATGACCTTTTGTTTTGTTATAAA
55 TTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCTAT-TC--ATA--CA--AGC--TT-ATTTGAAATAAA
** ** * * * * * * *
330581 CCAATTGT-TTTTATTCATGCAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
108 ATAATACTAATTTA-T--T--AA-TAT-TTC---A-AAAAT--TAATAA-GTA-AAAGATTTAAA
* * *
330645 AAATTAATAAG--TA--AAA-AAT
158 AAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * ** * * * *
330664 TTTAAA-A---ATAAATCATTT--AC--CGAGCAAGTTT-AAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
330720 GATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTCAGACTAAAA-AATACTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* **
330783 -TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATAT-TTATACTAAACAAG
128 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT-TACTAAACAAG
* * * * * *
330837 -T----TAGTCATGTCCATTTGAATATTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * * * *
330897 TAAAACAATTTTTTTTGTTCATGCAAAATTA-TTCAAATAAAATAACACTGATATCA-TAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT
* * * * *
330960 TTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAA-AAA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
331007 TTTAAATA---AT---TA--TGAA-AATTATTTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
331062 TAAAATAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAAATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * ** * * *
331127 CAAAAGTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGCGTTT-GTCAAACCAT
131 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * * * * *
331178 TTCAAATACTTAAGACTATTAGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGTC-
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
331242 TAAAGCAATTATTTC-AGTTCGTACAAGCTTA-TTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
331305 TTAAAAAACTAATGAGCAAAAGATTTAAAAAAATAAATCA-GTTTA-TCGAACAAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAAT-ATGTTTACT-AAACAAG
* * * *
331359 TTGAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGCCATTATGACCGTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** ***
331422 CATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAATTTATTTGAAATAAAATAATACTACCCTATTAATA
64 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * * *
331486 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAAAAACTAAAGCTGTTT-TTCGAACCAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * *
331540 TTCAAATAGTTATAAATATTTGAAAAAATT-TCAATTTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
331603 AGAAAACAGTTGTTTTTTTATCATACAAGCTTA--TGCAAATAAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTG-AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
331666 ATTTTAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATAAATGTGTCTGCTAAACCAA-
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAA-CAAG
* * * * * ** * *
331717 TTCAAATAATTAAGAATATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTT-ATTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
331781 TACATCAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA-CTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAACA-
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * *
331843 TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATGTGTATACTAAACAAG
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
331898 TTGAAATAGTTATGATTGTTTCAACAATTATC-AATTCAAAATCATTA-GACCCTTTTTTTTTTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGA-CC-TTTTGTTTTG
* * * *** * *
331961 TCGTAAAACAATTATTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAGAATACTACTTTATTAAT
63 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*
332025 ATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATTAAATCAA-
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACTAAA-CAAG
* * * *
332076 TTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAACTATCTATTTCAAAT-GATTATTACC-TTT-TTTTGT
1 TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
332137 CAT-AAATAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTAATTTGAAATAAAATATTCCTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
332200 TTTGAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACCA-
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
332249 TTACAAATAGTTATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATC
1 TT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
332314 ACAAAACAATTGTTTCTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTAGTAA-AAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *** * * * *
332378 TCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGCCAAGCTAG
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * *
332431 TTCGAACAGTTATGATTATATGAATAATTAGT-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * * *
332495 ATAAAACAATTATTT-TAGGTCATACAAGCTTCTACGGAATAGAATGAA-ACTAATTTATCAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATA
* * ** ** * * * * *
332558 TTTTAAAATTTTGTAAGTAAGAAG--TTAATTCCAATAATTCTATTTACCGAACCAA-
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAA--AAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAG
* * * * * * * *
332613 TCCAAATAATTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
332678 TAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAGGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * * *
332743 -AGATATTTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTCTTTACCAAACCAT
131 CA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
332794 TTCAAATAGGTT-TTACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCGTTATAAGCTTCTATTTTGTC
1 TTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** ** ** *
332858 ATCAAACAATTGGTTCTATTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-T
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * * * **** * *
332922 TCTAAAACTTAATAACCAAAAAAATTAAAACATAAGTCCAATTACCGAACCAA-
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAG
* * * * * * **
332975 TTCGAATAGTTAAGACTATATGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCATTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
333040 TAAAACAATTGTTT-TGTTCATACATGCTTA-TTCAAATTAAAATAACACTAAATTAATAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
333103 TCAAAAATTAATAAG----AGTTTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAATCAA-
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAA-CAAG
* * * * * * * * * * * *
333151 TTCAAGTGGTTAAGACAATTAGGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAGCTTTGGTTTAGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
333216 ATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGTTTA-TTCAGAATAAATTAGTACTAATTTATTAACA-
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
333279 TTCAAAAAATTAATTA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTATTTA-TCCAATAAG
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * * *
333334 GTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** *
333399 TAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATTAT
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * ** *
333462 TTCCTAAATTATTAAGTAAAA-TTTTTTAAAATAAAGT-TGTTTACT-AACTCAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACTAAAC-AAG
* * * * ** * * *
333514 TTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** *
333579 TAAAACAATTGTTTATGA-TCATAGAACCTTATTTG-GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-
66 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
333641 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-TCGAACTAG
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* ** * * * * * * * *
333695 TTCAAATAGTAAAAACTATTAGAATAATTTTCTATTTCTAATCTTTATAACATTTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
333760 TAAAA-TATTAGCTTC-ATATCCTACAAGCTTAATT-AACATTCAGAAA-ATTAATAA-GCA-AA
66 TAAAACAATT-GTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGAA-A-T-A-AAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * *** * *
333819 AGATTTGAAAAATTAAATCTATTTACAGA-AT-AAGTTTAAATA-G-TTA-T-GACTA-
125 ATATTTCAAAAATT-AAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
** * * * **** * ** * * **
333871 TTTGAATAATTAT--TTATTT-AA-AATTGTCATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACACTTGTTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-T-A--TTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTT
* * * * * ** * ** **
333932 CAGTTCACAAAAGC--TT-ATCCAAAATAAAGTA-ATA-CTAATTTCTTAAT-ATTTCAA-A--A
61 -TG-TCATAAAA-CAATTGTTTC--TATTCA-TACA-AGCTTATTT-GAAATAAAAT-AATACTA
* * * * ** ** * *
333988 ATTAATAAGCATGAGTTTAAAAAATAAATTTGT---TTATTGAACAAATTCAAATA-G-TTACT-
117 ATTTATTA--AT-A-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-AAAAT-AAATATGTTTACTA
* *
334047 -ACTAT
176 AACAAG
* * * * * *
334052 TTGAACA-A--T-TGTCTATTT---TAA--AT-T-GTT---A---TTA---CCTTTTATTTTGTT
1 TTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** *
334097 ATAAAACAATTGTTAC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * **
334161 TTGAAAAATTAATAATTAAGAA-ATTTAAAAAGTCAATCTATTTA-TCGAATTAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * ** * *
334214 TTCAAATAATTATGACCATTTCG-GTAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTG-TTTGCT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-T
* * * * *
334277 CATATAACAATTGTTTTTTTATCATACAAGCTTA-TTAAGAATAAAATATTACTAACTTT-TTAA
64 CATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TTTATTAA
* * * * * ** *
334340 TCTTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TCATTCACCGAACTAG
126 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACTAAACAAG
* * * * * * * * *
334395 TTTAAATAGTTACGACTATTTGAACAA-T-TGTATATCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * *
334458 TAAAAAAATTGTTTCCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAGTATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * ** * *
334523 CAAGAATTAATGATTAAGAGATGTAAAATAT-AATTTTTTTGTTGAACCAG
131 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * *
334573 TTTAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
334638 TAAAACAACTTTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTAGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAAAA
66 TAAAACAA--TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * *
334702 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-ACAATTTTGTTTACCTAACCAA-
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AA-TATGTTTA-CTAAACAAG
* * * *
334757 ATCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATCGTTACGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * * *
334822 TAAAA-AA-AGTTTTTATTCATATAAACATGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTACTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
334885 CAAAAATGAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAAAC-AG
131 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAG
* ** * * * * *
334932 TTTAAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTATTATGTT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * * * *
334996 ATAAAACAATAATTTCTATTCATACAAG-TATATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
335060 TTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * ** * * * * * * * *
335113 TTCAAATAGTCATGGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCAATTCATTTTGACTTTTTCTTCTATAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * **
335178 TAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGATATAAAATAATACAAATTTAAAAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * ** * *
335242 TGAAAAATTAATTAGTAAGAGAATTAAAAAA-GAATCTGTTTACCGAATACG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * * *
335293 TTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTAAACCAGTTCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTTTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
335358 ATAAAACAATTGGTTT-T-GTCAATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
65 ATAAAACAATT-GTTTCTATTC-ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * *
335420 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAGATCTGTTTACCAAACAAG
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * ** **
335475 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACAATTTGTTTTGTTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** **
335540 TAAAACAACTATTTTTATTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* ** * * *
335605 CAAAAA-T--TAAG-AAGAGA-TTAAAAGCTAAATATGTTT-TTGAACTAG
131 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
335650 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAAGTATCTATCTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * ** *
335714 TAAAACAATTGTTTCTATTTATGCAAGATTA-TTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAATAATA-
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATAT
* * * *
335776 TTCTAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAT-AA-A--TTTGCTGAACCAA-
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * ** * * *
335824 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTCATTTAGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTC
* * * *** ** *
335889 ATAAAATAATTGTTTC-AGTTCACACATGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATTCTAACAACA
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATA
* * * * * * * *
335952 -TTCAAAATTTTAATAAGCAAAAAATTAAAAAAAATAAATTTGTTTTCTGAACAAA
128 TTTCAAAA-ATTAATAAGTAAAAGATT-TAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * * * * *
336007 TTTAAATAGTCAAGTCTATTGGAACAAATATCTATTTAAAAT-GATTATGGCATTTTGTTTTATA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
336071 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTA--TGAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
336133 TTTAAAAAATTAAAAAGTTAGAGATTTTAAAAATAAATCA-GTTTA-TCAAATC-AG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACT-AAA-CAAG
* * * * **
336187 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
336252 TAAAATAGTTGTTTTTCATT-GTATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * *
336315 TCAAAAATTAA-ACAGTAGGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAACCAA-
130 TCAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAG
* * * * * *
336367 TTCAAATA-TATATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTGTAACCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * **
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* * * * *
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129 T-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAA-CAAG
* * ** * * * *
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1 TTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
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64 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
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* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-
* ** * * * * * * * * * *
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65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * *
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* * ** * ** * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * ** **
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65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
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130 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * **
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66 TAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
** * * * ** *
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129 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * **
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** ** *
337316 TAAAACAATTATTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * *
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131 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * ** *
337491 TAAAAAAATTGTATCTATTTATGCAAGATTA-TTCAAAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAATAATA-
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATA-CTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
337553 TTCTAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAA-
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * ** * * * *
337606 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACCTTTTATTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *** ** *
337671 TAAAATAATTGTTTC-AGTTCACACATGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATTCTAACAACA-
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATAT
* * ** *
337733 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAA
129 TTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * ** * * * * * *
337788 TTCAAATAGTGAAGTTTATTTGAAAAATTATCTATTTAAAAT-GATTATGGCATTTTGTTTTATA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
337852 ATAAAACAATTGCTTC-AGTTCATAAAAGCTTA--TGAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * **
337914 TTTAAAAAATTAAGAAGTTAGAGATTTTAAAAATAAATCAATTTATCAGTTTATTGAATTAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT--AAA-AAAT-AA-ATAT--GTTTACTAAACAAG
* * * * * *
337976 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTG--TTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** *
338039 TAAAACAACTATTTTTC-ATT--TATAAGTTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTT-TTAATAT
66 TAAAACAA-T-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * *
338100 TTCAAAAATTAA-ATAGTAGGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA-TCAAACCCA-
129 TTCAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAA-CAAG
* * * * * *
338153 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTT-AAATCATTGTAACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * **
338217 TAAAACAATTATTTATGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTA
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * * * * *
338282 T-GAAACTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCTAAACGAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * * * * * *
338333 TTCACATAATTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCGCTATGACCATTTGTTATGTCG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** ** * * *
338398 TAAAACAAATGTTT-TCCTTCATATAAGTTTGCTCAAAATAAAATAATACTAATCTACTAATATG
66 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
338462 TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATATA-TCAAACGAA-
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAAC-AAG
* * * * *
338510 TTCAAATAGTTATCACTATTCGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
338575 TAAAACAATTATTTATGTTAATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTA
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * * * * * *
338640 T-GAAAATTAATAAAT-AGAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
338690 TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * * ** * * *
338755 TAGAACAAATGTTTTTGTTCATTTAAGTTTGTTCAAAATGAAATAATATTAATATATTAATATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * *
338820 TGAAAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTACTAAACCAG
131 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * ** *
338867 TTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTCCCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * *
338932 TAAAACAATTGTTTCTATTGAT---AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * ** * *
338993 TCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAGAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAA-
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT-TACTAAACAAG
* * * * *
339046 TGCAAATAATTATAAC-AGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTTAT
1 TTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
339109 CATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-GTTCAGAACAACATAATTCTAATTTATTAATA
64 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * * * * *
339173 TTCCAAAAATTAATAAGGCAAATATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAACAAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * *
339227 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * *
339292 TAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATTCAAATTTATTAATA-TT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* *
339356 -AAGACAATTAATAAGTAAAA-ATTTGAAAAATAAATATGTTTACCT-AGCAAG
131 CAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACAAG
* * ** *
339407 TTCAAATCA-TTATGACTATTT-AAGCAATTTTTTATTTCAAATTATTATGA-CTACTTT-TTTA
1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT--TTTGTTTT
* * * * * * *
339468 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTGTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT
62 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * *
339533 ATTTTGACAA-TAATAAGT-ATA-A--T-AAAAAT-AATATGTTAAC-AGAACAAG
127 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTA-AACAAG
* * * * * * *
339581 TTCGAATAGTCATGACTATTTG-ACTCATTATTTA-TTCAAATCATTTTGACC-TTTGTTTTGTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
339643 ATAAAATAATTGTTTCAATTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * **
339708 CCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA-AGAATATGTTTACCGAACATA-
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATATGTTTACTAAACA-AG
* ** * ** * *
339760 TTCAAATAGTTATGACTA-TT-AA-AATAAT-TGGTTC-TATAC---ATG-CCAACTTATTTCG-
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-CGTTATGACC-TTTTGTTTTGT
* * * * * * * **
339815 AATAAAATCATTTAAATTTACTAATATTCCTAAAATTCATAAAT-AAATGTGTAAAATAATA-TA
64 CATAAAA-CAATT--GTTT-C---TATTCATACAA-GCTTATTTGAAA----TAAAATAATACTA
** * * ** * *
339878 TATTTACAAATATTCCTAAAATTTCTAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACAC
117 -ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACA-
339942 A-
180 AG
* * * * *
339943 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCCATTTCACATCATTATGACCCTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
340008 TAAACCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * **
340072 CCCAAAATTAATAAGCAAAATATTTATAAAAATAAATCTATTTA-TCAAGGAA-
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * * **
340124 TTTAGATAGTTATGAGTATTTAAACAATTATTTTTTTCAAGTCGTTATGATATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
340189 TAAAAACAATTGTTTCCATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 T-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
340254 TTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
340306 TTCAAATAGTAATG-TTCATTTGAACTATGATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** ** *
340370 GTAAAACAATTGTTGCTATTCATATAAAATTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * **
340435 TCAAAAATTAATAAG----AGAGTTAAAAACTAAATATGTTT-CTCGAATTAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * * *
340483 TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
340547 TAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
340610 TCTAAAAATTACTAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAATC-AG
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACAAG
* * * * * * * *
340663 TTCAAATAGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-CTAGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * **
340727 TAAAATAATAT-TTTGATAATTAATA-AGTAGAAAATT-TTTAAAATAAATATGTTTACTAAACT
66 TAAAACAAT-TGTTT-CT-ATTCATACA--AG---CTTATTTGAAATAAA-AT-AATACT-AA-T
** * * * ** * * *** * * *
340789 AGATCAGGCA-ATCATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTT
119 TTATTA---ATAT-TTCAAAAATT-AATAAGTAAAAGATTT-AAA--A-AAT-A-AATATG-TTT
* *
340852 GTCATAAAAGAATTG
172 -AC-T-AAACAA--G
** * * * ** * * ** * * ****
340867 TTTCAGCT--TATATAAGCT-TATTCAA-AATAAAATAATAGT-AATTTATTAATAAGCTGAAAA
1 -TTCAAATAGT-TATGA-CTAT-TTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATCGTT-ATGACCT-TTTG
** * * * *** * * * * *
340927 TTAAG-AATAAAGA-GATT-TTT-AAAAAAT-CTA-TTTATTTAACAAGTTTAAATACTTA-TGA
58 TTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AA--TAAAATA-ATACT-A
* * ***
340985 CTGTT-TTAATAGTTATCTATTTAAAATTGCTATAACCTTTGTTTTGTCGTAAAATGATTTTTTC
117 AT-TTATTAATA-TT-TC-A---AAAATT--AATAA-------------GTAAAA-GA-TTTAAA
* * * ** * * *
341049 TATTCACACGTGTTTATTTCAAATAAAA
158 AAAT-AAATATGTTTA-CT-AAA-CAAG
* * * * ** * ** **
341077 TAATACAAAT--TTATCAATA-TT-AAGGCAATTAAT-AAGTAAAAGAT-TTTAAAAAATAAATT
1 T--T-CAAATAGTTATGACTATTTGAA--CAATT-ATCTATTTCAA-ATCGTTATGACCT---TT
* * ** * ** ** *
341136 TGTTTAT-T-A-AACAAGTTTAAATCGTTATGACTATTTGTGCAA--TTATTT-ATTTTAACTTG
56 TGTTT-TGTCATAA-AA----CAATTGTT-T--CTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATA
* * ** * ** *
341195 TTA-TGATTT-TTTGT-TTTGACATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAATTTATTCATATTAA
111 ATACTAATTTATTAATATTT--C---AAA-AA----TT-AATAAGTA-AAA--GATT--TA--AA
* * **
341257 AAAT-AATATTAATTTATTAAA-ATT
158 AAATAAATA-T-GTTTACTAAACAAG
* * * * ** * * * * ** *
341281 TTGACAATTACTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT-TTATCAAATAAGTT-T-A--AATA
1 TT--CAAATAGTTA-T-GACTATTTGAACAAT---TATCTATT-TCAAAT-CGTTATGACCTTTT
** * * * * * * * *
341341 GTCATGACTATTAAATAA-T-TATCAATTTCAAAACATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACA
57 GTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTC-ATACA--A-G--C--TT-ATTTGAAAT-AAA-A
** ** * * * * * * ** *
341404 TTTGTTTTAGTTTATATAAGCTTATTTCAAGTAAAAAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
109 -TAATACTAATTTAT-TAA---TATTTC----AAAAATTAATAA-GTA-AAAGATTTAAAAAATA
* *
341469 AATGA-G-TAACAAAATTAAAAAAAG
163 AAT-ATGTTTAC-----T-AAACAAG
* * * * * *
341493 AATCTATTTATTGAATAAGTTTAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAACAT
1 ------TTCA---AAT-AG-TT--ATGA-CTA------TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * *
341557 TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGTTTATTTTG-AATAAAA
46 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAA
* * * * *
341620 TAAT-TTAAATTTATTAATAGTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTGAAAAATAAATATGTTTT
109 TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
* *
341683 CTGAACATG
173 CTAAACAAG
** * * * *
341692 TTCAAATAGTTATGACTATTCAAATAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * * *
341757 TAAGCCAATTGTTTTTGTGCATAAAAG-TATATTT-AGAATAAACTAATACTAATTTATTAAAAT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * *
341820 TTTTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTGAAAGATAAATACGTTTACTGAGCGAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * *
341873 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
341938 AAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATA-TT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * *
342002 CTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACTGAACAAG
131 C-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * ** * * * * ** *
342054 TTCAAATAATCTA-GTCCATTCAAACAATTATTTATTTCAATTTGTTATGACATTTCATTTTGTT
1 TTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * * *
342118 GTAAAATAATTATTTTTATTCATACAAAATTA-TTCAAATAAAATGATACTAGTTTATTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
342182 TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAGAAACTAAATCTATTTACCAAACTAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * *
342230 TTC--A-A---ATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * ** *
342288 TAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAATTATTACTAAACTAATAATATTG
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
* * * **
342353 T-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTACCGAACAAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * ** * * * * * * *
342404 TTCGAATGGTTAAAACTATTAGAATAATTATATATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
342469 TAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAACA-T
66 TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
342532 TCAAAAATTATTAAGCAAGAA-ATTT-AAAAAT--ATATGTTTACCAAACAAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAG
* * * * * * *
342581 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * ** * *
342646 TAAAACAATTATTGC-AGATCATAAAAGCTTA-TCCAATATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
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* * * **** * *
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AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTCAT
AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAATT
TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
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327225 TATTCTCATG
* * * *
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*
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64 ACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATCTT-TTGTTTTGTCA-TAAAGCAA-----T-TA--T
* * *
327360 ACACAAGCTTATTCTAAATAAAACAATATAACTTTCTTAATATTGCAAAAATTAATA
118 --ACAAGCGTATTCTAAATAAAACAATATAACTTTCTTAATACTCCAAAAATTAATA
* * * * * *
327417 AGTAAGAATTTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACACGTTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAAC
1 AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTTCAAATAGTTAGAACTATTTAAAC
*
327482 AATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTATACAAGCGTATT-T
66 AATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTATACAAGCGTATTCT
* *
327546 AAAATAAAATAATACT-A-TTTTTTAATACTCCAAAAATTAATA
131 -AAATAAAACAATA-TAACTTTCTTAATACTCCAAAAATTAATA
* ** *
327588 AGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAGTAAG-TTCAAATAGTTATAACTATTTAAA
1 AGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTTCAAATAGTTAGAACTATTTAAA
*
327651 CAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATT
65 CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATT
327702 GTTTCTATTC
Statistics
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AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTTCAAATAGTTAGAACTATTTAAAC
AATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTATACAAGCGTATTCT
AAATAAAACAATATAACTTTCTTAATACTCCAAAAATTAATA
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324409 ACCGAATAAT
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* * **
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** ** * * *
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125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * ** *
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* * * * ****
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254 T-T-T--A-T-ACA-A-GCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATTA-TACTCCAAAAATTA
* * * * * * *
324738 ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATATATTTACTGAA-CAAGTTC-AA-A--TA-G-----TT-
309 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
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373 AACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * * ** * * *
324855 TACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAACAAGTA-AAA
437 TATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTATAAAAATTAA-TAGTAGAAG
* **** * * * * * * *
324918 ATTTAAACAAA-AAATTTATTTTTTTAACACGTTCAAATATTTATGACCATTTGAATAATTGTTT
500 ATTTAAA-AAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
324982 ATTTCAAATCGTTATGACATTTT-TTTTGGCCATAAACCAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTA
564 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA-ATTA
* * *
325045 TTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTGAGAGATTT-AAAAAT
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* * * * ***
325109 AAAT-TGGTTTATTGAGTGAG
686 GAATCT-ATTTACTAAACAAG
* * * * *
325129 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * *
325194 TAAAGA-AACTGTTTCTATTCATACGAA-ATTATTCACAATAAAATAAAACTAATTTATTAATAT
65 TAAA-ACAATTGTTTCT-TTTATAC-AAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
*** * * * * *
325257 TTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTGTTTA-CCAAACTAG-TTCAAATAG
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * *
325315 TTATGACTATTTGAATAATTATTTATCTCAAATCAG-TATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAT-A
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATCA
* * *** * * * *** * * *
325377 ATTTTTTCTGTCCATA-AAACTTATTCGGAGTAAAATATTGCTAAACCAATAATATTCTAAAAAT
253 A-----T-T-T--ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT--ATTTATTATACTCCAAAAAT
* * * * ** *
325441 T--T-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATT
307 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
** * * * * * * * * *
325501 AAAACAATTGTCTATTTTAAATCA-TTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGT
371 TGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * * * * * *
325564 TCAAACATGCTTATTT-GAAATCAAATAATACTATTTTATTAATGTTAAAAAAATTAATAAGCA-
434 TCATATAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAG
* * * * * *
325627 AAGAATTTGAAAAAATAAATCTCTTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATT
497 AAG-ATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATT
* * * * *
325692 ATCCATTT-AAAATGTTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATA-AAA
560 ATCTATTTCAAATTG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAA
* * * * * *
325754 GCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTCTTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGTTGGAGATTT-
623 -ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAATT-AATAA----GAGATTTA
* * *
325817 -AAAATGTATATCAATTTATTGAATC-AG
680 AAAAATG-A-ATCTATTTACT-AAACAAG
* * * * * *
325844 TTCAAATAGTTATGGCTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAACCATTTTGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
*
325909 TAAAA-AACTT-TTT-TTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 TAAAACAA-TTGTTTCTTT--T-ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
* * * * * *
325971 TTTCAAAGATTAATATGT-AGTAGA---T------T--ATATGTTTA-CTGAACTAGTTT-AAAT
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAAT
* * * * *
326022 AATTAAGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGTTA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAG
188 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---A-
* * * * * * * ***
326086 AATTATTTATATTCATGCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTATGAAAA
248 AATCA---AT-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-AT-TTATTATACTCCAAAAA
* ** * * * * * * *** ** * * * **
326151 TTAACATCTAAGATATTTGAAATATAAATTTATTTGTTGAA-CCAGTTAAAATGGTTAAGGTTAT
306 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * * * * * *
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370 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAT-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * *
326279 TCATAGAAGTTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAACA--A-AA
434 TCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAGTAGAA
* * * * * *
326341 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATCAA-TTCAATTAGTTATAACAATTTAAACAACTATT
499 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATC
* * * * * **
326405 TATTTCATATCT-TTATGACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCTATTGATGCAGCCA-T
563 TATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACA-AAATT
* * * *
326468 ATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAAA
626 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC--TAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAA
* ** ** *
326533 TGAATCTGTTGGCTTGACCAG
685 TGAATCTATTTACTAAACAAG
* *
326554 TACAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * * * *
326619 CAAAAAGAATTATTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAGATAATTCTAATTTATTAATAT
65 -TAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA-TATAATTTATTAATAT
* * * * * * *
326683 TCCAAAAGTTACTAAATAAGAGA-TTTAAAAACTGAATTTGTTTATC-AAACAAGTTT-AAATAG
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * ** *
326745 TTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATCAA
* * * * * *
326809 TTTTTTTCTATTCCTACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAT-CATTCAGACAA
254 -----TT-TA----TACAAGCATATTTAAAATAAAATAATAC-TATTTATTATAC-TCCA-AAAA
* * *
326873 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
306 TTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCA-AGTAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
326937 TTTGAACAAATATTTCTTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTTTG
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* ** * * * * * *
327001 TTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAGTTTATTAATATTCA-GATAGTTAATAGTAG
433 TTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-ATAAAAATTAATAGTAG
* * * * *
327065 AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTAT
497 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
327130 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTCGTCATAAAAACAATTGTATC-AGTTTATATAGACT
562 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAAT
* * * * *
327194 TATTCAAAATAAAATAATGCTGATTTATTAATATTCT-CATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
625 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAAT
327258 CTATTTACTAAACAAG
690 CTATTTACTAAACAAG
* * *
327274 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTT-TTATTTTGTC
* * * *
327339 ATTAAACAATTGTTTCTATTTACACAAGCTTATTCTAAATAAAACAATATAACTTTCTTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATAA-TTTATTAATATT
* *
327404 GCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTTAAAAAATAAATATATTT-TCTAAACACGTTTCAAATAGT
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGT
* *
327467 TAGGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA-T
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATT
* *
327531 TATACAAGCGTATTTAAAATAAAATAATACTATTTTTTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAG
256 TATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACTATTTATT-ATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAG
* * *
327596 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATTTA
320 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * *
327661 TTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCACA-AAGTTTTTTT
385 TTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTT
* *
327725 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAA
450 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATA-GTAGAAGATTTAAAAAATAAA
* *** ** * * * **
327790 TTTGCTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCACTTGAATAATTATCTATTTGAAATCATTAT
514 TTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * * **
327855 AACCTTCTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATGCAAAATTATTCAGAATAATATTGTA
579 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATA
* * * *
327920 CTAACTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATAGATTTAAAAACT-ATATCTATTTACTAAAACAA
644 CTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGA-ATCTATTTACT-AAACAA
327984 -
705 G
* * * *
327984 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TCTTTATTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACT-TTTATTTTGTCA
* * * *
328048 TAAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACGAATTTAATAATATTT
65 TAAAACAATTGTTTCTTTT-ATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
328113 CAAAAATTAATAAGTAA-AGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAA
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATA------T-------ATT----TA--T--
* * * * *
328176 GACTATTTTGTCAATAAACATGTTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATA
171 --CTA-------AA-CAA-GT-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA
* * *
328241 GTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACATGCATATTTAAAATAAAA
224 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA-------T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAA
* * * * *
328306 TAATGCTAGTTTATTCATATTCCAAAAAATAATAA-TAAAATA-TTAAAAAATAAACCTGTTTAC
280 TAATACTA-TTTATT-ATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * **
328369 CCAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTGGTTGAACAATTATTTATTTC----AG--ATGATCTTTTG
343 CAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTG
* * * **
328428 TTTCGTCATAAAACAATT-ATTCTATTTATATAAGTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTAT
408 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
328492 TAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAA
473 TAATATTATAAAAATTAATA-GTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAA
** * * *
328557 TAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTT-AATTTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAAC
537 TAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * *
328621 AATTGTTTTTGTTCA-AGCAAAATTATTCAGAATAAAATTATATTTATCTATTAATATTTTGAAA
602 AATTATTTCTATTCATA-CAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAA
* * * * *
328685 CTTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTTCCGAAA-TAG
665 -TTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA-TTTACTAAACAAG
* * * * **
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-C-TTT-TAT-TTTG
* ** * * **** * *** *
328792 TTATGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TATTTTT
62 TCAT-AA-AACAAT-TGTTT---CTT-TTAT-ACAAGCT-TATTCAAATAAAATAATATA-ATTT
** * * *
328856 GATCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTTAAAAATTAGTAAGT
117 -AT--T--AA---TA-TT-CCA-AAAAT--TAATAA-GTA--AGAGATTTTAAAAA--A-T-A--
* * ** ** * *
328920 AAAAGATTTAAGAAATAAATCTATTTTTCAAACTAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAAT
160 AATATATTT---ATCTAAA-C-AAGTTTCAAA-TAGTT---ATGA-CTAT------TTGAACAAT
* * * * * *
328984 TAT-TAATCTCAAATTGTTAAGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TATCATAG-AAACT
209 TATCT-ATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATT-TATA-CA-AGCATA--
** * * * ** *
329046 TATTCGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAA
268 T-TTAAAAT-AAAATAATACT-ATTT-ATTATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* *** * * ** * * *
329111 ATAAATATGTTTGTTGAACT-AGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATATATTTCAAAT
329 ATAAATCTGTTT-ACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
* * * * * * * * * * *
329175 TGTTCA-AACCTTTTGTTTAGTCA-AAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTCAAAATA
393 AGTT-ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATATAAGTTTATTTAGAATA
* * * * * * * *
329237 AAATAATTCAAATTTATTAACATT-TGGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTC
456 AAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTAGAAGATTT-AAAAAATAAATTTG
*** * * ** * * * * **
329301 TTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACC
518 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
* * * * * * * * * *
329366 TTTTGCTTTGACATGAAAGAGTTGTTTCAATTTATA-AAAGCTTA-TCTAGAATAAAATAATACT
583 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA-ATTATTC-AAAATAAAATAATACT
* * * * *
329429 AATTTCTTAATATTTTCAGAATTAATAAGCAAAAGTTAAAAAAAATAAATTTAAATAAATTTATT
646 AATTTATTAATATTCT-A-AATTAATAAG--AGA-TT--------TAAA---AAATGAATCTATT
* *
329494 TACCAAACAAA
695 TACTAAACAAG
* * * * * *
329505 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
** * * * *
329570 TAAAACAATCATTTCAGTTCATACAAGCTTATCCAAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTC--AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * * **
329635 CCAAAAATTAATAAGT----GA-TTTAAAAAGTTAATTTGCTTATC-AAATCAA--TTCAAATAG
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAA-CAAGTTTCAAATAG
* * * * * * **
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* * ** * *
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* * * * * ** *
329819 TAAGAAGTGAGAGATTTGAAAAAATAAATCTTTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATT
307 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * ** * * * *
329884 TGAACAATTAAAATAATAT-AAACTTA-TTA--ATATTTAGATAAT-TAATAAGTA-GA-TGATT
371 TGAACAATT--ATTTATTTCAAA--TAGTTATGATCTTTTG-TTTTGTCATAA-AACAATTGTTT
** * * * * * **
329942 -TA-AAAAAGAAATCTATTTACCAAATAAGCTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAGCAATTATTTA
430 CTATTCATATAAGTTTATTTA--GAAT-A----AAATA---AT-ACTAATTT-ATTAA-TA-TTA
* * **** * * * * ** * *
330004 TTTAAAATCAATATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTC-T
481 -TAAAAATTAATA-G--TAGAAG-ATT-T-AAAAAATAAATT-TGTTT-ACCAAACAAG-TTCAA
* * * * ** ** * * *** *
330067 TTGGATTAAAATAATATT-AATTTATTAAC-ATTTCAACAATTAG-TAAGTA--AAAT-ATTT-T
536 ATAG-TCATAACCAT-TTGAA-CAATTATCTATTTC-A-AATT-GTTATG-ACCTTTTGTTTTGT
** * * * * ** *
330125 -A-AAAGTAAATATGTT-TA-CCA-A-ACAA--GTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAATAATTA
594 CATAAAACAATTAT-TTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATA-AAATAA-TA-CT-AAT--TTA
* ** * ** ** ** * * *
330181 TTTAT-TTC-AAATTGTTATGACTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTA-T---C-AG
652 TTAATATTCTAAATTAATAAGA--GAT-TTAAAAAATGAATCTATT-TACTAAACAAG
* * * * * * * ***
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1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTG--A-ACAATTAT-CT-ATCTCAAAT--CATTATGACTTTTAT
** * * * * * * * *** *
330290 TGAGTAAGAGATTTAGAATATGAATTT-GTTTA-CCAAAG--AAGTTCAAATGGTTATGACTAGT
58 TTTGTCATA-A--AACAAT-TG--TTTCTTTTATAC-AAGCTTA-TTCAAAT-AAAAT-AATA--
* * * * *** * * * *
330351 TGAA-TAATTATCTATGT-CAAATCATTATTACA-T-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTC
111 T-AATTTATTA-ATAT-TCCAAA-AATTAATA-AGTAAGAGATTT-T-AAAAAATAAATATATT-
* * * * * * * * * *
330411 TATCCACACAAGCTTATTTTGAAGAAAATAATATAAATTTATTAATATTTAAAAAAT-TC-ATAA
168 TATCTAAACAAG-----TTT----CAAATAGT-T--A-TGACT-AT-TTGAACAATTATCTAT-T
** * * ** ** * * * * *
330474 GAAAAAAATTGAAAAAGCAAATTTGTTTTCTGAACAT-ATTCAA-ATAGT-TATG-ACTATTTGA
217 TCAAATAGTT--ATGA-C-CTTTTG-TTT-TG-TCATAAATCAATTTA-TACAAGCA-TATTT-A
* * * ** ** ** * *
330535 ACAATTATCTATATCAAATAGTCATGACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTGTTTTTATTCATG
272 A-AA-TA---AAAT--AATA--C-T-A---TTTATTATACTCCAAA--AA-T-TAATAAGT-A--
* * * ** * * ** *
330600 CAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-T-ATTTCAAA-AATTA--A-TAAGTAA
316 AAAG-AT-TT-AAAA-AATA-AAT-CT-GTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** * * * * * ****
330659 AAAATT-TTAAAAAT-AAATCATTTACCGAGCAAGTTTAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTGA
374 ACAATTATT-TATTTCAAAT-AGTTA-TGATC---TTT---T-GTTTTG-TC--ATAAAA-----
* * * * *
330722 TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGACTAAAA-AATACTAATTTATTAATATTC
421 -----CAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTA
* * *
330786 TAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATT-TATACTAAACAAG-T----TAGTCAT
481 TAAAAATTAATA-GTAGAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT
** * * ** *
330845 GTCCATTTGAATATTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTT
544 AACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * *
330910 TTTGTTCATGCAAAATTATTC-AAATAAAATAACACTGATATCA-TAATATTTTAAAAATTAATA
609 TCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTCT--AAATTAATA
* * * * *
330973 AGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAA-AAA
671 AGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * ** *
331007 TTTAAATA---AT---TA--TGAA-AATTATTTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTTATTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACT-TTTATTTTGTCA
* * ** * * *
331062 TAAAATAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTAATAAAATTC
65 TAAAACAATTGTTTCTTTT-ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * *** * * *
331127 CAAAAGTTAGTAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATGCGTTTGTC-AAACCA-TTTCAAATACTT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * *
331189 AAGACTATTAGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTCTAACTTTTTGTTTAGTC-TAAAGCAATTA
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC-A--A
* * * * ** *
331253 TTTCAGTTCGTACAAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAACTAAT
254 TTT-A-----TACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATTAAT
* * * * * *
331318 GAGCAAAAGATTTAAAAAAATAAATCAGTTTATCGAA-CAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTG
311 AAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTG
* * * *
331381 AACAATTATCTATTT-AAAGCCA-TTATGACCGTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAATT
373 AACAATTATTTATTTCAAA--TAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATT
* * ***
331443 CATAAAAATTTATTT-GAAATAAAATAATACTACCCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA-
435 CATATAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTAG
* * ** ** * * * ** *
331505 AGAGATTCAAAAACTAAAGCTGTTTTTCGAACCAGTTCAAATAGTTATAAATATTTGAAAAAATT
497 A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTG-AACAATT
* * * * * * * * **
331570 -TCAATTTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTTAGAAAACAGTTGTTTTTTTATCATACAAGC
560 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAAA
* * * *
331633 TTATGC-AAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAAT
624 TTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * *
331697 AAATGTGTCTGCTAAACCAA-
686 GAATCTATTTACTAAA-CAAG
* * * * * * * *
331717 TTCAAATAATTAAGAATATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTA-TTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * * * *
331781 TACATCAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTACTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTC
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * * * * * *
331846 AAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAAATAAATGTGTATA-CTAAACAAG-TTGAAATAGTT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTT
* * * * * * *
331909 ATGATTGTTTCAACAATTATC-AATTCAAAATCA-TTA-GACCCTTTTTTTTTTGTCGTAAAACA
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAAT-AGTTATGA-CC-TTTTGTTTTGTCATAAATC-
* * ** * * *
331971 ATTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAAGAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAAT
252 A--A---T--TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACTA-TTTATT-ATACTCCAAAAAT
** * * *
332036 TAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATTAAATCAA-TTCAAATAATTATTG-CCA
307 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAGT-AAGTTCAAATAGTTA-TGACTA
* * * * * *
332094 TTTGAACAACTATCTATTTCAAAT-GATTATTA-CCTTT-TTTTGTCAT-AAATAATTGTTTTTC
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATAG-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* * * * * * *
332155 A-ACATACAAGCTAATTT-GAAATAAAATATTCCTAATTTATTAATATT-TGAAGAATTAATA--
432 ATTCATATAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGT
* * *** * * * * * *
332215 AG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACCA-TTACAAATAGTTATGACTACTTGAATAAT
495 AGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT-CAAATAGTCATAACCATTTGAACAAT
* * * * * * * **
332278 TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCACAAAACAATTGTTTCTGTTTATACAAGC
559 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAA
** * * * *
332343 TTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTAGTAAAATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAA
624 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAA
* * * * * *
332408 AATAAATCCATTTGCCAAGCTAG
683 AATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * ** *
332431 TTCGAACAGTTATGATTATATGAATAATTAGT-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * * * * * * *
332495 ATAAAACAATTATTT-TAGGTCATACAAGCTTCTACGGAATAGAATGAA-ACTAATTTATCAATA
64 ATAAAACAATTGTTTCT--TTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAAT-AATA-TAATTTATTAATA
** * ** * ** * * * * * *
332558 TTTTAAAATTTTGTAAGTAAGA-A-GTTAATTCCAATAATTCTATTTACCGAACCAA--TCCAAA
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAA--AAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAA
* * * * * * *
332619 TAATTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
187 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAT
* * ** * * ** *
332683 CAATTGTTTTTGTTAATATAGGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAGAT
251 CAA-------T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCA-AA
* * * * * *** * *
332747 ATTTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTCTTTACCAAACCATTTCAAATAGGTT-TTACT
304 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATA-GTTATGACT
* ** * * * * * * *
332811 ATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCGTTATAAGCTTCTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA
368 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * * ** *
332876 TTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACCAA
433 TTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAG
* * * * **** * * * * * *
332941 AAAAATTAAAACATAAGTCCAATTACCGAACCAA-TTCGAATAGTTA-AGACTATATGAACAATA
497 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATTTGAACAATT
** * ** * * ***
333004 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACATGCT
560 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAAT
* * * * * * *
333068 TATTCAAATTAAAATAACACTAAATTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGTTTTAAAAAATAA
625 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGA
* * *
333133 ATTTTTTTACCAAATCAA-
688 ATCTATTTACTAAA-CAAG
* * * * * * * * ** * *
333151 TTCAAGTGGTTAAGACAATTAGGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAGCTTTGGTTTAGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * * * * * *
333216 ATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAATTAGTACTAATTTATTAACATT
64 ATAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * * * * *
333281 CAAAAAATTAATTA-TAAAGAGA-TTTAAAAAATAAAATCTATTTATC-CAATAAG-GTCAAATA
126 CCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTTAAAAAAT-AAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * * * *
333342 GTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCA
* ** * * *
333406 ATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATAGAATAAAATAATACTAATTTATTATTATTTCC-TAAA
253 A-----T---TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATTA-TA-CTCCAAAAA
* * ** * * * * * * *
333470 TTATTAAGTAAAA-TTTTTTAAAATAAAGT-TGTTTACTAACTCAGTTAAAATAATTATGGCCAT
306 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * * * * * *
333533 TTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTATGA-
370 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AT
* ** ** * *
333597 TCATAGAACCTTATTT-GGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTA-
434 TCATATAAGTTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAG
* * * * * * * * * *
333660 AGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTAAAAACTATTAGAATAATTT
497 A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTA
* * * * * * *
333725 TCTATTTCTAATCT-TTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAA-TATTAGCTTC-ATATCCTAC--A
561 TCTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTAT-TCATACAAA
** * * * * * *
333785 A-GCTT---AAT----T-A-AC--ATTCA-GAA-AAT-T-AA-TAAGCAAAAGATTTGAAAAATT
623 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAATTAA-TAAGAGATTT-AAAAAAT
* *
333833 AAATCTATTTAC-AGAATAAG
686 GAATCTATTTACTA-AACAAG
* * * * * ** * * *
333853 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTCATGACTTTTTGTTTTGCCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * * * * * * *
333918 TAAAACACTTGTTTCAGTTCACAAAAGCTTATCCAAAATAAAGTAATACTAATTTCTTAATATTT
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * * * *
333983 CAAAAATTAATAAGCATGAG--TTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-TGAACAA-ATTCAAATAGTT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTT
* * * * * * *
334044 ACT-ACTATTTGAACAATTGTCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATT
192 A-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA--
* * * * **
334108 GTTACAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAA
254 --T----TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATTAA
* * * * * * * *
334173 TAATTAAGAA-ATTTAAAAAGTCAATCTATTTATCGAA-TTAGTTCAAATAATTATGACCATTTC
310 TAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-
** * * * * * *
334236 G-GTAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTACCTTTTG-TTTGCTCATATAACAATTGTTTTTTTA
372 GAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTAT-
* * * * *
334298 TCATACAAGCTTATTAAGAATAAAATATTACTAACTTT-TTAATCTT-TCAAAAATTAATAGTA-
434 TCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGTAG
* ** * * * * * ** *
334360 AGAGATTTAAAAACTAAATTCATTCACCGAACTAGTTTAAATAGTTACGACTATTTGAACAA-T-
497 A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTA
* * ** * * * * * * * **
334423 TGTATATCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTGTTTCCATTCATACAAGCTT
561 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATT
* * * * * *
334488 ATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAGTATTTCAAGAATTAATGATTAAGAGATGTAAAATA
626 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTA-AATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAA
* * ** * *
334553 T-AATTTTTTTGTTGAACCAG
685 TGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * *
334573 TTTAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * * *
334638 TAAAACAACTTTTTTTCAATTCATACTAGCTTATT-AGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAAAA
65 TAAAACAA--TTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTCA--AATAAAATAATAT-AATTTATTAATA
* * * * * * * * *
334702 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAACAATTTTGTTTACCTAACCAA--ATCAAATA
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * **
334765 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATCGTTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA
* * * ** * * * * *
334830 GTTTTTATTCATATAAACATGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTACTAATATTTCAAAAATGAA
254 -----T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTA-TTATACTCCAAAAATTAA
* * * * *
334895 TAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAA-AACAGTTTAAAATAGTTATGACTATTTG
310 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTA-AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * **
334955 AGTAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTATTATGTTATAAAACAATAATTTCTATTCAT
373 AACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * ** * * * *
335019 ACAAGTATATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAGTAAAAGA
438 ATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTAGAAGA
* * ** * **
335083 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGGCTATTTGAGTAATTATCTAT
501 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * **
335148 TTC-AATTCATTTTGACTTTTTCTTCTATAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATT
566 TTCAAATT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAATTATT
** * * ** *
335211 TGATATAAAATAATACAAATTTAAAAATATT-TGAAAAATTAATTAGTAAGAGAATTAAAAAA-G
629 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATG
* ** * *
335274 AATCTGTTTACCGAATACG
687 AATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * *
335293 TTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTAAACCAGT-TCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTA-TCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGT
** * *
335357 CATAAAACAATTGGTTT-TGTCAATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA
63 CATAAAACAATT-GTTTCT-TTTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATA
* * * * * *
335421 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTT-AAAAATAGATCTGTTTA-CCAAACAAG-TTCAAATA
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * ** ** *
335483 GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACAATTTGTTTTGTTGTAAAACAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC-A
* * * * *
335548 CTATTTTTATTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T
253 --A--TTTATACAAGC---A-TATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* ** * *** * *
335612 --TAAG-AAGAGA-TTAAAAGCTAAATATGTTTTTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTG
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
335672 AATAAGTATCTATCTCAAATCA-TTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTA
373 AACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
** * * * * ** * * *
335735 TGCAAGATTATTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAATAATATTCT-AAAATTAATAAGTA-AAA
437 TATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGAAG
* * * * * * * *
335797 ATTTTAAAAATAAATTTG-CT--GAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCT
500 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * ***
335857 ATTTCAAATTATTTTGACCTTTTCATTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCACACATGCTTA
564 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAATTA
* ** * * * *
335921 TCCAAAATAAAATAATACT-ATTCTAACAACATTCAAAATTTTAATAAGCAAAAAATTAAAAAAA
627 TTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCTAAA--TTAATAAG----AGATT-TAAAAA
* * * * * *
335985 ATAAATTTGTTTTCTGAACAAA
684 ATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * * * * * * *
336007 TTTAAATAGTCAAGTCTATTGGAACAAATATCTATTTAAAATGATTATGGCATTTTGTTTTATAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * ** * **
336072 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATGAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTA
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCC
* * * *
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128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCTAAA-CAAGTTTCAAATAGT
* * **
336197 TATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AG
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATCA-
* * ** * * *
336260 TTGTTTTTCATTGTATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATT
253 ----ATTT-A---TACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
** * * * **
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308 AATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGT-TATGACTAT
* * * * * * * * *
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370 TTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * ** * *
336450 TCATACATGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTATGAAAATTAATAACTA-A
434 TCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA
* * * ** * *
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498 -AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCA-TAA--CCATTTGAACAA
* * * * * *
336575 TTATCTATGTT-AAATCGTTATGACCATTTGTTATGTCTTAAAACAAATGT-TTTC-CTTCATAT
558 TTATCTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TATTTCTATTCATAC
** * * * * *
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620 AAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TC-TAAATTAATAAGAGATTTAAAA
* *
336701 AATAAATCTATATA-TCAAACGAA-
683 AATGAATCTATTTACT-AAAC-AAG
* * * * * ** *
336724 TTCAAATAGTTATCACTATTCGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTG-CT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTC-
* ** * ** * * * * *
336788 ATAAAATAATAATTTATGTTCGTACATGCATATTCAGATTAAAATAATATTCATTCATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
*** * * * *
336853 TGGACAA-T--TAA-TAAG-GA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAG-TTCAAATTGT
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGT
* * * * * *
336910 CATGACTATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAATTA-TTTTGACCTTTCCTTTTTTG-AAAAAATA
191 TATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTT--TGTTTTGTCATAAATC
* * * ** ** * *
336972 ATTATTTAGATCATATAAGCTTATTTGATGTAAAATCGTACTAATTTATTAATATTCAAAAAATT
252 A--A-TT---T-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * * * * * * * *
337037 AATGACTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATATGTTTACCAAATAGGTTTAAATAGTTATGATTGTTT
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
337101 AAATAATTATCTATTTCAAA-A--CAT-AAC-----TTTT-TCTTAAAACAATTGGTTT-TGTTG
372 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTC
** * * *** * *
337155 ATGCAAGCTTA-TTACAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATGCCAAAAATTATTAAGTAAA
436 ATATAAGTTTATTTA-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA
* * * * * * * *
337218 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
498 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATC
* * * ** *
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563 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTAT
* * * * * *
337348 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATCAATATTTCAAAAATTAATTAGAGA-TTAAAAACTAAATA
628 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* *
337412 TATTTACCAAACTAG
691 TATTTACTAAACAAG
* * * * *
337427 CTCAAATAGTTATCACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACT-TTTATTTTGTCA
* * * * * ** *
337491 TAAAAAAATTGTATCTATTTATGCAAGATTATTCAAAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAATAATATT
65 TAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATA--TAATTTATTAATATT
* * * * *
337555 -CTAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTT-AAAAATAAATGTATTT-GCTGAACCAA--TTCAAATAG
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCT-AAACAAGTTTCAAATAG
* * * * * * *
337615 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAAT-A
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATCA
* ** ** *
337678 ATTGTTTCAGTTCACACATGCTTATCCAAAATAAAATAATACTATTCTAACA-ACATTCAAAAAA
253 A---TTT-A--T-ACA-A-GCATATTTAAAATAAAATAATACTATT-TATTATAC--TCCAAAAA
* * * * * **
337742 TTAATAAGCAAGAA-ATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAATTCAAATAGTGAAGTTT
306 TTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
337805 ATTTGAAAAATTATCTATTTAAAAT-GATTATG-GCATTTTGTTTTATAATAAAACAATTGCTTC
368 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAG-TTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * *
337868 -AGTTCATAAAAGCTTA-TGAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TAAAAAATTAAGAA
431 TA-TTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAA-TA
* *** ** * * **
337930 GTTAG-AGATTTTAAAAATAAATCAATTTATCAGTTTATTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCA
493 G-TAGAAGA-TTT--AAA-AAAT-AAATT-T--GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCA
* ** * * *
337994 TTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTG--TTGTCATAAAACAACTATTTTTCA
549 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-A
* ** * *
338057 TT--TATAAGTTTATTCAAAATAAAATGATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAAATAGTAG
613 TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAATT-AATA--A-
* * *
338119 GAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA-TCAAACCCA-
672 GAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACT-AAA-CAAG
* * * * *
338153 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATAT-TTAAATCATTGTAACCTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * * ** *
338217 TAAAACAATTATTTATGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTA
65 TAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
** * * * * * * * * *
338282 TGAAACTTAATAACTAAGAGA-TTTAAAAAATAATTTTGTTT-GCTAAACGAG-TTCACATAATT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * * *
338344 AAGGCTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCGCTATGACCATTTGTTATGTCGTAAAACAAATG
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC-AAT-
* * * * * * *
338409 TTTTCCTTCA-TATAAGTTTGCTCAAAATAAAATAATACTAATCTACTAATA-TGTCAAAAATTA
255 TTATAC--AAGCAT-A--TT--T-AAAATAAAATAATACT-ATTTA-TTATACT-CCAAAAATTA
* * * * *
338472 ATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATATATCAAACG-AA-TTCAAATAGTTATCACTATTC
309 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAA-GTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
338531 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATGTTAA
372 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * ** * * * *
338596 TACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAAATAG-AGA
437 TATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGAAGA
* * * * * *
338660 TTTTAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGT--TAAGGCTATATGAATAATTATCT
501 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAA--CCATTTGAACAATTATCT
* ** * * * * * * ** ** *
338723 ATTTTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAGAACAAATGTTTTTGTTCATTTAAGTTTGTT
564 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATT
* * * * * * *
338788 CAAAATGAAATAATATTAATATATTAATATTTTGAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
629 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
* *
338853 CTTTACTAAACCAG
692 ATTTACTAAACAAG
* * * * * ** * *
338867 TTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTCCCATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTA-TGACTTTTATTTTGTCA
* * *
338932 TAAAACAATTGTTTCTATTGAT---AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAG-CTTATTC-AAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATT
* * * * * *** * * * *
338994 CTAAAAATTAATAAGTAATG-GA-TTTAGAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAA--TGCAAATAA
126 CCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * *
339055 TTATAAC-AGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTTATCATAAAAT-
190 TTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATC
* * * * * * * *
339117 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTGTTCAGAACAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAA
252 AA-------T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAA
** * * * ** *
339182 TTAATAAGGCAAATATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
306 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * ** *
339246 TTGAACAATTATCTATTTGAAATAGGTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATT
370 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * *
339311 CATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATTCAAATTTATTAATATTA-AGACAATTAATAAGTA-
435 CATATAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATA-AAAATTAAT-AGTAG
* * * * * * * *
339373 AAAATTTGAAAAATAAATATGTTTACCTAGCAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTT-AAGCAATT
497 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTCATAACCATTTGAA-CAATT
* * * * * * * *
339436 TTTTATTTCAAATTATTATGA-CTACTTT-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
560 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCT--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA
* * ** * * * * *
339499 CTTGTTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAA-TAATAAG-TA-TAATAAAAA
623 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A-AATTAATAAGAGATTTA-AAAAA
* * *
339561 T-AATATGTTAAC-AGAACAAG
685 TGAATCTATTTACTA-AACAAG
* * * * * * * *
339581 TTCGAATAGTCATGACTATTTG-ACTCATTATTTAT-TCAAATCATTTTGACCTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTATTTTGTCA
* * * *
339644 TAAAATAATTGTTTCAATTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTC
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * **
339709 CAAAAATTAATGAGTAAGAGA-ATTAAAAAA-AGAATATGTTTA-CCGAAC-A-TATTCAAATAG
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATA-AATATATTTATCTAAACAAGT-TTCAAATAG
* ** * * * ****
339769 TTATGACTA-TT-AA-AATAAT-TGGTTC-TATA--CATGCCAACTTATTTCGAATAAAATCATT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG---ACCT-TTT-G--TTTTGTCA--
* * * ** * * ** *
339827 TAAATTTACTAATATTCCTAAAATTCATAAATAAATGTGTAAAATAATATATATTTACAAATATT
246 TAAA--T-C-AAT-TT-ATACAA-GCATATTTAAA---ATAAAATAATA-CTATTTA-TTATACT
* ** * * * **
339892 CCTAAAATTTCTAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTA
299 CCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTA-AGTTCAAATAGTTA
** * * * * *
339955 TGACTATTTGAACAATTATCCATTTCACATCA-TTATGACCCTTTATTTTGTCATAAACCAATTG
363 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * ***
340019 TTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATTCCCAAAATTAA
427 TTTCTATTCATATAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAA
* * * * * * ** * * * * ** *
340083 TAAGCAAAATATTTATAAAAATAAATCTATTTATCAAGGAA-TTTAGATAGTTATGAGTATTTAA
491 T-AGTAGAAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGA
* * * * ** * *
340147 ACAATTATTTTTTTCAAGTCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAACAATTGTTTCCATTCAT
554 ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTATTTCTATTCAT
** * *
340212 ACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGAT
618 ACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAAT-A---AGAGAT
* * *
340277 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
677 TTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * *
340306 TTCAAATAGTAATG-TTCATTTGAACTATGATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTC
* * * * ** *
340370 GTAAAACAATTGTTGCTATTCATATAAAATTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * * * * ** *
340435 TCAAAAATTAATAAG--AGAG---TTAAAAACTAAATATGTTTCTC-GAATTAG-TTCAAATAAT
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGT
* * * * *
340493 TATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCTTAAAACAATT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA--
* * * * * * * * * * *
340557 GTTTCTATTCATATAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAC
254 -----T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT--ATTTATTATACTCCAAAAATTAA
* * * * * * * * *
340622 TAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAA-TCAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGA
310 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
340686 ACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-CTAGTAATAAAATAATAT-TTTGATAATT-
374 ACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTT-CT-ATTC
** * * * * * ** ***
340748 A-ATAAGTAGAAAATTT---TTAAAATAA-A-TATGTTTACTAA-ACTAGATCAGGCAATCA-T-
436 ATATAAGT---TTATTTAGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTA
** * * * * * ***** *
340804 GACTATTTGAATAAT-TATCTATTT--CAAATC-A-TT---AT-GAT-ATTTTGTTTTGTCATAA
496 GAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAG-TCATAACCATTTG--A-AC
** * ** * * * ***** * * *
340859 AAGAAT-TGTTTCAGCTT-ATATAAGCTTATT-CAAAAT-A-AAATA-ATAGTAATT-TATTAAT
556 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAA-ACA-ATTATTTCTATTCAT
* * *
340917 AAGCTGAAAATTAAGAATAAAGAGATTTTTAAAA-AAT-CT-ATTTATTTAACAAGTT-TAAA-T
618 -A-C--AAAATT---ATTCAA-A-A----TAAAATAATACTAATTTA-TTAA-TA-TTCTAAATT
* * * * * * **
340977 ACTTATGACTG-TTTTAATAGT-TATCTATTTA--AAA-TTG
667 A-ATAAGA--GATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* ** * * * * * * * *
341014 CT-ATAA-CCTT-TG--TTTTGTCGTAA-AATGAT-TTTTTCTATTCA-CACG--TGTTTA-TTT
1 TTCA-AATAGTTATGACTATT-T-G-AACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACT-TTTATTTT
*** * ***** *** * * * *
341068 CAAATAAAATAA-T-ACAAATTTAT-CAA---TATT--AAGGCAATTA-ATAA-GTA-AAAGATT
61 GTCATAAAACAATTGTTTCTTTTATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATATAATTTATTAATATT
** *** * * * ** * * *
341122 -TTAAAA--AATAA--ATTTGTTTATTAAACAAGTTTAA-ATCGTTA--T-GACTATTTGTGCAA
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TTAAA-AA-ATAAATATATTTATCTAAACAAGTT-T-CAA
* ** * * **** * ** * * ** * *
341178 TTA-TT-T-A-T-TTT-AACTTGTTATGATTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCTATTCG
186 ATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTAT-CTATTTCAAATAGTTAT-GACCTTTTGTTT-T-GTCA
* * * * * * * *** * *
341237 TACA--AATTTAT----TCATATTAAAAATAATATTAAT-TTA-TTA--AAATTTTGACAATTAC
246 TAAATCAATTTATACAAGCATATTTAAAATAA-AATAATACTATTTATTATACTCCAAAAATTAA
* * * * * *
341292 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGTCATGACTA-TTAAA
310 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* ** * * * * * *
341356 TAATTATCAATTTCAAA-ACATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACATTTGTTT-TAGTTTAT
375 CAATTATTTATTTCAAATA-GTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
* * * ** *
341419 ATAAGCTTATTTCA-AGTAAAA-AATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTA-ACAA
438 ATAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA-AG
* * * *** * * * * * * *
341481 AATTAAAAAA-AGAATCTATTTATTGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTT
500 ATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCT
*** * * * * **
341545 ATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGTTTAT
564 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTATTCATACAAAATTAT
*** * * * * * *
341609 TTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATAGTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTGAAAAATA
628 TCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC-TAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATG
* * * * *
341673 AATATGTTTTCTGAACATG
687 AATCTATTTACTAAACAAG
** * * * * *
341692 TTCAAATAGTTATGACTATTCAAATAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTCTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
** * * * * *
341757 TAAGCCAATTGTTT-TTGTGCATAAAAG-TATATTTAGAATAAACTAATACTAATTTATTAAAAT
65 TAAAACAATTGTTTCTT-T-TATACAAGCT-TATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
*** * * * ** * * *
341820 TTTTAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTGAAAGATAAATACGTTTA-CTGAGCGAG-TTCAAATAG
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * *
341882 TTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA
* ** * * *
341946 TTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATT
254 -------T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACTA-TTTATT-ATACTCCAAAAATT
** * * * * * *
342011 AATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACTGAA-CAAGTTCAAATAATCTA-GTCCATT
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAGTAAGTTCAAATAGT-TATGACTATT
** * * ** ** * * *
342074 CAAACAATTATTTATTTCAATTTGTTATGA-CATTTCATTTTGTTGTAAAATAATTATTTTTATT
371 TGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* ** * * *
342138 CATACAAAATTATTCA-AATAAAATGATACTAGTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA--AG-A
435 CATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGTAGAA
* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
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308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAG-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * *
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343836 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTACGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * *
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126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGT
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** * * *
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255 T-TA-TA---C--A-A-GCAT-ATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * * * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * *
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314 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * * * * *
344945 TGTCTATATAAAAT-GTTATAACCTTTGGATTTGCCATCAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAG
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* *** * * * * *
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505 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCA
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570 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT-TCT-ATTCATACAAAATTATTCAAA
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* *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-T-TTTATTTTGTC
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64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTA-TACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * * *
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125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAA-CAAGTTTCAAATA
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189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATCA
* * * *
345523 TTTGTTTCATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTA-ACATTCAAAAA
253 ----ATT--TA---TACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT--ATTTATTATAC--TCCAAAA
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305 ATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTA
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345651 CCTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTCTGACCTTTTGCTTTGACATAAAACAATTGGTTC-AG
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* ** ** * * *
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496 G-AAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACA
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557 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA
* * *
345905 ATTGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTA
622 AAT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C-TAAATTAATAAG--A--GATTTA
* * * * *
345970 AAAAGTGAATATGTTTATCGAATC-AG
680 AAAAATGAATCTATTTA-CTAAACAAG
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345996 TTCAAATAATTACGACCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTAAT-ACCTATT-GTTTGGA
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* * * * * * *
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125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
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* * * * * *
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* * * *
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499 GA-TTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTAT
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562 CTATTTCAAATTGTTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAC--AATTATTTCTATTCATACAAAA
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* *
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683 AATGAA-TCTATTTACTAAACAAG
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1 TTCAAATAGTTATGACTAT--TTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTATTTTGTC
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346816 GATT-TAAAAAATAACTTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAACAT-TATGACTATTTGAAC-AATTA
122 TATTCCAAAAATTAA-TAAG--TA--AGA-GATTTTAAAAAATAAAT-A-TATTT-ATCTAA--A
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346878 TTTA-TTTCAAATTGTTATGACT-TTT-TA-TTTTGTC-A--TAAAACAATTAT----TTTTG--
176 -CAAGTTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT
* * * ** ***
346930 -T-TCATATAAGC--TTT-TTC-AG---A-TTAAAAT--AATATTA--ATTTATTAATTTTTTGA
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346981 TAATTAATAAGTAAAATATTT-TAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACT
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* * * * *
347045 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-
368 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
