Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168114.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_359, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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1 TGAAT
* *
6 GAAACAATTG-CTTATGACAAAACTAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
70 TCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAACATATTTATTTTTAAAATT-TTTACTTATTAATTTTT
66 TCATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAACATATTTATTTTT-TAATTCTTTACTTATTAATTTTT
*
134 AGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAACA
130 AGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAACA
* ** * *
185 GAACCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGTTTAAAATAGATAATTGTTCAGATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
249 TCATAACTATTTGAACATGATT-GGTAAATAGATTAATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTT
66 TCATAACTATTTGAACATG-TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAATTCT-TTACTTATTAATTTT
* * *
313 TAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACT
129 TAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACA
* * **
365 GAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATA-ATTAA---TT---AT-
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATA
* * * * *
422 -TC--AAC-ATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGT
65 GTCATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAATTC-TTTACTTATTAATTTT
* * *
483 CA-AATATTAATAAATTAATATT-TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACA
129 TAGAATATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTCAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * *
533 TAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAG
1 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
**
598 TCATAAAGATTTGAAC
66 TCATAACTATTTGAAC
614 TTGGTCTTGT
Statistics
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180 113 0.32
181 14 0.04
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GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAATTCTTTACTTATTAATTTTTA
GAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAACA
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Indices: 284--593 Score: 428
Period size: 168 Copynumber: 1.8 Consensus size: 170
274 AAATAGATTA
* * * * * *
284 ATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAA
* * **
349 TAAGCTTATATAAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAA
66 TAAGCTTATATAAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCACAACAATTTGAAATAA
*
414 TTAATTATTCAACATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTT
131 ATAATTATTCAACATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTT
* * *
454 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTACTTGTCA-AATATTAATAAATTAATATT-TTTTAATCCAAA
1 ATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAA
* * * *
517 TAAGCTTGTATGAACAT-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATA
66 TAAGCTTATATAAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCACAACAATTTGAAATA
581 AATAATTATTCAA
130 AATAATTATTCAA
594 ATAGTCATAA
Statistics
Matches: 121, Mismatches: 18, Indels: 4
0.85 0.13 0.03
Matches are distributed among these distances:
168 76 0.63
169 20 0.17
170 25 0.21
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.06, T:0.42
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ATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTGTCAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAA
TAAGCTTATATAAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCACAACAATTTGAAATAA
ATAATTATTCAACATTTGAACTTGTTCGATAAACATATTT
Found at i:703 original size:145 final size:142
Alignment explanation
Indices: 485--748 Score: 357
Period size: 145 Copynumber: 1.8 Consensus size: 142
475 TTACTTGTCA
* * * **
485 AATATTAATAAATTAATATTTTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATG
1 AATATTAATAAATTAATATTTTTTAATCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATG
* *
550 ACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAAAGATTTGAACT
66 ACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAAAGATTTGAACT
615 TGGTCTTGTCTT
131 TGGTCTTGTCTT
** * *
627 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTT
1 AATATTAATAAATTAATATT-TTTTAATCAAAATAAGCTTGTATG-A-ACAAAAAAAATCATTTT
* * * * *
692 ATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAA
63 ATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAA
749 TTATTTAAAC
Statistics
Matches: 103, Mismatches: 16, Indels: 3
0.84 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
142 18 0.17
143 22 0.21
144 1 0.01
145 62 0.60
ACGTcount: A:0.46, C:0.09, G:0.09, T:0.36
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AATATTAATAAATTAATATTTTTTAATCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATCATTTTATG
ACAAAACAAAAGATCATAACAATTTCAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAAAGATTTGAACT
TGGTCTTGTCTT
Found at i:968 original size:181 final size:181
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 2.7 Consensus size: 181
617 GTCTTGTCTT
** * * * * ** **
627 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAG--AAACTATTGTTTT
* * * * *
692 ATGACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAACAGTCATAATTATTTAA
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * *
757 ACTTGTTCGTTAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT-TTCA
129 ACTAGTTCGGTAAACAAATTCATGTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTGTTCA
* * * *** * *
809 GAATATTGATAACTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACCGAAA-TGATTTTTTT
1 -AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACT-ATTGTTTT
* * *
873 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGA
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * *
938 TCTAGTTCGGTAAGA-ATATTTATGTTTTAAATTTTTTAGTTATTAATTGTTGA
129 ACTAGTTCGGTAA-ACAAATTCATGTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTGTTCA
** * *
991 AATATTAATAAATTGGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACTATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACTATTGTTTTAT
* ** * * * * *
1056 AACACAATGAAAA-GTCATAACAATTTGAAATAAATAAATGCTCAAATATTCATAACTATTTGAA
66 GACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
1120 CT
130 CT
1122 GGTTTGTTAA
Statistics
Matches: 252, Mismatches: 55, Indels: 12
0.79 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
181 201 0.80
182 11 0.04
183 40 0.16
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AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACTATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
TAGTTCGGTAAACAAATTCATGTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTGTTCA
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Indices: 1649--13214 Score: 4072
Period size: 181 Copynumber: 63.6 Consensus size: 181
1639 TTATTTTTTA
* * ** * * * *
1649 AAAACAATTGTTTTATGACAACA-AAAAGGTAATAATAATTTGAAATAAATAGTTGTTTAAATGG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
1713 CCATAATTATTTGAATTTATT-TAGTCAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACTT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
1776 TCGAAATAATAATAAAGTAGTATTATTTTCTTTTGGATAAGCTTTTATGAACT
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
1829 AAAACAATTG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATGATTGTTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** *
1893 TCATAACTCTTTGAACTTATTCGATAAACACATTTATCTTTTCGAATCTCTTGCTTATTAATTTT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
1958 TGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCATGTATAAACT
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * * * * *
2010 GAAACAATTATTATAAGACTAAATAAAA-GTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * *
2074 TCTTAACTATTTGAACTGGTTC-AGCAATATATTTATTTTTTAAATCTC-T-C--ACTAATTTTT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * *
2134 GGAATATTATTAAATTAGTATT-TTTT-GTTCCATATAAGCTTGTATGATCA
131 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * **
2184 AAAAAAGATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATGTTTGTTCAAATA
1 AAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * **
2248 TTCATAACTATTTGAACTAGTTCAAAAAAACA-ACTTTA-GTTTTAAATCT-TTGTTTATTAATT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
2310 TTTTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGGTTTTATGAAAT
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* *
2364 GAAACAATTGTTTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAAT
1 AAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
2428 AGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAA
64 AGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGA-TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * ** *
2492 TTTTTCAAATGTTAATAAATTACAATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACT
126 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
2548 GAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATA
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATA
* * * * * * * * *
2612 GTCTTAACTATTTAAACTGGTTCAACAAACACATTTATTTTTCAAAGCTCTTA-TTA--ATTTTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * * *
2674 TGGAATATTGTTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA-A
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* *
2725 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAACA--TCATAACGATTTGAGATAGATAATCAT-TTCAA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT--TGTTCAA
* * * *
2787 ATAGTAATAACTATTT-AAATTGTTTC-AGTAAATAGATTTAGTTTTTT-AA--T-TT-CTTACT
62 ATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGA-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATT
** ** *
2845 AATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAA-T
124 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * **
2902 AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGGTCATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTCATG
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * *
2966 TAGAT-ATGACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAA-
63 TAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * *
3029 TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGCATGAA-T
127 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
3083 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-T
* * *
3148 AG-CATAACTATTTGAACTTGCTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
64 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *
3212 TTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA-CTTATTTTGAATACA-CTTGTATGAA-T
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTGTATGAACT
** * *
3264 AGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTAAAATAGATAATTATTCAAAT
1 A-AAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
3328 AATCATAACTATTTGAACGTATTC-ATAAAACATATTTTATTTTTTAAAAT-T-TTATTTATTAA
64 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGAT-AAACAGA-TTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA
* *
3390 TTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTATATGAAC-
126 TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACT
* * * ** * * * * *
3445 AGAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAGAAAATTATTTATATA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
3510 GCCATAACAATTGGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
3575 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTAGCCTATATGAACT
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * ** * * *
3627 AATATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *** * * * * * *
3692 TTATGACTATCAAAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTC
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
3757 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGTATAAGCTTGTATGAAC-
131 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
3807 AAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
3872 TCACAACTATTTGAATTTATTC-AGTAATATAG--TTATTTTTTAAATCTTTTATTTATT-ATTA
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-
** * * *
3933 ACTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-ATTGAAATAAGGTTGTATGAA-T
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
3985 AGAAAAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGATTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
4050 ATCGTAATTGTTTTAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** *
4113 TGAAATATTAATAAATTAGAATTATGCTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-T
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * *
4164 AGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * * *
4229 GAT-ATAACTATTTGCA-TCGGTCAAGCCAACAGATTCATTTTCTAAATC-CGTTGCTTATTAAT
65 G-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAAT
* *** ** *
4291 TTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAATTGTATCAA-T
127 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
4345 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATA-GTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAAT
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* ** * * * * * *
4409 TGTTGTAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATATTTTAAATCTCTTA---A-TAATTT
64 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * *** * * *
4470 TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAA-T
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* ** * * * *
4522 AAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGGCAAGTATTCATACA
1 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * ** *
4587 GCCTTTACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACA-ATTT-TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
4649 TAATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC-
130 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
4701 ATAAATAATTGTTATATAACAAAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
4766 GTTATAACTATTTGAACTAGTTTGCTTAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * * ***
4831 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCCGAATAGGCTTATATGATGA
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
4883 AAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * ** * *
4948 CCACAATTATTTGAAC-TGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTCAATCTCCAACTTCTCAATTTT
66 TCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
5012 TAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATT
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * * *
5064 GACACAAATGTTTTATTATAAAGCAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
5129 TCATAACTATTTGAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTTGCTTATTAATTTT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * * * *
5194 TTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAACT
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * ** *
5246 AAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACGATTTAAAATAGATAATTGTTTTAATAT
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * * *
5311 TCTTAACTATTTGAACTGGTTCTACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTGCTTACTAATTTTA
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* ** ** * * *
5376 G-AATATTATTAGTTTACCAATATTTTTACTTTGAATAAGCTTGTATGGA-T
131 GAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
5426 AGAAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AATGATCATAATGATTTGAGATAGATAACTGTTCAAATA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * ** *
5490 GTTAT-ACTAATTTAAACTAGTTTGGTTAACAGATTTAGATTTTAAA--TC-T-CTTGTTAATTT
65 GTCATAACT-ATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* **
5550 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATATTGTATGAA-T
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
5602 AAAAATAATTGTTTTACGACCAAAC-AAAGTGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAAT
1 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * * ** *
5666 GGAT-GTGACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAA-T
64 AG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * *
5729 TTT-ATCATATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAA-T
128 TTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * *
5782 AGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTCAAATAAATAACTATTCAAAT
1 A-AAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *
5847 AGTTATAACTATTTAAACTTGTCTTG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TT-ATT
64 AGTCATAACTATTTGAACTTGT-TCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * *** **
5907 TTTGAACTATCATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTACAAAC-
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * ** **
5960 AAAATAATTATTTTATGAGAAACCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * ** * * ** *
6025 TCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCT-ATTAGA-TTA--TTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTT
66 TCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
** * * * ** ** * *
6086 CAAAATATCATTAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATCAAC-
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * *
6137 AGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGGAATAAATAATTATTCAAATA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
6202 GTTAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTT
* ** * *
6266 TCT-AAATATTAATAAATTAGTAATAATGATTTGAAATTG-ATAA--TTGT-TCAAAT
129 T-TGAAATATTAATAAATTAGT-AT--T-ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
** * ** * * * ** ** ** *
6319 AGTCATAATCATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAAATTATTTTC-TAAATCTCTTACAAAATTTTG
1 A-AAACAATTGTTT-TA-T-G-ACA--AAA-CAAA--A-GGTCAT-AA-CGATT-TGAAA--TAG
* ** ** * * ** * * * *
6383 AACAATTAAT-AAATTAGTTTTATTCTATTTCGAA-TAAGCTTATATAAGCTGAAATAATTGCTT
50 -ATAATTGTTCAAA-TAGTCATA-ACTATTT-GAACT-TG-TTCGATAAACAG-ATTTATT--TT
*** ** * * ** * * *
6446 TATGAAAAAACAAAAGGTCA-TAACAATTTGAAATAAATAATTGTACATATAGTCTTAACTGTTT
106 T-T-AAATCTC-TTA-CTTATTAA-TTTTTGAAAT-ATTAA---TAAAT-TAGTATT-A-T-TTT
* * ***
6510 GAACTAGTTTGAAAATAGATT-TATTTTCT
158 --A-T--TTTGAATA-AGCTTGTATGAACT
** * * *** *
6539 AAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATACTACTAAATTA-GT-ATTATTTTATTTCAAA-A-A
1 AAAA-CAATT-GTT-TT-A---TGACAA-A--AC-AAA--AGGTCA-TA-ACGATTTGAAATAGA
** *** ** * * * * * * ** *
6600 -AGCCTGTAGGAATAGAAATAATTGTTT-TA--TGATAGAATAAA-AGGTTATAACAATTTGAAA
51 TA-ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCG-ATAAACAGATT-T-A-TTTTTTAAA
* * * * * **
6660 TAGATAATTA-TTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAA-TAG-ATTTACTTTTTA
111 T--CT-CTTACTT--A-T--T---AA-TTTTTGAA-AT-ATTAATAAATTAGTA-TTA--TTTT-
* * *
6722 AATCTCTT-ATTAA--TTCT-TGAAAT
158 -AT-T-TTGAATAAGCTTGTATGAACT
*** *** * * * * *
6745 ATTAATA-AATTAGTTTTATTTTATTTCAATAA-G-CTTAATG--TTGAAA-AAAAAATT-TTTA
1 A--AA-ACAATT-GTTTTATGACAAAACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
** * * * * * * * * *
6803 AGATAAAACAAAAGGTA-AT-AAC--GATTC-A-AAATAG--GTAGTTGTTCAAATGCCCATACT
61 A-AT-AGTCATAA-CTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAAT-CTCTTACT
* * *** * * *
6860 TATTTGAACTATTTGGATAAACTGATTTATCTTTTAAATCCCTTA-TTAACTTTTGAA-ATA--T
120 TA-TT-AA-T-TTTTG--AAA-T-ATTAATAAATT-AGT--ATTATTTTA-TTTTGAATA-AGCT
* * *
6921 T-AATAAAGT
172 TGTATGAACT
* ** ** * * * * ** * *
6930 AATATTATT-TTTT-TGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTATTT--TATA-ATAA-AG--
1 AAAACAATTGTTTTATGACA-AAAC--A-A-AAGGT--CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * *** * * **
6987 CAGAA-GGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTATATAG-TCTTAACTGTTTGAACTAAT-
59 CA-AATAGTCATAACTATTTGAACT---T-GTTCGATAAACAGAT-TT-A-T-TTTTTA--AATC
* * * * * * * * * ** * * *
7049 TGGGTAAACATATTTATTTTT-AAATCTCTTACT-TATTAATTTTATGAATATTACTAAATTAGT
113 T--CT-TACTTATTAATTTTTGAAA--TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATT-TTGAATAAG-
* * * * *
7112 ATTATTTTATTCT
170 CTTGTATGA-ACT
* * * * ** * **
7125 -AAATAA--GTCTGTAT----AAATAGAA----ATAATTATTT--TAT-GAT-A--GAAC-AATA
1 AAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * * * *
7172 GGCTATAACAATTTGAAATAAATAATT-GTTCAAATAG-TCATAACTATTTAAA-CTAGTTCAAT
65 GTC-ATAACTATTTGAACT---T-GTTCGAT-AAACAGAT--TTATTTTTTAAATCT-CTT-ACT
* * * * * * ** * * * * *
7234 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTACTAAAATATTA--ATAAATTAG-TTTTATTT
120 ---T--ATTAATTTTTGAAATAT-TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA--T
* **
7296 TATTT
177 GAACT
* * ** * * ** * *
7301 CAAATAAAATTG-TATATTGA-AAAA-AAATTATTTTA-AGACAAAAT-AAAAAGCAATAA-CGA
1 -AAA-ACAATTGTTTTA-TGACAAAACAAA--AGGTCATA-ACGATTTGAAATAG--ATAATTG-
* * * * * * *
7360 TTTGAAATAG--GTAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAA-ATTGATTTA
57 -TTCAAATAGTCATAACTATT----T-G--A-ACTTGTTCG-A-TA-------AACA--GATTTA
* * * *
7422 TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAATAGTGTTATTTTATTTTGGAT
102 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
*
7483 AAGCTTTTATGAACT
167 AAGCTTGTATGAACT
* * *
7498 AAAACAATGGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
7563 GTCATAACTATTTAAACTTGTT-TAGTAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
** * * *
7627 TTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGATTAAGCTTGTATAAACT
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * * * *
7681 AAAACAATTATTATATGACTAACCCAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAGTAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
7746 TCTTAACTATTTGAACTGGCTCGACAAGCATATAT-TTTTTTAAATCTCTTA-TTA--ATTTTTT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
7807 G-AATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCT-AAAAACCTTGTATG-ATT
131 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
7855 AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-ATAAGGATCATAACTATTTTAAGATTGATATTTGTTCAAA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
7918 TGGTCATAACTATTTGAA-TTGGTGCGAAAAACAGATTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTACTAAT
63 TAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
** * * * * * * * * *
7982 TTTCAAAATATTAGTGAAGTAGTATTATTTGATTTCGGATAAGTTTTTTTGAACT
127 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
8037 GAAACAAATGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCGTAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
** * * *
8101 GTCA-AATCTATTACAACCTGTTTGATAAAC--A-TT-TTTTTT-AATCTCTTACTCATTAATTT
65 GTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *
8160 TTCAAATGTTAATAAATT-GCTATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
129 TTGAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * * *
8213 GAAATAATTATTTTATGACGAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCTAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* *
8278 T-ATTAACTATTTGAA-TTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTT
66 TCA-TAACTATTTGAACTT-GTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * **
8337 TTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTAT-AAAA
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * ** * * *
8389 AGAAACAAACTATTTTATGACAAAATAAATA--TCATAATTATTTGAGATAAATAATTGTTTAAA
1 A-AAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * *
8452 TAATCATAACTATTTGAAC-TGTTTCCG-TAAACATATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA
63 TAGTCATAACTATTTGAACTTG-TT-CGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
** * * * ** * * *
8511 TTTTCAAAATATTAATACATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCA-CAAAT
126 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
8566 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATG
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
8631 GACATAAGTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAA-TT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *** *
8694 TTCAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCCCAATAAACTTGTATGAA-T
129 TTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
8747 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAACA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
8812 ATCATAACTATTTGAAGTTGCTT-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * ** *
8876 TTGGAATATTAATAAACTAGCATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGAA-T
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * *
8928 AGAAACAAATTGGTTTT-TGACAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGATCAAA
1 A-AAAC-AATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * *
8992 TAGTCA-AAC-ATTTGAA-TGTGTTC-A-AAA-A-CTTT-TTTTTT-AAT-TTTTACTCATTAAT
63 TAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * **
9047 TTTTGGAATATTAAAAAATTTGTATTATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGAA-T
127 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * ** * * * *
9101 AAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATGGCAACTTGATATAGATAATTGTTCAAACA
1 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
9166 ATCATAACTATTTGAACTTGTT-TAGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT
* * *
9230 TTTG-AATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTT-AGATAAGCTTGTACGAA-T
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGTATGAACT
*** * * * *
9282 AGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * *
9347 GTCATAACTATTTGCACTCG-TCAGGCT-AACAAATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTTTTAAT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTC--GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAAT
* * * **
9409 TTTT-AGAATGTTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATGAA-T
127 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAACT
* * * *
9463 AGAAACAATTCTTTTATGACAAAACAAATA-GTCATCACGATTT-AAAGTAAATAATGGTTCAAA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
9526 TAGTTATAACTAATTCAACTGGTT-TAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAAT
63 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
** * *** * *
9590 TTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAAC-
127 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
9644 AAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA
1 AAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * *
9709 GTCATAATTATTTGAA-TTGATTCGGCAAACATAATTATTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * * **
9769 TTGAAATATTAATAAATTTGT-TTTTTTTACTCTAAATAAG-TTACTAAAAACT
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAACT
* * * * * * * * * *
9821 GAAAA-AATTGTTTTACGATAAAACAAAAAGTCCTAATGATTTAAAATAAAGAATTGTTGATATA
1 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * * * * *
9885 GTCTTAACTATTTGAACCGGTTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
9950 T-AGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTTTATGAACA
130 TGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
10002 AAAATAATTGTTTTATGATATAACAAAAGCTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** ** * *
10067 TCATAACTATTTGAACTAAT-TTAG-TAAACAGATCAATTTTTTGCATCTCCTAATTATTAATTT
66 TCATAACTATTTGAACT--TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * **** * ***
10130 CTAAAATATTAGTAAATGAGTATTA-TTTATACCAAATAGGCTTGTATGATGA
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * ** * * * **
10182 AAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAATTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAAGGG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * **
10247 CCAAAATTATTTGAA-TTGATTCTATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAAAT
66 TCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * * * * *
10310 TTGAAATATTAATAAGTGA-TATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGTATT
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * ** * * ** *
10362 GAAACAATTTTTTTACAATAAAAATAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 AAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
10427 GTCATAACTATTTGAACTT-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * *
10491 CT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTAT-ACATT
130 -TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ACT
* * * * **
10543 AAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTCATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
10608 GCTTAATTATTTGAACTAGTTC-AGTAAACACATTTATTTTTTAAA--TC---CTTATTAATTTT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * **
10667 TGAAATAGTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAA-T
130 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * ** * ** * *
10718 --ACCAATT-ATTT-TG----AATAATTGGT-ATTA-TTTTATGTTAAA-ACA-AAATG-TCATA
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TG--AAATAGATAATTGTTCA-A
* * ** * * * * * ** * **
10770 ACAATTCGA-AA-TAGATG-A-TAGTTCAAATAGACATGA-CTATTTGAACTT-GTTCGGCAAAC
62 A-TAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTC-GATAAACA-GATTTATTT---TTTAAATC-TCTTAC
** * * * * * * * * *
10829 AAATTTATTCTTT-AAATCTT--TAACTTATTAATT-TTTAGAATATT-AATAA-ATTAATATTA
119 TTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGT-ATTATTT--TATTTTGAATAAGCTT-GTATGA
**
10888 TTTT
179 -ACT
*** * * ** * * * *** * *
10892 ATTCCAAATATACTTTTATGAATAGAAAC-AATTGT-TTTATGATAAAACAAAAGATCATAATGA
1 AAAAC-AAT-T-GTTTTATG-ACA-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGAT-A-ATTG-
* * * * * * * **
10955 TTTGAAATA--AATAATTA-TTCAAATAG-TC-AT-AAC-TATTTGAACTCGCTTGGTAAAAAGA
57 -TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTT--A-T---TT--T--TTA-A
* * * *
11013 TTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT-AGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-TTC
110 ---ATCTCTT--A-C---T---TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** *
11076 CAAATAAGCTTGCATGAA-T
162 TGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * *
11095 AGAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATA
1 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ** * * * * * *
11160 GTCATAACTATTTGAACGTGTTTAATAAAAAAATTCATTTTTCAAAT-T-TTCGCTTA-TAA-CT
65 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTT
* *
11221 TTGGAATATTAATTAATTTA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAAC-
129 TTGAAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACT
* * * ** **
11273 AAAACCAATTGTTTTCTGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTTTAAGGAGATAATTGTTCTGAT
1 AAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * ** *
11337 AGTCATAACTCTTTGAACTTGTT-TAGCAAACAGATTCATTTTTCTAGTTCTCTTACTCATTAAT
64 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGA-TAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAAT
* * ** * * * * *
11401 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAACTTATGTTAACC
127 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
11456 GAAACAATT-TTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
11520 TCATGACTATTTGAAATTGTTCGGTAAACATATTTATGTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTC
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * *
11585 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTT-AATAAGCTTGTATGAACA
131 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * **
11636 AAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTTAT-A--A--T--AAT---TTGTTGTTCAAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
11691 TCATAACGATTTGAACTT-TTGTGGTGAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTAT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTT-CGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T
* * * * * * *
11755 CTG--TTAGTAATAAATTTGAATTATTTTA-TTTGAAATAGGCTTGTAT-AAAT
129 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACT
* * * * ** *
11805 AGATGA-AATCT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTCCAAATAGATAATTGTTTAAA
1 A-A-AACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * *
11868 TAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT
63 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * * *
11933 TTTGGAATATTAACAACTTACTATTATTTTATTTCGAATAACCTTATATGAACT
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* ** * *
11987 AAAATAATT-TTCTTATGAC-AAACAAAA-GTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTTAAAAT
1 AAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAAT
* * * * * * * * *
12049 AGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAAAT-TTTTAATTATTAATT
64 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* ** * * * *
12113 GTCAAAATAATAATAAATTAGTATT-TATTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAA-T
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* *** * * *
12166 AGAAACTATT-TTTTAT-AGTGGAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAA-A-ATTAATTGCTCAAA
1 A-AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAA
* * * * * *
12227 TAGTTATAACTATCTG-ACTAGTTTGATAAA-AGATTTA-TTTTTAAA-ATC-T-CTTATGAA-T
63 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * ** * * * * * *
12285 TTTGTAAT-TTAATAGATTTTTATTATTTTATTCTAAACAAAC-TATATGAACA
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * *
12337 AAAAC-A-TATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * * * * * *
12398 GTCAATAATTATTAGAACTAATATT--TTAAGTAGA-TAATTGTTCAAATAATAATAAC-TATTT
65 GTC-ATAACTATTTGAACT--TGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CT-CTTACTTA-TT
* * *
12459 AAGCTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTT-TTGAATGTTAAT
124 AA--TT-TTT-G--AA-ATA-TTA---AT-AAA--T-TAG--TATT-ATTTTATT---T-TGAAT
* * **
12523 AA-ATTAGTATTATTT
167 AAGCTT-GTATGAACT
* ** * * * * ** * * ** ** * *
12538 TATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGA-GTAAAT-AAAGGGTTAGAATG
1 AAAAC--AAT-TG-TTTTATG-AC-AAAACAA-AAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATA-ATTG
* * * * ** *
12601 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAAATGATTCGGCAAACACATTTATT
57 --TTCAAATAG-TCA-TA-ACT-AT--T-TGAA-C---T----TG-TTCGATAAACAGATTTATT
* * * * * * *
12666 TTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATCTAAATAA
104 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
*
12731 GCTTATATG-A-T
169 GCTTGTATGAACT
* ** * * * *
12742 AAGAA-ATAGTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGACCATAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAA
1 AA-AACA-A-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
12805 T-GATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGA-AAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAA
63 TAG-TCATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * * *
12868 TTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAA-ATTTTAATGAATT
126 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAACT
* * * *
12924 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
12989 TTATATCTATTTAAACTTGTTAC-ATAAACATATTAATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTT
66 TCATAACTATTTGAACTTGTT-CGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TT
** * *
13053 TTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATT
128 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
13106 GAAATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
1 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
13171 TCTTAACTATTTGAACTAGATCGGCA-AAACACATTTATTTTTTA
66 TCATAACTATTTGAACTTGTTC-G-ATAAACAGATTTATTTTTTA
13215 TTATTAAATT
Statistics
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0.70 0.17 0.13
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165 15 0.00
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Found at i:4688 original size:537 final size:535
Alignment explanation
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1640 TATTTTTTAA
* * ** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** * *
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124 T-AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTAT
* * * * * * * * *
1839 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATGATTGTTCAAATAGTCATAACTCTT
187 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATT
* * * ** * * * *
1904 TGAACTTATTCGATAAACACATTTATCTTTTCGAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATGTTAA
252 TGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAA
* * * * * * *
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314 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
2033 TAAAA-GTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACTATTTG-AACTGGTT
378 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAAACTGG-T
* * * * * * * *
2095 CAGC-AATATATTTATTTTTTAAATC---T-CTCACTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTAT
441 CAACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCAT
* *
2155 T-TTTTGTTCC-ATATAAGCTTGTATG-ATCAA
505 TATTTTATTCCGA-ATAAGCTTGTATGAAT-AG
* * * * * ** * *
2185 AAAAAGATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATGTTTGTTCAAATAT
1 AAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* **** * *
2249 TCATAACTATTTGAACTAGTTCAAAAAAACA-ACTTTA-GTTTTAAATCTTTGTTTATTAATTTT
64 TCATAACTAATTGAACTAGTT-TGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTT
* * * ** * * * *
2312 TTAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGGTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTT
124 TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATT-AT
* * * * *
2376 TTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-AAATCTA
187 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAA-CTA
* * * * * * * *
2439 TTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGT
250 TTTGAACTTGTTCGGTAAACAGA-TT-TATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATAT
** * * * *
2504 TAATAAATTACAATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATAACT
311 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACA
2568 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-ATAATAGTCT-TAACTATTT-AAACT
375 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGT-TATAACTATTTGAAACT
* * * **
2630 GGTTCAACAAACACATTTATTTTTCAAA---GCT-CTTATTAATTTTTTGGAATATTGTTAAATT
438 GG-TCAACAAACAGATTTATTTTT-AAATCTGTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATT
* * * *
2691 AGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAG
500 AGCATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * *
2727 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAACA-TCATAACGATTTGAGATAGATAATCATTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG
* * * * * * * * *
2791 TAATAACT-ATTTAAATTGTTTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTT-AATTTCTTACTAATTTTCAA
64 TCATAACTAATTGAACTAGTTT-GGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAA
* * ** * *
2854 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTATTTTAT
127 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTAT
* * *
2919 GACAAAACAAAAGGGTCATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTCATGTAG-ATATGACTATTTG
192 GACAAAACAAAA-GGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCT-TAACTATTTG
* *
2982 AACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTAAAATATTAATAAA
254 AACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT-AAATATTAATAAA
* * *
3047 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAA
318 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
3112 GATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTG-AACTTGCTCAATA
383 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCAACA
* * * *
3175 AACAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGCATTA-C
446 AACAGATTTA--TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATT
**
3239 TTATTTTGAATACA-CTTGTATGAATAG
509 TTATTCCGAATA-AGCTTGTATGAATAG
** * *
3266 AAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAA
1 AAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** * * *
3330 TCATAACTATTTGAAC--GTATTCATAAAACATATTTTATTTTTTAAAATTTTATTTATTAATTT
64 TCATAACTAATTGAACTAGT-TTGGT-AAACAGA-TTTATTTTTT-AAA-TCT-CTTATTAATTT
** * * * * * *
3393 TTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAACAGAAATAATTATT
123 TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATT
* ** * * * * * *
3458 TTATGATAAAACAAAATATCATAATGATTTGAAATAGAAAATTATTTATATAGCCATAACAATTG
188 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTT
* * * *
3523 GAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATA
253 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATA
* * * * * ** *
3588 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATTAGCCTATATGAACTA-ATATAATTGTTTTATGATGAAATA
316 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * ** *
3652 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTA-TCAAAACTTGTTCAA
380 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCAA
* * * * * **
3716 TAAACATATTTATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTAT
444 CAAACAGATTTATTTTT-AAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTAT
* *
3781 TTTAATT-CGTATAAGCTTGTATGAACA-
508 TTT-ATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * *
3808 AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * * * *
3873 CACAACTATTTGAATTTA-TTCAGTAATATAG--TTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTATTAAC
65 CATAACTAATTGAA-CTAGTTTGGTAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAA-
** * * *
3935 TGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGGTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTT
127 --AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAACAATTATTT
* * * * * * * ** * * * *
3999 TATAACAAAACAAAAGATTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAATCGTAATTGTTTT
189 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTG
** *
4064 AACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCT-CTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
254 AACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAA
* ** * * * *
4127 ATTAGAATTATGCTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATAGA
317 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * *
4192 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGATATAACTATTTGCATC-GGTCAAGCC
382 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTGGTCAA-CA
* * *
4256 AACAGATTCATTTTCTAAATCCGTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTT
446 AACAGATTTATTTT-TAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTT
* ** *
4321 TATTCCAAATAAAATTGTATCAATAG
510 TATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * *
4347 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATAGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATTGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
** * * * *
4412 TGTAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAAATTTATATTTTAAATCTCTTAATAATTTTCAAAAT
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAAT
** * * * * *
4477 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAATAAAAACATTTGTTTTATGAC
130 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGAC
** * * * *
4542 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGGCAAGTATTCATACAGCCTTTACTATTTGAACTGG
195 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTTG
* * * * * *
4607 TTTGGCAAACA-ATTT-TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTAATAATATTATTAGATTAGT
260 TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT-A-AATATTAATAAATTAGT
* * * * * * *
4670 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTATATAACAAAAGAAAAGGTTA
323 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * * *** *
4735 TAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTG-AACTAGTTTGCTTAACAGA
388 TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTGGTCAAC-AAACAGA
** * * *
4799 TTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTC
452 TTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTC
* * *
4863 CGAATAGGCTTATATG-ATGAA
515 CGAATAAGCTTGTATGAAT-AG
* * * * *
4884 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * ** * * *
4949 CACAATTATTTGAACT-GATTCGATAAATTGATTTATTTTTTCAATCTCCAACTTCTCAATTTTT
65 CATAACTAATTGAACTAG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT----CTTATTAATTTTT
* ** * ** * * *
5013 AAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGACACAAATGTTTT
125 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTT
* * * * * * * * * *
5078 ATTATAAAGCAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGA
* * * ** * * *
5143 ATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAA
255 ACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCCTACTTATTAA--TTTTAAATATTAATAA
* * * * * *
5208 AATAATATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAA
317 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * ** * *
5272 AAGGTCAGAACGATTTAAAATAGATAATTGTTTTAATA-TTCTTAACTATTTG-AACTGGTTCTA
381 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTT-ATAACTATTTGAAACTGG-TCAA
* * * * * ** * *
5335 CAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTGCTTACTAA-TTTTAGAATATTATTAGTTTACCAATAT
444 CAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTA-
* *
5399 TTTTACTT-TGAATAAGCTTGTATGGATAG
507 TTTTA-TTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * *
5428 AAACAATTGTTTTATAACAAAAC-AATGATCATAATGATTTGAGATAGATAACTGTTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * *
5492 TAT-ACTAATTTAAACTAGTTTGGTTAACAGATTTAGATTTTAAATCTCTTGTTAATTTTTGAAA
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* * * ** * * *
5556 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATATTGTATGAATAAAAATAATTGTTTTACGA
129 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGA
* * * ** *
5621 CCAAAC-AAAGTGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAAT-GGATGTGACTATTTGAA
194 CAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCATATAGCCT-TAACTATTTGAA
* * * * * * *
5683 CTTATTTGGTAAACAGATTAATTTTTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTTATCATATTAATAAATT
256 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTA-AATATTAATAAATT
* * * *
5748 AGTATTCTTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAACAAAAG
320 AGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAG
* * * * * * * * ***
5813 TTTATAATGATTTCAAATAAATAACTATTCAAATAGTTATAACTATTT-AAACTTGTCTTGTAAA
384 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTGGTC-AACAAA
* * * * *
5877 CAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTTATTTTT-GAACTATCATTAAATTAGTATTATTTT
448 CAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAA-TATTAATAAATTAGCATTATTTT
* * ** *
5937 AATCCAAATAAGCTTGTACAAACA-
511 ATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * **
5961 AAATAATTATTTTATGAGAAACCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * * * *
6026 CTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCT-ATTAGA-TTA--TTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTC
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGG-TAAACAGATTTATTTTTTAA--ATC-T-CTTATTAATTTTT
* * * * ** * * * * * * *
6087 AAAATATCATTAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTATCAACAGAACCAATTGTTTG
125 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTT
* * * * * *
6152 ATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGGAATAAATAATTATTCAAATAG--TTAAAACTATTT
190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTT--AACTATTT
* * * * * * *
6215 AAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCTAAATATTAAT
253 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTT-ATTAA-TTT-TAAATATTAAT
* ** * ** * ** *
6279 AAATTAGTAATAATGATTTGAAATTG-ATAA--TTGT-TCAAATAGTCATAATCATTTGAACTGG
315 AAATTAGT-AT--T-ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GAATAGAAACAATTGTTT-TA-T-G
* * ** ** ** * * ** *
6340 TTCAGTAAATAAAATTATTTTC-TAAATCTCTTACAAAATTTTGAACAATTAAT-AAATTAGTTT
372 -ACA--AAA-CAAA--A-GGTCAT-AA-CGATT-TGAAA--TAG-ATAATTGTTCAAA-TAGTTA
* ** * * ** * * * * *
6403 TATTCTATTTCGAATAAGCTTATATAAGCTGAAATA-ATTGCTTTATGAAAAAACAAAAGGT-CA
423 TA-ACTATTT-G-A-AA-CTGGT-CAA-C--AAACAGATTTATTT-T--TAAATC---TGTTACT
** * * * * * ** * *
6466 TAACAA--TTT-GAA-ATAAATAATTGTA-CATATAGTCTTA-ACTGTTTGAA-CTAGTTTGAA-
473 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAAT-TAGCAT-TA-TTTTATTCCGAAT-AAGCTTGTATGAAT
6523 A-
534 AG
* * * * * * *** * * * * *
6524 ATAGATTTATTTTCT-A-AAATCTCTTAGTTATTA--ATTT---TTAGA-ATACTACT-AAATTA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATA-ATTATTCAAA-TA
** * * ** ** * * * * **** *
6580 GT-ATTATTTTATTTCAAAAAAGCCT-GTAGGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAATA-AAA
63 GTCA-TA-ACTAATT-GAACTAGTTTGGTA--AACAG-ATTTATT-TTTTA-AATCTCTTATTAA
* * * ** * ** * * *
6642 GGTTATAACAAT-TTGAAATAGA-TAATTATTCA-AGTAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTG-G
120 -TTTTTAA-AATATT--AATAAATTAA-TATT-ATTTTATTTTAAA-TA----AGCTTGTATGAA
* * * ** * * * ** *
6703 TAAATAGATTTACTTTT-T-A-AATCTCTTATTAA-TTCTTGAAATATTAAT-AAATTAGTTTTA
174 TAAAAACAATTA-TTTTATGACAA-AAC--A-AAAGGTCAT-AACGATT--TGAAA-TAG--ATA
* * * * * * * ** **
6763 TTTTATTTCA-ATAAG-CTTAA-T-GTTGAAAAAAAAATTTTTAAGATAAAACA-A--AAGGTAA
228 -ATTA-TTCATAT-AGCCTTAACTATTTG------AACTTGTT-CGGT-AAACAGATTTATTTTT
* ** * * **** * ** *
6821 TAACGAT-T-CAAAATAGGTAGTTGTTCAAATGCCCAT-ACTTA-T-TTGA-ACTA-TTTGGATA
282 TAA--ATCTCCTACTTA-TTAATT-TT-AAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTTGAATA
* * *** * ** * * ** * * ***
6879 AACTGATTTATCTTTTA-AATCCCTTATTAACTTTTGA-AATATTAATAAAGTAATATTATTTTT
341 AGCT--TGTAT-GAATAGAAACAATTGTT---TTATGACAA-AACAA-AAGGTCATA--A-CGAT
** * * * * * ** * * *
6942 TTGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTAT-TTTATAAT-AAAGCAGAAGGTC-A-TAACA-
395 TTGAAAT-AG-ATA-AT-TGTTCAAATAGTTATAACTAT-TTGAAA-C---TGGTCAACAAACAG
** ** * * ** * *
7002 ATTTGAAATAAATAAT-TATTTA-TATAGTCTTAACTGTTT-GAACTAATTGGGTAAACATA--T
451 ATTT-ATTTTTA-AATCT-GTTACT-TA---TTAA-TTTTTAGAA-T-ATT-AATAAA-TTAGCA
* * * *
7062 TTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAA--TTTTATGAATATTACT
504 TTA-TTTT--AT-TC---C-GAATAAGCTTGTATG-A-A-TA-G
* * * * * * *
7104 AAATTAGTATTATTTTAT-TC-TAA-ATAAGTC-T---G-TAT-AAATAGAAATAATTATTTTAT
1 AAA-CA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAG--ATAATTA-TTCA-
* * * * * * * * * *
7160 GATAGAACAATAGGCT-A-T-AAC-AATTT-G-AAATA-AATAATTGTTCAAATAGTC--A-TAA
59 AATAG-TC-ATA-ACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTCTTATTAA
* * * **
7215 CTATTTAAACTAGTTCAATAAA-TAGAT-TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTA-CTAAAATAT
120 -TTTTTAAAATA-TT-AATAAATTA-ATATTA--TTTT--AT-T-TTA--AATAAGCT--TGTAT
* * *** ** ** *
7277 TAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCAAATA-AAATTGT-AT----A-TTGAAA-A-AAAATTATT
171 GAATAAA-AACAATTATTTTATGACAAA-ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA--
* ** * * * * * ** * *
7333 TTAAGACAAAATAAAAAGCAATAACGATTTGAAATAGGTAGCTGTTCAAATGGCCA-TAATTATT
232 TT----C---AT--ATAGCCTTAACTATTTGAACT-TGT-TC-GGT-AAACAG--ATTTATTTTT
* * * ** * * ** ** ** *
7397 TGAA-CT-AT-TTTGGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTTGAAATATT-AAT
282 TAAATCTCCTACTTATTAATTTTAAATA-TTAATAAAT-TAGTATT-A-TTTT---ATTTTGAAT
** * * * * *
7458 AAAATAGTGTTATTTTATTTTG-GATAA--GCTTTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAA
340 AAGCT--TG-TA--TGA-ATAGAAACAATTG-TTTTATG-AC----A--A-------A--AC---
* * *
7520 ATAAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTTGT
379 ---AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGG
* ** * * ** *
7584 TTAGTAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAGT
440 TCAACAAACAGATTT-ATTTTT-AAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGC
* * *
7649 ATTATTTTATTCTGATTAAGCTTGTATAAACTA-
503 ATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * ** * * * * *
7682 AAACAATTATTATATGACTAACCCAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAGTAGT
1 AAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * ** * * * **
7747 CTTAACTATTTGAACTGGCTCGACAAGCATATAT-TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTTGAAT
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * * *
7811 ATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCTAAA-AACCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGA
130 ATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * * * * *
7874 C-AAA-ATAAGGATCATAACTATTTTAAGATTGATATTTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAA-
194 CAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAC
* ** * * * * * * *
7936 TTGGTGCGAAAAACAGATTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTACTAATTTTCAAAATATTAGTGAAG
257 TT-GTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT--AAATATTAATAAAT
* * * * * * * *
8001 TAGTATTATTTGATTTCGGATAAGTTTTTTTGAACT-GAAACAAATGTTTTATGACAAAACTAAA
319 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * ** * * ** *
8065 GGTCGTAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATGGTCA-AATCTATTACAACCTGTTTGATA
383 GGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAA-CTATTTGAAACTGGTCAACA
* * *
8128 AAC--ATTT-TTTTT-AATCTCTTACTCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATT-GCTATTATT
446 AACAGATTTATTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGC-ATTATT
* **
8187 TTGTTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-G
509 TTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * * * * * ** *
8214 AAATAATTATTTTATGACGAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * ** * * **
8279 -ATTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGGAA
65 CA-TAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAA
* * * * * * *
8343 TATTATTAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTAT-AAAAAGAAACAAACTATTTTAT
129 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAA-AAAC-AATTATTTTAT
* ** * * * * * ** *
8407 GACAAAATAAATA--TCATAATTATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAA
192 GACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAA
* * * *
8470 C-TGTTTCCGTAAACATATTTAGTTTTTAAA--T-CT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATACA
256 CTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT--AAATATTAATAAA
* * ** * ** *
8530 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA
318 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * ** * * **
8595 GATCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATAAGTATTTG-AACTTGTTCAGTAA
383 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCAACAA
** * * * *
8659 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTT
447 ACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTT
* *
8724 ATTCCCAATAAACTTGTATGAATAG
511 ATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * * * *
8749 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAACAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * *
8814 CATAACTATTTGAAGTTGCTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTTTTG
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTA
* * ** * * * *
8879 GAATATTAATAAACTAGCATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGAATAGAAACAAATTGGTTT
126 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAC-AATT-ATTT
* * * * *
8944 T-TGACAAAATAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTC-AAAC-ATTT
189 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-ATTCATATAGCCTTAACTATTT
** * *
9005 GAA-TGTGTTC---AAA-A-ACTTT-TTTTTT-AAT-TTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAA
253 GAACT-TGTTCGGTAAACAGA-TTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAA
* * ** * * *
9061 AAAATTTGTATTATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAAC
314 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * ** * * * * * * * *
9126 AAAAAGTTATGGCAACTTGATATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTG-AACTTGTTTA
379 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCA
** * * * * * * *
9190 GTAAAAAAATTCATTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTA
443 ACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTA
* ** *
9255 TCTTATT-TTAGATAAGCTTGTACGAATAG
507 TTTTATTCCGA-ATAAGCTTGTATGAATAG
*** * * * * *
9284 AAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ** * * *
9349 CATAACTATTTGCACTCGTCAGGCT-AACAAATTCATTTTTTAAATCCATTACTTTTTAATTTTT
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGG-TAAACAGATTTATTTTTTAAAT-C--T-CTTATTAATTTTT
* * ** * *** * *
9413 AGAATGTTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATGAATAGAAACAATTCTTT
125 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAG-CTTGTATGAATAAAAACAATTATTT
* * ** * * *
9477 TATGACAAAACAAATA-GTCATCACGATTT-AAAGTAAATAATGGTTCAAATAG-TTATAACTAA
189 TATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTATTCATATAGCCT-TAACTAT
* * ** * * *
9539 TTCAACTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAA
251 TTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT--AAATATTAA
* *** * * * *
9604 TAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAACA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAA
314 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * *
9668 CAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG-AATTGATTC
378 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTG-GTC
** * * * * *
9732 GGCAAACATAATTATTTTTTAAATC---T-CTTACTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTTG-TT
442 AACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCAT
* * ** * **
9791 TTTTTTACTCTAAATAAG-TTACTAAAAACT-G
505 TATTTTATTCCGAATAAGCTT-GTATGAA-TAG
* * * * * * * * * * *
9822 AAAAAATTGTTTTACGATAAAACAAAAAGTCCTAATGATTTAAAATAAAGAATTGTTGATATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * ** * *
9887 CTTAACTATTTGAACCGGTTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTA
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTTA
* * * * * * * * * *
9952 GAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTTTATGAACAAAAATAATTGTTTTA
126 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTA
* * * * * * * * * *
10017 TGATATAACAAAAGCTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
191 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAA
** ** ** ** * *
10082 CTAATTTAGTAAACAGATCAATTTTTTGCATCTCCTAATTATTAATTTCTAAAATATTAGTAAAT
256 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTT-T-AAATATTAATAAAT
* **** * * * * *
10147 GAGTATTA-TTTATACCAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAA
319 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
** * * * ** ** * * * * * *
10210 ATTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAAGGGCCAAAATTATTTG-AATTGATTCTATAA
383 GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTG-GTCAACAA
* * * * ** * * *
10274 ACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTAACTTATCAAAATTT-GAAATATTAATAAGTGA-TATTATT
447 AC-AGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTATT
** * * * *
10336 TTATTTTGGATAAGCTTTTATGTATTG
509 TTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* ** * * ** * *
10363 AAACAATTTTTTTACAATAAAAATAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * *
10428 TCATAACTATTTGAACT-TTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTC
64 TCATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAATTTT-
* * * * *
10492 T-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTAT-ACATTAAAACAATTATT
124 TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAAACAATTATT
* * * * * *
10555 TTATGACTAAATAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-TCATAGGCTTAATTATT
188 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAT-ATAGCCTTAACTATT
* * * *
10619 TGAACTAGTTCAGTAAACACATTTATTTTTTAAA--T-C--CTTATTAATTTTTGAAATAGTAAT
252 TGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAAT
* * * ** * *
10679 AAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATACCAATTATTTTGAATAATTGGTATT
315 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT----A-GA-----AACAATT-G----
** * * * * * ** *
10744 ATTTTATGTTAAAACAAAATGTCATAACAATTCGAAATAGATGATAGTTCAAATAGACATGACTA
365 -TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTA
* ** *
10809 TTTG-AACTTGTTCGGCAAACAAATTTATTCTTTAAATCT-TTAACTTATTAATTTTTAGAATAT
429 TTTGAAAC-TGGTCAACAAACAGATTTATT-TTTAAATCTGTT-ACTTATTAATTTTTAGAATAT
** * *
10872 TAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATATA-CTTTTATGAATAG
491 TAATAAATTAGCATTATTTTATTCCGAATA-AGCTTGTATGAATAG
* * *
10917 AAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
10982 CATAACTATTTGAACTCGCTTGGTAAAAAGATTTATTTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTA
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTA
* * * ** * * * **
11047 GAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCCAAATAAGCTTGCATGAATAGAAATAATTGGTTTA
126 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTTA
* * * * * * * *
11111 TGATAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
191 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAA
* *** * * * * * * * ** *
11176 CGTGTTTAATAAAAAAATTCATTTTTCAAATTTTC-GCTTA-TAACTTTGGAATATTAATTAATT
256 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTAAATATTAA-TAAAT
* *
11239 TA-TATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAACCAATTGTTTTCTGACAAAACAAA
319 TAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * ** ** * * * * *
11301 AGGTCATAA-TATTTTTAAGGAGATAATTGTTCTGATAGTCATAACTCTTTG-AACTTGTTTAGC
382 AGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCAAC
* ** * * * *
11364 AAACAGATTCATTTTTCTAGTTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
445 AAACAGATTTA-TTTT-TAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTAT
* * * * * **
11429 TTTACTT-CAAATAAACTTATGTTAACCG
508 TTTA-TTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * *
11457 AAACAATT-TTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * * * *
11521 CATGACTATTTGAAATTGTTCGGTAAACATATTTATGTTTTAAATCTTTTGCTTATTAATTGTCA
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTA
* *
11586 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTT-AATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTATTTT
126 AAATATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTTT
* * * ** * * * * *
11650 ATGACAAAATAAAAAGTTAT-A--A--T--AAT---TTGTTGTTCAAATAGTCATAACGATTTGA
190 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGA
* * ** ** *
11705 ACTT-TTGTGGTGAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCT-GTTAGTAATAA
255 ACTTGTT-CGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATT-T-TAAATATTAATAA
* * * * *
11768 ATTTGAATTATTTTA-TTTGAAATAGGCTTGTATAAATAGATGA-AATCT-TTTTATGACAAAAC
317 ATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGA-AACAAT-TGTTTTATGACAAAAC
* * * ** * * * *
11830 AAAAGGTTATAGCAATTCCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTT-AAACTTGTTCA
379 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCA
* * * * * * * *
11894 ATAAATAGTTTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAACAACTTA-CTATT
443 ACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGC-ATT
* * *
11958 ATTTTATTTCGAATAACCTTATATGAACTA-
506 ATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* ** *
11988 AAATAATT-TTCTTATGAC-AAACAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTATTTAAAATAG
1 AAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG
* * * * * * * * *
12051 TCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAAATTTTTAATTATTAATTGTC
64 TCATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTT
* * * * * *
12116 AAAATAATAATAAATTAGTATT-TATTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACTATT-TTT
125 AAAATATTAATAAATTAATATTAT-TTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTT
*** * * ** * *
12179 TAT-AGTGGAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAA-A-ATTAATTGCTCAAATAG-TTATAACTAT
189 TATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTATTCATATAGCCT-TAACTAT
* * * * * * *
12240 CTG-ACTAGTTTGATAAA-AGATTTA-TTTTTAAA-AT-CT-CTTATGAATTTTGTAAT-TTAAT
251 TTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT-AAATATTAAT
* ** * * * * * * * *
12298 AGATTTTTATTATTTTATTCTAAACAAAC-TATATGAACAAAAAC-A-TATTTTATGAC-AAACA
315 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * **
12359 AAAGGTTATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAATAATTATTAG-AACTAAT-A
380 AAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAAACTGGTCA
** ** * * * * * *
12421 TTTTAAGTAGA-TAATTGTTCAAATAATAATAAC-TATTTAAGCTTGTTTGGTAAACATATTTAT
443 --ACAAACAGATTTATT-TTTAAAT-CT-GTTACTTA-TTAA---T-TTT--TAGA-ATA-TTA-
* * ** * * * **
12484 TTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTT-TTGAATGTTAATAA-ATTAGTATTATTTT
493 --AT-AAA--T-TAGC--ATT-ATTTTATT--CCG--AATAAGCTT-GTATGAATAG
** * * * ** * * ** ** * *
12539 ATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGA-GTAAAT-AAAGGGTTAGAATGA
1 AAAC--AAT-TG-TTTTATG-AC-AAAACAA--AAGTCATAACG-ATTTGAAATAG--ATAATTA
* * * * * * * **** * *
12602 TTTGAAATAG--ATAA-TTATTCTAA-TAGTCT--TAACCATTTGAAATGATTCGGCAAA-CACA
55 -TTCAAATAGTCATAACTAATT-GAACTAGTTTGGTAAACA---G-ATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * *
12660 T-TTATTTTTTAAATCTTTTACT-GATTAAT-TT-TTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTA
114 TATTAATTTTTAAA-ATATTAATAAATTAATATTATT---TTATT-TT-A------A--A---TA
* * * * ** *
12721 ATCTAAATAAGCTTAT-ATGATAAGAAATAGTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGACCATAGCGATT
162 AGCT---T--G--TATGA--ATAA-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * * * * * * * * *
12784 TGAGATTGATATTTGTTCAAAT-GATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAATAGCTTTAGTTT
217 TGAAATAGATAATTATTCATATAG-CCTTAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTT
* * * * * * * *
12848 TTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAA-A
281 TTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * *
12912 TTTTAATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAA
344 TTGT-ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * *
12977 TTGTTCAAATGGTTATATCTATTT-AAACTTGTTACATAAACATATTAATTTTTTTAAATCTCTT
408 TTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTGGTCA-ACAAACAGATT--TATTTTTAAATCTGTT
* * * * * * *
13041 GCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATT
470 ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATA
13106 G
535 G
* * * * * * *
13107 AAATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * *
13172 CTTAACTATTTGAACTAGATCGGCAAAACACATTTATTTTTT--AT-TATTAAATTAGTATTATC
65 CATAACTAATTGAACTAGTTTGG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT--ATTA--ATT-T-
** * * * * * * * * *
13234 TTAATCGGAATAAGCTTATATGAAAAGAA-A-CA-ATTATTTTATGACAA-CAT-AAAG-ATCAT
123 TTAA----AAT-A--TTA-AT-AAATTAATATTATTTTATTTTA-AATAAGCTTGTATGAATAAA
*** * ** * * * * * *
13293 AACAATT-TGAGATAGATAATTGTTCAAGTA-GTCATAACTATTTG-AATTGAT--TCA-ACAAA
178 AACAATTATTTTAT-GACAA---AACAA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATA
* * * * * * * * * * *
13352 CAG-ATTTAGT-TTTTAA-AT-CTC--T----A-A-TTAATTTTTAAA---AC-A-TTAATAA-A
238 TAGCCTTAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATT
* * * ** * * *
13399 TT-AGTATT-AT--TTTATTA-TAAATAATTTTG--T-A--TG-----AAGAGAAACAATTGTTT
303 TTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
** * * ** **
13449 TATGACAAAA-AAAATCTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTG
368 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
* ** * * * *** *
13513 -AACATGTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATA
433 AAAC-TGGTCAACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * **
13577 AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAG
496 AATTAGCATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * *
13617 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-CGA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-
* * * * **
13681 TCATAACT-ATTTAAGTTTGCTTAATAAACAGA-TT-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
64 TCATAACTAATTGAA-CTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTT
** ** * * ** * **
13743 TGGAATACAAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTT
124 TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTT
* * * * * * *
13808 TATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
189 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTG
* ** * *
13873 AACGTGTTTAG-AAGATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
254 AACTTGTTCGGTAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATA
* * * * * *
13936 AATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAACCGTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACA
316 AA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
14000 AAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAAGAACTATTT-AAACTTGTTCAG
380 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCAA
* * * * * **
14064 TAAACTA-ATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTGA-TTTTAGGAATATTAATAAATTAATAT
444 CAAAC-AGATT--TATTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGCAT
** * *
14127 TATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-G
505 TATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAG
* * ** *
14158 ATACAATTATTTTAAAATC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* ** * * * * * *
14222 TTATGGCTATTTGGACT-TTTTGGGTAAACATATTTATTTTTAAAAATCTTTTACTT-ATTATTT
64 TCATAACTAATTGAACTAGTTT-GGTAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTA-TTAATT-TTT
* * * * *
14285 GGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-TT
125 --AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATT
* * * * *
14349 TTAT---AAAA-AAAA-GTCGT-ATGATTT-AAATAAATAATTATTCAAATAGTCCATAACTATT
188 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAG-CCTTAACTATT
* * * * ** * *
14407 TAAACTTATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTTAATTGTTTAAATATTAA
252 TGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTA-CTTATTAA-T-TTTAAATATTAA
* * *
14472 TAAATTTGTGTTATTTTA-TTTGAAATAAGATTGTATGAATAGCAAA-AATTGTTTTATGACAAA
314 TAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
14535 ACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGAT-AAATAGTCATAACTATTT-TAACTTGTT
377 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGT
* * * ** * ** *
14598 CAACAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTGCTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAAT
441 CAACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCAT
* * * *
14663 TATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAG
505 TATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * ** * * * * * * *
14694 AAATAATTGATTTGCGATAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAAT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * ***** * * * *
14759 CATAAATATTTGCACTAAGCAAACT-AACAAATTCATTTTTGAAATTCATTAGTTATTAATTTTT
65 CATAACTAATTGAACT-AGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TC--T-CTTATTAATTTTT
* ** * * * *
14823 AGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTA-TTTGAATAAGAC-TGTATGACTAGAAACAATTGTTT
125 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAG-CTTGTATGAATAAAAACAATTATTT
* * ** * * * *
14886 TATGATAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAAATAATTGTTCAAATAG--TTAAACTAAT
189 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTATTCATATAGCCTT-AACTATT
* * *** * * * *
14949 TAAACTGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTGAAAATACTAAT
252 TGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT--AAATATTAAT
* * * * * * * *
15014 AAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAAC-ATTCATTTTATGACAAAAC
315 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAAC
* * * * ** * * *
15078 AAAAGGTCATAACGATATGAAATCGATAATTATTTTTTAAATCTCTTGCTGATTATTTTTGAAA-
379 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-A--ATTGTTCAAAT-AGTT-ATAACTA--TTTGAAAC
** * * * * * * * * *
15142 ---T--ATTAATAGATTT-GTTTT--AT-T-TTATTTCGAATAAGTTACTAAGAA-CTGAAAAAA
437 TGGTCAACAAACAGATTTATTTTTAAATCTGTTACTT--ATTAA-TT-TTTAGAATATTAATAAA
** *** *** ** * *
15196 TT-GTTTTACGATAAAAC-AA-AAGGTCATAACAATTTGAA-AT
498 TTAGCATTATTTTATTCCGAATAA-G-C-T---TGTATGAATAG
* * * ** * * * * * * **
15236 AAAGAATTGTTCATATAGCCTTAAC--TATTTA-AACTG-GTTCAAATA-A-ATTTATTGGAAT-
1 AAACAATTGTT-TTAT-GACAAAACAAAAGTCATAAC-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * ** * * * *
15294 TTC-TTAGTTATT-AA-T--TTT--CATA-ATA-TTATTACATTAGTAT-TATT-TT-ATTCTGA
63 GTCATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATT-TTTTA-AATCTCTTATTAATTTTTA
** * *** * * * ****
15347 ATAAGCT-TGTACA-AACAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACACAAG-GT-TAT-AACAATTTG
126 A-AA--TAT-TA-ATAA-ATTAAT-ATTATTTTAT--TTTAA-ATAAGCTTGTATGAATAAAAAC
* * * * ** * ** * * **
15407 AAATATATAATTG-C---TCAAATA-GTCATAACCTTTTGAACTA-AT--TTGGT-AAACA-AAT
181 AATTATTTTA-TGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCT
* * * * * ** * * * * * * * *
15462 TTA-T-TTTTAA-AT-CTC-CT--ACTTATTAATTTTTGAAATAT--TAATAAATTACTATTATT
244 TAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACT-TATTAATTTTA-A
* * * * * ** * * **
15518 TTATT-TTGAA-TAG--GT-TTGTATGATGAA-AAACAATTGTTTTATG-ACA-AAACAAAAG-T
307 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC--TTG---TATGAATAGAAACAATTGTT
* * * * ** * * *
15574 TCATAACATTTAA-AATA-G--ATAATTA-TTCAAATGGCCATAA---TT---AT--TT-GAACT
367 TTATGACA--AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG--ATAATTGTTCAAATAGTTATAACT
** *** * *
15625 AATTTG--A----T----AAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTAAAATAT
428 -ATTTGAAACTGGTCAACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATAT
* ** ** * *
15680 TAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTAT-AAGCTA-
491 TAATAAATTAGCATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA--TAG
* * * * * * *
15725 AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGCCATAA-TAGTTTTAAATAGATAATTGTTCATATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * *
15789 TCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTT
64 TCATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAA-ATC-T-CTTATTAATTTTT
** * * * * * * * **
15854 TGAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAACT-GAATTAATTATTT
125 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTT
* * * * * * * *
15918 TATGACTAAAGAAAAGGTCAGAATGATTTGAAACAGATAACTGTTC-TAATAGTCTTAACTATTT
189 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAT-ATAGCCTTAACTATTT
* * * * * *
15982 GAAC-TGTTTGGCAAACACATCTATTTTTTAAA--T-C--CTTATTAATTTTTAGAATACTATTA
253 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTTA-AATATTAATA
* * ** * * * * * *
16041 ATTTAGTAGTATTTTACATTGAACAAGCTTCTATGAATAGAAATAAATGTTTTAGGATAAAAC-A
316 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * * ***
16105 AAGATCTTACCAATTTCAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTG-AACTGATTCGGT
381 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTG-GTCAAC
* * **
16169 AAAGAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTT-GAAATAGTAATAAATTAATATTAT
445 AAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTAT
* ** **
16229 TTTTTTATGAATAATTTTGTATGAATA-
508 TTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * * *
16256 AAATAATTGTTTTACGACAAAATAAAATATCATAACAATTTCAAATAGATAA-TAGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAG
* * * *** * * *
16320 ACATGACT-ATTCGAACTTGTTCAATAAATAGATTAATTTTTTAAATTTTCAACTTATTAATTTT
64 TCATAACTAATT-GAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA---TC-TCTTATTAATTTT
* * * * * * *
16384 TAAAACATTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
124 TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTT
* * * * * * * *
16449 TATGACAAAACAAAAGAG-CATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTT
189 TATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTT
* *** ** * * * ** *
16513 AAACTCACTCAATAAGCAAATTT-TATTTTTAAATGTTTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATA
253 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTT-AAATATTAATA
*** * * * **
16577 AATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTTTGAAAAGAAATAATTCATTTATGACAAAACAA
316 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * *
16642 TTGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT-AAACATGTTCAGA
381 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGTCA-A
* * * * *
16706 -AAATTA-ATTTATTTTTAAAAT-TTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATT
444 CAAA-CAGATTTATTTTT-AAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGCATT
* * *
16767 ATTTTATT-TGAAATAAGCTTGCATGAACA-
506 ATTTTATTCCG-AATAAGCTTGTATGAATAG
