Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168107.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_352, whole genome shotgun sequence
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54 TGGATAATTA
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* * *
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66 TTAATTATCAAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAT
*
194 AATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTTATAATAATTTGTTG
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* * *
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**** * * *
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* * **
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* ** ** * * * * *
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1 TTCAAATAGTCATAACGATTTGAAA-TTGTTTGGTAAACAGATTTATGTTTTAAATCTTTTACTT
* *** * * * * * * * **
480 ATTAATTTTTGGAATATTAACAACTTAGTATTATTTT-ATTTGAATAACCTTATATGAACTGAAA
65 ATTAATTATCAAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
* *
544 TAATT-TTCTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTA
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* * ** * * * *
595 TTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAATTTTTTAATTA
1 TTCAAATAGTCATAACGATTTGAAATTGTTTGGTAAACAGATTTATGTTTTAAATCTTTTACTTA
* * * *
660 TTAATTGTCAAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAA
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AATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATAATTTGTTG
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AAATAGCATAATTATTC
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69 ATAGTCATGACTATTTGAAATTGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAATCTTTTGCTTATTAAT
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* ** *
134 TGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATG
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* * * * * * * *
185 AACAAAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTTATAATAA-TT----T-G----TTGTTCAA
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
355 AAATAGATGA-AATCT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTCCAAATAGATAATTGTT
1 AACTA-A-AACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
* * * * * * ** *
418 TAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATT
63 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * * *
483 AATTTTTGGAATATTAACAACTTAGTATTATTTTATTT-GAATAACCTTATATG
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* * *
536 AACTGAAATAATT-TTCTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCA
1 AACTAAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * * *
599 AATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAATTTTTTAATTATTAA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* ** * * *
664 TTGTCAAAATAATAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTTGTATG
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* * *** * * * **
716 AA-TAGAAACTATTGTTTTATAATGGAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATA-ATTAATTGCTC
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTATTC
* * * * *
779 AAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGATAAA-AAGATTTA-TTTTTAAA-ATC-T-CTTATG
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* * * * * * *
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128 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG
* * * *
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1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * *
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* * *
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* * * * * * *
1067 AATTGAAA-AATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAT
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * ** * *
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* * * *
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* * * * * * * *
1248 AAC-ATAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAAGGTTTTATTTTGTAAATAATTGATTTGAAGTA
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG--TCA-----T-AA-CA---ATTTGAAATA
* * * *
1312 TACAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GATTCAGTAAACAAA-TT-TTTTTTAAATC
53 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * *
1374 TCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAAGAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTAT
117 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAT
1438 G
181 G
* * * * * *
1439 ATA-TAAAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAACAACGATTTGAAATAGATAATTATTGA
1 A-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
1503 AAT-GATGATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTA
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* * * *
1563 ATGTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATAGG
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
1616 AACTGAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTTTTTAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* *
1681 ATAATCATAACTATTTGAATTTA-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTA
66 ATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * * *
1744 ATTTTTAAAATATTAAGAAATTATTATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATG
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* * * * * * * * *
1797 AATTGAAACAATTCTTATATGTCAAAACGAAAGATCATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * ** * * *
1862 ATAATTATAACTATTTAAACTTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTACTTTTTA
66 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA
** * * * * *
1926 ATTTTCCAAATGTTAATAAATTTGGATTATGTTATTTC-AATAAGCTTGTAAG
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
** ** * * *
1978 ATA-TGAAATA-AATT-TTTT-TGACTTAACAAAATATCAAAACAATCTGTAATAGATAATTATT
1 A-ACT-AAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
* * ** * * * * * * ** * *
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* * *
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* * * * * * * * *
2154 -A-TAAAAACAA-TATTTAATGACAAAAC-AAAGATCTTAACAATTTTAGATTGAAAATTGTTCA
1 AACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
2215 AATAGTCGTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * *
2280 TTTTTCAAATATTAATAAATTATTGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
130 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * *
2332 -ATTAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACGATTTCAAATAGATAATCATTCA
1 AACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * ** * * *
2396 AATGGCCTTTATTATTTTTACT-GATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTA
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*** * * * * **
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* * * ** * ** * * *
2513 AACTGAAACAATTATTTTATGACAAATCAAGTGGTTATAATGATTTTAAATAGACAATTACTCAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * **
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66 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-T-ATT
* * *
2643 AATTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
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* * * * * * * *
2696 AGCTGAAACAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
2875 AA-TAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGACATAGATAATCATTCAT
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * ** * * * ** *
2939 GTAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAG
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** * * * ** *
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* * * * ** *
3054 AA-TAGAACCAATTGTTTAATGAC-AAACTAAAATGTTATAATGATTAGAAATAGATAATTATTC
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * * * * * * *
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* * * * * *
3181 ATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTCTTTCCAATAAACTTATATT
129 ATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * *
3234 AACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACATAAA-GTAATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * ** * * * * * *
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65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* *
3363 TTTTTGAAATATTAA-AAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGTATG
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* * * * *
3414 AGCTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAT
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * *
3479 ATAGTCTTAACTGTTTAAACTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAAT
66 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
** *
3544 TTTCAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATG
131 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
3595 GA-TAGAAACAATT-TTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGGTAATTATTCA
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
3658 TATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATATATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * *
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3771 --TTGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCA
1 AACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
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* * * * * *
3898 AGTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTT-GGATATGATTTTATG
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * ** * * * *
3950 AACTAAAACAACTATTTTATGATAAAACAAATGGTCA-AATGATTTTAAATAAATAATTGTTTAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * *
4014 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATATTTTCAAATCTCATGCTTATTAA
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* * *
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* * * * * * *
4131 AATTGAAACAATTATTGTATAACTAAACAAAAGGTCA-AAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCT
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * * *
4615 AATTTTCAAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTA-ATCGAATAAACTTGTATG
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* * * * * *
4732 AATAGTCATAA-TGATATGAACTTGCTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATT
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* * * *
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4849 AA-TAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCA
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** * * *
4913 AATAGTCATAACTATTTGAA-TATGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTGCTTATTA
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* *
4976 ATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTATATG
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5029 AAC-ATAAACAATTATTTTATGATACAACAAAA-GTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCA
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
5091 AATAGTCATAACCATTTGAACTTGTCCGGTAAACATATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * *
5156 TTTTT-AGGATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATGTG
130 TTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * ** *
5208 AACTAATACAGTTGTTTTGTGATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * *** ** * * *
5273 ATAGTTATGA-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTACGACTATTTGAACATGTTCAGTA
66 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAAT--TT---A-TTTTTTAA-AT-CTC--T-
* * * * * * ** * * * **
5337 AACATATTTA-TTTTGAAAACCTTTTACTTTTTAATT-GTCAAAATATTA-AT-AAATTAATATT
120 TACTTATTAATTTTTG-AAA--TATTA---ATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCGAA-TAAGCTT
* * *
5398 ATTTT
177 GTATG
* * * ** * * * * *
5403 AA-TCAAAATAAACTTGTGTGA--ACAAAATCAATTGTTTTATGACAA---AAAAAAGTCATAAT
1 AACT-AAAA-CAA-TTGTTTTATGACAAAA-CAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAG--ATAAT
* ** * * * * *
5462 GATTTGGAATAAGTAATTGTTTAAATAGTTAT-AACT-GATTCGATAAACTAATTTCTTTTTTTA
59 TA-TTCAAAT-AGTCA-----TAACTA-TT-TGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTT-ATTTTTTA
** * ** * * *
5525 AATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAACATTATTTTATTTTGGATAAGATT
113 AATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT
*
5589 TTATG
177 GTATG
* * * ** * * * *
5594 AATTGAAACAATTATTTTATGTTAAAATAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTAT-A
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCA
* ** * * * * * * * *
5658 AATTGAAACAATTATTT-TA-T-G-AC--TAAACAAATGGTCAAAATGATTTGAAATAGCTAATT
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAAT--T---TAT-TTTTTAAAT--CT-CTT
* * * * * * **
5717 ATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAA-CA-TATT-TATTT-TTT-AAAT-CTC
121 A--CT--TA---TTAA-TTTTTGAAAT-ATT-AATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCGAATAAGC
* *
5776 TTACTTATT
175 TT--GTATG
* ** ** * ** ** *
5785 AATTTTTAGAATATTATTAATTTA-G-CAATATTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA
1 AA---CTA-AA-ACAATTGTTTTATGACAA-A----A--C--AA-AAGGTCATAACAATTTGAAA
* * ** * * * * * * *
5847 CA-ATTACTTTATGAGAAAAAAAGATCATAACAATTTTAGA-TAGATAATTGTTCAAA-TAGTCA
51 TAGA-TA-ATTAT---TCAAATAG-TCATAACTATTTGA-ACTAG-T--TCGGT-AAACAAAT--
* * * * * * * * * * * ** * * * *
5909 TAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTTAAATCTCTTCTTAATTTTTGAAATA
103 TTA-TTTTTTAAAT--CTC--TTACT-TA-TTAATTTTTGAAA--TATTAATAA-ATTAGTATTA
* * * *
5974 TTAATAAATTGGTACT-A-CTT-TAT-
158 TT--TTATTTCG-AATAAGCTTGTATG
* * * * * ** * * ** *
5997 -TCT-GAATAATT-TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAATAAAATAATGAT
1 AACTAAAACAATTGTTTTATG-ACA-AAACAAAAG--GT----CATAACAATTTGAAAT-A-GA-
* * * ** * * *
6059 TTGAAATAGCTAATAGTTCGAATAGAC-TAGACTATTTGAACTTGTTTAGTGAATAGATTTATTT
55 -T---A-A--T--TA-TTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTT
** *
6123 TTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTCTATTTCGAATAA
109 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
**
6187 ATTTGTAT-
173 GCTTGTATG
* * * * * * * * *
6195 AAGTAGAAACAATTGTTTTATAAGAAGACGAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCA
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
** * * * *
6260 AATAGTCATAACTATTCT-AACCCGCTCAGTAAACATATTTTATTTTTTAAAATCT-TTTCTTAT
65 AATAGTCATAACTATT-TGAACTAGTTCGGTAAACA-AATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTAT
* ** * *
6323 TAATTTTTGAAA-ATTTAATAAATTAGTATCATTTTATAGCAAATAAGCTTTTATG
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* * * ** * * *
6378 AACAAAAACAATTGGTTTACGACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATGGACAATTGTTCAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * ** * * *
6443 ATAAAT-ATAATTATTTGAACGT-GTGT-GAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATT
66 AT-AGTCATAACTATTTGAAC-TAGT-TCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
* * * *
6504 AATTTTTGTAATATTAATCAATTTA-TGTTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATG
128 AATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATG
* * *** * * *
6558 AA-TAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATGTTTTAAAATAGATAACTATTTA
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * *
6622 GATAGTCATAGCTATTTGAGCTTA-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
** * * * *
6686 ATTTAAGTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTG
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * ** * ** *
6739 AATTGAAACCGTTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * * * * * *
6804 ATAATCATGATTATTTCAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAA
66 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA
* ** * * *
6869 TTGTCAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTAATCCGAATAACCTTGTATG
130 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* *
6920 AAC-ATAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * *
6983 AAATAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* *
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129 ATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATG
* * * * * * * * *
7100 AA-TAGAAAAAATTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATA-ATTAATTGTTC
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTATTC
* * * * ** *
7163 AAATAGTCATAA-TCATTTAAAGTTA-TTCGATAAACAGATTT-TTTTAAAAATCTCTTAATTAT
64 AAATAGTCATAACT-ATTTGAA-CTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
7225 TAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAGTAAACTTATATG
127 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
7280 AA-TCGAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
1 AACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * * *
7344 AATAATCATGACCATTTGATCTAGTTCGATCAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA
* * * *
7408 ATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTGAATAAGCATGTATG
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG
* * ** * * *
7461 AA-TAGAAACAAATGTTTTATAACAGGACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT-TGTC
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TC
* *** * *
7524 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTA
64 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * *
