Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168237.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_47, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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* * * *
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* * *
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* * * * * * *
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** * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* * * * * *
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1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTT
* * ** * ** *
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* * * * * * * *** *
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129 -AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * ** **
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* ** * * *
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256 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAA
* * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
56876 TAAATTAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATT-ATATG-AATGAGATTTAAAAAAAGAAATC
447 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATG-AATC
* * * * * *
56939 TATTTATCGAATAGGTTCAAATACTTATTA
509 TATTTATCAAACAAGTTTAAATAATTATGA
* * * * * *
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1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTT
* ** * * ***
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* * * * * * * * * * *
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129 -AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * *
57162 TATCTATTTTAAATCATTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGC
193 TATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGC
* * * * *
57227 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTTACATATTTAAAA
258 TTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAA
* ** * * * * * * * *
57292 AATAAATCTACTTACCAGACTA-ATTTAAATAGTTATCACTAATTGAACAAATATCAATCTCAAA
323 AATAAATTTGTTTACGA-ACTAGATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* ** * * * * **
57356 TTGTTAAAATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT--TTCATATAACCTTATTTG-GTTAAA
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* * * * *
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450 AATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTT
* * * **
57482 GTCGAACCAA-TTTAAATAGTTAAAA
514 ATC-AAACAAGTTTAAATAATTATGA
* ** *
57507 CTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCGAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAT-ATTTGTTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT-TTT
** * * * * * *
57571 CATATCTTACAAGCTTATTTGGAAT-AAATAATCCAAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG
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* * * * * *
57635 TAAAAGATTT--AAAACAAATTTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTCGAATAA
129 -AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * *** *
57697 TTATTTATTT-ACAATCGTTATGACTTTTT-TTTTGACAT-AAAC-A-AGTTCCAGTTCATAAAA
192 TTATCTATTTCA-AATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAA
* * * * * * * * *
57757 ACTTATCCAAAATAAAATAATACAAACTTCTTAATATTTCAAAAATTAGTAAGT-AGGAGTTTCA
256 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAA
* * * * * * * *
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321 AAAATAAATTTGTTTA-CGAACTAGATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA
* *
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385 AATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTGAAATA
* * * *
57948 TAATATATACTAATTTAATT-ATATTCCAAAAATTAATAAGTAGGTGATTTAAAAAATGAATCTA
449 AAATA-ATACTAATTT-ATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA
** ** *
58012 TTTATCAAATTAGTACAAATAATTATGG
511 TTTATCAAACAAGTTTAAATAATTATGA
* * * ** * * *
58040 CCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACT-ACCTTTTGTTTAGTCATATAACAATTATTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTT
* * * * *
58104 TT-TATCATACTAGCTTA-TTCAGAATAAAAAAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATA
64 TTGT-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATA
* *** * * * * *
58167 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAATTAGTTCAAATAGTAATGTCTATTTTAACA
127 AG-AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * *
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191 ATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TAGTTTTTGTTCATACA
* * * * * * *
58296 AGTTTATTTAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAACTAATAACTAAGACATTTA
255 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTA
* * * * *
58361 AAAAAT-AATTTGTTTCCCAAACCA-ATTCAAATAGTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTC
320 AAAAATAAATTTGTTT-ACGAACTAGATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
* * * * ** *
58424 AAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTCTTAAATCATATTAGCTTATTTAGAA
384 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCATTCATACAAGCTTATTGA-AA
* * *
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447 TAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA-TC
* * *
58552 TATTTACCTAACCAG-TTAACATAATTATGA
509 TATTTATCAAACAAGTTTAA-ATAATTATGA
* *
58582 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAATGTTTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT-AATTTTTT
* * * ** **
58647 TGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAATACTAACCTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG-
65 TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGA
* * * * * *
58711 AGA-A-TTGAAAAATATATCTATTTATCAAATTAATTCAAATAGTTATGACTACTT-AAGCAATT
130 AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATT
* * * * *
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* * ** * * *
58837 TATTCAAATTAAAATATTACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAAAATTTAGAA
259 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAGAAATTTAAAA
* *
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323 AATAAATTTGTTTA-CGAACTAGATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
* * * *
58966 TCGTTATGACCTTTTCTATTGTCATAAAA-AATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCGAAATAA
387 TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATT-GAAATAA
* * * * *
59030 AATAATA-TTATGTTATTAATATTTCCAAAATTTTATAATTAAGAGATTT-AAAAATGAATTTGT
450 AATAATACTAAT-TTATTAATATTT-CAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
*
59093 TTATCAAATAAGTTTAAATAATTATGA
512 TTATCAAACAAGTTTAAATAATTATGA
* ** *
59120 CTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTATTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT-TTT
** * * *
59185 TGTTTGTACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAG
65 TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA-AAAATTAATAAG
* * * * * * ** * * *
59249 TAAAATATTTAGACAATAAATATGTTT-CTTGAA-CAAGTTGAACTCGTTATGACTATTTGAACA
129 -AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAC-CAAATCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * ** * * *
59312 ATTA-ATAAGT--AAT-ATTAAT-A-TATTAATATT-TCA-AAAATTAATA-----AG-T-A-A-
191 ATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATAGTTTTTGTTCATAC
* ** ** *
59360 AAGATT-TAAAAAATAAATATGTTTACTGAACAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAA-AGAGCA
254 AAGCTTATTCAAAATAAA-AT-AATACT----AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA-AGTA
* * * * * *
59422 AGAGAATTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAG-TTCAAACAGTTATGACTATCTGAACAAT
311 AGA-AATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC-GAACTAGATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
* * * *
59486 TATCTATTTCAAAAT-ATTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATT-TGTTCTGTTCATACAA
374 TATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTC-ATTCATACAA
* ** * * * *
59549 GCTTAATTTG-AATAAAATATTAAAAATTTATTAATATTCTAAAAATAAATAAGTAAAAAATTT-
436 GCTT-A-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * *
59612 AAAAATAAAT-TCATTTAT-AGAACATGTTTAAATAGTTATTA
498 AAAAATGAATCT-ATTTATCA-AACAAGTTTAAATAATTATGA
* * * * * ** *
59653 CTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTC
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTT
* * * * * **
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65 TGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAG
* * * * * *
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129 -AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * *
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192 TTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAA
* ** * * *
59907 GTTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGT-TGAGGATTT
256 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-AATTT
* * * * * ** * * * *
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* * * ** ** *
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* * * * ** *
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445 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* * * * * * *
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* * * * * * * * *
60189 CTATTTGAACACTTA--TATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAGA-CATTTGTTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT-TTT
* * * * * * * *
60250 CTATTCATGCAACCTTATTTGGAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTCT--AAAATTAAT--
65 -TGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAA
* * * * * *
60311 --A-AGATTTAAAAAACAAATGTGTTTACCGAA-CTAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC-A
128 GAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAATC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
*** ** * * * ** *
60371 TTATCTATTTCAAATCATCCCGACCGTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATG
192 TTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAG
** *
60436 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-AGAAAATTAATCGAA--AAGAAATTA
257 CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT--AAGTAAGAAATT-
* * * * * * *
60498 GAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
318 TAAAAAATAAATTTGTTTA-CGAACTAGATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATT
* * * * * *
60562 TAAAATCATTATGACCATTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTT
382 TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTT
60621 GAACAATTAT
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CTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTA
TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAT
AAATTTGTTTACGAACTAGATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTGAAATAAAATAAT
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AAGTTTAAATAATTATGA
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* * *
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* *
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59457 GTTCAAACAG
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* * * * * * * *
59431 AAAAAATAAATTTGTTTACTAAACAAGTTCAAACAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTC
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* * * * *
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* *
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* * * *
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192 ATTTATAGAACAAGTTCAAATAGTCATTACCATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGAC
* ** *
59689 CATTTGTTTTATCATAAACCAATTGTTTCTATTCAAACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATGCTA
257 CATTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTA
*
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* *
59854 AAATCATTATGATCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGTTTATTTGAAA
65 AAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTG-AA
* * ** ** *
59919 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGAGGATTTAAAAAATTAA-TCT
129 TAAAATATTAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAATTC-
** * **
59983 ATTTATCA-AACAAGTTCATCTAGTCATGT-CCATTTGAACTATTAT-ATATTTCAAATTGTTAT
192 ATTTAT-AGAACAAGTTCAAATAGTCAT-TACCATTTGAACAATTATCA-ATTTCAAATCATTAT
* * ** * *
60045 TA-CATTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAAT
254 GACCA-TTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAAATTATTCAGAATAAAATAAT
* ** * *
60109 ACTAACTTATTACTATTTTGAAAATT-AT-TAAGAGATTT
318 ACTAACTTATAAC-A-TTCCAAAATTAATATAAAAGATTC
* ** * * * * * * *
60147 AATAGCTAAATCTCTTTACCGAA-CTAGTTTAACTAGTTATAACTATTTGAACACTTA-TATCTC
1 AAAAAATAAATCTATTTACC-AAGCAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTATTTC
* * * * * ** *
60210 AAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCCTAAGACATTTGTTTCTATTCATGCAACCTTATTTGGAG
65 AAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTT-GAA
* * * *
60274 TAAAATATTACTAAATTAATAATATTCT-AAAATTAATAAG------ATTTAAAAAACAAATGT-
129 TAAAATATTAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTT-AAAAATAAAT-TC
* ** * ** * * * ***
60331 GTTTACCGAACTAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAAC-ATTATCTATTTCAAATCATCCCGA
192 ATTTATAGAAC-AAGTTCAAATAGTCATTACCATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGA
* * * *** *
60394 CCGTTTG-TTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATT-TGAAATAAAATAAT
256 CCATTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCAAACAAAATTATTCAG-AATAAAATAAT
* ** ** *
60456 ACTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATCGAAAAGAAATTAG
318 ACTAACTTA-TAACA-TTCCAAAATTAATATAAAAG--ATT-C
* * * *
60499 AAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTA
1 AAAAAATAAATCTATTTACCAAGCAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TTATTTC
* * * *
60564 AAATCATTATGACCATTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA
65 AAATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
60614 AAAGCTTGAA
Statistics
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AAAAAATAAATCTATTTACCAAGCAAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTATTTCA
AATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTTGAATA
AAATATTAATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAATAAATTCATTT
ATAGAACAAGTTCAAATAGTCATTACCATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGACCATT
TGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAACTT
ATAACATTCCAAAATTAATATAAAAGATTC
Found at i:60299 original size:17 final size:17
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60267 TTTGGAGTAA
60277 AATATTACT-AAATTAAT
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1 AATATTCTAAAATTAAT
*
60311 AAGATT-TAAAA
1 AATATTCTAAAA
60322 AACAAATGTG
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 1, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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AATATTCTAAAATTAAT
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60609 TCATAAAAGC
* * * **
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AACAATTGTTTTTGTTC
* * * * *
60684 ATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATACGTAGGAG
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** *
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* * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT--AACAATTGTTTTTGTT
* * * * * * *
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* * * * **
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* * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTG-T-CATAACAATTGTTTTT-GT
* * *
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** * * * * *
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* * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA-CAATTGTTTTTGTTC
* * * * * * *
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65 ATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * *
61288 AATTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACTAGTTCAATTAGTT-TAACTAT
130 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT--AACAATTGTTTTTGTT
* * * * *
61402 --TATACAGTCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAGTTAATAAGTAA
64 CATATA-AG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA
* ** ** * * *
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* * ** * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-T-AACAATTGTTTTTGTT
* * * * * *
61582 CATACAAGCTTATTCAAAATAACATAATTCTAACTTATTAATATTTTGAAACTTAATAAGTAAGA
64 CATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * *
61647 GATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTAT
129 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT--AACAATTGTTTTTGTT
* *
61762 CATA-AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTCAAACAATTAATAAGTAA
64 CATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA-AATTAATAAGTAA
* * * * * * *
61824 AAGATTTAAAAAATAATTATGTTTATTGAATAAGTTTAAATAGTTATGAC-AT
127 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * *
61876 TTGAACAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCGT---AATTGTTTTTGTTCA
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAACAATTGTTTTTGTTCA
* *** * * * * * *
61938 TACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAACAAA
66 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * * *
62003 TTTTAACAATAAATGTG-TT-CCAAAGAAGTCCAAATAGTCATAACTAT
131 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * ** * * *
62050 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACGTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATTAGTT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT--AACAATTGTTTTTGTT
* * *
62115 CATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGA
64 CATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * *
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129 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * *
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1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAACAATTGTTT
62289 ATAAATTTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA
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Found at i:61354 original size:359 final size:355
Alignment explanation
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60609 TCATAAAAGC
* * * *
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* * *
60682 TCATACAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATACGTAGG
64 TCATACAA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA--AAAG
** * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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253 TTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAAT
* * * * *
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* * * * *
60978 ATGAACAATTCTTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTTTTTTAGTT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTA-TT
* *
61043 CTTACTAACTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATCAAAAGA
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** * * * * *
61107 GATTTAAAAAATAGTTTTGTTTGCCAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCC
126 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
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256 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAA
* *
61302 TCTATTTACTAAACTAGTTCAATTAGTTTAACTAT
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* * * * * * * * *
61337 TTGAATAATTTTTTATTTTAAATTGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTTTATT
* * * * * *
61402 TATACAGTCTTATTCGAAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAGTTAATAAGTAATG
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* ** ** * * *
61467 -GATTTAAAAAATAAATTTGTTGGCTTGACCAGTGCAAATAGTTATGAC-GTTTGAACAATTATG
125 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
61530 TACTTCAAATCA-TTATAACCTTTTCTTTTATCACTAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA
190 TATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA-TAAACAATTGTTTTTGTTCAAACAAGCTTA
* * * * *
61594 TTCAAAATAACATAAT-TCTAACTTATTAATATTTTGAAACTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA
253 TTCGAAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAA
* *
61658 TGAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTAT
317 TAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAG-TTTAACTAT
* * * * * * *
61698 TTGAACAATAATCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTGATGAAATAATTTTTCTATTC
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTATTC
* *
61763 ATA-AAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCAAACAATTAATAAGTAAAA
66 ATACAA-CTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAA--AAGA
* * * * ** * *
61826 GATTTAAAAAATAATTATGTTTATTGAATAAGTTTAAATAGTTATGAC-ATTTGAACAATTATTT
126 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * *
61890 ATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCGT----AATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT
191 ATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTTTGTTCAAACAAGCTTATTC
* * * * * *
61951 GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAACA-AATTTTAACAATAA
256 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAA
* * * * * *
62015 ATGT-GTT-CCAAAGAAGTCCAAATAGTCATAACTAT
320 ATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGT-TTAACTAT
* * * ** * *
62050 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACGTTTTGTTTCATTATAAAACAATTGTATTAGTT
1 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTA-TT
* * *
62115 CATATAGGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGA
65 CATACA-ACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAAT-A-AAAGA
* * * * * *
62180 CATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCT
126 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * *
62245 ATTTCAAATTGTTTTGACCATTTGTTTTGTCATAAA-AATTGTTT
191 ATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTT
62289 ATAAATTTAT
Statistics
Matches: 1081, Mismatches: 190, Indels: 81
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTATTC
ATACAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAAAGAGATTT
AAAAAATAAATCTGTTTACTAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
AAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACAATTGTTTTTGTTCAAACAAGCTTATTCGAAAT
AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATCTAT
TTACTAAACAAGTTCAAATAGTTTAACTAT
Found at i:62760 original size:181 final size:177
Alignment explanation
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62363 TAGTTCTGAC
* * * * * *
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1 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAA-ATTATTTAG-AATAAAATAATACT
* * * *
62437 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACTAAATAA
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* * * * * *
62501 GCTCTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGAC
127 GTTCAAATAGTTATG-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAAT
* * * * *
62553 CTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACATATTTATTTAGAATAAAATAATACTA
1 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACA-AATTATTTAGAATAAAATAATACTA
* *
62618 ATTTATGAATATTGTAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTAAACAAG
65 ATTTATGAATATT-TAAAAATTAATA-GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
* *
62683 TTCAAATAGTTATGTTGATTTGAACAGTTATCTATTTCAAATCATTATAAT
128 TTCAAATAGTTATGCT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAT
* * *
62734 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTT
1 ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AAATTATTTAGAATAAAATAATACTA
* * * * *
62799 ATTTATTG-ATATTTTAAAAATT-A-A-TAAGAGATTTACAAACTAAATCTGTTTACCAAACTAG
65 ATTTA-TGAATA-TTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * *
62860 TTTAAATAGTTATAACTATTTGACCAATTATCTATGTCAAATCCTTATAAT
128 TTCAAATAGTTAT-GCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAT
62911 ATTT
1 ATTT
62915 AATTATAGAA
Statistics
Matches: 305, Mismatches: 46, Indels: 25
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
177 76 0.25
178 1 0.00
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Consensus pattern (177 bp):
ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAA
TTTATGAATATTTAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTC
AAATAGTTATGCTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAT
Found at i:63780 original size:360 final size:362
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Indices: 63117--63810 Score: 787
Period size: 360 Copynumber: 1.9 Consensus size: 362
63107 AAAATAAAAG
* *
63117 AATACTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTAC
1 AATACTAATTTAATAATATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATACATTTAC
* * * **
63182 CGAACAAGCTCAAATAGATATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACATTTTG
66 CGAACAAGCTCAAATAGATAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTACAACATTTTG
* * * * *
63247 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTAGAACTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTAT
131 TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTACAACTAAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
63312 TAATATTTCAAAAATTATGAAGCAAGAGATTTTAAAACTAAAGCTATTTTCCATACTAGTTCAAA
196 TAACATTTCAAAAATTATGAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTCCAAACAAGTTCAAA
* * * *
63377 TAGTTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCAGAAAAA
261 TAATTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTAAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCAGAAAAA
63441 AATTTGTTTCTGATCGTACACGCTTATTTGGATATAAA
326 AA-TTGTTTCTGATCGTACACGCTTATTTGGATATAAA
* * * **
63479 AATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAGAGA-TTTAAAAAATAAATGCATTTGT
1 AATACTAATTTAATAATATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATACATTTAC
* * * * * * * * *
63542 CGAATC-AGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTTTCTATTTCAAATCGTTCCAACCTTTT
66 CGAA-CAAGCTCAAATAGATAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTACAACATTTT
* * * * *
63606 GTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCA-TACAAGCTAAGTCAGAATAAATTAATACTAATTT
130 GTTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTACAA-CTAAGTCAAAATAAAATAATACTAATTT
**
63670 ATT-ACA-TTCAAAAAATTAAT-AAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTATTTAT-CAAACAAG
194 ATTAACATTTC-AAAAATT-ATGAAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAAGCTATTT-TCCAAACAAG
** ** * * *
63731 TTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTAT-ATATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTATC
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* *
63795 ATAAAACAATTGTTTC
319 AGAAAAAAATTGTTTC
63811 AGTTCATAAA
Statistics
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AATACTAATTTAATAATATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATACATTTAC
CGAACAAGCTCAAATAGATAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTACAACATTTTG
TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTACAACTAAGTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
TAACATTTCAAAAATTATGAAGCAAGAGATTTAAAAAATAAAGCTATTTTCCAAACAAGTTCAAA
TAATTACAACCATTTGAACAAATATCAATCTAAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCAGAAAAA
AATTGTTTCTGATCGTACACGCTTATTTGGATATAAA
Found at i:63788 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 63021--66137 Score: 1582
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63011 AGATAGTTAA
* * * * * *
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1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * *
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65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* * * *
63150 AGCAAGAGATTTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGCTCAAATAGA-TAT
129 AGCAAGAGA-TTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATA-ATTAT
* * * *
63203 GATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * *
63267 TTCAATTCATTAGAA-CTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTCAAAAATT-AT
65 TTCAGTTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* * ** * * * *
63330 GAAGCAAGAGATTTTAAAACTAAAGCTATTT-TCCATACTAGTTCAAATAGTTAC
128 -AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAT-CAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * *
63384 AACCATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTGTCAGAAAAAAATTTGT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAA-TTGT
* * * * *** * *
63448 TTCTGATCGTACACGCTTATT-TGGATATAAA-AATACTAATTTAATAATATTTTAAAAATTAAT
65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATA-AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* ** * * ** *
63511 AAG-TAGAGATTTAAAAAATAAATGCATTTGTCGAATC-AGTTCAAATGGTTAA
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * ** *
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1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
63627 TTTAGTTCATACAAGCTAAGTCAGAATAAATTAATACTAATTTATT-ACATTCAAAAAATTAATA
65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATA
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129 AGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * *
63744 GATTATTTGAACAATTATATATTTAAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTA-TCATAAAACAATTGT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * * *
63808 TTCAGTTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTTTTAATATTTCAAAAATTAATA
65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* * * * ** * *
63873 AGTAAGAGATATAGAAAATATAAATTT-GTTAACATTCCAG---AAAGTAATAAGT
129 AGCAAGAGATTTA-AAAA-ATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAA-TAATTA-T
* ** * * * *
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1 GACTATTTGAACAAT---TA-----TCT----A-TTTCAAATCGTTATGAACT-TTTG--T--TT
* * *
63989 A-TCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTT-TG-TCATAAACCAATTGTTTCTATTCACACAA
48 AGTC-A--T-AAA-A--CA--A----TTGTTTCAGTTCAT--A-CAA--G-CT-TATTCA-A-AA
* * *
64051 GTGTATTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTA
91 ---TA----AAAT--AATACTA--A-TTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGCAAGAGA-TTTA
* * * **
64115 AAAAATAAATCTATTTA-CGAAGCAAGTTCATATCGTTAT
142 AAAAATAAATTTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * *
64154 GACTGTTTGAATAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAACACAATTATT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
** * * * ** *
64219 TCTCTTCATACAAGTTTAGTCATAATAAAATAATACTCTTTTAGTAATATTCTAAAAATTAAT-A
66 TCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAA
** * * ** * *
64283 GGTAGAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATTGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
130 GCAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * *
64335 G------T---C------C-ATTTAAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAGCAAATGC
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG-
* * ** * * * * **
64383 TTTTA-TTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTATCAATATTTTGAAAATTAAT
64 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
** * * * * *
64447 ----AAGAGATTTAAAAACCAAATCTGTTTACCAAA-ACAGTTTAAATAGTTAT
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACA-AGTTCAAATAATTAT
* * * * *
64496 GACTATTTGAAAAATTATTTATCTCAAATTGTTATGATCTTTAT-TTT-GTCATAAAACAATTGT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTT-TGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * *** * * * *
64559 TTC-TTATCATGCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAAAAATTAGT
65 TTCAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT
* * * * * ** * *
64623 AAGTAAGAGATTTAGAAAATACATGTGTTTGCCAAACTAA-TTCAAATAGTTAA
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAAC-AAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * *
64676 GACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTCT-AATCTTTTATTTAGTCATAAGATAATTAA
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATT-G
* *
64740 TTT-AGGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATGAAT
64 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAAT
* * * *
64804 GAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATATATT-T
128 AAGCAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATA-ATTAT
* * * ** * * * * * *
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1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * *
64922 TTCAGTTCATAAAAACTTATTCAGAATAAAATAATACT-ATTTGTTTAATATTTCAAAAATTAAT
65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* * * * *
64986 AAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAGTTGTTT-TCCAAACCAGTTCAAAT-AGT-T
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAT-CAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * **
65037 GACTATTTGAACAAATGA-CAATCTCAAATCGTTAAGATCTTTT-TTTTCTCATAAAACAATTGT
1 GACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
** ** * * * * * *
65100 TTTTGACCATATAAGCTTA-TCCAGATAAAAATAATACTAATATAATAATAGTCCAAAAATTAAT
65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* * * * * * * *
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128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * *
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1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGAACTTTTGTTTAGTCATAA-AACAATTG
* * *
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* * * * * **
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* * * * * * * *
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1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
* * * *
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* * *
65522 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-ATAGTTTA-CTAAATC-AGTTCAAATAATTAT
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTATC-AAA-CAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * * * *
65575 GGCCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG--
* * *
65640 TTTCA--ACATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAAT
64 TTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAAT
* ** * *
65703 AAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCGAACCAA-TTCAAATAGTTAT
128 AAGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * * **
65752 GACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGAT-ATAAAACAATAAT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTAG-TCATAAAACAATTGT
* * * * * * **
65816 TTCAATTTATA-AAACTTATTAAAAATATAATAATACTAATTTTTTAATATTTTGAAAATTAATA
65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATA
* * * * * *
65880 AGCAAAAG-TCTAAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA-AA-TTCAAATAGTT-C
129 AGCAAGAGAT-TTAAAAAATAAATTTATTTA-TCAA-ACAAGTTCAAATAATTAT
* * * * * *
65931 GTCTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTCTTCTA-TCATAAAATAATTGT
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTGT
* * ** *
65995 TTTAGTTCATACAAGATTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATCAAT-
65 TTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATA
* * * * * **
66059 ---AAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTA-CTGAATTAGTTCAAATAATTATT
129 AGCAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTA-T
* * *
66109 GA-AATTTCAATAATTATCTATTTCAAATC
1 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
66138 ATTGTTCATG
Statistics
Matches: 2250, Mismatches: 491, Indels: 393
0.72 0.16 0.13
Matches are distributed among these distances:
160 1 0.00
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GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTT
TCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAG
CAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTAT
Found at i:64007 original size:17 final size:18
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Period size: 17 Copynumber: 2.7 Consensus size: 18
63950 TCTAAACACA
63960 TTCAAATAGTTATGACTAT
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* *
63979 TT-GAATAATTAT-CTAT
1 TTCAAATAGTTATACTAT
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1 TTCAAATAGTTAT
64008 GACCTTTTGT
Statistics
Matches: 24, Mismatches: 4, Indels: 4
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Matches are distributed among these distances:
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Found at i:64269 original size:410 final size:409
Alignment explanation
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* * * * *
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* * * * *
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* *
63637 ACAAGCTAAGTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATT
130 ACAAGCTAAGTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATT
* *
63702 TGAAAAAATAAATTTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATATATT
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* * *
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260 TAAAATAGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCACTTCATAAAAACTTATCCAA
*
63832 AATAAAATAATACTACTTTTTTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATATAGAAAATATAA
325 AATAAAATAATACTACTTTTGTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATATAGAAAATATAA
63896 ATTTGTTAACATTCCAGAAAG
389 ATTTGTTAACATTCCAGAAAG
* * * *
63917 TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTTCTAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTT
1 TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCAT-TTGTCGAAACA-ATTCAAATAGTTAAGACTATTA
** * *
63981 GAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTC
64 GAATAATTATCTATTTCAAATAGTTACAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTC
* * * * * *
64045 ACACAAG-TGTATTC-GAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-
128 ACACAAGCT-AAGTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATT-ACATTCAAAAAATTAATAAGCAAG
* * * ** * *
64107 AAATTTTAAAAAATAAATCTATTTA-CGAAGCAAGTTCATATCGTTATGACTGTTTGAATAATTA
190 AAATTTGAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * **
64171 TTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAACACAATTATTTCTCTTCATACAAGTTT
254 TATATTTAAAATAGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCACTTCATAAAAACTT
*
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319 A-TCCAAAATAAAATAATACTACTTTT-GTAATATTCTAAAAATTAATA
64283 GGTAGAAGAT
Statistics
Matches: 307, Mismatches: 49, Indels: 20
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (409 bp):
TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATCATTTGTCGAAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGA
ATAATTATCTATTTCAAATAGTTACAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCACA
CAAGCTAAGTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAAATTT
GAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTT
AAAATAGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCACTTCATAAAAACTTATCCAAA
ATAAAATAATACTACTTTTGTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATATAGAAAATATAAAT
TTGTTAACATTCCAGAAAG
Found at i:65373 original size:537 final size:531
Alignment explanation
Indices: 64407--65902 Score: 1568
Period size: 537 Copynumber: 2.8 Consensus size: 531
64397 AATTATTTAG
* * ** *
64407 AATAAAATAATACTAA-TCTATCAATATTTTGAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAACCAAAT
1 AATAAAATAATAC-AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAAT
* * *
64467 CTGTTTACCAAAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAAAATTATTTATCTCAAATTGTTATG
65 -TGTTTACCAAAACAGTTCAAATAG-TATGACTATTTGAAAAA-TATCTATCTCAAATCGTTATG
* * * ** *
64532 ATCTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTTATCATGCAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACT
127 ATCTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTAACATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAATACT
* * * *
64597 AATTCAATAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAGAAAATACATGTGTTTGCCAAACTA
191 AATT-AATAATATTCCAAAAATTAATAAG-AAGA-TTTTA-AAAATAAATGTGTTTGCCGAACTA
* * * * *
64662 ATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTCTAATCTTTTATTTAGTC
252 ATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCATT-TGACCTTTTGTTTAGTC
* **
64727 ATAA-GATAATTAATTTAGGTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
316 A-AACAATAATT--TTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
64791 TCCAAAAATGAATGAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATATAT
378 TCGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGAT
* * * * ** ** ** *
64856 TTCACAATTTGAACAATTATTTAT-TTAGCGTTGGTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACATTT
443 ATAACAATTTGAAAAATTATTTATCTGA-AATCAGTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATT
*
64920 GGTTCAGTTCATAAAAACTTATTCA
507 GGTTCAGTTCATAAAAACTTATCCA
* *
64945 GAATAAAATAATACTA-TTTGTTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAA
1 -AATAAAATAATACAACTTT-ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAA
* * * *
65009 GTTGTTTTCCAAACCAGTTCAAATAGT-TGACTATTTGAACAAATGA-CAATCTCAAATCGTTAA
64 -TTGTTTACCAAAACAGTTCAAATAGTATGACTATTTGAA-AAAT-ATCTATCTCAAATCGTTAT
* * * *
65072 GATCTTTTTTTTCTCATAAAACAATTGTTTTTGACCATATAAGCTTATCCAGATAAAAATAATAC
126 GATCTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-AACATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAATAC
* * *
65137 TAATATAATAATAGTCCAAAAATTAATAA-AAGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACTAGT
190 TAAT-TAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAAGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAAT
* * *
65201 TCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAGTCACTTTGACCTTTTGTTTAGTCAA
254 TCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCA-TTTGACCTTTTGTTTAGTCAA
*
65266 ACAATAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCG
318 ACAATAATT-TTT-AATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCG
* * * * *
65331 AAAAATTAATAAGCATGAGATTTGACAAAATAAATCTATTTACCTAACAAGTTCAAATAGGTATA
381 AAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATATA
* * *
65396 ACTATTTGAAAAATTATTTATCTGAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
446 ACAATTTGAAAAATTATTTATCTGAAATCAGTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTT
* *
65461 TAGTTCATAAAATCTTATCCA
511 CAGTTCATAAAAACTTATCCA
* * *
65482 AATAAAATAATACAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAAT
1 AATAAAATAATACAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACT-AAAT
* * * * * * * * * *
65547 AGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATTA
65 TGTTTACCAAAACAGTTCAAAT-AGTATGACTATTTGAA-AAATATCTATCTCAAATCGTTATGA
* * *
65612 CCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATAC
128 TCTTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-AACATACAAGCTTATTCAGATA-AAAATAATAC
* ** * * * * *
65676 TAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCGAACCAAT
190 TAA-TTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGAAGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAAT
* * * * *
65740 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGATAT
254 TCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCAT-TTGACCTTTTG-TTT-A-GT
* * * * * * *
65805 AAAACAATAA-TTTCAATTTATA-AAACTTATTAAAAATATAATAATACTAATTTTTTAATATTT
315 CAAACAATAATTTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TT
* * *
65868 TG-AAAATTAATAAGCAAAAG-TCTAAAAAAATAAAT
379 CGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
65903 TTGTTTACTG
Statistics
Matches: 800, Mismatches: 129, Indels: 58
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Matches are distributed among these distances:
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544 1 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.11, G:0.08, T:0.38
Consensus pattern (531 bp):
AATAAAATAATACAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAAAAACTAAATT
GTTTACCAAAACAGTTCAAATAGTATGACTATTTGAAAAATATCTATCTCAAATCGTTATGATCT
TTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAACATACAAGCTTATTCAGATAAAAATAATACTAATTA
ATAATATTCCAAAAATTAATAAGAAGATTTTAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACTAATTCAAATA
GTTAAGACTATTAGAATAATTATTTATTTAAAATCATTTGACCTTTTGTTTAGTCAAACAATAAT
TTTTAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCGAAAAATTAAT
AAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATATAACAATTTGAA
AAATTATTTATCTGAAATCAGTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCAGTTCATAA
AAACTTATCCA
Found at i:65456 original size:20 final size:21
Alignment explanation
Indices: 65431--65472 Score: 61
Period size: 21 Copynumber: 2.0 Consensus size: 21
65421 AATCATTATG
65431 ACAATTTGTTTT-G-TCATAAA
1 ACAA-TTGTTTTAGTTCATAAA
65451 ACAATTGTTTTAGTTCATAAA
1 ACAATTGTTTTAGTTCATAAA
65472 A
1 A
65473 TCTTATCCAA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 0, Indels: 3
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.38, C:0.10, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (21 bp):
ACAATTGTTTTAGTTCATAAA
Found at i:65898 original size:357 final size:356
Alignment explanation
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Period size: 357 Copynumber: 2.3 Consensus size: 356
65274 TGTTTGAATT
* *
65284 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCATGA
1 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-A--A
* *
65349 GATTTGACAAAATAAATCTATTTACCTAACAAGTTCAAATAGGTATAACTATTTGAAAAATTATT
63 -ATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGGTATAACTATTTGAAAAATTATT
* * ** * *
65414 TATCTGAAATCATTATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAATCTTAT
126 TATCTAAAATCATCATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATAATTTCAATTCATAAAATCTTAT
** * *
65479 CCAAATAAAATAATACAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
191 AAAAATAAAATAATACAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTAAAAAAATAA
* * * * * *
65544 AATAGTTTACTAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTA
256 AATAGTTTACTAAATAAATTCAAATAATT-CGGCCATTAGAACAACTATCTATTTAAAATCATTA
* * * * * *
65609 TTACCTTTTGTTTTGTCATCAAACAATTGTTTTTCAA
320 TGACCTTTTCTTCTATCATAAAACAATTGTTTTACAA
** *
65646 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAAATT
1 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAAATT
* * * * *
65711 TAAAAAATAAATCTATTTGCCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
66 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGGTATAACTATTTGAAAAATTATTTATC
** *
65775 TAAAATCATCATGACCTTTTGTTTTGAT-ATAAAACAATAATTTCAATTTATAAAA-CTTATTAA
130 TAAAATCATCATGACAATTTGTTTTG-TCATAAAACAATAATTTCAATTCATAAAATCTTA-TAA
* * **
65838 AAATATAATAATACTAA-TTTTTTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAAAAG-TCTAAAAAAATAA
193 AAATAAAATAATAC-AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAT-TAAAAAAATAA
* * * * * * * *
65901 ATTTGTTTACTGAATAAATTCAAATAGTTCGTCTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAT
256 AATAGTTTACTAAATAAATTCAAATAATTCGGCCATTAGAACAACTATCTATTTAAAATCATTAT
* ***
65966 GACCTTTTCTTCTATCATAAAATAATTGTTTTAGTT
321 GACCTTTTCTTCTATCATAAAACAATTGTTTTACAA
* ** * **
66002 CATACAAGATTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATCAATAAGTGATT
1 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAAATT
* * * **
66067 TAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATTAGTTCAAATA
66 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA
66103 ATTATTGAAA
Statistics
Matches: 384, Mismatches: 67, Indels: 18
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.07, T:0.38
Consensus pattern (356 bp):
CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGAAATT
TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGGTATAACTATTTGAAAAATTATTTATCT
AAAATCATCATGACAATTTGTTTTGTCATAAAACAATAATTTCAATTCATAAAATCTTATAAAAA
TAAAATAATACAACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTAAAAAAATAAAATAG
TTTACTAAATAAATTCAAATAATTCGGCCATTAGAACAACTATCTATTTAAAATCATTATGACCT
TTTCTTCTATCATAAAACAATTGTTTTACAA
Found at i:65992 original size:176 final size:175
Alignment explanation
Indices: 65127--66046 Score: 470
Period size: 180 Copynumber: 5.1 Consensus size: 175
65117 TATCCAGATA
* * * ** * ** * * *
65127 AAAATAATACTAATATAATAATAGTCCAAAAATTAATAA-AAGATTTTAAAAATAAATGTGTTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAA-ATTAAAAAAATAAATCTATTTA
* * * * * * * *
65191 TCGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTTAAGTCA-CTTTGACCTTT
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* * * * * *
65255 TGTT-T-AGT-CAAACAATAATTGTTTGAATTCATACAAGCTTATTCAAAAT
129 TCTTCTGA-TATAAACAATAA---TTTCAATTTATA-AAACTTATTAAAAAT
* ** * * *
65304 AAAATAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAGCATGAGATTTGACAAAATAAATCTA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAG-A--A-A-TTAAAAAAATAAATCTA
* * * ** * * * * * * *
65369 TTTACCTAACAAGTTCAAATAGGTATAACTATTTGAAAAATTATTTATCTGAAATCATTATGACA
61 TTTACCGAACAAATTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATGACC
* * * ** * * * **
65434 ATTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAATCTTA-TCCAAAT
126 TTTTCTTCTGAT-AT-AAACAATAATTTCAATTTATAAAA-CTTATTAAAAAT
* * * *
65485 AAAATAATAC-AACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-ATA
1 AAAATAATACTAA-TTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAG---AA-ATTAAAAAAATAAATCTA
** * * * * * * * * * * *
65548 GTTTACTAAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATTA
61 -TTTACCGAA-CAAATTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATGA
* * ** * * *
65612 CCTTTTGTTTTG-TCATCAAACAATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTTATTCAAAAT
124 CCTTTTCTTCTGAT-AT-AAACAA-T-AATTTCAATTTATA-AAACTTATTAAAAAT
* *
65666 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTGC
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * *
65731 CGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATCATGACCTTTTG
66 CGAACAAATTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATGACCTTTTC
*
65796 TTTTGATATAAAACAATAATTTCAATTTATAAAACTTATTAAAAAT
131 TTCTGATAT-AAACAATAATTTCAATTTATAAAACTTATTAAAAAT
* * * *
65842 ATAATAATACTAATTTTTTAATATTTTGAA-AATTAATAAGCAAAAGTCTAAAAAAATAAATTTG
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAGAATTAATAAG--AAA-T-TAAAAAAATAAATCTA
* * * * *
65906 TTTACTGAATAAATTCAAATAGTT-CGTCTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACC
61 TTTACCGAACAAATTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATGACC
* ** * * * **
65970 TTTTCTTCT-ATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGA-TTATTTGAAAT
126 TTTTCTTCTGAT-AT-AAACAATAATTTCAATTTATA-AA-ACTTATTAAAAAT
66022 AAAATAATACTAATTTATTAATATT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT
66047 CCAAAAATCA
Statistics
Matches: 597, Mismatches: 111, Indels: 67
0.77 0.14 0.09
Matches are distributed among these distances:
175 6 0.01
176 50 0.08
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185 7 0.01
ACGTcount: A:0.44, C:0.10, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (175 bp):
AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAGAATTAATAAGAAATTAAAAAAATAAATCTATTTAC
CGAACAAATTCAAATAGTTACGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATCATGACCTTTTC
TTCTGATATAAACAATAATTTCAATTTATAAAACTTATTAAAAAT
Found at i:67490 original size:182 final size:179
Alignment explanation
Indices: 66801--68010 Score: 941
Period size: 182 Copynumber: 6.7 Consensus size: 179
66791 TTTTAAATTT
* * * * *
66801 TTTTGTCATCAAAA-AATTATTTCAATTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATATTATTAAGTT
1 TTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * *
66864 ATTAATATTCCAAAAATTAGTAATTAAGAGATTTAAAAAATGAAA-CTGTTTACTGAACAAGTTT
63 ATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAAT-AAATATGTTTAC-GAACTAGTTC
* * * ** * * *
66928 AAATAATTATGATTATTTGAACAATTATCCATTTGGAATCATTATAACCTTTTA
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
** * * * ** *
66982 TTTTGTCATAAAAGGATT-TCATCTGTTCATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGT-TTC-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTA
*** * * * * * * * * * *
67046 TTAATATTAGGACAACTAATTAGTAAACGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAA
64 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTA-CGAACTAGTTCAA
* * *
67111 ATCA-TTATGACTATTTGAAC-A--A-C-A----AAA-TGTTATGACTTTTTC
128 AT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
* * * *
67153 TTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCCTA-TTCAAATTAAAATAATATTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTCAAA-TAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * *
67217 TTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAATTTCAA
64 TTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACTAGTTCAA
* * * * *
67282 ATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGAACTTTTG
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
* * * *
67334 TTTTGTGATAAAACAATTGTTTCAGTCAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTC-ATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
67399 TAGTATTCCAAAAATTAGTGAGTAAGAGAACTAAAATAATAAATTTGTTTATCGAACTAGTTCAA
65 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAA-AATAAATATGTTTA-CGAACTAGTTCAA
* * *
67464 ATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAATATTATGACCTTTTA
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
* * * * * * * **
67516 TTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTATTCATCCAAGCATATTTTAGATAAAATAATAGAAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * ** *
67581 CAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-AATTGAAAAATAAATTTGTTTTTTGAACGT-GTTTAA
65 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATG-TTTACGAAC-TAGTTCAA
* **
67644 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTAGTATGACCAATTG
128 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
* * * *
67696 TTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATTCAAGCTTA-TTCAGAATGAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
67760 TTAAAATTCCAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAGCGAGTTC
64 TTAATATTCC--AAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTACGAA-CTAGTTC
* * * *
67825 AAATAGTTATGACTATTTG-ATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTG
126 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
* * * * * * * ** *
67878 TTTTATGAGAAAGCAATTGTTTTTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAGTTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTAT
** * * * * * *
67943 TAATATTTTAAAAATTAATATGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-TAAGTTCAA
65 TAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTAC-GAACT-AGTTCAA
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128 ATAG
68011 CATATCCATT
Statistics
Matches: 822, Mismatches: 170, Indels: 75
0.77 0.16 0.07
Matches are distributed among these distances:
170 6 0.01
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174 1 0.00
175 1 0.00
176 2 0.00
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Consensus pattern (179 bp):
TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATATGTTTACGAACTAGTTCAAATA
GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTG
Found at i:67699 original size:362 final size:362
Alignment explanation
Indices: 66825--67881 Score: 877
Period size: 352 Copynumber: 2.9 Consensus size: 362
66815 AATTATTTCA
* * * * ** * * * **
66825 ATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATATTATTAAGTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAATTA
1 ATTCATACAAGCATATTCAAATTAAAATAATAGAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGCA
* * * * * * * *
66890 AGAGATTTAAAAAATGAAA-CTGTTTACTGAACAAGTTT-AAATAATTATGATTATTTGAACAAT
66 AAAGAATTAAAAAAT-AAATATGCTTACTAAACAA-TTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAAT
* ** * ** * ** * *
66953 TATCCATTTGGAATCATTAT-AACCTTTTATTTTGTCATAAAAGGATT-TCATCTGTTCATAT-A
129 TATCTATTTCAAATCAGTATGAA-CAATTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCAGTTCAT-TCA
** * * * * * * * **
67015 AGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT--AGGACAACTAATTAGTAAACGATT
191 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCA-AAAAATTAATAAGTAAAAGAAC
* * * * * * *
67078 TAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCAAATCA-TTATGACTATTTG---A--A-C-A--A
255 TAAAAAATAAATATGTTTACCAAGCGAGTTCAAAT-AGTTATGACTATCTGACAATTATCTATTT
* * * * *
67133 CAAAATGTTATGACTTTTTCTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCT
319 CAAAATGTTATGACCTTTTATTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCT
* ** * * * *
67177 ATTCATACAAGCCTATTCAAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTA
1 ATTCATACAAGCATATTCAAATTAAAATAATAGAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGCA
* *
67242 AAAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTA
66 AAAGAATTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTA
* * ** *
67307 TCTATTTCAAATCATTGTGAACTTTTGTTTTGTGATAAAACAATTGTTTCAG-TCAATAT-AAGC
131 TCTATTTCAAATCAGTATGAACAATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC-AT-TCAAGC
* ** * * *
67370 TTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCC-AAAAATTAGTGAGTAAGAGAACTAA
194 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGAACTAA
* * *
67433 AATAATAAATTTGTTTATCGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTTC
258 AA-AATAAATATGTTTA-CCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATCTG-ACAATTATCTATTTC
*
67497 AAAATATTATGACCTTTTATTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCT
320 AAAATGTTATGACCTTTTATTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCT
* * *
67540 ATTCATCCAAGCATATTTTAGA-TAAAATAATAGAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGC
1 ATTCATACAAGCATA-TTCAAATTAAAATAATAGAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGC
* * * ** * * * *
67604 AAAA-AATTGAAAAATAAATTTGTTTTTTGAAC-GTGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
65 AAAAGAATTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAAT-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAAT
* * * *
67667 TATCTATTTCAAATTAGTATGACCAATTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATTCAAGC
129 TATCTATTTCAAATCAGTATGAACAATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATTCAAGC
* **
67732 TTATTCAGAATGAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAA
194 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCC-AAAAAATTAATAAGTAAAAGAACTAA
* * *
67797 AAAATAAATATGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGATAATTATTTATTTCAAA
258 AAAATAAATATGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGACAATTATCTATTTCAAA
* * *
67862 TTGTTATGATCTTTTGTTTT
323 ATGTTATGACCTTTTATTTT
67882 ATGAGAAAGC
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Consensus pattern (362 bp):
ATTCATACAAGCATATTCAAATTAAAATAATAGAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGCA
AAAGAATTAAAAAATAAATATGCTTACTAAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTA
TCTATTTCAAATCAGTATGAACAATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATTCAAGCTT
ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAAATTAATAAGTAAAAGAACTAAAAA
ATAAATATGTTTACCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGACAATTATCTATTTCAAAATG
TTATGACCTTTTATTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCT
Found at i:67929 original size:362 final size:363
Alignment explanation
Indices: 67133--68043 Score: 865
Period size: 362 Copynumber: 2.5 Consensus size: 363
67123 ATTTGAACAA
* * * * * * * * * * * *
67133 CAAAATGTTATGACTTTTTCTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCCTA-TTCAA
1 CAAAATATTATGACCTTTTATTTTATCAAAAAACAATTGGTTCTATTCATAAAAGCATATTTGAG
* * * *
67197 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATA
66 A-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATA
* * *
67262 TGCTTACTAAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGA
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** * *
67327 ACTTTTGTTTTGTGATAAAACAATTGTTTCAGTCAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
195 ACAATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTCAATATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACT
** * * * * * *
67392 AATTTATTAGTATTCCAAAAATTAGTGAGTAAGAGAACTAAAATAATAAATTTGTTTATCGAACT
260 AATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAACTAAAATAATAAATATGTTTATCCAACG
67457 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTT
325 AGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTT
* * ** *
67496 CAAAATATTATGACCTTTTATTTTGTCAAAAAATAATTGGTTCTATTCATCCAAGCATATTTTAG
1 CAAAATATTATGACCTTTTATTTTATCAAAAAACAATTGGTTCTATTCATAAAAGCATATTTGAG
** * * * *
67561 ATAAAATAATAGAAATTTATCAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-AATTGAAAAATAAATTT
66 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATAT
* ** * * * * *
67625 GTTTTTTGAAC-GTGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTAGTATGA
131 GCTTACTAAACAAT-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAGTATGA
* * * *
67689 CCAATTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTC-AT-TCAAGCTTATTCAG-AATGAAATAAT
195 ACAATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TCAATAT-AAGCTTATT-AGAAATAAAATAAT
**
67751 ACTAATTTATTAAAATTCCAAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AATAAATATGTTTA-C
257 ACTAATTTATTAAAATTCC--AAAAATTAATAAGTAAAAGAACTAAAATAATAAATATGTTTATC
* * *
67814 CAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG-ATAATTATTTATTT
320 CAA-CGAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * **
67858 CAAATTGTTATGATCTTTTGTTTTATGAGAAAGCAATTGTTTTTATTCATAAAAGTTTATTTG-G
1 CAAAATATTATGACCTTTTATTTTATCAAAAAACAATTGGTTCTATTCATAAAAGCATATTTGAG
* * * ** * * *
67922 AATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTTTAAAAATTAATATGTTAGAGATTTAAAAAATAAATC
66 -ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATA
** * * * * * * *
67987 TATTTACTGAATAAGTTCAAATAG-CAT-ATCCATTTGAACTATCATCTATTTCTAATC
130 TGCTTACTAAACAATTTCAAATAGTCATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
68044 GTTATGACAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (363 bp):
CAAAATATTATGACCTTTTATTTTATCAAAAAACAATTGGTTCTATTCATAAAAGCATATTTGAG
ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGAATTAAAAAATAAATAT
GCTTACTAAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAGTATGAA
CAATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTCAATATAAGCTTATTAGAAATAAAATAATACTA
ATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGAACTAAAATAATAAATATGTTTATCCAACGA
GTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACAATTATCTATTT
Found at i:68107 original size:19 final size:20
Alignment explanation
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68050 ACATTATGAA
68060 TAAAATAATACCAATTATTC
1 TAAAATAATACCAATTATTC
*
68080 TAAAATAATACCATTTATTC
1 TAAAATAATACCAATTATTC
68100 AGAATAATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TAAAATAATACCAATTATTC