347108 AGTTCATATAAGCTTATTTA-ATATAAAAT-ATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA-AGT
432 A-TTCATATAAGTTTATTTAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAGT
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347170 -GTAAGAGAATTAAAAAAAAAATCTGCTTACCTAACAAGTTCAAACAGTTTTTAAATATTTGAAA
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*** * *
347234 AATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT-TCTTCATGC
556 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTATTCATAC
** ** *
347298 AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTAAAAAATTAAT-A-AG---T-AC
620 AAAATTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAATTAATAAGAGATTTAAA
*** * **
347355 AAAT---T-TAAAAAATAAACCTG
682 AAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * * *
347375 TTTAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTCTTTATTTCAAAT-AGTTTTGACCATTTCTCTTT-T
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGA-CTTTTAT-TTTGT
* * * * * *
347438 CATAAACCAATT-TGTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAACTTGTTAATA
63 CATAAAACAATTGT-TTCT-TTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
* * * * * *
347502 CTCC-AAAATTAATAATTAAAAGA-TTTAAAAAATAAAT-TGATTTA-CCAAACCAG-TTAAAAT
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATAT-ATTTATCTAAACAAGTTTCAAAT
* * * * ** *
347562 AGTTATGACAATTTGAGCAATTA-CTTATTTCAAGTCGTTATGGTCTTTTGTTTTGTCCTCAAA-
188 AGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAT
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347625 CAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAACATTAATTTATTGTTATTCTAAAA
251 CAA-------T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAA
* * * * * * * *
347690 ATTAACAAGTTGAAA-ATTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGTCC
305 ATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * *
347753 ATTTGAACTATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-CATTATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
368 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * *
347817 ATTCATACAAAATTATTT-GAAATAAAATAATGCTAATTTATTACTATT-TCAAAAATTAAT-G-
432 ATTCATATAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGT
* * * * * ** ** * * *
347878 A-CACATTTAAAAACTAAATGTCTTTACTGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
495 AGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATT
* * * * * * * * * * * **
347942 ATCTATCTAAAATTATTACGATCTATT-TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTATGTTCATACAAGCT
560 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAAT
* * * * * * *
348006 TATTCGAAGTAAAATATTATTAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGCATTTAAAAAA
625 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAG--AG-ATTTAAAAAA
* * * *
348071 T-AGATGTGTTTACCGAACCAA-
685 TGA-ATCTATTTA-CTAAACAAG
* ** * * ** * * *
348092 TGCAAATAGTTGA-GACTATAAGAATAATTATCTATTTTGAATC-TTCTGGTA-TTTTGTTTAGT
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAT-G-ACTTTTATTTTGT
* * *
348154 AATAAAATAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA
63 CATAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
* * * * * * * **
348218 TT-TAAACAATTAATAAGTAAAAAATTTT-AAAAGTAAATATGTTTAT-TGAAC-TGGATCAAAT
124 TTCCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAAT
** * * **
348279 AGCCATGACTATTTGAAAAATTATATATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAG
188 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC
* ** * * * * *
348343 AATTGTTTTAGTTCATATAAGTTTTTTCTAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAA
252 AA----TTTA-TACA-AGCA--TATTT-AAAATAAAATAATA-CTATTTATT-ATACTCCAAAAA
* * * * *** * * * *
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306 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
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370 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTAT
* * * ** *
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* ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * * * * * *
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*** * ** * * * ** * *
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126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGT
*** * * * *
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191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA-
* * ** * *
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* * * * * * ** *
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308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
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372 GAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATT
* * * * *
349260 CATA-AAGGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAAGTAA
435 CATATAA-GTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTAG
* * * *** * * * * *
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497 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTAT
* * * * * * * ***
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562 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTA
*
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627 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AAA-TTAATAA----GAGATTTAAAAA
* * * *
349517 ATAAATCTATTCAATGAACAAG
684 ATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * * *
349539 TTTAAATAGTCATGTCAATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTAAGATATTTTATTTTGTCG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * ** *
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65 TAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * * * *
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127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCT-AAACAAGTTTCAAATAGT
* * * * * *
349726 TATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAAT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATCA-
* * ** * * * * ** * * *
349789 TATTTTTGTTTAGACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAAGAATATTCTAGAAATTA
253 -A------TTTATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT--ATTTATTATACTCCAAAAATTA
* * * * * * * *
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309 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAGTAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTT
* * *
349917 GAACAATTATCTATTTC----A---A--ATC-ATT-TTAT-TCAT---ACAA--G---C--TT-A
372 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * * * *
349959 T-T-CG-------A-AATAAAATAATACCAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAATAAGAA-
437 TATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGT-AGAAG
** * * * *
350013 ATTTAAAAAA-AATATTTTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAACTAT
500 ATTTAAAAAATAA-A--TTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTAT
*** * *
350077 CTATTT-AAATAAATATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAACTATTT-TAGTTCATA-AAAGCT
562 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAA-AT
** * * * *
350138 TA-TCCGAA-AAAATAATATTACTTTATTAATATTTCCAAAATTGATAAGTTGAGATTTAAAAAA
625 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CTAAATTAATAA---GAGATTTAAAAAA
* * ***
350201 TTAGTC-AGTTTA-TCAAATTGG
685 TGAATCTA-TTTACT-AAACAAG
* * * * * * ** * *
350222 TTTAAATAATTA-CAGCTATTAGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAT-GACTTTTATTTTGTC
* ** * * *
350286 ATAAAATAATTGTTT-TTCATCCTACAAGCCTATTCAAAATAAAATTATACAAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTCTT--TTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * ** *
350350 TTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA-TTTAAAAGAATAAATCTATTTA-CCGAACCAGTTTC-AAT-
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA-AATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * **
350411 -TTA--A--A--T----AATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAAAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCA
* ** * ** *
350464 ATTGTTTCAGTTTCACATTAAGCTTATTTTGAATAAAAT-ATACTAATTTAATAATTTTTCAAAA
253 A---TTT-A---T-AC---AAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTT-ATTATACTCCAAAA
* * * * * **
350528 ATT-A-AA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCTAAAT-AGTTTAAATAGCTAAAACTA
305 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * * * *
350589 TAT-AACAAGTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAAT
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * * *
350653 TCATACATGCTTATTCAAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAAATAATAACTA-
434 TCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTAG
* * * * * * * *
350716 AGTGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGACTACGTT-AATAAT
497 A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATAACCA-TTTGAACAAT
** * * * * *
350779 TATCTATTTCAAATCATTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGCTTT-TGAAT-ATTCA
559 TATCTATTTCAAATTGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCT-ATTCATACA
** *** * * * *
350841 AGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGACTTA
621 AAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC-TAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTT
* * * * *
350906 AAAAAATAAATCTGTTTATTGAACTAG
679 AAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * ** * *
350933 TTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTGT-AAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTT-T
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC-TCAAATCATTATGA-CTTTTATT-TTGT
* ** * * * *
350996 TATAAAATTATTATTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
63 CATAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
* ** * * * * * *
351060 TTCCAAAAATTAATAACTAAGA-AAATTAAAAAATAAATTTTTTTGT-TGAACTA-TTTTAAATA
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * * * *
351122 TTTAAGATTATATGAATAAATATCTATTTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAT-
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATC
* ** * * * *
351185 AAGTTTTTTTGAATTCATA-CTAGTTTATTTGGAATAACATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA
252 AA-----TTT--ATACA-AGC-A---TATTTAAAATAAAATAATACT--ATTTATT-ATACTCCA
* * * * * *
351248 AAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACT-AGTTCAAATAATTATGA
302 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
351312 TTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTT-TCCATAAAAC-ATATGTT
366 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAAT-TGTT
* * ** ** * * * *
351375 TTTGTTTGTATAAGTTTGCTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATT-TCAAAAATTAATA
429 TCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATA
* * * * * * * * * *
351439 --AG-AGATTTAAAAAA-AAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTTAGCAA
493 GTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAA
* * * * * * * * ** * * *
351500 TTGTTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTATTAGAAAATGATTCTTTCTTTTCATACTAA
558 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA
* * ** * *
351565 TTTGTT---AAT---AT-AT-C-AA-CAATT-A-A---T-AACTAA-AA-A-ATTTAGAAAAT-A
623 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGA
* * *
351610 ATTATATTTA-TCGAACTAG
688 A-TCTATTTACT-AAACAAG
* * * * * ** * *
351629 ATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTAAT-TCAAATCGTTACAATCTTTTGTTTTGTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * * * * * *
351693 ATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATAAT
64 ATAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * * * *
351758 CCAAAAATTAATAA-TAAAGAGA-TTT-AAAAATGAATCT-TTTA-CTAAAAAAGCTT-AAATAA
126 CCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * * *
351817 TTATGACTGTTTGAACAATTGTCTATTT-AAGATCA-CTATAACCTTTCGTTTTGTGATAAAATA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-AT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAT-
* ** * * *
351880 AAATTTTCTATTCATACAAGTTTTTTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAGTA-T-TAAGAT
251 CAA-----T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT--ATTTATTA-TACTCCAA-A-
* * *
351942 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAACTGTTT--GAA-CAAGTTCAAATCA-TTATGACT
304 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAAT-AGTTATGACT
* * *
352003 ATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
368 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * * * * *
352067 ATTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTA
432 ATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTA
* * ** * * * *
352132 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAATAAGCAAGTTCAAATAGTCATTACTATTTGAATAATTA
496 GAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTA
* * * * * * * * **
352197 TCTATTTCAAATTATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTT
561 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATT
* * * * *
352262 ATTTAAAGTAAAATAGTACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA
626 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C-TAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAA
* * *
352327 TGAAT-TCGTTTA-TCGAATAAG
685 TGAATCT-ATTTACT-AAACAAG
* * * * * * *
352348 TTTAAAAAGTTATGGCTATTTGAACAATTAACTATCACAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * **
352413 TAAAACAATT-TGTTCTTTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAA-AATTTAAATTTCCTAATATT
65 TAAAACAATTGT-TTCTTTT-ATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATT
* * * * * *
352476 CCAAAAATTAATTAGCAA-AAATTTT-AAAAATAAATCTATTT-TCTGAAC-A-TATTCTAATAG
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGT-TTCAAATAG
* * * ** *
352536 TTATAACTATTTGAACAATAATCTATTTGAAATCCTTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAGCCAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCAT-A---AA
* * * * *** * * *
352600 TTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATT
250 -----TCAATTTATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * ** *
352665 AATTAGTAAATGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* *
352729 AAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-A-TGTTTCTATTTA
372 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * * *
352792 TACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCT-GGAG
437 TATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AG-TAGAAG
** * * ** ** **
352856 ATTTAAAAAATAAATTCATCTATCAAACAAGTTTGAATAGTCATGTCCATTTGAATTATTATCTA
500 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
352921 TTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAAATTATTC
565 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTC
* * * * *
352986 AAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTA
630 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA
* *
353051 TTTACCAAACTAG
693 TTTACTAAACAAG
* * *
353064 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTAT-AATCTTTATTTTGTCT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACT-TTTATTTTGTCA
* * * * ** *
353128 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTCATTTAGAGTAAAAT-ATAGCTAAACTAATAATATT
65 TAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA--TAATTTATTAATATT
* * * * * * *
353192 CTAAAAACTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAATATAAATGTATTT-GCCAAACCAA--TTCAAATAG
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAA-CAAGTTTCAAATAG
* * * * * * * *
353253 TTAAGATTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTTTGACATTTTGTTTAGTCATAAAAT-AA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATCAA
** * * * **
353317 TTCTTTCAGTTCATGCGTGCTTATTTGAAATAAAATAACACTATTTTATTA-ACATTTAAAAAAT
254 ---TTT-A--T-A--CAAGCATATTTAAAATAAAATAATACTA-TTTATTATAC--TCCAAAAAT
* * * * * *
353381 TAATAAGCAAGAA-ATTT-GAAAATAAATTTGTTTATCCAA-CAAATTTAAATAGTTATGA-TAA
307 TAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACT-A
* * * * * *
353442 TTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAATAATTGTTTCA
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * *
353506 ATTCATA-AATGCTGATTCAAAATAAAATTATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAG
432 ATTCATATAA-GTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAA-TAG
* * *** * * * * **
353569 TTGAAGATTTAAAAAATTAATCAATTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAA
494 TAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAA
* * * * * * * *
353633 TTATCTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTATTATAAAATAATTGTTTTTCA-ACATACAA
558 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAA
*** ** *
353697 GCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGGTGATTTAA
622 AATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAA-TTAATAAG-A---GATTTAA
* * * *
353762 AAAATAAATATATTTACTGAACTAG
681 AAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * *
353787 TTTAAATAATTA-CACTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTATTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTA-TTTTGTCA
* * * * * * * *
353851 TAAAATC-ATTATTTATGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATCTAATAATATT
65 TAAAA-CAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
*** * * * * *
353915 ATGAAAATTAATAACTAAGAGA--TTAAAAAACAAATTTATTTA-CCAAACCAA-TTTATATGAA
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAA-CAAGTTT-CA--AA
* * *
353976 TAATTAT--CTATTTCAAGTCATAACAATTCTGTTTGCAGAACTATTTCAAATAATTATGA-CTA
187 TAGTTATGACTATTT---G----AACAA------TT----ATCTATTTCAAATAGTTATGACCT-
* * ** *** * * ** **
354038 TTTGAATAATTATC-TATTTCAAATCGTTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAA-ACAAATGTTTTT
234 TTTG--T-TTTGTCATAAATC-AAT--TTA-TA-CAAGCATATT-T-A-AAATA-AAATAATACT
* ** ** * * * * *
354101 ATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAAAAGTAA
287 ATT--TAT---TAT-ACT-CCA-AAAATTA-AT-AA-GTA-AAAGATTT-AAAAAAT-AAA-T--
** ** * * *
354166 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACTAG-T-TGAATTAGTTAT-AACTATTTGAACAAT
335 CTG-TTTACCAAGT-AA---GTT---CAAA-TAGTTATG-ACTA-TT-TGAAC-A-AT-------
* * * * * **
354228 TATTTATTTCAAATCA-TTATGACCATTTGTATTATCAT-AAACAATTGTTTTTGGTCATAT-AG
379 TATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAG
* * * * * * *
354290 TCTTA-TTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTACTAATATTCTAAAAACTAATAAGTA-ACGGATTT
443 T-TTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA-AGATTT
* * * ** * * * * * * *** *
354353 AGAAAATATATTTATTGGCCAGACCAA-TGCAAACAATTATGATGGTTTGAATAATTATCTATTT
504 AAAAAATAAATTTGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTT
* * ** * ** *
354417 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTGTATAAGCTTATTCGAA
568 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCAAA
* * * *
354482 ATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAGAATCTATTT
633 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C-TAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTT
**
354547 ACCGAACAAG
696 ACTAAACAAG
* ** * * * *
354557 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTATTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * *** *
354622 TAAAAACAATT-TTTAGTATTCATACAAGCTTATTTCAAAT-CTGT-TTACTAA---A-TAAT-T
65 T-AAAACAATTGTTT-CT-TTTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * **** * *
354679 T-C---AA-T--T-AGTTA-TGATTATT--TGGGT-GAT-TATTTATTTCAAATC-A-TTATGAC
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TTAAAAAATAAATATATTTATCT-AAA-CAAGTT-T--C
** * * * * * * * ** * ** ****
354729 ATTTTGTTTTGTC-ATTAG-ACAAGTATTTTTGTTC--ATA-CCA--ACTTATTTGGATCAAAAT
184 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATAGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCAT
* * * * * ** *
354787 AATATTAATTTATTA-ATATTCATGAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
247 AA-ATCAATTTA-TACA-A-GCAT-ATTTAA-AA-T-AAA-A--T-AATACTATTTAT-TATACT
* * * * * * *
354851 --AAACAAGTTCAA-ATAGTAATAACTATTTGAATAAT-TATCTATTT--CAAAT-CGTT-ATGA
299 CCAAA-AA-TT-AATA-AGTAA-AA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCA--A
* ** ** * *** * **
354908 CAT-TTTATTTC-ATCATAAAACAA-T-TGTA--T-AAAT--TTAT-ATAGGCTT-ATTTGAAAT
356 -ATAGTTATGACTAT--TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAT-CTTTTGTTTTGTCAT
* ** ** * ** * ** * * * *
354962 AAAATAATACTAACTTATTACTATTTTGAAAATTAATTAG--TAAGAGATTTTA-AAAATGAAT-
417 AAAACAATTGTTTC-TATT-C-A-TAT-AAGTTTATTTAGAATAA-A-ATAATACTAATTTATTA
* * ** * * ** * *
355023 ATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-TGTCTATTT--CAAATC-A-
475 AT-ATTA-T-AA-AAATT--AATAG-TA-GAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAG
* * ***** * ** * * ** ** * *
355083 TT---AT-GACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAAT-TGTTTC-TATTCATACAAGC--TTATTTTG
531 TTCAAATAGTCATAACCATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** *
355140 -AATAAAATAA-TA--TAAATT--TAC-TAA-TATTCCAAAGATTAACAAGTAA-A--AATTTAA
593 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATT-CAAA-A-TAA-AA-TAATACTAATTT--
** * * ** * * * * * ** *** *
355194 ACAAAAAATCT-GTTTTATGA-ACATGTTCAAATATTTATGACTATTTGAAC-AATTGTTTAT
651 ATTAATATTCTAAATTAATAAGAGAT-TTAAAAAATGAAT--CTATTT--ACTAA---ACAAG
* * * *
355254 TTCAAATCA-TTATGAC-ATTT------TT-TTTGTCAT-AAACCAAT-TG--TTTCTA---T-T
1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC-TCAAATCATTATGACTTT-TATTTTGT
* * *** * *
355302 CATAAAA-ACTT-ATT-TAGAATA-AA----A---A------AT-A-CTAATTTATTAAAATTCC
63 CATAAAACAATTGTTTCTTTTATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCC
* *
355348 AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCA-ATTT-CCTAAGCAAG-TTCAAATAGTT
128 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTT
* * * * * *
355409 ATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAAT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC-AA-
* * * * * * ***
355473 TGTTTCTATTCATACAA-AATTATTCACAATAAAATAAAAATAATTTATTAATATTTTGAAAATT
254 ------T-TT-ATACAAGCA-TATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * * *
355537 AATAAG----AGA--TAAAAACTAAATCTATTTACCAAACT-AGTTTAAATAGTTATGACTATTT
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** * * * *
355595 GAATAATTATTTACCTCAAATCGGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCA
372 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* ** * ** * *
355659 TACAAACTTA-TTCGAAGT---A-AA-A-T-A-TTGCTAA-ATTCTAAAAATTTATAAGTA-AGA
437 TATAAGTTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA-A
* * * * * * **
355713 CATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTAAAACAATTAT
499 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATTTGAACAATTAT
* ** * * * * * * * ***
355776 CTATTTTAAATCATTGTAACCTTTTGTTTAGTCATGAAATAATTGTTT-TAGTTCAAACATGCTT
562 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAATT
** * ** *
355840 ATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACGTTCAAAAAAATTAATAAGCAAAGAATTTGAAAA
626 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC---TAAATTAATAAG---AG-ATTT-AAAA
* *
355905 AATAAATCTATTTACCAAACAAG
683 AATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * ** * *
355928 TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCCA-CTTAAAATGTTTATGACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC-TCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * *
355992 ATAAAACAATTGTTT-TATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTT-ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
** ** * * * * *
356056 TTTAAAAATTGAA-AAGTTGGAGA-TTTAAAACACATATCA-ATTTATCGAATC-AG-TTCAAAT
125 TCCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCTAAACAAGTTTCAAAT
* * * * * *
356116 AGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAACCA-TTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAC
188 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC
* * * *
356180 AATTTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
252 AA-----TT--T-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAAT
* ** * * * * *
356245 TAATATGTAGTAGA-TT-----AT--A--TGTTTA-C-AGAACCATTTTAAATAATTAAGACTAT
307 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTA--AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
356298 TTGAACAATTATATATTTCAAGTCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTATAT
370 TTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * * ** * * *
356362 TCATGCAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAAAATAATAATATTATGAAAATTAATATCTA-
434 TCATATAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATA-GTAG
* * *** * * * * * *
356425 AGAGATTTGAAAAATAAATTTATTTGTTGAACCAA-TTAAAATGGT--TAAGGCTATATGAATAA
497 A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAA--CCATTTGAACAA
* * * * * * * * * * *
356487 TTATCTATTTCAAATT-TTACGTCATTTTGTGTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG
558 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA
* * * * * *
356551 TTTGTTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
623 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAGAGATTTAAAAAAT
* * *
356616 AAATTTGTTTACTAAATC-AG
686 GAATCTATTTACTAAA-CAAG
* * * * * * * * * *
356636 TTCAATTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCATAT-ATTTATGACCATTTGTTTTGTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * * * * ** *
356700 ATAAAACAATTATTTCTATTCATGC-AGTCATATTTGAAATAATGTAATGCTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAG-CTTA-TTCAAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATAT
* * * * ** ** * *
356764 TCAAAAAAAT-ATAAGTAAGA-AATTTAAAAAATGAATCA-A-TTGGCTTGACTA--TACAAATA
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * * * * *
356823 GTTATGACTGTTTGAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCACAAAACAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC-A
* ** * * * *
356888 TTATTTTTGTCCATACAAGCTTATTCGAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAGTT
253 --A---TT-T--ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * * * * * **
356953 AATAAATAAGAGATTTAAAAATTGAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * *
357018 AACAATTACCTATTTCAAATCA-TCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTATTC
373 AACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTC
* ** * * *
357082 CTATAAACTTATTTCA-ATTAAAATAAT-CTAAATTTATT-ATCATTCA-GACAATTAATAAGTA
436 ATATAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT-ATT-ATAAAAATTAAT-AGTA
* * * * * * *
357143 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CATAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAAT
496 GAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATT
* * ** * * * **
357207 ATTTCTTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATAAGCT
560 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAAT
** * * * * ** *
357272 TATTCGGATTAAAATAATATTAGTTTATTAATATCCTGATAGCTAATAAGTAGAAGATTTTAAAA
625 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A-AATTAAT-A--AG-AGATTTAAAAA
* * * *
357337 ATAAATATGTTTACCAAACAAG
684 ATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * ** **
357359 TTCAAATAGTCATAACTATTTTAATAATTATCTATTTCAGATTGTTATGACCTTTTATTTCATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* *** ** * *
357424 TAAAACAATTATATAAATTCCTATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
65 TAAAACAATTGT-TTCTTTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * *
357488 C------TGATGAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAT-TGAACAAG-TTCAAATAGTT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTT
*
357544 ATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATTAAACAATT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-T--A-AA--
* * * * *
357608 GTTTCTATTTATACAAGCTTATTCT-GAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATT
250 ---TCAATTTATACAAGCATATT-TAAAATAAAATAATACT--ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * * * * * ** * * *
357671 ACTAAGTAAGAA-TTTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTAAGATTATTT
308 AATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * *
357735 GAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCAT---A-AA-----TCAATT-A
372 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* ** * * * ** *
357790 TACAAGCGTATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTTTTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGA
437 TATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGAAGA
** * ** *
357854 TTT-AAAAATAAATTTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATAACCATTCAAACAATTATTTAT
501 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * ** *
357918 TTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATATAGCAATTGTTTGTATTCACACAAGGTTATTTA
566 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCA
* * * *
357983 GAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTATAACAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT
631 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A-AATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATGAAT
** *
358048 CTGCTTACTGAACAAG
690 CTATTTACTAAACAAG
* * * * * * *
358064 TTCAAATAGTCATGTCCA-ATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTATTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTA-TTTTGTC
* * * * ** * * *
358128 ATAAAATAATTATTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAGAATAATATAGTACTAACTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
*** * *
358193 TTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTATTTA-CTAAA-ACAGTTT-AAATAG
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACA-AGTTTCAAATAG
* * * * * * *
358250 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTTACAAAACAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA-
* * * * * * * *
358314 TGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTCCAAAAATTT
254 -------TTT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTT-ATTATACTCCAAAAATTA
* *
358379 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATGGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTTTG
309 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-T---A-C----C-----------A--A----G
* * * * * *
358444 TTAATAAACACATTCAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATAGTTATGACCT
347 ----T--A-A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCT
* * * ** * * *
358509 TTTGTTTGGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACATGCGTATTCAAAATAAAATAATACTAG
404 TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAA
* ** * * * *** * *
358573 TTTATTCATATTCCAAAAAATAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAACCCGTTTACCTAGCAAGT
468 TTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
* * * * * * * *
358638 TCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATAATCTTTTGTTTTGTCAT
532 TCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** *** * *
358703 AAAACAATT-GTTCTATTTATATAAGTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTT
597 AAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT
* * *
358767 GAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAG
662 --AAATTAATA---A-GAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * ** *
358817 TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATG-ACTTTTATTTTGTCA
* ** * * *
358882 CAAAACAATTGTTT-TTGTTCA-AGCTAAAATTATTCAGAATAAAATTATATTTATCTATTAATA
65 TAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATA-C-AAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
*** * * * *
358945 TTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTATTT-TCCAAA-ATAG-ATCAAAT
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACA-AGTTTCAAAT
* *
359002 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGATTATTTGAACAATCATTATGAA
188 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAA--A-TA-G-TTA--TG-AC---C-TTTTG--
* * ** * ** ** * * * *
359067 TGATTATC-TATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTTATCATA
238 T-TTTGTCATAAAT-CAA-T-TTAT-A-C--AAG-CATATT-TAAAATAA--------AATAATA
* * * * * * * ***
359131 CAAGTTTATT-TGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTTAAAAATTAGTAAGTAAGAG
285 CTA-TTTATTAT--ACTCCAAA-AAT--TAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAA--A-TAA--ATCTG
* * * * *
359193 ATTTA--AGAGATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCA-AATTGTTATG-ACTATTTGAATAATTA
338 -TTTACCA-AG-T-AA---G--T-TC-AAATAGTT-ATGACTATT-TGAAC-AATT--AT--TTA
* * * **
359254 TCAATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAACT
385 T---T-TCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATATAAGTT
* * * * *
359317 TA-TTCGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAA
445 TATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA-AGATTTAAA
* * * * * * * *
359380 AAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAA
507 AAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * ** *
359444 TTGTTCA-GACCTTTTGTTTAGTCA-AAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGTTTATTCAGAAT
572 TTGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATACAAAATTATTCAAAAT
* * * * * * *
359506 AAAATAATTCAAAGTTATTAACATT-TGGAAAATTAACAAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCT
635 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAATGAATCT
* * *
359570 CTTTATTGAACAAG
692 ATTTACTAAACAAG
* * * * * ** *
359584 TTCAAGTAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTAT-TTAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGACA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * *
359648 TAAAAAAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTA-TCAAGAGTAAAATAATACTAATTTCTTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTCAA-A-TAAAATAATA-TAATTTATTAATA-T
* * ** * *
359712 TCC-AAAATTAATAAGCAAAAG-TTAAAAAAAATAAATTTAAATAAATTTATTTACCAAACAAAT
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAA--T--AT--ATTTA--T-CTAAACAAGT
* * * * *
359775 TT-AAATAGTTACGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
181 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
359839 TAAAATAATTATTTTAGTTCATACGAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTC
246 T-AAATCA--A-TTTA-TACA-A-G--CATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTC
* * * * * *
359904 CAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTTAATTTGCTTATCGAA-TCAA-TTCAAATAGTCA
300 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGT-AAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
359963 TGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
363 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** ** ** * * * * * * *
360027 TTTCTGCTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAAAAAAACTGATTTATTAACATTCTAAAAATTAAT
427 TTTCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT
* * * * * * **
360092 AACTCAG-AGATTTGAAAAAATAAATCTT-TTTACTAAACAAGTTCAAACAATTATGATTATTTG
492 -AGT-AGAAGATTT-AAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTG
* * * * *
360155 AACAATTAGCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AAT-AT
553 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
* * * *
360218 A-AAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAA-ATTTCAAAACTTATAAGTAAGAGAT
618 ACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAA--T-TAA-TAAGAGAT
* **
360280 TTAAAAAATAAATC-AGTTTACTAAATTAG
677 TTAAAAAATGAATCTA-TTTACTAAACAAG
* * * * ** * * *
360309 ATCAAATAATTATGGGC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
*** * ** * *
360373 ATAAAACAATTGTTT-TGCAACATATAAGCTTATT-AAATAAAATTGTTATTACCTTTCGTT--T
64 ATAAAACAATTGTTTCT--TTTATACAAGCTTATTCAAATAAAA-TAATA-TA-ATTT-ATTAAT
* ** * *
360434 -TGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACA-AGCTTATTTGAAATAAA-ATAATACTAATTT-T
123 AT-TC--CAAA-AA---TTAAT-AA-GTA-AGAG---ATTTTAAA-AAATA-AATA-T-ATTTAT
* * * * * *
360495 -TTAA-TA-TTTCAAGAATTAG-TAAGA-TATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTTA
171 CTAAACAAGTTTC-A-AA-TAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT--CAAA-TAG-TT-
* * **** * * ** * **
360555 AAT-A-GTTATGACCAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGA-ACAATTATTTATTTCAAATTATTA
227 -ATGACCTTTTGTTTTG-TC--ATA---AAT-CAATTT-ATACAAGCA--TATTT-AAAATAAAA
* * *** * * * * *
360617 TAACCTTCTATTCTATCATAAAACAATTATTTATTTTCA-TACAAATTTATTTAGAAAAA-ATAA
280 TAA--TACTATT-TATTATACTCCAA-AAATTA--ATAAGTA-AAA--GATTTA-AAAAATA-AA
* ** * * * * * * *
360680 TACTAATTTAATAA-T-AGTTTAAA-AATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTTGT
334 T-CT-GTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTT-ATGACT-----ATTTGAACAAT-TATTTA-TT-T
** * * ** * * *
360742 CGAACCAATTCAAATAGATAAAACTATATGAACAATTATCTATTGCAAATCATTATGACCTTTTG
388 C-AAATAGTT---AT-GAT----CT-TTTG---TTTTGTC-A-T--AAAACAAT-TG----TTT-
* * * ** * * * * * * **
360807 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGGAA--TA-AAATAAAATAAATT
430 CTAT-TCATATAA-GTTTATTT-AG--AATA-AA-ATAATAC-TAATTTATTAATATTATAAA--
** * ** * * * * * ** * * *
360869 TGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGGAAGAGATTT-TTAAAAAAAATTCTATTTACCAAGCTAGT
485 AATTAATAGTAGAAGA-TTTA-AA-AAATAAATTTGTT-TACCAAA--CAAGTT--CAA-ATAGT
*** ** ** * ** * * *
360933 TCAAATAATTATAACTATTTGAACAATATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCATA
541 CATAACCATTTGAACAAT--------TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** * *
360998 AAACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TA
598 AAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-
* * * * *
361062 GAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTA-TGAAATC-AT
662 --AAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACT-AAA-CAAG
* * * * * * * * * *
361112 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATCATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTTATGA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * ** * *
361177 TCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATTATGGCCATTTGAATAAT
65 TAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAA-TAT----AATT---T-AT
* * * ** ***** * * **
361242 TATCTATTTCAAATCATT-ATGACCT-TTTTTTTTGTCATAAAA-AAAT-TATTTTTCATCATTC
119 TA-ATATTCCAAA-AATTAAT-AAGTAAGAGATTT-T-AAAAAATAAATATATTTATC-T-AAAC
* ** * ** * * * **
361303 AAGCTTATTTGAAATA-AAAT-A--ATATGAATTTATTA-ATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGT
177 AAG----TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATAGT--TATG-ACCT
** * * * * *
361363 GATTTAAAAAACAAATTTGT-TTACCAAACTAGTTTGAATAGTTATG-ACTATTTGAATAATTAA
234 --TTT--------GTTTTGTCATA--AATC-AATTT--ATA--CAAGCA-TATTT-AA-AA-TAA
* ** * * * * * *
361426 AATAATACAAATTTATTAATA-TTTAGACAATTAATAAGTAGATGATTTAAAAAAGAAATATATT
278 AATAATAC-TATTTATT-ATACTCCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * *
361490 TACCAA-AAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGGTATGA-CTT
340 TACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATC-T
* * * * * * *
361553 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAAT
404 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * *
361618 TTTTTAATATT-TCAACAATTAGTAAGTAAAATATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGT
469 TTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGT
* * * * **
361682 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTCATCAT
532 TCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *** * * * *
361747 AAAACAATTATATC-AGTGCATATAGCCTCATTTAAAATAAAATAATACTAATTGAATAATATTT
597 AAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * * * * * *
361811 CAAAAATTATTGAGTAAGAGATTTAGAATATGAATTTGTTTACCAAAGAAG
660 C-TAAATTA---A-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * *
361862 TTCAAATGGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATGTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * ** * * *
361927 TAGAATAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCCGAAGAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
65 TAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTC
* * * * *
361992 CAAAAATTAATAAG-AA-AAAATTTAAAAAACAAA-AT-TGTTTTCTGAAC-A-TATTCAAATAG
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATAT-TTATCTAAACAAGT-TTCAAATAG
* * *
362051 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTCATGACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA-
* * * *
362116 TGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTGATATTTCAAAAAATA
254 ------T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATTA
* * ** * * * *
362181 ATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAAAT-AATTTATCAAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTGTTTGA
309 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * *
362245 ATAATTATTTATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTGTGATAAAATAATTGTTTCTATTCACA
374 ACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * *
362310 CAAGTTTA-TTAGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGAT
439 TAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATA-GTAGAAGAT
* * ** * * *
362373 TTAAAAAATAAATATT-TATACTAAACAAG-T----TAGTCATGTCCCTTTGAATATTTATCTAT
502 TTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
362432 TTCAAATTGGTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAAAATGATTCA
566 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCA
* * * ** * * * *
362497 AAACAAAAAAATACTGATACA-TAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGT
631 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
*
362561 TTACCGAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAT
694 TTA-C------TAAA---------C--A--AG
* * * * * * * * * *
362593 TTCAAATACTTAAGACTGTTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * ** * * *
362658 GAAAGCAATTATTTCAGTTCGTAGAAGCTTATTCATAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTA
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * * * * * *
362723 AAAAAACTAATGAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAAT-TCGTTTATC-GAACAAG-TTGAAATAGA
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATAT-ATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG-
* * **
362785 TT-TGACTATTT-ATACAATTATTTATTT-AAAGCCA-TTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAAC
190 TTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAA--TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---A-
* * * * * ** * *
362846 AATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTACCCTATTAATATTTCAAAAA
248 AA-----TCAATTTATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACTA-TTTATT-ATACTCCAAAAA
* *** ** * * *
362911 TTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTGAACCAA-TTCTAATAGTTATAAAT
306 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAA-TCTG-TTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * * * * *
362973 ATTTCAACAAATATTAATCTCAAATTGTTATAATC-TTTGTTTTCTCAGAAAATAGTTGTTTTTG
368 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* * * ** * *
363037 A-TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAGCTTAATAGTATT-TCAAAAATTAATA--
432 ATTCATATAAGTTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGT
* * ** * ** *
363097 AG-TGATTT-AAAAATAAATGTGTTTGATGAACCAA-TTCAAATAGT--TAAGAATATTAGAATA
495 AGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCAT-TT-GAACA
** * * * * * * *
363157 ATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTAGTCATACAATAATTGTTTC-AGTTCATATA
557 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACA
** * * * **
363221 AGCTTACTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTG
621 AAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--CTAAATTAAT-A--A-GAGATTT-
* * * * * *
363286 AAAAGATAAATGTGTTTA-TCGAATAAG
679 AAAAAATGAATCTATTTACT-AAACAAG
* *
363313 TTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATCAAT-TCAAAATCATTA-GACCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTC-AAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * * * * *
363376 GTAAAATAATTATTT-TAGTTCATA-AATGCTTATCCAAAATAAAATAATACAACTTTATTAATA
64 ATAAAACAATTGTTTCT--TTTATACAA-GCTTATTC-AAATAAAATAATATAA-TTTATTAATA
* *
363439 TTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCA-ATTTAT-TGAATCAA--TTCAAA
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCT-AAACAAGTTTCAAA
* * * * *
363495 TAATTATTG-CCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCA-TTATTACATTTTGTTTTGTCATAAA
187 TAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA
* * * * * **
363558 AT-AATTGTTTTTCAACATACCAGCTTATTTGAAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTGAA
249 ATCAA-----TTT----ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAA
* * ** **
363622 GAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAA-CCA-TTACAAATAGTT-TGA
303 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTT-CAAATAGTTATGA
* * * *
363680 CTACTTGAATAATTATCTATTTC-AA-A-TT-T-A------------TCACAAAACAATTGTTTC
366 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * * * *
363728 TATTTATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATGCTAATTTAGTAAAATTCTAAAAATTAATAAC
431 TATTCATATAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AG
* *** * * * * ** * *
363792 TAAAAGA-TTAAAAAATAAATCCATTTGCCAAGCTAGTTCAAATAGTTA-AGATTATATGAATAA
494 TAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATTTGAACAA
* *
363855 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGCTCATACAA
558 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAA
** * * * * * * *
363919 GCTTCTGCGAAATAGAATGAA-ACAAATTTATCAATATTTTAAAAATTTGTAAGTAAGA-AGTTT
622 AATTATTCAAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTCT--AAA--T-TAA-TAAGAGA-TTT
* * *
363982 AGAAAAT-AATTCTATTTACCGAACCAA-
679 AAAAAATGAA-TCTATTTA-CTAAACAAG
* * * * * * * *
364009 TTCAAATAATTATAACTATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * * *
364074 TAAAACAATTGTTT-TTGTTAATATAGGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
364138 -TAGATAATTAATCAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATCTCTTTA-CCAAACCA-TTTCAAATAG
126 CCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * * * * * *
364199 -T-TGAGTATTTAAATAATTAACTATTTCAAATTGTTATAAGCTTCTATTTTGTCATCAAA-CAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAATC-A
* * ** * * * * *
364261 TTAGTTTTGTTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTT
253 --A--TTTATACA-AGCA---TATTTAAAATAAAATAATACT-ATTT-ATTATACTCCAAAAATT
** * * *** * *
364326 AATAACCAAACA-AATTAAAAAATAAGTCCAATTACCGAACCT-A-TTCAAATAGTTAAGACTAT
308 AATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AA-GTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * * * * * *
364388 ATGAACAACAATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGT
370 TTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * *
364451 TCATACATGCTTATTT-GAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATA--AG
434 TCATATAAGTTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGTAG
* * * * * * * *
364512 -AGTTTTAAAAAAT-AATTTTTTTACCAAATCAA-TTCAAGTGGTTA-AGACAATTAGGAAAAAT
497 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATT-TGAACAAT
** * * * ** * * * **
364573 TATCTATTTCAAATCATTTTGAGCTTTTCTTTAATTATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGC
559 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAA
* * * * *
364638 TTATTCAGAATAAATTAGTACTAATTTATTAACATTCAAAAATTTAATTATAAAGAGATTTAAAA
624 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAA-TT-A--AT-AAGAGATTT-AAA
*
364703 AAATAAATCTATTTA-TCAAACAAG
682 AAATGAATCTATTTACT-AAACAAG
* * * * * * * * *
364727 GTCAAATAATTATTATTATTTGGACAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGA-TTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTT-ATTTTGTC
* * * *
364791 ATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATTAT
64 ATAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTA-TTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-
* * * * * * * * *
364855 TTCC-TAAATTATTAAGTAAAAAATTTT-AAAAATAAATTTGTTTA-C-CAACTCAG-TTAAAAT
124 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAAC-AAGTTTCAAAT
* * * * * * * *
364915 AATTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACA
188 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCA
* *** * * *
364980 ATTGTTTATGATCACAGAAGCTTATTT-GGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAA
253 A----TT-T-AT-AC--AAGCATATTTAAAAT-AAAATAATACT-ATTT-ATTATACTCCAAAAA
* * * * ** * * **
365044 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAA-CCAGTTCAAATAATAAAAACTAT
306 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * * ** ** * * *
365108 TAAAATAATTTTTTATTTTTAATCTTTATGA-CTTGTTGTTTAGTCGTAAAA-TATTAGTTTC-A
370 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTA
* * * * * *
365170 TGTCCTATAAG----CTTA-ATTAACAT--T-C-AA---A--AA-A-T-T---AA-T-A-AGCAA
433 T-TCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAGTAG
* * * * * * * * *
365212 AATATTTGAAAAATTGAATGTGTTTACAAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
497 AAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTA
* * ** * * * *
365277 TTTATTTAAAATTGCCATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACACTTGTTTC-AGTTC--ACAAAAG
561 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAA-
* * * *
365339 CTTATCCAAAATAAAGTAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCATGATTTTAAAA
624 -TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAATTAATAAG-A-GA-TTTAAAA
* * * * * *
365404 AATAAATTTGTTTATTGAACAAA
683 AATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * ** * *
365427 TTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * * *
365492 TAAAACAATTGTTGCAGTTCATACGAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTT
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * * * * ** *
365557 CAAAAATTAATAATTAAGA-AATTTAAAAAGTGAATATGTTTATC-GAATTAG-TTCAAATAATT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTT
* * * * ** *
365619 ATGACCATTTTAAGAATTATCTATTTCAAATCGCCATTACCTTTTG-TTTGCTCATATAA-CAAT
192 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATA-AATC-A-
* * **
365682 TATTTTTTATCATACAAGCTTA-TTAAGAATAAAATAATACTAATTTTTTA-ATCTTTTAAAAAT
253 -A----TT-T-ATACAAGCATATTTAA-AATAAAATAATACT-ATTTATTATA-C-TCCAAAAAT
* * *
365745 TAAT-AGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TCGTTTACC-AG-ACCAGTTTAAATAGTTATGACTA
307 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAGTA--AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * *
365806 TTTGAACAATTA--TATATCAAATCA-TCATAACCTTTTGTTCTATCCTAAAA-AAATATTTCTA
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
365867 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-TCAAAAATTAATGATTA
433 TTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTA
* * *** * * * * *
365931 -AGAGATTTAAAATATAAATTTTTTTGTTAAACTAGTTTAAATAGTTA-AGACTATATGAACAAT
496 GA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATTTGAACAAT
* *
365994 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAAATTCATACTA
559 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT--ATTCATACAA
** * * * * *
366058 GCTTATT-AGGAATAAAATAA-AATGAAGTTATTAAAATTTCAAAAATTGATAAGTAAGAGATTT
622 AATTATTCA-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC-TAAA-T--TAA-TAAGAGATTT
* * * *
366121 AAAAAAAT-AATTTTGTTTACCTAACCAAA
679 -AAAAAATGAA-TCTATTTA-CTAAACAAG
* * * * * *
366150 TT-AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
** * * ** * *
366214 TAAAACAAAAGTTT-TTGTTCATATAAATCTGT-TTGGAATAAAATAATACTAATCTACTAATAT
65 TAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATA-CAAGCT-TATTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* *
366277 TTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAAT--AT-TTTTTATC-AAA-ATAG-TTCAAATA
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACA-AGTTTCAAATA
* * * * * * *
366331 GTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-CTTTTATTATGTTATAAAATAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAT--
* * * * * * * *** *
366395 TAATTTCTGTTCATACAAGTATATTCATATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATT
251 CAA----T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * ** * *
366460 AATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGGCTATTTG
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * *
366525 AGTAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGATCTTTTCTTATGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTC
373 AACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * * * * *
366588 ATATAAGCTTATTT-GATGTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAGAAATTAATGAATA-AG
436 ATATAAGTTTATTTAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA-
* * * * * * * * * * *
366651 AGAATTAAAAGA-GAATCTGTTTACCGAATATGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTAT-
498 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATC
*** * * * ** * * * **
366714 TGATTTCAAAACATAATGACCTTTTGATTTGTTATAAAACAATTGGTTCTGTTGATGCAAGCTTA
563 T-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTA
*** * *
366779 TTTGGAATAAAATGATA-TAAATTTATT-ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
627 TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-C-TAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAA
* * * *
366842 TAAATATGTTTACCAAACAAG
685 TGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * *
366863 TTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * ** *
366928 TAAAACAACTATTT-TTATTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATT
65 TAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* ** * * ** * *
366992 TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAGCTAAATCT-GTT-TCCGAACTAG-TTCAAATAGC
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGT
** * * * * *
367049 TACAACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA--
* * * * * * * *
367113 GTTTCTATTTATGCAAG-ATTATTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAATCTAATAATA-TTCTAAAATT
254 --TT-TA--TA--CAAGCA-TATTTAAAATAAAATAATA-CT-AT-TTATTATACTCCAAAAATT
* * * * * * ** * * *
367175 AATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATATTTGCTGAACCAA--TCAAATAGTTAAGATTATTA
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
367238 GAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTT
372 GAACAATTATTTATTTCAAA-TAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * * ** * ** * *
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435 CATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT-ATAAAAATTAAT-A-GTA
* * * * * *
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496 GAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATTTGAACAAT
* * * * * * *
367427 TATCTATTT-AAAATGATTATGGCATTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTT-GAGTTCATA-AA
559 TATCTATTTCAAATTG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAA
* * * ** *
367489 AGCTTA-TGAAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATT-TAAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTT
622 A-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AAATTAATAA----GAGATTT
* * * * **
367552 TAAAAATAAAT-AAGTTTATCGAATGAA-
679 AAAAAATGAATCTA-TTTA-CTAAACAAG
* * * * * *
367579 TTCAAATAATTATTG-CCATTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATG-ACTTTTATTTTGTC
* * * * * *
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64 ATAAAACAATTGTTTCTT--TTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * * * * *
367707 TTCAAAAATTAA-ACAGTAGGAGA-TTTAAAAAATGAATTTGTTTATC-GAACCAG-TTCAAATA
125 TCCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * * *
367768 GTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCA-TTGTAACCTTTTATTTTGTCATAAAACA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC-
* * * * * * ***
367832 ATTATTTATGTTTATAAATGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAAT
252 A--ATTTA----TA-CAA-GCATATTTAAAATAAAATAATACT-AT-TTATTATACTCCAAAAAT
* * * * * *** * * * *
367897 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTATAT
307 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * * * *
367962 GAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCATTTGTTATGTCGTAAAACAAATGTTT-TCCTTC
372 GAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTC
* * * * * *
368026 ATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATCTACTAATATGT-CAAAAATTAATA--AG-AG
436 ATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TATAAAAATTAATAGTAGAAG
* * ** * * * * * *
368087 ATTTAAAAAATAAATCTATAAATCAAACGAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTT
500 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCT
* * * * * * *
368151 ATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATAATTTTTGTTCATACAAGCA-TAT
564 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA-AATTAT
* * * * * * * *
368215 TCAGATTAAAATAATATTCAGTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG-GATTTAAAAAATAAATA
628 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-A-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* *
368279 TGTTTA-TCGAACAAG
691 TATTTACT-AAACAAG
* * ** * * * * * *
368294 TTCAAATAGTAATGACAATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTATTTTGACCTTTCT-TTTTTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTT-TATTTTGTC
* * * * * * * ** *
368358 ATAAAATAATTATTT-TAGATCATATAAACTTATTTGATGTAAAATCATACTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTCT--TTTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
368422 TCCAAAAATTAATGAGTAAAAGA-ATTAAAAAA-AGAATCTGTTTA-CCAAATAAGTTT-AAATG
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATA-AATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * * * **
368483 GTTATGACTATTTAAACAATTATCTACTTCAAA-ACATAATTACCTTTTGTTTTGTCTTAAAAAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCA
* ** * * *
368547 ATTGGTTCTGTTGATGCTTA-TTACAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TGTCAAAAATT
253 A----TT-TATACAAGCATATTTA-AAATAAAATAATACT--ATTTATT-ATACT-CCAAAAATT
* * *
368609 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAA-CATA-TTCAAATAGTTATGACTATT
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTA-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
368672 TGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATAATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTATT
371 TGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* ** * *
368736 CATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA--AG-A
435 CATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGTAGAA
* ** * * * * * * * *
368797 GA-TTAAAAACTAAACATATTTACCAGACTAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
499 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCT
* ** * * * * * ***
368861 ATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCA-TCGTATAAGCCTAT
564 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTATTCATACAAAATTAT
* * * * *
368924 TTAGAATAAAATAATACTAATTT-TTGATATTTTAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATA
628 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAAT-A--AG-AGATTTAAAAAATG
* * **
368988 AATCTGTTTA-TCGAACTCG
687 AATCTATTTACT-AAACAAG
* * * * ** * * * *
369007 TTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTATTTAGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * * * *
369072 TAAAATAATTGTTTCACTTCATACATGCTTATCCGAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATT
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTC--AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
369137 CAAAAAATTAATAAGCAAGA-AATTAAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAA-ATTCAAATAGT
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGT
* * * * * * *
369199 CAAGTCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATGCCCTTTTGTTTTGTAATAAAACAAT
191 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAAT
* * * * * *
369263 TGTTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATGCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAGTATTTCAAAATT
255 T-TATACAAG--CAT---A--TT-T--AAAATAAAATAATACTA-TTTATTA-TACTCCAAAAAT
*** * ** * * *
369327 TGAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAA-TCAA-TTCAAATAATTATGGCCA
307 T-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGT-AAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
369389 TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAT-TTTTGATTTATCATAAAACAATTGTTTTTC
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATG-ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-
* ** * * * *
369453 A-TCGTATAAGCCTATTCAGAATAAAACAGTACTAATTT-TTAATATT-TCAAAATTAATGAGTA
432 ATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTA
* * * * * * * * *
369515 AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTA
496 GAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTA
* * * * * **
369580 TATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTAATACAAGCTT
561 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATT
* * * * *
369645 ATTCAAAATAAAATAGTACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTTAGAGATTTTAAAAA
626 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAAT-A---AGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
369710 TAAATTTCTTTGCCAAACTAG
685 TGAATCTATTTACTAAACAAG
* * *** * * * * * *
369731 TTCAAATAGTTAAGGCTGCATGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGTTCTTCTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATG-ACTTTTATTTTGTCA
* * * ** * * * *
369796 TAGAACAAATGTTT-TTGTTCGTTTAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATAT-TTAATATT
65 TAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
*** * * *
369859 TTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTCTTTA-CTAAACCAA--TTCAATTAG
126 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAA-CAAGTTTCAAATAG
* * * * *
369916 TTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTAT--TCTGATTTGTTTTGTCGTAAAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCT--TTTGTTTTGTCAT-AAAT
* * ** * * * *
369978 -AATTGTTTCTATTGATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAA
251 CAA-------T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAA
* * *
370042 ATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTG--T--C-----AG--C--CT-G-TATGAC-AG
305 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTA-
* * * * *
370091 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGACCCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * ** *
370155 GTTCGTACAAGCTTATTAAGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATT-CCAAAATTAATAAGGC
432 ATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-A-GT
* * * *** * * * *
370219 A-AATATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAACAGGTCCAAATAG-CTATGACTATTTGAACAAT
495 AGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTC-ATAACCATTTGAACAAT
* * * * * * ** * **
370282 TATATATTTGAAATAGGTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTATTTATACAAGC
559 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAA
* * ** **
370346 TTATTTC-GATTAAAATAATAAAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
624 TTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTA-AATTAATAAG----AGATTTAAA
* * * *
370410 AAATAAATATGTTTACCT-AACATAT
682 AAATGAATCTATTTA-CTAAACA-AG
* ** * * *
370435 TTTAACATATGTTA-G-CTAACAT-AA-ATATGT-T-TACCT-AACAT-ATTAAT-A-TTTGCAC
1 TTCAA-ATA-GTTATGACT-ATTTGAACA-AT-TATCTATCTCAA-ATCATT-ATGACTTT-TAT
** * * * **** ** * * * * *
370490 AAT-TAATAAGTAA-AAAT-TTGCAAAAATA-AATATTTTTAGCGAACAAGATCAA-ATAA-TCA
58 TTTGTCATAA--AACAATTGTTTCTTTTATACAAGCTTATT--CAAATAAAAT-AATATAATTTA
* * ** * * * ** *
370549 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAA-ATA-ATA-CT
118 TTAATATTCCAA-AA--AT-TA-ATAAG-T-A-A-GAGATT-TTAAAAAATAAATATATTTATCT
* * *
370610 AAACTATTAATATTCCAAAT--TTAATGACTAAGAGATTTAAAAAACGAACTTGTTTATAGAACG
173 AAAC-A--AGT-TT-CAAATAGTT-ATGACT-----ATTT---GAAC-AA-----TTAT----CT
* * ** * * * **** *
370673 AGTTT-AAATAATTAAGA-CTATTTAGACAATTATCTATTTGAAATCACTATA-AC-CTTTTGTT
214 A-TTTCAAATAGTTATGACCT-TTT-G--TTTTGTC-A--T-AAATCAATTTATACAAGCAT-AT
*** * * * ** ** ** * * *
370734 TTGTCATAAAATGAT-TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATT
269 TTAAAATAAAATAATACTATT-TATT-ATAC-TCCAAAAATT-AAT-AAGTAA-A-AGATTTA-A
* ** ** * ** *
370798 AATATCAAGA-C-AATTAATAAGTAAAAGATGTAAAAAATAAATCTGTTTACAAACGAGTTCAAA
326 AAAAT-AA-ATCTGTTTACCAAGT--AAG-T-T--CAAAT--A---G-TTA-TGACTA-TT----
* * *
370861 TCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTATTTTGTCATAAAA
371 T-G--A--AC-A-AT-------TATTTATTTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * * * * *
370925 CAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTTTTATA
421 CAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAA
* *** * * *
370989 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATACATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTA
486 ATTAAT-AGTAGAAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCA
* * * * * *
371054 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
549 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT
** * * * ** *
371119 TCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATGTTAATTTATTAAT-TTGTTGATAATTAATAAGTAA
614 TCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CT-A-AATTAATAAG---
* * *
371183 AAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAG
673 -AGA-TTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * *
371218 TTTAAATAGTCATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * *
371283 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
** ** * * ** * *
371347 TTAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAAATGAATCTATTTA-CCCAACAAG-TGCAAACAG
127 CAAAAATTAATA-AGTAAGAG-ATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * *
371409 TTATGAATATTTGAAAAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATC-A
* * * **
371473 TTGATTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTAAAAAAT
253 ---A---T-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT--ATTTATT-ATACTCCAAAAAT
* ** * * *
371536 TAATAAGTACAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTATATGAA-CACGTTCAAATAGTTATGATTATT
307 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
371599 TAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTGTGA-CAATTTTGTTTT-TCATAAACCAATT-TGTTCTG
371 TGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTA
* * * * * * * ** * *
371661 TTCAAACAAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTGTTAATACT-CCAAAATTAATAATTAA
433 TTCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAG
* ** ** * * * **
371725 AAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATGAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTA-
497 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTAT
* * *** * * * * * * **
371789 CTTATTTCAAGTCGTTATGGTATTATGTTTTGTCCTTAAATAACTGTTTCTATTCATAC-ATTTT
562 C-TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATT
* * * ** *
371853 ATTCAGAATAAAATAACATTAATTTATTGTTATTCTAAAAATTAACAAGTTGAAGATTTAAAAAA
626 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAA---G-AGATTTAAAAAA
* **
371918 TTAATCTATTTACCGAACAAG
685 TGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * * * ** * *
371939 TTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTCTTTTATTTTAAATTGTTATGACATTATGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTC
* * ** *
372004 ATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTATTCGAAATAAAATAATGCTAATTTATTACA-AT
64 ATAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAAT-ATAATTTATTA-ATAT
* * * * * * ** **
372068 TTCAAAAATTAAT--G--ACACA-TTTAAAAATTAAATCTCTTTA-CCGAAGTAG-TTCAAATAG
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * * * *
372126 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTAAAATCA-TTACGA-TTTTATTTTTTGTCCTAAAACA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAATCA
* * * * * * * * **
372189 TTTGTTTATATTCATACAAGCATATTCATAGTAGAATATTATTAAATTATTAATATTTTAAAAAT
253 -------AT-TT-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAAT
* * * * * * * *
372254 TAATAAGT--AAGCATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACT-AGTGCAGATAGTTAAGACAAT
307 TAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * ** * * * * * * *
372316 AAGAACAATTATGTATTTTGAAT-CTTCTCG-TCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTTTGT
370 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTAT-GATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * *
372379 TCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATACTACTAATTTATTAATACTTA-AACAATTAATAAGTAA
434 TCATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTATAAAAATTAAT-AGTAG
* * * ** * * * * * ** *
372443 AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGCCATGACTATACGAAAAATTAT
497 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTAT
* * * ** * *
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562 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAATT
* ** * * * *
372571 CTTTTGAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTGATAATAAAGATATTTAAAAA
626 -ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C-TAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAA
** * * *
372636 ATGAATCTATTTGTTGAATAAA
684 ATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * * * * * * *
372658 TTTAAATAATTCTAACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGA-TATAACCATTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAA-TCATTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * * * ** *
372722 ATAAAATAATATTTTTCTATCTATAAAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAAT-TGTTTCT-TTTATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * *
372787 T--AAGACAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAATAAATCTATTTAT-TGAACAAG-TTCAAAT
125 TCCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAAT
* * * * *
372846 CA-TTATGACTATTTGGACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAA
188 -AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAT
** * * * ** *
372909 CAATTGTTTCTGTTCATACAAG-ATTATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTGTAAC
251 CAA-------T-TT-ATACAAGCA-TATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAA
* * ** ** * * *
372973 AATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAAATAAATATGTTTATGAAACAAGTTGAAATAATCATGACT
304 AATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
373038 ATTTGAATAATTAATTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCA
368 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * * * *
373102 ATTCAAATAAACTTATTT-GAAATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATGAGT
432 ATTCATATAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGT
* * * * * * * * * * * *** *
373166 AAGAA-AATTAAAAAATGAATCTATTCATCGAACATA-TTCAAATAATTATGACTATCCAAATAA
495 -AGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAA
* * * *** * *
373229 TTACCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCTATTCATGCAAG
558 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA
* * * *
373294 CTTATTTAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAA
623 ATTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAG---AGATTTAAA
* *
373358 AAGTAAATCTATTTTA-TGAATAC-A-
682 AAATGAATCTA-TTTACT-AA-ACAAG
* * * * * * *
373382 TTCAAACAGTTATGACCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAC-TTTTATTTTGTCA
* * * *
373447 TAAACCAACTGTTT-TTGTTCATA-AAGGCTAATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAAT
65 TAAAACAATTGTTTCTT-TT-ATACAA-GCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * *
373510 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAT-TGAGCAAG-TTCAAATAG
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
373572 TTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGATAAGATCTTTTATTTTGTTATAAAACAAT
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA-
* * **
373637 TGTTTCTATTCATAG-ATGTTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAAA
254 ---TT-TATACA-AGCATATTTA----AAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATA--CTCCAAAAA
*** * * ** * * * * *
373701 TTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCAATGAA-CAAGTTGAAATAGTCATGTCCAT
306 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * **
373765 TTGAACTATTATCTATTTTAAATCGTTAAGATATTTTATTTTTTTGTAAAACAATTGTTTCTATT
370 TTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* ** * * *
373830 CATACAAAATTATTCATAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA--AG-A
435 CATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATAGTAGAA
* ** ** * * * * * *
373891 GATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTGAGCCAA-TTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTAGC
499 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATC
** ** * * * * * * **
373955 TACCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTAT
563 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTAT
*** * * * * ** * *
374019 TTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAAGAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATG
628 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT--AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* * * *
374084 TGTTT-GTCGAACTAG
691 TATTTACT-AAACAAG
* * * *
374099 TTCAAATAGTT-TAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATC------A-TTTTA---T-TCA
1 TTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTATTTTGTCA
* * * **
374152 T---ACAA-----TC--TTAT------TCA---AAATAATATAATACTAATTTATTAACATTTGA
65 TAAAACAATTGTTTCTTTTATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCA
* * * ** *
374198 AAAATTAATAAATAAGAAATTTTAAAAAATAAACT-TGTTTA-CCGAACAAGTTT-AAACAGTTA
129 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAA-TATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTTA
** * * * ** * * *
374260 CAACTATTTGAACAACTATTTATTTAAAATAAATATAACCTTTTGTTTTATCATAAACAACAATT
193 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA-ATCAA--
* * ** * * * *
374325 TTAGATCATAAAAGCTTATCCAAAAT-AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAA
254 TT---T-ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACTA-TTTATT-ATACTCCAAAAATTAATAA
** * * ** ** * * * *
374389 GT-TGAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCTTA-TTGGTTCAAATAATTATGGCTATTAGAATA
313 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
** * * * * * * **
374452 ATTATCCATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCCTGCA
377 ATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATATA
** * * *
374516 AGCCTATTCAAAATAAAATTATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATT
441 AGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAAT-AGTAGA-AGATT
* * * *
374579 TAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAG-T----T--TC---A--ATTTAAACAATTATCTATT
503 T-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * * * * * ** **
374632 TCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCACATAAGCTTATTTT
567 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAATTATTCA
* * * *
374696 GAATAAAAT-ATACTAATTTAATAA-ATTTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
631 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCT--AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA
* *
374759 TTTGCCAAA-ATAG
693 TTTACTAAACA-AG
* * * * * * ** * **
374772 TTCAAATAGCTAAGACTATATAAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * *
374837 TAAAACAATTGTTTCAATTCATAGATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
65 TAAAACAATTGTTTC-TTTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC
* * * * * * * *
374902 CAAAAAATAATAACTAAGTGA-TTTAAAAAGTAAATCTGTTTA-CCAAATC-AG-TTCAAATAAT
127 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAA-CAAGTTTCAAATAGT
* * ** * * **
374963 TAT--CTATTTCAA-ATCATTAT-TACCTTTTATTTGGTCATAT-AACAATTGCTTTTG-----A
191 TATGACTATTTGAACA--ATTATCTA--TTTCAAATAGT--TATGACCTTTTG-TTTTGTCATAA
* ** * *
375018 A-C-A--T-T-CAAGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTA-ATCTTTCAAAAATTAAT
249 ATCAATTTATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATTATA-C-TCCAAAAATTAAT
* * * *
375076 ATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
311 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * ** * * * * * * ** * * *
375140 TAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTCTTTTATAAAATTATTATTTTTGTTCATA
375 CAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * ** * *
375204 TAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AA
439 TAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGT-AGAAGAT
**** ** * * * * * * * ** *
375268 TTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAATTATTTTAAATATTTA-AGACAATATGAATAAACATTTAT
502 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACCATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * **
375332 TTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTTTTTTCAATTCATACTAGTTTATT
566 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTATTTCTATTCATACAAAATTATT
*** * * *
375396 TGGAATAACATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-
629 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC-TAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATG
* *
375459 AATTCTTTTTACCTAATC-AG
687 AA-TCTATTTA-CTAAACAAG
* * * * * * *
375479 TTTAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * * * * *
375544 TAAAGCAGA-TGTTTTTGTTTGA-ATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATAT
65 TAAAACA-ATTGTTTCT-TTT-ATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * * *
375607 TTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTT--AAAA-AAATCTATTTGTC-AAACTAG-TTCAAATAA
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * * * * *
375662 TTACGACTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTAT-TAGAAAATGA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT-T-TGT-CATAA--A
* * * ** * * * *
375726 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TATCGACAAT
250 -----TCAATTTATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACT-CCAAAAAT
* * * * * * * * * *
375790 TAATAACTAAAAAATTTAGAAAATAAATATATTTATCGAACT-AGATCAAATAATCATGACTATT
307 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * ** * * *
375854 TGAATAATTATCTATTTTATATCGTTACAATCTTTTGTATTGTAATAAAAGAATTGTTT-TAGTT
371 TGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
** * * * * ** * *
375918 CATATAAACTTAATCAGAATAAAATAATACTAATGTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGA
435 CATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAGTAGA-A
* * * * * * * * *
375983 GATTT-AAAAATGAATCTCTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
499 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCT
* *** * * * * ** *
376047 ATTT-GAATCACTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAA-TATAATTT-TCAGTTCATACAATCTTT
564 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-A-TTCATACAAAATTA
* **
376109 TGTC-AAATAAAATAATA-TAATTTTATTACTATTAAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
627 T-TCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATT-CTA-AATTAATAAG----AGATTTAAAAA
* * * *
376172 ATAAAACTGTTTA-TCGAACAAG
684 ATGAATCTATTTACT-AAACAAG
* * * * **
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1 TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTAT-T-TTGT
* * * * * * *
376257 TAGAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
63 CATAAAACAATTGTTTCT-TTTATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
*** * * * * *
376322 TTTGACAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTA-ATAAGCAAG-TTCAAATAG
125 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAG
* * * * *
376384 TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAA
190 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA
* * * * * * * *
376448 TTGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTTAAAGTAAAATAGTGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATC
250 -----TCAATTTATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * * * * * * *
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308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** * ** * * * *
376576 GAATAATTAACTGTCACAAA-ACATTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTGTT
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** * * * * *
376639 CATGCAAGCTTATTTCA-AACAAAA-AAT-TTAAATTTCTTAATAATT-CAAAAATTAATTAGTA
435 CATATAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT-ATTATAAAAATTAA-TAGTA
* * * * * ** * * *
376700 -AAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACATA-TTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATA
496 GAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATT
* * * *
376763 ATCTATTTGAAATCT-TTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCATA-AAA
560 ATCTATTTCAAAT-TGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAA
* * * * * * *
376825 GCTTATTTAGAATACAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTTATAAGTAAAAGATTTAA
623 -ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAAA--T-TAA-TAAGAGATTTAA
* * * ***
376890 AAAATAAATCGATTTACTGAGTGAG
681 AAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * *
376915 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGA-CTTTTATTTTGTC
* * *
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* * *** *
377043 TCTAAAAATTAATAAGCT-GGAGA-TTTAAAAAATAAATCCGTTTATC-AAACAAGTTT-GAATA
125 TCCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATA
* * * * * * * *
377104 GTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTTTTTTGTCATAAAACAA
189 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAA
* ** * * * *
377169 TTGTTTTTATTCATATAAAATTATTAAAAATAAAATAACACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATT
254 -----TTTA-T-ACA-AGCA-TATTTAAAATAAAATAATACTA-TTTATT-ATACTCCAAAAATT
* * * ***
377234 AATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTTG
308 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
377294 AACAATTATCTA-TCCAGATA-TTAT-AT-TATTTGTTTTGTCTTAAAACAATTG-TTCTTGTTC
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* * * * ** * * * ** *
377354 ATACAAGCTTATTCAGAGTAAAAT-ATAGCTAAACTAATAATATTCTAGAAACGAATAAGCA-AG
436 ATATAAGTTTATTTAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT-AGTAGA-
* * ** * *
377417 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGA-CAAACCAA-TTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTA
498 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAA-CAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTA
* ** * * * * * * ***
377480 TTTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATGCATGCT
561 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAAAT
** * * *
377543 TATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAA
625 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC--TAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAA
* * * *
377608 ATAAATATGTTTACTGAACAAG
684 ATGAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * *
377630 TTTAAATAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTAT
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-CTTTT-ATTTTGT
* * * *
377694 CATAAAACAACTGTTTCATTCATA-AATG-TTGATTCAAAATAAAATAATAGTACTTTATTAATA
63 CATAAAACAATTGTTTCTTTTATACAA-GCTT-ATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATA
* ** * * * * *
377757 TTTCAAATTTTGAAAAATTGAA-A-ATTTTAAAAAATAAATCA-GTTTATCGAATC-AG-TTCAA
124 TTCCAAAAATT-AATAAGT-AAGAGATTTTAAAAAATAAAT-ATATTTATCTAAACAAGTTTCAA
* * * * * * * *
377817 ATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTATTATAAAA
186 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAT
* ** * * *
377882 CAATTGTTTTTCAACATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAA
251 CAA-----TTT----ATACAAGCATATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTATT-ATACTCCAAAA
* *** * * ** * *
377947 GTTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAA-CCAGTTTAAATAGTTA-AACTA
305 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * **
378010 TTTGAACAATTATATATTTCAAA-ACATTATAACCTTTTATTTTTGTCATAAAACAATTATTGAT
369 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATA-GTTATGATCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * *
378074 GTTCATATAAGCTT-GTTCGAAATAAAATAATATTAATCTAATAATATTA-AGAAAATTAATAAC
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*
378137 TA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAAC
494 TAGA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC
378171 CAATTTGTAT
Statistics
Matches: 39374, Mismatches: 9513, Indels: 8297
0.69 0.17 0.15
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787 18 0.00
788 13 0.00
789 14 0.00
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794 9 0.00
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811 12 0.00
812 2 0.00
813 2 0.00
814 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (705 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGACTTTTATTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTCTTTTATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCCAAA
AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTATCTAAACAAGTTTCAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTTATAC
AAGCATATTTAAAATAAAATAATACTATTTATTATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
AAAATAAATCTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
ATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTAGAATA
AAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
ACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT
TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
ATTAATATTCTAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAG
Found at i:328383 original size:214 final size:214
Alignment explanation
Indices: 327987--328393 Score: 489
Period size: 214 Copynumber: 1.9 Consensus size: 214
327977 AAAACAATTT
* * * * *
327987 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTGTTATAAA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATAGTTATGACCTTTATTTTGTCATAAA
* * * * *
328052 ATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACGAATTTAATAATATTTCAAA
66 ACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACGAATTTAATAATATTCCAAA
* * *
328117 AATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTAT
131 AAATAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTGACAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTAT
328182 TTTGTCAATAAACATGTTC
196 TTTGTCAATAAACATGTTC
* * *
328201 AAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATAGTTATGACCTTT-TGTTTGGTCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATAGTTATGACCTTTAT-TTT-GTCATA
* * * * * * * *
328265 AACCAATTGTTTCTGTTCATACATGCATATTTAAAATAAAATAATGCTAGTTTATTCATATTCCA
64 AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACGAATTTAATAATATTCCA
* ** * *
328330 AAAAATAATAA-TAAA-ATATTAAAAAATAAACCTGTTT-ACCCAGCAAGTTCAAATAGTTATGA
129 AAAAATAATAAGTAAAGAT-TTAAAAAATAAACATGTTTGACAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
328392 CT
192 CT
328394 GGTTGAACAA
Statistics
Matches: 160, Mismatches: 29, Indels: 8
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
213 8 0.05
214 85 0.53
215 67 0.42
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (214 bp):
AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATAGTTATGACCTTTATTTTGTCATAAA
ACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACGAATTTAATAATATTCCAAA
AAATAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTGACAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTAT
TTTGTCAATAAACATGTTC
Found at i:328995 original size:229 final size:223
Alignment explanation
Indices: 328567--328997 Score: 539
Period size: 225 Copynumber: 1.9 Consensus size: 223
328557 TAGTCATGTC
* *
328567 CATTTGAACAATTATCTATTTAATTTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTTG
1 CATTTGAACAATTATCTATTTAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTTG
* * * * * *
328632 TTCAAGCAAAATTATTCAGAATAAAATTATATTTATCTATTAATATTTTGAAACTTAATAAGAGA
66 ATCAAGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAACTTAATAAAAGA
*
328697 TTTAAAAACTAAATCTATTTTCCGAAATAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTAT
131 TTTAAAAACTAAATCTATTTTCCGAAATAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
328762 CTCAAATCATTATGATCATTTGAATAAT
196 CTCAAATCATTATGATCATTTGAATAAT
* * * *
328790 CATTATGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTT
1 CATT-TGAACAATTATCTATTT-AAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTT
** * * *
328855 TGATCATA-CAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAA
64 TGATCA-AGCAAAATTATTCAG-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTT-AAAACT--TAA
* * *
328918 GTAAAAGATTTAAGAAA-TAAATCTATTTTTC-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
124 -TAAAAGATTTAA-AAACTAAATCTATTTTCCGAAA-TAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
328981 AATTAT-TAATCTCAAAT
186 AATTATCT-ATCTCAAAT
328998 TGTTAAGATC
Statistics
Matches: 176, Mismatches: 21, Indels: 16
0.83 0.10 0.08
Matches are distributed among these distances:
223 4 0.02
224 17 0.10
225 76 0.43
226 5 0.03
228 7 0.04
229 64 0.36
230 3 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (223 bp):
CATTTGAACAATTATCTATTTAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTTTG
ATCAAGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAACTTAATAAAAGA
TTTAAAAACTAAATCTATTTTCCGAAATAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
CTCAAATCATTATGATCATTTGAATAAT
Found at i:329175 original size:177 final size:175
Alignment explanation
Indices: 328791--329853 Score: 583
Period size: 177 Copynumber: 5.9 Consensus size: 175
328781 TTGAATAATC
* * *
328791 ATTATGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTT
1 ATTA-GAATAATTAT-TATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA--ATTGTT
** * *
328856 GATCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTA
61 -ATCATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * **
328921 AAAGATTTAAGAAATAAATCTATTTTTCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
125 AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTT-GAACTAGTTCAAATAATTAAAACT
* * * *
328973 ATTTGAATAATTATTAATCTCAAATTGTTAAGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTATCA
1 ATTAGAATAATTATT-ATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTATCA
* * * *
329038 TAGAAACTTATTCG-ATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAATAG
65 TACAAACTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAG
* *
329102 ATTTAAAAAATAAATATGTTTGTTGAACTAGTTCAAATAATTAAAACT
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTT-TTGAACTAGTTCAAATAATTAAAACT
* * *
329150 ATTAGAATAATTATATATTTCAAATTGTTCAA-ACCTTTTGTTTAGTCA-AAAATATTTGTT-TC
1 ATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATTGTT-AAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTATC
* * * * ** *
329212 ATATCTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATTCAAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGC
64 ATA-C--A-AA-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * ** *
329277 AAAAGATTTGAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATT
124 AAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTT-TTGAACTAGTTCAAATAATTAAAACT
* ** * * * * * *
329331 ATTTA-AATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGCTTTGACATGAAAGAGTTGTT-TC
1 A-TTAGAATAATTA-TTATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTATC
* * * * *
329394 AATTTATAAAAGCTTA-TCTAGAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTCAGAATTAATAAG
64 -A--TA-CAAA-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * **
329458 CAAAAG-TTAAAAAAAATAAATTTAAATAAATTTATTTACCAAACAAATTTAAATAGTTATGACT
123 TAAAAGATT-TAAAAAATAAA--T--CT--A-TT-TTT---GAACTAGTTCAAATAATTAAAACT
* * * ** * * *
329522 ATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATCATT-TCA
1 ATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA--ATTGTTA
* * * * **
329586 GTTCATACAAGCTTATCCAAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT
62 --TCATACAAACTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * * * * *** *
329651 ----GATTTAAAAAGTTAATTTGCTTATCAAATCAATTCAAATAGTCATGTCC
124 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTTGAACT-AGTTCAAATAATTAAAACT
* * *
329700 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTCTTTCTG
1 ATTAGAATAATTA-TTATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA-T-TGT-T-
* * * * * * * * * *
329765 TTCGTGCAAAATTATTCAAAATTAAAA-AA-ACTGATTTATTAACATTCTAAAAATTAAGAAGTG
61 ATCATACAAACTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
*
329828 AGAGATTTGAAAAAATAAATCT-TTTT
125 AAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTT
329854 ACTAAACAAG
Statistics
Matches: 697, Mismatches: 128, Indels: 114
0.74 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.01
176 42 0.06
177 145 0.21
178 89 0.13
179 3 0.00
180 61 0.09
181 140 0.20
182 67 0.10
183 3 0.00
184 1 0.00
185 4 0.01
186 1 0.00
188 13 0.02
189 3 0.00
190 3 0.00
191 66 0.09
192 41 0.06
193 4 0.01
194 2 0.00
195 1 0.00
196 2 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
ATTAGAATAATTATTATTTCAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTATCAT
ACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
TTAAAAAATAAATCTATTTTTGAACTAGTTCAAATAATTAAAACT
Found at i:329274 original size:582 final size:575
Alignment explanation
Indices: 328223--329363 Score: 1221
Period size: 582 Copynumber: 2.0 Consensus size: 575
328213 CTATTTAAAC
* * *
328223 AATTATCTATTTGAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACA
1 AATTATCTATTTGAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTATTTCTGATCATACA
* * * * *
328288 TGCATATTTAAAATAAAATAATGCTAGTTTATTCATATTCCAAAAAATAATAATAAAATATTAAA
66 AGCATATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATAATAAAAGATTAAA
* * * * * *
328353 AAATAAACCTGTTTACCCAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTGGTTGAACAATTATTTATTTCAGA
131 AAATAAACCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTAATCTCAGA
* * * * ** *
328418 TGATCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTATTCTATTTATATAAGTTTATTGGGAATAAAATAATA
196 AGATCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTAGTCTATTCATAGAAACTTATTGCGAATAAAATAATA
* * * *
328483 CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAAT
261 CTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT
* *** * * * *
328548 AAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTAATTTGTTATGAACTTTTGTTTTGT
326 AAGTTCAAATAATCAAAACCATTAGAACAATTATATATTTAAATTGTTA-GAACTTTTGTTTAGT
* * * *
328613 CACAAAACAATTGTTTTTGTTCAAGCAAAATTATTCAGAATAAAATTATATTTATCTATTAATAT
390 CACAAAACAATTGTTTTTCTTCAAGC---ATTATTCAAAATAAAATTATATTAATCTATTAACAT
* * *
328678 TTTGAAACTTAATAAG-AGATTT-AAAAACTAAATCTATTT-TCCGAA-ATAGATCAAATAGTTA
452 TTGGAAAATTAATAAGAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTAT-CGAACA-AGATCAAATAGTTA
* * *
328739 TGACTATTTGAGCAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCATTTGAATAATCATTATGAAT
515 TGACTATTTAAACAATTATCTATCTAAAATCATTATGATCATTTGAATAATCATTATGAAT
* * * *
328800 AATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTTGATCATACA
1 AATTATCTATTTGAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTATTTCTGATCATACA
** * ** * *
328865 AGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTA
66 AGCATATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATAA-TAAAAGA-TTA
* * ** * * *
328930 AGAAATAAATCTATTTTTCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTAATCTCA
129 AAAAATAAACCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTAATCTC-
* *
328995 AATTGTTAAGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GT-TA-TCATAGAAACTTATT-CGATTA
193 -A--G--AAGATCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTAGTCTATTCATAGAAACTTATTGCGAAT-
*
329056 AAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATATGT
252 AAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
329121 TTGTTGAACT-AGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATATATTTCAAATTGTTCA-AAC
317 TTATCGAA-TAAGTTCAAATAATCAAAACCATTAGAACAATTATATATTT-AAATTGTT-AGAA-
* *
329184 CTTTTGTTTAGTCA-AAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGC-TTATTCAAAATAAAA-TA-ATT
378 CTTTTGTTTAGTCACAAAACAATTGTTT--T-TCTT-CAAGCATTATTCAAAATAAAATTATATT
* * *
329245 CAAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTCTTTATTGAA
439 --AATCTATTAACATTTGGAAAATTAATAAG---AAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
* * * * *
329310 CAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGA
499 CAAGATCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTAAAATCATTATGA
329364 CCTTTTGCTT
Statistics
Matches: 459, Mismatches: 79, Indels: 42
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
577 100 0.22
578 6 0.01
579 54 0.12
580 3 0.01
581 6 0.01
582 158 0.34
583 24 0.05
584 3 0.01
585 30 0.07
586 11 0.02
587 62 0.14
588 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (575 bp):
AATTATCTATTTGAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTATTTCTGATCATACA
AGCATATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAAATAATAATAAAAGATTAAA
AAATAAACCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATTAATCTCAGA
AGATCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTAGTCTATTCATAGAAACTTATTGCGAATAAAATAATA
CTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAT
AAGTTCAAATAATCAAAACCATTAGAACAATTATATATTTAAATTGTTAGAACTTTTGTTTAGTC
ACAAAACAATTGTTTTTCTTCAAGCATTATTCAAAATAAAATTATATTAATCTATTAACATTTGG
AAAATTAATAAGAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGATCAAATAGTTATGACTA
TTTAAACAATTATCTATCTAAAATCATTATGATCATTTGAATAATCATTATGAAT
Found at i:330706 original size:361 final size:359
Alignment explanation
Indices: 329892--330706 Score: 802
Period size: 361 Copynumber: 2.3 Consensus size: 359
329882 TTTGAACAAT
* * * * * *
329892 TAAAATAATA-TAAACTTATTAATATTT-AGATAATTAATAAGTAGATGATTTAAAAAAGAAATC
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATC
* * * * * *
329955 TATTTACCAAATAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTAAAATCAATATGA
64 -ATTTACC-AAGAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATCTATGTAAAATCAATATGA
* * * * * * ** *
330020 CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTCTTTGGATTAAAATAATATT
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCACACAAGCTTATTTGGAAGAAAATAATATA
* * * * ** *
330085 AATTTATTAACATTTCAACAATTAGTAAGTAAAATATTTTAAAAGTAAATATGTTTACCAAACAA
192 AATTTATTAACATTTAAAAAATTAGTAAGAAAAAAATTGAAAAAGCAAATATGTTTACCAAACAA
* * * * *
330150 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGTTTTATCA
257 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATATCAAATAGTCATGACTTTTGTTTTATCA
* * **
330215 TAAAACGATTGTATCAGTGCATATAGCCTCATTTGAAA
322 TAAAACAATTGTATCAGTGCATATAGCATCATTCAAAA
* * * * * * * *
330253 TAAAATAATACTAATTAAATAA-AATTCTAAAAATTATTGAGTAAGAGA-TTTAGAATATGAATT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTA-AAAAT-AAAT
** * * * * *
330316 TGTTTACCAAAGAAGTTCAAATGGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATGTCAAATCATTATTA
63 CATTTACC-AAGAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATCTATGTAAAATCAATATGA
* *
330381 CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCACACAAGCTTATTTTGAAGAAAATAATATA
127 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCACACAAGCTTATTTGGAAGAAAATAATATA
* * * **
330446 AATTTATTAATATTTAAAAAATTCA-TAAGAAAAAAATTGAAAAAGCAAATTTGTTTTCTGAACA
192 AATTTATTAACATTTAAAAAATT-AGTAAGAAAAAAATTGAAAAAGCAAATATGTTTACCAAACA
* * *
330510 TA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATATCAAATAGTCATGACCTTTTGTTTTG
256 -AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATATCAAATAGTCATGA-CTTTTGTTTTA
* * * * *
330574 TTATAAACCAATTGTTTTTA-TTCATGCA-AGCAT-ATTCAAAA
319 TCATAAAACAATTG-TATCAGTGCAT--ATAGCATCATTCAAAA
*
330615 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCAT
* *
330680 TTACCGAGCAAGTTTAAATAGTTATGA
66 TTACCAAG-AAGTTCAAATAGTTATGA
330707 TCTTTTGTTT
Statistics
Matches: 359, Mismatches: 81, Indels: 28
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
360 8 0.02
361 257 0.72
362 78 0.22
363 15 0.04
364 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (359 bp):
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATCAT
TTACCAAGAAGTTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACAATTATCTATGTAAAATCAATATGACATT
TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATCCACACAAGCTTATTTGGAAGAAAATAATATAAATT
TATTAACATTTAAAAAATTAGTAAGAAAAAAATTGAAAAAGCAAATATGTTTACCAAACAAGTTC
AAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATATCAAATAGTCATGACTTTTGTTTTATCATAAA
ACAATTGTATCAGTGCATATAGCATCATTCAAAA
Found at i:330838 original size:145 final size:145
Alignment explanation
Indices: 330550--330825 Score: 360
Period size: 145 Copynumber: 1.9 Consensus size: 145
330540 TATCTATATC
* * * *
330550 AAATAGTCATGACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTGTTTTTATTCATGCAAGCATATTCAAAA
1 AAATAGTCATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCAAAA
*
330615 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATCAT
66 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCAT
* *
330680 TTACCGAGCAAGTTT
131 TTACCAAACAAGTTT
* * * ** * *
330695 AAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTGATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAC
1 AAATAGTCATGACCTTTTGTTTTGTGATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCAAAA
* ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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*
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* * *
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* *
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* * * * * *
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* ** *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * *
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**** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *** * * *
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* * * * * * * ** *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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** * * * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * **
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* *** * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * * * **
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* *
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* ** * * * ** *
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* * * * ** ** * *
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* * ** *** *
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* *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* ** * * * ** * * * *
333809 -AATAA-GCA-AA-AGATTTGAAAAATTAAATCTATTTACAGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGAC
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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1 CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
* ** * *
333969 ATTTCTTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCATGAG-TTTAAAAAATAAATTTGTTTAT--TGAAC
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* * * ** * *
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* * ** ** * * *
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* * * * * * **
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* ** ** ** * *
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* * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * **
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* * *
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* * * * * ** * * * * * ** *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * ** * *
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* * *
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* * * ** * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * ** * ** * *
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* * * * * * * *** * * *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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* * * *
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** * ** * * ** *
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* ** *
335589 TAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAAG-AAGAGA-TTAAAAGCTAAATATGTTT-T--TGA
64 TAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATA-GTTTATACTAA
* * * * * * * *
335645 ACTAGTTCAAATAG-TTATGATTATTTGAATAAGTATCTATCTCAAATCATTATCATC-TTTGTT
127 ACAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
335708 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTATGCAAGATTATTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAA
190 TTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCAT-AAAAATTATTTAAAATAAAATAATA-CT--ACTAT
* * * *
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250 TAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAACTAAACTGTT-TTTAACC-ATTCAAATA
* * * * * * *
335832 GTTA-AGACTATTAG-AATAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTCATTTAGTCATAAAA
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*** * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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1 CTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
* * * ** * *
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* * * **
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* * ** *
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* * * * ** * * *
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* * * *
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429 A--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTG-TAAACCAATTCAAATAATTAAGACTAT
* * * *
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* * * * * * *
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1 CTTTTGTTTA-GTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAC
* * * *
336661 TAATCTACTAATATGTC-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAAT-CTATATA-TCAA
64 TAATTTATTAATAT-TCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATAGTTTATACT-AA
* * * * * ** *
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* * * ** * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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** ** * ** ** *
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* * * ** * * * * * *
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* **
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* * * *
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* * * * * **
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* * * * *
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** * *
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* * * *
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* * * * * **
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* * * * * * ** *
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* * * *
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* *
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* * * * * *
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1 CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTA
** * * **
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* * ** ** * * * *
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* * ** * * * *
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**** * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* * * ** ** * * * * *
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* *** * *
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* * * * * ** *
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** ** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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C
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* *
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*** * * *** * * * * * *
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* * **
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** * * * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * * * ** *
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* * * *
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*** * *
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* ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *** * *
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* * * *
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66 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TT
* * * * * *
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129 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * *
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* * * * *
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63 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
* * * * *** * *
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* * * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACA-AG-TTCAAATAGT
* * ** * * * *
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* ** * *
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* * * ** *
335060 TTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCA
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
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* ** * * **
335190 TTCAGTTCATATAAGCTTATTTGATATAAAATAATACAAATTTAAAAATAT
131 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
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* * **
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* * * * * * *
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* * ** ** **
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* * **
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** * ** *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
335835 AAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTCATTTAGTCATAAAATAATT
65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** *
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* * * * * * * * *
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1 TTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * * * *
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* * * *
336082 GTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TGAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
129 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * ** * *
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* * * **
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130 --TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
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1 TTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * *
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* * * * **
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* * * **
336495 TAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAA-TTCAAAT-GA
1 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG-
* * ** * * * * *
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* * * * * * * *
336621 ATGTTTTC-CTTCATATAAGTTTGTTC-GAATAAAATAATACTAATCTACTAATAT
127 TTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
336675 GTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATATATCAAACGAA-TTCAAATAGTT
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTT
* * ** * ** * * *
336735 ATCACTATTCGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTG-CTATAAAATAATA
65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATT
* * * * * * * * *
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129 GTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * ** * * * * *
336912 TGACTATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTCCTTTTTTGAAAAAATAATTA
66 TGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * ** ** **
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* * * * * * * * *
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1 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
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* * *
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** * * * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * **
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* * ** *
337327 TTTTTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATCAATAT
129 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
337379 TTCAAAAATTAAT---T-AGAGA-TTAAAAACTAAATATATTTACCAAACTAGCTCAAATAGTTA
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
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* * * * * * ** *
337503 ATCTA-TTTATGCAAGATTATTCAAAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAATAATA-
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* * * * * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
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65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** *
337682 TTTCAGTTCACACATGCTTATCCAAAATAAAATAATACT-ATTCTAACAACA-
130 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATAT
* * * *
337733 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGT
1 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
* * ** * * * * * * *
337798 GAAGTTTATTTGAAAAATTATCTATTTAAAATGATTATGGCATTTTGTTTTATAATAAAACAATT
64 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * *
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* * * * ** **
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT--AAA-AAAT-AAATT-T--GTTTACCGAACAAGTTCA
* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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1 TTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * *
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* * * **
338227 ATTT-ATGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAAAAATAT
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* * * * * ** * * *
338280 TAT-GAAACTTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCTAAACGAGTTCACATAATT
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* * * * ** * * * *
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65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** * *
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130 -TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
338461 GTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATATATCAAACGAA-TTCAAATAGTT
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTT
* * * * ** * *
338521 ATCACTATTCGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA
65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* ** * *
338586 TTT-ATGTTAATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATAT
130 TTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
338638 TAT-GAAAATTAATAAAT-AGAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTT
1 T-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
338701 AAGGCTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAGAACAAATG
65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** ** * * * * *
338766 TTTTTGTTCATTTAAGTTTGTTCAAAATGAAATAATATTAATATATTAATAT
130 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * ** * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
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131 TTC-AGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * * *
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1 TTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAG
* * * *
339055 TTATAAC-AGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTTATCATAAAATA
63 TTATGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
339118 ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTGTTCAGAACAACATAATTCTAATTTATTAATAT
126 ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * **
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1 TTCAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * **
339238 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAT-AGGTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT
65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
339302 TTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATTCAAATTTATTAATA-
129 GTTTC-AGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
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1 TTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AG
* * * * *
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63 TTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT--TTTGTTTTGTCATAAAAC
** * ** * *
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** * * * * * * *
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1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * ** * *
340019 TTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCTGAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAAT
130 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * * * *
340071 TCCCAAAATTAATAAGCAAAATATTTATAAAAATAAATCTATTTATC-AAGGAA-TTTAGATAGT
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * **
340134 TATGAGTATTTAAACAATTATTTTTTTCAAGTCGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAAACAAT
64 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT
* *
340199 TGTTTCCA-TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
128 TGTTT-CAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
340253 TTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAA
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * **
340318 TG-TTCATTTGAACT-ATGATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATT
66 TGACT-ATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** *
340381 GTTGCTA-TTCATATAAAATTATTCAAAACAAAATAATACTAATTTATTAATAT
129 GTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** *
340434 TTCAAAAATTAATAAG--AGAG--TTAAAAACTAAATATGTTT-CTCGAATTAGTTCAAATAATT
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CGAACAAGTTCAAATAGTT
* * ** * *
340494 ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCTTAAAACAATTG
65 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
340558 TTTCTA-TTCATATAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-
130 TTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
340609 TTCTAAAAATTACTAAGTAAGAGGTTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTGAATC-AGTTCAAATAGT
1 TTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGT
* * * * ** *
340673 TAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG
64 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
340720 CTAGTAATAA
Statistics
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TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
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333262 GTACTAATTT
* *
333272 ATTAACATTCAAAAAATTAATTATAAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTATTTATCCAATAAGGTC
1 ATTAACATTCAAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTATTTATCCAATAAGGTC
* * * * *
333337 AAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAA
66 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATAACCTTTTGATTTGCCATAA
* * * * * **
333402 AACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATAGAATAAAATAATACTAATTTATTATTATTTCCT
131 AACAATTGTTTCAGTTAACAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * ** * * *
333467 AAATTATTAAGTAAAATTTTTTAAAATAAAGTTGTTTACTAACTCAGTTAAAATAATTATGGCCA
196 AAATTAATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAAGTTGTTTACTAACTAAATTAAAATAATTATGACCA
** *
333532 TTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTATGA
261 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGA
* **** *
333597 TCATAGAACCTTATTTGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
326 TCATACAACCTTATTAAAATAAAAATAACACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * *
333662 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTAAAAACTATTAGAATAATTTTC
391 AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAATAAAAACCATTAGAATAATTATC
* *
333727 TATTTCTAATCTTTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTAGCTTCATATCCTACAAGCTTA
456 TATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTAGCTTCATATCCTACAAGCTTA
* * * * *
333791 ATTAACATTCAGAAAATTAATAAGCAAA-AGATTTGAAAAATTAAATCTATTTA-CAGAATAAGT
1 ATTAACATTCAAAAAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTATTTATC-CAATAAGG
* * * ** * * *
333854 TTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTCATGACTTTTTGTTTTGCCAT
64 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATAACCTTTTGATTTGCCAT
* * ** * *
333919 AAAACACTTGTTTCAGTTCACAAAAGCTTATCCAAAATAAAGTAATACTAATTTCTTAATATTTC
129 AAAACAATTGTTTCAGTTAACAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
** * * * *
333984 AAAAATTAATAAGCATGAGTTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAAC-AAATTCAAATAGTTACT-
194 AAAAATTAATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAAGTTGTTTACT-AACTAAATTAAAATAATTA-TG
* * * * * *
334047 ACTATTTGAACAATTGTCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTG-TT
257 ACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *
334111 ACAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAACACTAATTTATTAATATT-TGAAAAATTAAT
322 A-AGATCATACAACCTTATT-AAAATAAAAATAACACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAAT
* * * * * ** * *
334174 AATTAAGAAATTTAAAAAGTCAATCTATTTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCATTTCG-G
384 AAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAATAAAAACCA-TTAGAA
* *
334238 TAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTT
448 TAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTT
334274 GCTCATATAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
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ATTAACATTCAAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAAAATAAAATCTATTTATCCAATAAGGTC
AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATAACCTTTTGATTTGCCATAA
AACAATTGTTTCAGTTAACAAAAGCTTAGACAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
AAATTAATAAGCAAAAGTTTAAAAAATAAAGTTGTTTACTAACTAAATTAAAATAATTATGACCA
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTAAGA
TCATACAACCTTATTAAAATAAAAATAACACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
AAATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAATAAAAACCATTAGAATAATTATC
TATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTAGCTTCATATCCTACAAGCTTA
Found at i:335086 original size:357 final size:354
Alignment explanation
Indices: 333819--340719 Score: 3920
Period size: 357 Copynumber: 19.3 Consensus size: 354
333809 AATAAGCAAA
* * *
333819 AGATTTGAAAAATTAAATCTATTTA-CAGAATA-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
1 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCA-AA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * ** * * * * * *
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* * * * * *
333946 TTATCCAAAATAAAGTAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCATGAG-TTTAAAA
127 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * *
334010 AATAAATTTGTTTA-TTGAACAAATTCAAATAGTTACT-ACTATTTGAACAATTGTCTATTTTAA
192 AA-AAATTTGTTTACCT-AACCAATTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * * * *
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254 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TT-TA-TTCATATAAGCTTGTTTAAAATA
* *
334138 AAATAACACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAATTAAG
316 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAG
* * * * * ** * * *
334181 AAATTTAAAAAGTCAATCTATTTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCATTTCG-GTAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAATAATTAT
* * * *
334245 CTATTTCAAATCATTATTACCTTTTG-TTTGCTCATATAACAATTGTTTTTTTATCATACAAGCT
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCT
* * *
334309 TATT-AAGAATAAAATATTACTAACTTT-TTAATCTTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAA
128 TATTCAA-AATAAAATAATATTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* ** * * * * * * * *
334371 AACTAAATTCATTCACCGAACTAGTTTAAATAGTTACGACTATTTGAACAA-T-TGTATATCAAA
191 AA-AAAATTTGTTTACCTAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
334434 TCATTATAACTTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTGTTTCCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
255 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTT--ATTCATATAAGCTTGTTTAAAATAA
* * * *
334499 AATAATACTAATCTAATAGTATTTCAAGAATTAATGATTAAG
317 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAG
* * * * * ** * * * * * *
334541 AGATGTAAAATAT-AATTTTTTTGTTGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATATAAACAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* * *
334605 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTTTTTTTCAATTCATACTAGCTT
66 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * *
334670 ATT-AGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
129 ATTCA-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * *
334734 AACAATTTTGTTTACCTAACCAAATCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAAT
193 AA-AA-TTTGTTTACCTAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * **
334799 CGTTACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAGTTTTTATTCATATAAACATGTTTGGAATAAAAT
256 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA-TTTTTATTCATATAAGCTTGTTTAAAATAAAAT
* * *
334864 AATACTAATCTACTAATATTTCAAAAATGAATAAG
320 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
334899 AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAAACAGTTTAAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAACAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* ** * * * **
334964 TTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTATTATGTTATAAAACAATAATTTCTATTCATACAAG-TAT
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-T
** * * *
335027 ATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
129 ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * ** *
335092 TAAATATGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTCATGGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCAATTC
194 -AAATTTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * * *
335156 ATTTTGACTTTTTCTTCTATAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGATATAAAA
257 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTT-A-TTCATATAAGCTTGTTTAAAATAAAA
* ** *
335221 TAATACAAATTTAAAAATATTTGAAAAATTAATTAGTAAG
319 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAG
* * * * * * *
335261 AGAATTAAAAAA-GAATCTGTTTACCGAATAC-GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTAA
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-A
* * * * * * * *
335324 ACCAGTTCAAAACATAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGGTTT-T-GTCAATGCAAGC
64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTC-ATACAAGC
** * * * *
335387 TTATTTGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAA
127 TTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA
* * * * *
335452 AATAGATCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
191 AAAAAATTTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** ** ** * * ** * *
335516 TTGTTATGACAATTTGTTTTGTTGTAAAACAACTATTTTTATTCAAACAAAATTATTCAAAATAA
255 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA--ATTTTTATTCATATAAGCTTGTTTAAAATAA
*
335581 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAG
317 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** * ** * *
335619 AGA-TTAAAAGCTAAATATGTTT-T-TGAACTAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAAGTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * *
335681 CTATCTCAAATCATTATCATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATGCAAGATTA
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * ** * * *
335745 TTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAA
130 TTCAAAATAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAA
* * * * *
335807 TAAATTTG-----CTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATT
193 AAAATTTGTTTACCT-AACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * **
335867 ATTTTGACCTTTTCATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCACACATGCTTATCCAAAATAAA
257 ATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAAAAATT-TTT-A-TTCATATAAGCTTGTTTAAAATAAA
** * *
335932 ATAATACT-ATTCTAACAACA-TTCAAAATTTTAATAAG
318 ATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAG
* * * ** * * * * * * *
335969 CAAAAAATTAAAAAAAATAAATTTGTTT-TCTGAACAAATTTAAATAGTCAAGTCTATTGGAACA
1 ----AGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * * *
336033 AATATCTATTTAAAATGATTATGGCATTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAA
60 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * * * *
336097 AGCTTA-TGAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATTAAAAAGTTAGAGATTTT
124 AGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* ** * * * * * * *
336161 AAAAATAAATCAGTTTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCA
188 AAAAAAAAATTTGTTTACCTAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * *
336226 AATCATTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAATAGTTGTTT-TTCATTGTATAAGTTTATTTGAAA
253 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTTATTCA---TATAAGCTTGTTTAAAA
*
336290 TAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAAACAGTAGG
314 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT--A-A-TAAG
* * * * *
336334 AGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAACCAATTCAAATA-TATATGACTATTTGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAACAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * *
336398 ATATTTCAAATCATTGTAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACATGCTTA
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * ** * *
336463 TTCAGAATAAAATAATACTAATCTAAAAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA
130 TTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** * *
336527 TAAATTTGTTT-GCTAAACCAATTCAAAT-GATTAAGGCTATAAGGATAATTATCTATGTT-AAA
194 -AAATTTGTTTACCT-AACCAATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAA
* * * * * * **
336589 TCGTTATGACCATTTGTTATGTCTTAAAACAAATGTTTTCCTTCATATAAGTTTG-TTCGAATAA
255 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT-TTTT-ATTCATATAAGCTTGTTTAAAATAA
* * *
336653 AATAATACTAATCTACTAATATGTCAAAAATTAATAAG
317 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * **
336691 AGATTTAAAAAATAAATCTATATATC-AAACGAATTCAAATAGTTATCACTATTCGAGCAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* ** * * ** * * * * *
336755 TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTG-CTATAAAATAATAATTTATGTTCGTACATGCAT
65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * ** *
336819 ATTCAGATTAAAATAATATTCATTCATTAATATTTGGACAA-T--TAA-TAAG-GATTTAAAAAA
129 ATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * *
336879 TAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATTGTCATGACTATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAAT
194 -AAATTTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAAT
* * ** * * * * * **
336942 TATTTTGACCTTTCCTTTTTTGA-AAAAATAATTATTTAGATCATATAAGCTTATTTGATGTAAA
256 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA-AATT-TTTA-TTCATATAAGCTTGTTTAAAATAAA
** *
337006 ATCGTACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGACTAAA
318 ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAAG
* * * * * * * *
337047 AGAATTAAAAAA-AGAATATGTTTACCAAATA-GGTTTAAATAGTTATGATTGTTTAAATAATTA
1 AGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATCAAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * *
337110 TCTATTTCAAAACA-TA--A-C-----TTTT-TCTTAAAACAATTGGTTT-TGTTGATGCAAGCT
64 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCT
* ** * *
337164 TATT-ACAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATGCCAAAAATTATTAAGTAAAAGATTTAAAA
128 TATTCA-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * *
337228 AATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
192 AA-AAATTTGTTTACCTAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * ** * ** * *
337293 -AGTTATAACATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTATTTTTATTCATACAAAATTATTCAAAATAA
256 CA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA--ATTTTTATTCATATAAGCTTGTTTAAAATAA
* *
337357 AATAATACTAATTTATCAATATTTCAAAAATTAATTAG
317 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
337395 AGA-TTAAAAACTAAATATATTTA-CCAAACTAGCTCAAATAGTTATCACTATTTAAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * *
337458 CTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTATCTATTTATGCAAGATTA
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* * * ** * * *
337522 TTCAAAGTTAAAT-ATAGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTTAAAAA
130 TTCAAAATAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAA
* * * * * * * *
337585 TAAATGTATTT-GCTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATT
193 AAAATTTGTTTACCT-AACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * * **
337649 ATTCTAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCACACATGCTTATCCAAAATAAAA
257 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TTT-A-TTCATATAAGCTTGTTTAAAATAAAA
** *
337714 TAATACT-ATTCTAACAACA-TTCAAAAAATTAATAAG
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
337941 TAAAAATAAATCAATTTATCAGTTTA-TTGAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAGTT
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* *
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* * *
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* * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAA-ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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** * * * * * * *
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257 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT-TTTT-ATTCATATAAGCTTGTTTAAAATAAAA
* * *
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* * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* ** * * * * *
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65 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
** * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * *
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* **
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** ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * ** *
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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*** * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * *
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* * * ** *
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* ** * * * * * * * ***
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* * *
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* * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* ** * * * **
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*
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* * * *
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* ** * * **
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* *
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* * * ** * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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** *
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* * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * ** *
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* ***
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* * * **
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* **** * * ** * * * *
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* * * * *
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* ** *** * *
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* * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * ** * * * **
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*** * * * ** * * * * *
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255 TTATATATTTCAAAACATTATGACCTTTTCTTTTCTAATAAAACAATTGTTTTAGTGCATAAAAG
* * * * *
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* * * * * ** ***
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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**** * * * * ** *
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* * ** * * * * ** * ** * *
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** * *
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** * *** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * * * * * *
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* ** * *
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65 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCTA
* * ** * * *
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** * ** * * * * * * *
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* * * ** * * * * * *
343500 ATTATCTATTTCAAATCATTATGATC-TTGGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTATA
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* ** *
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* *** * * ** * *
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* * ** * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * **
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* * *** * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * * ** *** * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * * * * * *
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* *
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* * * *
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1 AATTAATAAGTAAAAGAATTGAAAAAAA-AATACATT-TATT-GAACA-AGTTTAAATAGTTATG
* * * * *
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* * ** *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * * * * * * ** *
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* * * *
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*
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* * ** *
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** * * ** **
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * **
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* ** ** * *
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* * *
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*
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* * * *
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* *
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* * * * ** * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * ****
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* * *
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* * * * * *
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*
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * * * ** * *
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* ** ** ** * * *
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* * * * * *
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* * ** * * **
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* * * * * * * * *
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* * * *
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256 ATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAAT--AATTGTTTT-TATATCATATA
* * * * *
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* * *
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380 TAAAAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* * * *
343873 CAAATTGTTACGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGATATTGTTCATACAAGCTTATTCGAA
444 CAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTGTTCATACAAGATTATTC-AA
* * * *
343938 TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAATAAATAT
507 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGA-TTTAAAAATAAAT-T
* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
344133 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAATATGAATCG-GTTT-CTAGAACA
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* * * * *
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749 AGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGT
* * * *
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344325 TCCAAA
877 T-CAAA
* * * * * * * *
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* **
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* ** * * *
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* *
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* * * * * * *
344586 AAATATTTATGA-CTATTTGAACAAATATCTATCTCAAATTATTAT-GA-TATTTATTTTGTTAT
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* * * * *
344648 AAAACAATTATTTATT-T-TCATACAAGCTTATTCA-AATCAAAATAATACTAATTTAATAATAT
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* * *
344710 TCTAAAATT-TTAGGAGTAAGAT-ATTTAAAAAATAAAT-TGTTTATTGAACTAA-TTCAAATAG
356 TCAAAAATTAATA--AGTAA-ATGATTTAAAAAATAAATATG-TTACTGAAC-AAGTTCAAATAG
** * ** ** * * * *
344771 TTAAAAC--TTAGAACAATTACATATTTCAAATCATTCTGACATTTTGCTTAGTTATAAAATAAT
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* * ** * * *
344834 T-GTTTGACTTCATACAGGCGTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTT-AAAAAAT
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*** ** * * * * * *
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* * * * * * * * * * * *
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** * * * * *
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* * ** * * * * ** * * * *
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* * * * *
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** * * * * * * * * **
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1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* ** * ** * * * * * *
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* ** * * ** *
345352 ATCATTAAAGCTTATTCAGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA
128 -TCATAAAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * *
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** * * * * * * * *
345478 TTATCTATTTCAAATTGTTCTAATCTCTTGTTTGGTCATAAAATATTTG-TTTCATATCTTACAA
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* * * * *
345542 GCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTG
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* * * * *
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253 ATTATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATAT
** * ** * *
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317 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGA-TT
* * * * * * * * *
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380 TAAAAAATAAATA-TGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* ** ** * ** *
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* * *
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* * * *
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629 TGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-T-ATTCATATAAGCTTA-TTTGAAATAAATATACTAAA-T
* ** * *
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690 TAATAATATTTAA-A-AATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA-TGTGTTTA-CAGAACAA
* * * ** * * *
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750 GTTCAATA-GTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * *
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814 ATAAAACAATTGA-TTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTTATTAA-TA
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346976 TTTGAT
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* * * *
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1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATA-ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* *
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64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-
* * * * *
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128 TCATAAAAGCTTATTCAA-ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-AGTAA
* * * * ** * * * ** *
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191 AAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAAT
* * * * * * **
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255 TATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAAG
*
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320 CTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTA-AATGATTTA
* * * * *
347362 AAAAAT--A-A----AC----C-TGTTTAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTCTTTATTTCAA
382 AAAAATAAATATGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
* * * ** * * * *
347415 ATAGTTTTGACCATTTCT-CTTT-TCATAAACCAATT-TGTTCTATTCAAACAAGCTTATTCGGA
447 ATTGTTATGA-CATTT-TGTTTTGTCATAAAATAATTAT-TT-TGTTCATACAAGATTATTC-AA
* * * * * *
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507 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAATT-A
* * * ** * * *
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567 TTTACCAAACTAGTT-CAA-A--TA-GACTATTTGAATAATTATC-TATCTCAAATCGTTATGAT
* * * * * *
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626 C-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAATAT-AC--
* * ** * * * * *
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747 CAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA
** * ** *
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811 GTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
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347870 AATTAAT--G-ACACATTTAAAAACTAA-ATGTCTTTACTGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAATATG--TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * *
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64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-G
* * * * *
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128 -TCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * ** *
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191 AAG-ATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGATCTATTTGAACA
** * ** * * * *
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253 ATTATCTATTTCAAATCATTAT-AAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATAT
* * * **
348180 AAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAACAATTAATAAGTAAAAAATTT
317 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAATGATTT
* * * ** * ** * *
348245 TAAAAGTAAATATGTTTATTGAACTGGATCAAATAGCCATGACTATTTGAAAAATTATATATTTC
381 AAAAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
** * * * * * *
348310 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGTTTTTTCTAAA
445 AAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTT-GTTCATACAAGATTATTC-AAA
* * * * *
348375 TAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGATATTTAAAAAATGAATCTG
508 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAAT-AA-AT-
* ** * ** * * * * * * * * *
348440 TTTGTTGAATAAATTTAAAT-AATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGATATAAC
565 TAT-TT-ACCAAA-CTAGTTCAAATA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
* * * * *
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626 C-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAT-TC-ATATAAGCTTA-TTTGAA-ATAAAT-ATAC
* * * * * **
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685 TAAA-TTAATAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTACAGAA
* * * * *
348629 CAAGTTCAAATCA-TTTTGACTATTCGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT
747 CAAGTTC-AAT-AGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TT
* * * *
348693 TA-TTATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGATTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTTTT
809 TAGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATATTAATTTATT
* * *
348756 ACTATTTTAAC
872 AATA-TTCAAA
* * * * *
348767 AATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAATAAATATGTTTACGAAACAAATTGAAATAATCATGACT
1 AATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
*
348832 ATTTGAATAATTAATC-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCA
63 ATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-
* * * ** * *
348896 ATTCA-AATAAGCTTATTTAAAATAAAATAACACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGT
126 AGTCATAA-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *** *
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189 AA-AAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAAC
* * * * * * * * * *
349021 AATTACCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTAT-TCGTG
252 AATTATCTATTTC-AAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATA
* * *
349084 CAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAGTAAA--AT
316 TAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAATGA-
* * * * * *
349146 TTTAAATAATAAATCTAT-TTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTATCT
378 TTTAAAAAATAAA--TATGTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTT
** * * * * *
349209 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTTTGTTCATA-AAGGCTTA
440 ATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATT-ATTTTGTTCATACAA-GATTA
* *
349272 TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
502 TTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAAT
* *** * * * * * * * *
349337 ATATATATTTATTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTGA
561 AAAT-TATTTACCAAACTAGTTC-AA-A--TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGT
* * * * * * *
349402 TAAGATCTTTTATTTTGTTAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACATGTTTATTCT-AAATAAAAT
620 TATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATT-TGAAAT-AAAT
* * ** * * * *
349465 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCA
681 -ATACTAAATTAATAATATT-T-AAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTA
* * ** * * * * **
349530 -ATGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCAATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCATTAAGATATTT
742 CA-GAACAAG-TTCAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * ** *
349594 TATTTTGTCGTAAAACAATTG-TTTATATTCATACAAAATTATTCATAATAAAATAATAGTAATT
805 TGTTTAGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATT
349658 TATTAATATTTCAAA
868 TATTAATA-TTCAAA
* * * * ** * *
349673 AATTAATAAG---AGATTTAAGAACTAAATTTGTTTATTGAACCAA-TTCAAATATTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAT-AATATGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * **
349734 TTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAATTATTTTTGT
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
* ** * * ** * ** * * * *
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129 CATA-A-AAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * *
349862 GAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTGTCG-AACTAA-TTCAAATAGTT-TAGA-CTATTAGAACA
191 AAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAAC-AAGTTCAAATAGTTAT-GATCTATTTGAACA
* * *
349922 ATTATCTATTTCAAATC-------A---TT-TTAT-TCAT---ACAA--G--CTTAT-TC-----
253 ATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATA
* * ** * *
349962 -G-------A-AATAAAATAATACCAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAATAAGA-AATTT
318 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTT
* ** * *
350017 AAAAAA-AATATTTTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAACTATCTAT
381 AAAAAATAA-A--TATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
*** * * * * * * *
350081 TT-AAATAAATATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAACTATTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCG
442 TTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTT-GTTCATACAAGATTATTCA
* * * * * * *
350144 AA-AAAATAATATTACTTTATTAATATTTCCAAAATTGATAAGTTGAGATTTAAAAAATTAGTCA
506 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA---GAGATTT-AAAAATAAATTA
* * * * * * * * * * * *
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567 -TTTACCAAACTAG-TT-CA-AA-TAGA-CTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
* * * * **
350273 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TCATCCTACAAGCCTATTCAAAATAAAATTATAC-
626 C-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAT--TCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAA-TATACT
* * * * * *
350336 AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAGAATAAATCTATTTACCGAAC
686 AAA-TTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATGAATGTGTTTACAGAAC
* * *
350401 CAGTTTC-A-A-TT-TAA--A--T----AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTA
748 AAG-TTCAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TA
* * * * * ** * *
350454 -TTATAAAAAAATTG-TTTCAGTTTCACATTAAGCTTATTTTGAATAAAAT-ATACTAATTTAAT
811 GTCATAAAACAATTGATTTTA--TTCATA-CAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATT
*
350516 AATTTTTCAAA
872 AA-TATTCAAA
* * * * * * **
350527 AATT-A-AA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCTAAA-TAGTTTAAATAGCTAAAACT
1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAAT-AATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
350588 ATAT-AACAAGTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAA
63 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-A
* * * * * * * *
350652 TTCATACATGCTTATTCAAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAA
127 GTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
** * * * *
350717 GTGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTA-CCAAATCAA-TTCAAATAATTATGA-CTACGTT-AATA
191 AAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTATCGAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATCTA-TTTGAACA
* * * * *
350777 ATTATCTATTTCAAATCATTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGCTTTTGA-AT-AT-
253 ATTATCTATTTCAAATCATTA-TAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTTATATCATA
* * *
350838 TCAAGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GA
316 T-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAA-ATGA
* * * * * * * **
350902 CTTAAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTGTAAA
378 -TTTAAAAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * * * * *
350967 CTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTT-TTATAAAATTATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATT
441 TTTCAAATTGTTATGACATTTTGTT-TTGTCATAAAATAATTA-TTTTGTTCATACAAGATTATT
* * * * * *
351031 CGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAA
504 C-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAG-AGATTTAAAAATAA
* **** * * * * * * *
351096 ATTTTTTTGTTGAACTATTTTAAATATTTAAGATTATATGAATAAATATCTATTTCAAATCATTA
563 A-TTATTTACCAAACTA-GTTCAA-A--T-AGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTA
* * * *
351161 TGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATACT-AGTTTATTTGGAATAACA
622 TGATC--TTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTT--ATTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAA-A
* * * * * *
351224 TAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTTGTTTA
680 TATACT-AAATTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA-TGTGTTTA
** * * * * * * * * *
351288 CCTAACTAGTTCAAATAATTATGATTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTT
742 CAGAACAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * ** * * ** * * *
351353 GTTT-TTCCATAAAAC-ATATGTTTTTGTTTGTATAAGTTTGCTCAAAATAAAGTAATACTAATC
806 GTTTAGT-CATAAAACAAT-TGATTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATT
351416 TATTAATATTTCAAA
868 TATTAATA-TTCAAA
* * * * * * *
351431 AATTAATAAG---AGATTTAAAAAAAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATT
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * * * * * *
351493 TTAGCAATTGTTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTAT--TAGAA-AA-TGATTC--T--
66 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTCA
* * * * * * * *
351550 T----TCTT-TTC----------ATACTAATTTGTTAATATATCAACAATTAATAACTAAAAAAT
131 TAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
* * * * * * *
351600 TTAGAAAAT-AATTATATTTATCG-AACTAGATCAAATAATCATGA-CTATTTGAATAATTATCT
196 TTAAAAAATAAATTA-GTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * *
351662 AATTCAAATCGTTACAATCTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTG-TTTCAGT-TCATATAAACTTA
260 ATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TATCATATAAGCTTA
* * * *
351725 -TTCGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTT-AAAA
324 TTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAA-TGATTTAAAAA
* * * * * * * * *
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*** * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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688 ATTAATAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTACAGAA-CAAG
* * * * * * * * *
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* * * * * *
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815 TAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATT
352296 CCAAA
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* * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAAT-AATAT-GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * *
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** ** * ** ** *
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* * * *
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188 TAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATC-GAAACA-AGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGA
* * * * * *** *
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250 ACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCA
* ** * *
352613 TAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATTAGTAAATGA
314 TATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGA
*** *
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* * * * * *
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441 TTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TATTTTGTTCATACAAGATTATT
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504 C-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA----GAGATTT-AAAAATA
* * * * * * * *
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562 AATT-ATTTACCAAACTAG-TTCAA-A-T-A-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTT
* * * ** **
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621 ATGATC--TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG-TTTTATTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT-
** * * * * *
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681 ATACTAAATTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTA-CA
* * * * *
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744 GAACAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTAT-TTCAAATCATTATGACCTTT-T
* * * * * **
353121 -TTT-GTCTTAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTCATTTAGAGTAAAAT-ATAGCTAAAC
806 GTTTAGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TTAATT
*
353182 TAATAATATTCTAAA
868 TATTAATATTC-AAA
* * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAATATG--TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * *
353260 TATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTTTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTCTTTCA
62 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
**** * * * * * * *
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127 G-TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
353390 AGAA-ATTT-GAAAATAAATTTGTTTATC-CAACAAATTTAAATAGTTATGAT-AATTTGAACAA
190 A-AAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * * * **
353451 TTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAAT-TCATA-A
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTG-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATA
* * * * * * * *
353514 ATGCTGATTCAAAATAAAATTATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTTGAA-GATT
318 A-GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAG-TAAATGATT
* * * * *
353578 TAAAAAATTAATCAAT-TTA-TCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTA
380 TAAAAAATAAAT--ATGTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * * * * **
353640 TTTCAAATTGTTAT-AAACTTTTGTTTTATTATAAAATAATTGTTTT-TCAACATACAAGCCTAT
441 TTTCAAATTGTTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTGT--TCATACAAGATTA-
* *
353703 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATA
502 TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-A---GATTT-AAAAATA
** * * * * * * *
353768 AATATATTTACTGAACTAGTTTAAATAATTACACTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTA
562 AAT-TATTTACCAAACTAG-TT-CA-AA-TAGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTA
* * * ** * * *
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622 TGATCTTT-GTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT-AT
* * * ** * *
353898 A-TTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGA-TTAAAAAACAAATTTATTTACCAA
683 ACTAAAT-TAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTT-----
* *
353961 ACCAATTTATATGAATAATTATCTATTTCAAGTCATAACAATTCTGTTTGCAGAACTATTTCAAA
741 A-C-------A-G-------A---A---CAAGT--T--CAA-T-AG-TT--ATAACTA-TT----
* * * * * *
354026 TAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAAC
770 TGA--A-CA--A--T---T-A-T-T-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC
* * * * * * *
354091 AAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAA
821 AATTGATTTTATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * * * * *
354154 AACTAA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACTAGTTGAATTAGTTATAACTA
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * **
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64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAG
* * ** * * *
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128 TCATAAAAG-CTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
** * * ** * * * * * ** *
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191 AAGATTTAAAAAATAAATTAGT-TTATCGA-AACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
** * * * * * **
354407 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTGTATAA
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAA
* * *
354471 GCTTA-TTCGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG---A-GATTTA
319 GCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAATGATTTA
* *
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382 AAAAATA-AA--TATGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* * * * * * *
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444 CAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTATTT--TGTTCATACAAGATTA-TTC
*** * * * * **** * *
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* * * * *
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567 TTTACCAAACT-AGTTCAAATAGACTA-TTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTT
* ** * * * * ** * *
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* * *
354808 ATGA-A-TT---AA-TAACT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTA-AACAAGTTCA
692 ATAATATTTAAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTAC-AGAACAAGTTC-
* * * * * *
354862 AATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTCA-TCATAA
754 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-AGTCATAA
** * * * * * * * **
354926 AACAATTG-TATAAATTTATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTACTATTTTG
818 AACAATTGAT-TTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCA
354990 AA
880 AA
* * * **
354992 AATTAATTAGTAAGAGATTTTAAAAATGAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
355057 TTTGAACAATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTAT
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AG
* ** * * ** * *
355122 TCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAACAAGTAAA
128 TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* *
355187 A-ATTTAAACAAA-AAATCT-GTTTTAT-G-AACATGTTCAAATATTTATGA-CTATTTGAACAA
192 AGATTTAAA-AAATAAAT-TAG-TTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * * ** * *
355246 TTGTTTATTTCAAATCATTAT-GACATTTT-TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTAT-TCATAAA
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATA
* *
355308 AACTTATTTAGAATAAAA-AATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT
318 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTT
* * * *
355371 AAAAAATAAATCAAT-TTCCT-AAGCAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATTTATT
381 AAAAAATAAAT--ATGTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
** * * *
355434 TCAAATCATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAGCA-AATTGTTTCTATTCATACAAAATTATT
443 TCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAA--ATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATT
* * **
355497 CACAATAAAATAAAAATAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGA--TAAAAACTAAATCT
504 CA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAAT-T
* * * *
355560 ATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTACCTCAAATCGGTATGAT
566 ATTTACCAAACTAG-TTCAA-A--TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
* * * * * *
355625 CTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAACTTATTCGAAGT-AA-A-A-T--AT
626 CTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAATATACTAAAT
** * * * * *
355684 TGCTAA-ATTCTAAAAATTTATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCA-AACCAA-T
690 TAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTT-ACAGAA-CAAGT
** * * * *
355746 TCAAATAGTTA-AGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATCATTGTAACCTTTTGTTTAGTCA
752 TC-AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCA
* * * * * * * **
355810 TGAAATAATTG-TTTTAGTTCAAACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACGTT
815 TAAAACAATTGATTTTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
355874 CAAAAA
878 C--AAA
* * * *
355880 AATTAATAAGCAAAGAATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAA-AATTT-AAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** * *
355945 ATTTGAACAATTATCCACTTAAAATGTTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAT
63 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-
* * * *
356010 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGAA-AAGTT
127 GTCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-AATAAGTA
** * * * * * * * *
356074 GGAGATTTAAAACACATATCAATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATG-GCCATTTGAACAAT
190 AAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAAT
* * * * * *
356137 TATCTATTTCAAACCATTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTT-CATCATACAAG
255 TATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAAG
* * * *
356200 CCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGT--A-G---T---
320 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAA
* * * * * * * * * *
356256 AGAT-TATATGTTTACAGAACCATTTTAAATAATTAAGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAG
384 AAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
** * * * * * *
356320 TCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTATATTCATGCAAGCTTATTCGAAATAA
448 TTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTC-AAATAA
** * *
356385 AATAATACTAAAATAATAATATTAT-GAAAATTAATATCTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTATT
511 AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTT-AAAAATAAA-TTATT
**** * * * * * * * *
356449 TGTTGAACCAATTAAAATGGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAAT-TTTACG-TCAT
569 TACCAAACTAGTTCAAA----T-AGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC--
* * * * *
356512 TTTGTGTTGTCATAAAATAAA-TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT-AGAATAAAATAATATTA
627 TTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTG-TTTTATTCATATAAGCTTATTTGA-AAT-AAAT-ATACTA
* * * *
356575 ATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTA-AATC-
687 AATTAATAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTAC-AGAA-CA
* * * * *
356634 AGTTCAATTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCATAT-ATTTATGACCATTTGTTTTG
749 AGTTCAA-TAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * ** **
356698 TTATAAAACAATT-ATTTCTATTCATGC-AGTCATATTTGAAATAATGTAATGCTAATTTATTAA
812 TCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAG-CTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
356761 TATTCAAA
874 TATTCAAA
* * ** *** * *
356769 AA-AATATAAGTAAGAAATTTAAAAAATGAATCA-ATTGGCTTGACTA-TACAAATAGTTATGAC
1 AATTA-ATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AAT-ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
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356831 TGTTTGAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCACAAAACAATTATTTTT
62 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
* * ** * *
356896 GTCCATACAAGCTTATTCGAAATAAGATAAT-TCTAATTTATTAATATTCCAAAAGTTAATAAAT
127 GT-CATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * *
356960 AAGAGATTTAAAAATTGAATTTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
189 AAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * * * *
357023 TTACCTATTTCAAATCATCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTCTATTCCTATA
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATA-TCATATA
* * * *
357087 AACTTATTTCA-ATTAAAATAAT-CTAAATTTATT-ATCATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGAT
318 AGCTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT-ATTCA-AAAATTAATAAGTAAATGAT
* * * *
357149 TTAAAAAATAAATCTGTTTACAT-AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTCT
379 TTAAAAAATAAATATG-TTAC-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
** * * * * *
357213 TTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATAAGCTTATTCG
442 TTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA-TTTTGTTCATACAAGATTATTC-
* * * * * * *
357278 GATTAAAATAATATTAGTTTATTAATATCCTGATAGCTAA-TAAGT-AGAAGATTTTAAAAATAA
505 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCA-A--AAATTAA-TAAG-AGA-TTTAAAAATAA
* * * * * *
357341 ATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAATAATTATCTATTTCAGATTGTTA
563 AT-TATTTACCAAACTAGTTCAAATAG-----ACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTA
* * * * ** * * **
357406 TGACCTTT-TATTTCATCATAAAACAATTATATAAATTCCTATAGGCTTATTCAAAATAAAATAA
622 TGATCTTTGT-TTT-GTCATAAAAAAATTGT-TTTATTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT-A
* * * * * * * * **
357470 TACTAATTTATTAATA-TT-----CTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAA
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* * * *
357529 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
747 CAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTA
* * * * *
357594 GTCATTAAACAATTG-TTTCTATTTATACAAGCTTATTCTGAATAAAACAATATAAATTTATTAA
811 GTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAA
357658 TATTCCAAA
874 TATT-CAAA
* * * * * * * *
357667 AATTACTAAGTAAGAATTTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTAAGATTA
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * *
357732 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAATCAA-----T---
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG
* * * * * * **
357788 T-ATACAAGCGTATTTAAAATAAAATAATACT-ATTTTTTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAA
128 TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * ** * * **
357851 AGATTT-AAAAATAAATTTGTTTA-CCAAGTAAGTTCAAATAGTTAT-AACCATTCAAACAATTA
192 AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAATTA
* * * * ** * * * *
357913 TTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATATAGCAATTGTTTGTAT-TCACACAAGG
257 TCTATTTCAAATCA-TTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAAGC
* * *
357976 TTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTATTAATATT-ATAACAATTAATAGGTAGGA-GATTTAA
321 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AA-AATTAATAAGTA-AATGATTTAA
* * * * * * *
358039 AAAATAAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCA-ATGAATAATTATCTATTTCAA
383 AAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
** * * *
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447 ATTGTTATGACATT-T-TGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTCA-AA
* * * **
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508 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAAT-TATTTA
* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** *
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*
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* * *
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* * *
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846 TTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-CAAA
* * * *
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1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAATA--TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
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63 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-
* * * * ** * * * *
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** * * * *
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** * * * *
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255 TATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATA--TA
** * * * * * **
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* * * * * *
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382 AAAAATAAA--TATGTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT-T
* * *
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443 TCAA--A-T-TG-TTA--TG-AC-AT--TT-TG--T-TTTGTC-A--T---A-----A--A----
* * * *
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* * * * *
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524 TATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA-AAATAAA-TTATTTACCAAACTAGTTC
* *
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583 AAA----TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
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643 AAAATTGTTT-T-ATTCATATAAGCTTATTTGA--AATAAAT-ATACTAAATTAATAATA-TTTA
* * * * * *
359355 AAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCA-AACTAGTTCAAATAGTTAAAA
702 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTT-ACAGAACAAGTTC-AATAGTTATAA
* * ** * *
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765 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGATT
* * * * * * **
359480 TCATATCTTACAAGTTTATTCAGAATAAAATAAT-TCAAAGTTATTAACATTTGGAA
829 TTAT-TCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATAT-TAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *** * *
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1 AATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
359601 ATTTGAACAATTATTTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGACATAAAAAAATTGTTTCAA
63 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-A
* * * * ** *
359665 TTTATAAAAGCTTA-TCAAGAGTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCA
127 GTCATAAAAGCTTATTCAA-A-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
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190 AAAGATT-TAAAAAATAAA--T---T-AGTTTA--T-CGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTA
* * * * * * *
359792 TTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTAG
245 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-
* * * *
359856 T-TCATACGAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-
309 TATCATA-TAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
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372 AAATGATTTAAAAAATAAATATG-TTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
** * * * * * * *
359978 TTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTCATGCAAA
434 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAG
* * * *
360043 ATTATTCAAAATAAAAAAAAACTGATTTATTAACA-TTCTAAAAATTAATAACTCAGAGATTTGA
498 ATTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A---AGAGATTT--
* * * * * * * *
360107 AAAAATAAATCTTTTTACTAAACAAGTTCAAACAATTATGATTATTTGAACAATTAGCTATTTAA
555 AAAAATAAAT-TATTTACCAAACTAGTTC--A-AA-TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCA
* * * * * * **
360172 AATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAT-ATAAAAGCTTA-TCCAAATA
614 AATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTATTCATATAAGCTTATTTGAAAT-
** * * * **
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677 AAAT-ATACTAAATTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTT
** * * ** * ** *
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740 TAC-AGAACAAGTTC-AATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC
* * **
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802 TTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGATTTT--ATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAA-TAATAT
* * * * *
360422 TACCTTTCGTT-TTGTCATAAAA
863 TA-ATTT-ATTAATAT--TCAAA
** * * * *** * *
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* * * * *
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50 -AA-TAGTTATGACTATTTGAATAAT-TATCTATTT--C-AA--A---T---CA-TTATGACC--
* * ** * * *
360570 TTCAAATAGTTATT-ACTATTTGAACAATTATTT-ATTTCAAATTATTATAACCTTCTATTCTAT
98 TT----TTGTT-TTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCA-GTC--A-TA--A-AAGC-T-TATTC-A-
* *
360633 CATAAAACAATTATTTATTTTCATACAAATTTATTTAGAAAAAATAATACTAATTTAATAATAGT
145 -A-ATAA-AA-TA---A---T-AT--TAATTTA--T--------TAATA-T--TTTAA-AA-A--
* * * * *
360698 TTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCA-TTTGTCGAACCAA-TTCAAATAGAT
180 TT----A---ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-AGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
360761 A-AAACTATATGAACAATTATCTATTGCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
237 ATGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * ** * * ** * * *
360825 -ATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTGTTAATATTTCAAAATTT
302 GTTTTTATATCATATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATT
* * * * * * *
360888 TATAAGGAAGA-GATTTTTAAAAAA-AATTCTAT-TTAC-CAAGCTAGTTCAAATAATTATAACT
365 AATAAGTAA-ATGA--TTTAAAAAATAA--ATATGTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* ** * * * * * *
360949 ATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA
424 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTG
* * * *
361013 TTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTA
488 TTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TA
* ** * *
361077 AGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATGAAA-TCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATC
547 AGAGATTTAAAAA-TAAA-TTATTTACCAAACT-AGTTCAAATA-----GACTATTTGAATAATT
* * * * * * * * * **
361141 ATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTTATGATCAAACAATTGGTTCTATTCATACT-ATT
604 ATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-GTTTTATTCATA-TAAGC
* * * **
361205 TTATTT-AGAATAAAATAATTATGGCCATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCT
666 TTATTTGA-AAT-AAAT-A-TA----C---TAAATTAA-TA-ATATTT-AAA-AATTAAT-AAGT
****** * * ** * * ** * *
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715 AAGAGATT-T-A-AAAAATGAA-TGTGTTT-A-CAGAACAAG-TTCAATAGTTAT-AACT-ATTT
* * * ** **
361328 G-A-ATTTATTAATATTTCAAA-AAGTAAT-AAGTAAGTGATTTA---A-AAAACAAATTTG-TT
771 GAACAATTATT--TATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG-TTTAGTCATAAAAC-AA-TTGATT
* * * * **
361384 TACCAAACTAGTTTGAATAGTTATGAC-TATTTGAATAATTAAAATAATACAAATTTATTAATAT
829 T-------TA--TT-CATA--CAAG-CTTA-TT-CA-AA-TAAAATAATATTAATTTATTAATAT
* *
361448 TTAGAC
877 TCA-AA
** * *
361454 AATTAATAAGTAGATGATTTAAAAAAGAAATATATTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAA-TAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * **
361518 TTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGGTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-
* ** * * * * *
361583 TCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTTTTAATATTTCAACAATTAGTAAGTAAA
128 TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
361648 ATATTTTAAAAATAAA-TATGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAATAATT
192 AGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAATT
* ** * ** * * * * *
361710 ATTTATTTCAAATTGTTAT-GACTTTTTGTTTCATCATAAAACAATT-ATATCAGT-GCATAT-A
256 ATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TATCATATAA
* * * * * *
361771 GCCTCATTTAAAATAAAATAATACTAATTGAATAATATTTCAAAAATTATTGAGTAAGA-GATTT
319 G-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTT
* * * * ** * * * * * *
361835 AGAATATGAATTTGTTTACCAAAGAAGTTCAAATGGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATGTC
381 AAAAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
** * * * * * *
361900 AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCCGAA
445 AAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATT-CAAA
* * * *
361965 GAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAAAATTTAAAAAACAAAATTG
508 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTT-AAAAA-TAAATTA
* ** * * * * *
362029 TTTTCTGAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTCATGAC
567 TTTACCAAAC-TAGTTC-AA-A--TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
* ** * * * **
362093 CTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTA
626 C-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG-TTTTATTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT-ATACTA
* * * * * * * * ** *
362158 ATTTATTGATATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAAAT-AATTTATCA-AGCAA
687 AATTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTA-CAGAACAA
* * * * * * * * *
362221 GTTTAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTGTG
750 G-TTCAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTC
* * * * *
362286 ATAAAATAATTG-TTTCTATTCACACAAGTTTATTAGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATAT
814 ATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
362349 TCTAAA
877 TC-AAA
* * * * * * *
362355 AATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATAT-TTATACTAAACAAG-T----TAGTCATGTCC
1 AATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAAT-AATATGTT-TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *** **
362414 CTTTGAATATTTATCTATTTCAAATTGGTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
63 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG
* * * * * ** *
362479 TTCATGCAAAA--TGATTCAAAACAAAAAAATACTGATACA-TAATATTTTGAAAATTAATAAGA
128 -TCAT--AAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A-A
* * * * * *
362541 GATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCGAAAAATAAATGT-GTTT-GCCAAACCATTTCAAATACTT
187 G---T--AAA--AGA----TTTA---AAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * * **
362604 AAGA-CTGTTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCAGAAAGCAATT
237 ATGATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * * * * * *
362668 -ATTTCAGT-TCGTAGAAGCTTATTCATAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTAAAAAAACT
302 GTTTTTA-TATCATATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATT
* * * *
362731 AATGAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAAT-TCGTTTA-TCGAACAAGTTGAAATAGATT-TGACTA
365 AATAAGTAAATGA-TTTAAAAAATAAATAT-G-TTACT-GAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTA
*** * ** * * *
362793 TTT-ATACAATTATTTATTT-AAAGCCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
425 TTTGA-ACAATTATTTATTTCAAA-TTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-T
* * * ***
362856 ATTCATA-AAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTACCCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
487 GTTCATACAAGA-TTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-T
* * **** * * * * * * *
362920 AAGAGATTAAAAAACTAAAGTTGTTTTTTGAACCAATTCTAATAGTTATAAATATTTCAACAAAT
546 AAGAGATTTAAAAA-TAAA-TTATTTACCAAACTAGTTC-AA-A--TA-GACTATTTGAATAATT
* * * * * * *
362985 AT-TAATCTCAAATTGTTATAATCTTTGTTTTCTCAGAAAATAGTTGTTTT-TGATCATACAAGC
604 ATCT-ATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAT--TCATATAAGC
* ** *
363048 TTA-TTCAAATAAAAATAATACTAGCTTAATAGTATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTT-AA
666 TTATTTGAAAT--AAAT-ATACTAAATTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * * *
363107 AAATAAATGTGTTTGA-TGAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGAATATTAGAATAATTATCTATTTC
727 AAATGAATGTGTTT-ACAGAA-CAAGTTC-AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTC
* * * * * * *
363169 AAATCATTATGATCTTTTATTTAGTCATACAATAATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTTACTCAGA
788 AAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGATTTTA-TTCATACAAGCTTATTCA-A
* * *
363233 ATAAAATAATACTAATTTATTAACATTGAAAA
851 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-CAAA
* * * * * * * *
363265 AATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAGATAAATGTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATAAGTA-AAAATTT-AAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
363330 ATTCGAACAATTATC-AATTCAAAATCATTA-GACCTTTTATTTTGTCGTAAAATAATTATTTTA
63 ATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
* * * *
363393 GTTCATAAATGCTTATCCAAAATAAAATAATA-CAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-
127 G-TCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAA-TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
363456 ---AGATTTAAAAAATAAATCAATTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTAT--TGCCATTTGAACA
189 AAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGAT-CTATTTGAACA
* *
363515 ACTATCTATTTCAAATCATTAT-TACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-A-CATA
253 ATTATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATATCATA
** * * *
363577 CCAGCTTATTT-GAAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTGAAGAATTAATAAG---A-GAT
316 TAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGAT
* * * * *
363637 TTAAAAAATAAATCTAT-TTATTGAACCA-TTACAAATAGTT-TGACTACTTGAATAATTATCTA
379 TTAAAAAATAAA--TATGTTACTGAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * * * *
363699 TTTCAAA-T-TTAT--CA-----------C--AAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTC
441 TTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTC
* * * * *
363747 GAAATAAAATAATGCTAATTTAGTAA-AATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTAAAAAATAAA
505 -AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATAAA
* * * * * * * *
363811 TCCATTTGCCAAGCTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTAT
564 T-TATTTACCAAACTAGTTC-AA-A--T-AGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTAT
* * * * * * * ** *
363876 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTCTGCGAAATAGAATGAAA
623 GATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTA-TTCATATAAGCTTATTTGAAATA-AAT-ATA
* ** * * * *
363941 C-AAATTTATCAATATTTTAAAAATTTGTAAGTAAGA-AGTTTAGAAAAT-AATTCTATTTACCG
684 CTAAATTAAT-AATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATGAA-TGTGTTTACAG
* * * * * *
364003 AACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGT
745 AA-CAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * * * *
364067 TTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAGGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
808 TTAGTCATAAAACAATTGATTTTATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAAATAATATTAATTTATT
* *
364132 AATATTTAGAT
872 AATATTCA-AA
* * * * * * * *
364143 AATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTCTTTACCAAACCATTTCAAATAG-T-TGAGTA
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * * * * *
364206 TTTAAATAATTAACTATTTCAAATTGTTATAAGCTTCTATTTTGTCATCAAACAATTAGTTT-TG
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAG
** ** * * * * **
364270 TTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACCAA
128 -TCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
364335 ACA-AATTAAAAAATAAGTCCA-ATTACCGAACCTA-TTCAAATAGTTAAGA-CTATATGAACAA
191 A-AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
** * * * * * *
364396 CAATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTGT-TCATACAT
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* *
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* * * ** * * * * * * *
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** * * ** * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * ** * * * * * * *
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* * * ** * * * ** *
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* * **** * *
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* * ** * * * * **
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** * * ** * * * *
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64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCA
* * * * *
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* * * * *
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191 AAGATTT-AAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * **** * * * * * * *
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254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TATCATAT
** * * * *
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* * * * * *
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380 TAAAAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* * * * * * * ** * *
365464 TAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTGCAGTTCATACGAGCTTATTCAAA
444 CAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATT-TTGTTCATACAAGATTATTC-AA
* * *
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507 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAA-TAAAT-T
* * * * * * * * ** * *
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566 ATTTACCAAACTAGTTC--A-AA-TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
* * * * * *
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626 CTTTGT-TTTG-TCATAAAAAAATTGTTTTAT-TCATATAAGCTTATTTGA-AAT-AAAT-ATAC
* ** * * *
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685 TAAATTAATAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGT-GTTTA-CAGAA
* * * * * *
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747 CAAG-TTCAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-T
* * * * *
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810 AGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTA
365909 ATATTTCAAA
873 ATA-TTCAAA
* * * * * * *** * * *
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1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * *
365984 TATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTAAA
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT-CA
* ** * * * * * *
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127 GTCATAAAAGCTTATTCA--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
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190 AAAGATTT-AAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* ** * ** *
366176 TTATCTATTTCAAATCGTTA-CGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAGTTTTTGT-TCATATA
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATA
* * * * *
366239 A-ATCTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG---A-GATTT
318 AGCT-TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGATTT
* * * * * *
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381 AAAAAATAAATATGTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
* * * *
366361 AAATTGTTATGAC-TTTTATTATGTTATAAAATAATAATTTCTGTTCATACAAG-TATATTCATA
445 AAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGAT-TATTCA-A
* * ** * *
366424 TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
507 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTT-AAAAATAAAT-T
* * * * * *
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566 ATTTACCAAACTAGTTCAAATAG--A---CTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT
* * * **
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626 CTTTGT-TT-TGTCATAAAAAAATTGTTTTA-TTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT-ATACT
* * * * * * *
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686 AAA-TTAATAATATT-TAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTACAGAAC
* * * * * *
366680 ATGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTATTGATTTCAAAACATAATGACCTTTTGATTT-
748 AAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTA
* * * * * * ** * *
366744 GTTATAAAACAATTGGTTCTGTTGATGCAAGCTTATTTGGAATAAAATGATATAAATTTATT-AT
811 GTCATAAAACAATTGATTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
366808 ATTCCAAA
875 ATT-CAAA
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1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** *
366881 TTTCAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAACTAT-TTTTA
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCA
* ** * * *
366945 TTCA-AACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATGAATATTTCAAAAATTAATAAG--
127 GTCATAA-AAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
** * * * * * *
367007 --AGATTTAAAAGCTAAATCT-GTTT-CCG-AACTAGTTCAAATAGCTA-CAACTATTTGAATAA
190 AAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * * * * * * **
367066 TTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTATGCAA
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAA
* * * * * * * *
367129 GATTATTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAATCTAATAATATTCTAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTT
319 GCTTATTTAGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTTA
* * * * * * *
367192 AAAAATAAATATATTTGCTGAACCAA--TCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTC
382 AAAAATAAATAT-GTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
* * * * * * * * * * *
367255 AAATTATTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCACACATGCTTATCCAAAA
445 AAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTC-AAA
** *
367320 TAAAATAATACT-ATTCTAGCAACA-TTCAAAAAATTAATAAGGAAGAAATTTTAAAAAATAAAT
508 TAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-G-AG--A-TTT-AAAAATAAAT
* * * * * * *
367383 CTATTTACTAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCGATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT-GATTAT
565 -TATTTACCAAACTAGTTCAAATAG---A--CTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCG-TTAT
* * * * *
367447 GGCAT-TTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAGCTTA--TGAAAATAAAATAA
623 -G-ATCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTA-TTCATATAAGCTTATTTG-AAAT-AAAT-A
* *** * * ** * * **
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682 TACTAAATTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTA-CAG
* * ** * * * * *
367573 AATGAA-TTCAAATAATTATTGCCATTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGT
745 AA-CAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * * * * *
367637 TTTGTCATAAAACAGTT--TTTTTTTCATTGTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
808 TTAGTCATAAAACAATTGATTTTATTCA---TACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTT
367700 -TTAATATTTCAAA
869 ATTAATA-TTCAAA
* * * * * *
367713 AATTAA-ACAGTAGGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
1 AATTAATA-AGTA-AAAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
367777 ATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTGTAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT-AT
63 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-
* * * * * * * * *
367841 GTTTATAAATGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTA
127 G-TCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
367906 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-TCTAAACCAGTTCAAATAATTAAG-GCTATATGAATAAT
190 AAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAAT
* * * * * * * * * **
367969 TATCTATTTTAAATCGTTATGACCATTTGTTATGTCGTAAAACAAATGTTTTCCT-TCATATAAG
255 TATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAAG
* * * * * *
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320 CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCAAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAA
* * * * * *
368094 AAATAAATCTATAAATCAAACGAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAA
384 AAATAAATATGTTACT-GAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
* * * *
368158 ATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATAATTTTTGTTCATACAAGCA-TATTCAGATT
447 ATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA-TTTTGTTCATACAAG-ATTATTCA-AAT
* * * ** * * *
368222 AAAATAATATTCAGTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG-GATTTAAAAAATAAATATGTTTAT
509 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT-AAAAATAAAT-TATTTAC
* * * * * * ** * * *
368286 CGAACAAGTTCAAATAGTAATGACAATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTATTTTGACCTTTCT
572 CAAACTAGTTC-AA-A-T-A-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTT-G
* * * * * * ** * *
368351 TTTTTTAATAAAATAATTATTTTAGATCATATAAACTTATTTGATGTAAAATCATACTAATTTAT
631 TTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTA-TTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT-ATACTAAATTAA
* * * * * * * *
368416 TAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAAAGAATCTGTTTACCA-AATAAGTTTAA
693 TAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTA-CAGAACAAG-TTCA
* * * * * * * * * *
368480 ATGGTTATGACTATTTAAACAATTATCTACTTCAAAACATAATTACCTTTTGTTTTGTCTTAAAA
755 ATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA
* * * * * *
368545 AAATTGGTTCTGTTGAT----GCTTATTACAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATGTCAAA
820 CAATTGATTTTATTCATACAAGCTTATT-CAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT-TCAAA
* *
368605 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA-ACCTATTTACCGAACATA-TTCAAATAGTTATGAC
1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAATA--TGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * *
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62 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTC
* * * *
368733 ATTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-
126 AGTCATA-AAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
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189 AAAAGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACA
* * * * ** *
368854 ATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCCATCGTATA
253 ATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATA
* * * *
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318 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTA-AATGATTT
* ** * * *
368980 AAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACTCGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATATATTT
381 AAAAAATAAATATG-TTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* * * * * * * ** * * *
369044 CAAATTGTTCTAACCTTTTATTTAGTAATAAAATAATTGTTTCACTTCATACATGCTTATCCGAA
444 CAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTC--A
* * *
369109 AATAAAATAATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAAT
506 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--AG--ATT-TAAAAATAAAT
* * * * * * *
369173 CTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG
565 -TATTTACCAAACTAGTTCAAATAG---A--CTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATG
** * * * ***
369238 CCCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAGTTCATAAAAGCTTATGCAAAATAAAATAATA
624 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTT-A-TTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT-ATA
* ** * * * ** * ** **
369303 TTACTTTATTAGTATTTCAAAATTTGAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAA
684 CTAAATTAATAATATTT-AAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTACAGAA
* ** * * * * **
369367 TCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGATT
747 -CAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TT
* * * * * * *
369431 TA-TCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCGTATAAGCCTATTCAGAATAAAACAGTACTAATTT-TT
809 TAGTCATAAAACAATTGATTTT-ATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTTATT
369493 AATATTTC-AA
872 AATA-TTCAAA
* * * * * * *
369503 AATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTATAACTA
1 AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * *
369568 TTTAAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATG
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-G
* * * * * * * * * *
369632 TTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTTA
128 -TCATAAAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * * * * *** *
369697 GAGATTTTAAAAATAAATTTCTTT-GCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAG-GCTGCATGAATAATT
191 AAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAATT
* * *** * * * * * * * * *
369760 ATCTATTTTAAATCGTTATGTTCTTCTATTTTGTCATAGAACAAATGTTTTTGT-TCGTTTAAGT
256 ATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAAGC
* * * **
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321 TTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAA
* * * * * *
369883 AAATAAATCTCTTTACTAAACCAA-TTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAA
384 AAATAAATAT-GTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
** * * * * * **
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447 ATTGTTATGACAT--TTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTC-AAA
* * * *
370010 TAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAA-TC
508 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAATAAATTA
* ** * * * *
370073 TGT--CAGCCT-G-T---AT-GAC-AGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCCTTT
567 TTTACCAAACTAGTTCAAATAGACTA-TTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TC-TT
* * * * * * *
370129 TGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCGTACAAGCTTA-TTAAGAATAACATAATTCTAATT
629 TGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGA-AATAA-AT-ATACTAAAT
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370193 TATTAATATTCCAAAATTAATAAGGCAA-ATATTTAAAAACTAAATCTGTTTATTGAACAGGTCC
690 TAATAATATTTAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTACAGAACAAGTTC
* * * * * * * *
370257 AAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAAT-AGGTATAACCTTTTATTTTGTCATA
754 -AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTAGTCATA
** * * * **
370321 AAATGATT--TTTCTATTTATACAAGCTTATTTCGATTAAAATAATAAAAATTTATTAATATT-A
817 AAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCA
370383 AGA
880 A-A
* * *
370386 CAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCTAACATATTTTAACATATGTTA-G
1 -AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACA-AGTTCAA-ATA-GTTATG
** * * * * *
370450 -CTAACATAAATATGTTTACCTAACATATT--AAT-ATT-TGCACAATTAATAAGTAAAAATTTG
60 ACT-ATTTGAATA--ATTATCT---AT-TTCAAATCATTATG-AC-CTT--T-TGT-----TTTG
* * * ** * *
370510 -CA-AAAATAAATATTTTTAGCGAACAAGATCA-AATAATCATGACTATTTGAAT-AATTATCTA
108 TCATAAAA-CAAT-TGTTT------C-AG-TCATAA-AAGC-T---TATTCAAATAAAATA-ATA
* * * * **
370571 TTTAAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAAACTA-TTAATATTCCAAATTTAA
157 -TTAA-TTTAT-TAA---TATTT-TAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAA-A----AAA--TAA
* ** * * *
370634 TGACTAAGAGATTTA-AAAAACGAACTTGTTTATAGAACGAGTTTAAATAATTAAGACTATTT-A
207 --A-T--TAG-TTTATCGAAAC-AA---G-TT-CA-AA-TAG-TT--ATGA-T----CTATTTGA
* * * *
370697 GACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTTCTAT-TC
250 -ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TATATC
* *
370760 ATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TCAAGACAATTAATAAGTAAA
313 ATATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
370823 AGATGTAAAAAATAAATCTGTTTAC-AAACGAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATT
375 TGATTTAAAAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * * *
370887 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAT
439 TATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA-TTTTGTTCATACAAGATTAT
* * * * * *
370952 TTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTATAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAAAT
503 TCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AA--AATTAA-TAAGAGATTT--AAAAAT
* * * * *
371016 AAATACATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGT
561 AAAT-TATTTACCAAACTAG-TTCAA-A-T-A-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGT
* * * * * * *
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620 TATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG-TTTTATTCATATAAGCTTATTTGA-AAT-AAAT
** * * * * * * * * *
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681 -ATACTAAATTAATAATAT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATGAATGTGTTTA-
* * * * * * *
371210 CA-AACAAGTTTAAATAGTCATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
742 CAGAACAAG-TTCAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * *
371274 GTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
806 GTTTAGTCATAAAACAATTGATTTTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTT
**
371338 ATTAATATTTTAA
869 ATTAATATTCAAA
* * * * * *
371351 AATTAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAAATGAATCTATTTACCCAACAAGTGCAAACAGTTATGA
1 AATTAATA-AGTAA-A-AATT-TAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
371415 ATATTTGAAAAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT
61 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT
* ** * *
371480 -TGTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAATAAG
125 CAG-TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * *
371543 TACAA-ATTTAAAAAATAAATCT-GTTATAT-G-AACACGTTCAAATAGTTATGAT-TATTTAAA
188 TAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTT-TATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAA
** * ** * *
371603 CAATTATCTATTTCAAATTGTTGTGACAA-TTTTGTTTT-TCATAAACCAATT-TGTTCTGT-TC
251 CAATTATCTATTTCAAATCATTAT-A-AACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTTTATATC
* * * * * * * * *
371664 AAACAAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTGTTAATACTCCAAAATTAATAATTAAAAGA
313 ATATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAATGA
** * * *
371729 TTTAAAAAATAAATTTAT-TTACTGAATGAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTACTTA
378 TTTAAAAAATAAA--TATGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * ** * * * * * * **
371793 TTTCAAGTCGTTATGGTATTATGTTTTGTCCTTAAATAACTGTTTCTATTCATAC-ATTTTATTC
441 TTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTC
* * ** * *
371857 AGAATAAAATAACATTAATTTATTGTTA-TTCTAAAAATTAACAAGTTGAAGATTTAAAAAATTA
505 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA---G-AGATTT-AAAAATAA
* * * * * * * * *
371921 ATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACT-ATTCTTTTATTTTAAATTGT
563 AT-TATTTACCAAACTAGTTCAAATAG--A---CTATTTGAA-TAATT-ATCTATCTCAAATCGT
* * * ** *
371985 TATGA-CATTATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTATTCGAAATAAAAT
620 TATGATC-TT-TGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT
* * * * * * * * *
372049 AATGCTAATTTATTACA-ATTTCAAAAATTAAT--G--ACACATTTAAAAATTAAATCTCTTTAC
681 -ATACTAAATTAATA-ATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTAC
* ** * * * * * *
372109 CGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTAAAATCATTACGA-TTTTAT
743 AGAACAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTT-T
* * * * * * * * *
372173 TTTTTGTCCTAAAACATTTG-TTTATATTCATACAAGCATATTCATAGTAGAATATTATTAAATT
806 GTTTAGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTT
*
372237 ATTAATATTTTAAA
869 ATTAATA-TTCAAA
** * ** * * * * * *
372251 AATTAATAAGTAAGCATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAGTGCAGATAGTTAAGACAAT
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** * * ** * * * * * **
372316 AAGAACAATTATGTATTTTGAATC-TTCTCG-TCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTTTGT
65 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-
* * * * *
372379 TCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATACTACTAATTTATTAATA-CTTAAACAATTAATAAGTAA
128 TCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAA-AATTAATAAGTAA
* * * * ** ** *
372443 AAAATTTTAAAAATAAA-TATGTTTA-CTG-AACTAGATCAAATAGCCATGA-CTATACGAAAAA
191 AAGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTATC-GAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * * * *
372504 TTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTG-CTTCAGT-TCATAT
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TATCATAT
* * * * *
372566 AAG-TTCTTTTGAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTGATAA-TAAA-GATA
317 AAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAATG--A
* ** * * * * * * *
372628 TTTAAAAAATGAATCTAT-TTGTTGAATAAATTTAAATAATTCTAACTATTTGAACAATTATCTA
378 TTTAAAAAAT-AA-ATATGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
* * * * * *
372692 TTTGAAATTGATATAACCA-TTTGTTTTGTCATAAAATAA-TATTTTTCTATCTATAAAAGCTTA
441 TTTCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA-TTTTGT-TC-ATACAAGATTA
** *
372755 TTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
502 -TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG----AGATTTAAAAA
*** * * * * * *
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560 TAAAT-TATTTACCAAACTAGTTC-AA--A-TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCG
* * * * * * * *
372883 TTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCGAATTAAAAT
619 TTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGAAAT-AAAT
* * * * * * * *
372948 AATATTAATTTATTAATATTGTAACAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-
681 -ATACTAAATTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATGAATGTGTTTAC
* * * * * * *
373012 TGAAACAAGTTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTAATTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
743 AG-AACAAGTT-CAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * * * * **
373077 GTTTTGTAATAAAATAATTG-TTTCAATTCAAATAAACTTATTTGAAATAAAATAATACCAATTT
806 GTTTAGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTT
* **
373141 TTTAATATTTTGAA
869 ATTAATA-TTCAAA
* * * * * * * *
373155 AATTAATGAGTAAGAAAATTAAAAAATGAATCTATTCATCGAACATA-TTCAAATAATTATGACT
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACT
*** * * * * *
373219 ATCCAAATAATTACCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCT
63 ATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-
* ** * * *
373283 ATTCATGCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
126 AGTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
373348 AAA-ATTTAAAAAGTAAATCTATTTTAT-GAATAC-A-TTCAAACAGTTATGA-CCATTTCAATA
190 AAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA-ACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACA
** * *
373408 ATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAACCAACTGTTTTTGT-TCATA-
253 ATTATCTATTTCAAATCATTATAAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATAT
* * * * *
373470 AAGGCTAATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
317 AA-GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAATGATT
* * * *
373535 TAAAAAATAAATCTAT-TTATTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATT
380 TAAAAAATAAA--TATGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
* * * * * * * * * * *
373599 TCAAATCGATAAGATC-TTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATAGATGTTTATTCT
443 TCAAATTGTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTATTC-
*
373663 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAA
505 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAAAATTAATAA----GAGATTT-AAAAATAA
* *** * * * * *
373728 ATCTATTCAATGAACAAGTTGAAATAGTCATGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTTAAATCGTT
563 AT-TATTTACCAAACTAGTTCAAATAG--A---CTATTTGAA-TAATTATCTATCTCAAATCGTT
* * * * ** * * ** *
373792 AAGATATTTTATTTTTTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTA-TTCATAATAAAATA
621 ATGAT-CTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGA-AAT-AAAT-
* * * * * * **
373856 ATAATAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATTG
681 ATACTAAATTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTACAG
* * * * ** ** *
373917 AGCCAA-TTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTAGCTACCTCAAATCATTATGATC-TTTGT
745 A-ACAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-
* * * ** * * ** *
373980 TTTA-TCATAAAATAATT-ATTTTTGTTGATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTA
807 TTTAGTCATAAAACAATTGA-TTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTA
**
374043 AGAATATTCTAAA
870 TTAATATTC-AAA
* * ** * *
374056 AATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGTT-TAGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTA
* * * *
374117 TTAGAATAATTATCTATTTGAAATC------A----TT-TTAT-TCAT---ACAA-T-CTT-A-T
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
* * * * *
374163 --T-----C--A---AAATAATATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAATAAGAA
129 CATAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AA
* * * * * *
374216 -ATTTTAAAAAATAAACTT-GTTTACCG-AACAAGTTTAAACAGTTA-CAACTATTTGAACAACT
193 GA-TTTAAAAAATAAA-TTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAATT
* * * * * * * *** * *
374277 ATTTATTTAAAATAAATATAACCTTTTGTTTTATCAT-AAACAA-CAATTTTAGATCATAAAAGC
256 ATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAAGC
** * * * * **
374340 TTATCCAAAAT-AAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTGA-GATTTAAAA
321 TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAAA
* * *** * * * * **
374403 AATAAGTCA-GTTTATCT-TATTGGTTCAAATAATTATGGCTATTAGAATAATTATCCATTTCAA
385 AATAAAT-ATG-TTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAA
* * * * **
374466 ATTGTTAT-AAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TCATCCTGCAAGCCTATTCAAAA
447 ATTGTTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTGT--TCATACAAGATTATTC-AAA
*
374529 TAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT
508 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT--AAAAATAAAT-T
* * * * * * * *
374594 ATTTACCAAACCAGTT----T---CAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTT-
566 ATTTACCAAACTAGTTCAAATAGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTG
* * * * * *
374651 TATTCTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTCACATAAGCTTATTTTG-AATAAAATATACTAATTT
631 T-TT-TGTCATAAAAAAATTGTTTTA-TTCATATAAGCTTA-TTTGAAAT-AAATATACTAAATT
* * * * *
374715 AATAAATTTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCA-AA-ATAGTT
691 AAT-AATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTT-ACAGAACA-AGTT
* * * * **
374774 CAAATAGCTA-AGACTATATAAACAATTATATATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCA-TCA
753 C-AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-AGTCA
* * * *
374837 TAAAACAATTG-TTTCAATTCATAGATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
815 TAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-T
374901 TCAAA
877 TCAAA
* * ** * *
374906 AAATAATAACTAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACC--A-AA--TC----AG-T-T--C-A
1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
374957 ----AATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGCTTT-TG
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAG
* ** ** * * * * *
375017 AACATTCAAGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAA
128 -TCATAAAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
375082 GAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCG-AACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAAT
191 AAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAAT
* ** * ** * * * * * *
375144 TGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTCTTTTATAAAATTATTATTTTTGT-TCATATAA
255 TATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTT-TGTCATAAAATAATTGTTTTTATATCATATAA
* * * * * *
375207 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGA-AAATTA
319 GCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTTA
* ** ** * * * * * * * **
375271 AAAAATAAATTTGTTTGTTGAATTATTTTAAATATTTAAGACAATATGAATAAACATTTATTTCA
382 AAAAATAAATATG-TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA
* * * * **
375336 AATCGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTT-TTTTCAATTCATACTAGTTTATTTGG
446 AATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAA--TTATTTT--GTTCATACAAGATTA-TTCA
* * *
375399 AATAACATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATT
506 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAAT
* * * * *
375463 CTTTTTACCTAA-TCAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
565 -TATTTACCAAACT-AG-TT-CA-AA-TA-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTAT
* * * * * * * **
375527 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAGA-TGTTTTTGTTTGA-ATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAA
623 GATC-TTTGTTTTGTCATAAA-AAAATTG-TTTT-ATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAA-T-A
* * * *
375590 TACT-AATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAA--AATCTATTTGTCA
682 TACTAAAT-TAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTT-ACA
* * ** * * * *
375647 -AACTAGTTCAAATAATTACGACTATTTTAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGT
744 GAACAAGTTC-AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
* * ** * *
375711 TCTA-TTAGAAAATGATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTA
808 T-TAGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTA
* *
375774 TTAATATATCGAC
870 TTAATAT-TCAAA
* * * * * * * * *
375787 AATTAATAACTAAAAAATTTAGAAAATAAATATATTTATCGAACTAGATCAAATAATCATGACTA
1 AATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * * * * *
375852 TTTGAATAATTATCTATTTTATATCGTTACAATCTTTTGTATTGTAATAAAAGAATTGTTTTAGT
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-
* * * * **
375917 TCATATAAA-CTTAATCAGAATAAAATAATACTAATGTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAA
128 TCATA-AAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
375980 AGAGATTT-AAAAATGAATCT-CTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATGA-CTATTTGAACAA
191 A-AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * * * ** * *
376041 TTATCTATTT-GAATCACTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAT-ATAATTTTCAGT-TCATACA
254 TTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TATCATATA
* * *
376103 ATCTT-TTGTCA-AATAAAATAATA-TAATTTTATTACTATT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGA
318 AGCTTATT-T-AGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAATGA
* *
376164 TTTAAAAAATAAA-ACTGTTTA-TCGAACAAGTTTAAATCA-TTATGACTATTTGAATAATTATT
378 TTTAAAAAATAAATA-TG-TTACT-GAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * * * * *
376226 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTGTTGTTAGAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTAT
439 TATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACAAGATTAT
* * * ** *
376291 TCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
503 TC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTT-AAAAATA
* ** * * * **
376356 AATATGTTTAATAAGCAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATT
562 AAT-TATTTACCAAACTAGTTC-AA-A-T-A-GACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTT
* * * * * *
376421 ATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTT-AAAGTAAAATA
621 ATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TATTCATATAAGCTTATTTGAAA-T-AAATA
* * * * * * * *
376485 GTGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATCAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTG-TTATC-
682 -TACTAAATTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTTA-CA
* * * ** * ** * ** * *
376548 GAATAAGTTTAAAAAGTTATGGCTATTTGAATAATTAACTGTCACAAAACATTATGACATTTTGT
744 GAACAAG-TTCAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-
* * * * * *
376613 TTTA-TCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCAAACAAAA-AAT-TTAAATTTC
807 TTTAGTCATAAAACAATTGATTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATT-AATTTA
376675 TTAATAATTCAAA
870 TTAAT-ATTCAAA
* * * * * ** * *
376688 AATTAATTAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACATA-TTCAAATAGTTATAACAA
1 AATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
376752 TTTGAACAATAATCTATTTGAAATCTTTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTA
64 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-A
* * * * * * *
376816 TTCATAAAAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTTATAAGTAA
127 GTCATAAAAGCTTATTCA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* *** * *
376881 AAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTA-CTG-AGTGAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTAAATAA
191 AAGATTTAAAAAATAAATTAG-TTTATC-GAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAA
* * * * * * *
376942 TTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCACAAAA-CATATGTTTCTAT-TCATAC
254 TTATCTATTTCAAATCA-TTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT-TGTTTTTATATCATAT
* * * **
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317 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAG-TAAATGATT
** * ** * * * * *
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380 TAAAAAATAAATATG-TTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
* * * * * * *
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443 TCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTGTTCATACAAGATTATT-CA
* *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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690 TAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATGTGTTT-ACAGAA-CAAGT
** * * *
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* * * * * * * *
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377579 AAAA
879 -AAA
* ** *
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1 AATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-
* * * *
377647 ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAACAACTGTTTCA
63 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
* * * * * ** * *
377712 TTCATAAATG-TTGATTCAAAATAAAATAATAGTACTTTATTAATATTTCAAATTTTGAAAAATT
127 GTCATAAAAGCTT-ATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-AATAAGT
* * * * * *
377776 GAAAA-TTTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATG-GCCATTTGAACA
189 -AAAAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACA
** * * * * * *
377838 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTCA-A-CATAC
253 ATTATCTATTTCAAATCATTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATATCATAT
* * * * **
377901 AAGCCTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGGTGATTT
317 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAATGATTT
* * * * * *
377966 AAAAAATAAATATATTTACCGAACCAGTTTAAATAGTTA-AACTATTTGAACAATTATATATTTC
381 AAAAAATAAATAT-GTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
*** * * * * * * * *
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445 AAATTGTTATGACATTTT-GTTTTGTCATAAAATAATTATT-TTGTTCATACAAGATTATTC-AA
* * * *
378095 ATAAAATAATATTAATCTAATAATA-TTAAGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
507 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAAA-T
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TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTCA
TAAAAGCTTATTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
TTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAAACAAGTTCAAATAGTTATGATCTATTTGAACAATTATCTA
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TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAAA
TATGTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
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ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATTATTTACCAAACTAGTTCAAA
TAGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGT
TTTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAATATACTAAATTAATAATATTTAAAAATTAATAAGTA
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TTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGATTTTATTCATACAAGCTTA
TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCAAA
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*
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1 AAAAATTTTAAAAAACAAATTTGTTT
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Statistics
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AAAAATTTTAAAAAACAAATTTGTTT
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344331 ACTTAATAAG
* * * * *
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* * * *
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* *
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* * * *
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*
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**
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344717 TTTTAGGAGT
Statistics
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AAATTTGTT
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345364 TATTCAGTTA
* * * *
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* * * * * *
345439 TTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAAACTAATAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAATCT
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* * * * * * * *
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* *
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** * * *
345619 GTCTACCAAA-CAACCTAAAATAGTTATTACTACCT-GAATAATTATTTATTTAAAATTGTTCTG
63 GTCTACCAAACCAA-CTAAAATAGTTAAAACTA-ATAGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTCTA
*
345682 ACCTTTTGCTTTGACATAAAACAATTGGTTCAGTTCATAAAAAGCATATCCAAAAT
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* * *
345738 AAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATATG
* ** * * ** * *** * * * * ** *
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64 TCTA-CCAAACCAACTAAAATAGTTAAAACTAATAGAATAATTATCTATTTAAAATTGTTCT-AA
* * * * * *
345866 -CTTTTG-TTCT-ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAATTG--TATTCGAAAT
127 CCTCTTGCTT-TGA-CATAAAACAATTGGTTCAGTTCATAAAA-AGCATATCCAAAAT
* * * *
345919 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATATGT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATATGT
345984 TTATCGAATC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTGCTTTGACATAAAACAATTGGTTCAGTTCATAAAAAGCATATCCAAAAT
Found at i:345987 original size:181 final size:180
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345364 TATTCAGTTA
* * *
345374 AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATGTG
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* * * * ** * ** * * * ** *
345438 TTT-GCCAAACCAATTCAAATAGTTAAAACTAAT-AGAATAATTATCTATTTCAAATTGTT-CTA
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* * * * * * *
345500 ATCTCTTGTTTGGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAA-GCTTATTCAAAAT
129 A-CTATTGTTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAAT-TCATAAAATG--TATTCGAAAT
* * * * *
345555 AAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATAT
1 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATAT
* * ** * * ** * * * * ** ** *
345619 GTCTA-CCAAACAACCTAAAATAGTTATTACTACCTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTT-CTG
65 GTTTATCGAAA-AAATTCAAATAATTACGACCATCTCAACAATTATCAATTTAAAATCCTTAAT-
* * * * * * *
345682 ACCTTTTGCTTT-GACATAAAACAATTGGTTCAGTTCATAAAAAGCATATCCAAAAT
128 AACTATTG-TTTAG-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAATG--TATTCGAAAT
* * *
345738 AAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCC-AAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATAT
* * * * * * * *
345801 GTTTATTGAAAAAATTCTAATACTTATGGCTA-CTCGAACAATTGTCTATTTAAAATCCTT-ATG
65 GTTTATCGAAAAAATTCAAATAATTACGACCATCTC-AACAATTATCAATTTAAAATCCTTAAT-
* *
345864 AACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAATTGTATTCGAAAT
128 AACTATTGTT-TAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAA-TGTATTCGAAAT
* * *
345919 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTT-AAAAAGTGAATATG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATG
** * * * * *
345983 TTTATCGAATCAGTTCAAATAATTACGACCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTAATACC
66 TTTATCGAAAAAATTCAAATAATTACGACCATCTCAACAATTATCAATTTAAAATCCTTAATAAC
* * * * * *
346048 TATTGTTTGGAATAAAATAATTTTTTCAATTCATACCAA-GTTACTCGAAAT
131 TATTGTTTAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AAATG-TATTCGAAAT
* * * *
346099 AAAATAAAATTAATTTATCAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
346148 CAGAAAATAA
Statistics
Matches: 478, Mismatches: 94, Indels: 43
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
179 1 0.00
180 82 0.17
181 155 0.32
182 180 0.38
183 55 0.12
184 5 0.01
ACGTcount: A:0.44, C:0.12, G:0.08, T:0.36
Consensus pattern (180 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATATG
TTTATCGAAAAAATTCAAATAATTACGACCATCTCAACAATTATCAATTTAAAATCCTTAATAAC
TATTGTTTAGCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAATGTATTCGAAAT
Found at i:346115 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 345879--346235 Score: 436
Period size: 180 Copynumber: 2.0 Consensus size: 180
345869 TTGTTCTATC
* * * *
345879 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAATTGTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGTGTACTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATCAATATT
* * * * *
345944 CCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTA-AAAAGTGAA-TATGTTTATCGAA-TCAGTTCAAATAAT
66 CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAGAAAA-T-AATTATATTTACCGAACT-AGTTCAAAAAAT
346006 TACGACCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTAAT-ACCTATTGTTTGGA
128 TACGACCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTT-ATGACCTATTGTTTGGA
* * * *
346059 ATAAAATAATTTTTTCAATTCATACCAAGT-TACTCGAAATAAAATAAAATTAATTTATCAATAT
1 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-AAAGTGTACTCGAAATAAAATAAAACTAATTTATCAATAT
* * * *
346123 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAGAAAATAATTCTATTTACCTAACTAGTTTAAAAAATTA
65 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAGAAAATAATTATATTTACCGAACTAGTTCAAAAAATTA
* * * * *
346188 TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
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CCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTCAGAAAATAATTATATTTACCGAACTAGTTCAAAAAATTAC
GACCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACCTATTGTTTGGA
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346423 AATAGTTTCT
* * ** *** * *
346433 GTTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTA
1 GTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAACTATTAATATTACAAAAATTAATAACTA
* * * * *
346498 AAAAGTTTCAAAAATAAATATTTTTAGTGAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTA
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*
346563 TCTATTTAA
131 CCTATTTAA
*
346572 GTTCATATAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAAACTATTAATATTACAAAAATTAATGACT-
1 GTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAACTATTAATATTACAAAAATTAATAACTA
* * * * *
346635 AAGAGATTT-AAAAACTGAAT-TTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTAAGACTATTTAAACAA
66 AAAAG-TTTCAAAAA-TAAATATT-TTTACTGAACAAGATCAAATAATCAAGACTATTTAAACAA
346698 TTACCTATTT
128 TTACCTATTT
346708 GAAATCACTA
Statistics
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GTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAACTATTAATATTACAAAAATTAATAACTA
AAAAGTTTCAAAAATAAATATTTTTACTGAACAAGATCAAATAATCAAGACTATTTAAACAATTA
CCTATTTAA
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346562 ATCTATTTAA
* * * ** ** * *
346572 GTTCATATAAGCTTATTGA-AATAAAATAATACTAAACTATTAATATTACAAAAATTAATGACTA
1 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
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* * * **
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130 TCTATTTCAAATCA-T-TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
**
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1 G-TTCATACAAGCT-TTTTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAAT
* * * * *
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* ** * * * *
346871 ACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTT
123 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
346929 GTTCATATAAGCTTTTTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGATAATTAATAAGTA
1 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * *
346994 AAATATTTTAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
66 AAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
347059 CTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCA
131 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
347109 GTTCATATAAGCTTATTT-A-ATATAAAAT-ATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA-AGT
1 GTTCATACAAGCTT-TTTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-A
* * * ** * * * * * *
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63 GTAAAAG-ATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACA
*
347235 ATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT-T
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* * *
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1 GTTCATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* ** * * *
347352 TACAA-ATTT---AA-AAA---A--TA---AACCTGTTTAAATAGTTATGATTATTTAAACAATT
64 TAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
347404 CTTTATTTCAAAT-AGTTTTGACCATTTCTCTTT-TCATAAACCAATT-TGTTCT
129 ATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT
* * * * * * * ** *
347456 ATTCAAACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAACTTGTTAATA-CTCCAAAATTAATAATTA
1 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
347520 AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACCAAACCAGTTAAAATAGTTATGACAATTTGAGCAATT
66 AAAGATTT-AAAAATAAATCT-ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** * *
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129 ATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * ** * *
347636 ATTCATACAAG-TTTATTCAGAATAAAATAACATTAATTTATTGTTATTCTAAAAATTAACAAGT
1 GTTCATACAAGCTTT-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-
* * * * * *
347700 TGAAA-ATTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTAT
64 TAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** * *
347764 TATTTATTTTAAATTGTTATGACATTATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
128 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * * * *
347817 ATTCATACAAAATTATTTGA-AATAAAATAATGCTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAAT--G-
1 GTTCATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * **
347878 -ACACATTTAAAAACTAAATGTCTTTACTGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
65 AAAAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
347942 ATCTATCTAAAATTATTACGATCTATT-TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTAT
129 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
347993 GTTCATACAAGCTTATTC-GAAGTAAAATATTATTAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGT
1 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * ** *
348057 --AAGCATTTAAAAAATAGATGTGTTTACCGAACCAA-TGCAAATAGTTGA-GACTATAAGAATA
65 AAAAG-ATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACA
** * *** * * * *
348118 ATTATCTATTTTGAATC-TTCTGGTATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTTT
126 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* *
348172 GTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAACAATTAATAAGT
1 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA-AATTAATAAGT
* * * * ** ** * ** *
348236 AAAAAATTTTAAAAGTAAATATGTTTATTGAACTGGATCAAATAGCCATGACTATTTGAAAAATT
65 AAAAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *
348301 ATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT-T
129 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * ** *
348352 AGTTCATATAAGTTTTTTCTA-AATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAT
1 -GTTCATACAAGCTTTTTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * * *** * * * * *
348416 TAAGATATTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAATAAATTTAAATAATTATGATTATTTGAACAAT
64 TAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
348481 TATCTATTTGAAATTGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATAT-TTTCT
128 TATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCT
* * * **
348534 G-TCTATACAATCTTATTT-TGAACAAAATAATAAAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATA
1 GTTC-ATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATA
* ** * * *
348595 AGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATCA-TTTTGACTATTCGAATA
62 AGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACA
* * * *
348659 ATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCT
126 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
348714 GTTCATACAAGATTATTCA-AATTAAAATAATATTAATTTTTTACTATTTTAACAATTAATAAGT
1 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
348778 AAAATATTTAAAAAAATAAATATGTTTA-CGAAACAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAA
65 AAAAGATTT--AAAAATAAATCTATTTACCG-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *
348842 TTAATC-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCA
127 TT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * *
348896 ATTCAAATAAGCTTATTT-AAAATAAAATAACACCAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGT
1 GTTCATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *** *
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65 AA-AAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
349025 ACCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCT
129 ATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
349077 ATTCGTGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAG
1 GTTCATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * ** * *
349140 TAAAA-TTTTAAATAATAAATCTATTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAA
64 TAAAAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
349203 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTTT
127 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCT
* * * *
349257 GTTCATA-AAGGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGT
1 GTTCATACAA-GCTTTTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * ** * *
349321 AAAAGATTTAAAAAATATATATATTTATTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATT
65 AAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
349386 ATTTATTTCAAATTGA-TAAGATCTTTTATTTTGTTAT-AAACAATTGTTTCT
129 ATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * *
349437 ATTCATACATG-TTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTTAATA
1 GTTCATACAAGCTTT-TTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAAA-TTAATA
*** * ** * * * * *
349500 AGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCAATGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCAATTTGAACT
62 AGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * *
349565 ATTATCTATTTCAAATCATTAAGATATTTTATTTTGTCGTAAAACAATTGTTTAT
126 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * * * *
349620 ATTCATACAAAATTATTCATAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--
1 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * *
349683 --AGATTTAAGAACTAAATTTGTTTATTGAACCAA-TTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATT
66 AAAGATTTAA-AAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
349745 ATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAATTATTTTT
129 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * ** * * * *
349796 GTTTAGACAAGCTTATTT-GGAGTAAAATATTGCTAAATTAAGAATATTCTAGAAATTAATAGGC
1 GTTCATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * ** *
349860 AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAA-TTCAAATAGTT-TAGACTATTAGAACAA
65 AAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAA
349923 TTATCTATTTCAAATCATT
127 TTATCTATTTCAAATCATT
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Statistics
Matches: 2520, Mismatches: 526, Indels: 291
0.76 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
164 1 0.00
165 6 0.00
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170 2 0.00
171 2 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
GTTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
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CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
Found at i:347275 original size:361 final size:360
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Indices: 346800--349809 Score: 2140
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346800 AATTAATGAAGTAAAAGATTTAAAAAATAACTTTGTTTACCAAACAAGTTCAAA-ACATTATGAC
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* * ** * * * *
346864 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTT
64 TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
346929 GTTCATATAAGCTTTTTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTGATAATTAATAAGTA
129 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA
*
346994 AAATATTTTAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
194 AAATATTTTAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
* *
347059 CTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA
259 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA
**
347124 TTTAATATAAAAT-ATACTAATTTATTAATATTTTGAA
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* * * * * * *
347161 AATTAA-AGTGTAAGAGAATTAAAAAAAAAATCTGCTTACCT-AACAAGTTCAAACAGTTTTTAA
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* *
347224 ATATTTGAAAAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT
63 CTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT
* * * *
347289 -TCTTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTAAAAAATTAATAA
127 CTGTTCATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
* * * * * * *
347351 GTACAA-A-TTTAAAA-A-ATA-A---A-C---C-TGTTTAAATAGTTATGATTATTTAAACAAT
191 GTAAAATATTTTAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * *
347403 TCTTTATTTCAAAT-AGTTTTGACCATTTCTCTTT-TCATAAACCAATT-TGTTCTA-TTCAAAC
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** * * * *
347464 AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAACTTGTTAATA-CTCCAA
317 AAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * ** * * *
347508 AATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACCAAACCAGTTAAAATAGTTATGACA
1 AATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTG-TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * ** * *
347572 ATTTGAGCAATTA-CTTATTTCAAGTCGTTATGGTCTTTTGTTTTGTCCTCAAACAATTGTTTCT
65 ATTTGAAAAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * *
347636 ATTCATACAAG-TTTATTCAGAATAAAATAACATTAATTTATTGTTATTCTAAAAATTAACAAGT
129 GTTCATACAAGCTTT-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-
* * * * * *
347700 TGAAA-A-TTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACT-
192 TAAAATATTTTAAAATA-T-ATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-TA
* * ** * * *
347762 ATTATTTATTTTAAATTGTTATGACATTATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
254 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACA
** * *
347826 AAATTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTACTATTTCAAA
318 AGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * **
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1 AATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * * *
347931 TTTGAACAATTATCTATCTAAAATTATTACGATCTATT-TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTATGT
66 TTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* * * *
347995 TCATACAAGCTTATTC-GAAGTAAAATATTATTAAATTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
131 TCATACAAGCTTTTTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * * * * **
348059 GCAT-TTAAAAAATAGATGTGTTTACCGAACCAA-TGCAAATAGTTGA-GACTATAAGAATAATT
195 -AATATTTTAAAATATATATATTTACC-AAACAAGTTCAAATAG-TCATGACTATTTGAATAATT
** * *** * * **
348121 ATCTATTTTGAATC-TTCTGGTATTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
257 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT
* *
348185 TATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAA
322 TATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * ** * **
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1 -AATTAATAAGTAAAAGAA-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* *
348288 TATTTGAAAAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT-T
64 TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * ** *
348352 AGTTCATATAAGTTTTTTCTA-AATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAT
129 -GTTCATACAAGCTTTTTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * * **** * * * * * * *
348416 TAAGATA-TTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAATAAATTTAAATAATTATGATTATTTGAACAA
192 TAAAATATTTTAAAATAT--ATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAA
* * * * * *
348480 TTATCTATTTGAAATTGA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATAT-TTTCTG-TCTATAC
255 TTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAAT-TGTTTCAGTTC-ATAC
* * * **
348542 AATCTTATTTTGAACAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TT-AAGA
317 AAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A
* * *
348586 CAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATCA-TTTTGAC
1 -AATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGAC
* * * * * *
348649 TATTCGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCT
64 TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
348714 GTTCATACAAGATTATTCA-AATTAAAATAATATTAATTTTTTACTATTTTAACAATTAATAAGT
129 GTTCATACAAGCTTTTTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
348778 AAAATATTTAAAAAAATAAATATGTTTACGAAACAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAAT
193 AAAATATTT--TAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAT
* * *
348843 TAATC-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCAAATAAG
256 T-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG
* * **
348907 CTTATTTAAAATAAAATAACACCAATTTATTAATATTTTGAA
320 CTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * * *
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1 AATTAATAAGTAA-AAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT
** * * * *
349013 A-TCCAAATAATTACCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTC
65 ATTTGAAA-AATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
349076 TATTCGTGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAG
128 TGTTCATACAAGCTT-TTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
349140 TAAAAT-TTTAAATAATAAATCTATTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAA
192 TAAAATATTTTAA-AATATATATATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAA
* * ** **
349203 TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCAA-AAATTAATTGTTTTTGTTCATA-AA
255 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-AATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA
* * *
349266 GGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAA
319 -GCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
349310 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATATATATATTTATTGAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 AATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * *
349375 TTTCAACAATTATTTATTTCAAATTGA-TAAGATCTTTTATTTTGTTAT-AAACAATTGTTTCTA
66 TTTGAAAAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * *
349438 TTCATACATG-TTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTTAATAA
130 TTCATACAAGCTTT-TTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TTAAAAA-TTAATAA
*** * * * * * *** * * *
349501 GTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCAATGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCAATTTGAACT-
191 GTAAAATATTT-TAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-TA
* ** * ** *
349565 ATTATCTATTTCAAATCATTAAGATATTTTATTTTGTCGTAAAACAATTGTTT-ATATTCATACA
254 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACA
** * *
349629 AAATTATTCATAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAA
318 AGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
349673 AATTAATAAG----AGATTTAAGAACTAAATTTGTTTATTGAACCAA-TTCAAATATTTATGACT
1 AATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
349733 ATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAATTATTTTTG
65 ATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* *
349797 TTTAGACAAGCTT
130 TTCATACAAGCTT
349810 ATTTGGAGTA
Statistics
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0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
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AATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
TCATACAAGCTTTTTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA
ATATTTTAAAATATATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCT
ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
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Indices: 347734--348052 Score: 388
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347724 TTACCGAACA
* * * * * * *
347734 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATTTATTTTAAATTGTTATGACATTATGTTTTGT
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* * * * * *
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* * *
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* * * ** * * *
347975 CCTAAAACATTTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTATTAAATTAATAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAAATTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATAT
*
348040 TTTAAAAATTAAT
130 TTCAAAAATTAAT
348053 AAGTAAGCAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATTATCTATCTAAAATTATTACGACATATGTTTTGTC
ATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAAATTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTAATAATATT
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346870 AACAATTATT
** * * * ** * * *
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* ** * * *** * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** * * *
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194 TATAACCTTTTGTTTTATCAA-AAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGA-ACAAA
** * ** * * * * * **
347135 AT-ATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA-AGTGTAAGAGAATTAAAAAAAAAATCTGCTT
256 ATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTT
* * * * * * * * * * *
347198 ACCT-AACAAGTTCAAACAGTTTTTAAATATTTGAAAAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACC
320 A-TTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATC
* * * * * * *
347261 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT-TCTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAA
382 TTTTATTTTATTATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGATTA-TTCAAATAAAATAATATTA
* **
347325 ATTTATTAATA-TTAAAAAATTAATAAGTACAA-ATTTAAAAAATAAACCTGTTT------AAA-
445 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA-AACATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACAAAT
* * * * * * * * *
347381 T--AGT--T-ATGATTATTTAAACAATTCTTTATTTCAAAT-AGTTTTGACCATTTCT-CTTT-T
509 TGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-TATTT-TGTTTTGT
* * * ** * *
347438 CATAAACCAATTTGTTCT-ATTCAAACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAACTTGTTAATA
571 AATAAAACAA-TTGTT-TAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * * * ** * * **
347502 -CTCCAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACCAAACCAGTTAAAATAGT
634 TTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATAT-ATTCACCGAACTGGATCAAATAAC
* * ** ** *
347565 TATGACAATTTGAGCAATTACT
698 CATGACTATTCCAAAAATTACA
* * ** * * *
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1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAC-AAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* ** * ** *
347651 -TTCAGAATAAAATAACATTAATTTATTGTTATTCTAAAAATTAACAAGTTGAAAA-TTTAAAAA
65 TTTCA-AATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAG-T-AAAATTTTAAAAA
* * ** * * * * * * * *
347714 ATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATTTATTTTAAATT
127 ATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * ** * *
347779 GTTATGACATTATGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAA-AATTATT-TGAAATA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAG-AACA
*** ** * * * * *
347841 AAATAATGCTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAAT--G--ACACATTTAAAAACTAAATGTCTT
254 AAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
* ** * * * * *
347902 TACTGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTAAAATT-ATTACGATCT
319 TATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATCT
* * ** * * * * * *
347966 ATT-TTTTGTCCTAAAACATTTGTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTATTAAA
383 TTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATATTAAT
* * * * *
348030 TTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGCATTTAAAAAATAGATGTGTTTACCGAACCAA-TG
447 TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAATTG
* * ** ** * * *
348094 CAAATAGTTGA-GACTATAAGAATAATTATCTATTTTGAATC-TTCTGGTATTTTGTTTAGTAAT
511 -AAATA-ATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAAT
* ** * *
348157 AAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT
574 AAAACAATTG-TTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
* * * * ** *
348221 AAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAGTAAATATGTTTATTGAACTGGATCAAATAGCCATG
638 AAA-AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATG
** *
348286 ACTATTTGAAAAATTATA
702 ACTATTCCAAAAATTACA
* * * * *
348304 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATT-GTTTTAGTTCATATAAG-TTT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* * * *
348367 TTTCTAAATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGATATTTAAAAAA
65 TTTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAT-TTTAAAAAA
* * * * * ** *
348432 TGAATCTGTTTGT-TGAATAAATTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATT
128 TAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T
* * * **
348496 GA-TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATAT-TTTCTG-TCTATACAA-TCTTATTTTGAA
191 CATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAAT-TGTTTCTGTTC-ATA-AAGGCTTATTCAGAA
* *
348556 CAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATC
252 CAAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
* * *
348618 TGTTTATTGAACAAGTTCAAATCA-TTTTGACTA-TTCGAATAATTATTTATTTCAAA-TCATTA
315 TATTTATTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTC-AACAATTATTTATTTCAAATTCA-TA
* *
348680 TGA-CTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCAAATTAAAATAA
377 AGATC-TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCAAA-TAAAATAA
* * * *
348744 TATTAATTTTTTACTATTTTAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAAATAAATATGTTTACGA
440 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAACATTT-AAAAAATAAATATGTTTACG-
**
348809 AACAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTAATC-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
502 AACAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGT
* * * * *
348873 TTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCAAATAAGCTTATTTAAAATAAAATAACACCAATTTATT
566 TTTGTAATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
348938 AATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAAAA-TTAAAAAATGAATCTATTCACCGAACAT-GTTCAA
630 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAAC-TGGATCAA
** *
349001 ATAATTATGACTA-TCCAAATAATTACC
693 ATAACCATGACTATTCCAAA-AATTACA
* * *
349028 TATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCGTGCAAGCTTA
1 TATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * *
349092 TTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAATAATA
65 TTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAAAAATA
* * *
349157 AATCTATTTTCTAAACACATTCAAATAGTTATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
130 AATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* *
349222 ATAACCTTTTGTTTTATCAAAAATTAATTGTTTTTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAATAAAATAA
195 ATAACCTTTTGTTTTATCAAAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAAAATAA
** *
349287 TATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATATATATATTTATTGA
260 TAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATTGA
* *
349352 GCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTGATAAGATCTTTTATTT
325 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATCTTTTATTT
* * * * *
349417 TGTTAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACATGTTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
390 TATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* ** * * * * * * *
349481 TATTCTAAAAAATTTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCAATGAACAAGTTTAAAT
454 TATT-TTAAAAA-TTAATAAG-TAAACATTTAAAAAATAAATATGTT-TACGAACAAATTGAAAT
* * * * * **
349546 AGTCATGTCAATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTAAGATATTTTATTTTGTCGTAAAAC
515 AATCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAAC
** * * *
349610 AATTGTTTATATTCATACAAAATTATTCATAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAA
579 AATTGTTTA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA
* * * * * * ** ** ***
349675 TTAATAAG----AGATTTAAGAACTAAATTTGTTTATTGAAC-CAATTCAAATATTTATGACTAT
643 TTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGA-TCAAATAACCATGACTAT
** *
349735 TTGAATAATTATC-
707 TCCAAAAATTA-CA
* * * * * * ** * * * *
349748 TATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTATCATAAAATAATTATTTTTGTTTAGACAAGCTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
** * * * ** * * * * *
349812 TTGGAGTAAAATATTGCTAAA-TTAAGAATATTCTAGAAATTAATAGGCAAGAGA-TTTAAAAAA
66 TTCAAATAAAATAATAC-AAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-A-ATTTTAAAAAA
* * * * * * *
349875 TAAATGTGTTTGTC-GAACTAATTCAAATAGTT-TAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT
128 TAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTAT-GACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* *
349938 C------A----TT-TTAT-TC----A-T-A-----------C---AA-GCTTATTC-GAAATAA
191 CATTATAACCTTTTGTTTTATCAAAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAG-AACAA
** * ** * *
349969 AATAATACCAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAATAAGAA-ATTTAAAAAA-AATATTTTT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAA-A--TAT
* * ** * * * ** * *
350032 GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAACTATCTATTT-AAATAAATATGAC
316 ATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGAT
* * * * * * * * *
350096 CTTTTGTTTTGTCAT-AAACAACTATTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCGAA-AAAATAATATTA
381 CTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGATTATTCAAATAAAATAATATTA
* ** * ** * * * * ****
350158 CTTTATTAATATTTCCAAAATTGATAAGTTGAGATTTAAAAAATTAGTCA-GTTTATCAAATTGG
445 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CGAACAAA
* * * * ** *
350222 TTTAAATAATTACA-G-CTATTAGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTAT-AAACTTTTGTTTTG
508 TTGAAATAA-T-CATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATA-TTTTGTTTTG
* * * * *
350284 TCATAAAATAATTGTTT--TTCATCCTACAAGCCTATTCAAAATAAAATTATACAAATTTATTAA
570 TAATAAAACAATTGTTTAATTCA---TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * * * *
350347 TATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAGAATAAATCTATTTACCGAAC-----C-AGT-
632 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAA-AATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATA
**
350405 TTCA--A-T-TT--AAATAATTATC-
696 ACCATGACTATTCCAAA-AATTA-CA
* * * * * * * * *
350424 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTGTTTC-AGTTTCACATTAAGCT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTA--TTCATA-CAAGCT
** * * * * * *
350488 TATTTTGAATAAAAT-ATACTAATTTAATAATTTTTCAAAAATT-A-AA-TAAAAGATTTAAAAA
63 TATTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAA-TTTTAAAAA
* * * * ** ** * * *
350549 ATAAATCTATTTGCCTAAA-TAGTTTAAATAGCTAAAACTATAT-AACAAGTATCTATTTCAAAT
127 ATAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * ** * * * *
350612 CTTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAA
191 CATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAA
* ** * * * ** *
350676 AGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAGTGATTTAAAAAATAAATATGTTT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTT
*** * * * * ** *
350741 ACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGACTACGTT-AATAATTATCTATTTCAAA-TCATTACTACC
320 ATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATC
* ** * * * * * ** * *
350803 TTTTGTTTGGTCATATAACAATTGCTTT-TGAAT-ATTCAAGCTTATTTGGAATAAGATAATACT
382 TTTTATTTTATTATAAAACAATTG-TTTCTG-TTCATACAAGATTA-TTCAAATAAAATAATATT
* * * * * * *
350866 AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGACTTAAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACT
444 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-ACA-TTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACA
* * ** * * ** * ** * **
350931 AGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTT-
506 AATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTT-TTG
* ** * ** ** * *
350995 TTATAAAATTATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
570 TAATAAAACAATT-GTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * **** *** * **
351060 TTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAA-TTAAAAAATAAATTTTTTTGTTGAACTATTTTAAATATT
634 TTTTAAAAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAAC
* * * *
351124 TAAGATTATAT-GAATAAA-TATC-
698 CATGACTAT-TCCAA-AAATTA-CA
* * * * * * *
351146 TATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCATACTAGTT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAA-TTGGTTCT--ATTCATACAAGCT
** * * ** * * * *
351210 TATTTGGAATAACATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAAAA
63 TATTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-A-ATTTTAAAA
* * * * * * ** * *
351274 AATAATTTTGTTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGATTATTTAAATAATTATCTATTTCAAA
126 AATAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * ** * ** *
351338 TCGTTATGATCTTTTGTTTT-TCCATAAAA--CATATGTTTTTGTTTGTATAA-GTTTGCTCAAA
190 TCATTATAACCTTTTGTTTTAT-CA-AAAATTAAT-TGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGA
* * ** * * *
351399 ATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAA-AAATCT
251 ACAAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
** * * * * * * *
351459 ATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTTAGCAATTGTTTATTTCAAA-TCGTTATGA
316 ATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTC-ATAAGA
* * *
351523 -CTTTTTATTTTA-T-TAGAA-AA-TGATTC--TT--T-C----TT-TTC----------ATACT
380 TC-TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCAAATAAAATAATATT
* * * * * * * * *
351563 AATTTGTTAATATATCAACAATTAATAACTAAAAAATTTAGAAAATAATTATATTTATCGAACTA
444 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAAC-A
* * * * ** *
351628 GA-TCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTAATTCAAATCGTTACAATCTTTTGTTTTGT
506 AATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGT
* * * * * * *
351692 AATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATAA
571 AATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * ** *** * * **
351757 TCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTT-AAAAATGAATCT-TTTACTAAAAAAGCTTAAATAATT
635 TTTAAAAATTAATAAGTAAA-AAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACC
* ** * *
351819 ATGACTGTTTGAACAATTGTC-
699 ATGACTATTCCAAAAATT-ACA
* * * * * * *
351840 TATTT-AAGATCACTATAACCTTTCGTTTTGTGATAAAATAAAATT--TTCTATTCATACAAGTT
1 TATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-CAAA-ACAATTGGTTCTATTCATACAAGCT
* * * * * *
351902 TTTTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAGTATT--AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
63 TATTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAA-A-AATTAACAAGTAAAA-TTTTAAA
* * * * * * * *
351965 AAATAAAAC--TGTT-TGAACAAGTTCAAATCATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAA
125 AAATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * **
352027 TTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTCATACAA-GTTTATTCGGATT
190 TCATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAAC
** * ** * *
352090 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
253 AAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATAT
* * * * * * * *
352155 TTAAT-AAGCAAGTTCAAATAGTCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATT-ATTATGAC
318 TTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGAT
* * * * * ** * * * * *
352218 CATTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTTAAAGTAAAATAGTACTA
381 CTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCAAA-TAAAATAATATTA
** * * * * *
352283 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAAT-TCGTTTATCGAATAA
445 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATAT-GTTTA-CGAACAA
* * * * * * ** * *
352347 GTTTAAA-AAGTTATGGCTATTTGAACAATTAACTATCACAAAACATTATGACATTTTGTTTTGT
507 ATTGAAATAA-TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGT
* * * * * **
352411 CATAAAACAATTTGTTCT-TTTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAA-AAT-TTAAATTTCCTAA
571 AATAAAACAA-TTGTT-TAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
** * * * * ** * *
352472 TATTCCAAAAATTAATTAG-CAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACAT--ATTCTAAT
632 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAAC-TGGA-TCAAAT
*** * ** * *
352534 AGTTATAACTATTTGAACAATAATC-
695 AACCATGACTATTCCAAAAATTA-CA
* * * * ** * *
352559 TATTTGAAATCCTTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAGCCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA
1 TATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * * **
352623 -TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATTAGT-AAATGATTTAAAAA
65 TTTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAT--TTTAAAAA
* * *** * * * * *
352686 ATAAAT-TGATTTACTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAT
127 ATAAATCT-ATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * *
352750 -AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA--CA-TGTTTCTATTTATACAA-GTTTATTCAAAAT
191 CA-TTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAAC
** * **
352810 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGCT-GGAGATTTAAAAAATAAAT-T
253 AAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* ** ** * * * * ** * * *
352872 CATCTATCAAACAAGTTTGAATAGTCATGTCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAA-TCGTTATG
316 -ATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTC-ATAAG
* * ** * * * *
352936 A-CATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTTTGTTCATATAAAATTATTCAAAATAAAATAATA
379 ATC-TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATA
* * * * * * * * *
353000 CTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAACT
442 TTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACA
* * * * * *
353062 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTAT-A-ATCTTTATTTT
506 AATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGATAT-TTTGTTTT
** * * * * * ** *
353124 GTCTTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTCATTTAGAGTAAAAT-ATAGCTAAACTAATAA
569 GTAATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAA
* * * * * * * ** * **
353188 TATTCTAAAAACTAATAAGCAAGAGATTTAAAATATAAATGTATTTGCCAAAC-CAATTCAAATA
632 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGA-TCAAATA
*** * * ** * **
353252 GTTAAGATTATTAGAACAATTATT
696 ACCATGACTATTCCAAAAATTACA
* * * * * * ** * **
353276 TATTTCAAATCGTTTTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTCTTTC-AGTTCATGCGTGCTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* * * ** * ** * * * *
353340 TTTGAAATAAAATAACACTATTTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTT-GAAAAT
65 TTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-AATTTTAAAAAAT
* * * * * ** *
353404 AAATTTGTTTATC-CAACAAATTTAAATAGTTATGATAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA
129 AAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * * *
353468 TTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAA-TAATTGTTTCAATTCATAAATGCTGATTCAAAATAAA
193 TTATAACCTTTTG-TTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAAA
* ** * * * ** *
353532 ATTATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCA-ATTT
256 ATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATTT
* * * * * * *
353596 ATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA-A-C
320 ATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAA-T-TCATAAGATC
* * * *** ** * *
353658 TTTTGTTTTATTATAAAATAATTGTTTTTCAACATACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAA
382 TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTA-TTCAAATAAAATAATATTAA
* * *** * * *
353723 TTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACTAGT
446 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA-AACATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAAT
* * * * * * * ** *
353788 TTAAATAATTA-CACTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTAT-TTTTGTCA
509 TGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTT-TGTTTTGTAA
* * * * ** * * *
353851 TAAAATC-ATTATTTATGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATCTAATAATATT
573 TAAAA-CAATTGTTTA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
353915 ATGAAAATTAATAACTAAGAGA-TTAAAAAACAAATTTATTTACCAAACCAATTTATATGAATAA
636 TTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATA-TT--C--ACC---------G----A
*** * *
353979 TTATCTATTTCAAGTCATAACAATTCTGTTTGCAGAACTATTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
683 --A-CTGGATCAA---ATAAC----C---AT---G-ACTATTCCAAA-AA-T-T-AC--------
354044 TAATTA
719 -----A
* * * * * * * * *
354050 TCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTT
1 --TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * * *
354115 GTTTGAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAA-AAGTAAGAGA-TTTAAAAA
64 ATTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-A-ATTTTAAAAA
* * ** * * * * * * * * *
354178 ATAAATTTGTTCACCAAACTAGTTGAATTAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC
127 ATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
354243 ATTATGACCATTTGTATTATCATAAA-CAATTGTTTTTGGTCATATAGTCTTATTC-GAA-ATAA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTATCAAAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACA-AA
*** * * * ** * * *
354305 AGTAATGCTAATTTACTAATA-TTCTAAAAACTAATAAGTAACGGATTTAGAAAATATATTTATT
256 A-TAATAAAAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
**** * * * * * * * * ** * *
354369 GGCCAGACCAA-TGCAAACAATTATGA-TGGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
319 -TATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATC
* * * ** * * *
354432 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTGTATAAGCTTATTCGAAATAACATAAT-TCTA
382 TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATAT-TA
** * * * *
354496 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAA-AGAATCTATTTACCGAACAAG
445 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATA-AATATGTTTA-CGAACAAA
* * * * ** * ** * * *
354557 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTATTATCA
508 TTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAA
* *
354622 TAAAAACAATT-TTTAGTATTCATACAAGCTTATTTCAAATCTGTTTACTAAATAAT-TTCAA-T
573 T-AAAACAATTGTTTA--ATTCATACAAGCTTA-TTCAAA-----ATA--AAATAATACT-AATT
***** * ** ** * *** *** * *
354684 TAGTTATGATTATTTGGGTGATTATTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATTAGAC
626 TA-TTA--A-TATTTTAAAAATTA-ATAAGT-AAAAAATT-T-AAAAAAT-AAATAT-ATT-CAC
* ** * * ** * *
354749 AAGTATTTTTGTTC--AT-ACCA--ACTTATTTGGATCAAAATAATA
680 -CG-A-ACTGGATCAAATAACCATGAC-TA-TTCCA--AAAATTACA
* ** *** * * * *
354791 TTAATTT-ATTAAT-ATTCATGA-ATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAA
1 -T-ATTTCA--AATCATT-ATGACCTT--T-TGT-TTTG--TCACAAAA-CAAT-TGGTT-CT--
* * * * * * *
354853 ACAAGTTCAAATAGTAATAAC-TATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTAT
50 ---A-TTC--ATA--CA-AGCTTATTTCAAATAA--A-ATAATACAAA-C-TTATTA-A---TAT
* * * ** * * *
354916 TTCATCATAA--AACAATTGTATAAA-TTT---ATAT-AGGCT-TATTT-GAAATAAAAT-AATA
97 TCCA--AAAATTAACAA--GTA-AAATTTTAAAAAATAAATCTAT-TTTCTAAACAAATTCAA-A
* * * * * ** *
354971 CTAACTTATTACTATTTTGAA-AATTAAT-TA-GT-AAGA-GATTTTAAAAATGAATATG-TTTA
155 -TAA-TTATGACCA-TTTGAACAATT-ATCTATTTCAA-ATCATTAT-AACCT---TTTGTTTTA
* * * * * * * *
355030 CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTG-TCTATTTCA-AATC---ATTATGA
211 -TCAA-AAATT--AATTGTT-T--CT-GTTCATA-AA-GGCT-TA-TTCAGAA-CAAAATAATAA
*** * ****** * ** * *
355089 CCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATA
263 AAATTTATTAAAATTTCAAA-AATT-AAT-AAGT-A-A-AAG---A-TTT-AA-AAAATAA-ATA
* * * ** * ** * *
355154 AATTTACTAATATTCCAAAGATT-AACA-AG-TA--AAAATTTAAACAAAAAATCTGTTTTATGA
315 TATTTATTGA-A---C-AAG-TTCAA-ATAGTTATGACTATTTCAAC-AATTAT-T-TATT-TCA
* ** * * *
355214 ACATGT--TCAA-AT-ATTTATGACTATT-T-GAACAATTGTTTAT-TTCAAATCATTATGACAT
369 A-AT-TCAT-AAGATCTTTTAT-TTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-CA--A-G--A-
* *** ** * * ** *
355272 TTTTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTAGAATAAAAAATACTAATTT
423 --TTATTCAAATAAAATAA-T-ATT-AATT--TATTAA--TATTT----T-AAAAAT--TAA-TA
* ** * * * * * * * * *
355337 ATTAAA-ATTCCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCAATTTCCTAAGCAAGT
471 AGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGA---ACAAATTGAAAT-AA--TCATGA-CTA-T
* * * *
355399 TCAAATAGTTATAACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCAT
527 T----T-G-AATAA-T-T----------ATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAAT
* * ** * * *
355464 AAAGCAAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCACAATAAAATAAAAATAATTTATTAATATTT
574 AAAAC-AATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * * ***
355529 TGAAAATTAATAAG----AGA--TAAAAACTAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATG
637 TAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATG
** * **
355588 ACTATTTGAATAATTATT
702 ACTATTCCAAAAATTACA
** ** * * * * * *
355606 TACCTCAAATCGGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAACTTA-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* ** * * *
355669 TTCGAAGT--AA-AAT----A-TTGCTAA-ATTCTAAAAATTTATAAGTAAGACA-TTTAAAAAA
66 TTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-A-ATTTTAAAAAA
* * * * * * * ** *
355724 TAAATGTATTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATCA
128 TAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
355789 TTGTAACCTTTTG-TTTAGTCATGAAA-TAATTGTTT-TAGTTCA-AACATGCTTATT-TGAAAT
193 TTATAACCTTTTGTTTTA-TCA-AAAATTAATTGTTTCT-GTTCATAA-AGGCTTATTCAG-AAC
** * ** *
355849 AAAATAATACTATTTTATT-AACGTTCAAAAAAATTAATAAG-CAAAGAATTTGAAAAAATAAAT
253 AAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTC--AAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTT-AAAAAATAAAT
* *** * * ** * * * *
355912 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCCACTTAAAATGT-TTAT
314 ATATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAAT-TCATAA
* * * * * * *
355976 GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT
378 GATCTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAAT
* ** * * * * *
356040 ATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGAA-AAGTTGGAGATTTAAAACACATATCA-ATTTATCG
441 ATTAATTTATTAATATTTTAAAAATT-AATAAG-TAAACATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CG
* * * * * * * * *
356103 AATC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAACCATTTTGA-ACTTTTG
502 AA-CAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATA-TTTTG
* * * *
356166 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
565 TTTTGTAATAAAACAA-TTGTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * * * **** *
356230 TAATATTTCAAAAATTAATATGTAGTAGA-TT-----AT--ATGT-TT-ACAGAACCATTTTAAA
629 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAA
** * ** * *
356285 TAATTAAGACTATTTGAACAATTATA
694 TAACCATGACTATTCCAAAAATTACA
* * * * ** * *
356311 TATTTCAAGTCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTATATTCATGCAAGCTTA-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * *** * ** *
356375 TTCGAAATAAAATAATACTAAA-ATAATAATATTATGAAAATTAATATCTAAGAGA-TTTGAAAA
66 TTC-AAATAAAATAATAC-AAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-A-ATTTTAAAAA
* * * * ** * * * * *
356438 ATAAATTTATTTGT-TGAACCAATTAAAATGGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAAT
127 ATAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* *** * * * * * * * * *
356502 -TTTACGTCATTTTGTGTTGTCATAAAA-TAAATGTTTTTGTTCATATAA-GTTTGTTTAGAATA
191 CATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACA
** * * * *
356564 AAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGTT
254 AAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
* * * * * * * *
356625 TACTAAATC-AGTTCAATTAGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCATATATT--TATGAC
319 TATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCA-A-ATTCATAAGAT
* * * * * * * ** **
356687 CATTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTCTATTCATGC-AG-TCATATTTGAAATAATGTAATGC
381 CTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGAT--TA-TTCAAATAAAATAATAT
** * * * *
356750 TAATTTATTAATATTCAAAAAAAT-ATAAGTAAGAAATTTAAAAAATGAATCAATTGGCTT--G-
443 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAAT--A-T-GTTTACGA
* ** * * * * * * *
356811 AC-TATACAAATAGTTATGACTGTTTGAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTATT
503 ACAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TATTTTGTT
* * * * * * *
356874 TTGTCACAAAACAATTATTT-TTGTCCATACAAGCTTATTCGAAATAAGATAATTCTAATTTATT
567 TTGTAATAAAACAATTGTTTAAT-T-CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * * * * * * * * * * ** *
356938 AATATTCCAAAAGTTAATAAATAAGAGATTTAAAAATTGAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAAT
630 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAAT
*** ** * *
357003 AGTTATGACTATTTGAACAATTACC
695 AACCATGACTATTCCAAAAATTACA
* * * * ** * * *
357028 TATTTCAAATCATCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTATTCCTATAAACTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAA-TTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * *
357093 TTTCAATTAAAATAAT-CTAAATTTATT-ATCATT-CAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
65 TTTCAAATAAAATAATAC-AAACTTATTAAT-ATTCCA-AAAATTAACAAGTAAAA-TTTTAAAA
* * * * * * * * *
357155 AATAAATCTGTTTAC-ATAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTCTTTCAAA
126 AATAAATCTATTTTCTA-AACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * * **
357219 TCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTTTATTCATATAA-GCTTATTCGGATT
190 TCATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAAC
** * * * * * ** * * *
357282 AAAATAATATTAGTTTATTAATA-TCCTGATAGCTAATAAGTAGAAGATTTTAAAAATAAATATG
253 AAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA
*** * * * * * * ** * *
357346 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAATAATTATCTATTTCAGATTGTTATGACC
317 TTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATC
* * * * *** * * * * *
357411 TTTTATTTCATCATAAAACAATTATATAAATTCCTATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
382 TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATATTAA
* * * * * * * * *
357476 TTTATTAATATTCT---GATGAGTAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTT
446 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAATT
* * * ** ** * *
357535 CAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATT
510 GAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAATA
* * ** * **
357600 AAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCTGAATAAAACAATA-TAAATTTATTAATATTCC
575 AAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTT
* * * ** ** ** * *** *
357664 AAAAATTACTAAGTAAGAATTTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTAAGA
638 AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATGA
* ** *
357729 TTATTTGAACAATTATC-
703 CTATTCCAAAAATTA-CA
* * * *
357746 TATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGT--C-ATA-AA-----TCAATT-ATACAAGCGTA
1 TATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * * * *
357800 TTTAAAATAAAATAATAC-TATTTTTTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAT
65 TTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAA-TTTTAAAAAAT
* * * * ** * * * ** *
357863 AAATTTGTTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATAACCATTCAAACAATTATTTATTTCAAAT-AG
129 AAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-
* * * * * ** * * * * *
357927 TTATGATCTTTTGTTTTGTCATATAGCAATTGTTTGTATTCACACAAGG-TTATTTAGAATAAAA
193 TTATAACCTTTTGTTTTATCAAAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACAAAA
** * * * ** * **
357991 TAATACCAATTTATTAATATTAT-AACAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTA
257 TAATAAAAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA
* * * * * * * * * * *
358055 CTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCA-ATGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTC
321 TTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATCTTT
* * * * * * * *
358118 TATTTT-TGTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAGAATAATATAGTACTAAC
385 TATTTTAT-T-ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCA-AATAAAATAATATTAAT
* * * * * *
358182 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATCTATTTACTAA-AACAGTT
447 TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACAA-A-TT
* * * * * * * *
358243 TAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT-CTTTATTTTGTTACA
510 GAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAATA
** * * * * **
358307 AAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTCCA
575 AAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
* * * * * * ** ** * ** *
358372 AAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATGGAACCAGTTCAAATAATTAAGAC
639 AAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATGAC
*
358437 TATTTTGTTAATAAACACATTCAAATAGTTATTA
704 TA------T--T---C-CA---AAA-A-TTA-CA
* * *
358471 CTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCA-TAAACTAATTGTTT
1 -TATTT---CAA--ATC----------A-TTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAAC-AATTGGTT
* * * ** * * *
358535 CTATTCATACATGCGTA-TTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTCATATTCCAAAAAATAATAA
48 CTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAA
* ** * * * * * *
358599 GTAAAATATTTAAAAAATAAACCCGTTTACCT-AGCAAGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACA
112 GTAAAAT-TTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACA
* * * * * *
358663 ATTATTTATTTCAAAT-AGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTG-TTCTATTTATAT
175 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-
* ** * ** * * ** * **
358725 AA-GTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATT
237 AAGGCTTATTCAGAACAAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
358789 TAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTT
302 TAAAAAATAAATATATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTT
** * * * * * * * *
358854 CAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTTGTTCA-AGCTAAAATTATTCA
367 CAAATTCATAAGATCTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-C-AAGATTATTCA
* * * * * * *
358918 GAATAAAATTATATTTATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATC
430 -AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * * *
358980 TATTTTCCAA-AATAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTAT
494 TGTTTACGAACAA-A-TTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTAT
*
359043 GAT-TATTTGAACAATCATTATGAATGATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTT
556 GATAT-TTTG-----T--TT-TG--T-A--A--TA----AAA----CA--A---------TTGTT
* **
359107 ATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
586 -T-----AA--------T-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * * * * * ****
359172 TTAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAGAGATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATTGTTAT
636 TTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCAT
** *
359237 GACTATTTGAATAATTATCA
701 GACTATTCCAAAAATTA-CA
* * * * * * * *
359257 -ATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAACTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCT-ATTCATACAAGCTTA
* * * * * ** * *
359319 -TTCGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAA
65 TTTCAAAT-AAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAA-A-TTTTAAAAA
* * * * * * * ** * * * *
359382 ATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATT
127 ATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
359446 GTTCA-GACCTTTTG-TTTAGTCAAAAA-TATTTGTTTCAT-ATCTTACAA-GTTTATTCAGAAT
192 ATT-ATAACCTTTTGTTTTA-TCAAAAATTAATTGTTTC-TGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAAC
** * * ** * * * * *
359506 AAAATAATTCAAAGTTATTAACATTTGGAAAATTAACAAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCTC
253 AAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATA
* * * * * *
359571 TTTATTGAACAAGTTCAAGTAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTT-AAA-TCGTTATGAC
317 TTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTC-ATAAGAT
* * * * ** * * * *
359634 CTTTTGCTTTGA-CATAAAAAAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTA-TCAAGAGTAAAATAATAC
381 CTTTT-ATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCAA-A-TAAAATAATAT
* ** * * *
359697 TAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAA-AGTTAAAAAAAATAAATTTAAATAAATTTA
443 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACA-TT--------TAAA---AAATAAATATG
* * * * * * * * **
359761 TTTACCAAACAAATTTAAATAGTTACGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCGTTATGACC
496 TTTA-CGAACAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATA
* * * * *
359826 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACGAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACTA
560 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATT-GTTTAATTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
** * * * * * * *
359890 ATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTTAATTTGCTT-ATCGAA-TC
623 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATAT-ATTCACCGAACTG
* ** * * ** * **
359949 AATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATT
687 GA-TCAAATAACCATGACTATTCCAAAAATTACA
* * * ** * **
359983 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTCATGCAAAATTA-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * ** * * * * * * *
360047 TTCAAAATAAAAAAAAACTGATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAACTCAGAGATTTGAAAAAA
66 TTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGT-A-AAATTTTAAAAAA
* * ** * * *
360112 TAAATCT-TTTTACTAAACAAGTTCAAACAATTATGATTATTTGAACAATTAGCTATTTAAAATT
128 TAAATCTATTTT-CTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * ** * * *
360176 GTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTC-AAT-ATAAAAGCTTATCCA-AATAA
192 ATTAT-AACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAA
** * * * *
360236 AATAATACTACTTTATT-AAATTTCAAAACTT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-ATATT
* * ** * * * * * ** ** *
360298 TACTAAATTAGATCAAATAATTATGGGC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCT
319 TATTGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATCT
* * ** * * **
360362 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TGCAACATATAAGCTTATT-AAATAAAATTGTTATTAC
383 TTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTG-TTCATACAAGATTATTCAAATAAAA-TAATATTA-
* * * * * * ** *
360425 CTTTCGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
445 ATTT-ATTAATAT-TTTAAA-AA---TTAAT-AA-GTA-AA-C--ATTT--AA-AAAATAA-A-T
* ** * ** * **
360489 AATTTTTTAATATTTCAAGAATTAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCAA--A-CTA
493 -A-TGTTTACGA--AC-A-AATT-G--A-A-A--T-AATCAT-GA-CTATTTGAATAATTATCTA
* * * * ** * *
360550 GTTT-AAAT-AGTTATGACCAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATT
542 -TTTCAAATCA-TTATGA-TA-TT----TTGTT-TT-GTAATAAAACAATTGTTTAATTC-----
* * * * * ***
360613 ATTATAACCTTCTATTCTATCATAAAACAATTATTTATTTTCATACAAATTTATTTAGAAAAAAT
592 A-TACAAGC-T-TATTC-A--A-AATA-AA--A--TA-----ATACTAATTTA-TTA-ATATTTT
* * *
360678 AATACTAATTTAATAATAGTTTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTTGTC
638 AA-A--AA-TTAAT-A-AG-TAAAAAATT--TAA--AA-A-A--T---AAATATATTCA----CC
** * ** * *
360743 GAAC-CAATTCAAATAGA-TAAAACTATAT-GAACAATTATC-
681 GAACTGGA-TCAAATA-ACCATGACTAT-TCCAAAAATTA-CA
* * ** * *
360782 TATTGCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGCTCATACAAGTTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* * * * * * * * * *
360846 -TTCGGAATAAAATAAAATAAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGGAAGAGATTTTTAAAA
65 TTTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-A-A-TTTTAAAA
* * * * * * * *
360910 AA-AATTCTATTTACCAAGCTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAA-TATCTATTTCAAAT
126 AATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * *
360973 CATTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTATTCATATAA-GTTTGTTCAAAATA
191 CATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACA
** * * * * * *
361036 AAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGT
254 AAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATAT
* * * * * * * *
361100 TTA-TGAA-ATCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATCATCTATTTCAAA-TCGTTTTA-
318 TTATTGAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTC--ATAAG
* * * * * * * ** *
361161 ACCTTTTGTTTTATGATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATTA
379 ATCTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCA-AATAAAATAA-TA
** * * ** ***** *
361226 TGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAAA-AATT
442 T--TAATTT-ATTAA-TA--T-TTT-AAA-AATTAAT-A-AGTAAACATT-T-A-AAAAATAAAT
* * * * * *
361289 ATTTTTCATC-ATTCAAGCTTATTTGAAATAA-AAT-A--ATATGAATTTATTA-ATATTTCAAA
493 ATGTTT-A-CGA-ACAA----A-TTGAAATAATCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAA
* * * ** * ** *
361348 -AAGTA--ATAAGTAAGTGATT-TAA-AAAACAAATTTGTTTACCAAACTAGTTTGA-ATAGTTA
549 TCATTATGAT-ATTTTGT-TTTGTAATAAAAC-AA-TTGTTTA--ATTC-A---T-ACA-AG--C
* * * * **
361407 TGACTATTTGAATAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTAGACAATTAATAAGTAGATGA
600 T---TA-TTCAA-AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAAAAA
* * *** * *** ** * **
361471 TTTAAAAAAGAAATATATTTACC-AAAAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
658 TTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATGACTATTCCAAAAATTACA
* ** * * * * *
361532 TATTTAAAATCGGTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
** * ** * * * * ** *
361597 TTGGATTAAAATAATATTAATTTTTTAATATTTCAACAATTAGTAAGTAAAATATTTTAAAAATA
66 TTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAT-TTTAAAAAATA
* * * * * * * * * * * **
361662 AATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTT
130 AATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * * * * * * * *
361727 ATGACTTTTTGTTTCATCATAAAA-CAATTATATCAGTGCATATAGCCTCATTTAAAATAAAATA
195 ATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAAAATA
** * * * * * * * * * * * ***
361791 ATACTAATTGAATAATATTTCAAAAATTATTGAGTAAGAGATTTAGAATATGAATTTGTTTACCA
259 ATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATTG
* * * * * * * * *
361856 AAGAAGTTCAAATGGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATGTCAAA-TCATTATGA-CATTTTG
324 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATC-TTTTA
* * * * * * * * * *
361919 TTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCCGAAGAAAATAATATAAATTTAT
387 TTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATT-CAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * * *
361984 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAAAATTTAAAAAACAAA-ATTGTTTTCTGAACATATTCAAA
451 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATA-TGTTTAC-GAACAAATTGAAA
* * * * ** * *
362048 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTCATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAC
514 TAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAA
** * * *
362112 CAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTGATATTTCAAAA
578 CAATTG-TTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAA
* * * * ** * * *** *
362177 AATAATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAAATA-ATTTATC-AAGCAAGTTTAAATAGTTATGACTG
642 ATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAA-CTGGATCAAATAACCATGACTA
** * **
362240 TTTGAATAATTATT
706 TTCCAAAAATTACA
* * * * * * * * *
362254 TATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTGTGATAAAATAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
** * * * * * *
362319 TAGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGA-TTTAAAAAAT
66 TTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTA--AAATTTTAAAAAAT
* * * * * * * *
362382 AAA--TATTTATACTAAAC-AAGT----TAGTCATGTCCCTTTGAATATTTATCTATTTCAAATT
129 AAATCTATTT-T-CTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
** * * * * * * *
362440 GGTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATGCAAA--ATGATTCAAAACA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCAT--AAAGGCTTATTCAGAAC-
* * * * *
362502 AAAAAATACTGATACATAATATTT-TGAAAATTAAT-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTG-TTTA
253 --AAAATA---ATA-A-AA-ATTTATTAAAATT--TCAA-A-AATTAATAAGTAAA--AGATTTA
* * **** * * * * * ** *
362564 CCGAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCATTTCAAATACTTAAGACTGTTAGAACAATTATCTATT
304 ---AAAAATAAATATATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATT
* * ** * * * * * * * * * *
362629 TTAAA-TCGTTCTGACCTTTT-GTTTAGTCAGAAAGCAATTATTTCAGTTCGTAGAAGCTTATTC
366 TCAAATTC-ATAAGATCTTTTATTTTA-TTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC
* * ** * * * *
362692 ATAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTAAAAAAACTAATGAGCAAAAGATTTTAAAAAATAA
429 A-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAACA-TTTAAAAAATAA
* * * * *
362757 AT-TCGTTTATCGAACAAGTTGAAATAGAT-TTGACTATTT-ATACAATTATTTATTT-AAAGCC
491 ATAT-GTTTA-CGAACAAATTGAAATA-ATCATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAA-TC
** ** * * * **
362818 ATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAA
551 ATTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
*** * * * * *
362883 TAATACTACCCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAACTAAAGT-TGTTT
615 TAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAA-TAAA-TATATTC
*** ** * *** * * * *
362946 TTTGAAC-CAATTCTAATAGTTATAAATATTTCAACAAA-TA-T
678 ACCGAACTGGA-TCAAATAACCATGACTATTCCAA-AAATTACA
* ** * * * * * * * *
362987 TAATCTCAAATTGTTATAATC-TTTGTTTTCTCAGAAAATAGTTGTTTTTGA-TCATACAAGCTT
1 T-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCT-ATTCATACAAGCTT
* * * * * * *
363050 A-TTCAAATAAAAATAATACTAGCTTAATAGTATTTCAAAAATTAATAAGT--GA-TTT-AAAAA
64 ATTTCAAAT-AAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAAAAA
* * ** * * * * ** * *
363110 TAAATGTGTTTGATGAACCAATTCAAATAGTTAAGAATATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA
128 TAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
363175 TTATGATCTTTT-ATTTAGTCATACAA-TAATTGTTTCAGTTCATATAA-GCTTACTCAGAATAA
193 TTATAACCTTTTGTTTTA-TCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACAA
** * ** * ** * * *
363237 AATAATACTAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGAAAAGATAAATGTGTT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATT
* * * * * * *
363302 TATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTCGAACAATTA-TCAATTCAAAATCATTAGACCT
319 TATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTC-AACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATCT
* ** * * * * *
363365 TTTATTTTGTCGTAAAATAATTATTT-TAGTTCATA-AATGCTTATCCAAAATAAAATAATA-CA
383 TTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAA-GATTATTC-AAATAAAATAATATTA
* * * *
363427 ACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTATTGAATC-
445 A-TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-CGAA-CA
* * * * * * *
363487 AATTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACATTTTGTTTTG
506 AATTGAAATAATCA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTG
* * * ** *
363551 TCATAAAATAATTGTTT--TTCAACATACCAGCTTATTTGAAATAAAATAATCCTAATTTATTAA
570 TAATAAAACAATTGTTTAATT---CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * ** *
363614 TATTTGAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAAC--CATTACAAAT
632 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGA-T-CAAAT
*** * *
363673 -AGTTTGACTACTT-GAATAATTATC-
695 AACCATGACTA-TTCCAAAAATTA-CA
* *
363697 TATTTC-AA--ATT-T-A------------TCACAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTA-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * * * * * **
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66 TTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAAAAATA
* * * * * * * * ** * * * **
363809 AATCCATTTGCCAAGCTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTT
130 AATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * *
363874 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTCAGCTCATACAA-GCTTCTGC-GAA-ATAGA
195 ATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACA-A-A
* * * * ** * * *
363935 ATGAA-ACAAATTTATCAATATTTTAAAAATTTGTAAGTAAGAAG-TTTAGAAAATAATTCTATT
256 AT-AATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATATT
** * * * * * * *
363998 TACCGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTAAACAACTATCTATTTCAAA-TCATTA-TTAC
319 TATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGAT-C
* * * * * * * * * * *
364060 TTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAGGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTA
382 -TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATT-ATTCAAATAAAATAATATTA
* * * * * * * *
364125 ATTTATTAATA-TTTAGATAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTCTTTACCAAACCA
445 ATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAA
* * * * * * ** * ** * * *
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507 ATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTA
* ** ** ** *
364252 ATCAAACAATTAGTTTTGTTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
572 ATAAAACAATT-GTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** *
364317 CTAAAACTTAATAACCAAACAAA-TTAAAAAATAAGTCCA-ATT-ACCGAACCT--ATTCAAATA
636 TTAAAAATTAATAAGTAAA-AAATTTAAAAAATAAAT--ATATTCACCGAA-CTGGA-TCAAATA
*** * * *
364377 GTTAAGACTATAT-GAACAACAAT-C-
696 ACCATGACTAT-TCCAA-AA-ATTACA
* * * * * * * *
364401 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTGTTCATACATGCTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * * * * *
364465 TTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGTTTTAAAAAAT-A
66 TTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAAAAATAA
* * * ** * * * *
364526 AT-TTTTTTACCAAATC-AATTCAAGTGGTTAAGACAATTAGGAAAAATTATCTATTTCAAATCA
131 ATCTATTTT-CTAAA-CAAATTCAAATAATTATGACCATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * ** *
364589 TTTTGAGCTTTTCTTTAATTATAAAA-CAATTTTTTCAATTCATACAA-GCTTATTCAGAATAAA
193 TTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACAAA
* * ** * * *
364652 TTAGTACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATTA-TAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTAT
256 ATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATATAT
** * * * * ** * * * *
364715 TTATCAAACAAGGTCAAATAATTATTATTATTTGGACAATTGTCTATTT-AAAATCATTATA-AC
318 TTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TA-AGAT
* * * * * * *
364778 CTTTTGA-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATAC
381 CTTTT-ATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTA-TTCA-AATAAAATAATAT
* *** * * * * * *
364841 TAATTTATTATTATTTCCTAAATTATTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTACCAACTC
443 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAACATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAAC-A
* * * * * ** ** ** * *
364906 AGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTAT
506 AATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGT
* * * **** *
364971 CATAAAACAATTGTTT-ATGATCACAGAAGCTTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAAT
571 AATAAAACAATTGTTTAAT--TCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *** ** * *
365034 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAAT
633 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAAC
* ** * ***
365099 AAAAACTATT-AAAATAATTTTT
698 CATGACTATTCCAAA-AATTACA
** * * ** * * * *
365121 TATTTTTAATCTTTATGA-CTTGTTGTTTAGTCGTAAAA-TATTAGTT-TCATGTCCTATAAGC-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCT-AT-TCATACAAGCT
* * * *
365182 ---TT-AATTAACAT--T-C-AA---A--AA-ATT-----AA-TAAGCAA--AATATTTGAAAAA
63 TATTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAA-CAAGTAAAATTTTAAAAA
* * * * * * * * * * * * *
365225 TTGAATGTGTTTACAAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATT
127 ATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
*** * * ** * * * * * * * *
365290 GCCATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAA-CACTTGTTTCAGTTCACAAAAGCTTATCCAAAATAAA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAAA
* ** * * * * * *
365354 GTAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAG--CATGATTTTAAAAAATAAATTTGTTT
256 ATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATATTT
* * * * * * ** ** *
365417 ATTGAACAAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTTAAATTGTTATTACCTTT
320 ATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATCTTT
* * * * * * *
365482 TATTTTGTTATAAAACAATTGTTGCAGTTCATACGAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTT
385 TATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * ** * *
365547 ATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAAATTTAAAAAGTGAATATGTTTATCGAATTAGTTCA
449 ATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAATTGA
* * * * *** * ** * *
365612 AATAATTATGACCATTTTAAGAATTATCTATTTCAAATCGCCATTACCTTTTG-TTTGCTCATAT
512 AATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTG-TAATAA
* ** * *
365676 AACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATT-AAGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATCTTTTA
576 AACAATTGTTTAAT-TCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
* * * * * ** * * ***
365740 AAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TCGTTTACC-AGACCAGTTTAAATAGTTATG
639 AAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATAT-ATTCACCGA-ACTGGATCAAATAACCATG
** *
365802 ACTATTTGAACAATT--A
702 ACTATTCCAAAAATTACA
* * * * * *
365818 TATATCAAATCATCATAACCTTTTGTTCTATC-CTAAAAAAATAT--TTCTATTCATACAAGCTT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAC-AAAACAAT-TGGTTCTATTCATACAAGCTT
* * * ** *
365880 A-TTCAAAATAAAATAATACTAA-TCTAATAATATTTCAAAAATTAATGATTAAGAGA-TTTAAA
64 ATTTC-AAATAAAATAATACAAACT-TATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-A-ATTTTAAA
* * * * * * * * * *
365942 ATATAAAT-TTTTTTGTTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAA
125 AAATAAATCTATTTT-CTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * *
366006 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATT-TTTTTAAATTCATACTA-GCTTATT-AG
189 ATCATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCT--GTTCATA-AAGGCTTATTCA-
* * * * *
366067 GAATAAAATAA-AATGAAGTTATTAAAATTTCAAAAATTGATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAA
249 GAACAAAATAATAA-AAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAA
* * * * * * * * *
366131 TTTTGTTTACCT-AACCAAATT-AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCG
312 ATATATTTA-TTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTC-
* * * * * ** * * * **
366193 TTACGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAGTTTTTGTTCATATAA-ATCTGTTTGGAATAAA
374 ATAAGATC-TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGAT-T-ATTCAAATAAA
* * * * * *
366256 ATAATACTAATCTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAAT--AT-TTTTTAT
436 ATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-
* * * ** * * ** *
366315 C-AA-AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-CTTT
500 CGAACAA-A-TTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTT
* * * * ** ** * * *
366377 TATTATGTTATAAAATAATAATTTCTGTTCATACAAG-TATATTCATATTAAAATAATATTAATT
563 TGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * ** *
366441 TATTAATATTTTGATAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTC
626 TATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATC
** * ** **
366506 AAATAGTCATGGCTATTTGAGTAATTATC-
691 AAATAACCATGACTATTCCAAAAATTA-CA
* * * * * * * *
366535 TATTTCAAATCATTTTGATCTTTTCTTATGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* ** * * * * * *
366599 TTTGATGTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAGAAATTAATGAA-TAAGAGA-ATTAAAAG
65 TTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAA-CAAGTAA-A-ATTTTAAAAA
* * * ** * ** * * * * * *
366662 A-GAATCTGTTTACCGAATATGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTAT-TGATTTCAAAA
127 ATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT
* * * * * * * * * ** *
366725 CATAATGACCTTTTGATTTGTTATAAAA-CAATTGGTTCTGTTGATGCAA-GCTTATTTGGAATA
191 CATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCAT-AAAGGCTTATTCAGAACA
* * * * *
366788 AAATGATATAAATTTATT-ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT
254 AAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
*** *
366852 TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAA-TCATTATGA-CA
319 TATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATC-
* * * * * * * * * * *
366915 ATTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTTTATTCAAACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAA
382 TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATATTAA
* * * ** * * * * *
366980 TTTATGAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAGCTAAATCTGTTTCCGAACTAGTTC
446 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACAAATTG
* * * * *
367042 AAATAGCTACA--ACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGAT-CTTTGTTTTGTCAT
511 AAATA-AT-CATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAAT
* * * * * * * * * *
367104 AAAACAATTGTTTCTATTTATGCAAGATTATTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAATCTAATAATATTC
574 AAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTT
* * * ** * ** *** *
367168 T-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATATTTGCTGAAC-CAATCAAATAGTTAAG
637 TAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATG
* ** *
367231 ATTATTAGAATAATTATC-
702 ACTATTCCAAAAATTA-CA
* * * * * * * * *
367249 TATTTCAAATTATTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCACACATGCTTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* * * ** * * * *
367313 -TCCAAAATAAAATAATAC-TATTCTAGCAACATTCAAAAAATTAATAAGGAAGAAATTTTAAAA
65 TTTC-AAATAAAATAATACAAACT-TATTAATATTCCAAAAATTAACAA-GTA-AAATTTTAAAA
* * * * * * *
367376 AATAAATCTATTTACTAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCGATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
126 AATAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* ** * ** ** * * * *
367441 GATTATGGCATTTTGTTTTAT-AATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAGCTTA-TGAAAATAA
191 CATTATAACCTTTTGTTTTATCAA-AAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAA
**** * * * *** *
367504 AATAATATTGCTTTATTAATATTTAAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTTAAAAATAAATA-AGTT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA-TT
* * * * * * * * *
367568 TATCGAATGAA-TTCAAATAATTATTG-CCATTTTAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAA
319 TATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGAT
* * * * * * * *
367630 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTT-TTT-TTTTCATTGTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA
381 CTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCA---TACAAGATTA-TTCAAATAAAATAATA
* * * * * *
367693 CTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAA-ACAGTAGGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAA
442 TTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-AGTA-AACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAA
* * * * * * * * ** *
367756 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTGTAACCTTTTATTTT
504 CAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTT
* * * * * * * *
367821 GTCATAAAACAATTATTTATGTTTATA-AATGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAA
569 GTAATAAAACAATTGTTTA-ATTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * ** ** ** *
367885 TATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACCAGTTCAAATAA
632 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAA
** * * * *
367950 TTAAGGCTATAT-GAATAATTATC-
697 CCATGACTAT-TCCAAAAATTA-CA
* * * * ** * * * *
367973 TATTTTAAATCGTTATGACCATTTGTTATGTCGTAAAACAAAT-GTTTTCCTTCATATAAG-TT-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCT-ATTCATACAAGCTTA
* * * *
368035 TGTTCAAAATAAAATAATACTAA-TCTACTAATATGT-CAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAA
65 T-TTC-AAATAAAATAATACAAACT-TATTAATAT-TCCAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAAA
** * * * * *
368095 AATAAATCTATAAATC-AAACGAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAA
126 AATAAATCTAT-TTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * ** * * **
368159 TTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAA-TAATAATTTTTGTTCATACAA-GCATATTCAGATT
190 TCATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAAC
*** * * ** * *
368222 AAAATAATATTCAGTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG-----GATTTAAAAAATAAATATGT
253 AAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATAT
* * * * ** ** *
368282 TTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACAATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATT-ATTTTGACC
318 TTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATC
* * * * * ** *
368346 TTTCT-TTTT-TTAATAAAATAATTATTT-TAGATCATATAA-ACTTATTTGATGTAAAATCATA
382 TTT-TATTTTATT-ATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGA-TTA-TTCAAATAAAATAATA
* ** * * * * *
368407 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTGTTTACCAA-
442 TTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAACATTTAAAAAATA-AATATGTTTACGAAC
* ** * * * * * * * **
368470 ATAAGTTTAAATGGTTATGACTATTTAAACAATTATCTACTTCAAAACATAATTACCTTTTGTTT
505 A-AA-TTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTT
** * * *
368535 TGTCTTAAAAAAATTGGTTCT-GTTGAT----GCTTATT-ACAAATAAAATAATA-TAAATTTAT
568 TGTAATAAAACAATT-GTT-TAATTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACT-AATTTAT
* * * ** *
368593 TAATATGTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAACAT--ATTCA
629 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAAC-TGGA-TCA
*** ** * **
368656 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
692 AATAACCATGACTATTCCAAAAATTACA
* ** ** ** * **
368684 TATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTATTCATACAAAATTA-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
368748 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA--TTAAAAACTA
66 TTC-AAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAAAAATA
* * * * ** * * * *
368809 AA-CATATTTACCAGACTAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCAT
130 AATC-TATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * ** * * * *
368873 TATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTT-TCCATCGTATAA-GCCTATTTAGAATAAA
194 TATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCT-GTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACAAA
** * * * * * * *
368934 ATAATACTAATTT-TTGATATTTTAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
256 ATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA
* ** * * * ** * *
368998 TCGAACTCGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATTGTTCTA-ACCTTT
321 TTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCAT-AAGATCTTT
* * ** * * * * *
369062 TA-TTTAGTAATAAAATAATTGTTTCACTTCATACATGCTTATCCGAAAATAAAATAATACTATT
385 TATTTTA-TTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC--AAATAAAATAATATTAAT
* ** * * * * *
369126 TTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATT
447 TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-ACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAATT
* * * * * * ***
369191 CAAATAGTCAAGTCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTGTAATA
510 GAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAATA
* * * * * * *
369256 AAACAATTGTTTTCAGTTCATAAAAGCTTATGCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAGTATTTC
575 AAACAATTG-TTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
* *** * ** ** **
369321 AAAATTTGAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGT-TT-ATTGAA-TCAATTCAAATAATT
638 AAAAATT-AATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAAT-A-TATTCACCGAACTGGA-TCAAATAACC
* * *
369382 ATGGCCATT-TAAACAATTATC-
699 ATGACTATTCCAAA-AATTA-CA
* ** * * * * * * * *
369403 TATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGATTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCGTATAAGCCTA
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCT-ATTCATACAAGCTTA
* * * * * ** *
369467 -TTCAGAATAAAACAGTACTAA-TTTTTAATATTTC-AAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAA
65 TTTCA-AATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAA-TTTTAAAAAA
* * * * * * * * * * *
369529 TAAATCTGTTTATC-GAACCAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATT
128 TAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * *
369593 GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTATGTTAATACAA-GCTTATTCAAAATAA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACAA
* ** * * * * * * * * * *
369656 AATAGTACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTTAGAGATTTTAAAAATAAATTTCTT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
**** * * * *** * * * * * * *
369720 TGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTGCATGAATAATTATCTATTTTAAA-TCGTTATGTTCT
319 TATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTC-ATAAGATCT
* * * * * * * ** * * *
369784 TCTATTTTGTCATAGAACAAATGTTTTTGTTCGTTTAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATATTAAT
383 TTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATT-ATTCAAATAAAATAATATTAAT
* * * * * * * *
369849 AT-TTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTCTTTACTAAACCAATTC
447 TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACAAATTG
* * * * * * * ** **
369910 AATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTCTGA-TTTGTTTTGTCGTA
511 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAT-ATTTTGTTTTGTAATA
* * * * * * * *
369974 AAATAATTGTTTCTATTGATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTA
575 AAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA
* * * * * * *
370039 AAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCT-GTCA--G-CCT-G-T---ATGA-CA-G--
639 AAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATGAC
* *
370091 T-TT-GAATAATTATC-
704 TATTCCAAAAATTA-CA
* * * * * *
370105 TATTTCAAATCATTTTGACCCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCGTACAAGCTTA
1 TATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * * * ** *
370170 -TTAAGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCC-AAAATTAATAAGGCAAATATTTAAAAAC
65 TTTCA-AATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAT-TTTAAAAAA
* * ** * ** * * *
370233 TAAATCTGTTTAT-TGAACAGGTCCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAAT-
128 TAAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * **
370296 AGGTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-TGATT-TTTCTATTTATACAA-GCTTATTTC-GATT
192 A-TTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTA-TTCAGAAC
*
370357 AAAATAATAAAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
253 AAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT
* * * * * *
370420 GTTTACCT-AACATATTTTAACATATGTTAGCTAACATAAATATGTTTACCTAACATATTA-ATA
316 ATTTA-TTGAACA-AGTTCAA-ATA-GTTA--TGAC-----TA--TTT--C-AACA-ATTATTTA
* *** * ** * * * *
370483 TTTGCACAATTAATAAG---TAAAAATTT-GCA-AAAATAAATATTT-T-TAGCGA-ACAAGATC
364 TTT-CA-AATTCATAAGATCTTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGT-TC-ATACAAGAT-
* * * * *
370540 AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATA
424 ---TATTCA--A--A--T-AA-AA-TA-ATA-TTAA-TTTAT-TAA---TATTT-TAA-AAATTA
* * * * **
370605 AT-ACTAAAC-TATTAATATTCCAAATTTAATGACTAAGAGATTTA--AA-AAA-CGAACTTGTT
468 ATAAGTAAACAT-TTAA-A----AAA--TAA--A-T-A-TG-TTTACGAACAAATTGAA-ATAAT
* * * * *
370664 TATAGAACGAGTTTAAATAATTAAGACTATTTAGACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTT
518 CAT-G-ACTA-TTTGAATAATT-A-TCTATTT---CAA--ATC-A-TT---AT---GAT-A--TT
* ** * * ***
370729 TTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAAT
562 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AAT
* * * * * * *
370793 TTATTAATA--TCAAGACAATTAATAAGTAAAAGATGTAAAAAATAAATCTGTTTA-CAAAC-GA
625 TTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTG-
* **** ** * **
370854 GTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATT
687 GATCAAATAACCATGACTATTCCAAAAATTACA
** * * * ** * *
370887 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* ** * *** * * *
370952 TT-AGATTAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTTTTATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAA
66 TTCA-AATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGT-AAA-ATTTTAAAAAA
* * * * * * * * *
371015 TAAATAC-ATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATT
128 TAAAT-CTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * * **
371079 GTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAA-GTTTATTTAGATTAA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATTCAGAACAA
*** * ** *
371142 AATAATGTTAATTTATT-AATTTGTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAATATAT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATAT
*** * * * * * * * * *
371206 TTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACC
318 TTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCA-TAAGATC
* * * * * * * *
371270 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
382 TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTA-TTCAAATAAAATAATATTAA
* * * * * *
371335 TTTATTAATATTTT-AAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAAATGAATCTATTTACCCAAC-
446 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-AGTAA-A-CATT-TAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACA
* * * * * * * *
371397 AAGTGCAAACAGTTATGAATATTTGAAAAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTTTGTTTTG
506 AATTG-AAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTG
* ** *
371462 TCATAAAACAATTGATTTTGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
570 TAATAAAACAATTG-TTTAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * ** ** *
371525 TA-TTAAAAAATTAATAAGT-ACAAATTTAAAAAATAAATCTGTT-ATATGAACACGTTCAAATA
632 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCA-CCGAACTGGATCAAATA
*** * *
371587 GTTATGATTATT-TAAACAATTATC-
696 ACCATGACTATTCCAAA-AATTA-CA
** * * * * * * *
371611 TATTTCAAATTGTTGTGACAATTTTGTTTT-TCATAAACCAATTTGTTCTGTTCAAACAAGCTTA
1 TATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * * * *
371675 -TTCATAATAAAATAATACTAATTTGTTAATACTCC-AAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAA
65 TTTCA-AATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAA-TTTTAAAAAA
* * * ** * ** *
371738 TAAATTTATTTACTGAATGAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAGTC
128 TAAATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATC
* **** * * ** * * * ** *
371802 GTTATGGTATTATGTTTTGTCCTTAAA-TAACTGTTTCTATTCATACA-TTTTATTCAGAATAAA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTAT-CAAAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAAA
* ** *** * ** * *
371865 ATAACATTAATTTATTGTTA-TTCTAAAAATTAACAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTT
256 ATAATAAAAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTT
** * * * * * * * * ** *
371929 ACCGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTCTTTTATTTTAAATTGTTATGA-CAT
320 ATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATT-ATTTATTTCAAATTCATAAGATC-T
* * * * * * * **
371993 TATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTATTCGAAATAAAATAATGCTAAT
383 TTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTC-AAATAAAATAATATTAAT
* * * * * ** *
372058 TTATTACA-ATTTCAAAAATTAAT--G-ACACATTTAAAAATTAAATCTCTTTACCGAAGTAGTT
447 TTATTA-ATATTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAAATT
* * * * * * * * **
372119 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTAAAATCATTACGAT-TTTATTTTTTGTCCT
510 GAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTT-TGTTTTGTAAT
* * * * * * * *
372183 AAAACATTTGTTTATATTCATACAAGCATATTCATAGTAGAATATTATTAAATTATTAATATTTT
574 AAAACAATTGTTTA-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
** * * *** * * *** *
372248 AAAAATTAATAAGT-AAGCATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAG-TGCAGATAGTTAAG
638 AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGAT-CAAATAACCATG
* *** * **
372311 ACAATAAGAACAATTATG
702 ACTATTCCAAAAATTACA
** * * * * * * * * *
372329 TATTTTGAATC-TTCTCG-TCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
1 TATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * *
372392 -TTCAGATTAAAATACTACTAATTTATTAATACTT--AAACAATTAATAAGTAAAAAATTTT-AA
65 TTTCA-AATAAAATAATACAAACTTATTAATA-TTCCAAA-AATTAACAAGT--AAAATTTTAAA
* * * * * *** * ** *
372453 AAATAAATATGTTTACTGAACTAGA-TCAAATAGCCATGACTATACGAAAAATTATCTATTTCAA
125 AAATAAATCTATTTTCTAAAC-AAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * *
372517 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-GAATTGCTTCAGTTCATATAAGTTCTT-TTGA-A
189 ATCATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAG-GCTTATTCAGA
* ** * * * * * * *
372579 ATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCCAAAAATTGATAA-TAAAGATATTTAAAAAATGAATC
251 ACAAAATAATAAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATA
* * * * * * * * * * *
372643 TATTTGTTGAATAAATTTAAATAATTCTAACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGATATA-
315 TATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATA-AG
* * * * * * * * * * **
372707 ACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATATTTTTCT-ATCTATAAAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT
379 ATCTTTTATTTTATTATAAAACAAT-TGTTTCTGTTC-ATACAAGATTA-TTCAAATAAAATAAT
** * * * *
372771 ACAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTATTG
441 ATTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGT-AAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CG
* * * * * * *
372833 AACAAGTTCAAATCATTATGACTATTTGGACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGT
502 AACAAATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TATTTTGT
* ** * * * *
372897 TTTGTTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATT
566 TTTGTAATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * ** * *
372962 AATATTGTAACAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-TGAAACAAGTTGAA
630 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAA-AATTTAAAAAATAAATATATTCACCG-AACTGGATCAA
* ** *
373026 ATAATCATGACTATTTGAATAATTA-A
693 ATAACCATGACTATTCCAAAAATTACA
* * * * * * * *
373052 TTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCAAATAAACTTA
1 -TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * *** ** **
373117 TTTGAAATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAAAATTAAAAAAT
65 TTTCAAATAAAATAATACAAACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAA-AATTTTAAAAAAT
* * * * * *** * *
373182 GAATCTATTCATC-GAACATATTCAAATAATTATGACTATCCAAATAATTACCTATTTCAAAAT-
129 AAATCTATT-TTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATC
* * * * * * * * *
373245 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATCGGTTCTATTCATGCAA-GCTTATTTAGAATAA
192 ATTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCAT-AAAGGCTTATTCAGAACAA
* * * *
373308 AATAATATAAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAGTAAATCTATT
255 AATAATAAAAATTTATTAAAATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATT
* * * * * * * *
373371 T-TATGAATACA-TTCAAACAGTTATGACCATTTCAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAAC
319 TAT-TGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATC
* * * * * * * *
373433 ATTTTGTTTTGTCATAAACCAACTGTTTTTGTTCATA-AAGGCTAATTCAGAATAAAATAATATT
382 -TTTTATTTTATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA-GATTATTCA-AATAAAATAATATT
* ** * * * * *
373497 AATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAGCAA
444 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAACATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACAA
* * * * * * * * *
373562 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGA-TAAGATCTTTTATTTTGT
507 ATTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGATATTTTGTTTTGT
* * * * * *
373626 TATAAAACAATTGTTTCTATTCATAGATGTTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
571 AATAAAACAATTGTTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *** * * ** ** * * **
373691 TCTAAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTCAATGAACAAGTTGAAATAGT
635 T-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAAC
* * ** **
373756 CATGTCCATTTGAACTATTATC-
698 CATGACTATTCCAAAAATTA-CA
* * * ** * * *** * **
373778 TATTTTAAATCGTTAAGATATTTTATTTTTTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTA-
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * *
373842 TTCATAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAACT
66 TTCA-AATAAAATAATACA-AACTTATTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAATTTTAAAAAAT
* * * * * * * * * **
373903 AAATTTGTTTAT-TGAGCCAATTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTAGCTACCTCAAATCA
129 AAATCTATTT-TCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
373967 TTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAA-TAATTATTTTTGTTGATACAA-GCTTATT
193 TTATAACCTTTTGTTTTATCA-AAAATTAATTGTTTCTGTTCATA-AAGGCTTATT
374020 TGGAGTAAAA
Statistics
Matches: 19919, Mismatches: 4676, Indels: 3663
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
673 1 0.00
674 21 0.00
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ATCTATTTTCTAAACAAATTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
TAACCTTTTGTTTTATCAAAAATTAATTGTTTCTGTTCATAAAGGCTTATTCAGAACAAAATAAT
AAAAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATTGAA
CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATTCATAAGATCTTTTATTTT
ATTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
TTTTAAAAATTAATAAGTAAACATTTAAAAAATAAATATGTTTACGAACAAATTGAAATAATCAT
GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTT
TAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
TAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTCACCGAACTGGATCAAATAACCATGACTATTCCAAAAAT
TACA
Found at i:350806 original size:181 final size:179
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * ** **
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128 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * *
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1 ATTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAAT
* ** *
350653 TCATACATGCTTATTCAAAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAG
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* * *
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* * * *
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1 A-TTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG--TTT
* * * *
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* *** **
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* ** * ** * * * * **
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1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAATAATTGTTTCA
* * * * *
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64 ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TA
* * * * **** * * * * *
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128 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * *
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1 AT-TTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA--TTGTTTC
* * * *
351196 AATTCATACTAGTTTATTTGGAATAACA-TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
63 AATTCATACAAGCTTATTCGGAATAA-AGTAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
351259 TTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGATT
126 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * *
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1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAATAAT-TGTTTC
** ** * * ** ** *
351377 TGTTTGTATAAGTTTGCTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATA
63 AATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATA
* *
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128 AGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
** * * * * * * * * * * **
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1 A-TTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAA
* * * * * *
351555 TTCATACTAA-TTTGTT---AATATA-TCA-AC-AA-TTAATAACTA----AAAAATTTAGAAAA
65 TTCATAC-AAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAA-TATTTCAAAAA-TTA-ATAA
* * ** * * *** * * * **
351608 TAATTATATTTATCGAACTAGATCAAATAATCATGACTA-TTTGAATAATTAT--CT
126 TAA-GAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACCA-AACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * *
351662 AATT--CAA--ATC--GTT---A-CA--AT---CTTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCAGT
1 ATTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAAT
* * * * * * *
351712 TCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATGTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAG
66 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAT-AAG
* * **
351777 AGATTT-AAAAATGAATCT-TTTACTAAAAAAGCTT-AAATAATTATGACT
130 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAG-TTCAAATAATTATGACT
* * * * * * * *
351825 GTTTGAACAATTGTCTATTT-AAGATCACTATAACCTTTCGTTTTGTGATAAAATAAAAT-TTTC
1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTGTTTC
* * * * * *
351888 TATTCATACAAGTTTTTTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAGTA-TT-AAGATAATTAAT
63 AATTCATACAAG-CTTATTCGGAATAAAGTAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAAT
* * * * *
351949 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAACTGTTT---GAACAAGTTCAAATCATTATGACT
124 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * ** * *
352003 ATTTGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAA
* * * * ** *
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* * ** * * * * *
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129 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * *
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1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAA
* ** * * * *
352249 TTCATAGAAGCTTATT-TAAAGTAAAATAGTACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTA
65 TTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AATA
* * * * * *
352313 AGAGAATTAAAAAATGAAT-TCGTTTATCGAA-TAAGTTTAAA-AAGTTATGGCT
128 AGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACT-AGTTCAAATAA-TTATGACT
* * ** * * * *
352365 ATTTGAACAATTAACTATCACAAAACATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TGTTCT
1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCA
* * * * ** * *
352429 TTTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAA-AAAT-TTAAATTTCCTAATATTCCAAAAATTAATTAG
64 ATTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAGTAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAA
* * * * * ** * * *
352491 CAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACATA-TTCTAATAGTTATAACT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-TAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * *** *
352544 ATTTGAACAATAATCTATTTGAAATCCTTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAGCCAATTGTTTCT
1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA
* * * *
352608 ATTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATTAGTA
64 ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAATA
** * *
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128 AGA-GATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACCAAACT-AGTTCAAATAATTATGACT
* * * * *
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1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA
* * ** *
352787 ATTTATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGC
64 ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA--
* * * * * ** * * * *
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126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * ***
352904 ATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTTTG
1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAA
* ** ** * *
352969 TTCATATAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAG
65 TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAG
* * * *
353031 AGATTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
130 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * * *
353081 ATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATAATC-TTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCT
1 ATTT-AATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA
* ** * * ** * *
353144 ATTCATACAAGCTCATTTAGAGTAAAAT-ATAGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAACTAATAAG
64 ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATA-CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-
* * * * * * * * * *
353207 CAAGAGATTTAAAATATAAATGTATTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGATT
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * * * * *
353261 ATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTTTGACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTCTTTCAG
1 ATT-TAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAA
* ** * * * * * * * *
353326 TTCATGCGTGCTTATTTGAAATAAAATAACACTATTTTATTAACATTTAAAAAATTAATAAGCAA
65 TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAA
* * * * * * *
353391 GAAATTT-GAAAATAAATTTGTTTATCC-AACAAATTTAAATAGTTATGA-T
129 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * *
353440 AATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAATAATTGTTTC
1 -ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* ** * * * * *
353505 AATTCATA-AATGCTGATTCAAAATAAAATTATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAG
63 AATTCATACAA-GCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-
* * ** * * * *
353569 T-TGAAGATTTAAAAAATTAATCAATTTATCGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCC
126 TAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAATTATGACT
* ** * * * *
353623 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTATTATAAAATAATTGTTTTTC
1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG--TTTC
* * * * *
353688 AA--CATACAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGT
63 AATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-T
* * * * ** * *
353751 AGGTGATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAACTAGTTTAAATAATTA-CACT
127 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * *
353803 GTTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTAT-TTTTGTCATAAAATCATTATTT-A
1 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA
* * * * * * * * * *
353866 TGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAAC
64 -ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-
* * *
353930 TAAGAGA-TTAAAAAACAAATTTATTTACCAAAC
126 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
353963 CAATTTATAT
Statistics
Matches: 2620, Mismatches: 592, Indels: 326
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
155 2 0.00
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Consensus pattern (179 bp):
ATTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAAT
TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAGTAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGA
GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACT
Found at i:351411 original size:546 final size:535
Alignment explanation
Indices: 350427--353967 Score: 1211
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350417 AATTATCTAT
* *
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** * * * *
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* * *
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*
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*
350687 TTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAGTGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATCAAT
261 TTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATCAAT
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326 TCAAATAATTATGACTACGTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTACTACCTTTTGTTTGGTCAT
* * *** * *
350817 ATAACAATTGCTTTTGAATATTCAAGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTAATCTTTC
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* ** **
350882 AAAAATTAATAAGTAAGAGACTTAAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACTAGTTCAAATTGTTATG
456 AAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTAAAAAAA-AAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATG
350947 ACTATTTGAATAATTGTAAAC
515 ACTATTTGAATAATTGTAAAC
** * ** ** *
350968 TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTTTTATAAAATTATTATTTTTG-TTCATA-CAAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTATTTCAGTTTCACATCAAGCTTATT
351031 CGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATT-AATAACTAAGAAAATTAAAAAATA
66 CGGAATAAAAT-ATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAATAA--AAG--AATTAAAAAATA
* * * * * ** * * *
351095 AATTTTTTTG-TTGAACTATTTTAAATATTTAAGATTATATGAATAAATATCTATTTCAAATCAT
126 AATCTATTTGCCT-AAATAGTTTAAATAGCTAAAACTATAT-AACAAATATCTATTTCAAATCAT
* * * * ***
351159 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTCATAC-TAGTTTATTTGGAATAAC
189 TATGACATTTTATTTTGTCATAAAATAA--TTGTTTCAATTCATACAT-GCTTATTCAAAATAA-
* * * *
351223 A-TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTT
250 AGTAATAAT-AATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * * * * *
351286 TACCTAA-CTAGTTCAAATAATTATGATTA-TTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGAT
314 TACCAAATC-AATTCAAATAATTATGACTACGTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTACT-AC
* * ** * * *
351348 CTTTTGTTT-TTCCATAAAAC-ATATGTTTTTGTTTGTAT-AAGTTTGCTCAAAATAA-AGTAAT
376 CTTTTGTTTGGT-CATAAAACAAT-TGCTTTTGAATAT-TCAAGCTTACTCAAAATAAGA-TAAT
*
351409 ACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAATCTATTTATCAAACTAGT
437 ACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTAAAAAAAAAATCTATTTATCAAACTAGT
* ** ** *
351474 TCAAATAATTATGACTATTTTAGCAATTGTTTAT
502 TCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTAAAC
* * * * * * ** * * *
351508 TTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTATTAGAAAATGATTCTTTC--TTT-TCAT--A-CTAATT
1 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTATTTCAGTTTCACATCAAGCTTATT
* * * * * * *
351567 -TG--T--TA-ATA-T-ATC-AA-CA-ATT-----AA-TAACTAAAA-AATTTAGAAAATAATTA
66 CGGAATAAAATATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAATAAAAGAA-TTAAAAAATAAATC
** * * * * * ** * * * * * **
351614 TATTTATCGAACTAGATCAAATA-ATCATGACTATTTGAATAATTATCTAATTCAAATCGTTACA
130 TATTTGCCTAAATAGTTTAAATAGCT-AAAACTATAT-AACAAATATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * * ** * *
351678 ATC-TTTTGTTTTGTAATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATA
193 A-CATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAGTAATA
* * * * * * * *
351742 CTAATGTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTT-AAAAATGAATCT-TTTACTAAA
257 ATAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA
* * * *
351804 -AAAGCTT-AAATAATTATGACT--GTTTGAACAATTGTCTATTT-AAGATCACTA-TAACCTTT
321 TCAA--TTCAAATAATTATGACTACG-TT-AATAATTATCTATTTCAA-ATCATTACT-ACCTTT
* * * * * * * * ** *
351863 CGTTTTGTGATAAAATAAAATT--TTCT-ATTCATACAAGTTTTTTTC-AAATAAAATAATA-TA
380 TGTTTGGTCAT-AAA-ACAATTGCTTTTGAAT-ATTCAAG-CTTACTCAAAATAAGATAATACT-
* * * *
351923 AATTTATTAGTA-TT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAA-CT-GTT-T-GAA
440 AATCTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG----AGA-TTAAAAAA-AAAATCTATTTATCAAA
* * * * ** *
351982 CAAGTTCAAATCATTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
497 CTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTAAAC
* ** * * * * * * * * *
352021 TTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC--TATTCATA-CAAGTTTAT
1 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTATTTCAGT-TTCACATCAAGCTTAT
* * * * *** * *
352083 TCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
65 TCGGAATAAAAT-ATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATT-A-AA-TAAAAGAATTAAAAAATA
* * ** * ** * * * *
352148 AATATGTTT-AATAAGCA-AGTTCAAATAG-TCATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATT
126 AATCTATTTGCCTAA--ATAGTTTAAATAGCT-AAAACTATAT-AACAAATATCTATTTCAAATC
* * * * * *
352210 ATTATGACCA-TTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTTAAAGTAAA
187 ATTATGA-CATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * * *
352274 ATAGTACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAAT-TCGTTT
251 GTAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTT
* * * * * * * ** *
352338 ATCGAAT-AAGTTTAAA-AAGTTATGGCTA-TTTGAACAATTAACTATCACAAAACATTA-TGAC
315 ACCAAATCAA-TTCAAATAA-TTATGACTACGTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTACT-AC
* * * * * * *
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376 CTTTTGTTTGGTCATAAAACAA-TTG--CTTTTGAATATTCAAGCTTA-CTCAAAATAAGATAAT
* * ** * * * * * *
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437 ACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAA-TA--AGAGA-TTAAAAAAAAAATCTATTTATC-AA
* * * * ** ** *
352522 ACATA-TTCTAATAGTTATAACTATTTGAACAATAATCTAT
496 AC-TAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTAAAC
* * * * *** * * *
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1 TTCAAATCATTA-TAACCTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTATTTCAGT-TTCACATCAAGCTTA
* * * * * *
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64 TTCGGAATAAAAT-ATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAA--A-TAAAAGAATTAAAAAAT
* * * * * ** * * *
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* * * * * *
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187 A-TTATGA-CATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAA
* * * * *
352812 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGCT-GGAGATTTAAAAAATAAAT-TCA
250 AGTAATAATAATTTATTAATATTTC-AAAAAATAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-G
* * ** * * * * * * *
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312 TTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGACTACGTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTACT-
* * * * * * ** * *
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374 ACCTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTGCTTTTGAAT-AT-TCAAGCTTACTCAAAATAAGATAAT
* * ** * *
352999 ACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAACTAG
437 ACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA-TTAAAAAAAAAATCTATTTATCAAACTAG
* * * * *
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* * * * * *
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1 TTCAAATCATTATAACCTTT-TGTTCTAT-TATAAAAAAATTATTTCAGT-TTCACATCAAGCTT
** * * * * *
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63 ATTCGGAATAAAATATA-CTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAATAA--AAGA-A-TTAAAAA
* * * * * * * * * *
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123 ATAAATCTATTTGCCTAAA-TAGTTTAAATAGCTAAAACTA-TATAACAAATATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * **
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186 CATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAA
* * * * * * * *
353351 ATAACACTATTTTATTAACATTT-AAAAAATTAATAAGC-AAGAAATTT-GAAAATAAATTTGTT
251 GTAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAAA-TAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
* * ** * *
353413 TATCC-AA-CAAATTTAAATAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTA-TGA
314 TA-CCAAATC-AATTCAAATAATTATGACTACGTT-AATAATTATCTATTTCAAATCATTACT-A
** * * * * * * *
353474 CCTTTTGTTTTTATCATAAAATAATTG--TTTCAAT-TCATAAATGCTGATTCAAAATAAAATTA
375 CCTTTTG-TTTGGTCATAAAACAATTGCTTTTGAATAT--TCAA-GCTTACTCAAAATAAGATAA
* * * * ** * *
353536 TATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCAATTTATCGA
436 TACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA---G-AGA-TTAAAAAAAAAATCTATTTATCAA
* * * * ** *
353601 A-TCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTAT
496 ACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTAAAC
** * * * * *
353641 TTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTATTATAAAATAATT-GTT---TTTCAACATACAAGCCTA
1 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTATTTCAGTTTC-ACAT-CAAGCTTA
* * * * * * * *
353702 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTT-AATAAGTAGGTGATTTAAAAAA
64 TTCGGAATAAAAT-ATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAAATAA--A--AGAATTAAAAAA
* * * * * * * * * *
353766 TAAATATATTT-ACTGAACTAGTTTAAATA-ATTACACTGTTTGAACAATTATATATTTCAAATC
124 TAAATCTATTTGCCT-AAATAGTTTAAATAGCTAAAACTATAT-AACAAATATCTATTTCAAATC
* * * * * * * **
353829 ATTATAAC-CTTTATTTTTGTCATAAAATCATTATTT-ATGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAA
187 ATTATGACATTTTA-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA-ATTCATACATGCTTATTCAAAATAA
* * * * * * * * *
353892 AATAATATTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGA-TTAAAAAACAAATTTATT
250 AGTAATAATAATTTATTAATATT-TCAAAAAATAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTT
*
353955 TACCAAACCAATT
314 TACCAAATCAATT
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Statistics
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TTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTCAAAATAAAGTAATAATAA
TTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATCAAT
TCAAATAATTATGACTACGTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTACTACCTTTTGTTTGGTCAT
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AAAAATTAATAAGAGATTAAAAAAAAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATT
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351548 CTTTCTTTTC
* * * * * * *
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* * * * * * **
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* ** * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * * *
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* * * *
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* *
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* * * **
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* * ** *
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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* * *
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* * * * *
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1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATT-GATTTACT
* * * * ** *
352340 CGAATAAGTTTAAAAAGTTATGGCTATTTGAACAATTAACTATCACAAAACATTATGACATTTTG
64 -GAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTG
* * *
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** * * * * *
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* * * *
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*** *
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* *
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* * *
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* * *
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** * **
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* ** * ** * * *
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* * * *
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* * * **
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* *
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* * * * * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* **** *
353312 AATAATTCTTTC-AGTTCATGCGTGCTTATTTGAAATAAAATA
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* * * * * * *
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1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTACT
* * * * *
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64 -GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT
* * * * * *
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125 G-TTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * * * * * *
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* ** * * * * *
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251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * * * *
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* **
353716 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATAT-ATTTACT
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* * * * * *
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64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTT-TG
* * * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * **
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* *
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* * * *
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* *
354130 ATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAACTAA-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTCAC
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** * * * * *
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63 TGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * * ** * * * **
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126 TTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * * ** * *
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* * * * * *
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* ** * *
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* * *
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* ** *
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* * * * *
354615 ATTATCATAAAAACAATT-TTTAGTATTCATACAAGCTTATTTCAAATCTGTTTACTAAATAAT-
127 TTTGTCATAAAATC-ATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTA-TTCAAA-----ATA--AAATAATA
**** * * ** * ** * ** *
354678 TTCAA-TTAGTTATGATTATT-TGGGTGATTATTTATTTCAA-ATCATTATGACAT-TTTGT-TT
182 TT-AATTTA-TTA--A-TATTCT-AAAAATTAATAAGCTAAAGAT--TTAAAAAATAAATCTATT
* ** * *
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239 T-TCA--A-ACCAATTCA-AATAGTT-AT---AAC-TATTT-GA--ACAAT--TATCT-A-TT-T
* * *** *
354800 TAATATTCATGAATTAAT-AACTAAAAGATTTA--A-AAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTC
286 CAA-A-TC--G--TT-ATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAAT-AAT-TGTTT-CT-----A-TTC
* * *
354861 AAATAGTAATAAC-TATTTG-AATAATTATCTA
334 --ATA--AA-AGCTTATTCGAAATAA--A-ATA
* * * * ** * *** * *
354892 TTTCAAATCGTTATGACATTTTATTTCATCATAAAACAAT-TGTATAA-ATTTATATAGGCTTAT
1 ATACTAAT--TTATTA-A---TATTTCA--A-AAATTAATAAGTA-AAGATTTA-A-AAAATAAA
** * * * * * * * * *
354955 TTGAAATA--AAATAATAC-TA-ACTTATTACTATTTTGAA-AATTAAT-TA-GTAAGAGAT-TT
54 TTGATTTACTGAATAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATT-ATCTATTTCA-A-ATCAT
* * * * * ** *
355012 TAAAAATGA-ATATGTTTACTGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGA-ACAATTG-TCTA
115 T----ATGACTTTTGTTT--TG-TC-A--TAAAATCA-TTGTTTCTA-TTCATACAA--GCT-TA
** * * ** * * * **** * *
355073 TTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TA-
165 -TTCAAAAT-AAAAT-A-ATATTAATTT---AT-TAA-TATTCTAAAAATT-A-ATAAGCTAAAG
* ** * * *
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**
355195 CAAAAAATCTGTTTTATGAAC-ATGTTCAAATATTTATGA-CTATTTGAACAATTGTTTATTTCA
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* * *
355258 -AATCATTATGACATT-TTT-TTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTAGA
314 TAA--A--AT-A-ATTGTTTCTAT-TCAT-AA--AA--G-CT-TATTC---GAAA--TA---A-A
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* * ** *
355327 ATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTCCT-
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355456 TTTGTCATAAAGCA-AATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCACAATAAAATAAAAATAATTTA
127 TTTGTCATAAA--ATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* * * * * * *
355520 TTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGA--TAAAAACTAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAA
190 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATTCAA
* * * ** * * *
355579 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTACCTCAAATCGGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAA
254 ATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* *
355643 TAATTGTTTCTATCCATACAAA-CTTATTCGAAGTAAAAT-
319 TAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCGAAATAAAATA
** * * * * *
355682 AT--T--GCTA--AAT-TCT-AAAAATTTATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAA-TGTATTTGCC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTG-ATTTACT
* * * * ** * * *
355738 AAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATCATTGTAACCTTTTGT
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGT
* * * * * ** * *
355803 TTAGTCATGAAATAATTGTTT-TAGTTCAAACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTAT
127 TTTGTCATAAAATCATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
** * *
355867 TAACGTTCAAAAAAATTAATAAGC-AAAGAATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTT
191 TAATATTC-TAAAAATTAATAAGCTAAAG-ATTT-AAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TT
* * * * *
355930 CAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCCACTTAAAAT-GTTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * *
355994 AAAACAATTGTTT-TATTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATA
315 AAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * ** * * * **
356038 ATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGAA-AAGTTGGAGATTTAAAACACATATCAATTTA-T
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATTGATTTACT
* * * *
356101 CGAATCAGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAACCATTTTGAACTTTTG
64 -GAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTG
* * *
356166 TTTTGTCATAAAA-CAATT-TTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
126 TTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * *
356228 ATTAATATT-TCAAAAATTAATATG-TAGTAGA-TT-----AT--A--TGTTTACAGAACCATTT
189 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCA-AACCAATT
* * * * * * *
356281 TAAATAATTA-AGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGTCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
251 CAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * * **
356345 AAAAGAATTATTTATATTCATGCAAGCTTATTCGAAATAAAATA
315 AAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
** * * ** * * **
356389 ATACTAAAATAATAATATTAT-GAAAATTAATATCTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTATTTGTT
1 ATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTGATTTACT
* * * * * * * * * * *
356453 GAACCAATTAAAATGGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAAT-TTTACGTCATTTTGT
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGT
* * * * * * * * * *
356517 GTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATATTAATTTATT
127 TTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATT
* * * * * * *
356582 AATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATCAGTTCAATT
192 AATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTC-AAACCAATTCAAAT
* * * * ** * * * *
356643 AGTTATAACAATTTAAACAATTATTTATTTCATATATTTATGACCATTTGTTTTGTTATAAAACA
256 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATA
* ** * * **
356708 ATTATTTCTATTCAT-GCAGTCATATTTGAAATAATGTA
321 ATTGTTTCTATTCATAAAAG-CTTATTCGAAATAAAATA
* * * * ** **
356746 ATGCTAATTTATTAATA-TTCAAAAA-AATATAAGTAAGAAATTTAAAAAATGAATCAATTGGCT
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTGATTTAC-
* * * * * * *
356809 TGACTA-TACAAATAGTTATGACTGTTTGAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACTTTTTAT
63 TGAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGT
* * * * * * *
356873 TTTGTCACAAAA-CAATTATTTTTGTCCATACAAGCTTATTCGAAATAAGATAAT-TCTAATTTA
127 TTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT-TAATTTA
* * * * * * *
356936 TTAATATTCCAAAAGTTAATAA-ATAAGAGATTTAAAAATTGAATTTGTTTATCAAA-CAAGTTC
190 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TTC
* * * * * *
356999 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCATCATAACCTTTTGTTTTGTCATAA
252 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA
* * *
357064 AATAATTTTTTTCTATTCCTATAAA-CTTATTTC-AATTAAAATA
317 AATAA-TTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTA-TTCGAAATAAAATA
*
357107 AT-CTAAATTTATT-ATCA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTT
1 ATACT-AATTTATTAAT-ATTTCA-AAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTT
* * *
357168 ACAT-AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTCTTTCAAATCATTATGACTTT
61 AC-TGAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TT
* * * ** * *
357232 TTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTTTATTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAGT
123 TTGTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAT
* * * ** * * * *
357296 TTATTAATATCCTGATAGCTAATAAG-TAGAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAG
187 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-
* * * * * * *
357359 TTCAAATAGTCATAACTATTTTAATAATTATCTATTTCAGATTGTTATGACCTTTTATTTCATCA
249 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
* * * ** * * * *
357424 TAAAACAATTATATAAATTCCTATAGGCTTATTCAAAATAAAATA
314 TAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * *
357469 ATACTAATTTATTAATA-TTC------TGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATT
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* *
357526 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGT
* * ** * *
357591 TTTGTCATTAAA-CAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCTGAATAAAACAATATAAATTTAT
127 TTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * *
357655 TAATATTCCAAAAATTACTAAG-T-AAGAATTTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAA-CACGTTC
191 TAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAG-A-TTTAAAAAATAAATCTATTTTC-AAACCA-ATTC
* * * *
357717 AAATAGTTA-AGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCAT-
252 AAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * * **
357780 --A-AA-----TCAATT-ATACAAGCGTATTTAAAATAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * *
357814 ATACT-ATTTTTTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATTTG-TTTAC-
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTACT
* * * ** *
357875 CAAGTAAGTTCAAATAGTTATAACCATTCAAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTT
64 GAA-T-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CTTTT
* * * * * * * **
357939 GTTTTGTCAT-ATAGCAATTGTTTGTATTCACACAAGGTTATTTAGAATAAAATAATACCAATTT
125 GTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * ** * *
358003 ATTAATATTATAACAATTAAT-AGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACTGAA-CAAGTT
189 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTC-AAACCAA-TT
* ** * * * * *
358066 CAAATAGTCATGTCCA-ATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTCTAT-TTTTGTCA
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-T-TGTTTTATCA
* * *
358129 TAAAATAATTATTTCTGTTCATGCAAAA--TTATTC-AGAATAATATA
314 TAAAATAATTGTTTCTATTCAT--AAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * ** *
358174 GTACTAACTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATCT-ATTTACTA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT-
* * * * * *
358235 AAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TCTTTATT
64 GAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTT
* * * * * ** *
358299 TTGTTACAAAA-CAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATGCTAATTTAAT
128 TTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATT
* * * * ** *
358363 AATATTCCAAAAATTTATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATGGAACCAGTTCAAA
192 AATATTCTAAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATTCAAA
* * ** * * ***
358427 TAATTA-AGACTATTTTGTTAATAAACA-C-A-TTCAAATAGTTATTA-CTATTTAAACAATTAT
255 TAGTTATA-ACTA-TTTG--AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTT---GTTTTAT
* *
358487 CTATTTGAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCATAAACTAATTGTTTCTATTCATACATGCGTA
312 C-A--T-AAA-A--TA--A----TTG--T--T--T---CT-A----TTC-A-T-A-A-AAGCTTA
*
358552 TTCAAAATAAAATA
345 TTCGAAATAAAATA
* * * * * **
358566 ATACTAGTTTATTCATATTCCAAAAAATAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAACCCG-TTTACC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTA-C
* * * *
358630 TAGCA-AGTTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATAATCTTTT
63 T-GAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CTTTT
* * * *** *
358693 GTTTTGTCATAAAA-CAATTG-TTCTATTTATATAAGTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTT
125 GTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * * * *
358756 TTTAATATTTTGAAAATTAAT-AGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-CAAGTT
189 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTC-AAACCAA-TT
* ** * * * * *
358819 CAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACA
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * * *
358884 AAACAATTGTTTTTGTTCAAGCTAAAA--TTATTC-AGAATAAAATT
316 AAATAATTGTTTCTATTC-A--TAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * ** * * *
358928 ATATTTATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATCT-ATTTTCCA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGA-TTTACT
* * * *
358989 AAATAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATCATTATGATTATTTGA
64 GAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACT-TTTGT
**** * * ** ** ** * * **** *
359053 ACAATCATTATGAATGATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAT-
127 TTTGTCA-TA--AA--ATCAT-TGTTT-CTATTCATACAAGC--TT-ATTCAAAATAAAATAATA
** * ** *
359117 TGTTTTTTATCATACAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
182 T-TAATTTAT--T--AA---TATTCT---A-AAAAT--TAATAAGCTA--AAGA-TTTAAAAA--
* ** * * * * * *
359181 AGTAAGTAAGAGATTT-AAGA--GA-T-AAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAA-ATTGTTATGAC
228 A-TAAAT-CTA-TTTTCAA-ACCAATTCAAA-TAG-TTAT--AACTATTTGAACA--ATTAT--C
* ** * * * ** ***
359240 TATTT-GAATAATTATCAATCTCAAATCGTTAAGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
281 TATTTCAAATCGTTAT-GA-C-C---T--TT-TG-T-TTTATCATAAAATA-----ATTGTTTCT
*
359304 GA-TCATAGAAA-CTTATTCG-ATTAAAAATA
330 -ATTCATA-AAAGCTTATTCGAAAT-AAAATA
* * * * *
359333 ATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTGCC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* ** * * **
359397 AAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATTGTTCA-GACCTTTTG
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGA-CTTTTG
* * * * * *
359460 TTTAGTCA-AAAAT-ATTTGTTTC-ATATCTTACAAGTTTATTCAGAATAAAATAAT-TCAAAGT
126 TTTTGTCATAAAATCA-TTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT-TAATT
* * * * * * **
359521 TATTAACATT-TGGAAAATTAACAAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCTCTTTATTGAA-CAAG
188 TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-
* * * * *
359584 TTCAAGTAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGA-C
249 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTATC
* * *
359647 ATAAAAAAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTA-TC-AAGAGTAAAATA
313 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAA-A-TAAAATA
* * *
359693 ATACTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCAAA-AGTTAAAAAAAATAAATTTAAATAAA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGA-TT--------TAAA---AAATAAA
* ** * * * * * * * *
359757 TTTATTTACCAAACAAATTTAAATAGTTACGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCGTTAT
54 TTGATTTACTGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* *
359822 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TAGTTCATACGAA-CTTATTCAAAATAAAATAA
118 GA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * * * * *
359885 AACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-T---GATTTAAAAAGTTAATTTGCTTATCGA
180 TATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTTCAA
* * ** * * * * *
359946 ATCAATTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTT
244 ACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT
* * ** * *
360011 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTCATGCAAAA--TTATTCAAAATAAAAAA
309 TATCATAAAATAATTGTTTCTATTCAT--AAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * *
360061 AAACTGATTTATTAACA-TTCTAAAAATTAATAACTCAGAGATTTGAAAAAATAAATCT-TTTTA
1 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAAGATTT-AAAAAATAAAT-TGATTTA
* * * * * * * **
360124 CTAAACAAGTTCAAACAATTATGATTATTTGAACAATTAGCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTT
62 CTGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTT
* * * * *
360189 GTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTC-AAT-ATAAAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTT
125 GTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * **
360250 ATTAA-ATT-TCAAAACTT-ATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTACTAAATTAGA
189 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTTC-AAACCA-A
* ** * *
360310 -TCAAATAATTATGGGC-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATC
249 TTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * *
360373 ATAAAACAATTGTTT-TGCA-ACATATAAGCTTATT--AAATAAAATTG
313 ATAAAATAATTGTTTCT--ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAA-TA
* * * * * * * * ** *
360418 TTATTACCTTTCGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
1 ATACTA-ATTT-ATTAATAT-TTCAAA-AA---TTAAT-AA-GTA-AAG---ATTT--AA-AAAA
* * * * * * * * *
360482 TAATACTAATTT-TTTAATATTTCAAGAATTAG-TAAGA-TATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
50 TAA-ATTGATTTACTGAATAGTTC-A-AA-TAGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT--C
** * * * * * * *
360544 AAA-CTAGTT-T-A-AATAGTTATGACCAGTTCAAAT-AGTTATTACTATTTGA-ACAA--TTAT
108 AAATC-A-TTATGACTTTTGTTTTG-TCA--TAAAATCA-TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT
* ** * * * ***
360601 T-TATTTCAAATTAT-TATAACCTTCTATT-CTA-TCATAAAACAATTATTTATTTTCATACAA-
166 TCAAAATAAAATAATAT-TAA--TT-TATTAATATTC-T-AAA-AATTA---ATAAGC-TA-AAG
* * ** * * * *
360661 ATTTATTTAGAAAAAATAATACTAATTT-AATAATAGTTTAAA-AATTCATAACTAAGAGATTTA
219 ATTTA---A-AAAATA-AAT-CTATTTTCAA-ACCAATTCAAATAGTT-ATAACT-----ATTTG
* * * * * * * ** *
360724 AAAAATAAAT-TCATTTGTCGAACCAATTCAAATAGATAAAACTATATGAACAATTATCTATTGC
271 AACAAT-TATCT-A-TT-TC--A--AA-TC--GT-TAT-GACCT-TTTG---TTTTATC-A-T-A
* * *
360788 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGGA
316 AAAT-AAT-TG----TTT-CTAT-TCATAAAAGC--TTA-TTC-G-----A-AA---TA-----A
*
360852 ATAAA
355 A-ATA
* * * * * * *
360857 ATAAAATAAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGGAAGAGATTTTTAAAAA-AAATTCTATT
1 AT--ACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGA-TTTAAAAAATAAATT-GATT
* * * *
360921 TAC-CAAGCTAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATCATTATTACTT
60 TACTGAA--TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-T
* * * * *
360984 TTTGTTTTATCATAAAA-CAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAA
122 TTTGTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAA
* * * * * *
361048 TTTATTAATATT-TAGAAAATTAATCAG-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTTTATGAAATCA
186 TTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCA
* * * * * * * *
361111 TTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATCATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTTATG
248 ATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * ** ** *
361176 ATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATT-TAGAATAAAATA
313 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * * ** ***** *
361222 ATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAA-A
1 A-TA---CTAATT---T-ATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-A-AGTAAAGATT-T-AAAAAATA
** * * * * * ** *
361285 AATT-ATTT--TTCATCA-TTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATGAATTTATTA-ATATTTC
52 AATTGATTTACTGAAT-AGTTCAA--ATAGTT---AT-GACT-ATTTGAA-CAATTATCTATTTC
* * * * ** * *** * * *
361345 AAA-AAGTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAACAAAT--TTGTTTACCAAACTAGTTTGAATAGTTA
108 AAATCA-TTATGACT-TTTGTTTTGTCATA-AAATCATTGTTT------CTA--TT-CATA--CA
* * ** * *
361407 TGAC-TATTTGAATAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAG-TAGAT
159 AG-CTTA-TTCAA-AA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGCTA-AA
* * * * *
361469 GATTTAAAAAAGAAATATATTTACCAAA--AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
218 GATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * *
361532 TATTTAAAATCGGTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
281 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTAT
* * *
361597 TTGGATTAAAATA
346 TCGAAATAAAATA
* * * * * * *
361610 ATATTAATTTTTTAATATTTCAACAATTAGTAAGTAAAATATTTTAAAAATAAATATG-TTTACC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* * * * * * **
361674 AAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGT
** * * * * * * * *
361739 TTCATCATAAAA-CAATTATATC-AGTGCATA-TAGCCTCATTTAAAATAAAATAATACTAATTG
127 TTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTA-TTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * * * * * *
361801 AATAATATT-TCAAAAATTATTGAG-TAAGAGATTTAGAATATGAATTTGTTTACCAAA-GAAGT
189 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-T
* * * * * * * *
361863 TCAAATGGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATGTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAT
250 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * * *
361928 AGAATAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCCG-AAGAAAATA
315 AAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT-CGAAATAAAATA
* * * *
361972 ATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAAAATTTAAAAAACAAAATTG-TTTTCT
1 ATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAA-TAAATTGATTTACT
*
362035 GAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTCATGACCTTTT
64 G-A-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CTTTT
* * * * * *
362098 GTTTTGTTAT-AAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
125 GTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * *
362162 ATTGATATT-TCAAAAAATAATAAG-TAAAAAAATTAAAAAATAAAT-AATTTATC-AAGCAAGT
189 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-T
* * * * * ** * * * *
362223 TTAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTGTGAT
250 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * * *
362288 AAAATAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATTAGAAATAAAA-A
315 AAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* *
362331 ATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAA-T-ATTTA-T
1 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATTGATTTACT
* ** * * * ** * * ***
362392 -ACTA-AACAAGTTAGTCATGTCCCTTTGAATATTTATCTATTTCAAATTGGTATGACCTTTTGT
64 GAATAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGT
* * * ** * * *
362455 TTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATGCAAAATGATTCAAAACAAAAAAATACTGATACAT
127 TTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-T--TA-AT
* * * * * * *
362519 AATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAA-AAACTAAATCTG-TTTACCGAAAAATAAATGTGTT
187 --T-TATT-AATATT-CTAA-A-AATTAATAAGCTAAA---GATTTA---AAAAATAAATCTATT
* * * * * * *
362582 TGCCAAACCATTTCAAATACTTA-AGACTGTTAGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACCT
239 T-TCAAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
* ** * * *
362646 TTTG-TTTAGTCAGAAAGCAATTATTTC-AGTTCGTAGAAGCTTATTC-ATAATAAAATA
302 TTTGTTTTA-TCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* ** * * *
362703 AAACTAATTTATTAATATTAAAAAAACTAATGAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAATTCG-TTTA-
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAGA-TTTAAAAAATAAATT-GATTTAC
* * * *
362766 TCGAACAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTT-ATACAATTATTTATTT-AAAGCCATTATGACCT
63 T-GAA-TAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGA-CT
** * * * ** * *
362828 TTCATTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAC
122 TTTGTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAA
** * **
362892 CCTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG-TAAGAGA-TTAAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTGAAC
186 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAA-TAAA-TCT-ATTTTCAAAC
* * * * * * * *
362953 CAATTCTAATAGTTATAAATATTTCAACAAATAT-TAATCTCAAATTGTTATAATC-TTTGTTTT
246 CAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
363016 CTCAGAAAATAGTTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAAATA
310 ATCATAAAATAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCGAAAT-AAAATA
** * *
363065 ATACTAGCTTAATAGTATTTCAAAAATTAATAAGT---GATTT-AAAAATAAATGTG-TTTGA-T
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTT-ACT
* * * * * * *
363124 GAACCAATTCAAATAGTTAAGAATATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTAT
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGT
* * * * * * *
363189 TTAGTCATACAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTACTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
127 TTTGTCATAAAATCATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* ** * * * * * *
363253 TAACATTGAAAAAATTAATAAGC-ATGAGATTTGAAAAGATAAATGTGTTTATCGAA-TAAGTTC
191 TAATATTCTAAAAATTAATAAGCTA-AAGATTT-AAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TTC
* * * * * * *
363316 AAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATC-AATTCAAAATCATTA-GACCTTTTATTTTGTCGTA
252 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * * *
363379 AAATAATTATTT-TAGTTCATAAATGCTTATCCAAAATAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
** *
363422 ATAC-AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCAATTTATTG
1 ATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTGATTTACTG
* * * * *
363483 AATCAATTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACATTTTGT
65 AAT-AGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGT
* * * * ** **
363547 TTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-ACATACCAGCTTATTTGAAATAAAATAATCCTAATTTAT
127 TTTGTCATAAAATCATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* **
363611 TAATATT-TGAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACC-ATTACA
191 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATT-CA
* * *
363670 AATAGTT-TGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--TTAT---C---------A-C--AAA
253 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * *
363717 ACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
318 ATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * ** *
363758 ATGCTAATTTAGTAA-AATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGA-TTAAAAAATAAATCCATTTGC-
1 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATTGATTTACT
* * * * * * **
363820 CAAGCTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
64 GAA--TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * * * * * **
363885 TTTTGTCATAAAA-CAATTATTTC-AGCTCATACAAGCTTCTGCGAAATAGAATGAA-ACAAATT
126 TTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-AATATTAATT
* * ** * * * *
363947 TATCAATATTTTAAAAATTTGTAAG-T-AAGAAGTTTAGAAAATAATTCTATTTACCGAACCAAT
188 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAG-A-TTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAAT
* * * * * * * *
364010 TCAAATAATTATAACTATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTAAT
250 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * * * * * * * *
364075 AAAACAATTGTTTTTGTTAATATAGGTTTGTTTGAAATAAAATA
315 AAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * *
364119 ATACTAATTTATTAATATTT-AGATAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCT-CTTTAC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTAC
** * * * * * * ** * * *
364182 CAAACCATTTCAAATAG-T-TGAGTATTTAAATAATTAACTATTTCAAATTGTTATAAGCTTCTA
63 TGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * ** ** *
364245 TTTTGTCATCAAA-CAATTAGTTT-TGTTCATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
126 TTTTGTCATAAAATC-ATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * * * ** * *
364308 AATAATATTCTAAAACTTAATAA-CCAAACAAATTAAAAAATAAGTCCAATTACCGAACCTATTC
189 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAA-GATTTAAAAAATAAAT-CTATTTTCAAACCAATTC
* ** * * * *
364372 AAATAGTTA-AGACTATATGAACAACAATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCATA
252 AAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * * * * *
364436 AAATAATTATTT-TGTTCATACATGCTTATTTGAATTAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * ** **
364478 ATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGTTTTAAAAAAT-AATTTTTTTACCAA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTGATTTACTGA
* * * * * * * * *
364539 ATCAATTCAAGTGGTTAAGACAATTAGGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAGCTTTTCTT
66 AT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTT
** * * * * * * *
364604 TAATTATAAAA-CAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAGTACTAATTTATT
128 TTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATT
* * *
364668 AACATTC-AAAAATTTAATTA--TAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCAAA-CAAGGT
192 AATATTCTAAAAA-TTAATAAGCT-AA-AGATTT-AAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TT
* * * * * * * * * *
364729 CAAATAATTATTATTATTTGGACAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATA
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * * * *
364794 AAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGATAG-AATAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATA
* ** * * *
364837 ATACTAATTTATTATTATTTCCTAAATTATTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATTTG-TTTAC-
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTACT
* * * * * * ** *
364900 CAACTCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
64 GAA-T-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * * * **** *
364965 TTTTATCATAAAA-CAATTGTTTATGA-TCACAGAAGCTTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATT
126 TTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATATTAATT
* * * * *
365027 TAATAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTT
188 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATT
* * * ** * * * ** * *
365091 CAAATAATAAAAACTATTAAAATAATTTTTTATTTTTAATCTTTATGA-CTTGTTG-TTTAGTCG
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGTTTTA-TCA
* *
365154 TAAAAT-ATTAGTTTC-ATGTCCTATAAGC---TT---AAT----T-
314 TAAAATAATT-GTTTCTAT-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * *
365188 A-AC------ATT--CA----AAAAATTAATAAGCAAAATATTTGAAAAATTGAATGTG-TTTAC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAAGATTT-AAAAAATAAAT-TGATTTAC
** * * * * ****
365239 AAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGCCATGACTTTTTG
63 TGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTG
* * * * * *
365304 TTTTGCCATAAAA-CACTTGTTTC-AGTTCACAAAAGCTTATCCAAAATAAAGTAATACTAATTT
126 TTTTGTCATAAAATCA-TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * ** *
365367 CTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGC--ATGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATT
189 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATT
* * * * * * * *
365429 CAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTTATA
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * ** *
365494 AAACAATTGTTGC-AGTTCATACGAGCTTATTCAAAATAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * *
365537 ACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAAATTTAAAAAGTGAATATG-TTTA-T
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* * * * *** *
365600 CGAATTAGTTCAAATAATTATGACCATTTTAAGAATTATCTATTTCAAATCGCCATTACCTTTTG
64 -GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* *
365665 -TTTGCTCATATAACAATTATT-TTT-TA-TCATACAAGCTTATT-AAGAATAAAATAATACTAA
126 TTTTG-TC--ATAA-AATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATAATATTAA
* * * * ** *
365725 TTTTTTAATCTTTTAAAAATTAAT-AG-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTCGT-TTACCAGACCA
186 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAA-TC-TATTTTCAAACCA
* * * * * * * *
365787 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA--TATATCAAATCATCATAACCTTTTGTTCTATC
248 ATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * * * *
365850 CTAAAA-AAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
313 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * ** ** *
365895 ATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATGATTAAGAGATTTAAAATATAAATTTTTTTGTTA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATTGATTTACTG
* * * **
365960 AACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
65 AA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTT
* * * * * *
366025 TTGTCATAAAA-CAATT-TTTTTAAATTCATACTAGCTTATT-AGGAATAAAATAAAATGAAGTT
128 TTGTCATAAAATC-ATTGTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * * *
366087 ATTAAAATT-TCAAAAATTGATAAG-TAAGAGATTTAAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAAA
189 ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAA-AGATTT-AAAAAATAAATCTATTT-TCAAACC-AA
* * * * * *
366150 TT-AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTACGACATTTTGTTTTGTCA
249 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
* ** * * * *
366214 TAAAACAAAAGTTTTTGTTCATATAAATCTGT-TT-GGAATAAAATA
314 TAAAATAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCT-TATTCGAAATAAAATA
* * * **
366259 ATACTAATCTACTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAAT--ATT-TTTTATCAA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATTGATTTA-CTG
* * * ** * *
366318 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTATTAT
65 AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTT
* * ** * * *
366383 GTTATAAAATAATAATTTCTGTTCATACAAG-TATATTCATATTAAAATAATATTAATTTATTAA
130 GTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
* * * * * * *
366447 TATTTTGATAATTAAT-AGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAAT
194 TATTCTAAAAATTAATAAGCT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TTCAAAT
* ** ** * * * * * * * *
366510 AGTCATGGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTCTTATGTAATAAAACA
256 AGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATA
* * **
366575 ATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGATGTAAAATA
321 ATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * *
366613 ATACAAATTTATTAATA-TTCTAGAAATTAATGAA-TAAGAGAATTAAAAGA-GAATCTG-TTTA
1 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTA
* * * * * *
366674 CCGAATATGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACAATTAT-TGATTTCAAAACATAATGACCTTT
62 CTGAATA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGA-CTTT
* * * * * * *** * *
366738 TGATTTGTTATAAAA-CAATTGGTTCTGTTGATGCAAGCTTATTTGGAATAAAATGATATAAATT
124 TGTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * *
366802 TATT-ATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGT
188 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-T
* * * * ** *
366864 TCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCAT
250 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * * * ** *
366929 AAAACAACTATTTTTATTCA-AACAAAATTATTCAAAATAAAATA
315 AAAATAATTGTTTCTATTCATAA-AAGCTTATTCGAAATAAAATA
* ** *
366973 ATACTAATTTATGAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAGCTAAATCTG-TTT-CCG
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACTG
* ** * * *
367033 AACTAGTTCAAATAGCTACAACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGA-TCTTTGTT
65 AA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTT
* * * * * * * * *
367097 TTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTTATGCAAGATTATTCAGAGTTAAAT-ATAGCTAATCTAA
128 TTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TTAATTTAT
* * * *
367160 TAATATTCT-AAAATTAATAAG-TAAGAGATTTTAAAAATAAATATATTTGCTGAACCAA-TCAA
191 TAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTTC-AAACCAATTCAA
* * * ** * *
367222 ATAGTTA-AGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTT-ATTTAGTCATAA
254 ATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAA
* * * * *
367285 AATAATTGTTTC-AGTTCACACATGCTTATCCAAAATAAAATA
317 AATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
** * * *
367327 ATACT-ATTCTAGCAACA-TTCAAAAAATTAATAAGGAAGAAATTTTAAAAAATAAATCT-ATTT
1 ATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGA-TTTAAAAAATAAAT-TGATTT
* * * * * * * * * *
367389 ACTAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCGATTTGAACAATTATCTATTTAAAATGATTATGGCATTT
61 ACTGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTT
* * * * * **
367454 TGTTTTATAATAAAA-CAATTGTTT-GAGTTCATAAAAGCTTA-TGAAAATAAAATAATATTGCT
124 TGTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAT
* * ** * * * **
367516 TTATTAATATT-TAAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTTAAAAATAAAT-AAGTTTATCGAATGAA
187 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTT-TCAAACCAA
* ** * * * * * *
367579 TTCAAATAATTATTGCCATTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCA
249 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
* * * * *
367644 TAAAACAGTT-TTT-TTTTCATTGTATAAGCTTATTTGAAATAAAATA
314 TAAAATAATTGTTTCTATTCA---TAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* *
367690 ATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAA-ACAGTAGGAGATTTAAAAAATGAATTTG-TTTA-
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTA-AAGATTTAAAAAAT-AAATTGATTTAC
* * * * *
367751 TCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTGTAACCTTTT
63 T-GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTT
* * * * * * * * *
367816 ATTTTGTCATAAAA-CAATTATTTATGTTTATA-AATGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATC
125 GTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * * * *
367879 TAATAATATTATGAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACCAGTT
188 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTTC-AAACCAATT
* * * * * * * * *
367943 CAAATAATTA-AGGCTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCATTTGTTATGTCGT
251 CAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* * * * * * *
368007 AAAACAAATGTTT-TCCTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATA
315 AAAATAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * *
368051 ATACTAATCTACTAATATGTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCT-A-TAAATC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACTG
* * **
368111 AA-ACGAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG
65 AATA-G--TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTG
* * ** * * * * * * *
368175 TTTTGTTATAAAATAATAATTTTTGTTCATACAAGCATATTCAGATTAAAATAATATTCAGTTAT
126 TTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * *
368240 TAATATTTTGACAATTAATAAG-----GATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAA
191 TAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TTCAA
* * * ** * ** * * *
368299 ATAGTAATGACAATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTATTTTGACCTTTCT-TTTTTTAATAAA
254 ATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTATCATAAA
* * * ** *
368363 ATAATTATTT-TAGATCATATAAA-CTTATTTGATGTAAAATC
318 ATAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * *
368404 ATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTG-TTTAC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATA-AAT-TGATTTAC
** * * * * * * *
368467 CAAATAAGTTTAAATGGTTATGACTATTTAAACAATTATCTACTTCAAAACATAATTACCTTTTG
63 TGAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* ** * * * *
368532 TTTTGTCTTAAAAAAATTGGTTCTGTTGAT----GCTTATT-ACAAATAAAATAATATAAATTTA
126 TTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATATTAATTTA
* * *
368592 TTAATATGTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAACCTATTTACCGAA-CATATT
190 TTAATAT-TCTAAAAATTAATAAGCT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCA-ATT
* * * * ** * *
368654 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAATATTTTGTTTTGTCGTA
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * * * *
368719 AAACAATTATTTTTATTCATACAAA-ATTATTCAAAATAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * *
368762 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGA-TTAAAAACTAAACAT-ATTTACCA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTA-CT
* * * *
368822 GACTAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTT
64 GAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTT
* * * * * * *
368886 TTGTCATAAAA-CAATTGTTTTCCA-TCGTATAAGCCTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-T
128 TTGTCATAAAATC-ATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * *
368948 TGATATTTTAAAAATTAATGAG-TAGAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTC-GTTCA
191 TAATATTCTAAAAATTAATAAGCTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAAC-CAATTCA
* * * * * * *
369011 AATAGTTATAACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATTGTTCTAACCTTTT-ATTTAGTAATAA
253 AATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAA
* * *
369075 AATAATTGTTTC-ACTTCATACATGCTTATCCGAAAATAAAATA
317 AATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCG-AAATAAAATA
* * * * *
369118 ATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTG-TTTAC
1 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTAC
** * * * * * * *
369181 CAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGCCCTTTTG
63 TGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTG
* * * *
369246 TTTTGTAATAAAA-CAATTGTTT-TCAGTTCATAAAAGCTTATGCAAAATAAAATAATATTACTT
126 TTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * ** ** *
369309 TATTAGTATT-TCAAAATTTGAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATCAA
188 TATTAATATTCT-AAAAATT-AATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTT-TCAAACCAA
* ** * * ** *
369371 TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAATTTTTGATTTATCA
249 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
* * * * * *
369436 TAAAACAATTGTTTTTCA-TCGTATAAGCCTATTC-AGAATAAAACA
314 TAAAATAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* *
369481 GTACTAATTT-TTAATATTTC-AAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTA-T
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* * * * * ** *
369542 CGAACCAGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG
64 -GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * * * * * *
369607 TTTTGTCATAAAA-CAATTATTTATGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAATCTA
126 TTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* * * * * * * * * *
369671 ATAATATTATGAAAATTAATAA-CTTAGAGATTTTAAAAATAAATTTCTTTGCCAAACTAGTTCA
190 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGC-TAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATTCA
* *** * * ** * * * *
369735 AATAGTTA-AGGCTGCATGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGTTCTTCTATTTTGTCATAG
253 AATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA
* * * * * ** * * *
369799 AACAAATGTTTTTGTTCGTTTAAGTTTGTTTGAAATAAAATA
317 AATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * ** * *
369841 ATATTAATAT-TTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCT-CTTTACTA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACTG
* * * * * * *
369901 AACCAATTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT-TCTGATTTGT
65 AA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT--TTTGT
* * * * * * **
369965 TTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTATTGATACAATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATT
127 TTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATT
* * *
370030 AATATTCTAAAAATTAATAAG-TAACAGATTTAAAAAATGAATC---TGTC--AGC----C---T
192 AATATTCTAAAAATTAATAAGCTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCAAACCAATTCAAAT
* * * * *
370082 -G-TATGAC-AGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCCTTTTGTTTTGTCATAAAA
256 AGTTATAACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAA
* * * * *
370144 TAATTGTTTCTGTTCGTACAAGCTTATT-AAGAATAACATA
319 TAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * * * *
370184 ATTCTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGGCAAATATTTAAAAACTAAATCTG-TTTATT
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* * * * * * * *
370247 GAACAGGTCCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATATATTTGAAAT-AGGTATAACCTTTTA
64 GAATA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CTTTTG
* * * * **
370311 TTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTATTTATACAAGCTTATTTC-GATTAAAATAATAAAAATTTA
126 TTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* * * *
370374 TTAATA-T-TAAGACAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCTAA-CATAT
190 TTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGCT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCA-A-
* * * *
370435 TTTAACATATGTTAGCTAACATAAATATGTTTACCTAACATATTA-ATATTTGCACAAT--TAAT
249 TTCAA-ATA-GTTA--TAAC-----TA--TTT---GAACA-ATTATCTATTT-CA-AATCGTTAT
** ***** * * * * * * *
370497 -AAGTAAAAATTT-GCA-AAAATAAATATTTTTA-GCGA-ACAAG---A-TC-AAAT--AATC
297 GACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTC-ATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* ** * *
370548 ATGACT-ATTTGAATAATTATCTAT-TTAAGTTCATATAAGCT---TATTTGAAATAAAATAATA
1 AT-ACTAATTT-ATTAA-TAT-T-TCAAAAATT-A-ATAAG-TAAAGATTT--AA-AAAATAA-A
* * ** * *
370608 CTAAACTA-TTAATA-TTCCAAAT--TTAATGACTAAGAGATTTAAAAAACGAACTTGTTTATAG
54 TTGATTTACTGAATAGTT-CAAATAGTT-ATGACT-----ATTT---GAAC-AA-----TTAT--
* * * * *
370669 AACGAGTTT-AAATAATTAAGACTATTTAGACAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGT
101 --CTA-TTTCAAATCATTATGACT-TTT-G---------T-TTTG---TCA-TA-AA----AT-C
* *** *
370733 TTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATT
141 ATTG---T-----------TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATT
* * * * *
370798 AATA-TC-AAGACAATTAATAAG-TAAAAGATGTAAAAAATAAATCTGTTTACAAACGAGTTCAA
192 AATATTCTAA-A-AATTAATAAGCT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCAAACCAATTCAA
* * * * * * * *
370860 ATCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAA
254 ATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA
* * * * * * *
370925 CAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATT-TAGATTAAAATA
319 TAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* ** * ** *
370965 ATATTAATTTATTAAT-TTTTTATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATACATTTACC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTT-AAAAAATAAATTGATTTACT
* * * * * ** *
371029 AAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTAT
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGT
* * * * * * *
371094 TTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGATTAAAATAATGTTAATTTAT
127 TTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * *
371158 TAAT-TTGTTGATAATTAATAAG-TAAAAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCAAA-CAAGTT
191 TAATATT-CTAAAAATTAATAAGCT-AAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TT
* * * * * * * * *
371220 TAAATAGTCATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATA
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * *
371285 AAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * *
371328 ATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAAATGAATCT-ATTT
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAA-AG-ATT-TAAAAAATAAAT-TGATTT
** * * * * * *
371390 ACCCAACAAGTGCAAACAGTTATGAATATTTGAAAAATTATCTATTTCAAAACATTATGACATTT
61 ACTGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTT
* * *
371455 TGTTTTGTCATAAAA-CAATTGATTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAA
124 TGTTTTGTCATAAAATC-ATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTAA
* * *
371517 TTTATTAATATT-AAAAAATTAATAAG-TACAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTATAT-GAA-CA
186 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATT-T-TCAAACCA
* * * * * * *
371577 CGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTGTGACAATTTTGTTTT-
248 -ATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTA
** *
371641 TCATAAACCAATT-TGTTCTGTTCA-AACAAGCTTATTC-ATAATAAAATA
311 TCATAAAATAATTGT-TTCTATTCATAA-AAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * * *
371689 ATACTAATTTGTTAATA-CTCCAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTG
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATTGATTTACTG
* * * * *
371753 AATGAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTA-CTTATTTCAAGTCGTTATGGTA-TTATG
65 AAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTAT-G-ACTTTTG
* * * * ** * *
371816 TTTTGTCCTTAAATAACTGTTTCTATTCATAC-ATTTTATTCAGAATAAAATAACATTAATTTAT
126 TTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
** * * * * * * *
371880 TGTTATTCTAAAAATTAACAAGTTGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAA-CAAGTTTAA
191 TAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-TTCAA
* ** * * * * * * * * *
371944 ATAGTCATGTCCATTTGAACTATTCTTTTATTTTAAATTGTTATGACATTATGTTTTGTCATAAA
254 ATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * *
372009 ACAATTGTTTCTATTCACACAAA-ATTATTCGAAATAAAATA
318 ATAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * *
372050 ATGCTAATTTATTACA-ATTTCAAAAATTAAT--G-ACACATTTAAAAATTAAATCT-CTTTACC
1 ATACTAATTTATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* * * * *
372110 GAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTAAAATCATTACGATTTTATTT
64 GAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTT-TGT
* * * * * * * *
372175 TTTGTCCTAAAA-CATTTGTTTATATTCATACAAGCATATTCATAGTAGAATATTATTAAATTAT
127 TTTGTCATAAAATCA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * * * *
372239 TAATATTTTAAAAATTAATAAG-T-AAGCATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAGTGCAG
191 TAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATTCAA
* ** * ** * * *
372302 ATAGTTA-AGACAATAAGAACAATTATGTATTTTGAATC-TTCTCG-TCTTTTG-TTTAGTAATA
254 ATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTTTA-TCATA
* * * *
372363 AAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AGATTAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * *
372406 CTACTAATTTATTAATACTT-AAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATG-TTTAC
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTAC
* ** ** * *
372469 TGAACTAGATCAAATAGCCATGACTATACGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG
63 TGAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTG
** * * * ** *
372534 TTTTGTCATAAAAGAATTGCTTC-AGTTCATATAAGTTCTT-TT-GAAATAAAATAATACCAACT
126 TTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTA-TTCATACAAG--CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * ** **
372596 TATTAATATTCCAAAAATTGATAA--TAAAGATATTTAAAAAATGAATCTATTTGTTGAATAAAT
188 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAG--ATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAAT
* * * * * * * * *
372659 TTAAATAATTCTAACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGATATAACCATTTGTTTTGTCAT
250 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* *
372724 AAAATAATATTTTTCTA-TCTATAAAAGCTTATTTTG-AATAAAATA
315 AAAATAAT-TGTTTCTATTC-ATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAATA
*
372769 ATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-ATTTA
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTA
* * * *
372830 TTGAACAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGGACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTT
62 CTGAA-TAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTT
* * * * *
372894 TGTTTTGTTATAAAA-CAATTGTTTCTGTTCATACAAGATTATTCGAATTAAAATAATATTAATT
124 TGTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * * * *
372958 TATTAATATTGTAACAATTAATAAG-TAAAATATTTTAAAAAATAAATATGTTTATGAAA-CAAG
188 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCT-AAAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAA-
* * * * * * * *
373021 TTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTA
249 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
* * *
373085 ATAAAATAATTGTTTCAATTCA-AATAAACTTATTTGAAATAAAATA
313 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATAA-AAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * ** * * * * *
373131 ATACCAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAAAATTAAAAAATGAATCT-ATTCA-T
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* *** * * *
373194 CGAACATA-TTCAAATAATTATGACTATCCAAATAATTACCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTT
64 -G-A-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGA-CTTT
* * * * * * *
373257 TGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTT
124 TGTTTTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * *
373322 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAGTAAATCTATTTT-ATGAA-TACATT
189 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCA--AACCA-ATT
* * * * * * * * *
373384 CAAACAGTTATGACCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATA
251 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATA
** * * * * *
373449 AACCAACTGTTTTTGTTCATAAAGGCTAATTC-AGAATAAAATA
316 AAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * * *
373492 ATATTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATT
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTACT
* * * *
373556 GAGCA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCGA-TAAGATCTTTT
64 GA--ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGA-CTTTT
* * * * * * *
373619 ATTTTGTTATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATAGATGTTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTT
125 GTTTTGTCATAAAATC-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* ** *
373683 ATTAATATTCTAAAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTA--TTCAATGAACAAG
189 ATTAATATTCT--AAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTTCAA--ACCAA-
* * ** * * * * ** * * **
373746 TTGAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTTAAATCGTTAAGATATTTTATTTTTTTG
249 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCA
* *
373811 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAA-ATTATTC-ATAATAAAATA
314 TAAAATAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * *
373856 ATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATTTG-TTTATTG
1 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTACTG
** * * * * **
373917 AGCCAATTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTAGCTACCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTT
65 A-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTT
* * * * * * *** * * ** * **
373981 TTATCATAAAATAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAAGA
128 TTGTCATAAAATCATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTA
* * * * *
374046 ATATTCTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAGTTCAAATA
193 ATATTCTAAAAATTAATAAGCTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-TCAAACCAATTCAAATA
* * *
374107 GTT-TAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAAATC
257 GTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
374142 ATTTTATTCA
Statistics
Matches: 16694, Mismatches: 3792, Indels: 3483
0.70 0.16 0.15
Matches are distributed among these distances:
335 4 0.00
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TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGT
TTCTATTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
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*
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ACTATTTCAAATAATTAT
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* * * * **** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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*
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* ** * * * * * *
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129 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAA-AATAAATAT-A
* * * * * *
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1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * *
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* ** *
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* * * * * * *
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1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* ** * * *
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* *
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* * * * * ** ** *
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1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
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66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
** * * * * *
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131 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
* * * ** * * *
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* * * * *
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* ** ** * * *
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129 AATTTATTAATATT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTT-TAAAAATAAATATA
* * * * * **
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1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * *** *
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* ** * *
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130 ATTTATTAATATTTTAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATAT--A
* * * * * * *
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1 TTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * **
356160 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACT
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * *
356223 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGT-AGTAGA---T-----T--ATATG
129 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTTAAAAATAAATATA
* * * * * * * *
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1 TTTACTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *
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65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
** * * * ** * *
356395 AAATAATAATATTATGAAAATTAATATCTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTA
130 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
** * * * * * * * * * *
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1 TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * * * *
356510 ATTTTGTGTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT-AGAATAAAATAATATT
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT
* * *
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129 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
* * * * * *
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1 TTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA
* * * * * ** *
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** * * * *
356750 TAATTTATTAATATTCAAAAAAAT-ATAAGTAAGAAATTTAAAAAATGAATCA-A
128 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-ATA
** ** * * * * * * *
356803 TTGGCTTGACTA-TACAAATAGTTATGACTGTTTGAAAAATTATCAATTTCAAATCGTTATGACT
1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * * *
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66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
** * * * * *
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131 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATA
* * *
356983 TTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCATCATAAC
1 TTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
357047 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTATTCCTATAAACTTATTTCAATTAAAATAAT-CT
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
357111 AAATTTATT-ATCA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
129 -AATTTATTAAT-ATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
* * * *
357165 TTTAC-ATAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTCTTTCAAATCATTATGAC
1 TTTACTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * * *
357229 TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTA
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* ** * * ** *
357294 GTTTATTAATATCCTGATAGCTAATAAGT-AGAAGATTTTAAAAATAAATATG
130 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTTAAAAATAAATATA
* * * * * * **
357346 TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAATAATTATCTATTTCAGATTGTTATGACC
1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* ** * * ** * * * **
357411 TTTTATTTCATCATAAAACAATTATATAAATTCCTATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
357476 TTTATTAATA--TT-----CTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
131 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
* * *
357520 TTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * *
357585 TTTTGTTTTGTCATTAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCTG-AATAAAACAATA-TA
66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACT-
** *
357648 AATTTATTAATATTCCAAAAATTACTAAGTAAGA-ATTTTAAAAAATAAATATA
129 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTT-AAAAATAAATATA
* * * *
357701 TTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTAAGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAC
1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
* * * *
357765 CTTTTATTTTGTCAT---A-AA-----TCAATT-ATACAAGCGTATTTAAAATAAAATAATACT-
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * ** * * *
357819 ATTTTTTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATTTG
130 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
* ** * * ** * *
357870 TTTACCAAGTAAGTTCAAATAGTTATAACCATTCAAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGAT
1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC
* * * * * *
357934 CTTTTGTTTTGTCATATAGCAATTGTTTGTATTCACACAAGGTTATTT-AGAATAAAATAATACC
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT
* * * * * * *
357998 AATTTATTAATATTATAACAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTG
129 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
* * * * * * *
358051 CTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCA-ATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
1 TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * ** * * *
358115 TTCTAT-TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATGCAAAATTA-TTCAGAATAATATAGTAC
66 TT-T-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATAC
* * *
358178 TAACTTATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTA
128 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATATA
* * * *
358228 TTTACTAAA-ACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAT
1 TTTACTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
358292 C-TTTATTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATGCT
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT
* ** * * * *
358355 AATTTAATAATATTCCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTG
129 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
* * * *
358408 TTTA-TGGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTT
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358442 TGTTAATAAA
Statistics
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
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TTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATA
Found at i:357628 original size:355 final size:355
Alignment explanation
