Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168221.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_455, whole genome shotgun sequence
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* * * * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* ** * * * *
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* *
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* * * *
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62 ATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * * * * ** *
1471 -CAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTTTCAT-ATACAAGCCTA-TTC
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* * * *
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1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
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* * * *
1637 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTGT-AGTTCATATAAACTTA-TTC
129 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTGTTCATACAAGCTTATTTC
* * * *
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1 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
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*
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* * * *
1863 AAAATAAAATAATAATAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTAAA
1 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * *
1924 -CTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTAT-AGCCA-TTGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGG
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* * * * * *** * *
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* * * * *
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* * * * *
2167 TATAACCTTTTG-TATGTTAT-AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTC
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* ** * * *
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1 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * *
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* * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * *
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1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * * * *
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* * * * * **
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** *
2927 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAATTAATAA-TAAAAGATTTAAAAAATTAATC
1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
** * * * * *
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* * *
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* * *
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1 GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * ** * * *
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64 CTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * *
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128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC
* *
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1 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT--AAAAAAT
* ** * *
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* * * * * * ** * **
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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1 GAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * *
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* * * * *
3780 GACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATTT-TGTTCACAAAAGCTTATTT-
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC
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1 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT---AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * * * * ** * **
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* * * * *
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* * ***
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * **
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* *
4195 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAA
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* * * ** * * * *
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* *
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** * * *
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128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TTC
* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * **
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120 ATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTCT-GTT-CATAC-AAGCTTATTTC
* * * * * * * *
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1 -GAA-TAAAATA-ATACTAATTTATT-AA-TATTAAAAATT--AATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* ** *
4802 TAAATCAGTTTTATTGAAGC-AGTTCAATATA-TTATTG-CTCATTTGAAC-A-TATCTATTTAT
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* * * * * *
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**
4926 ACC
177 TTC
* * **
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
5112 GGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAA
1 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTA--AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * *
5291 AAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATTTTAAAAACTAATAAG----AGATTTAAAAAGTAAA
1 -GAATAAAATAATACTAATTTATT-A-ATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * ** *
5468 GAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAACAAGTAACGGATTTAAAAAATGAA
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5533 TTTGTTGGCCTGACCAA-TACAAATAGTTATAATTGTTTGAACAACTATCTATTTCAAAGT-GTT
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* * * * * * *
5596 ATAACCTTTTG-TTTGTTACAAAACAATTGTTT-TGTTCGTACAAGCTGACTTG
126 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC
* *
5648 GAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAGATTT--AAACTAAA
1 GAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA-TT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
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63 TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * *
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* * * *
5826 -AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTTAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 GAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
5890 TTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGCTT-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGCTA
63 TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
** * * *
5954 TGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTC
127 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC
* * * *** *
6006 GGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAA
1 -GAATAAAATAATACTAATTTATT--AATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
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** * * ** * *
6134 TGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAATTGTATCAATTCATATAGGCTTA-TTC
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* * * * * *
6186 AAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATGAGTTAGAGATTTAAAATATAAAT
1 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * *
6251 CTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATG
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** * * *
6316 ATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-
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* ** *
6366 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAA
1 G-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 GAATAAAATAATACTAATTTATT-A-ATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAA
*** ** * * * *
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* * * * * * *
6673 GATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGCCTA-TCC
128 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC
* * *
6723 AGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA
1 -GAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
6751 AAAAATAAAT
Statistics
Matches: 4817, Mismatches: 965, Indels: 645
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
157 3 0.00
158 39 0.01
159 32 0.01
160 38 0.01
161 2 0.00
162 2 0.00
164 29 0.01
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GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC
CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTTC
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1594 CAAACCAACT
* * * *
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* * ** * * *
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* * * * * *
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122 AA-TAAGAGATTTAAAAAA-TAATCTATTTACCGAA-CTAGTTCAAATAATTATA-A
* * * *
1782 CTATATG-AACAA-TATCTATTTCAAATCATTA-AGACCTTTTGTTTTGTC--ATAAA-ATAATT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATA-ACCTTTT-ATTTGTCATATAAACATTATT
* * *** *
1841 GTTTTAGTTCATA-CAATTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATGTTTTAAAAA-TTAA
64 -TTTGAATTCA-AGC--TTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTTAA
* * * * *
1904 TAAGTGATTTAAAAAGTAAACTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATAG
124 TAAGAGATTTAAAAAATAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAA
* * * *
1955 CCA-TTGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGGTATTAACCTTTT-TTTGGTCATATTAACAGTTA
1 CTATTTG-AAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA-TAACCTTTTATTT-GTCATATAAACA-TTA
* * *
2018 TATTTGAAAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAAT-ATACTACTTTATTAATCTTTCAAAAATTAAT
62 TTTTTG--AATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAT-TTTCAAAAATT--T
* *
2082 AACTAAGAGATTTAAAAAATAACCTATTTACCGAACTA-TCTCAAATAGTT-TAAA
122 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAATCTATTTACCGAACTAGT-TCAAATAATTAT-AA
** * * *
2136 CTATTTGAAACAATTATAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTGTATGT--TATAAACAATTATT
1 CTATTTGAAACAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTGTCATATAAAC-ATTATT
* * * * * * ** * *
2198 TTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAATATTCCAAAATTAATAAC
64 TTTG--AATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATTTTCAAAAATT--TAA-
* * * * *
2263 TAAGAGAATTT-AAAAA-AATTTGTTTGCCGAATTAAGTTCAAATATTTA-AGA
124 TAAGAG-ATTTAAAAAATAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATA-A
* * * * *
2314 CTATAATG-AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAATATT-TT
1 CTAT-TTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTA-TTTGTCATATAAACATTATT
2377 TTTGAATTCATATTAGCTTATTT-GAAT-AAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAATTTA
64 TTTGAATTC--A--AGCTTATTTGGAATAAAATAATAAT-AATTTATTAAT-TTTCAAAAATTTA
* * * *
2438 ATAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGA
123 ATAAGAGATTTAAAAAATAA-TCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAA
* * * *
2491 CTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATA-AAGCA-AATGT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTA-TTTGTCATATAAACATTAT-T
* * * * * * *
2553 TTTGTTCATAT-AAGTTTGTTTCGAAATAAAGTAATACAT--TCTATTAATATTTCAAATA-TTA
64 TTTG--AAT-TCAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATA-ATAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTTA
* * *
2614 ATCAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTATC-AACTAGTTTAAATAGTTA-AGA
123 AT-AAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATA-A
* * * * * * *
2665 CTATTTG-AGCAATCAT-TATTTCAAATCATTATGA-CTTTT-TTGTTTTATTATAAAACAATTG
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATT-TGTCA-TAT-AAAC-ATTA
* * * * * * * * *
2726 TTTTTGTTTATACAAGCTTACTTAGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTTAACAA-TTAA
62 TTTTTG--AATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTTAA
* * * * ** ** * *
2790 TAAGTAAAATTTTAAAAATAATATGTTTGTCGAACTAAAT-AAATAATCATGA
124 TAAG--AGATTTAAAAAATAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAA
* * * * * * *
2842 TTATTTG-AATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA-AAAGA--ATTG
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATATAAACATTATT-
** * * * ** *
2903 TTCCAGTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAATTAATA
64 TTTGAATTC----AAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATTTTCAAAAATT--TA
* * * *
2968 ATAAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAAC-ATGTTCAAATAATTATGA
123 ATAAGAGATTTAAAAAA-TAATCTATTTACCGAACTA-GTTCAAATAATTATAA
* * * * * *
3021 CTATTTG-AACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATT-TTT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATATAAACATTATTT
* * * * *
3084 TTGTTCATACAAGCTTATTT-AAAAAAAATAATACA-AATTTATTAATATT-AAGACAATTAATA
65 TTG--AATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATTTTCAA-A-AATT--TA
* * * * *
3146 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATCATTATAA
123 A-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAA
* ** * * * * * * * *
3200 CTATATG-TGCGATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATA-AAATAATTGTT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATATAAA-CATTATT
** * * ** * * *
3263 TCTATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAA
64 T-T-TGAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAT-TTTCAAAAATT--TAA
* * * ** * * * *
3328 GTAAAAGATTTTAAAAAAAATAAATATGTTTATTAGTAA-AAGTTCAAAATAGTCATGA
124 -TAAGAGA-TTT--AAAAAAT-AATCTATTTA-CCG-AACTAGTTC-AAATAATTATAA
* * * * * * *
3386 CTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATA-AAACA--AT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAAC--CTTTT-ATTTGTCATATAAACATTAT
* * * * * * * *
3447 TGTTTCAGTTCATG-TAAGTTTGCTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTGAAAATT
63 T-TTTGAATTCAAGCTTA-TTTG---GAA-TAAAATAATAATAATTTATTAATTTTC-AAAAATT
* * * * * ** * * * *
3511 AATGAGTAAAAGAATTAAAAAAAGAATCTATTTA-CTAAAAAGTTCAATTAGTTTTGA
121 --T-AATAAGAG-ATTTAAAAAATAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAA
* * * * * * * * * * *
3568 TTATCT-AAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCGTA-AAACAATTGGT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATATAAAC-ATT-AT
* * * * * * *
3631 TCTGTT-CATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATTCCAAAATTAGTA
63 T-T-TTGAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATTTTCAAAAATT--TA
* * * * * * *
3694 AGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAAC-ACATTCAAATAGTTATGA
123 A-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACCGAACTA-GTTCAAATAATTATAA
* * * * * * *
3747 TTATTTG-AACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATA-AACCCATTGAT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATATAA-ACATT-AT
** *** * * * *
3810 TTTGTTCACAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAACTTCCAAAAAATTAATA
63 TTT-TGAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATT-AATTTTC-AAAAATT--TA
* * * * * *
3875 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTTCAAATAGTTATGA
123 A-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACCGAACTAG-TTCAAATAATTATAA
* * * ** * * * *
3930 TTA-TTCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATA-AAATAATTGTT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-ATTTGTCATATAAA-CATTATT
** * * * * *
3993 TCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAA-TTAATA
64 T-T-TGAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTTAATA
* * * * **
4057 ATTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TAAATTTAAATAGTCATGT
126 A----GAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTATAA
* * * * * * *
4111 CCATTTG-AACTATTATCTATTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTCATA-AAACAATTGTT
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTA-TTTGTCATATAAAC-ATTATT
* *** *
4174 TTT--ATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAA
64 TTTGAATTCAAGC----TTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTTAA
* * * * ** * * * *
4236 TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTAAAATAGTTATGA
124 TAAGAGATTTAAAAAAT-AATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAA
*
4288 CTATTTG-AACAATTATCTATCTCAAATC
1 CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATC
4316 ATTAGGATCT
Statistics
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0.73 0.14 0.13
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (174 bp):
CTATTTGAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTTGTCATATAAACATTATTTT
TGAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATAATAATTTATTAATTTTCAAAAATTTAATAAGAGA
TTTAAAAAATAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAATTATAA
Found at i:2506 original size:18 final size:20
Alignment explanation
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*
2471 ACTAGTTCAAAT-AATTATG
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
2490 ACTATTT-AAA-CAATTAT-
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
2507 -CTATTTCAAATC-ATTATG
1 ACTATTTCAAATCAATTATG
2525 AC
1 AC
2527 CTTTTATTTT
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 1, Indels: 10
0.74 0.02 0.24
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (20 bp):
ACTATTTCAAATCAATTATG
Found at i:5373 original size:175 final size:180
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Period size: 181 Copynumber: 32.2 Consensus size: 180
1594 CAAACCAACT
* * *** ** * *
1604 CTATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTGT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATT-T
* * * *** *
1668 A-GTTCATATAAA-CTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT-TTATAATATTCCAAAAATTAACAA
65 ATGCTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAATAA
** * * * * * * *
1730 CTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATC-AAGCAATTTAAACAATTAAGA
128 CTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * ** * *
1782 CTATATGAACAA-TATCTATTTCAAATCATTA-AGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATA-ACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTT
* * * * * * * *
1845 -TAGTTCATACAA--TTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATGTT-TTAAAA-ATTAA-
65 AT-GCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATAATAAC
* ** * ** * *
1904 TAAGTGATTTAAAAAGTAAA-CTATTTACCGAATTAGTTCAAATAATTATAG-
129 TAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA-AGA
* * * ** ** * *
1955 CCAT-TGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGGTATTAACCTTTT-TTTGGTCATATTAACAGTTA
1 CTATATG--AACAATTATATATTTCAAACCATTA-TAACCTTTTGTTTCATCATA-AAACAATTA
*** ** *** * * * * *
2018 TATT-TGAAAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAAT-ATACTACTTTATTAATCTT-TCAAAAATTA
62 T-TTATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAA-TA
* * * *
2080 ATAACTAAGAGATTTAAAAAA-TAACCTATTTACCGAA-CTATCTCAAATAGTTTAA-A
124 ATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAAT-TCAAATAG-TTAAGA
* * * * *
2136 CTATTTGAAACAATTATAAACTTT-AAATCC-TTATAACCTTTTGTAT-GTTAT-AAACAATTAT
1 CTATATG-AACAATTATATA-TTTCAAA-CCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTAT
* * * * * **
2197 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAATATT-CCAAAATTAATA
63 TTATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAATA
* * * * ** *
2261 ACTAAGAGAATTT--AAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAAGTTCAAATATTTAAGA
127 ACTAAGAG-ATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
* *** * * **
2314 CTATAATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-ATATT-TT
1 CTAT-ATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACA-ATTATT
* * ** ** * * * * *
2377 TTTGAATTCATATTAGCTTATT-TGAAT-AAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAT-TT
64 TATG--CTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTATGAAAATAAT
* * * * * * * * *
2437 AA-TAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTTCAAATAATTATGA
126 AACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * ** * * *
2491 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAGCAAATGTTT-
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
* * * * * * * * * *
2555 TGTTCATATAAGTTTGTTTCGAAATAAAGTAATAC-ATTCTATTAATATT-T-CAAATATTAA-T
66 TGCTCATAAAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATAATAACT
* * * * *
2616 CAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTATC-AACTAGTTTAAATAGTTAAGA
130 -AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * * * *
2665 CTATTTGAGCAATCAT-TATTTCAAATCATTATGACTTTTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAAC-CTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTT
* * * * * * * * * *
2729 TTGTTTATACAAGCTTACTT-AGATTAAAACAATACTAATTTATTAATATT-TTAACAATTAATA
65 ATGCTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAA-AA-TAATA
* * * * * ** * * * * * *
2792 AGTAA-A-ATTTTAAAAA-TAATATGTTTGTCGAACTAAAT-AAATAATCATGA
127 ACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * * * ** * * *
2842 TTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTCC
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATT-T
* * *** * * *
2907 A-GTTCATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--ATCCAAAATTAATAA
65 ATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAA-TAATAA
* ** * ** * * *
2969 -TAAAAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAA-CATGTTCAAATAATTATGA
128 CTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCA-ATTCAAATAGTTAAGA
* * * * ** ** * * *
3021 CTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAAAATT-TTTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
* * * * * * * * *
3085 TGTTCATACAAGCTTATTTAAAA-AAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGT
66 TGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGA-AAATAATAACT
* * * * ** *
3149 AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATCA-TTATA-A
130 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAAT-AGTTA-AGA
** * * *** * * ** * * *
3200 CTATATGTGCGATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
** * * * * * * * *
3265 TATTCATACAAGTTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAG
66 TGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAA-AA-TAATAAC
* * * * ** * *
3329 TAAAAGATTTTAAAAAAAATAAATATGTTTATTAGTAA--AAGTTCAAAATAGTCATGA
129 TAAGAGA-TTT--AAAAAACAAATCTATTTACCA--AACCAA-TTC-AAATAGTTAAGA
* * * * * * * * ** * *
3386 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAAC--CTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATT
* ** * * * * * * *
3451 TCA-GTTCATGTAAGTTTGCTT-GAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTGAAAATTAAT
64 T-ATGCTCATAAAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAAT
* * * * * * **
3514 GAGTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAA--AAGTTCAATTAGTTTTGA
126 AACTAAGAGATTTAAAAAACA-AATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * * * * * ** *
3568 TTATCTAAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACTTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTGGTTC
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
* ** * * * * ** *
3633 TGTTCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATATT-CCAAAATTAGTAA
66 TGCTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTATGAAAA-TAATAA
* * * * * ** *
3695 GTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAA-CACATTCAAATAGTTATGA
128 CTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCA-ATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * * ** * *
3747 TTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGATTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATT-ATTT
* * ** * * *
3812 -TGTTCACAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTTCCA-AAAAATTAAT
65 ATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TT--ATGAAAA-TAAT
* * * * * * * * *
3874 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTTCAAATAGTTATGA
126 AACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCA-ATTCAAATAGTTAAGA
* * * ** * ** * *
3930 TTAT-TCAAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
1 CTATAT-GAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTT
* ** * * ** * * * * * *
3994 CTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAAT
65 ATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAATAAC
** * * ** * * * *
4059 TTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAAATTTAAATAGTCATGT
129 TAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * *** * * * ** * *
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1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
** * * * *
4176 TATTCATGCAAAA--TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA-ATTAA-
66 TGCTCAT--AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATAATAAC
* * * * ** * * *
4236 TAAGAGATTT-AAAAACTAAATTTGTATACAAAATTAGTTAAAATAGTTATGA
129 TAAGAGATTTAAAAAAC-AAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * ** * ** * *
4288 CTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
** * * * * * * * * *
4352 TATTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGT
66 TGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAATAACT
* * * *
4417 AAGAGATTTAAAAAATC-AATGTGTTTACTAAA-CAATTGAAATAGTTAAGA
130 AAGAGATTTAAAAAA-CAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* ** * * * * * * *
4467 CTAT-TAGAATAATTACCTATTTCAAATCATTCTGA-CTTTTGTTTAATCATAAAATAATTGTTC
1 CTATAT-GAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTT
* * * * * ** * * * *
4530 A-GTTCATACATGCTTTATT-GAAATAAAATAATGCTTTTGTATTAACATTCA-AAAAATTAATT
65 ATGCTCATAAAAGC-TTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-ATGAAAA-TAA-T
* * * * * * *
4592 AAGCCAAG-GAAGTTCAAAGAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAATTCAAATA-CTACTA-A
126 AA-CTAAGAG-A-TT-TAA-AAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA--AGA
* * * ** * * *
4651 CTATTTGAATAATTA-ACTATTTAAAACTGTTATAACCTTTTGTTTTATGCATAAAACATTTGTT
1 CTATATGAACAATTATA-TATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCAT-CATAAAACA-AT-TA
* ** * * * * * * * * *
4715 TTTAATTC-CACCAAAGC-CATACCAAAACTAACATAGAT-TTACTTTATTAA-AGTTTTCAAAA
62 TTT-ATGCTCATAAAAGCTTAT-TCAAAA-TAAAATA-ATACTAATCTAATAATA-TTATGAAAA
* * * *** * * *
4776 TTCGAAGAAGTGAA-AGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTTATTGAAGCAGTTCAATATA-TTATT
122 -T--AATAACT-AAGAGATTTAAAAAACAAATCTA--TTTACCAAACCAATTCAA-ATAGTTA-A
4838 G-
179 GA
* * * * * *
4839 CTCATTTGAACATATCTAT-T-TATCAAAATCTTTATGAAATCTTTTGTTAT-GTCATAAAACAA
1 CT-ATATGAACA-AT-TATATATTTC-AAACCATTAT--AACCTTTTGTT-TCATCATAAAACAA
* * ** * * * ** * * * * *
4901 TTGTTTTTTTTATCATACAA-CCTATACCGAATAAAATGATGGCTAATGTTATTAATATTATCAA
59 -T-TATTTATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTAAT-CTAATAATATTAT-GA
* * * * ** * *
4965 AAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAATATGCTTA-CAGAACTAAGTTCAAATAGTTATGA
119 AAA-TAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCA-AACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
* * **
5028 CTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTA
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
* * ** *
5093 TGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTAATAACT
66 TGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAATAACT
* * *
5158 AAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGG
130 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * *
5209 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCATTATGACCTTTTGTTTCATCTTAAAA-AATGT-TTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAAT-TATTT
* * * * * * * *
5272 -TGCTCATAAAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATATT-TTAAAA-ACTAA-T
65 ATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATAATAACT
** *
5333 AAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATA-A
130 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA-AGA
* * * * * * ** * * *
5384 CAATGTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTC
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
** * ** * * * * * ** ** * * *
5449 TATTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAACAAGT
66 TGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAATAACT
** * * ** ** *
5514 AACG-GATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAATACAAATAGTTATA-A
130 AA-GAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTA-AGA
* * * * * *** * * * *
5565 TTGTTTGAACAACTATCTATTTCAAAGTGTTATAACCTTTTGTTT-GTTACAAAACAATTGTTT-
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
* * * * ** * * * *
5628 TGTTCGTACAAGCTGACTT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA
66 TGCTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATA-CTAATCTAATAATATTAT-GAAAA-TAATA
* * * * * ** *
5690 AGTAA-AGATTT---AAACTAAATTTGTTTATC-GATTAAGTTCAAATAGTTATGA
127 ACTAAGAGATTTAAAAAAC-AAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
* * * ** * ** * * *
5741 CTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTACTATAACCTTTTGTTTTGTCACAAAATAACTTTTTC
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA-TTATT-
* * * * * *
5806 TAT--TCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAAT
64 TATGCTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTAT-GA-AAATAAT
* * * * * * * * * *
5867 TAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-TAAGTTTAAATAGCTT-TGA
126 AACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAG-TTAAGA
* * * ** * ** ** * *
5922 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATTATTTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
* * ** * * * * * * * * *
5987 TGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAATAAGT
66 TGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATG-AAAATAATAACT
* * * * * * * * * *
6052 AAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTGACCGAA-TAAGTTCTAATACTTATA-A
130 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTA-AGA
* ** * *
6103 CTACT-TGAATAATTAT-TGATTTCAAA-TGTTATGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAATTGTA
1 CTA-TATGAACAATTATAT-ATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA-T-TA
** * * * * *
6165 TCAAT--TCATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCA--AAAATTAA
62 TTTATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-ATGAAAA-TAA
* * * * * ** * *
6226 TGAGTTAGAGATTTAAAATATAAATCTATTTACTGAA-CAAGCTCAAATAGTTATGA
125 TAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * ** * ** *
6282 CTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAA-TAGTTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCA-TTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTT
* ** * * ** * * * * **
6346 CTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGG
65 ATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAA-TAATAAC
* * * * * ** * * *
6411 TAGGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCATGTT
129 TAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAG-A
* * * * * ** * *
6464 CGT-T-TGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGTTT
1 C-TATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTT
* * * ** * * * * *
6527 CTGTTCATACAGAA--TTATTTAGCATAAAATAATGCTGAT-TCATTAAGATTTTGAAAAT--TA
65 ATGCTCATA-A-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCT-AATAATATTATGAAAATAATA
* *** ** * *
6587 A-TAAGAG-TATT-AAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAGTTATGA
127 ACTAAGAGAT-TTAAAAAAC-AAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * * * * *
6640 CTTTTTGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGATCTTTAT-TTT-GTCATAGAACAATTGTTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTT-TGTTTCATCATAAAACAATTATTT
* ** * * * * * *
6703 CTTTTCATATAAGCCTATCCAGATTAAGATAATACTAAT-T--TAATA--AT-AAAA-AATAA--
65 ATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATAATAACT
* *** * * *
6759 ATGAG-TTT---TGCCAAA-CTA--T--CAAA-CAAGCTCAAATAGATATG-
130 AAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGA
* * * * *** * * * ** *
6800 GTCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTT-AGTAATTTAAGAATT-TT
1 CT-ATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCA-TCATAAAACAATTATT
* ** * * * * * * * * *
6863 TTTTATCGTACACGGTTGTTCAAAATAAAATAACACTAAT-TGATTAATCTT-TCAAAAATTAAT
64 TATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCT-AATAATATTAT-GAAAA-TAAT
* * * * * * * *
6926 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA
126 AACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * *
6981 CTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCTTTTG-TTCTATCATA
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAA-C---CA--T--T---ATA-ACCTTTTGTTTC-ATCATA
* * * ** * *
7045 AAACAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTCTG
53 AAACAATTATTTATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATG
** * * * * *
7110 AAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAAT-TGGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTAAGA
118 AAAA-TAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCT-ATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * * * ** *
7174 CTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTTT
1 CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTAT-AACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTT
** * * * * * *
7238 CAAT--TCATACTAGCTTATTCAGAATAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAA
65 --ATGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTAT-GAAAA-TAA
* * * * * * *
7299 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAATTCTAATAATTATGA
125 TAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
* * * *
7355 CTATTTGAAC-ATTATCA-ATTTGAAATCATTATCACCT
1 CTATATGAACAATTAT-ATATTTCAAACCATTATAACCT
7392 ATGGTATAAA
Statistics
Matches: 4346, Mismatches: 947, Indels: 632
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
160 3 0.00
161 75 0.02
162 9 0.00
163 1 0.00
164 4 0.00
165 3 0.00
166 3 0.00
167 5 0.00
169 7 0.00
170 9 0.00
171 8 0.00
172 11 0.00
173 56 0.01
174 89 0.02
175 170 0.04
176 341 0.08
177 403 0.09
178 403 0.09
179 571 0.13
180 369 0.08
181 824 0.19
182 176 0.04
183 162 0.04
184 72 0.02
185 59 0.01
186 48 0.01
187 28 0.01
188 125 0.03
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191 45 0.01
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194 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
CTATATGAACAATTATATATTTCAAACCATTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATTTA
TGCTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATAATAACTA
AGAGATTTAAAAAACAAATCTATTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGA
Found at i:6425 original size:541 final size:541
Alignment explanation
Indices: 1424--25178 Score: 14518
Period size: 541 Copynumber: 44.2 Consensus size: 541
1414 TATTGAATTG
* * * * * * * *
1424 GTTCAAATAATTTTGTC-ATTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTA-CAACTTTTGTTTTGTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
1487 ATAAAATAATTGTTTTTCA-T-ATACAAGCCTA-TTCAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
1549 TTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-C-CA-AA---C-CA-A---C
130 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA
** * *
1603 T--CTATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * ** *
1665 TGTAGTTCATATAAACTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTA-TAATATTCCAAAAATTAAC
259 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
* * * * * * * * *
1728 AACTAAGAGATTTAAAAAATTAATTTGTTTATC-AAGCAA-TTTAAACAATTAAGACTATATGAA
323 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * *
1791 CAA-TATCTATTTCAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAC
387 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC
** * * *
1855 AA--TTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTATTAATGTTTTAAAAATTAATAAGT----GATTT
452 AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** **
1914 AAAAAGTAAA-CTATTTACCGAATTA
516 AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * *
1939 GTTCAAATAATTAT-AGCCA-TTGCCAACAATTATCTATTTCAAATCGGTATTAACCTTTT-TTT
1 GTTCAAATAGTTATGA-CTATTTG--AACAATTATCTATTTCAAATAGTTA-TGACCTTTTGTTT
* * * * ** * ** *
2001 GGTCATATTAACAGTTATATT-TGA-AAATTCAAGCTTATTTGGAATAAAAT-ATACTACTTTAT
62 TGTCATA-AAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * * *
2063 TAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AACCTATTTACCGAACT-A-TCTCA
124 TAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGT-TCA
* ** * * * *
2125 AATAGTT-TAAACTATTTGAAACAATTATAAACTTT-AAATCCTTATAACCTTTTG-TATGTTAT
186 AATAGTTAT-GACTATTTG-AACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * ** *
2187 -AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAACAATA-TTC
248 AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
* * * * * * *
2250 CAAAATTAATAACTAAGAGAATTT--AAAA-AAATTTGTTTGCCGAATTAAGTTCAAATATTTAA
313 AAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTAT
* ** *
2312 GACTATAATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-ATATTT
376 GACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-A-TT
* * ** * *
2376 TTTTGAATTCATATTAGCTTATT-TGAAT-AAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC-AAAATT-
438 GTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTA
* * * *
2436 -TAA-TAAGTGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCT-AACTA
501 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAA
* * *
2475 GTTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
2539 CATAAAGCAAATGTTT-TGTTCATATAAGTTTGTTTCGAAATAAAGTAATAC--ATTCTATTAAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AAAATAAAATAATACTAATT-TATTAAT
* * * * * *
2601 ATTTCAAATATTAAT---CAAGAGATTT-AAAAATAAATCT-ATTATCAACT-AGTTTAAATAGT
128 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
2660 TAAGACTATTTGAGCAATCAT-TATTTCAAATCATTATGACTTTTTTGTTTTATTATAAAACAAT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
2724 TGTTTTTGTTTATACAAGCTTACTTAG-ATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTTAACAATT
256 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
* ** * * * *
2788 AATAAGTAA-A-ATTTTAAAAAT-AATATGTTTGTCGAACTAA-AT-AAATAATCATGATTATTT
320 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
2848 GAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTCCAGTTCA
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
* * * * *
2913 TATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAATTAATAA-TAAAAGAT
449 TACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
2977 TTAAAAAATTAATCTGTTTACTGAACAT
514 TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * *
3005 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
3070 ATAAAAAAATT-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAA-AAAATAATACAAATTTATTAATA-T
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
3132 TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATCA-T
131 TAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAAT-AGT
* * ** * * ** * *
3195 TATAACTATATGTGCGATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
3260 GTTTCTATTCATACAAGTTTATTC-AGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTA
257 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA
* ** *
3324 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAAATAAATATGTTTATTAGTAA-AAGTTCAAAATAGTCATGACT
321 ATAAGTAAGAGA-TTT--AAAAAATAAATATGTTTA-CCG-AACAAGTTC-AAATAGTTATGACT
* * * * *
3388 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATAATGACTTTTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC
380 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC--CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* ** * * * * *
3453 AGTTCATGTAAG-TT-TGCTTGAACTAAAATAATACTAATTTACTAATATTCTGAAAATTAATGA
443 AATTCATACAAGCTTATTC-GGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA
* *
3516 GTAAAAGAATTAAAAAA-AGAATCTATTTACTAAA-AA
505 GTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * *
3552 GTTCAATTAGTTTTGATTATCTAAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACTTTTTGTTTTAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * *
3616 CGTAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAAT-TTAAATTTACTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
** * * * * * * *
3680 TTCCAAAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTGAACACA-TTCAAATAGT
129 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATA-AGTTCAAATAGT
* * * * *
3742 TATGATTATTTGAACAATAATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAACCCATT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * **
3807 GATTTTGTTCACAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ACTTCCAAAAAATT
257 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-TTAAAAATT
* * * * * * *
3871 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAGCGAGTTTCAAATAGTTATGATTATTC
320 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
3936 AAACAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCA
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
