Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168130.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_373, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
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Found at i:536 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 98--1073 Score: 788
Period size: 181 Copynumber: 5.5 Consensus size: 179
88 GACAAAAGAT
* * *
98 ATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTT-G-AAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAA
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAA-TAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAA
* * * *
161 GTTTTAGAATATTCTTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAA-ATAGTATGAAAAGGACCAAT
65 TTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTA-TATGAAAAAGA-CAAT
* * * ** * * *
225 TGTTTGATGACAAAATAAGAAGTTATAATGATTAGAAATAGATAGTTATTCAA
128 TGTTTTATGAGAAAACAA-AAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * *
278 ATAGT-AAAACTATTTGAAATGGTTTAGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAAT
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAAT
* * *
342 TTTCTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATTAACAAAGACAATT
66 TTT-TAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAA-AAAGACAATT
* * *
407 GTTTTATGAGAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAT
129 GTTTTATGAGAAAACAAAA-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *
459 GTAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTTAGCAAATAGATTTATTTTTCAAATTTCTTAATTATTAAT
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAAT
* * **
524 TTTTAGAATATTACTAAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAGGCTTATATGAACCAAA-ACAAT
66 TTTTAGAATATTA-TTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAA--AAAGACAAT
* *
587 TGTTTTATGATAGAACAAAAGCTTATAACAATTTGAAATAGAT-ATTGTTCAA
128 TGTTTTATGAGAAAACAAAAG-TTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* *
639 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-GTTATTAAT
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAAT
* **
700 TCTTA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAGGCTTCTATATTG-AAAAG-CAAT
66 TTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAC-T-TATA-TGAAAAAGACAAT
* * * * *
762 TGTTTTAGGAGAAAACAAAAGTAATAATAATTTGAAATAGATAGTTGTTTAA
128 TGTTTTATGAGAAAACAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * *
814 AT-GGC----C-A--T-AATTA-TTT-G--AATTGATTTATTTTTT-AATCTCTTA-TTA--ACT
1 ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAAT
* * * * * *
862 TTTGA-AATATTAATACAA-TAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTATA-ACAAT
66 TTTTAGAATATTATTA-AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAA--AAAGACAAT
* ** * *
924 TG-TTTATG-GCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATTGATAATTGTTCAA
128 TGTTTTATGAG-AAAACAAAA-GTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * * *
976 ATCA-TCATAACTA-TTCAAATTGGTTCGATAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTT-GCTTAT
1 AT-AGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTT-AAATTTCTTAG-TTAT
* * *
1038 TAATTTTTCGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTA
62 TAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA
1074 ATCCAAGTAA
Statistics
Matches: 649, Mismatches: 98, Indels: 97
0.77 0.12 0.11
Matches are distributed among these distances:
159 2 0.00
160 5 0.01
161 17 0.03
162 88 0.14
163 5 0.01
164 5 0.01
165 3 0.00
166 3 0.00
167 2 0.00
168 1 0.00
169 2 0.00
170 4 0.01
171 2 0.00
172 1 0.00
174 39 0.06
175 64 0.10
176 13 0.02
177 14 0.02
178 7 0.01
179 16 0.02
180 96 0.15
181 181 0.28
182 79 0.12
ACGTcount: A:0.39, C:0.07, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (179 bp):
ATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAAT
TTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTATATGAAAAAGACAATTGT
TTTATGAGAAAACAAAAGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
Found at i:1478 original size:137 final size:136
Alignment explanation
Indices: 1222--1479 Score: 297
Period size: 137 Copynumber: 1.9 Consensus size: 136
1212 TTTTACTAAG
* * * *
1222 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTTGATCAGAAATAATTAT
1 TTTTAGAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTTGAACAGAAACAATTAT
* * *
1287 TTTATGAGAAAACAACGATCATAATGATTTAAGATTGATATTTATTCAAATAGTCATAACTTGCT
66 TTTATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTGCT
1352 TTTTAA
131 TTTTAA
* * * * * *
1358 TTTTTGAAAATTAATAAAGTAGTATTA-TTTTATTTTAGATAAGTTTTTATGAACTGAAACAATT
1 TTTTAGAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTTATCTGA-ATAAGCTTGT-TGAACAGAAACAATT
* * * * *
1422 TTTTTATGATAAAACAAAAGGTC-TGATGACTTTAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
64 ATTTTATGAGAAAAC-AAAGATCATAATGA-TTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCA
1480 AATCTATTCA
Statistics
Matches: 100, Mismatches: 18, Indels: 7
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
135 8 0.08
136 32 0.32
137 50 0.50
138 10 0.10
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.12, T:0.42
Consensus pattern (136 bp):
TTTTAGAAAATTAATAAAGTAGTATTATTTTTATCTGAATAAGCTTGTTGAACAGAAACAATTAT
TTTATGAGAAAACAAAGATCATAATGATTTAAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTTGCT
TTTTAA
Found at i:2103 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 1581--5092 Score: 2247
Period size: 181 Copynumber: 19.6 Consensus size: 180
1571 ATATTGTTCT
* * * * * * *
1581 AATAGTCCTAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATACATTTATTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAAT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCTATTAAT
* * * * * *
1643 TGTTGGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTATATGAAAAAGAAACAA
66 TTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAA
** * * *
1706 TTGTTTTATGATGAAATAAAA-ATCATAA-TGATTT-AAGATAGATAATTGTTCA
128 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAA-ATAGATAATTATTCA
* * * * *
1758 CATAGTCATAACTATTTAAACTAT-TTAT-GTAAACAAATTTAGTTTTTAAAT-C-T-CTTATT-
1 AATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCTATTA
* * * * * * * * * * *
1817 ATTTTCAAAATTTTAATAGATCAATATTATTTT-GTTCTGAATAA-TTTCGCATGAACAGAAACA
64 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTT-GTATGAATAGAAACA
* * ** *
1880 ATTATTTTATTA-AAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATAATTATTCCA
127 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATT-CA
* * * * * *
1934 AATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTTGGTAAATAGATTTA-CTTTTAAATCCCTACCTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCTATTAA
* * *
1998 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAATAATT
65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
* * * * *
2063 ATTTTATGACAGAACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCA
130 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
2114 AATAGGCATAATAACTATTTAAACTTGCTCT-GTAAACAGACTTATTTTTGTAAA--C-T---TA
1 AATA-G--TCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTT-TAAATCCTTACCTA
* * * *
2172 TTAATTTTT-GAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATATGCTTGTATAAACAGAAA
61 TTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
** * *
2236 CAATTGGCTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCA
125 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * ** *
2292 AATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCTATTAA
* * ** * * *
2356 TTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTAGTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAACATAAACAA
65 -TTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * * * *
2420 TTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAA-TGATTTGAAATAAAAAATTGTTCA
128 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
** * * * *
2473 AATAGTCATAACTATTCAAACTT-TTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTTCTT-GCTCATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCCTTACCT-ATTA
* ** * * * * * *
2536 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATTAACAGATATAAT
64 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
** ** *
2601 TGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
129 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * **** * * *
2653 AATAGTTATGACTATTTGAACTTGTACCTTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTA-CTCATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACCT-ATTA
* * * * * * *
2717 ATTGTT-GAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTCTATGAACA-AAAAAA
64 ATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* *
2779 TTTGTTTT-TCGACAAAACAAAAAGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTATTCA
128 -TTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * ** * * * * * *
2833 AATAGTCATAACTATTTGAATTTATTCAGTAAATATAGTTGTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACCTATTAA
* * * * * *
2898 TTGTCT-GAATATTAATAAATTTGTATTGTTTTAATTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAT
65 TT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * * * * * * *
2962 TATTTTATGACAAAACCAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGGTAATCACTCA
129 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
* *** * * * *
3014 AATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAATAAACAAATTCAGTTTTTAAAT-C-T-CTTATTAAT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCTATTAAT
* * * * *
3076 TTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATAGGAATAGAAACAATTG
66 TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
* * * **
3141 --TTGTGACAAAAGAAAAGGTCATAA-TGGTTTGAAATAGATAATCGTTCA
131 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * ** * * ** *
3189 AACAATCAAAACTATTTGCACTGGTTAGGCCAACATATTCATTTTTTAAATTTGTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA-TCCTTACCTATTAA
* * * * * * * * *
3254 TTTTTAGAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATTCCGAATGAGATTGCA-GTAATAGAAAAAAT
65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAAT
* ** * * * * *
3318 TATTTTATGATGAAACAAATGGTCATAA-TGATTTGCAAGAAATAATTGTTCA
129 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * *
3370 AATTA-TTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAAT-C-T--CTCATTA
1 AA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCT-ATTA
* * * * *
3430 ATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACA-AA-CTTATATGAACA-AAACA
64 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
* * *
3492 TTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAA-TGATTTGAGATAGATAATTATTCA
127 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * * ** *
3546 TATAGCCTTAACTATTT-AACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGATACTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACCTATTAA
* * ** * * * * * *
3610 TTTTCATAATATTTTTATATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGTTTGTATGAACATAAATAAT
65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAAT
* * * *
3674 TGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAA-TAGTTCA
129 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTA-TTCA
** * * *
3726 AATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA-CTCATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACCT-ATTA
* *
3790 ATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTT-TAT-AAT-GAAAACA
64 ATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACA
* * * * * *
3851 ATTGTTTTATGGCAAAATAAATGTTCATAACCATTTTGAAATAGATAATTATTTA
127 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTA-TTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * ** * * * *
3906 AATTGCCATAATTATTTGAAC-TGATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTCTCA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACCTATTA
* * * *** * * ** * *
3970 ATTTTT-GAAATATTAGTAAATTAATATTATGTTATTTTGGATAAACTTTTAAAAACT-TAAACG
64 ATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACA
* * * * *
4033 ATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCA
127 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * *
4087 AATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAA-TCCTTACCTATTA
* * * *
4152 ATTTTCTA-AATGTTAATAAAATAGTATTATTTTAGTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACG
64 ATTTT-TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACA
* ** * * * * * *
4215 ATTATTTTATGATTAAATAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCT
127 ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * ** * * * *
4269 AATGGTCTTAACTATTTGAACGAGTTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACCTATTAA
* ** * * * * * * *
4334 -TTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATAGTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGGA-CGAAAACAAT
65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAG-AAACAAT
* * *
4397 TGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTTGAGATAGATAATTATTTA
129 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * *
4448 AATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTACCTATTAA
* * ** * * *
4513 TTTTT-GAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAACT-TAAACAA
65 TTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAA
* * * * * * *
4576 TTATTTTTTGACAAAACAAAAGTTCGTAA-TGTCTTTAAATAGAAAATTATTCA
128 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTAT-TTGAAATAGATAATTATTCA
** * *
4629 AATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATGTTTTTAAATCTCGTA-CTCAT
1 AATAGTCATAA-CTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATC-CTTACCT-AT
* * * * * *
4692 TCATTTTTCA-AATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTAAATAAGCTTGCATAAACT-GAAA
62 TAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAA
* * * * * **
4755 TAATTGTTTTATGACTAAAA-AGAAGGT-AAAATTATTTGAAATAGATAATTGTTTT
125 CAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
** * ** **** * * *
4810 AATAGTTTTAACTATCTGAACTAATTCAACAAAC--ACTTATTATTTTTAATCTCTTACTTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATT-TTTTAAATC-CTTACCTATTA
* * * *
4873 ATTTTTAGAAAATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAA
64 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA
* * * * * **
4937 TTTTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAACGATTTGAGATA-AGTAATTGCTCA
128 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGA-TAATTATTCA
* * * * * * * *
4989 AATAGTCATAACTATTT-AAATTGCTTTCGTGAACAAATTTAATTTTTAAAT-C-T-CTTATGAG
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCTATTAA
* * * *
5050 TTTCTAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTA-TTCTAAATAA
65 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAA
5093 TTTTTAATGA
Statistics
Matches: 2625, Mismatches: 578, Indels: 265
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 16 0.01
175 182 0.07
176 155 0.06
177 169 0.06
178 136 0.05
179 357 0.14
180 644 0.25
181 649 0.25
182 286 0.11
183 27 0.01
184 4 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTACCTATTAAT
TTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTG
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTATTCA
Found at i:2621 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 1573--5084 Score: 2540
Period size: 180 Copynumber: 19.6 Consensus size: 181
1563 ATTTCATTAT
* * * * * * *
1573 ATTGTTCTAATAGTCCTAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATACATTTATTTTTTAAA--TC-T-
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
** * * * *
1634 CTTATTAATTGTTGGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAGCTTATATGAAAA
66 CTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AAC
** * *
1698 AGAAACAATTGTTTTATGATGAAATAAAA-ATCATAATGATTT-AAGATAGATA
129 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATA
* * * * *
1750 ATTGTTCACATAGTCATAACTATTTAAACTATTTAT-GTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * * *
1811 -CTTATT-ATTTTCAAAATTTTAATAGATCAATATTATTTTGTTCTGAATAA-TTTCGCATGAAC
65 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAAC
* * * *
1873 AGAAACAATTATTTTATTA-AAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATA
129 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
1925 ATTATTCCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTTGGTAAATAGATTTA-CTTTTAAATC-CC
1 ATTGTT-CAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * ** * * *
1988 TACCTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAAT
64 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * *
2053 AGAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATA
129 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATA
* * * * *
2106 ATTGTTCAAATAGGCATAATAACTATTTAAACTTGCTCT-GTAAACAGACTTATTTTTGT-AA--
1 ATTGTTCAAATA-G--TCATAACTATTTGAAC-TGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTT-TAAATC
* * ** * *
2167 ----ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATATGCTTGTATA
61 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
** *
2228 AACAGAAACAATTGGCTTATGACAAAACAAAAGCTCATAACT-ATTTGAAATAGATA
126 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATA
* * * * *
2284 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * *
2347 ACTTATTAATTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTAGTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAA
65 ACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
2411 CATAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAAAA
128 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
** * * * *
2465 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTCAAACT-TTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTTCTTG
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* ** * * *
2529 CTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATTAACAG
66 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG
* * ** ** *
2594 ATATAATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATA
131 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * ** * * *
2645 ATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTACCT--TAAACATATTTATTTTTAAAATCTTT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGT-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * *** *
2708 TACTCATTAATTGTTGAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTCTATGAAC
64 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC
* * *
2772 A-AAAAAATTTGTTTT-TCGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATA
129 AGAAACAA-TTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
2825 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-T-TTATTCAGTAAATATAGTTGTTTTTTAAATCTTT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTT-TT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * **
2888 TACTTATTAATTGTCT-GAATATTAATAAATTTGTATTGTTTTAATTAAAATAAGCTTGTATGAA
64 TACTTATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * * *** * *
2952 TAGAAAAAATTATTTTATGACAAAACCAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGGTA
128 CAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
*** *** * * *
3006 ATCACTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TATTCAATAAACAAATTCAGTTTTTAAA--TC-T
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * *** * * *
3067 -CTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATAGGAATA
65 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * *
3131 GAAACAATTG--TTGTGACAAAAGAAAAGGTCATAATGGTTTGAAATAGATA
130 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * * ** * * * *
3181 ATCGTTCAAACAATCAAAACTATTTGCACTGGTTAGGCCAACATATTCATTTTTTAAATTTGTTA
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * ** * * * *
3246 CTTATTAATTTTTAGAATATTAATTAATTAGCATTACTTTATTCCGAATGAGATTGCA-GTAATA
66 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AACA
* * ** * * * *
3310 GAAAAAATTATTTTATGATGAAACAAATGGTCATAATGATTTGCAAGAAATA
130 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * *
3362 ATTGTTCAAATTA-TTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-T
1 ATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
3425 -C--ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAACTTATATGAACA
65 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * *
3487 -AAACATTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAATGATTTGAGATAGATA
130 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
3538 ATTATTCATATAGCCTTAACTATTT-AACTAG-TTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * * ** * * *
3601 AGATACTAATTTTCATAATATTTTTATATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTTGTATGAACA
65 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * *
3666 TAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATA
130 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* ** * * *
3718 ATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTA
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * *** * *
3783 CTCATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTT-TAT-AA-TG
66 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG
* * * * **
3845 AAAACAATTGTTTTATGGCAAAATAAATGTTCATAACCATTTTGAAATAGATA
131 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATA
* * * * * * * ** *
3898 ATTATTTAAATTGCCATAATTATTTGAACTGATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTAA
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * * * * * * ** **
3963 CTTCTCAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAATATTATGTTATTTTGGATAAACTTTTAAAAACTT
66 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG
* * * * *
4028 AAACGATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATA
131 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * *
4079 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCT
* * * * **
4143 TGCTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTAGTTCAAATAAGCTTGTATGAA
64 TACTTATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* * ** * * * *
4207 CTA-AAACGATTATTTTATGATTAAATAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATA
128 C-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * * * *
4261 ATTGTTCTAATGGTCTTAACTATTTGAAC-GAGTTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** * * * * *** *
4325 ACTTATTAA-TTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATAGTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGGAC-
65 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
* *
4388 GAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATA
130 G-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
* * * * *
4440 ATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
4504 GCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAACT
65 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACA
* * * * * * *
4569 TAAACAATTATTTTTTGACAAAACAAAAGTTCGTAATG-TCTTTAAATAGAAA
130 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATA
* ** *
4621 ATTATTCAAATAGTCA-AATCTATTTGAACT-TGTTCAGTAAATAGATTTATGTTTTTAAATCTC
1 ATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGT-TTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTC
* * * * * * * * *
4684 GTACTCATTCATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTAAATAAGCTTGCATAAA
63 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
4749 CTGAAATAATTGTTTTATGACTAAAA-AGAAGGT-AAAATTATTTGAAATAGATA
128 CAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
** ** * ** **** * *
4802 ATTGTTTTAATAGTTTTAACTATCTGAACTAATTCAACAAAC--ACTTATTATTTTTAATCTCTT
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATT-TTTTAAATCTCTT
* * *
4865 ACTTATTAATTTTTAGAAA-ATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTATGAAA
65 ACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * *
4929 AGAAACAATTTTTTTATGACAAAATAAAA-ATCATAACGATTTGAGATA-AGTA
129 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TA
* * * * * * * *
4981 ATTGCTCAAATAGTCATAACTATTTAAATTGCTTTCGTGAACAAATTTAATTTTTAAA--TC-T-
1 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * * *
5042 CTTATGAGTTTCTAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATT
66 CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
5085 CTAAATAATT
Statistics
Matches: 2639, Mismatches: 590, Indels: 213
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
173 2 0.00
174 9 0.00
175 189 0.07
176 149 0.06
177 181 0.07
178 128 0.05
179 369 0.14
180 649 0.25
181 645 0.24
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183 30 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG
AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATA
Found at i:2669 original size:361 final size:358
Alignment explanation
Indices: 1581--5084 Score: 2507
Period size: 361 Copynumber: 9.8 Consensus size: 358
1571 ATATTGTTCT
* * * * *
1581 AATAGTCCTAACTATTTGAAC-TGGTTCGATAAATACATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAATTTTTACTTATTAA
* * * *
1642 TTGTTGGAAATATT-ATAAATTAGTATTATTTTAATAT-GAATAAGCTTATATGAAAAAGAAACA
64 TT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTATATG-AACAGAAACA
* ** * * *
1705 ATTGTTTTATGATGAAATAAAAATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTGTTCACATAGTCATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * *
1769 CTATTTAAACTATTTAT-GTAAACAAATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATT-ATTTTCAAAAT
190 CTATTTGAACT-TTT-TGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * * * * * * *
1828 TTTAATAGATCAATATTATTTTGTTCTGAATAA-TTTCGCATGAACAGAAACAATTATTTTATTA
253 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* *
1892 -AAAACAAAAGGTCATAAAGATTTGAAATAAATAATTATTCCA
317 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATT-CA
* * * * * * *** *
1934 AATGGACATGACTATTTGAACTTGTTTTGGTAAATAGATTTACTTTTAAATCCCTACCTATTAAT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAATTTTTACTTATTAAT
* * *
1999 TTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTATATGAATAGAAATAATT
65 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAATT
* * *
2063 ATTTTATGACAGAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGGCATAATA
129 ATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA-G--TCATA
* * * *
2127 ACTATTTAAACTTGCTCT-GTAAACAGACTTATTTTTGT-AA------ACTTATTAATTTTTGAA
189 ACTATTTGAACTT--TTTGGTAAACAGATTTATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
* ** * * **
2184 ATATTAATAAACTAGTATTATTTTATTTCAAATATGCTTGTATAAACAGAAACAATTGGCTTATG
251 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * *
2249 ACAAAACAAAAGCTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCA
316 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
2292 AATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTTAGAAAATAGATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTAGAAAATAGATTTATTTTT-AAATTTTTACTTATTAA
* * ** *
2356 TTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTAGTTTATTTGGAATAAGCTTATATGAACATAAACAA
64 -TTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* *
2420 TTATTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAAAAAATTGTTCAAATAGTCATAAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
** * * * * * **
2485 TATTCAAACTTTTTGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATTTCTTGCTCATTAATTTTTGGAATATT
191 TATTTGAACTTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* * * * * **
2550 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATTAACAGATATAATTGTTTTATGATGAA
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAA
**
2615 ACAAAATATCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
321 ACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
2653 AATAGTTATGACTATTTGAACTTGTACCTTA-AACAT--ATTTATTTTTAAAATCTTTTACTCAT
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGT---TTAGAAAATAGATTTATTTTT-AAAT-TTTTACTTAT
* * * * * *
2715 TAATTGTTGAAATATTAATAAA-TAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTCTATGAACA-AAAAA
61 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * *
2778 ATT-TGTTTTTCGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAT
126 ATTAT-TTTAT-GACAAAAC-AAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
2842 AACTATTTGAA-TTTATTCAGTAAATATAGTTGTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT-G
188 AACTATTTGAACTTT-TT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAA
* * * ** * * *
2905 AATATTAATAAATTTGTATTGTTTTAATTAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTAT
250 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * *
2970 GACAAAACCAAAGGTTATAGCAATTTAAAATAGGTAATCACTCA
315 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * *
3014 AATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCA-ATAAACAAATTCAGTTTTTAAA--TCT-CTTATTAA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAATTTTTACTTATTAA
* * * * *
3075 TTTTT-AGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTATTCCAAATAAGCTTATAGGAATAGAAACAA-
64 TTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAAT
* * * * * * * *
3138 T-TGTTGTGACAAAAGAAAAGGTCATAATGGTTTGAAATAGATAATCGTTCAAACAATCAAAACT
128 TATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT
* * * ** * * * * *