7585 ATTTTTGAAATATTAGTAGATTAGTATTACTTTATTAT-GAAAAAACTTATATG
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATG
* * * * ** *
7638 AACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * * ** *
7703 ATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTAGGTAAACAAAAATATTTTTTTAAATATCTTACTTATTAA
66 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * *
7768 TTTTTGCAATATTAATAAATCA-TTTTATTTTATTTCAAATCAGCTAGTATG
130 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * *
7819 -----AAA-ATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAA-AATTTTGAAACAGATAATTGTTCA
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
7877 TATAGTCTTAAATATTTG-A-TTGTT-TGTCAAACAAATTTA-TTTTTAATTCTCTTAGTTATTA
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* * * * * *
7938 ATTTTAG-AATATTATTATATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG
129 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * * * * *
7990 AA-TAGAAATAATT-TTTTGTTACAAAACAAAATGTTATAACTATTTGAAGTATACAATTGTTTA
1 AACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
8053 AATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGATGAACAGATTTATATTTTAAATCGCTTACTTATTAA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * *
8118 TTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCTGAATATGCTTGAATG
130 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG
* * * * * *** * * *
8170 ATC-AAATACACTTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGGTTTGAAATAGATAAATGTTGA
1 AACTAAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * ** * * * * *
8234 AATGGCCATAATTATTTGAAAT-GATTTAGTAAATAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTAATTA
65 AATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * *
8294 ATTTTTGGAATGTTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
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* ** * **
8347 AACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCGT
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * ** * *
8412 ATTGTCTTAACTATTTAAACT-GCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAA
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* * *
8476 -TTTTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
130 TTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * * ** *
8528 AACTGAAACAATT-ATTTA-GA-ATAGAATAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTC
1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACA-A-AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
* * * * *
8590 AAATA---AGAAC----TG--C---TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
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* * * *
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*** * * ** *
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1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * * ** * * * *
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* *
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* * * * ** ** * * *
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1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG-ATAATTATTCA
* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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1 AACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT-TATTCA
* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * ** *
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** * * * ** * *
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1 A-ACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * ** *
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* * * * ** * * * * **
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * *
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** * * * ** * * *
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* * * **** ** * *
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* * * *
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10707 ATTTTTAGAT
Statistics
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0.73 0.17 0.10
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*
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* * * * * *
201 TTATGACAAAATAAAAAGTTATAATAA-TT----T-G----TTGTTCAAATAGTCATAACGATTT
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* * * *
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* * * * ** *
360 GATGA-AATCT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTCCAAATAGATAATTGTTTAAAT
1 GA-AACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
423 AGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTT
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* * * * * * *
488 TTGGAATATTAACAACTTAGTATTATTTTATTT-GAATAACCTTATATGAACTGAAATAATT-TT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTT
* *
551 CTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATT
193 -TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * * * ** *
615 TGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAATTTTTTAATTATTAATTGTCAAAATAATAAT
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* *
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* * *** * * * *
720 GAAACTATTGTTTTATAATGGAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATA-ATTAATTGCTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATA
* * * * * *
784 GTTATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAAAAAGATTTA-TTTTTAAA-ATC-T-CTTATGAATTT
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * ** *
844 TTGTAATATTAATAGATTTGTATTATTTTA-TTCTAAACAAACTTATATGAACAAAAAC-A-TAT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGT
* * *
906 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATT
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* * * * * *
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257 TGAACTTG-TTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * *
1031 AAATTCA-T-TGTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATGAATT
321 AAATT-AGTAT-TATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * *
1071 GAAA-AATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
1135 TCTTAAACAAATTGAACTAGTT-TGACAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTT
66 TCAT-AA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * ** * * *
1199 TTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACAT-AAATAATTAT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGT
* * * * * * * * *
1263 TTTATAATAGAACAAAAGGTTTTATTTTGTAAATAATTGATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATA
192 TTTATGACAAAACAAAAGG--TCA-----T-AA-CA---ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
*
1328 GTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAACA-AATT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
245 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTC-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *
1390 TTGAAAGATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGATATA
308 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGA-ATA
* * * * * * *
1444 -AAACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAACAACGATTTGAAATAGATAATTATTGAAAT-G
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** ** * * *
1507 ATGATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATGTT
66 -TCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
1568 TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATAGGAACTGAAGCAATTGTTT
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* * * * *
1633 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTTTTTAAATAATCATAACTATTTG
194 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
1698 AATTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAGA
259 AACTTGTTC-GTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * *
1762 AATTATTATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAATT
322 AATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * * *
1801 GAAACAATTCTTATATGTCAAAACGAAAGATCATAACAATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
1866 TTATAACTATTTAAACTTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTACTTTTTAATTTT
66 TCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * * * * *
1931 CCAAATGTTAATAAATTTGGATTATGTTATTTC-AATAAGCTTGTAAGATA-TGAAATAAATT-T
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAA-CAATTGT
** ** * * * * * ** * *
1993 TTT-TGACTTAACAAAATATCAAAACAATCTGTAATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTGTT
192 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * *
2057 TGAA-TTGGTGCCGTATGCACATTTAATTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAT
257 TGAACTT-GT-TCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
*
2117 TAAATTAGTATTATTTTTAATT-GAATAAGCTTCTATG-ATA
320 TAAATTAGTATTA-TTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * * *
2157 AAAACAA-TATTTAATGACAAAAC-AAAGATCTTAACAATTTTAGATTGAAAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
2220 TCGTAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
66 TCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
2285 CAAATATTAATAAATTATTGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATTAAAAACAATTGTTT
130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTT
* * * * * * * * * *
2349 TATGACAAAACAAAAGCTCATAACGATTTCAAATAGATAATCATTCAAATGGCCTTTATTATTTT
194 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * ***
2414 TAC-TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTAAAAAATATTAATA
259 AACTTG-TTC-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * **
2478 ATTTAATATTATTTTATTCTATTTAAATTTGTACT-AACT-
322 AATTAGTATTATTTTATTCGA-ATAAGCTTGTA-TGAA-TA
* * ** * * * **
2517 GAAACAATTATTTTATGACAAATCAAGTGGTTATAA-TGATTTTAAATAGACAATTACTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * **
2581 GTAATTACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTGAATCTCTTTTTGTAATTAAT
65 GTCA-TAATATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-T-ATTAAT
* * ** *
2646 TTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAACAATTG
126 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG
* * * * * * * *
2710 TTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCAT
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
2775 TTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTTTAAAACATTAT
256 TTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * *
2838 TGAATTAGTATTATTTAAATCCTAATAAGCTTGTATGAATA
320 TAAATTAGTATTATTT-TATTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * ** **
2879 -AAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGACATAGATAATCATTCATGTAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * ** * * ** * *
2943 TCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTC
66 TCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * *
3008 AAAATATTATTAAATTAATATT-TTTTA-TTCTAAATAAAATAGTATGAA-TAGAACCAATTGTT
130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTT
* * * ** * *
3070 TAATGAC-AAACTAAAATGTTATAATGATTAGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATT
193 TTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * * *
3134 TAAAATGGTTTGATAAGCA-AATTACTTTTTAATTCTCTTACTGATTAATTTTCT-AAATATTAA
257 TGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAA
* * * * * * *
3197 TAAATTAGTGTTATTTTCTTTCCAATAAACTTATATTAACA
320 TAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * *
3238 AAAACAATTATTTTATGACAAAACATAAA-GTAATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** ** ** * * * * *
3302 GTTATAATTATTCAAACTAATTTGGTAAACAAAATTATTTTCTAAATCCCTTACTTATAAATTTT
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
3367 TGAAATATTAA-AAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTGTATGAGCTAAAATAATTGTTT
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * * * * *
3431 TATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTA
194 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * ** *
3496 AACTAGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTACTAA
259 AACTTGTTC-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
*
3561 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGGATA
323 ATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * *
3599 GAAACAATT-TTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTAAAATAGGTAATTATTCATATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * *
3663 TCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAAATATATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTCTT
66 TCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
3724 GAAATATTAATGAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATG--TTGAAAACAATTGTTT
130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG-AAACAATTGTTT
* ** * * * * *
3787 TATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTG
194 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
3852 AA-TTGATTCGGTAAACTA-ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAAGTTTTGAAATATTAAT
259 AACTTG-TTC-GTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * *
3915 AAAGTAGTATTATTTTATTTGGATATGATTTTATGAACTA
321 AAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * * * *
3955 -AAACAACTATTTTATGATAAAACAAATGGTCA-AA-TGATTTTAAATAAATAATTGTTTAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
4017 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATATTTTCAAATCTCATGCTTATTAATTT
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT
* * * *
4082 TTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTAT
127 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGT
* * * * *
4146 TGTATAACTAAACAAAAGGTCA-AAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTAT
192 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
4210 TTGAACTAGTTCGATAAACACATTAATTTTTTAAA--TC-TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAT
256 TTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* *
4271 TAAATTAGTATTATTTTTATCCGAATAAGCTTATATG-ATCA
320 TAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAAT-A
* * * * * * * *
4312 AAAACAGTTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTTGAGATTGATATTTCTTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * * *
4375 GTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAACA-ACTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * ** * *
4439 TTGAAATATTAAAAAAGTATTATTATTTTATTTCAGATAAATTTTTATGAACTGAAACAATTGAT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTT
*
4504 TTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTAT
193 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTAT
* * * * **
4567 TTAAACTTGTTCGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAA
256 TTGAACTTGTTCGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * *
4632 TAAAATAGTATTATTTTAATCGAATAAACTTGTATGAATA
320 TAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* ** *
4672 GAAAGAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
4737 TCATAATGATATGAACTTGCTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTT
66 TCATAAT-ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * *
4801 TGGAATATTAATAAAATATTATTATTTTATTTCAAATACA-CTTGTATGAA-TAGAAACAATTGG
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGT
* *
4864 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
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* * * * * *
4929 TGAA-TATGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAA
257 TGAACT-TG-TTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* *
4992 TAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTATATGAACA
320 TAAA-TTAGTATTATTTTATTCG-AATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
5033 TAAACAATTATTTTATGATACAACAAAA-GTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
5096 TCATAACCATTTGAACTTGTCCGGTAAACATATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTT
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* * * * *
5161 -AGGATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCCTATGTGAACT-AATACAGTTGTT
130 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAA-ACAATTGTT
* ** * *
5224 TTGTGATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGAGATTTG
193 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG---T--CA--T-
* * * * *
5289 AAATAGATAATTATTCAAATAGTTACGACTATTTGAACATGTTCAGTAAACATATTTATTTTGAA
250 --A-A-CT-A-T-TTGAACTTGTT-CG--TA----AACA-G---A-T----TTA-TT-TTTT--A
* * * * ** * * * *
5354 AACCTTTTACTTTTTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCAAAATAAACTTG
288 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTG
* *
5419 TGTGAACA
352 TATGAATA
* *
5427 -AAATCAATTGTTTTATGACAAAA-AAAA-GTCATAA-TGATTTGGAATA-AGTAATTGTTTAAA
1 GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAA
* **
5487 TAG---T--TA--T-AAC-TGATTC-GATAAACTA-ATTTCTTTTTTTAAATCTCCAACTT-TTC
63 TAGTCATAATATTTGAACTTG-TTCAG-TAAAC-AGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-
* ** *** * * *
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123 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAA
* ** * * * * * ** *
5605 TTATTTTATGTTAAAATAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTAT-AAATTGAAACAA
188 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAGTCATAA
* * * * * * * *
5669 TTATTT-TA--TG-AC-TAAACAAATGGTCAAAATGATTTGAAATAGCTAATTATTCTAATAGTC
