Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168226.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_46, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Pmatch=0.80,Pindel=0.10
tuple sizes 0,4,5,7
tuple distances 0, 29, 159, 1000
Length: 198541
ACGTcount: A:0.39, C:0.11, G:0.11, T:0.39
File 1 of 3
Found at i:24 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 1--59 Score: 64
Period size: 21 Copynumber: 3.1 Consensus size: 18
1 AAAATTATTTTTGACAAA
1 AAAATTATTTTTGACAAA
* *
19 AAAATTATGTATTAATCGAAA
1 AAAATTAT-TTTTGA-C-AAA
40 AAAATTATTTTATGACAAA
1 AAAATTATTTT-TGACAAA
59 A
1 A
60 CAAAATGTTA
Statistics
Matches: 33, Mismatches: 4, Indels: 7
0.75 0.09 0.16
Matches are distributed among these distances:
18 8 0.24
19 8 0.24
20 4 0.12
21 13 0.39
ACGTcount: A:0.53, C:0.05, G:0.07, T:0.36
Consensus pattern (18 bp):
AAAATTATTTTTGACAAA
Found at i:354 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 49--476 Score: 490
Period size: 179 Copynumber: 2.4 Consensus size: 179
39 AAAAATTATT
* * * **
49 TTATGACAAAACAAAATGTTATAGTGATTTGAAATAGGTAATTATTCAACTAATCGTAACTATTT
1 TTATGACAAAACAAAATGTTA-A-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * *
114 GAACTTGTTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATG
64 GAACTTGGTCAACAAATAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATA
* * *
179 AATTAGAATTATGCTATTCCAAAT-AAGCT-TGCATGAATAGAAACAATTGTC
129 AACTAGAATTATGCTATTCCAAATAAAACTAT--ATCAATAGAAACAATTGTC
* * * *
230 TTGTGACAAAACAAAATGTTAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGC
1 TTATGACAAAACAAAATGTTAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGA
* * *
295 AC-TGGTCAAGCCAATAGATTCATTTTTTAAAT-TCGTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAAT
66 ACTTGGTCAA-CAAATAGATTCAGTTTTTAAATCTC-TTACTTATAAATTTTTGA-AATATTAAT
* ** *
357 AAACTAGCATTATTTTATTCCAAATAAAACTATATCAATAGAAACAATTGTT
128 AAACTAGAATTATGCTATTCCAAATAAAACTATATCAATAGAAACAATTGTC
* *
409 TTATGACAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAATTGTTATAACTATT
1 TTATGACAAAACAAAAT-GT--TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATT
473 TGAA
63 TGAA
477 GTAGTTTGGT
Statistics
Matches: 209, Mismatches: 30, Indels: 16
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 12 0.06
179 129 0.62
180 5 0.02
181 63 0.30
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.11, T:0.38
Consensus pattern (179 bp):
TTATGACAAAACAAAATGTTAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGA
ACTTGGTCAACAAATAGATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAATAAA
CTAGAATTATGCTATTCCAAATAAAACTATATCAATAGAAACAATTGTC
Found at i:2708 original size:18 final size:20
Alignment explanation
Indices: 2675--2711 Score: 60
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
2665 ATAGTATAAA
2675 ATTTAGAAAAAGGAAATTTT
1 ATTTAGAAAAAGGAAATTTT
2695 ATTT-GAAAAA-GAAATTT
1 ATTTAGAAAAAGGAAATTT
2712 GAATTTTTTT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 2
0.89 0.00 0.11
Matches are distributed among these distances:
18 7 0.41
19 6 0.35
20 4 0.24
ACGTcount: A:0.51, C:0.00, G:0.14, T:0.35
Consensus pattern (20 bp):
ATTTAGAAAAAGGAAATTTT
Found at i:2717 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 2674--2717 Score: 56
Period size: 19 Copynumber: 2.2 Consensus size: 20
2664 AATAGTATAA
2674 AATTTAGAAAAAGGAAATTT
1 AATTTAGAAAAAGGAAATTT
*
2694 TATTT-GAAAAA-GAAATTT
1 AATTTAGAAAAAGGAAATTT
2712 GAATTT
1 -AATTT
2718 TTTTTGATGA
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 3
0.81 0.08 0.12
Matches are distributed among these distances:
18 7 0.33
19 10 0.48
20 4 0.19
ACGTcount: A:0.50, C:0.00, G:0.14, T:0.36
Consensus pattern (20 bp):
AATTTAGAAAAAGGAAATTT
Found at i:8960 original size:361 final size:362
Alignment explanation
Indices: 8370--11091 Score: 2103
Period size: 357 Copynumber: 7.6 Consensus size: 362
8360 AAAAGCTAAC
* ** * * * * * * *
8370 ACTTAATAATTTTCAAAATA-TAAAAAATTAATTTTATTTTA-TTCGAACAAACTTATATGAA-C
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * *
8432 AAAAGCATTTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACA
66 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * ** * ** *
8496 G-CATTTACTATTTGAACAGGTTTGGCAAACAAA-TTATTTTTTGAATCTTTTAGTTATTAATTT
131 GTCA-TAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTT
* * * * * * * * *
8559 TCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAG-TTGTATGAACATAAATAAATGT
195 TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTAT
* * *
8622 TTTATGTACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
259 TTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* *
8687 TTAAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATCCTT
323 TTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCCTT
* * * * *
8727 ACTCATTAAGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTCGAATAGGCTTATATG-AT
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * *
8791 GAAAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
65 GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *** * * *
8856 GGCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTT
130 AGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTT
* * * * *
8921 TTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTTGAATAAGCTTTTATGAACTA-AAACATTTGT
195 TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTAT
* * *
8984 TTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
259 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * ** * * *
9049 TGAATTTGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTTAATTTCTT
324 TGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCCTT
* * * * * * **
9089 GCTTATTAGTTTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATT-TACAAA
1 ACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAA
* * * * * *
9152 CTG--AAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTA
64 -TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * * * *
9215 ATATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTACTTTTTAAATCTAT-TACTTATTAA
128 ATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-TCAACTTATTAA
* * ** ** * * *
9279 -TTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTT-CTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATT
192 TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATT
* * * *
9342 ATTTTATGACAAAAC-AAAGATCGTAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAA
257 ATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *
9406 TTTGAACTAGTTTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAAT-C-T
322 TTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCCTT
* * **
9445 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAAT-
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATG
* * * * * ** *
9508 AAAAATAATTTTTTTAGGACAAAAC-AAATGTCATAACGATTTGAAATAGAGAATAATTCAAATG
66 AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * * * *
9572 GACGTGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAA-TAATTAATTTCTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TT
131 GTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTT
** * * * * * *
9634 TTATTATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAACTATT
195 TTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATT
* * * * *
9699 TTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATT
260 TTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * * * *
9764 TAAACTTA-CTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
324 TGAAC-TAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTT
* * *
9804 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAAT
* * *
9868 -AGAAA-AATTGGTTTATGAC--AA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
65 GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* ** * * * *
9928 AGTCATAA-AATTTTGAACAAATTAAGA-AAATAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTAACTTATTAAT
130 AGTCATAACTA-TTTGAACTGATT-CGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAAT
* * ** *
9989 TTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTT-TATTCGAAATAAGCTTACATGAATAG-AACTAA
193 TTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TTCG-AATAAGCTTGTATGAACAGAAAC-AA
* * * * ** *
10052 TTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTT-TGATAGTCGTAAA
255 TTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AA
* ** ** *
10116 CTATTTAAACTTA-TTTGGTAAATAGATTCCTTTTTTAGTTTTCTT
319 CTATTTGAAC-TAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTA-AATCCTT
* * * * * ***
10161 ACTCACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATAAGCTCACATGAACT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * * * *
10226 G--AAACAATTATTTTATTAGAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAA
65 GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * ** * *
10289 TAGTCATGACTATTTGAACTTATTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT
129 TAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATT
* * * * * **
10354 GTCAAAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTA
194 TTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTA
* ** ** * * * * *
10418 TTTTATAACAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGACAATTGTTCAAATTGTAATAACTA
258 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * *
10482 TTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
322 TTTGAACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTT
* * * * * * *
10524 -TTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGAATTAATTGA-TTCTAAATAGGCTTGTATGAA
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA
** * * * *
10586 -CCAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA
64 TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
10650 TAGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATTCTTC--CTTATTTAT
129 TAGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAA-TCTTCAACTTATTAAT
* * * * *
10713 TTTT-AACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAGTTCGAATAAGCTTGTACGAACA-AAACAATTA
193 TTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTA
* * * * * * * * *
10776 TTTTACGA-GAAA-AAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATAGTTTATATAGTCTTAACTAT
258 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * * *
10839 TTGAACTTGTTTGGCT-ATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT
323 TTGAACTAGTTTGG-TAAATAGATTTATTTTTTAA-ATCCTT
** * ** * * *
10880 GGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-ATTAGTATCAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAAT
* * * * * * * * *
10944 -AGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGGAATAGATAATTATACAAAT
65 GAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * * *
11008 AGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATC-TCTTA-TTGATTAAT
130 AGTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTC-AACTT-ATTAAT
11071 TTTCT-AAATATTAATAAATTA
193 TTT-TAAAATATTAATAAATTA
11092 GTAATAATAA
Statistics
Matches: 1857, Mismatches: 427, Indels: 160
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
353 45 0.02
354 97 0.05
355 69 0.04
356 164 0.09
357 356 0.19
358 86 0.05
359 146 0.08
360 170 0.09
361 340 0.18
362 224 0.12
363 111 0.06
364 49 0.03
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (362 bp):
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAATG
AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
GTCATAACTATTTGAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTCAACTTATTAATTTT
TAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTATTT
TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
AACTAGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCCTT
Found at i:9051 original size:180 final size:181
Alignment explanation
Indices: 8370--11091 Score: 2085
Period size: 181 Copynumber: 15.2 Consensus size: 181
8360 AAAAGCTAAC
* * * * * * *
8370 ACTTAATAATTTTCAAAATA-TAAAAAATTAATTTTATTTTA-TTCGAACAAACTTATATGAAC-
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * *
8432 AAAAGCATTTGTTTTATGACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACA
66 AAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * * * *
8496 G-CATTTACTATTTGAACAGGTTTGGCAAACA-AATTATTTTTTGAATCTTTT
130 GTCA-TAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
8547 AGTTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAG-TTGTATGAAC
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAC
* *
8610 ATAAATA-AA-TGTTTTATGTACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAA
65 -TAAA-ACAATTGTTTTATG-ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * *
8673 ATAGTCATAACTATTTAAACT-AGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTT
127 ATAGTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * **
8727 ACTCATTAAGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTCGAATAGGCTTATATGATG
1 ACTTATTAA-TTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * *
8792 AAAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATG
65 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * ** * **
8857 GCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCA
130 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * *
8909 ACTTCTCAATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTTGAATAAGCTTTTATGAACT
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
8973 AAAACATTTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAG
66 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* ** * * *
9038 TCATAACTATTTGAATTTG-TTCGGTAAGCATATTTATTTTTTTAATTTCTT
131 TCATAACTATTTGAA-CTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** * * * **
9089 GCTTATTAGTTTTTTGAATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATT-TACAAAC
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATGAAC
* * * * * * *
9153 TGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATA
65 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * ** * * * *
9218 TTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATT
130 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * ** ** * *
9270 ACTTATTAA-TTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTT-CTTCGAATAAGCTTGTATGAA-T
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * *
9332 AGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCGTAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATA
66 A-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * *
9396 GTCATAACAATTTGAACT-AGTTTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T
130 GTCATAACTATTTGAACTGA-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * **
9445 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TAAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAA-
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAA-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAAC
* * * * * **
9507 TAAAAATAATTTTTTTAGGACAAAAC-AAATGTCATAACGATTTGAAATAGAGAATAATTCAAAT
65 T-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * * **
9571 GGACGTGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATA-ATTAATTTCTTAAGTCTCCA
129 AGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* ** * * * *
9623 ACTCATTAA-TTTTATTATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-T
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * *
9686 AGAAACAACTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAAT
66 A-AAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * *
9751 AGTTATAACTATTTAAACTTACTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
129 AGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* ** * *
9804 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTAT-GAATAAGCTTGTATGAA-
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCGAATAAGCTTGTATGAAC
* *
9867 TAGAAA-AATTGGTTTATGAC--AA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAAT
65 TA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* ** ** *
9928 AGTCATAA-AATTTTGAACAAATTAAGAAAATAGATTTA-TTTTTAAAT-T-TT
129 AGTCATAACTA-TTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * **
9978 AACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTT-TATTCGAAATAAGCTTACATGA
1 -ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAT-TTCG-AATAAGCTTGTATGA
* * * * * **
10042 A-TAGAACTAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTT-TG
63 ACTAAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
* * * * ** ** *
10105 ATAGTCGTAAACTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTCCTTTTTTAGTTTTCTT
127 ATAGTCAT-AACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * * ***
10161 ACTCACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATAAGCTCACATGAACT
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * *
10226 GAAACAATTATTTTATTAGAAAAGAAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATA
66 AAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * *
10291 GTCATGACTATTTGAACTTATTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TCT
130 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT-T
* * * * * *
10343 ACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-TTCAAAATAAGCTTGTATTAAT
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAAC
* * * ** ** * * *
10407 TGAAACAATTATTTTATAACAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGACAATTGTTCAAAT
65 TAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * *
10471 TGTAATAACTATTTGAACTTG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
129 AGTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* ** * * * * *
10524 -TTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGA-ATTAATTGA-TTCTAAATAGGCTTGTATGAA
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-ATATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGAA
* * * * *
10586 CCAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAT
64 CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * *
10651 AGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAAT-TCTT
129 AGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
* * * * * * *
10703 CCTTATTTATTTTT-AACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAGTTCGAATAAGCTTGTACGAAC-
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
* * * * * * * *
10766 AAAACAATTATTTTACGA-GAAA-AAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATAGTTTATATAG
66 AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * *
10829 TCTTAACTATTTGAACTTG-TTTGGCT-ATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTT
131 TCATAACTATTTGAAC-TGATTCGG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
** * * * * * *
10880 GGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-ATTAGTATCAA-
1 ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAAC
* * * * * * * *
10943 TAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGGAATAGATAATTATACAAAT
65 TA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * *
11008 AGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTT
129 AGTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
11061 A-TTGATTAATTTTCT-AAATATTAATAAATTA
1 ACTT-ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTA
11092 GTAATAATAA
Statistics
Matches: 2005, Mismatches: 455, Indels: 166
0.76 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
174 14 0.01
175 72 0.04
176 186 0.09
177 112 0.06
178 221 0.11
179 124 0.06
180 489 0.24
181 519 0.26
182 259 0.13
183 9 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
ACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACT
AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
TCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
Found at i:10070 original size:357 final size:358
Alignment explanation
Indices: 8370--11094 Score: 2144
Period size: 361 Copynumber: 7.6 Consensus size: 358
8360 AAAAGCTAAC
* ** * * * * * * * *
8370 ACTTAATAATTTTCAAAATA-TAAAAAATTAATTTTATTTTATTCGAACAAACTTATATGAACA-
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAG
* * * * *
8433 AAAGCATTTGTTTTATGACAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCATACAG-
66 AAA-CAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* * * * * * * * * *
8497 CATTTACTATTTGAACAGGTTTGGCAAACA-AATTATTTTTTGAATCTTTTAGTTATTAATTTTC
130 CA-TAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTT
* * * * * * *
8561 ATAATATTATTAGA-TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-TTGTATGAACATAAATAAATGTTT
193 A-AATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTT
* * *
8624 TATGTACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
256 TATG-ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
8689 AAAC-TAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-CTT
320 GAACTTA-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * * * *
8727 ACTCATTAAGTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTCGAATAGGCTTATATG-AT
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTTGTATGAAT
* * * *
8791 GAAAAACAATTGTTTTTTGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
64 -AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * *** * * ** * *
8856 GGCCATAATTATTTGAACTGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTT
127 AGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTT
* * * * * * *
8921 TTAAAATATTAATAAA-GTAATATTATTTTTTTTGAATAAGCTTTTATGAACTA-AAACATTTGT
191 TT-AAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTAT
* * *
8984 TTTATTATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * ** * *
9049 TGAATTTGTTCGGTAAGCATATTTATTTTTTTAAT-TTCTT
319 TGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TT
* * * * * * **
9089 GCTTATTAGTTTTTTG-AATGTTAATAAAATAATATTATTTTATTTCAAATAAGCATT-TACAAA
1 ACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGC-TTGTATGAA
* * * * *
9152 CT-GAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA
63 -TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * ** * *
9216 TATTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTACTTATTAA-T
126 TAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATT
* * * * *
9280 TTTAGAATATT-ATTAGTTTAGCAATATTTTCTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT
190 TTTA-AATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT
* * * *
9344 TTTATGACAAAAC-AAAGATCGTAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
* * *
9408 TGAAC-TAGTTTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAAATC---T
319 TGAACTTA-TTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* **
9445 -CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAATA
* * * * * * ** *
9509 AAAATAATTTTTTTAGGACAAA-ACAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAGAATAATTCAAATGG
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAACA-AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
* * * * * ** *
9573 ACGTGACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAATA-A-TTAATTTCTTAAGTCTCCAACTCATTAA-TT
129 TCATAACTATTTGAAC-TGATTTGGTAAATAGATTTACTTT-TTAAATCT-TTACTTATTAATTT
* * * *
9634 TTATTATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAACTAT
191 TTA-AATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTAT
* * * * *
9698 TTTATGACAAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAGTTATAACTAT
254 TTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
* * *
9763 TTAAACTTACTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
318 TTGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
* * *
9804 ACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATAAGCTTGTATGAATA
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATA
* *
9869 GAAA-AATTGGTTTATGAC-AA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT
65 GAAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT
* ** ** *
9931 CATAA-AATTTTGAACAAATTAAGAAAATAGATTTA-TTTTTAAAT-TTTAACTTATTAATTTTT
130 CATAACTA-TTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTTT-ACTTATTAATTTTT
** *
9993 GAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTTATTCGAAATAAGCTTACATGAATAG-AACTAATTGT
193 -AAATATTAATAAATTTAGTATTA-TTTTATTCG-AATAAGCTTGTATGAATAGAAAC-AATTAT
* * * ** *
10056 TTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTT-TGATAGTCGTAAACTAT
254 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTAT
* * ** * *
10120 TTAAACTTATTTGGTAAATAGATTCCTTTTTT-AGTTTTCTT
318 TTGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TT
* * *** ***
10161 ACTCACTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATAAGCTCACATGAACT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAA-T
* * * * *
10226 -GAAACAATTATTTTATTAGA-AAAGAAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAA
64 AGAAACAATTGTTTTA-T-GACAAA-CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
10289 TAGTCATGACTATTTGAACTTATTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT
126 TAGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTT-TACTTATTAATT
** * * *
10354 GTCAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTA
190 -TTTAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTA
* ** ** * * * * *
10418 TTTTATAACAAGTCAAAAGGTTTTAAAGCTTCT-AAATAGACAATTGTTCAAATTGTAATAACTA
253 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* *
10482 TTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTT
317 TTTGAACTTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCT-TTT
* * * * * *
10525 --TTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGAATTAATTGATTCTAAATAGGCTTGTATGAAC
1 ACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAA-
* * * *
10587 CA-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAT
63 TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT
* * * * * * * *
10651 AGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAAT-TCTTCCTTATTTATTT
127 AGTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTT
* * * *
10715 TTAACTATTATTAAA-TTAGTATTATTTTAGTTCGAATAAGCTTGTACGAACA-AAACAATTATT
191 TTAAATATTAATAAATTTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATT
* * * * * * * * *
10778 TTACGA-GAAA-AAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATAGTTTATATAGTCTTAACTATTT
255 TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
10841 GAACTTGTTTGGCT-ATTAGATTTATTTTTT-AATTTTCTT
320 GAACTTATTCGG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTT-TT
** * ** * * *
10880 GGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-ATTAGTATCAAT
1 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAGCTT-GTATGAAT
* * * * * * * *
10944 AGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTATAATGATTTGGAATAGATAATTATACAAATA
64 AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * *
11009 GTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTT
128 GTCATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCT-TTACTT-ATTAATTT
11073 TCTAAATATTAATAAA-TTAGTA
191 T-TAAATATTAATAAATTTAGTA
11095 ATAATAATTT
Statistics
Matches: 1875, Mismatches: 400, Indels: 184
0.76 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
352 6 0.00
353 40 0.02
354 104 0.06
355 66 0.04
356 165 0.09
357 348 0.19
358 94 0.05
359 167 0.09
360 160 0.09
361 353 0.19
362 206 0.11
363 114 0.06
364 49 0.03
365 3 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (358 bp):
ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAG
AAACAATTGTTTTATGACAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
ATAACTATTTGAACTGATTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAATCTTTACTTATTAATTTTTAAA
TATTAATAAATTTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
ATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTT
Found at i:11173 original size:719 final size:707
Alignment explanation
Indices: 8425--11109 Score: 2017
Period size: 719 Copynumber: 3.7 Consensus size: 707
8415 AACAAACTTA
* * * *
8425 TATGAAC-AAAAGCATTTGTTTTATGAC-AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTA
1 TATGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * * *
8488 TTC-ATACAG-CATTTACTATTTGAAC-AGGTTTGGCAAACAAA-TTATTTTTTGAATCTTTTAG
65 TTCTA-ATAGTC-TTAACAATTTGAACTA-ATTAGGAAAACAAATTTAATTTTT-AA-ATTTTAC
* * * *
8549 TTATTAATTTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTCTGAATAAG-TTGTATGAACATA
125 TTATTTATTTTTA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATGAATA-A
* * * * * * * *
8613 AATAAATGTTTTATGTACAAAACAAAAGGTTATAACGATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGT
187 AACAATTATTTTAAG-A-AAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGT
* * * * * * *
8678 CATAACTATTTAAACTAGTTTGCTAAATAGATTTATTTTTTAA-ATCCTTACTCATTAAGTTTTT
249 CTTAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTTCTT-CTTATTAA-TTTTT
* * ** * *
8742 GAAATATTATTAAATTAGTATCATTTTATTTCGAATAGGCTTA-TATG-ATGAAAAACAATTGTT
312 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA-AATTAGTATGAAT-AGAAACAATTATT
* * ** * * * * *
8805 TTTTGACAAAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT
375 TTATGACAAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTT
*** * * ** * *
8870 GAAC-TGATTCAATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCAATTTT-TAAAATATTAA
439 GAACTTG-TTTGGTAAA-TAATTTAATTTTTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTCT-AAATATTAA
* * * * * * * * * * * ** *
8933 TAAAGTAATATTATTTTTTTTGA-ATA-AGCTTTTATGAACTA-AAACATTTGTTTTATTATAAA
500 TAAATTAGTAATA-ATTATTTCACATATAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTA--ACCAG
* * * * *
8995 ACAAAAGGTCATAATGATTT-TAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTT
561 TCAAAA--T-AGAATTATTTCTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTT
* ** * * * * * *
9059 CGGTAAGCATATTTATTTTTTTAATTTCTTGCTTATTAGTTTTTTGAATGTTAATAAAATA-ATA
623 CGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-TTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGA-A
9123 TTATTTTATTTCAAATAAGCATT-
686 TTATTTTATTT-AAATAAGC-TTG
** * * * *
9146 TACAAACTGAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAAGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGT
1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * ** * * *
9211 TCTAATATTCTTAACTATTTGAACTGGTT-CGACAAACACATTTACTTTTTAAATCTATTACTTA
66 TCTAATAGTCTTAACAATTTGAACTAATTAGGA-AAACAAATTTAATTTTTAAAT-T-TTACTTA
* ** * * *
9275 -TTAATTTTAGAATATTATTAGTTTAGCAATATTTTCTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACA
128 TTTATTTTTA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATA-AAACA
* * * * * * *
9339 ATTATTTTATGACAAAACAAAGATCGTAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC
191 ATTATTTTAAGA-AAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAAC
* * * * *
9404 AATTTGAACTAGTTTGGTCAATAGATTTAGTTTTTAA--ATC-TCTTATTAATTTTTGAAATATT
255 TATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATT
* * * * * * * *
9466 AATAAATAAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAATAAAAATAATTTTTTTAGGACAAA
320 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAA
* * * * * * * *
9531 ACAAATGTCATAACGATTTGAAATAGAGAATAATTCAAATGGACGTGACTATTTGAACTTGTTTG
385 AAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTG
* ** * * * *
9596 GTAAATAA-TTAATTTCTTAAGTCTCCAACTCATTAATTTTAT-TATATTAATAAATTAGTATTA
450 GTAAATAATTTAATTT-TTAAATCTCTTA-TTATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATA
* * * * * * ** *
9659 TTTTATTCCAAATA-AACTTGTATGAATAGAAACAACTATTTTATGACAAAAACAAAAGTTTATA
513 -ATTATTTCACATATAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTA--AC-CAGTCAAAA---TAGA
* * * * * * **
9723 ATGATTT-GAAATAAATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTTACTCGATAAATAGATT
571 ATTATTTCTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATT
* * * * *
9787 TATTTTTTAAATCT-TTTACTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTATG
636 TATTTTTTAAATCTCTTT--TTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGAATTATTTTATT-TA
9851 AATAAGCTTG
698 AATAAGCTTG
* *
9861 TATGAA-TAGAAA-AATTGGTTTATGAC--AA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * *
9921 TT-TAAATAGTCATAA-AATTTTGAACAAATTAAGAAAATAGATTT-ATTTTTAAATTTTAACTT
65 TTCT-AATAGTCTTAACAA-TTTGAACTAATTAGGAAAACAAATTTAATTTTTAAATTTT-ACTT
* * ** *
9983 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTTATTCGAAATAAGCTTACATGAATAGA
127 ATTTATTTTT-AAATATTATTAAA-TTAGTATTA-TTTTATTCG-AATAAGCTTGTATGAATAAA
* * *
10047 ACTAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTT-GATAGTC
188 AC-AATTATTTTAAGA-AAAA-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTC
* * * ** * * *
10111 GTAAACTATTTAAACTTATTTGGTAAATAGATTCCTTTTTTAGTTTTCTTACTCACTAATTTTTG
250 -TTAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTTCTT-CTTATTAATTTTTG
* * * * * *
10176 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATAAGCTCA-CATGAACT-GAAACAATTATTT
313 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-ATTAGTATGAA-TAGAAACAATTATTT
*
10239 TATTAGA-AAAGAAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATT
376 TA-T-GACAAA-AAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATT
* * * * * * *
10303 TGAACTTATTCGGCAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TCTACTTATTAATTGTCAAAATATTAA
438 TGAACTTGTTTGGTAAATA-ATTTAATTTTTAAATCTCT-TA-TTATTAATTTTCTAAATATTAA
* * * * * *
10367 TAAATT--TATATTATTTTATTCA-AAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTATTTTATAACAA
500 TAAATTAGTA-ATAATTAT-TTCACATATAA-CTTGTATAAATAGAAACAATTA-TTT-TAACCA
* ** * * *
10429 GTCAAAA-GGTTTTAAAGCTTCTAAATAGACAATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGT
560 GTCAAAATAGAATT--A-TTTCTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGT
10493 TCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGAAT
622 TCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGAAT
* * *
10558 TAATTGATTCTAAATAGGCTTG
687 TATTTTATT-TAAATAAGCTTG
* * *
10580 TATGAACCAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGT
1 TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
10645 TCTAATAGTCTTAACCATTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATTCTTCCTTATT
66 TCTAATAGTCTTAACAATTTGAACTAATTAGGAAAACAAATTTAATTTTTAAATT-TTACTTATT
* * *
10710 TATTTTTAACTATTATTAAATTAGTATTATTTTAGTTCGAATAAGCTTGTACGAACAAAACAATT
130 TATTTTTAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATT
* * * * * * *
10775 ATTTTACGAGAAAAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATAGTTTATATAGTCTTAACTATT
194 ATTTTAAGAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATT
* * * ** *
10840 TGAACTTGTTTGGCT-ATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTAT
259 TGAACTTGTTTGG-TAAATAGATTTATTTTTTAATTTTCTT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAA
* * * *
10904 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTAGTATCAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAAT
322 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAA-
* * * ** * *
10969 AAAAGGTTATAATGATTTGGAATAGATAATTATACAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGG
386 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGG
*
11034 TAAATAGATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAA
451 TAAATA-ATTTAATTTTTAAATCTCTTATT-ATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAA
* *
11099 TAATTTGACAT
514 TTATTTCACAT
11110 TGATAATTGT
Statistics
Matches: 1564, Mismatches: 317, Indels: 168
0.76 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
708 2 0.00
709 6 0.00
710 29 0.02
711 73 0.05
712 41 0.03
713 94 0.06
714 61 0.04
715 182 0.12
716 68 0.04
717 75 0.05
718 118 0.08
719 260 0.17
720 193 0.12
721 86 0.05
722 149 0.10
723 100 0.06
724 25 0.02
725 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (707 bp):
TATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGT
TCTAATAGTCTTAACAATTTGAACTAATTAGGAAAACAAATTTAATTTTTAAATTTTACTTATTT
ATTTTTAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAACAATTAT
TTTAAGAAAAAAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTG
AACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAATTTTCTTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAATTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAAAAAG
GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAAT
AATTTAATTTTTAAATCTCTTATTATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATTATTTC
ACATATAACTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTAACCAGTCAAAATAGAATTATTTCTAAATAG
ATAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC
TTTTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGAATTATTTTATTTAAATAAGCTTG
Found at i:11702 original size:649 final size:649
Alignment explanation
Indices: 10459--11712 Score: 1337
Period size: 649 Copynumber: 1.9 Consensus size: 649
10449 CTAAATAGAC
* ** * *
10459 AATTGTTCAAATTGTAATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT
1 AATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACCGGTTCGATAAATAGAATTATTTTCTAAATCTC-T
* * * *
10524 TTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGAATTAATTGATTCTAAATAGGCTTGTATGAACCA
65 TTTATTAAATTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTAATTGATTCCAAATAAGC-TGTATGAACCA
** * *
10589 AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGT
129 AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGT
* * * * * *
10654 CTTAACCATTTGAACTAATTTGGTAAACAAATTTAATTTTTAAATTCTTCCTTATTTATTTTTAA
194 CTTAACCATTTGAACTAAGTT-GCAAAAAAATTTAATTTTTAAATTCTTACTTATTAACTTTTAA
* * * * *
10719 CTATTATTAAATTAGTATTATTTTAGTTCGAATAAGCTTGTACGAACAAAACAATTATTTTACGA
258 CTACTACTAAATTAGTATTATTTTAGTTCGAAGAAGCCTATACGAACAAAACAATTATTTTACGA
* * * * *
10784 GAAAAAAAGGTCATAACGATTTAAAATAAATAATAGTTTATATAGTCTTAACTATTTGAACTTGT
323 GAAAAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGT
** * * * *
10849 TTGGCTATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATTAAATTAGTA
388 TTGGCTAACAGATTTACTTTTTAAATATC---GTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAATTAGTA
* * *
10914 TTATTTTATTTCGAATAAATTAGTATCAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAAGGTTAT
450 TTATTTTATTTCGAATAAATTAGTATCAATAGAAACAATTGTTTGAAGACAAAATAAAAGGTAAT
** * * *
10979 AATGATTTGGAATAGATAATTATACAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTGGTAAATAGATT
515 AAAAATTTGAAATAGATAATTATACAAATAGGCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGTAAATAGATT
*
11044 TACTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATAATTTGACA
580 TACTTTTTAAATCCCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATAATTTGACA
11109 TTGAT
645 TTGAT
* * *
11114 AATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACCGGTTTGATAAATAGAATTATTTTCTAAATC-C-T
1 AATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACCGGTTCGATAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTT
* * * *
11177 TTA-TAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TTTTATTCTATTCCGAATAAG-TGTAT-ATAGC
66 TTATTAAATTTTTG-AATATTAATAAATTAGAATTAATT-GATTCCAAATAAGCTGTATGA-A-C
* * *
11238 TAAAATAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTC-ATA
127 CAAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTA-A
** * *
11301 TAGTCTTAACTGTTTGAACT-AGTT-CAACAAAAATTTATTTTTTAAAATTTCTTAGTTATTAAC
190 TAGTCTTAACCATTTGAACTAAGTTGCAA-AAAAATTTAATTTTT-AAA-TTCTTACTTATTAAC
* * * * * *
11364 TTTTAGA-TACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAGAAGCCTATATGAATAGAAATAATTG
252 TTTTA-ACTACTACTAAATTAGTATTATTTTAGTTCGAAGAAGCCTATACGAACA-AAACAATTA
* * *
11428 TTTTACGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTT-AAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCATAACTA
315 TTTTACG--AGAAAAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAA-TAGTTCAAATAGTCATAACTA
* * **
11491 TTTTAACTAGTTTGG-TAAACATATTTACTTTTTAAATATC-TTATTAA-TTCTTGAAATATTAA
377 TTTGAACTAGTTTGGCT-AACAGATTTACTTTTTAAATATCGTTATTAAGTT-TCAAAATATTAA
* * ** * *
11553 TAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTAT-GTTGGAAAACAATTGTTTTAAGACAAA
440 TAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA-ATTAGTATCAATAG-AAACAATTGTTTGAAGACAAA
* * * * * * *
11616 ATAGAAA-GTAATAAAAATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAAT-GGCCATACTTATTTGAACT-GT
503 ATA-AAAGGTAATAAAAATTTGAAATAGATAATTATACAAATAGGCAAAAC-TATTTGAAATGGT
*
11678 TTCAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATCCCTTATT
566 TT-AGTAAA-TAGATTTACTTTTTAAATCCCTTATT
11713 AACTTTGAAA
Statistics
Matches: 492, Mismatches: 85, Indels: 50
0.78 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
648 15 0.03
649 144 0.29
650 20 0.04
651 139 0.28
652 44 0.09
653 54 0.11
654 23 0.05
655 53 0.11
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.11, T:0.42
Consensus pattern (649 bp):
AATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACCGGTTCGATAAATAGAATTATTTTCTAAATCTCTT
TTATTAAATTTTTGAATATTAATAAATTAGAATTAATTGATTCCAAATAAGCTGTATGAACCAAA
ACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAACAATTTGAAATAAATAATTATTCTAATAGTCT
TAACCATTTGAACTAAGTTGCAAAAAAATTTAATTTTTAAATTCTTACTTATTAACTTTTAACTA
CTACTAAATTAGTATTATTTTAGTTCGAAGAAGCCTATACGAACAAAACAATTATTTTACGAGAA
AAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAAATAATAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTG
GCTAACAGATTTACTTTTTAAATATCGTTATTAAGTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
TATTTCGAATAAATTAGTATCAATAGAAACAATTGTTTGAAGACAAAATAAAAGGTAATAAAAAT
TTGAAATAGATAATTATACAAATAGGCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGTAAATAGATTTACTTT
TTAAATCCCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTAATAATAATTTGACATTGAT
Found at i:12362 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 11095--14923 Score: 2699
Period size: 181 Copynumber: 21.4 Consensus size: 181
11085 TAAATTAGTA
* * * * * * * * *
11095 ATAATAATTTGACATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACCGGTTTGATAAATAGA
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
* * * * * **
11160 ATTATTTTCTAAATC-C-T--TTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCC
66 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* *
11221 GAATAAG--TGTAT-ATAGCTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTC
131 GAATAAGCTTGTATGA-A-CTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * ***
11271 ATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTTCAACAAA-A-A
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
* * * * * *
11334 TTTATTTTTTAAAATTTCTTAGTTATTAACTTTT-AGATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTT
66 TTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
11398 TGAAGAAGCCTATATGAA-TAGAAATAATTGTTTTACGATAGAACAAAAGGTT
130 TGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * *
11450 ATAACAATTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTAGTTTGGTAAACATA
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
* * * * *
11514 TTTACTTTTTAAA--T-AT-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTC
66 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
**** * * *
11575 GAATAAGCTTGTATGTTGGAAAACAATTGTTTTAAGACAAAATAGAAA-GTA
131 GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTC
* * * * * * * *
11626 ATAAAAATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCAT-ACTTATTTGAACTGTTTCAGTAAACTG
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
* * *
11690 ATTTATTTTTTAAATC-C---CTTATTAA-CTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTT
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * * *
11749 GGGATAAGCTTATATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGATAAAGCAAAAGGTC
130 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
11801 ATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTGTTTAAACTGATTTGGCAAACAGA
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
* * * *
11865 TTTA-TTTTTAAATCTC-TAGTTATTAATTTTTGGAATATTACT-AATTAGTATTATTTTATTCT
66 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
* * * * * * *
11927 GAATTAGC-TGTAT-AAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTT
131 GAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
11977 ATAACAATTTGAAATTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTGAACTGGTTTGGTAAACAA
1 ATAAGAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
*
12041 ATTTATTTTTT--A--TC-T-CTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATT
* * **** * *
12100 TCGAATAAGTTTGTATGTTGAAAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGT-
129 TTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* ** * * * ** * *
12152 AGTAACG-ATTTGAGATACG-TAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAAT
1 A-TAA-GAATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAAC
* *
12215 TGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAAT-AATGTAGTATTATTTTA
63 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTA
* * *
12279 TTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
127 TTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* ** ** *
12334 ATAAGAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGA
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
* * * *
12399 TTTAATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAATATTATTTTA-T
66 TTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * * * *
12462 TCCAATTAAGCTTGTATAAACTGAAATAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTC
129 TTGAA-TAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * ** * * * * **
12516 AAAATG-ATTTGAAATAGATAATTATTTTAGTAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCGACAAAC--
1 ATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
* * * * *
12578 ATATATTTTTTAAA--TCTT--TTATCAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TAT
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-T
* * * * * *
12638 CTAAAAAAGCTTGTATG-ATTAGAAACAATTGTTTTATGA-GAAAC-TAAGGATC
129 TTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TC
** * * * * * * ** * *
12690 ATAACTATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATTACTATGTGAATTGGTTCGAAAAATAGC
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
* * * *
12755 TTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTTTTTTTATTT
66 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTT
* * * * * *
12820 TGGATAAGTTTTTATGATCTAAAACAAATGTTTTATGACAAAATAAAAGGTC
130 TGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * *
12872 ATAACGACTTT-ACATTGATAATTATTTAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAGCA
1 ATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTCGGTAAACA
* * * * * * * *
12935 -A--T-TTTTTT-AATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACTATTGTTGTCTT
64 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *** *
12995 TTGAATAAACTTGTATGAACTGAAATAATTATTTTATGACTTTACAAAAGGTT
129 TTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
13048 AGAATG-ATTTGAAATAAATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGGCAAACAC
1 ATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
* * * *
13112 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAATA-TATTTTAAT
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
13176 CTGAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAAC-ATTTTTTTATGACAAAA-TAAAGATC
129 TTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * * ** * *
13227 ATAATG-ATTTGAGATAGACAATTATTTAAATAGTCACAACTGTTTAAAATGTTTCCATAAATAA
1 ATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
* ** * * *
13291 ATTTA-GTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTC
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* ** * ** *
13351 TAAATAATTTTGCACAAAC-AGAAACAATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGGC
130 TGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * *
13404 ATAATG-ATTTCAAATAGATAACTGTTCAAATGGAT-ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATA
1 ATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACA
* * *
13467 AATTTATTTTTTAAATCTCCTA-TCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTA
64 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACT-TATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* *
13530 TTCCT-AATAAACTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
127 TT-TTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
** * * * * * * *
13585 ATAATTATTTTAAATAAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGCTCGATAAAC-G
1 ATAAGAATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
* * *
13649 AATTTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTTTTG-AATATTAATAAACTAGTATTATTTTATT
65 -ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
** * * * * *
13712 TCAAATATGCTTATAT-AAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTC
129 TTGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * *
13765 ATAA-ATATTTAAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTC---ATA-A
1 ATAAGA-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGGTAAACA
* * * * * *
13824 GACTTATATTTTTAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTGTATTATTTTAC
64 GATTTAT-TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
** * * * *
13888 TTAAAATAAACTTGTATGAA-TGGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTT
128 TTTGAATAAGCTTGTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
13943 AT-AGCAATTTGATATAGATAACTATTCAAACAGTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGGTAAACAA
1 ATAAG-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
* * * *
14007 ATTCATTTTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTT
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * *
14072 T-AGATAAGCTTGTA-CAAATAGAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAGGGCC
130 TGA-ATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
14124 ATAACG-ATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGCACTGG-TCAGGCT-AAC
1 ATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GG-TAAAC
* * * * *
14186 AAATTTATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAATTTTT-AGATTGTTAATAAATTAGCATTACTTT
63 AGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTT
*** * * * * *
14249 ATTCCAAACAAGAC-TGTATGAA-TAGAAACAATTCTTTAATGACGAAACAAATGGTC
126 ATTTTGAATAAG-CTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * *
14305 ATCACG-ATTTGAAGTAAATAATGGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGCTT-AGTAAACA
1 AT-AAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTCGGTAAACA
* * ** *
14368 AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
64 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
*** * * * *
14433 CCAAATAAACTTATATGAA-TAAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTA
129 TTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * **
14486 ATAATG-ATTTGAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAACTAGTTCGACAAACA
1 ATAA-GAATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACA
* * * * *
14549 AAATTA-TTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTTGCATTATTAATAAAATTA-TTTTATTTTAT
64 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * * *
14608 TCTAAATAAG-TTATTAAGAATTGATAA-AATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTC
128 TTTGAATAAGCTT-GTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * * * * * *
14662 CTAATG-ATTTAAAATAAAAAATTATTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAC
1 ATAA-GAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAG
* * *
14726 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTACAA-TAGTATTATTTTAT
65 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * *
14789 TTTGAATAAACTTTTATAAACAAAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAAGTT
128 TTTGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * * *** *
14843 ATAACAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTAGTTTAATAAATAGA
1 ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
*
14908 TTTATTTTTTACATCT
66 TTTATTTTTTAAATCT
14924 TGTTAGATTA
Statistics
Matches: 2876, Mismatches: 617, Indels: 315
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
173 52 0.02
174 168 0.06
175 159 0.06
176 521 0.18
177 286 0.10
178 203 0.07
179 157 0.05
180 190 0.07
181 726 0.25
182 394 0.14
183 20 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATAAGAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGA
TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
GAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
Found at i:12666 original size:357 final size:353
Alignment explanation
Indices: 11101--14916 Score: 2482
Period size: 357 Copynumber: 10.7 Consensus size: 353
11091 AGTAATAATA
* * * * * ** * * *
11101 ATTTGACATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACCGGTTTGATAAATAGAATTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACA-TA-TATT
* * * * * **
11166 TTCTAAATCCT-TTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCGAATAAG--
64 TTTTAAATCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCT
* * * * *
11228 TGTATATAGCTA-AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
129 TGTATA-A-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGATAA
* * * * * ** *
11292 TTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAACTAGTTCAACAAA-A-ATTTATTTTTTAAAATTTCTTA
192 TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTT-AAATCTCTT-
* * * * * * * * *
11355 GTTATTAACTTTTAG-ATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAGAAGCCTATATGAATAG
254 CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAAT-G
* * * * * *
11419 AAATAATTGTTTTACGATAGAACAAAAGGTTATAACA
317 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * *
11456 ATTT-AAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTTAACTAGTTTGGTAAACATATTTACT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATA--TATT
* * * * *
11520 TTTTAAAT-ATCTTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATT-TCGAATAAGC
64 TTTTAAATCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGC
** * * * * * *
11583 TTGTAT-GTTGGAAAACAATTGTTTTAAGACAAAATAGAAA-GTAATAAAAATTTGAAATAGGTA
128 TTGTATAAATAG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACA-AAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGATA
* * *
11646 GTTGTTCAAATGGCCAT-ACTTATTTGAAC-TGTTTCAGTAAACT-GATTTATTTTTTAAATC-C
191 ATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTG-TTCAGTAAA-TAGATTTA-TTTTTAAATCTC
* * * * * * * *
11707 --CTTATTAA--CTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTTTTGGGATAAGCTTATATGAGC
252 TTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGA-A
* * * *
11768 TGAAATAATTGTTTTATGATAAAGCAAAAGGTCATAA-A
315 TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * ** * *
11806 ATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCATAACTGTTTAAACT-GATTTGGCAAACAGATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACATATAT-T
* * * *
11870 TTTTAAATCTCTAGTTATTAATTTTTGGAATATTACT-AATTAGTATTATTTTATTCTGAATTAG
64 TTTTAAATCT-TA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG
* * * * * *
11934 C-TGTATAAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATTAGATA
127 CTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAA-TAGATA
* ** * * *
11998 ATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTT---TATC-TCT
191 ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTCT
* * *
12058 TATTAA-TTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGTTTGTATG-TTGA
256 TATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAATG-
* *
12121 AAAACAATTGTTTTAAGACAAAACAAAAAGT-AGTAACG
317 -AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCA-TAACG
* ** * * * * * * * * *
12159 ATTTGAGATACG-TAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTAT
1 ATTTGAAATA-GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAA--CATATAT
* * **
12223 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAAT-AATGTAGTATTATTTTATTTTGGAT
63 TTTTTAAA--TCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * * *
12287 AAGCTTTTATGAACTA-AAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTAAAATAG
124 AAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAG
* *
12351 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTAATTTTTCAAATCT
188 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTT-ATTTTT-AAATCT
* * * *
12416 CTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAATTAAGCTTGTATAA
251 CTT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAA-TAAGCTTGTATGA
* * * * * *
12481 ACTGAAATAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATG
314 A-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
** * * * *
12522 ATTTGAAATAGATAATTATTTTAGTAGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCGACAAACATATATTTT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATATTTT
* * * * *
12587 TTAAATCTT-TTATCAATTTTTGGAATATTATTAAATTAATATTATTTT-TATCTAAAAAAGCTT
66 TTAAATCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCTAAATAAGCTT
* * * * ** * * *
12650 GTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGA-GAAAC-TAAGGATCATAACTATTTGAGATTGATATTT
130 GTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAAGAATTTGAAATAGATAATT
* * * *
12713 GTTCAAATAGTCATTACTATGTGAA-TTGGTTC-GAAAAATAGCTTTAGTTTTTAAATCTCTTAC
194 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAG-TAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTCTT-C
* * * * * * * *
12776 TTATTAA-TTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTTTTTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGATCT
255 TTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAATTAGTA-TTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGA-AT
* * *
12840 AAAACAAATGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACG
316 GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * *
12878 ACTTT-ACATTGATAATTATTTAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTC-AGTAAGCA-AT-T
1 A-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTAGTTCGA-TAAACATATAT
* * * * * * * * * * *
12938 TTTTTAATCTCTTGCTCATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTACTATTGTTGTCTTTTGAATAA
63 TTTTTAA-ATCTT-ATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
* * * * *** * * *
13003 ACTTGTATGAACT-GAAATAATTATTTTATGACTTTACAAAAGGTTAGAATG-ATTTGAAATAAA
126 GCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATAGA
* * * * * *
13066 TAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-TTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTC
189 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCTC
* * *
13130 TTACTTATTAATTTTTTGGAATATTATTAAATTAATA-TATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGA
252 TT-CTTATTAATTTTTT-GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATG-
* * * * *
13194 AAAGAAAC-ATTTTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAATG
313 AATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * * *
13233 ATTTGAGATAGACAATTATTTAAATAGTCACAACTGTTTAAAAT-GTTTCCATAAATAAAT-TTA
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAACATATATT-
* ** * * **
13296 GTTTTAAATC-TCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGATCAGTATTATTTTATTCTAAATAATT
64 -TTTTAAATCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGC
* * * * *
13360 TTGCACAAACAGAAACAATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGGCATAATG-ATTTCAAATAGATA
128 TTGTATAAATAGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATAGATA
* * * *
13424 ACTGTTCAAATGGAT-ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCCT
191 ATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAATCT-CT
* * * *
13488 ATC-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCCTAATAAACTTGTATGAAT
253 -TCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTATGAAT
**
13552 AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATT
316 -GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * *
13591 ATTTTAAATAAAACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAATTGCTCGATAAACGA-ATTTA
1 ATTTGAAAT-AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAAC-ATATAT-
* *
13655 TTTTTAAATCTTTTACTTATCAATTTTTG-AATATTAATAAACTAGTATTATTTTATT-TCAAAT
63 TTTTTAAATC--TTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAAT
* * * * *
13718 ATGCTTATATAAATAGAAAAAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-ATATTTAAAATAG
124 AAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGA-ATTTGAAATAG
*
13782 ATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTCA-T--A-AGACTTATATTTTTAAAT-
188 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAATAGA-TT-TATTTTTAAATC
* * * * ** *
13841 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTGTATTATTTTACTTAAAATAAACTTGTATG
250 TCTT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * *
13906 AATGGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAGCA
313 AAT-G-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * *
13949 ATTTGATATAGATAACTATTCAAACAGTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTCATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATA-T-ATT
* * * *
14014 TTTTAAACCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTAGATAA
64 TTTTAAA--TCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAA
* * * * *
14079 GCTTGTACAAATAGAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAGGGCCATAACG-ATTTGAAATAGAT
126 GCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATAGAT
* * * * *
14143 AATTATTCAAACAATCATAACTATTTGCAC-TGGTCAGGCTAACA-A-ATTTATTTTTTAAATC-
190 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-G-TAA-ATAGATTTA-TTTTTAAATCT
* * * * * * *
14204 CATTACTTATTAATTTTTAGATTGTTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAACAAGAC-TGTAT
251 C-TT-CTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAG-CTTGTAT
* * * * *
14268 GAATAGAAACAATTCTTTAATGACGAAACAAATGGTCATCACG
312 GAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * ** * * * * *
14311 ATTTGAAGTAAATAATGGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGCTTAG-TAAACAAATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTCGATAAAC--ATATAT
* ** * *
14375 TTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAATA
63 TTTTTAAA--TCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATA
* * * * *
14440 AACTTATATGAATA-AAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATG-ATTTGAAATA-
125 AGCTTGTATAAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATAG
* * * * * * *
14502 AGTAATTGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAACTAGTTC-GACAAACAAAATTATTTTTAAA--T
188 A-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAATAGATTTATTTTTAAATCT
* * * * * *
14564 C-TCTTACTAA-TTTTTGCATTATTAATAAAATTA-TTTTATTTTATTCTAAATAAG-TTATTAA
251 CTTCTTATTAATTTTTTG-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTT-GTAT
* * * * *
14625 GAATTGATAA-AATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTCCTAATG
312 GAA-TGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * * * * *
14668 ATTTAAAATAAAAAATTATTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACACATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGAT-AA-ACATATATT
* * * *
14733 TTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCATAATATTATTACAA-TAGTATTATTTTATTTTGAAT
64 TTTTAAA--TCTTA-TTATTAATTTTTGA-AATATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTCTAAAT
* * * * * * * * * *
14796 AAACTTTTATAAACAAAAATAATTGTTTTATGACATAACAAAAAGTTATAACAATTTGAAATATA
124 AAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGA
* * * *
14861 TAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTAGTTTAATAAATAGATTTATTTTT
189 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTT
14917 TACATCTTGT
Statistics
Matches: 2735, Mismatches: 554, Indels: 342
0.75 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
347 1 0.00
348 1 0.00
349 9 0.00
350 51 0.02
351 153 0.06
352 119 0.04
353 67 0.02
354 130 0.05
355 264 0.10
356 379 0.14
357 584 0.21
358 220 0.08
359 187 0.07
360 12 0.00
361 102 0.04
362 267 0.10
363 150 0.05
364 32 0.01
365 7 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (353 bp):
ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGATAAACATATATTTT
TTAAATCTTATTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTG
TATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAATCTCTTCTTATTA
ATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTG
TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
Found at i:12845 original size:538 final size:530
Alignment explanation
Indices: 11101--14916 Score: 2510
Period size: 538 Copynumber: 7.1 Consensus size: 530
11091 AGTAATAATA
* * * * * * * *
11101 ATTTGACATTGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACCGGTTTGATAAATAGAATTATT
1 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAATAGATTTATT
* * * * **
11166 TTCTAAATC-CT-TTATAAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATTCCGAATAAG-
66 TT-TAAATCTCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC
* * * * * *
11228 TGTATAT-AGCTAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAA
130 T-TTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGATAA
* * * ** *
11292 TTATTCATATAGTCTTAACTGTTTGAAC-TAGTTCAACAAA-AATTTATTTTTTAAAATTTCTTA
194 TTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAGTAAACAATTTA-TTTTT-AAATCTCTT-
* * * * * * * *
11355 G-TTATTAACTTTTAG-ATACTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAGAAGCCTATATGAATA
255 GCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATAAATA
* * * *
11418 GAAATAATTGTTTTACGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTT-AAATAGATAATTATTCAAATAG
319 GAAATAATTATTTTATGATA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* * * * * * *
11482 TCATAACTATTTTAACTAGTTTGGTAAACATATTTACTTTTTAAATATCTTATTAATTCTTGAAA
383 TCATAACTATTTAAACTAGTTCGGTAAACATA--TATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGGAA
* * *
11547 TATTAATAAATTAGTTTTA-TTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-TTGGAAAACAATTGTTTTAA
446 TATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATTAG-AAACAATTGTTTTAT
* * *
11610 GACAAAA-T-AGAAAGTAATAAAA
510 GA-AAAACTAAG-GA-TCATAAAT
* * * * * * * *
11632 ATTTGAAATAGGTAGTTGTTCAAATGGCCAT-ACTTATTTGAACTGTTTCAGTAAACT-GATTTA
1 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTC-GAAAAATAGATTTA
* * * *
11695 TTTTTTAAATC-C-CTTATTAA-CTTTGAAATATTAATAAAGTAATATTATTTT-TTTGGGATAA
64 -TTTTTAAATCTCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
* * * * * * *
11756 GCTTATATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGATAAAGCAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATA
128 GCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGATA
* * * * * ** * *
11820 ATTGTTCATATAGTCATAACTGTTTAAACTGATTTGGCAAACAGATTTATTTTTAAATCTCTAG-
193 ATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACA-ATTTATTTTTAAATCTCTTGC
* * *
11884 TTATTAATTTTTGGAATATTACT-AATTAGTATTATTTTATTCTGAATTAGC-TGTATAAATAGA
257 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTGTATAAATAGA
* * *
11947 AATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATTAGATAATTGTTCAAATAGT
321 AATAATTATTTTATGATA-AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA-TAGATAATTATTCAAATAGT
* * * * * * *
12012 CATAACTA-TTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTT--ATCTCTTATTAATTCTTGAAAT
384 CATAACTATTTAAACTAGTTCGGTAAAC--ATATATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGGAAT
* * *
12074 ATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGTTTGTATG-TTGAAAAACAATTGTTTTAAG
447 ATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATT-AGAAACAATTGTTTTATG
** **
12138 ACAAAAC-AAAAAGT-AGTAACG
511 A-AAAACTAAGGA-TCA-TAAAT
** * * * ** * ** *
12159 ATTTGAGATACG-TAGCTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAACTATTTTGGTAAATTGATTTAT
1 ATTTGAGATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAATAGATTTA-
* * *
12223 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATTAATAATGTAGTATTATTTTATTTTGGATA
64 TTTTTAAATCTC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* *
12288 AGCTTTTATGAACTAAAACAATGGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTAAAATAGAT
127 AGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGAT
* * *
12353 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTTAGTAAATAGATTTAATTTTTCAAATCTCT
192 AATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACA-ATTT-ATTTTT-AAATCTCT
* * * *
12418 TGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAATTAAGCTTGTATAAAC
254 TGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAA-TAAGCTTGTATAAA-
* * * ** *
12483 T-GAAATAATTATTATATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTTTAGT
317 TAGAAATAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* ** *
12547 AGTCTTAACTATTTAAACTAGTTCGACAAACATATATTTTTTAAATCTTTTATCAATTTTTGGAA
381 AGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGTAAACATATATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGGAA
* * * * *
12612 TATTATTAAATTAATATTATTTTTATCT-AAAAAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATG
446 TATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATG
* *
12676 AGAAACTAAGGATCATAACT
511 AAAAACTAAGGATCATAAAT
* * * * * *
12696 ATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTCATTACTATGTGAATTGGTTCGAAAAATAGCTTTAGT
1 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAATAGATTTA-T
* * *
12761 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAAGTAGTATTTTTTTTATTTTGGATA
65 TTTTAAATCTC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTA-TTATTTTATTTTGAATA
* * * * * * *
12826 AGTTTTTATGATCTAAAACAAATGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAACGACTTT-ACATTGA
127 AGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATAGA
* * *
12890 TAATTATTTAAATAGTCA-AATCTATTTGAACTTGTTCAGTAAGCAA-TT-TTTTT-AATCTCTT
191 TAATTATTCAAATAGTCATAA-CTATTTGAACTTATTCAGTAAACAATTTATTTTTAAATCTCTT
* * * * * *
12951 GCTCATTAATTTTTCA-AATGTTAATAAATTACTATTGTTGTCT-TTTGAATAAACTTGTATGAA
255 GCTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATT-T-TATTCGAATAAGCTTGTAT-AA
* ** * * * * * *
13014 CT-GAAATAATTATTTTATGACTTTACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCTAA
316 ATAGAAATAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAA
* * * * * *
13078 TAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
380 TAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGG-TAA-ACATATATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAA-T
* * * * **
13143 TTTTGGAATATTATTAAATTAATA-TATTTTAATCT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAAC-ATT
438 TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATT
* *
13205 TTTTTATGACAAAA-TAAAGATCAT-AAT
503 GTTTTATGA-AAAACTAAGGATCATAAAT
* * * * * * * * * * * *
13232 GATTTGAGATAGACAATTATTTAAATAGTCACAACTGTTTAAAATGTTTCCATAAATAAATTTAG
1 -ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAATAGATTTAT
** * * *
13297 TTTTAAA--TCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAGA-TCAGTATTATTTTATTCTAAATAA-
65 TTTTAAATCTCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGT-AGTATTATTTTATTTTGAATAAG
** * *
13358 -TTTTGCACAAAC-AGAAACAATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGGCATAATG-ATTTCAAATA
129 CTTTT--ATGAACTA-AAACAA-TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAATA
* * * * * *
13420 GATAACTGTTCAAATGGAT-ATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATC
189 GATAATTATTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAA-CAATTTA-TTTTTAAATC
* * *
13484 TCCTAT-C-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTTTTTTATTCCTAATAAACTTGTA
251 T-CT-TGCTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAATAAGCTTGTA
* * * * ** * * * *
13547 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTTAAATAAAACAATTGTT
313 TAAATAGAAATAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTATT
* * * *
13612 CAAATAGTCATAACTATTTGAAA-TTGCTCGATAAACGA-ATTTATTTTTAAATCTTTTACTTAT
376 CAAATAGTCATAACTATTT-AAACTAGTTCGGTAAAC-ATATAT-TTTTTAAATCTTTTA--T-T
* * * * * * *
13675 CAATTTTT-GAATATTAATAAACTAGTATTA-TTTTATTTCAAATATGCTTATATAAATAGAAAA
435 -AATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAAC
* *
13738 AATTGGTTTATGACAAAACAAAAGG-TCATAAAT
499 AATTGTTTTATGA-AAAAC-TAAGGATCATAAAT
* * * *
13771 ATTTAAAATAGATAATTGATCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TGTGTTC---ATA-AGACTTAT
1 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGAAAAATAGA-TT-T
* * * * * * * **
13831 ATTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAACAAATTTGTATTATTTTACTTAAAATA
63 ATTTTTAAATCTCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * * *
13896 AACTTGTATGAA-TGGAAAAAAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTTAT-AGCAATTTGATATA
127 AGCTTTTATGAACT--AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAG-AATTTGAAATA
* * * * * * *
13959 GATAACTATTCAAACAGTCATAACTAGTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTCATTTTTTAAACCT
189 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAAC-AATTTA-TTTTTAAATCT
* * * ** *
14024 CTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGAATTATCTTATTTTAGATAAGCTTGTACA
252 CTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-ATAAGCTTGTATA
* * * * *
14088 AATAGAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAGGGCCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
315 AATAGAAATAATTATTTTATGAT-AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * ** * * *
14153 ACAATCATAACTATTTGCACT-GGTCAGGCTAACAAATTTATTTTTTAAATCCATTACTTATTAA
379 ATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTC-GG-TAA-ACATATATTTTTTAAAT-C-TT--TTATTAA
* * * * * * * * *
14217 TTTTTAGATTGTTAATAAATTAGCATTA-CTTTATTCCAAACAAGAC-TGTATGAATAGAAACAA
437 TTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAG-CTTGTATGATTAGAAACAA
* * * * * **
14280 TTCTTTAATGACGAAACAAATGG-TCATCACG
501 TTGTTTTATGA-AAAACTAA-GGATCATAAAT
* * * * * *
14311 ATTTGA-AGTAAATAATGGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGCTTAGTAAACA-A-ATTT
1 ATTTGAGA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGG-TTCG-AAAAATAGATTT
* ** * * ***
14373 ATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAA
63 A-TTTTTAAATCTC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAA
* * * *
14438 TAAACTTATATGAA-TAAAAGCATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAATG-ATTTGAAAT
125 TAAGCTTTTATGAACTAAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-GAATTTGAAAT
* * * * *
14501 A-AGTAATTGTTCAAATAGTCATGATTATTTGAAC-TAGTTC-GACAAACAAAATTATTTTTAAA
188 AGA-TAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTA-TTCAG-TAAAC-AATTTATTTTTAAA
* * * * *
14563 --TC-T-CTTACTAATTTTT-GCATTATTAATAAAATTA-TTTTATTTTATTCTAAATAAG-TTA
249 TCTCTTGCTTATTAATTTTTAG-AATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTC-GAATAAGCTTG
* * * * * * * * *
14621 T-TAAGAATTGATAA-AATTATTTTACGACAAAATAAAAGGTCCTAATGATTTAAAATAAAAAAT
311 TAT-A-AATAGA-AATAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * *
14684 TATTCATATAGTCTTAATTATTTGAACTGGTTCGGTAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTAGT
372 TATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTAGTTCGGT-AA-ACATATATTTTTTAAA--TCTT--T
*** * * * * * ** *
14749 TATTAATTTTCATAATATTATTACAA-TAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAACTTTTATAAACAA
431 TATTAATTTTTGGAATATTAATA-AATTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATTAG
* * ** *
14812 AAATAATTGTTTTATGACATAAC-AAAAAGTTATAACA-
495 AAACAATTGTTTTATGA-AAAACTAAGGA-TCATAA-AT
* * * * *
14849 ATTTGAAATATATAATTGTTCAAATAGTCATAAGTATTTGAACTAGTT-TAATAAATAGATTTAT
1 ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAA-AAATAGATTTAT
14913 TTTT
65 TTTT
14917 TACATCTTGT
Statistics
Matches: 2662, Mismatches: 462, Indels: 316
0.77 0.13 0.09
Matches are distributed among these distances:
526 43 0.02
527 161 0.06
528 66 0.02
529 105 0.04
530 76 0.03
531 94 0.04
532 256 0.10
533 69 0.03
534 81 0.03
535 40 0.02
536 77 0.03
537 339 0.13
538 560 0.21
539 403 0.15
540 116 0.04
541 12 0.00
542 17 0.01
543 87 0.03
544 56 0.02
545 4 0.00
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (530 bp):
ATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAATAGATTTATT
TTTAAATCTCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT
TTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAGAATTTGAAATAGATAATT
ATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAATTTATTTTTAAATCTCTTGCTTAT
TAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAATAA
TTATTTTATGATAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACT
ATTTAAACTAGTTCGGTAAACATATATTTTTTAAATCTTTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
TTAGTATTATTTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGATTAGAAACAATTGTTTTATGAAAAACTAAG
GATCATAAAT
Found at i:17201 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 16889--24188 Score: 2625
Period size: 181 Copynumber: 41.1 Consensus size: 178
16879 ACTGGTATTA
** * * * **
16889 TTTTATGATGAAACAAAATG-TCATGACAGTTCGAAATAGAT-A-TAGTTCAAATAGAAATG-AC
1 TTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAGATAATTA-TTCAAATAGTCA-GAAC
* * * *
16950 TATTTGAACTTGTTCGGTAAACAA-ATTTATTTTTTAGAA-TTCTAACTTATTAATTTTTAGAAT
63 TATTTGAACTTGTTC-ATAAA-AAGATTTATTTTTTA-AATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAAT
* *
17013 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAAATAAACTTTTATGAATAGAAACAATTT
124 ATTAATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* *
17069 TTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* * * *
17134 TTGAACTCGCTCGATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTTCTTATTAACTTTTGGAATTTTAA
66 TTGAACTTGTTC-ATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAA
* *
17199 TAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTA
129 TAAATTAATATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * ** * * *
17250 GTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* *
17315 TTGAA-TGTGTTCAGTAAACAA-ATTTA-TTTTTAAAATTTTTGCTTATTAACTTTTGGAATATT
66 TTGAACT-TGTTCA-TAAA-AAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * * * *
17377 AATTAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGGATGAATTG-AACCATTT
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * *** * * * *
17429 GTTTTCTGACCAAAGAAACGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCAAAACTT
1 -TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
* * * * * * * *
17494 TTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTTAGTTCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATT
65 TTTGAACTTGTTCA-TAAAAAGATTTATTTTTTAAATT-TTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * * * *
17559 AATAAATTAGTATTATTTTACTTCAAATAAGCTTATGTTAACT-GAAACAGTTG
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTT
* * * **
17612 TTTTATTACAAAATAAAAGATCACAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATGAA-TA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-GAACTA
* * * * * **
17676 TTTAAAATTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTA
65 TTTGAACTTGTTCA-TAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATT-TTGGAATATTA
* * * * *
17741 ATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATATGAATAGAAATAATTG
128 ATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * *
17793 TTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAACAATTTG---TTGCTCA--A-T---ATAGTCATAACGA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
* ** * * * * * *
17848 TTTAAACTTGTGTGGTGAACAA-ATTTATATTTTAAA-TTTTTAATTACTAATTGTCT-TAATAG
65 TTTGAACTTGT-TCAT-AAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATT-T-TGGAATAT
** * * * * * *
17910 TAATAAATTTGTATTATTTTATCCAAAATAGGCTTGTATGAACAGATGA-AGTCT
126 TAATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGA-AACAATTT
* * * * * * * * *
17964 TTTTATGACAAAA-AAAAGGTTATAGCATTTTTAAATAAATAATTATTTAAATAGTCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* * * * *
18028 TTAAACTTGTTCTATAAATAG-TTTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTA
66 TTGAACTTGTTC-ATAAAAAGATTT-ATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTA
* * ** * *
18092 ACAACTTGGTATTATTTTATTGCAAATAAGCTTATATGAACT-GAAATAATTT
128 ATAAATTAATATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTT
* *
18144 TTTTATGACAAAAAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCATG-ACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-GAACTA
* * * * * * * * *
18207 TTTGATCTAGTTCAGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTAATTTATTAATTGTTGCAATAATA
65 TTTGAACTTGTTCA-TAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATT-TTGGAATATTA
* * * *
18272 ATAAATTAATATTATTTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACTATTG
128 ATAAATTAATATTA-TTTT-ATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * ** **
18325 TTTTATAATAGAACAAAA-AGTCAAAATGATTTGAAATA-ATTAATTGCTCAAATAGTC--AACT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCAGAACT
* * * * *
18386 ATTTGAACTAGATTGACAAAAAGATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATT
64 ATTTGAACTTG-TTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * *
18447 AAT--A--GAT-TT-TTTTATT----TTA---T-TATGAACAAAAAC-ATTT
127 AATAAATTAATATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * *
18484 GTTTTATGATAAAACAAAAGGTTAT-A-ACA-AT-TTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
1 -TTTTATGACAAAAC-AAAAG--ATCATA-ACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGA
* * * * * * *
18545 A-TCATTAGAACTAGTT-AGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAA
61 ACT-ATTTGAACTTGTTCA--TAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGA
* * * * * *
18608 ATATCT-ATAAATTCATTTTATTTTATTTCAAATAAGCTAGTTTGAA-ATGAAAAAATTG
122 ATAT-TAATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTT
* ** * * * ** * *
18666 TTTTATGACAAGACAAAAGATTGTAACAATTTGAAATAGATAATTGTTTATATAGTCTTAACAAA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* * * *** * * * *
18731 TTGAACTAGTTTGACAAACAA-ATTTAAAATTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTA
66 TTGAACTTG-TTCATAAA-AAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTA
* * * * * * * * * *
18795 TTAGATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAACATGTATGAACATAAATAATTA
128 ATAAATTAATATTATTTT-ATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * * * *
18847 TTTTATAATAGAACAAAATGTTTATTTTGTAAATAATTC-ATTTGAAGTATACAATTCTTCAAAT
1 TTTTATGACAAAACAAAA-G---A-----T-CATAA--CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * *
18911 AGTCATAACTATTTCAA-TTGGTTCAGTAAACAA-A-TT-TTTTTAAAATCTCTTACTTATTAAT
54 AGTCAGAACTATTTGAACTT-GTTCA-TAAA-AAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-
* * * *
18972 TTTTGAAAGATT-ATGAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATATGCTTGTATGATATA-AAACAAT
115 TTTTGGAATATTAAT-AAATTAATATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAAT
*
19035 TG
177 TT
* * ** * * * ** * * * *
19037 TTATACGATTAAACAAAAGGTAACAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAAT-GACGATAATTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-AGAACTA
** * * * *
19101 TTTGAACTAAT-TTGGTAAACAGATTCACTTTTTAAA----TCACTTATTAATTTTTGGAATATT
65 TTTGAACT--TGTTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * *
19161 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAGCAATTG
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTT
* * * * * *
19214 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATAAATAATTATTTAAATAGT-TGTAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAG-AACTA
* * * * **
19278 TTTGAATTTGTTCGATAAACAA-ATTTACTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATAT
65 TTTGAACTTGTTC-ATAAA-AAGATTTA-TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATAT
* * *** * * *
19341 TAAGAAATTATTATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTATGCAAT-GAAACAATTA
126 TAATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATG-AATAGAAACAATTT
* ** * * * * *
19395 TTTTATGTCAAAACAAAATG-TCATAATGATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
* * * * **
19459 TTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATTTTCCAA-ATGC
65 TTTGAACTTGTTC-ATAAAAAGATTTATTTTTT-AAATTTTTTACTTATTAATTTTGGAATAT--
* *** * * * *
19523 TACTAAATTTGGATTATTGTACTCCAAATAAGCTTGTAAG-ATATGAAATAAATATT
126 TAATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATA-GAAA-CAAT-TT
* * * ** * * *** *
19579 TTTTA--ACTAAAA-AAAATATTAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATGGTTTTAATTA
1 TTTTATGAC-AAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
** ** * * ** ** *
19641 TTTGAAC-TGATTTCGCAAGCACATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTAGCAATTTTTGAAATATT
65 TTTGAACTTG--TTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * ** * * * *
19705 ATTAAATTAGTATTATTTTTAACCAAATAAGCTTCTATG-ATAAAAAATAATTG
127 AATAAATTAATATTA-TTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTT
* * * * * * * * * *
19758 TTTAACGACAAAACAAAA-ATCTTAACGATTTGAGATTG-TAAATTGTTCAAATATTCATACCTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGAT-AATTATTCAAATAGTCAGAACTA
* * * * **
19821 TTTGAACTAGTTCAGTAAACAA-ATTTATTGTTTAAATCTCTTACTTATTAAATTTTTAAATATT
65 TTTGAACTTGTTCA-TAAA-AAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATT-AATTTTGGAATATT
* ** * *
19885 AATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATTA
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTT
* ** * * * * * *
19938 TTTTATGACAAAACAAAAG-CCTATAATGATTTCAAATAGATAATCATTCAAATGGCCATAATTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATC-ATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
** * * *
20002 TTTTTAC-TGATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTTAATTTTTTACTTATTAATTTTAGAAATATT
65 TTTGAACTTG-TTCA-TAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTT-GGAATATT
* **** * * *
20066 AATAAATTAGTATTA-TTTATTTTGTCTAAGCTTGTACT-ACCTA-AAATAATTA
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTA-TGA-ATAGAAACAATTT
* * * * * * * ** *
20118 TTTTATGACAAATCAAATGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGCTCAAATAG-CAATAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-AGAACTA
* ** * * *
20182 TTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTTTGTAATTAATTTTTTGAATG
65 TTTGAACTTGTTCA-TAAAAAGATTTA-TTTTTTAAAT-T-TTTTACTTATTAA-TTTTGGAATA
* * ** * * *
20247 TTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGATTAAGCTTGTATGAGCT-GAAACAATTG
125 TTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGA-ATAGAAACAATTT
* * ** ** * ** ** *
20302 TTTTATAACTAAATGAAAGGCCAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACCAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* * * * * **
20367 TTGAACTTATTTGATAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTA
66 TTGAACTT-GTTCATAAA-AAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTA
* * * * * * * *
20431 TTGAATTAGTATTATTTAAATCCAAATAAACTTGTATGAACA-AAACAATTG
128 ATAAATTAATATTATTT-TATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * **
20482 TTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* * ** * ** ***
20547 TTGAACTAGTTCGACAATTAGATTTGTTTTTT-AATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTA
66 TTGAACTTGTTC-ATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTT-TTACTTATTAA-TTTTGGAATATTA
* * * ** * * *
20611 TTAAA-TAGTATTATTTTATTCTGAATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTG
128 ATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * ** **
20662 TTTGACGA-AAAA-AATAATTGTTC-T-ACTAGTCTT-AACTATTTGAACTGGTTC----AG-CA
1 TTTTATGACAAAACAA-AA--GATCATAAC-AAT-TTGAAATAGAT-AA-TTATTCAAATAGTCA
* * ** ** *
20717 -AACACATTT--A--TGTT--T-TAAATCTCTTACATATT-AATTTTTAGAATA-TTATTAATTT
59 GAAC-TATTTGAACTTGTTCATAAAAAGAT-TTATTTTTTAAATTTTT----TACTTATTAATTT
* * * * * ** *
20772 AGCAATA-T--T---TTACTCTGA----A--C--A-AA-CTTGTATGAGCAGAAACAATTA
118 TGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * * *
20817 CTTTATGA-GAAA-AAAAGATCATAACGATTTTAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
** * * * * *
20880 TTGAACTAATTCGATAAATAGATTTAGTTTTTAAA---TCT-CTTATTTATTTT--CA-A--AAT
66 TTGAACTTGTTC-ATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTGGAATATTAAT
** * *
20936 --ATTAATA--A----ATT-AGAATAATTTTGTATGAATAAAAACAATTA
130 AAATTAATATTATTTTATTCA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * ** * *
20977 TTTTATGAC-AAACAAAATG-TCATAACGATTTGAAATAGTTAATAATTTGAATAGACTTG-ACT
1 TTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-AGAACT
* * * * * * * * *
21039 ATTTAAATTTGTTTAGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTTAGAATATT
64 ATTTGAACTTGTTCA-TAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * *
21104 AATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTAT-AAGTAGAAATAATTA
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTT
* * ** * * *
21157 TTTTATGAGAAGACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCATAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
*** * * *
21222 TTGAACTCACTCAGTAAATAGATTTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTT
66 TTGAACTTGTTCA-TAAAAAGA-TTTA-TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * * *
21287 AATAAATTAGTATTATTTTATACTGAATAAGCTTTTATG-A-ACAAA-AA---
127 AATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * *
21334 ---TA--A-AAGATC-ATA-A-C---A-AT-TTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACT
1 TTTTATGACAA-AACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TCAGAACT
* * * * * *
21384 ATTTCAACGTGTTTAGAAAACAGATTTA-TTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGTAATATT
64 ATTTGAACTTGTTCATAAAA-AGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * ** * *
21448 AATCAGTTTATATTATTTTATTCAAAATAAGCTTACATGAATAGAACCAATTG
127 AATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * *** *
21501 TTTTATGATAAAACAAAAAGGTCATGATGTTTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
1 TTTTATGACAAAAC-AAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
* * * * * * *
21566 TTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATT
65 TTTGAA-CTTGTTC-ATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * * * * *
21630 AATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTGAATTGAAATAGTTG
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * ** * *
21683 TCTTATTACAAAACAGAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCATG-ACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-GAACTA
* * * * * ***
21747 TTTCAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATATTTTACATATTAATTATCAAAATATT
65 TTTGAACTTGTTCA-TAAAAAGATTTA-TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATT-TTGGAATATT
* * * * *
21812 AAT-AATTAATATTTTTTTAATCCGAAT-AGCCTTGTATGAACAGAAACAATTG
127 AATAAATTAATATTATTTT-ATTCAAATAAG-CTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * *
21864 TTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAGCAATTCGAAATAAATAATTGTTCATATAGTCATAAC-A
1 TTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
* ** *
21927 TTTGAACTTGTTCGATAAACAA-ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCTTAGTATT
65 TTTGAACTTGTTC-ATAAA-AAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTT-GGAATATT
* ** * *
21991 AATAATTTTGTATTATTTTATTCAAA-ATAG--T-T-TGAACA-AAAAAATTT
127 AATAAATTAATATTATTTTATTCAAATA-AGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * *** * * * * *
22038 ATTTTATGTCAAAACAAAATG-TTATAGTGATTTCAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATT
1 -TTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACT
* * * * * *
22102 ATTTAAACTTATTCAGTAAATAGA-TT-TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATA-T
64 ATTTGAACTTGTTCA-TAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
** * * * ** * *
22164 --T-AATTGGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACCGAAACAAATC
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * ** * *
22214 TTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATAATCATG-ACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA-GAACTA
** * ** * * * ***
22278 TTTGGTCTGGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTATCAAAATATTA
65 TTTGAACTTG-TTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATT-TTGGAATATTA
* * * * * ** * *
22343 ATAAATTAGTATTGTTTTAATCTGAATAAGCATGTACAAATAGAAACAAATG
128 ATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * ** * * * * *
22395 TTTTATAATAGGACAAAA-AGTCAAAAGAATTTGAAATAAATAATT-TGCCAAATAGTCATAACT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAGATAATTAT-TCAAATAGTCAGAACT
* * * * * *
22458 ATTTGAACTGGTTTGAT-AATATATTTATTTTTTAAA---TCT-CTTATTAATTTTTGAAATATT
64 ATTTGAACTTG-TTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * * * * * * * *
22518 AATAGATGAGTATTACTTTATTTCGAACAAACTTATATGAACAAAAAC-ATTT
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
** ** * * * *
22570 GTTTTATGACAAAACAAAATG-TTGTAATGATTCT-AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAAT
1 -TTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAACAATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAAC
* * * * *
22633 TATTTGAA-TTGGTT-AGGTCAACAAAAATATT-TTTTTAAAATATCTTACTTATTAATTTTTGA
63 TATTTGAACTT-GTTCA--T-AA-AAAGAT-TTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGG
* * * * * *
22695 AATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCGAATCAA-CTAGTATGAATTG-AA-ATTTT
121 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-CAAAT-AAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
* * * * * ** *
22752 GTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAACATTTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAATA
1 -TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
* * * *
22817 TTTGAAC-TGATTCGTCAAACAA-ATTTA-TTTTT-AATTCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATA
65 TTTGAACTTG-TTCAT-AAA-AAGATTTATTTTTTAAATT-TTTTACTTATTAA-TTTTGGAATA
* * * * * * *
22878 TTATTATATTAGTACTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACA-ACAATAATTG
125 TTAATAAATTAATATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAATAGA-AACAATTT
* * * * * * * * * * * *
22933 TTTTGTGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTTATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* * * ** *
22998 TTGAACTGGTTTGATAAACAGATTTTATTTTTTAAA----TTACTTATTAATTTTTAAAAGATTA
66 TTGAACTTG-TTCATAAAAAGA-TTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTA
* * * * *
23059 ATAAATTAGTATTATTGTATTCTGAATAAGCTTGAATG-ATCA-AAACCATTT
128 ATAAATTAATATTATTTTATTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTT
* * * * * * * * * * * *
23110 GTTATATGAC-ATACAAAAGGTAATGACGATTTGAAATAGATAAATGTTGAAATAGCCATAATTA
1 -TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTA
** * * * * *
23174 TTT-AAAATGATTCAGTAAACAGATTCACTTTTTAAA----TCACTTATTAATTTTCAGAATATT
65 TTTGAACTTG-TTCA-TAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTT-GGAATATT
** * * *
23234 AATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACTA-AAACGATTG
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTT
* ** * * **
23287 TTTTATGATAAAACAAAATTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAACTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* ** ** * * **
23352 TTAAACTACTTCA-ACAAACAGATTTATTTTTTAAATCCTTTAGTTCTTAATTTTCATAATATTA
66 TTGAACTTGTTCATA-AAA-AGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTT-GGAATATTA
* * **
23416 TTAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAAC-ATTT
128 ATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTT
* * * * * * * ** *
23467 ATTTATAATAGAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCAAATA---AGAAC---
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
* * * * *
23526 -T--AC-T-TTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
66 TTGAACTTGTTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATTAAT
* * * *
23586 AAATTAGTA-TATTTTATTCCAAACAAGCTTGTAT-AATGAAAAACAATTG
130 AAATTAATATTATTTTATT-CAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTT
* * * ** * * * *
23635 TTTTATGACAAAA-TAATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATAGCCATAATTAT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
** * * * *
23699 TTGAA-TTGATTTGGTAAACAG-TTTCACTTTTTAAA----TCACTTATTAATTTTTGAAATATT
66 TTGAACTTG--TTCATAAAAAGATTT-ATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* * * *
23758 AATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAGGATT-TAATGAA-ATGAAACAATTG
127 AATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGT-ATGAATA-GAAACAATTT
** * ** * * * *
23811 TTTTATGATGAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTC-GCAACTA
1 TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAG-AACTA
* * * * ** **
23875 TTTGAATTTGTT-AAAAAAATGTATTTATTTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAATTTTTAAAATAT
65 TTTGAACTTGTTCATAAAAA-G-ATTTA-TTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATAT
* * **** * * * *
23939 TAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGGTTAATCTTTTATGAACTA-AAGCAATTG
126 TAATAAATTAATATTATTTTA-TTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTT
** * * * *
23993 TTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTTAAATA-ATTAATTGTTTAAATAGTCATAACT
1 TTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACAATTTGAAATAGA-TAATTATTCAAATAGTCAGAACT
* * ** * * * * * * * *
24056 ATTTGAGCTTATTTGGTAAACATATTTATTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTT
64 ATTTGAACTT-GTTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAA-TTTTGGAATATT
* ** * * * *
24121 AATATATTAGGATTATTTTATTCTGAATAAAGCTTATATG-ATATGAAACAAATA
127 AATAAATTAATATTATTTTATTC-AAAT-AAGCTTGTATGAATA-GAAACAATTT
24175 TTTTATGACTAAAA
1 TTTTATGAC-AAAA
24189 ATAGGTTAGA
Statistics
Matches: 5458, Mismatches: 1208, Indels: 905
0.72 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
151 5 0.00
152 7 0.00
153 6 0.00
154 7 0.00
155 30 0.01
156 12 0.00
157 14 0.00
158 2 0.00
159 5 0.00
160 80 0.01
161 136 0.02
162 35 0.01
163 18 0.00
164 50 0.01
165 10 0.00
166 36 0.01
167 58 0.01
168 61 0.01
169 18 0.00
170 48 0.01
171 100 0.02
172 54 0.01
173 25 0.00
174 41 0.01
175 184 0.03
176 279 0.05
177 353 0.06
178 125 0.02
179 268 0.05
180 985 0.18
181 1318 0.24
182 650 0.12
183 185 0.03
184 110 0.02
185 6 0.00
189 4 0.00
190 81 0.01
191 11 0.00
192 40 0.01
193 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAGAACTAT
TTGAACTTGTTCATAAAAAGATTTATTTTTTAAATTTTTTACTTATTAATTTTGGAATATTAATA
AATTAATATTATTTTATTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTT
Found at i:17712 original size:543 final size:542
Alignment explanation
Indices: 16488--24188 Score: 4484
Period size: 543 Copynumber: 14.4 Consensus size: 542
16478 TTTATTTTGG
* * * ** * * * *
16488 ATAAGCTTTTATGTATTGAAACAATTGTTTTACAATAAAAATAAAAGATCATAACAATTTTAAAT
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGA-CAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * *
16553 AGATAATTGTTCAAA-ACGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGGTAAACAAATTTATTGTTTTTA
65 AGATAATTGTTCAAATA-GTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATT-TTTTAA
** * * *** *
16616 A-CTTCTCGCTTATTAATTTTCT-AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAGCAT
128 ATC-TCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTT
* * * * *
16679 GTATGAACT-AAAACAATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTCAGAACGATTTGAAGTAGATAAT
191 GTATGAA-TAAAAACAATTAGTTTATGA-TAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
** * * * * * * * * *
16742 TGTTCTCATTGGCTTAACTGTTTGAACTAGTTCAGCAAACACATTCA-TTTTTAAA--TCT--TT
254 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTT
* * ** * **
16802 ATTAATTTTTGAAATAGTAATAAATTGGTATTATTTTATTTTAAATAATTTTGTATGAATACCAA
318 ATTAATTTTTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG-------A
* * ** * *
16867 TTATTCTGAATAACTGGTATTATTTTATGATGAAACAAAATGTCATGACA-G-TTCGAAATAGAT
376 --A-T-TG-A-AAC---AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT-A-ATGATTTGAAATAGAT
** * * * *
16930 -A-TAGTTCAAATAGAAATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTTAGAAT-T
430 AATTA-TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTA-AATCT
*
16991 C-TAACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCTAA
493 CTTAA-TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AA
* * * * *
17042 ATAAACTTTTATGAA-TAGAAACAATTTTTTTATGAGAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAAT
1 ATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
17106 AAATAATTATTCAAATAGTCAGAACTATTTGAACTCGCTC-GATAAA-AAGATTTATTTTTTAAA
65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAA-ATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
17169 TTTTTTTCTTATTAACTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
129 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
*
17234 TGAATAGAAACAATTAGTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
194 TGAATAAAAACAATTAGTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * *
17299 AAATAGTCATAACAATTTGAATGTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTAAAATTTTTGCTTATTAA
259 AAATAGTCATAACTATTTGAAT-TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAA
* * * * * *
17364 CTTTTGGAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGGATGAATTGAACCATTT
323 TTTTTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATT
* * * * * * * * *
17429 GTTTTCTGACCAAAGAAACGGTCATAATGTTTTGAAATAGATAATTGTTCAGATAGTCAAAACTT
388 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTA
* * ** * *
17494 TTTAAACTTGTTCAGTAAATAGATTCATTTTTTTAGTTCTCTTAATCATTAATTTTTGGAATATT
453 TTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATT
17559 AATAAATTAGTATTATTTTACTTCAA
518 AATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAA
* * * * * * *
17585 ATAAGCTTATGTTAACTGAAACAGTTGTTTTATTACAAAATAAAAGATCACAATGATTTGAAATA
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * * *
17650 GATAATTATTCAAATAGTCATGAA-TATTTAAAATTGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTTAAAT
66 GATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * ** *
17713 CTTTTACTTATTAATTGTTAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCTGAATAAGCTTATAT
130 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT
* * * ** * * *
17778 GAATAGAAATAATT-GTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAA-CAATT----T-G----TTGCTC
195 GAATAAAAACAATTAG-TTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * * * * * * *
17832 AATATAGTCATAACGATTTAAACTTGTGT-GGTGAACAAATTTATATTTTAAATTTTTAATTACT
259 AA-ATAGTCATAACTATTTGAA-TTGT-TCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATT
* * * * * ** *
17896 AATTGTCTT--AATAGTAATAAATTTGTATTATTTTA-TCCAAAATAGGCTTGTATGAACAGATG
321 AATT-T-TTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATTGA-A
* * * * *
17958 A-AGTCT-TTTTATGACAAAA-AAAAGGTTAT-A-GCATTTTTAAATAAATAATTATTTAAATAG
382 ACAAT-TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-A-TTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
* *
18018 TCATAATTATTTAAACTTGTTCTA-TAAATAG-TTTCA-TTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT
444 TCATAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAATAGATTT-ATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATT
* * * *
18080 TTTGGAATATTAACAACTTGGTATTATTTTATTGCAA
507 TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAA
* * * *
18117 ATAAGCTTATATGAACTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAAAAAAG-TCATAACAATTTGAAATA
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * *
18181 GATAATTATTCATATAGTCATGACTATTTGATCTAGTTCAG-TAAACATATTTATTTTTAAAAT-
66 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * *
18244 TTTTAATTTATTAATTGTTGCAATAATAATAAATTAATATTATTTTTAATT-CGAATAAGCTTGT
131 TCTT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTT-ATTCCAAATAAGCTTGT
* * * ** *
18308 ATGAATAAAAACTATT-GTTTTATAATAGAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATA-ATTAATTG
193 ATGAATAAAAACAATTAG-TTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTG
* * * * * *
18371 CTCAAATAGTC--AACTATTTGAACTAGATTGA-CAAAAAGATTTATTTTTTAAA--TCT-CTTA
256 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTA
* ***
18430 TTAATTTTTGAAATATTAA-T-A--GAT-TT-TTTTATTT----T-A---T-TATGAACAAAAAC
319 TTAATTTTTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAAC
* * * **
18480 ATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
384 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * *
18545 A-TCATTAGAACTAGTT-AGGTAAATAGAATTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-G
449 ACT-ATTTGAACTTGTTCA-GTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAG
*
18606 AAATATCT-ATAAATTCA-TTTTATTTTATTTCAA
512 -AATAT-TAATAAATT-AGTATTATTTTA-TTCAA
* * * * ** *
18639 ATAAGC-TAGTTTGAAATGAAAAAATTGTTTTATGACAAGACAAAAGATTGTAACAATTTGAAAT
1 ATAAGCTTA-TATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * * * ***
18703 AGATAATTGTTTATATAGTCTTAACAAATTGAACTAGTT-TGACAAACAAATTTAAAATTTAAAT
65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * *
18767 CTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAGTATTATTTTGTTTCAAATAAACATGTAT
130 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * * * * * *
18832 GAACATAAATAATTATTTTATAATAGAACAAAATGTTTATTTTGTAAATAATTCATTTGAAGTAT
195 GAATAAAAACAATTAGTTTATGATAAAAC-AAATG--------GT-CATAA-TGATTTGAAATAG
* * * * * *
18897 ACAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTCAATTGGTTCAGTAAACA-AATT-TTTTTAAAATCTC
249 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TT
* * * * *
18960 TTACTTATTAATTTTTGAAAGATT-ATGAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATATGCTTGTATG-
312 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATTAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA
* * * ** * * *
19023 ATATAAAACAATTGTTATACGATTAAACAAAAGGTAACAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAA
376 AT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAA
* * ** ** * * * *
19088 AT-GACGATAATTATTTGAACTAATTTGGTAAACAGATTCA-CTTTTTAAA--TC--ACTTATTA
440 ATAGTC-ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTA
*
19147 ATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
504 ATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAA
* * * *
19187 ATAAGCTTGTATGAAC-AAAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAAT
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * * ** *
19251 AAATAATTATTTAAATAGTTGTAACTATTTGAATTTGTTC-GATAAACAAATTTACTTTTTTAAA