3202 ATTTGCACTGGTTAGGCCAACATATTCATTTTTTAAATTTGTTACTTATTAATTTTTAGAATATT
192 ATTTGAACT-TTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATT
* * * ** * * * * * * **
3267 AATTAATTAGCATTACTTTATTCCGAATGAGATTGCA-GTAATAGAAAAAATTATTTTATGATGA
256 AATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-AACAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
3331 AACAAATGGTCATAATGATTTGCAAGAAATAATTGTTCA
320 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * * * *
3370 AATTA-TTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAATAAATTTATTTTTTAAA--TCT-CTCATTAA
1 AA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTA-TTTTTAAATTTTTACTTATTAA
* * * *
3431 TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACA-AA-CTTATATGAACA-AAACAT
64 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTATATGAACAGAAACAA
* * * * * * *
3493 TTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAATGATTTGAGATAGATAATTATTCATATAGCCTTAAC
127 TTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
* * * * ** * * *
3558 TATTT-AACTAGTTCGGCAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGATACTAATTTTCATAATAT
191 TATTTGAACT-TTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATAT
** * * * * *
3622 TTTTATATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGTTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATGACAA
255 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * *
3687 AATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAA-TAGTTCA
320 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA-TTCA
** * * * * *
3726 AATAGTCATAACTATTTGAAC-TAATTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTCATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTA
* * *
3790 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAGGCTT-TAT-AA-TGAAAACAA
63 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAG-AAACAA
* * * * ** * * * *
3852 TTGTTTTATGGCAAAATAAATGTTCATAACCATTTTGAAATAGATAATTATTTAAATTGCCATAA
127 TTATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * ** * * * *
3917 TTATTTGAACTGATTTGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTCTCAATTTTTGAAATA
190 CTATTTGAACT-TTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* * * * * * ** ** * * *
3982 TTAGTAAATTAATATTATGTTATTTTGGATAAACTTTTAAAAACTTAAACGATTGTTTTATTATA
254 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACA
* *
4047 AAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCA
319 AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * *
4087 AATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTCTTGCTTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGAAAATAGATTTA-TTTTT-AAATTT-TTACTTATTA
* * * * *
4152 ATTTTCT-AAATGTTAATAAAATAGTATTATTTTAGTTCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACG
63 ATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAAC-AGAAACA
** * * * * * * *
4215 ATTATTTTATGATTAAATAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATGGTCTTAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
** * * * *
4280 CTATTTGAACGAGTTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATA
190 CTATTTGAAC-TTTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATA
* ** * * * * *** *
4344 TTATTAGTTTAGCAATAGTTTACTCCAAATAAGCTTGTATGGAC-GAAAACAATTGTTTTATGAC
254 TTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAG-AAACAATTGTTTTATGAC
* * * *
4408 AAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATAGATAATTATTTA
318 AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
* * * * *
4448 AATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTTACTTATTA
* * ** * * **
4512 ATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGTTTTTATGAACTTAAACAAT
63 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACAAT
* * * * *
4577 TATTTTTTGACAAAACAAAAGTTCGTAATG-TCTTTAAATAGAAAATTATTCAAATAGTCA-AAT
128 TATTTTATGACAAAACAAAAG-TCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-
** * * * * *
4640 CTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATGTTTTTAAATCTCGTACTCATTCATTTTTCAAAT
190 CTATTTGAACTT-TTTGGTAAACAGATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* * * * * * *
4705 GTTAATAAATTAGTATTATTATATTTTAAATAAGCTTGCATAAACTGAAATAATTGTTTTATGAC
253 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * ** * **
4770 TAAAA-AGAAGGT-AAAATTATTTGAAATAGATAATTGTTTT
318 -AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
** * ** * * ** *
4810 AATAGTTTTAACTATCTGAACTAATTCA-ACAAACACTTATTATTTTT-AATCTCTTACTTATTA
1 AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGA-AAATAGAT-TTATTTTTAAAT-TTTTACTTATTA
* * * *
4873 ATTTTTAGAAA-ATTATTAAATTAGTATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACA
63 ATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTATATGAACAGAAACA
* * * * * *
4936 ATTTTTTTATGACAAAATAAAAATCATAACGATTTGAGATA-AGTAATTGCTCAAATAGTCATAA
126 ATTATTTTATGACAAAACAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAA
* * * * * * * *
5000 CTATTT-AAATTGCTTTCGTGAACAAATTTAATTTTTAAA--TC-T-CTTATGAGTTTCTAAAAT
190 CTATTTGAACTT--TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAAT
* *
5060 ATTAATAGATCAGTATTATTTTATT
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5085 CTAAATAATT
Statistics
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ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCA
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* ** * *
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* * *
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* *** * * *
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* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * ** **
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* * * ** *
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* *
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* * * *
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* *
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* * ** * * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * **
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* * *
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* * * * * *
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1 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * * * ** *
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* * * * * * ** **
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* * * * *
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1 TATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * * * *
6251 TAATACTAATTTAATAATTTTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAG
64 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
* * *
6316 CAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGT
129 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * *
6369 TATAACATTTTGTTTTGTTATAAAA-CATT-TTTTTATGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
1 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTA--TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * * * * * * *
6432 TAATACTAATATAATAATATTAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTCAAAAAATAAATTTGTTTG
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * * *
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1 TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAAT
* * ** *
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TATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCA
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
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AGATTTGTTT
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* *
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*
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* * * *
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GACTTGCAAGAGAAGAATTCTAAAAGGAAAGGGATTCTTAATAGGTAAGTTT
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TGTTTGATTTAT
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*
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*
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*
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*
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AGATTTGTTTA
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* * *
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* *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * *
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* ** * *
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* ** * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* ** * * *
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66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** * * *
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* ** * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATA
* * * * *
17529 ATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCC-TTTGTTTTATCATAAAACAGTTGTTTCTATTCATGCA
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* *
17593 AGTTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATATG
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* * * * * * * *
17647 TAAGAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTAC-TGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATATGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * *
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66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** * *
17776 ATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-
131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * ** * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * *
17887 ATTATCTATCTAAAATCGTTAT--CATATTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * *
17950 AGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-
129 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAATA
* * * *
18063 ATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACA
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* ** * * * * *
18127 ATCTTATTCAAAATAAAATAATAGTGATTTATTAACATT-AAAATAATTAATGAG
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
18307 AAAAACTTATTAGAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAA
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* * * * * * * * *
18364 CAAGAGATTT-AAAACTAAAGT-TGTTTTC-TAAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * ** * **
18426 AATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTCCTCATAAAGCAATCATTTCTGA-TCATACA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * * * *
18489 AGCTTATTTGGACA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAGT--G
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* * * * * *
18541 -AAG-GATTTAAAAAATAAATGTATTT-GTCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * * * *
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66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * *
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131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * ** * *
18720 CAAGAGATTTGAAAAGATAAATGTGTTTAC-CGAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * *
18784 ATTATCGATTTAAAATTGTTAAGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAGAAA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
** * * * * * *
18848 AGCTTATTCAAAAGAAAATAATACTACTTTATTATTATT-TCGAAAGTTAATAAT
129 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * * **
18902 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTAC-TGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGACCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * ** * * * * *
18965 ACTATTTATTTCAAATTATTATTACCTTTT-ATCTGTCATAAAGCAATT-ATT-T-TTCA-A-AA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * ** ** * * * * * * * **
19024 AATAAATTG-TTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTATT
130 GCTTATTTGAAATA---AAATAATACTAAT--TTATTAATATTCT-AAAAATTA-ATAAG
* * * ** * * * *** **
19082 TCAA-A-TTGTTATAACATTTTAT-T-TTATAATAAAACAATTGTTTC-TATCCATACAAGCTTA
1 T-AAGAGAT-TTA-AAAAATAAATCTATT-TACTTAAACAA--G-TTCAAATAGTTATGA-C-TA
* * * * ** ** * *
19142 TTTAGAATAAAATAATACTAATTT-AGTAAT-ATTCTAAAAATTAATAACTAATAGAT-ATAAAA
57 TTT-GAAT--AATTAT-CT-ATTTCA--AATCGTTAT-GACCTT--T-TGT-TTTG-TCATAAAA
*** * ** ** *
19204 -AA-TAAATCCATT--TACCGAA-CCAATTCAAACAGTTAAGACTATATGAAC-AA-TTATT--T
109 CAATTGTTTCTATTCATA-C-AAGCTTATTTGAA-A--TAA-AATA-AT--ACTAATTTATTAAT
* * ** **
19260 A-TCTTAAATTGTTCTGACCT
165 ATTCTAAAAAT-TAAT-A-AG
** ** * * * **
19280 TTTG-TTTTGTCATAAAA-CAAT-TATTTTAGCTCATAGAAGCTCA-TTCGAAATAAAG-TAAAA
1 TAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTA-TTTA-CT--TA-AA-C-AAGTTC-AAAT--AGTTATGA
* * ** ** * *
19340 CTAATTT-ATTAA-TATTTGAAAATTT-ATAAGAGATT-TAGAAAATAATTTTATTTACTGAACT
54 CT-ATTTGAATAATTATCT----ATTTCA-AATCG-TTAT-G---A-CCTTTTGTTT--TG-TC-
* * * * * * * ** * * *
19401 AGTTCAAATAATTATATCTATTTAAACAA--TTATCT-ATTTCAAATAATTATTAGTTT-TT-AT
103 A--TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAAT
* * ** *
19461 TTTGTAATAAAACAATATTGTTTG
165 ATTCTAA-AAATTAATA-----AG
* * * * *
19485 TTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAGCACTAATTTATTAATATTTATCAAACCAGTTCAAAT
1 -T-A-A-GAG-AT-TT---AA-AAAAT---A--AATCTATT--TA-CT-T-AAACAAGTTCAAAT
* ** * * * * *
19550 AGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTCTAT-T-ATAAAGC
46 AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAAC
* * * * * * * *
19613 AATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACACTAATTTATTAATATT-TCAACA
110 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
19677 ATTAATAAG
174 ATTAATAAG
* * * * ** * * * *
19686 TAAAATATTTAAAACATAAATATGCTTA-TCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * ** * *
19750 TTATCTA-TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAAAATCATTTCGATTCATATAAG
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
** * * * *
19814 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATCAATATTCTGAAAATTAATAAT
131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
19866 TAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTAATGAATA-AA-TTTAAATTA-TTATGACTATTTGAAC
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAA-ACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
19928 AATTATCTATTTGAAATCGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTCTATTCATA
64 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTGTTTCTATTCATA
*
19993 CAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAG
127 CAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAG
* * * * ** *
20049 TAAAAGATCTAACAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * *
20113 TTATTTATTTCTAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAG
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * * **
20178 CTTATTCGGATTAAAAAAATATTAATTTATTAATATTTTGGCAAA-TAATAAG
131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * ** * * *
20230 TAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-TCGAACAAGTTCAAATGGTCATGACTATTTGAGTAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
** * * *
20294 TTAAT-TATTTCAAATCAATGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATA
66 TT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
*
20356 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAG
129 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * *
20410 TAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTAC-CAAACATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * *
20473 TTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAG
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
*
20538 CTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATT-TCAAAAATTAATAAG
131 CTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
20590 TAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTC-TGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * *
20652 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* *
20717 GCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATT-ATAATT-TCAAAAAATAATAAG
130 GCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * * ** *
20770 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TGAGCAAGTTCGAATAGTTATGACCCTTCGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * *
20834 TTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAT
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* *
20899 TTTATTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAG
131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
** * * * **
20950 TTGGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTAC-TGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTG
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * ** *
21014 TTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTG-TTTGTCGTAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAA
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* *
21078 ATTA-TTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-
131 CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * * *
21126 TAAGAGATTTAAGAATTAAATCTGTTTA-TCAAACCAA-TTCAAATACTTATGACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * *
21189 ATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * *
21253 ACTTA-TTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCCAAAAA-T--TAA-
130 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * *
21301 TAAGAGCTTTGAAAAATAAATGC--GTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* ** * * *
21364 ATTATCAATTTCAAATTATTCCT-ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATAC
65 ATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * *
21427 AAGCTTATTT-AGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACT-TTCAAAAAATTAATGAG
128 AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCTAAAAATTAATAAG
* * *
21482 CAAAAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAA
1 TAAGAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAA
* * *
21545 CAATTATCTATTT-AAAGTTGTCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTTCAT
63 TAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAT
* * * *
21608 AAAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG
126 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
21665 CAAGAGATTT-AAAACTAAAGT-TGTTT-TTTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * ** * * * *
21727 AATATCAATCTCAAATCAATATGATC-TTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * *
21790 AGCTTATTTG-AATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTC-CAAAA--AAT-AG
129 AGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * *
21840 TGAA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGC-TAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACA
1 T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * * * ** * *
21903 ATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTAATAT-TTAGAA-AATT-AAT-TAGT-A-A-G
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* *** ** * *** * ** *
21961 AGATT-TAAAAAATAAAACTGTTTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAA-
129 AGCTTATTTGAAATAAAA-T-AATACTAATTTA-TT--AATA-TTCT-AAAAATT-AATAAG
* *** *** * * * * * *
22021 TTATCTATTTCAATTTGTTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAACAATTAGTTCTATTCATA-CTA
1 TAAGAGATTT-AA---AAAATAA--ATCTA-TTT-AC-TTAAAC-A--AGTTC-A--AATAGTTA
** * * * * *** *** ** **
22085 T-TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT-ATTCCAACACTTAATAACTAAGAAAATT
51 TGACTATT-TGAAT--AATTAT-CT-ATTTCA-AATCGTTATGAC-CTT--TTGTTTTG-TCA-T
*** * ** * * * * *
22148 AAAA-AA-TAAATCTAATT-GT-CGAA-C-CCTTTCAAATAGTAAGACTACATGAACGATTATCT
105 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC-AAGCTTATTTGAAATA-AAATAATAC-T-AA--TTTAT-T
* **
22207 -AT-TTC-AAATCATT-ATGACCT
162 AATATTCTAAA-AATTAAT-A-AG
** ** * * * * * * * * *** *
22227 TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACATGCTTATTCAAA-AAAAAT-A--ATA
1 TAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTATTT-ACTTAAACAAG----TTCAAATAGTTATGACTATT
* * * ** ** ** *** ***
22286 TCAATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-A-AGTAAGAGAT-T--TAAAA-AA-TAAATCTAT
59 TGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * *
22342 T--TACCGAA-C-CAGTTCAAAT--AATTATGACT-ATTTGAGTAGTTATCAATCTCAAATCATT
122 TCATA-C-AAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAATTT-A-T--TAAT-ATTCT-AAA-AATT
* **
22400 AAGATC
177 AATAAG
** ** * * * * * ** * ** * *
22406 TTTG-TTTTGTCATAAAA-CAAT-TATTT-CTGATCATAGAGCTT-ATTTGGTTAAAAATA-CT-
1 TAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTATTTACTTA-AACA-AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** ** ** ** * *
22464 ACTAATTTAATAATATTCCAAA-AATTAAT-A-AGTAAGAGATT-T-AAAAAATAAATATG-TT-
61 AATAA-TT-AT-CTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTC
* * * * * * *
22522 T-GTCGA-ACCAGTTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTA-TATATTT-TAAATCATTTTGA
119 TATTC-ATACAAGCTT--AT--TTGAAA-TA--A-AATAA-TACTA-ATTTATTAAT-ATTCTAA
*** ** *
22583 CCTTTTGTCTAG
172 AAATTAAT-AAG
* * * * ** * * * * * * *
22595 TTAGAAAATATTTGTTTCATATCTTACAATCTTATTGGAATAAAATAA-TCCAAAT--TTATTAA
1 -T--AAGAGA----TTTAAAAAATAA--ATC-TATT-TACTTAAACAAGTTCAAATAGTTA-TGA
* * **** *** ** ** ** * *
22657 C-ATTTGAAAAATTA-ATAAGGAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATCGA-ACAAATTCAA
54 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCT-TTTGT-TTTGTC-ATA-AAA--C-A
** * ** * *
22719 ATAGTGATGACTATT--T-GAA-CATTATTT-ATTTAAAATCATTA-TAACCTTTTATT-TTGAT
111 AT--TG-TTTCTATTCATACAAGC-TTATTTGAAATAAAAT-AATACTAA---TTTATTAAT-AT
* ** *
22777 AT-AAAACAATTGTTTCAG
167 -TCTAAA-AATT-AATAAG
* * * * * *
22795 TTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTT-CTT-AA-TATTTCAAA-AATTAATAA
1 ----TAAGAGATT-T--AAAA-AATA-AAT-CT-ATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTT-AT--
** * * * * * * *
22856 GCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTA-CAACTATTTGAACA
52 G-ACTA-TTT----GAAT-AATTA---T------CTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTG---T
* * * * *
22920 ATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAACAATTGTTTCAATTCATAGAA
97 TTTGTC-A--TAAAA-CAAT-TG----TTT-CTAT-TCAT---ACAA--GCTT--ATT--T-GAA
* **
22985 GCTTATTCAAAATAA-AATAATCTAATTTATTAATATTCTGGAAATTAATAAG
141 ----A-T-AAAATAATACTAAT-T----TATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * *
23037 TAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTAC-CAAATCAA-CTCAAATAATTGTGGCCATTTCAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * *
23100 ATTATCTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATT-ATAC
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATAC
* * * * *
23163 AAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATAGTATTTTATTAAT-CTCTCAAAAATTAATAAG
128 AAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * *
23218 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-TAAACAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAG
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * *
23281 TTGTATACTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
** * * * *
23346 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATA-AAATATTCCAAAAATTAATAAC
131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
23397 TGAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGC-TAAACTAA-TTTAAATAGTTAAGACTATATGAAC
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
** * * ** *
23460 CGTTATTTATTTCAAA----TA--A---TTT-TTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTAAATTCACAT
64 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATA-
* ** * * * ** *
23514 TAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATACTAAAAAAATTAATATG
127 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
23569 TAATAGGTTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * *
23633 TTAT-T-TTTGCAACTAGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAA
66 TTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
23695 GTTTGTTT-AGAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-
130 GCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * ***
23744 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCA-TCAAATC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGTGCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * * *
23807 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTATTTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATAC
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
* * * * * *
23871 ACGCTTATTCG-ATTAAAATAATACCATTTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAG
128 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * ** * * *
23925 TAAAAAATTTTAAAAATAAATATGCTTA-TTGAACTAA-ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
** *
23988 ATTATCTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATCATTT-TAGTTCATAT
65 ATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
** *
24050 AAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-
128 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * **
24103 TTAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTA-AT-GATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTTGAGCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATA
* * * * * *
24166 ATTATCTATTTGAAAT-TTACTATTTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTAATTCA
65 ATTATCTATTTCAAATCGT--TA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCT-ATTCA
* * * *
24230 TCATAAACTTTATTTTG-AATGAAATAATA-TAAATTTATTAATATTC-AGACAATTAATAAG
125 T-ACAAGC-TTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAG
* * * * * **
24290 TAAAAGATCTAAAAAATAAAATATTTTTAC-CAAACAAGTTCAAATTCTTTATGATCTATTTGAA
1 TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGA-CTATTTGAA
* * **
24354 CAATTATTTATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAACACAATTGTTTCTATTCAT
63 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAA-ACAATTGTTTCTATTCAT
** *
24419 AC-AGCTTATTTGGATTTAAAA-AATA-TAATTTATTAATATT-TGACAAA-TAATAAG
126 ACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * *
24473 TAA-ATATTTTAAAAAAATAAATAATGTTTAC--AGAAC-AGTTCCAATATAGTCATGAATATTT
1 TAAGAGA-TTT-AAAAAATAAAT-CTATTTACTTA-AACAAGTT-CAA-ATAGTTATGACTATTT
* * *
24534 GAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACC-TTT-TTTT-TAATAAAACAATTGTTTC-AGTT
60 GAATAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TT
* * * *
24594 CATATAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATAATAATTTATTAAATATTAT-AAAATTAATGAG
123 CATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATT-AATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * *
24655 TAGAGAGAATT-AAAAATTAATCTATTTAC--AGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAAC
1 TA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
24717 AATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGGTTT-TGTTCATGC
64 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAC
* * * *
24781 AAGTTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCTAATAGTTAATAAG
128 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * *
24836 TAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTC-TAAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * *
24899 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAG
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* *
24964 CTTATAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTC-CAAAATTAATAAG
131 CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * ** * * ** *
25014 TAAAAGATTT-AAAAATATATCTATTTAC-CGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACCCTTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * *
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66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * *
25134 TTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAATAATTAATAGG
131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
** * * * * * *
25185 TTGGAGATTT-AAAAAT-AATTTGTTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAATTA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * **
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**
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131 CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * ** * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TA
* * * * * * * * *
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* * * * * * *
25486 ACTTA-TTCATAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCT--AAA--AA-AAG
130 GCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * ** * * *
25534 AAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CGAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * *
25597 ATTATCTATTTCAAATCATTCTTATC-TTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* ** * * * *
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129 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * *
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1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
*** * * *
25775 ATTATCTATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTCT-TAGTTCATAA