Found at i:68530 original size:162 final size:158
Alignment explanation
Indices: 68311--68619 Score: 342
Period size: 159 Copynumber: 1.9 Consensus size: 158
68301 TATTCAAAAT
* *
68311 AAAATAATACTAATTTATTAACATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTTAAAAATAAATAAAT
1 AAAATAATACTAACTTATTAACATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAA-TTTAAAAA-ATA-AAAT
* * * * *
68376 CTATTTATCGAA-CAAGTTTAAATAGTTATGACT-ATTTGAAA-ACTTATCTATTTAAAATTGTT
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*
68438 AT-AACCTTTTTATTTTTATCATAAAGCAATTGTTTC
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* * * ** *
68474 AAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCA-AAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAATCA
1 AAAATAATACTAACTTATTAACA-TTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAAATCA
* *
68537 ATTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGGTCATTTAAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATGAA
65 ATTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGCTCATTTAAACAATTATCTATTCAAAATTGTTATGAA
68602 CTTTTTTTTCATCATAAA
130 CTTTTTTTTCATCATAAA
68620 ATAATTTTTT
Statistics
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AAAATAATACTAACTTATTAACATTCAGAAAATTAATAAGCAAGAAATTTAAAAAATAAAATCAA
TTTATCGAATCAGTTCAAATAATTATGCTCATTTAAACAATTATCTATTCAAAATTGTTATGAAC
TTTTTTTTCATCATAAAGCAATTGTTTC
Found at i:68801 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 68474--69275 Score: 613
Period size: 181 Copynumber: 4.4 Consensus size: 178
68464 CAATTGTTTC
* * * *
68474 AAAATAATA-TTACTTATTAATATTTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAA-ATCA
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATAT--
* * * * * *
68537 ATTTA-TCGAATCAGTTCAAATAATTATG-GTCATTTAAACAATTATCTATTCCAAATTGTTATG
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* * * * *
68600 AACTTTTTTTTCATCATAAAATAATTTTTTTTCATCATACAACCCTATTTGACAT
126 AACTTTTTGTT-ATCATAAAACAATTTTTTTTCATCATACAAGCTTATTAGA-AT
* * *
68655 AAAATAATGA-TAATTTACTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATGTAAAAAATAAATATA
1 AAAATAAT-ACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATA
* * *
68719 TTTACTGAACCAGTTCAAATAGTAATGATTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTATTATAACT
65 TTTACTGAACCAGTTCAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACT
* * *
68784 TTTTGTTATGCCATAAAACAATTATTTTTGC-TCTTACAAGTTTATTCAGAAT
130 TTTTGTTAT--CATAAAACAATT-TTTTTTCATCATACAAGCTTATT-AGAAT
* ** * * * * * * *
68836 AAAATAAAACTAAGGTAATAATCTTAT-AAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAGAAT-AATTTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATA
** * * * * * *
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* * * * * * *
68963 CCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAA--TTTCTTCAATTCTTAGTAA-CTTACTTAGAAT
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* * * * * ** *
69017 AAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAACAAATTTAAAAAATATTTTTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATAT
* * * * *
69082 TTGCTGAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTATCT
66 TTACTGAACCAGTTCAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTA-TAACT
* ** ** * * *
69147 TTTGTTTTATCATAAAACAATTGCTTTTGTTCATATAAGTTTATTTGAAAT
130 TTT-TGTTATCATAAAACAATTTTTTTTCATCATACAAGCTTATTAG-AAT
* ** * *
69198 AAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTAT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATAT
*
69262 TTACTAAACCAGTT
66 TTACTGAACCAGTT
69276 TATAAAACAA
Statistics
Matches: 491, Mismatches: 103, Indels: 55
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
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AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATAT
TTACTGAACCAGTTCAAATAATAATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATAACTT
TTTGTTATCATAAAACAATTTTTTTTCATCATACAAGCTTATTAGAAT
Found at i:70073 original size:181 final size:181
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Indices: 69277--73997 Score: 3545
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69267 AAACCAGTTT
* * * *
69277 ATAAAACAATTGTATT-AGTTGATAGAGGCTTATTCGAAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATA
1 ATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
** ** * * * * * ** * *
69340 TTCCAAAAATTAATGGGTAAGACATTTAAAATATGAATATGTTTA-CTGATTAAGTTCAATTGGT
64 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGT
*
69404 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
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* * * *
69458 ATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACATGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
69521 TTTTGAAAATTAATAAGTAA-AAATTTACAAAATAAATCTATTT-TCTGAACACAG-TCAAATAG
64 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAG
* * * * * *
69583 TTATGACTATTTGAAAAATTATCTCTTTCAAATAGATATAACCTTTTCTTTTGTC
127 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
69638 TTAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTCGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * ** * *
69703 CTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAAT-TCATTTACCAAGTAAGTTCATATTGTT
66 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCT-GTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * *
69766 ATGACTATTTGAATAATTATTTTATTTCAAATAGTTATGA--TTTT-TTTTTTC
129 ATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
69817 ATAAAACAATTATGTCTATTCATACAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
69881 TCTAAAAATTAATAGGTAGGAGGTTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAATAAGTTTAAATAGTCA
65 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
69946 TGTCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTTTC
130 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * *
69998 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTGATCTATTAATGTT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * *
70063 TTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGTATA-CTAAA-ATAGCTCAAATAATT
66 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTT
* * * *
70122 ATGACTATTTGAACAATTATCTATCTT-AAATTGTTATGATC-TTTATTTTATC
129 ATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
70174 AT-AAACAATTATTTCT-TTCATACAAGCTTATTC-AAATTAAAATAATACTAATTTAATAATAT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * * ** *
70236 TCCAAGAATTAGTAACTAAGAGATTTAAAAAA-AAATGTGTTTGTCGAATGATTTCAAATAGTTA
65 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
70300 AGATTATTAGAAGAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCTTTTGTTTTGTT
130 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
70352 GTAAAACAAATGTTTTTCTTCATATAAGTTTGTT-TAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
70415 TTT-AAAA--AATTAGTAAGATATTTAATAAATAAATCTGTTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTA
65 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
70477 TAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGA-CTATTTGTTTTGTC
130 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT-TTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
70529 ATCAAACATTTGTTTCTATTAATACAATCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTGTTAATATT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *** ** * **
70594 CTAAAATTTAATAAGTAA-AGGATTTAAAAAA-AGAATCTGTTGGCCTGACCAGTAAAAATAGTT
66 TTAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATA-AATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
70657 ATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGAC
129 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
70710 ACAAAACAACTCTTTCTATTCATACCAGCTGATTTTG--ATGAACATAATTCTAATTTATTAAT-
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * **
70772 TTTCAAAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAACTGTATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT
64 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
70837 ATGACGATTTGAGCAACTACCTATTTCAAGTTGCTATAACCTTTTGTTTTGTC
129 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * * * * *
70890 -TTAAACTAATAT-TTTCAATCCATATATGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTACTAAT
1 ATAAAAC-AAT-TGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
70952 A-TTCAAACAACTAATAAGTAA-ATGATTAAAAAAATATATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATA
63 ATTTTAAA-AATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATA
* * * **
71015 GTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTAT-ATTTTTTGTTTTGTC
126 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
71070 ACAAAATAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* ** * * ** * * *
71135 TCAGCAATTAATAAGTAATAAATTTTTAAAATAAATATGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTCA
66 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
71199 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTTTTTTGTC
130 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
71251 ATAAAACAATGGTATT-AGTTCATATAGGCTTATTCGAAAT-AAACAATATTAATTTATTAATGT
1 ATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * * * ** *
71314 TCCAAAAATTCATGAGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTATTTA-CTGGACAAGTTCAAA-CGTT
65 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTT
* * *
71377 ATTACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCGATATGA-CTTTATGTTTTGTC
129 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTT-TGTTTTGTC
* * * *
71430 ATAAAACAATTGTTTATGTTCGTACAAGATTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
71493 TTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATATATTT-TCTAAACACGTTCAAATAG
64 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAG
* * *
71556 TTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTC
127 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
71611 ATAAACCAATTGTTTCTGTTCACACCAGCATATTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * ** **
71676 CCAAAAATTAAGAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAGTAAGTTCGTATCA-T
66 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAAT-AGT
* * * * ** * *
71738 TATGACTGTTTGAACAATTTTTTATTTCAAATAGTTATGATCC-TTCATTCTATC
128 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTC
* * * * * *
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1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * **
71857 TTAAAAATTAATAAGTATGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGACAT
66 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * **
71922 GTCCATTTGAATAATTATCCATTTGAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTC
131 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** * * *
71973 ATAAAATAATTGTTTTTGTTTATGCAAATTTATTC-AGAATAAAATAATACTGATCTATCAATAT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
72037 TTTGAAAA-T--TAA-TAAGCGATCTGAAAACTAAATCTATTTACCGAAATAA-TTCAAATAGTT
65 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
72097 ATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAATTCGTTATGATC-TTTATTTTGTC
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* * * * * * * **
72149 ATAAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTCAATGTTATT
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * * * *
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* ** * * * * * *
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* * *
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** * * * * * * *
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* * * **
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * *
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* *** *
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* * * * ** *
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66 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
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* * * *
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1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
73469 TATCAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCATTTATCAAACCAA-TTCAAACAGT
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* * * * *
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128 TATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * * *
73586 AAAAAACAATTATTTCAGTCCCTACAAGCTTATTTGGAATAAAAGAGA-ACTAATTT-TTAGTA-
1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATA-ATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
73648 TTTCAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTACCGAAC-CGTTCAAATAAG-T
65 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAAT-AGTT
* * * * *
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* * * * * * * *
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1 ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
73828 TAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTATCAAACCATTTCAAATAGTTTT
66 TTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * ** *
73893 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATGTTTTATTTTGTC
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* * ** *
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1 ATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
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Statistics
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* * * * * **
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * ** *** * * *
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*** * * * *
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* ** * * *
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* * * * * *
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* * * * * * ** * * *
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* * * * ** * *
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* * * ** * * * * *
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* * * * * * * * **
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* * * * * * * * * *
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* * * ** * * * *
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* ** * * ** * * * * *
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*
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* * * * * * * * * * *
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** * * ** * * *
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* * * * * * *** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** **
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* * ** * * * * * *
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316 GAAAAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTC
* * * * * ** * *
71091 ATACAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAGCAATTAATAAGTAATAA
380 ATACAAGCTTA-TCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGAG
** * * * * *
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* * * * * * * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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*
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* * * *
71430 ATAAAACAATTGTTTATGTTCGTACAAGATTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
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* * *
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* *
71558 ATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAAT
126 A-AGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
71621 TGTTTCTGTTCACACCAGCATATTCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCCAAAAATTA
189 TGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* *
71686 AGAAGTAAAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAGTAAGTTCGTATCATTATGACTGTTTGA
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* * * * * * *
71751 ACAATTTTTTATTTCAAATAGTTATGATCC-TTCATTCTATCATAAAACAATTATTTCTCTTCAT
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* *
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** * * *
71880 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGACATGTCCATTTGAATAATTATCCATT
444 TTAAAAAATAAATTT-TTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATT
* * * * * * * *
71945 TGAAATCGTTATGAATTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTTATGCAAA-TTTATTCA
508 TCAAATCGTTATG-ATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTGATCATACAAACTTT-TTCA
* *** ** * *
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571 GACA-AAAATAATACTAATCTAAT-AATATTCCAAAAATTAATAAAAGATCTAAAAAAATAAATC
* * *
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698 A-CTTTATTTTGTC
* * * * **
72149 ATAAAATAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATACTAATTCAATGTTATT
1 ATAAAATAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * *
72214 CCAAAAATTAGTAAGTAAGAAATTTAAAAAATACATGTGTTTTTCGAAGCAATTCAAATAGTTAA
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* * * * * *
72279 GACTATTAGAATAATCATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATT
128 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * *
72344 GCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATG-
193 TCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GA
* * *
72408 AGT-AAGA-TTTAAGAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAGTATATT-TGACTATTTGA
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* * * * * **
72469 ATAATTATCTATTT-AAAGTTGTTGTGACCTTTTATTTTGTAATAAAACAATTGGTTCAGTTCAT
318 AAAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTCAT
* * *
72533 GA-AAACTTATCTGAAATAAAATAGTACTACTTTT-TTAATA-TTTCAAAATTAATAAGCAAGAG
382 -ACAAGCTTATC-GAAATAAAATAATACTA-TTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG--AGAG
* * * * * * * * * *
72595 ATTTAAGAACTAAAGCTATTTT-CCAAACCAGTTTAAAAAGTTATGACTATCTGAACAAATATCA
442 ATTTAAAAAATAAA--TTTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCA
* *
72659 ATCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTGATCATATAAACTTTTTC
505 ATTTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTGATCATACAAACTTTTTC
* * * *
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570 AGACAAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAAGATCTAAAAAAATAAATCT
* * * * * * * * * *
72789 GTTTGCTGAATCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAAAATAATTATTTATTTTAAATCATTTTGAC
635 ATTTACCGAATCAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-
72854 CTTT-TGTTTAGTC
699 CTTTAT-TTT-GTC
* *
72867 ATACAATAATTGTTTTAGTTCATACGAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
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* * * * * ** *
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64 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT-AAAAAATAAATAT-TTTTTCTAACAA-TTCAAATAGTT
* * * ** *
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* * * * * * * *
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* * ***
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* * * **
73188 AAAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCAACATA
318 AAAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTCATA
* * * *
73253 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAAT-A-AGAGATTTA
383 CAAGCTTA-TCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGAGATTTA
*** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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*
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** * * * * * *
73771 AATTGTTTTTGTTAATATAA-TTTGTTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAA
186 AATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA
** * * * * * * ** *
73835 TTAATCAGTAAGAGA-TTTAAAAAGTAAATCTGCTTA-TCAA-ACCATTTCAAATAGTTTTGACT
251 TTAAGAAGTAA-AAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATA--AGTTCGTATA-TTATGACT
* * * ** *
73897 ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAATGTTTTATTTTGTCATTAAACAATTGGTTT-T
312 ATTTGAAAAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCT
* * ** *
73961 GTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTA
376 CTTCATACAAGCTTA-TCGAAATAAAATAATACTA
73996 ATGGTTAAGA
Statistics
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Consensus pattern (710 bp):
ATAAAATAATTGTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
AAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATATTTTTTCTAACAATTCAAATAGTTAAGAC
TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA
GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGTA
AAAATTTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAATAAGTTCGTATATTATGACTATTTGAAAAATTAT
CTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTCTTCATACAAGCTTA
TCGAAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGAGATTTAAAAAATAAA
TTTTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATCGTTATG
ATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGCTTTTGATCATACAAACTTTTTCAGACAAAAATAATACT
AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAAAAGATCTAAAAAAATAAATCTATTTACCGAATCAATT
CAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTATTTTGTC
Found at i:74309 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 74016--76147 Score: 1595
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74006 CTAAATGAAC
* * ** * * * *
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1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCAGTTCATAC
* * *
74080 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
65 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * *
74145 AAAAAATAATTTTGTTTATCAAATCAATTCAAATGGTTAAGATTATTAGAAT
130 AAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
* * ** *
74197 AATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCGTTTGTTAAGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
* * * **
74262 AGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAACAAAAAGAGA-
66 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-A-AGTAAGAGAT
* * * *
74325 TTGAAAAA-AAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATTACTATT-TAAT
128 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
** * ** * *
74377 CAATTGCCTATTTAAAATCATTAT-AGCCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTT-AGT
1 -AATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCA-T
* * * * *
74440 ACAAGCTTAGAT-GGAATAAACTAATACTAATTTATTAATATTTCCAAAATTAATAAG-AAGAAA
63 ACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA
* * * * * * *
74503 TTTAAAAAATAAATATGCTTACCAAATCAGCTAAAATAATTAT-AGCCATTTA-AAC
127 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGA-CTA-TTAGAAT
* * * ** ** * ** *
74558 GATTAGCTATTTGAAATCATTATGATATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
* * *
74623 ATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTA
66 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * *
74688 AAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTTAAATAGTTGTGACTATTTGAAC
131 AAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
* * * * *
74739 AATTTTCAATCTT-AAATTGTTAAGATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-ATCATA
1 AATTATCTAT-TTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA
* * ** *
74801 GAAGCTTATTTG-GTTAAAAATAA-ACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--T-AGTAAGAGAT
64 CAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * ** *
74860 TTAAAAAATAAATGTGCTTACGAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACCATTAGAAT
128 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
** * * * * *
74914 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTGGTCATAAAATATTTATTTCA-TATCTTAC
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATAC
* * * * * * *
74978 AAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATCCAAATTTATTAACA-CTCGAAAAATTAATAAGCAAAAGAT
65 AAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
75041 GTAAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
128 -TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
* * * * ** * *
75096 AATTATTTATTTAAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTAAT-ATAAAAGAATTGTTTTAGTTTC-TA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTT-TTGTCATAAAACAATTGTTTCAG-TTCATA
* * * * * * ** *
75159 AAAACTTATCCAAAATAAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAAGAG-T
64 CAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * *
75223 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
128 TTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
* * * ** * * * *
75277 AATTGTCTATGTAAAATCATTATGACCTTTTATTCTGCCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
*
75342 AGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT----GATTTA
66 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
* * * * * *
75403 AAAAATGAATCTATTTACCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTA-AAT
131 AAAAATAAATTTGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAGAAT
* * * * * *** *
75454 AATTATCTATTTCAAATTATTTTTACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTTTATCATAT
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGT-TCATAC
* * * * **
75519 AAGCTTATTTGGAATAAAATTATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAGGTAATAAGTAAGAGATTT
65 AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** ** * *
75584 AGAAAAATAAATCTATTTAGTGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAG
130 A-AAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
* * * * * * * * * * *
75637 AATTGTATACTTCAAATCAATTATTTACAAATTAAACATTTTGTTCTATTATAAAATAATTATTT
1 AATTATCTATTTC--A--AATT-GTT----A-T-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
75702 -ATGTTCATACAAGCGTATTCGAAATAAAATAATA-TAATCTAATAATATGTT-GAAAATTAATA
55 CA-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TTCAAAAATTAATA
* * * * * * *
75764 ACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGCCGAACTAGTTCAAATTGTTAAGACTA-TATGAAC
118 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTA-GAAT
* * * *
75828 AATTATCTATTTTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTCATACT
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
* * *
75892 AGCTTATTTGAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTT
66 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * *
75956 AAAAAAT-AATTATGTTTACCTAACTAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAAT
130 AAAAAATAAATT-TGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
* * * * *
76008 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTA-TTCATAT
1 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATAC
* ** *
76072 AAGTTTGCTC-AGAATAAAATAAT-C-AAATTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
65 AAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
76130 TAAAAAATTAAA-TTGTTT
129 TAAAAAA-TAAATTTGTTT
76148 TTAATTTTGT
Statistics
Matches: 1543, Mismatches: 324, Indels: 174
0.76 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 2 0.00
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Consensus pattern (180 bp):
AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACA
AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
AAAAATAAATTTGTTTACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTAGAAT
Found at i:74428 original size:473 final size:467
Alignment explanation
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Period size: 473 Copynumber: 1.9 Consensus size: 467
73520 AATTCAAACA
* * * *
73530 GTTAAGACTATATAAGCAATTATTTATTTCAATTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAA
1 GTTAAGACTAAATAAGCAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAA
* * * *
73595 TTATTTCAGTCCCTACAAGCTTATTTGGAATAAAAGAGAACTAATTTTTAGTATTTCAAAATTTA
66 TTATTTCAGTCACTACAAGCTTATTTGGAATAAAAGAGAACTAATTTATAATATTTCAAAATTAA
* * **
73660 TAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTACCGAACCGTTCAAATAAGTATAACTATCTGAAT
131 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCAAACAATTCAAATAAGTATAACTATCTGAAT
* ** ** *
73725 AATTATCTATTTCAAATCATTTCTACTTTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTGTTAATATA
196 AATTATCTATTTCAAATCATTTCTACGTTATGTTAAGTCATAAAAAAATTGTTTCAGTTAATACA
* * * * ** *
73790 ATTTGTTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAA
261 ACTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATCAAAAAGAGATTGAA
* * * * * *
73855 AAAGTAAATCTGCTTATCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
326 AAAG-AAATCTGCTTACCAAACAAGTTCAAATACTTTTGACTATTTGAATAATTACCTATTTAAA
** ** *
73920 ATTGTTATAATGTTTTATTTTGTCATTAAACAATTGGTTTTGTTCATACTATTTTATTCAAAATA
390 ATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTGTTCATACTATTTTATTCAAAATA
73985 AAATAATACTAATG
454 AAATAATACTAATG
* *** *
73999 GTTAAGACTAAATGAA-CAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTGTAGAACA
1 GTTAAGACTAAAT-AAGCAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAAC-
* * * *
74063 AATTTTTTTATTCAC-ACAAGCTTATTTGGAATAAAATA-ATACTAATTTAATAATATTTCAAAA
64 AATTATTTCAGTCACTACAAGCTTATTTGGAATAAAAGAGA-ACTAATTT-ATAATATTTC-AAA
* * * *
74126 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATCAAATCAATTCAAAT-GGT-TAAGATT
126 ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCAAA-CAATTCAAATAAGTAT-A-ACT
** * *
74189 AT-TAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTT-TGACCGTT-TGTTAAGTTATAAAACAATTGTTT
188 ATCT-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTTCT-A-CGTTATGTTAAGTCATAAAAAAATTGTTT
* * *
74251 CAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAC
250 CAGTTAATACAA-CTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT--C
* *
74316 AAAAAGAGATTGAAAAA-AAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATACTTATT-ACTATTT-AATC
312 AAAAAGAGATTGAAAAAGAAATCTGCTTACCAAACAAGTTCAAATACTT-TTGACTATTTGAAT-
* *
74378 AATTGCCTATTTAAAATCATTATAGCCTTTTGA-TTTGTCATAAAACAATTGTTTT
375 AATTACCTATTTAAAATCATTATAACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
74433 AGTTAGTACA
Statistics
Matches: 357, Mismatches: 60, Indels: 31
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
468 1 0.00
469 81 0.23
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474 3 0.01
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Consensus pattern (467 bp):
GTTAAGACTAAATAAGCAATTATCTACTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAAAAAACAA
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TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTATTTACCAAACAATTCAAATAAGTATAACTATCTGAAT
AATTATCTATTTCAAATCATTTCTACGTTATGTTAAGTCATAAAAAAATTGTTTCAGTTAATACA
ACTTATTCAAAAGAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATCAAAAAGAGATTGAA
AAAGAAATCTGCTTACCAAACAAGTTCAAATACTTTTGACTATTTGAATAATTACCTATTTAAAA
TCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACTATTTTATTCAAAATAAA
ATAATACTAATG
Found at i:76019 original size:16 final size:17
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Indices: 75987--76019 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
75977 AACTAGTTCT
75987 AATAATTATGACTATTTG
1 AATAATTAT-ACTATTTG
76005 AATAATTAT-CTATTT
1 AATAATTATACTATTT
76020 CAAATTGTTA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATACTATTTG
Found at i:76389 original size:297 final size:300
Alignment explanation
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Period size: 297 Copynumber: 1.9 Consensus size: 300
75829 ATTATCTATT
* **
75839 TTAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGAA
1 TTAAATTGTTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAAA
* * *
75904 ATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTAT
66 ATAAAATAAAATGAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATAAT
* * * *
75969 GTTTACCTAACTAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC
131 GTTTACCTAACTAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAAC
*
76034 CTTTTCTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTATTCATATAAGTTTGCTCAGAATAAAATAAT-CAA
196 CTTTTCTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTATTCATACAAGTTTGCTCAGAATAAAATAATACAA
76098 A-TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA
261 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA
*
76137 TTAAATTGTTTTTA-ATTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTCAATTCATA-TAAGCTTATTCA
1 TTAAATTGTTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTCAATTCATACT-AGCTTATTCA
* * * * ** *
76199 AAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTTCGAAAGTTAGTAATTAAAAGATTTAAAAAATAA-A
64 AAATAAAATAAAATGAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATA
* *
76263 ACTGTTTACCTAA-TAAG-TCTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTGTTTTAAATCGCT
129 A-TGTTTACCTAACT-AGTTCT-AATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCT
* * * *
76326 GTAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AGAT-TTTATCTATTCATACAAGCTTAT-TTC-GAATAAA
191 ATAACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAAATGTTT-T-TATTCATACAAG-TT-TGCTCAGAATAAA
*
76387 ATAATATAAATTTATTAATATT
252 ATAATACAAATTTATTAATATT
76409 AAGACAATTA
Statistics
Matches: 235, Mismatches: 26, Indels: 21
0.83 0.09 0.07
Matches are distributed among these distances:
295 3 0.01
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Consensus pattern (300 bp):
TTAAATTGTTATTACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAAA
ATAAAATAAAATGAAGTTATTAATATTTCAAAAATTAACAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATAAT
GTTTACCTAACTAGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGCTATAAC
CTTTTCTTTTGTCATAAAATAAATGTTTTTATTCATACAAGTTTGCTCAGAATAAAATAATACAA
ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAA
Found at i:76475 original size:181 final size:180
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Indices: 76152--81681 Score: 4143
Period size: 181 Copynumber: 30.7 Consensus size: 180
76142 TTGTTTTTAA
* * * * *
76152 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTCAATTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
76215 AGTTATTAATATTTCGAAAGTTAGTAATTAAAAGATTTAAAAAATAAAACTGTTTACCTAATAAG
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * *
76280 -TCTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTGTTTTAAATCGCTGTAACC
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* * *
76394 AAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATATATCTATTCACCAAAC
64 -AATTTATTAATATTTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* *
76458 AAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTGAAC----A---A---CAAATTGTTATGACT
126 AAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * * * * *
76503 TTTTCTTTGGTTATAAAATAATTGTTTTTGTTCAAACAAGCTCATTTGGATTAAAATAATATTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
* * ** *
76568 TTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTACTGAACAATT
66 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGT
* * * ** * *
76632 TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACTGTGACA
130 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
76683 TTTTGTTTTGTAATAAGATAATTGTTTC-AGTTAATATAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACT
* * * ** *
76746 AATTTATTAATATTCTAAAAATTAGTGAGTAAGAGAACTAAAACAATAAATCTGTTTACCGAACA
64 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * *
76811 AGTTCAAATAGTTATGTCTATCTAAACAATTATCTCTTTCAAATCATTATGACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
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1 --TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACT
* * * * * * *
76929 AAATTAATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTTGAAAAATAAATTTGTTTTCTAAACA
64 -AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * *
76993 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGGTATGACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** * * * * * * * *
77047 AGTTATTTTGTTATAAACCAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
* ***
77112 TTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTGTA--GAGTGA
66 TTTATTAATA-TTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACCAAACAA
* * * ** * * * *
77174 GTTCAAATAGTTTTAACTATTCG-TTAATTATTTAATTCAAATCATTATGATC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
77226 TTTTGTTTTTTGATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAGGTTTTTTTGGAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTTCGAATAAAATAATACTA
* * * * ** *
77290 ATTTATTAATATTCTAAAATTTAATATGTTAAAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACGGAATAAG
65 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
77355 TTCAAAGAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTGTTTCAAATTGTTATGACA
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** *
77407 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCATACAAAATTATTTAG
1 TTTTGTTTTGTCAT---A-AA-A-C-A--ATT----GT--TT-CTATTCATACAAGCTTATTTCG
* * * *
77472 AATAAAATAATACCAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAG-----GATTT-AAAAATAAATG
50 AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * ** * * * * * *
77531 TGTTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGCCTATGAGAATAGTTATTTATTTCAAATTGTTCTAA
114 TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA
77596 CC
179 CC
* * * * *
77598 TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTA-TTCAAAATAAAATAGTACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACT
* * * *
77661 AATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-A-TT-AAAAA-AAATCTGTTTATCAAACA
64 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* *
77722 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
77776 TTTAT-TTTTATCGTAAAACAATTGTTTTCCATGCATAAAAACTTATCT-GAAATAAAATAATA-
1 TTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATAC
* * * * * * * *
77838 TTACTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAATC
63 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAAC
* * * * * *
77903 -AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTGTGAAC
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
77957 TTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTGTTTTTCA-TCATGCAACCCTA-TTC-ATTATAAAATAATAC
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCGA--ATAAAATAATAC
* ** * * *
78019 TAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATGTAAAACATAAA-CATGTTTACTAAAC
63 TAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTACCAAA-
* * * *
78083 CAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACC
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
78138 TTTTGTTATATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAAGAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
* * * * * * * * *
78203 TGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTATTTGCCAAACTAGT
66 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGT
* * * * * *
78268 TCAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCATTATGACC
130 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * ** * * * * *
78319 TTTTGTTTTATCGTAAAACAATTCATTCAATTCTTAGTAA-CTTA----GAATAAAATAAAACAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTA
* * * * **** *
78379 ATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGTTGAACCAG
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * *
78444 TTTACATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * * * * *
78496 TTTTTGTTTTATCATAAAATAATTACTTT-TGTTCATATAAGTTTAATTGGAAAAAAATAGTATT
1 -TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACT
* * * * * *
78560 AATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCA
64 AATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA
* * * * * *** *
78625 GTTTAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCAAGATGGCC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
78678 ATATGTTTTGTCATAAAAGC-ATTGTTTCTATTCCTA-TAGTCTTA-TTCGGAGTAAAGTAACAC
1 TTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTC-GAATAAAATAATAC
** * * * **
78740 TAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTAAAAAAATGAATTTG-TTAGCCTGAC
63 TAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAAC
* * * *
78804 ACA-TGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCGAATTGTTATGACC
126 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * ** * * *
78859 TTTTGTTTTATCACAAAACAATTTTTTCTATTTGTACAAGCTTA-TCCGAAATAACATAATTCTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACTA
* **
78923 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----GGATTTAAAAAATGCATCTGTTTACCAAACAAG
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
*** *
78984 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACCATAACC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
79036 TTTTATTTTGTCAGAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATTATACAAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
* * * * *
79101 TTTATTAATATTTAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCGAATAAGT
66 TTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGT
* * * * *
79166 TTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCGTTATAACT
130 TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
79217 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTCCATACAATCTTA-TTCGGATTAAAATAATATTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATACTA
* * * *
79281 ATTTATTAATAGTTTCACAATTAATAAGTAAAATA-TTAAAAAA-AAA-CATGTTTACCGAACAA
65 ATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTACCAAACAA
* * ** * *
79343 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATCGTTATGTCC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** * * *
79396 TTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACT
* * * * * *
79459 ATTTTATTAATATTTCAAAGATTAATGAGTAAAAGTTTTAAAAAATGAAA-CTATTTACCGAACA
64 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCAAACA
* * *
79523 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
79577 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACT-A
* * * ** **** **
79641 ATTTACTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATAAGTTTTTTGAACACC
65 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * *
79705 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACT
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * *
79757 TTTTGTTTTGTCATAAACCTATTGTTTCTGTTCATACAAGCATA-TTCGAAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACTA
* * *
79821 ATTTATTAATATTTGAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTCTATTTACCAAACAAG
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * * *
79886 TTTAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTAAAATAGCTATGACC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * *
79938 TTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGTTTA-TTCGAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
* * * ** *
80002 TTTATTAATATTATGAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAAGA
66 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG-
* * * *
80067 TT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * *
80118 TTTTG-TTCGATAATAAAACAATTAATTT-TGTTCATACGAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATAA
1 TTTTGTTTTG-TCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATAC
* * * *
80180 TAATTTAGTAATATTTTAAAGATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-CGGCAAA
63 TAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC--CAAA
* * * * * * * * *
80244 CCACTTCAAACAATTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACC
125 CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * *
80300 TTTGGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGCTCATACATGCTTA-TCCAAAAAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTA
* * * * **
80363 GTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAAA-TT
65 ATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAA
* * * * * * * * *
80423 GTTCAAATAATTAAGGCCATTTAAACAACTACCTATTTCAAATTGTTATTA-C
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * *
80475 TTTTG--TTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACT
* *
80536 AATTTATTAATATTTAAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTTAATCTGTTTACCAAATCA
64 AATTTATTAATATTTAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CA
* * * *
80597 A-TTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * *
80650 TTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAGGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
* ** * *
80715 TTTAGTAATATTCTAAAAATTAAT-AGCTAAAAGATTTTTAAAA-AAAT-TGTTTGCCAAACCAG
66 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * ** * * ** *
80777 TTTAAATAATTAAGACTAGATAAACACTTAGT-TATTTCAAATTATTATGGCC
129 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTA
* * * * * * * **
80893 ATTTATTACTATTTCAAAAAATT-ATAGGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTATCAAATTA
65 ATTTATTAATATTT--AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA
* * * *
80957 GTTCAAAT-GATTATAACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTA-C
128 GTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * ** *
81009 TTTTAATTTTGTCATAAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGA-TTAAAATGAAATAATAC
1 TTTT-GTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTCGAATAAAATAATAC
* * * * *
81073 TAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACC
63 TAATTTATTAATATTTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * *
81138 ATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAATCGTTATAACC
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * * * **
81192 TTTTATTTTTTCATCAAACAATTGGGTT-TGTTCATACTATTTTATTT-GAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATACT
* * ** * * * ** *
81255 AATTTAATAATATTTCAAAATTTAATAACCAAGAA-AATTCAAAAATAAATTTAATTGCCGAAA-
64 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAAC
* * * *** ** *
81318 AAATTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGGTTATCTATTTCAAATTATTATGATC
126 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
** * * * * *
81373 TTTTGTTTTGTTGTAAAACAATTGTTT-TGTTTATACAAGCTTATGTGGATTAAAATAATACTAA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
** * * * * * ** *
81437 CTGAAATAATAGTTCAAAAATTAAT--G--AGAGATTTAAGAAATAAATTTGTTTATTGAATC-A
66 -TTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAA
* * * * ** *
81497 GTACAAATGGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACC
128 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * *
81550 TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACTAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTA
* *
81614 ATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACA
65 ATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
81678 AGTT
127 AGTT
81682 GAACACTTGT
Statistics
Matches: 4236, Mismatches: 898, Indels: 430
0.76 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
169 1 0.00
170 33 0.01
171 95 0.02
172 6 0.00
173 38 0.01
174 106 0.03
175 57 0.01
176 52 0.01
177 449 0.11
178 183 0.04
179 423 0.10
180 654 0.15
181 1402 0.33
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183 20 0.00
184 76 0.02
185 3 0.00
186 2 0.00
187 3 0.00
188 2 0.00
190 3 0.00
191 71 0.02
192 5 0.00
194 1 0.00
196 2 0.00
197 49 0.01
198 4 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
Found at i:77326 original size:179 final size:178
Alignment explanation
Indices: 76495--82259 Score: 3389
Period size: 181 Copynumber: 32.1 Consensus size: 178
76485 CAACAAATTG
* * * * * * * * *
76495 TTATGACTTTTTCTTTGGTTATAAAATAATTGTTTTTGTTCAAACAAGCTCATTTGGATTAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTT-TTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * *
76560 AATATTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AATATGTTTAC
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* * * *
76623 TGAACAATTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA
129 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * *
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* * * **
76739 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAGTGAGTAAGAGAACTAAAACAATAAATCTGTTTA
64 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTA
* * *
76804 CCGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTATCTAAACAATTATCTCTTTCAAATCA
128 -CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * **
76857 TTATGACCTTTT-TTATTTTATCAGAAAACAATTGGTTCTATTCATCCAAGCTAATTTCAAATAA
1 TTATGACCTTTTGTT-TTTTAT---AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAA
* * * * *
76921 AATAATA-TAAATTAATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTTGAAAAATAAATTTGTT
62 AATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * *
76984 TTCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCG
126 TAC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * * * * *
77039 GTATGACCAGTTATTTTGTTATAAACCAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
*
77104 AATACTAATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTGTA
65 AATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TA
*** * * *** * *
77168 -GAGTGAGTTCAAATAGTTTTAACTATTCGTTAATTATTTAATTCAAATCA
128 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * *
77218 TTATGATCTTTTGTTTTTTGATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAGGTTTTTTTGGAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTTT-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA-GCTTATTTGGAATAAAA
* * * *
77282 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAATTTAATATGTTAAAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTAC
64 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * * **
77347 GGAATAAGTTCAAAGAGTCATGTCCATTTGAACT-ATTATCTGTTTCAAATTG
129 -GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT-AAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * **
77399 TTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCATACAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTT-T--T---ATAA-AAC-A--ATT----GT--TT-CTATTCATACAAGC
* * * * *
77464 TTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAG-----GATTT-AAA
49 TTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * * *
77523 AATAAATGTGTTTGCCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGCCTATGAGAATAGTTATTTATTTCAAAT
114 AATAAATCTGTTT-ACGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-AATAATTATCTATTTCAAAT
**
77588 TG
177 CA
* * * * * * ***
77590 TTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTT-TTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * * *
77654 TAGTACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAA-A-TT-AAAAA-AAATCTGTTTA
64 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * **
77715 TCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTG
128 -CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
** * * * * * *
77768 TTATGACCTTTAT-TTTTATCGTAAAACAATTGTTTTCCATGCATAAAAACTTATCTGAAATAAA
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* * * * * *
77832 ATAATA-TTACTTATTAATATT-TCAAAATTTGATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATCAGTTT
63 ATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT
* * * * *
77895 ATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTCCAAATCA
127 A-CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * * ****
77949 TTGTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTGTTTTTCA-TCATGCAACCCTATTCATTATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* ** * *
78013 TAATACTAATTTACTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATGTAAAACATAAA-CATGTTT
64 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTT
* * * * * **
78076 ACTAAACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTG
127 AC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
78130 TTATAACCTTTTGTTATATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAAG
1 TTATGACCTTTTGTT-TTTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * * * * * * *
78195 AATACTAATGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTATTTGCC
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* * * * * * * *
78260 AAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCA
129 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAAATAATTATCTATTTCAAATCA
** ** * * *
78311 TTATGACCTTTTGTTTTATCGTAAAACAATTCATTCAATTCTTAGTAA-CTTA----GAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-CAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * * * * *
78371 TAAAACAAATTTATTAATCTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTG
64 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-
** * * * * * * *
78435 TTGAACCAGTTTACATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
127 ACGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * *
78488 TTATTACCTTTTTGTTTTATCATAAAATAATTACTTT-TGTTCATATAAGTTTAATTGGAAAAAA
1 TTATGACC-TTTTGTTTT-TTATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
* * * * * * *
78552 ATAGTATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA
63 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * *
78617 CTAAACCAGTTTAATTAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCA
128 C-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
** * * * * * * * *
78670 AGATGGCCATATGTTTTGTCATAAAAGC-ATTGTTTCTATTCCTA-TAGTCTTATTCGGAGTAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAA-CAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATTTGGAATAAA
* * ** * * *
78733 GTAACACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTAAAAAAATGAATTTG-TTA
63 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * **
78797 GCCTG-ACACA-TGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCGAATTG
128 --C-GAACA-AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * ** ** * *
78851 TTATGACCTTTTGTTTTATCACAAAACAATTTTTTCTATTTGTACAAGCTTATCCGAAATAACAT
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * **
78916 AATTCTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG----GGATTTAAAAAATGCATCTGTTTAC
65 AATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-
* * *
78976 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
128 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
** * * * * * * **
79028 CCATAACCTTTTATTTTGTCAGAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * * * *
79093 TATACAAATTTATTAATATT-TAGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTAC
65 AATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-
* * * * * * *
79157 CGAATAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCG
128 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * *
79209 TTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTCCATACAATCTTATTCGGATTAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * * *
79274 AATATTAATTTATTAATAGTT-TCACAATTAATAAGTAAAATA-TTAAAAAA-AAA-CATGTTTA
65 AATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-TGTTTA
* * * * * *
79335 CCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGTAATTATCTATTTAAAATCG
128 -CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
79388 TTATGTCCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTT-TTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * * * *
79452 TAATACTATTTTATTAATATT-TCAAAGATTAATGAGTAAAAGTTTTAAAAAATGAAA-CTATTT
64 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTT
* * * *
79515 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA
127 A-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* *
79569 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* * * ** *
79634 AATA-TAAATTTACTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATAAGTTTTT
65 AATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTG-TTTA
* ** * *
79697 TGAACACCTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-A
128 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * *
79748 GTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAACCTATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCGAAATAAAA
1 -TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * *
79813 TAATACTAATTTATTAATATT-TGAAAAATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTCTATTTA
64 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * * * *
79877 CCAAACAAGTTTAAATAATTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTAAAAT-A
128 -CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
79929 GCTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGTTTA-TTCGAATAAAA
1 -TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * * *
79993 TAATACTAATTTATTAATATTATGAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
64 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * **
80058 TGAATAAGATT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTG
129 -GAACAAG-TTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * * * * *
80110 TTATAACCTTTTGTTCGATAATAAAACAATTAATTT-TGTTCATACGAGCTTATTCGAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTT-TTTTATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * * * * *
80174 TAATAATAATTTAGTAATATTTTAAAGATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-C
64 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTAC
* * * * * * * **
80238 GGCAAACCACTTCAAACAATTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTG
129 -G--AACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *** *
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1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * *
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64 TAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* * * * * * * * **
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* * * * * *
80468 TTATTA-CTTTTGTTGTCT-TAAAACAATTGTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTTTTATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* *
80530 AATACTAATTTATTAATATT-TAAAGAATTAATAAG----AGATTTAAAAAGTTAATCTGTTTAC
65 AATACTAATTTATTAATATTCTAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-
* * * **
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128 CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * *
80642 TTATTACCTTTTGTTCTATTATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAGGCTTATTTTGAATAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTT-TTTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
* ** *
80707 AATACTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAAT-AGCTAAAAGATTTTTAAAA-AAAT-TGTTTGC
65 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-A
* * * * * * * * *
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128 CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTA-TCTATTTCAAATCA
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1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * * * * * * *
80885 TAAAACTAATTTATTACTATTTCAAAAAATT-ATAGGTAAGAGATTTAGAAAATAATTCTATTTA
64 TAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA
* ** * * * *
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128 -CGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * ** *
81002 TTATTA-CTTTTAATTTTGTCATAAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGA-TTAAAATGA
1 TTATGACCTTTT-GTTTT-TTAT-AAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTGGAATAA
* * * *
81065 AATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATT
62 AATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* * * * * * *
81129 TACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAATCG
126 TA-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * ** *
81184 TTATAACCTTTTATTTTTTCATCAAACAATTGGGTT-TGTTCATACTATTTTATTTGAAATAAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTTT-ATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * ** * * * *
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** * * * * ** *
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126 TACGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
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1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
** * * * *
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* * * * * *
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128 -CGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTA-AATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * *
81542 TTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACTAGCTTATTTAGAATAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTT-TTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* *
81606 TAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTT
64 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA-AGATTT-AAAAAATAAATCTGTTT
* * * * * * *
81670 ACCAAACAAGTT-GAACA-CT-TGTCTATT-AA-GA--ATC---GT----T-A
127 A-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
81708 -TA--ACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGATAATACAAGCTTATTTTGAATAAAA
1 TTATGACCTTTTG-TTTTTTATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAA
* * * *
81769 TAATA-TAAATTTAATAATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAAATATGAT
64 TAATACT-AATTTATTAATATTCTAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT
* ** * * **
81831 TACCGAACAAGTCCAAATCA-TTATGACTATTTAAGCAATTATTTATTTCAACTTG
126 TA-CGAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * * * * * * *
81886 TTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATGCAATCTTATTTAGATTAAAAT
1 TTATGACCTTTTGTTTT-TTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
** * * * * * * *
81951 AATTTTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAAATATATTTGCC
65 AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-AC
* * * *
82016 AAACAAGTTCAAATAGTCATGACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCG
129 GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
* ** * * *
82067 TTATGACATTTT-TTTTTGTAATAAAATGATTGTTTC-AGTACATATAAGCTTATTTGAAATAAA
1 TTATGACCTTTTGTTTTT-T-ATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAA
* * * * * *
82130 ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAAGATAATTAAAAAA-AGAATCTATTT
63 ATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTT
* * * *
82194 ATCGAACAAGTTCAAATAGTTATCACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAACA
127 A-CGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
82248 TTATGACCTTTT
1 TTATGACCTTTT
82260 TTATTTTTGT
Statistics
Matches: 4389, Mismatches: 947, Indels: 497
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
161 2 0.00
162 28 0.01
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168 1 0.00
170 2 0.00
171 1 0.00
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180 612 0.14
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187 2 0.00
188 1 0.00
189 1 0.00
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Consensus pattern (178 bp):
TTATGACCTTTTGTTTTTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATA
ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACGA
ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTAAATAATTATCTATTTCAAATCA
Found at i:78565 original size:540 final size:540
Alignment explanation
Indices: 76152--82259 Score: 3888
Period size: 540 Copynumber: 11.3 Consensus size: 540
76142 TTGTTTTTAA
* * *
76152 TTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTATTTCAATTCATATAAGCTT-A-TTCA-AAATAAAATAATAT
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* * * * * * * * **