* * * * * * **
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449 TACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
** *
4066 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATAA
513 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * * *
4095 ATTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTGAAATTGTTATGACATTTTATTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * ** *
4160 ATAAAACAATTGTTTTTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
4225 TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTATA-CAAAATTAGTTAAAATAGTTA
131 T-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTTA
* * *
4285 TGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTAGGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * ** *
4349 TTCTATTCATACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATATTTTAAAAATTAAT
259 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
* * ** * * * *
4413 AAGTAAGAGATTTAAAAAATCAATGTGTTTACTAAACAA-TTGAAATAGTTAAGACTATTAGAAT
323 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * ** * *
4477 AATTACCTATTTCAAATCATTCTGA-CTTTTGTTTAATCATAAAATAATTG-TTCAGTTCATACA
388 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
* * * * * *
4540 TGCTTTATT-GAAATAAAATAATGCT-TTTGTATTAACATTCAAAAAATTAATTAAGCCAAG-GA
453 AGC-TTATTCGGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTC-AAAAATTAA-TAAG-TAAGAG-
* *
4602 AGTTCAAAGAAAATAAATCTGTTTA-TCAAACAA
512 A-TT-TAA-AAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * * * * * *
4635 ATTCAAATA-CTACTAACTATTTGAATAATTAACTATTTAAAACT-GTTATAACCTTTTGTTTTA
1 GTTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * * *
4698 TGCATAAAACATTTGTTTTTAATTCCA-CCAAAGC-CATACCAAAACTAACATAGAT-TTACTTT
64 T-CATAAAACAATTGTTTCT-ATT-CATAC-AAGCTTAT-TTAAAA-TAAAATA-ATACTAATTT
* * ** ** **
4760 ATTAA-AGTTTTCAAAATTCGAAGAAGTGAA-AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTTATTGAAGCA
122 ATTAATA--TTTAAAAATT--AATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTATCAAATAA
* *
4823 GTTCAATATA-TTATTG-CTCATTTGAAC-A-TATCTATTTATCAAAATCTTTATGAAATCTTTT
181 GTTCAA-ATAGTTA-TGACT-ATTTGAACAATTATCTA-TT-TC-AAATCATTATG--ACCTTTT
* * * * * *
4884 GTTATGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTATCATACAA-CCTATACCG-AATAAAATGATGGCTAA
238 GTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGT-TCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAAT-ACTAA
* * * *
4947 TGTTATTAATATTATCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTT-AAAAATAAATATGCTTACAGAACTA
299 T-TTATTAATATT-TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAAC-A
* *
5011 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGT
361 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
5076 CATAAAACAATTATTT-ATGTTCATACAAGCTTATTCGGAATACAATAATACTAATCTAATAATA
426 CATAAAACAATTGTTTCA-ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
5140 TT-ATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTTTTTACCAAACCAA
490 TTCA--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-CAA
* * * * * **
5194 -TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAACCA-TTATGACCTTTTGTTTCAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * * * *
5257 CTTAAAA-AA-TGTTTTTGCTCATAAAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTGATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
5320 TTTAAAA--ACTAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAATCAA-TTCAAATAGTTA
130 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAAT-AAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
5381 TAACAATGTGAACAGTTATTTATTTCAAATCATTATAACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATT-T
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * ** *
5445 TTTCTATTGATACTATCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATCCTAAAAATTAAC
259 TTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
* * ** * * * * *
5510 AAGTAACG-GATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTGACCAA-TACAAATAGTTATAATTGTTTGA
323 AAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * ** *
5573 ACAACTATCTATTTCAAAGT-GTTATAACCTTTTG-TTTGTTACAAAACAATTGTTT-TGTTCGT
386 ACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* *
5635 ACAAGCTGACTT-GGAATAACATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AG
450 ACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * **
5697 ATTT--AAACTAAATTTGTTTA-TCGATTAA
512 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * *
5725 GTTCAAATAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTA-CTATAACCTTTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
5789 CACAAAATAACTT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA
65 CATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
5853 TTTAGACAACTAATTAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTTAAATAGCT
129 TTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAG-T
* ** ** *
5918 T-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGCTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * ***
5982 ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGCCAATTAA
257 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * * *
6047 TAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTGACCGAATAAGTTCTAATACTTATAACTACTTGAA
322 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * ** * *
6112 TAATTAT-TGATTTCAAAT-GTTATGACCTTTTGTTTCATCATTAAACAATTGTATCAATTCATA
387 CAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA
* * ** * * *
6175 TAGGCTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATGAGTTAGAGATTT
451 CAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* *
6240 AAAATATAAATCTATTTACTGAACAA
516 AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * ** *
6266 GCTCAAATAGTTATGACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATATTTTATTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
6331 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
6396 CTAAAAATTAATAGGTAGGAGACTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAATTCAAATAGTCAT
131 -TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
6461 G-TTCGTTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTGT
195 GACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * * *
6525 TTCTGTTCATAC-AGAATTATT-TAGCATAAAATAATGCTGATTCATTAAGATTTTGAAAATTAA
259 TTTTGTTCATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * ** ** *
6588 TAAG--AG-TA-TTAAAAACTAAATCTGTTTATGGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAA
322 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * ** *
6649 CAATTATATATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAGAACAATTGTTTCTTTTCATAT
387 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC
* * * * * *
6713 AAGCCTATCCAGATTAAGATAATACTAATTTAATAATA---AAAAA-T-A-AA-T--GAG-TTT-
452 AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
****
6767 --TGCCAAA-CTA--T-C-AAACAA
517 AAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * *
6785 GCTCAAATAGATATG-GTCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTAGT
1 GTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * * * * * * * *
6849 AATTTAAGAATTTTTTTTA-TCGTACACGGTTGTTCAAAATAAAATAACACTAATTGATTAATCT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* **
6913 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA
130 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
6978 TGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCAATTATTTAATAAAATATACCTTTTGTTCTATCA
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC----A--T--T---AT-GACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
7043 TAAAACAATTATTTATGTTTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTC
247 TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
7108 TGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAAT-TGGTTTGCCGAACCAGTTTAAATAGTTAA
312 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
7172 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTTTT
376 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
7237 TCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAGTAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
441 TCAATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* *
7301 AGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCAA
504 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAA
* * * * * *
7340 -TTCTAATAATTATGACTATTTGAAC-ATTATCAATTTGAAATCA-TTATCACC-TATG----GT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** * *
7397 -ATAAAACAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGCTAATATATTAATA-
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
7460 TTACAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTATC--A-AA---C--AT-G-T
130 TTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTT
* **
7511 -T--C------AACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAATTG
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
7566 TTTTAGTTCATAAAAGCCTA-TCTAAA-ATAA-AAT-C-AAGTTGTATTAATATTTTAAAAGTTA
258 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TT-TATTAATATTTTAAAAATTA
* * * *
7626 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTT
321 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * ** * * * * *
7689 AAACAACTATCTATTTCAAATTGTTGTTATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTCCTTTTCAA-T
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT--GTTTCAATT
* * * *
7753 -ATAGAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGAATTAAT-A--AA-A
447 CATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* *
7813 GATTTAAAAAATAAAATCTATTTACCAAACCA
511 GATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTAAACAA
* * * * *
7845 GTTCAAATAGTTATGACTA-TTGAAACAATTCTCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
7909 CATAAAACAATTGTTTTGTGTTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA
65 CATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *** * * *
7974 TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTGCTGAACT-AGTTCAAATAGT
129 TT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATCAAATAAGTTCAAATAGT
* * * *
8038 TA-AACTATATGAA-AATTTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
192 TATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * ** *
8101 TGCTTTTTCTTAATATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTTAGAAAAT
256 TG-TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAAT
* * * * * * * * * *
8166 TAATTAGTAAGATATTTAAAAAGTAAATCTATTT-GCTAAGCCATTTCAAATAGTTTTGACTATT
319 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
8230 TGAATAATTATCTATTTTAAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTCCTATT
383 TGAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATT
* ** * * * ** *
8295 CATACTATTTTATAT-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACCAGG
447 CATACAAGCTTAT-TCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
8359 AAAATTCAAAAAATAAATATAATTGT-C-AAACCA
510 -AGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACTAAACAA
** * * * * *
8392 GTTCAAATAGTTAAAACTATATGAACGATTATTTATTCCAAACT-GTTATGACCTTTTTCTTTTG
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACC-TTTTGTTTTG
* * * ** * * *
8456 TCATTAACCAATTGTTT-TATTTATACAAGCTTATTTTGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * *
8520 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAATCAGTTCAAATGGTT
129 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
8585 AAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTCTGATCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
*** * * * **
8650 TTTCAATTCATACAAACTTATTC-AGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAA
258 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * * * *
8714 TAAGAAATAGATTTAAAAAGATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCGAATAATTATTACTATTTTA
322 TAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * * *
8779 ACAAATGT-TAATTT-AAATCGTTATAACTTTTTGATTTCTTATAAAACATTTGTTTCAATTAAT
386 ACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
8842 ACAAGCTTAGAT-GGATTAAAATAATACTAATTTATTAATACTTACTAAAA-TAATAAGTAAGAA
450 ACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * **
8905 ACTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTGAATTA
512 ATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTAAACAA
* * * * *
8935 GTTAAAATAATTAT-AGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACTTTTTGTTTTG
1 GTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
8998 TCATAAAACAATTATTTTTTTATCACATAAGCTTATTCAAAATAAAATGATATTAATTTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
9063 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATTAGTTCAAATAGT
128 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
9128 TATGACTATTTAAACAATTAT-TAATCTCAAATCGTTAAGA--TTTATGTTTTATCATAAAATAA
192 TATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * * *
9190 TTGTTTTTGATCATAGAAACTTATTTCGTTA-AAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAATT
255 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* ** * ** **
9254 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAGTCAA-TTTGAATAGTTAAAACTAT
319 TAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
9318 TAGAATAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATATTTGTTTCATAT
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-AT
* * * * * *
9383 T-TTACAAGTTTATTCGGAATAAAATAAT-CAAAATTTATTAACATTCAGAAAATTAAAAAGGAA
446 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAA
* ** *
9446 -ATGATTTGAAAAAATAAAATTTGCTTACCAAACAA
509 GA-GATTT-AAAAAAT-AAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * ** *
9481 GTTCAAATAGTGATGACTATTTAAACTATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCAGTTGTTTTGA
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** *
9545 CATAAAACATTTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-
* * * * * * *
9609 ATTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATT
128 ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTT
* * * *
9671 ATGACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
*** * * *
9736 TTTGAATTCATACAAGCTTAGTT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAA
258 TTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * *
9800 TAAGTAAGTGATTT-AAAAGTAAATTTGTTTACCGAATCAAG-TCAAATAATTATGGCCATTTCA
322 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
9863 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTATTTGGTCATATAACAATTGTTTTTAA-TCAT
386 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCAT
* * * ** * *
9927 ATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
450 ACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * **
9992 TTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACTG
514 TT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * *
10021 GTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTTTATACTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTATC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * **
10086 ATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGGTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
10151 CCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAGAAAGAAATTTGTTTGTCAAACT-AGTACAAATAGTTA
131 -TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-TAAGTTCAAATAGTTA
* *
10215 -GACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--A-T-TG--TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-T
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
*** * * * * *
10271 TTCACTTCAATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTA-TAACATTTCAAAAATTAA
259 TTTTGTTC-ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * * *
10334 TATGTAAGAGACTT-AAAAATAATTCTATTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG-A
322 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * **
10397 CAATTATTTATTTCAAAATTACTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTTATTCAT
387 CAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCAT
* * * * *
10462 ATAAGTTTGTTCAGAATAAAAT-ATACTAA-TCATTAAATATTTCAAAAATTAATAA-T--G-GA
450 ACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATT-AATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * *
10521 TTT-TAAAATAAATTTGTTTA-TAAAACTA
513 TTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * * * * ** ** * *
10549 GTTTAAAAAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTAT-
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
** * ** * * *
10613 -TACAAACAATAATTTCTATTCATAAAAATTTATTCATATTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 ATA-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * ** * *
10677 TTCGACATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAA-TCATTTACCAAACT-AGATC-AATAGTTA
130 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-TAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
10737 TGACTATTTGAATAAGTATTTATTTCAAATCATTATAACC-TTTGTTTTATTATAAAAAAATTAT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
10801 TTTAGTTCATATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTAAGTTA-TAATATTTTGAAAATTAATA
259 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
* * * * * * * *
10865 ATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATA
324 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* *** * * ** ** * *
10930 ATTATC-ATTTTGAAATTGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTCTATTCATACA
389 ATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
* *
10994 AGCTTATTAC-GAATAAAATAATAC-AATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAGGTAAAAGATT
453 AGCTTATT-CGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATT
* *
11056 TAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAA
515 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
** * * * *
11083 GTTCAAATCCTTATGACTAATTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
11148 ATAAAATAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATT
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * ** *
11213 TCAATAGCTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-
131 T-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGT-TA
* * * *
11277 TGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * * * * *
11342 TTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTCT-AAAATTAATG
259 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
* * * * * * * *
11406 AGCAAGAGAATTAAAAAATTAATTTGTTTATCGAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTAAAC
324 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
11470 AATTATCTATTTCAAAACATTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTTATACA
388 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
*
11535 AGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAA-A-ATT
453 AGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAGA-T
* * * *
11596 TTAAAAAATAAATATGTTTTCTTAACACA
514 TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA-A
* * * *
11625 -TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCGTTTTGTG
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
11689 ATAAATCAATTATTTATATTTATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATTAAAATT
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *** *
11754 TCAAAAATTAATAAATAA-AAATTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTA
131 T-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * **
11818 TGACTCTTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-GTTACGATATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** * * *
11882 TTTCTATTCATATAATTTTATTTGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
258 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
** * * ** * * * * * *
11947 GAA-TTGGAGATTT-AAAAATAAATCTATGCACCAAAGAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAG
323 -AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** ** * * * *
12010 TTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTATTTATA
387 CAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA
** ** * *
12074 CAAAATTATTAAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAGATT
451 CAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * *
12135 TAAAAACTAAATTTATTTA-TCAAACCA
515 TAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * * *
12162 GTTTAAATAGTTATGACTATTTCAATAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
12225 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATATTACGAAATTAATAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * * *
12290 TCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACAGGTTTAAATAGTTA
130 T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
12355 AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCTTAAAATAATT-T
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * **
12419 TTTCAGTTCATACATGGTCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTATTATTCAAAAAATTAAT
259 TTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
** * * ** *
12484 AAACAAGAAATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA
323 AAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** * * * *
12549 CAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTTCAATTCATA
387 CAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA
* * * * * * *
12613 AAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTTAA-AGAT
451 CAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGAT
* * * * *
12677 TTAAAAAATAAGTCAATTAATTGAATC--
514 TTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * * * * * *
12704 GCTTCAAATAATTATTG-CCATTTAAACAATTATCTATTTTAAATTGTTACGAACTTTTCTTTTG
1 G-TTCAAATAGTTA-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *** * * * *
12768 TCATAAAATAATTTTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCGGAGTAAAGTAATATTAATTTATTGAT
64 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * **
12832 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTCAAAAATAAATTTATTTA-C---T--G---AACCAGT
128 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
12888 T-T--TTATATGAACAATTATCTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTATTATAAAATAATT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * * * * * * ** *
12950 GTTTCAGCTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGA
257 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * * * * * * *
13015 TAACTAACAGATGTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAACAATTAAGACTATATGA
322 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** * * ** ** * **
13079 ACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTCATTGTATAACAATTGATTTTTA-TCA
386 ACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAATTCA
* * * * *
13143 TTCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAACCT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
449 TACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* *
13207 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGTAAACTAA
512 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC-AA
* * ** * * *
13238 -TTCAAATA--TATAACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCA-TTAT-ATCCTTTTGTTCTA
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-CCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
13298 TCACAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA
64 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * ** * *
13363 TTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTCAAACATTT
129 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTT
* * * *
13428 AAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TT
** * * * *
13493 -TTTCTCAATTCATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAA
257 GTTT-T-TGTTCATAC-AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAA
* * * * * * *
13555 -T--TAA-TAAGAGATTT-AAAAATAATTTTATTTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGACTATT
318 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
** ** * * *** *
13615 TGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTT
383 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* * * * * *
13680 ATATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTCAAAAA-T--T-AGTAAGAGA
448 ATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * **
13741 TTTTAAAAATAAACCTATTTA-TCAAATGA
513 TTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * * *
13770 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * *
13835 ATAAAATAGTTGTTTCCATTCATATC-AGCCTATCCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * ** ** *
13899 TTCACCAATTAATAAGTAAAAAAAGTAAAAAAT-AATTATGTTTA-CTAAACCAGATCAAATAGT
130 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGT
* * * *
13962 CATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-ATTT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* ** * * * * **
14026 ATTTCAGTTCATATAAACTTATTCTAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAA
257 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * *** ** ** * *
14091 TAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCCATTTGTCGAACAAGTTTGAATAATTATGACTATTTCAA
322 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * *** * ** * *
14156 CAATTATCTTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATAC
387 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC
** * ** * * *
14221 AAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATAAAGAAAATTAATTAGTAAAACATTT
452 AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * *
14286 AAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACAA
516 AAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * ** *
14312 GTTCAAAT-TTTATGACTATTTGAACAATTATTTACTTCAAATTCTTATGA-CTTCTTATTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT-TTGTTTTGT
* * * * * * **
14375 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGGTTATTCAAATTACAATAATGTTAATTTATTAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * * ** * **
14440 TTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCC
129 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
14505 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
*** * * ** *
14570 TTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATG
259 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
* * * * * * *
14635 AGTAAGAGAATTAAAAAATGAATATGTTTACAGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAATA
324 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
14700 ATTATCTATTTCAAAACATTAGGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TGTTCTATTCATGCA
389 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAATTCATACA
** * *
14764 AGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTAA-AAATT
453 AGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA--TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * *
14827 TTAAAAATAAATATGTTTTCTAAACAC
515 TAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* *
14854 GTTTAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
14918 CATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** *
14983 TTCAAAAATTAGTAAGTAAAAGATTTAACAAAATAAATCTGTTTA-CTAAACGAGTTCAACT-GT
130 TT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAG-
* * * * *
15046 TTATGACTATTTGAACAATTA-CTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTATTTTGTGATAAAACAA
191 TTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
15110 TTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTCCAAAAGAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAAA
255 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAAA
* * * * * * *
15175 TTTATAAGT-TGAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCA
318 TTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTA
* * * * * * ** *
15238 TTTGAGCTATTACCTATTTCAAATCATTATGACATTATATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTAT
381 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAAT
** ** * ** *
15303 TCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TGA-TAAG
446 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * *** *
15364 AGATTTAAAAACTAAATTTTTTTATTGTGCCA
510 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * *
15396 GTTCCAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTAT-A-ATATTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT-TTTGTTTTGT
* * * * * * * *
15459 CATAAAACAATTGTTTATATTCATGCAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAATTTGA-TAGTA
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATA
* ** * *
15523 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACT-AGTTCAAATAAT
129 TT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
15587 TAAGACTATTAGAATAATTATCAATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
*** * * * * **
15652 -TTGTCAATTCATACATGCTTATTCAAAAAAAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT
257 GTT-TTTGTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
* * * * * *
15716 AATAAACTACA-A-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTGCCTAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTAT
320 AAT-AAGTA-AGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
15779 TTGAACAATTACCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTCTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATT
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATT
* * * * * *
15844 CATAAAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAG
447 CATACAAGCTTATTC-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAG
* ** * * ***
15908 AGATTTAAATAATATGTCAATTTA-TCGAATTG
510 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
* * * * * ** *
15940 GTTCAAATAATTTTGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAATTCA-TTACAAACTTTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
16004 TATAAAACAATTGTTTTCTA-TCATATAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
16068 TTTCAAAAATTAAT-A--AATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C-CA-AA---C---CAG-T
129 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTT
* * ** * * * * *
16120 -T-CCTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTG
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * **
16183 TTTTAGTTCATATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAAT
258 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
* * * ** * * * * *
16248 AACTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTGTTTGTCGAAGC-AGTTGAAACAGTTAAGACTATATGAC
323 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** *
16312 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAC
387 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC
* ** * * * * * *
16377 AAACTTATTCAAAATACAATAATAATAATTTATTAATATTCTGAAAAGTAAAAAGTAAGTGATTT
452 AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * *
16442 AAAAAATAAATTTGTTTACCT-AATAA
516 AAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAA
* * * * *** * * * *
16468 GTTTAAATAATTATGGCCATGCCAATAATTAACTATTTCAAATAGTTATTACCTTTTGTTTGGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
16533 ATATAACAATTGTATT-TGA-ACATTCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-A---ATTAATC
66 ATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
16592 TTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACT-AGTTCAAATAG
129 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAG
* ** * * * * ** *
16656 TTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAAACCTTATAACCTTTTGTACTATCATAAAACAAT
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** *
16721 TATTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAATAATTA
256 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA
* * * ** *** * * ** *
16786 ATAA-TGAAAAGAATTAAAAAATAAATTTGACTGTTGAACTAGTTCAAATATTTAAAACTATATG
321 ATAAGT-AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
16850 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTTTTTTTGAATTT
385 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCAATTC
* * * * * *
16915 ATACTAGCTTATTTGGAATAACATAA-AATGAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAGA
448 ATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
16979 GATTTTAAAAATAATTTTGTTTACCT-AACCA
511 GATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAA
* *
17010 GTCCAAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-CTGTTTGTTTT
1 GTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCT-TTTGTTTT
* * * * * * * * * * *
17073 ATCATAAAATAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAAA-AAAGTAATACTAATCTATTAA
63 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * * *
17137 TATTT-CTAA-TATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACT-AGTTTAAATAG
127 TATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-TAAGTTCAAATAG
* * * * *
17198 TTATGACTATATGAGCAATTA-CTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAA
191 TTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
17262 TTGTTTATGTTCATACAAGCTTATT-TAGACTAAAAAAATAGTAATTTATTAATATTTCAATAAT
255 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * * *
17326 TAATAAGTAACA-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACTAGATCAAATAATCATGATTATT
319 TAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
17390 TAAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTT-TCATAAAA-AATTGTTTCAGTTC
383 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* * *
17453 ATATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGA
448 ATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGT-AAGA
* *
17517 GATTTAAAAAATGAATC-ATTTACTGAACAA
511 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * *
17547 GTTTAAATAATTATGACTGTTTGAACAATTATATATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * **
17612 ATAAAAGAATTTTTTTCTATTCATACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-
66 ATAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
17676 TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATCA-
130 TTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAAT-AG
* ** * * ** * *
17739 TTCTGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAAT
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
17804 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTC-ATATTAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATT
256 TGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
* * * ** *
17868 TATAAGCAA-ATGATTTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAAGTTCAAATA-TCATGACTATT
320 AATAAGTAAGA-GA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * *
17931 TGAATAATTATCTATTTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTC
383 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* * * * ** *
17996 TTATAAGTTTGTT-TAAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA
448 ATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGA
** * * *
18060 GAAATAAAAAATGAATCTATTTACTGAATAA
511 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * ** * * *
18091 GTTCAAATGGTTATAACTAGCTAAACAATTATTTATTTCAAA-ACATTATGACCTTTTTGTTTTG
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACC-TTTTGTTTTG
* * * ** *
18155 ACATAAAACAATTGATTCTGTTCA-ATCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAA
64 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * ** * *
18218 TATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTT-TTGAACACGTTCAAATAG
127 TATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAG
* *
18281 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCAT
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * **
18346 TGTTTTTGTTCATAAAAGCTTAATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATT
256 TGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
* *
18410 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
320 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * ** * *
18474 AAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
* * * * **
18538 TACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGA
449 TACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *
18603 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAA
513 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * * * ** * *
18632 GTTTAAACAATCATGTCCAATT-AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGATGTTTTATTTTAT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** *
18696 CATAAAACAATTGTTT-TGATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
18760 TTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGA-TTAAAAACTAAATTTGTTTA-CAAAATTATTTCAATTAGT
129 TTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * **
18819 TATGACTATTTGATCAATTATCTATCTCAAATTACTATGATC-TTCATTTTGTCATAAAACAATT
192 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * **
18883 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AGAGTAAAATATCATAAACAAAACTTT-TT--T-TCGTAC
257 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATA--AT--AC-TAA-TTTATTAATATTTTA-
** * ** * * * * *
18943 AAGCTTATTTGGTTTAA-A-ATAATACAAATTTAATAATGTTT--C-AA-AAATT--AATAAG-T
314 AAAATTAATAAG--TAAGAGAT-TTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTT
* * * * * * * * ** ** *
18999 AAGA-GATTTAAAAAATATATTTATTTACCAAACCA--AT--TCATAGGTTAAGACTATTAAAAC
374 ATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT--CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAAC
* * * *** * * ** * ** * * *
19059 AATTATCTATTTCAAATCGT-TTTGCCCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAC
434 -A--AT-TGTTTCAATTCATACAAG--C--TT-ATTCGGAATAAAATAA---TACTAATTTAT-T
* * * ***
19123 AAGTTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTA-AAATTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTT
486 AA---TA-TT-CAA-AAATT-A-A-TAA-GTA--AGAGATTT-AAAA--AAT---AAATCTATTT
19187 A--AAA-AA
533 ACTAAACAA
* * * * * *
19193 -AT-AAATCTATTTACTGAATAAGTTTAAATAATCATTACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
1 GTTCAAA--TAGTTA-TGACT-A-TTTGAACAATTA-T-CTATTT---C-A--A---A--T---A
* * * *
19256 TCATTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACATGCTTA---AACAGT
45 --GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAA-AAT
*
19316 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
106 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* * * * * * * * * * *
19377 TTA-CTGAATCAG-TAAAATAATTATGGCCATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCGTTCTAACC
170 TTATC-AAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * ** *
19440 TTTTTATTTTGTTATAAACCAATTGTTTGTGATCCGACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
234 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * * * *
19505 ATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAATAATTGTGTTT-TCGAA-TAG
298 ATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAG
* * *
19564 TT---A-A---A--ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACC--TTGTTTTAGTC
363 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTC
* * * * * *
19617 ATAAAATATTTGTTTC-ATATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCCTAATATATTAACAT
427 ATAAAACAATTGTTTCAAT-TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
19681 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATAA
491 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* *
19734 GCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAGT-TATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * **** **
19797 TCATAAAATAATTATTT-TAGTTAATACAAGCTTATACGGAATAAAATAATACTAACCTATTAAT
64 TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
19861 ATTTCTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAATCAGTTAAAATAA
128 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAG
* * *
19921 TTTTG-GTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-----AA
191 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
19980 TTGTTTTAGTTCTTACAAACTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATAATTTATAATATTCCT-
255 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT--T--TAT-TAATATT-TTA
* * * * ** * *
20044 AAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATC-AGTTCAAATAATTCT-A
314 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * *
20107 GCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATTTTT
378 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA-TTGT
* * *
20171 TTC-A-TCATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
440 TTCAATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* * **
20234 AGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC--
504 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * * * *
20270 ---C--A-A--T-T-CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCA-TCATAATCTTTTGTTCT-A
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * *
20323 CTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCA-ATATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATAAT
65 C-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * *
20386 ATTTCAAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAATAAATAAATCTATTTGCCGAAGT-AGTTCAAAC
128 ATTT-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAA-AAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAAT
* * * * * *
20449 ATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