65 ATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * **
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128 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * *** * * * *
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1 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAA
* ** * * *
25954 TAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA-TCATA
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* ** *
26018 CAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG
127 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * *
26074 TAGGAGGTTTAAAAAAT-AAT-T-TTGT--TT--AC----TGAACTAGTT-T--CTATTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-TACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * *
26125 ATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATA
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACA
* * * * * *
26189 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTTTTAAAATTGATAA-
129 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
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1 TAA-GAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** * * * * *
26306 AATTATTTGTTTACTAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTA-TCATT
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* * *
26369 CCAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAA-T--TAA-
127 CAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
* * * * * *
26421 CAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-TAAACTAGTTTAAATA--TATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * * **
26483 TTGT-AACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGCTCATACAAG
66 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * * *
26547 TTTA-TTCAGAATAAAATAATGCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAAC
131 CTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * * *
26599 TAAGAAAATTAAAAAATAAATTTGTTTGC-TGAACTAGTTTAAATATTTAAAGACTATATGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATA
* * * ** *
26663 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTGAATTCATACT
65 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACA
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* * * * * * * *
26780 TAAGAGATTTAAAAAACAATTCTGTTTACCT-AACTAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * *
26844 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG
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* * * * *
26909 -TGT-GTTCAAATAAAGTAATATTAATATATTAATA-TCTCAAAAA-T--TAA-
131 CT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
*
26956 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACAAGTTCAAATAGTTCAAATAGTTTTGACTA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAG-T----TA----TGACTA
** * * * * *
27020 TTTGAGCAATTATTTA-TTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTAT
57 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-
** * * * * * * * *
27084 TTCA-ATTA-CTAATTT--ATTAATAT-TTCGAC-AATTGA-TAAGTAAT-T--AATTTAAAAAG
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* ** * * ** * * * * * ** *
27139 TAA-ATATGTTTACTGAACTAGATC-AAATAGTCATGACTATTTGGAATAATTAT--CTATTT--
1 TAAGAGA--TTTA-AAAAATAAATCTATTTACTTA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * *
27198 --------------CAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAAAATTATT-TCAATTC-AT
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* ** ** * ** * * * * * * * * *
27247 GTAAGTTTATTC-AAAATAAAATAATATTA-AGTTA-TTAATATTA-T-G-AAAATTAATAAT
122 -TCA-TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
27304 TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTT-GTTGAACAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTTG-ATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATA
*** * **
27367 ATTATCTA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTATTCATACA
65 ATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* *
27430 AGTTTATTTTG-AATAAAATAATAC-AACTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAG
129 AGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAG
* ** * ** *
27483 TAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTA-TCGAACAATTTCAAATCTTTATGACTATTTGAAAAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * *
27546 TTATTTATTTGAAATTGGTTATGACTTTTTGTTTTTGTCGTAAAATAATTATTTCT-GTCATACA
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* * * * * * * * * *
27610 TGTTTATTCCG-ATTCACAAAT-AT-TTATTTTTTTAATATTTTCGACAATTAAT-AG
129 AGCTTATT-TGAAAT-A-AAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG
** * * * *
27664 T-AGA-ATTTAAAAAAATAAAT-TATTGTTTTTCCAACAAGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATT-TACTT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
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* * * *
27788 TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATCTTCCAAAAATTAATGAG
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* * *** * *
27845 AAAGAGAATTAAAAAA-AGGAATCT-TGTTACCGGAACATGTTC-AATAGGTTATGACTATATGA
1 TAAGAGATTTAAAAAATA--AATCTAT-TTACTTAAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGA
* * * * *
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* ** *
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* * ** * * *
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* * * * * * *
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* * ** *
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* * * * **
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * *
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* *
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* * ** *
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* * * * * * *
28456 ACAATTATTTCTTTCAAA-CGTACTATAATCTTTTGTTTTATTAT-AAACAATTGTTTCTATTCA
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*
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** * * * * *
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** * * * *
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** * * *
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* * * * * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAAT
* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * *
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* ** ** *
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* * * * * * *
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1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* *** * * *
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* * * ** *
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** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** ** *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * *
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*
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* * * * * * * * * * *
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* * * * *
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** ** *
29935 CAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAATAAG
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* * * * ** * * * * *
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* * *
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* *
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*
30352 TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTAC
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Statistics
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* * * * ***
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** * *
16703 AGCATAATTCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAG
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *
16743 TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * *
16808 TACCTATTTCAAATTGCTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAG
66 TATCTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** *
16872 CTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCATGCAATTAATAAATAAAAGATTTAA
130 CTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
* *** * * * * * * *
16936 AAAATAACTACATTTACCAAATAAATTCAAACAGTTTTGACTATTTAAATAAATATTTATTTCAA
193 AAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * * *
17001 ATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATTA
258 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* * ** *
17066 AAATAATATTAATTTATTAACATTTTGACAATTAATAAG
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** * * * * *
17105 TAACAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATTAAAAAAGTTTAAATAGTCATAACTATTTAAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * *
17170 TATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTCGTCATAAAACAATTATATC-AGTTCATATAGG
66 TATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAG
* * * *
17234 CTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAA
130 CTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA
* * * *
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194 AAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
** * * * * *
17364 TAATTATGACATTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCAAAAT-A
259 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* * *
17428 AATATTACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATATG
324 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
17466 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAGCAAGTTTAAATAATTATG-CTGGTTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAA
* * * * * *
17530 TTATTTATTTCAAATAGTTATGATCCTTTGTTTTATCATAAAACAGTTGTTTCTATTCATGCAAG
65 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** *
17595 TTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATTTTA
130 CTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
* ** * * * *
17659 AAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATATGAACAATTATCTATTTCAA
193 AAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * **
17724 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATA
258 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* *
17789 AAATAATACCAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
17824 TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCGAA-ACAGCTT-AAATAGTTATTATTATTTGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACA-AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * * * *
17887 ATTATCTATCTAAAATCGTTATCAT-ATTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
17951 GCTTA-TTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAA-T--T-AATAAGAGCTTTG
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* * * * * *
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* * * * *
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256 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * * *
18140 TAAAATAATAGTGATTTATTAACA-TTAAAATAATTAATGAG
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAG
* * * * * * *
18181 CAAAAGATTTAAAAAATATAAATCTATTTATCAAATATGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGGAC
1 TAAGAGATTT-AAAAA-ATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAAT
** * *
18245 AATTATCTATTT-AAAGTCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTC-ATTTCATA
63 AATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * ** * * *
18308 AAAACTTATTAGAAATAAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATT
126 CAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
* * * * * * * * * * *
18373 T-AAAACTAAA-GTTGTTTTCTAAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAATATCAATC
190 TAAAAAATAAATG-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * ** * ** * **
18436 TCAAATCATTATGATC-TTTGTTTCCTCATAAAGCAATCATTTCTGATCATACAAGCTTATTTGG
254 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCA
* * * * *
18500 ACA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAGT--G
318 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
18541 -AAG-GATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATTAGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * * * * *
18604 TATTTATTTCAAATAGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCTTATAATAATTGTTTCAATTCATACACGC
66 TATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* **
18669 TTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAA
131 TTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAATAAGAGATTT-AA
* * * * * *
18733 AAGATAAATGTGTTTACCGAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAA
193 AAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
18798 ATTGTTAAGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAGAAAAGCTTATTCAAAAG
258 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
18862 AAAATAATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAAT
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * **
18902 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGACCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * * * * * * * *
18965 ACTATTTATTTCAAATTATTATTACCTTTT-ATCTGTCATAAAGCAATT-ATT-T-TTCAAAAAA
64 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACA
** * * * *
19026 TAAATTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATT
128 -AGCTTATTT--C-AA--A--T-AAA-A-TAAT-ACTAATTT-----ATTA-ATA-TTCAAAAAT
* *** ** * * * *
19089 GTTATAACATTTTATTTTATAATAAAACAATTGT-TTCTATCCATACAAGCTTATTTAGAATAAA
174 -TAATAA-ATAAGAGATT-TAA-AAAATAAATGTGTT-TA-CCAAACAAG----TTCA-AAT--A
* * * * * * * * *
19153 ATAAT-ACTAATTT-AGTAA-TATTCTA---AAAAT--TAAT-AACTAATAG----AT-ATAAAA
226 GTTATGACT-ATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA
*** * * ** * *
19204 -AATAAATCCAT-TT-A-CCGAA-CCAATTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATTTATCT
288 CAATTGTTTC-TGTTCATAC-AAGCTTATTCAAA-A--TAA-AATA-AT--AC--TAATTTA--T
** ** *
19264 TAA-ATTGTTCTGACCTT--T-TG
340 TAATA-T-TTCAAAAATTAATAAG
*** * * * * * * * * **
19284 T-TTTG-TCATAAAACAATTATTTTAGCTCATAGAAGCTCA-TTCGAAATAAAG-TAAAACTAAT
1 TAAGAGAT-TTAAAA-AATAAATCTA-TTTATCGAA-C-AAGTTC-AAAT--AGTTATGACT-AT
* * ** * * * *
19345 TT-ATTAA-TATTTGAAAATTT-ATAAGAGATT-TAGAAAATAATTTTATTTACTGAACTAGTTC
57 TTGAATAATTATCT----ATTTCA-AATTG-TTAT-G---AT-CTTTTGTTT--TG-TC-A--TA
* * * * * ** * * ** *
19406 AAATAATTATATCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATTAGTTTTTATTT-TGTAATA
105 AAACAATTGTTTCTATTCATACAA-GCT-TATTTCAAATAA--AATAATACTAATTTAT-TAAT-
** ** ** * * *
19470 AAACAATATTGTTTGTTAATATAAGTTTG-TTCAAAATAAAATAGCACTAATTTATTAATATTTA
164 ATTCAA-A--AATTAATAA-ATAAG--AGATT-----TAAAA-A--A-TAA---A-T-GTGTTTA
* * * ** * * *
19534 TCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTT
209 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * ** * *
19599 GTCTAT-T-ATAAAGCAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACACTAATTT
274 GT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
*
19662 ATTAATATTTCAACAATTAATAAG
338 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** * * * *
19686 TAAAATATTTAAAACATAAATATGCTTATCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * ** * *
19751 TATCTA-TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAAAATCATTTCGATTCATATAAGC
66 TATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * * *
19815 TTA-TTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATCAATATTCTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAA
131 TTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA
* * *** * * * * *
19879 AAATGAATATGTTTAATGAATAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAA
194 AAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * ***
19943 ATCGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAA
258 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
*
20008 TAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAG
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG
* * * * * ** *
20049 TAAAAGATCTAACAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * *
20114 TATTTATTTCTAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGC
66 TATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
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20179 TTA-TTCGGATTAAAAAAATATTAATTTATTAATATTTTGGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAA
131 TTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
* * * * * * *
20242 AAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATGGTCATGACTATTTGAGTAATTAAT-TATTTCA
193 AAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCA
** * * * **
20306 AATCAATGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA
257 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAA
*
20369 TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAG
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * *
20410 TAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTGAATAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
*** * * * *
20474 TATCTATTTCAAAACATTATGA-CTTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAG
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* * * *
20538 CTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAA
130 CTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
* * ** * *
20601 AAAATAAATATGTTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCA
193 AAAATAAATGTGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * *
20665 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAAT
257 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
*
20730 AAAATAATACTAATTTATT-ATAATTTCAAAAAATAATAAG
322 AAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ** *
20770 TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAGCAAGTTCGAATAGTTATGACCCTTCGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* ** * *
20834 TTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAT
65 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* ** * * **
20899 TTTATTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAA
130 CTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAA
* ** ** * **
20964 AATAAATCTACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTGTTATCTATTTCAAAT
195 AATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * ** * **
21029 CATTATGACATTTTG-TTTGTCGTAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATT-AAGAATAA
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324 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
21126 TAAGAGATTTAAGAATTAAATCTGTTTATCAAACCAA-TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* ** * * * *
21190 TTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAA
65 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * * * *
21254 CTTA-TTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCCAAAAA-T--T-AATAAGAGCTTTGAA
130 CTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA
* * *** * * * * * *
21314 AAATAAATGCGTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAA
194 AAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
** * * * * *
21379 TTATTCCT-ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT
259 TCGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *
21442 AAAATAATAGTAATTTATTAA-CTTTCAAAAAATTAATGAG
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * *
21482 CAAAAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAAC
1 TAAGAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAAT
* *
21546 AATTATCTATTT-AAAGTTGTCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTTCATA
63 AATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * **
21609 AAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGAT
126 CAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGAT
* **** * * * *
21673 TT-AAAACTAAA-GTTGTTTTTTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAAT
189 TTAAAAAATAAATG-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* ** * * * * * *
21736 CTCAAATCAATATGATC-TTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATT-T
253 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
21799 GAATAAAAATAATATTAATTTAATAATA-TTCCAAAA--AAT-AG
318 AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
21840 TGAA-AGATTTAAAAAATAAATGTATTT-GCTAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACA
1 T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
** * * * * * * *
21903 ATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTAATAT-TTAGAAAATTAATTAGTAAGAGATT-
64 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTT--T-TGTCATAAAA-CAATT-GT------TTC
*** * * ** ** * * * * * *
21966 TAAAAAATA-AAACTGT-TTACCAAACCATTTCAA-A-TAGTTT-TGACTATTTGAATAATTATC
118 T-ATTCATACAAGCT-TATT-TCAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTA-A
** * ** *** ** * * *
22026 TATTTCA-ATTTGTTATAACCTTTTAT-T-TTGTCATCAAACAATTAGTTCTATTCATA-CTAT-
177 TAAATAAGAGAT-TTA-AAAAATAAATGTGTT-T-ACCAAAC-A--AGTTC-A--AATAGTTATG
** * * * * *** *** ** **
22086 TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT-ATTCCAACACTTAATAACTAAGAAAATTAA
232 ACTATT-TGAAT--AATTAT-CT-ATTTCA-AATCGTTATGAC-CTT--TTGTTTTG-TCA-TAA
*** * * * * * * * ** *
22150 AA-AA-TAAATCTAATT-GT-CGAACCCT-TTC-AAATAGTAAGACTACATGAA-CGATTATCTA
286 AACAATTGTTTCT-GTTCATAC-AAGCTTATTCAAAATA-AAATAATAC-T-AATTTATTA-ATA
* **
22208 TTTCAAATCATT-ATGACCT
345 TTTCAAA-AATTAAT-A-AG
** ** * * * * * * *** *
22227 TTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATC-ATACATGCTTATTCAAA-AAAAAT-A--ATA
1 TAAGAGATT-T-AAAAAATAAATCTATTT-ATCGA-ACAAG----TTCAAATAGTTATGACTATT
* * * ** ** ** *** ***
22286 TCAATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTA--ATAAGTAAGAGAT-T--TAAAA-AA-TAAATCTAT
58 TGAA-TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAT-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * *
22342 T--TACCGAA-C-CAGTTCAAAT--AATTATGACT-ATTTGAGTAGTTATCAATCTCAAATCATT
121 TCATA-C-AAGCTTATTTCAAATAAAATAAT-ACTAATTT-A-T--TAAT--AT-TCAAA-AATT
* ** ** ** * * * * * * * ** * ** *
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175 AATAAATAAGAGATT-T-AAAAAATAAATGTGTT-T-ACCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACT
* * * * ** ** ** ** * *
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* * * *
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** *** ** *
22578 TTTGACCTTTTGTCTAG
346 TTCAAAAATTAAT-AAG
* * * *** * ** * * *
22595 TTAGAAAATATTTGTTTCATATCTTACAATCTTATTGGAATAAAATAA-TCCAAAT--TTATTAA
1 -T--AAGAGA----TTT-AAAAAATA-AATC-TATT--TATCGAACAAGTTCAAATAGTTA-TGA
* * **** ** * * * * * **
22657 C-ATTTGAAAAATTAAT-AAGGAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATT-TATCGAACA-AATTCA
53 CTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAA-A-TTG---TTAT-GATCTTTTGTTTTG-TCATAAAAC-
** * ** * *
22718 AATAGTGATGACTATT--T-GAA-CATTATTT-ATTTAAAATCATTA-TAACCTTTTATT-TTGA
109 AAT--TG-TTTCTATTCATACAAGC-TTATTTCAAATAAAAT-AATACTAA---TTTATTAAT-A
* * ** * * * * * ** *
22776 TATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTT-CTTAA-T
165 T-TCAAA-AA----TT-AATAAATAAGAGATT-T--AAAA-AATA-AAT-GT-GTTTACCAAACA
* * ** * * * *
22839 ATTTCAAA-AATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAATTCAAATAG
216 AGTTCAAATAGTT-AT--G-ACTA-TTT----GAAT-AATTA---T------CTATTTCAAATCG
*
22903 TTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAACAAT
262 -T-----TA--TG-AC------C---------T--TT-TG---TTTTG-----TCATAAAACAAT
** * **
22968 TGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATA-TTCTGGAAATT
292 TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
23031 AATAAG
356 AATAAG
* * * * * * * * * * * *
23037 TAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAATCAA-CTCAAATAATTGTGGCCATTTCAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * *
23101 TTATCTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATT-ATACA
65 TTATCTATTTCAAATTGTTA-TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACA
* * * * *
23164 AGTTTA-TTCAGAATAAAATAATAGTATTTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
128 AGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCAAAAATTAATAAATAAGAGATTT
* * * * * * * * *
23228 AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAGTTGTATACTTC
191 AAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * *
23292 AAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAA
256 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
23357 TAAAATAATACTAATATA-AAATATTCCAAAAATTAATAAC
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
23397 TGAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACTAA-TTTAAATAGTTAAGACTATATGAAC
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATC-GAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
** * * ** *
23460 CGTTATTTATTTCAAA----TA--A---TTT-TTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTAAATTCACAT
63 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATA-
* * * ** ** * *
23514 TAA-CTTA-TTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATACTAAAAAAATTAATATGTAATAGG
126 CAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGA
* * * * *
23576 TTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-T-
188 TTTAAAAAATAAATGTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * * * * *
23638 TTTGCAACTAGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT
252 TTT-CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT
* * * * *
23702 TAGAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-
316 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ***
23744 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCATCAAATC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGTGCAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * *
23808 TTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTATTTTCTATTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACA
65 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTT-GTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * * * * *
23872 CGCTTA-TTCGATTAAAATAATACCATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTT
128 AGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTA
* * *** * *
23936 AAAAATAAATATGCTTATTGAACTAA-ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTTATTT
192 AAAAATAAATGTGTTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTT
** *
24000 CAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATCATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAA
255 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAA
*
24062 AATAAAAT-ATACTAAGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAA-
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * **
24103 TTAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTAAT-G-ATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTTGAGCA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATA
* * * * * *
24166 ATTATCTATTTGAAATT-TACTATTTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTAATTCA
64 ATTATCTATTTCAAATTGT--TA-TGATCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCT-ATTCA
* * ** * * * *
24230 TCATAAACTTTATTTTGAATGAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCAGACAATTAATAAGTAAA
124 T-ACAAGC-TTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAATAAG
* * * ** *
24294 AGATCTAAAAAATAAAATATTTTTACCAAACAAGTTCAAATTCTTTATGATCTATTTGAACAATT
185 AGATTTAAAAAAT-AAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGA-CTATTTGAATAATT
* ** *
24359 ATTTATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTGTCAATAAACACAATTGTTTCTATTCATAC-AG
247 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAA-ACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
** ** * *
24423 CTTATTTGGATTTAAAA-AATA-TAATTTATTAATATTTGACAAA-TAATAAG
310 CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
24473 TAA-ATATTTTAAAAAAATAAATAATGTTTA-CAGAAC-AGTTCCAATATAGTCATGAATATTTG
1 TAAGAGA-TTT-AAAAAATAAAT-CTATTTATC-GAACAAGTT-CAA-ATAGTTATGACTATTTG
** * * *
24535 AATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGA-CCTTT-TTTT-TAATAAAACAATTGTTTC-AGTTC
60 AATAATT-ATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTC
* * * * *
24595 ATATAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATAATAATTTATTAAATATT-ATAAAATTAATGAGTAGA
123 ATACAAGCTTATTTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATT-AATATTCA-AAAATTAATAAATA-A
* * * * * * *
24659 GAGAATT-AAAAATTAATCTATTTA-CAGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTA
184 GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * *
24722 TCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGTT
248 TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCT
* *
24786 TATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCTAATAGTTAATAAG
312 TA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * *
24836 TAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * *
24899 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAG
65 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
24964 CTTATAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA
130 CTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA
* * * * * * ** * *