76213 TAAGTTATTAATATTTCGAAAGTTAGTAATTAAAAGATTTAAAAAATAAAACTGTTTACCTAATA
62 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * *
76278 AG-TCTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTGTTTTAAATCGCTGTAACCTTTTGTTTTG
127 AGTTC-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTA
* * * *
76342 TCATAAAA-AGATT-TTATCTATTCATACAAGCTT-ATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTATT
191 TCATAAAACA-ATTATT-TTTGTTCATACAAGCTTAATTT-GAAAAAAATAATACT-AATTTACT
* * *
76403 AATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATATA-TCTATTCACCAAA-CAAGTTC
252 AATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAACT-TGTTTACCAAACCAA-TTC
* * * * *
76464 AAATCA-TTATGACTATTTGAAC----A---A---CAAATTGTTATGACTTTTTCTTTGGTTATA
312 AAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
76518 AAATAATTGTTTTTGTTCAAACAAGCTCATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TC
376 AAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-
* * * * ** * * * *
76582 AACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAATATGTTTACTGAACAATTTCAAATAGTCATGA
440 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATA-AATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
* * * * * *
76646 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACTGTGACA
504 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * * * * * *
76683 TTTTGTTTTGTAATAAGATAATTGTTTCAGTTAATATAAGCTT-A-TTTGAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCAATT-CTAT-AG-TTAACTTAGAAATAAAATAATACT
* * **
76746 AATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAGTGAGTAAGAGAACTAAAACAATAAATCTGTTTACCGAAC
63 AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTACCGAAC
* * * * * * * *
76810 AAGTTCAAATAGTTATGTCTATCTAAACAATTATCTCTTTCAAATCATTATGACCTTTTTTATTT
126 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC--TTTTGTTT
* ** * * * * * *
76875 TATCAGAAAACAATTGGTTCTATTCATCCAAGC-TAATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTAATT
189 TATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTTGAAA-AAAATAATACT-AATTTACT
* * * * * *
76938 AATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTTGAAAAATAAATTTGTTTTCTAAA-CACGTTCAAA
252 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAACTTGTTTACCAAACCA-ATTCAAA
* * * * * * ** * * *
77001 TAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGGTATGACCAGTTATTTTGTTATAAACC
315 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * *
77066 AATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTTTCAAAA
380 AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAA
* * * * * *
77130 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTGT---AGAGTGAGTTCAAATAGTTTTA-AC
444 ATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTATT-TACCAAACT-AGTTCAAATAG-TTAAGAC
* ** * * * *
77191 TATTCG-TTAATTATTTAATTCAAATCATTATGATC
505 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * * * ** * *
77226 TTTTGTTTTTTGATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAGGTT-TTTTTGGAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCAATTC-TATA-GTTAACTTAGAAATAAAATAATACTA
* * * * **
77290 ATTTATTAATA-TTCTAAAATTTAATATGTTAA-AGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACGGAATA
64 ATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
* * * * * * * * * *
77353 AGTTCAAAGAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTGTTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGT
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTAT
** *
77418 CATAAAATAATACCAATTATTCAAAATAATTGGTATTCATACAAAATT-ATTTAGAATAAAATAA
192 CAT---A-AA-A-CAATTATT-----T--TT-G--TTCATACAAGCTTAATTT-GAAAAAAATAA
* * * ** * *
77482 TACCAATTTATTACTATTTTGAAAATTAATAAG-----GATTTAAAAATAAA-TGTGTTTGCCGA
240 TACTAATTTACTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAACT-TGTTTACCAA
* * ** * * *
77541 A-CAAGTTCAAATAGTTAAGCCTATGAGAATAGTTATTTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTT
304 ACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTT
* * * * ** *
77605 TAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAATTTATTA
368 TTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * * *
77670 ACATTCAAAAAATTAATAAGCAAGA-AATTAAAAA-AAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAG
433 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAG
* * *
77733 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACC
498 TTAAGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * **
77776 TTTAT-TTTTATCGTAAAACAATTGTTTTCCATGC-ATA-AAAACTTATCTGAAATAAAATAATA
1 TTT-TGTTTTATCATAAAACAATT-TTTTCAATTCTATAGTTAACTTA---GAAATAAAATAATA
* * * * * *
77838 -TTACTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAA-AGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATCGAA
61 CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA
* * * * * *
77901 TCAGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTCCAAATCATTGTGAA-CTTTTGTTT
125 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTTT
* * * * ** * * * * *
77965 TGTCATAAAATAAGTGTTTTTCATCATGCAACCCT-ATTCAT-TATAAAATAATACTAATTTACT
189 TATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATT--TGAAAAAAATAATACTAATTTACT
** * * *
78028 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATGTAAAACATAAACATGTTTACTAAACCAATTCAAAT
252 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA-ATAAACTTGTTTACCAAACCAATTCAAAT
* * * *
78093 AATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTATATCATAAAACA
316 AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
78158 ATTATTTCTGTTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAAGAATACTAATGTAATAATATTCTAAAAAT
381 ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * *
78223 TAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTATTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGGCTATAT
446 TAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTT
* * *
78288 GAACAATTCTTTATTTCAAATCATTATGACC
510 GAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* ** * *
78319 TTTTGTTTTATCGTAAAACAATTCATTCAATTCT-TAG-TAACTTAG-AATAAAATAAAACAAAT
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCAATTCTATAGTTAACTTAGAAATAAAATAATACTAAT
* * * ***
78381 TTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTGTTGAACCAGTT
66 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTT
* * * *
78446 TACATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTTGTTTTATCAT
131 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC-TTTTGTTTTATCAT
* * * * * * * * *
78511 AAAATAATTACTTTTGTTCATATAAGTTTAATTGGAAAAAAATAGTATTAATTTATTAATATTTT
195 AAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTTGAAAAAAATAATACTAATTTACTAATATTTC
* * * * * * * * *
78576 GAAAATTAAGAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTATTTACTAAACCAGTTTAATTAGTTATA
260 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAACT-TGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATG
* **** ** * *
78640 ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCAAGATGGCCATATGTTTTGTCATAAAAGC-ATTGTT
323 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATTGTT
* * * * * *
78704 TCTATTCCTA-TAGTCTTATTCGGAGTAAAGTAACACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
387 TCTGTTCATACAAG-CTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
* * * * * * *
78768 AGTAACG-GATTAAAAAAATGAATTT-GTTAGCCTGACAC-A-TGCAAATAGTTATGACTGTTTG
451 AGTAA-GAGATT-TAAAAATAAATTTATTTA-CC--AAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG
* *
78829 AACAATTATCTATTTCGAATTGTTATGACC
511 AACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * * * *
78859 TTTTGTTTTATCACAAAACAATTTTTTCTATT-TGTA--CAAGCTTATCCGAAATAACATAATTC
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCAATTCTATAGTTAA-CTTA---GAAATAAAATAATAC
** * *
78921 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---G-GATTTAAAAAATGCATCTGTTTACCAAACA
62 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACC
*** * *
78982 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACCATAACCTTTTATTTTGT
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * * * *
79047 CAGAAAATAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTCAAATAAAATTATACAAATTTATTAAT
192 CATAAAACAATTATTTT-TGTTCATACAAGCTTAATTTGAAA-AAAATAATACTAATTTACTAAT
* ** * * *
79110 ATTT-AGATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCGAA-TAAGTTTAAATA
255 ATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAACTTGTTTACCAAACCAA-TTCAAATA
* * *
79173 GTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
317 GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
79238 TTGTTTTTCTCCATACAATCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATAGTT-TCACAAT
382 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAAT
* ** * * * *
79302 TAATAAGTAA-A-ATATTAAAAAAAAACATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATA-ACTATT
446 TAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATT
** * ** *
79364 TGAGTAATTATCTATTTAAAATCGTTATGTCC
509 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * *
79396 TTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATT-AGTTCATATAGGCTT-A-TTTGAAATAAAATAATAC
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATT-TTTTCAATTC-TATA-G-TTAACTTAGAAATAAAATAATAC
* * * * * *
79458 TATTTTATTAATATTTCAAAGATTAATGAGTAAAAGTTTTAAAAAATGAAA-CTATTTACCGAAC
62 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTGTTTACCGAAC
* * * * * *
79522 AAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
126 CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTA
* * * *
79587 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTTACTAA
191 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTT-GAAAAAAATAATACT-AATTTACTAA
* ***
79650 TA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAA-TAAGTTTTTTGAACACC--TTCAA
254 TATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAACT-TG-TTTACCAA-ACCAATTCAA
* * * *
79710 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAC
314 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *
79775 CTATTGTTTCTGTTCATACAAGCATATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TGAAA
379 CAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAA
* * * * * * * * * *
79839 AATTGATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAGTCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATGATTG
443 AATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA
* * *
79904 TTTGAACAATTATTTATTT-AAAATAGCTATGACC
507 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTA-TTATGACC
* * * * * *
79938 TTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATAAAAGTTTA-TTCG-AATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCAATTC-T-ATAGTTAACTTAGAAATAAAATAATACTA
* * * **
80001 ATTTATTAATATTAT-GAAAATTAATAGGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAATAA
64 ATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCA
* * * **
80065 GATT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCGAT
128 G-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTAT
* * * * * *
80129 AATAAAACAATTAATTTTGTTCATACGAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATAATAATTTAGTAATA
192 CATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTTGAAA-AAAATAATACTAATTTACTAATA
* * * * * *
80193 TTTTAAAGATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCTGTTT-CGGCAAACCACTTCAAACA
256 TTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAACT-TGTTTAC--CAAACCAATTCAAATA
* * * * * *
80256 ATTAAGACTATATAAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTGGTTTTGTCATAAAACAA
317 GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * ** * * * *
80321 TTATTT-TAGCTCATACATGCTTA-TCCAAAAAAAATAATACTAGTTTATTAATATT-TCAAAAG
382 TTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
* * * * * *
80383 T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCAGTTTATCGAAA-TTGTTCAAATAATTAAGGCCAT
446 TAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTA-TTTA-CCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT
* * * * *
80443 TTAAACAACTACCTATTTCAAATTGTTATTA-C
508 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * *
80475 TTTTG--TTGTCTTAAAACAATTGTTTTTCAA--CATACAAGCTT-A-TTTGAAATAAAATAATA
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAA-T-TTTTTCAATTC-TA-TAG-TTAACTTAGAAATAAAATAATA
* * *
80534 CTAATTTATTAATATTT-AAAGAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTTAATCTGTTTACCAAA
61 CTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA
* * * * * * *
80594 TCAATTCAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTCT
125 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTT
* * * * *
80659 ATTATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAGGCTTATTTTGAATAAAATAATACTAATTTAGTAAT
190 ATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTTGAAAAAAATAATACTAATTTACTAAT
* * * *
80724 A-TTCTAAAAATTAAT-AGCTAAAAGATTTTTAAAA-AAA-TTGTTTGCCAAACCAGTTTAAATA
255 ATTTC-AAAAATTAATAAG-TAAAAGA-TTTAAAAATAAACTTGTTTACCAAACCAATTCAAATA
* * ** * * * * ** * *
80785 ATTAAGACTAGATAAACACTTAGTTATTTCAAATTATTATGGCCCTTTGTTTTGCCATAAAACAA
317 GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * ** * * * *
80850 TTATTTCAGCTCATAAAAGCTTATTTAGAATAGAATAAAACTAATTTATTACTATTTCAAAAAAT
382 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAAT
* * *
80915 T-ATAGGTAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTATTTATCAAATTAGTTCAAAT-GATTATA-ACTA
446 TAATAAGTAAGAGATTTA-AAAATAAATT-TATTTACCAAACTAGTTCAAATAG-TTA-AGACTA
* * *
80976 TTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTA-C
507 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * ** * * *
81009 TTTTAATTTTGTCATAAAAACAATTGTTTT-TGTTAATATAAGTTTGA-TTA-AAATGAAATAAT
1 TTTT-GTTTTATCAT-AAAACAATT-TTTTCAATT-CTAT-AG-TTAACTTAGAAATAAAATAAT
* * * *
81071 ACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAA
60 ACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGA
* * * * *
81135 ACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTACTTCAAATCGTTATAACCTTTTATTT
124 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTT
* * *** * * * *
81200 TTTCATCAAACAATTGGGTTTGTTCATACTA-TTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATA
189 TATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTTGAAA-AAAATAATACTAATTTACTA
* ** * * * ** * *
81264 ATATTTCAAAATTTAATAACCAAGAAAATTCAAAAATAAATTTAATTGCCGAAA-AAATTCAAAT
253 ATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAATAAACTTGTTTACC-AAACCAATTCAAAT
* * *** * * * * **
81328 AGTTAAGACTATATGAATGGTTATCTATTTCAAATTATTATGATCTTTTGTTTTGTTGTAAAACA
316 AGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** *
81393 ATTGTTT-TGTTTATACAAGCTTATGT-GGATTAAAATAATACTAACTGAAATAATAGTTC-AAA
381 ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TCGGAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA-TTCTAAA
* *** * *
81455 AATTAAT--G--AGAGATTTAAGAAATAAATTTGTTTATTGAA-TCAGTACAAATGGTTAAGACT
443 AATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AAATAAATTTATTTACCAAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACT
* *
81515 ATTAGAACAATTATCTATTTCAAATTATTTTGACC
506 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * *
81550 TTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTT-AGTTCATACTAGCTT-ATTTAG-AATAAATTAATA
1 TTTTGTTTTA-TCATAAAACAATT-TTTTCAATTC-TA-TAG-TTAACTTAGAAATAAAATAATA
* *
81611 CTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACC-A
61 CTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCGA
* * * *
81674 A--A---C----A---A-G-----TTGAACACTTGTCTA-TTAAGAATCGTTATAACCTTTTGAT
124 ACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATAACCTTTTGTT
* * ** * * * * *
81720 TTGTCATAAAACAATTGTTTCAGATAATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTAAT
188 TTATCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTTGAAAAAAATAATACT-AATTTACT
* * * *
81784 AATA-TT-AAGACAATTAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAAA-TATGATTACCGAA-CAAGTCC
252 AATATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAACT-TGTTTACCAAACCAA-TTC
* * * *
81845 AAATCA-TTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTATTTTGTCAT
312 AAAT-AGTTATGACTATTTGAA-CAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * ** * ** *
81908 AAAACAATTGTTTTTGTTTATGCAATCTTATTTAGATTAAAATAATTTTAATTTATTAATATTTT
375 AAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT
* * * * * * * *
81973 GACAATTAATAAGTAAAAGATTTCAAAAATAAATATATTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTCATGA
440 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGA
* * ** *
82038 CTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACA
504 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACC
* * * ** * * * *
82075 TTTTTTTTTGTAATAAAATGATTGTTTCAGTACATATAAGCTT-A-TTTGAAATAAAATAATACT
1 TTTTGTTTTATCATAAAACAATTTTTTCAATTC-TAT-AG-TTAACTTAGAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
82138 AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATGAGTAAGATAATTAAAAAA-AGAATCTATTTATCGAACA
63 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTGTTTACCGAACC
* * * * * *
82202 AGTTCAAATAGTTATCACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAAACATTATGACCTTTT
127 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT
82260 TTATTTTTGT
Statistics
Matches: 4410, Mismatches: 888, Indels: 546
0.75 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
519 2 0.00
520 20 0.00
521 175 0.04
522 39 0.01
523 2 0.00
524 22 0.00
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527 1 0.00
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547 2 0.00
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557 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
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TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACCAGTT
CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTATCATA
AAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTAATTTGAAAAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCA
AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAACTTGTTTACCAAACCAATTCAAATAGTTATGACT
ATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
TTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
GAGATTTAAAAATAAATTTATTTACCAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATC
TATTTCAAATTATTATGACC
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Alignment explanation
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76188 AAGCTTATTC
** * * * * * *
76198 AAAATAAAATAATATTAAGTTATTAATATTTCGAAAGTTAGTAATTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAT
** * * * * * * * * *
76263 ACTGTTTACCTAATAAGTCTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTGTTTTAAATCGCTGT
66 TTTGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * *
76328 AACC-TTTTGTTTTGTCATAAAA-AGATT-TTATCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATA
131 GACCTTTTTATTTTATCATAAAACA-ATTATT-TTTATTCATAAAAGTTTA-TTGGAATAAAATA
* *** * * * * **
76390 ATATAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATATATCTATTCACCA
193 ATATTAATTTATTAATATTTTCAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTG
* * * **
76455 AACAAGTTCAAATCA-TTATGACTATTTG---AA-CA---A---CAAATTGTTATG-ACTTTT-T
257 AATAAGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGT
* * * * * ** * *
76507 CTTTGGTTATAAAATAATTGTTTTTGTTCAAACAAGCTCATTTGGATTAAAATAATATTAATTTA
321 -TTT-GTCATAAAACAATTGTTTTT-ATC--ATAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACTAATTTA
* *
76572 TTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATA-TGTTTACTGAACAATTTCAA
380 TTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA-ACTGTTTACTGAACAAGTTCAA
* * * *** * * * *
76636 ATAGTCATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCACTGTGACATTTTGTTTTGTAATAAGA
444 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * * *
76701 TAATTGTTTCAGTTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
509 CAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAA
* ** * * *
76766 ATTAGTGAGTAAGAGAACTAAAACAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGTCTA
574 ATTA-T-AATAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTGCCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
76831 TCTAAACAATTATCTCTTTCAAATCATTATGACCTTTTTTATTTTATCAG-AAAACAATTGGTTC
636 TATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC--TTTTGTTTTATC-GTAAAACAATTGTTTC
* *
76895 TATTCATCCAAGCTAATTT
698 TATTC-T--TAG-TAACTT
* * * * * * *
76914 CAAATAAAATAATATAAATTAATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAA-ATTTGAAAAATAAA
1 AAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAT
* * * * *
76978 TTTGTTT-TCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCGGTA
66 TTTGTTTATC-AAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTA
** * * * * * * *
77042 TGACC-AGTTATTTTGTTATAAACCAATTATTTTTGTTGATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAA
130 TGACCTTTTTATTTTATCATAAAACAATTATTTTTATTCATAAAAGTTTA-TTGGAATAAAATAA
*
77106 TACTAATTTATTAA-ATTTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTGTA--
194 TATTAATTTATTAATATTTTC-AAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATCTGTT-TACT
* * * * * * *
77168 GAGTGAGTTCAAATAGTTTTAACTATTCG-TTAATTATTTAATTCAAATCATTATGATCTTTTGT
256 GAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGT
* * * * * **
77232 TTTTTGATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAGGTTTTTTTGGAATAAAATAATACTAATTTATT
321 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCAT-AA-G-CTTATTCAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * *
77297 AATA-TTCTAAAATTTAATATGTTAAAGATTTAAAAAATAATTCTGTTTACGGAATAAGTTCAAA
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* * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* * * * * * * *
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* *
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*
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*
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* * *
89965 TTTTGTCATAAATCAATTATTTCTATTCATACATATTTATTCGT-AATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTC-TAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
90029 TTAAAATTTCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAAATCTGTTTATCAAGCAAGTTCAACT
65 TTAATATATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAAAATCTATTTATCAAGCAAGTTCAAAT
* * * *
90094 AGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATAATAAACTTTTG
130 AGTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT-GACTTTTG
*
90144 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTA
* ** * *
90208 TTAATATAAT-AAAA-TTAATGAGTTCGAA-A-CTAAAAAATTAATTTATTTATTGAA-CAAGTT
65 TTAATAT-ATCAAAAGTTAATAAG-TAAAAGATCTAAAAAA--AATCTATTTA-TCAAGCAAGTT
* * *
90268 CAAATAATTATGTCCATTTGAACT-ATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTG
125 CAAATAGTTATGTCTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTG
* * * * * *
90322 TTATGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAAATTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
90387 TAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAACCTAAATTTATTTACCATA-CCAGTT---
66 TAATATATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATCTAAAA--AAAATCTATTTATCA-AGCAAGTTCAA
* * **
90444 -TA---A-----A-TTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATGA-TCTTTG
128 ATAGTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTG
* * ** * ** * * **
90485 TTTTGAT-ATAAAACATTTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCTGAGCAAAATATTGCTAAACTA
1 TTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * *
90549 ATAATATTAT-GATA-TTAATAAGTAATAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAA-CCAGTTC
65 TTAATA-TATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATCT-AAAAA-AAATCTATTTATC-AAGCAAGTTC
* * * * * * *
90611 AAATAGTTAAGACTGTTGGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTG
126 AAATAGTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
* * *** * *
90665 -TTTGTTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATGCATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTATTTT
1 TTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAATTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * * * * * * *
90728 GTTAACAT-TTAGAAAATTAATAAGCAAGAA-ACTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-TAAA
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* * * * *
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123 TTCAAATAGTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTG
* * * * * * * *
90846 TTTTATAATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATA-AAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-TTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTT
* * * * *** * * * *
90909 ATTAATATTTCAAAAATTGAGAAGTTTGAGATTTAAAAAATAAATCAAATTATCAAATCAA-TTC
64 ATTAATATATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATCT-AAAAA-AAATCTATTTATC-AAGCAAGTTC
* * * ** * * **
90973 AAATAATTGTGGCCCTTTAAACAGCTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTG
126 AAATAGTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTG
* * ** ***
91027 TTTTGTCATAAAACAACTGTTTTTCA-TCATTTAAGCCTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAATTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTT
* * * ** * * *
91090 ATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTTAAAAAAAAAATCTATTTAGTGAA-CTAGTT
64 ATTAATATATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGA-TCT--AAAAAAAATCTATTTA-TCAAGCAAGTT
* * * * *
91154 CAAATGGTTATGAT-TATTTGAACAATTATATATTTCAAATCTTTATAACATTTTG
125 CAAATAGTTATG-TCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-TTTTG
* * * ** * * *
91209 TTTTGTCATAAAACAATTATTTATGTTCATACAAGCTTATT-TGGAATAAAATAAGACTAATCTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTCT-AAATAAAATAATACTAATTTA
* * ** * * * * * *
91273 ATAATATTATGAAAA-TTAATAACCAAGAGATTTAAAAAATATATTTGTTTGCA-AAACCAA-TT
65 TTAATA-TATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAA-A-ATCTATTT--ATCAAGCAAGTT
*
91335 CAAATAGTTAATG-CTATATGAATAATTATCTATTTCAAA-CTATTATGACCTTTTG
125 CAAATAGTT-ATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGA-CTTTTG
** * * * * * *
91390 TTTTGTTGTAAAACAAATGTTT-TGTTCATATAAGTTTGTT-TAGAATAAAATAATATTAATTTA
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTCTA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * * * *
91453 TTAATATTTTGAAAA--TCAT---TAAGAGAT-TCAAAATATAAATCTGTTTACCAAACTAGTTC
65 TTAATA-TATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATCT-AAAA-A-AAATCTATTTATCAAGCAAGTTC
* ** * * * * * *
91512 AATTAGTTATAACAATTTGAATAATTATTTATTTTAAATGATTATGACCATTTA
126 AAATAGTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTG
*
91566 TTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATT
1 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
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TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAATTTATTCTAAATAAAATAATACTAATTTAT
TAATATATCAAAAGTTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAAAATCTATTTATCAAGCAAGTTCAAATA
GTTATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTG
Found at i:98297 original size:21 final size:21
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* *
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*
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1 AAGGGATCGATCCCTTCCATT
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1 AA
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AAGGGATCGATCCCTTCCATT
Found at i:99708 original size:182 final size:178
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98461 CAAGGCCAAC
*** ** * * *
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1 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAATCAAAAACTATTATTTTAT
* * * ** * * * *
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66 GACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAA-AATCATAACTATTTGAA-
* * * * * * * ***
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* * * ** * * *
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** * * * * * **
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* * ** ** * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * * * * **
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* ** * * ** *
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* * ** * * *
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64 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAA-AATCATAACT-ATTTG
* * **
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* * * *
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1 ATATTAATAAATTA-GTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAATCA-A-AAACTATTATTT
* * * * * * ** * *
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63 TATGACAAAACAAAAAGTCATAAT-GATTTGAAATAAATAATTACTCAAA-AATCATAACTATTT
* ** * * * * *
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126 GAA-TTGGTTAGATAAACAAAATT-A-TTTTTAAATCTTTTACTTATT-A-TTTCAAA
* * *** *
99375 ATGTTAATAACTTAGTATTATTTTATTTTGAA-AAACTTATATGAATTGAAATAA-T-TT-TTTT
1 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAA-TCAAA-AACTATTATTTT
* * ** * * * * *
99436 ATGACAAAAC-AAATGATTATAACAATTTGAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTG
64 ATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAA-AATCATAACTATTTG
* * * *** * *
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* * * *
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1 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAATCAAAAACTATTATTTTAT
* * * * * * * *
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66 GACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAA-AATCATAACTATTTGAAT
* * * * * *
99685 TGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTA-TTAATT-TTT-GAA
130 TGGTTAGATAAACAAAATTA-TTTTTAAATCTTTTACTT-ATTATTTCAAA
* * * * * * *
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1 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAATCAAAAACTATTATTTTAT
* * *
99797 GACAAAACAAAATGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAAAATCATAATTATTTGAATT
66 GACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAAAATCATAACTATTTGAATT
* *
99862 GGTTAGGTGAACAAAATTATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAA
131 GGTTAGATAAACAAAATTATTTT-TAAATCTTTTACTTATT-A-TTTCAAA
* * ** * *
99913 ATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAACTGGTAGGAATTCAAAAA-AACTTATTTT
1 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAA-TCAAAAACTA-TTATTTT
* * ** * *
99977 ATGACAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAATCTTATA-TATTTG
64 ATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCA-AAAATCATA-ACTATTTG
** * * * * * **
100041 AACCGGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAA
127 AATTGGTT-AGATAAACAAAATTA-TTTTTAAATCTTTTACTTATT-A-TTTCAAA
* * * * * * *
100096 ATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-CAAAAA-TAACTGTTTTA
1 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAATCAAAAACT-ATTATTTTA
* * * * * * * **** * *
100159 TGATAGAATAAAATGTTATATTGATTTGAAGTTTGCAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
65 TGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAA-AATCATAACTATTTGAA
* * * * **
100224 CTAGTTCTG-TAAAC-AGATATATTTTTTAAATC--TTACTTATTAACTTTTTAA
129 TTGGTT-AGATAAACAAAAT-TA-TTTTTAAATCTTTTACTTATT-A-TTTCAAA
* *
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1 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAA
100310 GCTTGAATGT
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Consensus pattern (178 bp):
ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTATATGAATCAAAAACTATTATTTTAT
GACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTACTCAAAAATCATAACTATTTGAATT
GGTTAGATAAACAAAATTATTTTTAAATCTTTTACTTATTATTTCAAA
Found at i:99990 original size:359 final size:353
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Period size: 361 Copynumber: 5.3 Consensus size: 353
98461 CAAGGCCAAC
* *** **
98471 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATGAAT-AAAAAAATTTATTTTAT
1 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATCAAAAAAA-TTATTTTAT
* ** * * * * * *
98535 GACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAAAAAATAATTTTTGAAATAGTTATAACTATTTAAAC
65 GACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAA-
* * * * *
98600 TT-GCTCGATAAATATATTTATTTTTTAAATCT-TTTAGTTATCAATTTTTGGAATATTTATAAA
128 TTGGTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTA--T-T-AATTTTTGAAATATTAAT-AA
** * * *
98663 TATA-TATTATTTTA-TTCGAAATAAGCTTGCATGAA-C-ATAACTAATTGTTATATAACAAAAC
188 T-TAGTATTATTTTATTTCGAAA-AA-CTTATATGAATCGA-AA-TAATTTTTTTATGACAAAAC
* ** * ** * * * **
98724 AAAAAAGTCAT-ATTATTTAGAAATAGATAATTGTTTAGATAGTCATAACTATTTGTGCTTGTCT
248 -AAAATGTCATAACAATTT-GAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTG-AATTG--T
* * * * * * **
98788 TA--AAAATAAATTCATTTTTTGAATCTCTTACTCATTAATTTTTGAA
308 TAGGTAAACAAATT-A-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAA
* * * ** * * * *
98834 ATATTAATAAACTAGTATTATTTTACAT-CAAATAAGTTTATATGAA-CTGAAACAATTGTTTTA
1 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTA-TTCCAAATAAACTTGTATGAATC-AAAAAAATTATTTTA
* * * * * * * ** * * *
98897 TTACAAAAGAAAATGTTAGAATGATTTGAAATAGAAAATTACTCAAATGGTTATGATTATTTGAA
64 TGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AATATTTGAA
* * * * * * * *
98962 TT-TTTTGGTAAACATATTTATTTTTT-AAGCGTTTTACTTATTAATTATTGAAATATTAATAAA
128 TTGGTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATC--TCT--TTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AA
* * * * *
99025 TT-GATATTATTTTA-ATCTGAAGAAGCTTGA-ATGAA-CAAAAAAAATTGTTTTATGACAAAAC
188 TTAG-TATTATTTTATTTC-GAA-AAACTT-ATATGAATC-GAAATAATTTTTTTATGACAAAAC
* * * * *
99086 AATAA-GTCATTACAAGTTGAAATAAATAACTACTCAAATAGTCATAATGATTT-ACACTTGTTT
248 AA-AATGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGA-A-TTGTTA
* **
99149 GGTAAACAAATATATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAGTTATCTTA
310 GGTAAACAAAT-TA-TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTATCAAA
* * ** *
99195 ATATTAATAAATATGTATTATTTTATTCAAAATAAACTTGTATGAAT-AGAGTAAATCA-TTTAT
1 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATCA-AAAAAATTATTTTAT
* * * * *
99258 GACGAAACAAAAAGTTAT-CTCAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAA
65 GACAAAACAAAAAGTCATAAT-AATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAA
** * * ** *
99322 CTTACTCAG-TAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTAATTATTAATTTTCAAAATGTTAATAAC
128 -TTGGTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTTGAAATATTAATAA-
* *
99386 TTAGTATTATTTTATTTTGAAAAACTTATATGAATTGAAATAATTTTTTTATGACAAAAC-AAAT
188 TTAGTATTATTTTATTTCGAAAAACTTATATGAATCGAAATAATTTTTTTATGACAAAACAAAAT
* * * * * *
99450 GATTATAACAATTTGAAATAAACAATTATTCAAATAGTCATGATTATTTGATATAGTTCGGTAAA
253 G-TCATAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGA-ATTGTTAGGTAAA
** * * * *
99515 TTTACTTATTTTTAAAATTTTTTTACTTATTGATTGTCAAA
316 -CAAATTATTTTT-AAA-TCTTTTACTTATTAATTATCAAA
* * * * * *
99556 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCTAATAAGCTTTTATGAA-CAAAAACTATTATTTTAT
1 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATCAAAAA-AATTATTTTAT
* * * * * *
99620 AATAGAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAAATACTTCCTT-AAATAGTCATAACTATTTGAA
65 GACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAA-TATTTGAA
* *
99684 TTGGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTATTAATTTTTGAAATATTAGTATATTAG
128 TTGGTTAGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTATTAATTTTTGAAATATTAATA-ATTAG
*
99748 TATTATTTTATTTCGAACAAACTTATAT-AATCGAAA-ACTTTTATTTTATGACAAAACAAAATG
192 TATTATTTTATTTCGAA-AAACTTATATGAATCGAAATA-ATTT-TTTTATGACAAAACAAAATG
** * * *
99811 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTACTCAAA-AATCATAATTATTTGAATTGGTTAGGTGAACA
254 TCATAACAATTTGAAATAAATAATTACTCAAATAGTCATAATTATTTGAATT-GTTAGGTAAAC-
*
99875 AAATTATTTTCTAAATCTTTTACTTATTAATTTTCAAA
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* * *
99913 ATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAATAAACTGGTAGGAATTCAAAAAAACTTATTTTA
1 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAA-TCAAAAAAA-TTATTTTA
** * * *
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64 TGACAAAACAAAAAGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ATATTTGAA
** * * * * *
100043 CCGGTTCA-ACAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGA
128 TTGGTT-AGATAAATAGATTTATTTTTTAAATCTC-T--TTATTAATTTTTGAAATATTAATA-A
* * * * * * *
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* *** * **** * * * **
100170 AATGTTATATTGATTTGAAGTTTGCAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCTGTA
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* **
100235 AACAGATATATTTTTTAAATC--TTACTTATTAACTT-TTTAA
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* * * * * * * * *
100275 AGATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGAATG-TTTAAAAACAATTGTTATAT
1 ATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGAATCAAAAA-AATTATTTTAT
* * * * *
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100381 GACAAGGCCA
Statistics
Matches: 1215, Mismatches: 254, Indels: 159
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Matches are distributed among these distances:
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* * * * * *
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* ** *
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* **
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* * * * * * * *
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* * * ** * * *** * *
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* * ****
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * * **
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * * **
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* * *
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** * ** * * *** *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * **
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* **** * * * * **
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * *
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** * *
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1 TTTTT-AAATCTCTTGCTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
** * * * *
103942 AATTTTGCATGAA-TAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
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* * * * * * * *
104006 ATAATTATTCAAATGGACATGACTATTT-AAATTGATTCGGTAAACAAATTAAC
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGT-AA-ATATTTAT
* * * * * * * *
104059 TCTTTAAACCACTTACTTATT-ATATT-AATAAATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
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* * * * *
104122 AACTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAGA
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* * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * *
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*
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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* * * * * *
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* * ** * * *
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** * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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** * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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* * *
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* * *
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* * *
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***** * * * *
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* * *
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* **
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** * * * * * *
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* * * * * * * *
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* **
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129 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GGTAA-ATATTTAT
* * * *
106777 TTTTTAAATTTC-TACTTATTAATTTTG-GA-ATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTTGAAATA
1 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATA
* * * * *
106838 AGCTTGTATG-AGTAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
65 AGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * *
106902 TAATTATTCAAATAAG-CATAACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAGATTCA-
129 TAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGT-AA-ATATTTAT
* * * * * * * **
106953 CTTTAAAATTTTTTAACTCATTAACTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAAT
1 TTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* ** * * * * *
107018 AAGCTTATACAAACTGATAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTGATAA-CAATTGAAAATA
64 AAGCTTGTATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTG-AAATA
* * * *
107081 GATAATTATTCAAATAGTTATGACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTAT
127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGT-AA-ATATTTAT
* * * * * ** * * *
107135 TTTTAAAATCTTTTACCTAGTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATA
1 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
* * * * ** *
107200 AGCTTGTATGAACAAAAACATTTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAA-CA-ACG-ATTA-AT
65 AGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* ** * *
107261 -A-T-TT-AAATTATTTGGTAACTATTT----TT-TT---TAAATTTTTACA
130 AATTGTTCAAA-TA-GTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATATTTA-T
* * **
107301 TTTTTAAATGTC---C---TGAA-TTT--AA-A-T-AT---TT-GTATTATTTTACATTGCAATA
1 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATA
** * * * * *
107350 AGCTTGTATGAAGAGAAAAAAATGTATTTTATGA-ACAAACATAAAAGGCCTTATAGTAATTTGA
65 AGCTTGTATGAA-CTAAAACAAT-TGTTTTATGACA-AAACA-AAAA-G--TCATAATGATTTGA
* * * * * *
107414 AATAGGGTAATTGTTTTAAATTGTCATAACTATTTTATAACTTCGTTCGCTACAACTATTTAG
123 AATA-GATAATTG-TTCAAATAGTCATAACTA-TTT-GAACTT-GTTCGGTA-AA-TATTTAT
* ** * * **
107477 TTTTTAACTCTTCTTATTTATTATTTTTGAAATATTAAT-AATT-GAATTAAGTTATTTCTTGCC
1 TTTTTAAATC-TCTTGCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT-TTG--
* * * * ** * *
107540 CAGAA-CTTTGT-TCG-A-T-AGACAATTGTTATTGTGTTAAAACAAAATGT-ACAA-GATTT--
61 AATAAGC-TTGTAT-GAACTAAAACAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGA
* * * * * * * *
107596 AATAGAT-ATTATTCCAAAATAGTCATCAGTATTTGCA-TTGGTCAGGCCAAGAAATTCAT
123 AATAGATAATTGTT-C-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GG-TAA-ATATTTAT
* * * *
107655 TTTTT-AAT-TCGTTACTTATTAATTTTAAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTGAAT
1 TTTTTAAATCTC-TTGCTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * ** * *
107718 AAGATTGTAT-CAGTAGAAACAATT-TTTTATGA-AAAATAAATTGTCATAATAATTTGAAATAA
64 AAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * *
107780 ATAATTGTTCAAAT--TTATAACTAGTTGAACTAGTTTGGTAAAGAGATTATT
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATA-TTTA-T
* *
107831 TTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATT-ATAAATTA-TATTATTTTA-TCTGAACT
1 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-T
* * * * *
107889 AA-CTTATATAAACAAAAAC-ATT-TATTT-T-ACACAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
64 AAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGT-TTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
107948 ATAATTATTCATA-AGCCTTAACTATCTGAACTGGTTCCAGCAACA-ATTTA-
128 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTT-CGGTAA-ATATTTAT
* * * * * *
107998 TTTGTAAATCTCTTAGGTTATT-A-TTTCATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
1 TTTTTAAATCTCTT-GCTTATTAATTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
* * * * * * * * * *
108061 AAACTTGTACGAAC-ATAAATAATTGTTTGATGAGAAAA-TAAAAGGCTATGACGATTTAAAATA
64 AAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTC-ATAATGATTTGAAATA
* * * * * * *
108124 TAAAATTATTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGGTTCAAG-AAATAGATTTGT
127 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTC-GGTAAAT--ATTTAT
* * *
108178 TTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTATGAATA
1 TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAA-TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATA
*
108243 GGCTTGT
65 AGCTTGT
108250 TTATGAAAAA
Statistics
Matches: 5540, Mismatches: 1250, Indels: 850
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Matches are distributed among these distances:
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TTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
GCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATA
ATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAAATATTTAT
Found at i:102066 original size:176 final size:177
Alignment explanation
Indices: 101875--102203 Score: 383
Period size: 176 Copynumber: 1.9 Consensus size: 177
101865 TAATTATTCT
* * * * *
101875 AATAGTTTTAACTATTTGAACTAGCTCAACAAGCACATTTACTTTTTAAATCTCTTATTAACTTT
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* * *
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*
102004 TTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATAACTGCTCA
130 TTATAACAAAACGAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATAACTGCTCA
* * * **** * * * *
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*** ** * *
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66 TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAACCAGAATAAACTTCTATGATCAAAAACAATTGTTT
*
102181 TATAACAAAACGAAAGGTCATAA
131 TATAACAAAACGAAAGATCATAA
102204 CAATTTGAAA
Statistics
Matches: 123, Mismatches: 28, Indels: 3
0.80 0.18 0.02
Matches are distributed among these distances:
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AATAGTTATAACTATTCGAACTAGCTCAACAAACACACTTACTTTTTAAATCCCTTATTAACTTT
TGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAACCAGAATAAACTTCTATGATCAAAAACAATTGTTT
TATAACAAAACGAAAGATCATAATGATTTGAGATTGATAACTGCTCA
Found at i:102693 original size:180 final size:179
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102094 TTTTAAATCC
* * * * * * *
102104 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATT-ATTTTATTTAGAATAAGTTTGTATGATCA
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* * * ** * * *
102168 AAAGCAATTGTTTTATAACAAAACGAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTCATA-TA
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* ** ** ** * *
102232 GCCACAATTATTTTAACT-GATTCGATAAACAAATTTATTT-TTT-AA-ATC-T
127 GTCTTAACCAAATGAACTAG-TTCGGTAAACAAATTTATTTATTTAAATATCTT
* * * * *** * * **
102281 CTTACTT-A-----GAAATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGTATAACCTTATATTAACT
1 CTTA-TTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTCAAATAAGCTTGTAAGAAC-
* * * * * ** * * *
102340 AAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATAC
64 AAAA-AATTGTCTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCTAGTAG
** * ** * * * *
102405 TAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTATTTAAATATCTT
128 TCTTAACCAAATGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTATTTAAATATCTT
* * * * ** *
102457 TTTATTGATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGAATTG
1 CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTCAAATAAGCTTGTAAGAA--C
* * *
102522 AAATAATTGTCTTATGACTAAACAAAA-GTCAAAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCTAGTAGT
64 AAAAAATTGTCTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCTAGTAGT
*
102586 CTTAACCAAATGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTT-TTTAAATCTCTT
129 CTTAACCAAATGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTATTTAAATATCTT
* * * * *
102636 ACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATT-CTTCTAATTCAAATAAGCTTGTATGAAC
1 -CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATT-TAATTCAAATAAGCTTGTAAGAAC
* *
102700 AAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
64 AAAAAATTGTCTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAAT
102746 TGATAATCAT
Statistics
Matches: 364, Mismatches: 81, Indels: 38
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
171 1 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
CTTATTAATTTTTCAAATATTAATAAATTAGTATTAATTTAATTCAAATAAGCTTGTAAGAACAA
AAAATTGTCTTATAACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCTAGTAGTCT
TAACCAAATGAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTATTTAAATATCTT
Found at i:103320 original size:180 final size:180
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Indices: 101177--107249 Score: 3859
Period size: 181 Copynumber: 33.8 Consensus size: 180
101167 ATTCAAATAG
* * * * *
101177 GAACTGGTTTGATAAACATATTTATTTTTAAAAT-T-TTCAACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTT--ACTTA-TAATTTTTGAAATATTAA
* * *** * * *
101240 TAAAATAATATTATTTTATTCCAAACAAGCTTGTAT-CA-TG-AA-AA--GTATTT-TCAC-AAA
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* ** * * *
101297 CAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATTGGCATAATTATTT
127 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * *** * ** **
101351 TCATTGATTCGGTAAA-AAGATTCCCTCTTTAAATCAT-TTTTTTATTAATTTTCAAAATATTAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAA-ATTTATTTTTTAAATC-TCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * **
101414 TAAACTATTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGT-TAGAACTAAAACAATTGTTTTATGATGAAA
63 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTAT-GAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
101478 CAAAAAGTCATAACGATTTTAAATACACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTT
127 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
101532 GAATTTGTTCAGTAACAT--ATTTAATTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAA
1 GAACTGGTTCGGTAA-ATAAATTT-ATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATAATTTTTGAAATATTAA
* * * * * * * *
101595 TAAATTAATTTTACTTTATTGTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
63 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* ** *
101660 AAAAAGTCATAACAATTTTAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTT
128 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * ** * * * ** *
101712 GAGCTTGTTCAATAAATAGATTTATTTTTTCAAAACTGTCGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTA-TAA-TTTTTGAAATATTAA
* * * * * *
101776 TATATTAGGATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG-ATATGAAACAAATATTTTATGAC-TAA
63 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * **
101839 -AAAAGATTAGAATGATTTGAAAAAAATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTT
127 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *** ** * * * * *
101892 GAACTAGCTCAACAAGCACATTTACTTTTTAAATCTCTTA--T-TAACTTTTGGAATATTATTAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
**** * * **
101954 ATTAGTATTATTTT-TAACCAAATAAACTTCTATG-ATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-
66 ATTAGTATTATTTTAT-TTTGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * *
102016 AAAGATCATAATGATTTGAGATTGATAACTGCTCAAATAGTTATAACTATTC
129 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
102068 GAATTGGTTTGGTAAATAGACTTATTTTTTAAATCCCTTA--T-TAATTTTTGAAATATTAATAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * ** * *
102130 ATTAATATTATTTTATTTAGAATAAGTTTGTATG-ATCAAAAGCAATTGTTTTATAACAAAACGA
66 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * * *
102194 AAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAGTTGTTCATATAGCCACAATTATTT
130 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
102245 TAACTGATTCGATAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-T-T-A-----GAAATATTAATAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * * * *
102302 ATTTGTATTATTTTATTTTGTATAACCTTATATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAA
66 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * *
102367 AGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTATTCAAATACTAATAACTATTT
131 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * *
102417 GAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTATTTAAATATCTT-TTTATTGATTTTTCAAATGTTAAT
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTT-TTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * *
102481 AAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGAATTGAAATAATTGTCTTATGACTAAACA
64 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * **
102546 AAA-GTCAAAATGATTTGAAATAGGTAATTATTCTAGTAGTCTTAACCAAAT
129 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * *
102597 GAACTAGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * ** * * *
102662 AATTTGTATTCTTCTAATTCAAATAAGCTTGTATGAA--CAAAAAATTGTTTTATAACAAAACAA
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* ** * ** *
102725 AAGGTCATAATGATTTGAAATTGATAATCATCCTTATAGTCTTAACTATTT
130 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
*** * * * * ** * * *
102776 GAACTGGTTCAACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTACTA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAATA
* ** ** * * * *
102841 AATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAAATAATATGAATAGAACCAATTGTTTAATGACAAAAGAA
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * ** * * *
102906 AAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAATTATTT
130 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
102957 GAAATGATTTGCTAAATAAATTTACTTTTTAAATCTCTTA-TTGATTAATTTTCT-AAATATTAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-A-TAATTTT-TGAAATATTAA
* * * * *** **
103020 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTAAAACAAAAA
63 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAA
* * * * * * *
103085 AAAAAAGTAATAATGTTTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTTATAATTATTT
127 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
103139 GAATTGGTTTGGTAAATAAACTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATACAATTTGGAAATATTAACA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATA-ATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * * *
103203 AATTACTTTTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAGTTGAAATAATTATTTTATGACACAATAA
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * *
103268 AAGGTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTT
130 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* ** * *
103319 GAATTGGTTCAGG-AAACGAATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTT-AGAATATTAT
1 GAACTGGTTC-GGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-AATTTTTGA-AATATTAA
* * * * * *
103382 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAAC
63 TAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * *
103447 AAAAAG-CTATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAACAGTCATAGCTATGT
128 AAAAGGTC-ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
103500 GAACTGGTTTGGTAAATATATTAATTTTTTAAATCTCTTAC---TAATTCTGGAAATATTAATAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
* ** * * *
103562 ATCAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTTGTATG--TTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACG
66 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* ** * * *
103625 AAAGGTAATAACAATTTGAAATAGAT-A-TGTTCAAATTGCCATAATTATTT
129 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * **
103675 TATCCGATTTGGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TAATTTTTGAAATATTAATAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * * * * * * * * *
103737 AGTACTATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTAGGAACTGAAACAATTATCTTATTATAAAATAAA
66 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * *
103802 AGTTCATAGTGATTTTAAATAGATAATTGTTTAAAT-GATCATAACTATTT
131 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTT
* * * * * *
103852 GAAATTGTTCAGTAAATAGAA-TTATTTTTTCAAATCTCTTATTTATTAA-TTTTCAGAATGTTA
1 GAACTGGTTCGGTAAATA-AATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGA-AATATTA
** * * *
103915 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAA
62 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * *
103980 TAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATGGACATGACTATTT
127 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * * * * * * *
104034 AAATTGATTCGGTAAACAAATTAACTCTTTAAACCACTTACTTATTA-TATT-AATAAATTATTA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAA-ATATTAATA
* * * * *
104097 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAAAAA
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * *
104162 AAGGTTATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAAT-TTAGACAATTGTT
130 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATA-ACTA-T-TT
* * * * * * ** ** * * *
104215 CAAATAG-TC-ATAACTATTTGAATTTGTTTGGTAAA-CAAATTAATTTGTTTAAACTTTTACTT
1 GAACTGGTTCGGTAA--A--TAAATTTATTTTTTAAATC-TCTT-A-CT-TAT-AA-TTTT--TG
* * * * * * * *
104277 ATTAATTTTGAA-AGTATTAAGAAATTAGTATTATTTTAATTTGGATAAGCTTATATAAACTGAA
54 A--AATATT-AATA-AATT-AG-TATTA-TTTTA-TT----TTGAATAAGCTTGTATGAATTGAA
* * * * * * *
104341 ACAAATCTTTGATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAGTCA
107 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
104406 TAACTATTT
172 TAACTATTT
* * * * * * * *
104415 CAGCTTGTTCGGTAAAGAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTACTAATTTTCTG-AATGTTAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTA-TAATTTT-TGAAATATTAA
** * * *
104479 TAAATTTAG-ATTATTTTATTCCGGATAAGTTTGTCA-G-ATATGAAACTAA-TATTTTATGACA
63 TAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGT-ATGAAT-TGAAAC-AATTGTTTTATGACA
* * * * * * * *
104540 AATCAAAAGATTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAAGTATTT
124 AAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
104597 GAACCT-GTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTT-CTTATTAATTTTTTG-AATGTTA
1 GAA-CTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTACTTA-TAA-TTTTTGAAATATTA
* ** * * * *
104659 ATAAATTAGTATTAATTTATCCTAAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAA
62 ATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * ** *
104724 CAAAAGG--AGAA-CAGTTTGAAATAGATAATTGCTCTAATAGTTTTAACCATTT
127 CAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
104776 GAACTGATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATA-T--TA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAATA
* * * ** *** * * *
104838 AATTAATGTTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAT-AAACAAAACAATTATTTTACGACAGAACAA
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
** * * * *
104902 TCGAGT-ATAATGATTTGAAATAGATAATCGTTCATATGGTCTTAACTATTT
130 AAG-GTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * ** *
104953 GAACTGGTACAGCAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT-AGAAT-TTAAT
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGA-AATATTAA-
* * * ** * * * *
105016 TTAACTAGT-TTATTTTATTCCT-AATAAAATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAA
63 TAAATTAGTATTATTTTATT-TTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * *
105079 TAAAATGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTT
127 CAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
105133 GAAATGGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAATCCCTTGCTGATTAGTTTTCT-AAATATTAAT
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTT-TGAAATATTAAT
* ** * ** * * ***
105197 AAATTAGTATCATTTTATTTCAAAAAAAATTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
64 AAATTAGTATTATTTTATTT-TGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * * *
105262 AAAAAGTAATAGTGATTTCAAAAAGATAATTGTTCAAATCGTTATAATTATTT
128 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * *
105315 GAATTGGTTCGATAAATAGAA-TTATTTTCTAAATTTCTTACTTATAAATTTTAGAAATAGTAAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-AATTTTTGAAATATTAAT
* * ** ** *
105379 AAATTTGTTTTATTCCATTTTGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACA
64 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * ** *
105444 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCATATAGTTTTAACTGTTT
129 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * ** ** *
105496 GAACTAGATCGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTGTTATTAATTTTCAAAATATTACTA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * *
105561 AGTTAGTA-TATTTTATTTTGAATAAGTTTGTATAAATGGAAACAATTGTTTTATGATAGAACGA
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-A
** * *
105625 AAAGGT-ATAACAATTTGAAATAGATAATTATCCAAATAGTCATAACTATTT
129 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * *
105676 GAACTAGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATCTTA--T-TAATTCTTGAAATATTAATAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
* * * *
105738 ATTAATATTACTTTA-TTTGAATAAGCTTGTAT--TTTGAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACA
66 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
105800 AAATGTAATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTT
129 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * *
105852 GAATTGATTCGGTAAACT-GATTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
1 GAACTGGTTCGGTAAA-TAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAAT
** * * * *
105916 AAGGTAGTATTATTTTATTTTTG-ATAAGCTTTTTATGGACTAAAACAATTGTTTTATGGA-AAA
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* * * * * * * * *
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126 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
** * * * * * *
106034 GAACTTTTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCACTTGCTTATTAATTTTTTAAATATTATT
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * *
106099 AAATTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAGTTTGTATGAACTGAAACAATTATTATATGACTAAACA
64 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * ** * *
106164 AAAAGTCA-AACGATTTGAAATAGATAATTATTGTAATAGTCTTAACCATTT
129 AAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * *
106215 AAAATGGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC-T-CAT-TAATTTTTGGAATATTACTAA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
* * ** * * * *
106277 ATTAGTATCATATGTA-TCCGAATAAGCTTCTATG-ATAAGAAATAATTGTTCTATGACAAAAC-
66 ATTAGTATTAT-TTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* ** * * * *
106339 AAAGATCATAACAATTT-AAGATTGATATTTGTTCAAATAATCATAAATATTT
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* * * ** * * * * *
106391 GAACTAGTTTGGAAAATAGCTTTAATTTTTAAATCTCATGCTTATTAATTTTTAAAATATTAAGA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAATA
* * * * * * * *
106456 AATTATTATTATTTTATTTCGAATAAG-TATTTATGAACTAAAACAATCGTTTTATGATAGAGA-
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCT-TGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACA-AAAC
* * *
