Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019167852.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_122, whole genome shotgun sequence
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Warning! 1000 characters in sequence are not A, C, G, or T
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881 TGTGGCCATT
* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * **
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* * ** *
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* * * *
1194 GAGATTCAAAAAATAAATTTGTTT-GCCAAACCT-TTTCAAATAATAAAGGCTGTA
127 GAGATT-AAAAAATAAATCTGTTTAG-CAAA-CTAGTTCAAATAATAAAGACTATA
* *
1248 TGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
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TTAAAAAATAAATCTGTTTAGCAAACTAGTTCAAATAATAAAGACTATA
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CAATCCACTATTCTTGAATTGAA
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1656 ACCAAGGCTT
*
1666 CAATCCACTATTCTTGAATTGAA
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*
1689 CAATCCACTATTCTTGAATTGAA
1 CAATCAACTATTCTTGAATTGAA
1712 -AATACAAC
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1720 CTATCTTTTT
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CAATCAACTATTCTTGAATTGAA
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9271 AGGCTAACAT
* * * *
9281 TAAGAGATTTAAAATATAAATATATTTAC-CAAACTAGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAACAAG-TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
* * * * * *
9345 TTATTTATTTCAAAACATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATA-TAG
65 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * *
9409 TTTTATTTGGAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
130 -CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* ** ** * *
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* * *
9525 ATTATCTATTTCAAATCGGTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAGACAATTGTTTCTATTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * *
9590 GCTTATTTGGAATAGCATAATTCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTTATAAG
129 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * *
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* * * * * * *
9707 TTACCTATTTCAAATTGCTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAG
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* * * *
9772 CTTATTT-CAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTC-ATACAATTAATAAA
130 CTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAG
* * * * * * *
9824 TAAAAGATTTAAAAAATAACTAC-ATTTAC-CAAATAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTAAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTACTCAAA-CAAGTCAAATAGTTATAACTATTTGAATA
* * * * * *
9887 AATATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
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* * * * * *
9952 GCTTA-TTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAG
129 GCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
10005 TAACAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TTAAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAACAAG-TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
* * * ** * * * *
10069 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTCATCATAAAACAATTATATC-AGTTCATATAG
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* * * * *
10133 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAG
129 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * *
10186 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAACAAG-TCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
* ** * * * *
10250 TTATCTATCTCAAAT-AATAT-ACATTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAG
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* *** * * * *
10313 CATATTCAAAAT-AAATATTACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATATG
130 CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
10364 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CGAGCAAGTTCAAATAATTAT-GCTTGTTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAAACAAG-TCAAATAGTTATAAC-TATTTGAATA
* * * *
10427 ATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCA
64 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * *
10491 AGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATATG
128 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * *
10545 TAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTTAAATAGT
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10592 CATGTCTAGT
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TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
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9275 TAACATTAAG
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*** * * * * * * *
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** * *
9414 TTTGGAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTC-TAAAAATTAATAAGTAATGA-ATTTAAAAA
130 TTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAT-AAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAA
* ** *** * ** * *
9477 ATGAAT-CTATTGGCTTGACCAACGCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
193 ATAAATAC-ATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
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257 CGATATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA-A
* *
9606 ATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAG
321 ATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * *
9647 AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTACC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
* * * * *
9712 TATTTCAAATTGCTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTA
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* * * * *
9776 TTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCATACAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAAT
130 TTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * *
9841 AACTACATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTAAATAAATATTTATTTCAAATCGT
195 AAATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGA
* * * *
9906 TATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAATTAAAAT
260 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-T-AAAT
* ** * *
9970 AATAT-TAATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAGTAAC
323 AAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* ** * * * * *
10009 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
* * * * *
10074 TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTCATCATAAAACAATTATATC-AGTTCATATAGGCTTA
66 TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTA
* *
10138 -TTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCCA-AAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAA
130 TTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
** * * *
10201 ATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATCTCAAAT-
193 ATAAATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
10265 AATAT-ACATTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAT
258 GATATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAT
* * *
10329 -ATTACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATATGTAAA
323 AATT-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
10368 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAATTATGCTTGTTTGAACAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
* * * * *
10433 TATTTCAAATAGTTATGATCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTTTAT
66 TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT
*
10498 TT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAA
131 TTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* *** ** * * * * * * *
10561 CAAATTTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCTAGTTT-ATTAA-TATTCTGAAAATTAA
194 TAAATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATAATTA-TCT---ATTTCA
** * * ** * *
10624 TAAGTAACGAATTTAAAAAATGA-ATCTATTGGCTTGAC-CAATGCAAATAGTTATAACATATTC
254 -AA-T--CG-A--T-----ATGACAT-T-TTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTT-T--C-TGTTC
* * * * * * * * *
10687 AAAATA-AATC-TATTTCA-AAT-CATTATGACCT--TTTGTT-TTGTCATAAAATAATTGTTTC
300 ---ATACAAGCTTATTT-AGAATAAATAAT--TCTAATTTATTAATAT-TTCAAA-AA-----T-
* * *
10745 TATTCACGCAAA
351 TAAT-AAGTAAA
* * * ** * * ** * *
10757 ATTATTCAAAATAAAATAATACAATTTAT-TAATATTTTGAAA-A-TTAATAAGA-GATTT-AA-
1 A-GATTTAAAA-AATA-AAT-CTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTT-AT--GATTATTTGAAT
* * ** * * * * ** *
10816 AGATTAAATTTGTTTACCGAAACAGCTTA-AATAGTTAT-TATTAT--TTGAATAATTATCTATC
59 A-ATT--ATCTATTT--C-AAATTG-TTATGAT-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAT-T-TC
** * *** * * ** *
10877 TAAAATTGTTATCATA-TTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAG
114 T---ATTCATA-CA-AGCTTA-TTTCAAATAAAATAA-TA-CTAATTT-AT-TAA---TATTC--
* * * * * * * *
10941 ATTAAAATAATACTAATTTAATA-ATATTCCAAAAATTAATAAGAGCTTTGA-AAAATAAATGTG
164 A-TAAAAT--TAATAA-GTAAGAGAT-TT-AAAAAATAAAT-ACA--TTT-ACCAAACAAA----
* * *
11004 TTTGCTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAT-AATAATTATCTACTTCAAATTGCTATGAC
215 -TT-C-AAA-TAG--T---TA--T--GACTATT-TGAATAATTATCTATTTCAAATCGATATGAC
* * * * * * * **
11068 CTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATAGTA
266 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATTCTA
* * *
11133 ATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAA
330 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
11165 AGATTTAAAAAATATAAATCTATTTATCAAATATGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGGACAATT
1 AGATTT-AAAAA-ATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGATTATTTGAATAATT
** * * * * * * *
11229 ATCTATTT-AAAGTCATTATAATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTC-ATTTCATAAAAA
63 ATCTATTTCAAA-TTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAG
** * * **
11292 CTTATTAGAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAACAAGAGATTT-A
126 CTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* ** * * * * * * * * * * *
11355 AAACTAAAGT-TGTTTTCTAAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAATATCAATCTCA
190 AAAATAAA-TACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
** * ** *
11419 AATC-ATTATG--ATCTTTGTTTCCTCATAAAGCAATCATTTCT-TATCATACAAGCTTATTTGG
254 AATCGA-TATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTTAG
* ** * * * *
11480 ACAAAAATAACACTAATTTAATAATA-TTCCAAAACT--T-AGTGAA
316 A-ATAAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * * * *
11523 GGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
* * * * * * * * * *
11588 TATTTTAAATAGTTCT-AACTTTTTGTTTCATCTTATAATAATTGTTTCAATTCATACACA-CTT
66 TATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACA-AGCTT
** * * *
11651 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCA-AAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAA
129 ATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAA
* *** * * * * * * *
11715 GATAAATGTGTTTATCGAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAAT
192 AATAAATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * * *
11780 TGTTCA-GACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAGAAAAGCTTATTCAAAAGA
257 CGAT-ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAATA
* * * * * * *
11843 AA-ATATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAATTAAG
320 AATA-ATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * *** ** *
11885 AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGACCAACTA
1 AGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTA
* * * * * * * * *** *
11948 TTTATTTCAAATTATTATTACCTTTT-ATCTATCATAAAGCAATTATTTTTCAAAAAATA-AATC
64 TCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA--TTTCTATTCATACAAGC
* * ** ** * * *
12011 -TATTAACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTGTTTCAAATT-GTTA
127 TTATT---TCAA--A--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-ATTAA-TAT-T-CATAAAATTAATAA
* * * * *
12073 -TAACATTTTATTTTATAATAAA-ACAAT-CATTTCTATCCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAT
177 GTAAGA---GA-TTTA-AA-AAATA-AATACA-TT-TA-CCAAACAA----ATTCA-AAT--AGT
* * *** * * * * * *** *
12135 AAT-ACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAATAGATATAAAAAATAAATCCATTTAT
225 TATGACT-ATTT-G-AATAAT-TATCTATT--T--CAAATCGATAT--GACAT--TTTGTTTTGT
* * * * *** ** **
12199 CA-AACCAATCCAAATAGTTAAGACTATATGA-ACAA--TTATTTATCTTAAATTGTTCTGACCT
278 CATAA--AA--C-AATTGTT---TCTGT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAATAATTCT-AATT
* * *
12260 T-TT-GT-TTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATAGA
333 TATTAATATT-TC---AAA-AATTA-ATAAG-T-A-A-A
* * * * * * * * * *
12296 AGCTCATTCGAAATAAAGTAAAACTAATTTAT-TAA-TATTTGAAAAATTTATAAGA-GATTTAG
1 AG---ATT-TAAA-AAA-TAAATCT-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT--GATTATTT-G
* * * * * * * *
12358 AAAATAATT-T-TATTTATTAAACTAGTTCA-AATAATTAT-ATCTAT--TTAAACAATTA--TC
56 --AATAATTATCTA-TT-TCAAA-TTGTT-ATGAT-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC
* * ** * ** * * *
12415 TATTTCAAATAATTATTAGTTTTTATTTTGTAATAAAACAATA-TTGTTTGTTAATA-TAAGT-T
114 TA-TTC--AT-A-CA--AG--CTTA-TTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-TAA
** * ** * * * * * * * *
12477 TGTTCAA-AA-TAA-A-ATAGTAGTAATTTATTAATATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAA
168 AATT-AATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAAT-ACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGA
* * * ** * * * * *
12538 CTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAAT-TATTATGATTTTTTGTTCTATTATAAAGCAATAGTTT
230 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGA-TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** * ** *
12602 TTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAG
294 CTGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
12667 TAAA
358 TAAA
* * * * * * * * *
12671 ATATTTAAAACATAAATATGCTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
* * * * * * * *
12736 TA-TTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AAATATTTTCGATTCATATAAGCTTA
66 TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA-TTTCTATTCATACAAGCTTA
* * *
12799 -TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATCAATATTC-TGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAA
130 TTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* ** *** * * * *
12862 ATGAATATGTTTAATGAATAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAAT
193 ATAAATACATTTACCAAACAAATTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
12926 C-ACTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAA
257 CGA-TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA
*
12990 TAAAATAATAT-AAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAA
318 T-AAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAA
* * * * * ** * * *
13035 AGATCTAACAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATT-TT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
* * * * *
13099 TATTTCTAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-
66 TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT
* * * * * * *
13163 TTCGGATTAAAAAAATATTAATTTATTAATATT-TTGGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
131 TTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * *
13226 ATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTAAT-TATTTCAAAT
193 ATAAATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAAT
* * * * *
13290 CAATGTGACCTTTT-TTTT-TAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTT-GAAATA
257 CGATATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAG-AAT-
* * *
13351 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAG
319 AAATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * * *
13394 AGAATTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTAAATAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
* *** * * * ** *
13458 TATTTGAAAACATTATGA-CTTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAGCTTA
66 TATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * * *
13522 TTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAA
130 TTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
** * * * * * * *
13585 TAAATATGTTTTCTAAACATATTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTCAAATTG
194 TAAATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * * *
13650 TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAAT
259 ATATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAT
* * * *
13715 AATACTAATTCATTAAAATTTCAAAAAATAATAAGTAAA
323 AATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * ** ** *** * *
13754 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAGTAAGTTTGAATAGTTATGACCCTTCGAATAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
** * * * **
13819 TATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTAT
66 TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT
* **
13884 TTGC-AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-TAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAT
131 TT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* ** * * **
13947 AAAT-CTACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTGTTATCTATTTCAAATC-
195 AAATAC-ATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
** * ** * *
14010 ATTATGACATTTTG-TTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTAAGAACAAAA
259 A-TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAA
*
14074 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
322 TAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * *
14110 AGATTTAAGAATTAAATCTATTTATCAAACCAA-TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTAT
* ** * ** * *
14174 CTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGA-AATAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAACTT
65 CTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTT
* * * * * * * * *
14237 ATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCA-AAAA--ATTAA-TAAGAGCTTTGAAAAA
129 ATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * *** * * * * * * * *
14298 TAAATGCGTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAAT-T
194 TAAATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * * *
14362 AT-TCCTACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAA
259 ATAT--GACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTTAGAAT-A
** * * *
14425 AATAATAGTAATTTATTAA-CTTTCAAAAAATTAATGAGCAAA
320 AATAATTCTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA
* * * *
14467 AGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATT
1 AGATTT-AA-AAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGATTATTTGAATAATT
* * * * * * * * *
14531 ATCTATTT-AAAGTTATCACGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTC-ATTTCATAAAAA
63 ATCTATTTCAAA-TTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAG
* * *
14594 CTTA-TTCGAAATAAAATAATACTACTTTTATTAATATTTCA-AAAATCAATAAGCAAGAGATTT
126 CTTATTTC-AAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA-TTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * **** * * * * * *
14657 -AAAAGTAAAGT-TATTTTTTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCT
188 AAAAAATAAA-TACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * *
14720 CAAATCAATATG--ATCTTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTT-G
252 CAAATCGATATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAG
* * * *
14782 AATAAAAATAATAT-TAATTTAATAGTA-TTCCAAAA--AAT-AGTGAA
316 AAT--AAATAAT-TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
14826 AGATTTAAAAAATAAAT
1 AGATTTAAAAAATAAAT
14843 GTATTTGCTA
Statistics
Matches: 3833, Mismatches: 962, Indels: 807
0.68 0.17 0.14
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (361 bp):
AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATC
TATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT
TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCATAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
AATACATTTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGAT
ATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATAAT
TCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
Found at i:10178 original size:543 final size:539
Alignment explanation
Indices: 9285--10594 Score: 1499
Period size: 543 Copynumber: 2.4 Consensus size: 539
9275 TAACATTAAG
* * * *
9285 AGATTTAAAATATAAATATATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATAACAATTTGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATACATTTACCAAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * *
9349 TTATTTCAAAACATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATA-TAGTTTT
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* * * *
9413 ATTTGGAATAAAATAATGCTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAATGAATTTAAAAAA
129 ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAG-ATTTAAAAAA
* * * ** * * * *
9478 TGAATCTATTGGCTTGACCAACG--CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
193 TAAATATGTT-TATTGAACAA-GTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
* ** * * * * * **
9541 CGGTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAGACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAGC
256 CGGTATGACCTTTTATTTCATCACAAAACAATTATATCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAA
* * * *
9606 ATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA
321 ATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * **
9671 TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATTGCTATAACATTTT
386 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTACCTATCTCAAA-TAATAT-ACATTTT
* * * * *
9736 GTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTT
449 GTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATA-TTCAAAAT-AAATAATACAAATTT
*
9800 ATTAATATT-CATACAATTAATAAATAAA
512 ATTAATATTCCA-AAAATTAATAAATAAA
* * * * *
9828 AGATTTAAAAAATAACTACATTTACCAAATAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTAAATAAATATT
1 AGATTTAAAAAATAAATACATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT
* * * * *
9893 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-
66 TATTTCAAATCGTTATGACTATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAT
* * * * * *
9957 TTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAAT
131 TTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAAT
* * * *
10022 AAATATGTTTATTAAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGT
194 AAATATGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGG
* * * *
10087 TATGATCTTTTATTTCATCATAAAACAATTATATC-AGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAAT
259 TATGACCTTTTATTTCATCACAAAACAATTATATCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * *
10151 AATACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACC
323 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC
*
10216 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATCTCAAATAATATACATTTTGTTT
388 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTACCTATCTCAAATAATATACATTTTGTTT
* * * * *
10281 TATCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAATATTACTAGTTTATTAAT
453 TATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCAAAATAAATAATACAAATTTATTAAT
**
10346 ATTCCAAAAATTAATATGTAAA
518 ATTCCAAAAATTAATAAATAAA
* * ** * * *
10368 AGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAATTATG-CTTGTTTGAACAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATAC-ATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGAC-TATTTGAATAATTA
* * * *
10431 TTTATTTCAAATAGTTATGA-TCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAGTT
64 TTTATTTCAAATCGTTATGACT-ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTT
*
10495 TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAA
128 TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAA
* * *
10560 ACAAATTTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTCAT
192 ATAAATATGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTCAT
10595 GTCTAGTTTA
Statistics
Matches: 639, Mismatches: 115, Indels: 29
0.82 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
539 3 0.00
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544 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (539 bp):
AGATTTAAAAAATAAATACATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATT
TATTTCAAATCGTTATGACTATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAT
TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAA
ATATGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGGTA
TGACCTTTTATTTCATCACAAAACAATTATATCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
CAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTACCTATCTCAAATAATATACATTTTGTTTTAT
CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCAAAATAAATAATACAAATTTATTAATATT
CCAAAAATTAATAAATAAA
Found at i:10672 original size:83 final size:83
Alignment explanation
Indices: 10518--10674 Score: 183
Period size: 83 Copynumber: 1.9 Consensus size: 83
10508 ATAATACTAA
* * * *
10518 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTACTGAACAAGT
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTGACTGAACAAGT
**
10583 TTAAATAGTCATGTCTAG
66 GCAAATAGTCATGTCTAG
* ** * *
10601 TTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAACGA-ATTTAAAAAATGAATCTATTGGCTTGACCAA
1 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAACAAATCTATTGAC-TGAACAA
10665 -TGCAAATAGT
64 GTGCAAATAGT
10675 TATAACATAT
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 11, Indels: 4
0.80 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
83 53 0.87
84 8 0.13
ACGTcount: A:0.43, C:0.08, G:0.11, T:0.37
Consensus pattern (83 bp):
TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTGACTGAACAAGT
GCAAATAGTCATGTCTAG
Found at i:10978 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 10694--11894 Score: 694
Period size: 177 Copynumber: 6.7 Consensus size: 175
10684 TTCAAAATAA
* * * * * ** *
10694 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCACGCAAAAT
1 ATCTATCTAAAATCATTAT--CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAACT
* ***
10759 TATTCAAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AAGAGATTTAAAGATTA
64 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAGAGATTTAAA-ATTA
* * * * * *
10822 AATTTGTTTACCGAAAC-AGCTTAAATAGTTATTATTATTTGAATAATT
128 AATTTGTTT-TCTAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * * * *
10870 ATCTATCTAAAATTGTTATCATATTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTT
1 ATCTATCTAAAATCATTATCAT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAACTT
* * * *
10935 ATTCAGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT-AAGAGCTTTGAAAAATAA
65 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAGAGATTT-AAAATTAA
* * * *
10999 ATGTGTTTGCTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAT-AATAATT
129 ATTTGTTTTCTAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATT
* * * * ** *
11046 ATCTA-CTTCAAATTGCTATGA-CCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAT
1 ATCTATC-T-AAAAT-C-ATTATCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAA
* * * *
11109 CTTATTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAA
62 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-A--AAGAGATTT--A
* * * *
11174 AAATATAAATCTATTTATC-AAA-TATGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGGACAATT
122 AAAT-TAAATTTGTTT-TCTAAACTA-GTTTAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
11229 ATCTATTTAAAGTCATTATAATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCATTTCATAAAAACT
1 ATCTATCTAAAATCATTATCA--TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAACT
* * *
11294 TATT-AGAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAA
64 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT--A-AAGAGATTTAAAA
* * * * *
11358 CTAAAGTTGTTTTCTAAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAAT
125 TTAAATTTGTTTTCTAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ** ** * * *
11409 ATCAATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTCCTCATAAAGCAATCATTTCTTATCATACAAGCTT
1 ATCTATCTAAAATCATTATCAT-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAACTT
** * * * * * *
11474 ATTTGGACA-AAAATAACACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAGTGAAG-GATTTAAAAAATA
65 ATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAGAGATTT-AAAATTA
* * * * * * *
11537 AATGTATTTGTC-AAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAATT
128 AATTTGTTT-TCTAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * ** * * * ** *
11585 ATTTATTTTAAAT-AGTTCTAACTTTTTGTTTCATCTTATAATAATTGTTTCAATTCATACACAC
1 ATCTATCTAAAATCA--T-TATCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAAC
** * * *
11649 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAA
63 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-A--AAGAGATTT-AAA
* * * * * *
11714 AGATAAATGTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATT
124 A-TTAAATTTGTTT-TCTAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** * * * * * * *
11767 ATCGATTTAAAATTGTTCAGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAGA-AAAG
1 ATCTATCTAAAATCATT-A-TCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCT-TTTCATACAAA-
* * * * * * *
11830 CTTATTCAAAAGAAAAT-ATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAATTAAGAGATTTAAA
62 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-A--AAGAGATTTAAA
11894 A
124 A
11895 AATAAATTAG
Statistics
Matches: 799, Mismatches: 179, Indels: 90
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
175 62 0.08
176 143 0.18
177 155 0.19
178 6 0.01
179 73 0.09
180 61 0.08
181 63 0.08
182 108 0.14
183 122 0.15
184 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
ATCTATCTAAAATCATTATCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTTTTCATACAAACTTA
TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAAGAGATTTAAAATTAAAT
TTGTTTTCTAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
Found at i:11307 original size:183 final size:181
Alignment explanation
Indices: 10694--11777 Score: 687
Period size: 176 Copynumber: 6.1 Consensus size: 181
10684 TTCAAAATAA
* * * * ** *
10694 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-TATTCACGCAAAA
1 ATCTATTT-AAATCATTATAATCTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCAT-TTCATACAAAC
* * **
10758 TTATTCA-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG----AGATTTAAA
64 TTATT-AGAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAA
* * * * ** * *
10817 GAT-TAAATTTGTTTACCGAAA-CAGCTT-AAATAGTTATTATTATTTGAATAATT
128 AATATAAATGTATTTATC-AAACCAG-TTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
10870 ATCTATCTAAA--ATTGTTATCATATTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGC
1 ATCTATTTAAATCATTATAATC-T-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCATTTCATACAAAC
* * * * * * *
10933 TTATTCAG-ATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG----AGCTTTGAA
64 TTATT-AGAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAA
* * * * * *
10993 AA-ATAAATGTGTTT-GCTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAT-AATAATT
128 AATATAAATGTATTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATT-TGAACAATT
* *** * * ** * *
11046 ATCTACTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAATCT
1 ATCTA-TTTAAATCATTATAATCTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCATTTCATACAAACT
* * *
11111 TATTCAG-AATAAAATAATAGTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAA
65 TATT-AGAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AA
* * * *
11174 AAATATAAATCTATTTATCAAA-TATGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGGACAATT
127 AAATATAAATGTATTTATCAAACCA-GTTCAAATAG-TTAGGACTATTTGAACAATT
* * * *
11229 ATCTATTTAAAGTCATTATAATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCATTTCATAAAAACT
1 ATCTATTTAAA-TCATTATAATCTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCATTTCATACAAACT
* * * * *
11294 TATTAGAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAC
65 TATTAGAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAA
* * * * * *
11359 TA-AAGT-TGTTT-TCTAAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAAT
130 TATAAATGTATTTATC-AAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATT
* * * * ** * *
11409 ATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTCCTCATAAAGCAATCATTTC-TTATCATACAAGC
1 ATCTAT-TTAAATCATTATAATCTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCATT-TCATACAAAC
* * * * * * * *
11472 TTATTTGGACA-AAAATAACACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAGT--G--AAGGATTTAAA
64 TTA-TTAGAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAA
* * *
11532 AA-ATAAATGTATTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAATT
128 AATATAAATGTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
11585 ATTTATTTTAAAT-AGTTCTAA-CTTTT-TGTTTCATCTTATAATAATTGTTTCAATTCATACAC
1 ATCTA-TTTAAATCA-TTATAATCTTTTGT-TTTC-TCATAAAATAATTATTTCATTTCATACAA
* * * *
11647 ACTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGA
62 ACTTATTAGAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAA
* * * * * *
11712 AAAGATAAATGTGTTTATCGAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATT
127 AAATATAAATGTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATT
*
11767 ATCGATTTAAA
1 ATCTATTTAAA
11778 ATTGTTCAGA
Statistics
Matches: 712, Mismatches: 149, Indels: 89
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
173 6 0.01
174 2 0.00
175 74 0.10
176 138 0.19
177 137 0.19
178 4 0.01
179 72 0.10
180 49 0.07
181 31 0.04
182 66 0.09
183 127 0.18
184 6 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
ATCTATTTAAATCATTATAATCTTTTGTTTTCTCATAAAATAATTATTTCATTTCATACAAACTT
ATTAGAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAT
ATAAATGTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACAATT
Found at i:11339 original size:799 final size:799
Alignment explanation
Indices: 9893--11389 Score: 1801
Period size: 799 Copynumber: 1.9 Consensus size: 799
9883 AATAAATATT
* * * * * **
9893 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTAT
* * * *
9958 TCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATA
66 TCAAAATAAAATAATATCAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAG--A-AGATTTAAAAAATA
** * * *
10023 AATATGTTTATTAAACAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTT
128 AATATGTTTACGAAACAAGCTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATCTAAAATTGTT
* * * *
10088 ATGATCTTTTATTTCATCATAAAACAATTATATCAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAA
193 ATCATCATTTATTTCATCATAAAACAATTATATCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * *
10153 TACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAA
258 TACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA-GAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAA
*
10218 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATCTCAAATAATATACATTTTGTTTTA
322 ACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATCTGAATAATTATCTATCTCAAATAATATACATTTTGTTTTA
* * * * * *
10283 TCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAATATTACTAGTTTATTAATAT
387 TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAATAATACTAATTTATTAACAT
* * * * *
10348 TCCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAATAATTA
452 TCAAAAAATTAATATGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTA
* * *
10413 TGCTTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
517 TGCTTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAATCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
** ** *
10478 TTCTATTCATGCAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
582 TTCTATTCATAAAAACTTATTTAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
*** * *
10543 TGTAAGAGATTTAAAAAAC-AAATTTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCTAGTTTATT
647 AACAAGAGATTT--AAAACTAAAGTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCTAGTTTATT
10607 AATATTCTGAAAATTAATAAGTAACGAATTTAAAAAATGAATCTATTGGCTTGACCAATGCAAAT
710 AATATTCTGAAAATTAATAAGTAACGAATTTAAAAAATGAATCTATTGGCTTGACCAATGCAAAT
10672 AGTTATAACATATTCAAAATAAATC
775 AGTTATAACATATTCAAAATAAATC
* * *
10697 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCACGCAAAATTAT
1 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTAT
* * *
10762 TCAAAATAAAATAATA-CAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-AGATTTAAAGATTAAAT
66 TCAAAATAAAATAATATCAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAGAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
10825 TTGTTTACCGAAAC-AGCTTAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTATCTATCTAAAATTGTTAT
131 ATGTTTA-CGAAACAAGCTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATCTAAAATTGTTAT
** * * ** *
10889 CAT-ATTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AGATTAAAATAAT
195 CATCATTTATTTCATCATAAAACAATTATATCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAAT
* * * * *
10952 ACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT-A-A-TAAGAGCTTTGAAAAATAAATGTGTTTGCTAAAC
259 ACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAAC
* * * ** *
11014 TAGTTTAAATAGTTAAGACTAT-TATAATAATTATCTA-CTTCAAATTGCTATGACCTTTTG-TT
324 AAGTTCAAATAGTTAAGACTATCT-GAATAATTATCTATC-TCAAA-TAATAT-ACATTTTGTTT
* * * * *
11076 TAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTA
385 TA-TCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCATATTCAAAAT-AAATAATACTAATTTATTA
* * *
11141 ACATTCAAAAAATTAATGA-GCAAAAGATTTAAAAAATATAAATCTATTTATCAAATATGTTCAA
448 ACATTCAAAAAATTAAT-ATGCAAAAGATTT-AAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAA
* * * *
11205 ATAGATT-TGAC-TATTTGGACAATTATCTATTT-AAAGTCA-TTATAATCTTTTGTTTTGTTAT
510 ATA-ATTATG-CTTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T-AGTTATAATCCTTTGTTTTATCAT
* *
11266 AAAATAATTGTTTC-ATTTCATAAAAACTTA-TTAGAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATT
571 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAACTTATTTAG-AATAAAATAACACTAATTTATTAATATT
* *
11329 -TCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAACTAAAGTTGTTTTCTAAACTAGTTTAAATAGT
634 CT-AAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAACTAAAGTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGT
11390 TAGGACTATT
Statistics
Matches: 581, Mismatches: 93, Indels: 44
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
793 2 0.00
794 64 0.11
795 9 0.02
796 42 0.07
797 48 0.08
798 113 0.19
799 198 0.34
800 9 0.02
803 27 0.05
804 69 0.12
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (799 bp):
TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTAT
TCAAAATAAAATAATATCAATTTATTAACATTTTGAAAATTAATAAGAAGATTTAAAAAATAAAT
ATGTTTACGAAACAAGCTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAATTATCTATCTAAAATTGTTATC
ATCATTTATTTCATCATAAAACAATTATATCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC
TAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAACAA
GTTCAAATAGTTAAGACTATCTGAATAATTATCTATCTCAAATAATATACATTTTGTTTTATCAT
AAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAATAATACTAATTTATTAACATTCAA
AAAATTAATATGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGCT
TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAATCCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT
ATTCATAAAAACTTATTTAGAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAACA
AGAGATTTAAAACTAAAGTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCTAGTTTATTAATATT
CTGAAAATTAATAAGTAACGAATTTAAAAAATGAATCTATTGGCTTGACCAATGCAAATAGTTAT
AACATATTCAAAATAAATC
Found at i:11662 original size:539 final size:535
Alignment explanation
Indices: 10694--11894 Score: 1363
Period size: 539 Copynumber: 2.2 Consensus size: 535
10684 TTCAAAATAA
* *
10694 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-TATTCACGCAAAA
1 ATCTATTT-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCAT-TTCA-GAAAAA
* *
10758 -TTATTCAAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT--AAGAGATTTAAAGA
63 CTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCGAAAATTAATAAAAGAGATTTAAA-A
* * ** * * * * * *
10819 TTAAATTTGTTTACCGAAACAGCTTAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTATCTATCTAAAATT
127 CTAAAGTTGTTTACCGAAACAGCTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAATATCAATCTAAAATC
* ** * * * **
10884 GTTATCATATTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAAT
192 ATTATCATATTTATTTCCTCATAAAACAATCATTTCTTATCATACAAGCTTATTCAGACAAAAAT
* * * *
10949 AATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGCTTTGAAAAATAAATGTGTTTGCTAAAC
257 AACACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTAAAC
* * * * *
11014 TAGTTTAAATAGTTAAGACTATTATAATAATTATCTACTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTAG
322 CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTACTTCAAATAGCTATAACCTTTTGTTTAG
* *
11079 TCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACA
387 TCATAAAATAATTATTTCAATTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
* * * * *
11144 -TTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAAAAATATAAATCTATTTATCAAATATGTTCAAATA
452 TTTC-AAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAAGATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAAGA
*
11208 GATT-TGACTATTTGGACAATT
515 G-TTATGACTATTTGAACAATT
* * *
11229 ATCTATTTAAAGTCATTATAATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCATTTCATAAAAACT
1 ATCTATTTAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCATTTCAGAAAAACT
* *
11294 TATT-AGAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAA
65 TATTCA-AAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCGAAAATTAAT-AA-AAGAGATTTAAAA
* * * *
11358 CTAAAGTTGTTT-TCTAAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAATATCAATCTCAAAT
127 CTAAAGTTGTTTACCGAAAC-AGCTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAATATCAATCTAAAAT
* * * * **
11422 CATTATGATCTTTGTTTCCTCATAAAGCAATCATTTCTTATCATACAAGCTTATTTGGACAAAAA
191 CATTATCATATTTATTTCCTCATAAAACAATCATTTCTTATCATACAAGCTTATTCAGACAAAAA
* *
11487 TAACACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAGTGAAG-GATTTAAAAAATAAATGTATTTG-TCA
256 TAACACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCT-A
* * * * * * *
11550 AACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAATTATTTATTTTAAATAGTTCTAACTTTTTGTT
319 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTACTTCAAATAGCTATAACCTTTTGTT
* * * **
11615 TCA-TCTTATAATAATTGTTTCAATTCATACACA-CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
384 T-AGTCATAAAATAATTATTTCAATTCATACA-ATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
11678 TAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAGATAAATGTGTTTATCGAACAAGTTCAA
447 TAACATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAA
11743 AGAGTTATGACTATTTGAACAATT
512 AGAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * *
11767 ATCGATTTAAAATTGTTCA-GACCTTTTGTTTT-TTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAGAAAAG
1 ATCTATTT-AAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTT-ATAAAATAATTGTTTCATTTCAGAAAAA
* * *
11830 CTTATTCAAAAGAAAAT-ATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAATTAAGAGATTTAAA
63 CTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCGAAAATTAATAA--AAGAGATTTAAA
11894 A
126 A
11895 AATAAATTAG
Statistics
Matches: 557, Mismatches: 88, Indels: 40
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
534 8 0.01
535 66 0.12
536 26 0.05
537 44 0.08
538 109 0.20
539 284 0.51
540 20 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
ATCTATTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCATTTCAGAAAAACTT
ATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCGAAAATTAATAAAAGAGATTTAAAACTAA
AGTTGTTTACCGAAACAGCTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAATATCAATCTAAAATCATTA
TCATATTTATTTCCTCATAAAACAATCATTTCTTATCATACAAGCTTATTCAGACAAAAATAACA
CTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTAAACCAGT
TCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTACTTCAAATAGCTATAACCTTTTGTTTAGTCAT
AAAATAATTATTTCAATTCATACAATCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTC
AAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAAGAGTTATG
ACTATTTGAACAATT
Found at i:12416 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 12395--12430 Score: 56
Period size: 16 Copynumber: 2.2 Consensus size: 17
12385 CAAATAATTA
12395 TATCTATTT-AAACAAT
1 TATCTATTTCAAACAAT
*
12411 TATCTATTTCAAATAAT
1 TATCTATTTCAAACAAT
12428 TAT
1 TAT
12431 TAGTTTTTAT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.50
17 9 0.50
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.00, T:0.47
Consensus pattern (17 bp):
TATCTATTTCAAACAAT
Found at i:12430 original size:17 final size:17
Alignment explanation
Indices: 12383--12430 Score: 62
Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 17
12373 ATTAAACTAG
12383 TTCAAATAATTATATCTAT
1 TTCAAATAA-T-TATCTAT
*
12402 TT-AAACAATTATCTAT
1 TTCAAATAATTATCTAT
12418 TTCAAATAATTAT
1 TTCAAATAATTAT
12431 TAGTTTTTAT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 2, Indels: 4
0.81 0.06 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.35
17 10 0.38
18 5 0.19
19 2 0.08
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.00, T:0.46
Consensus pattern (17 bp):
TTCAAATAATTATCTAT
Found at i:12630 original size:140 final size:140
Alignment explanation
Indices: 12368--12652 Score: 320
Period size: 140 Copynumber: 2.0 Consensus size: 140
12358 AAAATAATTT
* * * *
12368 TATTTATTAAACTAGTTCAAATAATTATATCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATTA
1 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGA
* * * * * ** *
12433 GTTTTTATTTTGTAATAAAACAATATTGTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAGTAGT
66 GTTTTTATTCTATAATAAAACAATATTGTTTGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACT
12498 AATTTATTAA
131 AATTTATTAA
* * ** * *
12508 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTATTATGA
1 TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGA
* * * * * ** *
12573 TTTTTTGTTCTATTATAAAGCAATAGTT-TTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACAC
66 GTTTTTATTCTATAATAAAACAATA-TTGTTTGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACAC
12637 TAATTTATTAA
130 TAATTTATTAA
12648 TATTT
1 TATTT
12653 CAACAATTAA
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 26, Indels: 2
0.81 0.18 0.01
Matches are distributed among these distances:
140 116 0.98
141 2 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.07, T:0.46
Consensus pattern (140 bp):
TATTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGA
GTTTTTATTCTATAATAAAACAATATTGTTTGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACT
AATTTATTAA
Found at i:12843 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 12507--14848 Score: 1941
Period size: 180 Copynumber: 13.0 Consensus size: 180
12497 TAATTTATTA
** * * ** * *
12507 ATATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTATTATG
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
** * * * * * * * * *
12572 ATTTTTTGTTCTATTATAAAGCAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACAC
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAC
* * *
12637 TAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAACATAAAT
131 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * *
12688 ATGCTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCGTTATA
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * **
12752 ACCTTTTATTTTGTCATAAAAAAATAT-TTTCGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATA
* * * * * *
12816 CTAAGTTATCAATATTCTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
130 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
12868 ATGTTTAATGAA-TAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTA
1 ATATTTATTGAACT-AGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * **
12931 TAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAAT
64 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAAT
* *
12996 AATA-TAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATCTAACAAATAAAT
126 AATACT-AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* *** * ** * * **
13052 CTATTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATT-TTTATTTCTAATTGTTATG
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * *
13116 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAAAATAT
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAC
**
13181 TAATTTATTAATATTTTGGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
131 TAATTTATTAATA-TTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * *
13232 ATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTAAT-TATTTCAAATCAATGT
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
13296 GACCTTTT-TTTT-TAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
65 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAAT
* * * *
13358 ACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAAT
129 ACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* *** * * * * *
13411 CTATTTACCAAAC-ATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTAAATAATTATCTATTTGAAAACATTAT
1 ATATTTATTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
13474 GACTTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAAT
65 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAAT
*
13538 A-TAAATTTATTTATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAAT
129 ACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * **
13590 ATGTTT-TCTAAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTCAAATTGTTA
1 ATATTTAT-TGAAC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
13653 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
64 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAAT
* * *
13718 ACTAATTCATTAAAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
129 ACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** ** * * * *
13771 TTGTTTATTG-AGTAAGTTTGAATAGTTATGACCCTTCGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTT
1 ATATTTATTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* ** * *
13835 GATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGCAATAAAATAATA
65 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATA
* ***
13900 ATAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
130 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ***
13951 CTACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTGTTATCTATTTCAAATCATTATG
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* ** ** ** *
14016 ACATTTTG-TTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTAAGAACAAAATAATAC
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAC
* *
14080 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAGAATTAAAT
131 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * *
14127 CTATTTATCAAACCAATTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATG
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* ** * * * * * *
14192 ATC-TTTGTTTTGAAATAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAACTTATT-TGAAGTAAAATATTG
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATA
* * * * *
14255 CTAAATTAATAATATTCAAAAAATTAATAAG----AGCTTTGAAAAATAAAT
130 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
*** * * * * * * * *
14303 GCGTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATTATTCCT
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-AT
* * **
14368 -ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
65 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAAT
* * * *
14431 AGTAATTTATTAACT-TTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAATAAAATAAAT
129 ACTAATTTATTAA-TATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA-AAAATAAAT
* ** * * *
14486 CTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTATCA
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA
* * * * *
14549 CGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTC-ATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAA
64 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAA
* * * * *
14613 TACTACTTTTATTAATATTTCAAAAATCAATAAGCAAGAGATTT-AAAAGTAAAGT
128 TACTA-ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-T
* * * * *
14668 -TATTTTTTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCAATATG
1 ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * * *
14732 ATC-TTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAAATAAT
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAAT-AAAATAAT
* * * ** *
14794 ATTAATTTAATAGTATTCCAAAA--AAT-AGTGAAAGATTTAAAAAATAAAT
129 ACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
*
14843 GTATTT
1 ATATTT
14849 GCTAAACTAG
Statistics
Matches: 1736, Mismatches: 351, Indels: 153
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
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184 134 0.08
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
ATATTTATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAC
TAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
Found at i:13303 original size:364 final size:360
Alignment explanation
Indices: 12507--14848 Score: 2105
Period size: 364 Copynumber: 6.5 Consensus size: 360
12497 TAATTTATTA
* * * ** * *
12507 ATATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTATTATG
1 ATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
** * * * * * * * ** * *
12572 ATTTTTTGTTCTATTATAAAGCAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACAC
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC
* * * * ** ** *
12637 TAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAACATAAATATGCTTATTGAACT
131 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACA
* * * * * *
12702 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGT
196 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
12766 CATAAAAAAATAT-TTTCGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATCAATA
261 CATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
12830 TTCTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
325 TT-T-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
12868 ATGTTTAAT-GAATAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCACTA
1 ATATTT-ATCGAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
12931 TAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAAT
64 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAT
* *
12996 AATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATCTAACAAATAAATCTATTT
126 AATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* ** * * **
13058 ACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATT-TTTATTTCTAATTGTTATGACCTTT
188 ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * * *
13122 TGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAAAATATTAATTT
253 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
* *
13187 ATTAATATTTTGGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
318 ATTAATA-TTT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * *
13232 ATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTAAT-TATTTCAAATCAATGT
1 ATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTAT
* *
13296 GACCTTTT-TTTT-TAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAA
65 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAA
* * * * *
13357 TACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACCA
128 TACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCA
* * * * * * * *
13421 AACATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTAAATAATTATCTATTTGAAAACATTATGACTTTTTATT
192 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * *
13485 TTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTAT
257 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTAT
* *
13548 TTATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT
320 TAATATTT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * **
13590 ATGTTT-TCTAAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTCAAATTGTTA
1 ATATTTATC-GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
13653 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT
64 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * * * * ** *
13718 ACTAATTCATTAAAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAG
129 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA
* ** ** * * * * *
13783 TAAGTTTGAATAGTTATGACCCTTCGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTT
194 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
** * * *
13848 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGCAATAAAATAATAATAATTTATTAAT
259 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
**
13913 ATTCTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT
324 ATT-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ***
13951 CTACTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTGTTATCTATTTCAAATCATTAT
1 ATATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* ** ** * *
14015 GACATTTTG-TTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTAAGAACAAAATAATA
65 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* *
14079 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAGAATTAAATCTATTTATCAAAC
130 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAA-
* * *
14140 CAA-TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTT
194 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
** * * * * * * * * *
14203 GAAATAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAACTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAAT
259 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
14268 ATTCAAAA--AATTAA-TAAGAGCTTTGAAAAATAAAT
324 ATTTAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
*** * * * * * * * * *
14303 GCGTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATTATTCCT
1 ATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-AT
* *
14368 -ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
65 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * * *
14431 AGTAATTTATTAA-CTTTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATC
129 ACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTATC
* * *
14495 AAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTATCACGACCTTTT
191 AAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTT
* * * *
14558 GTTTTGTCACAAAACAATTGTTTC-ATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTACTTT
254 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATT
* * *
14622 TATTAATATTTCAAAAATCAATAAGCAAGAGATTT-AAAAGTAAAGT
317 TATTAATATTT--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-T
* * * * * * *
14668 -TATTTTTTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCAATATG
1 ATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * *
14732 ATC-TTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTT-GAATAAAAATAAT
66 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAAT
* * * * * *
14794 ATTAATTTAATAGTA-TTCCAAAA--AAT-AGTGAAAGATTTAAAAAATAAATGTATTT
129 ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
14849 GCTAAACTAG
Statistics
Matches: 1603, Mismatches: 309, Indels: 142
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
352 77 0.05
353 71 0.04
354 4 0.00
355 63 0.04
356 64 0.04
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359 257 0.16
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362 24 0.01
363 78 0.05
364 320 0.20
365 20 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (360 bp):
ATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC
TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACA
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
Found at i:14839 original size:540 final size:531
Alignment explanation
Indices: 12523--27431 Score: 6182
Period size: 539 Copynumber: 28.0 Consensus size: 531
12513 ATCAAACCAG
* ** * * * * * * *
12523 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAGTAATTATTTATTTCAAATTATTATGATTTTTTGTTCTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
12588 TAAAGCAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACACTAATTTATTAATATTT
65 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
* * * * * * *
12653 -CAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAACATAAATATGCTTATTGAACTAGATCAAATAGTCAT
130 CCAA-AA--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * *
12717 GACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AAATATT
192 GACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * ** * * * * *
12780 TTCGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATCAATATTCTGAAAATTAATA
255 TTAG-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATG
* * * * * * *
12845 ATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTA-ATGAATAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAA
318 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACA--AACAAGTTCAAA-TAGTTATG-CTATTTGAA
* * * * * * * * *
12908 CAATTATCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCA
379 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTCTATTCA
* * *
12973 TACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAA
441 TAAAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AA-TAATAAGTAA
* * *** *
13034 AAGATCTAACAAATAAATCTATTTACCAAACAA
501 GAGATTTAA-AAATAAAT-TATTTTTTAAACTA
** * * * ** *
13067 GTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATT-TTTATTTCTAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * * *
13131 ATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAAAATATTAATTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-T
* * * * * *
13196 TTGGCAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCAT
128 TT-CCAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
13261 GACTATTTGAGTAATTAATTATTTCAAATCAATGTGACCTTTT-TTTTTAATAAAACAATTGTTT
192 GACTATTAGAATAATT-ATTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* *
13325 TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAG
256 TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATGAG
* * * * *
13390 TAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGCTATCTAAATAATT
320 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGCTATTTGAATAATT
* * * * * * ** *
13455 ATCTATTTGAAAACATTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAGCT
384 ATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAACT
* * *
13520 TATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAA
449 TA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA-TAATAAGTAAGAGATTT-AA
13582 AAATAAA-TATGTTTTCTAAACATA
510 AAATAAATTAT-TTTT-TAAAC-TA
* * * ** *
13606 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
13671 TAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTCATTAAAATTT
65 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
* * ** **
13736 CAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAGTAAGTTTGAATAGTTATG
130 C-CAAAA-AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATG
** * * *
13801 ACCCTTCGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
193 ACTATTAGAATAATTA-TTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * *
13866 CTA-TTCATACAATTTTATTTGCAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAG
256 -TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCAAAAATTAATGAG
** * * **
13930 TTGGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTGT
320 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-AAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAATAAT
**
13995 TATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTG-TTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAA
383 TATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAA
* *
14059 -TTATT-AAGAACAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAG
447 CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGTAAGAGATTTAA-
* * * *
14119 AATTAAATCTATTTATCAAACCAA
510 AAATAAAT-TATTTTTTAAA-CTA
* **
14143 TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGAAAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * * * *
14208 AAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAACTTATT-TGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TT
66 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
* * * * * * * *
14271 -CAAAAAATTAA-TAAGAGCTTTGAAAAATAAATGCGTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGA
130 CCAAAAAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
14334 CTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATTATTCCT-ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
194 CTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATT-CTGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTT
*
14398 TAGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACT-TTCAAAAAATTAATG
256 TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATAATAATTTATTAA-TATTC-AAAAATTAATG
* *
14461 AGCAAAAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGA
318 AGTAAGAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAG-TTATG-CTATTTGA
* * * * * *
14525 ACAATTATCTATTT-AAAGTTATCACGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTC-ATTTCA
378 ATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA
* *
14588 TAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTACTTTTATTAATATTTCAAAAATCAATAAGCAAGAG
441 TAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAAT-AATAAGTAAGAG
* *
14653 ATTTAAAAGTAAAGTTATTTTTTGAACTA
504 ATTTAAAAATAAA-TTATTTTTTAAACTA
* * * * *
14682 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCAATATGATCTTTGTTTTCTTA
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* * *
14747 TAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAAATAATATTAATTTAATAGTA-
65 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCTGAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * *
14809 TTCCAAAAAAT-AGTGAAAGATTTAAAAAATAAA--TGTAT-TTG--C----T-AAACTAGTTGT
128 TTCCAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAA-TAGTTAT
* * * * * * * *
14863 GGCTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTAATAT-TTAGAA-AATT-A
192 GACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTT--TGTCATAAAACAATTGT
* * * ** * *
14925 ATTAG-T--GA-GAG---ATTT--AA-AAAATAA-AACT-ATTTACCAAACCATTTCAAATAGTT
254 TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAA-TAATTTA-TTAA-TA-TTCAAA-AATT
* * * * * *** **
14978 -TTGACT-----ATTTGAATAAT-TATCTATTT-C-AATTTGTT-ATAA-CCTT-T--TATTTTG
314 AATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAAACAAGTTCA-AATAGTTATGCTA-TTTG
* * ** * * * * ** *
15029 TCATCAA--A-C-AATT-AGTTCTATT-CGTAC-TATT-TTAT-TCA-AAATA-AAATAATACTA
377 -AAT-AATTATCTATTTCAAATC-ATTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTCT-
* * ** *** * ** * *
15083 ATT--TAATAA--TATTC-CAAT-ACTTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAT-AAATATAAT-TGT
436 ATTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGT
* ** * * ** *
15140 CAAAACCTTTCAAATAGTAAGACTACATGAATGATT-ATCTA
499 -AAGAGATTT-AAA-AATAA-A-T---T-ATTTTTTAAACTA
* *
15181 TTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG-----TT-T-TGTCAT-AAA--A-CA--A---TTGTTTT-
1 -TTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATC-TCAAATCATTATGATCTTTGTTTTG
* * * * * ** * ** * *
15227 TAATCATAC-A-TG-CT-TATTCAAAACAAAATAATATC--AATTTATTAATA-T--TTCAA-AA
62 TCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAGCTTAT-TCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAA
* * ** * *
15282 -A-TT------AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAATT
125 TATTTCCAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * ** *
15339 ATGACTATTTGAGTAGTTATCAATCTCAAATCATTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
190 ATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTG
* * ** * * *
15403 TTTCTA-ATCATA-GAGCTTATTTG-GTTAAAAATACTACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTA
253 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATAATAATTTATTAATATT-CAAAAATTA
* * * * * * * * ** *
15465 ATAAGTAAG-GAATTTAAAAAATAACTATGTTTGTCGAACCAGTTTAAATAGTTAAAACTATTAG
315 ATGAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGCTATTTG
* * * * * * * * * *
15529 AATAATTATATAGTTT-AAATCGTTTTGACCTTTTGTCTAGTTAGAAAATATTTGTTTCGTA-TC
377 AATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TATTC
* * * * * * * * *
15592 TTACAATCTTATTCGAAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGGAAAAG
440 ATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TAATAAGTAAGAG
* * * *
15657 ATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAA
504 ATTT--AAAAATAAAT-TATTTTTTAAAC-TA
* * * * * * * *
15689 TTCAAATAGTGATAACTATTT-AGACAATTATTTATTTAAAATTATTATAACCTTTTGTTTTGAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTG-T
* * ** **
15753 -ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATA
63 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * *
15816 TTT-CAAAAATTAA-TAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAAT-TAGTTTATGGAACAAATTCAAATA
127 TTTCCAAAAAATAAGTAA--AAGA-TTT-AAAAAATAAATGT-GTTTATTGAACAAGTTCAAATA
** * * * * * *
15878 GTTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAA
187 GTTATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAA
* * ** *
15943 TTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
250 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATT
* * ** * * * *
16008 -A--A-TAAGTGATTTAAAAAGTAAATCGGTTTACCAAATC-AGCTCAAATAATTAGGGCCATTT
314 AATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAA-CAAGTTCAAATAGTTA-TGCTATTT
* * ** * * * * *
16068 CAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTTTATT
376 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATT
* ** * * * *
16132 -ATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATAGTATTTTATTAATCTCTCAAAAAT--TAA-TAAGA
439 CATAAAAACTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGTAAGA
* *
16192 GATTTAAAAAATAAATTAATTTATTAAACAA
503 GATTT-AAAAATAAATT-ATTTTTTAAACTA
* * * * * * * *
16223 TTTAAATAATTTTGACTATTTGAA-TAGT-TGTATCTTCAAAT-AGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC-TCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGT
* * ** * *
16285 CATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATAT
63 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * ** * * *
16350 TCCCAAAATTAATAACTGAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACTAGTTTAAATAGTT
128 TTCCAAAA--AATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
* *** *
16415 AAGACTA-TATGAACCGTTATTTATTTCAAATCA---T----TTTT-TTTGTCATAAAACAAAAT
190 ATGACTATTA-GAATAATTA-TTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTGTCATAAAAC-AATT
* * * ** * * *
16471 -TTTCAATTCACACTAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATACTAAAAAACTT
252 GTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTCAAAAA-TT
* * * * * * * *
16533 AAT-ATGTAAGAGGTTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGACTATTT
314 AATGA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * * * * * *
16597 CAACAATTATCTTATTT-AAAT-AGCTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTT
376 GAATAATTATC-TATTTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* ** * * *
16660 CATATAAGTTTGTTCGAAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAAT--TAA-TAAGAG
439 CATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGTAAGAG
* *
16722 ATTTAAAAAATAAA-TATGTTCATCAAA-TCA
504 ATTT-AAAAATAAATTAT-TT-TTTAAACT-A
* * * * ** * * *
16752 GTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTTTCTATT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTT-TGTC
* * * * * * * * *
16816 ATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACATGCTTATT-TGATTAAACTAATACCATTTTATTAATATT
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * ** * * *
16880 T-CAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGCTTACCGAACTAGATCAAATAGTCA
129 TCCAA-AA--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * **
16944 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATGAAAA-AATCA
191 TGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCAT-AAAACAATTG
* * * * * * **
17008 TTTCAGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTACACCTTAAT
253 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAT
* * * * * * *
17073 AATTAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTA-ATGAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAG
317 GAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACA--AACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAA
* * *** * * * * * *
17137 CAATTATCTATTTGAAATTGCTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCATA
379 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATA
* ** *
17202 CAAACTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT-AATACAATTAATAAGTAAAAG
443 AAAACTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA-A-AA-TAATAAGTAAGAG
* * ** *
17264 ATCTAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
504 ATTTAAAAATAAAT-TATTTTTTAAACTA
** * * * ** *
17293 GTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * *
17358 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAAT-ATATTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-
* * * * * *
17421 TTTGACAAATAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCA
127 TTT-CCAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
17486 TGAATATTTGAATAATTAATTATTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTT-TAATAAAACAATTGTT
191 TGACTATTAGAATAATT-ATTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
17549 TCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATGA
255 TTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATGA
* * * * * *
17614 GTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACAGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAACAA
319 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACA-AACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAATAA
* * * * ** * * **
17679 TGATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATTGTAAAAAAATTGGTTT-TGTTCATGCAA
382 TTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAAAA
** ** ** * * *
17743 GTTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCTAATAGTTAATAAGTAAAAAATTA
446 ACTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AA-AAATAATAAGTAAGAGATTT
17806 AAAAATAAA-TATGTTTTCTAAAC-A
508 AAAAATAAATTAT-TTTT-TAAACTA
* * * ** *
17830 CGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 --TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * *
17895 CATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A
63 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * * * * *
17958 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATATATCTATTTACTGAGCGAGTTTAAATAGT
127 TTTCC-AAAA--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGT
** * * *
18023 TATGACCCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA-T-T----TTGT-TTTGTCATAAAATAATTG
189 TATGACTATTAGAATAATTA-TTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTG
** * *
18081 TTTCTA-TTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAATAATTAA
253 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATTAA
** * * * *
18145 T-AGGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGA
316 TGA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGA
* * *
18209 ATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACGATTGTTTCTTTTCATA
378 ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * *
18274 AAAAATTATT-TAGAATAACATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT--TAA-TAAGAGATT
443 AAAACTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGTAAGAGATT
* * * *
18335 TAAGAATTAAATCTATTTATCAAACCAA
507 TAA-AAATAAAT-TATTTTTTAAA-CTA
* * * * ** * *
18363 TTCAAATACTTATGGCTATTTGAGCAATTATCTATCTCAAGTTGTTATGATCTTTATTTTGTAAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * * *
18428 -AAACAACTGCTTCTGTTGATACAAACTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TT-
66 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC
* * ** *
18490 CTAAAAA-AAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTTAAGA
131 CAAAAAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * **
18552 CTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTTATCTTTTGTTTAGTCATAAAGTAATTGTTTT
194 CTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTT
* ** * * * * **
18617 AGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAAC
257 AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATGAGT
* * ** * * * * *
18682 AAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAATTTCAAA-ATGTCATAACTATTTAAACAA
321 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATA-GTTAT-GCTATTTGAATAA
* * * * *
18746 TTATCTATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTCT-TAGTTCATAAA
382 TTATCTATTTCA-AATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAA
* * * *
18809 AGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAACCAATAAGTTAA-AGATT
445 AACTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TAATAAG-TAAGAGATT
* * * * * *
18872 TAAACAATAAGTCAGTTTATCAAATTGG
507 TAAA-AATAAATTA-TTTTTTAAACT-A
* * * * * * * ** *
18900 TTTAAATAATTATG-GTCACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTACAAACTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * ** * * *
18964 ATAAAACAAATT-TTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAACTTATTAATA
64 ATAAAAC-AATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* ** * * *
19027 TTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGGTTTAAAAAATAATTTTGTTTATTG---AA---C---TAGTT
127 TTTCCAAAA--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
19083 -T--CTGTTTGAACAATTATCTATTGCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTG
190 ATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTG
* * * * * * * *
19145 TTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATATTTTTTAAAAATTGAT-
253 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCAAAAATTAATG
** * * * * * * ** *
19209 AACAAGGAGATTCGAAAAAATAAACCTATTTGCTAAAACAA-TTAAAACAATTAAAACTATATGA
318 AGTAA-GAGATT-TAAAAAATAAATCTATTTAC--AAACAAGTTCAAATAGTT-ATGCTATTTGA
* * * * * * * *
19273 ATAATTATTTGTTTACTAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTT-TTTATC
378 ATAATTATCTATTT-C-AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TC
*** * * * * * * *
19336 ATTCCAGCTTATTC-AGAATAAAATAATATTTATTTCTTAATCTTTTAAAAAT--TAA-CAAGAG
440 ATAAAAACTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGTAAGAG
* *
19397 ATTTAAAAAATAAATT-TGTTTGCTGAACTA
504 ATTT-AAAAATAAATTAT-TTT-TTAAACTA
* * * * * * * *
19427 GTTTAAATA--TATGACTATTTGAACAATT-GC-AACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATC-TCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGT
* * * * * * *
19488 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATGCTTATCTAATAATA
63 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * ** * * *
19552 -TTCC-AAAAATCAA-TAACTAAGAAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACTAGTTTAAATAT
127 TTTCCAAAAAAT-AAGTAA--AAG-ATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAG
* * *
19614 TTAAAGACTA-TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
188 TT-ATGACTATTA-GAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACA
* * * *
19678 ATTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTTAAATAAAA-AA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAA
249 ATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATA-TTCAAAA
* * * * * * *
19741 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATCAATTCTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGATTA
311 ATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTA
* * * * * *
19805 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGT
373 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * *
19870 TCAT-ATAAGTGTGTTCGAAATAAAGTAATATTAATATATTAATATCTCAAAAAT--TAA-TAAG
438 TCATAAAAACT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGTAAG
19931 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAA-TA
502 AGATTT-AAAAATAAAT-TATTT-T--------TT-AAACTA
* * * * * *
19972 GTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTAT-TCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTGTT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTC
* *
20036 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-CTTATTC-GAGTTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTGA-ATAAAATAATACTAATTTAATAATA-
* *** * * * * * * *
20099 TTTGACAATTGATAAGTAATTA-ATTTAAAAAGTAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTC
127 TTT-CCAAAAAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
20163 ATTATTATTTGGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAA-AATT
190 ATGACTA-TTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATT
* * * ** * * *
20227 ATTTCAATTCATGTAAG-TTATTTCAAAATAAAAATAATATTAAGTTATTAATATT-ATGAAAAT
252 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAAT-AAAATAATAATAATTTATTAATATTCA--AAAAT
* * * * *** * * *
20290 TAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAACAAGTTTAAATAATTTTGACTATTT
313 TAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTA-TT
* * * * ** *
20355 TG-ATAATTATCTA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTGTT
375 TGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* ** * *
20417 CATACAAGTTTATTTTG-AATAAAATAATACAAACTTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGT
439 CATAAAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAA-A-AA-TAATAAGT
* * ** *
20479 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCA
499 AAGAGATTT-AAAAATAAAT-TATTTTTTAAACTA
** * * * * * *
20514 TTTCAAATCTTTATGACTATTTGAATAATTATCTTTTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTA
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * *
20579 ATAAAATAATCGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
64 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * ** * ** * *
20642 -TTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAAGGAATCT-TGTTACCGAACATGTTTAAATAG
127 TTTCCAAAAAATAA-G-TAAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGT-TTATTGAACAAGTTCAAATAG
* * *
20705 TTATGACTA-TATGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
188 TTATGACTATTA-GAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAA
** * * *
20769 AAGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCCAAAAATT
250 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-CAAAAATT
* * * * *
20834 AATGAGAAAGAGAATTAAAAAATGAATCT-TGTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCT
314 AATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTT
* * * * * *
20898 GAACAATTATCTATTTTAAAACATTATGACATTTTGTTTTCTCATAAAAC-ATCTGGTTCTACTC
376 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTC
** * ** * *
20962 ATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATGAGTAA-A
440 ATAAAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATAATAAGTAAGA
*
21025 AATTTAAAAATAAATATATTTTTTGAACACT-
503 GATTTAAAAATAAAT-TATTTTTT-AA-ACTA
* * * * * * *
21056 TTCAAATAG-T-TGACTATTTCAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * *
21119 TAAACCAATCGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAACTTATTAA-AAT
65 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * *
21182 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTTGAGCGAGTTCAAATAGTTA
129 TCC-AAAA--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
21247 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATCTTCTGTTTTATTC-TAAAAAAAATT
191 TGACTATTAGAATAATTA-TTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTT-GTCAT-AAAACAATT
* *
21311 GTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
252 GTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATTA
* ** * * * * *
21375 ATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTACCGAATAAGCTCAAATAGTCATAT-CCATTT
315 ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGT--TATGCTATTT
* ** *
21438 GAACT-ATTATCTATATCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTC
376 GAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * *
21502 ATACAAAA-TTATTC-AGAATAAAATAATTCTAATTTATTAGTATTTCAAAAAT--TAA-TAAAA
440 ATA-AAAACTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAATAAGTAAGA
* * * * * *
21562 GATTTAAAAACTTAATCTGTATATCAAACCAA
503 GATTTAAAAA-TAAAT-TATTTTTTAAA-CTA
* * * * * *
21594 TTCAAATAATTATGATTTTTTTAAACAATTATATATCTCAAATCATTATGATATTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
21659 TAAAGCAATTTTTTTTGTTCATACAAACTTATT-TGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATA-
65 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAAT-ACTAATTTAATAATAT
* * * **** *
21721 TTCTAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAA
128 TTCCAAAAAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * * * *
21784 GAATATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGCTTGTCATAAAATAGTAT-TT
192 GACTATTAGAATAATTA-TTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAT-TGTT
* * ** * ** * *
21848 TCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTTAGAAAATTAATAA
255 TTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATGA
** * * * * * * * *
21913 ACAACAAATTTTAAAAATTAAATTTGTTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
319 GTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCT-ATTTACAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAATA
* * * * * * * *
21978 ATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTGTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCTTAAAA
381 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAA
* * * * * * * ** * *
22043 GCTTA-TCTAGAATAAAATAAGATTACTTTATTTATACTTCAAATTTTGATATA-TTAGAGATTT
446 ACTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATAATA-AGTAAGAGATTT
** * * *
22106 --AAA-AAA-TA--CATCAAATTGG
508 AAAAATAAATTATTTTTTAAACT-A
* * * * * ** *
22125 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAGCTTTTGTTTT-TCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCA
* * * * * *
22189 TAAAACAATTTTTTTTCA-TCATACAAGCCTATT-TGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAAT
65 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * *
22252 TT-AAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATC-GGTTC--CTA-T
128 TTCCAAAA--AATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGT
* * ** * * * * ** **
22311 T-TGGACAATT---AT--CTA-T-TTTC-AATTGTTATAACCTGTTGTTCTATTGTAAAATTATT
189 TAT-GACTATTAGAATAATTATTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
22367 ATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAACTAA
252 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATT-CAAAAATTAA
* * * * ** * * *
22432 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAA
316 TGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAA
* * * * * *
22497 TAATCATCTCTTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTTTTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCAT
379 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
* * **
22561 AGAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGTTA
442 AAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-TAATAAGTAAGAGA
* * * *
22624 TTTAACAAGTGAATCTATTTATCAAA-TCA
505 TTTAA-AAATAAAT-TATTTTTTAAACT-A
* * * * * * * *
22653 GTTCAAATAATTATGGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * ** * *
22718 ATATAACAATTGTGTT-TGA-ACATTCAATTTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTCATTAAT
64 ATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * * * *
22780 CTTTCAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGATCCAA-TTCAAATA
126 ATTTCCAAAA--AATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGA-ACAAGTTCAAATA
** * * * * * * ** * * *
22843 GCAATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTGTCATAAAACAAT
187 GTTATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * *
22908 TATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGATAAATTAATAATATTCTAAAAATTA
251 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC-AAAAATTA
* * * * * * * *
22973 AT-A--AA-AGATTTTAAAAATAATTGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAATATTAG
315 ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAAA-CAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTG
* * * ** * * **
23033 AACAATTATTTATTTCAAAAT-AGTATTTTCAGTTCATACATGCTTAT-TCA-AAATA-AAATAA
377 AATAATTATCTATTTC-AAATCATTA-TGACA-TT--T---TG-TTTTGTCATAAA-ACAATTGT
* ** * * * * *
23094 TACTAATT--TATTAGCAT-TTAGAAA-ATTAATAA-AC-AA--CA--AAT-TTT--AAAA-AAT
432 TTCT-ATTCATAAAAACTTATTCGAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATAAT
* ** *** * * * *
23145 AAATTTGTTTTTTGAACAAGTTCAAA-TA-GTTAT-GACTA
495 AAGTAAGAGATTT-AA-AA-AT-AAATTATTTTTTAAACTA
* * * * * * * *
23183 TTTGAACA-AGTTCA--AATAGTTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTTTTTT
1 -TTCAA-ATAGTT-ATGACTA-TTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTT
* * * * * *
23245 ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCTAGAATAAAATAATATTACTTTATTAA
61 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATACTAATTTAATAA
* ** * * * * *
23309 TACTT-CAAATTTTGATATA-TTAGAGATTTAAAAAATACAT-CG--AATTG-----GTTCAAAT
125 TATTTCCAAA---AAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAAT
* * * * ** * * *
23364 AATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAC-AAGCTTTTGTTTTTTCATAAAAC
186 AGTTATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATT-CTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAC
*** * * * * *
23428 AATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATCTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTAAAAA
248 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * ** *
23493 TTAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC--TGAA--TC----AG-T-TCCTATTT
312 TTAATGAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAAACAAGTTCAAATAGTTATGCTATTT
* * ** * * * * * ** **
23547 GGACAATTATCTATTTTC-AATTGTTATAACCTGTTGTTCTATTGTAAAATTATTGTTT-TAGTT
376 GAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * * * * *
23610 CATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGA
439 CATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TAATAAGTAAGA
*** *
23675 GATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGTA
503 GATTT-AAAAATAAAT-TATTTTTTAAACTA
* * * * * * * * * *
23706 GTTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTCTTTGAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * *
23771 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAGAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
64 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * * * * * *
23833 TTCTAAAAATTAA-TAAGTAAGTTATTTAACAAGTGAATCTATTTATTAAATC-AGTTCAAATAA
128 TTCCAAAAAATAAGTAA--AAG--ATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
23896 TTAT-AGCTATGT-CAACAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACA
188 TTATGA-CTAT-TAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACA
** * ** * * *
23959 ATTGTGTTT-GAACATTCAATTTTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA
249 ATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAAT-ATTCAAAAA
* * * * * ** *
24023 TT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACTGATCCAGTTCAAATAGCAATAACTATT
312 TTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-AAACAAGTTCAAATAGTTAT-GCTATT
* * ** * ** * * *
24084 TGAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTAT-A-ATCTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTT
375 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * * * * *
24146 TATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCTAAAATTAATAACTAAGA
439 CATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATAATAAGTAAGA
* * ***
24211 GAATTAAAAAATAAGTT-TGTTTGCCGAACTA
503 G-ATTTAAAAATAAATTAT-TTT-TTAAACTA
* * * * * * *
24242 GTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * *
24307 ATAAAATAAGTTTTTTTTTTAATTCATA-ATAGCTTATT-TGGAATAAAATGAA-A-TGAATTTA
64 ATAAAACAA---TTGTTTCT-ATTCATACA-AGCTTATTCT-GAATAAAAT-AATACT-AATTTA
* * * * * * * * *
24368 TTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACTAGTTCA
121 ATAATATTTCCAAAA--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTA-TTGAACAAGTTCA
* * * * * * *
24432 AATAATTACGATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
183 AATAGTTATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAA
* * * * * * * * *
24497 ACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAA
246 ACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * ** *
24562 TATT-A--A-TAAGAGATTTTAAAAATAAATTTATTTATCAAATTAGTTCAAATAGTTTTGACTA
310 AATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTA
** * * * *
24623 TTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTG-TTC-A-
373 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * * * * * **
24685 T-AT--ATGCTTATTCGGATTAAAGTAATATTAATTTATTAATATTTCAGCACCTAATAAGTAA-
438 TCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATAATAAGTAAG
* * *
24746 A-ATTTAAAAA-ACAAATATGTTTACTGAACTA
502 AGATTTAAAAATA-AATTAT-TTT-TTAAACTA
* * * * * * * * *
24777 GATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* * * * *
24842 ATAAAAGAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATGCTAATTTATTAGTA
64 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATA
* * * * * * *
24905 -ATCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAATATGAATCTATTTACTGAAAAAGTT-AAATA
127 TTTCC-AAAA--AATAAGT-AAAAGATTTAAAAA-ATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATA
* * * * * ** * * *
24967 ATTATTACTGTTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAA
187 GTTATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAA
* * * *
25032 TT-TTATCTA-TTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAAATCA-AATTTATTAATATT-AAGAC
250 TTGTT-T-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT-AATAATAATTTATTAATATTCAA-A-
* ** * * * *
25093 AGTTAAAAATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATTGTTATGACT
310 AATTAATGA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CT
* * ** * * *
25158 ATTT--ATGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGCCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTA
372 ATTTGAAT--AATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * ** * * * * *
25221 TGTTCATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAG
435 TATTCATAAAAACTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATAATAAG
* * ** *
25285 TAAAAAATTTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCAAACAA
498 TAAGAGA-TTT-AAAAATAAATTAT-TTT-TTAAACTA
* * * * * *
25322 GTTCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTT-TCGTTTGT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTTGT--TTTGT
* * * * * *
25386 AATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGTTTATT-TGAAGTAAAATATTATTAATTTATTAAT
63 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCTGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAAT
* ** * * * *
25449 A-TTCCAAAAATTAATGACTAAAAGAACTAAAAAA-AGAATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATA
126 ATTTCCAAAAAATAA-G--TAAAAGATTTAAAAAATA-AATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATA
* * * * * *
25512 GTTATGATTATCT-GAACAATTATCTATTTTAAAAT-ATTATGACCTTTCAT-TTTGCCACAAAA
187 GTTATGACTAT-TAGAATAATTAT-TA-TTTCAAATCATTCTGACCTTT--TGTTTGTCATAAAA
* *
25574 CAATTGGTTTTA-TTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCTA
247 CAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTC-A
* * ** *
25636 GAAATT-A--A-T-A-AGA---AAAAAAT--GT-T-TTT-TGAACACGTTCAAATAGTTATGACT
308 AAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CT
* * * ** * ** * *
25687 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTA-TATGATTTTTTGTTTTGTTATAAAGTAATTGTTTTTG
372 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
*
25751 TTCATAAAAACTTATTCG-AA-AAAA-AATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGTA
437 TTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-TAATAAGTA
* * * *
25812 AAAGATTTTAAAAGTAAA-TA-TGTTTAATGAGCGA
500 AGAGA-TTTAAAAATAAATTATTTTTTAA--A-CTA
* * *
25846 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTC
* ** * *
25911 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAG-TTAATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCTGAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
* ** * * *** **
25974 TTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAATATATTTGCCGAACAAGTTCAAATAGCC
128 TTC-CAAAA--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * * * * **
26039 ATGTCCGTTTGAACT-ATAATCTATTTTAAATTATTATGACATTTTATTTTGTTGTAAAACAATT
190 ATGACTATTAGAA-TAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATT
* ** ** *
26103 GTTTTA-TTCTTACAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTCAAAAATT-A
252 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAA
* * * * *
26165 --A-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTTTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTCAA
316 TGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACAAGTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAA
* * * * * *
26227 TAATTATTTATCTCAAAT-AGTATG--ATCTTTGTTTTGTCATAAAACATTTATTTCTATTCATG
379 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * ** *
26289 CAAGCTTGTTC-AAAGTAAAATAATACTAAACTAATAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
443 AAAACTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-TAATAAGTAAGAGA
* ** *
26352 TTTAAAAATAAATGTATTTGTCGAACCA
505 TTTAAAAATAAAT-TATTTTTTAAACTA
* * * * * * * * *
26380 GTT-ATAACAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAAT-GTTCTAACCTTT-TTTTGT
1 -TTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTC-AAATCATTATGATCTTTGTTTTGT
** * * * * *
26442 CATAAAA-TTTTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATT-TAAAATAAAATAATA-TAATTTTATTA
63 CATAAAACAATTGTTTCT-A-TTCATACAAGCTTATTCT-GAATAAAATAATACTAA-TTTAATA
* * * * ** *
26504 ACA-TT-CAGAAATTTAATAAAG-AAGAA-ATTTTAAAACATAAATCTATTTATCAAATAAGTTC
124 ATATTTCCA-AAA---AAT-AAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATGTGTTTATTGAACAAGTTC
* * * * * * *
26565 AATTAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTATCATG
182 AAATAGTTATGACTATTAGAATAATTAT-TATTTCAAATCATTCTGACC-TTTTG-TTTGTCATA
* * *** * * * *
26630 AAACAATTGTTTCAGTTCAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATATTACTCTATTACTATTTC
244 AAACAATTGTTTTAGTTC-ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATA-TTC
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* * *
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* **
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* * * * ***
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* * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * ** ** * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * * * *
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* ***
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** * * *
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* **
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* ** * * * * *
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* * * *
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** * *
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* * ** * * *
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1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-GTTTAAAAAATAAAT-TAGTTT-ATCGAACA
* * * * *** * *
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* * * * *
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* * *
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** * * **
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* * * *
17356 TCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAAT-ATATTAA
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* * * *
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* * *
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* * *
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* * * * * *
17650 TGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAACAATGATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTAT
62 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
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19368 TTTCTTAATCTTTTAAAAATTAACAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTGAACTAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATTAGTTTATC-GAACAAGT
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19606 TTAAATATTTAAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
65 TCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
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19852 TAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TGTGTTCGAAATAAAGTAATATTAA
129 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * *
19904 TATATTAATATCTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAACAAGT
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121 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
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* * * * * * *
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63 GTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
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127 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAAT-AAAATAATACTAA
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20270 GTTATTAATATTAT-GAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT-GTTTGTTGAACAA
1 TTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAA
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20333 GTTTAAATAATTTTGACTATTTTG-ATAATTATCTA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTG
63 GTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
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*
20450 CTTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAAC
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61 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
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126 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * ** * * *
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1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAG
* * ** *
20696 TTTAAATAGTTATGACTATATGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAA
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * *
20761 TAAAACAAAAGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
129 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * * *
20813 CTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAATGAATCTTG-TTACCAAACATG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAG
* * * * *
20877 TTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTTAAAACATTATGACATTTTGTTTTCTCA
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * **
20942 TAAAAC-ATCTGGTTCTA-CTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAAAAA
129 TAAAACAAT-TGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * **
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1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAGT
* * * * *
21057 TCAAATAG-T-TGACTATTTCAATAATTATATATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTGGTCAT
65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * *
21120 AAACCAATCGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
130 AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
21171 CTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTGTTGAGCGAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAG
* * * * * *
21235 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATCTTCTGTTTTATTC
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTC
* *
21300 -TAAAAAAAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
128 AT-AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
** * * *
21353 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTCGTTTACCGAATAAG
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* * * * * ** *
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64 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *
21481 GTAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTA-TTCAGAATAAAATAATTCTAA
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* * * * *
21534 TTTATTAGTATTTCAAAAATTAATAA--AAGA-TTTAAAAACTTAATCT-GTATATCAAACCAA-
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA-CAAG
* * * * * *
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* * ** * * * *
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127 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAA
* * ** *
21711 ATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATGT-GTTTGCCAAACCAA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA-CAA
* * * * ** * *
21771 -TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-CTTGTC
63 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * **
21834 ATAAAATAGTAT-TTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
128 ATAAAACAAT-TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
** ** * * * * *
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* * * * *
21951 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTGTTGTTTTATC
63 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
22016 ATAAAACAATTGTTTCAATTCTTAAAAGCTTATCT-AGAATAAAATAAGATTAC
128 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA
* * ** * * * * * *
22069 TTTATTTATACTTCAAATTTTGATATA-TTAGAGATTTAAAAAATACATCA---AATTG-----G
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAG-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAACAAG
* * * * ** *
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64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
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129 TAAAACAA--TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * *
22241 TTTATTAAAATTT-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTG---AA-
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATC-GAACAAG
* * * ** * * * * *
22300 -TC-----GGT-T-CCTATTTGGACAATTATCTATTTTC-AATTGTTATAACCTGTTGTTCTATT
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * *
22356 GTAAAATTATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
128 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * ** * **
22409 TTTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTGCCAAAGTAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAG
* * * * * * * * *
22473 TTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATCATCTCTTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTTTTC
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTC
* *
22538 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAGAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
128 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
22590 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGTTA-TTTAACAAGTGAATCTA-TTTATCAAATC
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG--AGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA-C
* * * * * *
22652 -AGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTTG
61 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * ** *
22716 TCATATAACAATTGTGTT-TGAACATTCAATTTTATTCGAAATAAAATAATACTAA
126 TCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
22771 TTCATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTA-CTGATCCA
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** * * ** * ** * *
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62 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * *
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127 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAA
* * * * ** *
22951 ATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAA--AAGA-TTTTAAAAAT-AATTGTGTTTGCCAAACCAA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATT-AGTTTATCGAA-CAA
* * * * * ** *
23011 -TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATTTATTTCAAAAT-AGTATTTTCAGTTCATACAT
63 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTA-TGAC-CTT--T---T
* * ** * * ** *
23074 GCTTAT-TCA-AAATA-AAATAATACTAATT--TATTAGC--ATTTAGAAA-ATTAATAA-AC-A
120 G-TTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATA-AAATAATACTA
23129 A
180 A
* * * ** ** ** *
23130 --CA--AAT-TTTAAAAAATAAATTTGT---TTTTTGAACAAGTTCAAA-TAG-TTAT-G-ACTA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTT-AA-AAAAT-AAATTAGTTTATCGAACAA
* * * * * * *
23183 TTTGAACA-AGTTCA--AATAGTTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTTTTTT
63 GTTCAA-ATAGTT-ATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * *
23245 ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCT-AGAATAAAATAATATTAC
125 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA
* ** * * * ***
23301 TTTATTAATACTTCAAATTTTGATATA-TTAGAGATTT---AAA-AAA-TA---CATCGAATTGG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAG-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAACAAG
* * * * ** ** * *
23357 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAGCTTTTGTTTTTTCA
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
23422 TAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGCCTATCTGAAATAAAATAATATTAA
129 TAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * *
23474 TTTATTAAAATTTTAAAAATTAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTG---AA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAG-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATC-GAACAA
* * ** * * * *
23534 --TC----AG-T-T-CCTATTTGGACAATTATCTATTTTC-AATTGTTATAACCTGTTGTTCTAT
63 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** ** * * *
23589 TGTAAAATTATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
127 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * ** * **
23643 TTTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTGCCAAAGTAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAG
* * * * * * * * *
23707 TTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTCTTTGAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCA
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
23772 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATAGAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAA
129 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * **
23823 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGTTA-TTTAACAAGTGAATCTA-TTTATTAAATC
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG--AGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA-C
* * * * *
23885 -AGTTCAAATAATTAT-AGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTTTGTTTT
61 AAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
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23948 GTCATATAACAATTGTGTT-TGAACATTCAATTTTATTAGAAATAAAATAATACTAA
125 GTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* ** * *
24004 TTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATTTTTTTA-CTGATCCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATTAGTTTATC-GAACAAGT
** * * ** * ** * *
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65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** *
24128 AAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
130 AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * ** *
24179 TCTAATAATATTTCTAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAGTTTGTTTGCCGAACTAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAACAAGT
* * * * *
24244 TCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCAT
65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
24309 AAAATAAGTTTTTTTTTTAATTCATA-ATAGCTTATTTGGAATAAAATGAA-A-TGAA
130 AAAACAA----TTGTTTCAGTTCATACA-AGCTTATTTGAAATAAAAT-AATACT-AA
* * * * *
24364 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCTAACTAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAG
* * * *
24428 TTCAAATAATTACGATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
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* ** * * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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* * * * * *
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** ** * * *
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1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATTA-GTTTATC-GAACAAG
* * * * * * *
24778 ATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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61 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
25139 AGTTCAAATTGTTATGACTATTT-ATGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATG-CCTTTTTGTTTT
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* * * *
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** * * * * *
25258 TTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCAAACAA
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* * * *
25322 GTTCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTCG-TTTGT
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * ** *
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63 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
25567 CACAAAACAATTGGTTTTA-TTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAAT-TTAAA
127 CATAAAACAATT-GTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AA
* * *
25621 TTTATTAATA-TTCTAGAAA-T--TAA-TAAGA----AAAAAAT--GTT--TTT-T-GAACACGT
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAACAAGT
* * ** *
25671 TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTA-TATGATTTTTTGTTTTGTTAT
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** ** * * *
25735 AAAGTAATTGTTTTTGTTCATAAAAACTTATTCG-AA-AAAA-AATACTAA
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* * * * * *
25783 TTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAGTAAA-TATGTTTAAT-GAGCG
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* * *
25845 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT
62 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** *
25910 CATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAG-TTAATTCAAAATAAAATAATATTAA
127 CATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAA
**
25964 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTGAAGA-TTTAAAAAATAAATATA-TTTGCCGAACA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-T-AAGAGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACA
** * ** * * * * * *
26026 AGTTCAAATAGCCATGTCCGTTTGAACTATAATCTATTTTAAATTATTATGACATTTTATTTTGT
62 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * ** ** *
26091 TGTAAAACAATTGTTTTA-TTCTTACAAAATTATTCAAAATAAAATAATATTAA
127 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
26144 -TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAACTAAATCT-TTTTACCAAACAAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAGT
* * * * * * * *
26204 TTAAATAGTTATGATTATTTCAATAATTATTTATCTCAAAT-AGTATGATC-TTTGTTTTGTCAT
65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
26267 AAAACATTTATTTCTA-TTCATGCAAGCTT-GTTCAAAGTAAAATAATACTAA
130 AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAA
** * * *
26318 ACTAATAATATTAT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTA-TTTGTCGAACCA
1 TTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAA
* * * * * * *
26380 GTT-ATAACAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAAT-GTTCTAACC-TTT-TTTTG
63 GTTCA-AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
*** * * *
26441 TCATAAAATTTTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATTTAAAATAAAATAATA-TAA
126 TCATAAAA-CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
26496 TTTTATTAACA-TTCAGAAATTTAATAAAG-AAGAAATTTTAAAACATAAATCTA-TTTATCAAA
1 -TTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAG--AGTTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA
* * *
26558 TAAGTTCAATTAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTGTTT
60 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTT
* * * *** * *
26623 TATCATGAAACAATTGTTTCAGTTCAATA-AAACTTATCCAAAATAAAATAATATTAC
124 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC-ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * ** * *
26680 TCTATTACTATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTAATTTCTCGAATC-AG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAA-CAAG
* * * *
26744 TTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTT
64 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
26808 ATAAAACAATTGTTTTTTCAATTCATCATACAAGTTTA-TTCAAAT-AAATAATACTAA
128 ATAAAACAATTG---TTTC-AGT--TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * *
26865 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAGGAGAATTAAAAAATAAATATAG-TTATCGGACTAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAACAAG
* * * * ** * * *
26928 TTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGGTTTGTCA
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
26993 TAAAACAATTATTT-ATGTTC--ACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAA
129 TAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * *
27042 TCTAATAATATTAT-GAAAATCAATAACTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAA
1 TTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAA-CAA
* * * ** ** **
27105 -TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAGTAATTATCTATTT-TGATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-C
63 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** * * * *
27167 ATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCT-AAAT-AAATAATATTAA
128 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAA
* * *
27219 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAAATAAATT-GTTTACCAAACCAA-T
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAA-CAAGT
* * * * * *
27279 TCAAGTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCAT
65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
27344 AAAACAATT-TTTCTA-TTGAT---ATCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAA
130 AAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
*
27391 TTTATTGATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAACGA-TTTAAAAAAT
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGTTTAAAAAAT
27434 GAATCTATTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
Found at i:19229 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 18919--19231 Score: 362
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 169
18909 TTATGGTCAC
* * * * *
18919 TTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTCAT
1 TTGAACAATTATCTATTGCAAATCATTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAAATTGTTTTCAT
* **
18984 CATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGA
66 CATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAACTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAGGA
* *
19049 GGTTTAAAAAATAATTTTGTTTATTGAACTAGTTTCTGT
131 GATTGAAAAAATAATTTTGTTTATTGAACTAGTTTCTGT
* * * *
19088 TTGAACAATTATCTATTGCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAA-TAATTGTTTT-AG
1 TTGAACAATTATCTATTGCAAATCATTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAAATTGTTTTCA-
* * *** * * * * *
19151 TTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAAT-ATTTTTTAAAAATTGATAACAAG
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129 GAGATT-GAAAAAATAA
19232 ACCTATTTGC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
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TTGAACAATTATCTATTGCAAATCATTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAAATTGTTTTCAT
CATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAACTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAGGA
GATTGAAAAAATAATTTTGTTTATTGAACTAGTTTCTGT
Found at i:25432 original size:545 final size:532
Alignment explanation
Indices: 14934--27433 Score: 5601
Period size: 540 Copynumber: 23.4 Consensus size: 532
14924 AATTAGTGAG
* * * * * * *
14934 AGATTTAAAAAATAAAACTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATC
1 AGATTTAAAAAAT-AAATTTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * * * * * * * * **
14999 TATTTCAATTTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTAGTTCTATTCGTACTATTTTAT
65 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTAT
** * ** * * *
15064 TCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAATACTTAATAACTAAGAAAA-TTAAAAAAT
129 TCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAAAT
* ** * * ** *
15128 AAATATAATTGT-CAAAACCT--TTCAAAT-AGTAAGACTACATGAATGATTATCTATTTCAAAT
193 AAATAT-GTT-TACCGAA-CTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * ** *
15189 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-ATCATACATGCTTATTCAAAACAA
255 CGTTATGACCTTTTGTTTT-ACATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * *
15253 AATAATA-TCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGT
318 AATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTAT
* ** ** * * * * * *
15316 TTACCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGTAGTTATCAATCTCAAATCATTAAGATC-
381 TTA-TGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
* * * *** * *
15380 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATA-GAGCTTATTT-GGTTAAAAATACTACTAA
445 TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAATCTTATTTCAAAT-AAAATAATACAAA
* *
15443 TTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
507 TTTATTAATATT-CAAACATTAATAA--A
* * ** * * * ** * *
15472 AGGAATTTAAAAAATAACTATGTTTGTCGAACCAGTTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTA
1 A-G-ATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * * * * * *
15537 TATAGTTT-AAATCGTTTTGACCTTTTGTCTAGTTAGAAAATATTTGTTTCGTATCTTACAATCT
63 TTTA-TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATACAAGCT
* * * * * * *
15601 TATTCGAAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAA
126 TATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAA
* ** * * * * * * * *
15666 AATAAATCTGTTTATTGAACAAATTCAAATAGTGATAACTATTT-AGACAATTATTTATTTAAAA
190 AATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAA
** * * * ***
15730 TTATTATAACCTTTTGTTTTGATATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAA
254 TCGTTATGACCTTTTGTTTT-ACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAA
* * ** * * *
15795 AATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAA-GCAAGAGTTTAAAAAAATAAAT-TAGT
318 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAAATTT-AAAAAATGAATCTA-T
* ** *
15858 TTATGGAACAAA-TTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACC
381 TTAT-GAA-AAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC
* * * *
15922 TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTA
444 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAATCTTATTTC-AAATAAAATAATACAA
* *
15986 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
506 ATTTATTAATATTC-AAACATTAATAAA
* * ** * * * * * *
16014 TGATTTAAAAAGTAAATCGGTTTACCAAATC-AGCTCAAATAATTAGGGCCATTTCAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
16078 CTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTTTTTTTATTATACAAGTTT
64 TTATTTCAAATTGTTA-TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATACAAGCTT
* * * * * * *
16142 ATTCAGAATAAAATAATAGTATTTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAA
127 ATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAA
* *** * * * * *
16203 TAAAT-TAATTTATTAAAC-AATTTAAATAATTTTGACTATTTGAAT-AGT-TGTATCTTCAAAT
192 TAAATAT-GTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAAT
* * * * * * **
16264 AGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
255 CGTTATGACCTTTTGTTTT-ACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAA
* ** * * * * * *
16329 ATAATACTAATATAAAAATATTCCCAAAATTAATAACT-GAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTT
319 ATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTT-AAAAAATGAATCTATT
* * * * * * ** * *
16393 TGCT-AAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATATGAACCGTTATTTATTTCAAATC------A--T
382 T-ATGAAA-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
** * * **
16449 TTT-TTTTGTCATAAAACAAAATTTTCAATTCACACTAA-CTTA-TTCAAAATAAAATAAAATGA
445 TTTGTTTTGTCATAAAAC--AATTTTTTATTCATAC-AATCTTATTTC-AAATAAAATAATACAA
* * * *
16511 ATTTATTCATACTAAAAAACTTAATATGTAA
506 ATTTATTAATATTCAAACA-TTAATA---AA
* * * * * * *
16542 GAGGTTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTAT
1 -AGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * *
16607 CTTATTT-AAATAGCTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTT
64 -TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCTT
* * * * * *
16671 GTTCGAAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAA
127 ATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAA
* * * * * ** * *
16732 TAAATATGTTCATC-AAATCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATT
192 TAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * ** * * *
16796 GTTATGA-CTTTT-TTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACATGCTTATTTG-ATTAAA
256 GTTATGACCTTTTGTTT-TA-CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAA
* * * * * * * * **
16858 CTAATACCATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT-AAAAAATTTTAAAAATAAATATGCTT
319 ATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTATTT
* ** * * * * * *
16922 ACCGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
383 A-TGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTT
* * * * * *
16987 TGTTTTGTCATGAAAA-AATCATTTCAGTTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAAG
447 TGTTTTGTCAT-AAAACAAT-TTTTTA-TTCATACAATCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAAT
* *
17050 TTATTAATATTCTACACCTTAATAATTA
508 TTATTAATATTC-AAACATTAATAA--A
* *** * * * *
17078 AGATATTTAAAAAATAAATCTATTTAATGAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTA
1 AG--ATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * * * *
17143 TCTATTTGAAATTGCTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCATACAAACT
63 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTT-TGTTCATACAAGCT
*** * *
17208 TATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA--TTAATACAATTAATAAGTAAAAGATCT-A
126 TATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAAATTTAA
* ** * ** * * *
17269 AAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTCAA
188 AAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
** * * * * *
17334 ATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGATT
253 ATCGTTATGACCTTTTGTTTT-ACATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT
* ** * * *
17398 AAAAT-ATATTAATTTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAGT-AAAAAATTTAAAAAATAAATAT
316 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGAATCT
* * * * * * * *
17460 GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGAATATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGA
379 ATTTAT-GAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTAAAATCATTATGA
* * * * * *
17524 CC-TTT-TTTT-TAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
442 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATACA
* *
17586 AATTTATTAATATTATAAAAATTAATGAGTAA
505 AATTTATTAATATT-CAAACATTAAT-A--AA
* * * * * * *
17618 GAGAATTAAAAAATTAATCTATTTA-CAGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAACAATGA
1 -AGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* *** * * ** * * *
17682 TCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATTGTAAAAAAATTGGTTTTGTTCATGCAAGTTT
63 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTT
*** * * *
17747 ATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAATAGTTAATAAGTAAAAAA-TTAAAAA
127 ATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAA
* ** * * * *
17810 ATAAATATGTTTTCTAAAC-ACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
191 ATAAATATGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * *
17874 TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATAT-AGAATA
255 CGTTATGACCTTTTGTTTT-ACATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATA
* *
17937 AAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGT-AAAATATTTAAAAAAT-ATATCTA
317 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGA-ATCTA
*** * * ** * * *
18000 TTTACTGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACCCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATC------A--
380 TTTA-TGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC
* * * *
18057 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
444 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATACAAA
**
18122 TTTATTAATATTCTAATA-ATTAATAGGTTGG
507 TTTATTAATATTC-AA-ACATTAATA----AA
* * * ** *
18153 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAATTATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
** * * * * **
18218 TATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACGATTGTTTCTTTTCATAAAAAATTAT
65 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTAT
** * * * * * *
18283 TTAGAATAACATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAGAATTA
129 TCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATA
* * * * * * * * ** * * *
18344 AATCTATTTATCAAACCAATTCAAATACTTATGGCTATTTGAGCAATTATCTATCTCAAGTTGTT
194 AATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * * * * *
18409 ATGATCTTTAT-TTTGTA-AT-AAACAACTGCTTCTGTTGATACAAACTTA-TTCAGAGTAAAAT
259 ATGACCTTT-TGTTT-TACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAAT
* * * * * * * * * * * *
18470 ATTGCTAAATTAATAATATT-C-TAAA--AA-AAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC
321 AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTATTTA-T
* * * * * * * * *
18530 GAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTTATCTTTTG
385 GAA-AAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
* ** * *
18594 TTTAGTCATAAAGTAATTGTTTTAGTTCATAC-ATGCTTA-TTCAAAATAAAATAACACTAATTT
449 TTTTGTCATAAAACAATT-TTTTA-TTCATACAAT-CTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTT
* *
18657 ATTAACATTCAAAAAATTAATAAACA
510 ATTAATATTC-AAACATTAAT-AA-A
* *** * * * *
18683 AGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAATTTCAAA-ATGTCATAACTATTTAAACAAT
1 AG--A-TTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAAT
* *** * * * *
18747 TATCTATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTCTTAGTTCATAAAAG
61 TATTTATTTCA-AATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGTTCATACAAG
* * * * ** * *
18811 CTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAACCAATAAGTTAAAGATTTAA
124 CTTATTC-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAA
* * * * * * * * *
18875 ACAATAAGTCA-GTTTATCAAATTGGTTTAAATAATTATG-GTCACTTGAATAATTATCTATTTC
188 AAAATAAAT-ATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTC
** ** * * * * * **
18938 AAATTATTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTCAA
251 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-ACATAAAAC-AA-TTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA
* * * ** **
19001 AATAAAACAATACTAACTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGGAGGTTTAAAAAAT-AAT
313 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGAAT
* * * * * ** *
19064 -T-TTGT-T----TA-TTGAACTAGTT-T--CTGTTTGAACAATTATCTATTGCAAATCATTATA
377 CTATT-TATGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG
* * * * * **
19118 ACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
441 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTA-TTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
19183 TAATTTAATATTTTTTAAAAATTGATAACAA
504 AAATTTATTAATATTCAAACATTAAT-A-AA
* * * * * * * * ** * *
19214 GGAGATTCGAAAAAATAAACCTATTTGCTAAAACAA-TTAAAACAATTAAAACTATATGAATAAT
1 --AGATT-TAAAAAATAAA-TTTTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * * * * *
19278 TATTTGTTTACTAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTTATCATTCCA
61 TATTTATTT-C-AAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATACAA
* * * * * * *
19342 GCTTATTCAGAATAAAATAATATTTATTTCTTAATCTTTTAAAAATTAACAAG----AGATTTAA
123 GCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAA
* * * * * * * *
19403 AAAATAAATTTGTTTGCTGAACTAGTTTAAAT-A-TATGACTATTTGAACAATT-GCAACTTCAA
188 AAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * ** * *
19465 ATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTT-AGAAT
253 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AAT
* * * * * * * * *
19529 AAAATAATGCTTATCTAATAATATTCCAAAAATCAATAACT-AAGAAA-TTAAAAAATAAATTTG
316 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTA
* ** * * * * * *
19592 TTTGCTGAACTAGTTTAAATATTTAAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
380 TTT-ATGAAAAAGTTCAAATAATT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC
* * * * * **
19657 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTTAAATAAAA-AAAATG
443 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTT--ATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATACA
*
19721 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
505 AATTTATTAATA-TTCAAACATTAAT-A--AA
* * * * *
19753 GAGATTT-AAAAATCAATTCTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTA
1 -AGATTTAAAAAATAAATT-T-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * * *
19817 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TG
63 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTCATACAAGCT-
* * * * * * * *
19881 TGTTCGAAATAAAGTAATATTAATATATTAATATCTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAA
126 TATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAA
* * * * * ** *
19942 ATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTA
191 ATAAATATGTTTA-C---C--G---AACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * *
20007 -TTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTGT-TATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-CTTAT
247 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-T-TACATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTAT
* ** *** * * ** *
20068 TCGAGTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTGATAAGT-AATTAATTTAAAAAGT
309 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAAT
* * * ** * * * * * * * *
20132 AAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATTATTATTTGGAATAATTATCTATTTCAAATCG
373 GAATCTATTTA-TGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTAAAATCA
* * * ** *
20197 TTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAA-AATTATTTCAATTCATGTAA-GTTATTTCAAAATAAAA
436 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAATCTTATTTC-AAAT-AAA
** * *
20260 ATAATATTAAGTTATTAATATT-ATGAAAATTAATAATTAA
497 ATAATACAAATTTATTAATATTCA--AACATTAAT-A--AA
* * **** * * * *
20300 GAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAACAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTTG-ATAATTA
1 -AGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTA
* ** * * ** *
20364 TCTA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTGTTCATACAAGTT
63 TTTATTTC-AAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCT
** * *
20427 TATTTTGAATAAAATAATACAAACTTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
126 TATTCGGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAAATTTAA
* * * * * ** *
20490 AAAATAAATCTATTTATCGAACCATTTCAAATCTTTATGACTATTTGAATAATTATCTTTTTCAA
188 AAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * *
20555 ATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTA-ATAAAATAATCGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT
253 ATCGTTATGACCTTTTG-TTT-TACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT
* * * * *
20619 AAAATAATATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAA-TTAAAAAAGGAATCT-
316 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAA-AAAATTTAAAAAATGAATCTA
* * * * * * ** *
20682 TGTTACCGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATATGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
380 T-TTA-TGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAC
* ** * * * *
20747 CTTTTGTTTTGTAATAAAACAAAAGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
443 CTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTTA-TTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATACAA
* *
20812 ACTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGAAA
506 ATTTATTAATATT-CAAACATTAAT---AAA
* * * * *
20843 GAGAATTAAAAAATGAATCTTGTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTAT
1 -AGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *** * * * ** *
20908 CTATTTTAAAACATTATGACATTTTGTTTTCTCATAAAAC-ATCTGGTTCTACTCATGCAAGCTT
64 TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-T-GTTTTGTTCATACAAGCTT
* ** * * *
20972 ATTTC-AAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATGAGT-AAAAATTT-AAAA
127 A-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAA
* *** * * * *
21034 ATAAATATATTTTTTGAAC-ACTTTCAAAT-AGT-TGACTATTTCAATAATTATATATTTCAAAT
191 ATAAATATGTTTACCGAACTA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * *
21096 CGTTATGACCTTTTGTTTGGT-CATAAACCAATCGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATA
255 CGTTATGACCTTTTGTTT--TACATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATA
* * * * *
21159 AAATAATACTAACTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT
317 AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTAT
* *** * * * * * *
21223 TTGTTGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATCT
381 TT-ATGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
* * * * *
21288 TCTGTTTTATTC-TAAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGT-TTATTTGAAATAAAATAATACT
445 TTTGTTTT-GTCAT-AAAACAATT-TTT-TATTCATACAA-TCTTATTTCAAATAAAATAATACA
* *
21351 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGG
505 AATTTATTAATATTC-AAACATTAATAA----A
* * * * * * *
21384 AGATTTAAAAAATAAATTCGTTTACCGAATAAGCTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATT-TTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTAT
* * * * * **
21448 CTATATCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTA
64 TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA
* * * * * *
21513 TTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAGTATTTCAAAAA-T--TAA-TAAAAGATTTAAAAACT
128 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * * * * * *
21574 TAATCTGTATATCAAACCAATTCAAATAATTATGATTTTTTTAAACAATTATATATCTCAAATCA
193 AAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * * ** * * * *
21639 TTATGA--TATTTGTTTTGTCATAAAGCAATTTTTTTTGTTCATACAAACTTATTTGGAGTAAAA
257 TTATGACCT-TTTGTTTT-ACATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * * * * * *
21702 TATTGA-TAAATTAATAATATTCTAAAAA-T--TAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTG
320 TAAT-ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTATTTA
** * * * * * * ** *
21762 CCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTT
384 TGAAA--AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTT
* * * * *
21826 TG-CTTGTCATAAAATAGTATTTTCAGTTCATAC-ATGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAAT
447 TGTTTTGTCATAAAACAAT-TTTTTA-TTCATACAAT-CTTATTTC-AAATAAAATAATACAAAT
** * *
21888 TTATTAGCATTTAGAAAATTAATAAACAA
508 TTATTAATATTCA-AACATTAAT--A-AA
* * ** *
21917 CAAATTTTAAAAATTAAATTTGTTTTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
1 -AGA-TTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *** * * * ** * *
21982 TCTATTTAAAATAAATATGACCTGTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCTTAAAAGCTT
63 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTT
* * * * * * * ** * * * *
22047 A-TCTAGAATAAAATAAGATTACTTTATTTATACTTCAAATTTTGATATA-TTAGAGATTTAAAA
127 ATTC-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA-AGTAAAAAATTTAAAA
* * * * * * *
22110 AAT--ACA----T--CAAATTGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
190 AATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * * *
22167 CGTTACAAGCTTTTGTTTTTCATAAAACAATTTTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAATAA
255 CGTTATGACCTTTTGTTTTACATAAAACAA--TTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * * * * * *
22230 AATAATATTAATTTATTAAAATT-TAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT
318 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTATTT
** * * ** ** * *
22294 ACTG---AA--TC-----GGT-T-CCTATTTGGACAATTATCTATTTTCAATTGTTATAACCTGT
383 A-TGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTT
* * ** ** * * * ** *
22347 TGTTCTATTGTAAAATTATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT
447 TGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTT
* * *
22412 AATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAG
510 ATTAATATT-C--AAAC-ATTAA-TAAA
* * ** * * * * * *
22440 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATCATC
1 AGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * * * * * *
22505 TCTTTGAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAGAAGCTTA
65 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA
* * *** * *
22570 TTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGTTATTTAACAAGT
128 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * **
22634 GAATCTATTTATC-AAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTA
193 AAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * ** ** *
22698 TTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTGTT-TGAACAT-TCAATTTTATTCGAAATAAA
257 TTATGACCTTTTGTTTT-ACATAAAACAATTGT-TTCAGTTCATAT-AAGCTTATTTGAAATAAA
* * * * * * * *
22761 ATAATACTAATTCATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA
319 ATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTATTTA
** *** * * ** * * ** * *
22826 CTGATCCAA-TTCAAATAGCAATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAATCTTT
384 -TGA-AAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTT
* * ** * * *
22890 TG-TTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGATAAA-T
447 TGTTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAAT-ACAAATT
* *
22953 TAATAATATTCTAAAAATTAATAAA
509 TATTAATATTC-AAACATTAATAAA
* * * * *
22978 AGATTTTAAAAAT-AATTGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATT-T-TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* *
23041 TTTATTTCAAA-----AT-A------GTATT-T--T----C-A-------GTTCATACATGCTTA
63 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTA
** ** ** *
23079 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCA-TTTAGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAA
128 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAA
* *** *
23143 ATAAATTTGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAGTTCAAATAGTTTGAA
191 ATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATA---AT---TA--TG----A---C---TA-TTTGAA
* * *** * * *
23208 CAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTTTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAA
237 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA-CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAT
* * * ** * * * *
23273 AAGCTTATCT-AGAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTT-CAAATTTTGAT-ATATTAGAGA
301 AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATAATA-AAAAAA
* * * * *
23335 TTTAAAAAAT-ACATCGA-AT-TG-----GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTAT
363 TTTAAAAAATGA-ATCTATTTATGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** ** * * * * *
23392 TTCAAATTGTTACAAGCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTT-TCATCATACAAGCCTATCT
427 TTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTAT--TCATACAATCTTATTT
* ** * * *
23456 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTAAAAATTAATAAGAA
489 CAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAAACATTAAT-A-AA
** * *
23503 GGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C--TGAA--TC----AG-T-T-CCTATTTGGACAATTA
1 --AGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * ** ** *
23556 TCTATTTTC-AATTGTTATAACCTGTTGTTCTATTGTAAAATTATTGTTTTAGTTCATATAAGCT
63 TTTA-TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATACAAGCT
* * ** * * * *
23620 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
126 TATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAA
* * * * * * * * * * *
23685 ATAAATCTATTTGCCAAAGTAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTCTTTGAAATC
191 ATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * *
23750 GTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAGAAGCTTA-TTCAAATAAAA
256 GTTATGACCTTTTGTTTTA-CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAA
* *** * *
23814 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGTTATTTAACAAGTGAATCTATTTA
320 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-TAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTATTTA
* * * * * * *
23878 TTAAATCAGTTCAAATAATTAT-AGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTATTATTACCTTT
384 TGAAA-AAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTT
* * * * ** *
23942 TGTTTTGTCATATAACAATTGTGTTTGA-ACATTCAATTTTATTAGAAATAAAATAATACTAATT
447 TGTTTTGTCATAAAACAATT-T-TTT-ATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATT
* * *
24006 TATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG
509 TATTAAT-ATTCAAACATTAATAAA
** * * ** * * *
24031 AGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACTGATCCAGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAACAATTGTA
1 AGATTTAAAAAATAAA-TTTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * * * * *
24096 AACTTCAAATTGTTAT-AATCTTTG-TTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTTATACAAGCTTAT
65 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
24159 TTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCT-AAAATTAATAACTAAGAGAA-TTAAAAAA
129 TCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAGTAA-AAAATTTAAAAAA
* * * * * * *
24222 TAAGTTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCG
192 TAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* * * * *
24287 TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAAGTTTTTTTTTTAATTCATA-ATAGCTTATTTGGAAT
257 TTATGACCTTTTGTTTTA-CATAAAACAA----TTGTTTCAGTTCATATA-AGCTTATTTGAAAT
* * * *
24351 AAAATGAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-ATGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATT
316 AAAAT-AATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAT-AAAAAAATTTAAAAAATGAA-T
** * * *
24412 CTATTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTACGATTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTAT
377 CTATTTA--TGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
* * * *
24476 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGT-TT-GTTCGAAATAAAGTAA
440 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTATTCATACAA-TCTTATTTC-AAATAAAATAA
* * * *
24539 TACTAATCTATTAATATTTCAAATATTAATAAG
501 TACAAATTTATTAATA-TTCAAACATTAATAAA
* * ** * *
24572 AGATTTTAAAAATAAATTTATTTATCAAATTAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * * *
24637 TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAA-----TTGTTCATATATGCTTATT
65 TATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATT
* * * * ** ** *
24697 CGGATTAAAGTAATATTAATTTATTAATATTTCAGCACCTAATAAGT--AAAATTTAAAAAACAA
130 CGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAA
* * * * * *
24760 ATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAATCATGATTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
195 ATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* *
24825 TGACCTTTTGTTTTATCATAAAAGAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
260 TGACCTTTTGTTTTA-CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
* * *
24890 GCTAATTTATTAGTAATCCAAAAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAATATGAATCTATTTACTGA
324 ACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAAAAAATTTAAAAA-ATGAATCTATTTA-TGA
* * * * ** *
24955 AAAAGTT-AAATAATTATTACTGTTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTT
387 AAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* *
25019 TGTCATAAAAGAATTTTATCTATTCATACAATCTTATTTCAAATAATATAA-ATCAAATTTATTA
452 TGTCATAAAACAATTTT-T-TATTCATACAATCTTATTTCAAATAAAATAATA-CAAATTTATTA
25083 ATATT-AAGACAGTTAAAAATGTAAA
514 ATATTCAA-ACA-TT---AA--TAAA
* *
25108 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATTGTTATGACTATTT-ATGCAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATTT-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTAT
* * *
25172 TTATTTCAACTTGTTATGCCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGTTTA
64 TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTA
* * * * *
25237 TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAA
128 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAAA-TTTAAAAAA
* * * * *
25302 TAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTCA
192 TAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
* *
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* * * * * *
25431 TATTATTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGACTAAAAGAA-CTAAAAAAAGAATCTATTTA
320 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-AATAAAAAAATTTAAAAAATGAATCTATTTA
* * * *
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** * * * * ** **
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* * * * *
25646 AGA---AAAAAAT--GTTTTTT---GAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
1 AGATTTAAAAAATAAATTTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTT
* * * ** * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * * **
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* * ** * * * **
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* *** * ** * * * * * *
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** * ** **
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* *
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* * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
* * * * * * * *
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* ** * * * *
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* * ** * * * * *
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* * *** * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * ***
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* * * *
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* ** * *
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* * * *
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* * * * * *
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183 TTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * *
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* * * *** * * *
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* * * * * * * * * ** ** **
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373 GAATCTATTT-ATGAA-AAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA
* * *
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** * * *
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* * * * *
27246 AGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACCAA-TTCAAGTAGTTATAACAATTTGAATAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATTTTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT
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* * * * ** **
27371 TTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTGATATTCAAAAAATTAATAAGT-AACGATTTAAAAAAT
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Statistics
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23581 TGTTCTATTG
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *** *
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* * * * * *
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* * * * ** **
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* ** * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * ** * * * ** * *
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* * * * * * ** * *
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* * *
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*** * * * * * * *
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* * * * * * * *
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64 TTCAGAAATTTAATAAA-G-AAGAA-ATTTTAAAACATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAAT
* * * * * ** *
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126 AGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAA
* * * * * * * * * * * *
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* ** * * * *
25276 ATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAAATAAA-T-ATGTT-TACCAAACAAGTTCAAATAATCAT-G
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* * * * * ** *
25337 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTCGTTTGTAATAAAACAATTG---
315 -CCATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTT
* * * * *
25399 TTTCAGTTCAT-AT--AAGTTTATTTGAAGTAAAATATTATTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
379 TTTCA-TTCATCATACAAG-TTA-TTCAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATT
** ** * * * * * * * * *
25461 AATGACTAAAAGAACTAAAAAA-AGAATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATCT
439 AAT-AAGAGGAGAATTAAAAAATA-AATATAGTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *** * * *
25525 GAACAATTATCTATTTTAAAATA-TTATGACCTTTCATTTTGCCACAAAACAATTGGTTT-TATT
502 CAATAATTATATA-TCTCAAATAGTTATAATCTTTTGGTTTGTCATAAAACAATT-ATTTATATT
** * * * * *
25588 CATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCTAGAAAT---TAA-T-A-
565 CA--CAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAAA-CTAATAATATTATAAAAATCAATAACTAAG
* * * * * * *
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626 AGATTTAAAAATAAATGTATTTGTCGAACCA-ATTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATC
* *** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ***
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* * * *
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* * * * *
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*
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* * * ** *
26166 T-A-A-GAGATTTAAAAACTAAATCTTTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGATTATTTCAAT
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* * * * *
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*
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*
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* * **
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27155 CTTTTGTTT-TGCA
709 CTTTT-TTTGT-CA
*** * * * ** *
27168 TAAAACAAATATTTTT--GTTCATATAAGTTTGTTCT-AAAT-AAATAATATTAA-TTTATTAAT
1 TAAAA-TTTTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATT-TAAAATAAAATAATA-TAATTTTATTAAC
* * * * * * *
27228 ATTTTA-AAAATTAAT-AAG-AG--A-TTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACCAA-TTCAAGT
63 A-TTCAGAAATTTAATAAAGAAGAAATTTTAAAACATAAATCTATTTATCAAA-TAAGTTCAAAT
* * * * * * *
27285 AGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACA
126 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA
27350 ATT-TTTCTATT
191 ATTGTTTCTATT
27361 GATATCTTAT
Statistics
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Consensus pattern (720 bp):
TAAAATTTTTTTTTTCAGTTCATACAAGCTAATTTAAAATAAAATAATATAATTTTATTAACATT
CAGAAATTTAATAAAGAAGAAATTTTAAAACATAAATCTATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA
TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
TTCTATTCATAAAACTTAATCCAAAATAAAATAATATTAATCTATTAATATTCTAAAAATTAAGA
AGTTGAAGATTTAAAAAATAAATTAATTTCTCGAATCAGTTCAAATAACCATAGCCATTTGAACA
ATAATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTTCATTCATCA
TACAAGTTATTCAAATAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGAGGAGAATTAA
AAAATAAATATAGTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAATAATTATATATCTCAA
ATAGTTATAATCTTTTGGTTTGTCATAAAACAATTATTTATATTCACAAGCTTATTCAAATAAAA
TAATACTAAACTAATAATATTATAAAAATCAATAACTAAGAGATTTAAAAATAAATGTATTTGTC
GAACCAATTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAAATGTTCTAACCTTTTTT
TGTCA
Found at i:28132 original size:360 final size:360
Alignment explanation
Indices: 27464--28113 Score: 835
Period size: 360 Copynumber: 1.8 Consensus size: 360
27454 ACAAATAGTT
*
27464 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATAGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATAGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATT
* * *
27529 TTATTATAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTATTCTATGAAAAAACAAAAGGTTATAACAA
66 TTATTATAAATAAACTTATATGAATAGAAATAATTATTCTATGAAAAAACAAAAAGTTATAACAA
* * * * * * **
27594 ATTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTAAACTGGTTCGATAAGTAATATTATTT
131 ATTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAATATTATTT
* * * * *
27659 TTTAAATCTCTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTATTTTATTACGAGTAAACTTGG
196 TTTAAATCTCTATAAATTCTTGAAATATTAATAAATTAAGTATATTTTATTACAAATAAACTTGG
**
27724 ATGAGCTGAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAATAAATAATT
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326 ATTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTGTTTCAAG
** * * *
27824 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATTTTTAGAATGTTATTA-ATGTAGTATTAT
1 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATAGTCAAAATATTATTAGAT-TAGTATTAT
* * * * * * *
27888 TTTATTTTGAATAAATTTATATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAGAATAAAAAGTTATAACA
65 TTTATTATAAATAAACTTATATGAATAGAAATAATTATTCTATGAAAAAACAAAAAGTTATAACA
* * *
27953 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTC-AGTAAACAGAT-TTA
130 AATTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTCGA-TAAACA-ATATTA
* * *
28016 TTTTTTGAATCTCGTACT-AATTCTTGAAATATTAATAAATT-AGTATGTTTTATTTCAAATAAA
193 TTTTTTAAATCTC-TA-TAAATTCTTGAAATATTAATAAATTAAGTATATTTTATTACAAATAAA
** * *
28079 CTTGTG-TGTTCAAAAATTATTGTTTTATGACAAAA
256 CTTG-GATGAGCAAAAATAATTGTTTTATAACAAAA
28114 TGAAAAGTAC
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATAAATAGTCAAAATATTATTAGATTAGTATTATT
TTATTATAAATAAACTTATATGAATAGAAATAATTATTCTATGAAAAAACAAAAAGTTATAACAA
ATTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGATTCGATAAACAATATTATTT
TTTAAATCTCTATAAATTCTTGAAATATTAATAAATTAAGTATATTTTATTACAAATAAACTTGG
ATGAGCAAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAATAAATAATT
ATTCATATAGTTTTAACTATTTGAACTGTTTCAAG
Found at i:28554 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 28129--33037 Score: 3952
Period size: 181 Copynumber: 27.4 Consensus size: 181
28119 AGTACTAACA
* *** * ** *
28129 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGCATGTTGAGAAACAATTTTTTTATGACAAAATGAAAGGTAATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
28194 TGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATA-TCCATAATTATTTAAAC-TGATTCAGTAAAC-TGAT
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAT-AT
* * * *
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128 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
28306 ATTTTATTTTAGATAAACTTTTGTGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAGTTCATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
28369 TGATTTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAGCTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT
66 TGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT
* *
28434 ATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATT
130 ATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * *
28487 ATTTTCTTTCAAAT-AGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACTAAACAAAA-GTCAAAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * * *
28550 TGATTTGAAATCGAAAATTATTCTAATAATCTTAACTATTTGTA-TTGATTCGGCAAACACATTT
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATATTT
* ** *
28614 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAAATATTATTAAATTAGT-TCT
130 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT-T
** * * * * * *
28666 ATTTT-TACCCGAATTAGCTTATATGATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATA
1 ATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * * *
28729 ACGATTTGAGATTTATATTTGTTCAAATAGTCATAACTACTAGAA-TTGCTTCAG-AAA-ATAGC
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATA--
* * * * *
28791 TTTAGTTTTTAAAT-TTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTCGTATT
127 TTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * *
28846 ATTTTATTTC-GATAAGTTTTTATTAACTA-AAACAATTATTTTCTGACAAAATAAAAGGTTAAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * *
28909 ACAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATATCTAATTAAAATTGTTCAGTAAACATA-TT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT
* * * *
28973 -TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
29024 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAG-AATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * *
29088 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTC-G-ACAAGCATAT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTA-AA-CATAT
* * *
29151 TTATTTTTTAAAT-TTCTTACTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAAATTAGTATC
128 TTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
29205 ATTTTA-ATCAAATAAGCTTATGTGAAAAGAAACAATTGTTGTATGACAAAA-TAAAGATCATTA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** * * * *
29268 CGATTTGCGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAATAAATTTA
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA
* ** * * *
29333 GTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATACTAATAAATCAATATT
131 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
** ** * *
29380 ATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGTACATAAACAATTGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** *
29444 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GAACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATT
** * *** * *
29508 TATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTGCAAAATCTTAATAAAATAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
29561 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCACGA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TA
* * * * * * ** *
29626 CT-ATTTGAAATAAAAAATTGCTCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTTACTCAGTAAACAGATTT
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT
29690 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * **
29742 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGGATAGAAACAATTGGTTTACCACAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
29807 CT-ATTTGAAATAGATGATTGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAA-TGTGTTC-G-AAA-AAAAT
66 -TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACATATT
* * *
29867 TAATTTTTAAAT-TTTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATT--TAATT
129 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * * *
29918 ATTTTA-TTCGGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
1 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * *
29982 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTC
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT
* * ** *
30047 ATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATGA-T
130 A-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATT
* * * ** * *
30100 ATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * *
30165 CGATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTCTTTAAACTTGTT-GGTAAATTATATT
66 TGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAA-CATATT
* * * *
30229 TA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAACTTTTAAAATATTAATAAA-TAATATT
129 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
30280 ATTTTAATCCAAATAGGCTTGTAATGAAGAAAAACAATTGTGTCATGACAAATA-AAAA-GTCTT
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGT-ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTCAT
* *
30343 AATGATTTGAAATA-ACTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGATAAACA-A
64 AATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATA
* *
30405 ATT-TTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATGTGTCT-AAATATTTAATAAATT--TATGT
127 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-T-TTTGAAATA-TTAATAAATTAGTAT-T
* * * * * * * *
30459 AATTTTATTTGAAATAAGCTTTTATGAATAG-AA-TATTTTGTTTATGACAAAAGAAAAGTTTTA
1 -ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAG-GTCA
** * * * * * *
30522 TAGCGATTTAAAATAGATAATT-TTCAAATAGTCATAATTATTTGTACTTGTTCAATAAATAGAT
63 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATAT
* * * * * * *
30586 TCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTGA-TTTTCAGAATACTAATAAAATAGAATT
128 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
30640 ATGTTA-TTCAAATAAGCTTATACGAATAGAAACAATTATTTTGTGATAAAACAAAAGGTCATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ** * ***
30704 TAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATTACTATTTGCCCTAG-TCAGGCCA-ATAGTTT
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATA-TTT
* * * ** *
30767 CATTCTTT-AATTTTGTTACTTATTAGTTTTCAAAATATTAATAAATTAGCATT
130 -ATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
30820 ACTTTATTCCAAATTACA-C-TATATGAACA-TAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCGT
1 ATTTTATTTCAAA-TA-AGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
30882 AATGATTTGAAATAAATGATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAACAAATT
64 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATT
* ** *
30947 TA-TTTTTAAAT-TTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATTATT
129 TATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
30999 ATTTTATTCTGAACA-AA-CTTATATGAACAAAAACATTTCTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAT
1 ATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * *
31062 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAA-TCATTTGAACTAGTT-AGGCAAACATA
64 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCA-GTAAACATA
* * * * * *
31125 ATTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTT
127 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * *
31180 ATTTTA-TTCTGAATATGCTACTAAGAACTA-AAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTAT
1 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * ** * * * *
31243 AATGATTTGAAATA-AAAAATGTTCATATACCCTTAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACAAATT
64 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATT
* * * * **
31307 TATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTGCATTAGTATT
129 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * * *
31360 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTGTGAACAGAAATAATTGTTTTATGAGATAACAAAAGGTTATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * *
31425 CAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTAA
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA
* * *
31490 CTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGA-AAATTAATATT
131 TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA-ATAAATTAGTATT
* * * ** * * * *
31541 ATTTTATTTCGAAGAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGTTCATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
31606 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAAT-TTGA-TAAAC-TGAT
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT--TGTTCAGTAAACAT-AT
* * * * * *
31668 TTATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAATTATTGAAATATTAATAAAGTAATATT
128 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * * * **
31722 ATTTAATTTTGAATAAACTTTTAT-ATACTGAAATAGTTGTTTTATGATAAAATAAAATATCATA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * *
31786 AAAATTTTAAATAGATAATTGTTCGAACAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGT-AA-ATA---
65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTT
* *
31846 ATTTTTTAAAAT-TTCTTACTTATTAATTTTTTAAATTTTAATAAATTAGTATT
130 ATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
31899 ATTATT-TTTCGAATAAG-TATGTATGAACTA-AAACAATTATTTTTTTACTAAACAAAAGATCA
1 ATT-TTATTTCAAATAAGCT-TGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* ** * * * * * * ** * *
31961 AAACAATTAGGAATAGATAATCGTTCTAATAGTCTTAACTATTT-AAATTGCTTCAAAAAATACA
63 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACATA
** * *
32025 TTTATTTTTT-AATC-----CTTATTAATTTTCAAAATAGTAATAAATTGGTATT
127 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
** * * *
32074 ATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATA
1 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* ** * * * ** *
32138 ACGATTTGAAATTA-ATAACAGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATT
65 ATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATT
* * * * *
32202 TATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAAAATAATAATAAATTAGTGTT
129 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * **
32255 ATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAACTATTTTATAACAAAATAAAAAATCATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * *
32320 TGATTTGAAATAAATAACTATTCCAATAGTCATAACTATTTGAATTTGCTC-GATAAACAGATTT
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATATTT
* * *
32384 GTTATTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATT
130 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * **
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* * *
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66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA
* *
32566 TTTTTTAAAT-TTTT-CTTATTAA-TTTTGGAATTTTAATAAATTTA-TATT
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* * * *
32614 ATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTATTTTATGATAAAACAAATGGTCAT
1 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * ** * *
32677 AATGTTTTAAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTTGGCAAACAGATT
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* * * * * * * *
32742 CATTTTTTTAATTCTCTCACTCATTAATTTTT-AGTATGTTAATAAATTAGAATT
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* * * *
32796 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATTAACTGAAACAATTGTTTTAT-ACAAAACAAAAGGTCACAA
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* * * * *
32860 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATA--TA
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATTTA
* * * ** *
32923 TTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAATTAATATT
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* * * *
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65 A
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-TAA-ACATAT
* * * **
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* * * * * * * *
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** * * * ** * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * * *
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66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATATT
* * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * *
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* * ** * * * *
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1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** * * * *
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66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGT-AA-ACATATA
* * * * * * *
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** * * * *
29394 AATTTTGTATGTACATAAACAATTGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
194 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
* *
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* * ** * * *
29521 TCCTACCTATTAATTTGCAAAATCTTAATAAAATAGTATT
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* * * *
29561 ATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCACG
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-T
* * * * * * ** *
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* * *
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* * * * ** *
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191 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAA
* * * * * *
29817 TAGATGATTGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAA--TGTGTTCG-AAA-AAAATTA-ATTTTTAA
255 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT-TTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAA
* * *
29877 AT-TTTTACTTATTAAATTTTGGAATATTAATAAATT--TAATT
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* * *
29918 ATTTTA-TTCGGAATAAGCTTATATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
1 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** *
29981 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATT
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* * *
30046 CATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATGA-TATTTTATT-T
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* * * *** * * * *
30109 CGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTTGA
190 -AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGA-TTTGA
* * * * * * * *
30174 AATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTCTTTAAACTTG-TTGGTAAATTATATTTA--TTTTA
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* * * *
30236 AAATCTTTTACTTATTAACTTTTAAAATATTAATAAA-TAATATT
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* * * * *** * * *
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1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTAT-ATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTCAT
* * *
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64 AATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACATA
* * *
30406 TTTTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATGTGTCT-AAATATTTAATAAATT--TATGTAATTTTAT
127 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-T-TTTAAAATA-TTAATAAATTAGTAT-T-ATTTTAT
* * * * * * * **
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* * * *** * * *
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* * * * *
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* * * * *
30640 ATGTTA-TTCAAATAAGCTTATACGAA-TAGAAACAATTATTTTGTGATAAAACAAAAGGTCATA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** * ** * *
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65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACA-TAT
* * * * * * * * *
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128 -ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA
* * * * ** *
30832 ATTACA-C-TATATGAAC-ATAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCGTAATGATTTGAAA
192 A-TA-AGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
* * * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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1 ATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * *
31062 AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAA-TCATTTGAACTAGTT-AGGCAAACATA
64 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAT-
* * * * *
31125 ATTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCT
126 A-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * ** * * * *
31190 GAATATGCTACTAAGAACTAAAAA-AATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAA
190 AAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA
* * * ** * * * **
31254 ATA-AAAAATGTTCATATACCCTTAACTATTTAAACTAGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAA
254 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAA
* * * * **
31317 ATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTGCATTAGTATT
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** * * * * * * * *
31360 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTGTGAACAGAAATAATTGTTTTATGAGATAACAAAAGGTTATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * *
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66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATA-T-A
* * * *
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* * ** * *
31553 AGAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTACGATAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAAT
192 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAAT
* * * ** * **
31617 AGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTTGATAAACTGATTTA-TTTTTTAAAT
256 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAAT
* * * * *
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* ** * * * * * * **
31722 ATTTAATTTTGAATAAACTTTTAT-ATACTGAAATAGTTGTTTTATGATAAAATAAAATATCATA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * *
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65 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATAT
* * * * *
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* * * * * * ** * *
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* * * * * ** *
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* * * *
32036 A--TC---CTTATTAATTTTCAAAATAGTAATAAATTGGTATT
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** * * *
32074 ATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCAT
1 ATTTTATTTC-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* ** * * * **
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* * * * *
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126 ATATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
* * * * * * * * *
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191 AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * * * *
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256 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAAT
*
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* * * * **
32436 ATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAATTGTCATAA
1 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * *
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66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATA--TA
* ** *
32566 TTTTTTAAAT-T-TTTCTTATTAA-TTTTGGAATTTTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCTAAA
129 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTAAA
* * * * ** * *
32627 TAAGCTTGCATGAACAAAACCAATTATTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGTTTTAAAATAG
193 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
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258 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCT
* * * * *
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* *
32796 ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATTAACTGAAACAATTGTTTTAT-ACAAAACAAAAGGTCACAA
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* * * * *
32860 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGATTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATATT
66 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACATATATT
* * * * * * *
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*
32990 GCTTGTATGAACAAAAACAATT-TTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA
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33038 CAATTTTGTT
Statistics
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Consensus pattern (361 bp):
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GCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATA
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Found at i:33389 original size:181 final size:180
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* * * ** *
33117 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTT--GTTCAT-CTAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTT
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* *
33179 ATTAATATTTCAATAATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC
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* * * * * * *
33233 AAACTAGTTTAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGT
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* *
33298 TTTGTCATAAAACATTTTTTTCAATTCATACTTGCTTATTTGAAATAAAATAAAATAAATTTATT
66 TTTGTCATAAAACATTTTTTTCAGTTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAAAAT-AATTTATT
* *
33363 AATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCAT-TTAT--C
130 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTT-TGCC
* * * *
33413 TAACTAGTTCTAATAATTATGACCATTT---TAA--A---A--TC--A---TAATGACCTTATTG
1 AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTG
* * * * * * * * * *
33463 -TTTATAATAAAATAATTATTTCAGTACATA-AAGCTTA--TCAAATAAAATAATATTACTTTAT
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* * ** *
33524 TAAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAAT-TTAT-CG
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* * * * * *
33578 AATC-AGTTCAAATAATTGTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGT
1 AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* ** * * * *
33642 TTTGTCATAAAACAATTACTTTTCA--TCATTTTAAGCCTATTTGGAATAAAGTAATACTAATTT
66 TTTGTCATAAAAC-ATT-TTTTTCAGTTCATACT-AGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATAATTT
* * * * *
33705 ATTAGTATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAG-T
127 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-GCC
* * * * * * **
33759 GAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATAATTTTTTGT
1 AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * *
33824 TTTATCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAA
66 TTTGTCATAAAACATTTTTTTCA-GTTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATAATTTAT
* * *
33888 TAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAA-AAATTTGTTTGCC
129 TAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC
* * * * * * * * * *
33938 AAACCAATTCAAGTAGTAAAGGCTATATGAATGACTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
1 AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
*
34003 TTTGCCATAAAACA
66 TTTGTCATAAAACA
34017 AATGTTTTGG
Statistics
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AAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
TTTGTCATAAAACATTTTTTTCAGTTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAAAATAATTTATTA
ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC
Found at i:33744 original size:182 final size:181
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33492 AAAGCTTATC
* * * *
33502 AAATAAAATAATATTACTTTATTAAATATTTCAAAAATTGA-GAAGTTGGAGATTTAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAATG-AGTAGGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * **
33566 ATCAATTTA-TCGAA-TCAGTTCAAATAATTGTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGT
64 ATCAATTTAGT-GAACT-AGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCAT
* **
33629 TATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTACTTT-TCATCATTTTAAGCCTATTTG
127 TAT-AATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA-TTTATCATCA-TACAAGCCTATTTG
* * *
33685 GAATAAAGTAATACTAATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT
** *
33750 CTGTTTAGTGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATA
66 CAATTTAGTGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATA
* * ** *
33815 ATTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTTG
131 ATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATCATCATACAAGCCTATTTG
* * * * * *
33866 AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAA
33926 AATTTGTTTG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAT
CAATTTAGTGAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATA
ATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTATCATCATACAAGCCTATTTG
Found at i:34738 original size:178 final size:178
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34394 TGCCCAACTA
* * ** * * **
34404 GTTCAAATAGTTAAGACT-CTAAGAACGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGT
1 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAA-AATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGT
* ** * *
34468 CGTAAAACAATTGTTCT-GTTTGTACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTTAAAATA
65 C--AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAATTAATACTAATTTTAAAATA
*
34531 TTTTAAAAATTATTAAGTACAAGATTTAAAAATAAACTTGTTTATCGAATTT
127 TTTTAAAAATTATTAAGTACAAGATTTAAAAATAAACTTGTTTATCGAAATT
34583 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC
1 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC
* *
34648 AAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATAGTAATTTTAAAATATTTT
66 AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTTAAAATATTTT
34713 AAAAATTATTAAGTACAAGATTTAAAAATAAACTTGTTTATCGAAATT
131 AAAAATTATTAAGTACAAGATTTAAAAATAAACTTGTTTATCGAAATT
34761 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC
1 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC
* * *
34826 AAAACTATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAA-TTTACTAACATTT
66 AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTTA-AAATATTT
** * * * ** *
34890 GGAAAATTAATAAG-A-AAGTGATTAAAAAAATAAA-TCTATTTGCCG-AATAA
130 TAAAAATTATTAAGTACAA--GATT-TAAAAATAAACT-TGTTTATCGAAAT-T
** ** * ** * * * *
34940 GTTCAAATAATTATTATTATTTTAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATT-TGT
1 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTT-ATTGAGT
* * * * ** * *
35004 CATAAAAAAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATAGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA
65 C--AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTTA-AAATA
*** * ** *
35068 TTTCCTAAATTAATAAG--CAAGAAATTTAAAAAATAAAACCAGTTTACCG-AATT
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* ** * * * ** * * * * **
35121 AGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 -GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGT
* * *
35186 CATAAAACAATTGTTTTTTA-TT-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA--TTAATTA
65 C--AAAACAATTG--TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTTAA--A
* * * * *
35247 ATATTTCAAAAATTAATAAGTA-ACAGATTTAAACAATAAA-TCTATTTATCGAACTG
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* * * ** * * * * * ** **
35303 GTTTAAATAGTTATGA-TATTTGAACAATTGTCAATCTCATATCA-TTAAACC-TTTATTTTGTC
1 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC
* * * * * *
35365 ATAAAACAGTTGTTTCTA-ATCATAGAAGTTTATTTGGTTAA-AAA-TAAGACTAA-TTTAATAA
66 --AAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAG--AATAAATTAATACTAATTTTAA-AA
* * * * **
35426 TATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAA-TGTGTTT-GCCAAACCA
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* * * * * * *
35481 GTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTTAGTC
1 GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC
* * * * * *
35546 ATGAAATATTTGTTTTA-TATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTA
66 A--AAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTTA
35603 TTGGCATTCA
Statistics
Matches: 836, Mismatches: 138, Indels: 90
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
GTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC
AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTTAAAATATTTT
AAAAATTATTAAGTACAAGATTTAAAAATAAACTTGTTTATCGAAATT
Found at i:38118 original size:538 final size:538
Alignment explanation
Indices: 34148--55425 Score: 12788
Period size: 538 Copynumber: 39.4 Consensus size: 538
34138 ATTTGTTTGA
** * * * * *
34148 AATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATTT---AAGTAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
** * * * * * *
34210 TACTTGCCAAACT-ATTTCAAATAGTT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATA
65 TGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * ** *
34273 ACATTTTATTTTGTCA-ACAAACAATTGGTTCTATTTATACTATTTTA-TTCGAAATAAAATAAT
129 ACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAAT
* * * ** * * ** * **
34336 ACTGATTTAATAATATTTC-AAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCCCA
192 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAA
* * * ** * * * *
34400 ACTAGTTCAAATAGTTAAGACTCTAAGAACGATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTCTT
256 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACATTTTGTT
* * * ** *
34464 TTGTCGTAAAACAATTGTTCTGTTTGTACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTT-TAAA
320 TTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATA-TAATTTAT-TA
* * **
34528 ATATTTTAAAAATTATTAAGTACA-AGA-TTTAAAAATAAA-CTTGTTTAT-CGAATTTGTTCAA
382 ATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTTAAAAATAAATC-TGTTT-TCCGAA-CAGTTCAA
* * ** * * * **
34589 ATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTGAGTC--AAAA
443 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *
34652 CAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAG
508 CAATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTTATTTCG
* * * * * * *
34683 AATAAATTAATAGTAATTT-TAAAATATTTTAAAAATTATTAAGTACAAGATTT-AAAAATAAAC
1 AATAAAATAATACTAATTTAT-TAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** * * *
34746 TTGTTTATCGAA-ATTGTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTTT
64 TTGTTTACCGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* ** * *
34810 GACCTTTTATTGAGTC--AAAACTATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAAT
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * *** * * * * * **
34872 ACTAATTTACTAACATTTGGAAAATTAATAAGAAAGTGATTAAAAAAATAAATCTATTTGCCGAA
192 ACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* * * * * * * * * *
34937 TAAGTTCAAATAATTATTATTATTTTAATAATTATCTATTT-AAAATCATTATAACCTTTTGATT
257 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACATTTTGTTT
* * * *
35001 TGTCATAAAAAAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTA
321 TGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTA
** * * * * * * * *
35065 ATATTTCCTAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAAACCAGTTTACCGAATTAGTTAAAAT
382 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAAT-AAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAAT
* * * ** *
35130 AATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
445 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *
35195 ATTGTTT-TTTATTATACAAGCTTA-TTCAA
510 ATTGTTTCTTT-TCATACAAGCTTATTTC-G
* * * *
35224 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAACAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * * * *
35289 TATTTATCGAACT-GGTTTAAATAGTTATGA-TATTTGAACAATTGTCAATCTCATATCATTA-A
65 TGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * ** *
35351 ACC-TTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTAATCATAGAAGTTTATTT-GGTTAAAAATAAGA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATA
* * * *
35414 CTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAA
193 CTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* ** * * * * * * * *
35478 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTTA
257 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTTTT
* * * * ** * ***
35543 GTCATGAAATATTTGTTTTATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATCTAAATTTATTGGC
322 GTCATAAAACAATTGTTTTAT-TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAAT
* * * * * * * *
35608 A-TTCAAAAAATTACTAAGCAAAAGATTTGAAAAAGTAAATATGCTTACCGAATAAGTTCAAATA
384 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAATA
* * * ** * * *
35672 GTTATGACTACTT-AGACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGACATAAAATA
446 GTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * *
35736 ATTATTCCAGTTCATTA-AAGCTTA-TCCA
510 ATTGTTTCTTTTCA-TACAAGCTTATTTCG
* *
35764 AATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAATAAAT
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
35828 TTGTTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAATTTGTTAT
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTAT
* * * * *
35892 GACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-AAGTTCATATAAGCTTACTT-GAAATAAAGTAA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAA
* * * * * *
35955 TGCTAATTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTATTTA-TAA
191 TACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAA
* * * * * * * * * *
36015 A-ATTAGTTTAAAAAATTATGGCCATTTCAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGT
256 ACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGT
* * * * **
36079 TTGGTCATATAACAATTATTTGTTTATCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTAT
319 TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAT-TCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTAT
* * * * *
36144 TAATATTTC-AAAATT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAATTCAAA
380 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAA
* * * * * * * *
36205 TAGTTATGATTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAC
444 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
36270 AATTATTTATATTCATACAAGCTTA-TACAA
509 AATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTC-G
* * * * * *
36300 AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAATATTAATAACTTAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* ** * * *
36365 TGTTTATCGAACCCA-TT-AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
65 TGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * *
36428 ACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATAAT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTAAGAAAAAAATAA-
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * * * * *
36491 AATGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATATGTAAGAGATTAAAAAAATAATTCTATTTACCTA
192 ACT-AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTA
** * * * * * *
36556 TTC-GGTTTAAATAATTATGACTATGTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AAACTTTTGT
255 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACA-TTTTGT
** * * * * *
36619 TTTGTCATAAAACAAAGGTTTATGTTCA-ATAAGTTTGTTCAGAATAAAATAATACTAATCTATT
319 TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATT
* * **
36683 AATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT-AAAAGCAGTTCAAA
381 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-TCCGAA-CAGTTCAAA
* * * *
36743 TAGTTATGACTATCTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGGA-CTTTTGTTTTG-CTATAAA
444 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACCTTTTGTTTTGTC-ATAAA
* *
36806 ACAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAG
507 ACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTC-G
* * * * * *
36838 ATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTACAAATTAATAAGCAAAA-ATCTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
36902 ATGCTTACCAAACTACA--TCAAATTGTAATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-AAATCATTA
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* * * *
36964 TGACCTTTTGTTTTGTCA-AAAA-ATTTATTTC-AGTTCATATAAACTTATTT-GAAATAAAATA
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATA
* * * * *
37025 ATACT-ATGTTATTAATATT-ATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTCAAAAATGAATCAGTTTA-
190 ATACTAAT-TTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * * *
37087 TCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT-GAAATCGCTATAACTTTT
253 T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACATTT
* * * * ** *
37151 TGTTTTGTTATAAAATGACTT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTTTGAGTAAAATAATATAAATTT
316 TGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAT-AATTT
* * * *
37215 ATTAATA-TTGAAACAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAGATAAATCTATTTACCGAACAAGTT
378 ATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA-ATAAATCTGTTTTCCGAAC-AGTT
* * ** * **
37278 CGAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTGTGATTTTTTTGTTTTGTCA
440 C-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCA
*
37342 TAAAATAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTA-TTCGG
503 TAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTC-G
* *
37378 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * * * *
37442 ATGTTTACTAAAGAATTTCAAATAGTCATGATTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAGTCATTCTA
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * *
37507 ACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTG-TTCCAGTTCATATAAACTTATTTTA-AATAAAATAAT
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTTAGAATAAAATAAT
* * * *
37570 ACTAATTTATTAATATTCAAAAAATCAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATCTATTTACTA
192 ACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA-AGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTA
* * * *
37634 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAATATTATGACATTTTGTT
255 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTT
* * *
37699 TTGTCGTAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAAT-ATA-AATTTATTAA
320 TTGTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATATAATTTATTAA
* * * ** * * *
37762 TATTCCAAAAATTAATAATTAA-AAATTTTAAAAATAAATCAATTTTCTGAACATGTTTAAATAA
383 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTTCCGAACA-GTTCAAATAG
* * **
37826 TTATTACTATTTGAACAATTATCTGTTTCAAATCATTATGACCATTTT-TTTTGTCATAAATGAA
447 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * *
37890 TTATTTCTTTTCAAACAAGCTTATTTTG
511 TTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* *
37918 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAAAACATTT-AAAAATAAATTT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * * * * **
37982 GTTTACCGAATGAGTTTAAATTGTTATAACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGGT
66 GTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
* * *
38047 CTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATATAATAATACTA
131 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTA
* ** * * * **
38112 ATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACTGTACAA
196 ATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * * * * * *
38176 GTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTATTATCTATTTGAAATTGTTATGATATTTTATTTTGTC
260 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTTTTGTC
* * *** * *
38241 GTAAAACAATTATTTTTATTCATACAAAAGTATTCATAAAAAAATAATATTAATTTATTACTATT
325 ATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
* * * *
38306 TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAACTAAATCTCTTTACTGAATCAATTCAAATAGTTA
387 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAATAGTTA
* * * * *** * * * * *
38366 TAACTATTTGAACAATTATTTATCTGAAATTGGTATGATC-TTTGTTTTATCCTAAAACATTTAT
450 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
38430 TTCTATTCATAGAAGCTT-GTTCA
515 TTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* * * * * *
38453 AAGTAAAATACTACTAAATTAATAGTATTATAAAAATTAATAAG-----GATTTAAAAAATAGAT
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
38513 GTGTTTGCCGAA-CAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTG
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * * * * *
38577 ACCTTTTGTTTAGCCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* * * * *
38641 CTATTTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAA
193 CTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAA
* * * *
38705 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTT-AAAACTCTTATGACCTTTTATTT
257 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-TGTTATGACATTTTGTTT
* * * *
38769 TATCATAAAACAATTGTTTTAGCTT-ATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTA
321 TGTCATAAAACAATTGTTTTA--TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* * ** * **
38833 ATATTTTAAAAATTGATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTAT-CGAACCAGTTCAAAT
382 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-TCCGAA-CAGTTCAAAT
* * * * * * * *
38897 AATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAAT-TTTATGAACTTTTTTTTTGTCATAAAACA
445 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-
* * *
38961 AATT-TTT-TTCATCATACAAACCTA-TTCG
509 AATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTCG
* * **
38989 AAATAAAATAATAGTAA-TTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * *
39052 TTGTTTACCGAATTAGTTCAAA-AGGTTATGACTATTTGAGGAATTATATATTTCAAATTGTTAT
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
39116 AACCTTGTGTTCTGTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAAATAAT
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAAT
* * * * * ** ** *
39181 ACTAATGTAATAATATT-ATGAAAACTAATAACTAAGAGA-TT--CCAATAAAT-TAATT--TGA
192 ACTAATTTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAA
* * ** * * * * * *
39239 ACCAGTTCAAATAGTTAAGGTTCTATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTT
256 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTTT
* * * * * * *
39304 TATCACAAAACAATT-TTTTCAATTCTTAGTAA-CTTATTCGAAATAAAATAAAACAAATCTATT
321 TGTCATAAAACAATTGTTTT--ATTCATA-CAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * ** * *
39367 AATATTTCAAAAA-TAATTAGCAAGAGA-TTTACAAAATAGTTTTGTTTGT-CAAATCAGTTCAA
381 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAATCTGTTT-TCCGAA-CAGTTCAA
* * * * * * *
39429 AAAATTATGACTATTTAAATAATTATCGATTTCATATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
443 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
39494 CAAATGTTTTTTTTCAAATAAG-TT-TGTTCAA
508 CAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTAT-TTC-G
* *
39525 AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGAGTTAAAAAAATAAATTTGT
1 AATAAAATAATACTAATTTATT-A-A---T----ATTCA-AA-A-A-TT-----AAT-AA---G-
* *** ** * *
39590 TTATTAAGAGAGTTAAAAAAATAAATTTGTTTATTAAACCAGTTCAATTAGTT-TAACTATTTGA
43 -TA--AA-AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* ** * * * *
39654 ACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTCTAGTCATA
103 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * * * *
39719 C-AGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAA-TTATTAATATTCTAAAAATTAATAACTAATGA-A
168 CAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAA-GAGA
* * * ** * * * * *
39781 TTTCAAAAATGAATTTG-TTAGCT-TGCCAGTGCAAATATTTATGATTGTTTGAACAATTATCTA
231 TTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
39844 TTTC-AAATCGTTATAATC-TTTTGTGTTATCACAAATCAATTATTTCTATTCATACAAGTTTTT
295 TTTCAAAAT-GTTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTAT
* * * ** * * *
39907 TGAAATAACATAATTCTAGCTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGA
357 TCAAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAA
* * * * *
39972 ATCTATTTGT-TGAACAAGTTAAAATAGTTATGACTATTT-ATCAATTATCTATTTCAAATCACT
421 ATCTGTTT-TCCGAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * *
40035 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTGCTATTCATACAATCTTATTTCA
484 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* * * * *
40090 AATAAAATAACAC-AATTTATTAATATTTAAACAATTAAAAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * **
40154 TATTTATCGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCATTCCGA
65 TGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * *
40219 ---ATT-TTTT-T-ATAAAA-AATTGTTTTTGTTCATAGAAGCTTATTCAGATTAAAATAATA-T
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT
* *** * * *
40276 TATTTATTAATATTTCCTTAAA-TAATAAGTAA-AGATTTTAAAAATAAATATG-TTACCCAAA-
195 AATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAAC
** * * * * *
40337 AAG-TCAAATAGCCATAACTATTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTGTTTT
258 AAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTTTT
* * * * * *
40401 G--ATTTAAATAATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
322 GTCA-TAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * * * * *
40464 TATTCCTAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAT-TAGTTTACCGAACAAGTTTAAATA
383 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTTCCGAAC-AGTTCAAATA
* * ** * *
40528 GTTCTTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGATTTGTCATAAAACAA
446 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
40593 TTGTTTCTATTCATATACGGTTATTCCA
511 TTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
*
40621 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * *
40684 CTATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATG
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * *
40749 ACATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATA
* * * * * *
40813 CCAATTTATTAGTATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
193 CTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* ** * * * * *
40878 AAGTTCAAATAGTTATGTCCCTTTGAATAATTATCTATTTC-ACATCATTATAAGATTTT-TTTT
258 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACATTTTGTTTT
* * * ** *
40941 GTCATAAAACAATTGTGTCTCTACATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
322 GTCATAAAACAATTGT-TTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAAT
* * * * *
41006 GTTTTAAAAATTAAT---T-AGAGA-TTTAAAAACTAAATCTGTTTGCTGAATCAATTCAAATAG
384 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAATAG
* * * ** *
41066 TTATGATTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT
447 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* *
41130 TGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTCCG
512 TGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* * * *
41157 ATTAAGATAATACTAA--T-TT-A-A-T-AATAA--AA-AA-T--AA-ATTT-----GT---TTT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
* * * * *
41200 G----CC-AATCTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGA
66 GTTTACCGAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * *
41260 CCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAAATAAAATAATAC
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATAC
* * *
41325 TAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATCAATATGTTTACCT-AA
194 TAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAA
* * * * *
41389 CAAGTTCAAATAGATATAACCATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATCGTTATGATC-TTTTATC
257 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CATTTTGTT
** * ** * * *
41452 TTGTCATAAAACAA---TTCAATTCATAAAAATTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTCATTAA
320 TTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * * ** *
41514 TATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAGA-TTTAAAAACTAAAGCTATCAT-CGCAATAGTTCAAATA
383 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTTCCG-AACAGTTCAAATA
* * * ** ** * *
41577 GTTATGA-TCATTTGAATAAATATCAATCACAAATCGCTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAAA
446 GTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
41640 ACTATTTCTTATT-ATATAAGCTTA-TTCA
510 ATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTCG
*
41668 AATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * * * * *
41733 GTGTTTGTCGAATCATTTCAAGTGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTA
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * **
41798 ACCTTTTATTTAGTCATAAAAAAAATTGTTTCGGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
129 ACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* * * * *
41863 CTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAATAAATATGTTTACCAAAC
193 CTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
* * * * *
41928 AAGCTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTACTT-AAAATTATTATGA-ACTTTTGTTT
258 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA-TGTTATGACA-TTTTGTTT
* * * * *
41991 TGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATTCTACTTTATTAA
321 TGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA-TATAATTTATTAA
* *
42056 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTAT-CGAATCGGTTCAAAT
383 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTT-TCCGAA-CAGTTCAAAT
* * * ** ** * * *
42119 AATTATGGCCATTTGAACAATTATAAATTAT-AAATTGTTATTACCTTTAGTTTTATCATAAAAC
445 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* **
42183 AATTATTT-TTCAACATACAAGCTTATTT-G
509 AATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTCG
* * *
42212 AAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAGATCT-AAAAATAAA
1 -AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * ** * * *
42272 -TAG-TTA-TGACT-ATTTGAACA-A-CTATG--TATTT-CA-AATTGT-TATAACCATTTGTTT
63 TTTGTTTACCGAATAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG--T
* * * *
42326 TGTCAGAAAACAATTAT-TTTTGTTCAT---ACAA--G-TT-TATT--TAGAA-C--A---A-AA
125 TAT--G---AC-CTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAA
* * * * * ** *
42374 TAATACTAAT-TTAATAATATT-CTA--AAAATTTA-T---AACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
183 TAA-AATAATACTAAT-TTATTAATATTCAAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * *
42431 CTGTTTGTTAAACCAA-TTCAAACAGTTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTC-AAATCATTA
245 CTGTTTACTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTA
* * * *
42494 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGTTTATAT-AGATTAAAATAA
308 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TCA-AATAAAATAA
* * * * * * * *
42558 AACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGCAAGAGATTTAAAAAAT-AATACTATTTACCG
370 TA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAAT-CTGTTTTCCG
* * * * * * *
42622 AATCGGTTAAAATAATTATAAAATAATTATAACTATTTCAACAATTGTTTATTTCAAATCATTAT
433 AA-C----------AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * *
42687 TACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATATAAGTTTGTTT-G
486 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTCG
* ** *
42739 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCCGTAAAAGAGTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
** * * * * * *
42804 TTGTTTACTAAACT-ATTTCGAATAGTTTTGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
64 TTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * ** *
42868 AACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTTGGAATAAAATAATA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* *** * ** * * * *
42933 CTAATTTAATAATATTTTGGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAGATAAATCTAATTGT-C-A
193 CTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT-TACTA
** * * **
42996 AATGAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTC-AAATAGTTATGACCA-TTTG
255 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CATTTTG
* * * * *
43059 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACAAATTTAAT
318 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAAATAATA-TAATTTATT
* * *
43124 AATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGA--TCAAAAA-AAAT-TGTTTAT-CGAACCAGTTTATA
381 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-TCCGAA-CAGTTCAAA
* * ** * *
43183 T-GATTAAT-ACTA-TT-AGCAATTATCTATTTTAAATTGTTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAA
444 TAG-TT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* *
43244 AGCAATTGTTTCAGTTT-ATACAAGCTTA-CTCG
507 A-CAATTGTTTC-TTTTCATACAAGCTTATTTCG
* * *
43276 AAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAGAAG-AAAGAGATTTAAGAAAATAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAA-AAAATAA
* * * * * * * * *
43340 ATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGCTA
62 ATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * ***
43405 TGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAGTTTATACGGAATAAAATAA
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAA
* *
43469 TAC------A--AAT-TT------ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCG
191 TACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-A
** * * * * * *
43518 AATTAGTT-AAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCA-TTTGT
255 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CATTTTGT
* *
43581 TTTGTTATAAAACAATT-TTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
319 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * ** *
43645 AATATTT-AAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGT-TAAACCAGTTTAAA
381 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-TCCGAA-CAGTTCAAA
** ** * ** * ** * * *
43705 TAGTTAAAACTATAAGAATAATGGTCTATTTTAAATTGTTCT-AGCCTATT-TTTAGTCATAAAA
444 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
43768 TATTTGTTTCATATCATACAAGCTTATTTAG
508 CAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* * * * * * *
43799 AACAAAATAATCCTAATATATTAACATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * *
43864 TTGTTAACCGAATAAGCTCAAGTAGTTATGACTATTTGAA-AGATTA-ATATTTAAAATCGTTAT
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * ** *
43927 GATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGCTTC-AGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAAT
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * * * * *
43990 ACCAATTTTTTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTTCTG
192 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTA
* * * * * * *
44054 AATAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTGTATATTT-AAAATCATTATGATATTTTGT
255 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACATTTTGT
* * *
44118 TTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAGCTTATTCAAAATAAAATAACAATAATTTAT
319 TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCA-TACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA-TATAATTTAT
* * * * *
44182 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGA-TTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAATTCAA
380 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAA
* * * * *
44246 ATAATTATGGCTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-ATT-TTTTGTCATAAAA
443 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
44309 CAATTATTT-TTCATCATACAAGCCTGTTT-G
508 CAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTCG
* *
44339 AAATAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
44404 CTATTTATCG---AAG--C----AGTTCT---TATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTATA
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * *
44457 ACTTTTTATTCTAT-TC-T-AAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATA
129 ACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATA
* * * * * *
44517 ATACTAATTTAATAATATT-ATGAAAATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTGT
190 ATACTAATTTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTT-A
* * * * * ** * *
44581 CGAAGC-AGTTTAAATAGTTAAGACAATACGAATAATTATCTATTTC-AAATGTTATGAAATTTT
252 CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTT
* * *
44644 GTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAGAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTA
317 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTA
* * * * * * *
44708 TTAACATTCCAAAAATTAATAAGT----GA-TTTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATCATTTCA
379 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCA
* * * * * * * * * *
44768 AATAATTATGGCCATTTCAACATTTATCTATTTCAAACCATTATTACCTTTTGTATGGTCATATA
442 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
44833 ACAAGTGTTT-TTGATCATTCAAGCTTA-TTCAG
507 ACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTC-G
* * ** *
44865 AATACAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * * * * *
44930 TGTTCATCAAACT-AGTTCAAATAATTATGACTATTTG---AATTGTATACTTCAAATTGTTATA
65 TGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * *
44991 ACATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAC
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC
* * * * * * *
45056 AAATATAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGAC-AAAC
194 TAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACTAAAC
* * * * * *
45119 TAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTTGCTTTG
258 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTTTTG
** * * * *
45184 TCATAAAACAAATT-TTCAATTCATACTAGCTGATTTGAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATA
323 TCATAAAAC-AATTGTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATA
* * * ** * * * *
45248 TTGCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAATATTTCTGTTTACCTAACCAATTCAAATAAT
385 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAATAGT
* *
45313 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT
448 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* *
45378 GTTT-TTGTTCATATAAG-TT-TGTTCAT
513 GTTTCTT-TTCATACAAGCTTAT-TTC-G
* * *
45404 AATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * *
45465 TATTTATCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCGTTCT
65 TGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
45528 GA-CTTTT-TTCCTGTTATAAAACATTTGTTTCTGTTCATACATGCTTATTCAGATTAAAATAAT
128 GACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * * *
45591 ATTAATTTATTAATATTTC-AACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-TC
192 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-
* * * * * * * * *
45653 GAACTAGATCAAATGGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAC-CTTTC
254 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACATTTTG
* * ** * * * *
45716 TTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCGGTTCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACAGTTTATT
318 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATATAATTTATT
* * * * *
45781 AATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGA-TTTAAAAA-AGAATCTGTTTAT-CAAATAAGTTTAA
381 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATA-AATCTGTTT-TCCGAA-CAGTTCAA
* * ** * * *
45843 AT-GATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGCTATAACATTTTGTTTTGACATAAA
443 ATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
45907 ATAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG
507 ACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* *
45939 AATAAAATAATACAAAATTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
46003 ATTGTTTATCAAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT
64 -TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** *
46067 GA-CTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGGTTATTCGGATTAAAATAAT
128 GACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
*** * * * **
46131 ACTAA-TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGA
192 ACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAA
* * * * * * * * *
46195 ACAAATTGAAATAATCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTT
256 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACATTTTGTT
* ** * * * *
46259 TTGTAATAAAACAACGGTTTCAATTCAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
320 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTA
* ** * * * * * * *
46324 ATATTACTTAAATTAATGAGTAAGAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGCTCAAATA
382 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAATA
* * * * * * * * *
46389 GCTATGACTATCTAAATAGTTATCTATTTTAAAACATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACGA
446 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
46454 TTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCA
511 TTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
*
46482 AATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
46545 CTGTTT-TCTACACACA-TTCAAATAATTAT-ATCTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATTGTT
64 TTGTTTACCGA-ATA-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * * *
46607 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTT-GCTACAAAATA
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATA
* *
46671 ATACTAATTTATTAA-ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAATATGTTTA
190 ATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AAATCTGTTTA
* * ** ** *
46734 CTGAGCGGGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC-AAATCGTTATGATC-TT
252 CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CATT
* * * ** *
46797 TTGTCTTCTTATAAAACAATTGTTTCTACTT-ATACAAATTTATTCAAAATAGAATAATACTAAT
315 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAAT
* * ** * * ** ** *
46861 TTATTAATATTTTAAAAGTTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAAAAAAT-TGTTCACTAAATAAGT
376 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAAATAAATCTGTTTTCCGAA-CAGT
* * * * * * * **** ***
46925 TCAAATAGTCAAGTCAATTCGAACTATTAGCTATTTCAAATCATTATTTTATTTTGTTTTGTTGC
439 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
** **
46990 AAAACAATTGTTTCTACTCATACAAAATTA-TTCAG
504 AAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTC-G
* * * *
47025 AATAAAGTAGTACCAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAAACTAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAAT
* * * ** * * * *
47086 CTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTAAAATTGTTATG
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * ** * * * *
47151 ATC-TTT-TTTTCTCATAAAGTAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGC
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC
* * * * *
47214 TAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACC
194 TAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-AAAC
* * * * *
47279 AA-TTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTAGCTATTTCAAATCAT-TT-TGACCA-TTTGTT
258 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA--ATGTTATGA-CATTTTGTT
* * * * ** **
47340 TAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTTATACAA--TTA-TCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTA
320 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAA-TAATAT-A-A-TTTA
* ** * * * *
47402 TTTAACA--T-AAATAATTGTTTCAATTCATA-AAATCTTATCCAAAATAAAATAATGTTACTTT
379 -TTAATATTTCAAA-AATT-AAT-AAGT-A-AGAGAT-TT-T-AAAAAT-AAAT-CTG-T--TTT
*** * * * *
47463 ATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAAAAATTAAGTTTATCGAATCAATTAT
430 CCGAACAGTTC--AAA-T----AGTT----A--T-------GACT-A--TT-T-GAA-CAATTAT
*
47528 GACTATTT-AAA-CAATTACTTATTCCAAATCATTATGACTTTTCATTTTGTCATAAAACAATTG
469 --CTATTTCAAATC-ATTA-TGA--CC---T--TT-TG--------TTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
47591 ATTT-TGTTCACACAAGTTTATTTTG
514 -TTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* * ** * * * ** *
47616 ATTAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTGACAATTAAAAAGTAAAAGGTTTTCAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* * * * * *
47681 TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TCAT-A
65 TGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * *
47744 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTC-A-TCATAAAACAACTGT
130 CCT-TTTG--T-TTTGTC-A--T-AAA--AC-A--A----TTGTTTCTATTCAT---ACAA--G-
* * * *
47807 ATTAGTTCACATAGGCTTATTTGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCTAAAAATTAATGAGT
172 CTTA-TT----TA-G---A-AT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAAATTAATAAGT
* * *** *
47872 AAGAGATTTAAAATATGAA--TG-TTACCGGACAAGTTCAAATGGTTATGACTATTTGAACAATT
225 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
47934 ATCTATTTCAAACTGTTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTTTATGTTCAT--AAGCT
290 ATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCT
* * *
47997 TATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAA-A-AATTTAAAA
354 TA-TTCAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAA
* ** *
48060 ATAAATTTGTTTTCTAAACATATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAAT-
417 ATAAATCTGTTTTCCGAACA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
48123 AGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAG-TGTATTT-G
481 A-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCT-TATTTCG
* *
48181 AAATAAAATAATAATATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAAATAAA
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAA
* * ** * * *
48245 TCTGTTTATCGAGCAAGTTCATATCA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTA
63 TTTGTTTACCGAATAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
** * * * * *
48309 TGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTCTATTCATACAAGTTTAGTCAGATTAAAATAAT
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT
* * *** * * * *
48374 ATTATTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAAATAAATCTATTT-C-G
192 ACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATCTGTTTACTA
* * *
48437 AACAAGTTTAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGACCTTTTG
255 AACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-ATGTTATGACATTTTG
* * * * * * *
48500 TTTTGTCACAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATAATACTTTTT
318 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAAT-ATAATTTAT
* *
48565 TAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTAAAAACTAAAGT-TGTTTTCCAAACCAGTTCA
380 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAA-TAAA-TCTGTTTTCCGAA-CAGTTCA
* * * * * * *
48628 AATAGTAATGACTATTTGAAGAAATATCAATGTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAA
442 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
48692 AC-ATCTATTT-TTGATCATATAAGCTTA-TTCG
507 ACAAT-TGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTCG
* * *
48723 GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATTAAT
1 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
48784 GTGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTCT
64 TTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
48848 GACCTTTTCTTTAGTTATACAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* ** * * * *
48913 CTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACATGAGATTTGAAAATATAAATCTATTTACCAAA
193 CTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* * *
48978 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTT-AAAATCATT-TGACCA-TTTGTT
257 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CATTTTGTT
* * * * * * * *
49040 TTATCATAAAATAGTTGTTTTAGTTCATAAAATCATATCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
320 TTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCAAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * *
49105 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAATTAGTTCAAATA
383 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCT-GTTTTCCGAA-CAGTTCAAATA
* * * * *
49169 ATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACA
446 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACA
*** * **
49234 ATTGTTT-TCAACATACAAGTTTATTTAA
510 ATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTCG
* * *
49262 AATAAAATAATACTAATTCATTAATATTTCAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATATATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT
* ** * * * * * *
49323 TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAATAATTACCTATTTTAAATTGTTATAA
65 TGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
* * * *
49388 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
130 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT
* * * * * * * *
49453 AATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAACTA
195 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAA
* * ** * * * *
49518 GTTTAAACAGTTAAAACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCA-TTTGTTTTGT
260 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGA-CATTTTGTTTTGT
* * * * *
49582 CATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGATTATTCGAAATAGAATAAAACTAATTT-TTAATAT
324 CATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAT
* * * * * * * ** *
49646 TTCAAAAATTTATAAGTAAGGGA-TTTAGAAAATAATTTTGTTTACCAAATTAGTTTGAATAATT
386 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTA-AAAATAAATCTGTTTTCCGAA-CAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
49710 ATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAATAATT
449 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *
49774 GTTT-TTGTTAATATAAGTTTA-TTCG
513 GTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTTCG
* * * * * * *
49799 AAAGAAAATAACACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGAATTAAAAAGTAAAT
1 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * * *
49864 TTGCTTATCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCTAATCGTTATA
64 TTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * * **
49929 ACATTTTAG-TTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTTAGAATAAAATAATA
129 ACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATA
* * * ** * * ** * **
49993 TTAATTTAATAATATTTC-AAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCCGAA
193 CTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAA
* * ** ** * * * *
50057 CCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATGATTATCTATGTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTT
257 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACATTTTGTTTT
* * * * *
50122 GTCGTAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATT-AGGATTTAAATAATACTAATTCAATAAT
322 GTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCA--AATAAAATAATA-TAATTTATTAAT
* * * * *
50186 GTTTTAAAAATTAATAAGT-A-AGA-TTTAAAAATAAATTTGTTTAT-CGAATAAGTTCAAATGG
384 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTT-TCCGAA-CAGTTCAAATAG
* * * * * * *
50247 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAAT
447 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
*** *
50312 TGTTTCAGCTCATACAAGCTTA-TTCAA
512 TGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTC-G
* * * *
50339 AATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATTACA-AAAAGAGATTCAAAAAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAA-TA-AGTAAA-AGATT-TAAAAAATA
* * * * * ** * * *
50403 AATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATTACTATTTGAGTAATTGTCTATTTAAAATCATT
61 AATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* ** * * ** **
50468 ATAACCACTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTT-AGCACAAATTTAAATAGAATAAAAT
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA-TACAAGCTTATTTAGAATAAAAT
* *** * *
50531 AATATTAATTTATTAATATT-TTGAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT
189 AATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT
* ** * * * * *
50595 AATC-AGTAAAAATAATTATGGCCATTTGAA-AGATTATCTATTT-GAAATCATTATGAGC-TTT
254 AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGA-CATTT
* *
50656 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAATAATTT
316 TGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAAATAA-TATAATTT
* * * *
50721 ATTAAT-TTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCAGTTC
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* * * * * * * ** *
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* *
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* * * **
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* * * * * ** * * ** * * * * * * *
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** ** * * * * * *
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* * * *** * * * * * *
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* * * * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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*
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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*** * * * *
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* ** * * * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * *
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** * * * * * * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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** * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* *
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* * * * *
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* * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * * *
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** * * * * * ** *
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* ** * * ** *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * ** *
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* * * * *
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* * * *
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* *
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** * * * *
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37686 ATGACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGGTTTT-GTTCATGCAAGCTTATTTC-
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* *
37917 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAATTAATAAGTAA-AACATTT-AAAAATAAAT
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121 ATCTTATGACCTTTTGTTT-TGTC--A-TA--A--AACAATTGTTTTAGTTCAT---AC-AA-G-
* *
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* *
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39907 TG
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*
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* * * *
40089 AAATAAAATAACAC-AATTTATTAATATTTAAACAATTAAAAAATAA-AAGATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAA
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40386 ATGGCCTTTTGTTTTG--ATTTAAATAATTGTATCAGTTCATATAGGCTTATTCG
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
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128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA
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* * *
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* *
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* * * ** * *
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* ** * * * ** *
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* * * *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
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* * * *
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* * * * * ** ** *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAG-TAAG--AA---A-TTTAAA-A
** * * * * * * * * *
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* * * ** * * * ** * ** *
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** *
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* * * * * ** ** *
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1 A-A-A--TAAAATAAT-ACTA-ATTTA-TTAA-TA-TTCAAA-A-AT-TAATAAGTAAGAA-ATT
** ** * * ** *** * * *
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* ** * ** ** * * * *
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108 -TTAT-CTATTTCAAATCTTA-TGACCTT--TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA
*
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168 CAAGCTTATTCA
* * * * * ** * *
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1 AAATAAAATAATA-CTAATTTAT--TAATA-TTCAAA-AATTA--AT-AAGT-AAGAAAT-TTAA
* * * * * * *
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56 --A-AAA----TA-AATC--TG-TTTATCA-AACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAA-CA
* * * ** * ** ** * * * ** *
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107 ATTA-TCTATTTCAAATCTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACA
* **
41716 AGATT-TAAA
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* ** * * * * * * ***
41725 AAATAAATGTGTTTGTCGAATCATT-TCAAGTGGTT-AAGACTATTAGAATAA-TTATCTATTTC
1 AAATAAA-AT-AAT-ACTAAT--TTATTAA-T-ATTCAA-A-AATT--AATAAGTAAGAAATTT-
** * * * * * *** * *
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54 AAA--A-AATAA--ATCTGTTTA-TC---AAACAAGTTCAAAT-AGTT-AT--GA-C-TATTT-G
* * * * * **** * *
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103 -A-ACAATTAT-CT-A-TT-TCAA-A-TC------TT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA
* *
41913 ATATG-TTTA--CCAAACAAGC----TC-
152 AT-TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
** * * ** * * ** **
41934 AAAT-AGTTATTA-TTATTTGAACAATTATCTACTTAAAATTATTATGAACTTTTG-TTTTGTCA
1 AAATAAAATAATACTAATTT-ATTAA-TAT-T-C-AAAAATTA--AT-AA-GTAAGAAATT-T-A
* * * * * ** *
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55 AAAAATAAATCTGTTT-A--TCA-AACAAG--T-T-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-
* ** ** ** ** * *
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111 T-CTATTTCAAATCTT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAA-CAATT-GTTT-T---A---GTT
* *
42114 CAAATA-ATTATGGC-CATTTGA
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* * *** * *
42135 ACAATTATAAATTATA--AATTGTTATTACCT-TT--AGTTTTATCATAA--AACAATTATTTTT
1 A-AA-TA-AAATAATACTAA-T-TTATTA-ATATTCAAAAATTA--ATAAGTAAGAA--A-TTTA
* * * * * ** *
42193 CAACATACAAGCT-TATT-TGAAATAA----AAATA---AT-ACTAATTT-ATTAATATTTCAAG
55 AAAAATA-AATCTGT-TTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAAT-TATC---
* * * ** **** * * * **
42247 AATTAGTAAGAGATCTAAAAATAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATGTATTTCAAATTGTT
113 TATT--TCA-A-ATCTTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAA-T-TGT-TTT---A--GTT
* *
42312 -ATAACCATTTG-TTTTGTCA
164 CAT-A-CA--AGCTTAT-TCA
* * ** ** * * * **
42331 GAAA-ACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAACAA--AATAA-T-ACTAATTTAATAA
1 -AAATAAAATAATACTAATTTAT-TAA---TATTCA-AA-AATTAATAAGTAAGAAATTTAA-AA
* ** * * * * ** * *
42391 TATTCTAAAAAT-TTATAACTAA-GAGATTTAAA-AAATA-AATCTGTTTGTTAAACCAATTCAA
58 -A--ATAAATCTGTT-TATCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTG---AA-CAATT--A
* * ** * * ** *
42452 AC-AGTT-AAGA-CTATAT-AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTT-G-TC
111 TCTATTTCAA-ATCT-TATGACCT--TT-TGT-TTT---GTCA-TAAAACA-ATTGTTTTAGTTC
* *
42511 ATA-AAAC-AATT--
165 ATACAAGCTTATTCA
** * ** * * * ** * **
42522 ATTTTAGCTCATAC-AAGTTTA-TATAGATT--AAAA-TAA-AACT-A-ATTTGTTAATATTTCA
1 AAATAAAATAATACTAA-TTTATTA-ATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAAT-TTAAAAAAT-A
* * * * * * * * ** *
42579 AA-AT-TTTAT-AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAT-ACTATTT-ACCGA--ATC-GGTTAAAATA
62 AATCTGTTTATCAAAC-A-AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-
* *** ** * ** ** * * * **
42636 ATTAT-A-AAATAATTATAACTATTTCAACAATTG-TTTATTTCAAATCATTATTACTT-TTTG
123 CTTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTTAGTTCATA-CA--A--GCTTATTCA
*** ** * * * * **
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1 AAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCA-A-AAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAA-AATA
* * * * * ** * * * * * *
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62 --AATCTGTT--TA-TCA-AACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT-
** *** * * * * * ** *
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118 C-AAATCTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATA-AAACAA-T-TGT-TTT-AGTTCA-TACAAGC--
* **
42873 TTTGTTTTG
173 -TT-ATTCA
** * * ** * ** * * *
42882 TCATCAAACAAT--TGGTTCTGTTCATACTATT--TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAAT
1 AAATAAAATAATACTAATT-TATT-A-A-TATTCAAAAATT--AAT-AAGTAAGA--AATTTAA-
* * * ** * * * * *
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56 AA-A--AT--AAATCTGT--TTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATC
* * * * * * *
42999 GAGTTCAAATAGTTAAGA-CTATATGAATGATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCATTTGTTTT
113 TATTTCAAAT-CTTATGACCT-T-T---TG--T-T-T-TGTC--ATA---A--AACAATTGTTTT
** * **
43063 -G-TCATAAAACAATTTTTTTGT
160 AGTTCAT---ACAAGCTTATTCA
*** * * * * * * *
43084 TCGTACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAATTAA-TAAGTAAG
1 AAATA-AA-ATAATACTAATT----TATTA-ATATTCAA-AA-A-TT---AA-TAAGTAAG-AA-
** * * * * * *
43148 AGATCAAAAA-AAAT-TGTTTATCGAACCAGTTTATAT-GATTAAT-ACTA-TT-AGCAATTATC
50 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAG-TT-ATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
43207 TATTTTAAATTGTTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAGCAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTA
113 TATTTCAAA-TCTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA
* *
43272 CTCG
176 TTCA
* * * * *
43276 AAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAGAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAA-AAAATAAA
* * * *
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64 TCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCT--T
* * * * * *
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126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * *
43458 GAATAAAATAATAC------A--AAT-TT-----ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * *
43509 TGTTTATCGAATTAGTT-AAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-TGCTATA
66 TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCT--TATG
* * * *
43572 ACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTT-TTATCATACAAGCTTATTCG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCA
*
43622 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * ** ** * ** * * *
43683 GTGTTTGTTAAACCAGTTTAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATGGTCTATTTTAAATTGTTCT-
65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATG
* * * * * *
43747 AGCCTATT-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTTATTTA
129 A-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCA
* * * * * * * *
43798 GAACAAAATAATCCTAATATATTAACATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * * * *
43863 TTTGTTAACCGAATAAGCTCAAGTAGTTATGACTATTTGAA-AGATTA-ATATTTAAAATCGTTA
64 TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTCAAATC-TTA
* * * * * *
43926 TGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGCTTCAGTTCATAAAAGGTTATCCA
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
43978 AAATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAA
* * * * * * * *
44043 TGTGTTT-TCTGAATAAATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTA
64 TCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTA
** * * *
44107 TGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAGCTTATTCA
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA-TACAAGCTTATTCA
* * ** * *
44160 AAATAAAATAACAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * *
44225 CTGTTTACCAAATCAA-TTCAAATAATTATGGCTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
65 CTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * *** * * **
44289 GAAC-ATT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTGTTTG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* *
44339 AAATAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAA
* * * * *
44403 TCTATTTATC---GAAG--C----AGTTCT---TATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATTAT
64 TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * * * **
44456 AACTTTTTATTCTAT-TC-T-AAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG
128 GACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * **
44507 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-ATGAAAATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA--AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAT-AA
* * * * * * ** * *
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63 ATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTA
** * **
44635 TGAAATTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAGAAGCTTATTTG
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
44687 AAATAAAATAATACAAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGT--G--ATTTAAAAAGTGAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
44748 CTATTTACTGAATC-ATTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACATTTATCTATTTCAAACCATTAT
65 CTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * * * * * *
44812 TACCTTTTGTATGGTCATATAACAAGTGTTTTTGATCATTCAAGCTTATTCA
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * **
44864 GAATACAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
44929 CTGTTCATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTG---AATTGTATACTTCAAATTGTTATA
65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATG
* * * **
44991 ACATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
45042 GAATAAAATAATACAAATATAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAA-TT-AAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-AATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
45105 TTTGTTTGA-CAAACTAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTA
64 TCTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCTTA
* * * * * * **
45169 TGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTGATTTG
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * *
45221 AAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTGCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAATAT
1 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAA
* * * *
45285 TTCTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
63 ATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TT
* * * * * *
45349 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCA
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * *
45403 TAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * *
45464 CTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCGTTCT
65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * *
45528 GA-CTTTT-TTCCTGTTATAAAACATTTGTTTCT-GTTCATACATGCTTATTCA
128 GACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
45579 GATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
45643 TATGTTTATCGAACTAGATCAAATGGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
64 TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * ** * * *
45708 GACC-TTTCTTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCGGTTCATATAAGTTTATTCG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
45759 AAATAAAATAATAC-AGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-GAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
45822 CTGTTTATCAAATAAGTTTAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGCTAT
65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * * *
45886 AACATTTTGTTTTGACATAAAATAATT-TTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC-
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTA-TTCA
* * *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAA
* * *
46001 ATATTGTTTATCAAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTT
63 AT-CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTT
* *
46065 ATGA-CTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTATGTTCATACAAGGTTATTCG
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* * ** *
46119 GATTAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT-AAAAAATAA
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63 ATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTA
* ** * * * * **
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127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
** * * *
46300 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACTTAAATTAATGAGTAAGAGACTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * * *
46365 TTGTTTACCGAATAAGCTCAAATAGCTATGACTATCTAAATAGTTATCTATTTTAAAACATTATG
65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATG
* * * *
46430 AACTTTTGTTTTGTCATAAAACGATTGGTTCT-GTTCATGCAAGCTTATTTC-
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCA
*
46481 AAATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAA
1 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * *
46544 TCTGTTT-TCTACACACA-TTCAAATAATTAT-ATCTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATTGT
64 TCTGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCT
* * * * **
46606 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTG
125 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
** *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTTAAAAAAT-A
* * * ** ** *
46724 AATATGTTTA-CTGAGCGGGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGT
62 AATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-T
* * * * * **
46788 TATGATCTTTTGTCTTCTTATAAAACAATTGTTTCTACTT-ATACAAATTTATTCA
125 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * ** * *
46843 AAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAGTTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAAAAAA
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* *
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128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
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* *** * * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * *
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65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATG
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52446 A-CTTTTGTTTTGTCATAAGAA-AATTATTTCAGTTCATATACGGTTATTCG
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
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* * * *
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52740 ATATGTTCACCACAA-AAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAC-A--A-C-A----AATTATTA
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* * * * *
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127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCA
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52848 AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGCAA-AAGATTTAAAACATAAA
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* * * *
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53093 ATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTAAAAATATT
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* *
53157 ATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGGTTTT-GTTCATCCAAGCTTATTTC-
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCA
* * * * * *
53211 AAATAAAATAATA-TAAATTAATTAATATTCCAAAAGTTAATAAGCAA-AAGTTTGAAAAATGAA
1 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
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53274 TTTTTTTATTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATCATTAT
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* * * **
53339 GACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCA
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53391 GAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGCAA-AAGATTTAAAAAATAAA
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* * * * * *
53455 TCTTTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTAT
64 TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * **
53520 GATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAG-TATATTTG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCT-TATTCA
* * * * *
53572 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAGAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
53637 TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACTATCATCTATTTCGAACTGTTATG
65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCTTATG
* * * * **
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129 ACCTTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-CAATTGTT--------TTAG--TTCATACAAGCTTATT
*
53767 TA
178 CA
* * *
53769 GAATAAAATAATACCAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAG---G--ATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * ** *
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* * * * *
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128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCA
* * * *
53945 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * *
54010 CTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATG
65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATG
* * ** * * * *
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129 ACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * * *
54126 AAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
54190 -TAGTTTAT-AGAATCAA-TTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATT
65 CT-GTTTATCA-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TT
** * * * *** * *
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126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
** * ** * * * **
54306 GTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAAATTAATAAGTAGGAGATGT-AAAAATTGATC
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATC
* * * * *
54370 TGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATA
66 TGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCTTATG
* * * * * * *
54434 AGCTTTTGTTATATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATAAAAGTTTATTCA
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
54485 AAATAAAATAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
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65 CTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTATG
* * * ** *
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129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATA-CAAGCTTATTCA
* * * * * * *
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1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
* * * *
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65 CTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTAT
* * * * **
54791 TACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGCTTTT-GTTCATATAAGTTTATTTG
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
54843 GAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTTGAAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
54906 TTTGTTTA-CTAAAC-AGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTATTTACTTCAAATCGTGA
64 TCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTA
* *
54969 TGA-CTATTG-TTTGTCATAAACAAGAATTGTTTCTA-TTCATAC-AGTCTTATTCA
127 TGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA-AACAATTGTTT-TAGTTCATACAAG-CTTATTCA
* * * * *
55022 GAATAAAGTAAT-CTAA-TTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAAATGA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAAATTT-AAAAAATAA
* * ** * * * * *
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* * *** *
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* * * * * *
55201 AAATAAGATAATTCTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATC
* * * *
55266 TGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATATCAAAT-TGCTAT
66 TGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCT--TAT
* * * * **
55329 AACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTT
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
* * *
55380 AAATAAAATAATACAAATTT-TTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAA-AAATTAAAAAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAA
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TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTATGAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCA
Found at i:39598 original size:30 final size:30
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* * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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** * * *
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* * *
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* * *
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** * *
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* * * * * **
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* * * **
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* * * * * ** * **
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* * * * * **** * * ** *
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* ** ** * *
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* * * * * *
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* * ** ** * *
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** * * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTT
* * * * * *
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65 CTATTCATACAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCT-AA-TTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * * * * **
40662 AGT-AGAAATTTAAAAAATAAATCTATT-TTCTAAACACGTTCAAATAGTTATG
128 ACTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTAGT-T-GACAAGTGAAAATAGTTATG
* * * * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TT
* * * *
40778 TCTATTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATACCAATTTATTAGTATTCCAAAAATTAATA
64 TCTATTCATACAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAA-TTATTAATATTCCAAAAATTAATA
* * * **** **
40842 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
128 ACTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA-TTAGTTGACAAGTGAAAATAGTTATG
* ** * * ** * *
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1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTT
* * ** * * * **
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65 CTATTCATACAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAA-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
* * * * * **
41021 -T-AGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTGCTGAATCAA-TTCAAATAGTTATG
129 CTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTAGTTG-A-CAAGTGAAAATAGTTATG
* * * ** * * *
41071 ATTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTT
* *
41135 CTTTTCATATAAG-CTTATTC
65 CTATTCATACAAGTCTTATTC
41155 CGATTAAGAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TATTCATACAAGTCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTATTAATATTCCAAAAATTAATAACT
AAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTAGTTGACAAGTGAAAATAGTTATG
Found at i:42273 original size:154 final size:153
Alignment explanation
Indices: 42115--42394 Score: 368
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* * * *
42115 AAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATAAATTAT-AAATTGTTATTACC-TTTAGTTTTATCAT
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*
42178 AAAACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTT-GAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATT
64 AAAACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTAG-AA-AAAAATAATACTAATTTAATAATATT
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* * ** *
42269 AAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATGTATTTCAAATTGTTATAACCATTTGTTTTGTCAGAA
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*** * *
42334 AACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTAATAATATT
66 AACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTAGAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAATTATGACCATTTGAACAACTATAAATTTCAAATTGTTATAACCATTTGTTTTATCAGAA
AACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTAGAAAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA
GAATTAGTAAGAGATCTAAAAAT
Found at i:42427 original size:154 final size:154
Alignment explanation
Indices: 42115--42430 Score: 354
Period size: 154 Copynumber: 2.0 Consensus size: 154
42105 GAATCGGTTC
* * * *
42115 AAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATAAATTATAAATTGTTATTACCTTTAGTTTTATCATAA
1 AAATAATTATGACCATTTGAACAACTATAAATTATAAATTGTTATAACCTTTAGTTTTATCAGAA
*
42180 AACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
66 AACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA
* *
42245 AGAATTAGTAAGAGATCTAAAAAT
131 AAAATTACTAAGAGATCTAAAAAT
* * ** *
42269 AAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATGTATT-TCAAATTGTTATAACCATTT-GTTTTGTCAG
1 AAATAATTATGACCATTTGAACAACTATAAATTAT-AAATTGTTATAACC-TTTAGTTTTATCAG
*** * *
42332 AAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGTTTATTT-AGAA-CAAAATAATACTAATTTAATAATA-T
64 AAAACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTGA-AATAAAAATAATACTAATTTAATAATATT
*
42394 TCTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAAT
128 TC-AAAAA--T-T-ACTAAGAGATCT-AAAAAT
42427 AAAT
1 AAAT
42431 CTGTTTGTTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAATAATTATGACCATTTGAACAACTATAAATTATAAATTGTTATAACCTTTAGTTTTATCAGAA
AACAATTATTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA
AAAATTACTAAGAGATCTAAAAAT
Found at i:42645 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 42629--42653 Score: 50
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42619 CCGAATCGGT
42629 TAAAATAATTA