65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTA-TTTTTTAAA
* * * * **** * *
19315 -CTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAAGAAATTATTATTATTTTATTTTGGATATGCTTTTA
129 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * *
19379 TGCAAT-GAAACAATTATTTTATG-TCAAAACAAAAT-GTCATAATGATTTTAAATAAATAATTG
194 TG-AATAAAAACAATTAGTTTATGAT-AAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * *
19441 TTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTT
256 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAAT-TTTTACTT
** ** * * ** * * * *
19506 ATTAATTTTCCAAATGCTACTAAATTTGGATTATTGTACTCCAAATAAGCTTGTAAG-ATATGAA
318 ATTAATTTTTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-TGAA
* * * * * ** * * * * *
19570 ATAAATATTTTTTAACTAAAA-AAAATATTAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATGGTT
382 ACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC
* * * ** * * * **
19634 TTAATTATTTGAAC-TGATTTC-GCAAGCACATTTA-TTTTTTAAATCTCCTACTTAGCAATTTT
446 ATAACTATTTGAACTTG--TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTT
* **
19696 T-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTAACCAA
509 TAG-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCAA
* ** * * * * *
19731 ATAAGCTTCTATGATA-AAAAATAATTGTTTAACGACAAAACAAAA-ATCTTAACGATTTGAGAT
1 ATAAGCTTATATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
19794 TG-TAAATTGTTCAAATATTCATACCTATTTGAACTAGTTCAG-TAAACAAATTTATTGTTTAAA
65 AGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* ***
19857 TCTCTTACTTATTAAATTTTT-AAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT
129 TCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGT
* * * * * **
19921 ATG-ATCAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AGCCTATAATGATTTCAAATAGATAATCA
193 ATGAAT-AAAAACAATTAGTTTATGATAAAACAAATGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * ** * *
19984 TTCAAATGGCCATAATTATTTTTACTGATTCAGTAAACAGATTTATTTTTTTAATTTTTTACTTA
256 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTTAAATTTTTACTTA
* * **** ** *
20049 TTAATTTTAGAAATATTAA-TAAATTAGTATTA-TTTATTTTGTCTAAGCTTGTACT-ACCTAAA
319 TTAATTTTTGAAATATTAATTAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA-TGAATTGAA
* * * * * * * * **
20111 ATAATTATTTTATGACAAATCAAATGGTTATAACGATTTTAAATAGACAATTGCTCAAATAG-CA
382 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTC-
**
20175 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTTTTGTAATTAATTTT
446 ATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAAT-T-ATTAATTTT
* * * **
20240 TTGAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGA
509 TAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAA
* * * * * ** ** * *
20275 TTAAGCTTGTATGAGCTGAAACAATTGTTTTATAACTAAATGAAAGGCCAAAATGATTTGAAATA
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * * * *
20340 GATAATTATTCAAATAGTCTTAACCATTTGAACTTATT-TGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
66 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * *
20404 TCTTACATATTAATTTTTAAAATATTATTGAATTAGTATTATTTAAATCCAAATAAACTTGTATG
131 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG
* * * * * ** **
20469 AA-CAAAACAATT-GTTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATCATTCA
196 AATAAAAACAATTAG-TTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * **
20532 TATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTC-G-ACAATTAGATTTGTTTTTTAATTTTCTTGGTTATT
260 AATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTA-AA-CAGATTTATTTTTTAAATTT-TTACTTATT
* ** * * ** * * *
20595 AAGTTTCAAAATATT-ATTAA-ATAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAAATAGTATGAATAGAACC
321 AATTTTTGAAATATTAATTAATTTA-TATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATTGAAAC
* * *
20657 AATTG--TT-TGAC-GAA-AAAA----AT-A--A-TTG---T---T--CTA--C---TAGTCTTA
384 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
20696 ACTATTTGAACTGGTTCAGCAAACACATTTA-TGTTTTAAATCTCTTACA-TATTAATTTTTAGA
449 ACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTA-ATTATTAATTTTTAGA
* * * * * *
20759 ATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCTGA
513 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AA
* * * * * ** * * *
20790 ACAAACTTGTATGAGCAGAAACAATTACTTTATGA-GAAA-AAAAGATCATAACGATTTTAGATA
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
** * * *
20853 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAATTC-GATAAATAGATTTAGTTTTTAAATC
66 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
** *
20917 TCTTA--T-TT-ATTTTCAAAATATTAATAAATTAG----A----A-T---AAT---TTTGTATG
131 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG
* * * * ** **
20963 AATAAAAACAATTATTTTATGA-CAAACAAAAT-GTCATAACGATTTGAAATAGTTAATAATTTG
196 AATAAAAACAATTAGTTTATGATAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * * *
21026 AATAGACTTGACTATTTAAATTTGTTTAGTGAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAA
260 AATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTATTAA
* * * * *
21091 TTTTT-AGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTAT-AAGTAGAAATAA
323 TTTTTGA-AATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TTGAAACAA
* * * * * *
21154 TTATTTTATGAGAAGACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCATAAC
386 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
*** * * *
21219 TATTTGAACTCACTCAGTAAATAGATTTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAAT
451 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGA-TTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAAT
* * *
21284 TTTAATAAATTAGTATTATTTTATACTGA
515 ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AA
* * *
21313 ATAAGCTT-T-T--A-TG-AAC------------A-AAAATAAAAGATCATAACAATTTGAAATG
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
* * * * *
21359 GATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTCAACGTGTTTAGA-AAACAGATTTATTTTTAAAAT
66 GATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * ** * **
21422 -TTTTACTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAGTTTA-TATTATTTTATTCAAAATAAGCTTACA
130 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * * * *
21485 TGAATAGAACCAATT-GTTTTATGATAAAACAAAAAGGTCATGATGTTTTGAAATAGATAATTAT
194 TGAATAAAAACAATTAG-TTTATGATAAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * *
21549 TCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAGTCTCTTACTCA
257 TCAAATAGTCATAACTATTTGAA--TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTTA
* * *
21613 TTAATTTTT-AGAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATTTGAATTGAA
319 TTAATTTTTGA-AATATTAATTAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAA
* * * * * * *
21676 ATAGTTGTCTTATTACAAAACAGAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTATTCAAATAATCA
382 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCA
* * * * * * * *
21741 TGACTATTTCAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATATTTTACA-TATTAATTATCA
447 TAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTA-ATTATTAATTTTTA
* * * * *
21805 AAATATTAAT-AATTAATATTTTTTTAATCCGA
511 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCAA
* * * * *
21837 AT-AGCCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAGCAATTCGAAA
1 ATAAG-CTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAA
* *
21900 TAAATAATTGTTCATATAGTCATAAC-ATTTGAACTTGTTC-GATAAACAAATTTATTTTTTAAA
64 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAA
* * * * * *
21963 TCTTTTACTTATTAATTTTCT-TAGTATTAATAATTTTGTATTATTTTATTCAAAAT-AG--T-T
129 TCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGT
* * * * * *
22023 -TGAACAAAAA-AATTTATTTTATG-TCAAAACAAAAT-GTTATAGTGATTTCAAATAAATAATT
193 ATGAATAAAAACAA-TTAGTTTATGAT-AAAAC-AAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * *
22084 GTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTATTCAGTAAATAGA-TT-TTTTTTAAATCTCTTAATT
255 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT-TTTTACTT
* ** * * * **
22147 ATTAATTTTTG-GA-A-T-ATTAATTGGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACCGAAA
318 ATTAATTTTTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAA
* * * * *
22208 CAAATCTTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTGAAATAATCAT
383 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
* ** * ** * * * * * * *
22273 GACTATTTGGTCTGGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTATCAAA
448 AACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGA
* * *
22337 ATATTAATAAATTAGTATTGTTTTAATCTGA
513 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-AA
* * * * * * * ** *
22368 ATAAGCATGTA-CAAATAGAAACAAATGTTTTATAATAGGACAAAA-AGTCA-AAAGAATTTGAA
1 ATAAGCTTATATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACG-ATTTGAA
* * * * * *
22430 ATAAATAATT-TGCCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TGAT-AATATATTTATTTTTTA
63 ATAGATAATTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTA
* * * * * * * *
22492 AA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATGAGTATTACTTTATTTCGAACAAACTTA
127 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTG
* * * **
22553 TATGAACAAAAAC-ATTTGTTTTATGACAAAACAAAAT-GTTGTAATGATTCT-AAATAGATAAT
192 TATGAATAAAAACAATTAG-TTTATGATAAAAC-AAATGGTCATAATGATT-TGAAATAGATAAT
* * * * ** *
22615 TGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTT-AGGTCAACAAAAATATTTTTTTAAAATATCTT
254 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATT-GTTCA-GTAAACAGATTTA-TTTTTT-AAAT-TTTT
* * * * * *
22679 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATTTTATTTTATTCCGAATCAA-CTAGTATGAAT
314 ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAAT-AAGCTTGTATGAAT
** * * * *
22743 TGAAA-TTTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAA-CATTTTGAAATAGATAATTGTTCATAT
378 TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * *
22806 AGTCTTAAATATTTGAAC-TGATTC-GTCAAACAAATTTA--TTTTTAATTCTCTTAGTTATTAA
442 AGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCAGT-AAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAA
* * *
22867 TTTTTAGAATATTATTATATTAGTACTATTTTATTCCAA
505 TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CAA
* * * * * * * * * *
22906 ATAAGCTTGTATGAAC-AACAATAATTGTTTTGTGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGT
1 ATAAGCTTATATGAACTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * *
22970 ATACAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTT-TGATAAACAGATTTTATTTTTTAAA
65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACA-AATTTATTTTTTAAA
* * * ** *
23034 ----TTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTATTCTGAATAAGCTTGAA
129 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTA
* * * * * * * * * *
23095 TG-ATCAAAACCATTTGTTATATGA-CATACAAAAGGTAATGACGATTTGAAATAGATAAATGTT
194 TGAATAAAAACAATTAGTT-TATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * * * * * *
23158 GAAATAGCCATAATTATTTAAAATGATTCAGTAAACAGATTCACTTTTTAAA---TCACTTATTA
258 CAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTA
* * * * * * *
23220 A-TTTTCAGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACTAAAACGA
322 ATTTTTGA-AATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAA
* ** ** * * *
23284 TTGTTTTATGATAAAACAAAATTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCTTAAC
386 TTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAAC
* ** ** * * * * *
23349 TATTTAAACTACTTCAACAAACAGATTTA-TTTTTTAAATC-CTTTAGTTCTTAATTTTCATAAT
451 TATTTGAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTC-TTAATTATTAATTTTTAGAAT
* * **
23412 ATTATTAAATTATTATTATTTTATTTTGA
515 ATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAA
* * * * * * * *
23441 ATAAGCTTGTATGAACTGAAAC-ATT-TATTTATAATAGAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
23504 AGGTAATTATTCAAATA---AGAAC----T--AC-T-TT--GATAAATAGATTTATTTTTTAAAT
65 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAAT
*
23556 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTATTCCAAACAAGCTTGTAT
130 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTAT
* * * *
23620 -AATGAAAAACAATT-GTTTTATGACAAAA-TAATGTTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
195 GAAT-AAAAACAATTAG-TTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT
* * * ** * *
23682 GAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTTGGTAAACAG-TTTCACTTTTTAAA---TCACTTATT
258 CAAATAGTCATAACTATTTGAATTG-TTCAGTAAACAGATTT-ATTTTTTAAATTTTTACTTATT
* * * *
23743 AATTTTTGAAATATTAA-TAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAGGATT-TAATGAAATGAAAC
321 AATTTTTGAAATATTAATTAATTTA-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGT-ATGAATTGAAAC
** ** * * * * **
23806 AATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAATAGTCGCA
384 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * ** ** *
23871 ACTATTTGAATTTGTTAAAAAAAT-GTATTTATTTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAATTTTTAAA
449 ACTATTTGAACTTGTTCAGTAAATAG-ATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGA
* ***
23935 ATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGG
513 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAA
* * * * *
23966 TTAATCTTTTATGAACT-AAAGCAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTTAAA
1 ATAAGCTTATATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAA
* * * * * * *
24029 TA-ATTAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTATT-TGGTAAACATATTTATTTTTCAA
64 TAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * **
24092 ATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCTGAATAAAGCTT
128 ATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAAT-AAGCTT
* * * *
24156 ATATG-ATATGAAACAAATATTTTATGACTAAAA
191 GTATGAATA-AAAACAATTAGTTTATGA-TAAAA
24189 ATAGGTTAGA
Statistics
Matches: 5617, Mismatches: 1138, Indels: 797
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
493 1 0.00
494 92 0.02
495 57 0.01
496 4 0.00
497 5 0.00
498 3 0.00
499 1 0.00
500 5 0.00
501 1 0.00
504 2 0.00
505 10 0.00
506 70 0.01
507 5 0.00
508 5 0.00
509 35 0.01
510 6 0.00
511 2 0.00
513 79 0.01
514 5 0.00
515 61 0.01
516 2 0.00
517 18 0.00
518 35 0.01
519 1 0.00
520 3 0.00
521 75 0.01
522 197 0.04
523 173 0.03
524 274 0.05
525 175 0.03
526 242 0.04
527 40 0.01
528 4 0.00
529 6 0.00
530 47 0.01
531 336 0.06
532 263 0.05
533 157 0.03
534 243 0.04
535 122 0.02
536 47 0.01
537 141 0.03
538 216 0.04
539 202 0.04
540 268 0.05
541 148 0.03
542 157 0.03
543 544 0.10
544 277 0.05
545 124 0.02
546 4 0.00
547 8 0.00
548 206 0.04
549 10 0.00
550 3 0.00
551 8 0.00
552 233 0.04
553 79 0.01
554 29 0.01
555 2 0.00
557 49 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (542 bp):
ATAAGCTTATATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGATAAACAAATTTATTTTTTAAATC
TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATG
AATAAAAACAATTAGTTTATGATAAAACAAATGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA
ATAGTCATAACTATTTGAATTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTT
TTGAAATATTAATTAATTTATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTT
TTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT
GAACTTGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTAGAATATTAAT
AAATTAGTATTATTTTATTCAA
Found at i:18488 original size:160 final size:166
Alignment explanation
Indices: 18307--18634 Score: 379
Period size: 160 Copynumber: 2.0 Consensus size: 166
18297 AATAAGCTTG
* * ** *
18307 TATGAATAAAAACTATTGTTTTATAATAGAACAAAAAGTCAAAATGATTTGAAATA-ATTAATTG
1 TATGAACAAAAACTATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGA-TAATTA
* * *
18371 CTCAAATAGTCA-ACT-ATTTGAACTAGATT-GACAAAAAGATTTATTTTTTAAA-TC-T-CTTA
65 CTCAAATAGTCATAATCATTAGAACTAG-TTAGACAAAAAGAATTATTTTTTAAACTCTTACTTA
* *
18430 TTAATTTTTGAAATAT-TAATAGATT-TTTTTATTTTAT
129 TTAATTTTTGAAATATCT-ATAAATTCATTTTATTTTAT
* * * *
18467 TATGAACAAAAAC-ATTTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTA
1 TATGAACAAAAACTA-TTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTA
* ** *
18531 TTCAAATAGTCATAATCATTAGAACTAGTTAGGTAAATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA
65 CTCAAATAGTCATAATCATTAGAACTAGTTAGACAAAAAGAATTATTTTTTAAA-CTCTTACTTA
18596 TTAATTTTTGAAATATCTATAAATTCATTTTATTTTAT
129 TTAATTTTTGAAATATCTATAAATTCATTTTATTTTAT
18634 T
1 T
18635 TCAAATAAGC
Statistics
Matches: 139, Mismatches: 18, Indels: 15
0.81 0.10 0.09
Matches are distributed among these distances:
159 1 0.01
160 62 0.45
161 5 0.04
162 29 0.21
164 2 0.01
165 1 0.01
166 26 0.19
167 13 0.09
ACGTcount: A:0.42, C:0.07, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (166 bp):
TATGAACAAAAACTATTGTTTTATAATAAAACAAAAAGTCAAAACAATTTGAAATAGATAATTAC
TCAAATAGTCATAATCATTAGAACTAGTTAGACAAAAAGAATTATTTTTTAAACTCTTACTTATT
AATTTTTGAAATATCTATAAATTCATTTTATTTTAT
Found at i:19088 original size:16 final size:18
Alignment explanation
Indices: 19067--19102 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.1 Consensus size: 18
19057 TAACAATGAT
19067 TTGAAAT-A-GATAATTA
1 TTGAAATGACGATAATTA
19083 TTGAAATGACGATAATTA
1 TTGAAATGACGATAATTA
19101 TT
1 TT
19103 TGAACTAATT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 7 0.39
17 1 0.06
18 10 0.56
ACGTcount: A:0.44, C:0.03, G:0.14, T:0.39
Consensus pattern (18 bp):
TTGAAATGACGATAATTA
Found at i:20662 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 20330--20664 Score: 413
Period size: 180 Copynumber: 1.9 Consensus size: 180
20320 GGCCAAAATG
* * *
20330 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCTTAACCATTTGAACTTATTTGATAAACAAATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCTTAACCATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTTATT
* * *
20395 TTTTAAATCTCTTACATATTAATTTTTAAAATATTATTGAATTAGTATTATTTAAATCCAAATAA
66 TTTTAAATCTCTTACATATTAAGTTTCAAAATATTATTGAAATAGTATTATTTAAATCCAAATAA
* *
20460 ACTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACA
131 AATAGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACA
* * ** * *
20510 ATTTGAAATAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAAC-TAGTTCGACAATTAGATTTGT
1 ATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCTTAACCATTTGAACTTA-TTCGACAAACAAATTTAT
* * *** * * **
20574 TTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTCAAAATATTATT-AAATAGTATTATTTTATTCTGAATA
65 TTTTTAAATCTCTTACATATTAAGTTTCAAAATATTATTGAAATAGTATTATTTAAATCCAAATA
* *
20638 AAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTT
130 AAATAGTATGAACA-AAACAATTGTTT
20665 GACGAAAAAA
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 25, Indels: 4
0.82 0.16 0.03
Matches are distributed among these distances:
179 33 0.26
180 95 0.74
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (180 bp):
ATTTGAAATAGATAATCATTCAAATAGTCTTAACCATTTGAACTTATTCGACAAACAAATTTATT
TTTTAAATCTCTTACATATTAAGTTTCAAAATATTATTGAAATAGTATTATTTAAATCCAAATAA
AATAGTATGAACAAAACAATTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAACA
Found at i:21479 original size:161 final size:164
Alignment explanation
Indices: 21171--21481 Score: 382
Period size: 164 Copynumber: 1.9 Consensus size: 164
21161 ATGAGAAGAC
** * *
21171 AAAAGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCACTCAG
1 AAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTCACTCAG
* * * *
21236 TAAATAGATTTTATTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATTTTAATAAATTAGTATT
66 AAAACAGATTTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
**
21301 ATTTTATACTGAATAAGCTTTTATGAACAAAAAT
131 ATTTTATACAAAATAAGCTTTTATGAACAAAAAT
** ** *
21335 AAAAGATCATAACAATTTGAAATGGATAATTGTTCAAATAGAT-ATAACTATTTCAACGT-GTTT
1 AAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTCAAC-TCACTC
* **
21398 AGAAAACAGA-TTTA-TTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAGTTTA-T
64 AGAAAACAGATTTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAAT-AAATTAGT
*
21459 ATTATTTTATTCAAAATAAGCTT
128 ATTATTTTATACAAAATAAGCTT
21482 ACATGAATAG
Statistics
Matches: 125, Mismatches: 19, Indels: 9
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
161 48 0.38
162 13 0.10
163 4 0.03
164 58 0.46
165 2 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.08, T:0.44
Consensus pattern (164 bp):
AAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTCAACTCACTCAG
AAAACAGATTTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATT
ATTTTATACAAAATAAGCTTTTATGAACAAAAAT
Found at i:23685 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 23664--23699 Score: 56
Period size: 16 Copynumber: 2.1 Consensus size: 17
23654 TCATAATGAT
23664 TTGAAATAG-ATAATTA
1 TTGAAATAGCATAATTA
23680 TTGAAATAGCCATAATTA
1 TTGAAATAG-CATAATTA
23698 TT
1 TT
23700 TGAATTGATT
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 0, Indels: 2
0.90 0.00 0.10
Matches are distributed among these distances:
16 9 0.50
18 9 0.50
ACGTcount: A:0.44, C:0.06, G:0.11, T:0.39
Consensus pattern (17 bp):
TTGAAATAGCATAATTA
Found at i:23758 original size:524 final size:528
Alignment explanation
Indices: 21405--23998 Score: 1622
Period size: 524 Copynumber: 4.9 Consensus size: 528
21395 TTTAGAAAAC
* * * **
21405 AGATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGTAATATTAATCAGTTTA-TATTATTTTAT
1 AGATTTATTTTTTAAA-TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTAT
** * ** * * * * * * * *
21469 TCAAAATAAGCTTACATGAAT-AGAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGGTCATGATGTTT
64 TCCGAACAAGCTTGTAT-AATCAAAAACATTTGTTTTATG---ACA-AAAAATGTTATAATGATT
* * * * * * *
21533 TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTG-TTCGGTAAACAGATTTATTT
124 TGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAA--TTGATTAGGTAAACAGATTCACTT
* * *
21596 TTTAAGTCTCTTACTCATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA
187 TTTAA--ATC--ACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATT-TTATTATTTTATTTCAAATAA
* * * * * * * ** ** *
21660 GCTTATT-TGAATTGAAATAGTTGTCTTATTACAAAACAGAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTT
246 GCTT-TTATGAAATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGAT
* * * * * * * ** * * *
21724 AATTATTCAAATAATCATGACTATTTCAACTTGTTCAGTAAACATATTTATTTTTTTAAATATTT
310 AATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAAC-TATTCAACAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCT
** * * * * * * **
21789 TACATATTAATTATCAAAATATTAAT-AATTAATATTTTTTTAATCCGAAT-AGCCTTGTATGAA
373 TAGTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG-CTTGTATGAA
* * * * * * * * *
21852 C-AGA-AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGAGTCATAGCAATTCGAAATAAATAATTGTTCA
437 CTA-ACAATAATTGTTTTATAATAGAACAAAAG-GTTATAACAATTTG--A-AGATAA-TGGTCA
* * ** * *
21914 TATAGTCATAACATT-T-GAACTTGTTCGATAAAC
496 AATAGTTAT-A-ATTATAGAACTACTTTGATAAAT
* * * * *
21947 AAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCT-TAGTATTAATAATTTTGTATTATTTTA
1 AGATTTATTTTTTAAATC--TTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * * *
22011 TT-C-AAAATAG-TT-T-GAA-CAAAAAAATTTATTTTATGTCAAAACAAAATGTTATAGTGATT
63 TTCCGAACA-AGCTTGTATAATCAAAAACATTTGTTTTATG--ACAA-AAAATGTTATAATGATT
* * * * * * *
22070 TCAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT-ATTCA-GTAAATAGATT--TTT
124 TGAAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAA-TTGATT-AGGTAAACAGATTCACTT
* * ** * *
22131 TTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTTGGAATATTAAT---TGGTATTATTTTATTTCGAATAAAC
187 TTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTATTATTTTATTTCAAATAAGC
* ** * * * *** **
22193 TTATATGAACCGAAACAAATCTTTTATGACAAAACAAAGGGTCATAATGATTTGAAATAGATAAT
248 TTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAAT
* * * * * * ** * **** * * * *
22258 TATTGAAATAATCATGACTATTTGGTCTGGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAAAT-TTTTAC
313 TGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACT-ATTCAACAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAG
* * * * * * * * *
22322 TTATTAATTATCAAAATATTAATAAATTAGTATTGTTTTAATCTGAATAAGCATGTA-CAAATAG
376 TTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA-
* * * * * * * * * *
22386 A-AACAAATGTTTTATAATAGGACAAAAAGTCAAAAGAATTTGAAATAAATAATTTGCCAAATAG
440 ACAATAATTGTTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTG--A-AGATAA-TGGTCAAATAG
* * * **
22450 TCATAACTATTTGAACTGGTTTGAT-AAT
501 TTATAATTA-TAGAACTACTTTGATAAAT
* * * * *
22478 ATATTTATTTTTTAAATC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAGATGAGTATTACTTTATTT
1 AGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
* * *
22541 CGAACAAACTTATATGAA-CAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTGTAATGATTCT-
66 CGAACAAGCTTGTAT-AATCAAAAACATTTGTTTTATGAC--AA-AAAATGTTATAATGATT-TG
* * * * * * *
22604 AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAATTATTTGAATTGGTTAGGTCAACAAAAAT-ATTTTTT
126 AAATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTAGGTAAAC-AGATTCA-CTTTT
* *
22668 TAAAATATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTCATT-TTATTTTATTCCGAATCAA
189 T--AA-ATC--ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT--TTATTATTTTATTTCAAAT-AA
** * ** * * ** *
22732 -CTAGTATGAATTGAAA-TTTTGTTTTATGACAAAGCAAAAGGTCATAACATTTTGAAATAGATA
246 GCTTTTATGAAATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATA
* ** * *
22795 ATTGTTCATATAGTCTTAAATATTTGAACTGATTCGTCAAACAAATTTA-TTTTTAATTCTCTTA
311 ATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACT-ATTCAACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
* * * ***
22859 GTTATTAATTTTTAGAATATTATTATATTAGTACTATTTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAAC-A
375 GTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTA
* * *
22923 ACAATAATTGTTTTGTGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAG
440 ACAATAATTGTTTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAG-AT--AA-TGGTCAAATAG
* ** *
22988 TTATAATTATTTGAACTGGTTTGATAAAC
501 TTATAATTA-TAGAACTACTTTGATAAAT
* * *
23017 AGATTTTATTTTTTAAA--TTACTTATTAATTTTTAAAAGATTAATAAATTAGTATTATTGTATT
1 AGA-TTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * * *
23080 CTGAATAAGCTTGAATGATCAAAACCATTTGTTATATGACATACAAAAGGTAATGACGATTTGAA
65 CCGAACAAGCTTGTATAATCAAAAACATTTGTTTTATGACA-A-AAAATGTTATAATGATTTGAA
* * *
23145 ATAGATAAATGTTGAAATAGCCATAATTATTTAAAATGATTCA-GTAAACAGATTCACTTTTTAA
128 ATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATT-AGGTAAACAGATTCACTTTTTAA
*
23209 ATCACTTATTAA-TTTTCAGAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATG
192 ATCACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTT-TATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATG
* * * *
23273 AACTAAAACGATTGTTTTATGATAAAACAAAATTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
255 AAATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAT
* *
23338 ATAGTCTTAACTATTTAAACTACTTCAACAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTTAGTTCTTAA
320 ATAGTCTTAACTATTTGAACTA-TTCAACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTAGTTATTAA
* * * * *
23402 TTTTCATAATATTATTAAATTATTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTGA-AA-CAT
383 TTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAACAATAAT
* ** *
23465 T-TATTTATAATAGAAGAAAAGGTTATAATGATTTGAA-AT-A-GGT-AATTA-TTCA-AA-TA-
448 TGT-TTTATAATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGATAATGGTCAAATAGTT-ATAATTAT
23521 AGAACTACTTTGATAAAT
511 AGAACTACTTTGATAAAT
23539 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTA-TATTTTAT
1 AGATTTATTTTTTAAA--TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * *
23603 TCCAAACAAGCTTGTATAATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAATAATGTTCATAATGATTTGA
64 TCCGAACAAGCTTGTATAATCAAAAACATTTGTTTTATGACAAAA-AATGTT-ATAATGATTTGA
* * *
23668 AATAGATAATTATTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTTGGTAAACAGTTTCACTTTTTAA
127 AATAGATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTAGGTAAACAGATTCACTTTTTAA
* * *
23733 ATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAGGATTTAATGA
192 ATCACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT-TTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGA
* ** * * * *
23798 AATGAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATATACAATTGTTCAAA
256 AATGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATA
** * * *
23863 TAGTCGCAACTATTTGAA-TTTGTTAA-AAAAATGTATTTATTTTTTTAAATCTCTT-GTTTATT
321 TAGTCTTAACTATTTGAACTAT-TCAACAAACA-G-ATTTA-TTTTTTAAATCTCTTAG-TTATT
** ** * * **
23925 AATTTTTAAAATATTAAAAAATTAGTATTATTTTATTTTGGTTAATCTTTTATGAACTAA-AGCA
381 AATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAACAATA
23989 ATTGTTTTAT
446 ATTGTTTTAT
23999 GACAAAACAA
Statistics
Matches: 1666, Mismatches: 296, Indels: 196
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
521 13 0.01
522 24 0.01
523 10 0.01
524 238 0.14
525 112 0.07
526 15 0.01
527 37 0.02
528 3 0.00
529 8 0.00
530 41 0.02
531 216 0.13
532 104 0.06
533 55 0.03
534 115 0.07
535 111 0.07
536 34 0.02
537 69 0.04
538 150 0.09
539 138 0.08
540 107 0.06
541 9 0.01
542 20 0.01
543 36 0.02
544 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (528 bp):
AGATTTATTTTTTAAATCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
CGAACAAGCTTGTATAATCAAAAACATTTGTTTTATGACAAAAAATGTTATAATGATTTGAAATA
GATAATTGTTGAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTAGGTAAACAGATTCACTTTTTAAATCA
CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAAATGA
AACAATTGTTTTATGATAAAACAAAATATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTC
TTAACTATTTGAACTATTCAACAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAA
ATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAACTAACAATAATTGTTTTAT
AATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAGATAATGGTCAAATAGTTATAATTATAGAACTACTT
TGATAAAT
Found at i:27070 original size:361 final size:355
Alignment explanation
Indices: 26540--27534 Score: 886
Period size: 361 Copynumber: 2.8 Consensus size: 355
26530 AATTATTTTT
* * *
26540 ATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACACATTTATTTTTTAAA-TC--TCTTATTAATT
1 ATAG-TTTAACTATTTGAACTCGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTCTTTCTTATTAATT
* *
26602 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG-ATAAAAAATAATTG
65 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AAAAACAATTG
* *** * *
26666 TTTGATAACAAAACAAATAGTTATCGCT-ATTTGGAATAGATAATTATTCAAATTGCCATAATTA
128 TTTGATGACAAAACAAA-AGTTA-AAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CATAATTA
* *
26730 TTTAATTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAAATATTAA
190 TTAAAATGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA-AAATATTAA
* * ** *
26795 TAAATTTGTATTATTTTATAT-CATATAAACTCGTATTAACTAAAACAATTTTTTTATGA-AAAA
254 TAAATTTGTATTATTTTATATCCAAATAAACTCATACGAACTAAAA-AATTGTTTTATGAGAAAA
* * **
26858 GCAAAAGGT-ATAGTGATTTTAAATAGACAATTGTTCAA
318 G-AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATCATTCAA
* * * *
26896 ATAGTTATAACTATTTGAGCTTGTTCGATAAATAGACTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTTTTAA
1 ATAGTT-TAACTATTTGAACTCGTTCGATAAATAGATTTATTTT-TTAAAT-TCTTTCTTATTAA
* * *
26961 TTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGCATGAATTAAAACAAT
63 -TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATT-TGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAAT
* * * * ** *
27025 TGCTTT-ATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAACAGATAATTGTTCTGATAGTATTAAT
126 TG-TTTGATGACAAAACAAAA-GTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCA-TAAT
* * **
27089 CATATAAACT-AGTTCAATAAACAAA-TT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATA
188 TAT-TAAAATGA-TTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AAAATA
* * * *
27151 TTATTAAATTTATATTATTTTA-ATCCAAATAAGCTTATACGAACTAAAAAATTGTTTTATGAGA
250 TTAATAAATTTGTATTATTTTATATCCAAATAAACTCATACGAACTAAAAAATTGTTTTATGAGA
* * * * *
27215 AAAGAAATGGTCATAATTATTTGAAATTGATAATCATTCAT
315 AAAGAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGACAATCATTCAA
* * * * * ** *
27256 ATAGTCTTAACTATTTGAACTCGTTCAACAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAG
1 ATAGT-TTAACTATTTGAACTCGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAA-ATTCTTTCTTATTAAT
* * * ** * * *** * *
27321 TTTCGAAATATTATTAAATTAGTATT-ATTTCATTTCAAATAAAATAGTATAAACCGAACCAATC
64 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTT-ATTT-GAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATT
* * * * *
27385 GTTTGATGACCAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCAAAACTA
127 GTTTGATGACAAAAC-AAAAGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CATAATTA
* * * * ** * *
27450 CATGAAATGGTTTGGTAAACCGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTTTTAAATATTA
190 -TTAAAATGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAAAATATTA
*
27515 ATAAATTAGTATTATTTTAT
253 ATAAATTTGTATTATTTTAT
27535 GACAAAACAA
Statistics
Matches: 508, Mismatches: 98, Indels: 60
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
355 2 0.00
356 36 0.07
357 5 0.01
358 12 0.02
359 129 0.25
360 145 0.29
361 149 0.29
362 30 0.06
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (355 bp):
ATAGTTTAACTATTTGAACTCGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATTCTTTCTTATTAATTT
TTGAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTATTTGAATAAGCTTGTATGAATAAAAACAATTGTTT
GATGACAAAACAAAAGTTAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCATAATTATTAAAA
TGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAAAATATTAATAAATTT
GTATTATTTTATATCCAAATAAACTCATACGAACTAAAAAATTGTTTTATGAGAAAAGAAAAGGT
CATAATGATTTGAAATAGACAATCATTCAA
Found at i:27184 original size:179 final size:178
Alignment explanation
Indices: 26540--27533 Score: 498
Period size: 181 Copynumber: 5.5 Consensus size: 178
26530 AATTATTTTT
* * * * * * *
26540 ATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTTCGATAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTA--ATT
1 ATAGTTATAACTATATAAACTAGTTCAATAAACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * *** * *
26602 TTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATA-AAAAATAATT
65 TTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGA-ACTAAAACAATT
* * * ** * * * *
26665 GTTTGATAACAAAACAAATA-GTTATCGCT-ATTTGGAATAGATAATTATTCAA
128 GTTTTATGA-AAAACAAA-AGGTCAT-AATGATTTGAAACAGACAATTGTTCAA
* ** * * * **
26717 ATTGCCATAATTAT-TTAA-TTGATTTGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
1 ATAGTTATAACTATATAAACTAG-TTCAATAAACAAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * *
26780 TTTTAGAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATAT-CATATAAACTCGTATTAACTAAAACAAT
64 TTTTA-AAATATTAATAAATTTATATTATTTTA-ATCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * *
26844 TTTTTTATGAAAAAGCAAAAGGT-ATAGTGATTTTAAATAGACAATTGTTCAA
127 TGTTTTATGAAAAA-CAAAAGGTCATAATGATTTGAAACAGACAATTGTTCAA
* * * * * * * * *
26896 ATAGTTATAACTATTTGAGCTTGTTCGATAAATAGACTTATTTTCTTAAATCTCTTTCTTTTTAA
1 ATAGTTATAACTATATAAACTAGTTCAATAAACA-AATTATTTT-TTAAATCTCTTACTTATTAA
** * * * ** * *
26961 TTTTTTGAATGTTAATAAA-TTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTGCATGAATTAAAACAAT
64 -TTTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * * **
27025 TGCTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAACAGATAATTGTTCTG
127 TGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAACAGACAATTGTTCAA
27078 ATAG-TATTAA-TCATATAAACTAGTTCAATAAACAAATT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
1 ATAGTTA-TAACT-ATATAAACTAGTTCAATAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * *
27140 TTTTCAAAATATTATTAAATTTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATACGAACTAAAA-AATT
64 TTTT-AAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATT
* * * ** * ** *
27204 GTTTTATGAGAAAAGAAATGGTCATAATTATTTGAAATTGATAATCATTCAT
128 GTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAACAGACAATTGTTCAA
* * * * ** * * * * **
27256 ATAGTCT-TAACTATTTGAACTCGTTCAACAATTAGATTTATCTTTTAATTTTCTTGGTTATTAA
1 ATAGT-TATAACTATATAAACTAGTTCAATAAACA-AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
** * * * * ** * * ** *
27320 GTTTCGAAATATTATTAAA-TTAGTATTATTTCATTTCAAATAAAATAGTATAAACCGAACCAAT
64 -TTTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* * * * * * * * *
27384 CGTTTGATGACCAAACAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAT
127 TGTTTTATGA-AAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAACAGACAATTGTTCAA
* * * * *** * * *
27437 ATAGTCAAAACTACATGAAA-TGGTTTGGTAAACCGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTGATTAA
1 ATAGTTATAACTATAT-AAACTAGTTCAATAAA-CAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
*
27501 TTTTTTAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA
64 -TTTTAAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTA
27534 TGACAAAACA
Statistics
Matches: 621, Mismatches: 160, Indels: 68
0.73 0.19 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.00
176 32 0.05
177 12 0.02
178 71 0.11
179 106 0.17
180 140 0.23
181 203 0.33
182 54 0.09
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.09, T:0.43
Consensus pattern (178 bp):
ATAGTTATAACTATATAAACTAGTTCAATAAACAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
TTAAAATATTAATAAATTTATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTT
TTATGAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAACAGACAATTGTTCAA
Found at i:27942 original size:181 final size:175
Alignment explanation
Indices: 27631--28473 Score: 730
Period size: 181 Copynumber: 4.7 Consensus size: 175
27621 ATAGAATTAT
* * *
27631 TTTTTAAATCTCTTACATATTAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTATTTTATTTCGAATA
1 TTTTTAAATCTCTT--ATA-T-AATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATA
* * ** * *
27696 AACTTGTAT-AAGATGAAATAATTGGTTTATGATAGAATAAAAGGTTATAACGATTTGAAATAGA
61 AACTTGTATGAACA-GAAACAATTATTTTATGATA-AACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGA
* * * * * *
27760 TAACTATTCAAATAGTCTTTACTGTTGGAATTGATTC-AGCAAACGGATTTAA
124 TAACTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGA-TAAACAGATTTAA
* *
27812 TTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTTATAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATA
1 TTTTTAAATCTCTTA--TAT-AATTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAATA
* *
27877 AACTTGTATGAACAGAAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAGATAGAT
61 AACTTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGATA-AACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGAT
* *
27942 AACTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAATT-ATTTCGATAAATAGATTT-A
125 AACTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGA-TTCGATAAACAGATTTAA
* * * *
27992 TTTTTAAATCTCTTA-CTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC
1 TTTTTAAATCTCTTATATAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT-GAATAAAC
*** * * * * * * * *
28056 TTGTATGTTGAAAAAGAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAAAATATAAT
64 TTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGAT-AAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAAC
* * * * * *
28121 TATTCGAATGGTCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACTGATTTAT
128 TATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAACAGATTTAA
* * *
28169 TTTTTAAATCTCTTAT-TAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGC
1 TTTTTAAATCTCTTATATAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTTGAATAAAC
* ** * * * * **
28233 TTTTTATGAATTGAAACAATTTTTTTATGACAAAAAAAAAGTTCATAACAATTTTCAATAGATAA
64 -TTGTATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAACAAAAGGTT-ATAACAATTTGAAATAGATAA
* * * * * * * *
28298 TTTTTCAAATAATAATAACTATTTGAGCTTG-TTTGATAAACATATTTAT
127 CTATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ATTGATTCGATAAACAGATTTAA
* * *
28347 TTTTTCAAATATCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGAAT
1 TTTTT-AAATCTCTTA--TA-TAA-TTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TGAAT
* * **
28412 AAACTTATATGAACTA-AAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAAAATGATTTGAAAT
60 AAACTTGTATGAAC-AGAAACAATTATTTTATGA-TAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAAT
28474 GATTCAACAA
Statistics
Matches: 541, Mismatches: 94, Indels: 53
0.79 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 1 0.00
176 128 0.24
177 67 0.12
178 80 0.15
179 12 0.02
180 25 0.05
181 138 0.26
182 41 0.08
183 44 0.08
184 5 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (175 bp):
TTTTTAAATCTCTTATATAATTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTGAATAAACTT
GTATGAACAGAAACAATTATTTTATGATAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAACTAT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAATTGATTCGATAAACAGATTTAA
Found at i:28776 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 28489--29015 Score: 530
Period size: 181 Copynumber: 2.9 Consensus size: 180
28479 AACAAATACA
* * *
28489 TTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTA-ATC
1 TTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * *
28553 TGAATAAGCTTGTATG-ATAAGAAACAATTTTTTTATAACAAAACAAAGATCATAGTAATTTGAG
66 -GAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAATAATTTGA-
* * * *
28617 ATTA-ATATTTGTTCAAATGGTCAGAACTATTTGAACTAGTTCA-GAAAACA-G
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCAGAACCATTTGAACTAGTT-AGGAAAACATG
* *
28668 CTTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTGTTGAAATATTAATGAAA-TAGTATTATTTTATT
1 -TTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * * * *
28732 TCGGATAAATTTTTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTA
64 TCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATAATTTGA
* * * * *
28797 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTATATCCATTTGAACTTGTTAGGTAAACATG
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCAGAACCATTTGAACTAGTTAGGAAAACATG
* * * *
28850 TTAATTGTTTTAAATCTCTTGCTTATTAGTTTTTTG-ACTATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 TTTAGT-TTTTAAATCTCTTGCTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * *
28914 TCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGACTAAACAAA-AGTCAGAATGATTTGA
64 TCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATAATTTGA
* * ** *
28978 AATAGATAATTGTTCTAATAATCTTAACTATTTGAACT
128 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCAGAACCATTTGAACT
29016 GGATTGGAAA
Statistics
Matches: 286, Mismatches: 50, Indels: 21
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
180 89 0.31
181 112 0.39
182 80 0.28
183 5 0.02
ACGTcount: A:0.38, C:0.08, G:0.11, T:0.43
Consensus pattern (180 bp):
TTTAGTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
GAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAGATCATAATAATTTGAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGTCAGAACCATTTGAACTAGTTAGGAAAACATG
Found at i:28794 original size:326 final size:325
Alignment explanation
Indices: 28130--28799 Score: 734
Period size: 326 Copynumber: 2.1 Consensus size: 325
28120 TTATTCGAAT
* * * * * *
28130 GGTCATAATTATTTGAACTGATTCGATAAACTGATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
1 GGTCATAATGATTTGAAATGATTCAACAAACTCATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
* * * * *
28195 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTTATGAATTGAAACAATTTTTTTA
66 AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTA
* * * *
28260 TGACAAAAAAAAAGTTCATAACAATTTTCAATAGATAATTTTTCAAATAATAATAACTATTTGAG
131 TAACAAAAAAAAAGATCATAACAATTTTCAATAGATAATTTTTCAAATAATAAGAACTATTTGAA
* * * * * * *
28325 CTTGTTTGATAAACATATTTATTTTTTCAAATATCTTACTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA
196 CTAGTTAGATAAACAGATTTAGTTTTTCAAATATCTTACTTAATAATTTGTTGAATATTAATAAA
*
28390 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAA
261 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
* *
28455 GGTTAAAATGATTTGAAATGATTCAACAAA-TACATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
1 GGTCATAATGATTTGAAATGATTCAACAAACT-CATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATT
* *
28519 TTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGC-TTGTATG-ATAAGAAACAATT
61 TTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTTGTATGAAT-AGAAACAATT
* ** * ** *
28582 TTTTTATAAC-AAAACAAAGATCATAGTAA-TTTGAGATTA-AT-ATTTGTTCAAATGGTCAGAA
125 TTTTTATAACAAAAAAAAAGATCATAACAATTTTCA-A-TAGATAATTT-TTCAAATAATAAGAA
* * *
28643 CTATTTGAACTAGTTCAGA-AAACAGCTTTAGTTTTT-AAATCTCTTGCTTAATAA-TTGTTGAA
187 CTATTTGAACTAGTT-AGATAAACAGATTTAGTTTTTCAAATATCTTACTTAATAATTTGTTG-A
* * * * * * *
28705 ATATTAATGAAA-TAGTATTATTTTATT-TCGGATAAATTTTTATGAATTGAAATAATTGTTTTA
250 ATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTATTTTA
28768 TGACAAAACAAAA
313 TGACAAAACAAAA
*
28781 GGTCATAATGATTTTAAAT
1 GGTCATAATGATTTGAAAT
28800 AGATAATTGT
Statistics
Matches: 285, Mismatches: 47, Indels: 25
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
324 1 0.00
325 43 0.15
326 101 0.35
327 63 0.22
328 29 0.10
329 48 0.17
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (325 bp):
GGTCATAATGATTTGAAATGATTCAACAAACTCATTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGA
AATATTAATAAAGTAGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTTGTATGAATAGAAACAATTTTTTTA
TAACAAAAAAAAAGATCATAACAATTTTCAATAGATAATTTTTCAAATAATAAGAACTATTTGAA
CTAGTTAGATAAACAGATTTAGTTTTTCAAATATCTTACTTAATAATTTGTTGAATATTAATAAA
TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAACTTATATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA
Found at i:29164 original size:152 final size:151
Alignment explanation
Indices: 28888--29167 Score: 354
Period size: 152 Copynumber: 1.8 Consensus size: 151
28878 GTTTTTTGAC
* * *
28888 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAATAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTAATATCAAATAAGCTTGTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGA
* *
28953 CTAAACAAAAGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAATCTTAACTATTTGAACTGG
65 CTAAACAAAAGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAATCATAACTATTTGAACTGG
29018 ATTGGAAAAACACATTTAATTT
130 ATTGGAAAAACACATTTAATTT
* * *
29040 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAA-AAGAAGCAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTAATATCAAATAAGCTTGTATGAACAA-AA-CAATTATTTTAT
* ** *
29103 GAC-AAA-ATAAAGATCATAACGATTTGAGCTAGATAATTGTT-TAAGTAGTCATAACTATTTGA
63 GACTAAACA-AAAG-TCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAA-TAATCATAACTATTTGA
29165 ACT
125 ACT
29168 AATTCAGTAA
Statistics
Matches: 110, Mismatches: 12, Indels: 12
0.82 0.09 0.09
Matches are distributed among these distances:
150 3 0.03
151 12 0.11
152 90 0.82
153 5 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.12, T:0.39
Consensus pattern (151 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTAATATCAAATAAGCTTGTATGAACAAAACAATTATTTTATGAC
TAAACAAAAGTCAGAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAATCATAACTATTTGAACTGGA
TTGGAAAAACACATTTAATTT
Found at i:29660 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 29040--31890 Score: 2022
Period size: 181 Copynumber: 15.9 Consensus size: 180
29030 CATTTAATTT
* * * * * *
29040 TATTATTAAATTAGTATTATCTTAATAT-GAATAAGCTTGTATGAAAAGAAGCAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * ** * * *
29104 ACAAAATAAAGATCATAACGATTTGAGCTAGATAATTGTTTAAGTAGTCATAACTATTTGAACTA
65 ACAAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * * **
29169 ATTC-AGTAAACATATCTAGTTTTTAAA--TCTT--TGATTAATTTTCAAAA
130 GTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * ** *
29216 TATTAGTAAATCAATATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTACG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
29280 ACAAAATAAAAGGTCATAA-GATTTGAATTAGATAATTATTCAAATCGACATGACTATTTGAATT
65 ACAAAA-AAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * ** *
29344 TGTTTGTTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAC-CATTAATTTTT-AGAA
129 TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * *
29395 TATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* ** * * * * *
29459 TAAAACAAAATATCATAACTATTCGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTT
66 CAAAA-AAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * *
29524 GCTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAA
130 GTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * *
29575 TACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * *
29640 CAAAAAAAAGGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTGTTTGAA-TG
66 CAAAAAAAA-GGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-
* * *
29704 TGTTTAGA-AAATATATTTATTTTTAAAAT-T-TTGACTTATTAATTTTTGAAA
129 TG-TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTATTAATTTTTGAAA
* *
29755 TATTAATAAATTTA-TATTATTCTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * *
29819 ACAAAATAGAAGGTCA-AAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAATAG-CAATGACTATTT-AA
65 ACAAAA-AAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTGAA
* * * * *
29881 GCTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTAGGAA
127 -CTTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * **
29936 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCCTATATGAACTA-ATACAATTGTTTTAAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
30000 ATCAAACAAAAGGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACT
65 A-CAAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
30065 TTTTC-AGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTTGTCAAA
129 TGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * *
30116 GTATTAATAAATTAATATTATTTTAATTT-GAATAAGCTTGTGTGAACAAAAATAATTG-TTTAT
1 -TATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * *
30179 GAAAAAATAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
64 GACAAAA-AAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
30244 TTTTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTATTTTTTAATTTTTTG-AA
128 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAA
* * * *
30297 TATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAA-AATTGTTTTAT-
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAG-AAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
30360 ACCAAAATAAAAAAGAT-ATAGCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTTA
65 A-C--AA-AAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* *
30424 ACTTGTTC-AGTAAACAGATTCT-TTTTTTAAA-ATC-T-CTTATTAATTTCTTG-AA
126 ACTTGTTCGA-TAAATAGATT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAA
** * * * * * *
30476 TATTAATAAGCTAGAATTATGTTATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTGTGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
30541 TAACACAAAAGGTTATAA-TGATTTGAAATATATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTTGCA-T
66 CAA-AAAAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
30604 TAG-GCAGGCT-AACAGATTCATTTTTTAAAT-TCATTAGTTATTAAATTTT-AGAA
129 T-GTTC--GATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AA
* * * * * * * *
30657 TAATAATAAGTTAGCAATACTTTA-TTCTGAATAAGATTGTATG-ACTAGAAACATTTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTAT
* * * *
30720 GACAAAACAACTA-GTCATAA-TAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTGA
64 GACAAAA-AA-AAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
* * * * * * * **
30782 GC-TGATT-TATTTAACAAATTTATTTTTTTAACTCTCTTATTTATTAATTTTCAAAA
126 ACTTG-TTCGA-TAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * * * *
30838 TAGTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACA-AA-TTTATTTGAA-A-AAA-ATTTTATTTTA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAA-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACA-ATTGTTTTA
* * * * * * *
30898 TGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATCGATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTGAG
63 TGAC-AAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* ** * * * *
30963 CTGGTTC-AGCGAATGGAATTATTTTTTAAATCTTTTACTAATT--TTTTTGAAA
127 CTTGTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * ** * * * *
31015 TATTAATAGATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTA-AAAAAATTGTTTTAC
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * ** *
31078 AATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATACCCTTAACTATTTGAA-
64 GACAAAA-AAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * *
31142 TTGGTTC---AAATAAATTTATTGTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTGAAAA
128 TT-GTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AAA
* * * * * * *
31193 TATTATTATATTAGTGTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTACGAACATAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * *
31258 CAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAACTG
66 CA-AAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* *
31323 GTTC-AGTAAACAGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTG--A
130 GTTCGA-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * * *
31371 CA-T-ATAAATTACTATTATTTTATTCCAAATAGGATTGTATGATA-A-AAACAATTGTTTTATT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGA-ACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
31432 ACAAAACAAAAGTTTATAA-TGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATGGCCATAATTATCTGAAC
65 ACAAAA-AAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** * ** * *
31496 TAATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTTTAAAA
128 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* * * * **
31549 TATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTAGATAAGCTAT-TATGAATTGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCT-TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
31613 ATAAAATAAAAGGTCATAA-TGGTTTTAAGTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAAC
65 ACAAAA-AAAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * *
31677 TTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAATTTCATGCTTATTAATTTTT-AAA
128 TTGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
* ** ** * * * *
31729 TGTTAATAAAACAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATAAACTA-AAACAATTATTTTATA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
31793 ACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-T
65 AC-AAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * *
31857 TGTTCGACAGACACATCTATTTTTTAAATC-CTTA
129 TGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA
31891 ATACTAATTT
Statistics
Matches: 2100, Mismatches: 451, Indels: 246
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.00
175 79 0.04
176 197 0.09
177 62 0.03
178 239 0.11
179 323 0.15
180 498 0.24
181 593 0.28
182 94 0.04
183 10 0.00
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAAAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
TTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA
Found at i:29909 original size:361 final size:359
Alignment explanation
Indices: 29069--31860 Score: 2055
Period size: 361 Copynumber: 7.8 Consensus size: 359
29059 TCTTAATATG
* * * * **
29069 AATAAGCTTGTATGAAAAGAAGCAATTGTTTTATGACAAAA-TAAAGATCATAACGATTTGAGCT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * ** * * * *
29133 AGATAATTGTTTAAGTAGTCATAACTATTTGAA-CTAATTCAGTAAACATATCTAGTTTTTAAAT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* *** * * * **
29197 C--TT--TGATTAATTTTCAAAATATTAGTAAATCAATATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTGTA
130 CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTA
** * *
29257 TGAAC-AGAAACAATTGTTTTACGACAAAATAAAAGGTCATAA-GATTTGAATTAGATAATTATT
194 TGAACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* ** * * ** *
29320 CAAATCGACATGACTATTTGAATTTGTTT-GTTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAC-CAT
257 CAAATAGTTATAACTATTTGAA-TTGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTAAAATCT-TTACTTAT
29383 TAATTTTT-AGAATATTAAT-AA-TTAGTATTATTTTATTTCG-
319 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GA
* * * * ** * *
29423 AATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGATAAAACAAAATATCATAACTATTCGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * * *
29488 AAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * *
29553 TTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATG
131 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
* * * *
29618 AAC-AGAAACAATTGGTTTATGACAAAAAAAAGGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCA
196 AACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAA-GGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* * *
29682 AATAGTTATAACTGTTTGAATGTGTTTAGAAAATATATTTATTTTTAAAAT-TTTGACTTATTAA
259 AATAGTTATAACTATTTGAAT-TGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTT-ACTTATTAA
*
29746 TTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTCTATTTGA
322 TTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGA
* * * *
29784 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAGAAGGTCAAAATGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * *
29849 AGATAATTGCTCAAATAG-CAATGACTATTTAAGCTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTTAAAT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTC-ATAACTATTTAAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
29913 CTCTTACTCATTAATTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAAAAGCCTATAT
130 CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * *
29978 GAACTAATACAATTGTTTTAAAATCAAACAAAAGGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCA
195 GAACTAAAACAATTGTTTTATAA-CAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCA
* *
30043 AATAGTTATGACTATTTGGACTT-TTTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-
259 AATAGTTATAACTATTT-GAATTGTTT-AGTAAATAGATTTATTTTTAAAATC-TTTACTTATTA
* * *
30106 ATTTGTCAAAGTATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTG-
321 ATTTTTGAAA-TATTAATAAATTTATATTATTTT-ATTTGA
* * * * * * *
30146 AATAAGCTTGTGTGAACAAAAATAATTG-TTTATGAAAAAATAAAAAGTCATAACGATTTAAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * *
30210 AAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTTTTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAAT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * *
30274 ATTTTATTTTTTAATTTTTTGAATATTAATAAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTAT
130 CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * * * *
30339 GAA-TAGCAAA-AATTGTTTTATACCAAAATAAAAAAGAT-ATAGCAATTTGAGATAGATAATTA
195 GAACTA--AAACAATTGTTTTATA--ACAA-AAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * *
30401 TTCAAATAGTCATAACCATTTTAACTTGTTCAGTAAACAGATTCTTTTTTTAAAATC--T-CTTA
255 TTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-TTGTTTAGTAAATAGATT-TATTTTTAAAATCTTTACTTA
** * * *
30463 TTAATTTCTTG-AATATTAAT-AAGCTAGAATTATGTTATTTCA
318 TTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTTGA
* * * * * * * *
30505 AATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTGTGATAACACAAAAGGTTATAATGATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
30570 ATATAATTGTTCAAACAATCATAAATATTT--GCATTAG-GCAGGCT-AACAGATTCATTTTTTA
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAGC-TT-GTTC-GG-TAAACAGATTTATTTTTTA
* * * * * * * * * * *
30631 AAT-TCATTAGTTATTAAATTTTAGAATAATAATAAGTTAGCAATACTTTA-TTCTGAATAAGAT
127 AATCT-TTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCT
* * * ** *
30694 TGTATG-ACTAGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAACTA-GTCATAATAATTTGAAATAAATAA
190 TGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAA-AA-AAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* ** * * * * * *
30757 TTGTTCAAATAGTTA-AACTAATTGAGCTGATTTATTTAACAAATTTATTTTTTTAACTCTCTTA
252 TTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTG-TTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTAAAATCT-TTA
* ** * *
30821 TTTATTAATTTTCAAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGA
314 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATT-TGA
* * * * * * *
30868 ACA-AA-TTTATTTGAA-A-AAA-ATTTTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAA
1 A-ATAAGCTTGTATGAACAGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA
* * * * * * ** ** *
30928 ATCGATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTTGAGCTGGTTCAGCGAATGGAATTATTTTTTAAA
64 ATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * * * ** *
30993 TCTTTTACTAATT--TTTTTGAAATATTAATAGATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACT
129 TCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GT
* * * * * *
31055 AAGAACTAAAAAAATTGTTTTACAATAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTT
193 ATGAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT
* ** * * * *
31120 CATATACCCT-TAACTATTTGAATTGGTT--CAAATAAATTTATTGTTT-AAATCTCTTAGTTAT
257 CAAATA-GTTATAACTATTTGAATTGTTTAGTAAATAGATTTATT-TTTAAAATCT-TTACTTAT
* * *
31181 TAA-TTTTGAAAATATTATTATA-TTAGTGTTATTTTATTTCG-
319 TAATTTTTG-AAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATTT-GA
* * * * * * *
31222 AATAAGCTTGTACGAACATAAATAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTATAACAATTTGAAAT
1 AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * * *
31287 ATAAAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAA-CTGGTTCAGTAAACAGATTTA-TTTTTAAAT
66 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT-AAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
** * * * * *
31350 CTCCTACTTATTAATTTTT-G-ACA-T-ATAAATTACTATTATTTTATTCCAAATAGGATTGTAT
130 CTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
* * * *
31411 G-A-TAAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTC
195 GAACT-AAAACAATTGTTTTATAACAAAA-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
* * ** * * * ** * * * ** *
31474 GAATGGCCATAATTATCTGAACTAATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCA
258 AAATAGTTATAACTATTTGAATTGTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTAAAATCT-TTACTTATTA
* * * *
31539 ATTTTTAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTA
321 ATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGA
* ** * * * * * *
31578 GATAAGCTAT-TATGAATTGAAACAATTGTTTTATGATAAAATAAAAGGTCATAATGGTTTTAAG
1 AATAAGCT-TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * *
31642 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAT
65 TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * * * ** ** *
31707 -TTCATGCTTATTAATTTTT-AAATGTTAATAAAACAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTA
130 CTT-TTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTA
* * * *
31770 TAAACTAAAACAATTATTTTATAACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
194 TGAACTAAAACAATTGTTTTATAAC-AAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTC
*
31835 TAATAGTCT-TAACTATTTGAATTGTT
258 AAATAGT-TATAACTATTTGAATTGTT
31861 CGACAGACAC
Statistics
Matches: 1899, Mismatches: 431, Indels: 209
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
352 2 0.00
353 66 0.03
354 71 0.04
355 119 0.06
356 172 0.09
357 114 0.06
358 137 0.07
359 184 0.10
360 337 0.18
361 491 0.26
362 167 0.09
363 38 0.02
364 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (359 bp):
AATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAGCTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC
TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATG
AACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAAAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA
TAGTTATAACTATTTGAATTGTTTAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTACTTATTAATTTT
TGAAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTTGA
Found at i:30623 original size:721 final size:715
Alignment explanation
Indices: 29262--31861 Score: 1830
Period size: 721 Copynumber: 3.6 Consensus size: 715
29252 TTGTATGAAC
** * * *
29262 AGAAACAATTGTTTTACGACAAAATAAAAGGTCATAAGATTTGAATTAGATAATTATTCAAATCG
1 AGAAACAATTGTTTTAAAACAAAACAAAAGGTCATAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
** * * ** * *
29327 ACATGACTATTTGAATTTGTTTGTTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCCAAC-CATTAATTTTT
66 TTATGACTATTTGACTTT-TTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTC
* * *
29391 AGAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTT
129 A-AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT-GAATAAACTTGTATGAA-AAAAATAATTATTTT
* * ** * *
29455 ATGATAAAACAAAATA-TCATAACTATTCGAAATAAATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTG
191 ATGAAAAAACAAAA-AGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * *
29519 AGCTTGCTCGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAATAA
255 AACTTGCTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAATAA
*
29584 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTTTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAAAAA
320 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAAAAA
* * * * * ** *
29649 GGGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTGTTTGAATGTGTTTAGAAA
385 AGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAATGTGTTCAGAAA
* * * ** *
29714 ATATATTTATTTTTAAAATTTTGACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTATATTATTCTA
450 ACAGATTTATTTTTAAAATTCT-ACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGCTAAATTATTCTA
* * * * *
29779 TTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAGAAGGTCAAAATGATTT
514 TTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTT
* * * * *
29844 GAAATAGATAATTGCTCAAATAGCAATGACTATTTAAGCTTGTTCGGTAAATAGATTCATTTTTT
579 GAAATAGATAATTGCTCAAAAAGCAATAAATATTT-AGCTTGTGCGGTAAACAGATTCATTTTTT
* * * *
29909 AAATCTC-TTACTCATT-AATTTTAGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAAAAAG
643 AAAT-TCATTACTCATTAAATTTTA-GAATAATAATAAATTAGCAATACTTTATTCT-AAAAAAG
*
29971 CCTATATGAACT
705 ACTATATG-ACT
* *
29983 A-ATACAATTGTTTTAAAATC-AAACAAAAGGTCATAACGACTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
1 AGAAACAATTGTTTTAAAA-CAAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* *
30046 AGTTATGACTATTTGGACTTTTTCAGTAAATAGATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATT-ATTT
64 AGTTATGACTATTT-GACTTTTT-AGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * *
30110 GTCAAAGTATTAATAAATTAATATTATTTTAATTTGAATAAGCTTGTGTGAACAAAAATAATT-G
127 -TCAAA-TATTAATAAATTAATATTATTTT-ATTTGAATAAACTTGTATGAA-AAAAATAATTAT
*
30174 TTTATGAAAAAATAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
188 TTTATGAAAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATT
** * * ** * *
30239 TGAACTTTTTCGATAAACATATTTATTTTTTAAATATTTTATTTTTTAATTTTTTGAATATTAAT
253 TGAACTTGCTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAAT
* * * * *
30304 AAATTTGTGTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGCAAA-AATTGTTTTAT-ACCAAAA
318 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAG-AAACAATTGGTTTATGA-C-AAA
* * * *
30367 TAAAAAAGAT-ATAGCAATTTGAGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTTAACT-TGT
380 -AAAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAA-TGTGT
* *
30430 TCAGTAAACAGATTCTTTTTTTAAAA-TCT-CTTATTAATTTCTTG-AATATTAAT-AAGCTAGA
443 TCAGAAAACAGATT-TATTTTTAAAATTCTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAAGCTA-A
* * * * *
30491 ATTATGT-TATTTCAAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGATTTGTGATAACACAAAAGGTT
505 ATTAT-TCTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTC
* * * *
30555 ATAATGATTTGAAATATATAATTGTTCAAACAATC-ATAAATATTT-GCATTAG-GCAGGCT-AA
569 AAAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAA-AAGCAATAAATATTTAGC-TT-GTGC-GG-TAAA
* * *
30616 CAGATTCATTTTTTAAATTCATTAGTTATTAAATTTTAGAATAATAATAAGTTAGCAATACTTTA
629 CAGATTCATTTTTTAAATTCATTACTCATTAAATTTTAGAATAATAATAAATTAGCAATACTTTA
* * * *
30681 TTCTGAATAAGATTGTATGACT
694 TTCTAAAAAAGACTATATGACT
* ** * * * *
30703 AGAAACATTTGTTTTATGACAAAACAACTA-GTCATAATAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAAT
1 AGAAACAATTGTTTTAAAACAAAACAA-AAGGTCATAA-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAAT
* * * * * * * * *
30767 AGTTA-AACTAATTGAGCTGATTTATTTAACAAATTTATTTTTTTAACTCTCTTATTTATTAATT
64 AGTTATGACTATTTGA-CT-TTTTAGTAAATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
* * * * * *
30831 TTCAAAATAGTAATAAATTAATATTATTTTATTCTGAACAAATTTATTTGAAAAAAAT-TTTATT
126 TTC-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT-TGAATAAACTTGTATGAAAAAAATAATTATT
** * ** * *
30895 TTATGACTAAACAAAAGGTCATAACGATTTAAAATCGATAATTGCTCAAATAGTCATAAATATTT
189 TTATGAAAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * ** ** * * * * *
30960 GAGCTGGTTC-AGCGAATGGAATTATTTTTTAAATCTTTTAC-TAAT-TTTTTTGAAATATTAAT
254 GAACTTGCTCGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAAT
* * * ** * * * * ** *
31022 AGATTTGTTTTATTTTATTTTGAATAAG-TTACTAAGAACTA-AAAAAATTGTTTTACAATAAAA
318 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTT-GTATGAAC-AGAAACAATTGGTTTATGACAAAA
* * * * * * ** * *
31085 TAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAAGAATTGTTCATATACCCTTAACTATTTGAAT-TGGTTC
381 AAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAATGT-GTTC
* * * * * *
31149 A-AATA-A-ATTTATTGTTT-AAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTGAAAATATTATTATA-TTAGT
445 AGAAAACAGATTTATT-TTTAAAAT-TC-TACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAAGCTA-A
* * * * * * * * * * *
31208 GTTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTACGAACATAAATAATTGTTTTATGACAGAACACAAGGTTA
505 ATTATTCTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCA
* ** * * ** * ** * * * *
31273 TAACAATTTGAAATATAAAATTATTCAAATAGTC-ATAACCATTTGAACTGGTTCAGTAAACAGA
570 AAATGATTTGAAATAGATAATTGCTCAAAAAG-CAATAAATATTT-AGCTTGTGCGGTAAACAGA
* * * * * * *
31337 TTTA-TTTTTAAATCTC-CTACTTATT-AATTTTTG-A-CAT-ATAAATTA-CTATTATTTTATT
633 TTCATTTTTTAAAT-TCATTACTCATTAAATTTTAGAATAATAATAAATTAGC-AATACTTTATT
* * * * *
31395 CCAAATAGGATTGTATGA-T
696 CTAAAAAAGACTATATGACT
* ** * * * * *
31414 AAAAACAATTGTTTTATTACAAAACAAAAGTTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCGAATG
1 AGAAACAATTGTTTTAAAACAAAACAAAAGGTCATAA-GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
** * * * ** * * ** *
31479 GCCATAATTATCTGAACTAATTCGATAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATCAATTTT
65 GTTATGACTATTTG-ACTTTTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * * * ** * *
31544 TAAAATATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTAGATAAGCTAT-TATGAATTGAAACAATTGTT
127 TCAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTGA-ATAAACT-TGTATGAA-AAAAATAATTATT
* * * * * * * *
31608 TTATGATAAAATAAAAGGTCATAATGGTTTTAAGTAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
189 TTATGAAAAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * * * * **
31673 AAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAT-TTCATGCTTATTAATTTTT-AAATGTTAAT
254 GAACTTGCTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATT-TTACTTAATAATTTTTGGAATACTAAT
** ** * * ** * * *
31736 AAAACAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATAAACTA-AAACAATTATTTTATAACTAAAC
318 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAC-AGAAACAATTGGTTTATGACAAAAA
* * * * * * * *
31800 AAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTGAAT-TGTTC
382 AAAAGATCATAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAATGTGTTC
31862 GACAGACACA
Statistics
Matches: 1499, Mismatches: 306, Indels: 156
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
710 3 0.00
711 115 0.08
712 57 0.04
713 97 0.06
714 117 0.08
715 19 0.01
716 33 0.02
717 164 0.11
718 56 0.04
719 12 0.01
720 156 0.10
721 353 0.24
722 198 0.13
723 97 0.06
724 22 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (715 bp):
AGAAACAATTGTTTTAAAACAAAACAAAAGGTCATAAGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
TTATGACTATTTGACTTTTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAA
ATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTGAATAAACTTGTATGAAAAAAATAATTATTTTATGAA
AAAACAAAAAGTCATAACGATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG
CTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATATTTTACTTAATAATTTTTGGAATACTAATAAATTAGT
ATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAGAAACAATTGGTTTATGACAAAAAAAAAGATCA
TAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAATAGTCATAACCATTTGAATGTGTTCAGAAAACAGAT
TTATTTTTAAAATTCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAGCTAAATTATTCTATTTCAAA
TAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAG
ATAATTGCTCAAAAAGCAATAAATATTTAGCTTGTGCGGTAAACAGATTCATTTTTTAAATTCAT
TACTCATTAAATTTTAGAATAATAATAAATTAGCAATACTTTATTCTAAAAAAGACTATATGACT
Found at i:32541 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 31889--35390 Score: 2338
Period size: 181 Copynumber: 19.5 Consensus size: 179
31879 TTTAAATCCT
* * * **
31889 TAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCCATTTAC
1 TAATACTAA-TTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * * *
31954 CAAACCAA-TTCAAACAGTTATAACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATCGTTATAACCTTTT
64 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * ** *
32018 GTTTCGTAATAAAACAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTCAAAAAAATAA
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA-AA
* * * * * *
32071 TAATACTAATCTAATAATATTCCT-AAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA
1 TAATACTAAT-TATTAATATT-TTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * *
32135 TCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
63 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* *** * *
32200 GTTTTGACATAAAACAACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAA
128 GTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAA
* * * *
32252 TAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA
1 TAATACT-AA-TTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
** * * * * *
32316 CTTAACTACTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTT
63 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * *
32381 ATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAA
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * *
32433 TAATACTAATTATTTACATTTTGAAAATTAATAGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
1 TAATACTAATTATTAATATTTTAAAAATTAATAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * *
32498 AAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGT
65 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * ** *
32563 TTTATCATAAAATAA-----TCTGTTCATTA-AAAATTATTT-AGACTAAAA
130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA-TACAAGCTTATTTGA-AATAAAA
* * * * * * * * *
32608 TAATATTGATCTATTAATATTTTAGAAACT--CA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTCACG
1 TAATACTAAT-TATTAATATTTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * ** * * *
32670 GCAGCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATCCCAAATTGTTATGATC-TTTA
65 G-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
*
32733 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTA-TTCAAATTAAAA
129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAA
* ** * * ** *
32784 TAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAATAATAGA-TTAAAAAA-AATAAGTGTTTG
1 TAATACTAA-TTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTA
** ** * ** * * * *
32847 TTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTT
63 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* ** * * * *
32912 -TTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGATTATTTAAAATAAAA
128 GTTTT-GTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * ** * * *
32964 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAATTTTAATGAGCAAGAGATTTAAAAACATAAACCTATTTA
1 TAATACTAA-TTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTA
* * * * * * * *
33029 CTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAGTTTTCTATTT-AAAGACATTACGAACTT
63 CCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTT
* * * * * * **
33092 TTGTTTTCTCAAAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAA
126 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * *
33146 TAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTAT
1 TAATACTA-ATTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * *
33211 CGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-TTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTG
64 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * *
33274 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAA
129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * * * *
33325 TATTGCTAAACTAATAATAGTCT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGC
1 TAATACT-AATTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * *
33389 CAAACCCA-TTCAAATAGTTAAGACCATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTT
64 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* ** * * * *
33453 ATTTAATCATAAAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAA
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * *
33505 TAATACTATTTTATTAACA-TTTAGAAAATTAAGAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTT
1 TAATACTA-ATTATTAATATTTTA-AAAATTAA-TAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * *
33569 ACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAACTTGTTATGACCTT
62 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTT
* * ** ** * * *** *
33633 TTGTTTTATAAT-AAACAATTGTTTCAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAATAACA
126 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * ** ** *
33686 TAATATTAATTGATTAGTATTTCAAAAATTCAAAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTAT
1 TAATACTAATT-ATTAATATTTTAAAAATT-AATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * *
33751 CAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTT
64 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * *
33815 ATTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTCATT-ATA-AAGCCTATTTGGAATAAAA
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * *
33866 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
1 TAATACTAA-TTATTAATATTT-TAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * *
33931 TCGAACTAGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACTATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTT
63 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * *
33996 ATTTTATCATAAAACAATTATTTATATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * ** * * * *
34048 TAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTTGTATCTAAGAGATTT-AAAAATAAGTTTGTTTGC
1 TAATACTAAT-TATTAATATTTTAAAAATTAATA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
** * * * * *
34112 CGAATGAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
64 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * ** *
34177 CTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTCTTCATTTAAG-TT-TGTTCATAATAAAA
129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TTGA-AATAAAA
* * * *
34227 TAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT
1 TAATACTAA-TTATTAATATTTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * * * * * * * * *
34289 GAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTCGGAGAAGTATTTATTACAAATCATTATGACCATTTGT
65 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * *
34354 TTTATCATAAAATAATT-TTTTCTATTAATAC-AGTCTGATTCGAAATAAAG
130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAG-CTTATTTGAAATAAAA
* * * * * **
34404 TAATGCTAATTAATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGC
1 TAATACTAATT-ATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * ** *
34469 CTGACCAA-TGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGAACTTTT
64 C-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT
* * * * * * * *
34533 GTTTTGTC--ACAACAATTGTTTCTATTCCTATAAGCTTATTCGGAATAACA
128 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * *
34583 TAATTCTAATTTATTAATATTCTT-AAAATT-A-A-TAAGAGATTTAAAAACTGAAT-TCGTTTA
1 TAATACTAA-TTATTAATATT-TTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA
** * ** * * * * * *
34643 TTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAGTAAGTGATTACCTATTTTAAATTGCTATAACA
63 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--G-AA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * *
34708 TTTGGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTTTAATTAAAA
124 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * * *
34764 AAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACAACTCTATTT
1 TAATACT-AA-TTATTAATATTTTA-AAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
** * * * * *
34827 ATTGAATAAATTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTT
62 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT
* ** * * * *
34891 CTGTTTTGTCAAAAAATTATTTTTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTGGATTAAAA
127 -TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * * *
34945 TAATATTATTTATTAATATTTCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACC
1 TAATACTAATTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
* * * * *
35010 GTACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGT
65 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
** * * * * * * * *
35075 TTCATCATAAAACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTA-TTCAAA-ATAA
130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
** * * *
35123 -AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTAC
1 TAATACTAA-TTATTAATATTTTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
** * * * *
35187 CGAACAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTATGACATTTTG
64 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * * * **
35252 TTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATATAAGATTATTCCAAATAAAA
129 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
** * * * *
35303 TAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTATTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTT
1 TAATACT-AA-TTATTAATATT-TTAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* **
35366 TCTAAACACA-TTCAAATAGTTATGA
62 ACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGA
35391 GCTTTTGTTT
Statistics
Matches: 2589, Mismatches: 612, Indels: 239
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
171 17 0.01
172 67 0.03
173 4 0.00
174 7 0.00
175 80 0.03
176 136 0.05
177 50 0.02
178 204 0.08
179 282 0.11
180 607 0.23
181 655 0.25
182 419 0.16
183 11 0.00
184 1 0.00
185 48 0.02
186 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TAATACTAATTATTAATATTTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
Found at i:33387 original size:541 final size:540
Alignment explanation
Indices: 31889--35396 Score: 2603
Period size: 541 Copynumber: 6.5 Consensus size: 540
31879 TTTAAATCCT
* * * *
31889 TAATACTAATTTATTAATC-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCCATTTA
1 TAATACTAATTTATTAA-CATTT-GAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * * *
31953 CCAAACCAA-TTCAAACAGTTATAACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATCGTTAT-AACCTT
63 CCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTT
* * * * ** * * *
32016 TTGTTTCGT-AATAAAACAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTCAAAAAAATAATAATACTAA
126 TTGTTTTGTCAA-AAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAA-AATAATATTAA
* * * * * * * * *
32080 TCTAATAATATTCCTAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATCGAACTAGT
189 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGT
* * * * *
32145 TCAAATAGTTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGA-CA
254 TCAAATAGTTATGACT-TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTT-ATCA
* * * * *
32209 TAAAACAACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATAT
317 TAAAACAA-TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAA-TTAATAATA-
* * * * * ** * *
32272 TTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTTAACTACTTCAAATAATTA
379 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * ** * * *
32337 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTT-GTCATAAAACAAATG
444 AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTAGTCATAAAACAATTA
** * * * * *
32401 TTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAA
509 TTTCAGTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * *
32433 TAATACTAA-TTATTTACATTTTGAAAATTAATAGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
1 TAATACTAATTTATTAACA-TTTGAAAATTAATAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * * *
32497 CAAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTAT-AACCTTTT
64 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAA-CTTTT
* * * * * * * *
32561 GTTTTATCATAAAATAA----TCT-GTTCATTAAAAA-TTATTTAGACTAAAATAATATTGATCT
128 GTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTTAGTTCA-TAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * * * * * * * * * *
32620 ATTAATATTT-TAGAA--ACTCA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTCA-CGGCAGCAATTT
192 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACCAGTTC
* * ** ** * * *
32680 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATCCCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAA
256 AAATAGTTATGACT-TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAA
* * *
32744 AACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCA
320 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAA-TAAAATAATACTAAATTAATAATATT-CA
* * * ** *
32808 AAAATTAATAAATAATAGA-TTAAAAAA-AATAAGTGTTTGTTGAATTAGTTCAAATAGTTAAGA
383 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
** * *
32871 CTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTT-TTTTAGTCATAAAACAATTATTT
447 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * **
32935 CAGTTTATGCAAGATTATTTAAAATAAAA
512 CAGTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* *
32964 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAATTTTAATGAGCAAGAGATTTAAAAACATAAACCTATTTA
1 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAA-ATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTA
* * * * * *
33029 CTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAGTTTTCTATTT-AAAGACATTACGAACTT
63 CCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAACTT
* * *
33092 TTGTTTTCTCAAAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTACTT
126 TTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * *
33157 TACTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGAACCAGTTC
191 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTC
* * *
33222 AAATAGTTATGACTTTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTATCATAAA
256 AAATAGTTATGACTTTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAA
* * * * * * * *
33286 ACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATAGTCTAAA
321 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCAAAA
* * *
33351 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCCA-TTCAAATAGTTAAGACCA
386 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAA-CTAGTTCAAATAGTTAAGACTA
* ** * * * * *
33415 TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTA-TTTAATCATAAAATAATTATTTTAG
450 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAG
* * *
33479 TTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAA
515 TTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * *
33505 TAATACTATTTTATTAACATTTAGAAAATTAAGAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTA
1 TAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAATTAA-TAGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * ** *
33570 CCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAACTTGTTATGACCTTT
63 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGAACTTT
* * * * ** ** * * *
33634 TGTTTTAT-AATAAACAATTGTTTCAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAATAACATAATATTAATTG
127 TGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* ** * * *
33698 ATTAGTATTTCAAAAATTCAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAATCAGTTC
192 ATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTC
* * * * * * **
33762 AAATAATTATGGCAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTTATTTTGCCATAA
256 AAATAGTTATGAC-TTTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAA
* * * * *
33827 AACAATTGTTTTTCATT-ATA-AAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
320 AACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAATTAATAATA-TTC-
* * * ** *
33890 AAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGA
382 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
* * *
33955 ATATTTGAACTATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTATTT
447 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTAGTCATAAAACAATTATTT
34019 -A-TATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
512 CAGT-TT-ATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * * ** * * * * *
34048 TAATACTAATCTAATAATATTATGAAAATTTGTATCTAAGAGATTT-AAAAATAAGTTTGTTTGC
1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAGC-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
** * * * * *
34112 CGAATGAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG
64 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTG
* ** ** ** * *
34177 CTTTGTCATAAAAA-AA-TGTTTTTCTTCATTTAAGTTTGTTCATAATAAAATAATATTAATTTA
129 TTTTGTCA-AAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
**
34240 TTAATATTTTGAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACCAGTTCA
193 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACCAGTTCA
* * * *** * * * *
34300 ATTAGTTATAACAATTCGGAGAAGTATTTATTACAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAA
257 AATAGTTATGAC-TTTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAA
* * * * * * *
34365 ATAATTTTTTCTATTAATAC-AGTCTGATTCGAAATAAAGTAATGCT-AATTAATTAATATTCTA
321 ACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTCGGAATAAAATAATACTAAATTAA-TAATATTC-A
* * * * * * * **
34428 AAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTG-ACCAATGCAAATAGTTTTGA
383 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCC-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
* * * * * *
34492 TTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGAA-CTTTTGTTTT-GTC--ACAACAATTGTT
447 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTATTTTAGTCATAAAACAATTATT
** * * *
34553 TCTA-TTCCTATAAGCTTATTCGGAATAACA
511 TC-AGTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * * * * * *
34583 TAATTCTAATTTATTAATATTCTTAAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAACTGAAT-TCGTTTAT
1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTAC
* * ** * * ***
34644 TGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAGTAAGTGATTACCTATTTTAAATTGCTAT-AACA
64 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT--G-AA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-
* * * * * ** * * *
34708 TTTGGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCAATTCATACAAGCTTATTTTAATTAAAAAAATATAA
124 TTTTGTTTTGTCAAAAAATAATTGTTTT-AGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTA
* * * * * **
34772 ATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACAACTCTATTTATTGAATAA
188 ATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCA
* * * * * *
34836 ATTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTTCTGTTTTGT
252 GTTCAAATAGTTATGACT-TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATT-TGTTTTAT
* ** * * * * * * * * *
34900 CAAAAAATTATTTTTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTTATTAATAT
315 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAATTAATAATA-
* * * * * * * * *
34964 TTCAACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGTACAAGTTCAAATAGTCA
379 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
35029 TA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTCA-TCATAAAACAATT
444 -AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTAGTCATAAAACAATT
* * * * * *
35092 ATATCTGTTAATATAGGCTTATTC-AAA-ATAA
508 ATTTCAGTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* ** *
35123 -AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTAC
1 TAATACTAATTTATTAACATT-TGAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
** * *
35187 CGAACAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTATG-ACATTTT
64 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTT
* * * * *
35251 GTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATATAAGA-TTATTCCAAATAAAATAATATAAATT
128 GTTTTGTCAAAAAATAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTAATT
* * * * *
35314 TATTAATATTCCAAAAAATTATTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACACA-
191 TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAAC-CAG
35376 TTCAAATAGTTATGAGCTTTT
253 TTCAAATAGTTATGA-CTTTT
35397 GTTTTGCCAT
Statistics
Matches: 2355, Mismatches: 500, Indels: 223
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
530 6 0.00
531 132 0.06
532 136 0.06
533 146 0.06
534 7 0.00
535 64 0.03
536 46 0.02
537 268 0.11
538 74 0.03
539 155 0.07
540 250 0.11
541 608 0.26
542 138 0.06
543 306 0.13
544 19 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (540 bp):
TAATACTAATTTATTAACATTTGAAAATTAATAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTT
TTGTCAAAAAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTA
ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTCAAATA
GTTATGACTTTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAAT
TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAAATTAATAATATTCAAAAATTAA
TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
CAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATA
CAAGCTTATTCGAAATAAAA
Found at i:33962 original size:361 final size:361
Alignment explanation
Indices: 31889--35361 Score: 2351
Period size: 361 Copynumber: 9.7 Consensus size: 361
31879 TTTAAATCCT
* * * *
31889 TAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCCATTTAC
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-
* * * * * *
31954 CAAACCAATTCAAACAGTTATAACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATCGTTAT-AACCTTTT
65 CAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTT
* * * * * * * * *
32018 GTTTCGTAATAAAACAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTCAAAAAAATAATAATACTAATCT
129 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAA-AATAATACTAATTT
* ** * * * *
32083 AATAATA-TTCCTAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTATCGAACTAGTTC
193 ATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTC
* * * * *
32147 AAATAGTTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGA-CATA
258 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTT-ATCATA
* * *
32211 AAACAACTT-TTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAATAAAA
322 AAACAA-TTGTTTC-ATTCATACAAGATTATTTAGAATAAAA
* * * *
32252 TAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTAC
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * * *
32317 TTAACTACTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTA
66 -AAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTA
* * * * * *
32382 TTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAA-TTAT
130 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * ** * * * * *
32446 TTACATTT-TGAAAATTAAT-AGCTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTTA
195 TAATATTTCAAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCA
* * * * * *
32509 AATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAA
259 AATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAA
* *
32574 ATAATCTG-TTCATT-A-A-AA-ATTATTTAGACTAAAA
324 ACAAT-TGTTTCATTCATACAAGATTATTTAGAATAAAA
* * * * * * * * * *
32608 TAATATTGATCTATTAATATTT-TAGAA--ACTCA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTCAC
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
** * * * * * ** * *
32669 GGCAGCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATCCCAAATTGTTATGATC-TTTA
66 -AAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTA
* *
32733 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTA
130 TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * ** * * *
32797 ATAATA-TTCCAAAAATTAATAAATAATAGA-TTAAAAAA-AATAAGTGTTTGTTGAATTAGTTC
194 TTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATCTGTTTATCGAACTAGTTC
* * * *
32859 AAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTT-TTTTAGTCATA
258 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA-TCATA
* * * *
32923 AAACAATTATTTCAGTTTATGCAAGATTATTTAAAATAAAA
322 AAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGATTATTTAGAATAAAA
* * * ** * * *
32964 TAATACTAATTTATTAACATTTGAAATTTTAATGAGCAAGAGATTTAAAAACATAAACCTATTTA
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTA
* * * * * * * *
33029 CTGAA-CAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAATAGTTTTCTATTT-AAAGACATTACGAACT
65 C-AAACCAA-TTCAAATA-ATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGAACT
* * * * * * * *
33091 TTTGTTTTCTCAAAAAATAATTG-TTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAC
126 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAA
* * * *
33155 TTTACTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTTATCGAACCAG
190 TTTATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAG
* * * *
33219 TTCAAATAGTTATGACT-TTTAAATAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTATCA
255 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCA
* * * *
33282 TAAAACAATTGTTTCTATCCATACAAGCTTATTTGGAGTAAAA
320 TAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGATTATTTAGAATAAAA
* ** ** * * * * * *
33325 TATTGCTAAACTAATAATA-GTCTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGC
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-A
* * * * * * *
33389 CAAACCCATTCAAATAGTTAAGACCA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTT
65 CAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTT
** * * * * *
33453 ATTTAATCATAAAATAATT-ATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAACTAAAATAATACTATTTT
129 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * * *
33517 ATTAACATTT-AGAAAATTAAGAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAATTT
193 ATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTT
* ** * *
33581 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAACTTGTTATGACCTTTTGTTTTATAAT
257 CAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAACCTTTTGTTTTATCAT
** * * ** * *
33645 -AAACAATTGTTTCAGTTTTTAAAAGTTTATCCAAAATAACA
321 AAAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGATTATTTAGAATAAAA
* * ** *
33686 TAATATTAATTGATTAGTATTTCAAAAATTCAA-AAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * *
33750 TCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCAATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACATTT
65 -CAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTT
* * **
33815 ATTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTCATT-ATA-AAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT
129 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
33878 ATTAATATTTCAAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTC
193 ATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTC
* * * * *
33943 AAATAGTTATGAATATTTGAACTATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTATCATAA
258 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAA
* * * *
34008 AACAATTATTTATATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAA
323 AACAATTGTTT-CATTCATACAAGATTATTTAG-AATAAAA
* * * * ** ** * * *
34048 TAATACTAATCTAATAATATTAT-GAAAATTTGTATCTAAGAGATTT-AAAAATAAGTTTGTTTG
1 TAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-
* * ** * * * * * * * * *
34111 CCGAATGAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
64 ACAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTT
** * * ** * * * * *
34176 GCTTTGTCATAAAA-AAATGTTTTTCTTCATTTAAGTTTGTTCATAATAAAATAATATTAATTTA
129 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
** * *
34240 TTAATATTT-TGAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACCAGTTC
194 TTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-GAACTAGTTC
* * * *** * * * * * *
34299 AATTAGTTATAACAATTCGGAGAAGTATTTATTACAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAA
258 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAA
* * * * *
34364 AATAATTTTTTCTATTAATAC-AG-TCTGA-TTCGAAATAAAG
323 AACAATTGTTTC-ATTCATACAAGAT-T-ATTTAG-AATAAAA
** * * * * * *
34404 TAATGCTAATTAATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATTTGTTGG
1 TAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT-T
* ** * * * * * * **
34468 CCTGACCAATGCAAATAGTTTTGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAATTATGAACTTTT
64 ACAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTT
* * * * * *** * *
34533 GTTTTGTC--ACAACAATTGTTTCTATTCCTATAAGCTTATTCGGAATAACATAATTCTAATTTA
129 ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTA
** * * *
34596 TTAATA-TTCTTAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTGAAT-TCGTTTATTGAA-TAAGTT
194 TTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCGAACT-AGTT
* * *** * * *
34654 CAAATAGTTATGACTATTTAAGTA-AGTGATTACCTATTTTAAATTGCTATAACATTTGGTTTTG
257 CAAATAGTTATGACTATTTAA--ACA---ATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTA
* * * *
34718 TCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACAAGCTTATTTTA-ATTAAAA
317 TCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGATTA-TTTAGAATAAAA
* * * * * *
34764 AAATATAAATTTATTAATA-TTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAACAACTCTATTTA
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
** ** * * * * *
34828 TTGAATAAATTCAAACAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATG-ACTTTC
65 -CAAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTT-
* * ** * * * ** * *
34892 TGTTTTGTCAAAAAATTATTTTTTTTGTTCATAGAAGCTTATTTGGATTAAAATAATA-TTATTT
128 TATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * *
34956 ATTAATATTTC-AACAATTAATGAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGTACAAGTTC
193 ATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTC
* * * * * * * *
35020 AAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTCATCATAA
258 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAA
* * * * * * * * *
35085 AACAATTATATCTGTTAATATAGGCTTATTCA-AA-ATAA
323 AACAATTGTTTC-ATTCATACAAGATTATTTAGAATAAAA
* * * *
35123 -AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTAC
1 TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-
* ** * * * * *
35187 CGAA-CAAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTTTATTTCAAATCATTATG-ACATTT
65 CAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTT
* * * * * * **
35250 TGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATATAAGATTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATT
128 TATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATT
* * * *
35314 TATTAATATTCCAAAAAATTATTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCT
192 TATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
35362 ATTTTCTAAA
Statistics
Matches: 2430, Mismatches: 573, Indels: 218
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
350 8 0.00
351 134 0.06
352 95 0.04
353 7 0.00
354 2 0.00
355 17 0.01
356 298 0.12
357 75 0.03
358 155 0.06
359 174 0.07
360 296 0.12
361 564 0.23
362 357 0.15
363 194 0.08
364 7 0.00
365 46 0.02
366 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (361 bp):
TAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC
AAACCAATTCAAATAATTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTAT
TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
AATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACTAGTTCAAA
TAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
AATTGTTTCATTCATACAAGATTATTTAGAATAAAA
Found at i:35801 original size:214 final size:216
Alignment explanation
Indices: 35483--35874 Score: 528
Period size: 214 Copynumber: 1.8 Consensus size: 216
35473 AAATTTAATA
* * * *
35483 AGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCATATTTGAACAAT
1 AGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACAGAGAAAGTTTAAATAG-T-TTATGAATATGTGAACAAT
* * ** * *
35548 TATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTT-ATATAAGT
64 TATCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTATTTCATCATAAAACAATTATTTCT-TTTCATATAAGC
*
35612 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTTTC
128 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAATAGGTAGGAGATTTTTC
35676 TATTAAAATTTTGAAAATTAATAAG
192 TATTAAAATTTTGAAAATTAATAAG
* *
35701 AGATTT-AAAAACTAAATTTGTTTACAGA-AATAGTTTAAATAG-TTATGAATATGTGAACAATT
1 AGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACAGAGAA-AGTTTAAATAGTTTATGAATATGTGAACAATT
*
35763 ATCTATCTT-AAATCA-TTATGATCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATATAAGC
65 ATCTAT-TTCAAAT-AGTTATGATCTTTATTTCATCATAAAACAATTATTTCTTTTCATATAAGC
* *
35826 TTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATA
128 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATA
35875 AGAGATTTAA
Statistics
Matches: 153, Mismatches: 16, Indels: 14
0.84 0.09 0.08
Matches are distributed among these distances:
213 3 0.02
214 107 0.70
215 6 0.04
216 1 0.01
217 30 0.20
218 6 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (216 bp):
AGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACAGAGAAAGTTTAAATAGTTTATGAATATGTGAACAATTA
TCTATTTCAAATAGTTATGATCTTTATTTCATCATAAAACAATTATTTCTTTTCATATAAGCTTA
TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTTTCTATT
AAAATTTTGAAAATTAATAAG
Found at i:35921 original size:176 final size:173
Alignment explanation
Indices: 35689--36227 Score: 509
Period size: 176 Copynumber: 3.0 Consensus size: 173
35679 TAAAATTTTG
* * * * *
35689 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACAGAAAT-AGTTTAAATAGTTATGAATAT