106519 AAAAGGTTAGAATGACTTT-AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCA-AATCTATTT
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* *** * * * * *
106572 AAACTCCCTCAGTAAACAGAA-TTATTTTTTAAAT-TTTTCCTTAATAATTTTTGGAATATTAAT
1 GAACTGGTTCGGTAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATAATTTTTGAAATATTAAT
* * *** * *
106635 AAATTAGTTTTATTTTATTTTAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTGTGACAAAACA
64 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
*
106700 AAAGGTCATAACT-ATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
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* * * * *
106752 GAACAT-GTTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATTTC-TACTTATTAA-TTTTG-GA-ATTAAT
1 GAAC-TGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * *
106812 AAATTAATATTATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTATGAGTAGAAATAATTATTTTATGACATAAC
64 AAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
*
106876 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAG-CATAACTATTT
128 AAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTCATAACTATTT
* * * * * * * * * * * *
106929 GAACTTGTTCAGTAAACAGATTCA-CTTTAAAATTTTTTAACTCATTAACTTTTGGAATATTAAT
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTA-TAATTTTTGAAATATTAAT
** * ** *
106993 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTATACAAACTGATAA-AATTGTTTTATGACAAAAC
64 AAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAAC
* * * * * * *
107057 AAAAGGTGATAA-CAATTGAAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACAATTT
128 AAAAGGTCATAATGATTTG-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * * * * **
107110 GAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACCTAGTAATTGTCAAAATATTAATA
1 GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAATTTTTGAAATATTAATA
* * * *** * *
107175 AATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACATTTGTTTTATAACAAAACAA
65 AATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
*
107240 AAAGTCATAA
130 AAGGTCATAA
107250 CAACGATTAA
Statistics
Matches: 4587, Mismatches: 1097, Indels: 423
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
172 117 0.03
173 19 0.00
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
GAACTGGTTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAATTTTTGAAATATTAATAA
ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
Found at i:103400 original size:543 final size:537
Alignment explanation
Indices: 100836--107250 Score: 4127
Period size: 539 Copynumber: 11.9 Consensus size: 537
100826 GCCCACCCTA
* * * * *
100836 GATTTGTTAAACAAATTCACTTTTTAAATCAC--TTACTT-ATTTTTAGAATATTAATAAATTAG
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTTA-TTAATTTTTA-AATATTAATAAATTAG
* ** * * * * * * *
100898 TATTACTTTATTTCGAATTAGCTTGTATGAACTAAAACCATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC
64 TATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTA
* ** * ** * ** ** * *
100963 ATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCATGTAATCT-TAACTGCTTGAACTATTTTGACAGACAG
129 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATA-
* * * * *
101027 ATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTT
192 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * ** * * *
101092 TGAATATGTTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTACAACAGAACAAAAGGTTATAATAATTTGAA
256 CGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAA
* * * * * *
101157 ATAGGT-A--A-T--TAT--TCA-AA-TA--GGAACTGGTT-TGATAAACATATTTATTTTTAAA
321 ATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAAGAGATTTATTTTTTAA
* * * *** * **
101209 AT-T-TTCAACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAAATAATATTATTTTATTCCAAACAAGCT
385 ATCTCTT--AGTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATT
* * * *
101271 TGTAT-CAT-G-AA-AA--GTATTT-TCAC-AAACAAAAGTTCATAACAATTTGAAATAGATAAT
447 TGTATGAATAGAAACAATTGT-TTTATGACAAAAGAAAAGTT-ATAACGATTTGAAATAGATAAT
* * * * * ** *
101328 TGTTCAAATTGGCATAATTATTTTCATT
510 TATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
* *** * * * *
101356 GATTCGGTAAA-AAGATTCCCTCTTTAAATCATTTTTTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAACT
1 GATTTGGTAAATAA-ATTTATTTTTTAAATC--TCTTTTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATT
* * ** * ** *
101420 ATTATTATTTTATTTTGAATATGCTTGT-TAGAACTAAAACAATTGTTTTATGATGAAACAAAAA
62 AGTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTAT-GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAA
* * * * * * * * **
101484 GTCATAACGATTTTAAATACACAATTGTTAAAATAGTCATAACTATTTGAATTTGTTCAGTAACA
126 GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAA-A
* * * * * *
101549 T-ATTTAATTTTTTAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATTTTACTTTA
190 TAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * * * **
101613 TTGT-GGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAATT
253 TT-TCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATT
* * * * * * *
101677 TTAAATA-AGTAATTGTTCAAATAGT-ATAACTATTTGAGCTTGTTCAATAAATAGATTTATTTT
317 TGAAATAGA-TAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTT
* * * * * * * *
101740 TTCAAAACT-GTCGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTTCGAATAA
381 TT-AAATCTCTTAG-TTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAA
** * * * * * * *
101804 GCTTGTATG-ATATGAAACAAATATTTTATGAC-TAA-AAAAGATTAGAATGATTTGAAAAAAAT
444 ATTTGTATGAATA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAG-TTATAACGATTTGAAATAGAT
* *** *
101866 AATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACT
507 AATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
** ** * * * ** *
101897 -AGCT-CAACAAGCACATTTACTTTTTAAATCTC--TTATTAACTTTTGGAATATTATTAAATTA
1 GATTTGGTA-AA-TAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTA
*** * * * *
101958 GTATTATTTT-TAACCAAATAAACTTCTATGATCAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-
63 GTATTATTTTAT-TTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAG
* * * * * *
102021 TCATAATGATTTGAGATTGATAACTGCTCAAATAGTTATAACTATTCGAATTGGTTTGGTAAATA
127 TAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATA
* * * *
102086 GACTTATTTTTTAAATCCCTTA--T-TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
192 -AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
* * * * * * **
102148 AGAATAAGTTTGTATGATC-AAAAGCAATTGTTTTATAACAAAACGAAAGGTCATAACAATTTGA
256 CGAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * * * * * * * *
102212 AATAGATAGTTGTTCATATAGCCACAATTATTTTAACTGATTC-GATAAACAAATTTATTTTTTA
320 AATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAAGAGATTTATTTTTTA
* * * * ** *
102276 AATCTCTTA---CTT-A----GA-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTTGTATAACCTTA
384 AATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTG
* * * * *
102332 TATTAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGACAATTA
449 TATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTTATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* *
102396 TTCAAATACT-AATAACTATTTGAACTT
512 TTCAAATAGTCAA-AACTATTTGAA-AT
* * * *
102423 G-TTTGGTAAATAGATTTATTTATTTAAATATCTTTTTATTGATTTTTCAAATGTTAATAAATTA
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTT-TTTAAATCTC-TTTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTA
* * * * *** * * * *
102487 GTATTAATTTATTTTGAATAAGCTTGTAAGAATTGAAATAATTGTCTTATGAC-TAAACAAAAGT
63 GTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGT
* * * * * ** * * * *
102551 CAA-AATGATTTGAAATAGGTAATTATTCTAGTAGTCT-TAACCAAATGAACTAGTTCGGTAAAC
128 -AATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAAT
* * * * * *
102614 AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTTGTATTCTTCTAA
191 AAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * *
102679 TTCAAATAAGCTTGTATGAAC--AAAAAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
254 TTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * ** **
102742 AAATTGATAATCATCCTTATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCAACAATTAGATTTATTTTTTA
319 AAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTTTTA
* * * * * * * * **
102807 ATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGGAATATTACTAAATTAGTATTATTTTATTTTTAATAAAATAA
384 AATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTG
* * *
102872 TATGAATAGAACCAATTGTTTAATGACAAAAGAAAAGATTATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
449 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAG-TTATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
*
102937 TCAAATAGTCAAAATTATTTGAAAT
513 TCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
* *
102962 GATTTGCTAAATAAATTTACTTTTTAAATCTCTTATTGATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTA
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* * * * **
103027 GTATTATTTTATTTTGAACAAACTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTAAAACAAAAAAAAAAAG
63 GTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAAAAAAAAAG
* * *
103092 TAATAATGTTTTGAAATAGATAGTTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATTGGTTTGGTAAATA
127 TAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATA
* * * *
103157 AACTT-TTTTTTAAATCTCTTACTTATACAATTTGGAAATATTAACAAATTACTTTTATTTTATT
192 AA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATA-AATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* ** * * * * *
103221 TCGAATAAACTTGTATGAGTTGAAATAATTATTTTATGACACAATAAAAGGTCATAAAGATTTGA
255 TCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * *
103286 AATAGATAATTATTCATATAGTCTTAACTATTTGAATTGGTTCAGGAAACGA-ATTTATTTTTTA
320 AATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAA-GAGATTTATTTTTTA
* * *
103350 AATCTCTTAGTTATGAATTTTTAGAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAACTTG
384 AATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTG
* * * * *
103415 TATGAATAGAAATAATTATTTTATGATAGAACA-AAAAGCTATAACGATTTGAAATAGATAATTG
449 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA-AA-AGAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * *
103479 TTTAAACAGTCATAGCTATGTGAACT
512 TTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
* * * * ** *
103505 GGTTTGGTAAATATATTAATTTTTTAAATCTC--TTACTAATTCTGGAAATATTAATAAATCAGT
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAGT
* * *** * ** *
103568 ATTATTTTATTTCAAATAATCTTGTATGTTGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACGAAAGGTAA
65 ATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTAA
** * ** * * * * *
103633 TAACAATTTGAAATAGAT-A-TGTTCAAATTGCCATAATTATTT-TATCCGATTTGGTAAATTGA
130 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAT-TGGTTTGGTAAA-TAA
* * * * *
103695 TTTATTTTTTAAATCTCTTA--T-TAATTTTTGAAATATTAATAAAGTACTATTATTTTATTTTG
193 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
* * * * * * * * * * *
103757 GATAAGCTTTTAGGAACTGAAACAATTATCTTATTATAAAATAAAAGTTCATAGTGATTTTAAAT
258 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * *
103822 AGATAATTGTTTAAAT-GATCATAACTATTTGAAATTGTTCAGTAAATAGAATTATTTTTTCAAA
323 AGATAATTATTCATATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTTTT-AAA
* * * * *
103886 TCTCTTATTTATTAATTTTCAGAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCA
386 TCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTA
* * * *
103951 TGAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTC
451 TGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTC
* * **
104016 AAATGGACATGACTATTT-AAATT
515 AAATAGTCAAAACTATTTGAAA-T
* * * * * * * * * *
104039 GATTCGGTAAACAAATTAACTCTTTAAACCACTTACTTATT-A-TATTAATAAATTATTAAATTA
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTT--TTATTAATTTTTAA-ATATTAATAAATTA
** ** * *
104102 GTATTATTTTATTTCGAATAAACTTGTATGAACTGAAATAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAGGT
63 GTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAG-
* * *
104167 TATAATGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAATTTAGACAATTGTTCAAATAGTCATAACTAT
127 --T-A--A---T-AAT-G---A-T-TT--GA-AA--TAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAT
* * * *
104232 TTGAATTTGTTTGGTAAACAAATTAATTTGTTTAAA-CTTTTACTTATTAATTTTGAAAGTATTA
172 TTGAATTGGTTTGGTAAATAAATT-ATTT-TTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTGAAA-TATTA
* * * * * * * *
104296 AGAAATTAGTATTATTTTAATTT-GGATAAGCTTATATAAACTGAAACAAATCTTTGATGTCAAA
234 ATAAATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAA
* * * * * *
104360 ACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATATATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTCAGCTTGTTC
298 ACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC
* * * *
104425 GGTAAAGAGATTTATTTTTTCAAATCT-TTTGCTTACTAATTTTCT-GAATGTTAATAAATTTAG
363 AGTAAAGAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTAG-TTATTAATTTT-TAGAATATTAATAAA-TTAG
** * * * **
104488 -ATTATTTTATTCCGGATAAGTTTGTCA-G-ATATGAAACTAA-TATTTTATGACAAATCAAAAG
424 TATTATTTTATTTTGAATAAATTTGT-ATGAATA-GAAAC-AATTGTTTTATGACAAAAGAAAAG
* * * * *
104549 ATTATAACGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGT-AATAAGTATTTGAACCT
486 -TTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAA-AACTATTTGAA-AT
* * * *
104603 G-TTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAATTA
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT-CTT-TTATTAA-TTTTTAAATATTAATAAATTA
* ** * * ** **
104667 GTATTAATTTATCCTAAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAAGGA
63 GTATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAAA
* * * * * * * *
104732 G-AA-CA-G-TTTGAAATAGATAATTGCTCTAATAGTTTTAACCATTTGAACTGATTTGGTAAAC
126 GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAAT
* * * *
104793 AAATTTATTTTTTAATTCTCTTACTTATTAAATTTTGAAATA-T--TAAATTAATGTTATTTTAA
191 AAA-TTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * **
104855 TCCGAATAAGCTTGTATAAAC-AAAACAATTATTTTACGACAGAACAATCGAGT-ATAATGATTT
254 TTCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG-GTCATAATGATTT
** * * * * **
104918 GAAATAGATAATCGTTCATATGGTCTTAACTATTTGAACTGGTACAGCAATTAGATTTATTTTTT
318 GAAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTTTT
* * * * * * * *
104983 AATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTAGAAT-TTAATTTAACTAGT-TTATTTTATTCCT-AATAAAA
383 AAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAA-TAAATTAGTATTATTTTATT-TTGAATAAAT
* * * * **
105045 TAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAATAAAATGTTATAGTGATTTGAAATAGATAAT
446 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTTATAACGATTTGAAATAGATAAT
105110 TATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
510 TATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
* * * * *
105138 GGTTTGGTAAATATATTTATTTTTTAAATCCCTTGCTGATTAGTTTTCTAAATATTAATAAATTA
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTT--TTATTAATTTT-TAAATATTAATAAATTA
* * * * * * *
105203 GTATCATTTTATTTCAAAAAAAATTTATATTAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG
63 GTATTATTTTATTT-TAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAG
* * * * * * *
105268 TAATAGTGATTTCAAAAAGATAATTGTTCAAATCGTTATAATTATTTGAATTGGTTCGATAAATA
127 TAATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATA
* * * * * * **
105333 GAATTATTTTCTAAATTTCTTACTTATAAATTTTAGAAATAGTAAAAAATTTGTTTTATTCCATT
192 -AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * *
105398 TTGAATAAGCTTGTATGAGCTGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
255 TCGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * ** * * * *
105463 AATAAATAATTGTTCATATAGTTTTAACTGTTTGAACTAGATC-GATAAACAGATTTATTTTTTA
320 AATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAG-TAAAGAGATTTATTTTTTA
* * * * * *
105527 AATCTCTTTGTTATTAATTTTCAAAATATTACTAAGTTAGTA-TATTTTATTTTGAATAAGTTTG
384 AATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTG
* * * * * *
105591 TATAAATGGAAACAATTGTTTTATGATAGAACGAAAAGGTATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
449 TATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA-AAAGAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTAT
* * *
105656 CCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
513 TCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
* * * * *
105681 -AGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATATC--TTATTAATTCTTGAAATATTAATAAATTAA
1 GA-TTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTTATTAATT-TTTAAATATTAATAAATTAG
* * * **** * * *
105743 TATTACTTTA-TTTGAATAAGCTTGTATTTTGAAAAACAATTGTTTTACGACAAAACAAAATGTA
64 TATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTA
* * ** * * * *
105807 ATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAATTATTTGAATTGATTCGGTAAACTGA
129 ATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAA-TAA
* * * * **
105872 TTTATTTTTCAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAGGTAGTATTATTTTATTTT
193 ATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTT
* * * * * * *
105937 TG-ATAAGCTTTTTATGGACTAAAACAATTGTTTTATGGA-AAAACAAAAGGTAATAACGATTTT
256 CGAATAAGC-TTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTAT-GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * ** *
106000 AAATAGATAATTATTTAAATATTCAAAATTGTTTGAACTTTTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTC
319 AAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTTTT-
* * * *
106065 AAATCACTT-GCTTATTAATTTTTTA-AATATTATTAAATTAGTATTATTTTCTTTTGAATAAGT
383 AAATCTCTTAG-TTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAT
* * *
106128 TTGTATGAACT-GAAACAATTATTATATGACTAAACA-AAAAGTCA-AACGATTTGAAATAGATA
446 TTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC-AAA-AGAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATA
** ** * *
106190 ATTATTGTAATAGTCTTAACCATTTAAAAT
508 ATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAAT
* * * *
106220 GGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTC--TCATTAATTTTTGGAATATTACTAAATTAGT
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTTTATTAATTTTT-AAATATTAATAAATTAGT
* * *** * * * * * * *
106283 ATCATATGTA-TCCGAATAAGCTTCTATGATA-AGAAATAATTGTTCTATGACAAAACAAAGA-T
65 ATTAT-TTTATTTTAAATAAACTTGTATGA-ACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGT
* ** * * * * * * * *
106345 CATAACAATTT-AAGATTGATATTTGTTCAAATAATCATAAATATTTGAACTAGTTTGGAAAATA
128 AATAATGATTTGAA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATTGGTTTGGTAAATA
** * * * * * * *
106409 GCTTTAATTTTTAAATCTCATGCTTATTAATTTTTAAAATATTAAGAAATTATTATTATTTTATT
192 -AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * *
106474 TCGAATAAG-TATTTATGAACTAAAACAATCGTTTTATGATAGAGA-AAAAGGTTAGAATGACTT
255 TCGAATAAGCT-TGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACA-AAACAAAAGGTCATAATGA-TT
* * * * *** * *
106537 T-AAATAGATAATTGTTTAAATAGTCA-AATCTATTTAAACTCCCTCAGTAAACAGAATTATTTT
317 TGAAATAGATAATTATTCATATAGTCATAA-CTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTT
* ** * * * * **
106600 TTAAAT-TTTTCCTTAATAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGTTTTATTTTATTTTAAATAAGC
381 TTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAAT
* * * * * * * *
106664 TTGTATGAACAAAAACAATTGGTTTGTGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGGTAAT
446 TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAA-GTTATAACGATTTGAAATAGATAAT
* *
106729 TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAT
510 TATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAA-AT
** * * * * ** *
106758 G-TTCAGAAAATATATTTATTTTTTAAATTTCTACTTATTAA-TTTTGGA-ATTAATAAATTAAT
1 GATTTGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCT-TTTATTAATTTTTAAATATTAATAAATTAGT
* * ** * * * * * * *
106820 ATTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAGTAGAAATAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTCA
65 ATTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTAA
* * ** * *
106885 TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAAG-CATAACTATTTGAACTT-GTTCAGTAAACAG
130 TAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AGTTATAACTATTTGAA-TTGGTTTGGTAAATAA
* * * * * * *
106948 ATTCA-CTTTAAAATTTTTTAACTCATTAACTTTTGGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
193 ATT-ATTTTTTAAATCTCTT-ACTTA-TAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * ** * * *
107012 TCAAATAAGCTTATACAAACTGATAA-AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTGATAA-CAATTG
255 TCGAATAAGCTTGTATGAACTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTG
* * * * * * * * *
107075 AAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATGACAATTTGAACTTGTTCGGTAAACATATTTATTTTTA
319 -AAATAGATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTTTT
* ** * * * * * * * **
107140 AAATCTTTTACCTAGTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAATTCGAATAAGCTT
383 AAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTT
* * * * * *
107205 GTATGAACAAAAACATTTGTTTTATAACAAAACAAAAAGTCATAAC
448 GTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-GAAAAGTTATAAC
107251 AACGATTAAT
Statistics
Matches: 4616, Mismatches: 1024, Indels: 491
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
519 2 0.00
520 23 0.00
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567 5 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (537 bp):
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TTATTTTATTTTAAATAAACTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAAAGTAAT
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ATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
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TAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCAGTAAAGAGATTTATTTTTTAAATCTCT
TAGTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAATTTGTATGAAT
AGAAACAATTGTTTTATGACAAAAGAAAAGTTATAACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG
TCAAAACTATTTGAAAT
Found at i:109181 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 108349--140721 Score: 8793
Period size: 181 Copynumber: 179.5 Consensus size: 178
108339 TTATCAAATC
* * * * * * * *
108349 AGTTCAAATAGCTATGGCCATTTGAATAATTATCAATTTCTAATCA-TTTTGAACTTTTGTTTTG
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** * * *
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** * * *
108477 TT-TCAAAAATTAATAAGTGGGCGA-TT----AT--CTGT-TTACCAAACCA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATAAATTTGTTACTAAA-CA
* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
108583 TCATAAAACAATTATTTATGTTCATTGCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
108648 ATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAGTAAATTTGTTGCTTGAACC
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTGTTAC-TAAACA
* * * * * * * *
108701 AGCTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATGTCAAGCTA-TTATGTCCTTTTGTTTT-
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * *
108764 ACTGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTCAT
65 TC-ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
108829 ATTTTAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAATTAAATTTGTTTACCAAACCA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACTAAA-CA
* * * * **
108879 A-TTCAATTAGTTAT-AATAATTTAAACAATTATTTATTTCATAACT--TTATGACCACTTGTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TAGTTATGACCTTTTGTTT
* * * ** *** * *
108940 TGTCATAAAACAATTATTTCTATTGAT-GTAGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTA
63 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * ** *
109004 TTATTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTAGAAAATGAATTTGTTGGCTTGACC
127 ATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-GGATTTA-AAAATAAATTTGTT-ACTAAACA
* * * *
109059 AGTAT-AAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTATTTTG
1 AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * **
109123 TCACAAAACAATAGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAGATAATTTTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
109188 TTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAGTTTGTTTA-TCAAACA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * ** * *
109240 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAAC-TTTACCTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
109304 CATAAAATAATTTTTTCTATTCCTACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATT-ATC
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-
* * * * *
109367 GTTC-AGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACCAAATA
129 ATTCTA-AAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * **
109420 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCA-TTATGATTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *** * * *
109484 TCATAAAACTATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAGTATTAGTTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
109549 TT-TCGATAGTTAATAAGCATAA-GATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACA
130 TTCT-AAAAATTAATAAG--TAAGGA-TTTAAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * * **
109601 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTCGTTTCAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
109666 CATAAAACAATTGTATT-AGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAA-AAAACTAATTTATTAAT
66 CATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** *
109729 A-T-T-----TTGATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTACTTACCAAACA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAAT-TTGTTACTAAACA
* *
109775 AGTTCAAATAATTATAACTATTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** *
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* * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
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* * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAAT-TATCTA-TTTCAAATAGTTATGACCT-TTT---
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* * *** * **
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*
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1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
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* * * * *
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* * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
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* * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTG
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65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
111337 TTCTAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCGAACCA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TT-ACTAAACA
* * * * * * * * * *
111390 A-TTCAAATAATTAAGACAATTGGAACAATGATCTATTTCAAATTGTTCTAACCATTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * * * * *
111454 TATAAAAAAATTATTTCAATTCATACAAGATTATTTAGAATAAAATAATACTAATATATTAACAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
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131 TCTAAAAATTAATAAGTAAG-GA-TTT--AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* *
111571 AGTTCAAATAGATT-TGACTATTTAAACAATCGATTTGACTATTT-AAAGTCA-TTATGACCTTT
1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAAT---TAT--CTATTTCAAA-T-AGTTATGACCTTT
* ** * *
111633 TCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATTA-AAACTTA-TCAAAATAAAATAATACTACTT
58 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
* ** * *
111696 T-CTAATATT-TTGAAATTAAT-AG--A-TATTTAAAAAACTAAAAGTATTTGTT--TAACCA
122 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAA-T--AA--ATTTGTTACTAAACA
* * * * * * * *
111751 A-TTCAAACAACCATTATGACTATTTAAACAAATATCAATGTCAAATCA-TTATGATC-ATTGTT
1 AGTTCAAA-TA--GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTT
* * *** * * * * *
111813 TTCTCATAAAATAATTGTTTCAACTCATACAAG-TGCATTCGAAATATAATAAAAACTAGTTTAT
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* * * * *
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125 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATAAATT-T-GTTACTAAA-CA
* * * * * *
111934 A-TACAAATAATTTTAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATTACTTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
111997 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGCTTGTTCAAAATAAAATAACACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
112062 TT-TAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTGAATCAAT-TTACCAAACCA
130 TTCTA-AAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAAT--TTGTTACTAAA-CA
** * * * *
112115 TTTTTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTATTT
1 --AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTT
* * **** *** *
112179 TATCATCAAACAATTGGTTT-TGTTCATACTCTTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATA
63 TGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * ** * * *** * * *
112243 ATATT-TGGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAATAAATCTAACTGCCAAACC
127 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATAAAT-TTGTTACTAAACA
* * * * * *
112297 AGTTCAAATTGTTAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTG-CTTTTTCTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTA-TGACCTTTTGTTTTG
* * ** ** ** * *
112361 TCGTAAAAGAATCATTT-TGTTTGTACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATACTAATTTAATAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
112425 TTTTGAAAATTAATAACTAAGAAATTCAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATC-
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATT-TAAAAATAAATTTG-TTA-CTAAACA
* * * * * * * * * * *
112477 AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTGTGTATATGATATCGTTCTGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
112542 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
112606 TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTTTAAAAAAAAATCTAT-TTACTGAACA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GA--TTTAAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * * * *
112659 AGTTTAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTCTCTATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGATTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * *
112723 TTATAAAACAATTGTTT-TAGTTAATACAAGCTTAGAT-GGAACAAAATAATACTAATTTACTAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
112786 TATT-TCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACC
128 TATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * *
112836 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTT-AAATCA-TTAAGATC-TTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** * *
112898 G-CATAAAATAATTGTTTCTGATCATAGAAGGTTATT-TAGTTAAAAATAATACTATTTTAATAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAA
* *
112961 TATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAATATAATTGTGTTTATCGAACCA
128 TATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATA-AATT-TG-TTA-CTAAACA
** * * * * *
113016 A-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
113080 CATAAAATATTTGTTTCAT-ATC-TAACAAGCTTATTGAGAATAAAATAAT-CCAATTTTATTAA
66 CATAAAACAATTGTTTC-TGTTCAT-ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAA
* * * * * *
113142 CATTC-AATAAATTAAAAAGCTAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACG
128 TATTCTAA-AAATTAATAAG-TAAGGATTT--AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * *
113197 AGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCA-TTATGGCCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
** * * *
113261 TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTCTTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** ** * **
113326 TT-TCAAAAATTAATAACCAA-GAGTCAAAAACGATTAAATTTTTTACCGAACA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGA-TTTAAAA--A-TAAATTTGTTACTAAACA
* * * * * ** *
113378 AATGCAAATAGTTACGACTATTTGAACAATTGTCTCTTGAAAATCA-TTATGACCTATTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** *
113442 TTACAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAACATATTTGAAATAAAATGATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
113506 ATT-TCAAATATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAATGAATCTGTTTACGAAATC-
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATAAATTTG-TTACTAAA-CA
* * * * * * * * * *
113558 AGTTCAAAAAATTATGGCAATTTCAACAATTATCAATTTCAAATCGTTATTACATTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * **** *
113623 CATATAACAATTGTTTTTGATCATACAAGTTTATTTTGGATAAAATAATACTAATTTATTAATCT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * **
113688 T-TCAAAAATTAATAA-T-A-G------------ATGT-TTACTGAAGT
131 TCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAATAAATTTGTTACTAAACA
* * * * * * * *
113720 AGTTTAAATAGCTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCA-TTAT-AGCATTTTGTTCT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA-CCTTTTGTTTT
* * * * * ** *
113783 ATCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATAAAATAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** *
113848 ATT-TCAAAAATTAATAACTTAGAGATTTAAAAAGATAAATTTGTTTGTAAAACT
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAA-ATAAATTTGTTACT-AAACA
* * ** * * * *
113902 AGTTCTAATAATTAACACTAAATT-AATAATTATCTA-TT-ACATA-TCAT----TTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * *** * *
113959 TCATATAACAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTGAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * *
114023 ATT-TCAAAAATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AGCT
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTA-CTAAACA
* * * *
114076 TGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCA-TTAAGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * ** * * *
114140 TCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAAATAAATACTAATCTACTAG
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAAT-AATACTAATTTATTAA
*
114205 TATT-TCAAAAATTAATAAG-AA--ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCA
128 TATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAA-CA
* * * * * *
114256 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * *
114320 TATAAAATAATAATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAACAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * **
114385 T-TCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTCAAAAATAAATATGTTTA-TCAAATT
131 TCT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * * * * *
114436 AGGTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAAATATCTATTTCAAATCGTTACGACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
114501 CAAAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
114566 T-TCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACTGAATA
131 TCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * * *
114617 AGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTCTCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
114682 CATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAAAAATA-TAAATTTATTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
** * * **
114745 A-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAATATTTCAAAAATAAATATGTTTATTAAATT
129 ATTCTAA-A-AATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * *
114798 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
114862 TCATAAAAAAATTATTT-TAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
114926 ATT-TCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACTGAATA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * *
114979 AGTTTAAATAATTATGACTATTTTAACAATTAT-TA-TTCGAAATTA-CTATAACCTTTTATTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTT
** * * *
115041 GTCATAAAATGATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * * * * *
115104 ATA-T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAACTCTGTTCATTGAACC
127 ATATTCTAA-A-AATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAATTTGTT-ACTAAACA
** * * *
115159 AGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATGAC-CTTTTGTTTT
* * ** * *** * * *
115223 GTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTGTAAAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTGTTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** *
115288 ATTTTGACAATTAATAAGTAAATGATTTAAAAAATAAATATAT-TTTTTGAACA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * * *
115341 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATAATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *** *
115406 AAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAAT-T
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
115469 TTTCAAAAATTAATGAGTAAGGGAATTAAAAAATGAATTTGTTTACTAAATA
131 TCT-AAAAATTAATAAGTAA-GG-ATTTAAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * *
115521 TGTTCAAATAGTTACGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGGCCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** *** *
115585 TCATAAAA-AATTGGTTCTGTTCATGCAAAATTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTTTTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
** * * *
115648 ATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAGACA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* *
115700 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
115765 CAT-AAAC---TG-AT-TGTT--T---A---TGTTC---AT-AAATAATACTAATTTATTAAAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * * *
115812 TCCAAAAATTTATAAGCAAAACATTTAAAAAATAAATCCAT-TTACTGAGCG
131 TCTAAAAATTAATAAG-TAAGGATTT-AAAAATAAAT--TTGTTACTAAACA
* * * * ** * **
115863 AGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTACTTCTAATCTTTATTATCAATTT-TTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
115927 TTATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTTTTCGAAATAAAATAATA-TCAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* ** ** *
115991 ATTCTAAAAATTATTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAATA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTGTT-ACTAAACA
* ** * * * *
116044 AGTTCAAATAGTCATGTTTATTTGAACTATTATTTATTTCAAATAGTTATGACATTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
116109 CGTAAAACAATTATTTCTATTCATACAAAAC-TATTCAGAATAAAATGATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
116173 TT-TCAAAAATTAACAAG--A-GATTTAAAAACAAAATCTAT-TTA-TCAAACGA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAAT-T-TGTTACT-AAAC-A
* * * * *
116222 A-TTTAAATAGTTATAAATATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * * * * *
116284 TCATAAAATAATTATTTCTATTTATGCAAGCTTATTTAGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
116349 TTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTAT-TTGCCGAACCA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAAT-T-TGTT-ACTAAACA
* * * * * *
116402 A-TTCAAAGAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCACTCTA--ACC--TT-TTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGT-TATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** **
116461 GTCATAAAATAATTTTTTTTAGTTGATACATGCTTATTTGAAATAAAACCATACTAATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
116526 CATTC-AGAAAAGTAATACA-CAAGAAATTTTTAAAAATAAATCTATG-TATTGAACA
128 TATTCTA-AAAATTAATA-AGTAAG-GA--TTTAAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * ** *
116581 AGTTCAAATAGTTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTCT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
116646 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * **
116711 T-TCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTAAACAATAAGTCAGTTTA-TCGAATT
131 TCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAA-AATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * * * * *
116762 GGTTCAAATAATTATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * *
116827 CATAAAACATTTGTTTTTAATCAT--AAGCCTATT-ATGAATAAAATATTACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
116889 TT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTATT--T-ATCA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTGTTACTAAACA
* * ** * * * *
116937 A--ACTAAT--TCCT-A-T-TTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTAT-AACTTATTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTT-TTGTTTTG
* * * * * *
116994 TTATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
117059 TT-TCAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAA-T
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TT-ACTAAACA
* * * * ** * * * *
117111 AGTTCAAATGGTTAAGACTATATGAACAATTATTTGCTTCAAATCA-TTATGGCATGTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
117175 TCATAAAACAATTGTTTCAGCTCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
117240 TTCCAAAATTTAAAAAGT---GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATCA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACTAAA-CA
* * * * * * * * ** **
117289 A-TTCAAATAATTATGGCCATGTCAACAATTATCAATTTCAAATCA-TCATTACCTTTTACTTCA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* *** * * * *
117352 TCATATAACAATTGTATT-TAAACATTCAAGCTTATTTAGAATTAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
117416 CTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACT
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * ** * * * * * * *
117469 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGA-AATTGTAAACTTGAAATCGTTATAACATTTTGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *** * * *
117533 TCATAAAATAATTATTTTTCTTCAGACAAG-TGTATTTGGAATAAAATAACACTAATCTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCT-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * ** * *
117597 ATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTCTTTGTTGAACT
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-G-ATTTAAAAATAAATTT-GTTACTAAACA
* * * ** * * * *
117650 AGTTCAAATATTTAAGTCTATAAGACCAATTATCTATTTCAAACAATTATGACCTTTCGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *** *
117715 CATAAAA-TATGTTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTA
66 CATAAAACAAT-TGTTTCTG--TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* * *
117778 ATATT-TAAAAAATTAATAAG--AGG-TTTAAAAAATAATTTTGTGGACCT-AACC
127 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTGT-TA-CTAAACA
* * * * * *
117829 AGTTTAAATAATTATGACTATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTCCTTTTTTTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC-TTTTGTTTTG
* * * * * * * *
117893 TCATAAAACAAATGCTTT-TGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATAAAGTAATACTAATCTACTAAT
65 TCATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
117957 ATTTTAAAAATTAAT-A--AATGATTTAAAAAGATAAATCTAT-TTA-TCAAACT
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAA-ATAAAT-T-TGTTACT-AAACA
* * * * * *
118007 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-AACTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *** * ** * *
118071 TATAAAGCAATTGTTTTTCAACATACAAGCTTTTTTGAATTAGAATAATAC-AGATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATA
* * * * * *
118135 TT-TCAAGAATTAATAAG--A-CATTTAAAAAACAAATCTGTTTGCTAAACC
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * *
118183 ATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTAACCCTTTTGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CCTTTTGTTTTG
* * *** *
118248 TCATAAAAAAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
118313 TTCTAAAAATTAATAACTAA-GATTTAAAAAATGAATCCATTTG-T-C-GAACC
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAAT-AA---ATTTGTTACTAAACA
* ** * * * * * * * *
118363 GGTTCAAGCAATTAAGACAATATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTATTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *** ** * * *
118428 CATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
118493 T-TCAAAAATTTATAAG--A-GATTTAGAAAAT-AATTCTATGTACTGAACC
131 TCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTA-AAAATAAATT-TGT-TACTAAACA
* * * * * *
118540 GGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
118605 CGTAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATATATTATTAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
118670 T-TAAAAAATTAATCAGTAAGAAATTTAAAAAGTAAATTTGCTTACCAAACT
131 TCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * *
118721 ATTTCAAATAGTTTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTA-TTATAACCTTTTATTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** ** *** *
118784 TCATCAAACAATTGGTTCCGTTAATATTATTTTATTGGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * * ** * ** *
118849 TTCCAAAACTTCATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCCCAACC
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG--GATTTAAAAATAAAT-TTGTTACTAAACA
* ** * * * * *
118901 AGTTTAAATAGTTAAAAATATATGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * * *
118966 CGTAAAACAAATGTTT-TGTTCATTCAAGATTATTTGAATTAAAAGAATACTAATTTAATAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
119030 T-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTCAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-
131 TCT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATT-TAAAAATAAATTTG-TTACTAAA-CA
* * * * * * * **
119081 AGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTAATTCAAATCA-TTCTAACCTTTTGTTGAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
119145 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACT-ATATTATTAAC
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAAT
* ** * * *
119209 ATTCAAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAGTAAATCCAT-TTGCTGAACA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAAT--TTGTTACTAAACA
* * * * * * * *
119262 AGTTCAAATAGTTATTATTATCTT-AACAATTGTCCATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGATTC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * **
119325 ATCATAAAACAATTGTTTCAGTTAATACAAGCTTAAAT-AGAATAAAATAATA-TTGTTTATCAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT--T
** ** ** ** * * *
119388 ACCA-ATT-TAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCGATTTCAAA-TTGTTA-TGACCTTT
126 A--ATATTCTAAA-AATTA--A-TAAGT-AAGGATT-TAAAAAT-AAATTTGTTACTAAAC--A
* *** ** * * * * ** * * * *
119448 TGTTTTGTCATAA-AACAATGGTTTTTTTCGAATAAGTTTTTTGAAATAAAATA-ATATTA-ATT
1 AG---T-TCA-AATAGTTAT-GACTATTT-GAACAA-TTATCT-ATTTCAAATAGTTATGACCTT
** * * ** ** ** * * * * * **
119510 TAT-TAATAT-TTTGAA-AATT-AATAAG-TGAGA-GAG-TTA--AAAAATAAATCTGTTTACTA
57 T-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAA-AT-AATACTA
* * * * * * *** * *
119566 AATCAGTTCAATTAGTT-TAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTAGGACTATCTGTT
119 ATTTA-TT-AA-TA-TTCTAA-AAATT-AATAAGTAAGGATTT-AAA--AATA--A--AT-T-TG
*
119630 TTGTCATAAAACA
169 TT-AC-T-AAACA
* * * * * *
119643 ATTGTTTCTATTCA--TACAGTCTTATTTAGAGTA-AAGTAATGCTAATTT-ATTAATA-TTCTG
1 A--G-TTCAAAT-AGTTA-TGAC-TATTT-GA--ACAA-TTAT-CT-ATTTCA--AATAGTTATG
* ** *** ** * ** ** * * * * *
119703 AAAACTAAT-AAGTAACA-AATTTAAAAATTGAATCCATTGGCCTGACCAGTGCAAATATTTATA
52 --ACCTTTTGTTTTGTCATAA---AACAATTGTTTCTGTT--CAT-A-CA-AGC--TTATTCAAA
**** * *** * *
119766 ATTGTTTGA-AC-AA-TTATCT-AT-TTC-ACATCTTTAA-AACCT-TGTG-TGTTATCACAAAT
105 ATAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCTA-AAAATTAATAA-GTAAG-GAT-TTA--A-AAAT
* * * *
119822 -CAGTTGTTTCTATTCCTACA
162 AAATTTGTTACTA----AACA
* * ** * * * * * * ** **
119842 AGTT-TATTCA-AAATAACATAATTCT-AGCTTATTA-ATATTCCAAA-AATTAAT-A-AGTAAG
1 AGTTCAAAT-AGTTATGAC-T-ATT-TGAAC-AATTATCTATTTCAAATAGTT-ATGACCTTTTG
** * * ** * * * ** *
119900 AGATT-T-AAAAAATGAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTAAACA-AT
60 -TTTTGTCATAAAA-CAA-TTGTTT-CTGTTC-A--T-ACA-AGCTTAT-TCAAAATAAA-ATAA
* * * *** * * * *
119961 TATCT-ATTTCA--AAT-TGCTATAACATT--TTA-TTTTG--TCATAAAACAATTTTTTCTATT
114 TA-CTAATTT-ATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGGATTTA-AAAATAAATTTGT-TA--
*
120017 CATACAAGCTT
172 C-TA-AA-C-A
* ** * * * * * ** ** *
120028 ATTTCAAATA-AAATAAC-A---CAA-ATTTAT-TAATATTCAAACAATTAAAAAATAAATCTG-
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-AT-TTCAAATAGTTATGACCT---TTTGT
** * * ** ** ** ** **** *
120085 TTTACCA-AATAAGTTCAAATAGTAATGACT-TTTTTTTAA--TTAAACAATTGTTTTTGTTCAT
61 TTTGTCATAA-AA---C-AATTGT--T-TCTGTTCATACAAGCTTATTCAA---AATAAAATAAT
* *** ** * * * * **
120146 AC-AAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAA-TACTTTGACAAAT-AATAAG-TA--
115 ACTAA-TTTATTAATATTCTAA-AA-ATTAA-TAAGTAAGGA-TTT-AAAAATAAATTTGTTACT
*
120205 AAAGA
174 AAACA
** * ** ** ** ** *
120210 TTTTAAAAATAAATATGTTTA-CCGAACAAGTCCAAATAGTCATAAGTATTTGAATAATTATGTA
1 AGTT-CAAATAGTTATGACTATTTGAACAA-T-----TA-TC-T-A-T-TTCAAATAGTTATG-A
* * * * * * * *
120274 TTTCAAATTGTTATGACCTATTGTTTCATTTTAAA-ACAAT-TAAATCAGTTCATATATGCTTAT
53 ---C---CT-TT-TG---T-TT-TGTCA--TAAAACA-ATTGT--TTCTGTTCATACAAGCTTAT
** * *
120337 TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAAAAGATTTACAAAAT
100 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTTA-AAAAT
*
120401 GAATCTAT-TTACTAAACA
162 AAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * * * * *
120419 ACTTCAAATAGTTATTACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCATTTGTTTTGC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
120484 CATAAAA-ACATTATTTCTATTTATACAAGTTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAA
66 CATAAAACA-ATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * *
120546 TATTCCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATCGATT-TT-CTGAGCA
128 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAAT---TTGTTACTAAACA
120599 CA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CTTTTGTTTTG
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * **
120662 TAATAAACCAATTGTTTCTATTCATACAAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** *
120727 TT-TCAAAGATTAATAAGTAAAAGATCTAAACAATAAATCTATCTACGGAGCA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAA-AATAAATTTGT-TACTAAACA
* * * * * *
120779 AGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATGGTTATGATCATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** * *
120844 CACAAAACAATTGTTTCTATTAATACTCGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAATA
* * * * ** **
120909 TT-TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAATATAAATCTATCTACGGAGTA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAA-ATAAATTTGT-TACTAAACA
* * * * * * **
120961 AGCTCAAATAGTTATGACTATTTCAATAATTTTTTATTTTAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
121026 CACAAAACAATTGTTTCTATTAATACTAGTTTATTCATAATAAAATAACACTAATTTATTAATAA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * *
121091 TCTAAAAATTAA-AAGGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACCAAACT
131 TCTAAAAATTAATAA-GTAAG-GATTT-AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * * * *
121142 AGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCA-TTATGACCTTTTATTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
* * ** * * * *
121205 GTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAGAATAAAATAATATTGATTTATTAAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * *
121270 ATTTTGAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAATCA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACTAAA-CA
* * * * * * *
121320 A-TTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTGTTATC-TTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * ** * * *
121383 CATGGAACAGTTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTCGGATTAATATAATACTAATTTAATAATA-
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *** * *
121447 ---AAAAA-TAA-ATGT---GCTTTGCCAATCCAA----TT-C-AAA-T
131 TCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAT-AAATTTGTTACTAAACA
* * * * * *
121481 A-TTTAAGACTA-TT-TGAAC-AATT-ATCTATT-T------CAAATCA-TTCTGACATTTTGTT
1 AGTTCAA-A-TAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTT
* * * * ** *
121533 TAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTTATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATT
62 TTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
121597 AACATTCAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTA-TCAAACA
126 AATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAGGA-TTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * *
121654 AGTTCAAATAGATATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATGACATTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
121719 AATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAACTTA-TCTAAAATAAAATAATACCACTTCATTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
121782 ATT-TCAAAAATTATTAAGCAA-GATTTAAAAACTAAAGCTATT-TTTCGAACCA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAA--T-TTGTTACTAAACA
* * * * ** * * *
121834 A-TGCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATCAAACTCAAATTGCTATGATC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
121897 AATAAAAAAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTC-AGATAAAAATAATACTAATATGA-TAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAAT-TTATTAAT
* * * * * *
121960 ATT-TCAAACATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAATCA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TT-ACTAAACA
* * * * * * *
122014 A-TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * *
122077 TAAAAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAC
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
122141 ATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTTAAAA-AAATATGTTTACCAAACA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * *
122192 AGCTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATGAACTTTTGGTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
** * *
122256 TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCAAAAATAAAATAATACTACTTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
** *
122320 ATT-TCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAAATAAATCAGTTTACTGAATC-
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * * * * * *
122369 AGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATATACTTCAAATCA-TTATTACCTTTTGTTTTA
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* * *
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* * * * * **
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
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* * * ** ** *
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130 TTCT-AAAAATTAATAAG-TAAGGA-TTT--AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * ** * * * **
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
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65 TCATAAAACAATTGTTTCT-G-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * *
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* * * *
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130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTGTTACTAAACA
* * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
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* * * ** *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
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131 TCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAATTTGT-TA-CTAAACA
* * * * * * * * * * *
125059 A-TTCTAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATTACCATTTGTTTGGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
125123 CATATAACAA-----AC-GATCATTCAAGCTTATTC-GAGTAAAATAATACTAATTTATTAATCA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-A
* * *
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130 TTCTAAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAA-ATAAATTTG-TTACT-AAACA
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1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * * *
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64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTG
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* * *
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* * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** ** * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
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131 TCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAAT-T-TGTTACTAA-ACA
* * * * ****
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
125834 TTATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAACACTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** *
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130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGGA---TTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * * *
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1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
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* * *
126260 T-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATCAATCTAT-TTA-TCGAACA
131 TCTAA-A-AATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAATAAAT-T-TGTTACT-AAACA
* * * *
126311 AGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** * *** *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * **
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* * * * *
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
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* * * * * * *
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130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-G-ATTTAAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* *
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1 AG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * *
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** * *
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126 AATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
126913 CAT-AAACTAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAA
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* * * * * ***
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130 TTCTAA-AAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * * *
127028 AGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTGTAATCTTTTGTCTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * *
127158 TCTAAAAATTAATAATTTGGAGATTTAAAAATAAATATGTTCACTGAACA
131 TCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATAAATTTGTT-ACTAAACA
* * * * * * * * * * *
127208 AGTTCAAATAATCAAGTCTATTGGAACTATTAGCAATTACAAATCA-TTATGACATTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * *
127272 TCATAAATCAATTGTTT-TCATTCATACAAAATTATCCAAAATAAAATAATACTAATTAATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
*
127336 ATT-TCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAACTAAATCTAT-TTA-TCAAACC
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* * * * *
127385 AGTTTAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *** * * * *
127449 CATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTTGGAGTAAAATATTACTAAATTAATAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * *
127514 TTTAAGAATTAATAAGTCAGGGATTTAAAAAATAAATGTAT-TTGTTGAACT
131 TCTAAAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* *** * * * * *
127565 AGTTCAAATAGTTAAGACTATAAAAACAATTAGCTATTTGTTGAACTTATTGGACTATAAGAACG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA--T-TTCAA---A-T--AGT-TATG-ACC
* * * * * * *
127630 TTTTGGTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAATTTATACATGCTTACTCAAAATAAAATAATACTA
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* * * * * **
127694 TTTTATTAACACTCAAAAAATTAATAAG-AA--ATTTTAAAAAATAAGTTTGCTTACCGAACA
119 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGA-TTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * *
127754 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
127818 TCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAATCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * ** * *
127883 TT-TCAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATCAGTTTATTGAATC-
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
** * * * *
127935 AGTTCACGTAATTAT-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCA-TTATGAACTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * ****
127998 GTTATAAAATAATTGTTT-TCG-TCATACAAGCCTGTTTGGCATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* **
128061 TAATTC-AAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAACTGCTTA-TCAAAC-
128 T-ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * *
128114 ----C--AT--TTCT---TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGCTCTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * *** * ** *
128167 TTATAAAATAATTGTTTCAAATCATATAAGCTTACTT-GGAATAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
128231 ATTTTGAAAATTAACAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTGCTGAAGCT
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAAT-T-TGTTACT-AAACA
* * * * * * *
128285 A-TTCAAACAATTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA-C----ATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * ** * *
128343 TCATAAAACAATTATTTCAG-T--T----G-TT-TTCTAAATAAGTTCA-AGT-CGTTATGACTA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * * *** * * * *
128397 TT-TAAGCAATTAATTATTTCAAACTGTTTTAACTTTTTACTTTGTCA-TAAAATA
130 TTCTAA-AAATTAA-TAAGT--AA-GGATTTAA-AAATAAATTTGTTACT-AAACA
* **** * * *
128451 ATTTTTTCTATTTAT-ACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATAT-TAATTT-ATTAATA-TTTTGA
1 AGTTCAAATAGTTATGAC-----TATTT-GA--ACAAT--TATCT-ATTTCA--AATAGTTATGA
* * *** * * *** * * ** * *
128512 CAATTAATAAGTAAAAGACTTAAAA-AATAAATAC-GTTTATTGAA-C-AAGTTC-AAAT--AGT
53 C-CTT--T-TGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAAT
* * * ** *****
128570 CATGACT-TTTTGAATAAT-TATCTATTTCAAATCATT-ATGACTTTTTTTTTGTAATAAA-ACA
112 AAT-ACTAATTT-ATTAATAT-TCTA----AAA--ATTAAT-AAGTAAGGATT-TAA-AAATA-A
128631 A-TTGTT--T---C-
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128639 AGTTCATATAAGCTTAT--TTGATGT-AA-AATAATACTAATTT-ATTAATA-TTCCAT-AAATT
1 AGTTCAAAT-AG-TTATGACT-ATTTGAACAATTAT-CT-ATTTCA--AATAGTT--ATGACCTT
* * ** ** **** * * * *
128697 AATGAGTAAGAGAATTAAAA-AA-AAAATCTATT--TACCGAA--TAAGTTC-AAAT--AGTTAT
57 -TTG-TTTTG-TCA-TAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-C-AAGCTTA-TTCAAAATAAAATAAT
* ** ** *
128753 GAC--ATCTTAATAATTATCTCTTTCAAAATATT-ATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATT
115 -ACTAAT-TTATTAA-TAT-TC--T-AAAA-ATTAAT-A--AGTAAGGATT-T-A-AAAATAA--
* ** *
128814 GGTTTTGTT-CATGCAGGCTT
164 --ATTTGTTAC-T--AAAC-A
* ** * * ** ** ******
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1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-AT-TT-CAAATAGTTATGACCTTTTGTTT
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63 TGTCATAAAA-CAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATA-ATACTAATTT-A
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124 TTAA-TAT-TC--TAAAAAT-TAAT-A-AGTAAGGATT-T-AAAAAT-AAAT-TTGTTA-CTA-A
*
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176 ACA
* * * * * *
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1 AG----TTC-AAAT-AGTTATGACT-A-TT-TGAACAATT-----ATCT-AT--TTCAAATAGTT
