Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* *** *
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* * *
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * *
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** * *
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**** * * *
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* * * *
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* *** ** * * ***** * * * *
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* * * * * * * **
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** * * ** * *
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* * * ** * ** * ** * *
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* * * * *
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* *** * ****
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* ** ** *
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* * *
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* * * * * * *
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** * ** * ** *
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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* ** * * ** * * ** * * *
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* * * * *
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* * * *
585700 ACACAA-TTATGAATATTTCAAAAATTAGATAAGTA-AGGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTTAC
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** * *
585763 TGAAC-CAGTCAATATGGTT-TAAGACTA-TT-ATA-A
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* * ** ** *
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* * * * *
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185 TATTTCAAATATTATGAAATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATT
* * * *
586035 GAAGAAAAAAATAATACTAATTT-TTAATA-TTT-CAAATTAATAGTAAGAGATTT-AAAAATAA
249 CAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-TAAGAGATTTAAAAAATGA
** * * ** * *
586096 AT-TG--TATGAATCAA-TTAAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-CAGCT
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* * * * *
586156 ATGACCTTTAT-TTTTATTATAAAACAATTGTTTTTGATT-ATGCAAGCTTAT-TCGAAATAAAA
376 ATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCAT-AAAGCTTATGTCTAAATAAAA
* * *
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* * * * * *
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126 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
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253 ATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATATAAGAGATTT--AAAAAATGAATC
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66 AC
* * * *
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AC
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*
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* * * * * * * *
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** ** * * * ** *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* ** *
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* * * * * * * *
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**** *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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1 TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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1 TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * *
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* * * * *
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193 CCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
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* ** * * * *
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* * * * * ** *
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1 TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
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1 TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * ** * * *
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* ** * * * * *
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128 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
* * * * * * *
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193 CCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * * * * * **
587878 AAATGTGTTTATTGAACTAATTTAAATCGTTATGTCTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGT
255 AAATTTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
* *
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* * * * * ** *
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1 TACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AG
* * * * * * * * * * *
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** * * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * *
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*
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** * * * * *
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* * ** *
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* * *
590476 TACTAGCTTATT-TAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
1 TACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGA
* * * * * *
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63 GATTTAAAAAATAAATTTGTTT-TCTAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
590603 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCA
127 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
* * * * * *
590657 TATAAGTTTGTTC-AGTATAAAATAATATTAATCCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--A-AG
1 TACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAG
* * * * *
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** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** *
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1 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATA
** ** * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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1 -TATG--ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAA
* * * * * * ** * * *
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* * * * * **
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* ** * **
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* * * ** **
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* * * *
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* * * * *
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1 --TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAA
* * ** * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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1 -TAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAA
* * * *
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* * *
592658 TTA-CTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATAT-AAATC
125 TTATC-GAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
592712 GTTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTTTTTATGA-TCATAAAAACTTATCTAAAATAAA
1 --TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAA
* * **
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63 ATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TT
* * * * * *
592839 TATCGAATTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTC
126 TATCGAA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TC
* * * * *
592894 TTATGAACTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTT-TCA-TCATATAAGCCTA-TTCAAAATAA
1 -TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAA
* * * * *
592956 AAGAACACTAATTTATTAATATTTAAAAAATAAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
62 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* *
593021 A-CTAAACTAGTTCAAATAGTTAT
127 ATC-GAAC-AATTCAAATAGTTAT
593044 AACTTGTCAT
Statistics
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TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCG
AACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
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ACTAAAATATTGCTAA
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* *
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* *
592703 ATATAAATCGTTATGAC
1 ATTTAAATAGTTATGAC
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Statistics
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* * *
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* * * * * * *
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* **
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* ** * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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** * * ** * * * *
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* * *
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* * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
591809 TCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAA-TTGTTTCTATTAATACAAACTTATTTAGAAT
192 TCATTATGAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTC-ATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
591872 AAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTAAAAAAATAAATCTAT
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
592043 TACTCAAAATATAATAATACT-AC-TTATTATTATTATTATAAAATTAATGAGTT-GTAGACTTA
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** * * * * * * * *
592105 AAAGCTTAATTTGTTTA-CTGAAAAAGTTCAAAGAGTCATCTGTCCATTTGAATTATTATCTATT
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* ** * **
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* * * **
592232 AAAATAAAATAACACTAATTTATTAATGCTTT-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTGAAAACCTAA
251 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * *
592292 ATCTCCTTA-TCGGACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
315 ATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
* * *
592341 CTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGCTT-
1 CTATATCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
** * * * * * *
592404 TTTCGGACTAAAATATTGCTAAAC--TAATAATA-TTCTAAAATTAAAAAG-TATGAGATTTAAA
66 TTT-AAAATAAAATAAT-AT-AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTA-GAGATTTAAA
* * * * * *
592465 AAATAAATATGTTTGTC-GAATCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTTTTTAA
127 AAATAAATA-GTTTATCTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * *
592528 AATCATT-TAAACCTTTTATTTAGTCATAAAATAA-TTTTTT-AGTTCATACATGCTTCTTCAAA
190 AATCATTATGAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * *
592590 ATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAACC
254 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATC
* *
592655 TATTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
318 TATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
* * * *
592701 CTATAT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATT-TTT-TATGATCATAAAAACT
1 CTATATCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT--TCATACAAGCT
* * * *
592763 TATCTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAA
64 TATTTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAA
** * * *
592828 ATAAATTAGTTTATC-GAATTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCTATTTTAAAT
129 ATAAA-TAGTTTATCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-
* * * *
592892 TC-TTATGAA-CTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATATAAGCCTATTCAAAAT
192 TCATTATGAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * *
592954 AAAAGAACACTAATTTATTAATATTTAAAAAATAAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
256 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* *
593019 TTACTAAACTAGTTCAAATAGTTAT
321 TTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
593044 AACTTGTCAT
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TTTAAAATAAAATAATATAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT
AAATAGTTTATCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
TATGAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
AATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT
GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
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