Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168109.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_354, whole genome shotgun sequence
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
352 TAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGAACATGACTATTTGAACTT
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* * *
417 A-TTTGGTAAA-A-ATTTATTTTTTAA-ATCTCCTACCTATTAA-TTTCTAGAA
128 AGTTTGATAAACAGATTTAGTTTTTAATA-CT-CT---TATTAATTTTC-AAAA
* *
466 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATCGAAA-AATTGTTTTATGA
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* * *
530 CAAAATAAAATATCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGCATAACTATTTG
65 CAAAATAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAACATAACTATTTG
589 GTGCTTGTTC
Statistics
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690 ACTTGTTCAG
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700 TAAACATATTTATATTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAT
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* * * * *
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* * *
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* * * * *
881 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAATAATTCATTGTCT-AAATATTAATAAATTTGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
945 TTTTAATT-GAAATAGGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
65 TTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * *
1008 GCAATTTGAAATAGATAATTATT-AAAGAGT-AGTAACTATTTGAACTTGA-TCGA
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* * *
1061 TAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-ATTTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTA
* * * * * * * * * * *
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65 TTTTAATTCGAA-TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * ** *
1189 C-ACTTTAAAATAGAT-ATTGTTCAAACAATTATAACCATTTGTA-TT-GGTCA
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* * * ** * * *
1239 GTCCAATAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTT-AGGATATTAACAAATTAGCAT
1 -T-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * * * *
1303 TACTTTATTTTGAATAAGAC-TGTATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTAT
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** * * ** *
1367 AATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTA-TTATAACTATTTGAACTGGTTTGG
127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
** * ** ** *
1422 TAAATGGACTTACCTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTAT
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* * * * ** * * * *
1483 TTTATTTCGAACAAACTTATATGAA-TGAAACATTTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTTATAAC-
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * ** * * ** *
1546 AGTTTGAAATAGATAAATATTCATATAACCTTAACTATTTGTA-TTGGTTCA
131 A-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * * * *
1597 GCAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGC-TATTACTTTTT-ATAATATTATTAAATTAGTAAT
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
1660 ATTGTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGACAAAGCAAAAGG-CTATA
64 ATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATA
* * * * * * *
1724 ATGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGACATAACTATTT-AAATTAGTTCGG
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * ** *
1778 TAAGCATATTTCTTTTTTAAATCTCCTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * * *
1843 TTT-ATTTGAAACAATCTTGTATG-ATGAAAACATTTGTTTTCTGACAAAACAAAAGATCATAAA
66 TTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * * *
1906 TATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTGA-AATTATTTAAACTGATTCGA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* ** * * * * *
1957 TAAACTGATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTCTCAATCTTTGAAATATTAATAAACTAATATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * *
2022 TTT-ATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGGTCATAAT
66 TTTAATTCGA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * *
2086 GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT-GTTCA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * **
2137 GTAAATAGATTTATTTTTTAAAACTTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAAGAGTAT
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * ** * * *
2201 TA-TTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGA
63 TATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** *
2265 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTAA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * ** * *
2319 TAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * **
2384 TTT-ACTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TGAAGATCATAGT
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * *
2447 GATTTGAGATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTAATTGAAATAATTTTG-
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * *
2499 TAAACAAATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * * *
2560 TTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAATGTCATAACG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * *
2625 ATTTGAAATAGATAATAGATT-AATTGGACATGATTGTTTAAACTTATTTGG
131 ATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
*** *
2676 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
2740 TTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTATAAC
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * *** *
2805 AATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTGG
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* *
2857 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
2922 TTT-ATTCCGATTAAGCTTTTATGAACAAAAACAATGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
66 TTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * *
2986 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGA
* * * *
3039 -AAACAAATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * *
3101 TTTT-ATTCAAAATAAGCTTG-ATTGAACAGAATCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATA
65 TTTTAATTC-GAATAAGCTTGTA-TGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** * *
3164 ATGTTTTGAAATAAATAATTGTTTAGCTAGTCATAACTATTTGAACTTATTCGG
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * ** * *
3218 TAAATAGATTCATTTTTTATTTCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * * * * ***
3282 TTTTAGTTTAAACAAACTTATAAGAACTAAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAGGTCATTGT
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * *
3347 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTT-A
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * **
3398 GTAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATT
1 -TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
3463 ATTCTAA-TCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCATA
64 ATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** * * *
3527 ACAAGTTGAAATAAATAATTGCACAAAATAGTCATAACGATTTGAACTTATTCGG
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * *
3582 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
3645 ATTTT-ATTTGAAATGAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTCTTTTAT-AGCAAAACAAAAGGTTA
64 ATTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * *
3708 TAGCGATTTCAAATATATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTT-GTTCA
126 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *
3763 GTAAA-TGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATT
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * *
3826 ATTTT-ATTCCCAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTCTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
3890 ACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAATCATGATTATTTGATC-TAGTTTGG
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* *
3944 TAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTG
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-
* * * * *
4008 TTTTTAA-TCTAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATA
64 ATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
4072 ACGATTTGAAATAAATAATTGCTCATATAGTCATAACTATTTAAAC-TAGTTTGA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * *
4126 TAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATATTAGAAATATTAATAGATTAGTATTAC
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-
* * * * * * *
4187 TTTT-TTTCGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAAATA-GTCATAA
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* * * ** * *
4250 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGGACTGGTTAGG
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
4303 TAAACA-AATTA-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTCA-TTTTA
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* * * * *
4365 TGTT-ATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTCAAAAA-AACTTATTTTATGACAAAAC-AAAGGTCA
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* * ** * ** *
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* * * * * * * * *
4484 CAGACAAATTTATTTTTTAATTCTTTTAGTTATTAATTATTGGAATATTATTATATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * ** * *
4549 TTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGTACAAAAGGTTATAAGG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* ** * * *
4614 ATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCGG
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* * *
4665 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAAGA-T--T-AATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * *
4726 TTT-ATTCTGAATAAGCTTGAATGTTCAAATACAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAAC
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
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4842 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCACTTACTTTTTACTTTTTGAAATATTAAAAAATTATTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** *
4907 TTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
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4972 ATTTGAAATAGATAATTGGTCATACAGTCTTAACTGTTTCAACTGCTTCGA
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* * * * * * *
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1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * * * *
5088 TTTATTTTGAATAAGTTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATAATAGAACAAAAAGTTATAACA
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* ** *
5153 ATTTGAAATTGATAATTGTTC--A-A---AT-A--A---GAACTGGTTTGG
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
5192 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGAAATATTGATAAATTAATATTAT
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* * * *** * * * ** *
5257 TTTATTTTGAATAGGCTTGTATGATGGAAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGTTTGTAATG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * ** **
5322 AATTGAAATAGACAATTGTTCAAATGGCCAAAATTATTTGAACCAATTCAA
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
** ** * * * * * *
5373 TAAATTGACATATTATTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *** * * ***
5438 TTT-ATT---ATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAAAGGTCATATTT
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * *
5499 ATTTTAAATAGGTAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTGTTAGG
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
5550 CAAATAGATTTATTTTTTGAAAT-TTGTAGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTA-CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * ** * * *
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63 TATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
5677 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTTGAAC-TAGTTCGG
127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * * * *
5732 CAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATACT-ATCAAATTAGCAAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT-AAATTAGTATT
* * * * * ** *
5795 ATTTT-ACTCTGAATAAGCTTGCATGAATATAAACAATTGTTTTATGACAAAATAATTGTTCA-A
64 ATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
** * * * * * ** * * * * *
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128 ACGAT-TTGAA--A-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTA--TTTGAACT-TATT-T-GA
*** ** ** ** * * * * *
5918 TTTTCA-AAATA-TTAATAAAT-TGGTA-TTATT-TTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-TAGAA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT-TTTTG-A-AATATT-AATAAATTAG-T
** * ** * * * * *** * *
5977 ACAATTGTT--TTAC-AACAAAATAT-AATG-TC-ATAACGATT-TGAAATAGATAATAGCTCAA
61 ATTATT-TTAATT-CGAATAAGCT-TGTATGAACAAAAACAATTGTTTTAT-GACAA-A--ACAA
* * * * * * *** ** * ** *
6035 ATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAA--ATCTTCAACTTA-T
119 AAGG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA--TA-GTCATAACTAT-TTGAACTTATT
**
6096 AAA
179 TGA
**** * ** ** * * * *
6099 TTTTTAGA-ATA-TTAATAAAT-TAGTA-TTATTTTATTTTGGAATAAACTTATATGAA-TAGAA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA-TTAATTTTTGAA-ATA-TTA-ATAAATTAG--
* * * * * * * * ** *
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60 --TATTATTTTAAT-TC-GAAT--AAG--C-T--TG-TATGAACAAAAACAATTGTT-TTAT-GA
* * * * * ** * ** * *
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111 CAAAACAAAAGGTCATA-ACGATTT-G--AA-ATAGATA-ATTGTTCAAAT-AGTCA-TAACT-A
*
6282 TTTTTGGAA--T-TTTAA
167 --TTT-GAACTTATTTGA
* * * * * * * *
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1 TAAA-CAGATTTATT-TTTTAAATCTTTTACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTA
*** ** * * * * ** * *
6350 TTATGACAAAAC-AA-AAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC--
62 TTATTTTAATTCGAATAA-G-C-T--TG-TATGAACAAAAACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAA
* * * * * * * * * *
6410 TA--T-TTGAACGTGTTTAGAAA-ACATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAA-TTTTTCAA
119 AAGGTCAT-AACG-ATTT-GAAATAGATA---ATTGTTCAAA----TAGTCA-TAACTATTTGAA
** *
6470 AATA-TTAA
173 CTTATTTGA
*** * * * ** ** **
6478 TAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTTTT-TTATGACAAAA
1 TAAACAGAT-TTATTTT-TT--AAAT---CTT---TTACT--TATTAATTTTTGAAAT-A-TTAA
* * * * * * * * ***
6542 CAAAATGTCA-TAATGTTTTGAAATAG-ATAA--TTGTTTAGATAGTC-ATAACTATT-TGAACA
52 -TAAAT-T-AGTATTATTTT-AATTCGAATAAGCTTGTAT-GA-A--CAAAAACAATTGT-TTTA
* * * **** ** * * * ** * *
6601 TGTTCAGTAAAC-ATA-TTCATTTTTTAATTCTCTTACTCA-TTAATTTTTGGAATATTAATAA-
108 TG-ACA--AAACAAAAGGTCA--TAACGATT-T-GAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * *
6662 -ATTAGTA-TTATTTTA
165 TATTTGAACTTATTTGA
** * * * * * *** * * * ** * * **
6677 T-TTCA-AATAAGCTTATATGAA-CTGAAAC-AATT-GTTTTATTACAA-AACAA-AAGGTCACA
1 TAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGA-AATATTAATAA-ATTAGT
* * * * * * * * * * *
6735 ATGATTTAAAATAG-ATAA--TTAT-TCAA-ATAGTCAGGACTATTTGAACTTGT-TCAAAAAAC
61 ATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACA-A---A-AAC-AATTG---TTTTATGACAAAAC
* ** * *** * ** * * *
6794 ATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTA-TTAATTG-TCAAAATATTAATAA--A-TT-AACATTA
117 A-A--AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TTA
6853 -TTG-
177 TTTGA
*** * * * * * **** * * ** * * *
6856 TAATTTGAATAACCTTGTATGAA-CAAAAAC-AATT-GTTTTATGACAA-AACAAGAAGTCA-TA
1 TAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGA-AATATTAATAAATTAGT-
** * * * * * **
6916 AGAATTTGAAGT-AAATAA--TTGT-TCAA-ATAGTCATAA-AATTTGAACTTGTT-CG-GTAAA
61 ATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACA-A---A-AACAA-TTG---TT-TTATGACAAAA
** ** ** * ** * * *
6973 CAAATTTATTTTTTAA--ATGTTTTACTA-ATTAATT-TTCTTTATATTAATAA--ATTTGTA-T
116 CAAA---AGGTCATAACGAT-TTGAAATAGA-TAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACT
*
7031 TATTTTA
175 TATTTGA
* * **** ** ** * * *
7038 TTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAAT-T
1 -T--AAA-CAGATT-TAT---T-TTTTAAATC--TTT-T-AC-TTA-TTAA--TTTTTGAAATAT
* * * ** * *
7102 TCAAAAAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATT--ATTCAAACTTGT-TCG-AC--AAACAGATTC
49 T-AATAA-AT--TAG-T--ATTA-TTTTAATTCGAAT-AAGCTTGTAT-GAACAAAAACA-ATT-
* * ** ** * ** * * ** * * *
7161 ATTTT-TTA-AATCTCTTAA--TTATTAA-TTTTTGTAATA-TTAATAACTT--AGTA-TTAT-T
102 GTTTTATGACAA-AACAAAAGGTCA-TAACGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAA
* *
7216 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAA
164 CTA-TTTG---AA-CTTATTTG-A
* ** * *** * * * *
7240 CTGAAATA-ATTT-TTTATGACAAAAC-AAAAGGTCA-TAATGATTTGAAATAAATAATTATTCA
1 -T-AAACAGATTTATTT-T-TTAAATCTTTTA-CTTATTAAT-TTTTGAAAT-ATTAA-TA---A
* * * * * *** * * * *
7301 AATAGTCATGACTATTTGA-TC---T-AG-TT-TAGTAAACATATTTATTTTTTACTTTTTCTAC
55 ATTAGT-ATTA-T-TTTAATTCGAATAAGCTTGTA-TGAACAAAAACA-ATTGT--TTTAT-GAC
** ** ** * * * * ** * * * *
7359 TTATTAATTGGTGA-AA-TATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAATCTGGATAGGCTTGTA-TGAA
112 AAAACAAAAGGTCATAACGATT--TGAAA-TAG-ATAATTGT--TC-AAATAGTCAT-AACT-AT
* * *
7420 TGGAAACAACTATTTTA
168 TTG-AAC--TTATTTGA
** ** * * ** *
7437 TAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAACTACTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
1 T----AAAC----AG--AT--TTATTT--TTTAAAT--CT-TTTACTTA-T--TAA-TTTTTGAA
* * * * * * ** *
7502 CTCATTTGATAAA-TAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA--TT-TTTGAATATTAATATAT
45 AT-A-TTAATAAATTAGTA-TTA-TT-TT-AAT-TC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACA-AT
* * * ** * *** * *
7562 TAGTATTACTTTATTCCAAACAAACTTATATAAACAAAAAC-ATTTGTTTTATGACAA--G-ACA
101 T-GTTTTA--TGA--CAAAACAAA---AGGT---C-ATAACGATTTGAAATA-GATAATTGTTCA
* * * * *
7623 AA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGT
153 AATA-GTCATAACTATTTGAACT---TATTTGA
* * * * * * * *
7655 TCAAATAG-TCATAATTATTTAAA-CTGGTTAGGTAAATAAAATTATTTTTAAATCTCTTATTAA
1 T-AAACAGAT--TTATTTTTTAAATCT-TTTA-CT-TAT-TAA-T-TTTTGAAA-----TATTAA
* * *
7718 TTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTGAAAAA-A
52 ----T--AA-ATTAGT--ATT-ATTTTA----ATT-CGAATAAGCTT-GTATGAA--CAAAAACA
* * * * *
7781 ACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTA
99 A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * ** * *
7846 AATGTTTGAACTGGTTCGG
163 ACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * * * *
7865 CAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
7930 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTGTGATAGAAGAAAAGGAT-ATAAT
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAAC
* ** * *
7994 GATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTTAT-A-TATTTGAA-TTAGTTT-A
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * *
8043 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAACAAATTAGTATTA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * ** * * *
8108 TTTTATTTCAAATAGGCTTGAATGATC-AAAACAATTGTTATACGATGAAACAAAAAGCCATAAT
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
** * * * * * * ** *
8172 TTTTTATAAACAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAACTGCTTTGG
130 GATTT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * * * *
8225 CAAATAGATTTATTTTTTACATCTCTTAGTTATCAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * * * * * *
8290 TTT-ATTCCAAAAAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAAT
66 TTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * **
8354 GATTGGAAATAGATAATTGTTC--ATA-TAAAAACTGGTT---C--A---G-
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * *
8394 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATCAATAAATTAATATTAC
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * *
8459 TTT-ATTCCGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCGTAAC
66 TTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * **
8523 AATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT-GGCAATAATTATTTGAAGC-GATTCAA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA-CTTATTTGA
* ** * * * * *
8575 TTAATTGACTTA-TTTTTAAATCTTTAACTTTTTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *** * * *
8639 TTTATTTTGGATATGCTTTTATGAATTGAAACAATCGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTAT-AC-
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * *
8702 TTCTTATAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTT-A
131 AT-TT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* **
8754 GTAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TTCTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGA-TAATAAATTAGT
1 -TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGT
* * * * * * * *
8816 ATTATTTTATTTCGAATAACCATGTATGAACTGAAAA-AATTATTTTAAGACTAAACGAAAGGTC
61 ATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * **
8880 AAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACCTGTTCAA
125 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * * * *
8937 CAAACACATTTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTTGTAATA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
9001 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAAC
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * **
9065 GATTTGAGATAGATAATTATTGAAATAGTCA-AACTATTTGAACTGGTTTGA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
9116 TAAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTACTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * * * **
9177 TTT-ATTCTTAATAATTTTGTATAAATAGAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAATATCATAAC
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* *** * * * * *
9241 TATTTGAAATAGATAATAACTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGG
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
** * * *
9293 TGCATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTAATTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
** * ** * * * *
9356 ATTTTCTTTTGAATAAAATTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGATCATA
64 ATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATA
* * * * * *
9421 AC-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGG
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* *
9474 TAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTTTTGAAAGT-TTAATAAATAAGTATT
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * **
9538 ATTTT-ATTCTGAATAAGCTTTTATAAATAGAAACAATTGATTTATCACAAAATGAAAGGTCATA
64 ATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * *
9602 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTAAGA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGA
* * *
9657 -AAACATATTTATTTTTTAAA-ATTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* ** * * *
9719 TTTT-ATTTGAAATAAGCTTACATAAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
65 TTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
9783 TGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGGAA-ATGTTTGA
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAACTTATTTGA
* * * * * * * *
9836 TAAACAAATTAATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTAG-AATATTCATGAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * *
9900 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * **
9965 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AGACTATTTGAACTTGTTCAA
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
10016 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTGTTGAAATATTTATAAATTAATATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *
10081 TTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
66 TTTAAT-TCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** *
10145 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAGTCATAAGGATTTGAACTTGTTT-A
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* *
10197 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATT-GTAT
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* ** ** * *
10259 TATTTT-ATTCGTAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATCATTTGGTGACAAAACAAAAAGTTA
63 TATTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * * *
10322 TAGCAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-GTTCA
126 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * ** *
10377 GTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAACTTAGTATTA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
10442 TTTTATTTCAAATAAG-TTGATATGAACTAAAATAATTTTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAA
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTG-TATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
10506 CGATTTGAAATAAATACTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGATC-TAGTTTGG
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * *
10559 TAAACA-ATTTATTTTTTAAA-ATTTTGCTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * ** * * * * ** **
10622 TTTAATAT-GAATAAATTTTTATGAATAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAAAATTGTAAC
66 TTTAAT-TCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** * *
10686 AATTTTAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTTTTTAAAC-TAGTTTGA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * *
10738 TAAACAAATTTATTTTTAAAATC---CA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
10799 TTT-ATTCTGAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGC
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** * *
10863 AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGG
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * *
10915 TAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATGTTAATAAATTTA-TTTTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* **
10979 TTTT-ATTCTGAATAAGCTAGTATGAAGTGAAAA-AATTGTTTTATGACAAAAC--AA----A-A
65 TTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
11035 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGTAC-TAGTTTGA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * * * ** *
11089 CAAACAAATTT-TGTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
11153 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAAC
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
11218 GATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC-CAGTTCGG
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * *
11270 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * ** * * * * *
11335 TTTATTTTGAATAAACATATATGATTAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAATG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * *
11400 ATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGACCTGATTCGG
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * ** *
11451 TAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** *** *
11516 TTT-ATTTTAACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
66 TTTAATTCGAA-TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
11580 GATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTTGTTCG-
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
11631 TAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * ** *
11693 TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAAATTGTTTTATGTCAAAACAACTGGTCATAAT
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
11758 GATTTTAAATAAATAATAGTTTAAATAGTCATCACTATTTGAACTTGTTTGG
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *
11810 TAAACAGATTTATTTTTTCAAATCATTTCCTTTTTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTAG-AT
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTAT
* * * * * * * *
11873 TATTTT-ATTCGAATAAACTTGTA-AAATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAG
63 TATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ** * * *
11936 AATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTCGAA-TTGACTCGA
127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTGA
* * * * * *
11991 CAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-
* * * * * * * *
12056 TTTTAA--CGAAATAAGTTTCTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-ATAGATCTTAA
65 TTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ** *
12118 CGATTTGAGATTA-ATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA
129 CGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * *
12171 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *
12236 TTTATTTCGAATAAGCTTGTGTGATA-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * **
12300 GATTTGAAATAGATAATCGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTTAACTAATTCAA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *
12352 TAAACTGATTTATTTTTTAAGT-TTCTTACTTATT-ATTTTAGTAAGTATTAATAAATTAGTATT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *** * * * * *
12415 ATTTTAA-TCCATCTAAGCTTGTATTAATTGAAACAAATGTTTTATGAGAAATCAAAAAGTTATA
64 ATTTTAATTCGA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * ** * * *
12479 ACGATTTTAAATTA-ACAATTGTTAAAATAGTAATAACTATTCAAACTTGTTCGG
128 ACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
*
12533 TAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTATTT-CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTAT
1 TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTAT
* *** * ** *
12596 TAATTT-ATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATATCAG
63 TATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * * *
12660 AACGATTTCAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTTAACCATTTGAACTGA-TTCA
127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
12714 GTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
12779 TTTTAA-TCAGAATAAGCTTGTATGAA-TAAAACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAAAGGTCATA
65 TTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATA
* * * * ** *
12842 ACGATTTGGAATAGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* ** * * * * * *
12896 CAATTATATTTATTTTTTTAAT-TTTCCTAGTTATTAAGTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT--TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * ** * * * * *
12960 ATTTT-ATTCTAAATAAAATAGTATGAATAGGACCAATTATTTGATGACAAAACAAAAAGTTATA
64 ATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * ***
13024 ATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGCTT-A
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * * *
13077 GCAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAAATATTAATAACTTAGTATT
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
13142 ATTTTATTTCGAACAAACTTATATTAAGAAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * *
13207 ACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGT-TTAACTATTTGAAC-TAGTTCA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* ** * * *
13259 GCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTT-AGAATATTACTAAATTAGTATT
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
13323 ATTTTATTTCGAATAAGCTTATATAAACAGAAAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATA
64 ATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * ** *
13388 ACAATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGG
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* *
13442 TAAACAGATTTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTATTGAAATATTAGTAAATTAGTATTA
1 TAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** * * * * *
13503 TTTTATTTCGAATAAGCTTCTAT-ATTGAAAAGCAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATAACAA
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * *
13567 CAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTTGAAC-TAATTCA
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
13619 GTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATACA--ACT-TTA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
** * *
13681 TTTT-ATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
65 TTTTAATTCGA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * ** * **
13744 CAATTTAAAATAGATAATTGTTGAACAGGT-TTGATAA--A-AAG-ATTTATTTTT
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-A--TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
** * * * * * *** *
13795 TAAATCTCTTATTAATTTTTGT-AA--TATTAATATATTAGCATTATTT-TATTCCAAACAAACT
1 TAAA---CAGATTTATTTTT-TAAATCTTTTACT-TATTA--ATT-TTTGAAATATTAATAAA-T
* * * ** ** * * ** ** *
13856 TA-TATGA-ATAAAAAC--ATTTG-TTTTATG-ACAAAACCAAAGGTGATAGTGTTCAAATAGTC
57 TAGTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTA-TG-ACAAA-A--C
*** * * * * * * * * * *
13915 ATAATTATTAGAATTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAAT-CTC-TTACT-TATT-AA-TT
117 A-AAAGGTCATAA-CGATT-TG-AAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTT
13975 -TTTGAAA
176 ATTTG--A
* * * * * * * * * * * * *
13982 TATTAATAAATTCATTTTACTT-TAT-TTTGAATAAGCT-A-GTATGAATTGA-AAAAAAATT--
1 TA--AACAGATTTATTTT--TTAAATCTTTTACTTA-TTAATTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAG
*** ** * ** * ** * **
14040 T-TTATGACAA-AAGAA-AAGGTCATAATGATTTA-AAATAGATAATTGGTCATATAGTCTTAAC
60 TATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGT-ATGA---ACAAA-A-ACAATT-GTTTTAT-GACAAAAC
* * * * * * * * *
14101 --TA-TTTA-AACTGGTTCGGCAAACAAATTTAATT-TTTAAATCTCTTAGTTATTAA-T-TTTC
117 AAAAGGTCATAAC-GATT-TG-AAATAGA--TAATTGTTCAAA-----TAGTCA-TAACTATTT-
* *
14159 AGAATATTATTAGA
170 -GAA-CTTATTTGA
* * * * * * *
14173 T-TAC-TA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAACATAAATAATTGTTT---TTATGACAG
1 TAAACAGATTTA-TTT-TTT-AAAT---CTT-T-T--AC-TTATTAATT-TTTGAAATATTA-AT
** ** * ** *
14232 AACAAAAGGT-TTATTTT--TTTAAATAA--TTGATTTGAA-GTATACAATTG---T-T--C--A
53 AA-ATTA-GTATTATTTTAATTCGAATAAGCTTG-TATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * * *
14283 AC--TA--T-TTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTC-TTACT-TATT-AA-
115 ACAAAAGGTCAT-AAC-GATTT-G-AAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAAC
14338 TT-TTTG-
174 TTATTTGA
* *** * * *** * * *
14344 --AA-AGATTAATCAATTAGTATTATTTTA-TT-TTGAACAACCTTGTACGATA-AAAAACAATT
1 TAAACAGATTTATTTTTTA--AATCTTTTACTTATT--A-ATTTTTG-A-AATATTAATA-AATT
** *** *** * * * * ** * *
14403 CTTATATGACTAAACAAAAAGTAATAA-CAAT-T-TGAA-ATAGATAATTGTTGAGATGGCCATA
58 AGTAT-T-A-T-TTTAATTCG-AATAAGC-TTGTATGAACAAAAACAATTGTT-TTAT-GACAAA
* *** * * * * * * * * *
14464 TCTATTTGAG-C-T--TG-TTTGATAA-ACAT-TTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG
115 AC-AAAAG-GTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAA----TAG-TCA-TAACTATTTG
*
14522 AA--T-TTTAA
171 AACTTATTTGA
* * * * *
14530 TAAATTAG-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACTGAAATAATTGTTTG--TTGACTA
1 TAAA-CAGAT-TTATTTT-TT--AAAT---CTT-T-T--ACT-TATTAATT-TTTGAAAT-A-TT
* * ** * * * * * ** **** *
14592 AACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCTAATAGTTTTAATTATTTGAATTGGT
50 AA-TAAA--TTAGTATTATTTTAATTCGAATAA--G--CT--T-GTATGAACAAAAACAATTGTT
* ** * * **** * * * * *
14656 TT-GGA-AAAAC-TCA-TTTATTTTTTATTATTAAATTAGTATTATCT-TAATCTGAATAGGCTT
105 TTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACGATT-TGAAA-TAG-ATAAT-TGT--TC-AAATAGTCAT
*** *
14716 ATA-TGAAAAGAAACAATTGTTCT-A
162 A-ACT-ATTTG-AAC--TTATT-TGA
** ** ** * * ** * * * * * *
14740 TGACAA-A-ATAAAGATCAT-AATGATTTGAGATATATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTG
1 T-A-AACAGATTTATTTTTTAAAT-CTTTTACTTAT-TAATTTTTGAAATATTAATAA--ATTAG
* * * ** * * ** * ** * ** * **
14802 AACTAGTTCGA-T-AAACAAATTTAGTTTTTA-ATACTCTTATTAATTT-T--CAAAATCTTAAT
60 TATTATTTTAATTCGAATAAGCTT-GTATGAACAAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAA-C--AA-
*** * * *
14861 GAATCGGT-ATTATTTTATTCTG-AATA-AT--TCTGTAT-GAACAG--A-AAC-AATTG---TT
119 -AA--GGTCA-TA-ACGATT-TGAAATAGATAAT-TGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
*
14913 -TTACGA
176 ATT-TGA
* * ** ** *** * ** * * * *
14919 CAAAACA-A--AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATGA--ACATGACTATTTG
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA-TTAATTTTTGAAAT-ATTA-AT-A-AATTAG
* * * ** * * * *** * * *
14979 AATTTATTTGGTAA-AC-ATATTTATTTTTTAAG-TCTCCTACCTATTAATTTT-TAGA-ATATT
60 TA-TTATTT--TAATTCGA-A-TAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATT-GTTTTAT-GACA-A--
* *** * ** * * * *
15039 AATAAATTA-GT-ATTATTTTATTTCG-AATA-A-ACTT-TT-ATGAATAGAAACAATTGTTT-T
114 AACAAA--AGGTCA-TA-ACGATTT-GAAATAGATAATTGTTCA--AATAGTCATAACTATTTGA
* ****
15096 A-TGACAAAA
172 ACTTATTTGA
** * * * ** *
15105 TAAA-AGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCA-TAACTATTTGAGCTTGTT
1 TAAACAGAT--T---TATTT--TTTAAAT-CTT-TT---AC--TTATTAA-TTTTTGA-AATATT
* * ** * * * *
15168 CAGTAAA-TAG-ATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGA
50 -AATAAATTAGTA-T--TATTTT-AAT-TC-GA---A-TAA-GCTT-G--TATGAACAAA-AACA
* **** * * * * * * * **
15231 ATTATTTTAT--TTTGA-ATAA-G-CCTATATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAA-
99 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ACGATTTG--A-AATAG-ATAAT--TG-TTCAAAT
* *
15290 AGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATT-A
156 A-GTCATAACTATTTGAACT---TATTTGA
** ** * * * * *
15318 TTCA-AGTAGTTATAACTATTAGAA-CTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACT
1 TAAACAG-A-TT-TATTTTTTA-AATC-T-TT---T--ACTTATTAATTTTTGAAA--TATTA--
* * * ** * ** * * * ** * *
15381 TATTAATTGGCAAAATTTTAA-T-AAATTAATATTATTTTAATC-CGAATAA--GCTTGTATGAA
51 -ATAAATTAGTATTATTTTAATTCGAA-TAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAATTG-TTTTATG-A
* * * * * *
15441 CAAAAACAATAGTTTTATGACAAAACAAAAAATCAT-AACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA
111 C-AAAACAA-A-----AGGTCATAAC----GAT-TTGAA--A--T---AG--ATAATTGTTCAAA
*
15505 TAGTCATAACTATTTAAACTTATTTGA
155 TAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
15532 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAGTTGTCT-AAATATTAATAAATTTGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
15596 TTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATA
65 TTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
*** * * * *
15659 GTAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTTAATCGA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *
15713 TAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG-ATTTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTA
* * * * * * *
15777 TGTT-ATTCCAAGTCAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGTTTTGTAAC-AAACAAAAGGTTATAA
65 TTTTAATTCGAA-TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * ** *
15840 C-ACTTTGAAACAGATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTTGTA-TTGGTCAGG
129 CGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTGA
** * ** * * * *
15893 CCAACAGATTCATTTTTTAAATCCGTTACTTGTTAATTTTT-AGGATATTAACAAATTAGCATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * *
15957 CTTTATTTCGAATAAGATAGTATCAATAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAACGGTTATAA
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
16021 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAACTGATTTGG
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *
16074 TAAATAGATTTACTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
16135 TTTATTTTGAACAAACTTATATGAGCAAAAACATTTGTTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAATG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * *
16200 GTTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAA-TTGGTTTGG
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTGA
* * * * * * *
16251 TAAA-AAATTTGTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
16314 TTGT-ATTCCGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
65 TTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* *
16378 TGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTCTG-
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TT-TGA
* * * ** *
16431 TGAGCATATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *
16494 TTT-ATTCAGAATAGGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATG--AACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * ** **
16558 AAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GGCAATAATTATTTGAACTGCTTCAA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * *
16612 TAAACTGATTTATTTTTTTAAATCTTTAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTA
1 TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * ** * * *
16677 TTTTATTTTGGATAGGCTTTTATGAATTAAAACAAATGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAAC
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * *
16742 AATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *
16794 TAAACATATTTATTTCTTTAAA-CTTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATACAA-GAGTA
1 TAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTA
* * ** * ** *
16856 TTATTTTATTTCGAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGATTAAACAAAAGGTCAG
62 TTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * ** *
16921 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTCAA-TTGGTTCA
127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * ** * *
16975 GTAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
17040 TTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCCTAAT
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* *
17104 GATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTTG-
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * *
17156 TATACAAATTTA-GTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * * *
17215 TTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAATGTCATAACG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * *
17280 ATTTCAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTGTTTAAATTTATTCGA
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* *** * * *
17331 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * **
17396 TTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGATTATAATA
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * *** * *
17461 ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTCGCTCGG
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * *
17512 TAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGGAAGT-TTAATAAATTAGTATT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
17575 ATTTT-ATTCCAAATAAGCTTTTATGAACAAAATCAATGGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
64 ATTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * *
17639 ACGATTTGAAATAGATTATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATT-TGA
* ** * * *
17694 -AAATAGATTTATTTTAAAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTA
* * * *
17756 TTTT-ATTCGGAATAAGCTTGCATGAACAAAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAA
65 TTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
17820 TGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCAAAACTATTTGAACTT-TTTTA
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * *
17872 GTAAATAGA-TTCTTTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * ** ** * *
17936 TTTTAGTTC-AAGCAAACTTACATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAAGGTCAT
65 TTTTAATTCGAA-TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAAGGTCAT
* * * * *
18000 TATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCTG-
127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGA
* *
18055 TAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
18120 TTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * ** * *
18185 AAGTTGAAATAAATAATCGCACATATAGTCATAA-TGATTTGAACTTA-TTCA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTTATTTGA
* *
18236 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTAT
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTAT
** * * * *
18299 TATTTT--TTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATA
63 TATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * **
18362 GCGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACATGTTCAA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * *
18416 TAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *** * *
18480 TTTT-ATTCCCAATAAGCTTATATGAACTGGAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
65 TTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * *
18544 CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTG-ATTTAGTTCGG
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * * *
18597 CAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTGT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * *
18661 TTTAA-TCTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAAC
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * *
18725 GATTTGAAATAAATGATTGCTCAAATAGTCTTAACTATTTAAAC-TAGTTTGA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * **
18777 TAAATAGATTTATTTTTTAAATC--TT--TGATTAATATTCAAAATATTAATAGAATT-GTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTA
* * * * * * *
18837 CTTT-ATTCCGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAA
65 TTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
18901 TGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TAGTTAGG
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * ** *
18954 TAAATAAAATTATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTA
* ** * * * * *
19018 TTTT-ATTCCAAATAAGCTAATATGAATTAAAAAAAACATATTTTATGACAAAATAAAAGGTCAT
65 TTTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* * * * * *
19082 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAATTCGGA
127 AACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGA
* * * * ** *
19138 -AAACA-A-TT-TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTGTTAGATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
19199 TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAATACAAAAGGTTATAAGG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* ** * * *
19264 ATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGA--TAGTTTGG
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTA-TTTGA
* * * * * *
19315 TAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * *** * * * * * * *
19380 TTT-ATTCCAAATAAGCTTGAATTTTCAAATATAACTGTTATATGACCAAAA-AAAGGGTAATAT
66 TTTAATT-CGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAA
*** * * * * *
19443 CGATTTGAAATAGATAATTGTTGGCAT-GGCTATAATTATTTGAACTAATTCGG
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * ** * *
19496 TAAATAGGTTTACTTTTTAAATC----ACTTATTAATTTTCAAAACATTAATAAATTATTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * *
19557 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
** * * * * * *
19622 ATTTGAAATAGATAGCTGTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAA-TTGCTTCGA
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTGA
* * * * *
19673 TAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTGTTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
19738 TTT-ATTCTGAATAAGTTTATATGAACTACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAAC
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * *
19802 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-------GAGTTG-----GTTTGG
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *
19842 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAATATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * **
19906 TTT-ATTCTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTATTTTATAACAAAA-AAAAGTTTGTAAC
66 TTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** **
19969 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGAG-CTAAAATTATTTGAACCAATTCAA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTC-ATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * *
20022 TAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTA
1 TAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** * * *
20086 TTTTATTTCGGATAAGCATT-TATGAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAT
65 TTTTAATTCGAATAAGC-TTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * *
20150 TTATAAT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTGTTCGG
129 CGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* ** * *
20203 TAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTGTTGTTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATT
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * * * ** *
20266 ATTTTATTTCGAATAAGCATGCGTGAACTGAAAA-AATTATTTTATGACTAAACAAAAAATCATG
64 ATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * *
20330 ATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCTTAA-TCAATTGAA-TTGGTTCGG
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTT-ATTTGA
* * * * * * *
20383 CAAACACATTTATTTTTTAAATC---TA-TTATTAATTTTT-AGAATACTATTAATTTAGCAATA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * *
20443 ATTTACTGCAAATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATACC
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * ** * * **
20507 GTTTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTAGAAC-GAGTTCAA
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTGA
* * * ** * **
20559 TAAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTCTTAATTTTCAAAATATTGATAAATTTTTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * ** * * * * * *
20620 TTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAATG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * *
20685 ATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATGGAT-ATGACTATTTGTACTTGTTCGG
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * *** ** *
20736 TGAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTAAG-AATATTAATAAGTTAGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * * * **
20800 TTTATTTTGAATAAACTTACATGAATAGAAACAATTGTTTCATGACAAAAC-AAAGGATCATAGT
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAAC
* * * *** *
20864 GATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGGACTCGCTTGC
130 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* *
20916 T-AACTAGATTTACTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTA
1 TAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
20980 TTTT-ATTCCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
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* * * * * **
21044 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAA
129 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATT-TGA
* * * * * *
21098 AAAACATAGTCATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTGATTTTTCAAATATTAATAAATTTA-TATT
1 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATT
* ** * * * * *
21161 ATTTT-ATTTGAAATAAGCTTACATGAATAGAATCAATTATTTTATGACAAAAC-AAATGTCATA
64 ATTTTAATTCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
* * * * * * * * **
21224 ATGTTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTAAACATGTTCAA
128 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * * * * *
21278 TAAACAAATTCATTTTTTTATTCTCTTACTCATTATTTTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTAT
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
21343 TTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATG
66 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * *
21408 ATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAGAACTATTTGAACTTGTTTGA
131 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * * ** *
21459 AAAACATATTT-TTTACTTAAATCTTTTACTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTA
1 TAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
21523 TTGTAATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAA-GTCATAA
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAA
* * * * *
21587 -GAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-GATTTGAGCTTA-TTCA
129 CG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * * **
21638 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATGTTTTACATATTAAGTATCTTT---ATATTAATAAGTTTTTA
1 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-T-T-TTTGAAATATTAATAAATTAGTA
* * * ** *
21700 TTATTTT-ATTCACAATAAACTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTA
62 TTATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * * * * ** * * * ** *
21764 TAGCAATTTCAAAAAGAAAATTATTGGAATAGTCATAATTATTTAAAGTTGCTCGA
126 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTGA
* * * ** *
21820 CAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTTTAATATTAATAACTTAGTATTA
1 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
21885 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATG-ACAAAA
65 TTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAA
21915 CAAAAGGCCA
Statistics
Matches: 15772, Mismatches: 3933, Indels: 2658
0.71 0.18 0.12
Matches are distributed among these distances:
160 1 0.00
161 1 0.00
162 3 0.00
163 2 0.00
164 1 0.00
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Alignment explanation
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Period size: 362 Copynumber: 63.9 Consensus size: 358
678 ATGACAATTA
* * * * * * **
688 GAACTTGTTCAGTAAACATATTTATATTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * *
753 AATTAATATTATTTTAATTCGAATAATCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGAA-AAAACA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT-AACAAAACA
* * * * * **
817 AAAAGTCATAACAATTTGAAAAAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAACTT-ATTTGA
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAG-
* * * * * *
881 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTAATAATTCATTGTCTA-AATATTAATAAATTTGTATTA
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
945 TTTTA-ATTGAAATAGGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAG
254 TTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * * *
1009 CAATTTGAAATAGATAATTATT-AAAGAGT-AGTAACTATTT
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* * * *
1049 GAACTTGATCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * *
1114 AATTAG-ATTTATGTTATTTCAAGTCAGCTTGTACGAATAGAAACAATTATTTTCTAATAAAACA
66 AATTAGTA-TTATTTTATTTCAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * * *
1178 AAAGGTTATAACACTTTAAAATAGAT-ATTGTTCAAACAATTATAACCATTTGTATTGGTCAGTC
129 AAAGGTCATAACA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCAGT-
* * * * * * *
1242 CAATAGATTCATTTTTTAAATCCATTACTTATTAATTTTTAGGATATTAACAAATTAGCATTACT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATCC-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * *
1307 TTATTTTGAATAAGAC-TGTATCAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGATTATAATA
256 TTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
*
1371 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTA-TTATAACTATTT
320 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTT
* * ** * ** **
1410 GAACTGGTTTGGTAAATGGACTTACCTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * ** *
1471 AATTAATATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATGAAT-GAAACATTTGTTTTACGATAAAACAA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * ** * * *
1535 AAGGTTATAACAGTTTGAAATAGATAAATATTCATATAACCTTAACTATTTGTATTGGTTCAGCA
130 AAGGTCATAACA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TCAGTA
* * * * * * * *
1600 AAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGC-TATTACTTTTTATAATATTATTAAATTAGTAATATTG
193 AACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * *
1664 TATTTCGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTTATGACAAAGCAAAAG-GCTATAATGA
257 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATC-ATAATGA
* * *
1728 TTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGACATAACTATTT
321 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
1766 -AAATTAGTTCGGTAAGCATATTTCTTTTTTAAATCTCCTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
1 GAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * *
1830 AAATTAGTATTATTTTATTTGAAACAATCTTGTATG-AT-GAAAACATTTGTTTTCTGACAAAAC
65 AAATTAGTATTATTTTATTT-CAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * * * * * * * *
1893 AAAAGATCATAAATATTTCAAATAGATAATTATTCAAATGGTGA-AATTATTTAAACTGATTC-G
128 AAAAGGTCAT-AACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-GTCAG
* * * * * *
1956 ATAAACTGATTTATTTTTTAAAT-CTTCAACTTCTCAATCTTT-GAAATATTAATAAACTAATAT
191 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTT--ACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
2019 TATTTTATTTT-AGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGGTCA
252 TATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * *
2082 TAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT
315 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
2126 GAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAACTTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
** * * * * *
2190 TAAAAGAGTATTA-TTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAA
64 TAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA
* * * * * *
2253 CAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTA
127 CAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TCA
* * * * * ** * *
2318 ATAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATA
190 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** *
2383 TTTTACTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-TGAAGATCATAGT
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * * *
2447 GATTTGAGATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTAATT
319 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** ** * *
2487 GAAATAATTTTGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC-T--TT-TTAATTTTTGAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* ** * * * * *
2548 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTGTTTTATGATAAAATAA
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* * * * * * * * * ** **
2613 AATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGATT-AATTGGACATGATTGTTTAAACTTATTTGGT
130 AAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAGT
** *
2677 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
** * * * **
2742 TTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATTATAACAA
256 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA
* *
2807 TTTGAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTT
321 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
2845 GAACTCGCTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAAT
1 GAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * * * *
2909 AAATTAGTATTATTTTATTCCGATTAAGCTTTTATGAACAAAAACAATGGGTTTATGACAAAACA
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* * * *
2974 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGA
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* * ** * *
3039 AAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATT
*** * * * *
3103 TTATTCAAAATAAGCTTG-ATTGAACAGAATCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATG
256 TTATTTTGAATAAGCTTGTA-TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * **
3167 TTTTGAAATAAATAATTGTTTAGCTAGTCATAACTATTT
320 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** *
3206 GAACTTATTCGGTAAATAGATTCATTTTTTATTTCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAAT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * * * * *
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*** * * * *
3334 AAAAGGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTAG
128 AAAAGGTCA-TAACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAG
* * * * *
3399 TAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAGTATTA
191 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
3464 TTCTAATCTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAA-AGTCATAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
** * ** *
3528 CAAGTTGAAATAAATAATTGCACAAAATAGTCATAACGATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTT
* * * *
3570 GAACTTATTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATAAATTGTCTT--AATATTAA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAA
* * * * * *
3633 TAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATGAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTCTTTTATAGCAAAA
64 TAAATTAGTATTATTTTATTT-CAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATAACAAAA
* * * * * * * *
3698 CAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATATATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCA
127 CAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCA
* * * *
3763 GTAAA-TGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATT
190 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-C-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
*** * * * *
3826 ATTTTATTCCCAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTCTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATA
253 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * * * *
3890 ACGATTTGAAATAAATAATTATTTAAATAATCATGATTATTT
317 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
3932 GATCTAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAAT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
3996 AAATTAGTATTGTTTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
65 AAATTAGTATT-ATTTT-ATTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * * * * * **
4061 AAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGCTCATATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTTGA
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCAG-
* * *
4126 TAAATAGATTTATTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAA-TATTAGAAATATTAATAGATTAGTATTAC
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTA-
* * * * * * * * *
4187 TTTT-TTTCGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAAATAG-TCATAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGATCATAA
* *
4250 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
4291 GGACTGGTTAGGTAAACA-AATTA-TTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTGAAATATTAGTA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * *
4354 AATTCA-TTTTATGTTATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTCA-AAAAAACTTATTTTATGACAAA
66 AATT-AGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTATAACAAA
* * ** * *
4417 AC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTTGAAACTGGTT
126 ACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTGG-T
* * * * * * * *
4481 C-G-ACAGACAAATTTATTTTTTAATTCTTTTAGTTATTAATTATTGGAATATTATTATATTAGT
188 CAGTA-A-ACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * ** * *
4544 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGTACAAAAGGTTA
250 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * ** *
4609 TAAGGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
315 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
4653 GAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAAGA-T--T-
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * *
4714 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGAATG-TTCA-AATACAATTGTTATATGACCAAAC