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49 ATGACCT---TTTG-TT-TTG-TC-A--TAAAACAATT--GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA
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103 AAATAAAAT-AATACTAAT-TTATTAATATTCT-A-AAAATTAATAAGTAAGGATT--TAAAAAT
** *
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162 AAATTTG-T-TACTAAACA
* ** * * * * * *
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1 AGTT--CAAA-T--AG--TT-ATGACT--ATTTG---AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
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53 CCTTTTG---TTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTAT-TCAAAATAAAAT
* * * * * * * * *
129331 AAT--T--TTTTTTTATCATAC-AAAAATTATTCAAAATAA-AATAATACTAATTTATTAAATAT
112 AATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAAT--AAGTAAGGAT--T--TAA--AAATAAATTT
*
129390 -TT-C-AAAAA
168 GTTACTAAACA
* * ** *** * * *
129398 ACTAAT-AAGACA-TTAAAAACTAAATTTG-TTTATCGAACTAGTTT-AAATAGTTATCA-CTAT
1 AGT--TCAA-ATAGTT-ATGACT--ATTTGAACAAT-TATCTA-TTTCAAATAGTTATGACCT-T
*** * * * * * * *
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57 TTG---TTTTGT-CATA--AAA-CA--AT--TGTTT-CTGT-TCAT---ACAA--G--CTTATTC
* *
129523 ATACAAGCTTATTCAGAGTAA-AAT-ATTGCTAAACTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
102 A-A-AA---TA---A-AATAATACTAATT--T--A-T--TAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * *
129586 AGATTTAAAAAATAAATGCAT-TTGCCAAACC
151 -GATTT-AAAAATAAAT--TTGTTACTAAACA
* * ** * * * * *
129617 AGTTAAAATAGTGAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * * *
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66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
129747 T-TAGAAAATTAATATA-CAAGAAATTTTAAAAAATAAGTATAT-TTA-TCGAACA
131 TCTA-AAAATTAATA-AGTAAG-GA-TTT-AAAAATAA--ATTTGTTACT-AAACA
* * * *
129799 AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TTATGACATTTT-TTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * * * *
129862 CCATAAAACAACT-TTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTATTACTTTATTAATG
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** *
129926 TT-TCAAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTAGTTTA-TCAAATCA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAA-CA
* * * * *
129979 A-TTCAAATAATTATGA-TCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGAACTTTT-TTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * *
130041 TCATAAAACAATTGTTTTTCATCATGCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
130106 TT-TCAAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTA-AGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * *
130158 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATATATTTGAAATCA-TTATAACCTTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
130222 TCATAAAACAATTATTTATCTTCATACAAACTTATT-AGAAATAAAATAGTACTAATCTAATT-A
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAAT-TTATTAA
* * * *
130285 TATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCA
128 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAA-CA
* * * * * *
130340 A-TT-AAATAGTTAAGA-TGATATGGATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * ** * *
130402 TCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAGTATTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** *
130467 TT-TCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAATAAATAAATCTAT-TTACCCAACT
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAA-AAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * * * *
130515 AGTT-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAACATTTGTTTTG
1 AGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
130579 TCATTAAATAACTT-ATTC-G---A-AAAAGC--A-T---AAT----T-CT---AATTTATTAAT
65 TCATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
130624 ATT-TCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAATTGAATATGTTTA-TCAAACA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * * * *
130673 AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
130738 CATAAAATAATTTTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTC-AATTAAAATAATA-TAAATTTATTAA
66 CATAAAACAA-TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * * * ** *
130801 CATT-TAGACAATTAGTAAGTAAAAGATATAAAGAATAACTCTGTTTACCGAATA
128 TATTCTA-AAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAA-AATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * *
130855 AATTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAA-ACATTATGACTTTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGAC-CTTTTGTTTT
* * * ** * * *
130919 GTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAGT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
130984 ATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGGA-TTTAAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * ** * * * * **
131037 TGTTTAAATAGTCAAAACTATTAGAATAATTATCTATTACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * **
131102 CATAAAACAATTATATT-AGTTCTTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * *
131166 TTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGACTTAAAAAATGAATCAAT-TTACTGAATA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GA-TTTAAAAATAAAT--TTGTTACTAAACA
* * * * *
131218 AGTTCAAATACTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCA-TGATGACATTTTGTTTTC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * *
131282 TCATAAAATAATTGTTTTTATTTGTACAATCTTATTCCAAATAGAATAATA-TATATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAAT
**
131346 ATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAATATATATTTATTT-TCTGAGCATAAA-A
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAA-ATA-A---ATTTGT-T-A-C-TAAACA
* * ** * * *
131403 ATTTTAAA-A---AT-AC-ATTT--A-TTTTCTGTGCACATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT--A-TTTCAAATAGTTATGACCT-TTTG--
* * **
131458 CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTT-TG-TCATAAACCAATTGTTTCTGTTCAT
60 ----T-T-T-TGTC--ATA---A--AACAATTGTTTCTGTTCAT--A-CAA--G---C--TT-AT
* * * * * **
131521 ACAAATGTTTTTAAACTAAATAAC-ACCAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAAAT
100 TCAAA-----ATAAAAT-AAT-ACTA--A-TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT-AAGGAT
* *
131585 CTAAAAAGTAAATCTAT-TTA-TCGAACA
154 TTAAAAA-TAAAT-T-TGTTACT-AAACA
* * * * * * * * *
131612 AGTTTAAATAGTTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAACAGTTCTAATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * *
131677 TGTAAAACAATTATTTCTATTTATACCAA-TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
131741 TTTTAAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTATTGAACA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAAT-AAATTTG-TTACTAAACA
* * * * *
131794 AGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAGCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * * *
131858 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCAATATTATTTAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
131923 TTTTGAAAGTTAATAAG--A-GATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAA-A
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * *
131970 CAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATAATTTATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTATTTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
* *** * * *
132033 GTCATAAAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATCATACTAATTTA-AATA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA-A
* * * * * *
132097 TATTCCAAAAATTTATAAG--A-GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCA
128 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TT-ACTAAACA
* * * * * * * * *
132148 A-TTCAAATAGTAAAGACTATTAGAACAATTATCTCTTTGAAATTGCTT-TGATCGTTTG-TTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * *** * *
132210 ACTATATATTAATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAC
65 TC-ATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * **
132274 ATT-TGAAAAATTAATAAGCAAGAGATCTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GAT-T-TAAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* *
132328 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCA-TTATTACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
132392 CCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAGCTTA-TCAAAAATAAAATAATGCTACTTTATTAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * **
132455 TATT-TCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTAAATT
128 TATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * *
132509 AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAACTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * * * *
132573 TCATAAAACAATTCTTTTTCATT-AGACAAGCCTATCCAAAAGAAAATAATACTTATTTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** * * *
132637 ATT-TCAAACATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATACTTACCATACC
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAAT-TTGTTACTAAACA
* *
132690 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAATTATATATTTCAAATTA-TTATAACCTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC----AATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
132754 TTTATGATAAAACAATTATTTGTCTTGATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATCTACT
61 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * **
132819 AATATTATGAAAATTAA-AATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCCAACA
126 AATATTCTAAAAATTAATAA-GTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * *
132875 TAG-T--AA-AGGT-T-A-TA--TGAATAATTATCTATTTCAAA-ATGTTATGACCTTCTGTTTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * *
132930 GTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCTAAATAAAATAATATTAA--TA-T-AT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
132991 -TTC-AAAAATTAATAAG--A-GATTTAATAAATAAATCTAT-TTACCAAACC
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAA-AAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* ** * * * * *
133038 AGTTCAATTAGTTATTTCAAGTCGTT-ATGACCATT-TGTTTTGTCATAA-A---AT-A---ATT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTA-T--TTGA--ACAATTATCTATT-TCA-AATAGTTATGACCTTTT
* * * * * * ** * *
133093 G-CTTCT-ATTAATACAATCT-TATT-TG--GA-ACAAAG-TAATGCTAATTTATTAAT-ATTCT
59 GTTTTGTCA-TAAAACAAT-TGT-TTCTGTTCATAC-AAGCTTATTC-AAAATA-AAATAATACT
* ** ** ** * *
133149 AA--AACTTAATA-AGTAAAGGAATTAA-AA--AAGG-------AATCTA-TTG-GCCT-GACC
118 AATTTA-TTAATATTCTAAA--AATTAATAAGTAAGGATTTAAAAATAAATTTGTTACTAAACA
* * * * * * *
133197 AGTACAAATAATGATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCA-TTATGACCTTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * ** * *
133261 TCACAAAACAATTGTTTCTATTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
133326 TTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATTGAACA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * *
133378 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATTGCTATAAGCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
133443 CATAAAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAAGTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** *
133507 TT-TAGACAACTTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATA
130 TTCTA-A-AAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * *
133559 AGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTT-GTTTTG
* ** * *
133623 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
133688 TTTTGATAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TAGAATA
130 TTCTAAAAATTAATAAGT-AAGGA-TTTAAAAATAAATTTG-TTACTA-AACA
* * * * * * * *
133740 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAAT-CTCAT-AACTATTTGAATAA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT-TTTG--T-T
* *** * * * *** ** * * *
133803 TTATC-TATTTCAAATTGTTAC-G-ACCT-TTTG-TT-TTGCCATAAA-AAAATTGTATTAGTTC
62 TTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATT--CA-AAATAAAATAATACTAATTT
* * * * * *
133861 ATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAA--TG--AGT
123 AT-TA---ATATTC----T-AAA-AAT--TAA-TAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTGTTACT
*
133921 AAGA-G
174 AA-ACA
* * * * ** * ** * *
133926 ATTTAAAATATGAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTTAAATAGTTAT-GACTA-TT-TGAACAACTA
1 AGTTCAAATA-G-TTATGACTATTTGAACAA--TTATCTA-TT-TCAAATAGTTATG-AC--CT-
** ** * * **** ***
133987 TCTAT-TTCAAATTGT--TATGACTTTTTGTTT-TG-TCATA-AA-ATAATTGTTTATGTTCATA
56 T-T-TGTT----TTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATA
* * ** * ** * * * * *
134045 CATGCTTATTTCAAACAAAATAATATAAATTTATTGATATTCCAA-GAATTAACAAGTAAAAATT
113 -ATACTAATTT--ATTAATATTCTA-AAAATTAAT-A-AGT--AAGGATTTAA-AA--ATAAATT
*
134109 T-TTA--AAATA
167 TGTTACTAAACA
* * * * * * * *
134118 AATT--AGT-TTTCTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATA
1 AGTTCAAATAGTTATG-ACTA-TTT-GA-A--CA--------------ATTATCTATTTCAAATA
* * * * *
134180 GTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATT---AA-AAAA
46 GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA
* ** *
134241 -AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTTAAAAATATATTTGTTTA-
111 TAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGA--TTTAAAAATAAATTTG-TTAC
* *
134304 TCGAGCA
173 T-AAACA
* * * * * * *
134311 AGTTCATATCGTTATTACTATTTGAATAATTATTTCTTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
134376 CATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * **
134441 TCT--AAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTACCGAACA
131 TCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * * *
134490 AATTCAAATAGTCAT-ATCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACTTTTTATTATG
1 AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * *
134554 TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATGCTAA-ATTATTCATAATAAAATAATGTTGATCTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * *
134618 ATTTTGAAAATTAATAAG--A-GATTTAGAAACTAAATTTATTTACCAAAACA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTA-AAAATAAATTT-GTTA-CTAAACA
* * * *
134668 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ****
134731 CATAAAACAATTGTTTTTTTTTCATACAAGCTTGTTCGGCTTAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTG-TTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * ** * *
134796 TTCCAAGAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACC
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * ** * ** * * *
134848 ATTTCAAGTAGTTAAAACTATTAGAAGTATTATCTATTTCAAATCA-CTCTGACCTTTTCTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * * * * *** * * *
134912 TTATAAAACAAACGTTTTTGTCCATATAAGTTTGTTTGGAACAAAATAATATTAATTTATTAATG
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * *
134977 TTTTGAAAATTAATAAG--A-GATTT--AGGTAAATCTAT-TTACCAAACC
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * * * * * * *
135022 AGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGACCATTTATTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * ** * * **
135087 AATAAAACAATTATTTTTATTAATACAATCTTATTCGCAATAAAGTAATGCTAATTCGTTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * ** *
135152 TCTAAAATTTAATAAGTAAAAAGTTTTAAAAA-ATAATCTATCAGCTTGACC
131 TCTAAAAATTAATAAGT--AAGGATTTAAAAATA-AATTTGTTA-CTAAACA
* * * * *
135203 AGTACAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-CTATGACCTTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * ** * * * *
135267 TCACAAAACAACTCTTTTTATTCATACAAGCTGCTTCCAAATAACATAATTCTGATTTATTAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* ** * *
135332 TTCCAAAAATTAATAAGTAACAAATTTAAAAACTGAATCTGTTTA-TCAAACA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAA-GGATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * *
135384 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * *
135449 CATAAAATAAAAT-TTTCTATCCATACAAGCTTATTTTAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA
66 CATAAAA-CAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * *
135513 TT-TAGACAACTAATAAGTAAAAGA-TTAAAAA-AAAACTGTTTACCAAATA
130 TTCTA-AAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * *
135562 AGTGCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCGTAATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
135627 CATAAAACAATTGTTT-TGTTTATATAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * ** * * * *
135691 TTTGATCATTAATAAGTAACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGAACA
131 TCTAAAAATTAATAAGTAA-GGA-TTTAAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * *
135742 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-CTCAT-AACTATTAGAATAA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCT-TTTG--T--
* * * * * * ** * ** *
135805 TTAT-TTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTCATCATAAAAC-AATT--GTATTAGTTCAT
61 TT-TGTCA--T-AAAACAAT-TG---TTTCTG-TTCAT-A-CAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
** * * * * *
135865 A-TAGGCTTATTTGAA-A-T-AAAACAATACTAATTTATTAA-TATTTCAAAAATTAA--TG--A
115 ACTA-ATTTA-TT-AATATTCTAAA-AAT--TAA-TAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTGTTA
* *
135921 AT-AA-G
172 CTAAACA
* * * * *
135926 AGATTTAAA-A--TATGAATTTATTTATGGGACAAGT-TCAAATGGTT-ATAACT-GTT-TGAAC
1 AG-TTCAAATAGTTATG-A-CTA-TT-T-GAACAATTATC-TAT--TTCA-AA-TAGTTATG-AC
* * ** ** ** * * **** **
135984 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT-TG-TCATA-AA-ATAATTTTTTTATGATC
54 -CTT-T-TGTTT--TGTCA-TAAAAC-AATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAAT-AAA
* * * * ** * * * * * *
136045 ATACATGCTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTACTATTCCAA-AAATTAATAAGTAAAA
110 ATA-ATACTAATTT--ATTAATATTCTA-AAAATTAATA--AGT--AAGGATTTAA-AAAT-AAA
* * *
136109 ATT-TTA-AAAATA
165 TTTGTTACTAAACA
* * * * * * * * *
136121 A-ATC-TAT-TTTCTGAAC-ACGTTCAA-ATAGTTATGACTATTT-GAATAATTATGTA--TTTC
1 AGTTCAAATAGTTATG-ACTA-TTTGAACA-A-TTAT--CTATTTCAAATAGTTATG-ACCTTTT
*** * ** * **
136178 AAATAGT--TAAAACCTTTTGCTTTGTCATAAACCAAATGTTTCTATTCATACAAGGGTATTCAA
59 GTTTTGTCATAAAA-CAATTG---T-T--T----C---TG-TTC-ATAC----AAGCTTATTCAA
* * **
136241 AATAAAATAATATTATTTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAACATAAAT
104 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGA-TTTAAAA-ATAAAT
* *
136305 TTGTTTACCAAGCA
166 TTG-TTACTAAACA
* * * * * * * **
136319 AGTTTATATCGTTATGACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAAAGTTATGATCTTTCATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
136384 CATAAAACAATTATTTCTCTTTATAAAAGTTTAGTCAGAATAAAATAATACTATTTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** * * * *
136449 TCTGAAAATTAATTGGCAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCGAATA
131 TCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * * * *
136500 AGTTCAAATAATCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCA-TTATGA-CTTTTGTTTTT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** * * * * *
136563 TCATAAAACAATTATCTT-TATTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATCAAT
65 TCATAAAACAATTGT-TTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
136627 ATTTTAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAACAAAATCTTTTTAGC-AAA-A
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAAT-TTGTTA-CTAAACA
* * * * * *
136675 TAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACTATTA-CTTATCTCCAATCA-TTATGATC-TTTATTT
1 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTT
* * * * * ** * * *
136737 TGTCATAAAACAAATATTTATTTTCACACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTCAATAA
63 TGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
136802 TATTCCAAAACTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAA-AAATACATGTGTTTGCCAAACCA
128 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATAAAT---T-TG-TTACTAAA-CA
* * * * *
136859 A-TTC-AATAGTTAAGACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTT
* * *
136920 GTCATAAAACAATTATTT-TACTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 GTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
136984 CATTCAAAAAATTAATGAGTAAGTGATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACA
128 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GA-TTT-AAAAATAAATTT-GTTACTAAACA
* *
137039 AGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTT
* ** * * * * * * * * *
137102 ATCATAAAACAATCATTTCAGTTCAAAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACCACTTTTTTTAT
64 GTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
137167 ATT-TCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAACCTAAAGTTCT-TTTCCAATCT
129 ATTCT-AAAAATTAATAAG-TAAGGATTTAAAA-ATAAA-TT-TGTTACTAAACA
* * * * * *
137220 AGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * ** *
137283 TAATAAAACAATTGTTTCTAG-TCATATAAGTTTATTTC-GTA-AAAATAATACTAATTTAATAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
137345 TATT-TCAAAAATTATTAAG--A-GATTTAAAAAAATAAATGTTTTTGCCAAACC
128 TATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT--AAAAATAAAT-TTGTTACTAAACA
* * * * * * *
137396 AGTTCAAAGAGTTAAGACTATTAGAAAAATTATCTATTTTAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *** * *
137460 TCATACAATAATTATTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTAACA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *
137525 TT-TGAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTAT-TTACTAAACA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT--AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * ***
137578 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATATTTATGAAAATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
137643 CATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATAAAATCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** **
137706 TT-TCAAAAGTTAATAAATAAAAAATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCAAATC-
130 TTCT-AAAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAA-CA
* * * * * * * * * *
137758 ATTTCAAATAATAATGGCCATTT-AACAACTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTCT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** **
137822 CATAAAACAATTATTT-TCCAACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** *
137886 TT-TCAAGAATTAATAAG--A-GATTGAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACC
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATT-TAAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * *
137934 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-TAA-A--TA--ACCTTTTATTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
137993 CATAAAACAAATGTTTCTATTCGTACAAGCTTATTCATAATAAAA-AAAACTAATTTAGTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
138057 TTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCGTTTGCTGAAC-
131 TCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * * *
138107 CGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAGTTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
138172 CATAAAACAATTATTT-TAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAA-AGCTAACTT-TTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAAT
* * * *
138234 ATT-TCAAAAATTTATACA-TAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTACTTA-TCGAACC
129 ATTCT-AAAAATTAATA-AGTAAG-GATTTA-AAAATAAATT-T-GTTACT-AAACA
* * * * *
138287 A-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-CTTATTA-CTTTATGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTT-TGTTTTG
* * * * * * *
138349 TCATAAAAAAATTGTTTTTGTTAATATAAG-TTCGTTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* *
138413 ATT-TAGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTACTAAACC
129 ATTCTA-AAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * *
138466 ATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCA-TTATAACATTTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** ** * *
138530 TCATCAAATAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTCAGCATAAAATAAGACTAATTTAATAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * * ** ** *
138595 TTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTTGAACCA
130 TTCTAAAAATTAATAAGTAAG--GATTTAAAAATAAAT-TTGTTACT-AAACA
* ** * * *
138648 A-TTCAAATAGTTCA-GACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTT-TTTTT
1 AGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
** * ** ** * * *
138710 TTGTAAAACAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATAATAATTTAATAATA
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
138775 TT-TCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACA
130 TTCT-AAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAAATTTG-TTACT-AAACA
* * * * * * *
138823 A-TTCAAATGGCTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTGACCTTTTGTTTAG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * **
138886 TTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAACCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACG
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * ** * * *
138951 TTCGAAAAGTTAATAACAAAAAGAGATTT-AAAA-AAATGT-TTACCAAATA
130 TTCTAAAAATTAAT-A-AGTAAG-GATTTAAAAATAAATTTGTTACTAAACA
* ** * * * * *
139000 AGTTCAAATAGTTATTACTATTCAAACAATTGTCAATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGATTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTG
*** * *
139064 TCATAAAACAATTGTTT-TAGTT-AGTACAAGCTTAGAGAGAATAAAATAATCCTAATTTATTAA
65 TCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCA-TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * **
139127 TATTTTAAAAATTAATAAATAAGAAATTTAAAAGATAAATTTGTTTACGAAATT
128 TATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAA-ATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * ** * * ** *
139181 AGTTGAAATAATTATGGCTATTTAAATGATTATCTATTTGAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * **
139246 CATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
139311 TTTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT
131 TCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAATTTG-TTACTAAACA
* * * * * * * * *
139362 AGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGCATAATT-TTTAATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * *
139425 TTAAAAAACAATTGTTTCTGATCATAGAAGCTTATT-TGATTAAAAATAATACTAATTTAATAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * *
139489 ATT-TCATAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTT-GTGGAACCA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAAT-TTGTTACT--AAACA
** * * * * * * ** *
139543 AG-TCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTCTAATATTTTGTTTAGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* *** * * * * * * * **
139607 CATAAGATTTTTATTTCAT-ATCTTGCAAGCTTATT-AGGAATAAAATAATTCAAATTTATTAGC
66 CATAAAACAATTGTTTC-TGTTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * **
139670 ATT-TGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTAT-TTACCGAACA
129 ATTCT-AAAAATTAATAAG-TAAGGATTT--AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * * * * * *
139724 AGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTTTGA
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
139789 CATAAAACAATTGTTT-TAGTTTATAAAAGGTTATCCAAAATGAAATAATA-TAAATTTCTTAAT
66 CATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * **
139852 ATTTTGAAAATTAATAAGCAA-TAGTTTAAAAAAATAAAATCAT-TTACCGAACAA
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAGGA-TTT--AAAAAT-AAAT-TTGTTACTAAAC-A
* * * * * *
139906 AG-TCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGGTCTAT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** **
139970 TATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
140035 TCCAAAAATTAATAAGT---GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTAACGAATC-
131 TCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAAATTTG-TT-ACTAAACA
* * * * * * *
140082 AGCTCAAATAATTATTG-CCA-TTGTAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTA
1 AGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTT
* * *** *
140145 GTCATATAACAAATT-TTT-TTTATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGTA
64 GTCATAAAAC-AATTGTTTCTGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * *
140208 ATCTT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACCAAACC
127 ATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAAAT-T-TGTTACTAAACA
* * ** * *
140263 AGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAAGAATGGTATACTTAAAAT-AAATTATTTACAAAATAAAC
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT--TAT-C-T-ATTTCAAA-TAGTT-----AT-GAC
* * * * * * * *
140327 CTTTGGTTTTGTTATAAAATAATTATTTATGTTTATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTA
54 CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTA
* * * * * ** *
140392 ATCTAATAATATTCCAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCAAACT
119 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAAATTTGTTACT-AAACA
* * * ** * * * * *
140455 AGTTCAACTTGTTAAGACTACATGAACAATTACCAATTTAAAATTGTTACT-ACATTTTGTTTTG
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTA-TGACCTTTTGTTTTG
* ** ** *
140519 TCATAAAACAATTTTTTCAATTCATATTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAAT
65 TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * *
140583 ATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAA-ATAATTCTATTTACCT-AACT
129 ATTCTAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAATA-AATT-T-GTTA-CTAAACA
* * * * *
140636 AGTTCTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* *
140701 CAT-AAACAAATGTTTTTGTTC
66 CATAAAACAATTGTTTCTGTTC
140722 TGTCATAAAA
Statistics
Matches: 24000, Mismatches: 5925, Indels: 4545
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
153 10 0.00
154 57 0.00
155 8 0.00
156 8 0.00
157 4 0.00
158 116 0.00
159 25 0.00
160 9 0.00
161 13 0.00
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163 122 0.01
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168 146 0.01
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179 2332 0.10
180 3706 0.15
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182 2167 0.09
183 590 0.02
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Consensus pattern (178 bp):
AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
CATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
TCTAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAATAAATTTGTTACTAAACA
Found at i:109993 original size:715 final size:712
Alignment explanation
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Period size: 715 Copynumber: 2.2 Consensus size: 712
109069 GTTATGATTG
* * *
109079 TTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACATTTTATTTTGTCACAAAACAATAGTTTCTG
1 TTTGAAC-ATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * *
109143 TTCATACAAACTTATTCAAAATAAGATAATTTTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAA
64 TTCATACAAACTTATTC-AAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
109208 GAGATTTAAAAACTAAGTTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACTTTACC
127 GA-ATTTAAAAA-TAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACGTTACC
* * * * *
109273 TATTTCAAATCGCCATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT-TTTTCTATTCCTACAAGCTTA
190 TATTTCAAATAGCCATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATACAAGCATA
* *
109337 TTTC-AATTAAAATAATACAAATTTATT-ATCGTT-CAGACA-ATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
254 -TTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATTCCA-A-ATATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
* *
109398 AAATAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAA
315 AAATAAATCTATTTACCAAATAAGTACAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAA
* * * * * **
109463 TCA-TTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATA
380 T-AGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATA
* * * * * * * *
109527 AAATAGTATTAGTTTATTAATATTTCGATAGTTAATAAGCATAAGATTTTAAAAATAAATATGTT
444 AAATAATACTAATTTATTAATATTTCGAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATATGCT
* * * * * * *
109592 TATCGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT
509 TACCAAACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTACCGATTTCAAATTATTATGACCTT
* * ***
109657 TCGTT-TCATCATAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAA-AAAACTA
574 TCGTTCT-ATCACAAAACAATTGTATCTA-TTCATACAAAATTATTCAAAA-TAAAATAAAACTA
* * * * *
109719 ATTTATTAATATTTTG-ATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTACTTACC-AAACAAGTTCAA
636 ATCTATTAAAAGTTTGAATGAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAAAC-AGTTCAA
109782 ATAATTATAACTA
700 ATAATTATAACTA
* *
109795 TTTGAACATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTT
1 TTTGAACATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
* * * *
109860 CATACAAGCTTATTCTGAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGA
66 CATACAAACTTATTC-AAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * *
109925 ATTTAAAGAATAAATATGTTT-TCTGAACATGTTCAAATAGTT-TAGACTATCTGAACAGTTATC
129 ATTTAAA-AATAAATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTTAT-GACTATCTGAAC-GTTACC
* ** * * * *
109988 TATTTCAACTAGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATAT
190 TATTTCAAATAGCCATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCATAT
** * *
110053 TCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATT
255 TCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATA
* * * *
110118 AATCTATTTACCGAGTAAGTACAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTT
320 AATCTATTTACCAAATAAGTACAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATAGTT
* * * *
110183 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAGCAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATTCATAATAAAATAA
385 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * *
110248 TACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATATGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAA
450 TACTAATTTATTAATATTTCGAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAA
* ** * *
110313 ACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTACCGATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTC
515 ACAAGTTCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTACCGATTTCAAATTATTATGACCTTTCGTTC
* * * * *
110378 TATCGCAAAACAATTGTTTCTATTCATGCAAAATTATTCAAAATAAAATAATACTGATCTATTAA
580 TATCACAAAACAATTGTATCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAA
* * * * * * *
110443 AAGTTTGAAAATTAATAAGTGCTTTAAAAACTAAATCTATTTACTAAAACAGTTCAAATAGTTAT
645 AAGTTTG--AATGAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAAACAGTTCAAATAATTAT
*
110508 GACTA
708 AACTA
* * * * *
110513 TTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTCTGTCATAAAACAATTGTTTCT-T
1 TTTGAA-CATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGT
* *
110576 TCCATACAATCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTAGTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
65 T-CATACAAACTTATTCAAA-TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
* * *
110641 GAAATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTAT
127 G-AATTT-AAAAATAAATATGTTTATCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
110694 TTTGTCATAA
Statistics
Matches: 750, Mismatches: 121, Indels: 53
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
713 3 0.00
714 54 0.07
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720 7 0.01
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (712 bp):
TTTGAACATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
CATACAAACTTATTCAAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAAT
TTAAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTGAACGTTACCTATTTC
AAATAGCCATAACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCATATTCAAAA
TAAAATAATACAAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTA
TTTACCAAATAAGTACAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATAGTTATGATC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATAGTTTCTATTCACACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAA
TTTATTAATATTTCGAAAATTAATAAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAAACAAGT
TCAAATAGTCATAACCATTTGAACAATTACCGATTTCAAATTATTATGACCTTTCGTTCTATCAC
AAAACAATTGTATCTATTCATACAAAATTATTCAAAATAAAATAAAACTAATCTATTAAAAGTTT
GAATGAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAAACAGTTCAAATAATTATAACTA
Found at i:110145 original size:534 final size:535
Alignment explanation
Indices: 108270--110658 Score: 1632
Period size: 542 Copynumber: 4.5 Consensus size: 535
108260 TAATTCTCCA
* * * * * ** *
108270 AAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAACATATAT
1 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGA-ATTTAAAA-ATAAAT
* * * * * *
108335 C-AGTTTA-TCAAATCAGTTCAAATAGCTATGGCCATTTGAATAATTATCAATTTCTAATCA-TT
63 CTA-TTTACT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTT
* * * ** * * *
108397 TTGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTCATCATACAAGCCTATTTAGAATAAAATAA
124 ATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * **** * * *
108461 TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGGGCGA--T------T--ATCTGTTTACCAA
189 TATTAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGA
* * * * * * * * *
108516 ACCAA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAGTCA-TTATAAACTTTTGT
254 A-CAAGTACAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTCGT
* * * * * ** * * * *
108579 TTTATCATAAAACAATTATTTATGTTCATTGCAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAA
317 TTCATCATAAAACAATTGTATCTATTCA-CACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTAT
* * * * ** * ** * *
108644 TAATATTATGAAAATTA-ATAACTAAGAGATTTGAAAAGTAAAT-TTGTTGCTTGAACCAGCTCA
381 TAATATTTTG--AATTAGAT--GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTAC-CAAACAAGTTCA
* * * * * * * * *
108707 AATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATGTC-AAGCTATTATGTCCTTTTGTTTTA-CTGTA
441 AATAGTTATGACTATTTGAA-CATTACCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTATC-ATA
* * * * * * * *
108770 AAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCA
503 AAATAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * *
108803 AAATAAAATAATATTAATTTATTCATATTTTAAAAATTAATAAG--AG-ATTTAAAAATTAAATT
1 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAA-TAAATC
* * * * * * *
108865 TGTTTACCAAACCAATTCAATTAGTTAT-AATAATTTAAACAATTATTTATTTCATAACT--TTA
64 TATTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCA-AA-TAGTTA
* ** * * * * * ** *** *
108927 TGACCACTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTGAT-GTAGTCTTATTTGGAATAAAGTAA
125 TGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAATAA
** * * * ** * * * * ** *
108991 TGCTAATTTATTATTATTCTAAAAATTAATAAGTAACGGATTTAGAAAATGAATTTGTTGGCTTG
189 TATTAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC-CG
* * * * * * * **
109056 -ACCAGTATAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTATT
253 AACAAGTACAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTCGTT
** * * * * * * * ***
109120 TTGTCACAAAACAATAGTTTCTGTTCATACAAACTTATTCAAAATAAGATAATTTTAATTTATTA
318 TCATCATAAAACAATTGTATCTATTCACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTA
** * * * * ** *
109185 ATATTCTAAAAATTA-ATAAATAAGAGATTTAAAAACTAAGTTTGTTTATCAAACAAGTTCAAAT
383 ATATT-T-TGAATTAGAT--GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAAT
* * *** *
109249 AGTTATGATTATTTGAACTTTACCTATTTCAAATCGCCATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA
444 AGTTATGACTATTTGAACATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAA
* *
109314 TTTTTTCTATTCCTACAAGCTTATT-T
509 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * * *
109340 CAATTAAAATAATACAAATTTATT-ATCGTTCAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA
1 -AAATAAAATAATATAAATTTATTAAT-ATTCA-AAAATTAATAAGTAAGA-ATTT-AAAAATAA
* * * *
109404 ATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATTTATTTCAAATCA-TT
61 ATCTATTTACTAAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTT
* * * * *** *
109468 ATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAACTATAGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAG
124 ATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * * * *
109533 TATTAGTTTATTAATATTTC-GATAGTTAATAAGCATAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCG
189 TATTAATTTATTAATATTCCAAATA-TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCG
* * *
109597 AACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTCGTT
253 AACAAGTACAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTCGTT
* * *
109662 TCATCATAAAACAATTGTAT-TAGTTCATATAGGCTTATTCAAAATTAAAA-AAAACTAATTTAT
318 TCATCATAAAACAATTGTATCTA-TTCACACAAGCTTATTCAAAA-TAAAATAAAACTAATTTAT
* *
109725 TAATATTTTG-A-T-GA-GTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAATAA
381 TAATATTTTGAATTAGATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * *
109786 TTATAACTATTTGAACATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT
446 TTATGACTATTTGAACATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATT
*
109851 GTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCT
511 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * *
109876 GAATAAAACAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAATTTAAAGAATAAATA
1 AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAA-AATAAATC
* * * * * *
109941 TGTTTTCTGAACATGTTCAAATAGTT-TAGACTATCTGAACAGTTATCTATTTCAACTAGTTATG
64 TATTTACTAAACA-GTTCAAATAGTTAT-GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * *
110005 ACCTTTTATTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATTCAAAATAAAATAATAT
127 ATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAT
* * * **
110070 TATTTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATTAATCTATTTACCGAGTA
192 TAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACA
* * * * * **
110135 AGTACAAATAGTTATAACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGT
257 AGTACAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTCGTTTCAT
* * * * *
110200 CATAAAGCAATTGTTTCTATTCACACAAGTTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
322 CATAAAACAATTGTATCTATTCACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
110265 TTTGAAAATTAATATGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGCTTACCAAACAAGTTTAAATAGTCA
387 TTTG--AATT-AGATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * ** *
110330 TGTCCATTTGAACAATTACCGATTTCAAATTATTTTGACCTTTTGTTCTATCGCAAAACAATTGT
449 TGACTATTTGAAC-ATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGT
* ** *
110395 TTCTATTCATGCAAAATTATTCA
513 TTCTATTCATACAAGCTTATTCT
* * * ** *
110418 AAATAAAATAATACT-GATCTATTAAAAGTTTGAAAATTAATAAGT--G-CTTTAAAAACTAAAT
1 AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAA-TAAAT
* * *
110479 CTATTTACTAAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATG
63 CTATTTACT-AAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * *
110544 ATC-TTTATTCTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TCCATACAATCTTATTCAAATTAAAATAATA
127 ATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA
* * *
110607 CTAATTTAGTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTTAAAAAATAAAT
191 TTAATTTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAAT
110659 GTGTTTGTCA
Statistics
Matches: 1459, Mismatches: 329, Indels: 131
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
528 1 0.00
529 78 0.05
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531 2 0.00
532 1 0.00
533 49 0.03
534 269 0.18
535 154 0.11
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537 6 0.00
538 179 0.12
539 159 0.11
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542 336 0.23
543 16 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.11, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (535 bp):
AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAATTTAAAAATAAATCTA
TTTACTAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGATCT
TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAAT
TTATTAATATTCCAAATATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTA
CAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTCGTTTCATCATA
AAACAATTGTATCTATTCACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTTG
AATTAGATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
TTGAACATTACCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCTATTC
ATACAAGCTTATTCT
Found at i:111018 original size:145 final size:146
Alignment explanation
Indices: 110752--111021 Score: 380
Period size: 145 Copynumber: 1.9 Consensus size: 146
110742 TATTTGAAAT
* * * *
110752 AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATACATGCGTATTTGAAATAAA
1 AGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTTGAAACAAA
* * * *
110817 ATAATACTAGTTTATTCATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAGATAAATCTATTTA
66 ATAATACTAATTTATTCATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAATCTATTTA
110882 CCCAGCAAGTTCAAAC
131 CCCAGCAAGTTCAAAC
* * **
110898 AGTTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTCTATTCATACAAGTTTATTTGAAACAAA
1 AGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTTGAAACAAA
* * * **
110962 ATAATACTAATTTATTTATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATCTAAAAAATAAATCT
66 ATAATACTAATTTATTCATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAATCT
111022 GCTTATCGAA
Statistics
Matches: 107, Mismatches: 17, Indels: 1
0.86 0.14 0.01
Matches are distributed among these distances:
145 77 0.72
146 30 0.28
ACGTcount: A:0.41, C:0.11, G:0.09, T:0.39
Consensus pattern (146 bp):
AGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCGTATTTGAAACAAA
ATAATACTAATTTATTCATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAAAATAAATCTATTTA
CCCAGCAAGTTCAAAC
Found at i:115500 original size:542 final size:540
Alignment explanation
Indices: 113720--140721 Score: 6467
Period size: 538 Copynumber: 49.8 Consensus size: 540
113710 TTACTGAAGT
* * * * * * *
113720 AGTTTAAATAG-CTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATCATTAT-AGCATTTTGTTCT
1 AGTTCAAATAGTC-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGA-CCTTTTGTTTT
* * * * * * ** *
113783 ATCATAAAATAATTATTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAAAATACTAATAAAATAA
64 GTAATAAAAAAATTA-TT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
113847 TATTTCAAAAATTAATAACTTAGAGATTTAAAAAGATAAATTTGTTT-GTAAA-ACTAGTTCTAA
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAA-ATAAATTTGTTTACTAAATA--AGTTCAAA
* ** * * * * *
113910 TAATTAACACTAAATT-AATAATTATCTA-TT---A-CA-TATCA-TTTTTGTTTTGTCATATAA
189 TAGTTATGACT-ATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATA-AA
* * * ** * * *
113967 CAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTGATATTTCAAAA
252 AAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * **
114032 ATTAATATGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCT-AGCTTGTTCAAATAATTATGACTA
317 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTA
* * * *
114096 TTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTAAGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGT
381 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
* * * * * * * * *
114161 TCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAAATAAATACTAATCTACTAGTATTTCA-AAAATTAATAAG-
446 TCATAAAAGCTTATTTG-AATTAAAAT-AATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGT
* **
114224 -AA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACCA
508 AAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAA-CA
* ** * ** * * *
114256 A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
114320 TATAAAATAATAATTTATGTTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAATACTAATTTATTAACAT
66 AATAAAAAAATTATTTA-GTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
114385 TTCAACAATTAATAAGTAA-AAAATTTCAAAAATAAATATGTTTA-TCAAATTAGGTCAAATAGT
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
114448 CATGACTATTTAAATAAATATCTATTTCAAATCGTTACGACCTTTTGTTTTATCAAAAAAAAATT
193 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATC-ATAAAAAATT
* * * *
114513 ATTTC-AGTTCATATAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AAGTTATTAATATTTCAAAAAT
257 TTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** *
114575 TAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTT
319 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * * *
114640 TAACAATTCTCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTATTC
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTC
* * * * *
114704 ATACAAGCTTATTTCTAA-TAAAAAAATATAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAA
448 ATAAAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGT-AAA
* **
114768 TATTTCAAAAATAAATATGTTTATTAAATT
511 TATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * *
114798 AGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAATATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
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66 AATAAAAAAATTA-TTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
114928 TTCAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATCAATTTGTTTACTGAATAAGTTTAAATAATTA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * * *
114993 TGACTATTTTAACAATTAT-TA-TTCGAAATTACTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATGATTT
195 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTT
115056 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTA
258 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTA
* * * * **
115119 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAACTCTGTTCATTGAACCAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGA
321 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * **
115184 ATAATTA-CTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTG
386 ACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * *
115248 TAAAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTGTTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAATGA
449 TAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGTAAAT-A
* * *
115313 TTTAAAAAATAAATATATTTTTTGAACA
513 TTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* *
115341 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATAATTGTGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * *
115406 AAT-AAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATTCTAATTTATTAATTT
66 AATAAAAAAATTATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * *
115470 TTCAAAAATTAATGAGTAAGGGAATTAAAAAATGAATTTGTTTACTAAATATGTTCAAATAGTTA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * **
115535 CGACTATCTGAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGGCCTTTTGTTTTATCATAAAAAATTGGT
195 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAAATTTTT
* * ** *
115600 TCTGTTCATGCAAAATTATTT-TGAATAAAATAATATAAATTTTTTAATATTTCAAAAATTAATA
260 TCTATTCATACAAGCTTATTTCT-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * *
115664 AGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATATGTTTTCT-AGA-CACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
324 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGA-ACCA-GTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * *
115726 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTGATTGTTTATGTTCAT-
387 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATA
* * * * * *
115789 -AA----A--T-AA-T--ACTAAT-TT-A-TTA--AA-ATTCCA-AAAATTTATAAGCAAAACAT
451 AAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAG-TAAATAT
*** * * * *
115836 TTAAAAAATAAATCCATTTACTGAGCG
514 TTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * ** * **
115863 AGTTCAAATAGTTATGAATATTTGAACAATTATTTACTTCTAATCTTTATTATCAATTT-TTTTG
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGA-CCTTTTGTTTTG
* * * * *
115927 TTATAAAATAATTATTTCTA-TTCATACAAG-TTTTTTCGAAATAAAATAATA-TCAATTTATTA
65 TAATAAAAAAATTA-TT-TAGTTCATATAAGCTTATTT-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTA
* ** * * **
115989 ATA-TTCTAAAAATTATTAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAATAAGTTCAAAT
126 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAAT
* ** * * * * *
116053 AGTCATGTTTATTTGAACTATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGACATTTTGTTTTATCGTAAAAC
190 AGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-
* * * *
116117 AATTATTTCTATTCATACAAAAC-TA-TTCAGAATAAAATGATACT-AATTTATTAATATTTCAA
253 AATTTTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * * * *
116179 AAATTAACAAG----AGATTTAAAAACA-AAATCTATTTA-TCAAACGAATTTAAATAGTTATAA
315 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-ATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * * *
116238 ATATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTC
378 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
* * ** * * ** * * *
116302 TATTTATGCAAGCTTATTT-AGAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTTTA-AAAATTAATAA
443 TGTTCATAAAAGCTTATTTGA-ATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAGACAATTAATAA
* * * *** *
116365 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCCGAACCA
506 GTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTT-ATTAAACA
* * * * * * * * * * *
116402 A-TTCAAAGAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTAATTCAAATCACTCTAACC--TT-TTTAGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * ** *
116463 CATAAAATAATTTTTTTTAGTTGATACATGCTTATTTGAAATAAAACCATACTAATTTATTAACA
66 AATAAAA-AA-ATTATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * *
116528 -TTCAGAAAAGTAATACA-CAAGA-AATTTTTAAAAATAAATCTATGTATTGAACAAGTTCAAAT
129 TTTCA-AAAATTAATA-AGTAAGAGAA--TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAAT
* * * * *
116590 AGTTATGACAATTTAAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACA
190 AGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-A
* * ** * *
116655 ATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAA
254 ATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * ** *** * *
116719 TTGATAAGTTAGAGATTTAAACAATAAGTCAGTTTA-TCGAATTGGTTCAAATAATTATGGCCAT
318 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * **
116783 TTAAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACATTTGTTTTTAAT
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * * *
116848 CAT--AAGCCTATTATGAA-TAAAATATTACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAG
447 CATAAAAGCTTATT-TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTA-
* * * * *
116909 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAAC-
509 AATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * ** * *
116940 ---T--AAT--TCCT-A-T-TTTGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTAT-AACTTATTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTT-TTGTTTTG
* * * *
116994 TTATAAAATAATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATA
65 TAATAAAAAAATTATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
117059 TTTCAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCGAAAT-AGTTCAAATGGT
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTT-ACTAAATAAGTTCAAATAGT
* * * * ** * * *
117123 TAAGACTATATGAACAATTATTTGCTTCAAATCATTATGGCATGTTGTTTTATCATAAAACAATT
193 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATT
* * * * * * * *
117188 GTTTC-AGCTCATACATGTTTA-TTCAAAATAAAATAAAACT-AATTTATTAATATTCCAAAATT
257 TTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * * * *
117250 TAAAAAGT----GATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAATCAATTCAAATAATTATGGCCATGT
319 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * ** ** * * ***
117311 CAACAATTATCAATTTCAAATCATCATTACCTTTTACTTCATCATATAACAATTGTATTTAAACA
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
** * * *
117376 TTCAAGCTTATTTAGAATT-AAATAATACTAATTTATTAATCTTTCA-AAAATTAATAAGTAAGA
449 TAAAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTAA-A
* * * *
117439 GATTTAAAAAATAAATTTGTTTATTGAACT
511 TATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * ** * * ** * * * *
117469 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAGA-AATTGTAAACTTGAAATCGTTATAACATTTTGTTCTA
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** * * ** * * *
117533 TCATAAAATAATTATTTTTCTTCAGACAAG-TGTATTTGGAATAAAATAACACTAATCTAATAAT
65 TAATAAAAAAATTA-TTTAGTTCATATAAGCT-TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * *
117597 ATTCCAAAAACTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTCTTTGTTGAACT-AGTTCAAATAT
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAG
* * * * *
117661 TTAAGTCTA--TAAGACCAATTATCTATTTCAAA-CAATTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAAT
192 TTATGACTATTTAA-A-CAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAA
* * ** * * *
117723 ATGTTTTTTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTAAAA
254 AT-TTTTTCT--ATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAA
* * ** *
117788 AATTAATAAG----AGGTTTAAAAAATAATTTTGTGGACCT-AACCAGTTTAAATAATTATGACT
316 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * *
117848 ATTT-AATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGTCCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAAATGCTTTT
380 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * * * * * *
117912 GTTCATATAAGTTTGTTCAGAA-TAAAGTAATACTAATCTACTAATATTTTA-A-AA--ATTAA-
444 GTTCATAAAAGCTTATT-TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAGACAATTAATAAG
* * * *
117971 TAAATGATTTAAAAAGATAAATCTATTTATCAAACT
507 TAAAT-ATTTAAAAA-ATAAATATGTTTATTAAACA
* ** * ** * * *
118007 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-AACTTTTGTTCTAT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * * * *
118071 TATAAAGCAATTGTTT--TTCAACATACAAGCTTTTTTGAATTAGAATAATAC-AGATTTATTAA
66 AATAAAAAAATTATTTAGTT---CATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA
* * * * * * ** *
118133 TATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGACATTTAAAAAACAAATCTGTTTGCTAAACCATTTCAAATAG
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAG
* * ** * * *
118194 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTAACCCTTTTGTTCTATCATAAAAAAA
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CCTTTTGTTTTATCAT-AAAAAA
* ** *
118259 TTGTTTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTAGTAATA-TTCTAAAA
255 TT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * *** * * ** * *
118321 ATTAATAACT--AAGATTTAAAAAATGAATCCATTT-GTCGAACCGGTTCAAGCAATTAAGACAA
317 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTA
* * * * * * * ****
118383 TATGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTATTGTTTTATCATAAAATAATTATTTCAAC
381 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
* * * * * *
118448 TCATACAAGCTTATTTGAAATAGAATAAAATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTTATAAG---
446 TCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * *
118509 AGATTTAGAAAATAATTCTATGTACTGAACC
510 ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * ** * *
118540 GGTTCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * * * * *
118605 CGTAAAACAATTGTTTTTGTTAATATAAGTTTGTTCAAAATAAAATAATACTAATATATTATTAT
66 AATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
118670 TTAAAAAATTAATCAGTAAGA-AATTTAAAAAGTAAATTTGCTTACCAAACT-ATTTCAAATAGT
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-TAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
118733 TTTGATTATTTGAATAA-TATCTATTTCAAATTATTATAACCTTTTATTTTATCATCAAACAATT
193 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAAAAATT
** ** * ** ** *** * * * *
118797 GGTTCCGTTAATATTATTTTATTGGGAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTCCAAAACTTC
257 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** * * ** * ** * * ** * *
118861 ATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGCCCAACCAGTTTAAATAGTTAAAAATATATG
321 ATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * *
118925 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTCTTTTGTCGTAAAACAAATG-TTTTGTTCAT
385 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
** * * * * * *
118989 TCAAGATTATTTGAATTAAAAGAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGA
450 AAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGT-AAATA
* * **
119053 TTCAAAAAATAAATTTGTTTACCAAATC-
513 TTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAA-CA
* * * * * * * * **
119081 AGTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTAATTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTGAGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
119146 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAATTAATACT-ATATTATTAACA
66 AATAAAAAAATTATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATA
** * * *** * * *
119210 -TTCAAAAAATTAATAAAAAAGAGATTTAAAAAGTAAATCCATTTGCTGAACAAGTTCAAATAGT
129 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
119274 TATTATTATCTT-AACAATTGTCCATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTCATCATAAAACAAT
193 TATGACTAT-TTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAT
* * ** ** **
119338 TGTTTC-AGTTAATACAAGCTTAAATAGAATAAAATAATAT-TGTTTATCATACCA-ATTT-AAA
256 TTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTAT--TA--ATATTTCAAA
** * ** ** *
119399 TAATTATGACTATTTGAATA-A-TTATCGATTTCAAA-TTG-TTA-TG-ACCTTTTGTTTTGTCA
316 -AATTA--A-TAAGT-AAAAGATTTA-AAAAAT-AAATTTGTTTACTGAACC---AG---T-TCA
** ** * * * * ** * ** * ** *
119458 TAA-AACAATGGTTTTTTTCGAATAAGTTTTTTGAAATAAAAT-AATATTAATTTATTAATATTT
367 -AATAATTAT-GACTATTT-GAACAA-TTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTT-TT-GT-TTT
* * * * ***** * * * * * *
119521 -TGAAAATTAATAAGTGAGAGAGTT-A-AAAA-ATAAATCTG-TTTACTAAATCAGT-TCAA-TT
424 GTCATAA--AACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCT-TATTTGAATTA--AAAT-AATATTAATTT
* ** ** * ** * * *
119579 AGTTTAACTATTT-GAACAATTATTTATTTCAAAT-TATT-AGGACTATCTGTTTTGTCATAAAA
483 A--TTAA-TATTTAG-ACAATTA-ATAAGT-AAATAT-TTAAAAAATAAATATGTT-T-ATTAAA
119641 CA
539 CA
* * * * * *
119643 ATTGTTTCTATTCA-TACA-GTCTTATTTAGAGTAAAGTAATGCTAATTT-ATTAAT-ATTCTGA
1 A--G-TTCAAAT-AGT-CATGAC-TATTT-GAAT-AA-TTAT-CT-ATTTCA--AATAATTATG-
* ** **** ** ** * * * * *
119704 AAACTAATAAG-TAACAAATTTAAAAATTGAATCCA-TTGGCCTGACCAGTGCAAATATTTATAA
52 -ACCT--TTTGTTTTGTAATAAAAAAATT--ATTTAGTT--CAT-A-TA-AGC--TTATTTAAAA
**** * * * * * * * ** * * ****
119767 TTGTTTGAACAATTATCTATTTCACATCTTT-AAAACCTT-GTGTGTTATCACA-AATCAGTTGT
105 TAAAAT-AATACTAATTTA-TT-A-ATATTTCAAAA-ATTAATAAG-TA--AGAGAATTA-AAAA
* ** * ** * * * *
119829 TTCTATTCCTACAAGTTTATTCAAAATAACAT-AATTCTAGCTTATTAATATTCCAAA-AATTA-
161 ATAAATT--T----GTTTA--CTAAATAAGTTCAA--ATAG-TTATGACTATT-TAAACAATTAT
* ** * * ** * * * * * ** *
119891 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGA--ATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
214 CTATTTCA-A-A--T-CATTATGACCTTTTGTTT--T-ATC-A--T-AAAAAATTTTTTCTATTC
* * * ** * * * * ** *
119954 AAACAA--TTA--TCTATTTCAAATTGCTATAACATTTTATT-TTGTCATAAAACAATTTTTTCT
267 ATACAAGCTTATTTCTA-AT-AAAATAATATAA-A-TTTATTAATAT-TTCAAA-AA-TTAAT-A
* ****** ** * * * *