* * * *
16796 AAACCAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAA-TATTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATA
1 AAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * *
16860 GTCATAAC-AATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTTAATTCTCTTGCTCTTTGATT
63 GTCATAACTAA-TTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAATT
** * * * *
16924 TTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTATATGAACT-GAAACAATTA
122 TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTA
* * * * * * ** * **
16988 TTTTATTACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTGAAATCGATAATTATTCAAATAATCATGGCTAT
186 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTAT
* * **
17053 TTGAACTTCTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATATTA
251 TTGAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTT-T--AAATATTA
* * * *** * * * *
17117 ATAAATTAATAATATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGGCGAAA
313 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
** * ** * * * * *
17182 CAAAAAAATCACAAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGA-TTCAAACTTGTT
378 C-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAAC-TGGT
**** * * * *
17246 CGGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTT-CAATATTAATAAATTTA-T
441 CAACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAA-TTAGC
** *
17309 ATTATTTTATTCAAAATAGGCTTGTATGAATAG
503 ATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
** * * * ** ** * *
17342 AAA-AAGTCATTTTATAAC-AAACAAAAAATTATAGTGATTCCAAATAGATAATTGTTTAAATAG
1 AAACAA-TTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * * * *
17405 TCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAACAGATTCATTTTTGAAATCTCTTAATTATTAATTTTC
64 TCATAACTAATTGAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTT
* * * * * ** *
17470 ATAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATTGAAATAATT-TTT
125 AAAATATTAATAA-ATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTATTT
* * * * * *
17533 TTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATT-ACAATTT
189 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAG-CCTTAACTATTT
** * * ** *
17597 GATGTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAGAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATTTTAAT
253 GAACTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAA-ATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAAT
* * * * *
17661 AAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAATATAAACTATTG-TTTAT-AGCAAAAC
315 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAAC
* * * * * * * * *
17724 AAAA-ATCCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAGATAGTCATAACTGTTTG-AACTGCTTT
379 AAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTG-GTC
* * * * *
17787 GACAAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTGATTTTT-GAAATATTAATAGATTAGTAT
442 AACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCAT
* * * * * *
17847 TATTTTATTCTGAACAAACTTAT-TGAACAT
505 TATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * *
17877 AAAC-ATTTTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCACATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * *
17941 CATAATTATTTGAA-TTGATTAGGTAAATAGAATTATTTTTTTAATCTCTTATTTATTAATTTTT
65 CATAACTAATTGAACTAG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC----TTATTAATTTTT
* * * * * * ** *
18005 TAAATATTAATAAATTCATTTTATTTGATTCTT-AATAAGCTAGTATGAATTGAAAATTATTGTT
125 AAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTATT
* * * *
18069 TTATGACAAGACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTT
188 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTT
* * * * * *
18134 -AA-TGGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTAAGTTATTAATTTTTGGAATATTAT
253 GAACT-TGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCT-ACTTATTAA-TTTT-AAATATTAA
* * * * * *
18196 TAGATTAGTATTATTTTATTTTGTATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGATAGAAC
314 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * *
18261 AAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAATCATAACTATTTG-AATTGGTTCG
379 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTGG-TCA
** * * * * * *
18325 GTAAACATATTTATTTTTTAAACCTCTTA-TTA--AATTTTGA-AAGATTAATAAATTAGTATTA
443 ACAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTA
* * *
18386 TTTTATT-CGAATAAGTTTGTATGATAAAA
507 TTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA-ATAG
* * * * * * * * * *
18415 AAATAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTGAAATGGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * ** * * * * **
18480 CATAA-TTATTTAAATTGATTTTATAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGGAA
65 CATAACTAATTGAACTAG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTAAAA
* * * * * * *
18544 TATTAATAAATTAACATTACTTTATTTCAAGTAAGCCTATATGAACT-AAAACAATTGTTTTATG
129 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATG
* * * * * * * *
18608 ACAAAATAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
193 ACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAAC
* * * * *
18673 TTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATAAGAAAT
257 TTGTTCGGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA-TTTT-AAATATTAATAAAT
* * * * *
18737 TAG---TATTTTAATTTGGATAAGCTT-TAATGAACT-GGAATAATTGTTTTATGTCAAAACAAA
319 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * ** ** ***
18797 AGGTCATACCAATTTTAAATAAATAATTG-TCTAAGTAGTCATAACTATTTGAATTTATTCGGTA
382 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTTATAACTATTTGAAACTGGTCAACA
* * * * * * * *
18861 AGCAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTAGTAATTTTTTGAATGTCAGTAAATTTAG-ATTAT
446 AACAGATTTA-TTTTT-AAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGCATTAT
* * *
18925 TTTATTGCAAATAAGCTTGTAAGATATA-
508 TTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA-ATAG
* * *
18953 AAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
18981 GTTCGATAAA
Statistics
Matches: 12442, Mismatches: 3172, Indels: 2362
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AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTTGT
TCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTAAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAACTGGTCAACAAACAGATTTA
TTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTCCGAATA
AGCTTGTATGAATAG
Found at i:5185 original size:900 final size:895
Alignment explanation
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1733 TTAGTCAACT
* * ** * * *
1743 AATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAACTTTCGAAATAATAATAAAGTAGTATTATTTTCTT
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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126 GAAATAGAT-AATATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTAT-TTT
** ** * *
1934 TCGAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGC
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* * * * * * * *
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* * ** * *
2062 TTATTCTAATAGTCT-TAACTATTTGAACTGGTT-C-AGCAATATATTTATTTTTTAAA--T-CT
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* * * *
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* * * * * * **
2182 CAAAAAAAGATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATGTTTGTTCAAA
440 -AAAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * **
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* * * * *
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566 TTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTG
* *
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630 -TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CT
* * * * * *
2438 ATTTGAACTTGTTTGATAAATAAATTTATATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCA-AAT
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* * * * * *
2502 GTTAATAAATTACAATTATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATGAACT-GAAATAATTGTTTTATAA
756 ATTAATAAATTAC-ATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGA
* * * * * *
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820 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTA-AATAG-CTTAACTAATTGAACT
**
2630 GGTTCAACAAACA
883 GGTTTGACAAACA
* * ** ** *
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1 AATTTATTTTT-AAATCTCCTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* *
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64 GAATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGA
* * *
2769 GATAGATAATCATTTCAAATAGTAATAACTATTTAAA-TTGTTTCAGTAAATAGATTTAGTTTTT
128 AATAGATAAT-A-TTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTT-AGTAAACAGATTTA-TTTTT
* * **
2833 T-AA--T-TTCTTACTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTT
188 TAAATCTCTTGTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * *
2894 GCATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGGTCATAA-CATTTTGAAATAGATAAT
252 GTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAAT
* ** * * * *
2958 TATTCATGTAGATATGACTATTTGAACTTATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTAC-
315 TGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TATTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACT
* ** * * *
3022 CTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGCATGAATAGA
379 C-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAAA
* * * * *
3086 AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-
443 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGT
* * *
3150 CATAACTATTTGAACTTGCTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
507 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA--GTTTTAAATC-TCTACTTATTAATTTTT
* * ** *
3215 GGAATATTAATAAACTAGCATTA-CTTATTTTGAATACA-CTTGTATGAATAGAAACAATTAG-T
569 GAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTT
** * * *
3277 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT
632 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
3342 GAACGTATTC-ATAAAACATATTTTATTTTTTAAAAT-TTTAT--TTATTAATTTTTGGAATATT
697 GAACTTGTTCGAT-AAACATA-TTTATTTTTTAAAATCTTT-TGCTTATTAATTTTTAGAATATT
* * * *
3403 AATAAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTATATGAAC-AGAAATAATTATTTTATGATAA
759 AATAAA-TTACATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAA
** * * * * *
3467 AACAAAATATCATAATGATTTGAAATAGAA-AATTATTTATATAGCCATAAC-AATTGGAACTTG
823 AACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATA-AATAATTATTTAAATAG-CTTAACTAATT-GAACTGG
** *
3530 TTTGGTAAATA
885 TTTGACAAACA
*
3541 AATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 AATTTA-TTTTTAAATCTCCT--T-ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * ** * *
3606 TTGAATTAGCCTATATGAACT-A-ATATAATTGTTTTATGATGAAATAAAAGGTCATAACAATTT
62 CTGAATAAGCTTATATGAA-TAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
** * * * *
3669 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATCAAAACTTGTTCAATAAACATATTTATTTTTA
126 GAAATAGATAA-TATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT
* * * * * * *
3734 AAATCTGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGTATAAGCTT
189 AAATCTCTT-GTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * *
3799 GTATGAACA-AAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTG
252 GTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * ** *
3863 TTCAAATAGTCACAACTATTTGAATTTATTCAG-TAATATAG--TTATTTTTTAAATCTTTTATT
317 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-CTATT-TGCTAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACT
* ** * *
3925 TATT-ATTAACTG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT--GAAATAAGGTTGTATGAATA
379 CATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCCG-AATAAGCTTGTATGAATA
* * * *
3986 GAAAA-AATTATTTTATAACAAAACAAAAGATT-ATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAAT
441 -AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
4049 AATCGTAATTGTTTTAACTTGTTCAATAAACAGATTTAGTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTT
504 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTAGTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTT
* ** *
4114 GAAATATTAATAAATTAGA-ATTATGCTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
569 GAAATATTAATAAAGTA-ATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
* * * *
4178 TGTGACAAAATAGAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTT
633 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTT
* * * * ** * * * **
4242 GCA-TCGGTCAAGCCAACAGATTCATTTTCT-AAATCCGTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAA
697 GAACTTGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAA
** * * * *
4305 TAAATTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAATTGTATCAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA
761 TAAATTA-CATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAA
* * * * *
4369 CAAATA-GTCATAACAATTTAAAATAAATAATTATTCAAATTGTTGTAACTAATTGAACTAGTTT
825 CAAA-AGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAGCT-TAACTAATTGAACTGGTTT
**
4433 GGTAAACA
888 GACAAACA
* * * **
4441 AATTTATATTTTAAATCT-CTTAATAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCA
1 AATTTAT-TTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * *
4505 AACAAACTTATATGAATAA-AAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
65 AATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
** * * * * * *
4569 TAGGCAAGTATTCATACAGCCTT-TACTATTTGAACTGGTTTGGCAAACA-ATTT-TTTTTTAAA
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* *
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* * * * * * *
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*
4761 AAATAGTTATAACTATTTGAACTAGTTTGCTTAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTA
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* * *
4826 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTCATTCCGAATAGGCTTATATG-ATGAAAAACAA
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* * * * * *
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* ** * * * * * *
4955 TATTTGAAC-TGATTCGATAAATTGATTTATTTTTTCAATCTCCAACTTCTCAATTTTTAAAATA
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * ** ** *
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * **
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * *** ** * * *
5913 CTATCATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTACAAACA-AAATAATTATTTTATG
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* * * * * ** ** *
5977 AGAAACCAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACT
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** * * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * ** * * * * *
6163 AAAGGTTATAATGATTTGGAATAAATAATTATTCAAATAG-TTAAAACTATTTAAAATGGTTTGG
827 AAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAGCTT--AACTAATTGAACTGGTTTGA
* *
6227 TAAATA
890 CAAACA
* *
6233 GATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTAGTAATAATGATT
1 AATTTA-TTTTTAAATCTC--CTT-ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGT-AT--T-ATT
* * * * * * * * * * *
6297 TGAAAT-TG-ATAATTG-TTCAAAT-AGTCATAATCATTTGAACTGGTTCAGTAAATAAAATTAT
57 T-TATTCTGAATAA--GCTT-ATATGAATAAGAAACAATTG---T--TTTA-T-GA-CAAA--A-
* ** * ** * * *
6358 TTTCTAAATCTCTTACAAAATTTTGAACAATTA-ATAA-ATT--AGT-TTTATTCTATTTCGAAT
107 ---CAAAAGGTCATA-ACGA-TTTG-A-AA-TAGATAATATTCAAATAGTTATACTATTT---A-
* * * ** ** * **** * * * *
6418 AAGCTTATATAAGCTGAAATA-ATTGCTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA
160 AA-CTTGT-TTAG-T-AAACAGATTTATTT-T-TTAAATC-TCTTGTTATTA-ATTTTAAAAT-A
* * * * * ***
6482 ATAATTGTACATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTTTGAAAATAGATT-TATTTTC-TAAAATC
216 TTAA---TAAAT-TAGTATT-A-T-TTT--A-T--TTTGAATA-AGCTTGTATGAACAT-AAA--
* * * * * * *
6545 TCTTAGTTATTAATTTTTAGAATACTACTAAATTA-GT-ATTATTTTATTTCAAAAAAGCCTGTA
265 -C--AATTATT--TTATGACAA-A--AC-AAA--AGGTCA-TA-ATGATTT---GAAA-----TA
* * * * *
6608 GGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTC
309 -G-AT---AAT-T--G---T-T--CA-AAT---A-GTTATAACTATTTG--A-A-CT-ATT-TGC
* * **** ** * * *
6673 AAGTAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTC
349 ---TA---AACA-GATTT--A-TT-TTT--TAAAT-CTCCTACTCATT-AAT-T-TT-TGAAATA
* * *** * * * *
6738 TTGAA-ATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCAATAAGCTT-AATG-TTGAAAAAAAAAT-T
396 TT-AATAAATTAGT--ATTA-TTTTA---T-TCCGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTGT
* * * * ** * * *
6799 TTTAAGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTCAAAATAGGTAGTTGTTCAAAT-GCCCAT-ACTTA
452 TTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAAC-TA
** * * *
6862 TTTGAACTAT-TTGGATAAACTGATTTATCTTTTAAATC-C--CTTATTAACTTTTGAAATATTA
515 TTTGAACT-TGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * * * * *
6923 ATAAAGTAATATTATTTT-TTTGGGATAAGCTTATATGAGCTA-AAATAATTATTTTATAATAAA
578 ATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * * * * ** *
6986 GCAGAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAATTG
642 ACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC
* * * * *
7051 GGTAAACATATTTA-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTATGAATATTACTAAATTAGTA
707 GATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTA-CA
* * * * * *
7113 TTATTTTATTCTAAATAAG-TCTGTAT-AAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAATAGG-C
770 TTATTTTATTTTAAATAAGAT-TATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * ** * *
7175 TATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAATAAATA
834 -ATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAG-CTTAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACA
* ** *
7239 GATTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATTACTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATT-TC
1 AATTTA-TTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-
* ** * * * * * * *
7302 AAATAAAATTGTAT-ATTGAA-AAAAAATTATTTTAAGACAAAATAAAAAG-CAATAACGATTTG
64 GAATAAGCTTATATGAAT-AAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACGATTTG
* * * * ** * * * **
7364 AAATAGGTAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAT-TTTGGTAAATTGATTTATTTTTT
127 AAATAGATA-ATATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACT-TGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT
* * * * *
7428 AAATCTC---TTATTAACTTTTGAAATATTAATAAAATAGTGTTATTTTATTTTGGATAAGCTTT
189 AAATCTCTTGTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
** * * *
7490 TATGAAC-TAAAACAATGGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATT
253 TATGAACAT-AAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * ** *
7554 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTTTTGC
316 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TATTT-GCTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATCTCCTAC
* ** * * *
7618 TTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGATTAAGCTTGTATAAACT-A
378 TCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA-TAA
* * * * * * * * * * *
7682 AAACAATTATTATATGACTAACCCAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAGTAGT
442 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
7747 CTTAACTATTTGAACTGGCTCGACAAGCATATATT-TTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTTTG
507 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGAT-TTAGTTTTAAATCTCTACTTATTAA-TTTTTG
* * * * * *
7808 -AATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCT-AAAAACCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTT
570 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
* * * * *
7870 ATGAC-AAA-ATAAGGATCATAACTATTTTAAGATTGATATTTGTTCAAATGGTCATAACTATTT
634 ATGACAAAACAAAAGG-TCATAACGATTTTAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * * *
7933 GAA-TTGGTGCGAAAAACAGATTTAATTTTT-AAATCTCTTGCTTACTAATTTTCAAAATATTAG
697 GAACTT-GTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAA
* * * * *** * * * * * *
7996 TGAAGTAGTATTATTTGATTTCGGATAAGTTTTTTTGAACT-GAAACAAATGTTTTATGACAAAA
761 TAAATTA-CATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
8060 CTAAAGGTCGTAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTTAAAT-GGTCAAATCT-ATTACAACCT-G
825 CAAAAGGTCATAACGA-TTTAAAATAAATAATTATTTAAATAGCT-TAA-CTAATT-GAA-CTGG
*
8121 TTTGATAAAC-
885 TTTGACAAACA
* * * *
8131 -ATTT-TTTTT-AATCTCTTACTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATT-GCTATTATTTTGTT
1 AATTTATTTTTAAATCTC---CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATT
* * * * * * *
8192 TTGAATAAGCTTGTATGAACT--GAAATAATTATTTTATGACGAAACAAAAGGTCAAAACAATTT
62 CTGAATAAGCTTATATGAA-TAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * *
8255 GAAATAAATAAT-TGCTCTAATAG-TATTAACTATTTGAA-TTGGTTCGACAAACACATTTATTT
126 GAAATAGATAATAT--TCAAATAGTTA-T-ACTATTTAAACTTGTTTAG-TAAACAGATTTATTT
** * * * * *
8317 TTTAAA--TCTT-TTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAAC
186 TTTAAATCTCTTGTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * * * * * *
8379 TTGTATAAAAAGAAACAAACTATTTTATGACAAAATAAATA--TCATAATTATTTGAGATAAATA
250 TTGTATGAACATAAAC-AATTATTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
8442 ATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTGTTTCCGTAAACATATTTAGTTTTTAAATCT-CT-
313 ATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTTGC-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTA
** * ** ** * ** *
8505 -T-ATTAATTTTCAAAATATTAATACATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCACAAATAG
377 CTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAA
* * * * *
8568 AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGA
442 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
8633 CATAAGTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAA-TTTTC
507 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCT-CTACTTATTAATTTTTG
* * * *** * *
8697 AGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCCCAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTT
570 A-AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
* * * * * *
8762 ATGACAAAACAAAAGATCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGA
634 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
8827 AGTTGCTT-GATAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATCAATTTTTGGAATATTAATA
699 ACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * * * * *
8890 AACTAGCATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATGAA-TAGAAACAAATTGGTTTT-TGACAAAA
763 AATTA-CATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAA-TAATT-ATTTTATGACAAAA
* * * * * * *
8953 TAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAG-TCAAAC-ATTTGAA-T-GTGT
825 CAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATT-ATTTAAATAGCT-TAACTAATTGAACTGGT-T
9013 T--CAAA-A
887 TGACAAACA
* * * * * * ** * *
9019 ACTTTTTTTTTAATTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAAAAATTTGTATTATTTTATT-TA
1 AATTTATTTTTAA-ATCTCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-
* * * * * * ** * * *
9083 AAATAAGCTTGTATGAATAA-AAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATGGCAACTTGAT
64 GAATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * * *
9147 ATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAAAAAATTCATTTTTTAAA
129 ATAGATAA-TATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
** * *
9212 TCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTT-AGATAAGCTTGT
192 TCTCTTG-TTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA-ATAAGCTTGT
* * * * *** * * **
9276 ACGAATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
254 ATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * ** * * * **
9341 CAAACAGTCATAACTATTTGCACTCGTCAGGCT-AACAAATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTT
319 CAAATAGTTATAACTATTTGAACT-AT-TTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-CTACTCA
* * * *
9404 TTAATTTTT-AGAATGTTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCGAATAAGAC-TGTATGAATAGAA
381 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAG-CTTGTATGAATAAAA
* * * *
9467 ACAATTCTTTTATGACAAAACAAATAG-TCATCACGATTT-AAAGTAAATAATGGTTCAAATAGT
444 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * **
9530 TATAACTAATTCAACTGGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCA
507 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTTTG
* *** * * * *
9595 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAACA-AAAGCATTTGTTTT
570 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTT
* * * * *
9659 ATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
634 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
** * *
9724 A-TTGATTCGGCAAACATAATTATTTTTT-AAATC---T-CTTACTAATTTTT-GAAATATTAAT
699 ACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT
*** * * * ** * * * *
9782 AAATTTGTTTTTTTTACTCTAAATAAG-TTACTAAAAACT-GAAAAAATTGTTTTACGATAAAAC
762 AAATTACATTATTTTATTTTAAATAAGATTA-TATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * * * * * * *
9845 AAAAAGTCCTAATGATTTAAAATAAAGAATTGTTGATATAGTCTTAACTATTTGAACCGGTTTGG
826 AAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAG-CTTAACTAATTGAACTGGTTTGA
* *
9910 TAAATA
890 CAAACA
* * * * *
9916 CATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATT
1 AATTTA-TTTTTAAATCTC---CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * *
9981 TTGAATAAACTTTTATGAACAA-AAATAATTGTTTTATGATATAACAAAAGCTTATAACAATTTG
62 CTGAATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * ** ** *
10045 AAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTAGTAAACAGATCAATTTTTTG
127 AAATAGATAA-TATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTA
* ** * * **** *
10110 CATCTCCTAATTATTAATTTCTAAAATATTAGTAAATGAGTATTA-TTTATACCAAATAGGCTTG
190 AATCT-CTTGTTATTAATTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
** * * * ** * *
10174 TATGATGAAAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAATTCATAATGATTTAAAATAGATAATTAT
253 TATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
** ** * * * * *
10239 TCAAAGGGCCAAAATTATTTGAATTGATTCT-ATAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCT-CTAACT
318 TCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATT-TGCTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCCT-ACT
* * ** * * ** * * * **
10301 TATCAAAATTTGAAATATTAATAAGTGA-TATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGTATTGAA
379 CATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAAAA
* ** * * * ** *
10365 ACAATTTTTTTACAATAAAAATAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
444 ACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
*** * * * *
10430 ATAACTATTTGAACTT-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTCT-
508 ATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTTT-TG
* * * * *
10493 AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTAT-ACATTA-AAACAATTATTT
570 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGA-A-TAGAAACAATTGTTT
* * * * ** * * *
10556 TATGACTAAATAAAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTCATAGGCTTAATTATTTG
633 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
10621 AACTAGTTC-AGTAAACACATTTATTTTTT-AAATC-----CTTATTAATTTTT-GAAATAGTAA
698 AACTTGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATTAA
** * ** * *
10678 TAAATTTGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGTATGAATACCAATTATTTTGAATAATTGGTAT
761 TAAA-TTACATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATG-A-A-C---TA----G-A-AA-T--AAT
** * * ** * * * * *
10743 TATTTTATGTTAAAACAAAATGTCATAACAATTCGAAATAGATGA-TAGTTCAAATAGACATGAC
810 TATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTA-TTTAAATAG-CTTAAC
* * * *
10807 TATTTGAACTTGTTCGGCAAACA
873 TAATTGAACTGGTTTGACAAACA
* * *
10830 AATTTATTCTTTAAATCTTTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
1 AATTTATT-TTTAAATC--T-CCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * *
10895 CCAAATATA-CTTTTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAATGATTT
62 CTGAATA-AGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * * * * *
10958 GAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTGGTAAAAAGATTTATTTTTT
126 GAAATAGATAA-TATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT
* * * ***
11023 AAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCCAAATAAGCTT
189 AAATCTCTTG-TTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * * ** * * * * *
11087 GCATGAATAGAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAATGGTCATAACGATTTGAAATAAATAACTG
252 GTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * ** * * * * * * * *
11152 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAATAAAAAAATTCATTTTTCAAATTTTC-GCTTA
317 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TATTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCA
* * * * *
11216 -TAA-CTTTGGAATATTAATTAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAACAAAA
381 TTAATTTTTGAAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTCCG-AATAAGCTTGTATGAATAAAA
* * * * * ** **
11277 CCAATTGTTTTCTGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTTTAAGGAGATAATTGTTCTGATAGTC
444 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * ** * * ** *
11341 ATAACTCTTTGAACTTGTTTAGCAAACAGATTCATTTTTCTAGTTCTCTTACTCATTAATTTTTG
508 ATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTT-TAAATCTC-TACTTATTAATTTTTG
* * * * ** * * * * **
11406 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAACTTATGTTAACCGAAACAATT-TTTTA
570 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
11470 TTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAA
635 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * *
11535 ATTGTTCGGTAAACATATTTATGTTTT-AAATCTTTTGCTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAA
700 CTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA
* * * * *
11599 TTAATATTATTTTAATTTT-AATAAGCTTGTATGAAC-AAAAATAATTATTTTATGAC-AAA-AT
765 TT-ACATTATTTT-ATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAA
* * ** * * * * * * **
11660 AA----A-AA-G--TTATAATAATTTGTTGTTCAAATAGTCATAACGATTTGAACT-TTTGTGGT
828 AAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAG-CTTAACTAATTGAACTGGTT-TGAC
*
11716 GAACA
891 AAACA
* * * ** * * *
11721 GATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCT--GTTAGTAATAAATTTGAATTATTTTAT
1 AATTTA-TTTTTAAATC---TCCTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * *
11784 T-TGAAATAGGCTTGTATAAAT-AGATGA-AATCT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAA
61 TCTG-AATAAGCTTATATGAATAAGA-AACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
** * * * * * * * *
11845 TTCCAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGTTTTATTT
123 TTTGAAATAGATAA-TATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTT
* ** * * * * *
11910 TTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAACAACTTACTATTATTTTATTTCGAATAAC
186 TTTAAATCTCTT-GTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
* * *
11975 CTTATATGAAC-TAAAATAATT-TTCTTATGAC-AAACAAAA-GTCATAATAATTTGAAATAGAT
249 CTTGTATGAACAT-AAACAATTATT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * * * * *
12036 AATTATTTAAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAAAT-TT
312 AATT-GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTA-TTTGCTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTC
* * * * ** * * **
12100 TTAATTATTAATTGTCAAAATAATAATAAATTAGTATT-TATTTAATCTAAATAAGCTTGTATGA
374 CTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA
* * *** * *
12164 ATAGAAACTATT-TTTTAT-AGTGGAACAAAAAG-TCAAAACGATTTGAAA-A-ATTAATTGCTC
438 ATAAAAACAATTGTTTTATGA-CAAAAC-AAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGA-TAATTGTTC
* * * ** * * *
12224 AAATAGTTATAACTATCTG-ACTAGTTTGATAAA-AGATTTATTTTTAAA-ATCT-CTTATGAA-
500 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTAGTTTTAAATCTCTACTTATTAAT
* * * ** * * * * * * * *
12284 TTTTGTAAT-TTAATAGATTTTTATTATTTTATTCTAAACAAAC-TATATGAACAAAAAC-A-TA
565 TTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* *
12345 TTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAAC-ATTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAATAATT
630 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-------
* * *
12408 ATTAGAACTAATATTTTAAGTAGATAATTGTTCAAATAATAATAACTATTTAAGCTTGTTTGGTA
687 A-T--AAC---TA--TT---T-GA-ACTTGTTC-GAT-A-AA-CA-TATTT-A--TT-TTT--T-
* * *
12473 AACATATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTT
727 -A-A-A---A----TC---T-T-TTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTA-CATTATTT
* * * * ** * * * * *
12538 TATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGAGTAAATAAAGGGTTAGAATGA
776 TATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * * *
12602 TTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACCATTTGAAATGATTCGGCAAACA
841 TTTAAAATAAATAATTATT-TAAATAG-CTTAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACA
* * * * * * *
12658 CATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAAT
1 AATTTA-TTTTTAAATC---TCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * ** *
12723 CTAAATAAGCTTATATG-ATAAGAAATAGTTTTTTTATGACAAAAC-AAAGACCATAGCGATTTG
62 CTGAATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
* * * * * * * * * * * *
12786 AGATTGATATTTGTTCAAAT-GATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAATAGCTTTAGTTTTT
127 AAATAGATA-ATATTCAAATAG-TTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTT
* * * * * * *
12850 AAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAA-ATT
189 AAATCTCTTG-TTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
* * * *
12914 TTAATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAAT
252 GT-ATGAACAT-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * *
12978 TGTTCAAATGGTTATATCTATTTAAACT-TGTTACATAAACATATTAATTTTTTTAAATCTCTTG
315 TGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAT-TTGC-TAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCCTA
* * * * *
13042 CTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATT
377 CTCATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * * *
13106 GAAATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
441 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
13171 TCTTAACTATTTGAACTAG----AT---C-G-----G---CAAA--AC-AC--ATTTATTTTT--
506 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTAGTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGA
* * * * * ** * * *
13213 --TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTAT
571 AATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
13276 GAC--AACATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGTAGTCATAACTATTTGAA
636 GACAAAACA-AAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * *
13339 -TTGATTCAACAAACAGATTTAGTTTTT-AAATC---T-CTAATTAATTTTTAAAACATTAATAA
700 CTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAA
* * ** * * * *
13398 ATTAGTATTATTTTATTATAAATAATTTTGTATGAA-GAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AA
764 ATTA-CATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAA
** * * * * ** * * *
13461 AATCTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACAT-GTTTGAT
828 AAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAG-CTTAACTAATTGAAC-TGGTTTGAC
*
13525 AAATA
891 AAACA
* *
13530 AATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 AATTTA-TTTTTAAATCT-C--CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * ** *
13595 -TCAAATAAAATTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACTATTT
62 CT-GAATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* * * ** * *
13658 GAAATAAATAATTATTCAAA-CGATCATAACTATTTAAGTTTGCTTAATAAACAGA-TT-TTTTT
126 GAAATAGATAA-TATTCAAATAG-TTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTT
* * ** ** * *
13720 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATACAAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAGCT
188 TAAATCTCTT-GTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
* * ** * *
13785 TGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATATATAAT
251 TGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAAT
* * * *
13849 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAG--AAGATAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTA
315 TGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TATTT-GCTAA-ACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTA
* ** * * * *
13911 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAACCGTATATGAACA
377 CTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * *
13975 GAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
441 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * ** * *
14040 TAAGAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACTA-ATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTGATTT
506 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAAC-AGATT--TAGTTTTAAATCTC-TACTTATTAATTT
* * * * * * *
14104 TAGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GATACAATTAT
567 TTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGT
** * * * * **
14168 TTTAAAATC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGCTAT
631 TTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * **
14232 TTGGACTTTTTGGGTAAACATATTTATTTTTAAAAATCTTTTACTTATT-A-TTTGGGAAATATT
695 TTGAACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATT
* * * * * *
14295 AATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAATAATT-TTTTAT---AA
759 AATAAATT-ACATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAA
* * * * * * **
14355 AA-AAAA-GTCGT-ATGATTT-AAATAAATAATTATTCAAATAGTCCATAACTATTTAAACTTAT
823 AACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAG--CTTAACTAATTGAACTGGT
* * *
14416 TCGATAAATA
886 TTGACAAACA
* * * *
14426 GATTTATTTTTTAAATCT-TTTATTTTTTTAATTGTTT-AAATATTAATAAATTTGTGTTATTTT
1 AATTTA-TTTTTAAATCTCCTTA-----TTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * *
14489 ATT-TGAAATAAGATTGTATGAAT-AGCAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCG
59 ATTCTG-AATAAGCTTATATGAATAAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * ** * *
14551 ATTTGAAATAGATAAT-TGAT-AAATAGTCATAACTATTTTAACTTGTTCAACAAATAGATTCAT