189 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* ** * * *
20514 ATCGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTTAAAAAT
254 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * **
20579 TAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAATC-ATTTCAAATAATTA-GGGTGAT
319 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACT-AT
* * * * * * * **
20642 TTCAATAATTATCTAATTCAAATCATTATTACC-TTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTGA-
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAAT
* * * * *
20705 TCATTCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAA
446 TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAG
* *
20770 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA
510 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * *
20802 TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTA-TTATAACCTTTTGTTATGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
20866 CATAAAACAATTATTTCTATTCACACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATAT
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** *
20931 TCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTT
130 T-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAA-TAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * ** * **
20995 AAGGTTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGCCATAGTACAATT-
193 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * *
21059 TTTCAGTTCTTAGTAA-CTTATTC-AGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
258 TTTTTGTTCATA-CAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATT
* * * * * * * ** *
21121 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTGCC-AAGCTAGTTTAAATAATTATTTCCATTT
320 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** *
21185 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATAAAACAAATGTTT-TTGTTCATTCATAAAACAA
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC------C---T-TTTGTT-TT--GTCATAAAACAA
* * * * * * * * * * **
21249 TT-TTT--TTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAACAAGATTAATTTATAAATATTTTGAAAATT
436 TTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATT
* * *
21311 AAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATCTA-TTACTAAACTA
500 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTAAACAA
* * * *
21353 GTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGACCATTTGTTTTGT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *** * *
21417 CATAAAATAATTGTTTCTATGCATA-TAGTCTTATTCGGAATAAAATAATGCTAATTTATCAATA
65 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *** ** ** * * *
21481 TTCTAAAAGTTAATAAGTAACG-GATTTAAAAAAACAAATTTATTGGCCTGACCAGTGCATAGAG
129 TT-TAAAAATTAATAAGTAA-GAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAG
* * * * ** * * *
21545 TTATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAAATAA
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAA
* * ** * * *
21610 TTGTTTCTATTTGTACAAGCATATTCGAAATAATATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
255 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
* * *
21675 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
320 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
*** * * * *
21740 AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCTATT
385 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCAATT
* * *
21805 CATGCAAGC---TT----AT----T--T-C---------AA-A-T--AAAATTAATAAGTAAAAT
447 CATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* *
21843 ATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCT-AATAA
512 ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACAA
* * * * * *
21873 GTTCAAATAGCTATGACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
21938 ATAAAACAATTGTTTTTCTTCACACAAACTTATTTGGATTAAAATAATA-TGAATTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-
*** * * * * * *
22002 TTTGCCAATTAATAAGTAAAAGATTT-TAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCA
129 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * ** *
22066 TAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGT
194 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** * * * * * * **
22131 ATCAGCTCATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTTAACG
259 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
* * * ** ** * *
22196 AGTAAGAGATTTTGAGAAAATGAATCTACTTAATGAACAAGTTCAATTAGTTATGATTATTTGAA
324 AGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
22261 CAATTATATATCTCAAATCATTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCATAC
387 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAC
* *
22326 AAGCTTATTTC-GAATAAAATAAT--TAACTTTTTTCAATATTCCAAAAATTAATAAATCAA-A-
452 AAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACTAA-TTTATT-AATATT-CAAAAATTAATAAGT-AAGAG
* * ** * *
22386 A-TAAAAAAATATATCTATTTTTTGAACCCA
512 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAA
*
22416 -TTCAAATAATTATGACTATTTATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTT
1 GTTCAAATAGTTATG-------A-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTT
* * *
22480 GTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTA
58 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * **
22545 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTA-A-ATATTAAAAAA-AAATATATGTTTA-CTGAGCAAGT
123 TTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAAT-T-TGTTTATC-AAATAAGT
* * * * *
22606 TAAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAAT-AGTTATG-CTATTTTGTTTTATC
183 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAC-CTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
22669 ATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAAGTTTATTCTAAATAAAATTATGCTAATTTATTAATATT
246 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * *
22734 TTGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCA
311 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT--
* * * * * ** * * *
22799 CATG-C-ACTTAAATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAGAAA-AAG
373 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAAT
* * * ** * *
22861 TATTTCTATTCATAC-A---TATTCTGCAATTTAATAGGTAGTAGATTTA--AA-A---AATAAA
437 TGTTTCAATTCATACAAGCTTATTC-GGAATAAAATA-ATACTA-ATTTATTAATATTCAA-AAA
** * *** ** * * * *
22916 TCTGTTTACCGAGCA-AGCT--GACAT-AGTC-ATGTCCACTTAAACAA
498 T-TAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTAT-T-TAC-TAAACAA
** * * * * ** * * *
22960 -TT-ATCTATTTCA-AATTATTATGACCTTTTGT-TTTTTCATAA-A---A--A-----AG--TT
1 GTTCAAATAGTT-ATGACTATT-TGAACAATTATCTATTTCA-AATAGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
23008 GT--T-----TA-TG-TTC-A-T-ACAGAA--TTATTGAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
63 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
23059 ATTTTGAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCTAACT-AGTTCAAATAG
128 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAATAAGTTCAAATAG
* * ** * * * *
23119 TTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGAAC-TTTATTTTGTCCTAGAACAAT
191 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * * *
23183 TGTTTCTT-TTCATAAAAGCAT-TTCGGATTAAAATTATATTGATTTAATAATA-TTTCAAAA--
256 TGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT
* ** * * * *
23243 AATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATACATTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAGGACTATTA
320 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
23307 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTCAGTTT
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAATTC
* * * * * * * * * ** * *
23371 ATATAAGTTTATTCGAAATAATATAATATTAATTTATTAACTTTTGAAAAGTTAGTAACCAAAAA
448 ATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* *
23436 ATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAA
512 A-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
* * * * * ** *
23467 GTTCAAATAGATAAGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAAAACCTTTTGTTTTGTA
1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
23532 ATACAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAACTTACTTGAAATAAAATAATACCATTTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * ** **
23596 TTCAAAAATTATTAAGCAAGAAATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TTTAACCAGTTCAAAATAGTT
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* * * ** ** * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* ** * *
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* * *
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* * ** * * *
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** * * * * * ** *
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** * * * ** * *
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** * * * **
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* * * * * ** * *
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* *** * * *
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *** * *
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65 CATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
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** * * * * * * *
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*** * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * ** * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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1 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
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25179 TTAAAAAAAT
Statistics
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7503 AAACATGTTC
* **
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* * * * * * * *
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* ** * *
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** *
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * * * ** *
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* * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * **
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * * * * *
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** * * * * *
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* * * * * * * * * ** *
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1 AACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
* ** ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
9087 ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
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* * *** * * *
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* * * * * ** ** *
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* * * * * * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCA
* * *** * * * *
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65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGA
* ** ** * * *
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128 -GATTT-AAAAAAT-AAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* ** * *
9568 TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATAATTC-AAAAATTAATAAGCAAGAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
9632 -TTT--AAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTG
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* * * * **
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* * * *
9747 ACAAGCTTAGTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAGTAAGTGA
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
9927 ATATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * *
9991 TTTAAAAAAATAAATATATTTACCAAACTGGTTTAAATAGTTATGACTATTTA
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* * * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* *
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*** * * *
10280 -ATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAA-AATAAATTTA-TAACATT-TCAAAAATTAATATGTAA
65 TATA--AGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * *
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* * * * *
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* * * * *
10460 ATATAAGTTTGTTCAGAATAAAAT-ATACTAA-TCATTAAATATT-TCAAAAATTAATAA-T--G
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* * * * * *
10519 -GATTT-TAAAATAAATTTGTTTA-TAAAACTAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTG
127 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** ** ** * * ** *
10572 AATAATTATTTATTTAAAATTGTTACAATTTTTTGTTCTAT--TACAAACAATAATTTCTATTCA
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* ** * * * ** *
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** *
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11171 ACAAGCTTATTCATATTAAAATAATATTAATTTATAAATATT-TCAATAGCTAATAAGTAAAAGA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
11235 TTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCT-TGTCTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTG
* * * *
11287 AATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTCAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * * * *
11351 TATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTCATGAATATTCT-AAAATTAATGAGCAAGAGA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
11415 ATTAAAAAATTAATTTGTTTA-TCGAAC-ATTTCCAAATAGTTATGACTATCTA
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
11467 AACAATTATCTATTTCAAAACATTGTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* ** * *
11532 ACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAATTTAATAAGTAA-A-A
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
11594 TTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTTAAC-ACATTTAAATAGTTATGACTATTTG
130 -TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
11647 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTCGTTTTGTGATAAATCAATTATTTATATTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * * *
11712 AAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATTCTTATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAAATAA-AAA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * *
11775 TTTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTCTTTG
130 -TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** *
11828 AACAATTATTTATTTCAAAT-GTTACGATATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
** * * **
11892 TATAATTTTATTTGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAA-TTGGAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AAGTAAGAG
** ** ** * * *
11956 ATTT-AAAAATAAATCTATGCACCAAAGAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
*** ** * * * *
12008 AGTTATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTATTTA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
* ** * *
12072 TACAAAATTA-TTAAGAATAAAATAGTACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT--G--AGAG
65 TATAAGCTTATTTAA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * *
12132 ATTTAAAAACTAAATTTATTTA-TCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTC
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
12185 AATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * * *
12249 ACAAGCTTATTCAAATTAAAATATTACGAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * ** * * *
12314 TTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAAC-AGGTTTAAATAGTTAAGACTATTAG
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
12365 AACAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCTTAAAATAATT-TTTTCAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * * * ** * * * ** *
12429 TACATGGTCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTATTATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * *
12494 TTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTG
130 TTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** * * * * **
12547 AACAATTATCTATTT-ATAAGAAGTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACGATTGTTTCAATTCA
1 AACAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
* * *** * * *
12611 TAAAAGCATATCCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTAAAAAGTTAA-A
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TAAGA
* * * * * * * *
12674 GATTTAAAAAATAAGTCAATTAATTGAA-TCGCTTCAAATAATTATTG-CCATTTA
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAG-TTCAAATAGTTA-TGACTATTTG
* ** * * * * *
12728 AACAATTATCTATTTTAAATTGTTACGAACTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTTCA-TCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCA
* * *** * * * *
12792 TACAAGCCTATTCGGAGTAAAGTAATATTAATTTATTGATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * *
12856 ATTTCAAAAATAAATTTATTTACTGAACCAG-T----T--TT-T-A-TA--TG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * *
12897 AACAATTATCTATTTCCAATCATTATAACCTTTTATTCTATTATAAAATAATTG-TTTCAGCTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* ** * * * * *
12961 TATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAACAGA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * ** * * * *
13026 TGTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAAGC-AGTTCAAACAATTAAGACTATATG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * ** ** *
13078 AACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCTTTTTGTTTCATTGTATAACAATTGATTTTTA-TC
1 AACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTATTC
* * *
13142 AT-TCAAGCCTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAACCT-TTC-AAAAATTAATAAGTAA
64 ATAT-AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
13204 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAGTAAACTAATTCAAATA--TATAACTATTTG
126 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * * * * *
13258 AACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT-ATCCTTTTGTTCTATCACAAAACAATTATTTTTGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
* * * * *
13322 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT-TCAAAAATTAATAACTAAGAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * * * * *
13386 AATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTCAAACATTTAAGACTATATG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
13439 AACAATTATCTATTTCAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTCTCAATT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT-T-TATT
** *
13503 CATACTAA-CTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TA
63 CATA-TAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA
* * * * *
13561 AGAGATTT-AAAAATAATTTTATTTACCT-AACCAGTTTAAATAATTATGACTATTTG
125 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
** ** * * * *
13617 AATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTTAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * ** * *
13682 ATAAGTTTGTTTGGAATAAAGTAATACTAATATATTAATATTC-AAAAA-T--T-AGTAAGAGAT
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
13742 TTTAAAAATAAACCTATTTA-TCAAATGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * **
13793 AGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAGTTGTTTCCATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * ** * * ** * *
13858 ATCAGCCTATCCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCACCAATTAATAAGTAAAAAA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
** * * * * * * *
13922 AGTAAAAAATAATTATGTTTACTAAACCAGATCAAATAGTCATGACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
13974 AATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-AATT-TATTTCAGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTA-TTC
* * *
14036 ATATAAACTTATTCT-AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTAC-AAAAATTAATAATTAAG
64 ATATAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** * *
14099 AGATTTAAAAAATGAATCCATTT-GTCGAACAAGTTTGAATAATTATGACTATTTC
127 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *** * **
14154 AACAATTATCTTTTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATT-TTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCA
* ** * ** * * *
14218 TACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TAAAGAAAATTAATTAGTAAAAC
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
14282 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAAT-TTTATGACTATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
14334 AACAATTATTTACTTCAAATTC-TTATGA-CTTCTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * * * ** * * * *
14397 ATACAAGGTTATTCAAATTACAATAATGTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAG
64 ATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * ** * **