1 AAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTAC-TAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* *
35753 GTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGATCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTTTC
64 -TGAACAATTATCTAT-TTAAATCATTATGACCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTATTC
* * * *
35818 ATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA
127 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* *
35865 AAAATTAATAAGAGATTTAAAGAATAAATGTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTAGGACTATT
1 AAAATTAATAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * *
35930 AGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTTTGACCTATTGTTTTC-TTATAAAACAATTATTT-TAAT
65 -GAACAATTATCTATTT-AAATCATTATGACCT-TT-ATTTCATCATAAAACAATTGTTTCT-AT
* * * *
35993 TCATACAAGCTTCTTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAA
125 TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-A
* ** * *
36042 AAAATTAATGAGAAGAGATTTAAAAAAAAATCTATTTTGTTGAA-CAAGTTCGAATAGATT-TGA
1 AAAATTAAT---AAGAGATTTAAAAATAAATCTA-TTTACTAAATC-AGTTCAAATAG-TTATGA
* *
36105 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
60 CTA-TTGAACAATTATCTATTTAAA-TCATTATGACC-TTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
36169 AATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT-TTTCA
122 TATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
*
36220 CAAATTAA
1 AAAATTAA
36228 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 296, Mismatches: 47, Indels: 38
0.78 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
175 7 0.02
176 78 0.26
177 67 0.23
178 15 0.05
179 73 0.25
180 52 0.18
181 4 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (173 bp):
AAAATTAATAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTG
AACAATTATCTATTTAAATCATTATGACCTTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAA
AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
Found at i:36200 original size:179 final size:175
Alignment explanation
Indices: 35689--36227 Score: 500
Period size: 179 Copynumber: 3.0 Consensus size: 175
35679 TAAAATTTTG
* * * * * * *
35689 AAAATTAATAAGAGATTTAAA-AACTAAATTTGTTTACAGAAAT-AGTTTAAATAGTTATGAATA
1 AAAATTAATAAGAGATTTAAAGAA-AAAATCTATTTAC-TAAATCAGTTCAAATAGTTAGGACTA
* * * * **
35752 TGTGAACAATTATCTATCTTAAATCATTATGATC-TTTATTTCATCATAAAACAATTGTTTCTTT
64 TTTGAACAATTATCTAT-TTAAATCATTA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAAT
* * * * *
35816 TCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA
127 TCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCA
* *
35865 AAAATTAATAAGAGATTTAAAGAATAAATGTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTAGGACTATT
1 AAAATTAATAAGAGATTTAAAGAAAAAATCTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTAGGACTATT
* * ** * * * * * *
35930 AGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTTTGACCTATTGTTTTCTTATAAAACAATTATTTTAATTC
66 TGAACAATTATCTATTT-AAA-TCATTAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* * *
35995 ATACAAGCTTCTTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAA
129 ATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTC-A
** * * *
36042 AAAATTAATGAGAAGAGATTTAAA-AAAAAATCTATTTTGTTGAA-CAAGTTCGAATAGATT-TG
1 AAAATTAAT---AAGAGATTTAAAGAAAAAATCTA-TTTACTAAATC-AGTTCAAATAG-TTAGG
36104 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
60 ACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA-TCATTAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
36169 AATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAA-TTTTCA
124 AATTCATAAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCA
*
36220 CAAATTAA
1 AAAATTAA
36228 AAAGCAAGTT
Statistics
Matches: 294, Mismatches: 56, Indels: 24
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.02
176 72 0.24
177 73 0.25
178 8 0.03
179 83 0.28
180 50 0.17
181 2 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (175 bp):
AAAATTAATAAGAGATTTAAAGAAAAAATCTATTTACTAAATCAGTTCAAATAGTTAGGACTATT
TGAACAATTATCTATTTAAATCATTAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
AAAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTCA
Found at i:36348 original size:137 final size:137
Alignment explanation
Indices: 36102--36351 Score: 319
Period size: 137 Copynumber: 1.8 Consensus size: 137
36092 CGAATAGATT
* * *
36102 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAGTCATTAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
1 TGACTATTTGAACAAATATCAATTTAAAGTCATTAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT
*
36167 TCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATTTTCACAAATTAAAAAG
66 TCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCACAAATTAAAAAG
36232 CAAGTTA
131 CAAGTTA
* * * *
36239 TGACTATTTGAATAAATATCAATCTTAAA-TCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAATAATTA
1 TGACTATTTGAACAAATATCAAT-TTAAAGTCATTA-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA
* * * * *
36302 TTTCTGA-TCATACAAGCTTATTC-AGATAAAAATAATACTAATTTATTAAT
64 TTTC-AATTCATAAAAACTTATCCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
36352 ATTCTAAAAC
Statistics
Matches: 96, Mismatches: 13, Indels: 8
0.82 0.11 0.07
Matches are distributed among these distances:
136 3 0.03
137 84 0.88
138 9 0.09
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (137 bp):
TGACTATTTGAACAAATATCAATTTAAAGTCATTAGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATT
TCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCACAAATTAAAAAG
CAAGTTA
Found at i:36668 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 36234--38830 Score: 1418
Period size: 182 Copynumber: 14.7 Consensus size: 179
36224 TTAAAAAGCA
* * * * * * *
36234 AGTTATGACTATTTGAATAAATATCAATCTT-AAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
36297 AATTATTTCT-GATCATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAAA
65 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA
* * * ** * *
36360 --ACT-AGTAAGAGACTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAATTTAAAT
128 TTAATAAGTAAGAGA-TT-TAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* ** * * * * * * * *
36411 AGTTAAGACTATTAAAATAATT-TTTAATTTCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTAGTCATAGAAT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
** *
36475 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTACTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAA
* *
36540 TTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTGAAT
128 TTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* * * * *
36593 AGTTATGA-TGATTTGAACAATTATCAATTTAAAATCATTATGACTTTTTTGTTTTGCCAT-AAA
1 AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAA
*
36656 CAATTATTTTAGTTCATA-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-ATTGTATTAATATTTC-AA
64 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATA-TTCAAA
* *
36718 AAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AA-------A-T---C-AATTCAAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* * * * * * * * * * *
36756 AATTATGGCCATTTAAACAACTAACTATTTCAAATTGTTATTA-C-TTTGTTTTTCTCCT-AAAG
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * *
36818 AATTGCTTTCCA-AT-ATAGAAGCCTATTCAAATAAAATAATACTTATTTAATAATATTTCAAGA
65 AATTG-TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* ** * * *
36881 ATTAATAA--CA-A-ATTTAAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACCAGTTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* * * * *
36931 AGTTATGACTATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACT
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * *
36995 ATTGTTTT-GTACATAAAAGGC-TATTCGGTAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTCTAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAA-GCTTATT--AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAA
* * *
37058 ATTAATAATTAAGA-ATTTAAAAAATAAA--TCTAT-TTG--C-----TAAACT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAA-T
* * * * *
37101 AGTTCATTAC-A--TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTCTCATAAAAC
1 AGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * * * *
37163 AATTGTCTTCGTTAATATAAGTTTATTCGAAATAAAATATTACTAATTTACTAATATTTTAGAAA
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCA-AAA
* * * * * * *
37228 ATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTAAAC-CATTTCAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTT-AAAT
* * * * * * * *
37281 AGTTTTGACTATTTG-ACTAATTATCTATTTCTAATCATTAT-AACTACTTATTTTGTTATCAAA
1 AGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAA
** * ** **
37344 CAATTGGTCCT-GTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAGAATATTCTAAA
64 CAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAA
* ** * * ** * * * * *
37408 ACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAT-AATTCTAATTGTCGAACCAGTTCAAAT
126 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* * * * *
37462 AGTTAAGACTGTATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTCTTTTGTCATAAAAC
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * * ** *
37527 AATTCTTTTA-TTCATACAAGCTT-TTTTATTAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTGACAAT
65 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAT
* * * * * * *
37590 TAATAAATAATATATTTAAAAAAT-AATTTTTTTGTCGAATC-AATTGAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAA-CAAATTTAAAT
* * * * * * * * *
37640 GGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
37705 ATTGTTTCAATTCATACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAATTT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATT
* *** *
37770 AATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAACAAACAAGTTTAAAT
130 AATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* * * * * * * *
37821 AGTTATTATTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTAGTCATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** * *
37886 ATTG-TTTCG-TAATAC-AGCTTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTACTAATACTTACTAAA
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGC-TTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT-CAAAA
* * * ** * *
37948 A-TAATAAGTAAGA-ACTTAAAAAAATAAATCTGTTTAATCGAATTAGTTAAAAT
127 ATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTT-ATTGAACAAATTTAAAT
* ** ** * * * *
38001 AATTAT-AGCCGTTTGAATGATTATCTATTTAAAATCATTTTGACCCTTTTG-TTTGCCCAGTAA
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTG-TCA-TAA
* * ** *
38064 AACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATATGCAATAAAATAATACTAATTTTATTAATATTTAA
62 AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA-TTCA
* * * * *
38129 AAAATTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAAATAAAATATG-TTATTGAACCAGTTCAAAT
124 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
** * *
38184 AAATATGACTATTTTGAACAA-TAT-TAATCTT-AAGT-GTTTAAGA--TATTTGTTTTGTCA-A
1 AGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATCG-TTATGACCT-TTTGTTTTGTCATA
* * ****
38242 AAACAATTGATTTTA--TCAGAGAAGCTTATTTGGTTAAAAATAATACTAA--T-TT-A-A-T-A
61 AAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTCA
* * * * * * *
38298 AAAATTAATAAGTAAAAAATTTACAAAATAAATGTGTTTACT-AAGCCAATTCAAAT
124 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAA-CAAATTTAAAT
* * * * * * *
38354 AGTTA-AAGCTATTAGAATAATTAT-TAATTTCGAATCGTTTTGACCTTTTGTGTAGTCATAAAA
1 AGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
38417 TATTTGTTTCATA-TT-TTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTCAA
64 CAATTGTTT--TAGTTCATACAAGCTTATT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC-A
* * * * * *
38479 AAAATTAATAAGGAA-ATGATTTGCAAAAATAAATCTGTTTATCGAACAAGTTCAAAT
124 AAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* * * *
38536 AGTGATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
38601 ATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATAATTCAAAAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCAAAAAT
* * *
38666 TAATAAGCAAGAG-TTT--AAAATAAA-TTGTTTACTAAACAAATTTAAAT
129 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
* * * *
38713 TGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATA
1 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
38777 ATTATTTGAATTCATACAAGCTTAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
66 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
38831 GTCATTTCAA
Statistics
Matches: 1879, Mismatches: 391, Indels: 301
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
160 4 0.00
161 46 0.02
162 27 0.01
163 42 0.02
164 4 0.00
167 1 0.00
168 8 0.00
169 114 0.06
170 75 0.04
171 31 0.02
172 12 0.01
173 26 0.01
174 27 0.01
175 47 0.03
176 105 0.06
177 155 0.08
178 163 0.09
179 146 0.08
180 131 0.07
181 233 0.12
182 328 0.17
183 72 0.04
184 50 0.03
185 31 0.02
186 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (179 bp):
AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTA
ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTTAAAT
Found at i:37161 original size:169 final size:169
Alignment explanation
Indices: 36944--37270 Score: 428
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 169
36934 TATGACTATT
* *
36944 TGAACAATATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACTATTGT-TTTG-TAC
1 TGAACAATATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTCTTCGTTA-
* * *
37007 ATAAAAGGCTATTCGGTAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTTCT-AAAATTAATAATTAAG
65 ATAAAAGGCTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTT-TAAAAATTAATAAGTAAG
*
37071 A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTAAACTAGTTCATTACA
128 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCATTACA
* * * * *
37112 TGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTTCGTTA
1 TGAACAA-TATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTCTTCGTTA
* ** * *
37177 ATATAAGTTTATTCGAAATAAAATATTACTAATTTACTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGA
65 ATAAAAGGCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGA
*
37242 GATTTAAAAAGTAAATCTATTTACTAAAC
129 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC
37271 CATTTCAAAT
Statistics
Matches: 136, Mismatches: 17, Indels: 9
0.84 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
168 8 0.06
169 71 0.52
170 29 0.21
171 28 0.21
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (169 bp):
TGAACAATATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTCTTCGTTAA
TAAAAGGCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCATTACA
Found at i:37926 original size:179 final size:180
Alignment explanation
Indices: 37647--37984 Score: 407
Period size: 181 Copynumber: 1.9 Consensus size: 180
37637 AATGGTTAAG
* * * * *
37647 ATTATTAGAACAATTATCTATTTGAAATCATTCTAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ATTATTAGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTT
* * ** * *
37712 CAATTCATACAAGCCTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TT-C-AAAATTTAATA
66 C-AGTAATACAAGCCTAGATAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACACTTACTAAAA--TAATA
* *
37774 AGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAACAAACAAGTTTAAATAGTTATT
128 AGAAAGA-ACTTAAAAAAATAAATCTGTTTAACAAACAAGTTTAAATAGTTATT
* * * *
37828 ATTATTTGAACAAATGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTT
1 ATTATTAGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTT
* * *
37893 C-GTAATAC-AGCTTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTACTAATACTTACTAAAATAATAAG
66 CAGTAATACAAGC-CTAGATAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACACTTACTAAAATAATAAG
*
37956 TAAGAACTTAAAAAAATAAATCTGTTTAA
130 AAAGAACTTAAAAAAATAAATCTGTTTAA
37985 TCGAATTAGT
Statistics
Matches: 132, Mismatches: 21, Indels: 10
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
178 3 0.02
179 54 0.41
180 13 0.10
181 58 0.44
182 4 0.03
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (180 bp):
ATTATTAGAACAAATATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTT
CAGTAATACAAGCCTAGATAGAATAAAATAATACTAATTTACTAACACTTACTAAAATAATAAGA
AAGAACTTAAAAAAATAAATCTGTTTAACAAACAAGTTTAAATAGTTATT
Found at i:39625 original size:176 final size:179
Alignment explanation
Indices: 39278--39939 Score: 402
Period size: 177 Copynumber: 3.7 Consensus size: 179
39268 AAATGAATTT
* * * * * ** * *
39278 ATTAATATTTCAAAAATTAATATGTACGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCTAACTAGTTCA
1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA--AAATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAGTTCA
* * *
39343 AATTA-ATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTTTTGTCATA
64 AA--AGGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTCTTTTGTCACA
* * * ** *
39407 AAACAAATGTTTTTGTCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTA-ATC
127 AAACAAATATTTATGTCCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTATATC
* *
39459 CTTAATATTTCAAAAATTAATAA-T-AGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAGTTCAAA
1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAGTTCAAA
* *** * ***
39522 AGGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTCTTTTGTCACAAAAC
66 AGGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTCTTTTGTCACAAAAC
* * * ** * *
39587 -AATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATTCTATTTT
131 AAAT-ATTTATGTCCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTATATC
* * * * *
39636 ATTAATATTTCAACAATTAATAAGTACAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACTAGATC
1 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--AAAATTTAAAAAATAAATATATTTATC-AAACCAGTTC
* * * ** * * * * * *
39700 AAATA-GTCATAATTATTT-ATATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
63 AAA-AGGTTATGACTATTTGA-GCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTCTTTTGTCAC
* * * * * * * *
39763 AAAA-AGATTATTTA-GTTCATATAAGCCTA-TCAAAGTAAAATAATA-TA-AGTT
126 AAAACA-AATATTTATGTCCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTATA-TC
* * * * * *
39814 ATTAATA-TTCTAAAAA-TAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAGTTT
1 ATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAGTTC
* * * * ** * * *
39877 AAATA-ATTACGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAC
63 AAA-AGGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTCTTTTGTCAC
39940 CAATTGATCT
Statistics
Matches: 380, Mismatches: 83, Indels: 40
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.02
176 83 0.22
177 137 0.36
178 18 0.05
179 13 0.03
180 15 0.04
181 105 0.28
182 3 0.01
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAGTTCAAA
AGGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTCTTTTGTCACAAAAC
AAATATTTATGTCCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAAAACTATATC
Found at i:39937 original size:358 final size:358
Alignment explanation
Indices: 39275--39939 Score: 790
Period size: 358 Copynumber: 1.9 Consensus size: 358
39265 ATAAAATGAA
* * * * * * *
39275 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTACGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGCCTAACTAGT
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGACTAACTAGA
* * * *
39340 TCAAATTAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTTTTGTCA
66 TCAAATTAATCATAACTATTTGAACAAGTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTTTTGTCA
* ** * *
39405 TAAAACAAATGTTTTTGTCCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAAAACTAATCCTTAATATTTC
131 TAAAACAAATGTTTTAGTCCATATAAGCCTGATCAAAATAAAATAAAACTAATCATTAATATTTC
* * * *
39470 AAAAATTAATAATAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACCAGTTCAAAAGGTTATGACTAT
196 AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACAAGTTCAAAAGATTACGACTAT
* * * * **
39535 TTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTCTTTTGTCACAAAACAATAATTTATGTT
261 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTCTTTTGTCACAAAACAATAATTTATGTT
39600 CATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATTCTAT
326 CATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATTCTAT
*
39633 TTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTACAAAATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACTGAACTAG
1 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGACT-AACTAG
* * * * * *
39697 ATCAAA-TAGTCATAATTATTT-ATATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
65 ATCAAATTAATCATAACTATTTGA-ACAAGTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTTTTGT
* * * * *
39760 CATAAAA-AGAT-TATTTAGTTCATATAAGCCT-ATCAAAGTAAAATAATA-TAAGTTATTAATA
129 CATAAAACAAATGT-TTTAGTCCATATAAGCCTGATCAAAATAAAATAAAACTAA-TCATTAATA
* * * *
39821 -TTCTAAAAATAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATCGAACAAGTTTAAATA-AT
192 TTTC-AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACAAGTTCAAA-AGAT
* *
39884 TACGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCAC
252 TACGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTCTTTTGTCAC
39940 CAATTGATCT
Statistics
Matches: 254, Mismatches: 44, Indels: 18
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
354 6 0.02
355 28 0.11
356 18 0.07
357 57 0.22
358 144 0.57
359 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTACAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTGACTAACTAGA
TCAAATTAATCATAACTATTTGAACAAGTATCTATTTCAAATCACTATGACCATTTGTTTTGTCA
TAAAACAAATGTTTTAGTCCATATAAGCCTGATCAAAATAAAATAAAACTAATCATTAATATTTC
AAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTATCAAACAAGTTCAAAAGATTACGACTAT
TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTCTTTTGTCACAAAACAATAATTTATGTT
CATAAAAACTTATTCAGATTAAAATAATTCTAT
Found at i:40487 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 38901--41861 Score: 1699
Period size: 181 Copynumber: 16.4 Consensus size: 182
38891 TTATATATGT
* * ** *
38901 TTATTTGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATT--AA
* * * * * * * * **
38966 AAAATAAATTTGTTTACCGAACCAA-TTTAAATACTTATGACTATTTGAATAATT-GCATACTAA
64 AAAATAAATCTATTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC-TATTTC
* * ** * * *
39029 AAAT-TTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAA-TGTTT-T-GTTCATATAAGC
127 AAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * ** * *
39081 TTA-TTGAAATAAAATAATGCTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
* * * * * * * * * *
39145 AACAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA-
66 AATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * *
39208 -A-T-T--T-TTTTG-TTTCTCATAAACCAATT-TTTC-AATTCATACTAGC
131 CATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * * * * *
39251 TTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTACGAGATTTAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAA
* * * * * * **
39315 AAATAATTTTGTTTGCCT-AACTAGTTCAAATTAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTCA
65 AAATAAATCTATTT-ACTAAACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
39379 AATCACTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTT-TTGTCCATATAAGT
128 AATCATTATGA-TATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* ** * ** * *
39433 TTGTTCAAAATAAAATAAAACTAA-TCCTTAATATTTCAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
* * ** *
39493 AATAAATATATTTA-TCAAACCAGTTCAAA-AGGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAA
66 AATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
** * * * * ** * * *
39556 ATTGTTATTATTTTTTCTTTTGTCACAAAACAATAATTTAT-GTTCATAAAAAC
129 ATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * * * * *
39609 TTA-TTCAGATTAAAATAATTCTATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTACA-A-AATTTA
1 TTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA-AGAGAA-TTA
* * * * * * * * * *
39671 AAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTCATAATTATTT-ATATAAGTATTTATTTC
63 AAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTC
** * *
39735 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATT-ATT-TAGTTCATATAAGC
127 AAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * * * * *
39789 CTA--TCAAAGTAAAATAATA-TAAGTTATTAATATTCTAAAAA-TAATAATTAAGAGATTTAAA
1 TTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAA
* * * * * * *
39850 AAATGAATCTATTTA-TCGAACAAGTTTAAATAATTACGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAA
65 AAATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
*** * ** * *** * * * *
39914 ATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCACCAATTGATCTTTTTTCT-GTTAAGTATAAGC
129 ATCATTATGATATTTTGTTTTGTCA-TAAAACA-ATTGTTTCTAGTTCA-TACAAGC
* ** * * *
39970 TGTATTTTGAATTAAAATAATAC-AATTTATTAATATT--AAGCATTAATAGGGTAAAAGATTTA
1 T-TA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA-AGTAAGAGAATTA
* * * ** * * * *
40032 AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTC-AATCTTTTATAACTAATTGGAACAATTATTGTATT
63 AAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACT-ATTTGAATAATTA-TCTATT
* * *
40096 TCAAAT--TTGTTATACTTTTAG-TTTGTCATTAAAACAATT-ATTCTA-TTCATACAAAGC
125 TCAAATCATTATGATA-TTTT-GTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTAGTTCATAC-AAGC
* * * * * * ** *
40153 TTA-TT-CAATTAAATAATATTTAATATATAAAAATTTTGAACAAA-TAATGAGTTAA-AGATTT
1 TTATTTGAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA-TTCCAA-AAATTAATAAG-TAAGAGA---
* ** * *
40214 TTTAAAAAAATATAATGCT-TTTACCGAGCAAGTTCAAATAGATCTTTTGACTATTT-AATAATT
59 ATT-AAAAAATA-AAT-CTATTTACTAAACAAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTGAATAATT
* * ** * * * *
40277 ATTTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGC
118 ATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * ** *
40341 TTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTAGTAATATTTTAAAAATTAATCAGTAAGAGAATTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
* * * * * * *
40406 AATTAATCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATTACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAA
66 AATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* *
40471 CATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCT-GTTCATGCAAGC
131 CATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* *
40522 TTATTGTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-ATATTTAA
1 TTATT-TGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAA
* * * * * * * *
40584 AAAATAAATATGTTT-TTCGAACACGTTCAAATATTTGTCACTA-TTGAATAATTATCTATTTCA
64 AAAATAAATCTATTTACT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * ** * ** * *
40647 AGTCGTTACAATTTTTTGTTTTGTCATAAATTAATTGTTT-TTGTTCATAAAAGC
128 AATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* ** * * * *
40701 TTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA--ATTAA
* * * * * * *
40766 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAGTAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTCTTTCAA
64 AAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
* * * * * * **
40831 ATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCTA-TTTATGCAATT
129 ATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * ** *
40884 TTATTTGAGATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
* * * ** * * * *
40949 AATAAGTCCATTCACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAGCT-ATTATCTATTTCAAA
66 AATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * **
41013 TGGTTATAACATTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTA-TTTATACAAAA
130 TCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
** * * * *
41065 TTATTCAAAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
* * * * * * * * *
41126 ATTAAATCTATTTATTAAACCAGGTCAAATAGTTATAACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAAT
66 AATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
** * *
41191 TGTTATGAT-CTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGC
131 CATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * * * * * *
41241 TTATTTGAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
* * * * * * * *
41305 AATAAATGTGTTTGCTGAGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT
66 AATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * *
41370 CGTTCTAATATTTTGTTTAGTCATAAAATAATT-TTTGC-AATTCATACATGC
131 CATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTAGTTCATACAAGC
* * * ** * *
41421 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATCAATAAACAA-AAAATTTTTA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA--TTAA
* * * * *
41485 AAAATAAATTTTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-AT
64 AAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-
** * ** * * * *
41549 AAGAAGTATGACCTTTTATTTTATCATAGAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGC
128 AATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
* * ** * *
41603 TTATGTGAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAA-AGATTTAA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATT-AATAAG-TAAGAGAATTAA
* * * * * * * * *
41666 AAAATAAGT-TAGTTTATCGAATC-ACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTC
64 AAAATAAATCTA-TTTA-CTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * *
41729 AAATCGTTAT-AAACTTTGATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCA--TCATACAAGC
127 AAATCATTATGATATTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AGTTCATACAAGC
* ** * * * *
41784 CTATTCAAAAT-AAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATA
1 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
41848 AATAAATCTATTTA
66 AATAAATCTATTTA
41862 TCGAACCAAT
Statistics
Matches: 2145, Mismatches: 506, Indels: 260
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
169 15 0.01
170 19 0.01
171 72 0.03
172 30 0.01
173 3 0.00
174 1 0.00
175 5 0.00
176 151 0.07
177 247 0.12
178 28 0.01
179 254 0.12
180 228 0.11
181 453 0.21
182 212 0.10
183 160 0.07
184 83 0.04
185 32 0.01
186 14 0.01
187 14 0.01
188 61 0.03
189 39 0.02
190 18 0.01
191 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (182 bp):
TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA
AATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
CATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAGTTCATACAAGC
Found at i:40865 original size:543 final size:539
Alignment explanation
Indices: 38901--41867 Score: 2140
Period size: 543 Copynumber: 5.5 Consensus size: 539
38891 TTATATATGT
* *
38901 TTATT-TGAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
1 TTATTCTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT--A
* * * * * * * * * * *
38965 AAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-CAATTTAAATACTTATGACTATTTGAATAATT-GCATACTA
61 AAAAATAAATATGTTTATCAAACAC-GTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATC-TATTT
* * * * * * *
39028 AAAATT-TTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAA-TGTTT-TGTTCATATAAGCTTATT-GAA
124 CAAATTGTTATAA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAA
* * ** * * * * *
39089 ATAAAATAATGCTAATATAAAAATATTCCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAACAAATTT
188 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * *
39154 GTTTGCCAAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTC-AA--ATT-T---
253 ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAC
* ** * * *
39212 -TTTTG-TTTCTCATAAACCAATTTTTC-AATTCATACT-AGCTTATTTGGAATAAAATAA-AAT
317 CTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTCTAGTTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
39272 GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATGTACGAGATTTAAAAAA-TAATTTTGTTTGCCT-AA
381 -AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAA-TCTATTT-ACTAAA
* *
39335 CTAGTTCAAATTAATTATGACTATTT-GAGCAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCA-TTTGT
443 CAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGGA-CAATTATCTATTTCAAATCACTATGA-CATTTTGT
* * * * *
39398 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTCCATATAAGT
505 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC
* ** * **
39433 TTGTTCAAAATAAAATAAAACTAA-TCCTTAATATTTCAAAAATTAATAA-T--AGATTTAAAAA
1 TTATTCTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAA
* * * * *
39494 ATAAATATATTTATCAAAC-CAGTTCAAA-AGGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAA
65 ATAAATATGTTTATCAAACAC-GTTCAAATA-TTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * ** * * * * *
39557 TTGTTATTATTTTTTCTTTTGTCACAAAACAATAATTTATGTTCATAAAAACTTATTCAGATTAA
128 TTGTTA-TAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAA
* * * * *
39622 AATAATTCTATTTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTACAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTT
192 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * *
39686 TACTGAACTAGATCAAATAGTCATAATTATTTATATAAGTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
256 TACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-ATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTT
* * *
39751 TTGTTTTGTCATAAAA-AGATTATT-TAGTTCATATAAGCCTA--TCAAAGTAAAATAATA-TAA
320 TTGTTTTGTCATAAAATA-ATTTTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAA
* * * * *
39811 GTTATTAATATTCTAAAAA-TAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-TCGAACAAG
383 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACT-AAACAAG
* * * * * ** * *
39874 TTTAAATAATTACGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCA
447 TTCAAATAGTTATGACTATTTGGACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACATTTTGTTTTGTCA
* *** * * * *
39939 CCAATTGATCTTTTTTCTGTTAAGTATAAGC
512 -TAAAACA-ATTGTTTCTGTTCA-TACAAGC
* * ** *
39970 TGTATTTTGAATTAAAATAATACAATTTATTAATA-TT-AAGCATTAATAGGGTAAAAGATTTAA
1 T-TATTCTGAA-TAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-AGT-AAAGATTTAA
* * * * * *
40033 AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTC-AATCTTTTATAACTAATTGGAACAATTATTGTATTT
62 AAAATAAATATGTTTATCAAACACGTTCAAAT-ATTTATAACT-ATTTGAACAATTA-TCTATTT
* * *
40097 CAAATTTGTTATACTTTTAG-TTTGTCATTAAAACAATT-ATTCTATTCATACAAAGCTTATTC-
124 CAAA-TTGTTATAATTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCA
* * * * * * * *
40159 -AATTAAATAATATTTAATATATAAAAATTTTGAACAAA-TAATGAGTTAAAGATTTTTTAAAAA
186 AAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA-TTTCAA-AAATTAATAAGTAAAAGA---TTT-AAAA
* *
40222 AATATAATGCT-TTTACCGAGCAAGTTCAAATAGATCTTTTGACTATTTAATAATTATTTATTTC
244 AATA-AAT-CTATTTACCGAACAAGTTCAAATAG---TTATGACTATTTAATAATTATTTATTTC
* * *
40286 AAATCATTGTGACCTTTTGTTTTATAATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAA
304 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAA
* * ** * *
40350 ATAAAACAATACTAATTTAGTAATATTTTAAAAATTAATCAGTAAGAGAATTAAAAAATTAATCT
368 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCT
* * * * * * * *
40415 GTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATTACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTATGAT
433 ATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGGACAATTATCTATTTCAAATCACTATGAC
* *
40480 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGC
498 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC
* * *
40522 TTATTGTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAATATTTAAAAA
1 TTATTCTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAA
* * * * * * *
40587 ATAAATATGTTTTTCGAACACGTTCAAATATTTGTCACTA-TTGAATAATTATCTATTTCAAGTC
65 ATAAATATGTTTATCAAACACGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
* ** * * *
40651 GTTACAATTTTTTGTTTTGTCATAAATTAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTACTCAAAATAAAA
130 GTTATAA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAA
*
40716 TAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAAATAAATCTATTT
194 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA--TTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * * * *
40781 ACCAAACAAGTTTAAGTAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTCTTTCAAATCATTATGATCTTT
257 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * ** ** * *
40846 TGTTTTGTTATAAAATAATTATTTCTA-TTTATGCAATTTTATTTGAGATAAAATAACACTAATT
321 TGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATT
** * * **
40910 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAA-TAAGTCCATTCACCGAACAAGTT
385 TATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAA-TCTATTTACTAAACAAGTT
* * * * *** * *
40974 CAAATAGTCATGTCCATTT-GAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTTGTCGT
449 CAAATAGTTATGACTATTTGGA-CAATTATCTATTTCAAATCACTATGACATTTTGTTTTGTCAT
* * * **
41038 AAAACAATTATTTCTATTTATACAAAA
513 AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC
** * *
41065 TTATTCAAAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG---AGATTTAAAAA
1 TTATTCTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAA
* * * * * * * * *
41127 TTAAATCTATTTATTAAAC-CAGGTCAAATAGTTATAACTACTTCAACAATTATCTATCTCAAAT
65 ATAAATATGTTTATCAAACAC-GTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * ** *
41191 TGTTATGATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAGTAAAA
129 TGTTATAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAA
* * * * * * * *
41256 TATTGCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATGTGTTTG
194 TAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * * * * **
41319 CTGAGCCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAATATTTT
258 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * *
41384 GTTTAGTCATAAAATAATTTTTGC-AATTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTT
322 GTTTTGTCATAAAATAATTTTT-CTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * ** * * * * * * *
41448 ATTAATATTCAAAAAATCAATAAACAAAAAATTTTTAAAAATAAATTTTTTTACCAAACAAGTTC
386 ATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATTAATCTATTTACTAAACAAGTTC
* * ** * * * *
41513 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTTATTTTATCATA
450 AAATAGTTATGACTATTTGGACAATTATCTATTTCA-AATCACTATGACATTTTGTTTTGTCATA
* * *
41577 GAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGC
514 AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGC
* **
41603 TTA-TGTGAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAAAGATTTAA
1 TTATTCTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATAAG-TAAAGATTTAA
* * * ** * *
41666 AAAATAAGT-TAGTTTATCGAATCAC-TTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTC
62 AAAATAAATAT-GTTTATC-AAACACGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * *
41729 AAATCGTTATAAACTTTGATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGCCTATTCAAA
125 AAATTGTTATAATTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCAAA
* * *
41793 AT-AAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCT
188 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT
*
41857 ATTTATCGAAC
253 ATTTACCGAAC
41868 CAATTTCTAT
Statistics
Matches: 1896, Mismatches: 432, Indels: 203
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
524 1 0.00
525 53 0.03
526 20 0.01
527 11 0.01
528 18 0.01
529 87 0.05
530 5 0.00
531 21 0.01
532 21 0.01
533 3 0.00
534 48 0.03
535 39 0.02
536 35 0.02
537 167 0.09
538 164 0.09
539 26 0.01
540 117 0.06
541 27 0.01
542 166 0.09
543 337 0.18
544 54 0.03
545 29 0.02
546 8 0.00
547 17 0.01
548 57 0.03
549 57 0.03
550 23 0.01
551 105 0.06
552 40 0.02
553 28 0.01
554 26 0.01
555 85 0.04
556 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (539 bp):
TTATTCTGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAA
TAAATATGTTTATCAAACACGTTCAAATATTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
TTATAATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
TGTCATAAAATAATTTTTCTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAG
TTATGACTATTTGGACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
TGTTTCTGTTCATACAAGC
Found at i:41285 original size:719 final size:720
Alignment explanation
Indices: 40348--41862 Score: 1715
Period size: 719 Copynumber: 2.1 Consensus size: 720
40338 AGCTTATTTG
* * * *
40348 AAATAAAACAATACTAATTTAGTAATATTTTAAAAATTAATCAGTAAGAGAATTAAAAAATT-AA
1 AAAT-AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--AGTAAGAG-ATTTAAAAATTAAA
* * * * ** * *
40412 TCTGTTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATTACTATCTGGATAATTATCTATTTCAAAACATTAT
61 TCTATTTATTAAACATGGTCAAATAGTTATAACTATCTCAACAATTATCTATCTCAAAACATTAT
* * * *
40477 GATATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTGTGAATAAAATAATA
126 GATACTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTATTGTGAATAAAATAATA
* * *
40542 TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTT-TTCGAA
191 TAAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTGCT-GAA
* ** * *
40605 -CACGTTCAAATATTTGTCACTATT-GAATAATTATCTATTTCAAGTCGTTAC-AATTTTTTGTT
254 CCA-GTTCAAATAGTTAACACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-CTAATATTTTGTT
* * ***
40667 TTGTCATAAATTAATTGTTT-TTGTTCATAAAAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
317 TAGTCATAAAATAATT-TTTGCAATTCATAAAAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * *
40731 AAAATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTA
381 AAAA-TTCAAAAAATCAATAAACAAAAAATTTTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCA
* * * * ** * * * * *
40795 AGTAGTTATGACTCTTTGAACAATTATTTCTTTCA-AATCATTATGATCTTTTGTTTTGTTATAA
444 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTTATTTTATCATAA
* * ** ** * *
40859 AATAATTATTTCTA-TTTATGCAATTTTATTTGAGATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
508 AACAATTATTTC-AGTTCATAAAAGCTTATGTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCA
* ** * *
40923 AAAATT-AATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAGTCCA-TTCACCGAA-CAAGTTCAAATAGTCAT
572 AAAATTGAA-AAGATAAAGATTTAAAAAATAAGT-CAGTTCACCGAATC-ACTTCAAATAATCAT
* * * * * *
40985 GTCCATTTGAGCTATTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTG-TTTTGTCGTAAAACAATTAT
634 GGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAA-ACTTTGATTTTGTCGTAAAACAATTAT
* *
41049 TTCT-ATTTATACAAAATTATTCA
698 TTCTCA-TCATACAAAACTATTCA
*
41072 AAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAA-TAAGAGATTTAAAAATTAAATCTA
1 AAATA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAATTAAATCTA
***
41136 TTTATTAAACCA-GGTCAAATAGTTATAACTA-CTTCAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA
65 TTTATTAAA-CATGGTCAAATAGTTATAACTATC-TCAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGA
* * *
41199 T-CTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAGTAAAATATTGC
128 TACTTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTATTGTGAA-TAAAATAAT-A
* * *
41262 TAAA-TTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATGTGTTTGCTGAGCC
191 TAAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTGCTGAACC
*
41326 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAATATTTTGTTTAGT
256 AGTTCAAATAGTTAACACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAATATTTTGTTTAGT
* * * * *
41391 CATAAAATAATTTTTGCAATTCATACATGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
321 CATAAAATAATTTTTGCAATTCATAAAAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
* *
41456 TCAAAAAATCAATAAACAAAAAATTTTTAAAAATAAATTTTTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
386 TCAAAAAATCAATAAACAAAAAATTTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* *
41521 ATGACTATTTGAACAATTATATATTTATAAGAAGTATGACCTTTTATTTTATCATAGAACAATTG
451 ATGACTATTTGAACAATTATATATTTATAAGAAGTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTA
* * ** *
41586 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATGTGAAATAAAATAATATTGCTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA
516 TTTCAGTTCATAAAAGCTTATGTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTGAA
* * * *
41651 AAGATAAAGATTTAAAAAATAAGTTAGTTTATCGAATCACTTCAAATAATTATGGCCATTTAAAC
581 AAGATAAAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTCACCGAATCACTTCAAATAATCATGGCCATTTAAAC
* * *
41716 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTGATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCATCATACA
646 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTGATTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTCATCATACA
**
41781 AGCCTATTCA
711 AAACTATTCA
*
41791 AAATAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATAAA-TAAAT
1 AAATAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAGATTTAA-AAATTAAAT
41855 CTATTTAT
62 CTATTTAT
41863 CGAACCAATT
Statistics
Matches: 664, Mismatches: 102, Indels: 52
0.81 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
718 40 0.06
719 371 0.56
720 185 0.28
721 6 0.01
722 25 0.04
723 5 0.01
724 32 0.05
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (720 bp):
AAATAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAATTAAATCTAT
TTATTAAACATGGTCAAATAGTTATAACTATCTCAACAATTATCTATCTCAAAACATTATGATAC
TTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACAAGCTTATTGTGAATAAAATAATATAAAT
TTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATATGTTTGCTGAACCAGTTC
AAATAGTTAACACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAATATTTTGTTTAGTCATAA
AATAATTTTTGCAATTCATAAAAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCAAA
AAATCAATAAACAAAAAATTTTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
TATTTGAACAATTATATATTTATAAGAAGTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCA
GTTCATAAAAGCTTATGTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTGAAAAGAT
AAAGATTTAAAAAATAAGTCAGTTCACCGAATCACTTCAAATAATCATGGCCATTTAAACAATTA
TCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTGATTTTGTCGTAAAACAATTATTTCTCATCATACAAAACT
ATTCA
Found at i:41891 original size:124 final size:125
Alignment explanation
Indices: 41756--41991 Score: 303
Period size: 125 Copynumber: 1.9 Consensus size: 125
41746 GATTTTGTCT
* * * *
41756 TAAAACAATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAAAAT-AAATAATAGTAATTTATTAATATTT
1 TAAAACAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
*
41820 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTATCGAACCAATTTCTATTA
66 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAATTTCTATTA
* ** * * * ***
41880 TAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
1 TAAAACAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
* * * *
41945 CAAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAA
66 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
41992 GTGGTTCAAA
Statistics
Matches: 93, Mismatches: 18, Indels: 1
0.83 0.16 0.01
Matches are distributed among these distances:
124 29 0.31
125 64 0.69
ACGTcount: A:0.46, C:0.08, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (125 bp):
TAAAACAATTGTTTTACATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAATAATTTAATAATATTC
CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAATTTCTATTA
Found at i:42672 original size:176 final size:178
Alignment explanation
Indices: 41879--42958 Score: 761
Period size: 180 Copynumber: 6.0 Consensus size: 178
41869 AATTTCTATT
* * * * * * * *
41879 ATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTTTTTGGAATAAAATAATAATAATTTAATAATATT
1 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *** *
41944 CCAAAAATTGATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-GTCGAAGTGGTTCAAATAATTA
66 TCAAAAA-T--TAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCGAACCAGTTCAAATAACTA
* * * * * *
42008 AGACTATATGAACAATTATCTGTTTATCAAA-AATTATGGCCTTTTGTTTGGTC
128 TGACTATTTGAACAATTATCT-ATT-TCAAATAGTTAT-GACTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
42061 ATATAACAATT-TTTTT-ATCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT
1 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
42124 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CGAACTAGTTCAAAT-ACGT
66 TCAAAAATTAAT-A--AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCGAACCAGTTCAAATAAC-T
* * ** * * * *
42187 A--ACTACTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTCTATC
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-CTTTTGTTTTGTC
*** * *
42238 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-T
1 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * **
42302 TCTGAAAATTAATAACTATGAGAATTAAAAAATAAATTTCTTT-GTCGAACCAATTCAAATATTT
66 TC-AAAAATTAATAA--A-GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCGAACCAGTTCAAATAACT
** * * *
42366 AAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTTTTTTAG-C
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG-ACTTTTGTTTT-GTC
* * * * * *
42419 ATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAA
1 ATAAAACAA-TTATTTTTG--TTCATACAATCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * *
42483 TATTTCAAAAATTAACAAA-AGATTTCAAAAATAATTTTATTTACT-TAACCAGTTCAAATAACT
62 TATTTCAAAAATTAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCGAACCAGTTCAAATAACT
*
42546 ATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATAGTTAT-ATCTTTTGTTTTGTC
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CTTTTGTTTTGTC
* * * *
42598 ATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGT-TTGTTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATAT
1 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAA-TCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * ** * **
42662 TTTGAAAATTAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-T-GAAATGAGTTGAAATAGTTAT
65 TTCAAAAATTAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCG-AACCAGTTCAAATAACTAT
* * * * *
42724 GACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATAGTTATGACTTGTTTTTTTGTT
129 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTT-TTGTTTTGTC
* * ** *
42775 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAATCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * * ** * *
42840 TCAATAATTAGTAAGTAAA-AAATTTTAAAAATAAACATGTTTA-TTGAAATAAATT-AAAT-AG
66 TCAA-AA--ATTAA-TAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCG-AACCAGTTCAAATAAC
* *
42901 TAATGACTATTTGAATAATTAT-TAATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
126 T-ATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGA-CTTTTGTTTTGTC
42956 ATA
1 ATA
42959 TAAGCTTATT
Statistics
Matches: 710, Mismatches: 143, Indels: 91
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.00
176 121 0.17
177 96 0.14
178 36 0.05
179 101 0.14
180 156 0.22
181 117 0.16
182 32 0.05
183 2 0.00
184 43 0.06
185 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (178 bp):
ATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAATCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
TCAAAAATTAATAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTCGAACCAGTTCAAATAACTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACTTTTGTTTTGTC
Found at i:42942 original size:181 final size:175
Alignment explanation
Indices: 42095--42958 Score: 508
Period size: 181 Copynumber: 4.8 Consensus size: 175
42085 AGCCTATTTG
* *
42095 GAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
1 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTC-AAAATTAATAA--AA-A-ATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * *
42159 TTTGTTTACCGAACT-AGTTCAAATACGT-A--ACTACTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCA-T
61 TCTATTTA-TGAAATAAATTGAAATA-GTAATGACTATTTGAACAATTAT-TATTTCAAAT-AGT
* * * * *
42219 TATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAA-TCTTATTCA
122 TATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTGTTCATACAAGT-TTATTCA
* * * *
42274 AAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTGAAAATTAATAACTATGAGAA-TTAAAAAATAAA
1 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTCAAAATTAATAA--A--A-AATTTAAAAAATAAA
* * * ** * * * * *
42338 TTTCTTTGTCG-AACCAATTCAAATATTTAA-AACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
61 TCTATTTAT-GAAATAAATTGAAATA-GTAATGACTATTTGAACAATTAT-TATTTCAAATAGTT
* * * * * * * * **
42401 ATGAACTTTTTTTTTAG-CATAAAATAAGTTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTG
123 ATG-ACTTTTGTTTT-GTCATAAAACAA-ATATTTCTG--TTCATACAAGTTTATTCA
* * * * * * *
42458 GAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAACAAAAGATTTCAAAAATAATTTT
1 GAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTTTC-AAAATTAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCT
* ** * * * *
42521 ATTTACT-TAACCAGTTCAAATAACT-ATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATAGTTAT-
64 ATTTA-TGAAATAAATTGAAAT-AGTAATGACTATTTGAACAATTAT-TATTTCAAATAGTTATG
* * * **
42583 ATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTG
126 A-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCA
* * *
42634 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
1 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTCAAAATTAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * *
42699 TTATGAAATGAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATAGTTATGACTT
66 TTATGAAATAAATTGAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTA-TTATTTCAAATAGTTATGACTT
* * * *
42764 GTTTTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA-TCTTATTCA
130 -TTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTGTTCATACAAGT-TTATTCA
* * *
42811 GATTAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAATAATTAGTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAA
1 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTCAA-AA-T--TAA-TAAAAAATTTAAAAAATAAA
* * *
42875 -CATGTTTATTGAAATAAATT-AAATAGTAATGACTATTTGAATAATTATTAATTTCAAATCGTT
61 TC-TATTTA-TGAAATAAATTGAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATT-ATTTCAAATAGTT
42938 ATGACCTTTTGTTTTGTCATA
123 ATGA-CTTTTGTTTTGTCATA
42959 TAAGCTTATT
Statistics
Matches: 544, Mismatches: 101, Indels: 78
0.75 0.14 0.11
Matches are distributed among these distances:
175 3 0.01
176 117 0.22
177 69 0.13
178 11 0.02
179 85 0.16
180 71 0.13
181 120 0.22
182 22 0.04
183 4 0.01
184 42 0.08
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (175 bp):
GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTCAAAATTAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTAT
TTATGAAATAAATTGAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATTATTTCAAATAGTTATGACTTT
TGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCA
Found at i:43098 original size:159 final size:160
Alignment explanation
Indices: 42784--43117 Score: 370
Period size: 159 Copynumber: 2.1 Consensus size: 160
42774 TATAAAACAA
* * * * * *
42784 TTGTTTCTGTTCATACAATCTTATTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATT
1 TTGTTT-TG-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATT
* * * * **
42849 AGTAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAACATGTTTATTGAAATAAATTAAATAGTAATGACTATTTG
64 AATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAACATGTTTATCGAAATAAATTAAATAATAATGACTATTCC
*
42914 AATAATTATTAATTTCAAATCGTTATGACCTT
129 AATAATTATTAATTTCAAATCGTTATAACCTT
*
42946 TTGTTTTGTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATT-ATATTACAAAAATTAA
1 TTGTTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAA
* * * * ** *
43010 TAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATC-TGTTTGTCGAGCA-ACTTTAAATAATTATGACTATTCC
66 TAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAA-CATGTTTATCGA-AATAAATTAAATAATAATGACTATTCC
** * *
43073 AATAATT-TTCTTTTTGAAATTGTTATAACCTT
129 AATAATTATT-AATTTCAAATCGTTATAACCTT
43105 TTGTTTTGTCATA
1 TTGTTTTGTCATA
43118 AAATAATTTT
Statistics
Matches: 144, Mismatches: 25, Indels: 9
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
158 2 0.01
159 97 0.67
160 37 0.26
161 2 0.01
162 6 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.08, T:0.43
Consensus pattern (160 bp):
TTGTTTTGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTACAAAAATTAA
TAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAACATGTTTATCGAAATAAATTAAATAATAATGACTATTCCAA
TAATTATTAATTTCAAATCGTTATAACCTT
Found at i:48722 original size:35 final size:35
Alignment explanation
Indices: 48682--48751 Score: 131
Period size: 35 Copynumber: 2.0 Consensus size: 35
48672 TGATGTTCGA
*
48682 GGAAAGTATTCACAATTGAGATGAAAAATGACCAT
1 GGAAAGTATTCACAATTAAGATGAAAAATGACCAT
48717 GGAAAGTATTCACAATTAAGATGAAAAATGACCAT
1 GGAAAGTATTCACAATTAAGATGAAAAATGACCAT
48752 CTTTCTTTTA
Statistics
Matches: 34, Mismatches: 1, Indels: 0
0.97 0.03 0.00
Matches are distributed among these distances:
35 34 1.00
ACGTcount: A:0.47, C:0.11, G:0.19, T:0.23
Consensus pattern (35 bp):
GGAAAGTATTCACAATTAAGATGAAAAATGACCAT
Found at i:49508 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 49168--51621 Score: 1733
Period size: 181 Copynumber: 13.6 Consensus size: 181
49158 AATAAGCTTA
* * * * * *
49168 TATGAAGAAAAACAATTGTTCTATGACAAAA-TAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTA
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTG
* * *
49231 TT-ATAATAGTTATAACAATTTGAA-TTAGTTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAA--TC---TC
65 TTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATC
* * * **
49289 TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAATATTATTTTATTTTGAATAATTCTG
128 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-TCTG
* * * * *
49344 TATGAATAGAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGGTCTTAATGATTTGAAATAAATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
49409 TCAAATAGACATGACTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTGAATCTCCTATC-TA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTTA
* * * *
49473 TTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAACTTG
131 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATC-TG
* * * * *
49525 TATGAATAGAAACAAATGTTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACT-ATTTGTAATAGATAATTA
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTG
** * * * * * *
49589 TTCAAGCAATCATAACTATTTGAGCTTGCTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTTTTA-CTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTT
* * * * *
49653 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAACTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTC
130 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATC-TG
* * * * * *
49706 TATGAACAAAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAACT-ATTTGAAATAGATAATTT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTG
*** * * *
49770 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCACAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTC-TA-CTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTT
** ** *
49833 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATGTA-TATTATTTTATTTGGAATAAGCTTG
130 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAAT-TAGTATTATTTTATTTCAAATAATC-TG
* * *
49886 TATGAA-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGCCATAATGATTTGAATTAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * *
49950 TCAAATATTCATAATTGTTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTA-CTCT
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCT-T
* * * * * * *
50014 -TTAATTTTTAGATTATTAATAGATTTGTATTATTTTATTTCGAATAAGCCTA
130 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-TCTG
* ** * ** * * *
50066 TATGAATTGGTACAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGTTCATAACT-ATTAGAAATAGATAATTA
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * *
50130 TTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTAAAATCAT-TTA-CT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATC-TCTTATCT
* * * * *
50193 TATTAATTGTCT-AAATATTAATAAATTCA-TATTATTTTAATCCGAATAAGCTTG
129 TATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTCAAATAATC-TG
* * * * * * *
50247 TAAGGATAGAAACAACTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTT-AATATAAATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA-ATAGATAATTG
* * * * * * * * *
50311 TTCAAATAATCATAATTATTTAAACTTATTCGATAAACAGGTTTATTTTTTAAATTTTTTAT-TT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTT
* * * * *
50375 ATTAGTTGTTT-GAATATTAATAAATTTGTATTA-TTTATTTAAAATAAGCCTG
130 ATTAATT-TTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAA-TCTG
* * * * ** * *
50427 TATGAATAGAAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTTATAGCGATTTGAAATAAATAACTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * * * *
50492 TCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTGAACATATTCATTTTTTAAGTCTCTTA-CTTA
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTTA
* * * * * *
50556 TTAATTTTTATAACATTAATAAATTAGAATTATGTTATTACAAATAAGCTTG
131 TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATC-TG
** * * * * * *
50608 TACAAATAGAAATAATTGTTTTACGATAAATCAAAAGGTTATAATGATTTGAATTAGATAATTGT
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
* * * * * *
50673 TCAAACAGTCACAACTATTTGCA-TTGGTCATGCT-AATAGATTCATTTTTTAAATC-CATTA-C
66 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC--GGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTATC
* * * * *
50734 TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGAT-TT
128 TTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT-A-ATCTG
* * * * * * *
50789 TATGAACA-AAAGCAATTATTTTATGACAAAACAAATGGTTATAACGATTTGAAATAAAAAATTG
1 TATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * * * ** ** * *
50853 TTTAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAAGCAGATTTATTTTTTAACTCTCTT-GCTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTT
* * * * *
50917 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAACTAATATTATTTTATTCCAAACAAACT-
130 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTG
* * * * *
50968 TATTTGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGACTTGAAATAGATAATT
1 TA--TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * *
51033 ATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAATTAAAATTATTTTTTAAATCTCTTA-CA
64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCT
* * * * * *
51097 AATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTCT-GTTCTAAATAAGT-TAG
129 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAA-TCT-G
* * * * ** ** * * *
51151 TAAGAA-ATGAAAAAATTATTTTATGACAAAATAAAATATCATAACAATTTAAAATAAAAAAATT
1 TATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT-AGATAATT
* * * * *** ** * *
51215 GTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAGCAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA-GT
64 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCT
* * * * ** *
51279 TATTAATTTTCATAATATTATTACATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAACTTG
129 TATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATC-TG
* * * * * * * * * *
51332 TATAAACAAAAATAATTATTTTATGACAGAACAAAAGGTTATAA-GAAATTGAAACATATAATTG
1 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATG-ATTTGAAATAGATAATTG
* * * * * * * *
51396 TTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTGCGGTAAATAAATTTATATTTTAAAACTCCTA-CTT
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTT
* * * **
51460 ATTGATTTTT----GA--ACTAAATTAGTATTA--TTATTTCAAATAGGCTAG
130 ATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATCT-G
* * * * * * *
51505 TATG-ATGAAAAATAATTATTTTATTACAAGACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
1 TATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG
* * ** ** *
51569 TTCAAATGGCCATAGTTATTTGAA-TTGATTCAATAAATTGATTTATTATTTTA
65 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAAATAGATTTATT-TTTTA
51622 TTATGGATAA
Statistics
Matches: 1807, Mismatches: 404, Indels: 136
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
172 4 0.00
173 93 0.05
174 19 0.01
176 26 0.01
177 65 0.04
178 6 0.00
179 104 0.06
180 332 0.18
181 1052 0.58
182 103 0.06
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTATCTTA
TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTG
Found at i:50692 original size:542 final size:538
Alignment explanation
Indices: 49129--51421 Score: 1798
Period size: 542 Copynumber: 4.2 Consensus size: 538
49119 ATTTATTTTT
* * * * * * * * *
49129 TATTATTAACTTAGTATTATCTTAATCCGAATAAGCTTATATGAAGAAAAACAATTGTTCTATGA
1 TATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAA-CAAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * * * *
49194 CAAAA-TAAAGATCATAATGATTT-AAGATAGATAATTATT-ATAATAGTTATAACAATTTGAA-
64 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAAATAATTGTTCA-AATAATCATAACTATTTAAAC
*** * * * ***
49255 TTAGTTCGGTAAATAGATTTAATTTTTAAA--TCT-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATC
127 TTA-TTCACAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATC
* * ** * *
49317 AATATTATTTTATTTTGAATAATTCTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGAAAAAACAAAAGG
191 TATATTATTTTATTTAGAATAAGCCTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGG
*
49382 TCT-TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGA-CATGACTATTTAAACTTGTTTGGTAAA
256 T-TATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATA-ATCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAA
* * *
49445 TAGATTTATTTTTTGAATCTCCTA-TCTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
319 TAGATTCATTTTTT-AATCTCTTACTCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * *
49509 ATTCCCAATAAACTTGTATGAATAGAAACAAATGTTTTATGACAAAAT-AAAAGATCATAACTAT
383 ATTACAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAATCAAAAGGTTATAACTAT
* *
49573 TTGTAATAGATAATTATTCAAGCAATCATAACTATTT-GAGCTTGCTCGATAAATAAATTTATTT
447 TTG-AATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGGA-CTTGCTCGATAAATAAATTTATTT
*
49637 TTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAA
510 TTTAAATCATTTACTTATTAATTTTT-AAA
* * * **
49667 TATTAATAAACTAATATTATTTTATTTCAAATAAGCTTCTATGAACAAAAATAATTGGTTTATGA
1 TATTAATAAA-TTATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGA
* * * * * *
49732 CAAAACAAAAGGTCAAAACTATTTGAAATAGATAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
64 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTT
* *
49797 GTTCACAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATGTAT
129 ATTCACAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATCTAT
* * * * **
49862 ATTATTTTATTTGGAATAAGCTTGTATGAA-AGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGCCA
194 ATTATTTTATTTAGAATAAGCCTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTA
* * * * * * * *
49926 TAATGATTTGAATTAGATAATTGTTCAAATATTCATAATTGTTTGAACTTGTTCGATAAATAGAT
259 TAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGAT
* * * * *
49991 TCATTTTTTAAATCTCTTACTCT-TTAATTTTTAGATTATTAATAGATTTGTATTATTTTATTTC
324 TCATTTTTT-AATCTCTTACTCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTAC
* * * * ** * *
50055 GAATAAGCCTATATGAATTGGTACAATTGTTTTATAATGAAA-CAAAA-GTTCATAACTATTAGA
388 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGAT-AAATCAAAAGGTT-ATAACTATTTG-
* * * * * * *
50118 AATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGGACTTGTTCGATAAACATATTTATTTTTAAA
450 AATAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGGACTTGCTCGATAAATAAATTTATTTTTTAA
*
50183 ATCATTTACTTATTAATTGTCTAAA
515 ATCATTTACTTATTAATT-TTTAAA
* * * * * * *
50208 TATTAATAAATTCATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAAGGATAGAAACAACTATTTTATGA
1 TATTAATAAATT-ATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAACA-AAACAATTATTTTATGA
* *
50273 CAAAACAAAAAGTCATAACGATTT-AATATAAATAATTGTTCAAATAATCATAATTATTTAAACT
64 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAA-ATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACT
* ** * * *
50337 TATTCGA-TAAACAGGTTTATTTTTTAAATTTTTTATTTATTAGTTGTTT-GAATATTAATAAAT
128 TATTC-ACAAAACAAATTTATTTTTTAAA-TTTCTACTTATTAATT-TTTGGAATATTAATAAAT
* * * * * *
50400 TTGTATTA-TTTATTTAAAATAAGCCTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTACGACAAAACAAAAT
190 CTATATTATTTTATTTAGAATAAGCCTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAG
** * * *
50464 GTTATAGCGATTTGAAATAAATAACTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTGAAC
255 GTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAAT
* * * * *
50529 ATATTCATTTTTTAAGTCTCTTACT-TATTAATTTTTATAACATTAATAAATTAGAATTATGTTA
320 AGATTCATTTTTTAA-TCTCTTACTCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
** * *
50593 TTACAAATAAGCTTGTACAAATAGAAATAATTGTTTTACGATAAATCAAAAGGTTATAA-TGATT
384 TTACAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAATCAAAAGGTTATAACT-ATT
* * * * * * *
50657 TGAATTAGATAATTGTTCAAACAGTCACAACTATTTGCA-TTGGTC-ATGCTAATAGATTCATTT
448 TGAA-TAGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGGACTTGCTCGAT--AAATAAATTTATTT
50720 TTTAAATCCA-TTACTTATTAATTTTTAGAA
510 TTTAAAT-CATTTACTTATTAATTTTTA-AA
* * * *
50750 TATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCCAAATAAGATTTTATGAACAAAAGCAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAACAAAA-CAATTATTTTATGA
* * * * * * * * *
50815 CAAAACAAATGGTTATAACGATTTGAAATAAAAAATTGTTTAAATAGTTATAACTAATTGAACTG
64 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTT
* * ** * * * * * **
50880 GTTTAGTAAGCAGATTTATTTTTTAACTCTCTTGCTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-CTA
129 ATTCACAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATCT-
* * * * * * * * * *
50944 ATATTATTTTATTCCA-AACAAACTTATTTGAACA-AAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAT
192 ATATTATTTTATT-TAGAATAAGCCTGTATGAATAGAAAA-AATTGTTTTATGAAAAAACAAAAG
* * * * * * * * * *
51007 GTCATAATGACTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAATT
255 GTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAAT
* ** * * * *
51072 AAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTAC-AAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTCT
320 -AGATTCATTTTTT-AATCTCTTACTCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * ** *
51135 GTT-CTAAATAAG-TTAGTAAGAA-ATGAAAAAATTATTTTATGACAAAAT-AAAATATCATAAC
383 ATTAC-AAATAAGCTT-GTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGA-TAAATCAAAAGGTTATAAC
* * * * * * * * * * * * * * **
51196 AATTTAAAATAAAAAAATTGTTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAAGCAAATTTA
444 TATTT-GAAT-AGATAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGGACTTGCTCGATAAATAAATTTA
* *
51261 TTTTTTAAATC-TCTTAGTTATTAATTTTCATAA
507 TTTTTTAAATCAT-TTACTTATTAATTTTTA-AA
* * *** * * * *
51294 TATTATTACATTAGTATTA-TTTATTTTGAATAAACTTGTATAAACAAAAATAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTA-TATTATTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAAC-AAAACAATTATTTTATGA
* * * * * * *
51358 CAGAACAAAAGGTTATAA-GAAATTGAAACATATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACT
64 CAAAACAAAAGGTCATAACG-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACT
51422 GGTGCGGTAA
Statistics
Matches: 1407, Mismatches: 288, Indels: 115
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
538 54 0.04
539 65 0.05
540 12 0.01
541 429 0.30
542 478 0.34
543 273 0.19
544 91 0.06
545 4 0.00
546 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (538 bp):
TATTAATAAATTATATTATTTTATTCCAAATAAGCTTCTATGAACAAAACAATTATTTTATGACA
AAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTAT
TCACAAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATCTATAT
TATTTTATTTAGAATAAGCCTGTATGAATAGAAAAAATTGTTTTATGAAAAAACAAAAGGTTATA
ATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTAAACTTGTTTGGTAAATAGATTC
ATTTTTTAATCTCTTACTCTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTACAAA
TAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAATCAAAAGGTTATAACTATTTGAATAGA
TAATTATTCAAACAGTCATAACTATTTGGACTTGCTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCATT
TACTTATTAATTTTTAAA
Found at i:51042 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 51021--51053 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
51011 TAATGACTTG
51021 AAATAG-ATAATTATTC
1 AAATAGCATAATTATTC
51037 AAATAGTCATAATTATT
1 AAATAG-CATAATTATT
51054 TGAACTAGTT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.48, C:0.06, G:0.06, T:0.39
Consensus pattern (17 bp):
AAATAGCATAATTATTC
Found at i:51745 original size:132 final size:131
Alignment explanation
Indices: 51513--51752 Score: 295
Period size: 132 Copynumber: 1.8 Consensus size: 131
51503 AGTATGATGA
* * * *
51513 AAAATAATTATTTTATTACAAGACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGG
1 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
** ***
51578 CCATAGTTATTTGAATTGATTCAATAAATTGATTTATTATTTTATTATGGATAAGCTTTTATGAA
66 CCATAACTATTTGAATTGATTCAATAAACAAATTTATT-TTTTATTATGGATAAGCTTTTATGAA
51643 CT
130 CT
* * *
51645 AAAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTT-ATAACGATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAA-GTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* ***
51709 GTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGTTAAACAAATTTATTTTTTA
65 GCCATAACTATTTGAA-TTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTA
51753 AAAATTTTTG
Statistics
Matches: 90, Mismatches: 16, Indels: 5
0.81 0.14 0.05
Matches are distributed among these distances:
131 5 0.06
132 79 0.88
133 6 0.07
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (131 bp):
AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG
CCATAACTATTTGAATTGATTCAATAAACAAATTTATTTTTTATTATGGATAAGCTTTTATGAAC
T
Found at i:51957 original size:19 final size:18
Alignment explanation
Indices: 51915--51953 Score: 53
Period size: 18 Copynumber: 2.2 Consensus size: 18
51905 GCAAACACAT
*
51915 TTATTTTTTAAATCTTTA
1 TTATTTTTTAAATCATTA
51933 TTATTTTTTAGAAT-ATTA
1 TTATTTTTTA-AATCATTA
51951 TTA
1 TTA
51954 ATTTAGCAAT
Statistics
Matches: 19, Mismatches: 1, Indels: 2
0.86 0.05 0.09
Matches are distributed among these distances:
18 16 0.84
19 3 0.16
ACGTcount: A:0.31, C:0.03, G:0.03, T:0.64
Consensus pattern (18 bp):
TTATTTTTTAAATCATTA
Found at i:52356 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 51628--53467 Score: 1562
Period size: 181 Copynumber: 10.3 Consensus size: 181
51618 TTTATTATGG
* * * * * *
51628 ATAAGCTTTTATGAACTA-AAACAATTATTTTATGATAAAATAAAAGGTTATAACGATTTTAAAT
1 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* *
51692 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-TGTTAAACAAATTTATTTTTTAAAA
65 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTT--AA
* * ***
51756 AT-TTTTGCTTATTAAATTTTT-GAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGA
127 ATCTTTTACTTATT-AATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * ** *
51810 ATAAG-TATATATGAACTA-AAACAATTATTTTAT-----AACAAAAGGTCAAAATAATTTGCAA
1 ATAAGCT-TGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAA
* * * * * *
51868 TAGATAATTGTTCTAATAG--AT---T-TGTTGAACTAGATT-GGCAAACACATTTATTTTTTAA
64 TAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTAT-TTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAA
* * * * *
51926 ATC-TTTA-TTA-T--TTTTTAGAATATTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAA
127 ATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * *
51976 ATGAGCTTGTATGAATAGAAACAAATGTTTTAGGATAAAAC-AAAGATCATGACGATTTGAAATA
1 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* ** * * *
52040 GATAATTGTTTGAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAA-AAGATTTAGTTTTTAAATC
66 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAA-ATTTATTTTTTAAATC
* *
52104 ---T-CTTATTAATTTTT-GAA-ATGGTAATAAATTAGCATTATTTTATTCTAA
130 TTTTACTTATTAATTTTTAGAATAT--TAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
** * * *
52152 ATAATTTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATA
1 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * *
52217 GATAATAATTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGTTCGGTAAACAAATTAATTTTTTAAATCT
66 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
** * * * *
52282 TCAACTTATTAATTTTTAGAATAATAATCAATTATTATTATTTTATTCCTA
131 TTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* *
52333 ATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATA
1 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * * * * *
52398 AATAATTGTACAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGCTCGGTAAACTAATTTATTCTTTAAA---
66 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* **
52460 TTT--TT-TTAA-TTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTGA
131 TTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * *
52507 ATAAGCTTGCT-TGAATAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAATGGTCATAACAATTTGAAAT
1 ATAAGCTTG-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * * * *
52571 AGATAATTATTTAGATAATCATAACTATTTGAA-TATGTTCAG--AACATAGCTTTATTTTCTAA
65 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTCAGTAAACA-A-ATTTATTTTTTAA
* * * *
52633 A-CTTTTACATATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TACTA-TTTATTCAAA
127 ATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * *
52686 ATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGCTTTATGACAAAACAGAAGGTCATAATGTTTTGAAATA
1 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * ** * * *
52751 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTAGTTAGTAGATTCATTTTTTTTAATT
66 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATT--TATTTTTTAAAT
* *
52816 CTTTTACTCT-TTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA
129 CTTTTACT-TATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * * *
52869 ATAAGGTTATATGAACT-GAAACTATTGTTTTATTATAAAACAAAAGGTCACAATGATTTGAAAT
1 ATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
* * **
52933 AGATAATTATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACTTGTTC-GATAAAC--A--TA-TTAATAAAT
65 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * * *
52992 ATTTTGCTTATAAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAA
129 CTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * *
53045 ATAAACTTGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAAAA
1 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
* * * * *
53110 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTGAACTTGTTCATTAAACATATTTATTTTTTAAATCT
66 GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * *
53175 TTTATTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCGAA
131 TTTACTTATTAATT-T-TTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * ** * * * *
53226 ATAAGCTTGTCTGAACAAAAAAAATCATTTTATGACAAAGCAAAAGGTTATAGA-GATTTCAAGT
1 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATA-ACGATTTGAAAT
* * * *
53290 AGATAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTTGAT-AGGTAAACAAATTCATTTTTTAAAT
65 AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCA-GTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * ***
53354 CTCTTAATTATTAATTTTCAAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGA
129 CTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
* * * * * * * *
53407 ATAAGCTTATATGAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAGAAAATGTTATAACAATTTGA
1 ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGA
53468 CAAAACAACA
Statistics
Matches: 1329, Mismatches: 257, Indels: 145
0.77 0.15 0.08
Matches are distributed among these distances:
165 7 0.01
166 47 0.04
167 1 0.00
168 1 0.00
169 3 0.00
170 38 0.03
171 4 0.00
172 30 0.02
173 9 0.01
174 136 0.10
175 39 0.03
176 205 0.15
177 105 0.08
178 5 0.00
179 104 0.08
180 28 0.02
181 398 0.30
182 68 0.05
183 100 0.08
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
ATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA
GATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
TTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAA
Found at i:53530 original size:18 final size:19
Alignment explanation
Indices: 53497--53533 Score: 58
Period size: 18 Copynumber: 2.0 Consensus size: 19
53487 TAACTTATCG
53497 AACTAGTTTAAATAATTAT
1 AACTAGTTTAAATAATTAT
*
53516 AACTA-TTTGAATAATTAT
1 AACTAGTTTAAATAATTAT
53534 CTATTCAAAT
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 1
0.89 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
18 12 0.71
19 5 0.29
ACGTcount: A:0.46, C:0.05, G:0.05, T:0.43
Consensus pattern (19 bp):
AACTAGTTTAAATAATTAT
Found at i:53994 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 53583--57001 Score: 2601
Period size: 181 Copynumber: 19.0 Consensus size: 180
53573 AATATTTAGA
* * * ** * * *
53583 AAGAGATTTAAAAAGTAAATATATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * * * * * * * * * **
53648 ATCTATTCCTAATCATTCTAACCTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTGCTTTTGTTTATACTATTT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAGCT
** * ** ** * **
53713 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTCAAAAATATTAT-GGAACTTAATAACCA
130 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-GT
* * * * ** * * * * *
53765 AAAAAATTT-AAAATTAAATGTAATTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * * * **
53829 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTATAGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTATTCATACACTCTT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTT
* * *
53894 ATTCAGATTAAAATAATTCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGT
131 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
53944 AATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAAT
* * * *
54008 TATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGT--T-----C-
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCT
* * * *
54065 T-TTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAGTAATAAGA
130 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * ** *
54115 AAAAAATTTAAAAAACTAAATATGTTTATTGAACAAGTT-AAATTGTTATTACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * *
54179 TGTCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGATTTGCCATAAAACTATTGTTTCAGTTAATACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGC
* **
54244 TTAGAT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGT
129 TTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
54296 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAATAAGTT-AGAATAATTATAG-CCATTTGAATG
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AGTTCA-AATAGTTA-AGACTATTTGAATA
* * * *
54358 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATATAA
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TCATACAA
* * *
54423 GTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATT
127 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
54477 AAGAGATTTAAGAAATAAATCTGTTTATTGAACCAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * * * *
54542 ATCAATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTTGA-TCATAGAAGC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TT-ATTCATACAAGC
* ** **
54605 TTATT-TGGTTAAAAATAATACTAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAGT
129 TTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * *
54657 AAGAGATTTAAAAAATAAA--TGTATTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT-TTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * * *
54720 TATCTATTTCAAATCATTCTAACCATTTGTTTAGTCA-AAAATATTTGTTTCATATCTTACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TCATACAAGC
* * * * * *
54784 TTATTTAGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTTTAAAAAATTAATAAGC
129 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
54837 AAAAGACTTGAAAAAAATAAAATCTCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAATA
1 AAGAGA-TT-TAAAAAAT-AAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATA
* * * * * * * *
54902 ATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATCAAAGAATTGTTTCAGTAT-ATAAA
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-T-TCATACA
* * * *
54966 AGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTT-ACAAAATTAATAAGC
126 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
55021 AAGAGTTTTAAAAAATAAGTTTATTTACTAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * * ** * *
55086 GTCTATTTAAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAATTAGTGTTTCAGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCT
* *
55150 TATTTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCAAAAACTTAATAAGT
130 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGT
* * * * * * * * *
55201 CAGTGATTTAAAAATTTAATTTGTTTACCGAA-TCAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAAT
* * * * * **
55265 TATCTATTTCAAGTCATTATGACCTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGC
* ** *
55330 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTTGAAAATTAAAAAGCT
129 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T
* * * ** * * * * *
55383 -AGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAATTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAAT
* * * * * *
55447 TATCTATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTTATAAAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATACAAGC
* * * **
55512 TTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGT
129 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
55564 AAGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTAC-CAAATCA-TATCAAATAATTATGGCCATTTGAATAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AGT-TCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAA
* * * * * *
55627 TTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTT-TCAACATACAA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAA
* * *
55691 GCTTATT-TGAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGT
127 GCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
55741 AAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * ** * * **
55806 ATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTTGTTGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAATT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGCT
** * * * ** * *
55870 TATTTGGAAAAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTCATAACT
130 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
55921 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTGCTGAACTAGTTTAAACAATTAAGACTGTATGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * * * * * * * *
55986 AACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAGCAATTATTTTAGATCGTACAAGT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGC
** * * * * *
56051 TTATTTGGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGG
129 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * *
56103 AAGAGATTT-AAGAA-GAATTCTATATACCAAAC-CGTTCAAATAATTATA-ACTATTTGAATAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATAA
* * * * *
56164 TTATCTATTTCAAAT-GTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCACATAAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAG
* * * * *
56228 TTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATTAGT
128 CTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * ** * *
56281 AAGAGATTTAAAAAGTAAATATGTTTACCAAACTATTTCAAATAGCTT-TGACTATTTGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAATAAT
* * * * * * * **
56345 TATCTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTGTTCATACTATT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAGC
* * * * **
56410 TTATTTAGAATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACC
129 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * * *
56462 AGGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTCAATACTATTTGAATGA
1 AAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAA
* * * * * *
56526 TTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAA
* * ** *
56591 -CTTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAA-T
127 GC--TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * * * * *
56645 AAAAAAAATTAAAAAATAAATCTAATTACTAAACTAGTTCAAATAATTAATACTATATGATTGAT
1 -AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAAT
* * * * * *
56710 TATCAATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTGTTCATACAAGCT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCT
* * * **
56775 TATT--GAATTAAAATGATAC-AGATATAATAATATTTTGAAAATTAATAAGT
130 TATTCAGAA-TAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
56825 AAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTCATATGGTTAAGACTACTAGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
* * * * *
56890 ATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAGCT
* *
56955 TATTC-GAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAT
130 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
57002 GAGATTTAAA
Statistics
Matches: 2592, Mismatches: 543, Indels: 205
0.78 0.16 0.06
Matches are distributed among these distances:
170 3 0.00
171 117 0.05
172 18 0.01
173 3 0.00
174 1 0.00
176 57 0.02
177 83 0.03
178 92 0.04
179 257 0.10
180 603 0.23
181 710 0.27
182 349 0.13
183 117 0.05
184 132 0.05
185 47 0.02
186 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATT
ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAGCTT
ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
Found at i:56173 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 56141--56173 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
56131 AAACCGTTCA
56141 AATAATTATAACTATTTG
1 AATAATTAT-ACTATTTG
56159 AATAATTAT-CTATTT
1 AATAATTATACTATTT
56174 CAAATGTTAT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.42, C:0.06, G:0.03, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATACTATTTG
Found at i:57969 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 57156--68192 Score: 5151
Period size: 181 Copynumber: 61.4 Consensus size: 179
57146 TGAGTAGATT
* * * * *
57156 TGACTA-TTGAAGAATTATCTATTTGAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * *
57220 TTCAGTT-CATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAATCAAT
66 TT--TTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
** * * * *
57284 AAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCT-GTTT-TCTGAACTAGTTCAAATAATTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTAT-TGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * ** ** * *
57336 TGAATATTTGAACAAATATCAATCCCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
57400 CTCTGATCATACAAGCTTATTC-AGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--T
66 TTTTTA-CATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * **
57461 -AATAAGAGATTTAAAAAATAAATGT-GTTTGTCAAACCAATTCAAATAGTTGA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACC-ATTCAAATAGTT-A
* * * * * * *
57513 -GACTATTAGAATAATTATCTATTTCACATTGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* *
57577 TTTAGTT-CATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAA
66 TTT--TTACATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAA
* ** * * * ** *
57640 CAAGCATGAGTTTTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAAAAAGTTCAAATAGCTA
127 TAAATAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * *
57694 TAACTATTTGAACAATTATCTATATAAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
57759 TTTAGTT-CATAAAAGCTT-TACCAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATATTTAAAATATTAA
66 TTT--TTACATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAA-ATTAA
* * *
57822 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGCTTATTGAATCCATTTAAATAATTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAA-CCATTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
57875 TGGCCATTGGAATAACTACCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
57940 TTTTTAGCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAAT-CATAATTTATTAACATTT--CAA-TAATT
66 TTTTTA-CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTAAAAATTAATA
* *
58001 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCT-AACCATTTCAAATAGTTA
129 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-TTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * *
58052 TGACTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
58117 TTATGTT-CAAAAAAGCTTATTC-ATACTAAAAAAATACTAATTTAGTAAAATTCTAAAAATTAA
66 TT-T-TTACATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAA
* * **
58180 TAACTAAGATATTTAAAAAATAAATCTA-TTTGCTGAACCTATTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACC-ATTCAAATAGTTA
* * * * ** * * *
58233 AGAC-ATATGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAATAA-T-T
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
58295 ATTTTAGCTTATACAAGCTTAATT-GGAATAGAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATT
66 TTTTTA-C--ATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATT
* * * * * *
58358 TATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTATTGAACCAATTCAACTAATTG
125 AATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACC-ATTCAAATAGTTA
* * * * * * *
58413 TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-G
* * * * *
58478 TTTTGTTA-ATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAACATTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAAT
65 TTTT-TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA-AAAATTAAT
* * * * ** *
58542 TATTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCT-GCTTATCAAACCATTTCAAATAGTTT
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * ** *
58594 TAACTATTTGAATAATTTAACTATTTCAAA-AGTTATAACTTTTTATTTTATCATCGAATAATT-
1 TGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** ** ** * * * *
58657 TATTTTGTTTATATTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTAAAACT--T
65 T-TTTT-TACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAAT
* * ** * *
58720 -AAT---A-ACTTAAAAAATAAATCTA-ATTATCAAACCGGTTCAAATATTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACC-ATTCAAATAGTTA
** * * * * * *
58767 AAACTATATGAATGATAATCAATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * * *
58832 TTTGTTTGA-ACAAGCTTATTTGAATTCAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATA
66 TTT-TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATA
* * * * * * *
58896 AGTAATAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATTAAATCAACTCAAATGGTTA
129 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAA-CCATTCAAATAGTTA
* * * * * *
58947 AGACTATTAGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
59012 TTATTT-CATACAAGCTTATT-TAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAG
66 TT-TTTACATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
* * * * *
59075 AAAAAATAGATTTAAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACAATTTTAAATAGTTAA
128 AAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTT-A
* * * ** ** * * * *
59129 T-ATTATTTAAACAATTGCCTATTAAAAATTTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAATTG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * ** * * ** *
59193 -TTTCGACTAATACAAGTTTAGACGGAATCAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCTAAATTAT
65 TTTTTTAC--ATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAA
* * * * *
59257 TAAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCT-GCTTATTG-ACTCAGTTAAAATAATTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAAC-CA-TTCAAATAGTTA
* * * * *
59310 TGACCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTGTGACAAAACAATTG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTG
* * ** *
59375 -TTTCTA-ATCACAAAGCTTATTTG-GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTA
65 TTTTTTACAT-AC-AAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTA
* * * **** *
59437 ATTAGAA-AA-AAATTTAAAAAATAAATGT-GCTTGCCAAACCAATTCAAAAAGTTA
126 A-TA-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACC-ATTCAAATAGTTA
** * * * * * * * *
59491 AAACCACTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * * * * * *
59556 TTCATATCTTACAAACTTATTC-AGAGTAAAATAATCCAAATTTATTAACATTAAAAAAATTAAT
66 TTTTTA-CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
* * ** * * *
59620 AAGA-AAAAGATTTGAAAAATAAATCT-GTTTACCGAACAAGTTTAAATTGTTA
128 AA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * *
59672 TGATTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCCTTTGTTTTGACATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * *
59737 TTCAATT-CATAAAAGCTTGTCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAAGTAAT
66 TT--TTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
** * * * * *
59801 AAGCAATAGTTTTAAAAAATAAAT-TTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAAC-CATTCAAATAGTTA
* * * * * *
59853 TGACTATTGGAATAAGTATCTATTT-AAATTTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTA
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
59917 TTTCAGTT-GATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--
65 TTT--TTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* * * * * *
59978 T-AATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCT-GTTTAGTGAATCAGTTCAAATAATTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
60030 TGGCTATTTCAACAATTACCTATTTCAAATCTTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * **
60095 TTTTGATCAAACAAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCATGCAAAAATTAATA
66 TTTTTA-CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAATA
* * * * **
60160 AGTAAGATATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACTAGTTTGAATAGTTA
129 AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * *
60211 TGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTAT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
60276 TTCCGTT-CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACAAATCTAATAATATTTCAAAAATTAAT
66 TT--TTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * *** *
60340 AACTAAGAGATTTAAAAAACAAAT-TTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * *
60392 AGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-T
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * *
60456 TTTCATTTCATACTAGCTTGTTAGGAATAACATAA-AATGAATCTATTAATATTTGAAAAA-T--
66 TTT--TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* * * *
60517 T-AATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTA-TTTACCT-AACCAGTGCAAATAATTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTA-TTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * *
60569 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTC--A-----A--A-CTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
60624 TTTTGCT-CATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--T
66 TTTT--TACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* ** * **
60685 -AATAAGAGATGTAAAAAATAAAT-TA-TTTATCAAACAAGTTTTAATAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
** * * * * * *
60735 TGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
60800 TTTTGTTCATACAAG-TGTATTC-AGATTAAAAAAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAA
66 TTTT-TACATACAAGCT-TATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* * * ** * * * *
60863 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACAAGGTAAAATAGTCA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* ** * * * *
60916 TGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCT-AACTTTGTCTTTTAT-AGTAAAACAATT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCA-TAAAACAATT
* * * ** * *
60979 GGTTTAGTT-CATATAAGCTTATTTGATGTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTA
64 -GTTT-TTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTA
* ** * * * * **
61043 AT-GAGCAGAAAATTAAAAAA-AGAATC-CGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTA
126 ATAAATAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * *** * *
61096 TGACTATTT-AAAAATTATCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-G
* * * * *
61160 TTCGGTTT--ATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTCAAAAATT
65 TT--TTTTACATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATT
* * * * **
61221 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-AATTTACTGAATGAGTTCAAATAGTTA
125 AATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
61276 TGACTTTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
61341 TTTTGTTCATACAAGCATATTC-AGATTAAAAGAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAAT
66 TTTT-TACATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * ** * * * *
61405 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACAAGGTAAAATAGTCA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* ** * * * * *
61457 TGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACTTTTTCTTTTAT-AGTAAAACAATTG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTG
* * ** *
61521 TTTTAGTT-CATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAA
65 TTTT--TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* ** * * * * * **
61585 TGAGCAAAAGAATTAAAAAA-GAATC-CGTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAG-TTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * *** * *
61638 TGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-G
* * * * * *
61703 TTCGGTTT--ATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTTTAAAATT
65 TT--TTTTACATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA-TATTTAAAAATT
* * * * * **
61764 AATAAGTAAAAGATTTAAATAATAAATC-AATTTACTGAATGAGTTCAAATA--TA
125 AATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
61817 -G-TTTTTTTAAAACATTA--TATTTCAAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATT
1 TGACTATTTGAATA-ATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * *
61878 -TTTTGTT-CATACAAGCGTATTCAGATTAA-AAAAT-ATATTAATTTATTAATATTTTAACAAT
64 GTTTT-TTACATACAAGCTTATTC-GA--AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAAT
* * * ** ** * * *
61939 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAATAAGGTAAAATAGTCA
124 TAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * ** * * * * *
61995 TAACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACTTTTTCTTTTAT-AGTAAAACAATTG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTG
* * ** *
62059 TTTTAGTT-CATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAA
65 TTTT--TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* ** * * * **
62123 TGAGCAAGAGAATTAAAAAA-AGAATC-CGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * *** * * *
62176 TGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTTTTTTTTCATAAAGCAATTGG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-G
* * * * *
62241 TTCAGTTT--ATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTCAAAAATT
65 TT--TTTTACATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AAAAATT
* * * * * **
62302 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-AATTAACTGAATGAGTTCAAATA-TTA
125 AATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * *
62356 TGACTTTTTGAACAATTTAATTTATTTCTAATCATTATGACATTTT-TGTTTATCATAAAACAAT
1 TGACTATTTGAATAA-TT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
62420 TGTTTTTTATTTATACAA-ATAATTTC-AAA-ATAA-AATACTAATTTAGTAAT-TTTCAAAAGT
63 TGTTTTTTA--CATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATT
* * *
62480 --T-AATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTTGTTT-TACGTAGACCAGTTCAAATAGTTAA
125 AATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTAT-TG-A-ACCA-TTCAAATAGTT-A
* * * * *
62536 AGAC-ATTTGAAAATAATTATTCTAGCTTCAAATCATTATTGATC-TTTGTTTTGTCATTAAAAT
1 TGACTATTTG--AATAATTA-TCTA-TTTCAAATCGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAAC
* * * * * * * * *
62599 AATTGTTTTATTGTCA-CCATAACTTATT-GCAGAGTAAAAATATTGCTAAAGCTGAATAATATT
60 AATTGTTTT-TT-ACATACA-AGCTTATTCG-A-AAT-AAAATAATACT-AA-TTTATTAATATT
* * * *
62662 TCGTAAAATTAATAAAGAA-A-ATTTTAAAAAAAATAAATGT-GTTTGTTGAACCAATTCAAATA
117 T--AAAAATTAATAAATAAGAGA-TTT--AAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACC-ATTCAAATA
62724 GTTA
176 GTTA
* * * * * * * *
62728 AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * *
62793 TTTAGTT-CATTCATGTTTATTCAAAATAAAATAATTCT-ATTCTATTAACATTCAAAAAATTAC
66 TTT--TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT-TAAAAATTAA
** * * * * * *
62856 TAAGCAAGA-AATT--AAAA-AAA---AGTTTACTGAACAAATAAAATAGTCA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCATTCAAATAGTTA
* * * * *
62902 AGACTATTTGAACATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAAGA-CTGTTTGTTTTATAATAA
1 TGACTATTTG-A-A--T----AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAA
* * * *
62966 AACAATTGTTTCAGTT-CATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA--AACTTTATTAATATTTC
57 AACAATTGTTT--TTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTT-
* * * * ** * * *
63028 AAAAGTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTA
118 AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
63090 TG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATTATAAAACAATTG
1 TGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * *
63154 TTGTTCATCGTATAACCCTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTTAAAAATTAA
65 TTTTTTA-CATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAA
* * * * * * * *** *
63217 TGAGTAGGAAATTTAAAAAACAAAACTA-TCTACCAAACTAGTTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * *
63270 TGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTAT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * *
63335 TTATGTT-CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTAAGAAAGTTAA
66 TT-T-TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-AAA-TTAA
* * ** *
63398 TAACTAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-TTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * ** * *
63452 AGGCTATATGAATAATTATCTATTTTAAATCATTAGGACCTTTTGTCTTGTTGTAAAAAAAATGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * *
63517 TTTTGTTCATATAAGTTTGTTC-ATATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--T
66 TTTT-TACATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* *
63578 -AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTAAACCAATT-AAACTAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACC-ATTCAAA-TAGTTA
* * * * * **
63629 TAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCACTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * ** * * * * * *
63694 TTCAATT-GATACAATATTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATCATGAAAATTAAT
66 TT--TTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTAAAAATTAAT
* * * ** * *