120014 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAACACAAATTTATTAA-TA-TTCAAACAATTA--A-A
324 AGT-A-A-AAG---ATTT--AA-AAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
** * ** * * * * * *
120074 AAATAAATCTGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTAATGA-C-TTT-TTTT-TAATTAAACAATTG
380 ATTTGAA-C-AATTATC---T-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * *
120135 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATACTTT-GACAAATAA
439 TTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAGACAATTAA
* * ***
120199 TAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTACCGAACA
503 TAAGT-AAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * ** * **
120238 AGTCCAAATAGTCATAAGTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATTGTTATGACCTATTGTTTCAT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * *
120303 TTTAAAACAATTAAATCAGTTCATATATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 AATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * * * *
120368 TTCAAAAATTAATGAGTAAAAGATTTACAAAATGAATCTATTTACTAAACAACTTCAAATAGTTA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * ** * * ** *
120433 TTACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCATTTGTTTTGCCATAAAAACATTAT
195 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAA-ATTTT
* * * *
120498 TTCTATTTATACAAGTTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
259 TTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * *
120563 AGTAGAA-ATTTAAAAAATAAA-TCGATTTTCTGAGCACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
324 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACTGAAC-CAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
* * * * * *
120625 CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-CTTTTGTTTTGTAATAAACCAATTGTTTCTATTCATAC
387 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAA
* * * *
120689 AAGCATATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-A-AGATTAATAAGTAAAAGAT
452 AAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACA-ATTAATAAGT-AAATAT
* * * * * *** *
120752 CTAAACAATAAATCTATCTACGGAGCA
514 TTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * ** * *
120779 AGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATGGTTATGATCATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
120844 CACAAAACAATTGTTTCTA-TTAATACT-CGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTTATTAA
66 AATAAAAAAATT-ATT-TAGTTCATA-TAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAA-TTTATTAA
* * * * * * ** * *
120907 TATTTAAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATCTAAAATATAAATCTATCTACGGAGTAAGCTCAAATA
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAAT-TAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATA
* * * * * ** * *
120971 GTTATGACTATTTCAATAATTTTTTATTTTAAAT-AGTTATGATATTTTGTTTTGTCACAAAACA
191 GTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-A
* * * * * *
121035 ATTGTTTCTATTAATACTAGTTTA-TTCATAATAAAATAACACT-AATTTATTAATA-ATCTAAA
254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAA
*** * * ** * * * * * *
121097 AATTAA-AAGGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTCATGTCC
316 AATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * *
121161 ATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCATTATGACCTTTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTCT
380 ATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * * *
121225 ATTCATACAAA-ATTATTTAGAA-TAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
444 GTTCATA-AAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAG
* * * **
121288 ---AGATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAATCA
507 TAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAA-CA
* * * * ** * * * *
121320 A-TTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTGTTATC-TTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * * * ** *** * * *
121383 CATGGAACAGTTGTTTCTTTTCATATAAGCTTATTCGGATTAATATAATACTAATTTAATAATA-
66 AATAAAAAAATTATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* ** ** ** ** * * * * *
121447 ---AAAAATAAATGTGCTTTGCCAA-T-CCAATTCAAA--TATTTA--AGACT-ATTTGAACA-A
130 TTCAAAAATTAATAAG-TAAGAGAATTAAAAAAT-AAATTTGTTTACTA-AATAAGTTCAA-ATA
* * ** * * * ** * *
121501 -TTAT--CTATTTCAAATC-ATTCTGACATTTTGTTTAGTCA-TA-AAACAATTATTTTAGTTTA
191 GTTATGACTATTT-AAA-CAATTAT--C-TATT-TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA--TCA
** ** * ** * * * * * * * * *
121560 TGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGC-TAATT-TATTAACAT--TCA-AAA--AATTAATA-A
248 TAAAAAATTTTTTCTATTCATACAA-GCTTATTTCTAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATT
* * * * * *
121617 GCAAAAGATTTTAAAAAATAAATATG-TTTATCAAACAAGTTCAAA-TAG-ATA-TG-ACTA-TT
311 TCAAAA-A--TTAATAAGTAAA-A-GATTTA--AAA-AA--T-AAATTTGTTTACTGAACCAGTT
** * **** ** * * * **
121676 TGAACAATTAT--CTATTT-AA-AATCGTTATGAC-ATTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTT
365 CAAATAATTATGACTATTTGAACAA---TTAT--CTATTTCAAATCGTTAT-GACCTTTTGTTTT
* * ** * *
121736 AGTTCAT-AAA-AA--------CTT-AT-----C-TA----AAATAAAATAATACCACTTCATTA
424 -G-TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTA
* * * * * * *
121780 ATATTTCA-AAAATTATTAAG-CAAGATTTAAAAACTAAAGCTAT-TTT-TCGAACCA
487 ATATTT-AGACAATTAATAAGTAAATATTTAAAAAATAAA--TATGTTTAT-TAAACA
* * * * * * ** *** *
121834 A-TGCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATCAAACTCAAATTGCTATGATC-TTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
121897 AATAAAAAAATTGTTTCTA-ATCATACAAGCTTA-TTCAGATAAAAATAATACTAATATGA-TAA
66 AATAAAAAAATT-ATT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAAT-AAAATAATACTAAT-TTATTAA
* * * * * *
121959 TATTTCAAACATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTT-GTCGAATCAA-TTCAAAT
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAAT-AAGTTCAAAT
* * * * * * *
122022 GGTTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTG-TTTAGTAAAAAAA
190 AGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-T-CATAAA
* * *
122085 AAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAACA-TTCA
252 AAATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-
* * * * ** * * * *
122146 AAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-TAAAA-AAATATGTTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATTA
313 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * * * *
122209 TTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGGTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
378 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
** *** * * * *
122274 AATTCATAAAAGCTTATCAAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
443 TGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAG
* * *
122338 ---AGATTTAAAAAATAAATCA-GTTTACTGAATC-
507 TAAATATTTAAAAAATAAAT-ATGTTTA-TTAAACA
* * * * * * * * * *
122369 AGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATATACTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
122434 CAA-AAAACAATTGTTT--TTCAACATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAA
66 -AATAAAAAAATTATTTAGTT---CATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * *
122495 TATTTCAAGAA-T--T-AGTAAGAG-ATTTAAAAATAAATATATTTACCACAA-CAGTTTAAATA
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTA-AATAAGTTCAAATA
* * ** *
122554 GTTATGACTATTTGAATTATTATAATCATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TTTTATCATA
191 GTTATGACTATTT--A--A--ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATA
* * ** * *
122618 AAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATCTAATAATA-TTC
250 AAA-AATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC
* * * ** * * * * *
122681 TAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTAAACCAATTCAAACAGTTAAG
313 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATG
* * * * ** * *
122746 ATTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTT
377 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
**** * * ** * * * * *
122811 CAACTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCA-A-AATT--TTA
442 TTGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAA
* * * ** ** *
122872 -TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTACTTACCAAACT
506 GTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * ** * * *
122907 A--TCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTATAGCATTATTACTTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** * * *
122970 CATAAAACAATTGTTTTTA-TTTAGATAAATTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATA
66 AATAAAA-AAAT-TATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * ** * *
123034 TTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGTGATTTAAAAAGTAAATCAGTTTACCAAACCATTTCAA-ATC
129 TTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAA--A--T-AAGTTC
** * * * * * *
123096 AAATAGATT-TGACTACATGAATAATTATCTATCTCAAAT-AGTTATAACTTTTTGTTTTGTCAT
186 AAATAG-TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCAT
* ** * * * ** *
123159 CAAACAATTGGTTCTGTTCATACTA-TTTAATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATT
249 -AAAAAATTTTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * * * * * ** * *
123222 TCAAAACTTTATAAGCAAGAA-AATTAGAACATAAATCTAATTGC-CAAGCCAGTTCAAATAATT
311 TCAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAATT
* * ** * * * * *
123285 AAGACTATATGAATGATTATCTATTCCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAAAT-
374 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * ** * *
123349 TTTTTGTTTGTACAAGTTTATTTAGAA-TAAAATAATACAAATTTAATAATATTTTA-AAAATTA
439 TTTTTGTTCATAAAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAGACAATTA
* * * * *
123412 ATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTGAACT
502 ATAAGTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * * *
123451 AGTTCATATAATTAAT-ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTAACCTTTTGTTTAG
1 AGTTCAAAT-AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * ** * *
123515 TTATAAAGCAATTGTTTAGTAT-ATACAAGCTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA
65 TAATAAAAAAATTATTTAGT-TCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * ** * *
123579 -TTCAAAAAATTAATGAGAAAAAGATTTAAAAGAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAA
129 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAA-AATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
123643 TTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATTGCA--ATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAAAA
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-T-CATTATGACCTTTTGTTTTATCAT-AAAAA
* * * * ** *
123706 ATTGTTTC-AGTTAACACAAGTTTATAGC-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCTAAA
254 ATTTTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * ** * *
123768 ATTAATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAGTT-AAATGGTTATGGCCAT
317 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTAT
* ** * * *
123832 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTTATAAAACAGTTATTTTT-TA
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT-
* * ** * * * *
123896 TCATACATGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAA
446 TCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTAA
* * * *
123960 GAGATTTAAAAAA-AAA-ATGTTTGTCAAACT
510 -ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* ** ** * ** * *
123990 AGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTTTCTATTTCAAATCTTTCTAACCTTTT-TTTTAG
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTT--
* * * * * *** *
124054 GT-ATAAAATATTTGTTTCA-TATCATACATGCTTATTTCGTATAAAATAAT-CTTAATATATTA
64 GTAATAAAAAAATTATTT-AGT-TCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATAC-TAATTTATTA
* * * **
124116 ACA-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTTGTTTCCTAAATAAACTCAA
126 ATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATT-AAAAAATAAA-TTTGTTTACTAAATAAGTTCAA
* * * * *
124180 ATAGTTATGACTATTTTAACAATTAAT-TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAA
188 ATAGTTATGACTATTTAAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
* * * *
124244 ACAATTGTTTT-TGTTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
252 A-AATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC
* * ** ** * * * * *
124306 AAAAATTAATGAGAAAAAGATTTTAAAAAAATAAAAGTGTTTTTTGAACAAATTTAAATAGTTAC
313 AAAAATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTAT
* * * * * **
124371 AACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
376 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
124436 TTAGTTTAAAAAAAG-TTATTTGAAATAAAACAATAATAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAT
441 TTTG-TTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAAT
* * * * * **
124499 AAGT---GATTTAAAAATTGAATTTATTTACCAAATC-
504 AAGTAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAA-CA
* * * * * * * * * *
124533 AGTTTAAATAATTATGGCTATTTAAACAATTATCTAGTTCAAATCATTAGGAACTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * *
124598 CAA-AAAACTATTGTTT--TTCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
66 -AATAAAAAAATTATTTAGTTCAT-AT--AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * *
124660 TATTT--GAAATT-TTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA--ACA-AAG------TAG
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAG
* * * * * **
124712 -T-T-CCTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTTTAAAATAA
192 TTATGACTATTTAAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AA
* * * * * * *
124773 TTGTTTCAATTCAGACAGGCTT-GTTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAA
255 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * * ** * * * * **
124836 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATATCTGTTT-GTCAAAGTAATTCAAACATTTAAGACTGC
318 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * ** * **
124900 ATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATCATCTCAGTT
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * ** * * *
124965 CATACAAGCTT-TTTGAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAG
447 CATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAGTAAA
* * * * ** *
125028 TGATTTAAAAAGTGAATCTGTCTACCGAATC-
511 T-ATTTAAAAAATAAATATGTTTA-TTAAACA
* * * * * * * * * ** * * *
125059 A-TTCTAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATTACCATTTGTTTGGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** *
125123 CATATAACAA--A---CGATCAT-TCAAGCTTA-TTCGAGTAAAATAATACTAATTTATTAATCA
66 AATAAAAAAATTATTTAGTTCATAT-AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-A
* * *
125181 -TTCAAAAATTAATAAGTAA-ACGATTTAAAATATAAAATTGTTTA-TCAAACT-AGCTT-AAAT
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAA-TAAG-TTCAAAT
* * * * * ** * * *
125241 AATTATGACTATTTGAATAATTGA-ATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCACAAAAC
190 AGTTATGACTATTTAAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-
* * * * * * **
125305 AAGTATTTT-TGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAACACT-AATCTAATAATATTTTGA
253 AA-TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * **
125367 AAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAGTAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAAT-ATTAAAACT
315 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * ** ** ***
125430 ATATGAACAATTATCTTTTTCAAACCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-AATTTCAA
380 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
** * ** * *
125494 TTCATACTAGCTTATTTGGAA-TAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGT
445 TTCATAAAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGT
* ** ** *
125558 AAGAGATTTAAAAAAATATTTATGTTTACCGAACCA
508 AA-ATATTT-AAAAAATAAATATGTTTA-TTAAACA
* * * * **
125594 A-TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * ** *** * *
125658 CATAAAACAAATGT-TTTTGTTCATATAAGTTTGCTCGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATA
66 AATAAAA-AAAT-TATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * *
125722 TTTC-GATAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTAT-TTTTC-AAGTCAA-TTCAAATA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAAT-T-TGTTTACTAAAT-AAGTTCAAATA
* * * * * *** *
125780 GTTATGAGTATTT-GACAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTCAAATTATAAAACA
191 GTTATGACTATTTAAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-A
* * * ** *
125844 ATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCATATTAAAATAACACT-AATTTATTAATATTTTGACA
254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAA
** * * * * * *
125907 ATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGATT-AAATAGTCATGGCT
317 ATTAATAAGTAAAA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAG-TTCAAATAATTATGACT
* * * * * * * ***
125971 ATTTGAATAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTATCATAAAA-TATT-TTTCAA
380 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * ** * * * *
126034 TT-AT-TATGCGTTTATTCGAAATAAAATAATACCAGTTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAC
445 TTCATAAAAGC--TTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAG
* **
126096 TAAGAGATTTAAAAAA-AGAATATGTTTACCAAACA
507 TAA-ATATTTAAAAAATA-AATATGTTTATTAAACA
* * * * * ** *** *
126131 AGTTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTGGAATCGCTATAACCTTTTGTTTTG-
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** *
126195 ACATAAAATAATTTTTTCTA-CTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAAT
66 A-ATAAAA-AAATTATT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * *
126259 A-TT-AAGACAATTAATAAGTAAAAG-ATTTAAAAATCAATCTATTTA-TCGAACAAGTTCAAAT
128 ATTTCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAAGTTCAAAT
* * ** *
126320 -GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACA
190 AGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-A
* * * * ** * * ** *
126384 ATTGTTTCTGTTCATACAAGGTTATTTGC-ATTAAAATAACGTTAA-TTATGAATATTTTGACAA
254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-CTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * * * * *
126447 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCCAACAAGTTGAAATAGTCATGATTATT
318 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * * ***
126512 TGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACTGTTTCAATTC
383 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* ** *
126577 A-AATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTCTA-A-AGATTAAT-GGTAA
448 ATAA-AAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACA-ATTAATAAGTAA
* * * * * * *
126638 GAGAATTAAAAAATGAATCTATTTATTGAACC
510 -ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
*
126670 AGCTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACC-TTT-TTTT
1 AG-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATA-ATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** ** *
126731 ATCATAAAATAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTGATTAA
64 GTAATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAA
* * * * * * *
126795 TATTACAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACGTTCAAATA
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATA
* * * * ** * ** *
126858 GTTATAACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTCGTCATAAACTAA
191 GTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA-AAA
* * ** * *
126923 TTGTTTT-TGTTCATAAAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAATTCCAACAA
255 TT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAA-AA
* * *** * * *
126985 A-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTCGTTTATTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGATTGT
317 ATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * *
127049 TTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTGTAATCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTT
* * * * * * * * * **
127114 TATACAAGTTTATTCGAAATAATATAATACTAATTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAATTTGG
447 CATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAA-GTAA
* * * *
127178 AGATTT-AAAAATAAATATGTTCACTGAACA
510 ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * * * * *
127208 AGTTCAAATAATCAAGTCTATTGGAACT-ATTAGCAATTACAAATCATTATGACATTTTGTTTTA
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
* ** * * ** ** *
127272 TCATAAATCAATTGTTTTCA-TTCATACAAAATTATCCAAAATAAAATAATACTAATTAATTAAT
65 TAATAAAAAAATT-ATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * ** * *
127336 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCAAACCAGTTTAAATGG
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAG
* * * * *
127396 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACC-TTTGTTTTGTCATAAAATAAT
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAT
* * * * ** * * * * *
127460 TGTTTCTGTTCATATAAGTTTATTTGGAGTAAAATATTACTAAA-TTAATAATATTTTAAGAATT
256 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * * ** * * * ***
127524 AATAAGTCAGGGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATAAA
320 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * * * * *
127589 AACAATTAGCTATTTGTTGAACTTATTGGACTATAAGAACGTTTTGGTTAGTCATAAAATAATTG
385 AACAATTATCTA--T-TTCAA---A-TCG--T-TATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * * ** * * * * * * * *
127654 TTTTAATTTATACATGCTTACTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACACTCAAAAAATTAAT
439 TTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAAT
* * * ***
127719 AAG-AAAT-TTTAAAAAATAAGTTTGCTTACCGAACA
504 AAGTAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * *
127754 AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * * *
127819 CATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAATCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAAAT
66 AATAAAAAAATTATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * ** * * * ** *
127884 TTCAAAATTTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATCAGTTTATTGAATCAGTTCACGTAATTA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
127949 T-AGCCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTG
195 TGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATT-
* * * *** *
128013 TTTTC--GTCATACAAGCCTGTTTGGCATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATTCAAAAATTA
257 TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
** ** * * * *
128075 ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAACTGCTTA-TCAA--A---C-CAT--TTCT---TATTTGA
321 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * * ****
128128 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGCTCTATTATAAAATAATTGTTTCAAATCATA
386 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
* * * * * * * * *
128193 TAAGCTTACTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAACAACTAAGAGAT
451 AAAGCTTA-TTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGTAA-ATAT
* * * * * *
128257 TTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCT
514 TTAAAAAATAAATATGTTT-ATTAAACA
* * * * * * * *
128285 A-TTCAAACAATTAAGACTATATAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-C----ATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** * * * * * * *** * * ***
128344 CATAAAACAATTATTTCAGTTGTTTTCTAA-ATAAGTTCAAGTCGTTATGACTATTTAAGCAATT
66 AATAAAAAAATTATTT-AG-T-TCATATAAGCTTATTTAAAAT-AAAAT-AATA-CTAATTTATT
* ** * *** *** * * * *
128408 AATTATTTC-AAACTGTTTTAACTTTTTACTTTGTCATAAAAT-AATTT-TTT-CT-ATTTA-TA
125 AA-TATTTCAAAAAT-TAATAA-GTAAGAGAAT-T-AAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTT
* **** * * * * * **
128467 CAAGT--TTATTTGGATTAAAATAA-TAT-TAATTT-ATTAAT-ATTTTGACAATTAATAAGTAA
185 CAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT-ATTTCA--AATCATTATGAC-CTT--T-TGTTT
* * * ** * * ** * * * * * *
128526 AAGACTTAAAAAATAAATACGTT-TATTGA-ACAAG-TTCAAATAGTCAT-GACT-TTTTGAA-T
243 TA-TCATAAAAAAT---T-TTTTCTATTCATACAAGCTT--ATTTCTAATAAAATAATATAAATT
* * * * * ****** *
128585 AATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACTTTTTTTTTGTAATAAAA-CAA-TTG-TT--T----CA
301 TATTA-ATATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATT-TAA-AAAATAAATTTGTTTACTGAACCA
* * ** * *
128640 GTTCATATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTTAT-TAATATTCCATAAAT--TAATGA
362 GTTCAAATAA--TTA--TGA-CT-ATTTGA-AC-AA-TTATCT-AT-TT-C--AAATCGTTATGA
* ** *** * * * * * *
128702 --GTAAGAGAAT-TAAAAAAAAAATCTATTTACCGAATAAGTTCA-AATAG-TTA--TGACATCT
413 CCTTTTG-TTTTGTCATAAAACAAT-TGTTT------T-TGTTCATAAAAGCTTATTTGA-AT-T
* * * * ** * * **
128760 -TAATAATTATCT-CTTTCA-AAATA-TTATGACCATT--T--GT-TTTGTCATAAAACAATTGG
467 AAAATAA-TAT-TAATTT-ATTAATATTTA-GACAATTAATAAGTAAATAT-TTAAAA-AA-TAA
* * * * ** *
128816 TTTTGTTCATGCAGGCTT
525 ATATGTTTAT-TAAAC-A
* ** * * * * ** ** ******
128834 ATTTCAAATA-AAAT-A--ATTTAAATTTATTA-ATATTCCAAA-AATTAAAAAGTAAAAAATT-
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** **
128892 TAA-AAAATAAATTTATTTTTTGAGCACGTTCAAATAGTTACAAC-TATTTGAACAATTATCTCT
65 TAATAAAA-AAA-TTA---TTT----A-GTTC--ATA--TA-AGCTTATTT-AA-AATAAAATAA
* * * * * * **** * * **
128955 TTC-AATTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAAT-TGT-TTTTATTTATAAAA-AGCTT
113 TACTAATTTATTA--A-------TATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATT
** * * * ** ** * ** **
129016 AT-TCAAAATAAATAA-TACTAAT--TTATGAAAATTCCAA-AATTA-ATAAGT-AAAAGATTTA
168 -TGT-TTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA
** ** * * * * *** * * *
129074 AAAAATAAATATGTTTATTGAGCGAGTTTAAATAGTTAGGAT-TATTTAAACAA--TTATTTAT-
230 TGACCT---TTTG-TT-TT-ATC-A---TAAAAAATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTA
* * * * * * * **** * * * *
129135 TTCAAATCAT-TATGATCTT-TT-GTTTTGTCATAAAA-TAAT-TGT-TTCTATTCATACAAGTT
284 ATAAAATAATATA-AAT-TTATTAATATT-TCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTA-AAAAATA
* * * * * * * * * *
129194 TA-TTGATATT-CT-AA-AAATT--AATAAATT-GGA-GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAA
344 AATTTG-T-TTACTGAACCAGTTCAAAT-AATTATGACTATTTGAACAAT-TATCTATTT--CAA
* * * * *
129251 ATAAGTTCAAATAGTCATGCCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCGTCCCATGGACATTTTG
403 AT-CGTT---AT-G--A---CCTTTTG---TTTTGTC-A--T--AA-------A---ACA-ATTG
* ** ** * * * * *
129316 GTTTTG-TCATAAAA-CAATT-TTT-TTTTATCATACA-A--AAATTATTCAA-AATAAAATAAT
439 TTTTTGTTCATAAAAGC--TTATTTGAATTAAAATA-ATATTAATTTATT-AATATTTAGACAAT
* * ** *
129373 ACTAATTTATTAAATATTTCAAAAAACTAATAAGACATTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAACT
500 --TAA-TAAGTAAATATTT----A-----A-AA-A-A-T--AAA-T--A--TGTTTATTAAACA
* * * * * * * * *
129437 AGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAACTATCCATATCAAATCATTATGA--TATTTATTTTG
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCT-TTTGTTTTG
* * * * * * * * * * ** *
129500 TCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAGAGTAAAATATTGCTAAACTAATAATA
65 TAATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* *** * * ** *
129565 -TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGCATTTGCCAAACCAGTTAAAATAGT
129 TTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGT
* ** * * *
129629 GAAAACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTG-TTTAGTCATAAAATAA
193 TATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAA-AA
* * * * * * * *
129692 TTGTATCAATTTATACATGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACT-ATTTTATTAACATTT-AGAAA
255 TTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCA-AAA
* * * * * * *
129754 ATTAAT-A-TACAAGAAATTTTAAAAAATAAGTATATTTA-TCGAACAAATTCAAATAGTTATGA
317 ATTAATAAGTA-AA-AGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAATTATGA
* * * ** * *
129816 CTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACATTTT-TTTTACCATAAAACAACT-TTTC
378 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT
** *** * * * * * * *
129879 AATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTATTACTTTATTAATGTTTCA-AAAATTGAGAAG
443 TGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAG
** * *
129943 TTGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAATCA
507 -TAAATATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATTAAA-CA
* * * * ** * *
129979 A-TTCAAATAATTATGA-TCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGAACTTTT-TTTTT
1 AGTTCAAATAGTCATGACT-ATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * *
130041 TCATAAAACAATTGTTT--TTCATCATGCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAA
65 TAATAAAAAAATTATTTAGTTCAT-AT--AAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * *
130104 TATTTCAAAAATTAATAAG-CAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACT-AGTTCAAAT
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-AGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-TAAGTTCAAAT
* * * * * * * * *
130167 AGTCATAACTATTTGAATAATTATATATTTGAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACA
190 AGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-A
* * * * *** * * *
130232 ATTATTTATCTTCATACAAACTTATTAGAAATAAAATAGTACT-AATCTAATT-ATATTAT-GAA
254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAAT-TTATTAATATT-TCAAA
* * * * * * *
130294 AATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAATT-AAATAGTTAAGA-TG
316 AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT-
* * * * * * *
130357 ATATGGATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTG
380 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
* * * * * *
130422 TTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAGTATTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG--
445 TTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTA
* * * * *** *
130484 -AGATTTAATAAATAAATCTATTTACCCAACT
509 AATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * ** * *
130515 AGTT-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAACATTTGTTTTG
1 AGTTCAAAT-AGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
* * ** *
130579 -----------TCA-TTA----A-ATAA-CTTATTCGAAAA-AGCATAATTCTAATTTATTAATA
65 TAATAAAAAAATTATTTAGTTCATATAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
130625 TTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAATTGAATATGTTTA-TCAAACAAGTTTAAATAGT
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGT
* * * ** * * *
130685 TATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATT
193 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AA-T
* * *
130750 TTTTTCTATTCATACAAGTTTATTTC-AATTAAAATAATATAAATTTATTAACATTT-AGACAAT
256 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAA-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCA-AAAAT
* * * * * * ** * * *
130813 TAGTAAGTAAAAGATATAAAGAATAACTCTGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGATTATTT
319 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * * * * *
130878 GAGCAATTATTTATTTTAAAACATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTC
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
** * * * *
130943 ATGCAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAGTATTTTGACAATTAGTAAGTAAAAG
448 ATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGT-AAAT
* *
131008 ATTTTAAAAATAAATATGTTTACTAAACA
512 ATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * ** * * ** **
131037 TGTTTAAATAGTCAAAACTATTAGAATAATTATCTATTACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCAT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * *
131102 CATAAAACAATTATATTAGTTCTTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 AATAAAAAAATTAT-TTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * *** * *
131167 TTTGAAAATTAATGAGTAAGAGACTTAAAAAATGAATCAATTTACTGAATAAGTTCAAATACTTA
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
131232 TGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATGATGACATTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGT
195 TGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATT-T
** * * * * *
131297 TTT-TATTTGTACAATCTTATTCCAAATAGAATAATATATATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
258 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * ** * * *
131361 AAGTAAAA-ATTTAAAATATATATTTATTTTCTGAGCATAAAAATTTTAAAAATACATT-T-ATT
323 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT--G---AACCA-GTT-CAAATA-ATTATGACT
* * * **
131423 TTCTGTGCACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATAGTTATGACCT
380 AT-T-TG-A-A--C--A-A-TTAT--CTATTT---CAA--ATCGT-TATGACCT--TT-TG---T
** * * * * * * **
131487 TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAATG-TT-TTTAAACT-AAATAACACCA
421 TTTG--TCATAAAA---CAATTGTTTTTGTTCATA-AAA-GCTTATTTGAATTAAAATAATATTA
* * * * * * * * * **
131549 GTTTATTAATATTCCA-AAAATTGATAAGTAAAAAATCTAAAAAGTAAATCTATTTATCGAACA
479 ATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAGT-AAATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * * * * * * *
131612 AGTTTAAATAGTTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAACAGTTCTAATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
** * * * * * *
131677 TGTAAAACAATTATTTCTA-TTTATACCAA-TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
66 AATAAAAAAATTA-TT-TAGTTCATA-TAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * * *
131740 ATTTTAAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAG
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAAT-AAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
131805 TCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAT
* * ** ** ** ** *
131870 TGTTTT-TGTTCATGCAATATTATTTAGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAGTT
256 T-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * * *
131934 AATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAAACAGTTTAAATAGTTATGACTATTTG
320 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * * *
131995 AACAATAATTTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTT-TTCA
385 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCA
* * * * * *
132058 TACAAGCTTATTTGGATTAAAATCATACTAATTTA--AATATATTCCA-AAAATTTATAAG---A
449 TAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATAT-TT--AGACAATTAATAAGTAAA
* * * * *
132117 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAACCA
511 TATTTAAAAAATAAATATGTTTAT-TAAACA
* * * * * * ** * * *
132148 A-TTCAAATAGTAAAGACTATTAGAACAATTATCTCTTTGAAATTGCTT-TGATCGTTTGTTTAA
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TAATTATGACCTTTTGTTT-T
* * ** * * ** * *
132211 CT-ATATATTAATTGTTTCA-TTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAC
64 GTAATAAAAAAATTATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * ** *
132274 ATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAG-ATCTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATA
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAAT-T-AAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATA
* * * **
132338 GTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGCCATAAAACAA
191 GTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AA
* * **** * * * *
132403 TTGTTTT-AATTCATAAAAGCTTATCAAAAATAAAATAATGCT-ACTTTATTATTATTTCAAAAG
255 TT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * * ** *
132466 TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGTTTATTAAATTAGTTCAAATAATTATGACCATT
318 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATT
* * * * *
132531 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTTTCATT
383 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-GTT
* * * *** ** * *
132596 -AGACAAGCCTATCCAAAAGAAAATAATACTT-ATTTAATAATATTTCAAAC-ATTAATAAGTAG
447 CATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAAGTA-
* * ** ** * *
132658 GAGATTTAAAAAATAAATATACTTACCATACC
509 AATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * *
132690 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTG---AA-TAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
132755 TTATGATAAAACAATTATTT-GTCTTGATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATCTACT
62 TTGTAATAAAAAAATTATTTAG--TTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * *
132819 AATATTAT-GAAAATTAA-AATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCCAACAT-AG-T-
125 AATATT-TCAAAAATTAATAA-GTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTT-ACTAA-ATAAGTTC
* * * * * *
132879 -AA-AGGT-T-A-TA--TGAATAATTATCTATTTCAAAAT-GTTATGACCTTCTGTTTTGTCATA
186 AAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCAT-
* * * *
132936 AAACAAATGTTTT-TGTTCATATAAG-TT-TGTTCTAAATAAAAT-A-AT--A-TTAAT-ATATT
249 AAA-AAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTAT-TTCT-AATAAAATAATATAAATTTATTAATATT
* * * **
132992 TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAATAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTC-----A--AT
311 TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTAT
* * * *
133046 ---TA---G--------T-TATTTCAAGTCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTGCT
376 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * **
133096 TCTATTAATACAATCTTATTTGGAA-CAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTA-A-AACTTAA
441 TTTGTTCATAAAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAA-TTAA
* * ** * * *** * *
133158 TAAGTAAAGGAATTAAAAAAGGAATCTATTGGCCT-GACC
503 TAAGTAAA-TATTTAAAAAATAAATATGTT-TATTAAACA
* * * * * * * **
133197 AGTACAAATAATGATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCATTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** * *** * *
133262 CACAAAACAATTGTTTCTA-TTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATA
66 AATAAAAAAATT-ATT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * *
133326 TTCCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTT
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTT
* *** * * *
133391 ATGACTATTTAAACAATTACCTATTTCAAATTGCTATAAGCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTT
194 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTT
* * *
133456 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAAGTTATTAATATTT-AGACAACTT
258 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAA-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCA-A-AAATT
* ** *
133519 AA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAATTATGACTATTTG
320 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* *
133583 AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
385 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* * * * * *
133647 TACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAAAAGA
449 TAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGT-AAATA
* *
133712 TTTTAAAAATAAATATGTTTA-TAGAATA
513 TTTAAAAAATAAATATGTTTATTA-AACA
*
133740 AGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCTCATAACTATTTGAATAATT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATC----T---AT-T--T--C-A----AATAATT
* * ** * * * *
133805 ATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCATAAAAAAATTGTATTAGTTCATATAGGCT
49 AT-GA---C--CTT-TT--G---TTTTGTAAT--AAAA---AAATTAT-TTAGTTCATATAAGCT
** * * *
133870 TATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAT
96 TATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAA
* * * * * * * *
133935 ATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATCTATTTCAAATT
161 ATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
134000 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGTTCATACATGCTTATTTCAAACAAAA
226 ATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAA
* * * * ** * *
134065 TAATATAAATTTATTGATATTCCAAGAATTAACAAGTAAAA-ATTTTTAAAATAAATTAGTTTTC
290 TAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAC
* * * * * * *
134129 TGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTG
355 TGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * * *
134194 TTTTTTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATA-TT-AA--AAAA-AATACTAATTTAT
420 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTAT
* * * * * * ** *
134254 TAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAAAATTTTTAAAAATATATTTGTTTATCGAGCA
485 TAATATT-TAGACAATTAATAAGTAAATA-TTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * * *
134311 AGTTCATATCGTTATTACTATTTGAATAATTATTTCTTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
134376 CATAAAACAATTATTTCTA-TTCAAACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTA
66 AATAAAAAAATTA-TT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * ** * * *
134440 -TTC-TAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTC
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * *
134503 AT-ATCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACTTTTTATTATGTCATAAAACAATT
194 ATGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATT
* * * * ** * **
134567 GTTTT-TGTTCATGCTAA-ATTA-TTCATAATAAAATAATGTTGATCTATTAATATTTTGAAAAT
257 -TTTTCTATTCATAC-AAGCTTATTTC-TAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * *
134629 TAATAAG----AGATTTAGAAACTAAATTTATTTACCAAAACAATTCAAATAGTTATGACTATTT
319 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * * *
134690 GAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTTC
384 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGTTC
* * * ** * * * *
134754 ATACAAGCTTGTTCGGCTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCA-AGAATTAGTAAGTAAGA
448 ATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAGTAA-A
* * * * *
134818 GATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACC
511 TATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * ** * * * * *
134848 ATTTCAAGTAGTTAAAACTATTAGAAGT-ATTATCTATTTCAAATCACTCTGACCTTTTCTTTTG
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * ** * *
134912 TTATAAAACAAACGTT-TTT-GTCCATATAAGTTTGTTTGGAACAAAATAATATTAATTTATTAA
65 TAATAAAA-AAA--TTATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* ** * ** * * * ** *
134975 TGTTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAG-ATT--TAGGTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAATTAG
127 TATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAG
* * * * * ** * * *
135033 TTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGACCATTTATTTTATAATAAAACAAT
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAT
* * * * * **
135098 TATTTT-TATTAATACAATCTTA-TTCGCAATAAAGTAATGCT-AATTCGTTAATA-TTCTAAAA
256 T-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * * * *
135159 TTTAATAAGTAAAAAGTTTTAAAAAAT-AATCT-ATCAGCTTG-ACCAGTACAAATAGTTATAAC
317 ATTAATAAGT-AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-C-TGAACCAGTTCAAATAATTATGAC
* ** * * * *
135221 TGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTATTTTGTCACAAAACAACTCTTTTT
379 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * ** ** * * * * *
135286 ATTCATACAAGCTGCTTCCAAATAACATAAT-TCTGATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAG
444 GTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATAT-TAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAG
* * * * *
135349 TAACAAATTTAAAAACTGAATCTGTTTATCAAACA
507 TAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * *** * *
135384 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
135449 CATAAAATAAAATT-TTCTA-TCCATACAAGCTTATTTTAATTAAAATAATACAAATTTATTAAT
66 AAT-AAA-AAAATTATT-TAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * *
135512 ATTT-AGACAACTAATAAGTAAAAG-ATTAAAAAA-AAA-CTGTTTACCAAATAAGTGCAAATAG
128 ATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
135573 TTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCGTAATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAT
* * * * ** **
135638 TGTTTTGT-TT-ATATAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATCAT
256 T-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAA-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* ** * * * * *
135700 TAATAAGTAACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTT
319 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTT
* * *
135765 GAATAATTATCTATTTCAAATCTCATAACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACC
384 GAACAATTATCTATTTC-AA----AT--C-----G-----TTA-TGA---C----C-TTTTG---
* * * * * * *
135830 TTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAA
420 TTTTG-----TCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAA
* * * * * * ***
135895 TTTATTAATATTTCA-AAAATTAATGAA-TAAGAGATTTAAAATATGAATTTATTTATGGGACA
480 TTTATTAATATTT-AGACAATTAAT-AAGTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * *
135957 AGTTCAAATGGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * * *
136022 CATAAAATAATTTTTTTATGATCATACATGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTACT
66 AATAAAA-AAATTATTTA-GTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
* * * * * * * *
136086 ATTCCAAAAATTAATAAGTAA-A-AATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACGTTCAAATAG
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAGTTCAAATAG
* * * ** * *
136149 TTATGACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAAT-AGTTAAAACCTTTTGCTTTGTCATAAACCAA
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA--AA
* ** * * *
136213 A-TGTTTCTATTCATACAAGGGTA-TTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAAA
254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * * ** *
136276 TTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAACATAAATTTGTTTAC-CAAGCAAGTTTATATCGTTATGACTG
318 TTAATAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAATTATGACTA
* ** * ** * * *
136339 TTTGAACAATTATTTATTTCAAAAAGTTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTCT
381 TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
* * ** * * * ** *
136404 TTATAAAAGTTTAGTCAGAA-TAAAATAATACTATTTTATTAATATTCT-GAAAATTAATTGGCA
446 TCATAAAAGCTTA-TTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TAGACAATTAATAAGTA
* * * ** *
136467 GGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATA
509 -AATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * *
136500 AGTTCAAATAATCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTTT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** ** * * * *
136564 CATAAAACAATTATCTTTA-TTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATCAATA
66 AATAAAAAAATTA--TTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * *
136628 TTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTT-TTTAGCAAAAT-AGTTCAAATA
129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAA-ATAAAT-TTGTTTA-CTAAATAAGTTCAAATA
* * * * * * * *
136686 GTTAGGACTATTTGAACTATTA-CTTATCTCCAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACA
191 GTTATGACTATTTAAACAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-A
* * * * * * * * * *
136749 AATATTTATTTTCACACAAGCTTA-TTCGGATTAAAATAATACT-AATTCAATAATATTCCAAAA
254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * ** * * *
136812 CTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATACATGTGTTTGCCAAACCAATTC-AATAGTTAAGACT
317 ATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * * *
136876 -TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTA
380 ATTT-GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* * * ** * * * * * * *
136940 CTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGTA
444 GTTCATAAAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGTA
* * * **
137005 AGTGATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACA
509 AAT-A-TTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * ** *
137039 AGTTCAAATAGAT-TTGACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTT
1 AGTTCAAATAG-TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TAATTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * * ** * * * *
137102 ATCATAAAACAATCATTTCAGTTCAAAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACCACTTTTTTTAT
64 GTAATAAAAAAATTATTT-AGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * ** * * * * * *
137167 ATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAACCTAAAGTTCTTTTC-CAATCTAGTTAAAATAG
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAT-AAGTTCAAATAG
* * * * * * *
137231 TTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTAATAAAACAAT
192 TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AAT
* * * * *
137295 TGTTTCTAGTCATATAAGTTTATTTCGT-A-AAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCAAAAAT
256 TTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * * *
137357 T-AT---TAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTT-TTTGCCAAACCAGTTCAAAGAGTTAAGACTAT
319 TAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAAT-TTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * * * **
137417 TAGAAAAATTATCTATTTTAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTATTTCAGT
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
* * * * * * *
137481 TCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTGTTAACATTT-GAAAAAGTAATAAGCA
446 TCATAAAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAG-ACAATTAATAAGTA
* * * *
137544 AGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
509 A-ATATTT-AAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * ***
137578 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATATTTATGAAAATTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * ** *
137643 CATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAAAATCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAT
66 AATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * ** * * *
137707 TTCAAAAGTTAATAAATAA-AAAATTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCAAATCATTTCAAATAAT
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA-TTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
137770 AATGGCCATTT-AACAACTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATT
193 TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATT
* * ** *
137834 ATTTTCCA-ACATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAGAATT
257 -TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
137897 AATAAG----AGATTGAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
320 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * * * * * *
137958 AACAATTATCTATTTTAAA----TA--ACCTTTTATTCTATCATAAAACAAATGTTTCTATTCGT
385 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * * * * * * *
138017 ACAAGCTTATTCAT-AA-TAAAA-AAAACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAG
450 AAAAGCTTATT--TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGTAA-AT
** *
138079 ATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTGCTGAAC-
512 ATTTAAAAAATAAATAT-GTTTATTAAACA
* * * * * * * * * **
138107 CGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAGTTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *** * *
138172 CATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAA-AGCTAACTT-TTAATA
66 AATAAAAAAATTA-TTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATA
* * * ** * **
138235 TTTCAAAAATTTATACA-TAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTACTTA-TCGAACCA-TTCAAATA
129 TTTCAAAAATTAATA-AGTAAGAGAATTAAAAAATAAATT-TGTTTACT-AAATAAGTTCAAATA
* * * * * *
138296 ATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAA
191 GTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTATCAT-AAAAA
* * * ** * *
138359 ATTGTTTT-TGTTAATATAAG-TTCGTTCGAAAGAAAATAATACT-AATTTATTAATATTT-AGA
254 ATT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCA-A
* * * * * * * *
138420 AAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACT
315 AAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACT
* * * * * * * * * *
138485 ATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTG
380 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTG
** ** * * * * * * **
138550 TTCATACTATTTTATTCAGCA-TAAAATAAGACTAATTTAATAATATTTTGA-AACTTAATAACC
445 TTCATAAAAGCTTATT-TGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAA-TTAATAAGT
* * * ** * *
138613 AAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGTTGAACCA
508 AA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATT-AAACA
* * ** * *
138648 A-TTCAAATAGTTCA-GACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTT-TTTTT
1 AGTTCAAATAG-TCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTG
** * * * ** * * * * *
138710 TTGTAAAACAATTGTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCT-GATTAAAATAATAATAATTTAATAAT
65 TAATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATT-TAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * *
138774 ATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAA-TTCAAATGG
128 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAAGTTCAAATAG
* * * * *
138833 CTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTG-TTTAGTTATAAAACA
192 TTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTA-TCATAAAA-A
* * * * * **
138896 ATTGTTTCAATTCATACAACCTTA-TTCAAAATAAATTAATACT-AATTTATTAA-CGTTCGAAA
254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTC-AAA
* ** ** ** * *
138958 AGTTAATAACAAAAAGAGATTT--AAAA-AAA--TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATTAC
316 AATTAATAA-GTAAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGAC
** * * * * * * *
139018 TATTCAAACAATTGTCAATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTTA
379 TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT
* ** * ** *
139083 GTT-AGTACAAGCTTA-GAGAGAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAA
444 GTTCA-TAAAAGCTTATTTGA-ATTAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTTAGACAATTAATAA
* * * * ** **
139145 ATAAGAAATTTAAAAGATAAATTTGTTTACGAAATT
506 GTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * * ** ** *
139181 AGTTGAAATAATTATGGCTATTTAAATGATTATCTATTTGAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTAT
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
139246 CATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
66 AATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * * *
139311 TTTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTGTTTACCAAACT-AGCTCAAATAGTT
130 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-TAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * * * * * *
139375 ATGACTGTTTGCATAATT-TTTAATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTTAAAAAACAATT
194 ATGACTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-AATT
* * * * * *
139438 GTTTCTGA-TCATAGAAGCTTATTT-GATTAAAAATAATACT-AATTTAATAATATTTCATAAAT
257 TTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTCTAAT-AAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * * **
139500 TAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTT-GTGGAACCAAG-TCAAATAGTTAAAACTAT
319 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACC-AGTTCAAATAATTATGACTAT
* * * * * ** * * * *
139563 TAGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTCTAATATTTTGTTTAGTCAT--AA-GATTTTTATTTCA
382 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TTT-G
* ** * * ** *
139625 TATCTTGCAAGCTTATTAGGAA-TAAAATAAT-TCAAATTTATTAGCATTT-GAAAAATTAATAA
445 T-TCATAAAAGCTTATT-TGAATTAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTAG-ACAATTAATAA
* * * * ***
139687 GCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACA
506 G-TAAATATTT-AAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * * * * ** *
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1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATAATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * ** * *
139788 ACATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAAAGGTTATCCAAAATGAAATAATA-TAAATTTCTTAAT
66 A-ATAAAAAAATT-ATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAAT
** * * * * ** *
139852 ATTTTGAAAATTAATAAGCAATAG-TTTAAAAAAATAAAATCATTTACCGAACA-AAG-TCAAAT
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* * * ** * * *
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190 AGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAA-A
* * ** *
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254 ATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAA
* * * * *
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318 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-ACTGAACCAGTTCAAATAATTA-TGACTA
* * * * *
140102 -TTGTAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAAATT-TTTTT
381 TTTG-AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTT
* * * * *
140165 -TATCATACAAGCTTATTTGGAA-TAAAATAATACTAATTTAGTAATCTTTCA-AAAATTAATAA
444 GT-TCATAAAAGCTTATTT-GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT-AGACAATTAATAA
* * * ** *
140227 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACC
506 GTAA-ATATTTAAAAAATAAATATGTTTATTAAACA
* * * ** * *
140263 AGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAAGAATGGTATACTTAAAAT-AAATTATTTACAAAATAAAC
1 AGTTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAT--TAT-C-T-ATTTCAAA-TAATT-----AT-GAC
* * * * * * **
140327 CTTTGGTTTTGTTATAAAATAATTATTTATGTTTATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTA
54 CTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTATTTA-GTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTA
* * * * * * * *
140392 ATCTAATAATATTCCAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTT-GTCAAACT-
118 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAA-TA
* * * ** * * * * ** * *
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181 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTA
* ** * *
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245 TCATAAAA-AATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-TAATAAAATAATATAAATTTATTAAT
* * * * * *
140583 ATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCT-AACTAGTTCTAATA
308 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTGAACCAGTTCAAATA
* * * *
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*
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AATAAAAAAATTATTTAGTTCATATAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
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CTATTCATACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAAT
TATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGC
TTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTAGACAATTAATAAGTAAATATTTAAAAA
ATAAATATGTTTATTAAACA
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116776 TGGCCATTTA
* *
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* * * * *
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* * * *
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*
117018 T-ATAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGA
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*
117081 TATTTAAAAAATAAAT
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AAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAATTCCTATTTTG
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1 AATTT
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120116 TTTTTTAATT
* * * * * * *
120126 AAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT-GGATTAAAATAATATTAATTTATTAATACTTT
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* * * * * * *
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* * * * * * ** ** **
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* * *
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* * * * *
120381 GAGTAAAAGATTTACAAAATGAATCTATTTACTAAACAA-CTTCAAATAGTTATTACTATTTCAA
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* * *
120445 CAATTATCTATTTCAAATTGTTTTGACCATTTGTTTTGCCATA
320 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * *
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* * *
120551 CAAAAATTAATAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAATCGATTTTCTGAGCACA-TTCAAATAGTTAT
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* *
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* *
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194 TCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * ** *
120743 GTAAAAGATCTAAACAATAAATCTATCTACGGAGCAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
259 GTAAAAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * * *
120808 TTATTTATTTCAAATGGTTATGATCATTTGTTTTGTCACA
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** *
120848 AAACAATTGTTTCTATTAATACTCGTTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTTATTAATATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
* * * * * * * *
120912 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATCTAAAATATAAATCTATCTACGGAGTAAGCTCAAATAGTTATG
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * ** *
120977 ACTATTTCAATAATTTTTTATTTTAAATAGTTATGATATTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTT
130 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
121042 CTATTAATACTAGTTTA-TTCATAATAAAATAACACTAATTTATTAATA-ATCTAAAAATTAA-A
195 CTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATA
*** * * * * ** * *
121104 AGGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAAT
258 A-GTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * *
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321 AATTATCTAT-TTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* ** ** *
121211 AAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTA
* * * * *
121275 GAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTG-TTTACCAAATCAA-TTCAAATAGTTAT
66 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-GATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * ** *
121334 GACTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTGTTATC-TTTATTTTGTCATGGAACAGTTGTT
129 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *
121398 TCTTTTCATATAAGCTTATTCG-GAT----TAATA-TAA--TACT-A-ATTT----AA-TAAT-A
194 TCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * **
121447 --AAAA-A--T--AAAT--GTGC--TTTGCCAATCCAA-TTCAAATATTTAAGACTATTTGAACA
259 GTAAAAGATTTAAAAATAAAT-CTATTTACCAA-ACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
* * *
121500 ATTATCTATTTCAAATCATTCTGA-CATTTTGTTTAGTCATA
322 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
121541 AAACAATTATTT-TAGTTTATGCAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATGCT-AATTTATTAACATT
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* * * * *
121603 CAAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAATATG-TTTATCA-AACAAGTTCAAATAGA
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* * * * *
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* * * * * * *
121731 GTTT-TAGTTCATAAAAACTTATCTAAAATAAAATAATACCACTTCATTAATATTTCAAAAATTA
191 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * *
121795 TTAAG--CAAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTTCGAACCAA--TGCAAATAGTTATGACCATTT
255 ATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTA-TTTACCAAACAAGCT-CAAATAGTTATAACTATTT
* * ** * * * *
121856 GAACAAATATCAAACTCAAATTGCTATGATC-TTTGTTTTGTAATA
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* * * * *
121901 AAAAAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTA-TTCAG-ATAAAAATAATACT-AATATGA-TAATAT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAAT-AAAATAATA-TAAAT-TTATTAATAT