66 AATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * *** * * * * * *
4777 AAAAGGTAATAACTATTTGAAATAGTTAATTATTGGCATGGCCATAATTATTTAAACTT-ATTAG
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCA-
* * * *
4841 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCACTTACTTTTTACTTTTT-GAAATATTAAAAAATTATTATT
190 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* *
4905 ATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA
253 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
** * * * * * *
4969 ACAATTTGAAATAGATAATTGGTCATACAGTCTTAACTGTTT
317 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * *
5011 CAAC-TGCTTCGACAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATT
1 GAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * * *
5075 AAATTAGTTTTATTTTATTTTGAATAAGTTTATATGAACTA-AAACAATTATTTTATAATAGAAC
65 AAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * * * *
5139 AAAAAGTTATAACAATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATA---AGAAC----TG-GTT--T-GGT
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCAGT
* * * *
5193 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTT-GAAATATTGATAAATTAATATTAT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * **
5257 TTTATTTTGAATAGGCTTGTATG-ATGGAAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGTTTGTAAT
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * * * * * *
5321 GAATTGAAATAGACAATTGTTCAAATGGCCAAAATTATTT
319 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
*** ** ** ** * * *
5361 GAACCAATTCAATAAATTGACATATTATTTAAATCTCTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * *
5426 AAGTAATATTATTTTA-TT--ATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAAGAAA
66 AATTAGTATTATTTTATTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAA
** * * * * *
5488 AGGTCATATTTATTTTAAATAGGTAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTT-GTTAGGCA
131 AGGTCATA-ACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCA-GTA
* * * * *
5552 AATAGATTTATTTTTTGAAAT-TTGTAGTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAT
193 AACAGATTTATTTTTT-AAATCCT-TA-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
5616 TTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACG
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * * * *
5681 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTT
320 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
5720 GAACTAGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATACT-AT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * * * *
5783 CAAATTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGCTTGCATGAATATAAACAATTGTTTTAT--------
65 -AAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * *
5840 -----G-----AC------AA-A-ATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAGAACTGGCTC-GA
128 AAAAGGTCATAACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TCAG-
* * * * * *
5886 TAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTA--T--CAATTTTCAAAATATTAATAAATTGGTATTAT
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
** ** * * *
5947 TTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAATATAATG-TCATAAC
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGATCATAAT
* * * * *
6011 GATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATGGAT-ATGACTATTT
319 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTT
* * * * *
6051 GAACTTGTTTGGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TCAACTTATAAATTTTT-AGAATATTAA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * * *
6114 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGGAATAAACTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
64 TAAATTAGTATTATTTTA-TTT-CAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA
* * ** * * * * * * *
6179 TAAAAGATCATAGTGATTTGGAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAATAGTTGAACTCGTTTA
127 CAAAAGGTCATA-ACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCA
* * * * *
6244 GTAAACATATTTATTTTGTTAAATCTTTTACTTACTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATT
190 GTAAACAGATTTATTTT-TTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
6309 ATTTTATTCTAAATAAGTTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
253 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
*
6374 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * * *
6415 GAACGTGTTTAGAAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTCAAAATATTAAT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAAT
* * * *
6479 AAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTTTTTTATGACAAAA
65 AAA-TTAGTATTATTTTATTTC--AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA
* ** * * * *
6542 CAAAATGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCA
127 CAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCA
* * * * *
6607 GTAAACATATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTA
190 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * *
6672 TTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * **
6736 TGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGGACTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
*** * * * * **
6777 GAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
** * * * * * *
6842 AATTAACATTATTGTAATTTGAATAACCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
66 AATTAGTATTATT-TTATTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * * *
6907 GAA-GTCATAAGAATTTGAAGTAAATAATTGTTCAAATAGTCATAA-AATTTGAACTTGTTCGGT
130 -AAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAGT
* ** * ** *
6970 AAACAAATTTATTTTTTAAATGTTTTACTAATTAATTTTCT-TTATATTAATAAATTTGTATTAT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAAT-CCTTACTTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
*** * ** * * ***
7034 TTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCA
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * * *
7099 ATTTCAAA-AAGATAATTGTTGAAATAGTCATAATTATTC
320 ATTTGAAATAA-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * *
7138 AAACTTGTTCGACAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGTAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * *
7203 ACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-GAAATAATT-TTTTATGACAAAACA
66 AATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * *
7266 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTG-ATCTAGTTTAG
129 AAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-T-GGTCAG
* ** ** **
7330 TAAACATATTTATTTTTTACTTTTTCTACTTATTAATTGGT-GAAATATTAATAAATTAGTATTA
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCCT-TACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
7394 TTTTAATCTGGATAGGCTTGTATGAATGGAAACAACTATTTTATAACAAAACAAAA-AGTCATAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
* * **
7458 CGATTTGAAATAAATAACTACTCAAATAGTCATAACTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * *
7499 GAACTCATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTG-AATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * * * * * *
7559 TATTAGTATTACTTTATTCCAAACAAACTTATATAAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAGACAA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * *
7624 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGTTAGGTA
130 AAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCA-GTA
* * * *
7689 AATAAAATTA-TTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTCA-TTTTATT
193 AACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTATTATT
*** * * * * *
7748 TTATTCCAAATAAG-TTAGTATGAATTGAAAAAAACTTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGA
256 TTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAATAG-AAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * * *
7812 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATGTTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
7853 GAACTGGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * * * *
7918 GATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTGTGATAGAAGAA
66 AATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * ** * * * *
7983 AAGGAT-ATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTTAT-A-TATTTGAATTAGTTTAGT
130 AAGG-TCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GGTCAGT
* *
8045 AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAAGATTAACAAATTAGTATTAT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * ** *
8109 TTTATTTCAAATAGGCTTGAATG-ATCA-AAACAATTGTTATACGATGAAACAAAA-AGCCATAA
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
** * * * * * * *
8171 TTTTTTATAAACAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTGTTT
318 TGATTT-GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * *
8213 GAAC-TGCTTTGGCAAATAGATTTATTTTTTACATCTCTTAGTTATCAATTTTTGGAATATTATT
1 GAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * * *
8277 AAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTATTTTATAATAGAAT
65 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * *
8341 AAAAGGTTATAATGATTGGAAATAGATAATTGTTC----A-T-ATAA--A----AACTGGTTCAG
128 AAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TCAG
* * * *
8394 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATCAATAAATTAATATTA
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * * * *
8458 CTTTATTCCGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCGTAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * * * *
8522 CAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT-GGCAATAATTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTT
** * ** * *
8563 GAAGC--GATTCAATTAATTGACTTA-TTTTTAAATCT-TTAACTTTTTAATTTTTGAAATATTA
1 GAA-CTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * * * * * *
8624 ATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGAATTGAAACAATCGTTTTATGATAAAA
63 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA
* * * * * *
8689 CAAAAGGTTAT-ACTTCTTATAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTT
127 CAAAAGGTCATAACAT-TT-GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTC
* * ** *
8753 AGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATTTCTTGTTTATTAATTTTTTGAATGA-TAATAAATTAGTA
189 AGTAAACAGATTTATTTTTT-AAA-TCCTTACTTATTAATTTTTAGAAT-ATTAATAAATTAGTA
* * * * * * * * *
8817 TTATTTTATTTCGAATAACCATGTATGAACT-GAAAAAATTATTTTAAGACTAAACGAAAGGTCA
251 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * * *
8881 AAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT
315 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *** * * *
8925 AAACCTGTTCAACAAACACATTTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTATT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * * * *
8989 AATTTTGTAATATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-
65 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * **
9053 AAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTATTGAAATAGTCA-AACTATTTGAACTGGTTTGAT
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCAG-T
* * * * *
9117 AAATAGATTTAGTTTTTAAAT-C-T-CTCATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTACTATTT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * *
9179 TATTCTT-AATAATTTTGTATAAATAGAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAATATCATAACT-
257 TATT-TTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-TG
* *** * * *
9242 ATTTGAAATAGATAATAACTCAAATGGACATGACTATTT
320 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * *
9281 GAACTTGTTTGGTGCATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TAATTCATTAATTTTT-AGAATATTAA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * ** * *
9344 TAAATTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAAATTATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
64 TAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * *** *
9409 AAAAAGATCATAACATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGG
128 -AAAAGGTCATAACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAG
* * *
9474 TAAACAGATTTATTTTTTAAAATCTTTTATTTATTAATTTTT-GAA-AGTTTAATAAATAAGTAT
191 TAAACAGATTTATTTTTT-AAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATA--TTAATAAATTAGTAT
* * * * * ** *
9537 TATTTTATTCTGAATAAGCTTTTATAAATAGAAACAATTGATTTATCACAAAATGAAAGGTCATA
252 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* *
9602 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
317 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * *
9644 GAACGTGTTAAGAAAACATATTTATTTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** * * * *
9707 AAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTACATAAACAGAACCAATTGTTTTATGACAAAAC
65 AAA-TTAGTATTATTTTATTT-CAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
** * * **
9771 AAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGGAAAT-GTTTG
128 AAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAATTGGTCAG
* * * * * *
9835 ATAAACAAATTAATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTAGAATATTCATGAATTAGTATTA
191 -TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * *
9899 TTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* *
9963 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AGACTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTT
** * * * * *
10004 GAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTGTTGAAATATTTATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
10069 AATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
66 AATTAGTATTATTTT-ATTTCAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * ** * *
10134 AAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAGTCATAAGGATTTGAACTTGTTTAGT
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAGT
* * *
10199 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACCTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATT-GTATTA
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * ** ** *
10261 TTTTA-TTCGTAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATCATTTGGTGACAAAACAAAA-AGTTATA
254 TTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATA
*** * * * *
10324 GCAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
317 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * **
10366 AAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * *
10431 ACTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-TTGATATGAACTA-AAATAATTTTTTTATAACAAAAC
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTG-TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * * * **
10494 AAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATACTTATTCAAATAGTCATAACTATTTG-ATCTAGTTTG
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-T-GGTCA
* * * *
10558 GTAAACA-ATTTATTTTTTAAAAT-TTTGCTTATTAA-TTGTCGAAATATTAATAAATTAGTATT
190 GTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * ** * ** * * * * * **
10620 ATTTTAATATGAATAAATTTTTATGAATAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAAAATTGTAA
253 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * ** *
10685 CAATTTTAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAACTTTTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
10726 AAACTAGTTTGATAAACAAATTTATTTTTAAAATC-C--A-TTATTAATTTTTGAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * *
10787 GATTAGTATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAA
66 AATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * *
10852 AAGGTCATAGCAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTAGGTA
130 AAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCA-GTA
* * * * *
10917 AATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTT-GAAATGTTAATAAATTTA-TTTTAT
193 AACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTAT
* * *
10980 TTTATTCTGAATAAGCTAGTATGAAGT-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-A-C---A-
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * *
11038 -ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTT
319 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** * * * **
11077 GTACTAGTTTGACAAACAAATTT-TGTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTTTT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
11141 ATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAACA
65 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * ** * *
11206 AAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACCAGTTCGGT
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAGT
* * *
11271 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAAGATTAATAAATTACTATTAT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * *
11335 TTTATTTTGAATAAACATATATGATTAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAATG
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * * * *
11400 ATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTT
320 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
11439 G-ACCTGATTCGGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTATTGAAATATTAAT
1 GAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** *
11503 AAATTAGTATTATTTTATTTTAACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
65 AAATTAGTATTATTTTATTTCAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * *
11568 AAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTTGTTC-GT
129 AAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAGT
* * *
11632 AAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTT-GAATTATTAAGAAATTAGTATTAT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** *
11693 TTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAAATTGTTTTATGTCAAAACAACTGGTCATAA
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * *
11757 TGATTTTAAATAAATAATAGTTTAAATAGTCATCACTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
11798 GAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCAT-TTCCTTTTTAATTTTTTG-AATGTTA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATC-TCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTA
* * * * * *
11861 ATAAATTTAG-ATTATTTTA-TTCGAATAAACTTGTA-AAATATGAAACAAATATTTTATGACTA
63 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATAACAA
* * * * * ** * *
11923 AACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTCGAATTGACT
125 AACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-GT
* * * * *
11988 C-GACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTT-GAAATATTATTAGATTAGT
188 CAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGT
*** * * * *
12051 ATTATTTT-TAACGAAATAAGTTTCTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-ATAGAT
250 ATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT
* * * * *
12113 CTTAACGATTTGAGATTAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT
313 CATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
12159 GAACTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
12224 AATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTGTG-ATAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * *** *
12288 AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATCGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTTAACTAATTCAA
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA-TTGGTCAG
* * *
12352 TAAACTGATTTATTTTTTAAGTTTCTTACTTATT-A-TTTTAGTAAGTATTAATAAATTAGTATT
191 TAAACAGATTTATTTTTTAA-ATCCTTACTTATTAATTTTTAG-AA-TATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * * * * *
12415 ATTTTA-ATCCATCTAAGCTTGTATTAATTGAAACAAATGTTTTATGAGAAATCAAAA-AGTTAT
253 ATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCAT
* * * * * * *
12478 AACGATTTTAAATTAACAATTGTTAAAATAGTAATAACTATTC
316 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
12521 AAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTATTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAA
* * * * *
12585 TAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACTAAAC
64 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
** * * * * * * * *
12650 AAAATATCAGAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTTAACCATTTGAACTGATTCAG
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-GTCAG
* * * *
12715 TAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTATTAAATTAGCATTA
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * *
12779 TTTTAATCAGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAAAGGTCATAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAA
* * * * * *
12843 CGATTTGGAATAGATAATCGTTCATATAGTCTTAACTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** ** * * * * * * * *
12884 GAACTGGTTCGACAATTATATTTATTTTTTTAATTTTCCTAGTTATTAAGTTTTGGAATATTATT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** * * * * * *
12949 AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAATAGGACCAATTATTTGATGACAAAACA
65 AAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * * * * *
13014 AAAAGTTATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGCTTAGC
129 AAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TCAGT
* * * * *
13079 AAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAAATATTAATAACTTAGTATTAT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * *
13144 TTTATTTCGAACAAACTTATATTAAGAAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
* * *
13209 AATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGT-TTAACTATTT
319 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** * *
13248 GAACTAGTTCAGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTT-AGAATATTACT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * * * *
13312 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTATATAAACAGAAAACAATTGTTTTATGATAGAAC
65 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * **
13377 AAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGAGAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGG
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TCAG
* *
13442 TAAACAGATTTTATTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTATT-GAAATATTAGTAAATTAGTATTA
191 TAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
13503 TTTTATTTCGAATAAGCTTCTAT--ATTGAAAAGCAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATAACA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
** * * * * * *
13566 ACAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAAATGGCCATAATTATTT
317 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * *
13608 GAACTAATTCAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * *
13673 CA--ACT-TTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTG-TTTATGACAAAACA
66 AATTAGTATTATTTTATTTCA-ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * *
13733 AAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTG-T----T-G----AAC-A---G-GTT--TGA-TA
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCAGTA
* * *
13780 AAAAGATTTATTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTT-GTAATATTAATATATTAGCATTATTT
193 AACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
*** * * * * *
13841 TATTCCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-------CA-AA-G--
257 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGAT
* * * *
13895 --G---T-GAT-AGTGTTCAAATAGTCATAATTATTA
322 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
13925 GAA-TTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
1 GAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * * * *
13989 AAATTCA-TTTTACTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAAAAT-TTTTATGACAAAA
65 AAATT-AGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATAACAAAA
* * * * * * * * *
14052 GAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTGGTCATATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCG
127 CAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TCA
* * * * * * * *
14117 GCAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTATTAGATTACTATTA
190 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * * * *
14182 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAACATAAATAATTGTTTTTATGACAGAACAAAAGGT--TTA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * * * *
14245 TTTTTTTAAATAATTGATTTGAAGTAT-ACAATTGT--TCAACTATTT
318 TGATTTGAAATAAAT-AATT---GT-TCA-AATAGTCAT-AACTATTT
* * * *
14290 GAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATC
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * * *
14355 AATTAGTATTATTTTATTTTGAACAACCTTGTACG-ATAAAAAACAATTCTTATATGACTAAACA
66 AATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * * * * **
14419 AAAAGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAGATGGCCATATCTATTTGAGCTT-GTTTGA
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTGGTCAG-
* * *
14483 TAAAC--A-TT-TTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATTTTAATAAATTAGTATTAT
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * * * *
14544 TTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACT-GAAATAATTGTTTGT-TGACTAAACAAAAGGTTAGAA
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * ** *
14607 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAATTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * * *
14648 GAA-TTGGTTTGGAAAAACTCATTTATTTTTT--AT-TATTAAATTAGT-ATTATCTT--AATCT
1 GAACTT-GTTCGG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-T-TTGAAATAT
* ** * **** ** * * *
14706 GAATAGGCTTA-TATGAAAAGA-AACAAT-TG-TTCTATGACAAAATA-AAGATCATAATGATTT
61 TAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAATAAGCTTGTATG----AATAGAA-A-CA-ATTG-TTT
* * ** * * * * *** **
14766 GAGATATATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTAGTTTT
117 --TATA-ACAA---AACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAA--TAG-TCA
* * * ** * * ** ** * *
14830 TAATACTCTTATTAATT-TTCA--AAATCTTA-ATGAATCGGTATTATTTTATT-CTGAATAATT
171 T-A-ACTATT-TGAATTGGTCAGTAAA-C--AGATTTAT--TTTTTAAATCCTTACTTATTAATT
* * * * **** **** * ** * * * *
14890 CTGTATGAACA-GAA-ACAATT-GTTTTACGACA-AAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAG
228 -TTTA-GAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAATAGAAACA-
** ** * * * * * * * *
14950 ATAATTTT-T--CAAATGAACATGA-CTATTTGAATTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAG
288 ATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGATC-A--T-AA-TGATTT-G-AAATA-AATAATTGTTCAAA
* * *
15011 T-CTCCTACCTA-TT
344 TAGTCATAACTATTT
* * * * * ** *
15024 -AA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--A--T-TT-CGAATAAACTTTTATG-AA
1 GAACTTGTTCG-GTA--AACAGATT--TATT-TTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-TGAAA
* * *** ** * * * *
15080 TA-GAA-ACAATT-GTTTTATGACAAAAT-AA-AAGATCATAACTATTTGAA-ATAAATAATTG-
58 TATTAATA-AATTAGTATTAT-TTTATTTCAATAAG--C-T---TGTATGAATAGAAACAATTGT
* ** * * * *
15138 TTCA-AAC-AGTCATAA-CT-ATTTGAGCTTGTTCAGTAAATAGATTCATATT-TT-AAATCTCT
115 TTTATAACAAAACAAAAGGTCA--T-AACAT-TT--G-AAATAGA-T-A-ATTGTTCAAA-----
* * * * * *
15197 TACTCATTAA-TTTTTGGAATAT--T-AATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATAT
165 TAGTCA-TAACTATTT-GAAT-TGGTCAGTAAA-CAG-ATT-TATT-TTTT--A-AATCC--T-T
* * * * * *** *
15258 GAATTGATACAATTGTTTTATG-ATGA--AACAAA--AG-GTCATAACA-TTTGAA-ATAGATAA
217 -ACTT-AT-TAA-T-TTTTA-GAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGCT--
* * ** ** *** ** * *
15315 T-TATTCAAGTAGTTATAACTATTAGAACTTATTCG-GTAAACATATTTATTTTTAA-AATCTTT
272 TGTA-TGAA-TAG--A-AACAATT-G-TTTTA-T-GACAAAACA-AAAGA-TCATAATGAT-TTG
* * * * * ** *
15377 TACTTATTAATTG-GCAAA-A-TTTTAA-TAAATT
325 AAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTT
* * * * * * * * * * **** * * *
15408 -AATATTATT--TTAATCCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAAC--AATAGTTTTATGACAA-AA
1 GAA-CTTGTTCGGTAAACAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGA-AATAT
* * * ** * ** * * * *
15466 CAAAAAATCA-TAACGATTTGAAATAAATAA--TTGT-TCAAATAGTCATAACTATT-TAAACTT
61 TAATAAATTAGT-ATTATTTTATTTCAATAAGCTTGTAT-GAATAG--A-AACAATTGT---TTT
*** ** ** ** * * * *
15526 ATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAA-ATCTTTTACTA-ATTAGTTG-TCTAAATATTAATAA--
118 ATAACA-AAACAAA---AGGTCATAACAT-TTGAAATAGA-TAATTGTTC-AAATAGTCATAACT
* * * * * ** ** *** * ****
15586 ATTTGTATTATT-TTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTA-TTTTGTGACA-AAAC
176 ATTTG-A--ATTGGTCAGT-AAA-CAGATT-TAT-TTTTTAAATCCTTACTTAT-T-A-ATTTTT
* ** * * * ** * * *
15648 AAAAGGTT-ATAGTAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAGTCATAA-CTATTTGAACTTAATC
231 AGAATATTAATA--AATTAGTATTATTTTATT-TT----GA---ATAAGC---TTGTA-TGAAT-
* * *** * * * *
15711 GATAAACAGATTCAGTTTT-T---AAATCTCTTA-CTTATTAAT-TTTTGGAATATTAATAAATT
281 -AGAAACA-ATT--GTTTTATGACAAAAC-AAAAGATCA-TAATGATTT-GAA-ATAAAT-AATT
* * * * **
15770 AGATT--TAT-GTTAT-TCCAAGT
337 -G-TTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** * * * * * * *** * **
15790 CAGCTTGTACGAACAAAAACAATTGTTTTGTAACAAAC-AAAAGGTTA-TAACACTTTGAAACAG
1 GAACTTGTTCG-GTAAACAGATTTATTTT-TTA-AATCTCTTA-CTTATTAA-TTTTTG--A-A-
* * * *
15853 ATAATTGTTCAA-ACAATTA-TAACTATTTGTATTGGTCAGGCCA-ACAGATTCATTTTTTAAAT
57 AT-A---TT-AATA-AATTAGT-ATTATTT-TATT--TCA----ATA-AG---C-TTGTATGAAT
* ** * * * *
15915 CCGTTAC--TTGTTAATTTTTAGGATATTAACAAATTA-G-CATTACTTTATTTCG-AATAAGAT
103 -AGAAACAATTG-T--TTTATA--ACA-AAACAAA--AGGTCATAAC---ATTT-GAAAT-AGAT
** * * * * * * *
15975 -A--GTATC-AATAGAAAAAATTATTT-TA-T-GACA--AAACAAACGGTTATAATGATTTGAAA
154 AATTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCAGTAAAC--A-GATT-T-AT-TTTTTAAA
*** * * * * * * * * * *
16031 TAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAAT
212 TCCTTACTTATT--AATTTTTAGAA-TA-TT-AA-TAAATTAGT-ATTA-TTTTA--TTTTGAA-
** * ** * * * *
16096 CTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAGC
266 ----TA--AGCTTGTATGA-A-T-AGAAA--CA-ATTGTTTTA---TG-ACAAA---ACA--A--
* * * * * * * * *
16161 AAAAACAT-TTGTTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAATGGTTTGAAATAGATAATTATTCATAT
308 AAGATCATAATGATTT--G----AA-ATAA----ATAATTG-TTCAAATAG-TCA-TA-AC-TAT
*
16225 AGCCT
357 ---TT
* ** * * * * * * *
16230 TAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAAAAATTTGTTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATA
1 GAACTTGTT----CGG--T--AAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-A
* * * * * * * *
16294 ATATTATTAGATTAGTATTATTGTATTCCGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATG
57 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATA
* * *
16359 ACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
121 ACAAAACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T
* * * * * * * *
16424 AGTTCTGTGAGCATATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTA
184 TGGTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA
* ** * * *
16487 GCATTATTTTATTCAGAATAGGCTTGTATGATAAAAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
248 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG--AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * *
16552 ATCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GGCAATAATTATTT
311 ATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTT
** * * *
16600 GAAC-TGCTTCAATAAACTGATTTATTTTTTTAAATCT-TTAACTTCTCAATTTTTGAAATATTA
1 GAACTTG-TTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * ** * * * * *
16663 ATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAGGCTTTTATGAATTA-AAACAAATGTTTTATGATAAA
63 ATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAA
* * *
16727 ACAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTT
126 ACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTC
* * * * * * *
16791 TGATAAACATATTTATTTCTTTAAACTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATACAA-GAGT
189 AG-TAAACAGATTTATTT-TTTAAA-TCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA-AATTAGT
* * * ** *
16855 ATTATTTTATTTCGAATAAGCATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGATTAAACAAAAGGTC
250 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATC
* * * *
16919 AGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTT
314 ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
16964 CAA-TTGGTTCAGTAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATT
1 GAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
** * * * *
17028 AGTTTAGCAATATTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-
65 AAATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * *** **
17092 AAAGATCCTAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTTGT
129 AAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAGT
* * * *
17157 ATACAAATTTA-GTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTT-GAAAATTAATAAATTAGTATTATTT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** * * * * *
17217 TATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAATG-TCATAACGA
257 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGA
* * * * * * *
17281 TTTCAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTGTTT
321 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * ** * * *
17319 AAATTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAAAACATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
17384 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACGAAACAA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * * * * * *
17449 AAGATTATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTCGCTCGGTA
130 AAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAGTA
* * * *
17514 AATAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGGAAGT-TTAATAAATTAGTATTAT
193 AACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAA-TTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTAT
*** * * * *
17577 TTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACA-AAATCAATGGGTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAA
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
* * * *
17640 CGATTTGAAATAGATTATTGTTCAAATAATCATAACTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** * * *
17681 GAA-TGTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTAAAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAAT
1 GAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
17744 AAATTTA-AATTATTTTA-TTCGGAATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTGTTTTATGATAAA
65 AAA-TTAGTATTATTTTATTTC--AATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATAACAAA
* ** * * * ** *
17806 ACAAAAAGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCAAAACTATTTGAACTTTTTT
126 ACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTC
* * * * * * *
17871 AGTAAATAGA-TTCTTTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATT
189 AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * ** * * *
17935 ATTTTA-GTTCAAGCAAACTTACATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAAGGTC
253 ATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAAGATC
* * * *
17998 ATTATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTT
314 ATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
18043 GAACTTGTTCTGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAAT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * *
18108 AAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
65 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * ** * **
18173 AAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATCGCACATATAGTCATAA-TGATTTGAACTTATTCAG
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAA-TTGGTCAG
* * *
18237 TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATT
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * *
18300 A-TTT-TTTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAG
253 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * *
18363 CGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * *
18404 AAACATGTTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAAT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
18468 AAATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAGCTTATATGAACT-GGAACAATTCTTTTATGACAAAAC
65 AAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * * * * * * *
18532 AAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGATTTAGTTCGG
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GGTCAG
* * * ** * *
18597 CAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTGTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTGT
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * *
18661 TTTAATCTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAA-AGTCATAAC
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAAT
* * *
18725 GATTTGAAATAAATGATTGCTCAAATAGTCTTAACTATTT
319 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * **
18765 AAACTAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TGATTAATATTCAAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * * * * *
18826 GAATT-GTATTACTTTATTCCGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGCTTTATGACAAAATA
66 -AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * * *
18890 AAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGT
129 AAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTCA-GT
* * * *
18955 AAATAAAATTATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTCA-TTTTA
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATT-AGTATTA
*** ** * * * * * *
19018 TTTTATTCCAAATAAGCTAATATGAATTAAAAAAAACATATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
** * * * *
19083 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTT
317 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * * **
19125 GAACTAATTCGGAAAACA-A-TT-TTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTGTTA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * *
19187 GATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATAACAATACAA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * ** * * * * **
19252 AAGGTTATAAGGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGATAGTTTGGTA
130 AAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTGGTCAGTA
* * * * *
19317 AATAGGTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-GAAAGATTAATAAAGTAGTATTATT
193 AACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATT
*** * ** * * * * * *
19381 TTATTCCAAATAAGCTTGAAT-TTTCA-AATATAACTGTTATATGACCAAAA-AAAGGGTAAT-A
256 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGATCATAA
* *** * *
19442 TCGATTTGAAATAGATAATTGTTGGCAT-GGCTATAATTATTT
318 T-GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTT
** * * * ** *
19484 GAACTAATTCGGTAAATAGGTTTACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTCAAAACATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
19545 AATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACAAAACA
66 AATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * ** * * * * *
19609 AAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAGCTGTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAATTGCTTC-GA
129 AAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-GTCAG-
* * * *
19673 TAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTGTTAATTTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATTA
191 TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
19737 TTTTATTCTGAATAAGTTTATATGAACTA-CAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * * *
19801 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-------GAGTT
318 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
19835 G-----GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTGAAA-ATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * *
19894 AATTAATATTATTTTATTCTGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATAACAAAA-A
66 AATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* ** * * ****
19957 AAAGTTTGTAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGAG-CTAAAATTATTTGAACCAATTCA
129 AAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTC-ATAACTATTTGAA-TTGGTCA
* * * * *
20021 ATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAATAT
190 GTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
20084 TATTTTATTTCGGATAAGCATT-TATGAACT-GAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
252 TATTTTATTTTGAATAAGC-TTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * * * *
20147 TATTTATAAT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTT
315 TAATGAT-TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** *
20191 GAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTATTAATTTTTG-AATGTTAAT
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * ** * * * *
20255 AAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCATGCGTGAACT-GAAAAAATTATTTTATGACTAAAC
65 AAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
** ** * * * * *
20319 AAAAAATCATGATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAATAGTCTTAA-TCAATTGAATTGGTTCG
128 AAAAGGTCAT-AACATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAATTGG-TCA
* * * * * * * *
20382 GCAAACACATTTATTTTTTAAAT-C-TA-TTATTAATTTTTAGAATACTATTAATTTAGCAATAA
190 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *** * * **
20444 TTTACTGCAAATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATACCG
255 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATG
* * * ** *
20508 TTTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTA
320 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** ** * * ** *
20547 GAACGAGTTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTT-C---TTAATTTTCAAAATATTGATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
** * ** **
20608 AATTTTTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAA
66 AATTAGTATTATTTTA-TTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* * * * * * * * * *
20673 AATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATGGAT-ATGACTATTTGTACTTGTTCGGT
130 AAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTG-AATTGGTCAGT
* * * ** * *
20737 GAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAA-TTTAAGAATATTAATAAGTTAGTATTATT
192 AAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * *
20801 TTATTTTGAATAAACTTACATGAATAGAAACAATTGTTTCATGACAAAACAAAGGATCATAGTGA
256 TTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGA
*
20866 TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
321 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
20904 GGACTCGCTT-GCT-AACTAGATTTACTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAA
1 GAACTTG-TTCGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * *
20967 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAC
64 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * *
21032 AAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAA
128 AAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTC-A
** * * * ** *
21097 AAAAACATAGTCATTTTTTAAAATTTTTACTTATTGATTTTTCA-AATATTAATAAATTTA-TAT
190 GTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAA-TTAGTAT
** * * *
21160 TATTTTA-TTTGAAATAAGCTTACATGAATAGAATCAATTATTTTATGACAAAACAAATG-TCAT
252 TATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* * * * *
21223 AATGTTTTGAAATAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTT
316 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * * * * * *
21266 AAACATGTTCAATAAACAAATTCATTTTTTTATTCTCTTACTCATTATTTTTTGGAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
21331 AATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGACAAAACA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACA
* * * * * * **
21395 AAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAGAACTATTTGAACTT-GTTTGA
129 AAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCAG-
* * * * * * * * *
21459 AAAACATATTT-TTTACTTAAATCTTTTACTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTA
191 TAAACAGATTTATTT-TTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
21523 TTGTAATTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAAG-TCATAA
254 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGATCATAA
* *
21587 -GAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAA-GATTT
318 TG-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
21627 GAGCTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATGTTTTACATATTAAGTATCTTT---ATATTA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-T-T-TTTGAAATATTA
* ** * * * * * ** *
21689 ATAAGTTTTTATTATTTTATTCACAATAAACTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATGACAAAA
63 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAA
* * * * * * ** * * *
21754 CAAAAGGTTATAGCAATTTCAAAAAGAAAATTATTGGAATAGTCATAATTATTTAAAGTTGCTC-
127 CAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTCA
* * ** *
21818 GACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTTTAATATTAATAACTTAGTAT
190 G-TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
**
21883 TATTTTATTTTGAATAAGC-----T---T-------A------TATGACAAAACAAAAGGCCATA
252 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * *
21927 ATGGTTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATTACTATTT
317 ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * * * *
21969 -AATTTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTAAAACTTTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAA
1 GAACTT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * *
22032 TAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACATAAACAGTTGTTTTATAATAAAAC
64 TAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC
* * * * *
22097 AACAA-GTTATAACTATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTCAT-TT
128 AA-AAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T--TGGT
* * * *
22160 CA-TAAATAGATTTATTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATT
188 CAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
*** * * * * * * *
22221 ATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAATATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT-ATAA
253 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * **
22285 CT-ATTTGAAATAGACAATTGTTGAAATAGTCATAGTTATTT
318 -TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
22326 GAACTGGTTAGGTAAATAGAGTTATTTTTTAAATCTCTT-GTTA--AA-TTTTGAAATATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * *
22387 AATTCA-T-TTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTCA-AAAAAACTTATTTTAT-GCTAA
66 AATT-AGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAA-T-AGAAACAA-TTGTTTTATAAC-AA
* * * ** * * *
22448 AATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTTTTAAATATTTGAACTGGTT
125 AACAAAAGGTCATAA-CATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTC
* * * * * * * * *
22513 TGACAAAGAAATTTATTTTCTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGATTAGTAT
189 AG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
22578 TATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAA-AGTTAT
252 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCAT
* ** *
22642 AATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGT--T-ACGTATTT
316 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTT
* * * *
22683 GAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATA
1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * * *
22748 AATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGAATG-ATAAAAAAAATTGTTATATGACGAAACCA
66 AATTAGTATTATTTTATTTC-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATAACAAAACAA
* ** * * *
22812 AAGGCCATAATTTTTGATAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAACCATT--TC-
130 AAGGTCATAACATTTG--AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-A--ATTGGTCA
* * * * * * *
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*** * * * * * * *
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252 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* *
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316 AATGATTTGAAATAAATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTT
* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* * * ** *
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* * ** * * *
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* ** *
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314 ATAATGATT-TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * *
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1 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCT-CTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTA
* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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189 AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATT
* *
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** * *
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AGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
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AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
Found at i:1583 original size:176 final size:177
Alignment explanation
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1259 AAATCCATTA
* ** * * * *
1269 CTTATTAATTTTTAGGATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGACTGTATCAATAG
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* * * * * * *
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* * * *
1446 CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAACAA-ACTTATATGAAT-
1 CTTATTAATTTTCAAAATATTAACAAATTAACATTACTTTATTTCGAACAAGAC-TATATCAATA
* * * * * *
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*
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CAAATAGTCATAATTGATT
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* * * *
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* ** * ** **
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** * * * * *
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* * * ** * ** *
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* * * *
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* * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* *
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** ** * *
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* * * *
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* * * * *
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1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * *
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* * * * *
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** * * * *
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* *** ** * * * *
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* *
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* * * * *
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* ** *
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* ** * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * *
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* *
7250 T-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAA
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* * * * * * * * *
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1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
** * ** *
7354 TCTACTTATTAATTGGTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGGATAGGCTTGTATG
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* * * * * * **
7418 AATGGAAACAACTATTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAACTACTCAA
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* *
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* * ** * * * * * * *
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*
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* * * * *
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1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* *
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* * * *
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* * * * ** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * *
8006 ACAATTGTTCAAATAGTTAT-A-TATTTGAATTAGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *
8069 TTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAACAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGAATG-A
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* * * ** * * *** * * *
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* * * * * * * * * *
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194 TAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* ** * * *
8263 TTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTA
258 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
* * * * * * *
8327 TTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAATGATTGGAAATAG
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*
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1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
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* * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
8674 CGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTAT-AC-TTCTTATAAATAG
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* * * *
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** * * *
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65 CTTACTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * *
8843 GAACTGAAAAAATTATTTTAAGACTAAACGAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCT
128 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
8908 AATAGTCTTAACTATTTAAACCTGTTCA-ACAAACACATTTGTTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
192 AATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * * *
8972 ATTTTTAGAATATTATTAATTTTGTAATATTTTAATTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAA
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* *
9036 TTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAGATAG
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* * * * * *
9077 ATAATTATTGAAATAGTCA-AACTATTTGAACTGGTT-TGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCT
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* * * ** *
9140 C-T-C--ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTACTATTTTA-TTCTTAATAATTTTGTATA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG
* * ** * ***
9200 AATAGAAATAATTGTTTTACGACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAAATAGATAATAACTCAA
129 AAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *** * * *
9265 ATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTGCATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTAATTCATTAA
193 ATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTT-ATTAA
* * * ** *
9329 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAAATTATATGAATAGAAACAATT
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* *
9394 GTTTTATGACAAAACAAAAAGATCATAAC-ATTTGAAATAA
321 GTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* *** * *
9434 ATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTCACTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT
* * * * *
9499 TTTATTTATTAATTTTTGAAAGT-TTAATAAATAAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTTTAT
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT
* * * **
9562 AAATAGAAACAATTGATTTATCACAAAATGAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
128 GAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
9627 AATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTAAGAAAACATATTTATTTTTTAAA-ATTTTACTTATTAA
192 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
** * * *
9691 TTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTACATAAACAGAACCAA
256 TTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* *
9754 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAG
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
9796 ATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGGAAATGTTTGA-TAAACAAATTAATTTTTTAATTCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * *
9860 CTTACTCATTAATTTTAG-AATATTCATGAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * *
9924 ACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
130 A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * *
9989 TAGTCA-AGACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAG
194 TAGTCATA-ACTATTTGAAC-TGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * * * *
10052 TTGTTGAAATATTTATAAATTAATATTATTTTAATATGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAACAAT
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAAT
* * *
10117 TGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAA
320 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* ** * * *
10158 ATAATTGTTCAATTAGTCATAAGGATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* *
10223 TTACCTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATT-GTATTATTTTA-TTCGTAATAAGCTTGTAT
66 TTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT
* ** ** * * * * * *
10284 GAATAGAAAAAATCATTTGGTGACAAAACAAAAAGTTATAGCAATTTCAAATAGATAATTATTCA
128 GAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * *
10349 AATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAA
192 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
*** * * *
10414 TTTTCAAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAG-TTGATATGAACTA-AAATA
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTG-TATGAA-TAGAAACA
* * * *
10476 ATTTTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAA
318 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * **
10519 ATACTTATTCAAATAGTCATAACTATTTGATCTAGTTTGGTAAAC-AATTTATTTTTTAAAAT-T
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT
* * * * * ** *
10582 -TTGCTTATTAATTGTCGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAATAAATTTTTATG
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATG
** * * * * ** ** * * * **
10645 AATAGAAATTATTGTTTTGTAATAGAACAAAAAATTGTAACAATTTTAAATAAATAATTACTCAA
129 AAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *
10710 ATAGTCATAACTTTTTAAACTAGTTT-GATAAACAAATTTATTTTTAAAATC---CA-TTATTAA
193 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * * * * *
10770 TTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAATAAAAACATTT
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* * *
10835 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAA
321 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* *
10875 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTT-AGGTAAATAGAA-TTATTTTTTAAATC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-GTAAACA-AATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
10938 TCTTACATATTAATTTTTGAAATGTTAATAAATTTA-TTTTATTTTA-TTCTGAATAAGCTAGTA
64 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTA
* *
11001 TGAAGTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC--AA----A-AACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
127 TGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
11059 ATATAGTCTTAACTATTTGTACTAGTTT-GACAAACAAATTT-TGTTTTTAAATCTCTTAGTTAT
191 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGA-AAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTAT
** * * *
11122 TAATTTTTGGAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAT
253 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * *
11186 AATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTAT
317 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * ** * * *
11230 ACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACCAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * ** * * * *
11295 TTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAAACATATATGAT
66 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * * *
11360 TAAAAACAATTGTTATATGACCAAATAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTGAAAT
131 T-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * ** * * * * ** *
11425 GGCCATAATTATTTGACCTGATTCGGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTA
195 AGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* * **
11490 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TTAACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGT
259 TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* *
11554 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG
323 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * *
11592 ACAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTTGTTC-GTAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *** *
11653 TTGCTTATTAATTTTTGAATTATTAAGAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAA
66 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
* * ** * * * * *
11718 CTAAAACAAATTGTTTTATGTCAAAACAACTGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATAGTTTAAA
131 -TGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
11783 TAGTCATCACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCATTTCCTTTTTAAT
194 TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * *
11848 TTTTTGAATGTTAATAAATTTAG-ATTATTTTATTC-GAATAAACTTGTA-AAATATGAAACAAA
257 TTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAAT
* * * * *
11910 TATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAG
320 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * ** * * ** * *
11951 ATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTCGAATTGACTC-GACAAACACATTTATTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * ** * *
12015 CTTACTTATTAAATTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTT-TAACGAAATAAGTTTCTATG
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
12079 -ATCAGAAACAATTGTTTTATGATAAAAC-ATAGATCTTAACGATTTGAGATTA-ATAATTGTTT
129 AAT--GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTC
* * * *
12141 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
191 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * *
12206 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTGTG-ATAAAAAACA
255 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACA
*
12269 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAG
318 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * ** * ** * *
12312 ATAATCGTTCAAAT-GGCTATAATTATTTTAACTAATTCAATAAACTGATTTATTTTTTAAGTTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * ** *
12376 CTTACTTATT-ATTTTAGTAAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCATCTAAGCTTGTATT
65 CTTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * *
12440 AATTGAAACAAATGTTTTATGAGAAATCAAAAAGTTATAACGATTTTAAATTA-ACAATTGTTAA
129 AA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCA
* ** ** *
12504 AATAGTAATAACTATTCAAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTATTT-CTTATT
192 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGAAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-TTTACTTATT
* * * *
12568 AATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAA
254 AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* ** * *
12633 TTGTTTTATGACTAAACAAAATATCAGAACGATTTCAAATAG
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