63758 AAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCT-GTTGGCTTG-ACCAATGCAAGTAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTT-TATTGAACC-ATTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * *
63810 TGACTGTTTGAACAATTATCTATCTCATATCGTTATAACCTTTGGTTTTGTCAGAAGATAATTAT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
63875 TTATGTT-CATACAAGCTTATTCAAAATAACATAATTCTAACTTATTAGTATTTGAAAAATTAAT
66 TT-T-TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * *
63939 --AT--GATATTTAAAAACTAAATAT-GTTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
63987 TGACTATTTGAATAATTACCTATTTC-AATCGCTATAATCTCTTATTTTGTTATAAAATAATT-T
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
64050 TTTCTATGCATACAAGCTTATTTC-TATTAAAATAAAAC-AATTTTATTAACATTCAAACAATTA
66 TTT-T-TACATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTAAA-AATTA
* * * * ** ** * *
64113 ATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAATAAGTTTAAGTAGTTA
126 ATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * ** ** *
64167 TGACTATTTGCACAATTATTTATTTTAAATCATTACAATATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
64232 TTTTATTCATACAAGCTTGTTC-AAATTAAATTAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAAT
66 TTTT-TACATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* * * * * * *
64296 AAGTAAAAGATTCT-AAAAATAAATAT-GTTTATCGAGCAAGTTCAAATAGTCA
128 AAATAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * ** * * *
64348 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTCATCATCAAGCAATTAT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * *
64413 ATCAGTT-CATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
66 -T-TTTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * * * *
64477 GAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA-TTTACTAAACAAGTTCAGATAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * * *
64529 TGACTATTTGAACAATTTTATATTTCAAATTGCTATGGCATTTTGTTTTGTTAAAAAAACAATTG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTG
* * * *
64594 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAT
65 TTTTT-TACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TAAAAATTAA
* * *
64658 TAAGTAATA-ATTTAAAAAATAAATCT-CTTT-TCTGAA-CATGCTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTAT-TGAACCAT--TCAAATAGTTA
* * * ** *
64710 TGACTATTTGAACAATTATCTAATTGAAAGAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* *
64775 TTCTATT-CATACAAG-TGTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAA
66 TT-T-TTACATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* * * * ** * *
64838 TAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACCGAGGACC-TTTAAATGGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGA--ACCATTCAAATAGTTA
* * * * * ** *
64891 GGAATGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * *
64956 TTGTATT-CATACAAGTTTGTTCGAAATAAGATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
66 TT-T-TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAA-
*** * * * * * * * *
65020 TTGGTAGGAGATTTAAAAAACAAAT-T-GTTTACTAAACAAATTCATATAATCA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAAC-CATTCAAATAGTTA
* * * * *
65072 TGTCCATTTGAACAATGATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** * * * *
65137 TTCTGTT-CATGCAAAATTATTC-AAAAAAAATAATATTTATCTATTAATATTTTAAAAA-T--T
66 TT-T-TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* * * * * * *
65197 -AATAAGAGATTTAGAAACTAAAT-TTGTTTATCGAAACAGTTCATATAGCTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * *
65248 TGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCGTTACGATC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
65312 TTCTTTTCATACAAGTTTTATTC-AGATTAAAATAATACTAA--T-TTAATA-GT----ATTAAT
66 TT-TTTACATACAAG-CTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAAT
* * * *
65368 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGC--GTTTACTGAACTAGTTCAAATAATTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * * * * *
65420 AGACTATTAGAACAATTTTCGATTTCAAATCATTCTAACCTTTTCTTTGGTCATAAAACAATTAT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* **
65485 TTTAGTT-CATACAAGCTTATTC-AGAATAAAGTAATACTAATTTATTACAT-TGAAAAAATTAA
66 TTT--TTACATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTAAAAATTAA
* ** ** *
65547 TGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTA-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-
127 TAAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAG-TTA
* * * * *
65601 TGAATATTTGAATAATCATCTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * * * *
65665 TTTTAGTT-CGTAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTACTAGTATTTCAAAAACTAA
65 TTTT--TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
** * * * * *
65729 TAAGCAAAAGATTTAAAAACTACAGT-TA-TTT-CTAAACCAGTTC-AATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* ** ** * * * * * *
65780 TGACTATTTGAACAAACATGAATATGAAATCGTTGTGATC-GTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
65844 TTTTGATCATACAAGCTTATTTG-GATAAAAATAACACTAATTTAATAATATTTTGAAAA-T--T
66 TTTTTA-CATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* * **** *
65905 -AATAAGAGATTTAAATAATAAATGT-GTTTGCCAAACCAGTTTAAATAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * ** * *
65956 AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTCAGTCATATAATAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * ** * *
66021 TTTAGTT-CATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAACT-CTAATTTAACAACATTCAAAATATTAA
66 TTT--TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTAAAA-ATTAA
** * * *
66084 TAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAA-CTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
66138 TAACTATTTGAACAATTATATTTTTAAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * **
66203 TTTAGTT-CATAAAAACTT-TTCCAAAAACAAAAAATTTAATACTCCTTTATTAATATTTCAAAA
66 TTT--TTACATACAAGCTTATT-C--GAA-ATAAAA--TAATACTAATTTATTAATATTT-AAAA
* * * * *
66266 GTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAATCAATTCAAATAATTA
122 ATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAA-CCATTCAAATAGTTA
* * * *
66324 T-AGCCATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCGTTAAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
1 TGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
66387 GTTTTTAACATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATACTAATATTTTAAGAATTAAT
64 GTTTTTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT
* **
66452 -AAT---AGATTTAAAAATTAAATCTA-TTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * *
66500 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTAT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * *
66565 TTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT-TGTAATATTATAAAAATTAAT
66 TTTT-TACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATT-TAAAAATTAAT
* * * * * * *
66629 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTGTCGAACTAGTTCAAACAATTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* ** * * * * *
66681 AGACTATAAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTCTACAAGCTTATTCGGAATAGAA
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT-T---TG-TT-TT--G--T--CA
* * * ** * * * * * *
66746 TAAAACTAATT-TATTAATATTTCATA-AAACAATTATTCCAGCTCATACAA-GCTTATTCA-TA
54 TAAAAC-AATTGT-TT--T-TTACATACAAGC--TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * * *
66807 ATAGAATAAAACCAATTTATTAATATTTCAA-AAATTTGTAAGTAAA-AGATTTAGAAAATAATT
112 AT--ATTTAAA--AA-TTAATAA-A--T-AAGAGA-TT-TAA-AAAATAAATCTAG---TTTATT
** ** *
66870 TTA-TTTATCGAACTAGTTCAAA
162 GAACCAT-TC-AAATAGTT---A
* *** * * * * * *
66892 TAACTATAACTATTTGAAAAATTGTCTATTCCAAATCTTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC
1 TGACTAT-TTGAA-T----AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
66957 AATTGTTTTGTTA-ATATAAGTTTGTTCGAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAA
60 AATTGTTTT-TTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAA
* * * **
67021 TTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T--TGT-TT--A-C---C-AA-ACCTA
123 TTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCATTCAAATAGTTA
* ** * * * * *
67066 --ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTATTTTGCCATCAAACAATTGG
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-G
* * * * * * * *
67129 TTATGTT-CATACTATCTTATTCGAAATAAAATAATGCTAATTTAATAAAATTTCGAAACTTAAT
65 TT-TTTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
*** * * * * *** *
67193 ATCCAAGAAAATTAAAAAATAAATTTAATTGCCT-AACCAGTTCAAATAGCTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * **
67245 T-ACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTCTTTTGTCGTAAGGCAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
67309 TTTGTT-CATACAACCTTATTTTG-ATTAAAATAATACTAA-TTAATAATATTTCAAAAATTAAT
66 TTT-TTACATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * * * *
67371 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTCATCGAATCAGTTCAATTGGTTA
128 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * ** * *
67423 T-ACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGATTTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
*** * * * * *
67487 TTGAGATTATACAAGCTTACTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATA
66 TTTTTA-CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATA
* * * *
67552 AGA-AACAGATTTTAAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAACAAATTTAAATAGTTA
129 A-ATAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTAGTTTATTGAAC-CATTCAAATAGTTA
* * * * * * *
67605 TTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
** * * * * **
67670 GTCAGTTA-ATACGAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCCTAAATTAA
66 -T-TTTTACATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAA
* * * * * *
67733 TAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTA-TTTGTTGAATCAGTTAAAATAATTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * ** * *
67786 TGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTG-
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
67850 --TTT-CATATAAGCATATTCGAAATAAAAGAACACTAATTTATTAATATTTTGAAAA-T--T--
66 TTTTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA
** *
67907 -T-----A-TT----AATAAATCT-GTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTA
130 ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * *
67946 TGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAGCAATTGT
1 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * ** * * *
68010 TTCTTATCATAGAAGCTTATT-TAGTTAAAAATAATACAAATTT-TATAATGTTTTGAAAATTAA
66 TTTTTA-CATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAAT-ATTTAAAAATTAA
* * * **** *
68073 TAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGT-GTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTA
127 TAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCA-TTCAAATAGTTA
* * * * * * * *
68126 -AACCTATTAGAATAATTATATATTTCCAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTG
1 TGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
68190 TTT
65 TTT
68193 CATATCTTAG
Statistics
Matches: 8346, Mismatches: 1910, Indels: 1201
0.73 0.17 0.10
Matches are distributed among these distances:
159 20 0.00
160 60 0.01
162 2 0.00
163 3 0.00
164 39 0.00
165 2 0.00
166 83 0.01
167 155 0.02
168 12 0.00
169 1 0.00
170 5 0.00
171 3 0.00
172 143 0.02
173 119 0.01
174 59 0.01
175 133 0.02
176 518 0.06
177 737 0.09
178 247 0.03
179 234 0.03
180 1193 0.14
181 2983 0.36
182 852 0.10
183 190 0.02
184 22 0.00
185 32 0.00
186 100 0.01
187 62 0.01
188 38 0.00
189 30 0.00
190 7 0.00
191 9 0.00
192 14 0.00
193 33 0.00
194 17 0.00
195 19 0.00
196 27 0.00
197 13 0.00
198 7 0.00
199 8 0.00
200 12 0.00
201 12 0.00
202 12 0.00
203 4 0.00
204 12 0.00
205 13 0.00
206 1 0.00
207 4 0.00
208 8 0.00
209 1 0.00
211 8 0.00
212 4 0.00
213 1 0.00
216 1 0.00
217 22 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
TTTTTACATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAATAAA
TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTTATTGAACCATTCAAATAGTTA
Found at i:58524 original size:538 final size:537
Alignment explanation
Indices: 57088--91167 Score: 11544
Period size: 543 Copynumber: 63.0 Consensus size: 537
57078 TTGTTATAAC
* * * ** ** *
57088 ATTTGAAAAATTAATGAGCAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTTGAGTAG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * ** *
57153 ATT-TGACTA-TTGAAGAATTATCTATTTGAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAACAA
64 -TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *** * * *
57216 TTGTTTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAATC
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * *
57281 AATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTGTTTTCTGAACTAGTTCAAATAATTATGAA-TATTT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTAT-AACTATTT
* * ** * * * * * *
57345 GAACAAATATCAATCCCAAATTATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTCTGATCA
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * *
57409 TACAAGCTTATTC-AGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT
321 TACAAGTTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTT
* * * * *
57473 AAAAAATAAATGTGTTT-GTCAAACCAA-TTCAAATAGTTGA-GACTATTAGAATAATTATCTAT
385 AAAAAATAAATATGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
57535 TTCACATTGTTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATATAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC
447 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC
* *
57599 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
511 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
57626 ATTCAAAAAATTAACAAGCATGAGTTTTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAAAAAGTTCAAATA
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATA
* * * * * *
57690 GCTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATATAAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACA
63 GTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* **** * *
57754 ATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTTACCAAAATAAAATAATAATACTTTATTAATATTT-AAAATA
127 ATTGTTTTAGTTCATACAAGC-TTATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-A
* * * * * ** *
57818 TTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGCTTATTGAATCC-ATTTAAATAATTATGGCCA
190 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGAA-CCAATTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * * * * *
57881 TTGGAATAACTACCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTT-T
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT
* * *
57945 AGCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAAT-CATAATTTATTAACATTTCAATAATTAATAAGAG
318 -TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAG
* * * *
58009 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCT-AACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAACT
381 ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
58073 ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCAAAAAAGCTTATT
445 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
* * * * *
58138 CATACTAAAAAAATACTAATTTAGTAAA
510 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
58166 ATTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACCTA-TTCAAATAG
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
58230 TTAAGAC-ATATGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAATAAT
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
58294 TATTTTAGCTT-ATACAAGCTTAATTGGAATAGAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT
129 TGTTTTAG-TTCATACAAGCTT-ATTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
58357 TTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTATTGAACCAATTCAACTAATTGTAACTATTT
191 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * *
58422 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTAA
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * *
58487 TATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAACATTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTATTAAGAG
321 TACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A--A-TAAGAG
* * * * * * * * * *
58551 ATTTAAAAAGTAAATCTGCTTA-TCAAACCATTTCAAATAGTTTTAACTATTTGAATAATTTAAC
381 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATC
* * * * ** * * ** **
58615 TATTTCAAA-AGTTATAACTTTTTATTTTATCATCGAATAATT-TATTTTGTTTATATTATTTTA
444 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT-TTTTGTTCATACAAGCTTA
*
58678 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** * ** *
58708 ATTTTAAAACT--TAA-T---A-ACTTAAAAAATAAATCTAATTA-TCAAACCGGTTCAAATATT
1 ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * ** *
58765 TAAAACTATATGAATGATAATCAATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
58830 GTTTT-GTTTGA-ACAAGCTTATTTGAATTCAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
130 GTTTTAG-TTCATACAAGCTTATTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * *
58893 ATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAATCAACTCAAATGGTTA-AGACTATTAG
193 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
* * * * *
58957 AAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTTATAAAATAATTGTTTAT-TTCA
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * *
59020 TACAAGCTTATT-TAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAGAAAAAATA
321 TACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT----AATAAGA
* * * * * * **
59083 GATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAATTTTAAATAGTTAAT-ATTATTTAAACAATTGC
380 GATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTAT
** * * * * * * * *
59147 CTATTAAAAATTTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAATTG-TTTCGACTAATACAAGTT
443 CTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCATACAAGCT
** ** *
59211 TAGACGGAATCAAATAATACTAATTTATTAAT
506 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * * * * *
59243 ATTTTCTAAATTATTAAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCTGCTTATTG-ACTCAGTTAAAATAA
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAG
* * * * *
59307 TTATGACCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTGTGACAAAACAA
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAA
* * * *
59372 TTGTTTCTA-ATCACA-AAGCTTATTTGG-TTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAA
128 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * * ** * * * *
59433 ATTAATTAGAAAAAAATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCAATTCAAAAAGTTAAAACCAC
189 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * * * * *
59498 TAGAATAATTTTCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTG-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-
254 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-TTG
* * ** * * * * **
59561 ATCTTACAAACTTATTC-AGAGTAAAATAATCCAAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAA
317 TTCATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--
* * * * * * * *
59625 AAAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTTAAATTGTTATGATTATTTAAATAATTA
379 --AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * *** *
59690 TTTATTTAAAATCATTATGACCCTTTGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCT
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * *
59754 TGTCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAAT
506 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
59786 ATTTCAAAAAGTAATAAGCAATAGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACAAATTCAAATAG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * ** * *
59850 TTATGACTATTGGAATAAGTATCTATTT-AAATTTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAA
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * **
59914 TTATTTCAGTTGATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * ** *
59979 AATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTAGTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTC
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * ** * * *
60040 AACAATTACCTATTTCAAATCTTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCAA
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * *
60105 ACAAGCTTACTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCA-TGCAAAAATTAATAAGTAAGATA
322 ACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAG--AG--A
* * * ** * * *
60169 TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATAC
382 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * **
60234 TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTCCGTTCATACAAGCTTATTCA
447 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
60299 AAATAAAATAACACAAATCTAATAAT
512 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
60325 ATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * ** * *
60390 TAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
60455 -TTTTCATTTCATACTAGCTTGTTAGGAATAACATAA-AATGAATCTATTAATATTTGAAAAA-T
130 GTTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * *
60517 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAGTGCAAATAATTATGACTATTT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * *
60578 GAACAATTATCTATTTCAAA-C-TT-TTA--TTTTG-----TCATAAAACAAATGTTTTTGCTCA
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * *
60633 TATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATGTA
321 TACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * ** * *
60698 AAAAATAAAT-TATTTA-TCAAACAAGTTTTAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTC
386 AAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
60761 AAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAG-TGTATTCAGA
450 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-TATTCAAA
* * *
60825 TTAAAAAAATATTAATTTATTAAT
514 ATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
60849 ATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGGTAAAATAGT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
60914 CATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCT-AACTTTGTCTTTTAT-AGTAAAACAA
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCA-TAAAACAA
* * * * * *
60977 TTGGTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGATGTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * *
61042 AATGAG-CAGAAAATTAAAAAA-AGAATCCGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATT
* * ** * * * ** *
61104 T-AAAAATTATCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCGGTTT
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * * *
61168 ATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAA
320 ATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
* ** *
61231 AGATTTAAAAAATAAATCA-ATTTACTGAATGAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTAT
379 AGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * *
61295 TTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCATA
443 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* * * *
61360 TTCAGATTAAAAGAATATTAATTTATTAAT
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
61390 ATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGGTAAAATAGT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
61455 CATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACTTTTTCTTTTAT-AGTAAAACAAT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAAT
* * * *
61519 TGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTA
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * *
61584 ATGAGCAAAAGAATTAAAAAA-GAATCCGTTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
193 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * ** * * * ** *
61647 AAAAAATTATCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCGGTTTA
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * **
61712 TGCAAGCTTATTTTG-AATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTTTAAAATTAATAAGTAAAA
321 TACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----A
* * ** * * * *
61775 GATTTAAATAATAAATCA-ATTTACTGAATGAGTTCAAATA--TA-G-TTTTTTTAAAACATTA-
380 GATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTAT
* * * * *
61834 -TATTTCAAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAA-T-TTTTTGTTCATACAAGCGT
443 CTATTTC-AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* * * *
61896 ATTCAGATTAAAAAATATATTAATTTATTAAT
507 ATTCAAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
61928 ATTTTAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGGTAAAATAGT
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
61993 CATA-ACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACTTTTTCTTTTAT-AGTAAAACAA
65 TA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAA
* * * *
62056 TTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * *
62121 AATGAGCAAGAGAATTAAAAAA-AGAATCCGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATT
* * * ** * * * * ** *
62184 TAAAAAATTATCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTTTTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCAGTTT
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * * *
62249 ATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAA
320 ATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
* * ** *
62312 AGATTTAAAAAATAAATCA-ATTAACTGAATGAGTTCAAATA-TTATGACTTTTTGAACAATTTA
379 AGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TT-
* * ** * * *
62375 ATTTATTTCTAATCATTATGACATTTT-TGTTTATCATAAAACAATTGTTTTTTATTTATACAA-
441 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGT-TTTATCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCATACAAG
* * *
62438 ATAATTTCAAAAT--AA-AATACTAATTTAGTAAT
504 CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
62470 -TTTCAAAAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTTGTTTTAC-GTAGACCAGTTCAAAT
1 ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TG-TTTACTG-A-ACAAGTTCAAAT
* *
62530 AGTTAAAGAC-ATTTGAAAATAATTATTCTAGCTTCAAATCATTATTGATC-TTTGTTTTGTCAT
62 AGTT-AAGACTATTTG--AATAATTA-TCTA-TTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCA-
* * * * * * * * * *
62593 TAAAATAATTGTTTTATTGTCA-CCATAACTTATTGCAGAGTAAAAATATTGCTAAAGCTGAATA
120 TAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACA-AGCTTATTG--GAAT-AAAATAATACT-AA-TTTATTA
* * **
62657 ATATTTCGTAAAATTAATAAAG-AA-A-ATTTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAATTC
178 ATATTTC-AAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTT--AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTC
* * * * *
62719 AAATAGTTA-AGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACTTTTTG-TTTAGTCAT
238 AAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCAT
* * * * * * *
62782 AAAATAATTGTTTTAGTTCATTCATGTTTATTCAAAATAAAATAATTCT-ATTCTATTAACA-TT
301 AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTT
* * * *
62845 CAAAAAATTACTAAGCAAGAAATT--AAAA-AAA-A-GTTTACTGAACAA-ATAAAATAGTCAAG
365 C-AAAAATTAATAAG--AG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT----
* * * *
62904 ACTATTTGAAC-ATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAAGA-CTGTTTGTTTTATAATAAA
422 --TA--TG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAA
** * *
62967 ACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA--AACTTTATTAAT
481 ACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAAT
* * * ** *
63023 ATTTCAAAAGTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCGAATC-AGTTCAAATA
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATA
* * * * * * * * *
63086 ATTATG-GTCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATTATAAAACA
63 GTTAAGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
63150 ATTGTTGTTCA--TCGTATAACCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTTAAAA
127 ATTGTT-TT-AGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * ** * * *
63212 ATTAATGAGTAGGAAATTTAAAAAACAAAACTATCTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAT
189 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTAT
* *** * * * * *
63277 TTGAACAATTATATATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTATGTT
254 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * * *
63342 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATA-TT-AAGAAAGTTAATAACTAA
319 CATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAA--T--TAA-TAA
* * * * * * * *
63405 GAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTA
378 GAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * * ** * * * *
63470 TCTATTTTAAATCATTAGGACCTTTTGTCTTGTTGTAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTT
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* * * * *
63535 GTTCATATTACAATAATATTAATTTATTAAT
507 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
63566 ATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAA-TT-AAACTA
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAA-TA
* * * **
63625 GTTATA-ACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCACTTGTTTTGTCATAAAACA
63 GTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * ** * *
63689 ATTGTTTCAATTGATACAATATTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATA--TCATGAAA
127 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAA
* * ** * * * *
63752 ATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACCAATGCAAGTAGTTATGACTG
189 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TGAACCAATTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * * * * * * *
63816 TTTGAACAATTATCTATCTCATATCGTTATAACCTTTGGTTTTGTCAGAAGATAATTATTTATGT
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT
* * * * * * * * *
63881 TCATACAAGCTTATTCAAAATAACATAATTCTAACTTATTAGTATTTGAAAAATTAATATGATAT
318 TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAT
* * *
63946 TTAAAAACTAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTAT
383 TTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * * *
64010 TTC-AATCGCTATAATCTCTTATTTTGTTATAAAATAATT-TTTTCTATGCATACAAGCTTATTT
447 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TT
* * * *
64073 C-TATTAAAATAAAAC-AATTTTATTAAC
510 CAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAAT
* * * * * * * *
64100 ATTCAAACAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAGTAGT
1 ATTTAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * ** ** *
64165 TATGACTATTTGCACAATTATTTATTTTAAATCATTACAATATTTTGTTTTGTCACAAAACAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* ** * * ** *
64230 GTTTTTA-TTCATACAAGCTTGTTCAAATTAAATTAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTA
130 G-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * *
64294 ATAAGTAAAAGATTCT-AAAAATAAATATGTTTA-TCG-AGCAAGTTCAAATAGTCATAACTATT
193 ATAAGTAAGAGATT-TAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATT
* ** * * * * * * * **
64356 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTCATCATCAAGCAATTATATCAGTTC
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * *
64421 ATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAG
320 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAG
* * * * * * *
64486 ATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTATA
381 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * *
64551 TTTCAAATTGCTATGGCATTTTGTTTTGTTAAAAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
446 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
*
64616 CCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
510 CAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * * *
64644 ATTCCAAAAATTATTAAGTAATA-ATTTAAAAAATAAATCTCTTTTCTGAACATGCTCAAATAGT
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
64708 TATGACTATTTGAACAATTATCTAATTGAAA-GAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAAT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* *
64772 TGTTTCTA-TTCATACAAG-TGTATTTGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAAT
129 TGTTT-TAGTTCATACAAGCT-TA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * *
64835 TAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAGGACC--TTTAAATGGTTAGGAA-TG
191 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA--ACCAATTCAAATAGTTA-TAACTA
* * ** * * * *
64897 TTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTGTA
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG
* *
64961 TTCATACAAGTTTGTTCGAAATAAGATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATTTGGT
317 TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-----T
* * * * * * * * * *
65025 AGGAGATTTAAAAAACAAAT-TGTTTACTAAACAAATTCATATAATCATGTCCATTTGAACAATG
376 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * **
65089 ATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAAT
441 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * *
65154 TATTCAAAA-AAAATAATATTTATCTATTAAT
506 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
65185 ATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAGAAACTAAATTTGTTTA-TCGAA-ACAGTTCATATA
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACA-AGTTCAAATA
* * * * * * * * *
65244 GCTATGACTATTTAAATAATTATCTATCTCAAATCGTTACGATC-TTTATTTTATCATAAAACAA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *
65308 TTGTTTCT-TTTCATACAAGTTTTATTCAGATTAAAATAATACTAA--T-TTAATA-GT-----A
128 TTGTTT-TAGTTCATACAAG-CTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * *
65363 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGC-GTTTACTGAACTAGTTCAAATAATTA-AGACTA
190 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTA
* * * * * * ** * *
65426 TTAGAACAATTTTCGATTTCAAATCATTCTAACCTTTTCTTTGGTCATAAAACAATTATTTTAGT
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT
* * * **
65491 TCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAGTAATACTAATTTATT-ACATTGAAAAAATTAATGAGCAA
318 TCATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT----AA
* * * * * *
65554 GAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGAATATTTGAATAATC
378 GAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
65618 ATCTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCGTAAAAAC
441 ATCTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * *
65682 TTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTACTAGT
505 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * *
65715 ATTTCAAAAACTAATAAGCAAAAGATTTAAAAACTACAGT-TATTT-CTAAACCAGTTC-AATAG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * ** ** * * * * * * *
65777 TTATGACTATTTGAACAAACATGAATATGAAATCGTTGTGATC-GTTGTTTTGTCATAAAATAAT
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * **
65841 TGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGG-ATAAAAATAACACTAATTTAATAATATTTTGAAAA-T
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * ** * * *
65904 --TAA-TAAGAGATTTAAATAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATAGTTA-AGACTATTA
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTATTT
* ** * * * * *
65965 GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTG-TTCAGTCATATAATAATTGTTTTAGTTC
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * ** *
66029 ATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAACT-CTAATTTAACAACA-TTCAAAATATTAATAAGCAAG
320 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAAT----AAG
*
66092 AGATTTGAAAAAATAAACT-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
379 AGATTT-AAAAAATAAA-TATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * *
66156 TATTTTTAAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTT
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* **
66221 -TTCCAAAAACAAAAAATTTAATACTCCTTTATTAAT
507 ATT-C--AAA-ATAAAA--TAATACTAATTTATTAAT
* *
66257 ATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAA-TTCAAATAA
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * *
66321 TTATAG-CCATTTGAACAACTATTTATTTCAAATCGTTAAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
64 TTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
66384 ATTGTTTT--TAACATACATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATACTAATATTTTAAGAA
127 ATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
66447 TTAATAA-T---AGATTTAAAAATTAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTAT
190 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATAACTAT
* ** * * *
66507 TTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTT
254 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * *
66572 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTT-TGTAATATTAT-AAAAATTAATAACTAA
319 CATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATT-TCAAAAA-T--TAA-TAA
* * * * * **
66635 GAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTT-GTCGAACTAGTTCAAACAATTAAGACTATAAGAACAATT
378 GAGATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *
66698 ATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTCTACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAA
441 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT-T---TG-TT-TT----AT--CATAAAAC----------A
* * * * * *
66763 TATTTCATAAAACAATTATTCCAGCTCATACAAGCTTATTCATAATAGAATAAAACCAATTTATT
484 -A-TT-GT-------TT-TT---GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
66828 AAT
535 AAT
** * * * * * * *
66831 ATTTCAAAAATTTGTAAGTAAAAGATTTAGAAAATAATTTTATTTA-TCGAACTAGTTCAAATAA
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
66895 CTATA-ACTATTTGAAAAATTGTCTATTCCAAATCTTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
64 TTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * *
66959 TTGTTTT-GTTAATATAAGTTTGTTCGAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * **
67023 AATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TT--T--A-C----C-AA-A--CCTAACTATTTG
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * * * ** * * *
67074 AATAATTATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTATTTTGCCATCAAACAATTGGTTATGTTCAT
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * * * * *
67139 ACTA-TCTTATTCGAAATAAAATAATGCTAATTTAATAAAATTTCGAAACTTAATATCCAAGAAA
322 ACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A-AT--AAGAGA
* * * ** * * * **
67203 ATTAAAAAATAAATTTAATTGCCT-AACCAGTTCAAATAGCTAT-ACTATATGAATGATTATCTA
382 TTTAAAAAATAAATAT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * ** * *
67266 TTTCAAATCATTTTGACCTTTTCTTTTGTCGTAAGGCAATTG-TTTTGTTCATACAACCTTATTT
446 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC
** * *
67330 TGATTAAAATAATACTAA-TTAATAAT
511 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
67356 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCA-TCGAATC-AGTTCAATTG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATA
* * * ** * ** * *
67419 GTT-ATACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGATTTTTTGATTAGTCATAAAACAA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* *** * * *
67483 TTGTTTGAGATT-ATACAAGCTTACTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAAT
128 TTGTTTTAG-TTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
67547 TAATAAGAAACAGATTTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATTACTAT
191 TAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * * * **
67612 TTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTGTCAGTT
254 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * * * * * **
67677 AATACGAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAG
319 CATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG
* * ** * * * * *
67741 AAATTTAAAAAATAAATCTATTTGTTGAATC-AGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATTAT
381 --ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
67805 CTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTG----T-TTCATATAAGCATA
443 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* * *
67865 TTCGAAATAAAAGAACACTAATTTATTAAT
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * *
67895 A--T-----TT--T--G-AA-A-ATTT-ATTAATAAATCTGTTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGT
1 ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGT
* * * * ** * * *
67944 TATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAGCAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * **
68008 GTTTCT--TATCATAGAAGCTTATT-TAGTTAAAAATAATACAAATTT-TATAATGTTTTGAAAA
130 GTTT-TAGT-TCATACAAGCTTATTGGA-AT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAA
* * * ** * *
68069 TTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AACCTAT
190 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAA-CTAT
* * * * * * * * *
68133 TAGAATAATTATATATTTCCAATCGTTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-
254 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-TTG
* * * * * * * * **
68196 ATCTTAGAAGTTTATTCGGAGTAAAACAATCCAAATTTATTAA-CGTTCGAAAAATTAATAAGCA
317 TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--
* * * * *** * *
68260 AAACATTTGACAAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCATA
379 --AGATTT-AAAAAATA--AAT-A-TGTTT--AC--TGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGA-C-TA
* * * ** * ** *
68324 TTTTAAAAATTA-ATA-AGCAAGA--GTTAAAAGAAATAAATTTG-TTTATTGA-ACAAATTCAA
430 TTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATTGTT--ATGACCT---TTTGTTTTA-TCATA-AAA--C-A
* * * * * * * * * *
68383 ATAGTTACAACTAT-TTGA-ACAGTTGCCTATTTAAAAT--CATTATGACCT--TTTGTT-TT
484 ATTGTT-----TTTGTTCATACA--AGCTTATTCAAAATAAAATAAT-A-CTAATTTATTAAT
* * ** * * * * * ** **
68439 GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATACAAGCCTATT-CAAAATAAA-AT-AATACT-AATTA-T
1 AT--TTAAA-AATT-AATAAG--TA-A-GAG-AT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGT
* ** * * * * * ** ***
68499 T--AATATGTTGAA-A--A-TT-AATAAGTAAGTAATTT-AAA-AAGTA-AATTCGTTTACTAAA
56 TCAAATA-GTT-AAGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTG
* * * *** * **** * **
68554 TCAGTTTAAATAATTATGGCCATTTCA-ACAA--TTATCTATTTTAAATCACTATTACCTTTTGT
117 TCA--TAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGGAATAAA--A-TAATA-C--TAAT
* * ** *** ** * * *
68616 TTAGTCATATAACAATTGTTTTTAA-TCACACA-AGTTTATAATGAATGAAATAATACTAATTTA
172 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-AGAGA-TTTA-AA--AA--ATA-AAT-CT-GTTTA
* * * * ** * * * *
68679 -TTAATC-TTTCAAA-AATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAATTCAAA
226 CTGAACCAATTCAAATAGTT-ATAA-CTATTTGAACAAT-TATCTATTT--CAAA-TCATT---A
* * ** ** *** * * * * *
68741 T-A-GTTATG-ACTAT--TTGAACAATTGTAAACTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCAT
282 TGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT----TTTTGTTCA-TACAA--GTTTATTCGA-AAT
* ** * * * * * *
68801 AACAATTATTTTTGA-TCATATAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATATGAG-TCTAATAATATTC
339 AA-AA-TAATACTAATTTAT-TAA--TAT-TTC--AA-AAATTAATAAGAGATTTAA-AA-AAT-
* ** * * * * * * * *
68863 CAAAAACTAATAACT-AAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAATCAGTTCAA-ATATTTA
392 -AAATA-TGTTTACTGAACA-AGTT--CAAAT--A---G-TTAT-GACT-ATTTGAACA-A-TT-
* ** * * * * * **
68926 AGACTAATGAACAATTATCTATTTCAAGTCATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATT
441 A-TCT-AT-TTCAA--AT-T-GTT-ATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTT
* * * *
68990 CACACTAGCTTAATCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAAT
496 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * *
69032 ATTTCAAAAGTTAATATGTAAGGGATTTAAAAAAT-AATTTCGTTTACCT-AACCAA-TTCAAAT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-CTGAA-CAAGTTCAAAT
* * * ** * *
69094 AATTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAAA
62 AGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *
69159 AATTATTTCAGTTCAT-CTAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAA
126 AATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
69223 TTTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTGTATTGAA-CAAGTTTAAATAATTAT-GCTA
189 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTA
* * ** * * ** * *
69286 TTTAAACAATTATCTATTTGAAATCACCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTA
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TG
* * * *
69351 TTCATACAAGTTTATT-TAAATTAAGATAATACAAATTTAGTAATA--TCAAGACAATTAATAAG
317 TTCATACAAGTTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAG
* * * *
69413 TAAAAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAA-ATTTTATGACTATTTGAACA
379 ----AGATTTAAAAAAT-AAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACA
* * *
69477 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTATTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATACA
438 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * * * *
69541 AGCTTATTCCGATTAAAATGATATTAATTTATTATT
502 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
69577 GTTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
*** * * * * * *
69641 CGTGACTATTT-AACTAATTATTTATTTCAAATCATTGTCACCTTTTATTTTGTAATAAAATAAT
65 TAAGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
69705 TGTTTTAGTTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATT
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* * ** * * * *
69769 AATGAGTAAGAGAATTCTAAAATGAATCT-TTT-CAT-AGATCATATTTAAATAGTTATGACTAT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TGA-ACCA-ATTCAAATAGTTATAACTAT
* ** * * * * * * *
69831 TAGAACAATTATCTATTTCAAAAAATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATT
254 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTT
** * ** * * *
69896 CATGGAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAGTTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAATAAA
319 CATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAAT--A-AGA
* * * * * * * *
69960 AATTTTAAAAATAAATATGTTTTCTAAACATGTTCAAATAGTTATAACTACTTAAACAATTATCT
380 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * *
70025 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATAAAAGCTTATT
445 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
*** * *
70090 TTGAATAAAATAATTCTAATTTATTAAA
510 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
70118 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTA-TCGAGCGAGTTTAGATAG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
70182 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAA-
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
70246 ----TTATTTC-TATAAGTTTATTCAGAATACAATAACACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTA
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * ** *
70306 ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TAAGTTTAAATAATCATGTC-ATTTA
193 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * * *
70369 AACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAC
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
** **
70434 ACAAAATTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
322 ACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA
* * * * * * *
70499 AAACTAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAACTAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATCTT-
387 AAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTC
* * * * * * * ** *
70562 AAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCATATTCGGAG
450 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
* * * *
70626 TAAAATATTTCTAAATTAATAAT
515 TAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
70649 ATTCTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAGCTAGTTTAAATAGT
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * ** *
70710 TAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATTTTTCTGACC--------T-T--T----C-A--
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
70757 --TTTAG----TA-ATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTAAAAAATTTA
130 GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTA
** * * * * * *
70814 ATAAACAAAAAATTTTAAAAAATAATTATGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
193 ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * ***
70878 CAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCA
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * * * *
70943 TAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATATTACTTGATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAG
321 TACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGAT
* * * * * * * *
71007 ATATAAAAATAAATCA-ATTTA-TCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTTTG
383 TTA-AAAAATAAAT-ATGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** * * * *
71069 TATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGT-ATAAAACAATT-TCTTTTCATT-ATACAAGCCT
444 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT-TTTT-GTTCATACAAGCTT
*
71131 ATTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTATT
507 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
71161 ATTTCAAAAACTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCGGTTTAC----C--GATC-CA-A-T
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
71217 T--CA-TATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
71279 ATTTAAATTCATATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA
130 GTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * ** ** * * * * *
71344 TAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGTTGAAGTAGTTCAAACAATTA-AGACCATATGA
194 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTATTTGA
* ** *
71408 ACAATTATCTATATCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATT-TTTTCAT-TTCA
258 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT--TGTTCA
* * *
71471 TACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAGAAAAAAAGTGA
321 TACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT----AATAAGAGA
* * * ** * * * ** *** *
71535 TTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATC-AGGTCAAATAATTATGGCCCTACCAATAATTATCTA
382 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * ** * * * ** * *
71599 TTTCAAA-TGTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAATAATTTTTTTTGAACATTCAAGCTTATTT
446 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC
*
71663 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
511 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
71690 CTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTAATTGAACTAGTTCAAATAGT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * ** * ** *
71755 TATGGCTATTTGGACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** * * *
71820 ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCTAAAAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAA
130 GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA
** * * ** * * *
71884 TAACAAAGAGAATTAAAAAATAAAT-TTTTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTA-ATACTATATG
194 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
* * ** * * *
71947 AACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAAGTTTTTTTTTTAAA
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGTTTTTGT---
* * * * *
72012 TCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA
318 TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A
* * * * * *
72075 GATATTTAAAAAATAATTATGTTGACTTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTTAACAATTAT
380 G--ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * **
72140 CTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAATTTA
443 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* ** ** * *
72205 TTCAGAATAAGGTAAGGCTATTTTATTGAT
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
72235 ATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTCAAAAATAAAATCTATTTA-TCAATCTAGTTCAAATA
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATA
* * ** * * * * * ** *
72295 ATTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAATAA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ** ** *
72360 CTGTTTCT-GTTTATACAAGCTTATCCGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAAT
128 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * ** * *
72424 TAATAA-TTAGAAAATTTAAAACATGAATATGTTTACCAAACTAGA-TCAAATATGTTTACCAAA
191 TAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCA-ATTCAAATA-G-TTA--TAA
* * * * *
72487 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGTATC-TTT-TTTTGTCATAAAA-AATTATTT
250 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
** * ** * *
72549 CAGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-ATCTAAAAATTAAT--
314 TTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * * * * * *
72611 -A-A--T----AA-AGATA--TTTA--GAA-AA--TGAATTTGTTTATGATTGTTTGAACAGTTA
378 GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTA
* *** * * * * * * * *
72660 TCTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTCTTGTCATAAAATAATAT-TTTCTATTCATAAAAGCC
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT-TGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * *
72724 CATTTC-GAATGAAATAATAC-ACATTTATTACT
506 TA-TTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAAT
* * * * ** *
72756 A-TTAAGATAATGAATAAGTAAAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAAATTCAAAT
1 ATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAAT
* * * ** * * * ** * **
72820 CGTTATGACTATTAGAGCAATTATTTATTTTAACTTGTGATGACCTTTTGTTTTAACATAAAACA
62 AGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
72885 ATTGTTTCT-GTTCATACAAGGTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGATAA
127 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * * * * * *
72949 TTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAAACACCTATGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTA
190 TTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTA
* * * * * *
73012 TTTGAATAATTATGTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATTAAAACAATTATTTTTG
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-TAAAACAATTGTTTTTG
* * * *
73077 TTCATATAA-TCTTATTTGAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTA
317 TTCATACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TA
* * * * * ** *
73141 AGAGAATT-AAAAA-AAATTTGTTCACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTACCTGAATAATTA
377 AGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
*** * * * ** * *
73204 TCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTACTCATGCAAGTTT
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
*** * *
73269 ATTTTGAATATAATAAT-TTAAATTTATTAAT
507 ATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * * *
73300 ATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTTAACACGTTCAAATAGT
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * ** * *
73364 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * *
73429 GTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTA
130 GTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * *
73493 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T--A-C----C---GAG--A-GACTATTTGA
193 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTGA
* * * * * *
73542 ACAATTTTCTATTTCAAA-CTATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCA
258 ACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * *
73606 TTCAAGTTTATTCAAAATAGAATAATACTAAATTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAAA
321 TACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA----GAGA
* * * *
73671 TTTTAAAAAATAAATTTGTTTGC-CAA-ATAGTTCAAATAGTTGA-GACTATTAGAACAATTATC
382 -TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** * * * *
73733 TATTTCAAATTGCTCTGACC-TTTCATTTAGTCATGAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTA
444 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* *
73797 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTAC
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * * * * * *
73827 ATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAATTATGTTTATTGAACAATTTAAAATAC
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
73892 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *** * *
73957 TGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT-CTTAATTTATCAATATTTC-AAATTT
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * ** * ** * *
74020 GATAAGTTAGAGATTTAAAAACTAAGTCAGTTTA-TCGAATCGGTTCAAATAATTATGGCCAATT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * ** *
74084 CAACAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGCTTTTCG-TC
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TTTTTGTTC
* *
74148 ATACAAGCGTTT-TTAG-AATAAAATACTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGT
320 ATACAA--GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AG-
* *
74211 AGATTTTTAAAAA-AAATTTGTTTAC----CAA-TTC---------T---TATTTGAACAATTAT
379 AGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * *** * *
74258 CTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTCAATTCATATACGCTTA
443 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
*** * *
74323 TTTGGAATAAAAT-AGACTAATTTAATAAT
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * *
74352 ATTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTCGAAAAATAAATCTGTCTACTGAAGC-AGTTCAAATAA
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * *
74416 TTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCA-T-T-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAAT
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * *
74478 TGTTTT--TGAATAGTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTCTTTCAAAAAT
129 TGTTTTAGTTCATA--CAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * ** *
74541 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACTAAACCGGTTCAAATAATTATGGCCT-TA
191 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTAT-AACTATT
* * * * * * ** * * **
74605 TCAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGTTTCGTCATATAATAATT-TTTTTAAAT
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT-GTT
* ** * * *
74669 -ATTCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTTATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
319 CATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGA
* * * * * * *
74733 GACTTAAAAAATAAATCTATTTACT-ACACTAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGT-
380 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** * * * * *
74796 AAACTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAT
444 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
*** * *
74861 TTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAAT
509 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
74890 ATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAACCAGTTCAAATAT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
74954 TTAAGATTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAAG
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-
* * *
75018 TTTTTTTAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAA-
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
75080 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACTAATTCAAATAATGATGACTATT
191 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTA-T
** * * * * *
75141 TTG-ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAAATGTTTTTGTT
254 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * * * * * *
75205 CATATAAGTTTAATC-AGAATAAGATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAAAAAT
319 CATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAT
* * * * * *
75269 TTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAATCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCCATTAT-TCA
383 TTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-A
* * ** * ** * * * * * * *
75332 TTTTAAATTATTATGATTTTTTGTTCTATTTTAAAATAGTTCTTTCTATTCATAAAAGCTTATTT
446 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTC
** *
75397 GGATTAAAATAATACTAATTTATTAAT
511 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * * * * *
75424 ATTTCAATGATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAACTACATATATTTACCGAACAAGTACAAATAGT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * *
75489 CATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTAATTAAA-ATTT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
75553 TTTTTAAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAA-AATATTAATTTATTAATATTCCAAAAGTTA
130 GTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTGGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** * * * * *
75617 ATGAGTAAGAGAAATAGAAAAA-GAATATGTTTACCGAA-TAAGTT-AAATAGTTATGACTATTT
193 ATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * *
75679 GAATAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTTTATTCA
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * *
75744 TTCAAGTTTATTTCG-ATTAAAATAAT-TTAAATATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA
321 TACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA
* * * ** * *
75807 ATTAAAAATATATATTTGTTTTTTCAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
382 TTTAAAAA-ATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * ** * * *
75872 TTTCAAATCATTATGAGCTTTTATTTTATCATAAGCCAATTGTTTCTGTGCATAAAAG-TATATT
446 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT-TATT
* * *
75936 CAGAATAAAATAATACTAATTTGTTAAA
510 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
75964 ATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTTATTCATACAAGTTTATTCG
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACTGA-ACAAG----TTC-
** * * *** **
76029 AAATAAAATAATACTAATTT-ATTAA-TATTCTA----AAA--ATTA--AAAGTTTGAGATT-T-
58 AAAT-AGTTAAGACT-ATTTGAATAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTC
* * * * * * * * * * **
76082 AAAAAATAAATCTATTTA--CCGA-ACAAG-TTCAAAT--AATCATATCCATTC-AAACTATTAT
119 ATAAAACAATTGT-TTTAGTTC-ATACAAGCTT--ATTGGAATAAAAT-AATACTAATTTATTA-
* * * ** *** ** * * * * * *
76140 CTATTTCAAATCATT-ATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAAATT
178 ATATTTCAAA-AATTAAT-A-AGTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA-AC--CA--
* * * ** * *
76204 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAGCTAAA
234 ATTC------AAATAGT--T-A--TA--ACTATTTGAACAATT-AT---CTATTTCAAA--T-CA
* ** * ** ** * * **
76269 TCTATTTACCAAACTAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTTTGTTCATGT
279 T-TA-TGACC--TTTTGTT-TTATCA--TAAAAC-AATT----------GT-T-TTTGTTCATAC
* * * * * * * ** * *
76333 GAGCTTATT-TAGAGTGAAATATTGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAGTTAATAAGTAAGAGAT
324 AAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA----TAAGAGAT
** * * * * * * * *
76396 TTAAAAAATAAAGGTGGTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTAATGGAAAAATTATCTATT
383 TTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * **
76461 TCAAATCATTCTGACCTTTTG-CTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTTG
448 TCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * *
76525 AAATCAAATAATACTATTTTAGTAAC
512 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * ** * *
76551 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGATATTTTAAAAAAATAAATCTATTTTCCAAATAAGTTCGAATA
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA
* * * * *
76616 GTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *** * * *
76681 TTGTTTCAGATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * ** * * * * ** *
76746 GAGAAGTTAGAGATTTAAAAAGTAAACCAATTTATTGAATCAATGCAAATAATTATGGCCATTTG
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * ** * * *
76811 AACAATTATTTATTTGAAATCGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTT-TATCA
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCA
* ** * * *
76874 TATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATCAGTAGGAGA
321 TACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGA
* * * * * * *
76939 TTTAAAAAATAAATATGCTTACTGAATAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTATCT
382 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
77003 TTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA----TTATGTACATACAAGCTTATTCG
447 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
* * * * *
77064 GATTAAAATAATACAAATATAATAAT
512 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
77090 ATTATGAAATTTAATATA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-TTCAAATA
1 ATT-TAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATA
* * *
77153 GTTAAGCCTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * * * *
77216 TTATTTTTGTTCATATAAATTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATGAATATTTTAAAAA-T
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
** * **
77280 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-CTGTTTACCAAACCAATTCAATTAGTTATAAGAATTTG
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * * * *
77341 AATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGAT
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * *
77406 AC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTATTA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAG
322 ACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG----AG
* * * ** * * * *
77469 ATTTAAAAAATGAATCTCTTGGCCT-AACTAGTAT-AAATAGTTATAACTGTTTGAATAATTATC
381 ATTTAAAAAATAAATATGTT-TACTGAACAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
77532 TATTTCAAATTGTTATGA--TATTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTG
444 TATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-
* ** * *
77595 CTT-GGAATAACATAAT-TTAATTTATTAAT
507 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * * *
77624 AGTCCAAAA--AATAA-TAAGTA-ATTTAAAAACTGAATCTATTTA-TCGAATAAGTTCAAATAG
1 ATTTAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG
* * * * * *
77684 TTATGACTATTTGTATAATTACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAT
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * *
77749 T-TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATTAAT-ATTTATTAATATTT-AGACAA
129 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTGGAA-TAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAA
* * * ** * * *
77810 TTAATAAATAAGCGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAATTCAAATAGTAATGAGTATT
190 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATT
* *
77875 TGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * * * * *
77939 CATACAAGCTTATTCG-AATCAAAGTAATATTGATTTATTAATACTTCAACAATTAATAAGTAAA
319 CATACAAGTTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----
** * * * * *
78003 AGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATC
379 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** ** * ** *
78068 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTA--A-AATATGAATT-TGTTT-ACCAAACAAGC---
444 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAA-AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
*
78124 -TC-AAAT--AATTATGACT-ATTTGAACAATT-AT
508 TTCAAAATAAAATAAT-ACTAATTT-----ATTAAT
* * * ** *** ** ** * *
78154 CCATTTCAAATTGTTATGATCTTTCATTTTTTCTAAAAT-AAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTT
1 --ATTTAAAAAT-TAAT-AAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTG-TT-TACTGA-ACAAG-TT
** ** * * * * ** *****
78217 -ATTCTAAATAA-AATAATAT-AA-ATTTAT-TAATATTCTAAA-AATTAAT-A-AGTAAAAATT
57 CA-AATAGTTAAGACT-ATTTGAATAATTATCT-AT-TTC-AAATCATT-ATGACCTTTTGTTTT
* * * * ** *
78274 -T-AAAAAATAAATATGCTTTCTGAACACGTT--TAAATAG-TTA-T-GACT-ATTTGA-AC-AA
116 GTCATAAAA-CAAT-TG-TTT-T----A-GTTCATACA-AGCTTATTGGAATAAAATAATACTAA
* * ** * ** * * * *
78329 -TTA-TCA-ATTTCAAATAGTT-ATGACCTATTG-TTTTGTCATAAACT-AAT-TATTT-CTG-T
171 TTTATTAATATTTCAAA-AATTAAT-AAGTA-AGAGATT-T-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAA
* * * ** * * * ***
78385 TC-ATACAAGCATA-TT-TGAAATAAAAT-AACACTAATTTA-TT--AAT-ATGTA--A---AAA
231 CCAATTCAA--ATAGTTAT-AACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT-TATGACCTTTT
* * ** *
78437 ATTTTA--A-AAATA-AATATG--TTT-ATCGA-ACAAG----TTC-AAATACTTATAACTATTT
291 GTTTTATCATAAA-ACAAT-TGTTTTTGTTC-ATACAAGTTTATTCGAAATA-AAATAA-TA-CT
** * ** *
78489 GAATAATTATT--TATTTCAAAAAATTATGATCTTTG-GTTTTCTTGTAAAA-CAATCAT-TTCT
350 -AAT--TTATTAATATTTC-AAAAATTA--A--TAAGAG--AT-TTAAAAAATAAAT-ATGTT-T
* * * * ** * * **
78549 ATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAAT-ACTAATTT-ATTAA-GATTCTA---AAAATTAA
402 ACTGA-ACAAG----TTCA-AAT--AGTTATGACT-ATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATTGT
** * * ** * ** *
78608 TAGGTAGAAGATTTAAAAGGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAA
457 TA--T-G-ACCTTT---TGTTTTATC-A--TA--AAACAA-TT---GT--TTTTGTTCA--T--A
** * * * *
78673 CAATTATCTATTTC-AAAT--CATTATGACCT--TTTGTT-TT
500 CAA-GCT-TA-TTCAAAATAAAATAAT-A-CTAATTTATTAAT
* * ** * * * *
78710 ATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATGCAAAGTTATTCAAAATAAAATAATATC-GATCTA-TTA
1 AT--TTAAA-AATTA-ATAAG-T-A---AGAG--ATT--TAA-AAAATAA-ATCTG-TTTACTGA
* ** * * ** * * *
78773 ATATTTTGAAA-A-TTAATAAAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATAGTTCAAATAGT
50 ACAAGTTCAAATAGTTAA-GACTA-TTTGAATAAT-TATCTATTT--C--AA-A--TC----A-T
* *** * * *
78836 TATGA-GTATTTGGACAAATATCTATAAAAAATCATTATGATGTTTT-G-TCAAAAAACAATTGT
100 TATGACCT-TTT-G--TTTTGTC-AT--AAAA-CA--AT--TGTTTTAGTTC---ATACAA--GC
* *** ** * ** * * *
78898 TTCTTTTCATACAGGCT-TTTTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGT
148 TTATTGGAATA-A-AATAATACT-AATT-TATTAATA-T--TTCAA-AA-ATT-----A---A-T
* * * * * * * * * * *
78962 AAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATTTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAATTAATAGAAC
195 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * ** * *
79027 AATTATCTATTTCAAATCGTTCT-ATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATAA
260 AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * **
79091 AAGTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATT
324 AAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-A--A-TAAGAGATT
* * * * * * *
79155 TAAAAGAATATATCTGTTTA-TCGAATAAATTCAAACAGATT-TGACCATTTTAAACAATTATCT
384 TAAAA-AATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTA-TTTGAACAATTATCT
* * * * *
79218 -TTTCAAAGTTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTA-
445 ATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
* *
79281 TCTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAAT
509 TC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * *
79311 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTGAACTAGTTCCAATAG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * * * *
79371 TTATGACTATTTCAACAAATGT-TAATGTCAAATCATTGTGATCTTCT-TTTTCTCATAATACAA
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * *
79434 TTGTTTCT-GATCATA-AGAGCTTATT-TAGATAAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAA
128 TTGTTT-TAGTTCATACA-AGCTTATTGGA-AT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * ***
79496 A-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATAAA-CATGTTTGCCGAACTTGTTCAAATA-TT-TAAGTC
189 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAA--C
* * * * * * * *
79554 TATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTG-TTTAGTCATATAATAATTATTTT
251 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTT
* * * * * *
79618 AGTTCATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAG
315 TGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A-
* * * * *
79682 CATGAGATTTAGAAAAATAAATCTATCTAC-CAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
377 -A-GAGATTTA-AAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* *** * * * *
79746 ATTATCTATTTAAAAGCATTATGACCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAA
438 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * *
79810 GCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAT
503 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
79845 ATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TCGAATC-GGTTCAAAT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACT-GAA-CAAGTTCAAAT
* * * * * * ** * *
79907 AATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTTCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
62 AGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
**** * * *
79972 AATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCGTAACACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
126 AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
80037 -T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
190 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATT
* ** * * * * * *
80098 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTT
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * * *
80163 ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAAA
320 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGA
* * * ** * *
80227 GATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATC-AGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATTATT
380 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * **** *
80291 TATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTTTAAACTCATAGAAGCTTAT
444 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT
** * *
80356 TTGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAAT
509 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** *
80385 ATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGTTGAACCAGTTCAAATA-T
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * *
80449 TATA-ACTATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATC-TGAAAATAA
65 TA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAA
* * * * * *
80512 TTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * *
80577 AATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGCT-AAACTATTAGAAATAATTTTAACTATTT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATT-CAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * **
80641 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTGA--AT-----AGTT-TTGACTGTTC
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT-TTTGTTC
* * * * *
80698 ATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAACTTAATAACCAAGA
320 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT----AAGA
* * * * * * * * * ***
80762 AAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-C-AAACCTA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAGTGATTA
380 GATTTAAAAAATAAATAT-GTT-TACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** ** * *
80824 TCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTATTGTGGAACAATTG-TTTTGTTCTTATAAGCTT
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* * * * *
80888 ATTTAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAAT
507 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** *
80919 ATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATC-AGGTCAAAT-G
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAG
* ** * * * * * * *
80982 CTTAAAACTATTAAAATAATAATATATTGCAAAT-AGTTATGACATTTTGCTTAGCCATAAAACA
64 -TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * * *
81046 ACTATTTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAA
127 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAA
* * * * ** * * *
81110 CTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CAAATAAGTTTAAATAGTTATTATTA
190 TTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTA
* ** * * * **
81174 TTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTT-TCATAAAGCATTTGTTTCAG
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * * * ** *
81238 CTAATACGAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAGTAAGTA
317 TTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-A
* * * * * * * **
81302 TGAAATTTAAAAAATAACTCTATTTACTAAATC-AGTT-AAATACTTATGGCCATTTGAATGATT
380 -G--ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** * * *
81365 ATCTACTACAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCT
441 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
**
81430 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
506 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
81462 ATTTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACCAGGTT-AAATA
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATA
* * * * ** * *
81525 ATTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAAAATC-TTTGTTTTATCATAAAACA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * *
81588 ATTGTTTCTA-ATCATATAAGCTTATT-CAATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTGT-GAA
127 ATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTGGAA-T-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA
* * * ** * * * *
81650 AATTAAT-AGATAAGTGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAAATTGTTAAAAC
188 AATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCA-ATTCAAATAGTTATAAC
* *** * * * *
81714 TATTAT-AATAATTATCTATTTCAAATTGGTCTGACCTCTTG-TTTAGTCATAAAATACTTGTTT
251 TATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
81777 CAT-ATCTTATAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAAT
314 -TTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAA-
* * * ** * * *
81839 TAGCAAAAGATTTGAAACAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTGTTTGAA
375 T---AAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
81904 TAATTATTTATTTAAAATCGTTATTACCTTTAGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA
436 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
* *
81968 AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAAT
500 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
82006 ATTTCCAAAATTAATAAGTAAG-GGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAGTAG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG
* * * * ** * * *
82070 TTACGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAAT
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
82135 TGTTTCAGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * * * *
82200 AT---T-AGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATCAATGCAAATAATTATAGCCATTTGA
193 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTGA
* * ** * * *
82261 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTTGGTTTGGTTATAAAATAATTGTTTTTTTTTCA
258 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTATCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCA
* *
82325 TACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
321 TACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * * * *
82390 AAAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTGTATACTTT
386 AAAAATAAATATGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT
* * * * * * * *
82454 -AAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTTTTATTCATACAAGTTTATTCAAA
449 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAA
* * * *
82518 ATAAAATAATGCTAATCTAATAAA
514 ATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * *
82542 ATTCAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAGATAGT
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
82607 TAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAATAAT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
** * * *
82671 T-TTTTCAACTCATAGAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
129 TGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * ** * *
82735 TATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTTATTGAATCAGTTCAAATAA
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCA---AAT-AGTT---AT-A
* * * * * * *
82800 TTATGGCCATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTTTCATAAAACATT
249 --A---CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
** ** * * * **
82865 TGTTTTTCAAT-ATACAAGCCTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTTCAAATTGT
309 TGTTTTT-GTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AAT
* ** * * * * *
82929 TACAAGTAGGAGATCAAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGCTATAACTATTT
372 T--AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * *
82993 GAACAATTATATATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCA
433 GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * *
83058 AACAAGCTTATTCGAAATAAAATGATACTAATCTAATAAT
498 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
83098 ATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAA-CAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCCTA
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC---TG-TTTA-CTGA-ACAAG--T-
** * ** * * *** *
83162 TCCAAAATAAAATAATG-CTACTTT-AGTAA-TAT-T-TTGAAAATTGA-TAAGTAAAATAT-TT
56 T-C-AAAT-AGTTAA-GACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCATTATG-ACCTTTTGTT
***** * * * *
83220 AAAAAATAAATCAGTT-TATTGAATCAGTTCAAATAATTATAGC-TATTTGAA-AAAATATCTAT
114 TTGTCATAAAACAATTGT-TT---T-AGTTC--AT-A-CA-AGCTTATTGGAATAAAATA---A-
* * **** * ** ** * ** ** *
83282 TTCAAATCGTTATTAACT-TTT--GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACTTACAAGCT-TA
165 TACTAAT--TTATTAA-TATTTCAAAAAT-TAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGT-
* * ** * * * * * * **
83343 TTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTTTTAA-TATTTCAAGAATTA-CTAAGAGATTAAAAAAATA
223 TT---ACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCT-----ATT--TCAAAT-
* * * * ** * *
83405 AATTTGTTTATTGGACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTC
277 CA-----TTA-T-GAC--CTTT---T-GTTTTATC-A-TAAAACAATTGT-T-TTT----GT-TC
** *** ** * ** * * *
83470 AT--AACCTT-TT-GTTTTATCATAAAAC--ATTTATTTTTA-TTCATATAAGCTTATTCAGA-A
320 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-A-AA-ATTAATAAGAGA
** * * * * ** * ** * * *
83527 TAAAATAAAATTAATTTAGTAATATTCT-AA-AAATT--AATAACTA-AAAGATTTAAAAAATAA
382 TTTAA-AAAATAAATAT-GT--T-TACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT-T
* * ** ***** * * *
83587 AT-TGATTTGCTAAACTAGTTCA-AACAGTTAAAACTAT-ATGAACAATTATTTATTTCAAATTG
441 ATCT-ATTT-C-AAA-TTGTT-ATGACCTTTTGTTTTATCAT-AA-AA-CAATTGTTT----TTG
** * * * * **
83649 TT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAA-ACAATTAT-TTCAGCTTA-TAGAT
494 TTCAT-A-C--AAGCTTAT-TCA-AAATAAAATAATACT-AATTTATTA-AT
* * * * * * *
83696 GTTTATTCAAAATAGAATGAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTAAACCAGTTCAA
1 ATTTA---AAAAT-TAAT--AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAA
* ** *
83761 ATAATTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTA--TTTT-TTTTGTCATAAA
60 ATAGTTA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * * ** * *
83822 ACAACTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATAATAATTTATTAATATTT-AGA
124 ACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-A
** * * * ** * * *
83886 AAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGCAAATTTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGAC
187 AAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAAC
* * * * * * * * * *
83950 TATTTAAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCCTTT-TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCT
251 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * * *
84014 ATTCATACTATTTTATTC-AGAATAAAATAATATTAATTCAATAATATTCTGAAACTTAA-TAAC
316 GTTCATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAA---AATTAA-
* * * * * * * * * **
84077 CAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAGTGT--TGAACTAGTTGAAATAGTTAAGACTATATGAATG
375 TAAGAGATTTAAAAAATAAA--TATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * ** * * ** * * *
84140 CTTATCTATATCAAATCATTATGACTTTTTTTTTTCATTGTAAAACAATT-ATTTTATTCATAGA
438 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
** * * *
84204 AGCTTATTCGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAAT
502 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
84240 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC-GGTTCAAATGG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAG
* * * *
84304 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAAAAAT
64 TTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * *
84369 TGTTTCAGTTCATACAAGCTTGTTTAGAATAAATTCATACCAATTTA-TAA-ACGTTCAGATAA-
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTT-ATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCA-AAAAT
* * * * * * *
84431 TAGAAAAGAAAGAGACTTAAAAAAATAAATCTATTCACTG-ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTA
191 TA-ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTA
* ** * * * ***
84495 TTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAA
253 TTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * *
84559 TTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTCTAAATTAA-TAAGT
317 TTCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC-AAA--AATTAA-T
* * * * * * **
84622 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAATC-ATTTAAAATAATTAAGACTATTTGAATGA
376 AAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
84685 TCATTTATTTGAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAG
439 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
*
84749 CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
504 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * *
84783 ATTTCAAAAACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTATTG---TAGTTCAAATAGT
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * * *
84845 TATA-ACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCTTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAGACAAT
65 TA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * *
84908 TGTTTCTA-ATCATAGAAACTTATTCGG-TTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAA-
129 TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
84969 -AGTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTT-GTGAAACCAATTCAAATAGTTAAAACCACT
191 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG-AACCAATTCAAATAGTTATAACTATT
* * ** * * * * * *
85031 AGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTCATCATTTG-TTTAGTCATAAAAC-ATTTTTTTTATA
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGT-
* * * * * * * *
85094 TCTTACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATCCAAATTTAATAACATTTGAAAAATTAATAAGCAA
318 TCATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---
* * * * * *
85158 AATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATAAATATTTGAACAATTA
379 -AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * ** *
85223 TTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGACATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAGCT
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* *
85287 TATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAAT
506 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
85319 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAAATTAATTTGTTTA-TCAAACAAATTCAAATA
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATA
* * * * *
85382 GTTATGACCA-TTGAACAATTGA-CTATTTAAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * *
85445 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-CAA-AATAA-AATAATAATTTATTAATATTCCAAATAT
127 ATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * * * * **
85507 TAATAAGGAAGTGTTTTAAAAAGTGATTCTATTTATTGAA-TAAGTTCAAATA-TGATGGCTATT
191 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATT
* * ** * ** *
85570 TCAATAATTATCTATTTGGAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATT
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG-TT
* * *
85635 -ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCA-TTCAAAAATTAATAAGTAAG
319 CATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAG--AG
* * * * * * * * * *
85698 AAATTTTAAAAATAAATCTATTTATTGAACCCA-TTGAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTGT
381 --ATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * *
85762 ATAATTCAAATCAATTATTTAAAAAATAAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTATGTTC
443 CTATTTC--A--AATT-GTT-----AT-GACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * ** * *
85827 ATTCAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAAT
497 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * *
85868 ACTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGT
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * *
85933 TAAGATTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * *
85998 -TTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGAAATAAAATAA-AATAAATTTACTAATATTTCAAAAAT
130 GTTTT-AGTTCATACAAGCTTATT--GGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * *
86061 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTTTGCTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATAATTATT
191 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATT
* ** ** *
86125 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTT
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC-AATTGTTTTTGTT
* * * * * *
86189 GATATAAGACTGTA-TAG-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGATA
319 CATACAAG--TTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * * * * * *
86252 TTTAAGAAATAAATCTTTTTA-TCAATCCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
382 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * *
86316 TTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTTTTTATATATAAAACAATAGTTTCTATTCATACGAA-CTTAT
446 TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTAT-CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC-AAGCTTAT
*** *
86379 TTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAAT
509 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
86408 ATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATT-AAATAG
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG-TTCAAATAG
* * * * ** * * * * * ****
86472 TCATGACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAT-TATTTC-AATTAATATAAGC--TT-ATTCAAAATAA
64 TTAAGAC---T-ATTTG-AAT-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* ** * * * * * * *
86532 AATAA-T-ACTAAGTT-AT--TA--TTATT---CTAAAA-ATTAATAA-TTA--AGAGATTTAAA
123 AACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTTCAA
* ** * * * * * * * * * *
86583 AAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAA
187 AAATTAATAAG--TA-AG-A-GA-TTTAAAAAATAAAT--CTGTTT--AC--TGAACCAATTCAA
* ** * * * ** * *
86647 ATAGCTATAAGC-ATTTG---TTTTGTC-A--TAAAATAATT-T---CTTTTG-TCCAT-ACAAG
240 ATAGTTATAA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
*** **** * * * * * * * *
86699 CTTATT-TTGAATAAAATAATACAAATTTATT--AATATTAAGACAATTAATAA-GTA-AAAGAT
304 ACAATTGTT---TTTGTTCATACAAGTTTATTCGAA-A-TAAAATAA-TACTAATTTATTAATAT
* * ** * ** *
86759 TTAAAAAAATAAATCTG-TATACCAAATAAATTCAAATCAT-TATGACTATTTGAACGATTATCG
363 TT-CAAAAATTAATAAGAGAT-TTAAA-AAA-T-AAAT-ATGT-T---TA-CTGAAC-A--A--G
* * ** * *** * * * * ***
86822 ATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG---TTTTGTC-ATAAAAAAATTATTTTTGTTCATACAAGCT
412 --TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATT-GTTATG-ACCT-TTTG-T
* * * * * ** * * * **
86883 TATTCA-AATTAAAATAA-TATTATT-TT-AT-TAATATT-TTGACAAT-TAATAAGTAAAAGAT
470 T-TT-ATCA-TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACTA-AT
*
86941 TTA-GAA-
530 TTATTAAT
* * * * * * * * * * * * * *
86947 A-GTAAATATGT-TTACCG-AACA-AGTTCAAATAGT-CATGACTATTTAAATAATTATCTATTT
1 ATTTAAAAAT-TAATA-AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT--CTGTTT-ACTGA--A-CAAGTT
* * * * * * * * * *
87007 CAAATCA-TTATGACCT-TTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATATAAGCTTATTT
57 CAAAT-AGTTAAGA-CTATTTG---AATAAT-TATC---TATTTCAAATCATTATGA-CCT-TTT
*** *** * * * * * * **
87069 GAAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTCA-A-AAAC-TAATGAGTAAGAGAATTAA-AAA
111 GTTTTGTCATAAAAC-AATTGT-TT--TAGTTCATACAAGCTTATTG-G-AATA-AAATAATACT
** * * * *** * *
87129 AATGAATT--TGTTTACCAAACAAGTTCAA-ATAGTTATG-GCTATTTGAATTGT-TATCTATTT
169 AATTTATTAATATTT--CAAA-AA-TT-AATA-AG-TAAGAG--ATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * *** * ** * * * * ** *
87189 -C-AAAACATTATTACCTTTTGTT-TTGCCA-TTAAACAATTGGT-T-TTGC---TCA-TACAAG
225 ACTGAACCA--ATT-CAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * *** * * *
87244 C--TTATTTTA-AATAAAATAA-TATAAAT-TT-AT-TAA---TATTC---CTAAAAT--TAATA
286 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTA
* * * * ** ** **** *
87294 A-GTA--AAAATTTTAAAAATAAATTTG-TTTTCTAAGCGGTTCAAATA-G-TTA-TGAA-TA-T
351 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATT-TAA-AAAAT-AAATATGTTTACTGAACAAGT
** * * *** * *** * *
87350 TTGAATAATTATCTA-T-TGCAAATC-GTTATGAC--T---A---TT-TG---TTTTG--TCATA
413 TCAAATAGTTAT-GACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATC
*** *** * *
87398 AACCAATTGTT---TTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
476 ATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** * * * * *
87457 ACTAAAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCTAGTTCAAATAGT
1 A-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * * ** * * * *
87522 TATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTGGTAATAAAACAATT
65 TAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* **
87587 GTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATT
130 GTTT-TAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
** * * * * * ** *
87650 AATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-ACTAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * *
87714 GAACTATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTTTTTTAT-AGTAAAACAATTATTTCTT-TT
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCA-TAAAACAATTGTTT-TTGTT
** * * * *
87777 CATACAAAATTATTC-AGAATAAAATAATACCAATTTATCACTATTTCAAAAATTAATATG-GAT
319 CATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGAT
* * * * * * *
87840 TT-AAAAATAAATGTATTTGCTGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAAATTATGC-
383 TTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC--AATTAT-CT
* * ** *
87903 ATTTCAAATAAGTT-TGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTA
445 ATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
* * ** * *
87966 TTAAAAATATAGCAATACTAATTTATTTAC
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * *
87996 ATTCAAAATTTTAATAAGCAAGAAATTTTTAAAAAATAAAAT-TTTTTA-TCAAATAAATTCAAA
1 ATTTAAAA-ATTAATAAGTAAGAGA--TTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAA
* * * * *
88059 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCACTATGACCTTTTATTTTATCATAAAAC
61 TAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * *** * *
88124 AAATTGTTTTCGTGCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TCACTTTATTAATATTTCCAA
126 -AATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAA
* * ** * * * * * * **
88188 AATTGATAAGTGAGAGATTTCCAAAATCAATCAGTTTA-TCAAATCAATTAAAATAATTATGGCT
188 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATAACT
* * * * * **
88252 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAACACAATTGTTTTCC
252 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTG
* ** * * * * *
88317 ATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTACTGATATTTCATAAATTAAT-A-AG-
317 TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * * * ** * * * * *
88379 --TAAGAGAT-TATTTGTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATATAT
382 TTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * *
88441 TTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTCA
447 TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA
* *
88505 AAATAAAATAATACTAATGTAATAAT
512 AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * *
88531 ATTCTAAAAATTAATAACTAA-AAATTTTTAAAAATAAATTTGTTT-GTCAAACTAGTTCAAACA
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATA
* * * * * * * * **
88594 ATGAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* *
88659 TTTTTTTAGTTC-T--TAG--TA-T--AA-AATAA-AATA--AATTTATTAATATTTCAAAAATT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * *
88712 AATAAGTAAGATATTAAAAAAATAATTATGTTTGC-CAAGCCAGTTCAAATAATTATGACTATTT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CCAATTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * *
88776 GAACAATTATCT-TTTCCAAATCGTTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAATAGA-TGTTTTTGTT
256 GAACAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA-ATTGTTTTTGTT
* ** * * * * *
88838 CATATAAGTTGGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTACTATATT-GAAAATTAAGAAGTAAG
319 CATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATT---AA-TAAG
* * * * * * * * *
88902 AAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTTAACAATTATG
379 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * * *
88967 TATTTCAAATCGTTATAATCATATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTGTCCATGC-AGTCTTA
444 TATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTA
* * *
89031 TTCAGAATAAAATGATACTATTTTATTAAT
508 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * ** *
89061 ATTCTAAAAATCAATAAGTAACAGATTGAAAAAATGAATTTGTTGGCTTG-ACTAA-TGCAAATA
1 ATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TGAAC-AAGTTCAAATA
** * ** * * * *
89124 GTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCACAAAATAA
63 GTTAAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * * *
89189 TTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCGAAATAACATATTTCTACTTTATTAATATTCCAAATATT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * ** *
89254 AATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTAACTA
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTG
* ** * **
89319 AACAATTATCTATTTTAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTTTCTAATCA
257 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCA
** * * * * *
89383 TACAAGCCTATTTC-CAATAAAATTATACAAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAGGTAAAA
321 TACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-A-A--TAAGA
* * * * *
89446 GATTTAAAAAATAAATCTTTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCT
380 GATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
** * ** * * *
89511 ATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTGGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAAT
445 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
*
89576 -ATTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT
510 CA-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * *
89604 ATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAACATGTTCAAATAG-
1 ATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT
* * ** * **
89667 TAATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTCTTTTACCGTAAATTAA
65 TAA-GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * *
89731 TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAATCCAAAAACT
128 TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * ** * * *
89795 AATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTACTG-AGTAAGCTCAAATAGTTGTGACTATTT
192 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAA-TTCAAATAGTTATAACTATTT
* ** * * * *
89859 GAACAATTATTTATTTCAAAT-ACTTATGTTCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTC
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
*
89923 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGC--AAATTAATAGGTAGG
320 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAAAATTAATA---AGA
* * * * * * *
89986 GTATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTTAACAATTAC
380 G-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * **
90050 CTATTTCAAATTGTTATGACCCTTTGTCTTGTCGTAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAAATT
443 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTT
*
90114 ATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAAT
507 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
90145 A--T---AATTAAT-AG--A-AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCG---AA--TC-AAT--TT
1 ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
90193 AA-A-TAGTT--ATGA--CTC-ATTT----T-A--AT----TTGTATTTTATCATAAAATAATTG
66 AAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * * *
90240 TTTCT-TTTCATATAAGCATATTTGAATTAAAATAATACAAATTT-TAAAAAATTTCATAAATTA
131 TTT-TAGTTCATACAAGCTTATTGGAA-TAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTA
* * * * *
90303 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTTA-AGATTATTA
193 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACCAATTCAAATAGTTATA-ACTATTT
* * * * * ** * *
90366 GAACAATTATCTATTTCATATCATTTTAACCTTCT-ATGCAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTC
256 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * *
90430 ATACAAGCTTATTCCG-AATAAAATAAAACTAATTTATTAACA-TTCAAAATTTTAATAAGCAAG
320 ATACAAGTTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAAT----AAG
* * * * * * * *
90493 AGACTTAAAAAATTAATTTTGTTTGCCGATCCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTA
379 AGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACTGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * *** * *
90557 TTTATTTCAAATTTTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACATTTTTGTTCA-ATAAGTTT
442 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT
* * *
90621 GTTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
507 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** ***
90652 ATTTGAAAATTAATAAG---G-CATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAA-TTTTGATAGT
1 ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
90712 TATA-ACTATTTGAGTAATTATTTATTTTAAATCTTTACGACCATTTATTTTGTCATAAAGCAAC
65 TA-AGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** ** * *
90776 TATTTTTGTTCACACAATCTTATTCAAAATAATTTAATGCTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAATT
129 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT
* *** ** * *** * *
90840 AATAAGTAATG-GATTTAGAAAAGGTATCTGTTGGCTTG-ACTAGCGCAAATAGTTATGACTGTT
192 AATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC-TGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATT
* * * *
90903 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC
255 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * * * * *
90968 GTACAAGCTTATTCGAAATAACATAATTCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAT
320 ATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AG--
* * * * *
91033 ATTTAAAAGAATGAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCT
381 ATTTAAAA-AATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * *
91098 ATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGA-CGTAAAACAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTA
445 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTA
91161 TTTCAAA
508 -TTCAAA
91168 TCTGTTTACT
Statistics
Matches: 25341, Mismatches: 5914, Indels: 4572
0.71 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
493 11 0.00
494 18 0.00
495 17 0.00
496 10 0.00
497 11 0.00
498 21 0.00
499 18 0.00
500 10 0.00
501 7 0.00
502 8 0.00
503 8 0.00
504 36 0.00
505 9 0.00
506 59 0.00
507 228 0.01
508 135 0.01
509 64 0.00
510 126 0.00
511 11 0.00
512 86 0.00
513 101 0.00
514 18 0.00
515 9 0.00
516 35 0.00
517 21 0.00
518 30 0.00
519 90 0.00
520 135 0.01
521 341 0.01
522 195 0.01
523 148 0.01
524 442 0.02
525 369 0.01
526 355 0.01
527 366 0.01
528 306 0.01
529 632 0.02
530 394 0.02
531 311 0.01
532 274 0.01
533 291 0.01
534 854 0.03
535 877 0.03
536 1316 0.05
537 713 0.03
538 1851 0.07
539 1481 0.06
540 1449 0.06
541 1532 0.06
542 1763 0.07
543 1908 0.08
544 1373 0.05
545 430 0.02
546 103 0.00
547 92 0.00
548 53 0.00
549 162 0.01
550 129 0.01
551 135 0.01
552 229 0.01
553 105 0.00
554 130 0.01
555 167 0.01
556 231 0.01
557 49 0.00
558 45 0.00
559 41 0.00
560 41 0.00
561 53 0.00
562 34 0.00
563 69 0.00
564 182 0.01
565 65 0.00
566 42 0.00
567 45 0.00
568 25 0.00
569 15 0.00
570 20 0.00
571 41 0.00
572 31 0.00
573 35 0.00
574 190 0.01
575 26 0.00
576 55 0.00
577 32 0.00
578 48 0.00
579 37 0.00
580 45 0.00
581 44 0.00
582 23 0.00
583 33 0.00
584 50 0.00
585 62 0.00
586 94 0.00
587 162 0.01
588 62 0.00
589 89 0.00
590 79 0.00
591 36 0.00
592 59 0.00
593 43 0.00
594 35 0.00
595 20 0.00
596 27 0.00
597 13 0.00
598 36 0.00
599 15 0.00
600 27 0.00
601 15 0.00
602 4 0.00
603 19 0.00
604 6 0.00
606 1 0.00
609 6 0.00
610 11 0.00
611 10 0.00
612 10 0.00
613 14 0.00
614 7 0.00
615 3 0.00
616 4 0.00
617 5 0.00
618 10 0.00
619 9 0.00
620 6 0.00
621 7 0.00
622 4 0.00
623 3 0.00
624 14 0.00
625 14 0.00
626 22 0.00
627 9 0.00
628 1 0.00
629 2 0.00
630 6 0.00
631 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (537 bp):
ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT
AAGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
TTTTAGTTCATACAAGCTTATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACCAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
ATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA
TAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTG
TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
AATACTAATTTATTAAT
Found at i:58694 original size:897 final size:894
Alignment explanation
Indices: 57109--93238 Score: 7950
Period size: 897 Copynumber: 40.1 Consensus size: 894
57099 TAATGAGCAA
* * * *
57109 AAGATTTAAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTT-GAGTAGATT-TGACTA-TTGAAGAAT
1 AAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAA-TTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAAT
* * * * *
57171 TATCTATTTGAAGTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAGAAAACAATTGTTTCA-GTTCATAAAAA
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATAAAAG
* * * *
57235 CTTATCCAAAATAAAATAATACTACTCTATTAATATTTCAAAAATCAATAAGC-AAGAGATTTAA
127 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * **
57299 AAACTAAAGCTGTTTTCTGAACTAGTTCAAATAATTATGA-ATATTTGAACAAATATCAATCCCA
191 AAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATA--TGAACAATTACCTATTTCA
* * * * * *
57363 AATTATTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTCTGATCATACAAGCTTATTCAG-AT
254 AATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGATCATACAAGCTTAATCGGAAT
* * *
57426 AAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
318 AAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* ** * * * * * **