* * * * *
121962 TTCAAACATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-GTGTTTGTC-GAATCAA-TTCAAATGG
63 TTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCG-ATTT-TCAG-AGCAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * *
122024 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTAGTAAAAAAAAAA
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** *
122088 TTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAA
189 TTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAA
* * * * * * *
122151 TTAATAAGCAAGAGATTTTAAAA-AAATATGTTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATTATTATTT
252 TTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * *
122215 GAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGGTTTGTCATA
317 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
122261 AAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA--TCAAAAATAAAATAATACT-ACTTTATTAATATT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTC-AGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * * * *
122323 TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTACTGAATC-AGTTTAAATAATT
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* * * * * * * *
122382 ATGGCCATTTGAATAATTATATACTTCAAATCA-TTATTACCTTTTGTTTTATCAAAAAACAATT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
122446 GTTTTTCA-ACATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAGAA-T-
191 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * *
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255 ATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGA
* * * * *
122569 ATTATTATAATCATCTATTTCAAATTGTTATAACC-TTTTTTTTATCATA
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* * * *
122618 AAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-
* * * * * * * * *
122681 T-AAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTAAACCAA-TTCAAACAGTTA
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTTA
* * * * ** * *
122744 AGATTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA
128 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * ** * *
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192 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
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257 AAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * * ** *
122932 AATTATCTATTTTATAGCATTATTACTTTTTATTTTGTCATA
321 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * *
122974 AAACAATTGTTTTTATTTAGATA-AA-TTTTTTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTGTTAATAT
1 AAACAATTGTTTCTA-TTA-ATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
* ** * * * * **
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** * * * * *
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121 ATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
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185 ACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA
* * * * * * * * * * *
123226 AACTTTATAAGCAAGAA-AATTAGAACATAAATCTAATTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTA-AGA
249 AAATTAATAAGTAA-AAGATTTA-AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATA-A
* ** * * *
123289 CTATATGAATGATTATCTATTCCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCATA
311 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* ** * *
123341 AAACAAATT-TTT-TGTTTGTACAAGTTTATTT-AGAATAAAATAATACAAATTTAATAATATTT
1 AAAC-AATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
* * * * * * * * *
123403 TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTG-TTTACTGAACTAGTTCATATAATTAA
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTT-A
* * * * * * *
123466 T-ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTTTAACCTTTTGTTTAGTTATAAAGCAATTG
128 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * *
123529 TTTAGTA-T-ATACAAGCTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTA
192 TTT-CTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* * * * * * *
123591 ATGAGAAAAAGATTTAAAAGAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATTATTATTTG
255 ATAAGTAAAAGATTT-AAA-AATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * ** * *
123656 AATAATTGTCTATTTAAAATTGCAATGACCTTTTGTTTTTTCATA
318 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* *
123701 AAAAAATTGTTTC-AGTTAACACAAGTTTA--T-AGCAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
1 AAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGTTTATTTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
** * * ** * * * *
123761 TTCTAAAATTAATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATC-AGTT-AAATGGTT
63 TTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTTTCAG-AGCAAGTTCAAATAGTT
* * ** * *
123824 ATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGATATTTTGTTTTGTTATAAAACAGTT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** *
123888 ATTT-TTTATCATACATGCTTATTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
191 GTTTCTAT-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* ** * ** * * * **
123952 ATAAGTAAGAGATTTAAAAA-AAAAATGTTTGTCAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAA
255 ATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * * * * *
124016 TAATTTTCTATTTCAAATCTTTCTAACC-TTTTTTTTAGGT-ATA
320 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTT--GTCATA
* * * * * * * * * * *
124059 AAATATTTGTTTC-ATATCATACATGCTTATTTC-GTATAAAATAATCTTAATATATTAACATTC
1 AAACAATTGTTTCTAT-TAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
* * * ** **
124122 AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAATAAATTTTG-TTTCCTA-AATAAACTCAAATAGT
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAA--TCGATTTTC-AGAGCAAGTTCAAATAGT
* * * *
124185 TATGACTATTTTAACAATTAAT-TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT
126 TATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * ***
124249 TGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
190 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * ** * **** ** * *
124314 ATGAGAAAAAGATTTTAAAAAAATAAAAGTGTTTTTTGAACAAATTTAAATAGTTACAACTATTT
255 ATAAGTAAAAGA-TTT--AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * ***
124379 GAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGATGTTTTGTTTTGTCATA
317 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * *
124425 AAACAATTGTTT-TAGTTTAAAAAAAG-TTATTTGA-AATAAAACAATA-ATAATTTATTAATAT
1 AAACAATTGTTTCTA--TTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATA-AATTTATTAATAT
* * * ** * * * * *
124486 TTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAATTGAATTTATTTACCAAATC-AGTTTAAATAATT
63 TTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
124546 ATGGCTATTTAAACAATTATCTAGTTCAAATCA-TTAGGAACTTTTGTTTTGTCAAAAAACTATT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
124610 GTTTTTCA-TCATACAAGCCTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--GAAATT
191 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * *
124671 -TTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT----AAC-A----AAGTAG-T-T-CCTATTTG
254 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * * * **
124722 AATAATTA-CTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATTTTA
318 AACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
124767 AAATAATTGTTTCAATTCAGACAGGCTT-GTTCAAAATAAAATAATACT-AATTTAATAATATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
* * * * * * * *
124830 CAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATATCTG-TTTGTCAAAGTAA-TTCAAACATTTA
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-GATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTTA
* *** * * * * * **
124893 AGACTGCATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAATCAT
128 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* ** *
124958 CTC-AGTTCATACAAGCTT-TTTGAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
193 TTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
** * * * * * * * ** * *
125021 AAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTCTACCGAATC-A-TTCTAATAATTATGGCCATTTCAA
257 AAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACC-AAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * * * *
125084 CAATTATTTATTTAAAATTGTTATTACCATTTGTTTGGTCATA
320 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* ** * * *
125127 TAACAAACG-ATC-A-T--T-CAAGCTTA-TTC-GAGTAAAATAATACT-AATTTATTAATCA-T
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-ATT
* * * * * * *
125182 TCAAAAATTAATAAGTAAACGATTTAAAATATAAAATTG-TTTATCA-AACTAGCTT-AAATAAT
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAATCGATTT-TCAGAGCAAG-TTCAAATAGT
* * * * * * * * *
125244 TATGACTATTTGAATAATTGA-ATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTATCACAAAACAAG
126 TATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * * **
125308 TATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAACACTAATCTAATAATATTTTGAAAATT
190 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * * * * * *
125372 AATAACTAAGAGAATTAAAAGTAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATA-TTAAAACTATATGA
254 AATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGA
* * * *
125436 ACAATTATCTTTTTCAAACCATTATGA-TATTTTGTTTTGTCATA
319 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATA
** * * * * * * *
125480 AAACAA-AATTTCAATTCATACTAGCTTATTT-GGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT-
* * ** * * * *
125543 AAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-ATATTTATGTTTACCGAACCAA-TTTAAATAATT
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGAT-TTT-CAG-AGCAAGTTCAAATAGTT
* *
125606 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATG
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * ** * * * * * * *
125671 TTTTTGTTCATATAAGTTTGCTCGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCGATAGTTAAT
192 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
** * * * *
125736 AAG----AGATTTAAAAACTAAATCTATTTTTCAAGTCAA-TTCAAATAGTTATGAGTATTTG-A
257 AAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAA-ACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* ** **** *
125795 CAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTCAAATTATA
320 C-AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
125839 AAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA-TTCATATTAAAATAACACT-AATTTATTAATATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
** * ** * * *
125902 TGACAATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAAATAAAT--ATGTTTACCGAACTAGATT-AAATAGT
65 AAAAAATTAATAAGTAAAA-GATTTAAAAAATAAATCGAT-TTT-CAGAGCAAG-TTCAAATAGT
* * * * * * * * *
125964 CATGGCTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTATCATAAAA-TATT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * *
126028 -TTTCAATT-AT-TATGCGTTTATTCGAAATAAAATAATACCAGTTTATTAATATTCCAAAAATT
191 GTTTCTATTCATACAAGC--TTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * * *
126090 AATAACTAAGAGATTTAAAAAAAGAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTG
254 AATAAGTAAAAGATTTAAAAATA-AATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
** * * * *
126155 AACAATTATCTATTTGGAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGACATA
318 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
126200 AAATAATTTTTTCTACTCATACAAGCTTATTT-TGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTA
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTA
* * * *
126263 AGACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATCAATCTATTTATC-GAACAAGTTCAAAT-GTTAT
66 A-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
* * * *
126325 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
129 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * *** * ** *
126390 TCTGTTCATACAAGGTTATTTGCATTAAAATAACGTTAA-TTATGAATATTTTGACAATTAATAA
194 TCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * * *
126454 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCCAACAAGTTGAAATAGTCATGATTATTTGAATAA
259 GTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * * *
126519 TTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATA
323 TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
126559 AAACAACTGTTTCAATTCAA-ATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATGCT-AATTTATTAATATT
1 AAACAATTGTTTCTATT-AATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATT
* * * * * * * * *
126621 CT-AAAGATTAAT-GGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTATTTAT-TGAACCAGCTT-AAATAGT
64 -TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAG-TTCAAATAGT
* * * *
126682 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATGACC-TTT-TTTTATCATAAAATAAT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * *
126744 TGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTACAAAAA
190 T-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAA
* ** * *
126806 TTAATAAGTAAAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTATAACTATT
252 TTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * * *
126870 TGAATAATTATCCATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTTCGTCAT-
316 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
126916 AAACTAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTA-TTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAAAATT
1 AAAC-AATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * **
126978 CCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTCG-TTTAT-TGAGTGAGTTCAAATAGT
64 -TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * *
127040 TATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTGTAATCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
127105 GTTTCTATTTATACAAGTTTATTCGAAATAATATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTA
191 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTA
* *** * * * ** * * * * *
127169 ATAATTTGGAGATTTAAAAATAAATATGTTCACTGAACAAGTTCAAATAATCA-AGTCTATTGGA
255 ATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATA-ACTATTTGA
* * * * * *
127233 ACTATTAGCAATTACAAATCATTATGA-CATTTTGTTTTATCATA
319 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATA
* * ** * * *
127277 AATCAATTGTTT-TCATTCATACAAAATTA-TCCAAAATAAAATAATACT-AATTAATTAATATT
1 AAACAATTGTTTCT-ATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * * * * *
127339 TCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCA-AACCAGTTTAAATGGTTA
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
127399 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACC-TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
128 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * * * *
127463 TTCTGTTCATATAAGTTTATTTGGAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTTTAAGAATTAATA
193 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* ** * **** * * ***
127528 AGTCAGGGATTTAAAAAATAAATGTATTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATAAAAAC
258 AGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAAC
* * * * ** * *
127592 AATTAGCTATTTGTTGAACTTATTGGACTATAAGAACGTTTTGGTTAGTCATA
321 AATTATCTA--T-TTCAA---A-TCG--T-TATG-ACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
127645 AAATAATTGTTT-TAATTTATACATGCTTA-CTCAAAATAAAATAATACT-ATTTTATTAACACT
1 AAACAATTGTTTCT-ATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
127707 CAAAAAATTAATAAG--AAA-TTTTAAAAAATAAGTTTG-CTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTA
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAA-ATCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTTA
* * * *
127768 TGATTATTTGAACAATTACCTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTG
128 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * ** * * * * *
127832 TTTC-AGTTCATAAAATCTTATTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAAATTTCAAAATTTGA
192 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* *** * ** * * ** * * *
127896 GAAGTTGGAGATTTAAAAAATATATC-AGTTTATTGAATC-AGTTCACGTAATTATAGCCATTTG
256 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTTA-CCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * *
127959 AACAATTATCTATTTTAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTTATA
318 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* ** * ** * * * *
128004 AAATAATTGTTT-TCGTCATACAAGCCTGTTT-GGCATAAAATAATACT-AATTTATTAATAATT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
* ** * * * * *
128066 CAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAACTGCTTATC--A--AA---C-CAT--TTCT
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-GATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
128121 ---TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGCTCTATTATAAAATAATTGT
129 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * ** *
128182 TTCAAATCATATAAGCTTACTTGGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTTGAAAATTAACA
193 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * * * * * *
128247 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCTGAAGCTA-TTCAAACAATTA-AGACTATATAAA
258 AGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTAC-CAAACAAGCTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAA
* *
128310 TAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CA----TTTTGTCATA
320 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
128348 AAACAATTATTTC-AGT--T----GTTT-TCT-A-AAT-AAGT--T-CAAGTCGTTATGACTATT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAAT--TTATTAATATT
** ** * * *** ** * *
128399 TAAGCAATTAATTATTTCAAACTG-TTTTAACTTTTTA-C--TTTGTCATA--AA-AT--AAT--
64 TAAAAAATTAA-TAAGT-AAA-AGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAG
** * * * * ** * *
128453 TT-TTTCTATTT-ATACAAGTTTATTTGGA-TTAAAATA-ATATTAATTTATTAATATTTTGACA
125 TTATGACTATTTGA-ACAA--TTATCT--ATTTCAAATAGTTA-TGACCT-TT--TGTTTTGTC-
* ** * * *** * * * ** * *
128514 ATTAATAAGTAAAAGACTT-AAAAAATAAATACGTTTA-TTG-AACAAGTTCAA-A-T-AGTCAT
180 A-TAA-AA-CAATTG-TTTCTATTCATACA-A-GCTTATTTGAAATAAAAT-AATACTAATTTAT
* * * * * * ** ** ** * ** * * **
128573 GACTTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACT-TTTTTTTTGTAATAAAACAATTGT
238 TAATATTTCAAAAATTA-ATAAGT-AAAAGATTTAAAAATAAATCTATT-T-ACCAAACAA--G-
* ** * * * *
128636 TTCAGTTCA--TATAAGCTTATTTGATGTAAAATAATACTAATTT-ATTAAT-ATTCCAT-A-AA
296 CTCAAAT-AGTTATAA-C-TATTTGA---ACAATTAT-CT-ATTTCA--AATCGTT--ATGACCA
* ** **
128695 TTAATGAGTAAGAGAATTA
349 TT--TG-TTTTG-TCA-TA
**** * * ** * * * *
128714 AAA-AA-AAAATCTATT--TACCGAA--TAAGTTCA-AATAGTTATGACATCTTAA-TAATTATC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATA-C-AAGTTTATTTCAGAATA-AAAT-A-ATATAAATTTATTA-A
* * * ** *** * * * * * * *
128771 TCTTTCAAAATATT-ATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAGGCTTA
60 TATTT-AAAAAATTAATAAGTAAAAG-ATT-T-AAAAAATAAATCG-ATT-TTCA-G-A-GC-AA
* ** * * ** ** ******
128835 TTTCAAATA-AAAT-A--ATTT-AA-ATTTAT-TAATATTCCAAA-AATTAAAAAGTAAAAAATT
115 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-AT-TT-CAAATAGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * **
128892 -T-AAAAAATAAATTTATTTTTTGAGCACGTTCAAATAGTTACAA-C-TATTTGAACAATTATCT
177 GTCATAAAA-CAA-TT-GTTTCT----A--TTC----A--TACAAGCTTATTTG-A-AATAAAAT
** * * * * * * **** * *
128953 CTTTC-AATTTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAAT-TGT-TTTTATTT-ATAA-AAAG
225 AATACTAATTTATTA--A-------TATT-TCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAAT
* * * * * ** * ** * ***
129013 CT-TATT-CAAAATAA-AT-AATACTAATTTATGAA-AATTCCAA-AATTA-ATAAGTAAAAGAT
280 CTAT-TTACCAAACAAGCTCAA-A-T-AGTTAT-AACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG
* ** * *
129071 TTA-AAAAATAAATATGTTTATTGAGCGAGTTT
340 TTATGACCAT---T-TG-TT-TTG-TC-A--TA
* * ** * * ** * ***
129103 AAATAGTTAGGAT-TATTTAA-ACAATTATTTATTTCA-AATCATTATGATCTTTTGTTTTGTCA
1 AAACAATT-GTTTCTA-TTAATACAA--GTTTATTTCAGAAT-A--A-AATAATATAAATT-T-A
* **** * * ** * * ** *
129165 TAAAATAATTGT-TTCTATTCATACAAGTTTATTGATATTCTAAAAATTAAT--AAATT-GGAG-
56 T-TAAT-ATT-TAAAAAATT-A-ATAAG-TAAAAGAT-TT-AAAAAATAAATCGATTTTCAGAGC
* * * * * * * * * * * *
129225 -A-TTTAAA-A--AATAAATTTGTTTACCAA--AT-AAGTTCAAATAGTCATGCCCATTTGAACT
113 AAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTG---T
* * *** * * * ** ** * ** * ** **
129282 ATTATC-TATTTCAAATCG-TCCCA-T-GGAC-ATTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTTT
174 TTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTT--ATTTGAAATAAAATAATACTAATTT
* * ** * *
129342 ATCATACAAAAATTATTC-AAAATAAAATAA-TACTA-ATTTATTAAATATTTCAAAAAACTAAT
236 AT--T---AATA-T-TTCAAAAAT-TAATAAGTAAAAGATTTA--AAA-A--T---AAATCTATT
* * * * * * *
129404 AAGACATTAA-AAACT-AAATTTGTTTATCGAACTAGTTTAAATAGTTATCACTATTTGAACAAC
285 TA-CCA--AACAAGCTCAAA-TAG-TTAT--AACTA-TTTGAACAATTAT--CTATTT---CAA-
** * * * * ** * *
129467 TATCCATATCA-AATCATTATGATATTTATT
336 -ATCGTTATGACCAT--TTGT-TTTGTCATA
* * * * * * * * * *
129497 TTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAGAGTAAAATATTGCTAAA-CTAA
1 --------AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAAT-ATAAATTTAT
* * * * *
129560 TAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-GCATTTGCCA-AACCAGTTA
57 TAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCG-ATTT-TCAGAGCAAGTTC
* ** * * * * *
129622 AAATAGTGAAAACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAA
119 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAA
* * * * * * * *
129687 AATAATTGTATCAATTTATACATGCTT-TTTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACATTT-A
184 AACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA
* * * * * **
129750 GAAAATTAAT-A-TACAAGAAATTTTAAAAAATAAGTATATTTATCGAACAAATTCAAATAGTTA
248 -AAAATTAATAAGTA-AA-AGA-TTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTA
* * * * **
129813 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGA-CATTTTTTTTACCATA
308 TAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * * * * *
129867 AAACAACT-TTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAGTATTACTTTATTAATGTTTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTA
* * *** * * * *
129930 AAAAATTGAGAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAATCAA-TTCAAATAATTAT
66 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGA-TTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
* * * *
129993 GA-TCATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTATGAACTTTT-TTTTTTCATAAAACAATTGT
129 GACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * ** *
130056 TTTTCA-TCATGCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
193 TTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * *
130120 AAGCAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
257 AAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * * *
130185 AATTATATATTTGAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATA
321 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * ** * *
130227 AAACAATTATTTATCTTCATACAAACTTA-TT-AGAAATAAAATAGTACT-AATCTAATT-ATA-
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAG-AATAAAATAATA-TAAAT-TTATTAATAT
* * * * * * *
130287 TTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTGCTAAACCAA-TT-AAATAG
63 TTA-AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTTC-AGAGCAAGTTCAAATAG
* * * * * * *
130349 TTAAGA-TGATATGGATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAA
125 TTATGACT-ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
130413 ATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAGTATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
189 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * **
130478 AATAAG----AGATTTAATAAATAAATCTATTTACCCAACTAG-TTTAATAAGTTATAACTATTT
254 AATAAGTAAAAGATTTAA-AAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAAT-AGTTATAACTATTT
* * * *
130538 GAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAACATTTGTTTTGTCATT
317 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * *
130584 AAATAACTT-ATTC---GAA-A-AAG-------C---AT--AAT--TCT-AATTTATTAATATTT
1 AAACAA-TTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
* * * *
130628 CAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAATTGAATAT-G-TTTATCA-AACAAGTTTAAATAGTT
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AA-ATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
130686 ATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TT
* * * * * *
130751 TTTTCTATTCATACAAGTTTATTTCAATTAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTT-AGACAATT
191 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATT
* * * * * * ** * *
130814 AGTAAGTAAAAGATATAAAGAATAACTCTGTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGATTATTTG
254 AATAAGTAAAAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * * **
130879 AGCAATTATTTATTTTAAAACATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATA
318 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
130925 AAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCTTATTT--GAATTAAAATAATATTAATTTATTAGTATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAA-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
** * * * * * * *
130988 TGACAATTAGTAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAAT--ATGTTTACTA-AACATGTTTAAATAGTC
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGAT-TTT-C-AGAGCAAGTTCAAATAGTT
** * * * * ** *
131050 AAAACTATTAGAATAATTATCTATTACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTA
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * **
131115 TAT-TAGTTCTTATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA
192 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * * ** * * * *
131179 TGAGTAAGAGACTTAAAAAATGAATCAATTTACTGAATAAGTTCAAATACTTATGACTATTTGAA
256 TAAGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * * *
131244 CAATTTTCTATTTCAAATCATGATGA-CATTTTGTTTTCTCATA
320 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATA
* * ** * * *
131287 AAATAATTGTTTTTATTTGTACAA-TCTTATTCCA-AATAGAATAATATATATTTATTAATATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGT-TTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
* * * ** * ** * **
131350 CAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAATATATATTTATTTTCTGAGC-A-TAAAAAT-TTTAAA
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTTATG
* ** * * * ** * *
131411 AATACATTT--A-TTTTCTGTGCACATTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTC
130 ACT--ATTTGAACAATTATCT--A-TTTCAAATAGTTATGACCT-TTTG---TTTTGTC-A--TA
* * * * *
131472 AAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTGTTCATACAAATGTTTTTAAAC
183 AAACA-AT-TG----TTT-CTAT-TCAT--A-CAA--G---C---T--T----A---TTTGAAA-
* * * * * * *
131537 T-AAATAACACCAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAGTAAAAAATCTAAAAAGTAAATCTA
219 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTA
* * * * ** * * * * * *
131601 TTTATCGAACAAGTTTAAATAGTTATGCCTGTTTGAACAAATATTTATTTCAAA-CAGTTCTAAT
283 TTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGAC
* **
131665 CTTTTGTTTTGTTGTA
347 CATTTGTTTTGTCATA
* *
131681 AAACAATTATTTCTATTTATACCAA-TTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATA-CAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * * ** * * *
131743 TTAAACATTAGTAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAAATTTG-TTTAT-TGAACAAGTTCAAATAGT
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT-AAA-TCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGT
* * * * *
131806 CATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * ** * * ** *
131870 TGTTTTTGTTCATGCAATATTATTT-AGAATAAAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAGTT
190 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
131934 AATAAG----AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCAAA-ACAGTTTAAATAGTTATGACTATTT
254 AATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACA-AGCTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * *
131994 GAACAATAATTTATCTCAAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATA
317 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
132039 AAACAATTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTT-GGATTAAAATCATACT-AATTTA--AATATAT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT-T
* * * *
132100 TCCAAAAATT--T-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-GTGTTTGTC-GAACCAA-TTCAAATAG
64 T-AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCG-ATTT-TCAG-AGCAAGTTCAAATAG
* * * * * * * * ** * **
132158 TAAAGACTATTAGAACAATTATCTCTTTGAAATTGCTT-TGATCGTTTG-TTTAACTATATATTA
125 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAG-TTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACA
* * * *
132221 ATTGTTTC-ATTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTGAAAAAT
188 ATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * *
132285 TAATAAGCAAGAGATCTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
253 TAATAAGTAAAAGAT-T-TAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * *
132350 TGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGCCATA
316 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
132397 AAACAATTGTTT-TAATTCATAAAAGCTTA--TCAAAAATAAAATAATGCT-ACTTTATTATTAT
1 AAACAATTGTTTCT-ATTAATACAAGTTTATTTC-AGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATAT
* * * * *** *
132458 TTCAAAAGTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATTA-AATTAGTTCAAATAAT
63 TTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGA-TTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGT
* * *
132521 TATGACCATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGAACTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *** * * * *
132585 TCTTTTTCATT-AGACAAGCCTATCCAAAAGAAAATAATACTTATTTAATAATATTTCAAACATT
190 TGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
** * * * * * *
132649 AATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATACTTACCATACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTG
254 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
* ** * * * *
132714 AACAATTAATTATATATTTCAAATTATTATAACCTTTTGTTTTATGATA
318 AAC----AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
132763 AAACAATTATTTGTCTTGATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAACACT-AATCTACTAATA-TT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
* * * * * ** * *
132825 ATGAAAATTAA-AATCTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTGCCCAACATAG-T--AA-AGG
65 A-AAAAATTAATAA-GTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTTCAGAGCA-AGTTCAAATAGT
* * *
132884 T-T-A-TA--TGAATAATTATCTATTTCAAA-ATGTTATGACCTTCTGTTTTGTCATAAAACAAA
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * *
132943 TGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCT-AAATAAAAT-A-A-T-A-TTAAT-ATATTTCAAAAATT
190 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
133001 AATAAG----AGATTTAATAAATAAATCTATTTACC--A-AA-C-C----AG----------TT-
254 AATAAGTAAAAGATTTAA-AAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
*
133042 --CAATTAGT-TATTTCAAGTCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
318 AACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * *
133085 AAATAATTGCTTCTATTAATACAA-TCTTATTT-GGAACAAAGTAATGCT-AATTTATTAATATT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGT-TTATTTCAGAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATT
* * * ** * ** * * * * *
133147 CT-AAAACTTAATAAGTAAAGGAATTAAAAAAGGAATCTATTGGCCTGA-CCAGTACAAATAATG
64 -TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATT-TTCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
133210 ATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCACAAAACAATT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * * * * * * * *
133274 GTTTCTATTTGTATAAGCTGATTCGGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAG
191 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * *** * * *
133339 TAAGTAAGAGATTTAAAAACTGAATCTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAA
256 TAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
* * * * * *
133404 CAATTACCTATTTCAAATTGCTATAAGCTTTTGTTTTGTCATA
320 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
133447 AAATAATTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAAGTTATTAATATTTA
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTA
* * * * * ** * *
133511 GACAACTTAA-AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTACCGAATAAGTTTAAATAATTAT
66 -AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
* *
133574 GACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTGT
129 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * ** *
133638 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATA
193 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * * * * *
133703 AGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TAGAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAT
258 AGTAAAAGA-TTTAAAAATAAATCTATTTACCA-AACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * * *
133767 AATTATCTATTTAAAATC-TCATAACTATTTGAATAATTATC-TA
321 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTG--T-TTTGTCATA
*** * * * ** * * ** * * *
133810 TTTCAAATTGTTACGACCTT--T---TGTTT-TGCCATAAAAAAATTGTATTAGTTCATATAGGC
1 AAAC-AATTGTTTCTA--TTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTAT-TA---
* * * * * * * * * *
133869 TTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-GA--GTAAGAG--A-T
59 ATATT--TAA-AAAAT--TAATAA-GTA-AAAGATTTAAAAAATAAATCGATTTTCAGAGCAAGT
* * * * * *
133928 TTAAA-A--TATGAATCTGTTT--AC--TGAACAAGTTT-AAATAGTTATGA-C---T-ATTTG-
117 TCAAATAGTTATG-A-CTATTTGAACAATTATCTA-TTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *** * ** ** *
133979 -A-ACAACTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGTT
179 CATAAAACAAT-TGTTTC-TA-T-TCAT-ACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAA-TACTAAT-TT
* *** * * ** ***
134041 CA-TACATGCTTATTTCAAACAA--AATAA-TATAA-ATTTATTGAT-ATTCCA-AGAATTAACA
236 -ATTA-A----TATTTCAAA-AATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
* * * * * **** * * * *
134099 AG-T-AAAAATTTTTAAAATAAATT-AGTTTTCTGAACAAGTTT-AAATAGTTATGACTATTTGA
294 AGCTCAAATAGTTAT-AACT-ATTTGAACAAT-T-ATCTA-TTTCAAATCGTTATGACCATTTG-
134160 ATAATTATGT-ATTTCA
353 -T--TT-TGTCA--T-A
* * * * * * * **
134176 AATAGTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAACCAATTGTTTTTGTTC---ATACAAGCATATTAAA
1 AA-A--CA--A-TTGTT-TCTATT-A-ATA-CAA--GTTTAT-TTCAGAATAAAATAATA-TAAA
*** * * * * * * * **
134238 AAAAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG---TAAAAATTTTTAAAAATATATTTG
52 TTTATTAAT-ATTTA-AAAAATT--AATAAGTAA-AAGATTTAAAAA-----ATAAATCGA-TT-
* * * * * * * *
134300 TTTATCGAGCAAGTTCATATCGTTATTACTATTTGAATAATTATTTCTTTCAAATAGTTATGATC
105 TTCA--GAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACC
* * * *
134365 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATAATACTA
168 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTA
* * * ** * * * *
134429 ATTTATTACTA-TTC-TAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTACCGAACAAA
232 ATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAG
* * * * * ** * *
134492 TTCAAATAGTCATATCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACTTTTTATTATGTCA
296 CTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCA
134557 TA
361 TA
* * * * * * * ** *
134559 AAACAATTGTTTTTGTTCATGCTAA-ATTA-TTCATAATAAAATAATGTTGATCTATTAATATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATAC-AAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
** * * ** * * *
134622 TGAAAATTAATAAG----AGATTTAGAAACTAAATTTATTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTAT
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
* * * *
134682 GACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
129 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T
* * * * *** * * *
134746 TTTTTTTCATACAAGCTTGTTCGGCTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAGAATTAGTA
193 TTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
* * * **** * ** * * * **
134811 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCATTTCAAGTAGTTAAAACTATTAGAAGT
258 AGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
** * * * *
134876 ATTATCTATTTCAAATCACTCTGACCTTTTCTTTTGTTATA
322 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
** * * ** * * * * * * *
134917 AAACAAACGTTTTTGTCCATATAAGTTTGTTT-GGAACAAAATAATATTAATTTATTAATGTTTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTTA
* ** * * * * * *
134981 GAAAATTAATAAG----AGATTT---AGGTAAATCTATTTACCA-AACCAGTTCAATTAGTTATA
66 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
135038 ACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGACCATTTATTTTATAATAAAACAATTATTT
130 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * ** *
135103 TTATTAATACAATCTTATTCGCAATAAAGTAATGCTAATTCGTTAATA-TTCTAAAATTTAATAA
195 CTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAA
* * *** * *
135167 GTAAAAAGTTTTAAAAA-ATAATCTA-TCAGCTTGACCAG-TACAAATAGTTATAACTGTTTGAA
259 GT-AAAAGATTTAAAAATA-AATCTATTTA-CCAAACAAGCT-CAAATAGTTATAACTATTTGAA
** * * *
135229 CAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTATTTTGTCACA
320 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * ** * * ** *
135272 AAACAACTCTTTTTATTCATACAAGCTGCTTCCA-AATAACATAAT-TCTGATTTATTAATATTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATATTT
* * * *
135335 CAAAAATTAATAAGTAACAA-ATTTAAAAACTGAATCTG-TTTATCA-AACAAGTTCAAATAGTT
65 AAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATC-GATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
135397 ATGACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAAAAT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-CAATT
* * * * * *
135462 -TTTCTATCCATACAAGCTTATTTTAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTT-AGACAACTA
191 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTA
* * * *
135525 ATAAGTAAAAGA-TTAAAAA-AAAACTGTTTACCAAATAAG-TGCAAATAGTTATGACTATTTGA
255 ATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCT-CAAATAGTTATAACTATTTGA
* * * * **
135587 GCAATTATTTATTTTAAATCGTAATGACTTTTTGTTTTGTCATA
319 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * *
135631 AAACAATTGTTT-TGTTTATATAAGCTTATTT--GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAA-TAAAATAATATAAATTTATTAATATTT
** ** * ** * * *
135693 TGATCATTAATAAGTAACAGATTTTCAAAATAAAT--ATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCA
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGAT-TTT-CAGAGCAAGTTCAAATAGTTA
* * * * *
135756 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTCA-TAACTATTAGA-ATAATTATTTATTTCAAA
128 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA--T-AGT---TA-T-GACCT--TT-TGT-TTT---G
* * ** *
135819 TCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAA
178 TCA-TA-AAACAATTG-TT--TC-T------ATT-CA-TA---C--A-A-GCTTATTTGAAATAA
* * * *
135884 AACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTAAAATATGAATTTATT
222 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAAAAGATTTAAAA-ATAAATCTATT
**** * * * * **
135948 TATGGGACAAGTTCAAATGGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTT
285 TACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCAT
136013 TTGTTTTGTCATA
350 TTGTTTTGTCATA
* * * * * *
136026 AAATAATT-TTTTTATGATCATACATGCTTATTTCA-AATAAAATAATATAAATTTATTACTATT
1 AAACAATTGTTTCTAT--TAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT
** * * * * *
136089 CCAAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTAT
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTTAT
* * ** * * *
136153 GACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATAGTTAAAACCTTTTGCTTTGTCATAAACCAAATGTT
129 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
** ** * *
136218 TCTATTCATACAAGGGTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
194 TCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * * * * *
136283 GTAAAA-ATTTTAAAACATAAATTTGTTTACCAAGCAAGTTTATATCGTTATGACTGTTTGAACA
259 GTAAAAGA-TTTAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
* ** * *
136347 ATTATTTATTTCAAAAAGTTATGATC-TTTCATTTTGTCATA
322 ATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTT-GTTTTGTCATA
* * * * * *
136388 AAACAATTATTTCTCTTTATAAAAGTTTA-GTCAGAATAAAATAATACT-ATTTTATTAATATTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT-
* ** * ** * ** * *
136451 T-GAAAATTAATTGGCAGGAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTATC-GAATAAGTTCAAATAATC
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
136513 ATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCA-TTATGA-CTTTTGTTTTTTCATAAAACAATT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** * * * *
136576 ATCTT-TATTCATGCAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTGATCTATCAATATTTTAAAAATT
191 GT-TTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * **
136639 AATAAG----AGATTTAAAAACAAAATCTTTTTAGCAAA-ATAGTTCAAATAGTTAGGACTATTT
254 AATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACA-AGCTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * *
136699 GAACTATTA-CTTATCTCCAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATA
317 GAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * * * * *
136744 AAACAAATATTTATTTTCACACAAGCTTA-TTCGGATTAAAATAATACT-AATTCAATAATATTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
* * * * * * *
136807 CAAAACTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATACAT-G-TGTTTGCCAAACCAA-TTC-AATAG
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT--AAAAAATAAATCGAT-TTT--CAGAGCAAGTTCAAATAG
* * * * *
136868 TTAAGACT-TTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA
125 TTATGACTATTT-GAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* * ** *
136931 ATTATTT-TACTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAA
188 ATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* ** * * *
136994 ATTAATGAGTAAGTGATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACT
251 ATTAATAAGTAAAAGA-TTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAG-TTATAACT
* * * *
137058 ATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATA
313 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
** * ** * * ** * * *
137108 AAACAATCATTTC-AGTTCAA-AAAAACTTA-TCCAAAATAAAATAATACCACTTTTTTTATATT
1 AAACAATTGTTTCTA-TT-AATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATT
* * ** * * *
137170 TCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAACCTAAAGTTC--TTTTCCA-ATCTAGTTAAAATAGT
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA--TCGATTTT-CAGAGCAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
137232 TATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCA-TTATGATC-TTTGTTTTCTAATAAAACAAT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * *
137295 TGTTTCTAGTCATATAAGTTTATTTCG-TA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT
190 TGTTTCTATTCATACAAGCTTATTT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * * * *
137358 -AT---TAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTTTTTGCCAAACCAGTTCAAAGAGTTA-AGACTATT
254 AATAAGTAAAAGATTT--AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATA-ACTATT
* * * * *
137418 AGAAAAATTATCTATTTTAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATA
316 TGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * *
137465 CAATAATTATTTC-AGTTCATACAAGCTTATTT-GGAATAAAATAATACT-AATTTGTTAACATT
1 AAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * * * * *
137527 TGAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTA-AACAAGTTCAAATAGTT
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCGATTTTC-AGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * *** *
137591 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATATTTATGAAAATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTG
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * ** * *
137656 TTT-TAGTTCATAAAATCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAA
192 TTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * ** * * ** *
137719 TAAATAAAAAATTTAAAAAATAAATC-AGTTTATCAAATC-ATTTCAAATAATAATGGCCATTT-
256 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTTACCAAA-CAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
* * * * *
137781 AACAACTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATA
318 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * *
137826 AAACAATTATTTTCCA--ACATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
1 AAACAATT-GTTTCTATTA-ATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAT
* * * * * * * *
137887 TTCAAGAATTAATAAG----AGATTGAAAAAATAAATTTG-TTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTT
63 TTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * *
137947 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-TAA-A--TA--ACCTTTTATTCTATCATAAAACAAATG
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * **
138006 TTTCTATTCGTACAAGCTTA-TTCATAATAAAA-AAAACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAA
192 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
* * * * ** * * * *
138069 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTGCTGAAC-CGTTCAAACAGTTA-AGACTATATG
256 TAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCT-ATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
* * * * *
138131 AACAGTTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
318 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * * * *
138176 AAACAATTATTT-TAGCTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAGAATAA-AGCT-AACTT-TTAATAT
1 AAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA--TAAATTTATTAATAT
* * * * * * * * * *
138236 TTCAAAAATTTATACA-TAAGAGATTTAGAAAATAATTCTACTTATC-GAACCA-TTCAAATAAT
63 TTAAAAAATTAATA-AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGA-TTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGT
* * * * *
138298 TATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT-CTTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAAAT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * * *
138361 TGTTTTTGTTAATATAAG-TTCGTTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAAT
190 TGTTTCTATTCATACAAGCTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAAT
* * * ** * * ** * *
138424 TAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATTTGCTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTT
253 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTT
* * * * * *
138489 GAATAATTATCTATTTAAAATCATTAT-AACATTTTATTTTGTCATC
317 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATA
* * * * * * * * *
138535 AAATAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTA-TTCAGCATAAAATAAGACT-AATTTAATAATATTT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
** * ** * * * *
138598 TGAAACTTAATAACCAAGAA-AATTAAAAAATAAATCTAATTGTTGA-ACCAA-TTCAAATAGTT
65 AAAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTAAAAAATAAATC-GATT-TTCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * **
138660 CA-GACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACATTTT-TTTTTTTGTAAAACAATT
127 -ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** * * *
138723 GTTTTTGTTTGTACAAGCTTATTCTG-ATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTA
191 GTTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * *
138787 ATAAG----AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAA-TTCAAATGGCTA-AGACTATTAG
255 ATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATA-ACTATTTG
* * * * * *
138846 AATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATA
318 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * ** * * ** *
138891 AAACAATTGTTTCAATTCATACAACCTTA-TTCAAAATAAATTAATACT-AATTTATTAACGTTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
* * ** * **
138954 GAAAAGTTAATAACAAAAAGAGATTT--AAAA-AAAT-G-TTTACCA-AATAAGTTCAAATAGTT
65 AAAAAATTAATAA-GTAAA-AGATTTAAAAAATAAATCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * *
139013 ATTACTATTCAAACAATTGTCAATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
** * *
139077 GTTT-TAGTT-AGTACAAGCTTA-GAGAGAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
191 GTTTCTA-TTCA-TACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * ** * * * **
139139 TAATAAATAAGAA-ATTTAAAAGATAAATTTGTTTACGAAATTAGTTGAAATAATTATGGCTATT
253 TAATAAGTAA-AAGATTTAAAA-ATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATT
* ** * *** *
139203 TAAATGATTATCTATTTGAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTATCATA
316 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * *
139250 AAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
1 AAACAATTGTTTCT-ATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
* * * * * * * *
139312 TTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTG-TTTACCA-AACTAGCTCAAATAGTT
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATC-GATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * *
139375 ATGACTGTTTGCATAATT-TTTAATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTTAAAAAACAATT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
139438 GTTTCTGA-TCATAGAAGCTTATTTG-ATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCATAAATT
191 GTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* ** * *
139501 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTGT-GGAACCAAG-TCAAATAGTTAAAACTATT
254 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTA-TT-TACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * ** *
139564 AGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTCT-AATATTTTGTTTAGTCATA
316 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATA
* *** * * * **
139611 AGATTTTTATTTCATATCT--TGCAAGCTTA-TT-AGGAATAAAATAAT-TCAAATTTATTAGCA
1 AAACAATTGTTTC-TAT-TAATACAAGTTTATTTCA-GAATAAAATAATAT-AAATTTATTAATA
* * * * * *
139671 TTTGAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
62 TTTAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAAATAAATCGATTTTCAGAGCAAGTTCAAATAGT
* * * * * * *
139736 TATAATTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTTTGACATAAAACAATT
126 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *** * * **
139801 GTTT-TAGTTTATAAAAGGTTATCCAAAATGAAATAATA-TAAATTTCTTAATATTTTGAAAATT
191 GTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
139864 AATAAGCAATAG-TTTAAAAAAATAAAATC-ATTTACCGAACAAAG-TCAAATAGCTATGACTAT
254 AATAAGTAAAAGATTT--AAAAAT-AAATCTATTTACCAAAC-AAGCTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * * * *
139926 TTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGGTCTATTATA
315 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
* * * * *
139974 AAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTC
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTT
* * * * * * * *
140037 CAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAAT--TTGTTTAACGAATC-AGCTCAAATAATT
65 AAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCGAT-TTTCA-G-AGCAAGTTCAAATAGTT
* * * * * *
140095 ATTG-CCA-TTGTAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAAA
127 A-TGACTATTTG-AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AA
* * * * *
140158 TTTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATCTTTCAAAAATT
189 TTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT
* * * * *
140222 AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTG
254 AATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTG
* ** ** * *
140287 AAGAATGGTATACTTAAAAT-AAATTATTTACAAAATAAACC-TTTGGTTTTGTTATA
318 AACAAT--TAT-C-T-ATTTCAAA-TCGTT-----AT-GACCATTT-GTTTTGTCATA
* * * * * ** * *
140343 AAATAATTATTTATGTTTATACAAACTTA-TTC-GAAATAAAATAATACT-AATCTAATAATATT
1 AAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTTCAG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATT
** * * * * * * * * *
140405 CCAAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTG-TTTGTCA-AACTAGTTCAACTTGTT
64 TAAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA-TCGATTT-TCAGAGCAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * * *
140468 AAGACTACATGAACAATTACCAATTTAAAATTGTTACT-ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
127 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * ** ** * *
140532 TTTTCAATTCATATTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTTAAAAATTA
191 GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * * * * * *
140596 ATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAACTAGTTCTAATAGTTATGACTATTTGA
255 ATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATAACTATTTGA
* * * *
140661 ATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-
319 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATA
*
140704 AAACAAATGTTT
1 AAACAATTGTTT
140716 TTGTTCTGTC
Statistics
Matches: 15081, Mismatches: 3758, Indels: 2779
0.70 0.17 0.13
Matches are distributed among these distances:
321 3 0.00
322 98 0.01
323 8 0.00
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** * * *
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* * *
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* * * *
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* ** * * *
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65 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * **
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* *
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* * * * *
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257 ACGGAGCACA-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA-ATT
* * **
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320 TTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * ***
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* * * ** * *
121120 AAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAATAATTATCTATCTT-AA
64 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAA
* * * * * ** *
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128 ATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAATA
* ** * * * *
121249 AAATAATATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATCTG-TT
193 AAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAAATCTAAAAAATAAATC-GATC
** * * * * * * * *
121310 TACCAAATCA-ATTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTGT-TATC
256 TA-CGGAGCACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAAT-
* * *** * * * * *
121373 TTTATTTTGTCATGGAACAGTTGTTTCTTTTCATATAAGCT
319 TTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * * * * *
121414 TA-TTCGGATTAATATAATACTAATTTAATAATA----AAAAA-TAAATGTGCTTTGCCAATCCA
1 TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAG-G---T---AA--AA
* ** * ** *
121473 -ATTCAAATATTTAAGA-CTATTT---GAACAA-TT-ATCTA-TT-TCAAATCATTCTG-AC-AT
56 GATTTAAA-AAATAA-ATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAT-AACT-ATT-TGAACAAT
* * * ** * * * * * * ** ** *
121527 T-T-TGTTT--AGTC-ATAAAACAATTAT-TTTAGTTTATGCAAGCTTATTTGAAATAAAATAAT
116 TATCTATTTCAAATCGTTATGACCATT-TGTTTTG-TCAT-AAAAC--AATTG-TTTCTATTAAT
* * * * * ** * * * *
121586 GCTAA-TTTATTAACATTCAAAA-AAT-TAA-TAAGCAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGT--T
175 AC-AAGTTTATTCAGAAT-AAAATAATATAATTTA--TTAATA-TTTAAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * ** * *
121645 TATC-AAACAAGTTCAAATAGA--TA-TGA-C-TATTTGAACAATTAT--CTATTT-AA-AATCG
235 AATCTAAA-AA-AT-AAATCGATCTACGGAGCACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAA---
**** * * ** * * * *
121700 TTATGAC-ATTTTGTTTTA-TAATAAAACAATTGTTTTAGT-TCATAAA-AACT-TATCTA-AAA
294 TTAT--CTA-TTTCAAATAGTTAT-GAA-TTTTGTTTT-GTAACA-AAACAATTGTTTCTATTAA
121759 TA-AA--A
352 TACAAGCA
* * * * ** * * * ** * *
121764 TAATACCACTTCATTAATA-T--TTCA--AA-AATT-ATTAAG---------CAAGATTTAAAAA
1 TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAGGTAAAAGATTTAAAAA
* * * * * * * * * * **
121813 CTAAAGCTATTTTTCGAACCAA-TGCAAATAGTTATGACCATTTGAACAAATATCAAACTCAAAT
66 ATAAATCTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
121877 TGCTATGATC-TTTGTTTTGTAATAAAAAAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTCAG-ATAAA
130 CGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAAT-AA
* * * * *
121940 AATAATACTAATATGA-TAATATTTCAAACATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-GTGT
194 AATAATA-TAAT-TTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAA-ATCTAAAAAATAAATCG-AT
* * * * * * * ** * *
122003 TTGTCGAATCA-ATTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTCT-AA
255 CT-ACGGAGCACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGAA
* * * * *
122065 CCTTTTGTTTAGTAAAAAAAAAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCT
318 --TTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGCA
* * * *
122109 TA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAA-GCAAGAGATTT-T
1 TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAA
* * * * * *
122170 AAAA-AAATATGTTTACCAAACAAGCTCAAATAGTTATTATTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
63 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * *
122234 ATCATTATGAACTTTTGGTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCAAAAAT
128 ATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTC-AGAAT
* * * *
122298 AAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATC-AGT
192 AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAAATCTAAAAAATAAATCGA-T
* * * * * * * * * * * *
122359 TTACTGA--ATCAGTTTAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATATACTTCAAATCA-TTATTA
255 CTACGGAGCA-CA-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* * * *
122421 CCTTTTGTTTTATCAA-AAAACAATTGTTT-T-TCAACATACAAGCT
317 -ATTTTGTTTTGT-AACAAAACAATTGTTTCTAT-TA-ATACAAGCA
* * *
122465 TATTTAAAATAAAATAATACTAA-TTATTAATATTTCAAGAATT---A-GTAAGAGATTT-AAAA
1 TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAGGTAAAAGATTTAAAAA
* * * *
122524 ATAAATATATTTACCACAAC-AGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATTATTATAATCATCTATT
66 ATAAATCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA-CA--AT--T-ATCTATT
* * * * * * *
122588 TCAAATTGTTATAACC-TTTTTTTTATCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAG
124 TCAAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAG
* * * * * *
122652 AATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCT-AAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
189 AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAA-AAATCTAAAAAATAAA-
* * * **** * * * * * * *
122716 TTGTTTTTTAAACCA-ATTCAAACAGTTAAGATTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTA
250 TCGATCTACGGAGCACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA
* * * * * * * **
122779 TGATATTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCAACTCATACAAGTT
314 TGA-ATTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * ** *
122826 TA-TTCAAAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTC-AAAATT-TTA--TAAGAGATTTAAAA
1 TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAGGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * * *
122886 AATAATTCTACTTACCAAACTA--TCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTATAG
65 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * ** * * * * *
122949 CATTATTACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTTAGATA-AATTTTTTTGA-AATA
130 CGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTA-ATACAAGTTTATTCAGAATA
* * ** * *
123012 AAATAATACTAATTTGTTAATATTTAGAAAATTAATCAA-TAAGTGATTTAAAAAGTAAATC-AG
193 AAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-AAGTAA-AAATCTAAAAAATAAATCGA-
* ** * * ** * * *
123075 TTTACCAAACCATTTCAAATCAAATAGATT-TGACTACATGAATAATTATCTATCTCAAATAGTT
254 TCTA-CGGAGCA---C-ACTCAAATAG-TTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTT
* * * * * **
123139 AT-AACTTTTTGTTTTGTCATC-AAACAATTGGTTCTGTTCATACTA-TT
313 ATGAA--TTTTGTTTTGT-AACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * * * * * *
123186 TAATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAACTTTATAA-GCAAGAA-AATTAG
1 T-ATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-ATTAAAAGGTAA-AAGATTTAA
* * * * * * * ** *
123249 AACATAAATCTAATTGCCAAGCCAGTTCAAATAATTA-AGACTATATGAATGATTATCTATTCCA
63 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * ** *
123313 AATCATTATGACCATTTGTTTTATCATAAAACAAATT-TTT-TGTTTGTACAAGTTTATTTAGAA
127 AATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAA
* * * * * *
123376 TAAAATAATACAAATTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT-TTAAAAATAAATTTG
191 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATCTAAAAAATAAA-TCG
* * * * * ** *
123440 -TTTACTGA--ACTAGTTCATATAATTAAT-ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TT-
253 ATCTACGGAGCAC-A-CTCAAATAGTT-ATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTA
* * * * * * *
123499 TTAACCTTTTGTTTAGTTATAAAGCAATTG-TT-TAGTATATACAAGCT
314 TGAA--TTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTA-ATACAAGCA
** * * * *
123546 TATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATT-AATGAGAAAAAGATTTAAA
1 TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAAAG-GTAAAAGATTTAAA
* * * * * * *
123609 AGAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAATTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAA
64 A-AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* ** * * * *
123674 ATTGCAATGACCTTTTGTTTTTTCATAAAAAAATTGTTTC-AGTTAACACAAGTTTA-T-AGCAA
128 ATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGTTTATTCAG-AA
** * * **
123736 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTAAAATTAATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATTTA
191 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATCTAAAAAATAAATCGA
* * * * * * * *
123801 TTTACCGA--ATCAGTTAAATGGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGA
254 TCTACGGAGCA-CACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGA
* * * * * *
123863 TATTTTGTTTTGTTATAAAACAGTTATTT-T-TTATCATACATGCT
317 -ATTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTA--ATACAAGCA
* *
123907 TA-TTCAAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-GTAAGAGATTTAAA
1 TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAAA
* * * * ** * *
123970 AAAAAAATGT-TTGT--CAAACTAGTTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTTTCTATTTCAA
64 AAATAAATCTATT-TACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * * * *
124032 ATCTTTCTAACC-TTTTTTTTAGGT-ATAAAATATTTGTTTC-ATATCATACATGCTTATTTC-G
128 ATCGTTATGACCATTTGTTTT--GTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TAATACAAGTTTA-TTCAG
* * * * * * *
124093 TATAAAATAATCTTAATATATTAACATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAATAAAT
189 AATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATCT-AAAAAATAAA-
* * * ** ** * * * *
124158 TTTG-TTTCCTAAATAAACTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTAAT-TATTTAAAATCGTT
250 -TCGATCTACGGAGCACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATT-ATCTATTTCAAATAGTT
* * * * * * * * *