252 CTATTTGAACTTGTTCGTAAACAGAT--T---TAT-TTTTTAAAT--CT-CTTA--CT--TA---
* * * * * * ** * *
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301 TTAA-TTTTTGAAAT-ATT-AATAAATTAGTA-TTATTTTATTCGAATAAGCTT--GTATGAA--
5789 TTTA
358 --TA
** ** * **** * *
5793 GAATATTATTAATTTA-G-CAATATTTTA-CTCTGAATAAGCT-TGTATG-AATAGAAACAATTA
1 GAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC---ATAA-CTAT-T-TGAAATAG--ATAA-T-
* * * * * *
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55 -TGT-T----CAAATAG-TCAT---AATATT---T-GA-ACTTGTTC----AGT-A-AACAGATT
** * * * * * * * *
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* * * * ** ** * * **
5980 -AATTGGTACTAC-TTTATTC-TGAAT-AATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAA
150 TTATT-TTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA--CTG-A--A------ACAATTGTTTTATGACAAA
**** ** * * *
6041 ACAAAATAAAATAATGATTTGAAATAGCTAA-TAGTTCGAATAGAC-TAGACTATTTGAACTTGT
203 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTG-
* * * **
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* **
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* * * * * * *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * *
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127 TTTGAAATA-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG
* * ** * * * * *
6392 GTTTACGACAAAACAAAAAATCATAACAATTTGAAATGGACAATTGTTCAAATAAAT-ATAATTA
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-AGTCATAACTA
* * * * *
6456 TTTGAACGTGTGT-GAAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGTAATATT
255 TTTGAACTTGT-TCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * *
6519 AATCAATTTA-TGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATA
318 AAT-AAATTAGTATTATTTTATTCG-AATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * *
6562 GAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA-TGTTTTAAAATAGATAACTATTTAGATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
6626 GTCATAGCTATTTGAGCTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTA
65 GTCATA-ATATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * **
6691 AGTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTGAATTGAAACCGTTGTTT
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* ** * * * * *
6756 TATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATGATTATTTC
194 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * **
6821 AATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAAT-
259 AACTTGTTC-GTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * *
6885 AATTAGTATTATTTTAATCCGAATAACCTTGTATGAACA
322 AATTAGTATTATTTT-ATTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * *
6924 TAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
6988 GTCATAACATTTGAACTTGTT-TGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGT
65 GTCATAATATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* * *
7052 CTT--AATATTAATAATTTTGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATT
128 -TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATT
* * * * * * * *
7113 ATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGCGATTTCAAATA-ATTAATTGTTCAAATAGTCATAA-T
190 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * ** * *
7176 CATTTAAAGTTATTCGATAAACAGATTT-TTTTAAAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATAT
254 -ATTTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * *
7240 TAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAGTAAACTTATATGAATC
317 TAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * *
7284 GAAACAAATCTTTTATGACAAAAGAAAGGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * * * *
7349 TCATGACCATTTGATCTAGTTC-GATCAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTG
66 TCAT-AATATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
7412 TTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTGAATAAGCATGTATGAA-TAGAAACAAATG
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTG
* ** * * *
7475 TTTTATAACAGGACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT-TGTCAAATAGTCATAACTA
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAGTCATAACTA
* ** *
7539 TTTGAACTGGTTTAATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTA
255 TTTGAACTTG-TTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * * *
7600 GTAGATTAGTATTACTTTATTATGAAAAAACTTATATGAACA
319 ATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
7642 AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** *
7706 GTCATAATTATTTGAA-TTGGTT-AGGTAAACAAAAATATTTTTTTAAATATCTTACTTATTAAT
65 GTCATAA-TATTTGAACTT-GTTCA-GTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * *
7769 TTTTGCAATATTAATAAATCA-TTTTATTTTATTTCAAATCAGC---TA-GTA-TGAAA-ATTTG
126 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG
* * * * * *
7827 TTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAA-AATTTTGAAACAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATA
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
7891 TTTG-A-TTGTTTGTCAAACAAATTTA-TTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTAG-AATATTA
255 TTTGAACTTGTTCGT-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
7952 TTATATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATA
319 ATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * *
7994 GAAATAATT-TTTTGTTACAAAACAAAATGTTATAACTATTTGAAGTATACAATTGTTTAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
8058 TCATAATTATTTGAACTAGTT-TGATGAACAGATTTATATTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTT
66 TCATAA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * *
8122 TGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTA-TTCTGAATATGCTTGAATGATC-AAATACACTTGT
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAA-ACAATTGT
* * * *** * * * * * *
8185 TATATGACCAAACAAAAGGTAATAATGGTTTGAAATAGATAAATGTTGAAATGGCCATAATTATT
192 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * * *
8250 TGAA-ATGATTTAGTAAATAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTAATTAATTTTTGGAATGTTAA
257 TGAACTTG--TTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* *
8310 TAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA
320 TAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* ** * * ** *
8352 -AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCGTATTG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
8416 TCTTAACTATTTAAAC-TGCTTC-GACAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCTTAGTTATTAA-TT
66 TCATAA-TATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *
8478 TTCATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-A
128 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGT
* * * ** * *
8542 TTTA-GA-ATAGAATAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATA---AGAAC--
192 TTTATGACA-A-AACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* *
8600 --TG--C---TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
255 TTTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
*
8658 ATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA-ACAGGCTTGTATG-ATGA
319 ATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATA-A-GCTTGTATGAAT-A
* * * * *
8700 AAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AATGTTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
8763 GCCATAATTATTTGAA-TCGATTTAGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTT
65 GTCATAA-TATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *
8827 TTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-TAATGAATTGAAACAATTTT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT-ATGAACTGAAACAATTGT
* ** ** * * * * *
8891 TTTATGATAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAAT-GTACAATTGTTCAAATAGTCACAACGAT
192 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* *
8955 TTGAA----TT--T------A--T-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAA
256 TTGAACTTGTTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
9005 AAATTGGTA-TATTTTATTTTGGATAACCTTTTATGAACT-
321 AAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * * * *
9044 GAAGCAATTGATTTATGACAAAACAAATGATCATAACGATTTTAAATA-TTAATCT-TTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATA
* * * * * *
9107 GTCATAACTACTT-AAGCTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATATCTTGCTTATTAATT
65 GTCATAA-TATTTGAA-CTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
9171 TTTCAAATGTTAATATATTAGGATTATTTT-GTTCTAAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAAT
127 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATT
* * * * * * ** **
9234 ATTTTATGACTAAA-AATAGGTTAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTTATAGTTTTAACTA
190 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * *
9298 TTTGAACTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
255 TTTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
*
9363 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAA
319 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGA-ATA
* * * * * * *
9406 AAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAATGGTTAT-AGTAATTTGAAACAGATAATTGTTCAAATT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** *
9470 GTCATAATTATTT-AACTAATTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC---TT-A---
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * *
9526 TT--AATA--AAT---TT-GTATTATTTTATTTCGTATAAACTTGTATTAACTGAAACAATTGTT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTT
* * * * * * * *
9583 TTATGA-AAAAAAAAATGTCATAGCAATTTTAAATAGACAATTGTTAAAATAGTTATAACTATTT
193 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
9647 GAACTTTTTTGGTAAATAGATTTATTTGCTTAAATCTCTTTCTTCTTAATTTTTTG-AATGTTAA
258 GAAC-TTGTTCGTAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
* * **
9711 TAAATTAGTATTAATTTATTTTGGGTAAGCTTG--T--AT-
320 TAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * *
9747 -AAAC----------TG---AAACAAAAGATTAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *
9798 T-ATTAATCATATGAA-TTGGTTC-GATAAACA-A--T-TTTTTT-GATCTCTTACTTATTAA-T
66 TCA-TAAT-ATTTGAACTT-GTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * *
9854 TTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTACGAACAT-AAA-AATTG
127 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTG
* * * * * *
9917 TTTTATGACAAAACAAATGGTGATAACTATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTAT
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * * ** * ** *
9982 TTGAACTCGTTCGATAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTAT
256 TTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
10047 TAAGTTAGTATTATTTTATTCCAAATGAA-ATAGTATGAACA
320 TAAATTAGTATTATTTTATT-CGAAT-AAGCTTGTATGAATA
* * * * *
10088 -AAACCAATTGTTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCATAT
1 GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
10151 AGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
64 AGTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * * ** *
10216 TTTAAAT-TTAATAAATTAGTATTATTTGATTTCGAACAAACTTATATCAACAAAAATAATTGTT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTT
* * * * * * * *
10280 TTATGACAAAATAAAAAGTAATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTT
193 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
10345 TAA-TTGATTCGGTAAATAG-TATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAA
258 GAACTTG-TTC-GTAAACAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
10408 CAAATTAGTTTTATTTTATTCTAAATATA-CTTGTATGAGTT
320 TAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATA-AGCTTGTATGAATA
* * * *
10449 GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTTATATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * * *
10513 GTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTAACAAACGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTT
65 GTCATAA-TATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * ** *
10577 TT-AGAGTATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTG
128 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG
* * * *
10640 TTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACAATTTGAAATACATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
10705 TT--A-TT-TT--T----AGATCT-CTTATT-AAT-TC-T--TGA--AA----T---A--TTAAT
256 TTGAACTTGTTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * *
10743 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAAGCTTGTATG-CTGA
321 AAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAAT-A
* * * * * ** * *
10783 AAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-ATAATTTATAATTATTCAAATG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATA
* *
10847 GTCATAATTATTTGAACTGGTTC-GATAAACTA-ATTTATTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATT
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * *** *
10910 TTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGT
127 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGT
* * * * * * * *
10975 TTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTTAAGTAGATAATTGTTTAAATAATAATAACTATT
192 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
11040 TGAGCTTGTTTGGTAATCATATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATGTTAA
257 TGAACTTG-TTCGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
*
11105 TAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-
320 TAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * * * * *
11146 GAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTTAGAA-TGATTTTAAATATTAATGAAGTTGTATT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATA--GAT-AA-TTGT-TC
** * ** ** * ** * ***
11210 ATTTTATTTCGGATAA-ATTTTTA--TGAACTG-AAACA-ATTGT-TTTATGACAAAAC-AAAAG
60 A-AATA-GTC--ATAATATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATT-TATTT-T-TTAAATCTCTTA-
* * * * * * * **
11268 GTCA-TAATGATTTT-AAATA--GAT-AATTATTCA-AATGGTTATATCTATTTGAA-CTTGTTA
117 CTTATTAAT--TTTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTAT-TTTATTTC-AAAT-AAGCTTG-TA
* * ** * **** * * ***
11326 GGTAAAT-ATATTAATT-TTTT-T---AAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATCA-ATAA-
175 TG-AACTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTTGAA-AT-AGATAAT
* * ** * * * * * * *
11383 -ATT--AGTA-TTAT-TTTATTTCAAATAAGCTT-GTACGAACTGAAATAATTGTTTTATGA-CT
235 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TG-TTCGTA--AACAG-ATTTATT-TTTTA-AATCT
** ** * * *** * * * * *
11441 -AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACT-A
293 CTTAC-TTA--T--TAAT-TTTTGAAATA-TTAATAAAT-TAGTATTATT--TTATTCGAA-TAA
*
11504 GATTG---GCAA-A
347 GCTTGTATG-AATA
* * * * * ** *
11514 -ACACATTTATT-TTTTATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGAAATAAGCTTATATGAAA-AG
1 GAAACA---ATTGTTTTATGA-CAAA--A-CA--A----AA-GGTCATAA-C-TATTTGAAATAG
* * *
11576 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGTAGTC
50 --ATAATTG---T-T--C-AAAT--AG-TCATAA-TA-TT----T-GA-ACTTGTTC-AGTA---
* * * * * *
11641 ATA-ACTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTAATTAATTTTTAAAAC
91 A-ACA-GATTT--A-TT-TT---T---TAAA--T--CTCTT--A-CT-T-ATTAATTTTTGAAAT
** **
11705 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGA
135 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA
* * ** ** *
11769 CAAAATAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACTT
199 CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-T
* * * ** *
11834 TTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTA
263 TGTTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTA
* ** *
11898 GTATTATTTTATTTCAAATAAAATTATATGAATA
327 GTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* ** * * * **
11932 GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAAATAAATATTTATTCAAACGG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * * *
11997 TCCATAACTATTT-AGTTTGCTCAATGAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
66 T-CATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
12061 TGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATGAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTT
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * *
12126 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
194 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
12191 AACATGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAA
259 AACTTG-TTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * *
12255 ATTTA-TATTATTTTATTTGGAATGACCGTGTATGAACA
323 A-TTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
12293 GAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
12358 TAAGAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTT
66 TCATAA-TATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * ** *
12422 TGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACTGATGCAATTATTT
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
** * * * **
12487 TAAAATC-TAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGCTATTT
194 TATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * **
12551 GGACTTTTTAGATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACCTATT-ATTTGAGGAAATATTAAT
258 GAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAAT
* *
12615 AAATTAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAACA
321 AAATTAGTATTATTTT-AT-TCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * *
12655 AAAACAATT-TTTTAT----AAACAAAA-GTCGTAA-TGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
12713 GTGATAACTATTTAAACTTATTC-GATAAATAGATTTA--TTTT-AAT-T-GT--TTA--AA---
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * *
12765 -T---ATA--AATAAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAATTTT
128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGT
* *
12823 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGA-T-AAATAGTCATAACTAT
192 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * *
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256 TTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
** * * * * *
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* * * * * * * * * * *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *** * * * *
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* * **
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* * * * * *
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* ** * * **
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254 ATTTGAACTT-G-TTCGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * *
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* * * * * * *
13354 AAAAAAATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATATGAAATCGATAATTATTTAAATA
1 GAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
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65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* ** * * * *
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* * * * * * * * * * *
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192 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
13606 TGAACTGGTTC--AAATAAATTTA---TTGAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATT
257 TGAACTTGTTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * *
13665 ACATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTACGAACA
321 AAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * *
13705 GAAATAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** *
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* * * *
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128 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTG
* * * *
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* * ** * *
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255 TTTGAACTTG-TTCG-TAAA-CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * *
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* * * * *
14067 -AAACAATTGTTTTATGATAAAACTAAAGGTCATAAC-AGTTTTAAATAGATAATTATTCATATA
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
14130 GTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGATAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTT
65 GTCATAA-TATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* ** * * * * *
14194 TCTG-AATGTTAATAAGA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAACTGAAATAAATA
128 T-TGAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG
* * * * * * * * *
14257 TTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAACAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTAT
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * *
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256 TTGAACTTGTTCG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * * *
14381 TAATTTAGTAGTATGTTACTTTGAACAAGATTCTATGAATA
320 TAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * * * *
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1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
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66 TCATAA-TATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * *
14546 TGAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTT-TTT-ATGAATAATTTTGTATGAA-TAAAAATAATTG
129 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA--AATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTG
* * ** * * ** *
14608 TTTTACGACAAAATAAAATATCATAATAATTTCAAATAGATAA-TAGTTCAAATAAAACATGACT
191 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-AGTCATAACT
* * * * * *
14672 ATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTAATTTTTTAAATCT-TCAACTTACTAATTTTT-AGAACA
254 ATTTGAACTTG-TTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGA-AATA
* * *
14735 TTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGAATAAACTTGTATGAATA
316 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
14780 GAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGAG-CATAA-TGATTTAAAATAAATAATTGTTTAAAT
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * *** * * *
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TCATAATATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
CTTGTTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
AGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATA
Found at i:5276 original size:16 final size:16
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*
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AAATAGATAATTATTC
Found at i:5709 original size:64 final size:64
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5584 AGATTTTATG
* * *
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1 AATTGAAACAATTATTTTATGCTAAAATAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTATA
* ** *
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1 AATTGAAACAATTATTTTATG-CTAAAATAAAAT-GTCAAAACAATTTGAAATAGATAATT
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AATTGAAACAATTATTTTATGCTAAAATAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTATA
Found at i:8707 original size:168 final size:168
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* *
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* *
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*
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* * * ** *
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* * *
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* *
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* ** * * * * * *
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1 A--A-CTGCTTCG----A-CAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAA-TTTTCATAA
* * * * * *
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* ** * * *
8897 ATAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAAT-GTACAATTGTTCAAAT-AG
121 ACAAAACAATGT-TCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTATTCAAATAAG
* * **** * * *
8945 ---T-C-ACAACGATTTGAATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGA-AATATTAA
1 AACTGCTTCGAC-AAACAAATTTA-TTTTTTAAATCCCTTACTTATTAA-TTTTCATAATATTAA
* * **** * * * *
9004 AAAATTGGTA-TATTTTATTTTGGATAACCTTTTATGAACTGAAGCAATTGATTT-ATGACAAAA
63 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-ATTTAATGACAAAA
* * * * *
9067 CAAATGATCATAACGATTTTAAATA-TTAATCT-TTCAAATAGTCATA
127 C-AATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAATA---A-G
** ** *
9113 ACTACTTAAGCTTATTCGGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATATCTTGCTTATTAATTTTTCA-A
1 A--AC-T--GC---TTCGACAAACAAATTTATTTTTT-AAATCCCTTACTTATTAA-TTTTCATA
* * * * * * * *
9177 ATGTTAATATATTAGGATTATTTTGTTCTAAATAAGCTTGTATGATA-TGAAACAAATATTTTAT
56 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTATTTAAT
* * ** * *
9241 GACTAAAA-ATAGGTT-AGAACAATTTAAAATAGATAATTATTCTTATAGTTTTAACTATTTG
120 GAC-AAAACA-ATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC----A-----AA-TA--AG
* * * * *
9302 AACTGGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATA
1 AACTGCTTCGACAAACAAATTTATTTTTTAAATCCCTTACTTATTAA-TTTTCATAATATTAATA
* * * *** * * *
9366 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
65 AATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTATTTAATGACAAAAC-
* * * *
9431 AATGGTT-ATAGTAATTTGAAACAGATAATTGTTCAAAT
128 AAT-GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
9469 TGTCATAATT
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ATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAT
GTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAG
Found at i:8760 original size:16 final size:17
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8773 TT
1 TT
8775 TGAATCGATT
Statistics
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TTGAAATAGCATAATTA
Found at i:9543 original size:166 final size:166
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Period size: 166 Copynumber: 2.0 Consensus size: 166
9348 ATTTTTGAAA
*
9358 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATAA-AAAAACAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTAT--TAACAAAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * *
9422 -AACAAAACAAATGGTTATAGTAATTTGAAACAGATAATTGTTCAAATTGTCATAATTATTT-AA
64 GAA-AAAAAAAAT-GTCATAGCAATTTGAAACAGACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAA
*
9485 CTAATTCGATAAACAAATTTATTT-TTTAAATCTCTTACT
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* * **
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* * * **
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66 AAAAAAAAATGTCATAGCAATTTGAAACAGACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTAA
* * * * *
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*
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAAAAAAAATGTCATAGCAATTTGAAACAGACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAACTAA
TTCGATAAACAAATTTATTTGCTTAAATCTCTTACT
Found at i:9868 original size:17 final size:17
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Period size: 17 Copynumber: 2.5 Consensus size: 17
9836 GATCTCTTAC
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* * *
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
16 5 0.24
17 16 0.76
ACGTcount: A:0.36, C:0.00, G:0.05, T:0.60
Consensus pattern (17 bp):
TTATTAATTTTGAAATA
Found at i:10755 original size:153 final size:153
Alignment explanation
Indices: 10583--10859 Score: 396
Period size: 153 Copynumber: 1.8 Consensus size: 153
10573 ATTTTTAGAG
* *
10583 TATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAAGAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATG
* * *
10647 ACAAAACAAATGGTTATAACAATTTGA-AATACATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTATTT
65 ACAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-ATAATACATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTATTT
10711 TTAGATCTCTTATTAATTCTTGAAA
129 TTAGATCTCTTATTAATTCTTGAAA
* ***
10736 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAAGCTTGTATGCTGAAAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
* ** * *
10801 TAAAACAAAAGGTAATAACAATTTATAATTTATAATTATTCAAATGGTCATAATTATTT
66 CAAAACAAAAGGTAATAACAATTTATAATACATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
10860 GAACTGGTTC
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 14, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
152 1 0.01
153 104 0.96
154 3 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (153 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAAACTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTAATAACAATTTATAATACATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTATTTTT
AGATCTCTTATTAATTCTTGAAA
Found at i:10975 original size:181 final size:182
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Indices: 10719--11176 Score: 532
Period size: 181 Copynumber: 2.5 Consensus size: 182
10709 TTTTAGATCT
* * *
10719 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAGAAGCTTGTATG--CTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTG
* **
10782 AAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTTATAA-TTTATAATTATTCAAAT
66 --AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTT-TAAGTAGATAATTATTCAAAT
** * *
10846 GGTCATAATTATTTGAACTGGTTCGATAAAC-TAATTTATTTTTT-AAACCTCTTA
128 AATAATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACAT-ATTTATTTTTTCAAACCTCTTA
* * ** *
10900 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGAATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * * * *
10965 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTTAAGTAGATAATTGTTTAAATAAT
66 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTTTAAGTAGATAATTATTCAAATAAT
* * * * * * *
11030 AATAACTATTTGAGCTTGTTTGGTAATCATATTTATTTTTTCAAATCTCTTG
131 AATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTCAAACCTCTTA
* * *
11082 CTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTG
* *
11147 AAACAATTATTTTATGACT-AAATAAAAGGT
66 AAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGT
11177 TAGAATGATT
Statistics
Matches: 231, Mismatches: 40, Indels: 11
0.82 0.14 0.04
Matches are distributed among these distances:
180 3 0.01
181 134 0.58
182 91 0.39
183 3 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.10, T:0.44
Consensus pattern (182 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACTG
AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACAATTTTAAGTAGATAATTATTCAAATAAT
AATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTCAAACCTCTTA
Found at i:11198 original size:93 final size:93
Alignment explanation
Indices: 11092--11286 Score: 250
Period size: 93 Copynumber: 2.1 Consensus size: 93
11082 CTTATTAATT
* *
11092 TTTTAAATGTTAAT-AAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT
1 TTTTAAATATTAATGAAATT-GTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATT
* * *
11155 ATTTTATGACTAAATAAAAGGTTAGAATGA
64 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGA
* ** * * *
11185 TTTTAAATATTAATGAAGTTGTATTATTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTGAAACAATTGT
1 TTTTAAATATTAATGAAATTGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTAT
*
11250 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
66 TTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGA
11278 TTTTAAATA
1 TTTTAAATA
11287 GATAATTATT
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 12, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
93 81 0.92
94 7 0.08
ACGTcount: A:0.41, C:0.06, G:0.12, T:0.42
Consensus pattern (93 bp):
TTTTAAATATTAATGAAATTGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACTGAAACAATTAT
TTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGA
Found at i:11680 original size:153 final size:153
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Indices: 11380--11681 Score: 382
Period size: 153 Copynumber: 2.0 Consensus size: 153
11370 TGAATATCAA
* * * ** *
11380 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTACGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAAC
1 TAAATTAGTATTATCTTATATCAAATAAGCTTATACGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACTAAAC
* * *
11445 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGATTGG
66 AAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATT-G
*
11510 CAAAACACATTTATTTTTTATTAT
130 CAAAACAAATTTATTTTTTATTAT
*
11534 TAAATTAGTATTATCTTA-ATCGAAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA
1 TAAATTAGTATTATCTTATATC-AAATAAGCTTATACGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACTAAA
* *
11597 -ATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTC-AAGTAGTCATAACTATTTGAACT-TAT
65 CA-AAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA-TAGTCATAACTATTTGAACTAGAT
*
11659 T-CAATAAACAAATTTAGTTTTTA
128 TGC-A-AAACAAATTTATTTTTTA
11682 AATCTCTAAT
Statistics
Matches: 129, Mismatches: 14, Indels: 12
0.83 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
150 1 0.01
151 1 0.01
152 22 0.17
153 55 0.43
154 50 0.39
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (153 bp):
TAAATTAGTATTATCTTATATCAAATAAGCTTATACGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACTAAAC
AAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATTGC
AAAACAAATTTATTTTTTATTAT
Found at i:11940 original size:181 final size:181
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Indices: 11528--14861 Score: 2122
Period size: 181 Copynumber: 18.7 Consensus size: 181
11518 ATTTATTTTT
* * * * *
11528 TATTATTAAATTAGTATTATCTTA-ATCGAAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
11592 ACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
11656 TATTCAATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC-TA---ATTAATTTTTAAAA
130 TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * ** *
11704 CATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * ** *
11768 ACAAAATAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * ** *
11833 TTTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAA
130 TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * *
11885 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * ** **
11950 CAAAACAAAATATCATAACT-ATTTGAAATAAATATTTATTCAAACGGTCCATAACTATTT-AGT
66 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAAC
* * * * *
12013 TTGCTCAATGAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
129 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
12066 TACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATGAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * *
12131 CAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACA
66 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * *
12195 TGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAGTTTTT-GAAA