57488 TTGTCAAACCAATTCAAATAGTTGA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCACATTGTT-TTGAC
383 TTATTGAACCAATTCAAATAATT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATT-AC
* * * *
57551 CTTTTG-TTTAGTCATATAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATA
446 CTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAACA
* * * * * * * ** *
57613 CTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAACAAGCATGAGTTTTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA
508 CTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGCTTA-CCAA
* * * * * *
57678 A-AAGTTCAAATAGCTATAACTATTTGAACAATTATCTATATAAAATCA-TTATGAAC-TTTTAT
570 ACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT-AACTTTTTAT
* * * * * *
57740 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTTA-CCAAAATAAAATAATAATACTTTAT
633 TTTATCATAAAACAATTTTTTTA-TTTAT-ATAGTTTTATTCAAAAT--AA-AATAATAC-TTAT
* * *
57804 TAATATTTAAAATATTAATAA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGCTTATTGAATCCA-TTT
692 TAATATTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTGAA-CCAGTTC
* * * * * * *
57866 AAATAATTATGGCCATTGGAATAACTACCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAA
755 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * *
57931 AATAATTGTTTTTTAGCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAAT-CATAATTTATTAACATTTCA
820 AACAATTGTTTTTT-GCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCA
*
57995 ATAATTAATAAG
883 AAAATTAATAAG
* * * *
58007 -AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCTAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAA
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * *
58071 CTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCAAAAAAGCTTA
66 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTA
* * * * * *
58136 TTCATACTAAAAAAATACTAATTTAGTAA-AATTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAA
131 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA
* **
58200 TAAATCTATTTGCTGAACCTA-TTCAAATAGTTAAGACATATGAACAATTATTTATTTCAAATTA
195 TAAATCTATTTGCTGAA-CTAGTTCAAATAATTAAGACATATGAACAATTACCTATTTCAAATTA
* * * * * * *
58264 TTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAATAATTATTTTAGCTTATACAAGCTTAATTGGAAT-AGAA
259 TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GATCATACAAGCTTAATCGGAATAAAAA
* *
58328 TAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTA
323 TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA-TTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
* * *
58392 TTGAACCAATTCAACTAATTGTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTT
386 TTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTT
* * * * * *
58457 GTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAACATTAATTTA
451 GTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTA
* * * * * *
58522 TTAATATTTAGAAAATTAATTATTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTATCAAACCATTTCAA
516 ATAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCAGTTCAA
** * **
58587 ATAGTTTTAACTATTTGAATAATTTAACTATTTCAAA-AGTTATAACTTTTTATTTTATCATCGA
580 ATAGTTAAAACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTATCATAAA
* * * * * *
58651 ATAATTTATTTTGTTTATATTA-TTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT--TA-ATAATATTT
644 ACAATTT-TTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATACTTATTAATATTTAAAATAT
* * * * * * * **
58712 TAA-AACTTAATA-ACTTAAAAAATAAATCTAATTA-TCAAACCGGTTCAAATATTTAAAACTAT
707 TAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * *
58774 ATGAATGATAATCAATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTT
771 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTT-TTT
* * * *
58839 G-A-ACAAGCTTATTTGAATTCAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
834 GCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
** * * * * *
58898 TAATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTAAATCAA-CTCAAATGGTTAAGACTATTAGAAAAA
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * *
58962 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGTTATAAAATAATTGTTTAT-TTCATACAA
62 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAA
* * * * * ** *
59025 GCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAGAAAAAATAGATTTA
126 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTT-
* * * * * * * * * * **
59089 AAAAAATAAATCTATTTACTGAACAATTTTAAATAGTTAATATTATTTAAACAATTGCCTATTAA
189 AAAAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGA-CATATGAACAATTACCTATTTC
* * * * * *
59154 AAATTTGTTATAACCTTTTGA-TTTGTCATAAAAAAATTGTTTCGACTAATACAAGTTTAGA-CG
253 AAA-TTATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGA-TCATACAAGCTTA-ATCG
* * * * *
59217 GAAT-CAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTATTAAATAAAAAATTTAAAAAATAA
314 GAATAAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * **
59280 ATCTGCTTATTG-ACTCAGTTAAAATAATTATGACCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATT
377 ATCTATTTATTGAAC-CAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * ** * * **
59344 ATGACCTTTTGTTTTTGTGACAAAACAATTGTTTCTAATCACA-AAGCTTATTTG-GTTAAAAAT
441 ATTACCTTTTG-TTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAAT
* * * * * * *
59407 AATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATTAGAAAAAAATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCC
504 AACACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACC
* * * * * * * * * *
59472 AAACCAATTCAAAAAGTTAAAACCACTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCGTTATGACATTTT-G
568 AAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTAT
* * ** * * *
59536 TTTAGTCATAAAA-TATTTGTTTCATATCTTACA-A-ACTTATTCAGAGTAAAATAATCCAAATT
633 TTTA-TCATAAAACAATTT-TTT--TAT-TTATATAGTTTTATTCAAAATAAAATAAT----ACT
* * * * * * * * *
59598 TATTAACATTAAAAAAATTAATAAGA-AAAAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTT
689 TATTAATATTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTT
* ** * * * * * * *
59662 TAAATTGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCCTTTGTTTTGACATA
754 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
59727 AAACAATTGTTTCAATT-CATAAAAGCTTGTCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTC
819 AAACAATTGTTT--TTTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
*
59791 AAAAAGTAATAAG
882 AAAAATTAATAAG
* * * * * *
59804 CAATAGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTGGAATAAG
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * *
59869 TATCTATTT-AAATTTGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCA-GTTGATATAA
63 TATCTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATAAAA
*
59932 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGTGATTTAA
126 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
59993 AAAGTGAATCTGTTTAG-TGAA-TCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTCAACAATTACCTATTTC
191 AAAATAAATCTATTT-GCTGAACT-AGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTC
* * * * * * **
60056 AAATCT-TTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCAAACAAGCTTACTCAAA
253 AAAT-TATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGATCATACAAGCTTAATCGGA
* *
60120 AT-AAAATAATACTAATTTATTAATCA-TGCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAAT
316 ATAAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * ** * * * * * *
60183 CTATTTACTGAACTAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTATACTTCAAATCATTATA
379 CTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATT
* * * *
60248 ACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTCCGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACAC
444 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAC
* * * * * * * * *
60313 AAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAACAAATTTGTTTGCCGAACT
509 TAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACC
* * * * * *
60378 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-TCTTTTATTTTG
573 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACT-TTTTATTTTA
* ***
60442 TCATAAAACAATTTTTTCATTTCATACTAGCTTGTTAGGAATAACATAAAATGAAT-C-TATTAA
637 TCATAAAACAATTTTTTTATTT-ATA-TAG-TT-TTATTCA-AA-ATAAAAT-AATACTTATTAA
* *
60505 TATTTGAAAA-A-T--T-A-ATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACCAGTGCAAA
695 TATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACCAGTTCAAA
* *
60563 TAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC--A-----A--A-CTTTTATTTTGTCATAAAAC
758 TAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
60618 AAATG-TTTTTGCTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAA
823 AATTGTTTTTTG--CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
60682 ATTAATAAG
886 ATTAATAAG
* * * * **
60691 -AGATGTAAAAAATAAA-TTATTTATCAAACAAGTTT-TAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTA
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAA-TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * * *
60753 TTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAG-TG
65 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCT-
* * * * * * *
60817 TATTCAGATTAAAAAAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
129 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * * * ** *
60882 ATAAATATGTTTACCGAACAAGGTAAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATT
194 ATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAATT
* * * * * * * ** *
60947 ATTCT-AACTTTGTCTTTTAT-AGTAAAACAATTGGTTTAGTTCATATAAGCTT-ATTTG-ATGT
258 ATTATGACCTTT-TATTTTGTCA-TAAAACAATT-GTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAAT-A
* * * * * * **
61008 AAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAG-CAGAAAATTAAAAAA-AGAATCCG
319 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTA
* * * * * * ** *
61071 TTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAAAATTATCTATTTCAAAACACAATGAC
382 TTTATTGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC
* * ** * * * * * *
61134 CTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCGGTTTATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAAGAATA-T
446 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAACACT
* * * *** ** **
61197 AAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAATG
510 -AATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACC
** * * * * * * * *
61262 AGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGT
573 AGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTAT
* * * * * ** * *
61327 TATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAG-CATATTCAGATTAA-AAGAATATTAATTTATTAAT
638 CATAAAACAAT-TTTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCA-A--AATAA-AATAAT-ACTTATTAAT
* * * * * * * * *
61390 ATTTCAACA-ATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGGTAAAATA
696 ATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATA
* * * ** * * * * *
61453 GTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACTTTTTCTTTTAT-AGTAAAACA
760 ATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACA
* * **
61517 ATTGTTTTAGTT-CATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
824 ATTGTTTT--TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
* *
61581 CTAATGAGCAA
887 TTAAT-A--AG
* * ** ** * * * *
61592 AAGAATTAAAAAA-GAATCCGTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTA
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
***** * * * ** * **
61656 TCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCGGTTTATGCAAGCTT
65 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTT
*** * * ** * * *
61721 ATTTTGAATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTTTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAATA
130 ATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * *** * * *
61785 ATAAATCAATTTACTGAA-TGAGTTCAAAT-A-T-AGTTTTTTTAAAACATTA--TATTTCAAAA
194 ATAAATCTATTTGCTGAACT-AGTTCAAATAATTAAGACATATGAACA-ATTACCTATTTC-AAA
* * * * * * * * * *
61844 TTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATT-TTTTGTTCATACAAGCGTATTCAGATTAAA
256 TTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAATAAA
* * * * * *
61908 AA-ATATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTT
321 AATA-ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * * ** * * * *
61972 TACCGAA-TAAGGTAAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATTATTCTAACTT
384 TATTGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT
* * * * ** *
62036 TTTCTTTTAT-AGTAAAACAATTGTTT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTA
448 TTTGTTTTATCA-TAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTA
* * * * * * * ** **
62099 ATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAGCAAGAGAATTAAAAAA-AGAATCCGTTTACTGAATAA
511 ATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGCTTACCAAACCA
** * * *** * *
62163 GTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAA-ACACAATGACCTTTTT-TTTTT
574 GTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-GTTAT-AACTTTTTATTTTA
* ** * * * *
62226 TCATAAAGCAATTGGTTCAGTTTATGCA-AGCTTATT-TTGAATAA-AAGAATATAAATTTATTA
637 TCATAAAACAATTTTTTTA-TTTAT--ATAG-TT-TTATTCAA-AATAA-AATA-ATACTTATTA
* * * * * **
62288 ATTTTTCAAAA-ATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTAACTGAATGAGTTCAAA
694 ATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAA
* * * * * * *
62351 T-ATTATGACTTTTTGAACAATTTAATTTATTTCTAATCATTATGACATTTT-TGTTTATCATAA
758 TAATTATGACTATTTGAATAA-TT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTTGTCATAA
** * * * *
62414 AACAATTGTTTTTTATTTATACAA-ATAATTTC-AAA-ATAA-AATACTAATTTAGTAAT-TTTC
820 AACAATTG-TTTTT-TGCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
*
62474 AAAAGTTAATAAG
882 AAAAATTAATAAG
* * * * * *
62487 -AGATTTAAAAACTAAATCTTGTTTTACGTAGACCAGTTCAAATAGTTAAAGAC-ATTTGAAAAT
1 AAGATTTAAAAAATAAAT-TTG-TTTAC-CAAACAATTTCAAATAGTT-ATGACTATTTG--AAT
* ** * * *
62550 AATTATTCTAGCTTCAAATCATTATTGATC-TTTGTTTTGTCATTAAAATAATTGTTTTAT-TGT
60 AATTA-TCTA-TTTCAAATTGTTA-TGACCTTTTGTTTTATCA-TAAAACAATTG-TTTATGT-T
* * * * * * * * * *
62613 CACCATAA-CTTATTGCAGAGTAAAAATATTGCTAAAGCTGAATAATATTTCGTAAAATTAATAA
119 CA-TAAAAGCTTATT-CAAAAT-AAAATAATACT-AA-TTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
** * * * * * *
62677 AGAA-A-ATTTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAATTCAAATAGTTAAGAC-TATTAGA
178 CTAAGAGA-TTT--AAAAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATA-T-GA
* * * * * * * * * * *
62739 ATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATT
238 ACAATTACCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GATCATA
* * * ** * * *
62804 CATGTTTATTCAAAAT-AAAATAATTCT-ATTCTATTAACA-TTCAAAAAATTACTAAGCAAGA-
302 CAAGCTTAATCGGAATAAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTA-TAAGTAAGAG
* * * * * *** **
62865 AATTAAAAAA-AAGTTTACTGAACAAATAAAATAGTCAAGACT-ATT-TGAAC-ATTTGAACAAT
364 ATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAA-CCAAT--TCAA-A-TAATTAT-AACTATTTGAACAAT
* * ** * * * *
62926 TATCTATTTAAAATCGTTAAGA-CTGTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAG
423 TATCTATTTCAAATCATTATTACCT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG
* * * * * * * **
62990 CTTATCCAAAATAAAATAATA--AACTTTATTAATATTTCAAAAGTTGAGAAGTTGGAGATTTAA
487 CTTATTCGAAATAAAATAACACTAA-TTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *** * * *
63053 AAAATAAATCAGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATT-ATGGTCATTTCAACAATTATCTATTTTA
550 AAAATAAATCTGCTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCA
* * * * ***
63117 AATCA-TTATGAAC-TTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTGTTCATCGTATA-A-CCCTATTCA
614 AAT-AGTTAT-AACTTTTTATTTTATCATAAAACAATT-TT-TTTAT-TTATATAGTTTTATTCA
* * * * * * *
63178 GAATAAAATAATACTAATTTTTAATATTTTAAAA-ATTAATGA-GTAGGAAATTTAAAAAACAAA
674 AAATAAAATAATAC---TTATTAATA-TTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * *
63241 ACTATCTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGCTAT
735 TCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * *
63306 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTATTTATGTT-CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
800 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
* * *
63370 ACTAATCTAATAATA-TT-AAGAAAGTTAATAACTA
863 ACTAATTTATTAATATTTCAA-AAA-TTAATAA--G
* * * * * * *
63404 AGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATT
1 A-AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* ** * * * ** * * * * *
63469 ATCTATTTTAAATCATTAGGACCTTTTGTCTTGTTGTAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGTT
64 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCT
* * * * * *
63534 TGTTCATATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAA
129 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * **
63595 ATAAATCTATTTACTAAACCAATT-AAACTAGTTATA-ACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
194 ATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAA-TAATTA-AGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAA
* ** * ** * ** * *
63658 TCATTATGACCACTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTGATACAATATTATTTGGAAT-A
256 TTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGA-TCATACAAGCTTAATCGGAATAA
* * * * *
63722 AAGTAATGCTAATTTATTAATA--TCATGAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTG
320 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
** * * * * * * * * *
63785 TTGGCTTG-ACCAATGCAAGTAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATCTCATATCGTTATAAC
382 TT-TATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC
* * * * * * * * **
63849 CTTTGGTTTTGTCAGAAGATAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAACATAATTCTA
446 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTA
* * * * * * * * * *
63914 ACTTATTAGTATTTGAAAAATTAAT-A-T--GATATTTAAAAACTAAATATGTTTATCGAACAAG
511 ATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCAG
** * * * * * *
63975 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTC-AATCGCTATAA-TCTCTTATTTTGTT
575 TTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACT-TTTTATTTTATC
* ** * * * *
64038 ATAAAATAATTTTTTCTATGCATACAAGCTTATTTCTATT-AAAATAAAACAAT-TTTATTAACA
639 ATAAAACAATTTTTT-TATTTATA-TAG----TTT-TATTCAAAATAAAATAATACTTATTAATA
* * * * * * * ** * * *
64101 TTCAAACA-ATTAATAA-GTAAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAGTAG
697 TTTAAA-ATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAA
* * * * * ** ** *
64164 TTATGACTATTTGCACAATTATTTATTTTAAATCATTACAATATTTTGTTTTGTCACAAAACAAT
761 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * ** *
64229 TGTTTTTATTCATACAAGCTTGTTC-AAATTAAATTAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATT
826 TGTTTTT-TGCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
64293 AATAAG
889 AATAAG
* * * * * * *
64299 TAAAAGATTCT-AAAAATAAATATGTTTATCGAGCAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAA
1 ---AAGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * * *
64363 TTATCTATTTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTCATCATCAAGCAATTATATCA-GTTCATATAG
62 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT-TTATGTTCATAAAA
* *
64427 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAA
126 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * ***
64492 AAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTATATTTCAA
191 AAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAA
** * * * * * * * **
64557 ATTGCTATGGCATTTTGTTTTGTTAAAAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCCAAAT
255 ATTATTATGACCTTTTATTTTG-TCATAAAACAATTG-TTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAAT
* *
64622 -AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAAGTAATA-ATTTAAAAAATAAATCT
318 AAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
* * * * * *
64684 CTTT-TCTGAA-C-ATGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAATTGAAA-GAGTTA
381 ATTTAT-TGAACCAAT--TCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA
* * * * * *
64745 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTATTCATACAAG-TGTATTTGAAATAAAATAA
442 TTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAA
* * * * * * *
64809 TACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGA
506 CACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACC-A
* * * * * * *
64874 GGACC--TTTAAATGGTTAGGAA-TGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TGTTTT
569 -AACCAGTTCAAATAGTTA-AAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACT-TTTT
* * * * * * * * *
64935 GTTTTGTCATAAAATAATTGTTTGTATTCATACAAG-TTTGTTCGAAATAAGATAATACTAATTT
631 ATTTTATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC----TT
**** * * * * * *
64999 ATTAATATTCTAAAA-ATTAATTTGGTAGGAGATTTAAAAAACAAAT-TGTTTACTAAACAAATT
690 ATTAATATT-TAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTT
* * * * * * *
65062 CATATAATCATGTCCATTTGAACAATGATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATA
754 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* ** * * * * *
65127 AAACAATTGTTTCTGTT-CATGCAAAATTATTC-AAAAAAAATAATATTTATCTATTAATATTTT
819 AAACAATTGTTT-T-TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
65190 AAAAATTAATAAG
882 AAAAATTAATAAG
* * * * * * *
65203 -AGATTTAGAAACTAAATTTGTTTATCGAAAC-AGTTCATATAGCTATGACTATTTAAATAATTA
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * * * *
65266 TCTATCTCAAATCGTTACGATC-TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGTTT
65 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAG-CT
* * * *
65330 TATTCAGATTAAAATAATACTAA--T-TTAATA-GT-----ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAA
129 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * ** *
65386 ATAAATGC-GTTTACTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-TATTAGAACAATTTTCGATTTCAAA
194 ATAAAT-CTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATA-T-GAACAATTACCTATTTCAAA
* * * * * * * * *
65449 TCATTCTAACCTTTTCTTTGGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAGAAT-A
256 TTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GATCATACAAGCTTAATCGGAATAA
* * ** * *
65513 AAGTAATACTAATTTATT-ACATTGAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTAT
320 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTAT
** * * ** *
65577 TTACCGAA-CAAGTTCAAATAGATT-TGAA-TATTTGAATAATCATCTATTT-AAAGTTGTTATG
383 TTATTGAACCAA-TTCAAATA-ATTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATT
* * * * * * *
65638 ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCGTAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATA
444 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACA
* * * * * * * * * * * *
65702 TTACTTTACTAGTATTTCAAAAACTAATAAGCAAAAGATTTAAAAACTACAGT-T-ATTTCTAAA
508 CTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGCTTACCAAA
** * ** ** * * * * * ** *
65765 CCAGTTC-AATAGTTATGACTATTTGAACAAACATGAATATGAAATCGTTGTGA-TCGTTGTTTT
571 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTT
* * * * * * *
65828 GTCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATT-TGGATAAAAATAACACTAAT--TTAA
636 ATCATAAAACAATT-TTTTT-ATTTATA-TAG-TT-TTAT---TCAAAATAA-AATAATACTTAT
* * * * * ** *
65889 TAATATTTTGAAA-A-T--T-A-ATAAGAGATTTAAATAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTA
692 TAATA-TTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCA
* * * * * ** *
65948 AATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTCAGTCATATA
756 AATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * ** *
66013 ATAATTGTTTTAGTT-CATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAACT-CTAATTTAACAACA-TTCA
821 ACAATTGTTTT--TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA
66075 AAATATTAATAAG
883 AAA-ATTAATAAG
* ** * * *
66088 CAAGAGATTTGAAAAAATAAACTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
1 --A-AGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * *
66153 TTATATTTTTAAAATTGTTGTGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAA
62 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT-GTTCATAAAA
* * ** * *
66217 ACTT-TTCCAAAAACAAAAAATTTAATACTCCTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTAAGAG
126 GCTTATT-C--AAA-ATAAAA--TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAG
* * * * * * **
66281 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-TCAATTCAAATAATTATAGCCATTTGAACAACTATTT
185 ATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACT-AGTTCAAATAATTA-AGACATATGAACAATTACCT
** * * * * *
66345 ATTTCAAATCGTTAAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAACATACATGCTTATT
248 ATTTCAAATTATT-ATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCTTAAT
* * * * * * * *
66409 TGAAAT-AAAATAATACTAATATACTAATATTTTAAGAA-T-TAA-TAATAGATTTAAAAATTAA
312 CGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** * * * * **
66470 ATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTA
377 ATCTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
66535 TAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT
442 TTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAC
** * * ** *
66600 ACTAATTTTGTAATATTATAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTGTCGA
507 ACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GCTTACCAA
* * * * ** * * * *
66664 ACTAGTTCAAACAATTAAGACTATAAGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTCTACAA
570 ACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTAT-AACTT-T----
* ** *
66729 GCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCATAAAACAATTATTCCAGCTCATAC
629 --TTATT----TTATCATAAAAC-AATTT-TT-TTA-TT--T------A-TA-T--AG-T--T--
* * * ** * *
66794 AAGCTTATTCATAATAGAATAAAACCAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTTGTAA-GTAAAAGAT
667 ----TTATTCAAAATAAAATAATA-C---TTATTAATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGAT
* * * * * * * *
66857 TTAGAAAATAATTTTATTTA-TCGAACTAGTTCAAATAACTATAACTATTTGAAAAATTGTCTAT
723 TTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT
* * * * * * * *
66921 TCCAAATCTTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTT-AATATAAGTTTGTTCG
787 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TTGCATACAAGCTTATTCG
* * *
66985 AAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAG
851 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
67029 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-----C-------TA--ACTATTTGAATAAT
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * * ** * * ** *
67080 TATTTATTTCAAATTATTATAATCTTTTATTTTGCCATCAAACAATTGGTTATGTTCATACTATC
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGC
* * * * * * * * * *
67145 TTATTCGAAATAAAATAATGCTAATTTAATAAAATTTCGAAACTTAATATCCAAGAAAATTAAAA
128 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* * * ** * ** *
67210 AATAAATTTAATTGCCT-AACCAGTTCAAATAGCT-ATACTATATGAATGATTATCTATTTCAAA
193 AATAAATCTATTTG-CTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAA
* * * * ** * * * ** *
67273 TCATTTTGACCTTTTCTTTTGTCGTAAGGCAATTGTTTTGTTCATACAACCTTATTTTG-ATTAA
256 TTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAATAAA
* * * *
67337 AATAATACTAA-TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTC
321 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
* * * * ** * ** * * **
67401 ATCGAATCAGTTCAATTGGTTAT-ACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTGATTTTT
385 ATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTT
* * ** * * * *
67465 TG-ATTAGTCATAAAACAATTGTTTGAGATT-ATACAAGCTTACTCAAAATAAATTAATACTAAT
450 TGTTTTA-TCATAAAACAATTATTTCTG-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTAAT
* * * * ** ** * *
67528 TTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGAAACAGATTTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAA
513 TTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCAG
* ** * * * * *
67593 TTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGA-TTTGT
575 TTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAA-CTTTTTATTTTAT
* * * * * ** ** *
67656 CATAAAACAATTGTGTCAGTTAATACGAGCTTAGATGGAATAA-AATAATAATAATTTATTAATA
638 CATAAAACAATTTTTTTA-TTTATA-TAG-TTTTATTCAA-AATAA-AATAAT-ACTTATTAATA
** * * ** * *
67720 TTTCCTAA-ATTAATAA-GTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGTTGAATCAGTTAAAATAA
697 TTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAA
* * ** * *
67783 TTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAAT
761 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * **
67848 TG---TTT-CATATAAGCATATTCGAAATAAAAGAACACTAATTTATTAATATTTTGAAAATT--
826 TGTTTTTTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
67907 T---
891 TAAG
* * * * *
67908 ---A-TT----AATAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * *
67965 CAATCTCAAATTGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCT-TATCATAGAAGCTT
66 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGT-TCATAAAAGCTT
* ** * * ** * *
68028 ATT-TAGTTAAAAATAATACAAATTT-TATAATGTTTTGAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAA
130 ATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* * ** * * * ** *
68091 AATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAA-ACCTATTAGAATAATTATATATTTCCAA
193 AATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATA-T-GAACAATTACCTATTTCAAA
** * * * * * * * * * *
68155 TCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCTTAGAAGTTTATTCGGAGT-
256 TTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TGATCATACAAGCTTAATCGGAATA
* * * ** * * * *
68218 AAAACAATCCAAATTTATTAA-CGTTCGAAAAATTAATAAGCAAAACATTTGACAAAATAGTAAT
319 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATA--AAT
** * * * *
68282 GACTA--T-TTGAA-CAATT-ATTTATTTA-AAATCATTATG-ACCA-TA--T-TTT-AAA-AAT
379 --CTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACT-ATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * ** ** * * * * ** ** *
68334 TAATAAGC--AAGAGTTA--A-AAGA-AATAAATT-TGTTTATTGAA-CAAATTC-AAAT--AGT
440 T-ATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* ** ** ** ***
68388 TACAACT-ATTTGAACAGTTGCCTATTTAAAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
504 AAC-ACTAATTT--A-A--T-AATATTTAAAA--ATTAAT-A-AGTAAGAGAT-T--TAAAA-AA
*** * * * * ** * * * **
68451 TTGTTTCAGTTTATACAAGCCTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTATTAATATGTTGA-AAAT
554 -TAAATCTGCTTA-CCAAACC-AGTTC-AAAT-AGTTAAAACT-ATT-TGAATA-ATT-ATCTAT
* * * * ** * * ****
68514 TAATAAGTAAGTAATTTAAAAAGTAAATTCGTTTACTAAATCAGTTTAAATAATTATGGCCATTT
610 T--TCA--AA-T-AGTT----A-TAACTT--TTTATTTTATCA--TAAAACAATT-TTTTTATTT
* * ** * * * * * * * **
68579 CA-ACAATTATCTATTTTAAAT-CACTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGTTTTTAAT
659 -ATATAGTT-T-TATTCAAAATAAAATAATA-C--TT-ATTAAT-ATTTAA-AA-TATTAATAA-
* * * * *
68642 CACACA-AG-TTTATAATGAATGAAATAATACTAATTTA-TTAATC-TTTCAAA-AATTAATAAG
713 CATA-AGAGATTTA-AA--AA--ATA-AAT-CT-ATTTACTGAACCAGTTCAAATAATT-AT--G
* * * * * * *** * * * **
68702 A-AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA-C-TAAT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
766 ACTATTTGAATAAT-TATCTATTT--CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC-A-TAAAACAAT
* * * * * * * ** * *
68763 TGTAAACTTTAAAT-CATTATAACCTTTTGTTCTATCATAACAATTATTTTTGA-TCATATAAGC
826 TGT----TTT--TTGCA-TACAAGC--TTATTCGA-AATAA-AA-TAATACTAATTTAT-TAA--
*
68826 T-TATTCGAAATAAAATAATATGAG
876 TAT-TTC--AA-AAATTAATA--AG
* *** * ** * *
68850 TCTAATAATATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAATCAGT
1 ---AA-GAT-TT---AAAA--AATAA--ATTTG-TTTACCAAA-CAA-----TT-TCAAAT-AGT
* * * * * * * * * * *
68915 TCA--AATATTTAAGACTAATGAACAATTATC-TATT-TCAAGTCATTTTTGTTTTGTCATAAAA
45 T-ATGACTATTT--GAATAATTATCTATT-TCAAATTGTTATGAC-CTTTTGTTTTATCATAAAA
* * * ** * *
68976 CAATTTTTTCA-ATTCACACTAGCTTAATCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAA
105 CAATTGTTT-ATGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAA
* ** * * ** * * *
69039 AAGTTAATATGTAAGGGATTTAAAAAATAATTTCGT-TTACCT-AACCAATTCAAATAATTATGA
168 AAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAA-ATC-TATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGA
* * * * * *
69102 CTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTT
231 C-ATATGAACAATTACCTATTTCAAATTATTATGACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
69167 CAGTTCAT-CTAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAATTTAATA
294 -TGATCATAC-AAGCTTAATCGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATA
* * * * * * *
69230 AATAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTGTATTGAA-CAAGTTTAAATAATTAT-GCTATTTAAAC
356 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAAC
* ** * * * * * *
69293 AATTATCTATTTGAAATCACCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCATAC
420 AATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAA-CAATTATTTCTGTTCATAC
* * * * * * * *
69358 AAGTTTATT-TAAATTAAGATAATACAAATTTAGTAATA-TCAAGACAATTAATAAGTAAAAGAT
484 AAGCTTATTCGAAA-TAAAATAACACTAATTTAATAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * ** * *
69421 TTAAAAAATAAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAA-ATTTTATGACTATTTGAACAATTATTTA
546 TTAAAAAAT-AAATCTGCTTACCAAACCAGTTCAAATA-GTTAAAACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * * *
69485 TTTCAAATTGTTATGACTATTTATTTTATCATAAAACAA-TTGTTTATGTTCATACAAG-CTTAT
609 TTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTTTTTTAT-TT-ATA-TAGTTTTAT
** * * * * * * *
69548 TCCGATTAAAATGATATTAATTTATTATTGTTTCAACA-ATTAATAA-GTAAAAGATTT-AAAAA
671 TCAAAATAAAAT-A-A-T-ACTTATTAATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** *
69610 TAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCGTGACTATTT-AACTAATTATTTATTTCAAATC
731 TAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
69674 ATTGTCACCTTTTATTTTGTAATAAAATAATTGTTTTAGTT-CATATAAGTTTATTTGAAATAAA
795 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAA
*
69738 ATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAG
858 ATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* ** * * *
69775 TAAGAGAATTCTAAAATGAATCT-TTT--CATAGATCATATTT-AAATAGTTATGACTATTAGAA
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCA-A-A-CA-ATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* *** * * * * * * * **
69836 CAATTATCTATTTCAAAAAATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATGG
59 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAA
** * * * *
69901 AAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAGTTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-AAATT
124 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATT
* * * * * * * *
69964 TTAAAAATAAATATGTTTTCTAAAC-ATGTTCAAATAGTTATA-AC-TACTTAAACAATTATCTA
188 TAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACTA-GTTCAAATAATTA-AGACATA--TGAACAATTACCTA
** * * * * *
70026 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCT-ATTTATAAAAGCTTATT
249 TTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGA-TCATACAAGCTTAAT
** * * *
70090 TTGAAT-AAAATAATTCTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
312 CGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
** * * * * * * * * * *
70154 AATCTGCTTATCGAGCGAGTTTAGATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATT
376 AATCTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * *
70219 ATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC---T-AT--AAGTTTATTC-AGAATACAATA
441 ATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATA
* * ** **
70277 ACACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG
505 ACACTAATTTAATAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCA
** * * * *** * * * *
70342 AATAAGTTTAAATAATCATGTC-ATTTAAACT-ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACATTTTG
569 AACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACTTTTTA
* * * * * *** *
70404 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAATTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTAT
632 TTTTATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATATAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC----TTAT
* *
70469 TAATATTTCAAAA-A-T--T-A-ATAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTC
692 TAATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTC
* * * *
70527 AACTAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATA
755 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
70590 AAACAATTGTTTCTATT-CGTACAAGCATATTCGGAGTAAAATATTTCTAAATTAATAATA-TTC
819 AAACAATTGTTT-T-TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
70653 TAAAAATTAATAAG
882 -AAAAATTAATAAG
* ** * * * *
70667 -AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAGCTAGTTT-AAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTA
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * *
70730 TTTATTTCAAATTTTTCTGACC--------T-T--T----C-A---TTTA-G----T-AATGCTT
65 TCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTT
** * ** * * *
70770 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTAAAAAATTTAATAAAC-AAAAAATTTTAAAA
130 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AACTAAGAGA-TTTAAAA
* * * * * * * * * *
70834 AATAATTATGTTTACTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAA
193 AATAAATCTATTTGCTGAACT-AGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAA
* * * * ** * * *
70898 TAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTT-ATC-TAAAAT
256 TTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGA-TCATACAAGCTTAATCGGAATA-
* * * * * *
70961 AAAATAATATTACTTGATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATAT-AAAAATAAATCAAT
319 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * ** * * * * * *
71025 TTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTTTGTATTTCAAATCATTATGAACT
383 TTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT
* * * * *
71090 TTTGTTTTGT-ATAAAACAATT-TCTTTTCATT-ATACAAGCCTATTC-AAATAAAATAATACTA
448 TTTGTTTTATCATAAAACAATTAT-TTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTA
* * * * * *
71151 ATTTATTATTATTTCAAAAACTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATC-GGTT----TACC-G
511 ATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCAG
* * * * * * * *
71210 ATC-CA-A-TT--CA-TATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTATAACTTTTTGTTCTATT
575 TTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACTTTTTATTTTATC
* ** * * * *
71268 ATAAAATAATTATTTAAATTCATATAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATA-TTAATTTAATAATA
639 ATAAAACAATT-TTTTTATTTATAT-AGTTTTATTCAAAATAAAATAATACTT-A-TTAAT-AT-
* ** ** *
71331 TTCCAAAA-ATTAATAAC-TAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGTTGAAGTAGTTCAAACAA
698 TT--AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAA
* * * * * * * *
71394 TTAAGACCATATGAACAATTATCTATATCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAAT
761 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * *
71459 T-TTTTCATTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATT
826 TGTTTT--TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* *
71522 AGAAAAA
889 A-ATAAG
* * * ** * * ** ***
71529 AAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATC-AGGTCAAATAATTATGGCCCTACCAATAAT
1 AA--GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * ** * * * * ** **
71593 TATCTATTTCAAA-TGTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAATAATTTTTTTTGAACATTCAAGC
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGC
** * *
71657 TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
128 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
*** * * * * * **** *
71722 AATAAATCTATTAATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGGACAATTGTAAACTTCAAAT
193 AATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAAT
* * * * * * *
71787 TGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-TAA-AAA
257 TATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAATAAA
* * ** * * *
71850 AATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACAAAGAGAATTAAAAAATAAATTTTTT
321 AATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATT
* * * * * * *
71914 TGTCGAACCAGTTCAAATATTTA-ATACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCT
384 TATTGAACCAATTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCT
* ** * * * * * * *
71978 TTTGTTTTGTTGTAAAATAAGTTTTTTTTTTAAATCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-A-
448 TTTGTTTTATCATAAAACAA-TTATTTCTGT---TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAC
* * * * **
72041 TGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAATTATG-TTGACTTAA
509 T-AATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTT-ACCAAA
* ** * * * * *
72105 CCAGTTCAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTT
571 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTT
* * * * * ** * ** * *
72170 GTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAATTTATTCAGAATAAGGTAAGGCTATTTTATTGAT
636 ATCATAAAAC-AATTTTTTTATTTATATAGTTTTATTCAAAATAAAATAA---TA-CTTATTAAT
* * *
72235 ATTTTAAAA-A-T--T-A-ATAAGAGATTTCAAAAATAAAATCTATTTA-TCAATCTAGTTCAAA
696 A-TTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACTGAA-CCAGTTCAAA
** * * * * ** *
72293 TAATTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAAT
758 TAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * ** *
72358 AACTGTTTCTGTT-TATACAAGCTTATCCG-AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAT
823 AATTGTTT-T-TTGCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
72421 AATTAATAATTAG
885 AATTAAT-A--AG
* * * * * ** **
72434 AAAATTTAAAACATGAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATATGTTTACCAAACTATTTGAATAA
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATA-G-TTA--TGACTATTTGAATAA
* * * *
72499 TTATCTATTTCAAATTATTATGTATC-TTT-TTTTGTCATAAAA-AATTATTTCA-GTTCATATA
62 TTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATA-A
* * * *
72560 AA-CTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-ATCTAAAAATTAATAA-TAAAGATAT
124 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAACT-AAGAGAT
* * * * * *
72622 TTAGAAAAT-GA---A-TT--TG---T--TT---ATGATT--G---TTTGAACAGTTATCTATTT
187 TTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATATGAACAATTACCTATTT
* * * * * * * * ** *
72667 GAAATCACTATAACCTTTTGTCTTGTCATAAAATAATAT-TTTCT-ATTCATAAAAGCCCATTTC
252 CAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT-TGTTT-TGA-TCATACAAGCTTA-ATC
* * * *
72730 -GAAT-GAAATAATAC-ACATTTATTACTA-TT-AAGATAATGAATAAGTAAAAGATTTTAAAAA
313 GGAATAAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAA-A-AAT-TATAAGTAAGAGA-TTT-AAAA
* * ** * ** * * * * * *
72790 AATAAATATGTTT-TCCAAACAAATTCAAATCGTTATGACTATTAGAGCAATTATTTATTTTAAC
372 AATAAATCTATTTAT-TGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * *
72854 TTGTGATGACCTTTTGTTTTAACATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGGTTATTC-AGATTA
436 TCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATA
* * * * * * ** * *
72918 AAATAATATTAATTTATTAATATTTCGATAATTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAAACACCTATGT
500 AAATAACACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGC
* * * * ** * * *
72982 TTATCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATCA-TTATGACC
563 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACT
* * * * * * * ** *
73046 TTTTCTTTTGTAATTAAAACAATTATTTTTGTTCATATAATCTTATTTGAAGTAAAATAATATTA
627 TTTTATTTTATCA-TAAAACAATT-TTTTTATTTATATAGTTTTATTCAAAATAAAAT-A-A-T-
* * * * * * * * **
73111 ATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATGA-GTAAGAGAATT-AAAAA-AAATTTGTTCACTAAATA
686 ACTTATTAATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACC
* ** * *
73172 AGTTCAAATAGTTATGACTACCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGT
750 AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * *
73237 CATAAAACAATTGGTTCTACT-CATGCAAGTTTATTTTG-AATATAATAAT-TTAAATTTATTAA
815 CATAAAACAATT-GTT-TTTTGCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
*
73299 TATTCCAAAAATTAATAAG
876 TATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * ** ** * *
73318 TAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTTAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATT
1 --AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* * *
73383 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAGCT
64 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCT
** * * * * *
73448 TATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
129 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * ** *
73513 ATAAATCTGTTTACCG-A-GAG----ACT-A-T------T-TGAACAATTTTCTATTTCAAACTA
194 ATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATATGAACAATTACCTATTTCAAATTA
* * * * ** *
73563 TTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATTCAAGTTTATTCAAAAT-AG
259 TTATGACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGA-TCATACAAGCTTAATCGGAATAAA
* * ** * *
73626 AATAATACTAAATTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAAATTTTAAAAAATAAAT-T-TG
321 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATT
** * * * * *** * *
73689 T-TTGCCAAATAGTTCAAATAGTTGA-GACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGAC
384 TATTG--AACCAATTCAAATAATT-ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC
** * * * * * *
73752 C-TTTCATTTAGTCATGAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
446 CTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAC
* * * * ** * * * * ***
73815 TAATTTATTTACATTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTTAAAAAATAATTATGTTTATTGAAC
509 TAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAAC
* * * * ** * * ** * * *
73880 AATTTAAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTA
572 CAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTA
* * * * * *
73945 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAG-CTTATCCAAAATAAAATAAT-CTTAATTTATCAA
637 TCATAAAACAATTTTTTTA-TTTAT-ATAGTTTTATTCAAAATAAAATAATACTT-A--T-T-AA
* * * * * * * *
74008 TATTTCAAAT-TTGATAA-GTTAGAGATTTAAAAACTAAGTC-AGTTTA-TCGAATCGGTTCAAA
695 TATTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-GAACCAGTTCAAA
* * * * * * * *
74069 TAATTATGGCCAATTCAACAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGCCATAAAAC
758 TAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
74134 AATTGCTTTTCGTCATACAAGCGTTTTTAG-AATAAAATACTACTAATTTATTAATATTTCAAAA
823 AATTGTTTTTTG-CATACAAGC-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
74198 ATTAATAAG
886 ATTAATAAG
* *
74207 TAGTAGATTTTTAAAAA-AAATTTGTTTA-C---CAA-TTC---------T---TATTTGAACAA
1 -A--AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * *
74254 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTCA-ATTCATATAC
62 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATAAAA
*** * * **
74318 GCTTATTTGGAATAAAAT-AGACTAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTCG
126 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
* * * * *
74381 AAAAATAAATCTGTCTACTGAAGC-AGTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTC
190 AAAAATAAATCTATTTGCTGAA-CTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTC
* * * * * * *
74445 AAATCA-T-T-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA--ATAGTCAAGCTTATTTGA
253 AAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGATCATA--CAAGCTTAATCGG
* * *
74505 AAT-AAAATAATACTAATTTATTAGTCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATAAAT
315 AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * ** ** * * * * * *
74569 TTGTTTACTAAACCGGTTCAAATAATTATGGCCT-TATCAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTAT
379 CTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
** * * ** * *
74633 TACCTTTTGTTTCGTCATATAATAATT-TTT-T-TAAATATTCAAACTTATTCAAAATAAAATAA
443 TACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATA--CAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * ** * *
74695 TACTTATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTACTAC
506 CACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAA
* ** * * * * ** * * * *
74760 ACTAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGT-AAACTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTT
570 ACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTT
* * * * * * *** *
74824 TGTCGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAG-CTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATA
635 TATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC---T-TATTA
* *
74888 ATATTTCAAAA-ATTAATAAC-TAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAACCAGTTCAA
694 ATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTCAA
* * * * * *
74950 ATATTTAAGATTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAA
757 ATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
75014 TAAGTT-TTTTTAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTCA
822 CAA-TTGTTTTT--TGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA
75076 AAAATTAATAAG
883 AAAATTAATAAG
* * * * *
75088 -AGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCTAACTAA-TTCAAATAATGATGACTATTTTG-ACAAT
1 AAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACCAAAC-AATTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATAAT
* * * * * * * *
75149 TATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGT
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGC
* * * * *
75214 TTAATCAGAATAAGATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AA-A-ATTTAAAA
128 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * * *
75275 AATAAATCTATTT-ATCAATCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCCATTA-TTCATTTTAA
193 AATAAATCTATTTGCTGAA-CTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCT-ATTTCAA
** * * * ** * * * * * *
75338 ATTATTATGATTTTTTGTTCTATTTTAAAATAGTTCTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTTGG-AT
255 ATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGA-TCATACAAGCTTAATCGGAAT
* ** * * * * *
75401 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATGATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAACTACATATA
318 AAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
** * * * * * * *
75466 TTTACCGAA-CAAGTACAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGAC
382 TTTATTGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC
* * * * * * * * * * * *
75530 CTTTTCTTTTGTAAT-TAA-AATTTTTTTTAAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAA-AATAT
446 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCT--GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAC
* * * * ** * * * * *
75592 TAATTTATTAATATTCCAAAAGTTAATGAGTAAGAGAAATAGAAAAA-GAATATGTTTACCGAAT
509 TAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-AAAAATAAATCTGCTTACCAAAC
* ** * * *
75656 AAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATAACCTTTTGTTTT
572 CAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-GTTATAACTTTTTATTTT
* * * * * *
75719 GTCATAAAACAATTGATTTTATTCAT-TCAAG-TTTATTTC-GATTAAAATAATTTAAATATATT
636 ATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATAT--AGTTTTA-TTCAAAATAAAATAA--T-ACT-TATT
* * * * * * ** *
75781 AATATTCCAAAA-ATTAATAA-GTAA-A-AATTAAAAATATATATTTGTTTTTTCAA-CATGTTC
693 AATATT-TAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTACTGAACCA-GTTC
* * * * * *
75841 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAGCTTTTATTTTATCATAA
755 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * * *
75906 GCCAATTGTTTCTGTGCATAAAAG-TATATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTGTTAAAATTCC
820 AACAATTGTTT-TTTGCATACAAGCT-TATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
75969 AAAAATTAATAAG
882 AAAAATTAATAAG
* * * * *
75982 TAAAAAATTTAAAAAATAAATCTAT-TTTATTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAAT-ACTA
1 ---AAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTA-CCAAACAA---T-TTC-AAAT--AGTTATGACT-
* * * ** ** ** * *
76045 ATTT-ATTAA-TATTCTAAAAATTAAAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGA-ACA
52 ATTTGAATAATTA-TCT---ATTTCAAA--TT--G--TTATGACCT-TTTGT-TTTATC-ATA-A
* * ** * * * * * ** * * *
76107 AGTTCAAATAATCATATCCATTCAAA-C-TATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACATTT-TGTT
103 A--ACAATTGTTTATGTTCA-TAAAAGCTTA-T-TCAAAATAAAAT-AATACT-A-ATTTAT-TA
* * * * * * * *
76168 TTGTTGTAAAATAATTGTTTTTATTCATAC-AAAATTATTCAGAATAAA-ATAATACTAATTT-A
159 ATATT-TCAAA-AA------TTAAT-A-ACTAAGA-GATTTA-AA-AAATA-AAT-CT-ATTTGC
* * * * * * * * *
76230 TTAA-TATTTGAAA-AATTAATAAGAGAT-TTAA-AAGCTAAATCTATTTACCAAACTAGT-T--
208 TGAACTAGTTCAAATAA-T--TAAGACATATGAACAA--T-TACCTATTT--CAAATTATTATGA
*** * * * * ** ** * * * **
76288 -CAAATAGTTATGACTATTTAAACAA-T-TATCTATC-T--TTG-TTCAT-GTGAGCT-TATTTA
265 CCTTTTA-TTTTGTC-A-TAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCTTAATCG-GA-ATAAAAATA
* * *
76344 GAGTGA--AATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
325 -A-T-ACTAAT-TT-AT-TA---AT-AT-TTC-AAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
** ** ** * * * * *
76407 AGGTGGTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTA-AGACTAATGGAAAAATTATCTATTTCAAATCATT
377 ATCTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * *
76471 CTGACCTTTTG-CTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACATGCTTATTTGAAATCAAAT
441 ATTACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAAT
* * * * * * * ** *
76534 AATACTATTTTAGTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGATATTTTAAAAAAATAAATCTATTTT
504 AACACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGCTTA
** * ** * * * * *
76599 CCAAATAAGTTCGAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACCTTT
566 CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-GTTATAACTTTT
* * * * * * * *
76663 TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGATCATAAAAG-CTTATCCAAAATAAAATAATATTACTT
630 TATTTTATCATAAAACAATTTTTTTA-TTTAT-ATAGTTTTATTCAAAATAAAAT-A-A-TAC-T
* * * * * * * * * * * *
76727 TATTAATATTTAAAAAATTGAGAA-GTTAGAGATTTAAAAAGTAAACCAATTTATTGAATCAATG
689 TATTAATATTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTT
* * * * * ** * *
76791 CAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATA
754 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * *
76856 AAACAATT-TTTTTTATCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
819 AAACAATTGTTTTTT-GCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
*
76920 AAAATTCATCAGTAG
883 AAAATTAAT-A--AG
* * * ** * * *
76935 GAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTGAATAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGT
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * *
76999 ATCTTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA----TTATGTACATACAAGCTTA
66 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTA
** * * * * * *
77060 TTCGGATTAAAATAATACAAATATAATAATATTAT-GAAATTTAATATA-TAAGAGATTTAAAAA
131 TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA-ACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * * * * * *
77123 ATAAATTTGTTTGCTGAACCAATTCAAATAGTTAAGCCTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATC
194 ATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAATT
* * * * ** ** * *
77188 ATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTTTGTTCATATAAATTTGTTTGAAAT-AAA
258 ATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAATAAAA
* * * * *
77250 ATAATATTAATTTATGAATATTTTAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-CTGTTTAC
322 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAT
** * * ** * * * *
77311 CAAACCAATTCAATTAGTTATAAGAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTG
387 TGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTG
* * * * * * **
77376 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTA
452 TTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTA
* * * * * * *
77440 TTATTATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCT-CTTGGCCTAACTAGTAT-
516 ATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTT-ACCAAACCAGT-TC
* * * * * ** *
77503 AAATAGTTATAACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-TATTGGTTTTGTCATAA
578 AAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTATCATAA
* * * ** ** * * * **
77567 AACAATTGTTTCTATTCGTACA-AGCTTGCTT-GGAATAACATAATTTAATTTATTAATAGTCCA
643 AACAATT-TTTTTATT--TATATAGTTTTATTCAAAATAAAATAA--T-ACTTATTAATATTTAA
* * ** *
77630 AA-A--AAT-A-ATAAGTA-ATTTAAAAACTGAATCTATTTA-TCGAATAAGTTCAAATAGTTAT
702 AATATTAATAACATAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTAT
* * ** * *
77688 GACTATTTGTATAATTACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TT
765 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
77752 TCTATT-CATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATTAAT-ATTTATTAATATTT-AGACAATTA
830 T-T-TTGCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTA
*
77813 ATAAAT
890 AT-AAG
* *** * * * * *
77819 AAGCGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAATTCAAATAGTAATGAGTATTTGAACAATT
1 AA--GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
* ** * * *
77884 ATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
64 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT-TTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGC
* * * * * * * * **
77948 TTATTC-GAATCAAAGTAATATTGATTTATTAATACTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTTA
128 TTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAA
* * * * * * * * * * *
78012 AAATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
192 AAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTA-AGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAA
* * *** ** * * * *
78076 ATCATTATGACCTTTT-GTTTAAAATATGA-ATTTG-TTT-ACCAAACAAGCTCAAAT---AATT
255 ATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCT-TAATCGGAA-T
** * * ** ** ** *** ** **
78134 ATGACTATTTGAAC-AA-TTA-T-CCATTTCAAATTGTTATGATCTTTCATTTTTTCTAAAATAA
318 AAAAATA-AT--ACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAT-AAGTAAGA-GATTTAAAAAATAA
* * * * * *
78195 TTGT-TTCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAA-AATAA-TA--T-AA-ATTTAT-TAATATTC
377 ATCTATT-TATTGA-AC---C-AATTC-AAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCT-AT-TTC
* * ** ***** * * * *
78252 TAAA-AATTAATAAGTAAAAATTTA--A-AAAATAAATA-TGCT-TTC-TGA-ACA-CGT-TT--
433 -AAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCAT-ACA-AGCTTATTCG
** ** * * ** * **
78305 AAAT-AGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCAATTTCAAATAGTT-ATGACCTATTG-TTTTGTC
495 AAATAAAATAACACTAATTT----AATAAT--ATTT-AAA-AATTAAT-AAGTA-AGAGATT-T-
** * * * * * ** * *
78366 ATAAACTAATTATTTCTG-TTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTAATTT-ATTAA-T
548 A-AAA--AA-TAAATCTGCTT-A-CCAAAC-CAGTTCAAAT-AGTTAAAACT-ATTTGAATAATT
* ** * * * *** * **
78428 ATGTA--AAAAAT-TTTAAAAATAAATATGTTTATCGA-ACAAGTTCAAATACTTATAACTATTT
604 ATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTAT-TTTATC-ATA-AA--AC-AAT--TT-T-TTTATTT
* * * ** * **
78489 GA-ATAATTATTTATTTCAAAA-AATTATGAT-CTT-TGGTTTTCTTGTAAAACAATCATTTCTA
659 -ATAT-AGT-TTTA-TTCAAAATAA-AATAATACTTAT--TAATATT-T--AA-AAT-ATTAATA
* * * *
78550 TTCATACA-AG-TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA-TTAA-GA-TTCTAAA-AATTAAT
712 -ACATA-AGAGATTTA---A-AA-AATA-AAT-CT-ATTTACTGAACCAGTTC-AAATAA-T--T
** * * * * * * *
78609 AGGTAGAAGATTTAAAAGGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAAC
763 A--T-GACTATTT-GAA--T-AAT-TA--T------CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG---
** * * * * *
78674 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATA-AAACAATTATTTTTGTTCATGC
809 TTTTGTC-A--T-AAAACA--AT----TGTT-TTTT-GCATACAAGC--TTA------TTC--G-
* * **
78738 AAAGTTATTCAAAATAAAATAATATCGATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAA-
851 -AA---A-T-AAAAT--AATACTA---ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
78792 AA-ATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAA-TAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGGACAAAT
1 AAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
*** ** * * * * * *
78855 ATCTATAAAAAATCATTATGA-----TGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAGGCT
64 ATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCT
* ** * * * * * *
78915 TTTTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTTAAAA
129 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
* * * * *
78980 ATAAATATTTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAA-A-ATTAATAGAACAATTATCTATTTCAAA
194 ATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACA-T-AT-GAACAATTACCTATTTCAAA
** * * * * * * * * * **
79043 TCGTTCT-ATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATAAAAGTTTATTCAAAAT-
256 TTATTATGA-CCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGATCATACAAGCTTAATCGGAATA
* ** * *
79106 AAAACAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAGAATATATCT
319 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCT
* * ** * * * * **
79170 GTTTATCGAATAAATTCAAACAGATT-TGACCATTTTAAACAATTATCT-TTTCAAAGTTGTTAT
381 ATTTATTGAACCAATTCAAATA-ATTATAACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTAT
* * * * * *
79233 GACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTA-TCTGAAATAAAATAA
443 TACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAA
* * * * * * ****
79296 TACTATTTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTG
506 CACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGCTTACCA
* * ** * * * * * * * *
79356 AACTAGTTCCAATAGTTATGACTATTTCAACAAATGT-TAATGTCAAATCA-TTGTGA-TCTTCT
569 AACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATAACT-TTTT
* * * * ** * *
79418 -TTTTCTCATAATACAATTGTTTCTGA-TCATA-AGAGCTTATT-TAGATAAAAATAATACAAAT
631 ATTTTATCATAAAACAATT-TTT-TTATTTATATAG-TTTTATTCAAAAT-AAAATAATAC----
* * * * * **
79479 TTAATAATATTTCAAAA-A-T--T-A-ATAAGAGACTTAAAAAATAAA-CATGTTTGCCGAACTT
688 TTATTAATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATC-TATTTACTGAACCA
* * * * * * *
79537 GTTCAAATATTTAAGTCTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTTAGTC
751 GTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
79602 ATATAATAATTATTTTAGTT-CATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-
816 ATAAAACAATTGTTTT--TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
79665 TTCAAAAAATTAATAAG
879 TTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * **
79682 CATGAGATTTAGAAAAATAAATCTATCTACCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAA
1 -A--AGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* *** * *
79747 TTATCTATTTAAAAGCATTATGACCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAA
62 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTAT-GTTCATAAAA
* * * *
79810 GCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
126 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
79875 AAAATAAAT-TAGTTT-ATCGAA-TCGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTT
191 AAAATAAATCTA-TTTGCT-GAACT-AGTTCAAATAATTA-AGACATATGAACAATTACCTA-TT
* * * * * * * *
79937 TCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCGT
251 TCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGATCATACAAGCTTAATCGG
* * *
80002 AA-CACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATT
315 AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * ** *
80063 TGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAA
380 TATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA
* * * * * * * *
80128 CCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
445 CCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACT
* * * * ** ** *
80193 AATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATCA
510 AATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCA
* * * * * * * * * *
80258 GTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
574 GTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTATC
* ** * * * * ** * *
80323 ATAAAATAATTCTTTAAACTCATAGAAG-CTTATTTGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAATAT
639 ATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATA-AA-ATAA-T-ACTTATTAATAT
* * * * **
80387 TTCAAAA-ATTTATAA-GTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGTTGAACCAGTTCAAAT-AT
698 TT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAAT
* * * * * * *
80449 TATAACTATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATC-TGAAAATAAT
762 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT
** * * * * *
80513 TGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTA
826 TGTTTTT-TGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
*
80578 ATTAG
890 ATAAG
* * * * * * ** * * *
80583 TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGCTAAACTATTAGAAATAATTTTAACTATTTGAATAAT
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
** * * * * * ** *
80648 TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTGA--AT-----AGTT-TTGACTGTTCATACTAT
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTA-TGTTCATAAAAG
* * * * * *
80705 TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAA
127 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
* * *** *
80769 AAAATAAATCTAATTG-TCAAACCTA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAGTGATTATCTATTTC
191 AAAATAAATCTATTTGCT-GAA-CTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTC
* * ** ** * * * * **
80832 AAA-TAGTTATGACCTTTTCTTTTATTGTGGAACAATTGTTTTGTTCTTATAAGCTTATTTAG-A
253 AAATTA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAA
* * * * *
80895 TTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT
317 TAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT
*** * ** ** * ** * * * * *
80960 ATTTACCAAATCAGGTCAAATGCTTAAAACTATTAAAATAATAATATATTGCAAAT-AGTTATGA
381 ATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTA
* * * * ** * * *
81024 CATTTTG-CTTAGCCATAAAACAACTATTTCAATTCATACAAGCTTATT-TAGAATAAATTAATA
445 CCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAACA
* * * * * *
81087 CTAATTTATTAACATTTAGAAAACTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA
508 CTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAA
** * ** * * * * *
81152 TAAGTTTAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTT
571 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAA-CTTTTTATTT
* * * * * ** ** * *
81217 T-TCATAAAGC-ATTTGTTTCAGCTAATACGAGCTTAGATGGAATAA-AATAATATTAATTTATT
635 TATCATAAAACAATTT-TTTTA-TTTATA-TAG-TTTTATTCAA-AATAA-AATAAT-ACTTATT
** * * * * * * *
81279 AATATTTCCTAA-ATTAGTAA-GTATGAAATTTAAAAAATAACTCTATTTACTAAATCAGTT-AA
693 AATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAA
* * * * * * * *
81341 ATACTTATGGCCATTTGAATGATTATCTACTACAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
757 ATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
*
81406 CAATTG-TTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
822 CAATTGTTTTTTG--CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
81470 AATTAATAAG
885 AATTAATAAG
* * * ** * *
81480 TAATAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGGTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAA
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* ** ** * * ** *
81544 TTAT-TAATCTCAAATCATTAAAATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAATCATATAA
62 TTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAA
* * * *
81607 GCTTATTC-AATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTGT-GAAAATTAATAGA-TAAGTGATT
126 GCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA-ACTAAGAGATT
* * ** * * ** * * *
81669 TAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAAATTGTTAAAACTATTAT-AATAATTATCTAT
188 TAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACTAG-TTCAAATAATTAAGAC-A-TATGAACAATTACCTAT
** * * * * * * * * *
81733 TTCAAATTGGTCTGACCTCTTGTTTAGTCATAAAATACTTGTTTCAT-ATCTTATAAGCTTATTC
250 TTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TGATCATACAAGCTTAATC
* * * * * *
81797 GAAAT-AAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATTAGCAAAAGATTTGAAACAA
313 GGAATAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATT-ATAAGTAAGAGATTT-AAAAAA
* ** * * * * * * * *
81859 TAAATCTGTTTA-CCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTGTTTGAATAATTATTTATTTAAAATC
374 TAAATCTATTTATTGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *
81923 GTTATTACCTTTAGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAA
438 ATTATTACCTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAA
* ** * * * *
81986 AATAATACTAATTTTTTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAG-GGTTTAAAAAAATAAATTTGTT
501 AATAACACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGCT
** * * * ** * * * * * *
82050 TACTGAACAAATTCAAGTAGTTACGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTT
564 TACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTT
* * * * * * * ** **
82115 TTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAG-CATATTTGAAATAAAATAATACTAAT
629 TTATTTTATCATAAAACAATTTTTTTA-TTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC----
* * * * * * * * *
82179 TTATTAATATTCCAAAA-ATTAAT----T-AGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATCAA
688 TTATTAATATT-TAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAG
* * * * *
82238 TGCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTTGGTTTGGT
752 TTCAAATAATTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGT
* * * *
82301 TATAAAATAATTGTTTTTTTTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATC
815 CATAAAACAATTG--TTTTTTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
82366 TTTCAAAAATTAATAAG
878 TTTCAAAAATTAATAAG
* * ** * *
82383 -AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTG
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
* * * * * * * * * * *
82446 TATACTTT-AAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTTTTATTCATACAAGTT
65 TCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCT
* * * * *
82510 TATTCAAAATAAAATAATGCTAATCTAATAA-AATTCAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAA
129 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * * *
82574 AATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAGATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAA
193 AATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAAT
* * * * * *
82639 TGTTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCAACTCATAGAAGCTTATTCGGAAT-A
257 TATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GA-TCATACAAGCTTAATCGGAATAA
* *
82702 GAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATT
320 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTATAAGTAAGAGATTT---AAA-AA----A--
* * * * ** * * * *
82767 TACCAAACCAGTTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATTTATTTTAAA
374 TA--AATCTA-TTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * ** * * *
82832 TCATTATGAACTTTTGTTTTTTCATAAAACATTTGTTTTTCAAT-ATACAAGCCTATTTGGAATA
436 TCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATA
* * * * * * * * ** * **
82896 AAATCATACTAATTTATTAATATTTCAAATTGTTACAAGTAGGAGATCAAAAAAATAAATTTATT
500 AAATAACACTAATTTAATAATATTTAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCT
* * * * * * * * *
82961 TATCGAACCAGTTCAAATAGCTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTTTAACCTT
564 TACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTT
* * * * * * * * *
83026 TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAAG-CTTATTCGAAATAAAATGATACTAAT
629 TTATTTTATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAAT-A-A-TACT
* * * *
83090 CTAATAATATTTTGAAA-ATTAATAAC-TAAGAGAATTAAAAAATAAA-CAATTGTTTTAGTTCA
689 -TATTAATA-TTTAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATC---T-ATTTA---C-
* * * * ** *
83152 TAAAAGCCTA-TCCAAAATAAAATAATG-CTACTTT-AGTAA-TAT-T-TTGAAAAT--TGAT-A
744 T-GAA-CC-AGTTC-AAAT--AATTATGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
** **** * * * * * * *
83208 AGTAAAATATT-T-AAAAAATAAATCAGTTTATTGAAT-C-AG----TTC-AAAT--AATTATAG
802 CCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTTTTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-
* * ** * *
83262 CT-ATTTGAAAAAATATCTATTTCAAATCGTTATTAACTT
864 CTAATTT-----ATTA-ATATTTCAAA-AATTAATAA--G
** * * * ** * *
83301 TTGTTTTGTCATAAAA-CAA-TTGTTTTTCAACTTACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT-ACTA
1 AAG-ATT-T-AAAAAATAAATTTGTTTACCAA---ACAA---T-TTC-AAAT--AGTTATGACT-
* ** * * * *
83363 ATTT---T--TTA-ATATTTCAAGAATTACTAAGA------G-ATTA--AAAAAATAAATTTGTT
52 ATTTGAATAATTATCTATTTC-A-AATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-CAA-TTGTT
** * ** * * *
83413 TATTGGACTAGTTTAAATAG-TTA-T--AACT-ATTTGA-AC-AA-TTA-T-CTATTTC-AAATT
113 TA-TGTTC-A---TAAA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* ** ** ** * * *
83467 GTCATAACCTTTTG-TTTTATCATAAAACATTTAT-TTTTATTCATATAAGCTTA-TTCAGAATA
172 -TAATAA-C-TAAGAGATT-T-A-AAAA-ATAAATCTATT-TGC-T-GAA-C-TAGTTCA-AAT-
* * * * * *** ** *
83529 AAATAA-A-AT-T--A-ATTTA-GTAATATTCTAAA-AATTAAT-AACTAAAAGATT-T-AAAAA
223 AATTAAGACATATGAACAATTACCT-AT-TTC-AAATTATT-ATGACCTTTTATTTTGTCATAAA
* * * * * * * * * *
83583 ATAAATTGATTTGCTAAACTAGTTCAAACAGTTAAAAC-TATATGAACAATTATTTATTTCAAAT
284 A-CAATTG-TTT--TGATC-A-TACAAGC--TT-AATCGGA-AT-AA-AA--A--TAATACTAA-
** * * *
83647 TGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGCTTATAGATGTTTATTCAAAATAGA
332 --TT-T-A---TTAATATT-TC---AAA-AATTA--TAAG--TA-AGA-G---ATT-TAAA-A-A
** ** ** * * * * * ** *
83712 ATGAAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAATTCTATTTACTA-AACCAGTTCAAATAATTATAACTAT
373 AT-AAA-T---CTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTA-TTTGAACAATTAT--CTAT
* * ** * * ** * * * *
83775 TTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATTTTTTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTAAT
430 TT-CA-AATCAT-TA-TT---A-CCTT-TT-GTTTTATCAT-AAA--ACAATTATTTCTGTTCAT
* * * * * * * *
83840 ATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATAATAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAA-TAAGAGA
482 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAATATTTA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGA
** * * * *** *
83904 TTTAAAAAGCAAATTTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAATAATTATCTAT
545 TTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTAT
* * ** * * * * *
83969 TTAAAATCGTTATAACCCTTT-TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTA-TTTTATTC
610 TTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTC
* * * * * *
84032 AGAATAAAATAATA-TTAATTCAATAATATTCTGAAA-CTTAATAAC-CAAGAAAATTAAAAAAT
673 AAAATAAAATAATACTT-A-T---TAATATT-TAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAAT
** ** * * * * * ** * *
84094 AAATCTAAGTGTTGAACTAGTTGAAATAGTTAAGACTATATGAATGCTTATCTATATCAAATCAT
732 AAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
* * * * *
84159 TATGA-CTTTT-TTTTTTCATTGTAAAACAATTATTTTATT-CATAGAAGCTTATTCGGATTAAA
797 TATGACCTTTTGTTTTGTCA---TAAAACAATTGTTTT-TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAA
* *
84221 ATAATAGTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
858 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* ** * * *
84258 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC-GGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAA
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
** * * *
84322 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTG-TTTAGTTATAAAAAAATTGTTTCA-GTTCATACA
62 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATAAA
* * * * * * * * * **
84385 AGCTTGTTTAGAATAAATTCATACCAATTTA-TAA-ACGTTCAGATAA-TAGAAAAGAAAGAGAC
125 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCA-AAAATTA-ATAACTAAGAGA-
* ** * * * * * **
84447 TTAAAAAAATAAATCTATTCACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTAT
186 TTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTAT
* * ** *
84512 TT-AAATTTGTTATAACCTTTTGA-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAGCTTAGA
250 TTCAAA-TTATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGA-TCATACAAGCTTA-A
* * *
84575 T-GGAAT-AAAATAATACTAATCTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAA
311 TCGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
* * * * * ** * * *
84637 TAAATCTGTTTATCGAATCATTTAAAATAATTA-AGACTATTTGAATGATCATTTATTTGAAATC
374 TAAATCTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
84701 GTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
438 ATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAA
* * * *
84765 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATC--CATT-
503 TAACACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGC-TTA
* **** * * * * * * *
84827 -TATTGTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAAT-CTT-TAAGATCTT
566 CCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAA-CTTTT
* * * * * * * *** *** *
84889 TGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTCTAATCATAGAAACTTATTC-GGTTAAAAATAATACTAATT
630 TATTTTATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATATAGTTTTATTCAAAAT-AAAATAATACTTA-T
* * * ** * *
84953 TAATAATATTCTAAA-A--AGT-A-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTT-GTGAAACCAAT
692 TAAT-AT-TT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG-AACCAGT
* ** * * * * * * * * *
85012 TCAAATAGTTAAAACCACTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTCATCATTTGTTTAGTCAT
753 TCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
85077 AAAAC-ATTTTTTTTATATCTTACAAGCTTATT-TAGAATAAAATAATCCAAATTTAATAACATT
818 AAAACAATTGTTTTT-T-GCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
*
85140 TGAAAAATTAATAAG
880 TCAAAAATTAATAAG
* * * ** * * *
85155 CAAAATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTT-AAATAGTTATAAATATTTGAACA
1 ---AAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAA-TTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * *
85219 ATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTAGACATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAA
61 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTAT-GTTCATAA
* * *
85282 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTT
124 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTT
* * * * * * * * *
85346 AAAAAAATTAATTTGTTT-ATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACCAT-TGAACAATTGA-CTAT
189 -AAAAAATAAATCTATTTGCT-GAACTAGTTCAAATAATTAAGA-CATATGAACAATT-ACCTAT
* * * * * *
85408 TTAAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTC-
250 TTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-GATCATACAAGCTTAATCG
* * * * * * * * * *
85472 -AA-AATAA-AATAATAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGGAAGTGTTTTAAAAAGTGAT
314 GAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * **
85534 TCTATTTATTGAA-TAAGTTCAAAT-ATGATGGCTATTTCAATAATTATCTATTTGGAATCATTA
378 TCTATTTATTGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
** * * * *
85597 TTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
442 TTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTG-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
* * * * * * ** **
85661 TATTAATTTATTAATCATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAATAAATCTATTTATTGA
506 CACTAATTTAATAAT-ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTA-CCA
* * * * * * * * *
85726 ACCCA-TTGAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTGTATAATTCAAATCAATTATTTAAAAAATA
569 AACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA--T---AACT-
* * * * *** **
85790 AAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAA-TTATTTATGTTCAT-TCAAACTTATTTGAAATAAAATAA
627 ----TTTTATTTTATCATAAAACAATTTTTTTAT-TT-ATAT-AGTTTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * *
85853 TACTAATCTAATAATACTCCAAAA-ATTAATAAC-TAAGAGATTTAAATAATAAATTTGTTTACT
685 TACTTAT-TAAT-AT--T-TAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT
* * * * *
85916 GAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGT
745 GAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* *
85981 TTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATT-CATACTAGCTTATTCAGAAATAAAATAA-AATAAATT
810 TTTGTCATAAAACAATTGTTTT---TTGCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACT-AATT
*
86043 TACTAATATTTCAAAAATTAATAAG
870 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
86068 TAAGAGATTTAAAAAGTAATTTTGCTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATAATTATTTGAATAAT
1 --A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
** * * * *
86133 TATCTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTGATATAAG
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC-AATTGTTTATGTTCATAAAAG
* * *
86197 ACTGTA-T-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTTA
127 -CT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTA
* ** * * * * * * **
86256 AGAAATAAATCT-TTTTATCAATCCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
190 AAAAATAAATCTATTTGCTGAA-CTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTC
* * * * * * *
86320 AAATTGTTATGA-CTTTTTTTTTATATATAAAACAATAGTTTCT-ATTCATACGAA-CTTATTTG
253 AAATTATTATGACCTTTTATTTTGT-CATAAAACAATTGTTT-TGA-TCATAC-AAGCTTAATCG
* * * * *
86382 G-ATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAA
314 GAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * **
86446 TATGTTTACCGAACTAGATT-AAATAGTCATGACTTTTGTTTTGTCATA-AAAAAT-TATTTC-A
378 TCTATTTATTGAACCA-ATTCAAATAATTATAAC---T-ATTTG--A-ACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * ** * * ** * *
86507 ATTAATATAAGC--TT-ATTCAAAATAAAATAA-TA-CTAAGTT-AT--TA--TTATTC--TA-A
435 ATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATA
* * * * ** * * * *
86559 AAATTA-A-TAA-TTAAGAGAT-TTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAAT-TA
500 AAATAACACTAATTTAATA-ATATTTAAAAATTAATAAG--TA-AG-A-GA-TTTAAAAAATAAA
** * * * * * * * *
86619 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGCTATAAGC-ATTTG--T-TTTGTC-A--T--AA
558 T--CTGCTT-ACCAA--A-CCAGTTCAAATAGTTA-AAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * ** * *
86675 -A---ATAA-TTTCTT-TTGT-CCAT---ACAAGCTTATT-TTGA-ATA-----A---AATAAT-
616 TAGTTATAACTTT-TTATTTTATCATAAAACAATTTTTTTATTTATATAGTTTTATTCAA-AATA
* * * * *
86719 ACA-AAT--TTATTAATA-TTAAGACA-ATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTA
679 AAATAATACTTATTAATATTTAA-A-ATATTAATAACATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATT
** ** * * ** * * *
86778 TACCAAATAAATTCAAATCATTATGACTATTTGAACGATTATCGATTTCAAATTGTTATGACTTT
741 TACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTT
* * * * *
86843 TTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATATTATT
806 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TGCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAAT
** *
86907 TTATTAATATTTTGACAATTAATAAG
869 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * * *
86933 TAAAAGATTTAGAAAGTAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAAT
1 ---AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
** * * *
86998 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCA-GTTAATATAAG
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATAAAAG
** * * * *
87062 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAGTAAGAGAATTAAA
127 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAG-ATTTAA
* * * * ** * * * * * *** *
87127 AAAATGAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATTGTTATCTATTTCAA
191 AAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAA
** * * * * * * ***
87192 AACATTATTACCTTTTGTTTTGCCATTAAACAATTGGTTTTGCTCATACAAGCTTATTTTAAAT-
255 ATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAATA
* * * * * *
87256 AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTG
319 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA
* ** * * * * *
87319 TTT-TCT-AAGCGGTTCAAATAGTTATGAA-TATTTGAATAATTATCTATTGCAAATCGTTATGA
382 TTTAT-TGAACCAATTCAAATAATTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTA
* * * * * *
87381 -CTATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATA
445 CCT-TTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAACA
* ** * * ** ** *
87444 CTAATTTATTAATACTAAAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGC
508 CTAATTTAATAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAAC
* ** * * * * *
87509 TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-TCTTTTATTTG
572 CAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACT-TTTTATTTT
* * * * *
87573 GTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
636 ATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC----TTATTAA
* ** * * *
87637 TATTCTAAAA-ATTAATAA-GTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-ACTAAGTTTAAA
695 TATT-TAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAAC-CAGTTCAAA
* * * * ** * * *
87699 TAGTCATGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTTTTTTAT-AGTAAA
758 TAATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAA
* * ** * * *
87762 ACAATTATTTCTTTTCATACAAAATTATTC-AGAATAAAATAATACCAATTTATCACTATTTCAA
821 ACAATTGTTT-TTTGCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
*
87826 AAATTAATATG
884 AAATTAATAAG
* * * ** * * * *
87837 --GATTT-AAAAATAAATGTATTTGCTGAACTAGTTT-AAATAGTTAAGACTATTAGAACAAAAT
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AATTTCAAATAGTTATGACTATTTG-A-ATAAT
* * *
87898 TATGC-ATTTCAAATAAGTT-TGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATAC
63 TAT-CTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTT-ATGTTCATAA
* * * ** * * * *
87959 ATGCTTATTAAAAATATAGCAATACTAATTTATTTACA-TTCAAAATTTTAATAAGC-AAGAAAT
124 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAA-CTAAGAGA-
** * * * * * * * *
88022 TTTTAAAAAATAAAAT-T-TTTTATCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
186 -TTTAAAAAAT-AAATCTATTTGCTGAACT-AGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACC
* * * * *
88085 TATTTAAAATCACTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAAATTGTTTTCG-TGCATAAAAGCTT
247 TATTTCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTT-GAT-CATACAAGCTT
* * * * * **
88149 -ATC-CAAAATAAAATAATA-TCACTTTATTAATATTTCCAAAATTGATAAGTGAGAGATTTCCA
309 AATCGGAATA-AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAA
* ** * * ** * *
88211 AAATCAATC-AGTTTATCAAATCAATTAAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATTTATTTCAA
371 AAATAAATCTA-TTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** * *
88275 ATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAACACAATTGTTT-TCCATCATACAAGCCTATTCAAAAT
435 ATCATTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAAT
** * * * *
88339 AAAATAATTCTAATTTACTGATATTTCATAAATTAATAAGTAAGAGA-TT-----AT---T-TGT
499 AAAATAACACTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGC
* * ** * * * *
88394 TTACCAAACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAAC-C
563 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTT
* * * * * * *
88458 TTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAG-TTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
628 TTTATTTTATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC---
* * * * * * *
88522 TGTAATAATATTCTAAAA-ATTAATAAC-TAA-AAATTTTTAAAAATAAATTTGTTT-GTCAAAC
688 T-TATTAATATT-TAAAATATTAATAACATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAAC
* * * * * * * * *
88583 TAGTTCAAACAATGAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
749 CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * *
88648 TTGTAAAACAA---TTTTTT---T---AG-TTCTTAG-TATAAAATAA-AATAAATTTATTAATA
814 TCATAAAACAATTGTTTTTTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
88701 TTTCAAAAATTAATAAG
878 TTTCAAAAATTAATAAG
* * * * * *
88718 TAAGATATTAAAAAA-ATAATTATGTTTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
1 -AAGAT-TTAAAAAATA-AATT-TGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * *
88782 TTATCT-TTTCCAAATCGTTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAATAGA-TGTTTTTGTTCATATA
62 TTATCTATTT-CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACA-ATTGTTTATGTTCATAAA
* *** * * * * * *
88844 AG-TTGGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTACTATATT-GAAAATTAAGAAGTAAGAAATT
125 AGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATT
* * * * * * * * **
88907 TAAAAAATAAATTTATTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTATA-ACTATTTTAACAATTATGTATT
188 TAAAAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTA-AGAC-ATATGAACAATTACCTATT
** * * * * * * * * *
88971 TCAAATCGTTATAATCATATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTG-TCCATGC-AGTCTTATTC
251 TCAAATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGAT-CATACAAG-CTTAATC
* * * * * * *
89034 AGAAT-AAAATGATACTATTTTATTAATA-TTCTAAAAATCAATAAGTAACAGATTGAAAAAATG
313 GGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAAT-TATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA
* * ** * * * * **
89097 AATTTGTTGGCTTG-ACTAATGCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGT
376 AATCTATT-TATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * *
89161 TATGACCTTTTATTTTATCACAAAATAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCGAAATAACATA
440 TATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA
*** * * * * * * * *
89226 TTTCTACTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG
505 ACACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCA
* * ** ** * * * * * * *
89291 AACAAATTCAAATAGTTATGACTAACTAAACAATTATCTATTTTAAATCGCTATAACCTTTTGTT
569 AACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATT
* * * ** * *
89356 TTATCATAAAACAATTTTTTCTAATCATACAAG-CCTATTTC-CAATAAAATTATACAAATTTAT
634 TTATCATAAAACAATTTTTT-TATTTATA-TAGTTTTA-TTCAAAATAAAATAATAC----TTAT
* ** * * * **
89419 TAATATTTAGACA-ATTAAT-AGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATTGAATAAGTTCA
692 TAATATTTA-AAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCA
* * * * * *
89482 AATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTGGTCATAAA
756 AATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * ***
89547 ATAATTGTTTCTGTT-CATACAAGCTTAATATTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCA
821 ACAATTGTTT-T-TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA
89610 AAAATTAATAAG
883 AAAATTAATAAG
* * * * * * * *
89622 TAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAAC-ATGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAAT
1 --AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAT-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * * ** * *
89686 TATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTACCGTAAATTAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGC
* * * * * *
89751 TTATTCAAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAATCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTTAAA
128 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * ** * **
89815 AATAAATTTGTTTACTG-AGTAAGCTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
193 AATAAATCTATTTGCTGAACT-AGTTCAAATAATTAAGAC-ATATGAACAATTACCTATTTCAAA
** * * * * * * *
89879 -TACTTATGTTCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAAGTTTATTCGAAAT-
256 TTA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGATCATACAAGCTTAATCGGAATA
* * *
89942 AAAATAATACTAATTTATTAATATTATGC--AAATTAATAGGT-AGGGTATTTAAAAAATAAATT
319 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAAAATT-ATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATC
* * * ** * * * ** *
90004 TATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTTAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATG
380 TATTTATTGAACCAA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATT
* * * * * * * ** * * *
90068 ACCCTTTGTCTTGTCGTAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAAGAAAATAATAC
444 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAC
* * * * *
90133 TAATTTATTAATA--T---AATTAAT-AG--A-AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACC-GA--A
509 TAATTTAATAATATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCA
* * *
90186 --TC-AAT--TT-AAA-TA---G-----TTAT-GA-CTC--AT--TT-TAA-TTTGTATTTTATC
574 GTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTATC
* * ** ** * *
90228 ATAAAATAATTGTTTCTT-TTCATATAAG-CATATTTGAATTAAAATAATACAAATT-TTAAAAA
639 ATAAAACAATT-TTT-TTATTTATAT-AGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC---TTATT--AAT
* * * * *
90290 ATTTCATAA-ATTAATAA-GTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTA-TCGAACCAGTTCAAAT
696 ATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTCAAAT
* * * * * * * * * * * ***
90352 AGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCATATCATTTTAACCTTCTATGCAGTCATAAAACA
759 AATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * *
90417 ATTATTTTAGTT-CATACAAGCTTATTCCG-AATAAAATAAAACTAATTTATTAACA-TTCAAAA
824 ATTGTTTT--TTGCATACAAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
*
90479 TTTTAATAAG
886 -ATTAATAAG
* * * ** *
90489 CAAGAGACTTAAAAAATTAATTTTGTTTGCCGATCCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
1 --A-AGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACC-AAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
* * * * *** * *
90553 ATTATTTATTTCAAATTTTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACATTTTTGTTCA-ATAA
61 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAA
* * * * *
90617 GTTTGTTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-GAAAA-T--TAA-TAAG-GCATTTA
126 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAG-ATTTA
* ** * *** * * ** ** *
90676 AAAAATAAATCTATTTACCAAACTAATTTTGATAGTTATA-ACTATTTGAGTAATTATTTATTTT
190 AAAAATAAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTA-AGAC-ATATGAACAATTACCTATTTC
* * * * * * * **
90740 AAATCT-TTACGACCATTTATTTTGTCATAAAGCAACTAT-TTTTGTTCACACAATCTTATTCAA
253 AAAT-TATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-T-TGTTTTGATCATACAAGCTTAATCGG
** * * * ***
90803 AAT-AATTTAATGCTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAGAAAAGGT
315 AATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-ATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAA
* ** * *** * * *
90865 ATCTGTTGGCTTG-ACTAGCGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
377 ATCTATT-TATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * *
90929 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTCGAAATAACATAA
441 ATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAA
** * * * * * * *
90994 TTCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAGAATGAATCTGTTTACCG
506 CACTAATTTAATAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGCTTACCA
** ** * * * *
91059 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTT
569 AACCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATT
* * * * *** * * *
91124 TTGA-CGTAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTC-AAAT-CTGT-TTACTGAATAA
634 TT-ATCATAAAACAATTTTTT-TATTTATA-TAGTTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTTATTAA
* * * * * ** * ** *
91184 -GTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAACA-A-TTAATTTGAAT-AAT-TATTTA-T-------TTT
695 TATTTAAA-A-TATTAATAACAT-AAGAGATTTAA--AAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTC
** * * * *** * * * * *** *
91236 AAATTGTTATGACTATATG--T-TTTGTC-ATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTAT-T
755 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCG-TTATG-ACCT-TTTG-TTTTGT
* * * * * * * *
91296 CAAATTAAAA-TATTATTAATTT--AT-TAA---TATTTCGACAAT-TAGTAAGTA-AAAGATT-
815 C--A-TAAAACAATTGTT-TTTTGCATACAAGCTTA-TTCGA-AATAAAATAA-TACTAA-TTTA
** * *
91351 TTAA-AAAT-AAACATGTTTATCATAG
872 TTAATATTTCAAA-A-ATTAAT-A-AG
*
91376 AAG-TTT---AAAT--A---G--T-------AA--T-AACTA--T-T---TA---G-ATAATTAT
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * *
91410 CTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTATCA-GTTCATATAAGCTT
66 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT-TTATGTTCATAAAAGCTT
* * * * * * * *
91474 ATTCAAAATAAAACAATATTAACTTATTCATATTTCAAAAACTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAA
130 ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA
* * * ** * ** * *
91539 TGAATATGTTTATTGAA-TAAGTTCAAATAGTTATCAC-TAATTGAACTATTATCTATTTCAAAT
195 TAAATCTATTTGCTGAACT-AGTTCAAATAATTAAGACAT-A-TGAACAATTACCTATTTCAAAT
* * * * * * *
91602 CACTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCTGAAT-AA
257 TATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGA-TCATACAAGCTTAATCGGAATAAA
* *
91666 AATAATA-TAAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAAATCTAT
321 AATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT-ATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTAT
* * * * * * *
91729 TT-TCT-AAACACATTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCATATCGTTATGAC
383 TTAT-TGAACCA-ATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTAC
* * * * * *
91792 CTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGCTTT-T-TTGCATAAAAGCTT-TT----TTAAAATAATAC
446 CTTTTGTTTTATCATAAAACAATT-ATTTCTGTT-CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACAC
* * * * **
91850 T-ATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGGTTTACCAAGT
509 TAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GCTTACCAAAC
* ** * * * * * * *
91913 GAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAGAATTATTTATTTCAAATCA-TTATGATTTTTTGTATT
572 CAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATAACTTTTTATTTT
* * * * *
91977 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAGAAG-TTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
636 ATCATAAAACAATT-TTTTTATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC----TTATTAA
* ** * ** ** *
92041 TATTCT-AAA-ATTAATAA-GTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAATAAACTCCAA
695 TATT-TAAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTCAAA
* * * * * * * * *
92102 TAGTCATGTCCATTTAAACT-ATTATCGATTTTAAATCGTTATGACATTTTATTTTGT-AGTAAA
758 TAATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAA
* * ** * *
92165 AC-ATTTTTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTCAA
821 ACAATTGTTTT-T-TGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
*
92229 AAATTAAAAAG
884 AAATTAATAAG
* * * * *
92240 -AGATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
1 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * * *
92304 CTATTTCAAATTGGTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCTTACTAA-CTT
66 CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATA-AAAGCTT
* * * * * * * *
92367 ATTTAGAGTAAAATATTACTAAACTGA-TAATATAAT-AAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAA
130 ATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* * * * ** * * * * * * *
92430 AATAAAATGTGTCTACCAAACCAATTCAAATAGTTAGGAC-TATTAGAATAATTATCTATTTTAA
193 AAT-AAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATA-T-GAACAATTACCTATTTCAA
** * * * * * * ** * * *
92494 ATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTTATAACATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTTC-AAAT
255 ATTATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGA-TCATACAAGCTTA-ATCGGAAT
* * * ** * * *
92558 -AAAATAATAGTATTTTATTAA-AGTAGAAAATATTAACAAGCAAG-GAATTTAAGAAAACAAAT
318 AAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATT-ATAAGTAAGAG-ATTTAA-AAAATAAAT
* * * * * * * * * *
92620 CTGTTTACTAAACAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATG
379 CTATTTATTGAACCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATT
* * * * * *
92685 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATTAAATAATA
444 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACA
* ** * * * * * ** * * * *
92749 TTACCTTATTAGTATTTCAAAAGTTGAGAAGTTGGAGACTTAAAAAATAAAAT-AGTTTATCAAA
508 CTAATTTAATAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGCTTACCAAA
** * * * *
92813 TTAGTTCAAATAG-------T-TTTG--------GCCATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTT
571 CCAGTTCAAATAGTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTAT-AACTTTTTATTT
* * * ** *
92861 TGTCATAAAACAATTATTTTTCA-TCATACAAG-CCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
635 TATCATAAAACAATT-TTTTT-ATTTATA-TAGTTTTATTCAAAATAAAATAATAC----TTATT
* * *
92924 AATATTTCAAAA-ATTAATAA-GTAGGAGA--T------T--ATCTATTTA-TCGAACCAGTTTA
693 AATATTT-AAAATATTAATAACATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GAACCAGTTCA
* * * * *
92976 AA-AAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAA
756 AATAA-TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
** * * * * * *
93040 AACAATAATTTATGTT-CATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAGTCTAATAATAGTAT-
820 AACAATTGTTT-T-TTGCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTC
*
93103 GAAAATTAATAAGG
882 AAAAATTAATAA-G
* * * *
93117 AAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAAT
1 -A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * *
93181 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCA
63 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCA
93239 AATAAGTTTG
Statistics
Matches: 26179, Mismatches: 6512, Indels: 5099
0.69 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
850 4 0.00
851 97 0.00
852 93 0.00
853 57 0.00
854 14 0.00
855 19 0.00
856 7 0.00
857 111 0.00
858 215 0.01
859 10 0.00
860 17 0.00
861 87 0.00
862 73 0.00
863 94 0.00
864 370 0.01
865 408 0.02
866 150 0.01
867 232 0.01
868 141 0.01
869 152 0.01
870 149 0.01
871 35 0.00
872 66 0.00
873 100 0.00
874 37 0.00
875 39 0.00
876 133 0.01
877 27 0.00
878 15 0.00
879 18 0.00
880 114 0.00
881 515 0.02
882 492 0.02
883 189 0.01
884 723 0.03
885 454 0.02
886 482 0.02
887 392 0.01
888 772 0.03
889 439 0.02
890 287 0.01
891 639 0.02
892 520 0.02
893 870 0.03
894 1062 0.04
895 390 0.01
896 699 0.03
897 1403 0.05
898 678 0.03
899 705 0.03
900 1147 0.04
901 1228 0.05
902 472 0.02
903 784 0.03
904 886 0.03
905 692 0.03
906 527 0.02
907 184 0.01
908 174 0.01
909 135 0.01
910 49 0.00
911 329 0.01
912 400 0.02
913 227 0.01
914 240 0.01
915 175 0.01
916 51 0.00
917 64 0.00
918 56 0.00
919 73 0.00
920 165 0.01
921 108 0.00
922 150 0.01
923 101 0.00
924 112 0.00
925 36 0.00
926 87 0.00
927 35 0.00
928 17 0.00
929 14 0.00
930 26 0.00
931 12 0.00
932 31 0.00
933 15 0.00
934 13 0.00
935 23 0.00
936 12 0.00
937 23 0.00
938 33 0.00
939 39 0.00
940 59 0.00
941 92 0.00
942 127 0.00
943 39 0.00
944 28 0.00
945 22 0.00
946 121 0.00
947 63 0.00
948 37 0.00
949 54 0.00
950 184 0.01
951 103 0.00
952 30 0.00
953 36 0.00
954 21 0.00
955 47 0.00
956 31 0.00
957 33 0.00
958 32 0.00
959 61 0.00
960 44 0.00
961 118 0.00
962 156 0.01
963 38 0.00
964 17 0.00
965 23 0.00
966 169 0.01
967 11 0.00
968 10 0.00
969 12 0.00
970 37 0.00
971 122 0.00
972 49 0.00
973 149 0.01
974 106 0.00
975 33 0.00
976 18 0.00
977 16 0.00
978 21 0.00
979 6 0.00
980 7 0.00
981 7 0.00
982 6 0.00
983 10 0.00
984 5 0.00
985 6 0.00
986 7 0.00
987 6 0.00
988 2 0.00
989 2 0.00
990 6 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (894 bp):
AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
CTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTATGTTCATAAAAGCTTA
TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAAT
AAATCTATTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACATATGAACAATTACCTATTTCAAATTATT
ATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGATCATACAAGCTTAATCGGAATAAAAATAA
TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAA
CCAATTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTT
ATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTAATAAT
ATTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTACCAAACCAGTTCAAATAGTT
AAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTATTTTATCATAAAACAATTT
TTTTATTTATATAGTTTTATTCAAAATAAAATAATACTTATTAATATTTAAAATATTAATAACAT
AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTGCATACAAGCTT
ATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
Found at i:60616 original size:167 final size:166
Alignment explanation
Indices: 60431--60944 Score: 425
Period size: 167 Copynumber: 3.0 Consensus size: 166
60421 TTGTTATGAT
* *
60431 CTTTTATTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTT-CATTTCATACT-AGCTTGTTAGGAATAACATAA-
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGC---TCATA-TAAGCTTGTTAGAAATAAAATAAT
* * * * *
60491 AATGAATCTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACCA
62 AAT-AATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATGTAAAAAATAAAT-TATTTACCAAACAA
60556 GTGCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
125 GTGCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * *
60598 CTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTA
1 CTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAGCTTGTTAGAAATAAAATAATAATA
* ***
60663 ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATGTAAAAAATAAATTATTTATCAAACAAGTTTTA
66 ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATGTAAAAAATAAATTATTTACCAAACAAGTGCAA
* * *
60728 ATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAA
131 ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * *
60764 TTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAA-ACAATAGTTTTTGTTCATACAAG-TGTATTCAG-AT
1 CT-TT-T-A--TTTTGTCA---TA-AAACA-AAT-GTTTTTGCTCATATAAGCT-TGTT-AGAAA
* * * * * *
60826 TAAAAAAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG
53 TAAAATAATAATAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATGTAAAAAATAAAT-TA
* * * * **
60891 TTTACCGAACAAG-GTAAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAA
113 TTTACCAAACAAGTG-CAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
60945 TTATTCTAAC
Statistics