25026 AAATATATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACCCTTTGAACAATTATTTATTTCAAA
194 AAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * ** **
25091 TC------A--TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGAAAT-A
259 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAA
* *
25147 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAATAATTAATAGG
324 AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
** * * * * * * *
25185 TTGGAGATTT-AAAAAT-AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAATTAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
** **
25248 TATCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAA-
66 TATCTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
**
25311 AATATTT-AGAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAA
130 CTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
* * * * ** * * * * * *
25370 GAATTAAATCTATTTGTCGAACCAGTTCAAATACTTATGGCTATTTGAAGCAATTATCTATCTCA
193 AAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * *
25435 AATTGTTATGATC-TTTATTTTGTAATAAAACAACTGCTTCTGTTGATACAAACTTATTCATAGT
257 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * *
25499 AAAATATTGCTAAATTAATAATA-TTC-TAAA--AA-AAG
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
25534 AAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
** * * * * * *
25598 TTATCTATTTCAAATCATTCTTATC-TTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAT
65 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * *
25661 GCTTA-TTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTT
129 GCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAATAAGAGA-TTT
* *** * * * * * *
25725 AAAAAATAAATCTGTTT---ATTGAATTTCAAATTGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTT-
191 AAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
*** * * *
25786 AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTCTT-AGTTCATAAAAGCTTA-TCTA
256 A-AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTC-A
* * **
25849 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAACCAATAAG
318 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * *** * * * *
25893 TTAA-AGATTTAAAAAATAAGTC-AGTTTATCAAATTGGTTTAAATAATTATG-GTCACTTGAAT
1 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAAT
** * * *
25955 AATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA-TCATAC
63 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * * *
26019 AAGCCTA-TTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGGTT
127 AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
* * * * *
26083 TAAAAAATAATTTTGTTT-----AC----TGAACTAGTT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTT
190 TAAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * ***
26136 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGG
255 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAA
* * ** *
26200 AATAAAATAATACTAATTTAATATTATTTTTAAAATTGATAA-
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * ** * * * * *
26242 CAAGGAGATTTAAAAAAATAAACCTATTTGCTAAAACAA-TTCAAACAATTAAGACTATATGAAC
1 TAA-GAGATTT-AAAAAATAAATCTATTT-ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * ** ** * * * *
26306 AATTATTTGTTTACTAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTA-TCATT
63 AATTATCTATTT-C-AAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
* * *
26369 CCAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--T-AACAAGAGAT
126 CAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAATAAGAGAT
* * * * * * * *
26429 TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTTAAATA--TATGACTATTTGAACAATTGT-AACT
189 TTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * * * *
26491 TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGCTCATACAAGTTTATTCAG
254 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAA
* * * * *
26556 AATAAAATAATGCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAAC
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * * *
26599 TAAGAAAATTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTGAACTAGTTTAAATATTTAAAGACTATATGAATA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATA
** * * * ** *
26663 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTGAATTCATACT
64 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACA
* *
26728 AGCTTATTTGAAATAAAA-AA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
128 AGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTT
* * * * * * * *
26790 AAAAAACAATTCTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTC
191 AAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * *
26855 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TGTGTTC-AA
256 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAA
* * * *
26918 ATAAAGTAATATTAATATATTAATATCTCAAAAA-T--TAA-
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
*
26956 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTCAAATAGTTTTGACTAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAG-T----TA----TGACTAT
** * ** * *
27021 TTGAGCAATTATTTA-TTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTAT
57 TTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * *
27084 T--T-CAA--TTA---C---T--AAT--T--T-A-TTAAT-AT-TTCGACAATTGATAAGTAATT
121 TCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAATAA-G
* * ** * * *
27128 A-ATTTAAAAAGTAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGGAATAATTAT
185 AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAATAATTAT
* * * ** ** *
27192 CTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCTTAAAA-AATTATTTCAATTCATGTAAGTTTA
249 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
* * * *
27256 TTCAAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTAT-GAAAATTAATAAT
314 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
27304 TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAACAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTTG-ATAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATAA
** * * **
27368 TTATCTA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTCTATTCATACAA
65 TTATCTATTTC-AAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* ** * * *
27431 GTTTATTTTGAATAAAATAATAC-AACTTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTA
129 GCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAATAAGAGATTTA
* * * * ** * * *
27494 AAAAATAAAT-TATTTATCGAACAATTTCAAATCTTTATGACTATTTGAAAAATTATTTATTTGA
192 AAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * * * **
27558 AATTGGTTATGACTTTTTGTTTTTGTCGTAAAATAATTATTTCTG-TCATACATGTTTATTCCGA
257 AA-TCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * * * *
27622 TTCACAAAT-AT-TTATTTTTTTAATATTTTCGACAATTAAT-AG
320 AT-A-AAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
27664 T-AGA-ATTTAAAAAAATAAAT-TATTGTTTTTCCAACAAGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAA
1 TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTA---TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* ** * * *
27726 TAATTATCTAGTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTGTAAT-AAACAATTGTTTC-AGTTCATA
62 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* * * *
27788 TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATCTTCCAAAAATTAATGAGA-AAGAG
126 CAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TT-CAAAAATTAAT-AAATAAGAG
* * * * * *
27851 AATTAAAAAA-AGGAATCT-TGTTACCGGAACATGTTC-AATAGGTTATGACTATATGAATTATT
187 ATTTAAAAAATA--AATGTGT-TTACC-AAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAATAATT
* * * * *
27913 ATCTATTTC-AATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTTAGTTCATATAAGC
247 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGC
** ** *
27977 TTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATA-TTCCGAAATGTAAATTGAG
311 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-T-AA-TAAG
* * * * *
28029 AAAGAGGAATTTAAAAAATGAATCT-TGTTATCGAACATGTTTAAATCAGTTATGACTATCGTGA
1 TAAGA-G-ATTTAAAAAATAAATCTAT-TTATCGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTAT-TTGA
* * *** * *
28093 ACAATT-TCTATTTTAAAAACATTATGA-CATTTTGTTTTTTCATAAAAC-ATCTAG-TTCTACT
61 ATAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-T-GTTTCTATT
* ** * *
28154 CATTGCAAGCTTATTTCAAATAAAATTAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAA
122 CA-TACAAGCTTATTTCAAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAA
* * * * * **
28219 -AAATTTAAAATAAATATATTTTTTTA--ACACTTG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
184 GAGATTT-AAA-AAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * * *
28280 ATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTGGTCATAAACCAATCGTTTCTATTCATA-AAGCT
247 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT
** * *
28343 TATTTGAAATAAAATAATACCTAACTTATTAA-AATTC-AAAATTAATAAGG
312 TATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-G
* * * * *
28393 TAAAAGAATTTAAAAAATAAATTCTGTTTATTG-GCGAGTTCCAAATAGTTATGACTATTTTGAA
1 TAAGAG-ATTTAAAAAATAAA-TCTATTTATCGAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTA-TTTGAA
* * * * * * *
28457 CAATTATTTCTTTCAAA-CGTACTATAATCTTTTGTTTTATTAT-AAACAATTGTTTCTATTCAT
62 TAATTATCTATTTCAAATTGT--TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* * * **
28520 ACAAGTTTATTTGAAAT-AAATAATTACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAACTAAGTTGGAG
125 ACAAGCTTATTTCAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAA-TAAATAAGAG
* * * **
28584 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AGCCTCAAATAGTTCAT-ATCCATTTGAACTGCTTA
187 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAG-TTCAAATAGTT-ATGA-CTATTTGAA-TAATTA
* * * * * *
28647 TTCTCTATCAAATTGTTATGGACATTTTTGTTTTGT--TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAA
248 -TCTATTTCAAATCGTTAT-GAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
* * * *
28710 ATTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAGTATTTCAAAAATTAAT-A-
310 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
28760 -AA-AGATTTAAAAACTTAATCTGTATATCAAACCAA-TTCAAATAATTATGATTTTTTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAATA
* ** * * * *
28822 ATTATCTATCTCAAATCATTATGAT-ATTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * *
28886 GCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATATTCTAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTA
129 GCTTATTTCAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTA
* * * * * *
28946 AAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATTTATTTC
192 AAAAATAAATGTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * * *
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256 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAA
** *
29072 AATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTT-AGAAAATTAATAAA
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
* * * * * * *
29115 CAACAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* *** * * *
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65 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * ** * * *
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130 CTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
* * *** * * * *
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193 AAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
** * * * ** * ***
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258 ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA
* *
29427 AAATAATATTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAG
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
29466 -AAGGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTT-T---AC----T-GAATCGGT-T-CCTATTTGGACA
1 TAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * ** ** *
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64 ATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
** * * *
29580 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAACTAATAACTAAGAGATTT
127 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTT
* * * *
29645 AAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGC-AGTTCAAATAGTTAAGACTA--T-AATAATTATCTCTTT
191 AAAAAATAAATGTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * *
29706 AAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGCTCATAGAAGCTTATTC-A
255 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAA
29769 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAG
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
29812 T-A-AG-TTATAACAAGTGAATCTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAACA
1 TAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * *
29873 ATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTGTT-TGAAT-ATTC
64 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATAC
** * *
29936 AATTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
127 AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAATAAGAGATT
* ** * * ** * * * ** *
30000 TAAAAAATAAATTTGTTTACTGATCCAGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAACAATTGTAAACTT
190 TAAAAAATAAATGTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
* * * * * **
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255 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* * *
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* * * ** * * * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * *
30236 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTTAATTCATA-AT
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** *
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190 TAAAAAATAA
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Statistics
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TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
Found at i:17278 original size:543 final size:534
Alignment explanation
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16375 TAACATTAAG
* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * **
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* * *
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* * * *
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* * *
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*
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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129 TCGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATA
* * * * * * *
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193 AATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTT
* * * * * * * *
17188 ATGATCTTTTATTTCGTCATAAAACAATTATATCAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAA
258 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * *
17253 TACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAA
322 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAA-TTATTTACCGA
* *** *
17318 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATCTCAAATAATTATGACAT-TTTGTT
386 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACATATTTGTT
* * * * * * *
17382 TTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCAA-AATAAATATTACTAGTTTATTA
451 TTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAATAA-AAATAATACTAATTTAATA
* *
17446 ATATTTCAAAAATTAATATGTAAA
515 ATATTCCAATAA-TAA-A--TAAA
* * * * * * * *
17470 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAGCA-AGTTTAAATAATTATG-CTGGTTTGAACAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CCA-AATAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTAAATAATTA
* * * *
17533 TTTATTTCAAATAGTTATGATCC-TTTGTTTTATCATAAAACAGTTGTTTCTATTCATGCAAGTT
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* * * * *
17597 TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATATGTAAGAGATTTTAAAA
126 TA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAA
* * * * *
17662 ATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATC
190 ATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* *
17727 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATGCAAAA--TTATTCAAAATAA
255 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCAT--AAAAGCTTATTCGAAATAA
* * *
17790 AATAATACCAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTT
317 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAA-TTATTT
* * * * *
17851 ACCGAA-ACAGCTT-AAATAGTTATTATTATTTGAATAATTATCTATCTAAAATCG-T-TATCAT
381 ACCGAACA-AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACAT
* * * * *
17912 ATTTATTTTGTTATAAAACAATTATTTCTTTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAA
444 ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AATAAAAATAATACTAA
* * *
17977 TTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
508 TTTAATAATATTCCAATAATAAATAAA
* * * * * * * *
18004 AGCTTTGAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTA-TTATAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTAT
* * * * * *
18068 CTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTCATACAATCTT
64 TTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT
* * * * * * *
18132 ATTCAAAATAAAATAATAGTGATTTATTAACATT-AAAATAATTAATGAGCAAAAGATTTAAAAA
127 ATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAA-AATTAATAAGTAACAGATTT-AAAA
* ** * * * *
18196 ATATAAATCTATTTATCAAATATGTTCAAATAGAT-TTGACTATTTGGACAATTATCTATTT-AA
189 A-ATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAG-TCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * * * * *
18259 AGTCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCATTTCATAAAAACTTATTAGAAAT
252 A-TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAAT
* * ** *
18324 AAAATAACACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTT-AAAACTAAAGTTGT
315 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAA-TTAT
* ** * * * * * * * **
18388 TTTCTAAACTAGTTTAAATAGTTAGGACTATTGGAACAAATATCAATCTCAAA-T-C-ATTATGA
379 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTA-TAACA
* ** * * ** *
18450 TCTTTGTTTCCTCATAAAGCAATCATTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGGACAAAAATAATACT
443 TATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTCAATAAAAATAATACT
* * *
18514 AATTTAATAATATTCCAA-AACTTAGTGAA
506 AATTTAATAATATTCCAATAA-TAAATAAA
* * ** * *
18543 GGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTCAAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTA-TTAGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTAT
* * * * * * * *
18607 TTATTTCAAATAGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCTTATAATAATTGTTTCAATTCATACACGCTTA
64 TTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * * *
18672 TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAGA
128 TTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTT-AAAAAA
* ** * * * *
18737 TAAATGTGTTTACCGAACAAGTTCAAAGAGTTATGACTATTTGAACAATTATCGATTTAAAATTG
191 TAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
* * * * * *
18802 TTAAGACCTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAGAAAAGCTTATTCAAAAGAAAAT
256 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * * * * *
18867 AATACTACTTTATTATTATTTCGAAAGTTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACT
320 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATTA-TTTACC
* * * * ** * * * ** * *
18932 GAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGACCAACTATTTATTTCAAATTATTATTACCT-TTT-
384 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACATATTTG
* * * * *** * * * *
18995 ATCTGTCATAAAGCAATTATTTTTCAAAAAATA-AATTGTTTA-CCGAACCAGTTCAAATAGTTA
449 TTTTGTCATAAAACAATTA--TTTCTATTCATACAA--GCTTATTC--A--A--T-AAA-AATAA
* * * ***
19058 TGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACATTTT
502 T-ACTAATTT----AA-TA-ATA-TTCCAA---TAATAA-ATAAA
** * * * * **
19102 ATTTTATAATAAAACAATTGT-TTCTATCCATACA-AGCTT---AT--TTA-GAATAAAATAATA
1 AGATT-TAA-AAAATAAATATATT-TA-CCA-A-ATAG-TTCAAATAGTTATGACT-ATTTAA-A
* * * * * * ***** * * **
19159 CTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAAT-AACTAATAGATATAAAAAATAAATCCATTTACCGAA
57 -TAA-TTATTTAT-TTC-AAATATT-ATGACCT-TTTG-T-TTTGTCATAAA-ACAATT---GTT
* * * ** * * * * **
19223 CCAATTCAAAC-AG-TTAAGACTATATGAACAATTATTTATCTTAAATTGT-TCTGACCTT-TTG
110 TCTATTCATACAAGCTT-ATTCGA-AT-AA-AA-TA-ATA-C-T-AATT-TAT-TAACATTCTAA
*** * * **** * * * *
19284 TTTTGTCATAA--AACAATTATTTTAGCTCATAGAA---GCTCATTCGAAATAAAG-TAAAACTA
164 AAAT-TAATAAGTAAC-A-GA-TTTAAAAAATA-AATCTGTTTATT-G-AA-CAAGTTCAAA-T-
* * * * ** * * *
19343 ATTTATTAATATTTGAA-AATTTATAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTACTGAACTAGTTCA
219 AGTCATGACTATTTGAACAA-TTAT---CTATTT----CA-AA--TT-GTTA-TGACCT--TT--
* * * * * * * * *
19407 AATAATTATATCTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATAATTATTAGTTTTTATTTTGTAATAA
267 --T-GTTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTCA-TTC--ATAA--A--AG--CTTA-TTCGAAATAA
* * ** * * * ** *
19471 AACAATATTGTTTGTTAATATAAGTTTGTTC-AAAA-TAA-AA-T-AG-CA-CTAATTTA-TTAA
317 AATAATACT-AAT-TT-AT-TAA-TAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAACTAAA
* * * * ** * * * *
19528 -TATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
375 TTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATA
* * * * * * *
19592 AC-TTTTTGTCTAT-T-ATAAAGCAA-TAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAA
440 ACATATTTGT-TTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AATAAAAATAA
* * *
19653 CACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAA
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19690 ATATTTAAAACATAAATATGCTTATCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATC
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* * * ** * *
19755 TA-TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAAAATCATTTCGATTCATATAAGCTTAT
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19819 TCAAAATAAAATAATACTAAGTTATCAATATTCTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATG
129 TC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATA
* * * * * * * * *
19884 AATATGTTTAATGAATAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGC
193 AATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAA-TAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * *
19948 TATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTG-AATAAA
257 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAA
* * *
20012 ATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATCTAACAAA-TAAATCTAT
318 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAACTAAAT-TAT
* ** * * * * * * *
20074 TTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACCT
379 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACAT
* * * *
20139 -TTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAA-AATATTA
444 ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTC--AATAAAAATAATACTA
* * *
20202 ATTTATTAATATTTTGGCAAATAATAAGTAAA
507 ATTTAATAATA--TT--CCAATAATAAATAAA
* * * * * *
20234 AGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACA-AGTTCAAATGGTCATGACTATTTGAGTAATTAA
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CCAA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTAT
* * * *
20298 TTATTTCAAATCAATGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTT
64 TTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT
* * * * *
20361 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAA
127 ATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAA
* * *** * * * * ***
20426 TTAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAACA
191 TAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
* * * * **
20490 TTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAA
256 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATAAAAGCTTA-TTCGAAATAAAA
* * * * *
20554 TAATA-TAAATTTATTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATATGTTTT
319 TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TATTTA
* * * * * * *
20617 CTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-T
382 CCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACATAT
* * *
20680 TTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAAT
446 TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCA-ATA-AAAATAATACTAAT
* *
20744 TTATTATAAT-TTCAAAAAATAATAAGTAAA
509 TTA--ATAATATTC---CAATAATAAATAAA
* * * * * ** **
20774 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGCA-AGTTCGAATAGTTATGACCCTTCGAATAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTAC-CA-AATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTAT
* * **
20838 TTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTA
64 TTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
* * ***
20903 TTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAT
128 TTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAAT
** * * * *** **
20967 AAATCTACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTGTTATCTATTTCAAATCAT
192 AAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * ** * *
21032 TATGACATTTTG-TTTGTCGTAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAA-ATTATT-AAGAATAAAA
257 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATA-AAAGCTTATTCGA-AATAAAA
* * * *
21094 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAGAATTAAATCTGTTTAT
319 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TATTTAC
* * * ** *
21155 CAAACCAA-TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAA-T-C-ATTATGATCT
383 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTA-TAACATAT
* ** * * * * * *
21216 TTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAACTTATTGAAGT-AAAATATTGCTAAAT
446 TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAA-TAAAAATAATACTAATT
* * *
21280 TAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
510 TAATAATATTCCAATAATAAATAAA
* * *** * ** ** * * *
21305 AGCTTTGAAAAATAAATGCGTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTA-TTAGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CCAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTAT
** * * *
21369 CAATTTCAAATTATTCCT-ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCT
64 TTATTTCAAA-TATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT
* * * * * * *
21432 TATTTAGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACTTTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAATA
126 TA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTT-AA-A
* ** *
21497 AAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGAT-TTGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AA
188 AAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAG-TCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* *
21560 AGTTGTCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTTCATAAAAACTTATTCGAAAT
252 A-TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATAAAAGCTTATTCGAAAT
* * *
21625 AAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAACTAAAGTTGT
315 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAA-TTAT
*** * * * * * **
21689 TTTTTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAA-T-CAATATGAT
379 TTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACAT
* * * * * * *
21752 CTTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGAATAAAAATAATATTA
444 ATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTCAATAAAAATAATACTA
*
21816 ATTTAATAATATTCCAA-AA-AATAGTGAA
507 ATTTAATAATATTCCAATAATAA-A-TAAA
* * * * *
21844 AGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAACAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTAT
* * * * * * * * ** * *
21908 CTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTAATAT-TTAGAA-AATT-AAT-TAGT-A-A-GAG---
64 TTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT
* * * ** * * ** * * * *
21963 ATT-TAA-AAAATAAAACT-GTTTACCAAACCATT-T-CAAA-TAGT-TTTGAC-TATTTGAATA
127 ATTCGAATAAAATAATACTAATTTA-TTAA-CATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAA
* * * * * * ** *
22020 AT-TATCTATTTCAATTTGTTATAACCTTTTATTTTGTCAT--C-A----AACAATTAGTTCTA-
190 ATAAATCTGTTT--A-TTG-AACAA--GTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTA--TCTAT
* ** * * ** *
22076 TTC--A----TACT-A--TTTTATTCAG-AATAAAATAA-T-ACTAATT--TAATAA---TATTC
247 TTCAAATTGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTCATAA-AAGCTTATTC
* * * * * *
22124 CAACACT-TAAT-A-ACTAA--GA--AA-A-TTAAAAAATAAATCTAATTGT-CGA-ACCCTTTC
310 GAA-A-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA--TAA--GTAAGAGA---TTT-
* * * * * * * * * *
22178 AAATAGTAAGACTACATGAACGATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG--T-TTTGTC
365 AAAAACTAA-ATTA-TTTACCGA--A-CAAGTTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAATAATTATC
*** * * * ** * *
22238 -ATAAAACAATTGTTTTTGATCATACATGCTTAT-TCA-AAAA-AA--A----TAAT-AT-CAA-
423 TATCTCA-AATTG-CTAT-AACATATTTG-TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAG
* * *
22290 --T-TT--AT-----TAATA-T--TTCAA-AA-A-T----TAATAAGTAAG
484 CTTATTCAATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAATAATAAATAAA
* ** * * * * *