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Period size: 361 Copynumber: 64.8 Consensus size: 355
354694 TATTTGGGTG
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATA-CA
* * * ** *
354769 A-CTTATT-TGGATCAAAATAATATTAATTTATTAATATTC-ATGAATTAATAACTAAAAGATTT
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* * * *
354831 AAAAAATAAATATGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * ** * * * **
354896 AAATCGTTATGACATTTTATTTCATCATAAAACAATTGTATAAATTTATATAGGCTTATTTGAAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * * *
354961 TAAAATAATACTAACTTATTACTATTTTGAAAATTAATTAGTAAGAGATTTTAAAAATGAATATG
258 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-T-A--AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
355026 TTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
316 TTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *
355065 ATTGTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
** * * * * *
355130 GCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTACTAATATTCC-AAAGATTAACAAGTAAA-AATTTA
66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTA
* * ** * * * * *
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130 AA-AATAAATATG-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
355257 AAATCATTATGACATTTT-TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTAGAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* *
355321 TAAAA-AATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAA
258 TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * *
355385 TTTCCT-AAGCAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAATA
316 TTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * *
355424 ATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAATTGTTTCTATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTATTCATACA
** * * * ** *
355489 AAATTATTCACAATAAAATAAAAATAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGA---TA
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTA
* * * * * * * **
355548 AAAACTAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTACCTCA
130 AAAA-TAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * *
355613 AATCGGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAACTTATTCGAAGT
194 AATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * * * * * **
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259 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA
* **
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* * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * * * ** *
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* * * * * * *
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126 TT-TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
355963 TTAAAAT-GTTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TATTTCATAAAAGCTTATC
190 TTCAAATCG-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATT
* * * ** * * *
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253 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-T---AAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * *
356091 ATCAATTTA-TCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGGCCATTTGAACA
311 ATCTATTTACT-GAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *
356135 ATTATCTATTTCAAACCATTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-TCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACA
* * * * *
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65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTT
* * * * * * *
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129 AAAAATAAATATGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * *
356316 CAAGTCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTATATTCATGCAAGCTTATTCGAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
** * * * * *
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257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-T-A-A-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
** * * * * * *
356446 ATTTGTTGAACCAA-TTAAAATGGTTAAGGCTATATGAATA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
356486 ATTATCTATTTCAAAT-TTTACGTCATTTTGTGTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * ** *
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66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAA
* * * * * * *
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131 AAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * * **
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195 ATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG-CTTATTCAAAAT
** * * * * *
356740 AATGTAATGCTAATTTATTAATATTCAAAAAAATATAAGTAAGAAATTTAAAAAATGAATCAATT
259 AAAATAATACTAATTTATTAATATTC-----TA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * *
356805 GGCTTG-A-CTA-TACAAATAGTTATGACTGTTTGAAAA
318 TAC-TGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
356841 ATTATCAATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCACAAAACAATTATTTTTGTCCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * *
356906 GCTTATTC-GAAATAAGATAAT-TCTAATTTATTAATATTCC-AAAAGTTAATAAATAAGAGA-T
66 GCTTATTCAG-AATAAAATAATAT-TAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATT
* * * * *
356967 TTAAAAATTGAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATT
127 TTAAAAA-TAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
357032 TCAAATCATCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTATTCCTATAAACTTATTTC
191 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTC
* *
357097 -AATTAAAATAAT-CTAAATTTATT-ATCATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
254 AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT-ATT----C---TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* *
357159 AATCTGTTTACAT-AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
310 AATCTATTTAC-TGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
357204 AATATTTCTTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * * **
357269 GCTTATTCGGATTAAAATAATATTAGTTTATTAATATCCTGATAGCTAATAAGTAGAAGATTTTA
66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTTA
* * * *
357334 AAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAATAATTATCTATTTCAG
130 AAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* ** * ** * * *
357399 ATTGTTATGACCTTTTATTTCATCATAAAACAATTATATAAATTCCTATAGGCTTATTCAAAATA
195 ATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * *
357464 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAA
260 AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA
*
357529 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
325 CCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *
357559 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATTAAACAATTGTTTCTATTTATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * *
357624 GCTTATTCTGAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCC-AAAAATTACTAAGT-AAGAATTTT
66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAAAG-ATTTT
* * * * *
357687 AAAAAATAAATATATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTA-AGATTATTTGAACAATTATCTATTT
129 -AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
357751 CAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCAT-----AA--A--TCAATT-ATACAAGCGTATTTAAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
357806 ATAAAATAATACT-ATTTTTTAATACTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATTT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * ** * * **
357869 GTTTAC-CAAGTAAGTTCAAATAGTTATAACCATTCAAACA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
357909 ATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATATAGCAATTGTTTGTATTCACACA
1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * ** ** * * * *
357973 AGGTTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTATAACAATTAATAGGTAGGAGATTTA
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTT
* * ** * ** * * *
358038 AAAAATAAATCTGCTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCA-ATGAATAATTATCTATTTCA
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * ** *
358102 AATCATTATGACCTTCTATTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAGAA
194 AATCGTTATGACCTTTTA-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
358167 TAATATAGTACTAACTTATTAATATTTTGAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTT
258 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * *
358231 ACTAAAAC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATA
319 ACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
358267 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTTACAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACA
* ** * *
358330 AGCTTATTCAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTCC-AAAAATTTATAAGTAAGAGATTT
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT
* * *** * *
358394 AAAAAATAAATGTGTTTATGGAACCAGTTCAAATAATTA-AGACTATTTTGTTAATAAACACATT
128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTA-TTTG---------A-A--
* ** * ** * *
358458 CAAATAGTTATTACTATTTAAACAATTATC-TATTTGAAATAGTTATGACCTTTTGTTTGGTCAT
179 C--A-A-TTA-T-CTATTT---CAA--ATCGT-TATGACCT-TTTA-----TTTTG--TCATAAA
* * * * * * *
358522 A-AACTAATTGT-TTCTATTCATACATGCGTATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTCATATT
224 ACAATTATTTCTATTC-ATAC--A-A-GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** *
358585 CCAAAAAATAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAACCCGTTTACCT--AGCAAGTTCAAATAGTT
284 -C------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACCAAGTTCAAATAGTT
*
358648 ATGACTACTTGAACA
341 ATGACTATTTGAACA
* * * * * *
358663 ATTATTTATTTCAAAT-AGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTCTATTTATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* ** * * ** * * * *
358726 AGTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTA
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTT
* * * ** *
358791 AAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCA
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * ** *
358856 AATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTTGTTCA-AGCTAAAATTATTCAGA
194 AATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATA-C-AAGCTTATTCAAA
* * * * * *
358920 ATAAAATTATATTTATCTATTAATATTTTGAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * *
358984 TTC-CAA-AATAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
318 TACTGAACCA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ***** * ** *
359021 ATTATCTATCTT-AAATCATTATGA-TTATTTGAACAATCATTATGAATGATTATCTATTTGAAA
1 ATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCA-TA-AAACAATTGT-T-TTT---A
** ** * * ** * * ** *
359084 TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAT-TGTTTTTTATCATACAAGTTTAT-TTGAAAT
57 TTCATACAAGC--TTATTCAG-AATAAAATAATAT-TAATTTAT--T--AA---TATCCT---A-
* * * * * * ** *
359147 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAG--TAAGAGATTTA-AGAGAT-AAAT
107 AAAAT--TAATAA-GTA--AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCA-A---ACA-AGTTCAAA-
* * * * * ** * * ***
359208 TTGTTTATCGAACTAGTTCAA-ATTGTTATGACTATTT-GAATAATTATCAATCTCAAATCGTTA
161 TAG-TTAT--AACTATTTGAACA--ATTAT--CTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTAT--TT-
* * ****** * * * * *
359271 AGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAACTTATTC-GATTAAAAATAA
215 TG-TC---ATAAAACAATT-----A---TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAA
* * * * * * *
359334 TACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGC-CA
266 TACTAATTTATTAATA--TT-----CTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA
* * ** * *
359398 AACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATA
324 ACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
** * * * * *
359430 ATTAT-TATTTCAAATTGTTCA-GACCTTTTGTTTAGTCA-AAAATATTTG-TTTCATATCTTAC
1 ATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-TCATAC
* * * * * * * *
359491 AAGTTTATTCAGAATAAAATAAT-TCAAAGTTATTAACAT-TTGGAAAATTAACAAGCAAA-ATA
64 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAGAT-
* * *** * * * *
359553 TTTGAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACAAGTTCAAGTAGTTATGATTATTTGAACAATTATTTA
126 TTT--AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * * *
359618 TTT-AAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGACATAAAAAAATTGTTTCAATTTATAAAAGCTTA-TC
189 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC
* * * *
359681 AAGAGTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAA-TAAGCAAAAGTTAAAAAAAATA
254 AA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-C-TAA-TAAGTAAG--AGA-TT--------TA
* * * * * * *
359745 AATTTAAATAAATTTATTTAC-CAAACAAATTTAAATAGTTACGACTATTTGAATA
303 AA---AAATAAATCTATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
359800 ATTTTCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTAGTTCATACG
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATAC-
* * *
359864 AA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCC-AAAAATTAATAAGT---GA-TT
64 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTT
* * * * * * ** * * *
359923 TAAAAAGTTAATTTGCTTATCGAATCAA-TTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATT
128 TAAAAA-TAAATATGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * **
359987 TCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTCATGCAAAATTATTCAA
191 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * *
360052 AATAAAAAAAAACTGATTTATTAACATTCTAAAAATTAA-TAACTCAGAGATTTGAAAAAATAAA
256 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-TAAGT-A---AGAGATTT-AAAAAATAAA
* * * * *
360116 TCTTTTTACT-AAACAAGTTCAAACAATTATGATTATTTGAACA
312 TCTATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * ** * * * *
360159 ATTAGCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAAT-ATAAAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * * *
360222 GCTTATCCA-AATAAAATAATACTACTTTATTAA-AT-TTCAAAACTT-ATAAGTAAGAGATTTA
66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTTT
* ** * * **
360283 AAAAATAAATCA-GTTTACTAAATTAGATCAAATAATTATGGGC-ATTTGAACAATTATCTATTT
129 AAAAATAAAT-ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
360346 CAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TGCA-ACATATAAGCTTATT--
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCT--ATTCATACAAGCTTATTCA
** * * * * ** * ** * *
360407 AAATAAAATTGTTATTACCTTTCGTT--T-TGTCATAA-AA-CAATTGTTTTTCAACATACAAGC
255 AAATAAAA-TAATACTA-ATTT-ATTAATAT-TC-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATC
* * ** * * * * * * *
360467 TTATTTGAAATAAAATAA-TACTAAT--TTTTTAATATTTCAAGA
314 -TATTT--ACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * ** * * **
360509 ATTAGTAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACCAGTTCA
1 ATTA-T---CTATTT--CAAAT-CAT-TA-TGACC--TTTTGTTT---T-GTCAT-A--A-AAC-
* * * ** * * *
360574 AATAGTTATTACTATTTGA-ACAA--TTATTTA-TTTCAAATTAT-TATAACCTTCTATT-CTAT
46 AATTGTT-TT--TA-TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAT-TAA--TT-TATTAATAT
* * ** * * * **
360633 CATAAAACAATTATTTATTTTCATACAAATTTATTTAGAAAAAATAATACTAATTTAATAATAGT
103 CCT-AAA-AATTA-ATA-AGT-A-A-AGA--T-TTTA-AAAATA-AATA-T-GTTT-ACCA-A--
* * * ** **
360698 TTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCATTTGTCGAACCAATTCAAATAGAT-A
150 --ACAAGTTCA-AA-T---AG--TT-----AT-AACT-A-TT-T-GAA-CAATT-ATCTATTTCA
* * ** * * * * *
360762 AAAC-TATATGAACAATTATCTATTG-C--AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAC-
194 AATCGT-TATGACCTTTTAT-T-TTGTCATAAAACA--ATTA---TTT-CTAT-TCATACAAGCT
* ** * ** * *** ** * **
360821 AATT--ATTTCAGCTCATAC-AAGTTTATTCGGAATAAAATAA-AA-TAA-ATTTGTTAATATTT
249 TATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATT---AATATTCTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAAT
** * * * *** * *
360880 CAAAAT-T-TTATAAGGAA-GAGATTTTTAAA-AAAAAT-TCTATTT--ACC
309 --AAATCTATT-TACTGAACCA-A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *** * * *
360925 A--AGCTAGTTCAAATAATTAT-AACTATTTGAACAATATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTT
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTG--TTTTGTC-A--T-AAAACA--A-T--TGTTT
* *
360987 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
54 -TTAT-TCAT---ACAA--G--CTTATTC-----A----G-----AATAAAATAATATTAATTTA
* * * ** *
361052 TTAATAT-TTAGAAAATTAATCAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATTTGTTTATGAAATC-ATTT
96 TTAATATCCTA-AAAATTAATAAGTAA-AGATTTTAAAAA-TAAATATGTTTACCAAA-CAAGTT
* * * * * * * * * *
361114 CAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATCATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTTATGATC
157 CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATA
** * ** * * * *
361179 AAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTA
222 AAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TA---CTAATT---T-ATTA
* * * * * ** * * * **
361244 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTCATAAAA-AAAT-TATTTTTCATCATTCAAGC
279 -ATA-TTCTAATAAGTAAGA-------GATT-T-AAAAAATAAATCTA-TTTAC-TGAACCAAG-
* * ** * * * **
361307 TT--ATTTGAAATAAAATAATATGAATTT
330 TTCAAATAGTTAT-GACT-ATTTGAA-CA
* * * ** ** * * *
361334 ATTA-ATATTTCAAA-AAGTAAT-A-AGTAAGTGATT-T-AAAAAACAAATTTGTTTACCAAACT
1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAAC-AA-TTGTTT------TT
* * * * * ** * *
361393 AGTTTGAATAGTTATGAC-TATTTGAATAATTAAAATAATACAAATTTATTAATAT-TTAGACAA
56 A--TT-CATA--CAAG-CTTA-TT-CAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTA-AAAA
* * * * *
361456 TTAATAAGTAGATGATTTAAAAAAGAAATATATTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATT
111 TTAATAAGTA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * * * * *
361520 TGAACAATTATTTATTTAAAATCGGTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
175 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
*** * * * * * *
361585 ATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTTTTAATATTTCAACAATTAGTAAGTAAAAT
240 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT---C---TAATAAGTAAGAG
* * * * * * * *
361650 ATTTTAAAAATAAATATGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATA
298 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * ** * * * * *
361707 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTCATCATAAAACAATT-ATATCAGTGCATA-T
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * * * * * * * *
361770 AGCCTCATTTAAAATAAAATAATACTAATTGAATAATAT-TTCAAAAATTATTGAGTAAGAGA-T
65 AG-CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAA-AGATT
* * * * * * * * *
361833 TTAGAATATGAATTTGTTTACCAAAGAAGTTCAAATGGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATG
127 TTA-AAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * **
361898 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAATAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCCG
191 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * *
361963 AAGAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAAATTTAAAAAACAAAA
256 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAA
* *
362026 T-TGTTTTCTGAA-CATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
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* * * *
362068 ATTATCTATTTCAAAT-AGTCATGACCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * * * * * *
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65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGT-AAAGATTT
* * * * * * * * *
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128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
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193 AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AA
* *
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257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-T-A-A-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * ** *
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* *** * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
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120 AAAGAT-TTT----AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAA
* * * * * * *
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179 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATA
* * * * * *
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243 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-------CTAATAAGTAAGAGA-T
* *
362746 TTAAAAAATAAAT-TCGTTTA-TCGAA-CAAGTTGAAATAGATT-TGACTATTT-ATACA
300 TTAAAAAATAAATCT-ATTTACT-GAACCAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGA-ACA
* * ** ** *
362801 ATTATTTATTT-AAAGCCATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAA
1 ATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * *** *
362865 AACTTATT-TGAAATAAAATAATACTACCCTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-T
65 AGCTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAA-AGATT
* *** * * * * *
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127 TTAAAAA-TAAA-TATG-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT-
* * * * * * * * * * *
362989 ATCTCAAATTGTTATAATC-TTTGTTTTCTCAGAAAATAGTTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTAT
188 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTAT
** * * * *
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252 TCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
363114 TGTGTTTGA-TGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAATA
312 TCTATTT-ACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
363157 ATTATCTATTTCAAATCATTATGATCTTTTATTTAGTCATACAATAATTG-TTTCAGTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * * *** * * *
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65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTT
* * * * * * *
363286 AAAAGATAAATGTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATC-AATTC
129 AAAA-ATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * *
363350 AAAATCATTA-GACCTTTTATTTTGTCGTAAAATAATTATTT-TAGTTCATA-AATGCTTATCCA
193 -AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAA-GCTTATTCA
* *
363412 AAATAAAATAATAC-AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCA
255 AAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * *
363475 ATTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACA
* * * * * *
363515 ACTATCTATTTCAAATCATTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-ACATACC
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACA
* ** * *
363579 AGCTTATT-TGAAATAAAATAATCCTAATTTATTAATAT-TTGAAGAATTAATAAG---AGATTT
65 AGCTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTT
* * * *** * * * *
363639 AAAAAATAAATCTATTTATTGAACCA-TTACAAATAGTT-TGACTACTTGAATAATTATCTATTT
128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTT-CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * *
363702 CAAAT--TTAT---C----A------C--AAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCGAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
363750 ATAAAATAATGCTAATTTAGTAAAATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGA-TTAAAAAATAAATCC
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
363814 ATTTGC-CAAGCTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * *
363854 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCAGCTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * * ** * ** ** *
363918 AGCTTCTGC-GAAATAGAATGAA-ACAAATTTATCAATATTTTAAAAATTTGTAAGT-AAGAAGT
65 AGCTTATTCAG-AATAAAAT-AATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAAG-ATT
* * * * * * *
363980 TTAGAAAATAATTCTATTTACCGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTAAACAACTATCTAT
127 TTA-AAAATAAATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * * * * * **
364044 TTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAGGTTTGTTTG
190 TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* *
364109 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGATAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT
255 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT--CTAA-T-A--AGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * *
364174 CTCTTTACCAAACC-ATTTCAAATAG-T-TGAGTATTTAAATA
313 CTATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * * * **
364214 ATTAACTATTTCAAATTGTTATAAGCTTCTATTTTGTCATCAAACAATTAG-TTTTGTTCATATT
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTATTCATACA
** * * * * * ** * * *
364278 ATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACCAAACAAATTA
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* **** * * * **
364343 AAAAATAAGTCCAATTACCGAACCTA-TTCAAATAGTTA-AGACTATATGAACAACAATCTATTT
129 AAAAATAAATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * **
364406 CAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACATGCTTATTTGAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
364470 TTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGTTTTAAAAAAT-AATTTTTT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * * * *
364533 TACCAAATCAA-TTCAAGTGGTTAAGACAATTAGGAAAA
318 TACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACA
* * * ** * *
364571 ATTATCTATTTCAAATCATTTTGAGCTTTTCTTTAATTATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACA
* * * * * *
364635 AGCTTATTCAGAATAAATTAGTACTAATTTATTAACATTC-AAAAATTTAATTA-TAAAGAGATT
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAA-TTAATAAGT-AA-AGATT
* * * * * * * * * *
364698 TAAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGGTCAAATAATTATTATTATTTGGACAATTGTCTATT
127 T-TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
364763 TAAAATCATTATAACCTTTTGA-TTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAGAT
191 TCAAATCGTTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TT
* * * * *
364826 -AGAATAAAATAATACTAATTTATTATTATTTCCTAAATTATTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAA
253 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CT--A--A-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
364890 ATTTGTTTAC-CAACTC-AGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACG
311 ATCTATTTACTGAAC-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
** * * * * *
364934 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTATGA-TCACAGA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACA
* ** * * *
364998 AGCTTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
65 AGCTTATTCAGAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT
* * ** * * * * * ** * * * *
365062 AAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAATAAAAACTATTAAAATAATTTTTTATTTT
128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
365127 TAATCTTTATGA-CTTGTTGTTTAGTCGTAAAA-TATTAGTTTC-ATGTCCTATAAGC---TT--
193 AAATCGTTATGACCTT-TTATTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTAT-TCATACAAGCTTATTCA
* * * * * * * * *
365184 AATTAACAT--T-C-AA---A--AA-A-T-TAATAAGCAAAATATTTGAAAAATTGAATGTGTTT
255 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTT
* * *
365237 AC-AAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
319 ACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * **** * * * * * *
365273 ATTATTTATTTAAAATTGCCATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACACTTG-TTTCAGTTCACAAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * * * * * * *
365337 AGCTTATCCAAAATAAAGTAATACTAATTTCTTAATAT-TTCAAAAATTAATAAG-CATGATTTT
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTT
* *** * * * *
365400 AAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTT
129 -AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
365465 AAATTGTTATTACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTGC-AGTTCATACGAGCTTATTCAAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
365529 ATAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAAATTTAAAAAGTGAATAT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * *
365594 GTTTA-TCGAA-TTAGTTCAAATAATTATGACCATTTTAAGA
315 ATTTACT-GAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
*** * * *
365634 ATTATCTATTTCAAATCGCCATTACCTTTTG-TTTGCTCATATAACAATTATTTTT-TATCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTAT-TCATAC
* * * * **
365697 AAGCTTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATCTTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGA-TT
64 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT
* * * * *
365760 TAAAAACTAAAT-TCGTTTACCAGACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA--TATA
128 TAAAAA-TAAATAT-GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * *
365822 TCAAATCATCATAACCTTTTGTTCTATCCTAAAA-AAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
191 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * *
365886 AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATGATTAAGAGATTTAAAATATAAAT-
256 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAA-G--TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * * *
365950 TTTTTTGTTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACA
314 TATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
**
365992 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTAAATTCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT--ATTCATAC
* * * * * * *
366056 TAGCTTATT-AGGAATAAAATAAAATGAAGTTATTAAAAT-TTCAAAAATTGATAAGTAAGAGAT
64 AAGCTTATTCA-GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAA-AGAT
* * * * * * * *
366119 TTAAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAAATT-AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTA
126 TT-TAAAAATAAATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
366183 TTTCAAATCGTTACGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-AAGTTTTTGTTCATATAAATCTGT-
189 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTATTCATA-CAAGCT-TA
** * * *
366246 TT-GGAATAAAATAATACTAATCTACTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAAT--A
251 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
366307 T-TTTTTA-TCAA-AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
312 TCTATTTACTGAACCA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * ** * * * * ** * *
366349 ATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-CTTTTATTATGTTATAAAATAATAATTTCTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * ** * * * *
366413 G-TATATTCATATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAGGTAAAAGATTTA
66 GCT-TATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTT
* ** **
366477 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCA
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * ** **
366542 AATCATTTTGATCTTTTCTTATGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGATG
194 AATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
366606 TAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAGAAATTAATGAATAAGAGAATTAAAAGA-GAATCTG
258 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-TAA-G--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * * * * *
366670 TTTACCGAA-TATGTTCAAATAGTTATAACTATCTAAACA
316 TTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * *
366709 ATTAT-TGATTTCAAAACATAATGACCTTTTGATTTGTTATAAAACAATTGGTTCTGTTGATGCA
1 ATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
** * *
366773 AGCTTATTTGGAATAAAATGATATAAATTTATT-ATATTCC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTT
* * * *
366836 AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTC
128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * **
366901 AAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAACTATTTTTATTCAAACAAAATTATTCAAAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * ** *
366966 TAAAATAATACTAATTTATGAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTGTTT
258 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * ** *
367030 -CCGAA-CTAGTTCAAATAGCTACAACTATTTGAATA
319 ACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
367065 ATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATGCAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * * * *
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66 GCTTATTCAGAATAAAATAATA-TTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTT
* * * * * * *
367192 AAAAATAAATATATTTGCTGAACCAA--TCAAATAGTTA-AGATTATTAGAATAATTATCTATTT
129 AAAAATAAATATGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * * * *
367254 CAAATTATTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCACACATGCTTATCCAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAA
** * * *
367318 AATAAAATAATACT-ATTCTAGCAACATTCAAAAAATTAATAAGGAAGAAATTTTAAAAAATAAA
256 AATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTC-------TAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * *
367382 TCTATTTACT-AAACAAATTCAAATAGTCAAGTCGATTTGAACA
312 TCTATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
367425 ATTATCTATTTAAAATGATTATGGCATTTTGTTTTATAATAAAACAATTG-TTTGAGTTCATAAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * ** * * **
367489 AGCTTA-TGAAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATAT-TTAAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTT
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAG-TAAAGATTT
* * ** * ** * * *
367552 TAAAAATAAATAAGTTTATCGAATGAA-TTCAAATAATTATTGCCATTTTAATAATTATCTATTT
128 TAAAAATAAATATGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
367616 CAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTT-TTT-TTTTCATTGTATAAGCTTATTT
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCA---TACAAGCTTATTC
* * * *
367679 GAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAAACAGTAGGAGATTTAAAAAATGAA
254 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-T--A-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * *
367743 TTTGTTTA-TCGAACC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
312 TCTATTTACT-GAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
367786 ATTATATATTTCAAATCATTGTAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTTATA-AA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * ** * * *
367850 TGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
66 -GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTT
* * * * * * * * *
367915 AAAAATAAATTTGTTTTCTAAACCAGTTCAAATAATTA-AGGCTATATGAATAATTATCTATTTT
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
367979 AAATCGTTATGACCATTTGTTATGTCGTAAAACAAATGT-TTTC-CTTCATATAAGTTTGTTCAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AAT-TATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * *
368042 AATAAAATAATACTAATCTACTAATATGTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-
256 AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * *
368105 TAAATCAAACGAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
317 TTACT-GAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * * ** *
368144 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATAATTTTTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * ** * * *
368209 GCATATTCAGATTAAAATAATATTCAGTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG----GATTTAAA
66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAA
* * * * * ** *
368270 AAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTAATGACAATTTGAGTAATTATTTATTTCAAA
131 AAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * * ** **
368335 TTATTTTGACCTTTCT-TTTTTTAATAAAATAATTATTT-TAGATCATATAAACTTATTTGATGT
196 TCGTTATGACCTTT-TATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
368398 AAAATCATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTG
259 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-C------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTA
* ** * * *
368462 TTTAC-CAAATAAGTTTAAATGGTTATGACTATTTAAACA
316 TTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * * * *
368501 ATTATCTACTTCAAAACATAATTACCTTTTGTTTTGTCTTAAAAAAATTGGTTCTGTTGAT----
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* *
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66 GCTTATT-CAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGT-AAAGATTT
* ** * * * *
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* * ** * * * **
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192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* *
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257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TAT
* * * *
368816 TTAC-CAGA-CTAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
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* * * * *
368854 ATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCA-TCGTATA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACA
* * * * ** * *
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65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTT
* * * ** * *
368981 AAAAATAAATCTGTTTATCGAACTCGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATATATTTCA
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * *
369046 AATTGTTCTAACCTTTTATTTAGTAATAAAATAATTGTTTC-ACTTCATACATGCTTATCCGAAA
194 AATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAA
* * * * *
369110 ATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * *
369175 GTTTAC-CAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCTATTTGAACA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
369215 ATTATCTATTTAAAATCATTATGCCCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAGTTCATAAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* * * * * * **
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65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATT-AATAAG-TAAAGATT
* ** * * ** * *
369343 TAAAAAATAAATCA-GTTTATTGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTAT
127 TTAAAAATAAAT-ATGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * *
369406 TTCAAATCGTTATGAATTTTTGA-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCGTATAAGCCTATT
190 TTCAAATCGTTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATT
* * * * *
369469 CAGAATAAAACAGTACTAATTT-TTAATATTTCAAAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
253 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-----TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
369533 TCTGTTTA-TCGAACC-AGTTTAAATAGTTATAACTATTTAAACA
312 TCTATTTACT-GAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * *
369576 ATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTAATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * * ** * * *
369641 GCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTTAGAGATTTTA
66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAA-GTAAAGATTTTA
* * * * * *** * *
369706 AAAATAAATTTCTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AGGCTGCATGAATAATTATCTATTTTA
130 AAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * * * * ** * * **
369770 AATCGTTATGTTCTTCTATTTTGTCATAGAACAAATGTTTTTGTTCGTTTAAGTTTGTTTGAAAT
194 AATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
369835 AAAATAATATTAATAT-TTAATATTTTGAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTCTTTA
259 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * *
369898 CTAAACCAA-TTCAATTAGTTATAACAATTTGAACA
320 CTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
369933 ATTATTTATTTCAAATCATTAT--TCTGATTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTATTGATAC
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATAC
* * ** *
369996 AATCTTATTC-GAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATT
64 AAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATT
* * * * * *
370060 TAAAAAATGAATCTG--T------C-AG--C--CT-G-TATGAC-AGTTTGAATAATTATCTATT
127 TTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTA-TTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
370109 TCAAATCATTTTGACCCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCGTACAAGCTTATT-A
191 TCAAATCGTTATGA-CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
370173 AGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAATTAA-TAAGGCAAATATTTAAAAACTAAA
255 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C-TAA-TAAGTAA-G---AGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
370237 TCTGTTTATTGAA-CAGGTCCAAATAGCTATGACTATTTGAACA
312 TCTATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * ** * *
370280 ATTATATATTTGAAAT-AGGTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTATTTATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* **
370343 AGCTTATTTC-GATTAAAATAATAAAAATTTATTAATAT--TAAGACAATTAATAAGTAAAAGAT
65 AGCTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAA-A-AATTAATAAGT-AAAGAT
* * * *
370405 TTAAAAAATAAATATGTTTACCTAACATATTTTAACATATGTTAGCTAACATAAATATGTTTACC
126 TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACA-AGTTCAA-ATA-GTTA--TAAC-----TA--TTT---
* * * ** *** * * * *
370470 TAACATATTA-ATATTTGCACAAT--TAAT-AAGTAAAAATTTG-CA-AAAATAAATATTTTTA-
176 GAACA-ATTATCTATTT-CA-AATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT
* * * *
370528 GCGA-ACAAG---A-TC-AAAT--AATCATGACT-ATTTGAATAAT-TATCTATTTAAGTTCATA
238 TC-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTT-ATTAATAT-TCTA-ATAAG-T-A-A
* * * * * * *
370583 TAAGCTTATTTGAAATAAA-ATAATACTAAACTATTAAT-ATTCCAAATT-TAAT-GACTAAGA-
295 -GAG---ATTT-AAA-AAATA-AAT-CT--A-T-TTACTGA-ACCAAGTTCAAATAG-TTATGAC
* * *
370643 GATTTAAAAA
346 TATTTGAACA
** * * * ** ** ** * * * *
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1 ATTATCTAT-TTCA-A-ATC-A-TTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGT-T-TTT-
* * * * ** * * * * *
370713 AAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGAT-TT-TTTCTATTCATA-CAAGCTTATTTT
56 -ATTCA-TACAAGC--TTATTCAG-AATAAAATAATATTAATT-TATTAATATC---C-TA---A
* * * * * * *** ** * **
370775 GAATAAAATAA-TATAA-ATTTATTAATATCAAGACAATTAATAAGTAAAAGATGT-AAA-AAAT
108 AAAT-TAATAAGTA-AAGATTT-TAAAAATAAATATGTTTACCAA--ACAAG-T-TCAAATAGTT
* * * * ** *
370836 A-AATCTGTTT--ACAA--A-CGAGTTCAAATCGTTATGA-C---TA-TTTG-AAT-AATTATTT
166 ATAA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
* ** ** * *** *** * ** * *
370888 ATTTCAAATTGTTATGA-CTT-TTTATTTTGTCATAAAAC-AA-TTATTTTTGTTC-ATACAAGC
230 ATTTC-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-ATAAG-
** * ** ** * * *
370948 TTATTTAGA-TTAAAATAATATTAATTTATTAATTTTTTA-TAA-TT--AATAAGTAAAAGA-T-
292 -TA-AGAGATTTAAAA-AATA--AATCTATT--TACTGAACCAAGTTCAAAT-AGT-TATGACTA
** *
371006 TTAAAAAA
348 TTTGAACA
* * ** * * *
371014 ATAAATAC-ATTTACCAAA-CAAGTTTAAAT-A-GTCATGACTATTTG-AATAATTATCTATT-T
1 AT-TAT-CTATTT--CAAATC-A--TT--ATGACCTTTTG--T-TTTGTCATAA--AACAATTGT
** * *** ** * * * * * **
371073 CAAATTGTT-ATGAC-TTTTTATTTTGTCATAAAA-CA-ATT-GTTT-TT-GT-TCATACAAGTT
52 --TTTTATTCAT-ACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTA-AAAAT
* * ** * * *** * * * *
371130 TATTTAGATTAAA-ATAATGTTAATTTATTAATTTGTTGATAATTAATAAG-TAAAAGATTTTAA
112 TA-ATA-AGTAAAGAT--T-TTAA-AAATAAATATGTT--TACCAAACAAGTTCAAATA-GTT--
* * * * * * * * *
371193 AAAATAAATATATTTACCAA--A-CAAGTTT-AAATAGTCATGA----TT-GTTTG--A-ATAAT
166 ---ATAACTAT-TTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC
* * * ** * **** ** * * *
371246 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TT-GTTTTGTAATAAAAC-AATTGT-TTCA-GTTC-AT
226 AAT-TATTTCTATTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCTA-
*** ** * * * * *
371305 ATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA--AA-TT-AAAGAG-TAAG
287 ATAAG--TAAGAGATTTAAAA-AATA--AATCTATT--TA-CTGAACCAAGTTCAAATAGTTATG
** ** *
371365 AGAATTAAAAAAA
344 ACTATT-TGAACA
* * ** *
371378 ATGAATCTATTTACCCAACAAGTGCAAACAGTTATGA-ATATTTGAAAAATTATCTATTTCAAAA
1 AT-TATCTATTT---C-A-AA-T-----CA-TTATGACCT-TTTG---TTTTGTC-A--T-AAAA
* * * ** * * *** ** *
371442 CATTATGACATTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGATTTTG-TTCATGCAAGCTT-ATTTCAAAT
45 CAAT-TG----TTT-TTAT-TCATACAAGC--TT-ATTCAGAATAAAATAATATTAATTT--ATT
* ** * ** *
371504 AAAATAATATAAATTTATTAAT-ATTAAA-AAATTAATAAGTACAA-A--TTTA--AAA-AA--T
98 AATATCCTA-AAA---ATTAATAAGTAAAGATTTTAA-AAATA-AATATGTTTACCAAACAAGTT
* * * * * * *
371559 -AAATCTGTTATATGAAC-ACGTTCAA-ATAGTTATGATTATTTAAACAATTATC-TATTTCAAA
157 CAAAT-AG-T-TAT-AACTA-TTTGAACA-A-TTAT--CTATTT---CAA--ATCGT-TAT-GAC
* ** ** * * * *
371620 TTGTTGTGACAATTTTGTTTTTCATAAACCAATT-TGTTCTGTTCAAACAAGCTTATTCATAATA
206 CT-TT-T----ATTTTGTCATAAAA----CAATTAT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * *
371684 AAATAATACTAATTTGTTAATACTCCAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTT
260 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-----TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
** * *
371749 ACTGAA-TGAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACA
319 ACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *** * * * * * *
371785 ATTA-CTTATTTCAAGTCGTTATGGTATTATGTTTTGTCCTTAAATAACTGTTTCTATTCATAC-
1 ATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
** * ** * * * *
371848 ATTTTATTCAGAATAAAATAACATTAATTTATTGTTATTCTAAAAATTAACAAGTTGAAGATTTA
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTT
* * * * * * ** * * * * *
371913 AAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTCTTTTATTTT
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATCTATTTC
* * * * * * ** *
371978 AAATTGTTATGACATTATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTATTCGAAA
193 AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * * *
372043 TAAAATAATGCTAATTTATTACA-ATT-TCAAAAATTAATGACACATTTAAAAATTAAATCTCTT
258 TAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTCT-AATAAGTAA-G--AGATTTAAAAAATAAATCTATT
* **
372106 TACCGAA-GTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
318 TACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
372143 ATTATCTATCTAAAATCATTACGA-TTTTATTTTTTGTCCTAAAACATTTGTTTATATTCATACA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * * * * ** *
372207 AGCATATTCATAGTAGAATATTATTAAATTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAGCATTTA
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAAG-ATTTT
* ** * * * * * ** * *
372271 AAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAGTGCAGATAGTTA-AGACAATAAGAACAATTATGTATTTT
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * * *
372335 GAATC-TTCTCG-TCTTTTGTTTAGTAATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGA
193 AAATCGTTAT-GACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
372398 TTAAAATACTACTAATTTATTAATACTTAAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATAT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT---C---TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * ** ** *
372463 GTTTACTGAA-CTAGATCAAATAGCCATGACTATACGAAAA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
372503 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTG-CTTCAGTTCATATA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
* ** * *
372567 AGTTCTT-TTGA-AATAAAATAATACCAACTTATTAATATTCC-AAAAATTGATAA-TAAAGATA
65 AG--CTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAAAGAT-
* * * **** * * * * *
372628 TTTAAAAAATGAATCTATTTGTTGAATAAATTTAAATAATTCTAACTATTTGAACAATTATCTAT
126 TTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
372693 TTGAAATTGATATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATATTTTTCTA-TCTATAAAAGCTTATT
190 TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT-TATTTCTATTC-ATACAAGCTTATT
*** * *
372757 TTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAA
253 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT----C---TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* *
372821 ATCTATTTATTGAA-CAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGGACA
311 ATCTATTTACTGAACCAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
372865 ATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* ** * *
372930 GATTATTC-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTGTAACAATTAATAAGTAAAATATTTT
66 GCTTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTT
** * * * * *
372994 AAAAAATAAATATGTTTATGAAACAAGTTGAAATAATCATGACTATTTGAATAATTAAT-TATTT
129 -AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATCTATTT
* * * * * * * * * **
373058 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCAAATAAACTTATTTGAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
373123 ATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAAAATTAAAAAATGAATCT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT---AA-T-A--AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * *** *
373188 ATTCA-TCGAA-CATA-TTCAAATAATTATGACTATCCAAATA
315 ATTTACT-GAACCA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
373228 ATTACCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATCGGTTCTATTCATGCA
1 ATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * *
373292 AGCTTATTTAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-AATTTA
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTA
** * * * * *
373356 AAAAGTAAATCTAT-TTTATGAATAC-A-TTCAAACAGTTATGACCATTTCAATAATTATCTATT
130 AAAA-TAAA--TATGTTTACCAA-ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * * *
373418 TCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAACCAACTGTTTTTGTTCATA-AAGGCTAATTCA
191 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA-GCTTATTCA
* * * *
373482 GAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
255 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
373547 CTATTTATTG-AGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATA
313 CTATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
373589 ATTATTTATTTCAAATCGA-TAAGATCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATAGA
1 ATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
* * * * **
373653 TGTTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAAATTAATAAGTTGGAGAT
65 AGCTTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT--AAAAATTAATAAG-TAAAGAT
* * * * *** * * ** * *
373717 TTAAAAAATAAATCTATTCAATGAACAAGTTGAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATT
126 TTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATT
* * ** * ** * ** *
373782 TTAAATCGTTAAGATATTTTATTTTTTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAT
191 TCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * *
373847 AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGT
256 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * *
373911 TTATTGAGCCAA-TTCAAATATTTATGACTATTTGAATA
317 TTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * * * * *
373949 ATTAGCTACCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTTTGTTGATACAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
** * * ** * ** * *
374013 GCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAAGAATATTCTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAA
66 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTTAA
* ** * * * * *
374075 AAATAAATGTGTTTGTCGAACTAGTTCAAATAGTT-TAGACTATTAGAATAATTATCTATTTGAA
131 AAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
374139 ATC------A--TTTTA---T-TCAT---AC-A--ATCT-TATTCA-A-AA---TAAT-ATAATA
195 ATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * * * * * * * * *
374179 CTAAT-TTATTAACATT-TGAAAAAT-TAATAAATAAGAAATTTTAAAAAATAAACT-TGTTTAC
260 -AAATAATACTAA-TTTATTAATATTCTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA-TCTATTTAC
* * * **
374240 CGAA-CAAGTTTAAACAGTTACAACTATTTGAACA
321 TGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * ** *
374274 ACTATTTATTTAAAATAAATATAACCTTTTGTTTTATCATAAACAACAA-T-TTTAGA-TCATAA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA-AACAATTGTTTTTATTCATAC
* * * * * **
374336 AAGCTTATCCAAAAT-AAATAATATTACTTTATTAATAT-TTCAAAAATTGATAAGTTGAGATTT
64 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTT
* * * ** *** * ** * * *
374399 AAAAAATAAGTCA-GTTTATCTTATTGGTTCAAATAATTATGGCTATTAGAATAATTATCCATTT
128 TAAAAATAAAT-ATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * *
374463 CAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCA-TCCTGCAAGCCTATTCAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAA
*
374527 AATAAAATTATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
256 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC------TAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
**
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* * * * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACA
** * * ** *
374686 AGCTTATTTTGAATAAAAT-ATACTAATTTAATAA-ATTTTTAAAAATTAATAAG---AGATTTA
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTT
* * * * * * *
374746 AAAAATAAATCTATTTGCCAAA-ATAGTTCAAATAGCTA-AGACTATATAAACAATTATATATTT
129 AAAAATAAATATGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * ** * * * *
374809 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAGATGCTTATTCAAA
192 CAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * *
374874 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAACTAAGTGATTTAAAAAGTAAATCT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * *
374939 -GTT--T--ACCAA-ATC----AG-T-T--C-A----AATA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTATTCATACA
** * * * * *
375025 AGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTAATCT-TTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTT
65 AGCTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAA-AGATTT
* * * * * * * * ** *
375089 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTAAACTTC
128 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * ** * * * ***
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193 AAATCGTTATGACCTTTTATTT-TGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
375218 ATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAAATTAAAAAATAAATTT
257 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C------TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* ** ** * * * * * * *
375283 GTTTGTTGAA-TTATTTTAAATATTTAAGACAATATGAATA
315 ATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
** * * * *
375323 AACATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTT-TTTTCAATTCATA
1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTT-TATTCATA
* * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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126 TTTAAAAATAAATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
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* * *
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253 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC--TAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
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314 TATTTACTGAACCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * ** *
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1 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAA
* * * * * * *
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66 GCTTATTCAGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATCCT-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTT
* * * * * * * * * *
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129 A-AAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * *
376103 ATCTTTTGTCA-AATAAAATAATA-TAATTTTATTACTAT--TAAGATAATTAATAAGTAAAAGA
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
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* * ** * * *
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* * * * * * * * ** * * * **
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* * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *** * * * *
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* * * * * *
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** * * ** * * * *
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** * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * * *
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* ** * * **
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* * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * *
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* * * * *
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* *
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* * * * *
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TTTTGTTAATAAACACATTC
Found at i:359027 original size:178 final size:178
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* * *
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** ** * *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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Statistics
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAATCTTTTGTTTTGTCAC
AAAACAATTGTTCTATTTATATAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTG
AAAATTAATAGAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGA
Found at i:359247 original size:407 final size:405
Alignment explanation
Indices: 358663--359434 Score: 971
Period size: 407 Copynumber: 1.9 Consensus size: 405
358653 TACTTGAACA
* *
358663 ATTATTTATTTCAAATAGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTATTTATATAAG
1 ATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTATTTATATAAG
* * * * *
358728 TTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAA
66 TTTATTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * *
358793 AAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
131 AAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATTATCAATCTCAAA
* * * *
358858 TTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTTGTTCA-AGCTAAAATTATTCAGAAT
196 TCGTTAAGAAC-TTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGATCATAG--AAAATTATTC-GAAT
* * * * * * *
358922 -AAAATTATATTTATCTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTT
257 AAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTT
* ** *
358985 TCCAAAATAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGATTATT
322 GCCAAAATAGATCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGATTATT
359050 TGAACAATCATTATGAATG
387 TGAACAATCATTATGAATG
* * * *
359069 ATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTT-T-TTTATCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTATTTAT-AT--
* *
359132 AAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTT
63 AAGTTTATTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * * *
359197 AAGAGATAAATTTGTTTA-TCGAACTAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATCT
128 AAAAAATAAATTTGTTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATTATCAATCT
* * * *
359261 CAAATCGTTAAGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAACTTATTCGATT
192 CAAATCGTTAAGAACTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAAATTATTCGAAT
* *
359326 AAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATATG
257 AAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTAAAAATTAAT---AAAGAGATTTAAAAAATAAATATA
* * *
359391 TTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT
319 TTTGCCAAAATAGATCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTAT
359435 TATTTCAAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (405 bp):
ATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTATTTATATAAG
TTTATTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
AAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATTATCAATCTCAAA
TCGTTAAGAACTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAAATTATTCGAATAAAA
ATAATACTAATCTAATAATATTTTAAAAATTAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTGCCA
AAATAGATCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGATTATTTGAA
CAATCATTATGAATG
Found at i:359404 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 359063--360387 Score: 995
Period size: 180 Copynumber: 7.3 Consensus size: 181
359053 ACAATCATTA
* * * * * *
359063 TGAATGATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTTATC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* ** * * * *
359128 ATACAAGTTTATTTGAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAGTAAGTAAGA
66 ATAGAAACTTATTCGAATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGA
* * * * * *
359192 GATTTAAGAGATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATTGTTATGACTATT
130 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
359244 TGAATAATTATCAATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * *
359308 ATAGAAACTTATTCGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGAAAGAG
66 ATAGAAACTTATTCGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAG
* * * **
359373 ATTTAAAAAATAAATATGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATT
131 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
359424 AGAATAATTAT-TATTTCAAATTGTTCA-GACCTTTTGTTTAGTCA-AAAATATTTGTTTCAT-A
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TGA
* * ** * * * * ** *
359485 TCTTACAAGTTTATTCAGAAT-AAAATAATTCAAAGTTATTAACATTTGGAAAATTAACAAGCAA
64 TCATAGAAACTTATTC-GAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AA
* * * *** * *
359549 A-ATATTTGAAAAAATAAATCTCTTTATTGAACAAGTTCAAGTAGTTATGATTATT
127 AGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
359604 TGAACAATTATTTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGACATAAAAAAATTGTTTC-AATT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-T
* * * *
359667 TATA-AAAGCTTA-TC-AAGAGTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCCAAAATTAATAAGCA
65 CATAGAAA-CTTATTCGAATA--AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--
* ** * * * *
359729 AAAGTTAAAAAAAATAAATTTAAATAAATTTATTTACCAAACAAATTTAAATAGTTACGACTATT
125 AAAG-----AGATTTAAA---AAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
359794 TGAATAATTTTCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TAGTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GAT
* * *
359858 CATACG-AACTTATTC-AAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT----AA
65 CATA-GAAACTTATTCGAATA-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAA
* * * * * * * * *
359917 GTGATTTAAAAAGTTAATTTGCTTATCGAATCAA-TTCAAATAGTCATGTCCATT
128 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
359971 TGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGCTC
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * * * ***
360036 AT-GCAAAATTATTCAAAATAAAAA-AAAACTGATTTATTAACA-TTCTAAAAATTAATAACTCA
66 ATAG-AAACTTATTC-GAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGAAA
* * * *
360098 GAGATTTGAAAAAATAAATCTT-TTTACTAAACAAGTTCAAACAATTATGATTATT
128 GAGATTT-AAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
360153 TGAACAATTAGCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AAT-
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
* * * * *
360216 ATA-AAAGCTTATCCAAAT-AAAATAATACTACTTTATTAA-ATTTCAAAACTT-ATAAGTAAGA
66 ATAGAAA-CTTATTCGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGA
** * ** * * *
360277 GATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTAAATTAGATCAAATAATTATGGGC-ATT
130 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATT
* * * *
360329 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
1 TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
360388 TGCAACATAT
Statistics
Matches: 910, Mismatches: 182, Indels: 109
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATC
ATAGAAACTTATTCGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGAG
ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
Found at i:360332 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 359777--360387 Score: 552
Period size: 177 Copynumber: 3.4 Consensus size: 175
359767 AAACAAATTT
* * * * *
359777 AAATAGTTACGACTATTTGAATAATTTTCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * *
359842 AATAATTATTTTAGTTCATACGAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAA
66 AACAATTGTTTCA-ATCATA-AAACTTATTCAAAATAAAATAAAACT-ATTTATTAACATTTCAA
* * * * * * * *
359907 AAAT-TAATAAGTGATTTAAAAAGTTAATTTGCTTA-TCGAATCAA-TTC
128 AATTATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAT-AAGATC
* * * * * * * *
359954 AAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAA
1 AAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * *
360019 AACAATTGTTTCTGCTCATGCAAAA-TTATTCAAAATAAAAAAAAACTGATTTATTAACATTCTA
66 AACAATTGTTTC-AATCAT--AAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACT-ATTTATTAACATT-TC
* * * *
360083 AAAATTAATAACTCAGAGATTTGAAAAAATAAATCTTTTTACTAAACAAGTTC
126 AAAATT-ATAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGATC
* ** * * *
360136 AAACAATTATGATTATTTGAACAATTAGCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
1 AAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* *
360201 AACAATTGTTTCAAT-ATAAAAGCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAA-ATTTCAAA
66 AACAATTGTTTCAATCATAAAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACTA-TTTATTAACATTTCAAA
* *
360263 ACTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTAAATTAGATC
129 A-TTATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGATC
** * * * *
360312 AAATAATTATGGGCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATCATAA
1 AAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
360377 AACAATTGTTT
66 AACAATTGTTT
360388 TGCAACATAT
Statistics
Matches: 354, Mismatches: 66, Indels: 29
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
AAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
AACAATTGTTTCAATCATAAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTATTTATTAACATTTCAAAAT
TATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAATAAGATC
Found at i:360451 original size:65 final size:67
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360337 TATCTATTTC
* *
360347 AAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTGCAACATATAAGCTTA-TT-AAA
1 AAATTGTTATTACCTTTCGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTGAAA
360410 TA
66 TA
* *
360412 AAATTGTTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAA
1 AAATTGTTATTACCTTTCGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTGAAA
360477 TA
66 TA
360479 AAAT
1 AAAT
360483 AATACTAATT
Statistics
Matches: 65, Mismatches: 4, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (67 bp):
AAATTGTTATTACCTTTCGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTGCAACATACAAGCTTATTTGAAA
TA
Found at i:360974 original size:181 final size:177
Alignment explanation
Indices: 360568--365108 Score: 1121
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360558 AGTTATGACC
* * * * * * *
360568 AGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAACCTTCTATTCTAT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * *
360633 CATAAAACAATTATTTATTTTCATACAAATTTATTTAGAA-AAAATAATACTAATTTAATAATAG
66 CATAAAACAATTATTTA--TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAA-AATAATTTATTAATA-
* * * * *
360697 TTTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTC-ATTTGTCGAACC
127 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATTCTATTT-ACGAACT
* * * * * *
360748 AATTCAAATAGA-TAAAACTATATGAACAATTATCTATTGCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATA-ATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * *
360812 TCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGTTTATTCGGAATAAAATAAAATAAATTTGTTAATA
65 TCATAAAACAATTATTT-A-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAAAAT-AATTTATTAATA
* * * *
360877 TTTCAAAATTTTATAAGGAAGAGATTTTTAAAAA-AAATTCTATTTACCAAGCT
127 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTTAAAAATAAATTCTATTTACGAA-CT
* *
360930 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * *
360994 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAA-T-TATTTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAA-AATAATTTATTAATAT
* * * *
361059 TTAGAAAATTAATCAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATT-TGTTTATGAAAT
128 TTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATTCTATTTACGAACT
* * * * * * * *
361109 CATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATCATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTTA
1 -AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * * * * *
361174 TGATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATTATGGCCATTTGAAT
65 TCATAAAACAATT-ATT-TATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAA-AAT----AATT---T
* * ** ***** * *
361239 AATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCT-TTTTTTTTGTCATAAAA-AAATTATTTTTCATCAT
120 -ATTA-ATATTT-AAA-AATTAAT-AAGTAAGAGATTT-T-A-AAAATAAATTCTATTT-A-C--
*
361301 TCAAGCTT
173 -GAA-C-T
* * * ** * * * * ** *
361309 ATTTGAAATAA-AATAA-TA--TGAATTTATTA-ATATTTCAAA-AAGTAATAA-GTAAGTGATT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCT-TTTGTTT
* * * * *
361367 TA--A-AAAACAAATTTGTTTA-CCAAACTAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAAAA
63 TATCATAAAAC-AA-TTATTTATTCATACAAGTTT--AT--TCA-GA--A--T-AA-AA-T--AA
* * * *
361428 TAATACAAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGT-AGATGATTTAAAAAAGAAA-TATATTT
112 -AAT---AATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGA-GATTTTAAAAATAAATTCTATTT
* **
361491 ACCAAAA
171 ACGAACT
* * * * ** * * *
361498 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGGTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * ** * * *
361563 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTTTTAATAT
66 CATAAAACAA-T-TATTTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAA-AATAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
361628 TTCAACAATTAGTAAGTAAAATATTTTAAAAATAAA-TATGTTTACCAAACA
128 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATTCTATTTA-CGAACT
* * * * ** * * *
361679 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTCAT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * * * * * * *
361744 CATAAAACAATTATATCAGTGCATA-TAGCCTCATTTAAAATAAAATAATACTAATTGAATAATA
66 CATAAAACAATTAT-TTA-TTCATACAAG-TTTATTCAGAATAAAATAA-AATAATTTATTAATA
* * * * * * **
361808 TTTCAAAAATTATTGAGTAAGAGA-TTTAGAATATGAATT-TGTTTACCAAAGA
127 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAATTCTATTTA-CGAACT
** * * * * * * *
361860 AGTTCAAATGGTTATGACTAGTTGAATAATTATCTATGTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * * * * *
361925 CATAGAATAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCCGAAGAAAATAATATAAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATT-ATT-TATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAAAAT-AATTTATTAATAT
* * * * *
361990 TTCAAAAATTAATAAG-AAAAAATTTAAAAAACAAAATTGT-TTT-CTGAACAT
128 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATTCTATTTAC-GAAC-T
* * * * *
362041 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTCATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * ** * * *
362104 TTATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTGATA
65 TCATAAAACAA-T-TATTTATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAA-AATAATTTATTAATA
* * * * * * *
362169 TTTCAAAAAATAATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAAA-T-AATTTATC-AAGCA
127 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATTCTATTTA-CGAA-CT
* * * * * * * * *
362220 AGTTTAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAATTATAATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * *
362285 GATAAAATAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATT-AGAAATAAAA-AATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATT-ATT-TATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAA-AATAATTTATTAATA
* * * * * *
362348 TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATAT-T-TATACTAAACA
127 TT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-TCTATTTAC-GAACT
* * * ** * * *** * *
362400 AGTT--AGTCA-TGT--CCCTTTGAATATTTATCTATTTCAAATTGGTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * ** * * * *
362460 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAAAATGATTCA-AA-ACAAA-AAAATACTGATACATAAT
66 CATAAAACAA-T-TATTTATTCATACAAGTTTATTCAGAATA-AAATAAAATAAT-TTA-TTAAT
* *
362522 ATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAA-TCTGTTTACCGAA--
126 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATTCTATTTA-CGAACT
** * * * * * * * *
362569 AAAT-AAAT-GTGTTTGCCAAACCATTTCAA-ATACTTAAGACTGTTAGAACAATTATCTATTTT
1 AGTTCAAATAAT-TAT----AACTATTTGAACA-A-TT-A-TCTATT---TCAA--ATC-ATTAT
* * * * * * * *
362631 AAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCAGAAAGCAATTATTTCAGTTCGTAGAAGCTTATTCATAA
51 -AA-C---CT---TTTGT-TTTA-TCATAAAACAATTATTT-A-TTCATACAAGTTTATTCAGAA
* * * * *
362696 TAAAATAAAACTAATTTATTAATATTAAAAAAACTAATGAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAATTC
104 TAAAATAAAA-TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTT-AAAAATAAATTC
* *
362761 -GTTTATCGAACA
166 TATTTA-CGAACT
* * * * * **
362773 AGTTGAAATAGATT-TGACTATTT-ATACAATTATTTATTT-AAAGCCATTATGACCTTTCATTT
1 AGTTCAAATA-ATTATAACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTT
* * * ** * * ***
362835 TGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATT-TGAAATAAAATAATACTACCCTATTA
63 TATCATAAAACAATTATTT--ATTCATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAA-AATAATTTATTA
* * ** *
362899 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAACTAAAGTTGT-TTTTTGAACC
124 ATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAA-TTCTATTTACGAACT
* * * * * * * ** * *
362954 AATTCTAATAGTTATAAATATTTCAACAAATAT-TAATCTCAAATTGTTATAATC-TTTGTTTTC
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * * * * ** * *
363017 TCAGAAAATAGTTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCA-AATAAAAATAATACTAGCTTAATAGT
65 TCATAAAACAATTATTTAT--TCATACAAGTTTATTCAGAAT-AAAATAA-AATAATTTATTAAT
* * * *
363081 ATTTCAAAAATTAATAAGT----GA-TTTAAAAATAAATGTGT-TTGATGAACC
126 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-TCTATTTACGAACT
* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * * * * *
363192 GTCATACAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTACTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
65 -TCATAAAACAATTATTT-A-TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAA-AATAATTTATTAAT
* * * * * *
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126 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA-ATAAATTCTATTTA-CGAACT
* * * * * *
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1 -AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATAACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
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* * *
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* ** * * * * *
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1 -AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * * **
363551 TCATAAAATAATTGTTT-TTCAACATACCAGCTTATT-TGAAATAAAATAATCCTAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTATTTATT---CATACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAA-AATAATTTATTAA
* * * *
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125 TATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATTCTATTTA-CGAACT
* * * *
363664 A-TTACAAATAGTT-TGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAAT--TTAT---C---------A
1 AGTT-CAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * ** * *
363713 -C--AAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATGCTAATTTAGTAAA
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* * * * * *
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126 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATTCTATTTACGAA-CT
* * * * * ** * *
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1 AGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * * *
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** * *
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125 TA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAATTCTATTTA-CGAACT
* * * * * *
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1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * ** * * * *
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* * ** * * * *
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* ** * ** * * *
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* * ** * *
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1 AGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * * * *
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65 TCATAAAACAATTA-TTTATTCATACAAGTTTATTCAGAA-TAAAATAA-AATAATTTATTAATA
* * *
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* * ** * * * * * * *
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1 -AGTTCAAATAATTATA-ACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTT
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * * *
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** * * * * *
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* ** * * ** * *
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1 -AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * * * ** * *
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* * *
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * **
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* * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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* * * * *
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* **
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* * * ** * * *
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* * ** *
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* * * ** ** *
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* * * * * *
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* * * *** * * * ** * *
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**
362674 GT
179 AA
*** * * * * ** * * * * ** ** **
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* * * *
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** **
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* * **
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*** * *
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** * * * * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *** * **
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* * *
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* ** * * *
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** * * * * * * * * * * *
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** ** **
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** * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * * * **
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** **
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128 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * ** * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAAAT
*** * * * * * **
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* * * * * ** *
364416 TAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TGTTCATACATGCTTATTTGAAT
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATTG
* * * * * * *
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* * ** * * ** *
364594 AGCTTTTCTTTAATTATAAAACAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAGAA
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* * * *
364648 TAAATTAGTACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATTA-TAAAGAGATTTAAAAAA-ATAAA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATA-AAA
* * * * * * * * *
364710 TCTATTTATCAAACAAGGTCAAATAATTATTATTATTTGGACAATTGTCTATTTAAAATCA-TTA
63 T-TGTTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA
* * * * * *
364774 TAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGAT-AGAA
125 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAA
* ** * * * *
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATTG
* * * * * * ** *
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66 TTTACAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC
* * * * * * ****
364960 TTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTATGATCACAGAAGCTTATT-TGGT
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* *
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* * * * ** * *
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* * ** * * * **
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* * * * * *** *
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* * * * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * * * * * **
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* * * * *** * * * *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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*
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1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAAATAAT
* * ** * * * * *
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66 TTATCAAACAAG-TT--ATAGTCATGACCCTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTAGTATGACCT
* * **
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* * ** * *
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* * *
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362476 TTGTTCATGC
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TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAAATAAT
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GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAGCATATTCAAAA
Found at i:362724 original size:25 final size:23
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*
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*
362711 TTATTAATATTAAAAAAACTAAT
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Statistics
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TTATTAATAATAAAAAAACTAAT
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363063 TAATACTAGC
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1 T
363111 AAATGTGTTT
Statistics
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362557 CTGTTTACCG
*** * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * ** * *
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* ***
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256 GACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATA
* ** *
362888 CTACCCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTAAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTGAA
321 CAACCCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-ATTAAAAAA-TAAA-TCAATTTATTGAA
* * * **
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* * * *
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* *
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*
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* * * * *
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* * * ** *
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131 AAAATAAAACTAATTTATTAACATTAAAAAAACTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATGTG
* *
363300 TTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATCAATTCAAAATCATTAGACCT
196 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATCAATTCAAAACCATTAGACCT
* * * * * ** *
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261 TTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACAACC
* * *
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*** * * * * *
363495 TAATTATTGCCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAAT
391 TAATTATAAACATTTCAACAAATATCTATCTCAAATCATTATTACATTTTGTTTTCTCAGAAAAT
* * * * * * *
363560 AATTGTTTTTCAACATACCAGCTTATTTGAAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTGAAGAA
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* * *
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1 AAAAATAAATGTGTTTGA-TGAACCAATT-CAAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATT
363701 TCAAAT
63 TCAAAT
363707 TTATCACAAA
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (535 bp):
AAAAATAAATGTGTTTGATGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCA
AATCATTATGACCTTTTATTTAGTCAGACAACAATTATTTCAGTTCATAGAAGCTTACTCAGAAT
AAAATAAAACTAATTTATTAACATTAAAAAAACTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATGTG
TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATCAATTCAAAACCATTAGACCT
TTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACAACC
CTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAATTAAAAAATAAATCAATTTATTGAACCAATTCAAA
TAATTATAAACATTTCAACAAATATCTATCTCAAATCATTATTACATTTTGTTTTCTCAGAAAAT
AATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAACTTAATAATATTTCAAAAA
TTAATAAGAGATTTA
Found at i:363246 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 362567--370424 Score: 2854
Period size: 181 Copynumber: 44.1 Consensus size: 175
362557 CTGTTTACCG
*** * * * * *
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* * * * * ** * * * *
362632 AATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCAGAAAGCAATTATTTCAGTTCGTAGAAGCTTATTCATAAT
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGAAT
* * ** * *
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* * *
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* * * * * * **
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* * *
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* * * * ** * *
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1 AAAAA-TAAATG-TG-TTTATGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCT-ATT
** * * * * * * ** * *
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* * * *
363055 AATAAAAATAATACTAGCTTAATAGTATTTCAAAAATTAATAAGTGATTT-
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* * *
363105 AAAAATAAATGTGTTTGATGAACCAATTCAAATAGTTAAGAATATTAGAATAATTATCTATTTCA
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* * *
363170 AATCATTATGATCTTTTATTTAGTCATACAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTACTCAGAAT
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGAAT
* * **
363235 AAAATAATACTAATTTATTAACATTGAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGA
129 AAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-GAGATTT-A
* * * *
363287 AAAGATAAATGTGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAACAATTATC-AATTC
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * *
363350 AAAATCATTA-GACCTTTTATTTTGTCGTAAAATAATTATTTTAGTTCATA-AATGCTTATCCAA
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363413 AATAAAATAATAC-AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
126 AATAAAATAATACTAAC-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
*** * * * * *
363463 AAAAATAAATCAATTTATTGAATCAATTCAAATAATTATTG-CCATTTGAACAACTATCTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTA-TGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * **
363527 AAATCATTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT---TTCAACATACCAGCTTATTTG
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* * * *
363589 AAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTGAAGAATTAATAAGAGATTTA
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* * *
363640 AAAAATAAATCTATTTATTGAACC-ATTACAAATAGTT-TGACTACTT-GAATAATTATCTATTT
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* * *
363702 CAAAT--TTAT---C----A------C--AAAACAATTGTTTCTA-TTTATACAAGCTTATTC-G
63 CAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA-TCAG
* * * * *
363748 AAATAAAATAATGCTAATTTAGTAA-AATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGA-TTA
126 -AATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
*** *** * * * * * *
363802 AAAAATAAATCCATTTGCCAAGCTAGTTCAAATAGTTAAGATTA-TATGAATAATTATTTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTATGAA-CCAATTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTATTTC
** * * * * * *
363866 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGCTCATACAAGCTTCTGC-GAA
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTAT-CAG-A
* * * * *
363930 ATAGAATGAA-ACAAATTTATCAATATTTTAAAAATTTGTAAGTAAGA-AGTTTA
127 ATAAAAT-AATACTAACTTATTAATATTTCAAAAA--T-TAA-TAAGAGA-TTTA
* * * * * * * *
363983 GAAAATAATTCTATTTACCGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTA-AACAACTATCTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ** * * * * **
364047 AAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAGGTTTGTTTGAAA
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATCAG-AA
* *
364112 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGATAATTAATCAGTAAGAGATTTA
128 TAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAGATTTA
* * * ** * * * *
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1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * * * ** *
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64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGA
* * * * * *
364290 ATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAACTTAATAACCAAACAAATTA
127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A--AGA-GATTTA
* **** * * * **
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1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTATTTC
* * * * * * **
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64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATCAGAA-
* * *
364471 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGTTTTA
128 TAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * ** * * * * * *
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1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTATTTC
* * * ** * * * * *
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64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGAA
* * * *
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128 TAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAA-TT-A--AT-AAGAGATTT-A
* * * * * * * * * * * *
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1 AAAAATAAATGTGTTTATGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * *
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65 AATCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTT--ATCAGA
* * * * * *
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127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTT-C-AAA-AATTAA-TAAGAGATTTA
* ** * * * * * * *
364882 AAAAATAAATTTGTTTACCAACTCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTATGAAC-CAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * * ** **
364947 AATTGTTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTT-ATGATCACAGAAGCTTATTTGGTT
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATATAAGCTTATCAGAAT
* *
365011 AAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
129 -AAAATAATACTAACTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
* * * * ** * * * * **
365063 AAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAATAAAAACTATTAAAATAATTTTTTATTTTT
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
365128 AATCTTTATGA-CTTGTTGTTTAGTCGTAAAAT-ATTAGTTTCA-TGTCCTATAAGCTTAATTA-
65 AATCATTATGACCTT-TTATTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCAGT-TCATATAAGCTT-ATCAG
* * * *
365189 ACATTCAAAA-AATTAATAAGC--A-AAATATTTGAAAAATTGAAT--GTG-TTTACA
126 A-A-T-AAAATAA-TACTAA-CTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGAGATTT--A
* * * * * *
365240 AAACAAGTTTAAAT-AG-TTATG-ACTATTTGAACA-A-TTAT--TTATT-TAA-AATTGCCATG
1 AAA-AA---TAAATGTGTTTATGAACCAATTCAA-ATAGTTATGACTATTAGAACAATT---AT-
* **** ** * ** * * *
365296 ACTTTTTGTTTTGCCA-TAAAACACTTGT-TTCAGT--TCACAA-AA--GCTT-A-TCCA-A-AA
57 -CTATTTCAAAT--CATTATGAC-CTTTTATTTTGTCAT-AAAATAATTGTTTCAGTTCATATAA
* * * * * * ** *
365350 ---TA--A-AGTAATACTAATTTCTTAA--TATTTCAAAAATT-AATAA-GCAT--GA-TTTTA
117 GCTTATCAGAATAA-AATAA-TAC-TAACTTA-TT-AATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * * * *
365401 AAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTTA
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * ** *
365466 AATTGTTATTACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTGCAGTTCATACGAGCTTATTCAAAAT
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGAAT
* * *
365531 AAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAAATTTA
129 AAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
* * * ** * * * ** *
365582 AAAAGTGAATATGTTTATCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCATTTTAAGAATTATCTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
*** * * * * * ** * *
365647 AATCGCCATTACCTTTT-GTTTGCTCATATAACAATTATTT-TTTATCATACAAGCTTATTAAGA
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTG-TCATAAAATAATTGTTTCAGT-TCATATAAGCTTA-TCAGA
* * * *
365710 ATAAAATAATACTAATTTTTTAATCTTTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A-TAAGAGATTTA
* ** * * * *
365762 AAAACTAAAT-TCGTTTACCAGACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA--TATATC
1 AAAAATAAATGT-GTTTATGA-ACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * *
365824 AAATCATCATAACCTTTTGTTCTATCCTAAAA-AAATATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAA
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA-TCAGA
*
365887 ATAAAATAATACTAA-TCTAATAATATTTCAAAAATTAATGATTAAGAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACT-TATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTA
* * * * * * * * *
365940 AAATATAAATTTTTTTGTTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTA-TATGAACAATTATCTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTT-ATGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTATTTC
** * * * * * *
366004 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTAAATTCATACT-AGCTTATTAGG
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAA-TTGTTTCAGTTCATA-TAAGCTTATCA-G
* * *
366068 AATAAAATAA-AATGAAGTTATTAAAATTTCAAAAATTGATAAGTAAGAGATTTAA
126 AATAAAATAATACT-AACTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT-A
* * * * *
366123 AAAAATAATTTTGTTTACCT-AACCAAATT-AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
1 AAAAATAAATGTGTTTA--TGAACC-AATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** ** * **
366186 CAAATCGTTACGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAGTTTTTGTTCATATAAATCTGT-TTGG
63 CAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATAT-AAGCT-TATCAG
*
366250 AATAAAATAATACTAA-TCTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
126 AATAAAATAATACTAACT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * * * * *
366300 AAAAAT--AT-TTTTTATCAA-AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTT
1 AAAAATAAATGTGTTTATGAACCA-A-TTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
** * * ** * * *
366361 AAATTGTTATGA-CTTTTATTATGTTATAAAATAATAATTTCTGTTCATACAAG-TATATTCATA
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCT-TA-TCAGA
* * * ** * *
366424 TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAGGTAAAAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATT-A-A--TAAGAGATTTA
* ** * * * * **
366477 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGGCTATTTGAGTAATTATCTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTATGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * ** *
366542 AATCATTTTGATCTTTTCTTATGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGATGT
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATCAGA-AT
* * * * *
366607 AAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAGAAATTAATGAATAAGAGAATTA
129 AAAATAATACTAACTTATTAATATT-T-CAAA--AATTAATAAGAGATTTA
* * * * * * *
366658 AAAGA-GAATCTGTTTACCGAA-TATGTTCAAATAGTTATAACTATCTA-AACAATTAT-TGATT
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTAT-TAGAACAATTATCT-ATT
* * * * * * * ** **
366719 TCAAAACATAATGACCTTTTGA-TTTGTTATAAAACAATTGGTTCTGTTGATGCAAGCTTATTTG
62 TCAAATCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCA
* * *
366783 GAATAAAATGATA-TAAATTTATT-ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
125 GAATAAAATAATACT-AACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTA
* ** * ** *
366837 AAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATTTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTATGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * * ** *
366902 AATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAACTAT-TTTTA-TTCAAACAAAATTATTCAAA
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAA-T-TGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGA
* *
366965 ATAAAATAATACTAATTTATGAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
** * ** * * * ** * * *
367014 AAAGCTAAATCTGTTTCCGAACTAGTTCAAATAGCTACAACTATTTGAATAATTATCTATCTCAA
1 AAAAATAAATGTGTTTATGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** * *
367079 ATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTTATGCAAGATTATTCAGAGT
66 ATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA-TCAGAAT
* * * *
367142 TAAAT-ATAGCTAA-TCTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTT
129 AAAATAATA-CTAACT-TATTAATATTTC-AAAA--ATTAA-TAAGAGATTTA
* * * * * *
367192 AAAAATAAATATATTTGCTGAACCAA-TCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTT-ATGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
367256 AATTATTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCACACATGCTTATCCAAAAT
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTAT-CAGAAT
* ** *
367321 AAAATAATACT-ATTCTAGCAACA-TTCAAAAAATTAATAAGGAAGAAATTTTA
129 AAAATAATACTAACT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-G-AG--A-TTTA
* * * * * * * * * *
367373 AAAAATAAATCTATTTACTAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCGATTTGAACAATTATCTATTTAA
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * * *
367438 AATGATTATGGCATTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTGAGTTCATAAAAGCTTATGAAAATA
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATCAGAATA
** * * *
367503 AAATAATA-TTGCTTTATTAATATTTAAAAAATTAAGAAGTTGGAGATTTT
130 AAATAATACTAAC-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAA----GAGATTTA
** ** * * ** *
367553 AAAAATAAATAAGTTTATCGAATGAATTCAAATAATTATTG-CCATTTTAATAATTATCTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAATTCAAATAGTTA-TGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * ** * * **
367617 AAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTTTTTTTTCA-TT-GTATAAGCTTATTTG
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT-AAA-A-TAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATCAG
* *
367680 AAATAAAATAATACTAA-TTTTTAATATTTCAAAAATTAAACAGTAGGAGATTTA
126 -AATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATT--A-A-TAAGAGATTTA
* * * * * *
367734 AAAAATGAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATATATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
367799 AATCATTGTAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTTATA-AATGCTTATTTAGA
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATATAA-GCTTA-TCAGA
* * *
367862 ATAAAATAATACTAA-TCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACT-TATTAATATT-TCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTA
* * * * * * * * *
367915 AAAAATAAATTTGTTTTCTAAACCAGTTCAAATAATTAAGGCTA-TATGAATAATTATCTATTTT
1 AAAAATAAATGTG-TTTATGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTA-GAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * * *
367979 AAATCGTTATGACCATTTGTTATGTCGTAAAACAAATGTTTTC-CTTCATATAAGTTTGTTCAAA
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTT-ATCAGA
* *
368043 ATAAAATAATACTAA-TCTACTAATATGTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * ** * * * * *
368092 AAAAATAAATCTATAAATCAAACGAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
** * * * ** ** * * *
368157 AATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATAATTTTTGTTCATACAAGCATATTCAGATT
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGAAT
* * * ** *
368222 AAAATAATATTCAGTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG-GATTTA
129 AAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * * ** *
368268 AAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTAATGACAATTTGAGTAATTATTTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * **
368332 AAATTATTTTGACCTTTCT-TTTTTTAATAAAATAATTATTTTAGATCATATAAACTTATTTGAT
64 AAATCATTATGACCTTT-TATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATCAGA-
* * * * * *
368396 GTAAAATCATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTA
127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTA
* ** ** * * *
368449 AAAAA-AGAATCTGTTTACCAAATAAGTTTAAATGGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTACTT
1 AAAAATA-AATGTGTTTATGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * *
368512 CAAAACATAATTACCTTTTGTTTTGTCTTAAAAAAATTGGTTCTGTT--GAT--GCTTATTACA-
63 CAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-T-CAG
* *
368572 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATGTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
126 AATAAAATAATACT-AACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTA
** * * * *
368626 AAAAATAAACCTATTTACCGAA-CATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * * * ** *
368690 AAATCATTATAATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAAATTATTCAAA
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-GTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGA
*
368754 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA-TTA
127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* ** * ** * ** * * *
368802 AAAACTAAACATATTTACCAGACTAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTATGA-ACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
368867 AATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCA--TCGTATAAGCCTATTTAGA
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTT-CAGTTCATATAAGCTTA-TCAGA
* * *
368929 ATAAAATAATACTAA-TTTTTGATATTTTAAAAATTAATGAGTAGAAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AG-AGATTTA
* * * *
368981 AAAAATAAATCTGTTTATCGAACTC-GTTCAAATAGTTATAACTATTTA-AACAATTATATATTT
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAAC-CAATTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTT
** * * * * * * * *
369044 CAAATTGTTCTAACCTTTTATTTAGTAATAAAATAATTGTTTCACTTCATACATGCTTATCCGAA
63 CAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTAT-C-AG
** * *
369109 AATAAAATAATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTAA
126 AATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--AG--ATTTA
* ** * * * * * *
369163 AAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAATTCAAATAGTCAAGTCTATTTGAACAATTATCTATTTAA
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
369228 AATCATTATGCCCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAGTTCATAAAAGCTTATGCAAAA
65 AATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTTAT-CAGAA
* * *
369293 TAAAATAATA-TTACTTTATTAGTATTTCAAAATTTGAA-AAGTTGGAGATTTA
128 TAAAATAATACTAAC-TTATTAATATTTCAAAAATT-AATAA----GAGATTTA
** * * * *
369345 AAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAATTCAAATAATTATGGCCATTTA-AACAATTATCTATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * *
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64 AAATCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAATAATTG--TTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCA
* * * *
369471 GAATAAAACAGTACTAA-TTTTTAATATTTC-AAAATTAATGAGTAAAAGATTTA
125 GAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTA
* * * * *
369524 AAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGTTTAAATAGTTATAACTATTTA-AACAATTATATATTTC
1 AAAAATAAATGTGTTTAT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * * *
369588 AAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-ATGTTAATACAAGCTTATTCAAA
64 AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATATAAGCTTA-TCAGA
* * * *
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127 ATAAAATAATACTAACT-TATTAATATT-TCAAAAATTAAT-A---AGAGATTTA
* * *** * * * * *
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1 AAAAATAAATGTGTTT-ATGAACCAATTCAAATAGTTATGACT--ATTAGAACAATTATCTATTT
* * ** * * * * ** * * * * **
369768 TAAATCGTTATGTTCTTCTATTTTGTCATAGAACAAATGTTTTTGTTCGTTTAAGTTTGTTTGAA
63 CAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATCAG-A
* **
369833 ATAAAATAATATTAA--TATTTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTA
127 ATAAAATAATACTAACTTA-TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * * * * * *
369881 AAAAATAAATCTCTTTACTAAACCAATTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
369946 AATCATTAT--TCTGATTTGTTTTGTCGTAAAATAATTGTTTCTA-TTGATACAATCTTATTC-G
65 AATCATTATGACCT--TTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA-TCAG
* * *
370007 AAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTA
126 -AATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AGATTTA
* * * * *
370062 AAAAATGAATCTG-TCA-G---C----C---T-G-TATGAC-AGTTTGAATAATTATCTATTTCA
1 AAAAATAAATGTGTTTATGAACCAATTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
370112 AATCATTTTGACCCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCGTACAAGCTTATTAAGAA
65 AATCATTATGA-CCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTA-TCAGAA
* * * * *
370177 TAACATAATTCTAATTTATTAATA-TTCCAAAATTAATAAGGCAAATATTTA
128 TAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-G---AGATTTA
* * * * * * * *
370228 AAAACTAAATCTGTTTATTGAA-CAGGTCCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATATATTTG
1 AAAAATAAATGTGTTTA-TGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
370292 AAAT-AGGTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTA-TTTATACAAGCTTATTTC-
64 AAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTA--TCA
* ** *
370353 GATTAAAATAATAAAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTA
125 GAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG----AGATTTA
*
370408 AAAAATAAATATGTTTA
1 AAAAATAAATGTGTTTA
370425 CCTAACATAT
Statistics
Matches: 5869, Mismatches: 1316, Indels: 984
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
157 5 0.00
158 4 0.00
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1 AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
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* * * *
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* * * * * * *
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* ** * ** * * * *
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** * * ** ** * *
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* * * * * * * * *
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**
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* * * * *
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1 AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATC-TGTTTATCGA-ACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
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1 AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
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* * * * * *
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* * * *
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1 -AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
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* * * * * * **
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* * **
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* * * * *
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1 AA-A-AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACA-AGTTCAA-ATA-G
* * * * ** *****
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* * ** * *
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172 TAA-TAT-T-TC
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* * * * * ** * * * ** ** ** *
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166 ATTTAT-TAA---TA-TTTC
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1 AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTA-AAAAAT-AA-ATCTGTTTAT-CG-AACAAG-T-TCAAATA
** * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** *
375463 CTTTTTACC-TAATCAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
61 CTATTTACCAAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTTAT
* * ** * * * * * *
375527 GACCTTTTGTTT-TGTCATAAAGCAGA-TGTTTTTGTTTGA-ATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTA
125 AACCTTTTGTTTCTATCATAAAATA-ATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* *
375589 ATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAATCTATTTGTCAAAC
188 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAA--TA------AATC
* ** * * * * * * * * *
375650 TAGTTCAAATAATTACGACTATT-TTAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCT
244 T-GTT-TACCAA--ACCAGT-TTCTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCT
* * ** * * *
375714 ATTAGAAAATGATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTCG
304 ATCATAAAACAATTGTTTATGA-ACAT--AAGCTTATTTGG
* * * * * * *
375753 AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATATCGACAATTAATAACTAAAAAATTTAGAAAATAAAT
1 AA-T-AAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATT-AT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * ** * * * *
375818 ATATTTATCGAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTATATCGTTACA
61 CTATTTACCAAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTTATA
* * * * * * *
375883 ATCTTTTGTATTGTA--ATAAAAGAATTG-TTTTAGTTCATATAAACTTAATCAGAATAAAATAA
126 ACCTTTTGT-TTCTATCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * *
375945 TACTAATGTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTT-AAAAATGAATCTCTTTACTA
189 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * * *
376008 AACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-GAATCACTATAACCTTTTGTT
253 AACCAG---------TT-T--CTA----AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATT
* * * ** * **
376072 TTATCATAAAATATAATT-TTCA-GTTCATACAATCTT-TTGTCA
302 CTATCAT-AAA-ACAATTGTTTATGAACAT--AAGCTTATT-TGG
* * *
376114 AATAAAATAATA-TAATTTTATTACTATT-AAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AAT-AAATAATACTAA-TTTATTAATTTTCAA-A-AATT-AT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * **
376177 ACTGTTTATCGAACA-AGTTTAAATCA-TTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTT
60 TCTATTTA-CCAAAATAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTT
* * * * * * * ** *
376240 ATGACTTTTTGTGTTGT-T-AGAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTCGGATTAAAAT
123 ATAACCTTTTGT-TTCTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
* ** * * * *
376303 AATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAAT
187 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T
* * * * * * *
376368 AAGCAAGTTCAAATAGTCATGACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTC
249 -A-C-----C-AA-A-CCA-G--T-TTCTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTA
* * * * ** * * *
376432 TTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTT-A
300 TTCTATCATAAAACAATTGTTT--ATGAACATAAGCTTATTTGG
* * * * * *
376475 AAGTAAAATAGTGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATCAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAAT
1 AA-T-AAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAAT-TAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * ***
376540 CT-GTTATC-GAATAAGTTTAAAAAGTTATGGCTATTTGAATAA-T-TAACTGTCACAAAACATT
61 CTATTTACCAAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATAAAT-T-TCAAATTGTT
* * * * * * * *
376601 ATGACATTTTGTTT-TATCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAACAAAA-
123 ATAACCTTTTGTTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT
* * * * * * * *
376663 AAT-TTAAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATTAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTC
187 AATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATC--TGTT-
* * * * *
376726 TGAACATATTCAAA-TAGTTATAACAATTTGAACAATAATCTATTTGAAATCTTTAGT-ACCTTT
248 T--AC-----CAAACCAGTT-T--C----TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTT
* * * * * *
376789 TGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTTAG
298 TATTCTATCATAAAACAATTGTTTATGA-ACAT--AAGCTTATTTGG
* *
376835 AATACAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTTATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATA-AATAATACTAATTTATT-AATTTTCAAAAA-TTAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * ** * *
376900 GATTTA-CTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATG
62 TATTTACCAAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTTATA
* * * * * *
376964 ATCTTTTGTTT-TGTCACAAAA-CATATGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAT
126 ACCTTTTGTTTCTATCATAAAATAAT-TGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * *
377027 ACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGCT-GGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTATCA
190 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA
* * ** * * *
377090 AACAAGTTTGAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTTTT
253 AACCAG--T---T--TC---T--A----AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATT
* * ** * ** ***
377155 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAAATTATTAAA
302 CTATCATAAAACAATTG--TTTATGAACATAAGCTTATTTGG
* * * *
377197 AATAAAATAACACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTA-A-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTA
1 AAT-AAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
** * ** * * * *
377260 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTTGAACAATTATCTA-TCCAGA-TATTAT-A-T
64 TTTACCAAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTTATAACC
* * * * * * *
377320 TATTTGTTT-TGTCTTAAAACAATTGTTCTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAAT-ATAGC
129 T-TTTGTTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-C
** * * ** *
377383 TAAACTAATAATA-TTCTAGAAACGAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGA-CAA
192 TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAA
* * * * *
377445 ACCAATTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTGTT-
254 A-C----C----AGTT-----T-CTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTC
* * ** * *
377508 TAGTTATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATGCATGCTTATTTGA
303 TA-TCATAAAACAATTGTTT-ATGAACAT--AAGCTTATTTGG
* ** * * *
377550 AATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATA
1 AAT-AAATAATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATT-AT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * ** * **
377615 TGTTTACTGAACA-AGTTTAAATAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
62 TATTTAC-CAAAATAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTTAT
* * * * *
377678 GACCTTTTGTTTTTATCATAAAACAACTG-TTTCATTCATA-AATG-TTGATTCAAAATAAAATA
125 AACCTTTTGTTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAA-GCTT-ATTCAAAATAAAATA
* * ** * * *
377740 ATAGTACTTTATTAATATTTCAAATTTTGAAAAATTGAA-A-ATTTTAAAAAATAAATCAGTTTA
188 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAACT-AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTA
** * * ** * *
377803 TCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTT
250 -C----CA----AACCAGTT-T---C---TAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTT
* * * * * *
377868 GTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCCTATTTGG
299 ATTCTATCATAAAACAATTGTTTATGAACAT--AAGCTTATTTGG
* * * * *
377913 AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATA
1 AAT-AAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATT-AT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * ***
377978 TATTTACCGAACCAGTTTAAATAGTTA-AACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAACATTATAA
62 TATTTACCAAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTTATAA
* * * * * ** * * * * *
378042 CCTTTTATTTTTGTCATAAAACAATTATTGATGTTCATATAAGCTTGTTCGAAATAAAATAATAT
127 CCTTTTGTTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
378107 TAATCTAATAATA-TTAAGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAAC
192 TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * * *
378171 CAATTTGTATGAATAATTATCTATTTCAAGTCAT
256 CAGTTTCTA--AACAATTATCTATTTCAAATCAT
378205 AACAATTTTG
Statistics
Matches: 2656, Mismatches: 584, Indels: 537
0.70 0.15 0.14
Matches are distributed among these distances:
337 4 0.00
338 2 0.00
339 68 0.03
340 24 0.01
341 2 0.00
342 1 0.00
343 4 0.00
344 172 0.06
345 31 0.01
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347 6 0.00
348 23 0.01
349 28 0.01
350 7 0.00
351 6 0.00
352 16 0.01
353 70 0.03
354 140 0.05
355 173 0.07
356 41 0.02
357 89 0.03
358 70 0.03
359 167 0.06
360 355 0.13
361 243 0.09
362 355 0.13
363 340 0.13
364 28 0.01
365 6 0.00
366 8 0.00
367 2 0.00
368 6 0.00
369 9 0.00
371 2 0.00
372 2 0.00
373 1 0.00
374 1 0.00
375 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (341 bp):
AATAAATAATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
TACCAAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATAAATTTCAAATTGTTATAACCTT
TTGTTTCTATCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTT
TCTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTATGA
ACATAAGCTTATTTGG
Found at i:375274 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 374957--378166 Score: 2244
Period size: 181 Copynumber: 17.8 Consensus size: 181
374947 AATCAGTTCA
* * * * * * **
374957 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGCTTTTGAACAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* ** * * * *
375022 TCAAGCTTATTTGGAATAAGATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATATGTAAGAGAT
66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAAT
375087 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * * * * ** *
375138 AATAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTCTTTTATAAAATTATTATTTTTGTTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* ** * * * *
375202 TATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAAA
65 TACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAA
* * * *** * * * * * * *
375267 ATTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAATTATTTTAAATATTTAAGACAATATG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * **
375319 AATAAACATTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGGTT-TTTTCAATT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTT-TGTT
* * ** * * *
375382 CATACTAGTTTATTTGGAATAACATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAG
63 CATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
375446 AGATTTAAAAAATAATTCTTTTTACCTAA-TCAGTTTAAATAATTATAACTATTTG
127 AAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* *
375501 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAGA-TGTTTTTGTTTG
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTTTG-TTC
* * * * * *
375565 A-ATAAGTTTGTTCAAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--
64 ATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA
** * * * *
375625 ATTT--AAAA-AAATCTATTTGTCAAACTAGTTCAAATAATTACGACTATTTT
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * * * ** * *
375675 AGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTAGAAAATGATTGTTTCTATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
** * * * * * *
375740 ACAAGCTTATTCGAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATATCGACAATTAATAACTAAAAAAT
66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAAT
* * * * * *
375805 TTAGAAAATAAATATATTTATCGAACTAGATCAAATAATCATGACTATTTG
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * * * *
375856 AATAATTATCTATTTTATATCGTTACAATCTTTTGTATTGTAATAAAAGAATTGTTTTAGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * * * * * * *
375921 ATAAACTTAATCAGAATAAAATAATACTAATGTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGA
66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAAA
* * ** * * *
375985 TTT-AAAAATGAATCTCTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * * * **
376036 AACAATTATCTATTT-GAATCACTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATATAAT-TTTCAGTTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTTTGTTCA
* * *
376099 TACAATCTT-TTGTCAAATAAAATAATA-TAATTTTATTACTA-TT-AAGATAATTAATAAGTAA
65 TACAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAA
* * * * *
376160 -AAGATTTAAAAAATAAAACTGTTTATCGAACAAGTTTAAATCA-TTATGACTATTTG
126 GAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
376216 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTGTTGTTAGAAAATAATTGTTTCTGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* *** * * ** *
376281 ACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAGA
66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-A
* * ** * *
376345 TTTAAAAAATAAATATGTTTA-ATAAGCAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * ***
376397 AATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCATTTCTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * * * * *
376462 AGAAGCTTATTTAAAGTAAAATAGTGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATCAATGAGTAAGAGAA
66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-AA
* * * * * *
376527 -TTAAAAAATGAATCT-GTTATCGAA-TAAGTTTAAAAAGTTATGGCTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * * * * *
376577 AATAATTAACTGTCACAAAACATTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * * * * *
376642 GCAAGCTTATTTCAAACAAAA-AAT-TTAAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATTAGTAA-AAA
66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAA
* * * * *
376704 TTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACATA-TTCAAATAGTTATAACAATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * *
376756 AACAATAATCTATTTGAAATCTTTA-GTACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * *
376820 TAAAAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTTATAAGTAA-AAG
65 TACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-
* * * *
376884 ATTTAAAAAATAAATCGATTTACTG-AGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
376937 AATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCACAAAAC-ATATGTTTCTATTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTTGTTCA
* * *
377001 TACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGCT-GGA
65 TACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGA
* ** * * * ** * * *
377064 GATTTAAAAAATAAATCCGTTTATCAAACAAGTTTGAATAGTCATGTCCATTTG
128 AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
377118 AACT-ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
1 AA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* ** * * *
377182 TATAAAATTATTAAAAATAAAATAACACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--A
65 TACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAA
* * * *
377243 TTTAAAAACTAAATTTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-GACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
377294 AACAATTATCTA-TCCAGAT-ATTAT-A-TTATTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTCTTGTTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * ** * * ** *
377355 TACAAGCTTATTCAGAGTAAAAT-ATAGCTAAACTAATAATA-TTCTAGAAACGAATAAGCAAGA
65 TACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * *
377418 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGA-CAAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTAG
128 AATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * **
377472 AACAATTATTTATTTCAAATCATTTTGACC-TTTGTTTAGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * * * *
377536 GCATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAA
66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAA
* * * * *
377600 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA-TAATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG
* * * * * **
377652 AACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTATCATAAAACAACTG-TTTCATTCA
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * ** * *
377716 TA-AATG-TTGATTCAAAATAAAATAATAGTACTTTATTAATATTTCAAATTTTGAAAAATTGAA
65 TACAA-GCTT-ATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGT-AA
* * * * *
377779 -AATTTTAAAAAATAAATC-AGTTTATCGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTG
126 GAAATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * ***
377834 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTCAACAT
1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* ** * * * **
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66 ACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAAT
* * * *
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131 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * **
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1 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * ** * * * * * *
378079 TATAAGCTTGTTCGAAATAAAATAATATTAATCTAATAATA-TTAAGAAAATTAATAACTAAGAG
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*
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TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
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375199 TCATATAAGC
*
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** * * * *
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* * * * * * *
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* * * **
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AATAATTATACTATTTG
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375026 GCTTATTTGG
* * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * ** *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * *
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* * **
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* *
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* * * * * * * *
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*
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* * * *
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192 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACT
* * * * ** *
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* * * * * *
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* * *
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*
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* *
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* * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
376498 AATATTCCAAAAATCAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCT-GTTATCGAATAAGTTTAAA-
382 AATATTCCAAAAATTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTCTTTATCAAACAAGTTTAAAT
* * * * ** * *
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* *
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* * * * *
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1 AATAAAATAATAT-AATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
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* * * ** * * *
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126 TG-ACTTTTTG-TTTATTAGAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAA
* * * * **
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * ** * * *
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* * * * ** **
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* * * *
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1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
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** * * *
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** * * ** * * * *
377379 TAGCTAAACTAATAATA-TTCTAGAAACGAATAAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGA
189 TA-CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-CTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTT-A
* * * * * * * * * * *
377442 -CAAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATCATTTTGA-CCTTT
250 TCGAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTT
* * * * ** * * *
377505 GTTTAGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATGCATGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTATTTT
315 GTTTTGTAATAAAATAATTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * *
377569 ATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTT
379 ATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTCTTTATC-AAACAAGTTT
*
377633 AAATAGTTATGA-TAATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTATCAT
442 AAATAATTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTG-TTTTATCAT
* * * * *
377697 AAAACA-ACTGTTTC-ATTCATAAATGTTGAT-TCAA
504 AAAA-ATAAT-TTTCTGTTCATCAATCTT-TTGTC-A
* ** * * *
377731 AATAAAATAATAGTACTTTATTAATATTTCAAATTTTGAAAAATTGAAAA-TTTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTCAAAAATT-AATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
377795 TC-AGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
62 TCTA-TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
* * * * * *
377858 ATGAGC-TTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCCTATTTGGAATAAAAT
125 ATGA-CTTTTTG-TTTATTAGAAAATAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAAT
* * * **** *
377921 AATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATAAATATATTTACC
187 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATC
* * * * * * * * * * *
377986 GAACCAGTTTAAATAGTTA-AACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAACATTATAACCTTTTAT
252 GAACTAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTT-G
* * * * * * * *
378050 TTTTGTCATAAAACAATT-ATTGATGTTCATATAAGCTTGTTC-GAAATAAAATAATATTAATCT
316 TTTTGTAATAAAATAATTGTTTTA-ATTCATATAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTT
* *
378113 AATAATATT-AAGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT
379 ATTAATATTCCA-AAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAAT
378154 AAATTTATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATAAAATAATATAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACT
TTTTGTTTATTAGAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACTAGTT
CAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTAATA
AAATAATTGTTTTAATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
AAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAAATGAATCTCTTTATCAAACAAGTTTAAATAATTATGACT
ATTTGAACAATTATCTATTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAATAATTTTCTGTT
CATCAATCTTTTGTCA
Found at i:378246 original size:19 final size:19
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378212 TTGTTTGCAA
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* *
378241 AACTATTT-GAACAATTAT
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*
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AACTATTTCAAATAATTAT
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378221 AAACTATTTC
* * *
378231 AAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGCT-TTGTCATA
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* * * ** *
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* *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * * *
378590 CAAACAATTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATTACA
1 -AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTATTATCATA
* * * * ** * *
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65 AAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCT
* * * * * * *
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130 AAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATA-AATCTATTTGCCAAACCAGTTG
* * ** ** *
378767 AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAACCTTTTGTATTGTCATAA
1 AAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTATTATCATAA
378832 AACAATT-TTTACTATTCATA
66 AACAATTGTTT-CTATTCATA
378852 CACGCTTATT
Statistics
Matches: 358, Mismatches: 72, Indels: 27
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
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AACAATTGTTTCTATTCATATAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTA
AAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTGCCAAACCAGTTG
Found at i:379106 original size:17 final size:18
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379056 ACTAAACAAG
*
379066 TTCAAATAGTAATACTAT
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*
379084 TT-AAATAATTAT-CTAT
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Statistics
Matches: 20, Mismatches: 2, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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TTCAAATAATAATACTAT
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378874 ACCAAATAAT
* * * * *
378884 TTCAATTAGTTATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
378949 ATAAGACAATTATTTTTGTTCT-TACCAA-CTTATTCGGATCAAAATAATATTAGTTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTATT-TATA-CAAGCTTATTTGAAT-AAAATAATATAAATTTACTAATA
* *
379012 TTTC-ATGAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAA
127 TTTCAAAG-ATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
* * * * * **
379065 GTTCAAATAGTAAT-ACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTCATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *
379129 ATAAAACAATTGTATAAATTTATA-TAGACTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTACT-A
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAG-CTTATTTG-AATAAAATAATA-TAA-AT-TTACTAA
* * *
379192 T-TTTGAAA-ATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAA
125 TATTTCAAAGATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAAC-AA
* * *
379246 TTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTGTCTGTTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTC
379311 ATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTACTAATATT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTA-TTTGAATAAAATAATATAAATTTACTAATATT
* * **
379376 CCAAAGATTAACAAGTAAAAATTTAAACAAA-AAATATGTTTTTTGAACACA
129 TCAAAGATTAATAAGTAAAAATTTAAA-AAATAAATATGTTTACTGAACA-A
* * * *
379427 TTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTCAAATCGTTATGA-CATTT-TTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * *
379490 TAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATCATACT-AATGTATTAAAATT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTT-GAATAAAATAATA-TAAATTTACTAATATT
* * * **
379554 ACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGGTTTACTGA
129 TCAAAGATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGA
379601 GTGAGTTCAA
Statistics
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTGAATAAAATAATATAAATTTACTAATATTTC
AAAGATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAA
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Period size: 108 Copynumber: 1.9 Consensus size: 108
379497 ATTGTTTCTA
* * **
379507 TTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATCATACTAATGTATTAAAATTACAAAAATTAATAAGTAA
1 TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATACTAATGTATTAAAATTACAAAAATTAATAAGTAA
*
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* * * * * *
379615 TTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTAA
1 TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATACTAATGTATTAAAATTACAAAAATTAATAAGTAA
* **
379680 GAGATATAAAAAATGAATTTGTTTACTG
66 GAGATATAAAAAATAAATCGGTTTACTG
379708 GACATGTTCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
108 79 1.00
ACGTcount: A:0.47, C:0.07, G:0.11, T:0.35
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TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAAAAATACTAATGTATTAAAATTACAAAAATTAATAAGTAA
GAGATATAAAAAATAAATCGGTTTACTGAGTGAGTTCAAATAG
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379616 TCATATAAGT
* * * *
379626 TTATTCGAAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTAAGAGATATAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAA
* * ** * * *
379691 AATGAATTTGTTTACTGGACATGTTCAATTGGTTATTACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
65 AATAAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTA-TACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * *
379756 CA-TTATTACTTTTTGTTTTGTCAT-AAATAATTG--TCTATGTTCGTA-AAGGC
129 -AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAA--C
* * *
379806 TTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAGTTAAA
1 TTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAA
* *
379869 AAATAAATATGTTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTATATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
64 AAATAAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * *
379934 TAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTTGCA-CCAAC
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* * * * *
379986 GTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATAATCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAA
* ** ** * * ** * * * *
380051 AATAAATCTATTTACCCAGTAAGTTCATATTCTTATGACTGTTTGAAGAATTTTTTATTTCAAAT
65 AATAAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
380116 AGTTATGATCTTTCGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-CTTCATACAAGT
129 AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA-C
* * * **
380167 TTAGTT-AGAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGTGATTTAAA
1 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAA
* * * * * *
380231 AAATAAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCCA-TTCGA
64 AAAT-AAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTC-A
* * * *
380295 AATTA-TTATGACTTTTTGTTCTG-CTATAAAATAATTGTTTCTATTT-ATGCAAC
126 AA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAC
* * * * * *
380348 ATTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATCTATCAATGTTT-GAAAATTAATAAG---AGATTTGAA
1 -TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAA
* * *
380408 AACTAAATCTGTTTACTAAA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAA
64 AAATAAATCTGTTTACTAAACAT-GTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
380472 ATCGTTATGATCTTTAT-TTTT-TCAAAAAACAATTGTTTCT-TTTCA-ACAAGC
127 ATAGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA-C
* * * * ** * *
380523 TTA-TTCAGATTAAAATAATACTAATTCAATGTTATTCCAAAAATTAGTAAG--AA-ATTTAAAA
1 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAA
* * * * * * * *
380584 AATACATGTGTTTGCCAAAGCA-ATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
65 AATAAATCTGTTTACTAAA-CATGTTCAAATAGTT-ATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
380648 TCA-TTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGT
128 T-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA-C
** * * *
380700 TTATTCAAAATGAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGT-AAGATTTAAGA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAA-A
* * * *
380763 AAATAAATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCAACTAGATT-TGACTATTTGGACAATTATCTATTT-A
64 AAATAAATCTGTTTACT-AAACATGTTCAAATAG-TTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
380825 AAGTTGTTATGACCTTTTGGTTTGTTATAAAAGAATTGGTTC-AATTCAAAAAAAC
126 AA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTC-ATACAAC
* * * * *
380880 TTATCTAAAATAAAATAATACTATTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAA
* * * * * * * * *
380945 ACTAAAGCTATTTTCTAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAA
65 AATAAATCTGTTTACTAAA-CATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * *
381009 TCA-TTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTTTA-ATCATATAAAC
128 T-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATA-CAAC
* * * * *
381060 TTATTTG-ATTAAAAATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG---AGATTTTAAA
1 TTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAA
* * * * * * *
381121 AATAAATGTGTTTGCTAAATC-GGTTTAAATAG-T-TA--A---G-ACTATTTATCTATTTTAAG
65 AATAAATCTGTTTACTAAA-CATGTTCAAATAGTTATACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAA
* * * * *
381177 TCACTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTGTTTC-AATTCATACAAGC
128 T-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA-C
* * * * * * *
381229 TTATTTGGAATAAAAATAATACTAAGTTATTAACATTTGAAAAATTAATATGCATGAGATTTGAA
1 TTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAGATTT-AA
* * * *
381294 AACATAAATCTATTTACCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
63 AAAATAAATCTGTTTA-CTAAACATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * *
381358 AATCA-TTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAATC
126 AAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA-C
** * *
381412 TTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAA
* * * *
381476 AATAAAT-TAGTTTACTGAA-TTAGATCAAATAGTTATAGAC-ATTTGAACAACTATCTATTTCA
65 AATAAATCT-GTTTACTAAACAT-GTTCAAATAGTTAT--ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * ** *
381538 AATGGCTATTG-CCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTT-T-TCAACAGACAAGC
126 AATAGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TTCATACAA-C
* * * *
381592 TCATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG---AGGTTTAAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAA
* * *
381654 ATAAATCTTTTTGCTGAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
66 ATAAATCTGTTTACTAAACAT-GTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
381718 TGTTATAACCTTTTGTTCTATCATCAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTT
129 AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA--C
* * * * *
381770 TTATTTAGAAA-AAAGTAATACTAATTTAGTAGTATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
1 TTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAA
* * * * * * * *
381833 AAAATAAAT-TCGTTTGTCGAACCA-GTTCAAATAGTAAGACTATATGAGCAATTATTTATTTCA
63 AAAATAAATCT-GTTT-ACTAAACATGTTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * **
381896 AATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAACTATTTC-AGCTCATACAAGC
126 AATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAA-C
* * * * * * *
381950 TTATTCGGAATAAAAGAGA-ACAAATTT-TTAATATTTCAAAAATTTATATGTAAGAGATTTAGA
1 TTATTTGAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAA
* * * * * *
382013 AAATAAATTTATTCACTGAACCA--TTCAAATAATTATAACTATTTGAACATTTATCTATTTCAA
64 AAATAAATCTGTTTACT-AAACATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * *
382076 ATTGTTACT-A-TTTTATGTTTTGTCATAAAA-AAGTTGTTT-T-TGTTAATATAAG
127 ATAGTTA-TGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTAT-TTCATACAAC
* * * *
382128 TT-TGTTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGCAAGAGATTTA
1 TTAT-TT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-AGATTTA
* * * * * *
382191 AAAAGTAAATATGTTTATTAAACCAT-TTCAAGTAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
62 AAAAATAAATCTGTTTACTAAA-CATGTTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTC
382255 AAAT
125 AAAT
382259 CATTATAATG
Statistics
Matches: 1931, Mismatches: 388, Indels: 267
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
167 2 0.00
168 20 0.01
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171 1 0.00
173 1 0.00
174 43 0.02
175 124 0.06
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAA
ATAAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTCATACAAC
Found at i:380050 original size:468 final size:467
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Indices: 379158--380058 Score: 1219
Period size: 468 Copynumber: 1.9 Consensus size: 467
379148 TTATATAGAC
* * * ** * *
379158 TTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTACTATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAA
1 TTATTCGAAATAAAAAAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAA
* * * *
379223 AATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTGTCTGTTTCAAAT
66 AATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
379288 CATTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGCTTATTTTGAATAA
131 CATTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTCTATTTATACAAGCTTATTTTGAATAA
* *
379353 AATAATATAAATTTACTAATATTCCAAAGATTAACAAGTAAAAATTTAAACAAAAAATATGTTTT
195 AATAATATAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAAGTTAAACAAAAAATATGTTTT
* * * * *
379418 TTGAACACATTCAAATATTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT
260 CTAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTT
* * *
379483 TTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATCATACTAATGTATT
325 TTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCGTATTTGAAATAAAATAATACTAATGTATT
*
379548 AAAATTACAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCGGTTTACTGAGTGAGTTCAAAT
390 AAAATTACAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCGGTTTACTGAGTGAGTTCAAAT
379613 AGTTCATATAAGT
455 AGTTCATATAAGT
* *
379626 TTATTCGAAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTAAGAGATATAAAA
1 TTATTCGAAATAAAAAAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAA
* * * ** * * *
379691 AATGAATTTGTTTACTGGACATGTTCAATTGGTTATTACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
66 AATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * *
379756 CATTATTA-CTTTTTGTTTTGTCAT-AAATAATTG-TCTATGTTCGTA-AAGGCTTATTTTGAAT
131 CATTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTAT-TT-ATACAA-GCTTATTTTGAAT
* *
379817 AAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAGTTAAA-AAATAAATATGT
193 AAAATAATATAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAAGTTAAACAAA-AAATATGT
**
379881 TTTCTAAACATGTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACA
257 TTTCTAAACACATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACA
* **
379945 TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTTGCA-CCAA-CGTATTTGAAATAAAATAATACT
321 -TTT-TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-ATT-CATAAAAGCGTATTTGAAATAAAATAATACT
* * *
380008 ATTTTATTAATAA-TCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATC
382 AATGTATTAA-AATTACAAAAATTAATAAGTAAGAAA-TTTAAAAAATAAATC
380059 TATTTACCCA
Statistics
Matches: 377, Mismatches: 45, Indels: 22
0.85 0.10 0.05
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (467 bp):
TTATTCGAAATAAAAAAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAA
AATAAATATGTTTACTGAACAAATTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
CATTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTATTTATACAAGCTTATTTTGAATAAA
ATAATATAAATTTACTAATATTCCAAAAATTAACAAGTAAAAAGTTAAACAAAAAATATGTTTTC
TAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTT
TTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCGTATTTGAAATAAAATAATACTAATGTATTA
AAATTACAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCGGTTTACTGAGTGAGTTCAAATA
GTTCATATAAGT
Found at i:381559 original size:532 final size:521
Alignment explanation
Indices: 379615--381929 Score: 1676
Period size: 532 Copynumber: 4.3 Consensus size: 521
379605 GTTCAAATAG
* * * * * * *
379615 TTCATATAAGTTTA-TTCGAAATAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATAAGTA
1 TTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATATG-A
* * * * *** * * * * *
379679 AGAGATATAAAAAATGAATTTGTTTACTGGACATGTTCAATTGGTTATTACTACTTGAACAATTA
64 TGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * *
379744 TCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCAT-AAATAATTG-TCTATGTTCGTAAAGGCT
129 TCTATTTAAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-ATTCATAAA-ACT
*** * * *
379807 TATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAGTTAAAAA
192 TA-TCCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAG-AAAGATTTAAAAA
* * * * * *
379871 ATAAA-TATGTTTTCTAAACAT-GTTCAAATAGTTAT-ATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
253 CTAAATTA-GTTTACTAAA-ATAGATCAAATAGTTATGA-CTATTTAAACAAATATCTATCTCAA
* * ** * * * *
379933 ATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGT-TTGCACCAA-CGTATTTGA-A
315 ATCGTTATG-C-TTTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTT-T-TAAT-CAACAAGCTTATTTGATT
* * * * *
379995 ATAAAATAATACTATTTTATTAATAATCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATCT
375 A-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG---AGA-TTTAAAAAATAAATGT
* * * * * ** * * * *
380060 ATTTACCCAGTA-AGTTCATATTCTTATGACTGTTTGAAGAATTTTTTATTTCAAAT-AGTTATG
435 GTTT-GCTA-AACAGTTCAAATAGTTAAGACTATTT-----A---TCTATTTCAAATCA-TTCTG
* * * **
380123 ATCTTTCGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTC
489 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAA
* * * * * *
380156 TTCATACAAGTTTAGTTAGAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAG
1 TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATATG-AT
* * * *
380221 GTGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTA
65 GAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * * * **
380286 TCCATTCGAAATTATTATGACTTTTTGTTCTG-CTATAAAATAATTGTTTCT-ATTTATGCAACA
129 TCTATTTAAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAC-
* * * * * *
380349 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATCTATCAATGTTTGAAAATTAATAAG--AGATTTGAAAACT
191 TTATCCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAACT
* *
380412 AAATCT-GTTTACTAAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTCAAATCG
255 AAAT-TAGTTTACTAAAATAGATCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCTATCTCAAATCG
* * * * *
380476 TTATGATCTTTATTTTTTCA-AAAAACAATTGTTTCTT-TTCAACAAGCTTATTCAGATT-AAAA
319 TTATGCT-TTTGTTTTCTCATAAAAA-AATTGTTT-TTAATCAACAAGCTTATT-TGATTAAAAA
* ** * * * *
380538 TAATACTAATTCAATGTTATTCCAAAAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATACATGTGTTTGCCAAA
380 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAA
*
380603 GCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTA
445 -CAGTTCAAATAGTTAAGAC---T---AT--TTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTA
* * *
380668 GTCATAAAACAATTATTTTAG
501 GTCATAAAATAATTATTTCAA
* * * *
380689 TTCATACAAGTTTATTCAAAATGAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT-A-ATGAGT
1 TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATATGA-T
* * * * *
380752 AAGATTTAAGAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAACTAGATT-TGACTATTTGGACAATT
65 GAGATTTAA-AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
380816 ATCTATTTAAAGTTGTTATGACCTTTTGGTTTGTTATAAAAGAATTGGTTCAATTCAAAAAAACT
128 ATCTATTTAAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTC-ATAAAACT
* * *
380881 TATCTAAAATAAAATAATACTATTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAA
192 TATC-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAG-AA-AGATTTAAAAA
* * ** *
380946 CTAAAGCTA-TTTTCTAAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCAATCTCAAA
253 CTAAA-TTAGTTTACTAAAATAGA-TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCTATCTCAAA
* * * *
381009 TCATTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTTTAATCATATAAACTTATTTGATTAAAA
316 TCGTTATGCT-TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTTTAATCA-ACAAGCTTATTTGATTAAAA
* *
381074 ATAATACCAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGCTAA
379 ATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAA
* * * *
381139 ATCGGTTTAAATAGTTAAGACTATTTATCTATTTTAAGTCACTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATA
444 A-CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTATCTATTTCAAATCA-TTCTGACCTTTTGTTTAGTCATA
* *
381203 CAATAATTGTTTCAA
507 AAATAATTATTTCAA
* * * *
381218 TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAATAATACTAAGTTATTAACATTTGAAAAATTAATATGCA
1 TTCATACAAGTTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATATG-A
* * *
381283 TGAGATTTGAAAACATAAATCTATTTACCTAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
64 TGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *
381348 ATCTATTTAAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAATCT
128 ATCTATTTAAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAA-CT
* *
381413 TATCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
192 TATCCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAG--AAAGATTTAAAAAC
* * * * * *
381478 TAAATTAGTTTACTGAATTAGATCAAATAGTTATAGAC-ATTTGAACAACTATCTATTTCAAATG
254 TAAATTAGTTTACTAAAATAGATCAAATAGTTAT-GACTATTTAAACAAATATCTATCTCAAATC
* * * * *
381542 GCTATTGCCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTCAA-CAGACAAGCTCATTTCA-AATAA
318 GTTA-TG-CTTTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTTT-AATCA-ACAAGCTTATTTGATTA-AA
* * * * * * *
381605 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGAGGTTTAAAAAATAAATCTTTTTGCTG
378 AATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTA
* ** * *
381670 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTT
443 AAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTA--T------TTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTT
* * * *
381735 CTA-TCATCAAACAATTGTTTCTA
499 -TAGTCATAAAATAATTATTTCAA
* ** *
381758 TTCATACAAGTTTTATTTAGAA-AAAAGTAATACTAATTTAGTAGTA-TTATGAAAATTAATAAC
1 TTCATACAAG-TTTATTTAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAACATTTA-AAAAATTAAT-A-
* ** * * * * *
381821 T-AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAG-TAAGACTATATGAGCA
61 TGATGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
381883 ATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
125 ATTATCTATTTAAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA
381930 CTATTTCAGC
Statistics
Matches: 1430, Mismatches: 262, Indels: 167
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Matches are distributed among these distances:
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535 2 0.00
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544 2 0.00
545 1 0.00
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Consensus pattern (521 bp):
TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATATGATG
AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
TATTTAAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAACTTATC
CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAACTAAATTA
GTTTACTAAAATAGATCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCTATCTCAAATCGTTATGCT
TTTGTTTTCTCATAAAAAAATTGTTTTTAATCAACAAGCTTATTTGATTAAAAATAATACTAATT
TAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACAGTTCAAATA
GTTAAGACTATTTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCA
A
Found at i:382613 original size:291 final size:292
Alignment explanation
Indices: 382056--382621 Score: 703
Period size: 291 Copynumber: 1.9 Consensus size: 292
382046 TATAACTATT
*
382056 TGAACATTTATCTATTTCAAATTGTTACTATTTTATGTTTTGTCATAAAAAAGTTGTTTTTGTTA
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACTATTTTATGTTTTGTCATAAAAAAGTTGTTTTTGTTA
* * * * *
382121 ATATAAGTTTGTTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGCAAGAG
66 ATAGAAGCTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAGAAAATTAATAAGCAAGAG
* * * ** **
382186 ATTTAAAAAGTAAATATGTTTATTAAACCATTTCAAGTAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTA
131 ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTA
** * * * * **
382251 TTTCAAATCATTATAATGTTTTATTTTGTTATCAAACAATTAGTTTTGTTCATACTATTTTATTA
196 TTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTAGTTATAAAACAATTAGTTTAGTTCATACAAGCTTATTA
382316 AAAATAAAATAATACCAATGGTTAAGACTAAA
261 AAAATAAAATAATACCAATGGTTAAGACTAAA
382348 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TCACTTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA-TTG-TTTTG
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACT-A-TTTTATGTTTTGTCATAAAA-AAGTTGTTTTTG
* ** ** *
382409 TTCATAGAAGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTA
63 TTAATAGAAGCTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-AGAAAATTAATAAGCA
* * * * *
382473 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATCAATTCAAATGGTTAAGATTATTAAAATAATTA
127 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTA
* * * *
382538 TCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATT-GTTTCAGTTTATACAAGCT
192 TCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTAGTTATAAAACAATTAGTTT-AGTTCATACAAGCT
* *
382602 TATTCAAAATAAATTAATAC
256 TATTAAAAATAAAATAATAC
382622 TAATTTATTG
Statistics
Matches: 231, Mismatches: 38, Indels: 11
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
290 4 0.02
291 175 0.76
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293 6 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (292 bp):
TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACTATTTTATGTTTTGTCATAAAAAAGTTGTTTTTGTTA
ATAGAAGCTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAGAAAATTAATAAGCAAGAG
ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTA
TTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTAGTTATAAAACAATTAGTTTAGTTCATACAAGCTTATTA
AAAATAAAATAATACCAATGGTTAAGACTAAA
Found at i:382641 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 382353--384458 Score: 1387
Period size: 182 Copynumber: 11.7 Consensus size: 181
382343 CTAAATGAAC
* * * * * * *
382353 AATTATCTATTTCAAATTGTTATCACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATAGA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACA
** * *
382417 AGCTTATTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * *
382482 AAAAATAAATTTGTTTATTGAATCAATTCAAATGGTTAAGATTATTAAAAT
131 AAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
* * *
382533 AATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACA
* * * **
382598 AGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAACAAAAAGAGA-
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A-AGTAAGAGAT
* * * * * *
382661 TT-AAAAA-AAATCTATTTACTG-AGCAAGTTCAAATACTTATTACTATTTAAAC
128 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
* * * * * * ** *
382713 AATTGTCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTGTTATAAAACGACCGTTTTAG-TTAGTAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTTA-TAC
* * * *
382777 AAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAGAAATT
65 AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* ** * * *
382840 TAAAAAATAAATATGTTTACCAAAATCAGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTAAACT
129 TAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAATCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTAAA-T
* * * ** * * *
382895 -ATTAGCTATTTGAAATCTTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TTTATCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTT-T-ATA
** *
382957 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATT
64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
383022 TAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAGCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
129 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAA-T
* * * * * * * * * * ** * * *
383076 AATT-TCAATCTCATATTGTTAAGATC-TTCGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTTGATCATAGA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACA
* * *
383139 AGCTTATGT--GATTAAAAGTAATACTAA-TTA-TAATATTTTAAAAA-T--T-AGTAAGAGATT
66 AGCTTAT-TCAAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
383196 TAAAAAACAAATGTGCTTA-TGAAACTAGTTTAAATAGTTA-AAGCCA-TTAGAAT
129 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTA-AAT
* ** * * * * *
383249 AATTATCTATTTCAAATCGTTTTGATATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTATTTCA-TATCT-TA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGT-T-TATA
* * * * * *
383312 CAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-CTAAATTTTTTAACA-CTCAAAAAATTAATAAGCAA-AAA
64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* **
383374 TTTGAAAAAATAAAATTTGTTTA-TCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGC
127 TTT-AAAAAAT-AAATTTGTTTACT-GAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
* * * * * * *
383431 AATTATTTATTTAAAATAGTTATGACCTTTTGTTTT-TACATAAAACAACTGTTTCAGTTTCTAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT-TATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAC
* * * ** *
383495 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT
65 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * *
383559 GAAACAATAAATTTGTTTAC-CAAACAAATTTAAAATAGTTATGACTATTTGAAC
130 -AAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
* * * * * * * *
383613 AATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACTTTTCTTCTATTATAAAACAATTATTTTAGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACA
* * ** * * *
383678 GGCTTCTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-A-T--GTGATTTA
66 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * ** ** * * *
383739 AAAAGTGAATCAGTTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATTG-CCATTTCAAT
131 AAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTAAAT
* * * * * ***
383790 AATTATCTATTTTAAATTGTTTTTACCTTTTGTTTGGTTATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTT-T-ATA
*
383855 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
383916 TAAAAAATCAATTTGTTTAGTGAAT-TGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAG
129 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
* * * * * * *
383968 AATTGTATACTTCAAATCAATTATTTACAAATTAAACCTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
1 AATTATCTATTTCAAATC-----GTT----A-T-GACC-TTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTT
* ** * * **
384033 T-A-TGTCATACAAG-TGTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTGAAAATTAAT
54 TCAGT-TTATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * * *
384095 AACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTT-GTCAAACTAGTTCAGATTGTTAAT-AC-ATATCA
117 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTAA
*
384157 AC
180 AT
* * * * *
384159 AATTATCTATTTTAAATTGTTACT-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCA-TTTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTT-ATA
* ** *
384222 CTAGCTTATTGGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
384286 TTAAAAAAT-AATTATGTTTACCT-AACCAATTCTAATAATTACGATTATTTAAAT
128 TTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
* * * *
384340 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACCAA-TGTTTTTA-TTCATA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAA-CAATTG-TTTCAGTTTATA
* * ** * * *
384403 TAAGTTTGCTCAGAATAAAATAATACAAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
64 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
384459 AGATTTAAAA
Statistics
Matches: 1496, Mismatches: 329, Indels: 201
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
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180 295 0.20
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183 20 0.01
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ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACA
AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
AAAAATAAATTTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAT
Found at i:382752 original size:471 final size:469
Alignment explanation
Indices: 381867--382758 Score: 987
Period size: 471 Copynumber: 1.9 Consensus size: 469
381857 GTTCAAATAG
* * *
381867 TAAGACTATATGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAACT
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* *
381932 ATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAAGAGAACAAATTTTTAATATTTCAAAAATTTAT
66 ATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAAGAGAACAAATTTATAATATTTCAAAAATTAAT
* * * **
381997 ATGTAAGAGATTTAGAAAATAAATTTATTCACTGAACCATTCAAATAATTATAACTATTTGAACA
131 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTCACTGAACAATTCAAATAATTATAACTATTAAAACA
* * * ** *
382062 TTTATCTATTTCAAATTGTTACTATTTTATGTTTTGTCATAAAAAAGTTGTTTTTGTTAATATAA
196 ATTATCTATTTCAAATTGTTAC-ACTTTATGTTTAGTCATAAAAAAGTTGTTTCAGTTAATACAA
* * * * * **
382127 GTTTGTTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGCAAGAGATTTAA
260 GCTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATCAAAAAGAGATTTAA
* * * * * * * * *
382192 AAAGTAAATATGTTTATTAAACCATTTCAAGTAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
325 AAAG-AAATATATTTACTAAACAAGTTCAAATACTTTTGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAA
** *
382257 ATCATTATAATGTTTTATTTTGTTATCAAACAATTAGTTTTGTTCATACTATTTTATTAAAAATA
389 ATCATTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACTATTTTATTAAAAATA
382322 AAATAATACCAATGGT
454 AAATAATACCAATGGT
* * * *
382338 TAAGACTAAATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATCACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
1 TAAGACTAAATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAACT
* * * * * * *
382403 GTTT-TGTTCATAGAAGCTTATT-TGAATTAAAATA-ATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT
66 ATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAAGAGA-ACAAATTT-ATAATATTTCAAAAATT
* * * ** *
382465 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATCAATTCAAATGGTTA-AGATTATTA
128 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTCACTGAA-CAATTCAAATAATTATA-ACTATTA
* * *
382529 AAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAC-CTTT-TGTTTAGTTATAAAACAA-TTGTTTCAGT
191 AAACAATTATCTATTTCAAAT--TGTT-ACACTTTATGTTTAGTCATAAAA-AAGTTGTTTCAGT
* * * *
382591 TTATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTGACATTCAAAAAATTAATAACAAAA
252 TAATACAAGCTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT--CAAAA
* * * *
382656 AGAGA-TTAAAAA-AAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATACTTATT-ACTATTTAAACAATTG
315 AGAGATTTAAAAAGAAATATATTTACTAAACAAGTTCAAATACTT-TTGACTATTTAAACAATTA
**
382718 TCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGA-TTTGTTATAAAAC
379 TCTATTTAAAATCATTATAACCTTTT-ATTTTGTTATAAAAC
382759 GACCGTTTTA
Statistics
Matches: 343, Mismatches: 65, Indels: 26
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
469 4 0.01
470 28 0.08
471 179 0.52
472 107 0.31
473 12 0.03
474 11 0.03
475 2 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (469 bp):
TAAGACTAAATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAACT
ATTTCAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAAGAGAACAAATTTATAATATTTCAAAAATTAAT
AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTCACTGAACAATTCAAATAATTATAACTATTAAAACA
ATTATCTATTTCAAATTGTTACACTTTATGTTTAGTCATAAAAAAGTTGTTTCAGTTAATACAAG
CTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATCAAAAAGAGATTTAAA
AAGAAATATATTTACTAAACAAGTTCAAATACTTTTGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAAT
CATTATAACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTAGTTTTGTTCATACTATTTTATTAAAAATAAA
ATAATACCAATGGT
Done.