Matches: 285, Mismatches: 38, Indels: 34
0.80 0.11 0.10
Matches are distributed among these distances:
166 49 0.17
167 87 0.31
168 6 0.02
169 6 0.02
170 1 0.00
171 7 0.02
174 3 0.01
175 7 0.02
176 56 0.20
177 1 0.00
180 16 0.06
181 46 0.16
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (166 bp):
CTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAGCTTGTTAGAAATAAAATAATAATA
ATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATGTAAAAAATAAATTATTTACCAAACAAGTGCAA
ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
Found at i:61619 original size:362 final size:362
Alignment explanation
Indices: 53583--86483 Score: 13122
Period size: 362 Copynumber: 90.7 Consensus size: 362
53573 AATATTTAGA
* * * ** * *
53583 AAGAGATTTAAAAAGTAAATATATTTACCAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * * * * **
53648 ATCTATTCCTAATCATTCTAACCTTTTGTTTTGTCATCAAATAATTGCTTTTGTTTATACTATTT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
** * ** ** * ** *
53713 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTCAAAAATATTAT-GGAACTTAATAACCAAAAAAATTT-AA
131 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA-GTAAAAGATTTAAA
* * ** * * * * *
53776 AATTAAATGTAATTGCTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAACAATTATCTATTTCAAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * ** * *
53841 TTGTTATGACCTATAGTTTTGTCATAAAAGAATTGTTTTA-TTCATACACTCTTA-TTCAGATTA
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATA
* *
53904 AAATAATTCTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGT
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
53944 AATAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATCAGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
54009 ATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAG-T--T-----C-
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * * *
54065 T-TTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAGTAATAAGAAAAAAATTTAAAA
131 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
54128 AACTAAATATGTTTATTGAACAAGTT-AAATTGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAA
195 AA-TAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * **
54192 TCGTTATAACCTTTTGATTTGCCATAAAACTATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGAT-AGAATA
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATA
**
54256 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGT
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* ** ** * * **
54296 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTT-AGAATAATTAT-AGCCATTTGAATGA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCA-AATAGTTATGA-CTATTTGAACAA
* * * *
54359 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-TATCATATAA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAA
* * * *
54423 GTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAA
128 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * *
54488 GAAATAAATCTGTTTATTGAACCAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * **
54553 ATCGTTAAGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTCTT-GATCATAGAAGCTTATTTG-GTT
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
**
54615 AAAAATAATACTAATTTAACAATATTTCAAAAATTAATAAGT
322 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * ** * *
54657 AAGAGATTTAAAAAATAAA--TGTATTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT-TTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * * * * * *
54720 TATCTATTTCAAATCATTCTAACCATTTGTTTAGTCA-AAAATATTTGTTTCAT-ATCTTACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAG
* * * * * * *
54783 CTTATTTAGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTTTAAAAAATTAATAAGCAAAAGACTTGA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TT-T
* * * *
54848 AAAAAATAAAATCTCTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACAATTTGAATAATTATTTATTT
191 AAAAAAT-AAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * ***
54913 AAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATCAAAGAATTGTTTCAGTAT-ATAAAAGCTTATCCAA
255 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTGA
* *
54977 AATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTT-ACAAAATTAATAAGC
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
55021 AAGAGTTTTAAAAAATAAGTTTATTTACTAAACAAATTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** * **
55086 GTCTATTTAAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAATTAGTGTTTCAGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * **
55150 TATTTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-CTCAAAAACTTAATAAGTCAGTGATTTAAA
131 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * *
55213 AATTTAATTTGTTTACCGAATC-AGTTCAAATAGTCATGTCTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** *
55277 GTCATTATGACCTTTAGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATGCAAAATTA-TTCAGAA
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* ** *
55340 TAAAATAATACTAATTTATTAACATTTTGAAAATTAAAAAGCT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T
* * * ** * * *
55383 -AGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACAATTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *** * *
55447 TATCTATTTAAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTTATAAAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * ** *
55511 CTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
** * * * * *
55576 AAATAAAT-TAGTTTACCAAATC-A-TATCAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATCTATTTT
194 AAATAAATCT-GTTTACTGAA-CAAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * ****
55638 AAATCATTATTACCTTTCGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTTGAAA
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* *
55703 TAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--T-AGT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
55741 AAGAGATTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTAATTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ** * **
55806 ATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTTGTTGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAATT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
** * * * ** * * *
55870 TATTTGGAAAAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAA
131 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * * * *
55935 ATAAATATGCTTGCTGAACTAGTTTAAACAATTAAGACTGTATGAATAATTAACTATTTCAAATC
196 ATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
56000 ATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAGCAATTATTTTAGATCGTACAAGTTTATTTGGAATAAA
261 GTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * * * *
56065 ATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAATTTTATAAGG
325 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * *
56103 AAGAGATTT-AAGAA-GAATTCTATATACCAAACC-GTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
56165 TATCTATTTCAAAT-GTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCACATAAGT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * *
56229 TTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAA
130 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * ** * * *
56293 AAGTAAATATGTTTACCAAACTATTTCAAATAGCTT-TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * **
56357 ATTGTTAT-AATCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCT-GTTCATACTATTTTATTT-AGA
258 ATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-A
* * * **
56419 ATAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTCAAAACTTAATAACC
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * **
56462 AGGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTA-TCGAACCAGTTCAAATAGTCAAT-ACTATTTGAATG
1 AAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
56525 ATTATCAATTTCAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACT
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * ** * * *
56590 A-CTTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAA-TAAAAAAAA
127 AGC--TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAAAGAT
** * * * * *** *
56653 TTAAAAAATAAATCTAATTACTAAACTAGTTCAAATAATTAAT-ACTATATGATTGATTATCAAT
189 TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * *
56717 TTCAAATCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTT-GTTCATACAAGCTTA-TT
253 TTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT
* * * * **
56779 GAATTAAAATGATAC-AGATATAATAATATTTTGAAAATTAATAAGT
317 GAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
56825 AAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTCATATGGTTAAGACTACTAGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * **
56890 ATCTATTTCAAATTGTTCTGACCTTTTGTTTAGTCATAAGACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* *
56955 TATTC-GAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAT--G----AGATTTAAA
131 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AA
**** ** * *
57012 AAAATAAATCAAACTACCAAACAAATTCAAATAGTTA-GTACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *** * * * ** * **** * *
57076 AATTGTTATAAC-ATTTGAAAAAT-TAAT-GAGCAAAAGATTTAAAAAAATA-AATC-TGTTT-A
257 AATCGTTATGACTTTTTG--TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * * * * * **
57135 CCAA-ACAAGT-TTGAGTAGA-TT-TGACTA-TTGAAGAATTATCTATTT
319 --AATA-AAATAAT-ACTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGT
* * ** ** * *** * * * * *
57180 GA-AGTTGTTATGACCT---TTTGTTT--TG--TCAGAAAACAATTGTT-TCAGT-TCAT-AAAA
1 AAGAGAT-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCA-AATAGTTATGACTAT-TTGAACA
* ** * ** ** * * *****
57234 ACTTATCCAAAATAAAAT-AATACT-ACTCTATTAATATT-TCA-AAAATCAATAAGCAAGAGAT
63 A-TTAT-CTATTTCAAATCGTTA-TGACT-T-TTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTTTG--
* * * * ** * *
57295 TTAAAAACTAAAGCTGTTTTCTGAACT-AGTTCAA-A-TAA-TTATGAATATTTGAACAAA-T-A
119 TT-CATAC--AAGCT-TATTCAGAA-TAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAATTAA
** ** * * * **
57354 TCAA-TCCCAA-A-TT--ATTAT-GATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTCTGATCA--TA
177 T-AAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATC--TG-TTT-AC-T-GAACAA--GT-TCAAAT-AGTTA
** * * * * ** ** * ** **
57411 CAAGCTTATTCAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATT-T-A
230 TGA-C-TATT-TG--AACAATTAT-CT-ATTTCA-AATCGTT-ATGACTT--TTTG-TTTTGTCA
* * * * * * * *
57474 AAAAATAAATGTGTTT-G-TCAAACCAATTCAAATAGTTGAGACTATTAGAATAATTATCT-ATT
283 TAAAACAATTGT-TTTAGTTCATA-CAA-GC--TTATTTGA-A--A-TAAAATAA-TA-CTAATT
* * * ** ** *
57536 TCA-CATTGTTT-TGACCTT--T-TGTT
337 T-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T
* ** * * *** * * *
57559 TAGTCATAT-AATAATTGTTTTAGTTCATAC--AAGCTTA-TTCAGAATAAAATAAT-ACTAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTT-GTT--TACTGAA-C-CAGTTCA-AAT--AGTTATGACT-ATT
* *** ** * ** * * * * * *
57619 T-----ATTAAC-A-TTCAAAAAATTAACAAGC-ATGAGTTTT-T-AAAAAATAAATCTATTT-A
57 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
* ** ** *
57673 TCGA-AAAAG----TTCA-AAT-AGCT-ATAACT-ATTTGAACAATTATCTAT-ATAAAATCATT
120 TC-ATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAAT-ACTAATTT-ATTAA-TAT-T-TCA-AAAAT--TA
* *** ** * * * * * *
57728 ATGAACTTTTATTTTGTCATAAAA-CAAT-TGTTTTAGTTCATAAAAGCTTTACCAAAATAAAAT
176 AT-AAGTAAAAGATT-T-AAAAAATAAATCTG-TTTA-CTGA-ACAAG--TT--C-AAAT--AGT
* * * ** * ** * * *
57791 AATAAT-ACT-TTATTAATATTTAAAATATTAAT-AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTAGCTT
228 --T-ATGACTATT-TGAACAATT-ATCTATT--TCAAAT---CG--TT-ATGACT--TTTTG-TT
* * * *** * * * *** *
57853 ATTGAATCCATTTAAATAATTATGGCCA-TTGGAATAACTA-CCTATTTGAAAT-CGTTATTACC
277 -TTG--T-CA-TAAAACAATTGT-TTTAGTT--CAT-ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-C
* * * * * ** *
57915 T--TTTGTT-TTGTCATAAAATAATTGTTTTTTAGCAT
332 TAATTTATTAATAT-TTCAAA-AA---TTAATAAG--T
* ** * * * *
57950 ACA-AG-TTTATTCGAAATAAAATAATCATAATTTA-TTAA-CATTTC-AATAATTAATAAGA-G
1 A-AGAGATTTA----AAA-AATA-AAT--TTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTT-AT--GACT
* * * * ** *
58009 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCTAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT-TAACT
54 ATTTGAACAAT---TA----T--CT----ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG--TTTTGTCA-T
*** * * * * * * *
58073 ATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTGTTTATG-TTCAAAA-AA-GCTT
103 AAAAC-AATTG---T----TTTTGTTC-AT-A-CAAGC--TTATTCA-GAAT-AAAATAATACTA
* * * * ** * *
58135 ATTCATACTAAAAAAATACTAATTTAGTAAAATTCTAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAA
153 ATT--TA-T-TAATATTTC-AA-AAATTAA-----T----A--AGTAA--AAG--ATTTAAAAAA
* * * * * * *
58200 TAAATCTATTTGCTGAACCTA-TTCAAATAGTTAAGAC-ATATGAACAATTATTTATTTCAAATT
197 TAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
58263 ATTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAATAATTATTTTAGCTT-ATACAAGCTTAATTGGAATAGA
261 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* *
58327 ATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGT
325 ATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
58365 AAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTATTGAACCAATTCAACTAATTGTAACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
58429 TATCTATTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTAATATAAGT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * *
58494 TTGTTC-GAAATAAAATAACATTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATTATTAAGAGATTTAA
130 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * * * *
58557 AAAGTAAATCTGCTTA-TCAAACCATTTCAAATAGTTTTAACTATTTGAATAATTTAACTATTTC
193 AAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTC
* * * * ** * * * ** ** **
58621 AAA-AGTTATAACTTTTTATTTTATCATCGAATAATT-TATTTTGTTTATATTATTTTATTCAAA
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * *
58684 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTT-TAAAACT--TAA-T
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * ** * * * ** * **
58723 ---A-ACTTAAAAAATAAATCTAATTA-TCAAACCGGTTCAAATATTTAAAACTATATGAATGAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
58783 AATCAATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTGTTTGA-ACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCATACAAG
* * * *
58846 CTTATT-TGAATTCAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAA
129 CTTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * * *
58910 AAAATAAATTTGTTTATTAAATCAA-CTCAAATGGTTAAGACTATTAGAAAAATTATCTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *
58974 AATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAATAATTG-TTTATTTCATACAAGCTTATTT-AGAA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * **
59037 TAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAAGAAAA
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
59079 AATAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAATTTTAAATAGTTAAT-ATTATTTAAACAA
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAA
** ** * * * * * * * *
59143 TTGCCTATTAAAAATTTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAAAAATTG-TTTCGACTAATACA
64 TTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCATACA
* ** * * * * * *
59207 AGTTTAGACGGAATCAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTATTAAATAAAAAATTT
127 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * * * **
59271 AAAAAATAAATCTGCTTATTG-ACTCAGTTAAAATAATTATGACCATTTGAATGATTATCTATTT
191 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
59335 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTTGTGACAAAACAATTGTTTCTA-ATCACA-AAGCTTATTTG
255 CAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTG
** * * *
59398 -GTTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAATTAATTAGA
318 AAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * ** * * ** * * * *
59443 AAAAAATTTAAAAAATAAATGTGCTTGCCAAACCAATTCAAAAAGTTAAAACCACTAGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
59508 TTCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCTTACAAAC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGC
* * * * ** * *
59572 TTATTCAGAGTAAAATAATCCAAATTTATTAACATTAAAAAAATTAATAAGAAAAAGATTTGAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * * * *
59637 AATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTTAAATTGTTATGATTATTTAAATAATTATTTATTTAAAAT
195 AATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* ** * * * * * ***
59702 CATTATGACCCTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTGTCCAAAATAAA
260 CGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * *
59767 ATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAAGTAATAAGC
325 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
59805 AATAGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTGGAATAAG
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * *
59869 TATCTATTT-AAATTTGTTATGAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCAGTTGATATAA
65 TATCTATTTCAAA-TCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
*
59932 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAA
128 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * *
59993 AAAGTGAATCTGTTTAGTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTTCAACAATTACCTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * **
60057 AATCTTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATCAAACAAGCTTACTCAAAAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
*
60122 AAAATAATACTAATTTATTAATCA-TGCAAAAATTAATAAGT
322 AAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * **
60163 AAGATATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTTGAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * * * **
60228 GTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAAAAATTATTTCCGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * * * * *
60293 TATTCAAAATAAAATAACACAAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
131 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * *
60358 ACAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATTTATTTCAAATT
196 ATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
60423 GTTATGA-TCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCATTTCATACTAGCTTGTTAGGAATAA
261 GTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * *
60486 CATAA-AATGAATCTATTAATATTTGAAAAA-T--TAA-T
324 AATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *
60521 AAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCT-AACCAGTGCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *
60584 TTATCTATTTC--A-----A--AC-TTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGCTCATATAAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * *
60639 TTTGTT-TGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATGTAA
129 CTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * ** * *
60699 AAAATAAAT-TATTTA-TCAAACAAGTTTTAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
60762 AATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAG-TGTA-TTCAGA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT-TATTTGA-A
* * * *
60825 TTAAAAAAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGT
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * **
60868 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGGTAAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * * * * * * * *
60933 ATCTATTTCAAATTATTCTAACTTTGTCTTTTAT-AGTAAAACAATTGGTTTAGTTCATATAAGC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * *
60997 TTATT-TGATGTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAGCAGAAA-A-TTAA
130 TTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAA
* * *
61059 AAAA-AGAATCCGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAAAATTATCTATTTCA
193 AAAATA-AATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* *** * * * * ** * *
61122 AAACACAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCGGTTTATGCAAGCTTATTTTG-AA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAA
* *
61186 TAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGT
321 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* *** ** *
61228 AAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTTACTGAATGAGTTCAAATAGTTATGACTTTTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
61293 ATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCA
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * *
61358 TATTCAGATTAAAAGAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
131 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * * * ** *
61423 ATAAATATGTTTACCGAACAAGGTAAAATAGTCATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATT
196 ATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * **
61488 ATTCTAACTTTTTCTTTTAT-AGTAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGATGTAAA
261 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * *
61552 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAGC
325 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** ** * *
61590 AAAAGAATTAAAAAA-GAATCCGTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* *** * * * * ** * *
61654 TATCTATTTCAAAACACAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCGGTTTATGCAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
** * * **
61719 TTATTTTGAATAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTTTAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* ** ** * * * *
61783 TAATAAATCAATTTACTGAATGAGTTCAAATA--TA-G-TTTTTTTAAAACATTA--TATTTCAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCTATTTC-A
* * * * *
61842 AATTGTTATGACTTTTTGTTATGTTATAAAACAATT-TTTT-GTTCATACAAGCGTATTCAGATT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT-TGA--
* * *
61905 AA-AAAAT-ATATTAATTTATTAATATTTTAACAATTAATAAGT
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * * **
61947 AAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAATAAGGTAAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * * * * * *
62012 ATCTATTTCAAATTATTCTAACTTTTTCTTTTAT-AGTAAAACAATTGTTTTAGTTCATATAAGC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * * *
62076 TTATT-TGATGTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAGCAAGAGAATTAAA
130 TTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * *
62140 AAA-AGAATCCGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAA
194 AAATA-AATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* *** * * * * * *
62204 AACACAATGACCTTTTT-TTTTTTCATAAAGCAATTGGTTCAGTTTATGCAAGCTTATTTTG-AA
258 ATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAA
* *
62267 TAAAAGAATA-TAAATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGT
321 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* *** * ** *
62309 AAAAGATTTAAAAAATAAATCAATTAACTGAATGAGTTCAAATA-TTATGACTTTTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T
* * * * * *
62373 TAATTTATTTCTAATCATTATGACATTTTTG-TTTATCATAAAACAATTGTTTTTTATTTATACA
65 T-ATCTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCATACA
* * * * *
62437 A-ATAATTTCA-AA-ATAA-AATACTAATTTAGTAAT-TTTCAAAAGTTAATAAG----AGATTT
127 AGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * *
62493 AAAAACTAAATCTTGTTTTAC-GTAGACCAGTTCAAATAGTTAAAGAC-ATTTGAAAATAATTAT
191 AAAAAATAAATC-TG-TTTACTG-A-ACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTG--AACAATTA-
* * * * * *
62556 TCTAGCTTCAAATCATTATTGA-TCTTTGTTTTGTCATTAAAATAATTGTTTTATTGTCA-CCAT
248 TCTA-TTTCAAATCGTTA-TGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACA-
* * * * * * * *
62619 AACTTA-TTGCAGAGTAAAAATATTGCTAAAGCTGAATAATATTTCGTAAAATTAATAAAG-
308 AGCTTATTTG-A-AAT-AAAATAATACT-AA-TTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGT
* ** * * * *
62679 AA-A-ATTTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATA
1 AAGAGA-TTT--AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * * *
62742 ATTATCTATTTCAAATCATTCTAACTTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATTCAT
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
62807 GTTTATTCAAAATAAAATAATTCT-ATTCTATTAACA-TTCAAAAAATTACTAAGCAAGAA-A-T
128 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATT
* *
62868 T-AAAAA-AAA---GTTTACTGAACAA-ATAAAATAGTCAAGACTATTTGAAC-ATTTGAACAAT
190 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGT------TA--TG-ACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
62926 TATCTATTTAAAATCGTTAAGACTGTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGC
246 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGC
*** * * *
62991 TTATCCAAAATAAAATAATA--AACTTTATTAATATTTCAAAAGTTGAGAAGT
311 TTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** ** * * * *
63042 TGGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCGAATCAGTTCAAATAATTATG-GTCATTTCAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAA
* * * * * ** * *
63105 TTATCTATTTTAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTGTTCATCGTATAA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * *
63169 CCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAGGAA-ATTTA
128 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTA
* * * * ** * *
63232 AAAAACAAAACTATCTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCA
192 AAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * **
63297 AATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATT-ATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAAA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * *
63361 TAAAATAATACTAATCTAATAATA-TT-AAGAAAGTTAATAACT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AAA-TTAATAAGT
* * * * * *
63403 AAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAAT
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * ** * * * *
63468 TATCTATTTTAAATCATTAGGACCTTTTGTCTTGTTGTAAAAAAAATGTTTTTGTTCATATAAGT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * *
63533 TTGTTCATATTACAATAATATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * *
63594 AATAAATCTATTTACTAAACCAA-TT-AAACTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAA
195 AATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* *** * * * ** *
63657 ATCATTATGACCACTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTGATACAATATTATTTGGAATA
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
* *
63722 AAGTAATGCTAATTTATTAATA--TCATGAAAATTAATAAGT
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCA--AAAATTAATAAGT
* * * ** * * * *
63762 AACAGATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTG-ACCAATGCAAGTAGTTATGACTGTTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-TGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * * *
63826 TATCTATCTCATATCGTTATAACCTTTGGTTTTGTCAGAAGATAATTATTTATGTTCATACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * * * *
63891 TTATTCAAAATAACATAATTCTAACTTATTAGTATTTGAAAAATTAAT-A-T--GATATTTAAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * *
63952 ACTAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTC-AA
195 AATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * * ** *
64015 TCGCTAT-AATCTCTTATTTTGTTATAAAATAATTTTTTCTA-TGCATACAAGCTTATTTCTATT
259 TCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* *
64078 AAAATAAAAC-AATTTTATTAACA-TTCAAACAATTAATAAGT
322 AAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGT
* * * ** * * *
64119 AAAACATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAGTAGTTATGACTATTTGCACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
64184 ATTTATTTTAAATCATTA-CAATATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * ** *
64248 TTGTTCA-AATTAAATTAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTCT-A
130 TTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATT-TAA
* * * * *
64311 AAAATAAATATGTTTA-TCGAGCAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * ** * * * * * * * **
64375 AATTGTTTTGACTTTTTGTTTCATCATCAAGCAATTATATCAGTTCATATAGGCTTATTCAAAAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
*
64440 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGT
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
64481 AAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * *
64546 TTATATTTCAAATTGCTATGGCATTTTGTTTTGTTAAAAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * *
64611 TTATTCCA-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTATTAAGTAATA-ATTTAA
130 TTATT-CAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * *
64673 AAAATAAATCTCTTTTCTGAACATGCTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAATTGAA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
** * *
64738 AGAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTCTA-TTCATACAAG-TGTATTTGAAA
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCT-TATTTGAAA
*
64801 TAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
64843 AAAAGACTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAGGACC--TTTAAATGGTTAGGAATGTTTGAATAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA--ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
64906 TTATTTATTTCAAATAGTTATGA-TGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTGTATTCATACAA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * ** **
64970 GTTTGTTC-GAAATAAGATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATTTGGTAGGAGATT
128 GCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-TAAGTAAAAGATT
* * * * * * * * *
65033 TAAAAAACAAAT-TGTTTACTAAACAAATTCATATAATCATGTCCATTTGAACAATGATCTATTT
190 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * ** *
65097 CAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATGCAAAATTA-TTCA
255 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * * * *
65160 AAAAAAATAATATTTATCTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-T
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
65200 AAGAGATTTAGAAACTAAATTTGTTTA-TCGAAACAGTTCATATAGCTATGACTATTTAAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
65264 TATCTATCTCAAATCGTTACGA-TCTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAG
* * * *
65327 TTTTATTCAGATTAAAATAATACTAA--T-TTAATA-GT-----ATTAATAAGTAAGAGATTTAA
129 -CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * *
65383 AAAATAAATGC-GTTTACTGAACTAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAACAATTTTCGATTTCA
193 AAAATAAAT-CTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
65447 AATCATTCTAACCTTTTCTTTGGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * ** * *
65511 TAAAGTAATACTAATTTATT-ACATTGAAAAAATTAATGAGC
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
65552 AAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGATT-TGAATATTTGAATAA
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
65616 TCATCTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCGTAAAA
64 TTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * * * *
65680 ACTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTACTAGTATTTCAAAAACTAATAAGCAAAAGATTTAA
128 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * ** ** * *
65745 AAACTACAGT-TATTT-CTAAACCAGTTC-AATAGTTATGACTATTTGAACAAACATGAATATGA
193 AAAATA-AATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* ** * * * *
65807 AATCGTTGTGA-TCGTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTG-GAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * **
65870 AAAAATAACACTAATTTAATAATATTTTGAAAA-T--TAA-T
322 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * *
65908 AAGAGATTTAAATAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * ** * * * * *
65973 ATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTCAGTCATATAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGTT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
** ** * * *
66038 TATTTGGAATAAAATAACT-CTAATTTAACAACA-TTCAAAATATTAATAAGCAAGAGATTTGAA
131 TATTCAGAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAAAGATTT-AA
* * * *
66101 AAAATAAA-CTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATATTTTTAA
193 AAAATAAATC-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * **
66165 AATTGTTGTGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTT-TTCCAAAA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATT---TGA
* ** *
66229 ACAAAAAATTTAATACTCCTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGT
319 A-ATAAAA--TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
66276 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATCAATTCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAAC
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAT
* * ** *
66340 TATTTATTTCAAATCGTTAAT-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-AACATACATG
65 TATCTATTTCAAATCGTT-ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * *
66403 CTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATATACTAATATTTTAAGAATTAATAA-T---AGATTTAA
129 CTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * *
66463 AAATTAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
66527 AATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
*
66592 AAAATAATACTAATTT-TGTAATATTAT-AAAAATTAATAACT
322 AAAATAATACTAATTTAT-TAATATT-TCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * **
66633 AAGAGATTTAAAAAATAAATTCGTTT-GTCGAACTAGTTCAAACAATTAAGACTATAAGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** *
66697 TATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTCTACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTT-T--TTG-TT-TT--G--T--CATAAAAC----------
* * * * * *
66762 ATATTTCATAAAACAATTATTCCAGCTCATACAAGCTTATTCATAATAGAATAAAACCAATTTAT
108 A-A-TT-GT-------TT-TT---GTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * * *
66827 TAATATTTCAAAAATTTGTAAGTAAAAGATTTAGAAAATAATTTTATTTA-TCGAACTAGTTCAA
159 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAA
** * * * * * *
66891 ATAACTATAACTATTTGAAAAATTGTCTATTCCAAATCTTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
223 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * * *
66956 CAATTGTTTT-GTTAATATAAGTTTGTTCGAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTAAAAA
288 CAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
*
67020 ATTAATCAGT
353 ATTAATAAGT
** *
67030 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TT--T--A-C----C-AA-ACCTA--ACTATTTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * * * * * *
67081 ATTTATTTCAAATTATTAT-AATCTTTTATTTTGCCATCAAACAATTGGTTATGTTCATACTATC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * * *** *
67145 TTATTC-GAAATAAAATAATGCTAATTTAATAAAATTTCGAAACTTAATATCCAAGAA-AATTAA
130 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAA
* * ** * * * **
67208 AAAATAAATTTAATTGCCT-AACCAGTTCAAATAGCTAT-ACTATATGAATGATTATCTATTTCA
193 AAAATAAATCT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * ** * *
67271 AATCATTTTGACCTTTTCTTTTGTCGTAAGGCAATTGTTTT-GTTCATACAACCTTATTTTG-AT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTTGAAA
*
67334 TAAAATAATACTAA-TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
67375 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCA-TCGAATCAGTTCAATTGGTTAT-ACTATTAGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * **
67438 TATCTATTTCAAATTGTTCTGATTTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTGAGATT-ATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCATACAAG
* * * * *
67502 CTTACTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAG-AAACAGATTTTA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGA-TTT-
* * * * * *
67566 AAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAATTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTA
191 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * ** *
67631 AAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTGTCAGTTAATACGAGCTTAGATGGAA
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* **
67696 TAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * * * *
67738 AAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGTTGAATCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * * *
67803 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTG----T-TTCATATAAGCA
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * **
67863 TATTC-GAAATAAAAGAACACTAATTTATTAATA--T------TT--T--G--AAA-ATTT-ATT
131 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * *
67911 AATAAATCTGTTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAA
195 AATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * **
67975 TTGTTATGA-TCTTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCT--TATCATAGAAGCTTATTT-AGTT
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGT-TCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * **
68036 AAAAATAATACAAATTT-TATAATGTTTTGAAAATTAATAAGT
322 -AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * *
68078 AAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AACCTATTAGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAT
* * * * * * * * * * *
68142 TATATATTTCCAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT-ATCTTAGAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAG
* * * * * * ** * *
68206 TTTATTCGGAGTAAAACAATCCAAATTTATTAA-CGTTCGAAAAATTAATAAGCAAAACATTTGA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-A
* * * *** * * * *
68270 CAAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TTATGACCATATTTTAAAAAT
192 AAAAATA--AAT--CTGTTT--AC--TGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGA-C-TATTTGAACAAT
* ** * * * * *
68334 TA-ATA-AGCAAGA--GTTAAAAGAAATAAATTTGTTTAT-TGA-ACAAATTCAAATAGTTACAA
246 TATCTATTTCAA-ATCGTT--ATG-ACT--TTTTGTTT-TGTCATA-AAA--C-AATTGTT----
* * * * * ** * * * * * *
68393 CTATTTGA-ACAGTTGCCTATTT-AAA-ATCATTATGACCT--TTTGTT-TTGTCATAAAACAAT
296 TTAGTTCATACA--AGCTTATTTGAAATAAAATAAT-A-CTAATTTATTAATAT-TTCAAA-AAT
** *
68452 TGTTTCAGTTT
355 T-AATAAG--T
* * * * ** * * * * * * *
68463 ATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTA-TTAA-TATGTTGAAAATTAATAAGTAAGT
1 A-A-GAG---ATTTAAAA-AATA-AAT-TTGTTTACTGAACCA-GTT-CAAA-TAGTTA-TGACT
* * * ** ** * * * **
68526 AATTT-AAAAAGTAAATTCGT-TTACTAAATCAGTT-T-AAATAAT-TATGGCCATTTCAACAAT
54 -ATTTGAACAA-T-TA-TC-TATTTC-AAATC-GTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAAT
* ** * * * * * * *
68586 TATCTATTT-TAAATCACTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAAT--T-GTTT-TTAATCA--
111 TGT-T-TTTGT---TCA-TACAAGC--TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT
* * * * *** * * * * *
68644 -CACAAGTTTATAATGAATGAAATA-ATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAAT-AAGAAAT
166 TCAAAAATTAATAA-G--T-AAA-AGAT-TTAAAAAATAAATCTGT------TTACTGAACAAGT
* ** * * * *
68706 TTAAA-AAATA-AATCTATTT-ACCAA--A-CTAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTG
219 TCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC--TTT------TTG
* * * * *
68765 TAAACTTTAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAACAATTATTTTTGATCATATAAGCTTAT
275 T----TTT--GTCA-TA-AA-----------------ACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT
* * * * * * *
68830 TCGAAATAAAATAATA-TGAGTCTAATAATATTCCAAAAACTAATAACT
315 TTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
68878 AAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTT-GTCGAATCAGTTCAAATATTTAAGACTA-ATGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * *
68941 TATCTATTTC-AA--G---TCA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCACACTAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAG
* * * * * **
68998 CTTAATCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAGTTAATATGTAAGGGATTTAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * *
69062 AAAAT-AATTTCGTTTACCT-AACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAAAAATTATCTATTT
193 AAAATAAATCT-GTTTA-CTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
69124 CAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAGTTCAT-CTAAGCTTATTTG
255 CAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTTG
* * *
69188 AAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAAT
318 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
69233 AAGATATTTAAAAAATAAATCTGTGTATTGAACAAGTTTAAATAATTATG-CTATTTAAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* *** * * ** * * *
69297 ATCTATTTGAAATCACCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTTCTATTCATACAAGT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGC
* * * *
69362 TTATTTA-AATTAAGATAATACAAATTTAGTAATA--TCAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTA
130 TTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * *
69424 AAAAATAAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAA-ATTTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
192 AAAAAT-AAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
69488 CAAATTGTTATGACTATTTATTTTATCATAAAACAATTG-TTTATGTTCATACAAGCTTATTCCG
255 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATT-TG
* * * * * *
69552 -ATTAAAATGATATTAATTTATTATTGTTTCAACAATTAATAAGT
318 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * **
69596 AAAAGATTT-AAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCGTGACTATTT-AACTAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AAT
* * * * * * * * * * *
69659 TATTTATTTCAAATCATTGTCACCTTTTATTTTGTAATAAAATAATTGTTTTAGTTCATATAAGT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * **
69724 TTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTCT
130 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * *
69787 AAAATGAATCT-TTT-CATAGATCATA-TTTAAATAGTTATGACTATTAGAACAATTATCTATTT
193 AAAATAAATCTGTTTAC-T-GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
*** * * * * * ** *
69849 CAAAAAATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTA-TTCATGGAAGCTTATTTTA
255 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * *
69913 AATAAAATAATA-TAAGTTTACTAATATTCCAAAAATTAATAAAT
319 AATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
69957 AA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTTCT-AAACATGTTCAAATAGTTATAACTACTTAAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *
70020 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTTATAAAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
** * *
70085 TTATTTTGAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
70150 AATAAATCTGCTTA-TCGAGCGAGTTTAGATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
195 AATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * *
70214 TTATTATGA-TCATTTGTTTTGTCATAAAACAA-----TTATTTC-TATAAGTTTA-TTCAGAAT
259 TCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AAT
* * *
70271 ACAATAACACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * * * *
70312 AGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTTAAATAATCATGTC-ATTTAAACTATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * **
70376 ATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCACACAAAAT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* *
70441 TATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAA
131 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
* * * * * *
70502 CTAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTCAACTAGTTATGACTATTTGAAAAATTATCTATCTT-AAA
196 ATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAA
* * * * * *
70565 TCGTTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCGTACAAGCATATTCGGAGTA
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
70628 AAATATTTCTAAATTAATAATA-TTCTAAAAA-T--TAA-T
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
70664 AAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAGCTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *** * *
70729 ATTTATTTCAAA----T-T---TTTCTGACCT-T--T----C-A----TTTAG----TA-ATGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * ** * ** *
70769 TATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTAAAAAATTTAATAAACAAAAAATTTTAAA
131 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAA
* * * * *
70833 AAATAATTATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
*** * * * * * * *
70898 TAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATCTAAAATAA
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * *
70963 AATAATATTACTTGATTAATATTTCAAAAATTGATAAGT
324 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *** * * * * *
71002 TAGAGATAT-AAAAATAAATCAATTTA-TCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
71065 TTTGTATTTCAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTGT-ATAAAACAATT-TCTTTTCATT-ATACA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTT-GTTCATACA
* * * **
71126 AGCCTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTATTATTTCAAAAACTAATAAGTAGGAGATTTA
127 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * * *
71190 AAAAATAAATCGGTTTAC----C--GATC-CA-A--T-TCA-TATTTGAACAATTATATATTTCA
192 AAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * *
71243 AATCATTATAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTAAATTCATATAAGCTTATTT-AGAA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * *
71307 TAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** ** * * * * *
71349 AAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGTTGAAGTAGTTCAAACAATTAAGACCATATGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
71414 ATCTATATCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATT-TTTTCAT-TTCATACAAG
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT--TGTTCATACAAG
* *
71477 TTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAGA-AA--AAAAGTGATT
129 CTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAAA--GATT
* * ** * * * ** *** *
71537 TAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATC-AGGTCAAATAATTATGGCCCTACCAATAATTATCTATT
190 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * ** *
71601 TCAAAT-GTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAATAATTTTTTTTGAACATTCAAGCTTATTTGA
254 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
*
71665 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGT
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
71709 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTAATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGGACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * * *
71774 GTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * *
71839 TATTCTA-AA-AAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAA-CAAAGAGAATTAA
131 TATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAA
* ** * * * *
71900 AAAATAAAT-TTTTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAT-ACTATATGAACAATTATTTATTTC
193 AAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * ** * * ** *
71963 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAAGTTTTTTTTTTAAATCATACTAGCTTATTT
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA----TTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTT
* *
72028 GGAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGT
317 GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
72073 AAGATATTTAAAAAAT-AATTATGTTGACTTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTTAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * **
72137 TATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAAT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
** ** * * * *
72202 TTATTCAGAATAAGGTAAGGCTATTTTATTGATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTCAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
72263 AATAAAATCTATTTA-TCAATCTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAA
195 AAT-AAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * ** * * * **
72327 ATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAATAACTGTTTCT-GTTTATACAAGCTTATCCG-AAT
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
** *
72390 AAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAA-T
322 -AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * ** * * **
72431 TAGAAAATTTAAAACATGAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATATGTTTACCAAACTATTTGAA
1 AAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATA-G-TTA--TGACTATTTGAA
* ** * * **
72496 TAATTATCTATTTCAAATTATTATGTA-TCTTT-TTTTGTCATAAAA-AATTATTTCAGTTCATA
61 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
* * * * *
72558 TAAACTTATTC-GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-ATCTAAAAATTAATAA-TAAAGAT
125 CAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAA-AG
* * * *
72620 ATTTAGAAAATGAATTTGTTTA-T------G-------A--T-TG----TTTGAACAGTTATCTA
187 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
* ** * * * * * **
72664 TTTGAAATCACTATAACCTTTTGTCTTGTCATAAAATAATAT-TTTCTA-TTCATAAAAGCCCAT
252 TTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTT-TAGTTCATACAAGCTTAT
* * *
72727 TTCG-AATGAAATAATAC-ACATTTATTACTA-TT-AAGATAATGAATAAGT
315 TT-GAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGT
* * * ** * * * * *
72775 AAAAGATTTTAAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAAATTCAAATCGTTATGACTATTAGAGCAA
1 AAGAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * ** *
72840 TTATTTATTTTAACTTGTGATGACCTTTTGTTTTAACATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * * *
72905 GTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCGATAATTAATAAGTAAATGATTTAAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* ** * * * * * *
72970 AAACACCTATGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATGTATTTCAA
194 AAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * *
73034 ATCATTATGACCTTTTCTTTTGTAATTAAAACAATTATTTTTGTTCATATAATCTTATTTGAAGT
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* *
73099 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGT
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** ** *
73140 AAGAGAATT-AAAAA-AAATTTGTTCACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTACCTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * ** * *
73203 ATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTACTCATGCAAGTT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
** * * * *
73268 TATTTTGAATATAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAA
131 TATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * *
73331 AATAAATCTATTTTCTTAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAAT
195 AATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * *
73396 TGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTTGAAATAA
260 CGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * *
73460 AATAATTCTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGT
324 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* *
73499 AAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT--T--ACC-G-------AG--A-GACTATTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * *
73548 TTCTATTTCAAA-CTATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATTCAAG
66 ATCTATTTCAAATC-GTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * * * *
73612 TTTATTCAAAATAGAATAATACTAAATTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAAA-TTTTA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-T-AAAAGATTTA
* * * *
73676 AAAAATAAATTTGTTTGC-CAA-ATAGTTCAAATAGTTGA-GACTATTAGAACAATTATCTATTT
192 AAAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * ** * * * * **
73738 CAAATTGCTCTGACCTTTCATTTAGTCATGAAATAATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTCAAA
255 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * **
73803 ATAAAATAATACTAATTTATTTACA-TTCAAAAAATTAATAAAC
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * *
73846 AAGAAATTTTAAAAAAT-AATTATGTTTATTGAACAATTTAAAATACTTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* *** * * ** *
73910 TTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * * * *
73975 CTTATCCAAAATAAAATAAT-CTTAATTTATCAATATTTC-AAATTTGATAAGTTAGAGATTTAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * * * * *
74038 AAACTAAGTCAGTTTA-TCGAATC-GGTTCAAATAATTATGGCCAATTCAACAATTATGTATTTC
193 AAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* *
74101 AAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGCTTTTCG-TCATACAAGCGTT-TTT-
256 AAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGC-TTATTTG
*
74162 AGAATAAAATACTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
318 A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* *
74208 -AGTAGATTTTTAAAAA-AAATTTG-TT--T--A-C----C--A-A-TTCT---TATTTGAACAA
1 AAG-AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * * *** * *
74254 TTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTCAATTCATATACG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
** * * * * **
74319 CTTATTTGGAATAAAAT-AGACTAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTCGA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * *
74382 AAAATAAATCTGTCTACTGAAGC-AGTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * **
74446 AATC---ATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT--TGAATAGTCAAGCTTATTTGAA
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATA--CAAGCTTATTTGAA
* *
74506 ATAAAATAATACTAATTTATTAGTCTTTCAAAAATTAATAAGT
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
74549 AAGAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACTAAACCGGTTCAAATAATTATGGCCT-TATCAGCAAC
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAAT
* * * * * * ** * *
74613 TATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGTTTCGTCATATAATAATT-TTTTTAAAT-ATTCAAA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-GTTCATACAAG
* * * * *
74676 CTTATTCAAAATAAAATAATACTTATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGACTTAAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * **
74741 AAATAAATCTATTTACT-ACACTAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGT-AAACTCAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
74804 ATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATA
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
* * *
74869 AAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACT
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
74909 AAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAACCAGTTCAAATATTTAAGATTATATGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
74973 TATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTAATTCATACTA
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTT-GTTCATACAA
**
75036 GCTTATTTGGAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTA
128 GCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * *
75095 AAAAATAATTCTATTTACCT-AACTAA-TTCAAATAATGATGACTATTTTG-ACAATTATCTATT
192 AAAAATAAATCTGTTTA-CTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
75157 TCAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTA-ATCA
254 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* * *
75221 GAATAAGATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--
319 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
75264 AA-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAATCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCCAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* ** * * * ** * * * * * *
75326 TAT-TCATTTTAAATTATTATGATTTTTTGTTCTATTTTAAAATAGTTCTTTCTATTCATAAAAG
65 TATCT-ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
** * ** *
75390 CTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATGATTAATAAGTAAAAGGTTTAAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * * *
75455 AACTACATATATTTACCGAACAAGTACAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
** * * * * * * * * *
75520 TTATTATGACCTTTTCTTTTGTAATTAAA-ATTTTTTTTAAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTA
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
75584 AAA-AATATTAATTTATTAATATTCCAAAAGTTAATGAGT
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * * * ** *
75623 AAGAGAAATAGAAAAA-GAATATGTTTACCGAATAAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
1 AAGAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
75686 TATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTTTATTCATTCAAGT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * *
75751 TTATTTC-GATTAAAATAAT-TTAAATATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA-A-TTAA
130 TTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * ** * *
75812 AAATATATATTTGTTTTTTCAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
193 AAA-ATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * ** * * *
75877 AATCATTATGAGC-TTTTATTTTATCATAAGCCAATTGTTTCT-GTGCATAAAAG--TATATTCA
257 AATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTAT-TTGA
* * *
75938 GAATAAAATAATACTAATTTGTTAAAATTCCAAAAATTAATAAGT
319 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * ** ** *
75983 AAAAAATTTAAAAAATAAATCTAT-TTTATTCATACAAGTT-TATTCGAAAT-A--AAATAATAC
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACTGA-ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-AC
** ** * ** * * * * * * **
76043 TAATTTAT-TAATATTCTAAA-AATTAAAAGTTTGAG-ATT-T-AAAAAATAAATCTATTT-ACC
62 -AA-TTATCT-AT-TTC-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * ** * *
76102 GA-ACAAG----TTCA-AATAATCAT-ATCCATTCAAACTATTATCTATTTCAAATCATT-ATGA
122 -ATACAAGCTTATTCAGAATAA-AATAAT--ACT-AATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-A
* ****** ** * * * * * * * *
76159 CATTTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTTTATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAAT-AC
179 -AGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTACTGA-AC--AA--GTTCA-AAT--AGTTATGAC
** * * * ** ** *** * **
76223 TAATTT-ATTAA-TATTTGAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAGCTAAATCTATTTACCA-AACTA
234 T-ATTTGAACAATTATCT----ATTTCA-AATCG--TTATGA-CTTTTTGT-TTTGTCATAA--A
* * * * * * * * ** * * *
76285 GTTCAAATAGTTATGACTA-TTTAAACAATTATCTATCTTTG--TTCATGTGA-GCTTATTTAGA
287 --AC-AATTGTT-T---TAGTTCATAC-A--AGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTT--A
* * **
76346 GTGAAATATTGCTAAACTAA-TAATATTCT
339 -T-TAATATTTC-AAA--AATTAATA-AGT
* * * **** * * *** ** * * * *
76375 AA-A-AGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGGTGGTTGCTGA-A-CTAGTTCAAATAATT
1 AAGAGATTTAA-AA--AATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTT-CAAATAGTTA--T-GACTATTT
* * * * * * *
76436 AAGACTAATGGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGCTTAGTCATAAAATAATTG
58 GA-AC---------AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * *
76501 TTTTAGTTCATACATGCTTATT-TGAAATCAAATAATACTATTTTAGTAACA-TTCAAAAAATTA
113 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * * * ** * * *
76564 ATAAGCAAGATATTTTAAAAAAATAAATCTATTTTCCAAATAAGTTCGAATAGTTATGACTATAT
176 ATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
76629 GAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGATCA
239 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA
* *** * * * * *
76694 TAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATTGAGAAGT
304 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * **** * * * * * * *
76753 TAGAGATTTAAAAAGTAAACCAATTTATTGAATCAATGCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** * *
76818 ATTTATTTGAAATCGTTACAAAC-TTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTT-TATCATATAAG
66 ATCTATTTCAAATCGTTA-TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATACAAG
* ** * * **
76880 CCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATCAGTAGGAGATTTAAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * * *
76945 AAATAAATATGCTTACTGAATAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTATCTTTCAAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * ** * * * * *
77009 TTGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA---TTAT-GTACATACAAGCTTATTCGGATTAA
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * *
77070 AATAATACAAATATAATAATATTAT-GAAATTTAATATA-T
324 AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA-AGT
* * * * * *
77109 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAATTCAAATAGTTAAGCCTATATGAAAAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * **
77174 ATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTTTGTTCATATAAATT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * * *
77237 TGTT-TGAAATAAAATAATATTAATTTATGAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAA
131 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
** * * ** * *
77297 AATAAA-CTGTTTACCAAACCAA-TTCAATTAGTTATAAGAATTTGAATAATTATTTATTTCAAA
195 AATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* ** * **
77360 TCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTGATAC-AGTCTTATTCAAAAT
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAG-CTTATTTGAAAT
* * *
77423 AAAGTAATGCTAATTTATTATTA-TTCTAAAAATTAATAAGT
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * * *
77464 AACAGATTTAAAAAATGAATCTCTTGGCCT-AACTAGTAT-AAATAGTTATAACTGTTTGAATAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-TACTGAACCAGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
77527 TTATCTATTTCAAATTGTTATGA-TATTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * * * *
77591 CTTGCTT-GGAATAACATAAT-TTAATTTATTAATAGTCCAAAAAATAATAAGT---A-ATTTAA
129 CTT-ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * *
77650 AAACTGAATCTATTTA-TCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGTATAATTACCTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * *
77714 AATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * *
77777 TAAAATAATTAAT-ATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAAT
321 TAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
* * * ** * * *
77819 AAGCGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAATTCAAATAGTAATGAGTATTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * *
77884 ATTTATTTCAAATCATTATGACTTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * * * * **
77949 TATTC-GAATCAAAGTAATATTGATTTATTAATACTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAA
131 TATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * *
78013 AATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
195 AATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * *** ** * * *
78078 CATTATGACCTTTTG-TTTAAAATATGA-ATTTG-TTTA--CCAAACAAGCTCAAATAATTATGA
260 CGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCT----T-ATT-TGA
* * * * * * ****
78138 CTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTCATTTTTTCTAA-AA-T
319 --A-AT-AA-AATAAT--A-CT-AATTTATTA--ATATTTCA-AAAAT-TAATAAGT
** * *** * * * * ** * * *
78193 AATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTCTAAATAAAATAATAT-AAAT--TTATTAATATTCT-
1 AAGAGATTT-AAAAAATA-AA-TTTGTT-T-ACTGAACCAGT-TCAAATAGTTATGACTATT-TG
* * * *** * **** * **
78253 AAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATG-CTTTCTGAACACGT-TTAAATA-GTTAT
59 AACAATT-AT--CT----ATTT--CAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTTGTCATAAA-ACAAT-T
** * * * * * * ** * *
78315 GACTAT-TTGA-ACAA--TTA-TCA-ATTTCAAATAGTTA-TGACCTATT-GTTTTGTCATAAAC
112 GTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGA-ATAAAATA-ATACTAATTTATTAATATT-TC--AAA-
* ** * * * *
78372 TAATTATTTCTGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATGTAAAAA
171 -AATTA-ATAAG-T-A-A-AAG---ATTT--AA-AAAATAA-A-T-CTGT-TT-A-CTG--AACA
* * ** ** * ** * * * ** *
78437 ATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATACTT-ATAA-C-TATTTGAATAATTA
216 A-GTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-TT-ATCTATTTCA-AATCGT-TATGACTTTTTG
* * * ** * * *
78498 TTTATTTCAAAAAATTATGATCTTTGGTTTTCTTGTAAAACAATCATTTCTATTCAT-ACAAGTT
275 TTT-TGTCATAAAA-CA--A---TT-GTTTTAGT-TCATACAAGC---T-TATT--TGA-AA---
* * * * *
78562 TATTCAGAATAA-AATAATACTAATTTATTAAGATTCTAAAAATTAATAGGT
321 TA---A-AATAATACTAAT--TTA-TTAAT-A-TTTC-AAAAATTAATAAGT
** * * ** * * * *
78613 -AGAAGATTTAAAAGGTAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAAT
1 AAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
78677 TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATGCAAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC-AAG
* * * ** *
78742 -TTATTCAAAATAAAATAATA-TCGATCTATTAATATTTTGAAAATTAAT-A--AAAA-TTTTAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * ***
78801 AAAATAAATCTATTTACCGAA-ATAGTTCAAATAGTTATGAGTATTTGGACAAATATCTATAAAA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
78865 AATCATTATGA-----TGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCT-TTTCATACAGGCTTTTTTGAAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* * *
78924 TAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * ** * * *
78966 AAGAGATTTTAAAAATAAATATT-TTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAATTAATAGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** * *
79030 TATCTATTTCAAATCGTTCT-ATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATAAAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * ** * *
79094 TTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * *
79158 AAGAATATATCTGTTTA-TCGAATAAATTCAAACAGATT-TGACCATTTTAAACAATTATCT-TT
193 AA-AATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATT
* * * * * *
79220 TCAAAGTTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCTG
254 TCAAA-TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTG
*
79285 AAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-T
318 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * * * *
79326 AAGACATTTAAAAACTAAAGTTGTTTTTTGAACTAGTTCCAATAGTTATGACTATTTCAACAAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * *
79391 GT-TAATGTCAAATCATTGTGA-TCTTCT-TTTTCTCATAATACAATTGTTTCTGATCATA-AGA
66 ATCT-ATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA-A
* * * *
79452 GCTTATTTAG-ATAAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGACTTA
128 GCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * ** * * * * *
79512 AAAAATAAA-CATGTTTGCCGAACTTGTTCAAATATTTAAGTCTATTAGAATAATTATCTATTTC
192 AAAAATAAATC-TGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
79576 AAATCGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTTTAGTTCATTCAAGCTTATTTGGAA
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
* *
79641 TAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGC
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
79683 ATGAGATTTAGAAAAATAAATCTATCTAC-CAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAA
1 AAGAGATTTA-AAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * ** * *
79747 TTATCTATTTAAAAGCATTATGACCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * * *
79811 CTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * *
79876 AAATAAAT-TAGTTTA-TCGAATC-GGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTT
194 AAATAAATCT-GTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT
* * **** * *
79938 CAAATTGTTATTA-TCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCGT
255 CAAATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* *
80002 AACACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-T
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *
80042 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * * * *
80107 ATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTATATAAGCT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
* * *
80172 TATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAA
131 TATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * ** * * *
80235 AAATAAATTTATTTACTGAATC-AGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATTATTTATTTTAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * ** *
80299 ATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTTTAAACTCATAGAAGCTTATTTGAAATA
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATA
* * *
80364 GAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGT
323 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * ** * *
80404 AAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTTGTTGAACCAGTTCAAATA-TTATAACTATTTGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
80467 TATCTGTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATC-TGAAAATAATTGTTTTTGTTAATATAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * * * *
80531 TTTGTT-GGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAA
129 CTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * * * * *
80595 AAAGTAAATCTGCTTGCTAAACTA-TTAGAAATAATTTTAACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *** ** * ** **
80659 AATCATTATAACCTTTT-ATTTG----AATAGTTTTG-ACT-GTTCATACTATTTTATTCAAAAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * **
80717 AAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAACTTAATAACC
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * ** * * * * ***
80758 AAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-C-AAACCTA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAGTG
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTT-TACTGAACC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * ** ** * *
80820 ATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTATTGTGGAACAATTG-TTTTGTTCTTATAA
63 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * *
80884 GCTTATTTAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
128 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * ** * ** ** * * * *
80949 AAAATAAATTTATTTACCAAATC-AGGTCAAAT-GCTTAAAACTATTAAAATAATAATATATTGC
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * * *
81012 AAATAGTTATGACATTTTGCTTAGCCATAAAACAACTATTTCAATTCATACAAGCTTATTT-AGA
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-A
* * * *
81076 ATAAATTAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAACTAATAAGA
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
** ** * * *
81119 AAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATTATTATTTGAACAAT
1 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * ** * * *
81184 TATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTT-TCATAAAGCATTTGTTTCAGCTAATACGAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * ** * *
81248 CTTAGAT-GGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAGTAAGTATGAA-ATTTA
129 CTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTA
* * * * * * ** * *
81311 AAAAATAACTCTATTTACTAAATC-AGTT-AAATACTTATGGCCATTTGAATGATTATCTACTAC
192 AAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * *
81374 AAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAA
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAA
81439 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * *
81481 AATAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACCAGGTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * * ** *
81544 TTAT-TAATCTCAAATCATTA-AAATCTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAATCATATAA
64 TTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
* * * **
81607 GCTTATTCA-ATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTGT-GAAAATTAAT-AGATAAGTGATT
128 GCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG-TAAAAGATT
* * ** * * * ** *
81669 TAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAAATTGTTAAAACTATTAT-AATAATTATCTAT
190 TAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * * * *
81733 TTCAAATTGGTCTGACCTCTTGTTTAGTCATAAAATACTTGTTTCA-TATCTTATAAGCTTATTC
253 TTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTT
* * *
81797 GAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATTAGC
317 GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGT
* * * ** * * * * *
81843 AAAAGATTTGAAACAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTGTTTGAATAAT
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * *
81908 TATTTATTTAAAATCGTTATTACCTTTAGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * *
81973 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCCAAAATTAATAAGT-AAGGGTTTAAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAA
* * * * * *
82037 AAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAGTAGTTACGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAA
194 AAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
82102 TTGTTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCATATTTGAAATAA
259 TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
*
82167 AATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT---T
324 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
82203 -AGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATCAATGCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAAT
* * * * * *
82266 TATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTGGTTTGGTTATAAAATAATTGTTTTTTTTTCATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCATACAAG
*
82331 CTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAA
129 CTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * *
82391 AAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTGTATACTTT-
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTC
* * * * * * * * **
82454 AAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTTTTA-TTCATACAAGTTTATTCAAA
256 AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAA
* * * * * *
82518 ATAAAATAATGCTAATCTAATAA-AATTCAAAAAATGAATAACT
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
** * * *
82561 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAGATAGTTAAGACTATATGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * * *** *
82626 ATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCAACTCATAGAAG
66 ATCTATTTC-AAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAG
* * * * *
82689 CTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGA
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT---
* * * * * * *
82754 AAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTTATTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAA
191 AAA-AA----A--T---AAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
82818 TTATTTATTTTAAATCATTATGAAC-TTTTGTTTTTTCATAAAACATTTGTTTTTCA-AT-ATAC
245 TTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTT-AGTTCATAC
* * * * * *
82880 AAGCCTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTTC-AAATTGTTACAAGT
307 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGT
* ** * * *
82936 AGGAGATCAAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAACCAGTTCAAATAGCTATAACTATTTGAACAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
83000 TATATATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * ** * * *
83065 TTATTC-GAAATAAAATGATACTAATCTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAA
130 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * **
83129 AAATAAA-CAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCCTATCCAAAATAAAATAATG-CTACTTT-AGTAA
194 AAATAAATC---TG-TTTA-CTGA-ACAAG--T-T-C-AAAT--AGTTATGACTA-TTTGAACAA
** * * * *** * ***** * *
83191 -TAT-T-TTGAAAATTGATAAGTAAAATAT-TTAAAAAATAAATCAGTT-TATTGAATCAGTTCA
245 TTATCTATTTCAAATCGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TT---T-AGTTC-
* * * * *
83251 AATAATTATAGC-TATTTGAAA-AAATATCTATTTCAAATCGTTATTAACTTTTGTTTTGTCATA
303 -AT-A-CA-AGCTTATTTGAAATAAA-A--TAATACTAAT--TTATTAA------TATT-TC---
** *
83314 AAACAATTGTTTTTCAACTT
349 AAA-AA---TTAAT-AA-GT
* ** * ** ** ** * *
83334 ACA-AGCTTATTCAAAATAAA-AT-AATACT-AA--TTTTTTAATATTTCAAGA--ATTACT-AA
1 A-AGAGATT-TAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATT--TGAA
* *** ** * * ** ** *
83390 GAGATTAAAAAAAT-AAATTTGTTTATTGGACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
61 CA-ATTATCTATTTCAAA-TCG-TTA-T-GACT--TTT---T-GTTTTGTC-A-TAAAACAATTG
* * ** ** * **
83454 TCTATTTCAAATTGTCAT--AACCTT-TT--GTTTTATCATAAAAC--ATTTATTTTTA-TTCAT
113 T-T-TTT----GT-TCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-
* * * * * * * * *
83511 ATAAGCTTATTCAG-AATAA-A---ATAAAATTAATTTAGTAATATTCT-AA-AAATT--AATAA
169 A-AA-ATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCT-GT--T-TACTGAACAAGTTCAAATAG
* * ** * * * * * ** ***** * *
83567 CTA-AAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTGCTAAACTAGTTCA-AACAGTTAAAACTAT-AT-G
227 TTATGACTATTTGAACAAT-TATCT-ATTT-C-AAA-TCGTT-ATGACTTTTTGTTTTGTCATAA
* * ** * * ** *
83627 AACAATT-ATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--T-ATTTCAGC
286 AACAATTGTTTTAGTTC--A----TACAAGC--TT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTT-A--
* * *
83688 TTATAGATGTTTATTCAAAATAGAATGAAAGT
339 TTA-ATAT-TTCA---AAAAT-TAAT--AAGT
* * * * * *
83720 AAAAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACTAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
83784 TATCTATTTCAAATTGTTATTA--TTTT-TTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTAATATAAGT
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * *
83846 TTGTTCAAAATAAACTAATAATAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAA
** * * * ** * * * * * *
83909 AAAGCAAATTTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAA
193 AAAATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* ** * * * ** *
83974 ATCGTTATAACCCTTT-TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTA-TTCAGAA
258 ATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AA
* * * * * **
84036 TAAAATAATATTAATTCAATAATA-TTCTGAAACTTAATAACC
321 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * ***
84078 AAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAGTGT--TGAACTAGTTGAAATAGTTAAGACTATATGAATGC
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
84141 TTATCTATATCAAATCATTATGACTTTTT-TTTT-TCATTGTAAAACAATT-ATTTTATTCATAG
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCA---TAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * * *
84203 AAGCTTATTCGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
126 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT
* * * * * * *
84268 AAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC-GGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTT
191 AAAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
84332 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTGTTT-AG
255 CAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-
* * * * * * *
84396 AATAAATTCATACCAATTTA-TAA-ACGTTCAGATAA-TAGAAAAGA
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCA-AAAATTA-ATAAGT
* * * * * *
84440 AAGAGACTTAAAAAAATAAATCTATTCACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 AAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * *** *
84505 TGTCTATTT-AAATTTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAAG
65 TATCTATTTCAAA-TCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * * *
84569 CTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAGTAAGAA-ATTT
129 CTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTT
* * * * ** * *
84631 AAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAATC-ATTTAAAATAATTAAGACTATTTGAATGATCATTTATT
191 AAAAAATAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * *
84694 TGAAATCGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCGA
254 TCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA
* *
84758 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAATT
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
*** * * *
84802 AAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTATTG---TAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * * * ** * *
84864 ATCAATCTCAAATCTTTAAGA-TCTTTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTCTAATCATAGAAACT
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
** * *
84928 TATTC-GGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAAAGTAATAAG----AGATTTAAA
131 TATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * ** * * * *
84987 AAATAAATGTGCTT-GTGAAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACCACTAGAATAATTATCTATTTCA
194 AAATAAATCTGTTTACTG-AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * *
85050 AATTGTTCTCA-TCATTTGTTTAGTCATAAAACATTTTTTTTA-TATCTTACAAGCTTATTT-AG
257 AATCGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTTGA-
* * * * * *
85112 AATAAAATAATCCAAATTTAATAACATTTGAAAAATTAATAAGC
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
85156 AAAATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATAAATATTTGAACAAT
1 AAGAGATTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * ** *
85221 TATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGACATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAGC
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * *
85286 TTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAA
130 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAA
* * * * * *
85350 AAATTAATTTGTTTA-TCAAACAAATTCAAATAGTTATGACCA-TTGAACAATTGA-CTATTTAA
194 AAATAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCA
* * * **
85412 AATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT
* * *
85477 AAAAT-A-A-TAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGG
322 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * ** * * * *
85515 AAGTGTTTTAAAAAGT-GATTCTATTTATTGAATAAGTTCAAATA-TGATGGCTATTTCAATAAT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * * * * *
85578 TATCTATTTGGAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATACAAG
65 TATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG-TTCATACAAG
* * *
85642 CTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTT
129 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTA
* * * * * * * * * *
85705 AAAAATAAATCTATTTATTGAACCCA-TTGAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTGTATAATTC
192 AAAAATAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
85769 AAATCAATTATTTAAAAAATAAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-ATTTATGTTCATTCAA
256 AAATC-GTTA--T---GACT-----TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAA
* * * * * *
85833 ACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATACTCCAAAAATTAATAACT
309 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * *
85887 AAGAGATTTAAATAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATAATT
1 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** *
85952 ATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATACTAGC
66 ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCATACAAGC
* * *
86016 TTATTCAGAAATAAAATAA-AATAAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
130 TTATTCAG-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
* * * * * * * * *
86080 AAAGTAATTTTGCTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCA
193 AAAATAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
86144 AATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTGATATAAGACTGTA-TAG-
257 AATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAGTTCATACAAG-CT-TATTTGA
*
86206 AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-T
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *
86246 AAGATATTTAAGAAATAAATCTT-TTTA-TCAATCCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
1 AAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
86309 TTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTT-TTTTATATATAAAACAATAGTTTCTATTCATACGA
64 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC-A
** * * * *
86373 A-CTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTT
127 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
* * * *
86437 AAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATT-AAATAGTCATGACT-TTTG
192 AAAAATAAATCTGTTTACTGAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTG
86484 TTTTGTCATA
Statistics
Matches: 24356, Mismatches: 6105, Indels: 4162
0.70 0.18 0.12
Matches are distributed among these distances:
328 42 0.00
329 4 0.00
332 4 0.00
333 65 0.00
334 61 0.00
335 4 0.00
336 1 0.00
337 53 0.00
338 9 0.00
339 6 0.00
340 171 0.01
341 173 0.01
342 26 0.00
343 287 0.01
344 193 0.01
345 150 0.01
346 173 0.01
347 420 0.02
348 317 0.01
349 102 0.00
350 82 0.00
351 260 0.01
352 300 0.01
353 632 0.03
354 563 0.02
355 1109 0.05
356 559 0.02
357 1319 0.05
358 1877 0.08
359 1409 0.06
360 1797 0.07
361 2206 0.09
362 3079 0.13
363 1803 0.07
364 896 0.04
365 413 0.02
366 45 0.00
367 104 0.00
368 147 0.01
369 135 0.01
370 131 0.01
371 98 0.00
372 159 0.01
373 156 0.01
374 173 0.01
375 308 0.01
376 80 0.00
377 57 0.00
378 56 0.00
379 39 0.00
380 56 0.00
381 69 0.00
382 67 0.00
383 91 0.00
384 49 0.00
385 70 0.00
386 55 0.00
387 49 0.00
388 20 0.00
389 58 0.00
390 59 0.00
391 32 0.00
392 47 0.00
393 55 0.00
394 98 0.00
395 66 0.00
396 51 0.00
397 103 0.00
398 154 0.01
399 36 0.00
400 41 0.00
401 24 0.00
402 23 0.00
403 24 0.00
404 43 0.00
405 48 0.00
406 44 0.00
407 41 0.00
408 50 0.00
409 55 0.00
410 37 0.00
411 21 0.00
412 18 0.00
413 26 0.00
414 24 0.00
415 14 0.00
416 21 0.00
417 24 0.00
418 40 0.00
419 47 0.00
420 14 0.00
421 28 0.00
422 11 0.00
423 2 0.00
424 3 0.00
425 7 0.00
426 2 0.00
427 3 0.00
428 3 0.00
429 2 0.00
430 2 0.00
434 4 0.00
435 7 0.00
436 10 0.00
437 12 0.00
438 8 0.00
439 2 0.00
440 2 0.00
441 1 0.00
442 4 0.00
443 1 0.00
444 1 0.00
445 2 0.00
446 2 0.00
447 1 0.00
448 9 0.00
449 7 0.00
450 3 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (362 bp):
AAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
ATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCT
TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA
ATAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
Found at i:63262 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 62913--63299 Score: 401
Period size: 180 Copynumber: 2.2 Consensus size: 178
62903 GACTATTTGA
*
62913 ACATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAAGACTGTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTC
1 ACATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAAGACTGTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
62978 AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAAACTTTATTAATATTTCAAAAGTTGAGAAGTT
66 AG-TCATAAAACCCTATCCAAAATAAAATAATAAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTA
* * * * * *
63043 GGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGG
130 GGAAATTTAAAAAACAAAACAGTCTACCAAATCAGTTCAAATAATTAT-G
* * * * *
63093 TCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACT-TTTGTTTTATTATAAAACAATTGTTG
1 ACATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAAG-ACTGTTTGTTTTATAATAAAACAATTG-T-
* * * * *
63157 TTCA-TCGTATAACCCTATTCAGAATAAAATAATACTAA-TTT-TTAATATTTTAAAAATTAATG
63 TTCAGTCATAAAACCCTATCCAAAATAAAATAATA--AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAA-G
*
63219 -AGTAGGAAATTTAAAAAACAAAACTA-TCTACCAAA-CTAGTTCAAATAGTTATG
125 AAGTAGGAAATTTAAAAAACAAAAC-AGTCTACCAAATC-AGTTCAAATAATTATG
* *
63272 ACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT
1 AC-ATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
63300 TGCTATAACC
Statistics
Matches: 171, Mismatches: 27, Indels: 18
0.79 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
179 3 0.02
180 153 0.89
181 9 0.05
182 6 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (178 bp):
ACATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAAGACTGTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTC
AGTCATAAAACCCTATCCAAAATAAAATAATAAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTAG
GAAATTTAAAAAACAAAACAGTCTACCAAATCAGTTCAAATAATTATG
Found at i:63959 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 63923--63961 Score: 53
Period size: 20 Copynumber: 1.9 Consensus size: 20
63913 AACTTATTAG
*
63923 TATTTGAAAAATTAATATGA
1 TATTTGAAAAATAAATATGA
63943 TATTT-AAAAACTAAATATG
1 TATTTGAAAAA-TAAATATG
63962 TTTATCGAAC
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 1, Indels: 2
0.85 0.05 0.10
Matches are distributed among these distances:
19 5 0.29
20 12 0.71
ACGTcount: A:0.51, C:0.03, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (20 bp):
TATTTGAAAAATAAATATGA
Found at i:67039 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 66788--68257 Score: 821
Period size: 180 Copynumber: 8.3 Consensus size: 179
66778 TTATTCCAGC
* * * * **
66788 TCATACAAGCTTATTC-ATAATAGAATAAAACCAATTTATTAATATTTCAAAAATTTGTAAGTAA
1 TCATACAAGTTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
66852 AAGATTTAGAAAATAATTTTATTTATCGAACTAGTTCAAATAACTATAACTATTTGAAAAATTGT
65 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACTAGTTCAAATAACTAT-ACTATTTGAACAATTAT
* * *
66917 CTATTCCAAATCTTTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT
129 CTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT
* * * * * *
66968 TAATATAAGTTTGTTCGAAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAG
1 TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
67033 AGATTTAAAAAATAAATTT-GTT-T---AC-----C-AA-ACCTA-ACTATTTGAATAATTATTT
66 AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACTAGTTCAAATAACTATACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
67085 ATTTCAAAT-TATTATAATCTTTTATTTTGCCATCAAACAATTGGTTATGT
131 ATTTCAAATCT-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGT
* * * * * * ***
67135 TCATACTA-TCTTATTCGAAATAAAATAATGCTAATTTAATAAAATTTCGAAACTTAATATCCAA
1 TCATACAAGT-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * ** * * * * **
67199 GAAAATTAAAAAATAAATTTAATTGCCTAACCAGTTCAAATAGCTATACTATATGAATGATTATC
65 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACTAGTTCAAATAACTATACTATTTGAACAATTATC
* * **
67264 TATTTCAAATCATTT-TGACCTTTTCTTTTGTCGTAAGGCAATTGTTTTGT
130 TATTTCAAATC-TTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT
** * * *
67314 TCATACAACCTTATTTTG-ATTAAAATAATACTAA-TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *** *
67377 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCATCGAA-TCAGTTCAATTGGTTATACTATTAGAACAATTAT
65 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAACTATACTATTTGAACAATTAT
* ** * * *
67441 CTATTTCAAAT-TGTTCTGATTTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTGAGAT
129 CTATTTCAAATCT-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TG-T
* * * * * * * *
67494 T-ATACAAGCTTACTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGAAAC
1 TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * **
67558 AGATTTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACAAATTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAATT
66 AGA-TTT-AAAAAATAAATTTATTTATC-GAACTAGTTCAAATAACTA-TACTATTTGAACAATT
* * * * * **
67622 GTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTGTCAGT
127 ATCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTTGT
* * * * * * **
67676 TAATACGAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAGTTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
67740 GAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGTTGAA-TCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATTA
65 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAACTAT-ACTATTTGAACAATTA
* * *
67804 TCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAATTG---T-T
128 TCTATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT
* ** * *
67852 TCATATAAGCATATTCGAAATAAAAGAACACTAATTTATTAATA--T------TT--T--G-AA-
1 TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
** * * * **
67903 A-ATTT-ATTAATAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
66 AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACTAGTTCAAATAACTAT-ACTATTTGAACAATTATC
* * * * *
67966 AATCTCAAAT-TGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCT-T
130 TATTTCAAATCT-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGT
* * * ** * * **
68015 ATCATAGAAGCTTATT-TAGTTAAAAATAATACAAATTT-TATAATGTTTTGAAAATTAATAAGT
1 -TCATACAAGTTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT-TAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * ** * ** * * *
68078 AAGAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAACCTATTAGAATAATT
63 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACTAGTTCAAATAACTATA-CTATTTGAACAATT
* * * * * **
68143 ATATATTTCCAATCGTTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCAT
127 ATCTATTTCAAATC-TTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT
* * * * * * * **
68196 ATCTTAGAAGTTTATTCGGAGTAAAACAATCCAAATTTATTAA-CGTTCGAAAAATTAATAAG
1 -TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
68258 CAAAACATTT
Statistics
Matches: 994, Mismatches: 222, Indels: 147
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
159 20 0.02
160 60 0.06
161 5 0.01
162 1 0.00
163 7 0.01
164 31 0.03
165 1 0.00
166 52 0.05
167 71 0.07
168 8 0.01
169 2 0.00
170 1 0.00
172 4 0.00
174 2 0.00
175 3 0.00
176 36 0.04
177 5 0.01
178 110 0.11
179 66 0.07
180 206 0.21
181 157 0.16
182 37 0.04
183 107 0.11
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
TCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACTAGTTCAAATAACTATACTATTTGAACAATTATCT
ATTTCAAATCTTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT
Found at i:67629 original size:183 final size:180
Alignment explanation
Indices: 67152--67854 Score: 551
Period size: 183 Copynumber: 3.9 Consensus size: 180
67142 ATCTTATTCG
* * * * * *** * *
67152 AAATAAAATAATGCTAATTTAATAAAATTTCGAAACTTAATATCCAAGAAAATTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* ** * * * * ** * *
67217 TTAATTGCCT-AACCAGTTCAAATAGCTA-TACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTTT
66 CT-ATT-TATGAATCAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
** * * ** * * * ** *
67280 GACCTTTTCTTTTGTCGTAAGGCAATTGTTT-TGTTCATACAACCTTATTTT
129 GACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATA
* * *
67331 GATTAAAATAATACTAA-TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
67395 TTGTTCATCGAATCAGTTCAATTGGTTA-TACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTG
66 CTATTTAT-GAATCAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
** * *
67459 ATTTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTGAGATT-ATACAAGCTTA-CTCA
130 ACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TTAATACAAGCTTAGAT-A
* * * * *
67510 AAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATAAGAAACAGATTTTAAAAAAATAA
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAA
* * * * *
67575 ATCTATTTACTGAA-CAAATTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATT
64 ATCTATTTA-TGAATC-AGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * * *
67639 ATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTGTCAGTTAATACGAGCTTAGATG
127 ATGACCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATA
* * ** *
67693 GAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAAT
1 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * *
67758 CTATTTGTTGAATCAGTTAAAATAATTATGGCCATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATG
66 CTATTT-ATGAATCAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
* *
67823 ACCATTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCA
130 ACCTTTTG-ATTAGTCATAAAACAATTGTTTCA
67855 TATAAGCATA
Statistics
Matches: 416, Mismatches: 92, Indels: 30
0.77 0.17 0.06
Matches are distributed among these distances:
176 2 0.00
177 2 0.00
178 107 0.26
179 39 0.09
180 30 0.07
181 90 0.22
182 36 0.09
183 109 0.26
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (180 bp):
AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
CTATTTATGAATCAGTTAAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
CCTTTTGATTAGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAGATA
Found at i:69291 original size:17 final size:16
Alignment explanation
Indices: 69269--69309 Score: 55
Period size: 17 Copynumber: 2.4 Consensus size: 16
69259 ATTGAACAAG
69269 TTTAAATAATTATGCTA
1 TTTAAATAATTAT-CTA
*
69286 TTTAAACAATTATCTA
1 TTTAAATAATTATCTA
69302 TTTGAAAT
1 TTT-AAAT
69310 CACCATAACC
Statistics
Matches: 21, Mismatches: 2, Indels: 2
0.84 0.08 0.08
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.29
17 15 0.71
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.05, T:0.46
Consensus pattern (16 bp):
TTTAAATAATTATCTA
Found at i:69304 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 69269--69304 Score: 56
Period size: 17 Copynumber: 2.2 Consensus size: 17
69259 ATTGAACAAG
*
69269 TTTAAATAATTATGCTA
1 TTTAAACAATTATGCTA
69286 TTTAAACAATTAT-CTA
1 TTTAAACAATTATGCTA
69302 TTT
1 TTT
69305 GAAATCACCA
Statistics
Matches: 18, Mismatches: 1, Indels: 1
0.90 0.05 0.05
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.33
17 12 0.67
ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.03, T:0.50
Consensus pattern (17 bp):
TTTAAACAATTATGCTA
Found at i:69411 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 68328--86479 Score: 3382
Period size: 180 Copynumber: 100.4 Consensus size: 179
68318 ACCATATTTT
* * * * * * **
68328 AAAAATTAATAAGCAAGAG-TTAAAAGAAATAAATTTGTTTATTGAACAAATTCAAATAGTTACA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA-AAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * ** * *
68392 ACTATTTGAACAGTTGCCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
68457 C-AGTTTATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATGTT
130 CTA-TTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TC
* * * * * *
68508 GAAAATTAATAAGTAAGTA-ATTTAAAAAGTAAAT-TCGTTTACTAAATC-AGTTTAAATAATTA
1 AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTA
* * * * * * * * *
68570 TGGCCATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCACTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTGT
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * *
68635 TTTTAATCACACAAGTTTATAATGAATGAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC
128 TTCTATTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC
* *** *
68689 AAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAA-TTCAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAAC-AAGTTTAAATAGTTATG
* * ** * * * * *
68749 ACTATTTGAACAATTGTAAACTTT-AAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCAT--AACAATTATT
65 ACTATTTAAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
68811 TTTGA-TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TGAGTCTAATAATATTCC
129 TCT-ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-C
* * * * * * * * * *
68864 AAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAATC-AGTTCAAATATTTAAG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * *
68928 ACTA-ATGAACAATTATCTATTTCAAGTC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** *
68985 CAATTCACACTAGCTTAATCAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTC
130 CTATTCATACAAGCTT-ATTTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC
* * ** * * * *
69037 AAAAGTTAATATGTAAGGGATTTAAAAAAT-AATTTCGTTTACCT-AACCAA-TTCAAATAATTA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTA-TTGAA-CAAGTTTAAATAGTTA
** *
69099 TGACTATTTGAAA-AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTGTCATAAAAAAATT
63 TGACTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATT
* *
69163 ATTTC-AGTTCAT-CTAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTTC
126 GTTTCTA-TTCATAC-AAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * *
69219 AAAATTTAATAAATAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTGTATTGAACAAGTTTAAATAATTATG-
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* ** * * * * *
69283 CTATTTAAACAATTATCTATTTGAAATCACCATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTT
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATTGTTT
* * * *
69348 CTATTCATACAAGTTTATTTAAATTAAGATAATACAAATTTAGTAATA-TC
130 CTATTCATACAAGCTTATTTAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
** * * *
69398 AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAATCTGTTTACCGAGCAAGTTCAAA-ATTTT
1 AA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATA-GTT
* * ** *
69462 ATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTATTTATTTTATCATAAAACAATT
62 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTATTTTGTCATAAAACAATT
* * ** * * * * *
69526 GTTTATGTTCATACAAGCTTATTCCGATTAAAATGATATTAATTTATTATTGTTTC
126 GTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC
* * * * * **
69582 AACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCGTGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * *
69646 CTATTT-AACTAATTATTTATTTCAAATCATTGTCACCTTTTATTTTGTAATAAAATAATTGTTT
66 CTATTTAAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* *
69710 -TAGTTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
130 CTA-TTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * ** * * *
69761 TAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTCTAAAATGAATCT-TTTCATAGATCATA-TTTAAATAGTTA
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ATTGAACA-AGTTTAAATAGTTA
** * *
69824 TGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAAAAATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTG
63 TGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
* ** *
69888 GTTCTATTCATGGAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAGTTTACTAATATTCC
127 TTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATATT-C
* * * * * * *
69943 AAAAATTAATAAATAAAA-ATTTTAAAAATAAATATGTTT-TCTAAACATGTTCAAATAGTTATA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * *
70006 ACTACTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
70071 CTATTTATAAAAGCTTATTTTGAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATTTC
130 CTATTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * *
70123 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGCTTATCGAGCGAGTTTAGATAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * * *
70188 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGATCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
70253 ---T-AT--AAGTTTATTCAGAATACAATAACACTAATTTATTAATATTTT
131 TATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
** * * * * * *
70298 AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAATAAGTTTAAATAATCATGT
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * *
70363 C-ATTTAAACTATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* ** *
70427 TATTCACACAAAATTATTAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
131 TATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * ** * * *
70478 AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAACTAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * *
70539 CTATTTGAAA-AATTATCTATCTT-AAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
66 CTATTT-AAACAATTATCTAT-TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * ** * * * * *
70601 TCTATTCGTACAAGCATATTCGGAGTAAAATATTTCTAAATTAATAATATTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * *
70653 TAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTACTGAGCTAGTTTAAATAGTTAAG
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * ** * * * ** *
70714 ACTA-TTAGAATAATTATTTATTTCAAATTTTTCTGACCTTTCATTTAG---TAATGC--TTATT
65 ACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * * * * * *
70773 TGAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAACAT--TA--AA---A--AAT-TT-
129 TCTATTCATACAA-GCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * *
70813 AATAAA-CAA-AA--AA---TTTTAAAAAATAATTATGTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATG
1 AA-AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * *
70871 ACTATTTCAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
70936 CAATTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTGATTAATATTTC
130 CTATTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * ** * * *
70988 AAAAATTGATAAGTTAGAGATAT-AAAAATAAATCAATTTATCGAATC-AGTTCAAATAATTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * *
71051 GCCATTTGAGCAATTTTGTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGT-ATAAAACAATT-TCT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT-T
* * * *
71114 TTTCATT-ATACAAGCCTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATTATTATTTC
129 TCT-ATTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* ** * ** * *
71166 AAAAACTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCGGTTTACCGATCCAA--TT-CATA-TT-TG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGA-ACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
71226 --------AACAATTATATATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** * * *
71283 AAATTCATATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCC
130 CTATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C
* * * * * ** * * * *
71335 AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTATTTGTTGAAGTAGTTCAAACAATTAAGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
71400 CCATATGAACAATTATCTATATCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATTTTTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
*
71465 -ATTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
131 TA-TTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * *** * * *
71516 -AAAATTAGA-AA--AAAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTACCAAATC-AGGTCAAATAATT
1 AAAAATTA-ATAAGTAAAA--GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTT
* ** *** * * * * * * * * *
71576 ATGGCCCTACCAATAATTATCTATTTCAAAT-GTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAATAATTT
62 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
71640 TTTTTGA-ACATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC
127 TTTCT-ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC
* * * * * *
71695 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTAATTGAACTAGTTCAAATAGTTATGG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
** * ** * ** * * * *
71760 CTATTTGGACAATTGTAAACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTT
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
71825 TGTTCATACAAGCTTATTCTAAA-AAAATAATACTAATCTAATAATATTC
131 TATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * * * *
71874 TAAAAATTAATAA-CAAAGAGAATTAAAAAATAAATTTTTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAA
1 -AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTT-A
* * * * ** *
71938 T-ACTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAAGTTT
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA---T
* * * * * *
72002 TTTTTTTAAATCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTA
125 TGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * *
72059 AAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAATTATGTTGACTT-AACCAGTTCAAATAATTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * *
72123 ACTATTTTAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * ** * ** ** * * *
72188 TTGTTCATATAAATTTATTCAGAATAAGGTAAGGCTATTTTATTGATATTTT
130 CTATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * *
72240 AAAAATTAATAAG----AGATTTCAAAAATAAAATCTATTTA-TCAATCTAGTTCAAATAATTAT
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * * * * * ** * *
72300 GACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAATAACTGTT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *** *
72365 TCTGTTTATACAAGCTTATCCGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
129 TCTATTCATACAAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * *** * * *
72418 GATAATTAATAATTAGAAA-ATTTAAAACATGAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATATGTTTA
1 AAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATA-G-TTA
** * * * *
72482 CCAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGTATC-TTT-TTTTGTCATAAAA-AAT
63 --TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * *
72544 TATTTC-AGTTCATATAAACTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATAATC
125 TGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * ** * *
72600 TAAAAATTAATAA-TAAAGATATTTAGAAAATGAATTTGTTTA-TG-A-TTGTTTGAACAGTTAT
1 -AAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT
* * * *** * * ** * *
72661 --CTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTCTTGTCATAAAATAATATTTT-CTAT-TCATAAAAG
64 GACTATTT-AAA-CA--ATTATCTATT-TCAAATCAT--TATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-
* ** ** * * * * * * * * *
72722 CCCATTTCGAATGAAATAATACACA-TTTA-TTACTATTAAGATAATGAATAA-GTA-AAAGATT
121 --CAATT-GTTTCTATTCATACA-AGCTTATTTA--AATAAAATAAT-ACTAATTTATTAATA-T
*
72783 TT
178 TC
* * * * ** *
72785 AAAAA--AATAA--ATATGTTTTCCAAACAAATTCAAATC-G-TTA-TG-ACTA--TTAGAGCAA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAA-AAA-T-AAATCTGTTTATTGAACAAGTTTA-AATAG
* * * * ** ** * * *
72840 TTAT--TTATTTTAAC-TTGTGATGACCTTTTGTTTTAA-CA-TAAAACAATTGT-TTCTGTTCA
60 TTATGACTATTTAAACAAT-T-AT---C-TAT-TTCAAATCATTATGAC-CTTTTATTTTG-TCA
* ** * * * * * ** * * * * * *
72899 TACAA-GGTT-ATTCAGATTAAAATAATATTAATTT--AT-TAATATTTC-GA-TAATTAATAAG
116 TAAAACAATTGTTTC-TATTCATACAAGCTT-ATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-AT
72957 T-
178 TC
* * ** * * * * * *
72958 AAATGATTTAAAAAACACCTATG-TTTATCAAACAAGTTTAAAT-AG-TCA-TG-ACTA-TTTGA
1 AAA--AATTAATAAGTA--AAAGATTTA--AAA-AA---TAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAA
* *** * * * **
73017 ATAATTATG--TATTTCAAATC-ATTATGACCT-TTTCTTTTGTAATTA-AAACAATTATTTTTG
56 ATAGTTATGACTATTT-AAA-CAATTAT---CTATTTC--AAATCATTATGACCTTTTA-TTTTG
* * ** * * ** * *
73077 TTCATATAATC--TTATTTGAAGT-A-A-AA--TAATATT-AATTTATTAATA-T--TTCA--AA
113 -TCATA-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
*
73129 AATT-
175 TATTC
* * * * * * * * * *
73133 ---AATGAGTAAG--AGA-ATTA--AAAA-AAATTTGTTCACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
** * * * * *
73189 CTACCTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * * *
73254 TACTCATGCAAGTTTATTTTGAATATAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCC
131 TATTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-C
* * * * *
73305 AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTT-TCTTAACACGTTCAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAT-TGAACAAGTTTAAATAGTTATG
** * * *
73368 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * *
73433 CTATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATTCC
130 CTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C
*
73485 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG--T-TT--AC-CG-------AG--A-GA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * *
73534 CTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAA-CTATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTT
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
73598 TCTATTCATTCAAGTTTATTCAAAATAGAATAATACTAAATTATTAATATTTT
129 TCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * *** *
73651 AAAAATTAATAAGTTGGAAA-TTTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCCAA-ATAGTTCAAATAGTTG
1 AAAAATTAATAAG-T-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACA-AGTTTAAATAGTT-
*** * * * * *
73713 A-GACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATTGCTCTGACCTTTCATTTAGTCATGAAATAATT
62 ATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
73776 GTTT-TAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTACATTC
126 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
** * * *
73831 AAAAAATTAATAAACAAGAA-ATTTTAAAAAATAATTATGTTTATTGAACAA-TTTAAAATACTT
1 -AAAAATTAATAAGTAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTT-AAATAGTT
* * * * * *
73894 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
62 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
* ** *
73959 TTTC-AGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAAT-CTTAATTTATCAATATTTC
127 TTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * * * * *
74014 -AAATTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAACTAAGTCAGTTTATCGAATC-GGTTCAAATAATTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
74077 GCCAATTCAACAATTATGTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGCTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT
** *
74142 T-TCGTCATACAAGCGTT-TTTAGAATAAAATACTACTAATTTATTAATATTTC
129 TCTATTCATACAAGC-TTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
** * * *
74194 AAAAATTAATAAGTAGTAGATTTTTAAAAA-AAAT-T-TGT-TT-ACCAA-TTCT---TA-TT-T
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTT-TAAATAGTTAT
** * * * * * * *
74248 G--------AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
74305 TCAATTCATATACGCTTATTTGGAATAAAAT-AGACTAATTTAATAATATTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * ** * * * * *
74356 AAAAAATTAATAACTAAGAGATTCGAAAAATAAATCTGTCTACTGAAGC-AGTTCAAATAATTAA
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * * *
74420 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCA-T-T-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * *
74482 T-T-TGAATAGTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTCTTTC
129 TCTATTCATA--CAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC
* * * * * ** * *
74535 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATAAATTTGTTTACTAAACCGGTTCAAATAATTATGG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT-G
* * * * * * * * * * * *
74600 CCT-TATCAGCAACTATCTATTTGAAATCGTTATTACCTTTTGTTTCGTCATATAATAATT-TTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * *
74663 TTAAAT-ATTCAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTTATTTATTAATTTTTC
130 CT-ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTC
* * * * * * *
74715 AAAAATTAATAAGTAAGAGACTTAAAAAATAAATCTATTTACT-ACACTAGTTCAAATAGTTATT
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGA-ACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * ** ** * * * * *
74779 ATTATTTGAACAATTGT-AAACTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
74843 TTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTC
130 CTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * * * *
74895 AAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACCAGTTCAAATATTTAAGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * *
74960 TTATATGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAAGTT-TTT
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TTGTTT
* * *
75023 TTAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-A-TGAATTTATTAATATTTC
130 CT-ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC
* * * * * *
75075 AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACTAA-TTCAAATAATGAT
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TTGAAC-AAGTTTAAATAGTTAT
** ** * * * * *
75134 GACTATTTTGACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAAATGTT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * * *
75199 TTTGTTCATATAAGTTTAATCAGAATAAGATAAAACTAATCTATTAATATTTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * *
75252 AAAAATTAAT-A--AAAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCAATCTAGTTCAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * ** * * * ** * * *
75312 ACTATTTGAGCCATTAT-TCATTTTAAATTATTATGATTTTTTGTTCTATTTTAAAATAGTTCTT
65 ACTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
75376 TCTATTCATAAAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
** * * * * * ** ** *
75429 AATGATTAATAAGTAAAAGGTTTAAAAACTACATATATTTACCGAACAAGTACAAATAGTCATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
75494 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTAAT-TAA-AATTTTTTT
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
75557 TAAATTCATATAAGCTTATTTGAAGTAAAA-AATATTAATTTATTAATATTCC
131 T--ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C
* * * ** * * ** *
75609 AAAAGTTAATGAGTAAGAGAAATAGAAAAA-GAATATGTTTACCGAATAAG-TTAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * *
75672 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TT
* * * * * *
75737 T-TATTCATTCAAGTTTATTTCGATTAAAATAAT-TTAAATATATTAATATTCC
129 TCTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-C
* * * * * *
75789 AAAAATTAATAAGTAAAA-A-TTAAAAATATATATTTGTTTTTTCAACATGTTCAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * **
75852 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAGCTTTTATTTTATCATAAGCCAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
75917 CTGTGCATAAAAG-TATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTGTTAAAATTCC
130 CTATTCATACAAGCT-TATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C
* * * * * **
75969 AAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTTATTCATACAAGTTT-ATTCGAAAT
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATTGA-ACAAGTTTAAATAGTTAT
** * * ** * ** * *
76033 -A--AAATAATACTAATTTAT-TAATATTCTAAA-AATTA-AAAGTTTGAGATT-T-AAAAAATA
64 GACTATTTAA-AC-AA-TTATCT-AT-TTC-AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACA
* * * ** * * * * *
76090 AATCTATT-TA-CCGA-ACAAG-TTCAAAT-AATCATATCCATTCAAACTATTATCT-AT-TTC
123 ATTGT-TTCTATTC-ATACAAGCTT-ATTTAAATAAAAT-AATACTAA-T-TTAT-TAATATTC
* * ****** ** * * * * *
76147 AAATCATT-ATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTTTATTCATACAA----AATTA-T
1 AAA-AATTAAT-A-AGTAAAAGAT-TTAAAAAATAAATCTGTTTATTGA-ACAAGTTTAAATAGT
* ** * * * ** ***
76206 TCA-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTGAAA-AATTAATAAGA-GATTTA-AAAG-C-
61 T-ATGACT-ATTTAA-AC-AA-TTA-T-CTATTTCAAATCATT-AT--GACCTTTTATTTTGTCA
* * ** * ** * *
76265 TAAATCTATT-TACCAAACTAGTTCA-A-ATAG-TTATGACTATTTAAACA-ATTATCTATCTTT
116 TAAAACAATTGT----TTCTA-TTCATACA-AGCTTAT--TTAAATAAA-ATAATA-CTA-ATTT
* * *
76325 GTTCAT-GT-
170 ATTAATATTC
* ** * * * *** * ** *
76333 -GAGCTTATTTAGAGTGAAATATTGCTAAACT-AA--T-AATATTCTAA-AAG-TT-AATAAG-T
1 AAAAATTA-ATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATT-GAACAAGTTTAAAT-AGTT
* * * * * * *
76389 AAGA-GATTTAAAAAATAAAGGTGGTTGCTGAACTAGTTCAAATAATTAAGA-C---TA--ATG-
62 ATGACTATTTAAACAAT-----T--AT-CT--A-T--TTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT
* ** * * * * * * * * **
76446 GA-AAAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGCTTAGTCATAAAATAAT--TGTTTTAGT
114 CATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATAC-AAGCTTAT--TTA--AATAAAATAATACTAATTTA-T
* *
76508 TCATACATGC
172 T-A-ATATTC
** * * ** * * *** * * * *
76518 -TTATTTGAAATCAAATAATACTATTTTAGTAACATTCAAA-AAATTAATAAGCAAGATATTTTA
1 AAAAATT--AAT-AAGTAA-AAGA-TTTA--AAAAAT-AAATCTGTTTAT-TG-AACA-AGTTTA
* ** * * * * * **** * * **
76581 AAAAAATA-AATCTATTTTCCAAATAAGT-TCGAATAGTTATGACTATATGAACAATTATCTATT
55 AATAGTTATGA-CTA-TTT--AAACAATTATCTATTTCAAATCA-T-TATGACCTTTTAT-T-TT
* * * * *
76644 -TCA-AAACATTATGACCTTTTGTTT-TA-TCATA-AAACAATTGTTTCAGAT--CATAA-A--A
112 GTCATAAA-A-CA--A----TTGTTTCTATTCATACAAGC--TTATTT-AAATAAAATAATACTA
** * *
76699 GCTTATCCAA-AAT-
166 ATTTAT-TAATATTC
* * ** * * * *
76712 AAAATAATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATTGAGAAGT-TAGAGATTTAAAAAGTAAACCAA
1 AAAA-ATTAATA-AGTA-AAAGATTTAAAAAA-T-A-AA-TCT---G-TTT----ATTGAA-CAA
** * * * * * * ** *
76776 -TTTATTGAATCAATGCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGTTACAAA
50 GTTTA---AAT--A-G-TTATGACT------ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
* * * * * * *
76840 CTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTA-TCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTA
102 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTA
76904 ATTTATTAATATTTC
166 ATTTATTAATA-TTC
* * ** * * * * * *
76919 AAAAATTCATCAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTGAATAA-TTCAAATAATTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * ** * * ** * *
76983 CTATTTGAATAATTGTATCTTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA-T-TATG
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
** * * * *
77046 TA--CATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACAAATATAATAATATT-
131 TATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * ** *
77093 ATGAAATTTAATATA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAA-TTCAAATAGTT
1 A--AAAATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTT
* * * *
77156 AAGCCTATATGAAA-AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATT
62 ATGACTAT-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
* * * * ** * * * *
77218 ATTTTTGTTCATATAAATTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATGAATATTTT
126 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
*** * * *
77274 AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAA-CTGTTTACCAAACCAA-TTCAATTAGTTATA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
** * * * * *
77333 AGAATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * *
77398 CTATTGATAC-AGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTATTATTC
130 CTATTCATACAAG-CTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * *** * *
77449 TAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTCTTGGCCT-AACTAGTATAAATAGTTAT
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * ** **
77513 AACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA--TATTGGTTTTGTCATAAAACAATTGT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* * ** * * *
77576 TTCTATTCGTACAAGCTTGCTTGGAATAACATAAT-TTAATTTATTAATAGTCC
128 TTCTATTCATACAAGCTT-ATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * *
77629 AAAAAATAATAAGT---A-ATTTAAAAACTGAATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
** * * * * * *
77690 CTATTTGTATAATTACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
77754 TATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATTAAT-ATTTATTAATATTT
131 TATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAA-TACTAATTTATTAATATTC
* * ** * * * *
77804 AGACAATTAATAAATAAGCGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAATTCAAATAGTAATG
1 A-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * *
77869 AGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-CTTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTT-TTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * ** * * *
77933 TTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATCAAAGTAATATTGATTTATTAATACTTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* ** * ** * * * *
77986 AACAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATAA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * *** ** *
78051 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTAAAATATGA-ATTTG-TT-
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * ** * * * * **
78112 TA-CCAAACAAGCTCAAATAATTATGACTATTTGAAC-AA-TTATCCAT-TTC
131 TATTCATACAAGCTTATTTAAATA-AAATA-AT--ACTAATTTATTAATATTC
* * ** ** *** ** * * **
78161 -AAATTGTTATGATCTTTCATTTTTTCTAAAAT-AAT-TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTA
1 AAAAAT-TAAT-A-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TT-TATTGA-ACAAGTTTA-AATA
** * * * * * ** ** ** *
78223 AATA-AAATA-ATATAA-ATTTAT-TAATATTCTAAA-AATTAAT-A-AGTAAAAATT-T-AAAA
59 GTTATGACTATTTA-AACAATTATCT-AT-TTC-AAATCATT-ATGACCTTTTATTTTGTCATAA
* * * * ** ** * * * *
78279 AATAAATATGCTTTC---TGA-ACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AA-TTATCAAT-
119 AA-CAAT-TG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTAAATA-AAATA-AT--ACTAATTTATTAATA
78337 TTC
177 TTC
* ** ** * ** * **
78340 AAATAGTT-ATGACCT-ATTGTTTTGTCATAAACTAATTATTTCTGTTCATACAAGCATA-TTTG
1 AAA-AATTAAT-AAGTAAAAG-ATT-T-A-AAA--AA-TAAATCTGTTTATTGAA-CA-AGTTT-
** ** * *** * * *
78402 AAATAAAATAACACTAATTTATTAA-TATGTAAAAAATTTTAAA-AATAAAT-A--TGTTTA--T
54 AAAT-AGTTATGACT-ATTTA--AACAAT-T-ATCTATTTCAAATCAT-TATGACCT-TTTATTT
* * * * * * ** * * * *
78460 CGAACAAGTTCAAATACTTATAACTATTTGAATA-ATTA-TTTATTTCAA-AAAATTATGATCT-
111 TG-TC-A--TAAAACAATTGTTTCTA-TT-CATACA--AGCTTATTTAAATAAAATAAT-A-CTA
** *
78521 -TTGGT-TTTCT-TGTA
166 ATT--TATTAATAT-TC
* * * * * * *
78535 AAACAATCATTTCTATTCATACAAG-TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAGATTCT
1 AAA-AATTA-AT-AAGT-A-A-AAGATTTA---A-AA-AATA-AAT-CT-GTTTATT--GA-AC-
** * ** * * ** ***
78599 AAAAATT-AATAGGTA-GAAGATTTAAA-AGGTAAATCTATTTACCAAA-CA--A-GTTCAAATA
48 -AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACA-AT-TATCTATTT--CAAATCATTATGACCTTTTA
** ** * * * * *
78657 GTCATGTCCATTTGAACAA-T-TATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC
108 -TTTTGT-CA-TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CA--A-G--C--TT-ATTTA-AATAAAAT
* ** *
78720 AATTATTTTTGTTCATGCAAAGTTATTC
159 AA-TACTAAT-TT-AT--TAA--TATTC
* * ** * * * * * * **
78748 -AAAA-TAA-AA-TAATATCGATCT-ATTAAT-ATTTTGAAAATTAAT-AAAAATTTTAAA-AAA
1 AAAAATTAATAAGTAA-A-AGATTTAAAAAATAAATCTG---TTTATTGAACAAGTTTAAATAGT
* * * * *** *
78805 TA-AATCTATTT-ACCGAA--A--TAGTTCAAAT-AGTTATGA-GTATTTGGACAAATATCTATA
61 TATGA-CTATTTAAAC-AATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTT--A-TTTTGTC-AT-
* * * * * * * **** * * * *
78862 AAAAATCATTATGATGT-TTTGTCA-AAAAAC-AATTGT--TTCTTTTCATAC-AGGCTTTTTTG
117 -AAAA-CAAT-TG-TTTCTAT-TCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTA--ATTTATTA
78921 A-ATT-
174 ATATTC
* * * * * *** * * * **
78925 AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATTT
1 AAAA-ATTAATAA-GTAA-AAGATT-TAAAAA--A-TAA--ATCTG--TTT---ATTGAACAAGT
* * * *
78990 TTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAATTAATAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCT-ATCC
52 TTA---AA-TAGTT---ATGACT---ATT--TA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CC
* * * * * * *
79054 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTTATAAAAGTTTATTCAAAATAAAACAATACTA
103 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTA
**
79118 ATTTATTAGCATTC
166 ATTTATTAATATTC
* * * * * * * *
79132 AAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAGAATATATCTGTTTATCGAATAAATTCAAACAGATT-
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAG-TTA
* **
79196 TGACCATTTTAAACAATTATCT-TTTCAAAGTTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
63 TGACTA-TTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
79260 GTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTC
126 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * **
79316 AAAAATTAATAAG----ACATTTAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTGAACTAGTTCCAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
79376 ACTATTTCAACAAATGT-TAATGTCAAATCATTGTGATCTTCT-TTTTCTCATAATACAATTGTT
65 ACTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
79439 TCTGA-TCATA-AGAGCTTATTTAGATAAAAATAATACAAATTTAATAATATTTC
129 TCT-ATTCATACA-AGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* *** ** * * *
79492 AAAAATTAATAAG----AGACTTAAAAAATAAA-CATGTTTGCCGAACTTGTTCAAATATTTAAG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * * * *
79552 TCTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATT
65 ACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
79616 T-TAGTTCATTCAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTC
129 TCTA-TTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* ** * * ** *
79668 AAAAAATTAATAAGCATGAGATTTAGAAAAATAAATCTATCTA-CCAAGCAAGTTCAAATAGTTA
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTA
* * * * *
79732 TGACTATTTGAGCAATTATCTATTTAAAAGCATTATGACCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGT
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** * *
79796 TT-TAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTC
128 TTCTA-TTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * *
79850 AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAATC-GGTTCAAATAATTAT
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * ** * * *
79913 GGCCATTTGAACAACTATCTATTTTCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
64 GACTATTTAAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
79978 TTTTCA-ACATACAAGCTTATTCGT-AACACAATAATACTAATTTATTAATATTTC
128 TTCT-ATTCATACAAGCTTATT--TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * *
80032 AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * ** * * *
80093 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * *
80158 TATTTATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTC
131 TATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * *
80208 TAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACTGAATC-AGTTCAAACAGTTAA
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * * ** * * *
80272 AACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * *
80337 TAAACTCATAGAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * * *
80390 AAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGTTGAACCAGTTCAAATA-TTATAA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
80454 CTATTTGAATAATTATCTGTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATC-TGAAAATAATTGTTT
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT-AAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
80518 TTGTTAATATAAGTTTGTTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTA
130 CTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * ** * * * * * *
80570 AAAAATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGCTAAACTA-TTAGAAATAATTTTA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTT-TAAATAGTTATG
* * * * *
80634 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTA-TTTG------AATAGTT-TTG
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT-
* * * ** * *
80691 ACTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* ** * ** * ** * * *
80743 TAAAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGTCAAACCTA-TTCAAATAATTA
1 -AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTA
* * * *** * * ** **
80806 AGACTATATGAGTGATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTCTTTTATTGTGGAACAATTG
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * *
80870 TTT-TGTTCTTATAAGCTTATTTAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTT
127 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * *** * * *
80924 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATC-AGGTCAAAT-GCTTAA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAG-TTAT
* * * * * * * ** * * * *
80987 AACTATTAAAATAATAATATATTGCAAAT-AGTTATGACATTTTGCTTAGCCATAAAACAACTAT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
81051 TTCAATTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTT
128 TTCTATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * *** *
81104 AGAAAACTAATAAG-AAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTA
1 A-AAAATTAATAAGTAAA-AGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTA
* * * * ** * * *
81168 TTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGATTTT-TCATAAAGCATTTG
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * ** *
81232 TTTC-AGCTAATACGAGCTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC
127 TTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
** * * * * * * *
81287 CTAAATTAGTAAGTATGAA-ATTTAAAAAATAACTCTATTTACTAAATC-AG-TTAAATACTTAT
1 AAAAATTAATAAGTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTAT
* * * ** * * * *
81349 GGCCATTTGAATGATTATCTACTACAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
*
81414 TTTGA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
129 TCT-ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * *
81467 AAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGGTTAAATAATTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * ** * * *
81532 CTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAAAATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
66 CTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
81595 CTAATCATATAAGCTTATTCAATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTGT
130 CTATTCATACAAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-C
* ** * **** * * *
81647 GAAAATTAAT-AGATAAGTGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAAATTGTTAA
1 AAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTT-AAATAGTTAT
* * *** * * * * * *
81711 AACTA-TTATAATAATTATCTATTTCAAATTGGTCTGACCTCTTGTTTAGTCATAAAATACTTGT
64 GACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
81775 TTC-ATATCTTATAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTT
128 TTCTAT-TCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC
* * * *** *
81828 AGAAAATTAATTAGCAAAAGATTTGAAACAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTAAAATAGTTAT
1 A-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * * * * * *
81893 TACTGTTTGAATAATTATTTATTTAAAATCGTTATTACC-TTTAGTTTTGACATAAAACAATTGT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTA-TTTTGTCATAAAACAATTGT
* * *
81957 TT-TAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTC
128 TTCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * * *
82011 CAAAATTAATAAGT-AAGGGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAGTAGTTACG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * ** * * * *
82075 ACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
*
82140 C-AGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCC
130 CTA-TTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C
* * * * * * ** *
82192 AAAAATTAATTAGT----GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACTAAATCAA-TGCAAATAATTAT-
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * *
82251 AGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTTGGTTTGGTTATAAAATAATTGT
65 A-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTG-
* * * *
82315 TTTTTTTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC
127 TTTCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC
* * *
82370 AAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAA-TTCAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAAC-AAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * ** * * * * * *
82430 AATATTTGAATAATTGTATACTTT-AAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATT
65 ACTATTTAAACAATTATCTA-TTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
82494 TTTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATCTAATAAAATTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * * * *
82546 AAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAGATAGTTAAG
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * *
82611 ACTATATGAACAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAATAATTTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * ** * *
82675 TCAACTCATAGAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTC
129 TCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * *
82728 AAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTTATTGAATC-AGT
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT---AAA-AA----A--T---AAATCTGTTTATTGAA-CAAGT
* * * * * * * * * * *
82792 TCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTTTCAT
52 TTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCAT
* * * * * *
82857 AAAACATTTGTTTTTCAAT-ATACAAGCCTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTT
117 AAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
82921 C
179 C
* * * ** ** * * * * * * *
82922 -AAATTGTTACAAGTAGGAGATCAAAAAAATAAATTTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGCTATA
1 AAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * ** * * * *
82986 ACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
83051 CTATTCAAACAAGCTTATTCGAAATAAAATGATACTAATCTAATAATATTTT
130 CTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * *
83103 GAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAA-CAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCCTATCCAA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC---TG-TTTA-TTGA-ACAAG--T-T--TA
* * ** * ** ** **
83167 AATAAAATAATG-CTACTTT-AGTAA-TA--T-TTTGAAA--ATTGAT-AAGTAAAATATTTAAA
55 AAT--AGTTATGACTA-TTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCT--TTTATTT-TG
** * * * * * *
83223 AAATAAATCAGTT-TATTGAATCAGTTCAAATAATTATAGC-TATTTGAAA-AAATATCTATTTC
113 TCATAAAACAATTGT-TT--CT-A-TTC--AT-A-CA-AGCTTATTT-AAATAAA-A--TAATAC
*
83285 AAATCGTTATTAACT-TT-
164 TAAT--TTATTAA-TATTC
***** * * ** ** * * * ***
83302 TGTTTTGTCATAA--AACAATTGTTTTTCAACTTACAA---GCTTATTCAAAATAAAATAATACT
1 AAAAAT-TAATAAGTAA-AA--GATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATTGAACA-AGTTTAA-A-T
* * * * * * * ** * * ** * *
83362 AATTTTTTAATATTTCAAGAATTA-CTAAGAGATT-AAAAAAATA-AATTTGTTTA-TTGGACTA
58 -AGTTATGACTATTTAAACAATTATCT---A-TTTCAAATCATTATGACCT-TTTATTTTGTC-A
* * * * ** * * ** * ** *
83423 GTTTAAATAGTTATAACTATTTGA-ACAA--TTATCTATTTCAAATTGT-CATAACCTTT-TGTT
116 --TAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATAATAC-TAA--TTTAT-TA
*
83483 TTA-TC
174 ATATTC
* * * * * * *
83488 ATAAAACATTTATTTTTATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAAAAT-TAATTTAGT-AA-T
1 --AAAA-A-TTA--ATAAGT-A-A-AAG---ATT--TAA-AAAAT-AAATCT-GTTTATTGAACA
* * * * *
83550 A-TTCTAAA-AATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTGCTAAA-CTAGTTCA-A
49 AGTT-TAAATAGTT-ATGACT-----ATTTAAACAAT-TATCT-ATTT-C-AAATC-A-TT-ATG
** * *** * * * * * ** ** * * **
83610 ACAGTTAAAACTAT-ATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
100 ACCTTTTATTTTGTCAT-AA-AA-CAATTGTTTC-TATTCATACAAGC--TT-ATTT-AAATAAA
* * * *
83674 ACAATTATTTCAGCTTATAGATGT-TTATTC
157 ATAA-TA-CT-A-ATT-T--AT-TAATATTC
* * * * * * * *
83704 -AAAATAGAATGAAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTAAACCAGTTCAAATAATTA
1 AAAAAT-TAAT--AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTA
* * * ** * * *
83768 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTA--TTTT-TTTTGTCATAAAACAACTAT
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * * * *
83830 TTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAACTAATAATAATTTATTAATATTT
128 TTCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* ** * * **** * *
83883 AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTTAAAAAGCAAATTTGCTTGCCAAACCA-TTTCAAATAGTTT
1 A-AAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTT-AAATAGTTA
* * * * * * *
83946 TGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCCTTT-TTTTGTCATCAAACAATTGG
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** * * * *
84010 TTCTATTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTCAATAATATTC
128 TTCTATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * ** * *** * * * *
84063 TGAAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAAGTGTTGAACTAGTTGAAATAGTTAA
1 -AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTAT
* * *** * *
84127 GACTATATGAATGCTTATCTATATCAAATCATTATGA-CTTTT-TTTTTTCATTGTAAAACAATT
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA---TAAAACAATT
* * ** * * *
84190 ATTT-TATTCATAGAAGCTTATTCGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTC
126 GTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * ** * * * *
84245 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC-GGTTCAAATGGTTAAG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * *
84309 ACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAAAAATTGTT
65 ACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * **
84373 TC-AGTTCATACAAGCTTGTTTAGAATAAATTCATACCAATTTATAAACGTTC
129 TCTA-TTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * * * *
84425 AGATAA-TAGAAAAG-AAAGAGACTTAAAAAAATAAATCTATTCACTGATCAAGTTCAAATAGTT
1 A-AAAATTA-ATAAGTAAA-AGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTT
* * ** *
84488 ATGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTTGTTATAACCTTTTGA-TTTGTCATAAAACAAT
62 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAAT
* * * ** *
84551 TGTTTCAATTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTC
125 TGTTTCTATTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TTC
* * *
84609 -TAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAATC-A-TTTAAAATAATTA
1 AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTT-AAATAGTTA
* * ** * * * * *
84670 AGACTATTTGAATGATCATTTATTTGAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
63 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* *
84734 TTTTGA-TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
128 TTCT-ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * ** * * *
84788 AAAAACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTATTG---TAGTTCAAATAGTTATAA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
84850 CTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCTTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * **** *
84914 TAATCATAGAAACTTATTCGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTC
131 TATTCATACAAGCTTATTTAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * *
84964 TAAAAAGTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATGTGCTT-GTGAAACCAA-TTCAAATAGTTA
1 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTG-AA-CAAGTTTAAATAGTTA
** * * * ** * * * * * * *
85023 AAACCA-CTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTCATCATTTGTTTAGTCATAAAAC-ATTT
63 TGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * * *
85086 TTTTTATATCTTACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATCCAAATTTAATAACATTTG
127 TTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * *
85142 AAAAATTAATAAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * * * * *
85207 AATATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGACATAAAACAATTGTTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** *
85272 -TAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTC
130 CT-ATTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * ** * *
85324 AAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAAAAAAATTAATTTGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * * *
85388 ACCA-TTGAACAATTGA-CTATTTAAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
65 ACTATTTAAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
*
85451 T-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT-A-A-TAATTTATTAATATTCC
129 TCTA-TTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-C
* * ** * * * * * * * * *
85501 AAATATTAATAAGGAAGTGTTTTAAAAAGTGATTCTATTTATTGAATAAGTTCAAATA-TGATGG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * ** * * * * *
85565 CTATTTCAATAATTATCTATTTGGAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* *
85630 TGATT-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCATTC
131 T-ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTC
* * * *
85681 AAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTATTGAACCCA-TTGAAATAGTTAT
1 AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTAT
* * * * * * * * * * *
85744 AACTATTTGAATAGTTGTATAATTCAAATCAATTATTTAAAAAATAAAACTTTTGTTCTGTCATA
64 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC----A-TT-----AT-GACCTTTTATTTTGTCATA
* * * * * * * *
85809 AAACAATTATTTATGTTCATTCAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATACTCC
118 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * *
85873 AAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
* * * * * * * *
85938 TTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTC
66 CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
* * * * *
86003 AATTCATACTAGCTTATTCAGAAATAAAATAA-AATAAATTTACTAATATTTC
131 TATTCATACAAGCTTATT--TAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTC
* * * * * * * * * *
86055 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTTTGCTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TTGAACAAGTTTAAATAGTTATG
* * * ** ** *
86119 ATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AATTGTT
* * * * *
86183 TTTGTTGATATAAGACTGTA--TAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTC
129 TCTATTCATACAAG-CT-TATTTA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * *
86236 AAAAATTAATAAG----ATATTTAAGAAATAAATCTTTTTA-TCAATCCAGTTTAAATAGTTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATG
* * ** * * * *
86296 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTTTTTATATATAAAACAATAGTT
65 ACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT-CATAAAACAATTGTT
* *
86360 TCTATTCATACGAA-CTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
129 TCTATTCATAC-AAGCTTATTT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
* * * * ** * * *
86413 AATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATTAAATAGTCATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
86478 CT
66 CT
86480 TTTGTTTTGT
Statistics
Matches: 13292, Mismatches: 3363, Indels: 2633
0.69 0.17 0.14
Matches are distributed among these distances:
157 77 0.01
158 10 0.00
159 22 0.00
160 15 0.00
161 14 0.00
162 41 0.00
163 53 0.00
164 72 0.01
165 49 0.00
166 79 0.01
167 60 0.00
168 38 0.00
169 63 0.00
170 14 0.00
171 23 0.00
172 28 0.00
173 128 0.01
174 280 0.02
175 343 0.03
176 717 0.05
177 1184 0.09
178 691 0.05
179 627 0.05
180 2769 0.21
181 2483 0.19
182 1341 0.10
183 389 0.03
184 220 0.02
185 112 0.01
186 55 0.00
187 30 0.00
188 34 0.00
189 61 0.00
190 23 0.00
191 51 0.00
192 174 0.01
193 63 0.00
194 155 0.01
195 46 0.00
196 34 0.00
197 36 0.00
198 55 0.00
199 77 0.01
200 50 0.00
201 51 0.00
202 52 0.00
203 43 0.00
204 58 0.00
205 37 0.00
206 34 0.00
207 29 0.00
208 24 0.00
209 14 0.00
210 14 0.00
211 23 0.00
212 11 0.00
213 7 0.00
214 1 0.00
215 3 0.00
216 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGTTATGA
CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
TATTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
Found at i:71094 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 70766--90146 Score: 4966
Period size: 181 Copynumber: 107.2 Consensus size: 180
70756 ATTTAGTAAT
* * * * ** * *
70766 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTAAAAAATTTAATAAACAAAAAATTTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * *
70830 AAAAAATAATTATGTTTA-CTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTT
64 -AAAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
70894 AAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* ** * * * * *
70948 GCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTGATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATATAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
71013 AAATAAATCAATTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAATTTTGTATTTCAAA
66 AAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* *
71078 TCATTATGAACTTTTGTTTTGT-ATAAAACAATT-TCTTTTCATT-ATACAA
131 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-ATTCATACAA
* ** * * * *
71127 GCCTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTATTATTATTTCAAAAACTAATAAGTAGGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
** * * *
71191 AAAATAAATCGGTTTACCG-ATC----C--A-A--T-TCA-TATTTGAACAATTATATATTTCAA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * ** *
71244 ATCATTATAACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTAAATTCATATAA
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
71295 GCTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * * * *
71360 AAAATAAATCTATTTGTTGAAGT-AGTTCAAACAATTAAGACCATATGAACAATTATCTATATCA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAA-TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * *
71424 AATCATTATGACCTTTTGTTTCGTCATAAAATAATTTTTTC-ATTTCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * ** *
71476 GTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAGA-AAAAAAGTGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * * ** *** *
71539 AAAAGTGAATCTGTTTACCAAATCAGGTCAAATAATTATGGCCCTACCAATAATTATCTATTTCA
65 AAAA-TAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * *
71604 AAT-GTTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAATAATTTTTTTTGA-ACATTCAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * *
71655 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * ** *
71720 AAAATAAATCTATTAATTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGGACAATTGTAAACTTCA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * *
71784 AATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * **
71836 GCTTATTCT--AAAAAAATAATACTAATCTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACAAAGAGAATT
1 GCTTATT-TGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAG-ATT
* * * * * * * *
71898 AAAAAATAAATTTTTTTGTCGAACCAGTTCAAATATTTAAT-ACTATATGAACAATTATTTATTT
63 TAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * *
71962 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAATAAGTTTTTTTTTTAAATCATACTA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA---TTGTTTCT-ATTCATACAA
* * *
72020 GCTTATTTGGAATAAAATAA-ATGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * *
72084 AAA-ATAAT-TATGTTGA-CTTAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTTAACAATTATCTATTT
66 AAATA-AATCTAT-TT-ATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
72146 CAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** ** ** *** * * *
72200 ATTTATTCAGAATAAGGTAAGGCTATTTTATTGATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTCA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * *
72261 AAAATAAAATCTATTTATC-AATCTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTC
65 AAAAT-AAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * ** * * * *
72325 AAATCGTTATGACTTTTTGTTCTATTTTAAAATAACTGTTTCTGTTTATACAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * ** * * *
72378 GCTTA-TCCGAATAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAA-TTAGAAAATTT
1 GCTTATTTGGAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGATTT
* * * * * * ** *
72441 AAAACATGAATATGTTTA-CCAAACTAGATCAAATATGTTTACCAAACTATTTGAATAATTATCT
64 AAAA-ATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATA-G-TTA--TGACTATTTGAACAATTATCT
* * * *
72505 ATTTCAAATTATTATGTATC-TTT-TTTTGTCATAAAA-AATTATTTC-AGTTCATATAA
123 ATTTCAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * *
72561 ACTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-ATCTAAAAATTAATAA-TAAAGATATTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT
* * * * ** * * * *
72624 AGAAAATGAATTTGTTTAT-G-AT-TGTTTGAACAGTTAT--CTATTTGAAATCACTATAACCTT
64 A-AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-AA-CA--ATTATCTA
*** * * ** * * * ** ** * *
72684 TTGTCTTGTCATAAAATAATATTTT-CTAT-TCATAAAAGCCCATTTCGAATGAAATAATACACA
124 TT-TCAAATCAT--TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA---CAATT-GTTTCTATTCATACA-A
* *** * * * * * * * * * * *
72747 -TTTATTACTATTAAGATAATGAATAA-GTA-AAAGATTTTAAAAA--AATAAAT-A-TGTTTTC
1 GCTTATTTGGAATAAAATAAT-ATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * ** * * * * *
72805 CAAACAAATTCAAATCGTTAT-GACTATTAGAGCAATTATTTATTTTAACT-TGTGATGAC-CTT
65 AAAATAAA-TC-TAT--TTATCGA--ATCAGTTCAAATAGTTA---TGACTATTTGA--ACAATT
* * * * ** * ** * * * * *
72867 -T-TGTTT-TAA-CA-TA-AAACAATTGTTTCTGTTCATACAA-GGTT-ATTCAGATTAAAATAA
119 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TG-TCATAAAACAATTGTTTC-TATTCATACAA
** * * * * * * ** *
72924 TATTAATTT--ATTAATATTTCGATAATTAA-TAAGTAAATGATTT--AAAA--AACACCT-A-T
1 GCTT-ATTTGGAATAA-A-AT-AAT-ATTAATTTA-TTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * ** * ** * *
72980 G-TTTATCAAACAAGTTTAAATAGTCATGACT-A-TTTGAATAATTATG--TATTTCAA-ATCAT
59 GATTTA-AAAATAAATCTATTTA-TC--GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA--AT
*** * ** * * * * ** *
73039 TATGACCT-TTTCTTTTGTAATTAAAACAATTAT-TTTTGTTCATATAATC--TTATTTGAAGT-
118 TAT---CTATTTC--AAATCATTATGAC-CTTTTGTTTTG-TCATA-AAACAATTGTTTCTATTC
73099 A-A-AA
175 ATACAA
* ** * ** *
73103 --TAATATT--AATTTATTAATATTTCAA-AAATTAATGA-GT-AAGAGAATTAA-AA--AA-A-
1 GCTTAT-TTGGAATAAAATAATA-TT-AATTTATTAAT-ATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAG
* * * ** *
73156 ATTT----GT---TC-A-CTA---AATAAGTTCAAATAGTTATGACTACCTGAATAATTATCTAT
60 ATTTAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
73209 TTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTACTCATGCAA
125 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
73265 GTTTATTTTGAATATAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* *
73328 AAAAATAAATCTATTT-TCTTAA-CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT
64 AAAAATAAATCTATTTATC-GAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * *
73391 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
73445 GCTTATTTGAAATAAAATAAT-TCTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* *
73509 AAAAATAAATCTGTTTA-C----C-G-------AG--A-GACTATTTGAACAATTTTCTATTTCA
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * *
73558 AA-CTATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATTCAA
129 AATC-ATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* *** * * * * ** *
73611 GTTTATTCAAAATAGAATAATACTAAATTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTGGAAATTTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-
* * ** * *
73676 AAAAATAAATTTGTTTGCCAAAT-AGTTCAAATAGTTGA-GACTATTAGAACAATTATCTATTTC
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
*** * ** * * * *
73739 AAATTGCTCTGACCTTTCATTTAGTCATGAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAT
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
*** * * * ** *
73792 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTTACA-TTCAAAAAATTAATAAACAAGAAATTTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * * * *
73856 AAAAAATAATTATGTTTATTGAA-CAATTTAAAATACTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
64 -AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
73920 AAAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
**** * * * * *
73974 GCTTATCCAAAATAAAATAATCTTAATTTATCAATATTTC-AAATTTGATAAGTTAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
74038 AAACTAAGTC-AGTTTATCGAATCGGTTCAAATAATTATGGCCAATTCAACAATTATGTATTTCA
66 AAA-TAAATCTA-TTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * **
74102 AATCGTTATGAACTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGCTTT-TCGTCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAA
* * *
74154 GCGTT-TTTAGAATAAAATACTACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AGTAGATTT
1 GC-TTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGA--T
*
74217 TTAAAAA-AAAT-T-TGTT-T---A-C----C--A-A-TTCT---TATTTGAACAATTATCTATT
62 TTAAAAATAAATCTAT-TTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * * * * * *
74263 TCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTTCAATTCATATAC
126 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
74318 GCTTATTTGGAATAAAAT-AGACTAATTTAATAATA-TTCAAAAAATTAATAACTAAGAGATTCG
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT-T
* * * * * * *
74381 AAAAATAAATCTGTCTA-CTGAAGCAGTTCAAATAATTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTC
64 AAAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * **
74445 AAATCA-T-T-ACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTT-T-TGAATAGTCAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA--CAA
* * * *
74495 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * * * * *
74560 AAGATAAATTTGTTTA-CTAAACCGGTTCAAATAATTATGGCCT-TATCAGCAACTATCTATTTG
66 AA-ATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
74623 AAATCGTTATTACCTTTTGTTTCGTCATATAATAATT-TTTTTAAAT-ATTCAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* *** * *
74675 ACTTATTCAAAATAAAATAATACTT-ATTTATTAATTTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGACTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * * **
74739 AAAAATAAATCTATTTA-CTACA-CTAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTGT-AAACT
64 AAAAATAAATCTATTTATCGA-ATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * * *
74801 CAAATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAATTATTTTTGTTCATACAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
74855 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTA
* * * * * * *
74920 AAAATAAATTTATTTATCGAACCAGTTCAAATATTTAAGATTATATGAACAATTATTTATTTCAA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * *
74985 ATCGTTATGACCTTTT-TTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTAATTCATACTA
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT-ATTCATACAA
*
75036 GCTTATTTGGAATAAAATAA-ATGAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * *
75096 AAAATAATTCTATTTACCTAA-CTAATTCAAATAATGATGACTATTTTG-ACAATTATCTATTTC
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * * *
75159 AAATTGTTATAACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * ** * * * *
75212 GTTTAATCAGAATAAGATAAAACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--AA-A-ATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * *
75273 AAAATAAATCTATTTATC-AATCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCCATTAT-TCATTTT
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTC
* ** * * ** * * * *
75336 AAATTATTATGATTTTTTGTTCTATTTTAAAATAGTTCTTTCTATTCATAAAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * ** * *
75389 GCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATGATTAATAAGTAAAAGGTTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * *
75454 AAACTACATATATTTACCGAA-CAAGTACAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
66 AAA-TAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
75518 AATTATTATGACCTTTTCTTTTGTAAT-TAA-AATTTTTTTTAAATTCATATAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT--ATTCATACAA
* * * **
75570 GCTTATTT-GAAGTAAAA-AATATTAATTTATTAATATTCCAAAAGTTAATGAGTAAGAGAAATA
1 GCTTATTTGGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
75633 GAAAA-AGAATATGTTTACCGAATAAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
65 -AAAATA-AATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * *
75696 AAAACATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGATTT-TATTCATTCAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAA
* * * * * *
75749 GTTTATTTCGATTAAAATAAT-TTAAATATATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * *
75811 AAAATATATATTTGTTTTTTC-AA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
65 AAAATA-A-ATCT-ATTTATCGAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * ** * * *
75874 TCAAATCATTATGAGCTTTTATTTTATCATAAGCCAATTGTTTCTGTGCATAAAA
126 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * * * *
75929 G-TATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTGTTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTA
1 GCT-TATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * ** *
75993 AAAAATAAATCTATTT-T--ATTCA-TACAAGT--TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT-
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTA-T-G-ACT-ATTTGA-AC-AA-TTATC
* *** *** ***
76051 TAATATTCTAAA-AATTA--AAAGTTTGAGAT-T--TAAAA-AA-TAAATCTATT--TACCGAA
122 T-AT-TTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-C-AA
* * ** * ** * * * **
76105 -C-AAGTTCAAATAATCAT-ATCCATTCAAACTATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACATTTTG
1 GCTTATTTGGAATAA-AATAAT--ATT-AATTTATTA-ATATTTCAAA-AATTAAT-A-AGTAAG
*** * * * * * * ** *
76166 TTTTGTTGTAAAAT-AAT-TGTTT-T-TATTCA-TACAAA-A-TTAT-TC-AGAAT-AA-AATAA
58 AGAT-TT-AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTA
**** ** ** ** * ** ***
76220 TACTAATTT-ATTAAT-ATT-TGAAAAATTAATAAGAGATTTAAA-AGCTAAATCTATT--TACC
120 T-CT-ATTTCA--AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATA-C
76279 AA
179 AA
* * ** ** * * * * * ** *
76281 AC-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATCTTTGTTCATGTGAGCTTATTTAG
1 GCTTATTTGGAATA-AAAT-AATA-TT--A-ATTTAT-TA-ATAT-TTCA---AAAATTA-ATA-
* * * * * * * * *
76345 AGTGAA-ATATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAGTTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATAAA
52 AGT-AAGAGATT--TAAA--AATAA-A-TCT---A-TTTAT-CG-AATCAG-TTCAAATAGTTAT
* ** * * * * * ** ** *
76408 G-GTGGTTG--C--TGAACTAGTTCAAATAATTAAGA-CTAATG----G--A-AAAATTATCTAT
103 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGT
* * * *
76460 TTCAAATCATTCTGA
167 TTCTATTCATAC-AA
* * ** * * * * *
76475 CCTTTTGCTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCA-TACATGCTTATTTGAAATCAAATAATAC
1 GCTTAT--TT-GGAATAAAATAA---TATTAATTTATTA-A----TATTTCAAA--AATTAATA-
* * * * * * * * * * * ** *
76539 TATTTTAGTA-ACATT-CAAA-AAAT-TAATAAGCAAGAT-ATTTTAAAAAAATA-AATCTATTT
52 -A-GTAAG-AGA-TTTAAAAATAAATCTATTTATCGA-ATCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTT
** * * * * ** * *
76598 -TCCAA--AT-AAGTTCGAAT-AGTTATGA-CTATATGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATG
111 GAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCT-TTTG---TTTTGTC-A--T-AAAACAAT-TG
* *
76657 ACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA
166 ----TTT-CTAT-TCAT---ACAA
* ** * *
76681 TTGTTTCAGATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTAAAAAATT
1 --GCTT---AT--T-TG-G---------AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * * * *
76746 GAGAAGTTAGAGATTTAAAAAGTAAACCAATTTATTGAATCAATGCAAATAATTATGGCCATTTG
48 AATAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * * ** * * * *
76811 AACAATTATTTATTTGAAATCGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTA-TCAT
112 AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
*
76875 ATAA
177 ACAA
* * * * *
76879 GCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTCATCAGTAGGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* ** * * * * * *
76944 AAAATAAATATGCTTA-CTGAAT-AATTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGTATCTTTCA
65 AAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * ** * *
77007 AATTGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAA-T-TATGTA--CATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * ** * * * *
77055 GCTTATTCGGATTAAAATAATACAAATATAATAATATTAT-GAAATTTAATATA-TAAGAGATTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATA-AGTAAGAGATTT
* * * * * * * * *
77118 AAAAAATAAATTTGTTT-GCTGAACCAATTCAAATAGTTAAGCCTATATGAAAAATTATCTATTT
64 -AAAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
77182 CAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTTTGTTCATATAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * *
77234 ATTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATGAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * * * ** * *
77295 AAAATAAA-CTGTTTACCAAACCAATTCAATTAGTTATAAGAATTTGAATAATTATTTATTTCAA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* *
77359 ATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTGATAC-A
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
*** * ** * *
77409 GTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTATTATTA-TTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTT
1 G-CTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * *** * * * *
77473 AAAAAATGAATCTCTTGGCCTAA-CTAGTAT-AAATAGTTATAACTGTTTGAATAATTATCTATT
64 -AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * *
77536 TCAAATTGTTATGA--TATTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAA
126 TCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * *
77590 GCTTGCTTGGAATAACATAAT-TTAATTTATTAATAGTCCAAAAAATAATAAGT---A-ATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * *
77650 AAACTGAATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGTATAATTACCTATTTCAA
66 AAA-TAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
77715 ATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTCTATTCATACAA
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
77765 GCTTATTT-CAATTAAAATAAT-TAATATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAATAAGCGATT
1 GCTTATTTGGAA-TAAAATAATATTA-ATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
77827 TAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAATTCAAATAGTAATGAGTATTTGAACAATTATTTATTT
63 T-AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* *
77892 CAAATCATTATGA-CTTCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAA
127 CAAATCATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * *
77946 GCTTA-TTCGAATCAAAGTAATATTGATTTATTAATACTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTT
1 GCTTATTTGGAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * * * * *
78010 TAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAACTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
*** ** * * *
78074 AAATCATTATGACCTTTTG-TTTAAAATATGA-ATTTG-TT-TA-CCAAACAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * ** ** *** *
78122 GCTCA-----AATAATTATGACTATTTGAA-CAATT-ATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTCA
1 GCTTATTTGGAATAA-AAT-AATA-TT-AATTTATTAAT--ATTTCAAA-AATTA--ATAAGTAA
*** * * * * ** *
78180 -TTTTTTCTAAAATAATTGTTTCTATTCATAC-AAGCTTA-TTCTAAATA-AAAT-A--ATAT-A
57 GAGATTT-AAAAATAA----ATCTATTTAT-CGAA--TCAGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGA
* * ** ***** * *
78237 A-ATTTAT-TAATATTCTAAA-AATTAAT-A-AGTAAAAATT-T-AAAAAATAAATATGCTTTCT
113 ACAATTATCT-AT-TTC-AAATCATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAAT-TG-TTTCT
* *
78295 GA-ACACGTTTAAATA
171 -ATTCA----TACA-A
* * * * * *
78310 GTTATGACTATTTGAACAATTATCAAT-TTCAAATAGTTATGACCTATTGTTTTGTCATAAACTA
1 GCT-T-A-T-TTGGAATAA-AAT-AATATT--AAT--TTAT----TA--ATATT-TC--AAA--A
* ** * ** * *
78374 ATTATTTCTGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTAT-TAAT-A-TGTAAAA
45 ATTA-ATAAG-T-A-A-GAG-AT-TTAAAAAT-AAAT----CT-ATTTATCGAATCAGT-TCAAA
* * * * ** * * *
78436 AATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATACTT-ATAA-CTATT-TGA-ATAATT
96 TA-GTT----ATGACTA---TT-T-GAACAA-TT-ATCTATTTCA-AATC-ATTATGACCT-TTT
* * * * * *
78497 ATTTATTTCAAAAAATTATGATCTTTGGTTTTCT-TGTAAAACAA
146 GTTT-TGTCATAAAA-CA--A---TT-G-TTTCTAT-TCATACAA
* * * * * * * * * * *
78541 --TCATTT---CT--ATTCATA-CAAGTTTATTCAGA-ATAAAATAATACTAATTTA-TTA-AGA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAA-TTTATTAATATTTCAAA-AAT--TAA-TAAGTAAGAGA
* ** * * * * * *
78595 TTCTAAAAATTAA--TAGGTA--GAA-GA-TTTAAA-AGGTA-AATCTATTTACCAAACAAGT-T
61 TT-TAAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTT---GAACAATTAT
* * ** * * ** * * **
78651 CAAATAGTCATGTCCATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT-TA-TC
121 C-TAT-TTCAAAT-CATTATG-AC-CTT-T-TGTTT--TGTCA-TA-AAACAATTGTTTCTATTC
78713 ATA-AA
175 ATACAA
* ** * ** * * *
78718 ACAATTATTTTTGTTCATGCAAAGT--TATTCAAAATAAAATAATATCGATCTATTAATATTTTG
1 GC--TTA--TTTG-GAAT--AAAATAATATT---AATTTATTAATAT--TTC-A--AA-A-ATT-
* * *
78781 AAAATTAA-TAA-AAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAAT-AGTTCAAATAGTTATGAGT
48 --AA-TAAGTAAGAGA-TTT-AAAAATAAATCTATTTATCG-AATCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *** * *
78843 ATTTGGACAAATATCTATAAAAAATCATTATGA-----TGTTTTGTCAAAAAACAATTGTTTCTT
107 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
*
78903 TTCATACAG
172 TTCATACAA
* * * * *
78912 GCTT-TTTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTT
1 GCTTATTTGGAA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * ** * * *
78976 AAAAATAAATATTTTTACCGAA-CTAGTTCAAATAATTAAAATTAATAGAACAATTATCTATTTC
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * *
79040 AAATCGTTCT-ATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTTATAAAA
128 AAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* *** * * ** *
79093 GTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAGCA-TTCAAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * * *
79157 AAAGAATATATCTGTTTATCGAATAAATTCAAACAGATT-TGACCATTTTAAACAATTATCT-TT
64 AAA-AATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAG-TTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATT
** * *
79220 TCAAAGTTGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAA
126 TCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * * *
79276 ACTTATCTGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGACATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
79337 AAACTAAAGT-TGTTTTTTGAA-CTAGTTCCAATAGTTATGACTATTTCAACAAATGT-TAATGT
66 AAA-TAAA-TCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTT
* * * * *
79399 CAAATCATTGTGATCTTCT-TTTTCTCATAATACAATTGTTTCTGA-TCATA-AGA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA-A
* ** * * *
79452 GCTTATTTAG-ATAAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGA-CTTAA
1 GCTTATTTGGAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* ** * * * * * *
79513 AAAATAAA-CATGTTTGCCGAA-CTTGTTCAAATATTTAAGTCTATTAGAATAATTATCTATTTC
65 AAAATAAATC-TATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * * *
79576 AAATCGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTT-TAGTTCATTCAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * *
79629 GCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * *
79693 GAAAAATAAATCTATCTA-CCAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTT
64 -AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * *
79757 AAAAGCATTATGACCATTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
**** * *
79810 GCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * *
79875 AAAATAAAT-TAGTTTATCGAATCGGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTTC
65 AAAATAAATCTA-TTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTTC
** * * * *
79939 AAATTGTTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * * * *
79992 GCTTATTCGTAACACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * *
80053 AAAATAAATTTGTTTA-CTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * * * *
80117 AATTGTTATAACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTTATATAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
80169 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * ** * * *
80233 AAAAATAAATTTATTTA-CTGAATCAGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATTATTTATTTT
64 AAAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * ** * *
80297 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTCTTTAAACTCATAGAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
80350 GCTTATTTGAAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAG
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-
* * * * * * *
80415 AAAATAATTCTATTTGTTGAACCAGTTCAAATA-TTATAACTATTTGAATAATTATCTGTTTCAA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * *
80479 ATCATTATTACTTTTTGTTTTATC-TGAAAATAATTGTTTTTGTTAATATAA
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * *
80530 G-TT-TGTTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATTAGTAAGAGATTT
1 GCTTAT-TTGG-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
** * * * * * * * *
80593 AAAAAGTAAATCTGCTT-GCTAAACTA-TTAGAAATAATTTTAACTATTTGAATAATTATCTATT
64 AAAAA-TAAATCTATTTATCGAATC-AGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
80656 TCAAATCATTATAACCTTTT-ATTTG------AATAGTT-TTGACTGTTCATACTA
126 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTATTCATACAA
** *** * * * ** * *
80704 TTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTT
* * * * * * * ***
80768 AAAAATAAATCTAATTGTCAAACCTA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAGTGATTATCTATTTC
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * ** ** * * *
80832 AAAT-AGTTATGACCTTTTCTTTTATTGTGGAACAATTGTTT-TGTTCTTATAA
128 AAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * ** * *
80884 GCTTATTTAGATTAAAATAATGCTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * ** ** * * * *
80949 AAAATAAATTTATTTACCAAATCAGGTCAAAT-GCTTAAAACTATTAAAATAATAATATATTGCA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
81013 AAT-AGTTATGACATTTTGCTTAGCCATAAAACAACTATTTCAATTCATACAA
129 AATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * *
81065 GCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAACTAATAAGAAAGAGATTTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * * * * * *
81129 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAATAAGTTTAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTA
64 -AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * *
81194 AAATTGTTATAACCTTTTGATTTT-TCATAAAGCATTTGTTTC-AGCTAATACGA
128 AAATCATTATGACCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
** ** * * *
81247 GCTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAGTAAGTATGAAATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * ** * *
81312 AAAATAACTCTATTTA-CTAAATCAGTT-AAATACTTATGGCCATTTGAATGATTATCTACTACA
65 AAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* *
81375 AATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * *
81427 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * *
81492 AAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGGTT-AAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTC
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTC
** * * * *
81555 AAATCATTAAAATC-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAATCATATAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
81607 GCTTA-TT-CAATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTGT-GAAAATTAAT-AGATAAGTGAT
1 GCTTATTTGGAA-T-AAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG-TAAGAGAT
* * ** * * * * ** *
81668 TTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAAATTGTTAAAACTATTAT-AATAATTATCTA
62 TT-AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAG-TTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTATCTA
*** * * * * * * *
81732 TTTCAAATTGGTCTGACCTCTTGTTTAGTCATAAAATACTTGTTTC-ATATCTTATAA
124 TTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAA
* * * * * * * *
81789 GCTTATTCGAAATAAAATAATCTAAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATTAGCAAAAGATTTG
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * * * *
81853 AAACAATAAATCTGTTTA-CCAAACAAGTTAAAATAGTTATTACTGTTTGAATAATTATTTATTT
64 AAA-AATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
81917 AAAATCGTTATTACCTTTAGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
*** * * * *
81971 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAG-GGTTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--
* * * * * *
82035 AAAAATAAATTTGTTTA-CTGAA-CAAATTCAAGTAGTTACGACTATTTGAACAATTGTCTATTT
64 AAAAATAAATCTATTTATC-GAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* ** * * *
82098 AAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATACAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * *
82152 GCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT---T-AGTGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * *
82213 AAAGTGAATTTGTTTA-CTAAATCAATGCAAATAATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTC
66 AAA-TAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
82276 AAATCGTTATTA-CTTTTGGTTTGGTTATAAAATAATTGTTTTTTTTTCATACAA
128 AAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAA
* * * *
82330 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * *
82391 AAAATAAATCTATTTA-CTGAA-CTAATTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTGTATACTTT
65 AAAATAAATCTATTTATC-GAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTT
** * * * * * *
82454 -AAATTGTTATAACCTTTTGTTATGTCATGAAGCAATTATTTTTATTCATACAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* *** ** * * * * *
82507 GTTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATCTAATAA-AATTCAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * * * *
82571 AAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAGATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCA
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-
* * * * * * * *
82636 AAAT-GTTATGACCCTTTATTTTGTCATAAAATAATTTTTTCAACTCATAGAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
82688 GCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAG
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA-
* * * * * *
82753 AAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAGCAA
65 AAAATAA----A--T------CTA-TTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
82818 TTATTTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTTTCATAAAACATTTGTTTTTCAAT-ATACAA
117 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * * * * * * **
82882 GCCTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATATTTC-AAATTGTTACAAGTAGGAGATCAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGAT-TT
* * * * *
82946 AAAAATAAATTTATTTATCGAACCAGTTCAAATAGCTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCA
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * *
83011 AATTGTTTTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * ** * *
83063 GCTTATTCGAAATAAAATGATACTAATCTAATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAATTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTA
* * * * * * ** *
83128 AAAATAAA-CAATTGT-T----TTAGTTCATAAAAGCCTAT-CCAAAAT-AA-AATAATGCTACT
65 AAAATAAATCTATT-TATCGAATCAGTTCA-AATAG-TTATGACTATTTGAACAATTAT-CTA-T
* ** * * * * *
83184 TT-AGTAAT-ATTTTGAAAATTGATAAGTAAAATATT-T-AAAAAATAAATCAGTTTATTGAATC
125 TTCA--AATCATTATG-ACCTT--T-TGT----T-TTGTCATAAAA-CAAT---TGT-TT--CT-
*
83245 AGTTCAAATAATTATA
171 A-TTC--AT-A-CA-A
* *
83261 GC-TATTT-GAA-AAAATATCTATTTCAAATCGTTATTAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
1 GCTTATTTGGAATAAAATA-ATA-TT--AAT--TTATTAA------TATT-TC---AAA-AA---
** * * * * **
83323 TTTTTCAACTTACA-AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCAAGAATTAC
46 TTAAT-AA-GTA-AGAG---ATT-TAAA-AATA-AAT-CT-ATTTATCGA-A--TC-AG--TT-C
* * ** * *** * *
83387 TAAGAGATTAAAAAAATAAATTTG-TTTATTGGA-CTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGAACA
93 AAATAG-TT--ATGACT--ATTTGAACAATT--ATCTA-TTTCAA-A-TCAT---TA--TG-AC-
* * * **
83450 ATTATCTATTTCAAATTGTCAT-AACCTTTTGTTT-TA-TCATA-AA
141 CTT-T-T-GTT----TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* ** * * * ** * * ** * *
83493 ACATTTATTTTTATTCATATAAGCTT-ATTCA-GAATA--AAATAAAATTAATTTAGT-A-ATAT
1 GC--TTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAA-TAAGTAAGAGAT
* *** * * * * * * * ** *
83552 TCTAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-GATTTGCTA-AACTAGTTCAAACAGT
62 T-TAAAAA-TAA-ATCT-----ATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAAT
* * * * **** * * * ** *
83615 TAAAACTATAT-GAA-CAATTATTTA--TTTCAAATTGTTAT-GACCTTTTGTTT-T-GTCATA-
118 T--ATCTATTTCAAATC-ATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
83672 AA
179 AA
* * * * * * * * * *
83674 ACAATTATTT-CAGCT--TAT-AGA-T-GTTTATTCAA-A-AT--AGAA-TGA-AAGTAAAAGAT
1 GC--TTATTTGGA-ATAAAATAATATTAATTTATT-AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
83727 TTAAAAAATAATTCTATTTA-CTAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTAT
62 TT-AAAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
** * * * * * * *
83791 TTCAAATTGTTATTA--TTTT-TTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTAATATAA
125 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * *** * *
83844 GTTTGTTCAAAATAAACTAATAATAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGAGATTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTT
* * ** ** * * * * * * *
83907 AAAAAGCAAATTTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAATAATTATCTATTTA
64 AAAAA-TAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
83972 AAATCGTTATAACCCTTT-TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** ** * * * * ** * *
84024 TTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTCAATAATA-TTCTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTT
** * * * * * *** *
84088 AAAAATAAATCTAAGTGTTGAA-CTAGTTGAAATAGTTAAGACTATATGAATGCTTATCTATATC
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * *
84152 AAATCATTATGA-CTTTT-TTTTTTCATTGTAAAACAATTATTT-TATTCATAGAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA---TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
84205 GCTTATTCGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * * * *
84270 AAAATAAATTTGTTTACCGAATCGGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
84335 ATCATTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAAAAATTGTTTC-AGTTCATACAA
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * ** * * * *
84386 GCTTGTTTAGAATAAATTCATACCAATTTA-TAA-ACGTTCAGATAA-TAGAAAAGAAAGAGACT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCA-AAAATTA-ATAAGTAAGAGA-T
* * *
84448 TAAAAAAATAAATCTATTCA-CTG-ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTA
62 T-TAAAAATAAATCTATTTATC-GAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * *
84511 TTT-AAATTTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATACAA
124 TTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * *
84568 GCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAGTAAGAAATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * ** * * *
84632 AAAAATAAATCTGTTTATCGAATCATTTAAAATAATTAAGACTATTTGAATGATCATTTATTTGA
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* *
84697 AATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
* * * * *
84748 GCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATAATTAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * *
84813 AAAATAAATCCATTTATTG--T-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCAATCTCAA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
84875 ATCTTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTCTAATCATAGAA
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * *
84925 ACTTATTCGG-TTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAA--AGTAA-TAAGAGATTTA
1 GCTTATTTGGAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* ** * * * ** * * * *
84985 AAAAATAAATGTGCTTGT-GAAACCAATTCAAATAGTTAAAACCACTAGAATAATTATCTATTTC
64 AAAAATAAATCTATTTATCG-AATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * * * * * *
85049 AAATTGTTCTCATCATTTGTTTAGTCATAAAAC-ATTTTTTTTATATCTTACAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAA
* *** * * * * * *
85102 GCTTATTTAGAATAAAATAATCCAAATTTAATAACATTTGAAAAATTAATAAGCAAAATATTTGA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--
* * * *
85167 AAAAATAAATCTATTTA-CTGAA-CAAGTTTAAATAGTTATAAATATTTGAACAATTATTTATTT
64 AAAAATAAATCTATTTATC-GAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * *
85230 AAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGACATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
**** * *
85284 GCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-TTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--
* * * * * *
85348 AAAAATTAATTTGTTTATC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACCA-TTGAACAATTGA-CTATTT
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTT
* *
85410 AAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
*** * * * * *
85464 GCTTATTCAAAATAAAAT-A-A-TAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGGAAGTGTTTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * * * **
85526 AAAGTGATTCTATTTATTGAATAAGTTCAAATA-TGATGGCTATTTCAATAATTATCTATTTGGA
66 AAA-TAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * *
85590 ATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATACAA
130 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAA
*** *
85641 GCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT
* * * * * * * * *
85705 AAAAATAAATCTATTTATTGAACCCA-TTGAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTGTATAATTC
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAA-TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * * *
85769 AAATCAATTATTTAAAAAATAAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATTCAA
128 AAATC----A-TT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * * *
85833 ACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATACTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
85898 ATAATAAATTTGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATAATTATCTATTTCA
66 A-AATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *
85962 AATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATACTA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
86014 GCTTATTCAGAAATAAAATAAAATAAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
1 GCTTATT-TGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * ** * * * * * * *
86079 AAAAGTAATTTTGCTTACCTAACCAGTTCAAATAATTATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCA
65 AAAA-TAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** ** * * * *
86144 AATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTGATATAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAA
* * * *
86196 GACTGTA--TAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGATATTT
1 G-CT-TATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * *
86255 AAGAAATAAATCTTTTTATC-AATCCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
64 AA-AAATAAATCTATTTATCGAAT-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * *
86319 CAAATTGTTATGA-CTTTTTTTTTATATATAAAACAATAGTTTCTATTCATACGAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-AA
* * * * *
86374 -CTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTA
* * * * * **
86438 AAAATAAATATGTTTACCGAA-CTAGATT-AAATAGTCATGACTTTTGTTTTGTCATA-AAAAAT
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATC-AG-TTCAAATAGTTATGAC---T-ATTTG--A-ACAATTAT
* * * * **** *** * *
86500 -TATTTC-AATTAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAT-TATTC-TA-AA
121 CTATTTCAAATCATTATGACCTT-TT-GTTTTGTCATAAAAC-AA-TTGTT-TCTATTCATACAA
** * * * *
86560 AATTAATAATTAAGAGATTTAAAA-AATA--AATTTGTT--TA--TCGAACAAGTTTAAATAATT
1 GCTT-AT--TT--G-GA-ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AA-AA-ATT-AATAAGT
* * * * * * * **
86618 ATGACTATTTGAACAAT-TATCTA-TT-T-GAAAT-AGCTAT-AAGCATTTGTTTTGTC-A-TAA
55 AAGA-GATTT-AAAAATAAATCTATTTATCG-AATCAG-T-TCAA--A-TAGTTATGACTATTTG
* * * * * * ***
86675 AATAATT-TCTTTTGTC-CATACA--A-G--C--TTATTTTG-AATAAAATAATACAAATT-TAT
112 AACAATTATCTATT-TCAAAT-CATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT--TGTTTCTAT
* *
86729 TAATATTAA
173 TCATA-CAA
* * * ** ** *** * *
86738 GAC--AATT--AAT-AAGTAA-A--AGATTTA--AAAAAAT-AAATCTGT-ATACCAAATAAATT
1 G-CTTATTTGGAATAAAATAATATTA-ATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGTAAGAGATT
* * * * * * * ** *
86791 CAAATCAT-TATGACTATTTGAACGATTATCGATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG---TTTTGT
63 TAAA-AATAAAT--CTATTT-ATCGA--ATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * * * *
86852 C-A--TAAAAAAATTAT----TTTTG---T-TCATACAAGC--TT-ATTCAAATTAAAATAA
121 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTC-TATTCATACAA
** * * * * ** **
86900 TATTATTT--TAT-TAAT-ATTTTGA-CAATTAATAAGT-AAAAGATT--T-AG-AA-AG---T-
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
86950 -AAAT--A--TGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *
87009 AATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATATAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
* * * * *
87061 GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAGTAAGAGAATTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATT-T
* * * * * * ***
87126 AAAAATGAATTTGTTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATTGTTATCTATTTC
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * **
87190 AAAACATTATTACCTTTTGTTTTGCCATTAAACAATTGGTTT-TGCTCATACAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAA
** * * * *
87243 GCTTATTTTAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTA
* * * * * * * *
87307 AAAATAAATTTGTTT-TCTAAGCGGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATTGCAA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * *
87371 ATCGTTATGA-CTATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTATTCATACAA
130 ATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * ** * *
87422 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATACTAAAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* *
87487 AAAATAAATCTATTTA-CTG-AGCTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
65 AAAATAAATCTATTTATC-GAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * *
87550 AAATTGTTATGATCTTTTATTTGGTAATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* *** * **
87603 GTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * * * * *
87667 AAAAATAAATCTATTTACCGACTAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCA
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
87732 AATTATTATGACATTTTTTTTTAT-AGTAAAACAATTATTTCTTTTCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** ** ** * *
87784 AATTATTCAGAATAAAATAATACCAATTTATCACTATTTCAAAAATTAAT-A-T--G-GATTTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * * *
87844 AAATAAATGTATTT-GCTGAA-CTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAAATTATGC-ATT
66 AAATAAATCTATTTATC-GAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC--AATTAT-CTATT
* * * *
87906 TCAAATAAGTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAT
126 TCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAA
*** * ** * * * * * *
87961 GCTTATTAAAAATATAGCAATACTAATTTATTTACA-TTCAAAATTTTAATAAGCAAGAAATTTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAGAGA--TT
* * * * *
88025 TAAAAAATAAAAT-TTTTTATCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
63 T-AAAAAT-AAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * *
88089 TAAAATCACTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAAATTGTTT-TCGTGCATAAAA
126 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCT-ATTCATACAA
**** * * * * * *
88145 GCTTATCCAAAATAAAATAATATCACTTTATTAATATTTCCAAAATTGATAAGTGAGAGATTTCC
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-A
* * * * * * * *
88210 AAAATCAATC-AGTTTATCAAATCAATTAAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATTTATTTCA
65 AAAATAAATCTA-TTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * *
88274 AATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAACACAATTGTTTTCCA-TCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAA
* *** * * *
88326 GCCTATTCAAAATAAAATAAT-TCTAATTTACTGATATTTCATAAATTAATAAGTAAGAGA-TT-
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * * *
88388 ---AT---T-TGTTTA-CCAAACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATATATTTCA
65 AAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * *
88445 AATTGTTATAACC-TTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* *** * * * * *
88496 GTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAA-AAATTTT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGA--TT
* * * * * * * * * * * *
88559 TAAAAATAAATTTGTTTGTC-AAACTAGTTCAAACAATGAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTT
63 TAAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* **
88623 CAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAA---TTT-T-TT--T---A
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * *
88667 G-TT-CTTAGTATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATA-TTAA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
* * * *
88729 AAAAATAAT-TATGTT-TGCCAAGCCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-TTT
66 AAATA-AATCTAT-TTAT-CGAA-TCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * *
88791 CCAAATCGTTATGA-CATTTGTTTTGTCATAAAATAGA-TGTTTTTGTTCATATAA
127 -CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-ATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
88845 G-TTGGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTACTATATT-GAAAATTAAGAAGTAAGAAATTT
1 GCTT-ATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * * *
88908 AAAAAATAAATTTATTTA-CTAAACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTTAACAATTATGTATTT
64 -AAAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * *
88972 CAAATCGTTATAATCATATGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTGTCCATGC-A
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** * * * * *
89025 GTCTTATTCAGAATAAAATGATACTATTTTATTAATA-TTCTAAAAATCAATAAGTAACAGATTG
1 G-CTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATT-
* * * * ** * * * * *
89089 AAAAAATGAATTTGTTGGCTTGACT-AATGCAAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCTATTT
63 TAAAAATAAATCTATT-TATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** * * * * * * *
89153 CAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCACAAAATAATTGTTTTTGTTCGTACAA
127 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * * *
89207 GCTTATTCGAAATAACAT-ATTTCTACTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAGATATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * * ** * *
89271 AAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAATTCAAATAGTTATGACTAACTAAACAATTATCTATTTT
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
** * * * *
89335 AAATCGCTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCTAATCATACAA
128 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* ** * ** * * *
89388 GCCTATTTCCAATAAAATTATACAAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAGGTAAAAGATTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-
* * * *
89452 AAAAATAAATCTTTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCA
64 AAAAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *
89517 AATCATTATGACATTTTGTTTGGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAA
129 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* *
89569 GCTTAATATT--AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTT
1 GCTT-AT-TTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
* * *
89631 TAAAAATAAATCTATTT-TCTAAACATGTTCAAATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
63 TAAAAATAAATCTATTTATCGAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* ** * ** * *
89695 CAAAT-AGTTATGACCTTTTCTTTTACCGTAAATTAATTGTTTTTGTTCATACAA
127 CAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
*** * * * *
89749 GCTTATTCAAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAATCCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTTA
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTA
* * * * * * *
89813 AAAATAAATTTGTTTA-CTGAGTAAGCTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA
65 AAAATAAATCTATTTATC-GAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
** * * * *
89877 AAT-ACTTATGTTCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATGTTCATACAA
129 AATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * *
89929 GTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGC--AAATTAATAGGT-AGGGTATT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-T-CAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATT
* * * * * *
89991 TAAAAAATAAATTTATTTATCGAA-CAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTTAACAATTACCTATT
63 T-AAAAATAAATCTATTTATCGAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
** * * * * *
90055 TCAAATTGTTATGACCCTTTGTCTTGTCGTAAAATAATTTTTTCTATTCATACAA
126 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
** *** * *
90110 AATTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATAT
1 GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATAT
90147 AATTAATAGA
Statistics
Matches: 14346, Mismatches: 3436, Indels: 2835
0.70 0.17 0.14
Matches are distributed among these distances:
146 20 0.00
147 1 0.00
149 8 0.00
150 5 0.00
152 9 0.00
154 1 0.00
155 2 0.00
156 6 0.00
157 3 0.00
158 8 0.00
159 21 0.00
160 10 0.00
161 27 0.00
162 30 0.00
163 75 0.01
164 102 0.01
165 71 0.00
166 109 0.01
167 107 0.01
168 94 0.01
169 188 0.01
170 99 0.01
171 77 0.01
172 30 0.00
173 58 0.00
174 220 0.02
175 272 0.02
176 658 0.05
177 1198 0.08
178 684 0.05
179 742 0.05
180 2744 0.19
181 3245 0.23
182 1458 0.10
183 374 0.03
184 239 0.02
185 145 0.01
186 51 0.00
187 39 0.00
188 29 0.00
189 34 0.00
190 20 0.00
191 59 0.00
192 167 0.01
193 35 0.00
194 144 0.01
195 27 0.00
196 20 0.00
197 30 0.00
198 36 0.00
199 28 0.00
200 22 0.00
201 20 0.00
202 8 0.00
203 14 0.00
204 18 0.00
205 15 0.00
206 10 0.00
207 22 0.00
208 31 0.00
209 16 0.00
210 5 0.00
211 24 0.00
212 28 0.00
213 13 0.00
214 19 0.00
215 15 0.00
216 17 0.00
217 12 0.00
218 14 0.00
219 6 0.00
220 5 0.00
221 12 0.00
222 2 0.00
223 2 0.00
224 3 0.00
225 6 0.00
226 5 0.00
227 6 0.00
228 9 0.00
229 6 0.00
230 4 0.00
231 9 0.00
232 7 0.00
233 4 0.00
235 16 0.00
236 12 0.00
237 5 0.00
238 2 0.00
240 4 0.00
241 10 0.00
242 2 0.00
243 3 0.00
244 2 0.00
245 3 0.00
246 1 0.00
248 10 0.00
249 7 0.00
250 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
GCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA
AAATAAATCTATTTATCGAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
Found at i:73664 original size:166 final size:166
Alignment explanation
Indices: 73367--73691 Score: 420
Period size: 166 Copynumber: 2.0 Consensus size: 166
73357 AAATAGTTAT
* * * *
73367 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAACCAATTGTT
1 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAACTATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTT
** * *
73432 TCTATTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAA
66 TCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTATTAAAATTCCAAAAATTAATAA
73497 G-T-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGA
131 GTTGAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGA
* * * *
73532 GACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAACTATTATGACCTTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGT
1 GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAACTATTATGACC-TTTTATTTTATCATAAAACAATTGT
** * * * **
73597 TTCTATTCATTCAAGTTTATTCAAAATAGAATAATACTAAATTATTAATATTTTAAAAATTAATA
65 TTCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTATTAAAATTCCAAAAATTAATA
* * *
73662 AGTTGGAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTT
130 AGTTGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTT
73692 GCCAAATAGT
Statistics
Matches: 135, Mismatches: 22, Indels: 4
0.84 0.14 0.02
Matches are distributed among these distances:
165 35 0.26
166 77 0.57
167 20 0.15
168 3 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.42
Consensus pattern (166 bp):
GACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAACTATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTT
TCTATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAATTATTAAAATTCCAAAAATTAATAA
GTTGAAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAGA
Found at i:73895 original size:27 final size:28
Alignment explanation
Indices: 73858--73911 Score: 74
Period size: 27 Copynumber: 2.0 Consensus size: 28
73848 GAAATTTTAA
**
73858 AAAATAATTATGTTTA-TTGAACAATTT
1 AAAATAATTATGACTATTTGAACAATTT
*
73885 AAAATACTTATGACTATTTGAACAATT
1 AAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
73912 ATCTATTTAA
Statistics
Matches: 23, Mismatches: 3, Indels: 1
0.85 0.11 0.04
Matches are distributed among these distances:
27 13 0.57
28 10 0.43
ACGTcount: A:0.44, C:0.07, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (28 bp):
AAAATAATTATGACTATTTGAACAATTT
Found at i:76087 original size:91 final size:91
Alignment explanation
Indices: 75922--76098 Score: 250
Period size: 91 Copynumber: 2.0 Consensus size: 91
75912 TGTTTCTGTG
*
75922 CATAAAAGTATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTGTTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA
1 CATAAAAGTATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA
75987 AATTTAAAAAATAAATCTATTTTATT
66 AATTTAAAAAATAAATCTATTTTATT
* * * * ***
76013 CATACAAGTTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAA-AAGTTTG
1 CATAAAAGTATATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAA
*
76076 AGATTTAAAAAATAAATCTATTT
65 AAATTTAAAAAATAAATCTATTT
76099 ACCGAACAAG
Statistics
Matches: 76, Mismatches: 9, Indels: 3
0.86 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
90 27 0.36
91 49 0.64
ACGTcount: A:0.51, C:0.07, G:0.05, T:0.37
Consensus pattern (91 bp):
CATAAAAGTATATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAA
AATTTAAAAAATAAATCTATTTTATT
Found at i:77263 original size:355 final size:355
Alignment explanation
Indices: 76366--78095 Score: 1428
Period size: 355 Copynumber: 4.8 Consensus size: 355
76356 GCTAAACTAA
* * ** * * *
76366 TAATATTCTAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAGGTGGTTGCTGAACTAGTTCAAA
1 TAATATTATAAAATTTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACCAATTCAAA
* * * * * * *
76431 TAATTAAGACTAATGGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTCTGACCTTTTGCTTAGTCATAAAAT
65 TAGTTAAGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * *
76496 AATTGTTTTAGTTCATACATGCTTATTTGAAATCAAATAATACTATTTTAGTAACA-TTCAAAAA
129 AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * *
76560 ATTAATAAGCAAGATATTTTAAAAAAATAAATCTATTTTCCAAATAAGTTCGAATAGTTATGACT
193 ATTAAT-AGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
76625 ATATGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCAG
255 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG-TT---
* * ** *
76690 ATCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTAT
316 ATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTAT
* * * * * * ** ** * *
76730 TAATATTTAAAAAATTGAGA-AGTTAGAGATTTAAAAAGTAAACCAATTTATTGAATCAATGCAA
1 TAATA-TTATAAAATTTA-ATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACCAATTCAA
* * * * * * * * ** *
76794 ATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTGAAATCGTTACAAACTTTTGTTTTGTTATAAAA
64 ATAGTTAAGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * *
76859 CAATT-TTTTT-TATCATATAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA
128 CAATTGTTTTTGT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAA
* * * * * *
76922 AATTCATCAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTGAATAA-TTCAAATAATTATGACTA
192 AATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * ** * * *
76986 TTTGAATAATTGTATCTTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTATGTA-CA
256 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT-TATCA
** * * *
77050 TACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACAAATATAA
320 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTAT
* *
77086 TAATATTATGAAATTTAATATATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAATTCAAA
1 TAATATTATAAAATTTAATA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACCAATTCAAA
* *
77151 TAGTTAAGCCTATATGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAA-A
65 TAGTTAAGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** * * *
77215 ATTATTTTTGTTCATATAAATTTGTTTGAAATAAAATAATATTAATTTATGAATATTTTAAAAAT
130 ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * **
77280 T-A-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-CTGTTTACCAAACCAA-TTCAATTAGTTATAAGAATTT
195 TAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-TAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * *
77340 GAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCTATTG
259 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTATC-A-T-
* * * *
77404 ATACAGTCTTATTCAAAATAAAGTAATGCTAATTTAT
321 ACA-AG-CTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTAT
* * * * * * * * *
77441 TATTATTCTAAAAATTAATAAGTAACAGATTTAAAAAATGAATCTCTTGGCCT-AACTAGTAT-A
1 TAATATTATAAAATTTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTG-CTGAACCAAT-TCA
* * ** *
77504 AATAGTTATA-ACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-TATTGGTTTTGTCATAA
63 AATAGTTA-AGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * * *
77567 AACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTGCTTGGAATAACATAAT-TTAATTTATTAATA-GTCCA
126 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * *
77630 AAA--AATAATAAGTA-ATTTAAAAACTGAATCTATTTATCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
191 AAATTAATAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * *
77692 ATTTGTATAATTACCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTCTAT
255 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAA-TTGT-TA-
* *
77757 TCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATTA-ATATTTAT
317 TCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAA-TACAAATTTAT
* ** **
77796 TAATATT-TAGACAA-TTAATAAATAAGCGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAATAAATTCA
1 TAATATTATA-A-AATTTAAT-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACCAATTCA
* * *
77859 AATAG-TAATGAGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTCTTGTTTTGTCATAA
63 AATAGTTAA-GACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTT-TTGTTTTGTCATAA
* * * *
77923 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCG-AATCAAAGTAATATTGATTTATTAATACTTCA
126 AACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCA
* * ** * * * * *
77987 ACAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATAAC
190 AAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGAC
78052 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
254 TATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
78096 AAAATATGAA
Statistics
Matches: 1071, Mismatches: 244, Indels: 105
0.75 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
350 10 0.01
351 84 0.08
352 2 0.00
353 4 0.00
354 22 0.02
355 330 0.31
356 262 0.24
357 19 0.02
358 7 0.01
359 2 0.00
360 70 0.07
361 100 0.09
362 4 0.00
363 55 0.05
364 89 0.08
365 10 0.01
366 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (355 bp):
TAATATTATAAAATTTAATAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCTGAACCAATTCAAAT
AGTTAAGACTATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
TTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
AATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTATCATACAAG
CTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTAT
Found at i:78352 original size:266 final size:268
Alignment explanation
Indices: 77856--78361 Score: 661
Period size: 266 Copynumber: 1.9 Consensus size: 268
77846 TTGAATAAAT
* * ** *
77856 TCAAATAGTAATGAGTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTCTTGTTTTGTCAT
1 TCAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACTTCATGTTTTGTCAT
* * * * **
77921 AAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAATCAAAGTAATATTGATTTATTAATACTTC
66 AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATCAAAATAATATAAATTTATTAATACTTC
* **
77986 AACAATTAATAAGTAAAAGATTTTTAAAATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATAA
131 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATAA
* * *
78051 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAAAATATGAATTTGTTTACC
196 CTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTATTGTTTAAAATATGAATTTGTTTACC
78116 AAACAAGC
261 AAACAAGC
* **
78124 TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTCAT-TTTT-TC
1 TCAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGA-C-TTCATGTTTTGTC
*
78187 -TAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTAAAT-AAAATAATATAAATTTATTAATA-
64 ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAATCAAAATAATATAAATTTATTAATAC
* *
78249 TTCTAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGCTTT-CTGAAC-ACGTTTAAATAG
128 TTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCGAACAAC-TTCAAATAG
* *
78311 TTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAAT-AGTTATGACCTATTGTTT
190 TCATAACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCA-TTATGACCTATTGTTT
78362 TGTCATAAAC
Statistics
Matches: 206, Mismatches: 25, Indels: 16
0.83 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
265 3 0.01
266 76 0.37
267 71 0.34
268 47 0.23
269 5 0.02
270 4 0.02
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (268 bp):
TCAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACTTCATGTTTTGTCAT
AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAATCAAAATAATATAAATTTATTAATACTTC
AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAACTTCAAATAGTCATAA
CTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACCTATTGTTTAAAATATGAATTTGTTTACC
AAACAAGC
Found at i:78556 original size:166 final size:165
Alignment explanation
Indices: 78257--78592 Score: 401
Period size: 166 Copynumber: 2.0 Consensus size: 165
78247 TATTCTAAAA
* * * *
78257 ATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTTCTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATT
1 ATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTTCTGAACAAGTTCAAATACTTATAACTATT
* * * * *
78322 TGAACAATTATCAATTTCAAATAGTTATGACCTATTGTTTTGTCATAAACTAATTATTTCTGTTC
66 TGAACAATTATCAATTTCAAAAAATTATGACCTATTGTTTTCTCATAAACTAATCATTTCTATTC
*
78387 ATACAAGCATATT-TGAAATAAAATAACACTAATTT
131 ATACAAGCATATTCAG-AATAAAATAACACTAATTT
* * *
78422 ATTAATATGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATG-TTTATCGAACAAGTTCAAATACTTATAACTA
1 ATTAATAAGT-AAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTTCT-GAACAAGTTCAAATACTTATAACTA
* ** * **
78486 TTTGAATAATTATTTATTTCAAAAAATTATGATCT-TTGGTTTTCTTGTAAAAC-AATCATTTCT
64 TTTGAACAATTATCAATTTCAAAAAATTATGACCTATT-GTTTTCTCAT-AAACTAATCATTTCT
** *
78549 ATTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT
127 ATTCATACAAGCATATTCAGAATAAAATAACACTAATTT
78588 ATTAA
1 ATTAA
78593 GATTCTAAAA
Statistics
Matches: 144, Mismatches: 22, Indels: 9
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
165 15 0.10
166 124 0.86
167 5 0.03
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (165 bp):
ATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTTCTGAACAAGTTCAAATACTTATAACTATT
TGAACAATTATCAATTTCAAAAAATTATGACCTATTGTTTTCTCATAAACTAATCATTTCTATTC
ATACAAGCATATTCAGAATAAAATAACACTAATTT
Found at i:78727 original size:347 final size:346
Alignment explanation
Indices: 78093--78735 Score: 839
Period size: 347 Copynumber: 1.9 Consensus size: 346
78083 TGACCTTTTG
* * *
78093 TTTAAAATATGAATTTGTTTACCAAACAAGCTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCCAT
1 TTTAAAATATAAATATGTTTACCAAACAAGCTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCCAT
*** * **
78158 TTCAAATTGTTATGATCTTTCATTTTTTCTAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCTA
66 TTCAAAAAATTATGATCTTTCATTTTTTCTAAAACAATCATTTCTATTCATACAAGCTTATTCTA
*
78223 AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATAT
131 AATAAAATAATATAAATTTATTAAGATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATAT
* ** * * * *
78288 GCTTTCTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATAGTTATGAC
196 GATTTCCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATTATCAATTTCAAATAGTTATGAC
*
78353 CTATTGTTTTGTCATAAACTAATTATTTCTGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTA
261 CTATTGTTTTATCATAAACTAATTATTTCTGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTA
78418 ATTTATTAATATGTAAAAAAT
326 ATTTATTAATATGTAAAAAAT
* * * * * **
78439 TTTAAAA-ATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATACTTATAACTATTTGAATAATTATTTAT
1 TTTAAAATATAAATATGTTTACCAAACAAGCTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCCAT
** * *
78503 TTCAAAAAATTATGATCTTTGGTTTTCTTGTAAAACAATCATTTCTATTCATACAAGTTTATTC-
66 TTCAAAAAATTATGATCTTTCATTTT-TTCTAAAACAATCATTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * **
78567 AGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAGATTCTAAAAATTAATAGGTAGAAGATTTAAAAGGTAA
130 A-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAAGATTCTAAAAATTAATAAGTA-AAAATTTAAAAAATAA
* * *
78631 ATCT-ATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T
192 ATATGATTT-CCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATTATCAATTTCAAAT-AGT
* *
78694 TATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAC-AATTATTTTTGTTCAT
255 TATGACCTATTGTTTTATCAT-AAACTAATTATTTCTGTTCAT
78736 GCAAAGTTAT
Statistics
Matches: 252, Mismatches: 38, Indels: 13
0.83 0.13 0.04
Matches are distributed among these distances:
345 69 0.27
346 83 0.33
347 95 0.38
348 5 0.02
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (346 bp):
TTTAAAATATAAATATGTTTACCAAACAAGCTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCCAT
TTCAAAAAATTATGATCTTTCATTTTTTCTAAAACAATCATTTCTATTCATACAAGCTTATTCTA
AATAAAATAATATAAATTTATTAAGATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATAT
GATTTCCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATTATCAATTTCAAATAGTTATGAC
CTATTGTTTTATCATAAACTAATTATTTCTGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTA
ATTTATTAATATGTAAAAAAT
Found at i:79507 original size:536 final size:533
Alignment explanation
Indices: 78117--91161 Score: 4312
Period size: 542 Copynumber: 24.2 Consensus size: 533
78107 TTGTTTACCA
* * * * * * *
78117 AACAAGCTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTCATT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * *
78182 TTTTC-TAAAATAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCT-AAATAAAATAATA-TAAATTTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATACT-AATTTA
* *
78243 TTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTT-CTGAAC-ACGTTT
127 TTAATATTTC-AAAAATTAATAAG---AAATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCGAACTA-GTTC
* *
78305 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-AATTTCAAAT-AGTTATGACCTATTGTTTTGTCAT