22321 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGTAGTTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTACC-AAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATT
* * * * * *
22386 AATCTCAAATCATTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTGA-TCATA-GAGCTTA
65 TATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA
* ** * * * * *
22448 TTTGGTTAAAAATACTACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
128 TTCGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAAT
* * * * * * ** * * * * **
22513 AAATATGTTTGTCGAACCAGTTTAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATATATTTTAAATCAT
192 AAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
* * * * * * * * * * *
22578 TTTGACCTTTTGTCTAGTTAGAAAATATTTGTTTCATATCTTACAATCTTATT-GGAATAAAATA
257 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TCATAAAAGCTTATTCGAAATAAAATA
* * * * * * * *
22642 ATCCAAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGGAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATC
321 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAACTAAAT-TATTTACC
* * * * * * *** * *
22707 GAACAAATTCAAATAGTGATGACTATTTGAA-CATTATTTATTTAAAATCATTATAACCT-TTTA
384 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACATATTTG
* * * *
22770 TTTTGAT-ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTT
449 TTTTG-TCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAATA-AAAATAATACTAATTT
** * * *
22833 CTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCA
511 AATAATATTCCAATAATAAATAA--A
* ** * *
22859 AGAGTTTAAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACA-AATTCAAATAGTTACAACTATTTGAACAAT
1 AGA-TTT-AAAAAATAAATATA-TTTACC-AA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAAT
* * * * * *
22922 TGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAACAATTGTTTCAATTCATAGAAGC
61 TATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGC
* * ** **
22987 TTATTCAAAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTGGAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAA
125 TTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAA
* *** * * ** * * *
23051 AGTAAATCTGTTTACCAAATCAA-CTCAAATAATTGTGGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAA
189 AATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * *
23115 TTGTTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATT-ATACAAGTTTATTC-AGAA
253 TTGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCATTCATAAAAGCTTATTCGA-AA
* * * * *
23177 TAAAATAATAGTATTTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
314 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TA
** * * * * * * *
23242 TTTACTAAACAA-TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAGTTGTATA-CTTCAAATAGTTATAAC
378 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATC-TCAAATTGCTATAAC
* *
23305 CT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
442 ATATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAATA-AAAATAATACT
* * *
23369 AATATAA-AATATTCCAAAAATTAATAACTGA
506 AATTTAATAATATTCCAATAATAAATAA---A
* * * * * * * * * ***
23400 GAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACTAATTTAAATAGTTAAGACTATATGAACCGTTA
1 -AGATTT-AAAAAATAAATATATTTACCAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTA
* ** * *
23465 TTTATTTC-AA-A-TA--A---TTT-TTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTAAATTCACATTAA-CT
63 TTTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATA-CAAGCT
* * * * * *
23519 TATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATT--CATACTAAAAAAATTAATATGTAATAGGTTTAA
126 TATTC-GAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCT--AAAAATTAATAAGTAACAGATTTAA
* * * *
23581 AAAATAATTCTGTTTACCT-AACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-T-TTTG
187 AAAATAAATCTGTTTA-TTGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-
* * * * ** * * * *
23642 CAACTAGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-TAG
249 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCATTCATAAAAGCTTATTCGA-
* * * *
23705 AATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATC
312 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-
* * * * * *** * * * *
23766 TGTTCATCAAATC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATG
376 TATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATA
* * * * * * * *
23830 AC-T-TTTATTTTCTATTATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACACGCTTATTCGATTAAAATAA
440 ACATATTT-GTTT-TGTCATAAAACAATTA-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCAATAAAAATAA
* * * *
23892 TACCATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAA
502 TACTAATTTAATAATA-TTC--CAA-TAATAAATAAA
* * ** ** * ** * *
23929 AAATTTTAAAAATAAATATGCTTATTGAACTAAATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATC
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CCAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTAT-
* ** *
23994 TTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATCATTT-TAGTTCATATAAGCTT
64 TTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT
* * * * * *
24056 ATTCAAAATAAAAT-ATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA-TTAGATATTTAAAAAA
127 ATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAA
* * * * * * * *
24119 TAAATCTATTTAATG-ATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTTGAGCAATTATCTATTTGAAATT
191 TAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* * * * *
24183 -TACTATTTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTAATTCATCATAAA-CTTTATTTT
255 GT--TA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTC--ATTCAT-A-AAAGC-TTA-TTC
* * * * *
24246 G-AATGAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATA
310 GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACT-
* * ** * * *
24308 AAATATTTTTACCAAACAAGTTCAAATTCTTTATGATCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATT
372 AAAT-TATTTACCGAACAAGTTCAAA-TAGTTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATT
** * * * * * *
24373 TTTATGACCT-TTTGTTTTGTCAATAAACACAATTGTTTCTATTCATAC-AGCTTATTTGGATTT
434 GCTATAACATATTTGTTTTGTC-ATAAA-ACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TT-CAATA
* * *
24436 AAAA-AATA-TAATTTATTAATATTTGACAAATAATAAGTAAA
495 AAAATAATACTAATTTAATAATA-TT--CCAATAATAAATAAA
* * * * * *
24477 TA-TTTTAAAAAAATAAATAATGTTTA-CAGAACAGTTCCAATATAGTCATGAATATTTGAATAA
1 -AGATTT-AAAAAATAAAT-ATATTTACCA-AATAGTT-CAA-ATAGTTATGACTATTTAAATAA
* * * *
24540 TTAATTATTTCAAATCATTGTGACC-TTT-TTTT-TAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAA
60 TTATTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * *
24601 GCTTATTTGAAATAAAAATAATAATAATTTATTAA-ATAT-TATAAAATTAATGAGTAGAGAGAA
123 GCTTATTCG-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAACAT-TCTA-AAAATTAATAAGTA-ACAGAT
* * ** * * *
24664 TT-AAAAATTAATCTATTTACAGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATT
183 TTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATT
*** * * ** ** *
24728 TCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATTGGTTTTGTTCATGCAAGTTTATTTC-
248 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCATTCATAAAAGCTTA-TTCG
* * * *
24792 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCTAATAGTTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAA
311 AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAA
* * ** * * * *
24854 ATATGTTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTA
374 AT-TATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTA
* * * * * *
24919 TGACCT-TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATATAGAAT-AAAATA
438 TAACATATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTAT-T-CAATAAAAATA
* *
24982 ATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAATTAATAAGTAAA
501 ATACTAATTTAATAATATTCC--AA-TAATAAATAAA
* * *** ** * *
25018 AGATTT-AAAAATATATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTATGACCCTTTGAACAATTATT
1 AGATTTAAAAAATAAATATATTTACC-AAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATT
* * **
25082 TATTTC--A-A--AT--CATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATT
65 TATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * * * ***
25140 TGAA-ATAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAATAATTAATAGGTTGGAGATTT-AAAAAT-A
130 CGAATA-AAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATAA
* *** * ** **
25202 ATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTA
194 ATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA
* ** * *
25267 TGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAA--ATATT-TAGAAT-AAATA
259 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATA-AAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * **
25328 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAGAATTAAATCTATTTGTCG
321 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAAT-TATTTACCG
* * * * ** * *
25389 AACCAGTTCAAATACTTATGGCTATTTGAAGCAATTATCTATCTCAAATTG-T-TATGATCTTTA
385 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATCTCAAATTGCTATAACATATTTG
* * ** * * * * * *
25452 TTTTGTAATAAAACAACTGCTTCTGTTGATACAAACTTATTC-ATAGTAAAATATTGCTAAATTA
449 TTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAATA--AAAATAATACTAATTTA
* *
25516 ATAATATTCTAA-AA-AAAGAAA
512 ATAATATTCCAATAATAAATAAA
* * * * * *
25537 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAATTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAATTA
1 -AGATTTAAAAAATAAATATATTTACC-AAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AATAATTA
* * * * * * * *
25601 TCTATTTCAAATCATTCTTATC-TTTATTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCT
63 TTTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCT
* * * ** * *
25664 TATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAA
126 TATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGA-TTTAAAA
* * * *
25729 AATAAATCTGTTTATTG---AATTTCAAATTGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTT-AGAA
189 AATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA
*** * *
25790 TAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTCTT-AGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAAT
253 TTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCA-TTCATAAAAGCTTATTC-GAAAT
* * ** * * *
25853 AAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAACCAATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAGTCAG
315 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTA-
* * *** * * * * * * *
25917 TTTATCAAATTGGTTTAAATAATTATG-GTCACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAA-
378 TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAATAATTATCTATCTCAAATTGCTATAAC
* * * *
25980 ACT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATA
442 A-TATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAATA-AAAATAATA
* * * *
26043 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
504 CTAATTTAATAATATTCCAATAATAAATAA--A
* * * * * * *
26076 GGAGGTTTAAAAAATAATTTTGTTTA-C---T-G---AACTAGTT-T--CTATTTGAACAATTAT
1 --AGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTAT
* * * * * * *
26130 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTT
64 TTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT
* * ** * * * * *
26194 ATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTTTTAAAATTGATAA-CAAGGAGATTTAAAAA
127 A-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCTAAAAATTAATAAGTAA-CAGATTT-AAAA
* * * ** * * * * * * *
26258 AATAAACCTATTTGCTAAAACAA-TTCAAACAATTAAGACTATATGAACAATTATTTGTTTACTA
189 AATAAATCTGTTT-ATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-C-A
** * * * * ***
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* * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * ** *
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* * *
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* * * * * * *
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*** * *
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19391 TTACTGAACT
* * * *
19401 AGTTCAAATAATTATATCTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATTAGTTTTTAT-TTTG
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACTTTTTATCTAT-
* * * *
19465 TAATAAAACAATA-TTGTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAGCACTAATTTATTAAT
65 T-ATAAAACAATAGTT-TTTGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAAT
19529 ATTTATCAAACC
128 ATTTATCAAACC
* * * * ** *
19541 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTCTATT
1 AGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACTTTTTATCTATT
* * ** *
19606 ATAAAGCAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACACTAATTTATTAATATT
66 ATAAAACAATAGTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATT
19671 T
131 T
19672 CAACAATTAA
Statistics
Matches: 109, Mismatches: 20, Indels: 5
0.81 0.15 0.04
Matches are distributed among these distances:
139 54 0.50
140 53 0.49
141 2 0.02
ACGTcount: A:0.38, C:0.09, G:0.08, T:0.45
Consensus pattern (139 bp):
AGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGACTTTTTATCTATT
ATAAAACAATAGTTTTTGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATT
TATCAAACC
Found at i:19817 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 19530--21932 Score: 2230
Period size: 180 Copynumber: 13.4 Consensus size: 181
19520 TTTATTAATA
* * * * * ** *
19530 TTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACT
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * *
19595 TTTTGTCTAT-T-ATAAAGCAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACACTA
66 TTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTA
* * * *
19658 ATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAACATAAATATG
130 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * *
19710 CTTATCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCGTTATGACC
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * ** * * **
19774 TTTTATTTTGTCATAAAAAAATCATTTCGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
19839 GTTATCAATA-TTCTGAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATG
131 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * ** *
19890 TTTAAT-GAATAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAA
1 TTT-ATCGAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * * **
19953 CTTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA
64 CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATA
* * * *
20018 CAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATCTAACAAATAAATCTA
127 CTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * ** * * **
20073 TTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACC
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * *
20138 TTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAAAATATTAA
66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAA
*** * *
20203 TTTATTAATATTTTGGCAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATA
131 TTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * ** * *
20254 TTTATCGAACAAGTTCAAATGGTCATGACTATTTGAGTAATTAAT-TATTTCAAATCAATGTGAC
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * *
20318 CTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT
* * * * *
20381 AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTA
129 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * * *
20434 TTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACT
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * *
20498 TTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TA
66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACT-
* *
20561 AATTTATTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATG
129 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* **
20613 TTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA
1 TTTATC-GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * *
20676 CCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT
64 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT
*
20741 AATTTATT-ATAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
129 AATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * ** * * * * *
20794 TTTA-CTGAGCAAGTTCGAATAGTTATGACCCTTCGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGAT
1 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
** * *
20858 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGTAATAAAATAATACTA
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTA
* *** *
20923 ATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTA
130 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * ***
20974 CTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATTGTTATCTATTTCAAATCATTATGAC
1 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * ** ** **
21038 ATTTTG-TTTGTCGTAAAATGATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTAAGAATAAAATAATACTA
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTA
* *
21102 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAGAATTAAATCTG
130 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * *
21150 TTTATCAAACCAA-TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGAT
1 TTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * *
21214 C-TTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAACTTATT--GAAGTAAAATATTGCT
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATACT
* * * * *
21276 AAATTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG----AGCTTTGAAAAATAAATGC-G
129 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-CTG
* * * * * * * * *
21325 TTAATTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATTATTCCT-AC
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGAC
* * ** *
21389 CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAGT
65 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT
* * * *
21453 AATTTATTAA-CTTTCAAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAATAAAATAAATCTA
129 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA-AAAATAAATCTG
* ** *
21508 TTTATCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTCATGA
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGA
* * *
21571 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTTCATAAAAACTTATTCGAAATAAAATAATAC
64 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAC
* * * *
21635 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-AAAACTAAAGT-TG
128 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCTG
* * * * * * * *
21688 TTTTTTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCAATATGATC
1 TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
21753 -TTTGTTTTCTTATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAAATAATATT
66 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAAT-AAAATAATACT
* * * * *
21815 AATTTAATAATA-TTCCAAAA--AAT-AGTGAAAGATTTAAAAAATAAATGTA
129 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
* * * * * *
21864 TTT-GCTAAACGAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAAC
1 TTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
21928 CTTTT
65 CTTTT
21933 ATTAATATTT
Statistics
Matches: 1816, Mismatches: 337, Indels: 143
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 5 0.00
175 113 0.06
176 205 0.11
177 36 0.02
178 20 0.01
179 222 0.12
180 599 0.33
181 315 0.17
182 17 0.01
183 278 0.15
184 6 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG
Found at i:20766 original size:540 final size:541
Alignment explanation
Indices: 19543--30370 Score: 5785
Period size: 540 Copynumber: 20.3 Consensus size: 541
19533 ATCAAACCAG
* * * * *
19543 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTCTAT-T-
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT-TTTGTC
* * * * * *
19606 ATAAAGCAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAACACTAATTTATTA-ATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-AT
* * * * * * * * *
19670 TTCAACAATTAATAAGTAAAATATTTAAAACATAAATATGCTTATCAAACTAGATCAAATAGTCA
129 TTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * **
19735 TGACTATTTGAATAATTATCTA-TTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-AAATCA
194 TGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * ** * * *
19798 TTTCGATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATCAATATTCTGAAAATTAAT
259 TTTAG-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
* * * * *** * * *
19863 AATTAAGAGATTTAAAAAATGAATATGTTTAATGAATAAATTTAAATTA-TTATGACTATTTGAA
323 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAA
* * ** * * * *
19927 CAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTTCTATTCAT
387 CAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CA-GTTGTTTCTATTCAT
* * *
19992 ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAG
450 ACAAACTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAA-
* * * * *
20055 ATCTAACAAATAAATCTATTTACCAAACAA
512 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAACAA
** * *
20085 GTTCAAATCTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCTAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
20150 ATAAAGCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAAAAATATTAATTTATTA-ATAT
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-AT
**** * * *
20214 TTTGGCAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCGAACAAGTTCAAATGGTCA
129 TTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
20279 TGACTATTTGAGTAATTAAT-TATTTCAAATCAATGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAAACAATTG
194 TGACTATTAGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
*
20342 TTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
258 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
* * * * * *
20407 GAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATG-CTATCTGAAT
323 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * *
20471 AATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGGTTCTATTCATGCA
388 AATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTATTCATACA
* *
20536 AGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA
453 AACTTATTTCGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA
* *
20600 AAAAATAAATATGTTTTCTGAACACA
517 AAAAATAAATCTGTTTTCTAAACA-A
*
20626 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
20691 TAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTATAATTT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATAATTT
* * *
20756 CAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAGCAAGTTCGAATAGTTAT
131 CAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGTTAT
** * * * *
20820 GACCCTTCGAATAATTATTTATTTCAAATCATTTTGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
195 GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** *
20885 TCTA-TTCATACAATTTTATTTGTAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATA
260 T-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
** * ** * **
20948 AGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATT
324 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
21013 GTTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTG-TTTGTCGTAAAA-TGATTGTTTCTATTCATACA
389 ATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAG-TTGTTTCTATTCATACA
* ** *
21076 AAATTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
453 AACTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* *
21138 GAATTAAATCTGTTTATC-AAACCAA
518 AAAATAAATCTGTTT-TCTAAA-CAA
* * ** * *
21163 TTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
21227 TAAAACAATTGCTTCTGTTCATACAAACTTATT--GAAGTAAAATATTGCTAAATTA--ATAATA
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTATAAT-
* * * * ** * * * *
21288 TTCCAAAAAT--TAA-TAAGAGCTTTGAAAAATAAATGCGTTAATTGAACCAGTTCAAATAATTA
129 TTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
21350 AGACTATTAGAACAATTATCAATTTCAAATTATTCCT-ACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTA
194 TGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* *
21414 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATAGTAATTTATTAACT-TTCAAAAAATTA
258 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCTAAAAATTA
* * * *
21477 ATGAGCAAAAGATTTAAATAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATT
321 ATAAGTAAGAGATTT-AA-AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATT
** * *
21541 TGAACAATTATCTATTT--AAAGTTGTCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AT
383 TGAACAATTATCTATTTCAAAACAT-T-ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTA-
* * *
21603 TTCATAAAAACTTA-TTCGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCA
445 TTCATACAAACTTATTTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
* * * * *
21667 AGAGATTT-AAAACTAAAGT-TGTTTTTTGAACTAG
509 A-AAATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTTCTAAAC-AA
* * * *** * * *
21701 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCAATATGATC-TTTGTTTTCTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
21765 TAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGAATAAAAATAATATTAATTTA--ATAAT
66 TAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTATAAT
* * * * * * *
21826 ATTC-CAAAA-AAT-AGTGAAAGATTTAAAAAATAAATGTATTT-GCTAAACGAGTTCAAATAGT
129 -TTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
21887 TATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTATTAATAT-TTAGAA-AAT
192 TATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAAT
** * * * ** * *
21950 T-AATTAG-T-A-A-GAG---ATTT--AA-AAAATAAAACT-GTTTACCAAACCATT-T-CAAA-
256 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA-TTAA-TATTCTAAAAAT
* ** * * * * *** ** *
22000 TAGT---TTTGACTATTTGAATAAT-TATCTATTT--C-AATTTGTT-ATAA-CCTT-TTA-T-T
319 TAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA-AATAGTTATGACTAT
* ** * * ** * ** * * * *
22053 TTGTCATCAAACAAT-TAGTTCTATTC---AT-ACTATTTTATTCAG-AATAAAATAATACTAAT
382 TTG--AAC-AATTATCTATTTCAAAACATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAGT--T-GT
* * * ** * * * ** * *
22112 TTAATAAT-ATTCCAACACTTAATAACTAAGAAAATTAA-A-AAATAAATCTAAT-TGTCGAACC
440 TT-CTATTCA-TACAA-ACTT-ATTTCGAATAAAA-TAATACTAATTTAT-TAATATTTC-AA-A
** * * * * * *
22173 CTTTCAA-ATAGT-AAGA-CT---ACATGAA-C-GATTATCT----AT
497 AATT-AATA-AGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTG-TTTTCTAAACAA
** * *** * * **
22209 TTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG---TTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTGATCATACATGCT
1 TTCAAAT-AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATTG-TTATGA-CCT-TTTG-T
* * * * ** *
22268 TAT-TCA-AAAA-AA------ATAAT-AT-CAA-TTTATT---AAT-ATTTCAA-A--AA-TTAA
59 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAAT-AATACTAATTTAT
* * * * *
22313 TA------------------AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAA
123 TATAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAA
* * * * * * * *
22360 TAATTATGACTATTTGAGTAGTTATCAATCTCAAATCATTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAC
188 TAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** * * *
22424 AATTATTTCT-GATCATA-GAGCTTATTTG-GTTAAAAATACTACTAATTTAATAATATTCCAAA
253 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
* * ** * * * **
22486 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAACCAGTTTAAATAGTTAAAACTA
316 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * * * * * * * * *
22551 TTAGAATAATTATATATTTTAAATCATTTTGACCTTTTGTCTAGTTAGAAAATATTTGTTTC-AT
381 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTAT
* * * * * * * *
22615 ATCTTACAATCTTA-TTGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGGAA
446 -TCATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* *
22679 AAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACAAA
510 AA-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAAC-AA
* * * ** * *
22714 TTCAAATAGTGATGACTATTTGAAC-ATTATTTATTTAAAATCATTATAACCTTTTATTTTGAT-
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-TC
* * ** *
22777 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTA-ATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-A
* * * * *
22840 TTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACAAATTCAAATAG
128 TTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATAT-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAG
** * * * * *
22903 TTACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAACAAT
191 TTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * ** **
22968 TGTTTCAATTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTGGAAATTA
256 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * * * * * *
23032 ATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAATCAA-CTCAAATAATTGTGGCCATTTC
321 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
*** * * * * *
23096 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATT-
385 AACAATTATCTATTTCAAAACATTA-TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTG-TTTCTATTC
** * * * *
23159 ATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATAGTATTTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAGTAAGA
448 ATACAAACTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A
* * *
23223 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
511 AATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAACAA
* * * * * * * * *
23254 TTTAAATAATTATGACTATTTGAATAGTTGTATACTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * ** *
23319 TAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATAAAAT-ATTC
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATAATTT
* * * * * * * *
23383 CAAAAATTAATAACTGAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACTAA-TTTAAATAGTT
131 CAAAAAATAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTATC-GAAC-AAGTTCAAATAGTT
* *** * *
23446 AAGACTA-TATGAACCGTTATTTATTTC-AA--A-TA--A---TTT-TTTTGTCATAAAACAAAA
193 ATGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT
* * * * ** * * * **
23500 T-TTTAAATTCACATTAA-CTTATTCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATACTAAAAAAAT
256 TGTTTTAGTTCATA-CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * * * * *
23562 TAATATGTAATAGGTTTAAAAAATAATTCTGTTTACCTAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATT
319 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * *
23626 TGAACAATTAT-T-TTTGC--AACTAGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTG
383 TGAACAATTATCTATTT-CAAAAC-A-TTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTA
* ** * * * * *
23686 TTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---
445 TTCATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
23748 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTCATC-AAATCAG
510 AAATTTAAAAAATAAATCTGTT-TTCTAAA-CAA
* ** * * *
23781 TTTAAATAGTTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTATTTTCTAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTT-GTTT-TGT
* * * * * * * *
23845 TATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACACGCTTATTC-GATTAAAATAATACCATTTTATTA-ATA
64 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-A
* * * * * * *
23908 TTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGCTTATTGAACTAA-ATCAAATAGT
128 TTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGT
* * *
23972 CATGACTATTTGAATAATTATCTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAT
192 TATGACTATTAGAATAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * ** *
24035 CATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTA
256 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * * *
24099 ATAA-TTAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTA--ATGATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTT
321 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTT
* * * * * *
24161 GAGCAATTATCTATTTGAAATTTACTATT-T-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCT
384 GAACAATTATCTATTTCAAA---AC-ATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAGTTGTTTCT
* * * *
24224 AATTCATCATAAACTTTATTTTGAATGAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAAT
444 -ATTCAT-ACAAAC-TTATTTCGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT
* * *
24287 AAGTAAAAGATCTAAAAAATAAAATAT-TTTTACCAAACAA
504 AAGTAAAA-ATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTT-CTAAACAA
** * *
24327 GTTCAAATTCTTTATGATCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTTG
1 -TTCAAA-TAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* *
24392 TCAATAAACACAATTGTTTCTATTCATAC-AGCTTATTTGGATTTAAAA-AATA-TAATTTATTA
63 TC-ATAAA-ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGA-ATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
24454 -ATATTT-GACAAATAATAAGTAAATA-TTTTAAAAAAATAAATAATGTTTA-CAGAAC-AGTTC
125 TA-ATTTCAAAAAATAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAAT-ATGTTTATC-GAACAAGTT-
* * * * *
24514 CAATATAGTCATGAATATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACC-TTT-TTTT-TAA
184 CAA-ATAGTTATGACTATTAGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
24575 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATAATAATTTATTAAATAT
247 TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATT-AATAT
* * * * *
24640 TAT-AAAATTAATGAGTAGAGAGAATT-AAAAATTAATCTATTTA-CAGAACATGTTCAAATAGT
310 TCTAAAAATTAATAAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
24702 TATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAAATT
373 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTT
* * ** * * *
24767 GGTTT-TGTTCATGCAAGTTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCTAATAGT
438 -GTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAAT
* *
24829 TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACACG
500 TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAACA-A
* *
24872 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *
24937 TAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTA-AA-T
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATAATT
* * * * * * * *
24999 TCCAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATATATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTTAT
130 TCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
** * * * *
25063 GACCCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATC------A--TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT
195 GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** *
25120 TCTA-TTCATACAATTTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTCTAATAATTAATA
260 T-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* ** * * * * **
25183 GGTTGGAGATTT-AAAAAT-AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAATT
324 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * *
25246 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-TGATTGTTTCTATTCATACA
389 ATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAG-TTGTTTCTATTCATACA
* * *
25310 AA-ATATTTAGAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
453 AACTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAA
* * * * * *
25370 GAATTAAATCTATTTGTCGAACCAG
518 AAAATAAATCTGTTT-TCTAAACAA
* * * * * *
25395 TTCAAATACTTATGGCTATTTGAAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * ** * * * *
25459 ATAAAACAACTGCTTCTGTTGATACAAACTTATTCATAGTAAAATATTGCTAAATTA--ATAATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATAAT-
* * *
25522 TTC--TAAA-AA-AAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATAGT
129 TTCAAAAAATAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAAC-AAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
25581 TAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTTATC-TTTATTTAGTCATAAAATAATT
192 TATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* ** * * *
25645 GTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAA
257 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
** * * *** * * * * *
25710 TAAACAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTT---ATTGAATTTCAAATTGTCATAACTATTTAA
322 TAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
25772 ACAATTATCTATTT-AGAATA-AATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTCT-TAGTTC
386 ACAATTATCTATTTCA-AA-ACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTA-TTC
* ** * * **
25834 ATA-AAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAACCAATAAGTTAAA
448 ATACAAA-CTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAA
* * * ***
25898 GATTTAAAAAATAAGTCAGTTTATC-AAATTGG
511 AATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAA-CAA
* * * * * ** *
25930 TTTAAATAATTATG-GTCACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * ** *
25994 ATAAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTA-ATA
65 ATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-A
* ** * * *
26057 TTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGGTTTAAAAAATAATTTTGTTTA-CTG---AA---C---TAGT
128 TTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * *
26112 T-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATT
192 TATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
26174 GTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTTTTAAAATTGA
257 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA
* * * * * * * *
26239 TAA-CAAGGAGATTTAAAAAAATAAACCTATTTGCTAAAACAA-TTCAAACAATTAAGACTATAT
322 TAAGTAA-GAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
26302 GAACAATTATTTGTTTACTAAAA-ATTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTA-T
384 GAACAATTATCTATTT-C-AAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTATT
* * * * *
26365 CATTCCAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAACAAG---A
447 CATACAAACTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * *
26426 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAG
511 AATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAAC-AA
* * * * * * * *
26458 TTTAAATA--TATGACTATTTGAACAATTGT-AACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * * *
26520 TAAAACAATTATTTTTGCTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATCTA--ATAATAT
66 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTATAAT-T
* * * * * * * *
26583 TCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTGAACTAGTTTAAATATT
130 T-CAAAAAATAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTCAAATAGT
* *
26646 TAAAGACTA-TATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
192 T-ATGACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* *
26710 GTT-TTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAA-AA-A-TGAATTTATTAATATT-TCAAA
255 -TTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAA
* * * * * * *
26770 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAATTCTGTTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGATTA
316 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * *
26835 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTGT
381 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGTTTCTAT
* * * * * * * *
26900 TCATA-TAAGTGT-GTTCAAATAAAGTAATATTAATATATTAATATCTCAAAAATTAATAAG---
446 TCATACAAACT-TATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* *
26960 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAA
510 AAATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAACAA
* * ** *
26992 GTTCAAATAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTA-TTCAAATCATTATGACTTTT
1 -TTCAAATAG-T----TA----TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTT
* *
27056 TGTTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTATT--T-CAA--TTA--C----T--AAT--T--T-A-TT
56 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * *
27102 A--AT-ATTTCGACAATTGATAAGTAATTA-ATTTAAAAAGTAAATATGTTTA-CTGAACTAGAT
121 ATTATAATTTCAAAAAATAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTT
* * * * *
27162 CAAATAGTCATGACTATTTGGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCTT
184 CAAATAGTTATGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * ** * ** * * *
27227 AAAA-AATTATTTCAATTCATGTAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTAT
248 AAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT
* * * * **** * * *
27291 GAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAACAAGTTTAAATAATTTTGA
313 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * * *
27356 CTATTTTG-ATAATTATCTA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TGATT-T
378 CTA-TTTGAACAATTATCTATTTC-AAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAG-TTGT
** * *
27417 TTCTATTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAC-AACTTATTAATA-TT-AAGACAATTAA
440 TTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAA
* *
27479 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTATC-GAACAA
503 TAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTT-TCTAAACAA
** * * * *
27518 TTTCAAATCTTTATGACTATTTGAAAAATTATTTATTTGAAATTGGTTATGACTTTTTGTTTTTG
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTATGACCTTTTG-TTTTG
* * * * * * * * * * *
27583 TCGTAAAATAATTATTTCT-GTCATACATGTTTATTCCGATTCACAAAT-AT-TTATTTTTTTAA
63 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAAT-A-AAATAATACTAATTTATT-A
* * * * * * *
27645 TATTTTCGACAATTAAT-AGT-AGA-ATTTAAAAAAATAAATTATTGTTTTTCCAACAAGTTCAA
125 TAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAA-TA-TGTTTATCGAACAAGTTCAA
* * * * * * *
27707 CTAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTGTAAT-AAA
187 ATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
27770 CAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATCTTCCAA
252 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTCTAA
* * * * *
27834 AAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAA-AGGAATCT-TGTTACCGGAACATGTTC-AATAGGTTA
315 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA--AATCTAT-TTACC-AAACAAGTTCAAATA-GTTA
* ** * * * * *
27896 TGACTATATGAATTATTATCTATTTC-AATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
375 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGTTGT
* * * **
27960 TTTTAGTTCATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATA-TTCCGAAATGTA
440 TTCTA-TTCATACAAACTTATTTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-T-
* * * * * *
28022 AATTGAGAAAGAGGAATTTAAAAAATGAATCTTGTTATC-GAACATG
501 AA-TAAGTAA-A--AATTTAAAAAATAAATC-TGTTTTCTAAACA-A
* * * *** * *
28068 TTTAAATCAGTTATGACTATCGTGAACAATT-TCTATTTTAAAAACATTATGACATTTTGTTTTT
1 TTCAAAT-AGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * **
28132 TCATAAAAC-ATCTAG-TTCTACTCATTGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATTAATAAAAATTTAT
63 TCATAAAACAAT-T-GTTTCTATTCA-TACAAGCTTA-TTCGGAATAAAA-TAATACTAATTTAT
* * * * ** **
28194 TA-ATATTTCAAAAATTAATGAGTAAAA-ATTT--AAAATAAATATATTTTTTTAACACTTGTCA
123 TATA-ATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGT-TCA
* * *
28255 AATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTGGTCATAAA
186 AATAGTTATGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * *
28319 CCAATCGTTTCTA-TTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCTAACTTATTAAAATTC--
251 ACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTCTA
* * **** *
28380 AAAATTAATAAGGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATTCTGTTTA-TTGGCGAGTTCCAAATAGTTA
314 AAAATTAATAA-GTAAGAG-ATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACCAAACAAGTT-CAAATAGTTA
* * * * * * *
28444 TGACTATTTTGAACAATTATTTCTTTC-AAACGTACTAT-AATCTTTTGTTTTATTAT-AAACAA
375 TGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAAAC--ATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAG
**
28506 TTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-GAA-ATAAATAATTACTAATTTATTAATA-TTCTAAAA
436 TTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATA-AAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
** * * * * *
28568 ATTAACTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAGC
498 ATTAA-TAAG-TAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAACA-A
* * ** * * *
28615 CTCAAATAGTTCAT-ATCCATTTGAACTGCTTATTCTCTATCAAATTGTTATGGACATTTTTGTT
1 TTCAAATAGTT-ATGA-CTATTTGAAC-AATTA-TCTATTTCAAATTGTTAT-GAC-CTTTTGTT
** * *
28679 TTGT--TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTA
60 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
28742 GT-ATTTC-AAAAAT--TAA-TAAAAGATTTAAAAACTTAATCTGTATATCAAACCAA-TTCAAA
125 -TAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAA
* * * * * *
28801 TAATTATGATTTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA--TATTTGTTTTGTCATAAA
188 TAGTTATGA-CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * *
28864 GCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATATTCTAA
251 ACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTCTAA
* * * * *
28928 AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGAA
315 AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * *** * * * *
28988 TATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-CTTGTCATAAAATAGTAT-TTT-
379 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAGT-TGTTTC
** * **
29050 TAGTTCATACATGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTT-AGAAAATTAATA
443 TA-TTCATACAAACTTATTTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATA
** * * * *
29113 AACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAA
505 AGTAA-AAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAACAA
* *** *
29152 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATG--CTTTTGTTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
29215 ATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCTAGAATAAAATAATATTACTTTATTA-ATA
65 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-A
* *** * * * * *** *
29278 CTTCAAATTTTGATATA-TTAGAGATTT---AAA-AAATA----CATCGAATTGGTTCAAATAAT
128 TTTCAAAAAATAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGT
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* * ** ** *
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* * ** * * ** *
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* ** * *** * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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510 -A-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTTCTAAAC-AA
* * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
30273 TAAAATAAGTTTTTTTTAATTCATA-ATAGCTTATTTGGAATAAAATGAA-A-TGAATTTATTA-
66 TAAAACAA-TTGTTTCT-ATTCATACA-AGCTTATTCGGAATAAAAT-AATACT-AATTTATTAT
* * *
30334 ATATTTCAGAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAA
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Statistics
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* * * * * ** * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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* * ** *
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * * *
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** * * ** *
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* * * ***
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*
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* * ** * *
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* * *
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* * * * * * *
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128 AT-TTC-AAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATA
* * * * * *
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* * *
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*
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* **
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* *
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* * * *
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** * * * * *
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** * *
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** * ** *
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* *** *
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* ** **
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTG
* *
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* * *
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** *
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* * *
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* * * *
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315 AAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTTCTGAACA
* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
21763 TATAAAATAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGAATAAAAATAATATTAATTTA--ATAA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTATAA
* * * * *
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129 T-TTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * *
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193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT--T-TGTCATAAAA-C
**** * ** * ** ** * * * * *
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* * * ** * ** * ** ** *
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* * * ***
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*** ** ** *** * * * *
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* * ** * ** * ** *** * * * *
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* * * * *** * * ** *
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* ** ** *** *** *
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* * * * * * * *** * *
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* * *
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** * ** * * * * * ** **
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** * * * ** * * *
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** * * * * * *** * *** * ***
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* * * * * * * *** **
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** ** * * ** *
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22804 GCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAA-T
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* ** * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * *
23666 GTCATAAAA-AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAAGAATACTAATCTATTA-A
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTAGAATAAAATAATACTAATTTATTATA
* * * * *
23729 TATTT-TAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCA-TCAAATC-AGTTTAAAT
128 -ATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAA-CAAGTTCAAAT
** * ** * * *
23788 AGTTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTATTTTCTATTATAAAA
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTT-TGTCATAAAA
* * * * * * * *
23852 CAATAGTTTTTGTTCATACACGCTTATTCGATTAAAATAATACCATTTTATTAATATTTCAACAA
253 CAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
23917 TTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGCTTAT-TGAACTA
318 TTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTTCTGAAC-A
* * * *
23961 A-ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * *
24024 TCATAAAA-AATCATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAAGTTA-T-TA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATA
* * * * * * * *
24084 ATATTCTAAAAATTAATAA-TTAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTAAT-GATAAGTTTAAATA
128 AT-TTC-AAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATA
* * * * * *
24147 ATTATGACTATTTTGAGCAATTATCTATTTGAAATTTACTATTTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
191 GTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
24212 TGATTTTTTTCTAATTCATCATAAACTTTATTTTGAATGAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TT
253 -CAATTGTTTCT-ATTCAT-ACAAGC-TTA-TTCGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT
* * **
24275 CAGACAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAAATAT-TTTTACCAAACA
312 CA-AAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTT-CTGAACA
** * **
24326 AGTTCAAATTCTTTATGATCTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTTTTATGACCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAA-TAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* *
24391 GTCAATAAACACAATTGTTTCTATTCATAC-AGCTTATTTGGATTTAAAA-AATA-TAATTTATT
64 GTC-ATAAA-ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTAGA-ATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
24453 A-ATATTT-GACAAATAATAAGTAAATA-TTTTAAAAAAATAAATAATGTTTAC-AGAAC-AGTT
125 ATA-ATTTCAAAAAATAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAAT-CTATTTACTA-AACAAGTT
* * * * *
24513 CCAATATAGTCATGAATATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACC-TTT-TTTT-TA
185 -CAA-ATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
24574 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATAATAATTTATTAA-A
247 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCG-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
24637 TATT-ATAAAATTAATGAGTAGAGAGAATT-AAAAATTAATCTATTTACAGAACA
309 T-TTCA-AAAATTAATAAGTA-A-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * *
24690 TGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
24755 CATAAAAAAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGTTTATTTCA-AATAAAATAATA-TAAATTTA-T-T
66 CATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TT-AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAT
* ** * * * *
24815 AATATTCTAATAGTTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAACACGTTCAAAT
127 AAT-TTC-AAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAAT
* * ** *
24879 AGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCA
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
24944 ATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATATAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-A-TTCCAAAAT
255 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
25007 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATATATCTATTTACCGAGCG
319 TAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
** *
25048 AGTTCAAATAGTTATGACCCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATC------A--TTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** *
25105 CATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAATTTTATTTGAA-ATAAATAATACTAATTTA-T-TAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAGAATA-AAATAATACTAATTTATTATAAT
* * * *** * * *
25167 ATTCTAATAATTAATAGGTTGGAGATTT-AAAAAT-AATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
130 -TTC-AAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGT
* * ** * **
25230 CATGTCTATTTGAATTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** *
25295 GTTTCTATTCATACAA-AATATTTAGAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
258 GTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * *
25358 TAAG---AGATTTAAGAATTAAATCTATTTGTC-GAACC
322 TAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* * * ** * *
25393 AGTTCAAATACTTATGGCTATTTGAAGCAATTATCTATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * * *
25457 TAATAAAACAACTGCTTCTGTTGATACAAACTTATTCATAGTAAAATATTGCTAAATTA--ATAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATAA
* * * **
25520 TATTC--TAAA-AA-AAG-AAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATA
129 T-TTCAAAAAATAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC-AAGTTCAAATA
* * * * * * * *
25579 GTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTTATC-TTTATTTAGTCATAAAATAA
191 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
25643 TTGTTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAA
256 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
** * *
25706 TTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TG---A
318 TTAATAAGTAA-AGA-TTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* * * * * * * *
25747 ATTTCAAATTGTCATAACTATTTAAACAATTATCTATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
25811 TCATAAAACAATTGTCT-TAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTATTA-A
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTATA
** * * *** *
25874 TATTTCAAAAACCAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAGTC-AGTTTA-TCAAATTGGTTTAAAT
128 -ATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-AAACAAGTTCAAAT
* * * * ** ** *
25937 AATTATG-GTCACTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAAC
190 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
26001 AATTATTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
254 AATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * *
26065 ATTAATAAGTAGGAGGTTTAAAAAATAATTTTGTTTACTG---A
317 ATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * *
26106 A---C---TAGTT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
26162 TATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATATTA
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTATAA
** * * * * * * *
26226 TTTTTAAAATTGATAA-CAAGGAGATTTAAAAAAATAAACCTATTTGCTAAAACAA-TTCAAACA
129 TTTCAAAAAATAATAAGTAA-AAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * * *
26289 ATTAAGACTATATGAACAATTATTTGTTTACTAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAAC
191 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-C-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
26353 AATTGTTTTTA-TCATTCCAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA
254 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
26417 TTAACAAG---AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACT
318 TTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * * * * *
26456 AGTTTAAATA--TATGACTATTTGAACAATTGT-AACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * *
26518 CATAAAACAATTATTTTTGCTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATCTA--ATAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATAAT
* * * * * * * * * *
26581 ATTCCAAAAATTAATAACTAAGAA-AATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACTAGTTTAAATAT
130 -TT-CAAAAAATAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAG
* * * *
26645 TTAAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAA
192 TT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * *
26710 GTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGAAATAAAA-AA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAA
256 -TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
26772 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAATTCTGTTTACCT-AACT
318 TTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTT-TCTGAACA
* *
26815 AGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
26880 CATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TGTGTTCA-AATAAAGTAATATTAATATATTA-AT
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCT-TATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-
* *
26942 ATCTC-AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACAAGTTCAAATAG
128 ATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAG
* * * * *
27002 TTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTA-TTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTGTTA
192 -T----TA----TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
27066 TAAAACAATTG----T-TTC-T---A---T-TTC------AAT--TACTAATTTATTAATATTTC
248 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * *
27110 GACAATTGATAAGTAATTA-ATTTAAAAAGTAAATATGTTTACTGAACT
313 AAAAATTAATAAGTAA--AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * *
27158 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * * *
27223 TCTTAAAA-AATTATTTCAATTCATGTAAGTTTATTCAAAATAAAATAATATTAAGTTATTA-AT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATA-
* * * * * * ** * * *
27286 ATTAT-GAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTGTTGAACAAGTTTAAATAA
128 ATT-TCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAG
* * * * * **
27350 TTTTGACTATTTTG-ATAATTATCTA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATG
192 TTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
27413 ATT-TTTCTATTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAC-AACTTATTAATA-TT-AAGACA
255 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-A
*
27474 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTAT-TTATC-GAACA
317 ATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAA-TATGTTTTCTGAACA
* ** * * * ** *
27517 ATTTCAAATCTTTATGACTATTTGAAAAATTATTTATTTGAAATTGGTTATGACTTTTTGTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTG-TTTT
* * * * * * * * * * *
27582 GTCGTAAAATAATTATTTCT-GTCATACATGTTTATTCCGATTCACAAAT-AT-TTATTTTTTTA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAAT-A-AAATAATACTAATTTATT-
* * * * * ** *
27644 ATATTTTCGACAATTAAT-AGT-AGA-ATTTAAAAAAATAAAT-TATTGTTTTTCCAACAAGTTC
125 ATAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTA-T-TTACT-AAACAAGTTC
* * * * * * *
27705 AACTAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTGTAAT-A
186 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
27768 AACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATATCTTC
251 AACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TT-
* * * * ** *
27831 CAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAA-AGGAATCTTGTTACCGGAACA
312 CAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATA--AAT-ATGTTTTCTGAACA
* * ** *
27882 TGTTC-AATAGGTTATGACTATATGAATTATTATCTATTTC-AATCATTGTGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
27945 TAATAAAACAATTGTTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTA-A
65 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTATA
* * ** * * * *
28008 TATTCCGAAATGTAAATTGAG-AAAGAGGAATTTAAAAAATGAATCT-TGTTA-TCGAACATGTT
128 -ATTTCAAAAAAT-AA-TAAGTAAA-A-G-ATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACT-AAACAAGTT
* * * * * *
28070 TAAATCAGTTATGACTATCGTGAACAATT-TCTATTTTAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTTC
185 CAAAT-AGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * **
28134 ATAAAAC-ATCTAG-TTCTACTCATTGCAAGCTTATTTCAAATAAAATTAATAAAAATTTATTAA
247 ATAAAACAAT-T-GTTTCTATTCA-TACAAGCTTA-TTCGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAA
* * * * *
28197 TATTTCAAAAATTAATGAGTAAAAATTT--AAAATAAATATATTTTTTTAACA
307 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
** * * *
28248 CTTGTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTGG
1 AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
28312 TCATAAACCAATCGTTTCTATTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCTAACTTATTA-A
65 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAG-AATAAAATAATA-CTAATTTATTATA
* * * *** *
28375 AATTC-AAAATTAATAAGGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATTCTGTTTA-TTGGCGAGTTCCAAA
128 ATTTCAAAAAATAATAA-GTAAAAG-ATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACTAAACAAGTT-CAAA
* * * * * * *
28438 TAGTTATGACTATTTTGAACAATTATTTCTTTCAAA-CGTACTATAATCTTTTGTTTTATTAT-A
189 TAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATC--ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* *
28501 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAA-ATAAATAATTACTAATTTATTAATA-TTCT
251 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGAATA-AAATAA-TACTAATTTATTAATATTTC-
** * * **
28564 AAAAATTAACTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-
313 AAAAATTAA-TAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * ** * * ** *
28612 AGCCTCAAATAGTTCAT-ATCCATTTGAACTGCTTATTCTCTATCAAATTGTTATGGACATTTTT
1 AG-TTCAAATAGTT-ATGA-CTATTTGAAC-AATTA-TCTATTTCAAATCATTAT-GAC-CTTTT
** *
28676 GTTTTGT--TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTA
59 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
28739 TTAGT-ATTTC-AAAAAT--TAA-TAAAAGATTTAAAAACTTAATCTGTATA-TCAAACCAA-TT
123 TTA-TAATTTCAAAAAATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAA-CAAGTT
* * * *
28797 CAAATAATTATGATTTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA--TATTTGTTTTGTCA
185 CAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
28860 TAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATA-T
248 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATATT
* * **
28923 TCTAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCA
311 TC-AAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-CA
* * * * ** * *
28971 A-TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-CTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * **
29034 CATAAAATAGTAT-TTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGC
66 CATAAAACAAT-TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATA
* ** * ** *
29097 ATTT-AGAAAATTAATAAACAACAA-ATTTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAAGTTCAAAT
128 ATTTCA-AAAAATAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAAT
* * * *
29160 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATG--CTTTTGTTTTATCATAAAACA
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * **
29223 ATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCTAGAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAATTT
255 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * **
29288 TGATATATTAGAGATTTAAAAAAT--ACA-----TC-GAATT
319 TAATA-AGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
* * * * * ** * *
29322 GGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAGCTTTT-TTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
29386 CATAAAACAATT-TTTTTCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTATAA
* * * * * *
29449 TTTCAAAAATTAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT------G----AATCGG
129 TTTCAAAAAATAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGT
* * ** * * * ** **
29503 T-T-CCTATTTGGACAATTATCTATTTTC-AATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTGTAAAATTAT
193 TATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
29565 TGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAACT
257 TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * **
29629 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGC-
320 AATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAA-CA
* * * * * * *
29670 AGTTCAAATAGTTAAGACTA--T-AATAATTATCTCTTTAAAATCGTTATGACCATTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
29732 CATAAAACAATTGTTT-TAGCTCATAGAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTA-T-TAA
66 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTATAA
* * * * * * *
29793 TATTCTAAAAATTAATAAGT--AAG-TTATAACAAGTGAATCTGTTTATCGAATC-AGTTCAAAT
129 T-TTC-AAAAAATAATAAGTAAAAGATT-TAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAAGTTCAAAT
* * * * ** * *
29854 AATTATGGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACA
190 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * *
29919 ATTGTGTT-TGAAT-ATTCAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAA
255 ATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTC-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * *
29982 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGATCC
317 ATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTGAACA
** * * ** * ** * *
30026 AGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAATCTTTTG-TTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
30090 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATA-ATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTATA-A
* * * * * * * ** * *
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* * * *
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194 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TT
* * * *
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Statistics
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*
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* * ** *
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* * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * *
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** * *
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* * *
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** * * *
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* * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * **
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* * * * * * * *
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*
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* * * * * * * **
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * ** * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * *
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* ** * ** * *
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* * ** * * * * *
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* * * * * **
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* * * *
23962 -ATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGT
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** * *
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * *** *
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* * * * * *
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** * **
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** **
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* * * * *
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1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTA-GTTTACCGAACA
* * * *
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* * ** *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * ** *
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* * **
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* * *
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* * * * *
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** *
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* ** **
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* * ** * *
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* * ** *
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** ** * *
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* * * *
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* * * ***
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* ** * * * *
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* *
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* * ** * * * *
26882 TAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAG-TGTGTTC-AAATAAAGTAATATTAA
130 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
26933 TATATTAATATCTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAACAAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACAAG
* * *
26993 TTCAAATAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAGCAATTATTTA-TTCAAATCATTATGACTTTTT
65 TTCAAATAG-T----TA----TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * * *** *
27057 GTTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTTCAATTACTAA-TTTATT-AATATTTCGACAATTGA-
121 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTC-A-TAC-AAGCTTATTCAA-AATAAAATAA-T-AC
27119 TAA
179 TAA
* * * * * ** ** * *
27122 GTAATT-A-ATTT-AAAAAGTAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTA-TTTGG
1 TTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAG-TAAGAGATTTA-A--AAA-A-T-A-AATTAGTTT--
*** * * * ** * *** * *
27183 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-ATTTTG---TTTTGTCT-TAAAAAATTATT-TCA-
55 ACCGA--A-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * ** * *
27241 ATTCATGTAAGTTTAT-TCA-AAATAAAATAATATTAAGTT-AT-TAA---TATT----ATGAAA
116 CTT--T-T--GTTT-TGTCATAAA-ACAATTGT-TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAA
*
27295 AT--TAATAA
172 ATAATACTAA
* * * ** ** * ** * *
27303 -TTA--AGAGATTTAAAAAATGAATCTGT--TTG-TTGAACAAGTTTAAA-TAATTT--TG-ACT
1 TTTATTA-ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AA-AATAAATTAGTTTACCGAAC-
** * * * * * * *
27358 ATTTTGATAATTA-TCTATTCGA-AATTACTATAAC-CTTTTGTTTTGTCATAA--A--ATGA--
62 AAGTTCA-AA-TAGT-TA-T-GACTATT--T-GAACAATTATCTATT-TCA-AATCATTATGACC
* *** * ** * * * *
27414 TTTT-TCTAT-TCATACAAGTTTATT-TTGAATAAAATAATACAA-CTTATT-AATATTAAGACA
117 TTTTGT-TTTGTCATA-AA-ACAATTGTT---TCAGTTCATACAAGCTTATTCAA-AATAAAATA
*
27474 ATTAATAA
175 A-TACTAA
* * * * * * * * ** * ** * * * *
27482 -GTA-AAAGATTTAAAAAATAAATTATTTATCGA---ACAATTTCAAA-T-CTTTA-TG-ACTAT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTAGTTTACCGAACAAG
* * * ** *
27538 TTGAAA-AATTAT--TTATTTG----A--A---A--T----TGGTTATGACTTTTTGTTTTTGTC
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTC
* * * * * * ** * * *
27585 GTAAAATAATTATTTCTG-TCATACATGTTTATTCCGATTCACAAAT-AT-TTAT
129 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-A-AAATAATACTAA
* * * *
27637 TTTTTTAATATTTTCGACAATTAAT-AGT-AGA-ATTTAAAAAAATAAATTATTGTTTTTCC-AA
1 TTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTA--G-TTTACCGAA
* * * * * *
27698 CAAGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAGTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTT
61 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT
* * ** *
27762 GTAAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA
126 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
27817 -TTATTAATATCTTCCAAAAATTAATGAGAAAGAGAATTAAAAAA-AGGAATCTTG-TTACCGGA
1 TTTATTAATAT-TT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA--AAT-TAGTTTACC-GA
* * ** *
27879 ACATGTTC-AATAGGTTATGACTATATGAATTATTATCTATTTC-AATCATTGTGACCTTTTGTT
60 ACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * **
27942 TTGTAATAAAACAATTGTTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
124 TTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
** * * * * *
28001 -TTATTAATA-TTCCGAAATGTAAATTGAGAAAGAGGAATTTAAAAAATGAATCTTG-TTATCGA
1 TTTATTAATATTTCAAAAAT-T-AA-TAAGTAAGA-G-ATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGA
* * * * * *
28063 ACATGTTTAAATCAGTTATGACTATCGTGAACAATT-TCTATTTTAAAAACATTATGACATTTTG
60 ACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTG
* * * **
28127 TTTTTTCATAAAAC-ATCTAG-TTCTA-CTCATTGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATTAATAAAA
122 TTTTGTCATAAAACAAT-T-GTTTC-AGTTCA-TACAAGCTTA-TTCAAAATAAAA-TAATACTA
28188 A
181 A
* * **** **
28189 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAA-AAATTT--AAAATAAATATA-TTTTTTTAACACT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAACAAG
* * *
28250 TGTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTGGTC
65 T-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * **
28314 ATAAACCAATCGTTTCTA-TTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCTAA
129 ATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAA
* * * * ** * *
28367 CTTATTAA-AATTC-AAAATTAATAAGGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATTCTGTTTATTG-GCG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATT-AGTTTACCGAACA
* * * * *
28429 AGTTCCAAATAGTTATGACTATTTTGAACAATTATTTCTTTCAAA-CGTACTATAATCTTTTGTT
63 AGTT-CAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATC--ATTATGACCTTTTGTT
* * * **
28493 TTATTAT-AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAAT-AAATAATTACTAA
124 TTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACTAA
** * *
28550 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAACTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-A
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAA
* * ** * * ** *
28613 GCCTCAAATAGTTCAT-ATCCATTTGAACTGCTTATTCTCTATCAAATTGTTATGGACATTTTTG
64 G-TTCAAATAGTT-ATGA-CTATTTGAAC-AATTA-TCTATTTCAAATCATTAT-GAC-CTTTTG
** * *
28677 TTTTGT--TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATTCTAA
122 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
28735 TTTATTAGTATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAACTTAATCT-GTATATCAAACCAA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAA-CAA
* * * *
28795 -TTCAAATAATTATGATTTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA--TATTTGTTTTG
64 GTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTG
* ** *** * *
28857 TCATAAAGCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAA
127 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAA
* * * *
28912 ATTAATAATA-TTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTGCCAAACCA
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAA-CA
* * * * ** * *
28971 A-TTCAAATAGTTAAGAATATTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-CTTGT
63 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
29034 CATAAAATAGTATT-TTT-AGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
128 CATAAAACA--ATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
** ** * * ***
29088 TTTATTAGCATTT-AGAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATTTA-TTTTTTGAACA
1 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA-TTAGTTTACCGAACA
* * * *
29151 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATG--CTTTTGTTTTAT
63 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
29214 CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCTAGAATAAAATAATATTAC
128 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAA
* ** * * * ***
29268 TTTATTAATACTTCAAATTTTGATATA-TTAGAGATTTAAAAAAT--A-CA---T--CGAATTGG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAG
* * * * ** * *
29324 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAGCTTTT-TTTTTTCA
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *** *
29388 TAAAACAATTTTTTTCA--TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAA
130 TAAAACAA-TTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * *
29439 TTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAG-AAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTG---AA-
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAG
* * * ** * * * *
29499 -TC-----GGT-T-CCTATTTGGACAATTATCTATTTTC-AATTGTTATAACCTTTTGTTCTATT
65 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * ***
29555 GTAAAATTATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
129 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
29608 TTTAATAATATTTCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTGCCAAAGC-A
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAA-CAA
* * * * * * *
29671 GTTCAAATAGTTAAGACTA--T-AATAATTATCTCTTTAAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATC
64 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * *
29733 ATAAAACAATTGTTTTAGCTCATAGAAGCTTATTC-AAATAAAATAATACTAA
129 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
29785 TTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT-A-AG-TTATAACAAGTGAATCT-GTTTATCGAATC
1 TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAAT-TAGTTTACCGAA-C
* * * * ** *
29845 -AGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTG
62 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * **
29909 TCATATAACAATTGTGTT-TGAAT-ATTCAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
127 TCATAAAACAATTGT-TTCAG-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
29964 TTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGATCCAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAGT
** * * ** * ** * *
30029 TCAAATAGCAATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAATCTTTTG-TTTGTCAT
66 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* ** **
30093 AAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
131 AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
30144 TCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAGT
* * * *
30209 TCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
66 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * ***
30274 AAAATAAGTTTTTTTTAATTCATA-ATAGCTTATTTGGAATAAAATGAA-A-TGAA
131 AAAACAA--TTGTTTCAGTTCATACA-AGCTTATTCAAAATAAAAT-AATACT-AA
*
30327 TTTATTAATATTTCAGAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAA
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
30371 TTCTATTTAC
Statistics
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TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
Found at i:23903 original size:707 final size:707
Alignment explanation
Indices: 22844--24123 Score: 1552
Period size: 707 Copynumber: 1.8 Consensus size: 707
22834 TTAATATTTC
*
22844 AAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTACAA
1 AAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTACAA
* * * *
22909 CTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAACAATTGTTTC
66 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAAAAAATGTTTC
* * **
22974 AATTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAATCTAATTTATTAATATTCTGGAAATTAATAAGTA
131 AATTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAAGAATCTAATCTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-A
* * * *
23039 AGTGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAATCAACTCAAATAATTGTGGCCATTTCAACAATTA
195 AG-GATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAATCAACTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATTA
* * * *
23104 TCTATTTCAAATTGTTACTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTATTATACAAGTTT
259 TCTATTTCAAATTGTTACTACCTTTTATTT-GTCATATAACAATAGTTTTTTATCATACAAGCTT
** * * *
23169 ATTCAGAATAAAATAATAGTATTTTATTAATCTCTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
323 ATTCAGAATAAAATAATACCATTTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAA
* * * * * * *
23234 TAAATCTATTTACTAAAC-AATTTAAATAATTATGACTATTTGAATAGTTGT-ATACTTCAAATA
388 TAAATATACTTACTAAACTAAATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCATACTTCAAATA
*
23297 GTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
453 GTTATAA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATCATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA
23361 ATAATACTAA--TATAAAATATTCCAAAAATTAATAACTGAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTT
515 AT-ATACTAAGTTAT-AAATATTCCAAAAATTAATAA-TGAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTT
23424 TGCTAAACTAATTTAAATAGTTAAGACTATATGAACCGTTATTTATTTCAAATAATTTTTTTGTC
576 TGCTAAACTAATTTAAATAGTTAAGACTATATGAACCGTTATTTATTTCAAATAATTTTTTTGTC
23489 ATAAAACAAAATTTTAAATTCACATTAACTTATTCAAAATAAAATAAAATGAATTTATTCATACT
641 ATAAAACAAAATTTTAAATTCACATTAACTTATTCAAAATAAAATAAAATGAATTTATTCATACT
23554 AA
706 AA
* * * * * * *
23556 AAAAATTAATATGTAATAGGTTT-AAAAAAT-AATTCTGTTTACCTAACCAATTCAAATAATTAT
1 AAAAATTAATAAGCAAGA-GTTTAAAAAAATAAATT-AGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTAC
* **
23619 GACTATTTGAACAATTAT-T-TTTGCAA-CTAGCTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAAAAATG
64 AACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC-A-CTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAAAAAATG
*** * * * * * *
23680 TTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTAGAATAAAAGAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAAT
127 TTTCAATTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAAGAAT-CTAATCTATTAATATTCTAAAAATTAAT
* ** * * * ***
23745 AAG-A-GATTTAAAAAATAAATCTGTTCATCAAATCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGTGCAA
191 AAGAAGGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAATCAACTCAAATAATTATGACCATTTCAACAA
*
23808 TTATTTATTTCAAATTGTTA-TGA-CTTTTATTT-TCTATTATAAAACAATAGTTTTTGT-TCAT
256 TTATCTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTATTTGTC-A-TAT--AACAATAGTTTTT-TATCAT
* * * *
23869 ACACGCTTATTC-GATTAAAATAATACCATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAAT
315 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACCATTTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAAAAT
* * * * * * *
23933 TTTAAAAATAAATATGCTTATTGAACTAAATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTTAT
380 TTAAAAAATAAATATACTTACTAAACTAAATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCATAC
* * *
23998 TTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAAAATCATTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAA
445 TTCAAATAGTTATAACTTTTGTTTTGTCATAAAAAATCATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
24063 ATAAAATATACTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAGATATTTAAAAAATAAAT
510 ATAAAATATACTAAGTTATAAATATTCCAAAAATTAATAATGAGAGATTTAAAAAATAAAT
24124 CTATTTAATG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (707 bp):
AAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAAATTAGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTACAA
CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAAAAAATGTTTC
AATTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAAGAATCTAATCTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGAA
GGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAATCAACTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATTATC
TATTTCAAATTGTTACTACCTTTTATTTGTCATATAACAATAGTTTTTTATCATACAAGCTTATT
CAGAATAAAATAATACCATTTTATTAATATCTCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAA
ATATACTTACTAAACTAAATCAAATAATCATGACTATTTGAATAATTATCATACTTCAAATAGTT
ATAACTTTTGTTTTGTCATAAAAAATCATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATATAC
TAAGTTATAAATATTCCAAAAATTAATAATGAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACTA
ATTTAAATAGTTAAGACTATATGAACCGTTATTTATTTCAAATAATTTTTTTGTCATAAAACAAA
ATTTTAAATTCACATTAACTTATTCAAAATAAAATAAAATGAATTTATTCATACTAA
Found at i:26256 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 25949--26638 Score: 421
Period size: 169 Copynumber: 4.0 Consensus size: 169
25939 TTATGGTCAC
* * * *
25949 TTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACAAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCAT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTACAT
* **
26014 CATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGA
66 CATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAGGA
*
26079 GGTTTAAAAAATAATTTTGTTTACTGAACTAGTTTCTAT
131 GATTTAAAAAATAATTTTGTTTACTGAACTAGTTTCTAT
* * * * * **
26118 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAGTT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTACAT
* * *** * * ** *
26183 CATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATATTATTTTTAAAATTGATAACAAGGA
66 CATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAAGGA
** * * *
26248 GATTTAAAAAAATAAACCTATTTGCTAAAACAATTCAAAC-AATTAAGACTAT
131 GATTT-AAAAAAT-AA--T-TTTG-T-TTAC---T-GAACTAGTT---TCTAT
* * * ** **** * *
26300 ATGAACAATTATTTGTTTACTAAA-AATTATGGCCTTTTGTT-TAGTCATATAACAATTGTTTT-
1 TTGAACAATTATCTATTT-C-AAATCGTTACAAACTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTATTTTA
* * * * * * * *
26362 TATCATTCCAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAACAA
63 CATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACAA
* *
26424 -GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTTAAATATATGACTAT
128 GGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACTGAACTAG------T-T-T--CTAT
* * * * * * *
26475 TTGAACAATTGT-AACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGC-
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTA-TTTTACA
** * * * * *
26538 TCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATGCTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAA-
65 TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAC-AAG
* * * *
26602 GAAAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACTAGTTT
129 GAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACTGAACTAGTTT
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Statistics
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Consensus pattern (169 bp):
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Found at i:28550 original size:549 final size:534
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21984 ACCAAACCAT
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* ** ** * * * *
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* * * * *
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* ** * * *
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* * * * * * *
22368 ACTATTTGAGTAGTTATCAATCTCAAATCATTAAGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
375 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGTTT
* ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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125 TATTCAG-ACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAAT-TATTTATCGAACAATTTCAAAT
* * * * * * * * *
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* * * *
22782 ACAATT-GTT-TCAGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAAT-A-AAATAATACTAATTTCTTAATA-T
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* * ** *
22841 TTCAAAAATTAATAAGCAAGAGTTTAAAAAAATAA--ATTAGTTTACCGAACAAATTCAAATAGT
310 TTCAAAAATTAAT-AGTAA-AATTTAAAAAAATAATTATT-GTTTTTC-AACAAGTTCAAATAGT
* ** * * * *
22904 TACAACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATACAACAATT
371 CATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATA-AACAATT
** * *
22969 GTTTCAATTCATAGAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAATTTATTAAT-ATTCTGGAAATTA
434 GTTTC-ATTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATAATTC--AAAATTA
** * * **** *
23032 ATAAGTAAGTG-ATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAATCAA
494 ATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATGAATCTGTTTA--TTGGCAG
* * * * * * * * * ** *
23074 CTCAAATAATTGTGGCCA-TTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTGTTTGGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTAT-TCTTTCAAACTACTA-TAACCTTTTGTTTTGT
* * * * **
23137 CATATAACAATTGTTTTTTATT-ATACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATAGTATTTTATTAAT
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* * * * *
23200 CTCTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAATTT-AAATA
126 AT-TCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTATC-GAACAATTTCAAATC
* * * * * * * * * * * * *
23262 ATTATGACTATTTGAATAGTTGTATACTTCAAATA-GTTATAACCTTTTG-TTTTGTCATAAAAC
188 GTTATGACTATGTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTGTCATAAAAT
* * * * * * *
23325 AATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAAT-A-AAATAATACTAATATA-AAATA-TTCCAA
253 AATTAGTTCT-CTCATACAAGCTTATTCCAAATCACAAAT-ATA-AAATTTATTAATATTTTCAA
* * * * * * * *
23386 AAATTAATAACTGAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TTGTTTGCTAAACTAA-TTTAAATAGTTAAG
315 AAATTAAT-AGT-A-AAATTTAAAAAAATAATTATTGTTT-TTCAAC-AAGTTCAAATAGTCATG
* *** *
23449 ACTATATGAACCGTTATTTATTTCAAA----TA--A--TTT-TTTTGTCATAAAACAAAATT-TT
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** * ** * * * * ** *
23504 AAATTCACATTAA-CTTATTCAAAATAAAATAAAATGAATTTATTCATACTAAAAAAATTAATAT
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* * *** *
23568 GTAATAG-GTTTAAAAAAT-AATTCTGTTTACCTAACCAA
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* * *
23606 TTCAAATAATTATGACTA-TTTGAACAATTATT-TTTGC-AACTAGCTATGACCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTATTCTTT-CAAACTA-CTATAACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
23668 CATAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTT-AGAATAAAAGAATACTAA-TCTATTAATA
64 AATAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGA-AATAAAATAATACTAACT-TATTAATA
* * * * * * *
23731 TTTTA-AAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTGTTCATCAAATCAGTTT-AAATAG
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* *** * * *** * * * *
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* * * * * * *
23853 AA-TAGTTTTTGTTCATACACGCTTATT-C-GATTA-AAATAATACCATTTTATTAATA-TTTCA
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* * * * * *
23913 ACAATTAATAAGTAAAAAATTT-TAAAAATAAATA-TGCTTATTGAACTAA-ATCAAATAGTCAT
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* **
23975 GACTATTTGAATAATTATCTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAAAATCATTT
374 GACTATTTGAATAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTT
* ** *
24040 TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAAT-ATACTAAGTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAA
438 CA-TTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATAATTC--AAAATTAATAA
* * * * **
24103 -T--TAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTAATGATAAG
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* * ** * * * *
24139 TTTAAATAATTATGACTATTTTGAGCAATTATCTATTTGAAATTTACTATTTACCTTTTGTTTTG
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTAT-TCTTTCAAA-CTACTA-TAACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
24204 TCATAAA-ATGATTTTTTTCTAATTCATCATAAACTTTATTTTG-AATGAAATAATA-TAAATTT
63 TAATAAACA--A-TTGTTTCT-ATTCAT-A-CAAGTTTA-TTTGAAATAAAATAATACT-AACTT
* * * * *
24266 ATTAATATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAAATATTTTTACCAAACAAGTTC
120 ATTAATATTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAAT-TATTTATCGAACAATTTC
* * * * * *** *
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183 AAA-TCGTTATGA-CTATGTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTGTC
* * *** * * * *
24394 AATAAACACAATT-GTTTCTATTCATAC-AGCTTATTTGGATTTA-AAAAATATAATTTATTAAT
246 -ATAAA-ATAATTAG-TTCT-CTCATACAAGCTTATTCCAAATCACAAATATAAAATTTATTAAT
* * * * *
24456 A-TTTGACAAA-TAATAAGTAAATATTTTAAAAAAATAAATAATG-TTTACAGA-ACAGTTCCAA
307 ATTTTCAAAAATTAAT-AGTAAA-A-TTTAAAAAAATAATTATTGTTTTTCA-ACA-AGTT-CAA
* * * * *
24517 TATAGTCATGAATATTTGAATAATTAAT-TATTTCAAATCATTGTGACCTTT-TTTT-TAATAAA
366 -ATAGTCATGACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCAT-AA
* *
24579 ACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAAATAATAATAATTTATTAA-ATATTAT
428 ACAATTGTTTCA-TTCATA-AAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATATTAA-TTATTAATA-ATT-C
* * * * ** *
24643 AAAATTAATGAGTAGAGAGAA-TT-AAAAATTAATCTATTTACAGAACATG
487 AAAATTAATAAGTA-AAAGAATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTG-GCA-G
* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTAT-TCTTTC-AAACTACTATAACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
24755 CATAAAAAAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGTTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
64 AAT-AAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACT-AACTTATTAAT
* * * * ** *
24818 ATTCTA-ATAGTTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAA-TATGTTTTCTAAACACGTTCAAATA
126 ATTC-AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTAT-TTATC-GAACAATTTCAAATC
* * * * *** * **
24880 GTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATTGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAACC
188 GTTATGACTATGTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTGTCATAAAAT
* * *
24943 AATT-GTTTCTATTCATAAAAGCTTATAT--AGAAT-A-AAATAATACTAATTTATTAA-A--TT
253 AATTAG-TTCT-CTCATACAAGCTTAT-TCCA-AATCACAAAT-ATA-AAATTTATTAATATTTT
* * ** * * *
25000 CCAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAT-A-TATCTATTTACCGAGCGAGTTCAAATAGTT
312 CAAAAATTAAT-AGT-AAA-ATTTAAAAAAATAATTAT-TGTTTTTC-AACAAGTTCAAATAGTC
** * * *
25061 ATGACCCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATC------A-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
372 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGT
** *
25119 TTCTATTCATACAATTTTATTTGAAAT-AAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAATAATTAAT
436 TTC-ATTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATAATTC-AA-AATTAAT
* *** * ****
25182 AGGTTGGAG-ATTT-AAAAAT-AATTTGTTTACCAAACAAG
496 AAGTAAAAGAATTTAAAAAATGAATCTGTTTA-TTGGC-AG
* * * * * * *
25220 TTCAAATAGTCATGTCTA-TTTGAATTATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACATTTTGTTTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTAT-TCTTTCAAACT-ACTATAACCTTTTGTTTTGT
* ** *
25283 CATAAA-ATGATTGTTTCTATTCATACAA-AATATTT-AGAAT-AAATAATACTAATTTATTAAT
64 AATAAACA--ATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGA-AATAAAATAATACTAACTTATTAAT
* * * * * *
25344 ATTTCA-AAAATTAATAAG----AGATTTAAGAATTAAATCTATTTGTCGAACCAGTTCAAATAC
126 A-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTATCGAACAATTTCAAAT-C
* * * * * *** * *
25404 -TTATGGCTATTTGAAGCAATTATCTATCT-CAAATTGTTATG--ATCTTT-ATTTTGTAATAAA
188 GTTATGACTATGTGAA-AAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACAT-TTTGTTTTTGTCATAAA
* * * * * * * *
25464 ACAACT-GCTTCTGTTGATACAAACTTATT-CATAGT-A-AAATATTGCTAAA-TTAATAATATT
251 ATAATTAG-TTCT-CTCATACAAGCTTATTCCA-AATCACAAATA-T--AAAATTTATTAATATT
* * ** * * ** *
25524 CTAAAAAAAGAA-AG--AGATTT-AAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTTA
310 TTCAAAAATTAATAGTAAAATTTAAAAAAATAATTATTGTTTTTC-AAC-AAGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * * *
25583 AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTTA-TCTTTATTTAGTCATAAAATAATTGT
373 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCAT-AAACAATTGT
* * ** * * *
25647 TTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAAT
436 TTCA-TTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATAATTC--AAAATTAAT
* * * *
25711 AA--ACAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTATT-GAAT
496 AAGTAAAAG-AA-TTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGGCAG
* * * * * * * * *
25749 TTCAAATTGTCATAACTA-TTTAAACAATTA-TCTATTTAGAA-TAAATATGACCTTTTGTTTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTATTCT-TTCA-AACT-ACTATAACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
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63 TAAT-AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAC-TTATTAA
* ** * * * * *
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** * * * *** * *
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186 TCGTTATGACT-A-TGTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACA-TTTTGTTTTTGTCAT
* * * * * * *
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** * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *** *
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* * * * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * * * * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * **
26777 AAGTAAGAG-ATTTAAAAAA-CAATTCTGTTTACCTAACTAG
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* * * * * *
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26880 CATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTGT-GTTCAAATAAAGTAATATTAA-TATATTAATA
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* *
26943 TCTCA-AAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGT
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* * * ** * * * * * *
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* *
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246 ATAAAATAATTAGTTCTCTCATACAAGCTTATTCCAAATCACAAATATAAAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * *
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* * *
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435 TTTC-ATTCAT-AAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATAAT-TCAAAATTAAT
* * * *
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*
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* *
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256 TAGTTCTCTCATACAAGCTTATTCCAAATCACAAATATAAAATTTATTAATATTTTCAAAAATTA
* * *
27660 ATAGTAGAATTTAAAAAAATAAATTATTGTTTTTCCAACAAGTTCAACTAGTCATAACTATTTGA
321 ATAGTAAAATTTAAAAAAAT-AATTATTGTTTTT-CAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGA
* * * *
27725 ATAATTATCTAGTTCAAATCATTGTGACCTTTT-TTTTGTAATAAACAATTGTTTCAGTTCATAT
384 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCA-TTCATA-
* *
27789 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTATTAATATCTTCCAAAAATTAATGAG-AAAGAGAA
446 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTATTAATA-ATT-C-AAAATTAATAAGTAAA-AGAA
* * **
27853 TTAAAAAAAGGAATCT-TGTTACCGGAACATG
507 TTTAAAAAATGAATCTGT-TTATTGG--CA-G
* * * * * * *
27884 TTC-AATAGGTTATGACTA-TATGAATTATTATCTATTTCAATC-ATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 TTCAAATA-GTTATGACTATTTTGAATAATTAT-TCTTTCAAACTACTATAACCTTTTGTTTTGT
* * *
27946 AATAAAACAATTGTTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATA
64 AAT-AAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATA
* * * *
28010 TTCCGA-AATGTAAATTGAG-AAAGAGGAATTTAAAAAATGAATCT-TGTTATCGAAC-ATGTTT
127 TTCAGACAAT-T-AA-TAAGTAAA-A-G-ATTTAAAAAATAAAT-TAT-TTATCGAACAAT-TTC
* *
28071 AAATCAGTTATGACTATCGTGAACAATT-TCTATTTTAAAAACATTATGACATTTTGTTTTT-TC
183 AAATC-GTTATGACTAT-GTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTGTC
* * *
28134 ATAAAA-CATCTAGTTCTACTCATTGCAAGCTTATTTCAAAT-A-AAATTAATAAAAATTTATTA
246 ATAAAATAAT-TAGTTCT-CTCA-TACAAGCTTATTCCAAATCACAAA-T-AT-AAAATTTATTA
**
28196 ATA-TTTCAAAAATTAATGAGTAAAAATTTAAAATAAAT-A-TATT-TTTTT-AACACTTGTCAA
305 ATATTTTCAAAAATTAAT-AGT-AAAATTTAAAA-AAATAATTATTGTTTTTCAACAAGT-TCAA
* *
28256 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTGGTCATAAACC
366 ATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAA-C
* *
28321 AATCGTTTCTATTCATAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCTAACTTATTAA-AATTCAAAAT
430 AATTGTTTC-ATTCATAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-TTAA-TTATTAATAATTCAAAAT
*
28385 TAATAAGGTAAAAGAATTTAAAAAATAAATTCTGTTTATTGGCGAG
492 TAATAA-GTAAAAGAATTTAAAAAATGAA-TCTGTTTATTGGC-AG
* * *
28431 TTCCAAATAGTTATGACTATTTTGAACAATTATTTCTTTCAAACGTACTATAATCTTTTGTTTTA
1 TT-CAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTA-TTCTTTCAAAC-TACTATAACCTTTTGTTTTG
* *
28496 TTATAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAAT-AAATAATTACTAATTTATTAATA
63 TAATAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAA-TACTAACTTATTAATA
* *** * * * *** *
28560 TTCTA-AAAATTAACTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAGCCTCAAATAG
127 TTC-AGACAATTAA-TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTATTTATCGAACAATTTCAAATCG
* * *** * * * ***
28624 TTCAT-ATCCATTTGAACTGCTTATTCTCTAT-CAAATTGTTATGGACATTTT-TGTTTTGT--T
189 TT-ATGA-CTATGTGAA-AAATTA-TCTATTTGAAAAACATTAT-GACATTTTGT-TTTTGTCAT
* * ** ** *
28684 AAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAAATTATT-CAGAAT-A-AAATAATTCTAATTTATTAGTA
248 AAAATAATTAG-TTCT-CTCATACAAGCTTATTCCA-AATCACAAAT-A-TAAAATTTATTAATA
** * * * *
28745 -TTTCAAAAATTAATA--AAAGATTTAAAAACTTAA-T-CTGTATATCAAACCAA-TTCAAATAA
308 TTTTCAAAAATTAATAGTAAA-ATTTAAAAAAATAATTATTGTTTTTC-AA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
28804 TTATGATTTTTTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGA-TATTTGTTTTGTCATAAAGCAA
370 TCATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTGTTTTGTCATAAA-CAA
** * * * * *
28868 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGATAAATTAATAAT-ATTCTAAAAAT
432 TTG-TTTCATTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAAT-ATTAATTATTAATAATTC--AAAAT
* * *** *
28932 TAATAAG----AG-ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCA-AACCAA
492 TAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATGAATCTGTTT---ATTGGCAG
* * * * * * ** * * * *
28972 TTCAAATAGTTAAGAATA-TTAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-CTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTA-TTCTTTCAAACTACTATAACCTTTTGTTTTGTA
* * * * * ** * **
29035 ATAAA-ATAGTATTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCAT
65 ATAAACA-ATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATAT
* * ** * * * *
29099 TTAGAAAATTAATAAACAACAA-ATTTTAAAAAATAAATTTATTTTTTGAACAAGTTCAAATAGT
128 TCAGACAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAA-TTATTTATCGAACAATTTCAAATCGT
* * * * *
29163 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAATA-AATATG-C-TTTTG-TTTTATCATAAAACA
190 TATGACTATGTGAAAAATTATCTATTTGAAAA-ACATTATGACATTTTGTTTTTGTCATAAAATA
* * * * *
29223 ATT-GTT-TCAATTCATAAAAGCTTA-TCTAGAAT-A-AAATAATATTACTTTATTAATA-CTTC
254 ATTAGTTCTC---TCATACAAGCTTATTCCA-AATCACAAAT-ATA-AAATTTATTAATATTTTC
** * * * * *** * *
29282 AAATTTTGATATATTAGAGATTT-AAAAAAT-A-CATCG------AATTGGTTCAAATAATTATG
313 AAAAATT-A-ATAGTA-AAATTTAAAAAAATAATTATTGTTTTTCAACAAGTTCAAATAGTCATG
* * * ** * *
29338 GCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAGCTTTT-TTTTTTCATAAAACAATTTTTT
375 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCAT-AAACAA-TTGTT
* *
29402 TCA-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAA-AATTTCAAAAATTAATAA
437 TCATTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATAA-TTC-AAAATTAATAA
* * *
29465 G--AAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA----C--
498 GTAAAAGA-ATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTGGCAG
* * * * * * * * **
29495 -T-GAATCGGT-T-CCTA-TTTGGACAATTATCTATTTTC-AATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTAT-T-CTTTCAAACTACTATAACCTTTTG-T-T-T
** * * * * *
29554 TGT-A-AAATTATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAA
61 TGTAATAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAA
* * * * * ** * *
29616 TATTTCA-AAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAAGC-AGTTCAAAT
125 TA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTATCGAA-CAATTTCAAAT
* * * * * * *
29679 AGTTAAGACTA--T-AATAATTATCTCTTT-AAAATCGTTATGACCA-TTTG-TTTTATCATAAA
187 CGTTATGACTATGTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGA-CATTTTGTTTTTGTCATAAA
* * * * *
29738 ACAATT-GTTTTAGCTCATAGAAGCTTATT-CAAAT-A-AAATAATACTAATTTATTAATATTCT
251 ATAATTAGTTCT--CTCATACAAGCTTATTCCAAATCACAAAT-ATA-AAATTTATTAATATTTT
* * * * * * *
29799 -AAAAATTAATAAGT--AAGTTATAACAAGTGAA-T-CTGTTTATCGAATC-AGTTCAAATAATT
312 CAAAAATTAAT-AGTAAAATTTA-AAAAAAT-AATTATTGTTTTTC-AA-CAAGTTCAAATAGTC
* * * * * *
29858 ATGGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTG
372 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATA-AACAA-T-
* * * ** ** * **
29923 TGTTTGAAT-ATTCAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAA
433 TGTTTCATTCA-TAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAA-TTATTAATAATTC-AAAATTAA
* * * * *
29987 TAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGATCCAG
495 TAAGTAAAAGAATTTAAAAAATGAATCTGTTTATTG--GCAG
** * * ** * ** *
30028 TTCAAATAGCAATAACTA-TTTGAACAATTGTAAAC-TTCAAATTGTTATAATCTTTTG-TTTGT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAA-T-TATTCTTTCAAACTACTATAACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
30090 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TCTAATAATA
64 AAT-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACT-TATTAATA
* * * * * ** * * **
30154 TTTCA-AAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATATT
127 -TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTATTTATCGAACAATTTCAAATCGT
* * * * * * *
30218 TAAGACTATATGAACAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAATAA
190 TATGACTATGTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTGTCATAAAATAA
30281 GTTTTTTTTA
Statistics
Matches: 6040, Mismatches: 1121, Indels: 1174
0.72 0.13 0.14
Matches are distributed among these distances:
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555 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (534 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTTGAATAATTATTCTTTCAAACTACTATAACCTTTTGTTTTGTAA
TAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAATATTCA
GACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTATTTATCGAACAATTTCAAATCGTTATGAC
TATGTGAAAAATTATCTATTTGAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTGTCATAAAATAATTAGTT
CTCTCATACAAGCTTATTCCAAATCACAAATATAAAATTTATTAATATTTTCAAAAATTAATAGT
AAAATTTAAAAAAATAATTATTGTTTTTCAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA
TCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTCATTCATAAAGCTTATTT
GAAATAAAATAATATTAATTATTAATAATTCAAAATTAATAAGTAAAAGAATTTAAAAAATGAAT
CTGTTTATTGGCAG
Found at i:28591 original size:363 final size:368
Alignment explanation
Indices: 27887--28578 Score: 773
Period size: 367 Copynumber: 1.9 Consensus size: 368
27877 GAACATGTTC
* * *
27887 AATAGGTTATGACTATATGAATTATTATCTATTTCAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAA
1 AATAGGTTATGACTATATGAATAATTATCTATTTCAATCATTATGACCTTTTGTTTGGTAATAAA
* * * *
27952 ACAATTGTTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTATTAATATTCCGAA
66 ACAATCGTTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTATTAAAATTCCAAA
* * *
28017 ATGTAAATTGAGAAAGAGGAATTTAAAAAATGAATCTTGTTATCGAACATGTTTAAATCAGTTAT
131 ATGTAAATAGAGAAAGAGGAATTTAAAAAATAAATCTTGTTATCGAACATGTTCAAATCAGTTAT
* * *
28082 GACTATCGTGAACAATTTCTATTTTAAAAACATTATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACATCTAG
196 GACTATCGTGAACAATTTCTATTTCAAAAACACTATAACATTTTGTTTTTTCATAAAACATCTAG
*
28147 TTCTACTCATTGCAAGCTTATTTCAAATAAAATTAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
261 TTCTACTCATTACAAGCTTATTTCAAATAAAATTAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
*
28212 TGAGTAAAAATTTAAAATAAATATATTTTTTTAACACTTGTCA
326 TAAGTAAAAATTTAAAATAAATATATTTTTTTAACACTTGTCA
* * *
28255 AATA-GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTGTTTGGTCATAA
1 AATAGGTTATGACTATATGAATAATTATCTATTTC-AATCATTATGACCTTTTGTTTGGTAATAA
*
28318 ACCAATCGTTTCTA-TTCATA-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACCTAACTTATTAAAATT-C
65 AACAATCGTTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-CTAA-TTATTAAAATTCC
* *
28380 AAAAT-T-AATA-AGGTAAA-A-GAATTTAAAAAATAAAT-TCTGTTTATTG-GCGA-GTTCCAA
128 AAAATGTAAATAGA-G-AAAGAGGAATTTAAAAAATAAATCT-TG-TTATCGAAC-ATGTT-CAA
** * * ***
28437 AT-AGTTATGACTATTTTGAACAATTATTTCTTTCAAACGTACTATAATC-TTTTGTTTTATT-A
187 ATCAGTTATGACTATCGTGAACAATT-TCTATTTCAAAAACACTATAA-CATTTTGTTTT-TTCA
* * * **
28499 T-AAACAAT-T-GTTTCTATTCA-TACAAGTTTATTTGAAAT-AAA-TAATTACTAATTTATTAA
249 TAAAAC-ATCTAG-TTCTACTCATTACAAGCTTATTTCAAATAAAATTAA-TAAAAATTTATTAA
28558 TA-TTCTAAAAATTAACTAAGT
311 TATTTC-AAAAATTAA-TAAGT
28579 TGGAGATTTA
Statistics
Matches: 274, Mismatches: 33, Indels: 40
0.79 0.10 0.12
Matches are distributed among these distances:
360 6 0.02
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (368 bp):
AATAGGTTATGACTATATGAATAATTATCTATTTCAATCATTATGACCTTTTGTTTGGTAATAAA
ACAATCGTTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTATTAAAATTCCAAA
ATGTAAATAGAGAAAGAGGAATTTAAAAAATAAATCTTGTTATCGAACATGTTCAAATCAGTTAT
GACTATCGTGAACAATTTCTATTTCAAAAACACTATAACATTTTGTTTTTTCATAAAACATCTAG
TTCTACTCATTACAAGCTTATTTCAAATAAAATTAATAAAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
TAAGTAAAAATTTAAAATAAATATATTTTTTTAACACTTGTCA
Found at i:29109 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 28700--29114 Score: 417
Period size: 177 Copynumber: 2.3 Consensus size: 175
28690 ATTGTTTCTA
** *
28700 TTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATTCTAATTTATTAGTATTTCAAAAATTAATAAAAGA
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTT-AAAAATTAATAAAAGA
* * * * * * *
28765 TTTAAAAACTTAATCTGTATATCAAACCAATTCAAATAATTATGATTTTTTTGAACAATTATCTA
65 TTTAAAAAATAAATCTGTATACCAAACCAATTCAAATAATTAAGATATATTAGAACAATTATCTA
* * *
28830 TCTCAAATCATTATGATATTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTTTG
130 TCTCAAATCATTATGATATTTGTCTTGTCATAAA-CAAGTATTTTTG
** * * * * * *
28877 TTCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGA-TAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAG
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-ACTAATTTATTAGTATT-TAAAAATTAATAAAAG
* * * * *
28941 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA-ATATTAGAACAATTATTT
64 ATTTAAAAAATAAATCTGTATACCAAACCAATTCAAATAATTAAGATATATTAGAACAATTATCT
* ** *
29005 ATTTCAAATTGTTTTGACCT-TTTG-CTTGTCATAAA-ATAGTATTTTTAG
129 ATCTCAAATCATTATGA--TATTTGTCTTGTCATAAACA-AGTATTTTT-G
* * *
29053 TTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATTTAGAAAATTAATAAA
1 TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTA-AAAATTAATAAA
29115 CAACAAATTT
Statistics
Matches: 189, Mismatches: 41, Indels: 17
0.77 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 1 0.01
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178 2 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
TTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTAAAAATTAATAAAAGAT
TTAAAAAATAAATCTGTATACCAAACCAATTCAAATAATTAAGATATATTAGAACAATTATCTAT
CTCAAATCATTATGATATTTGTCTTGTCATAAACAAGTATTTTTG
Found at i:29475 original size:171 final size:171
Alignment explanation
Indices: 29152--29483 Score: 402
Period size: 171 Copynumber: 1.9 Consensus size: 171
29142 TTTTGAACAA
* * * *
29152 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGCTTTTGTTTTATCAT
1 GTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAACAAGCTTTTGTTTTATCAT
* * *
29217 AAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCTAGAATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTC
66 AAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCCTATCTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAACTTC
** * **
29282 AAATTTTGATATATTAGAGATTTAAAAAATACATCGAATTG
131 AAAAATTAATATAGAAGAGATTTAAAAAATACATCGAATTG
* * ** *
29323 GTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTACAAGCTTTT-TTTTTTC
1 GTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT--AAACAAGCTTTTGTTTTATC
* * * * *
29387 ATAAAACAATTTTTTTC-A-TCATACAAGCCTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAAT
64 ATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATAAAAGCCTATCTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAAC
29450 TTCAAAAATTAATA-AGAAGGAGATTTAAAAAATA
128 TTCAAAAATTAATATAGAA-GAGATTTAAAAAATA
29484 AATTTGTTTA
Statistics
Matches: 135, Mismatches: 22, Indels: 8
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
170 2 0.01
171 103 0.76
172 16 0.12
173 14 0.10
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (171 bp):
GTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAACAAGCTTTTGTTTTATCAT
AAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCCTATCTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAACTTC
AAAAATTAATATAGAAGAGATTTAAAAAATACATCGAATTG
Found at i:30031 original size:356 final size:360
Alignment explanation
Indices: 29592--30274 Score: 844
Period size: 356 Copynumber: 1.9 Consensus size: 360
29582 GCTTATTTGG
29592 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * ** *
29657 TGTTTGCCAAAGCAGTTCAAATAGTTAA-GACTA-T-AATAATTAT-CTCTTTAAAATCGTTATG
66 TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAG-CAATAACTATTGAACAATTATAAAC-TTAAAATCGTTATA
* *
29718 ACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGCTCATAGAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATAC
129 ACCATTTG-TTTATCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATAC
* * * ** * * * *
29782 TAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-TTA-TAACAAGTGAATCTGTTTATCGAA-
193 TAATCTAATAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC
* * * * *
29843 TCAGTTCAAATAATTATGGCTATGTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTT
257 T-AGTTCAAATAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
29908 GTCATATAACAATTGTGTTTGAATATTCAATTTTATTCAA
321 GTCATATAACAATTGTGTTTGAATATTCAATTTTATTCAA
* * * * *
29948 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * *
30013 TGTTTACTGATCCAGTTCAAATAGCAATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAA
66 TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGCAATAACTA-TTGAACAATTATAAACTTAAAATCGTTATAA
* * * * * *
30078 TCTTTTGTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTA
130 CCATTTGTTTATCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTA
* *
30143 ATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACTAG
195 ATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAG
* *
30208 TTCAAATATTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
260 TTCAAATAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
30273 TA
325 TA
30275 AAATAAGTTT
Statistics
Matches: 272, Mismatches: 45, Indels: 15
0.82 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
355 2 0.01
356 83 0.31
358 34 0.12
359 67 0.25
360 5 0.02
361 80 0.29
362 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (360 bp):
AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAACTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGCAATAACTATTGAACAATTATAAACTTAAAATCGTTATAAC
CATTTGTTTATCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAA
TCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACTAGT
TCAAATAATTAAGACTATATCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
ATAACAATTGTGTTTGAATATTCAATTTTATTCAA
Done.