130 TG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * * *
12246 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATGACCGTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATG
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * ** * * * *
12310 ACAAAAGAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAAGAACTATTTAAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
12375 TGTTC-AGTAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTAGTCATTAATTTTTGGAA
130 TGTTCGA-TAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * ** * **
12427 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACT-GATGCAATTATTTTAAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * * ** *
12491 ATC-TAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGCTATTTGGAC
65 A-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * * *
12555 TTTTTAGATAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACCTATT-A-TTTGAGGAAA
129 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-G-AA
* * * *
12608 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-TTTTAT-
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
12670 ---AAACAAAA-GTCGTAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTAAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * *
12731 TATTCGATAAATAGATTTA--TTTTAATTGT-TTAAATATAAATAAATTTGT-GTTA
130 TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACT-T--ATTAATTTTTAG-AA
* * * * * * * * * * ** * * ** *
12784 TTTTATTTGAAATAAG-CTTGTATGA-ATAGAAAAAATTTTTTTATG-ACA-AAACAAAAG-GTT
1 TATTA-AT-AAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAA-GCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
* ** * * ** *
12844 AT-----AGC--AATTTGA-AAT-A---GATAATTGATAA--A-T-AGT----CATAACTATTTT
62 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
12889 AACTTGTTCGACAAATAGATTCATTTTTTACATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAA
126 AACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** * * * * * * * *
12945 TATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAGTAGAAATAATTGATTTGTGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * * *
13010 TAACATAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCACACAATCATAAATATTTGCACTA
66 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* *** * * * * *
13075 GGGAAGCTAACA-A-ATTCATTTTTGAAAT-TCATTAGTTATTAATTTTTGGAA
130 TGTTCGATAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
13126 TATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGAC-TGTATGACTAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
13190 ATAAAACAAATA-GTCAAAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTGAA-
65 ACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** * * * * *
13252 TTGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTAAAAA
129 TT-GTTCGATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * *
13307 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAAAAATTTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTATG
* * * * * * * *
13372 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATATGAAATCGATAATTATTTAAATAGTCATAATTTTTTTACCT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
13437 AGTTCGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCTGATT-ATTTTT-GAA
130 TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
13487 -A-T-ATTAA-TAG-ATTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTA-AAAAAATTGTTTTA
1 TATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * * * * *
13545 CGATAAAACAAAAAGTCATAACGAGTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAA
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
13610 CTGGTTC---AAATAAATTTA---TTGAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
128 CTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
13658 TATTATTACATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTACGAACAGAAATAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * ** * **
13722 ACAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAGTCATAACCT-TTTGAAC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAAC
* * * *
13786 -TGATTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAA
129 TTG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * *
13838 TATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAGGTTTGTATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
13902 ACAAAACAAAAGGTTCATAA-CATTTAAAATAGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAAC
65 ACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* ** * *
13966 -TGATTTGATAAATTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTAAAA
129 TTG-TTCGATAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
14019 TATTAATAAAGTAATATTATTTTGTTTTGGATAAGCTTTTAT-AAGCTA-AAACAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA--TAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
14082 GATAAAACTAAAGGTCATAA-CAGTTTTAAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAA
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * *
14146 CTTGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTCT-GAA
128 CTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAGAA
* * * * * * *
14200 TGTTAATAAGA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAACT-GAAATAAATATTTTAT
1 TATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * * *
14263 AACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAACAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
14328 -TGTTCGATAGACACATCTATTTTTTAAA--TC---CTTATTAACTTTTAGAA
129 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * * * *
14375 TACTATTAATTTAGTAGTATGTTACTTT-GAACAAGATTCTATGAATAGAAATAAATGTTTTAGG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * *** * * * * *
14439 ATAAAAC-AAAGATCATACCAATTTTAGATAAATAATTCTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * *
14502 TGATTCGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTGATTTTT-GAAA
130 TG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * ** * * *
14551 TAGTAATAAATTAGTATTATTTT-TTTATGAATAATTTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTACG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * * ** *
14615 ACAAAATAAAATATCATAATAATTTCAAATAGATAA-TAGTTCAAATAAAACATGACTATTTGAA
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAA
* * * *
14679 CTTGTT-TAGTAAATAGATTAATTTTTTAAATCT-TCAACTTACTAATTTTTAGAA
128 CTTGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAGAA
* * * *
14733 CATTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
14798 CAAAATAAAAGAG-CATAATGATTTAAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTAAACT
66 CAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
14862 CACTCAGTAA
Statistics
Matches: 2462, Mismatches: 548, Indels: 291
0.75 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
159 10 0.00
160 11 0.00
161 20 0.01
162 34 0.01
163 1 0.00
164 9 0.00
165 2 0.00
166 1 0.00
167 1 0.00
168 1 0.00
169 20 0.01
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171 3 0.00
172 14 0.01
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176 191 0.08
177 121 0.05
178 64 0.03
179 17 0.01
180 353 0.14
181 954 0.39
182 209 0.08
183 27 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
GTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
Found at i:12765 original size:542 final size:536
Alignment explanation
Indices: 11528--14861 Score: 1385
Period size: 542 Copynumber: 6.2 Consensus size: 536
11518 ATTTATTTTT
* * * *
11528 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGAAATAAGCTTATATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTG-AATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTAT-
* * * * *
11592 ACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAACTT
63 A-AACA-AAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* *
11657 ATTCAATAAACA-A---ATTTAGTTTTTAAA-TCTCTAATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTA
125 ATTCGATAAATAGATTTATTTA-TTTTTAAATTCTCTAATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTA
*** * * * *
11717 GTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGT
189 GTATTATTTTATTCTAAATAACCGTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGT
* ** * * * * **
11782 CATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACTTTTTTGGTAAATAG
254 CAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAGGACAGAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAG
*
11847 ATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
319 ATTCATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** *
11912 CAAATAAAATTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAA
384 CAAATAAAACTATATGAATAGAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAA
* * * * * *
11977 ATAAATATTTATTCAAACGGTCCATAACTATTTAGTTTGCTCAATGAATAGATTTATTTTTTAAA
449 ATAAATAATTATTCAAACAGTCCATAACTATTTACTTT-CTCAATAAACAGATTTATTTTTAAAA
* **
12042 TCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
513 TCTTTTACCTATTAATTTGAGGAA
* ** * *
12066 TACTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATGAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-GTTT-T-A
*
12131 CAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACA
62 -TAAACAAAA-GTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-
* * * * *
12195 TGT-TTAGA-AAATAGATTTA--T-TTTTTAAATTTCTACTTATTAGTTTTTGAAATATTAATAA
123 T-TATTCGATAAATAGATTTATTTATTTTTAAA-TTCT-CTAATTAATTTTTAAAACATTAATAA
* *
12255 ATTTA-TATTATTTTATT-TGGAATGACCGTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAGA
185 A-TTAGTATTATTTTATTCT-AAATAACCGTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAGA
* *
12318 AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTA-AGAACTATTTAAACTTGTTCAG
248 AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGGACAGAACTATTTAAACTTGTTCAG
** * *
12382 TAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTA-GTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
312 TAAA-TAGATTCATTTTTTAAATCTCCAACCT-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* ** ** * *
12445 ATTTTATTTCGAATAAGCCTATATGAACT-GATGCAATTATTTTAAAATC-TAACAAAAGGTCAT
375 ATTTTATTTCAAATAAAACTATATGAA-TAGAAACAATTATTTTAAAA-CAAAACAAAAGATCAT
* * * ** * *
12508 AA-TAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TATGGCTATTTGGACTTT-TTAGATAAACAT
438 AACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCCATAACTATTT--ACTTTCTCA-ATAAACAG
12570 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACCTATT-ATTTGAGGAAA
499 ATTTATTTTTAAAATCTTTTACCTATTAATTTGAGG-AA
*
12608 TATTAATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-TTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATAA
* * * * *
12672 ACAAAAGTCGTAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTAAACTTATTCG
65 ACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCG
* * * * *
12737 ATAAATAG--------A--TTT--ATT-T-TAA-T--TGTTT-AAATATAAATAAATTTGTGTTA
130 ATAAATAGATTTATTTATTTTTAAATTCTCTAATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * *
12784 TTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAG
195 TTTTATTCT-AAATAACCGTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAAAA
* * * *
12848 CAATTTGAAATAGATAATTGA-T-AAATA-GTCATAACTATTTTAACTTGTTC-GACAAATAGAT
259 CAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAA-AGGACAGAACTATTTAAACTTGTTCAG-TAAATAGAT
* ** * * ** * *
12909 TCATTTTTTACATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCA
321 TCATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * * *
12974 AAT-AAACTTGTATGAGTAGAAATAATTGATTTGTGATAAC---ATAAAAGATTATAA-TGATTT
386 AATAAAAC-TATATGAATAGAAACAATT-ATTT-T-AAAACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTT
* * * * **** * *
13034 GAAATAGATAATTATTCACACAAT-CATAAATATTTGCAC-TAGGGAAGCT-AACAAATTCATTT
446 GAAATAAATAATTATTCAAACAGTCCATAACTATTT--ACTTTCTCAA--TAAACAGATTTATTT
* * ** **
13096 TTGAAAT-TCATTAGTTATTAATTTTTGGAA
507 TTAAAATCT-TTTACCTATTAATTTGAGGAA
* * *
13126 TATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGAC-TGTATG-ACTAGAAACAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTGAATAAG-CTTGTATGAAC-AAAAACAATTG-TTT-T
* * * *
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61 -AT-AAACAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* ** * * * * * *
13252 TTGGTTTAATAAACAAATTTA-TT-TTTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTAAAAATATTAATA
123 TT-ATTCGATAAATAGATTTATTTATTTTTAAAT-TC-T-CTAATTAATTTTTAAAACATTAATA
* * * * * * * * * * * * *
13315 AATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAAAAATTTGTTTTATGACAAAACA
184 AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAACCGTGTATGAACAGAAACAA-TTATTTTATGACAAAAGA
* * * * * * * * * * * *
13380 AAAGGTCATAACGATATGAAATCGATAATTATTTAAATA-GTCATAATTTTTTTACCTAGTTC-G
248 AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-AGGACAGAACTATTTAAACTTGTTCAG
* * * * *** *
13443 ACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTGCTGATT-ATTTTT-GAA-A-T-ATTAA-TAG-ATT
312 -TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCCAACCT-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTA-T
** * * * ** *
13500 TATTTTATTTTGAATAAGTTACTA-A-GAACTA-AAAAAATTGTTTTACGATAAAACAAAA-AGT
374 TATTTTATTTCAAATAA--AACTATATGAA-TAGAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAAGA-T
* * * * * * * * *
13561 CATAACGAGTTGAAATAAAGAATTGTTCATATAG-CCTTAACTATTTGAACTGGT-TCAA-ATA-
435 CATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCCATAACTATTT--ACT-TTCTCAATAAAC
* * ** * *
13622 A-ATTTA---TTGAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCA-TAA
497 AGATTTATTTTTAAAATCTTTTACCTATTAA-TTTGAGGAA
* * * * * *
13658 TATTATTACATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTACGAACAGAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT--
* * ** * *
13723 CAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGCTCAAATAGTCATAACCT-TTTGAACT
63 -A-AACA-AAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACT
* * * * * * *
13787 GATTTGGTAAACA-A---ATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
124 TATTCGATAAATAGATTTATTTATTTTTAAAT-TC-T-CTAATTAATTTTTAAAACATTAATAAA
* * **** ** * * *
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186 TTAGTATTATTTTATTCT-AAATAACCGTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAA
* * * * * * * *
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250 AGG-TCAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAGGACAGAACTATTTAAACTTG-TTCAG-
* * * * * *
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312 TAAA-TAGATTCATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* *** * * * ** * * *
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376 TTTTATTTCAAATAAAAC-TATATGAA--TAGAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAAGATCAT
* * * * ** *
14100 AAC-AGTTTTAAATAGATAATTATTCATATAGT-CATAACTATTTGAACTTGT-TTGATAAATAG
438 AACTA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCCATAACTATTT--ACTT-TCTCAATAAACAG
** * * ***
14162 ATTTATTTTTTTAAT-TTCTTGCTTATTAATTTTCTGAA
499 ATTTATTTTTAAAATCTT-TTACCTATTAATTTGAGGAA
* * * *
14200 TGTTAATAAGA-TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAACTGAAATAA-ATATT-TTA
1 TATTAATAA-ATTAGTATTATTTTA-ATTGAATAAGCTTGTATGAAC--AAA-AACA-ATTGTT-
* * * * * * * * *
14262 TAACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAACAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAA
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* * * * * * * * * * * *
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* * * * *** * * * * * * * *
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* * * * * * * ** * * *
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* * * * *
14512 AATAGATTTAGTTTTTAAATCT----CTTATTGATTTTT-GAAATAGTAATAAATTAGTATTATT
314 AATAGATTCATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATT
*** * * * * ** * *
14572 TT-TTT-ATGAATAATTTTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTACGACAAAATAAAATATCATAA-
378 TTATTTCA--AATAAAACTATATGAATAGAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAAGATCATAAC
* * * *** * * * *
14634 TAATTTCAAATAGATAA-TAGTTCAAATAAAACATGACTATTTGAACTTGT-TTAGTAAATAGAT
441 T-ATTTGAAATAAATAATTA-TTCAAACAGTCCATAACTATTT--ACTT-TCTCAATAAACAGAT
* * ** * * *
14697 TAATTTTTTAAATCTTCAACTTACTAATTTTTA-GAA
501 TTATTTTTAAAATCTTTTACCTATTAA-TTTGAGGAA
* * * * * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT--
* * * * * *
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CAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGA
TAAATAGATTTATTTATTTTTAAATTCTCTAATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTAT
TTTATTCTAAATAACCGTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGACAAAAGAAAAGGTCAAAACA
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAAAGGACAGAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATT
TTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
AACTATATGAATAGAAACAATTATTTTAAAACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATA
ATTATTCAAACAGTCCATAACTATTTACTTTCTCAATAAACAGATTTATTTTTAAAATCTTTTAC
CTATTAATTTGAGGAA
Found at i:14711 original size:178 final size:180
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14481 AATAGTTATA
* * * *
14491 ACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATC-T-CTTATTGATTTTT-GAA-AT
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* ** *
