Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168115.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_36, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
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Warning! 1000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 1 of 5
Found at i:463 original size:11 final size:10
Alignment explanation
Indices: 423--472 Score: 61
Period size: 9 Copynumber: 5.1 Consensus size: 10
413 ATCTATACAG
423 TTATAATTAA
1 TTATAATTAA
433 TT-TAATTAA
1 TTATAATTAA
442 --ATAATTTAA
1 TTATAA-TTAA
451 TTATCAATTAA
1 TTAT-AATTAA
462 TTATAATTAA
1 TTATAATTAA
472 T
1 T
473 AAAAAACTAT
Statistics
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12 2 0.06
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Consensus pattern (10 bp):
TTATAATTAA
Found at i:1378 original size:16 final size:17
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Indices: 1357--1389 Score: 50
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1347 TATTGATTTC
1357 AAATAG-ATAATTATTG
1 AAATAGCATAATTATTG
1373 AAATAGCCATAATTATT
1 AAATAG-CATAATTATT
1390 TGAACTAATT
Statistics
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AAATAGCATAATTATTG
Found at i:1660 original size:180 final size:177
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Indices: 1315--1753 Score: 531
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1305 TATGATAAAA
* * ** * * * *
1315 AAACAATTATTATATGACCGAACAAAAGGTAATATTGATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGC
* * * * * *
1380 CATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACAAAATCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAAT
66 CATAACTATTTAAACTAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACTCATTAATTTTTGAAAT
*
1445 ATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
131 ATTAAGAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
*
1492 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAA-TATTCAAATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGC
* ** * *
1556 CATAACTATTTAAATTTGTTAAATAAACAAATTAATTTTTTTAAACTCTTGCTCATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTAAACTAATTAAATAAACAAAATAA-TTTTTTAAA-TC--ACTCATTAATTTTTG
* * *
1621 AAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATCTT-GGATAAGCTTTTATGAACTG
127 AAATATTAAGAAATTACTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * *
1672 AAACAATTGTTTTTTTGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * *
1737 TCACAACTATTTGAACT
65 CCATAACTATTTAAACT
1754 TGATTGGTAA
Statistics
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AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGC
CATAACTATTTAAACTAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACTCATTAATTTTTGAAAT
ATTAAGAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
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Indices: 2132--2566 Score: 427
Period size: 173 Copynumber: 2.5 Consensus size: 176
2122 CTATTTGACC
* * ** *
2132 AATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTCG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA--ACATAC
*
2195 AAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGTGATTT
64 AAGCTTATT--AAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAACTAAGAGATTT
* * **** * * * *
2260 AAAAAGTTAATTTTTTTATCGAATCAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAT
126 AAAAAATAAATCAGCTTACCAAATCAGTTCAAATAATCATGGCCA-TTGAAT
* * * * * ** *
2312 AGTTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTG-TTTCAGTATAAAA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAACATACAA
* * * *
2376 GCTTATGCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAA
66 GCTTAT--TAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAA
* * *
2438 AAATAAATCAGCTTGCCAAATTA-TATCAAATAATTATGGCC-TTGAAT
129 AAATAAATCAGCTTACCAAATCAGT-TCAAATAATCATGGCCATTGAAT
* *
2485 AATTATCTATTTCCAATCATTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCAACATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-CAACATACA
2550 AGCTTATTAAATAAAAT
65 AGCTTATTAAATAAAAT
2567 TGTTATTACC
Statistics
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0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 59 0.28
174 4 0.02
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178 1 0.00
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180 30 0.14
181 17 0.08
ACGTcount: A:0.40, C:0.12, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (176 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAACATACAA
GCTTATTAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAA
ATAAATCAGCTTACCAAATCAGTTCAAATAATCATGGCCATTGAAT
Found at i:4133 original size:17 final size:18
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Indices: 4102--4143 Score: 59
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4092 CACAATTATT
*
4102 AATTATTAATTAAAAATA
1 AATTATTAATAAAAAATA
4120 AATTA-TAATAAAAAATA
1 AATTATTAATAAAAAATA
*
4137 AACTATT
1 AATTATT
4144 TGTTATGTGA
Statistics
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Consensus pattern (18 bp):
AATTATTAATAAAAAATA
Found at i:4237 original size:19 final size:18
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Indices: 4215--4252 Score: 58
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4205 TTCATAATTA
4215 ATAAATAATTAAAATTAAT
1 ATAAATAA-TAAAATTAAT
*
4234 ATAAATCATAAAATTAAT
1 ATAAATAATAAAATTAAT
4252 A
1 A
4253 ATTATATTAT
Statistics
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18 11 0.61
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Consensus pattern (18 bp):
ATAAATAATAAAATTAAT
Found at i:4441 original size:17 final size:16
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Indices: 4401--4450 Score: 61
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4391 ATCTATACAG
4401 TTATAATTAA-TTTAA
1 TTATAATTAATTTTAA
4416 TTA-AA-TAATTTTAA
1 TTATAATTAATTTTAA
4430 TTATCAATTAATTTATAA
1 TTAT-AATTAATTT-TAA
4448 TTA
1 TTA
4451 ATAAAAACTA
Statistics
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13 3 0.10
14 10 0.33
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18 6 0.20
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TTATAATTAATTTTAA
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Indices: 5337--5369 Score: 50
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5327 TATTGATTTC
5337 AAATAG-ATAATTATTG
1 AAATAGCATAATTATTG
5353 AAATAGCCATAATTATT
1 AAATAG-CATAATTATT
5370 TGAACTAATT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
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16 6 0.40
18 9 0.60
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Consensus pattern (17 bp):
AAATAGCATAATTATTG
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Indices: 5295--5733 Score: 531
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5285 TATGATAAAA
* * ** * * * *
5295 AAACAATTATTATATGACCGAACAAAAGGTAATATTGATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGC
* * * * * *
5360 CATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACAAAATCATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAAT
66 CATAACTATTTAAACTAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACTCATTAATTTTTGAAAT
*
5425 ATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
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*
5472 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAA-TATTCAAATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGC
* ** * *
5536 CATAACTATTTAAATTTGTTAAATAAACAAATTAATTTTTTTAAACTCTTGCTCATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTAAACTAATTAAATAAACAAAATAA-TTTTTTAAA-TC--ACTCATTAATTTTTG
* * *
5601 AAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATCTT-GGATAAGCTTTTATGAACTG
127 AAATATTAAGAAATTACTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * *
5652 AAACAATTGTTTTTTTGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * *
5717 TCACAACTATTTGAACT
65 CCATAACTATTTAAACT
5734 TGATTGGTAA
Statistics
Matches: 222, Mismatches: 33, Indels: 9
0.84 0.12 0.03
Matches are distributed among these distances:
176 37 0.17
177 53 0.24
178 2 0.01
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181 41 0.18
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (177 bp):
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGC
CATAACTATTTAAACTAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACTCATTAATTTTTGAAAT
ATTAAGAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
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Indices: 5794--5835 Score: 59
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5784 GAATGTTAAT
*
5794 AATTAAAAGTTTTAAATATTTA
1 AATTAAAAGTTTAAAATATTTA
5816 AATTAAAA-TATTAAAATATT
1 AATTAAAAGT-TTAAAATATT
5836 ATTAGTTAAT
Statistics
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AATTAAAAGTTTAAAATATTTA
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Indices: 6113--6547 Score: 427
Period size: 173 Copynumber: 2.5 Consensus size: 176
6103 CTATTTGACC
* * ** *
6113 AATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTCG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCA--ACATAC
*
6176 AAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGTGATTT
64 AAGCTTATT--AAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-ATAACTAAGAGATTT
* * **** * * * *
6241 AAAAAGTTAATTTTTTTATCGAATCAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAT
126 AAAAAATAAATCAGCTTACCAAATCAGTTCAAATAATCATGGCCA-TTGAAT
* * * * * ** *
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1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAACATACAA
* * * *
6357 GCTTATGCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAA
66 GCTTAT--TAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAA
* * *
6419 AAATAAATCAGCTTGCCAAATTA-TATCAAATAATTATGGCC-TTGAAT
129 AAATAAATCAGCTTACCAAATCAGT-TCAAATAATCATGGCCATTGAAT
* *
6466 AATTATCTATTTCCAATCATTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCCAACATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-CAACATACA
6531 AGCTTATTAAATAAAAT
65 AGCTTATTAAATAAAAT
6548 TGTTATTACC
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Consensus pattern (176 bp):
AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTCAACATACAA
GCTTATTAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTATAACTAAGAGATTTAAAAA
ATAAATCAGCTTACCAAATCAGTTCAAATAATCATGGCCATTGAAT
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Indices: 7152--7193 Score: 59
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7142 CACAGTTATT
*
7152 AATTATTAATTAAAAATA
1 AATTATTAATAAAAAATA
7170 AATTA-TAATAAAAAATA
1 AATTATTAATAAAAAATA
*
7187 AACTATT
1 AATTATT
7194 TGTTATGTGA
Statistics
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0.84 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
17 15 0.71
18 6 0.29
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Consensus pattern (18 bp):
AATTATTAATAAAAAATA
Found at i:8114 original size:17 final size:18
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Indices: 8083--8124 Score: 59
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8073 CACAATTATT
*
8083 AATTATTAATTAAAAATA
1 AATTATTAATAAAAAATA
8101 AATTA-TAATAAAAAATA
1 AATTATTAATAAAAAATA
*
8118 AACTATT
1 AATTATT
8125 TGTTATGTGA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 2
0.84 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
17 15 0.71
18 6 0.29
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Consensus pattern (18 bp):
AATTATTAATAAAAAATA
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Indices: 8363--8412 Score: 61
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8353 ATCTATACAG
8363 TTATAATTAA-TTTAA
1 TTATAATTAATTTTAA
8378 TTA-AA-TAATTTTAA
1 TTATAATTAATTTTAA
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1 TTAT-AATTAATTT-TAA
8410 TTA
1 TTA
8413 ATAAAAACTA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 7
0.81 0.00 0.19
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13 3 0.10
14 10 0.33
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16 2 0.07
17 6 0.20
18 6 0.20
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TTATAATTAATTTTAA
Found at i:9320 original size:16 final size:17
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9289 TATTGATTTC
9299 AAATAG-ATAATTATTG
1 AAATAGCATAATTATTG
9315 AAATAGCCATAATTATT
1 AAATAG-CATAATTATT
9332 TGAACTAATT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
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AAATAGCATAATTATTG
Found at i:9555 original size:177 final size:174
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Indices: 9203--9690 Score: 518
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9193 ACTTACTAAC
** * * ** *
9203 TTTTGAAAGGTTAATAAATTAGTGTTATTTTA-TTC-AGAAGCTTGTATGATAAAAAAACAATTA
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGATAAGCTTGTATGA-AATGAAACAATTG
* * * * * * *
9266 TTATATGACCGAACAAAAGGTAATATTGATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGCCATAATTAT
65 TTTTATGA-CAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTAT
* * * *
9331 TTGAACTAATTCAGTAAACAAAATCATTTTTTAAATCACTTATTAAT
129 TTGAAC-AATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACTCATTAAT
* *
9378 TTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-ATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTG
* *
9443 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAA-TATTCAAATAGCCCTAACTAT
65 TTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTAT
* * *
9507 TT-AA-ATTTAAATAAACAAATTAATTTTTTTAAACTCTTGCTCATTAAT
129 TTGAACAATTAAATAAACAAAATAA-TTTTTTAAA-TC--ACTCATTAAT
* * * * *
9555 TTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATCTTGGATAAACTTTTATGAATTGAAACAATTG
1 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTG
* * * * * *
9620 TTTTTTTGTCAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAACTAT
65 -TTTTATGACAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTAT
9685 TTGAAC
129 TTGAAC
9691 TTGATTGGTA
Statistics
Matches: 261, Mismatches: 39, Indels: 21
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
173 14 0.05
174 9 0.03
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179 2 0.01
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Consensus pattern (174 bp):
TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGATAAGCTTGTATGAAATGAAACAATTGT
TTTATGACAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTT
GAACAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACTCATTAAT
Found at i:9919 original size:17 final size:16
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Indices: 9879--9928 Score: 61
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9869 TTCTATACAG
9879 TTATAATTAA-TTTAA
1 TTATAATTAATTTTAA
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1 TTATAATTAATTTTAA
9908 TTATCAATTAATTTATAA
1 TTAT-AATTAATTT-TAA
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1 TTA
9929 ATAAAAACTA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 7
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Matches are distributed among these distances:
13 3 0.10
14 10 0.33
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16 2 0.07
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TTATAATTAATTTTAA
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10772 TATTGATTTC
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AAATAGCATAATTATTG
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10750 TATATGATCG
* * * * * *
10760 AACAAAAGGTAATATTGATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAACTAATT
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* * * * *
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*
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* * **
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* * * * *
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66 AAATAAACAAAATAATTTTTTTAAACTC-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAACTACTAT
* * * * * * *
11070 TATTTTATCTTGGATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTTTTGTCAA
130 TACTTTATCTTGAAAAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTTATGACAA
* *
11122 AACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACT-ACTATTTGAACT
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11183 TGATTGGTAA
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AACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATT
AAATAAACAAAATAATTTTTTTAAACTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAACTACTATT
ACTTTATCTTGAAAAAACTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTTATGACAA
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*
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1 AATTAAAAAT-TTAAAATATT
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AATTAAAAATTTAAAATATTTA
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11521 AACTAATATT
* * * * * * *
11531 AACAAATTTAAATAGCTATGACTATTTGACCAATTGTCTATTTAAAATTGTTATTACCTTTTG--
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* **
11594 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATT
66 TTTGTCATAAAACAATTCTTTTAGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATT
* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
11775 TTTTTTGCATAAAACAATTCTTTCT-GTTCATGCAAAATTATTCAAAATAAACA-AATATTGATT
65 TTTTGT-CATAAAACAATTCTTT-TAGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAA-ATAAAACTAATT
** * ** *
11838 TATTAACATTCTGAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAGAAA-TAAATCTGTTCA-CTA
127 TATTAACATTCCAAAAATTAAAAACCAAGAGATTT-AA-AAAGTAAAT-TGTTCATCGA
*
11895 AACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTG-T
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
* * * ** * * *
11959 TTTATCATAAAATAATT-TTTCAGTGT-A-A-AAGCTTATGCAAAATAAAATAATACTACTTTAT
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*
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AACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTT
TTTGTCATAAAACAATTCTTTTAGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATT
AACATTCCAAAAATTAAAAACCAAGAGATTTAAAAAGTAAATTGTTCATCGA
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12871 TAAGCAATCC
*
12881 AATAAATTTATTCAT-AATT
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1 AATAAATTAATTATAAATT
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1 AATA
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AATAAATTAATTATAAATT
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12885 AATTTATTCA
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TAATTATAAAT
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13127 ATCTATACAG
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1 TTATAATTAATTTTAA
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13184 TTA
1 TTA
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TTATAATTAATTTTAA
Found at i:14390 original size:180 final size:180
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14022 TATGACAAAA
* * ** * * * ** *
14032 AAACAATTATTATATGACCGAACAAAAGGTAATATTGATTTCAAATAGATAATTATTGGAATAGC
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
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*
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* *
14213 GAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAA-TATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* ** * *
14277 CATAACTATTTGAATTTGTTAAATAAACAAATTAATTTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTTG
66 CATAACTATTTGAACTAATTAAATAAACAAAATAA-TTTTTTAAA-TC--ACTTATTAATTTTTG
* * * *
14342 AAATA-T-T-AAGAAATTAGTATTATTTTATCTT-GGATAAGCTTTTATGAACTG
127 AAATATTATAAAGAAATTACTATTACTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
* * * *
14393 AAACAATTGTTTTTTTGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
*
14458 TCACAACTATTTGAACT
65 TCATAACTATTTGAACT
14475 TGATTGGTAA
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CATAACTATTTGAACTAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACTTATTAATTTTTGAAAT
ATTATAAAGAAATTACTATTACTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
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17370 TATTGATTTC
17380 AAATAG-ATAATTATTG
1 AAATAGCATAATTATTG
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1 AAATAG-CATAATTATT
17413 TGAACTAATT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
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AAATAGCATAATTATTG
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17311 TTTTATTCAG
* * * ** * * *
17321 AAGCTTGTATG-ACAAGAAAACAATTATTATATGACCGAACAAAAGGTAATATTGATTTCAAATA
1 AAGCTTGTATGAAC-TG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATA
* * * * * *
17385 GATAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAACTAATTCAGTAAACAAAATCATTTTTTAAATCA
64 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCA
*
17450 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAAATTACTATTACTTTATTTCGGAT
129 CTTATTAATTTTTGAAATATT-ATAAAGAAATTACTATTACTTTATTTCGGAT
* *
17503 GAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGA
1 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGA
* ** *
17568 TAA-TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTAAATAAACAAATTAATTTTTTTAAACTCT
66 TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTAAATAAACAAAATAA-TTTTTTAAA-TC-
* * *
17632 TGCTTATTAATTTTTGAAATA-T-T-AAGAAATTAGTATTATTTTATCTT-GGAT
128 -ACTTATTAATTTTTGAAATATTATAAAGAAATTACTATTACTTTAT-TTCGGAT
* * * * * *
17683 AAGCTTTTATGAGCTGAAACAATTGTTTTTTTGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAACAA
1 AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG
* *
17748 ATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACT
65 ATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
17781 TGATTGGTAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGA
TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTAAATAAACAAAATAATTTTTTAAATCACT
TATTAATTTTTGAAATATTATAAAGAAATTACTATTACTTTATTTCGGAT
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17831 GATTGTTAAT
*
17841 AATTAAAAATTTTAAATATTTA
1 AATTAAAAATTTAAAATATTTA
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1 AATTAAAAAT-TTAAAATATT
17883 ATTAGTTAAT
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AATTAAAAATTTAAAATATTTA
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19648 TTGGATTATC
*
19658 TAA TAA -AA T-A TATA TAA TAA TAA TAA TAA TAA TAC TAA TAA T
1 TAA TAA TAA TAA TA-A TAA TAA TAA TAA TAA TAA TAA TAA TAA T
19700 TAAATAAGAA
Statistics
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TAA
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19729 ATCTATACAG
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20653 TATTGATTTC
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Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
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AAATAGCATAATTATTG
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20611 TATGACAAAA
* * * * * * *
20621 AAACAATTATTATATGACAGAACAAAAGGTAATATTGATTTCAAATAGATAATTATTGAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGT
* * * *
20686 CATAATTATTTGAACTGATTCAGTAAACAAAATCA-TTTTTTAAA-TC-ACTTATTAATTTTTGA
66 CATAACTATTTGAACTGATTAAATAAACAAAATAATTTTTTTAAACTCTACTTATTAATTTTTGA
* *
20748 AATATTAATAAATAAATTACTATTACTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTG
131 AATA-T--T-AAGAAATTACTATTACTTTATCTT-GAATAAGCTTGTATGAACCG
*
20802 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTAAATAGATAA-TATTCAAATAGT
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* * *
20866 CATAACTATTTGAATTTG-TTAAATAAACAAATTAATTTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTTT
66 CATAACTATTTGAA-CTGATTAAATAAACAAAATAATTTTTTTAAACTC-TACTTATTAATTTTT
* * * *
20930 GAAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATCTTGGATAAGCTTTTATGAACCG
129 GAAATATTAAGAAATTACTATTACTTTATCTTGAATAAGCTTGTATGAACCG
* * *
20982 AAACAATTGTTTTTTGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGT
*
21047 CACAACTATTTGAACTTGATT
66 CATAACTATTTGAAC-TGATT
21068 GGTAAACAGA
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21113 GAATGTTAAT
*
21123 AATTAAAAATTTTAAATATTTA
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21145 AATT-AAAATATTAAAATATT
1 AATTAAAAAT-TTAAAATATT
21165 ATTAGTTAAT
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Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 2
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Matches are distributed among these distances:
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AATTAAAAATTTAAAATATTTA
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* * * * * * *
21207 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTAATTAAAATCATTATGAGCTTTTATTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTATAA
* * * *
21272 TAAAATAATTATTTTATCTCATAAAAGCTTATCCGAAATAAAATAATATTACTTTTAATATTATA
66 TAAAACAATTATTTTATCTCATAAAAGCCTATCAGAAATAAAATAATATAACTTTTAATATTATA
* * * * * *
21337 AAATTTGATATGTTAGATATTTAAAACATAAATTAGTTTATCGAATCAG
131 AAAATTAATAAGTTAGAGAATTAAAAAATAAATTAGTTTATCGAATCAG
* * *
21386 TTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTGTTA
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* * *
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*
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* * * * * *
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* * * *
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** *
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172 -AGTCATA-A-C--T
* * * * * *
28299 TTTTGAA---GTATCAATAAAGTA-ATATTATTTTATTTCAGATAAGCTTTTA-TGAATTGAAAC
1 ATTTGAACTTGT-TCAGTAAA-CAGAT-TTA-TTT-TTT---A-AATCTCTTACT-TATT-----
** * ** * *
28359 AATTGTTTT-ATGATAAAACAAAAAGTTA-TATTTATTTTA-AGT-AGATAA-C-TGT-TCAAAT
51 AATT-TTTTGA--ATATTA-ATAAA-TTAGTA-TTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAACT
* * * ** * * * ** *
28417 -AATC-ATAAGTATT-TG----AAC--TTGTTCGATAAATAATTTTATTTTCTAGA-ATTTGTT-
109 GAAACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-AT-AATGATTTGA---AATAGATAATTGTTC
** *
28471 -GTTA-T--TAATT
168 AAATAGTCATAACT
* * * * ** *
28481 TTTTGAA--TGCTAATTAATTAG-TATTATTTTATTTCAAATAAGCATGTATGAACTAAAAATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGAT-TTA-TTT-TTT-AAAT---C-TCT-T--ACT-----TAT
* * * *** * ** * ** * *
28543 TAATTTATGGCAA-A-CAA-AAGGCCAGAATGGTTTGA-AAT-AGATAA--TTGTTATAATAGTT
50 TAATTTTTTG-AATATTAATAA-ATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTG-TATGA-A-CT
** * * * ** ** * * *
28601 TTAACTATTTGAACTGGTT-TGGCAAACACTTTTATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTAGAAT
109 GAAAC-AATTG---T-TTTATGACAAA-AC----A------AAAGGTCATAATGA-TTTGA-AAT
* * *
28665 ATTATTAATT-TATC-AATA-T-TTGACT
156 A-GA-TAATTGT-TCAAATAGTCATAACT
* ** ** ** * *** * *
28690 -TTGAATAAACTTGTATGCACCAAAACA-ATTGCTTTATGACAAAACAAATA-TCATAACGATTT
1 ATT---TGAACTTGT-T-CA-GTAAACAGATTTATTT-T-TTAAATCTCTTACTTATTA--ATTT
* * * * * * * *
28752 GAGATAGATAATTGTTTAAAAAATCA-TAATTATTTGAACTGGT-TCGATATATAGATT-TA-GT
56 ---TTTG--AA-T-ATTAATAAATTAGT-ATTATTT-TA-T--TCT-GA-ATA-AGCTTGTATGA
** * * * * * * * * * ** *
28813 TTTTAAATTTCTTATTAATTTT-TGA-AATACTAATAA-ATTAGAATTATTTTATTCTAAATAAT
106 ACTGAAA---C-AATT-GTTTTATGACAAAAC-AA-AAGGTCATAATGATTTGA-AATAGATAAT
*
28875 T-TTATATGAATAG--A-AAC-
163 TGTT-CA--AATAGTCATAACT
* ** ** * * * * *
28892 AATTG---TT-TT-ATGATAAAACA-AAATA-TCATAACAAT-T-TCAC-TATTTGAGCTTGTTC
1 ATTTGAACTTGTTCA-G-T-AAACAGATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTTA-TT-A-ATTTTTT
* * * ** *
28947 G---ATGAACAAATT--TATT-TTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATTAA-T-AAA
59 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTT--AT-TCTGA---A-TAA-GCTT-G--TATGAACTGAAA
* * ** *** ** *
29004 TTAGTATTATTTTATTTCAAATA-AACTTGT-ATGAAT-A--T-AAATA-ATTTTTTTATGACAA
113 -CA--ATTGTTTTATGACAAA-ACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGT-T--C--
*
29062 AACAAAAGATCATAA-T
168 -A-AATAG-TCATAACT
* *** * * * * * * * ** *
29078 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTCACTTGGTAAACAGATTTA
1 -ATTTGAACTTGTTCA--G-T-AAACAGAT--TTA-TTTTTTAAATCTC-T--T--ACTTATTAA
* * * * * * * * * * *
29142 TTTCTTAAATCTT--TTACTTATTAATT-TTTGGAATT-TGAATAA-ATTATTATTATTTTATTT
53 TTTTTTGAATATTAATAAATTAGT-ATTATTT--TATTCTGAATAAGCTT-GTATGA----A--C
** * * * ** * **** *
29202 TGAATA-AGCT-TTTTATAAATAGAAATAATTGGT--TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
108 TGAA-ACAATTGTTTTAT-GACA-AAACAAAAGGTCATAATGATTTGA-AATA-G--AT-A--A-
**
29263 TTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTGTTAACT
162 TTG---T----------TCAAATAGTCATAACT
** * * * * *
29296 ATTT-AAAGTGTTAAGAAAAAAAATAAATTATTTAATTTTTAAAT-T-TCACTTATT-A-TTTTT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGAT---TTATTT----TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTT
* * *
29356 GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTCATTC-GAAAATAAACTTGCATGAA-T-AGAACCA-T
59 G-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT-ATTCTG--AATAAGCTTGTATGAACTGA-AACAATT
* *
29416 GTTTTATGAACAAAACAAAATGTCATAATG-TTTG-AATAGATAATTGTTTAAGATAGTCATAAC
118 GTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAAC
29479 T
181 T
* * * * * * * *
29480 ATTTGACCATGTTTAGT-AACAAGATTCATTTTTTAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATAT
* * * * *
29544 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAA
65 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * *
29609 AACAAAAAGTCACAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACT
130 AACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* ** * * * * *
29661 ATTTGAACATGTTC-G-ATAACAAGATTCCTTTTTGAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAATA
1 ATTTGAACTTGTTCAGTA-AAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATA
* * * * *
29724 TTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGTTTATATGAACTGAAACAATTGTTTCATTAC
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * *
29788 AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACT
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * ** * * * * *
29842 AGTTGAACTTATTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATGT-TCTACTTATTAATTGTTGGAATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTTGAATAT
* * * * * *
29906 TAATAAATTAATATT-TTGTTAATCAGAAT-AGCATGTATG-A-TAGAAATAATTATTTTATGAC
65 TAATAAATTAGTATTATT-TTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGAC
* *** * * *
29967 AAAACAAAAAGTCATACCAATTTGAAATAAATAATT-TTCAAATAATCATAAAT
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * ** * * *
30020 ATTTGAAATTATTTAGTAAATGGATTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATGAATTGTCTT-AATA
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-TTTTGAATA
* ** ** * **
30084 TTAATAAATTTGTATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATAATTTTATGACA
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
30149 AAACAGAAGGTTATAGTGATTTCAAATATATAATT-ATCAAAATAGTCAAAATT
129 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACT
* ** * * * *
30202 ATTTAAACTTGTTTGGCAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAT-AATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TTGAATAT
* * * * * *
30266 TAGTAACTTAGTGTTATTTTATT-TCGAATAAGC-TGATAT-AAGTTGAAATAATTTTTTTATGA
65 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTG-TATGAA-CTGAAACAATTGTTTTATGA
* * ** * *
30328 CAAAAGAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACT
127 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * ** * * * * *
30383 ATTT-AATCTAT-TTCGGTAAACATAGTTACATTTTAAATTTTTTACTTATCAA-CTGTTGAAAT
1 ATTTGAA-CT-TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AAT
* ** * * * * * * *
30445 TTTAATAAATTAGTATTATTTTAACCGGGATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTATAAT
63 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC
* ** ** * ** *
30510 AGAACAAAAATTCATAACAATTTGAAATACATAATTACTCAAATAGTCAAAACT
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * *
30564 ATTTGAAATTATT-TGATAAATAGATTTA-TTTTTAAA--TCTT--TTATTAA-TTTTTGAAATA
1 ATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATA
* * * * * ** * *
30622 TTAATATATTAGTATTACTTTATT-TCAAACAAGCTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGAC
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * *
30686 AAAACAAAAGGTCTTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATT
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * *
30740 ATTTGAACTAGTT-AGGTAAACAAAATTGTTTTTTAAA--TC-T-CTTGTTAA-TTTTTGAAATA
1 ATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATA
* * ** ** * * * *
30799 TTAATAAATTAATTTTATTTTATTCCAAATAAGCAAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTTATGA
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAA-TTGTTTTATGA
* * * *
30864 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAACAGATAATTGTTC--ATAGTCTTTAAAT
127 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACT
* * * * * * * *
30918 ATTTGAACTGGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTTAATTCCCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATT
* * * ** ** * *
30983 ATTAGATTAGTATTATTTTATAT-TGAATAAACTTGTATGAACAAAAATGATTGTTTTATGATAG
66 AATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * **
31047 AACAATAGGTTATAATGATTTGAAGTTTATAATTGTTCAAATAGTCAT-A-T
130 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * *
31097 ATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTTGAAAGAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATAT
* * * * *
31157 TAATAAATTAGCATTATTTTATT-TCAAATAAACTTGAATG-A-TGAAAAACAATTGTTATATGA
65 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAATTGTTTTATGA
* * * ** * * * * *
31219 CCAAACAAAAAGGCCGTAATTTTTTGTAAACAGAAAATTGTTCATATAGTCCTAATT
127 CAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * *
31276 GTTTGAAC-TGTTTTAGCAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCCTTA-TTATCAA-CTTTTGAAAT
1 ATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTTG-AAT
* * ** * * * * * * *
31338 AATATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGATACATTTATTTTATAAT
63 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC
* *
31403 AGAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAA---TT---AT--TCA-AA-T
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * *
31447 A--GGAACTGGTTCGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTA-TAAATTTTTGAAATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATAT
* * * * *
31509 TAATAAATTAGCATCATTTTATTTTG---AA---TG-ATGAA---AAATAATTGTTCTATGACAA
65 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAA
* ** ** * * * * *
31564 AACAAAAGTTTGTAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAAT-GAACAAAATT
130 AACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACT
* *** ** * * * *
31616 ATATGAACCAATTACA-TAAATTGACTTATTTTTTAAATCAT-TAACTTGTT-AGTTTTTGAAAT
1 ATTTGAACTTGTT-CAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTATTAATTTTTTG-AAT
* * * * * * **
31678 ATTAAT-AAGTAATATTATTTTATT-TTAGATAAGCTTTTATGAACTGAGACAATTATTTTACAA
63 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA
* * ** * * *
31741 TAAAACAAAAGGTCA-AATTTATTCT-AAATAGATAGCTATTCAAATAGTTATGACT
127 CAAAACAAAAGGTCATAA-TGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * ** *
31796 ATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAAT-TCCTTGTTTATTAATTTTTTGAATG
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTTGAATA
* * * *
31860 TTAATAAATTAATATTATTTTATT-TGGAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGAC
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
31924 TAAACAAAAGGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACT
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * *
31978 ATTTCAACTAGTTC-GATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCCTT-TTTATT-ATTTTTTAGAAT
1 ATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTT-GAAT
* * * * * *
32040 ATT-ATCAATTTAGTAATATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAGCAATTGTTTTATT
63 ATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATG
* * * *
32103 ACAAAAC-AAAGATAATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAAC-
126 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACT
* * * *
32158 ATTTAAAC-CGATTC-GATAAACAGATTTAATTCTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTTGAAAT
1 ATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AAT
* ** ** **
32216 ATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTCT-AATAATTTTGTATGAA-T-AGAACAATCATTTTACAA
63 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGA-AACAATTGTTTTATGA
* ** * *
32278 CAAAAC-AAATGTCATAATGATTTGAAAT--ATAATAATTCAAATAGACATGACT
127 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
** * * *
32330 ATTTGAACTTGTTTGGTAAACA-AATTATTTTTTAAAATCTC-CACCTATTAAATTTTTTAGAAA
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATT-AATTTTTT-G-AA
* ** *
32393 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCCAATAAAATTGTGTGAA-TAGAAAACAATT-TTTTA
62 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACT-G-AAACAATTGTTTTA
* * * * *
32455 TGA-AAGTAACAAAA-AT-ATCAATGA-TTGAAATAAAT-ATTGTTTAAA-GGATCAGAACT
124 TGACAA--AACAAAAGGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACT
* * * * *
32511 ATTTGAACTCGCTT-AGTAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGTATTT
1 ATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATA
* * * *
32573 TTAATAAATTAGTATTACTTTATT-TCGAATAAGCTTTTATGAA-TAGAAACAATTGGTTTCATA
64 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATT-GTTTTATG
** * *
32636 ACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
126 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * *
32692 ATTTAAACGTATTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTAATTAA-TTTTTGAAATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATAT
*
32755 TAATAAATTTA-TATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGCT-TGAA-TAGAACCAATTGTTTTATG
65 TAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTG-TATGAACT-GAAACAATTGTTTTATG
* * * * * *
32816 TCAAAACAAAAGCTCATAATGTTTTAAAATAAATAATTGTTCAGATAGTCATAACT
126 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * *
32872 ATTTGAACATGTT-AG------G---TA------AATTCTCTTACTCATAAATTTTCAT-AATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TTGAATAT
* * *
32920 TAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACA
65 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
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129 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * *
33037 ATTTGAACTTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTAC---TT-ATTTGTTGAAATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATAT
* * * ** * * *
33098 TAATAAATTAATACTT-TTTAAATCCAAATAAACTTGCATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGAC
65 TAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGAC
* * * **
33161 AAAACAAAAAGTCATAA-CAGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAG
128 AAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
** * * * * *
33215 ATTCAAACTTGTCCAATAAATAGATTTATTTTTTAGATC-CTTTACTTATTAATTGTCTT-AATA
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT-TTTTGAATA
* * **
33278 TTAATAAATTTGTATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAAAATCATTTTAT
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* ** * * * * *
33341 GACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAAGAGATAATTATTCAGATAGTCATAATT
125 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * **
33398 ATTTAAACTTGTT-TGTTAAACAAATTCATTTTTTAATTCTCTTAATTATTAACTTTCAGAATAT
1 ATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATAT
* * * * * * *
33462 TAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAACTGAAATGATTTTTTTTATGACA
65 TAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACA
* * *
33527 AAACAAAAGGTCATAA-CACTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACT
129 AAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * * ** * *
33580 ATTTGATCTAGTT-TGGAAA-TGTTACTTAATTTTTAAAAATTTTACTTATTAA-TTGTTGAAAT
1 ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAG--ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AAT
* * *
33642 ATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAC--ATAACTATTGTTTTATAA
63 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGA-AACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
33705 TAGAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGCTT--AA-A-TCATAATT
127 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTCATAACT
*
33757 ATTTGAAC-TGATT-TGATAAACAGATTTATTTTTTGAAAT
1 ATTTGAACTTG-TTCAG-TAAACAGATTTATTTTTT-AAAT
33796 ATTAATAGAT
Statistics
Matches: 8663, Mismatches: 2040, Indels: 1523
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
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162 7 0.00
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224 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATT
AATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAA
ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
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22607 TGCTTGTATG
*
22617 AAAAGAAACAATTATTTTATAACG
1 AAAAGAAACAATTATTTTATAACA
*
22641 AAAAGAAACAATTATTTTATGACA
1 AAAAGAAACAATTATTTTATAACA
22665 AAAA
1 AAAA
22669 ACATAATTAT
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25415 AAACAGATTT
* * *
25425 ATTTTTTAAATCTCTAATTA
1 ATTTTTGAAATATCTAATAA
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1 ATTTTTGAAATATCTAATAA
25464 ATT
1 ATT
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25762 TTGCTCATTA
*
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* * *
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AATAAATTAATTTTTAAATATTTT
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25782 TTTTTAAATA
* * * *** **
25792 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTTTAT
1 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAAATATTTTTATTAAAAATAAGCTTGCAT
* * * * *
25857 GAACAGAAACAATTAGTTTATGACAATATAAAAGATATTATGATTTAAAATGGATAATTGTTTAA
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* *
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* * * * * *
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65 TGAACAGAAA-CAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGAT-ATAATGATTTAAAATAGATAATTGTT
*
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28920 TAACAATTTC
* **
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* * * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
29187 ATTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTTTTATAAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAG
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* **
29252 GTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAGTGTTA
318 GTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * **
29293 ACTATTTAAAGTGTTAAGAAAAAAAATAAATTATTTAATTTTTAAAT-T-TCACTTATT-ATTTT
1 ACTATTTGAACTGTT-CGATAAAAGAT---TTA--T--TTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTT
* * *
29355 TGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTCA-TTCGAAAATAAACTTGCATGAAT-AGAACCA-T
58 TGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT-ATTTC--AAATAAGCTTGTATGAATGA-AACAATT
* * *
29416 GTTTTATGAACAAAACAAAATGTCATAATG-TTTG-AATAGATAATTGTTTAAGATAGTCATAAC
118 GTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA-ATAGTCATAAC
* * * * * * * *
29479 TATTTGACCATGTTTAG-TAACAAGATTCATTTTTT-AATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAAT
181 TATTTGAACTTATTTGGAAAAC-AGATTTATTTTTTAAATT-TC-TACTTATTAATTTTTGGAAT
** * * *
29542 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTAC
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* * * *
29607 AAAACAAAAAGTCACAACTATTTGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATA
308 AAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
** * * * *
29658 ACTATTTGAACATGTTCGATAACAAGATTCCTTTTTGAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAAT
1 ACTATTTGAAC-TGTTCGATAA-AAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAAT
* * * *
29723 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAACTGAAACAATTGTTTCATTAC
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* * * *
29788 AAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAACTTA
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA
* * *
29853 TTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATGTTCTACTTATTAATTGTTGGAATATTAATAAATTAAT
193 TTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
* * * * *
29918 ATT-TTGTTA-ATCAGAAT-AGCATGTATG-ATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGT
257 ATTATT-TTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * *
29979 CATACCAATTTGAAATAAATAATT-TTCAAATAATCATA
320 CATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * ** * *
30017 AATATTTGAAAT-TATTTAGTAAATGGATTTATTTTTTAAAATCT-TTTACTTATGAATTGTCTT
1 ACTATTTGAACTGT-TCGA-TAAA-AGATTTATTTTTT-AAATCTCTTT-CTTATTAATT-T-TT
* ** * **
30080 --AATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATAATTT
59 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTT
* * * * * * *
30142 TATGACAAAACAGAAGGTTATAGTGATTTCAAATATATAATTA-TCAAAATAGTCAAAATTATTT
122 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC-AAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *** *
30206 AAACTTGTTTGGCAAACAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCATAATATTAGTA
186 GAACTTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
* * * * * *
30271 ACTTAGTGTTATTTTATTTCGAATAAGC-TGATAT-AAGTTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAG
250 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG-TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
30334 AAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
313 AAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * ** * * * *
30380 ACTATTT-AATCTATTTCGGTAAACATAGTTACATTTTAAAT-TTTTTACTTATCAACTGTTGAA
1 ACTATTTGAA-CT-GTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTGAA
* ** ** * * *
30443 ATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-ACCGGGATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
62 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTAT
* * * ** ** * * * *
30507 AATAGAACAAAAATTCATAACAATTTGAAATACATAATTACTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAA
125 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * *
30572 TTATTT-GATAAATAGATTTA-TTTTTAAA--TCT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATATATT
190 TTATTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
* * * * * * * *
30632 AGTATTACTTTATTTCAAACAAGCTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAAAAGG
254 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * *
30697 TCTTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATA
319 TCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * *
30737 ATTATTTGAACTAGTTAGGTAAACAAAATTGTTTTTTAAA--TC--TCTTGTTAATTTTTGAAAT
1 ACTATTTGAACT-GTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAAT
* * * ** * * *
30798 ATTAATAAATTAATTTTATTTTATTCCAAATAAGCAAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTTATG
64 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-T-GAAACAA-TTGTTTTATG
* * * * *
30863 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAACAGATAATTGTTC--ATAGTCTTTAAATATTTGAAC
126 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAAC
** ** * * * * * * *
30926 TGGTTCAGCAAATAAATTTATTTTTT-AATTCCCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGAT
190 TTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATT-TC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT
* * * ** * * *
30990 TAGTATTATTTTATATT-GAATAAACTTGTATGAACAAAAATGATTGTTTTATGATAGAACAATA
253 TAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * **
31054 GGTTATAA-TGATTTGAAGTTTATAATTGTTCAAATAGTCAT-
317 GGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* *
31095 A-TATTTGAACTAGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTGAAAG
1 ACTATTTGAACT-GTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAAT
* * * *
31155 ATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAACTTGAATG-ATGAAAAACAATTGTTATATGA
64 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATG--AAACAATTGTTTTATGA
* * * ** * * * * * * *
31219 CCAAACAAAAAGGCCGTAATTTTTTGTAAACAGAAAATTGTTCATATAGTCCTAATTGTTTGAAC
127 CAAAAC-AAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * * * * *
31284 TGT-TTTAGCAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCCTTA-TTATCAACTTTTGAAATAATATTAAA
190 T-TATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
* * * * * * * * * *
31347 TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAATTGATACATTTATTTTATAATAGAACAAAA
252 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * *
31412 GGTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG---GA
317 GGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
31451 AC----TG----GTTCGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCCTACTTATAAATTTTTGAAATA
1 ACTATTTGAACTGTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAATA
* * * *
31508 TTAATAAATTAGCATCATTTTATTT----TGAA---TG-ATGAA--AAATAATTGTTCTATGACA
65 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACA
* ** ** * * * * * *
31563 AAACAAAAGTTTGTAACAATTTTAAATAGATAATTATTCAAAT-GAACAAAATTATATGAAC-CA
129 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTA
* ** ** * * * * * *
31626 ATTACATAAATTGACTTATTTTTTAAATCATT-AACTTGTTAGTTTTTGAAATATTAAT-AAGTA
193 TTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAAT--TTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
* * * * * ** *
31689 ATATTATTTTATTT-TAGATAAGCTTTTATGAACT-GAGACAATTATTTTACAATAAAACAAAAG
255 GTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* ** * * *
31752 GTCA-AATTTATTCT-AAATAGATAGCTATTCAAATAGTTATG
318 GTCATAA-CTATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
*
31793 ACTATTTGAACTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTTAAAT-TCCTTGT-TTATTAATTTTTTG
1 ACTATTTGAAC-TGTTCGATAAA-AGATTTA-TTTTTTAAATCT-CTT-TCTTATTAA-TTTTTG
* * ** * * *
31856 -AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTGGAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTA
60 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
31920 TGACTAAACAAAAGGTAAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTCAA
124 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * ** * *
31985 C-TAGTTCGATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCCTTTTTATTATTTTTTAGAATATT-ATCAA
189 CTTATTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AA
* * * * * *
32048 TTTAGTAATATTTTACTCCGAATAAGCTTGTATGAACA-AAAGCAATTGTTTTATTACAAAAC-A
251 ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * *
32111 AAGATAATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
315 AAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-A
* * * *
32156 AC-ATTTAAACCGATTCGATAAACAGATTTAATTCTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTGAAAT
1 ACTATTTGAACTG-TTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAAT
* * ** ** **
32216 ATTAATAAGTTAGTATTATTTTA-TTCTAATAATTTTGTATGAAT-AGAACAATCATTTTACAAC
64 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATGA-AACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
32279 AAAAC-AAATGTCATAATGATTTGAAAT--ATAATAATTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTG
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA
* * * * * *
32341 TTTGGTAAACA-AATTATTTTTTAAAATCTCCACCTATTAAATTTTTTAGAAATATTAATAAATT
193 TTTGGAAAACAGATTTATTTTTT-AAATTTCTACTTATT-AA-TTTTT-GGAATATTAATAAATT
* ** *
32405 AGTATTATTTTATTTCCAATAAAATTGTGTGAATAGAAAACAATT-TTTTATGA-AAGTAACAAA
254 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAA--AACAAA
* * * * *
32468 A-AT-ATCAA-TGA-TTGAAATAAAT-ATTGTTTAAA-GGATCAGA
316 AGGTCAT-AACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATA
* * *
32508 ACTATTTGAACTCGCTTAG-TAAACAAATTTA-TTTTTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTGTA
1 ACTATTTGAACT-G-TTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTGAA
* * * * * *
32570 TTTTTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAATAGAAACAATTGGTTTCAT
62 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATT-GTTTTAT
* ** * *
32635 AACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
125 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * *
32700 GTATTTAGAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTT
190 TTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA-TT
* *
32765 A-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGCT-TGAATAGAACCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAA
254 AGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTG-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * *
32827 GCTCATAA-TGTTTTAAAATAAATAATTGTTCAGATAGTCATA
317 GGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * *
32869 ACTATTTGAACATG-T---T---AG--GTA------AATTCTCTTACTCA-TAAATTTTCATAAT
1 ACTATTTGAAC-TGTTCGATAAAAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGA-AAT
* *
32918 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTAC
64 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * *
32983 AAAACAAAATGTTACAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATACTCATGACTATTTGAACTTG
128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA
** * * * * * *
33048 TTCAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTA-T--TTGTTGAAATATTAATAAATTAAT
193 TTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * *
33110 ACTT-TTTAAATCCAAATAAACTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTC
257 A-TTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
*
33174 ATAAC-AGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATA
321 ATAACTA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
** ** * * *
33212 AAGATTCAAACTTGTCCAATAAATAGATTTATTTTTTAGATC-CTTTACTTATTAATTGTCTT--
1 ACTATTTGAAC-TGTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATT-T-TTGA
* * * **
33274 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTT
61 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-G--AAACAATTGTTTT
* ** * * * * *
33339 ATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAAGAGATAATTATTCAGATAGTCATAATTATTTAA
123 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * * **
33404 ACTTGTTTGTTAAACAAATTCATTTTTT-AATTCTCTTAATTATTAACTTTCAGAATATTAATAA
188 ACTTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATT-TC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAA
* * * * * * *
33468 CTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATAAACT-GAAATGATTTTTTTTATGACAAAACA
251 ATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACA
* *
33532 AAAGGTCATAAC-ACTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATG
314 AAAGGTCATAACTA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * * * ** *
33577 ACTATTTGATCTAGTTTG-GAAATGTTACTTAATTTTTAAAAAT-TTTACTTATTAATTGTTGAA
1 ACTATTTGAACT-GTTCGATAAAAG--ATTTATTTTTTAAATCTCTTT-CTTATTAATTTTTGAA
* * * *
33640 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGTATGAA-CATAACTATTGTTTTAT
62 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATGA-AACAATTGTTTTAT
* * * * * * * *
33703 AATAGAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGCTT--AA-A-TCATAATTATTTGAA
125 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * *
33764 CTGATTT-GATAAACAG-------------A----T--TTA-T--TTTTTGAAATATTAATAGAT
189 CTTATTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT
* * * * * * * * *
33806 TAGTATTCTTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAG
253 TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * *
33871 GTCCTACCAATTTGAAAAACATAATTGTTTAAATAGTCATA
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* * * * * *
33912 ACTATTTGAACTGGTTAGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTATTAT-ATATTAATTTTT-TAA
1 ACTATTTGAACT-GTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTT-TCTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * *
33975 TATGAATAAATT--CATT-TTTTATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAATTGTTTAATGA
63 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGA
*** * * *
34037 C--AAC--AA----A-AATGATTTGAAATAGATAAAGGTTCATATATTCTTAACTATTTGAAC-T
127 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
** * * * * ** **
34092 AGTTTGGCTAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTAGTAATTTTTGGAATATTTTTGTATTA
192 A-TTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCT-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
* * * * * *
34157 GTATTATTTTATTTCGATTAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAAGGT
255 GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * *
34222 TATAACTATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATA
320 CATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * * * *
34261 ACTATTTAAACTATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC--TCTTATTAATTTTTGAGAGA
1 ACTATTTGAACTGTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * ** *
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65 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-T-GAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * * *
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128 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTT
* * *
34451 ATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA--TC--CTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGT
192 ATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
* * ** * *
34511 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTGTGAATTTAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTA
257 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* * *
34576 TAA-TGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATA
322 TAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * *
34613 ACTATTTGAATTTGTTC-AGTAAACTA-ATTTATTTTTTAAA-CTATTGCTTATTAATTTTTGAA
1 ACTATTTGAA-CTGTTCGA-TAAA--AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAA
* * * * * * *
34675 ATATTGAGAAATTAGTATTATTTT-TTT--TATAAGATTTTATGAACTGAAGCAATTATTTTAT-
62 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATG
* * *
34736 ATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAAC
126 A-CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * * *
34801 TT-GTTCGATAAATAGATTTATTTCTTCAAATCTTTTTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATA
190 TTATTTGGA-AAACAGATTTATTT-TTTAAA---TTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
* * * * * * ** * *
34865 AATTTGGATTATTTTATTCCGAATAAGATTGTAAG-ATATGCAACAAATAATTTT-TAACCAAAC
250 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAAC-AATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * **
34928 AAAAGGTTAGAA-TGATTTAAAATATATAATTATT-ATAATAGTTTTA
313 AAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATA
* ** * *
34974 ACTATTTGAACTGGCTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAA
1 ACTATTTGAACT-GTTCGATAAA-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * * *
35038 TATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAATGAAATAAGC-TCTATGATTAGAAATAATTGTTTTATG
63 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATG
* * ** * * * * *
35101 ACAAAAC-AAAGATCTTAACAATTT-AAGATTA-ATAATTGCTT-AAATAGTTACAATTA-TTCA
126 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-A-TAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * *
35161 AATTGGTTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTT-T--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
188 ACTTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAT
* *
35223 TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAA
253 TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * *
35287 GGTCATAA-TGATTTGAAATATATAATTGTTCATATAATC-TT
317 GGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
* * ** * * * ** *
35328 ACTATTTGAAATGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT-AGAA
1 ACTATTTGAACT-GTTCGATAA-AAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGA-AA
* * * ** * * *
35392 TATTATTAAATTAGTATTATATTATTTCTAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGA
63 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
35457 CAAAATAAAATGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATG
127 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * * * * ***
35522 GTTTGGTAAATAGTTTTA-CTTTTAAATCTCTTA-TTGATTGATATTCAAAATATTAATAAATTA
192 ATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTC-TACTT-ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
35585 GTATT-TTTTATTT
255 GTATTATTTTATTT
35598 TGAACAAATT
Statistics
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322 2 0.00
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TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
TATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA
Found at i:30452 original size:722 final size:721
Alignment explanation
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28982 TAATTTTTAG
* * * *
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* * *
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* * * * *
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* ** * * **
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* * * ** * *
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255 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAAAGTATTAAGAAA
* *
29314 AAAAATAAATTATTTAATTTTTAAATTTCACTTATTATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTA
320 AAAAAT--ATTATTT-ATTTTAAAATTTCACTTATAATTTTT-AAATATTAATAAATTTATATTA
* * ** * *
29379 TTTTCATTCGAAAATAAACTTGCATGAATAGAACCATGTTTTATGAACAAAACAAAATGTCATAA
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* * * * * * * *
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* ** ** *
29509 TTTTTAATTCTCTTTCTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAAATA
511 TTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATA
* * *
29574 AGCTTATATGAATTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAAGTCACAACTATTTGAAATAGAT
576 AGCTGATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTTGAAATAGAT
* * * * * *
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641 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGATAACAAGATTACATTTTAAATTCTCTT
* * * *
29704 TCTCATTAATTTTTGG
706 TCTCATCAACTGTTGA
** *
29720 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAACTGAAACAATTGTTTCAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
29785 TACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTAGTTGAAC
66 AACAAAACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* *
29850 TTATTTGGAAAACATATTTATTTTTTAAATGTTCTACTTATTAATTGTTGGAATATTAATAAATT
131 TTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
* * * *
29915 AATATT-TTGTTAATCAGAATAGCATGTATGATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGT
195 AATATTATT-TTATTCAGAATAGCTTATATGATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * * ***
29979 CATACCAATTTGAAATAAATAATT-TTCAAATAATCATAAATATTTGAAATTATTTAGTAAATGG
259 CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAAAGTATTAAGAAAAAAA
* *
30043 AT-TTA-TT-TTTTAAAATCTTTTACTTATGAATTGTCTT-AATATTAATAAATTTGTATTATTT
324 ATATTATTTATTTTAAAA--TTTCACTTAT-AATT-T-TTAAATATTAATAAATTTATATTATTT
* * * * *
30104 T-ATTC-AAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAAATAATTTTATG-ACAAAACAGAAGGTTATAGT
384 TCATTCGAAAATAAACTTGCATGAA-AAAAAAAAT-ATTTTATGAACAAAACAAAAGGTCATAAT
* * * *
30166 GATTTCAAATATATAATT-ATCAAAATAGTCAAAATTATTTAAACTTGTTTGGCAAAC-AGATTC
447 G-TTT-AAATAGATAATTGATCAAAATAGTCAAAACTATTTAAACATGTTTAG-AAACAAGATTC
* * * * * *
30229 ATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCATAATATTAGTAACTTAGTGTTATTTTATTTCGAA
509 ATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
* * * * *
30294 TAAGCTGATAT-AAGTTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTCATAACAATTTGAAATA
574 TAAGCTGATATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTTGAAATA
* *
30358 GATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTT-AATCTAT-TTCGGTAAACATAG-TTACATTTTAAA
638 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-C-ATGTTCGAT-AACA-AGATTACATTTTAAA
*
30420 TT-T-TTTACTTATCAACTGTTGA
699 TTCTCTTT-CTCATCAACTGTTGA
* ** ** *
30442 AATTTTAATAAATTAGTATTATTTTA-ACCGGGATAAACTTATATGAACAGAAACAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTA
* * ** * * *
30506 TAATAGAACAAAA-ATTCATAACAATTTGAAATACATAATTACTCAAATAGTCAAAACTATTTGA
65 TAACAAAACAAAAGATT-ATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
30570 AATTATTT-GATAAATAGATTTA-TTTTTAAA--TCT-TTTATTAATTTTTGAAATATTAATATA
129 ACTTATTTGGA-AAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
* * * * *
30630 TTAGTATTACTTTATTTCA-AACAAGCTTATATGA-ACAAAAACATTTATTTTATGACAAAACAA
193 TTAATATTATTTTA-TTCAGAA-TAGCTTATATGATAGAAATA-A-TTATTTTATGACAAAACAA
* * * * *
30693 AAGGTCTTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTG-AACTAGTTAGGT
254 AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAAAGTA-TTAAGA
* * * * * *
30757 AAACAAA-ATT-GTT-TTTT-AAA--TCTCTTGTTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTA
318 AAAAAAATATTATTTATTTTAAAATTTCACTT-ATAATTTTT-AAATATTAATAAATTTATATTA
* * ** * *
30816 TTTT-ATTC-CAAATAAGCAAGTATGAATTCAAAAAAACTTATTTTATG-ACAAAACAAAAGGTC
381 TTTTCATTCGAAAATAAACTTGCATGAA---AAAAAAA-ATATTTTATGAACAAAACAAAAGGTC
* * * * * *
30878 ATAACGATTTGAAACAGATAATTGTTC---ATAGTCTTTAAA-TATTTGAAC-TGGTTCAGCAAA
442 ATAATG-TTT-AAATAGATAATTGATCAAAATAGTC--AAAACTATTTAAACAT-GTTTAG-AAA
* * * * * * ** * *
30938 TAA-ATTTATTTTTTAATTCCCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATTATTAGATTAGTATTATTTT
501 CAAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * *** ** * * * * * * **
31002 ATATT-GAATAAACTTG-TATGAACAAAAATGATTGTTTTATGATAGAACAATAGGTTATAATGA
566 AT-TTCAAATAAGC-TGATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAA
* ** * * *
31065 TTTGAAGTTTATAATTGTTCAAATAGTCAT-A-TATTTGAAC-TAGTTCAATAA-ATAGATTTAT
629 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTCGATAACA-AGA-TTAC
* * * *
31126 TTTTTAAA-TCTC--T-T-ATTAATTTTTGA
691 ATTTTAAATTCTCTTTCTCATCAACTGTTGA
* * *
31152 AAGATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCAAATAAACTTGA-ATG-A-TGAAAAACAATTGTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTT-ATATGAACTG--AAACAATTGTTT
* * **** ** * * * * * *
31214 TATGACCAAACAAAAAGGCCGTAATTTTTTGTAAACAGAA-AATTGTTCATATAGTCCTAATTGT
63 TATAACAAAAC-AAAAGATTATAATGATTTG-AAATA-AATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * *
31278 TTGAACTGT-TTTAGCAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCCTTA-TTATCAACTTTTGAAATAAT
125 TTGAACT-TATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTC-TACTTATTAATTTTTGGAATATT
* * * * * * * * *
31341 ATTAAATTAGTATTATTTTATTCCA-AATAAGCTTATATGAATTGATACATTTATTTTATAATAG
187 AATAAATTAATATTATTTTATT-CAGAAT-AGCTTATATG-ATAGAAATAATTATTTTATGACAA
* * * ** *
31405 AACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC--A-AAT-A-GGA-A-CTG---G--TT
249 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAAAGTATT
** * * * *
31458 CGGTAAACAGA-ATTA-TT-TTTT-AAATCTCCTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAA-TT
314 AAGAAAAAAAATATTATTTATTTTAAAAT-TTC-ACTTAT-AATTTTT-AAATATTAATAAATTT
* * * * * * * *
31518 AGCATCATTTT-ATT-----TTGAA--TG-ATG-AAAAATAATTGTTCTATG-ACAAAACAAAAG
375 A-TATTATTTTCATTCGAAAATAAACTTGCATGAAAAAAAAAATATTTTATGAACAAAACAAAAG
* * * * * * * *
31572 TTTGTAACAAT-TTTAAATAGATAATT-ATTC-AAAT-GAACAAAATTATATGAACCA--ATTAC
439 ---GTCATAATGTTTAAATAGATAATTGA-TCAAAATAG-TCAAAACTAT-TTAAACATGTTTAG
* * ** * * * *
31631 ATAA-ATTGACTT-ATTTTTTAAATC-ATTAACTTGTTAGTTTT-TGAAATATTAAT-AAGTAAT
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* * ** * * * ** * *
31691 ATTATTTTATTTTAGATAAGCTTTTATGAACTGAGACAATTATTTTACAATAAAACAAAAGGTCA
558 ATTATTTTATTTCAAATAAGCTGATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCA
** ** * * * *
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623 CAA-CAATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGATAACA-A
** * * * *
31818 GATTTATTTTTTTAAATTC-CTTGT-TTATTAATTTTTTG-
685 GA-TTA-CATTTTAAATTCTCTT-TCTCATCAA-CTGTTGA
* * ** * * * * *
31856 AATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTTGGAATAAGCATGTATGAACTAAAACAATTATTTTAT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * * *
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* * * * ** * * *
31986 -TAGTTCGATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCCTTTTTATTATTTTTTAGAATATT-ATCAAT
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* * * * * * * * *
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193 TTAATATTATTTTATTCAGAAT-AGCTTATATGATA-GAAA-TAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * * * *
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* * * *
32174 TAAACAGAT-TTA---ATTCTT-AAA--TCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAGTTAGTA
318 -AAAAAAATATTATTTATT-TTAAAATTTCACTTA-TAATTTTT-AAATATTAATAAATTTA-TA
* ** * * * * * *
32231 TTATTTT-ATTC--TAATAATTTTGTATGAATAGAACAATCATTTTA-CAACAAAAC-AAATGTC
378 TTATTTTCATTCGAAAATAAACTTGCATGAAAAAAAAAAT-ATTTTATGAACAAAACAAAAGGTC
* * ** * * *
32291 ATAATGATTTGAAAT--ATAA-TAATTC-AAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACA
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* * *
32352 A-ATT-ATTTTTTAAAATCTC--CACCTATTAAATTTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
503 AGATTCATTTTTT-AAATCTCTTAATC-ATT-AA-TTTTCAG-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* ** * *
32413 TTTATTTCCAATAAAATTG-TGTGAATAGAAAACAATT-TTTTATGA-AAGTAACAAAAA-T-AT
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** * * * * * *
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32533 A-ATTTA-TTTTTAAA-TCT-TTTACTTATTAATTTTTGT
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* * * * * *
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255 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAA-AGTATTAAGAA
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* * ** * * * *
32998 AATGATTTGAAATAAATAATT-ATTC-AAATACTCATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAAC-AT
444 AATG-TTT-AAATAGATAATTGA-TCAAAATAGTCAAAACTATTTAAACATGTTTAG-AAACAAG
* * * * * * *
33060 ATTTATTTTTTAAATCT-TTTA-C-TTATTTGTTGA-AATATTAATAAATTAATACTT-TTTAAA
505 ATTCATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATT-TTCAGAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTAT
* * * * * * *
33120 TCCAAATAAACTTG-CATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAGTTT
568 TTCAAATAAGC-TGATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTT
* * ** ** * * * **
33184 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTCAAACTTGTCCAATAA-ATAGATTTATTTTT
632 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGATAACA-AGA-TTACATTT
* * * * *
33248 TAGA-TC-CTTTACTTATTAATTGTCT-T
695 TAAATTCTCTTT-CTCATCAACTGT-TGA
* * * * * **
33274 AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAAAATCATTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAACT-G--AAACAATTGTTT
* * ** * * * * * *
33338 TATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAAGAGATAATTATTCAGATAGTCATAATTATTTA
63 TATAACAAAACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * * **
33403 AACTTGTTTGTTAAACAAATTCATTTTTT-AATTCTCTTAATTATTAACTTTCAGAATATTAATA
128 AACTTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATT-TC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA
* * ** * * *
33467 ACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATAT-AAACTGAAATGATTTTTTTTATGACAAAAC
191 AATTAATATTATTTTATTCAGAAT-AGCTTATATGATA--GAAAT-AATTATTTTATGACAAAAC
* * * * *
33531 AAAAGGTCATAAC-ACTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGT-TT
252 AAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGA--AAGTATT
* *** * * * *
33594 --G-GAAATGTTACTTAATT-TTTAAAAATTTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAA-TTA
314 AAGAAAAAAAATA-TTATTTATTTTAAAATTTCACTTA-TAATT-TTTAAATATTAATAAATTTA
* * * * ** * * * *
33654 GTATTATTTT-AATCTG--AATAAGCTTGTATGAACATAACTATTGTTTTAT-AATAGAACAAAA
376 -TATTATTTTCATTC-GAAAATAAACTTGCATGAA-AAAAAAAATATTTTATGAACAAAACAAAA
* * * ** * * *
33715 AGTCATAATAATTTGAAATAAATAATTG--CTTAA-A-TCATAATTATTTGAAC-TGATTT-G--
438 GGTCATAAT-GTTT-AAATAGATAATTGATCAAAATAGTCAAAACTATTTAAACATG-TTTAGAA
* * * * *
33772 ATAA-A--C-------AGA----TT--T-ATT--TTTTGA-AATATTAATAGATTAGTATTCTTT
500 ACAAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * *** * * *
33817 TATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-CTACCAA
565 TATTTCAAATAAGCTGATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAC-AACAA
* * * * * * *
33881 TTTGAAAAACATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGGTAA-ACAGAATTAT
629 TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTCGATAACA-AG-ATTAC
* * * * * **
33944 TTTTTAAA-TCTATTATAT-ATTAA-TTTTTT
691 ATTTTAAATTCTCTT-TCTCATCAACTGTTGA
* * * * * * * *
33973 AATATGAATAAATT--CATT-TTTTATTCCAAATAAGC-TAGTATAAATTGAAAAAATTGTTTAA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTA-TATGAACTGAAACAATTGTTTTA
* * *** * * *
34034 TGAC--AAC---A-A--A-AATGATTTGAAATAGATAAAGGTTCATATATTCTTAACTATTTGAA
65 TAACAAAACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** * * * * ** **
34090 C-TAGTTTGGCTAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTAGTAATTTTTGGAATATTTTTGTA
130 CTTA-TTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCT-ACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
* * * * * * * *
34154 TTAGTATTATTTTATTTC-GATTAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAA
193 TTAATATTATTTTA-TTCAGAAT-AGCTTATATG-ATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * * *
34218 AGGTTATAACTATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAACTATT-TGATA
255 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAAAGTATTAAGA-A
* * * * *
34281 AATAGAT-TTA-TT-TTTT-AAA--TCTCTTATTAATTTTTGAGAGATTAATAAA-TTACTATTA
319 AAAAAATATTATTTATTTTAAAATTTCACTTA-TAATTTTT-AAATATTAATAAATTTA-TATTA
* * * **
34339 TTTT-ATTTCG--AATAAACTTGTAT-AATTAAAAACAAT-TGTTACATG-ATGAAACAAAAGGT
381 TTTTCA-TTCGAAAATAAACTTGCATGAA--AAAAAAAATAT-TT-TATGAACAAAACAAAAGGT
* ** * * ** * *
34398 AATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTGAAATGGCCACAATTTATTTGAAC-TGATTTGGTAAA
441 CATAATG-TTT-AAATAGATAATTGATCAAAATAGTCA-AAACTATTTAAACATG-TTTAG-AAA
* *
34461 C-AGATTCACTTTTTAAATC-C-T--T-ATTAATTTT-GGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
501 CAAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * * * * **
34519 ATTTTGAATAAGCTTG-TGTGAATTTAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGAT
566 ATTTCAAATAAGC-TGATATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAAT
* * * * ** * **
34583 TTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTC-AGTAAACTAA-TTTATT
630 TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGA-T-AAC-AAGATTACA
* * * * * *
34646 TTTTAAA--CTATTGCTTATTAATTTTTGA
692 TTTTAAATTCTCTTTCTCATCAACTGTTGA
* * * * * *
34674 AATATTGAGAAATTAGTATTATTTT-TTT--TATAAGA-TTTTATGAACTGAAGCAATTATTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ACTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTA
* * * * *
34735 TATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAA
65 TAACAAAACAAAAGATTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * *
34800 CTT-GTTCGATAAATAGATTTATTTCTTCAAATCTTTTTTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAAT
130 CTTATTTGGA-AAACAGATTTATTT-TTTAAA---TTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT
*** * * * * * * *
34864 AAATTTGGATTATTTTATTCCGAATAAGATTGTAAGATATGCAACA-AATAATTTT-TAACCAAA
190 AAATTAATATTATTTTATTCAGAAT-AGCTTATATGATA-G-AA-ATAATTATTTTATGACAAAA
* * * * * * * ** * * **
34927 CAAAAGGTTAGAATGATTTAAAATATATAATTATT-ATAATAGTTTTAACTATTTG-AACTGGCT
251 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAATCATAAATATTTGAAAGT-ATT
** * * * * *
34990 CGGCAAACACAT-TTA-TT-TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTATTAAA-TT
314 AAGAAAAAAAATATTATTTATTTTAAAAT-T-TCACTTA-TAATTTTTA-AATATTAATAAATTT
* * * * * * *
35050 AGTATTATTTTTAAT-G-AAATAAGC-T-CTATGATTAGAAATAATTGTTTTATG-ACAAAAC-A
375 A-TATTATTTTCATTCGAAAATAAACTTGC-ATGA--AAAAAAAAATATTTTATGAACAAAACAA
* * ** * * * * * * * * *
35109 AAGATCTTAACAATTTAAGATTA-ATAATTGCT-TAAATAGTTACAATTATTCAAA-TTGGTTCG
436 AAGGTCATAA-TGTTTAA-A-TAGATAATTGATCAAAATAGTCAAAACTATTTAAACATGTTTAG
* * *
35171 TAAAC-AGATTTATTTTTTAAAT-T-TT--TTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATT
498 -AAACAAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATCATTAATTTTCAG-AATATTAATAAATTAGTATT
* ** * * *
35230 ATTTTATTTCGAATAAGCTTG-TATG-ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCAT
561 ATTTTATTTCAAATAAGC-TGATATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCAC
** * * * * * * ** **
35293 AATGATTTGAAATATATAATTGTTCATATAATC-TTACTATTTGAA-ATGGTTTGGCAATTAGAT
624 AACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTCGATAACAAGA-
* * * ** * * * *
35356 TTA-TTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGT-TTTA
687 TTACATTTTAAATTCTCTTTCTCATCAACTGTTGA
* * * * *
35389 GAATATTATTAAATTAGTATTATATTATTTCTAATAAA-ATAGTATGAA-TAGAACCAATTGTTT
1 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTA-TATGAACT-GAAACAATTGTTT
* * * * * *
35452 GATGACAAAATAAAATG-TTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTT
63 TATAACAAAACAAAA-GATTATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
35516 GAA
127 GAA
35519 ATGGTTTGGT
Statistics
Matches: 4458, Mismatches: 947, Indels: 797
0.72 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
678 5 0.00
679 55 0.01
680 35 0.01
681 7 0.00
682 7 0.00
683 7 0.00
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690 1 0.00
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695 1 0.00
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TTATTTGGAAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
ATATTATTTTATTCAGAATAGCTTATATGATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
TAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAAAGTATTAAGAAAAAAAAT
ATTATTTATTTTAAAATTTCACTTATAATTTTTAAATATTAATAAATTTATATTATTTTCATTCG
AAAATAAACTTGCATGAAAAAAAAAATATTTTATGAACAAAACAAAAGGTCATAATGTTTAAATA
GATAATTGATCAAAATAGTCAAAACTATTTAAACATGTTTAGAAACAAGATTCATTTTTTAAATC
TCTTAATCATTAATTTTCAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTGATATG
AATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCACAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGATAACAAGATTACATTTTAAATTCTCTTTCTCATCAAC
TGTTGA
Found at i:32409 original size:178 final size:174
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * *
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* *** * *
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** *** * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * * *
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124 AAATAAATAA---TTCAAATAGACAT-AACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACA-AA
* * * * *
32183 TTAATTCTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTA-TTCTA
1 TTATTTTTTAAATCTTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
* * * *
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* *
32308 AATAATTCAAATAGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAA
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**
32354 TTATTTTTTAAAATCTCCACCTATTAAATTTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 TTATTTTTT-AAATCTTTACCTATT-AA-TTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
32419 TCCAATAAAATTGTGTGAATAGAAAACAATTTTTTATGAA-AGTAACAAAAAT-ATCAATGA-TT
62 TCAAATAAATTTGTATGAATAG-AAACAATGTTTTAT-AACA-AAACAAAAGTCAT-AATGATTT
* * * * * *
32481 GAAATAAATATTGTTTAAA-GGATCAGAACTATTTGAACTCGCTTAGTAAACAAA
123 GAAATAAATA--ATTCAAATAGA-CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAA
* * * * *
32535 TT-TATTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGTATTTTTAATAAATTAGTATTACTTTATTTC
1 TTAT-TTTTTAAATC-TTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * ** *
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64 AAATAA-ATTTGTATGAATAGAAACAA-T-GTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGA
* * * * * *
32663 AATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACGTATTTAGAAAACAAA
125 AAT--A-AATAATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAA
*
32716 TTTATTTTTTAAATTTTTA-CTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TT
1 -TTATTTTTTAAATCTTTACCT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTT
** * ** * *
32778 CGAAATAAGCTTGCT-TGAATAGAACCAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGCTCATAATGTTTTA
63 C-AAATAAATTTG-TATGAATAGAAACAA-TGTTTTATAACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTG
* * *
32842 AAATAAATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAACATG-TTAGGT----AAA
124 AAATAAATAA---TTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTA-GTAAACAAA
* * * *
32892 -T-TCTCTT--A-C--T--C-A-TAAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
1 TTATTTTTTAAATCTTTACCTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
** * * * *
32946 AATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAATGTTACAATGATTTGAAA
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** * * * *
33010 TAAATAATTATTCAAATACTCATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAACATAT
127 TAAAT-A--ATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA-AA
* * * *
33062 TTATTTTTTAAATCTTT---TACTT-ATTTGTTGAAATATTAATAAATTAATACTT-TTTAAATC
1 TTATTTTTTAAATCTTTACCTA-TTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTT
* * * * *
33122 CAAATAAACTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-CAGTTTGA
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* ** ** ** * * *
33186 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAAAGATTCAAACTTGTCCAATAAATAGAT
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* * *
33240 TTATTTTTTAGATCCTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTT
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* ** * * * * **
33303 GAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTC
63 CAAATAAATTTGTATGAATAG--AAACAAT-GTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTT-
* * * * * * *
33368 AAAGAGATAATTATTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTT-GTTAAACAAA
123 GAA-ATA-AATAATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAA
* ** * * *
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** ** * * * * * * *
33486 TGAATAAGCTTATATAAACT-GAAATGATTTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CACTTT
63 CAAATAAATTTGTATGAA-TAGAAA-CA-ATGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGA-TTT
* * * * * * ** *
33549 GAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTT-GGAAATGTTAC
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* * * *
33605 TTAATTTTTAAAAAT-TTTACTTATTAATTGTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATC
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* ** * * * * * *
33668 TGAATAAGCTTGTATGAACA-TAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATAATTTGAA
64 -AAATAAATTTGTATGAATAGAAAC-AATGTTTTATAACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAA
* *
33732 ATAAATAATTGCTTAAAT---CATAATTATTTGAAC-TGATTT-GATAAACAGAT
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* * *** ** * * * *
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* * * ***
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* * *
33885 AAA-AACATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGGTAAACAGAA
124 AAATAA-ATAA---TTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTA-GTAAACA-AA
** * * * *
33940 TTATTTTTTAAATCTATTATATATTAATTTTT-TAATATGAATAAATT--CATT-TTTTATTCCA
1 TTATTTTTTAAATCT-TTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
** * * * * * *
34001 AATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAATTGTTTAATGAC--AAC--AA---A-AATGATTTGAAATA
65 AATAAATTTGTATGAATAGAAACAA-TGTTTTATAACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATA
* * ** * * *
34058 GATAAAGGTTCATATATTCTTAACTATTTGAACTAGTTTGGCT-AACAAA
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* ** * * ** **
34107 TTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTAGTAATTTTTGGAATATTTTTGTATTAGTATTATTTTATTTC
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34172 GATTAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAGAATAAAAGGTTATAACT-ATTTGAA
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* * ** * ** *
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* * * * * * * *
34414 AGATAATTATTGAAATGGCCACAATTTATTTGAAC-TGATTTGGTAAACAGA
128 --A-AATAATTCAAATAGACATAA-CTATTTGAACTTG-TTTAGTAAACAAA
* * * **
34465 TTCACTTTTTAAATC----CTTATTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
1 TT-ATTTTTTAAATCTTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
** * ** * * * *
34525 AATAAGCTTGTGTGAATTTAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTTAAAT
65 AATAAATTTGTATGAATAGAAACAA-TGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAAT
* * * * *
34590 AAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAAACTAAT
128 AAATAA---TTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAAC-AAA
* * * *
34641 TTATTTTTTAAA-CTATTGCTTATTAATTTTTGAAATATTGAGAAATTAGTATTATTTT-TTT--
1 TTATTTTTTAAATCT-TTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA
* * * * *
34702 TATAAGATTT-TATGAACT-GAAGCAATTATTTTATATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAA
65 AATAA-ATTTGTATGAA-TAGAAACAA-TGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAA
* * * * *
34765 ATAAATAATTATTCAAATAGTCATCACTATTTGAACTTG-TTCGATAAATAGAT
126 ATAAAT-A--ATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACA-AA
* * * * * *
34818 TTATTTCTTCAAATCTTTTTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTAT
1 TTATTT-TTTAAATC---TTTACCTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * *
34882 TCCGAATAAGA-TTGTAAG-ATATGCAACAAATAATTTT-TAACCAAACAAAAGGTTAGAATGAT
61 TTCAAATAA-ATTTGTATGAATA-GAAAC-AAT-GTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGAT
* * * *** * * ** * *
34944 TTAAAATATATAATTATTATAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGCTCGGCAAACACAT
121 TTGAAATAAATAA-T-TCA-AATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA-AA
* * *
35002 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAAT
1 TTATTTTTTAAATCT-TTACCTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TT
* ** * * * * * **
35065 GAAAT-AAGCTCTATGATTAGAAATAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTAACAATTT-AA
63 CAAATAAATTTGTATGAATAGAAACAA-TGTTTTATAACAAAACAAAAG-TCATAATGATTTGAA
* ** * * * * * * *
35127 GATTAATAATTGCTTAAATAGTTACAATTA-TTCAAATTGGTTCGTAAACAGAT
126 -ATAAATAATT-C--AAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA-AA
* *