122 ATTTGAAATAGATAATAT--TCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTAT
* ** ** ** * * **
14614 TTTTTAAATCTCTTACTTGCTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATA
184 TTTTTAAATCTCTT-GTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * ** * * * *
14679 AACTTGTATGAATAGAAATAATTGA-TTTGCGATAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGA
247 AGCTTGTATGAACATAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * * *
14743 TAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCACTA--AGCAAACTAACAAATTCATTTTTGAAAT-T
311 TAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTATTTGC-TA--AACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * * *
14805 CATTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATT-TGAATAAGAC-TGTA
373 C-CTACTCATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAG-CTTGTA
* * * * * ** *
14867 TGACTAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAAATAATTGTT
435 TGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTT
* * * * * * * *
14932 CAAATAGTTA-AACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTAACTCTCTTACTTATT
499 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTC-TACTTATT
* * * * * * * *
14996 AA-TTTTGAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAAC-
562 AATTTTTG-AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* * * * * * *
15059 ATTCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATATGAAATCGATAATTATTTTTTAAAT-CTC
626 ATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGAT-A--ATTGTTCAAATAGTC
** * * ** * * * * *
15123 -TTGCTGA-TT--A-TT-TTTGA-AATA-TTAATAGATTTGTTT--TATTTTATTTC-GAATAAG
687 ATAACT-ATTTGAACTTGTTCGATAA-ACAT-ATTTATTT-TTTAAAATCTT-TTGCTTATTAA-
** * * * * ** * * * ** * *
15177 TTACTA-AGA-ACTGA-AAA--A-ATTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
746 TTTTTAGA-ATATTAATAAATTACATTATTTTA--TTTTAA-ATAAGATTATATGAACTAGAAAT
** * ** ** * * * **
15236 AAAGAATTGTTCAT-A-TAGCCTTAA-CT-ATTTAAACTG-GTTCAAATAAAT--TTATTGGAAT
807 -AATTATT-TT-ATGACAAAACAAAAGGTCA--T-AAC-GATTTAAAATAAATAATTATTTAAAT
** * * *
15294 TTCTT-AGTTATT-AA-T--TTT--C--A-T
865 AGCTTAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACA
* * ** * * * * * * *
15315 AA--TATTATTACAT-T-AGTATT-A-TTTT--ATTCTGAATAAGCTT-GTA-CA----A-ACAG
1 AATTTATTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCTG
* * *
15365 AAATAATTG-TTTTATG-A-CAGAACACAA--G-GTTAT----------AA---C---A--ATTT
65 -AATAA--GCTTATATGAATAAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTT
* ** * * ** * *
15406 GAAATATATAATTGCTCAAATAGTCATAACCT-TTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTTA-TTTT
126 GAAATAGATAA-TATTCAAATAGTTAT-A-CTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTT
** * * * *
15469 TAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTGAATAGGTT
188 TAAATCT-CTTGTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
** * * * * *
15534 TGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAA-CATTTAAAATAGATAATT
251 TGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * ** * * ** * *
15598 ATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT
316 GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTC
* * * * ** * *
15663 ATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTAT-AAGCT-AA
380 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAA--TAAA
* * ** * * *
15726 AACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGCCATAA-TAGTTTTAAATAGATAATTGTTCATATAGT
443 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
15790 CATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTTT
507 CATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTC-TACTTATTAA-TTTTT
* * * * * ** *
15855 G-AATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATATATGAACT-GAATTAATTATTT
569 GAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTT
* * * * * * * * *
15918 TATGACTAAAGAAAAGGTCAGAATGATTTGAAACAGATAACTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTG
633 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * *
15983 AAC-TGTTTGGCAAACACATCTATTTTTT-AAATC-----CTTATTAATTTTTAGAATACTATTA
698 AACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATA
* * * ** * * * * * * * *
16041 ATTTAGTAGTATTTTACATTGAACAAGCTTCTATGAA-TAGAAATAAATGTTTTAGGATAAAAC-
763 AATTA-CATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAACA
* * * * * * * * * * **
16104 AAAGATCTTACCAATTTCAAATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACTGATTCGGT
827 AAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAGCT-TAACTAATTGAACTGGTTTGAC
*
16169 AAAGA
891 AAACA
* * * * * *
16174 GATTTAGTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTTTTATG
1 AATTTA-TTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
** * * * * ** * *
16238 AATAATTTTGTATGAAT-A-AAATAATTGTTTTACGACAAAATAAAATATCATAACAATTTCAAA
65 AATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
** ** * * * *
16301 TAGATAATAGTTCAAATAGACATGACTATTCGAACTTGTTCAATAAATAGATTAATTTTTTAAAT
130 TAGATAATA-TTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-
* *** * * *
16366 TTTCAACTTATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTATATTTTGAATAAACTTGTAT
192 TCTCTTGTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT
* * * * *
16431 GAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAG-CATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTT
256 GAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * *** * * * ** *
16495 AAATAGTCATAACAATTTAAACTCACTCAATAAGCAAATTT-TATTTTTAAATGTTTTACTTATT
320 AAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTTGCTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCCTACTCATT
* ** * *
16559 AA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTTTGAA-AAGAAATA
383 AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAA-AAACA
** ** * *
16622 ATTCATTTATGACAAAACAATTGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
447 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * * * * *
16687 TTATTTAAACATGTTCAGA-AAATTA-ATTTATTTTTAAAATTTTTAATTATTAATTTTTGGAAT
512 CTATTTGAACTTGTTCA-ATAAA-CAGATTTAGTTTT-AAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAAT
* * * * *
16750 ATTAATAAATTTATATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTGTTTTACG
574 ATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATG
* * * *
16813 ACAAAACAAAATGTCATAA-TATTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACAATTTGAAC
637 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * * * *
16877 TTGTT-TAGTAAATAGATTCATTTTTTTAATTCTCTTGCTCT-TTGATTTTTGGAATATTAATAA
701 TTGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAA
* * * *
16940 ATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGTTTATATGAACT-GAAACAATTATTTTATTACAAAACAA
764 ATTA-CATTATTTTATTTTAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * * ** * * * ** * ** * **
17004 AAAGTCACAATGATTTGAAATCGATAATTATTCAAATAATCATGGCTATTTGAACTTCTTCGGTA
828 AAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAAT-AGCTTAACTAATTGAACTGGTTTGACA
17069 AACA
892 AACA
* * * * * *
17073 TATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTATTTGTCAAAATATTAATAAATTAATAATATTTTAA
1 AATTTA-TTTTTAAATCTCCTTA-TTA--ATTT-TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * * ** * **
17137 TCCAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGGCGAAACAAAAAAATCACAAAAATT
61 TCTGAATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGATT
* * * * * ** * *
17201 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTCAAACTTGTTCGGTGAATAGATTTATTTTT
125 TGAAATAGATAA-TATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTT
* * ** *** *
17266 TAAATCTTTTACTTATTAATTGTTTCAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAGGC
188 TAAATCTCTT-GTTATTAATT-TTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * * ** * * **
17330 TTGTATGAATAGAAA-AAGTCATTTTATAAC-AAACAAAAAATTATAGTGATTCCAAATAGATAA
250 TTGTATGAACATAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * *
17393 TTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACT-TGTTCGATAAACAGATTCATTTTTGAAATCTCTTA
314 TTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTAT-TT-GCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTA
* * * * * * *
17457 ATTATTAA-TTTTCATAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAAT
377 CTCATTAATTTTTGA-AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAAT
** * * * * * *
17520 TGAAATAATT-TTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATA
440 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * ** * * * *
17584 GTCATTACAATTTGATGTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAGATTTTTACTTATTAATTTT
505 GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAA-ATCTCTACTTATTAATTTT
* * * * * * *
17649 TAAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAATATAAACTATTG-TT
568 TGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTT
* * * * * * *
17713 TAT-AGCAAAACAAAA-ATCCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTTAGATAGTCATAACTGTT
633 TATGA-CAAAACAAAAGGT-CATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
17776 TGAAC-TGCTTTGACAAATAGATTTATTTTTT-AAATC---T-CTTATTGATTTTT-GAAATATT
696 TGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATT
* * * * * * * *
17834 AATAGATTAGTATTATTTTATTCTGAACAA-ACTTAT-TGAAC-ATAAA-CATTTTTTTATGACA
759 AATAAATTA-CATTATTTTATTTTAAATAAGA-TTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACA
* * * * * * * * * * * * *
17895 AAACAAAAGTTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCACATAGTCATAATTATTTGAATTGAT
822 AAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTATTTAAATAG-CTTAACTAATTGAACTGGT
* ** *
17960 TAGGTAAATA
886 TTGACAAACA
* * * * *
17970 GAA-TTATTTTTTTAATCTCTTATTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTGA
1 -AATTTA-TTTTTAAATCTC---CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTA
* * * *
18033 TTCTTAATAAGC-TAGTATGAAT-TGAAA-ATTATTGTTTTATGACAAGACAAAAGGTCATAACA
60 TTCTGAATAAGCTTA-TATGAATAAGAAACA--ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * *
18095 ATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT-TAACTATTT-AA-TGGGTTTGGTAAACAAATTTA
122 ATTTGAAATAGATAA-TATTCAAATAGT-TAT-ACTATTTAAACT-TGTTTAGTAAACAGATTTA
* ** * * *
18157 TTTTTTAAATCTCTAAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGTAT
183 TTTTTTAAATCTCT-TGTTATTAA-TTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * * * * *
18222 AAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGTATA
246 AAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * * * * *
18287 CAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAA---CC
311 TAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACT-ATTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCC
* * * *
18349 T-CTTATTAAATTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGTTTGTATGATA
375 TACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGA-A
* * * * * * * * *
18412 AAAAAATAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTGAAAT
439 TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * ** * * *
18477 GGCCATAATTATTT-AAATTGATTTTATAAATAGATTCACTTTTTAAA--TC-ACTTATTAATTT
504 AGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTCTACTTATTAATTT
* * * * * * *
18538 TTGGAATATTAATAAATTAACATTACTTTA-TTTCAAGTAAGCCTATATGAACTA-AAACAATTG
567 TTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTG
* *
18601 TTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
630 TTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
18666 TTTGAATTTGTTC-AGTAAACAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATA
694 TTTGAACTTGTTCGA-TAAACATATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAG-AATA
* * * * ** * * * *
18728 ATAAGAAATT--AGTATTTTAATTTGGATAAGCTT-TAATGAACT-GGAATAATTGTTTTATGTC
757 TTAATAAATTACATTATTTTATTTTAAATAAGATTAT-ATGAACTAGAAATAATTATTTTATGAC
* * *
18789 AAAACAAAAGGTCATACCAATTTTAAATAAATAATT
821 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATT
18825 GTCTAAGTAG
Statistics
Matches: 12390, Mismatches: 2806, Indels: 1977
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
846 14 0.00
847 12 0.00
848 30 0.00
849 12 0.00
850 128 0.01
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Consensus pattern (895 bp):
AATTTATTTTTAAATCTCCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA
ATAAGCTTATATGAATAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
AGATAATATTCAAATAGTTATACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
TTGTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
TAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TTATAACTATTTGAACTATTTGCTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTG
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
CTTGTTCAATAAACAGATTTAGTTTTAAATCTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTA
ATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
CATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAT
ATTTATTTTTTAAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTACATTATTTTATTT
TAAATAAGATTATATGAACTAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAA
AATAAATAATTATTTAAATAGCTTAACTAATTGAACTGGTTTGACAAACA
Found at i:6704 original size:476 final size:472
Alignment explanation
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5862 AACTTGTCTT
* * *** * * * *
5872 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTTTTGAACTATCATTAAATTAGTATTATTTT
1 GTAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACAAAATTTTGAACAATCAATAAATTAGTATTATTCT
* * * * **
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* * * ** * *
6002 GAAATAAATAATCATTCATTTAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCTATTAGATTATTTTAAT
131 GAAATAAATAATCATACATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGAAAATAGATTATTTTAAA
* * * *
6067 TTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATCATTAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTA
196 TCTCTTAGTTATTAAGTTTCAAAATATCACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTA
* * ** *
6132 TCAACAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGGAATAAATAATTATTC
261 GCAACAGAAACAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTC
*
6197 AAATAGTTAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTA
326 AAATAGTCAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTA
6262 ATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
391 ATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
6327 TCATTTGAACTGGTTCA
456 TCATTTGAACTGGTTCA
* * *
6344 GTAAATAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACAAAATTTTGAACAATTAATAAATTAGTTTTATTCT
1 GTAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACAAAATTTTGAACAATCAATAAATTAGTATTATTCT
* * * * * * *
6409 ATTTCGAATAAGCTTATATAAGCTGAAATAATTGCTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATT
66 AATCCAAATAAGCTTATACAAAC-AAAATAATTACTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATT
** *
6474 TGAAATAAATAATTGTACATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTTT-GAAAATAGATTTATTTTC
130 TGAAATAAATAATCATACATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGAAAATAGA-TTA-TTT-
* * *
6538 TAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATA-CTACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA-AAA
192 T-AAATCTCTTAGTTATTAAGTTTCAAAATATC-ACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAA
* * * * * * * *
6601 GCCT-GTAGGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGAT
255 --ATAGTAGCAACAGAAACAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAAT
* * * *
6665 AATTATTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTT
318 AATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTT
6730 ATT
383 ATT
6733 AATTCTTGAA
Statistics
Matches: 321, Mismatches: 60, Indels: 12
0.82 0.15 0.03
Matches are distributed among these distances:
472 76 0.24
473 77 0.24
474 3 0.01
475 5 0.02
476 159 0.50
477 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (472 bp):
GTAAACAAAATTATTTTCTAAATCTCTTACAAAATTTTGAACAATCAATAAATTAGTATTATTCT
AATCCAAATAAGCTTATACAAACAAAATAATTACTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
GAAATAAATAATCATACATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGAAAATAGATTATTTTAAA
TCTCTTAGTTATTAAGTTTCAAAATATCACTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATAGTA
GCAACAGAAACAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTC
AAATAGTCAAAACTATTTAAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTA
ATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
TCATTTGAACTGGTTCA
Found at i:7288 original size:530 final size:532
Alignment explanation
Indices: 6378--8914 Score: 1662
Period size: 530 Copynumber: 4.7 Consensus size: 532
6368 TCTTACAAAA
* * * * * * * *
6378 TTTTGAACA-ATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTTCGAATAAGCTTATATAAGCTGAAATAATT
1 TTTTGAA-ATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATT
* *
6442 GCTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTACATATAGTCTTAACTG
65 GTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTG
* * * * *
6507 TTTGAACTAGTTTGAAAATAGATTTATTTTCTAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATACTA
130 TTTGAACTAGTTAGTAAACAGATTTATTTT-TAAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTA
* ** *
6572 CTAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAAAAAGCCTGTAGGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGA
193 CTAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAG-CTGTATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAGA
* * * * * * *
6636 ATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTTGTTT
256 ACAAAAGGCTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTAGTTC
** *
6701 GGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTT
321 AATAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTT
** * * * *
6766 TATTTC-AATAAGCTT-AATGTTGAAAAAAAAAT-TTTTAAGATAAAACAAAAGGTAATAACGAT
386 TATTTCAAATAAAATTGAATATTGAAAAAAAAATATTTTAAGACAAAACAAAAAGCAATAACGAT
* *
6828 TCAAAATAGGTAGTTGTTCAAATGCCCATACTTATTTGAACTA-TTTGGATAAACTGATTTATCT
451 TCAAAATAGGTAGCTGTTCAAATGCCCATAATTATTTGAACTATTTTGG-TAAACTGATTTATCT
6892 TTTAAATCCCTTATTAAC
515 TTTAAATCCCTTATTAAC
* *
6910 TTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTA
1 TTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTG
* * * *
6974 TTTTAT-AATAAAGCAGAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTTATATAGTCTTAACTG
66 TTTTATGAA-AAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTG
* * *
7038 TTTGAACTAATTGGGTAAACATATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTATGAATATTA
130 TTTGAACTAGTT-AGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTA
7102 CTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTCTGTATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAA
193 CTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CTGTATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAA
* * *
7167 CAATAGGCTATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCA
257 CAAAAGGCTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTAGTTCA
*
7232 ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTAC-TAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTT
322 ATAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATT-CTTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTT
* * *
7296 TATTTCAAATAAAATTGTATATTGAAAAAAAATTATTTTAAGACAAAATAAAAAGCAATAACGAT
386 TATTTCAAATAAAATTGAATATTGAAAAAAAAATATTTTAAGACAAAACAAAAAGCAATAACGAT
** * * *
7361 TTGAAATAGGTAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTATTTT
451 TCAAAATAGGTAGCTGTTCAAATGCCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAACTGATTTATCTT
*
7426 TTAAATCTCTTATTAAC
516 TTAAATCCCTTATTAAC
* * * * * * *
7443 TTTTGAAATATTAATAAAATAGTGTTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATGG
1 TTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTG
* * * * *
7508 TTTTATGACAAAATA-AAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
66 TTTTATGA-AAAA-ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACT
* * * * * * *
7572 ATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTTAATAT
129 GTTTGAACTAG-TTAGTAAACAGATTT-ATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATAT
* * * * *
7637 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGATTAAGCTTGTATAAACTA-AAACAATTATTATATGACT
191 TACTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGC-TGTATAAA-TAGAAATAATTATTTTATGA-T
* * * ** * * * ** * *
7701 A-ACCCAAAGG-TCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAGTAGTCTTAACTATTTGAACTG
253 AGAACAAAAGGCT-ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTA
* * * * * ** * * *
7764 GCTCGACAAGCATATA-TT--TTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTTGAATATTATTAAATTAATA
317 GTTCAATAA--ATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTT
* ** * * * * * * * ** *
7826 TTATTTT-TATCTAAA-AACCTTGTATGATT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAGGATC-
380 TTATTTTATTTC-AAATAAAATTGAAT-ATTGAAAAAAAAATATTTTAAGACAAAACAAAAAGCA
* * * * * ** ** * ** *
7887 ATAACTATTTTAAGATTGATATTTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAA-T-TGGTGCGAAAAAC
443 ATAACGA-TTCAAAATAGGTAGCTGTTCAAATGCCCATAATTATTTGAACTATTTTG-G-TAAAC
* *
7950 AGATTTAAT-TTTTAAATCTCTTGCTTACTAA-
505 TGATTT-ATCTTTTAAATC-C---CTTATTAAC
* * * * * * * * * * * * * *
7981 TTTTCAAAATATTAGTGAAGTAGTATTATTTGATTTCGGATAAGTTTTTTTGAACTGAAACAAAT
1 TTTT-GAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATT
* * * * * * * * * *
8046 GTTTTATGACAAAACTAAAGGTCGTAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATGGTC-AAATC
65 GTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAA-CAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAA-C
* ** * * * *
8109 TATTACAACCT-GTTTGATAAAC--ATTT-TTTTT--AATCTCTTACTCATTAATTTTTCAAATG
128 TGTTTGAA-CTAGTTAG-TAAACAGATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * * * *
8168 TTAATAAATT-GCTATTATTTTGTTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAATAATTATTTTATGA
190 TTACTAAATTAG-TATTATTTTATTCTAAATAAGC-TGTAT-AAATAGAAATAATTATTTTATGA
* * ** * * *
8231 -CGAAACAAAAGG-TCAAAACAATTTGAAATAAATAATTGCTCTAATAGT-ATTAACTATTTGAA
252 TAG-AACAAAAGGCT-ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-AAACTATTTAAA
* * * * * * * * * ** * *
8293 TTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAAT
314 CTAGTTCAATAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGT
* * * * ** * * *
8358 ATTATTTTA-ATCTGAATAAACTTG--TATAAAAAGAAACAAACTATTTTATGACAAAATAAATA
379 TTTATTTTATTTC-AAATAAAATTGAATATTGAAA-AAA-AAA-TATTTTAAGACAAAACAAAAA
* ** ** * ** ** * *** * * **
8420 TC-ATAATTATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTGTTTCCGTAAAC
440 GCAATAACGATTCAAAATAGGTAGCTGTTCAAATGCCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAAC
*
8484 AT-ATTTAGT-TTTTAAATCTCTTATTAA-
505 -TGATTTA-TCTTTTAAATCCCTTATTAAC
* * * * ** ** ** * ** *
8511 TTTTCAAAATATTAATACATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAATTTTGCA-CAAATAGAAACAA
1 TTTT-GAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATT-TGGGATAAGCTTATATGAGCTA-AAATAA
* * * * * * * * * * *
8574 TTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATAAG
63 TTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAAC
* * * * * *
8639 TATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAGAATAT
128 TGTTTGAACTAGTT-AGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATAT
* * ** * * * * *
8704 TAATAAATTAGTATTTTTTTATTCCCAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAA
191 TACTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGC-TGTATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAG
* * * * * * * * * * *
8769 AACAAAA-GATCATAACTATTTTAAATAAACAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAAGTTGC
255 AACAAAAGGCT-ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTAG-
* * * * * * ** * *
8833 TT-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTTTTGGAATATTAATAAACTAGC
318 TTCAATAAATAGATTTACTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGT
*
8897 ATTATTTTATTTCAAATA
379 TTTATTTTATTTCAAATA
8915 GGCTTGTATG
Statistics
Matches: 1640, Mismatches: 281, Indels: 161
0.79 0.13 0.08
Matches are distributed among these distances:
529 8 0.00
530 320 0.20
531 120 0.07
532 187 0.11
533 190 0.12
534 114 0.07
535 319 0.19
536 72 0.04
537 133 0.08
538 63 0.04
539 112 0.07
540 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (532 bp):
TTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTGGGATAAGCTTATATGAGCTAAAATAATTG
TTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGT
TTGAACTAGTTAGTAAACAGATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAATATTACTA
AATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTGTATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAA
AGGCTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTAAACTAGTTCAATAA
ATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAATTCTTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTT
CAAATAAAATTGAATATTGAAAAAAAAATATTTTAAGACAAAACAAAAAGCAATAACGATTCAAA
ATAGGTAGCTGTTCAAATGCCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAACTGATTTATCTTTTAAA
TCCCTTATTAAC
Found at i:8755 original size:535 final size:532
Alignment explanation
Indices: 6288--15108 Score: 3798
Period size: 535 Copynumber: 16.4 Consensus size: 532
6278 TAAATTAGTA
* ** * * *
6288 ATAATGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TCATTTGAACTGGTTCAGTAAATAA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACT-GTTTAGTAAACAG
* * ** * * * * *
6352 AATTATTTTCTAAATCTCTTACAAAATTTTGAACA-ATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTTCGA
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-AA
** * * * * * * * *
6416 ATAAGCTTATATAAGCT-GAAATAATTGCTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
127 ATAATTTTGTACAA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
* * * * * * * * * *
6480 AAATAATTGTACATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTT-TGAAAATAGATTTATTTTCTAAAAT
191 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTT-TTAAAT
* * * *
6544 CTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATACTACTAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAA-AAAGCCTGT
255 CTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAA-CTTGT
* * * * * * * * *
6607 AGGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAGAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATT
318 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTT
* * * * * *
6672 CAAGTAGTCAAAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATC-TCTTATTAA
383 CAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCTTATTAA
* * * *
6735 TTCTT-GAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTT-ATTTCAATAAGCTTAATGT-TGAAA-A-AAA
447 TTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAAC-T--TGTAT-AAATAGAAA
* * * *
6795 -AA-T-TTTTAAGATAAAACAAAAGGTA
507 CAATTATTTTATGACAAAATAAAA--TC
** ** * * * * *
6820 ATAACGATTCAAAATAGGTAGTTGTTCAAAT-GCCCAT-ACTTATTTGAACTATTTGGATAAACT
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAAC-TATTTGAACTGTTTAG-TAAACA
* * * * * *
6883 GATTTATCTTTTAAATCCCTTATTAACTTTT-GAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTGG
63 GATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-A
* ** * * ** * * * * * * * *
6946 GATAAGCTTATATGAGCTA-AAATAATTATTTTATAATAAAGCAGAAGGTCATAACAATTTGAAA
126 AATAATTTTGTA-CAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA
* * * * * * ** ** *
7010 TAAATAATTATTTATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAATTGGGTAAACATATTTA-TTTTTAAAT
190 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* *
7074 CTCTTACTTATTAA-TTTTATGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAAT-AAGTCTGT
255 CTCTTACTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACT-TGT
* * * * * * *
7137 ATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAATAGG-CTATAACAATTTGAAATAAATAATTGT
318 ATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * *
7201 TCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTATTAA
382 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCTTATTAA
** * * * * * * *
7265 TTACTAAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTT-ATTTCAAATAAAATTGTAT-ATTGAAAAAAAA
447 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAACTTGTATAAAT-AGAAACAA
* *
7328 TTATTTTAAGACAAAATAAAAAGC
510 TTATTTTATGACAAAAT-AAAATC
** ** * * * * * **
7352 AATAACGATTTGAAATAGGTAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAATTG
1 -ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAG
* * * **
7417 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTT-GAAATATTAATAAAATAGTGTTATTTTATTTTGG
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTAA
* * * * *
7481 ATAAGCTTT-TATGAACTA-AAACAATGGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAACGATTTTAA
127 ATAA-TTTTGTA-CAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTTAA
* * *
7544 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTAGTAAACAGATTTAATTTTTCAA
189 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTT-ATTTTTTAA
* * ** * * *
7609 ATCTTTTGCTTATTAATTTTTTTAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGATTAAGCTTGT
253 ATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGT
* * * * * * * * * *
7674 ATAAACTA-AAACAATTATTATATGACTAACCCAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTAT
318 ATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGT
* * * * * * * * *
7738 TCTAGTAGTCTTAACTATTTGAACTGGCTCGACAAGCATATAT-TTTTTTAAATC-TCTTATTAA
382 TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCTTATTAA
* * * * * * *
7801 TTTTTTGAATATTATTAAATTAATATTATTTTTATCT-AA-AAACCTTGTATGATTAGAAACAAT
447 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAA-CTTGTATAAATAGAAACAAT
* *
7864 TGTTTTATGACAAAATAAGGATC
511 TATTTTATGACAAAATAA-AATC
* * ** * * * * ** *
7887 ATAACTATTTTAAGATTGATATTTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAATTGGTGCGAAAAACAG
1 ATAACGATTTGAA-ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAACAG
* * * * * *
7952 ATTTAATTTTTAAATCTCTTGCTTACTAATTTTCAAAATATTAGTGAAGTAGTATTATTTGATTT
64 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * ** * * * * * *
8017 CGGATAAGTTTTTTTGAACT-GAAACAAATGTTTTATGACAAAACTAAAGGTCGTAATGACTTTA
125 -AAATAA-TTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTA
* * ** * *
8081 AATAGATAATTGTTTAAATGGTCA-AATCTATTACAACCTGTT-TGATAAAC--A-TT-TTTTTT
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTT
* * * * * *
8140 -AATCTCTTACTCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATT-GCTATTATTTTGTTTTGAATAAGC
251 AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTCTAAATAAAC
* * * * *
8202 TTGTATGAACT-GAAATAATTATTTTATGACGAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAAATAA
314 TTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAA
* * * *
8266 TTGCTCTAATAGT-ATTAACTATTTGAATTGGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTT-TT
378 TTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCTT
* * * * *
8329 ATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAACTTGTATAAAAAGAAA
442 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAACTTGTATAAATAGAAA
*
8394 CAAACTATTTTATGACAAAATAAATATC
507 C-AATTATTTTATGACAAAATAAA-ATC
** * * * * *
8422 ATAATTATTTGAGATAAATAATTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTGTTTCCGTAAACATA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTT-AGTAAACAGA
* *
8487 TTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATACATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT
* * *
8552 AATTTTGCACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACGATTTTAAATAGA
129 AATTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGA
* * * *
8617 TAATTGTTCAAATGGACATAAGTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCC
194 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * **
8682 TACCTATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCCCAATAAACTTGTATGAAT
259 TACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAAT
* * * * *
8747 AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTTAAATAAACAATTGTTCAAAC
324 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
* * * *
8811 AATCATAACTATTTGAAGTTGCTT-GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATCAATT
388 AGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC--TT-CTTATTAATT
* * * * ** *
8875 TTTGGAATATTAATAAACTAGCATTATTTT-ATTTCAAATAGGCTTGTATGAATAGAAACAAATT
449 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAACTTGTATAAATAGAAAC-AATT
*
8939 GGTTTT-TGACAAAATAAAAGGTC
512 -ATTTTATGACAAAATAAAA--TC
* * *
8962 ATAACTATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCA-AAC-ATTTGAA-TGTGTTCA--AAA-A-
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TT-AGTAAACAG
* * * * *** * *
9020 CTTT-TTTTTTAATTTTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAAAAAATTTGTATTATTTTATTTAA
64 ATTTATTTTTTAA-ATCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-A
** ** * * * * * ** * * * *
9084 AATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTTATGGCAACTTGATAT
126 AATAATTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
* * * * * *
9149 AGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAAAAAATTCATTTTTTAAATC
191 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * *
9214 TCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTAGATAAGCTTGTACG
256 TCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATG
*** * * * *
9279 AATAGAAACAATTGTTTTGCAATAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
321 AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
* * * * * * * *
9344 ACAGTCATAACTATTTGCACTCG-TCAGGCT-AACAAATTCATTTTTTAAATCCATTACTTTTTA
386 ATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTC--GATAAACAGATTTATTTTTTAAAT-C-TT-CTTATTA
* * * * *
9407 ATTTTTAGAATGTTAATAAATTAGCATTACTTT-ATTCCGAATAAGAC-TGTATGAATAGAAACA
446 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAA-ACTTGTATAAATAGAAACA
* *
9470 ATTCTTTTATGACAAAACAAATAGTC
509 ATTATTTTATGACAAAATAAA-A-TC
* * * * * *
9496 ATCACGATTT-AAAGTAAATAATGGTTCAAATAGTTATAACTAATTCAACTGGTTTAGTAAACAA
1 ATAACGATTTGAAA-TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAG
*
9560 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTC
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTA----TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-
* ** * ** * * * * *
9625 CAAATAAACTTATATGAACA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGA
124 TAAATAATTTTGTACAAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTA
* * * * * *
9689 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAA-TTGATTCGGCAAACATAATTATTTTTTA
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTA
* * * *
9753 AATCTCTTAC----TAATTTTT-GAAATATTAATAAATTTGT-TTTTTTTACTCTAAAT-AAGTT
252 AATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTT
* ** * * * * * * * *
9811 ACTAAAAACT-GAAAAAATTGTTTTACGATAAAACAAAAAGTCCTAATGATTTAAAATAAAGAAT
316 -GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAAT
* * * ** * * * * *
9875 TGTTGATATAGTCTTAACTATTTGAACCGGTTTGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT
379 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA--TCTT-CT
* * * * * * *
9940 TATTAATTTTTAGAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTTTATGAACAAAA
441 TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAACTTGTATAAATAGAA
* * * * * *
10005 ATAATTGTTTTATGATATAACAAAAGCTT
506 ACAATTATTTTATGACAAAATAAAA--TC
* * *
10034 ATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTTAGTAAACAGA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGA
** ** * * *
10099 TCAATTTTTTGCATCTCCTAATTATTAA-TTTCTAAAATATTAGTAAATGAGTATTA-TTTATAC
65 TTTATTTTTTAAATCT-C---TTATTAATTTTC-AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
* *** ** * * * * ** * *
10162 CAAATAGGCTTGTA-TGATGAAAAATAATTATTTTATGATAAAACAAAAATTCATAATGATTTAA
124 TAAATAATTTTGTACAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTA
* ** * * * *
10226 AATAGATAATTATTCAAAGGGCCAAAATTATTTGAA-TTGATTCTA-TAAACTA-ATTCATTTTT
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTC-AGTAAAC-AGATTTATTTTT
* * ** * * * ** *
10288 TAAATCTCTAACTTATCAAAATTT-GAAATATTAATAAGTGA-TATTATTTTATTTTGGATAAGC
250 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAAC
* * * * ** * * * *
10351 TTTTATGTATTGAAACAATTTTTTTACAATAAAAATAAAAGGTCATAATAATTTTAAATAGATAA
314 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAA
* * *
10416 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT--TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTAATTTCTTG
378 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAA-ATCTT-
* * * * *
10479 CTTATTAATTTTCTA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATACATT
439 CTTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAACTTGTATA-AAT
*
10543 A-AAACAATTATTTTATGACTAAATAAAAGGTC
502 AGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAA--TC
* * ** * * * * *
10575 AGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTCATAGGCTTAATTATTTGAACTAGTTCAGTAAACACA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGA
** * *
10640 TTTATTTTTTAAATC-CTTATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTTGTATTATTTTATTCTAAAT
65 TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAAT
* * ** *
10704 AATTTTGTATGAATACCAATTATTTTGAATA-ATTGGTATTATTTTATGTTAAAACAAAATGTCA
129 AA--TT-T-TG--TA-CAA--A--TAGAA-ACA-----ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* ** * * * * * * *
10768 TAACAATTCGAAATAGATGATAGTTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGCAAACAAAT
177 TAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGAT
* * *
10833 TTATTCTTTAAATCT-TTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCC
242 TTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * *
10897 AAATATACTTTTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAA
306 AAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAA
* * * * *
10962 TAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTT-GGTAAAAAGATTTATTTTTTAAA
371 TAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAA
* ** * *