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* * * *
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* *
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* *
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* * *
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128 CAAAATAAAAGAGCATAATAATTTAAAATAAATAATAGTTCAAATA
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1 AGGATCGATCCCTTTTGGTAG
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Statistics
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AGGATCGATCCCTTTTGGTAG
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* **
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* * *
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* * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * ** * ** * *
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* * *
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** * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
24933 CTAAAATAATT-TTTT-TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAAT
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* * ** * * * *
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* * * *
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* ** * *
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** *
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* * *
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* ** * * ** * *
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* * * * * *
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* *
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** * * ** *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * ** * * *
25827 AAAAACAATT-TTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGGAATGGATAATTGTTGAAAT
64 TAAAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
26005 AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
65 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** *
26070 TCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TT
* * *
26121 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTCTTTTAATTTG-GATAAGCTT-TAATGAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGT-ATGAA
** * * ** * * *
26184 CTGGAATAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTCCAAAT
64 -TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* ** *
26249 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAGCAGATTTATTTTTTCAAATCTTTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATC-TTT
* * * * ** *
26303 GCTTAGTAATTTTCTG-AATGTCAATAAATTTAG-ATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAAGAT
1 ACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGA-
* * * * * * * * *
26366 ATAAAACAAATATTTTATAACTAAA-AAAACGTCAAAATAATTTGAAATCA-ATAATTATTCTAA
63 ATAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAA
** * * * * *
26429 TAGTTTTAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTT
127 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TT
* *** * *
26483 ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTATATGATT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTGAAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * *
26547 AGAAACAACTGTTTTATGACAAAA-TAAAGGT-TTCAATGATTTGAGATTGACAATTGTTCAAAT
65 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * *
26610 AGTCGTAACTATTT-AAATCGATTCGATAAATAGATTTATTATTTAAATTTGTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TT
*
26663 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATG-AT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAAT
* * * **
26726 CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAACTTGAAATAGACAATCATTCAAAT
65 --AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * ** ** * * *
26791 GGCCATAATTATTTTAACTAATTCGGTGAACCGATTTATTTTTTAAATTTCTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TT
** ** * *
26844 ACTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-ATCTAAAGCTTTTATTAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAAT-AAGCTTGTATGAA
* * * * *
26908 TTGAAACAATTGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTAAAAT
64 -TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
26973 AATAATAATTATTTGAACTTGTTCAGCAAATAGATTTATTTTTTTAATCCCTTT
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT--CTTT
* * * * *
27027 -CTTATTAAATTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCT-AAATAAGCTTCTATGAAC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAA-
* ** * *
27090 TGAAACAATTG-TTT-TGACTCAATAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAA---TT---AT-
64 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * *
27146 -T-TTAACCATTTGAAC-TAATTCGACAAACA-AGTTTA-TTTTTAAATC--T
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTT
* * **
27192 -CGTACTTAA----T--AAT-TT-TTAAATTAGTATTATTTTAATTTG-AATAAGCTTGTACAAA
1 ACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * *
27247 CAAAATAATTGTTTTATGACAAAAGAATACGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATA
64 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * *
27312 GTCTTAATTATTTGAAC-TGGTTAGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TT
** * * ** * *
27364 GGTTATTAAATTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAAATAGTATAAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAAT
* ** * * * *
27428 AGAACCAATTGTTTGCTGACAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
65 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * *
27493 GTCAAAACTATTTGAAATAGTTTGGCAAGCAAATTTA---CTTAAATCTCTT
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TT
* ** ** * * * *
27542 ACTGATTAATTTTCCAAATATTAATAAATTAGTACAATTTTATTTCAAAT-AGATTTATATTAAC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAG-CTTGTATGAA-
* * * * *
27606 AAAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAC
64 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * *
27671 AGTTATAAATTATTTGAACTAGTTCAGTAAATATAATTATTTTCTAAATC-TT
128 AGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * * * * *
27723 --TTATAAATTTTAGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCTATTTAAAATAAGCTTGTATGAGTT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGA-AT
* * * * ** * *
27786 GAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAG
65 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * *
27851 TCTTAGTTATTTGAACTGGTTT-GATAAAC-GTATTCATTTTTTAAATC-TT
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTT
* * * *
27900 AGTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTTTATGAAC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-
* * * * * ** * *
27964 AAAAACAAAT-TTTTATAATAGAAA-AAAAGAGTTATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTTAAA
64 TAAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAA
* * * *
28027 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAATAGATTTATTTTTTAAA--TGT
126 ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
* * *
28079 -CTTATTAATTCTTGAAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA-AAGCTTGTATG
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATG
28138 TTGATATAAA
Statistics
Matches: 3180, Mismatches: 638, Indels: 355
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
157 8 0.00
158 33 0.01
159 37 0.01
160 3 0.00
162 3 0.00
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167 2 0.00
168 22 0.01
169 22 0.01
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171 1 0.00
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175 10 0.00
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184 4 0.00
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CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT
Found at i:25497 original size:542 final size:533
Alignment explanation
Indices: 23965--32021 Score: 3272
Period size: 542 Copynumber: 15.1 Consensus size: 533
23955 CAAGGCTAAC
* * * * *
23965 ACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAAATAAACTTGTTTGAAA
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** * *
24028 AGAAATAATTCATTTATG--AAAA-AAAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAT--TCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
* * * ** *
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* * *
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* * * *
24217 GTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
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* * *
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* * *
24345 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAAATAAGTTTATATGAACTGAAACAATT-ATTTTATTAC
376 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTATATGAACTGAAA-AATTGTTTTTATGAC
* * * * * ** *
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439 --AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATGTA
* * *
24474 TTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTT
502 GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTT
* * * ** * *
24507 ACTAATT-ATTTGTCGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAACTTGTATGAAC
1 ACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * * *
24571 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAAATCACAACAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAAT
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
24636 AGTCATAACGATTTGAACTTGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTG
129 AGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC--TTACTTATTAATT-
* * * *
24701 TTT-CAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC-AAAATAAGCTTGCATGAATAGAAAA-AGT
190 TTTGAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGCTT--ATTAA-A-AAAACAAT
** * * * * ** * *
24762 CATTTTATAACAAAACAAAAAGCTATAGTGATTCCAAATAGGTAATTGTTTAAATAGTCATAATT
250 TGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATT
* * * * * ** * *
24827 ATTTAAATTTG-TTCGATAAACAGATTCATTTCTGAAATCTCTTAATTATTAA-TTTTCATAATA
314 ATTTGAA-CTGATTAGGTAAATAGATTCATTT-TTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATA
* *
24890 TTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAACT-AAAATAAT-TTTTT-TGA
376 TTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTATATGAACTGAAAA-ATTGTTTTTATGA
* * * *
24951 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATTACAATTTGATGTA
438 CAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATGTA
*
25016 GTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAGATTTTT
502 GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAA-ATTTTT
* * * *
25049 ACTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATATAAATAAGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAATA
* *
25114 GAAACT-ATTGTTTTATTG-CAAAACAAAAATTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAAT
66 GAAA-TAATTGTTTTA-TGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
*
25177 AGTCATAACTATTTGAACTACTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTT
129 AGTCATAACTATTTGAACTA-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTT
* **
25240 GAAATATTAATATA-TTAGTATTATTTTATTCTGAACAAA-CTTATTAAAGATAAACCTTTGTTT
193 GAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAA-AAAGCTTATTAAA-A-AAACAATTGTTT
* * *
25303 TATGACAAAACAAAAGTTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCACATAGTTATAATTATTTG
255 TATGACAAAACAAAAG-TTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
*
25368 ATCTGATTAGGTAAATAGAATT-ATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAA
319 AACTGATTAGGTAAATAG-ATTCATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * *
25431 ATTCA-TTTTATTTTATTCTTAATAAGC-TATTATGAATTGAAAATTATTG-TTTTATGATAAGA
383 ATT-AGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTA-TATGAACTGAAAA--ATTGTTTTTATGACAA-A
* ** * * * *
25493 CAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTAATG-GGTTCA
442 AAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATGTAGTTCA
* *
25557 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTA
507 GTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTT
* * * * * **
25585 AGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * * *
25650 TAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTT-ATAATGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATA
66 GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-ATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
25714 ATCATAACTATTTAAATTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTAAATTTTG
130 GTCATAACTATTTGAACT-ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTG
*
25777 AAAGATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATGATAAAAAAACAATT-TT
194 AAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGC-T-TAT--TAAAAAAACAATTGTT
* * * ** * * * *
25839 TATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGGAATGGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATT
254 T-TATGACAAAACAAAA-GTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
* * *** * * *
25904 TAAACTAATTTTATAAATAGATTCACTTTTTAA-ATC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
317 TGAACTGATTAGGTAAATAGATTCATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
25966 AATTAGCATTAATTTATTTCAAGTAAGCTTATATGAACTAAAACAATTG-TTTTATGACAAAATA
382 AATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTATATGAACTGAAA-AATTGTTTTTATGACAAAA-A
* ** * * *
26030 AAATGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TTGTTCGG
444 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-ATGTAGTTCAG
* *
26094 TAAACAAATTTATTTTTTTAAACTCTT
508 TAAACAAATTTA-TTTTTTAAATTTTT
* * **
26121 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTCTTTTAATTTGGATAAGCTT-TAATGAAC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGT-ATGAA-
* * ** * * *
26185 T-GGAATAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTCCAAAT
64 TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
** * * *
26249 AGTCATAACTATTTGAACTTATTCGGTAAGCAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTAGTAATT
129 AGTCATAACTATTTGAAC-TATTCAATAAACAGATTTATTTTTT-AAATC--TTACTTATTAATT
* * * * * *
26314 TTCTG-AATGTCAATAAATTTAG-ATTATTTTATTC-CAAATAAGCTTGTAAGATATAAAACAAA
190 TT-TGAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGCTTATTA-A-A-AAAACAAT
* * * * * * * * **
26376 TATTTTATAACTAAAA-AAACGTCAAAATAATTTGAAATCA-ATAATTATTCTAATAGTTTTAAT
250 TGTTTTATGAC-AAAACAAAAGTTATAATAATTTAAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
* * * * *
26439 TATTTGAACT-AGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
313 TATTTGAACTGA-TTAGGTAAATAGATTCATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* *** * *
26503 TTATTAAATTAGTATTATTTTTAACCAAATAAGCTTATATG-ATTAGAAACAACTG-TTTTATGA
376 TTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTAAATAAGCTTATATGAACT-GAAA-AATTGTTTTTATGA
* * * * * * *
26566 CAAAATAAAGGT-TTCAATGATTTGAGATTGACAATTGTTCAAATAGTCGTAACTATTTAAATCG
438 CAAAAAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAT-G
* * *
26630 -A-TTC-GATAAATAGATTTATTATTTAAATTTGTT
500 TAGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTT-TT
* * *
26663 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAAT-
* * ** * * * ** *
26727 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAACTTGAAATAGACAATCATTCAAATG
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * ** * * *
26792 GCCATAATTATTTTAACTAATTCGGTGAACCGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTA
130 GTCATAACTATTTGAACT-ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTT
* * **
26857 GGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCT-ATCTAAAGCTTTTATTAATTGAAACAATTG
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* * * * * *
26920 TTTTATGACAAATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTAAAATAATAATAATTAT
252 TTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTAT
* * * * * * *
26985 TTGAACTTG-TTCA-GCAAATAGATTTATTTTTTTAATCCCTTTCTTATTAAATTTTCAAATGTT
316 TTGAAC-TGATT-AGGTAAATAGATTCA-TTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATT
* * *
27048 AATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAAGCTTCTATGAACTGAAACAATTG--TTT-TGACTC
378 AATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTATATGAACTGAAA-AATTGTTTTTATGAC-A
* * * * ** *
27110 AATAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAA---TT---AT--T-TTAACCATTTGAACTAATT
440 AAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATGTAGTT
* * *
27166 C-GACAAACAAGTTTA-TTTTTAAA--TCT
505 CAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTT
* * * ** *
27192 -CGTACTTAA----T--AAT-TT-TTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTACAAAC
1 ACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAAT
* * ** * * * *
27248 A-AAATAATTGTTTTATGACAAAAGAATACGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATA
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * ** *
27312 GTCTTAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAATT
130 GTCATAACTATTTGAACT-ATTCA-ATAAACAGATTTATTTTTTAA--ATCTTACTTATTAATTT
* * *
27376 TTGAAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAA--ATAGTATAAATAGAACCAAT
191 TTGAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCT-GAA-AAAGCTTA-T-TAAA-A-AAACAAT
** * * * * * *
27437 TGTTTGCTGACAAAATAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACT
250 TGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATT
* * * ** * ** * * **
27502 ATTTGAAAT-AGTTTGGCAAGCAAATT--TACTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCCAAATATT
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** * * **
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378 AATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAG-CTTATATGAACTGAAA-AATTGTTTTTATGAC-
* * * * * **
27627 AAACAAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGTTATAAATTATTTGAACTA
439 AAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGATGTA
* *
27692 GTTCAGTAAATATAA-TTATTTTCTAAATCTTTT
502 GTTCAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAAT-TTTT
* * * * *
27725 A--TA--AATTTTAGAAATATTAATAAATTAATTTTATTCT-ATTTAAAATAAGCTTGTATGAGT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-AAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * *
27785 TGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATA
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* ** * ** * *
27850 GTCTTAGTTATTTGAACTGGTTTGATAAAC-GTATTCATTTTTTAAATCTTAGTTATTAATTTTT
130 GTCATAACTATTTGAACT-ATTCAATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
27914 AAAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAAAT-TTT
193 GAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAAAAGC--TTATTAA-AAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
27977 TATAATAGAAAAAAAGAGTTATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTTAAAATAGTCATAACTATT
255 TATGACA-AAACAAA-AGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAATTATT
* * * * * * *
28042 TGAACTAGTTTA-GCAAATAGATTTATTTTTTAA-AT-GT-CTTATTAATTCTTGAAAAATTAAT
317 TGAACT-GATTAGGTAAATAGATTCATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * **
28103 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAA-AAGCTTGTATG--TTGATATAAA---TAATTACT--C---
381 AAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTATATGAACTGA-A-AAATTGTTTTTA-TGACAAA
* * * *
28157 AAATAGGT-ATAACT-ATTTGAACTAG-T--TTGAT-AAATAGAT-TTAACT-TTT-A---A---
442 AAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGATGTAGTT
* ** * * *
28207 -A-T-CACTTATTAATTTTTGAAA-TATT
505 CAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTT
* * * ** * **
28232 AATATATTAGTATTACTTT---AT-TTCGAACAAACTTA-TATGA--ACAA--AAACATTTG-TT
1 ACT-TATTA--ATT--TTTGAAATATT--AATAAA-TTAGTATTATTTTAATTTAA-ATAAGCTT
* * ** * * * * *
28287 TTATGACA-A-AAACAAAAGTTAATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAATTAGTCATAGTT-
57 GTATGA-ATAGAAATAATTGTT--TTATGA--CAAAACA-A-AA--ATTC-A-TAAT-A-ATTTG
** * * * * * * * * *
28349 ATTTAAAT--TGGTTACGTAAACAG-AATTA-TTTTTTAA--ATCTC--T-TACTTG-TTAATTT
109 AAATAAATAATTGTT-C--AAATAGTCATAACTATTTGAACTAT-TCAATAAAC-AGATTTATTT
* * * * * ** * * * ****
28404 TTGAAATATTAATAAATTCA-TTTT-ATTTTATTCCAA-ATAATCTAGTATGA-ATTA-AAAAAA
169 TTTAAATCTTACT-TATTAATTTTTGA-AATATT--AATA-AATTTAGTATTATTTTATTCTGAA
** * * * * * * *
28464 AACTTATTTTATGACAAAACAA-AA-GGTCATAATGATTTGA-AATAGATAATTA-TTCT-ATAG
229 AA---AGCTTATTA-AAAA-AACAATTGT--T--T--TATGACAA-A-ACAA-AAGTTATAATAA
* * * ** * * *
28524 TCTTAAATATTTGA-ACTGGTTCGACAA-AGAAAT-TTATATTTTAATTCT-TTTA-GT---T--
280 T-TTAAA-A-TAGATAATTGTTC-A-AATAGTCATAAT-TATTTGAA--CTGATTAGGTAAATAG
* * * * ** * *** * * *
28579 ATTAATTTTTGGAA--TATTA-TTAGATTAGTGTTATTTTATTCCAAATAAACTT-GTATGAATA
337 ATTCATTTTT-TAATCTCTTACTT--ATTAAT-TT-TTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTT
* ** * * ** * * * **** * * *
28640 AAAGT-AATTA--TTTTATG-ACAAAACAAAATG---TTATAACGATTTCAAGTTTATAATG-GT
396 TATTTAAATAAGCTTATATGAACTGAA-AAATTGTTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * *
28697 TCAAATAGTCAAAACTAT-TTGAACTAAGTCAGTAAACAAATTT-AT-T--TT---T----TAA-
460 TGAAATAG--ATAA-T-TGTTCAAAT-AGTCA-T-AAC-TATTTGATGTAGTTCAGTAAACAAAT
* * * *
28749 --ATCTCTT-ACTTATT
517 TTATTTTTTAAATTTTT
* * *
28763 A---ATT--TTT--GAAAGATTAGTAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAG-AT-TA--AAC
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TAAATAAGCTTGTATGAA-
** * ** * ** * * * * *
28816 TTTCAAATAAATTTGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGA
64 -TAGAAAT-AA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCA
* * * * * * * *
28881 CATGGTCATAATTATTTGAA-TAGATTCGACAAACAGATTCACTTTTTAAATC--ACTTATTAAA
126 AATAGTCATAACTATTTGAACT--ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAAT
* * * * * *
28943 TTTTAAAATATTAATAAA-TT-GTTTTATTTTATT-TAAAATAAGCTT-GTACGAACTGAAACGA
189 TTTTGAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGCTTATTA--AA--AAAACAA
* * ** * * * * *
29004 TTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAACAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAC
249 TTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAT
* * * * * *
29069 T-GTTGAACT-ACTTCA-GCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTT-AGAA
313 TATTTGAACTGA-TT-AGGTAAATAGATTCATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * * * * * *
29130 TATTATTAAATTCGTTTTAATTTATTTTGAATATGCTTATATAAACT-AAAACATT-ATTTTATA
374 TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTATATGAACTGAAAA-ATTGTTTTTATG
* * * * * * *
29193 ACATAACAATAGGTTAT-A-GCAATTGAAATAGATAATTATTCAAAT-G-GA-AACCA----A--
437 ACA-AAAAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATG
** *
29247 T--TT-AGTAAATGAATTTATTTTTTAAATATCTT
500 TAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTT
* * * * *
29279 ATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATCCTGAATAGGCTTATATG-AT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TTAAATAAGCTTGTATGAAT
* * * * ** * *
29342 GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
65 -AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
* * * * ** ** * * * *
29407 -GGCTACAATTATTTGAATCGATTTGATAAATTGACTTAATTTTTAAATATCTAACTCATTAATT
129 AGTC-ATAACTATTTGAA-CTATTCAATAAACAGA-TTTATTTTTTAA-ATCTTACTTATTAATT
* * * * *
29471 TTTGAAATTTTAATAAA-ATAATATTATTTTA-TCTCAAATAAGCCTT-TTCAAACTGAAACAAT
190 TTTGAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAG-CTTATT-AAA--AAAACAAT
* * * * * * * * *
29533 TTTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATATTTATTTTAAATAGATAATTGTTTAAATCGTTATAACT
250 TGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATT
* * * * * * * *
29598 ATTTAAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTA-TGTATTGATGTTCT-ACA
314 ATTTGAAC-TGATTAGGTAAATAGATTCATTTTTT--AATCTCTTACT-TATTAAT-TTTTGAAA
* * * * * * *
29660 TGTTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAA-AAGCATGTATGAGCTAAAAAAATT-ATTTTATG
374 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTATATGAACT-GAAAAATTGTTTTTATG
* * * * * * **
29723 ACTAAACAAAAGGTTAGAATGGTTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACT
437 AC-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATGT
* * *
29788 GGTTCTA-TAAGA-ATATTTATTTTTTAAA--TCT
501 AGTTC-AGTAA-ACAAATTTATTTTTTAAATTTTT
* * * * * *** * ** *
29819 A-TTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCGAATAAGCTAGTGCGCAT
1 ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTAAATAAGCTTGTATGAAT
* ** * * * *
29882 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATGAAGA-TCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATA
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
29946 CTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATTT-TGTTTTTGAATC-T-CTTAGTAATTTTT
130 GTCATAACTATTTGAACT-ATTCAATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTT
* *
30008 GAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAG-TTTTGTATGAATAGAAAC-ATATG
193 GAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAAAAGCTTAT-TA--AA-A-AAACAAT-TG
* * * * *
30069 TTTGT-TGATAAAAC-AAAGTGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATAGCTT-AAATGAAT-ATG
252 TTT-TATGACAAAACAAAAGT-T-ATAA-TAATTTAAAATAGATAATTG-TTCAAAT-AGTCATA
** ** * * * * **
30129 ACCATTTGAACTTG-TTTTGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGA
311 ATTATTTGAAC-TGATTAGGTAAATAGATTCATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-A
* ** * * *
30192 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAA-TGGAAACAACT-ATTTTA
373 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTATATGAACT-GAAA-AATTGTTTTTA
** ** * * *
30255 TGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGA-
435 TGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAT
* * *
30319 --ACTCCTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTT
499 GTAGTTC-A-GTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TTTTT
*** * * ** *
30355 ACTTATTAATTTTTGGTCTTTTAAGAAATTAGTATTATTTT-ATTCCGAATAAGCTTTTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TAAATAAGCTTGTATGAAT
* * *** * * * * *
30419 AGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTGAAGTAGATAATTATTTAAATA
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* * * * *
30484 GTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAAACATACTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTT
130 GTCATAACTATTTGAAC-TATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
30549 TAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTATT
193 GAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGCTT--ATTAA-AAAAACAATTGTT
** ** * *
30612 TTATGACAAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
254 TTATGACAAAACAAAA-GTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
* * * * *
30677 AAACATG-TTCGGTAAATATATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTGGAATATTAAT
318 GAAC-TGATTAGGTAAATAGATTCATTTTTTAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* **
30740 AAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGCTTATATGAGTTGAAACAATTG-TTTTACT-ACAAAA
381 AAATTAGTATTATTTTATTT-AAATAAGCTTATATGAACTGAAA-AATTGTTTTTA-TGACAAAA
* * * * * * * * *
30803 CAAAAGGTCACAATAATTTAAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAATTTA-TTC
443 -AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GATGTAGTTC
** *
30867 AAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTT
506 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTT
* * * *
30896 ACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAA-TCAGAATAAGCTTGTATAAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTA-AATAAGCTTGTATGAAT
* * * *
30960 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
65 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
* ** * * ** * * *
31024 GTTATAAAGATTTGAACTTGTTCGACGAAGATATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTGT
130 GTCATAACTATTTGAAC-TATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATC--TTACTTATTAATT-T
* *
31089 CTT--AATATTAATAAATTT-GTATTATTTTATT-AGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AAT
191 -TTGAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAA-AAGC-T-TATTAA-A-AAAACAAT
** ** * * *
31149 CATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTGTTAAAATAGTCACAATT
250 TGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATT
* * *
31214 ATTTAAACTTG-TTCA-ATAAATATG-TTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAAT
314 ATTTGAAC-TGATT-AGGTAAATA-GATTCATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * *
31276 ATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATTTTTTTTATGA
375 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAAATAAGCTTATATGAACTGAAA-AATTGTTTTTATGA
* ** * * * * *
31341 CAAAACCAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATATTTATTC-AATAGTCATGACTATTTGATCTA
438 CAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATGTA
* * ** *
31405 GTTCAATAAACATATTTACTTTTGAAAATGTTT
502 GTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATTTTT
* * *
31438 ACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAATTTGAATAAGTTTGTATGGAA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AATTTAAATAAGCTTGTAT-GAA
* * * * *
31503 TAGGAAACTATTTATACCATTTATTA-AATTAAGAAACAAAATCATAATAATTTGAAATAAATAA
64 TA-GAAA-TAATTGT----TTTATGACAA--AA-CAA-AAATTCATAATAATTTGAAATAAATAA
* * *** *
31567 TTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATC-T-CTT
119 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-ATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTT
* * *
31628 ATTAATTTTTGAAATATTAATAGA-TTAGTATTTTTTTATTTTGAACAAA-CTTATATAAACAAA
183 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAA-AAAGCTTAT-TAAA-AAA
* * * * * *
31691 A-ATATTAATTTTATGACAAAATAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
245 ACA-ATT-GTTTTATGACAAAACAAA-AGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
31755 CATAATTATTTGAATTGATTAGGTAAACAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACATATTAAATTTT
307 CATAATTATTTGAACTGATTAGGTAAA-TAGATTCATTTTTT-AATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
31819 GAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATGAATTGAAAAAATTG-T
370 GAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-TAAATAAGCTTA-TATGAACTG-AAAAATTGTT
* * * *
31881 TTTATGGCAAAACAAAA----A-CA--ATTTGAAATAGAATAATTGTT-AATATAGTCTTAATTA
431 TTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTA
* ** ** *
31938 TTAGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
493 TTTGATGTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTT
* ** * *
31980 AGTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
32022 TT
Statistics
Matches: 5754, Mismatches: 1212, Indels: 1099
0.71 0.15 0.14
Matches are distributed among these distances:
505 3 0.00
506 3 0.00
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Consensus pattern (533 bp):
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GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAATTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAA
ATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCTGAAAAAGCTTATTAAAAAAACAATTGTTTTATGAC
AAAACAAAAGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGAT
TAGGTAAATAGATTCATTTTTTAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
TATTTTATTTAAATAAGCTTATATGAACTGAAAAATTGTTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAAT
GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGATGTAGTTCAGTAAACAAATTTAT
TTTTTAAATTTTT
Found at i:28796 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 28155--32023 Score: 2533
Period size: 181 Copynumber: 21.6 Consensus size: 180
28145 AAATAATTAC
* * * **
28155 TCAAATAGGT-ATAACTATTTGAACTAGTT-TGATAAATAGATTTAACTTTTAAA--TC--ACTT
1 TCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * * * * *
28214 ATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGTATTACTTTATTTCGAACAAACTTATATGAACAAAAA
64 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * * * * *
28279 CATTTGTTTTATGACAAAAACAAAAGTTAATAATGATTTAAAATAGATAATTAT
128 CAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * * *
28333 TCAATTAGTCATAGTTATTTAAATTGGTT-ACGTAAACAGAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * *
28396 GTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAATCTAGTATGAATTAAA
64 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-T--A
* * *
28460 AAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
125 AAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * * * *
28517 TC-TATAGTCTTAAATATTTGAACTGGTTC-GACAAAGAAATTTATATTTTAATTCTTTTAGTTA
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * *
28580 TTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTGTTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAAAAGT
65 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA-C
* * * * ** *
28645 AATTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACGATTTCAAGTTTATAATGGT
129 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
*
28697 TCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTAAG-TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-AGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * ** *
28761 TTAATTTTTGAAAGATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGATTAAACT--TTCAAAT
65 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA-TGAAT-AAA-
** * * * *
28824 A-AATT-TGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
127 ACAATTAT-TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
28878 TGACATGGTCATAATTATTTGAA-TAGATTC-GACAAACAGATTCACTTTTTAAA--TC--ACTT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * ** * *
28937 ATTAAATTTTAAAATATTAATAAATT-GTTTTATTTTATTTAAAATAAGCTTGTACGAACTGAAA
64 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAA
* * * *
29001 CGATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAACAGATAATTGT
128 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
29054 TCATATAGTCTTAACT-GTTGAACTACTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTAT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *** * * *
29118 TAATTTTT-AGAATATTATTAAATTCGTTTTAATTTATTTTGAATATGCTTATATAAACTAAAAC
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* * * * * * *
29182 -ATTATTTTATAACATAACAATAGGTTATAGC-AATTGAAATAGATAATTAT
129 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * *
29232 TCAAAT-G-GA-AAC-----CAA-T--TT-AGTAAATGAATTTATTTTTTAAATATCTTATTTAT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * *
29285 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCCTGAATAGGCTTATATG-ATGAAAAA
66 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC-AAATAAGCTTGTATGAAT--AAAA
* * * *
29348 CAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