12675 ATAATTGTTCTAATAATCTTAACCATTTGAACTGATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * *
12740 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATTTTA-ATCAGAATAAGCTTGTATGA
66 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGA
* * * * * *
12804 ATAAAACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAAAGGTCATAACGATTTGGAATAGATAATCGTTCATA
130 ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * ** * * *
12869 TAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAATTATATTTATTTTTTTAAT-TTTCCTAGTTATTAA
194 TAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTT--TACTTATTAA
* * * ** * * *
12933 GTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAATAGTATGAATAGGACCAATT
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* * * * * *
12998 ATTTGATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTAAAATAG
321 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * *
13038 ATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGCTT-AGCAAATAGATTTACTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * *
13102 CTTACTAATTAATTTTCTAAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTCGAACAAACTTATATT
65 CTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* *
13167 AA-GAAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
129 AATG--AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * ** * *
13231 ATATAGT-TTAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
191 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * * *
13295 ATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTATATAAACAGAAAACA
255 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACA
* * * *
13359 ATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAG
318 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* ** *
13402 AGAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTTATTTTTTAAA--T
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
13465 C-T-CTTATTAATTATTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTCTAT-A
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * * * *
13527 TTGAAAAGCAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGATAACAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAA
130 ATG-AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * * *
13592 ATGGCCATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAC
193 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * *
13657 TTTTGAAATATTAATACA--ACT-TTATTTTATT-TTAGATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAAT
257 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAAT
* *
13717 TG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAG
320 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* *
13757 ATAATTG-T----T-G----AAC-A---G----GTTTGA-TAAA-AAGATTTATTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * *
13802 CTTA--T--TAATTTTTGTAATATTAATATATTAGCATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * *
13863 ATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAC-------CA-AA-G----G---T-GAT-AGTGTTCAAA
130 AT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * *
13910 TAGTCATAATTATTAGAATTGGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
194 TAGTCATAACTATTTGAACTGTTTA-GAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * * * * * *
13975 TTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTACTTTATTTTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAAAAT
258 TTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATT
* * *
14039 -TTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAG
321 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * *
14078 ATAATTGGTCATATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGCAAACAAATTTAATTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * *
14143 TTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTATTAGATTACTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAA
66 TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-G
* * * *** * *
14207 ACAT-AAATAATTGTTTTTATGACAGAACAAAAGGT--TTATTTTTTTAAATA-ATTGATTTGAA
129 A-ATGAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-T-AATT---
* * * *
14268 GTAT-ACAATTGT--TCAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
187 GT-TCA-AATAGTCAT-AACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTA
* * * * * * *
14330 CTTATTAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAACCTTGTACG-ATAA
248 CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-A
* * * * * * *
14394 AAAACAATTCTTATATGACTAAACAAAAAGTAATAACAATTTGAAATAG
312 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
14443 ATAATTGTTGAGATGGCCATATCTATTTGAGCTTGTT-TGATAAAC--A-TT-TTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
14503 CTTGCTTATTAATTTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATA
65 CTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * *
14567 AACTGAAATAATTGTTTGT-TGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCT
129 AA-TGAAACAATTGTTT-TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
** * * * * *
14631 AATAGTTTTAATTATTTGAATTGGTTT-GGAAA-A-ACTCA---TTT--A--TTTT--TTATT-A
192 AATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * * * * * *
14683 ---TT--AA-ATTAGT--ATTA-TCTTAATCTGA--AT--AG--GCTTATATGAAAAGAAACAAT
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * *
14733 TGTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATAT
320 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * *
14773 ATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAACTAGTTC-GATAAACAAATTTAGTTTTT-AAT-A
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
** * * ** * *
14835 C-T-CTTATTAATTTTCAAAATCTTAATGAATCGGTATTATTTTA-TTCTGAATAA-TTCTGTAT
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCT-TGTAT
* * *
14896 GAACAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTTTTCA
128 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * * ** *
14961 AAT-GAACATGACTATTTGAATTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAGTCTCCTACCTATTA
192 AATAG-TCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * *
15025 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAACTTTTATGAATAGAAACAA
255 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * * *
15089 TTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAATAA
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * *
15131 ATAATTGTTCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTTGTTCAGTAAATAGATTCATATTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * ** * *
15196 TTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAA
66 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
* ** * *
15261 TTGATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAAC-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAGT
131 -TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
15325 AGTTATAACTATTAGAACT-TATTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATT
195 AGTCATAACTATTTGAACTGT-TT-AGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
***** * * * * * * *
15389 GGCAAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATAGT
258 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
** *
15454 TTTATGACAAAACAAAAAATCATAACGATTTGAAATAA
323 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* ** *
15492 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTATT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * *
15556 TTTACTAATTAGTTGTCT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATG
65 CTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * *** *
15620 AATAGAAAAAATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGTAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
129 AAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * *
15685 AGAGTCATAACTATTTGAACT-TAATCGATAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
193 ATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * * * *
15749 TTTTTGGAATATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTC-CAAGTCAGCTTGTACGAACAAAAACAA
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCTGAA-TAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * * *
15812 TTGTTTTGTAAC-AAACAAAAGGTTATAAC-ACTTTGAAACAG
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAG
* * * * * ** * *
15853 ATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTTGTATTGG-TCAGGCCAACAGATTCATTTTTTAAATC-
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * *
15916 CGTTACTTGTTAATTTTT-AGGATATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTCGAATAAGATAGTAT
65 C-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
15980 CAATAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAACGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCA
128 GAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
16045 AATTGTTATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATC---T-CTTATTAA
192 AATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
** * * * * * ** * *
16106 TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAGCAAAAACATTT
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* * *
16171 GTTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAATGGTTTGAAATAG
321 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * ** *
16211 ATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAA-AAATTTGTTTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * * *
16275 TTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTGTATTCCGAATAAGCTTGTATGA
66 TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-
* * * *
16339 ACAT-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAA
129 A-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
** * * **
16403 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCT-GTGAGCATATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAA
193 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-TAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * * * *
16466 -TTTTGAAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCAGAATAGGCTTGTATGATAAAAAAAACAA
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATG--AATAGAAACAA
* *
16530 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAAGATTTGAAATAG
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * **
16572 ATAATTGTTCAAAT-GGCAATAATTATTTGAACTGCTTCAATAAACTGATTTATTTTTTTAAATC
1 ATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATC
* * * * *** * *
16636 T-TTAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAGGCTTTTAT
64 TCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * *
16700 GAATTAAAACAAATGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCA
128 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* *
16765 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT-GATAAACATATTTATTTCTTTAAA-CTTCTTGCTTAT
192 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGA-AAACAGATTTATTT-TTTAAATCTT-TTACTTAT
* * * *
16828 TAATTTTTTGAATGTTAATACAA-GAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCATGTATGAACT-GAA
253 TAATTTTTGGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
* ** * *
16890 ACAATTATTTTATGATTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAG
315 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * *
16936 ATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTCAATTGGTTCAGTAAACACATTGATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * ** * * *
17001 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTTT-GAATAAGCTTGTATGA
66 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * *
17065 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCCTAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAA
130 AT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
17129 TAGTCATAACTATTTGAACTAATTTTGTATACAAATTTA-GTTTTAAATC---T-CTTATTAATT
194 TAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * ** * * *
17189 TTT-GAAAATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTAT
258 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGT
* * *
17253 TTTATGACAAAATAAAATGTCATAACGATTTCAAATAG
323 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * ** * *
17291 ATAATAGTTCAAATGGACATGACTGTTTAAATTTATTC-GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
** * * * *
17355 CCAAATTATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * ** * *
17420 ATAGAAACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGATTATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAA
130 AT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * ** * * *
17485 TAATCATAACTATTTGAACTCGCTCGGTAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
194 TAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-T
** * *
17549 TTTTGGAAGT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATGAACA-AAATCAAT
257 TTTTGGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAAT
* * *
17612 GGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAG
320 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * **
17653 ATTATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTAAAAAT-T
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
17716 TTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTTA-TTCGGAATAAGCTTGCAT
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT
** * * * * *
17779 GAACAAAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTTA
128 GAATGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * *
17844 GATAGTCAAAACTATTTGAACTTTTTTAGTAAATAGA-TTCTTTTTTAATTCTTTTACTCATTAA
192 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * **
17908 TTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAGTTC--AAGCAAACTTACATGAACT-GAAACA
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAA-TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACA
* * * *
17970 ATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAAGGTCATTATGATTTGAAATAG
318 ATTGTTTTATGAC-AAA-ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
18015 ATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTCTGTAAACATATTTATTTTTTAAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT
* * * * * *
18080 TTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAAACTTGTATGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * ** *
18145 ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAATAATCGCACATA
130 AT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* *
18210 TAGTCATAA-TGATTTGAACT-TATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
194 TAGTCATAACT-ATTTGAACTGT-TT-AGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * * * *
18273 TTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTT-TT-TAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAA
256 TT-T-TTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * * * *
18334 TTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAG
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
18376 ATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACAT-GTTCAATAAACAGATTCATTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * *
18440 CTTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAGCTTATATG
65 C-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * *
18504 AACTGGAACAATTCTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAA
129 AA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * ** ** * * *
18569 ATAATCATGATTATTTGATTTAGTTCGGCAAACATATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAAT
193 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * * * *
18633 TGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTAATCTGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTG
257 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * * *
18698 TTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAA
322 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
18737 ATGATTGCTCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTT-TGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--T
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * ** * * * * * *
18799 CTT--TGATTAATATTCAAAATATTAATAGAATT-GTATTACTTTATTCCGAACAAACTTATATG
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
** * * * * * *
18861 AACAAAAACATTTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTTAA
129 AA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * **
18926 ATAGTCATAATTATTTGAACTAG-TTAGGTAAATAAAATTATTTTTTAAATCACTTACTTATTAA
193 ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTA-GAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
* * ** ** * *
18990 TTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAGCTAATATGAATTAAAAAAAA
256 TTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAA
* * * *
19054 CATATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
319 -TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * ** * * *
19097 ATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAATTCGGAAAAC-AA-TT-TTTTTTAATTCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * ** * *
19159 TTAGTTATTAATTTTTGGAATATTGTTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA
66 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
** * * * * * * ** *
19224 CAAAAATAATTGTTTTATAACAATACAAAAGGTTATAAGGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAAT
131 -TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
19289 AGTTATAACTATTTGAGA-TAGTTTGGTAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATT
195 AGTCATAACTATTTGA-ACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * ** * ** * *
19353 TTTGAAAGATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAAT-TTTCA-AATATAACT
258 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATT
* * * *
19416 GTTATATGACCAAAA-AAAGGGTAATATCGATTTGAAATAG
321 GTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
*** * * ** * * ** *
19456 ATAATTGTTGGCAT-GGCTATAATTATTTGAACTAATTCGGTAAATAGGTTTACTTTTTAAA--T
1 ATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
** * * **
19518 C--ACTTATTAATTTTCAAAACATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * ** *
19581 ACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAGATAGCTGTTCATA
130 A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * * * * *
19646 TAGTCTTAATTGTTTGAATTGCTTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTGTTAATT
194 TAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
* * * * * *
19711 TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTTATATGAACTA-CAACAATTA
258 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
* *
19775 TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAG
322 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
** ** * *
19814 ATAATTGTTCAAATAG------------GAGTTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *
19867 TTACTTTTTAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCTGAATAGGCTTGTATG-
66 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA
* * * ** *
19929 ATGAAAAACAATTATTTTATAACAAAA-AAAAGTTTGTAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
130 ATG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * ** * * * *
19993 ATGAG-CTAAAATTATTTGAACCAATTCA-ATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTAT
193 AT-AGTC-ATAACTATTTGAA-CTGTTTAGA-AAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * *
20055 TAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATT-TCGGATAAGCATT-TATGAACT-GAA
253 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGC-TTGTATGAA-TAGAA
* * *** *
20117 ACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATATTTATAAT-AAATAG
315 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT-TTGAAATAG
* * * * *
20163 ATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT
* ** * * * * **
20228 GTTGTTTATTAATTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCATGCGTGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * ** * * * *
20292 ACTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAAAATCATGATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAA
130 A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * ** * *
20356 TAGTCTTAA-TCAATTGAATTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATC---TA-TTATTAAT
194 TAGTCATAACT-ATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
* * * * * * * *
20416 TTTTAGAATACTATTAATTTAGCAATAATTTA--CTGCAAATAAGCTTGTATGAATATAAACAAT
257 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG--AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * *
20479 TGTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATACCGTTTTGAGATAG
320 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
** * * * * *
20519 ATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTAGAAC-GAGTTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
** * ** ** **
20583 CTT-C---TTAATTTTCAAAATATTGATAAATTTTTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * *
20644 ATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATAGCTCAAA
130 AT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * ** ** * * ***
20709 TGGAT-ATGACTATTTGTACTTGTTCGGTGAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAA-
194 TAG-TCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAAT
** * * * **
20772 TTTAAGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTACATGAATAGAAACAATTG
257 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* ** *
20837 TTTCATGACAAAAC-AAAGGATCATAGTGATTTGAAATAA
322 TTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAAATAG
* * * * *
20876 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGGACTCGCTT--GCT-AACTAGATTTACTTTTTAAAT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCAG-TAAAC-AAATTTATTTTTTAAAT
* * * *
20938 CTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTAT
63 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * *
21003 GAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCA
128 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
21068 AACAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAAAACATAGTCATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATT
192 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-TAGAAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATT
* ** ** *
21132 GATTTTTCAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTACATGAATAGAATC
254 AATTTTTGGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * *
21195 AATTATTTTATGACAAAAC-AAATGTCATAATGTTTTGAAATAG
317 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
21238 ATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTTAAACAT-GTTCAATAAACAAATTCATTTTTTTATTCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * *
21302 CTTACTCATTATTTTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * * * *
21367 ACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAA
130 A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * *
21432 TAGTTAGAACTATTTGAACTTGTTT-GAAAAACATATTT-TTTACTTAAATCTTTTACTTAATAA
194 TAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAG-AAAACAGATTTATTT-TTTAAATCTTTTACTTATTAA
* *** * * *
21495 TTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTGTAATT-TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAAT
256 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT-TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
*
21559 TGTTTTATGACAAAACAGAAA-GTCATAA-GAATTTGAAATAA
320 TGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAG
* * * ** * * * *
21600 ATAATTATTCAAATAGTCATAA-GATTTGAGCTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATGTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * ** *
21664 TTACATATTAAGTATCTTT---ATATTAATAAGTTTTTATTATTTTA-TTCACAATAAACTTGTA
66 TTACTTATTAA-T-T-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTA
** * ** * * * * * * * *
21725 TGAACAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAAAAGAAAATTATTG
127 TGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * *
21790 GAATAGTCATAATTATTT-AA-AGTTGCTCGACAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
191 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTT--TAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
** * *
21853 TAATTTTTTTTAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-----T---T------
253 TAA-TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * *
21904 -A------TATGACAAAACAAAAGGCCATAATGGTTTGAAATAA
317 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
21941 ATAATTATTCAAATAGTCATTACTATTT-AATTTAGTTCAATAAACATATTTA-TTTTAAAACTT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA-TC
* * * *
22004 TTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTAT
64 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
22068 GAACAT-AAACAGTTGTTTTATAATAAAACAACAA-GTTATAACTATTTGAAATAAATAATTGCT
128 G-A-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * *
22131 CAAATAGTCATAACTATTTTAACTCATTTCA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTAT
190 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTT-AGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
*** * ** * * * * * *
22191 TAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAATA
253 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* * *
22256 TTTGTTTTATGACAAAACAAAAGAT-ATAACTATTTGAAATAG
318 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * ** * * *
22298 ACAATTGTTGAAATAGTCATAGTTATTTGAACTGGTT-AGGTAAATAGAGTTATTTTTTAAATCT
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * *
22362 CTT-GTTA--AA-TTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATA
65 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * *
22421 AATTCAAAAAAACTTATTTTATG-CTAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
129 AA-T-GAAACAA-TTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* ** * * * * * * *
22485 CATATAGTTTTAAATATTTGAACTGGTTT-GACAAAGAAATTTATTTTCTAATTCTCTTAGTTAT
190 CAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT
* * * * * * * *
22549 TAATTTTTAGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAACAAAAATA
253 TAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* * * * * * **
22614 ATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAGTTT
318 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* *
22657 ACAATTGTTCAAATAGT--T-ACGTATTTGAACTAGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * *
22718 TCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGAATG
64 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * **
22783 -ATAAAAAAAATTGTTATATGACGAAACCAAAGGCCATAA-TTTTTGATAAATAGATAATTGTTC
129 AAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG--AAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * * * * *
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191 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
* * * ** * *
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255 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAA
* * * * * *
22975 TTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTCAAATAG
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
* * *
23017 ATAATTG-TCTAAATA---A-AA--A-TT--A---GTTC-GATAAATAGATTTATTTATTAAATC
1 ATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
23068 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTAATTCCGAATAGGCTTGTATG
64 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * * *
23133 -ATGAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAATAAAAGTTTATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTTA
129 AATG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * *
23197 AATGGCCATAATTATTTAAAGC-GATTCGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATC-TTTATCTT-T
192 AATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGA-AAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTTAT
** * ** * *
23258 TCAATTTTTTAAATATTGATAAAGCAATATTATTTTATT-TCACATAAGCTT-TATGAACT-GAA
253 T-AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
* ** * * * * *
23320 AAAATCATTCTATGATAAAACAAAAGGTCAT-AC-TTCTTATAAATAT
315 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT-TT-GAAATAG
* ** *
23366 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTTGTAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-T
1 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCT
* * * * *
23430 GTTTATTTATTAACTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAGCATGTAT
65 -CTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
23494 GAACTGAAAAAATTATTTTATGACTAAACAAAATGTTAGAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTC
128 GAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * ** * * *
23558 TAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGCTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
191 AAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
** * * * *
23623 ATTTTTAAAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
255 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * *
23687 TTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACAATTTGAGATAG
319 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
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Consensus pattern (360 bp):
ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
GTCATAACTATTTGAACTGTTTAGAAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG
Found at i:9000 original size:17 final size:17
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.5 Consensus size: 17
8956 AATCTCTTAC
8966 TTATTAATTTTTAGAATA
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9009 CGAATAAGCT
Statistics
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TTATTAATTTTTAAATA
Found at i:10350 original size:16 final size:17
Alignment explanation
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10363 TT
1 TT
10365 TAAACTTGTT
Statistics
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TTCAAATAGCATAATTA
Found at i:13999 original size:158 final size:154
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Indices: 13629--14000 Score: 369
Period size: 158 Copynumber: 2.4 Consensus size: 154
13619 GTAAACTGAT
* * ** * *
13629 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATACAACTTTATTTTATTTTAGAT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AA-TTCATTTTATTCCAAAC
* *
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* * *
13759 AATTGTTGAACAGGTTTGATAAAAAGAT
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* *
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1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT--C---ATTTTATTCCA
* * * * *
13848 AACAAACTTATATGAA-TAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACCAAAGGTGAT-AGTGTTCAAAT
61 AACAAACTTATATGAACT-AAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAT-TTAAAAT
** * *
13911 AGTCATAATTATTAGAATTGGTTAGGTAAATAGAA
123 AG--ATAATTATT-GAACAGGTTAGATAAAAAGAA
13946 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTA
14001 CTTTATTTTG
Statistics
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Consensus pattern (154 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTCCAAACAA
ACTTATATGAACTAAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAATTTAAAATAGATAATT
ATTGAACAGGTTAGATAAAAAGAA
Found at i:14045 original size:163 final size:155
Alignment explanation
Indices: 13629--14083 Score: 408
Period size: 163 Copynumber: 2.8 Consensus size: 155
13619 GTAAACTGAT
*
13629 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATACAA--C-TTTATTTTATTTTA
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-AATTCATTTATTTTATTTTA