35180 TTATTTTTTAAAT-TTT--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
1 TTATTTTTTAAATCTTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
** * * *
35242 ATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
66 ATAAATTTGTATGAAT-AGAAACAA-TGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * ** *
35306 ATATAATTGTTCATATA-ATC-TTACTATTTGAAATGGTTTGGCAATTAGAT
128 AAATAA---TTCAAATAGA-CATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA-AA
* * *** * * *
35356 TTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT-AGAATATTATTAAATTAGTATTATATTATTTC
1 TTATTTTTTAAATCT-TTACCTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * * *
35420 TAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAATGTTATAACGATTTGAAA
64 AAATAAATTTGTATGAATAGAAACAA-TGTTTTATAACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAA
* * * * * * * *
35485 TAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAA-TAG
127 T--A-AATAATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAA
* * * **
35535 TT-TTACTTTTAAATCTCTTA-TTGATTGATATTCAAAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTATT
1 TTATT--TTTTAAATCT-TTACCT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
35597 T
62 T
35598 TGAACAAATT
Statistics
Matches: 2893, Mismatches: 586, Indels: 597
0.71 0.14 0.15
Matches are distributed among these distances:
154 6 0.00
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163 1 0.00
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186 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (174 bp):
TTATTTTTTAAATCTTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
ATAAATTTGTATGAATAGAAACAATGTTTTATAACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAA
TAATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAA
Found at i:33040 original size:165 final size:165
Alignment explanation
Indices: 32750--33049 Score: 405
Period size: 165 Copynumber: 1.8 Consensus size: 165
32740 TAATTTTTGA
* *
32750 AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGCTTGAATAGAACCAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGATTGAATAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
32815 GTCAAAACAAAAGCTCATAATGTTTTAAAATAAATAATTGTTCAGATAGTCATAACTATTTGAAC
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131 ATGTTAGGTAAATTCTCTTACTCATAAATTTTCAT
32915 AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-ATATGAACT-GAAACAATTGTT
1 AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGAT-TGAA-TAGAAACAATTGTT
* * *
32976 TTAT-TACAAAACAAAATG-TTACAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATACTCATGACTAT
62 TTATGT-CAAAACAAAA-GCTCACAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATACTCATAACTAT
*
33039 TTGAACTTGTT
125 TTGAACATGTT
33050 CAGCAAACAT
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 11, Indels: 12
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Matches are distributed among these distances:
164 5 0.04
165 108 0.92
166 5 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (165 bp):
AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGATTGAATAGAAACAATTGTTTTAT
GTCAAAACAAAAGCTCACAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATACTCATAACTATTTGAAC
ATGTTAGGTAAATTCTCTTACTCATAAATTTTCAT
Found at i:33463 original size:183 final size:179
Alignment explanation
Indices: 32890--33741 Score: 632
Period size: 183 Copynumber: 4.7 Consensus size: 179
32880 ATGTTAGGTA
* *
32890 AATTCTCTTACTCATAAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
1 AATTCTCTTACTTATTAA-TTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * * *
32955 ATATGAACTGAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAATGTTACAATGA-TTTGAAATAAATAATT
65 ATATGAACTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-CACTTTGAAATAAATAATT
* * * * * *
33019 ATTCAAATACTCATGACTATTTGAACTTGTTCAGCAAACATATTTATTTTTT
129 ATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGTT-AGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * * * * * *
33071 AAATCTTTTACTTATT--TGTTGA-AATATTAATAAATTAATACTT-TTTAAATCCAAATAAACT
1 AATTCTCTTACTTATTAAT-TTCATAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCT
** * * *
33132 TGCATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAGTTTGAAATAAATAAT
64 TATATGAACT-GAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACACTTTGAAATAAATAAT
* * * * * * *
33196 TGTTCAAATAGTCATAAAGATTCAAACTTGTCCAATAAATAGATTTATTTTTT
128 TATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGT-TAGTAAACAAATTTATTTTTT
* * * *
33249 AGATCCT-TTACTTATTAATTGTCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTGAAATAAGCT
1 A-ATTCTCTTACTTATTAATT-TCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT
* ** * * * * *
33313 TGTATGAA-TAGAAAAAAAATCATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGA-TTTCAAAGAGAT
64 TATATGAACT-G--AAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC-ACTTTGAAATAAAT
* * * *
33376 AATTATTCAGATAGTCATAATTATTTAAACTTGTTTGTTAAACAAATTCATTTTTT
125 AATTATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGTTAG-TAAACAAATTTATTTTTT
* * * **
33432 AATTCTCTTAATTATTAACTTTCAGAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT
1 AATTCTCTTACTTATTAA-TTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT
* * * * *
33497 ATATAAACTGAAATGATTTTTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACACTTTGAAATAGATAATT
65 ATATGAACTGAAA-AAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACACTTTGAAATAAATAATT
* * * * * * * *** * *
33562 ATTCAAATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTTGGAAATGTTACTTAATTTTT
129 ATTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGTTAGTAAA-CAAATTTATTTTTT
*** * * * *
33614 AAAAATTTTACTTATTAATTGTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATCTGAATAAGC
1 AATTCTCTTACTTATTAA-T-TTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGC
* ** * * * * * *
33677 TTGTATGAAC--ATAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATAA
63 TTATATGAACTGA-AAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACACTTTGAAATAAATAA
33740 TT
127 TT
33742 GCTTAAATCA
Statistics
Matches: 531, Mismatches: 116, Indels: 49
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 2 0.00
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184 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AATTCTCTTACTTATTAATTTCATAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA
TATGAACTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACACTTTGAAATAAATAATTAT
TCAAATAGTCATAAATATTTAAACTTGTTAGTAAACAAATTTATTTTTT
Found at i:33838 original size:154 final size:158
Alignment explanation
Indices: 33635--33952 Score: 371
Period size: 154 Copynumber: 2.0 Consensus size: 158
33625 TTATTAATTG
** * * * *
33635 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAC-ATAAC-TATTGT
1 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACAT-TTGT
* * * *
33698 TTTATAATAGAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAA-ATAATTGCTT-AA-A-TCATAATTAT
65 TTTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAA-AACATAATTGCTTAAATAGTCATAACTAT
* *
33759 TTGAACTGATTTGATAAACAGATTTATTTT
129 TTGAACTGATTAGATAAACAGAATTATTTT
* * *
33789 TTGAAATATTAATAGATTAGTATTCTTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTT
1 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTT
* * * * *
33854 TTATGACAAAACAAAAGGTCCTACCAATTTGAAAAACATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT
66 TTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAAACATAATTGCTTAAATAGTCATAACTATTT
* *
33919 GAACTGGTTAGGTAAACAGAATTATTTT
131 GAACTGATTAGATAAACAGAATTATTTT
33947 TT-AAAT
1 TTGAAAT
33953 CTATTATATA
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 22, Indels: 9
0.81 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
154 46 0.34
155 45 0.33
156 3 0.02
157 5 0.04
158 37 0.27
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (158 bp):
TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTT
TTATAACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAAACATAATTGCTTAAATAGTCATAACTATTT
GAACTGATTAGATAAACAGAATTATTTT
Found at i:34304 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 33786--35655 Score: 1192
Period size: 176 Copynumber: 10.5 Consensus size: 180
33776 ACAGATTTAT
* * * * * * * * *
33786 TTTTTGAAATATTAATAGATTAGTATTCTTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
* ** *** * * * *
33851 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCCTACCAATTTGAAAAACATAATTGTTTAAATAGTCATAACTA
66 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * **
33916 TTTGAACTGGTTAGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTATTATATATTAA
131 TTTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTCGT-TATTAA
* * * * * * * **
33967 TTTTT-TAATATGAATAAATT--CATT-TTTTATTCCAAATAAGCTAGTATAAATTGAAAA-AAT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAAT
* * * *** * * *
34027 TGTTTAATGAC---A-ACAA----A-AATGATTTGAAATAGATAAAGGTTCATATATTCTTAACT
65 TGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * *
34083 ATTTGAACTAGTTTGGCTAACA-A-ATTTATTTTTTAAATCTCTCAGTTAGTAA
130 ATTTAAACTGGTTTGG-TAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTC-GTTATTAA
** ** * *
34135 TTTTTGGAATATTTTTGTATTAGTATTATTTTATTTCGATTAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
* * *
34200 GTTTTATGACAGAATAAAAGGTTATAACT-ATTTGAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAACT
66 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* *
34264 ATTTAAACT-ATTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTC-TTATTAA
130 ATTTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTCGTTATTAA
* * * *
34311 TTTTT-GAGAGATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTAT-AATTAAAAACAA
1 TTTTTGGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAACAA
** ** * * * * * * *
34374 TTGTTACATGATGAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATGGCCACAAT
64 TTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAA-
* * * * * *
34439 TTATTTGAACTGATTTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA--TC-C-TTATTAA
128 CTATTTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTCGTTATTAA
* * ***
34488 -TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTGTGAATTTAAACAATT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
* * * *
34552 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
66 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * ** * *
34617 TTTGAATTTGTTCAGTAAACTA-ATTTATTTTTTAAA-CTATTGCTTATTAA
131 TTTAAACTGGTTTGGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTCG-TTATTAA
* * * * * * ** *
34667 TTTTTGAAATATTGAGAAATTAGTATTATTTT-TTT--TATAAGATTTTATGAACTGAAGCAATT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
* * * * * *
34729 ATTTTAT-ATCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATCACT
66 GTTTTATGA-CAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACT
* * * * * *
34793 ATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTCTTCAAATCTTTTTTTC-TTATTAA
130 ATTTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTT-TTTAAATC----TCTCGTTATTAA
* * * * * * * *
34848 TTTTTTGAATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCCGAATAAGATTGTAAGATATGCAACAAAT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-A--CAA-AAAC
* * * * **
34913 AA-T-TTTTA--ACCAAACAAAAGGTTAGAATGATTTAAAATATATAATTATT-ATAATAGTTTT
62 AATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCA-AATAGTCAT
* * * * * *
34973 AACTATTTGAACTGGCTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAA
126 AACTATTTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-T-CGTTATTAA
* * * * ** * *
35029 TTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAAT-GAAATAAGC-TCTATGATTAGAAATAA
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCG-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAA
* * ** * *
35091 TTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCT-TAACAATTT-AAGAT-TAATAATTGCTT-AAATAGTTA
64 TTGTTTTATGACAAAATAAAAGGT-TATAATGATTTGAA-ATAT-ATAATT-ATTCAAATAGTCA
* * * * * * *
35151 CAATTATTCAAATTGG-TTCGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-T-T-TTTATTAA
125 TAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTCGTTATTAA
* *
35203 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATCAAAAACAATT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
* * * * *
35268 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCATATAATC-TTACTA
66 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
35332 TTTGAAA-TGGTTTGGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAA
131 TTT-AAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TCGTTATTAA
* * * * * ** * * * *
35383 GTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATATTATTTCTAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
* * * * *
35448 GTTTGATGACAAAATAAAATGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTA
66 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * ** *
35513 TTTGAAA-TGGTTTGGTAAATAGTTTTA-CTTTTAAATCTCTTATTGATTGA
131 TTT-AAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTCGTT-ATTAA
* *** * * ** * *
35563 TATTCAAAATATTAATAAATTAGTATT-TTTTATTTTGAACAAATTTATATTAACAAAAACAATT
1 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
* * * *
35627 ATTTTATGATAAAATAAAAAGTAATAATG
66 GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATG
35656 TGATGTCGGG
Statistics
Matches: 1322, Mismatches: 288, Indels: 160
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
168 69 0.05
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170 1 0.00
171 7 0.01
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173 3 0.00
174 45 0.03
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186 5 0.00
187 2 0.00
188 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT
GTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
TTTAAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTCGTTATTAA
Found at i:36414 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 36389--36436 Score: 87
Period size: 20 Copynumber: 2.4 Consensus size: 20
36379 AACATTGAAG
36389 GTGAAAGATACCTCATACGT
1 GTGAAAGATACCTCATACGT
36409 GTGAAAGATACCTCATACGT
1 GTGAAAGATACCTCATACGT
*
36429 GTCAAAGA
1 GTGAAAGA
36437 GCTTTATCTT
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 1, Indels: 0
0.96 0.04 0.00
Matches are distributed among these distances:
20 27 1.00
ACGTcount: A:0.38, C:0.19, G:0.21, T:0.23
Consensus pattern (20 bp):
GTGAAAGATACCTCATACGT
Found at i:42136 original size:363 final size:355
Alignment explanation
Indices: 41231--42262 Score: 873
Period size: 357 Copynumber: 2.9 Consensus size: 355
41221 TATCATAATG
* * * * * * * *
41231 ATTTCAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGCTCGATAAATAAAATTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAATAAA-CAAATTATT
* * * * * * * * *
41296 TTCTAAATA--TTTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTTTTACTCT-TTTCAAATAACC
65 TT-TAAA-ACCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC
* * * * * * * * * * *
41358 ATGTATGAGCTG-AAGTAATTGCTTAATGACAAAACAAAAGTTCATAATAATTTGAGATA-AATA
128 TTGTAT--GCTGAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAAGAACAATATGAAATAGAA-A
* * ** * * **
41421 ATTGTTTATATAATCATAACTGTTTGAATTGGTTCGGTAAACGAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
190 ATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTAGTTTAGTAAACG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * *
41486 GTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAAGTCGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAA
254 CTTATTAATTTTGAGAATAATAATAAAGTAGCATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAATAA
* * * *
41551 AAATAATTATTTTATTATAGAAAAAAATGTTATAACA
319 AAACAATTATTTTATGACAGAAAAAAAGGTTATAACA
* *
41588 ATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAATAAACAAATTATTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAATAAACAAATTATTT
* ** * *
41653 TTTAAACCTCTTATTAATTTTTGAAATATTTGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
66 TTAAAACCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG
* * * * *
41718 TATGTTGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACAATATGAAATAGATAGTTGT
131 TATGCTG-AAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAAGAACAATATGAAATAGAAAATTGT
* *
41783 TCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTA-TTTAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
195 TCAAATAGCCATAACTATTTGAA-TTAGTTTAGTAAAC-GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
* ** * * *
41847 TTAACTTTTGA-AATAATAATAAAGTAGCATTATTTTTTTTTTAGATAAGCTTTTCTAAACT-AA
258 TTAA-TTTTGAGAATAATAATAAAGTAGCATTA-TTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAA-TAAA
* **
41910 AACAA-TAGTTTTATGACA-AATAAAAGGTTATAATG
320 AACAATTA-TTTTATGACAGAAAAAAAGGTTATAACA
* * * * * *
41945 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTT-GTTTAGTAAACAATTTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAATTGGTTCAATAAACAA-ATTAT
* * *
42009 CTTTTCAAATATCTTGCTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAAT
64 -TTTT-AAA-A-CCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * *
42074 AAGCTTGTATGAACTG-GAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTAAGAACGATTTGAAATAG
124 AAGCTTGTATG--CTGAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAAGAACAATATGAAATAG
* * * * *
42138 AAAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
187 AAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTGAATTAGTTTAGTAAAC-GATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * ** * * **
42203 TTTCTTATTATTTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCTGAATAAGCTTGT
251 TTACTTATTAATTTTGAGAATAATAATAAAGTAGCATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGT
42263 TAAGTTATAT
Statistics
Matches: 541, Mismatches: 111, Indels: 41
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
354 1 0.00
355 6 0.01
356 43 0.08
357 234 0.43
358 50 0.09
359 5 0.01
360 2 0.00
361 1 0.00
362 25 0.05
363 172 0.32
365 2 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (355 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAATAAACAAATTATTT
TTAAAACCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG
TATGCTGAAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTAAGAACAATATGAAATAGAAAATTGTT
CAAATAGCCATAACTATTTGAATTAGTTTAGTAAACGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
ATTTTGAGAATAATAATAAAGTAGCATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATAAATAAAAACAAT
TATTTTATGACAGAAAAAAAGGTTATAACA
Found at i:42146 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 41231--42262 Score: 811
Period size: 181 Copynumber: 5.8 Consensus size: 180
41221 TATCATAATG
* * * * * * * *
41231 ATTTCAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGG-CTCGATAAATAAAATTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAG-TAAA-CAATTTAT
* * * * * * * * * *
41295 TTTCTAAA--TATT--TTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTTTTACTCT-TTTCAAATA
64 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * * * * * * *
41355 ACCATGTATGAGCTGAAGTAATTGCTTAATGACAAAACAAAAGTTCATAATA
129 AGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTAATAACA
* * * * * * **
41407 ATTTGAGATAAATAATTGTTTATATAATCATAACTGTTTGAATTGGTTCGGTAAACGAATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAAC-AATTTATT
* * * * *
41472 TTTTAAATCTCTTAG-TTATTAATTTTTAGAATATTACTAAAGTCGTATTATTTTATTCCAAATA
65 TTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * *
41536 AGCTTGTATGAA-TAAAAATAATTATTTTATTA-TAGAAAAAAATGTTATAACA
129 AGCTTGTATGAACT-AAAATAATTGTTTTATGACTA-AACAAAAGGTAATAACA
* * * * * *
41588 ATTTGAAATAGATAATTTTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATTGGTTCAATAAACAAATTATTT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAATTTATTT
* ** * *
41653 TTTAAA-C-C-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTTGTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
66 TTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG
**** *
41714 CTTGTATGTTGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACA
131 CTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTAATAACA
* * * * * * *
41764 ATATGAAATAGATAGTTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTT-ATTTAGTAAACTGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAAC-AATTTAT
* * * * * * **
41828 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATAATAATAAAGTAGCATTATTTTTTTTTTAGAT
64 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGA-AT
* * * * * * * **
41893 AAGCTTTTCTAAACTAAAACAATAGTTTTATGAC-AAATAAAAGGTTATAATG
128 AAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTAATAACA
* *
41945 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTCTTTGAACTT-GTTTAGTAAACAATTTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTAGTAAACAA-TTTAT
* * * *
42009 CTTTTCAAATATCTTGCTTATTAATTTTTGGAATGTTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCGAAT
64 -TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAAT
** * * *
42074 AAGCTTGTATGAACTGGAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTAAGAACG
128 AAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTAATAACA
* * * * *
42127 ATTTGAAATAGAAAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTAGTTTGGTAAACACATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACA-ATTTATT
* * * * ** * * *
42192 TTTTAAATCTCTTTCTTATTATTTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTA-CTCTGAATA
65 TTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTC-GAATA
42256 AGCTTGT
129 AGCTTGT
42263 TAAGTTATAT
Statistics
Matches: 675, Mismatches: 156, Indels: 45
0.77 0.18 0.05
Matches are distributed among these distances:
176 175 0.26
177 18 0.03
178 5 0.01
179 2 0.00
180 49 0.07
181 281 0.42
182 144 0.21
183 1 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTAGTAAACAATTTATTT
TTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG
CTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTAATAACA
Found at i:42766 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 42328--42771 Score: 502
Period size: 184 Copynumber: 2.4 Consensus size: 181
42318 TCTTAAATCT
* * *
42328 CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATCAATA
1 CTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAATTT-TATGAATA
* * *
42392 GAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAAATAGATAATAATTTAAATA
63 GAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAAATAAATAATAATTTAAAGA
* * *** * *
42457 GACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAAATCTCCAA
128 GACATAACTATTCGAACTCACTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAAATCTCCAA
* * * *
42512 CTTATTAATTTTTAGAATCTTAATAAATTAATATTACTTTATTTCAAATAAAATTGTATGAATAG
1 CTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-AAATTTTATGAATAG
*
42577 AAACAATTGTTTT-CTGACAAAACAAAA-GATCAAAATGATTTG-AAATAAATAATTATTTAAAG
64 AAACAATTGTTTTAC-GACAAAACAAAATG-TCAAAATGATTTGAAAATAAATAATAATTTAAAG
* * ***
42639 GGTCATAACTATTCGAACTCACTCGGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTTTTA
127 AGACATAACTATTCGAACTCACTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCCAA
* * * * *
42693 CTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAACAA
1 CTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-ATTTTATGAATAG
*
42758 AAACAATTGGTTTA
64 AAACAATTGTTTTA
42772 TGATGAAATA
Statistics
Matches: 220, Mismatches: 32, Indels: 18
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
180 2 0.01
181 71 0.32
182 1 0.00
183 55 0.25
184 84 0.38
185 7 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
CTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAATTTTATGAATAGAA
ACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTCAAAATGATTTGAAAATAAATAATAATTTAAAGAGAC
ATAACTATTCGAACTCACTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAATCTCCAA
Found at i:42887 original size:156 final size:156
Alignment explanation
Indices: 42672--42965 Score: 382
Period size: 156 Copynumber: 1.9 Consensus size: 156
42662 CGGTAAACAA
*
42672 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTTGAAA-TTTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
**
42737 CG-AATAAGCTTTTATGAACAAAAACAATTGGTTTATGAT-GAAATAAAAGCTCATAACAATTTC
64 CGAAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAG-AA-AAAAGCTCATAACAATTTC
42800 AAATAGATAATGAACATGTGTAGAAAATAT
127 AAATAGATAATGAACATGTGTAGAAAATAT
* *
42830 ATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTAATTAGTTTTTGGAAA-TTAATAAATTTA-TATTATTTTATT
1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTT-GAAATTTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT
** * * * * * *
42892 CGAAATAAGCTTGCATGAACGGAACCAATTGTTTTATGATAGAAAAAAGGTCATAATATTTTGAA
64 CGAAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAGAAAAAAGCTCATAACAATTTCAA
42957 ATAGATAAT
129 ATAGATAAT
42966 TGTTCAAATA
Statistics
Matches: 119, Mismatches: 13, Indels: 11
0.83 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
155 30 0.25
156 51 0.43
157 29 0.24
158 9 0.08
ACGTcount: A:0.40, C:0.06, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (156 bp):
ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTTGAAATTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCG
AAATAAGCTTGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGATAGAAAAAAGCTCATAACAATTTCAAAT
AGATAATGAACATGTGTAGAAAATAT
Found at i:43212 original size:143 final size:143
Alignment explanation
Indices: 42951--43213 Score: 332
Period size: 143 Copynumber: 1.8 Consensus size: 143
42941 GTCATAATAT
* * * * *
42951 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACATGTTCGATAAATAGATTAATTT
1 TTTGAAATAAATAATTATTCAAATACTCATAACCATTTGAACATGTTCGATAAACAGATTAATTT
* * *
43016 TTTAATTCTCTTACTCATTGATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTTTACAAAACAA
66 TTTAAATCTCTTACTCATTGATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTTTACAAAACAA
43081 AACGTCACAATGA
131 AACGTCACAATGA
* * * * ** *
43094 TTTGAAATAAATAATTATTCAAATACTTATGACCATTTGAACTTGTTTGATAAACATTTTTATTT
1 TTTGAAATAAATAATTATTCAAATACTCATAACCATTTGAACATGTTCGATAAACA-GATTAATT
* * *
43159 TTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAAATATTCATAAATTAATATT-TTTTTT
65 TTTTAAATCTCTTACTCATTGATTT-TCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTT
43214 AATCTGAATA
Statistics
Matches: 100, Mismatches: 18, Indels: 4
0.82 0.15 0.03
Matches are distributed among these distances:
143 57 0.57
144 43 0.43
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.07, T:0.46
Consensus pattern (143 bp):
TTTGAAATAAATAATTATTCAAATACTCATAACCATTTGAACATGTTCGATAAACAGATTAATTT
TTTAAATCTCTTACTCATTGATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTTTTACAAAACAA
AACGTCACAATGA
Found at i:44641 original size:180 final size:175
Alignment explanation
Indices: 44216--46119 Score: 883
Period size: 176 Copynumber: 10.7 Consensus size: 175
44206 AGAATATTAC
* ** * * * *
44216 TAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTATAGAAC
1 TAAAGTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTTTTTGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAAC
* * * * * * * *
44281 AAAATGTTATAACAATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTAG
65 AAAAAGTAATAA-TATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTCAA
* * * *
44346 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAG
129 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCGAAATAATAA
* *
44393 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGTTG-A-AAAACAATTGTTTTATGATAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTT-T-T-TTGAATAAAACAATTGTTTTATGATAAA
* * * *
44456 ACAAAAGGTAATAATATTTGAAACAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTTATTCA
63 ACAAAAAGTAATAATATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTCA
*
44521 ATGAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTCGAAATAATAA
128 AT-AAATAGATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAACTTTCGAAATAATAA
* * * *
44573 TGAAGTAGTATTATTTTCTTTTAG-ATAAGCTTTTTTGAACTAAAATAATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTT-ATTTAGAATAAGCTTTTTTGAA-TAAAACAATTGTTTTATGATAAAA
* * *
44637 CAAAAAGTCATAATGATTTTTAAATC-GATAATTATTCAAATAGTCATAACTT-TTTGAACTTGT
64 CAAAAAGTAATAAT-A-TTTGAAA-CAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-TTATTTGAACTTAT
* * * * * * * * **
44700 TTAGTAAACAAAATTT-TCTTTTCAAATCTCTTGCTATTAATTTTTGGAATGTTAA
125 TCAATAAA-TAGATTTAT-TTTTTAAATCTC-T--TATTAACTTTCGAAATAATAA
* * * * * * * * *
44755 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATAGGACT-TAA
1 TAAAGTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTTTTTGAA-TAAAACAATTGTTTTATGA-TAAAA
* * * * *
44819 -AAAAAGTTAA-AACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTAGTT
64 CAAAAAG-TAATAA-TATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTA-TT
* *** * * ** * *
44881 CAGA-AAATACAAACATTTTTTAAATCTC--A-CAATTTTTAAAATATTAT
126 CA-ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCGAAATAATAA
* * * * * * *
44928 TAAATTAGTATTATTTT-TGTCCA-AATAAGCTTGTATGATAAAAAACAATTATTTTATGAGAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTTAT-T-TAGAATAAGCTTTTTTGA-ATAAAACAATTGTTTTATGATAAA
* * * * ** * *
44991 ACAAAGA-TCATAGTGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TAGTT
63 ACAAAAAGTAATAAT-ATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTA-TT
* * ** * * * * *
45054 CAGA-AAACA-ACTTAAGTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAGTATTAG
126 CA-ATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCGAAATAATAA
* **
45103 TAAAGTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAG-TTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATGGCAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTTATTT-AGAATAAGCTTTTT-TG-AATAAAACAATTGTTTTATGATAAA
* * * *
45166 AC-AAAAGCTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTG
63 ACAAAAAG-TAATAA-TA-TTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAAT-TATTTGAACTTA
** * * **
45228 TTTGATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTG-AATGTTAA
124 TTCAATAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAA-CTTTCGAAATAATAA
* ** * * * *
45285 TAAATTACAATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATTACT-AA
1 TAAAGTAGTATTATTTTATT-TAGAATAAGCTTTTTTGAA-TAAAACAATTGTTTTATGA-TAAA
* * * * ** * *
45348 ACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTAGTT
63 ACAAAAAGTAATAAT-ATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTA-TT
** * * * * * * * *
45412 CAGCAAACATATTTATTTTTCAAAGCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAT
126 CAATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCGAAATAATAA
* ** * * * * *
45462 TAAATTAGTATTATTTTAATCCA-AATAAGATTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTATGATAAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTT-ATTTAGAATAAGCTTTTTTGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAA
* * * * * * * * * * * *
45526 TAAATA-TCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAAACTGTTTTG
64 CAAAAAGTAATAA-TATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT-TATTC
* * * * * *
45590 ATTAACA-A-ATGTAATTTTTCAATCTCTTATTAATTTTC-AAATATTAA
127 AATAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAACTTTCGAAATAATAA
* * * * * *
45637 TAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAA--TTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTTT--TTGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAA
* * * * * * * * * *
45700 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGACATGACTATTTGAACTTGTTT
63 ACAAAAAGTAATAAT-ATTTGAAACAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTATTC
** * * *
45765 GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTAA-TTTTGAGAATATTAA
127 AATAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-CT---TATTAACTTTCGA-AATAATAA
* * *** *
45818 TAAATTAGTATTATTTTATTCTA-AATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTTATT-TAGAATAAGCTTTTTTGAATA-AAACAATTGTTTTATGATAAAA
* * * * * * **
45882 C-AAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCT
64 CAAAAAG-TAATAA-TATTTGAAACAGATAATTATTCAAA-TAGTCATAATTATTTGAACTTATT
** * * * * * *
45945 CGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATGTTTTACCTATTAATTTTTGAAATATTAA
126 CAATAAATAGATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAACTTTCGAAATAATAA
* * * * * * * *
45999 TAAACTACTATTA-TTTATTTTGAATACGCTTGTAT-AAGTAAAAACAATTGGTTTATGACAAAA
1 TAAAGTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTTTTTGAA-T-AAAACAATTGTTTTATGATAAAA
* * * * *
46062 CAAAAGGTCATAATGATTT-AAA-ATGAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
64 CAAAAAGTAATAAT-ATTTGAAACA-G-ATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC
46120 GTGCTTAGAG
Statistics
Matches: 1369, Mismatches: 248, Indels: 217
0.75 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
172 16 0.01
173 115 0.08
174 16 0.01
175 132 0.10
176 233 0.17
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* * * * * ** * *
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* *
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* * ****
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* *
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130 ACTTGTTTAGTAAAC-AAATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* ** * * * * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* ** *
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* * *
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* ** * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * * * ** *
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* * * * *
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* * ** * * **
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* * * * * * *
45517 ATGATAAAATAAATA-TCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
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130 ACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* ** * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * *
45691 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGACATGACTATTTG
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* * *
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* * * *
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* *
45872 TATGACAAAAC-AAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTAT
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* ** * * * * *
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* * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTT
* * *
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64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
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* * *
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* * * * * * *
46221 AT-ACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATGGTTTATATATTCATAACTATTTGA
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* * *
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* * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
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** * * ** *
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*
46524 TTT
178 TTG
* * **** ** * * * ** *
46527 TAAT-TTGAATAAGCTT-GTA-TAAAAAAAATCA-AT-TG-TTTTATG-A-TAAAACAAAAGTCA
1 AAATATT-AATAA-ATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGT-T
* *** * * * * * * * *
46584 TAATGATTTTGAA-ATAAA-T-A-ATTG-TTCG-AATAGTCACAACAAT-TTGAATGTATTCAGT
63 TTATGA--CAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG--A-TA-ATTGTTCAA-ATAGTCA-T
* * * * * * * *
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120 -AAC-TATTTGAACTTGTTTAGTAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTT
* * *** * * *
46747 TATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTG
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* *
46812 AACTTGTTT-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
129 AACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* *** ** * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTT
* * * * * * * *
46929 GTGATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTGC
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * ** * * * * *
46994 ACTAG-TCAGGCCAATATATTCATTTGTTAAATC-CATTACTTATTAA-TTTTC
130 ACTTGTTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-TTAC-TATTAATTTTTG
* ** * ** *
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1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
*** * * * * * *
47109 TAT-----AAC-ATTGGTCATAATGATTGGAAATAAATAATTCTTCAAATTGTTATAACTAATTG
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * **
47168 AACTAGTTTGGTAAACAGATTTATATTTTAAATCTCTTA--A-TAATTTTCA
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * * * * * *
47217 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAGCCAAAACATTTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * * * * *
47282 TGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTATATAGCCTTTACTACTTGAA
66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
47347 -TTGGTTTTGCAAACAAA-TT-TTTTTAAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTC
131 CTT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTATTAATTTTTG
* * * * * * *
47395 ATAATATTATTAGATTAGTATTATTATGTTTT-GAATAAGCTTGTATGGAC-ATAAATAATTATT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * * *
47458 TTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
47523 GAACTAGTTCACTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTG
128 GAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTTTG
* * * * ***
47577 AAATACTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAGGCTTATATGATGAAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* ** * * * * * *
47641 ATGAC--AACAAAAATTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAGATGGCCACAATTATTTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * ** * **
47704 A-TTGATTCGATAAATTGATTTTATTTTTTAAATCTCCAACT-TCTCAATTTTTG
130 ACTTGTTTAG-TAAA-CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTAT-T-AATTTTTG
* * * * *
47757 AAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGTACTAAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * *
47822 TTATAAAACAAAAAGGTCATAATGATTT----TA-A-AA-TGGTCAGAAT--T-AT---TA---G
66 TGACAAAACAAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTG
* * *
47871 AAC-TGGTTAGGTAAACAGAGTTATTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTTG
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* * ** * ***
47920 AAATATTAATACATTTA-TTTTATTTTATTTT-GAATAAGCAAGTATGAATTGGAAAA-AA-AAA
1 AAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGT
* * ** * * * * * *
47981 TTTATGACAAAACAAAAGGTCGTAACAATTTGAAATATATAAATGTTCATACAGTCTTAACAATT
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* * * * *
48046 TGAACTAG-TTAGACAAACAAATTTAATTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTTG
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* * * * *
48102 -AATATTATTAGATTTGTATTATTTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGAAC-ATAAATAATTATT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * * * * *
48164 TTATAATAGAACAAAAGGTTTATTTTGTAAATAATTGATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATAGT
63 TTATGACAAAACAAAA-----A----GT-CATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
48229 CATAATTGTTTGAA--TGGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATCTTATTTGTTAATTTTT
117 CATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTATTAATTTTT
48292 G
180 G
* ** * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTT
* * * * ** * * * * *
48357 ATGATC-AAACAAAAGGTAACAACGATTTGAAATAGATAATTCCTAAAATTGTGACAATTATTTG
65 ATGA-CAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * * * *
48421 AACTAATTCAGTAAATAGATTCACTTTTTAAAT-TACTTACTA--ATTTTTTG
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTATTAATTTTTG
* * * * *
48471 -AATATTAA-ATA-TAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
48532 ATGATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATCTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
48597 ATTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTTAAA-CTC-T--TATTAATTTTTA
130 ACTTGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * * *
48645 AAATATTAAGAAATTAGTATTATTTTATCTTGGATATGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * ** * * ** * *
48710 TGTCACAAC-AAAAGTTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTTTAATAATCATAATTATTTGA
66 TGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
48774 ATTTGTTT-GATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT-
130 ACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
** * * * ** * * * * * *
48826 -TTTACTAATAAATTTGGATTATTTTATTACAAATAAGCTT-TAAGATA-TGAAATAAATATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTT
* * * ** * * * ** *
48888 ATGACTAAACAAAATA-TCAGAACGACCTGAAATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTT-
65 ATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * *
48951 AAATTGGTTTCGCAAGCACATTTA-TTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTT
129 AACTT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * *** * * *
49004 TAATATTATTAAATTAG-ATTATTTT-TAACCAAATAAAC-TGATATGATC-AGAAACAATTGTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAGATAAGCTTG-TATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * * * *
49065 TTATGACAAAACAAAGA-TCTTAACGATTTGAGATTGAAAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * *
49129 GAA-TTGGTTCGGTAAAAAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
128 GAACTT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
*** *
49183 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* ** * * * * *
49247 ATGACAAAAC-AAAAGATCATAATGATTTCAAATAGATAATCATTGAAATGGCCATAATTATTTT
65 ATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * ***
49311 AA-TTGATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAATTTCAA
129 AACTTG-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * * * *
49364 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-G-TCCAAGCTTGTTTTACCTGAAATAATTTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGAT--AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
* ** * * * * * * * *
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64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
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* * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * ** * ** **
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*** * **
50034 AA-TTGGTTT-GATAGGTAGATTTACGTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCT-
129 AACTT-GTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTT-TG
* * * * * * *
50087 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTT-GAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
50151 ATGACAAAACATAAAGTAATAATTATTTGAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
50216 ACTGGTTTGGTAAATAGAA-TTATTTTCTAAATCTCTTACTTATGAATTTTTG
130 ACTTGTTTAGTAAACA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * * * * * * *
50268 AAATAATAA-AAATTTGTTTTATTCTATTTT-GAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAGTTGTCTC
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* ** * * * ** * *
50331 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCATACAAACTTAACTGTTTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * **
50396 AC-AGGTTCGACAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCA
130 ACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTATTAATTTTTG
* * * *
50448 AAATATCACTAAATTAGCATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * * * *** *
50511 CATGATAGAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * * * * *
50576 AAATAGTTCGGTAAATAGATATATTTTTTAATTCTC-T--TATTAATTCTTG
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * *
50625 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTCGAATAAGCTTGTGTGTTAA--ACAACAACTATT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATG--AACTAAAACAATTGTT
** * * * *
50687 TTATGACAAAACAAATGGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAAT-GACCATAATTATT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATT
* * *
50751 TGAAC-TGATTTGGTAAACTAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTG
127 TGAACTTG-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * *
50806 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATATGA-ATAAGATTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
** * *
50870 TGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * *
50935 CCTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTGAAAACTCGTGCTTATTAATTTTTTG
131 CTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC-TATTAA-TTTTTG
* * * * * * * *
50988 -AATGTTAATAAATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTATTATA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * *
51052 TGACTAAACAAAAGGT-AAAAGCGATTT-AAATTAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTG
66 TGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
51115 AACTGGTTTGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCT-TT--TATTAATTTTTG
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * * * * *
51164 GAATATT-ATCAAATTAGTAATATTTTTATTTGA-ATAAGCCTATATGATCAAAAACAATTATTT
1 AAATATTAAT-AAATTAGTATTA-TTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
* * * *
51227 TATGAGAAAACAAAGA-TCATAATGATTTGAGATTA-ATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * ** * *
51290 GAACTAGTTTGGAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTG
128 GAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
** * * * *
51344 AAATATTAA-ATAGGTAGTATTATTTTAATTCAGATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
** *
51408 ATGAAAAAACAAAAGGTCAAAACAAAAGGTCATAACAACTTT-AAATAGATAATAGTTCAAATAG
65 ATG-----ACAAAA---C---A-AAAA-GTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * *
51472 TCAT--CTAGTTGAACTTG-TTCGATAAACATATTTATTTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATT
116 TCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAA-T
51534 TTTTG
176 TTTTG
* * * *
51539 -AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
51602 ATGACTAAACAAAAGGTCAAAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAAC-AATTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG-
* * * * *
51666 AATTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTGATTAATTTTGG
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTTTG
* * * * * * * * * *
51719 AAATATTAAGAAATTAGCATTATTTTATTTTGGACAAGCTTTTATAAATTGAAACAATTCTTTGA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
51784 CGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * *
51849 CTT-TTTGGGTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG
131 CTTGTTT-AGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC-TATTAA-TTTTTG
* * * * * * * * * *
51902 -AATGTTAATAAATTTGGATTATTTTATTCTAAATAAGCTTTTAAGATA-TGAAACAAATATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATTGTTTT
* * * * * ** *
51965 -TGA-ATATACAAAAAAGGT-AGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATTTTGACTATT
65 ATGACA-AAAC-AAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
52027 TGAACTAGTTCAGCAAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTG
127 TGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTATTAATTTTTG
* * *** * * ** * **
52081 GAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAACTTCAATGATCGGAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * * * * *
52145 ATGACAAAACAAAGA-TCTTATTGATTTGATATTGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT-A
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *** *
52208 ATTTGGTTCGATAAACAGATTTATTTCAAATAATCT-TTA--ACTAATTTTT-
130 ACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * * *
52257 AGAATATTATTGAATTAGTATTATCTTAATCT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * *
52320 TTATGAC--AACATAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAAATAT
63 TTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * **
52382 TTGAAC-TGTTTTAGTAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTCA
126 TTGAACTTG-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * * * ** * *
52434 AAATATTAATAGATCAATATTAGTTTATTCTAAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * *
52499 TGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAAT-GAACATAACTATTTAA
66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGA
* * * * * **
52563 ACTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCA
130 ACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTATTAATTTTTG
* * * * *
52615 AAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTT-TATGAA-TAGAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTT
* * * * *
52678 ATGATAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATCA-ATAATTGTTCAAATAGTTATAACGATAT
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
52741 GAACTTGCTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTG
128 GAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * ** * * * * *
52795 GAATCTAAATAAAATAACATTATTTTATTTCAAATACGCTTATATGAA-TAGAAACAATTGGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTT
* * * *
52859 GTTACAAAACAAAAGGTCCTAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
52923 AACATGTTTAGAAAACAAATTTATTTTTAAAAT-TTTTGCTTATTAATGTTT-
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * *
52974 AGAATATTAATAAATGTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAAC-ATAAACAATTATT
1 A-AATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * * *
53037 TTATGACACAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAGCCATTT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * ** * *
53102 GAACTTGTCT-G-ATAATAGATTCATACTTTAAATTTATTACTCATTAATTTTTG
128 GAACTTGTTTAGTA-AACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTTTG
** * * * *
53155 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCCGAATAAGCCTATATGAACTAACACAATTTTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * ** * * * * * * *
53219 ATGGCAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAACAGTTATGA-GATTTAA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * ** * * * * *
53283 AATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTG
130 ACTTGTTTAGTAAACAAAT--TTAT---T-TTTTAA-AT-CTC--T-TAC-TATTAATTTTTG
* * * * * *** * * * * * ** * * * *
53345 AAA-ATCT-TTTACTTATTAATTGTCAAAATATTA-ACAA-ATTAATATTATTTTAATCTGATAA
1 AAATAT-TAATAAATTAGT-ATTAT-TTTATTTTAGATAAGCTT-GTATGAACTAAAAC-AAT-T
** * * * ** *
53406 GTTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAATA
60 GTTT-TATG-AC-AAAAC-A-------A--A-AAGTC-ATAA-TGAT-TTGAAAT-AGAT-AAT-
** * * * * * * * *
53471 ACTGTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTCAGTAAATAGATTT-TTTTTTATATCTTTTAC
105 TGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC
*
53535 TTATTAGTTGTTTG
169 -TATTAATT-TTTG
* * * * * *
53549 -AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA-AATATATTC
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAAT-TGTTT
* ** * * *
53611 TATGACAAAACAAAATA-TTATAGCGACTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT
64 TATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
53675 GAACTTG-TTCGATAAA-AAGATTCA-GTTTTAAATCTCCTACTTAATAATTTTTG
128 GAACTTGTTTAG-TAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * * *
53728 AAATATTAATAAGTTAGAATTATGTTATTCT-GAATCAGCTTGTATAAAC-AGAAACAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * * *
53791 TCA-GACAAAAC-AAAAGATGATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAACAATTATAACTATT
64 T-ATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
53854 TGTAC-TGGTCAGGCT-AACAGATTCT-TTTTTTAAAT-TCGTTACTTACTAGTTTTT-
127 TGAACTTGTTTA-G-TAAACAAATT-TATTTTTTAAATCTC-TTAC-TATTAATTTTTG
* * * *
53908 AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTT-GAATAAGATTGTATTAA-TAGAAACAATTGTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
** * * * * * *
53971 TTATGACAAAACAAATGGCCATAATGACTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
54036 GAAC-TGATTTGGTAAATAGATTTATTTATTAAATCTC-T--TATTAATTTTTG
128 GAACTTG-TTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * ** *
54086 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT-GAACAAACTTATATGAAAAAAAAAACATTTGTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATG--AACTAAAACAATTGTT
* * *
54150 TTATGACAAAACAAAAGGTCA-AGATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATA-ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * * *
54214 TGAACTAGTTTGGCAAAGAAATTTATTTTTTCAATCACTTAC---TAATTCTTGG
127 TGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATT-TTTG
* * * * *
54266 AAA-ATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTA-ACTACA-CTTGTGTGAA-AAGAAACAATTGTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGA-TA-AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * * * *
54327 TTATGATAAAATAAAGA-TCATACTGATTAGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * **
54391 GAAC-TGTTTCGGTAAACATAGTTAGTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTCA
128 GAACTTGTTT-AGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * ** *
54441 AAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTCT-GAGTAATTTTGCT-TGAA-TAAAAGCAATTATT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGA-TAAGCTTG-TATGAACTAAAA-CAATTGTT
* * * * ** **
54503 TTATAACAAAACAAAGAGTCATAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCGAAT-GAAAATGGCTATT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATT
* *
54567 TGAACTTGTTTAGTAAAC-GATTTATTTTTTAAATCT-TCTACCTATTAATTTTTA
127 TGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TA-CTATTAATTTTTG
*
54621 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAATTAA-CTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-A-TAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * *
54683 TTATGACAAAACAAAATA-TCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCTAACAGTCATAACGT-
63 TTATGACAAAACAAAA-AGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TA
* * * * ** * * *
54745 TATGAACTTGCTCAGTAAACATATTTATTTTTTTTATTTTTTTCTCATTAATTTTTG
125 TTTGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTTTG
* * * * * * *
54802 GAACATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT-GAATATGCTTGTGTGAA-TAGAAACATTTTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * *
54865 TATGATAAAACAAAAGGTCAT-ATCTATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * * * *
54929 GAA-TGCGTTCAAAAAACAAATTTATTTCTTATAT-TTTTACTTATTAGTTATT-
128 GAACT-TGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * **
54981 AGAATGTTAATAAGTTA-TATTATTTTA-TTCAGAATAAGTTTGTATGAA-TAAAAGCAATTACT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAATTGTT
* ** *
55043 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCA-TT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * *
55107 GAATTTGTTCGGTAAACAGATTCATATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTG
128 GAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTTTG
* * * * * * * *
55161 GAATAGTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCCA-ATAAGCCTATATAAACTAATACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-TAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
** * ** * * ***
55225 ATGATGAAAC-AAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGTTATTTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* *** * * * **
55289 ACATGTTCTA-TAAATGTATTTA-TTTCTAGAATATTTTACTTATTAATTTATCA
130 ACTTGTT-TAGTAAACAAATTTATTTTTTA-AATCTCTTAC-TATTAATTT-TTG
* **** * * *
55342 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA-AACCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-ATTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
*
55405 ATGAC-AAA-AAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * *
55468 ACTTATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTTAGTTATCTG
130 ACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATT-TTTG
* * * * * * * * *
55521 -AATACTAATACATTTGTATTGTTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAAAAAATTATTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTT
* * * ** * * * *
55584 TATGATAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTA
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
55649 AACTT-ATTCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTT-
129 AACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
** * * * **
55697 AAACTATTAATAAATTAAAATTATGTTATTCAAATAGAAATAA--TTGTTTTGCGGC-AAAACAA
1 AAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT---TTAG--ATAAGCTTG-TATG-AACTAAAACAA
** * * * **** * * *
55759 AAG-ATCATAACGATTTGAAATAG--ATAAT--TGTT-CAA-AG---A--GTTACAACTA-T--T
58 TTGTTTTATGAC-AAAACAAAAAGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTT-CAAATAGTCAT
** ** * *** * * * * * *
55809 -TGTA-TTGGTC-AGGCCA--AGA-AATTCTT-TTTTTAAATCTGT-TACT-C-ACTAATTTTTA
120 AACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACAAAT-TTATTTTTTAA-ATCTCT--TACTATTAATTTTT-
55864 G
180 G
* * ** * * *
55865 -AATATTAATAAATTAGCATTACTTTA-TTCCGAATAAGATTGTATTAA-TAGAAGCAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
** * * * * * * *
55927 TATGACAAAACAAATGGCCATAACGAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGTTATAACTAATTG
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * *
55992 AA-TTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTATTAAATCTC-T--TATTAATTTTTA
129 AACTT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * *
56041 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT-GAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
** ** * * * * *
56105 ACAACAAAACAAAGGGTCATAATGATTCGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGA
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * *
56170 A-TTGGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGATAATAA-TTTTC
130 ACTT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTATTAATTTTTG
* * *
56221 ATAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTT-GAATAAGCTTGTATGAA-TATAAATAATTGTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
** * *
56284 TTATGGTAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT-GTATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * * ****
56348 AAAACTAGTTCAGCAAGTTTATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTG
127 TGAACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TAC-TATTAATTTTTG
* * * ****
56403 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTT-GATTAGACTCGTATGGTGAAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAG-CTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* *
56467 ATGACAAAAC-AAAAGTTCATAATGATTTGAAATACG-TAATTGTTCAAA-AGGCCATAATTATT
65 ATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATT
* * ** * *
56529 TGAA-TTGATTCGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCGTACTTATTAACTTTTG
127 TGAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * * *
56584 AAATAATGATAAACTAGTATTA-TTTAGTTTTAGATAAGCTTTTATAAACTAAAAAAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* * * *
56648 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCCAATAGTCTTAACTAATTG
65 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
56712 AATTTGTTTGGTAAGCAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCG
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTAC-TATTAATTTTT-G
* * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTT
* ** * * *
56830 ATGACTAAATGAAAGGTCGA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TACACTATTT
65 ATGACAAAACAAAAAGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTT
* * * * * * * *
56893 GAAC-TGGTTAGGCAAATACATTTAATTTTAAAATCT-TT-C-AATAA-TTTTC
128 GAACTTGTTTA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
** * *
56942 ATAATATTTTTAAATTAGTATTATTTTTATTTGA-ATAAGCTTGTATGATC-AGAAACAATTGTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTT
* * * * *
57005 TTATGAGAAAACCAAGA-TCATAATGATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
63 TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** *
57069 GAACTAG-TTAGAAAAACAAGTTTAGCTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTG
128 GAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TATTAATTTTTG
* * * * *
57123 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTCA-AT----TTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * *
57183 TGATAAAACAAAATGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTG
66 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTG
* * * * * *
57246 AACTTATTTGGTAAACAGATTAATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTT
129 AACTTGTTTAGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACT-ATTAATTTTTG
* * * * * * * * *
57300 TAATGTTAATAAATTACTATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
* * * * * * * *
57365 TGACTAAACAAAATGT-TTAAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATATTCTTAACTATTTGA
66 TGACAAAACAAAAAGTCAT-AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
** * *
57429 A-TTGGTTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TA--AATTTTTG
130 ACTT-GTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * * * *
57477 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAATAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAG-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTT
* * * *
57540 TATGACAAAATAAAGA-TTATAATGATTT-AACATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
64 TATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * **
57603 AAAC-TGTTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTC-T--TATTAATTTTCA
128 GAACTTGTTTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
* * ** * *
57653 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATGAA-TAGAAACAATTGTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTAGATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTT
*
57717 ACGACAAAAC-AAAAGATCATAACT-ATTTGAA
65 ATGACAAAACAAAAAG-TCATAA-TGATTTGAA
57748 TTTGCTCAAT
Statistics
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TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
CTTGTTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTATTAATTTTTG
Found at i:45731 original size:176 final size:177
Alignment explanation
Indices: 43850--46422 Score: 1866
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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** ** * * * * * * *
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** ** * *** * *
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* * *
44206 AGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTT
* * * * * ** * *
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65 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* *
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* ** *
44384 AAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-GTTGAAAAACAATTGTTTT
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* * * * * *
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65 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
*
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* * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTT
* * * * * * * *
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65 ATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
44873 AATTAGTTCAGAAAATACAAA--CATTTTTTAAATCTC--A-CAATTTTTA
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* * * *
44919 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TGTCCAAATAAGCTTGTATGATAA-A-AAACAATTATT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTAT-A-AATAGAAACAATTGTT
* * * * * * *
44981 TTATGAGAAAAC-AAAGATCATAGTGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAATTATTT
63 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * **
45045 GAACTAGTTCAGA-AAAC-AACTTAAGTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
128 GAACT-GTTTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
* * * * * *
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTT
* * ** *
45158 ATGGCAAAACAAAAGCTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTT
65 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTT
* *
45221 GAACTTGTTT-GATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTG
128 GAAC-TGTTTAGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAA-TTTTTG
* ** * *
45277 -AATGTTAATAAATTACAATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAATAATTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTT
* * * * * ** *
45339 TATTACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAGTCTTAACTATTTG
64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * *
45404 AATTAGTTCAG-CAAACATATTTATTTTTCAAAGCTCTTATTAATTTTTG
129 AACT-GTTTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
* * * * * *
45453 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGATTGTATAAAAAGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
45518 TGATAAAATAAATA--TCATAACGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTAA
66 TGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
45581 ACTGTTTTGATTAACAAATGTAATTTTTCAATCTCTTATTAA-TTTTC
130 ACTGTTTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
* * ** *
45628 AAATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTA
* * *
45693 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGACATGACTATTTGAA
66 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* *
45758 CTTGTTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTAA-TTTTG
131 C-TGTTTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CT---TATTAATTTTTG
* * * *
45808 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT
* * *
45872 TATGACAAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATT
64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATT
* * * * * * * *
45935 TGAACT-TGCTCGGTAAATAGATTTAGTTTTTAAATGTTTTACCTATTAATTTTTG
127 TGAACTGT-TTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
45990 AAATATTAATAAACTACTATTA-TTTATTTTGAATACGCTTGTATAAGTAAAAACAATTGGTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTA
* *
46054 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAAT-GAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGA
66 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * *
46118 ACGTGCTTAGA-GAATATATTTATTTTTAAAAATTTTACTTATTAATTTTTG
130 AC-TGTTTAGATAAACAAATTTATTTTT-TAAA-TCT-CTTATTAATTTTTG
46169 AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GACATAAGCTTG--T--AT-G-AAC-A--G---
1 AAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
46220 AAT-ACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATGGTTTATATATTCATAACTATTTG
64 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
46284 AACTTGTGT-GGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTG
129 AAC-TGTTTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC-T--T-ATTAA-TTTTTG
* * * * * *
46338 -AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GATATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTT
*
46401 ATGACAAAACAAAAGGTTATAA
65 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA
46423 CAATTTCAAA
Statistics
Matches: 1906, Mismatches: 359, Indels: 258
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
164 1 0.00
165 3 0.00
166 4 0.00
167 74 0.04
168 40 0.02
169 8 0.00
170 3 0.00
171 3 0.00
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184 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
CTGTTTAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTG
Found at i:46363 original size:168 final size:167
Alignment explanation
Indices: 46056--46385 Score: 406
Period size: 167 Copynumber: 2.0 Consensus size: 167
46046 TTGGTTTATG
* *
46056 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATGAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACG
1 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATGAATAATGGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACG
* *
46121 TGCTTAGAGAATATATTTATTTTTAAAAATTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA
66 TGCTTAGAGAATAAATTTATTTTTAAAAATTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA
* *
46186 TATTATTTTA-TTTGACATAAGCTTGTATGAACAGAAT
131 TATTATTTTATTTTGA-ATAAGCCTATATGAACAGAAT
* * * *
46223 ACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAA-AATGGTTTATATA-TTCATAACTATTTGAA
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* * *
46286 CTTG-TGTGGTA-AATAAATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTG-AATATTAAT
64 CGTGCT-TAG-AGAATAAATTTATTTTTAAAAAT-T-TTACTCATTAA-TTTTTGAAATATTAAT
46347 AAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAAC
124 AAATTTA-TATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAAC
46386 TGATATAATT
Statistics
Matches: 141, Mismatches: 13, Indels: 17
0.82 0.08 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 7 0.05
167 73 0.52
168 50 0.35
169 11 0.08
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (167 bp):
ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATGAATAATGGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACG
TGCTTAGAGAATAAATTTATTTTTAAAAATTTTACTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA
TATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACAGAAT
Found at i:50271 original size:539 final size:539
Alignment explanation
Indices: 43850--67777 Score: 13284
Period size: 539 Copynumber: 44.4 Consensus size: 539
43840 TTGGTTTGAT
* * ** * * * * * **
43850 AAATATTAATGAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAGCTATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAA-AAATTGTTTTA
* * * * * * * *
43915 TAACAAAATAAAAAGTAATAAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAATTATAATTATTTGA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * *
43979 ACTAGTTTGGTCAATAAATTT-TTTTTCTAAATCTCTTA--TA--AATTTTTGAAATATTAATAA
130 ACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * * * *
44039 ATTAGT-TGTA-CTCATTTCCGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGATGAAAA-
194 ATTAGTAT-TATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAAC
* * * * * * * * * * * * *
44101 AAAGGTCATAACAATTTGAGATAAATAACTGTTTATATAGTCTTAACTGTTTGAGTTTGTTCGGC
256 AAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTT-TGA
** * * *
44166 T-AATGGATTTATTTTTCAAATATCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAATTAGTATTAT
320 TAAACAGATTTATTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * * **
44230 TTTATTCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATTATAGAACAAAATGTTATAACA
383 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATG
* * * * * *
44295 ATTTGAAAAAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTTAGTAAATAGATTTATT
447 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTATT
44360 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTG
512 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
44384 AAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AATTGTTTT
* * * * * *
44448 ATGATAAAACAAAAGGTAATAAT--ATTTGAAACAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
** * * * * ** * *
44511 AACTTATTCAATGAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAACTTTCGAAATAATAATG
129 AACTGGTTCAGT-AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * * *
44575 AAGTAGTATTATTTTCTT-TTAGATAAGCTTTTTTGAACTA-AAATAATTGTTTTATGACAAAAC
193 AATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
44638 AAAAAGTCATAATGATTTTTAAATCGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTTTTGAACTT-GTTT
256 -AAAAGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTT
* * * *
44702 -AGTAAACAAAATTT-TCTTTTCAAATCTCTTGC-TATTAATTTTTGGAATGTTAATAAATTAGT
318 GA-TAAAC-AGATTTAT-TTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGT
* * * * * * * *
44764 ATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTATAGGACTTAAA-AAAAGTT
378 ATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGTC
* * * * * * * ** * * *
44827 AAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTAGTTCAGAAAATACA
441 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGA
** *
44892 AACATTTTTTAAATCTC--AC-----AATTTTTA
506 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* ** * *
44919 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTGTCCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAACAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AATTGTTTT
* * * * * * *
44983 ATGAGAAAAC-AAAGATCATAGT-GATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAATTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * ** * * *
45046 AACTAGTTCAGAAAACA-ACTTAAGTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAGTATTAGTAA
129 AACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * * *
45106 AGTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGTTTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACA
194 ATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* *
45169 AAAGCTCATAACAACTTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTT-GTTT
257 AAAG-TCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAA-TTGGTTT
* * * * * **
45231 GATAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTACAAT
318 GATAAACAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * * * *
45296 TATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAATAATTGTTTTATTACTAAACAAAAGGTTAG
380 TATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT
* ** * * * ** * * *
45360 AATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAATAGTCTTAACTATTTGAATTAGTTCAGCAAACATATT
443 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAAT
* *
45425 TATTTTTCAAA--GC-T-CTTATTAATTTTTG
508 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * *
45453 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAGATTGTAT-AAAAAGAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAA-AAA-AATTGTTTT
* * * * *
45517 ATGATAAAATAAATA--TCATAA-CGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTT
64 ATGACAAAACAAA-AGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * *
45579 AAACTGTTTTGATTAACA-A-ATGTAATTTTTCAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAAATATTAA
128 GAACTG-GTTCAGTAA-ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
* * ** * * *
45637 TAAATTAGTATCATTTTATTTTGAATAATTTTGCATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
191 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
45702 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGACATGACTATTTGAACTT-GTTTG
256 AAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTG
* * * *
45766 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACATATTAATTTTGAGAATATTAATAAATTAGTATTA
319 ATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTA
* * * ** *
45831 TTTTATTCTAAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
382 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-
* * * * * * *
45896 T-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAG-CATAACTATTTGAACTTGCTCGGTAAATAGATTT
445 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATT
* * * *
45959 AGTTTTTAAATGTTTTACCTATTAATTTTTG
509 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** * *
45990 AAATATTAATAAACTACTATTA-TTTATTTTGAATACGCTTGTAT-AAGTAAAAACAATTGGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAA-AATTGTTTT
* *
46053 ATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTAAAAT-GAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
46116 GAACGTGCTT-AG-AGAATATATTTATTTTTAAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
128 GAAC-TGGTTCAGTA-AATAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
46177 ATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGACATAAGCTTGTATGAACAG-----A-------AT-ACAA
190 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * *
46227 AACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAAAATGGTTTATATATTCATAACTATTTGAACTT-GT
253 AACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGT
* * * * * *
46291 GTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTA
316 TTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTA
* * * *
46356 TTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAACT-GATATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG----
379 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCAT
* * * * * *** * *
46416 ---G--TT---ATA-ACAA-T-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACTTGTTCAATAAACATATT
443 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAAT
* * * **
46470 TATTTTTAAAATCTGTTACTTATTAATTGTCA
508 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * ** *
46502 AAATGCTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTAT-AAAAAAAATCAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA--AATTGTTTT
* * * * *
46566 ATGATAAAACAAAA-GTCATAAT-GATTTTGAAATAAATAATTGTTCGAATAGTCACAACAATTT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * *
46629 GAA-TGTATTCAGTAAACATAGTTATTTTTTAAATCTTTTATTTATTCATTGTCT-AAATATTAA
128 GAACTG-GTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAA
* * * *
46692 TAAATTTA-TATTATTTTAAT-TGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTATTTTATGACAA
191 TAAA-TTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAACAG-AAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
46755 AACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTT-GT
253 AACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGT
*
46819 TTGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAA
316 TTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTA
*** *** * * * * * * * *
46884 TTAAGCTATTCCAAATAATCTTGTACGAATAGAAATAATTGTTTTGTGATAAAATAAAAGGTCAT
379 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT
* * * * * ** ** * *
46949 AACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTTGCACTAGTCAGGCCAATA-TAT
443 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAAT
* *
47013 TCATTTGTTAAATC-CATTACTTATTAA-TTTTC
508 T-ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTG
* ** * *
47045 AGAATATTAATAAATTAGCATTATTTT-ATTCCAAATAAGAGTGTATCAATAGAAACAATTGTTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTT
** * * * * * *
47109 TAT-----AAC-ATTGGTCATAAT-GATTGGAAATAAATAATTCTTCAAATTGTTATAACTAATT
63 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * * *
47167 GAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATATTTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTCAAAATATTAATA
128 GAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * * * * *
47228 AATTAATATTATTTTATT-TCAAACAAACTTATATGAGCCA-AAACATTTGTTTTATGACAAAAT
193 AATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * *
47291 AAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTTATATAGCCTTTACTACTTGAATTGGTTTTG
256 AAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGG-TTTG
* * * * * * *
47356 -CAAACAAATTT-TTTTAAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTAT
319 ATAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * * * * * *
47419 TATGTTTTGAATAAGCTTGTATGGACATAAATAATTATTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACG
383 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATG
* * * ***
47484 ATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCACTAAACA-AATTTAT
447 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAA-TTAT
* *
47548 TTTTTAAATCTCCTACTCATTAATTTTTG
511 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
47577 AAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAGGCTTATATG-ATGAAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AATTGTTTT
** * * * * * * *
47641 ATGAC--AACAAAAATTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAGATGGCCACAATTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * ** * * *
47703 AATTGATTC-GATAAATTGATTTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAATATTAAT
129 AACTGGTTCAG-TAAATAGA-TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * *
47767 AAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGTACTA-AAACAATTGTTTTATTATAAAAC
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
47831 AAAAAGGTCATAATGATTT----TA-A-AA-TGGTCAGAAT--T-AT---TA---GAACTGGTTA
256 -AAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTT
* * * *
47880 GGTAAACAGAGTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATACATTTA-TTT
318 GATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATA-AATTAGTAT
* **
47940 TATTTTATTTTGAATAAGC-AAGTATGAATTGGAAAAA-AA--AATTTATGACAAAACAAAAGGT
380 TATTTTATTTTGAATAAGCTTA-TATGAA-T--AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GT
* ** * * * * * * * * **
48001 CGTAACAATTTGAAATATATAAATGTTCATACAGTCTTAACAATTTGAACTAGTTAGACAAACA-
440 CATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAG
* * *
48065 AATTTAATTTTTAAATATCTTAGTTATTAATTTTTTG
505 AA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTG
* * * * ** * * *
48102 -AATATTATTAGATTTGTATTATTTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTT
* * * * * * * *
48166 ATAATAGAACAAAAGGTTTATTTTGTAAATAATTGATTTGAAGTATACAATTCTTCAAATAGTCA
64 ATGACAAAACAAAAGG-TCA-----T-AAT-A--GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
48231 TAATTGTTTGAA-TGGTTC-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATATCTTATTTGTTAATTTTTGA
119 TAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAA
* ** * * *
48294 AAGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGATTGTATGATATA-AAACAATTGTTATA
183 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTA
* * ** * * * * *
48358 TGATC-AAACAAAAGGTAACAACGATTTGAAATAGATAATTCCTAAAATTGTGACAATTATTTGA
247 TGA-CAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * * * *
48422 ACT-AATTCAGTAAATAGATTCACTTTTTAAAT-TACTTAC-TA--ATTTTTTGAATATTAA-AT
310 ATTGGTTTGA-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCT-CTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAA
* * ** * *
48481 A-TAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAA
372 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * *
48545 AGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATCTGAATTTGTTTGGTAA
437 A-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAA
* *
48610 ATA-AATTTATTTTTTTAAA---C-T-CTTATTAATTTTTA
501 ACAGAA-TTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* *** * * *
48645 AAATATTAAGAAATTAGTATTATTTT-ATCTTGGATATGCTTTTATGAACTAAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT
* * * * * * ** * *
48709 ATGTCACAACAAAAGTTCATAACA-ATTTTAAATAAATAATTGTTTTAATAATCATAATTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * ** *
48773 AATTTGTT-TGATAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTT--TTTACTAAT
129 AACTGGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * * *
48835 AAATTTGGATTATTTTATTAC-AAATAAGCTT-TAAGATA-TGAAATAAATATTTTATGACTAAA
192 AAATTAGTATTATTTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * ** * * * ** * *
48897 CAAAATATCAGAACGACCTGAAATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTATTTAAATTGGTTTC
255 CAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTT-
* * * * * *
48962 G-CAAGCACATTTATTTTTAAATTTCTTACTTATTAATTTTTTTAATATTATTAAATTAG-ATTA
318 GATAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTA
**** * * * *
49025 TTTT-TAACCAAATAAACTGATATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCTTA
382 TTTTAT-TTTGAATAAGCTTATATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATA
* * * * * * * *
49087 ACGATTTGAGATTGAAAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTCGGTAAA-AAAATT
444 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAA-T
*
49151 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
508 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* **
49183 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAA-AATTGTTTT
* * ** * * * * *
49247 ATGACAAAACAAAAGATCATAAT-GATTTCAAATAGATAATCATTGAAATGGCCATAATTATTTT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * **
49311 AATTGATTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATTTCTTACTTACTAATTTCAAAAATATTAATAA
129 AACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
*** * * * * * * *
49376 ATTAGTATTATTTTATTCTGTCCAAGCTTGTTTTACCTGAAATAATTTTTTTATGACAAATCAAA
194 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * * * *
49441 TGGTTATAATGATTTTAAATAGACAATTATTCAAACAGTAACAACTATTTAAACTT--TTTTAGT
259 -AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTGA-T
* * * * *
49504 AAACAGATTTATTTTTTTAAATCCCTTTTAGTTATTACCTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
321 AAACAGATTTA--TTTTTAAAT--CTCTTACTTATTA-ATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * * * *
49569 AATTTGTTTTAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTGTAACTAAACAAAAGGTCAGA
381 ATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATA
* * * * * *** *
49633 ATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCAATAAGCA-AATT
444 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAA-T
49697 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
508 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* *
49729 AAATATTATTAAATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAATTGTTTTAT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAATTGTTTTAT
* *
49794 GACAAAACAAAAGGTCATAATAG-TTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAA
66 GACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * ** * ** * *
49858 CTGGTTCAGCAAATAGATTTATTTTTT-AATTTTTTGGTTTGTTAAGCTTCAAAATATTATTAAA
131 CTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA
* ** * * * * * *
49922 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAA-AAT-AATGAGCAGAACCAATTATTTGATGA-AAAATAAAA
195 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * **
49984 TGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAATTGGTTTGATAGG
260 -GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGATAAA
* * * *
50049 TAGATTTACGTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTC
324 CAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * *
50114 TTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACATAAAGTAATAATTATTT
387 TTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGTCATAATGATTT
* * * * *
50179 GAAAAAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGAATTATTTTCT
451 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTATTTTTT
*
50244 AAATCTCTTACTTATGAATTTTTG
516 AAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * ** * * * * * *
50268 AAATAATAA-AAATTTGTTTTATTCTATTTTGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAGTTGTCTCA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAAAAAAATTGTTTTA
* * * * ** * *
50332 TGACAAAACAAAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCATACAAACTTAACTGTTTGA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * * *
50396 ACAGGTTC-GACAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATCACTAA
130 ACTGGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAA
* * * *
50460 ATTAGCATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTCATGATAGAACAAA
194 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * *
50525 AGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAATAGTTCGGTAA
259 A-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGATAA
* * * *
50590 ATAGATATATTTTTTAAT-TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
323 ACAGATTTATTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * * * *
50652 TTTCGAATAAGCTTGTGTG-TTAAACAACAACTATTTTATGACAAAACAAATGGTAATAATGATT
387 TTTTGAATAAGCTTATATGAATAAA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAATGATT
* * * * *
50716 TGAAATAGATAGTTGTTCAAAT-GACCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAACTA-ATTTATTT
450 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC-AGAATTATTT
*
50779 TTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTG
513 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
50806 AAATATTAATAAAGTAGTATTATTTT-ATAT-GAATAAGATTTTATGAACTAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAAT-TCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT
* * *
50869 ATGACAAAACAAATGGTTATAAT-GATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * ** *
50933 AACCT-ATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTGAAAACTCGTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAAT
129 AA-CTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * *
50997 AAATTAGCATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTATTATATGACTAAACA
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * *
51062 AAAGGT-AAAAGCGATTT-AAATTAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTG
257 AAA-GTCATAA-CGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTG
* * * *
51125 GTAAACACATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTGGAATATT-ATCAAATTAGTAAT
319 ATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAAT-AAATTAGTATT
* * *
51185 ATTTT-TATTTGAATAAGCCTATATG-ATCAAAAACAATTATTTTATGAGAAAAC-AAAGATCAT
381 ATTTTAT-TTTGAATAAGCTTATATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCAT
* * * * * **
51247 AATGATTTGAGATTA-ATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTGGAAAATAGCT
443 AATGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAA
* *
51311 TTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTG
507 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * * * *
51344 AAATATTAA-ATAGGTAGTATTATTTTAATTCAGATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT
* * * * *
51408 ATGAAAAAACAAAAGGTCAAAACAAAAGGTCATAACAACTTTAAATAGATAATAGTTCAAATAGT
64 ATGACAAAACAAAAGGTC---ATAATA-G--AT------TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
51473 CAT--CTAGTTGAACTTGTTC-GATAAACATATTTATTTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTT
117 CATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAATAGATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * * *
51535 TTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTGTT
179 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTT
* * * * * *
51600 TTATGACTAAACAAAAGGTCAAAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAAC-AATT
244 TTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
51664 GAAATTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTTAAA-CTCTTGCTGATTAATTTTGGAAATATTAA
308 G-AATTGGTTTGATAAACAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAA
* * * * * * ** * * * *
51728 GAAATTAGCATTATTTTATTTTGGACAAGCTTTTATAAATTGAAACAATTCTTTGACGTCAAAAC
369 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
51793 AAAAGGTCATAATGATTTTAAATAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TTTTGG
434 AAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT-G
* * *
51857 GTAAACAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTTTG
497 GTAAACAGAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTG
* * * * * * *
51902 -AATGTTAATAAATTTGGATTATTTT-ATTCTAAATAAGCTTTTAAGATATGAAACAAA-TATTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGA-AT-AAAAAAATTGTTT
* * * * * ** *
51964 T-TGA-ATATACAAAAAAGGT-AGAAT-GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAATTTTGACTA
63 TATGACA-A-A-ACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * **
52025 TTTGAACTAGTTCAGCAAACACATTTA-TTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTTTGGAATATTA
125 TTTGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * ** * ** * *
52089 TTAAATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAACTTCAATGATCGGAAACAATTGTTTTATGACAAA
190 ATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* ** * * * *
52153 AC-AAAGATCTTATTGATTTGATATTGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTT-AATTTGGTT
254 ACAAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTT
* * * * * * *
52216 CGATAAACAGATTTA-TTTCAAATAATCTT--TAACTAATTTTTAGAATATTATTGAATTAGTAT
317 TGATAAACAGATTTATTTTTAAAT-CTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTAT
* * * *
52278 TATCTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAACAATTGTTTTATGAC--AACATAAAGATCA
380 TATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAG-TCA
* * * *
52340 TAATGATTT-AAGATAGATAATTGTTAAAATAGTCATAAATATTTGAACTGTTTTAGTAAACAGA
442 TAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGA
* * **
52404 TTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCA
506 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * ** * *
52434 AAATATTAATAGATCAATATTAGTTT-ATTCTAAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-AATTGTTTT
* * * * *
52498 ATGATAAAACAAAAAGTCATAAT-GATTTCAAATAGATAATTATTCAAAT-GAACATAACTATTT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTT
* ** * * *
52561 AAACTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTCAAAATATTAATA
128 GAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * * *
52626 AAATAGTATTATTTTATTCTAAATAAACTT-TATGAATAGAAATAATTGTTTTATGATAAAACAA
193 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * *
52690 AAGGTCATAACTATTTGAAATCA-ATAATTGTTCAAATAGTTATAACGATATGAACTT-GCTTGG
258 AA-GTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTGA
* * * * * **
52753 TAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATCTAAATAAAATAACATTA
320 TAAACAGATTTA-TTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * * * * *
52817 TTTTATTTCAAATACGCTTATATGAATAGAAACAATTGGTTTGTTACAAAACAAAAGGTCCTAAC
382 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA-
* *
52882 T-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTTAGAAAACA-AATT
445 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTTGGTAAACAGAA-T
* * * *
52944 TATTTTTAAAAT-TTTTGCTTATTAATGTTT-
508 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * *
52974 AGAATATTAATAAATGTA-TATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACATAAACAATTATTT
1 A-AATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTT
* * * *
53038 TATGACACAACAAAAGGTCATAATA-ATTTGAAATAGACAATTGTTCAAATAGTCATAGCCATTT
63 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** * * * *
53102 GAACTTG-TCTG-ATAATAGATTCATACTTTAAATTTATTACTCATTAATTTTTGAAATATTAAT
128 GAACTGGTTCAGTA-AATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * *
53165 AAATTAGTATTATTTTATTCCGAATAAGCCTATATGAACTA-ACACAATTTTTTTATGGCAAAAC
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * *
53229 AAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAACTATTCAAACAGTTATGAGATTTAAAATAGA-TAAT
256 AAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC--A-A---AT-AG---T--CATA-ACT-A-
* * * * * * *
53293 TATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTGAAAATCTTTTACT
305 T-TTGAATTGGTT-TGA-TA----AAC-AGAT---T-----TA-TT-TTTA---AATCTCTTACT
** * * * * * * *
53358 TATTAATTGTCAAAATATTAACAAATTAATATTATTTTAATCTG-ATAAGTTTGTATGAACAAAA
349 TATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAA
* * *
53422 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTT-AAATAGTCA
413 ACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** ** * * * * *
53486 TAACTATTTGAATTTATTCAGTAAATAG-ATTTTTTTTTATATCTTTTACTTATTAGTTGTTTG
477 TAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTG
* * * * *
53549 -AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAATATATTCTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAAT-TGTTTTA
* * * *
53613 TGACAAAACAAAA--T-ATTATAGCGACTTGAAATATATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATA--GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
53675 GAACTTGTTC-GATAAAAAGATTCA-GTTTTAAATCTCCTACTTAATAATTTTTGAAATATTAAT
128 GAACTGGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * *
53738 AAGTTAGAATTATGTTATTCTGAATCAGCTTGTATAAACAGAAACAATTGTTTTCA-GACAAAAC
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAAC
* * * * * * * * **
53802 AAAAGATGATAATGATTTGAAATACATAATTGTTCAAACAATTATAACTATTTGTACTGGTCAGG
256 AAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGT-TTG
* * * * *
53867 CT-AACAGATTCTTTTTTTAAAT-TCGTTACTTACTAGTTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATT
319 ATAAACAGATT-TATTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
53930 ACTTTATTTTGAATAAGATTGTATTAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAA
381 ATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAA
* * * * * * * *
53995 TGACTTGAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTA
445 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTA
*
54060 TTTATTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTG
510 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * ** * * * *
54086 AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATGAAAAAAAAAACATTTGTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATG-AATAAAAAA-A-TTGTTT
* *
54151 TATGACAAAACAAAAGGTCA-AGAT-GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATT
63 TATGACAAAACAAAAGGTCATA-ATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* ** * * * * * ** *
54214 TGAACTAGTTTGGCAAAGAAATTTATTTTTTCAA--TC--ACTTACTAATTCTTGGAAA-ATTAT
127 TGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAAATATTAA
* * * *
54274 TAAATTAGTATTATTTTAATCT-AACTACA-CTTGTGTGAAAAGAAACAATTGTTTTATGATAAA
191 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAA-TA-AGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * *
54337 A-TAAAGATCAT-ACTGATTAGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT-GTT
254 ACAAAAG-TCATAAC-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTT
* * * * *
54399 TCGGTAAACATAGTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAGTA
317 T-GATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTA
* * ** * * * *
54460 TTATTTTATTCTGAGTAATTTTGCT-TGAATAAAAGCAATTATTTTATAACAAAACAAAGAGTCA
379 TTATTTTATTTTGAATAAGCTT-ATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCA
* * ** ** * *
54524 TAATGATTTCAAATAGATAATTGTTCGAAT-GAAAATGGCTATTTGAACTTGTTTAGTAAAC-GA
442 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGA
* * *
54587 TTTATTTTTTAAATCT-TCTACCTATTAATTTTTA
506 ATTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTG
* * * *
54621 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATTAA-CTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-ATTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTT
** * * * *
54685 ATGACAAAACAAAATATCATAACT--ATTTGAAATAAATAATTGTTCTAACAGTCATAACGT-TA
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATT
* * * * ** * * * * ** *
54747 TGAACTTGCTCAGTAAACATATTTATTTTTTTTATTTTTTTCTCATTAATTTTTGGAACATTAAT
127 TGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * * * *
54812 AAATTAATATTATTTTATTTTGAATATGCTTGTGTGAATAGAAACATTTTTTTTATGATAAAACA
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * **
54877 AAAGGTCATATCTATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGCGTTCAA
257 AAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-GTTTGA
* * * * * * * *
54941 AAAACAAATTTATTTCTTATAT-TTTTACTTATTAGTTATTAGAATGTTAATAAGTTA-TATTAT
320 TAAACAGATTTATTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * ** **
55004 TTTATTCAGAATAAGTTTGTATGAATAAAAGCAATTACTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACA
383 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATG
* * * *
55069 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACCA-TTGAATTTGTTCGGTAAACAG-ATTCAT
447 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATT-AT
* *
55132 ATTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTG
511 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * * * *
55161 GAATAGTAATAAATTAGCATTATTTTATTTCCAATAAGCCTATATAAACTAATACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTA
** * * * ***
55226 TGATGAAAC-AAAGGTCATAACA-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGGTTATTTGA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * *
55289 ACAT-GTTCTA-TAAAT-GTATTTA-TTTCTAGAATATTTTACTTATTAATTTATCAAAATATTA
130 AC-TGGTTC-AGTAAATAG-ATTTATTTTTTA-AATCTCTTACTTATTAATTT-TTAAAATATTA
* ** * * * *
55350 ATAAATTAATATTATTTTAAACCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATT-ATTTATGACAAAA
190 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * *
55414 -AAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT--ATTC
255 CAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTG
* * * * * * * *
55476 AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTTTTAGTTATCTGAATACTAATACATTTGTATT
319 A-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * * *
55541 GTTTTA-ATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTTAT
381 ATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCAT
** * * * * ** * * *
55605 AGCGATTTGAAATAGGTAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTCGATAAACAGATT
443 AATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAAT
*
55670 TAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-
508 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
** * *
55697 AAACTATTAATAAATTAAAATTATGTT-ATTCAAAT-A----G-A--AAT-----AATTGTTTTG
1 AAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAATTGTTTTA
* * * * * * * *
55748 CGGCAAAACAAAAGATCATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGAGTTACAACTATTTGT
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* ** * * * * * *
55812 ATTGG-TCAGGCCAAGAAATTCT-TTTTTTAAATCTGTTACTCACTAATTTTTAGAATATTAATA
130 ACTGGTTCA-GTAAATAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * * * *
55875 AATTAGCATTACTTTATTCCGAATAAGATTGTATTAATAGAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAA
193 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * *
55940 ATGGCCATAACGAATTGAAATAAATAATTGTTCAAATGGTTATAACTAATTGAATTGGTTTGGTA
258 A-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGATA
*
56005 AATAGATTTATTTATTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
322 AACAGATTTATTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * ** *
56066 TATTTTGAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTACAACAAAACAAAGGGTCATAATGAT
385 TATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAATGAT
* * * * * * ** *
56131 TCGAAATAGATAATTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAATTGGTTCAGCAAACA-AATTTATTT
449 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAA-TTATTT
** * *
56195 TTTAAATCTCTTAGATAATAA-TTTTC
513 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** *
56221 ATAATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATATAAATAATTGTTTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTT
** * *
56286 ATGGTAAAACAAAAGGTTATAAT-GATTTGAAAT-GTATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTA
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * ** *
56349 AAACTAGTTCAGCAAGTTTATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
128 GAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * *** *
56413 AAATTAGTATTATTTTCTTTTG-ATTAGACTCGTATGGTGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-CTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * *
56477 AAAAGTTCATAATGATTTGAAATACG-TAATTGTTCAAA-AGGCCATAATTATTTGAATTGATTC
256 AAAAG-TCATAACGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAATTGGTTT
* * * * * *
56540 GATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCGTACTTATTAACTTTTGAAATAATGATAAACTAGTATT
318 GATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATT
* *
56605 A-TTTAGTTTT-AGATAAGCTTTTATAAACTAAAAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA
381 ATTTTA-TTTTGA-ATAAGCTTATATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCA
* * * * * *
56667 TAATGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCCAATAGTCTTAACTAATTGAATTTGTTTGGTAAGCA-A
442 TAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGA
*
56730 ATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCG
506 A-TTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTT-G
* * * ** * * * *
56767 -AGTATCAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTA
* ** * *
56831 TGACTAAATGAAAGGTCGA-AAT-GATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTC-TACACTATTT
65 TGACAAAACAAAAGGTC-ATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTATTT
* * * * * * * **
56893 GAACTGGTT-AGGCAAATACATTTAATTTTAAAATCT-TT-C--AATAATTTTCATAATATTTTT
128 GAACTGGTTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* *
56953 AAATTAGTATTATTTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGATCAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC
192 AAATTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
57017 -CAAGATCATAATGATTTGAAATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTAGA
256 AAAAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGA
* * * *
57081 AAAACA-AGTTTAGCTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTA
320 TAAACAGA-TTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * *
57145 TTTTA-TTTCAAT----TTTTATGAA-ATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATGTCATAA
382 TTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* **
57204 CGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTATTTGGTAAACAG-AT
445 TGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAAT
* * *
57266 TAATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTT
508 T-A-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * *
57300 TAATGTTAATAAATTACTATTATTTT-ATTCTAAATAAGATTGTATGAATTGAAATAATTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT
* * * * * * * *
57364 ATGACTAAACAAAATGT-TTAA-ATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATATTCTTAACTATTT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATA-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
57427 GAATTGGTTCGGTAAATACATTTATTTTTTAAATCTCTTA--TA--AATTTTTGAAATATTATTA
128 GAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * *
57488 AATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA-TA
193 AATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * *
57552 AAGATTATAATGATTT-AACATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGTTTTGAT
258 AAG-TCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGAT
* *
57616 AAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
321 AAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * ** ** * * *
57677 TTATTCTAAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTAACGACAAAACAAAAGATCATAACT-
384 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-TG
*
57741 ATTTG----A-AT--TTGCTC--A-A-T-A-AACATATTT--A----TTT--T-AA-A-AA--A-
447 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTAT
* * * * *
57779 TTTTT-ACT-TATTAATTTTTGAA---AT-
511 TTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTG
* * ** * * * *
57803 -A---TTAATAAACTAGTATTA-TTTATTTTGAATATGTTTGTATGAACAGAAACAATTAG-TTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATT-GTTTT
** * * * * *
57862 ATGACAAAACAAAACTTCATACCT--ATTTGAAACAAATAATAGTTAAAATAGTCATAACTATTT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATA-ATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * **
57925 GAAC-GTGTTCAG-AAA-ACGAATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTA
128 GAACTG-GTTCAGTAAATA-G-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * *
57986 ATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGGAATAAACTTGTATGAACATAAAAAATTATTTTATGACAA
190 ATAAA-TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * ** *
58049 AACAAAATGTCATAACGATTAGAAATAAAAAATTGTTTAAGTAGTTGTAATTATTTGAACTT-GT
253 AACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGT
** ** * * * *
58113 TCAATAAATTGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAATAATTTTTAAAATATTAATTAATTAGTA
316 TTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTA
* * * * * * *
58178 TTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATCAACT-GATATAATTGTTTTATGATAAAACAAAGGGTCA
379 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAA-TAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCA
* * * * ** * *
58242 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATAT
442 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAA
* * *
58307 TTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTG
507 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * *
58339 AAAATATTAATACATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-TTTT
1 -AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAAAA-AATTGTTTT
* * * *
58403 ATGACAAAACAAAAAGTCATAAT-GATTTCAAATAAATAATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * * * *
58467 AATTTATTCAGTAAACAAAGTTATTTTTTGAATCT-TTAACTTATTAATTGTCT-GAATATTAAT
129 AACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-TTTAAAATATTAAT
* * * * * * *
58530 AAATTTGTATTATTTTAAT-TGAAATAAGCTTGTATCAATAGAATAAAATTATTTTATGATAAAA
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTG-AATAAGCTTGTATGAACAGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * **
58594 C--AA---AT---G-GTT---ATAG-CAA-T-TTGAAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTCAA
255 CAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGA
* * * * *
58644 TAAACAGATCTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAAATTTGAAATATTAATAAAATAGAATTAT
320 TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTAT
** * * * * * * * **
58709 GCTATTTCGAATAAGCCTGTACGAATAGAAACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAACA
383 TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATG
* * * * * ** **
58774 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACCA-TTATAACTATTTGCATTGGTTAAGCCAACA-AATTCA
447 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATT-A
58837 TTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTT-
510 TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * *
58866 AGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCGAATAAGATTGTATTAATAGAAACAATTATTTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATA-AAAAAATTGTTTT
** * * *
58931 ATGACAAAACAAGTGGTCATAACA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-TATT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT-TT
* * ** * *
58994 AAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTATTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
128 GAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * ** * * * * * *
59055 AATCAATGCTATTTTATT-TCAAACAAACTTATATGTACA-AAA-AATTTTGTTTTATGATAAAA
193 AATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAA--TTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * * * *
59117 CAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATCCATATCA-TCTTAATTATTTAAATTGGTTC
255 CAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAATTGGTTT
** * * * * * *
59181 GCCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTACT
318 GATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATT
** * * * * * * *
59246 ATTTTATTTCAAACAAGCTTGTATGAAGATAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGCTTATAA
381 ATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA
* * * *** ** * *
59311 CGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAATCATAA-T-TTTGAACTGGTTCATTAAGTATATTTA
445 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTA
*
59374 TTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTG
510 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * *
59404 AAATATTAATAAATTAGTATGATTTT-ATTCCGAAT-AGACTAGTATG-ATGAAAAATAATTGTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATT-CAAATAAG-CTTGTATGAAT-AAAAA-AATTGTT
* * * * * *
59466 TTATGACAAAACAAAAGTTCATAA-CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATGATTATT
62 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** * * * *
59530 TGAACTGATTC-GATAAACT-GATTTATCTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTTTGAAATTTTA
127 TGAACTGGTTCAG-TAAA-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
* * * * * * * *
59593 ATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATGATAAAA
190 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
59658 CAAAAGGTCATAACGATTTTAAATTGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTGAACTT-GTTC
255 CAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTT
* * * * * * * *
59722 GGTAAAAAGACCTTT-TTGTTT-TATTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAAGAT-TTTATGAACTGA
318 GATAAACAGA--TTTATT-TTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTT-AA-ATATTAAT-AAAT--
* ** * * * * * * * * **
59784 AACAATTCTTTTA-TGTCAA-AA-C--AAAAG-GTTATAACAATT-TTAAAT-A-AATAATTGTT
374 TAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAA-AA-----
* ** * * * * * ** * * * *
59840 CAAATAGTCATAACT-ATTT-AACT---TGCTTGATAAACAAAATTAT-TTTTTTTCAAAT-CTT
433 CAAA-AGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
** * ** ** **
59898 T--T--AC-TTATTAATTTTTTGAGGCTAATAAAT-TTAGATTATTT-
495 TGGTAAACAGAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-ATT-TTTG
* * ** * * * * *
59939 -TAT-TTCGAATAAGCTT-GTAAGATATGAA-ACAAAT-A--TTTTATGACTAAACAAAA--G--
1 AAATATT--AATAA-ATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAATAAA-AAAATTGTT
* * **
59993 -----------------GTCAGAAT-GA-TTGAAAATAGATAATTAAGTT--GATAGTTGTAACT
62 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTG-AAATAGATAATT--GTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * *
60037 ATTTAAACTGGTTC-GACAAACACATTTATGTTTTAAATCTC--A--TATTAATTTTTGAAATAA
124 ATTTGAACTGGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
* * * ** * * * *
60097 TATTAAATTAGCATTATTTT-TAACCCAATAATCTTTTATGATAAAAAAAACAATTGTTTTATGA
188 TAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTGAATAAGCTTGTATG--AACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
60161 CAAAAC-AAAGATCTTAACGATTT-AAGATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACT
250 CAAAACAAAAG-TCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT
* * * *
60224 GGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTTATATTTGAAATATTAATAAATTA
313 GGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT-TTTTAAATATTAATAAATTA
* * * *
60289 GTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATG-ATAAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
376 GTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-G
* * * * * * * *
60353 TCATAATGATTTGAAATCA-ATAGTCGTTCAAATGGCCATAATTATTTTAACTGATTTGATAAAC
439 TCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC
* * * **
60417 ATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTAGG
503 AGAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * ** * * * *
60454 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCATCTAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTATTTAA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTA
* * * * * *
60519 TGACAAATCAAAAGGTTATAATA-ATTCT-AAATAGACAATTATTCACATAGTAATAACTATTTG
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * ** *
60582 AACTTGTTC-G-ATGAGAGA-TTATTTTTTAAAATCTCTTTCTTATTATTTTTTTGAATGTTAAT
129 AACTGGTTCAGTA-AATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * * * *
60644 AAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCATGTATGAACTGAAACAAGTGTTTTATGACTAAACA
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * * * *
60709 GAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTGATTCGGT
257 -AAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGAT
* * * * * *
60774 AATCAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAA-GATTATTATT
321 AAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * * **
60838 TTAATCTAAATAAGCTTGTACGCAT-AAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAACAA
384 TTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGTCATAATGA
** * * ****** * *
60902 TTTGAAATAGATAATTGTTGTAATA---ACAATTA-TT-ATA-TGACAAAATAAAAAGTAATAAT
448 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTGGTTTGGTAAACAG-AATTAT
* * * * * * *
60961 GATTTGAAATAGATAGTTGCTCAAATGGCCATAATCATTTG
511 -TTTTTAAAT--CT-CTTACT--TAT-----TAAT-TTTTG
* ** * * *
61002 AACTGATTTGGTAAAGTGATTTATT-TTTTAAATCTCTAACTTATTAA-CTTTTGAAATATTAAT
1 AAAT-A-TTAATAAA-TTA-GTATTATTTT-AAT-TC-AA---A-TAAGC--TTG---TATGAAT
** * * * *
61065 AAAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
50 AAA--A--A--A----A---T---T--G-TTTTATG-AC-AAAACAAAAG-GTCAT---AATAGA
*** * * * * * **
61130 AAAGATCATA-ACAATT-TTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAAACCATTTGAACTTGTTTG
90 TTTGA-AATAGATAATTGTT-CA-A-AT-A--G-TC----A-T---AACTATTTGAACTGGTTCA
** ** *
61193 GTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATT
139 GTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * *
61258 ATTTTATTCTGAATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAA
203 ATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAA
* * * * * * * * * *
61323 TGATTTGAAATAGATAAATATTCTAATAGTCTTAACAATTTCAACTT-GTTCGACAAACACATTT
267 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTGATAAACAGATTT
* *
61387 ATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGA
331 A-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTTGA
* * * * *
61447 ATAAGCTTATATG-ATCAGAAACAATTATTTTATGAGAAAA-TAAAGTTCATAACT-ATTTTAGA
393 ATAAGCTTATATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-TGATTTGA-A
* * ** * * * * ** * **
61509 TTA-TTTTTTGTTCAAATAATCATAATTATTTGAACTGG-TTCG-AAATAGCTTTAGTTTCCAAA
454 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTATTTTTTAAA
* *
61571 TATCTTGCTTATTAATTTTTG
519 TCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** * * *
61592 AAATATTAGTAAAATAGTATT-TTTTATTTCGTATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTA
* * * * **
61656 TTACAAAATAAAAGGTTATAAT-GACTTT-AAATAGAAAATTGTTCAAATAGTCA-AATCTATAA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTT
* * * * * * *
61718 GAAATTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTCAAATGTTAAT
128 GAACTGGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * *
61783 AAATTAATATTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGACTAAA
192 AAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTG-TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA
* ** * * **
61847 A-AAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACAGGTTT
254 ACAAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTT
** * * * *
61911 GGCAGACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTAT
318 GATAAACAGATTTA--TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTAT
* ** * *
61976 TATTTTAATTTGAATAAGCTTGCATGAA-AAGAAACAATTGTTTTAGGACAAAA-TAAAGATCAT
380 TATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-TCAT
* * * ** ** * * *
62039 AACGAATT-AAGATAGATAATTATTTGAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTTCGTAAATAGAT
443 AATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAA
* *
62103 TTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTAG
507 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * * * *
62131 AAAATTTTAATAGATCAATATTATTTT-ATTCTAAAT--GATT-T-TGCATGAATAGATTGTTTA
1 -AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAAAAAAATTGTTTT
* * * * *
62191 ATGACAAAAGAAAAGATCATAAT-GATTTCAAATAGATAATTAG-TCAAATGGAT-ATGACTATT
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAG-TCATAACTATT
* ** * * * * * *
62253 TGAACTTGTTTTGTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAAT
127 TGAACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT
* * * ** *
62318 AAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAGGCTTGTATGAATAGAAATAATTGACTTATGACAAAGC
192 AAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * **
62382 AAAAGGTCATAACTATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACAT-ATTCA
256 AAAA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTG
* * * * * *
62446 AAAAAGAAATTTATTTTGTAAAT-TTTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTT
319 ATAAACAGATTTATTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAA-TTAGTATT
* * * * * * * *
62509 ATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAGAACAATTG-CTTATGAAAAAATAAAAGGTGATA
381 ATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATA
* * **** * *
62572 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAAAAAATAG-TTT
444 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATT
* *
62636 CATTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTG
509 -ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** * * * * *
62668 GAATATTAATAAATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATGAATTGATACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTTTA
** * * * * ** * ** * *
62733 TGATGAAACAAAAGGTCA-AAAAAATTTTAAATAAATAATTACTCAAATAGTTATGGCTATGTAA
65 TGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * * * * * *
62797 ATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTCTTCAAATATAAAAAAA
130 ACTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT-TAATAA
* * * *
62862 ATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATAGGGA-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA
194 ATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTAT--GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * *
62925 AAATGTCATAA-TAGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTT-ATTTG
257 AAA-GTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGGTTTG
* * * * * * *
62988 GTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTGTATAA
319 ATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * *
63053 TTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
382 TTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATA
* * * *
63116 GTGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAG-ATT
444 ATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATT
* *
63180 CATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTATA
509 -ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * * * * * *
63211 AGAATATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTTCGAATAAGCTTTTACGAATTGAAACAATTGCTT
1 A-AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAAAAAAATTGTTT
* * * * * *
63275 TGTGATAAAACAAAATGTCATAAT-GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTT
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* * ** * *
63339 GCAGTGGTT-AGGCCAATAGATTCATTTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
128 GAACTGGTTCA-GTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTA
** * * * **
63402 ATGCATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAATGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
190 ATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * **
63467 CAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAATTT-
255 CAAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTG
* * * * *
63531 AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATT
319 A-TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA-TATTAATAAATTAGTATT
* ** * ** *** * * *
63596 ATCTTATTCCGAACAAATTTATATGAACGTAAACATTTGTTTTATTACAAAAGCAAAGGTCATAA
381 ATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGTCATAA
* * * * * * ** * *
63661 CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-AATTATTTGAACCGGCTTGACAAATAAAATTA
445 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAACAGAATTA
*
63725 TTTTTTAAA-ATC-T-CTTATTAATTTTTG
510 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG
* * * ** * * * **
63752 AAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTGAAAATTTTGTTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTT-GTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT
* * *
63816 ATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAGGTCATAATAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * ** * *
63880 CAGTGGTT-AGGCCAATAGATTCATTTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
129 AACTGGTTCA-GTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAA
** * * * **
63943 TGCATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAATGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
191 TAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * **
64008 AAATGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAATTT-A
256 AAA-AGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTTGA
* * * * *
64072 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTA
320 -TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA-TATTAATAAATTAGTATTA
* ** * ** *** * * * *
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* * * * * ** * *
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*
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* * * ** * * * **
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1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTT-GTATGAA-TAAAAAAATTGTTTT
* * * * ** * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* *** * * * **
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* * * * * *
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446 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAC-AGAATTA
*
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * *
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320 -TAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTA
** * * **
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* *
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** * * * * *
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* * * ** * *
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* ** * * ** *
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* * *
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* * *
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* * *
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** * * * * * *** *
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* * *
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* * * * * * *
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** * * * *
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* * *
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* * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * * *
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* ** * * * * ** **
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* * *
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* * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
56660 AAGGTCATAATGATTTGAAATCA-ATAATTGTTCCAATAGTCTTAACTAATTGAATTTGTTTGGT
186 AAGGTCATAATGATTTGAAAT-ATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTAGTTCGGT
* *
56724 AAGCA-AATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTCG-AGTATCAATAAATTAGTATT
250 AA--ATAATTTATTTTTT-AAAT-TC-TGCTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** * *
56787 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGA
309 ATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAA-AAAAACAATTGTTTTATGA
* ** * *
56834 CTAAATGAAAGGTCGA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTACACTATTTGAACT
1 CAAAACAAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCTA-ACTATTTGAATT
* * * * * **
56898 GGTT-AGGCAAATACATTTAATTTTAAAATCT-TT-CAATAATTTTCATAATATTTTTAAATTAG
63 GGTTCA-GCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATAATAATTTTCATAATATTAATAAATTAG
* * *
56960 TATTATTTTTATT-TGAATAAGCTTGTATG-ATCAGAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-CAAGA
127 TATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * ** *
57022 TCATAATGATTTGAAAT-TGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTAGAAAAAC
190 TCATAATGATTTGAAATAT-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTAGTTCGGTAAAT
** *
57086 AAGTTTAGCTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTA-
254 AA-TTTATTTTTTAAAT-TC-TGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * *
57150 TTTCAAT----TTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATGA
316 TTTGAATAAACTTGTATGAAA-AAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
57186 TAAAACAAAATGTCATAACGACTTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAACT
1 CAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTC-AATAGTCTAA-CTATTTGAA-T
* ** * * * * ** *
57250 T-ATTTGGTAAACAGATTAATTTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTTAATGTTAATAAAT
62 TGGTTCAGCAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTT-AT-AATAATTTTCATAATATTAATAAAT
* * * * * * *
57314 TACTATTATTTTATTCTAAATAAGATTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAAT
124 TAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * * * *
57379 GT-TTAAATGATTTGAAATATATAATTATTCTAATATTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGGTAAA
189 GTCAT-AATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTAGTTCGGTAAA
* * *
57443 TACATTTATTTTTTAAA-TCT-CTTATAAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
253 TA-ATTTATTTTTTAAATTCTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * *
57506 CTGAATAAGCTTGTATGAAAAGAAATAATTGTTTTATGA
317 TTGAATAAACTTGTATGAAAA-AAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
57545 CAAAA-TAAAGATTATAATGATTT-AACATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT
1 CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTC-AATAGTC-TAACTATTTGAATT
** * * * *
57608 -GTTTTGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTAT--TAATTTTCAAAATATTAATAAATTAG
63 GGTTCAG-CAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATAATAATTTTCATAATATTAATAAATTAG
* ** * * * *
57670 TATTATTTTATTCTAAATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTAACGACAAAACAAAAGATC
127 TATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
57735 ATAACT-ATTTGAA
192 ATAA-TGATTTGAA
57748 TTTGCTCAAT
Statistics
Matches: 1316, Mismatches: 248, Indels: 155
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
351 2 0.00
352 80 0.06
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355 6 0.00
356 18 0.01
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359 91 0.07
360 7 0.01
361 17 0.01
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363 146 0.11
364 6 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (354 bp):
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAATAGTCTAACTATTTGAATTGGT
TCAGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATAATAATTTTCATAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
TGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAATTAGTTCGGTAAATAATTTAT
TTTTTAAATTCTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAA
CTTGTATGAAAAAAACAATTGTTTTATGA
Found at i:57744 original size:142 final size:143
Alignment explanation
Indices: 57591--57894 Score: 316
Period size: 145 Copynumber: 2.1 Consensus size: 143
57581 GTTCAAATAG
** * *
57591 TCATAACTATTTAAACTGTT-TTGATAAATAGATTTAGTTTT-TAAA-TCT-CTTATTAATTTTC
1 TCATAACTATTTAAACT-TTCTCAATAAACAGATTTA-TTTTAAAAATTCTACTTATTAATTTTC
* *
57652 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAT-TTTGCATGAATAGAAACAATT-GTT
64 AAAATATTAATAAACTAGTATTA-TTTATTCTAAAT-ATGTTTGCATGAACAGAAACAATTAGTT
*
57715 TAACGACAAAACAAAAGA
127 T-ACGACAAAACAAAACA
* * *
57733 TCATAACTATTTGAA-TTTGCTCAATAAACATATTTATTTTAAAAAATTTTTACTTATTAATTTT
1 TCATAACTATTTAAACTTT-CTCAATAAACAGATTTATTTT-AAAAA-TTCTACTTATTAATTTT
** * * *
57797 TGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTATTTTGAATATGTTTGTATGAACAGAAACAATTAGTTT
63 CAAAATATTAATAAACTAGTATTATTTATTCTAAATATGTTTGCATGAACAGAAACAATTAGTTT
* *
57862 ATGACAAAACAAAACT
128 ACGACAAAACAAAACA
*
57878 TCATACCTATTTGAAAC
1 TCATAACTATTT-AAAC
57895 AAATAATAGT
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 19, Indels: 17
0.79 0.11 0.10
Matches are distributed among these distances:
140 2 0.02
141 5 0.04
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143 3 0.02
144 2 0.02
145 55 0.42
146 39 0.30
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (143 bp):
TCATAACTATTTAAACTTTCTCAATAAACAGATTTATTTTAAAAATTCTACTTATTAATTTTCAA
AATATTAATAAACTAGTATTATTTATTCTAAATATGTTTGCATGAACAGAAACAATTAGTTTACG
ACAAAACAAAACA
Found at i:58225 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 57733--59721 Score: 1560
Period size: 181 Copynumber: 11.1 Consensus size: 181
57723 AAACAAAAGA
* * * ** *
57733 TCATAACTATTTGAATTTGCTCAATAAACATATTTATTTTAAAAAAT-TTTTACTTATTAATTTT
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
57797 TGAAATATTAATAAACTAGTATTA-TTTATTTTGAATATGTTTGTATGAACAGAAACAATTAG-T
65 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-GTT
** * * * * *
57860 TTATGACAAAACAAAACTTCATACCTATTTGAAACAAATAATAGTTAAAATAG
129 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * *
57913 TCATAACTATTTGAACGTGTTCAGA-AAAC-GAATTTATTTTTTTAAT-TTTTACTTATTAATTT
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTCA-ATAAACAG-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
** * * * *
57975 TTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGGAATAAACTTGTATGAACAT-AAAAAATTA
64 TTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTG
* * * * *
58038 TTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTAGAAATAAAAAATTGTTTAAGTAG
127 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
** * ** * * *
58093 TTGTAATTATTTGAACTTGTTCAATAAATTGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAATAATTTTT
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * *
58158 AAAATATTAATTAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATCAACTGATATAATTGTTTT
66 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT
* * * * *
58223 ATGATAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
131 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * *
58274 TTATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTG
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * **
58339 AAAATATTAATACATTAATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATT-TTTT
66 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT
* * * *
58403 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTCAAATAAATAATTGCTCAAATAG
131 ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
58454 TCATAACTATTTGAATTTATTCAGTAAACAAAGTTATTTTTTGAATCT-TTAACTTATTAATTGT
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATT-T
* * * * * *
58518 CT-GAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAAATAAGCTTGTATCAA-TAGAATAAAATT
64 TTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACT-GAA-ACAATT
* * * **
58580 ATTTTATGATAAAACAAATGGT--T----A--T---AGCAAT--TTG---AAATAG
126 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * * **
58620 TCATAACTATTTAAATTTGTTCAATAAACAGATCTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAAATTT
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * ** * *
58685 GAAATATTAATAAAATAGAATTATGCTATTTCGAATAAGCCTGTACGAA-TAGAAACAATTGTTT
66 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTT
* * * *
58749 TGTAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACCA-
130 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAA-TAG
* * ** * *
58801 TTATAACTATTTGCA-TTGGTT-AAGCCAACAAATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATT
1 TCATAACTATTTGAACTT-GTTCAA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATT
* * * * *
58863 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCGAATAAGATTGTATTAA-TAGAAACAATTA
63 TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTG
** *
58927 TTTTATGACAAAACAAGTGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
127 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * *** *
58982 TTATAACT-TATTAAACTAGTTTGGTAAACAGATTTATTTATTAAA--TC-T-CTTATTAATTTT
1 TCATAACTAT-TTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * ** * * * * * *
59042 TAAAATATTAATAAATCAATGCTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGTAC--AAAAAATTTTGT
65 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAA--TTGT
* * * * * *
59105 TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATCCATATCA-
128 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-AG
* * * *** * *
59159 TCTTAATTATTT-AAATTGGTTCGCCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTT
1 TCATAACTATTTGAACTT-GTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * * *
59223 CATAATATTATTAGATTAGTACTATTTTATTTCAAACAAGCTTGTATGAAGAT-AAATAATTGTT
65 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-CTGAAACAATTGTT
* * * * *
59287 TTATGATAAAACAAAAGCTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAA
129 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * ** * *
59340 TCATAA-T-TTTGAACTGGTTCATTAAGTATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTT
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * *
59403 GAAATATTAATAAATTAGTATGATTTTATTCCGAAT-AGACTAGTATG-A-TGAAAAATAATTGT
66 AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGAACTG--AAACAATTGT
* * *
59465 TTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGG
128 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * ** * *
59519 CCATGATTATTTGAAC-TGATTCGATAAACTGATTTATCTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTT
1 TCATAACTATTTGAACTTG-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * * * *
59583 TGAAATTTTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAGCTGAAACAATTGTTT
65 TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTT
* * ** * *
59648 TATGATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATTGATAATTATTCAAATAA
130 TATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
59700 TCATAACTATTTGAACTTGTTC
1 TCATAACTATTTGAACTTGTTC
59722 GGTAAAAAGA
Statistics
Matches: 1438, Mismatches: 301, Indels: 139
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
165 24 0.02
166 96 0.07
167 4 0.00
169 3 0.00
171 5 0.00
173 1 0.00
174 1 0.00
175 5 0.00
176 9 0.01
177 124 0.09
178 9 0.01
179 181 0.13
180 306 0.21
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182 24 0.02
183 7 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TCATAACTATTTGAACTTGTTCAATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
AAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTT
ATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
Found at i:58724 original size:166 final size:165
Alignment explanation
Indices: 58448--58783 Score: 369
Period size: 166 Copynumber: 2.0 Consensus size: 165
58438 ATAATTGCTC
* * * *
58448 AAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTCAGTAAACAAAGTTATTTTTTGAATCTTTAACTTATTA
1 AAATAGTCATAACTATTTAAATTTATTCAATAAACAAAGTTAGTTTTTAAATCTTTAACTTATTA
* * * * ** *
58513 ATTGTCTGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATC-AATAGAATAAA
66 AATGTCTGAATATTAATAAAATAGAATTATGCTAATTGAAATAAGCCTGTA-CGAATAGAA-AAA
* * * * *
58577 ATTATTTTATGATAAAACAAATGGTTATAGCAATTTG
129 ATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
* *
58614 AAATAGTCATAACTATTTAAATTTGTTCAATAAACAGA-TCTAGTTTTTAAATCTCTT-ACTTAT
1 AAATAGTCATAACTATTTAAATTTATTCAATAAACAAAGT-TAGTTTTTAAATCT-TTAACTTAT
*
58677 TAAAAT-T-TGAAATATTAATAAAATAGAATTATGCTATTTCG-AATAAGCCTGTACGAATAGAA
64 T-AAATGTCTG-AATATTAATAAAATAGAATTATGCTAATT-GAAATAAGCCTGTACGAATAGAA
* * *
58739 ACAATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
126 AAAATTATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
58779 AAATA
1 AAATA
58784 AATAATTGTT
Statistics
Matches: 142, Mismatches: 22, Indels: 13
0.80 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
165 41 0.29
166 95 0.67
167 6 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.10, T:0.39
Consensus pattern (165 bp):
AAATAGTCATAACTATTTAAATTTATTCAATAAACAAAGTTAGTTTTTAAATCTTTAACTTATTA
AATGTCTGAATATTAATAAAATAGAATTATGCTAATTGAAATAAGCCTGTACGAATAGAAAAAAT
TATTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTG
Found at i:59179 original size:358 final size:358
Alignment explanation
Indices: 58741--59508 Score: 843
Period size: 358 Copynumber: 2.1 Consensus size: 358
58731 GAATAGAAAC
* * * * *
58741 AATTGTTTTGTAACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACCATTATA
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATCCAAACCATTATA
** *
58806 ACTATTTGCATTGGTTAAGCC-AACAAATTCATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTTAGA
66 ACTATTTAAATTGGTT-AGCCAAACAAATTCATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTCAGA
* * * * *
58869 ATATTAATAAATTAGTATTACTTTATTTCGAATAAGATTGTATTAATAGAAACAATTATTTTATG
129 ATATTAATAAATTAGTACTACTTTATTTCAAACAAGATTGTATGAAGAGAAACAATTATTTTATG
** * * *
58934 ACAAAACAAGTGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTTATTAAACT
194 ACAAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAA-TT-TTAAACT
**
58999 AGTTTGGTAAACAGATTTATTTATTAAA-T-CT-CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCA-
257 AGTTCAGTAAACAGATTTATTTATTAAACTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAG
*
59060 ATGCTATTTTATTTCAAACAAACTTA-TATGTACAAAAAAT
322 ATG--ATTTTATTCCAAACAAAC-TAGTATG-ACAAAAAAT
* * * * * *
59100 -TTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATCCATATCATCT-T
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATCCAAACCAT-TAT
* * * * *
59163 AATTATTTAAATTGGTTCGCCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
65 AACTATTTAAATTGGTTAGCCAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAA
* * * * * * *
59228 TATTATTAGATTAGTACTATTTTATTTCAAACAAGCTTGTATGAAGATAAATAATTGTTTTATGA
130 TATTAATAAATTAGTACTACTTTATTTCAAACAAGATTGTATGAAGAGAAACAATTATTTTATGA
* * * * * *
59293 TAAAACAAAAGCTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAATCATAATTTTGAACTGGT
195 CAAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTTTAAACTAGT
* ** * * * *
59358 TCATTAAGTATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA
260 TCAGTAAACAGATTTATTTATTAAA-CTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAG-A
* * * **
59423 TGATTTTATTCCGAATAGACTAGTATGATGAAAAAT
323 TGATTTTATTCCAAACAAACTAGTATGACAAAAAAT
* *
59459 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATT
59509 GTTCAAATGG
Statistics
Matches: 335, Mismatches: 63, Indels: 21
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
356 26 0.08
357 5 0.01
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359 13 0.04
360 89 0.27
362 3 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATCCAAACCATTATA
ACTATTTAAATTGGTTAGCCAAACAAATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAGAAT
ATTAATAAATTAGTACTACTTTATTTCAAACAAGATTGTATGAAGAGAAACAATTATTTTATGAC
AAAACAAAAGCTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTTTAAACTAGTT
CAGTAAACAGATTTATTTATTAAACTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAGATGA
TTTTATTCCAAACAAACTAGTATGACAAAAAAT
Found at i:59196 original size:177 final size:178
Alignment explanation
Indices: 59007--59508 Score: 460
Period size: 179 Copynumber: 2.8 Consensus size: 178
58997 CTAGTTTGGT
* * *
59007 AAACAGATTTATTTATTAAATCTC-TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATCAATGCTATTTTA
1 AAACAAATTTATTTATTAAATCTCTTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAATACTATTTTA
* * *
59071 TTTCAAACAAACTTATATGTACA-AAAAAT-TTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGAT
66 TTTCAAACAAACTTATATG-A-AGAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGCTCATAACGAT
59134 TTAAAATAAATAATTATCCATATCATCTTAATTATTTAAATTGGTTCGCC
129 TTAAAATAAATAATTATCCATATCATCTTAATTATTTAAATTGGTTCGCC
* * * * * *
59184 AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTACTATT
1 AAACAAATTTATTTATTAAATCTC-T--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAATACTATT
* * * *
59249 TTATTTCAAACAAGCTTGTATGAAGATAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGCTTATAACGA
63 TTATTTCAAACAAACTTATATGAAGAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGCTCATAACGA
* * * * * * * * * ***
59314 TTTGAAATATATAATTGTTCAAATAATCATAA-T-TTTGAACTGGTTCATT
128 TTTAAAATAAATAATTATCCATATCATCTTAATTATTTAAATTGGTTCGCC
** * * ** * *
59363 AAGTATATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TGAT
1 AAACAAATTTATTTATTAAATCT-CT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAATACT-AT
* * * * * * *
59427 TTTATTCCGAATAGAC-TAGTATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAAC
62 TTTATTTCAAACAAACTTA-TATGAAGAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGCTCATAAC
* *
59491 GATTTGAAATAGATAATT
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AAAATAAATAATTATCCATATCATCTTAATTATTTAAATTGGTTCGCC
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** * * ** * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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* * * ** *
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1 AAATAATCATAACTT-TTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTA
* * * * *
59037 ATTTTTAAAATATTAATAAATCA-ATGCTATTTTATTTCAAACAAACTTA-TATGTACA-AAAAA
65 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGATG--ATTTTATTTCGAATAGAC-TAGTATG-A-ATAAAAA
* * * * * * * *
59099 T-TTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATCCATATCATCTT
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* * *
59163 AATTATTTAAATTGGTTCGCCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
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* * * * * *
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252 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAGATAAACAATTGTTTTATGA
* *
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* * ** *
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1 AAATAATCATAACTTTTGAACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAA
*
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* * *
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* * * ** * ** * * * *
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* * * * * *
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* *
59656 AACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT-TGATAATTATTC
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* *
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TTTTTGAAATATTAATAAATTAGATGATTTTATTTCGAATAGACTAGTATGAATAAAAATAATTG
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AGGTCATAACGATTTGAAATATATAATTGTTC
Found at i:60218 original size:178 final size:178
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60015 AATTAAGTTG
* *
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* * *
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* ** * * * *
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* * ** * *
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ATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTCGACAAACACATTTATGTTTTAAATCTCTACTATTAATAT
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59773 TTATGAACTG
* * * ** * *
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*** * **
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* * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATT--GTTCAAAT
** * * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
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*
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* * * *
60324 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATCA-ATAGTCGTTCAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
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* * * * **
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126 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA-AA
* * * * *
60685 AAACAAGTGTTTTATGACTAAACAGAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** **
60864 AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGTAATA--
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * **** * * * * * * * * *
60927 -ACAATTA-TT-ATA-TGACAAAATAAAAAGTAATAATGATTTGAAATAGATAGTTGCTCAAATG
66 CATAACTATTTGA-ACTGATTCGATAAACAG-ATTTAT-TTTTTAAAT--CT-TTTACT--TAT-
* * ** * * * * *
60988 GCCATAATCATTTGAACTGATTTGGTAAAGTGATTTATT-TTTTAAATCTCTAACTTATTAACTT
122 ----TAAT-TTTTGAAAT-A-TTAATAAA-TTA-GTATTATTTT--ATTTCGAA--TA--AGC--
*
61052 TTGAAAT-ATTAATA
170 TTG-TATGA-TAA-A
* * * * *
61066 AAGTAGCATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAA---CA-ATTGTTTTATGACAA-
1 AA--A-CA--ATTGT--TTT--ATGA-C----A-AAAC-AAAAGGTCATAATG-ATT-TGA-AAT
* ** * * * ** * ** * * * *
61126 A-ACAAAAGATCATAACAATTTTAAATAGAT-AATTG-TTCAAATAGTCAAAACCATTTGAACTT
47 AGATAATTGTTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTGATTC-GATA---AACA-GATTT--A-TT
* *
61188 GTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGGTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATT
103 -TTT--TAAA--------TCTTTT---A---C----TTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATT
* **
61252 AGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTATATGA-ACTG
146 AGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGATA-AA
* * * * * * *
61288 AAACAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAAATATTCTAATAGT
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *
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* * * * *
61413 -AGAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATCTGAATAAGCTTATATGATCAG
130 GA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGATAAA
* * * * * * * **
61465 AAACAATTATTTTATGAGAAAA-TAAAGTTCATAACT-ATTTTAGATTA-TTTTTTGTTCAAATA
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGA-AATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * ** * * *
61527 ATCATAATTATTTGAACTGGTTCG--AAATAGCTTTAGTTTCCAAATATCTTGCTTATTAATTTT
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* * * * * *
61590 TGAAATATTAGTAAAATAGTATT-TTTTATTTCGTATAAGTTTTTATGA-ACTA
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* * * *
61642 AAACAATTGTTTTATTACAAAATAAAAGGTTATAATGACTTT-AAATAGAAAATTGTTCAAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** * * * *
61706 TCA-AATCTATAAGAAATTG-TTCAATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATT
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* * * ** *
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127 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG-TATGATA-AA
* * * *
61825 AAATAATTGTTTTATGACTAAAA-AAAAGGTCAAAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAG
1 AAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * ** * * *
61889 TCTTAACTATTTGAACAGGTTTGGCAGACATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
65 TCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT
* * *
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* * * * * * **
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1 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATA
* *
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* * * * * * * * *
62127 TTAGAAAATTTTAATAGATCAATATTATTTTA-TTCTAA-ATGATT-T-TGCAT-GA
127 TTTG-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATAAA
* * * * * * *
62179 ATA-GATTGTTTAATGACAAAAGAAAAGATCATAATGATTTCAAATAGATAATTAG-TCAAATGG
1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAG
* * * * * ** *
62242 AT-ATGACTATTTGAACTTGTTTTG-TAAACATATTCATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTT
65 -TCATAACTATTTGAAC-TGATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
* *
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* ** * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
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*
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* * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
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* * * * * **
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* ** * ** * * **
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* ** * * * * * * *
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* * * * * * **
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* *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * * *
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65 TCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TT
* * *
63030 T-AAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATTT-GAAATAAGCTTGTATGAATAGA
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* * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * *** * * ** *
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* ** * * * ** *
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130 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATA-AA
* ** * *
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1 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * *
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* * * * * * ** * **
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* * * * *
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* * * * * * *
63690 TCA-AATTATTTGAACCGGCTT-GACAAATAAAATTATTTTTTAAAATC---T-CTTATTAATTT
65 TCATAACTATTTGAA-CTGATTCGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTT
* * * * * *
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** * * *
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* * * * *** * * ** *
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180 -AA
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* * * *
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319 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* ** * ** * * ** *
62720 TACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTCAAAAAAATTTTAAATAAATAATTACTCAAATAGTT
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
** * * * * * * *
62785 ATGGCTATGTAAATTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTCTTCA
66 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TTGA
* *
62850 AATATAAAAAAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATAGGGAAAAACAATTGTTTTA
130 AATAT-TAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATA-GGAAAAACAATTGTTTTA
*
62915 TGACAAAACAAAATGTCATAATAGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
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* * * *
62980 CTTATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTGTCT-AAATATTAATAAA
258 CTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAA
* *
63044 TTTGTATAATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAA-TAGA
322 TTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAACT-GA
* * * ** *
63083 AAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * *
63148 ATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATAAG
66 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGA-
* * * * *
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130 AATATTAATAAATTA-ATATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTATAGGAA---AAACAATTGTT
* * * *
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190 TTATGACAAAACAAAATGTCATAATAG-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * ** * * * **
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254 TGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
** * * ** *
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317 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* * * * *
63446 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTT
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** ** * * *
63511 ATAACTAATTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAA
66 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTGAA
* * * ** * * * *
63576 AGTATGAATAAATTAATATTATCTTATTCCGAACAA-ATT-TATATGAACGTAAACATTTGTTTT
131 A-TATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATAGGAA---AAACAATTGTTTT
* * * * *
63639 ATTACAAAAGC-AAAGGTCATAA-CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-AATTATTT
192 ATGACAAAA-CAAAATGTCATAATAG-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * ** * * *
63701 GAACCGGCTTGACAAATAAAATTATTTTTTAAA-ATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
255 GAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *
63763 AATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTGA
320 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAACTGA
* * * * *
63804 AA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAAT
1 AACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * ** * **
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* ** ** * * * * ** *
63933 AAAATATTAATGCATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGAATGTAT-GAACAGAAACAATTGTTT
128 GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTATAGGA-A-AAACAATTGTTT
* * * * *
63997 TATGACAAAAC-AAATGGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATT
191 TATGACAAAACAAAAT-GTCATAATAGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * * * *
64061 GAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAA-TTTTCAAAGTATGAAT
255 GAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATTAAT
* * ** * ** *
64125 AAATTAATATTATCTTATTCCGAACAAATTTATATGAAC-GTA
319 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTG-A
* * * *
64167 AACATTTGTTTTATTACAAAAGC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGT
1 AACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** ** * *
64231 CA-AATTATTTGAACCGGCTT-GACAAATAAAATTATTTTTTAAAATC---T-CTTATTAATTTT
65 CATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAA-TTT
** * * * * * *
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* * * * ** *
64351 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-GATTTGAAATAAAGAATTATTCATATAACCTTAACT
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
64525 AATAATTGTTTTATGACATAAGAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * ** *
64590 ATAACTATTTGAACTCGTTAGGTAAACAGATTTACTTTTTAAATCTACTATTTATTAATTTTTGA
66 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTGA
* * * * * **
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130 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTAAATAAGCTTGTAT-A-GGAAAAACAATTGTTTTA
** * * *
64720 TGATGAAACAAAA-GTTCATAAT-GATTT---A-AAAT-A--G-----AT-GCCATAATTACTTG
193 TGACAAAACAAAATG-TCATAATAG-TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
64770 AAC-TGATTTGATAAACTAATTTATTTTTTAAATCT-TTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT
256 AACTTG-TTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * *
64833 -AAGTAATATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGCACTGA
319 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* * * * *
64874 AACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTGTTCAAATAGTC
1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * *
64939 ATATCTATTTGAACTTGTTTAGTAAACT-GATTTATGTTTCT-AAT-TTCTTGCTTATTAATTTT
66 ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAA-TAGATTTAT-TTTTTAAATCTT-TTACTTATTAA-TTT
* * * * * ** * * *** *
65001 TTAAATGTTAATAAATTAGTATTATTAT-ATTTCAAATTGGCATGTTTAAGCTGAAACAATTATT
127 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCT-AAATAAGCTTGTAT-AGGAAAAACAATTGTT
** * * * * * *
65065 TTATGATTAAACAAAAAGCCAGAACAAG-TTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATT
190 TTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TAGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * * *
65129 TAAACTGGTTTAGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TC---CTTATTAATTTTTGAAATAGTAAT
254 TGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* ** *
65189 AAATTGGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATACCAATTA
319 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-A-A-C--TGA
* ** * * *
65236 TTCTTAATCATTGGTATTATTTTACAACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATAG
1 -----AA-CA-----ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * **
65301 TTCAAATTGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCCATCTT
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* * * * * * * *
65365 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAGTAAACTTTTAT-GAATAGA
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* * * * * * *
65428 AACAATTGTTTTATGACCAAAGAAAATATCGT-ATTGATTTTAAATAAAATATTTGTTCAAATAG
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* * * * * * * *
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243 TCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * **
65556 TGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATGAACAAA
307 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* * * * *
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1 AACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
*** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * *
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250 TATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * * * * *
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* ** * * *
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1 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** *
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* * *
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* * * * *
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*
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257 ACTTGTTTGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTGAAATATTAAT
* * *
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319 AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAAC-TGA
* * * *
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1 A-ACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * **** * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * * ** *
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* ***
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* * * * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** * *
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** * *
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244 CATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
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308 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA
* * * * * *
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1 A-A-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * * **
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* * *
67536 AAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTAT--GAATTGAAACAATTGTTT
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** * * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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*
67769 AATAATTGT
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Statistics
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* * * * *
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** ** *
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* * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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192 AAAGGTCATAATGA-TTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTT-
* * * * * *
61728 A-ATAAACAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAATA
253 AGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * *
61792 TTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTTATGAACTA-AAATAATTGTTTTATGACTAAAA-AAAAGGT
316 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTG-TATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAAGT
* * * * * * * * * *
61855 CAAAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACAGGTTTGGCAGACAT
378 CATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAG
** *
61920 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAAT
442 ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-AT
* * * * * * *
61985 T-TGAATAAGCTTGCATGAAAAGAAACAATTGTTT
504 TCCGAACAAACTTGTATGAACATAAACATTTGTTT
* * * * * ** *
62019 TAGGACAAAA-TAAAGATCATAACGAATT-AAGATAGATAATTATTTGAATAGTCATAACTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
** * * * * *
62082 GAACTATTTTCG-TAAATAGATTTAGTTTTT-AAATC-TCTTATTAA-TTTAGAAAATTTTAATA
65 GAACTGGTTT-GATAAATAAAATTATTTTTTAAAATCTTCTTATTAATTTTTG-AAATATTAATA
* * * * * * * * * *
62143 GATCAATATTATTTTA-TTC---TAAATGATTTTGCA-TGAATA-GATTGTTTAATGACAAAAGA
128 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTATTATGAACTGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * **
62202 AAAGATCATAATGATTTCAAATAGATAATTAG-TCAAATGGAT-ATGACTATTTGAACTTGTTTT
192 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATT-GTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTAG
* * * * * *
62265 GTAAACATATTCATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTA
255 GTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* * * * ** * *
62330 TTTTATTTCGAATAGGCTTGTATGAATAGAAATAATTGACTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAAC
319 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
* * * * * * ** * *
62395 TATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACATATTCAAAAAAGAAATTTAT
384 AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTAT
* * * * *
62460 TTTGTAAAT-TTTTCCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATT-CGAA-
448 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCGAAC
* *
62521 ATAAGCTTGTATGAACA-AGAACAATTG-CT
511 A-AA-CTTGTATGAACATA-AACATTTGTTT
* * * * * *
62550 TATGAAAAAATAAAAGGTGATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTA
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTG
* ** * ** * * * *
62615 AACTTGTTCAAAAAAT-AGTTTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTATTTTTTGGAATATTAATA
66 AACTGGTTTGATAAATAAAATT-ATTTTTTAAA-ATCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * **
62679 AATTAGCATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA-TATGAATTGATACAATTGTTTTATGATGAAACA
128 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG-TTATTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* ** * ** * ** * * * * *
62743 AAAGGTCAAAAAAATTTTAAATAAATAATTACTCAAATAGTTATGGCTATGTAAATTTGTTCGGT
192 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGT
* * * * * * * * *
62808 AAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTCTTCAAATATAAAAAAAATTAATATTAT
257 AAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATAT-TAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
62873 TTTAATCTAAATAAGCTTGTATAGGGA-A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA
320 TTTATTTTGAATAAGCTTGTAT--GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * *
62936 TAGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATTTA
383 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATTTA
* * * * * *
63001 TTTTTTAAGTCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAATTTGTATAATTTTATT-TGAA-
447 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAAC
* * * * *
63064 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTT
511 A-AA-CTTGTATGAACATAAACATTTGTTT
* * * * *
63094 TATGACAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTGAAATTGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTG
* * * * * *
63159 AACTTGTTTGGTAAAT-AGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTATAAGAATATTAAT
66 AACTGGTTTGATAAATAAAATT-ATTTTTTAAA-ATCTT-CTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * * * *
63222 AAATTAG-ATTTATGTTATTTCGAATAAGCTT-TTACGAATTGAAACAATTGCTTTGTGATAAAA
127 AAATTAGTA-TTATTTTATTTCGAATAAG-TTATTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
63285 CAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCAGTGGTTAG
190 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAG
** * * ** *
63350 GCCAATAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATGCATTAGCATT
255 GTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* ** **
63415 ACTTTATTTTGAATAAGAATGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAA
318 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * *
63480 CAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTA
383 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTA
* * * *
63545 TTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTATTCCGAAC
447 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAAC
* * *
63610 AAATTTATATGAACGTAAACATTTGTTT
511 AAACTTGTATGAACATAAACATTTGTTT
* * *
63638 TATTACAAAAGC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-AATTATTT
1 TATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
* * *
63701 GAACCGGCTTGACAAATAAAATTATTTTTTAAAATC-TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
65 GAACTGGTTTGATAAATAAAATTATTTTTTAAAATCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * *
63765 TTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAA
130 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTATTATGAACTGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * **
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194 AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTAGGTAA
* * ** * *
63894 ATAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATGCATTAGCATTACTT
259 ATAGATTTA-TTTTTTAAATCC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** **
63959 TATTTTGAATAAGAATGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAAT
322 TATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAAT
* * * * *
64024 TTGAAATAAAGAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTAATTTAGTAAATAGATTTATTTT
387 TTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTATTTT
* * * * *
64089 TTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTATTCCGAACAAAT
451 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAA-TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAACAAAC
* *
64154 TTATATGAACGTAAACATTTGTTT
515 TTGTATGAACATAAACATTTGTTT
* * *
64178 TATTACAAAAGC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCA-AATTATTT
1 TATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
* * *
64241 GAACCGGCTTGACAAATAAAATTATTTTTTAAAATC-TCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
65 GAACTGGTTTGATAAATAAAATTATTTTTTAAAATCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * *
64305 TTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAA
130 TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTATTATGAACTGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * ** * * *
64369 AGGTCATAATGATTTGAAATAAAGAATTATTCATATAACCTTAACTATTTCAA-TAGATTTA-GT
194 AGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-GTTAGGT
* * * * *
64432 AAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATTTTATTACAA-TAGTATTAT
257 AAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA-AATTAGTATTAT
* * * * * * * *
64496 TTTATTTTTAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACATAAGAAAAGGTTATAACA
320 TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACA
* *
64561 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCG-TTAGGTAAACAGATTTAC
385 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTA-GTAAACAGATTTAT
* * * * * * *
64625 TTTTTAAATCTAC-TATTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTTTTATTTTAATCCAAAT
448 TTTTTAAATCT-CTTACTTATTAA-TTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAAC
** * * *
64689 AGGCTTGTATGATAAAAAAACAATTGTTT
511 AAACTTGTATGA-ACATAAACATTTGTTT
** * * * *
64718 TATGATGAAACAAAAGTTCATAATGA-TT----T--A-AA--A-T-AGAT-GCCATAATTACTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTG
* * *
64770 AACTGATTTGATAAACT-AATTTATTTTTT-AAATCTTTAACTTATCAATTTTTGAAATATTAAT
66 AACTGGTTTGATAAA-TAAAATTATTTTTTAAAATC-TT--CTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * *
64833 -AAGTAATATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATGCACTGAAACAATTGTTTTATGATAAAATA
127 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTATTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * *
64897 AAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATATCTATTTGAACTTGTTTA-G
192 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTAGG
* * * * * *
64961 TAAACT-GATTTATGTTTCTAATTTCTTGCTTATTAATTTTTTAAATGTTAATAAATTAGTATTA
256 TAAA-TAGATTTAT-TTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTA
* ** ** * * * * ** * *
65025 TTATATTTCAAATTGGCATGT-TTAAGCTGAAACAATTATTTTATGATTAAACAAAAAGCCAGAA
319 TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA-CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA
* * * * * *
65089 CAAGTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACTGGTTTAGCAAACACATTTA
383 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAACAGATTTA
* * * * ** *
65154 TTTTTTAAATC-CTTA-TTA--ATTTTTGAAATAGTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATA
447 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAACA
** *
65215 ATTTTGTATGAATACCAATTATTCTTAATCATTGGTATTATTT
512 AACTTGTATG-A-A-C-A-TA-----AA-CA----T-TTGTTT
** * * * * *
65258 TACAACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TAGTTCAAATTGACATGACTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAATTATTT
* * * *
65322 GAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCCATCTTATTAATTTTT-AGAATATTAA
65 GAACTGGTTTGATAAATAAAATTATTTTTTAAAATCT---TCTTATTAATTTTTGA-AATATTAA
* * *
65385 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAGTAAACTT-TTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACCAA
126 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AAGTTATTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAA
* ** * * * * * *
65448 AGAAAATATCGTATTGATTTTAAATAAAATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACT-CTC
189 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-
* * * * * * ** *
65512 TCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTA
252 TAGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTA
* * * *
65577 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTATGAACAAAAATAATT-TATTTATCACAAAACAAAATAGTC
316 TTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAA-AGTC
* * ** *
65641 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTT-AA-TGTGTTCAAAAAAATA
379 ATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TT--AGTAAACA
* * * * *
65704 AATTTATTGTTTAAAT-TATTATTTATTATTATTTT-TAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
441 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTA--ATTTTCAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
* * * ** * *
65766 TT-CGAAACAAGCTT-TCATGAATAGATCCAATTGCTT
503 TTCCG-AACAAACTTGT-ATGAACATAAACATTTGTTT
* * ** *
65802 TCTGACAAAACAAAAAGTCATAATG-TATTGAAATAGATAATTATTCCCATAGTCATTATTATTT
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTT
** * ** * *
65866 GAACTTTTTTTG-TAAA-CAAATTCATTTTTATAATTCTCTTACTCATTAATTTTTCAAATATTA
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* * * * * * * **
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125 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGTTATTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * *
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* * * * * *
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253 AGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