14462 ATTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAAATAGTCCTGACTATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * **
14515 AATAATTATCTATTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * *
14580 ATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGAA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
14645 TTAAAAAATGAATATGTTTACAGAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATCTA
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
14696 AATAATTATCTATTTCAAAACATTAGGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT-TGTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTATTCA
** ** *
14760 TGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTTGAAAAATTAATAAGTAA-A
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * *
14823 AATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTAAAC-ACGTTTAAATAGTTATGAATATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* *
14877 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * *
14942 AAAAACTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAGTAAGTAAAAGA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * *
15006 TTTAACAAAATAAATCTGTTTACTAAACGAGTTCAACT-GTTTATGACTATTTG
130 TTTAA-AAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTG
* * * * * *
15059 AACAATTA-CTTATTCCAAATCACTATGATCTTTTATTTTGTGATAAAACAATTGTTTCTATTCA
1 AACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
* * * * * *
15123 TATAAGTTTATTCCAAAAGAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAAATTTATAAGT-TGA
65 TATAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-
* * * ** * * *
15187 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCAAACAAGTTCAAATAGTCAT-ATCCATTTG
127 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTG
* * * * * * ** *
15242 AGCTATTACCTATTTCAAATCATTATGACATTATATTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* ** * * * * *
15307 ACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACCAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--TGA-TAAGAGAT
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * ** * * *
15368 TTAAAAACTAAATTTTTTTATTGTGCCAGTTCCAATAGTTATGATTATTTG
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
15419 AACAATTATCTATCTCAAATCGTTAT-A-ATATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTATATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
** * * * * * *
15482 TGCAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAATTTGA-TAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * *
15546 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * **
15599 AATAATTATCAATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTGTCAATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTTATTCA
* * * * * * *
15663 TACATGCTTATTCAAAAAAAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAACTACA-
65 TATAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT-AAGTA-AG
* * *
15727 A-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTGCCT-AACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTG
127 AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * **
15782 AACAATTACCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTCTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * * *
15847 AAAAGCTTATCTGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATT-TCAAAAATTGATAAGTTAGAGA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA
* ** * * * * * * *
15911 TTTAAATAATATGTCAATTTA-TCGAATTGGTTCAAATAATTTTGGCCATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * *
15963 AACAATTATCTATTTCAATTCATTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTCTA-TCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCA
* * * *
16027 TATAAGCCTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT-A--AATAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** *
16088 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC----C-A----AACCAG-T-T-CCTATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * * * *
16129 AACAATTATCAATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTG-TTTTAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * * * *
16193 TATAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
16258 TTTAAAAAATTAATCTGTTT-GTCGAAGC-AGTTGAAACAGTTAAGACTATATG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** *
16310 ACCAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * * * * * * * *
16374 TACAAACTTATTCAAAATACAATAATAATAATTTATTAATATTCTGAAAAGTAAAAAGTAAGTGA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * ***
16439 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AA-TAAGTTTAAATAATTATGGCCATGCC
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
16491 AATAATTAACTATTTCAAAT-AGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTATTTGA-AC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTTATTC
* * * * *
16554 AT-TCAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTAAT-CT-TTC-AAAAATTAATATGTAAAA
64 ATAT-AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA
*
16614 GATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
128 GATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * * * ** * * *
16669 AACAATTGTAAACTTCAAAACCTTATAACCTTTTGTACTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
** * * * * *
16734 ATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCCAATAATTAATAA-TGAAAAGA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGAGA
* * * * ** *
16798 ATTAAAAAATAAATTTGACTGT--TGAACTAGTTCAAATATTTAAAACTATATG
130 TTTAAAAAATAAATCT-A-TTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
*
16850 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTT--ATT
* ** * * * *
16914 TATACT-AGCTTATTTGGAATAACATAA-AATGAATTTACTAATATT-TCAAAAATTAATATGTA
63 CATA-TAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
16976 AGAGATTTTAAAAATAATTTTGTTTACCT-AACCAGTCCAAAATAATTATGACTATTTG
125 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
17034 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTGTTTGTTTTATCATAAAATAAATGTTTTTGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
* * * * * *
17098 TATAAGTTTGTTCGAAAA-AAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCT---AA-TATTAA-TAAGA
65 TATAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * *
17157 GATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATATG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
17211 AGCAATTA-CTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTATGTTCA
1 AACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
* * * * * * *
17275 TACAAGCTTATTTAGACTAAAAAAATAGTAATTTATTAATATT-TCAATAATTAATAAGTAACA-
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * ** * * * * *
17338 ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACTAGATCAAATAATCATGATTATTTA
129 A-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
17392 AATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTT-TCATAAAA-AATTG-TTTCAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
*** * *
17454 TATAAGCTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAGAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGAG
* * * * *
17518 ATTTAAAAAATGAATC-ATTTACTGAACAAGTTTAAATAATTATGACTGTTTG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * * *
17570 AACAATTATATATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAAGAATTTTTTTCTATTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCA
* * * ** *
17635 TACAAGCTCATTTCAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAGA
* * *
17698 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATCA-TTCTGACTATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTG
** * * ** * * *
17752 TGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * * * * * * *
17817 ACAAGTTTATTCATATTAGAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTTATAAGCAA-ATGA
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA-GA
* ** * * *
17881 TTTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAAGTTCAAATA-TCATGACTATTTG
130 -TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** * * *
17933 AATAATTATCTATTTCAAATCACAATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACAATTG-TTTTAGTTCT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * * *
17997 TATAAGTTTGTTTAAACTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
** * * * ** *
18062 AATAAAAAATGAATCTATTTACTGAA-TAAGTTCAAATGGTTATAACTAGCTA
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * *
18114 AACAATTATTTATTTCAAAACATTATGACCTTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGATTCTGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
** * *
18179 -ATCAAGCTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A
65 TAT-AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * *
18241 AATTTTAAAAATAAATTTGTTT-TTGAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
18294 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCCATTGTTTTTGTTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * ** * * *
18359 AAAAGCTTAATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
18424 TTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * *
18475 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * **
18539 ACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTGGAGAT
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * * * * *
18604 TTAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAATAAGTTTAAACAATCATGTCCAATT-
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * *
18654 AATCTATTATCTATTTCAAATCGTTATGATGTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTGATTCA
1 AA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCA
** ** *
18719 TGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATT-A-AA--AAGAG
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * ** * * *
18779 A-TTAAAAACTAAATTTGTTTACAAAATTATTTCAATTAGTTATGACTATTTG
129 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * ** *
18831 ATCAATTATCTATCTCAAATTACTATGATC-TTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * * **
18895 ACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATCATAAACAAAACTT-TT--T-TTCGTACAAGCTT-AT---T
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATA--AT--AC-TAATTTATTAATATTC-TA-AAAATTAATAAGT
* * * **
18952 -TG-G-TTTAAAATAATACAA---ATTTAAT-AA-T-GTTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATT
124 AAGAGATTTAAAA-AATA-AATCTATTTACTGAACTAG-TTCAAATAGTT-AT--G--A-CTATT
*
19007 TA
180 TG
* * * * * ** ** * *
19009 AAAAATATATTTATTTACCAAACCA--AT--TCATAGGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATT
1 AACAAT-TATCTATTT--CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAATTGT-T-TT
* * ** * ** * ** * * *
19070 TCAAATCGT-TTTGCCCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGTTTATT-T
59 T--ATTCATATAAG--C--TTATTTA-AAATAAAATAA---TACTAATTTAT-TAA---TATTCT
* *** * * ** * *
19133 GGAATAAATTAAT-ACTAATTTA-TTAAAATTTAA-AAAT-TA-ATA-AGAAAGAGATTTAAAAA
110 --AA-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA---AATAAATCTATTTACTGAACTAG-TTCAAATA
** *
19192 AATA-AATCTATTT-
168 GTTATGA-CTATTTG
* * * ** * *
19205 -ACTGAA-TA---AGTTT-AAATAATCATTA-CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT
1 AAC--AATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCT-TTTG---TTTTGTC-A--TAAAA-CAAT-T
* * * * *
19263 GACCTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACATGCTTAAACAGTAA-AATAATATT
54 G----TTTTTAT-TCAT---ATAA--GCTT-ATTTAA-A-A----TAAA-A-TAATACTAAT-TT
* * * * * *
19327 AATTTATTAATATTTTAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-TCA
99 -A-TTAAT-AT-TCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-A
* * * *
19388 G-TAAAATAATTATGGCCATTTG
159 GTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * *
19410 AATAGTTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTTATTTTGTTATAAACCAATTGTTTGTGA-TC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTC
** * *
19474 CGACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAAGA
64 ATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * *
19534 GATTTGAAAAATAATTGTGTTTTC-GAA-TAGTT---A-A---A--ACTATTAG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
19577 AATAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACC--TTGTTTTAGTCATAAAATATTTG-TTTCATATC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTAT-TC
* ** * * * * *
19638 ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATCCTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAG
64 ATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * *
19703 ATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAC-CAAATAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTG
129 ATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
19757 AACAATTAGT-TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-ATTTTAGTTA
1 AACAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTC
* **** **
19820 ATACAAGCTTATACGGAATAAAATAATACTAACCTATTAATATTTCT-AAAA-T--TAA-TAAGA
64 ATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * *
19880 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATCAGTTAAAATAATTTTG-GTCATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG
* *
19934 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-----AATTG-TTTTAGTTCT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * *
19993 TACAAACTTATTTGAAATAAAATAATAATAATAATAATTTA-TAATATTCCT-AAAATTAATAAG
65 TATAAGCTTA-TT----TAAAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
20056 TAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACT-AAATCAGTTCAAATAATTCT-AGCCATTTG
123 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTG
* *
20115 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTCA-TC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTT-ATTC
* * * ** *
20177 ATACAAACCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGA
64 ATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * *
20241 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-----C--A-A--T-T-CCTATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * * * *
20283 AATAATTACCTATTTCAAATCATCATAATCTTTTGTTCT-ACTATAAAATAATTG-TTTCAGTTC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTA-TTC
* ** * *
20346 A-ATATGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAAT-AGCTAAG
64 ATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAG-TAAG
* * * * * * * *
20408 AGATTTAAATAAATAAATCTATTTGCCGAAGTAGTTCAAACATTTAAGATTATATG
127 AGATTTAAA-AAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * *
20464 AACAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATCG-TTTCAGTTCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * * *
20528 TATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGTGA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * ** *
20593 TTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAA-TCATTTCAAATAATTA-GGGTGATTTC
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTG
* * * * * *
20645 AATAATTATCTAATTCAAATCATTATTACC-TTTGTTTGGTCATATAACAAATGTTTTTGA-TCA
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCA
** * * *
20708 T-TCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATT-TCAAAAATTAATATGTAAAA
65 TAT-AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA
** * *
20771 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTG
128 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
20825 AACAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAC
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
* * * * * * *
20890 ACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGAT
66 ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * ** * * * ** *
20955 TTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGTTATATG
131 TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * ** * *
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1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCA
* * *
21069 TAGTAA-CTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAG
65 TA-TAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * ** *
21131 AGATTTAAAAAATAATTCTATTTGC-CAAGCTAGTTTAAATAATTATTTCCATTTG
127 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* ** *
21186 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATAAAACAAATGTTT-TTGTTCATTCATAAAACAA-
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC------C---T-TTTGTT-TT--GTCATAAAACAAT
* * * * * * * * *
21249 T-TTTTT-TTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAACAAGATTAATTTATAAATATTTTGAAAATTA
53 TGTTTTTATTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
* * * * *
21312 AAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATCTA-TTACTAAACTAGTTCAATTAGTTATAACTATTTG
118 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * * *
21376 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATGCAT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCAT
*** * * *
21441 AT-AGTCTTATTCGGAATAAAATAATGCTAATTTATCAATATTCTAAAAGTTAATAAGTAACG-G
66 ATAAG-CTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GAG
* * ** * * * * * *
21504 ATTTAAAAAAACAAATTTATTGGCCTG-ACCAGTGCATAGAGTTATGATTGTTTG
129 ATTT-AAAAAATAAATCTATT-TACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * ** * * * * **
21558 AATAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAAATAATTGTTTCTATTTG
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTTATTCA
* * ** * * *
21623 TACAAGCATATTCGAAATAATATAATTCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
65 TATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * *
21688 TTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
130 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
*** * * *
21740 AACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTTTTTTCTATT
1 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC--TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATT
** *
21805 CATGCAAGCTTATTTCAAATAAAATTAATA
63 CATATAAGCTTATTTAAAATAAAA-TAATA
21835 AGTAAAATAT
Statistics
Matches: 11104, Mismatches: 2359, Indels: 1356
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
162 2 0.00
163 8 0.00
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ATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
TTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
Found at i:20916 original size:361 final size:358
Alignment explanation
Indices: 18957--21834 Score: 2146
Period size: 361 Copynumber: 8.0 Consensus size: 358
18947 TTATTTGGTT
* * * * *
18957 TAAAATAATACAAATTTAATAATGTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATATTTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * ** * * **
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* * * *
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130 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTA
* * * * *
19150 ATTTATTAA-AATTTAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAA
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* * *
19214 GTTTAAATAATCATTA-CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTTTTTGTC
258 GTTCAAAT-A--ATTAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTC
* * * ** *
19278 ATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACATGCTTAAAC--AG
320 ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATTCAAGCTTATTCGAAA
* * * *
19315 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
** * * * * * * * * *
19376 TTTACTGAATCAG-TAAAATAATTATGGCCATTTGAATAGTTATCTATTTCAAATCGTTCTAACC
66 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
* * * ** **
19440 TTTTTATTTTGTTATAAACCAATTGTTTGTGA-TCCGACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
131 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT
* * * * *
19504 AATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAAAATAATTGTGTTT-TCGAAT-A
193 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCA
* * *
19563 GTT---A-AA--A-CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGACC-TTGTTTTAGTCAT
258 GTTCAAATAATTAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTT-GTCAT
* * *
19619 AAAATATTTGTTTCA-TATCATACAAGCTTATTCGAAA
322 AAAACAATTGTTTCAGT-TCATTCAAGCTTATTCGAAA
* * * *
19656 TAAAATAATCCTAATATATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATC
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
* ** * * *
19720 TGTTTACCAAATAAGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAGT-TATTTAAAATCATTATG
64 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCATTATA
* * * *
19784 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTAGTTAATACAAGCTTATACGGAATAAAATAATAC
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAC
** * **
19849 TAACCTATTAATATTTCT-AAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAT
192 TAATTTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAT
* * * *
19909 CAGTTAAAATAATTTTGGTCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
256 CAGTTCAAATAA-TTAGCT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTG
* * *
19974 TCAT-----AATTGTTTTAGTTC-TTACAAACTTATTTGAAA
318 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATT-CAAGCTTATTCGAAA
* * * * * * *
20010 TAAAATAATAATAATAATAATTTATAATATTCCTAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGA
1 TAAAATAATACTAAT--T--TAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
20075 ATTTGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTCT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
61 ATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * *
20139 ATGAA-CTTTTG-TTTGTCATAAAACAAATTTTTTTCA-TCATACAAACCTATTTGGAATAAAAT
125 AT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAAT
* *
20201 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
187 AATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * *
20266 GAA-C----C----AATT-CCTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCATCATAATCTTTTGTTC
252 GAATCAGTTCAAATAATTAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTGTTT
* * * *
20321 T-ACTATAAAATAATTGTTTCAGTTCAAT-ATGCTTATTCGAAA
316 TGTC-ATAAAACAATTGTTTCAGTTCATTCAAGCTTATTCGAAA
* *
20363 TAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-AGCTAAGAGATTTAAATAAATAAATC
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAA-AAATAAATC
* * ** * * * * * * * *
20427 TATTTGCCGAAGTAGTTCAAACATTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTATTTTGA
64 TATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * * * *
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129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT
* *
20557 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAATCA
193 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCA
* * * * * * *
20622 TTTCAAATAATTAGGGTGATTTCAATAATTATCTAATTCAAATCATTATTACCTTTGTTTGGTCA
258 GTTCAAATAATTA-GCT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCA
* * ** *
20687 TATAACAAATGTTTTTGATCATTCAAGCTTATTCGAAA
321 TAAAACAATTGTTTCAGTTCATTCAAGCTTATTCGAAA
* * *
20725 TAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* * *
20790 TTTACCAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTATTATAACC
66 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
* * * * *
20855 TTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTATTCACACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
131 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * *
20920 TATAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAAT
195 TTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGT
* * * * * ** *
20985 TCAAATAGTTAAGGTTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGCCAT
260 TCAAATAATT-A-GCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTGTTTTGTCAT
** *
21050 AGTACAATT-TTTCAGTTC-TT-AGTAACTTATTC-AGAA
322 AAAACAATTGTTTCAGTTCATTCA--AGCTTATTCGA-AA
* *
21086 TAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCT
1 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * ** * * *
21150 ATTTGCCAAGCTAGTTTAAATAATTATTTCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAC
65 ATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA---TCAT---
* * * * * * * *
21215 ATAAAACAAATGTTT-TTGTTCATTCATAAAACAATT-TTTT-TTCATATAAGTTTGTTTGAAAT
124 -TATAAC--CT-TTTGTT-TT--GTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCGGAAT
* * * * * * *
21277 AAAACAAGATTAATTTATAAATATTTTGAAAATTAAAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATCT-
182 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTG
* * * * * * *
21341 ATTA-CTAAACTAGTTCAATTAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC
246 TTTACCGAATC-AGTTCAAATA-AT-TAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * *
21405 CATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA-TGCA-T-ATAGTCTTATTCGGAA
308 C-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATTCA-AG-CTTATTCGAAA
* * * *
21457 TAAAATAATGCTAATTTATCAATA-TTCTAAAAGTTAATAAGTAACG-GATTTAAAAAAACAAAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-GAGATTT-AAAAAATAAAT
* ** ** * * * * * * * ** *
21520 TTATTGGCCTGACCAGTGCATAGAGTTATGATTGTTTGAATAATTATCTATTTTAAATTGTTATG
63 CTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * ** * * * *
21585 ACCTTTTGTTTTATCACAAAAATAATTGTTTCTATTTGTACAAGCATATTCGAAATAATATAATT
128 ACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATA
* *
21650 CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAA-
191 CTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAT
* *** * *
21714 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTTATT
256 C-AGTTCAAATAATTA-G-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC---TTTGTT
* *
21779 TTGTCATAAAACAATTTTTTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTC-AAA
315 TTGTCATAAAACAA-TTGTTTC-AGTTCATTCAAGCTTA-TTCGAAA
21824 TAAAATTAATA
1 TAAAA-TAATA
21835 AGTAAAATAT
Statistics
Matches: 1991, Mismatches: 397, Indels: 254
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
338 7 0.00
339 35 0.02
340 30 0.02
341 26 0.01
342 2 0.00
344 5 0.00
345 10 0.01
346 117 0.06
347 44 0.02
348 37 0.02
349 105 0.05
350 105 0.05
351 18 0.01
352 13 0.01
353 30 0.02
354 113 0.06
355 68 0.03
356 10 0.01
357 87 0.04
358 110 0.06
359 36 0.02
360 21 0.01
361 383 0.19
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363 11 0.01
364 112 0.06
365 7 0.00
366 18 0.01
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369 8 0.00
370 130 0.07
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372 54 0.03
373 13 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (358 bp):
TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATCAGTT
CAAATAATTAGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTGTTTTGTCATAAAA
CAATTGTTTCAGTTCATTCAAGCTTATTCGAAA
Found at i:21258 original size:22 final size:25
Alignment explanation
Indices: 21214--21259 Score: 71
Period size: 25 Copynumber: 2.0 Consensus size: 25
21204 ATTGTTATGA
21214 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATT
1 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATT
21239 CATAAAAC-AAT-TTTTT-TTCAT
1 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCAT
21260 ATAAGTTTGT
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 0, Indels: 3
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
22 5 0.24
23 5 0.24
24 3 0.14
25 8 0.38
ACGTcount: A:0.37, C:0.13, G:0.04, T:0.46
Consensus pattern (25 bp):
CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATT
Found at i:21859 original size:156 final size:155
Alignment explanation
Indices: 21669--21956 Score: 434
Period size: 156 Copynumber: 1.9 Consensus size: 155
21659 TAATATTTTA
* * *
21669 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGCTATGAC
* *
21734 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACCTTTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTT
66 TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGCTATCA-C-TTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTT
21798 TTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
129 TTCTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
* * * *
21825 AAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCTAATAAGTTCAAATAGCTATGAC
1 AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGCTATGAC
* * * *
21890 TATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
66 TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
21955 CT
131 CT
21957 TCACACAAAC
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 13, Indels: 3
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
154 22 0.19
155 8 0.07
156 88 0.75
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (155 bp):
AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGCTATGAC
TATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGCTATCACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
CTATTCATGCAAGCTTATTTCAAAT
Found at i:22334 original size:183 final size:178
Alignment explanation
Indices: 21825--22733 Score: 762
Period size: 180 Copynumber: 5.0 Consensus size: 178
21815 TATTTCAAAT
* * * *
21825 AAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCT-AATAAGTTCAAATAGCTATGA
1 AAAATTAATAAGTAAAAT-TTT-AAAAATAAATCTATTTA-ATGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
21889 CTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * ***
21954 TCTTCACACAAACTTATT-TGGATTAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTTG
127 TATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCA
** * * *
22006 CCAATTAATAAGTAAAAGATTTT-AAAATAAATTTATTT-ATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAA
1 AAAATTAATAAGT-AAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTAAT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
22069 CTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATC
63 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
22134 -AGCTCATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
127 TA-TTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* ** * * *
22186 AAATTTAACGAGTAAGAGATTTTGAGAAAATGAATCTACTTAATGAACAAGTTCAATTAGTTATG
1 AAAATTAATAAGTAA-A-ATTTT-A-AAAATAAATCTATTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * *
22251 ATTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCATTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTT
62 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
* *
22316 CTATTCATACAAGCTTATT-TCGAATAAAATAAT--TAACTTTTTTCAATATTCCA
126 CTATTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATACTAA-TTTATT-AATATTCCA
* ** * ** * *
22369 AAAATTAATAAATCAAAA-TAAAAAAATATATCTATTTTTTGAACCCA-TTCAAATAATTATGAC
1 AAAATTAATAAGT-AAAATTTTAAAAATAAATCTATTTAATGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG--
* *
22432 TATTTATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAA
62 -----A-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
* *
22497 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
120 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
* * * * * * *
22556 AAAATTAATAAGTTAAATATTAAAAAAAAATATATGTTTACTGAGCAAGTTAAAATAGTTATGAC
1 AAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAATAAATCTA--TTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * * *
22621 TATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATG-CTATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC
64 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-TTATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * *
22685 TATTCAAACAAGTTTATTCTAAATAAAATTATGCTAATTTATTAATATT
127 TATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
22734 TTGCAATTTA
Statistics
Matches: 585, Mismatches: 107, Indels: 72
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
179 31 0.05
180 141 0.24
181 117 0.20
182 14 0.02
183 127 0.22
184 5 0.01
186 5 0.01
187 116 0.20
188 7 0.01
189 21 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
AAAATTAATAAGTAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
TTTGAACAATTATCTATTTCAAATATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATT
CATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA
Found at i:22765 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 21825--22872 Score: 618
Period size: 180 Copynumber: 5.7 Consensus size: 182
21815 TATTTCAAAT
** * * * * * * *
21825 AAAATTAATAA-GTAAA-ATATTTAAAAAATAAATCTTTTTACCTAATAAGTTCAAATAGCTATG
1 AAAATTAATAAGGTAAAGAT-TAAAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTAAAATAGTTATG
* * * * *
21888 ACTATTTGAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT
* * * * *** * * ***
21953 TTCTTCACACAAACTTATTTGGATTAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTTG
130 CTATTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACT-AATTTATTAATATTCCA
** ** * * * * *
22006 CCAATTAATAA-GTAAAAGATT--TTAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATA
1 AAAATTAATAAGGT-AAAGATTAAAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTAAAATAGTTATG
* * * * * * * *
22068 ACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTAT
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT
* * * * * * *
22133 C-AGCTCATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
130 CTA-TTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
* ** ** * * * * * * *
22186 AAATTTAACGA-GTAAGAGATTTTGAGAAAATGAATCTACTTAAT-GAACAAGTTCAATTAGTTA
1 AAAATTAATAAGGTAA-AGA-TTAAAAAAAATAAATAT-GTTTATCGAACAAGTTAAAATAGTTA
* * * ** * * * *
22249 TGATTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCA-TTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAGCAATTG
63 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTA
* * * *
22313 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAAT-A-ATTAACTTTTTTCAATATTCCA
127 TTTCTATTCAAACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAACACTAA-TTTATT-AATATTCCA
* ** * *
22369 AAAATTAATAA-ATCAAA-A-TAAAAAAATATATCTAT-TTT-TTGAACCCA-TTCAAATAATTA
1 AAAATTAATAAGGT-AAAGATTAAAAAAA-ATAAATATGTTTATCGAA-CAAGTT--AA-AA-TA
* * * *
22428 TGACTATTTATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
59 -G-TTA-TGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAA
* * *
22493 CCAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
120 ACAATTATTTCTATTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
* * * *
22556 AAAATTAATAAGTTAAATATTAAAAAAAA-ATATATGTTTA-CTGAGCAAGTTAAAATAGTTATG
1 AAAATTAATAAGGTAAAGATTAAAAAAAATAAATATGTTTATC-GAACAAGTTAAAATAGTTATG
* *
22619 ACTATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATG-CTATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC-ATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT
* * * ** ***
22683 TCTATTCAAACAAGTTTATTCTAAATAAAATTATGCTAATTTATTAATATTTTG
129 TCTATTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
* * * * * * *
22737 CAATTTAAT-AGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCACA
1 AAAATTAATAAGGTA-AAGATTAAAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTAAAATAGT--TA
* * * * * * * *
22801 TG-C-ACTTAAATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAGAAA-AAGTA
63 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTATCATA-AAACAATTA
22863 TTTCTATTCA
127 TTTCTATTCA
22873 TACATATTCT
Statistics
Matches: 686, Mismatches: 136, Indels: 89
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
179 9 0.01
180 148 0.22
181 141 0.21
182 91 0.13
183 128 0.19
184 15 0.02
185 4 0.01
186 8 0.01
187 111 0.16
188 14 0.02
189 16 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (182 bp):
AAAATTAATAAGGTAAAGATTAAAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTAAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC
TATTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
Found at i:22868 original size:182 final size:180
Alignment explanation
Indices: 21825--22872 Score: 498
Period size: 181 Copynumber: 5.7 Consensus size: 180
21815 TATTTCAAAT
* * *
21825 AAAATTAATAA-GTAAAATATTTAAAAAATAAATCT-T-TTTACCT-AATAAGTTCAAATAG-CT
1 AAAATTAATAAGGT-AAATA-TTAAAAAA-AAATATATGTTTA-CTGAACAAGTTAAAATAGTC-
* * * * *
21885 ATGACTATTTGAAA-AATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
61 ATGACTACTT-AAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT
* * * * * *** * * ***
21949 GTTTTTCTTCACACAAACTTATTTGGATTAAAATAATA-TGAATTTATTAATATTTTG
124 ATTTCTATTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACT-AATTTATTAATATTCCA
** * * * * *
22006 CCAATTAATAA-GTAAAAGATTTTAAAATAAAT-T-TATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTCAT
1 AAAATTAATAAGGT-AAATA-TTAAAAAAAAATATATGTTTACT-GAACAAGTTAAAATAGTCAT
* * * * * ** * * *
22067 AACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTA
63 GACTACTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATT
* * * * * * *
22132 TC-AGCTCATATAGGCTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTA
127 TCTA-TTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
* ** * *** * * * * * *
22186 AAATTTAACGA-GTAAGAGATTTTGAGAAAATGA-ATCTACTTAATGAACAAGTTCAATTAGTTA
1 AAAATTAATAAGGTAA-ATATTAAAAAAAAAT-ATATGT--TTACTGAACAAGTTAAAATAGTCA
* * * * * ** * * *
22249 TGATTATTTGAACAATTATATATCTCAAATCA-TTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAGCAATTG
62 TGACTACTTAAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTA
* * * *
22313 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAAT-A-ATTAACTTTTTTCAATATTCCA
125 TTTCTATTCAAACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAACACTAA-TTTATT-AATATTCCA
* * * * ** *
22369 AAAATTAATAA-ATCAAA-A-TAAAAAAATATATCTATTTTTTGAACCCA-TTCAAATAATTATG
1 AAAATTAATAAGGT-AAATATTAAAAAAAAATATATGTTTACTGAA-CAAGTT--AA-AA-TA-G
* * * * * *
22430 ACTATTTATCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACC
59 TC-A-TGA-CTACTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAA-A
* *
22495 AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
120 AATTATTTCTATTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
* * *
22556 AAAATTAATAAGTTAAATATTAAAAAAAAATATATGTTTACTGAGCAAGTTAAAATAGTTATGAC
1 AAAATTAATAAGGTAAATATTAAAAAAAAATATATGTTTACTGAACAAGTTAAAATAGTCATGAC
* * * * *
22621 TATTTGAACAATTATTTTTTTCAAATAGTTATG-CTATTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC
66 TACTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAC-ATTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTC
* * * ** ***
22685 TATTCAAACAAGTTTATTCTAAATAAAATTATGCTAATTTATTAATATTTTG
129 TATTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
* * * *
22737 CAATTTAAT-AGGTAGGAGAT-TTAAAAAAATAA-ATTTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTC
1 AAAATTAATAAGGTA--A-ATATTAAAAAAA-AATATATGTTTACT-GAACAAGTTAAAATAGT-
* * * * *
22798 ACATG-C-ACTTAAATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAGAAAAAG
60 -CATGACTACTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATA-AAAAAT
22861 TATTTCTATTCA
123 TATTTCTATTCA
22873 TACATATTCT
Statistics
Matches: 687, Mismatches: 130, Indels: 99
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
178 1 0.00
179 23 0.03
180 135 0.20
181 147 0.21
182 96 0.14
183 121 0.18
184 12 0.02
185 3 0.00
186 8 0.01
187 106 0.15
188 10 0.01
189 25 0.04
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AAAATTAATAAGGTAAATATTAAAAAAAAATATATGTTTACTGAACAAGTTAAAATAGTCATGAC
TACTTAAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAATTATTTCTA
TTCAAACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
Found at i:23019 original size:146 final size:147
Alignment explanation
Indices: 22729--23022 Score: 385
Period size: 146 Copynumber: 2.0 Consensus size: 147
22719 TAATTTATTA
* * * *
22729 ATATTTTGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
1 ATATTCTGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGCTCAAAT
* * * * *
22794 AGTCACATGCACTTAAATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCGTAGAAAA
66 AGTCACATCCACTTAAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAAAA
*
22859 AGTATTTCTATTCATAC
131 AGTATTTATATTCATAC
* * * *
22876 ATATTCTGCAATTTAATAGGTAGTAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGCTGACAT
1 ATATTCTGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGCTCAAAT
** * *
22940 AGTCATGTCCACTTAAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTTTCATA-AAAA
66 AGTCACATCCACTTAAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAAAA
* *
23004 AGTTGTTTATGTTCATAC
131 AG-TATTTATATTCATAC
23022 A
1 A
23023 GAATTATTGA
Statistics
Matches: 126, Mismatches: 20, Indels: 3
0.85 0.13 0.02
Matches are distributed among these distances:
145 6 0.05
146 92 0.73
147 28 0.22
ACGTcount: A:0.36, C:0.12, G:0.12, T:0.40
Consensus pattern (147 bp):
ATATTCTGCAATTTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGCTCAAAT
AGTCACATCCACTTAAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTGTTTTGTCATAGAAAA
AGTATTTATATTCATAC
Found at i:23725 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 22952--25158 Score: 1487
Period size: 179 Copynumber: 12.3 Consensus size: 179
22942 TCATGTCCAC
** *
22952 TTAAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCT-TTTGTTTTTTCATAAAA-AAGTTGTTT-AT
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA--TATTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCA-
* ** *
23014 GTTCATACAGAA--TTATTGAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTTATAAG
62 GTTCATA-A-AAGCTTATTG-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * *
23077 --AG--ATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCT-AACTAGTTCAAATAGTTATGATTAT
124 CAAGAAATTTAAAAAATAAAGCTATTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * **
23129 TTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-ACTTTATTTTGTCCTAGAACAATTGTTTCTTTT
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT
* * * * * * * * *
23193 CATAAAAGCATT-TCGGATTAAAATTATATTGATTTAATAATATTTC-AAAA--AATCAGTAAGA
65 CATAAAAGC-TTATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGA
* * * * *
23254 GATTTAAAAAATAAATAC-ATTTGCTGAACCAATTCAAATAGTTAGGACTA-
129 AATTTAAAAAATAAA-GCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * *
23304 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-TGA-ACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTCA
1 TTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATA--TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCA
* * * * * * * * *
23367 GTTTATATAAGTTTATTCGAAATAATATAATATTAATTTATTAACT-TTTGAAAAGTTAGTAACC
62 GTTCATAAAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAATAAGC
* * ** * *
23431 AAAAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGATAAGACTAT
125 AAGAAA-TTTAAAAAATAAAGCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * ** * *
23487 TTAAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAAAACCT-TTTGTTTTGTAATACAACAATTGTTTCAGT
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA--TATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
* * * *
23551 TCATAAAAACTTACTTGAAATAAAATAATACCATTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAG
64 TCATAAAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG
* * *
23616 AAATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TTTAACCAGTTCAAAATAGTTATGACTAT
128 AAATTTAAAAAATAAAGCTATTTACTGAACCAGTTC-AAATAGTTATGACTAT
* * * ** * *
23668 TTAAACAAATATCAATCTT-AAATCGTTATGATAATTGTTTTGTCATAAAGTAATTGTTT-TGAT
1 TTAAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGATATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT
* * * * * * *
23731 CATATAAGCTGATTCAGATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A
65 CATAAAAGCTTATTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGA
* ** ** *
23795 AGATTTAAAAAATAAAATG-TGTTTACTGAATTAGTTTGAATAGTTAAGACTA-
129 A-ATTTAAAAAAT-AAA-GCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
23847 TTAGAATAATTATCTATTTCAACTCGTTCTAACCT-TTTATTTAGTTATAAAATAATTGTTTCAG
1 TTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA--TATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG
* * * * *
23911 TTCATACAAGCTTATTTGAAAGAAAATAATATTAATTTATTAACT-TTT-GAAAATTCATAAGCA
63 TTCATAAAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAATAAGCA
* * * *
23974 AGAAATTTGAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAGGTTCAAATAGTTATGACTAT
126 AGAAATTT--AAAAAATAAAGCTATTTACTGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * **
24030 TTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATCTTT-ATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTC
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC
* * * * * * * * *
24094 ATACAAGCATATTTGGATTAAAATAATATTAATTTAATAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAGAG
66 ATAAAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAA
* * ** *
24158 ATTT-AGAATTAAA--TATGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTA-
130 ATTTAAAAAATAAAGCTAT-TTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
24206 TAAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGATCTTTCATTTAGTC--AAAACAATTATTTCAGT
1 TTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
* * * *
24269 TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAACTTATTAA-CTTTCAAAAAATTAATAAGC-A
64 TCATAAAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAA
* * ** *
24332 GAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAAATATAACTAT
127 GAAA-TTTAAAAAATAAAGCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
24386 TTAAACAATTATCTATTTAAAATTGCTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTT
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-TATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT
* * * * *
24451 CATAAAA-CTTATCGAAATAAAATAATAGTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAG
65 CATAAAAGCTTATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAA
* **
24515 ATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTTGAACCAGTTCAAATAGTTA--ACTAT
130 ATTTAAAAAATAAAGCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * * *
24563 TTAAATAAATATCAATCTCACAT-GATTAT-ATCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGAT
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGATATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT
* * * * * ** *
24626 CATACAAGCTGATTCG-GATAAAAATAATACTAATTTAATATTATTTTGAAAATTAAT-AGTAAG
65 CATAAAAGCTTATT-GAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG
* * ** * **
24689 AGATTTAAAAAATAAATG-TGTTTACCAAATCAGTT-AAATAGTTAACACTA-
128 AAATTTAAAAAATAAA-GCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * *
24739 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCT-TTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAA
1 TTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA--TATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG
* * * *
24803 TTCA-AACAAGCTTATTTGGAAGAAAATAATACTAATTTATTAACT-TTTGAAAAATTAATATGC
63 TTCATAA-AAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAATAAGC
* *
24866 AAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTAT
125 AAGAAATTT-AAAAAATAAAGCTATTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
24921 TTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-AGT
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATA--TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT
** ** * * * * * *
24984 TCATAAAAATTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAGATCAATAAGTAA-
64 TCATAAAAGCTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAG
* * * * *
25048 AAGATTTAAAAAATAAA--AATTTA-TCGAATCACTTCAAATAATTATAACTAT
128 AA-ATTTAAAAAATAAAGCTATTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * **
25099 TTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
25159 TTCAACATAC
Statistics
Matches: 1599, Mismatches: 326, Indels: 209
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
172 4 0.00
174 8 0.01
175 79 0.05
176 149 0.09
177 255 0.16
178 119 0.07
179 281 0.18
180 236 0.15
181 219 0.14
182 210 0.13
183 39 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC
ATAAAAGCTTATTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAAA
TTTAAAAAATAAAGCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
Found at i:23848 original size:361 final size:354
Alignment explanation
Indices: 22902--25158 Score: 1318
Period size: 356 Copynumber: 6.3 Consensus size: 354
22892 TAGGTAGTAG
* * * * * * * * * *
22902 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGCTGACATAGTCATGTCCACTTAAACAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA
** * * * **
22967 T-TTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAA-AAGTTGTTTATGTTCATACAGAATTAT
66 TCTT-AAATCGTTATGA--TATTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATA-A-AGCTAT
* * ** * *
23030 T-GAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTTATAAG----AGATTTAAAAACT
125 TCG-ATA-AAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
23090 -AAATCTGTTTATCT-AACT-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATCTCAAAT
188 AAAATGT-TTTA-CTGAA-TAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * ** ** * * *
23152 TGTTATGAA-C-TTTATTTTGTCCTAGAACAATTGTTTCTTTTCATAAAAGC--ATTTCGGATTA
250 CGTTAT-AACCTTTTATTTAGTAATA-AACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATA
* * * * * * *
23213 AAATTATATTGATTTAATAATATTTCAAAAA--ATCAGTAAGAG
312 AAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTATAAGCAAGAA
* * *
23255 ATTTAAAAAATAAATAC-ATTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTTAGGACTA-TTAGAATAATTAT
1 ATTTAAAAAATAAAT-CTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTAT
* * * * * *
23317 CTAT-TTCAAATCGTT-TGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTCAGTTTATATAAGTT
63 CTATCTT-AAATCGTTATG-A-TATTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATA-AAG-C
* * * * * *
23380 TATTCGA-AATAATATAATATTAATTTATTAACT-TTTGAAAAGTTAGTAACCAAAAAATTTTAA
122 TATTCGATAA-AA-ATAATATTAATTTAATAA-TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGA-TTTAA
* * * *
23443 AAAAT-AAATCTATTTACTGAATAAGTTCAAATAGATAAGACTATTTA-AACAATTATCTATTTA
183 AAAATAAAATGT-TTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTC
* * * * * * *
23506 AAATTGTTAAAACCTTTTGTTTTGTAATACAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAACTTACTTGAAA
246 AAATCGTTATAACCTTTTATTTAGTAATA-AACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* *
23571 TAAAATAATACCATTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAA
310 TAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAATTA-TAAGCAAGAA
* * * * * * *
23618 ATTTAAAAACTAAAGCTATTT-TTTAACCAGTTCAAAATAGTTATGACTATTTAAACAAATATCA
1 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
** *
23682 ATCTTAAATCGTTATGATAATTGTTTTGTCATAAAGTAATTGTTT-TGATCATATAAGCTGATTC
65 ATCTTAAATCGTTATGAT-ATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGCT-ATTC
*
23746 AGATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
127 -GATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAA
* ** * *
23811 ATGTGTTTACTGAATTAGTTTGAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAACTCGTTC
191 ATGT-TTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTA
* * *
23876 TAACCTTTTATTTAGTTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAGAAAATAAT
255 TAACCTTTTATTTAGTAAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
* *
23941 ATTAATTTATTAACTTTT-GAAAATTCATAAGCAAGAA
319 ACTAATTTATTAA-TTTTCAAAAATT-ATAAGCAAGAA
* * * * *
23978 ATTTGAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAGGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
1 ATTT--AAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATC
* * * *
24043 TATCTCAAATCATTATGATCTT-TATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCATATT
64 TATCTTAAATCGTTATGATATTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGC-TA-T
* * * * * * *
24107 TGGATTAAAATAATATTAATTTAATAATA-TTCCAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AGAATTAA
125 TCGATAAAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAA
** * * *
24170 ATATGTTTGT-C-GAACCAGTTCAAATAGTTAGGACTATAAGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
190 A-ATGTTT-TACTGAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * * * *
24233 TTTGATCTTTCATTTAGTCA-AAACAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
253 TATAACCTTTTATTTAGTAATAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* *
24297 TACTAACTTATTAACTTTCAAAAAATTAATAAGC-AGAA
318 TACTAATTTATTAATTTTC-AAAAATT-ATAAGCAAGAA
** *
24335 ATTTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAAATATAACTATTTAAACAATTATCT
1 A-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
* * * * * *
24400 AT-TTAAAATTGCTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAACT-TAT
65 ATCTT-AAATCGTTATGA--TATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAGCTAT-T
* * * * * * *
24463 CGAAATAAAATAATAGTACTTTATTAATATTTCAAAAATTATTAAGCAAGAGATTTAAAAACTAA
126 CGATA-AAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAA
* * * ** * * * *
24528 AGCTATTTT-TTGAACCAGTTCAAATAGTT-A-ACTATTTA-AATAAATATCAATCTCACAT-GA
190 A-ATGTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCG-
* * * * * * * *
24588 TTAT-ATCTTTGT-TTT-GTCATAAAATAATTGTTTCTGATCATACAAGCTGATTCG-GATAAAA
252 TTATAACCTTT-TATTTAGTAAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAA
* * * *
24649 ATAATACTAATTTAATATTATTTT-GAAAATTA-ATAGTAAGAG
314 ATAATACTAATTT-AT-TAATTTTCAAAAATTATA-AGCAAGAA
* * ** ** *
24691 ATTTAAAAAATAAATGTGTTTACCAAATC-AGTT-AAATAGTTAACACTA-TTAGAATAATTATC
1 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATC
* * * * * ** *
24753 TAT-TTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCAAACAAGCTTA
64 TATCTT-AAATCGTTATGA--TATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-AAGC-TA
* * * * * *
24817 TTTGGA-AGAAAATAATACTAATTTATTAACT-TTTGAAAAATTAATATGCAAGAGATTTGAAAA
124 -TTCGATA-AAAATAATATTAATTTAATAA-TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAA
* * * * * *
24880 AAT-AAATCTATTTA-TCGAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
185 AATAAAATGT-TTTACT-GAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * ** ***
24942 ATCATTATGAA-CTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATAAAAATTTATCCAAAA
248 ATCGTTAT-AACCTTTT-ATTTAGTAAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
25004 TAAAATAATATTACTTTATTAATATTTTAAAGATCAATAAGTAA-AA
310 TAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCAAAAAT-TATAAGCAAGAA
* * * * * *
25050 GATTTAAAAAATAAA--AATTTA-TCGAATC-ACTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTAT
1 -ATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
* *
25111 CTAT-TTAAAATCATTATTACCT-TTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
63 CTATCTT-AAATCGTTATGA--TATT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
25159 TTCAACATAC
Statistics
Matches: 1521, Mismatches: 280, Indels: 200
0.76 0.14 0.10
Matches are distributed among these distances:
351 1 0.00
352 28 0.02
353 104 0.07
354 77 0.05
355 49 0.03
356 228 0.15
357 113 0.07
358 183 0.12
359 190 0.12
360 119 0.08
361 224 0.15
362 112 0.07
363 86 0.06
364 7 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (354 bp):
ATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA
TCTTAAATCGTTATGATATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAAAGCTATTCGATA
AAAATAATATTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAAATGTT
TTACTGAATAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCT
TTTATTTAGTAATAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
TATTAATTTTCAAAAATTATAAGCAAGAA
Found at i:25116 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 25084--25116 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
25074 AATCACTTCA
25084 AATAATTATAACTATTTG
1 AATAATTAT-ACTATTTG
25102 AATAATTAT-CTATTT
1 AATAATTATACTATTT
25117 AAAATCATTA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.42, C:0.06, G:0.03, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATACTATTTG
Found at i:25879 original size:180 final size:177
Alignment explanation
Indices: 25278--26099 Score: 678
Period size: 179 Copynumber: 4.6 Consensus size: 177
25268 GAATTAGTAT
* * * * *
25278 GAGATTCAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 GAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTAT
* * * *
25343 CTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTATTTTC-GTTCATATAAGTTT
65 CTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA-TTTCAGTTCATACAAGCTT
* * * * * *
25407 A-TTCAAATAAAGTAATACAAAATTAAAAATATTCTAAAAATCATAACTAA
129 ATTTGAAATAAAATAAAAC-AAATTAATAATATT-TAAAATTAATAACTAA
* * * * * * *
25457 -AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTGCTGAACAAGTTAAAACAATTAAAACTATATGAAGAATTAT
1 GAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTAT
* * * * *
25521 CTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAGA-AATTATTTCAGCTCATCCAAGTTT
65 CTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA-ATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTT
* * * ** * *
25585 ATTCGTAATAAAATAAAACTAATTTTTTAATATTTCAAAATTTTAA-AAGTTA
129 ATTTGAAATAAAATAAAAC-AAATTAATAATATTT-AAAA--TTAATAACTAA
* * * *
25637 GAGATTTTAAAAAAAAAATTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTCAACAATTA
1 GAGA-TTTAAAAAATAAATTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTA-AGACTATATGAACAATTA
* ** **
25701 TATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT-TTTTCATACAAGCTT
64 TCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTT
* * * *
25765 ATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAAGATTATGACAATTAATAACTAA
129 ATTTGAAATAAAATAAAACAAAT-TAATAATATT-T-AAAATTAATAACTAA
* ** * * * *
25817 GAGATTTAAAAAATAAATTTTTTGGTCAAACCACTTCAAATAGTTAAGGA-TGTATGAACAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTAA-GACTATATGAACAATTA
* ** * * * *
25881 TCTATTGCAAATTGTTATGGCCTTTTAG-TTTGTCGTAAAACAATT-TTTCAGTGCTTACTAA-C
64 TCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATAC-AAGC
* * * * * *
25943 CTATTTGGAATAAAACAAAACAAATTACTAATATTTCAAAAATTATTAAGTAA
127 TTATTTGAAATAAAATAAAACAAATTAATAATATTT--AAAATTAATAACTAA
* * * * *
25996 GAGATTTAAAAAATAATTATGTTT-GTCGAACCAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTA
1 GAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTA
** *
26060 TCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
64 TCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
26100 CAAATTTTTT
Statistics
Matches: 508, Mismatches: 112, Indels: 46
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 4 0.01
178 108 0.21
179 155 0.31
180 138 0.27
181 89 0.18
182 14 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (177 bp):
GAGATTTAAAAAATAAATTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATC
TATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTAT
TTGAAATAAAATAAAACAAATTAATAATATTTAAAATTAATAACTAA
Found at i:25977 original size:359 final size:358
Alignment explanation
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Period size: 359 Copynumber: 2.3 Consensus size: 358
25263 TTCAAGAATT
* * * * * *
25273 AGTATGAGATTCAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
1 AGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAT-TATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
** * * *
25338 ATTATCTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTATTTTCGTTCATATAA
65 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTCGTTCATACAA
* * * * *
25403 GTTTATTCAAATAAAGTAATACAAAATTAAAAATATTCTAAAAATCATAACTAAAGATTTAAAAA
130 GCTTATTCAAATAAAATAATACAAAATTAAAAAGATTATAAAAATAATAACTAAAGATTTAAAAA
* * * **
25468 ATAAATCAGTTTGCTGAACAAGTTAAAACAATTAAAACTATATGAAGAATTATCTATTTTAAATT
195 ATAAATCAGTTTGCTAAACAACTTAAAACAATTAAAACTATATGAACAATTATCTATTGCAAATT
* ** *
25533 GTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAGAAATTATTTCAGCTCATCCAAGTTTATTCGTAATAAAA
260 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGAAATTATTTCAGCTCATCCAAGCCTATTCGGAATAAAA
* * **
25598 TAAAACTAATTTTTTAATATTTC-AAAATT-TTAAA
325 CAAAACTAAATTACTAATATTTCAAAAATTATT--A
* * *
25632 AGTTAGAGATTTTAAAAAAAAAATTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTCAACA
1 AGTAAGAGA-TTTAAAAAAAAAATTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACA
* *
25697 ATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTT-TTTCATACAA
65 ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTCGTTCATACAA
* * * * *
25761 GCTTATTTGAAATAAAATAATAC-TAATCTAATAAGATTATGACAATTAATAACTAAGAGATTTA
130 GCTTA-TTCAAATAAAATAATACAAAAT-TAAAAAGATTAT-AAAAATAATAACTAA-AGATTTA
** * * * * * * *
25825 AAAAATAAAT-TTTTTGGTCAAACCACTTCAAATAGTTAAGGA-TGTATGAACAATTATCTATTG
191 AAAAATAAATCAGTTTGCT-AAACAACTTAAAACAATTAA-AACTATATGAACAATTATCTATTG
* * * *
25888 CAAATTGTTATGGCCTTTTAG-TTTGTCGTAAA-ACAATT-TTTCAG-TGCTTACTAA-CCTATT
254 CAAATTGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAGA-AATTATTTCAGCT-CAT-CCAAGCCTATT
*
25948 TGGAATAAAACAAAAC-AAATTACTAATATTTCAAAAATTATTA
315 CGGAATAAAACAAAACTAAATTACTAATATTTCAAAAATTATTA
* ** *
25991 AGTAAGAGATTT-AAAAAATAATTATGTTTGTCGAACCAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAAC
1 AGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATTAT-TTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
*
26055 AATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
64 AATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
26100 CAAATTTTTT
Statistics
Matches: 391, Mismatches: 62, Indels: 30
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
357 12 0.03
358 21 0.05
359 211 0.54
360 61 0.16
361 84 0.21
362 2 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (358 bp):
AGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
TTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTTCGTTCATACAAG
CTTATTCAAATAAAATAATACAAAATTAAAAAGATTATAAAAATAATAACTAAAGATTTAAAAAA
TAAATCAGTTTGCTAAACAACTTAAAACAATTAAAACTATATGAACAATTATCTATTGCAAATTG
TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAGAAATTATTTCAGCTCATCCAAGCCTATTCGGAATAAAAC
AAAACTAAATTACTAATATTTCAAAAATTATTA
Done.