* *
13691 GATAAGCTTTTATGAACT-AAAACAATTGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAAT
65 -ATAAGC-TATATGAA-TAAAAAAAATT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-A-AATTTAAAAT
* * *
13755 AGATAATTGTTGAACAGGTTTGATAAAAAGAT
124 AGATAATTATTGAACAGGTTAGATAAAAAGAA
* * *
13787 TTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGTAATATTAATATATTAGCA-TTATTTTATTCC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT--CATTTATTTTATT-T
* * * ** * * * *
13847 AAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACCAAAGGTGAT-AGTGTTCAAAT
63 TAATAAGC-TATATGAATAAAAA-AAAT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAAT-TTAAAAT
** * *
13911 AGTCATAATTATTAGAATTGGTTAGGTAAATAGAA
124 AG--ATAATTATT-GAACAGGTTAGATAAAAAGAA
*
13946 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTACTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTATTTTATTTT-
*
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124 AGATAATT
14084 GGTCATATAG
Statistics
Matches: 235, Mismatches: 36, Indels: 47
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (155 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTATTTTATTTTAA
TAAGCTATATGAATAAAAAAAATTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAATTTAAAATAGATAAT
TATTGAACAGGTTAGATAAAAAGAA
Found at i:14649 original size:177 final size:177
Alignment explanation
Indices: 13944--14659 Score: 542
Period size: 177 Copynumber: 4.0 Consensus size: 177
13934 AGGTAAATAG
* *
13944 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTACTTTATT
1 AATT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT
** * * * * * * * * *
14008 TTGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAAAATT-TTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTA
64 TCAAATAAGCTTGTATAAACT---AAATAATTGTTTATGACTAAACAAAAGGTTATAACGATTTG
* * * *
14072 AAATAGATAATTGGTC-ATATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTCGGCAAAC
126 AAATAGATAATTGTTCTATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC
* * * * *
14123 AAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTATTAGATTACTATTATTTTA
1 -AATTT--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
***
14187 TTTCAAATAAGCTTGTATAAACATAAATAATTGTTTTTATGAC-AGAACAAAAGGTT-T-ATTTT
62 TTTCAAATAAGCTTGTATAAAC-TAAATAATTG--TTTATGACTA-AACAAAAGGTTATAACGAT
* * *** * * *
14249 TTTAAATA-ATTGATTTGAAGTATACAATTGTTCAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC
123 TTGAAATAGA-T-AATTGTTCTATA-TAGTCTT-AACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC
* *
14307 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATCAATTAGTATTATTTTAT
1 A-A-TT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * * * *
14372 TTTGAACAACCTTGTACGATAAA--AAACAATTCTTATATGACTAAACAAAAAGTAATAACAATT
63 TTCAAATAAGCTTGT---ATAAACTAAATAATTGTT-TATGACTAAACAAAAGGTTATAACGATT
* * * * * * * * *
14435 TGAAATAGATAATTGTT-GAGATGGCCATATCTATTTGAGCTTGTTTGATAAAC
124 TGAAATAGATAATTGTTCTATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC
* * *
14488 -ATTTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
1 AATTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* *
14551 CAAATAAGCTTGTATAAACTGAAATAATTGTTTGTTGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTGAA
65 CAAATAAGCTTGTATAAACT-AAATAATTGTTT-ATGACTAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAA
* * *
14616 ATAGATAATTGTTCTA-ATAGTTTTAATTATTTGAATTGGTTTGG
128 ATAGATAATTGTTCTATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGG
14660 AAAAACTCAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AATTTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
AAATAAGCTTGTATAAACTAAATAATTGTTTATGACTAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATA
GATAATTGTTCTATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC
Found at i:18937 original size:18 final size:20
Alignment explanation
Indices: 18894--18949 Score: 61
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18884 AAAATAAAAG
18894 GTCATAA-TGATTTGAAATA
1 GTCATAATTGATTTGAAATA
18913 -T-ATAATTG-TTT-AAATA
1 GTCATAATTGATTTGAAATA
*
18929 GTCATAATT-ATTTGAACTA
1 GTCATAATTGATTTGAAATA
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1 GT
18950 TAGGTAAATA
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 1, Indels: 10
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (20 bp):
GTCATAATTGATTTGAAATA
Found at i:22665 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 22010--23735 Score: 1141
Period size: 181 Copynumber: 9.7 Consensus size: 179
22000 ACTTTTTTAC
* * **
22010 TTATTAATTATT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAT
1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-
* * * * * *
22074 AAACAGTTGTTTTATAATAAAACAACAAGTTATAACTATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGT
64 AAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
22139 CATAACTATTTTAACTCATTTCATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC----
128 CTTAATTATTTGAACTCGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * * * *
22187 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * * * *
22252 AATATTTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATATAACTATTTGAAATAGACAATTGTTGAAATAGTC
66 AA-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
22316 ATAGTTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAGTTATTTTTTAAATCTCTT-G
129 TTAATTATTTGAACTCGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * *
22366 TTA--AATTTTGA-AATATTAATAAATTCA-T-TTATTTTATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTC
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAA--C
* * * * * *
22426 AAAAAAACTTATTTTATGCTAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATA
63 AAAAAAA-TTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
22491 GTTTTAAATATTTGAACTGGTTTGACAAAGAAATTTATTTTCTAATTCTCTTAG
126 GTCTTAATTATTTGAACTCGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * *** *
22545 TTATTAATTTTTAGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGATTGTATGAACAAA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAAA
* * ** *
22610 AATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAG--
66 AA-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** * * * * *
22673 TTACGTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
129 TTAATTATTTGAACTCGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * *
22724 TTATTAATTTTT-GAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTGAATGATA-A
1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGA-ACA
* ** * * ** * *
22787 AAAAAATTGTTATATGACGAAACCAAAGGCCATAATTTTTGATAAATAGATAATTGTTCATATAG
64 AAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAATATTTG--AAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
22852 TCTTAATTATTTGAAC-CATTTCGA-CAAGCAGATTTGTTTTTTAAATCTCTTAA
127 TCTTAATTATTTGAACTCGTTT-GATAAAG-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * * * * *
22905 TTATCAATTTTTGGAATATTATTAAGTTAGTGTTATTTTATTCCAAAAAAGCTTATATGAACTAA
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-AA
* * * * * * *
22970 AACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTATAATGATTTCAAATAGATAATTG-TCTAAATA--
65 AAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGT
* * * * *
23032 ---AA--AATT--A---GTTCGATAAATAGATTTATTTATTAAATCTCTTAC
128 CTTAATTATTTGAACTCGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * * **
23074 TTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTACTATTATTTAATTCCGAATAGGCTTGTATGATGAA
1 TTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACAA
* * * * * * *
23138 AAACAATTGTTTTAAGACAAAA-TAAAAGTTTATAACGATTTGAAATTGATAATTGTTTAAATGG
65 AAA-AATTGTTTTATGATAAAACAAAAAG-TTATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * *
23202 CCATAATTATTT-AAAGCGATTCGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCT-TTA-
127 TCTTAATTATTTGAACTCG-TTTGATAAA-GAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * ** * * *
23253 TCTTTTCAATTTTTTA-AATATTGATAAAGCAATATTATTTTATTTCACATAAGCTT-TATGAAC
1 T-TATT-AA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC
* ** * * * * * *
23316 TGAAAAAATCATTCTATGATAAAACAAAAGGTCATACT-TCTTATAAATATATAATTGTTCAAAT
63 -AAAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAATAT-TT-GAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
23380 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTTG-TAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TGTTTAT
125 AGTCTTAATTATTTGAACTCG-TTTGATAAAGAGATTTATTTTTT-AAATCT-CTTAG
* * * * *
23436 TTATTAACTTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAGCATGTATGAACTG
1 TTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-A
* * * * * *
23500 AAAAAATTATTTTATGACT-AAACAAAATGTTAGAACATTTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
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* * * * ** * * *
23564 TCTTAACTATTTGAACTAGCTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
127 TCTTAATTATTTGAACTCGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
* * * * * * *
23617 TTATTAATTTTTAAAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTT-CGAATAAGCTTGTATGAATAG
1 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-
* * * * * *
23681 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAACAATTTGAGATAGATAATTGT
64 AAAAAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTTATAA-TATTTGAAATAGATAATTGT
23736 ATTATTGATA
Statistics
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AATTATTTGAACTCGTTTGATAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAG
Found at i:23526 original size:531 final size:528
Alignment explanation
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14981 TTTATTTGGT
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** * * * * ** * *
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* * * * ** ***
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* ** * * ** * ** * *
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* * * * * ** * * *
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* * * ***** * * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* * * *
15500 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTA-TTTGAT
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* * * * * * **
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* * **
15598 TTAATT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTTTGTGACAAAACAAAAGGTTATAGT
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* ** * * * * * *
15661 AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTTA-ATCGATAAACAGA-TTC
123 GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAAC-GAGTTCGATAAACAAACTT-
* * * ** *
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* * * * ** * * * ** **
15788 GTCAGCTTGTACGA-ACAAAAACAATTGTTTTGTAAC-AAACAAAAGGTTATAACACTT--TGAA
248 ATAAGCTTGAATGATA-AAAAA-AATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAATTCTTGAT-AA
* * * * * * *
15849 ACAGATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTTG---TATTGGTCAGGCCAA-CAGATTCATTTTT
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
16136 TTATTTTGAACAAACTTATATGAGCAAAAACATTTGTTTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAATGG
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* * * * * ** * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * ** * **
16328 AGCTTGTATGA-ACATAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGAT-TTG--AAAT
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* * * ** *
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* * * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * * *
16578 -GTTCAAATGGCAATAATTATTTGAACT-GCTTCAAT
501 AG-TCTAAT---ATTAA-CA--T-AACTAGC-TCGAC
** * * * * *
16613 AAACTGATTTATTTTTTTAAATCT-TTAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTA
1 AAACACATTTA--TTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAATTACTATTA
* * * * * * * *
16677 TTTTATTTTGGATAGGCTTTTATGAATTAAAACAAATGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAAC
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* * * * * ** * * *
16742 AATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACATATTTAT
123 GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAACGAGTTCGATAAACAAACTTAT
* * * * *
16807 TTCTTTAAA-CTTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATG-TTAATACAAG-AGTATTATTTTATTTCG
186 TT-TTTAAATC-TCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAGATTAATA-AAGCAATATTATTTTATTCCA
* * * * * * ** * *
16869 AATAAGCATGTATGA-ACTGAAACAATTATTTTATGATTAAACAAAAGGTCAGAATGAT-TTG--
247 AATAAGCTTGAATGATA--AAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAAT--TCTTGAT
* * * **** * *
16930 AAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTCAATTGGTTCAGTA-AA-CACATTGATTTTT
308 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCATTTC-G-ACAAGCAGATTTATTTTT
* * ** * ** * * ** *
16993 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTT-TGAATAAGC
371 TAAATCTCTTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAAAAAGC
* * * * * * ** * *
17057 TTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCCTA-ATGA-TTTGAGATAGAT
435 ATATATGAACTA-AAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGT--TAGAACATTTTCAAATAGAT
* ** * *
17118 AATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTTG-T
497 AATTAG-TCTAATA-T--TAAC-A--T-AACT-AGCTCGAC
* * * * *
17157 ATACAAATTTAGTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAGTATTATTT
1 AAACACATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAATTACTATTA-TT
* * ** * * *
17217 TATTTTGAATAATTTTGCATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAATGTCATAACGAT
64 TAATTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAA-GTTATAACGAT
* * * * * * * ** * * *
17282 TTCAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTGTTTAAATTTA-TTCGATAAATAGATTTATTT
126 TTGAAATTGATAATTGTTCAAAT--AGATAAGTATTTAAA-CGAGTTCGATAAACAAACTTATTT
** * * * ** * * *
17346 TTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA
188 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAATAAG
* * * * * * *** *
17411 CTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACGAAACAAAAGATTATAATAAT-TTG--AAATAAA
253 CTTGAATG-ATAAAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAAT--TCTTGATAAATAGA
* * ** ** ** * *
17473 TAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTC-GCTCGGTAAATAAATTTA-TTTTTAAATCTT
315 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-CATTTCGACAAGCAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
17536 TTACTTATTAATTTTTTGGAAGT-TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTATG
379 TTAATTATCAA-TTTTTGGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATATATG
*** * * * * * * *
17600 AAC-AAAATCAATGGGTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGA-TTTGAAATAGATTATT-GTT
442 AACTAAAA-CAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAAC-ATTTTCAAATAGATAATTAG-T
* * *
17662 CAAATAATCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGA-
504 CTAAT-AT--TAAC-A--T-AACT-AGCTC-GAC
* * * * * * * *
17694 AAATAGATTTATTTTAAAAAT-TTTTACTTACTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTAT
1 AAACACATTTATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAA-TTACTATTAT
* * * * *
17757 TTTATTCGGAATAAGCTTGCATGA-ACAAAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAAT
63 TTAATTC-GAATAAGCTTGTATGATA-AAAA-CAATTGTTTTATGA-CAAA-AAAAAGTTATAAC
* * * * * * * ** ** * * *
17821 GTTTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCAAAACTATTTGAAC-TTTTTTAGTAAATAGA-TTC
123 GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAACGAGTTCGA-TAAACAAACTTA
* * * * * * ** * *
17884 TTTTTTAATTCTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTAGTT-CAAG
185 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTA-TTCCAAA
* * * * ** * * * * *
17948 CAAACTT-ACATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAAGAAAAAAGGTCATTATGAT-TTG-
249 TAAGCTTGA-ATGATA--AAAAAAATCATTATATGAC-AAA-ACAAAAGGCCATAAT--TCTTGA
* * * *
18009 -AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-CTTGTTCTGTA-AA-CATATTTATTT
307 TAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCAT-TTC-G-ACAAGCAGATTTATTT
* * * * * * *
18070 TTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCGAATAA
369 TTT-AAATCTCTTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCC-AAAAA
* * * * * * * * ** * *
18135 A-CTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAGTTGAAATAAA
432 AGCATATATGAACTA-AAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAACATTTTCAAATAGA
* * * * *
18198 TAA-TCG-CACATATAGTCATAATGATTTGAACTTA-TTC-AGT
496 TAATTAGTC-TA-ATA-T--TAA-CA--T-AAC-TAGCTCGA-C
* * * **
18238 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTAT
1 AAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAAATATTATTAAATTACTATTAT
* ** * * * * *
18302 TT-TTTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAGCGA
63 TTAATTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAA-GTTATAACGA
* * * * *
18366 TTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAAC-ATGTTCAATAAACAGA-TTCAT
125 TTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAACGA-GTTCGATAAACAAACTT-AT
* ** ** * *
18429 TTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGGATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCCAAT
186 TTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAAT
** * * * * * *
18493 AAGCTT-ATATGAACTGGAACAATTC-TTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGAT-TTG--AA
250 AAGCTTGA-ATG-A-TAAAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAA--TTCTTGATAA
* * * * * *** * * * * *
18553 ATAAATAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGATTTAGTTCGGCAAACATATTTATTTTTAAAA
310 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCATTTCGACAAGCAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * * * ** * * *
18618 T-TTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTAATCTGAATAAGCTTGTA
375 TCTCTTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATATA
* * * * * * * * * * *
18682 TAAACAAAAACAATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGA-TTTGAAATAAATGATT-GC
440 TGAACTAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAAC-ATTTTCAAATAGATAATTAG-
* * * *
18745 TCAAATAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTTGAT
503 TCTAATA---TTAAC-A--T-AACTAGCTCGAC
* * * ** * *
18778 AAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TGATTAATATTCAAAATATTAATAGAATT-GTATTAC
1 AAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTAAATATTATTA-AATTACTATTA-
* * * * * * * *
18838 TTT-ATTCCGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAAT
62 TTTAATT-CGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAA-GTTATAAC
* * * * * * * *
18902 GATTTGAAATAT-ATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTAGGTAAATAAAATTA
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* * * *
18966 TTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTC-ATTTTATTTTATTCCAAA
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* * * * *
19030 TAAGC-TAATATGAATTAAAAAAAA-CATATTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACAAT-TTG-
249 TAAGCTTGA-ATG-A-TAAAAAAAATC--ATTATATGACAAAACAAAAGGCCAT-A-ATTCTTGA
* * * * * *
19091 -AAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTAATTCGGA-AAACA-A-TT-TTTTT
307 TAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCATTTC-GACAAGCAGATTTATTTTT
* * * ** * * * * *
19151 TAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTGTTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT
371 TAAATCTCTTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCA
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* * * **
19279 TT-GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGA-TAGTTTGGT
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* ** * * * * *
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* * * ** * * * * * * *
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* *** * * * * * * * *** *
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** * ** * ***
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* * * * * * *
19572 CTTGTATGA-ACTGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCTTAATGAT-TTG--AAATAG
253 CTTGAATGATA--AAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAAT--TCTTGATAAATAG
** * * * * **** * * *
19633 ATAGCTGTTCATATAGTCTTAATTGTTTGAATTGCTTCGATAAACAGATTAATTTTTTAAATCTC
314 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCATTTCGACAAGCAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * ** * **
19698 TTAGTTGTTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTTATATGAA
379 TTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATATATGAA
* * * * * *
19763 CTACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATT-GT-TCAA
444 CTAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAACATTTTCAAATAGATAATTAGTCT-AA
** * * * **
19826 -A-TAGGAGT---TGGTTTGGT
508 TATTAACA-TAACTAGCTCGAC
* * * * *
19843 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTTTTAATTTTTGAAA-ATTAATAAATTAATATTATT
1 AAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAATTACTATTATT
* * * * * *
19907 TTATTCTGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTATTTTATAACAAAAAAAAGTTTGTAACAAT
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* * * * * * * *
19972 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATGAGCTAAAATTATTTGAACCAATTCAATAAACTAACTTATTT
126 TTGAAATTGATAATTGTTCAAAT-AG--ATAAGTATTTAAACGAGTTCGATAAACAAACTTATTT
* * * * **
20037 TTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCGGATAAG
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* * * * * * * *
20102 CATT-TATGA-ACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCAT-ATT-TATAATAAATAG
253 C-TTGAATGATA--AAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAATTCT-TGATAAATAG
* * ** * * *
20163 ATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAA-CTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATT
314 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCAT-TTCGACAAGCAGATTTATTTTTT-AAATC
* ** * * * * * * ***
20227 TGTTGTTTATTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCATGCGTG
377 TCTTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATATATG
* ** * ** *
20291 AACTGAAAA-AATTATTTTATGACTA-AACAAAAAATCATGATGA-TTTGAAATAGATAATTA-T
442 AACT-AAAACAATTATTTTATAAC-AGAACAAAAGGTTA-GAACATTTTCAAATAGATAATTAGT
* * * * *
20352 TTAATAGTCTTAATCAATTGAATTGGTTCGGC
504 CTAATA---TTAA-C-A-T-AACTAGCTCGAC
* * * *
20384 AAACACATTTATTTTTTAAA--TC-TA-TTATTAATTTTTAGAATACTATTAATTTAGCAATAAT
1 AAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTATTAAATTA-CTATTAT
* * * * * * * *
20445 TTACTGCAAATAAGCTTGTATGAATATAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAATCATACCGTT
63 TTAATTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGTTATAACGAT
* * * * * * * * *
20510 TTGAGATAGATAATTGTTCAAATAACCATAACTA-TTAGAACGAGTTCAATAAATAGATTTAGTT
126 TTGAAATTGATAATTGTTCAAAT-A-GATAAGTATTTA-AACGAGTTCGATAAACAAACTTATTT
** * * **** *** *
20574 TTTAAATCTCTT-C---TTAATTTTCAAAATATTGATAAATTTTTATTATTTTATTTTGAATAAT
188 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAATAAG
* * * * ** * * * **
20635 TTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAATGAT-TTG--AAATAGA
253 CTTGAATG-ATAAAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAAT--TCTTGATAAATAGA
* * * * * * ** * *
20697 TAATAGCTCAAATGGAT-ATGACTATTTGTA-CTTGTTCGGTGAA-TAAATTTATTTTTTAAATC
315 TAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACCAT-TTC-GACAAGCAGATTTATTTTTTAAATC
* * ** * ** * * *
20759 TC-CAACTTATTAA-TTTAAGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAA-CTTACA
377 TCTTAA-TTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCAAAAAAGCATATA
* * * * ** * *
20821 TGAA-TAGAAACAATTGTTTCATGACAAAAC-AAAGGATCATAG-TGA-TTTGAAATAAATAATT
440 TGAACTA-AAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGG-T--TAGAACATTTTCAAATAGATAATT
* * * * *
20882 ATTCAAATAGTCATAACTATTTGGACTCGCTTG-C
501 AGTCTAATA-T--TAAC-A--T-AACTAGCTCGAC
* * * * * *
20916 TAACTAGATTTACTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTAT
1 AAAC-ACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAATTACTATTAT
* * * * *
20981 TTTATTCCAAATAAGCTTTTATGA-ACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
63 TTAATT-CGAATAAGCTTGTATGATA-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAA-GTTATAAC
* * * * * * * * * * * *
21045 AATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAAAACATAGTCA
123 GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAACGAGTTC-GATAAACAAACTTA
* * * * *** **
21110 TTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTGATTTTTCAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAA
185 TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAA
* ** * * * * *
21174 TAAGCTT-ACATGAATAGAATCAATTATTTTATGACAAAAC-AAATGTCATAATGTTTTG--AAA
249 TAAGCTTGA-ATG-ATAAAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAAT-TCTTGATAAA
* * * * * * * * * * *
21235 TAGATAATTATTTAGATAGTCATAACTATTT-AAACATGTTCAATAAACAAATTCATTTTTTTAT
311 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCAT-TTCGACAAGCAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * * * *
21299 TCTCTTACTCATTATTTTTTGGAATATTAATAAATTGGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATA
375 TCTCTTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATATA
* * * * * * * * *
21364 TGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCACAATGA-TTTAAAATAGATAATTATT
440 TGAACTAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAA-CATTTTCAAATAGATAATTAGT
* * * * *
21428 CAAATAGTTAGAACTATTTGAACTTGTTTGAA
504 CTAATA-TT--AAC-A--T-AACTAGCTCGAC
* * * ** * *
21460 AAACATATTT-TTTACTTAAATCTTTTACTTAATAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAT
1 AAACACATTTATTT--TTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTATTAAATTACTATTAT
* *
21524 TGTAATTTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAGAAAGTCATAA-
63 T-TAATTCGAATAAGCTTGTATGATA-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-A-AAAGTTATAAC
** * * * * * * *
21587 GAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAG-ATTTGAGCTTA-TTC-AGTAAATAGATT
123 G-ATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAAC-GAGTTCGA-TAAACAAACT
* * * * ***
21649 TATTTTTTAAATGTTTTACATATTAAGTATCTTT---ATATTAAT-AAGTTTTTATTATTTTATT
183 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-T-T-TTTGAAAGATTAATAAAG-CAATATTATTTTATT
* * * * ** *
21710 -CACAATAAACTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAAT-TT
244 CCA-AATAAGCTTGAATG-ATAAAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATA--ATTCTT
* * * ** * **
21773 CA-AAA-AGAAAATTATTGGAATAGTCATAATTATTT-AA--AGTTGCTCGACAAATAGATTTAT
305 GATAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCA-TT--TCGACAAGCAGATTTAT
* * ** * *** *
21833 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTTTAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAAT
367 TTTTTAAATCTCTTAATTATCAA-TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAA
* * **** ** **** *
21898 AAGCTTATATG-AC-AAAACAA-AAGGCCATAATGGTTTGAAA---TA-AATAATTATTCAAATA
431 AAGCATATATGAACTAAAACAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAA-CATT-TTCAAATA
* * * * *
21956 G-TCATTA--CT-AT-TT-A-AT--TTAGTTCAAT
494 GATAATTAGTCTAATATTAACATAACTAGCTCGAC
* * * * * * *
21982 AAACATATTTATTTTAAAACTTTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAACACATTTATTTTTAAA-TCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTATTAAATTACTATTA-T
* * *
22047 TTAA-TCTGAATAAGCTTGTATGA-ACATAAACAGTTGTTTTATAATAAAACAACAAGTTATAAC
63 TTAATTC-GAATAAGCTTGTATGATA-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-AA-AAGTTATAAC
* ** * * * * * * * *
22110 TATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTCATTTC-ATAAATAGATTTA
123 GATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAAC-GAGTTCGATAAACAAACTTA
** * * ** * *
22174 TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCCAAAC
185 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAAT
* * ** * **
22235 AAACTT-ATATGA-ACAAAAATATTTGTTTTATGACAAAACAAAA-GATATAACTAT-TTG--AA
250 AAGCTTGA-ATGATA-AAAAA-AATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAA-T-TCTTGATAA
* * ** *** * ** ** *
22294 ATAGACAATTGTTGAAATAGTCATAGTTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGAGTTATTTTTTAAA
310 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCATTTCGACAAGCAGATTTATTTTTTAAA
* * *
22359 TCTCTT-GTTA--AA-TTTTGAAATATTAATAAATTCA-T-TTATTTTATTCCAAATAAGC-TAG
375 TCTCTTAATTATCAATTTTTGGAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATA-
* * * * * * * * * *
22417 TATAAATTCAAAAAAACTTATTTTAT-GCTAAAATAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAA
438 TATGAACT-AAAACAA-TTATTTTATAAC-AGAACAAAAGGTTAGAA-CATTTTCAAATAGATAA
* * * * *
22480 TT-GTTCATATAGTTTTAAATATTTGAACTGGTTTGAC
499 TTAG-TC-TA-A-TATT-AACA--T-AACTAGCTCGAC
* * * * * *
22517 AAAGAAATTTATTTTCTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTAGATTAGTATTATT
1 AAACACATTTATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTATTAAATTACTATTA-T
* * * * * * *
22582 TTATTTTGAATAAGATTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAATGA
63 TTAATTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACA-AA-AAAAAGTTATAACGA
* * * * * * * *
22647 TTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTTACGTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTT
125 TTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGATAAGTATTTAAACGAGTTCGATAAACAAACTTATTTTT
** * *
22712 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCT
190 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAATAAGCT
** * * *
22777 TGAATGATAAAAAAAATTGTTATATGACGAAACCAAAGGCCATAATTTTTGATAAATAGATAATT
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* * * *
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* * * *
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* *
22972 CAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTATAATGA-TTTCAAATAGATAATT-GTCTAA-A-TAA
450 CAATTATTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAA-CATTTTCAAATAGATAATTAGTCTAATATTAA
* * *
23033 -A-AATTAGTTCGAT
514 CATAACTAGCTCGAC
* * *
23046 AAATAGATTTATTTATTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATT
1 AAACACATTTATTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAATTACTATTATT
* *
23111 TAATTCCGAATAGGCTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAATAAAAGTTTATAACGA
64 TAATT-CGAATAAGCTTGTATGAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAG-TTATAACGA
* * * *
23176 TTTGAAATTGATAATTGTTTAAATGGCCATAATTATTTAAAGCGA-TTCGATAAACTAACTTATT
125 TTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAG--ATAAGTATTTAAA-CGAGTTCGATAAACAAACTTATT
* * * * *
23240 TTTTAAATCT-TTATCTT-TTCAATTTTTTAAATATTGATAAAGCAATATTATTTTATTTCACAT
187 TTTTAAATCTCTTA-CTTATT-AATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAAT
* * * * * *
23303 AAGCTT-TATGA-ACTGAAAAAATCATTCTATGATAAAACAAAAGGTCATACTTCTT-ATAAATA
250 AAGCTTGAATGATA--AAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAATTCTTGATAAATA
* ** *
23365 TATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTTGTA-AA-CAGATTTATTTTTTAAAA
313 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-CATTTCG-ACAAGCAGATTTATTTTTT-AAA
* * * * * * * *
23428 T-TGTTTATTTATTAACTTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAGCATG
375 TCT-CTTAATTATCAA-TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATA
* * *
23491 TATGAACTGAAAA-AATTATTTTATGACTA-AACAAAATGTTAGAACATTTTGAAATAGATAATT
438 TATGAACT-AAAACAATTATTTTATAAC-AGAACAAAAGGTTAGAACATTTTCAAATAGATAATT
* *
23554 ATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGCTCGGC
501 AGTCTAATA---TTAAC-A--T-AACTAGCTCGAC
* *
23589 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAATTTAGC-AATAT
1 AAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTATTAAATTA-CTATTA-
* * * * *
23653 TTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAACAA
62 TTTAATTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAG-TTATAACGA
* *
23718 TTTGAGATAGATAATTGT
125 TTTGAAATTGATAATTGT
23736 ATTATTGATA
Statistics
Matches: 6474, Mismatches: 1271, Indels: 916
0.75 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
511 2 0.00
512 20 0.00
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TCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATAAAGCAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGAATG
ATAAAAAAAATCATTATATGACAAAACAAAAGGCCATAATTCTTGATAAATAGATAATTGTTCAA
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TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAAAAGCATATATGAACTAAAACAATTA
TTTTATAACAGAACAAAAGGTTAGAACATTTTCAAATAGATAATTAGTCTAATATTAACATAACT
AGCTCGAC
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23779 TAAATAAAAT
* * * * * * * * *
23789 AAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATGATAACGATTTGAAAGAAATAATTGTTCAAAGAGTCAT
1 AAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * ** * * * *
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* * * *
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** * ** *
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* *
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** ** * *
24150 AAGATCATTTGGTGACAAAACAAAAGGTTATACA--ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
1 AA-ATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * * * *
24213 ATAATTATTTAAATTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAG
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* * * * * *
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* * * *
24330 ATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATACTTATACAAATAATCA
1 A-AATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * *
24395 TGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATTTTCTACTTGTTAATTGTCAAA
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* * * *
24460 ATATTAATAAAATAGTATTAATTTAATTTGAATAAGTTTTTATGAAC-AT
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* ** * ** *
24509 AAATTATTGTTT-TGTAGCAAAAGAAAAAATAATAACAATTTGAAATAAATAATT-TCTCAAATA
1 AAATT-TT-TTTATG-A-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATA
* * **
24572 GTCATAAAGT-TTTGAACTGGTTTGATAAACATATTTATTTTTTAAA--TCTA-TTATTAATTTT
61 GTCAT-AATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTT
* * * * * * * *
24633 TGAAATATTAATAGATTAGTTTTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGGACAAA
125 TAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAA
* *
24687 AACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTC
1 AA-ATTT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
** * * *
24752 ATAATTATTTGAACTAGTT-AGGCAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTA
64 ATAATTATTTGAACTAGTTCA-ATAAACATATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTA
* * * **
24816 AAATATTAGTAAATTCA-T-TTTATTTTATTCTGAATAAGC-TAGTATGAATTGAA
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* * * *
24869 AAATTTTCTTTATGACAAAACAAAA----A-CA--ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT
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**** * * * * **
24927 TAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAACAAATTTGTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGA
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** * * *
24992 ATATTTTTATATTAGTATT-ATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAAAA
129 ATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTT-GAATAAGCTTATATGAAC-AAA
* * * ** * *
25043 ATAATTCTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTCAGTATG-CAATTATTCAAATAGTC
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* * * * * *
25107 ATAACTATTTAAACTGGTTCAATAAACAAATTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
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* * * * * *
25171 AAGATTAATAAATTACTATT-ATTTTATTTCAAATAAACATATAT-AATCAAAA
128 AATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTT-GAATAAGCTTATATGAA-C-AAA
* * * * * * *
25223 ACAATTGTTATATGACCAAAC-AAA---C---A--ATTTGAAATTGATAACTGTTGAAAT-G---
1 A-AATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * ** * **
25275 --A-CA-TTG----A-TTCAGTAAACATATTCAGTTTTTAAATCACTTGCTTATTAATTTTTTGA
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* * * * *
25331 ATGTTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTATGACTAAGCTTGTATGGATTCAAA
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* * * * * *
25383 TAATTGTTTTATCACAAAATAAAAGGTCATAATGATTT-AAATAGACAATTGTTCAAATAGTCAT
1 AAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * * * * * * * *
25447 AACAATTTGAATTTGTTTAGTAAACAAATTTA--TTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAAT
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* * * *
25509 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAA
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* * * * * *
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* * * * * * * * **
25625 CACTATTTGAAC-ATGTTCGATAAAGAAATTTATTTTTCCAAATTATTTCCTTATTAATTTTTTG
66 AATTATTTGAACTA-GTTCAATAAACATATTTATTTTT-TAAATT-TCTACTTATTAATTTTTAA
* * * * * *
25689 AATGTTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTTGAATCAGCTTATAAGATATGAAA
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* * * * * *
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* * * * * * *
25803 CTTTAACTATTTGAATTAGCTCAGTAAACACATTTATTTTGTAAA-TT-T-CTTATTAATTTTTA
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* * *** *
25865 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAA-CCAAATAAGCTTCTATGATA-AAA
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* * * * * * * *
25917 ATCAGTTGTTTTT-TTAC-ATACAAATA--TCTTAACGACTTGAGATTA-ATAATTGTTCAAATA
1 A--AATT-TTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGA-AATAGATAATTATTCAAATA
* * *
25977 GTCATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACAT-TTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTTT
61 GTCATAATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTT
* * * * *
26041 TGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCATATAAGCTTGTATGATCAAA
125 TAAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTTGA-ATAAGCTTATATGAACAAA
* * * * *
26095 AGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATCATTCAAAT-GGC
1 A--AATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * ** * * * **
26159 TATAATTATTTTAACTAATTCGGTAAACAGATTTATTTATT-AA-GT-TA-TTATT--TTAGT-A
64 -ATAATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAA
* * ** * * *
26217 AGTATTAATAAATTAGTATTATTTTAA-TCCATCTAAGCTTGTATTAACCGAAA
128 AATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTTGA-ATAAGCTTATATGAA-C-AAA
* * * * * * * * * *
26270 CAATTGTTTTATGACTAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGATATTTGTTCAAATAGTAAT
1 AAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * * * *
26450 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAGCGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTT
1 AAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * * * * * * * *
26515 AACCATTTCAA-TTGATTCGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATATCTTATTTATTAATTTTCAAA
66 AATTATTTGAACTAG-TTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTAAA
* * * *** * * *
26579 ATATTATTAAATTTA-CATTATTTTAATAAAAAAAAGCTTGTATGAATAAA
129 ATATTAATAAA-TTAGTATTAATTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAA
* * * * * * * *
26629 ACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAAAGGTCATAA-CACTTTGAAACAAATAATTGTTCATATAGT
1 A-AATTTTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * ** * * * ** *
26693 CTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTAAGTTTTA
63 CATAATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAA-ATTTCTACTTATTAATTTTTA
* ** * * **
26758 GAATATTCTTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-AATAGTATGAACAAGA
127 AAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTTGAATAAGCTTA-TATGAACAA-A
* * * * * * * * *
26811 CCAGTTGTTTGATGACTAAATAAGAA-GTTATAATGATTAGAAATAGATAGTTATTCAAATAGTC
1 -AAATTTTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * * * * *
26875 AAAACTATTTGAAATAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTCTA
64 ATAATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTT-TA
* * * *
26940 AAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTCGAATAAACTTATATTAATGAAGA
127 AAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTT-GAATAAGCTTATATGAA-CAA-A
* * * ** * * ** **
26994 CAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATGTAGTTTT
1 AAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * ** * * * *
27059 AACTATTTGAACTAGTTTAGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTCAAAA
66 AATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTAAAA
* * * *
27124 TATTACTAAATTAGTATT-ATTTTATTCCGAATAGGCTTATATGAACAAAA
130 TATTAATAAATTAGTATTAATTTAATT-TGAATAAGCTTATATGAAC-AAA
* * * * * ** *
27174 ACAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGAT-ATTGTTCAAATAGTCA
1 A-AATTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * *** * * * * *
27238 TAACTATTTGAGCTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAA-TT-T-GTTATTAATTCTTGAAA
65 TAATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAA
** ** *
27300 TATTGTTAAATTAGTATT-ATTTTCTTTCGAATAGGCTTCTATATTGAA-AAA
130 TATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTT-GAATAAGC-T-TATA-TGAACAAA
* * * * * ** * * * * * *
27351 CAATTGTTTTAGGAGAAAACCAAAA-GTAATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTTAAATGGCCA
1 AAATTTTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
27415 TAATTATTTGAA
65 TAATTATTTGAA
27427 TTGATTTATT
Statistics
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AATTATTTGAACTAGTTCAATAAACATATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTAAAAT
ATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTTGAATAAGCTTATATGAACAAA
Found at i:24852 original size:358 final size:359
Alignment explanation
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23779 TAAATAAAAT
* * * * * *
23789 AAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGATGATAACGATTTGAAAGAAATAATTGTTCAAAGAGTCAT
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* * * * * * * * *
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66 AATTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTT-AAA-CTCTTAATTATTAATTTTTGA
* *
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* ** * * *
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* * * *
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* *
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** * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * *
24511 ATTATTGTTTTGTAGCAAAAGAAAAAATAATAACAATTTGAAATAAATAATT-TCTCAAATAGTC
1 A-AATTGTTTTGTAGCAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGT-TCAAATAGTC
* * *
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* * * *
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* * *
24701 GACAAAACAAAAGGTCATAGTGATTTGAAATAGATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC
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** * *
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* *
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* * *
24869 AAATT-TTCTT-TATG----ACAAAACA-AA-AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTC
1 AAATTGTT-TTGTA-GCAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * * *
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** ** * * *
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* * ** * * *
25056 GATAAAACAAAAGGTTATAATGATTTTCAGTATG-CAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAA
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* * * *
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* * * *
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* * * * ** * * *
25223 ACAATTGTTATAT-G----AC-CAA-A-CA-AACAATTTGAAATTGATAACTGTTGAAAT-GACA
1 A-AATTGTTTTGTAGCAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * **
25278 T--TGA-TT---C-A----G-TAAACATATTCAGTTTTTAAATCACTTGCTTATTAATTTTTTG-
65 TAATTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTAATTATTAA-TTTTTGA
* * * * * *
25330 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGACTAAGCTTGTATGGATTCAAATA-A-TTGTTTT
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* * * * *
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* * * * * * * *
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255 ACTAGTTCAATAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* * * *
25519 TTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAAC-TGAA
320 TTACTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACAT-AA
* * * ** *
25559 ACAATTGTTTTAT-GTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
1 A-AATTGTTTTGTAG-CAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * * **
25623 ATCACTATTTGAAC-ATGTTCGATAAAGAAATTTATTTTTCCAAATTATTTCCTTATTAATTTTT
64 ATAATTATTTGAACTA-GTTTGATAAACAGATTTATTTTT-TAAACT-CTTAATTATTAA-TTTT
* * * ** ** *
25687 TG-AATGTTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTTGAATCAGCTTATAAGATA-TGAAACAAATAT
125 TGAAATATTAAT-AA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGA-ACAAAAACATTTGT
* * * * * *
25749 TTTATGACTACACAAAAGTTCAAAATGATTCGAAATTA-ATAATTATT-ATAATAG-CTTTAACT
187 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTATTCA-AATAGTC-ATAACT
* * * * * *
25811 ATTTGAATTAGCTCAGTAAACACATTTATTTTGTAAA--T-TT-CTTATTAATTTTTAAAATATT
249 ATTTGAACTAGTTCAATAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* * * ** *
25872 ATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATGATA-A-AA
314 AATAAATTACTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTATATGA-ACATAA
* * * * ** * * * *
25917 ATCAGTTGTTTTTTTA-C-ATAC-AAATATCTTAACGACTTGAGATTAATAATTGTTCAAATAGT
1 A--AATTG-TTTTGTAGCAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
* * ** * * * *
25979 CATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAACA-TTTTATTTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTTTTG
63 CATAATTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTAATTATTAATTTTTG
* * * * *
26043 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCATATAAGCTTGTATGATCAAAAGCAATTGTTTT
127 AAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTTT
* * * * * *
26107 ATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATCATTCAAAT-GGCTATAATTATTTT
190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTG
* ** * * * * ** *
26171 AACTAATTCGGTAAACAGATTTATTTATT-AA---GTTA-TTATT--TTAGT-AAGTATTAATAA
254 AACTAGTTCAATAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * * * **
26228 ATTAGTATTATTTTAATC-CATCTAAGCTTGTATTAACCGAA
319 ATTACTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTATATGAACATAA
* * * * * * * * * *
26269 ACAATTGTTTTAT-GACTAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGATATTTGTTCAAATAGTA
1 A-AATTGTTTTGTAG-CAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * **
26333 ATAACTATTTGAACTTG-TTCATTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTT
64 ATAATTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAA-CTCTTAATTATTAATTTTT
* * * * * * ** *
26397 G-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAGGCTTGT-TGAACTGAAACAATTGTTTT
126 GAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTTT
* * ** * * * * * * *
26460 ATGACAAAACAAAATGTTATAGCGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTTAACCATTTCA
190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * * *
26525 A-TTGATTCGACAAA-AAAATTTATTTTTTAAATATCTTATTTATTAATTTTCAAAATATTATTA
255 ACTAG-TTCAATAAACATAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* *** * * *
26588 AATTTAC-ATTATTTTAATAAAAAAAAGCTTGTATGAATA-AA
318 AA-TTACTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACATAA
* * * * * *
26629 ACAATTG-TTT-TACGACAAAAGAAAAAGGTCATAACACTTTGAAACAAATAATTGTTCATATAG
1 A-AATTGTTTTGTA-G-CAAAA-CAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * * ** ** * ** *
26692 TCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTTTTGGTTATTAAGTTTT
62 TCATAATTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAA-ACTCTTAATTATTAATTTTT
** ** * * *
26757 -AGAATATTCTTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-AATAGTATGAACAAGACCAGTTGTT
126 GA-AATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTA-TATGAACAAAAACATTTGTT
* * * * * * *
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188 TTATGACAAAACAA-AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
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252 TGAACTAGTTCAATAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTAA
* * *
26949 TAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAACTTATAT-TA-ATGAA
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* * * **
26992 GACAATTGTTTTATGAG-AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATGTAGT
1 -A-AATTGTTTTGT-AGCAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
** * * * * * *
27056 TTTAACTATTTGAACTAGTTT-AGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTC
63 CATAATTATTTGAACTAGTTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAA-CTCTTAATTATTAATTTTT
* * ** * *
27120 AAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAGGCTTATATGAACAAAAACAATTGTTTT
126 GAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTTT
* * * * ** *
27185 ATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGAT-ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * *** * * * * **
27249 GCTGGTTTGGTAAACA-AATTTATTTTTTTAA--T-TT-GTTATTAATTCTTGAAATATTGTTAA
255 ACTAGTTCAATAAACATAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * *
27309 ATTAGTATTATTTTCTT-TCGAATAGGCTTCTATATTGAA-A-AA
319 ATTACTATTATTTTATTCT-GAATAAGC-T-TATA-TGAACATAA
* * * * * * *
27351 CAATTGTTTTAGGAG-AAAACCAAAAG-TAATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTTAAATGGCC
1 AAATTGTTTT-GTAGCAAAA-CAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTC
* * *
27414 ATAATTATTTG-A--A---T--T-----GATTTATTTTTTCAA-TC-T-CTTATTAACTTTTGAA
64 ATAATTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTAATTATTAATTTTTGAA
* * * *
27463 ATATTAATACAATAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TAATGAACTAAAACAATT-TTTTAT
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* * * * * **
27526 GGCAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATCA-TCATAACTATTCAAA
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* * * ** *
27590 TTTGTTCGATAAACA-AATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAA
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* * * *
27654 ATTAGTATTATTTCATTC-CAAGTAAGCTTGTATGAAC
319 ATTACTATTATTTTATTCTGAA-TAAGCTTATATGAAC
27691 TGAAACAATT
Statistics
Matches: 2798, Mismatches: 566, Indels: 372
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (359 bp):
AAATTGTTTTGTAGCAAAACAAAAGATAATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCAT
AATTATTTGAACTAGTTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAACTCTTAATTATTAATTTTTGAAAT
ATTAATAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACA
AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
TCAATAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTACTA
TTATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACATAA
Found at i:25743 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 25315--27940 Score: 1620
Period size: 181 Copynumber: 14.8 Consensus size: 179
25305 AAATCACTTG
* * * * * *
25315 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGACTAAGCTTGTATGGATTC
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GAATG
* * * * *
25380 AAATAATTGTTTTATCACAAAATAAAAGGTCATAATGATTT-AAATAGACAATTGTTCAAATAGT
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
25444 CATAACAATTTGAATTTGTT-TAGTAAACAAATTTA--TTTTAAACTCTTG
130 CATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTA
* *
25492 CTTATTAATTTTT-GAATTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT
1 CTTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * *
25556 GAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAG
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
25621 TCATCACTATTTGAAC-ATGTTCGATAAAGAAATTTATTTTTCCAAATTATTTC
129 TCATAACTATTTGAACTA-GTTCGATAAACAAATTTATTTTT-TAAATT-TTTA
* * * * *
25674 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTTGAATCAGCTTATAAGATAT
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-AT
* * * * * * * * *
25738 GAAACAAATATTTTATGACTACACAAAAGTTCAAAATGATTCGAAATTA-ATAATTATT-ATAAT
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCA-AAT
* * * * *
25801 AG-CTTTAACTATTTGAATTAGCTC-AGTAAACACATTTATTTTGTAAA--TTT-
127 AGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTA
* * **** *
25851 CTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAGCTTCTATG-ATA
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAAT-
* * * * * * * *
25914 AAAATCAGTTGTTTTTTTAC-ATACAAATA--TCTTAACGACTTGAGATTA-ATAATTGTTCAAA
64 GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAA
* * *
25975 TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAATAAAC-ATTTTATTTTTTAAATGTTTTA
126 TAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTA
*
26029 CTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCATATAAGCTTGTATG-AT
1 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAAT
* * * * **
26091 CAAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTAAAATAGATAATCATTCAAAT
64 -GAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * *
26156 -GGCTATAATTATTTTAACTAATTCGGTAAACAGATTTATTTATT-AA--GTTA
127 AGTC-ATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTA
** * * ** * * *
26206 -TTATT--TTAGTA-AGTATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCCATCTAAGCTTGTATTAACC
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * *
26266 GAAACAATTGTTTTATGACTAATCAAAAGGTTATAACGATTTTAAATAGATATTTGTTCAAATAG
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
26331 TAATAACTATTTGAACTTGTTC-ATTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTT-
129 TCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTA-TTTTTTAAAT-T-TTTA
* * * * *
26384 CTTATTAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTAAATAGGCTTGT-TGAACTG
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * * *
26447 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAGCGATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAAT
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
26512 CTTAACCATTTCAA-TTGATTCGACAAAAAAATTTATTTTTTAAATATCTTA
130 CATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTA
* * * * * * *** * *
26563 TTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAATTTA-CATTATTTTAATAAAAAAAAGCTTGTATGAATA
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * *
26627 AAACAATTGTTTTACGACAAAAGAAAAAGGTCATAAC-ACTTTGAAACAAATAATTGTTCATATA
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * * *
26691 GTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTTTTG
128 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAA-ATTTTTA
* * ** ** * *
26744 GTTATTAAGTTTTAGAATATTCTTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATGAA-CA
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATGA
* * * * * * * * *
26808 AGACCAGTTGTTTGATGACTAAATAAGAA-GTTATAATGATTAGAAATAGATAGTTATTCAAATA
66 A-A-CAATTGTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
26872 GTCAAAACTATTTGAAATAGTT-TAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
128 GTCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTA
* * * * * *
26925 CTGATTAATTTTCTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATTAATG
1 CTTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * **
26990 AAGACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATGTAG
65 AA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * *
27055 TTTTAACTATTTGAACTAGTT-TAGCAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTA
129 TCATAACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTT-TTA
* * * * ** * * **
27107 GTTATTAATTTTCAAAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAGGCTTATATGAACAA
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TG
* * * * *
27172 AAACAATTGTTTTATGATAGAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGAT-ATTGTTCAAATAGT
65 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
27236 CATAACTATTTGAGCTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTTAA--TTT-
130 CATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTA
* * ** * * * * *
27283 GTTATTAATTCTT-GAAATATTGTTAAATTAGTATTATTTTCTTTCGAATAGGCTTCTAT-ATTG
1 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * * *
27346 AAAAACAATTGTTTTAGGAGAAAACCAAAA-GTAATAACAATTTGAAATACATAGTTGTTTAAAT
65 --AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
27410 GGCCATAATTATTTG-A--A-TT-G--------ATTTATTTTTTCAA--TCT-
127 AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTA
* *
27447 CTTATTAACTTTT-GAAATATTAATACAA-TAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTT-TAATGAA
1 CTTATTAATTTTTAG-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAA
* * * * * *
27509 CTAAAACAATT-TTTTATGGCAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAAT
63 -TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
** * * *
27573 CA-TCATAACTATTCAAATTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTA
127 -AGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTT-AAAT-TTTTA
* * * **
27628 CTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTCA-TTCCAAGTAAGCTTGTATGAACT
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAA-T
* * * * * * * * * *
27692 GAAACAATTATTCTATGACTAAACAAAATGTTAAAATGATTTGAAATTA-AAAATTATTCTAATA
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATA
* * * *** * * *
27756 GTC-TCAACTATATGAACTGGTTC-AGCAAATGCATTTATTTTTT-TA-GTCT-
128 GTCAT-AACTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTA
* * * *
27805 CTTACTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TATTTGAAAAAGCTTGTATGATTA
1 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAAT-
* * ** * * * *
27869 GAAATAATTATTTTATGGGAAAACAAATA--TCATAATGATTT-AAGATTGATATTTATTCAAAT
64 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAAT
*
27931 GGTCATAACT
127 AGTCATAACT
27941 TGCTTTTTAA
Statistics
Matches: 1917, Mismatches: 409, Indels: 247
0.75 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
162 4 0.00
163 46 0.02
164 69 0.04
165 3 0.00
166 1 0.00
167 2 0.00
168 1 0.00
172 1 0.00
173 119 0.06
174 25 0.01
175 53 0.03
176 157 0.08
177 249 0.13
178 127 0.07
179 44 0.02
180 242 0.13
181 396 0.21
182 363 0.19
183 15 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (179 bp):
CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATGA
AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTA
Found at i:28048 original size:137 final size:135
Alignment explanation
Indices: 27814--28071 Score: 292
Period size: 137 Copynumber: 1.9 Consensus size: 135
27804 TCTTACTAAG
* * *
27814 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTGAAAAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTA
1 TTTTAGAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTTATTTGAAAAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTA
* * *
27879 TTTTATGGGAAAACAAATATCATAATGATTTAAGATTGATATTTATTCAAATGGTCATAACTTGC
66 TTTTAT-GGAAAACAAATATCATAATGATTTAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTGC
27944 TTTTTAA
129 TTTTTAA
* * * * *
27951 TTTTTGAAAATTAATAAAGTAGTATTA-TTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAATT-GAAACAAT
1 TTTTAGAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTTATTTGA-AAAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAAT
* *
28014 TGTTTTAT-GATAAACAAA-AGGTC-TAATGACTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
64 TATTTTATGGA-AAACAAATA--TCATAATGA-TTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
28072 AATCTATTCG
Statistics
Matches: 102, Mismatches: 13, Indels: 13
0.80 0.10 0.10
Matches are distributed among these distances:
135 3 0.03
136 41 0.40
137 55 0.54
138 3 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.05, G:0.12, T:0.43
Consensus pattern (135 bp):
TTTTAGAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTTATTTGAAAAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTA
TTTTATGGAAAACAAATATCATAATGATTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTGCTT
TTTAA
Found at i:28153 original size:492 final size:496
Alignment explanation
Indices: 27451--28432 Score: 1286
Period size: 492 Copynumber: 2.0 Consensus size: 496
27441 CAATCTCTTA
*
27451 TTAACTTTTGAAATATTAATACAATAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTAATGAACTAAAAC
1 TTAACTTTTGAAATATTAATACAATAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTAATGAACTAAAAC
* *
27516 AATTTTTTATGGCAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATCATCATAA
66 AATTTTTTATGGCAAAAAAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGATAATTGTTCAAATCATCATAA
* *
27581 CTATTCAAATTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAAT
131 CTATTCAAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTGAAT
* *
27646 GTTAATAAATTAGTATTATTTCATTC-CAAGTAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTCTATGA
196 GTTAATAAATTAGTATTATTTCATTCTCAA-TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTCTATAA
* * * *
27710 CTAAACAAAATGTTAAAATGATTTGAAATTA-AAAATTATTCTAATAGTCTCAACTATATGAACT
260 CTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTG-AAGTAGAAAATTATTCTAATAGTCTCAACTATATGAACC
* * * *
27774 GGTTCAGCAAATGCATTTATTTTTTTAGTCTCTTACTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
324 GATTCAGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * ** * *
27839 TATTTTTATTTGAAAAAGCTTGTATGATTAGAAATAATTATTTTATG-GGAAAACAAATATCATA
389 TATTTTAATCTGAAAAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAGG-AAACAAAGATCATA
* * *
27903 ATGATTTAAGATTGATATTTATTCAAATGGTCATAACTTGCTTT
453 ATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTGCTTT
* * * * *
27947 TTAATTTTTGAAA-ATTAATA-AAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAATTGAAA
1 TTAACTTTTGAAATATTAATACAA-TAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTAATGAACTAAAA
*
28010 CAATTGTTTTAT-G-ATAAACAAAAGGTC-TAATGACTTTAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTC
65 CAATT-TTTTATGGCA-AAAAAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGATAATTGTTCAAATCA-TC
* * * *
28071 A-AATCTATTCGAACTTGTTCGATAAATAGATTT-TTTTTT-AAATCTCTTGCTCATTAATTTTT
127 ATAA-CTATTCAAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTCATTAATTTTT
* * * * *
28133 TGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTCATTCTGAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTGTTTT
191 TGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTCATTCTCAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTCT
* * * * *
28198 ATAACTAAACAACAGGTCAAAATGATTTGAAGTAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGA
256 ATAACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAGTAGAAAATTATTCTAATAGTCTCAACTATATGA
* * * ** * *
28263 ACCGATTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTACTTTTTGGAATATTATTAAATTAG
321 ACCGATTCAGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAG
* * * *
28328 TATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGATGAAATAAAGATCA
386 TATTATTTTAATCTGAAAAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAGGAAACAAAGATCA
* *
28393 TAATGATTTAAGATAGATAATTGTTCACATAGTCATAACT
451 TAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
28433 ATTTAAACTA
Statistics
Matches: 420, Mismatches: 58, Indels: 20
0.84 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
491 4 0.01
492 268 0.64
493 12 0.03
494 59 0.14
495 59 0.14
496 18 0.04
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (496 bp):
TTAACTTTTGAAATATTAATACAATAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTAATGAACTAAAAC
AATTTTTTATGGCAAAAAAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGATAATTGTTCAAATCATCATAA
CTATTCAAACTTGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTGAAT
GTTAATAAATTAGTATTATTTCATTCTCAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTCTATAAC
TAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAGTAGAAAATTATTCTAATAGTCTCAACTATATGAACCGA
TTCAGCAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAAGTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTAATCTGAAAAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATGAGGAAACAAAGATCATAATG
ATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTGCTTT
Found at i:28779 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 27947--31645 Score: 2621
Period size: 180 Copynumber: 20.5 Consensus size: 180
27937 AACTTGCTTT
* * * * * * *
27947 TTAATTTTT-GAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAATTGAAAC
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
*
28011 AATTGTTTTATGA-TAAACAAAAGGTC-TAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-
66 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * **
28072 AATCTATTCGAACTTGTTCGATAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTGCTCA
130 AA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCT-A
* * * *
28124 TTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTCA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
* * * * * * * *
28187 ATAATTGTTTTATAACTAAACAACAGGTCAAAATGATTTGAAGTAGATAATTGTTCTAATAGTCT
64 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* *
28252 TAACTATTTGAAC-CGATTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCT---TA
129 TAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCTA
* * * * * * *
28301 TTACTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTATATGAAAAGAAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
** * * *
28365 CAATTGTTTTATGATGAAA-TAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTGTTCACATAGTCA
65 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
28428 TAACTATTTAAACTAT-TTCTGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCT---TA
129 TAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCTA
* * * * * * ** * *
28477 TTAATTTTCAAAATTTTAATAGATTAGTATTATTTT-GTTCTGAATAATTTTGCATGAACAGAAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * * * * * * *
28541 CAATTATTTTATTAAAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATGGACAT
65 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * *
28606 GACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATATATTTA-CTTTCAAATCTCCTACCTA
130 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTACCTA
* *
28657 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAAC
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * *
28722 AATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGGCAT
66 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-G--T
* * * * *
28786 AATAACTATTTAAACTT-TCTTGGTAAACAGATTTATTTTTTGAAATCTTATTAATTTTTGAAAT
127 CATAACTATTTGAACTTGT-TCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATC---------TCT---A-
*
28850 CTTA
177 CCTA
* **
28854 TTAATTTTT-GAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATATA-CTTGTATGAGCAGAA
1 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTGTATGAATAGAA
** * *
28917 ACAATTGGCTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCCAATAGTC
64 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * * * * *
28981 ATAACTATTTGCA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTACTTA
128 ATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCTA
* ** *
29034 TTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAATAGAA
1 TTAA-TTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * *
29098 ACAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCA
64 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
** * * **
29163 TAACTATTCAAACTT-TTCGGTAAATAGATTCATTTCTTAAATCTCTTGCTCA
129 TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCT-A
* ** * * * * * *
29215 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAGCCTATATTAACAGATAT
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * *
29280 AATTGTTTTATGATGAAAA-AAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAT
66 AATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * *
29344 GACTATTTGAATTTGTAT-GGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTA-CTCA
130 AACTATTTGAACTTGT-TCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTACCT-A
* * * * * *
29396 TTAATTGTT-GAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTCTATGAACA-AAA
1 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * * *
29458 AAATGTGTTTTTTGACAAAACGAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC
65 CAAT-TGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * *
29522 ATAACTATTTGAATTTATTCAGTAAATAGAGTTGTTTTTTAAATCTTTTACTTA
128 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTACCTA
* * * ** *
29576 TTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTGTATTGTTTTAACTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
1 TTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * * * *** * ***
29640 AAATTATTTTATGACAAAACCAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGATAATCACTCAAATAGTCAT
65 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* ** * * * *
29705 AACTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTCAGTTTTTAAATCTCT---TA
130 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCTA
* ** * * * **
29753 TTAATTTTTAGAATATTAATATATTAAAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATGGGAATAGAAAC
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * *
29818 AATTG--TTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAAG-CAA
66 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCAT
* * ** * * * *
29880 AACTATTTGCAC-TGGTCAGGCCAACAGATTAATTTTTTAAATCTATTACTTA
130 AACTATTTGAACTTGTTC-GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTACCTA
* * * * * * * * * *
29932 TTAATTTTTAGAATTTTAATTAATTAGCATTACTTTATTCCGAATGAGATTGTATTAATAGAAAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * * *
29997 AATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGCAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATA
66 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
30062 ACTAATTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT--C-A
131 ACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCTA
* * * * * *
30109 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACA-AA-CTTATATGAACAAAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAA
* * * * * * * *
30172 ACATTTGTTTTATGACAAAGCAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCT
64 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * **
30237 TAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGATA
129 TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TACCTA
* * ** ** * *
30290 CTAATTTTTATAATATTTTTAGGTTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATGAAGATAAA
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * * * *
30354 TAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATAGTT-AAATAGTCAT
65 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * *
30418 AACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCCTA-CTCA
130 AACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CTACCT-A
* * * *
30470 TTAATTTTT-GAAATATTGATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTT-TAT-AATGAAAA
1 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA
* * * * * * * *
30532 ACAATTGTTTTATGGCAAAATAAATGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATTGCCA
64 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * *
30597 TAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAATTGATTTCATTTTTTAAATCTCTAACT-
129 TAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTACCTA
* * * *** * * ** *
30649 TCTCAATTTTT-GAAACATTAATAAATTAATATTATGTTATTTTGGATAAACTTTTAAAAACT-T
1 T-T-AATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * *
30712 AAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAAGCTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
62 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
30777 CATAACAATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGACTTATTTTTAAAAATTTCTTGCTTA
127 CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTT-TAAATCTC-TACCTA
* * *
30833 TTAATTTTCTA-AATGTTAATAAAAATAGTATTATTTTAGTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-A
1 TTAATTTT-TAGAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
* * ** * * * *
30896 AATAATTATTTTATGATTAAATAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGGTC
63 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
30961 TTAACTA-TT---C-AG--C---AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
128 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TACCTA
* ** * * * * * *
31005 TTAA-TTTTAGAATATTATTAGGTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGGATGGAAAC
1 TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
* * * * * * * * *
31069 ATTTGTTTTATAAGAAAAC-AATGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTATTTAAATAGTCATA
66 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * ** * *
31133 ACTATTGGAACTGGTTCAATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTA
131 ACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TACCTA
* * ** * *
31184 TTAATTTTT-GAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAACT-GAA
1 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAA
* * * * * *
31247 ACAATTAGTTTTTTAACAAAACAAAAGTTCATAATG-TCTTTAAATAGAAAATTATTCAAATAGT
64 ACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * **
31311 CA-AATCTATTTGAGCTTGTTCAGTAAATAGATTTATGCTTTTAAATCTCTTGCTCA
127 CATAA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTACCT-A
* * * *
31367 TTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTAAAATAAGCTTGCAT-AACT-G-
1 TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
* * * **
31428 AATAATTG-TTTATGACTAAAA-AGAAGGTCA-GATGATTTGAAATAGATAA-TGTTTTTAATA-
63 AACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAG
* ** *** *** * *
31488 TCCCTTAACTATTTGAACTAATTCAACAAGCCG-TTAATATTTTT-AATCTCTTACTTA
126 T--CATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTC-TACCTA
* *
31545 TTAATTTTTAGAATATTTAGTAAATTTAGTAATGTATTTTATTT-GAAT-AGCTTGTAAATGAA-
1 TTAATTTTTAGAATA-TTAATAAA-TTAGT-AT-TATTTTATTTCAAATAAGCTTGT--ATGAAT
*
31607 AGAAACAATTGTTTTATCGACAAAGATAAAGAGGTCATA
60 AGAAACAATTGTTTTAT-GACAAA-ACAAA-AGGTCATA
31646 TGAAACGATT
Statistics
Matches: 2790, Mismatches: 575, Indels: 304
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 40 0.01
170 49 0.02
171 10 0.00
172 16 0.01
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174 4 0.00
175 74 0.03
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186 6 0.00
193 6 0.00
194 32 0.01
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196 3 0.00
197 113 0.04
198 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAC
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTACCTA
Found at i:28845 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 28822--28867 Score: 92
Period size: 18 Copynumber: 2.6 Consensus size: 18
28812 ACAGATTTAT
28822 TTTTTGAAATCTTATTAA
1 TTTTTGAAATCTTATTAA
28840 TTTTTGAAATCTTATTAA
1 TTTTTGAAATCTTATTAA
28858 TTTTTGAAAT
1 TTTTTGAAAT
28868 ATTAATAAAC
Statistics
Matches: 28, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (18 bp):
TTTTTGAAATCTTATTAA
Found at i:28872 original size:15 final size:16
Alignment explanation
Indices: 28822--28873 Score: 61
Period size: 18 Copynumber: 3.1 Consensus size: 16
28812 ACAGATTTAT
28822 TTTTTGAAATCTTATTAA
1 TTTTTGAAA--TTATTAA
28840 TTTTTGAAATCTTATTAA
1 TTTTTGAAA--TTATTAA
28858 TTTTTGAAA-TATTAA
1 TTTTTGAAATTATTAA
28873 T
1 T
28874 AAACTAGTAT
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 0, Indels: 3
0.92 0.00 0.08
Matches are distributed among these distances:
15 7 0.21
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ACGTcount: A:0.35, C:0.04, G:0.06, T:0.56
Consensus pattern (16 bp):
TTTTTGAAATTATTAA
Found at i:29169 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 28850--31630 Score: 1981
Period size: 181 Copynumber: 15.5 Consensus size: 181
28840 TTTTTGAAAT
* **
28850 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATATA-CTTGTATGAGCA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AGCTTGTATGAATA
** * *
28914 GAAACAATTGGCTTATGACAAAACAAAA-GCTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCCAAT
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * *
28977 AGTCATAACTATTTGCA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTA
128 AGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** *
29030 CTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAAT
1 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT
* * * *
29094 AGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** ** * * * *
29159 GTCATAACTATTCAAACTT-TTCGGTAAATAGATTCATTTCTTAAATCTCTTG
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * * * *
29211 CTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAGCCTATATTAACAG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *
29276 ATATAATTGTTTTATGATGAAAA-AAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
66 AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * * * *
29340 TTATGACTATTTGAATTTGTATGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTA
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
29392 CTCATTAATTGTTGAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTCTATGAACA-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * *
29455 AAAAAATGTGTTTTTTGACAAAACGAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATA
66 AAACAAT-TGTTTTATGACAAAAC-AAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
29519 GTCATAACTATTTGAATTTATTCAGTAAATAGAGTTGTTTTTTAAATCTTTTA
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * ** *
29572 CTTATTAATTGTCTG-AATATTAATAAATTTGTATTGTTTTAACTAAAATAAGCTTGTATGAATA
1 CTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * *** * * *
29636 GAAAAAATTATTTTATGACAAAACCAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGATAATCACTCAAATAG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * *
29701 TCATAACTATTTGAACTTATTCA-ATAAACAAATTCAGTTTTTAAA--TC-T-
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * * **
29749 CTTATTAATTTTT-AGAATATTAATATATTAAAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATGGGAATA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
29813 GAAACAATTG--TTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAA
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TA
* * * * ** * * *
29876 G-CAAAACTATTTGCAC-TGGTCAGGCCAACAGATTAATTTTTTAAATCTATTA
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTA-GAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * * *
29928 CTTATTAATTTTT-AGAATTTTAATTAATTAGCATTACTTTATTCCGAATGAGATTGTATTAATA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * *
29992 GAAAAAATTATTTTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGCAATAAATAATTGTTCAAATT
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * *
30056 GTTATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-T-
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
30107 C--ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACA-AA-CTTATATGAAC
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAAT
* * * * *
30168 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAGCAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * ** * * *
30233 GCCTTAACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * ** ** *
30286 GATACTAATTTTT-ATAATATTTTTAGGTTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATGAAG
1 CTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAAT
* * * * * *
30349 ATAAATAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAA-TAGTT-AAAT
64 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAAT
* * * * *
30412 AGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCCTA
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * *
30466 CTCATTAATTTTTGAAATATTGATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTT-TAT-AATGA
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-A
* * * * * * *
30529 AAAACAATTGTTTTATGGCAAAA-TAAATGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATT
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * *
30593 GCCATAATTATTTGAAC-TGATTT-GATAAATTGATTTCATTTTTTAAATCTCTAA
129 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGA-AAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *** * * **
30647 CTTCTCAATTTTTGAAACATTAATAAATTAATATTATGTTATTTTGGATAAACTTTTAAAAACT-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * * * *
30711 TAAACAATTGTTTTATTATAAAACAAAA-GCTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * *
30775 GTCATAACAATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGACTTATTTTTAAAAATTTCTTG
129 GTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTA
* * *
30829 CTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAAAATAGTATTATTTTAGTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
1 CTTATTAATTTT-TGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-
* * ** * * * * *
30893 TA-AAATAATTATTTTATGATTAAATAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAT
63 TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * *
30957 GGTCTTAACTA-TT---C------AGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA
128 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * * * * * *
31001 CTTATTAATTTTAG-AATATTATTAGGTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGGATGG
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * *
31065 AAACATTTGTTTTATAAGAAAAC--AATGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTATTTAAATAG
66 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * *
31128 TCATAACTATTGGAACTGGTTCA-ATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTA
130 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * ** * *
31180 CTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAACT-
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TA
* * * *
31244 GAAACAATTAGTTTTTTAACAAAACAAAA-GTTCATAATG-TCTTTAAATAGAAAATTATTCAAA
65 GAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAATG-TCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * *
31307 TAGTCA-AATCTATTTGAGCTTGTTCAGTAAATAGATTTATGCTTTTAAATCTCTTG
127 TAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTA
* * * * * *
31363 CTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTAAAATAAGCTTGCAT-AACT
1 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * **
31427 -G-AATAATTG-TTTATGACTAAAA-AGAAGGTCA-GATGATTTGAAATAGATAATGT-TTTTAA
64 AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT-TATTCAAA
* ** * *** *
31486 TA-TCCCTTAACTATTTGAACTAATTCA-ACAAGCCG-TTAATATTTTT-AATCTCTTA
127 TAGT--CATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTA
* *
31541 CTTATTAATTTTT-AGAATATTTAGTAAATTTAGTAATGTATTTTATTT-GAAT-AGCTTGTAAA
1 CTTATTAATTTTTGA-AATA-TTAATAAA-TTAGT-AT-TATTTTATTTCAAATAAGCTTGT--A
31603 TGAA-AGAAACAATTGTTTTATCGACAAA
59 TGAATAGAAACAATTGTTTTAT-GACAAA
31631 GATAAAGAGG
Statistics
Matches: 2048, Mismatches: 443, Indels: 217
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
168 3 0.00
169 37 0.02
170 47 0.02
171 7 0.00
172 20 0.01
173 15 0.01
174 4 0.00
175 69 0.03
176 4 0.00
177 188 0.09
178 39 0.02
179 205 0.10
180 490 0.24
181 547 0.27
182 195 0.10
183 160 0.08
184 18 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
CATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
Found at i:29549 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 27947--31477 Score: 2435
Period size: 361 Copynumber: 9.8 Consensus size: 357
27937 AACTTGCTTT
* * ** * * * ** *
27947 TTAATTTTTGAAA-ATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAATTGAAAC
1 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAA-CAAAAA
* *
28011 AATTGTTTTATGA-TAAACAAAAGGTC-TAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-
65 AATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * *
28072 AATCTATTCGAACTTGTTC-GATAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTG
128 AA-CTATTTGAA-TTATTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAG
* * * * *
28135 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTCA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTGTTTT
190 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * * * *
28198 ATAACTAAACAACAGGTCAAAATGATTTGAAGTAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGA
253 ATGAC-AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * *
28263 AC-CGATTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATC---T-CTTA
317 ACTTG-TT-GGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
* * * * * **
28301 TTACTTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAA-AAGAAA
1 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAA-AAA
** * * *
28365 CAATTGTTTTATGATGAAA-TAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTGTTCACATAGTCA
65 -AATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
28428 TAACTATTTAAACTATTTCTGTAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATTTTCAAA
127 TAACTATTTGAATTA-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGA
* * * * ** * *
28489 ATTTTAATAGATTAGTATTATTTT-GTTCTGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAATTATTTTAT
191 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * *
28553 TAAAAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATGGACATGACTATTTGAAC
255 GACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * ** *
28618 TTGTTTGGTAAATATATTTA-CTTTCAAATCTCCTACCTA
319 TTG-TTGGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
* * * *
28657 TTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAA
1 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA-AAA
* * * *
28721 CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGGCA
64 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA-G--
* * ** * *
28785 TAATAACTATTTAAACTT-TCTTGGTAAACAGATTTATTTTTTGAAATCTTATTAATTTTTGAAA
124 TCATAACTATTTGAA-TTAT-TCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATC--------TCTT---A
* * *
28849 TCTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATATA-CTTGTATGAG
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** * * * *
28912 CAGAAACAATTGGCTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCCAAT
237 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * *
28977 AGTCATAACTATTTGCA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTA
301 AGTCATAACTATTTGAACT-TG-TTGGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
* * *** *
29034 TTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAATAGAAA
1 TTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA-AAA
* * * * *
29099 CAATTATTTTATGATAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAAAAATTATTCAAATAGTCAT
64 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
** * * * * *
29164 AACTATTCAAACTT-TTCGGTAAATAGATTCATTTCTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTGGAA
128 AACTATTTGAA-TTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAA
** * * * * *
29228 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAGCCTATATTAACAGATATAATTGTTTTATGA
192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
29293 TGAAAAAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATTT
257 -CAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * *
29358 GTATGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTCA
321 GT-TGGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
* * *
29396 TTAATTGTTGAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTCTATGAACAAAAAA
1 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAAAAA
* *
29460 ATGTGTTTTTTGACAAAACGAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
66 AT-TGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
29525 ACTATTTGAATTTATTCAGTAAATAGAGTTGTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-GAA
129 ACTATTTGAA-TTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATT-TTTAGAA
* * ** * * * *
29589 TATTAATAAATTTGTATTGTTTTAACTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGA
192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
29654 CAAAACCAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGATAATCACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
257 CAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* ** * * *
29719 ATTCAATAAACAAATTCAGTTTTT-AAATC---T-CTTA
321 GTT-GGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTA
* * * ** *
29753 TTAATTTTT-AGAATATTAATATATTAAAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATGGGAATAGAAA
1 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACA-AAA
* * * *
29817 CAATTG--TTGTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAAG-CA
64 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA-TAGTCA
* * * ** ** * * * *
29879 AAACTATTTGCACTGGTCAGGCCAACAGATTAATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTTTAGA
127 TAACTATTTGAATTATTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGA
* * * * * * * * * * * *
29944 ATTTTAATTAATTAGCATTACTTTATTCCGAATGAGATTGTATTAATAGAAAAAATTATTTTATG
191 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
30009 ACAAAACAAATGGTCATAATGATTTGCAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGAACT
256 ACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * *
30074 AGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTCA
320 TG-TTGGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
* ** * *
30109 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAACAAAAAC
1 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAAAA-
* * * * * *
30174 ATTTGTTTTATGACAAAGCAGAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTA
65 AATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * * * * *
30239 ACTATTTGAACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGAT-ACTAATTTTTATAA
129 ACTATTTGAATTA-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTCATTAATTTTTAGAA
** ** * * *
30303 TATTTTTAGGTTAGTATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGTATGAAGATAAATAATTGTTTTATG
192 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
30367 ACAAAAAAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAA-TAGTT-AAATAGTCATAACTATTTGAAC
256 AC-AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * ** *
30430 TAGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCA
319 TTGTT-GGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
* * *
30470 TTAATTTTTGAAATATTGATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTTTATAATG-A-AAAA
1 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGC-TTAT-ATGAACAAAA
* * * * * * * * *
30533 CAATTGTTTTATGGCAAAATAAATGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATTGCCAT
64 AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* * * * * *
30598 AATTATTTGAACTGATT-TGATAAATTGATTTCATTTTTTAAATCTCTAACTTC-TCAATTTTT-
128 AACTATTTGAA-TTATTCAG-TAAATAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTAC-TCATTAATTTTTA
* * * *** * * ** **
30660 GAAACATTAATAAATTAATATTATGTTATTTTGGATAAACTTTTAAAAACTTAAACAATTGTTTT
189 G-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT
* * * * * *
30725 ATTATAAAACAAAAGCTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGA
253 ATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * *
30790 ATTTGTTTGGTAAATAGACTTATTTTTAAAAAT-TTCTTGCTTA
317 ACTTG-TTGGTAAATAGATTTATTTTT-AAAATCTT-TTACTTA
* * * *
30833 TTAATTTTCT-AAATGTTAATAAAAATAGTATTATTTTAGTT-CAAATAAGCTTGTATGAACTAA
1 TTAATTTT-TGAAATATTAAT-AAATTAATATTATTTTA-TTCCAAATAAGCTTATATGAAC-AA
* * ** * * * *
30896 AATAATTATTTTATGATTAAATAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAT-G--
62 AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * * * *
30958 GT--C---TT-AACTATTCAGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGA
126 ATAACTATTTGAATTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGA
* ** * * * * * ** * *
31016 ATATTATTAGGTTAGCAATATTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGGATGGAAACATTTGTTTTATA
191 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
31081 AGAAAACAATGATCATAACGATTTGAGATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTGGAACTG
256 ACAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
** *
31146 GTTCAATAAATAGATTTAGTTTTT-AAATCTCTTACTTA
321 GTT-GGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCTTTTACTTA
* * * *** * * * *
31184 TTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAACTGAAAC
1 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAAC-AAAAA
* * * *
31249 AATTAGTTTTTTAACAAAACAAAAGTTCATAATG-TCTTTAAATAGAAAATTATTCAAATAGTCA
65 AATT-GTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * *
31313 -AATCTATTTGAGCTTGTTCAGTAAATAGATTTATGCTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTC
127 TAA-CTATTTGA-ATTATTCAGTAAATAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTT-
* * * * * *
31377 A-AATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTAAAATAAGCTTGCAT-AACTG-AATAATTG-TT
188 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTT
* * *
31438 TATGACTAAAAAGAAGGTCA-GATGATTTGAAATAGATAAT
252 TATGAC-AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
31478 GTTTTTAATA
Statistics
Matches: 2510, Mismatches: 523, Indels: 281
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
349 2 0.00
350 42 0.02
351 67 0.03
352 74 0.03
353 181 0.07
354 39 0.02
355 89 0.04
356 384 0.15
357 128 0.05
358 202 0.08
359 29 0.01
360 205 0.08
361 503 0.20
362 110 0.04
363 58 0.02
364 41 0.02
365 56 0.02
366 1 0.00
369 1 0.00
370 1 0.00
373 5 0.00
374 18 0.01
375 17 0.01
376 2 0.00
377 137 0.05
378 117 0.05
379 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (357 bp):
TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAACAAAAAA
ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
TATTTGAATTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATT
AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
AAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTGG
TAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTA
Done.