11026 TCTTTTGCTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTT--TTCCAAATAAGCTTGC
435 TC--TT-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAACTTGT
* * ** * * *
11089 ATGAATAGAAATAATTGGTTTATGATAAAACAAATGGTC
496 ATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAA--ATC
* * * *
11128 ATAACGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAATAAAAAAA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGA
* * * * ** *
11193 TTCATTTTTCAAATTTTCGCTTA-TAACTTT-GGAATATTAATTAATTTA-TATTATTTTATTTG
65 TTTATTTTTTAAA---TCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTT-
** ** * * *
11255 AAATAAGCTTGTATGAACA-AAACCAATTGTTTTCTGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTTTA
125 AAATAATTTTGTACAAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTTA
** ** * * * *
11318 AGGAGATAATTGTTCTGATAGTCATAACTCTTTGAACTTGTTTAGCAAACAGATTCATTTTTCTA
188 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTT-TA
** * *
11383 GTTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTTC-AAATAAACTT
252 AATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTT
* * * ** * * ** *
11447 ATGTTAACCGAAACAATT-TTTTATTACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATGGATAATTA
316 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG
* * * *
11511 TTCAAATAGTCATGACTATTTGAAATT-GTTCGGTAAACATATTTATGTTTTAAATCTTTTGCTT
381 TTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC--TT-CTT
* * * * * * * * *
11575 ATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTTAATAAGCTTGTATGAACAAAAA
442 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAACTTGTATAAATAGAAA
*
11640 TAATTATTTTATGACAAAAT--AA--
507 CAATTATTTTATGACAAAATAAAATC
* ** * * * *
11662 A-AA-G--TT-ATAATAATTTGTTGTTCAAATAGTCATAACGATTTGAACTTTTGTGGTGAACAG
1 ATAACGATTTGA-AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTT-TAGTAAACAG
* *** * * *
11722 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATC-TGTTAGTAATAAATTTGAATTATTTTATTT
64 ATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
*** * * * * * **
11786 GAAATAGGCTTGTATAAATAGATGA-AATCT-TTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTCC
125 -AAATAATTTTGTACAAATAGA-AACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTT
* * * * * *
11849 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCAATAAATAGTTTTATTTTTTA
187 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTA
* * * * * * *
11914 AATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAACAACTTACTATTATTTTATT-TCGAATAACCTT
252 AATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAACTT
* * *
11978 ATATGAACTA-AAATAATT-TTCTTATGAC-AAACAAAA-GTCATAATAATTTGAAATAGATAAT
316 GTATGAA-TAGAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAAT
* * * * * * * * *
12039 TATTTAAAATAGTCATGACTATTTG-ATCTAGTTTGGTAAACATATTTATGTTTTAAAATTTTTA
379 T-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT-TGGTTCGATAAACAGATTTAT-TTTTTAAA-TCTT-
* * * * * * * * *
12103 ATTATTAATTGTCAAAATAATAATAAATTAGTATT-TATTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAATA
439 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTAATTTGAATAAACTTGTATAAATA
* * * *
12167 GAAACTATTTTTTATAGTGGA-ACAA-AAAGTC
503 GAAACAATTATTT-TA-T-GACAAAATAAAATC
* * * * *
12198 AAAACGATTTGAAA-AATTAATTGCTCAAATAGTTATAACTATCTG-ACTAGTTT-GATAAA-AG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAACAG
* * ** * **
12259 ATTTATTTTTAAAATCTCTTATGAATTTT-GTAAT-TTAATAGATTTTTATTATTTTATTCTAAA
64 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAAA
* ** * ** * * * *
12322 CAA-ACTATATGAACAAAAAC-A-TATTTTATGAC-AAACAAAAGGTTATAAC-ATTTTGAAATA
128 TAATTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTT-AAATA
* * * * * ** * * *
12382 GATAATTATTCAAATAGTCAATAATTATTAGAACTAATATT--TTAAGTAGA-TAATTGTTCAAA
192 GATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT--TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
12444 TAATAATAAC-TATTTAAGCTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAAT
254 T-CT-CTTACTTA-TTAA---T-TTT--TAGA-ATA-TTA---AT-AAA--T-TAG--TATT-A-
*
12508 TTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATT
297 -TTTT--A---T--T-------------------CTAAATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATT
* ** * * * * * * * * * *
12572 ATTTTATGAGTAAATAAAGGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCA
334 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * ** * *
12637 TTTGAAATGATTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTT-GAAATATT
399 TTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATC--TT-CTTATTAATTTTTAG-AATATT
* * * * * * * * * *
12701 ATTAAATTTGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTATAT-GATAAGAAATAGTTTTTTTATGACAA
460 AATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAACTTGTATAAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAA
* *
12765 AACAAAGACC
524 AATAAA-ATC
* * ** * * * *
12775 ATAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAAT-GATCATAACTATTTGAACTGGTTTGGAAAATAG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAG
* * * ** * *
12839 CTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGTATTATTTTATTT
64 ATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
** * * *
12904 CGGATAAATTT-TA-ATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTT
125 -AAATAATTTTGTACA--AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTT
* * * * * *
12967 AAATAGATAATTGTTCAAATGGTTATATCTATTTAAACTTGTTACA-TAAACATATTAATTTTTT
187 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-CAGTAAACAGATTTA-TTTTT
* * *
13031 TAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGC
250 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAAC
* * * * * * * *
13095 TTGTATAAATTGAAATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAAT
314 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAAT
* * * * * * *
13160 TGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGATCGGCA-AAACACATTTATTTTTT--A--TTATT
379 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTC-G-ATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCTT
** ** * * * * * * ** * **
13220 A--AATTAGTATTATCTTAATCGGAATAAG-CTTATATGAA-AAGAA-ACAA-TTAT-TTTAT-G
442 ATTAATTTTTAGAATATTAAT--AAATTAGTATTATTTTAATTTGAATA-AACTTGTATAAATAG
* ** * * ** * * *
13277 ACAAC-ATAAAGATCATAACAATTTGAGATAG
504 A-AACAAT-TATTTTATGACAAAATAAAAT-C
* * * * * * * * * *
13308 ATAA--TTGTTCAAGTAGTCATAACTAT-TTGAATTGATTCAACAAACAGATTT--A--GTTT-T
1 ATAACGAT-TTGAAATA--AATAA-T-TGTTCAAAT-AGTC-A-TAAC-TATTTGAACTGTTTAG
** * * * * * * ** * * *
13365 TAAATCTCTAATTAATTTTTAAAACAT-TAATAAATTAGT-ATTATTTTATTATAAA-TAATTTT
57 TAAA-C-AGATTTATTTTTTAAATC-TCTTATTAATT-TTCAAAATATTA--ATAAATTAGTATT
* ** *** * * * * * *
13427 GTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAA-AAAAATCTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
116 AT-TTTATTTAAATAA---TTTTGT-ACAAATAGAAA---CA-ATTG-TTT--TAT-GACAA--A
* * * * * * * * * * *
13491 TTCAAAGGGACATAACTATTTGAACAT-G-T--TTGAT-AAATA--AATTTA-TTTTTTAA-AT-
166 -ACAAAAGGTCATAACGATTTTAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTTG
* * ** * * * ** ** * *
13546 CTC---CAACCTA-TTAATTTTTAGAA--TATTA---ATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA-T
228 TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTA-AT-AAATT
** * * * * **
13601 AAAATT-GTAT-G------------------AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATA
290 AGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * *
13646 TCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-CGATCATAACTATTT-AAGTTTGCTT-AATA
355 TCATAA-TAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAA--TTGGTTCGATA
* **
13707 AACAGA-TT-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATACAAATAAATTAGTATTATTT
416 AACAGATTTATTTTTTAAATC--TT-CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * ** *
13770 T-GTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATC
478 TAATTT-GAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA-TAAA-ATC
* * *
13827 ATAACTATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAG-AAGATAG
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAA-ACAG
**
13891 ATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT
64 ATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
* *** * ** * * * * *
13955 GGAATAACCGTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAA
125 -AAATAATTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAA
* * * *
14020 ATAGATAATTGTTCAAATAGTAAGAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACTA-ATTCATTTTTTTA
189 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-AGATTTA-TTTTTTA
* * * * * * *
14084 AATCTCTTACTCATTGA-TTTTAGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCCT
252 AATCTCTTACTTATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTT
* * * ** * *
14148 ATATGAACT-GATACAATTATTTTAAAATC-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
316 GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAAT
* * ** * * * * * *
14211 TATTCAAATAGTTATGGCTATTTGGACTT-TTTGGGTAAACATATTTATTTTTAAAAATCTT-TT
379 TGTTCAAATAGTCATAACTATTT-GAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTTCTT
* * * * * * *
14274 ACTT-ATTATTTGGGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACA
442 A-TTAATT-TTT-AG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAACTTGTATAAATA
* * *
14338 AAAATAATT-TTTTAT-A-AAAA-AAAGTC
503 GAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAATC
* * * * * *
14364 GT-ATGATTT-AAATAAATAATTATTCAAATAGTCCATAACTATTTAAACT-TATTCGATAAATA
1 ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACTGT-TTAG-TAAACA
* * * *
14426 GATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTTAATTGTT-TAAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTA
63 GATTTATTTTTTAAATCTCTTA-----TTAATT-TTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** ** * *
14490 TTTGAAATAAGATTGTATGAATAGCAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATT
122 TTT-AAATAATTTTGTACAAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * ** * *
14554 TGAAATAGATAATTGAT-AAATAGTCATAACTATTTTAACTTGTTCAACAAATAGATTCATTTTT
185 TTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTT
** * ** * *
14618 TAAATCTCTTACTTGCTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATT-TCAAATAAAC
250 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAAC
* * ** * * * * * *
14682 TTGTATGAATAGAAATAATTGATTTGCGATAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAAT
314 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAAT
* * * * ** * * * *
14747 TGTTCAAACAATCATAAATATTTGCACTAAG--C-AAACTAACAAATTCATTTTTGAAATTCATT
379 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-AATTGGTTCGATA--AACAGATTTATTTTTTAAA-TC-TT
* * * *
14809 AGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTT-ATTTGAATAAGAC-TGTATGACT
439 -CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAA-ACTTGTATAAAT
* * * *
14872 AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTC
502 AGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAA--ATC
** * * * * *
14905 ATAATAATTTGAAATAAAATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAA
1 ATAACGATTTGAAAT-AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAG
* * * *
14969 ATTTATTTTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTGAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTATTT
64 ATTTATTTTTTAA--ATC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
*
15034 TGAACA-AACTTATT-TGA-AAA-A-AAAC-ATTCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
124 T-AA-ATAA-TT-TTGT-ACAAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * *
15093 TATGAAATCGATAATT
183 TTTTAAATAGATAATT
15109 ATTTTTTAAA
Statistics
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ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
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ATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAACAGAT
TTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAAATAA
TTTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATA
ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTTGTATGAATAG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGT
CATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTCTTATTAATTTTTAGAA
TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGA
CAAAATAAAATC
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12007 AACAAAAGTC
*
12017 ATAATAATTTGAAATAG
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*
12034 ATAATTATTTAAAATAG
1 ATAATAATTTAAAATAG
12051 TCATGACTAT
Statistics
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ATAATAATTTAAAATAG
Found at i:13338 original size:153 final size:153
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Indices: 13059--13338 Score: 361
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13049 ATTTTTTGAA
* * * * * *
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* ** *
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* *
13213 TATTATTAAATTAGTATTATCTTA-ATCGGAATAAGCTTATATGAAA-AGAAACAATTATTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATCTTATATC-AAATAAGCTTATAT-AAATAGAAACAATTATTTTAT
* *
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64 GACAAACA-AAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA-TAGTCATAACTATTTGAA
13339 TTGATTCAAC
Statistics
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CAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
ATCGGCAAAACACATTTATTTTT
Found at i:13365 original size:153 final size:153
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Period size: 153 Copynumber: 2.0 Consensus size: 153
13049 ATTTTTTGAA
* * * * * *
13059 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATAAATTGAAATAATTTTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATCTTATATCAAATAAGCTTATATAAATAGAAACAATTATTTTATGA
* ** *
13124 CTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTA
66 C-AAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTA
**
13189 GATCGGCAAAACACATTTATTTTT
130 GATCAACAAAACACATTTATTTTT
* *
13213 TATTATTAAATTAGTATTATCTTA-ATCGGAATAAGCTTATATGAAA-AGAAACAATTATTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATCTTATATC-AAATAAGCTTATAT-AAATAGAAACAATTATTTTAT
* *
13276 GAC-AACATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTC-AAGTAGTCATAACTATTTGAA
64 GACAAACA-AAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA-TAGTCATAACTATTTGAA
* * *
13339 -TTGATTCAAC-AAACAGATTTAGTTTT
127 CTAGA-TCAACAAAACACATTTATTTTT
13365 TA
1 TA
13367 AATCTCTAAT
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 19, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
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154 51 0.39
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ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (153 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATCTTATATCAAATAAGCTTATATAAATAGAAACAATTATTTTATGA
CAAACAAAAGATCAGAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAG
ATCAACAAAACACATTTATTTTT
Found at i:13621 original size:180 final size:180
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Indices: 13213--15111 Score: 1506
Period size: 180 Copynumber: 10.6 Consensus size: 180
13203 ATTTATTTTT
* * * * * * *
13213 TATTATTAAATTAGTATTATCTTA-ATCGGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * ** * * *
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65 ACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
13341 GATTCAACAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC-TA---ATTAATTTTTAAAA
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* ** *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
** ** * *
13453 ACAAAAAAAATCTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACAT
65 ACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * ** *
13518 GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAA
130 GTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** *
13569 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
** * *
13634 CAAAACAAAATATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-CGATCATAACTATTT-AAG
66 CAAAA-AAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAA-
* * * *
13696 TTTGCTTAATAAACAGA-TT-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAA
127 CTTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** * * *
13748 TACAAATAAATTAGTATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
13813 CAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACG
66 CAAAA-AAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * *
13877 TGTTTAGA-AGATAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTT-GAAA
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** * * * *
13928 TATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAACCGTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * ** * * * *
13992 ATAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAAGAACTATTTAAACT
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* * * * *
14057 TGTTCAGTAAACTA-ATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTGA-TTTTAGGAA
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* ** * * * * **
14110 TATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GATACAATTATTTTAAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * ** *
14174 ATCAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGCTATTTGGACT
65 A-CAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * * **
14239 T-TTTGGGTAAACATATTTATTTTTAAAAATCTTTTACTTATT-A-TTTGGGAAA
129 TGTTT-AATAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
14291 TATTAATAAATTAATATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-TTTTAT-
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
14353 --AAAAAAAA-GTCGT-ATGATTT-AAATAAATAATTATTCAAATAGTCCATAACTATTTAAACT
65 ACAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACT
* ** * * * *
14413 TATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTTAATTGTTTA-AA
129 TGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTTATTAATT-TTTAGAA
* * * *
14466 TATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGATTGTATGAATAGCAAA-AATTGTTTTATG
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* ** *
14530 ACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGA-T-AAATAGTCATAACTATTTTAAC
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* * * * ** *
14593 TTGTTCAACAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTGCTAATTTTTGGAA
128 TTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** * * * * * **
14646 TATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGATTTGCGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * *
14711 TAACACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCACTA
66 CAA-AAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* ** * * * *
14776 AG-CAAACT-AACAAATTCATTTTTGAAAT-TCATTAGTTATTAATTTTTAGAA
129 TGTTTAA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
14827 TATTAATAAATTAGCATTATTTTATTT-GAATAAGAC-TGTATGACTAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
14890 ATAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAAATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTAAAC
65 ACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
14954 TGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTGAAAA
128 TTGTTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * ** * * * * * * *
15007 TACTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATTTGAAAAAAAAC-ATTCATTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATG
* * *
15071 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATATGAAATCGATAATTATT
65 ACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
15112 TTTTAAATCT
Statistics
Matches: 1394, Mismatches: 260, Indels: 134
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 32 0.02
174 37 0.03
175 51 0.04
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177 5 0.00
178 1 0.00
179 163 0.12
180 454 0.33
181 340 0.24
182 151 0.11
183 16 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
TTTAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
Found at i:13690 original size:510 final size:515
Alignment explanation
Indices: 12697--13692 Score: 1244
Period size: 510 Copynumber: 1.9 Consensus size: 515
12687 ATTTTTGAAA
* * * * * * *
12697 TATTATTAAATTTGTATTATTTTAATCTAAATAAGCTTATATGATAAGAAATAGTTTTTTTATGA
1 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGAAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
* * * *
12762 CAAAACAAAGACCATAGCGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATGATCATAACTATTTGAACTGG
66 CAAAACAAAGACCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATGATCATAACTATTTGAACTGG
* ** * * * * *
12827 TTTGGAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATGAAGTAGT
131 ATTCAAAAACAGATTTAGTTTTTAAA-CTCTTGCTTAATAATTTTTAAAACATTAATAAAGTAGT
** ** *
12892 ATTATTTTATTTCGGATAAATTTTAATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
195 ATTATTTTATTTCAAATAAATTTTAATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGCTCA
* * * ** * * *
12957 TAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGTTATATCTATTTAAACTTGTTACATAAACATAT
260 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTAAACATGTTACATAAACAAAT
*** * *
13022 TAATTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
325 TAATTTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
** * * * * *
13087 AAATAAGCTTGTATAAATTGAAATAATTTTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAA
390 AAATAAAATTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAGAATGATTTGAAA
* * *
13152 TAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGATCGGCAAAACACATTTATTTTT
455 TAAATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATCGGCAAAACACATTTATTTTT
*
13213 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGGAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGAAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * *
13278 CAACATAAAGATCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAGT-AGTCATAACTATTTGAA-TT
66 CAAAACAAAGACCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATGA-TCATAACTATTTGAACTG
*
13341 GATTCAACAAACAGATTTAGTTTTTAAA-TC-T-C-TAATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTA
130 GATTCAA-AAACAGATTTAGTTTTTAAACTCTTGCTTAA-TAATTTTTAAAACATTAATAAAGTA
* *
13402 GTATTATTTTATTAT-AAAT-AATTTTGTATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAT
193 GTATTATTTTATT-TCAAATAAATTTT-AATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* ** *
13464 CTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTGAACATGTTTGATAAAT
256 CTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTAAACATGTTACATAAAC
*
13529 AAATTTA-TTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
321 AAATTAATTTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * *
13593 TTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACT-ATT
386 TTTCAAATAAAATTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAGAA-TGATT
13657 TGAAATAAATAATTATTC-AA-ACGATCATAACTATTT
450 TGAAATAAATAATTATTCTAATA-G-TCATAACTATTT
13693 AAGTTTGCTT
Statistics
Matches: 408, Mismatches: 64, Indels: 22
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
508 1 0.00
509 3 0.01
510 131 0.32
511 72 0.18
512 65 0.16
513 2 0.00
514 2 0.00
515 6 0.01
516 126 0.31
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (515 bp):
TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATCGAAATAAGCTTATATGAAAAGAAACAATTATTTTATGA
CAAAACAAAGACCATAACAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATGATCATAACTATTTGAACTGG
ATTCAAAAACAGATTTAGTTTTTAAACTCTTGCTTAATAATTTTTAAAACATTAATAAAGTAGTA
TTATTTTATTTCAAATAAATTTTAATGAAGAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGCTCAT
AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAGGGACATAACTATTTAAACATGTTACATAAACAAATT
AATTTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
AATAAAATTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAGAATGATTTGAAAT
AAATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACTAGATCGGCAAAACACATTTATTTTT
Found at i:14650 original size:718 final size:713
Alignment explanation
Indices: 13375--15030 Score: 1599
Period size: 718 Copynumber: 2.3 Consensus size: 713
13365 TAAATCTCTA
* * ** * *** * **
13375 ATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATAAATAATTTTGTATGAAGAGAAA
1 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAACATTATTTTATT-TGAATAAGACTATATGACTAGAAA
* ** * ** ** * ** **
13440 CAATTGTTTTATGACAAAA-AAAATCTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAAGGGACA
65 CAATTATTTTAAAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAATAATTATTCAAATAGTTA
* * * * * ** * ** *
13503 TAACTATTTGAACAT-GTTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACCTATTAATTTTTAG
130 -AACTAATTAAAC-TGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTGGAA
* * * ** * * *
13567 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTATTTTA
193 AATACTAATAAATTAATATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-TTTTA
* * *
13631 TGACAAAACAAAATATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAAACGATCATAACTATTTAA
256 T---AAAA-AAAA-GTCGT-A-TGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAAGATCATAACTATTTAA
** * *
13695 GTTTGCTTAATAAACAGATTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATACAAATAAATT
314 ACTTGATTAATAAACAGATTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATACAAATAAATT
* *
13760 AGTATTATTTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGA
379 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGA
* * * * *
13825 TCATAACTATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTTAGAAGATA
444 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAATA
* * * ** * *
13890 GATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
509 GATTCATTTTTTAAATCTCTACTTACTAATTTTTGAAATATTAAT-AAGCTAGAATTATGTTATT
** * * * *
13954 TGGAATAACCGTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGA
573 TCAAATAAACGTATATGAACAGAAACAATTGATTTACGATAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGA
* * * * *** * * *
14019 AATAGATAATTGTTCAAATAGTAAGAACTATTTAAACT-TGTTCAGTAAACTAATTCATTTTTTT
638 AATAGATAATTGTTCAAACAATAAGAAATATTTAAACTAAGCAAACT-AACAAATTCA-TTTTTG
14083 AAATCTC-TTACTC
701 AAAT-TCATTACTC
* * *
14096 ATTGA-TTTTAGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GA
1 ATTAATTTTTA-GAATATTAATAAATTAACATTATTTTA-TTTGAATAAGACTATATG-ACTAGA
* * *
14159 TACAATTATTTTAAAATCAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGT
63 AACAATTATTTTAAAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAATAATTATTCAAATAGT
** * ** * ** * *
14223 TATGGCTATTTGGACT-TTTTGGGTAAACATATTTATTTTTAAAAATCTTTTACTTATT-ATTTG
128 TA-AACTAATTAAACTGGTTT-AATAAACAAATTTATTTTT-AAAATCTCTTACTTATTAATTTG
* *
14286 GGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTTTTT
190 GAAAATACTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTTTTT
14351 ATAAAAAAAAGTCGTATGATTT-AAATAAATAATTATTCAAATAG-TCCATAACTATTTAAACTT
255 ATAAAAAAAAGTCGTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-AGAT-CATAACTATTTAAACTT
* * * * **
14414 -ATTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTATTTTTTTAATTGTTT-AAATATTAATAAAT
318 GATT-AATAAACAGA-TT-TTTTTTAAATCTTTTA-CTTATTAATT-TTTGAAATACAAATAAAT
* * *
14477 TTGTGTTATTTTATTT-GAAATAAGATTGTATGAATAGCAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAA
378 TAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGATTGTATGAATAG-AAACAATTGGTTTATGACAAAACAAA
* * * * *
14540 AGGTTATAGCGATTTGAAATAGATAATTGAT-AAATAGTCATAACTATTTTAACTTGTTCA-ACA
441 AGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGA-A
* *
14603 AATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTGCTAATTTTTGGAATATTAATAAGCTAGAATTATGT
505 AATAGATTCATTTTTTAAATCTC-TACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAGCTAGAATTATGT
* * * * * * * * **
14668 TATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGATTTGCGATAACACAAAAGATTATAATGAT
569 TATTTCAAATAAACGTATATGAACAGAAACAATTGATTTACGATAAAACAAAAGATCAAAACAAT
* * **
14733 TTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCACTAAGCAAACTAACAAATTCATTTT
634 TTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATAAGAAATATTTAAACTAAGCAAACTAACAAATTCATTTT
* *
14798 TGAAATTCATTAGTT
699 TGAAATTCATTACTC
* *
14813 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTGAATAAGACTGTATGACTAGAAAC
1 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAACATTATTTTATTTGAATAAGACTATATGACTAGAAAC
* ** * * *
14878 AATTGTTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATAATTTGAAATAAAATAATTGTTCAAATAGTTAA
66 AATTATTTTAAAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAATAATTATTCAAATAGTTAA
* * *
14943 ACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTTAACTCTCTTACTTATTAATTTTGAAAAT
131 ACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTGGAAAAT
15008 ACTAATAAATTAATATTATTTTA
196 ACTAATAAATTAATATTATTTTA
15031 TTTTGAACAA
Statistics
Matches: 762, Mismatches: 146, Indels: 59
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
714 23 0.03
715 46 0.06
716 119 0.16
717 136 0.18
718 227 0.30
719 9 0.01
720 5 0.01
721 66 0.09
722 116 0.15
723 15 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (713 bp):
ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAACATTATTTTATTTGAATAAGACTATATGACTAGAAAC
AATTATTTTAAAATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAAATAATTATTCAAATAGTTAA
ACTAATTAAACTGGTTTAATAAACAAATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTTGGAAAAT
ACTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTTTTTATAAAA
AAAAGTCGTATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAAGATCATAACTATTTAAACTTGATTAATA
AACAGATTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATACAAATAAATTAGTATTATTTTA
TTTCGAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTT
GAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAGAAAATAGATTCATTTTTT
AAATCTCTACTTACTAATTTTTGAAATATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACGTA
TATGAACAGAAACAATTGATTTACGATAAAACAAAAGATCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAACAATAAGAAATATTTAAACTAAGCAAACTAACAAATTCATTTTTGAAATTCATTACTC
Found at i:15518 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 15107--18982 Score: 2973
Period size: 180 Copynumber: 21.6 Consensus size: 181
15097 AAATCGATAA
* * * * *
15107 TTATTTTTTAAATCTCTTGCTGATT-ATTTTTGAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTATT-TC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-
* * * * * *
15170 GAATAAG-TTACTAAGAACTGAAAAAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
65 GAATAAGCTT-GTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * * * * * *
15234 ATAAAGAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTAAACTGGTTC---AAATAAAT
129 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
** * * * * *
15284 TTA---TTGGAATTTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTACATTAGTATTATTTTATTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
** * * *
15345 GAATAAGCTTGTACAAACAGAAATAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAA
65 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * ** * *
15410 TATATAATTGCTCAAATAGTCATAACCT-TTTGAACTAATTTGGTAAACAAAT
130 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * *
15462 TTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * ** * * * *
15526 AATAGGTTTGTATGATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAAC-ATTTAAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * ** * * **
15590 AGATAATTATTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTAATTTGATAAATTGAT
131 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
** * * * * *
15641 TTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * * * * * * * *
15706 GATAAGCTTTTAT-AAGCTA-AAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGCCATAATAGTTTTAA
66 AATAAGCTTGTATGAA-C-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* *
15769 ATAGATAATTGTTCATATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGAT
129 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * * * *
15822 TTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAAATAGTATTATTTTATTTT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * * * * **
15886 GAATAAGCATATATGAACTGAATTAATTATTTTATGACTAAAGAAAAGGTCAGAATGATTTGAAA
65 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * * *
15951 CAGATAACTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTTGGCAAACACAT
130 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * * * *
16002 CTATTTTTTAAA--TC---CTTATTAATTTTT-AGAATACTATTAATTTAGTAGTATTTTACAT-
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTC
* * * * * * * * * *
16060 TGAACAAGCTTCTATGAATAGAAATAAATGTTTTAGGATAAAAC-AAAGATCTTACCAATTTCAA
64 TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * *
16124 ATAAATAATTGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAAGAGAT
129 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGAT
* * * * *
16177 TTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTTTTATG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
** * * * ** *
16238 AATAATTTTGTATGAATA-AAATAATTGTTTTACGACAAAATAAAATATCATAACAATTTCAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * ** *
16302 AGATAATAGTTCAAATAGACATGACTATTCGAACTTGTTCAATAAATAGAT
131 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * * *
16353 TAATTTTTTAAAT-T-TTCAACTTATTAATTTTTAAAACATTAATAAATTAGTATTATTATATTT
1 TTATTTTTTAAATCTCTT--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * **
16416 TGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAG-CATAATGATTTGA
64 TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGA
* * * * *** ** * *
16480 AATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACAATTTAAACTCACTCAATAAGCAAAT
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * *
16534 TT-TATTTTTAAATGTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCA
1 TTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * ** ** **
16597 AAATAAGCTTGTTTGAAAAGAAATAATTCATTTATGACAAAACAATTGGTCATAATGATTTGAAA
65 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * *
16662 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACATGTTCAGAAAATTA-AT
130 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-CAGAT
* * * *
16714 TTATTTTTAAAAT-TTTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-T
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * *
16776 GAAATAAGCTTGCATGAACA-AAACCAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATATTTTGA
65 G-AATAAGCTTGTATGAACAGAAA-TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * ** *
16840 AATAGATAATTGTTCAGATAGTCATAACAATTTGAACTTGTTTAGTAAATAGAT
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * * * *
16894 TCATTTTTTTAATTCTCTTGCTCT-TTGATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 TTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * * * * * * * * **
16958 TAAATAAGTTTATATGAACTGAAACAATTATTTTATTACAAAACAAAAAGTCACAATGATTTGAA
64 TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * ** * *
17023 ATCGATAATTATTCAAATAATCATGGCTATTTGAACTTCTTCGGTAAACATAT
129 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* ** * * * *
17076 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATATTAATAAATTAATAATATTTTAATCC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * ** * *
17140 AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGGCGAAACAAAAAAATCACAAAAATTTGAA
65 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * ** * *
17205 ATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACGATTCAAACTTGTTCGGTGAATAGAT
129 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* *
17258 TTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTT-CAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC
** * * ** * ** * *** **
17321 AAAATAGGCTTGTATGAATAGAAA-AAGTCATTTTATAAC-AAACAAAAAATTATAGTGATTCCA
64 TGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * *
17384 AATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTCGATAAACAGAT
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * *
17438 TCATTTTTGAAATCTCTTAATTATTAA-TTTTCATAATATTAATAACA-TAGTATTATTTTATT-
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTC
* * * ** * ** *
17500 TCAAATAAGTTTATATGAATTGAAATAATT-TTTTTTGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAA
64 T-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * ** * *
17564 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATTACAATTTGATGTAGTTCGGTAAACATAT
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * * *
17618 TTATTTTTTAAGAT-TTTTACTTATTAATTTTTAAAATTTTAATAAATTAATATTATTTTAATCT
1 TTATTTTTTAA-ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * **
17682 GAATAAGCTTGTATGAATATAAACT-ATTG-TTTAT-AGCAAAACAAAA-ATCCATAATGATTTG
65 GAATAAGCTTGTATGAACAGAAA-TAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGGT-CATAACAATTTG
* * * * * ** *
17743 AAATAAATAATTGTTTAGATAGTCATAACTGTTTGAAC-TGCTTTGACAAATAGAT
127 AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGAT
* *
17798 TTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTGATTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * * * * * * *
17859 AACAAACTTAT-TGAACATAAA-CATTTTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAACAATTTGAAAT
66 AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * *
17922 AGATAATTGTTCACATAGTCATAATTATTTGAA-TTGATTAGGTAAATAGAA
131 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGAT
* * * * *
17973 TTATTTTTTTAATCTCTTATTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTGATTCT
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCT
* * ** * *
18037 TAATAAGCTAGTATGAATTGAAAATTATTGTTTTATGACAAGACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
65 GAATAAGCTTGTATGAACAG-AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * *
18102 ATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTT-AA-TGGGTTTGGTAAACAAAT
129 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAACAGAT
* * * * * *
18154 TTATTTTTTAAATCTCTAAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * * * * * * *
18219 TATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAGT
66 AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
* * * * *
18284 ATACAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAA-TTGGTTCGGTAAACATAT