1 TAAAATAATTA
42640 TAAAATAATTA
1 TAAAATAATTA
42651 TAA
1 TAA
42654 CTATTTCAAC
Statistics
Matches: 14, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
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TAAAATAATTA
Found at i:43134 original size:17 final size:16
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Indices: 43096--43142 Score: 51
Period size: 17 Copynumber: 2.9 Consensus size: 16
43086 GTACAAGCTT
43096 ATTCAAATTAA-AATA
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*
43111 ATACAAATTTAATAATA
1 ATTCAAA-TTAATAATA
*
43128 TTTCAAAATTAATAA
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43143 GTAAGAGATC
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 3, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
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ATTCAAATTAATAATA
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Alignment explanation
Indices: 43311--43648 Score: 432
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43301 CATTCAAAAA
* * *
43311 ATTAAGAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAGTTATAACTA
1 ATTAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAATTATAACAA
* * *
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66 TTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTT-ATAAAACAATT-TTT--G
* *
43440 TTA-ATACAAGTTTATACGGAATAAAATAATACAAATTT
127 TTACATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATACAAATTT
* * * ** **
43478 ATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTATCGAATTAGTT-AAATAATTATGGCAA
1 ATTAATAAGAAAGAGATTTAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAATTATAACAA
* *
43541 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTAT
66 TTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGCTATAACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTGTTA-
* *
43606 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
130 CATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATACAAATTT
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Statistics
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ATACAAGCTTATACGAAATAAAATAATACAAATTT
Found at i:44350 original size:361 final size:359
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43468 ATACAAATTT
* * ** * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
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* *
43606 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAA--ATTAA-TAAGA
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* ** * ** * ** ** * **
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* ** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
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* * *** * * *
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127 --TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
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190 AGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ** *
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* *
44153 TTATTCAAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATTTCAAAA
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* * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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258 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA
** * *
44503 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTAT-GAAA
321 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA
* * * * * * * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTT-ACCAAACAATTCAAATAGTTATGACTA
** * *
44607 TACGAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGAAATTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTG-TTTTAG
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-AACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* * * *
44669 TTCATAGAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGT--
127 -TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * * * *
44732 --GATTTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATCATTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACATTTAT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * ** *
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256 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTT
* * *
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* * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
44964 TTG---AATTGTATACTTCAAATTGTTAT-AACATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTCTAT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* * * * *
45025 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACAAATATAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAA
127 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
45089 GAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGAC-AAACT-AGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
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* ** * *
45214 TGATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTGCAAAA
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* ** * *
45256 ATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAATATTTCTGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAATTCAAATAGTTATGACTA
* *
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* * * * *
45385 TTCATATAAG-TT-TGTTCATAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-T
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* * *
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* * * * * * **
45506 ATTATTTATTTCAAATCGTTCTGA-CTTTT-TTCCTGTTATAAAACATTTGTTTCTGTTCATACA
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* * * * *
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* * * * * * *
45614 ATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGA-TCAAATGGTCATGATT
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-A-ATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
45677 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCTTTTGTCATAAAAGATTTGTTTCGGT
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TT
* * * * * *
45742 -TCATATAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAC-AGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAA
126 ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
45805 GAGATTTAAAAAA-GAATCTGTTTA-TCAAATAAGTTTAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATT
* * ** * * * * * **
45867 ATTTATTTGAAATCGCTATAACATTTTGTTTTGACATAAAATAATTTTTTCTGTTCATACAAGCT
254 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT
* * *
45932 TATTTC-GAATAAAATAATACAAAATTATTAATA-TT-AAGACA
319 TA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-A
* * *
45973 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATTGTTTATCAAACAAGTTCAAAT-GTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* * *
46037 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATGT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-ACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-T
* * * * ** *
46102 -TCATACAAGGTTATTCGGATTAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAA
126 ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * * *
46165 AAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTGAAATAATCATGATTATTTGAATAATTA
191 GAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * *
46230 ACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACGGTTTCAATTCAAATAAGCTT
255 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTT
** * **
46295 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACTTAA
320 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
46400 CTAAATAGTTATCTATTTTAAAACATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACGATTGGTTCTGT-
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TTTA
* * * *
46464 TCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAA
127 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
46528 -AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCT-ACACACA-TTCAAATAATTAT-ATCTATTTGAACAAT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA-ATA-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAT
* ** * * *** *
46589 TATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGC
253 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC
**** *
46654 TTATTTGCTACAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTCAAAA
318 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * ** * ** **
46695 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAATATGTTTACTGAGCGGGTTTGAATAGTTATGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
46760 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTCTTCTTATAAAACAATTGTTTCTA
63 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* ** ** * * * **
46825 CTTATACAAATTTATTCAAAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAGTTAATAAGTTG
127 -TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * * * *
46890 GAGATTTAAAAAAAAAAATTGTTCACTAAATAAGTTCAAATAGTCAAGTCAATTCGAACTATTAG
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
**** *** * * **
46955 CTATTTCAAATCATTATTTTATTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAAATTA
256 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA
* * * *
47020 TTCAGAATAAAGTAGTACCAATTTATTAATATTTCAAAA
321 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
47059 A-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTA-CCAAACAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * ** *
47120 TTTGAACAATTATATATCTAAAATTGTTATGATCTTT-TTTTCTCATAAAGTAATTGTTTCTATT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * * *
47184 CATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAA
128 CATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
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191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
47311 GCTATTTCAAATCATTTTGACCATTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTTATACAA--TT
255 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTT
* ** * * *
47374 A-TCTATTTAAAATTGTTATGAC-ATTTTATTTAACA--T-AAATA
320 ATTCAAAATAAAA---TAAT-ACTAATTTA-TTAATATTTCAAA-A
** * * * * * * *
47415 ATTGTTTCAATTCATA-AAATCTTATCCAAAATAAAATAATG-TTACTTTATTAATATTTCAAAA
1 ATT-AAT-AAGT-A-AGAGAT-TTA--AAAAAT-AAAT-CTGTTTAC--CA--AACAATTC--AA
* * * * ** * *
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51 A-T----AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-A--TT-TCAAATC-GTTATGAAC--TTT---
* * * * * * * * *
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101 --GTT--TT-GT-CATAA--A--A-CAATTGT--TTTTATCATACAAGC--TT-A-TTTGAAATA
* * * * * ** * ** * * *
47600 ACACAAGT-TTATTTTGATTAAAATAATAGT-AATTTATTAAT-ATTTTGACAATTAAAAAGTAA
149 AAATAA-TACTAATTT-ATT--AAT-AT-TTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * * *
47662 A-AGGTTT--TCAA-AA--T-AAATATGTTTACTGAACAAGTTCAA-ATAGTCATAACTATTT-G
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* * * ** ** *
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** * *
47780 CCTTTTGTTTCA-TCATAAAACAACTGTATTAGTTCACATAGGCTTATTTGAAAATAATACTAAT
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* **
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346 TTAAT-AT-TTCAAAA
* * * ** *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * ** *
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* * * * *
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** * *
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* ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
48706 TCATATAAGCTTATTCG-GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAA
127 TCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * *
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191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
*** * * * * * *
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*** *
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** * * *
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* * *
49296 A-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATATATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
49357 ATGAATAATTACCTATTTTAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTAT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* * *
49421 CCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTA
128 -CATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** * *
49484 AGATATTTAAAAAATAAATATGTTTGCTGAACT-AGTTTAAACAGTTAAAACTATATGAATAATT
190 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * ** *
49548 ATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGAT
254 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT
* * *
49613 TATTCGAAATAGAATAAAACTAATTT-TTAATATTTCAAAA
319 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * ** * *
49653 ATTTATAAGTAAGGGATTTAGAAAATAATTTTGTTTACCAAATTAGTTTGAATAATTATAACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
49718 TTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTAT-TACTTTATGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-A
* * * * * * *
49782 TAATATAAGTTTATTCGAAAGAAAATAACACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAA
127 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
49846 GAGAATTAAAAAGTAAATTTGCTTA-TCAA-ACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * **
49909 ATCTATTTCTAATCGTTATAACATTTTAG-TTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATT
254 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGC
* * * *
49973 TTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAA
318 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * * ** * * * * *
50015 CTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTAC
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAATTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * *
50080 ATGAATGATTATCTATGTCAAATTGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTG-TTTTAT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* * * * * * * *
50143 TCATACAAGCTTATTAGGATTTAAATAATACTAATTCAATAATGTTTTAAAAATTAATAAGT-A-
127 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
50206 AGATTT-AAAAATAAATTTGTTTA-TCGAATAAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTAT
192 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * **
50269 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTTCAGCTCATACAAGCTTA
256 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTA
* *
50334 TTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAA
321 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * *
50373 ATTAATTACAAAAAGAGATTCAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATTAC
1 ATTAA-TA-AGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGAC
** * * * * *
50438 TATTTGAGTAATTGTCTATTTAAAATCATTAT-AACCACTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTC
62 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-
* ** ** * **
50502 AGTTAGC--ACAAATTTAAAT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-TGAAATTAATA
124 --TTATCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * ** * * *
50563 AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AATCAGTAAAAATAATTATGGCCATTTGAA-A
186 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *
50626 GATTATCTATTTGAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAA-TCATAC
251 -ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATAC
* * * *
50690 AAGCTTATTCGAAATAAAATAACAATAATTTATTAAT-TTTGAAAA
314 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* *
50735 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACAA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * * ** *
50800 TTTGAACAATTTTCAATCTCAAATTATTAAGATCTTCATTTTGTCATTAAACAAATT-TTTTTAT
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTAT
* * * * * *
50864 CATAAAAGCTTA-TTCAATTAAAAATGATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT-AT---TAAG
128 CATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
** * * * * * ** * * ** * * *
50924 AGATTTAAAAGTTAAATGTGATTGCGGCACCAGTTTAAATAATTAAAACCATTAGAATAATTATC
192 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** * ** ** * * * * *
50989 TATTACAGATTGTTTTGATATTTTGTTAAGTCAAAAAATATTTATTTC-ATATCTTACAAGCTTA
257 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAT-TCATACAAGCTTA
** * * * * **
51053 TTTGAAATAACATAATCCAAATTTATTAACATTTGGAAA
321 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * ** * * * *
51092 ACTAAAAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGCTCAAATAGTTATAATTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * * * **
51157 TTTGAACAATTATTTATTTAAAATTTTTTTG-ACATTTCATTTTGACATATAACAATTGTTTCAA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * *** * * *
51221 TTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATAATAATTTCTTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
127 -TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
51286 CAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTA
191 GAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * *
51350 TCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAGTTCCTATAAGCTT
255 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTT
* *
51415 ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
320 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
51455 ATTAAT-A--AA-TGATTTAAAAAGTGAATATGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATCG-CCA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAATAGTTAT-GACTA
* * * * * * *
51515 TTTCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGTTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTATA
64 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TA
* * *
51580 TCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTCTTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAA
127 TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
51644 GAGATTT-AAAAA-AAATTTGTTTACTGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTGT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * *
51707 ATACTTCAAATCAATTATTTACAAAATAAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTT-ATGTT
256 CTATTTCAAATC----A-TT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATT
* * *
51771 CATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAA
309 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * ** * * * *
51822 ATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAATTTGTTAAGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
51887 ATAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTCAA
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TA
* * *
51950 TTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTGCAAAAA-T--TAA-TA
127 -TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * *
52010 AGAGATTTAAAAAAT-AATTATGTTTACCT-AACT-AGTTCTAATAATTATGACTATTTGAATAA
190 AGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *** *
52072 TTATCTATTTCAAAAT-GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TA-TGTTTTTGTTCATATAA
252 TTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA
* * * * * * *
52134 GTTTGTTTAGAATAAAATAATACAAATCTATTAATATTACAAAA
316 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
52178 A-T--TCA-TAAGAGATTT-AAAAA-AAATCTTTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
52237 TTGAGC-ATTAT-TATTTCAAATTGTTTTG-ACTTT-TTGTTCCATTATAAAACAATAGTTTCTA
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTGTT-TT--GTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * ** * *
52298 TTCATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAATAATTA
127 -TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * * ** * * * *
52362 AAAAATTGAAAACATAAATATGTTTACCAAACT-AGATCAAATAGTGATGACTATTTAAATAATT
190 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
52426 ATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAGAA-AATTATTTCAGTTCATATACGG
254 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-AACAATTGTTTCAATTCATACAAGC
* * * *
52489 TTATTCGAAATAAAATAATACTAA-GTAGTTAGTATTCCAAAA
318 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATATTTCAAAA
* * * ** * *
52531 ATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * * * *
52596 TTAAACAATTATATATTTGGAATTGCTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATT-TCATCT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-C-TTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGT-TTTT
* * * * * * * *
52658 ATTTATACAAGCCTATTTCAGATAAAATAATTCAAATTTATTACTA--ACAAGATAATTAATAAG
126 A-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG
* * * * * *
52721 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTCAC-CACAAAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAAC--
188 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA-ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
52783 --A---A---CAAATTATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAA
252 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAA
* * ** *
52839 GCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATA
316 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
52883 ATTAATAAGCAAAAGATTTAAAACATAAATATGTTTACCGAACAATTTCAAATAGTCATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
52948 TTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAACAAAATAATTGTTTCAGTT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT---TT
* * * *
53013 AACAT--AAGCTTATTTGAAGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAA
126 ATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
** * * * * *
53076 GAGAACTAGAAAAATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATCTGAACAATTA
191 GAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** *
53141 TCTATTTAAAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGGTTT-TGTTCATCCAAGC
255 TCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAATTCATACAAGC
* *
53204 TTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTAATTAATATTCCAAAA
318 TTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *** *
53246 GTTAATAAGCAAAAG-TTTGAAAAATGAATTTTTTTATTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-ATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
53310 TTGAATAGTTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * *
53375 CATGCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCTAAAAATTAATAAGCAAA
128 CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* ** *
53439 AGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTAC-CAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
192 AGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * *
53502 TTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAG-TA
255 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT-
*** *
53566 TATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
319 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * *
53607 ATTAATAAGTTAGAGATTTAAAGAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
53672 TTGAACTATCATCTATTTCGAA-CTGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAATAATACCAATTAT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGA-ACTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-CAATTGT
** * *
53736 TCAAAACAATTGGTATTCATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACCAATTTATTACTATTTC
122 T--------TT--TA-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * *
53800 AAAAA-T--TAA-TAAG-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAATTAAG
175 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * * *
53859 CCTATGAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT
239 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
53924 TAATGT-ATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAA
304 CAAT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAA
* * *
53980 ATTAATAAGCAAGAAATTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * * ** *
54044 TTGAACAATTATCTATTTAAAATTATTATGACCTTTTATTTTTATTGTAAAACAATTG-TTTCAG
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-
* *** * * * * *
54108 TACATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTA
127 T-CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * *
54172 GAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTA-TAGAATCAA-TTCAAATAATTTTGGCCATTTGAATAATT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * *
54235 ATCTATTTTAAATCATTATGAATTTTTGTTTTATCATAAAATAATTATTTTTC-A-TCATACAAG
254 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTCAATTCATACAAG
* *** * *
54298 CCTATTCGGTATAAAATAATACTAATTTACTAATATTT-TAAA
317 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * ** * * *
54340 ATTAATAAGTAGGAGATGT-AAAAATTGATCTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAACAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
54404 TTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTAT-AAGCTTTTGTTATATCATAAAACAATTATTTTTGT
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-A
* * ** * * *
54468 TCATAAAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAA
127 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * ** ** * * *
54532 GAGATTTAAAAAATAAATGTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCT
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * ** *
54597 TTATTTTAAATCATTAGGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTTTTTCAGTTTTTAGTAA-CTT
256 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-CAAGCTT
* * * * *
54661 ATTCAGAGTAAAAAAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAA
320 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
54701 A-T--T-AGTAAGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTGTCGAATCAATTCAAATAATTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCAAACAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
54762 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGCTTTTGT-
65 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT-TA
* * * * * *
54826 TCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATTTTGAAAAATTAAGAAGTAA
127 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
54890 GAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACT-AA-ACAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACCATTA
191 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
54952 TTTACTTCAAATCGTGATGA-CTATTG-TTTGTCATAAACAAGAATTGTTTCTATTCATAC-AGT
255 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA-AACAATTGTTTCAATTCATACAAG-
* * *
55014 CTTATTCAGAATAAAGTAAT-CTAA-TTATTAACA-TTCTAAAA
317 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * ** * * *
55055 ATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAAATGAATTTG-TTAGCCTTGACAGTGCAAATA-ATAT-AC
1 ATTAATAAGTAA-GAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTA-CC-AAACAATTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *** *
55116 TATTTAAACAGTTATCTATTCTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTATTGCAAAACAATTGTTTC
62 TATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGAAC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
55181 TATTCGTACAAGCTTATCTAAAATAAGATAATTCTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGC
125 TA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
55245 AAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATT
189 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *** * * * **
55310 ATCTATATCAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTTATTCATACAAGCT
254 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCT
** * *
55374 TATTTTAAATAAAATAATACAAATTT-TTAATATTCCAAAA
319 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
*
55414 ATTAATGAGTAA
1 ATTAATAAGTAA
55426 AAATTAAAAA
Statistics
Matches: 8973, Mismatches: 1982, Indels: 1272
0.73 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
344 22 0.00
345 3 0.00
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* *
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* * * ** * ** * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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* ** * * *
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*** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * ***
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* *
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* * * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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449 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAATAATTTATTAATAT
* * * * * ** *
42394 TCTAAAAATTTATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTTAAACCAA-TTCAAACAGTT
513 TCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
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576 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * * * *
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*
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* * * * *
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1 TAAAAAATAAAT-TTATTT--CGAA-C---------AAGT-TCAAATAGATTATGACTATTTGAA
* * * * * * *** *
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52 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC
* * ** *
42728 AAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCCGTAAAAGAGT
117 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * * * * * * *
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180 TTAAAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * ** * * * ** **
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* * * * * *
42922 -ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGGAAACTTAA-TAACCAAGAAAATTAAAAGATAAA
309 TA-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT-CAAA---AATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* ** * * * * *
42985 TCTAATT-GTCAAATGAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TATGAATGATTATCTATTTCAAATAGTT
368 TGTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * ** *
43048 ATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTGTTCGTACAAGCTTATTC-AAATTAAAATA
431 ATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATA
* * * *
43111 ATACA-AATTTAATAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGA--TCAAAAA-AAAT-TGTTTATC
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* * * * * * * * *
43170 GAACCAGTTTATAT-GATTAAT-ACTA-TT-AGCAATTATCTATTTTAAATTGTTTTGATCTTTT
558 GAACAAGTTCAAATAG-TT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TATTATGACCTTTT
* * *
43231 GTTTTGTCATAAAAGCAATTGTTTC-AGTTTATACAAGCTTACTC-GAAATAAATTAATACTAAT
620 GTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TCAG-AATAAAATAATATTAAT
* *** * *
43294 TTATTAACATTCAAAAAATTAAGAAGAAAGAGATT
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* * * * *
43329 TAAGAAAATAAATCTATTTATCGAAAAAGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACAATTGTCTAT
1 TAA-AAAATAAATTTA-TT-TCGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* *** * * * * **
43393 TTAAAATTGCTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGTTTATACG
63 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
*
43458 GAATAAAATAATAC---------AA-ATTT-----ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAAT
* * * ** * * * * * *
43508 TTGTTTATCGAATTAGTT-AAATAATTATGGCAATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATA
192 CTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* * * *
43572 ACCATTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTTTATCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATA
257 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTATTTTTGATCATACAAGCTTATTCAGATA-AAAATAATA
* ** * *
43635 CTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTAAACCAG
320 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACTAG
* * * ** * * *
43699 TTTAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATGGTCTATTTTAAATTGTTCT-AGCCTATT-TTTAGTC
385 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTAGTC
* * * * ** * *
43762 ATAAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTTATT-TAGAACAAAATAATCCTAATATATTAACA
449 ATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATAATAATTTATTAATA
** * * * * * * * *
43825 TTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTAACCGAATAAGCTCAAGTAGT
512 TTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
43890 TATGACTATTTGAA-AGATTA-ATATTTAAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAT
575 TATGACTATTTGAACA-ATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** * **
43952 TGCTTC-AGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTCAAAAATT
638 TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-CAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATT
*
44016 AATAAGCAAGAGATT
701 AATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
44031 TAAAAAAATAAATGTGT-TTTCTGAATAAATTCAAATAG-TTGTGACTATTTGAACAATTGTATA
1 T-AAAAAATAAAT-T-TATTTC-GAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* ** *
44094 TTTAAAATCATTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAGCTTATT
62 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA-TACAAGCTTATT
** * * * *
44158 CAAAATAAAATAACAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGA
126 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAA
* * * * * *
44223 ATCTGTTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
190 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * *
44288 TGAAC-ATT-TTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTGT-TTGAAAT-AAAATA
255 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTATTTTTGATCATACAAG-CT-TATTCAGATAAAAATA
* * * *
44349 ATATTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-T
317 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACTAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACT
* ** * *
44412 CGAAGC-AGTTC------TT---A-T-TT-GAATAATTACCTATTTCAAATCATTATAACTTTTT
378 -GAA-CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
* * * * *
44464 ATTCTATTC-T-AAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
441 GTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTT
* *** * ** * *
44527 AATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTGTCGAAGC-AGTT
505 ATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCGAA-CAAGTT
* * * ** * * * **
44591 TAAATAGTTAAGACAATACGAATAATTATCTATTTCAAATGTTATGAAATTTTGTTTTGTCAT-A
567 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* ** ** * ***
44655 AACAATTGTTT-TAGTTCATAGAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAACATTCCA
632 AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTG
44719 AAAATTAATAAGT----GATT
695 AAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * *
44736 TAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATC-ATTTCAAATA-ATTATGGCCATTTCAACATTTATCTAT
1 TAAAAAATAAATTTATTT-C-GAA-CAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * ** *
44799 TTCAAACCATTATTACCTTTTGTATGGTCATATAACAAGTGTTTTTGA-TCATTCAAGCTTA-TT
63 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTT
* * * *
44862 CAGAATACAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAA
127 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAA
* * * * * * * *
44927 ATCTGTTCATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTG---AATTGTATACTTCAAATTGTTA
190 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * **
44989 TAACATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATA
255 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTATTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAGATA-AAAATA
* * * * *
45052 ATACAAATATAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGAC
317 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-AC
* * * *
45115 -AAACTAGTTCAAATATTTAAGACTA-TATGAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACCTTTT
377 TGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
* * * * *
45178 GCTTT-GTCATAAAACAAAT-TTTCAATTCATACTAGCTGATTTGAAATAAAATAA-AATGAATT
441 G-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAAT-AATT
* * ** * *
45240 TATTAATATTGCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAATATTTCTGTTTACCTAACCAA-T
504 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAA-CAAGT
* * *
45304 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
566 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * * * *
45369 AAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCATAATAAAGTAATACTAATCTATTAATA-TTT
630 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
* *
45433 CAAAA--ATTAA-TAAGAGATT
694 GAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
45452 TAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGACA-AATTATTTAT
1 TAAAAAATAAATTTA-TT-TCGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGA-ATAATTATCTAT
* * * * * ** *
45515 TTCAAATCGTTCTGA-CTTTT-TTCCTGTTATAAAACATTTGTTTCTGTTCATACATGCTTA-TT
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* * * * *
45577 CAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATA
127 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAATA
* * * * * * * * *
45641 AATATGTTTATCGAACTAGATCAAATGGTCATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
189 AATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * * * *
45706 ATGACC-TTTCTTTTGTCATAAAAGATT-TGTTTCGGTTCATATAAGTTTATTC-GAAATAAAAT
254 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATTAT-TTT-TGATCATACAAGCTTATTCAGATA-AAAAT
* * * * *
45768 AATAC-AGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-GAATCTGTTTA-T
316 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACT
* * * * * * * * * * * *
45830 CAAATAAGTTTAAAT-GATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGCTATAACATTTT
378 GAACT-AGTTCAAATAG-TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT
* * * * * *
45894 GTTTTGACATAAAATAATTTTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACA-AAAT
441 GTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATA-ATAATT
* *
45957 TATTAATATT--AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATTGTTTATCAAACAAG
504 TATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTATCGAACAAG
*
46020 TTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTCTTTGTTTTGTC
565 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TATTATGACCT-TTTGTTTTGTC
* * * * * *
46083 ATAAAACAATTGTTTATGTTCATACAAGGTTATTCGGATTAAAATAATACTAA-TTATTAATATT
628 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
* *
46147 TTGACAATTAATAAGTAAAAGATT
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* * * * * * *
46171 TAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTGAAATA-ATCATGATTATTTGAATAATTAACTAT
1 T-AAAAAATAAATTTATTT--CGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* ** * *
46235 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACGGTTTCAATTCAAATAAGCTTATTTG
63 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
* ** * *
46300 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACTTAAATTAATGAGTAAGAGACTTAAAAAATAAAT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAAT
* * ** * * * * * * * * *
46365 TTGTTTACCGAATAAGCTCAAATAGCTATGACTATCTAAATAGTTATCTATTTTAAAACATTATG
192 CTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* ** * * * *
46430 AACTTTTGTTTTGTCATAAAACGATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCAAAT-AAAATAATA
257 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTATTTTTGATCATACAAGCTTA-TTCAGATAAAAATAATA
* * * * *
46494 -TAAATTGATTAATATTACAAAAATTAA-TAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCT-AC
320 CT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAACTAAG---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGA-
* * * * * * *
46556 AC-ACATTCAAATAATTATA-TCTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGT
380 ACTA-GTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT
* * ** * * ** * *
46619 TTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGCTACAAAATAATACTAATTTATT
443 TTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATT
* * * ** **
46684 AA-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAATATGTTTA-CTGAGCGGGTTTG
508 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-A-TTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCA
* * * * *
46747 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTCTTCTTATAAA
569 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
** * * *
46812 ACAATTGTTTCTACTT-ATACAAATTTATTCAAAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTT-A
633 ACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGA
**
46875 AAAGTTAATAAGTTGGAGATT
696 AAA-TTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * * * * * *
46896 TAAAAAAAAAAATTGTTCACTAAATAAGTTCAAATAG-TCAAGTCAATTCGAACT-ATTAGCTAT
1 TAAAAAATAAATTTATT-TC-GAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTAT
**** *** * * ** *
46959 TTCAAATCATTATTTTATTTTGTTTTGTTGCAAAACAATTGTTTCTACTCATACAAAATTA-TTC
63 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
* * *
47023 AGAATAAAGTAGTACCAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAG-AAGAGATTTAAAAAACTAA
128 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA-TAA
* * * * * * *
47084 ATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTAAAATTGTTA
190 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * *
47149 TGATC-TTT-TTTTCTCATAAAGTA-ATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAGAGT-AAAAT
255 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAA--ACATTATTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAGA-TAAAAAT
* * * * * *
47209 ATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
316 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTAC
* * * * ** * *
47273 TGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATTAGAATAATTAGCTATTTCAAATCATTTTGACCATTTG
377 TGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * ** **
47338 TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTTATACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTAT
442 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAA-GCT-TATTCGAAA----TA--A-A----A-
* *
47403 TTAACATAAATAATTGT-TTCAATTCATAAAATCTTATCCAAAATAAAATAATGTTACTTTATTA
493 -T-A-AT-AATAATT-TATT-AA-T-AT----TC----CAAAAAT-TAATAA-G-TA----A--A
* ** * * *
47467 ATATTTCAAAAATTGAGAAGT-TGGAGATTTA-AAAAAAAATT-AAGT--TTATCGAATCAATTA
533 A-ATTT-AAAAAAT-A-AA-TCT---G-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-G-A-C---TA
* * * *
47527 TGACTATTTAAACAATTACTTATTCCAAATCATTATGA-CTTTTCATTTTGTCATAAAACAATTG
583 T------TTGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** * * *
47591 ATTT-TGTTCACACAAGTTTATTTTGATTAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTTGACAATTAA
640 -TTTCTATTCATACAAGCTTA-TCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA
* * *
47655 AAAGTAAAAGGTT
703 TAAGTAAGAGATT
** * * * *
47668 TTCAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAATAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATTTATTT-C-GAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
47732 TCAAATCTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTCATCATA
64 TCAAA--TCAT---TA--TG-------A-C-----C---TT--T-TG---TTTTG-----TCATA
* * * * * *
47797 AAACAACTGTATT-AGTTCACATAGGCTTATTTG----AAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
95 AAACAATTGT-TTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * ** * *
47857 TAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAA--TG-TTACCGGACAAGTTCAAATGGTTATG
159 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-ATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * *
47919 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-CTGTTATGACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGTT
222 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CATTATT
* * * *
47983 TATGTTCAT--AAGCTTATTTCAAAT-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA-
285 TTTGATCATACAAGCTTA-TTCAGATAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAC
* * * * * *
48043 TAAGCAAAAATTT-AAAAATAAATTTGTTTTCTAAACATA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
348 TAAG---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAAC-TAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA
* * * * *
48106 -CATTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATA
409 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA
* *
48169 CAAG-TGTATTTGAAATAAAATAATAATATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATT
473 CAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAA-T
* *
48233 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAGCAAGTTCATATCA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
536 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
** * *
48297 TTCAAATAGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTCTATTCATACAAGTTTAGTCA
600 TTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TCA
* * * *
48362 GATTAAAATAATATTATTTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGGTAGGAGATT
663 GAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
48415 TAAAAAAAATAAATCTATTTCGAACAAGTTTAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATT
1 T--AAAAAATAAATTTATTTCGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
** * * *
48479 T-AAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAACTTATTTG
64 TCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
* * * *
48543 AAATAAAATAATAATACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAG
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAA-
* * * * * * *
48608 T-TGTTTTCCAAACCAGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAAGAAATATCAATGTCAAATCATTAT
191 TCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * *
48672 GATC-TTTGTTTTCTCATAAAACATCTATTTTTGATCATATAAGCTTATTCGGATAAAAATAATA
256 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAT-TATTTTTGATCATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAATA
* * **
48736 CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATTAATGTGTTTACCAAACTAG
320 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAACTAG
* * * *
48800 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGACCTTTTCTTTAGTTA
385 TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCA
* * * * * * *
48865 TACAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC
450 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTC
* ** * * * * * *
48930 AAAAAATTAATAAACATGAGATTTGAAAATATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
515 CAAAAATTAATAAGTA-AAAATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
48995 GACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAATCATT-TGACCATTTGTTTTATCATAAAATAGTTGTT
578 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * **
49059 T-TAGTTCATAAAATCATATCCA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
642 TCTA-TTCATACAAGCTTAT-CAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
*
49122 AGTAAAAGATT
705 AGTAAGAGATT
** * * * *
49133 TAAAAAATAAA-TTAGTTTACCGAATTAGTTCAAATA-ATTATGGCCATTTGAACAACTATCTAT
1 TAAAAAATAAATTTA-TTT--CGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* *
49196 TTCAAATCATTATTACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAA--CATACAAGTTTATT
63 TTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATT
* * * *
49259 TAAAATAAAATAATACTAATTCATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAT
126 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAA
* * * * * *
49320 ATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATATGAATAATTACCTATTTTAAATTGTTA
190 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * *
49385 TAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATCCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATA
255 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTATTTTTGAT-CATACAAGCTTATTCAGATA-AAAATA
* * * *
49448 ATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATATGTTTGCT
317 ATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACT
* * * * *
49512 GAACTAGTTTAAACAGTTAAAACTA-TATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCATTTG
378 GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
49576 TTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGATTATTCGAAATAGAATAA-AACTAATTT-
442 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAA-TAATTTA
* * ** * * * * * ** **
49639 TTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGGGATTTAGAAAATAATTTTGTTTACCAAATTAGTTTGA
506 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAA
* * * * *
49704 ATAATTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAA
570 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * * * *
49768 ATAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTATTC-GAAAGAAAATAACACTAATTTATTAATATTTAGA
633 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGA
* *
49832 AAATTAATCAGTAAGAGAAT
696 AAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
49852 TAAAAAGTAAATTTGCTTATCAAACCATTTCAAATAG-TTTTGACTATTTGAATAATTATCTATT
1 TAAAAAATAAATTT-ATT-TCGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * * **
49916 TCTAATCGTTATAACATTTTAG-TTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTT-
64 TCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
* * * ** * *
49979 AGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAA
128 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAATAAA
** * * * ** ** * *
50044 TCTAATTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAATGATTATCTATGTCAAATTGTTAT
191 TCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * **
50109 AACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACA--ATTGTTTTATTCATACAAGCTTATT-AGGATTTAAATAA
256 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATTATT-TTTGA-TCATACAAGCTTATTCA-GATAAAAATAA
* * * * *
50171 TACTAATTCAATAATGTTTTAAAAATTAA-TAAGTAAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTA-TCGA
318 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACTAAG--AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACT-GA
* * *
50233 A-TAAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTT
380 ACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
50297 TAGTTATAAAACAATTGTTTCAGCTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTA
444 TAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTATTA
* * * * * *
50362 ACATTCAAAAAATTAATTACA-AAAAGAGATTCAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCA
509 ATATTCCAAAAATTAA-TA-AGTAAA-A-ATT-TAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCA
* * ** * * * * ** *
50426 AATAGTAATTACTATTTGAGTAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCACTTGATTTGTCATAAA
569 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* **
50491 ACAATTGTTTC-AGTT-AGCACAAATTTAAAT-AGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
633 ACAATTGTTTCTA-TTCA-TACAAGCTT--ATCAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTT
*
50553 G-AAATTAATAAGTAAGAAATT
694 GAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** * *
50574 TAAAAAATAAATTTGTTTACTAATC-AGTAAAAATA-ATTATGGCCATTTGAA-AGATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATTTATTT-CGAA-CAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATA-ATTATCTAT
* * * *
50636 TTGAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAA-TCATACAAGCTTATTC
63 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTT
* * *
50700 GAAATAAAATAACAATAATTTATTAAT-TTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAGTAA
127 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA-TAA
* * * * **
50764 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAACAATTTTCAATCTCAAATTATTA
190 ATCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * ** * * *
50829 AGATC-TTCATTTTGTCATTAAACAAATT-TTTTT-ATCATAAAAGCTTATTCA-ATTAAAAATG
255 TGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAA-ACATTATTTTTGATCATACAAGCTTATTCAGA-TAAAAATA
* * * ** * * * *
50890 ATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT-ATTAAGAGATTTAAAAGTTAAATGTGATTGCGGCAC
317 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAAC
* * * * * * * * ** *
50954 CAGTTTAAATAATTAAAACCATTAGAATAATTATCTATTACAGATTGTTTTGATATTTTGTTAAG
382 TAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAG
* * * * * * * *