128 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * *** * * * * *
29401 TCAAAT-GGCTACAATTATTTGAATCGATTTGA-TAAATTGACTTAATTTTTAAATATCTAACTC
1 TCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA-CTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * *
29464 ATTAATTTTTGAAATTTTAATAAAATAATATTATTTTA-TCTCAAATAAGCCTT-T-TCAAACTG
64 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-CAAATAAG-CTTGTAT-GAA-TA
* * * *** *
29526 AAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATATTTATTTTAAATAGATAATTGT
125 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * ** * *
29582 TTAAATCGTTATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTA-TGT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACT-T
* * * * * * * *
29646 ATTGATGTTCT-ACATGTTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAA-AAGCATGTATGAGCTAAA
64 ATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-ATAAA
* * * * * *
29709 AAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGGTTTGAAATAGATAATTGT
127 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
29763 TCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCTA-TAAGA-ATATTTATTTTTTAAA--TC-TA-TT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC-AGTAA-ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * * * * * * ** *
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* ** * * *
29886 ACAATTGTTTTATGACAAAA-TGAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGT
127 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
29939 TCAAATACTCATAACTATTTGAATTGGTTC-GATAAATAGATTT-TGTTTTTGAA--TC-T-CTT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTT
* ** *
29998 AGTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AGTTTTGTATGAATAGAA
64 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG-CTTGTATGAATA-AA
* * * *
30062 AC-A-TATGTTTGTTGATAAAAC-AAAGTGTCATAACTATTTGAAATAGATAATAGCT
127 ACAATTAT-TTT-ATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-T
* * * * ** * **
30117 T-AAATGAAT-ATGACCATTTGAACTTGTTTTGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTA
1 TCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
*** ** *
30180 TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAATGGAAA
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* ** * * *
30244 CAACTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAAATAATTAT
128 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * * *
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1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
*** * * * *
30360 TTAATTTTTGGTCTTTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTTTATGAATAGAAAC
65 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAC
* * * *
30425 AATTGA-TTTATGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTGAAGTAGATAATTAT
129 AATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * * *
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1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* ** * *
30540 TTAATTTTTTAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGAAC
65 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAA
* * *
30604 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGT
128 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * *
30657 TCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-ATGTTCGGTAAATATATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCA
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * * * *
30721 TTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGCTTATATGAGTTGAAAC
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* * ** * * * *
30785 AATTGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCACAATAATTTAAAATAAACAATTAT
129 AATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * ** * *
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1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * * *
30901 TTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAAT-CAGAATAAGCTTGTATAAATAGAAA
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* * * * *
30965 CAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTAT
128 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* ** * * * * *
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1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTA--AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * ** * *
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1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* *** * *
31263 TAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTAAAATA
66 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACA
* * * * * *
31328 ATTTTTTTTATGACAAAACCAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATATTTAT
130 A-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * ** *
31380 TC-AATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTACTTTTGAAAATGT-TTACTTA
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTA
* ** *
31443 TTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAATT-TGAATAAGTTTGTATGGAATAGG
65 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--ATTCCAAATAAGCTTGTAT-GAATA--
* * * ** *
31507 AAACTATTTATACCATTTATTAAATTAAGAAACAAAA--TCATAATAATTTGAAATAAATAATTG
125 AAAC-AATTAT----TTTA-T-GA--CA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
*
31570 C
180 T
** * *
31571 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T-GTTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTAAA--TC-T-CTTA
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *** * * * * *
31629 TTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTATTTTGAACAAACTTATATAAACAAAA-A
65 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAAAACA
* * *
31693 TATTAATTTTATGACAAAATAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
130 -ATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
31746 TCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGATT-AGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACAT
1 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
* * *
31809 ATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATGAATTGAA
64 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA-T-AA
* * *
31873 AA-AATTGTTTTATGGCAAAAC--AA----A-AACAATTTGAAATAGAATAATTGT
126 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG-ATAATTGT
* * * ** *
31921 T-AATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTA
1 TCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
** * *
31985 TTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTATT
65 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
Statistics
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Statistics
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TATTATTAATTTTAGAA
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* * * * * *
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* ** * * * *
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* * * *** * *
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* * **
28453 AATTAAAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
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* * * * ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * **
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129 CTTTTATGAATAGAAA-CAATTGA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGAT
* * * * *
28691 AATGGTTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTAAG-TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
192 AATAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * *
28755 TACTTATTAATTTTTGAAAGATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-AT-TA--AAC
255 AACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-
** * ** * * **
28816 TTTCAAATAAATT-TGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAATAATGAT
319 -TAGAAA-CAATTAT-TT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * ** * * *
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1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTAGGTAAACATATTTATTT
* * * * ***
28925 TTTAAA----TCACTTATTAAATTTTAAAATATTAATAAATT-GTTTTATTTTATTTAAAATAAG
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* * * * *
28985 CTTGTACGAACT-GAAACGATTG-TTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAACAGAT
129 CTTTTATGAA-TAGAAACAATTGATT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGAT
* * * * ** ** * * * *
29048 AATTGTTCATATAGTCTTAACT-GTTGAACTACTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTT
192 AATAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTA
* * * * * * * *
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* * * * *
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319 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * *
29215 TTGAAATAGATAATTATTCAAAT-G-GA-AAC-----CAA-T-TTA-GTAAATGA-ATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGGTAAA-CATATTTATTTT
* * * *
29268 TTAAATATCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TCCTGAATAGG
65 TTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC-GAATAAG
* * * * * *
29332 CTTATATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATA
129 CTTTTATGAAT-AGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATA
* * * * ** * * * *
29396 ATTA-TTCAAAT-GGCTACAATTATTTGAA-TCGATTTGATAAA-TTGACTTAATTTTTAAATAT
193 A-TAGTT-AAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * ** *
29457 CTAACTCATTAATTTTTGAAATTTTAATAAAATAATATTATTTTATCTCAAATAAGCCTT-T-TC
253 CTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATG
* * * ***
29520 AA-ACTGAAACAATTTTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATATTTAT
317 AATA--GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * *
29565 TTTAAATAGATAATTGTTTAAATCGTTATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * * * * * *
29630 TTAAAATTTCTTA-TGTATTGATGTTCT-ACATGTTAATAAATTAGTATCATTTTATTTC-AAAA
65 TT-AAATTTTTTACT-TATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATA
* * * * * * * *
29692 AGCATGTATGAGCTA-AAAAAATT-ATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAA-TGGTTTGAAATA
127 AGCTTTTATGA-ATAGAAACAATTGA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATA
* * * * *
29754 GATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCTATAAGA-ATATTTATTTTTTAAA--
189 GATAATAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAA-ACATATTTATTTTTTAAATC
* * * * * ** * **
29816 TCT-A-TTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCGAATAAGCTAGTGC
252 TCTAACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * ** * **
29878 GCATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TGAAGATCATAATGAT
316 GAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * *
29922 TTGAGATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATTT-TGTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTAGGTAAACATATTTAT-TT
* * * *
29986 TTTGAA---TCT-CTTAGTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT-AG
64 TTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAG
* * *
30046 TTTTGTATGAATAGAAAC-ATATG-TTTGTTGATAAAAC-AAAGTGTCATAACTATTTGAAATAG
129 CTTT-TATGAATAGAAACAAT-TGATTT-ATGACAAAACAAAAG-GTCATAACTATTTGAAATAG
* * * *** * *
30108 ATAATAGCTTAAATGAAT-ATGACCATTTGAACTTGTTTTGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCT
190 ATAATAG-TTAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCT
* **
30172 CCAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATG
253 CTAACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
* * **
30236 AATGGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAAT
317 AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * ** *
30280 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTCCTAGGTAAACAGATTTATTTTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGGTAAACATATTTATTTTT
*** * *
30345 TAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGGTCTTTTAAGAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCT
66 TAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCT
* * *
30410 TTTATGAATAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGACATAACAATTTGAAGTAGATAATT
131 TTTATGAATAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAA-T
* * * * * *
30475 ATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAAACATACTTATTTTTTAAAT-TTTTACTT
195 AGTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTT
* *
30539 ATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAATAGA
260 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGA
* * ***
30602 ACCAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGCCATAATGTT
323 AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * *
30640 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTCGGTAAATATATTCATTTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * *
30705 TT-AATTCTCTTACTCATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AGATAA
65 TTAAATT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGA-ATAA
* * * * * * *
30767 GCTTATATGAGTTGAAACAATTGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCACAA-TAATTTAAAATAAA
128 GCTTTTATGAATAGAAACAATTGATTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGA
* * * * * * *
30830 CAATTA-TTCAAATAGTCATGACTATTTAAATTTATTCAAAAAACATATTTATTTTTTAAATCTT
191 TAA-TAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * ** *
30894 TTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCAGAATAAGCTTGTATAAA
254 TAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* *
30959 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGTCATAACAAT
319 TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * ** * *** *
31000 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAAAGATTTGAACTTGTTCGACGAAGATATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * *
31065 TTAAATCTTTTAGTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-AGAAATA
65 TTAAATTTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCG-AATA
* * * * * * * *
31127 AGCTTGTATGAACAGAAA-AAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAATAGA
127 AGCTTTTATGAATAGAAACAATTGA-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGA
* * * * * * *
31191 TAATTGTTAAAATAGTCACAATTATTTAAACTTGTTCAATAAATATGTTCATTTTTTAAATCTCT
191 TAATAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-
* *
31256 TAA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA
254 TAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* * *
31320 CTA-AAATAATTTTTTTTATGACAAAACCAAAGGTCATAACAAT
319 -TAGAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * *
31363 TTCAAATAGATATTTATTC-AATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCA-ATAAACATATTTACTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-AGGTAAACATATTTATTT
* * * * *
31426 TTGAAAATGTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAATT-TGAATA
64 TTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--ATTCCGAATA
** * *
31490 AG-TTTGTATGGAATAGGAAACTATTTATACCATTTATTAAATTAAGAAACAAAA--TCATAA-T
127 AGCTTT-TAT-GAATA-GAAAC-A---AT-TGATTTA-T-GA--CA-AAACAAAAGGTCATAACT
* * * *** * *
31551 AATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TGTTTTGGTAAATAGATTTA
179 -ATTTGAAATAGATAATAG-TTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACATATTTA
* * *
31614 -TTTTTAAA--TCT--CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTTTTTTATTTTGAAC
241 TTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * * **
31674 AAACTTATAT-AA-ACAAAAATATTAATTTTATGACAAAATAAATGGTCATAATGAT
306 AAGCTTGTATGAATAGAAACA-ATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * *
31729 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGATTAGGTAAACAAAATTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * * * *
31794 TTAAATCTCTTACATATTAAATTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAG
65 TTAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCGAATAAG
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31858 CTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAAC--AA----A-AACAATTTGAAATAGAATA
129 CTTTTATGAATAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAG-ATA
* * * * * * * *
31916 ATTGTTAATATAGTCTTAATTATTAGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
193 ATAGTTAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAA
* ** * *
31981 GTTATTAATTTTCAAAATATTATTACATTAGTATTATTTTATT
257 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
Statistics
Matches: 2757, Mismatches: 584, Indels: 372
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
342 15 0.01
343 3 0.00
345 2 0.00
346 35 0.01
347 79 0.03
348 71 0.03
349 44 0.02
350 44 0.02
351 17 0.01
352 59 0.02
353 81 0.03
354 33 0.01
355 21 0.01
356 126 0.05
357 235 0.09
358 145 0.05
359 15 0.01
360 372 0.13
361 510 0.18
362 268 0.10
363 92 0.03
364 136 0.05
365 88 0.03
366 55 0.02
367 129 0.05
368 2 0.00
369 2 0.00
370 5 0.00
371 13 0.00
372 12 0.00
373 38 0.01
374 2 0.00
375 8 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (360 bp):
TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGGTAAACATATTTATTTTT
TAAATTTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCT
TTTATGAATAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATA
GTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTA
TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
Done.