131 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAACAGAT
* *
18335 TTATTTTTTAAA-C-C-T-CTTATTAAATTTTGAAAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-G
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * * * * *
18395 AATAAGTTTGTATGATAAAAAAATAATTGTTATATGACCAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAA
66 AATAAGCTTGTATGA-ACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAA
* * * * * * *** *
18460 TGGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTT-AAATTGATTTTATAAATAGAT
130 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAACAGAT
* * * ** * *
18512 TCACTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAACATTACTTTATT-TC
1 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
* * * * *
18572 AAGTAAGCCTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAAGGTCATAACAATTTTA
66 AA-TAAGCTTGTATGAAC-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * *
18636 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAAACAAAT
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * *
18690 TTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATAAGAAATTAGTA-T-TTTAATT-T
1 TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT
* * * * * *
18751 GGATAAGCTT-TAATGAACTGGAATAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATACCAATTTTAA
65 GAATAAGCTTGT-ATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAA
* * * * *
18815 ATAAATAATTG-TCTAAGTAGTCATAACTATTTGAATTTATTCGGTAAGCAGAT
129 ATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
* * * * * *
18868 TTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTAGTAATTTTTTG-AATGTCAGTAAATTTAG-ATTATTTTATT
1 TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
18931 GC-AAATAAGCTTGTAAGATATA-AAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGT
63 -CTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
18983 TCGATAAATA
Statistics
Matches: 2953, Mismatches: 627, Indels: 233
0.77 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 70 0.02
175 295 0.10
176 189 0.06
177 199 0.07
178 157 0.05
179 192 0.07
180 933 0.32
181 501 0.17
182 400 0.14
183 16 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTG
AATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAGAT
Found at i:19272 original size:306 final size:305
Alignment explanation
Indices: 18688--19289 Score: 645
Period size: 306 Copynumber: 2.0 Consensus size: 305
18678 CAGTAAACAA
* *
18688 ATTTATTTTTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATAAGAAATTAGTATTTTAATTTGG
1 ATTTATTTGTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATAAGAAATTAGTATTTTAATTTGA
*** * * *
18753 ATAAGCTTTAATGAACTGGAATAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGGTCATACCAATTTTAAATA
66 ATAAGCTTTAATGAACAAAAACAATTGTTTTATG-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * *
18818 AATAATTGTCTAAGTAGTCATAACTATTTGAATTTATTCGGTAAGCAGATTTATTTTTTCAAATC
130 AATAATTGTCTAAGTAGCCATAACTATTTGAACTAATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATC
** * * *
18883 TTTTGCTTAGTAATTTTTTGAATGTCAGTAAATTTAGATTATTTTATTGCAAATAAGCTTGTAAG
195 TTTTGCTTAGTAATTTTAGGAATATCAATAAATTTAGATTATTTTATTGCAAATAAGCTTGTAAA
18948 ATATAAAACAAATATTTTATGACTAAA-CAAAAGGTTCGATAAATAG
260 ATATAAAACAAATATTTTATGAC-AAATCAAAAGGTTCGATAAATAG
* * ** *
18994 ATTTA-TTGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTATTTGTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATAAGAAATTAG---TATTTTAAT
* *
19058 TTGAATAAGC-TTATATGATCAAAAACAATTGTTTTATG-AAAACAAAAGGTCATAATAATTTGA
62 TTGAATAAGCTTTA-ATGAACAAAAACAATTGTTTTATGCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGA
* * * * * *
19121 AATAGATAATCAT-TC-AAGTGGCCATAATTATTTTAACTAATTCGGTAAACCGGTTTATTTTTT
126 AATAAATAAT--TGTCTAAGTAGCCATAACTATTTGAACTAATTCGGTAAACAGATTTATTTTTT
* * **
19184 -AAAT-TTCTTGCTTATTAA-TTTAGGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-CTATCTA
189 CAAATCTT-TTGCTTAGTAATTTTAGG-AATATCAATAAATTTAG-ATTATTTTATTGC-AAATA
* * *
19244 AGCTTG-AATTAAT-TGAAACAATTATTTTATGACAAATTAAAAGGTT
250 AGCTTGTAA--AATATAAAACAAATATTTTATGACAAATCAAAAGGTT
19290 ATAATGATTT
Statistics
Matches: 245, Mismatches: 37, Indels: 28
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
305 24 0.10
306 107 0.44
307 72 0.29
308 5 0.02
309 37 0.15
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (305 bp):
ATTTATTTGTTTAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAATAAGAAATTAGTATTTTAATTTGA
ATAAGCTTTAATGAACAAAAACAATTGTTTTATGCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAA
ATAATTGTCTAAGTAGCCATAACTATTTGAACTAATTCGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCT
TTTGCTTAGTAATTTTAGGAATATCAATAAATTTAGATTATTTTATTGCAAATAAGCTTGTAAAA
TATAAAACAAATATTTTATGACAAATCAAAAGGTTCGATAAATAG
Found at i:19400 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 18988--19421 Score: 460
Period size: 181 Copynumber: 2.4 Consensus size: 178
18978 AAGGTTCGAT
* * *
18988 AAATAGATTTATTGTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATCAATTAGTATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * *
19053 TTATTTTGAATAAGCTTATATGATCAAAAACAATTGTTTTATGAAAACAAAAGGTCATAATAATT
66 TTATTCT-AATAAGCTTATATAATCAAAAACAATTATTTTATGAAAACAAAAGGTCATAATAATT
* * ** * * * *
19118 TGAAATAGATAATCATTCAAGTGGCCATAATTATTTTAACTAATTCGGT
130 TGAAATAGATAATCATTAAAATAACAATAATTATTTAAACTAATTCAGC
** * * * **
19167 AAACCGGTTTATTTTTTAAATTTCTTGCTTATTAATTTAGGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * *
19232 TTATTCTATCTAAGCTTGA-ATTAAT-TGAAACAATTATTTTATGACAAATTAAAAGGTTATAAT
66 TTATTCTA-ATAAGCTT-ATA-TAATCAAAAACAATTATTTTATGA-AAA-CAAAAGGTCATAAT
* * * *
19295 GATTTTAAATAGATAATTC-TTAAAATAATAATAATTATTTAAACTTATTCAGC
126 AATTTGAAATAGATAA-TCATTAAAATAACAATAATTATTTAAACTAATTCAGC
* * * * * *
19348 AAATAGATTTATTTTTTTAATCACTTTCTTATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAAT
1 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
19413 TTATTCTAA
66 TTATTCTAA
19422 AACAATTGTT
Statistics
Matches: 206, Mismatches: 43, Indels: 11
0.79 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
179 85 0.41
180 7 0.03
181 111 0.54
182 2 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.09, T:0.45
Consensus pattern (178 bp):
AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTCTAATAAGCTTATATAATCAAAAACAATTATTTTATGAAAACAAAAGGTCATAATAATTT
GAAATAGATAATCATTAAAATAACAATAATTATTTAAACTAATTCAGC
Found at i:19871 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19541--19871 Score: 439
Period size: 181 Copynumber: 1.8 Consensus size: 180
19531 ATAATTTTTA
* ** * * *
19541 AAATATTTTTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTACAAGCAAAACAATTCTTTTAC
1 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAAATAGTACAAACAAAACAATTCGTTTAC
* ** *
19606 GACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAAC
66 GACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAA
* **
19671 TAGTTGGGTAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCG
131 TAGTTGGGCAAGCAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCG
* * * * *
19721 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAATAGTATAAATAGAACCAATT-GTTTG
1 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAAATAGTACAAACA-AAACAATTCGTTTA
* * *
19785 CTGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGA
65 C-GACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGA
*
19850 AATAGTTTGGCAAGCAGATTTA
129 AATAGTTGGGCAAGCAGATTTA
19872 CTTAAATCTC
Statistics
Matches: 127, Mismatches: 22, Indels: 3
0.84 0.14 0.02
Matches are distributed among these distances:
180 46 0.36
181 81 0.64
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAAATAGTACAAACAAAACAATTCGTTTAC
GACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAA
TAGTTGGGCAAGCAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCG
Found at i:20277 original size:179 final size:177
Alignment explanation
Indices: 19992--20457 Score: 512
Period size: 179 Copynumber: 2.6 Consensus size: 177
19982 TAACGATTTG
* * * * * * * *
19992 AAATAGTTATAATTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGAATT-AATTTCTAAATCTCTTATAAATT
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACA-AATTCATTTTTTAAATGTCTTATTAATT
* * * * * *** *
20056 ATAGAAATATTAATAAATTATTTTTATTCTATTTCAAATAAGCTTGTATGAGTTGAAACAATTAT
65 CTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAAAT-T
*
20121 TTTATGACA-AAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
129 TTTATAACAGAAA-AAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
* * * * * * *
20169 ATATAGTCTTAGCTATTTGAACTGGTTT-GACAAACATATTCATTTTTTAAATCTTAGTTATTAA
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAG-CAAACAAATTCATTTTTTAAAT-GT-CTTATTAA
* * * *
20233 TT-TTTACAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAA
63 TTCTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
* * *
20296 ATTTTTATAATAGAAAAAAAGAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTC
126 ATTTTTATAACAGAAAAAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
*
20348 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATGTCTTATTAATTC
1 AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAAATTCATTTTTTAAATGTCTTATTAATTC
*
20413 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTG
66 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG
20458 CATGTTGAAA
Statistics
Matches: 235, Mismatches: 43, Indels: 22
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 4 0.02
177 77 0.33
178 26 0.11
179 127 0.54
180 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
AAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAAATTCATTTTTTAAATGTCTTATTAATTC
TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAAATTTT
TATAACAGAAAAAAAGAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTC
Found at i:20567 original size:133 final size:133
Alignment explanation
Indices: 20329--20579 Score: 369
Period size: 133 Copynumber: 1.9 Consensus size: 133
20319 TTATAACAAT
* * * **
20329 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAACAAATTTATTTT
1 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAACAAACAAATTTAAGTT
** *
20394 TTAAATGTCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGC
66 TTAAATCACTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCAAAAAAGCTTGC
20459 ATG
131 ATG
* * *
20462 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGGT-ATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAATAGATTTAAGT
1 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTAGTTTAACAAACAAATTTAAGT
* *
20526 TTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGTATTACTTTATTTC
65 TTTAAATCACTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTC
20580 GAACAAACTT
Statistics
Matches: 104, Mismatches: 13, Indels: 2
0.87 0.11 0.02
Matches are distributed among these distances:
133 102 0.98
134 2 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.09, T:0.44
Consensus pattern (133 bp):
TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAACAAACAAATTTAAGTT
TTAAATCACTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCAAAAAAGCTTGC
ATG
Found at i:20643 original size:310 final size:314
Alignment explanation
Indices: 20150--20763 Score: 721
Period size: 310 Copynumber: 2.0 Consensus size: 314
20140 TCATAACAAT
* * * * * * * **
20150 TTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAGCTATTTGAACTGGTTTGACAAACATATTCATTTT
1 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAACAAACAGATTCAAGTT
* * * * *
20215 TTAAATCTTAGTTATTAATTTTTACAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTT
66 TTAAATC-TACTTATTAATTTTTACAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCTGAACAAACTT
* * * * *
20280 TTATGAACAGAAACAAATTTTTATAATAGAAAAAAAGAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTG
130 ATATGAACAAAAACAAATTTTTATAACAGAAAAAAAGAGTTATAACAATTTGAAATAGATAAGTA
*
20345 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTA-GCAAACA-AATTTATTTTTTAAA-TG-T-CTT
195 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTACGCAAACAGAA-TTATTTTTTAAACTGTTACTT
*
20405 ATTAATTCTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCTTGCATG
258 ATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTATTCCAAAAAAGCTTGCATG
* * *
20462 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGGT-ATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAATAGATTTAAGT
1 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTAGTTTAACAAACAGATTCAAGT
*
20526 TTTAAATC-ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATATATTAGTATTACTTTATT-TCGAACAAAC
65 TTTAAATCTACTTATTAATTTTT-ACAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCT-GAACAAAC
* ** * * * *
20588 TTATATGAATAAAAACATTTATTTTATGACA-AAACAAA-ATTTAATAACGATTTGAAATAGATA
128 TTATATGAACAAAAACAAAT-TTTTATAACAGAAAAAAAGAGTT-ATAACAATTTGAAATAGATA
* * *
20651 AGTATTCAATTAGTCATAATTATTTGAACTGGTTACGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTGTTA
191 AGTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTACGCAAACAGAATTATTTTTTAAA-CTGTTA
* *
20716 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCAAA
255 CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTCATATTATTTTATTCCAAA
20764 TAATCTAGTA
Statistics
Matches: 253, Mismatches: 37, Indels: 22
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
309 8 0.03
310 128 0.51
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312 59 0.23
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315 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (314 bp):
TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAACAAACAGATTCAAGTT
TTAAATCTACTTATTAATTTTTACAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTCTGAACAAACTTA
TATGAACAAAAACAAATTTTTATAACAGAAAAAAAGAGTTATAACAATTTGAAATAGATAAGTAT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTACGCAAACAGAATTATTTTTTAAACTGTTACTTATT
AATTCTTGAAATATTAATAAATTCATATTATTTTATTCCAAAAAAGCTTGCATG
Found at i:20778 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 20462--24455 Score: 2459
Period size: 181 Copynumber: 22.3 Consensus size: 179
20452 AGCTTGCATG
* * * ** * * **
20462 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGGT-ATAACTATTTGAACTAGTTTAATAAATAGATTTAAGT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACT-GGTTCGTAAACA-AATTATTT
* * * * * *
20526 TTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATTAGTATTACTTTATTTCGAACAAA
63 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG
* ** *
20587 CTTA-TATGAATAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAATTTAATAACGAT
128 C-TAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * *
20639 TTGAAATAGATAAGTATTCAATTAGTCATAATTATTTGAACTGGTTACGTAAACAGAATTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-CGTAAACA-AATTATTTT
* * *
20704 TTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCAAATAAT
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAG
* *
20768 CTAGTATGAATTAAAAAAAAACTTATTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAATGAT
128 CTAGTATGAA-T-AAAAACAA-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * *
20822 TTGAAGTAGATAATTATTC-TATAGTCTTTAAATATTTGAACTGGTTCG-ACGAAGAAATTTTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTGGTTCGTA--AACAAA-TTATT
* * * * * * *
20885 TTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATCAATGTTATTTTATTCCAAATAA
62 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* * * * *
20950 ACTTGTATGAATAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACGAT
127 GCTAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * ** * * * *
21003 TTCAAGTTTATAATTGTTCAAATAGTCAAAACTCTTTGAACTAAG-TCAGTAAACAGATTTATTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTC-GTAAACA-AATTATTT
* * * *
21067 TTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTGTGAAAGATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG
63 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG
* * ** * * * *
21128 --A-T-TGAACTTTCAAATAA-AATTGTTATATGATGAAGCAAAAGGTAATAATGAC
128 CTAGTATGAA---T-AAA-AACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * * *
21180 TTGAAATAGATAATTATTGACATGGCCATAATTATTTGAA-TAGATTCGACAAACAAATTCACTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCG-TAAACAAATT-ATTT
* ** * * *
21244 TTTAAATCACTTACTTATTAAAATTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAG
63 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG
* * * * * *
21309 CTTGTACGAACT-GAAACGATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
128 CTAGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * ** * *
21361 TTGAAACAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTGTTAGAACTACTTCAGCAAACAATTTATTTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GTAAACAAATTATTTTT
* * * *** *
21426 TAAATCTTTTAGTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGC
65 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
* * ** * * * *
21490 TTA-TATAAACT-AAAAC-ATTATTTTATAACTTAATAATAGGTTAT-A-GTAA
129 -TAGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG-AT
* * *
21539 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--A-AAC-----CAA-T--TTAGTAAACGAATTTATTTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGTAAAC-AAATTATTTTT
* * * * *
21593 TAAATCTCCTATTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCCCAAATAGGCT
65 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC-
* * * *
21658 TA-TATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTTTATAACGAT
129 TAGTATGAAT-AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * ** * * * *
21708 TTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GGC-TACAGTTATTTGAA-TCAATTTGATAAACTGACTTAA
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-A-CTATTTGAACT-GGTTCG-TAAAC-AAATTAT
* * * * * * *
21770 TTTTTAAATATCTAACTCATCAATTTTTGAAATTTTAATAAAATAATATTATTTTA-TCTCAAAT
61 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-CAAAT
* * * * * * ***
21834 AAGCT-TTTTCAA-ACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGGTTATATTTAT
125 AAGCTAGTATGAATA--AAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * ** *
21890 TTTAAATTGATAATTGTTTAAATCGTTATAACTATTTAAACTTTTTTGGTAAACAAATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGTAAACAAA-TTATTTT
* * * * * * * * *
21955 TTAAAATTTCTT-GTGTTTTGATGTTCT-ACATGTTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATA
64 TT-AAATCTCTTACT-TATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATA
* * * * * * * *
22018 ATC-ATGTATGAGCT-AAAAGAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGGT
126 AGCTA-GTATGA-ATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * *
22072 TTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTC-TATAAGCATATTTATTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGTA-AA-CA-AATTATTT
* * * * * *
22136 TTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCGAATAA
63 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* * ** * *
22196 GCTAGTGTGAATAAAAACAATTATTTTATGACCAAA-TGAAGATCATAATGAT
127 GCTAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * *
22248 TTGAGATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATTTTGTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCG-TAAACAAATTAT-TTT
** **
22313 TTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCTGAATAATT
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
* * * *
22373 TTGTATGAATAGAAACAATT-TGTTTGATGATAAAAC-AAAGTGTCATAACTAT
129 TAGTATGAATAAAAACAATTAT-TTT-ATGACAAAACAAAAG-GTCATAACGAT
* * * * * * *
22425 TTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGGT-ATGACCATTTGAACTTGTTTTGTGAACAAATTTATTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGTAAACAAA-TTATTT
* * *
22489 TTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA
63 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
** * * * ** * ** *
22553 ATTTGTATTATTGGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAAT
127 GCTAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * ** **
22606 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCCTAGGTAAACAAATTTATTTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGTAAACAAA-TTATTTTT
* *** * * * * * * **
22671 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGTCTTTTAAGAAGTTATTTTTCTTTTATT-TGAATAAGCT
65 TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCT
** * * * *
22735 TTTATGAACAAAAACAATTGA-TTTATGATAAAACAAAAGGACATAACAAT
130 AGTATGAATAAAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * *
22785 TTGAAGTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-GTGTTC-AAAAAATATACTTATT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGTAAACA-A-A-TTATT
* **
22848 TTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATA
62 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATA
* * * * * * * * * *
22911 AGCTTGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGCCATAATGTT
126 AGCTAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * *
22965 TTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTTGGTAAACATATTCATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGTAAACAAATT-ATTTT
* * * * *
23030 TTAATTCTCTTACTCATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAGATAAGC
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
* ** ** * **
23094 TTA-TATGAGTTGAAACAATCGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCACAATAAT
129 -TAGTATGAATAAAAACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * ** * *
23145 TTAAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAATTTATTCAGAAAACATATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GTAAACA-AATTATTTT
* * * *
23210 TTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGC
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
* * * * * * *
23275 TTGTATAAATAGAAACCATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAT
129 TAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * ** * * * *
23326 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAAAGATTTGAACTTGTTTGGTGAACATATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGTAAACA-AATTATTTT
* * **
23391 TTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTAGAAA-AA
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
* * * * * *
23453 GGCTTGTATGAATAGGAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAAT
127 -GCTAGTATGAATA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * * *
23507 TTCAAGTAGATAATTGTTAAAATAGTCACAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATATATTCATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GTAAACAAATT-ATTTT
* * * ***
23572 TTAAATCTCTTAATAATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGC
* * * * *
23637 TTA-TATGAACT-GAAATAATTTTTTTATGACAAAACCAAAGGTCATAACAAT
129 -TAGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * * *
23688 TTCAAATAAATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAATAAACATATTTACTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GTAAACA-AATTA-TTT
** * * * * **
23753 TGAAAAT-TTTTATTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAG
63 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG
* * * * * * **
23817 TTTGTATGAATAGAAACTATTATTTTATAATAGAAA-AAAA--TCATAATAAT
128 CTAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * *
23867 TTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTTGGTAAATAGATTTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGTAAACA-AATTATTTT
* * *
23932 CTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTTATTCTGAACA-A
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTC-CAA-ATA
* * * * * * * *
23992 ACCTA-TACGAACAAAAATATTTATTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGAT
126 AGCTAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * *
24045 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGATTAGGTAAACAAAATTATTTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-CGTAAAC-AAATTATTTT
* * * * *
24110 TTAAATCTCTTACATATTAAATTTTGAAGTATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCGAATAAG
64 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCCAAATAAG
* * * *
24174 CTAGTATGAATTGAAAA-AATTGTTTTATGGCAAAAC--AA----A-AACAAT
128 CTAGTATGAA-TAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * **
24219 TTGAAATAGATAATTGTT-AATATGGTCTTAATTATTAGAACTAGTTCAACAAACAAATTTATTT
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GTAAACAAA-TTATTT
* * ** * * *
24283 TTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTACTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAG
63 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAG
* * * * * * * * *
24348 CTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAATGGTTATAATGAT
128 CTAGTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGAT
* * * * * * * *
24401 TTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTTAATTGGTTTAGTAAACA
1 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTCGTAAACA
24456 TCTTTTATTA
Statistics
Matches: 2979, Mismatches: 657, Indels: 357
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
165 1 0.00
166 6 0.00
167 77 0.03
168 23 0.01
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170 4 0.00
171 1 0.00
173 13 0.00
174 129 0.04
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182 264 0.09
183 204 0.07
184 23 0.01
185 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGTAAACAAATTATTTTTT
AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTA
GTATGAATAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
Found at i:22694 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 21575--30244 Score: 2547
Period size: 181 Copynumber: 47.8 Consensus size: 179
21565 AACCAATTTA
** * *
21575 GTAAACGA-ATTTATTTTTTAAATCTCCTATTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATT
1 GTAAAC-ATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * * * * *
21639 ATTTTATCCCAAATAGGCTTATATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTTTATA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * * ** *
21703 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT-GGC-TACAGTTATTTGAATCAATTTG
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-A-CTATTTGAA-CTGTTAG
* * * * * * * * * * *
21756 ATAAAC-TGACTTAATTTTTAAATATCTAACTCATCAATTTTTGAAATTTTAATAAAATAATATT
1 GTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
21820 ATTTTATCTCAAATAAGCTT-TTTCAA-ACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGGTTA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA--GAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAAGATCA
*** * * * * * * * *
21883 TATTTATTTTAAATTGATAATTGTTTAAATCGTTATAACTATTTAAACTTTTTTG
126 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * * * * *
21938 GTAAACAAATTTATTTTTTAAAAT-TTCTT-GTGTTTTGATGTTCT-ACATGTTAATAAATTAGT
1 GTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTT-TTACT-TATTAAT-TTTTGA-ATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * * *
22000 ATCATTTTATTTCAAATAATCATGTATGAGCTA-AAAGAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTT
61 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATC
* *** * * **
22064 AGAATGGTTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCT
125 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTAG
* * * * * *
22120 ATAAGCATATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * ** *
22181 TTTTACTCCGAATAAGCTAGTGTGAATAAAAACAATTATTTTATGACCAAA-TGAAGATCATAAT
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * * * *
22245 GATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAATTGGTTCG
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTAG
* * *
22296 ATAAATAGATTT-TGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
1 GTAAACATATTTAT-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
** * *
22356 A-TTT-TTTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATT-TGTTTGATGATAAAAC-AAAGTGTC
64 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT-TTT-ATGACAAAACAAAAG-ATC
* * * * * **
22417 ATAACTATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGGT-ATGACCATTTGAACTTGTTTT
125 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * * *
22473 GTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * *
22538 TTTTATTTCGAATAAATTTGTATTATTGGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAAC
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * **
22603 AATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCCTAG
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAG
* ** * * * * * *
22653 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGTCTTTTAAGAAGTTATTTTTC
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
22718 TTTTATTT-GAATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGA-TTTATGATAAAACAAAAGGA-CATA
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATA
*
22780 ACAATTTGAAGTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCA-
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AG
** * *
22833 AAAAATATACTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA-TTAGTATT
* * * * * **
22896 ATTTTATTT-GAAATAAGCTTGCATGAACAGAACCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGCCATA
64 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
*** * * *
22960 ATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTTG
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * * * *
23013 GTAAACATATTCATTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTAT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * ** * *
23078 TTTATTTC-AGATAAGCTTATATGAGTTGAAACAATCGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCACAA
66 TTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTA-TGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * * * * * * *
23141 TAATTTAAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAATTTATTCA-
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTT-AG
* * *
23193 GAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
23258 TTTTAATCCAAATAAGCTTGTATAAATAGAAACCATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAA
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAA
* * * ** *
23322 CAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAAAGATTTGAACTTGTTTG
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* *
23374 GTGAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
23438 ATTTTA-TTAGAAAAAGGCTTGTATGAATAGGAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTAT
64 ATTTTATTTCGAATAA-GCTTGTATGAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* * * * * * *
23501 AGCAATTTCAAGTAGATAATTGTTAAAATAGTCACAATTATTTAAACTTGTTCA-
127 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AG
* * * * * *
23555 GTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAATAATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
23620 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACT-GAAATAATTTTTTTATGACAAAACCAAAGGTCATAA
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * * * *
23684 CAATTTCAAATAAATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCA-
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-AG
* ** * *
23736 ATAAACATATTTACTTTTGAAAAT-TTTTATTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATT
1 GTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
23800 ATTTTA-ATCTGAATAAGTTTGTATGAATAGAAACTATTATTTTATAATAGAA-AAAA-ATCATA
64 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * * *
23862 ATAATTTGAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGTTTTG
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAG
* * *
23915 GTAAATAGATTTATTTTCTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * * * * * * *
23975 TTTTTTATTCTGAACAAACCTATACGAACAAAAATATTTATTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATA
65 TTTTAT-TTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
** * *
24040 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGATTAG
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAG
* * * * * *
24093 GTAAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAAATTTTGAAGTATTAATAAATTCA-TTTT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATT-AGTATT
* * * * * *
24157 ATTTTATTCCGAATAAGCTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAAC---A-A--A-AA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * *
24215 CAATTTGAAATAGATAATTGTT-AATATGGTCTTAATTATTAGAACTAGTTCA-
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-AG
** * * ** * *
24267 ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTCAAAATATTACTATATTAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
24332 TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAATGGTTATAA
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAA
** * * * * * * *
24397 TGATTTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTTAATTGGTTTA-
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTAG
* ** * * * * * * *** **
24449 GTAAACATCTTTTATTAATTTTTGAAAGATATAAATTAGT-ATTATTTTATTCGAAATAAATTTC
1 GTAAACAT-ATTTA-T--TTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAATATTAATAAATTAG
* ** *** * * ** * ** * * ** ** * *
24513 TATGA-TCAAAAAC-AAT-TG-TTATAT-AA-CCAAACAA-AAGGTAATAATGATTCGAAATA-C
60 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATC
* * * * *
24570 AT---AA-TT---ATTGA-AA-TG--------GCCATAATTATTTAAACTGATATG
125 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTA-G
* * * *
24609 GTAAACAGATTCACTTTTTAAATC-T---CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATCA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
24670 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTGTAACAAAATAAAAGGTCATAAC
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* ** * * **
24735 GATTTTCAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTT
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTAG
* * * * * *
24786 GTAAAAAAAATTATTTTTTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTACT
1 GTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * *
24850 ATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTAT-ATTAAAACCAAAGGTCGT
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTTATGA-CAAAACAAAAGATCAT
** * * * * *
24913 AATGATTTTAAAAAAATAATTG-TCAAATAGTCATAACTGTTTAAACTTGTTTA-
127 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTAG
* * * * * * * *
24966 GTAAATAGATTTATTTTTTCAAA-CCTTTAGCTTATTAATTTTTTGAATGTCAATAAATTTGGAA
1 GTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTTTTA-CTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * *
25030 TATTTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAACGAAAGGT-A
63 TA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * * * * *
25093 AAAAATTATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAG-CTTTAATTATTTGAACTAGTTCA-
126 TAACA--ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-GTT-AG
* * * * * * * * *
25150 GCAAATACATTTATATTATAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
25215 TATTTAATT-GAATAACCTTCTATG-ATCA-AAATCAAATTATTTTATTACAAAAC-AAAGATC-
65 T-TTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAA-C-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * * * * * * * ** * *
25275 TAACGATTTGATATTGATAACT-TTC--TTGGTTATTAAGT-TTCAAAATATTA-
126 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTGAACTGTTAG
* * * * ** * ** **
25325 TTAAATTAGTATTAATTTATTCCAAATAAAATAGTATGAACATAACCAATTGTTTG-ATGACAAA
1 GTAAA-CA-TATTTATTT-TT-----T-AAAT-CT-TTTAC-TTATTAATT-TTTGAAT-A-TTA
* * ** * * *** * *
25389 ATAAAACGTTA-TAATGATTTGAAATAG-ATAA--TTATCCAAATAGTCAA-AACTATTTGAAAT
51 AT-AAA--TTAGT-ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTATTT----T
** *** ** * * * * * *
25449 AGTTTG-GTAAACAGATTCACTTTTTA-AATCTCT-TACTA-ATTATT-TTCTAAATATTAAATA
107 A---TGACAAAACA-AAAGA-TCATAACAAT-T-TGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGT-CATA
* *
25509 A-TAGTATT--A-TTTTATT
163 ACTA-T-TTGAACTGTTA-G
* * * **** * * ***** * *
25525 TTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTT--TTATGACA-AAAAAAAGTATTAAT-GATTT
1 GTAAACATA-TT-TATTTTTTAAATC--TT-TTACTTATTA-ATTTTTGAA-TATTAATAAATTA
* ** * * * ** ** * *
25586 G-AATAGATAATTTTCAAAT-AG--T-TAT-AATTTTGAAAC---TGGTTT-TGGTAATAGAATT
59 GTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTATGAA--TAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAA--
*** * ** * * * * * * * * *
25641 ATTTTC-T-A-AATCTCTTACTTATA-AATTTTTGAAATATTAATACATTAGTTTTAGTCTGTTC
119 AAGATCATAACAAT-T-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTA-TTTGA-ACTGTTA
*
25702 T
179 G
* * **** * *** * * ** *
25703 G-AATGGCACT-TGTATGAGCTAAA-ATAAAAGTCA-TAACACTTTGAATA--AAT-AATTATTC
1 GTAA--ACA-TATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGT-
* * * ** * * * * *
25761 ATATAGTTTTAACTATTTGAACAAAAG-TTATAACATTTGAAATAAATAATGTTAT-A-AATTAG
61 AT-TA-TTTT-A-T-TTCG-A-ATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTATTTTATGACAA--A-
* **** * * * * * * * * * * *
25823 TATTATTTTATTTAGAATAAGTTTGTATGAACTAAAACAATTATT-ATATGATTAAACAAATGAT
115 -A-CAAAAGA-TCATAACAA-TTTG-A--AA-T-AGATAATTGTTCAAAT-AGT-CATAACT-AT
** * *
25887 TAAAAATGATT-T
168 TTGAACTG-TTAG
* * * * * * * ** * *
25899 G-AAATAGA-TAATTATTCTAATAGTC--TTAATTATTCGAATTGGTTCAGCA--AACATATT--
1 GTAAACATATTTATT-TTTTAA-A-TCTTTTACTTATT--AATT-TTTGAATATTAATAAATTAG
* * * * * ** * * *
25956 TATT-TTTTAAATCTCTTATTAA-TTTTTAAAATATTATTAAATTATTATTATTTTAT-CCAAAT
60 TATTATTTT--ATTTC-GAATAAGCTTGTATGA-A-TA-GAAA-CA--ATTATTTTATGACAAA-
* * * * ** * * * *
26018 A-AGCATGATGAGAAACAATTATTTTAAGAGA-AA----ACAAAGA-TCATAA-TGATTTGAGAA
115 ACA-AAAGATCA-TAACAA-T-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGA-AC
*
26075 TGATATTTG
174 TG---TTAG
* * * * * * * ** * * ***
26084 TTTAA-ATAGTCATAACTATTTAAAT-TGATT-C-GAAAAATAGTTTT-AGTTTTTAAATCGCTT
1 GTAAACATA-T--TTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAAT--TTTTGA-ATATT-AATAAATT
* * * * * * ** ** * *
26144 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTA-AAG-TAGTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTCTATGAG
58 A-GTATT-A-TTTT---AT-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGA-AAC-AATTA-TTT-TATGA-
* ** ** * * * *
26207 CTGAAACATTATTTTATAATGGAA---GAAA-AGGTCATAA-TGACTTTAAATAGT--TAGATTG
111 C-AAAACAAAAGATCATAA--CAATTTGAAATA-G--ATAATTG--TTCAAATAGTCATA-ACT-
** ***
26265 A-TTGTTCAAATA-
166 ATTTGAACTGTTAG
* * * * * *
26277 GTCCAATC-TATTTAAACTTGTTCAATAAA-CAGATTTATCTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAAT
1 GT--AAACATATTT--A-TT-TT--TTAAATC--TTTTA-CTTATT-AAT-T-TT--TGAAT---
* * * *
26340 TTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTG
47 ------A--TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTA
* ** * * * * **
26404 CTTTATGATTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGATCTAATAGTGTTAACTAT
103 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
*
26469 TTGAATTGGTTCA-
168 TTGAACT-GTT-AG
* * *
26482 GCAAACATATTTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGTAATATTATTAAATTAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * *
26547 TTTTAATTT-GAATAAGGTTTTATTAAAAGAAACAATTGTTTTAT-A-AAAAAATAAAGATCATA
65 TTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA-AAAGATCATA
* * * * *
26609 ACGATTTGAGATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAATTGTTTCA-
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TT-AG
** * * * * * * *
26662 AAAAATAGATTTA-GTTTTAAATC---T-CTTATT-ATTTTTCAAATTATTAATAGATAAATATT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAA-TATTAATAAATTAGTATT
* ** * * * ** *
26721 ATTTTA-TTCTAAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * * *
26785 ACAACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTG
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * ** * * *
26838 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTC
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
26903 TTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * * *** *
26968 TATTTGAAATAAATACTTGTTCATCCAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCA-
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTAG
* * * * * *
27019 GTAAATAGATTTATTTTTTTTAGATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATGAATAAACTAGCAT
1 GTAAACATATTTA--TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTAT
* * ** *
27084 TATTTTATTTCGAATACA-CATGTTTGAATAGAAAC-ATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
63 TATTTTATTTCGAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCAT
* * * * * * *
27147 AACTATTTGAAATAAATAATTGTTTAACTAATAATAACTATTTGAATGTGTTTTATG
127 AACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTG--TTA-G
** ** * * * * *
27204 ACAAAAAAGTCCTAACTATTTGACCTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
1 ---GTAAA---C--A-TATTT-A--T--TTT-TTAAA-TCTTTTACTTATT-AAT-T-TT--TGA
* * * * *
27269 TTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTGGTATGAAAAGAAA
45 AT-A----T----TA--A-TAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
* * * ** * *
27333 CAATTGTTTTGTGACAAAATGAAAAG--CATAACGGTCT-AAGATAGATAATTATTCAAATAGTC
97 CAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAGATCATAACAATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTC
27395 ATAACTATTTGAACTGTTTCA-
160 ATAACTATTTGAACTG-TT-AG
* * * ** * *
27416 GTAAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAGTAGATTAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** * * *
27477 TTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * * * * * *
27542 AATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTTG
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * ** *
27593 GTAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * ** *
27658 TTTTATTTTGAATAAACTTATGTGAATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAT
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * * *
27723 TATTTGAAATAAATGATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC--TTACGCG
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTA---G
* *
27774 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * ** * * *
27839 TTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATGAC
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * *
27904 AATTTGCAATAGATAATGGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATGTGTTCA-
130 AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTT-AG
* * * * *
27955 GAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATAAATTTGTATTAT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
28019 TTTA-TTCAATATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
66 TTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
*
28083 GATTTGAAATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-
130 AATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AG
* * * * *
28134 GTAAATAAATTCATTTTTTAAATCTCTTT-CTCATTAATTTTTAGAGTATTAATAAATTAGTATT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * ** *
28198 ATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAA-ATGATACAATT-GTTTATGATGAAACAAAAGGTCATA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * * *
28261 GCAATTTGAAATAGATTATTATTCAAATAATTATAACTATTT-AACTTGTTCA-
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AG
* * * * *** * *
28313 GCAAACATATTTATTTTTAAAATCTTATACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAACTAATATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * * *
28378 TTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTC--AAT
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
* * * * **
28441 GATTTGAAATAAAT-ATTAATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTC
130 AATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * * * * * * * *
28492 ATAAACAGATTTATTTTTCAAATGTTTTGCTTATTAATTATCT-AAGGGA-TAATAACTTTGTAT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTTGAA--TATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
28555 TATTTTAATT-GAAATAAGCTTATAAGAATAGCAAA-AATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTTA
63 TATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCA
** * *
28618 TGGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCG
126 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * * * * *
28673 ATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
28738 TGTTA-TTCTGAATAAGTTTGTATGAACAGAAACAATT-GTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAA
65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * * * *
28801 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGCACTGGTCAG
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTAG
* * * * * * *
28853 GTGAACAGATTCATTATTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGACTATTAATAAATTAGCATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
28918 CTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA
65 TTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
** * * * * * * * *
28982 TGATATGAAATAAATAATTATTTAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTCG
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTAG
* * *
29035 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * * * *
29096 TTTTATTTTAAACAAACTTATATGAACA-AAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAAG-TACATAA
65 TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGAT-CATAA
** * * * *
29159 TTATTTGAAATGGATAATTATTCATATAG-CTTTAACTATTTGAACTGGTTCA-
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-GTT-AG
** * * ** * * ** *
29211 ACAAACAAATTTA-TTTTCAAATCTCATAATTATTAATTTTCAT-AATATTATTAGTTTAATATT
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT--TGAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
29274 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAA
64 ATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
* * * *
29339 CGACTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCA-
129 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-AG
**
29391 GTAAACA-A---A-----T-AATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * * * *
29445 TTTTA-TTCTAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAA
65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
** * * *
29508 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAATTGATT-G
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAG
* * * ** * * * *
29560 AATAAA-TTGATTTATGTTTTAAAT-TTCCAAATT-TCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATA
1 -GTAAACAT-ATTTATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA
* * * * * *
29622 TTATTTTATTTTGGATAAGGTTTTATGAA-ATGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCA
62 TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * * * * *
29686 TAACGATTTTAAA-ATGATAATTGTTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTG
126 TAACAATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAG
* * * * * * *
29741 GTTAACAAATTTATGTTTTTAAAT-TGCTTGCTTATTAATTTTCTGAATGTTAATAAAATAATAT
1 GTAAACATATTTAT-TTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * *
29805 TATTTTTATTTAGAATAAG-TATGTACGAATTGAAACAATTATTTTATAACTAAAC-AAAGGTCA
63 TA-TTTTATTTCGAATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCA
* * * * * *
29868 GAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACAGATTCG
126 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAG
* * * * * * * ** * *
29923 ATAAATATATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * *
29988 TTTTA-CTCTGAATAAGTTTGTAT-AGACAGAAACAATTGTTTAATGACAAAAC-AAAGATCATA
65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* * * * * *
30050 CCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAATTGTCTA-
128 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TAG
* * **
30102 GTAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAACTATTAATAAATTAGTATTA
1 GTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTA
** * *
30163 TTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGACAATACAAAAGATCATA
65 TTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGATCATA
* *
30227 ACGATTT-AAATAAATAAT
128 ACAATTTGAAATAGATAAT
30245 ATTGGTAAAT
Statistics
Matches: 6309, Mismatches: 1590, Indels: 1185
0.69 0.18 0.13
Matches are distributed among these distances:
151 7 0.00
152 17 0.00
153 2 0.00
154 3 0.00
155 4 0.00
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157 2 0.00
158 8 0.00
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209 6 0.00
210 9 0.00
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* * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *** * * *
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1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-GTTAGGTAAACATATTTATTT
* * * * * * *
20886 TTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATCAATGTTATTTTATTCCA-AATAA
64 TTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT--AGAATAA
* * * * * * * * * **
20950 ACTTGTATGAATAAAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTTATAACGATTTCAAGTTTATA
125 GCTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
21015 ATTGTTCAAATAGTCAAAACTCTTTGAACTAAG-TCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC--
190 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-TGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * **
21077 --TTATTAATTTGTGAAAGATTAGTAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAGATTGAACT-TT
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* * ** * * ** *
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317 CAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * ** * * *
21180 TTGAAATAGATAATTATTGACATGGCCATAATTATTTGAA-TAGATTCGACAAACAAATTCACTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTAGGTAAACATATTTATTT
** * * *
21244 TTTAAATCACTTACTTATTAAAATTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAG
64 TTTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAG
* * ** * * *
21309 CTTGTACGAACT-GAAACGATTGTTCTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAACAGATA
126 CTTGTATGAA-TAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * ** * * *
21373 ATTGTTCATATAGTCTTAACT-GTTAGAACTACTTCAGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTTTT
190 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA-AACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** * * *
21436 AGTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATATGCTTATATAAAC
254 AATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
* * ** * * * **
21500 TA-AAAC-ATTATTTTATAACTTAATAATAGGTTATAGTAA-
318 -AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * *
21539 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--A-AAC-----CAA-T-TTA-GTAAACGA-ATTTATTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGGTAAAC-ATATTTATTTT
** * * * *
21592 TTAAATCTCCTATTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATCCCA-AATAGG
65 TTAAATCTTTTACTTATTAA--TTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT--TAGAATAAG
* * ** * * * *
21656 CTTATATG-ATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTTTATAACGATTTGAAATAGATA
126 CTTGTATGAAT-AGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * * * * * * * *
21720 ATTATTCAAAT-GGC-TACAGTTATTTGAATCAAT-TTGATAAACT-GACTTAATTTTTAAATAT
190 ATTGTTCAAATAGTCATA-A-CTATTT-AAAC-TTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * *
21781 C-TAACTCATCAATTTTTGAAATTTTAATAAAATAATATTATTTTATCTCAAATAAGCTT-TTTC
251 CTTAA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT-
* * * * * ***
21844 AAACTGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAAGGTTATATTTAT
314 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGGTCATAACAAT
* ** * * * * * * * *
21890 TTTAAATTGATAATTGTTTAAATCGTTATAACTATTTAAACTTTTTTGGTAAACAAATTTATTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * * *
21955 TTAAAAT-TTCTT-GTGTTTTGATGTTCT-ACATGTTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCA-AA
65 TT-AAATCTT-TTACT-TATTAAT-TT-TGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT-AGAA
* * * * * * * * ***
22016 TAATCATGTATGAGCTA-AAAGAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAATGGTTTGAAATA
122 TAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * **
22080 GATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCTA-TAAGCATATTTATTTTTTAAATC
186 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTC-AGAAAATATATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * * *
22144 TC----TTATTAATTTTT-AGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCGAATAAGCTAGTGT
250 TCTTAATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * ** * **
22204 GAATAAAAACAATTATTTTATGACCAAA-TGAAGATCATAATGAT
314 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * * *
22248 TTGAGATAGATAATTGTTCAAATACTCATAACTATTTGAATTGGTTCGATAAATAGATTT-TGTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTAGGTAAACATATTTAT-TT
* *
22312 TTTAAATC---T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-TTCTGAATAAT
64 TTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-AGAATAAG
* * * *
22372 TTTGTATGAATAGAAACAAT-TTGTTTGATGATAAAAC-AAAGTGTCATAACTATTTGAAATAGA
126 CTTGTATGAATAGAAACAATCAT-TTT-ATGACAAAACAAAAG-GTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * ** ** * *
22435 TAATAGTTCAAATGGGT-ATGACCATTTGAACTTGTTTTGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
188 TAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTC
* ** *
22499 -TAACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTTGTATT
252 TTAA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
*** * * **
22562 ATTGGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAATATCATAACAAT
315 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
** *
22606 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCCTAGGTAAACAAATTTATTTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGGTAAACATATTTATTTTT
** * * * * * * *
22671 TAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGTCTTTTAAGAAGTTATTTTTCTTTTATTTGAATAAGCTT
66 TAAATCTTTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAGAATAAGCTT
* * * * * * *
22736 TTATGAACAAAAACAATTGA-TTTATGATAAAACAAAAGGACATAACAATTTGAAGTAGATAATT
129 GTATGAATAGAAACAA-TCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
22800 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTGTTCAAAAAATATACTTATTTTTTAAAT-TTTTACTT
193 GTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTAATT
* *
22864 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGCATGAACAGAA
258 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAA
* * * ***
22928 CCAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGCCATAATGTT
322 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * *
22965 TTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCATAACTATTTAAACATGTTTGGTAAACATATTCATTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAGGTAAACATATTTATTTT
* * *
23030 TTAATTCTCTTACTCATTAATTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAG-ATAAGC
65 TTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT-AGAATAAGC
* * * * * * * * *
23094 TTATATGAGTTGAAACAATCGTTTTACT-ACAAAACAAAAGGTCACAATAATTTAAAATAAACAA
127 TTGTATGAATAGAAACAATCATTTTA-TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAA
* * * * * * *
23158 TTATTCAAATAGTCATGACTATTTAAATTTATTCAGAAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAC
191 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTAA
* * * * * *
23223 TTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATAAATAGA
256 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* *
23288 AACCATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAT
321 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* ** * *
23326 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTTATAAAGATTTGAACTTGTTTGGTGAACATATTTATTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAGGTAAACATATTTATTTT
* * *
23391 TTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTAGAAAAAGGC
65 TTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAGAATAA-GC
* * * *
23456 TTGTATGAATAGGAAA-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTCAAGTAGATAA
127 TTGTATGAATA-GAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAA
* * * * *
23520 TTGTTAAAATAGTCACAATTATTTAAACTTGTTCAGTAAATATATTCATTTTTTAAATCTCTTAA
191 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTAA
* * ** * *
23585 TAATTAATTTTTGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGA
256 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGA
* * *
23650 AATAATTTTTTTATGACAAAACCAAAGGTCATAACAAT
321 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * *
23688 TTCAAATAAATATTTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCA-ATAAACATATTTACTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTT-AGGTAAACATATTTA-TT
** *
23752 TTGAAAAT-TTTTATTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCT-GAATA
63 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT-TAGAATA
* * * * * * *
23815 AGTTTGTATGAATAGAAACTATTATTTTATAATAGAAA-AAAA--TCATAATAATTTGAAATAAA
124 AGCTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * ** * * *
23877 TAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTTTGGTAAATAGATTTATTTTCTAAATCTC
188 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * *
23941 ----TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTTATTCTGAACA-AA-CCTATAC
252 TTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTAT
* * * * * * **
24000 GAACAAAAATATTTATTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGAT
314 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * *
24045 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGATTAGGTAAACAAAATTATTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * *
24110 TTAAATCTCTTACATATTAAATTTTGAAGTATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTCCGAATAAG
65 TTAAATCTTTTACTTATT-AATTTTGAA-TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATT-AGAATAAG
* * * ** *
24174 CTAGTATGAATTGAAAAAATTGTTTTATGGCAAAAC--AA----A-AACAATTTGAAATAGATAA
126 CTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAA
* * * * * * *
24232 TTGTT-AATATGGTCTTAATTA-TTAGAACTAGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTT
191 TTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTA-AACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAATCTCT
* ** * *
24294 TAGTTATTAATTTTCAAAATATTACTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
253 TAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * **
24359 AGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAATGGTTATAATGAT
318 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACAAT
* * * * * * * *
24401 TTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTTAA---TT-GG--------TTTA---GT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGGTAAACATATTTATTTTT
* * * * **
24451 AAACATCTTTTA-TTA--ATTTTTGAA-A-GATATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAATT
66 TAA-ATCTTTTACTTATTAATTTTGAATATTA-ATAAATTAGTATTATTTTATTAG-AATAAGCT
* * ** * * * * ** * *
24511 TCTATG-ATCAAAAACAATTGTTATATAACCAAACAAAAGGTAATAATGATTCGAAATACATAAT
128 TGTATGAAT-AGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * * * * * *
24575 TATTGAAATGGCCATAATTATTTAAAC-TGATAT-GGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCTC---
192 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-T-TCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** **
24635 -TTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATT
255 ATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * *
24698 GAAACAATTATTTTGTAACAAAATAAAAGGTCATAACGAT
319 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
** * * * * ** * * *
24738 TTTCAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTTGTAAAAAAAATTATTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTAGGTAAACATATTTA-TTT
* * * * *
24803 TTTAAA-CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTACTATTTTATTTTGGATAAG
64 TTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAAG
* ** * * * ** * * *
24867 CTTTTATGAACT-GAAACAATTGTTTTAT-ATTAAAACCAAAGGTCGTAATGATTTTAAAAAAAT
126 CTTGTATGAA-TAGAAACAATCATTTTATGA-CAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * *
24930 AATTG-TCAAATAGTCATAACTGTTTAAACTTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAACCT-T
189 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTT-AAATCTCT
* * * * * * ** *
24993 TAGCTTATTAATTTTTTG-AATGTCAATAAATTTGGAATATTTTTATTTTGAATAAGCTTGTAAG
253 TA-ATTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * * * * *
25057 ATA-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACGAAAGGT-AAAAAATTAT
315 A-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA--AT
* * * * * * * *
25102 TTGAAATAGATAATTATTCTAATAG-CTTTAATTATTTGAACTAGTTCA-GCAAATACATTTATA
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-GTT-AGGTAAACATATTTATT
* * * * *
25165 TTATAAATCTCTTACTTAATAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGCATTATATTTAATT-GAATA
63 TTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTT-ATTAGAATA
* * * * * * * *
25229 ACCTTCTATG-ATCA-AAATCAAATTATTTTATTACAAAAC-AAAGATC-TAACGATTTGATATT
124 AGCTTGTATGAAT-AGAAA-C-AATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * * * * ** * *
25290 GATAACT-TTC--TTGGTTATTAAGT-TTCAAA-ATATT-ATTAAAT-TA-GTATTAATTT--AT
186 GATAATTGTTCAAATAGTCA-TAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATT-TTTTAAAT
* * * * * * ** * *
25345 -TC-CAAATA-AAATAGTATG-AACA-TAACCAATT-GT-TTGA--TGA---CAAAATAAAACGT
249 CTCTTAATTATTAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTATTTC-AAAT-AAGC-T
* *** * ** * * * ** * * *
25398 TATAATGATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGTCAAAAC--TATTTGA-AATAGT
309 TGT-ATGAACAGAAACA-ATTGTT-T---TAT-GACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * * *
25452 TTGGTAAACAGATTCACTT-TTTAAAT-CTCTTACTAATTATTTTCTAAATATTA---AATA-AT
1 TT-G-AAATA-AAT-AATTATTCAAATAGTC--A-TAACTA-TTT-GAACTGTTAGGTAA-ACAT
* * ** * * * * * *
25511 A-GTATTATTTT--AT-TTTGAACAAACTT-ATATT-AACA--AAAACAATT-GT-TT-TATGAC
56 ATTTATT-TTTTAAATCTTT-TACTTA-TTAATTTTGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * *** *
25565 AAAAAAAAG-TAT-TAATGATTTGAATA-GAT-AATTT-T--CAAATAGTTATAATTTTGA-AAC
117 TAGAATAAGCT-TGT-ATGAATAGAA-ACAATCATTTTATGACAAA-A--CA-AAAGGTCATAAC
** * * * * * *
25622 TGGTTTTGGTAATAGAATTATT-TTCTAAAT-CTC-TTACT-TATAAA-TT-TT-TGAAATATTA
175 --AATTT-GAAATAG-ATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAA-A-T-
* * * * *** * * ** *
25680 ATACATTA-GTTTT-AGTCTGTTCTGAA-TGGCACTTGTATGAGCTA-AAATAAA--AGTCATAA
232 ATA-TTTATTTTTTAAATC---TCTTAATTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGT-AT--
* * * * * * **** * * *
25739 CACTTTGA-AT-AAATAA--TTAT-TCATATAGTTTTAA--CTATT-TG----AACAAAA-GTTA
289 TA-TTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
25791 TAAC-AT
352 TAACAAT
** *
25797 TTGAAATAAATAATGT-TAT-AAATTAGT-ATTATTTTATTTAGAA-TAAGTTTGTATGAACTAA
1 TTGAAATAAATAAT-TAT-TCAAA-TAGTCA-TA-ACTATTT-GAACT--G--T-TA-G--GT-A
** * ** * *
25858 AACA-A-TTATTATATGATTAAA-CAAATGA-TTAAAAATGATTTGAA-A-TAGAT-AATTATTC
51 AACATATTTATT-T-T--TTAAATC-TTTTACTTATTAAT--TTTGAATATTA-ATAAATTAGTA
* ** * * * ** * * **
25916 TAATAGTCTT--AATTA--TTCGAATTGGTTCAGCAAACATATTTATTTT-TTA-AATCTCTTAT
108 TTATTTTATTAGAATAAGCTT-GTA-TGAAT-AG-AAACA-A-TCATTTTATGACAA-AAC--A-
* * ** * * * * * *
25975 TAA-TTTTTAAAATATTATTAAATTATTATTATTTTATCCAAATAAGCATGATGAGAAACAATTA
163 AAAGGTCATAACA-ATT-TGAAA-TA-GATAATTGT-T-CAAAT-AG--TCAT----AAC---TA
* ** *** * * * * * * * * * *
26039 TTTTAA-GAGAAAACAAAGATCATAATGATTTGAGAATGATATTTGTTTAAATAGTCATAACTAT
212 TTTAAACTTGTTCAGAAA-AT-ATATTTATTT----TTTAAATCT-CTTAATTA-T--TAA-TTT
* * * ** *
26103 TT-AAATTGATTCGAA-AAA-TAGTTTTAGTTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAAT-A
266 TTGAAA-T-ATT--AATAAATTAGTATTA--TTTT--AT---TT-C-AAATAA-GCTTG-TATGA
** * * * ** ** * *
26164 TTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAGTTTCTATGAGCTGA-AACATTAT
316 ACAG-AAA-CA--ATTGTTTTA--T--GACAA--AAC-AAAAGGTCATAACA--AT
* * * * * * * * * * *
26219 TTTATAATGGAAGAA-AAGGTCATAAT-GACTTTAAATAGTTAGATTGATTGTTCAAATAGTCCA
1 TTGA-AAT-AAATAATTA-TTCA-AATAGTC-ATAACTA-TTTGA---ACTGTT---A-GGT--A
* * * * **
26282 ATC-TATTTAAACTTGTTCAATAAA-CAGATTTATCTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTG
51 AACATATTT--A-TT-TT--TTAAATC--TTTTA-CTTATT-AAT-T-TTGAATATTAA----T-
* * * ** * ** * * * ***
26345 AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTGCTTTAT
99 AA-ATTAGT--ATTA-TTTTATTAGAATAAG-C-----TTGTATGAATAGAAACAATCATTTTAT
** * * * ** *
26410 GATTAAACAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGATCTAATAGTGTTAACTATTTGAA-
154 GACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
* * * * * *
26474 TTGGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGTAATATTATTAAAT
219 TT-GTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * *
26539 TAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGGTTTTATTAAAAGAAACAATTGTTTTAT-A-AAAAAATAA
283 TAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AA
* *
26601 AGATCATAACGAT
346 AGGTCATAACAAT
* * * * ** * * *
26614 TTGAGATAGATAA-TAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAATTGTTTCA-AAAAATAGATTTA-G
1 TTGAAATAAATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TT-AGGTAAACATATTTATT
* ** * * *
26676 TTTTAAATCTCTTA-TTATT--TTTCAAATTATTAATAGATAAATATTATTTTATTCTA-AATAA
63 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T-TAGAATAA
** * * ** ** *
26737 TTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTCATAACAACTTGAAATAGATA
125 GCTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * * * *
26802 ATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCT
190 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * * * *
26866 ACCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTCTTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATA
254 AATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA
* * *
26931 GAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACTAT
319 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * *** * * *
26971 TTGAAATAAATACTTGTTCATCCAGTCATAACTATTTGAACTTGCTCA-GTAAATAGATTTATTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG-TTAGGTAAACATATTTA--T
* * * * *
27035 TTTTTAGATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATGAATAAACTAGCATTATTTTATTTCGAATA
62 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATA
* * *** * *
27100 CA-CATGTTTGAATAGAAAC-ATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAA
124 -AGCTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * *
27163 TAATTGTTTAACTAATAATAACTATTTGAA-TGTGTTTTATGACAAAAAAGTCCTAACTATTTGA
188 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-TG---T-T--CAGAAAA----T-A-TATTT-A
** * * * *
27227 CCTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAA
239 --T--TTT-----TTA-A---ATCTCTT-AA----TTA-TTA--AT-TTTTGAAATATTAATAAA
* * * * *
27292 TTAGTATTATTTTA-ATCTAAATAAGCTGGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATGAA
282 TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAA
**
27356 AA-G-CATAACGGT
345 AAGGTCATAACAAT
* * * * *
27368 CT-AAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCA-GTAAATAGATTTAGT
1 TTGAA-ATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TT-AGGTAAACATATTTATT
* * * *
27431 TTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
63 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT--GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAA
** * * ** * *
27492 TTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGGTA
125 GCTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * * ** * ** * *
27557 ATTATTCAAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTTGGTAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCCTA
190 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** ** * * * *
27622 CCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATGTGAATA
255 ATTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA
* * **
27686 GAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTAT
319 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * *
27726 TTGAAATAAATGATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC--TTACGCGGTAAACAAATTTATT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTA---GGTAAACATATTTATT
*
27789 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCA-AATA
63 TTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT-AGAATA
* * * *** * * *
27853 CGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGCAATAGAT
124 AGCTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * *
27918 AATGGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTT
189 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-TGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCT
* * *
27981 TACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAATATAAGCTTGTATGAA
253 TAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-ATAAGCTTGTATGAA
* * **
28044 CAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
317 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * *
28086 TTGAAATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAATAAATTCATT
1 TTGAAATAAAT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTT-AGGTAAACATATTTATT
* *
28149 TTTTAAATCTCTTT-CTCATTAATTTTTAGAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTA-AAT
63 TTTTAAATCT-TTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA--TTAGAAT
* * * ** *
28212 AAGCCTATATGAA-ATGATACAAT--TGTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATA
123 AAGCTTGTATGAATA-GAAACAATCAT-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA
* * * * * * *
28274 GATTATTATTCAAATAATTATAACTATTT-AACTTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTAAAATCT
186 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCT
* * * ** * * * * * *
28338 -TATACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATA
251 CT-TAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * **
28402 AACAAAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTC--AATGAT
315 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* *** *
28444 TTGAAATAAAT-ATTAATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTCATAAACAGATTTATTT
1 TTGAAATAAATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTAGGTAAACATATTTATTT
* * * * * *
28508 TTCAAATGTTTTGCTTATTAATTATCT-AAGGGA-TAATAACTTTGTATTATTTTAATT-GAAAT
64 TTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TGAA--TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTAG-AAT
* * * * * * **
28570 AAGCTTATAAGAATAGCAAA-AATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAG
123 AAGCTTGTATGAATAG-AAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * *
28634 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTC-GATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCT
187 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGA-AAATATATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
28698 CTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTA-TTCTGAATAAGTTTGTATG
251 CTTAATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATG
* * **
28762 AACAGAAACAATTG-TTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGAT
315 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * *
28805 TTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGCACTGGTCAGGTGAACAGATTCATTAT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * *
28870 TTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGACTATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCA-AATAAG
65 TTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT--AGAATAAG
* * * * ** * *
28934 AC-TGTATCAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATATGAAATAAATA
126 -CTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * * * * * * *
28998 ATTATTTAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC--
190 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTG-TTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
29061 --TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAACAAACTTATATGAACA
254 AATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA
* * **
29124 -AAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAA-GTACATAATTAT
319 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACAAT
** * * ** *
29163 TTGAAATGGATAATTATTCATATAG-CTTTAACTATTTGAACTGGTTCA-ACAAACAAATTTA-T
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACT-GTT-AGGTAAACATATTTATT
* ** * * * ** * *
29225 TTTCAAATCTCATAATTATTAATTTTCATAATATTATTAGTTTAATATTATTTTATTTTGAATAA
63 TTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT--GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATAA
* * * ** * * * *
29290 GCTTGTATGAACATAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGACTTGAAATATATA
125 GCTTGTATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * *
29355 ATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGTAAACA-A---A-----T-AATCTCCTA
190 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * **
29410 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTA-TTCTAAATAGGCTTGTATGATGA
255 ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * **
29473 AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGAT
319 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * *
29513 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAATTGATT-GAATAAA-TTGATTTATG
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAG-GTAAACAT-ATTTATT
** * * * * * *
29576 TTTTAAAT-TTCCAAATT-TCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATA
63 TTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTAGAATA
* * * * * *
29639 AGGTTTTATGAA-ATGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA-ATG
124 AGCTTGTATGAATA-GAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-G
* * ** ** * *
29702 ATAATTGTTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTTAACAAATTTATGTTTTTAAAT-T
187 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTAT-TTTTTAAATCT
** * * *
29766 GCTTGCTTATTAATTTTCTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTTATTT-AGAATAAG-TATG
251 -CTTAATTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTCA-AATAAGCT-TG
* ** * * * * *
29828 TACGAATTGAAACAATTATTTTATAACTAAAC-AAAGGTCAGAACGAT
311 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * *
29875 TTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAACAGATTCGATAAATATATTTATTTT
1 TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTAGGTAAACATATTTATTTT
* * * * * ** * *
29940 GTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTACTCT-GAATAAG
65 TTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T-TAGAATAAG
* * ** * * * *
30004 TTTGTAT-AGACAGAAACAATTGTTTAATGACAAAAC-AAAGATCATACCAATTTGAGATAGATA
126 CTTGTATGA-ATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
* * * * * *
30067 ATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAA-TTG-TCTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC--
190 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTC-AGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * **
30128 --TTATTAA-TTTTCAAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAATTTTGTATGAA
254 AATTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA
* * * *
30189 TAGAAACAATTGTTTTTATGACAATACAAAAGATCATAACGAT
317 CAGAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
30232 TT-AAATAAATAAT
1 TTGAAATAAATAAT
30245 ATTGGTAAAT
Statistics
Matches: 7052, Mismatches: 1676, Indels: 1394
0.70 0.17 0.14
Matches are distributed among these distances:
334 6 0.00
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452 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
TTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTAGGTAAACATATTTATTTTT
TAAATCTTTTACTTATTAATTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAGAATAAGCTTGT
ATGAATAGAAACAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTT
CAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATT
AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA
TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAAT
Found at i:24615 original size:160 final size:161
Alignment explanation
Indices: 24322--24615 Score: 342
Period size: 160 Copynumber: 1.8 Consensus size: 161
24312 ATATTACTAT
* * * * * * *
24322 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAA
1 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTCTATGAACAAAAACAATTGTTATATAACAGAACAAA
* * * * * * * * * * *
24387 ATGGTTATAATGATTTGAAGTATACAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTTAATTGGTTTAGTA
66 ATGGTAATAATGATTCGAAATACACAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTAAACTGATATAGTA
24452 AACATCTTTTATTAATTTTTGAAAGATATAA
131 AACATCTTTTATTAATTTTTGAAAGATATAA
* *
24483 ATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAATTTCTATGATCAAAAACAATTGTTATATAACCA-AACA