186 AAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCA-TTATGATCT-TTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
78368 -AAACTAATTATTTCTGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAACACTAATTTATTAATATGT
249 AAAAC-AATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTT
* * * *
78432 --AAAA--AAT------TTT-AAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTTCAAATACTTATAACTA
312 CAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTA
* * *** * * ** *
78486 TTTGAATAATTATTTATTTCAAAAAATTATGAT-CTTTGGTTTTCTTGTAAAACAATCATTTCTA
377 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA
* * * * *
78550 TTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAGATTCTAAAAATTAATAGGT-A
442 TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAA
** *
78614 GAAGATTTAAAAGGTAAATCTATTTACCA
507 G-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * ** *
78643 AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAACAGT-TTGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * * * *
78708 TTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATGCAAAG-TTAT-TCAAAATAAAATAATA-TCGATCTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT-AAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACT-AATTTA
** * * *
78770 TTAATATTTTGAAAATTAATAA-AAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAATAGTTCAAATA
127 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATA
* * *** *
78834 GTTATGAGTATTTGGACAAATATCT-ATAAAAAATCATTATGA----TGTTTTGTCAAAAAACAA
191 GTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * * * *
78894 TTGTTTCTTTTCATACAGGCTTTTTTGAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
256 TTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTG-ATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T
* * * *
78959 AGTAAGTAAGAGATTTTAAAAATAAATATTTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAATTAATAG
319 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAG
* * *
79024 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTCT-ATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTC-AGTTT
381 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTC
* * * * *
79087 ATAAAAGTTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAGCATTCAAAAAATTAATGAGTAAGAG
445 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* *
79152 ATTTAAAAGAATATATCTGTTTATCG
510 ATTTAAAA-AATAAATCTATTTA-CG
* * *
79178 AATAAATTCAAACAGATTTGACCATTTTAAACAATTATCT-TTTCAAAGTTGTTATGACCTTTTA
1 AACAAGTTCAAACAG-TTTGACCA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTA
* * *
79242 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCTGAAATAAAATAATACTATTTTAT
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *** *
79307 TAATATTTCAAAAATTAATAAGACATTTAAAAACTAAAGT-TGTTTTTTGAACTAGTTCCAATAG
128 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAG
* * * * * *
79371 TTATGACTATTTCAACAAATGT-TAATGTCAAATCATTGTGATCTTCT-TTTTCTCATAATACAA
192 TTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTT-TGTTTTGTCATAAAACAA
*
79434 TTGTTTCTGATCATA-AGAGCTTATTTAGATAAAAATAATACAAATTTAATAATATTTCAAAAAT
256 TTGTTTCTGATCATACA-AGCTTATTT-GATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAAT
* * * * * **
79498 TAATAAGAGACTTAAAAAATAAACATGTTTGCCGAACTTGTTCAAATATTTAAGTCTATTAGAAT
319 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAAT
* * * * * *
79563 AATTATCTATTTCAAATCGTTTTGA-CTTTTTGTTTAGTCATATAATAATTATTT-TAGTTCATT
384 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCATA
*** * *
79626 CAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCATGAGATT
448 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* *
79691 TAGAAAAATAAATCTATCTACC
513 TA-AAAAATAAATCTATTTACG
* * * * *** *
79713 AAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTAAAAGCATTATGACCATTT-T
1 AA-CAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
* * *
79777 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
79842 AATATTTCAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCGAA-TCGGTTCAA
129 AATATTTCAAAAA-T--T-AATAAGAAATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCGAACT-AGTTCAA
* * * * * ** *
79905 ATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTTCAAATTGTTATTATCTTTTGTTTTGTCATAAA
188 ATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
79970 ACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCG-TAACACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
252 ACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATAA-A-AATAATACTAATTTAATAATATTTCAA
* ** * ** *
80034 AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
315 AAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTA
* * * * * * *
80099 GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTATTCTATCATAAAACAATTGTTTCTATTT
380 GAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
* ** * * * * *
80163 ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAAAG
445 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
*
80228 ATTTAAAAAATAAATTTATTTACTG
510 ATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-G
** * * * * *
80253 AATC-AGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACCTTTTGT
1 AA-CAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
* * * ** * * * * *
80317 TTTGTCATAAAATAATTCTTTAAACTCATAGAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAACTAATTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *** *
80382 AATATTTCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTGTTGAACCAGTTCAAAT
129 AATATTTCAAAAA--T-TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAAT
* * * * * * *
80447 A-TTATAACTATTTGAATAATTATCT-GTTTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTTATC-TGAAAA
190 AGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCAT-AAAA
* * * * * * * * * * *
80509 TAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTGGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAA
253 CAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
* * * * ** * **
80574 ATTAATTAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGCTAAACTA-TTAGAAATAATTTTAACTA
317 ATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTT-CAAATAATTAAAACTA
* * * * * * *
80638 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTT-ATTTG------AATAGTT-TTGACT
377 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT-TCT
* * ** * * * * **
80694 GTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACCA
441 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTA
* * *
80759 AGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-CA
506 AGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATT-TACG
* * * * * * *** * *
80788 AACCTA-TTCAAATAATTAAGACTATATGAGTGATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCT
1 AA-CAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
* ** ** * * * * * * *
80852 TTTATTGTGGAACAATTGTTTT-GTTCTTATAAGCTTATTTAGATTAAAATAATGCTAATTTAAT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
80916 AATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACC-AAATCAGGTCAAA
129 AATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAA
** * * * * * *
80980 T-GCTTAAAACTA-TT-AAAATAATA-ATATATTGCAAAT-AGTTATGA-CATTTTGCTTAGCCA
189 TAG-TTATGACTATTTGAACA-AATATCTA-ATTTCAAATCA-TTATGATC--TTTGTTTTGTCA
* * * * * *
81039 TAAAACAACTATTTC-AATTCATACAAGCTTATTTAGA-ATAAATTAATACTAATTTATTAACAT
248 TAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTT-GATA-AAAATAATACTAATTTAATAATAT
* * * * *
81102 TT-AGAAAACTAATAAGAAAGAGATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAATAAGTTTAAATAG
310 TTCA-AAAA-T--TAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAA
** * * * * * * *
81165 TTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTAT-AACCTTTTGATTTT-TCATAAAGCA
368 TTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTG-TTTTGTCATAAAACA
* * * * * * ** * * **
81228 TTTGTTTC-AGCTAATACGAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-CTA
432 ATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAA
* * * * *
81290 AATTAGTAAGTATGAAATTTAAAAAATAACTCTATTTACT
494 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACG
* * * ** * * ** * *
81330 AA-ATCAGTT-AAATACTTATGGCCATTTGAATGATTATCTACTACAAATCATTATGACTTTTTG
1 AACA--AGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * * *
81393 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
63 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * *
81458 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCGAACCAGGTT-AA
128 TAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA-GTTCAA
* * * ** *
81522 ATAATTATGACTATTTGAACAATTAT-TAATCTCAAATCATTAAAATCTTTGTTTTATCATAAAA
188 ATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAA
* * ** *
81586 CAATTGTTTCTAATCATATAAGCTTATTCAATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTGTGAAA
253 CAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGA-TAAAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAAA
* * * * * * * **
81651 ATTAATAGATAAGTGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACCAGTTTAAAATTGTTAAAACTA
316 A--ATTA-ATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAG-TTCAAATAATTAAAACTA
* * * * * * * * *
81716 TTATAATAATTATCTATTTCAAATTGGTCTGA-CCTCTTGTTTAGTCATAAAATACTTGTTTC-A
377 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA
* * * * * * *
81779 TATCTTATAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT-CTAAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATTAGC
442 T-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGT
* * * *
81843 AAAAGATTTGAAACAATAAATCTGTTTACCA
505 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * ** * * * * *
81874 AACAAGTTAAAATAGTTATTACTGTTTGAATAATTATTTATTTAAAATCGTTATTACC-TTTAGT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTA-T
* *
81938 TTTGACATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATTTTT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
82002 TAATATTTCCAAAATTAATAAGTAAGGGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAATTCAAG
128 TAATATTTCAAAAATTAATAAG-AA--ATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAA
* * * * ** * * * *
82067 TAGTTACGACTATTTGAACAATTGTCT-ATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATTATAAAA
189 TAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * *
82131 CAATTGTTTCAGTTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAA
253 CAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
* * * * * * * * * * * * *
82196 ATTAATTAGTGATTTAAAAAGTGAATTTGTTTA-CTAAATCAATGCAAATAATTATAGCCATTTG
317 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTAAAACTATTAG
* * * * * * * *
82260 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT--TACTTTTGGTTTGGTTATAAAATAATTGTTTTTTTTT
381 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTATT
* *
82323 CATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC-AAAAA-T--TAA-TAAG
444 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAGTAAG
82383 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG
508 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-G
* ** * * * * *
82410 AACTAA-TTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTGTATACTTT-AAATTGTTATAACCTTTTG
1 AAC-AAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATTGTTATGACCTTTTA
* * * * * * * *
82473 TTATGTCATGAAGCAATTATTTTTA-TTCATACAAGTTTAT-TCAAAATAAAATAATGCTAATCT
63 TTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *** *
82536 AATAA-AATTCAAAAAATGAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTC
126 ATTAATATTTC-AAAAAT---TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTC
* * * * * * *
82600 AGATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCT-ATTTCAAAAT-GTTATGACCCTTTATTTTGTCAT
186 AAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTC-AAATCATTATGA-TCTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * * *
82663 AAAATAATTTTTTC-AACTCATAGAAGCTTATTCGGA-ATAGAATAAAACTAATTTATTAATATT
249 AAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATT
* * * * * * * *
82726 TCAAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTACCAAACCAGTTTATTGAATCAG
311 TCAAAAA--T-TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCA---AAT-AA
* * * * * * *
82791 TTCAAA-TAATTATGGCCATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCATTATGA-ACTTTTGTTTTTT
368 TTAAAACT-ATTA--G--A----A-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGT
* * * * * *** * *
82854 CATAAAACATTTGTTTTTCAAT-ATACAAGCCTATTTGGAATAAAATCATACTAATTTATTAATA
423 CATAAAACAATTATTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
*** * * ** *
82918 TTTCAAATTGTT-ACAAGTAGGAGATCAAAAAAATAAATTTATTTATCG
487 -TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * * * * * * *
82966 AACCAGTTCAAATAGCTATAACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTTTAACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAACAG-TTTGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * *
83031 TTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCA-AACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATGATACTAATCTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAA-AAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * **
83093 ATAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAA-TTAAAAAATAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAA
127 TTAATA-TTTCAAAA--ATTAA-TAAGA-AATTTAAAAAATAAA-TA-TG-TTTA---C--CGAA
* * * ** ** * * * **
83157 GCCTA-TCCAAAATAAAATAATG-CTACTTT--AGTAATAT-T--TTGAAAATTGATAAGTAAAA
179 --CTAGTTC-AAAT--AGTTATGACTA-TTTGAACAAATATCTAATTTCAAA-TCATTA-TGATC
* ***** * ** * * *
83215 TAT-TTAAAAAATAAATCAGTTTATTGAATCAGTTCAAATAATTATAGC-TATTTGA-AAAAAT-
236 TTTGTTTTGTCATAAAACA----ATTGTTTCTGATC--AT-A-CA-AGCTTATTTGATAAAAATA
* ** * * * ** * * * * *
83276 AT-CT-ATTTCA-AATCGTT-ATTAACTT--T-TG-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACT
292 ATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGAGATT-T-AAAAAATAAATATGTTT--AC-
* * ** * *** * * **
83333 TAC-AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCAAGAATTACTAAGAGATT
351 --CGAA-C-TAGTTC-AAAT-AATTAAAACT-A--TTAGAATAATT-ATCTATTTCAAATCG-TT
** *** * * * * ** * **
83396 AAAAAAATAAATTTGTTTATTGGACTAGTTTAAATAGTTATAACTATTTGA-ACAATTATCTATT
405 ---ATGATCCTTTTG-TT-TT-GTC-A--TAAAACAATTATTTCTA-TTCATACAA-GCT-TA-T
* *** ** ** * **** * **
83460 TCAAATTGTCATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACATTTATTTTTATTCAT-A-TAAGCTTATTC
457 TCAAAATAAAATAA--TACTAATTTAT--T--AACATTCA-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATT-
*
83523 AGAATAAAATAAAAT-TAATTTA-G
513 -TAA-AAAAT-AAATCT-ATTTACG
* * * * * * * *
83546 TAA-TA-TTCTAAA-AATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TGATTTGCTAAACTAGTT
1 -AACAAGTTC-AAACAGTT--TGAC-----CATTTGAACAAT-TATCT-ATTT-C-AAA-TTGTT
* ** * *** * * * * * * * *
83607 CA-AACAGTTAAAACTAT-AT-GAACAATT-ATTTATTTCA-AATTGTTATGACCTTTTGTTTTG
52 -ATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAA-----A--AGC--TT-ATCTA
** * * * *
83667 TCATAAAACAAT--T-ATTTCAGCTTATAGATGTTTATTCAAAATAGAATGAAAGTAAAAGATTT
106 AAATAAAATAATACTAATTT-A--TTA-ATAT-TTCA---AAAAT-TAAT--AAG---AA-ATTT
* * * ** * * * * *
83729 AAAAAATAATTCTATTTACTAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCT-ATTT
156 AAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTT
** * * * * * * * * *
83793 CAAATTGTTATTAT-TTT-TTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTAATATAAG-TT-TGTTCAA
221 CAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTAT-TTGAT
* * **
83854 AATAAACTAATAATAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAATAAGAGATTTAAAAAGCAAAT
285 AA-AAA-TAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * *** *
83918 TTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTA-AATAATTATCTATTTAAAATCGTTAT
343 ATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * ** * ** *
83982 -AACCCTTT-TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATTCAGAATAAAATAAT
407 GATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * ** * ** * *
84045 ATTAATTCAATAATATTCTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAGTGTT--G
472 ACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-A-T-TTACG
* * * * * * *** * **
84108 AACTAGTTGAAATAGTTAAGACTATATGAATGCTTATCTATATCAAATCATTATGA-CTTTT-TT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * ** * *
84171 TTTTCATTGTAAAACAATTATTTTA-TTCATAGAAGCTTAT-TCGGATTAAAATAATAGTAATTT
65 TTGTCA---TAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTT
* * *
84234 AATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAA-TCGGTTC
126 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTC
* * * * * * * *
84298 AAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTTATA
186 AAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
84362 AAAAAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTGTTTAGA-ATAAATTCATACCAATTT-ATAA-ACGTT
250 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTT-GATA-AAAATAATACTAATTTAATAATA-TTT
** * * * * * * * * *
84424 CAGATAATAGAAAAGAAAGAGACTTAAAAAAATAAATCTATTCACTGATCAAGTTCAAATAGTTA
312 CA-A-AA-A-TTAA-TAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTA
** * * * * * *
84489 TGACTATTTGAACAATTGTCTATTT-AAATTTGTTAT-AACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATT
371 AAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * ** * * ****
84552 GTTTCAATTAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTCTAAATTA
435 ATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTA
* *
84616 ATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCG
499 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * * * * ** * * * * *
84652 AATC-ATTTAAAATAATTAAGACTATTTGAATGATCATTTATTTGAAATCGTTATGACC-TTTGT
1 AA-CAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
* * * *
84715 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTAT
* *** **
84779 TAATATTTCAAAAACTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTATTG---TAGTTCAAA
128 TAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAA
* * * * * *
84841 TAGTTATAACTATTTGAACAATTATC-AATCTCAAATCTTTAAGATCTTTGTTTTGTCATAAGAC
189 TAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
84905 AATTGTTTCTAATCATAGAAACTTATTCGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAA
254 AATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATT-TGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAA
* * * ** * * * * *
84969 AGTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTT-GTGAAACCAATTCAAATAGTTAAAACCACTAG
317 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG-AACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAG
* * * * * * *
85033 AATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTCAT-CATTTGTTTAGTCATAAAAC-ATTTTTTTTATATC
381 AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT-TC
* * * * * * ** * * *
85096 TTACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATCCAAATTTAATAACATTTGAAAAATTAATAAGCAAAAT
445 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
85161 ATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTG
510 ATTT-AAAAAATAAATCTATTTAC-G
* * * ** * * * *
85187 AACAAGTTTAAATAGTTATAAATATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * * *
85252 TAGACATAAAACAATTGTTTTAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
85317 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGTTTAAAAAAATTAATTTGTTTATCAAACAAATTCAAATA
130 ATATTTCAAAAATTAATAAG-AA-A-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATA
* * * * *
85382 GTTATGACCA-TTGAACAATTGA-CT-ATTTAAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
191 GTTATGACTATTTGAACAAAT-ATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
85444 AATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCA-AAATAA-AATAATAATTTATTAATATTCCAAAT
254 AATTGTTTCT-GATCATACAAGCTTATTTGATAAA-AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
* * * * * * ** * ***
85505 ATTAATAAGGAAGTGTTTTAAAAAGTGATTCTATTTATTGAA-TAAGTTCAAAT-ATGATGGCTA
317 ATTAATAA-G-A--GATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTAAAACTA
** ** * * * * * *
85568 TTTCAATAATTATCTATTTGGAATCATTATTA-CCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTG
377 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-
*
85632 ATT-ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCATTC-AAAAATTAATAAGT
441 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-CATTCAAAAAATTAATAAGT
* * *
85695 AAGAAATTTTAAAAATAAATCTATTTATTG
505 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * * * * * * * * *
85725 AACCCA-TTGAAATAGTTATAACTATTTGAATAGTTGTATAATTCAAATCAATTATTTAAAAAAT
1 AA-CAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTC--A--AATT-GTT-----AT
* * * * * * * *
85789 AAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-ATTTATGTTCATTCAAA-CTTATTTGAAATAAAATA
54 -GACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCA-TAAAAGCTTATCTAAAATAAAATA
* * * * * * * *
85852 ATACTAATCTAATAATACTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAATAATAAATTTGTTTACTG
116 ATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCG
* * * * * * *
85917 AACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAATAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGA-CATTTTG
177 AACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC--TTTG
* * * * * *
85980 TTTTGTCATAAAACAATTTTTTC-AATTCATACTAGCTTATTCAGAAATAAAATAA-AATAAATT
240 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATT-TGATA-AAAATAATACT-AATT
* * * * * * *
86043 TACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTTTGCTTACCTAACCAGTTC
301 TAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTC
* * * * *
86108 AAATAATTATAATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAT-TTTTTGTTTTGTCATA
362 AAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
86172 AAACAAATT-TTTTTGTTGATATAAGACTGTA-T-AGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATT
427 AAAC-AATTATTTCTATTCATACAAG-CT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-T
* * *
86234 TC-AAAAA-T--TAA-TAAGATATTTAAGAAATAAATCTTTTTATC-
488 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * * * *
86275 AATCCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTT
1 AA-CAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
* * * * * ** *
86339 TTTATATATAAAACAATAGTTTCTA-TTCATACGAA-CTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTT
64 TTTGT-CATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTT
* *
86402 ATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATT-
126 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAG-TTC
* * * * * * * *
86466 AAATAGTCATGACTTTTGTTTTGTCATA-AAAAAT-T-ATTTC-AATTAATATAAGC----TTAT
186 AAATAGTTATGAC---T-ATTTG--A-ACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTT
* ** * * ** * * *
86523 -TCA-AAATA-AAATAATACTAAGT--TATTA--TTA-TT-CTAAAAAT--TAATAA-TTAA-GA
244 GTCATAAA-ACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGATAAAAATAATACTAATTTAATAA
* * *** *** * *
86575 GATTT-AAAAAATAA-ATTTG-TTT-ATCGA-ACA-A-GTTT----AA--A--T---A--ATTAT
307 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAA
* * * * * * ** * *
86620 GACTATTTGAACAATTATCTATTTGAAATAGCTAT-AAGCATTTGTTTTGTCATAAAATAATT-T
372 AACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * *** * * *
86683 CTTTTGTCCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAA
437 -TTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAA-AAAATTAA
* * * *
86747 TAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTATACCA
500 TAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * * * * *
86783 AATAAATTCAAATCA-TTATGACTATTTGAACGATTATCGATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGT
1 AACAAGTTCAAA-CAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
* * * * * * *
86847 TTTGTCATAAAAAAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TCAAATTAAAATAATATTATTTTAT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * *
86911 TAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAGTAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAA
128 TAATATTTCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAA
* * * * * * *
86976 TAGTCATGACTATTTAAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAA
189 TAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * *
87040 CAATTGTTTCAGTTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
253 CAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
* * * * * * * ***
87105 ACTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTA
317 A-T--T-AATAAGAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTA
* ** * * * * * *
87170 TTTGAATTGTTATCTATTTCAAAACATTATTA-CCTTTTGTTTTGCCATTAAACAATTGGTTT-T
377 TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCT
** ** * **
87233 GCTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGT
441 ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGT
* * * * * *
87297 AA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTTCT
505 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACG
* * ** * * * *
87325 AAGC-GGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATTGCAAATCGTTATGA-CTATTTG
1 AA-CAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCT-TTTA
* * *
87388 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTT
63 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTT
* ** * * * * *
87451 ATTAATACTAAAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCTAGTTCA
126 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCA
* * ** *
87516 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT-TTATTTCAAATTGTTATGATCTTT-TATTTGGTAATA
187 AATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTTTGT-TTT-GTCATA
* ** * *
87579 AAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC
250 AAACAATTGTTTCTGA-TCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTC
* * * * * *
87642 TAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-ACTAAGTTTAAATAGTCAT
313 -AAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTAA
** * * ** * * *
87706 GTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATTATTATGA-CATTTTTTTTTAT-AGTAAAACAATT
372 AACTATTAGAA-TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATT
* ** * * *
87768 ATTTCTTTTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACCAATTTA-TCACTATTTC-AAAAATT
435 ATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC-A-TTCAAAAAATT
* *
87831 AAT-A-T--G-GATTT-AAAAATAAATGTATTTGCTG
498 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-G
* * * * * * *
87862 AACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAAATTATGC-ATTTCAAATAAGTT-TGACCTTT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAAC--AATTAT-CTATTTCAAAT-TGTTATGACCTTT
* * * * * * * **
87925 TGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTAT-TAAAAATATAGCAATACTAATT
61 TATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATT
* * * * * *
87989 TATTTACA-TTCAAAATTTTAATAAGCAAGAAATTTTTAAAAAATAAA-ATTTTTTATC-AAATA
125 TATTAATATTTCAAAA-ATTAAT----AAGAAA--TTTAAAAAATAAATA-TGTTTACCGAACT-
* * * * * * * *
88051 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTAAAATCACTATGACCTTTTATTTTA
181 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTG
* *** * * *
88115 TCATAAAACAAATTGTTT-TCG-TGCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATA-TCACTTTATT
245 TCATAAAAC-AATTGTTTCT-GAT-CATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACT-AATTTAAT
* * ** * * * * *
88177 AATATTTCCAAAATTGATAAGTGAGAGATTTCCAAAATCAATCA-GTTTATC-AAATCAATTAAA
305 AATATTT-CAAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTACCGAACT-AGTTCAA
*** * * * * *
88240 ATAATTATGGCTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGA-ACTTTTGTTTTATCATAAC
364 ATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * * * *
88304 ACAATTGTTTTCCA-TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTACTGATATTTC-A
429 ACAATT-ATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAA
* * *
88367 TAAATTAATAAGTAAGAGA-TT-----AT---T-TGTTTACCA
492 AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * ** * * * *
88400 AACTAGTTTAAATAGTTATGATTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * * * *
88464 ATGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATACAAGTTTAT-TCAAAATAAAATAATACTAATGTAA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * ** *
88527 TAATA-TTCTAAAAATTAATAACTAAAAATTTTTAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAA
128 TAATATTTC-AAAAATTAAT-A--AGAAA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAA
* * * * * * * * * **
88591 ACAATGAAGGCTATATGAAC-AAT-TCTTTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTGTAA
188 ATAGTTATGACTATTTGAACAAATATC-TAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAA
* * * *
88654 AACAA-T-TTT-T--T--T---AG-TTCTTAG-TATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCA
251 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCA
* * * **
88706 AAAATTAATAAGTAAGATATTAAAAAAATAATTATGTTTGCC-AAGCCAGTTCAAATAATTATGA
314 AAAATTAATAAG--AGAT-TT-AAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CTAGTTCAAATAATTAAAA
* * * *
88770 CTATTTGAACAATTATCT-TTTCCAAATCGTTATGA--CATTTGTTTTGTCATAAAATAGATGT-
374 CTATTAGAATAATTATCTATTT-CAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-AT-TA
* * * *** * **
88831 TTT-TGTTCATATAAG-TTGGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATT-ACTATAT-TGAAAATT
436 TTTCTATTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC-AT-TCAAAAAATT
* * * *
88892 AAGAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATTTATTTACTA
498 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAC-G
* ** * * * * * * * * * *
88929 AACCAGTTCAATTAGTTATAACTATTTTAACAATTATGTATTTCAAATCGTTATAATCATATGTT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * ** * * *
88994 TTATCATAAAATAATTGTTTCT-GTCCAT-GCAGTCTTAT-TCAGAATAAAATGATACTATTTTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAG-CTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * ** * * *
89056 TTAATA-TTCTAAAAATCAATAAGTAACAGATTGAAAAAATGAATTTGTTGGCTTG-ACTAATGC
127 TTAATATTTC-AAAAATTAATAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CGAACTAGTTC
* * ** * * * *
89119 AAATAGTTATCACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCACA
186 AAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * * *
89183 AAATAATTGTTTTTGTTCGTACAAGCTTATTCGA-AATAACATATTTCTACTTTATTAATATTCC
250 AAACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATAA-AA-ATAATACTAATTTAATAATATTTC
* * * * **
89247 AAATATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGA
313 AAAAATTAATAAG--AG--ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAA
* * * * * * *
89312 CTAACTA-AACAATTATCTATTTTAAATCGCTAT-AACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTT
374 CT-ATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * * * *
89375 TCTAATCATACAAGCCTATTTC-CAATAAAATTATACAAATTTATTAATATTTAGACAATTAATA
438 TCTATTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATA
* * * *
89439 GGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATTG
502 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * * ** * *
89472 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * * *
89537 TGGTCATAAAATAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTA-ATATTAATAAAATAATA-TAAATTTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTATCTA-AAATAAAATAATACT-AATTTA
* * * * **
89599 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAAC-ATGTTCAA
127 TTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTA-GTTCAA
* * * * ** *
89663 ATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTCTTTTACCGTAA
188 ATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTGTCATAA
** * * ** * * * *
89726 ATTAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAATCCAA
251 AACAATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAA
* * * * * * * ***
89790 AAACTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTACTG-AGTAAGCTCAAATAGTTGTGAC
315 AAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAATAATTAAAAC
* * * * *
89854 TATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAC-TTATG-TTCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT
375 TATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT-CGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
* * * * * ** *
89917 ATGTTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-ATGCAAATTAATAG
439 CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCA-AAAAATTAATAA
* *
89981 GT-AGGGTATTTAAAAAATAAATTTATTTATCG
503 GTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CG
* * * * * * * *
90013 AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTTAACAATTACCTATTTCAAATTGTTATGACCCTTTGTC
1 AACAAGTTCAAACAGT-TTGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * * *
90078 TTGTCGTAAAATAATTTTTTCTA-TTCATACAAA-ATTAT-TCAAAAGAAAATAATACTAATTTA
65 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATA-AAAGCTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
90140 TTAATA--T----AATTAAT-AGAAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCGAA-TCAATTTAAAT
127 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACT-AGTTCAAAT
* * *
90197 AGTTATGAC----T---C----A--T--TTT---A--ATT-TG-----TATTTTATCATAAAATA
190 AGTTATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACA
** * * * * *
90236 ATTGTTTCTTTTCATATAAGCATATTTGAATTAAAATAATACAAATTTTAA-AAAATTTCATAAA
255 ATTGTTTCTGATCATACAAGCTTATTTG-ATAAAAATAATACTAA-TTTAATAATATTTCA-AAA
* * * * * * *
90300 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATT
317 --ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATT
* * * * * * * ***
90365 AGAACAATTATCTATTTCATATCATT-TTAACCTTCTATGCAGTCATAAAACAATTATTT-TAGT
379 AGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-T
** * ** *
90428 TCATACAAGCTTATTCCGAATAAAATAAAACTAATTTATTAACATTCAAAATTTTAATAAGCAAG
443 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * *
90493 AGACTTAAAAAATTAATTTTGTTTGCCG
508 AGATTTAAAAAA-TAAATCTATTT-ACG
* * * * * * * * *
90521 ATCCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTTTTATTACCTTTTGT
1 A-ACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
*** * * * * * *
90585 TTTGTCATAAAACAAACATTTTTGTTCA-ATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATATTAATTTATT
64 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* ** * * * * ***
90649 AATATTT-GAAAATTAATAAGGCATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAATTTTGATAGTT
129 AATATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * * * * * *
90713 ATAACTATTTGAGTAATTAT-TTATTTTAAATCTTTACGACCATTTATTTTGTCATAAAGCAACT
194 ATGACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * * *
90777 ATTTTTGTTCACACAATCTTA-TTCA-AAATAATTTAATGCTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAAT
258 GTTTCTGATCATACAAGCTTATTTGATAAA-AA--TAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAAT
* *** * ** * ** * ** *
90839 TAATAAGTAATGGATTTAGAAAAGGTATCTGTTGGCTTG-ACTAGCGCAAATAGTTATGACTGTT
319 TAATAAG--A--GATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATT
* * * * *
90903 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
379 AGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATT
* * * * * * *
90967 CGTACAAGCTTATTCGAAATAACATAATTCTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA
444 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * *
91032 TATTTAAAAGAATGAATCTGTTTACCG
509 GATTTAAAA-AATAAATCTATTTA-CG
* * * * * * *
91059 AATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAACAGTT-TGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * *
91124 TTGACGTAAAACAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTAT
65 TTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAGCTTAT
91162 TTCAAATCTG
Statistics
Matches: 9518, Mismatches: 2177, Indels: 1635
0.71 0.16 0.12
Matches are distributed among these distances:
500 3 0.00
501 17 0.00
502 97 0.01
503 13 0.00
504 2 0.00
505 3 0.00
506 67 0.01
507 351 0.04
508 105 0.01
509 9 0.00
510 9 0.00
511 6 0.00
512 47 0.00
513 8 0.00
514 3 0.00
515 5 0.00
516 9 0.00
517 4 0.00
518 16 0.00
519 143 0.02
520 97 0.01
521 14 0.00
522 5 0.00
523 7 0.00
524 62 0.01
525 13 0.00
526 71 0.01
527 60 0.01
528 13 0.00
529 64 0.01
530 156 0.02
531 16 0.00
532 56 0.01
533 99 0.01
534 444 0.05
535 469 0.05
536 835 0.09
537 112 0.01
538 546 0.06
539 508 0.05
540 690 0.07
541 646 0.07
542 1058 0.11
543 605 0.06
544 381 0.04
545 204 0.02
546 23 0.00
547 24 0.00
548 9 0.00
549 102 0.01
550 81 0.01
551 60 0.01
552 58 0.01
553 52 0.01
554 65 0.01
555 104 0.01
556 171 0.02
557 29 0.00
558 16 0.00
559 8 0.00
560 18 0.00
561 10 0.00
562 17 0.00
563 27 0.00
564 29 0.00
565 17 0.00
566 25 0.00
567 8 0.00
568 22 0.00
569 15 0.00
570 17 0.00
571 8 0.00
572 17 0.00
573 16 0.00
574 7 0.00
575 1 0.00
576 3 0.00
577 8 0.00
578 13 0.00
579 5 0.00
580 15 0.00
581 9 0.00
582 10 0.00
583 6 0.00
584 6 0.00
585 23 0.00
586 23 0.00
587 13 0.00
588 13 0.00
589 20 0.00
590 14 0.00
591 14 0.00
592 21 0.00
593 16 0.00
594 9 0.00
595 21 0.00
596 18 0.00
597 5 0.00
598 4 0.00
599 6 0.00
600 4 0.00
601 2 0.00
602 2 0.00
603 11 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (533 bp):
AACAAGTTCAAACAGTTTGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTT
TGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
TATTTCAAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAACAAATATCTAATTTCAAATCATTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
TCTGATCATACAAGCTTATTTGATAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG
AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTCAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATC
TATTTCAAATCGTTATGATCCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA
TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
AAATCTATTTACG
Found at i:83792 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 83760--83792 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
83750 AACCAGTTCA
83760 AATAATTATAACTATTTG
1 AATAATTAT-ACTATTTG
83778 AATAATTAT-CTATTT
1 AATAATTATACTATTT
83793 CAAATTGTTA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
18 9 0.60
ACGTcount: A:0.42, C:0.06, G:0.03, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATACTATTTG
Found at i:84635 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 83716--86446 Score: 1794
Period size: 182 Copynumber: 15.1 Consensus size: 179
83706 AATAGAATGA
* * * * * * *
83716 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACTAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTGAAT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * ** * *
83781 AATTATCTATTTCAAATTGTTATTA--TTTT-TTTTGTCATAAAACAACTATTTTTGTTAATATA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATACA
* * ** * * *
83843 AGTTTGTTCAAAATAAACTAATAATAATTTATTAATATTTAGAAAATTAAT
131 AGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAAT
** * ** * ** * * * * *
83894 CAA-TAAGAGATTTAAAAAGCAAATTTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTAAA
1 -AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
83958 TAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCCTTT-TTTTGTCATCAAACAATTGGTTCT-ATTCATA
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTAATTCATA
* ** * * * * * *
84021 CTATTTTATTCAGAATAAAATAATATTAATTCAATAATATTCTGAAACTTAAT
129 CAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAAT
** * * ** ** * * * * *
84074 AACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAAGTGTTGAACTAGTTGAAATAGTTAAGACTATATGAAT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
** * * * *
84139 GCTTATCTATATCAAATCATTATGA-CTTTT-TTTTTTCATTGTAAAACAATTATTTT-ATTCAT
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA---TAAAACAATTGTTTTAATTCAT
* * * *
84201 AGAAGCTTATTCGGATTAAAATAATAGTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
128 ACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAT
* * * * * * *
84255 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATC-GGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG-ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
84319 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTTATAAAAAAATTGTTTCAGTTCATAC
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAC
* * * * * * *
84384 AAGCTTGTTTAGAATAAATTCATACCAATTTA-TAA-ACGTTCAGATAA-TAGAA
130 AAGCTT-ATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCA-A-AATTA-AT
* * *
84436 AAGAAAGAGACTTAAAAAAATAAATCTATTCACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
1 AAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
84501 CAATTGTCTATTT-AAATTTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTAATA
65 TAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATA
* * *
84565 CAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTCTAAATTAAT
129 CAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAAT
* * * * * *
84618 AAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAATC-ATTTAAAATAATTAAGACTATTTGA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-G-ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
84681 ATGATCATTTATTTGAAATCGTTATGACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGA-TCAT
64 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAATTCAT
* *
84744 ACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAAT
128 ACAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAT
* * * * *
84798 AATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCATTTATTG-T--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * *
84860 AATTATCAATCTCAAATCTTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAGACAATTGTTTCTAA-TCATAG
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAC
* * * *
84923 AAACTTATTCGG-TTAAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCTAAAA--AGT
130 AAGCTTATT-GGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAT
* ** * * ** * * *
84972 AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGCTT-GTGAAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACCACTAGA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG--ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
85034 ATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTCATCATTTGTTTAGTCATAAAAC-ATTTTTTTTATATCTT
64 ATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAAT-TCAT
* * * * * *
85098 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATCCAAATTTAATAACATTTGAAAAATTAAT
128 ACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAAT
* * * * * * *
85152 AAGCAAAATATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATAAATATTTGAA
1 AAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * *
85217 CAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGACATAAAACAATTGTTTTAATTCATAA
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATAC
*** *
85282 AAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAAT
130 AAGCTTAT-TGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAT
* * * * * * *
85334 AAGTAAGAG-TTTAAAAAAATTAATTTGTTTA-TCAAACAAATTCAAATAGTTATGACCA-TTGA
1 AAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACT-GATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
85396 ACAATTGA-CTATTTAAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT
64 ATAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCAT
* * *
85460 ACAAGCTTATT-CAA-AATAA-AATAATAATTTATTAATATTCCAAATATTAAT
128 ACAAGCTTATTGGAATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-ATTAAT
* * * * * * * * * *
85511 AAGGAAGTGTTTTAAAAAGTGATTCTATTTATTGAAT-AAGTTCAAATA-TGATGGCTATTTCAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG-ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** * * * * *
85574 TAATTATCTATTTGGAATCATTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGATT-ATA
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAATTCATA
** *
85638 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATCA-TTCAAAAATTAAT
129 CAAGCTTATT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTC-AAAATTAAT
* * * * * * *
85691 AAGTAAGAAATTTTAAAAATAAATCTATTTATTGAACCCA-TTGAAATAGTTATAACTATTTGAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTG-ATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * * *
85755 TAGTTGTATAATTCAAATCAATTATTTAAAAAATAAAACTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-AT
65 TAATTATCTATTTCAAATC-----GTT-----AT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * *
85819 TTATGTTCATTCAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATACTCCAAAAATTAAT
119 TTA-ATTCATACAAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAT
* * * * * * * * *
85883 AACTAAGAGATTTAAATAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTAAGATTATATGAAT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
*
85948 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAATTCATAC
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-AATTCATAC
* * * *
86012 TAGCTTATTCAGAAATAAAATAA-AATAAATTTACTAATATTTCAAAAATTAAT
130 AAGCTTATT--GGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAATTAAT
* * * ** * * * * *
86065 AAGTAAGAGATTTAAAAAGTAATTTTGCTTACCT-AACCAGTTCAAATAATTATAATTATTTGAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* ** ** *
86129 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTTGTTGATA
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTAATTCATA
* * * *
86193 TAAGACTGTA-TAGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAA--ATT
129 CAAG-CT-TATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAAT
* * * * * *
86243 AA-TAAGATATTTAAGAAATAAATCTTTTTA-TCAATCCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-GATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
86306 CAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTTTTTATATATAAAACAATAGTTTCT-ATTCAT
65 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTT-TAATTCAT
*
86369 ACGAA-CTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAATAATTAAT
128 AC-AAGCTTA-TTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-AATTAAT
* * *
86423 AAGTAAAAAATTTTAAAAATAAAT
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
86447 ATGTTTACCG
Statistics
Matches: 2006, Mismatches: 436, Indels: 218
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
172 2 0.00
173 23 0.01
174 4 0.00
175 5 0.00
176 81 0.04
177 382 0.19
178 104 0.05
179 26 0.01
180 390 0.19
181 390 0.19
182 413 0.21
183 35 0.02
184 6 0.00
186 2 0.00
187 2 0.00
190 3 0.00
191 9 0.00
192 127 0.06
193 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (179 bp):
AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGATCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAATTCATACA
AGCTTATTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTAAT
Found at i:87006 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 86985--87017 Score: 50
Period size: 17 Copynumber: 2.0 Consensus size: 17
86975 ATAGTCATGA
86985 CTATTT-AAATAATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
*
87001 CTATTTCAAATCATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
87018 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 1, Indels: 1
0.88 0.06 0.06
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
17 9 0.60
ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.00, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
CTATTTCAAATAATTAT
Found at i:87686 original size:723 final size:719
Alignment explanation
Indices: 86474--91167 Score: 3373
Period size: 723 Copynumber: 6.6 Consensus size: 719
86464 TTAAATAGTC
* * * *
86474 ATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTCAAT-TAATATAAGCTTATTCAAAATAAAATA
1 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC--TGTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATA
* * * * *
86536 ATACT-AAGTTATTATTATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC
64 ATA-TAAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATTTGTTTATC
* * * * * *
86600 GAA-CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTG-AAATAGCTATAAGCATTT
126 TAAGC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA-TTGCAAATCGTTATGA-CATTT
* ** *
86663 GTTTTGTCATAAAATAATT-TCTTTTGTCCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTT
188 GTTTTGTCATAAAATAATTGT-TTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAATTT
* * * * * *
86727 ATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATCTGTATACCAAA-TAAATT
251 ATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAACT-AGTT
* * * *
86791 CAAATCA-TTATGACTATTTGAACGATTATCGATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCA
314 CAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATC-TTTTGTTTTATCA
* * * * * * *
86854 TAAAAAAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATATTATTTTATTAATATTT
377 TAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * * *
86919 TGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAGAAAGTAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATG
442 TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * *
86984 ACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTT
507 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT
* * * * * *
87049 CAGTTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAACTAATGAG
572 CTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
* * * * ***
87114 TAAGAGAATTAAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATTG
637 TAAGA-AATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAA
87179 TTATCTATTTCAAAACATT
701 TTATCTATTTCAAAACATT
* * * *
87198 ATTACCTTTTGTTTTGCCATTAAACAATTGGTTT-TGCTCATACAAGCTTATTTTAAATAAAATA
1 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTG-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATA
87262 ATATAAATTTATTAATATTCCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTT-TCTA
64 ATATAAATTTATTAATATT-CTAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTATCTA
* * *
87326 AGCGGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAATAATTATCTATTGCAAATCGTTATGACTATTTGTTT
128 AGCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGCAAATCGTTATGAC-ATTTGTTT
** *
87391 TGTCATAAACCAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
192 TGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAA
* * * *
87456 TACTAAAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCTAGTTCAAATAG
256 TATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAG
* * * ** *
87521 TTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTGGTAATAAAACAAT
321 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAAT
* *
87586 TGTTTCTATTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
386 TGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTA
*** * * * * * *
87651 ATAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCG-ACTAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTG
451 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
* * *
87715 AACT-ATTATCTATTTCAAATTATTATGACATTTTTTTTTAT-AGTAAAACAATTATTTCTTTTC
515 AA-TAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCA-TAAAACAATTATTTCTGTTC
** * * *
87778 ATACAAAATTATTC-AGAATAAAATAATACCAATTTATCACTATTTCAAAAATTAAT-A-T--G-
578 ATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * ** * * *
87837 GATTT-AAAAATAAATGTATTTGCTGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAAATTAT
642 AATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAAC--AATTAT
87901 GC-ATTTCAAATA-AGTT
705 -CTATTTCAAA-ACA-TT
* * * * * * **
87917 -TGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTAAAAATATAGCAA
1 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAA
* * *
87981 TACT-AATTTATTTACATTC-AAAATTTTAATAAGCAAGAAATTTTTAAAAAATAAAATTT-TTT
65 TA-TAAATTTATTAATATTCTAAAA--TTAATAAGTAA-AAA-TTTT-AAAAAT-AAATTTGTTT
* ** * * ** ** *
88043 ATCAAATAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCACTATGACCTTT
123 ATCTAAGCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGCAAATCGTTATGA-CATT
* * * * * * * * *
88108 TATTTTATCATAAAACAAATTGTTTTCGTGCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATCACTT
187 TGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATAT-AATT
*** * * * ** * *
88173 TATTAATATTTCCAAAATTGATAAGTGAGAGATTTCCAAAATCAATC-AGTTTA-TCAAA-TCAA
250 TATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-AAACT-AG
* * * * * *
88235 TTAAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCA
312 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCA
* ** * * * *
88300 TAACACAATTGTTT-TCCATCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTACTGATATT
377 TAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
88364 -TCATAAATTAATAAGTAAGAGA--T------T--ATTTGTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTA
441 CT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
88418 TGATTATTTGAATAATTATATATTTCAAATTGTTATAACC-TTTGTTATGTCATAAAACAATTAT
505 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTAT
* * * *
88482 TTCTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATGTAATAATA-TTCTAAAAATTAAT
570 TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* * ** * * * * * *
88546 AACTAA-AAATTTTTAAAAATAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAAACAATGAAGGCTATATGAA
634 AAGTAAGAAA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
* * * *
88610 CAATTCTTTATTTCAAATCGTT
698 CAATTATCTATTTCAAAACATT
** * ** *
88632 ATGACCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAA-T-TTT-T-T--T---AG-TT-CTTAGTATAAAATAAA
1 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAAT
* * * * * *
88686 ATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGATATTAAAAAAATAATTATGTTT-GCCA
66 ATAAATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATA-AATT-TGTTTATCTA
* * *
88749 AGCCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTTTTCCAAATCGTTATGACATTTGTTT
128 AG-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGCAAATCGTTATGACATTTGTTT
* * **
88814 TGTCATAAAATAGA-TGTTTTTGTTCATATAAG-TTGGTTTGGAATAAAATAATATTAATTTATT
192 TGTCATAAAATA-ATTGTTTTTGTTCATACAAGCTT-ATTCAGAATAAAATAATA-TAATTTATT
* * * *
88877 ACTATATT--GAAAATTAAGAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTATTTACTAAACCAGTTCA
254 A--ATATTAAAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCA
* * * * * * *
88939 ATTAGTTATAACTATTTTAACAATTATGTATTTCAAATCGTTATAATCATATGTTTTATCATAAA
316 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * * * *
89004 ATAATTGTTTCTGTCCATGC-AGTCTTATTCAGAATAAAATGATACTATTTTATTAATATTCTAA
381 ACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA
* * * * ** * * *
89068 AAATCAATAAGTAACAGATTGAAAAAATGAATTTGTTGGCTTG-ACTAA-TGCAAATAGTTATCA
445 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-CGAAC-AAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * *
89131 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTATCACAAAATAATTGTTTT
508 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC
* * * * * * *
89196 TGTTCGTACAAGCTTATTCGAAATAACATATTTCTACTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGT
573 TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * ** *
89261 AAGATATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATGACTAACTAAACAATT
638 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
* * **
89326 ATCTATTTTAAATCGCT
703 ATCTATTTCAAAACATT
* * * * * ** *
89343 ATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCTAATCATACAAGCCTATTTCCAATAAAATTA
1 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAA
* * *
89408 TACAAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTAT-
65 TATAAATTTATTAATATTCTA-A-AATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAAT-TTGTTTATC
** * * *
89470 TGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTG
126 T-AAGCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGCAAATCGTTATGACA-TTTG
* * * *
89535 TTTGGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAAT-ATTAATAAAATAATATAAATTTA
189 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCA-GAATAAAATAATAT-AATTTA
** * *
89599 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTAAAC-ATGTTCA
252 TTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTA-GTTCA
* * * * * *
89662 AATAGTAATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTCTTTTACCGTAAA
316 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAA
** * * *
89727 TTAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TAATTTATTAATAATCCAAA
381 ACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
* * * ** * *
89791 AACTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATTTGTTTACTGAGTAAGCTCAAATAGTTGTGACTA
446 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * ** * * *
89856 TTTGAACAATTATTTATTTCAAA-TACTTATGTTCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATG
511 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTG
* *
89920 TTCATACAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATGC--AAATTAATAGGT
575 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-T-CAAAAATTAATAAGT
* ** * * * * * * * *
89983 AGGGTATTTAAAAAATAAATTTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTTAACAATT
638 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATT
* ***
90048 ACCTATTTCAAATTGTT
703 ATCTATTTCAAAACATT
* * * * * * ** * *
90065 ATGACCCTTTGTCTTGTCGTAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAAATTATTCAAAAGAAAATAA
1 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAA
* * *
90130 TACT-AATTTATTAATA---T--AATTAAT-AG--AAGA-TTTAAAAACTAAATTTGTTTACCGA
65 TA-TAAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAA-TAAATTTGTTTATCTA
* * * *
90185 ATCAATTTAAATAGTTATGAC----T---C----AT-T-TT---AA---TT-TG-----TATTTT
128 AGCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGCAAATCGTTATGACATTTGTTTT
* * * * * *
90225 ATCATAAAATAATTGTTTCTT-TTCATATAAGCATATT-TGAATTAAAATAATACAAATTT-TAA
193 GTCATAAAATAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCAGAA-TAAAATAATA-TAATTTAT-T
* ** * * * * * * *
90287 AAAATTTCATAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTA-TCGAACCAGTTCAAA
254 AATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACTAGTTCAAA
* * * * * * * * * * **
90351 TAGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCATATCATTTTAACCTTCT-ATGCAGTCATAAAA
318 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTA-TCATAAAA
* ** * *
90415 CAATTATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCCGAATAAAATAAAACTAATTTATTAACATTC-AAA
382 CAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAA
* * * * * * * *
90478 ATTTTAATAAGCAAGAGACTTAAAAAATTAATTTTGTTTGCCGATCCAA-TTCAAATAATTATGA
446 A-ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA-TAAATTTGTTTACCGA-ACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * ** *
90542 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTTTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACATTTT
508 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTC
* * * ** * *
90607 TGTTCA-ATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-GAAAATTAATAAG-
573 TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * *** **
90669 --G-CATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAA-TTTTGATAGTTATA-ACTATTTGAGTAA
638 AAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAACAA
* * * *
90729 TTATTTATTTTAAATCTTT
701 TTATCTATTTCAAAACATT
* * * * * * * * * * **
90748 ACGACCATTTATTTTGTCATAAAGCAACTATTTTTGTTCACACAATCTTATTCAAAATAATTTAA
1 ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG-TCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAA
* * ** **
90813 TGCT-AATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAATGGA-TTTAGAAAAGGTATCTGTTGGCT
65 T-ATAAATTTATTAATATTCT-AAAATTAATAAGTAA-AAATTTTA-AAAA--TAAAT-TT-G-T
* * * * * *
90876 TGA-CT-AGC-G--CAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
121 TTATCTAAGCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGCAAATCGTTATGA-CA
* * * * * * *
90936 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTC-GAAATAACATAATTCTAG
185 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAA-TATAA
** * * * * **
91000 TTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAGAATGAATCTGTTTACCGAA-TAA
248 TTTATTAATATTAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AATAAATCTATTTACTAAACT-A
* * * *
91064 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGA-
311 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTT-AT
* * *
91128 CGTAAAACAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA
375 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAA
91168 TCTGTTTACT
Statistics
Matches: 3133, Mismatches: 638, Indels: 401
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
683 115 0.04
684 3 0.00
685 3 0.00
686 77 0.02
687 124 0.04
688 71 0.02
689 92 0.03
690 5 0.00
692 3 0.00
693 21 0.01
694 4 0.00
695 3 0.00
696 6 0.00
697 3 0.00
698 3 0.00
699 7 0.00
700 196 0.06
701 32 0.01
702 54 0.02
703 2 0.00
704 29 0.01
705 7 0.00
706 7 0.00
708 2 0.00
709 3 0.00
710 55 0.02
711 166 0.05
712 106 0.03
713 62 0.02
714 7 0.00
715 5 0.00
716 87 0.03
717 11 0.00
718 124 0.04
719 86 0.03
720 100 0.03
721 25 0.01
722 388 0.12
723 704 0.22
724 221 0.07
725 53 0.02
726 56 0.02
727 5 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (719 bp):
ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAAT
ATAAATTTATTAATATTCTAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAAATAAATTTGTTTATCTAAGC
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTGCAAATCGTTATGACATTTGTTTTGTC
ATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTA
AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAAATAGTTATG
ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
CTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG
TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
TATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGC
TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAA
AATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAA
CATT
Found at i:90596 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 90292--91167 Score: 701
Period size: 181 Copynumber: 4.9 Consensus size: 179
90282 TTTAAAAAAT
* ** * * * * *
90292 TTCATAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAACAAATATGTTTATCGAACCAGTTCAAATAGTTA
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATTAATCTGTTTACCGATCTAATTCAAATAGTTA
* * * * * * ***
90357 AGATTATTAGAACAATTATCTATTTCATATCATTT-TAACCTTCTATGCAGTCATAAAACAATTA
65 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-TTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTA
** * *
90421 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCCGAATAAAATAAAACTAATTTATTAACA
129 TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
90472 TTCAAAATTTTAATAAGCAAGAGACTTAAAAAATTAATTTTGTTTGCCGATCCAATTCAAATAAT
1 TTCAAAA-ATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAAATTAA-TCTGTTTACCGATCTAATTCAAATAGT
* * * * **
90537 TATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTTTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAAC
63 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * *
90602 ATTTTTGTTCA-ATAAGTTTGTTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA
128 ATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * ***
90653 TTTGAAAATTAATAAG---GCATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAATTTTGATAGTTAT
1 TTCAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACCGATCTAATTCAAATAGTTAT
* ** * * ** * * * *
90715 AACTATTTGAGTAATTATTTATTTTAAATCTTTACGACCATTTATTTTGTCATAAAGCAACTATT
66 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * ** * *
90780 TTTGTTCACACAATCTTATTCAAAATAATTTAATGCTAATTTATTAGTA
131 TTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** ** * ***
90829 TTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAGAAAAGGT-ATCTGTTGGCTTGA-CTAGCGCAAATAG
1 TTC-AAAAATTAATAAGTAA-GGATTTA-AAAAATTAATCTGTTTAC-CGATCTAATTCAAATAG
* *
90892 TTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
62 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * *
90957 TGTTTCTA-TTCGTACAAGCTTATTCGAAATAACATAATTCTAGTTTATTAATA
127 TATTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
91010 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAGAATGAATCTGTTTACCGA-ATAAGTTCAAATAG
1 TT-CAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAA-AATTAATCTGTTTACCGATCTAA-TTCAAATAG
* ** * *
91074 TTATGACTATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATAGTTATAACCTTTTGTTTTGACGTAAAACAAT
62 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
*
91139 TTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAA
127 TATTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAA
91168 TCTGTTTACT
Statistics
Matches: 543, Mismatches: 135, Indels: 33
0.76 0.19 0.05
Matches are distributed among these distances:
175 82 0.15
176 44 0.08
177 13 0.02
180 18 0.03
181 203 0.37
182 178 0.33
183 5 0.01
ACGTcount: A:0.39, C:0.11, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TTCAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAATTAATCTGTTTACCGATCTAATTCAAATAGTTAT
GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCTTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
TTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
Found at i:91112 original size:17 final size:18
Alignment explanation
Indices: 91065--91113 Score: 57
Period size: 17 Copynumber: 2.8 Consensus size: 18
91055 ACCGAATAAG
91065 TTCAAATAGTTATGACTAT
1 TTCAAATAGTTAT-ACTAT
* *
91084 TT-GAACAGTTAT-CTAT
1 TTCAAATAGTTATACTAT
91100 TTCAAATAGTTATA
1 TTCAAATAGTTATA
91114 ACCTTTTGTT
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 4, Indels: 5
0.73 0.12 0.15
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.25
17 8 0.33
18 8 0.33
19 2 0.08
ACGTcount: A:0.37, C:0.10, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (18 bp):
TTCAAATAGTTATACTAT
Found at i:91527 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 91255--93238 Score: 809
Period size: 181 Copynumber: 11.2 Consensus size: 180
91245 TGACTATATG
* * * * *
91255 TTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATATTATTAATTTAT
1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * *
91320 TAATATTTCGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAACATGTTTA-TCATAGAAGTTTAA
66 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTATTCA-AGAAGTTCAA
* **
91384 ATAGTAATAACTATTTAGATA-ATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTA
130 ATAGTAATAACTAATT-GA-ACATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* * * * *
91436 TTTTATCATAAAACAATTGTATCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAACAATATTAACTTAT
1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * * *
91501 TCATATTTCAAAAACTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAATGAATATGTTTATTGAATAAGTTCAAA
66 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTATTCAAGAAGTTCAAA
* * * *
91566 TAGTTATCACTAATTGAACTATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTG
131 TAGTAATAACTAATTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* ** *
91617 TTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATATAAATTTA
1 TTTTATCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* * *
91681 CTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAG-TTTAAAAAATAAA-ATCTATT-TTCTAA-ACACAT
65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGT-TTATTC-AAGA-A-GT
** * * * ** * *
91742 TCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCATATCGTTATGACCTTTTG
126 TCAAATAGTAATAACTAATTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* * * * *
91798 TTTTGTCATAAACCAATTGCTTTT--TTGCATAAAAGCTT-TT----TTAAAATAATACT-ATTT
1 TTTTATCATAAAACAATTG-TTTTAGTT-CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * *
91855 ATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TTGGTTTA-CCAAGTGAGTT
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACAT-GTTTATTCAAG-AAGTT
* * * * * * * * ** *
91918 CAAATAGTTATGACTATTTAAAGAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTG
127 CAAATAGTAATAACTAATTGAA-CATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* * * * * *
91973 TATTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAGAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTATCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* *** ** * * ** *
92037 TTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA-TCGAATAAACTCC
65 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTATTC-AAGAAGTTCA
* ** * * * * * ** * *
92100 AATAGTCATGTCCATTTAAACTATTATCGATTTTAAATCGTTATGACATTTTA
129 AATAGTAATAACTAATTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* * * ** *
92153 TTTTGT-AGTAAAACATTTTTTTCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTTATCA-TAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* * * *
92216 ATTAATGTTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAAAACTAAATC-TGTTTA-CCAA-ACTAGT
64 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-CATGTTTATTCAAGA--AGT
* * * *** * * *
92274 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGGTATGATC-TTTG
126 TCAAATAGTAATAACTAATTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* * * * * * * * * *
92329 TTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTA-TTCTTACTAA-CTTATTTAGAGTAAAATATTACTAAACT
1 TTTTATCATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-TTAATT
* * * *
92392 GA-TAATATAAT-AAAAATTAATAA-CAAAGAGATTTAAAAAATAAA-ATGTGTCTA-CCAA-AC
63 TATTAATAT-TTCAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTTAAAAAATAAACATGT-T-TATTCAAGA-
* * ** * * ** * *
92451 CAATTCAAATAGTTAGGACT-ATTAGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACCTTTT-
123 -AGTTCAAATAGTAATAACTAATT-GAA-CATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* * * * * * * * *
92510 GTTTAGTTATAACATAATTGTTTCAATTCATACATGCTTATTTC-AAATAAAATAATAGTATTTT
1 TTTTA-TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTAATTT
* ** * * * * * * * *
92574 ATTAA-AGTAGAAAATATTAACAAG-CAAGGAATTTAAGAAAACAAATC-TGTTTACTAAACAAA
64 ATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAAAG-ATTTAA-AAAATAAA-CATGTTTATTCAAGAAG
* * * * * * * * *
92636 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTG
125 TTCAAATAGTAATAACTAATTGAA-CATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* * * * * **
92693 TTTTATCATAAAACAATTATTTTAGTTTATAAAAGCTTATCCAAAATTAAATAATATTACCTTAT
1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
* * * * *** *
92758 TAGTATTTCAAAAGTTGAGAAGTTGGAGACTTAAAAAATAAA-ATAGTTTA-TCAA-ATTAGTTC
66 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACAT-GTTTATTCAAGA--AGTTC
* *** *
92820 AAATAG---T---T--TTG-GC-----C-ATTTCAAATTGTTATGAA-CTTTTG
128 AAATAGTAATAACTAATTGAACATTATCTATTTCAAATCACTAT-AACCTTTTA
* * *** * * *
92858 TTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAGCCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
** * ** *
92923 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA-TT-----AT---C-TATTTA-TCGAACCAGTTTAA
66 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTATTC-AAGAAGTTCAA
* * * * * *
92977 AAAGTTATAACTATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTA
130 ATAGTAATAACTAATTGAA-CATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* ** * ** * * *
93029 TTTTGTCATAAAACAA-TAATTTATGTTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAGTCTA
1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTA
* * * * * * ** * *
93093 ATAATAGTAT-GAAAATTAATAAGGAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTA-CCAA-ACCAATT
65 TTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTATTCAAGA--AGTT
* ** * *
93155 CAAATAGT--TAAGGCT-ATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
127 CAAATAGTAATAA--CTAAT-TGAA-CATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
* *
93210 TTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCA
1 TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA
93239 AATAAGTTTG
Statistics
Matches: 1406, Mismatches: 289, Indels: 216
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
155 15 0.01
156 3 0.00
158 1 0.00
159 2 0.00
161 1 0.00
163 3 0.00
164 2 0.00
165 94 0.07
166 2 0.00
170 7 0.00
171 89 0.06
172 4 0.00
173 3 0.00
174 3 0.00
175 111 0.08
176 87 0.06
177 75 0.05
178 3 0.00
179 19 0.01
180 202 0.14
181 483 0.34
182 168 0.12
183 25 0.02
184 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTAT
TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAACATGTTTATTCAAGAAGTTCAAA
TAGTAATAACTAATTGAACATTATCTATTTCAAATCACTATAACCTTTTA
Found at i:92023 original size:356 final size:352
Alignment explanation
Indices: 91215--93233 Score: 1211
Period size: 356 Copynumber: 5.7 Consensus size: 352
91205 TGAACAATTA
* * * ** * * * * *
91215 ATTTGAATAATTATTTATTTTAAATTGTTATGACTATATGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * *
91280 TTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATATTA-TTAATTTATTAATATTTCGACAATTAGTAAGT
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
91343 AAAAGATTTTAAAAATAAACATGT-TTATCATAGAAGTTTAAATAGTAATAACTATTT-AGATAA
130 AAAAGATTTAAAAAATAAA-ATGTATTTTC-TAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAA
* * * * ** *
91406 TTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTATCAGTTCATATAAG
192 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT-T-TTTTCATAAAAG
* * * * * *
91471 CTTATTCAAAATAAAACAATATTAACTTATTCATATTTCAAAAACTAATGAGTAAAAGATTTAAA
255 CTTTTTTAAAATAATAC--TA-T---TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* ** *
91536 AAATGAATATGTTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATCACT
314 AAATAAATATGTTTA-CCAAT-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
91577 AATTGAACTATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
*
91642 TTCATACAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATA-TAAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
66 TTCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
* *
91705 AAAAG-TTTAAAAAATAAAATCTATTTTCTAAACACATTCAAATAGTTTTGACTATTTGAACAAT
130 AAAAGATTTAAAAAATAAAATGTATTTTCTAAA-A-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
91769 TATCTATTTCATATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGCTTTTTTGCATAAAAGC
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTT-CATAAAAGC
*
91834 TTTTTTAAAATAATACTATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
256 TTTTTTAAAATAATACTATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
91899 T-TGGTTTACCAAGTGAGTTCAAATAGTTATGACT
321 TAT-GTTTACCAA-T-AGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
91933 ATTTAAAGAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTGTATTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * *
91998 TTCATAGAAGTTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCTAAAATTAATAAGTT
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
** * * * * * * * * *
92061 GGAGATTTAAAAAAT-AAATTTATTTATCGAATAAACTCCAATAGTCATGTCCATTTAAACTATT
131 AAAGATTTAAAAAATAAAATGTATTT-TCTAA-AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * *
92125 ATCGATTTTAAATCGTTATGACATTTTATTTTGT-AGTAAAACATTTTTTTCTATTCATACAAA-
194 ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCA-TAAAACAATTGTTT-T-TTCATA-AAAG
* * * *
92188 ATTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTTCAAAAATT-A-AA--AAGAGATTTAAA
255 CTT-TT----TTAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* *
92249 AACTAAATCTGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACT
314 AAATAAATATGTTTACC-AA-TAGTTCAAATAGTTATGACT
*** * * *
92290 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGGTATGA-TCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * *
92354 TTCTTACTAA-CTTATT-TAGAGTAAAATATTACTAAACTGA-TAATATAAT-AAAAATTAATAA
66 TTCATAC-AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * *
92415 -CAAAGAGATTTAAAAAATAAAATGTGTCTACCAAACCAATTCAAATAGTTAGGACTATTAGAAT
128 GTAAA-AGATTTAAAAAATAAAATGTATTTTCTAAA--AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * * *
92479 AATTATCTATTTTAAATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGTTATAACATAATTGTTTCAATTCATACA
190 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT--TTTCATAAA
* * * ** * * *
92544 TGCTTATTTCAAATAAAATAATAGTATTTTATTAA-AGTAGAAAATATTAACAAG-CAAGGAATT
253 AGCTT-TTT----TAAAATAATACTA-TTTATTAATATTTCAAAA-ATTAATAAGTAAAAG-ATT
* * * * * *
92607 TAAGAAAACAAATCTGTTTACTAAACAAATTTAAATAGTTATGACT
310 TAA-AAAATAAATATGTTTAC-CAA-TAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * *
92653 ATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TA
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * ** * * * *
92717 GTTTATAAAAGCTTATCCAAAATTAAATAATA-TTACCTTATTAGTATTTCAAAAGTTGAGAAGT
66 -TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
*** * * * *
92781 TGGAGACTTAAAAAATAAAATAGT-TTATC-AAATTAGTTC-AA-A--TA-G--T-TTTG-GC--
130 AAAAGATTTAAAAAATAAAAT-GTATTTTCTAAA--AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
92833 ----C-ATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTCATCATACAAG
192 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT--TCATAAAAG
** **
92893 CCTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGA-TT---
255 -CT-TT---TTTAAAATAATACT-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* * * * * *
92954 --AT--CTA--TTTATCGAACCAGTTTAAAAAGTTATAACT
314 AAATAAATATGTTTA-CCAA-TAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * ** * *
92989 ATTTGAATAATTATATATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATAATTTATG
1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
* * * * * * * *
93054 TTCATACTAGCTTATTCGGAATAAAATAATACT-AGTCTAATAATAGTAT-GAAAATTAATAAGG
66 TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * * *
93117 AAGAGATTTAAAAACT-AAATTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAAT
130 AAAAGATTTAAAAAATAAAATGTATTTTCTAAA--AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
93181 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTT
193 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
93234 GTTCAAATAA
Statistics
Matches: 1289, Mismatches: 277, Indels: 192
0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
334 1 0.00
335 7 0.01
336 138 0.11
337 7 0.01
338 2 0.00
340 3 0.00
341 1 0.00
343 1 0.00
344 3 0.00
345 1 0.00
346 2 0.00
347 73 0.06
348 12 0.01
349 1 0.00
351 1 0.00
352 43 0.03
354 4 0.00
355 101 0.08
356 236 0.18
357 113 0.09
358 106 0.08
359 7 0.01
360 23 0.02
361 42 0.03
362 201 0.16
363 84 0.07
364 73 0.06
365 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (352 bp):
ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA
TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
AAAGATTTAAAAAATAAAATGTATTTTCTAAAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTCATAAAAGCTTTTT
TAAAATAATACTATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT
TTACCAATAGTTCAAATAGTTATGACT
Found at i:94098 original size:151 final size:153
Alignment explanation
Indices: 93872--94164 Score: 360
Period size: 151 Copynumber: 1.9 Consensus size: 153
93862 TTATGAGCAT
* * * *
93872 AAACAATTATTTTATGATAGAACAAAAAGTTATAACAATTTAAAATAGATCATTGTTAAAATAGT
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAGATCATTGTTAAAATAGC
* * *
93937 CATAACTATTTGAACT-AGTTCGATAAACAGATTTATTTTTTTAA-TTTCCT-ATTAATTCTTGA
66 CATAACTATTTGAACTGAGTTAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTGATTAATTCTTGA
93999 AATATTAATAAGCTTGTAATTGAA
130 AATATTAATAAGCTTGTAATTGAA
* * ** * *
94023 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTAATAATGATTTGAAATAGAT-AGTTGTTCAAATAG
1 AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAGATCA-TTGTTAAAATAG
* * * * *
94087 CCATAATTATTTGAATTGATTTAGTAAACTGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTT
65 CCATAACTATTTGAACTGAGTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAA--TTTTACTGATTAATTCTT
94152 GAAATATTAATAA
128 GAAATATTAATAA
94165 AATAGTATTA
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 18, Indels: 8
0.82 0.12 0.06
Matches are distributed among these distances:
150 1 0.01
151 86 0.73
152 4 0.03
154 5 0.04
155 22 0.19
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (153 bp):
AAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTAATAACAATTTAAAATAGATCATTGTTAAAATAGC
CATAACTATTTGAACTGAGTTAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATTTTACTGATTAATTCTTGAA
ATATTAATAAGCTTGTAATTGAA
Found at i:94734 original size:359 final size:362
Alignment explanation
Indices: 94056--94744 Score: 856
Period size: 361 Copynumber: 1.9 Consensus size: 362
94046 AAAATGTAAT
* * * * * * **
94056 AATGATTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGCCATAATTATTTGAATTGATTTAGTAAACTGATT
1 AATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGCAAACACATT
* ****
94121 TATTTTTTAAATCTTTTACTGATTAATTTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTTTGG
66 TATTTTTTAAATC--TTACTGATTAAATTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAA
* * *
94186 ATAAGCTTCTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAATGATTTTAAATA
129 ATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATA
* * * *
94251 GATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAACAGATTTAATTTTTCAAATC
194 GATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAACAGATTTAATTTTTCAAATC
*
94316 TCTTGCTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATG
259 TCTTGCTTATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATG
94381 AACTGAAACAATTATTATATGACTACACAAAAAAATCCA
324 AACTGAAACAATTATTATATGACTACACAAAAAAATCCA
* * * * *
94420 AATGATTTCAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTAGCAAACACCTT
1 AATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGCAAACACATT
* * *
94485 TATTTTTTAAAATC-T-CTTATTAAATTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTCA-TCCAA
66 TATTTTTT-AAATCTTACTGATTAAATTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTT-ATTCCAA
* * *
94547 ATAAGCTTATATGATC-AGAAACAATTGTTTTATAAGAAAATAAAA-ATCATAATGA-TTTAAGA
129 ATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATATCATAATGATTTTAA-A
* * * * * *
94609 TTGATATTTGTTCAAAGAGTCATAACTATTT-AACCTGGTTTGAAAAATAGCTTTAGTTTTT-AA
192 TAGATAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAA-CTGGTTCGAAAAACAGATTTAATTTTTCAA
* * ** *
94672 ATCTTTTGCTTATTAA-TGTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCTGATAAGCTTT
256 ATCTCTTGCTTATTAATTGTTTG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTA
94736 TATGAACTG
320 TATGAACTG
94745 TGTGGACACT
Statistics
Matches: 276, Mismatches: 43, Indels: 17
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
358 5 0.02
359 70 0.25
360 59 0.21
361 75 0.27
362 2 0.01
364 60 0.22
365 5 0.02
ACGTcount: A:0.39, C:0.09, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (362 bp):
AATGATTTCAAATAGATAATTATTCAAATAGCCATAACTATTTGAACTGATTTAGCAAACACATT
TATTTTTTAAATCTTACTGATTAAATTTTGAAATATTAATAAAATAGTATTATTTTATTCCAAAT
AAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATAACAAAACAAAATATCATAATGATTTTAAATAGA
TAATTGTTCAAAGAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGAAAAACAGATTTAATTTTTCAAATCTC
TTGCTTATTAATTGTTTGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTATATGAA
CTGAAACAATTATTATATGACTACACAAAAAAATCCA
Found at i:96152 original size:57 final size:57
Alignment explanation
Indices: 96029--96192 Score: 154
Period size: 57 Copynumber: 2.8 Consensus size: 57
96019 TGCTTTTGTA
** ** *
96029 CAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCC-CCAAAATGTTTTTCTG-AAACTTTAATTT
1 CAAGGAAAATTGATACTTTCAAC-TTTCCTAAAAAAAATTTTT-AGAAAACTTTAATTT
* * *
96086 CGAGAAAAATTGATACTTTCAACATTTCCTAAAAAAAATTTTTAGAAAAC-TTATTTT
1 CAAGGAAAATTGATACTTTCAAC-TTTCCTAAAAAAAATTTTTAGAAAACTTTAATTT
* *
96143 TAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATATATTTTTTAGAA
1 CAAGGAAAATTGATACTTTCAACTT-TCCT-AAAAA-A-AATTTTTAGAA
96193 TTTTTATTTA
Statistics
Matches: 88, Mismatches: 13, Indels: 9
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
56 2 0.02
57 57 0.65
58 18 0.20
59 1 0.01
60 10 0.11
ACGTcount: A:0.39, C:0.15, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (57 bp):
CAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTCCTAAAAAAAATTTTTAGAAAACTTTAATTT
Found at i:96224 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 96214--96278 Score: 76
Period size: 5 Copynumber: 12.0 Consensus size: 5
96204 AGAAAATCAA
*
96214 AAAAT AAAAT AAAAT AAAAAT AAAAAT AAAGAT AAAAAT AGAAT AAAATT
1 AAAAT AAAAT AAAAT -AAAAT -AAAAT AAA-AT -AAAAT AAAAT AAAA-T
96264 AAAAT AAAAT AAAAT
1 AAAAT AAAAT AAAAT
96279 CAGAAATACT
Statistics
Matches: 54, Mismatches: 2, Indels: 8
0.84 0.03 0.12
Matches are distributed among these distances:
5 31 0.57
6 20 0.37
7 3 0.06
ACGTcount: A:0.77, C:0.00, G:0.03, T:0.20
Consensus pattern (5 bp):
AAAAT
Found at i:96233 original size:11 final size:11
Alignment explanation
Indices: 96213--96278 Score: 82
Period size: 11 Copynumber: 6.0 Consensus size: 11
96203 AAGAAAATCA
96213 AAAAATAAAAT
1 AAAAATAAAAT
96224 -AAAATAAAAAT
1 AAAAAT-AAAAT
96235 AAAAATAAAGAT
1 AAAAATAAA-AT
*
96247 AAAAATAGAAT
1 AAAAATAAAAT
*
96258 AAAATTAAAAT
1 AAAAATAAAAT
96269 -AAAATAAAAT
1 AAAAATAAAAT
96279 CAGAAATACT
Statistics
Matches: 48, Mismatches: 4, Indels: 7
0.81 0.07 0.12
Matches are distributed among these distances:
10 14 0.29
11 19 0.40
12 15 0.31
ACGTcount: A:0.77, C:0.00, G:0.03, T:0.20
Consensus pattern (11 bp):
AAAAATAAAAT
Found at i:96317 original size:16 final size:15
Alignment explanation
Indices: 96298--96346 Score: 57
Period size: 16 Copynumber: 3.2 Consensus size: 15
96288 TAAATAATTC
96298 TAATATAATCAATAAA
1 TAATATAAT-AATAAA
96314 TAATAATAATAATAAA
1 TAAT-ATAATAATAAA
96330 TAA-ATAAATAA-AAA
1 TAATAT-AATAATAAA
96344 TAA
1 TAA
96347 AAAAATAAAT
Statistics
Matches: 31, Mismatches: 0, Indels: 6
0.84 0.00 0.16
Matches are distributed among these distances:
14 8 0.26
15 5 0.16
16 13 0.42
17 5 0.16
ACGTcount: A:0.69, C:0.02, G:0.00, T:0.29
Consensus pattern (15 bp):
TAATATAATAATAAA
Found at i:96321 original size:28 final size:24
Alignment explanation
Indices: 96298--96356 Score: 77
Period size: 24 Copynumber: 2.5 Consensus size: 24
96288 TAAATAATTC
* *
96298 TAATATAATCAATAAATAATAATAA
1 TAATA-AATAAATAAATAAAAATAA
96323 TAATAAATAAATAAATAAAAATAA
1 TAATAAATAAATAAATAAAAATAA
96347 -AA-AAATAAAT
1 TAATAAATAAAT
96357 GAAAAAAGAA
Statistics
Matches: 32, Mismatches: 2, Indels: 3
0.86 0.05 0.08
Matches are distributed among these distances:
22 8 0.25
23 2 0.06
24 17 0.53
25 5 0.16
ACGTcount: A:0.71, C:0.02, G:0.00, T:0.27
Consensus pattern (24 bp):
TAATAAATAAATAAATAAAAATAA
Found at i:96335 original size:14 final size:14
Alignment explanation
Indices: 96302--96356 Score: 53
Period size: 14 Copynumber: 3.9 Consensus size: 14
96292 TAATTCTAAT
96302 ATAATCAATAAATAATA
1 ATAAT-AATAAAT-A-A
96319 ATAATAATAAATAA
1 ATAATAATAAATAA
96333 ATAAATAA-AAATAA
1 AT-AATAATAAATAA
96347 A-AA-AATAAAT
1 ATAATAATAAAT
96357 GAAAAAAGAA
Statistics
Matches: 36, Mismatches: 0, Indels: 9
0.80 0.00 0.20
Matches are distributed among these distances:
11 2 0.06
12 6 0.17
14 10 0.28
15 6 0.17
16 7 0.19
17 5 0.14
ACGTcount: A:0.73, C:0.02, G:0.00, T:0.25
Consensus pattern (14 bp):
ATAATAATAAATAA
Found at i:96369 original size:18 final size:18
Alignment explanation
Indices: 96318--96362 Score: 63
Period size: 18 Copynumber: 2.4 Consensus size: 18
96308 AATAAATAAT
* *
96318 AATAATAATAAATAAATA
1 AATAAAAATAAAAAAATA
96336 AATAAAAATAAAAAAATA
1 AATAAAAATAAAAAAATA
96354 AATGAAAAA
1 AAT-AAAAA
96363 AGAAAAAAAA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 1
0.89 0.07 0.04
Matches are distributed among these distances:
18 19 0.79
19 5 0.21
ACGTcount: A:0.78, C:0.00, G:0.02, T:0.20
Consensus pattern (18 bp):
AATAAAAATAAAAAAATA
Found at i:97285 original size:22 final size:23
Alignment explanation
Indices: 97260--97306 Score: 87
Period size: 22 Copynumber: 2.1 Consensus size: 23
97250 ACAAAAAATG
97260 TTAATAGATAAA-AATAAATATA
1 TTAATAGATAAATAATAAATATA
97282 TTAATAGATAAATAATAAATATA
1 TTAATAGATAAATAATAAATATA
97305 TT
1 TT
97307 TAAAAAAAAA
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 0, Indels: 1
0.96 0.00 0.04
Matches are distributed among these distances:
22 12 0.50
23 12 0.50
ACGTcount: A:0.60, C:0.00, G:0.04, T:0.36
Consensus pattern (23 bp):
TTAATAGATAAATAATAAATATA
Found at i:97318 original size:24 final size:23
Alignment explanation
Indices: 97272--97323 Score: 68
Period size: 24 Copynumber: 2.2 Consensus size: 23
97262 AATAGATAAA
* * *
97272 AATAAATATATTAATAGATAAAT
1 AATAAATATATTAAAAAAAAAAT
97295 AATAAATATATTTAAAAAAAAAAT
1 AATAAATATA-TTAAAAAAAAAAT
97319 AATAA
1 AATAA
97324 TAACACTAAT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 3, Indels: 1
0.86 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
23 10 0.40
24 15 0.60
ACGTcount: A:0.67, C:0.00, G:0.02, T:0.31
Consensus pattern (23 bp):
AATAAATATATTAAAAAAAAAAT
Found at i:97614 original size:45 final size:43
Alignment explanation
Indices: 97538--97665 Score: 127
Period size: 45 Copynumber: 3.0 Consensus size: 43
97528 AAATTTTGAT
* * * *
97538 CAAAGCTCCTTTAAGCAGATGTTCAACGACTTTGAAAAACATAAA
1 CAAAGCTCTTTTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAA-AT-AA
*
97583 CAAAGCTCTTTTAATCAGAGGCTCAATGACTTTG--AAAATAA
1 CAAAGCTCTTTTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAAATAA
** *
97624 -ATGGCTCTTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTAGAAATAAAT
1 CAAAGCTCTTTTAATCAGAGGCTCAACGACTTT-GAAA-AAAT
97666 GGCTCCTTAA
Statistics
Matches: 70, Mismatches: 9, Indels: 9
0.80 0.10 0.10
Matches are distributed among these distances:
40 28 0.40
41 3 0.04
42 2 0.03
43 4 0.06
44 4 0.06
45 29 0.41
ACGTcount: A:0.39, C:0.19, G:0.15, T:0.27
Consensus pattern (43 bp):
CAAAGCTCTTTTAATCAGAGGCTCAACGACTTTGAAAAAATAA
Found at i:97638 original size:40 final size:40
Alignment explanation
Indices: 97587--97670 Score: 134
Period size: 40 Copynumber: 2.1 Consensus size: 40
97577 CATAAACAAA
* *
97587 GCTCTTTTAATCAGAGGCTCAATGACTTT-GAAAATAAATG
1 GCTCTTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTAG-AAATAAATG
97627 GCTCTTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTAGAAATAAATG
1 GCTCTTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTAGAAATAAATG
97667 GCTC
1 GCTC
97671 CTTAATAATC
Statistics
Matches: 41, Mismatches: 2, Indels: 2
0.91 0.04 0.04
Matches are distributed among these distances:
40 40 0.98
41 1 0.02
ACGTcount: A:0.33, C:0.19, G:0.18, T:0.30
Consensus pattern (40 bp):
GCTCTTCTAATCAGAGGCTCAACGACTTTAGAAATAAATG
Found at i:98689 original size:11 final size:10
Alignment explanation
Indices: 98675--98771 Score: 63
Period size: 11 Copynumber: 9.1 Consensus size: 10
98665 TTTTCATTCA
98675 CTTTTTCTTTT
1 CTTTTT-TTTT
98686 CTTTTTTTTTT
1 C-TTTTTTTTT
98697 CTTTTCATTTTT
1 CTTTT--TTTTT
**
98709 -TTTCATTTT
1 CTTTTTTTTT
98718 CATTTTTTTTT
1 C-TTTTTTTTT
*
98729 C-ATTTTTTT
1 CTTTTTTTTT
*
98738 CATTTTTCATTT
1 C-TTTTT-TTTT
*
98750 CATTTTTTTCT
1 C-TTTTTTTTT
98761 CTTTTTTTTT
1 CTTTTTTTTT
98771 C
1 C
98772 AAGCATAGTA
Statistics
Matches: 68, Mismatches: 10, Indels: 17
0.72 0.11 0.18
Matches are distributed among these distances:
9 12 0.18
10 13 0.19
11 23 0.34
12 20 0.29
ACGTcount: A:0.07, C:0.14, G:0.00, T:0.78
Consensus pattern (10 bp):
CTTTTTTTTT
Found at i:98697 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 98676--98770 Score: 88
Period size: 16 Copynumber: 6.0 Consensus size: 16
98666 TTTCATTCAC
98676 TTTTTCTTTTCTTTTT
1 TTTTTCTTTTCTTTTT
*
98692 TTTTTCTTTTC-ATTT
1 TTTTTCTTTTCTTTTT
*
98707 TTTTTCATTTTCATTTT
1 TTTTTC-TTTTCTTTTT
**
98724 TTTTTCATTTT-TTTCA
1 TTTTTC-TTTTCTTTTT
* *
98740 TTTTTCATTTCATTTT
1 TTTTTCTTTTCTTTTT
*
98756 TTTCTCTTTT-TTTTT
1 TTTTTCTTTTCTTTTT
98771 CAAGCATAGT
Statistics
Matches: 64, Mismatches: 12, Indels: 7
0.77 0.14 0.08
Matches are distributed among these distances:
15 16 0.25
16 34 0.53
17 14 0.22
ACGTcount: A:0.07, C:0.13, G:0.00, T:0.80
Consensus pattern (16 bp):
TTTTTCTTTTCTTTTT
Found at i:98711 original size:21 final size:21
Alignment explanation
Indices: 98677--98772 Score: 61
Period size: 21 Copynumber: 4.3 Consensus size: 21
98667 TTCATTCACT
98677 TTTTC-TTTTCTTTTTTTTTTC
1 TTTTCATTTT-TTTTTTTTTTC
*
98698 TTTTCATTTTTTTTCATTTTCATTTTT
1 TTTTCA--TTTTTT--TTTT--TTTTC
**
98725 TTTTCATTTTTTTCATTTTTC
1 TTTTCATTTTTTTTTTTTTTC
* *
98746 ATTTCATTTTTTTCTCTTTTT-
1 TTTTCATTTTTTT-TTTTTTTC
98767 TTTTCA
1 TTTTCA
98773 AGCATAGTAT
Statistics
Matches: 59, Mismatches: 8, Indels: 16
0.71 0.10 0.19
Matches are distributed among these distances:
21 26 0.44
22 5 0.08
23 4 0.07
24 4 0.07
25 10 0.17
27 10 0.17
ACGTcount: A:0.08, C:0.14, G:0.00, T:0.78
Consensus pattern (21 bp):
TTTTCATTTTTTTTTTTTTTC
Found at i:98735 original size:27 final size:28
Alignment explanation
Indices: 98692--98749 Score: 93
Period size: 27 Copynumber: 2.1 Consensus size: 28
98682 TTTTCTTTTT
98692 TTTTTCTTTTCATTTTTTTTCA-TTTTCA
1 TTTTTCTTTTCA-TTTTTTTCATTTTTCA
98720 TTTTT-TTTTCATTTTTTTCATTTTTCA
1 TTTTTCTTTTCATTTTTTTCATTTTTCA
98747 TTT
1 TTT
98750 CATTTTTTTC
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 0, Indels: 3
0.91 0.00 0.09
Matches are distributed among these distances:
26 9 0.31
27 15 0.52
28 5 0.17
ACGTcount: A:0.10, C:0.12, G:0.00, T:0.78
Consensus pattern (28 bp):
TTTTTCTTTTCATTTTTTTCATTTTTCA
Found at i:98769 original size:32 final size:32
Alignment explanation
Indices: 98671--98769 Score: 112
Period size: 32 Copynumber: 3.1 Consensus size: 32
98661 TCCTTTTTCA
* * *
98671 TTCACTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTCAT
1 TTCA-TTTTTCATTTCATTTTTTTTTCTTTT-TT
*
98705 TT--TTTTTCATTTTCATTTTTTTTTCATTTTT
1 TTCATTTTTCA-TTTCATTTTTTTTTCTTTTTT
*
98736 TTCATTTTTCATTTCATTTTTTTCTCTTTTTT
1 TTCATTTTTCATTTCATTTTTTTTTCTTTTTT
98768 TT
1 TT
98770 TCAAGCATAG
Statistics
Matches: 56, Mismatches: 6, Indels: 8
0.80 0.09 0.11
Matches are distributed among these distances:
31 9 0.16
32 38 0.68
33 7 0.12
34 2 0.04
ACGTcount: A:0.08, C:0.14, G:0.00, T:0.78
Consensus pattern (32 bp):
TTCATTTTTCATTTCATTTTTTTTTCTTTTTT
Found at i:108914 original size:58 final size:58
Alignment explanation
Indices: 108788--109008 Score: 311
Period size: 57 Copynumber: 3.8 Consensus size: 58
108778 TTTGTACAAG
*
108788 GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAACCCTTTTTTAGAAAA-TTATTTTCAAA
1 GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAA--ATTTTTTAGAAAACTTATTTTCAAA
* * *
108847 GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCGAAAATATTTTTTAGAAAACTTATTTTCAAG
1 GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAAATTTTTTAGAAAACTTATTTTCAAA
* *
108905 GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCC-CAAAAAAAATTTTTAGAAAACTTATTTTTAAA
1 GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAAATTTTTTAGAAAACTTATTTTCAAA
* * * *
108962 AAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATATTTTTTAAGAAAA
1 GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAAATTTTTT-AGAAAA
109009 ATTGATACTT
Statistics
Matches: 145, Mismatches: 14, Indels: 6
0.88 0.08 0.04
Matches are distributed among these distances:
57 62 0.43
58 46 0.32
59 37 0.26
ACGTcount: A:0.41, C:0.14, G:0.06, T:0.39
Consensus pattern (58 bp):
GAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCTCAAAAAAATTTTTTAGAAAACTTATTTTCAAA
Found at i:109012 original size:43 final size:43
Alignment explanation
Indices: 108954--109050 Score: 178
Period size: 43 Copynumber: 2.3 Consensus size: 43
108944 AGAAAACTTA
*
108954 TTTTTAAAAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATAT
1 TTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATAT
108997 TTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATAT
1 TTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATAT
109040 TTTTT-AGAAAA
1 TTTTTAAGAAAA
109051 CTCATTTTCA
Statistics
Matches: 53, Mismatches: 1, Indels: 1
0.96 0.02 0.02
Matches are distributed among these distances:
42 6 0.11
43 47 0.89
ACGTcount: A:0.41, C:0.12, G:0.04, T:0.42
Consensus pattern (43 bp):
TTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATAT
Found at i:109071 original size:101 final size:101
Alignment explanation
Indices: 108895--109109 Score: 306
Period size: 101 Copynumber: 2.1 Consensus size: 101
108885 TTAGAAAACT
* * * * *
108895 TATTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTTTCCCAAAAAAAATTTTTAGAAAACTTATTTTTA
1 TATTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCCAAAAAAAATTTTTAGAAAACTCATTTTCA
*
108960 AAAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATA
66 AAAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATA
* * *
108996 T-TTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATATTTTTTAGAAAACTCATTTTC
1 TATTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCC-CAAAAAAAATTTTTAGAAAACTCATTTTC
**
109060 AAGGAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATA
65 AAAAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATA
*
109097 TATTTTTTAGAAA
1 TATTTTTAAGAAA
109110 TTTTATTTAA
Statistics
Matches: 100, Mismatches: 12, Indels: 3
0.87 0.10 0.03
Matches are distributed among these distances:
100 30 0.30
101 60 0.60
102 10 0.10
ACGTcount: A:0.40, C:0.14, G:0.06, T:0.40
Consensus pattern (101 bp):
TATTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCCAAAAAAAATTTTTAGAAAACTCATTTTCA
AAAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATA
Found at i:109086 original size:58 final size:60
Alignment explanation
Indices: 108997--109109 Score: 185
Period size: 58 Copynumber: 1.9 Consensus size: 60
108987 TTAAAAATAT
* *
108997 TTTTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCT-TAAAA-ATATTTTTTAGAAAACTCA
1 TTTTCAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATATATTTTTTAGAAAACTCA
*
109055 TTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATATATTTTTTAGAAA
1 TTTTCAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATATATTTTTTAGAAA
109110 TTTTATTTAA
Statistics
Matches: 50, Mismatches: 3, Indels: 2
0.91 0.05 0.04
Matches are distributed among these distances:
58 32 0.64
59 4 0.08
60 14 0.28
ACGTcount: A:0.39, C:0.14, G:0.06, T:0.41
Consensus pattern (60 bp):
TTTTCAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATATATTTTTTAGAAAACTCA
Found at i:109126 original size:58 final size:56
Alignment explanation
Indices: 108991--109126 Score: 166
Period size: 58 Copynumber: 2.4 Consensus size: 56
108981 TTCTCCTTAA
*
108991 AAATATTT-TTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTTAAAAATATTTTTTAG
1 AAAT-TTTATTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTAAAAAATATTTTTTAG
** * *
109047 AAAACTCATTTTCAAGGAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTCAAAAATATATTTTTTAG
1 AAATTTTA-TTT-AAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCT-AAAAA-ATATTTTTTAG
*
109107 AAATTTTATTTAAAAAAAAT
1 AAATTTTATTTAAGAAAAAT
109127 CAAAAAATAA
Statistics
Matches: 65, Mismatches: 10, Indels: 8
0.78 0.12 0.10
Matches are distributed among these distances:
55 1 0.02
56 3 0.05
57 3 0.05
58 35 0.54
59 7 0.11
60 16 0.25
ACGTcount: A:0.42, C:0.12, G:0.05, T:0.41
Consensus pattern (56 bp):
AAATTTTATTTAAGAAAAATTGATACTTTCAACTTCTCCTAAAAAATATTTTTTAG
Found at i:109132 original size:11 final size:10
Alignment explanation
Indices: 109128--109211 Score: 78
Period size: 11 Copynumber: 7.9 Consensus size: 10
109118 AAAAAAAATC
109128 AAAAAATAAA
1 AAAAAATAAA
*
109138 ATAAAATAAA
1 AAAAAATAAA
109148 AATAAAGATAAA
1 AA-AAA-ATAAA
109160 AATAAAATAAA
1 AA-AAAATAAA
109171 ATAAAAATAAA
1 A-AAAAATAAA
* *
109182 ATAAAATAAT
1 AAAAAATAAA
*
109192 AAATAATAAA
1 AAAAAATAAA
*
109202 TAATAAATAA
1 -AAAAAATAA
109212 TTCTAATGTA
Statistics
Matches: 61, Mismatches: 9, Indels: 7
0.79 0.12 0.09
Matches are distributed among these distances:
10 24 0.39
11 25 0.41
12 12 0.20
ACGTcount: A:0.79, C:0.00, G:0.01, T:0.20
Consensus pattern (10 bp):
AAAAAATAAA
Found at i:109133 original size:8 final size:7
Alignment explanation
Indices: 109120--109208 Score: 52
Period size: 8 Copynumber: 11.4 Consensus size: 7
109110 TTTTATTTAA
109120 AAAAAAT
1 AAAAAAT
109127 CAAAAAAT
1 -AAAAAAT
*
109135 AAAATAAA
1 AAAA-AAT
109143 ATAAAAAT
1 A-AAAAAT
*
109151 AAAGATAAA
1 AAA-A-AAT
109160 AATAAAAT
1 AA-AAAAT
*
109168 AAAATAAA
1 AAAA-AAT
109176 AATAAAAT
1 AA-AAAAT
109184 AAAATAAT
1 AAAA-AAT
*
109192 AAATAAT
1 AAAAAAT
*
109199 AAATAAT
1 AAAAAAT
109206 AAA
1 AAA
109209 TAATTCTAAT
Statistics
Matches: 66, Mismatches: 7, Indels: 17
0.73 0.08 0.19
Matches are distributed among these distances:
7 23 0.35
8 32 0.48
9 10 0.15
10 1 0.02
ACGTcount: A:0.79, C:0.01, G:0.01, T:0.19
Consensus pattern (7 bp):
AAAAAAT
Found at i:109140 original size:5 final size:5
Alignment explanation
Indices: 109130--109190 Score: 86
Period size: 5 Copynumber: 11.4 Consensus size: 5
109120 AAAAAATCAA
109130 AAAAT AAAAT AAAAT AAAAAT AAAGAT AAAAAT AAAAT AAAAT AAAAAT
1 AAAAT AAAAT AAAAT -AAAAT AAA-AT -AAAAT AAAAT AAAAT -AAAAT
109179 AAAAT AAAAT AA
1 AAAAT AAAAT AA
109191 TAAATAATAA
Statistics
Matches: 52, Mismatches: 0, Indels: 8
0.87 0.00 0.13
Matches are distributed among these distances:
5 35 0.67
6 14 0.27
7 3 0.06
ACGTcount: A:0.80, C:0.00, G:0.02, T:0.18
Consensus pattern (5 bp):
AAAAT
Found at i:109148 original size:16 final size:16
Alignment explanation
Indices: 109130--109197 Score: 102
Period size: 16 Copynumber: 4.1 Consensus size: 16
109120 AAAAAATCAA
109130 AAAATAAAAT-AAAAT
1 AAAATAAAATAAAAAT
109145 AAAAATAAAGATAAAAAT
1 -AAAATAAA-ATAAAAAT
109163 AAAATAAAATAAAAAT
1 AAAATAAAATAAAAAT
109179 AAAATAAAATAATAAAT
1 AAAATAAAATAA-AAAT
109196 AA
1 AA
109198 TAAATAATAA
Statistics
Matches: 49, Mismatches: 0, Indels: 5
0.91 0.00 0.09
Matches are distributed among these distances:
16 28 0.57
17 16 0.33
18 5 0.10
ACGTcount: A:0.79, C:0.00, G:0.01, T:0.19
Consensus pattern (16 bp):
AAAATAAAATAAAAAT
Found at i:109149 original size:28 final size:28
Alignment explanation
Indices: 109118--109211 Score: 113
Period size: 28 Copynumber: 3.2 Consensus size: 28
109108 AATTTTATTT
109118 AAAA-AAAATCAAAAAATAAAATAAAATA
1 AAAATAAAAT-AAAAAATAAAATAAAATA
109146 AAAATAAAGAT-AAAAATAAAATAAAATA
1 AAAATAAA-ATAAAAAATAAAATAAAATA
109174 AAAATAAAATAAAATAAT-AAATAATAAATA
1 AAAATAAAATAAAA-AATAAAAT-A-AAATA
109204 ATAAATAA
1 A-AAATAA
109212 TTCTAATGTA
Statistics
Matches: 59, Mismatches: 0, Indels: 11
0.84 0.00 0.16
Matches are distributed among these distances:
27 2 0.03
28 36 0.61
29 7 0.12
30 8 0.14
31 6 0.10
ACGTcount: A:0.79, C:0.01, G:0.01, T:0.19
Consensus pattern (28 bp):
AAAATAAAATAAAAAATAAAATAAAATA
Found at i:109209 original size:7 final size:7
Alignment explanation
Indices: 109141--109268 Score: 87
Period size: 7 Copynumber: 19.0 Consensus size: 7
109131 AAATAAAATA
109141 AAATAA-
1 AAATAAT
109147 AAATAA-
1 AAATAAT
*
109153 AGATAA-
1 AAATAAT
109159 AAATAA-
1 AAATAAT
*
109165 AATAAAAT
1 AA-ATAAT
109173 AAA-AAT
1 AAATAAT
109179 -AA-AAT
1 AAATAAT
109184 AAAATAAT
1 -AAATAAT
109192 AAATAAT
1 AAATAAT
109199 AAATAAT
1 AAATAAT
109206 AAATAAT
1 AAATAAT
**
109213 -TCTAAT
1 AAATAAT
*
109219 GTAATCAAT
1 -AAAT-AAT
109228 AAATAAT
1 AAATAAT
109235 -AATAAT
1 AAATAAT
109241 -AATAAT
1 AAATAAT
109247 AAATAAAT
1 AAAT-AAT
*
109255 AAATAAC
1 AAATAAT
109262 AAATAAT
1 AAATAAT
109269 GAAAAAAATA
Statistics
Matches: 102, Mismatches: 10, Indels: 19
0.78 0.08 0.15
Matches are distributed among these distances:
5 5 0.05
6 37 0.36
7 41 0.40
8 16 0.16
9 3 0.03
ACGTcount: A:0.70, C:0.02, G:0.02, T:0.26
Consensus pattern (7 bp):
AAATAAT
Found at i:109240 original size:6 final size:6
Alignment explanation
Indices: 109132--109248 Score: 70
Period size: 6 Copynumber: 19.8 Consensus size: 6
109122 AAAATCAAAA
* * *
109132 AATAA- AATAA- AATAAA AATAA- AGATAAA AATAA- AATAA- AATAAA
1 AATAAT AATAAT AATAAT AATAAT A-ATAAT AATAAT AATAAT AATAAT
** *
109176 AATAA- AATAA- AATAAT AAATAAT AAATAAT AAATAAT TCTAAT -GTAAT
1 AATAAT AATAAT AATAAT -AATAAT -AATAAT -AATAAT AATAAT AATAAT
109224 CAATAAAT AATAAT AATAAT AATAA
1 -AAT-AAT AATAAT AATAAT AATAA
109249 ATAAATAAAT
Statistics
Matches: 99, Mismatches: 4, Indels: 17
0.82 0.03 0.14
Matches are distributed among these distances:
5 35 0.35
6 36 0.36
7 25 0.25
8 3 0.03
ACGTcount: A:0.71, C:0.02, G:0.02, T:0.26
Consensus pattern (6 bp):
AATAAT
Found at i:110195 original size:20 final size:20
Alignment explanation
Indices: 110170--110224 Score: 56
Period size: 22 Copynumber: 2.6 Consensus size: 20
110160 AATGATACAA
*
110170 AAAAATATATGTTAATAGAT
1 AAAAATATATATTAATAGAT
*
110190 AAAAATAAATATATTAGTAGAT
1 AAAAAT--ATATATTAATAGAT
*
110212 AAATAATAAATAT
1 AAA-AATATATAT
110225 ATTTAAAAAA
Statistics
Matches: 29, Mismatches: 3, Indels: 5
0.78 0.08 0.14
Matches are distributed among these distances:
20 6 0.21
21 5 0.17
22 15 0.52
23 3 0.10
ACGTcount: A:0.60, C:0.00, G:0.07, T:0.33
Consensus pattern (20 bp):
AAAAATATATATTAATAGAT
Found at i:110223 original size:23 final size:22
Alignment explanation
Indices: 110163--110227 Score: 78
Period size: 23 Copynumber: 2.8 Consensus size: 22
110153 ATAGATAAAT
110163 GATACAAAA-AAATATATGTTAATA
1 GATA-AAAATAAATATA--TTAATA
*
110187 GATAAAAATAAATATATTAGTA
1 GATAAAAATAAATATATTAATA
110209 GATAAATAATAAATATATT
1 GATAAA-AATAAATATATT
110228 TAAAAAAATA
Statistics
Matches: 38, Mismatches: 1, Indels: 5
0.86 0.02 0.11
Matches are distributed among these distances:
22 11 0.29
23 16 0.42
24 11 0.29
ACGTcount: A:0.58, C:0.02, G:0.08, T:0.32
Consensus pattern (22 bp):
GATAAAAATAAATATATTAATA
Found at i:110236 original size:21 final size:22
Alignment explanation
Indices: 110193--110241 Score: 64
Period size: 21 Copynumber: 2.2 Consensus size: 22
110183 AATAGATAAA
* *
110193 AATAAATATATTAGTAGATAAAT
1 AATAAATATATTA-TAAAAAAAT
110216 AATAAATATATT-TAAAAAAAT
1 AATAAATATATTATAAAAAAAT
110237 AATAA
1 AATAA
110242 TAATAATACT
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 2, Indels: 2
0.86 0.07 0.07
Matches are distributed among these distances:
21 12 0.50
23 12 0.50
ACGTcount: A:0.63, C:0.00, G:0.04, T:0.33
Consensus pattern (22 bp):
AATAAATATATTATAAAAAAAT
Done.