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317 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATA
* * *
66185 ACAA--T----T---T-ATTGTTCAAATAATCATAA-TGATTTGAACTTGTTTGGTAAAAAGATT
382 ACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TGTTTAGTAAACAGATT
* * * * *
66239 TATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCTTAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATT-TGA
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* * * *
66303 AATAAACTTGTTTGAACATAAGAAATCT-TTT
508 AACAAACTTGTATGAACATAA-ACATTTGTTT
* ** * *
66334 TATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTA
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTG
* * * ** * * * *
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* * * * *
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*** * * * * * * * *
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* * * ** * * *
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258 AATAGATTTA--TTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* *** * * * * * *
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* ** * *
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386 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAACAGATTTATT
* * * *
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449 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAACAAA
* *
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* * * *
66870 TATAACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATACTTGA-TCAAATAGTCATAATTATTA
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCATAATTATTT
* * * *
66934 GAATTGGTTAGGTAAA-AAGAATTA-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
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* * * * * * *
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* * * * *
67059 AGAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTT
189 A-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
* * * * * * * * *
67124 TGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTACTAT
253 AGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTAT
** * * * * * *
67189 TATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGATAGAACAAAAGGTTTAT
317 TATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCA-
* * ** * * * *
67254 TTTTTAAATAATTGATTTGAAGTTTATAATTGTTGACATAGTCATAACTATTTGAATTGGTTCAG
380 ----T-AA-CA---ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG
* *
67319 TAAACAGATTTATTTTTT-AA-CTCTTACTTATTAATTTCTGAAAGATTAATAAATTAGTATTAT
435 TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TCAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * * * *
67382 TTTATTCTGAACAACCTCGTATGATAAAT-ATCAATTGTTG
499 TTTATTCCGAACAAACTTGTATGA-ACATAAACATTTGTTT
* * ** * * * *
67422 TATGACTAAACAAAAGGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAGATAGCCATAATTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTG
** * * * * *
67487 AACT-AATTCAGTAAAT-AGATTCACTTTTT-AAATC-ACTTATTATTTTTTGAAATATTAATAA
66 AACTGGTTTGA-TAAATAAAATT-ATTTTTTAAAATCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * **
67548 ATTAGTTTTATTTTA-TTCTAAATAAGCTT-GTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGGTAAAACA
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* * * * * * * * * *
67611 AAATGTCATAATGATTCT-AAATAGACAATTATTCCAATAATCGTAACTACTTGAATTTGTTTA-
192 AAAGGTCATAATGATT-TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGGTTAG
* * * * * *
67674 GTAAACAAATTTGTTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAGAAATTAGTATT
255 GTAAATAGATTT-ATTTTTTAAATC-CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * *
67738 ATTTTATTTTGGATAACCTTTTATGAACTGAAATAATTGT
318 ATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGT
67778 GAATGTTAAA
Statistics
Matches: 5114, Mismatches: 930, Indels: 506
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
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AGATTTATTTTTTAAATCCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
TTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGA
AATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
TCTCTTACTTATTAATTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGAACAAACTTGTAT
GAACATAAACATTTGTTT
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* * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * ** *** * * **
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* * * ** * * * * *
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* ** * * * * * * *** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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*
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* *
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1 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATA-AATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTAT
** * * ** * * * * * *
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* ** ** * * *
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125 TAATAAATTAGAT-TTATGTTATTTCGAATAAGAATG-TACGAAC-AGAAACAATTGCTTTATGA
* * * * * * * * * *
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187 C-AAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAACAATCATAACTAATTGAACT
* * * * * *** * *
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251 A-GTTAGGCAAATAGATTCATTTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAA
** * * * ** ** * * *
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314 TTAACATTACTTT-ATTCCGAACAAGAATATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * ** * * * ** *
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378 TGGTCATAAC-AATTTGAA-ATAAAGAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACGAATTGAGC
* * * ** * * * * * *
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441 AAATAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTA
* * * * * * * * *
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506 TTCCGAACAAAG-TTATAAGAACGTAA-ACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT
* * * * * * * * *
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569 TTGAAATAAATAATTATTCAAAT-AACCT-TAACTATTTGAA--TGATTTGTAAATAAATTTATT
* * * * *
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**
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* * * *
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1 TATGACAAAACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * * * * * **
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* * ** * *
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127 ATAAA-TTAGATTTATGTTATTTCG-AATAAGAATGTACGAACAGA-AACAATTGCTTTATGACA
* * * ** * * * * * * *
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189 AAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAACAATCATAACTAATTGAACTAGT
** * * * *** *
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* * ** * ** ** * ** *
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* * * * * * ** * **** * *
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* * * * * * *
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445 AAAATTATTTTTTAAATCTCTTAC---TTAATT-TTCAAAGTAT-GAATAAATTAATATTATCTT
* * * * *
62876 AAT-CTAA-ATAAGCTTGTATAGGGAA---AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA
505 ATTCCGAACA-AAG--T-TATA-AGAACGTAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** * *
62936 T-AGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAACTTATTTGGTAAACAAATT
565 TGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAACCT-TAACTATTTGAA-TGATTT-GTAAATAAATT
* * * *
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626 TATTTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTG-
* *
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* **
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1 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
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** * ** * *
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131 ATTAGATTTATGTTATTTCGAATAAGAATGTACGAACAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAA
** * * * * * *
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* ** *
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261 ATAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAATTAACATTACTT
** * *
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326 TATTCCGAACAAGAATATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAAT
* * * * * * *
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391 TTGAAATAAAGAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACGAATTGAGCAAATAAAATTATTTT
*
63549 TTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTATTCCGAACAAAT
456 TTAAATCTCTTA---CTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTATTCCGAACAAAG
* * *
63614 TTATATGAACGTAAACATTTGTTTTATTACAAAAGC-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAA
518 TTATAAGAACGTAAACATTTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAA
** * * * ** * *
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582 TTATTCAAATAACCTTAACTATTTGAA-TGATTTG-TAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTA
* * *
63739 TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAGTTACTAAGAACTGA
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*
63804 AAATTTTGTTT
706 AAATATTGTTT
* * *
63815 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * *
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66 AACTGGTTAGGCAAATAGATTCA-TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTAT-AAGAATATTAA
** * * *
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128 TAAATTAG-ATTTA-TGTTATTTCGAATAAGAATGTACGAACAGAAACAATTGCTTTATGACAAA
* * * *
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191 ACAAAAT-GTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAACAATCATAACTAATTGAACT-AGT
* * * *
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254 TAGGCAAATAGATTCATTTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAATTAA
* * * *
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* * * * **
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379 GGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAA-CGAATTGAGCAA
* * ** * *
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443 ATAAAATTATTTTTT-AAATCTCTTACTTAA-TTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTA
** *
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506 TTCCGAACAAAGTTA-TAAGAACGT-AAACA-TTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* * *
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568 TTTGAAATAAATAATTATTCAAATAACCTTAACTATTTGAAT-GATTT-GTAAATAAATTTATTT
* * * *
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*
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* * ** *
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1 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * * ** *
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* * * * * * ** * * * * **
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** * * * *
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** * * * ** * * *
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256 GGCAAA-TAGATTCATTTTTTTAAATCCGTT-ACTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAATTAAC
* * * ** * * * * * *
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319 ATTACTTTATTCCGAACAAGAATATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCA
** * * * * * * *** * * *
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384 TAACAATTTGAAATAAAGAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACGAATTGAGCAAA-TAAA
* * * * *
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* * * * * ** * * * *
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* * * * ** * * * * *
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* *
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* *
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * *** * * * * * *
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* ** * * * ** * *** * * **
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255 AGGCAAATAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAATTAACA
* ** * ** * * * * *
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320 TTACTTTATTCCGAACAAGAATATATGAACAGAAACAATTGT-TTTATGACAAAAC-AAATGGTC
* * * * * * ** * **
65641 ATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACT-ATTTAATGTGTTCAAAAAAATAA
383 ATAACAATTTGAAATAAAGAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACGAATT-GAGCAAATAA
* * * * ** * * *
65705 ATTTATTGTTTAAAT-TATTATTTATTATTATTTTTAA-TATTAATAAATTTATATTATTTTATT
447 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA--A-T-TTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTATT
* * * * * *
65768 -CGAA-ACAAGCTT-TCATGAA--TAGATCCAATTGCTTTCTGACAAAACAAAAAGTCATAATG-
508 CCGAACA-AAG-TTAT-AAGAACGTA-A-ACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA
* ** * * * ** * *
65827 TATTGAAATAGATAATTATTCCCATAGTCATT-ATTATTTGAACTTTTTTTGTAAACAAATTCAT
568 T-TTGAAATAAATAATTATTCAAATA-ACCTTAACTATTTGAA--TGATTTGTAAATAAATTTAT
* * * * *
65891 TTTTATAATTCTCTTACTCATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTGGTATTATTTT-GTTTAAGA
629 TTTT-TAAATCTCTTA-TTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGA-A
* * * *
65955 TAATTTATATTAACT-AAAACAATTGTTT
690 TAAGTTGTATGAA-TGAAAA-TATTGTTT
* ** * * * * *
65983 TATTATGAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTG
1 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* ** * * * * *
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66 AACTGGTT-AGGCAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATAAG-AATATTAAT
* * ** * * ** *
66111 AAATTA-ATATTATTTTA-ATCTGAATAAGCTTGT-TGAATAGAAACAATTATTTTACGACAAAA
129 AAATTAGAT-TTATGTTATTTC-GAATAAGAATGTACGAACAGAAACAATTGCTTTATGACAAAA
* * * * *
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192 CAAAATGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAACAATCATAACT-AATTGAACTAGTTA
* * * ** * ** * ***
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256 GGCAAATAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAATTAACAT
* * * * * *
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* * * * * * * * * *** * ** *
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* * * ** * * * *
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* * * * ***
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506 TTCCGAACA-AAG-TTATAAGAACGT-AAA-CATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG
* * ** * * * * * *
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* * * ** * * * ***
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*
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* * * * * * **
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* * * * * ** * * * *
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320 TTACTTTATTCCGAACAAGAATA-TATGAACAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAA-CAAATGGT
** * * * * * * * ** * *
67069 CATAATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTG-GTAAACA
382 CATAACAATTTGAAATAAAGAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAAC-GAATTGAGCAAATA
* * * * * * * * *
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446 AAATTATTTTTTAAATCTCTTA---CTTAA-TTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTAT
* * * * * * * *
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507 TCCGAACA-AAG-TTATAAGAACGTAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGG---------T-
* * ** * * * ** * * * *
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560 CATAA-TGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAACCTTAACTATTTGAA-TGATT-TGTAAATA
* * * *
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* * * * *
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* * ** * * * * *
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** * * * * *
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* * * ** * ** * **
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TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
AACTGGTTAGGCAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTATAAGAATATTAATAA
ATTAGATTTATGTTATTTCGAATAAGAATGTACGAACAGAAACAATTGCTTTATGACAAAACAAA
ATGTCATAACAATTTGAAATAAAGAATTGTTCAAACAATCATAACTAATTGAACTAGTTAGGCAA
ATAGATTCATTTTTTTAAATCCGTTACTTATTAATTTTCAAAATATGAATAAATTAACATTACTT
TATTCCGAACAAGAATATATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAAT
TTGAAATAAAGAATTATTCAAATAGTCATAACTAATTGAACGAATTGAGCAAATAAAATTATTTT
TTAAATCTCTTACTTAATTTTCAAAGTATGAATAAATTAATATTATCTTATTCCGAACAAAGTTA
TAAGAACGTAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTAT
TCAAATAACCTTAACTATTTGAATGATTTGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTATTAA
TTTTTAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTGTATGAATGAAAATATTGTT
T
Found at i:65686 original size:18 final size:18
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*
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* *
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1 AA
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AAATAGTCATAACTATTT
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1 TT
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Statistics
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TTCAAATAGCATAATTA
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68639 TATTTTAAAC
* * * * *
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1 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGG
* * * * * * **
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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*
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511 TTTATTCTAAATAAGCTTATATGAA
** * * * *
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1 -AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATA-TTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
* * * * * *
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* *
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* * * *
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* * * * **
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* * * *
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320 -AAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAATTATTTTATGACAAA
* * * * * * * *
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382 ACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
* * * *
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*
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* *
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1 -AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
* * * * * * * *
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64 GGCCATAATTATTTGAACAT-GTT-GATAAA-TAGATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * *
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126 TTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TATGAATTGAACTAATT
* * * * *
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189 GTTTTATGACAAAACAAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTA
** * * * * * * *
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* * * * * *
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317 ATAAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAA
* * * * * * * *
70093 TCAATAGGAT-ATAAC-A-TTCAAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTGGC
382 ACAA-AAGATCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-
** * * * * * * *
70155 TCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTTAAAGATTAATAAAGTAGTA
444 TTTGAAAACAGATTTATTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTATAAATATTAATAAATTAGTA
* ** *
70220 TTATTTTATTCCAAATATCCTTGTATGATA
507 TTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGA-A
* * * * * * * *
70250 AAAAATAATTGTTCTATGA-TAAACAAAATGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATG
1 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATG
* * * ** *
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65 GCCATAATTATTTGAACATG--TTGATAAATAGATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* ** * *
70378 TTAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTA-TTCTGATAAGCTTCTATGAATTGAAAATAATTGT
127 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTG-AACTAATTGT
* * * * * *
70441 TTTATGACAAAACAAATA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAAACTTAACTCT
191 TTTATGACAAAACAAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTAT
* *
70505 TTAAACTAC-TTCGGCAAATAGATTTATATTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTA
255 TTAAACT-CGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TAGTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * * *
70569 TTAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATAATAGA
318 TAAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAA
* * * * * * *
70633 ATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG---GAACTA---G--C---CTT
382 ACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTT
* * * * *
70687 GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCATATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATT
447 GAAAACAGATTTATTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAATTTTAT-AAATATTAATAAATTAGTATT
* * * *
70751 ATTTTATTCTGAAT-AGACATGTATGATG
509 ATTTTATTCTAAATAAG-CTTATATGA-A
* *
70779 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
1 AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAAT-ATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
*
70843 GGCCATAATTATTTGAATCGAT-TTGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAAT
64 GGCCATAATTATTTGAA-C-ATGTTGATAAA-TAGA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * ** *
70906 TTTTGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAACTCT-TATGAATTGAAACT-AT
125 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TATATGAATTG-AACTAAT
* * * * * *
70969 TGTTTTATGATAAAAC-AAAAGGTCGTATTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
188 TGTTTTATGACAAAACAAAAAGGTC-AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAAC
** * * * * * *
71033 TATTTAAACTTATTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTTTTGTGTAGTAGTTTTTTGAAA-
252 TATTTAAACTCGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTAGT-TATTA-ATTTTTGAAAT
* * * *
71097 GTTA-ATAAATTAGTATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTCCAAA-AATTATTTTATG
314 ATTATA-AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTATTTTATG
* * * * * *
71160 ACTAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAGCT
377 ACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
71225 AGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTT-TAGAATATT-ATTAATT
442 GGTTT-GAAAACAGATTTA-TTTTTAAA-ATTTTACTTATTAATTTTATA-AATATTAATAAATT
* * * * * *
71288 GAGCAATATTTTACTCCAAATTAGCTTGTATGAA
503 -AGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTATATGAA
* * * *
71322 CAGAAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAA
1 -AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TATTTGAA
71368 TTGGTTCGAT
Statistics
Matches: 1758, Mismatches: 311, Indels: 219
0.77 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
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527 2 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (535 bp):
AAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATGG
CCATAATTATTTGAACATGTTGATAAATAGATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAATTGAACTAATTGTTTTAT
GACAAAACAAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAATCATAACTATTTAAAC
TCGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATAAAATTA
GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGAT
CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGAAAACAGA
TTTATTTTTAAAATTTTACTTATTAATTTTATAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAA
ATAAGCTTATATGAA
Found at i:69923 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 68658--71367 Score: 1935
Period size: 180 Copynumber: 15.2 Consensus size: 180
68648 CAAAAACAAT
* * * ** * * *
68658 TTTTACGACAAAACAAAATGTCATAA-GATTTGAAATAGATAATAGTTTGAATGGACATGACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * **
68722 TTGAACTTGTTTA-GTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTAATTTTT-AGAATATT
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* * * *
68785 AA-AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATAG
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* * * * * * *
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1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
68902 TTGAACTCGCTCA-ATAAACAGATTTATTATTTCAATCT-TCTACTTATTAATTTTTGAAAT-TT
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* * *
68964 TATAAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTTTATGAATAGAAATAATTAG
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* * * * *
69019 -TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGGAATGGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
** * * * **
69083 TTGAACGGGTTTA-GAAAACATATTTACTTTTTAAAAT-T-TTACTTATTAA-TTTCCATAATAT
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* * * ** * * * *
69144 TAATCAATTTA-TATCATTTTA-TTCTAAATAAGCTTACATGAACAGCACCAACTA
128 TAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAG-AACAATTG
* * * *
69198 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAT-ATTTTGAAATAAATAATTGTTTATATAGTCATAACTC
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
69262 TTTGAAC-ATGTTCGATAAATAGA-TT-TTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTTGAAATATT
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* * *
69324 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTGAACT--AACGTAATTG
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* * * * * *
69377 TTTTATTACAAAATAAAAAGGTCA-AATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATGACTA
1 TTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * ** * **
69441 TTTTAACTTGTTCGGT-AA-ATATTTATTTTTTAAATCGATTACTTATTAATTGTCAAAATATTA
65 TTTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
69504 ATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAACCTTGTATGAACAAAAGCAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAA-CAATTG
* * ** * * * * * *
69556 TTTTATTACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTCAAATAAATATTTGTTCGAATAATCATAACAAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
69621 TTGAATTGGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA---A-TAATTTTTTAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * *
69681 CAAATTAGTA-T-TTTT-TTT-GAACAAACTT-TATGAATAAAAACATTTA
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAACAATTG
* * *
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* * * * * *
69792 TTGAATTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTTCTGAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * *
69857 TAAATTCA-TTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAATTGAACAATTG
131 TAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAACAATTG
* * * *
69907 TTTTATGACAAAAC--AA----A-AAGGATTTGACATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * * * * * *
69965 TGGAATTAGTTTGGCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTCTCATAATATTA
66 TTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * * * * *
70029 TTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTA
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAACAATTG
* * * * * * * * * *
70081 TTTTATGGCAGATCAATAGGAT-ATAA-CA-TTCAAAGTATACAATTATTCAAATAGTCATAATT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * * * * *
70143 ATTTAAACTGGCTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCATACTTATTAATTTTTTAAAGAT
64 ATTTGAACTAG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * ** * * *
70207 TAATAAAGTAGTATTATTTTATTCCAAATATCCTTGTATGATAAAAAATAATTG
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA-ATAGAACAATTG
* * * * ** * * * *
70261 TTCTATGA-TAAACAAAATGTAATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* ** * * ** * *
70325 TTGAACT-GATTTGGTAAATGGATTCACTTTTTAAATAACTTACTTTTTAATTTTTAAAATATTA
66 TTGAACTAG-TTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * *
70389 AT-AATTAGTATTATTTTA-TTCTG-ATAAGCTTCTATGAATTGAAAATAATTG
130 ATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA-T-AGAACAATTG
* * * ** * *
70440 TTTTATGACAAAACAAATA-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAAACTTAACTC
1 TTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * * *
70504 TTTAAACTACTTCGGCAAATAGATTTATATTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTA
65 TTTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTA
* * * *
70569 TTAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTA
130 ATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAACAATTG
* * * * * * *
70621 TTTTATAATAGAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG---GAACTA-
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
70682 --G--C--CTT--GTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTGCATATTAATTTTTGAAATATTAA
66 TTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* *
70739 TAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAAT-AGACATGTATG-ATGAAAAACAATTG
131 TAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAG-CTTGTATGAAT--AGAACAATTG
* * *
70790 TTTTATGACAAAAC-AAAGGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * *
70854 TTTGAA-TCGATTTGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATAT
65 TTTGAACTAG-TTAGGTAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
* * * * * *
70917 TAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAACTCT-TATGAATTGAAACTATTG
128 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCT-TGTATGAATAG-AACAATTG
* * * * * *
70971 TTTTATGATAAAACAAAAGGTCGTATTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * ** * *
71036 TTAAACTTA-TTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTAAAAT-TTTTTGTGTAGTAGTTTTTTGAAA-
66 TTGAAC-TAGTT-AGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACT-TATTA-ATTTTTGAAAT
* * * ** * *
71097 GTTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTCCAAAAATTA
126 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAACAATTG
* * * * *
71153 TTTTATGACTAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * * *
71218 TTGAGCTAGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATATCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATT-
66 TTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTA
* * * * * * * * * *
71281 ATTAATTGAGCAATATTTTACTCCAAATTAGCTTGTATGAACAGAAATAATTA
130 ATAAATT-AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAG-AACAATTG
* *
71334 TTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAACGATTTGAA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
71368 TTGGTTCGAT
Statistics
Matches: 1995, Mismatches: 419, Indels: 233
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
167 2 0.00
168 9 0.00
169 123 0.06
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183 12 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
TTGAACTAGTTAGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAACAATTG
Found at i:69945 original size:173 final size:173
Alignment explanation
Indices: 69318--70068 Score: 444
Period size: 173 Copynumber: 4.3 Consensus size: 173
69308 TAATTTTTGA
* *
69318 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTA-TTTGAACT-AACGTAATTGTTTT
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC-TAGTATGAATTGAAC--AATTGTTTT
* * * * * * **
69381 ATTACAAAATAAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATGACTATTTTA
63 ATGACAAAACAAAAA-G------GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGGA
* * * * ** * * *
69446 ACTT-GTTCGG-TAA-ATATTTATTTTTTAAATCGATTACTTATTAATTGTCAA
121 A-TTAGTTAGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTCTCAT
* * * * ***
69497 AATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAACCTTGTATGAACAAAAGCAATTGTTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTAGTATGAATTGAA-CAATTGTTTTA
* * * * * * * * *
69561 TTACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTCAAATAAATATTTGTTCGAATAATCATAACAATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAAG-------GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGGAA
* * ** * * * *
69626 TTGGTTTGATAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCTTA-ATAATT--TT-TTA-
122 TTAGTTAGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCTTACAT-ATTAATTCTCAT
* * * ** * *
69673 AATATTAACAAATTAGTA-T-TTTT-TTTGAACA-AA-CT-TTATGAATAAAAACATTTATTTTA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-ATAAGCTAGTATGAAT-TGAACAATTGTTTTA
* * * *
69732 TGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAA
64 TGACAAAAC--AA----A-AAGGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGGAA
* *
69797 TTAGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTTCTGA-
122 TTAGTTAGGCAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAA-TTCTCAT
* *
69849 AATATTAATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCGAATAAGCTAGTATGAATTGAACAATTGTTTTAT
1 AATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATGAATTGAACAATTGTTTTAT
* * * *
69913 GACAAAACAAAAAGGATTTGACATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTGGAATTAGTTTG
65 GACAAAACAAAAAGGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGGAATTAGTTAG
* * * **
69978 GCAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTCTCAT
130 GCAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTCTCAT
* * *
70022 AATATTATTATATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA
1 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATGAA
70069 CTAAAATAAT
Statistics
Matches: 455, Mismatches: 83, Indels: 74
0.74 0.14 0.12
Matches are distributed among these distances:
171 73 0.16
172 32 0.07
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174 6 0.01
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176 32 0.07
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181 14 0.03
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (173 bp):
AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTATGAATTGAACAATTGTTTTATG
ACAAAACAAAAAGGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTGGAATTAGTTAGG
CAAACAAAATTATTTTTTAAATCCCTTACATATTAATTCTCAT
Found at i:70889 original size:350 final size:349
Alignment explanation
Indices: 70371--71025 Score: 829
Period size: 350 Copynumber: 1.9 Consensus size: 349
70361 AACTTACTTT
* *
70371 TTAATTTTTAAAATATTAATAATTAGTATTATTTTATTCTGATAAGCTTCTATGAATTGAAAATA
1 TTAATTTTTAAAATATTAATAATTAGTATTATTTTATTCTGATAAGCATCTATGAATTGAAAACA
* *
70436 ATTGTTTTATGACAAAACAAATAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAAACTTAA
66 ATTGTTTTATGACAAAACAAATAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAACATAA
* * * * * *
70501 CTCTTTAAACTACTTCGGCAAATAGATTTATATTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATA
131 CTATTTAAACGACTTCGACAAATAGACTTATATTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATA
* * * *
70566 TTATTAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCT-TATATGAACTAAAACAATTATTTTATAAT
196 TTAATAAAATAATATTATTTTATTATGAATAAACTCT-TATGAACTAAAACAATTATTTTATAAT
* * *
70630 AGAATAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGAACTAGCCTTGTAAACAA
260 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGAACTAGCCTTGTAAACAA
70695 ATTTATTTTTTAAATCTCTTGCATA
325 ATTTATTTTTTAAATCTCTTGCATA
* *
70720 TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAGACATGTATG-A-TGAAA
1 TTAATTTTTAAAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTCTGATA-AG-CATCTATGAATTG-AA
* * * ***
70782 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-GGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGC
62 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAATAG-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAA
* * * * *
70846 CATAATTATTTGAATCGA-TTTGATAAACTA-ACTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTT
126 CATAACTATTT-AAACGACTTCGACAAA-TAGACTTATATTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTT
* * * * *
70909 TGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTTTGAATAAACTCTTATGAATTGAAACTATTGTTT
189 TGAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTATGAATAAACTCTTATGAACTAAAACAATTATTT
* * * * *
70974 TATGATAAAACAAAAGGTCGTATTTATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAG
254 TATAATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
71026 TCATAACTAT
Statistics
Matches: 258, Mismatches: 40, Indels: 15
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
349 23 0.09
350 222 0.86
351 13 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (349 bp):
TTAATTTTTAAAATATTAATAATTAGTATTATTTTATTCTGATAAGCATCTATGAATTGAAAACA
ATTGTTTTATGACAAAACAAATAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAACATAA
CTATTTAAACGACTTCGACAAATAGACTTATATTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTGAAATA
TTAATAAAATAATATTATTTTATTATGAATAAACTCTTATGAACTAAAACAATTATTTTATAATA
AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGGAACTAGCCTTGTAAACAAA
TTTATTTTTTAAATCTCTTGCATA
Found at i:71746 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 71353--72439 Score: 858
Period size: 181 Copynumber: 6.0 Consensus size: 180
71343 AAAACAAAGA
* * * * *
71353 TCATAACGATTTGAATTGGTTC-GATAAATAGATTTAGTTTTCAAATCTCTTAC----TAATTTT
1 TCATAACTATTTGAACT-GTTCAG-TAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * ** *
71413 T-GAAATATTAAAAAATTATTATTAGTTTA-TTCTTAATAATTTTGTGTGAATAGAAATAATTGT
64 TAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGT
* * *
71476 TTTATGACAAAA-AAAATG-TCATAATAATTTGAAATAGATGATAGTTCAAATA-
127 TTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** *
71528 TACATGACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTGATTTT
1 T-CATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * **
71593 TAGAATATTAATAAATTAGTGTTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAATAGAAATAATTGTTT
64 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTT
*
71658 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
129 TATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * *
71710 TCATAACTATTTAAACTCGCTT-GGTAAATTGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTATTAATTTT
1 TCATAACTATTTGAACT-G-TTCAGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * ** * * * **
71774 TGGAATTTTAGTAAATTAGTATTATTTTATCCCGAATAAGCTTTTAT-AAGTAGAAACAACTAAT
64 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTT
* * * *
71838 TTATGACAAAAGAAAA-ATGTCTTAATGATTTGAAATAGATAATTCTTTAAATAG
128 TTATGACAAAACAAAAGA--TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** **
71892 TCATAACTATTTGAACATGTTCAAAAAACTT-ATTTATTTTTTAAAT-T-TTTGTTCATTAATTT
1 TCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAA-TTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTT
** * *
71954 TTAGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTACATGAACAGAACTAATTG
63 TTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTG
* * * * * *
72017 TTTTATCATAAAACAAAAAAGATCGTAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAA
126 TTTTATGACAAAAC--AAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * * *
72074 TCATAACTATTTGAACATGTTCGGTAAACAGATTCACTTTTTAATTCTCTTACTCATTAATTTTT
1 TCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT
* * * * * *
72139 AAAATATTAATAAATTAGTACTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATAAACT-GAAACAATTGTTT
65 AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAATAATTGTTT
* * * * * * * **
72203 TATTG-CTAAACAAAAGGTTACAATGATTTAAAATAGATCATTATTTGAATAG
129 TA-TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * ** * * * *
72255 TCCTGAGAATTTGAACTTGTTCAATAAACAT-ATTTA-TTTTTAAATTTTTTACTTATT-ATTTG
1 TCATAACTATTTGAAC-TGTTCAGTAAA-TTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-
* * * * * *
72317 TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAT-AATA-AAAAAATTATT
63 TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTT
* ** * * *
72380 TTATGGCAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTAAAATAAAAAAATTGTTCAAATAG
128 TTATGACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAG
72434 TCATAA
1 TCATAA
72440 AGATTTAAAA
Statistics
Matches: 725, Mismatches: 147, Indels: 76
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 41 0.06
177 4 0.01
178 35 0.05
179 22 0.03
180 137 0.19
181 264 0.36
182 142 0.20
183 71 0.10
184 8 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
TCATAACTATTTGAACTGTTCAGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTA
GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
Found at i:72462 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 72391--72476 Score: 129
Period size: 35 Copynumber: 2.4 Consensus size: 35
72381 TATGGCAAAA
*
72391 CAAAAAGTCATAACAATTTAAAATAAAAAAATTGTT
1 CAAATAGTCATAA-AATTTAAAATAAAAAAATTGTT
72427 CAAATAGTCATAAAGATTTAAAAT-AAAAAATTGTT
1 CAAATAGTCATAAA-ATTTAAAATAAAAAAATTGTT
*
72462 CAAATATTCATAAAA
1 CAAATAGTCATAAAA
72477 CAATTGTTTG
Statistics
Matches: 47, Mismatches: 2, Indels: 4
0.89 0.04 0.08
Matches are distributed among these distances:
34 1 0.02
35 25 0.53
36 21 0.45
ACGTcount: A:0.57, C:0.08, G:0.06, T:0.29
Consensus pattern (35 bp):
CAAATAGTCATAAAATTTAAAATAAAAAAATTGTT
Found at i:74691 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 72930--75407 Score: 1982
Period size: 361 Copynumber: 6.9 Consensus size: 361
72920 TAAATAAATG
* * *
72930 TTAATAAATTAGTACTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATT-TTTATATC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTT-TATG
* * * * * * * * * *
72992 ACTAAACAAAAGATCAAAATGATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-T
63 ACAAAACAAAAGGTCATAACGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
**** ** * *
73056 TGGTTCAACAAACTCATTTA-TTTTTAAATC---T-CCTATTAATTTTTGGAATATTATTAAATT
128 T-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATT
* * * * *
73116 AGTATTATTTTTATT-TGAATAAGGTTGGATG-ATCAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAT
192 AGTATTA-TTTTATTCTAAATAAGTTTGTATGAAT--GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-
* * * * * *
73179 A--TCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCA--AA
253 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAA
* * * *
73240 AAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATA
318 ACATA--TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
* * * *
73286 TTAATAAAGTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAGTTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * *
73349 CAAAACAAAAGCTCATAACGACTCTAAATAATTAGA-ACGATTGTTCAAAAAGTCA-AATCTTTT
64 CAAAACAAAAGGTCATAACG--TTTTAA-AA-TAGATA--ATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATT
* * * * * * *
73412 TGAACTTTTTTGGTAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTGAATGTTAAT
122 TGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT
* * *
73476 AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACTAAACA
187 AAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-
* * * *
73541 AAAAGGTCAGACTGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTTGTTTAG
250 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG
* *
73606 TAAACACAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
315 TAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
* * * *
73653 TTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAAAGGAAA-AATTGTTTTATGCC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGAC
* * * *
73717 AAAA-TAAAGATCATAACATTTTAAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TG
65 AAAACAAAAGGTCATAACGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * * *** *
73780 TTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATTAG
130 TTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* * * * ** * * * *
73841 TATTAGTTTAATCTGAATAATTTTACATTAGCA-GAAATAATTATTGTATGACAAAACAAAAGGT
194 TATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTA-T-GAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
* * * * * *
73905 CATAATGATTTGAAATAGATTA-TAGTTCAAATCGACATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATA
257 CATAATGATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA
* ** * *
73969 GATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTATTTTTTAGAATA
321 TATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
* * **
74010 TTAATAAATTAGTACTATTTTATTTTGAATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* * * * * * *
74075 AAACCAAAA--TTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTAAAATAGTCACAACTATTTAAACTTG
66 AAA-CAAAAGGTCATAACGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* ** * *
74138 CTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGT
130 TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
* ** * *
74203 ATTACTTTATTC-ATAATAAGCTTT-TATGAAAAAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTC
195 ATTATTTTATTCTA-AATAAG-TTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
74266 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATATTCATAACTATTTGAA-TATGTTCAGAAAACAT
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* *
74330 ATTTATATTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATA
322 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
** * * * * *
74369 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAACAAGCTTGCATGAATAGGACCAATTGTTTTATGAT
1 TTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * *
74433 AAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAGATAGGCATAACTATTTGAACATA
65 AAAACAAAAGGTCATAACGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
** * * * * * *
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130 TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGT
* * *
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195 ATTATTTTATTCT-AAATAAGTTTGTATGAATGAA-ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
74627 ACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGCAAACATA
258 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATA
* * *
74692 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATA
323 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGGAATA
* * * * * *
74731 TTAATAAATTAATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAAATGTTTTATGA-T
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
** * * * **
74795 AAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTCTTTAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGT
66 AAACAAAAGGTCATAACGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGT
* *
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131 TTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGGAATATTAATAAA-TTA
* * ** * ** *
74923 -TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATCATTTTCTGACAAAACAAAA-G--
193 GTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * ** * *
74984 -----G--TT---ATAG-CAA-T-TTCAAATAG--AT---TATTTAAATTTGTTCGGTAAATAGA
258 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACATA
* *
75031 TTCT-TTTTTT-AATCTTTTAATTATTAATTTTTGGAATA
323 TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
** ** * * *
75069 TTAATAGCTTAGTATTATTTTATT-TAGAATAATTTTAG-ATTAACTA-AAATAATTTTTTTATG
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTT-GTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATG
* * ** * * * * * * *
75131 ACAAAACAAAAGCTCAAAACAATTTGATATAGATATTTATTAAAATAGTCATGACTATTTGATCT
63 ACAAAACAAAAGGTCATAACGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* ** ** * * * * *
75196 AGTTCAGTAAACATCTTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTTGAAATTTTAATAAATTA
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* * * * * * * * *
75261 GTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAACAT-AAACTATTCTTTTATAATAGAACAAAAAG
193 GTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATG-A-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
** * ** * * * *
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256 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTAAACA
* *
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321 TATTTATTTTTTAAATCTC
75408 ATATTATACA
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ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
Found at i:74704 original size:721 final size:711
Alignment explanation
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* * * * ** *
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* * * * * * *
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* ** ** * *
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125 CTATTTCAGA-AAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCTC-ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTA
* ** *
73117 GTATTATTTTTATTT-GAATAAGGTTGGATGATCAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAATA-
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* * * * * *
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* * *
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* * *
73307 ATTTCAAATAAGTTTTTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACGAC
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* * * *
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* * * *
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** * * *
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* * * *
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* ** * * *
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* * * *
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* * *** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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257 GATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-AAAAATATTTA
** * *
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320 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTA-TTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* *
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* * **
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* * *
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* *
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575 AAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AAT
* * * *
74297 ATTCATAACTATTTGAA-TATGTTCAGAAAACATATTTATATTTTAAAT-TTTTACTTATTAATT
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74360 TTTGGAATA
703 TTTGGAATA
* * ** *
74369 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAACAAGCTTGCATGAATAGGACCAATTGTTTTATGAT
1 TTAATAAA-TTAGTATTATTTTAATCAAAACAAGCTTGCATGAAAAGGAAAAATTGTTTTATGAC
* ** *
74433 AAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAGATAGGCATAACTATTTGAACATA
65 AAAA-AAAAGATCATAACATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGGCATAACTATTTGAAC-TA
* * ** * * * *
74498 TTT-GGTAAACCTATTCATTTTTTAATTCTATTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATACATAAG
128 TTTCAGAAAACAGATTCAGTTTTTAAATC---T-CTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAG
* * *
74562 TATTATTTTATTTCAAATAAGTTTATATGAATGAAGACAATTGTTTTATTAGAAAACAAAAGGTC
189 TATTATTTTATTTCGAATAAGTTTACATG-ATGAA-ACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTC
* * *
74627 ACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTAGCAAACATA
252 ATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAG-AAAAATA
* * * * *
74692 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTGTAGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCC
316 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * *
74757 GAATAAGCTTGTATGAATAGAAATAAATGTTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAA
381 GAATAAGATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAACGATTT-AAA
* * ** * * *
74821 TAAATAATTCTTTAAATAGTCATAAAGATTTGAACTTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTATAT
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508 CTTTTACTTATTAATT-T-TTGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-ATAATAAGCTTG
* ** *
74948 TATGAACAAAAAAATCATTTTCTGACAAAACAAAAGGT
569 TATGAAAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
74986 TATAGCAATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (711 bp):
TTAATAAATTAGTATTATTTTAATCAAAACAAGCTTGCATGAAAAGGAAAAATTGTTTTATGACA
AAAAAAAGATCATAACATTTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGGCATAACTATTTGAACTATTT
CAGAAAACAGATTCAGTTTTTAAATCTCTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATT
TTATTTCGAATAAGTTTACATGATGAAACAATTGTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAATGATT
TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAAATATTTATTTTTT
AAATCTCTTACTTATTATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGATT
GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTCATAACGATTTAAATAAATAATTGTT
AAAATAGTCAAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTA
ATTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCATAATAAGCTTGTATGAAAAAAAAAATTG
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCATAACTAT
TTGAACTTGTTCAGAAAACACAATTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
Found at i:74984 original size:180 final size:179
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Indices: 72930--75005 Score: 1748
Period size: 180 Copynumber: 11.5 Consensus size: 179
72920 TAAATAAATG
* * * *
72930 TTAATAAATTAGTACTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATT-TTTATATCA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAAAATTGTTT-TATGA
* * * * * * * *
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63 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* ** ** *
73057 GGTTCAACAAACTCATTTA-TTTTTAAATC---T-CCTATTAATTTTTGGAATA
128 -GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * * * * *
73106 TTATTAAATTAGTATTATTTTTATTTG-AATAAGGTTGGATGATCAAAAACAATTGTTTTATGAG
1 TTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAA-AATTGTTTTATGAC
* * * * *
73170 AAAACAAATA--TCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTA
64 AAAACAAA-AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* ** * * * * *
73233 GTTCAAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATA
128 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG-AATA
* * * *
73286 TTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAAAATTGTTTTATGAC
* ** * *
73350 AAAACAAAAGCTCATAACGACTCTAAATAATTAGA-ACGATTGTTCAAAAAGTCA-AATCTTTTT
64 AAAACAAAAGGTCATAACGA-T-TTGA-AA-TAGATA--ATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTT
* * * * * * *
73413 GAACTTTTTTGGTAAATAGATTT-TTTTTTAAATCTCTTGCTCATTAATTTTTTGAATG
122 GAACTTGTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTGAATA
* * * *
73471 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACT
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAAAAATTGTTTTATGACA
* * * *
73536 AAACAAAAAGGTCA-GACTGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTT
65 AAAC-AAAAGGTCATAAC-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * *
73600 GTTTAGTAAACACAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATA
128 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * *
73653 TTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTG-AATAAGCTTGTATGAA-AAGGAAAAATTGTTTTATGC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATGAACAA--AAAAATTGTTTTATGA
* * *
73716 CAAAA-TAAAGATCATAAC-ATTTTAAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-
63 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * **
73778 TGTTTCAGAAAACAGATTTAGTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATA
127 TGTTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTT-TGAATA
* * * ** ** * * * * *
73829 TTAATAGATTAGTATTAGTTTAATCTG-AATAATTTTACATTAGCAGAAATAATTATTGTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTGTTTTATGAC
* * * * * *
73893 AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATTATAGTTCAAATCGACATGACTATTTGAACTTG
64 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * *** *
73958 TTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATTATTTTTTAGAATA
129 TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * ** * *
74010 TTAATAAATTAGTACTATTTTATTTTG-AATAAAATTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAC
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTGTTTTATGAC
* * * * *
74074 AAAACCAAAA--TTATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTAAAATAGTCACAACTATTTAAACTT
64 AAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
74137 GCTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATT
128 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * * *
74190 TTAATAAATTAGTATTACTTTATTC-ATAATAAGCTTTTATGAAAAAAAAAATTGGTTTATGACA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-AATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATTGTTTTATGACA
* * * *
74254 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATATTCATAACTATTTGAA-TATG
65 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TG
* * * *
74318 TTCAGAAAACATATTTATATTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATA
129 TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * * * * ** *
74369 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAACAAGCTTGCATGAATAGGACCAATTGTTTTATGAT
1 TTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAAATTGTTTTATGAC
* * * * * * *
74433 AAAACAAAAGGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTGTTCAGATAGGCATAACTATTTGAACATA
64 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* ** * * * *
74498 TTTGGTAAACCTATTCATTTTTTAATTCTATTACTCATTAATTTTTGGAATA
129 TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAATA
* * * * * * * * *
74550 TTAATACATAAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGTTTATATGAATGAAGACAATTGTTTTATTAG
1 TTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAAAATTGTTTTATGAC
* * * *
74614 AAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTG
64 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
* * *
74679 TTTAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTAGAAATA
129 TTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT-TTG-AATA
* * *
74731 TTAATAAATTAATATTATTTTAATCCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAATAAA-TGTTTTATGA
1 TTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAAATAAGCTTGTATGAACA-AAA-AAATTGTTTTATGA
* * * * * * **
74794 -TAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATTCTTTAAATAGTCATAAAGATTTGAACTT
63 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * *
74858 GTTTGGTAAACATATTTATTTTTTATATCTTTTACTTATTAATTATCTT-AATA
128 GTTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-T-TTGAATA
** *
74911 TTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCGAAATAAGCTTGTATGAACAAAAAAATCATTTTCTGACA
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* * * *
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*
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** * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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201 3 0.00
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206 4 0.00
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209 5 0.00
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218 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAATT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
Found at i:76619 original size:16 final size:17
Alignment explanation
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Period size: 16 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
76577 AACAAGTTTA
76587 AATAATTATGACTATTTG
1 AATAATTAT-ACTATTTG
76605 AATAATTAT-CTATTTG
1 AATAATTATACTATTTG
76621 AA
1 AA
76623 ATCGCTATAA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.50
18 9 0.50
ACGTcount: A:0.42, C:0.06, G:0.08, T:0.44
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATACTATTTG
Found at i:76652 original size:178 final size:179
Alignment explanation
Indices: 75744--76789 Score: 716
Period size: 178 Copynumber: 5.9 Consensus size: 179
75734 TTAAAACATA
* * *
75744 AACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTA-TTTATGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
1 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTA-GTTCATATAAGCTTA-TTAAAATAAAATAAT
* * ** * * * * *
75808 AGGT-ATCTAACAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGA
64 A-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAA
* * * * * *
75872 ACCAGTTCCAATAATTAAGACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCATTAT
127 ACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * * ** *
75925 AACCTTTTCTTTTGTTATAAAATAAAAATTTCAATTCAGCCT-AGCTTATTCAGAATAAAATAAA
1 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCA-TATAAGCTTATT-AAAATAAAAT-AA
* ** * * *
75989 AAAGAATTTATTAATATTTCAAACA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCTA
63 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACC-A
* ** * *
76050 ACCAA-TTTTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTTCAAATCATTAT
126 AACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
76103 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATA
1 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTT-ATTAAAATAAAATAATA
* * * * * *
76168 CTAATCTACTAATATTTCAAAGA-T--TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCCT-TTTATCAAAC
65 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCAAA-
* * * *
76229 CAA-TTCAAATAGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTACAAATTGTTAT
128 CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * *
76280 TACTTTTTGTTCTAT-ATAAAACAA-TAGTTTCTA-ATCATATAAGCTTATTTAAATTAAAATAA
1 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA-TTT-TAGTTCATATAAGCTTA-TTAAAATAAAATAA
* * * ** * * *
76342 TACTATTTTATTTACATTT---TGA-CAAT-GTAAAA-A-TTAAAAAATTAAATATGTTTACCAA
63 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAAAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACCAA
* * * * * * *
76400 ACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTAT
127 ACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
*
76453 GA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTAAAATAAAATAATAC
1 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTAAAATAAAATAATAC
* * * ***
76516 TAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATTGAACA
66 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * *
76581 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTAT
130 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * *
76631 AACCTTTT-TTTTGTCATAAAA-ATATT-TCTTCTA-TTCATACAAGTTTGTTTCAAATAAAATA
1 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTAT-TT-TAGTTCATATAAGCTT-ATTAAAATAAAATA
* * * * ** *
76692 ATACAAAGTTACTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAATTTAAATCTGTTTAC
62 ATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATA-ATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* ** *
76755 CAAACAAGTTTAAATCGTTATGATTATTTGAACAA
124 CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
76790 CAAATTGTTA
Statistics
Matches: 681, Mismatches: 143, Indels: 83
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
171 30 0.04
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173 64 0.09
174 7 0.01
175 5 0.01
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178 184 0.27
179 39 0.06
180 90 0.13
181 41 0.06
182 21 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGCTTATTAAAATAAAATAATAC
TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAA
GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
Found at i:78541 original size:209 final size:211
Alignment explanation
Indices: 78171--78602 Score: 832
Period size: 209 Copynumber: 2.1 Consensus size: 211
78161 AATAATACTA
*
78171 ATTTAATAATATTCCAAAGCATAATAACCAAGAAACTTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACAGT
1 ATTTAA-AAAATTCCAAAGCATAATAACCAAGAAACTTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACAGT
78236 TCAAATAGTTAAGACTATATAAATGATTATCTAATGCAAATCATAACTCTTTTGTTTTGTCGTAA
65 TCAAATAGTTAAGACTATATAAATGATTATCTAATGCAAATCATAACTCTTTTGTTTTGTCGTAA
78301 AACAATTTATTTTGTTCGTACAAGCTTATTCATATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAA
130 AACAATTTATTTTGTTCGTACAAGCTTATTCATATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAA
78366 AAATTAATAAGT-A-AG
195 AAATTAATAAGTAAGAG
78381 ATTTAAAAAATTCCAAAGCATAATAACCAAGAAACTTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACAGTT
1 ATTTAAAAAATTCCAAAGCATAATAACCAAGAAACTTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACAGTT
78446 CAAATAGTTAAGACTATATAAATGATTATCTAATGCAAATCATAACTCTTTTGTTTTGTCGTAAA
66 CAAATAGTTAAGACTATATAAATGATTATCTAATGCAAATCATAACTCTTTTGTTTTGTCGTAAA
78511 ACAATTTATTTTGTTCGTACAAGCTTATTCATATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAA
131 ACAATTTATTTTGTTCGTACAAGCTTATTCATATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAA
78576 AATTAATAAGTAAGAG
196 AATTAATAAGTAAGAG
78592 ATTTAAAAAAT
1 ATTTAAAAAAT
78603 AAATTTGTTT
Statistics
Matches: 219, Mismatches: 1, Indels: 3
0.98 0.00 0.01
Matches are distributed among these distances:
209 199 0.91
210 7 0.03
211 13 0.06
ACGTcount: A:0.46, C:0.11, G:0.08, T:0.36
Consensus pattern (211 bp):
ATTTAAAAAATTCCAAAGCATAATAACCAAGAAACTTAAAAAATAAATCTAATTACTGAACAGTT
CAAATAGTTAAGACTATATAAATGATTATCTAATGCAAATCATAACTCTTTTGTTTTGTCGTAAA
ACAATTTATTTTGTTCGTACAAGCTTATTCATATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAA
AATTAATAAGTAAGAG
Found at i:80322 original size:179 final size:181
Alignment explanation
Indices: 79856--81617 Score: 1258
Period size: 179 Copynumber: 9.8 Consensus size: 181
79846 CTGAATCAAC
* * * * * * * * * *
79856 TCAAATAATTATGGCTATTTCAACAATTATCTATATT-TAATCATTATTACTTTTTGTTTGGCCA
1 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * * * *
79920 TATAACAATTGTTTTTGA-TCACATAAGCCTATTTGAAATAAAAATAATACTAATTTATTAATCT
65 TAAAACAATTG-TTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
79984 TTCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCT-AACCAAT
128 TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTGAACCAGT
* * * * * * * * * * *
80037 TTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTGTATACTTGAAATCGTTATAACCGTTTGTTCTATCAT
1 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * *** * * * * *
80102 AAAATATTTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCC
66 AAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
*
80167 AAAAATT-ATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTTTTTGCTGAACCAGT
131 AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAGT
*** * * *
80216 TCAAATAGTTAAGACTACACGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGACAT
1 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * ** *
80281 AAAACAACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTGTTTGGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATT
66 AAAACAA-TTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * *
80344 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTCAAAAAT-AATTATGTTTACCT-AACTAGT
129 TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTT-GCTGAACCAGT
* * *
80397 TCAAATAATTACA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAATTGTTATGACCTTTTTGTTTTGT
1 TCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGT
* *** * * * * *
80461 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTATA-
63 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
80525 TTCTAAAAATTAATAGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATCGAACAAGT
128 TTC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCT-GAACCAGT
* * * * * * * * *
80580 TCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTGAAATTGTTATGACCTTTCGTTTGGT-AT
1 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
80644 AAAACAATCTG-TTC-ATTGAT--AA--TTTTTTAGAATAAAATAATAC-GATCTATTAATATTT
66 AAAACAAT-TGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * *
80702 TAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTG-TT-CATGAAAACAGT
130 CAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGC-TG-AACCAGT
* * * * *
80750 TTAAATAGTAAATAGTTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTATT
1 TCAAATAGT---TA---A-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
** * * * * *
80814 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGATTATTCATATTAAAATAATACTAATTTAATA
59 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * ** ** **
80879 ATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTAAAAAA-AATAAGTGTTTGCCAAATTAGT
124 ATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATTTGTTTGCTGAACCAGT
* * * *
80936 TCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTT-TTTTAGTCA
1 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT-GTCA
* * *
81000 TAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT
65 TAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
** * * **
81065 GGAAAATTAATGAGC-AAGAGATTTAAAACAATAAATTTGTTTACTGAATAAGT
130 CAAAAATTAAT-AACTAAGAGATTTAAAA-AATAAATTTGTTTGCTGAACCAGT
* * * * * *
81118 TCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAAATT-TATATTT-AAAGACATTATAAACTTTTGTTTTGT
1 TCAAATAG-TTAAGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * ** * * *
81180 CATAAAATAATTGTTTTAGTTTATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACGACTTTACTAATAT
63 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
81245 TTCAAAAATTAATAAGC-GAGAGA-TTAAAAACTAAATATGTTTACTCAACCAGT
128 TTCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAGT
* * * *
81298 T-AAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTGTTTTGTCA
1 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * ** *
81360 TAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTT-TATTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATA-T
65 TAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTAT-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
81423 TCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGT
129 TCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAGT
* * * **
81476 TCAAATAGTTAAGACTATTGGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAATCAT
1 TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
81541 AAAATAGTTG-TTCAA-TCATACATGCTTATTTGAACTAAAATAATACTATTTTATTAACATTT-
66 AAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
81603 AAAAAGTT-ATAACTA
131 AAAAA-TTAATAACTA
81618 TTTGAACAAT
Statistics
Matches: 1243, Mismatches: 270, Indels: 139
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 3 0.00
170 36 0.03
171 2 0.00
173 2 0.00
174 14 0.01
175 20 0.02
176 9 0.01
177 66 0.05
178 135 0.11
179 237 0.19
180 212 0.17
181 138 0.11
182 173 0.14
183 152 0.12
184 6 0.00
185 2 0.00
186 26 0.02
187 9 0.01
188 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (181 bp):
TCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAGT
Found at i:81939 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 81620--81975 Score: 405
Period size: 181 Copynumber: 2.0 Consensus size: 180
81610 TATAACTATT
* * * *
81620 TGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCAGTTT
1 TGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACATTTATTTTATAATAAAACAATTGTTTCAG-TC
* ** * * * *
81685 TTAAAAGTTTATCCTAAATAAAACAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAATTAGAG
65 ATAAAAGCCTATCCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAAGTAGAG
* * * *
81750 ATTTAAAAAATAAATCA-ATTTATCAAATTAGTTTAAATAATTATGGCAATA
130 ACTTAAAAAACAAAT-ATATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATGGCAATA
* * * *
81801 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCA-T
1 TGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACATTTATTTTATAATAAAACAA--TTGTTTCAGT
* * * *
81865 CATATAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-ATGAGTAG
64 CATAAAAGCCTATCCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGA-AAGTA-
* *
81928 GAGACTTAAAAAACAAATATGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATG
127 GAGACTTAAAAAACAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATG
81976 ACTTTTGTTG
Statistics
Matches: 145, Mismatches: 25, Indels: 10
0.81 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
179 1 0.01
180 5 0.03
181 132 0.91
183 7 0.05
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (180 bp):
TGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGAACATTTATTTTATAATAAAACAATTGTTTCAGTCA
TAAAAGCCTATCCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTGAGAAAGTAGAGA
CTTAAAAAACAAATATATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATGGCAATA
Found at i:82081 original size:143 final size:146
Alignment explanation
Indices: 81816--82094 Score: 345
Period size: 143 Copynumber: 1.9 Consensus size: 146
81806 AATTATCTAT
* * * * *
81816 TTCAAATCGTTATGAACATTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTCATCATATAAGCCTATTCA
1 TTCAAATAGTTATGAACATTTATGTTGTCATAAAACAATTTTTATGCATCATACAAGCCTATTCA
* * * * * *
81881 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGACTTAAAAAACAAAT
66 AAATAAAATAATACTAATCTAATAACATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGACTTAAAAAACAAAT
81946 ATGTTTATCAAACTAG
131 ATGTTTATCAAACTAG
*
81962 TTCAAATAGTTATG-AC-TTT-TGTTGTCATAAAACAATTATTTATGC-TCATACAAGCTTATTC
1 TTCAAATAGTTATGAACATTTATGTTGTCATAAAACAATT-TTTATGCATCATACAAGCCTATTC
* * *
82023 AAAATAAAATAATACTAATCTAATAACATTAT-GAAAATTAATAACTAATAGA-TCTAAAAAATA
65 AAAATAAAATAATACTAATCTAATAACATT-TCAAAAATTAATAACTAAGAGACT-TAAAAAACA
*
82086 AATTTGTTT
128 AATATGTTT
82095 GCCGCATTAG
Statistics
Matches: 114, Mismatches: 16, Indels: 9
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
142 1 0.01
143 89 0.78
144 9 0.08
145 2 0.02
146 13 0.11
ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.07, T:0.38
Consensus pattern (146 bp):
TTCAAATAGTTATGAACATTTATGTTGTCATAAAACAATTTTTATGCATCATACAAGCCTATTCA
AAATAAAATAATACTAATCTAATAACATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGACTTAAAAAACAAAT
ATGTTTATCAAACTAG
Found at i:82807 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 81962--84348 Score: 969
Period size: 180 Copynumber: 13.5 Consensus size: 178
81952 ATCAAACTAG
* * * * *
81962 TTCAAATAGTTATGAC--TTT-TGTTGTCATAAAACAATTATTTATGCTCATACAAGCTTA-TTC
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGCTTATTTC
* * * * * * * *
82023 AAAATAAAATAATACT-AATCTAATAACATT-ATGAAAATTAATAACTAATAGATCTAAAAAATA
65 -AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCA--AAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-C
* * * * * ** * * * *
82086 AATTTGTTTGCCGCATTAGTTCGAATAGTTAATG-CTATGTGAATAATTGTCTAT
125 AATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** ** * *
82140 TTCAAATCATTATGACATTTTGCTTTATCGA-AAAA-AA-TGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGT
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGCTTAT-T
* *** * * *
82200 TCACAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAAT--TAA-TGAGAGATTTAAAAAATAA
63 TCA-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-CA
* ** * * * * * *
82262 ATATATTTACCAAACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGACCAATTATTTAT
126 ATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * *
82315 TTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTGACACAGTCTTATTT
1 TTCAAATTGTTATGA-CATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAG-CTTATTT
** * * * * * * * *
82379 GGAATAAAGTAATGCT-TATTAATTAATACTCTAAAAATTGATAAGTAACAA-ATTTAAAAAATG
64 CAAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTC-AAAAAATAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAA-C
** * *
82442 AATCTATTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGTT-TCGACTATTTGAACAATTATCTAT
125 AATCTATTTAC-TGAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * *
82496 TTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTATCACAAAATAATTGTTTCTGTTCCTATAAGCTTA-TTC
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGCTTATTTC
* * ** *
82560 AGAATAATATAAT-TCTAATTTATTAATATTTTAAAAAT--TAA-TAAGAGATTT-AAAAACTGA
65 A-AATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAC--A
* * *** *
82620 ATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAG-T-TGACCATTTGAGGGATTACCTAT
126 ATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
82671 TTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT-TTTCTAG-TCATACAAGCTTATTT
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATA-AAGCTTATTT
* *
82734 CAATTAAAATAATACAAAATTTATTAATATTCAGACAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACA
64 CAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCA-A-AAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACA
* * *
82799 ACTCTATTTACTAAATGAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
126 A-TCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* *
82853 TTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTCTT-TGTTCATAGAAGCTTATTT
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATA-AAGCTTATTT
** * * * *
82916 GGATTAAAATAAT-TTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATA-A
64 CAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAA-ACA
* * * * * *
82979 ATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTCA-AACTATTTAAATAATTATCTAT
126 ATCTATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * ** * * *
83031 TTCAAATCATTATGACATTCTATTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTAATAAATGCTTA-TTC
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAA-GCTTATTTC
* * * * ** * *
83095 GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATACTCTAAAAATAATGAGCAAGGGAATTAAAAAATGAA
65 -AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-CAA
* ** *
83159 TCTATTTACCGAACAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTAT
127 TCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
83211 TTCAAATTGTTATAATATTTT-GTTTGCCATAAAAAAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCC
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGCTTATTTC
* *
83275 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAAAA-CTTTAAAAAATAAA
65 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-CAAAAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-CAA
* * *
83339 TCTATTTCCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
127 TCTATTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
83391 TTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTG--T-T-TTCATATAAGCATATTTG
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGCTTATTTC
* * * *
83452 AAATAAAATAATACT-AGTTTGTTAATATTCCAAAAAT--TAA-T--AAGATTTTAAAAAATAAA
65 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAATAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAA-CAA
* * * * * *
83511 TCTATTTAC-CAAGCAAGTTTAAATAGTTATTATACCTATTAG-A-TATGATCT-T
127 TCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTA-T-GA-CTATTTGAACAATTATCTAT
*** * ** * * * *
83563 TT-GTTTTGTCAT-A-AAATAATTGTT-TCTATTCATACAA--G-TT-TATTCA-AAA---TA--
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATT-TTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAGCTTATT
* * * * * * * * * * * **
83614 --AAATAATATTAAT-T-TA-TTAAT-ATTTTGAAAATTAAGAGGT-AG-GAGA-TTTAAAAGTA
63 TCAAATAA-AATAATATAAATTTATTAATATTCAAAA--AATA-ATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
** * * * *
83670 -AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTAT
124 CAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * *
83724 TTCAAATGGTTTTGACTTTTTGTTTT-TTACTAAAACAATTATTTTTGTTCATGCAAA-ATTATT
1 TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTGTTCAT--AAAGCTTATT
* ** * *** * *
83787 TAAAATAAAATAATATTGA-TCATTAATATTTTGAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACCAAA
63 TCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAC-AA
* * * * * * *
83848 TTTGTTTAC-CAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAGCAATTATCT-T
127 TCTATTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** *
83899 TCTCAAATAT-TTGTG--ATCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTA-
1 T-TCAAAT-TGTTATGACAT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGCTTAT
* * * * * *
83960 TTCGGATTAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAGAA
62 TTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-CAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAA-AA
* * * * * * *
84024 TA-AATATGTTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTGTCTAC
123 -ACAATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * *
84080 TTCAAATCATTTTGAC-TGGTTGTTTAGTCATAAAACAAATT-TTTTTAATTCATACAAGCTTA-
1 TTCAAATTGTTATGACAT-TTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCT-GTTCATA-AAGCTTAT
* * * *
84142 TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA
62 TTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAAAAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
**
84206 -AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGA-TGATTT-AACCAATTATCTAT
124 CAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACT-ATTTGAA-CAATTATCTAT
* * * *
84260 TT-AAA--GTCATTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTA-T
1 TTCAAATTGTTA-TGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCAT-AAAGCTTATT
*
84320 TCGAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAAT
63 TC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
84349 TAGAAAGCAA
Statistics
Matches: 1675, Mismatches: 378, Indels: 313
0.71 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
158 5 0.00
159 8 0.00
160 10 0.01
161 31 0.02
162 19 0.01
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165 3 0.00
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169 11 0.01
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182 132 0.08
183 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (178 bp):
TTCAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAGCTTATTTCA
AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACAATCTA
TTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
Found at i:83032 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 83011--83043 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
83001 AATAGTCAAA
83011 CTATTT-AAATAATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
*
83027 CTATTTCAAATCATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
83044 GACATTCTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
CTATTTCAAATAATTAT
Found at i:83193 original size:358 final size:356
Alignment explanation
Indices: 81962--84348 Score: 1646
Period size: 356 Copynumber: 6.8 Consensus size: 356
81952 ATCAAACTAG
*
81962 TTCAAAT-AGTTATGAC-TTTTG--TTGTCATAAAACAATTATT-TATGCTCATACAAGCTTATT
1 TTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCTAT--TCATACAAGCTTATT
* * * * * * * * *
82022 CAAAATAAAATAATACTAATCTAATAACATTATGAAAATTAATAACTAATAGATCTAAAAAATAA
63 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-A-GAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * **
82087 ATTTGTTTGCC-GCATTAGTTCGAATAGTTAATG-CTATGTGAATAATTGTCTATTTCAAATCAT
126 ATCTATTTACCAACA--AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGT
* * * * * * *
82150 TATGACATTTTGCTTTATCGAAAAA-AA-TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCACAATAAAATA
188 TATGAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
**
82213 ATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCA
252 ATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATATATTTACCA
* * * ** *
82274 AACTAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGACCAATTATTTAT
316 AACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
* *
82315 TTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCTATTGACAC-AGTCTTATT
1 TTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTTTTCTATTCATACAAG-CTTATT
* * * * * * * * * * *
82378 TGGAATAAAGTAATGCTTATTAATTAATACTCTAAAAATTGATAAGTAACAAATTTAAAAAATGA
63 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AG-AAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * **
82443 ATCTATTGGCTTGACCAA-TGCAAATAGTT-TCGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
126 ATCTATTTAC--CAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGT
* * * * * *
82506 TATGACTTTTTGTTTTATCACAAAATAATTGTTTCTGTTCCTATAAGCTTATTCAGAATAATATA
188 TATGAC-TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * **
82571 AT-TCTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTGAATCTATTTATT
252 ATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATATATTTACC
* * * *** *
82631 GAACAAGTTCAAATAG-T-TGACCATTTGAGGGATTACCTAT
315 AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
*** * * * * *
82671 TTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTTTTCTAGTCATACAAGCTTATTTC-
1 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCG
* * * * *
82735 AATTAAAATAATACAAAATTTATTAATATTC-AGACAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACA
65 AAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTCTA-A-AAATTAAT-AG-AAGAGATTTAAAAAATA
* * *
82799 ACTCTATTTACTAA-ATGAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGT
125 AATCTATTTACCAACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGT
* *** *
82863 TATGACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTCTT-TGTTCATAGAAGCTTATTTGGATTAAAATA
188 TATGACTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGT-TTCTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * *
82927 AT-TTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCG
252 ATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAATAAATATATTTACCA
* *
82991 AACAAGTTCAAATAGTCA-AACTATTTAAATAATTATCTAT
316 AACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
* * ** * *
83031 TTCAAATCATTATGACATTCTATTTCATCATAAAACAATTGTATCTATTAATA-AATGCTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCTATTCATACAA-GCTTATTC
* * * *
83095 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTCTAAAAA-TAATGAGCAAGGGAATTAAAAAATGAA
64 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AG-AAGAGATTTAAAAAATAAA
**
83159 TCTATTTACCGAACAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TTCTATTTCAAATTGTTA
127 TCTATTTACC-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT-TATTTCAAATTGTTA
* * * *
83223 TAATATTTTG-TTTGCCATAAAAA-AATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCCAAATAAAATAA
190 TGA-CTTTTGTTTTGTCA-AAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * *
83286 TATAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGTAA-A-ACTTTAAAAAATAAATCTATTT-CC
253 TATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAATAAATATATTTACC
*
83348 TAAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
315 -AAACA-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * *
83391 TTCAAAT-AGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCAA-TTGT-T-TTCATATAAGCATATTTG
1 TTCAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
83452 AAATAAAATAATACTAGTTTGTTAATATTCCAAAAATTAAT--AAGA-TTTTAAAAAATAAATCT
65 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * *
83514 ATTTACCAAGCAAGTTTAAATAGTTAT---TA--T--AC--CTA-TTA---GATA-TG--AT--C
130 ATTTACCAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC
* * * * *
83561 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAA
194 TTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAA
** * * * * *
83626 TTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAGGTAGGAGATTTAAAAGTAAATCTATTTACCAAACAAGTT
259 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTT
* ** *
83691 CAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTAT
324 CAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
** * * * * * * ** *
83724 TTCAAATGGTTTTGACTTTTTGTTTT-TTACTAAAACAATTATTTTTGTTCATGCAAAATTATTT
1 TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTC
* * * * * * ** *
83788 AAAATAAAATAATATTGA-TCATTAATATTTTGAAAATTAAT--AAGAGATTTAAAAACCAAATT
64 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
83850 TGTTTACCAAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAGCAATTATCTT-TCTCAAATAT-TTGT
129 TATTTACCAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTCAAAT-TGTTAT
* ** * * * ** *
83913 GA-TCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATA
191 GACT-TTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * * * * * *
83977 CTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAGAATAAATATGTTTGCTGAAC
255 TTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA-AATAAATATATTTAC-CAAA
* * * *
84042 CAA-TTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACAATTGTCTAC
318 CAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * *
84080 TTCAAATCATTTTGAC-TGGTTGTTTAGTCATAAAACAAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATT
1 TTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTTTTCT-ATTCATACAAGCTTATT
* * *
84144 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTT-AAAAA-AA
63 CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AG-AAGAGATTTAAAAAATAA
*
84207 ATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGA-TGATTT-AACCAATTATCTATTT-AAA--G
126 ATCTATTTACC-AACAAGTTCAAATAG-TTATGACT-ATTTGAA-CAATTATTTATTTCAAATTG
* * * * *
84266 TCATTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAA
187 TTA-TGA-CTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCT-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAA
* *
84330 ATAATACTACTTTATTAAT
249 ATAATATTAATTTATTAAT
84349 TAGAAAGCAA
Statistics
Matches: 1615, Mismatches: 301, Indels: 230
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
332 3 0.00
333 103 0.06
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335 3 0.00
336 26 0.02
337 62 0.04
338 2 0.00
339 2 0.00
340 2 0.00
342 3 0.00
343 2 0.00
344 1 0.00
345 2 0.00
346 2 0.00
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348 2 0.00
349 2 0.00
350 2 0.00
351 2 0.00
352 38 0.02
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354 9 0.01
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361 37 0.02
362 9 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (356 bp):
TTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGA
AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACCAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTT
TTGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCA
AATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
Found at i:83386 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 83360--83412 Score: 56
Period size: 17 Copynumber: 3.0 Consensus size: 18
83350 AACACATTCA
83360 AATAGTTATGACTATTTG
1 AATAGTTATGACTATTTG
* *
83378 AATAATTAT--CTATTTCA
1 AATAGTTATGACTATTT-G
*
83395 AATAGTTATGACTTTTTG
1 AATAGTTATGACTATTTG
83413 TTTTGTCATA
Statistics
Matches: 27, Mismatches: 5, Indels: 6
0.71 0.13 0.16
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.22
17 8 0.30
18 8 0.30
19 5 0.19
ACGTcount: A:0.34, C:0.08, G:0.11, T:0.47
Consensus pattern (18 bp):
AATAGTTATGACTATTTG
Found at i:84333 original size:182 final size:181
Alignment explanation
Indices: 83926--84343 Score: 437
Period size: 182 Copynumber: 2.3 Consensus size: 181
83916 CTTTATTTCA
* * * ** *
83926 TCATAAAAC-AATTGTTTCT-TTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAA
1 TCATAAAACAAATTGTTT-TAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAA
* * * * * *
83989 TATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAGAATAAATATGTTTGCTGAACCAATTCAAATAG
65 CATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAGAATAAATATATTTACTCAAACAATTCAAATAG
*
84054 TTAAGACTATTAGAACAATTGTCTACTTCAAATCATTTTGACTGGTTGTTTAG
130 TTAAGACTATTAGAACAATTATCTACTTCAAATCA-TTTGACTGGTTGTTTAG
* * * *
84107 TCATAAAACAAATTTTTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
1 TCATAAAACAAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAAC
* *
84172 ATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAA-AA-AAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAG
66 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAGAATAAATATATTTACTCAAACAA-TTCAAATAG
* * * * *
84234 ATT-TGA-TGATTTA-ACCAATTATCTA-TTTAAAGTCA-TTGACCT-TTTGTTTTG
130 -TTAAGACT-A-TTAGAACAATTATCTACTTCAAA-TCATTTGA-CTGGTTGTTTAG
* * *
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1 TCATAAAACAAATTGTTTTAATTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
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*
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180 TA
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* ** * * * * * * *
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* * * * * *
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1 TGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-T
* * * ** * **
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* *** * ** * ** *
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* * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * * * *
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** ** * * * *
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* * * * * *
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* * * ** ** * * * * * *
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* * *
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** ** * * **
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* * * * *
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* * * ** *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT-TGTTTT
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
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130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * ** * **
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
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* * * * ** *
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* * **
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * **
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* * ** * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * ** * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *** * * *
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
92378 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATCAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * **
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130 TTTCAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATA
* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
92619 TTCTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAAAAAATATGTTTGCCGAATA
131 TTC-AAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * * ** * *
92667 A-TTCAAAT-GATTAGGAGTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAG
1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
92730 TCATAAAATAATTTTTTCAGTTCATACATA-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
92794 A-TTCATAAATTAATAAACAAAAAATTT-AAAAATAAA-ATGCTTATTTGAAATA
129 ATTTCAAAAATTAAT-AAGAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTG-AATA
** * * * * * * ** * * *
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1 AGTTCAA-A-TA-GTTA-TGACTATTTGAACAATT-AT---CTAT---TTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * * ** *
92908 TGTTTATCAAATTGGT--TCAAATAATT-TTGGCCAT-TTGA-ACAA--TTA-ACTATTTCAAAT
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* * ** * * * * * *
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** *
93028 ATAATATTAATTTA-TTAATA
161 ATAA-ATTTGTTTACTGAATA
* * * * * * * * * *
93048 ATTTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTCCTATTTG
1 AGTT-CAAA-TAGT---TATGACTATTTGAACAAT-TATCT-ATT-TCAAATCA--T--TA--TG
* * * ** *
93112 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAAA-TTTTG-TTCTGTT-ATAAAATAATTGTTGTAGTT
52 -AC-CTT-T-T-GTT----TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT---A-CA-------AG--
* * * * * *
93174 CATATAAACTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAATTTAATAACCAAGA
95 C---T-----TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GAAAA
* * * **
93239 GATTTAAAAAATTAATCTATTTA-TCGAAGC
151 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATA
* * * * * *
93269 AGTTCAAACAATTAAGACTATATGAACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
93334 CATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AAA-ATAA-AATAATACTAATTTATTAA
* ** ** * * *
93399 TATTTTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAACCTCTTTA-TCAAATT
128 TATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATA
* * * *** * * *
93453 AGTTCAAATAATTATGGCCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
93518 CATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTCGAAATAGAGTAATACT-ATTCTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATA
** * * * *
93582 TTTTGAATATTAAT---AAAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAA-A
130 TTTCAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * * ** *
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1 --AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
* * * * * ** * *
93691 TGTTATAAAACAATTATTT-TTTTTACACAAGCTTATTCGGATTAAAACAATACTAATTTATTAA
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* * * * * **
93755 CATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-
128 TATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TA
* * * * * * * * *
93809 AG-ACAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ***
93873 CATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
93937 ATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACA
130 TTTCAAAAATTAATAAGAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * * * *
93989 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATATGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
94054 TATAAAATAAATT-TTTTTGTTCATACCAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAAT
66 CATAAAA-CAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
**
94117 ATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TAGAATA
129 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATA
* * **
94170 AGTTCAAATCA-TTATGACTATTGTG--CAATTATTTATTTCAACTTGTTATGA-C-TTTGTTTT
1 AGTTCAAAT-AGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
94230 GT-ATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAAT
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* * * *
94292 ATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACA
129 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * *
94345 AGTTCAAAATAGTCATGACTATTTG--TAATTATCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTTTTTTG
1 AGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * *
94408 TAATAAAACAATTGTTTCAGTTCAT--AAG-TT-TTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
94469 -TTCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATT-AAAAA-AAATCTATTTAC--AAAA
130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * * *
94516 AGTTCAAATAGTTTTGACTATATT-AATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *** *
94580 TCATAAAACAATTG-TTC-ATTCATGCAAGCTT-TTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * *
94641 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAA-AAATCTATTT-CT-AA-A
129 ATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* *
94689 ACATTCAAATAGTTATGATTA-TTGAACAA-TATCTATTTCAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTG
1 A-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ***
94750 TCA-AAACCCATTG-TT-TGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
94811 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACT-AAGA
130 TTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * ** * * *
94862 GAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTATTTTG
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** *
94927 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
**** * * **
94992 -TTCTAAAAATTAATAATTTGGATATTTAAAAACTAAA-TTGTTTACCAAATA
130 TTTC-AAAAATTAATAA-GAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * * * * * *
95043 AGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * **
95108 CATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** *
95173 TTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATT
131 TTCAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * *
95220 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTAGGATC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
95284 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
95349 TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTGAACCA
131 TTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TA
* * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** ** * *
95465 CATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTCTTTTGTTAACA-
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
95529 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCAAACA
131 TTC-AAAAATTAATAAG-AA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATA
* ** * *
95582 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * *
95647 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *** * * * *
95712 TTTAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATGAATTAGTTTATTGAATC
131 TTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * * * *
95763 AGTTCAAATAATTATCG-CCATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTTTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * *
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* * * * **
95891 ATTTCAAAAATTAATAA-ATAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACC
129 ATTTCAAAAATTAATAAGA-A-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** *
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* * *
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1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
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65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * ** **
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * *
96362 CATAAAATAATTGTTTCTATTGATACAATCCTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATATGTTAATA-
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * ** * *
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131 TTC-AAAAATTAATAAGAAAAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTT-TACTGAATA
* * * * * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
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* ** * * * * *
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125 TAATATTTCAAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAATA
* * * * ** *
96658 AATTCAAATAGTTATGACTCTTCGAGCAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
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* * * * * **
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129 ATTTCA-AAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
**** * * * * *
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* * * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
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131 TTCAAAAATTAATAAGAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* ** ** * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
97260 TCATTAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT-AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * *
97324 A-TTCTAAAAATTAATAGGCAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAATA
129 ATTTC-AAAAATTAATAAG-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA
* * * *
97377 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * *
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* * * **
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* * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
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Statistics
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*
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Statistics
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AATAATTCAAAAATTA
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * **
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** * *
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* * * * * * * *
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188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * **** *
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252 TTTTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
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* * ** * * * *
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* * * * * * **
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * ***
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184 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * ** * * * *
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249 TAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* **
86723 AATTAAATAATTCAA-A-ATTTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTGTTTA-CTAAAAA
313 AATT-AATAAGT-AAGAGA-TT--T-----A-A----AAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * * ** * *
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1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** * * *
86846 CATGAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAGAATAATACTAATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
86911 TTCAAAAATTAATAA-ATGATTTAAATAGTGAATTTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATAATTATGG
130 TTCAAAAATTAATAATA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * * * *
86974 CCATTTCAATAATTATCAATTTCAAATCATTATTACCTTTTT-TTTGGTCATATAACAATTGTTT
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTT
* * * * * * *
87038 TTT-ATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTAAAAAATTAATAA
257 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * *
87102 GTAAGAGATTTAAACAAATAAATTTGTTTATCAAACC
322 GTAAGAGATTTAAA-AAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * ** * * *
87139 AATTTAAATAGTTACGACTATTAGAATAATT-GCATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTA
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * **
87203 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** ** *
87268 TTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGATTGAAAAAATAAGTTTATTTGCCAAATTAGTTCAAATAGTT
129 TTTCAAAAATT---AA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT
* * *
87333 AAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC------A-TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
** *
87391 TTTTCAATTCATACCAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT
255 TTTT-TGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * *
87454 AATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCTAACT
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* *
87495 AGTTCAAATAAGTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-CATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
87559 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATAGTAATCTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
87624 TTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACCAGTTTAAA-AATTGATCA
130 TTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT-ATGA
* * * * * * * * * ** *
87688 CTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCTTCTATTAGAAAATAATAATTTA
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTT
* * * * * ** *
87753 TGTTCATAAAAACTTATTCAGATTAAAATGATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGT
259 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
87818 AAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACT
324 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * *
87852 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
87917 CATAAAA-AATT-TATTTTAGTTCATATTAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT
65 CATAAAACAATTGT-TTTT-GTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * * * *
87980 ATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTGAAAAATGAATCTATTGA-CTGAACAAGTTTAAATAA
128 ATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAA
* * * * * ** **
88044 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGGT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * *
88109 TTTTTCTGTACATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTACGACAATT
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
88172 AATAGGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
317 AATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
** * * * ** *
88214 AGTTCAAATCTTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * * *
88279 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATATATAAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
88344 TTCTACAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACAAGTTCAAATAGTCT
130 TTC-A-AAA-ATTAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT-T
* * * * * * * * *
88408 -TAACTATTTGAATAATAATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
* * * **
88472 TTTTAGTTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAATTAA
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAA
* * * * **
88536 TGACTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTACAGAACT
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * *
88575 TGTTCAAATAGTTATGACTA-TCGGATAATTACCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *** *
88639 CATAAAACAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * ** *
88703 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CATGTTCAAATATTT
129 TTTCAAAAATTAATAA-T--AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCA-GTTCAAATAATT
* * * **
88767 ATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTCTTTTGTCATAAACCAATTG
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-
* * * * * *
88832 TTTTCTGTTCATAAAAGCTTATT-AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTAAGAATTA
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * *
88896 ATAAGTAA-AG-TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAGCG
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * ** ** *
88934 AGTTGAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTAT-TGAATTCAAATTGTTATGATATTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
88998 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-TTTCATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
89062 A-TTCTAAAAATTAATAAGTTGAAAATTTAAAAAATAAATATGTTCATCGAACAAATTCAAATAG
128 ATTTC-AAAAATTAATAA--T--AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAA
* * * * * * * * ** * *
89126 TCATGTCCA-TTCAAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTCATCGTAAAACAA
188 TTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * * * * *
89190 TTATTTCTATTTATACAAGATTATTTATAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAA-T
252 TTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * *
89254 --TCA-TAACAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACC
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * *
89292 AATTCAAATAGTTATGACTAATTT-AATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-ATTATTTTA
1 AGTTCAAATAG-TATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * *
89355 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * * *
89420 -TTCTAAAAATTAATAAGAAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCATACCAGTCCAAATAGT
129 TTTC-AAAAATTAAT----AATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * * *
89484 TAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* ** * * * *
89549 TTTTTAGTTTGTACATGCTTATTCGAAATAGAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAATAATTA
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTA
** * * * * * * *
89613 ATAAACAAAAAATTTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACA
318 ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * ** * *
89654 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATATATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** ** * * *
89718 TCATAAAATGATTGTTTCAGTTCATA-AAGCTTA-TCTAAAATAAAATAACATTACTTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * *
89781 ATTTCAAAAATTGAAAAGATAAAGATTT-AAAAATAAGTTAGGTTATTGAATCACTTCAAATAAT
128 ATTTCAAAAATT-AATA-AT--AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * * *
89845 TATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACAAT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* ** * * ** *
89909 TGTTTTTCATCATGCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * *
89974 ATAAGCAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTATCGAAC-
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * * *
90013 ----C--AT--T-T-TCTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTGTTATTCTGTT
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *** *** *
90068 ATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-T
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** * ** *
90132 TCTAAAATTTAATATCTAAGAGATTTGAAAAACAAATTTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAACTA
131 TC-AAAAATT-A-A--TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTA
* * * * *** * * * *
90197 AGATTATATGAACAATTATCTATTTAAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTGGTCATATAACAATTTT
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTT
* * * *** *
90262 TTTT-TATCATTCAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAAT
256 TTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* *
90326 AAGAAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
320 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * ** * * * *
90364 AGTTCAAATA-TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTGTC
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
90428 ATAAAAAAATTATTTTTTTTCATACAATCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
90493 TCAAAAAACTAACTAAGAGAATTAAAATATAAATTTGTTT-GCAAACCAATTCAAATATTTAAGA
131 TC-AAAAATTAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA
** * * * * *
90557 CTACATGTACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGGCATAAAATAAGTTTTTT
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTT
* * * ** *
90622 TGAATTTATACTAGATTATTTGGAAA-AAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T
259 TG--TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
90682 AA-CAAGAGATTCAATAAAT-AATTCTATTTACCTTACC
320 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCTAACT
* * * *
90719 ATTTCAACTAATTATGACTATTTGAA-AATTTATCCATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *** * *
90782 GTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** *
90847 ATTTCAAAAATTAATAAGAGCTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTCAAATAGTTATG
128 ATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATG
* ** * * * ** * * *
90912 ACTATTTCAGTAATTATTTATTTCAAATAGTTATGAATTGCTGTTTTTTTATAAAATAATTATTT
193 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTT
* * * * * * * **
90977 CTATTTATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAATTAATAAG
258 TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
91042 TAAAAAAGTTT-TAAAATAAATATGTTTA-CTGAACT
323 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* *
91077 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
91142 CAT------ATAG-----G--------A--TTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATAA
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * * *
91186 TACAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATGAA-TTGTTTATTGAGCAACTTTAAATAATTATGAC
130 TTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGAC
* * * * * * * * * * *
91250 TATTTCAATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTAT-AGCCTTTTGTTTTGTCATATAATGATTTTTTC
195 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTT
* * ** ** *
91314 TATTCATACAAGTTTA-TCTTGAATAAAATAATAAAAATTTAATAATA--T-AAAGACACTTAAT
259 TGTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-TTAAT
* * * * * *
91375 AAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
320 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* ** * * *
91413 AGCTCAAATCTTATGACTAGTTGAACAA-TATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT-TGTTTTG
* * * * *
91475 TCATAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * ** *
91539 ATTTTGACAATTAATAAGTAAAATATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAAT
128 ATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
** * * * * * * *
91604 CCTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGA-TATTTTCTTTTGTAATAAAACAAT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * ** * *
91668 TATTTTAGTTCTTATAAGCATATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * **
91733 ATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACGGAAC-
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * **
91772 ATGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAATGATTATCTATTTTTAAA-CATTATGAAATTTTGTTTT
1 A-GTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * **
91836 GTCATAAAATAATTGGTTCTATTTATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTA
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * ** *
91899 ATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CACGTTCAAATAG
126 ATATTTCAAAAATTAATAA-T-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCA-GTTCAAATAA
* ** * * **
91963 TTATGACTATTTGAATAATTATCTAGCTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * ** * *
92028 TGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTA
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * *
92093 ATAATTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTACC-AAGCG
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAA-CT
* ** * *
92133 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** * *
92198 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATGTAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAA-AA
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
92262 TTCTTAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCAAACAAGTTCAAATAGTC
130 TTC-AAAAATTAATAA---T-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT
* * * * * *
92327 AT-ATTCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGGCATTTTT-TTTTGTCATAAAACAAT
190 ATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * * **
92390 TGTTTCTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAA-T-
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * ** * *
92453 -TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTGTCGAACC
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * *
92491 AGTTCTAATAGTTATAATTATTTGAATAAATATCTATCTCAAATCATTATGATC-TATGTTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * * * * *
92555 CATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGTTTACTCAGAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTA-
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * * * *
92619 TTCTAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAAAAAATATGTTTGCCGAA-TAATTCAAATGATTAGGA
130 TTC-AAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * * *
92683 GTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTC
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTT
* * * * *
92748 AGTTCATACATA-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCATAAATTAATAAA
259 TGTTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * **
92811 CAAAAAATTT-AAAAATAAA-ATGCTTATTTGAA--
323 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * * ** * *
92843 A--TAAAATAATATTAC--TTT-ACT-A--A--TATTTCAAA-AATTAAT-AAGTTATAG-ATT-
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTT-TTGTTTTG
* * * * * ** *
92894 TAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATTGGTTCAAATAA--TT-TTGGCCATTTGAACAATTA-AC
64 TCATAAAA-CAAT-TG-TT-T----TT-GTTCATATAAGCTTATT--CAAAAT-AA-AATAATAC
* ** ** * * * * * * *
92955 T-ATTTCA--AATCATTACAAACTTTTGT-TTTG--TTATAAAAT-ATTTTTTTTATCATACAAG
116 TAATTT-ATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAG
* * ** * * * * * ****
93013 CTTATTCAAAATAA-AAT-AATA-TT-AATTTATTAAT-AATTTAAAAAT--TAATAAGTAAGAG
179 ----TTC-AAATAATTATGACTATTTGAA-CAATT-ATCTATTT-CAAATCGTTATGACTTTTTG
* * * * * * * * * ** * *
93071 -ATT-T-AAAAAATAAATCTGTTT-ATCAAACCAGTTCCTATT--TGA-ACAATTAT-CT-ATTT
236 TTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCATACAAG--CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
* *** * * **
93127 CA--AAT-TGTT-ATAAAATT--T-TGT-TCTG--TTATAAAATAATTGTTGTAGTTCATATAAA
299 -ATTAATAT-TTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGT--TT-ACCT-AA
93182 CTT
356 C-T
* * * **
93185 A-TTCAGAATAAAATAAT-ACTAATTT-AAT-A--A--TATTCCAAA--ATTTAATAACC--AAG
1 AGTTCA-AAT--AGT-ATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TT-ATGACCTTTTG
*** * * * ** *
93238 AGAT-T--TAAAA-AATTAATCTAT-TT-ATCGAAGC--AGTTCAAACAATTAAGACTATATGAA
59 TTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTGTTCATATAAGCTTA-TTC-AA-AA-TAA-AATA-AT--A
* * * * * * * *
93295 C-AA-CTA-T-CTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAA-TTGTTTCAGT
115 CTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATA---ATAG-ATT-T-AAAAAATAAATTTGTTT-A--
* * * * * * * * **
93354 TCATACAAGCTTATTCGAAATAA-AAT-AATA-AT-AATAATTTATTAATATTTTAAA-AATTAA
170 TCAAACCAG----TTC-AAATAATTATGACTATTTGAACAA-TTA-T-CTATTTCAAATCGTT-A
* * *** * * *** * * *
93414 TAAGTAAGTG-ATT-T-AAAAAATAA--ACCTCT-TT-AT-CAA-ATTAGTTC-AAATAATTATG
226 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAA-AAT-
* * * ** * * * ** *** ** * *
93469 GCCATGCCAA-CAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTTATTTTTTCATAAAACAAATGT
288 --AATACTAATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-AAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAAT-T
* *
93532 T-TTTATTCATATAAGTT
345 TGTTTA--C--CTAA-CT
* * * * ** ** **
93549 TGTTCGAAATAGAGTAAT-ACTATTCT-ATTAA-TATTTTGAATATTAATAAAAGATTAAAAAAT
1 AGTTC-AAAT--AGT-ATGACTATT-TGAATAATTA-TCT--AT-TT--CAAATCATTATGACCT
** * * * * * * * * **
93611 AAATCTATT-T-ATCAAAC--TAGTTTAAATAGCTATGACTATTTAAGCAATCATT-TATTTCAA
55 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT---TTG-T-T--C-ATATAAGC--TTATTCAAAAT-AA
* * * * * * * *** ** * *
93671 ATTGTTATGACT-TTTTGTT-TTGTTATAAAACAATT-AT--TTTTTTTACACAAGCT-TATTCG
108 A--ATAAT-ACTAATTTATTAATATT-TCAAA-AATTAATAATAGATTTA-A-AAAATAAATT-T
* * * * * * * ** *** *
93730 GATTA--AAA-CAATACTAAT--TTATTAAC-ATTTCAACAATTA-ATAAGT-AAAAAATTAAAA
165 GTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT--AT
* * * * ** ** * * * * **
93787 AAATAAATATG-TTTACCAAACTAGACAAATAATCATGATTAT-TTGA-ATAA--TTATT-TATT
227 GACT--TTTTGTTTTGTC--A-T--A-AAATAAT--TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* ** * * ** * *
93846 TCAAATCGTTA-TAACTTT-TT-GTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATT
282 TAAAAT-AATACTAA-TTTATTAATATT-TC---AAA-AATT-AATAAG-T-A-A-GAG---ATT
* * ** *
93908 GGGAATAAAATAATACTAATTTA-TTAA-T
332 --TAA-AAAATAA-ATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * * *
93936 AATCCAAAAATTAATAATAAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTT-T-A--
1 AGTTC--AAA-TAGT-AT---GACTATTTGAATAAT-TATCTATTT-C-AAATC-A-TTATGACC
** ** * * ** * * * * * ****
93995 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATATGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAA
54 TTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGT-T-TTTG--TTCA-TATAAGC--TT-ATTCAAAATAAA
* ** * *
94060 ATAA-ATTTTTTTGTTCATACCAGCTTATTTCAAATAA--AATAATACAAATTTATTAATATTAA
109 ATAATACTAATTT-AT--TA--A---TATTTCAAA-AATTAATAAT--AGATTTA--AA-A--AA
* * ** * ** * * * * *
94122 AAAAATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATAGAATAAGTTCAA-ATCATTAT
158 TAAATTTGTTTA-TCAAACCAGTT--CAAAT-AA-----TTAT-GACT-ATTTGAACA--ATTAT
* ** * ** ** *
94185 GACTATTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTT-TGTTTTGTATAAA-ACA-ATTTTTT
210 --CTATT-T-CAAATCGTTA--T-GACTT-TT-TGTTTTGT-CA---TA-AAATA-ATTTTTTTT
* * * * *
94247 ATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTA
260 GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** *
94312 AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACA
325 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* *
94345 AGTTCAAAATAGTCATGACTATTTG--TAATTATCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTTTTTTG
1 AGTTC-AAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** ** * *
94408 TAATAAAACAATTGTTTCAGTTC--ATAAG-TT-TTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
94469 -TTCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATT-AAAAA-AAATCTATTTA-CAAA-AAGTTCAAATAGTT
129 TTTCAAAAATT-A--A-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT
* * * * * *
94529 TTGACTATATT-AATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAA--
190 ATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* ** * *** * *
94591 TTGTTCATTCATGCAAGCTT-TTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * *
94654 ATAAGTAA-AAATTTTAAAAA-AAATCTATTT--CTAAAAC-
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT--AACT
* *
94691 A-TTCAAATAGTTATGATTA-TTGAACAA-TATCTATTTCAAAT-ATTATGA-CTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ***
94751 CA-AAACCCATTG--TTTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
94812 TCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTAAGA-GAGTTCAAATAGT
130 TTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AA-ACCAGTTCAAATAAT
* * * * * *
94875 TATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-AATCTTTTATTTTGTCATAAAATAAT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * * * * ** *
94939 TGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATA-TTCTAAAAATT
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* ** * * *
95003 AATAATTTGGATATTTAAAAACTAAA-TTGTTTACC-AAAT
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * *
95042 AAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTATTTT
1 -AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* ** **
95106 GTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** *
95171 ATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAAAATTAGTTCAAATAGTTAT
128 ATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTAT
* * * * *
95235 GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTAGGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTT
* * * * * * ** * *
95299 TCTATTCATACAAGTTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAA
257 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
95364 GTAAAAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTA-CTGAACC
322 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * * *
95400 AATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * ** ** * *
95465 CATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTCTTTTGTTAACA-
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
95529 TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGT
130 TTC-AAAAATTAATAA--TAG-A--TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * * *
95594 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* *** * * * * * *
95659 GTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGA
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* ** * * *
95724 GAAGTTGGAGATTTAAAAAATGAATTAGTTTA-TTGAA-T
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * * * *
95762 CAGTTCAAATAATTATCG-CCATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTTTTTT
1 -AGTTCAAAT-AGTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * *
95826 GTCAAAAAATAATTGTTTTTCATCAT-TCAAG-TCTATCCTAAATAAAATAATACTAATTTATTA
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAT-AAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* *
95889 ATATTTCAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTA-CTAAACCAGTTCAAAT
126 ATATTTCAAAAATTAAT-AAT---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
95953 AGTTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATGAAACA
186 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * * * *
96018 ATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATACAATAATACTAATCTAATAACATTAT-GAAAA
251 ATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA
* * * *
96082 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCCAACC
315 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * *
96125 AATTCAAATAGTTAATG-CTATATGAATAATTATCTA-TT----TCGTTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAG-T-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
96184 TCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATACGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * * * * *
96249 TTTTGAAAATAAATAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTATAA
129 TTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * ** * *
96314 CAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTGTAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTT
* * * * * * * * * *
96379 TATTGATACAATCCTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATATGTTAATA-TCCTAAAAATTAATAAG
259 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * ** **
96443 TAACGA-ATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCCGACT
323 TAA-GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * * * * * *
96478 AGTACAAATAATAATAATTGTTTGAACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
96542 AT-ACAAAACATTTTTTTTTATTTC-TACAAG-TTGACT-AAGAATAACATAA-ATCTAATTTAT
64 -TCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATATAAGCTT-ATTCAA-AATAAAATAATA-CTAATTTAT
* * * * * * * *** *
96602 TAATATTCCAATGTTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTATCGATTAAATTCAAA
124 TAATATTTCAA---AAATTAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAA
* * * * * * *
96666 TAGTTATGACTCTTCGAGCAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
185 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * ** * * *
96731 AATTTTGTCTATTCATACAAATTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGAC
250 AATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AA
* * * * * *
96794 AACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAAT
313 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * *
96838 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATCACTTTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * * *
96903 TCATAAAACATTTGTTTTTGTTCTTACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTA-TAACA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * * *
96967 TTTTGCCAATTAA-TAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATAGT
129 -TTT--CAA-AAATTAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * * * *
97031 CATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * *** * * * *
97096 GTATAAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTC-CAAA--AA
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * *
97157 TGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTA-CTGAACA
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* ** * * * * * * *
97196 AGCTCAAAGGGGAATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTTAAAT-AGTTATGAACTTTTATTTTG
1 AGTTCAAA-TAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
97260 TCATTAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT-AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** *
97324 A-TTCTAAAAATTAATAGGCAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAATAAGTTCAAATAG
128 ATTTC-AAAAATTAATA---A-TAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAA
* * * * * * *
97388 TCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * ** * * * * * *
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253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
97517 AATAAG--AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAACT
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * *
97554 AATTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * *
97618 CATAGAACAATTGTTTCTT-TTCATATAAGCTTATTTGAATTAAGATAATACTAA--T-TT-A-A
65 CATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * **
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129 TTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * * ** * * *
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194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTT
* ** *
97789 AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-AATTCAAAATATTAATAAG
259 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAG
* * * * * *
97853 CAAGAGATTTAAAAAATTAATTATTTTTATCAAACA
323 TAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCTAACT
* * * * * * * * *
97889 AGCTT-AAATAGATATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTATCTTTTATTTAG
1 AG-TTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
97953 TCATATAACAATTGTTTTTTTATCATACAAGGTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTGATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * *
98018 CTTTCAAAATTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAATCAATTCAAATAG
128 ATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAA
* * * * * * * *
98082 TT-TGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAAAAAATAAACCTTTTGTTCTAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-----GTT-----AT-GACTTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * *
98146 CATAAAACAATTATTTATGTTCATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAA-TCAATAATAT
242 CATAAAATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * ** * *
98210 TTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAATTTGAATTTGTTT-GCTAAACCT
307 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AA-CT
* * * * * *
98262 A-TTGAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTTTTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
98326 CATAAAATAGTT-TTTTCAATTTATACT-AGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAA
65 CATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * *
98388 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTATATTTACCTAATCCA-TTCTAAT
127 TATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATC-AAACCAGTTCAAAT
* * * * * *
98451 AATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTAAGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACA
186 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * *** * * *
98516 AATATTTTT-TTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCCAAAAA-
251 ATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* *
98579 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTA-TTAAACC
316 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * ** *
98617 AATTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
98682 CAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT-GT--TGTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** ***
98743 TTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATTGATTTAGTTCAAATAATTA
130 TTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTA
* * * * * * * * * * *
98808 TGGCCATTTAAACAACTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGC
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-T
*** * * * * * *
98873 TTTTCAAT-ATAGAATCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAGAA-T--T
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * *
98934 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACC
320 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * ** * * *
98971 AATTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTATAT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** *
99035 CATAAAACAATTGTTTCTATTTACATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *** * * * * *
99099 TTCTAAAAATAAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCATTT-GCTAAACTAGTTTAATTAGT
130 TTC-AAAAAT---TAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAAT
* ** * * * * * *
99163 TAAGACTATACGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * * * *
99228 GCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATT
254 -TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT
* * *
99293 AATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTA-CTAAACT
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * *
99334 ATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTATTGTTTTG
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTG
* * * ** * *
99398 TCATCAAACAATTGGTCTTGTTCATACT-ATTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * ** ** *
99462 ATTTCAAAACCTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTGGT-GAACCAGTTCAAATA
128 ATTTCAAAAATTAATAA-T-AG---ATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCAAACCAGTTCAAATA
* * * * * * * ** *
99526 GTTAAGACTATATG---AATGAT-TATTT--ATTCCTTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAACA
187 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * *** * * * *
99585 A-TTGTTTTATTCATACAAGCTTATTTTGATTAAAACAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
251 ATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
99649 TAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAAC-AAAT
316 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * ** * * * *
99690 CAGTTTAAACAGTTAAGATTATTAAAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTAG
1 -AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * *
99755 TCATAAAATAGTTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT-----T---AGAATA--AA--TA--AATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
99806 -TT----AA-TAAGAATAGATTTAGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATT
129 TTTCAAAAATTAATAATAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATG
* * * * * * * * *
99865 ACTATATGAATAATTGTCAATTTAAAATCGTTATAACGTTTTGATTTGTCATAAAA-CATTTGTT
193 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT-TT
*** * * ** * *
99929 TCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCACTAAAA-TAA
257 TTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAAATTAA
* * * ** * *
99991 TAAGTATGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TTGAATT
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * *
100030 AGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAAT-AGTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** ** *
100094 TCATAAAACAATTGTTTTT-TATCATCCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* **
100158 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGACCAGTTCAAATAGT
128 ATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATA--
* * * *
100222 TATGACTATTACTATTTGAACAATTAT-TAATCTT-AAATCGTTAAGA-TCTATGTTTTGTCATA
187 -AT---TATGACTATTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * **** *
100284 AAACAATTATTTTTGATCATAGAAACCTATT-TGGTTAAAAATAATACTGATTTAATT-ATATTT
246 AAATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTT-ATTAATATTT
* * * ** * * *
100347 CAAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGATCC
309 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * ** * * * * * *
100396 AATTGAAATAGTTAAAACTATTAGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTATTTAGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ***
100461 CATAAAA-TATT-TTTTTCATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATT-A
65 CATAAAACAATTGTTTTT-GT-TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * *
100522 TCATTTTAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAA
127 T-A-TTTCAAAAATTAAT-A--ATA-GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAA
* * * * * * ** * *
100587 TAGTGATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGACATAAAAC
185 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * * * * *
100652 AATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAA
250 AATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * *
100717 TTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTATCGAACA
315 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * *
100757 AATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** *
100822 CATAAAACAGTTGTTTGAATTCAT-TCAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACAAATTTATTAAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAT-AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** *
100885 ATTTCAAAAATTAATAAGT-GATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAATTAGTTTAAATAATTAT
128 ATTTCAAAAATTAATAA-TAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * * *
100949 GGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TT
* * * * *
101014 TTTT-ATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATA
256 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * *
101078 AGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT
321 AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * * * * * *
101116 AATTTAAATAGTTAT-ACGATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * **
101180 CATAAAACAATTATTTTTGTTTATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
101245 TTCAAAAATTAATTACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTT
130 TTCAAAAATT-A--A-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAATT
* * * *
101309 AAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC------A-TTTTTATTTTGTCATAAAACAATTT
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
*** * *** * *
101367 TTTCACTTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAA
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * *
101431 TATGTAAGAGATTTACAAAATAATTTTGTTTACCTAA-T
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * ** *
101469 CAGTTCAAAAAATTATGATTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATCACCACGACCTTTTGTTTTG
1 -AGTTC-AAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * **
101534 TCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATACGTTTGTTTAGAATAAAATAATACTTATCTAACAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* **
101599 GTTTTCTATTTATAAAAGCTTATTCAGACTA-AAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATT
129 --TTTC-----A-AAAA--TTAAT-A-A-TAGATTTAA-A--AA---A-TAA-A-TTTG----TT
* * * * * * * * * * * ** * * *
101663 AAT-AAGCAAAATTTAAAAAAATA-AATTGTTT-ACCAA--A-CTAGATCAACTAGTCATGACTA
168 TATCAAAC-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-
* * **
101722 TTCGAATAAGTTTT-T-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTT-ATAAAAAAATTATGT-
231 TT----T-TGTTTTGTCA--T-AAA--A-TA--A--TTTT-TTTTGTTCAT-ACAAGCTTAT-TC
* ** * * * * * * * ** * * *
101783 TAGTTCATATCA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATA-
278 AAAATAAAATAATACTAATTT--ATTAATATTT--C--A---A--AA-A-T-TAATAAGTAAGAG
* * * * *
101846 ATTAAAAGATTTAAAAAATGAGTCTCTTTACCGAACA
329 ATTTAAA-A---AATAAAT---T-TGTTTACCTAACT
* * * * **** *
101883 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATATGAAATTGCCATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** ** * * * ** *
101948 CACCAAATGATT-TTTTCTATTCATACATGCTTACTT-TGAATAAAATACTAC-AATTTATTAAT
65 CATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
102010 A--CCAAGACAATTAATAGGTAAATGATTTACAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAAT
128 ATTTCAA-A-AATTAATA---ATA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAAT
** * * * * * * *
102072 CCTCATGA-TA-TTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTCTATTTTGTCATAAAACA
186 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* * * * * * * *
102135 ATTGTTTTTATTCTTACAAGTTTATTCAGATTATAATAATACTAATTTATAAATATTTCAACAAA
251 ATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAA
* * * * *
102200 -TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTATGTTTACCGAACA
315 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * *
102242 AGTTCAAATAGTCTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * ** * * *
102307 AATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTTGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATA-
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
102371 TTCTAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAA-CATTTTCAAATAGTT
130 TTCAAAAATT-A--A-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCA-GTTCAAATAATT
* * *
102435 ATGACTA--T-----A--A---A---C--A---TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
* * * * * *
102480 GTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTCCAAAAATTAA
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* *
102543 TAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAAC-
319 TAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * *
102580 ACATTCAAATCGTTACGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTCGTTTT
1 A-GTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * **
102644 ATCATAAAGCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ***
102708 ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTCAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAGTGAGTTCAAAT
128 A-TTTCAAAAATTAAT-AAT---AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAAT
* * * * * * *
102772 AGTTATGACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTTATAAAAC
186 AATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAAT
* * ** ** * *
102836 AATTGTTTCTACTCATACAATTTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
250 AATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * *
102900 ATTAATAAGTTAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCGAA-T
314 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * **
102943 AAGTTCAAATAGTCATGTCCATTT-AAGCT-ATTATTTATATGAAAT-AGTTATGATATTTTGTT
1 -AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAA--TAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTT
* * * * * * ** * * *
103005 TTATCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTAGAATAAAGT-ATACTAATTTATTA
61 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * *
103069 ATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTAT-TTTATCAAACTAGTTCAATTAAT
126 ATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * *
103133 TATGACTATTTCAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * * *
103197 GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTA-TGAAATTAATAATA-TTCTAAAAATT
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * * ** *
103260 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATAATTATCTATTTTAAAT
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATTTGTTTA-CCTAACT
* * ** * ** * * * ** * * *
103303 CATTTGACCT--TTTGTTTAGTTGTAA-AATAAT-TTTTTCAGTTAATAAATG--C--TT-ATTT
1 -AGTTCAAATAGTATGACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTTGTTTT
** ** ** ** * ** * *
103359 GAAATAAATTAA-TAATAAT-TT-AT-T-A--TCATTCAGAAATTTAATTA-AC-AA--GA--AA
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * ** *
103411 T-TTT-AAAAAATAA-ATTTG-TTTATCAAACAAGTTCAAA-TAG-TTAT--GACTA-TTTGAAC
127 TATTTCAAAAATTAATAATAGATTTA--AAA-AA--T-AAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAAT
* * ** ** * * * ** * * * ** *
103467 AATTATCTATTAATAAGAAGTATGACCTTTTGTTTAATC-ATA-AAATGATTGTTTCAGTTCATA
186 AATTAT-GACT-ATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTT-TG-TCATA
** * ***** ** * * **
103530 AAAGCATATTCGAAATAAAATA-ATATTGCTTTATT-AATATTTCAAA-AAT--TAA-AAAGTTA
246 AAATAATTTTTTTTGT-TCATACA-A--GC-TTATTCAA-A-ATAAAATAATACTAATTTA-TTA
* * * * * * * * * *
103589 AAAGTTT-AAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAAT-TATTTAGTTTATC-AAAT
303 ATA-TTTCAAAAATTAA-TAAG--TA--AGA-GA-TTTAAAAAATAAATTT-GTTTACCTAACT
* * * * * * * * ** *
103650 CACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTGAAGTCATTACAAACTTTTTGTTTT
1 -AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTT
** * * * * *
103715 GTCATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCTTATTCGAAACAAACTAATATTAATTTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
103780 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATTTATTTA-CTGAACCAG---------
128 ATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAA
* * * * * *
103835 TT-T--CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTATGTTATAAAATAAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* *** * *** * * *
103897 TGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTG
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** ** * * * *
103962 ATAACCAAGAGACGTAAAAAATAAA--TCTATGCCAAAGC-
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAA-CT
* * * * * * * * * ** *
104000 AGTTTAAACAATTAAGACTATATAAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATG-CCTTTTGTTTGG
1 AGTTCAAA-TAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *** *
104064 TCATATAACAATTGTTTTTGATCAT-TCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATAAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
104128 CA-TTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAATTCAAAT-A-TA
128 -ATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTA
* * ** * * * * * * *
104189 TAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTAT
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTT
* * * * * *
104254 TTTTATTCATACAAGCTTAGTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATA
256 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * ** * *
104319 ACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACC
321 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * *
104356 GGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTTTTTTTG
1 AGTTCAAATA-GTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTG
* * *** * *
104421 TCATAAAATAAGTT-TTTTTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAACTTAT
64 TCATAAAACAA-TTGTTTTT--GTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAT
* *
104483 TAATATCTT-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAT-AATTCTATTTATCTAACCAGTTCA
124 TAATAT-TTCAAAAATTAATAA-T-AG--ATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATCAAACCAGTTCA
** * * *
104545 AATAATTATGACTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTGTCATAAA
183 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA
** * * * * ** * * *** * * *
104610 CCAAATGTTTTTATTTATTTAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATCAATATTTC-AA
248 ATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
104674 AA--AATAA-TAAGAGATATAAATAATAAATCTATTTATC-AAAT
313 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* *
104715 GAGTTCAAATATTCATGACTATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTT
1 -AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * ** *
104779 GTTACAAAATAATTGTTTTCGTTCATACAAGCCTATTCGAGTTAAAATAATATTAATTTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * *
104844 ATTTCACCAATTAAT-A-AG---TAAAAAATAAATATGTTTA-CTAAACTAGATCAAATAGTCAT
128 ATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAATTAT
* * * *
104903 GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAA-AATTAT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-T
** * * * * *
104967 TTCAT-TTCATATAAGCTTATTTGAAAA-AAAATAACACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAA
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * *
105030 TAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCAAACA
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * ** *
105069 AG-TCTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTTTTATAACCTTTTGTTTTG
1 AGTTC-AAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *** * *
105133 TCATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATCCAAATTTATTA
64 TCATAAAA-CA-ATTGTTTT-TGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *** * * * *
105198 ATA--TAAAGACAATTAATAAATAAAACATTTTTTAAA-AAATCTATTTACTGAATA--AGGTCA
126 ATATTTCAA-A-AATTAAT-AAT---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAA-ACCAGTTCA
* *
105258 AAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAACTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
183 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
* ** * * * * **
105321 AATAATTGTTTCTAATT-ATACAAACTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTG
247 AATAATT-TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * ** * *
105385 ATAATTAATAACTAAAAGATTTAAGAAATAAATTTGTTTTTCAAACA
311 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * *
105432 AGTTCAAATAG--T-CCTA----ATTAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACATTTTGCTTTGTA
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *** * **
105490 ATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGATTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
105554 CCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTATTAAA-CATGTTCATATAGTTA
131 TCAAAAATT-A--A-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCA-GTTCAAATAATTA
* * * *
105618 TGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGA-TATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
* * * *** *
105682 GTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAA
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * *
105746 TAGGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTAAAC-
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* *
105783 ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
1 A-GTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * **** * ** *
105848 TCATAAATATATATTATTTTAT-TGCAAATAAGCTTGTTTGTTGA-AAAACAAT--TGTTTTA-C
64 TCATAAA-ACA-ATTGTTTT-TGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* *** ** * * * *
105908 AACAAAACAAAAGGTAATAATA-ATTTGAAATAGAT-AA-TTG--T-TCAAA-TAG-CCATAATT
125 AATATTTCAAAAATTAATAATAGATTT-AAA-AAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCA-AATA
* * * * * * *** *
105965 ATT-TGAACTGATTTGGTA-AATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAATA
187 ATTATG-ACT-ATTT-GAACAATT-ATCTA--TTTCAAA--TC---GTTATGACTTTTTGTTTTG
* * * * * * **
106028 TTAAAAAAGTAGTATTATTTTATT-TTGGAT--AAGCTT-TT-ATGAACTGAAACAAT--TTTTT
241 TCATAAAA-TA--ATT-TTTT-TTGTT-CATACAAGCTTATTCA--AAATAAAATAATACTAATT
* ** * * * ** * * *
106086 TATGACA-A-AACAAAAGTTCATAA--CA-ATTTTTAATAAAT-AA-TT-ATT--C-AATT
298 TATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * *
106136 A-ATCATAATTGTTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTAT-TTTTTCAAATC-TCT-TG--CTTA
1 AGTTCA-AATAGTATG-AC-TATT---TGAA-TAA-TTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTT-
* * * * * * * **
106195 TTAATTTT-TTAAAAGTTAATTAATTAGTATTAATTTATTTCA-ACTAAGCTTGTAT-GAGCTAA
56 TT-GTTTTGTCATAA---AA-CAATT-G--TT--TTT-GTTCATA-TAAGCTTAT-TCAAAATAA
* * *** *** * * *
106257 AACAAT--TATTTTATGGCTA-AAAAAAAGATT-AGAACA-ATTTGAAATAGA-AAATTAT-TCT
108 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAATAGATTT-AAA-AAATAAATT-TGT-T
* * * * * *
106315 AATAGTCTTAACCATTTGAATTGACTTA-G-C-A----AACACATTTAT-T-TTT-TAA-C--TA
168 --TA-TC-AAACCAGTTCAAAT-AATTATGACTATTTGAACA-A-TTATCTATTTCAAATCGTTA
* ** * * * *
106367 T--CTTACTTTATTTT-T--TAAACCAA---------TTCATATAAGATTATTCAAATTAATATA
226 TGACTT--TTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA
* * * * * * **
106418 ATACTAATTTATTAATATTT----TATT--T-A-T--TA-ATTT-----ATTAATCTATTCATAT
289 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT
106467 AAGCTT
354 AA-C-T
* * * * * *
106473 A-TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * *** * *
106537 CATAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTAATAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** *
106602 TTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAAT-AATCCG-TT-T---ACC-GTTCCAATAATTA
130 TTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTA
* * * * * *
106660 TGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTATGTCATAAAACAATTAT
191 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTT
* * *
106725 TTCTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTGTAATAATA-TTCTAAAAATTAA
256 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAA
* * * *
106788 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTT-GCTGAACC
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * * * * *
106827 AATTCAAATAGTTAAGCCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * *
106891 TCATAAAACAAAAT-TTTCAGTTCTTAGTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAACAAATTTATTAA
64 TCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATA-TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * ** **
106954 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAA-AAATCTATTTGTTGAATTAGTTCAAATAA
127 TATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAA
* * * * * *
107018 TTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTCTTTTGTCATAAAATTAA
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAA
* * * * * ** *
107083 --GTTTTTGTTCATATC-AGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTGAAAAC
252 TTTTTTTTGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * *
107145 TAAGAAGTAGGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CCTAAATT
316 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * ** *
107187 AGTTCAATTAGTTATAACTATTT-AGACAATTCT-TCATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTT
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGA-ATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** *
107250 GTCATAAAACAATTGTTTATGTTCACACAATCTTATTCAGAATAATGTAATGCTAATTTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * ** *** ** * * *
107315 ATTTTGAAAATTAGTAAGTAAAGGATTT-AAAAATGAACATGTTGGCCTGATCAGTGCAAATAGT
128 ATTTCAAAAATTAATAA-T--A-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * * * * * * **
107379 TATGATTGTTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCA-CAAAGCATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * ** * * * * * *
107443 TGTTTCTATTTGTAAAAGCTTATTCCAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCTAAAATG
254 T-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
107507 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGCTTA-TTGAA-T
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * * *
107547 AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-TGTTTTATCGTAAA--A-TA--A-ATTTT-CT
1 -AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATT-TC--AAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * ** * * * * *
107604 AT-TCAT---ACAA--GCTTAT-TTCAAATAAAATTATAC-AAAT---TTATTAAT-ATTTA-GA
61 TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * ** *
107656 CTA-TT-AATAAGT-A-AA-AGATATAAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT
126 ATATTTCAAAAATTAATAATAGAT-TTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT
* * * * *
107716 ATAACTATTTTAACAATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGA-TATTTTGTTTTGTCATAAAACAAC
190 ATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* * *** * * ** *
107779 TTTTTTTCTCCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTTACAATTA
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * *
107844 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAGATATGTTTACCGAACA
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * ** * *
107884 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATTGTTATGATCTTTCGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *** * **
107949 CGTAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-T
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * **
108013 TCCAAAAAATAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAACTAT-TTT-CCGAACAAGTTCAAATAGC
130 TTC-AAAAAT--T-AATAATAGATTTAAAAAAT-AAA-TTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * *
108076 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* **** * *** * *
108141 GTTCCAATTCAAACAAGCTTATTTGGAATAAAATGATA-TAAATTTATTAATATTT---TAA--A
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *
108200 A-AA-T-A-A-ATCT-----AT---TTT-TTGAAC--A-T
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* *
108223 -GTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
108286 TCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCAAAATAAAAGAGTACTAGTTTATTAAT
64 TCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * * * *
108350 ATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACCAAGCAAATTCAAATAGT
128 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
** * *
108415 TATGACTGCTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTAT-TTTT-TCATAAAATAA
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTT-TGTTTTGTCATAAAATAA
* *** * * *
108478 TTATTTGCATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-GAAAAT
252 TTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAAT
** * *** ** **
108542 TAATTGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATAAATTGAACAATTATTT
316 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT---TTGTTTACCTAACT
* * * * * * * * *
108587 ATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG--T-TTTGTC-A--T-AAAACAAT-TG----TTT-CTAT-T
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * **** * * ** * *
108638 CATACAAGC--TTATTCACATTAAAATAA---TATT-AATATATAAATATTTTGACAAATAATAA
65 CATA-AAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAA-A-ATAAA-ATAAT-ACTAAT--TTA
* * * * *** * *
108697 GTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-AT-G-TTTACTGAA-CAA---G--TA-CAAA-TAG-T--AAT
123 -T-TAATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAAT
* * * * * * * * * *
108748 GACTATT-TGAATAATT-ATCTATT-T------CAAATCATTGTGACCTATTATTTTGTAATAAA
186 -A--ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAA
* * ** * * **
108804 ACAATTGTTTCAGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAA
248 ATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AA
* * ** * * * * *
108868 AAATAAATGAGTGGGACAATTAAAAAATTAATCTGTTTACC-AAAT
312 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * *
108913 ATGTTCAAATAGTTATGATTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTCTATTTTG
1 A-GTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
108978 TCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTA-T-A
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * ** * * * * *
109039 T-TTTCTGAACACATTCAAATATTTGTAATTGT-ATGAA-CAATTATCTATCTCAAATC-GTT-A
127 TATTTC--AA-AAATT--AATAATAG--ATT-TAAAAAATAAATT-TGTTTATCAAACCAGTTCA
* * * ** * * ** ** * *
109099 TGAT-CTTTTG--T-TTTGTCATA-AACCAAT-TGTTTC-TATCCATAAAAGC---TT-ATTTGA
183 -AATAATTATGACTATTTG--A-ACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGT
* ** * * * ** *
109153 AATAAAATAATATTAATTTATT-A-A-AA---T-TCCAAAA-ATTAATAAGTAAAAGATTTA-AA
242 CATAAAATAAT-TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA-AAATAA-TACTA-ATTTATTA
* * ** * * * * * * * * * * *
109209 AAAATT-AATCCATTTAT-CG--AGCGAGCTCAAATAGTCATGACTTT-TTGAAC-AATT
303 ATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAA-A--AATAAATTTGTTTACCTAACT
* ** * * * * * * **
109263 A-TTTATTTCA-AATGA-T-TATG-ATAATT-TGT-TTT---GTCA-TA-AAACAATTGTTTCTA
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-T-
* * * * * *
109316 TTCAT---ACAATT-TTATTTGAAAATAATACTAA-TTTATT-AATATTCTAAA-AAT--TAA-T
63 GTCATAAAACAATTGTT-TTTG---TTCATA-TAAGCTTATTCAA-AAT-AAAATAATACTAATT
* * * * * ***** * * **
109371 AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-AT-G-TTCGCTGAA-CAAGTT-TAAAT-A-----G-TC--
121 TA-TT-AATATTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAA
* * * * * * *
109422 ------ATGTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAA
184 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * ** *
109481 CAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
249 TAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
109546 A-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACA
314 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * **
109586 AGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTATCTATCTTC-AATTGTTATGA-CTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * * * * *
109649 TCATTAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
109714 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAATCAGTTCAAATAGTT
129 TTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT
* * * * * * *
109779 ATGACTAGTAGAACAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTT
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
* ** * *
109844 TTTTAGTTTGTACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAA
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
** * * * * *
109908 TAAACAAGAAATTTAAAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
319 TAAGTAAGAGATTT---AAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
** * * *
109950 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTTATTTTA
1 AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * *
110014 TCATAAAATGATTG-TTTTGTTCATAAAAGCTTATGT-AAAATAAAATAATATTACTTTATTAGT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** *
110077 ATTTCAAAAATTGAAAAGATAAAGATTTAAAAAACAAGTCAGTTTAT-AGAATC-GCTTCAAATA
128 ATTTCAAAAATT-AATA-AT--AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCA-AACCAG-TTCAAATA
* * * * * * * * * *
110140 ATTATGGCCATTTAAATATTTATCTATTTTAAACCGTTACGAACTTTTAT-TTTT-TTATAAAAC
187 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTT-TGTTTTGTCATAAAAT
* ** * *
110203 AATTATTTTTCATCATAAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
250 AATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
** * * *
110268 TTAATAAGTAAGAGATTTAGCAAATAAATCTATTTATC-AA--
315 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * * * *
110308 A---CCAAT--T-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTTAACTCATTATAACCTTTTGTTCTATT
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * *** *
110365 ATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAACCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * *
110430 TCAAAAATTGATAATTAAGAGATTTTGAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAACAGTTCAAATACTTA
131 TCAAAAA-T--TAA-TAATAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTA
* ** * * * * * * *
110495 AGACTA-ACGAACAATTATCTATTTATAAAAT-ATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATAA-CATT
191 TGACTATTTGAACAATTATCTA-TT-TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * *
110557 TTTTTTGATCATTCAAACCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAA
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * *
110622 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAAT
319 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * ** * * * * *
110661 AGTTTAAATA-AATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAATCTTTTGTTCTATC
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
110725 ATAAAACAATTATTTTTCTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** * * *
110790 TCAAAAATTAATAACTTAGAGAATTAAAAAACAAATTTATTTGTTGAACTAGTTCAAATATTTAA
131 TCAAAAATTAATAA--T--AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTAT
* * * * * *
110855 GATTATATGAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTAT
192 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA-TTTT
* * * * *
110920 TTTCGAATTCATACTAGCTTATTTAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
256 TTTTG--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA
110984 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTGTTTACCTAACT
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCTAACT
* * * *
111024 AGTTAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCACAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *** * * *
111088 TCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATATGTTAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
111152 TTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAA
129 TTTCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * ** * * * * *
111217 CTATTTGAGCAATTATTTGTTTCAAATAATTA-GACTTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTC
194 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTT
* * * * *
111281 TATTCATACAAGCTAATTCAAATTAAAATAAGACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT
259 TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
111346 AAAAAATTTTAAAATTAAATATGTTTA-CTAAACT
324 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * *
111380 AATT-GAATAGTCATGCCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-------TT-T
1 AGTTCAAATAGT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * *
111436 --T----C------TTTTG-TCATATAAGCTTATTTGAAACAAAATAATAATAAGTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * * * * * *
111488 TATGAAAGGTAA-TAAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGCTTGTCGAGCAACTTTAGATAATT
130 T-TCAAA---AATTAA-TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT
* * * * * * * ** * * *
111552 ATGACTATTTCAATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTACAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATTT
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
* * * *** * * **
111617 TTTCTATTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATA-AAACTTGATTAATA--GAAAGACAATT
255 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAA-A-AATT
* * * * * * *
111679 AATAAATAAAACAGTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACA
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* ** * * *
111720 AGTTTAAATCTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGACTTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAC-CTTTTGTTTTG
* * * * * * *
111784 TCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATTACAAGAATACTAATTTATTAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * ** * * * * *
111849 TTTCGACACTTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTTAGCAAGTGCAAATAGTC
129 TTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATT
* * * * * * * * *
111914 CTGACTATTTCAATAATTATTTATTTTAAATCAG-TGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAA-T
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * ** *
111977 TGTTTTGAATTCATAGAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
254 TTTTTTG--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
112042 AATGAGTGATAGA-ATTAAAAAAATAAATCTATTTA-TTGAAC-
317 AATAAGT-A-AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * * * *
112083 ATGTTTAAATAATTATGACTATCTGAATAATTATCTATATCAAAACATTATAACATTTTGTTTTG
1 A-GTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * **
112148 TCATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * *
112211 TATTTGAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTT-T-GAACACA-TTCAAATA
127 TATTTCAAAAATTAATAA-T--AGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTATCAAAC-CAGTTCAAATA
* * * * * **
112273 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAA
187 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* * * * *** * * *
112338 TTGTTTATGCTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATTAA-AATTCTAAAAAT
252 TTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* * * *
112402 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAGT
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* * *** * * *
112443 AAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGCTATAATCTTTTGTTGTG
1 -AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * ** *
112508 TCATAAAATAACTATTTCTATTCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAGTACTAACGTATCAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
112573 -TTCTTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTCACCGAACAAGTTCAAATAGT
129 TTTC-AAAAATTAATAA--T--AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * ***
112637 CAT-ACCCATTT-AAGCTATTATCTATTTCAAATCGATATGA-TATTTTGTTTTGTTGCAAAATA
189 TATGA-CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAATA
* *** ** * * **
112699 ATTGTTTCCATTCATACAAAATTATTCAAAAT-AAATAACACCAATTTATTAATATTTTGAAAA-
251 ATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *
112762 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATC-AAAT
316 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * *
112800 CAGTTCTAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTG
1 -AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * * * * * *
112864 TCATAAAACAATTGTTTATATTCATACAAGCTTAATT-GGAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGT
64 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
112928 A-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATGTGTTTACCGAACTAATTCAAATGA
128 ATTTC-AAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAA
* * * * * *
112992 TTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAT
188 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
** * *
113057 TTTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAACTTATTAATA-TTCAAAAATTA
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** * * *
113121 CTAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-T
318 ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * *
113161 AAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTATATATTT-ATTATAAATATGACCTTTTGTTTT
1 -AGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * **** * * * * *
113225 ATCATAAAACAATTATCCGAGTTCATAAAAGTTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT
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* * * * ** ** ***
113290 ATTTTAAAAATTTACAAGTTAGAAATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATCGGATTGGTTCAAATAAT
128 ATTTCAAAAATTAATAA--TAG--ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAAT
* * * * * * ** * *
113355 TTTGGCCATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTACAAACTTTTT-TTTTCTTATAAAATAAT
189 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
* ** * *** * *
113419 TATTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTTA
253 TTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * *
113484 AT-ATTAAGATATTT-AAAAATAAATCTGTTTATC-AA--
318 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * *
113519 AG--C--A-A-T-T-CCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-CTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
113575 TATAAAATAATGGTTTTAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** *
113640 TCCAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATTAATTTGTTT-GCTGAAGTAGTTCAAACAATT
130 TTCAAAAATTAATAA-T-AG--ATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACCAGTTCAAATAATT
* * * * * * *
113704 AAGACTATATAAAGAATTGTCTATTTCAAATCGTT-TAGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT
190 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-GACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
* ** * * *
113768 GTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAAAATAATAATAATAATTTATTAATA-TTCTAAA
254 TTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TT--CA-AAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAA
* * ** * *
113832 AATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAACATATTTA-CTGAATT
313 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AACT
* * * * *** * * * * *
113873 AGTTCTAATAATTATGGCCATGCCAACATTTATCTATTTCAAATCGTTACT-ACCTTTTCTTTGG
1 AGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTG
* *** ***
113937 TCATATAACAATT-TTATTTAAACAT-TCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATTGTT-TTTGTTCATAT-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
114000 TCTTTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAGATAAATCTATTTATCAAACTACTTTAAATA
127 TATTTC-AAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATA
* * * ** * * * * * *
114065 GTTATGACTATTTCAACAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACATTTTGTATTGTCATAAAACAA
187 ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
* ** * * *
114130 TTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATT
252 TTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
114194 AATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACC
317 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
* * * * * *
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1 AGTTCAAATA-GTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *** *
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* * * *
114362 ATATTTCAAAAATTAATGAGTGAGTGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAGTTCAAATA
126 ATATTTCAAAAATTAAT-AAT-A--GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATA
* * * * * *
114427 ATTATGACTA-TTGAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTCTATTTTGTCATAAAACA
187 ATTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATA
* *
114491 AATGTTTTTGTTCATA
251 ATTTTTTTTGTTCATA
114507 TAAGTTTGTT
Statistics
Matches: 21244, Mismatches: 5255, Indels: 3916
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
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AGTTCAAATAGTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTATGACT
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTG
TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
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Alignment explanation
Indices: 85689--105854 Score: 4694
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
85753 TCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACCAATTTATTAACA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** *
85818 -TTCAAAACTTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAATGAATAAGTTCAAATAG
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTT-AAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
85881 TTATTACTATTTGAAAAATGA-CTATTT-AACATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAA
192 TT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * *
85944 TTGTTTTATTTAAAACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTA-TAAAACTTACTAAAA-
255 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA--AAAAT
* **
86007 TAATAAGTAAGA-AACTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATT
318 TAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * ** * * *
86049 AGTTAAAATAATTATAGGC-ATTTGAGCAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG--TTG
1 AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * **
86111 TCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTA-TTCGACATAAAATAATGCTAATTCGTTAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * *
86174 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTACTAAACTAGTTCAAATAG
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
86239 TTATAACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAGTCGTTAAGA--TATCTGTTTTGTCAAAAAACA
192 TT-TGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * ** *
86301 ATT-TTTTTTTATCATAGAAGTTTATTTG-GCTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
254 ATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAA
* * * * *
86364 A-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAGCA
316 ATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * ** * * * *
86404 AATTCAAATAATCAAAACTATTAGAATAATTAT-TAATTTCAAATCATTCT-AGCTTTTTGTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * * * *
86467 GTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTAATTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * * *** *
86530 ACA-TTCAAAAATTTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTCAAA
127 ATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAA-AATTT-AAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAA
* * * * ***
86594 TAGTGATGACTATTTGGACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAAAATAAAAC
189 TAGT-TTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *** * *
86659 ACTTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAA
253 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT-TAAAA
* * * * * *
86724 ATTAAATAATTCAAAATTTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTGTTTACTAAAAA
316 ATT-AATAAGT-AAGA--GAAT----TA-A----AAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * ** * *
86781 AATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * *
86846 CATGAAACAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAGAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * *** *
86911 TTCAAAAATTAAT-A--AATGATTTAAATAGTGAATTTG-TTTACCAA-ATAGTTCAAATAATTA
131 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACA-AGTTCAAATAGTT-
* * * * * * *
86971 TGGCCATTTCAATAATTATCAATTTCAAATCATTATTACCTTTT-TTTTGGTCATATAACAATTG
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTG
* * * * ** * *
87035 TTTT-TTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTAAAAAATTAA
258 TTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* *
87099 TAAGTAAGAGATTTAAACAAATAAATTTGTTTATCAAACCA
321 TAAGTAAGAGAATTAAA-AAATAAATTTGTTTACCAAA-CA
* * * * * ** * * *
87140 A-TTTAAATAGTTACGACTATTAGAATAATT-GCATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * **
87203 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
87268 TTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGATTGAAAAAAT--A-A-GTTTATTTGCCAA-ATTAGTTCAAA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TTTG--AACA--AGTTCAAA
* * * *
87328 TAGTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAAT
189 TAGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * ** *
87386 AATTTTTTTCAATTCATACCAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAA
253 AATTGTTTT-AGTTCATA-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AA
* * * * * *
87449 AAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCTAACT
314 AAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* *
87495 AGTTCAAATAAG-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-CATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * *
87558 TCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATAGTAATCTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * * *
87623 TTTCAAAAATTAATAA-T--AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACCAGTTTAAA-AATTG
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT-
* * * ** ** * * * * * * *
87684 ATCACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTCTTCTATTAGAAAATAA-TA
194 -TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * * *
87748 ATTTATGTTCATAAAAACTTA-TTCAGATTAAAATGATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTA
258 TTTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTA
* * * *
87812 ATAAGTAA-AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACT
320 ATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * *
87852 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * *
87917 CATAAAA-AATT-TATTTTAGTTCATATTAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAA
66 CATAAAACAATTGT-TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * * * * *** * *
87979 TATTTTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTGAAAAATGAATCTATTGACTGAACAAGTTTAAATAA
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* *** * ** ***
88044 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGGT
192 TT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
88109 T-TTTTCTGTACATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC-AATTTATTAATA-TTACGACAAT
256 TGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA--AAAAT
* * *
88171 TAATAGGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
318 TAATAAGTAAGAGAATT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
** * * * ** *
88214 AGTTCAAATCTTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * *
88279 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATATATAAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ***
88344 TTCTACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCAACAAGTTCAAATAGTC
131 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGT-
* * * * *
88407 TTAACTATTTGAATAATAATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG
193 TTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* *
88472 TTTTAGTTCATATAAGCTCATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAAT
258 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
* * * *
88537 GACTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTA-CAGAACT
322 AAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-AACA
* * * * *
88575 TGTTCAAATAGTTATGACTA-TCGGATAATTACCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * *
88639 CATAAAACAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * *
88703 TTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACATGTTCAAATATTTA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT-
* * ** * *
88768 TGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTCTTTTGTCATAAACCAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
88833 TTTCTGTTCATAAAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTAAGAATTAAT
259 TTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* * * ** * *
88898 AAGTAA-AG-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCG
322 AAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * ** ** *
88934 AGTTGAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTAT-TGAATTCAAATTGTTATGATATTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
88998 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-TTTCATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * *
89062 A-TTCTAAAAATTAATAAGTTGAAAATTTAAAAAATAAATATGTTCATCGAACAAATTCAAATAG
129 ATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * ** * * ** *
89126 TCATGTCCA-TTCAAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTCATCGTAAAACAA
192 T-TTGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
89190 TTATTTCTA-TTTATACAAGATTATTT-ATAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAA
255 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAA
* * * * * * *
89253 -T--TCA-TAACAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACCA
317 TTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CA
* * * * * *
89293 A-TTCAAATAGTTATGACTAATTT-AATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-ATTATTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
89355 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GAAGTAAAATATTACTAAATTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *** * *
89419 A-TTCTAAAAATTAATAAGAAAAAGATTTAAAAAATAAATGTG-TTTGCCATACCAGTCCAAATA
129 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGA-ACAAGTTCAAATA
* * * * *
89482 GTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA
191 GTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * * *
89547 TTTTTTTAGTTTGTACATGCTTATTCGAAATAGAATAATACTAATTTATTAACATTCAAATAATT
255 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAA-AATT
** * * * * *
89612 AATAAACAA-AAAATTTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACA
319 AATAAGTAAGAGAA--TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * ** * *
89654 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATATATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * * *
89718 TCATAAAATGATTGTTTC-AGTTCATA-AAGCTTATCTAAAATAAAATAACATTACTTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
89781 ATTTCAAAAATTGAA-AAGATAAAGATTT-AAAAATAAGT-TAGGTTATTGAATC-ACTTCAAAT
129 ATTTCAAAAATT-AATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATAT-GTTTTTTGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * *
89842 AATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAAC
190 AGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
*** * * *
89906 AATTGTTTTTCATCATGCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA
253 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAA
* * * * * * *
89971 TTAATAAGCAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTATCGAAC-
317 TTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * *
90013 ----C--AT--TT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTGTTATTCTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
90067 TATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * * * *** ** *
90131 TTCTAAAATTTAATATCTAAGAGATTTGAAAAACAAATTTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAACT
131 TTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAAT-AGT
** * * * ** * * * *
90196 AAGATTATATGAACAATTATCTATTTAAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-
193 TTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * * *
90260 TTTTTTTATCATTCAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAA
258 TTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* * * * *
90325 TAAGAAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCTAACT
321 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * ** * * * *
90364 AGTTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
90427 CATAAAAAAATTATTTTTTTTCATACAATCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ***
90492 TTCAAAAAACTAACTAAG--AGAA-TTAAAATATAAATTTG-TTTGCAAACCAA-TTCAAATA-T
131 TTC-AAAAATTAA-TAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CAAGTTCAAATAGT
** * * *
90551 TTAAGACTACATGTACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGGCATAAAATAAG
193 TT--GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
* * * * * *
90616 TTTTTTTGAATTTATACTAGATTATTTGGAAA-AAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAA
255 TTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAA
* * * ** *
90679 A-T--TAA-CAAGAG-ATTCAATAAAT-AATTCTATTTACCTTACC
316 ATTAATAAGTAAGAGAATT-AAAAAATAAATT-TGTTTACCAAACA
* * * *
90719 ATTTCAACTAATTATGACTATTTGAA-AATTTATCCATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * * *
90782 GTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * ** **
90847 ATTTCAAAAATTAATAAG---AGCTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTCAAATAGTT
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * * *
90909 ATGACTATTTCAGTAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-ATTGCTGTTTTTTTATAAAATAAT
194 -TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * **
90972 TATTTCTA-TTTATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAAT
256 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAAT
* ** * ** *
91035 TAATAAGTAA-AAAAGTTTTAAAATAAATATGTTTACTGAACT
318 TAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * *
91077 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** ** ** * * * *
91142 CATATAGGATTATTCGAAATAAAATAATACTAAG-TTATTAATAATACAAA-AAT--TAA--TA-
66 CATA-A-AACAATT-G-TTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTAGAATA-AAATAATACTAATTTAT
* * * * ** * *** * * * *
91200 -AGAGATTTAAAAAATGAAT-TGT--TTATTGAGCAACTTTAAATA---ATTATG-ACTATTTC-
125 TA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA--AAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCA
* * * * *
91256 AATAATTT-TCTTTTTG----A--A---ATTGC---T-A-TA-G-CCTTTTGTTTTGTCATATAA
187 AATAGTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
** * * ** *
91304 TGATTTTTTCTA-TTCATACAAGTTTATCTTG-AATAAAATAATAAAAATTTAATAATA--TAAA
252 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTAT-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAA
* * * * *
91365 GACACTTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
315 -A-A-TTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * *
91413 AGCTCAAAT-CTTATGACTAGTTGAACAA-TATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT-TGTTTT
* * * *
91474 GTCATAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATTACAATAATATTAATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * *
91538 TATTTTGACAATTAATAAGTAAAATATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAA
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * ** * *
91603 TCCTGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGATATTTTCTTTTGTAATAAAACAAT
192 T-TTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * *
91668 TATTTTAGTTCTTATAAGCATATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
256 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTA
* * * **
91733 ATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTGTTTACGGAACA
320 ATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * **
91773 TGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAATGATTATCTATTTTTAAA-CATTATGAAATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
91837 TCATAAAATAATTGGTTCTATTTATGCAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * *
91900 TATTTGAAAAATTAATAAGT-AAAATTTTAAAAATAAATATGTTTTTTGAACACGTTCAAATAGT
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGT
* ** *
91964 TATGACTATTTGAATAATTATCTAGCTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATT
193 T-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *
92029 GTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTA
257 GTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTA
* * * * * *
92093 ATAATTAA-AAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCG
320 ATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* ** * *
92133 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * *
92198 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATGTAAGTTTATTT-GAAATAAAATAATACTAACTTATTAA-A
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * * ** **
92261 ATTCTTAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCAAACAAGTTCAAATAGT
130 TTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * *
92326 CAT-ATTCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATCATTATGGCATTTTTTTTTGTCATAAAACAAT
193 -TTGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* ** * * *
92390 TGTTTCTA-TTCATACAAGATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAA-T
256 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATT
* * * * ** * *
92453 --TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTGTCGAACC
319 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * * *
92491 AGTTCTAATAGTTATAATTATTTGAATAAATATCTATCTCAAATCATTATGATC-TATGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *** *
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131 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG-TT
* * * * ** * * *
92679 AGGAGTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-
194 -TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
92743 TTTTCAGTTCATACATA-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCATAAATTAA
258 TTTT-AGTTCATACA-AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAA
** * * * * ****
92807 TAAACAA-AAAATTTAAAAATAAA-ATGCTTATTTGA-A
321 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * ** * *
92843 A--TAAAATA-ATATTAC--TTT-ACT-A--A--TATTTCAAA-AATTAAT-AAGTTATAG-ATT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTT-TTGTTTT
* * * * ** * * * * * *
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64 GTCATAAAA-CAAT-TG-TT-TC-TATTCATACAAGCTTA-TTTAG--A-AT-AA-AATAATACT
* * * ** * * *
92956 -ATTTCA--AATCATTAC-AAACTT--T-TGT---TTTGTTATAAAAT--AT-TTTTTTTATCAT
118 AATTT-ATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAAT-TTAAAAAATAAATATGTTTTT-TGA-
*** * ** * * **
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178 ACAAG----TTC-AAATAGTTTGACTATTTGAA-CAATT-ATCTATTTCAAATCATT-ATGACCT
** ** * * * * * * *
93065 TAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTG-TTTA--TCAAACCAGTTCCTATTTG--A-ACAATTAT-
235 TTTG-TTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTTAGTTCATACAAG--CTTATTTGAAATAAAATAATA
* *** * *
93121 CT-ATTTCA--AAT-TGTTATAAAATT--T-TGT-TCTG--TTATAAAATAATTGTTGTAGTTCA
295 CTAATTT-ATTAATAT-TTA-AAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAAT-TTGT--TT-A
** *
93176 TATAAACTT
353 -CCAAAC-A
* * * * **
93185 A-TTCAGAATAAAATAAT-ACTAATTT-AAT-A--A--TATTCCAAA--ATTTAATAACC--AAG
1 AGTTCA-AAT--AGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TT-ATGACCTTTTG
*** ** * * * * *
93238 AGAT-T--TAAAA-AATT-AATCTATTTAT-CGAAGC--AGTTCA-AA-CAATTAAGACTATATG
60 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTA-TTTAGAATAAAATAATACTA-AT-
** * * * * ** ***** * * *
93293 AACAACTATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT-TGTTTCAGTTC
121 --TTATTA-ATATTTCAAA-AATTAATA-AGTAAAAATT-T-AAAAAATAAATATGTTT--TTTG
*** * * * * * *
93356 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT-AATA-AT-AATAATTTATTAATATTTTAAA-AATTAAT-A
177 A-ACAAG----TTC-AAATAGTTTGACTATTTGAACAA-TTA-T-CTATTTCAAATCATT-ATGA
** ** * * * *** * * *
93416 -AGTAAGTGATT-T-AAAAAATAAACCTCTTTA--TC--A-AA--TTAGTTCAAATAATTATGGC
232 CCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA-AAT---
* * * ** * * * ** *** *** * *
93471 CATGCCAA-CAATTATCTATTTCAAATCATT-TTGACCTTTTATTTTTTCATAAAACAAATGTT-
291 AATACTAATTTATTA-ATATTT-AAA-AATTAAT-AAGTAAGA-GAATT-AAAAAATAAAT-TTG
* * *
93533 TTTATTCATATA
349 TTTA-CCAAACA
* * * * * * * ** *
93545 AGTT----T-GTT-CGA--AATAGAGTAA-TA-CTA-TTCTATTAAT-ATTTTGA-ATATTAATA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-A--AATCATTATGACCTTTTGTTT
**** *** * * ** * * ***
93597 AAAGATTAAAA-AA-TAAATCTATTTAT-CAAAC-TAGTTTA-AATAGCTATGACTATTTAAGCA
63 TGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTAGAATA-AAAT-AATA-CTAATTT
* * * * ** ***** * * * *
93657 ATCATTTATTTC-AAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTAT-TTTTTTTACACA
123 ATTA-ATATTTCAAAAAT-TAAT-A--AGTAAAAAT-TTAAAAAATAAATATGTTTTTTGA-ACA
* * * ** * * ** ** **
93720 AG--C--TTA-TTCG--GATTAAAACAA-TA-CTAATTT-ATTAA-CATT-TCAACAATTAATAA
181 AGTTCAAATAGTTTGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCA--AATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * *** * * * * *
93773 GTAAAAAATTAAAAAAATAAATAT-GTT--TACCAAAC-TA---GACAA-ATAATCATGA-TTAT
243 GT----CA-TAAAACAATTGTTTTAGTTCATA-CAAGCTTATTTGA-AATAAAATAAT-ACTAAT
* * * * **** ** * *
93829 TTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-GAA-TTGTTTTAG
300 TT-ATTAA-TATTTA---AAAAT--TAATAAGTAAGAG-AAT-T-AAAAAATAAATTTG-TTTA-
* * *
93892 TTCATATA
353 -CCAAACA
* * ** ** * * * * * ***
93900 AGCTT--ATTGGGAAT-AAAATAAT-ACTAATTTAT-TAATAATCCAAA-AATTAAT-A-ATAAA
1 AG-TTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAATAA-TTATCT-AT--TTCAAATCATT-ATGACCTTTT
** * * * * * * *
93957 GAGATT-T-AAAAAATAAATCTATT-TACTGA-ACAAG----TTTA-AAT--AATTATGACT-AT
59 G-TTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAAT-ACTAAT
** * * * ***** * *
94010 TTGAACAATTATCTAT-ATGAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAAT-TTTTTTG
121 TT-ATTAA-TAT-T-TCA-AAAATTA--ATAA---GTAAAAAT-TTAAAAAATAAATATGTTTT-
* * ** ** ** * * ** * * **
94073 TTCATACCAGCTT-ATTTCAAATAAAATAATACAA-ATTTAT-TAATATTAAAAAAATTA--A--
174 TTGA-ACAAG-TTCAAAT-AGTTTGACTATTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATCATTATGACC
** *** * *** * * * * * * *
94131 -TAAGTAAAAGAT-TTAAAA-AATAAATTT-GTTTATAGAA--TAAGTTCAAAT--CATTATGAC
234 TTTTGT-TTTG-TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-AC
* * ** * * * ** *** * *
94188 T-ATTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTG-TTTTGTATAAAA-CAATTT-TTTAT
296 TAATT-T---ATTA-ATATTTAAAAAT-TAATAAGTAAGAGAAT-TAAAAAATAAATTTGTTTA-
* *
94249 TCATACA
353 CCAAACA
* * * * * * * ** **
94256 AGTT-TATTCAGATTA-AAATA-AT-ACTAATTTATTAATATTTC-AA-CAATTAAT-AAGTAAA
1 AGTTCAAAT-AG-TTATGACTATTTGAATAA-TTA-T-CTATTTCAAATC-ATT-ATGACCT-TT
* * * * * * *
94314 AG-ATT-T-AAAAAATAAATATG-TT-TA--CAGAACAAG-TTCA---A-AAT--AGTCATGACT
58 TGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTCTATTCA-TACAAGCTT-ATTTAGAATAAAATAAT-ACT
* * * ** ***** *
94365 ATTTGTAATTATCTATTTCAAATCA-TAATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGT
118 AATT-T-ATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-A-AGTAAAAATT-TAA-AAAATAA-------A--
** * * * * * *
94429 TCATAAG-TTTTTGAACTAAAAT-AATACTAATTT-ACTAATATTCAAAAATTAAT-GA-GTAAA
166 T-AT--GTTTTTTGAAC-AAGTTCAA-A-TAGTTTGACT-AT-TTGAACAATT-ATCTATTTCAA
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* * * * * * *
94550 TATTT-CAA-AACATTATGACT-TTTTGTT-TTATCATAAAACAATTGTTCATTCATGCAAGCTT
276 TATTTGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATAT--TTAAA-AA---TT-A---AT--AAG--T
**** *
94611 TTTTGAA-TAAAATAATTTAAATTTATTAATATTCCAAA-A
326 AAGAGAATTAAAA-AA--TAAATTTGTT--TA--CCAAACA
** * * ** * * *
94650 A-TT--AATAAG-TA--AAAATTTTAAAAAAAATCTATTTCTAAAACATTCAAAT-A-GTTATGA
1 AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATT---ATGACCTTTTG-
* * * * *
94707 TTATTGAACAATATCTATTTCAA-ATATTATGACTTTTGTTTTGTCA-A-AACCCATTGTTT-GT
60 TT-TTG-TC-ATA---A----AACA-A-T-TG---TTT-CTAT-TCATACAA-GC-TTATTTAG-
* * * ** * * * * * * * *
94768 TCATAAAAGCTTAT-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAA
104 -AATAAAA--TAATACT--AATTTATTAATA-T--TTCA-AAAATT--AATAAGTAAAAATTTAA
* ** * ** * ** * *
94832 AGATTTAAAAAATAAATTTATTT--AC----T-AAGAGAGTTCAAATAGTTATGATTATTTAAAC
158 A-A---AATAAATATGTTT-TTTGAACAAGTTCAA-ATAGTTTGACTA-TT-TGAACAATT-ATC
** * * * * *
94890 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATAA
214 ---TA----TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAC
* * * ** * *
94954 AAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGATATTT
271 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGAATT
* *
95019 AAAAACTAAA-TTGTTTACCAAATA
335 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * * *
95043 AGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * *
95107 TCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * **** **
95172 TTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATTAGTTCAAATAGTTA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT-
* * * *
95234 TGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * ** *
95298 TTCTA-TTCATACAAGTTTA-TTCAAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAA
259 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAA
* * * * * *
95361 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTGAACCA
321 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAACA
* * * * *
95401 A-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * *
95465 CATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATATGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTCTTTTGTTAAC
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * **
95528 A-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATA
129 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATA
* ** * *
95592 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
191 GTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *** * *
95657 TTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATT
255 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATT
* * ** * * * ** *
95722 GAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATGAATTAGTTTATTGAATC-
319 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACA
* * * * * * *
95763 AGTTCAAATAATTATCG-CCATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTTTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
95827 TCAAAAAATAATTGTTTTTCA-TCATTCAAG-TCTATCCTA-AATAAAATAATACTAATTTATTA
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCT-TAT-TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * ** * *
95889 ATATTTCAAAAATTAATAAATAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACCAGTTCAAATA
127 ATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATA
* * * * *
95954 GTTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATGAAACAA
191 GTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
96019 TT-ATTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATACAATAATACTAATCTAATAACATTATGAAAAT
255 TTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAT
* * * *
96083 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCCAACCA
318 TAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACA
* *
96126 A-TTCAAATAGTTAATG-CTATATGAATAATTATCTA-TT----TCGTTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * * * * *
96184 TCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATACGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * **** * *
96249 TTTTGAAAATAAATAAG---AGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTA
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT-
* * * * * * *
96311 TAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTGTAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * * *
96376 TTCTA-TTGATACAATCCTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATATGTTAATATCCTAAAAATTAAT
259 TT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAAT
* * * * ** ** *
96440 AAGTAACGA-ATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCCGACT
322 AAGTAA-GAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * * * * * * * *
96478 AGTACAAATAATAATAATTGTTTGAACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
96542 AT-ACAAAACATTTTTTTTTATTTC-TACAAG-TTGACTAAGAATAACATAA-ATCTAATTTATT
65 -TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT-ATTTAGAATAAAATAATA-CTAATTTATT
* ** * * * * * * ** *
96603 AATA-TTCCAATGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTATCGATTAAATTCAAAT
126 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAAT
* * * ** * *
96667 AGTTATGACTCTTCGAGCAATTATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATA
190 AGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * * * *
96732 ATT-TTGTCTA-TTCATACAAATTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAGACA
254 ATTGTT-T-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAA
* * * * * * *
96795 ACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATA
316 ATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * *
96839 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATCACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** * * *
96904 CATAAAACATTTGTTTTTGTTCTTACAAGTTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTA-TAACAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
**** * *** * *
96968 TTTGCCAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATAGTCA
131 TTCAAAAATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGT-T
* * * * * *
97033 TAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * ** * ** *
97098 ATAAATTCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATA-TTCCAAA--AATGA
259 TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAA
* * * * * **
97160 GTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTACTGAACA
324 GTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* ** ** * * * * * *
97196 AGCTCAAAGGGGAATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTTAAAT-AGTTATGAACTTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
* *
97260 TCATTAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTA-TTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
97324 A-TTCTAAAAATTAATAGGCAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAATAAGTTCAAATAG
129 ATTTC-AAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * *
97388 TCATGTCCATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
192 T-TTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* ** * * *
97453 TATTTCT-GTTCATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATAAC-GATTCATTAAGATTTTAAAAA
256 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATA-TTTAAAAA
* * *
97515 -T--TAA-TAAGAGTATTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAACTA
317 TTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-A
* * * * * *
97555 A-TTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
97618 CATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTT-GAATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * * * *
97682 ----AAAAATAAATGAGTTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTAAA-A--CTATTAGAACAATTAT
130 TTTCAAAAATTAATAAG---TA---AA--AATTTAAA-AAATAAATATGTTTTTTGAACAAGT-T
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97740 CTATATCAAATTG--T-TTTGACCATTTGTTTA-GTCATAA--A--AT-A-ATTAT-TTCAGTTC
185 C-AAAT-AGTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTG-TC
* * ** * ** * * * * * **
97794 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTA-TTAAAATTCAAAATATTAATAA-GCA-
246 ATA-AAAC--AATTG-TTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTTGAAA-T-AAAATAATACTAATTTAT
* ** * * * ****** *
97855 -AGAGATTTAAAAAATTAATTATTTTTATCAAACAAGCTTAAATAGATATGGCCATTTCAACAAT
304 TA-ATATTT-AAAAATTAA-TA--AGTA--AGAGAA--TTAAA-AAATAAATTTGTTT-ACCAA-
*
97919 TATCT
357 -A-CA
* * * * *
97924 ATTTCAAATCGTTATTATCT-TTT--AT--TTAGTC-ATAT--AA-CAAT-TG----TTT-TTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * *
97974 ATCAT---ACAA--G-GT-T-GT--T-----C--A---A-AATAAAATAATACTAATTGATTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * **
98018 CTTTCAAAATTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATCAA-TTCAAATAG
129 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
98082 TTTGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAAAAAATAAACCTTTTGTTCTATC
192 TTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC----A-TT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
98147 ATAAAACAATT-ATTTATGTTCATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAA-TCAATAATAT
246 ATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * ** * * * *
98210 TTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAATTTGAATTTGTTTGCTAAACCT
309 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CA
* * * * * *
98262 A-TTGAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTTTTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
98326 CATAAAATAGTTTTTTCAATTTATACTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * ** * * *
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130 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TTTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
98453 TTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTAAGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAA
192 TT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * * *
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256 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTA
* **
98580 -TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTATTAAACCA
320 ATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CA
* * ** *
98618 A-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * *
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* * * * *** *
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130 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATAT-GTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * ** * *
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193 T-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
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257 G-TTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATT
* * * *
98933 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACCA
319 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACA
* * * * ** * * *
98972 A-TTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTATAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *** ** * * * *
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131 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * * ** *
99164 AAGACTATACGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
194 -TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * ** *
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258 -TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTA-AAAATTA
* * * * * *
99294 ATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAACT
320 ATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * *
99334 ATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTATTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTG
* * * * ** * *
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65 TCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * ** ** *
99462 ATTTCAAAACCTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTGGTGAACCAGTTCAAATAG
129 ATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * **
99527 TTAAGACTATATG---AATGAT-TATTT--ATTCCTTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAACAA
192 TT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
99586 TTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTG-ATTAAAACAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
255 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAAT
* * * *
99649 TAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAACAAATC-
318 TAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CA
* * * * ** * * * *
99691 AGTTTAAACAGTTAAGATTATTAAAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
99756 CATAAAATAGTTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT---A-AATA--AA--TATT-A-A
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ***
99810 --T----AA-GAAT-AG-----ATTTAGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTT
130 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA-AAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * * *
99862 ATTACTATATGAATAATTGTCAATTTAAAATCGTTATAACGTTTTGATTTGTCATAAAACATTTG
194 -TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** * * * *
99927 TTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTCACTAAAA-TAA
258 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA--AAAATTAA
* ** *** **
99991 TAAGTATGA-AACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATT
321 TAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * *
100030 AGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
100094 TCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATCCAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** *
100157 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTG-ACCAGTTCAAATAG
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * *
100221 TTATGACTATTACTATTTGAACAATTAT-TAATCTT-AAATCGTTAAGATC-TATGTTTTGTCAT
192 TT-TG------ACTATTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * ** *
100283 AAAACAATTATTTTTGATCATAGAAACCTATTTG-GTTAAAAATAATACTGATTTAATT-ATATT
248 AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTT-ATTAATATT
* * * * * * **
100346 TCAAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGATCCA
311 T-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTT-ACCAAACA
* ** * * * * * *
100397 A-TTGAAATAGTTAAAACTATTAGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTATTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
100461 CATAAAATATTTTTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATT-AT
66 CATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * *
100523 CATTTTAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
129 -A-TTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AATTT-AAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAAT
* * * * * *
100588 AGTGATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGACATAAAACA
190 AGT-TTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *** * *
100653 ATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAAT
254 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAAT
* * * *
100718 TAATAAGCAAGAG--TT-TAAAATAAATTTGTTTATCGAACA
318 TAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * *
100757 AATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * *
100822 CATAAAACAGTTGTTTGAATTCATTCAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * **** ** * *
100887 TTCAAAAATTAATAAGT---GATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAATTAGTTTAAATAATTAT
131 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT-T
* * * * * * *
100949 GGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTT
195 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * ** *
101014 TT-TTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATA
260 TTAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATA
* * * *
101078 AGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTA
323 AGTAAGAGAATT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-A
* * * * * * * * * *
101117 A-TTTAAATAGTTAT-ACGATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * * **
101180 CATAAAACAATTATTTTTGTTTATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * *
101245 TTCAAAAATTAATTACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTA
131 TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTT-
* * *
101310 AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTATTTTGTCATAAAACAATT-T
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
101367 TTTCACTTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAA
259 TTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* * * * *
101431 TATGTAAGAGATTTACAAAATAATTTTGTTTACCTAATC-
321 TAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACA
* * * * * ** *
101470 AGTTCAAAAAATTATGATTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATCACCACGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * **
101535 CATAAAACAAATGTTTTTATTCATATACGTTTGTTTAGAATAAAATAATACTTATCTAACAATAG
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * ** * * * * **
101600 TTTTC---TATTTATAA--AAGCTTATTCAGACTAAAAT-AATACTAATTTATT-AATATTTTGA
130 -TTTCAAAAATTAATAAGTAA--AAATTTA-A--AAAATAAATA-T-GTTTTTTGAACAAGTT--
* * ** ** * * * * *** * **
101658 CAATTAATAAGCAAAATTTAAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAA-C--TA-GATCAACTAGTCATG
185 CAAATAGTTTG-ACTATTT-GAACAAT-TATCTATTT--CAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTG
* ** * * * * * * * *
101718 ACTATTCGAATAAGT-TTTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATG
244 TC-A-TAAAACAATTGTTTTAGTTCATA-CA--A-G--C--TT-ATTTG--A-AATAAAATAATA
* * * * * * *
101782 TTAGTTCATATCAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
295 CTAATT--TATTA--ATATTT---A-AAAAT--TAATAAG----T-A-A----GAGAA-T--T-A
* *
101847 TTAAAAGATTTAAAAAATGAGTCTCTTTACCGAACA
336 --AAAA-A--T---AAAT---T-TGTTTACCAAACA
* * * * **** *
101883 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATATGAAATTGCCATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
** ** * * *
101948 CACCAAATGATTTTTTCTATTCATACATGCTTACTTT-GAATAAAATACTAC-AATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** **
102011 --CCAAGACAATTAATAGGTAAATGATTTACAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATCC
130 TTTCAA-A-AATTAATAAGTAAA-AATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAG
* * * ** *
102074 TCATGA-TA-TTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTCTATTTTGTCATAAAACAA
192 T-TTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * *
102136 TTGTTTTTA-TTCTTACAAGTTTA-TTCAGATTATAATAATACTAATTTATAAATATTTCAACAA
255 TTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AA-AA
* * * * *
102199 A-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTATGTTTACCGAACA
316 ATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* *
102242 AGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
102306 TAATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAACTTATTT-GAAACAAAATAATACTAATTCATGAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * ** **
102369 TA-TTCTAAAATTAATGAGTAAGAGAA-TTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAACATTTTCAAATA
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATA
102432 G--T---TA--TG-------A-CTA--T-AAA-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
191 GTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
102478 TGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTCCAAAAATT
256 T-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATT
* * * **
102541 AATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
319 AATAAGTAAGAGA-ATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * *
102581 CA-TTCAAATCGTTACGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTCGTTTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * **
102644 ATCATAAAGCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** **
102708 ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTCAAAAAATAAATCTATTTACT-AAGTGAGTTCAAAT
129 A-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CAAGTTCAAAT
* * * * *
102772 AGTTATGACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACA
190 AGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * *
102837 ATTGTTTCTA-CTCATACAATTTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAA
254 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAA
* * * * * * *
102901 TTAATAAGTTAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCGAATA
317 TTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * * **
102944 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTT-AAGCT-ATTATTTATATGAAAT-AGTTATGATATTTTGTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA--TAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTT
* * * ** *
103006 TATCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTAGAATAAAGT-ATACTAATTTATTAA
63 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * ** * * *
103070 TATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATCTATTTTATCAAACTAGTTCAATTAA
128 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTT-TTGAACAAGTTCAAATAG
* * *
103132 TTATGACTATTTCAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT
192 TT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
103196 TGTTTCT-GTTCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTA-TGAAATTAATAATATTCTAAAAA
256 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAA
* * **
103258 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATAATTATCTATT-TTAAATC-
317 TTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAAT-A-AATT-TGT-TTACCAAA-CA
* * ** ** * * * ** * * * ***
103304 ATTTGACCT--TT-TGTTTAGTTGTAA-AATAAT-TTTTTCAGTTAATAAATG-CTTATTTGAAA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCT-TTTGTTT
** * * * ** * *
103363 T-AAATTAATAATAATT-TAT-TA-TCATTC-AG-AAATTTA-ATTAACAAGAA-A-T--TTTA-
63 TGTCA-TAA-AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAGAATAA-AATAATACTAATTTAT
** * ** * * * ** * * *
103416 -AA-AAAT--AAATTTGTTTA-TCAAACAAGTT--CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
125 TAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAA-AATTTAAAAAATAAATATG-TTTTTTGAACAAGT-TC
* * * ** * * * * *
103474 TATTAATAAGA--AGTATG-AC-CTT-T-TGTTT--AATCATAAAATGA----TTGTTTCAGTTC
186 AAATAGTTTGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT--TATGACCTTTTGTTT-TG-TC
** * ** * ** * **
103527 ATAAAAGCATATTCGAAATAAAATAATA-TTGCTT-TATT-AATATTTCAAA-AAT--TAA-AAA
246 ATAAAA-CA-ATT-G-TTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TTGAA-A--TAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * * *
103585 GTTAAAAGTTTAAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAAT-TATTTAGTTTATCAAA
303 -TTAATA-TTTAAAAATTAA-TAAG--TA--AGA-GAATT-AAAAAATAAATTT-GTTTACCAAA
103649 TC-
358 -CA
* * * * * * * * ** *
103651 ACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTGAAGTCATTACAAACTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTG
* * *
103716 TCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCTTA-TTCGAA-ACAAACTAATATTAATTTATTA
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAGAATA-AAA-TAATACTAATTTATTA
* * * * **
103778 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAATAT-AA-AT-TTATTT--AC----TGAACCA
127 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATA
* * * * * *
103834 GTTT--CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTATGTTATAAAATAAT
191 GTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
103897 TGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTG
256 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTA
** ** * * *
103962 ATAACCAAGAGACGTAAAAAATAAA--TCTATGCCAAAGC-
320 ATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CA
* * * * * * * * * ** *
104000 AGTTTAAACAATTAAGACTATATAAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATG-CCTTTTGTTTGG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
104064 TCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATAAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * **
104128 CA-TTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATA-
129 -ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAAC-AAGTTCAAATAG
* * * ** * * * * *
104187 TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATT
192 TTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
104252 ATTTTTA-TTCATACAAGCTTA-GTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATT
257 -GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATT
* ** *
104315 AATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACC
319 AATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * * *
104356 GGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTTTTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTG
* * * * * *
104421 TCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAACTTATT
65 TCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATT
* * * * *
104484 AATATCTT-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAATAATTCTATTTATCT-AACCAGTTCAA
126 AATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TTTGAACAAGTTCAA
* ** * *
104546 ATAATTATGACTATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTGTCATAAAC
188 ATAGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** * * * * * * *
104611 CAAATGTTTTTA-TTTATTTAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATCAATATTTCAAA
252 CAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAA
* * * * **
104675 A--AATAA-TAAGAG-ATATAAATAATAAATCTATTTATCAAATG
316 ATTAATAAGTAAGAGAAT-TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
*
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1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
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** ** * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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1 AGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
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* * *** * * ** * *
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127 ATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAA
* * *
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189 TAGTT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
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252 CAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAA
* * * * * **
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314 AAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
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* * * * * * * *
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130 TTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGT
* * ** *
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193 T-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* *
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* * * * *
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* * *
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TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTTG
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TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGT
AAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
Found at i:90155 original size:169 final size:168
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89842 AATTATGGCC
* *
89852 ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTC
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* *
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* * * *
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* * *
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* * * * ** ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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AGATTTAACAAATAAATCTATTTATCGAACCATTTTCT
Found at i:92321 original size:541 final size:540
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84986 AATTTACTAA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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319 TAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * **
85378 TGAAATCATTAT-AACTTTTTATTTTGTCATCAAACAATTG-GTCTAGTTCATACTATTTTA-TT
383 TCAAA-CATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTT
* ** * * * * *
85440 CAGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTTGAAACTTAACAACTAAGAAAATTAAAAAATA
445 CA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG--ATTTTAAAAATA
* * * * *
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* ** * *
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1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * ** * * * **
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * *
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323 AAATAAATCTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * ** **
85910 CATCATTAT-AACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTTAAAACAAGCTTAGATGGA
387 -A-CATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAA
* * * * *
85973 ATAAAATAATACT-AATTTA-TAAAACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAAACTTAAAAAATAAAT
448 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAG--ATTTTAAAAATAAAT
* * * * * *
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509 CTATTTATCAAA-CACGTTCAAATAGTTAT-GAC
* * * *
86068 -ATTTGAGCAATTATATATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG--TTGTCATAAAACAATTGTTT-T
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * **
86129 TTATCATACAAGCTTA-TTCGACATAAAATAATGCTAATTCGTTAATATTTCAAAAATTAATAAG
66 AT-TCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * *
86193 TAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * * * * ** *
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193 TATTTAT-TTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGT-TCATAT
* ** *
86318 AAGTTTATTTG-GCTAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
255 AAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* ** * * * * * ** *
86377 TTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAGCAAATTCAAATAATCAAAACTATTAGAATAATTAT-TAAT
318 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-AT
* * * * * * *
86441 TTCAAATCATTCT-AGCTTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTAAT
382 TTCAAA-CATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATT
** * * * *
86504 TGGAATAAAATAATCTAAATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATAAGGAAATGATTTGGAAAAAT
444 TCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAA-GTAA-GATTT-TAAAAAT
* * * * *
86568 AAATCTATTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTGATGAC
505 AAATCTATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *** *
86604 TATTTGGACAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAAAATAAAACACTTGTTTC-
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *
86668 AGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAAATTAAATA
66 A-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-AATA
** * ** * *
86732 A-TTCAAAATTTAATAAGCAAGAGTTTAAAATAAATTTGTTTACTAAAAAAATTCAAATTGTTAT
127 AGTAAAAAATTT-A-AA--AA-A---T-AAAT--A--TGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTAT
** * * * * *
86796 GACTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCATGAAACAATTGTT
178 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * ** *
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243 TCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAAT
* * * * * * * * * * *
86924 -A--AA-TGATTTAAATAGTGAATTTGTTTACCAAA-TAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAAT
307 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * *
86984 AATTATCAATTTCAAATCATTATTACCTTTT-TTTTGGTCATATAACAATTGTTT-TTTATCATA
372 AATTATCTATTTCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATA
* * * * *
87047 TATGTTTA-TTCAAAATAAAATAATAGT-AATTTATTAATCTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGA
434 CAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGA
* * * * * *
87110 TTTAAACAAATAAATTTGTTTATCAAAC-CAATTTAAATAGTTACGAC
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* * * * ** * * * * *
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* * * ** * * *
87221 TGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAAAAAC
65 TATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * *
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129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
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193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AGTTCATA-TA
** * *
87407 A-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATATGTAAGAGATT
256 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** * * *
87469 TAAAAAATAATTTTGTTTGCCTAACTAGTTCAAATAAG-TATGACTATTTGAACAATTATCTATT
319 TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * *
87533 TCAAATCA-CATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTC
383 TCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTC
* *
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446 -AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAAT
* * * *
87657 TTATTTATCAAAC-CAGTTTAAA-AATTGATCAC
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* * ** ** * * * * * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* ** *** * * *
88075 A-TTGCTAT-AACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGGTTTTTTCTGTACATACAAGCTTATTTCAAA
387 ACAT--TATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA
* * * * * * *
88138 TAAAATAATA-CAATTTATTAATATTACGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATTT
449 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATTT-TAAAAATAAATCT
* * * **
88202 GTTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGAC
511 ATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * *
88232 TAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
88297 ATTCATACAAGCTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAATATATAAATATTTCTACAAA-TAATAAG
66 ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * *
88360 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACAAGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAATAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACTAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
88424 AATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAG
193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAG
* * * * *
88488 CTCATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATGACTAAGAGAATTAAA
258 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * ** * * *
88553 AAATTAATTTGTTTA-CAGAACTTGTTCAAATAGTTATGACTA-TCGGATAATTACCTATTTCAA
323 AAATAAATCTGTTTATCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-A
* * ** **
88616 AACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGTAAGCTTATTTTGAATA
386 AACATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATA
* * * * * *
88681 AAATAATATAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTT
451 AAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGATTTTAAAAATAAATCTATTT
* ** * *
88746 TTTGAACATGTTCAAATATTTATGAC
515 ATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * *
88772 TATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATTTTTTCTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTC
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTC
* * *** * * *
88837 TGTTCATAAAAGCTTATTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTAAGAATTAATAAGT
65 TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
88902 --AAAGTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCGAGTTGAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATT
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ** * * *
88965 ATTGAATTCAAATTGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-T
194 ATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGC
**
89028 TTCATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAA-A-ATTTA
259 TT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-T-AAGAGATTTA
* * * * * * * *
89091 AAAAATAAATATGTTCATCGAACAAATTCAAATAGTCATGTCCA-TTCAAGCT-ATTATCTATTT
321 AAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA--TAATTATCTATTT
** ** * * * *
89154 CAAATGGTTAT-AACATTTTGTTTCATCGTAAAACAATTATTTCTATTTATACAAGATTATTT-A
384 CAAA-CATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * *
89217 TAATAAAATAATACT-AATTTACTAATATTTCAAAAATTCATAA--CAGA-TTTAAAAATTAAAT
447 -AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAA-TAAAT
*
89278 CTATTTATCAAAC-CAATTCAAATAGTTATGAC
509 CTATTTATCAAACAC-GTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
89310 TAATTT-AATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-ATTATTTTATCATAAAACAATTGTTTT
1 T-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
89373 TGTTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAG
65 TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * *
89437 -AAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCATACCAGTCCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
129 TAAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * ** * *
89501 TTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTTGTACAT
192 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAA
* * * ** * *
89565 GCTTATTCGAAATAGAATAATACTAATTTATTAACATTC-AAATAATTAATAAACAAAAAATTTT
257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * *
89629 AAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATATATTT-
320 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * ** * *
89693 ATAAGAAGTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATGATTGTTTC-AGTTCATA-AAGCTTATCTAA
385 A-AA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCA
* * * *
89756 AATAAAATAACATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAAAGA-TTTAAAAATAAGT
447 AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAG-T-AAGATTTTAAAAATAAAT
* * * * *
89819 -TAGGTTATTGAATCAC-TTCAAATAATTATGGC
509 CTA-TTTA-TCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
89851 CATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
89915 TCA-TCATGCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
65 T-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
89979 CAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTATCGAAC-----C--AT--TT-T--CTATTTGAACAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * * *
90032 TATCTATTTTAAATCATTATAACCTGTTATTCTGTTATAAAATAATTGTTTC-AATTCATATAAG
193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAG
* * * ** *
90096 CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAATTTAATATCTAAGAGATTTGAA
258 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * ** * ** ** * * * * *
90161 AAACAAATTTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAACTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTAAAA
323 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAA
* * * * * * * * * **
90226 AAATTATG-GCTTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-TTTTTTTATCATTCAAACCTATTTGGAAT
387 ACATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTCAAAT
* * * *
90289 AAAATAATACT-AATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGAAAGATATTTAAAAAATAAATTTG
450 AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAT-TTT-AAAAATAAATCTA
* * *
90353 TTTACCTAACTA-GTTCAAATA--TATAAC
512 TTTATCAAAC-ACGTTCAAATAGTTATGAC
* ** * * * * * * *
90380 TATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAAAAATTATTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
90445 TTTCATACAATCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAA--ACTAACT
66 ATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * ** *
90507 AAGAGAA-TTAAAATATAAATTTGTTTGCAAACCAATTCAAATATTTAAGACTACATGTACAATT
130 AA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
90571 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGGCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTTATACT-
194 ATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT-AGTTCATA-TA
* * *
90634 AGATTATTTGGAAA-AAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-CAAGAGAT
256 AGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * ** * * * * *
90692 TCAATAAATAATTCTATTTACCTTACCATTTCAACTAATTATGACTATTTGAA-AATTTATCCAT
318 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA-TTATCTAT
* * * * * * * * * *
90756 TTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTG
382 TTCAAACA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC
* * * * *
90821 GAATAAAGTAATACT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGCTTTAAAAAATAAATC
446 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAATC
*
90883 TATTTATCAAATGA-GTTCAAATAGTTATGAC
510 TATTTATCAAA-CACGTTCAAATAGTTATGAC
* ** * * * * * * *
90914 TATTTCAGTAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGA-ATTGCTGTTTTTTTATAAAATAATTATTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * **
90977 CTATTTATACAAGCTTATTT-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAATTAATAA
64 CTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * *
91041 GTAAAAAAGTTT-TAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
128 GTAAAAAA-TTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *
91105 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT------A-------TAG--------
191 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATA
* * * *
91149 -GATTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATAATAC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTT
256 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** * * * * * * * *
91208 AAAAAATGAAT-TGTTTATTGAGCAACTTTAAATAATTATGACTATTTCAATAATTTTCTTTTTG
320 AAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * ** * *
91272 AAA-TTGCTAT-AGCCTTTTGTTTTGTCATATAATGATTTTTTCTATTCATACAAGTTTATCTT-
385 AAACAT--TATGA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTC
* * * *
91334 GAATAAAATAATAAAAATTTAATAATA--T-AAAGACACTTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATA
446 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAA-A-A-TTAATAAGTAAGAT-TTT-AAAAATA
* * * *
91396 AATCTATTTACCAAACAAGCTCAAAT-CTTATGAC
506 AATCTATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
91430 TAGTTGAACAA-TATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * ** *
91492 CTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAA
64 CTATTCATACAAGCTTATTTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * *** * * ** *
91556 GTAAAATATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAATCCTGACTATTTGAATAA
128 GTAAAAAATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * ** * * * *
91621 TTATCTATTTTAAATCATTGTGATATTTTCTTTTGTAATAAAACAATTATTT-TAGTTCTTATAA
192 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAA
* * * * *
91685 GCATATTTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAA
257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
91750 AAAATGAATCTGTTTA-CGGAACATGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAATGATTATCTATTTTT
322 AAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTC
* * * * *
91814 AAACATTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTTATGCAAGCTTATTTCAAAT
385 AAACATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAAT
* * * *
91879 AAAATAATATAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAATAAATATGTTT
450 AAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAATCTATTT
* **
91944 TTTGAACACGTTCAAATAGTTATGAC
515 ATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* ** *
91970 TATTTGAATAATTATCTAGCTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
92035 ATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAATTA
66 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * *
92100 AAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
131 AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
92165 TTTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TTCATGTAAGTT
195 TTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGCT
* * * **
92229 TATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAAAATTCTTAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAA
260 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
* * * * *
92294 ATAAATTTGTTCATCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATTCATTTGAGCT-ATTATCTATTTCAAA
325 ATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAA
* * *
92357 TCATTATG-GCATTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGATTA-TTCAAAAT
388 -CATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
** * **
92420 AAAATAATACCAATTTATCAATATTTTGAAAATTAATAAG--AGA-TTTAAAAACTAAATCTATT
450 AAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAA-TAAATCTATT
* * * * *
92482 TGTCGAAC-CAGTTCTAATAGTTATAAT
514 TATCAAACAC-GTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
92509 TATTTGAATAAATATCTATCTCAAATCATTATGATC-TATGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * * *
92573 ATTCATACAAGTTTA-CTCAGAGTAAATTATTGCTAAATTAATAGTA-TTCTAAAAATTAATAAG
66 ATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
92636 ----AGATTTAAAAAAAAAATATGTTTGCCGAA-TAATTCAAAT-GATTAGGAGTATTAGAACAA
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
92695 TTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATACAT
192 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATA-
* * * ** * *
92759 A-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC-ATAAATTAATAAACAAAAAATTT-
256 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * *** * * * *
92821 AAAAATAAA-ATGCTTATTTGA-AA--TAAAATA-ATATTAC--TTT-ACT-A--A--TATTTCA
321 AAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * *** * * * **
92873 AAAATTAAT-AAGTTATAG-ATT-T-A-AAAA-AA-TAAATCTGTTTAT-CAA-ATTGGTTCAAA
386 AACATT-ATGAACTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA
** * * * ** * * ** *
92929 TAATTTTGGCCATTTGAA-CAATTAACTATTTCAAATCATTACA-AACTTTTGTTTTGTTATAAA
449 TAA-AAT---AATATAAATTTATTAA-TATTTCAAA-AATTA-ATAA-GTAAG-ATT-TTA-AAA
* * * * * ** *
92992 AT-ATTTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATA-AAAT-AA
503 ATAAATCTATTTATCAAAC-A-C--GTTC-AAATAGTTATGAC
** * * * * ** ** * *
93032 TA-TT-AATTTATTAAT-AATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
1 TATTTGAA-CAATT-ATCTATTT-CAAA-TCAT---TATGACCTTT------T-GTTTTG-TCAT
* * * * ** ** * * ** *
93094 CAAACCA--GTTCCTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAAT--TGTTATA-AAATTT-TGTTCTG
51 AAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA-GCT-TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATA
* ** * * * **
93152 TTATAAAATAATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAA-ATAATACTAATTTAATAA-
112 TT-TCAAA-AATTAAT-AAG-T-A-A-AAA---ATTTA-AA-AAATA-AATA-T-GTTTACCAAC
* * * * * * * * *
93215 TA-TTCCAAA-ATTTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTATCGAAGCAGTTCA-AA
162 TAGTT-CAAATAGTT-ATGA-C----TATTTGAACAATT-ATTTA-TT-TCAAATC-GTT-ATGA
* ** ** * * * ** * **
93277 CAATTAAG-ACTAT-ATGAACAACTATCTATTTC-AAATCAT-TAAGACCTTTTGTTTTGTCATA
215 C-CTTTTGTTTTGTCAT-AA-AACAAT-TGTTTCTAGTTCATATAAG--C--TT-ATTTGAAATA
* ** * * * * *
93338 AAAAAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTA-ATAT
271 AAATAA-T-ACT-AATTTAT-TAA---TATTC----T-AAA-AAT--TAATAA-GTA--AGAGAT
* * ** * * * ** * *
93402 TTTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAA-AA-AT-AAACCTCTTTATCAAATTAGTTCAAAT-A
318 TTAAAAAATAAATCTGT---TTA-TCAAACAAGTTCAAA--TAGTTAT--GACTA-TT----TGA
* * * *
93463 ATTATGGCCATGCCAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTTTTTCATAAAACAA
370 A-T--------------AATTATCTATTTCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * **
93528 ATGTTTTTATTCATATAAG-TT-TGTTCGAAATAGAGTAATACT--ATTCTATTAATATTTTGAA
419 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTC-AAATAAAATAATA-TAAATT-TATTAATATTTCAAA
* * * *
93589 TATTAATAA--AAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTA-GTTTAAATAGCTATGAC
480 AATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAATCTATTTATCAAAC-ACGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * *
93647 TATTT-AAGCAATCATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTT-
1 TATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * * *
93710 TTTTTACACAAGCTTA-TTCGGATTAAAACAATACTAATTTATTAACATTTCAACAATTAATAAG
65 TATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
93774 TAAAAAATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAG-ACAAATAATCATGATTATTTGAATAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
93838 TATTTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTT-TAGTTCATATAAG
193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAG
* * * *
93902 CTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAA
258 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAA
* * * * * * *
93966 AAAATAAATCTATTTA-CTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATATGA
322 AAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * *
94030 AATCACTAT-AACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAATT-TTTTTGTTCATACCAGCTTATTTCAA
386 AA-CATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAA
* ** * *
94093 ATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
448 ATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATTTTAAAAATAAATCT
* * *
94158 GTTTAT-AGAATAAGTTCAAATCA-TTATGAC
511 ATTTATCA-AACACGTTCAAAT-AGTTATGAC
* * **
94188 TATTGTG--CAATTATTTATTTCAACTTGTTATGA-C-TTTGTTTTGT-ATAAAACAATT-TTT-
1 TATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
94246 TATTCATACAAGTTTA-TTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAG
65 TATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
94310 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACAGAACAAGTTCAAAATAGTCATGACTATTTG--TAA
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
94373 TTATCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTC--ATAA
192 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAA
* * * * *
94435 G-TT-TTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTC-AAAAATTAATGAGTAAAAGAATT-A
257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* *
94496 AAAA-AAATCTATTTA-CAAA-AAGTTCAAATAGTTTTGACTATATT-AATAATTATCTATTTCA
322 AAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTC-
* * **
94557 AAACATTATG-ACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTC-ATTCATGCAAGCTT-TTTTGAA
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* * *
94618 TAAAATAATTTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAA-AAATCTAT
449 TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGATTTTAAAAATAAATCTAT
* * *
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513 TTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* *
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1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * ** *
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66 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * ** * *
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131 AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
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195 TTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGCT
* * ** *
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* * * * * * * *
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* * * **
95087 CATTATG-ACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTA-TTCAAAATA
388 CATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAATA
* *
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451 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAA-TAAATCTATT
*
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514 TATCAAACA--CGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
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1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * ** * *
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66 ATTCATACAAGCTTATTTCAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
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130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
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194 ATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGC
** * * * * *
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259 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAA
* *
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323 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
** * * * *
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388 -CATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
* * * * * * * *
95688 AAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATGAAT-TAG
450 AAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T-AAGATTTTAAAAATAAATCTA-
* * *
95752 TTTATTGAATCA-GTTCAAATAATTATCG-C
512 TTTA-TCAAACACGTTCAAATAGTTAT-GAC
* * * * * * * *
95781 CATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTTTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* *
95846 CA-TCATTCAAG-TCTA-TCCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
66 -ATTCATACAAGCT-TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* ** * * * * * *
95908 ATAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACCATTTAAACAA
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* * * * * * *
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192 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAA
* * * * * * * *
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257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * *
96102 AAAATAAATTTTTTTACCCAACCAA-TTCAAATAGTTAATG-CTATATGAATAATTATCTATTT-
322 AAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * ** * *
96164 ---CGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATACG-TT-TGTTCAAA
385 AAACATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTC-AA
* ** *
96224 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATAAATAAG--AGA-TTTAAAAAGTAAATCTA
448 ATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAA-TAAATCTA
* * *
96286 TTTACCAAAC-CATTTCAAATAGTTATAAC
512 TTTATCAAACAC-GTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
96315 AATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTGTAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * *
96380 ATTGATACAATCCTA-TTCGAAATAAAGTAATGCTAATATGTTAATA-TCCTAAAAATTAATAAG
66 ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
** * * * ** * * * * * * *
96443 TAACGAATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCCGACTAGTACAAATAATAATAATTGTTTGAACAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTT-TACCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
96508 TATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACATTTTGTTTTGAT-ACAAAACATTTTTTTTTATTTC-TACA
193 TATTTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATA
* * * * **
96570 AG-TTGA-CTAAGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTC-CAATGTTAATAAGTAAGAGAT
256 AGCTT-ATTTGA-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * ** * * * **
96631 TTAAAAATTGAATCTGTTTATCGATTAAATTCAAATAGTTATGACTCTTCGAGCAATTATCTATT
318 TTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
** * **
96696 TCAAATCGCTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTGTCTATTCATACAAATTTATTT
383 TCAAA-CATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTATTCATACAAGCTTATTT
* * * * * *
96759 CAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
445 CAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT--AAGATTTTAAAAATAA
* * *
96823 ATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGAC
507 ATCTATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
96857 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATCACTTTTTGTTTTGTCATAAAACATTTGTTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * ****
96922 GTTCTTACAAGTTTA-TTCGGATTAAAATAATATTAATTTA-TAACATTTTGCCAATTAATAAGT
66 ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
96985 AAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATT
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
97050 ATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTAT-AAATTCATATAGGC
194 ATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGC
** * * *
97114 TTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTC--CAAA--AATGAGTAAGAGATTTAAAA
259 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * ** ** * * * *
97175 TATGAATCTATTTA-CTGAACAAGCTCAAAGGGGAATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTTAAA
324 AATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * ***
97239 TAGTTATGAACTTTTATTTTGTCATTAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTAGGAATAA
388 CA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAA
* * * * *
97304 AATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGCAGGAGATTTAAAAAATAAATATGT
452 AATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA--AGATTTTAAAAATAAATCTAT
* * * * *
97367 TTATTAAATAAGTTCAAATAGTCATGTC
513 TTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
97395 CATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * * * *
97460 GTTCATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATAAC-GATTCATTAAGATTTTAAAAATTAATAAG
66 ATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** * * * *
97523 ---AGTA-TTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAACTAATTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
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193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAG
* * *
97647 CTTATTTGAATTAAGATAATACTAATTTAATAATA----AAAAA-T-A-AA-T--GAG-TTT---
258 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * ** * * *
97698 ---T--A-C-------CGAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATATCAAA
323 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * *
97750 TTGTTTTGACCATTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
388 -CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATA
* * * *
97814 AAATAATACT-AATTTATTAA-AATTCAAAATATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATTAAT-TA
451 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAG-TA-AGATTTTAAAAATAAATCTA
* * *
97876 TTTTTATCAAACAAGCTT-AAATAGATATGGC
512 --TTTATCAAACACG-TTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * *
97907 CATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTATCTTTTATTTAGTCATATAACAATTGTTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * *
97972 TTATCATACAAGGTT-GTTCAAAATAAAATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAATTTAATAAG
66 AT-TCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
98036 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TCAATTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAA
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * *
98099 TTGTATACTTCAAATCAATTATTTAAAAAATAAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTAT
192 TTATTTATTTCAAATC-----GTT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
** * * * * * *
98164 -GTTCATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAA-TCAATAATATTTTGAAAATTAATAACT
246 AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
** * * * * * * * *
98227 AAGAGATTTAAAATTTGAATTTGTTT-GCTAAACCTA-TTGAAATAGTTAAGACTATATGAACAA
311 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * * *
98290 TTATCTTTTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAGTTTTTTCAATTTATACTAG
374 TTATCTATTTCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * *
98355 CTTA-TTCAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
438 CTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTTTA
* * * * * * * *
98419 AAAATAATTATATTTACCTAATC-CATTCTAATAATTATGAT
500 AAAATAAATCTATTTATC-AAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
98460 TATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTAAGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATATTT-T
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * ** * * *
98524 TTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG--
66 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * *
98587 --AGATTTAAAAAATAAAT-TTTTTATTAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTA
131 AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
98649 TCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCT
195 TTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGCT
*** * * *
98712 TATCCAAAATAAAATAAT-GT--TGTATTAATATT-TCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
260 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* ** *** * * * * * * *
98773 AATAAGT-TAGTTTATTGATTTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTTAAA
324 AATAAATCT-GTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * *
98837 TTGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTT-TCAAT-ATAGAATCTTA-TTCGAAA
388 -CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTC-AAA
* * * * *
98899 TAAAATAATACT-AATTTACTAATATTTTAAGAATTAATAAG--AGATTTAAAAAATAAATTTAT
449 TAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAATCTAT
* * *
98961 TTATCGAAC-CAATTCAAATAGTTACGAC
513 TTATCAAACAC-GTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * *
98989 TATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTATATCATAAAACAATTGTTTCT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * *
99053 ATTTACATAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATAAATAAC
66 ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* *** * * * * * ** *
99116 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGCTAAACTAGTTTAATTAGTTAAGACTATACGAATAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
99181 TATTTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT-TTGTTAATATAA
193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTAGTTCATATAA
* * ** * * *
99245 GTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTA
257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
99310 AAAAGTAAATCTGTTTA-CTAAACTATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
321 AAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * **
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385 AAA-CATTATGAACTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTTATTTCA
* ** * **
99436 GAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAACCTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAATAA
447 -AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG---ATTTTAAAAATAA
** * * *
99500 ATCTAATTGGTGAACCA-GTTCAAATAGTTAAGAC
507 ATCT-ATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * **
99534 TATATG---AATGAT-TATTT--ATTCCTTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTT-
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
** * * * * *
99592 TATTCATACAAGCTTATTTTGATTAAAACAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATGAGT
65 TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * * **
99657 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAACAAATCAGTTTAAACAGTTAAGATTATTAAAACAATT
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
99722 ATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAGTTATTTC-AGTTCATACAAGC
194 ATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGC
* *
99786 TTA-TT----T---A-GA-A-TAA---A-TAA-A---T----ATTAATAAG-AATAGATTTAGAA
259 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AA
* * * * * * *
99827 AAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATATGAATAATTGTCAATTTAAAA
323 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * ** ** *
99892 TCGTTAT-AACGTTTTGATTTGTCATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGATTA
388 -CATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATA
* * * *
99956 AAATAATACT-AATTTATTAATA-CTCACTAAAA-TAATAAGTATGAAACTTAAAAAATAAATC-
451 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGTA--AGATTTTAAAAATAAATCT
* ** * *
100017 AGTTTATTGAATTA-GTTAAAATAATTAT-AGC
511 A-TTTA-TCAAACACGTTCAAATAGTTATGA-C
* ** *
100048 CATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *
100112 TTATCATCCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
66 AT-TCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * ** *
100177 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTACTATTTGAA
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACTAGTTCAAATAGTTATG------ACTATTTGAA
* * * * * * *
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189 CAATTATTTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCAT
* * * ** * * *
100304 AGAAACCTATTTG-GTTAAAAATAATACTGATTTAATT-ATATT-TCAAAAATTAATAACTAACA
253 ATAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTT-ATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * ** * *
100366 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGATCCAA-TTGAAATAGTTAAAACTATTAGAAGAATTATC
315 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* * * * * * * * *
100430 TATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTATTTAGTCATAAAATATTTTTTTC-ATATCTTACAAGCTTA
379 TATTTCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTA
** * * * *
100494 TTTGGAATAAAATAATCTAAATTTATT-ATCATTTTAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAA
442 TTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAAT-A-TTTCAAAAATTAATAA-GTAA-GATTT-TAAA
* * * *
100558 AATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTGATGAC
502 AATAAATCTATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
100597 TATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-T
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * *
100661 AGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAG
66 A-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
100725 -CAAGAGTTT--AAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
100787 TATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTT-GAATTCAT-TCAA
193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATAT-AA
* * *
100850 GCTTAGTTAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGT----GATTTA
257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * ** * * * * *
100910 AAAAATGAATTTGTTTACCAAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCA
321 AAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
100975 AATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTT-TTTATCATATATGTTTA-TTCAAA
386 AA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTC-AA
* *
101038 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
448 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTT-TAAAAATAAAT
* * * *
101102 CTATTTACCGAACTA-ATTTAAATAGTTAT-AC
509 CTATTTATCAAAC-ACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * * * *
101133 GATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * ** * *
101198 GTTTATATAAACTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTTCAAAAATTAATTACT
66 ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
101262 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATT
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *
101327 ATCTATTTCAAATC---AT----TTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-ACTTCATACT-AG
194 ATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATA-TAAG
* * * *
101383 CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTGTTAATATT-TCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTA
258 CTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * * * *
101446 CAAAATAATTTTGTTTACCTAATC-AGTTCAAAAAATTATGATTATTTGAACAATTATCGATTTC
321 AAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * * * * * *
101510 AAATCACCACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCATATACGTTTGTTT-AGA
385 AAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-A
* * ** * * *
101574 ATAAAATAATACT-TATCTAACAATAGTTTTC---TATTTATAA--AAGCTTATTCAGACTAAA-
448 ATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA--TTTCAAAAATTAATAAGTAAGATT-TT-A-A--AAAT
* * ** * * * *
101632 ATAATACTAATTTAT-TAATATTTTGACAATTA-ATAAGCAA
505 A-AAT-CT-ATTTATCAAACACGTT--CAAATAGTTATG-AC
* * * * *
101672 AATTTAAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACTAGATCAACTAGTCATGA-CTATTCGAATAAGTTT
1 TATTT-GAACAAT-TATCTATTT--C--A--A-ATC-A-T--T-ATGACCT-TT----T--GTTT
* * * * * * ** ** * * * *
101735 T-T-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATGTT-AGTTCATATCA-G
45 TGTCA--T-AAAACAAT-TG----TTT-CTAT-TCAT-ACAAGCTTAT-TTCAAATAAAATAATA
* * * * ** ** *
101796 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAA
98 CTAATTT---AT-TAATATTTC-AA-AAATTAATA-AGT-AAAA--AAT--TT-AAA-A---AAT
* * * * * * * *
101861 AAATGAGTCTCTTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATATGAAA
146 AAAT-A---TGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
* ** * ** ** * * *
101926 TTGCCATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTA-TTCATACATGCTTACTTTG-AAT
206 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGCTTA-TTTGAAAT
* * * * *
101989 AAAATACTAC-AATTTATTAATA--CCAAGACAATTAATAGGTAA-ATGATTTACAAAATAAATT
270 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * **
102050 TGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATCCTCATGA-TA-TTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
332 TGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-CATTATG
* * * * * *
102112 -ACTTTCTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCTTACAAGTTTA-TTCAGATTATAATAAT
395 AACTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAAT
* * * * * * *
102175 ACT-AATTTATAAATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTATGTTTACCG
458 A-TAAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGT--AAGATTTTAAAAATAAATCTATTTATCA
*
102238 AACAAGTTCAAATAGTCT-TGAC
519 AACACGTTCAAATAGT-TATGAC
* * * * *
102260 TATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTC-
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * * * * *
102324 AGTTCATATAAACTTATTTGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATA-TTCTAAAATTAATGAGT
66 A-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
102388 AAGAGAA-TTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAAC-ATTTTCAAATAGTTATGACTA--T-----A
130 AA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* **
102444 --A---A---C--A---TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAA
192 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAA
* * *
102495 GCTTATTTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTA
257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTA
* * * * *
102557 AAAAATAAATATGTTT-TCTGAACACA-TTCAAATCGTTACGACTATTTAAATAATTATCTATTT
321 AAAAATAAATCTGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * * * *
102620 CAAATAGTTATGACCTTTCGTTTTATCATAAAGCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTA-TTCGG
384 CAAACA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-A
* *
102684 AATAAAATAATACT-AATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTCAAAAAATAA
447 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATTT-TAAAAATAA
**
102747 ATCTATTTA-CTAAGTGA-GTTCAAATAGTTATGAC
507 ATCTATTTATC-AA-ACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
102781 TCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** *
102846 ACTCATACAATTTTA-TTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAG
66 ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * *
102909 TTAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCGAA-TAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTT-AAGCT
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CA
* * * ** * * * *
102972 ATTATTTATATGAAATAGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTA-TTTATACA
191 ATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATA
** *
103036 AAATTATTT-AGAATAAAGT-ATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
256 AGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * *
103094 TAAAAACTAAATCTATTTTATCAAACTAGTTCAATTAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATC
319 TAAAAAATAAATCT-GTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* *
103159 TCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCA
383 TCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * *
103222 AAGTAAAATATTATGAAA-TTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
447 AA-TAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-A-AGATTT--TAAA-AA
* * ** **
103285 TAATTATCTATTT-T-AAATCA-TTTGACCT--TT-TGTT
504 TAA--ATCTATTTATCAAA-CACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * ** * * * *** ** *
103319 TAGTTGTAA-AATAAT-TTTTTCAGTTAATAAATG-CTTATTTGAAAT-AAATTAATAATAATT-
1 TATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCT-TTTGTTTTGTCA-TAA-AACAATTG
* * * * * * * * * *
103379 TATTATCATTCAGA-AA-TTTAATTAACAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTT--TA--TCAAA
61 T-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAA--AT-AATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* ** * * * ** ** * **
103438 CAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAAT---TATCTATTAATAAGAAGTATGACCT--TT
119 -AA-TT-AATA-AG-TA-AAAAATTTAAAAAATAAATATGT-TTACCAACTAGT-TCAAATAGTT
** * * * ** * ** * * * * ** *
103497 -TGTTTAATCAT-AA-AATGA-TTGTTTCAGTTC-ATAAAAGC--AT-ATTCGAAATAAAATAA-
176 ATGACT-AT-TTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * *
103553 TATTGCT--TT-AT-TAA---TATTT-CAA-AAATTAA-A--AAGTTA--AA-AGTT-TAAAAAA
239 TGTTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAAT
* * * * * * * * *
103602 TAAGTTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAAT-TATTTAGTTTATCAAATC-ACTTCAAATAATTA
303 TAA-TAAG--TA--AGA-GA-TTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * **
103665 TGGCCATTTAAACAATTATCTATTTGAAGTCATTACAAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
359 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA-ACATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
103730 TTTTTCA-TCATACAAGCTTA-TTCGAAACAAACTAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
422 TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * **
103793 ATAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATTTATTTA-CTGA-AC---C----AGTT-T--C
485 ATAAGTAAGA-TTTTAAAA-ATAAATCTATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * *
103839 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTATGTTATAAAATAATTGTTTCA
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * * * **
103904 ATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACCA
66 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * ** * * * * * * * * *
103969 AGAGACGTAAAAAAT-AA-ATCTATGCCAAAGC-AGTTTAAACAATTAAGACTATATAAACAATT
131 AAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * *** * * * *
104031 ATCTGTTTATAAAAAATTATG-CCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTT-TTGATCAT-TCAA
194 ATTTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATAT-AA
* * *
104093 GCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATAAATCATTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTA
257 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * ** *
104153 AAAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTT
321 AAAAATAAATCTGTTTATC-AAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * *
104214 CAAATCGTTAT-AACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTA-GTCA
384 CAAA-CATTATGAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
* * * * * *
104277 GAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAA
447 -AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTTTAAAAATAAA
* * * * *
104341 TTTGTTTGTCAAAC-CGGTTCAAATATTTAAGAC
508 TCTATTTATCAAACAC-GTTCAAATAGTTATGAC
* * * * *
104374 TATATGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTTTTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTT
* ** * *
104439 TCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAACTTATTAATATCTT-AAAAATTAA
63 TCTATTCATAC-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAA
* * * * * * *
104501 TAAGTAAGAAATTT-AAAAATAATTCTATTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
125 TAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** * * * * * * * *
104565 TGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTGTCATAAACCAAATGTTTTTA-TTTATT
189 CAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATA
* * * * * * * *
104629 TAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATCAATATT-TCAAAA--AATAA-TAAGAGATA
254 TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * **
104690 TAAATAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTCAAATA-TTCATGACTATTTGAGA-AATTATCTAT
319 TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGA-ATAATTATCTAT
* * * * * * *
104753 TTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTT-TCGTTCATACAAGCCTA-TT
382 TTCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTT
** * **
104816 CGAGTTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATAAGT---A----AAAAATAAAT
445 C-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAAT
* * * *
104874 ATGTTTA-CTAAACTA-GATCAAATAGTCATGAC
509 CTATTTATC-AAAC-ACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
104906 TATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAA-AATTATTTC
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * * *
104970 -ATTTCATATAAGCTTATTTGAAAAAAAATAACACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAAT
65 TA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
105034 TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCAAACAAG-TCTAAATAATTATGACTATTTCAACAA
129 TAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACTAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* ** * * * *
105098 TTATCTT-TTTGAAATTTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTCTA-TTCAT
192 TTAT-TTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTCTAGTTCAT
* * * * * *
105161 ACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATCCAAATTTATTAATA-T-AAAGACAATTAATAAATAAAA
253 ATAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAGA
* *** * * * * * * *
105223 CATTTTTTAAA-AAATCTATTTA-CTGAATAAGGTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATT
315 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* * *
105285 TATTTCAAACTCTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAATT-ATACAAACTT
379 TATTTCAAAC-ATTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT
* * ** * *
105348 A-TTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAACTAAAAGA-TTTAAGA
441 ATTTCAAA-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATTTTAA-A
* * * * *
105411 AATAAATTTGTTTTTCAAACAAGTTCAAATAG---T-CC
502 AATAAATCTATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * * * *
105446 TAATT----AATTATCTATTTTAAATCATTGTGACATTTTGCTTTGTAATAAAATAATTGTTTCA
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* * * * *
105507 ATTCATATAAGATTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTA
66 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * ** * *
105571 AGAGAA-TTAAAAAATGAATTTGTTTATTAAAC-ATGTTCATATAGTTATGACTATCTGAACAAT
131 A-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * * **
105634 TATCTATTTCAAAACATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCT-GTTCATGCAAG
193 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAG
* *
105698 CTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-TGAAAAATTAATAGGTAA-AAATTT
258 CTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * *
105759 TAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTT
320 AAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * *
105823 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATATATATTATTT-TATTGCAAATAAGCTTGTTT
384 CAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAA-ACA-ATTGTTTCTATT-CATACAAGCTTATTT
*** * ** * * *** ** * *
105887 GTTGA-AAAACAAT-T-GTTTTA-CAACAAAACAAAAGGTAATAA-T-A-A-TTT-GAAATAGAT
445 -CAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAAT
* * *
105943 -AATTGT-TCAAATA-G-CCATAATTA-TT-TGAAC
509 CTATT-TATCAAACACGTTCA-AA-TAGTTATG-AC
* * * * * ** *** * * *
105973 TGATTTGGTA-AATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAAAAAG
1 T-ATTT-GAACAATT-ATCTA--TTTCAAA--TC---ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-
* * * * * * * * ** * *
106037 TAGTATTATTT-TATT-TTGGATAAGCTT-TTATGAACTGAAACAAT--TTTTTTATGACA-A-A
55 CA--ATTGTTTCTATTCAT--ACAAGCTTATT-TCAAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATT
* * * * ** * * * * *
106095 ACAAAAGTTCAT-A--ACAATTTTTAATAAAT-AAT-T-ATT--CAATTA-ATCATAATTGTT-T
114 TCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACTAGTTCA-AATAGTTAT
* * * *
106150 GAACTTATTCGATAAACAAATTTATTT-TTTCAAATC-TCT-TG--CTTATTAATTTT-TTAAAA
178 G-AC-TATT---TGAAC-AA-TTATTTATTTCAAATCGT-TATGACCTT-TT-GTTTTGTCATAA
* * * * * ** *
106209 GTTAATTAATTAGTATTAATTTATTTCA-ACTAAGCTTGTATGAGCTAAAACAAT--T-A-TT-T
233 ---AA-CAATT-G--TT--TCTAGTTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
** ** * * * * * * * * * *
106268 T-AT-GGCTAAAAAAAAGATTAG-AACA-ATTTGAAATAGAAA-AT-TAT-TCTAA-TAGTCTTA
288 TAATATTCTAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGT-TCA
** * * * * *
106325 ACCA-TT-TGAATTGACTTAGCAAACACATTTAT-T-TTT-TAACTATCT-T--AC-TTTATTTT
351 AATAGTTATG-ACT-A-TTTG--AATA-A-TTATCTATTTCAAAC-AT-TATGAACTTTTGTTTT
* * *
106381 -T--TAAACCAA----TTC-A-T-AT--AAGATTA-TTCAAATTAATATAATACT-AATTTATTA
407 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA-TAAAATAATA-TAAATTTATTA
* * * * ***
106432 ATATTT----TATT--T-A-TTA-A-TTT----ATTAATCTATTCATAT-AAGCTTATTCAAATA
470 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAATCTATT--TATCAAACACGTTCAAATA
* *
106482 ATTATGGC
533 GTTATGAC
* * * *
106490 CATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** * *
106555 CA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGT
66 -ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * ** * *
106619 AGGAGATTTAAAAAAT-AATCCGTTTA-C--C--GTTCCAATAATTATGACTATTTGAACAATTA
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * *
106678 TATATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGTT
195 TTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATATAAGCT
** * *
106742 TATTCAAAATAAAATAATACT-ATTGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
260 TATTTGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * * * * *
106806 AATAAATTTATTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGCCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAA
324 AATAAATCTGTTT-ATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * *
106870 TAGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAAAT-TTTC-AGTTCTTAGTAA-CTTA-TTCAAA
388 CA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTA-TTCATA-CAAGCTTATTTC-AA
* * *
106931 ATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAA-AAATCT
448 ATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAGATTTTAAAAATAAATCT
* * ** *
106995 ATTTGTTGAATTA-GTTCAAATAATTATGAC
511 ATTT-ATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * * * * *
107025 TATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTCTTTTGTCATAAAATTAA--GTTTT
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTC
* * * ** * *
107088 TGTTCATATC-AG-TT-TGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTGAAAACTAAGA
65 TATTCATA-CAAGCTTAT-TTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
** * * * * * *
107150 AGTAGGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CCTAAATTAGTTCAATTAGTTATAACTATTT-AGA
127 AGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACC--AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-A
* * * * * *
107213 CAATTCTTCATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT-GTTCACA
189 CAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATA
* * * ** * * * *
107277 CAATCTTA-TTCAGAATAATGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAGTAAGTAA-AGGA
254 TAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GA
* *** * * * * * *
107340 TTT-AAAAATGAA-CATGTTGGCCTGATC-AGTGCAAATAGTTATGATTGTTTCAATAATTATCT
317 TTTAAAAAATAAATC-TGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * * * ** *
107402 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCACAAAGCATTTGTTTCTATTTGTAAAAGCTTATT
380 ATTTCAAA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * * * * * *
107467 CCAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCTAAAATGAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATG
444 TCAAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTTTAAAAATA
* ** ** * * *
107531 AATATGCTTATTGAATAAGTTTAAATAGTTATGAC
506 AATCTATTTATCAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
*
107566 TATTTGAAC-A--AT-T-TGT----T--TTAT---C---------GT-A-AAATA-AA-T-TTTC
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ACAATTGTTTC
* * **
107603 TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATTATACAAATTTATTAATATTT-AGACTATTAATAAG
65 TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
* * * * *
107667 TAAAAGATATAAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTTAACAA
129 TAAAAAAT-TTAAAAAATAAATATGTTTACCAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * ** ** * *
107732 TTACTTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAACTT-TTT-TTCTCCATACA
192 TTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTAGTTCATATA
* * * * * * * *
107795 AGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTTTACAATTAATAAGTAAAAGATTTT
256 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * *
107860 AAAAATAGATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTAA
321 AAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
** * * * * * * * *
107925 AATTGTTATGATCTTTCGTTTTGTCGTAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAAT
386 AA-CATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAAT
* * * *
107990 AAAATAATACT-AATTTATTAAT-TTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAA-CT
450 AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGATTTTAAAAAT-AAATCT
* * *
108052 ATTT-TCCGAACAAGTTCAAATAGCTATGAC
511 ATTTAT-CAAACACGTTCAAATAGTTATGAC
* * *
108082 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTCCA
1 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT
* ** *
108147 ATTCAAACAAGCTTATTTGGAATAAAATGATA-TAAATTTATTAATA-TT------TTAA-AA--
66 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
108201 AATAAATCT-----AT---T-T-TTT--GAAC-ATGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATT
130 AAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *
108253 ATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
194 ATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTAGTTCATATAAG
* ** * * * * * * *
108316 CATATTCAAAATAAAAGAGTACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGAATTAAA
258 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * * * ** * *
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323 AAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
108446 TAGTTATGATCTTTTATTTTTTCATAAAATAATTATTTGC-ATTCATACAAGTTTA-TTCGAAAT
388 CA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTATTTC-AAAT
* ** *
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ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
TAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAACAT
TATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATA
ATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTTAAAAATAAATCTATTTATCAAA
CACGTTCAAATAGTTATGAC
Found at i:93243 original size:169 final size:167
Alignment explanation
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92930 AATTTTGGCC
* * * * *
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* * * * **
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*
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131 GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCCT
* ** *
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1 ATTTGAACAATTAACTATTTCAAATCATTACAAAATTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTGTA-
* * *
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* * *
93236 AGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTATCGAAGCAGTTCAAACAATT
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* * ** * * *
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* * * * * *
93346 GTT-TCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAA
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** * * *
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93451 TTAGTTCAAA
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CATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATAATTCAAAAATTAATAACCAAGA
GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCCT
Found at i:94500 original size:720 final size:714
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Indices: 85004--114506 Score: 7228
Period size: 718 Copynumber: 41.3 Consensus size: 714
84994 AATATTTGAA
* * * * * * *
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* * * * *
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** * * ** * ** * *
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* * * * * * *
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*** * * ** * *
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250 CGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA-AAAATTAAT-AAGTAAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * * *
85321 TAAATTTGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAACTATCTATTTGAAATCA
313 TAAATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * **
85386 TTATAACTTTTTATTTTGTCATCAAAC-AATTGGTCTAGTTCATACTATTTTA-TTCAGAATAAA
378 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCA-AATAAA
* *** * * * * *
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440 ATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT
** * * * * * *
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503 TATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-T-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC-T
* * * *** * *
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565 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAG-TTTATTCAGAAATAAAATAATACTA
* ** * * * *
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629 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAG
* *
85699 ATTAAGATTA-TTA-GA--A----
693 TTTAA-A-TAGTCATGACCATTTG
* * * * * * *
85715 CAATTATCTATTTAAAATCATTCTGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCAATTCATA
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCAT-
* * * * * *
85779 CAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACCAATTTATTAACA-TTCAAAACTTAATAAGAAAGAGATT
64 CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AAGATA-T
* *** * * *
85843 TAAAAAAATAAATTTGTTTAATGAA-TAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAAAAATGA-CTAT
123 TAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
85906 TT-AACATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTTAAAACAAGCTTAGAT
187 TTCAA-ATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TT
* * * * *
85970 -GGAATAAAATAATACTAATTT-ATAAAACTTACTAAAA-TAATAAGT-AAGAAACTTAAAAAAT
250 CGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * * * * *
86031 AAATTTGTTTA-TCAAATTAGTTAAAATAATTATAGGC-ATTTGAGCAATTATATATTTCAAATC
314 AAATCTATTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
86094 GTTATAACCTTTTG--TTGTCATAAAAC-AATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTA-TTCGACATA
377 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGT-TCATA-AAGCTTATTTC-AAATA
* **
86154 AAATAATGCTAATTCGTTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-CATG
438 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-TG
* * * *
86217 TTTA-CTAAACT-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAGTCGTTA-A
501 TTTATC-AAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTAT-TTCAAATTGTTATA
* * * * * * ** **
86278 GA--TATCTGTTTTGTCAAAAAACAATT-TTTTTTTATCATAGAAGTTTATTTGGCTA-AAAATA
561 -ACCT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATA
* * *
86339 ATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCG
623 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCA
* * * * ** * *
86400 AGCAAATTCAAATAATCAAAACTATTAG
687 AACAAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * *
86428 AATAATTAT-TAATTTCAAATCATTCT-AGCTTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCATAT
1 --TAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAT-T
* * *
86490 CTTACAAGCTTAATT-GGAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACA-TTCAAAAATTTAATAAGGA
61 CAT-CAAG-TT-ATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAA-G-
** * * * * * * *
86552 AATGATTTGGAAAAATAAATCTATTTACCGAGCAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGGACAATT
119 -AT-A-TTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *** * * *
86617 ATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAAAATAAAACACTTGTTTCAGTTCATAAAAGCT
181 ATCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT
* ** ** * *
86682 TATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAAATTAAATAATTCAAAATTTAATA
246 TATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT-ATTCCAAAAA-T---TAA-T---AA-GT-A-A
* * * ** *
86747 AGCAAGAGTTT--AAAATAAATTTGTTTACTAAAAAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAA
299 AG--AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * ** * * * *
86810 TTACCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCATGAAAC-AA-TTGTTTGAATTCATACA
361 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTG--TTCATA-A
* * *
86873 AGCTTA-GTCAAAATAGAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAATGATT
423 AGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * * *
86932 TAAATAGTGAATTTGTTTACCAAAT-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCAATTT
486 TAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTT
** * * * * *
86996 CAAATCATTATTACCTTTT-TTTTGGTCATATAACAATTGTTT-TTTATCATATATGTTTATTCA
549 CAAATTGTTATAACCTTTTATTTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAAAAGTTTATTCA
* * * *
87059 -AAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAACAAATAA
612 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA-AAATAA
* * * * *
87123 ATTTGTTTATCAAACCAA-TTTAAATAGTTACGACTATTAG
676 A-TTGTTTACCAAA-CAAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * ** * * * * * * **
87163 AATAATT-GCATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCA
1 --TAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCA
* * * ** * *
87227 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAAAAACTAAGAGA
63 T-CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AA-TAAGATA
* * * * * * * * *
87292 TTGAAAAAATAAGTTTATTTGCCAAATTAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAACAATTATCTAT
122 TTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
87357 TTCAAATC------A-TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCAATTCATACCAA-CTTATT
187 TTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATA-CAAGCTTATT
** * * * *
87414 CAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGT-AAGAGATTTAAAAAAT
250 CGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
87477 AATTTTGTTTGCCT-AACTAGTTCAAATAAG-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
314 AAATCTATTT-ACTGAACCAATTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* *
87540 A-CATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TT-TGTTCAAAATAA
377 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCATA-AAGCTTAT-TTC-AAATAA
* * * *
87602 AATAATAGTAATCTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAATTTATT
439 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
** * * * * * **
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503 TATCAAATAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTT-A-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT
* * * * * * ** * * ** * *
87726 TTTCTTCTATTAGAAAATAATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCAG-ATTAAAATGATACTAA
565 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAA
** * * * * *
87790 TTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGA
630 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGT
* *
87855 TCAAATAGTCATGACTATTTG
694 TTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * *
87876 AATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AATT-TATTTTAGTTC
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGT-TTTCA-TTC
* * *
87939 AT-ATTAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTGAAAATTAATAATTAAGA
62 ATCA--AG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAA--ATTAA-TAAGA
* ** * * * * ** * * *
88003 GATTTGAAAAATGAATCTATTGACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT
120 TATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * ** *** * *
88068 ATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGGTT-TTTTCTGTACATACAAGCTTAT
185 ATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTA-
* * * * * *
88132 TTC-AAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATTACGACAATTAATAGGTAAA-AGATTTAAAAAA
248 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTT-AAAAA
* * * * ** * *
88194 ATAAATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAAT
312 ATAAATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * * *
88258 TGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGGATTA
376 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTC-AAATA
* * * * * *
88321 AAATAATATTAATATATAAATATTTCTACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
438 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGT
* * * * * ** * *
88385 TTA-CCAACAAGTTCAAATAGTCT-TAACTATTTGAATAATAATCTATTTCAAATCATTGTGACC
502 TTATCAAATAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
* * * * * *
88448 TTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTCATT-TGAAATAAAATAATACT
564 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACT
* * * * *
88511 AATTTATTAATATTAT-AAAAATTAATGACTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTA-CAGAAC
628 AATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATTGTTTACCA-AAC
** * * * **
88574 TTGTTCAAATAGTTATGACTATCGG
690 AAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * *
88599 ATAATTACCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-GTTCTATTCAT
1 -TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCAT
* * * * *
88663 GTAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAA
64 -CAAG-TTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---ATA
* **** * *
88726 TTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAAC-ATGTTCAAATATTTATGACTATTTGAGCAATTATCTA
122 TTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
88790 TTTCAAATCGTTATGATTTTTTCTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTCTGTTCATAAAAGCTTATT
186 TTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATT
* * * ** *
88855 AGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTTAAGAATTAATAAGT-AA-AG-TTTAAAAAATA
250 CGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * * **
88917 AATCTATTTACTGAGCGAGTTGAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTAT-TGAATTCAAATTGT
315 AATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCAT
** * * * *
88981 TATGATATTTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAA-TTTCA-TTCAAAATAAA
379 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTT-ATTTC-AAATAAA
* * * *
89043 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTC
440 ATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * * * * *
89107 ATCGAACAAATTCAAATAGTCATGTCCATTCAAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTT
504 ATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT
* ** * * * * * * *
89172 TGTTTCATCGTAAAACAATTATTTCTATTTATACAAGATTATTTA-TAATAAAATAATACTAATT
567 TATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
89236 TACTAATATTTCAAAAA-T--TCA-TAACAGATTTAAAAATTAAATCTATTTATCAAACCAA-TT
632 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAA-CAAGTT
* * * *
89296 CAAATAGTTATGACTAATTTAA
695 TAAATAGTCATGAC-CATTT-G
* * * * * * * **
89318 TAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-ATTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCAT-C
* * * * * *
89382 AAGCTTATTTGAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGAAAAAGATT
65 AAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----ATATT
* * * * * * * *
89446 TAAAAAATAAATGTGTTTGCCATACCAGTCCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTT
124 AAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * ** * *
89511 CAAATCATTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTTGTACATGCTTATTCGAA
189 CAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGGA
* * * ** *
89576 ATAGAATAATACTAATTTATTAACATT-CAAATAATTAATAAACAAA-AAATTTTAAAAAATAAA
254 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAA-AATTAATAAGTAAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * ** *
89639 TATATTTA-TCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATATATTT-ATAAGAAG
317 TCTATTTACT-GAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCAT
* ** ** * *
89701 TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-TGATTGTTTCAGTTCATAAAGCTTATCTAAAATAAAATA
379 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATAAAGCTTATTTCAAATAAAATA
* * * * *
89765 ACATTACTTTATTAATATTTC-AAAAATTGAA-AAG-ATAAAGATTT-AAAAATAAGT-TAGGTT
443 ATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATT-AATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTT
** * * * * * *
89825 ATTGAATCACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAA-CTT
504 ATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTT
* ** ** * *
89889 TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATGCAAGCCTATT-TGAAATAAAATAATATTAA
566 TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
89952 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAACAAATAAATCTATTTATCGAACCA-T
630 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGT
** *
90016 TT-TCTA-T-TTGA--A----
694 TTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * * * *
90028 CAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCTGTTATTCTGTTATAAAATAATTG-TTTCAATTCATA
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCAT-
* * * * * *
90092 TAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAATTTAATATCTAAGAGAT
64 CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A-A--TAAGATAT
** * * * * * ** * * *
90156 TTGAAAAACAAATTTGTTTGCCGAAGTAGTTCAAATAACTAAGATTATATGAACAATTATCTATT
123 TAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* *** ** * * ** * * * *
90221 TAAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-TTTTTTTATCATTCAAACCTATTTG
188 TCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCG
* * * *
90285 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAG-AAAGATATTTAAAAAATAAA
252 GAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * ** * *
90349 TTTGTTTACCT-AACTAGTTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTATTA
317 TCTATTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
90411 TAACCTTTTGTTCTGTCATAAAA-AAATTATTTTTTTTCATACAATCTTATTT-AGAATAAAATA
381 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCA-AATAAAATA
* * * * * * *
90474 ATACTAATCTAATAATATTTCAAAAAACTAACTAAG----AGAATTAAAATATAAATTTGTTT-G
443 ATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
* * * * ** *
90534 CAAACCAA-TTCAAATATTTAAGACTACATGTACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
506 CAAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACT--ATTTACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
* * * * * ** * ** *
90598 GTTTTGGCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTTATACTAGATTATTTGGAAA-AAAATAA-AATGA
568 ATTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACT-A
* * * * * ** *
90660 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAG----AGATTCAATAAATAATTCTATTTACCTTACCA-
629 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAG
* * * *
90720 TTTCAACTAATTATGACTATTTG
693 TTT-AAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * **
90743 AAAATTTATCCATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCA
1 -TAA-TTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCA
* * * * * * ** *
90807 TATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGCTTTA
63 T-CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGATATTAA
* * * * ** *
90872 AAAAATAAATCTATTTATCAAA-TGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAGTAATTATTTATTTC
126 AAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * * **
90936 AAATAGTTATGAA-TTGCTGTTTTTTTATAAAATAATTATTTCTA-TTTATACAAGCTTATTTAG
190 AAATCGTTAT-AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGG
* * ** ** * *
90999 ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAGCAATTAATAAGTAAA-AAAGTTT-TAAAATAAA
253 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * *
91062 TATGTTTACTGAACTAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
317 TCTATTTACTGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * *
91126 TAACCTTTTGTTTTG---T----C--A---------T-AT-AGGATTA-TTCGAAATAAAATAAT
381 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCATAAAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT
* * * **
91170 ACTAAGTTATTAATAAT-ACAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATGAAT-TGTTTATTGA
445 ACTAATTTATTAATATTCA-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAA
** * * * * * * * * * *
91229 GCAACTTTAAATAATTATGACTATTTCAATAATTTTCTTTTTGAAATTGCTATAGCCTTTTGTTT
509 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTT
* ** * * * ** *
91294 TGTCATATAATGATTTTTTCTATTCATACAAGTTTA-TCTTG-AATAAAATAATAAAAATTTAAT
572 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTC-AGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
91357 AATA--T-AAAGACACTTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCA
636 AATATTTCAAA-A-A-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTTA
* * * *
91419 AAT-CTTATGACTAGTTG
697 AATAGTCATGACCATTTG
* * * * *
91436 AACAATATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTCTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCTATTC
1 TA-ATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTT-TTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTC
* * ** *
91498 ATACAAGCTTATTC-AAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAA
62 AT-CAAG-TTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----A
* * **** * * ** *
91562 TATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAATCCTGACTATTTGAATAATTATCT
120 TATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * * * *
91627 ATTTTAAATCATTGTGA-TATTTTCTTTTGTAATAAAACAATTATTTTAGTTCTTATAAGCATAT
185 ATTTCAAATCGTTATAACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * *
91691 TTGAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGT-AAGAGAATTAAAAAAT
249 TCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * ** *
91755 GAATCTGTTTACGGAA-CATGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGAATGATTATCTATTTTTAAA-C
314 AAATCTATTTACTGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATC
** * * * * * *
91818 ATTATGAAATTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGGTTCTATTTATGCAAGCTTATTTCAAATAAA
377 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCAT-AAAGCTTATTTCAAATAAA
** * *
91882 ATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGT-AAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTT
440 ATAATACT-AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* ** * * * ** ** *
91944 TTTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAGCTCAAATCATTATGACCTTT
504 ATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT
* * * *
92009 TGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATT
567 TATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * * * *
92073 TATTAAAATTCCAAAAATTAATAATTAAAAAATTTTAAAAATAAATCTGTTTACCAAGCGAGTTC
632 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTT
* *
92138 AAATAGTTATGACTATTTG
696 AAATAGTCATGACCATTTG
* ** * * * *
92157 AATAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTATTCA
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCA
* * * * * *
92221 TGTAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAA-AATTCTTAAAATTAATAAGTTTGAG
63 T-CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA----GAT
* * * * * * * * *
92285 ATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATTCATTTGAGCTATTATCT
121 ATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCT
* ** *
92349 ATTTCAAATCATTATGGCATTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGATTA
185 ATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA
** * ***
92412 TTCAAAATAAAATAATACCAATTT-ATCAATATTTTGAAAA-T--TAA-T-AAGAGATTTAAAAA
248 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * *
92471 CTAAATCTATTT-GTCGAACCAGTTCTAATAGTTATAATTATTTGAATAAATATCTATCTCAAAT
312 ATAAATCTATTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
92535 CATTATGATC-TATGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTATATTCATACAAGTTTA-CTCAGAGTA
376 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCA-AATA
* * * * * * * * *
92597 AATTATTGCTAAATTAATAGTATTCTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAAAAAATATGTT
438 AAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
** * * * * *
92658 TGCCGAATAA-TTCAAAT-GATTAGGAGTATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCT
503 TATCAAATAAGTTCAAATAG-TTATGACTATT--TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT
* * * * * *
92721 TTTGTTTAGTCATAAAATAATTTTTTC-AGTTCATACATA-CTTATTC-GAAATAAAATAATACT
565 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACT
* * ** * * * ****
92783 AATTTATTAACA-TTCATAAATTAATAAACAAAAAATTT-AAAAATAAAATGCTTATTTGA-AA-
628 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAG
* * *
92844 -TAAAATAAT-ATTA-C--TT-
693 TTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * ** * *** * *
92860 T-ACTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-AAGTTATAGATT-TAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAT
1 TAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAA-CAAT-TGTTT-TC--AT
** * * * ** * * *
92920 TGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTA-ACT-ATTTCA--AATCATTAC-AAACTT--T
60 T-CATCAAGT--TATT--CGAAAT-AA-AATAATACTAATTT-ATTAAT-ATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * * * ** *
92978 -TGTTTTGTTATAAAAT-ATTTTTTTTATCATACAAGCTTA-TTCAAAATA-AAAT-AATA-TT-
116 AAGATAT-TAAAAAAATAAATATGTTTA-C---CAAAC-TAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * **** * * *
93036 AATTTATTAAT-AATTTAAAAAT--TAATAAGTAAGAG-ATT-T-AAAAAATAAATCTG-TTTA-
174 AA-CAATT-ATCTATTT-CAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTTAG
* * * * * * * * * * * *
93093 -TCAAACCAGTTCCTATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAAATTTTGTTCTGTTAT
234 TTCATACAAG--CTTATTCGGAATAA--A-ATAATACTAA-T-TTA-ATAA---TATTC---CA-
* * * * * *
93156 AAAA-TAATTGTTGTAGTTCATATAAACTTATTCAGAATAAA-ATAATACTAATTTAATAATATT
284 AAAATTAA----T-AAG-T-A-A-AGA--GATTTA-AA-AAATA-AAT-CT-ATTTACTGA-A--
* *** * * * *
93219 CCAAAATT-TAATAACCAAGA-GATTTAAAAAATTAATCTATTTATCGAAGCAGTTCAAACAATT
330 CC--AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTA-TT-TC-AA--A--T----C-ATT
* * * ** **
93282 AAGA-CTATATGAACAACTATCTATTTCA-AATCATTAAGACCTTTTGTTT-TGTCATAAAAAAA
380 ATGACCT-TTTG------T-T-T-TGTCATAA--AACAA-A--TTTT-TTTGT-TCAT--AAAGC
* * * * * * * * *
93344 TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAATAATAATTTATTAATATTTTAAAA
426 TTATTTCA---AATA-AA--ATAAT---ACT-AATTTATT-----AA--TATT--CA----AAAA
** * * * * * *
93409 ATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATAAACCTCTTTATCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCAT
468 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
** ** * * * * *
93474 GCCAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTATTTTTTCATAAAACAAATGTTTTTATT
533 --TTACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
* * * * ** *
93539 CATATAAGTTTGTTC-GAAATAGAGTAATACT-ATTCTATTAATATTT--TGAA-TATTAA-TAA
596 CATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
93598 AAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTTAAATAG-CTATGACTATTTAAG
660 AAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTC-ATGACCATTT--G
* * * ** * * **
93655 CAATCATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTATTTTTTTTACA-
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATT-CAT
* * * * * *
93718 CAAGCTTATTCGGATTAAAACAATACTAATTTATTAACATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATT
64 CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----ATATT
* * * * * *
93783 AAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAG-ACAAATAATCATGATTATTTGAATAATTATTTATTT
124 AAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * *
93847 CAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTGGGA
189 CAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGGA
* *
93912 ATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAATC
254 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *
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319 TATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * *
94040 ACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAATTTTTTTGTTCATACCAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC
383 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC
* * *
94105 AAATTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAT-AGAAT
447 TAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCA-AAT
* * * * *
94169 AAGTTCAAATCA-TTATGACTATTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGA-C-TTTGTTTTG
511 AAGTTCAAAT-AGTTATGACTATT-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTG
* *
94231 T-ATAAAACAATT-TTT-TATTCATACAAGTTTATTCAG-ATTAAAATAATACTAATTTATTAAT
574 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
94292 ATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CAGAACAAGTTCAAAATA
639 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCA-AACAAGTT-TAAATA
*
94356 GTCATGACTATTTG
701 GTCATGACCATTTG
*
94370 TAATTATCTATTTCAAATCATAATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTCAGTTCAT-
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCA-TTCATC
* * * * **
94433 AAGTT-TTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATA-TTCAAAAATTAATGAG-TAAAAGAATT
65 AAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGATATTA-AA--
* * * * * *
94495 AAAAAAAATCTATTTA-CAAA-AAGTTCAAATAGTTTTGACTATATT-AATAATTATCTATTTCA
127 AAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * **
94557 AAACATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTCA-TTCATGCAAGCTT-TTTTGAAT
191 AATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGGAAT
* * *
94619 AAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAA-A-ATTTTAAAAA-AAATCT
256 AAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * *
94680 ATTT-CTAAAAC-ATTCAAATAGTTATGATTA-TTGAACAA-TATCTATTTCAAAT-ATTATGA-
320 ATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
** * **
94739 CTTTTGTTTTGTC--AAAACCCA-TTGTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTA
385 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCAT-AAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTA
* * * * *
94801 ATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-CTAAGAGA
449 ATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATA-A
* * *
94864 GTTCAAATAGTTATGATTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTATTTTGTC
513 GTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTC
* * *
94929 ATAAAATAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATT-TGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATA-
576 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *** * * *
94992 TTCTAAAAATTAATAATTTGGATATTTAAAAACTAAATTGTTTACCAAATAAGTTTAAATAGTCA
641 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCA
*
95057 TGTCCATTTG
705 TGACCATTTG
* * * * * *
95067 AACTATTATCTATTTGAAATCATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
1 TA--ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCAT
* * * *
95132 GCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
64 -C-AAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGATATTAAA
* * * * *
95197 AAACTAAATTTGTTTACAAAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAA
127 AAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * *
95262 ATCGTTAGGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTC-AAAG
192 ATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGGAA-
* * ** ** * *
95324 TAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATCAATGT
255 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * *
95388 GTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGAC
320 ATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * ** * *
95453 CTTTTGTTTAGTCATAAAA-TAATTGTTTCAGTTCATATATGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
385 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT
** * * * * *
95517 CTTTTGTTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAGTTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACA
448 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATA
* * *
95582 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTAT
512 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGT
* * * * *
95647 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCCA-AAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
575 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *** * ** * * *
95711 TTTTAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATGAATTAGTTTATTGAATC-AGTTCAAATAAT
640 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-GTTTA-CCAAACAAGTTTAAATAGT
*
95775 TATCG-CCATTT-
703 CAT-GACCATTTG
* * *
95786 TAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGATCTTTTTTTTTGTCAA-AAAATAATTGTTTTTCA-T
1 T---AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGT-AATAAAACAATTG-TTTTCATT
* *
95849 CATTCAAGTCTATCCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAGGA
61 CA-TCAAGT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT--A-A-GA
* * * * * * * *
95914 GATTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACCATTTAAACAATTATAT
120 TATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * *
95979 ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATGAAACAATT-ATTTATGTTCATACAAGCTTAT
185 ATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTAT
* * * * *** *
96043 TCGAAATACAATAATACTAATCTAATAACATTATGAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAAT
249 TCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAAT
* * ** * * *
96107 AAATTTTTTTACCCAACCAATTCAAATAGTTAATG-CTATATGAATAATTATCTA-TT----TCG
314 AAATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * *
96166 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATA-CGTT-TGTTCAAAATAAA
378 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCATAAAGC-TTAT-TTC-AAATAAA
* *** * * *
96229 ATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T-A-AA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTA
440 ATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* ** * * * * ** * *
96290 CCAAACCATTTCAAATAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTGTAACCATTT
505 TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
* * * * * * * *
96355 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTGATACAA-TCCTATTC-GAAATAAAGTAATGCTAATA
568 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGT-TTATTCAGAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * ** ** *
96418 TGTTAATA-TCCTAAAAATTAATAAGT-AACGAATTTAAAAAATGAATCTATTGGCCCGACTAGT
632 TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGT
** * * * ***
96481 ACAAATAATAATAATTGTTTG
694 TTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * * * * * * *
96502 AACAATTATTTGTTTCAAAGT-GTTATAACATTTTGTTTTG-ATACAAAACATTTTTTTTTATTT
1 --TAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTTTTTTGTA-ATAAAACAATTGTTTTCA-TT
* * * * *
96565 C-TACAAGTTGACT-AAGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCAATGTTAA-TAAGTAA
61 CAT-CAAGTT-ATTCGA-AATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAA---AAATTAA-TAA
* * * * * * * * * * * *
96626 GAGATTTAAAAATTGAATCTGTTTATC-GATTAAATTCAAATAGTTATGACTCTTCGAGCAATTA
118 GATATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * **
96690 TCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTGTCTA-TTCATACAAAT
182 TCTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-T-TAGTTCATACAAGC
* * * * *
96753 TTATTTC--AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-CAGACAACTAATTAGTAAA-AGATTT
245 TTA-TTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAGAGATTT
* ** *
96814 AAAAAATAAATCTATTTAC-CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
307 AAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
96878 CAAATCGTTATCACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC-ATTTGTTTTTGTTCTTACAAGTTTA-TTCG
371 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTC-
* * * * ***** * *
96941 GATTAAAATAATATTAATTTA-TAACATTTTGCCAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
433 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * *
97005 ATGTTTACCGAACAAGTTCTAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
498 CTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATA
* * * * ** * * * *
97070 ACATTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTATAAATTCATATAGGCTTATTCA-AAATAAAATAATT
561 ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATA
* * * * * * **
97134 CTAATTTATTAATA-TTC-CAAA--AATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTACTGAAC
626 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAAC
* * ** ** **
97195 AAGCTCAAAGGGGAATGACTGTTTG
690 AAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * * *
97220 AACAATTATTTATTTTAAAT-AGTTATGAACTTTTATTTTGTCATTAAACAATTG-TTTCTATTC
1 --TAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTC
* *
97283 ATACAAGTTTATTAGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGCAGGA
62 AT-CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA---A-GA
* * ** * * * *
97347 GATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAA-TAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAAAATTATC
120 TATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * **
97411 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAAATTA
184 TATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA
** * * * * ** *
97475 TTTAGAATAAAATAATAAC-GATTCATTAAGATTTTAAAAATTAATAAG---AG-TA-TTAAAAA
248 TTCGGAATAAAATAAT-ACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAA
* * ** * * * *
97534 CTAAATCTGTTTACCAAACTAATTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATC
312 ATAAATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *
97599 ATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAAC-AATTGTTTCTT-TTCATATAAGCTTATTTGAATTAA
377 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTT-TTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATAA
* * * * *** * *
97661 GATAATACTAA--T-TTAATAAT-AAAAAA-T-A-AA-T--GAG-TTT---TACCGAACCAG--T
439 AATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * *
97710 -TCAAAT-AGTTAAAACTA-TTA-G---A---ACAATTATCTATATCAAATTGTTTTGACCATTT
504 ATCAAATAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT
* * * * * * *
97765 GTTTAGTCATAAAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATT
568 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATT
* * * *
97828 TATTAA-AATTCAAAATATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATTAATTATT-TTTATCAAACAAG
632 TATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAA--ATTGTTTACCAAACAAG
* * *
97891 CTTAAATAGAT-ATGGCCATTTCAA
693 TTTAAATAG-TCATGACCATTT--G
* * * * * * * * **
97915 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATTATCTTTTATTTAGTCATATAACAATTGTTTTTTTATCATA
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAT-TCAT-
* * * * * *
97980 CAAGGTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTGATTAATCTTTCAAAATTTAATAAGTAAAAGATT
64 CAA-GTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----ATATT
* * * ** * * * *
98045 TAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TCAATTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTGTATACT
124 AAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
98108 TCAAATCAATTATTTAAAAAATAAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATT-ATTTATGTTCATGC
188 TCAAATC-----GTT-----AT-AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATAC
* * * * *** *
98172 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAA-TCAATAATATTTTGAAAATTAATAACT-AAGAGATT
241 AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATT
** * * * * * * * * * *
98235 TAAAATTTGAATTTGTTTGCTAAACCTATTGAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTTTTT
306 TAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * ** * *
98300 CAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAA-TAGTTTTTTCAATTTATACTAGCTTA-TTCA
371 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTT-TGTTCATA-AAGCTTATTTC-
* *
98363 AAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
433 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * * * * *
98426 TTATATTTACCTAATCCA-TTCTAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTT
496 ATCTGTTTATCAAAT-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTT
** * * * * * * *
98490 A-AGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAAATATTT-TTTTCATATAAGTTTGTT-TGGAATAAAAT
558 ATA-ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAAT
* * * * **
98552 AATGCTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTTTTATTA
622 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCA
* *
98613 AACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTG
687 AA-CAAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* ** * * *
98641 AAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTT-AGTTCA
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCA-TTCA
* * * * * * *
98704 TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT-GT--TGTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGA
63 T-CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAA-TAAGATA
* * *** ** * * * * *
98766 TTTAAAAAATAAGT-TAGTTTATTGATTTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTA
122 TTAAAAAAATAAATAT-GTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
98830 TTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTCA-AT-ATAGAATCTTAT
186 TTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT-AGTTCATACAAGCTTAT
* * ** *
98893 TCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAGAA-T--TAA-T-AAGAGATTTAAAAAAT
249 TCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * **
98953 AAATTTATTTA-TCGAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTG
314 AAATCTATTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
99017 TTATAACCTTTT-TTATATCATAAAAC-AATTGTTTCTAT-TTACAT-AAGCTTA-TTCGGAATA
378 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTT-T-TGTT-CATAAAGCTTATTTC-AAATA
* * * * **
99077 AAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATAAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCATT
438 AAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * ** * * **
99142 T-GCTAAACT-AGTTTAATTAGTTAAGACTATACGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGGCC
503 TATC-AAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT--TTACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACC
* * * * * *
99205 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCA-AAATAAAATAATACT
564 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
99269 AAGTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACTAAACT
628 AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACA
* ** *
99334 ATTTTAAATAGTTTTGACTATTTG
691 AGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * *
99358 AATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTATTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCTT-GTTC
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTTTTTTGTAATAAAACAATT-GTTTTCATTC
** * *
99421 ATACTATTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACCTAATAACTAAGA
62 AT-C-AAGTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA---ATTAA-TAAG-
* * ** **** * * * *
99485 AAATTAAAAAAATAAATCTAATTGGTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG---AATGAT-
119 ATATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * **
99546 TATTT--ATTCCTTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTA
184 TATTTCAAATCGTTAT-AACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA
** * * * * *
99608 TTTTGATTAAAACAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATGAGT-AAGAGATTTAAAAAA
248 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * * * ** *
99672 TAAATTTATTTAAC-AAATCAGTTTAAACAGTTAAGATTATTAAAACAATTATCTATTTGAAATC
313 TAAATCTATTT-ACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * **
99736 ATTATGACTTTTTGTTTAGTCATAAAA-TAGTTATTTCAGTTCATACAAGCTTA-TT----T---
377 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATAAA
* *
99792 A-GA-A-TAA---A-TAA-A-T------ATTAATAAG-AATAGATTTAGAAAAATAAATCTGTTT
440 ATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * * * * * *
99841 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATATGAATAATTGTCAATTTAAAATCGTTATAACGTTT
504 ATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-T-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT
* * * * * * * *
99906 TGA-TTTGTCATAAAACATTTGTTTCAATTAATACAAGCTTA--GATGGATTAAAATAATACTAA
567 T-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCA-GAAATAAAATAATACTAA
* * * * *** **
99968 TTTATTAATA-CTCACTAAAA-TAATAAGTATGAA-ACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATT
630 TTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACA
* * *
100030 AGTTAAAATAATTAT-AGCCATTTG
691 AGTTTAAATAGTCATGA-CCATTTG
* * *
100054 AATTATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTATC
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCAT-TC
* * *
100117 ATCCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
62 AT-CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAT
* ** *
100182 ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTACTATTTGAACAAT
121 ATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATG------ACTATTTGAACAAT
* * * * * *
100246 TAT-TAATCTT-AAATCGTTA-AGA-TCTATGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGATCATAGA
180 TATCT-AT-TTCAAATCGTTATA-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACA
* * * * * * * * *
100307 AACCTATTTGG-TTAAAAATAATACTGATTTAATTATATTTCAAAAATTAATAACT-AACAGATT
242 AGCTTATTCGGAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATT
* * * * * ** * *
100370 TAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGATCCAATTGAAATAGTTAAAACTATTAGAAGAATTATCTATT
306 TAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
100434 TCAAATCGTTTTGACCTTTTATTTAGTCAT-AAA-ATATTTTTTTCATATCTTACAAGCTTATTT
370 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTT-GT-TCATA-AAGCTTATTT
** * * *
100497 GGAATAAAATAAT-CTAAATTTATT-ATCATTTTAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAAAA
432 CAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT-A-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAA
* * * * * * **
100560 TAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCA
493 TAAATCTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTG
* * * * * *
100625 TTATGACCATTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCA-AAATAAA
556 TTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAA
* * * *
100688 ATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTA
620 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTA
* * * * * * *
100750 TCGAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTG
684 CCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * **
100781 AACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTGAATTCAT
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCA-
* * *
100846 TCAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TGATTT
63 TCAAG-TTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAT-ATTA
* * * * * * * * *
100909 AAAAAATGAATTTGTTTACCAAATTAGTTTAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTC
125 AAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * * **
100974 AAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT-TTATCATATATGTTTATTCAAA
190 AAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCGGA
* * *
101038 ATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAAATAAAT
254 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
101102 CTATTTACCGAACTAATTTAAATAGTTAT-ACGATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATA
318 CTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG
* * * *
101166 ACCTTTTGTTCTATCATAAAAC-AATTATTTTTGTTTATATAAACTTA-TTCAAAATAAAATAAT
383 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTC-AAATAAAATAAT
* ** * * * *
101229 ACTAATATAAAAATATTTC-AAAAATTAATTACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTA
445 ACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-A
* * *
101292 AACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA---TCAT----TTTTAT
508 AA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-T-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTAT
* ** * * * *
101349 TTTGTCATAAAACAATTTTTTC-ACTTCATACTAGCTTATT-TGGAATAAAATAA-AATGAATTT
570 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACT-AATTT
* * * * * * *
101411 GTTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTACAAAATAATTTTGTTTACCTAATC-AGTTC
633 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA-ATTGTTTACC-AAACAAGTTT
* * * **
101475 AAAAAATTATGATTATTTG
696 AAATAGTCATGACCATTTG
* * ** * * * * *
101494 AACAATTATCGATTTCAAATCACCACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTATTCAT
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCAT
** * * ** *
101559 -ATACGTT-TGTTTAGAATAAAATAATACTTATCTAACAATAGTTTTCTATTTATAAAAGCTTAT
64 CA-A-GTTAT-TCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTTC-----A-AAAA--TTAA
* * * * *
101622 TCAGACTA-AAATAATACTAATTTATTAATAT-TTTGA-CAATTAATAAG--CAAA-ATTTAAAA
115 TAAGA-TATTAA-AA-A--AA--TA--AATATGTTT-ACCAA--ACT-AGTTCAAATAGTT--AT
* * * * * * * * * * **
101681 AAATAAATTGTTTACCAAACTAGATCAACTAGTCATGACTATTCG-AATAAGTTTTTATTTCAAA
165 GACT--A-T-TTGAAC-AA-T-TATCTA-T-TTCA--A--A-TCGTTATAACTTTTTGTTT--TG
* * ** * ** ** * * * * * *
101745 TCATTATGACCTTTTGTTTT-GTT-ATAAAAAAATTATGTTAG-TTCATATCA-GCTTATTTGAA
214 TCA-TA-AAACAATTGTTTTAGTTCAT-ACAAGCTTAT-TCGGAATAAAATAATACTAATTT--A
* * * * * * *
101806 ATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAGTCT
273 AT--AAT-ATTC-CA---A--AA-A-T-TAAT-A--AGT-A--AAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * **** *
101871 CTTTACCGAA-CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATATGAAATTGCCATAA
320 ATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
** ** * * * *
101935 CCTTTTGTTTTGTCACCAAA-TGATTTTTTCTATTCATACATGCTTACTTT-GAATAAAATACTA
384 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTT-TGTTCATA-AAGCTTA-TTTCAAATAAAATAATA
* * * * * * *
101998 C-AATTTATTAATA-CCAAGACAATTAATAGGTAAATGATTTACAAAATAAATTTGTTTA-CTGA
446 CTAATTTATTAATATTCAA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AA
* ** * * * *
102060 ACAAGTTCAAATCCTCATGA-TATTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTCTATTT
509 ATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTT-TATTT
* * * * * *
102123 TGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCTTACAAGTTTATTCAG-ATTATAATAATACTAATTTATAA
572 TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
102187 ATATTTCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTATGTTTACCGAACAAGTTCAAAT
637 ATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTTAAAT
* *
102251 AGTCTTGACTATTTG
700 AGTCATGACCATTTG
* * * *
102266 AATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTG-TTTCAGTTCA
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCA-TTC-
* * * * * * * *
102330 TATAAACTTATTTGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATA-TTCTAAAATTAATGAGTAAGAGA
62 -ATCAAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGA-T
* * * *
102394 ATT-AAAAAATTAATTTGTTTATCAAAC-ATTTTCAAATAGTTATGACTA--T----AA--A-C-
121 ATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *
102447 A-TT---AT-G-----ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTCATGCAAGCTTAT
185 ATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-
* * * *
102501 TTC-AAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-TTCCAAAAATTAATAAGTAAA-A-TTTTAAAAAA
248 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * * *
102562 TAAATATGTTTTCTGAA-CACATTCAAATCGTTACGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-
313 TAAATCTATTTACTGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *
102625 AGTTATGACCTTTCGTTTTATCATAAAGC-AATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTA-TTCGGAATA
377 A-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCAT-AAAGCTTATTTC-AAATA
* * *
102688 AAATAATACTAATTTATTAAATTTTC-AAAAATTAATAAATAAAAGATTTCAAAAAATAAATCTA
438 AAATAATACTAATTTATT-AATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTG
* * * * * ** * *
102752 TTTA-CTAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAT
501 TTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAAC
* * * * * *
102816 CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTACTCATACAATTTTATTC-GAAAGAAAATAATACT
563 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
102880 AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCGAATA
628 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACA
* *
102944 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAG
691 AGTTTAAATAGTCATGACCATTT--G
* * * ** * * * * *
102970 CT-ATTATTTATATGAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATT-ATTTCTATTTA
1 -TAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCA
* * * * *
103032 TACAAAATTATT-TAGAATAAAGT-ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT
63 T-C-AAGTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGATATTA
* * * * * *
103095 AAAAACTAAATCTAT-TTTATCAAACTAGTTCAATTAATTATGACTATTTCAACAATTATCTATC
125 AAAAAATAAA--TATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * *
103159 TCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTC-
188 TCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
103221 AAAGTAAAATATTA-TGAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATA
252 GAA-TAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTT--AAAA-A
* * * * ** ** * * * *
103284 ATAATTATCTATTT--TAAATCATTTGACCT--TT-TGTTTAGTTGTAA-AATAAT-TTTTTCAG
312 ATAA--ATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAA
* * * * *** ** * ** * * * *
103342 TTAATAAATG-CTTATTTGAAAT-AAATTAATAA-TAATTTATTATCATTCAGAAA-TTTAATTA
374 ATCAT-TATGACCT-TTTGTTTTGTCA-TAA-AACAAATTT-TT-TTGTTCATAAAGCTTATTTC
* * * * * * * ** *
103403 ACAAGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTT--TA-TCAAACAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTG
433 A-AATAAA--AT-AATACT-AATTTATTAATATTCAAA-AAATT-AATA-AG-TA-AAAGATTTA
* * * * * * ** ** * * * *
103464 AACAAT-TATCTATTAAT--AAGAAGTATGACCT--TT-TGTTTAATCATAAAATGAT-TGTTTC
488 AAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGT-TCAAATAGTTATGACT-AT-TTACAATTATCTATTTC
* ** * * * * ** * * * * *
103522 -AGTTCATAAAAGC--ATA-TTCGAAATAAAATAA-TATTGCT-TT-AT-TAA-TAT-TTC---A
550 AAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAA
* * * * * * *
103574 A-AAATTAA-A--AAGTTA--AA-AGTTT-AAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCACTTCAAATA
615 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAA-TAAG--TA--AAA-GA-TTTAAAAA
* * * * * * * * *
103631 ATTATTTAGTTTATCAAATC-ACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAA
672 ATAAATT-GTTTACCAAA-CAAGTTTAAATAGTCATGACCATTT--G
* * * ** * *
103677 CAATTATCTATTTGAAGTCATTACAAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCAT
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTG-TTTTCATTCAT
* * * *
103741 ACAAGCTTATTCGAAACAAACTAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
64 -CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGATAT
* * * * ** *
103806 TTAAAATATAAATTTATTT-----ACT-G---AACCAGTT-T--CTATTTGAATAATTATCTATT
123 TAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
103859 TCAAATCATTATAACATTTTGTTATGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGG
188 TCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGG
* ** **
103924 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAA-CCAAGAGACGTAAAAAATAAAT
253 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * * * * * **
103988 CTA--TGCCAAAGCAGTTTAAACAATTAAGACTATATAAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTAT
318 CTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTAT
* * * * * **
104051 G-CCTTTTGTTTGGTCATATAAC-AATTGTTTTTGATCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAAT
382 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCA-TAAAGCTTATTTCAAATAAAATAAT
* * *
104114 ACTAATTTATAAATCATTC-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGA
445 ACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCA
* * * ** * *
104174 ACTAA-TTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACCTTTTATT
508 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATT
* * * * * * * *
104236 CTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTAGTCAG-AATAAAATAATACTAATCTAAT
571 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * ** ** *
104300 AATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACCGGTTCAAAT
636 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACAAGTTTAAAT
* * * * *
104365 ATTTAAGACTATATG
700 AGTCATGACCATTTG
* * * * *
104380 AACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTTTTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATT
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTTTTTTGTAATAAAACAA-TTGTTTTC-ATT
* * * * *
104445 CATACTAACTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAACTTATTAATATCTT-AAAAATTAATAAGTAA
61 CAT-C-AAGTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TTCAAAAA-T--TAA-TAA
* * * * * * * * * **
104508 GAAATT-TAAAAATAATTCTATTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATGATTAT
118 GATATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * ** *
104572 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGATTTGTCATAAACCAAATGTTTTTA-TTTATTTAAGTTT
183 CTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTT
* * * * * * *
104636 GTTTGGAATAAAGTAATACTAATCT-ATCAATATTTC-AAAA--AATAA-T-AAGAGATATAAAT
247 ATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAA
* ** *
104695 AATAAATCTATTTA-TCAAATGAGTTCAAATA-TTCATGACTATTTGAGA-AATTATCTATTTCA
311 AATAAATCTATTTACT-GAACCAATTCAAATAGTT-ATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
104757 AATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAAA-TAATTGTTTTCGTTCATACAAGCCTA-TTCGAG
373 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTC-AA
* * ** *
104820 TTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-ACCAA-T--TAA-T--AAG---TAAAAAATAAATA
435 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * **
104875 TGTTTA-CTAAACT-AGATCAAATAGTCATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
499 TGTTTATC-AAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATT--TACAATTATCTATTTCAAATTGTTAT
* * * * * *
104938 GACCTTTTTATTTTGTCATAAAA-AATTATTTC-ATTTCATATAAGCTTATT-TGAAAAAAAATA
560 AACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATA
* * * * * * *
105000 ACACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCA
623 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCA
* * * * *
105065 AACAAGTCTAAATAATTATGACTATTTCAA
687 AACAAGTTTAAATAGTCATGACCATTT--G
* * * ** * * * * * *
105095 CAATTATCTTTTTGAAATTTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCA
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAA-CA-ATTGTTTTC-ATTCA
* * * *
105160 TACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATCCAAATTTATTAATA--TAAAGACAATTAATAA-ATA-
63 T-CAAG-TTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGATAT
* * ** * *
105220 -AAACATTTTTTAAA-AAATCTATTTACTGAA-TAAGGTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAAT
123 TAAA-A------AAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
105281 TATTTATTTCAAACTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAATT-ATACAA
180 TATCTATTTCAAA-TCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAA
* * * * * *** * *
105344 ACTTATTC-AAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAACTAAA-AGATTT
243 GCTTATTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTT
* * * * * * * *
105407 AAGAAATAAATTTGTTT-TTCAAACAAGTTCAAATAG---T-CCTAATT----AATTATCTATTT
307 AAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *** * *
105463 TAAATCATTGTGACATTTTGCTTTGTAATAAAA-TAATTGTTTCAATTCATATAAGATTATTTGA
371 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCA
* * * * * *
105527 AAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATT
434 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * *** *
105591 TGTTTATTAAACATGTTCATATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGA
499 TGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-T-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA
** * * * * ** * **
105656 TATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-
562 CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATAC
* * * * *
105719 TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAGGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTAAAC
627 T-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAAC
* * * *
105783 ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
690 AAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * *
105808 AACAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATATATATTATTTT-ATTG
1 TA-A-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAA-ACA-ATTGTTTTCATT-
* * ** * ** * * *** ** *
105872 CAAAT-AAGCTTGTTTGTTGA-AAAACAAT--TGTTTTA-CAACAAAACAAAAGGTAATAATA-A
61 C--ATCAAG-TTATTCG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGATA
* * * *
105931 TTTGAAATAGAT-AAT-TG-TT--CAAA-TAG-CCATAATTA-TT-TGAACTGATTTGGTA-AAT
122 -TT-AAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCA-AA-TAGTTATG-ACT-ATTT-GAACAAT
* * * *** * * * * *
105986 TGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAA-TTTTTGAAATATTAAAAAAGTAGTATTATTTTA
180 T-ATCTA--TTTCAAA--TC---GTTA-TAACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTTA
* *** * ** * * * * * * *** * *
106050 TTTTGGATAAGCTT-TTATGAACTGAAACAAT--T-TTTTTATGACAAAACAAAAGTTCAT-A--
233 GTTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGT
* ** * ** * *
106108 ACA-ATTTTTAATAAAT-AAT-TA-TT-C--AATTAA-TCATAATTGTT-TGAACTTATTCGATA
297 AAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAATTCA-AATAGTTATG-AC-TATT---TG
* * ** ** *
106164 AACAAATTTAT-TTTTTCAAATC-TCT-TG--CTTATTAATTTT-T--TAAAAGTTAATTAATTA
356 AAC-AA-TTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTT-TT-GTTTTGTCATAAAA-CAAATTTTTTT
* * * ** * * * *
106221 G-T-ATTAA-TTTATTTCAACTAAGCTTGTATGAGCTAAAACAATTATT-TTATGGCTAAAAAA-
415 GTTCATAAAGCTTATTTCAAATAA-AAT-AAT-A-CT---A-ATTTATTAATAT-TC-AAAAAAT
* * * * * * * * * * ** *
106281 AAGATTAG-AACA-ATTTGAAATAGAAA-AT-TAT-TCTAAT-AGTCTTAACCA-TT-TGAATTG
470 TA-ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAATAAGT-TCAAATAGTTATG-ACT-
* ** * * ** *
106338 ACTTAGCAAACA-C-ATTT---ATT-TTTTAA-CTATCTTACTTTATTTTTTAAACCAA----TT
531 ATTTA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCT-T-TTA-TTT-TGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
106392 C-A-T-AT--AAGATTATTCA-AATTAATATAATACTAATTTATTAATATTT----TATT--T-A
591 CTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* ** ** ** * * * * * * * *
106444 -T--TA-ATTT-ATTAATCTATT-CATA-TAAGCTTA-TTCAAATAATTATGGCCATTTAAA
656 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAAC-AAGTTTAAATAGTCATGACCATTT--G
* * * *
106498 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATA
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTTCATTCAT-
* * * * * *
106562 CAAGCCTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATT
64 CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--A-GATATT
* ** * * *
106627 TAAAAAAT-AATCCGTTTA-C---C--GTTCCAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTT
124 AAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * **
106685 CAAATTGTTATAACTTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGTTTATTCAA
189 CAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGG
* *
106749 AATAAAATAATACT-ATTGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACT-AAGAGATTTAAAAAATAAA
253 AATAAAATAATACTAATT-TAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
106812 TTTATTTGCTGAACCAATTCAAATAGTTAAGCCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAAT-AGTTA
317 TCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA
* * ** *
106876 TGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAAATTTTCAGTTCTTAGTAA-CTTA-TTCAAAATAAAATA
381 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCATA--AAGCTTATTTC-AAATAAAATA
* * ** * * *
106939 AAACAAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAA-AAATCTATTTGTT
443 ATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC
* * * * * ** * *
107002 GAATTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTTTCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTCT
507 AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTAT
* * * ** * *
107067 TTTGTCATAAAATTAA--GTTTTTGTTCATATCAGTTTGTTCA-AAATAAAATAATATTAATTTA
570 TTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTA
* ** * * ** * ** *
107129 TTCATATTTTGAAAACTAAGAAGTAGGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CCTAAATTAGTTCA
634 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACC-AAACAAGTTTA
* * * *
107193 ATTAGTTATAACTATTTAG
697 AATAGTCATGACCATTT-G
* * ** * * * *
107212 ACAATTCT-TCATTTCAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTAT-GTTCA
1 -TAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TCATTCA
* * ** * ** * *
107275 CACAATCTTATTC-AGAATAATGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAGTAAGTAAAGG
63 -TCAA-GTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---A-T
* * * ** ** * * * * *
107339 ATT-TAAAAATGAACATGTTGGCCTGA-TCAGTGCAAATAGTTATGATTGTTTCAATAATTATCT
121 ATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * * * ** *
107402 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCACAAAGCATTTGTTTCTA-TTTGTAAAAGCTTAT
185 ATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTAT
** * * * *
107466 TCCAAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTCCTAAAATGAATAAGT-AAGAGATTTAAAAAA
249 TCGGAATAAAATAATA-CTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAA
* * ** * * * *
107529 TGAATATGCTTATTGAA-TAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC-A--AT-T-TGT----T-
313 TAAATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * *
107583 -TTAT---C---------G---TAAAATAAA-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAA
377 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATAAAA
* * * * ** * *
107631 TTATACAAATTTATTAATATTTAGACTATTAATAAGTAAAAGATATAAAAAAATAAATATGTTTA
441 TAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * **
107696 CCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTTAACAATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGATATTT
505 TCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTT-ACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATAACCTTT
* * * * * * * * *
107760 TGTTTTGTCATAAAACAACTT-TTTTTCTCCATACAAGCTTATT-TGGATTAAAATAATACTAAT
567 TATTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAAT
* ** * * * *
107823 TTCTTAATATTTTTACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAGATATGTTTACCGAACAAGTT
631 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTT
* * *
107888 CAAATAGTCATAACTATTTGAG
695 TAAATAGTCATGACCATTT--G
* ** * ** ** *
107910 TAATTATCTATTTAAAATTGTTATGATCTTTCGTTTTGTCGTAAAACAATTG-TATCAATTCAT-
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCATC
* * * *
107973 ATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTCCAAAAAATAATGAGTAAGAGAT
65 A-A-G-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT--T-AATAAGATAT
* * * *
108037 TTAAAAAATGAAACTAT-TTT-CCGAACAAGTTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTA
123 TAAAAAAAT-AAA-TATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * ** * * *
108100 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTCCAATTCAAACAAGCTTATTT
186 TTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
*
108165 GGAATAAAAT--GA-T-A--T-A-AAT-TT------ATTAAT-A-T-------TTTAAAAAATAA
251 GGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAA
** * *
108206 ATCTATTTTTTGAA-CATGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGT
316 ATCTATTTACTGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T
* * * *
108269 TATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTCTATTCATACAAGCATA-TTCAAAATAAAA
379 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTC-AAATAAAA
* * * * * * * *
108332 GAGTACTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTAC
441 TAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
** * * * * * * *
108397 CAAGCAAATTCAAATAGTTATGACTGCTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTA
506 CAAATAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATT-TACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTA
* * * *
108462 TTTTTTCATAAAATAATTATTTGC-ATTCATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTT
569 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTT
* ** **
108525 ATTAATATTAT-GAAAATTAATTGGTAGGAGATTTAAAAAATAAA-----T-----A-AA---T-
633 ATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACCAAACAAGTTTA
108574 --T-G--A--A-C-----
697 AATAGTCATGACCATTTG
* ** *
108579 -AATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCAT
1 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCAT
* * * * * *
108641 ACAAGCTTATTC-ACATTAAAATAATATTAATATATAAATATTTTGACAAATAA-TAAGTAAAAG
64 -CAAG-TTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTT--CAAA-AATTAA-TAAGAT
* ** * * * *
108704 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTACAAATAGTAATGACTATTTGAATAATTATCTA
121 ATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * * * * *
108769 TTTCAAATCATTGTGACCTATTATTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTTATATAAGCTTATTT
186 TTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * * * ** * * *
108834 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATAAATGAGT-GGGACAATTAAAAAATTA
251 GGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATAA
* * ** * * * * * *
108898 ATCTGTTTAC-CAAATATGTTCAAATAGTTATGATTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATT
316 ATCTATTTACTGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * *
108962 ATGACCTTCTATTTTGTCATAAAAC-AATTGGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATA
380 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATAAAATA
* * * * ** * * * *
109026 ATA-TAAATTTA-T-ATTTTCTGAACACATTCAAATATTTGTAATTG-TATGAACAAT-TATC--
443 ATACT-AATTTATTAATATTC--AAAAAATT--AATA--AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * * * ** * * *** *
109084 TATCTCAAAT-CGTT-ATGAT-CTTTTG--TTTTGTCATAAACCAAT-TGTTTC-TATCCATAAA
501 TTTATCAAATAAGTTCA-AATAGTTATGACTATT-T-A-CAA-TTATCTATTTCAAATTGTTATA
* ** * * * * * * *
109142 AGC--TTA-TTTGAAATAAAATAA-T-ATT-AATTTATTAAAA---T-TCCAAAAAT-TAATAAG
561 ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-TAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAA-
** * * * ** * * ** * * * * *
109196 TAAAAGATTTA-AAAAAATT-AATCCATTTAT-CG--AGCGAGCTCAAATAGTCATGACTT-TTT
624 TACTA-ATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAA-A--AATAAATTGTTT
* ** * **
109255 GAACAATTATTTA-TTTCAAAT-GATTATGATAATTTG
683 -ACCAA--A-CAAGTTT-AAATAG-TCATGACCATTTG
* * *** * ** * * *
109291 T-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACAATTTTATTTGAAAATAATACTAATT-TATT
1 TAATTATC-TATTTCAA----ATC-ATT-ATGACCTTTTTTTTTG-TAATAAAAC-AATTGT-TT
** ** * *** * ** *
109353 AAT-ATTC-T-AA-AAATT---AATAAGTTGGAGAT-TTAAAAAATAAATATGTTC---GCTGAA
56 --TCATTCATCAAGTTATTCGAAATAAAAT--A-ATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAA
* * * ** * * * * * *
109407 CAAG-T-TT-AAATAGTCATGTCCAT-TTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTG
115 TAAGATATTAAAAAAAT-AAAT--ATGTTTA-CCA--AACTAGTTCAAATAGTTATGAC----T-
* * ** * *** * *** * *
109468 TTTTGTCATAAAACAAT-TATTTC-TAT--TTAT-ACAAAATT-ATTTAAAATAAAATAATACTA
169 ATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TG
* * * ** ** *** *
109527 ATTTA-TT-A-A-TA---T-TTC--AA-AAATTAATAAGAGATTTAA-AA-ATTAAATCTATTTA
228 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTA-ATTTAATAATATTCCAAAAATTAA
* * * *
109579 TCAA--ACA-AG--TT--CAAAT-AGT-TA-TGACT--A-C--TTCAACA-A-TTAT--CTATCT
292 T-AAGTAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAATTCAA-ATAGTTATGACTAT-T
* *** * **** * ** * ** *
109625 TCAATTGTTATGACTTTTGTTTTGTCATTA--AACAATTGTTTCTATTCAT---ACAAGCTTATT
354 TGAACAATTAT--CTATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-T-GTCATAAAACAAATTTTTT
* * * * * ** * * *
109685 TG--AAGTAAA--ATATTGCTAAATTAATAAT-ATTCCAA-AAATTAATAAGT-AAGAGATTTAA
414 TGTTCA-TAAAGCTTATTTC-AAA-TAA-AATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAA-AAAATTAA
* * * * ** * * * * *
109743 AAAATAAATGTGTTTGTCAAATCAGTTCAAAT-AG-TTAT-GACT-AG-T-AGAACAATTAT--C
473 TAAGTAAA--AGATT-T-AAA--AAAT-AAATCTGTTTATCAAATAAGTTCA-AATAGTTATGAC
* * ** *** * * *** *
109800 TATTTTA-AATCAT-TCTGACCTTTTGTT-T-A---GTCA-TAAA--AT-----AATT-TTTTTA
530 TA-TTTACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
** * * * * *
109849 GTTTGTACATGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAA
594 -TTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * *
109912 CAAGAA-ATTTAAAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
657 TAA-AAGATTT---AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
** * * * * ** *
109974 AATAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTTATTTTATCATAAAATGATTGTTTT-GTTCA
1 --TAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCA
* * * * *
110037 TAAAAGCTTATGT-AAAATAAAATAATATTACTTTATTAGTATTTCAAAAATTGAA-AAGATAAA
63 T-CAAG-TTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGAT---
* * * * * * * * * * *
110100 GATTTAAAAAACAAGTCA-GTTTA-TAGAA-TCGCTTCAAATAATTATGGCCATTTAAATATTTA
121 -ATTAAAAAAATAAAT-ATGTTTACCA-AACTAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *** *
110162 TCTATTTTAAACCGTTACGAACTTTTAT-TTTT-TTATAAAACAATTATTTTTCATCATAAAAGC
182 TCTATTTCAAATCGTTA-TAACTTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGC
* ** * * **
110225 CTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAGC
245 TTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAA
* * * *
110289 AAATAAATCTATTTA-T----CAA-AC-CA-A-TT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTTAAC
310 AAATAAATCTATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * ** * **
110342 TCATTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAA-TAATTGTTTCAGTTCATATAACCTTATTTGGAATA
375 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATA
* * * * *
110406 AAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTGATAATTAAGAGATTTTGAAAAATAAATCTG
438 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTG
** * * *** * * * **
110470 TTTGCCAAA-ACAGTTCAAATACTTAAGACTAACGAACAATTATCTATTTATAAAATATTATGGC
501 TTTATCAAATA-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTACAATTATCTATTT-CAAATTGTTATAAC
* * * * * * **
110534 CTTTTGTTTGGTCATATAAC-ATTTTTTTTGA-TCATTCAAA-CCTATTCA-AAATAAAATAATA
563 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCA-TAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATA
* *
110595 CTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-
626 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAAC
* * *
110659 ATAGTTTAAATA--AATAACTATTTG
690 A-AGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * ** * * * * * * * *
110683 AACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAATCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTC-TTCA
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATT-GTTTTCATTCA
* * * *
110747 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTTAGAGA
63 T-CAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A---AGA-T
* * * **** * * * *
110812 ATT-AAAAAACAAATTTATTTGTTGAACTAGTTCAAATATTTAAGATTATATGAACAATTATCTA
121 ATTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
110876 TTTGAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTATTTTCGAATTCATACTAGCTTA
186 TTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTT--AGTTCATACAAGCTTA
** * * *
110941 TTTAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAGATTTAAAAA
248 TTCGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * *
111004 ATAATTCTGTTTACCT-AACTAGTTAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCACAT
312 ATAAATCTATTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * **
111068 -AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAA
376 CA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAATAA
* * * *
111131 AGTAATACTAATATGTTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATT
439 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * ** *
111191 TATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTGTTTCAAATAATTA-GA-CTT
503 TATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-A-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTT
* * * * * * *
111254 GTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTAATTCA-AATTAAAATAAGACTAA
566 -TTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
111318 TTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAATTAAATATGTTTACTAAACTAA-
630 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAAC-AAG
*
111382 -TTGAATAGTCATG-CCTATTTG
693 TTTAAATAGTCATGACC-ATTTG
* * * *
111403 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTCTTTTGTCAT---ATAA--G----C--T--T
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTCATTCAT
* * * * * *
111455 --A--T-TT-GAAACAAAATAATAATAAGTTATTAATATTATGAAAGGTAA-TAAGCAAGAGATT
64 CAAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA---AATTAA-TAAGATATT
* * * * ** * * * * * * * * * * *
111513 TAAAAAATGAATCTGCTTGTCGAGCAACTTTAGATAATTATGACTATTTCAATAATTTTCTTTTT
124 AAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * ** * * **
111578 GAAATTGCTACAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTTG
189 CAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCGG
* * * ** * * *
111642 AATAAAATAATA-AAACTTGATTAATA--GAAAGACAATTAATAAATAAA-ACAGTTAAAAAATA
253 AATAAAATAATACTAA-TTTAATAATATTCCAA-A-AATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAATA
* * * * * *
111703 AATATGTTTACCGAA-CAAGTTTAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-
315 AATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCA
* * * * *
111765 TTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAC
378 TTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTCATA-AAGCTTATTTCAAA-TAA
* * * * * *
111828 AAGAATACTAATTTATTAATATTTC-GACACTTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATGTT
439 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* ** ** * ** * * * * * *
111892 TTTTTAGCAAGTGCAAATAGTCCTGACTATTTCAATAATTATTTATTTTAAATCAG-TGTGACCT
503 TATCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--ACAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATAACCT
* * * * *
111956 TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TGAATTCATAGAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACT
565 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT--ATTCATAAAAGTTTATTCAGAAATAAAATAATACT
* * * * * * ***
112019 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTGATAGAATTAAAAAAATAAATCTATTTATTGAACA
628 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACA
* * * * *
112084 TGTTTAAATAATTATGACTATCTG
691 AGTTTAAATAGTCATGACCATTTG
* * * * * * * * *
112108 AATAATTATCTATATCAAAACATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-GTTCTGTTCA
1 --TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTC-ATTCA
* *
112172 TGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAAA
63 T-CAAG-TTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AT
* ** *
112235 ATTTAAAAAATAAATATGCTTT-TGAACAC-A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
121 ATTAAAAAAATAAATATG-TTTACCAA-ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * *
112297 TATTTTAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTG-TTTATGCTCATAAAAGCTTA
184 TATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTA
* * * * * *
112361 TTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAA
248 TTCGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAGAGATTTAAAAAA
* ** * * * *
112425 TAAATCTATTTAC-CAAGTAAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATTTATTTCAAATT
313 TAAATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
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* * * * * * * * * **
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* *** * * * * *
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** * * *
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* **
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * *
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311 AATAAATCTATTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-A
* * * **** * *
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* * ** * * * * *
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** ** * * * * * * ** * *
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* * * * * * * ** * * *
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* * * * *
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** *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * ** * * * * * *** *
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312 ATAAATC-TATTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * *** * **
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376 CATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTT-TTTGTTCA-TAAAGCTTATTTCAAATA
* * *
113980 AAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAGATAAATCTAT
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* * * ** * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
114172 ATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAG
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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Statistics
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* * * * *
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* *
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* * **
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* * * **
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100447 ACCTTTTATTTAGTCATAAAA-TATTTTTTTCATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATC
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* * * * * * * * **
100573 CGAA-CAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATG
119 -TAATCCA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * *
100630 ACCATTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAAT-A-A-
* * * * * ** *
100695 TAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAATA-AATTTGTTTATCGAA-CA
62 TGATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTAATTTAT-TAATC-
* * * * * **
100757 AATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG
124 CATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* **
100808 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTG-TTTGAATTCATTCAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAAT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTG--TTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAT
* ** **
100871 ACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAA
63 ---GATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTAATTTA-TTAA
* * * * * * ** *
100932 T-TAGTTTAAATAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATT
122 TCCA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * * * *
100985 ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAC
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAAT-A-A-
* * **
101050 TAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT-ATTTACCGAA
62 TGATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAAT-AAT-TAATTTA-TTAA
* * * * * * * * * *
101114 -CTAATTTAAATAGTTAT-ACGATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATA
122 TC-CATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * * *
101166 ACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTTATATAAA-CTTATTCAAAATAAAATAAT-
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATG
** * * ** * *
101229 ACTAATATAAAAATATTTCAAAAATTAATTACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA
64 A-T--T-TATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTAATTTATTAAT
* * * * * *
101294 CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA---TCAT-
123 CCA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
* * ** ***
101343 ---TTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCACTTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAA
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--GTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAAT--AA
* * * ** *
101404 TGAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTACAAAATAATTTTGTTTACCTAAT
62 TG-ATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TTAATTTA-TTAAT
* * * * **** *
101469 -CAGTTCAAAAAATTATGATTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATCACCACG
123 CCA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
*
101521 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT
1 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
101552 TATTCATATA
Statistics
Matches: 2511, Mismatches: 508, Indels: 440
0.73 0.15 0.13
Matches are distributed among these distances:
157 1 0.00
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159 1 0.00
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189 5 0.00
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Consensus pattern (174 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGAT
TTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTAATTTATTAATCCATTCAA
ATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
Found at i:99666 original size:540 final size:524
Alignment explanation
Indices: 98204--101544 Score: 1341
Period size: 540 Copynumber: 6.3 Consensus size: 524
98194 TAGTAATCAA
** * ** * * * *
98204 TAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAATTTGAATTTGTTTGCTAAACCTA-TTGAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTAAA-CTAGTTCAA
* * * * * * * * * * *
98268 ATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTTTTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAA
65 ATAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTCTCATAAAA
* * * * * *
98333 TAGTT--TTTTCAATTTATACTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCA
130 CAATTGCTTTTCAA--TATA--ATCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCA
* * * * * * * *
98395 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTATATTTACCTAATCC-ATTCTAATAATTATG
190 AGAATTAATAAG--A-A-ATTAAAAAAATAAATTA-ATTGATCGAA-CCAATTCAAATAGTTAAG
* * * * * * *
98458 ATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTA-AGACCTTTGGTTT-TGTCATAAAACAAATAT
249 ACTATATGAACAATTATTTATTT--CA-C-TTATA-ACCTTT--TTTATATCATAAAACAATTGT
* * * * * *
98521 TTTTTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATTAATATTCCAAAAATT-A-AT
307 TTTATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAT
** * * **
98584 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTATTAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTA
372 AAGAGATTTAAAAAATAAATCATTTACTAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATACGAAAAATTA
*
98649 TCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA
437 TCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTTAGTTAATAAAAGCTTA
* *
98714 TCCAAAATAAAATAATGTTGTAT
502 TCCAAAATAAAATAATCTAGTAT
* * * * **
98737 TAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATTGATTTAGTTCAAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTAAACTAGTTCAAA
* * ** *
98802 TAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAAC
66 TAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTCTCATAAAAC
* *
98867 AATTGCTTTTCAATATAGAATCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAGAA
131 AATTGCTTTTCAATAT--AATCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGAA
* * * * * *
98932 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTGAA
194 TTAATAAGAAATTAAAAAAATAAATTAATTGATCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAA
* * * *
98997 CAATTCTTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTTTATATCATAAAACAATTGTTTCTATTTACATA
259 CAATTATTTATTTC--A--CTTATAACCTTTTTTATATCATAAAACAATTGTTT-TATTCATATA
* * * * *
99062 AGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATAAATAACTAAAAGATTT
319 AGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAAT-A-TAAGAGATTT
* * * * * *
99126 AAAAAATAAATCCATTTGCTAAACTAGTTTAATTAGTTAAGACTATACGAATAATTATTTATTTC
381 AAAAAATAAAT-CATTTACTAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATACGAAAAATTATCTATTTC
* * * * *
99191 AAATTGTTATG-GCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAA
445 AAATTGTTATGAG-CTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTG-TTTTAGTTAATAAAAGCTTATCCAA
99255 AATAAAATAATACTAAGTTAT
507 AATAAAATAAT-CT-AG-TAT
* * * * *
99276 TAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCT-GTTTACTAAACTATTTTA
1 TAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACTAAACTAGTTCA
* * * * * * * *
99340 AATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAACTTATTGTTTTGTCATCA
64 AATAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTAACTT-TTGTTTTCTCATAA
*
99404 AACAATTGGTCTTGTTC-ATACT-ATTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
128 AACAATT-G-CTT-TTCAATA-TAATCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
* *
99466 CAA-AACCTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTGGT-GAACCAGTTCAAATAGTT
188 CAAGAA--T--TAA-TAAG-AAATTAAAAAAATAAAT-TAATTGATCGAACCAATTCAAATAGTT
** * * * **
99529 AAGACTATATGAATGATTATTTA-TTC-CTTATGACCTTTTTATTTTGTTGTAAAACAATTGTTT
246 AAGACTATATGAACAATTATTTATTTCACTTATAACC-TTTT-TTATATCATAAAACAATTGTTT
* * * *
99592 TATTCATACAAGCTTATTTTGATTAAAACAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATGAGT
309 TATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-T
* * * * *
99657 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAAC-AAATCAGTTTAAACAGTTAAGATTATTA--AAACA
372 AAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTT-ACTAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTA-TACGAAA-A
* ** * * * * *
99719 ATTATCTATTTGAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTAGTCATAAA-ATAGTTATTTCAGTTCATAC
433 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGC-TTTTGTTTTGTCATAAACA-A-TTGTTTTAGTTAATAA
*
99782 AAGC---T------T---AT--T-TAG-AA
495 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATCTAGTAT
* * ** *
99796 TAA-A--T-AAATATTAATAAG-AATAGATTTAGAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGTTCA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAAT-TAGTTTACTAAACTAGTTCA
* * * * * * * * * * * * *
99855 AATAGTTATTACTATATGAATAATTGTCAATTTAAAATCGTTA-TAACGTTTTGATTTGTCATAA
64 AATAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTAAC-TTTTGTTTTCTCATAA
* * * * * * *
99919 AACATTTG--TTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-CT
128 AACAATTGCTTTTCAA-T-AT--AATCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT
* * * * * * ** * * *
99980 CACTAAAATAATAAGTATGAAACTT-AAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTA
188 CA--AGAAT--TAA-TAAGAAA-TTAAAAAAATAAATTAATTGATCGAACCAATTCAAATAGTTA
* * ** * * * * *
100044 TAG-CCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
247 -AGACTATATGAACAATTATTTATTTC--A-C-TTATAACCTTTT-TTATATCATAAAACAATTG
* ** * ** *
100108 TTTTTTATCATCCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
306 TTTTAT-TCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
* * * *
100173 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACT-GACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTACTA
370 -A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCA--TTTACTAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTA-TAC--
* * * * * * *
100236 TTTGAACAATTAT-TAATCTT-AAATCGTTAAGATC-TATGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTT
428 ---GAAAAATTATCT-AT-TTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTA
* * * ***** *
100298 GATCATAGAAA-CCTAT-TTGGTTAAAAATAATACTGATTTAAT
487 GTTAATA-AAAGCTTATCCAAAAT-AAAATAAT-CT-A-GT-AT
* * * * * * * *
100340 T-ATATTTCAAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTT-GTCGATCCAATTGA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACT-AAACTAGTTCA
* ** * * * * * * **
100402 AATAGTTAAAACTA-TTAGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTT-TTGACCTTTTATTTAGTCATA
64 AATAATTATGACCATTTA-AACAACTATCTATTTCAAATCATTATT-AACTTTTGTTTTCTCATA
* * * * * * *
100465 AAA-TATT-TTTTTCATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTT-ATTATCAT
127 AAACAATTGCTTTTCA-A---TATAATCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTAATAAT-A-
* * * * *
100526 TTTAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAA-CAAGTTCAAATA
185 TTTCAAGAATTAATAA-G-AA--A-TTAAAAAAATAAAT-TAATTGATCGAACCAA-TTCAAATA
* * * * * *
100589 GTGATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTT-TGA-CATAAAAC
243 GTTAAGACTATATGAACAATTATTTATTT--CA-C-TTATAACC-TTT-TTTAT-ATCATAAAAC
* **** * ** *
100652 AATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAA
301 AATTGTTTTA-TTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAA
* ** * * *
100717 TTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTA-TCGAACAAATTCAAATAGTTATA-ACTA
365 TTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTACT-AAACCAATTTAAATAGTTA-AGACTA
** * * ** * * * *
100777 TTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTGAAT
425 TACGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGT
* ** * * *
100842 TCATTCAAGCTTAGT-TAAAATAAAATAATACAAATTTAT
489 TAATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAAT-C-TA-GTAT
* * * * *
100881 TAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAATTAGTTTAAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTAAACTAGTTCAAA
* * * * * ** *
100942 TAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAAC
66 TAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTCTCATAAAAC
** * * * * *
101007 AATTG-TTTTTTATCATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAA
131 AATTGCTTTTCAAT-ATA-AT-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGA
* * * * * *
101071 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT-ATTTACCGAACTAATTTAAATAGTT-ATACG
193 ATTAATAAG--A-A-A-TTAAAAAAATAAAT-TAATTGATCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACT
* * * * * * * *
101134 ATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTG
252 ATATGAACAATTATTTATTTC--A--CTTATAACCTTTT-TTATATCATAAAACAATT-GTTTTA
* * *** * * *
101199 TTTATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTTCAAAAATTAATTACTAA
311 TTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA-TA-TAA
** * * * * *
101264 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTAT
374 GAGATTTAAAAAATAAA-TCATTTACTAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATACGAAAAATTAT
* * * * **
101329 CTATTTCAAA---TCAT----TTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCACTTCATACTAGCTT
438 CTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTTT-AGTTAATAAAAGCTT
**** ** * *
101386 ATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTGT
501 ATCCAAAATAAAAT--AATCTA-GTAT
* * * * *
101413 TAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTACAAAATAATTTTGTTTACCTAATC-AGTTCAA
1 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTA-CTAAACTAGTTCAA
* ** * * * ** ** * *
101477 AAAATTATGATTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATCACCACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
65 ATAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTCTCATAAAA
101542 CAA
130 CAA
101545 ATGTTTTTAT
Statistics
Matches: 2202, Mismatches: 414, Indels: 381
0.73 0.14 0.13
Matches are distributed among these distances:
510 3 0.00
511 2 0.00
512 2 0.00
513 5 0.00
514 57 0.03
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516 5 0.00
517 3 0.00
518 1 0.00
519 52 0.02
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527 6 0.00
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531 5 0.00
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551 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (524 bp):
TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACTAAACTAGTTCAAA
TAATTATGACCATTTAAACAACTATCTATTTCAAATCATTATTAACTTTTGTTTTCTCATAAAAC
AATTGCTTTTCAATATAATCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAGAATT
AATAAGAAATTAAAAAAATAAATTAATTGATCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAACA
ATTATTTATTTCACTTATAACCTTTTTTATATCATAAAACAATTGTTTTATTCATATAAGCTTAT
TTGGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATAAGAGATTTAAAAAATAAA
TCATTTACTAAACCAATTTAAATAGTTAAGACTATACGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
AGCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTTAGTTAATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATCTA
GTAT
Found at i:99812 original size:176 final size:181
Alignment explanation
Indices: 97703--99799 Score: 1435
Period size: 181 Copynumber: 11.6 Consensus size: 181
97693 AGTTTTACCG
* * * * * * *
97703 AACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAACAATTATCTATATCAAATTGTTTTGACCATTTGTT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
97768 TAGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATT
66 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * *
97832 AA-AATTCAAAATATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATTAATTATTTTTATCA
130 AATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTAGCA
* * * * * * * * * *
97885 AACAAGCTTAAATAGATATGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTATCTTTTATT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * *** * * * * *
97950 TAGTCATATAACAATTGTTTTTTTATCATACAAGGTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATTGATT
66 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * *
98015 AATCTTTCAAAATTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTG
130 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGC-A
* * * * * * * *
98067 AATCAATTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAAAAAATA
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-----GTT-----AT-
* * * * * *
98131 AACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTT-ATGTTCATGCAAGCTTATT-TGAAATAAAATAA
55 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA
* * ** * ** * *
98194 TAGTAA-TCAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAATTTGAATTTGTTT-GCTA
118 TACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGC-A
* * * * *
98257 AACCTA-TTGAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTTTTTCAAATCATTATGACCTTTTCT
1 AACC-AGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
98321 TTTGTCATAAAATAGTTTTTTCAATTTATACTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTAT
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTAA
*
98385 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTATATTTACCTA
129 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTAGC-A
* * * * * * *
98439 ATCCA-TTCT-AATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTAAGACCTTTGGT
1 AACCAGTT-TAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * ** * * * ** * * *
98502 TTTGTCATAAAACAAATATTT-TTTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATCTATT
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAAT
* **
98566 AATATTCCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTATTA
130 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGCA
* * * * *
98613 AACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAGCTTTTGTT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
98678 TTGTCAT-AAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT-GT--TGTATTA
66 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATA
* * ***
98739 ATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAGTTAGTTTATTG
131 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTAGCA
*** * * * * * * * * * *
98790 ATTTAGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * *
98855 TTCTCATAAAACAATTGCTTTTCA-AT-ATAGAATCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTA
66 TTGTCATAAAACAATTG--TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
98917 CTAATATTTTAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCG
128 ATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGCA
* * * * * * *
98967 AACCAATTCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
99031 ATATCATAAAACAATTGTTTCTATTTACAT--AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTAG
66 TTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTT-CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAA
* * * **
99094 TAATA-TTCTAAAAATAAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCCATTT-GCTA
129 TAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGC-A
* * ** * * * *
99147 AACTAGTTTAATTAGTTAAGACTATACGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGGCCTTTTGTT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
** * * * * * * *
99212 TTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATT
66 TTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAAT
* * * * *
99277 AATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTA-CTA
130 AATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGC-A
* * ** * * *
99330 AACTATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACTTATTGT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-TTGT
* * **
99394 TTTGTCATCAAACAATTGGTCTT--GTTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
65 TTTGTCATAAAACAATT-GT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA
** * * * * * * **
99457 ATAATATTTCAAAACCTAATAACTAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTGGTG
128 ATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGCA
* * * * * *
99512 AACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATG---AATGAT-TATTT--ATTCCTTATGACCTTTTTAT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGT
** * ** * * *
99571 TTTGTTGTAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTTGATTAAAACAATGCTAATTTAAT
65 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAAT
* *
99635 AATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAACA
130 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGCA
* * * ** * * *
99687 AATCAGTTTAAACAGTTAAGATTATTAAAACAATTATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTTGTT
1 AACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * *
99752 TAGTCATAAAATAGTTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAA
66 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAA
99800 TAAATATTAA
Statistics
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TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATA
ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAGCA
Found at i:100144 original size:181 final size:181
Alignment explanation
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99795 ATAAATAAAT
* * * *
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* * * * * * * * * * *
99868 ATATGAATAATTGTCAATTTAAAATCGTTATAACGTTTTGATTTGTCATAAAACATTTGTTTCAA
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT--T
** ** * *
99933 TTA--ATACAAGCTTAGATGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCACTAAA
127 TTATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAA
* * * * * * * *
99987 A-TAATAAGTATGAAACTTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTATAGCCAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTAAAATAGTTATAGCTAT
** *
100051 TTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTAT
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* * *
100116 CATCCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAA
131 CATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * *
100167 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTG-ACCAGTTCAAATAGTTATGACTA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACTAGTTAAAATAG-T-T-A-TA
* * * * *
100230 TTACTATTTGAACAATTAT-TAATCTT-AAATCGTTAAGATC-TATGTTTTGTCATAAAACAATT
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* * * * * *** *
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122 GTTTTTTATCATACAAGCTTATTTAAAAT-AAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTAAAATAGTTATAGCTAT
* * * * * * *
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* ** *
100480 ATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CTAAATTTATT-ATCATTTTAAAAA
129 ATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT-A-TTTCAAAA
* * * *
100534 ATTAATAAGGAA-ATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTGAT-GAC
1 ATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTAAAATAGTTATAG-C
* * * * *
100597 TATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTA
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* * ** * *
100662 GT-TCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAA
127 TTATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTAAAATAGTTATAGCTAT
* * **
100778 TTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTG-TTTGAAT
66 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTA-
* * *
100842 TCATTCAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAA
130 TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * * *
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1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTAAAATAGTTATAGCTAT
* * * * *
100955 TTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTAT
66 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTAT
* * * * *
101020 CATATATGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAA
131 CATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
101071 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAATTTAAATAGTTATA-CGA
1 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTAAAATAGTTATAGCTA
* * * * * * * *
101135 TTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGT
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* * * * * **
101200 -TTATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTTCAAAA
129 ATCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
101252 ATTAATTACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACTAGTTAAAATAGTTATAG-CT
* * *
101315 ATATGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTATTTTGTCATAAAACAA-T-TTTTTC
64 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTT
* ** * *
101371 ACTTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTGTTAATATTTCAAAA
129 A--TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
101426 ATTAATATGTAAGAGATTTACAAAATAATTTTGTTTACCTAA-TCAGTTCAAAA-AATTAT-GAT
1 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACT-AGTT-AAAATAGTTATAG-C
* ** * *
101488 TATTTGAACAATTATCGATTTCAAATCACCACGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG-TTTT
63 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
101552 TATTCATATACGTTTGTTTAGAATAAAATAATACT
128 TA-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT
101587 TATCTAACAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
172 5 0.00
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176 1 0.00
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Consensus pattern (181 bp):
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CATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
Found at i:101513 original size:355 final size:350
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Indices: 99954--101544 Score: 1043
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99944 TTAGATGGAT
* * * * *
99954 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCACTAAAA-TAATAAGTATGAAACTTAAAAAATAAATC
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* ** ** * * * * ** *
100017 AGTTTATTGAATTAGTTAAAATAATTATAGCCATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGA
63 TGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * * ** * * * * *
100082 CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATCCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAT
127 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTGAAT-TCATTCAAACTTAGTTAAAATAAAATAATAC
* * ** * * *
100146 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GACC
191 AAATATAAAAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACT
* *
100210 AGTTCAAATAGTTATGACTATTACTATTTGAACAATTAT-TAATCTT-AAATCGTTAAGATCTAT
252 AGTTCAAATAGTTATG------ACTATTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATCATT---AT-TTT
* * *** * * * ****
100273 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGATCATAGAAACCTATT-TGGT
305 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTACTTCATA-TAGCTTATTCAAAA
* * * *
100319 TAAAAATAATACTGATTTAATT-ATATTTCAAAAATTAATAACTAACAGATTTAAAAAATAAATG
1 T-AAAATAATACTAATTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATT
** * * * * * * * * *
100383 TGTTTGTCGATCCAATTGAAATAGTTAAAACTATTAGAAGAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGA
63 TGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTT-ATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * ** * * **
100448 CCTTTTATT-TAGTCATAAAA-TATTTTTTTCATATC-TTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
127 CCTTTTGTTCTA-TCATAAAACAATTATTTGAAT-TCATT-CAAACTTAGTTAAAATAAAATAAT
* ** * *
100510 -CTAAAT-TTATTATCATTTTAAAAAATTAATAAGGAAATGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTA-
189 AC-AAATATAAAAAT-A-TTTCAAAAATTAATAA-G--A-GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * *
100572 TCGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACAATTGTTTATTTAAAATCATTATGACCATTT
246 T-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-----TTT
* * * * *
100637 GTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAA
305 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTACTTCAT-ATAGCTTATTCAAAA
* * *
100684 TAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT-AAAATAAATTTGT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGT
* * *
100747 TTATCGAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
66 TTACCGAACAAATTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
* * * * *
100812 TTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTGAATTCATTCAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACAAAT
130 TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTGAATTCATTCAAACTTAGTTAAAATAAAATAATACAAAT
* ** * * * * *
100877 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAATTAGTTTAAA
195 ATAAAAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAA
* * * * * * *
100942 TAATTATGGCCATTTCAATAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAAC
260 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATT---TTAT-TTT-GTCATAAAAC
* *
101007 AATTGTTTT-TTATCATATATGTTTATTCAAAA
320 AATTGTTTTACT-TCATATA-GCTTATTCAAAA
* *
101039 TAAAATAATACTAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAATAAATTT
* * * * * * * *
101104 ATTTACCGAACTAATTTAAATAGTTATACGATTTGAACAATTGTATACTTCAAATTATTATAACC
64 GTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
*** * *
101169 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTTATAT-AAACTTA-TTCAAAATAAAATAATACT
129 TTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTGAATTCAT-TCAAACTTAGTT-AAAATAAAATAATACA
101232 AATATAAAAATATTTCAAAAATTAATTACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTA
192 AATATAAAAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTA
* *
101297 GTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T-TTTTATTTTGTCATAAA
253 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTTTATTTTGTCATAAA
***
101360 ACAATT-TTTTCACTTCATACTAGCTTATTTGGAA
318 ACAATTGTTTT-ACTTCATA-TAGCTTATTCAAAA
* * * *
101394 TAAAATAA-AATGAATTTGTTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTACAAAATAATTTT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAATAAATTT
* * * * * * ** **
101458 GTTTACCTAATC-AGTTCAAAAAATTATGATTATTTGAACAATTATCGATTTCAAATCACCACGA
64 GTTTACCGAA-CAAATTCAAATAGTTAT-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* *
101522 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
127 CCTTTTGTTCTATCATAAAACAA
101545 ATGTTTTTAT
Statistics
Matches: 981, Mismatches: 186, Indels: 128
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
350 1 0.00
353 4 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (350 bp):
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATTTGT
TTACCGAACAAATTCAAATAGTTATACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTT
TTGTTCTATCATAAAACAATTATTTGAATTCATTCAAACTTAGTTAAAATAAAATAATACAAATA
TAAAAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAAT
AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
TTTACTTCATATAGCTTATTCAAAA
Found at i:102356 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 101628--102442 Score: 701
Period size: 181 Copynumber: 4.5 Consensus size: 180
101618 TTATTCAGAC
* * *
101628 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAG-CAAA-ATTTAAAAAAATAAA-TT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATTT
* * * * * *
101690 GTTTACCAAACTAGATCAACTAGTCATGACTATTCGAATAAGTT-TTTATTTCAAATCATTATGA
65 GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCTTGACTATTTGAATAA-TTATTTATTTCAAATCATTATGA
* * *
101754 CCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATTATGTT-AGTTCATATC-AGCTTATTTGAAA
129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTCA-TTCATA-CAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * *
101807 TAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAAAGATTTAAAAAATGAGTCTC
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * * **** *
101872 TTTACCGAACAAGTTTAAATAAT-TATGACTATTTGAATAATTATCTATATGAAATTGCCATAAC
66 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC
** * * *
101936 CTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACATGCTTACTTTG-AA
130 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTA-TTTGAAA
* * * * * *
101988 TAAAATACTAC-AATTTATTAATA-CCAAGACAATTAATAGGTAAATGATTTACAAAATAAATTT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-ACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
* ** * * * **
102051 GTTTACTGAACAAGTTCAAATCCTCATGA-TA-TTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-
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* * * * * * *
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130 CTTT-TGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * * *
102166 TATAATAATACTAATTTATAAATATT-TCAACAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTT
*
102230 GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTGTGAC
65 GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC
* * *
102295 CTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAACTTATTTGAAA
130 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * *
102347 CAAAATAATACTAATTCATGAATATTCTAA-AATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * **
102411 TTTATCAAACATTTTCAAATAGT-TATGACTAT
66 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGACTAT
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TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG
TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCTTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC
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Found at i:102619 original size:16 final size:17
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1 CTATTTCAAATAATTAT
*
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1 CTATTTCAAATAATTAT
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Statistics
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CTATTTCAAATAATTAT
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102436 TGACTATAAA
* * *
102446 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAATAAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAA
* * * *
102511 ATAATATTAATTTATTAATTTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTT-
65 ATAATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * *
102573 TCTGAAC-ACATTCAAATCGTTACGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT
129 TCT-AACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
102625 -AGTTATGACCTTTCGTTTTATCATAAAGCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAA
1 CA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAA
* *
102689 AATAATACTAATTTATTAAATTTTCAAAAATTAATAAATAAAAGATTTCAAAAAATAAATCTATT
64 AATAATACTAATTTATT-AATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATT
* * *
102754 TA-CTAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAAT
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* * ** *
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1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATAAA
* * * * * *
102872 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTCA
65 ATAATACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * *
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* * * * ** *
102988 -AGTTATGATATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTTATACAAAATTATTTAGAATAA
1 CA-TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-AATAA
* *
103052 AGT-ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTT
64 AATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TT
* * * * *
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127 TATCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
*
103165 CATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAA-TAAA
* * * *
103229 ATATTA-TGAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATAAT-TAT
65 ATAATACT-AATTTATTAATTTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A-AATCTAT
* * * * * ** ** * * **
103292 CTATTTTAAATCATTTGACCT--TT-TGTTTAGTTGTAA-AATAAT-TTTTTCAGTT
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* * * *** ** * * * *
103344 AATAAATGCT-TATTTGAAAT-AAATTAATAATAATT-TATTATCATTCAGA-AA-TTTAATT-A
1 CAT-TATGATCT-TTTGTTTTGTCA-TAA-AACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTT-ATTCA
** ** ** ** * * *
103403 ACA-AGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAA-ATAGTTATGACTATTTGAA
59 A-ATA-AAATAAT-ACTAATTTATTAATTT-TCAAA-AA-TT-AATA-AG-TAAGA-GATTTAAA
* * * ** * ** ** * * *
103466 CAAT-TATCTA-TTA-ATAAGAAGTATGACCT--TT-TGTTTAATCATAA-AATGAT-TGTTTCA
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**
103523 GTT
176 AAT
** * * * * ** * * * *
103526 CA-TAAAAGC--AT-ATTCGAAATAAAATAA-TATTGCT-TT-AT-TAA---TATTTC-AA-AAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAA
* * * * * * * * * * * *
103578 TTAA-A--AAGTTA-AAAGTTT-AAAAAATAAGTTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAAT-TATT
65 ATAATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAA-TAAG--TA--AGA-GA-TTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
103637 TAGTTTATC-AAATCACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTGAAGT
123 TA-TTTATCTAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
** * * *
103695 CATTACAAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCTTATTCGAAACA
1 CATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATA
* * * *
103759 AACTAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAATATAAATTTATT
63 AAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
103824 TA-CTGAAC-----C----AGTT-T--CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
127 TATCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * **
103865 CATTAT-AACATTTTGTTATGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGAATAA
1 CATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAA
* * * ** **
103929 AATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACCAAGAGACGTAAAAAATAAATCTA--T
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** * * * * * * * * * *
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128 ATCTAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAATAATTATCTATTT-CAAAT
* * * * * * * **
104045 AATTATG-CCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATTCAAGCCTATTTGGAATAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAA
* *
104108 AATAATACTAATTTATAAATCATTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
64 AATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * ** *
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128 ATCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
104219 CGTTATAACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTAGTCAGAATAAA
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* * * * * * * *
104284 ATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTG
65 ATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* ** * * * *
104349 TCAAACCGGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAT
129 TCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * **
104400 CTTTATGACCTTTTTTTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAA
1 CATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTA-TTCAAA
* * * *
104464 TAAAATAA-AATGAACTTATTAATATCTT-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAATAATTC
61 TAAAATAATACT-AATTTATTAAT-T-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * *
104526 TATTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATGATTATCTATTTCAAAT
123 TATTTATCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * ** * * **
104583 CATTATGACCTTTTGATTTGTCATAAACCAAATGTTTTTATTTATTTAAGTTTGTTTGGAATAAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAAATAAA
* * * * *
104648 GTAATACTAATCTATCAATATTTC-AAAA--AATAA-TAAGAGATATAAATAATAAATCTATTTA
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*
104709 TC-AAATGAGTTCAAATA-TTCATGACTATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAAT
129 TCTAACT-AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTT-A-ATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * **
104760 TATTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTT-TCGTTCATACAAGCCTATTCGAGTTAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-AAATAA
* ** * *
104824 AATAATATTAATTTATTAATATTTCACCAA-T--TAA-T-A-AG---TAAAAAATAAATATGTTT
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* * *
104880 A-CTAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT
128 ATCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * *
104932 CATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAA-AATTATTTC-ATTTCATATAAGCTTATTTGAAAAA
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* * * * * *
104995 AAATAACACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTT
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* * * * * *
105060 TATCAAACAAG-TCTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAAT
127 TATCTAACTAGTTC-AAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
** * * * * * **
105113 TTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAAT
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA--ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAT
* * * * * * * ***
105178 AAAATAATCCAAATTTATTAA-TATAAAGACAATTAATAAATAAAACATTTTTTAAA-AAATCTA
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* * * *
105241 TTTA-CTGAA-TAAGGTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAACT
125 TTTATCT-AACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAA-T
* *
105296 C-TTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAATT-ATACAAACTTATTCAAATTA
1 CATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAA-TA
* * ** * * * * * *
105358 CAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAACTAAAAGATTTAAGAAATAAATTTGTT
63 AAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * *
105423 TTTCAAACAAGTTCAAATAG---T-CCTA---ATTAATTATCTATTTTAAAT
127 TATCTAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
105468 CATTGTGA-CATTTTGCTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGATTATTTGAAAT-A
1 CATTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAA
* * * * * *
105531 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTT
64 AATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * *
105596 AT-TAAAC-ATGTTCATATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAA
128 ATCT-AACTA-GTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * **
105648 CATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAA
* * * * * *
105713 ATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAGGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTT
65 ATAATACT-AATTTATTAAT-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* *
105776 -TCTAAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAAT
128 ATCT-AACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAAT
*
105828 CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
1 CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAA
105855 TATATATTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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159 3 0.00
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Consensus pattern (178 bp):
CATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC
TAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAATAATTATCTATTTCAAAT
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Alignment explanation
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Period size: 521 Copynumber: 1.9 Consensus size: 519
101924 AATTGCCATA
* ** ** * * *
101934 ACCTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACATGCTTACTTTGAATAAAATACTAC
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* * *
101999 AATTTATTAATACCAAGACAATTAATAGGTAAATGATTTACAAAATAAATTTGTTTACTGAACAA
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* * * *
102064 GTTCAAATCCTCATGATATTAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTCTATTTTGTCAT
130 GTTCAAATCCTCACGATATTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTCTATTTTATCAT
* * * * * *
102129 AAAACAATTGTTTTTATTCTTACAAGTTTATTCAGATTATAATAATACTAATTTATAAATATTTC
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* * *
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* *
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* * * *
102324 AGTTCATATAAACTTATTTGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATATTCT-AAAATTAATGAGT
390 AGCTCATACAAACTTATTCGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATATTCTAAAAATTAATAAGT
*
102388 AAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTATCAAACATTTTCAAATAGTTATGACTATAAACATTATG
455 AAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACATTTTCAAATAGTTATGACTATAAACATTATG
* *
102453 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATGCAAGCTTA-TTTCAAATAAAATAATA
1 ACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTACTTT-AAATAAAATAATA
* * *
102517 TTAATTTATTAATTTCCAA-A-AATTAATAAGTAAA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA
65 -CAATTTATTAA-TACCAAGACAATTAATAAGTAAATA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA
* * * *
102579 CACA-TTCAAATCGTTACGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTC-GTT
127 CA-AGTTCAAATCCTCACGA-TA-TTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CTTTCTATT
* * *
102642 TTATCATAAAGCAATTGTTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTA
188 TTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA-TA
* * **
102707 AAT-TTTCAA-AAATTAATAAATAAAAGATTTCAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAGTGAGTTCA
252 AATATTTCAACAAA-TAATAAATAAAAGATTT-AAAAAATAAATATATTTACCGAA-CAAGTTCA
* * *
102769 AATAGT-TATGACTCTTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAA
314 AATAGTCT-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAA
** * * *
102833 AACAATTGTTTCTA-CTCATACAATTTTATTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
378 AACAATTGTTTC-AGCTCATACAAACTTATTCGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATATTCTA
* * *
102897 AAAATTAATAAGTTAGATATTTAAAAAATAAATTTGTT
442 AAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTT
102935 CATCGAATAA
Statistics
Matches: 409, Mismatches: 58, Indels: 27
0.83 0.12 0.05
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (519 bp):
ACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTACTTTAAATAAAATAATAC
AATTTATTAATACCAAGACAATTAATAAGTAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAG
TTCAAATCCTCACGATATTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTCTATTTTATCATA
AAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATAAATATTTCA
ACAAATAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCTTGAC
TATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCA
GCTCATACAAACTTATTCGAAACAAAATAATACTAATTCATGAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
AGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACATTTTCAAATAGTTATGACTATAAACATTATG
Found at i:103641 original size:30 final size:30
Alignment explanation
Indices: 103606--103665 Score: 120
Period size: 30 Copynumber: 2.0 Consensus size: 30
103596 AAAAAATAAG
103606 TTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAATTAT
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103636 TTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAATTAT
1 TTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAATTAT
103666 GGCCATTTAA
Statistics
Matches: 30, Mismatches: 0, Indels: 0
1.00 0.00 0.00
Matches are distributed among these distances:
30 30 1.00
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Consensus pattern (30 bp):
TTAGTTTATCAAATCACTTCAAATAATTAT
Found at i:105369 original size:535 final size:531
Alignment explanation
Indices: 103670--105868 Score: 1771
Period size: 535 Copynumber: 4.1 Consensus size: 531
103660 AATTATGGCC
* * * ** * *
103670 ATTTAAACAATTATCTATTTGAAGTCATTACAAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTT
* * * *
103735 CA-TCATACAAGCTTATTCGAAA-CAAACTAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
64 AATTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT-ATAAC
* * * *
103798 TAAGAGATTTAAAATATAAATTTATTTACT-GAACCAGTTTC---TA-T-----T-T-GAATAAT
126 TAA-AGA--TAAAAAATAAATTTGTTT-CTCAAACAAG-TTCAAATAGTCAGACTATAGAATAAT
* * *
103851 TATCTATTTCAAATCATTAT-AACATTTTGTTATGTTATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAG
186 TATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAG
* * * ** **
103915 CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACCAAGAGACGTAAA
251 CTTATTTGGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
* * ** * * * * * * *
103980 AAATAAATC--TATGCCAAAGC-AGTTTAAACAATTAAGACTATATAAACAATTATCTGTTTATA
316 AAATGAATCTGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CA
* * * * *
104042 AAAAATTATG-CCTTTTGTTTGGTCATATAACAA-TTGTTTTTGA-TCATTCAAGCCTATTTGGA
379 AAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AA-AATTTTTTTTTTATTCA-TCAAGCTTATTTGGA
* * *
104104 ATAAAATAATACTAATTTATAAATCATTCAAAAAT--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
441 ATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATT-AAAAATAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * *
104166 TTTACTGAACTAA-TTCAAATATATAACT
504 TTTACT-AAATAAGTTCAAATTTATGACT
* ** * * * * * * * *
104194 ATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAA
* * * * *
104259 TTCATACAAGCTTAGTCAGAA-TAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTA
66 TTCATACAAGCTTATTCA-AATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAATT-ATAACTA
* ** * * *
104323 AGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACCGGTTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTA
128 A-AG-A-TAAAAAATAAATTTGTTTCTCAAACAAGTTCAAATA-GTCAGACTATA-GAATAATTA
* * * *
104388 TCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTTTTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTCAATTCATACTAA
188 TCTATTTCAAATCATTATGACCATTTTGTTTTGTCATAAAATAA--TTGTTTCAATTCATA-TAA
* * * * *
104453 -CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAACTTATTAATA-TCTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT
250 GCTTATTTGGAAAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * **
104515 -AAAAAT-AATTCTATTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATGATTATCTATTT
313 AAAAAATGAA-TCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
104578 CAAATCATTATGACCTTTTGATTTGTCATAAACCAAATGTTTTTATTTATT--T-AAGTTTGTTT
377 CAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AA--AAAT-TTTTTTTTTATTCATCAAGCTTATTT
* * * * * * * *
104640 GGAATAAAGTAATACTAATCTATCAATATTTCAAAA-AAT-AATAAGAGATATAAATAATAAATC
438 GGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAAAATAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATC
*
104703 TATTTA-TCAAATGAGTTCAAATATTCATGACT
502 TATTTACT-AAATAAGTTCAAAT-TT-ATGACT
* * * *
104735 ATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTTTC
1 ATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTA
* * * * *
104799 GTTCATACAAGCCTATTCGAGTTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCACCAA-T-TAA-T-A
65 ATTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAATTATAACTAA
* * *
104860 AG-TAAAAAATAAATATGTTTACT-AAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTAGAATAATTATCT
129 AGATAAAAAATAAATTTGTTT-CTCAAACAAGTTCAAATAGTCA-GACTA-TAGAATAATTATCT
* * * *
104923 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAA-AATTATTTCATTTCATATAAGCTTAT
191 ATTTCAAATCATTATGACCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTAT
* * * * *
104987 TTGAAAAAAAATAACACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATG
256 TTGGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATG
* * * ***
105052 AATCTGTTTATCAAACAAG-TCTAAATAATTATGACTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTTT
321 AATCTGTTTATCAAACAAGTTC-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACAT
* *
105116 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAA
385 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA--ATTTTTTTTT-TATTCAT-CAAGCTTATTTGGAATAAA
* * * ***
105181 ATAATCCAAATTTATTAATATAAAGACAATTAATAAATAAAACATTTTTTAAA-AAATCTATTTA
446 ATAATACAAATTTATTAATATTAA-A-AA-TAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* *
105245 CTGAATAAGGTCAAATCTTATGACT
508 CTAAATAAGTTCAAAT-TTATGACT
* *
105270 ATTTGAACAATTATTTATTTCAAACTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-T
* * * *
105334 AATT-ATACAAACTTATTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAACT
64 AATTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAATT-ATAACT
* * *
105398 AAAAGATTTAAGAAATAAATTTGTTTTTCAAACAAGTTCAAATAGTC---C--TA-ATTAATTAT
127 -AAAGA--TAAAAAATAAATTTGTTTCTCAAACAAGTTCAAATAGTCAGACTATAGAATAATTAT
* * * * *
105457 CTATTTTAAATCATTGTGA-CATTTTGCTTTGTAATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGATT
189 CTATTTCAAATCATTATGACCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTT
* * *
105521 ATTT-GAAATAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA
254 ATTTGGAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * *
105585 TGAATTTGTTTATTAAACATGTTCATATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACA
319 TGAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACA
** * ** * * *
105650 TTATGATATTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAA
384 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAT-TTTTTTTTTATTCAT-CAAGCTTATTTGGAATAAAA
* ** * * * *
105714 TAATATAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAGGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTTTC
447 TAATACAAATTTATTAATA-TT-AAAAA-TAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* *
105778 TAAACACGTTCAAATAGTTATGACT
509 TAAATAAGTTCAAAT--TTATGACT
* *
105803 ATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATATATATTATTTT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATA-ATTGTTTT
105868 A
64 A
105869 TTGCAAATAA
Statistics
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0.77 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (531 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAA
TTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAATTATAACTAAAG
ATAAAAAATAAATTTGTTTCTCAAACAAGTTCAAATAGTCAGACTATAGAATAATTATCTATTTC
AAATCATTATGACCATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGGA
AAAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
GTTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAAATTTTTTTTTTATTCATCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACAAA
TTTATTAATATTAAAAATAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAATAAGTTCA
AATTTATGACT
Found at i:105844 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 103838--105854 Score: 1499
Period size: 180 Copynumber: 11.3 Consensus size: 178
103828 GAACCAGTTT
* * * * *
103838 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTATGTTATAAAATAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * * **
103903 AATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACC
66 TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * * * * * * *
103968 AAGAGACGTAAAAAATAAATC--TATGCCAAAGCAGTTTAAACAATTAAGA
131 AA-A-AATTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * ** * * *
104017 CTATATAAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATG-CCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * *
104081 TTGA-TCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATAAATCA-TTCAAAAATTAATA
65 CT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * *
104144 AG--AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAATTCAAATA--TATAA
128 AGTAAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * * * * * * *
104192 CTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTCTGTCATAAAACAATTATTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* ** * * * *
104257 TATTCATACAAGCTTAGTCAGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACT
66 TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
104322 AAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTC-AAACCGGTTCAAATATTTAAGA
131 AA-A-AATTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
104373 CTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTTTTTTTGTCATAAAATAAGTTTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAA--TTGT
* * *
104438 TTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAACTTATTAATATCTT-AAAAATTA
63 TTCTATTCATAC-AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TTCAAAAATTA
* * * * *
104500 ATAAGTAAGAAATTTAAAAATAATTCTATTTATCTAACCAGTTCAAATAATTATGA
125 ATAAGTAA-AAATTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAACAGTTCAAATAGTTATGA
** * ** * *
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1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* ** * * * * * *
104621 TATTTATTTAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATCTATCAATATTTCAAAAAATAATAAG-
66 TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
104685 AGATA-TAAATAATAAATCTATTTATC-AAATGAGTTCAAATA-TTCATGA
131 AAAAATTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAA-CAGTTCAAATAGTT-ATGA
* * *
104733 CTATTTGAGA-AATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTTACAAAATAATTGTTT
1 CTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * **
104797 -TCGTTCATACAAGCCTA-TTCGAGTTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCACCAATTAATA
65 CT-ATTCATACAAGCTTATTTGGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * *
104860 AG-------TAAAAAATAAATATGTTTACTAAACTAGATCAAATAGTCATGA
128 AGTAAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAAC-AGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
104905 CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAA-AATTATTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * * * * *
104969 C-ATTTCATATAAGCTTATTTGAAAAAAAATAACACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAATAA
65 CTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
105033 TTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATC-AAACAAG-TCTAAATAATTATGA
129 GTAA-A-AATTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAAC-AGTTC-AAATAGTTATGA
* * * ** * * *
105086 CTATTTCAACAATTATCTTTTTGAAATTTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-A--ATTGT
* * * *
105151 TTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATCCAAATTTATTAATA--TAAAGACAATTAA
63 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAA
* *** * * * *
105214 TAAATAAAACATTTTTTAAA-AAATCTATTTACTGAATA-AGGTCAAAT-CTTATGA
126 TAAGTAAAA-A-TTAAAAAATAAATCTGTTTTCT-AA-ACAGTTCAAATAGTTATGA
* *
105268 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAACTC-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* ** * * ** *
105332 CTAATT-ATACAAACTTA-TTCAAATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATA
65 CT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * *
105395 ACTAAAAGATTTAAGAAATAAATTTGTTTT-TCAAACAAGTTCAAATAG---T-C
128 AGTAAAA-A-TTAAAAAATAAATCTGTTTTCT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
105445 CTAATT----AATTATCTATTTTAAATCATTGTGACATTTTGCTTTGTAATAAAATAATTGTTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * * *
105506 AATTCATATAAGATTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGT
66 TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *
105570 AAGAGAATTAAAAAATGAATTTGTTTAT-TAAACATGTTCATATAGTTATGA
131 AA-A-AATTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAACA-GTTCAAATAGTTATGA
* * ** *
105621 CTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * *
105686 TGTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAGG
66 TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* *
105750 TAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTATGA
130 TAAAAA-TTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAACA-GTTCAAATAGTTATGA
*
105801 CTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
105855 TATATATTAT
Statistics
Matches: 1440, Mismatches: 306, Indels: 183
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
171 3 0.00
172 185 0.13
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174 15 0.01
175 108 0.08
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
TATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
AAAAATTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAACAGTTCAAATAGTTATGA
Found at i:106175 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 105892--106318 Score: 450
Period size: 182 Copynumber: 2.3 Consensus size: 181
105882 TGTTTGTTGA
* ** * * * * *
105892 AAAACAATTGTTTTACAACAAAACAAAAGGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
1 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAA
* * *** *
105957 CCATAATTATTTGAACTGATTTGGTAAATTGATTTATTTTTT-AAATCTCTTTCTTATTAATTTT
65 CCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* ** *
106021 TGAAATA-TTAAAAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGA-TAAGCTTTTATGAACT
130 TGAAA-AGTTAAAAAAGTAGTATTAATTTA-TTTCAACTAAGCTTGTATGAACT
* * ** *
106073 GAAACAATTTTTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTTTAATAAATAATTATTCAATTAA
1 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTT-ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAA
* * *
106138 TCATAATTGTTTGAACTTATTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
65 CCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTT
* ** * *
106203 TTAAAAGTTAATTAATTAGTATTAATTTATTTCAACTAAGCTTGTATGAGCT
130 TGAAAAGTTAAAAAAGTAGTATTAATTTATTTCAACTAAGCTTGTATGAACT
* * *
106255 AAAACAATTATTTTATGGCTAAAA-AAAAGATTAGAACAATTTGAAATAGAA-AATTATTCTAAT
1 AAAACAATTATTTTATGAC-AAAACAAAAG-TTATAACAATTTGAAATA-AATAATTATTCAAAT
106318 A
63 A
106319 GTCTTAACCA
Statistics
Matches: 201, Mismatches: 38, Indels: 13
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
180 2 0.01
181 89 0.44
182 102 0.51
183 8 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAAC
CATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT
GAAAAGTTAAAAAAGTAGTATTAATTTATTTCAACTAAGCTTGTATGAACT
Found at i:106706 original size:174 final size:174
Alignment explanation
Indices: 106478--106810 Score: 447
Period size: 174 Copynumber: 1.9 Consensus size: 174
106468 AGCTTATTCA
* * *
106478 AATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAA
1 AATAATTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTATGTCATAAA
* * ***
106543 ACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAAAACTAATT-TAATAATATT-TCA
66 ACAATTATTTCTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAAAACT-ATTGTAATAATATTCT-A
* *
106606 AAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAATCCGTTTACCGTTCC
129 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATCCGTTTACCGTTCC
* * **
106652 AATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTAT-AACTTTTTGTTATGTCATAA
1 AATAATTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTATGTCATAA
** ** *
106716 AACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTATTGTAATAATATTCTAA
65 AACAATTATTTCTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAAAACTATTGTAATAATATTCTAA
106781 AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
130 AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA
106811 ATTTATTTGC
Statistics
Matches: 137, Mismatches: 19, Indels: 6
0.85 0.12 0.04
Matches are distributed among these distances:
173 6 0.04
174 130 0.95
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ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (174 bp):
AATAATTATGACCATTTAAACAATTATATATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTATGTCATAAA
ACAATTATTTCTCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAAAACTATTGTAATAATATTCTAAA
AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATCCGTTTACCGTTCC
Found at i:107189 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 106474--108201 Score: 758
Period size: 180 Copynumber: 9.8 Consensus size: 178
106464 TATAAGCTTA
* * * * * *
106474 TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** ** *** * *
106539 TAAAACAATTGTTTT-TCATCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATT
66 TAAAACAA--GTTTTCTGTTCATACAA-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * ** * ** *
106603 TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT--AAA-AAA--TA-ATCC-GTTTACCG
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* * * * ** * * *
106648 TTCCAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTATGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *
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* * * * * * *
106777 CTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTGCTGAACCAA
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * * * *
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* * ** * * *
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* * ** *
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* * * * ** *
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64 CATAAAACAAGT-TTTCTGTTCATACAAT-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * **
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* * ** * ** * * * *
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* * * * * * ** ** *
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* * * *
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* * * * *
107606 -TCAT---ACAAG-CTTAT-TTCAAATAA--AATT----ATACAAAT---------TTATTAATA
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** * * * * * *
107650 -TTTAGACTATTAATAAGTAAAAGATATAAAAAAATAAATATGTTTACC-AAATAAG
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* * * ** **
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *** * *
107769 ATAAAACAACTTTT-TTTCTCCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTCTTAATAT
65 ATAAAACAAGTTTTCTGT-T-CATACAA-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
107833 TTTTACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAGATATGTTTACC-GAA-CAAG
127 TTTAAAAATTAAGAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATTTATTT-CCTGAATC-AG
* * ** * * ** * * *
107886 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATTGTTATGATCTTTCGTTTTGTCG
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** * ** **
107951 TAAAACAA-TTGTATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TT
66 TAAAACAAGTT-T-TCTGTTCATACA-ATTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * *
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128 TTAAAAATTAA-GAAGTAAAAGATTT-AAAAAT-AAATTTA-TTTCCTGAATC-AG
* * *
108066 TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * *** *
108131 TAAAACAA-TTGTTCCAATTCAAACAAGCTTATTTGGAATAAAATGATA-TAAATTTATTAATAT
66 TAAAACAAGTT-TT-CTGTTCATACAA-TTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
108194 TTTAAAAA
127 TTTAAAAA
108202 ATAAATCTAT
Statistics
Matches: 1194, Mismatches: 261, Indels: 191
0.73 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
152 1 0.00
153 4 0.00
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Consensus pattern (178 bp):
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Alignment explanation
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107567 ATTTGAACAA
* * * * * * *
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* * * *
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* * *
107705 TTCAAATAGTTATAACTATTTTAACAATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGATAT
128 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATTGTTATGATCT
* * * *
107758 TTTGTTTTGTCATAAAACAACTTTTTTTC-TCCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAA
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* * * *
107822 TTTCTTAATATTTTTACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAGATATGTTTACCGAACAAGT
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** *
107887 TCAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATTGTTATGATCT
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* * * * *
107939 TTCGTTTTGTCGTAAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
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** * * * *
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* ** *
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128 TTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCT
* * * * *
108119 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTCCAATTCAAACAAGCTTATTTGGAATAAAATGATA-TAAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AA
108183 TTTATTAATATTTTAA
64 TTTATTAATATTTTAA
108199 AAAATAAATC
Statistics
Matches: 367, Mismatches: 62, Indels: 24
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
179 7 0.02
180 140 0.38
181 151 0.41
182 61 0.17
183 4 0.01
184 4 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
TATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTC
AAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCT
Done.