1 ATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTCTATGAACAAAAACAATTGTTATATAA-CAGAACA
* * *
24546 AAA-GGTAATAATGATTCGAAATACATAATTATTGAAATGGCCATAATTATTTAAACTGATATGG
64 AAATGGTAATAATGATTCGAAATACACAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTAAACTGATATAG
24610 TAAACA
129 TAAACA
24616 GATTCACTTT
Statistics
Matches: 108, Mismatches: 23, Indels: 5
0.79 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
160 56 0.52
161 50 0.46
162 2 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (161 bp):
ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTCTATGAACAAAAACAATTGTTATATAACAGAACAAA
ATGGTAATAATGATTCGAAATACACAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTAAACTGATATAGTA
AACATCTTTTATTAATTTTTGAAAGATATAA
Found at i:26942 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 25814--30244 Score: 2933
Period size: 181 Copynumber: 24.5 Consensus size: 181
25804 AAATAATGTT
* * * **
25814 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TAGAATAAGTTTGTATGAACTA-AAACAATTATTATATGATTA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * * * * * * *
25877 AACAAATGATTAAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAATTATTCGAA-TTGG
64 AACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* * *
25941 TTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTA
128 TTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * * *
25992 TTAAATTATTATTATTTTA-TCCAAATAAGCATG-ATG---AGAAACAATTATTTTAAGAGAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
26052 C-AAAGATCATAATGATTTGAGAAT-GATATTTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGATT
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TT
* * * ** * * *
26114 CGAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCGCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
129 TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * ** * * * * * ***
26167 GTAAAGTAGTATTATTTTATT-TCGGATAAGTTTCTATGAGCT-GAAAC-ATTATTTTATAATGG
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
26229 AAGAAAAGGTCATAATGACTTTAAATAGTTAGATTGATTGTTCAAATAGTCCA-ATCTATTTAAA
64 AACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAA-A--TAGA-TAATTGTTCAAATAGT-CATAACTATTTGAA
** * * * *
26293 CTTGTTCAATAAACAGATTTATCTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT-GAATGTTA
123 CTTGTTTGATAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * **
26352 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTGTATGAATTGAAATAATTGCTTTATGATTAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * ** * *
26417 CAAAAGGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGATCTAATAGTGTTAACTATTTGAA-TTGGTTC
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
* * * **
26481 AGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTGTAATATTA
131 A-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * *
26533 TTAAATTAGTATTATTTTAATT-TGAATAAGGTTTTATTAAAAGAAACAATTGTTTTAT-A-AAA
1 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * *
26595 AAATAAAGATCATAACGATTTGAGATAGATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTTAA-TTGTT
65 ACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * *
26659 TCA-AAAAATAGATTTA-GTTTTAAATCTCTTA-TTA-T--TTTTCAAATTATTA
129 TGATAAACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * ** * * **
26708 ATAGATAAATATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTACAACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
26773 CAAAAGGTCATAACAACTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTG
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
* *
26838 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAAAATATTA
131 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * *
26889 ATAAATTAGTATTCTTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *** * *
26954 CAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATACTTGTTCATCCAGTCATAACTATTTGAACTTG-CTC
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
* * * * ** *
27018 AGTAAATAGATTTATTTTTTTTAGATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATGA
131 A-TAAACAAATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * *
27072 ATAAACTAGCATTATTTTATT-TCGAATACA-CATGTTTGAATAGAAAC-ATTGGTTTATGACAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
27134 AACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTTAACTAATAATAACTATTTGAA-TGTGT
64 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGT
* * * * * * * ** ** * * *
27198 TTTATGACAAAAAAGTCCTAACTATTTGACCTAGTTTGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCT
128 TTGAT-A-AACAAA-T--TTA-TTTTTTA---AATCT--CTTACTTATTAATTTTTAAAATAT-T
27263 -
181 A
* * * * * * * * ** * **
27263 -T-ACTTATTAATT-TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTAAATAA--GCTGGTA
1 ATAAATTAGT-ATTATTT----TATT-CTAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTTA
* ** * *
27323 TGAAAAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATGAAAAGCATAACGGTCT-AAGATAGATAATTATTC
58 TG-ACA-AAACAAAAG----GT--C---AT--AACG-AT-----T-TGAA-ATAGATAATTGTTC
* * * *
27387 AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTCAGTAAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATT
102 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT
*
27447 AATTTTCAAAATATTA
166 AATTTTTAAAATATTA
* * * * ** * *
27463 GTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
27528 CAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTTG
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
* * * * *
27593 GTAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTA
131 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * *
27644 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATGTGAATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* ** * * * ****
27709 CAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATGATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTACGCG
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
* * **
27774 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA
131 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * *
27825 ATAAAATAGTATTATTTTATT-TCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * *
27889 ACAAAAGGTCATGACAATTTGCAATAGATAATGGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT
* * * * **
27953 CAGA-AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTA
129 -TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * *
28004 ATAAATTTGTATTATTTTATTC-AATATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
*
28068 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-T
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * * * *
28131 TCAGTAAATAAATTCATTTTTTAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTAGAGTATTA
129 TGA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * **
28185 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAA-ATGATACAATTG-TTTATGATGAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
28248 ACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATTATTATTCAAATAATTATAACTATTT-AACTTG-TT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
* * * * * * *
28311 CAGCAAACATATTTATTTTTAAAATCT-TATACTTATTAACTGTCAAAATATTA
130 GA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * ** * * * * *
28364 ATAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGGCAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
28429 CAAAAGGTC--AATGATTTGAAATAAAT-ATTAATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTT
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
* * * * * * * ***
28491 CATAAACAGATTTATTTTTCAAATGTTTTGCTTATTAATTATCTAAGGGA-TA
130 GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAAATATTA
* * * * * * *
28543 ATAACTTTGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTATAAGAATAGCAAA-AATTATTTTATGATAA
1 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAA
* * ** * *
28606 AATAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTT
64 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * **
28671 CGATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTA
129 TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * *
28724 ATAAATTAGAATTATGTTATTCTGAATAAGTTTGTATGAACAGAAACAATTG-TTTGTGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * **
28788 TAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGCACTGGTCAG
66 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
* * * * * * * *
28853 GTGAACAGATTCATTATTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGACTATTA
131 ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * *
28904 ATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAATTATTTTATGACAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * * * *
28968 ACAAATGGTCATAATGATATGAAATAAATAATTATTTAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
*
29033 CGGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTA
130 -GATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * * * *
29082 ATAAATTAATATTATTTTATTTTAAACAAACTTATATGAACA-AAACATTTGTTTTACGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
** * * * * *
29146 CAAAA-GTACATAATTATTTGAAATGGATAATTATTCATATAG-CTTTAACTATTTGAACTGGTT
66 CAAAAGGT-CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTT
** * * * * * *
29209 CAACAAACAAATTTA-TTTTCAAATCTCATAATTATTAATTTTCATAATATTA
129 TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* ** * * * * * *
29261 TTAGTTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTGTTTTATGACAAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
29326 CAAAAGGTTATAACGACTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGGTTC
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* *
29390 AGTAAAC-AA---A-----T-AATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
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* * *
29432 ATAAATTAGTATT-TTTTATTCTAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
29495 ACAAAAGTTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAA-TTGATT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
*** * * ** * * *
29559 GAATAAATTGATTTATGTTTTAAATTTCCAAATT-TCAATTTTTGAAATATTA
130 G-ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * ** * * * *
29611 ATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGGTTTTATGAA-ATGAAACAATTATTTTATGATAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * *
29675 ACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA-ATGATAATTGTTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT
* * * * *
29739 TGGTTAACAAATTTATGTTTTTAAAT-TGCTTGCTTATTAATTTTCT-GAATGTTA
129 TGATAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTT-TAAAATATTA
* * * * * * *
29793 ATAAAATAATATTATTTTTATT-TAGAATAAG-TATGTACGAATTGAAACAATTATTTTATAACT
1 ATAAATTAGTATTA-TTTTATTCTA-AATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * *
29856 AAAC-AAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTATTTGAAC-AGA
63 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-
* * * * *
29919 TTCGATAAATATATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTAAAATATTA
127 TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* ** * * * * * * *
29974 TTAGTTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGTTTGTAT-AGACAGAAACAATTGTTTAATGACAAA
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * * * *
30038 AC-AAAGATCATACCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTT-AAATTGTCT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTT
* * * *
30101 -AGTAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAACTATTA
130 GA-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* ** *
30149 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGACAAT
1 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG-TTTTATGACAAA
* *
30214 ACAAAAGATCATAACGATTT-AAATAAATAAT
65 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
30245 ATTGGTAAAT
Statistics
Matches: 3314, Mismatches: 747, Indels: 386
0.75 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 101 0.03
171 90 0.03
172 9 0.00
173 20 0.01
174 5 0.00
175 157 0.05
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179 457 0.14
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181 786 0.24
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183 114 0.03
184 11 0.00
185 80 0.02
186 65 0.02
187 2 0.00
189 9 0.00
190 4 0.00
191 16 0.00
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195 22 0.01
196 15 0.00
197 18 0.01
198 5 0.00
199 1 0.00
200 14 0.00
201 6 0.00
202 8 0.00
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215 31 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTG
ATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
Found at i:28448 original size:718 final size:720
Alignment explanation
Indices: 27238--30244 Score: 2762
Period size: 718 Copynumber: 4.2 Consensus size: 720
27228 CTAGTTTGAC
* * *
27238 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATT
1 AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * *
27303 TTAATCTAAATAAGCTGGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATGAAAA-G-CATAAC
66 TTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAAT
* * * *
27365 GGTCT-AAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCAGTAAATAGATTTA
129 GATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAATAGATTCA
* * * * * *
27429 GTTTTTAAATCTC--T-TATTAATTTTCAAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
193 TTTTTTAAATCTCTTTCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
*** * *
27491 ATTTTGCATGAACA-GAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAG
258 AGACTGTATGAA-ATGAAACAATTAG-TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
* * * * * * *
27554 GTAATTATTCAAATGGA-CATGATTATTTGAACTTGTTTGGTAAGCAAATTTATTTTTTAAATCT
321 ATAATTATTCAAAT-AATCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * *
27618 CCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATGTGA
385 -TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGA
* * ** * * * *
27683 ATAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATGATTGTTCAAA
449 ACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA
* * ** * * *
27748 TAGTTATAACTATTTGAACTTACGCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT
513 TAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATT
* ** *
27813 TTTGGAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTCAAATACGCTTGTATGAACA-AAAACAATTG
578 TTT-AAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTG
* * *
27877 GTTTATGATAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGCAATAGATAATGGTTCAAATAGTCATAACTAT
641 GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
*
27942 TTGAA-TGTGTTCAGA
706 TTAAACT-TGTTCAGA
* * * * *
27957 AAATAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTTGTATTATT
1 AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
*
28020 TTATTC-AATATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
66 TTATTCTAA-ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
*
28084 ATTTGAAATAGATAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAATAAATTCA
130 ATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCAGTAAATAGATTCA
*
28147 TTTTTTAAATCTCTTTCTCATTAATTTTTAGAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAT
193 TTTTTTAAATCTCTTTCT-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAAT
* * * ** *
28212 AAGCCTATATGAAATGATACAATT-GTTTATGATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGA
257 AAGACTGTATGAAATGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * *
28276 TTATTATTCAAATAATTATAACTATTT-AACTTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTAAAATCTTA
322 TAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT-
* * * * ** * * *
28340 TACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATAAAC
386 TACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAAC
*
28405 AAAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTC-AATGATTTGAAATAAAT-ATTAATTCAAATA
451 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAAATAATT-ATTCAAATA
* * * * *
28468 GTCATAACTATTTGAACTTATTTC-ATAAACAGATTTATTTTTCAAATGTTTTGCTTATTAATTA
515 GTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGATAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATT-
* ** * * * * * * *
28532 TCTAAGGGA-TAATAACTTT-GTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTATAAGAATAGCAAAAATTA
578 TTTAA-ATATTAATAA-TTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTG
* * * * *
28595 TTTTATGATAAAATAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
641 GTTTATGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
28660 TTAAACTTGTTC-GA
706 TTAAACTTGTTCAGA
* * * *
28674 TAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTAT
1 -AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * *
28739 GTTATTCTGAATAAGTTTGTATGAACAGAAACAATTG-TTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATG
65 TTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * * * *
28803 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGCACTG-GTCAGGTGAACAGATTCAT
130 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCA-GTAAATAGATTCAT
* * * * * * **
28867 TATTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGACTATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATA
194 TTTTTAAATCTCTTTC-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
* * * * ** * *
28932 AGACTGTAT-CAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATGATATGAAATAAA
258 AGACTGTATGAAAT-GAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* ** * * * *
28996 TAATTATTTAAATTGTTATAACTAATTGAACTAGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC--
322 TAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTT
* * *
29059 T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAACAAACTTATATGAAC
386 TACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAAC
* * * * ** *
29123 -AAAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAA-GTACATAATTATTTGAAATGGATAATTATTCATAT
451 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT-CA-AATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAT
* * * * * *
29186 AG-CTTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTA-TTTTCAAATCTCATAATTATTAATT
514 AGTC-ATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * ** * *
29249 TTCATAATATTATTAGTTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAAAAATTGT
578 TTTA-AATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGG
* * * * * *
29314 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGACTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
642 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
29379 TGAACTGGTTCAGT
707 TAAACTTGTTCAGA
*
29393 AAACA-A---A-----T-AATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-TT
1 AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* ** * * *
29447 TTATTCTAAATAGGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGA
66 TTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * * * * * * * *
29512 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAATTGATTGAATAAATTGATTTATGT
131 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAATAGATTCATTT
* **** * * **
29577 TTTAAATTTCCAAAT-TTCAATTTTT-GAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAA
196 TTTAAATCTCTTTCTATT-AATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAA
** * * * * *
29640 GGTTTTATGAAATGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA-ATGAT
259 GACTGTATGAAATGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-GAT
* * * * * *
29704 AATTGTTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTTAACAAATTTATGTTTTTAAAT-TGC
323 AATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCT--
* ** * * * * * *
29768 TTGCTTATTAATTTTCTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTTATTTAGAAT-AAGTATGTACG
385 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTTATTTTGAATAAACT-TATATG
*** * * * * *
29832 AATTGAAACAATTATTTTATAACTAAAC-AAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
448 AACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATAAATAATTATTCAA
* * * *
29896 ATAGTCATAACTATTTGAACAGATTCGATAAATATATTTATTTTGT-AAATCTCTTACTTATAAA
512 ATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTT-TCAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * * * *
29960 TTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTA-CTCTGAATAAGTTTGTAT-AGACAGAAACAA
576 TTTTT-AAATATTAATAATTTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAAAAA
* * * *
30023 TT-GTTTAATGACAAAAC-AAAGATCAT-ACCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATACTCATA
638 TTGGTTT-ATGACAAAACAAAAGGTCATGA-CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
*
30085 ACTATTTAAA-TTG-TCTAGT
701 ACTATTTAAACTTGTTC-AGA
*
30104 AAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAAACTATTAATAAATTAGTATTAT
1 AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * * * * *
30164 TTTATTCTGAATAATTTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGACAATACAAAAGATCATAAC
65 TTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT
*
30229 GATTT-AAATAAATAAT
129 GATTTGAAATAGATAAT
30245 ATTGGTAAAT
Statistics
Matches: 1866, Mismatches: 342, Indels: 161
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
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709 3 0.00
710 3 0.00
711 45 0.02
712 123 0.07
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714 3 0.00
715 1 0.00
716 15 0.01
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721 64 0.03
722 81 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (720 bp):
AAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGTAAATAGATTCATTT
TTTAAATCTCTTTCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGA
CTGTATGAAATGAAACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
TATTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTACTT
ATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAACAAAAA
CAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATA
ACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTCAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATA
TTAATAATTTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGGTTTATGACA
AAACAAAAGGTCATGACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGT
TCAGA
Found at i:28596 original size:539 final size:533
Alignment explanation
Indices: 27238--30244 Score: 2273
Period size: 539 Copynumber: 5.6 Consensus size: 533
27228 CTAGTTTGAC
* * *
27238 AAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATTAT
1 AAACAAATTTA-TTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAAATAGTATTAT
* * * * * * * * *
27302 TTTAATCTAAATAAGCTGGTATGAAA-AGAAACAATTGTTTTGTGACAAAATGAAAAGCAT-AAC
63 TTTATTCCAAATAAGCTTGTAT-AAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAA-CAAAAG-GTCAAT
* * * * *
27365 GGTCT-AAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTCAGTAAATAGATTT
125 GATTTGAA-ATAAAT-ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTCA-TAAACAGATTT
* * * * * * * **
27428 AGTTTTTAAA--TCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAGTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
187 ATTTTTTAAATTTTTCTTATTAA-TTTC-TAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATA
** ** * * * *
27491 ATTTTGCATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGGT
250 AGCTTATATGAA-ACAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * ** * *
27556 AATTATTCAAATGGACATGATTATTTGAACTTGTTTGGTAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCCT
313 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * *
27621 AC-CTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATGTGAAT
378 ACTC-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC
* ** * * *
27685 A-GAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATTATTTGAAATAAATGATTGTTCAAAT
442 ATGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* *** *
27749 AGTTATAACTATTTGAACTTACGCGGT
507 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGT
*
27776 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAATAGTATTATT
1 AAACAAATTTA-TTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGTATTATT
* * * ** *
27841 TTATTTCAAATACGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTC-ATGACA
64 TTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAATG---
* * ** * * *
27905 ATTTGCAATAGATAATGGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGT-GTTCAGAAAATAGATTTA
126 ATTTGAAATAAAT-ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTTCA-TAAACAGATTTA
27968 TTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTT-TGGAATATTAATAAATTTGTATTATTTT-ATTCAATAT
188 TTTTTTAAATTTTT-CTTATTAATTTCT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTCAA-AT
* * **
28031 AAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
249 AAGCTTATATGAA-ACAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
* *
28096 TAAATT-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAAATTCATTTTTTAAATCTC
312 T-AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *
28160 TTTCTCATTAATTTTTAGAGTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCCTATATGAA
376 TTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA
* ** * * *
28225 -ATGATACAATTG-TTTATGATGAAACAAAAGGTCATAGCAATTTGAAATAGATTATTATTCAAA
441 CATGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * *
28288 TAATTATAACTATTT-AACTTGTTCAGC
506 TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGT
* * * * * * *
28315 AAACATATTTATTTTTAAAATCTTATACTTATTAACTGTCAAAATATTAATAAACTAATATTATT
1 AAACAAATTTATTTTT-AAATCTT-TACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGTATTATT
* * *
28380 TTAATCCGAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCAATGATT
64 TTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAATGATT
28445 TGAAATAAATATTAATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTCATAAACAGATTTATTTTT
129 TGAAATAAATATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTCATAAACAGATTTATTTTT
* * * *
28510 CAAATGTTTTGCTTATTAATTATCTAAGGGA-TAATAACTTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGC
193 TAAAT-TTTT-CTTATTAATT-TCTAA--TATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAAGC
* * * * **
28574 TTATAAGAATAGCAAAAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTTATGGCAATTTGAAATAGATAAT
253 TTATATGAA-A-CAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * *
28639 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTC-GATAAACAAATTTAGTTTTTAAATCTCTTAT
316 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
* * * * * * *
28703 TTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCTGAATAAGTTTGTATGAACA-G
380 TCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACATG
* * * *
28767 AAACAATTG-TTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGT
445 AAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* *
28831 CATAACTATTTGCAC-TGGTCAGGT
510 CATAACTATTTGAACTTGTTCA-GT
* * * * * * *
28855 GAACAGATTCATTATTTAAATCTGTTACTTATTAATTTTTAGACTATTAATAAATTAGCATTACT
1 AAACAAATTTATT-TTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGTATTATT
* * * * *
28920 TTATTCCAAATAAGAC-TGTATCAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTCATAATG
64 TTATTCCAAATAAG-CTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC--AATG
* * * * * * *
28984 ATATGAAATAAATAATTATTTAAATTGTTATAACTAATTGAAC-TAGTTTCGGTAAACAAATTTA
126 ATTTGAAATAAAT-ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTTC-ATAAACAGATTTA
* * ** * * *
29048 TTTTTTAAA--TCTCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTAAACAA
188 TTTTTTAAATTTTTCTTATTAATTTCT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAA
* * * ** *
29111 ACTTATATG-AACAAAACATTTGTTTTACGACAAAACAAAA-GTACATAATTATTTGAAATGGAT
251 GCTTATATGAAACAAAA-A-TTATTTTATGACAAAACAAAAGGT-CATAACAATTTGAAATAGAT
* * * ** * *
29174 AATTATTCATATAG-CTTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAACAAATTTA-TTTTCAAATCTCA
313 AATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * ** * *
29237 TAATTATTAATTTTCATAATATTATTAGTTTAATATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC
377 TACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAC
* * * * * *
29302 AT-AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACGACTTGAAATATATAATTGTTCAAAT
442 ATGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* *
29366 AGTCATAATTATTTGAACTGGTTCAGT
507 AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGT
* *
29393 AAAC-AA---A----T-AATCTCCTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATT-TT
1 AAACAAATTTATTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAAATAGTATTATT
* * * ** * * *
29447 TTATTCTAAATAGGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAAAATGA
64 TTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTC--AATGA
* * * * ** ** *
29512 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAA-TTGATTGAATAAATTGATTTATG
127 TTTGAAATAAAT-ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTTCATAAACAGATTTATT
* ** * * ** * ***
29576 TTTTAAA-TTTCCAAATTTCAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAA
190 TTTTAAATTTTTCTTA-TT-AATTTCT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAA
* * * * * *
29640 GGTTTTATGAAATGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAA-ATGAT
251 GCTTATATGAAA-CAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATA-GAT
* * * * ** *
29704 AATTGTTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGGTTAACAAATTTATGTTTTTAAAT-TGC
313 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTAT-TTTTTAAATCT-C
* * * * * * * *
29768 TTGCTTATTAATTTTCT-GAATGTTAATAAAATAATATTATTTTTATTTAGAATAAG-TATGTAC
376 TTACTCATTAATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGCT-TATAT
* ** * * *
29831 GAA-TTGAAACAATTATTTTATAACTAAAC-AAAGGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
438 GAACATGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* *
29894 TAATAGTCATAACTATTTGAAC-AGATTC-GAT
503 AAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAG-T
* * * * * *** * *
29925 AAATATATTTATTTTGTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTAAAATATTATTAGTTTAGCAATATT
1 AAACAAATTTATTTT-TAAATCT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGTATTATT
* ** * * * * * * **
29990 TTACTCTGAATAAGTTTGTATAGACAGAAACAATTGTTTAATGACAAAAC-AAAGATCATACCAA
64 TTATTCCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-A-TGA
* * * * * * *
30054 TTTGAGATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTT-AAATTGTCT-AGTAAACAGATTTAGT
127 TTTGAAATAAAT-ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTCA-TAAACAGATTTATT
* * * * *
30117 TTTTAAA--TCTCTTATTAATTTTCAAACTATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAT
190 TTTTAAATTTTTCTTATTAA-TTTCTAA-TATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTC-AAATAAG
* * * * * * * *
30179 TTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTTATGACAATACAAAAGATCATAACGATTT-AAATAAATA
252 CTTATATGAA-ACAAA-AATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATA
30243 AT
314 AT
30245 ATTGGTAAAT
Statistics
Matches: 1998, Mismatches: 371, Indels: 200
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
526 18 0.01
527 94 0.05
528 41 0.02
529 47 0.02
530 72 0.04
531 10 0.01
532 96 0.05
533 42 0.02
534 1 0.00
536 11 0.01
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539 494 0.25
540 183 0.09
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542 132 0.07
543 63 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (533 bp):
AAACAAATTTATTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAAATAGTATTATTTT
ATTCCAAATAAGCTTGTATAAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCAATGATTTG
AAATAAATATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTCATAAACAGATTTATTTTTTAA
ATTTTTCTTATTAATTTCTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTATATGA
AACAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTT
TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACATGAAACAATTGCT
TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
GAACTTGTTCAGT
Found at i:30401 original size:277 final size:277
Alignment explanation
Indices: 29998--30524 Score: 677
Period size: 277 Copynumber: 1.9 Consensus size: 277
29988 TTTTACTCTG
* * *
29998 AATAAGTTTGTATAGACAGAAACAATTGTTTAATGACAAAACAAAGATCATACCAATTTGAGATA
1 AATAAGCTTGTATAGACAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAGATCATACCAATTTGAAATA
* *
30063 GATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTAAATTGTCTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC
66 GATAATTATTCAAATACTCATAACTATTGAAATTGTCTAGTAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTC
* *** *
30128 -T-T-ATTAATTTTCAAACTATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAATTTTGTATGAAT
131 TTCTCATTAATTTTCAAA-TAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCCTATATGAAT
* *
30190 AGAAACAATTGTTTTTATGACAATACAAAAGATCATAACGATTT-AAATAAATAATATTGGTAAA
195 AGAAACAATT-ATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATATTGGTAAA
30254 TTCATATTATTTTATTTGA
259 TTCATATTATTTTATTTGA
* * * **
30273 AATAAGCTTGTAT-GAACAGAAACAATTATTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAAGGAATTTGAA
1 AATAAGCTTGTATAG-ACAGAAACAATTATTTAATGACAAAAC-AAAGATCAT-ACCAATTTGAA
* * * * * *
30337 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGAACTTGTTTAGTAAATAGATTCATTTTTTAAAT
63 ATAGATAATTATTCAAATACTCATAACTATTGAAATTGTCTAGTAAACAGATTCAGTTTTTAAAT
* * * *
30402 CTCTTGCTCATTAATTTTGAAATAGTAATAAGTTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATG
128 CTCTT-CTCATTAATTTTCAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCCTATATG
* * * * *
30467 AATTGATACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
192 AATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAAT
30525 TATTCAAATA
Statistics
Matches: 212, Mismatches: 32, Indels: 11
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
274 1 0.00
275 36 0.17
276 8 0.04
277 68 0.32
278 1 0.00
279 29 0.14
280 57 0.27
281 12 0.06
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (277 bp):
AATAAGCTTGTATAGACAGAAACAATTATTTAATGACAAAACAAAGATCATACCAATTTGAAATA
GATAATTATTCAAATACTCATAACTATTGAAATTGTCTAGTAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTC
TTCTCATTAATTTTCAAATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCCTATATGAATA
GAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAAATAATATTGGTAAATT
CATATTATTTTATTTGA
Found at i:30678 original size:182 final size:178
Alignment explanation
Indices: 30251--30750 Score: 590
Period size: 182 Copynumber: 2.8 Consensus size: 178
30241 TAATATTGGT
* * *
30251 AAATTCATATTATTTT-ATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGGCAAAAC
1 AAATTAATATTATTTTAATTTG-AATAAGCTAGTATGAACA-AAACAATTATTTTATGACAAAAC
* *
30315 AAAAGGTCATAAGGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGAACTTGTTTAG
64 AAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGAACTTGTTCAG
* * * *
30380 TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTGAAATAGTAAT
128 TAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTAAAATAGTAAC
* * * ** *
30431 AAGTTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA-TATGAATTGATACAATTATTTTATGACAAAAC
1 AAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAG-CTAGTATGAA-CAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * *
30495 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTACTATTTGAACTTGTTCGG
64 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTGAACTTGTTCAG
* * * * * *
30560 TAAACATATTTATTTTTTTATATCTTTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAC
128 TAAACAGATTCA-TTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTT-AAAATAGTAAC
* * *
30613 AAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAGTAATTGTTTTATGAAAAAACA
1 AAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAA-CAATTATTTTATGACAAAACA
* * * * *
30678 AAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTGAAATTATTCAGTA
65 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGAACTTGTTCAGTA
*
30743 AATAGATT
130 AACAGATT
30751 TGAGATAAGC
Statistics
Matches: 266, Mismatches: 46, Indels: 15
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
179 33 0.12
180 80 0.30
181 54 0.20
182 99 0.37
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
AAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGAACTTGTTCAGTAA
ACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTAAAATAGTAAC
Found at i:30847 original size:119 final size:118
Alignment explanation
Indices: 30630--30847 Score: 303
Period size: 119 Copynumber: 1.8 Consensus size: 118
30620 TATTATTTTA
* * *
30630 ATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAGTAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAATTT
1 ATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAGAAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAAATT
*
30695 GAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTGAAATTATTCAGTAAATAG
66 GAAATAAATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTGAAATTATTCAGTAAATAG
* * * * * *
30748 ATTTGAGATAAGCTTGTATGAATAGAAA-AAATTATTTTATGACAATACAAAAGGTTATAGCAAA
1 ATTTGA-ATAAGCTAGTATGAACA-AAAGAAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAAA
* *
30812 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGCCATAACTATT
64 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAACCATAACTATT
30848 TGAACTTGTT
Statistics
Matches: 86, Mismatches: 12, Indels: 3
0.85 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
118 6 0.07
119 77 0.90
120 3 0.03
ACGTcount: A:0.47, C:0.08, G:0.13, T:0.33
Consensus pattern (118 bp):
ATTTGAATAAGCTAGTATGAACAAAAGAAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCATAACAAATT
GAAATAAATAATTGTTCAAATAACCATAACTATTGAAATTATTCAGTAAATAG
Found at i:31420 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 31375--31421 Score: 53
Period size: 19 Copynumber: 2.7 Consensus size: 18
31365 GGTAATAACG
31375 ATTTGAAATAG-ATAATT
1 ATTTGAAATAGTATAATT
* *
31392 -GTTCAAATAGTCATAATT
1 ATTTGAAATAGT-ATAATT
31410 ATTTGAAATAGT
1 ATTTGAAATAGT
31422 TTTGCAAACA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 4, Indels: 4
0.74 0.13 0.13
Matches are distributed among these distances:
16 8 0.35
18 6 0.26
19 9 0.39
ACGTcount: A:0.43, C:0.04, G:0.13, T:0.40
Consensus pattern (18 bp):
ATTTGAAATAGTATAATT
Done.