51019 TCAAAAAATATTTATTTCA-TATCTTACAAGCTTATTTGAAATAACATAATCCA-AATTTATTAA
447 TCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-AATAATTTATTAA
* *** * * * * * *
51082 CATTTGGAAAACTAAAAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAATAAGCTCAAAT
510 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAAAT
* * * * * * ** * *
51146 AGTTATAATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTTTTTTGACATTTCATTTTGACATATAACA
572 AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
51211 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCATATCCAAAATAAAATAATAATAATTTCTTAATATTTTAAAAAT
636 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-CAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAAT
*
51276 TAATAAGTAACAG-TT
700 TAATAAGTAAGAGATT
* * * *
51291 TAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAG-TCATGACTATTTAAATAATTATCTAT
1 T-AAAAAATAAATTTATTT--CGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * * *
51355 TTAAAATCGTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAATAATTGCTTCAGTTCCTATAAGCTTATTCG
63 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTG
* * *
51420 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT-A--AA-TGATTTAAAAAGTGAAT
128 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAAT
* ** * * * * *
51481 ATGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATCG-CCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCGTTGT
192 CTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * *
51545 TACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTAT-ATCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAA
256 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTATTTT-TGATCATACAAGCTTATTCAGATA-AAAATAA
* * * *
51608 TACTAATTTCTTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAA-AAATTTGTTTACTGA
318 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGA
* * * * * * *
51671 A-TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTACAAAATA
380 ACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTC--A--AATT-GTT-----AT-
* * * * * *
51735 AACCTTTTGTTCTA-TTATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAA
433 GACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * * * * * *
51798 TACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCAA
496 TAATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGA
* * * * * * * * *
51863 ACTAGTTCAATTTGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTT
560 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTT
* * * * ** * *
51928 TGTTATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAAAATGAATTTATTAA
624 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATCAG-AATAAAATAATATTAATTTATTAA
*
51993 TA--TTGCAAAA--ATTAA-TAAGAGATT
688 TATTTTG-AAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * *
52017 TAAAAAAT-AATTATGTTTACCTAACTAGTTCTAATA-ATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
1 TAAAAAATAAATT-TATTT--CGAACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * *** * * *
52080 TTCAAAAT-GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TA-TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT
63 TTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTT
* * * *
52142 -AGAATAAAATAATACAAATCTATTAATATTACAAAAA-T--TCA-TAAGAGATTTAAAAA-AAA
127 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAA
* * * * * * *
52201 TCTTTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGC-ATTAT-TATTTCAAATTGTTTT
191 TCTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* *** * * * * *
52264 GACTTTTTGTTCCATTATAAAACAATAGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAAT
256 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATTA-TTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAAT
* * * * * * * * **
52328 ACTAATTTATTATTATTTTGACAATTAA-TAATTAAAAAATTGAAAACATAAATATGTTTACCAA
319 ACTAATTTATTAATA-TTT--CAA-AAATTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGA
* * * *
52392 ACTAGATCAAATAGTGATGACTATTTA-AATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CTTTTGTT
380 ACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
52455 TTGTCATAAGAA-AATTATTTCAGTTCATATACGGTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-GTAGT
444 TAGTCATAA-AACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATTTA-T
* * * * * *
52518 TAGTATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAAACTATTTA-CTGAACAAGTTTAA
507 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACAAGTTCAA
* * * ** *
52582 ATAATTATGACTATTTAAACAATTATATATTTGGAAT-TGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
570 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAT--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * ***
52646 A-AGATT-TCATCTATTTATACAAGCCTATTTCAG-ATAAAATAAT-TCAAATTTATTACTAACA
633 ACA-ATTGT-TTCTATTCATACAAG-CT-TATCAGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTT
* * *
52707 AGATAATTAATAAGTAAAAGATT
693 TGAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * *
52730 TAAAAAATAAATATGTTCACCACAAAAGTTCAAATCG-TTATGACTATTTG----A--A-C-A--
1 TAAAAAATAAATTTATT-TCGA-ACAAGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * * *
52784 ACAAATTATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTA-TTC
64 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTTG
* ** * * *
52847 AAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAACATAAA
128 AAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-ATAAA
* * * * * * * * *
52912 TATGTTTACCGAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTGT
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* * * * ** * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* *
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* * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * **
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * *
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* * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* ** * * * * **
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** * *
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* * * * * * * *
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* * * **
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* * * * * ** * *
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* * ** * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * **
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*
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* * * * ** * *
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1 TAAAAAATAAATTTATTT-CGAACA-AGTTCAAATAGATTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * *
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64 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA-AACAATTGTTTCAATTCATACAAG-CTTATT
* * *
55019 TCAGAATAAAGTAAT-CTAA-TTATTAACA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAA
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* * ** * * * *
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* * * *** * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * **
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* *
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* *
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* * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * ** ** *
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* * * * ** *
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* * * * * *
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* * * **
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* * * * *
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* * * * * *
57701 AA-TTTAAATAGTTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGAACTTTTGTTTT
1 AAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
** * * *
57764 GTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAAAAATACCAATTTATTAAT
65 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
57829 ATTTCAAAAAAATT-ATATGTAGGAGA-TT----AT---T-TGTTTACT-AA-
130 A-TTC-TAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAATAAATCTG-TTACTGAAC
* * * * * *
57870 AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGTCATTAT-AACTTTT-TTTTG
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
57933 TCATAAAA-TATT-TTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAAAAAATAATAATATTAATCTAATA
66 TCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATT-TAGAATAA-AATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * * * **
57996 ATATTATGAAAGTTAATAATTATGAGATTTGAAAATAAATTTTTTGTTGAAGCC
128 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAATAAATCTGTTACTGAA--C
* * * * * **
58050 CAGTTCAAATAGTTA-AAGCTATATGAATAATTATCCA-ATCAGAATAAATTATGTA-CTTTTGT
1 AAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AAT-CGTTATG-ACCTTTTGT
* * * * * *
58112 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAATAATATTAAGTTATT
62 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
** * **
58177 AATATT-TTGAAATTAAT--G--AG--ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC
127 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAATAAATCTG-TTACTGAAC
* * * * * * * * *
58225 TAGTTTAATTAGTTATTAACAATTTAAACAATTAT-TATTT-ATATCGTTATGACCATTTGTTTT
1 AAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
58288 GTCATAAAATAATTATGTTCTATTGATAC-AGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTA
65 GTCATAAAACAATTGT-TTTTGTTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
58352 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAATAATGAATCTGTTGGCTTG-AC
128 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAA-AATAAATCTGTT-AC-TGAAC
* * * *
58406 CAGTTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTATT
1 AAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC--TTTTGTT
* * *
58471 TTGTCAT-AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAACA-AATTCTAATTTATTA
63 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
58534 ATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAATTGAATTTGTTTA-TCGAAAC
128 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAA-TAAATCTG-TTACT-G-AAC
* * ** * * *
58589 AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTATTTTA
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
58654 TCATAAAATAATT-TTTGCTATTCTTATAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATAC-AAGGTTATT-
66 TCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAA-TTTATTA
* * * ** *
58715 ATCATTC-AGACAATTAAAAAG-AAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAT
128 AT-ATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTT-AAAAATAAATCTG-TTACTGAAC
* *
58771 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTTGTTTT
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTT
* ** * * *
58835 GCCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAGTTTATTAAT
65 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
58900 ATTTTGATAGTTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAAT
130 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTTAAAAATAAATCTG-TTACTGAAC
* * * * * **
58952 AAGTT-AAATAGTTATAATTATTTGAATAATAATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTCA
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * * *
59016 TCAT-AAACAATTGTATCAT-TTCATATAGGCTTATCTAAAATAAAATCATACTAATTTATTAAT
66 TCATAAAACAATTGT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * * * *
59079 ACTCTAAAAATTAACGAGAAAGAGATTTAAAAATGAATCTATTTATTGAAC
130 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAATAAATCT-GTTACTGAAC
*
59130 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AA-AATTTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTT
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * *
59192 GTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATATT-GAATAAAATAGTA-TAAATTTACTA
65 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * **
59255 ATATGCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAAC
128 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAATAAATCT-GTTACTGAAC
* * * * * *
59308 ACA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTCATAACCTTTTGTTTT
1 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
59372 ATCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTT-GAAATAAAATAATGCTATTTTATTAA
65 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * ***
59436 TATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AATATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGCGT
129 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT-AAAAATAAATCT-GTTACTGAAC
* * * * * *
59489 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATCATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTG
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
59554 TCATAAAGCAATTGTTTCTATTCACATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
59619 TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCGAAC
131 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAATAAATCTG-TTACTGAAC
* * * ** * * * *
59670 AAGTTCAAATAATCATGTCCGTTTGAATAATTATTTGTTT-ATAATTGTTATCACCTTTTGTTTT
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * * * *
59734 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATTACTAATCTACTAA
65 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAA
* * * *
59799 TATTTTGAAAATTAATAA--CAG--ATTTAAAAACTAAATCTATTTACTGAA-
129 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAA-TAAATCT-GTTACTGAAC
*
59847 ACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCGTTATG--CTTTTCATT
1 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTT
** * * *
59909 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTTGTACCAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTAAT
63 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * **
59973 AATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAAC
127 AATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAATAAATCTG-TTACTGAAC
* * *
60028 TAGCTCAAATAGTTAAGACTATTT
1 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
60052 TGTCATAAAA
Statistics
Matches: 2697, Mismatches: 548, Indels: 351
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 4 0.00
167 23 0.01
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185 16 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAATAAATCTGTTACTGAAC
Found at i:60386 original size:183 final size:181
Alignment explanation
Indices: 60060--61448 Score: 912
Period size: 183 Copynumber: 7.7 Consensus size: 181
60050 TTTGTCATAA
* * * * * *
60060 AACACATTCAAATAGTTATTATTAGTTAAACAATTATTTATTTCAAGTAGTTATGACCTTTTGTT
1 AACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * * * *
60125 TTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCAAACATGTGTATTCAAAATAAAATAATGCTAGTTTATTC
65 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
*
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130 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAAATAAATCTATTTACTG
* *** * * * *
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1 AACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT
* *
60308 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAAGAATACTAATTTATTA
65 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** * * * *
60373 ATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-ACAAAATAAATTTGTTTA-TCA
130 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACT-G
* * * * * *
60424 AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATGTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTT
1 AACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT
* * ** * * *
60489 TTGTTATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTTAGAATAAAATAATATTTATCTATT
65 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTA-TTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * **
60554 AATTTTTTGAAAATTAATAAG----AGATTT--AAAACTTAATCTATTTTTTG
129 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTG
* * * *
60601 AAACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTAT-T
1 -AACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTT-TGT
* * * ** * *
60665 TTT-T-ATAAAACAATTGTTCCT-TTAATACAACCTTATTCA-AATTAAAATAATACTAATTTAA
64 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
60726 TAATATTAC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGCTAA
128 TAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACT-G
** * *
60781 AACAATTCAAATAGTTAACACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACC-TTTGTT
1 AACAATTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTT
** * * * *
60845 TAATCATAAAGCAATTATTTCAATTCGTACAAGTTTATTTAGAACAAAATAATACTAATTTATTA
65 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
60910 ACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAGATAAAATCTATTTATTG
130 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAT-AAATCTATTTACTG
* * * *
60963 AACAAATTTAAATAGATT-GGACTATTTGAACAATCAATCTAACTATTTAAAGTCA-TTATGACC
1 AAC-AATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAAT-TATCT-A-T-TTCAAA-T-AGTTATGACC
* *** * * * * * ** ** *
61026 TTTTCTTCCATTATAAAATAA-TGTTTC-AGCTCATAGAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTA
58 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTA
* * * * * *
61089 CTTTACTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAACTAAAACTATTT-TTCG
122 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACT-G
* * * * *
61148 AATCAATTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAAATATC-ATTCTCAAATCA-TTATGATC-TTTG
1 AA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT-TCAAAT-AGTTATGACCTTTTG
* * * * * * *
61210 TTTTCTCTTAAAATAATTGTTTCTGA-TCAT----GCTTATTT-GGATAAAATAATAATAATTTA
63 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
61269 ATAATATTTTAAAAATT-A-AA--AAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTG
127 TTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTG
* * * * * * * * * *
61319 AACCAGTTCGAATAATTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTAATCATTTGT
1 AA-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGT
** * * * ** *
61383 TTAATCATATAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
64 TTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTA
61446 TTA
127 TTA
61449 GCATTTATTT
Statistics
Matches: 956, Mismatches: 197, Indels: 112
0.76 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
170 1 0.00
171 67 0.07
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182 119 0.12
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186 12 0.01
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188 14 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
AACAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTT
TGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
TATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTG
Found at i:60896 original size:355 final size:358
Alignment explanation
Indices: 60249--60898 Score: 796
Period size: 356 Copynumber: 1.8 Consensus size: 358
60239 ACTGAGCAAG
* * * *
60249 TTCAAATAGTTATGACTGGATGAACAAGTATTTATTTCAAATAGTTGTGATCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCA
* * ** ** *
60314 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAAGAATACTAATTTATTAATATTC
66 TAAAACAATTATTCCTATTAATACAACCTTATTTCAAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTC
* ** * * * **
60379 TAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTACAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATG
131 TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAAACAAGTTCAAATAGTCAAC
* * * ** *
60444 TCCATTTGAACAATTATGTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTT
196 ACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAATCATAAAACAATTATTT
* * *
60509 CTATTTATACAAAATTATTTTAGAATAAAATAATATTTATCTATTAATTTTTTGAAAATTAATAA
261 CAATTCATACAAAATTATTTTAGAACAAAATAATATTTATCTATTAATTTTTTGAAAATTAATAA
60574 GAGATTTAAAACTTAATCTATTTTTTGAAACAA
326 GAGATTTAAAACTTAATCTATTTTTTGAAACAA
** * * *
60607 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTAT-TTTT-T-
1 TTCAAATAGTTATGACTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTT-TGTTTTGTC
* *
60669 ATAAAACAATTGTTCCT-TTAATACAACCTTA-TTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 ATAAAACAATTATTCCTATTAATACAACCTTATTTCAAA-TAAAAGAATACTAATTTAATAATAT
*
60732 TAC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTGCTAAAACAA-TTCAAATAG
129 T-CTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTT-ATAAAACAAGTTCAAATAG
* * * *
60795 TTAACACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACC-TTTGTTTAATCATAAAGCAA
191 TCAACACCATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAATCATAAAACAA
* **
60859 TTATTTCAATTCGTACAAGTTTA-TTTAGAACAAAATAATA
255 TTATTTCAATTCATACAAAATTATTTTAGAACAAAATAATA
60899 CTAATTTATT
Statistics
Matches: 243, Mismatches: 43, Indels: 15
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
354 4 0.02
355 71 0.29
356 81 0.33
357 36 0.15
358 50 0.21
359 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
TTCAAATAGTTATGACTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCA
TAAAACAATTATTCCTATTAATACAACCTTATTTCAAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTC
TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAAACAAGTTCAAATAGTCAAC
ACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAATCATAAAACAATTATTT
CAATTCATACAAAATTATTTTAGAACAAAATAATATTTATCTATTAATTTTTTGAAAATTAATAA
GAGATTTAAAACTTAATCTATTTTTTGAAACAA
Found at i:60929 original size:355 final size:360
Alignment explanation
Indices: 56455--60020 Score: 1149
Period size: 358 Copynumber: 10.0 Consensus size: 360
56445 NNNNNNAAAG
* * **
56455 TTCAAATAGTAAT-ACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * *
56518 ATAAAATAATTGTATCAATTCATATAGGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAACTTATTACTAT
66 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * *
56582 TTC-AAAAATTAATGAGTAAGAGATTT-AAAAATGAATCTGTTTACTAAACAAGTTC-AATAGTT
129 TTCAAAAAATTAATAAG-AAGA-TTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
** * * * * *
56644 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGCCATAAAATAATT
192 ATGACTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
56708 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT--TGAATTTACTAATATTCCAAAGATTA
256 ATTCCTATTAATACAACCTTATTTCAAATAAAAGAATACT-AATTTAATAATATTCTAAAAATTA
* * * ** *
56771 ATAAGTAAAA-ATATAAAAAATAAATATATTTTTTGAACACG
320 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAAACA-A
* ** * * ** * * **
56812 TTGAAATAGTTATGGCTATTT-GAACAATTATCTATTACAAATCATGATGACTTTTTGTTTTACC
1 TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** * * * * *
56876 AGAAAACAATTGTTTTTATTTGTAAAAGCTTA-TCAAAATAAAAT-A-A-TAATTTATTAAAATT
66 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * * ***
56937 CCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAATAAATTTGTTTAACT-AGTGAGTTCAAATAGTTAT
131 CAAAAAATTAATAAG-AAGATTTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** * * * * * * * * *
57001 GAATATTTAAATAATTATTTGT-TTAAATCGTTATGATCTTTT-ATTTGTCATAAAAACAATTGT
194 GACTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTAT
* * ** * * * * *
57064 TTCTATTTATACAAAATTA--TCAGAATAAAATAACACTAATTT-ATTATATTTTGAAAATTAAT
258 TCCTATTAATACAACCTTATTTCA-AATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAAT
* * *
57126 AAG----AGATTTTAAAAACTAAATATGTTTACATAGACAA
322 AAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATA-AAACAA
* * * * * * *
57163 TTTAAATAGTTATGA-TATTT-GAATAATTATCTATCTCCAAATTGGTATGATC-TTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTAT-TTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** ** * ** ** *
57225 CATTAAATAA-TGTTTCTA-TCTATACAAACTTATTCGGCAGTAAAAT-ATTGTCAAACTAATAA
65 CATAAAACAATTATTTCTATTC-ATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAA
** * * * * **
57287 TATTTTAAAAATTTATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATATTT-GTCGAATTAGTTCAAATA
127 TATTCAAAAAATTAATAAG-AAG-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * * * *
57351 GTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGA-CCTTTGTTTAGTTATAAAATA
189 GTTATGACTAGAT-GAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * * * * *
57414 ATTGTTTCAATTCATACATA-CTTATTTGAAATAAAATAATATTATTTTATTAACATTC-AGAAA
253 ATTATTCCTATTAATACA-ACCTTATTTCAAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCTA-AAA
* * * * **
57477 ATTAATAAGCAAGCA-ATTTAAAAACATAAATCTGTTAACCAAACAA
316 ATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAA-ATAAATATGTTTATAAAACAA
* * * * * * * *
57523 GTTAAAATAATTATGACTGTTT-GAACAATTATC-ATTTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTA
1 -TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTA-TTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** ** * * *
57586 TCATAAAATAATTGTTTC-ATTTCATAAAACCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
57650 ATT--AAAAATTGAA-AATTTGGAA-A-TTTAAAACAGAAATCAATTTATTCAATCAA-TTTAAA
128 ATTCAAAAAATT-AATAA----GAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAA
* ** * * * *
57709 TAGTTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGAACTTTTGTTTTGTCATAAA
187 TAGTTATGA-CTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAA
* ** * * * *
57772 ACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCC-TATTT-AGAATAAAAAAATACCAATTTATTAATATTTC
250 ACAATTATTCCT-ATTAATACAA-CCTTATTTCA-AATAAAAGAATACTAATTTAATAATA-TTC
* * ** *
57834 AAAAAAATT-ATATGTAGGAGA-TT-----AT---T-TGTTTACT-AAA-AG
311 -TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TAAAACAA
* * * ** *
57873 TTCAAATAATTATGACTATTT-GAACAATTATATATTTCAAGTCATTAT-AACTTTT-TTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * * * *
57935 ATAAAA-TATTTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAAAAAATAATAATATTAATCTAATAATA
66 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATT-TAGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** *
57999 TT-ATGAAAGTTAATAATTATGAGA-TTT-GAAAATAAAT-TTTTTGTTGAAGCCCAGTTCAAAT
129 TTCA-AAAAATTAATAA-GA--AGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA--CAAGTTCAAAT
* * * * * * *
58060 AGTTA-AAGCTATATGAATAATTATCCA-ATCAGAATAAATTATG-TACTTTTGTTTTGTCATAA
188 AGTTATGA-CTAGATGAACAAGTATCTATCTCA-AAT-AGTTATGAT-CTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * * * ** * * * * * *
58122 AACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT-AGAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATT-TT
249 AACAATTATTCCTATTAATACAACCTTATTTCA-AATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCTA
* * ** *
58185 GAAATTAAT--G----AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACTAG
313 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAAAC-AA
* * * * * *
58228 TTTAATTAGTTATTAACAATTTA-AACAATTAT-TATTT-ATA-TCGTTATGACCATTTGTTTTG
1 TTCAAATAGTTA-TCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCA-AGTTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
58289 TCATAAAATAATTATGTTCTATTGATAC-AGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATTAT-TTCTATTCATACAAGT-TTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * ** *
58353 TATTCTAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAATAATGAATCTGTTGGCTTG-ACCAGTTGCAAAT
127 TATTCAAAAAATTAATAAG-AA-GATTTTAAAAAATAAATCTATTTAC-TGAACAAGTT-CAAAT
* * * * * *
58417 AGTTATGACT-GTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTTTATTTTGTCAT-A
188 AGTTATGACTAG-ATGAACAAGTATCTATCTCAAAT-AGTTATGA--TCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * * * *
58479 AACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAACA-AATTCTAATTTATTAATATTCTA
249 AACAATTATTCCTATTAATACAACCTTATTTCA-AATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCTA
* * * * * *
58542 AAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAATTGAATTTGTTTATCGAAACAA
313 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-AAAACAA
* * * * * * ** * * *
58591 GTTTAAATAGTTATGACTATTT-GAATAATTACCTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTATTTTAT
1 -TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
58655 CATAAAATAATT-TTTGCTATTCTTATAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATAC-AAGGTTATT-A
65 CATAAAACAATTATTT-CTATTCATACAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAA
* * * * ** *
58716 TCATTCAGACAATTAAAAAGAAAAAGATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAAT
127 T-ATTCAAAAAATTAATAAG---AAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAAT
** * * * * * *
58781 AGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTTGTTTTGCCATAAAAC
188 AGTTATGACTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * * * * * * * * * *
58845 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTTGATA
252 AATTATTCCTATTAATACAACCTTATTTC-AAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCTAAAA
* * * *
58909 GTTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAATA-AG
316 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-T-AAAACAA
* * * * * * **
58955 TT-AAATAGTTATAATTATTT-GAATAATAATCTATTTCAAATTGCTATGACCTTTTGTTTCATC
1 TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
59018 AT-AAACAATTGTATC-ATTTCATATAGGCTTATCTAAAATAAAATCATACTAATTTATTAATAC
66 ATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * *
59081 TCTAAAAATTAACGAGAAAGAGATTT-AAAAATGAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTA
130 TCAAAAAATTAATAAG-AAGA-TTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
59145 TGACTA-TTTAA-AATTTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
193 TGACTAGATGAACAA-GTATCTATCTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* ** * * * * * * * * *
59206 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATATT-GAATAAAATAGTA-TAAATTTACTAATATGCCAAAAATT
256 ATTCCTATTAATACAACCTTAT-TTCAAATAAAAGAATACT-AATTTAATAATATTCTAAAAATT
* * * **
59269 AATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTTTTGAACACA
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAAACA-A
* * * * * *
59311 TTCAAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATTGTCATAACCTTTTGTTTTATC
1 TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * *
59375 ATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTT-GAAATAAAATAATGCTATTTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ***
59439 TCCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGCGTAAGTTCAAATAGTTA
130 TCAAAAAATTAATAAG-AAGAT-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
* ** * * * *
59504 TAACTATTTGAACAA-TCATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTG
193 TGACTAGATGAACAAGT-ATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * ** * *
59568 TTTCTATTCACATAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
257 TTCCTATTAATACAACCTTATTTC-AAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAA
* ** * * ***
59632 TAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCGAACAA
321 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAAACAA
* * ** ** * * * * *
59672 GTTCAAATAATCATGTCCGTTT-GAATAATTATTTGTTT-ATAATTGTTATCACCTTTTGTTTTG
1 -TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCA-AGTTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * * *
59735 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATTACTAATCTACTAAT
64 TCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAAT
*** * *
59800 ATTTTGAAAATTAATAA-CAGA-TTTAAAAACTAAATCTATTTACTGAA-ACAGTTCAAATAGTT
128 ATTCAAAAAATTAATAAGAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTT
** * * * * *
59862 ATGACTATTTGAATAATTATCTATCTTAAATCGTTATG--CTTTTCATTTTGTCATAAAACAATT
192 ATGACTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** * * * *
59925 GTTTCTTTTTGTACCAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATT
256 ATTCCTATTAATACAACCTTATTTCA-AATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATT
* *
59988 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT
319 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
60021 GCCAAACTAG
Statistics
Matches: 2498, Mismatches: 524, Indels: 373
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
343 3 0.00
344 2 0.00
346 19 0.01
347 20 0.01
348 39 0.02
349 75 0.03
350 83 0.03
351 124 0.05
352 8 0.00
353 50 0.02
354 129 0.05
355 134 0.05
356 146 0.06
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363 138 0.06
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365 58 0.02
366 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (360 bp):
TTCAAATAGTTATCACTATTTAGAACAATTATCTATTTCAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
CAAAAAATTAATAAGAAGATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
CTAGATGAACAAGTATCTATCTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTCC
TATTAATACAACCTTATTTCAAATAAAAGAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT
AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATAAAACAA
Found at i:61367 original size:171 final size:175
Alignment explanation
Indices: 61075--61403 Score: 386
Period size: 171 Copynumber: 1.9 Consensus size: 175
61065 CTTATCCAAA
* * * *
61075 ATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAACT
1 ATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAGAGATTTAAAAAATAAAACT
* * * * * *
61140 ATTTTTCGAATCAATTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAAATATCATTCTCAAATCATTATGAT
65 ATTTTACGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATTTAAATAAATATCATTCTCAAATCATTATAAT
** *
61205 C-TTTGTTTTCTCTTAAAATAATTGTTTCTGATCATGCTTATTTGG
130 CATTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCTGATCATGCTTATTTGG
*
61250 ATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTTAAAAATT-A-AA-AAGAGATTTAAAAAAT-AAA-TA
1 ATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAAACTA
* * * *
61310 TGTTTACTGAACCAGTTCGAATAATTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATT-TCAAATCATTTT
66 T-TTTAC-GAACCAATTCAAATAATTAAGACTATTTA-AATAAATATC-ATTCTCAAATCATTAT
*
61373 AATCATTTGTTTAATCATATAATAATTGTTT
127 AATCATTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTT
61404 TAGTTCATAC
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 19, Indels: 13
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.02
170 10 0.08
171 57 0.44
172 25 0.19
173 2 0.02
174 1 0.01
175 32 0.25
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (175 bp):
ATAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAAGAGATTTAAAAAATAAAACTA
TTTTACGAACCAATTCAAATAATTAAGACTATTTAAATAAATATCATTCTCAAATCATTATAATC
ATTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTTCTGATCATGCTTATTTGG
Found at i:62309 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 61884--64124 Score: 777
Period size: 181 Copynumber: 12.5 Consensus size: 179
61874 TTTATGTCCT
* * * **
61884 TTTGTTTTGTCATAAATCAATTGGTTCTGTTCATA-AAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * ** * * * ** ***
61948 TTTCTTAAAAGACCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAGGGGTT
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACAAACAAGTT
* * * * * * * *
62013 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCGAATTGTTCTGATAT
129 CAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
* * * ** * *
62064 TTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCCATTAATACAAATTTATGCAAAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
** *
62129 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTCACAAAACAAGTT
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCAC-AAACAAGTT
*
62194 CAAATGGTCAT-ATCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
129 CAAATAGTCATGA-CCATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
*
62245 TTTGTTTTATCATCAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * * *
62310 TTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATTTATCGAACCAA
65 TTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATTTGTTCA-C-AAACAA
* ** * * * *
62369 -TTCAAATAGTTATGAGTATTTGAACAATTATCTATCTCAAA-ACATTATGA-TC
126 GTTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACAC
** * * * * * ** * * *
62421 TTCATTTGGTCAAAAAACAATTGTTTCTATTCACAC-TAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAA
1 TTTGTTTTGTC-ATAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAAATAATACTAA
* * * *** * *
62485 ATTAATAATATTCT--AAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATACACTT-ATAGAACCAG
64 TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTCACA-AACAAG
* * * * * * * * *
62545 TTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAACCA-TTCTAAC-C
127 TTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACAC
* * * * ** * *
62597 TTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTAGCTCATAC-ATGCTTATT-TGAAATAAAATGATAC
1 -TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAAC-TATTCAG-AATAAAATAATAC
* * * * ** * * * *
62659 TAATTTATTAACA-TGTAGAACATCAA-AACACAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAA
61 TAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAA-GTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTCA-CAA
* * ** * * * ** *
62722 ACAAGTTTAAATAGTAATGATGATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATAAC-C
122 ACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
* * * *
62779 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGGTTGA-A-AAAGCTTATT-TGAGATAAAATAATA
1 -TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTA--TTCATACAAAAC-TATTCAGA-ATAAAATAATA
* * * * * * * * * ** *
62840 TTATTTTATTAAAATT-TCAAAAATTGATGAGTTAGATATTTAAAAATTAAGTCAGTTTATCAAA
60 CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCA-CAAA
** * * *
62904 -TTGATTCAAATAAT--TGTAGCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AAAC
123 CAAG-TTCAAATAGTCATG-A-CCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
* * * *** * *
62960 TTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATATAGGCCTATTCGGGATAAAATAATACTA
1 -TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTA
* * ** * *
63024 ATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAATAGGAGATTT-AAAAATAAATTCATTTAC-TA-AA-
63 ATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACAAACAAG
* * * * *
63084 -TC----AGT--T-TCTATTTGAATAATTATCTATTTC-AATTGCTATAAC-C
127 TTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
* * * * * *
63127 TGTTGTTATGTTACA-AAATAA-TGTTT-TAGTTTATA-TAAGCATATTCAAAATAAAATAATAC
1 T-TTGTTTTG-T-CATAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAAATAATAC
* * * ** * **
63188 TAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAAGT
61 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCAC-AAACA
* * * * * * * *
63253 AGTTCTAACAGTTAGGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-C
125 AGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
* * *
63307 TTTGTTTTTGTCATAGAACAATTGTTTC-AGTTCATAC-AAGCTTATT-TGAAATAAAATAAAAC
1 TTTG-TTTTGTCATA-AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAAC-TATTCAG-AATAAAATAATAC
* * ** * * ** *
63369 TAATTTATTAATATT-TCAAAATTTAATAAGTAAGTGATTTAAAAGGTGAATTTTTTTGTCGAAT
61 TAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTCAC-AAA
* * * * ** * *
63433 CTA-TTCAAATAATTATGGCCACGTCAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTAC-C
123 CAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACAC
* ** ** * * *
63488 TTTTGCTTCATCATATAACAATT-TTAT-T-TGAAAGTTC-AATCTTATTTAGAATAAAATAATA
1 -TTTGTTTTGTCATA-AACAATTGTT-TCTAT-TCA-TACAAAAC-TATTCAGAATAAAATAATA
* * * * * *
63549 CTAATTTACTAATCTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAT
60 CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCAC-AAA
** ** * * ** * * * *
63613 TTAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATAAACTTGAAATCA-TTATAACAT
123 CAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACAC
* * * * *** ** * *
63670 TTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACACTGAT
1 TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * ** *
63735 CTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAAAATTTCTTTGTCGAACCAA-T
65 TTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-GTTCAC-AAACAAGT
* * ** * **
63799 TCAAATATTTAAAACTA-TAAAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC-C
128 TCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACAC
* * * * * * * *
63849 TTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTAATTCATACTAGATTATTTAGAATAAAATAA-AAT
1 -TTTGTTTTGTCAT-AAACAA-TTGTTTCT-ATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACT
* *
63913 GAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTATGTTTACGTAA
62 -AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTCAC-AAA
* * * * * * *
63976 CCAGTTCAAATAATTATGACTAATTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-AC
123 CAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
* * * * * * *** * *
64032 TTTTCTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATACTAA
1 -TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAA
**
64097 TAAATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGT
64 TTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT
64125 GATTTAAAAA
Statistics
Matches: 1577, Mismatches: 373, Indels: 221
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
164 1 0.00
165 2 0.00
166 61 0.04
167 35 0.02
168 24 0.02
169 3 0.00
170 1 0.00
171 3 0.00
172 2 0.00
174 5 0.00
175 8 0.01
176 134 0.08
177 110 0.07
178 14 0.01
179 34 0.02
180 189 0.12
181 648 0.41
182 244 0.15
183 59 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAATT
TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACAAACAAGTTCA
AATAGTCATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACAC
Found at i:62509 original size:176 final size:176
Alignment explanation
Indices: 62259--62590 Score: 420
Period size: 176 Copynumber: 1.9 Consensus size: 176
62249 TTTTATCATC
* * *
62259 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
1 AAACAATTGTTTCTATTCACACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTCA
* * * *
62324 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACA-AAAT-CTATTTATCGAACCAATTCAAATAGTTATGAGTA
66 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-ATAAATAC-ACTTATAGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTA
*
62387 TTTGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGATCTTCATTTGGTCAAA
129 TTAGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGATCTTCATTTGGTCAAA
* * ** * * *
62435 AAACAATTGTTTCTATTCACAC-TAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTC
1 AAACAATTGTTTCTATTCACACAAAAC-TATTCAGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTC
* * *
62498 TAAATATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATACACTTATAGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTA
65 -AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATACACTTATAGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTA
* *
62563 TTAGAACAATTATCTATTTCAAACCATT
129 TTAGAACAATTATCTATCTCAAAACATT
62591 CTAACCTTTT
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 20, Indels: 8
0.82 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.05
176 125 0.95
177 1 0.01
ACGTcount: A:0.45, C:0.12, G:0.08, T:0.36
Consensus pattern (176 bp):
AAACAATTGTTTCTATTCACACAAAACTATTCAGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTTCA
AAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATACACTTATAGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATT
AGAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGATCTTCATTTGGTCAAA
Found at i:62824 original size:182 final size:182
Alignment explanation
Indices: 62515--62851 Score: 400
Period size: 182 Copynumber: 1.9 Consensus size: 182
62505 TAATAAGAGA
*
62515 TTTAAAAAATAAATACACTTATAGAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT
1 TTTAAAAAATAAATACACTTATAGAACAAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * *
62580 TTCAAACCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGCTCATACATGCTTATTTG
66 TTAAAACAAATATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATAAAAGCTTATTTG
*
62645 AAATAAAATGATACTAATTTATTAACATGTAGAACATCAAAACACAAGAAAT
131 AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATGTAGAACATCAAAACACAAGAAAT
*
62697 TTTAAAAAATAAAT-CTATTTATCA-AACAAGTTTAAATAG-TAATGA-TGATTTA-AACAATTA
1 TTTAAAAAATAAATAC-ACTTAT-AGAACAAGTTTAAATAGTTAA-GACT-A-TTAGAACAATTA
* * *
62757 TCTATTTAAAATAAATATAACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAGGTTGA-AAAAGC
61 TCTATTTAAAACAAATATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCA-GCTCATAAAAGC
* * *
62820 TTATTTGAGATAAAATAATATTATTTTATTAA
124 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
62852 AATTTCAAAA
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 18, Indels: 14
0.80 0.11 0.09
Matches are distributed among these distances:
181 5 0.04
182 114 0.88
183 11 0.08
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (182 bp):
TTTAAAAAATAAATACACTTATAGAACAAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAT
TTAAAACAAATATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATAAAAGCTTATTTG
AAATAAAATAATACTAATTTATTAACATGTAGAACATCAAAACACAAGAAAT
Found at i:64043 original size:363 final size:357
Alignment explanation
Indices: 63175--64122 Score: 987
Period size: 362 Copynumber: 2.6 Consensus size: 357
63165 GCATATTCAA
* *
63175 AATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAT
* * * * *
63239 TTGTTTGCTGAAGTAGTTCTAACAGTTAGGACT-ATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
64 TTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAAT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * * *
63303 GACCTTTGTTTTTGTCATAGAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAAA
128 TAACTTT-TTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTA-TTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAAA
* * * * * **** * *
63368 CTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGTGATTTAAAAGGTGAATTTTTTTGTCGAAT
191 CTAA-TTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAAAATTTCTTTGTCGAAC
* *** * *
63433 CTATTCAAATAATTATGGCCACGTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGCTTCA
255 CAATTCAAATAATTAAAACCAC-TAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTCA
* *
63498 TCATATAACAATTTTATTTGAAAGTTCAATCTTATTTAG
319 TCATAAAACAATTTTATTTGAAAGTTCAATATTATTTAG
* * *
63537 AATAAAATAATACTAATTTACTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATT
** * * ** * * *
63602 TGTTTACTGATTTAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATAAACTTGAAATCATTA-TA
65 TGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA
*
63666 ACATTTTATTTTGTCATAAAATAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAACAC
130 AC-TTTT-TTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAAAC
* *
63731 TGATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAAAATTTCTTTGTCGAACC
192 TAAT-TAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAAAATTTCTTTGTCGAACC
* * * **
63796 AATTCAAATATTTAAAACTA-TAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
256 AATTCAAATAATTAAAACCACT-AAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTCAT
* *
63860 CATAAAATAAGTTTT-TTT-TAA-TTCATACTAGATTATTTAG
320 CATAAAACAA-TTTTATTTGAAAGTTCA-A-T--ATTATTTAG
* *
63900 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATT
1 AATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATT
* * *
63964 ATGTTTAC-GTAACCAGTTCAAATAATTATGACTAATTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
65 -TGTTTACTG-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * ** * *
64028 TAACTTTTCTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATA
128 TAACTTTT-TTTTGTCATAAAAT-AATTTTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAAA
*
64093 CTAATAAATTAATATTTCAAAAATTAATAA
191 CTAATTAA-TAATATTTCAAAAATTAATAA
64123 GTGATTTAAA
Statistics
Matches: 485, Mismatches: 83, Indels: 35
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
359 4 0.01
360 4 0.01
361 53 0.11
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363 190 0.39
364 7 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTT
GTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTAA
CTTTTTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAATAAAACTAAT
TAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAAAAAATTTCTTTGTCGAACCAATTC
AAATAATTAAAACCACTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGCTTCATCATAAA
ACAATTTTATTTGAAAGTTCAATATTATTTAG
Found at i:64230 original size:133 final size:133
Alignment explanation
Indices: 64081--64329 Score: 358
Period size: 133 Copynumber: 1.9 Consensus size: 133
64071 GTTTGTTCAG
* ** *
64081 AATAAAGTAATACTAATAAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAATTAAATCTATT
1 AATAAAATAATACTAATAAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * *
64146 T-ATCAAACTAATTCAAATAGTT-TTACCTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACATACAAGCTTT
66 TGCT-AAACTAATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAACATACAAGCTTT
64209 TTTGA
129 TTTGA
** *
64214 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTATT
1 AATAAAATAATACTAATAAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTATT
*
64279 TGCTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
66 TGCTAAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
64330 ATTGTTATAA
Statistics
Matches: 102, Mismatches: 12, Indels: 4
0.86 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
133 99 0.97
134 3 0.03
ACGTcount: A:0.45, C:0.10, G:0.06, T:0.39
Consensus pattern (133 bp):
AATAAAATAATACTAATAAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAAATAAATCTATT
TGCTAAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAACATACAAGCTTTTT
TGA
Found at i:65021 original size:177 final size:174
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Indices: 64470--66659 Score: 1140
Period size: 181 Copynumber: 12.2 Consensus size: 174
64460 AAAATATTTG
* * * * * * * * *
64470 AAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCTAAAATT--T-A-CAAGAGATTTATAAAATAATT
1 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAAT
* * * *
64531 CTATTTACTGAACTAG-TCAAATGAGTTATAAACTATTTGAACAATTATCTATTTTCAAATCGTT
66 CTATTTGC-CAACTAGTTCAAAT-AGTTAT-GACTATTTGAA-AATTATCTA-TTTCAAATCATT
* * * ** * *
64595 ATTACCTTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAAATATAAATTTGTTTG
126 ATAACC---TTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT-TT--ATACAAGCTT-ATTC
** * * * * * **
64652 AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAG-AGATT--TAAGCAAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAA
* * *
64713 TCTACTTGCCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAAAATTATCTA-TTCAAATCATTATA
65 TCTATTTGCC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* ** * * **
64777 ACCTTTTATTTTGTTAGCAAACAATTAGTTCTATTCATACTATTTTA-TC
129 ACC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TATTTATACAAGCTTATTC
* * *
64826 GAAATAAAATATTACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAA
1 -AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAA
* * * * * *
64891 TCTAATCGCCAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTA-TTCAAATCA-TATG
65 TCTATTTGCCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTATA
* *
64954 ACCTTTTCTTTGTCGTAAAACAATTGTTTGTTTATACAAGCTTATTC
129 ACCTTTT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTATTTATACAAGCTTATTC
* * * * * * *
65001 AAATTAAAAATTAATACTAATTTAAAAAAATTT-AAAAATTATTAAG-TACAAGATTTAAAAATA
1 AAA-T-AAAA-TAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATA
* * * * * * ** *
65064 AA-CTTGTTTATCGAATTAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGT
63 AATC-TATTT-GCCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCAT
* * * *
65128 TTTGACCTTTTATTG--AGTCAAAACAATTGTTTCAGTTTATACAAGCTTATTT
125 TATAACCTTTTTTTGTCA-T-AAAACAATTGTTT-A-TTTATACAAGCTTATTC
* * * ** * **
65180 AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAGAAAG-TGATTAAAAAAATAA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATT-AAAAAATAA
* * * * * * *
65244 ATCTATTTGCTGAA-TAAGTTCAAATAATTATTATTATTTTAAGAATCATCTATTTAAAATCATT
64 ATCTATTTGC-CAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATT
* * ***
65308 ATAACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAA
126 ATAACCTTTT--TTTGTCATAAAACAATTGTTT--ATTTATACAAGCTTATTC
* ** *
65361 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAA
1 A-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
65426 -CCAGTTTACCGAATTAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTATTA
65 TCTA-TTTGCC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
65490 TGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTTATTATACAAGGTTATTC
127 TAACCTTTT-T-TTGTCATAAAACAATTG-TTTAT-TTATACAAGCTTATTC
* * * * * * *
65542 AAAATAAAATAATACTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAACAATAAA
1 -AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
65607 TCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTGTCAATCTCAAATCATTAA
65 TCTATTT-GCCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
65672 AACCTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTAATTATAAAAGCTTATTT
128 AACCTTT-TTTTGTCATAAAACAATT-GTT-TATTTATACAAGCTTATTC
*** * * * * *
65722 GGTTAAAAATAATACTAATATAATAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAA
1 AAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATT-AAAAAATAA
* * ** * * * *
65787 ATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATTATTT
64 ATCTATTTGCC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
65852 TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTTATATCT-TACAAGCTTATTTG
127 TAACCTTTT-TTT-GTCATAAAACAATTG-TTTAT-T-TATACAAGCTTA-TTC
* * * * * **
65905 GAATAAAATAAT-CTAAATTTATTGACA-TTCAGAAAATTACTAAGCAA-AAGTTTGAAAAAATA
1 AAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGCAAGAAAATT-AAAAAATA
* ** * * * * * * **
65967 AATTTGCTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTACCTAGACAATTATTTATTTAAAATTGT
63 AATCTATTTGCC-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAAAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * *
66031 TATGACATTTTCTTTTGACATAAAACAATTATTCCAATTCATTA-AAGGTTATCC
125 TATAAC-CTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTT--TATTTA-TACAAGCTTATTC
** * **
66085 AAATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGTTTAAAAAAATAA
1 AAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATT-AAAAAATAA
* * * * * * **
66149 ATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTA
64 ATCTATTTGCC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
66214 TGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTACTTG
127 TAACC-TTT-TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTA-TTTATACAAGCTTA-TTC
* * * * * * *
66267 AAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG--TG--ATTTAAAAAATGAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAAT
*** * * * * * * * * ** *
66328 CTATTTATAAAATCAATTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATT
66 CTATTTGCCAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * *
66393 ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTATTTTTTTATCATACAAGCTTATTCC
129 ACCTTTT-TTT-GTCATAAAACAATT-GTTTATT-T-ATACAAGCTTATT-C
* * * * *
66445 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAATTTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * *
66506 ATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCGTTATA
66 CTATTTGCC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-AATTATCTATTTCAAATCATTATA
* *
66571 ACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATAC
129 ACCTTTT-TT-TGTCATAAAACAATTGTTTAT-TT-ATACAAGCTTATTC
*
66621 AAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
1 -AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT
66660 TTTTTACCGA
Statistics
Matches: 1579, Mismatches: 335, Indels: 193
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 16 0.01
175 64 0.04
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178 197 0.12
179 102 0.06
180 95 0.06
181 600 0.38
182 133 0.08
183 28 0.02
184 7 0.00
185 3 0.00
186 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (174 bp):
AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAAATTAAAAAATAAAT
CTATTTGCCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
CTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATTTATACAAGCTTATTC
Found at i:65668 original size:362 final size:359
Alignment explanation
Indices: 64653--66659 Score: 1393
Period size: 362 Copynumber: 5.6 Consensus size: 359
64643 ATTTGTTTGA
** * **
64653 AATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAGCAAAT---
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAAATAAA
* * * * * * *
64714 CTA-CTTGCCAAACTATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAA-AATTATCTA-TTCAAATCATTAT
64 TTAGTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * ** * * ** * *
64776 AACCTTTTATTTTGTTAGCAAACAATTAG--TTCTATTCATACTATTTTA-TCGAAATAAAATAT
129 GACCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * ** * * * ***
64838 TACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATCGCCAA
192 TACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAA
* * * * * * * * *
64903 CT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACGATTATCTA-TTCAAATCA-TATGACCTTTT-CTT
256 ATCAGTTTAAATAGTTATGACCAT-TTAACAATTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTGATT
* * * *
64964 TGTCGTAAAACAATTGTTT--GTTTATACAAGCTTATTCAA-
320 TGTCATAAAACAATTATTTCAATTAATACAAGCTTA-T-AAG
* ** * *
65003 ATTAAAAATTAATACTAATTTAAAAAAATTT-AAAAATTATTAAGTACA-AGATTT--AAAAATA
1 AAT-AAAA-TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AGA-ATTTAAAAAAATA
* * * * * ** **
65064 AACTT-GTTTATCGAATTAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCGT
62 AA-TTAGTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTAT
* * * * * * *
65128 TTTGACCTTTTATTGAGTC--AAAACAATTGTTTCAGT-TT-ATACAAGCTTATTTAGAATAAAT
126 TATGACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTA-TATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* *** *
65189 TAATACTAATTTATTAACATTTGGAAAATTAATAAG-AAAGTGATTAAAAAAATAAATCTATTT-
189 TAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAA--GATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * ** * * * *
65252 GCTGAATAAGTTCAAATAATTATTATTATTTTAAGAATCATCTATTTAAAATCATTATAACCTTT
252 TC-AAATCAGTTTAAATAGTTATGACCA-TTTAACAATTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTT
* * *
65317 TGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGAAAG
315 TGATTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTAATACAAGCTTA-TAAG
** * *
65363 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGCAAGAAATTT-AAAAAATAAAC
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AATTTAAAAAAATAAAT
* * * * * * * *
65427 CAGTTTACCGAATTAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTATTATG
65 TAGTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * *
65492 ACCTTTTGTCTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTTATT-ATACAAGGTTATTCAAAATAAAATAATA
130 ACCTTTTGT-TTGTCATAAAACAATTGTTTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * *
65556 CTAATTGATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAACAATAAATCTATTTATCAAAC
194 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAT
* * *
65621 CAGTTTAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTGTCAATCTCAAATCATTAAAACC-TTT-ATTTT
258 CAGTTTAAATAGTTATGACCATTT-AACAATTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTGA-TTT
* ** * **
65684 GTCATAAAACAGTTGGTTCTAATT-ATAAAAGCTTATTTG
321 GTCATAAAACAATTATTTC-AATTAATACAAGCTTATAAG
** * * *
65723 GTTAAAAATAATACTAATATAATAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAA
1 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAAAAATAAA
* * * ** * * *
65788 TGT-GTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATTATTT
64 T-TAGTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTA
* * * ***
65852 TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTTATA-TCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
128 TGACCTTTTGTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * ** *
65916 T-CTAAATTTATTGACATT-CAGAAAATTACTAAGCAAA-AGTTTGAAAAAATAAATTTGCTTAC
192 TACT-AATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTAT
* * * * ** ** * ** * * *
65978 CGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTACCTAGACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACATTTTC
253 CAAATCAGTTTAAATAGTTATGACCATTTA-ACAATTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTG
* * * * *
66043 TTTTGACATAAAACAATTATTCCAATTCATTA-AAGGTTATCCAA-
317 ATTTGTCATAAAACAATTATTTCAATT-AATACAAGCTTAT--AAG
* * *
66087 ATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAAATAAATT
* * * * *
66152 TGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGA
66 AGTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * *
66217 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATATAAGCTTACTT-GAAATAAAGTAATG
131 CCTTTT-GTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA
* *
66280 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT---GATTTAAAAAATGAATCTATTTATAAAATC
194 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATC
* * * * ** *
66342 AATTTAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATTACCTTTTG-TTTGG
259 AGTTTAAATAGTTATGACCATTT-AACAATTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTGATTT-G
* ** **
66406 TCATATAACAATTATTT-TTTTATCATACAAGCTTATTCCG
322 TCATAAAACAATTATTTCAATTA--ATACAAGCTTA-TAAG
* *
66446 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAATTTAATAAG--AG-ATTT-AAAAAATAAA-T
1 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAAATAAATT
* * * * * ** *
66506 ATGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCGTTATA
66 A-GTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* *
66571 ACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-ATTTATATTCATACAAGCTTATACAAAATAAAATAATA
130 ACCTTTTGTT-TGTCATAAAACAATTGTTTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
*
66635 CTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
194 CTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
66660 TTTTTACCGA
Statistics
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364 5 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (359 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAAAATAAATT
AGTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
CCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATCAG
TTTAAATAGTTATGACCATTTAACAATTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCAT
AAAACAATTATTTCAATTAATACAAGCTTATAAG
Found at i:66801 original size:153 final size:153
Alignment explanation
Indices: 66509--66812 Score: 366
Period size: 152 Copynumber: 2.0 Consensus size: 153
66499 AATAAATATG
* * * * *
66509 TTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACC
1 TTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATACTTCAAATCGTTATAACC
* *
66574 TTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATACAAAATAAAATAATACTAA
66 TTTTGTTCTGTCATAAAACAATAATTTATATTCATACAAGCTTATACAAAATAAAATAATAATAA
*
66639 TTTAATAATATTCCAAAAATTTT
131 TTTAATAATATTCAAAAAATTTT
* * * * *
66662 TTTACCGAACCCATT-AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
1 TTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATACTTCAAATCGTTATAACC
** *
66726 TTTTG-TCTTGTCATAAAACAATAATTT-TCAATTCATAGTAGCTTATTA-AGAATAAAATAA-A
66 TTTTGTTC-TGTCATAAAACAATAATTTAT--ATTCATACAAGCTTA-TACAAAATAAAATAATA
* *
66787 ATGAATTTATTAATATTTAAAAAATT
127 AT-AATTTAATAATATTCAAAAAATT
66813 AATAAGTAAA
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 18, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (153 bp):
TTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATATACTTCAAATCGTTATAACC
TTTTGTTCTGTCATAAAACAATAATTTATATTCATACAAGCTTATACAAAATAAAATAATAATAA
TTTAATAATATTCAAAAAATTTT
Found at i:67630 original size:359 final size:354
Alignment explanation
Indices: 66677--69005 Score: 1504
Period size: 358 Copynumber: 6.5 Consensus size: 354
66667 CGAACCCATT
* * * * ** ** * *
66677 AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAA
1 AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGT--TAT
** ** * *
66742 AACAAT-AATTTTCAATTCATAGTAGCTTA-TTAAGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTT
64 AA-AATGAATTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATAT-AATTTATTAATA-TT
* * * * *
66805 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAATTCTATTTACCTAATC-AGTTCAAATAATTAT
125 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATTATTAT
* * * *
66869 GACTGTGTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--AGG
189 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTC--AAAACAATTA-G
* * * * *
66932 TTTATGTTCAAT-AAGTTTGTTCAAAACAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCATAAATTAAT
251 TTTA-GTTCAATGAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAATTAAT
* * ***
66996 -A--AGAGATTTCAAAAATAAATCTATTTATCAAAGTTGTTC
313 AATTAAAGATTTCAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTC
* * * * * *
67035 AAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGGATTTTTGTTTTGCTATAA
1 AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTTATAA
* * * * * *
67100 AA-CAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTT
66 AATGAAT--TTTTTATTCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TTC
* * * ** * *
67163 AAAAATTAATAAGTAAAA-ATCTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTACATCAAATTGTAATG
126 AAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATTATTATG
* * *
67227 ACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAA-AATTA-TTTC
190 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAACAATTAGTTT-
*
67290 AGTTCATATGAA-CTTATTTGAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATTATGAAAATTAATAA
254 AGTTCA-ATGAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT-TCAAAATTAATAA
* * *
67353 TTAAGAGATTTCAAAAATGAATCTGTTTATCGAACAAGTTT
315 TTAA-AGATTTCAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTC
* * ** *
67394 AAGTAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTGGAATCACTAT-AATTGTTTGTTTTGTTATA
1 AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATT-TTTGTTTTGTTATA
* * * *
67458 AAATGACTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATATAAAATTATTAATATTGAAA
65 AAATGAATTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCAAA
* * ** *
67523 TAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAATATAAATCTATTTATCGAACAAGTTTGAATCATTATGACT
129 -AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATTATTATGACT
* * * * * *
67588 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTGTGATATTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTT
193 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-ACTTTTGTTTTGTC--AAAACAATTA-GTTT
* * * * *
67653 A-TTC-ATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAAATAATAAG
254 AGTTCAAT-GAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAATAAT
* * * * *
67716 TACAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAAAAGTTC
316 TA-AAGATTTCAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTC
* * * * * * * * *
67756 AAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCGATTTCAAATCATTGTGACTTTTTGTTTTGTAATAA
1 AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTTATAA
* * *
67821 AAT-AATTGTTTCAATTCATATAAACTTATTTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
66 AATGAATT-TTT-TATTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-CA
* * * * **
67885 AAAATCAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAA-TAGTTAT
127 AAAATTAATA-AGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATTA-TTAT
* * * *
67948 GACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAATATTATG-ACATTTTGTCTTGTTGT-AAAACAATTG
189 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAAC-TTTTG--TT-TTGTCAAAACAATTA
* * *
68011 GTTTTGTTC-ATGCAAGCTTATTTCAAATAAAAT-ATA-AAATTTATTAATA-TCCAAAATTAAT
250 GTTTAGTTCAATG-AAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAAT
* * * * * *
68072 AATTAAAAATTTTAAAAATAAATCAATTTTTTGAACATGTGT-
313 AATTAAAGATTTCAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGT-TC
*** *
68114 AAATAATTATGACTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCAT-
1 AAATAATTATGACTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTTATA
* * * * *
68178 TAATGAATTTTTCTTTTTCAAACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
65 AAATGAA-TTTT-TTATTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCA
* * * * *** * * *
68243 AAAATTAATAAGTAAAA-CTTTTAAAAATAAATTTGTTTACCG-GTGAGTTTAAATTGTTATGTC
127 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATTATTATGAC
* * * ** *
68306 TATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTA-GCTCTTTTGTTTTTATCATAAAACAATT-GTTT
192 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTG-TTTTGTC--AAAACAATTAG-TT
* * * * * *
68369 CTA-TTC-ATACAAGTTTATTCAGAATATAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATA
253 -TAGTTCAAT-GAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAATTAATA
* *
68432 AGTTGAAGA-TT-AAAAATTAATCTATTTA-CAGAACAAGTTC
314 A-TTAAAGATTTCAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTC
* * * * * * ** * *
68472 -AATAGTCATGTCTATTTGAACTATTATCTATTTGAAATTGTTATG-ATATTTTATTTTGTTGTA
1 AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAT-TTTTGTTTTGTTATA
* ** * * * *
68535 AAA-CAATTATTTTTATTCATACAAAATTA-TTCACAAAAAAATAATATTAATCTATTACTATTT
65 AAATGAA-T-TTTTTATTCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATA-TT
* *
68598 CAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTCTTTACCGAATC-AGTTCAAA-TAGTTA
125 CAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATTA-TTA
* * * * * ** * * * *
68657 TAACTATTTGAAGAATTATTTATCTAAAATTGGTATGATC-TTTGTTTTATCCTAAAACATTTAT
188 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGT-C-AAAACAATTAG
* * * * * * *
68721 TTCTA-TTC-ATAGATGCTTGTTCAAAATAAAATACTACTAAATTAATAATA-TTCTAAAA--AT
251 TT-TAGTTCAAT-GAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAA
* * * * **
68781 TAA-TAAGGATTT-AAAAAAAAGATGTGTTTGCCGAAC-AGTTC
312 TAATTAAAGATTTCAAAAATAA-ATCTATTTATCGAACAAGTTC
* * * * ** * *
68822 AAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATA
1 AAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTTATA
* * * ** * *
68886 AAAT-AATTATTTCAGTTCATATATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTCA
65 AAATGAATT-TTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTC-
* * * * *
68950 AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTAAAAAAATAAATGTGTTTATCAAACAAGTTCAAA
126 AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAA
69006 ACTGTTATGA
Statistics
Matches: 1550, Mismatches: 317, Indels: 211
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
349 5 0.00
350 23 0.01
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353 7 0.00
354 95 0.06
355 193 0.12
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357 189 0.12
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360 16 0.01
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366 4 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (354 bp):
AAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAATTTTTGTTTTGTTATAA
AATGAATTTTTTATTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCAAAAA
TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATTATTATGACTATT
TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTCAAAACAATTAGTTTAGTTCAA
TGAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAATTAAAGATTTC
AAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTC
Found at i:67715 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 66677--69005 Score: 1666
Period size: 178 Copynumber: 13.0 Consensus size: 179
66667 CGAACCCATT
* * * * *
66677 AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * * *
66742 AACAATAATTTTCAATTCATAGTAGCTTATTAAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTA
66 AACAATTATTTT-TATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* * *
66806 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTAAAAAAATAATTCTATTTACCTAATC-AGTTC
129 AAAAA-TAATAAGTAAAAGATT-TAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTC
* * * * *
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1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
*** * * * * * * * * *
66924 AACAAAGGTTTATGTTCA-ATAAGTTTGTTCAAAACAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAT
66 AACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * ***
66988 AAAT--TAA-TAAGAGATTTCAAAAATAAATCTATTTATCAAAGTTGTTC
131 AAATAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * * * *
67035 AAATAGTTATGACTATCTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGGATTTTTGTTTTG-CTATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTC-ATA
* * * * *
67099 AAACAA-TAGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTT
65 AAACAATTA-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * **
67163 AAAAATTAATAAGTAAAA-ATCTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTACATC
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* * * * *
67216 AAATTGTAATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTC--AA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
67279 AA-AATTA-TTTCAGTTCATATGAA-CTTATT-TGAAATAAAATAATACT-ATGTTATTAATATT
66 AACAATTATTTTTA-TTCATA-CAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATT
* * * * * * * *
67339 ATGAAAATTAATAATTAAGAGATTTCAAAAATGAATCTGTTTATCGAACAAGTTT
127 -TCAAAAATAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * ** * * * *
67394 AAGTAATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTGGAATCACTAT-AATTGTTTGTTTTGTTATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACT-TTTGTTTTGTCATA
** * * * *
67458 AAATGACT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTTA-AATAAAATAATA-TAAAATTATTAATA-TT
65 AAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT
* * *
67519 GAAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAATATAAATCTATTTATCGAACAAGTTT
128 CAAA-AA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAA-ATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * *
67574 GAATCA-TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTGTGATATTTTTGTTTTGTCAT
1 AAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA-ACTTTTGTTTTGTCAT
* * * *
67638 AAAATAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC
64 AAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
67703 AACAAATAATAAGTACAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAAAAGTTC
129 AA-AAATAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * * * *
67756 AAATAGTCATGATTATTTGAATAATTATCGATTTCAAATCATTGTG-ACTTTTTGTTTTGTAATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATA
* * ** * * * *
67820 AAATAATTGTTTCAATTCATATAAACTTATTTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
65 AAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * **
67884 AAAAATCAA-AGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTC
129 AAAAAT-AATA-AGTAAAAG-ATT-TAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * **
67938 AAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAATATTATG-ACATTTTGTCTTGTTGTA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATA
** * * * *
68002 AAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAAT-ATA-AAATTTATTAATA-TCC
65 AAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *** *
68063 AAAATTAATAATTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCAATTTTTTGAACATGTGT-
129 AAAAATAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGT-TC
* * * * *
68114 AAATAATTATGACTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATT
1 AAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTGTTTTGTCATA
** * * ** *
68179 AATGAATT-TTTCTTTTTCAAACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
65 AAACAATTATTT-TTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* ** * * *** *
68243 AAAATTAATAAGTAAAACTTTTAAAAATAAATTTGTTTACCG-GTGAGTTT
129 AAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTC
* * * * * ** *
68293 AAATTGTTATGTCTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTA-GCTCTTTTGTTTTTATCATA
1 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGAACTTTTG-TTTTGTCATA
* * * * * *
68357 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAGAATATAATAATACTAATTTATTAATGTTTTA
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** * *
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* * * * * * **
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** * * * * *
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* *
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * *
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* *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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1 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA
* * * *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* **
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* * * * * **
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* ** * **
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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1 AA
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* * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* ** * * * * ** *
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** * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* **
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* * * * * *
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* * * * * * * **
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* * ** *
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** * * * * *
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* * ** * * * * * * * *
73205 TTTCATCCTTTATCTATTTCAAACCATTATTACCTTTTGTATGGTCATATAACAAGTGTTTTTGA
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA
* * * * *
73270 TCATTCAAGCTTACTCAAAAT-CAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAA
130 TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
73321 ATTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAAATATGTTCATCAAA-CTAGTTCAAATAATTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATC-AATTCAAATAATTATGACTA
* * * * * * * *
73385 TTTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTAT-AACATTTTGTTTTGTCACAAAATAATTATTTCT-
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
** * * *
73448 ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACAAATATAATAATA-TTCTAAAA
129 A-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * * *
73502 ATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGA-CAAACCAGTTTAAATATTTAAGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCAAATCAATTCAAATAATTATGACTA
* * * * * **
73565 TATAAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAA--ATTTTCA
65 TTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * *
73627 ATTCATACTAGCTGATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTGCAAAA
129 A-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * * *
73681 ATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAATATTTCTGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAATCAATTCAAATAATTATGACTA
* * * *
73746 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTTTG
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * * * *
73810 TTCATATAAGTTTGTTCATAATAAAGTAATACTAATCTATTACTATTTCAAAA
129 ATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
73863 A-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATC-AATTCAAATAATTATGACTA
* * * * * *
73923 TTTGATA-AATTATTTATTTCAAATCATTCTG-ACTTTT-TGTCTGATTATAAAACATTTGTTTC
65 TTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGT-TTTG-TCATAAAACAATTGTTT-
* * * * * * *
73985 TT-TTCATACATGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACA
126 TTGATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * ** * *
74040 ATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CTAGA-TCAAATGGTCATGAT
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATC-A-ATTCAAATAATTATGAC
* * * * * * **
74102 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTATCATAAAAGATTTGTTTCG
63 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
74167 GATCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAGTTTATTAATATTTCAAAA
128 GATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
74221 ATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-GAATCTGTTTATCAAAT-AAGTTTAAATGATTATGTCTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATCAA-TTCAAATAATTATGACTA
* * * * * *
74284 TTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGCTAT-AACATTTTGTTTTGGCATAAAATAATAT-TTTCT
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTT
* * ** * *
74347 GTTCATACAAGTTTATTTCGAATAAAATAATACAAAATTATTAATA-TT-AAGACA
128 GATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-A
* * *
74401 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAA-CAAGTTCAAAT-GTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATCAA-TTCAAATAATTATGACTA
* * *
74464 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG-ACTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATG
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * ** *
74528 TTCATTCAAGGTTATTCAGATTAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTTGACA
129 ATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * *
74580 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAATTGAAATAATCATGATT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAATC-AATTCAAATAATTATGACT
* ** * * * ** ***
74644 ATTTGAATAATTAAATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACGGTTTCAA
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * **
74709 ATCAAATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACTTAA
129 ATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * **
74762 ATTAATGAGTAAGAGACTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAAT-AAGGTT-AAATAGCTATGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATCAA--TTCAAATAATTATGACT
* * * ** * * * * * *
74825 ATCTAAATAGCTATCTATTTGAAAACATTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGGTTCTG
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * *
74890 TTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTACAAAA
129 ATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * *
74943 ATTGATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTACA-CACATTCAAATAATTAT-AT
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAATCA-ATTCAAATAATTATGA-
* * * *
75003 CTATTTGAACAGTTATCCATTTCAAATTGTTATGATA-TTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTT
62 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *** * *
75067 TTGTTCATAAAAGCTTATTTGCTACAAAATAATACTAATTTATT-TTAATTTCAAAA
126 TTGATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAA
* * * * ** ** *
75123 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAATATGTTTA-C-TAGCGGGTTTGAATAGTTATGAC
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATCAAATC-AATTCAAATAATTATGAC
* ** * * *
75186 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGTCTTCTTATAAAACAATTGTTT
63 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
75249 CTACTTATCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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171 1 0.00
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TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGAT
CATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
Found at i:73786 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 71891--75250 Score: 1793
Period size: 361 Copynumber: 9.4 Consensus size: 357
71881 ATACAAATTT
* * * * * * *
71891 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAATTAGTT-AAATAATTATG-GTAA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAATTCAAATAGTTATGACT-A
* * * * * * * * * * *
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65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* *
72019 ATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
130 -TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CAAATTATTAATATTT-AAAAATTAATAA-TAA
* ** * * * ** ** *
72084 GAGATTTAAAAAATAAATGTACTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTA-CAAGAATAATTA
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* * ** * * * * ***
72148 TCTATTTTAAATTGTTCT-AGCCTATT-TTTAGTCATAAAATATTTTTTTC-ATATCATAC-ATG
254 TTTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACATTTTCAAT-TCATACTA-G
* ** * * *
72209 CTTATTT-AGAACAAAATAATCCTAATATATTAACATTTGAAAA
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* * * * * *
72252 ATTAATAAGCAGGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TAAGCTCAAGTAGTTATGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
72316 ATATGAA-ATATTA-ATATTTAAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTTGTCATAAAACAATTGCTTC
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* * * * * * * * *
72379 AGTTCATAAAAGGTTATCCAAAATAAAATAATACCAATTTTTTAATATTTTAAAATTTAAAAAGC
127 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CAAATTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA-T
* * * * * * * *
72444 AAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTT-TCTGAATAAATTCAAATAGCTGTGACTATTTGAACAA
189 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATA-TTATGACTATTTAAACAA
* * * ** * * *
72508 TTGTATATTTAAAATCATTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATTA-A
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*
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314 AGCTTATTTCAAATAAAATAA-AATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
72616 ATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTA-CCAAATCAATTCAAATAATTATGGCTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACT-AATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
72680 TTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * *** * *
72743 ATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAA
129 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC-AAATTATTAATATTT-AAAAATTAATAA-TAA
* * *
72808 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAGC-AGTTCT---TATT-TGA--A--T----AATTA
191 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTT-TAAATATTATGACTATTTAAACAATTA
** * * * * *
72860 CCTATTTCAAATCATCAT-AACTTTTATTCTAT-TC-TAAATA-ATTATTTCA-GTTC-ATACA-
254 TTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-T-TGTCATAAA-ACA--A---CATTTTCAATTCAT
* ** * * ** * * * ** *
72918 AGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTAA--AAATATTA-TGAAAAT
311 A-C-TAGCTT-ATTTCAAATAA-AATAAAATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * **
72965 --TAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTGTCGAAGC-AGTTTAAATTGTTAAGAAA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTATCGAA-CTAATTCAAATAGTTATGACT
** * * *
73027 ATACGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAA-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** * * * *
73090 AGTTCATAGAAGTTTATTTGAAATAAAATAACACAAATTTATTAACATTCAAAAA--ATTAATAA
128 -GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAA-TTATTAATATTTAAAAATTAATAATAA
* * * * * * * * * * **
73153 GTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATC-A-TTTCAAATAATTATGGCCATTTCATCCTTT
191 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAAGTTT-AAAT-ATTATGACTATTTAAACAATT
* * * * * * ** ** * *
73216 ATCTATTTCAAACCATTATTACCTTTTGTATGGTCATATAACAAGTGTTTTTGA-TCATTCAAGC
253 ATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-CATTTTCAATTCATACTAGC
* * * *
73280 TTA-CTCAAA-ATCAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAA
317 TTATTTCAAATA-AAATAA-AATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
73321 ATTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAAATATGTTCATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
73386 TTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTATAACATTTTGTTTTGTCACAAAATAATTATTTCTATT
66 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
*** *
73451 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACAAATATAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGA
131 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAAT-TATTAATATT-TAAAAATTAATAA-TAAGA
* * * * * *
73516 GAATT-AAAAATAAATTTGTTTGA-CAAACCAGTTTAAATATTTAAGACTATATAAACAATTATC
193 GATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCAAACAAGTTTAAATA-TTATGACTATTTAAACAATTATT
* * *
73579 TATTTCAAAAT-GTTATGACCTTTTGCTTTGTCATAAAACAA-ATTTTCAATTCATACTAGCTGA
256 TATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACATTTTCAATTCATACTAGCTTA
* *
73642 TTTGAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTGCAAAA
320 TTTCAAATAAAATAAAAT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* ** * * * * *
73681 ATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAATATTTCTGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTA
* * * * *
73746 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATGTTTTTGT
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* * * * * * *
73811 TCATATAAGTTTGTTCATAATAAAGTAATACTAATCTATTACTATTTCAAAAA-T--TAATAAGA
130 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAAT-TATTAATATTT-AAAAATTAATAATAAGA
* * * * *
73873 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATA-AATTATT
193 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATA-TTATGACTATTT-AAACAATTATT
* * * * ** **
73937 TATTTCAAATCATTCTGACTTTTTG-TCTGATTATAAAAC-ATTTGTTTCTTTTCATAC-ATGCT
256 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAACAT-TTTCAATTCATACTA-GCT
* * *
73999 TA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACA
318 TATTTCA-AATAAAATAA-AATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
74040 ATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGA-TCAAATGGTCATGATT
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTA-ATTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
74103 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTATCATAAAAGATTTGTTTCGG
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * **
74168 ATCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACCAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAA
129 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CAAATTATTAATATTT-AAAAATTAATAA-TAA
* * * *
74233 GAGATTTAAAAAA-GAATCTGTTTATCAAATAAGTTTAAATGATTATGTCTATTTGAACAATTAT
191 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAAT-ATTATGACTATTTAAACAATTAT
* ** * * * * * ** * *
74297 TTATTTGAAATCGCTATAACATTTTGTTTTGGCATAAAATAATATTTTCTGTTCATACAAGTTTA
255 TTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACATTTTCAATTCATACTAGCTTA
* *
74362 TTTCGAATAAAATAATACA-AAATTATTAATA-TT-AAGACA
320 TTTCAAATAAAATAA-A-ATAATTTATTAATATTTCAA-A-A
* *
74401 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAAC-AAGTTCAAAT-GTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTA
* * * *
74464 TTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATG
65 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * * * * * *
74528 TTCATTCAAGGTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAA
129 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA-TAAG
* * * * * * * * * *
74593 AGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTGAAATAATCATGATTATTTGAATAATTAA
192 AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAAT-ATTATGACTATTTAAACAATTAT
* * ** * *
74658 ATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACGGTTTCAAATCA-AATAAGCTT
255 TTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACATTTTCAATTCATACT-AGCTT
* * **
74722 ATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACTTAA
319 ATTTCAAATAAAATAA-AATAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
74762 ATTAATGAGTAAGAGACTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAA-TAAGGTT-AAATAGCTATGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAA--TTCAAATAGTTATGACT
* * * ** * * * * *
74825 ATCTAAATAGCTATCTATTTGAAAACATTATGAA-CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGGTTCT
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *
74889 GTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTGATTAATATTACAAAAATTGATAAGT
128 GTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACAAATT-ATTAATATT-TAAAAATTAATAA-T
* * * *
74953 AA-A-ATTTTAAAAAATAAATCTATTT-TCTACACACA-TTCAAATAATTAT-ATCTATTTGAAC
189 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACA-AGTTTAAAT-ATTATGA-CTATTTAAAC
* ** ** ** * * *** *
75013 AGTTATCCATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACCAA-TTGTTTTTGTTCATAA
249 AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACAT-TTTCAATTCATAC
* * * * *
75077 AAGCTTATTTGC-TACAAAATAATACTAATTTATT-TTAATTTCAAAA
313 TAGCTTATTT-CAAATAAAATAA-AATAATTTATTAAT-ATTTCAAAA
* * * *** **
75123 ATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAATAAAATATGTTTA-CTAGCGGGTTTGAATAGTTATGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAAT-AAATATGTTTATCGAACTAATTCAAATAGTTATGACT
* * ** * * *
75187 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTGTCTTCTTATAAAACAATTGTTTCT
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
75251 ACTTATCAAT
Statistics
Matches: 2298, Mismatches: 549, Indels: 303
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
343 1 0.00
344 2 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (357 bp):
ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAATTCAAATAGTTATGACTAT
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTATTAATATTTAAAAATTAATAATAAGAGAT
TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTTAAATATTATGACTATTTAAACAATTATTTATTT
CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACATTTTCAATTCATACTAGCTTATTTCAA
ATAAAATAAAATAATTTATTAATATTTCAAAA
Found at i:74372 original size:899 final size:900
Alignment explanation
Indices: 73284--75213 Score: 2066
Period size: 899 Copynumber: 2.1 Consensus size: 900
73274 TCAAGCTTAC
* * * *
73284 TCAAAATCAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGCGATTTAAAAAATAA
1 TCAAAATAAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * *
73349 ATATGTTCATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTGTTA
66 ATATGTTCATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATACTTCAAATCGCTA
* *
73414 TAACATTTTGTTTTGTCACAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
131 TAACATTTTGTTTTGGCACAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAAT
* *
73479 AC-AAATATAATAATATTCTAA-A-AATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAATAAATTTGTTTGA-
196 ACAAAAT-TAATAATA-T-TAAGACAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTT-AT
* * *
73539 CAAACCAGTTTAAATATTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGAC-CTTTT
257 CAAACAAGTTCAAAT-GTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACTC-TTT
* *
73603 GCTTTGTCATAAAACAAATT-TTCA-ATTCATACTAGCTGATT-TGAAATAAAATAA-AATGAAT
320 GCTTTGTCATAAAAC-AATTGTTCATATTCATACAAGCTGATTCAG-AATAAAATAATAAT-AA-
* * ** * * *
73664 TTATTAATATTGCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAAATATTTCTGTTTACCTAACCAAT
381 TTATTAATATTGCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAAT
* ** *
73729 TCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
446 TCAAATAATCATGACTATTAGAACAATTAAATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAAT
* **** * * *
73794 AAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCATAATAAAGTAATACTAATCTATTACTATT
511 AAAAAAAAGGTTTCAAATCAAATAAGCTTAT-TTCA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATT
* * ** *
73857 -TCAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTAAACT-A-GTTCAAATAGTTAT
574 ATCAAATAATGAATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-TAAGGTT-AAATAGCTAT
* * * * * *
73918 GACTATTTGATAA-A-TTATTTATTTCAAATCATTCTG-ACTTTT-TGTCTGATTATAAAACATT
637 GACTATCT-A-AATAGCTATCTATTTCAAAACATTATGAACTTTTGT-TCTG-TTATAAAACAAT
* * * * * * * *
73979 TGTTTCTTTTCATACATGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATT
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74043 AATAAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAATGGTCATGATTATTTG
762 AATAAGT-AAAATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAATGGTCATGATTATTTG
74108 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTATCATAAAAGATTTGTTTCGGATCAT
826 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTATCATAAAAGATTTGTTTCGGATCAT
74173 ATAAGTTTAT
891 ATAAGTTTAT
* * *
74183 TCAAAATAAAATAATACCAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAA-G
1 TCAAAAT-AAATAATACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * *
74247 AATCTGTTTATCAAA-TAAGTTTAAATGATTATGTCTATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGC
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* * *
74311 TATAACATTTTGTTTTGGCATAAAATAA-TATTTTCTGTTCATACAAGTTTATTTCGAATAAAAT
129 TATAACATTTTGTTTTGGCACAAAATAATTA-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAAT
* * *
74375 AATACAAAATTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC
193 AATACAAAATTAATAATATTAAGACAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTATC
* * * * * *
74440 AAACAAGTTCAAATGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTCTTTGTT
258 AAACAAGTTCAAATGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACTCTTTGCT
* * * * * * *
74505 TTGTCATAAAACAATTGTTTATGTTCATTCAAGGTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTATTAA
323 TTGTCATAAAACAATTGTTCATATTCATACAAGCTGATTCAGAATAAAATAATAATAATTATTAA
*** * *
74570 TATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTGAAATA
388 TATTGCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTCAAATA
* * * * *
74635 ATCATGATTATTTGAATAATTAAATATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA
453 ATCATGACTATTAGAACAATTAAATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAA
* * *
74700 CGGTTTCAAATCAAATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTACTTAAATT
518 AGGTTTCAAATCAAATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTA-TCAAA-T
* * * *
74765 AATGAGTAAGAGACTTAAAAAATAAATTTTTTTACCGAATAAGGTTAAATAGCTATGACTATCTA
581 AATGAATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGGTTAAATAGCTATGACTATCTA
* *
74830 AATAGCTATCTATTTGAAAACATTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGGTTCTGTTCAT
646 AATAGCTATCTATTTCAAAACATTATGAACTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTGGTTCTGTTCAT
* *
74895 GCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTGATTAATATTACAAAAATTGATAAGTAAAATTT
711 ACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAATTT
* * * * ** * * *
74960 TAAAAAATAAATCTATTT-TCTACAC-ACATTCAAATAATTAT-ATCTATTTGAACAGTTATCCA
776 TAAAAAATAAATATGTTTATCGA-ACTAGA-TCAAATGGTCATGAT-TATTTGAACAATTATCTA
* *** * * ** * ** * * *
75022 TTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATT
838 TTTCAAATCGTTATGACCCTTTCTTTTATCATAAAAGATTTGTTTCGGATCATATAAGTTTA-T
* * * * *
75086 TGCTACA-AAATAATACTAATTTATT-TTAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAA
1 T-CAAAATAAATAATACCAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAA
* * * ** ** * * *
75149 TAAAATATGTTTA-CTAGCGGGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATC
63 T-AAATATGTTCATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATACTTCAAATC
75213 G
127 G
75214 TTATGATTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (900 bp):
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TAACATTTTGTTTTGGCACAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAAT
ACAAAATTAATAATATTAAGACAATTAATAACTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTATCAAA
CAAGTTCAAATGTTAAGACTATATAAACAATTATCTATTTCAAAATGTTATGACTCTTTGCTTTG
TCATAAAACAATTGTTCATATTCATACAAGCTGATTCAGAATAAAATAATAATAATTATTAATAT
TGCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTCAAATAATC
ATGACTATTAGAACAATTAAATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAAAGG
TTTCAAATCAAATAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTATCAAATAATGA
ATAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATAAGGTTAAATAGCTATGACTATCTAAATAG
CTATCTATTTCAAAACATTATGAACTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTGGTTCTGTTCATACAAG
CTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAA
AATAAATATGTTTATCGAACTAGATCAAATGGTCATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
CGTTATGACCCTTTCTTTTATCATAAAAGATTTGTTTCGGATCATATAAGTTTAT
Found at i:76058 original size:167 final size:168
Alignment explanation
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75255 ATCAATTTAA
* *
75265 TAATATGTCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAAATTAATGTGTTTACCAAACTAGTTCAAATA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTT-AAAAA-TAAT-TGTTTACCAAA-TAGTTTAAATA
* * * * *
75328 GTTAAGACTAT-TAGAATAATTATCTATTTCAAAT-TGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTTATACAA
62 ATT-A-ACTATATTGAATAATTATTTATTTCAAATCT-ATTATGA-C-TTTGTTT-GTCATA-AA
* * * ** * * * *
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120 CAATTATTTTAGCTCATACAAGTTTATTCGAAATAGAATAA-ACTAA-TT-T
* * * * * *
75442 TAACA-TTCAAAAAATTAATACACATGAGATTTGAAAATATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCA
1 TAATATTTC-AAAAATTAATA-A-GTAAGATTT-AAAA-AT-AA-TTGTTTACCAAA-TAGTTTA
* * * * *
75506 AATAGTTATGACTAT-TTAAACAATTATTTATTTAAAATC-ATT-TGACCATTTGTTTTATCATA
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* * * * * * *
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* *
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* * * * * *
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* * ** * *
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119 ACAATTATTTTAGCTCATACAAGTTTATTCGAAATAGAATAA-ACTAATT--T
* * * * * *
75797 TATTATTTCAAGAATTAATAAG--AGATTTAAAAAATATATATGTTCACCAAACAGTTCAAATAG
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTT-AAAAATA-AT-TGTTTACCAAATAGTTTAAATAA
*
75860 TTATGACTATA-TGAATAATTATATT-TTTCAAAT-TGTTATGACCATTTG-TT-TCAT-AACAA
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*
75919 TTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTCGAAATAGAATAAACTAATTT
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*
75965 TAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGATTTAGAAAATAATTGTTTACTAAATAGTTTAAATAATT
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTA-AAAATAATTGTTTACCAAATAGTTTAAATAATT
* *
76029 AAACTATATTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTATTATGACTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
65 -AACTATATTGAATAATTATTTATTTCAAATC-TATTATGACTTTG-TTTGTCAT-AAACAATTA
* * * *
76094 TTTTTGTTAATATAAGTTTATTCG-AA-AGAATAAACTAATTTT
126 TTTTAGCTCATACAAGTTTATTCGAAATAGAATAAACTAA-TTT
* * *
76136 TAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGGAATTAAAAAGTAAATTTGCTTATACCAAATTAGTTTG
1 TAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA-GATTTAAAAA-T-AA-TTG-TT-TACCAAA-TAGTTTA
76200 AATAATT-ACTAT-TTGAATAATTA-TTATTTC-AATC-ATTAT-ACTTTAGTTTGTCATCAAA-
58 AATAATTAACTATATTGAATAATTATTTATTTCAAATCTATTATGACTTT-GTTTGTCAT-AAAC
76258 AATT
121 AATT
76262 GGTTTATTTT
Statistics
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0.75 0.10 0.15
Matches are distributed among these distances:
166 8 0.01
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Consensus pattern (168 bp):
TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAATAATTGTTTACCAAATAGTTTAAATAATTA
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GCTCATACAAGTTTATTCGAAATAGAATAAACTAATTT
Found at i:76216 original size:15 final size:15
Alignment explanation
Indices: 76196--76228 Score: 57
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*
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76226 TTT
1 TTT
76229 CAATCATTAT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 0
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:76237 original size:15 final size:15
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Indices: 76200--76238 Score: 51
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* *
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1 AATAATTATTATTTC
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1 AATAATTAT
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Statistics
Matches: 21, Mismatches: 3, Indels: 0
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Done.