124221 ATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCT
313 ATGA-ATTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * *
124269 TA-TCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AATGAGAAAAAGATTTTAA
1 TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAG-GTAAAAGA-TTT-A
** * **** * * * * * *
124332 AAAAATAAAAGTGTTTTTTGAACAAATTTAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTGTATATTTAA
62 AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* *** * * *
124397 AATCATTATGATGTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTTAAAAAAAG-TTATT-TGA
127 AATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA--TTAATACAAGTTTATTCAG-
* * * * * * **
124459 AATAAAACAATAATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---GATTTAAAAATTGAATTT
189 AATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAAATCTAAAAAATAAATCG
* * * * * * * * * *
124521 ATTTAC-CA-AATCAGTTTAAATAATTATGGCTATTTAAACAATTATCTAGTTCAAATCA-TTAG
253 ATCTACGGAGCA-CA-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT-AGTTAT
* * * *
124583 GAACTTTTGTTTTGTCAA-AAAACTATTGTTTTTCA-TCATACAAGCC
315 GAA-TTTTGTTTTGT-AACAAAACAATTGTTTCT-ATTAATACAAGCA
* ** *
124629 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT--GAAATTTTAA--TAAGAGATTTAAAA
1 TATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAGGTAAAAGATTTAAAA
* * *
124689 AATAAATCTATTT----AAC-A----AAGTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAA
65 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAA
* * * * * ** * * * * * * * *
124741 TCATTATAACCTTTTGTTCTATTTTAAAATAATTGTTTCAATTCAGACAGGCTTGTTCAAAATAA
129 TCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAATAA
* * * * * * *
124806 AATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATATCTG-TT
194 AATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAA-AAATCTAAAAAATAAATC-GATC
* ** * * * * * *** * * * *
124870 TGTCAAAGTA-ATTCAAACATTTAAGACTGCATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGAACT
256 T-ACGGAGCACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAA-T
* * * ** * *
124934 TTTATTTTGTCATAAAACAATCATCTC-AGTTCATACAAGC-
319 TTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGCA
* * ** * **
124974 TTTTTGAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-GTAAGTGATTTAAAA
1 TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAAAA
* * * * * * * ** * * * *
125038 AGTGAATCTGTCTACCGAATC-A-TTCTAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATTTATTTAAAA
65 AATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * ** * * *
125101 TTGTTATTACCATTTGTTTGGTCATATAACAAACG-ATC-A-T--T-CAAGCTTATTC-GAGTAA
129 TCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAATAA
* * * * *
125159 AATAATACTAATTTATTAATCA-TTCAAAAATTAATAAGTAAACGATTTAAAATATAAAATTG-T
194 AATAATA-TAATTTATTAAT-ATTTAAAAAATTAATAAGTAAA-AATCTAAAAAAT-AAATCGAT
* * * * * * * * *
125222 TTATC--A-AACTAGCTTAAATAATTATGACTATTTGAATAATTGA-ATACTTCAAATTGTTAT-
255 CTA-CGGAGCAC-A-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATT-ATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * * *
125282 AACCTTTTGTTCTATCACAAAACAAGTATTTTTGTTCATACAAGCT
316 AA--TTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * * ** * * *
125328 TA-TTCAGAATAAAATAACACTAATCTAATAATATTTTGAAAATTAATAA-CTAAGAGAATT-AA
1 TATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * * * *
125390 AAGTAAATTTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATA-TTAAAACTATATGAACAATTATCTTTTTCAAA
64 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * ** * * * * **
125454 CCATTATGA-TATTTTGTTTTGTCATAAAACAA-AATTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATA
129 TCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAATA
* * * * *
125517 AAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAATATTTAT-
193 AAATAATA-TAATTTATTAATATTT-AAAAAATTAATAAGTAA-AAATCT-AAAAAATA--AATC
* * * * * * * *
125581 G-TTTACCGAAC-CAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATG
252 GATCTACGGAGCAC-ACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
125644 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG--
316 A-ATTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * * * * * *
125687 T-TTGCTCGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATTTCGATAGTT--AA--TAAGAGATTTAA
1 TATT--TC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAGGTAAAAGATTTAA
* ** * * * *
125747 AAACTAAATCTATTTTTCAAGTCAA-TTCAAATAGTTATGAGTATTTG-ACAAATTATTTATTTC
63 AAAATAAATCTATTTACCAA-ACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-AATTATCTATTTC
** **** * * * * * *
125810 AAATCGTTATGACTTTTTGTCAAATTATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCATAT
126 AAATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAA
* ** * * * *
125875 TAAAATAACACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAAATAAATAT
191 TAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAA--ATCTAAAAAATAAAT-C
* * * * * * * * * * *
125940 G-TTTACCGAACTAGA-TTAAATAGTCATGGCTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATTGTTATG
252 GATCTACGGAGC-ACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
126003 ACTTTT-TCTTT-TATCATAAA-ATATT-TTTCAATT-AT-TATGCG
316 AATTTTGT-TTTGTAACA-AAACA-ATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * * * * *
126044 TTTATTCGAAATAAAATAATACCAGTTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-CTAAGAGATTTAA
1 TAT-TTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAA
* * * * **
126108 AAAA-AGAATATGTTTACCAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTGG
63 AAAATA-AATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * **
126172 AATCGCTATAACCTTTTGTTTTGACATAAAATAATTTTTTCTACTCATACAAGCTTATTTTGAAT
127 AATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAAT
* * * * *
126237 AAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAAGTAAAAGAT-TTAAAAATCAATCTA
192 AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAA-AAAATTAATAAGTAAAA-ATCTAAAAAATAAATCGA
* * * * * *
126300 TTTATC-GAACA-AGTTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
254 TCTA-CGGAGCACA-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * **
126362 CTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGGT
317 -ATTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* *** * ** *
126406 TATTTGC-ATTAAAATAACGTTAA-TTATGAATATTTTGACAATTAATAA-GTAAAAGATTTAAA
1 TATTT-CAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAAA
* * * * * * * * *
126468 AAATAAATATGTTTACCCAACAAGTTGAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAAA
64 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * *
126533 TCATTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAACTGTTTCAATTCAA-ATAAGCTTATT-TGAAAT
129 TCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT-AATACAAGTTTATTCAG-AAT
* * * * *
126596 AAAATAATGCTAATTTATTAATATTCT-AAAGATTAAT-GGTAAGAGAAT-TAAAAAATGAATCT
192 AAAATAAT-ATAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAA-A-AATCTAAAAAATAAATCG
* ** * * * * *
126658 ATTTATTGAAC-CAGCTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-ACATTATG
253 ATCTACGGAGCACA-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATA-GTTATG
** * * * * * * * *
126721 ACCTTT-TTTTATCATAAAATAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCT
316 AATTTTGTTTTGTAACAAAACAATT-GTTTCTATTAATACAAGCA
* * *
126764 TATTTCGAATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAA-GTAAAA-ATTTAAA
1 TATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAAA
* ** * * *
126826 AAATAAATCTATTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAA
64 AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * * * * *
126891 TTGTTATGATCTTTTGTTTCGTCAT-AAACTAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTGA-AATA
129 TCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAATA
* * * *
126954 AAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTCG-
193 AAATAATA-TAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAAAA-ATCTAAAAAATAAA-TCGA
* ** * ** * * * * * *
127017 TTTATTGAGTGA-GTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTGT-AA
254 TCTACGGAG-CACACTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGAA
* * * * **
127080 TCTTTTGTCTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAGTT
318 --TTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
* * ***
127124 TA-TTCGAAATAATATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAA-TTTGGAGATTT-A
1 TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAA
* * * ** * * * * * * * *
127185 AAAATAAATATGTTCACTGAACAAGTTCAAATAATCA-AGTCTATTGGAACTATTAGCAATTACA
63 AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * ** * *
127249 AATCATTATGA-CATTTTGTTTTATCATAAATCAATTGTTT-TCATTCATACAAAATTATCCAAA
127 AATCGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTAATACAAGTTTATTCAGA
* * * * * *
127312 ATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATTTAAAAACTAAATCTA
190 ATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAAATCTAAAAAATAAATCGA
* * * * * * * * *
127374 TTTATC-AAAC-CAGTTTAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAT-A
254 TCTA-CGGAGCACA-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGA
* * * * * * * **
127436 ACCTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCATATAAGTT
317 A-TTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGCA
** * * * * * * * **
127480 TATTTGGAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTTTAAGAATTAATAA-GTCAGGGATTTAAAA
1 TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-AAGGTAAAAGATTTAAAA
* **** * *** * *
127544 AATAAATGTATTTGTTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATAAAAACAATTAGCTATTTGTTG
65 AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACAATTATCTA--T-TTC
* * ** * * * * * *
127608 AACTTATTGGACTATAAGAACGTTTTGGTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAATTTATACATGCT
126 AA---A-TCG--T-TATG-ACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTAATACAAGTT
* * * * * * * *
127672 TACTCAAAATAAAATAATACTATTTTATTAACACTCAAAAAATTAATAAG--AAATTTTAAAAAA
182 TATTCAGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAAAATCTAAAAAA
* * * * * * * * * *
127735 TAAGTTTGCT-TACCGAACA-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTAAAAT
246 TAA-ATCGATCTACGGAGCACA-CTCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * * * * * *
127798 CA-TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAATCT
309 -AGTTATGA-ATTTTGTTTTGTAACAAAACAATTGTTTCTA-TTAATACAAGCA
* * * * * ***
127850 TA-TTCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAAAATTTCAAAATTTGAGAA-GTTGGAGATTTAAA
1 TATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AAAAGGTAAAAGATTTAAA
* ** * ** * * * *
127913 AAATATATC-AGTTTATTGAATC-AGTTCACGTAATTATAGCCATTTGAACAATTATCTATTTTA
64 AAATAAATCTA-TTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * ** * ** * ** *
127976 AATCATTATGAACTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTT-TCGTCATACAAGCCTGTTTGGCAT
127 AATCGTTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTAATACAAGTTTATTCAGAAT
* * * * *
128040 AAAATAATACTAATTTATTAATAATTCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAA
192 AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTA-AAAATCTAAAAAATAAA
128100 ACTGCTTATC
Statistics
Matches: 5589, Mismatches: 1350, Indels: 934
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
329 1 0.00
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* * * * *
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* * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *** * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
121899 TAAAAAAATTGTTTCTAATCATACAAGCTTATTC-AGATAAAAATAATACTAATATGA-TAATAT
66 TAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAAT-AAAATAATACTAAT-TTATTAATAT
* * * * ** *
121962 TTCAAACATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAATCAA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-CAG
* * * * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
122080 AAAAAAAATTGTTTTAGT-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-T
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* * * * *
122143 TCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTT-TAAAA-AAATATGTTTACCAAACAAG
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* * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * *
122259 TAAAACAATTG-TTTCAATTCATAAAAGCTTA-TCAAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATAT
66 TAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* *
122322 TTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAA-TCAGTTTACTGAATCAG
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* * * * * * * * *
122371 TTTAAATAATTATGGCCATTTGAATAATTATATACTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
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66 TAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
* * *
122500 CAAGAA-T--T-AGTAAGAGATTT-AAAAATAAATATATTTACCACAACAG
131 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACC-GAACAG
* * ** *
122546 TTTAAATAGTTATGACTATTTGAATTATTATAATCATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CA--AT--T-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * *
122610 TTATCATAAAACAATT-ATTTCTATTCATACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATCTAAT
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* * * **** *
122674 AATA-TTCTAAAAATTCATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTTTTAAACCAA
124 AATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-CAG
* * * * * **
122732 TTCAAACAGTTAAGATTATATAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * ** * * *
122797 TAAAATAATT-ATTTCAACTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * *
122861 TC-AAAATT--TTA-TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTCTACTTACC-AA-AC
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TATTTACCGAACAG
* * * * * * * *
122906 TATCAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTTATAGCATTATTACTTTTTATTTTGTC
1 T-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
122971 ATAAAACAATTGTTTTTATTTAGATA-AA-TTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATA
65 ATAAAACAATTGTTTTT-TAT-CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
123034 TTT-AGAAAATTAATCAA-TAAGTGATTTAAAAAGTAAA-TCAGTTTACCAAACCATT
128 TTTCA-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTACCGAA-CA-G
** * * * *
123089 TCAAATCAAATAGATT-TGACTACATGAATAATTATCTATCTCAAAT-AGTTATAACTTTTTGTT
1 T----TCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTT
* * * * * ** *
123152 TTGTCATCAAACAATTGGTTCTGT-TCATACTA-TTTAATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAA
60 TTGTCATAAAACAATT-GTTTTTTATCATACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * * * *
123215 TAATATTTCAAAACTTTATAAGCAAGAAAATTAGAACATAAATCTAATTGCC-AAGCCAG
123 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA--CAG
* * * ** * * *
123274 TTCAAATAATTAAGACTATATGAATGATTATCTATTCCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * * *
123339 TAAAACAAATT-TTTTGTT-T-GTACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACAAATTTAATAATAT
66 TAAAAC-AATTGTTTT-TTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * *
123401 TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAG
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* * * * * * * *
123453 TTCATATAATTAAT-ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTAACCTTTTGTTTAGTT
1 TTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** *** * *
123517 ATAAAGCAATTGTTTAGTAT-ATACAAGCTTATTTGGAATAAATTAATACTAATTTATTAACA-T
65 ATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
123580 TCAAAAAATTAATGAGAAAAAGATTTAAAAGAATAAATCTATTTACCGAACAAG
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATTTATTTACCGAAC-AG
* * * * * * *
123634 TTCAAATAATTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAAATTGCA--ATGACCTTTTGTTTTTT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-T-CATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * *
123697 CATAAAAAAATTGTTTCAGTTA--ACACAAGTTTA-T-AGCAATAAAATAATACTAATTTATTAA
64 CATAAAACAATTGTTT--TTTATCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *
123758 TATTTCTAAAATTAATAAGTAAGACATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAATCAG
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* * * ** *
123814 TT-AAATGGTTATGGCCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * *
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* * *
123943 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAATGTT-TGT--CAAACTAG
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** ** * * * * *
123992 TTCAAATAGTTAAAACTATAAGAATAATTTTCTATTTCAAATCTTTCTAACCTTTT-TTTTAGGT
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* * ** * ** * *
124056 -ATAAAATATTTGTTTCATATCATACATGCTTATTTC-GTATAAAATAAT-CTTAATATATTAAC
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* * * *
124118 A-TTCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAAATAAATTT-TGTTTCCTAAATAAA
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* * * * *
124175 CTCAAATAGTTATGACTATTTTAACAATTAAT-TATTTAAAATCGTTATGACCTTTTATTTTGTC
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* *
124239 ATAAAACAATTGTTTTTGT-TCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
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* * * ** * *** *
124303 TTCAAAAATTAATGAGAAAAAGATTTTAAAAAAATAAAAGTGTTTTTTGAACAAA
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* ** * * * **
124358 TTTAAATAGTTACAACTATTTGAACAATTGTATATTTAAAATCATTATGATGTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * *
124423 TAAAACAATTGTTTTAGTT-TAAAAAAAG-TTATTTGAAATAAAACAATAATAATTTATTAATAT
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* * *
124486 TTCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAATTGAATTTATTTACCAAATCAG
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* * * * * * *
124535 TTTAAATAATTATGGCTATTTAAACAATTATCTAGTTCAAATCATTAGGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
124600 AAAAACTATTGTTTTTCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
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* * *
124665 --GAAATT-TTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT----AACA-
131 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACAG
* * * * * * *
124706 ---AAGTAG-T-T-CCTATTTGAATAATTA-CTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATT
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* * ** * * * *
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65 ATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * ** * * *
124828 TTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATATATCTGTTTGTCAAAGTAA
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-CAG
* * * *** * ** * * *
124881 TTCAAACATTTAAGACTGCATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTAAGAACTTTTATTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** *** ** **
124946 TAAAACAATCATCTCAGT-TCATACAAGCTT-TTTGAAATAAAATAATAAAAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGT-TTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
125009 CCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTCTACCGAATCA-
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-CAG
* * * * * * * ** * * *
125060 TTCTAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATTACCATTTGTTTGGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * *
125125 TATAACAAACG------ATCATTCAAGCTTATTC-GAGTAAAATAATACTAATTTATTAATCA-T
66 TAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATT
* * * * *
125182 TCAAAAATTAATAAGTAA-ACGATTTAAAATATAAAATTGTTTATCAAACTAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAC-AG
* * * * ** * * *
125234 CTT-AAATAATTATGACTATTTGAATAATTGA-ATACTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTCTAT
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
125297 CACAAAACAAGTATTTTTGT-TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAACACTAATCTAATAATA
64 CATAAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * **
125361 TTTTGAAAATTAATAACTAAGAGAATT-AAAAGTAAATTTGTTTGCTAAACCAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-CAG
** * * * **
125414 TTCAAATA-TTAAAACTATATGAACAATTATCTTTTTCAAACCATTATGATATTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** ** * *** * *
125478 TAAAACAA--AATTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* *
125541 TCAAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA-ATATTTATGTTTACCGAACCAA
130 TC-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA--TTTACCGAA-CAG
* * **
125595 TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** ** * *
125660 TAAAACAAATGTTTTTGT-TCATATAAGTTTGCTCGGAATAAAGTAATACTAATCTATTAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTT-TATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * ** *
125724 TC-GATAGT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTTTC-AAGTCAA
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA--CAG
* * * * **** *
125772 TTCAAATAGTTATGAGTATTTG-ACAAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTCAAATT
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
125836 ATAAAACAATT-ATTTCTATTCATACAAGCTTATTCATATTAAAATAACACTAATTTATTAATAT
65 ATAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * ** * *
125900 TTTGACAATTAATAAGTAAAATTTTTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACTAG
129 TTCAAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAC-AG
* * * * ** * * *
125954 ATT-AAATAGTCATGGCTATTTGAATAATTATCAATTTCAAATTGTTATGACTTTTTCTTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * * * * *
126018 ATAAAA-TATT-TTTCAATTATTATGC--GTTTATTCGAAATAAAATAATACCAGTTTATTAATA
65 ATAAAACAATTGTTT--TTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
126079 TTCCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAA-AGAATATGTTTACCAAACAAG
128 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATTTATTTACCGAAC-AG
* * * ** ** * *
126133 TTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTGGAATCGCTATAACCTTTTGTTTTGACA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *** *
126198 TAAAATAATT-TTTTCTACTCATACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
126261 T-AAGACAATTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATCAATCTATTTATCGAACAAG
130 TCAA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAC-AG
* ** * *
126313 TTCAAAT-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTATCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * *** * *** *
126377 TAAAACAATTGTTTCTGT-TCATACAAGGTTATTTGCATTAAAATAACGTTAA-TTATGAATATT
66 TAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * *
126440 TTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCCAACAAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAC-AG
* * * * * *
126492 TTGAAATAGTCATGATTATTTGAATAATTAACTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTAA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* ** * * ** *
126557 TAAAACAACTG-TTTCAATTCAAATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATGCTAATTTATTAATA-T
66 TAAAACAATTGTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * **
126620 TCTAAAGATTAAT-GGTAAGAGAATTAAAAAATGAATCTATTTATTGAACCAG
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* * *
126672 CTT-AAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAACATTATGACC-TTT-TTTTATC
1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * *
126734 ATAAAATAATTGGTTTTGT-TCATGCAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATA-TAAATTGATTAAT
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* * * * *
126796 ATTACAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACG
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* * * ** * *
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* * *
126915 T-AAACTAATTGTTTTTGT-TCATAAAAGCTTATT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAAT
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* * ** ** **
126977 TCCAACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTCGTTTATTGAGTGAG
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* * * * * * * *
127030 TTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTGTAATCTTTTGTCTTGTCA
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* * *
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* ** * * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * ** * *
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* * * *
127339 TCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCAAACCAG
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAA-CAG
* * * * *
127387 TTTAAATGGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACC-TTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
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* * * * * ***
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130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAAC-AG
* *** * * * * *
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* * * * * *
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* * * * **
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* * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
** * * * * *
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66 TAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * ** * * **
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130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTA-TTTACCGAA-CAG
** * * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* ** * * **** *
128001 ATAAAATAATTG-TTTTCGTCATACAAGCCTGTTTGGCATAAAATAATACTAATTTATTAATAAT
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* ** ** *
128065 TCAAAAATTAATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAAACTGCTTATC-AA-A-
130 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACAG
* * * * * * *
128113 --C-CAT--TTCT---TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGCTCTATTA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* *** * ** *
128170 TAAAATAATTGTTTCAAATCATATAAGCTTACTT-GGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT
66 TAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
** * * * * *
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* * * * * * *
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TAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACAG
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128427 AACTTTTTAC
* * * * * * *
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* * *
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* * * *
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* * **
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* * * ** *
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65 AATATTCCATAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAAT
* * *
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** * * * *
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* * * * * *
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** * * **
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* * * * **
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* *
129158 TTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTATT
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129198 GATATTCTAA
Statistics
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Consensus pattern (179 bp):
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ATATTCCATAAATTAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGTTCAAATA
GTTATGACATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT
Found at i:129661 original size:180 final size:179
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 7.7 Consensus size: 179
129182 TTCATACAAG
* * ** * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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** * ** * *
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1 TTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAAT
* * ** * * * * *
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65 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCAT
* * ** * * * * *
129685 AAAATAATTGTATCAATTTATACATGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAT
129 AAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAA
* * * * * * *
129736 TTTATTAACATTTAGAAAATTAATATA-CAAGAAATTTTAAAAAATAAGTATATTTATCGAACAA
1 TTTATTAATATTTA-AAAATTAATA-AGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCA
* * **
129800 ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACATTTT-TTTTACC
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* ** * * * *
129864 ATAAAACAACT-TTTCAATTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTATTAC
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* * * ** * *
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* * * * *
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* * * *
130043 ATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATGCAAGCCTATTCAAAATAAAATAATAGTAA
127 ATAAAACAATTGTTTTT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAA
* * * *
130096 TTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-CAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACTAG
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* * * * *
130160 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATATATTTGAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCA
64 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTATTTTGTCA
* * * *
130225 TAAAACAATTATTTATCTTCATACAAACTTATT-AGAAATAAAATAGTACTAA
128 TAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAGTACTAA
* * * * * * *
130277 TCTAATT-ATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTAAACCAA
1 T-TTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAA
* * * ** * *
130341 TT-AAATAGTTAAGA-TGATATGGATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
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* * * * * * ** *
130404 GTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATAGTATTAA
127 ATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAA
* * * * *
130457 TTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTACCCAACTAGT
1 TTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAAT
* * * * ** * *
130518 T-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAACATTTGTTTTGTCA
65 TCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTATTTTGTCA
130582 T
128 T
130583 TAAATAACTT
Statistics
Matches: 956, Mismatches: 208, Indels: 91
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
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CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTATTTTGTCATAA
AACAATTGTTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAGTACTAA
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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** * * * *
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123 CCTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATT-AATATTTC-AAAAATTAAGAAGCAGA
* * * * * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * * ** * * *
129471 CATATCAAATCATTATGATATTTATTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATT
66 TATTTAAAATCATTATGACATTTTTTTTATCATAAAACAA-T-CTTTTCATCATAAAAGCCTATC
* * * ** * * *
129536 CAGAGTAAAAT-ATTGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTA-A
129 CAAAATAAAATAATAG-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAGAAGCAGA
* ** * * * * ** * *
129585 GAGATTTAAAAAATAAATGCA-TTTGCCAAACCAGTTAAAATAGTGAAAACTATTAGAATAATTA
1 -AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * * * * * *
129649 TCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAT-TGTATCAATTTATACATGCT
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* * * * * *
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125 TATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAGA-AGC-AGA
* *
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1 AGA-TTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* *
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* * * * * ** *
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*
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1 AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATCAAA-CAAATTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTA
* * * * **
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64 TCTATTTAAAATCATTATGACA-TTTTTTTTATCATAAAACAA-T-CTTTTCATCATAAAAGCCT
* *
130074 ATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAGA
126 ATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGCAGA
* * * * * *
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1 AGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * *
130191 ATATTTGAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTATCTTCATACAAA-CTT
65 CTATTTAAAATCATTATGACATTTT-TTTTATCATAAAACAA-TCTTT-TCATCATA-AAAGCCT
* * * * * *
130255 AT-TAGAAATAAAATAGTACTAATCTAATT-ATATTAT-GAAAATTAATAA-CTA-A
126 ATCCA-AAATAAAATAATAGTAAT-TTATTAATATT-TCAAAAATTAAGAAGC-AGA
* * * * * * *
130307 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTAAACCAATT-AAATAGTTAAGA-TGATATGGATAATT
1 -AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATT
* ** * * * * * ** * **
130369 ATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTGTCGTAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTT
63 ATCTATTTAAAATCATTATGACATTTT-TTTTATCATAAAAC-AAT-CTTTTCATCATAAAAGCC
* *** * * *
130434 TGTTTGAAATAAAATAGTATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TA--AG-
125 TATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGCAGA
* * * * * * *
130484 AGATTTAATAAATAAATCTA-TTTACCCAACTAGTT-TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAACAAATTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * * * *
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64 TCTATTTAAAATCATTATG-ACATTTTTTTTATCATAAAACAATCTT-TTCATCATAAAAGCCTA
* *
130604 --C---AT--AAT--T-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TA--AG-
127 TCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGCAGA
* * * * * *
130642 AGATTTAAAAATTGAA-TATGTTTATCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAC
1 AGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * * * * **
130706 CTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTTTTTTCTATTCATACAAGTTT
65 CTATTTAAAATCATTATGACATTTT-TTTTATCATAAAACAA-TCTTTTC-A-TCATAAAAGCCT
* * * * * *
130771 ATTTC-AATTAAAATAATA-TAAATTTATTAACATTT-AGACAATT-AGTAAGTAAA
126 A-TCCAAAATAAAATAATAGT-AATTTATTAATATTTCA-AAAATTAAG-AAGCAGA
* * * * * * * *
130824 AGATATAAAGAATAACTCT-GTTTACCGAATAAATTCAAATAGTTATGATTATTTGAGCAATTAT
1 AGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * ** ** *
130888 TTATTTTAAAA-CATTATGACTTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTTGTTCATGCAAGCT
65 CTA-TTTAAAATCATTATGAC-ATTTT-TTTTATCATAAAACAA-T-CTTTTCATCATAAAAGCC
*** * * * ** * * *
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125 TATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAG-AAGCAGA
* ** * * ** * *
131006 AGATTTTAAAAATAAA-TATGTTTA-CTAAACATGTTTAAATAGTCAAAACTATTAGAATAATTA
1 AGATTTAAAAAATAAATTA-GTTTATC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * *
131069 TCTA-TTACAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAAT-TATATT-AGTTCTTATAAG
64 TCTATTTA-AAATCATTATGACATTTT-TTTTATCATAAAACAATCT-T-TTCA--TCATAAAAG
* *** * ** *
131131 CTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATG-AGTA-A
123 CCTATCCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-GAAGCAGA
* * * * * * * * *
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1 -AGATTTAAAAAATAAATTAGTTTATC-AAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * * ** * * *
131250 TCTATTTCAAATCATGATGACATTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTTTATTTGTACAATCTT
64 TCTATTTAAAATCATTATGACATTTT-TTTTATCATAAAACAA-TCTTTTCA-TCATAAAAGCCT
* * *
131315 ATTCC-AAATAGAATAATA-TATATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA-A
126 A-TCCAAAATAAAATAATAGTA-ATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGCAGA
*
131367 AAATTTAAAA
1 AGATTTAAAA
131377 TATATATTTA
Statistics
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AAATAAAATAATAGTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGAAGCAGA
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130444 AAAATAGTAT
* * *
130454 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAATAAATCTATTTACCCAACTAGTT
1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAATAAATATATTTACCAAACAAGTT
** * * *
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*
130583 TAAATAACTTATTCGAAAAAGCATAATTC
130 AAAATAACTTATTCGAAAAAGCATAATTC
* * *
130612 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAA-AAATTGAATATGTTTATCAAACAAGT
1 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAATAAA-TAAATATATTTACCAAACAAGT
* * *
130676 TTAA-ATAGTTATGACTATTTGAATAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCTTTTATTTTGTCA
65 TTAATA-AGTTATAACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCATTTATTTTGTCA
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129 TAAAATAA
130748 TTTTTTTCTA
Statistics
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TAATAAGTTATAACTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCGCTATAACCATTTATTTTGTCATA
AAATAACTTATTCGAAAAAGCATAATTC
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1 CTATTT
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Statistics
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CTATTTGAATAATTAT
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*
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1 TCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAAT
133818 TGTTACGACC
Statistics
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TCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATC
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133565 AATAATTATG
* * * * *
133575 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACTTTTGGTTTTGCCATAAAAAAATTGTAT
* * * * ** *
133640 TTGTTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAG
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* * *
133705 TAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATAGAATAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAAT
131 TAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAAC
133770 TATCTATTTAAAATCTCATA
196 TATCTATTTAAAATCTCATA
*
133790 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTT-GTTTTGCCATAAAAAAATTGTA
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACGA-CTTTTGGTTTTGCCATAAAAAAATTGTA
* * *
133854 TTAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGA
65 TTAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * * * *
133919 GTAAGAGA-TTTAAAATATGAATCTGTTTACT-GAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC
130 GTAAAAGATTTTAAAA-ATAAATATGTTTA-TAGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
*
133982 AACTATCTATTTCAAAT
193 AACTATCTATTTAAAAT
133999 TGTTATGACT
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Matches are distributed among these distances:
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ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACTTTTGGTTTTGCCATAAAAAAATTGTAT
TAGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG
TAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATAGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAAC
TATCTATTTAAAATCTCATA
Found at i:134184 original size:17 final size:17
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134127 TCTGAACAAG
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* *
134155 TTTGAATAATTATG-TA
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134171 TTTCAAATAGTTATGA
1 TTT-AAATAGTTATGA
134187 CTTTTTGTTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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133780 AAATCTCATA
* * * * * * * *
133790 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCATAAAAAAATTGTAT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * ** *
133855 TAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAG
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* ** *
133920 TAAGAGATTTA-AAATATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
129 --A-AGATTTAGAAA-ATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * * *
133984 CTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTATGTTCATACAT
190 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA
* * * * * *
134048 GCTTATTTCA-AACAAAATAATA-TAAATTTATTGATATTCCAAGAATTAACAAGTAAAAATTTT
254 GCTTA-TTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAGAATTAATAAGTAAAGATTTA
* * * *
134111 TAAAATAAAT-TAGTTTTCTGAACAAGTTTAAATAGTTAT
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* * * * * *
134150 GACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAACCAATTGTT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ***
134215 TTTGTTCATAC-AAGCA-TA-TTAA-AAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
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* * * * * * * * * *
134275 GTAAAAATTTTTA-AAAATATATTTGTTTATCGAGCAAGTTCATATCGTTATTACTATTTGAATA
128 G--AAGA--TTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * *
134339 ATTATTTCTTTCAAATAGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAA
189 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA
* * * *
134404 GTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTCTA-AATTAATAGGTAGGAGATTTAAA
254 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAGAATTAATAAGTA-AAGATTTAAA
* * *
134468 AAAAAAATCTGTTTACCGAACAAATTCAAATAGTCAT
318 AAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * *
134505 ATCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGACTTTTTATTATGTCATAAAACAATTGTT
1 A-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
134570 TTTGTTCATGCTAA-ATTATTCATAATAAAATAATGTTGATCTATTAATATTTTGAAAATTAATA
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATT--TAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
* * *
134634 AG-AGATTTAGAAACTAAATTTATTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
127 AGAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * *
134697 TATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTTCATACAAG
191 TATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTATTCATACAAG
* * ** * *
134761 CTTGTTCGGCTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAGAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAA
255 CTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-CTAGAATTAATAAGTAA-AGATTTAAA
* * ** * * * *
134826 AAATAAATGTGTTTGTTGAACCATTTCAAGTAGTTAAA
318 AAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-AT
* ** ** * * * * **
134864 ACTATTAGAAGTATTATCTATTTCAAATCACTCTGACCTTTTCTTTTGTTATAAAACAAACGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * *
134929 TTGTCCATATAAGTTTGTTTGGAACAAAATAATATTAATTTATTAATGTTTTGAAAATTAATAAG
66 TTGTTCATCTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG
* * * * * *
134994 -AGATTTAG---GTAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTAT
129 AAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * * * * * *
135055 TTATTTCAAGTTGTTATGACCATTTATTTTATAATAAAACAATTATTTTTATTAATACAATCTTA
194 CTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTA
* * ** * * *
135120 TTC-GCAATAAAGTAATGCTAATTCGTTAATATTCTAAAATTTAATAAGTAAAAAGTTTTAAAAA
259 TTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAGAA-TTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAA
* * * * *
135184 ATAATCT-ATCAGCTTG-ACCAGTACAAATAGTTAT
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* ** * * * *
135218 AACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTATTTTGTCACAAAACAACTCTT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * ** * * * ***
135283 TTTATTCATAC-AAGCTGCTTCCAAATAACATAAT-TCTGATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATT--TAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT
* * *
135346 AAGTAACAAATTTA-AAAACTGAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
126 AAG--A-AGATTTAGAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * *
135410 CAATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAA-AATTTTCTATCCATA
187 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTA-TTTCTATTCATA
* * * *
135474 CAAGCTTATTTTA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATT-TAGACAACTAATAAGTAAAAGA
251 CAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAG--AATTAATAAGT-AAAGA
** * *
135537 -TT-AAAAAAAAA-CTGTTTACCAAATAAGTGCAAATAGTTAT
312 TTTAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
135577 GACTATTTGAGCAATTATTTATTTTAAATCGTAATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-T
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * **
135641 TTTGTTTATATAAGCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATCATTAATAA
65 TTTGTTCATCTAAGATTATTT-AA-TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAA
** * ** * * *
135706 GTAACAGATTTTCAAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAA
128 G--A-AGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * * ** * * * **
135771 TTATCTATTTCAAA-TCTCAT-AAC---TA-TTAG-AAT-AATTATTTATTTCAAATCATTATGA
190 TTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCA-TACAA
* * ** * ** * * * * *
135828 CCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGT-A-TTAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAACAATA
254 GC--TT-ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA-TT-A-ATA---TT-CTAGAATTAATA-AGTA
* * ** * * * * *
135891 CTA-ATTTATTAATATTTCAAAAAT-TAATGAAT-AAGAGATTTAAAATATGAATT-T
308 -AAGATTTA--AA-A---AAAAAATCTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATA-G--TTAT
* ** * *
135945 ATTTATGGGACAAGTTCAAATGGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC
1 A-CTATTTG--AA---C-AA---TTAT--CTATTT---CAA--ATC--GTT---------ATGAC
* * * * * *
136010 TTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTATGATCATAC-ATGCTTATTTCAAATAAAATAATAT
38 TTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TGTTCAT-CTAAGATTATTT--AATAAAATAATAT
* * *** * * * **
136074 AAATTTATTACTATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTA-AAAATAAATCTATTTTCTGAACA
99 TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAG--AAGA-TTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACA
* * * * ** * **
136138 CGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATGTATTTCAAATAGTTAAAACCTTTTGCTTTGT
161 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGT
* * * ** * * *
136203 CATAAACCAAATGTTTCTATTCATACAAGGGTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATAT
226 CATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-
* * * * * * * * * *
136268 TTCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAAAACATAAATTTGTTTAC-CAAGCAAGTTTATATCGTT
290 TTCTAGAATTAATAAGTAAAGA-TTTAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAA-CAAGTTCAAATAGTT
136332 AT
353 AT
* * ** * *
136334 GACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAAAGTTATGA-TCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTAT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * ** * ** * * *
136398 TTCTCTTTATAAAAGTTTAGTCAGAATAAAATAATACTATTTTATTAATATTCTGAAAATTAATT
64 TTTTGTTCATCTAAGATTA-T-TTAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA-T
* * * * * * * * * * * *
136463 GGCAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAATAAGTTCAAATAATCATGTCCATTTGAATA
126 --AAGAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* ** * * *
136528 ATTATCTATTTGAAATCATTATGA-CTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATCTT-TATTCATGCA
189 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTAT-TTCTATTCATACA
** * * * * * *
136591 AAATTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATCAATATTTTAAAAATTAATAAG---AGATTTAA
253 AGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AGAATTAATAAGTAAAGATTTAA
* * * *
136653 AAACAAAATCTTTTTA--GCAAAATAGTTCAAATAGTTAGG
317 AAAAAAAATCTGTTTACTG-AACA-AGTTCAAATAGTTA-T
* * * * * * *
136692 ACTATTTGAACTATTA-CTTATCTCCAATCATTATGA-TCTTTATTTTGTCATAAAACAAATATT
1 ACTATTTGAACAATTATC-TATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * * ** *
136755 TATT-TTCA-CACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTCAATAATA-TTCCAAAACTTAG
65 T-TTGTTCATC-TAAGATTATT--TAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTAA
* * * * *
136817 TAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATACATGTGTTTGCCAAACCAA-TTC-AATAGTTAAGACT-TTT
125 TAAG--A-AGATTT--AGAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* ** * * * * *
136879 AGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TACTT
184 -GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TT
* * * * * * *
136943 CATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGTAAGT
247 CATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-TAGAATTAATAAGTAA-A
* * * **
137008 GATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-T
310 GA-TTTAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAG-TTAT
* * * **
137054 GACTATTTGAACAATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGA-TCTTTTGTTTTATCATAAAACAATCA
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTG
** ** * ** ** * * * **
137117 TTTCAGTTCA-AAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACCACTTTTTTTATATTTCAAAAATTAA
63 TTTTTGTTCATCTAAGA-TTAT--TTAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAA
* * * *
137181 TAAGCAAAAGATTTA-AAACCTAAAGTTCT-TTT-CCAATCTAGTTAAAATAGTTATGACTATTT
125 TAAG---AAGATTTAGAAA-ATAAA--TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * ** * * * * *
137243 GAACAAATATCAATCTCAAATCATTATGATC-TTTGTTTTCTAATAAAACAATTGTTTCTAGTCA
184 GAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCA
* * * * * * *
137307 TATAAGTTTATTTC-GTA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTATTAAG---AGA
249 TACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAGAATTAATAAGTAAAGA
* * * ** * * *
137367 TTTAAAAAAATAAATGTTTTTGCCAAACCAGTTCAAAGAGTTAAG
312 TTTAAAAAAA-AAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-AT
* * * * * * * * *
137412 ACTATTAGAAAAATTATCTATTTTAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTATT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG-TTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
** * * * * *
137476 TCAGTTCATAC-AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTAACA-TTTGAAAAAGTAAT
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTG-AAAATTAAT
* * *
137539 AAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
126 AAG--A-AGATTT-AGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * *** * * *
137604 TAATTATCTATTTAAAATAT-TTATGAAAATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTT-TAGTTCAT
187 CAATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCAT
* * * * * * *
137667 AAAATCTTATCCA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATT-TCAAAAGTTAATAAATAAAAAA
250 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AGAA-TTAATAAGT-AAAGA
* * * * * *
137730 TTTAAAAAATAAATCAGTTTA-TCAA-ATCATTTCAAATAATAAT
312 TTTAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * * *
137773 GGCCATTT-AACAACTATTTATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
**** * * *
137837 TTCCAACATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAGAATTAAT
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAA-AATTAAT
* * * * * *
137900 AAG-AGATTGAAAAAATAAATTTGTTTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
126 AAGAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
137964 TATCTATTTTAAA----TA--ACCTTTTATTCTATCATAAAACAAATGTTTCTATTCGTACAAGC
191 TATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGC
* * * * * *
138023 TTATTCATAATAAAA-AAAACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
256 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AGAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAA
* * * * *
138087 AATAAAT-TCGTTTGCTGAAC-CGTTCAAACAGTTAAG
319 AAAAAATCT-GTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTT-AT
* * * * * * * *
138123 ACTATATGAACAGTTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * **
138188 TAGCTCATAC-AAGCTTATTCGGAATAGAATAA-AGCTAACTT-TTAATATTTCAAAAATTTATA
66 TTGTTCAT-CTAAGATTATT--TAATAAAATAATA-TTAATTTATTAATATTTTGAAAA--T-TA
* ** * * * * * *
138250 CATAAG-AGATTTAGAAAATAATTCTACTTATCGAACCA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAAT
124 -ATAAGAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * * *
138313 AATTATCTATTTCAAA-TCTTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTGTTAATAT
188 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTT-TATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAC
* * *
138376 AAG-TTCGTTC-GAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATCAGTAAGAGA
252 AAGCTT-ATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAG--AATTAATAAGTAA-AGA
** * * * * * *
138438 TTTAAAAAGTAAATTTGCTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTT
312 TTTAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * * *
138481 GACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * * * * *
138546 TCTGTTCATACT-ATTTTATTCAGCATAAAATAAGACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATA
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATTTA--ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
* * * * ** * *
138610 ACCAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-TGAACCAA-TTCAAATAGTTCA-GACTATATGA
127 A-GAAG--ATTTAGAAAATAAATCT-GTT-TACCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGA
** * ** * * * **
138672 ATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CATTTT-TTTTTTTGTAAAACAATTGTTTTTGTTTGT
186 ACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAT
* * * * * *
138735 ACAAGCTTATTCTGATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG---AGATT
250 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAGAATTAATAAGTAAAGATT
* * * * * *
138797 TAAAAAATAAATTTGTTTA-TCAAACAA-TTCAAATGGCTAAG
314 TAAAAAAAAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAG-TTAT
* * * * * * * *
138838 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
*** ** * * * ** *
138903 CAATTCATAC-AACCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAA-CGTTCGAAAAGTTAATA
66 TTGTTCAT-CTAAGATTATT--TAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTAAT-
* * * **
138966 ACAAAAAGAGATTT--AAAA-AAA--TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATTACTATTCAAA
126 ---AAGA-AGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * ** * * *
139026 CAATTGTCAATTTAAAATCATTATAACCTTTTGA-TTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTT-AG
187 CAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TTCA-
*** * * * * *
139088 TACAAGCTTAGAGAGAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAAGAAA
249 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AGAATTAATAAGTAA-AGA
* * * * *
139153 TTTAAAAGATAAATTTGTTTAC-GAA-ATTAGTTGAAATAATTAT
312 TTTAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACA--AGTTCAAATAGTTAT
* * ** * * * *
139196 GGCTATTTAAATGATTATCTATTTGAAATCGTTATGATTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * *
139261 TTTGATCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTTAAT
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA-TTAAT
* * * *
139324 AAGTAAGAGATTT-GAAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGCA
126 AAG--A-AGATTTAG-AAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * * *
139388 TAATT-TTTAATCTCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTTAAAAAACAATTGTTTCTGA-TCAT
187 CAATTATCT-ATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-ATTCAT
* * * *
139450 AGAAGCTTATT-TGATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCATA-AATTAATAAGTAAGAG
250 ACAAGCTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-TAGAATTAATAAGTAA-AG
* ** * *
139513 ATTTAAAAAATAAATCTACTT-GTGGAACCAAG-TCAAATAGTTAAA
311 ATTTAAAAAAAAAATCTGTTTACT-GAA-CAAGTTCAAATAGTT-AT
* * * * * * * *
139558 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTCT-AATATTTTGTTTAGTCAT--AA-GATT-TT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * **
139618 TAT-TTCATATCTTGCAAGCTTATTAGGAATAAAATAAT-TCAAATTTATTAGCA-TTTGAAAAA
65 TTTGTTC--ATC-T--AAGATTATT--TAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTG-AAAA
* * * * *
139680 TTAATAAGCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAATTAT
121 TTAATAAG---AAGATTT-AGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * * * *
139745 TTGAACAATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT-TAGT
182 TTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-T
* * * * * * * * * *
139809 TTATAAAAGGTTATCCAAAATGAAATAATA-TAAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAA
246 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AGAATTAATAAGTAA
* * *
139873 TAG-TTTAAAAAAATAAAATC-ATTTACCGAACAAAG-TCAAATAGCTAT
309 -AGATTT-AAAAAA-AAAATCTGTTTACTGAAC-AAGTTCAAATAGTTAT
* * * ** * * *
139920 GACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGGTCTATTATAAAACAATTGTT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
*** * * ***
139985 TCAATTCATAC-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA
* * * * * * * * *
140049 AG-TGATTTA-AAAAGTGAATTTGTTTAACGAATC-AGCTCAAATAATTATTG-CCA-TTGTAAT
127 AGAAGATTTAGAAAA-TAAATCTGTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTG-AAC
* * * * * * *
140109 AATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTAGTCATATAACAAATTTTTTTTA-TCATAC
188 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AATTATTTCTATTCATAC
** * * * *
140173 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
252 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAGAATTAATAAGTAA-AGATTT
* * ** * *
140238 AAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAAAAGTTAT
315 AAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** ** * * ** *
140278 GACTATTTGAAGAATGGTATACTTAAAAT-AAATTATTTACAAAATAAACCTTTGGTTTTGTTAT
1 -ACTATTTGAACAAT--TAT-C-T-ATTTCAAA-TCGTT-----AT-GACTTTTTATTTTGTCAT
* * * * * * * *
140342 AAAATAATTATTTATGTTTATAC-AA-ACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATT
53 AAAACAATTGTTTTTGTTCAT-CTAAGA-TTATT--TAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT
*** * ** * * *
140405 CCAAAAAGTAATAACTAAG-AGATTTA-AAAATTAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAACTTGTT
114 TTGAAAA-T--TAA-TAAGAAGATTTAGAAAA-TAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT
* ** * * * *
140468 AAGACTACATGAACAATTACCAATTTAAAATTGTTACT-A-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
174 ATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTA-TGATC-TTTTATTTTGTCATAAAACAAT
* * ** * * * *
140531 TTTTTCAATTCATATTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTTAAAAATT
237 TATTTCTATTCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCT-AGAATT
* * * * * *
140595 AATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AACTAGTTCTAATAGTTAT
300 AATAAG-TAAAGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTA-CTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * *
140651 GACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACAAATGTT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* ** * * ** * *** *
140715 TTTG-T--TCT--G-TCATAAAAT-AAAT-GTTTTTGTTTA-TAGA-AGTTTGCTCA-GAATAA-
65 TTTGTTCATCTAAGATTATTTAATAAAATAATATTAATTTATTA-ATATTTTGAAAATTAATAAG
* * * * * * * *
140768 AATA-ATACAAATCTATTAA--TATTT--CAAA-AA-TT--AATA---A-GA-GATTTAAAAAAT
129 AAGATTTAGAAA---ATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * * * ** *** * *
140819 TAAACTCT-TTTTAATTTTGTTTTG-TCATAAAAAAT-T--T---A------TTTCAATTCATAT
191 T--A-TCTATTTCAA-ATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATAC
* * * * * * *
140870 AAGCTTATTCAAAATAACATAATATTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAGTAATTAAGAGATTT
252 AAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AGAATTAATAAGTAA-AGATTT
** * * *
140935 AGAAAATGAAA-CTGTTTACCGAAAAAGTTCAAATAATTAT
315 A-AAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* ** * * * *
140975 GACTATTTGAACAATTATCTATTT-AGATTCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATATAAA-GATT-
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATA-AAACAATTG
* ** ** *
141037 TCATTTGTTCATAC-AAGATTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTA
63 T-TTTTGTTCAT-CTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTA
* * *
141101 ATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAACAAATTCAAATCA-TTATGACTATTTG
124 ATAAG---AAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTG
* * * *
141165 AAC----A---A---CAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTTA
185 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-ATTTCTATTCA
* * * * *
141218 TACAAGCCTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGA
249 TACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AGAATTAATAAGT-AAAGA
* * * * * *
141283 TTTAAAAAATAAATATGTATA-TCGAATAATTTCAAATAGTTAAG
312 TTTAAAAAAAAAATCTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTT-AT
* * * * * * *
141327 ACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTAT-AATCTTTTATTTTGTAATAAAATAATAGTT
1 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACT-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * *
141391 TTAGTTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAGTGA
65 TTTGTTCATCTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTA---A
** * * * * *
141456 GTAAG-AGAACTAAAACAATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAAC
125 -TAAGAAGATTTAGAA-AATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
*** * * * * ***
141520 AATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTTATTTTATAAAAAAAACAATTGGCTCTATTCATAC
188 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGT-CATAAAACAATTATTTCTATTCATAC
* * * *
141585 AAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TATATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATT
252 AAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATT-CTAGAATTAATAAGTAAAGATT
* * * * * * *
141648 TGAAAAATAAATTTATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTAT
314 TAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* *
141689 GACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCG----G------TA---TG------ACCAATTGTT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT
* * * * * * **
141735 TCTATTCATAC-AAGCTTATTTGGAATGAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATA
65 TTTGTTCAT-CTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-
* * * ** * * * *
141799 ACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATA
126 A--AGAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * * * * *
141864 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGTAATAAAGCAATTGTTTCTATTCATAAAA
189 ATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAA
* ** * *
141929 GTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAA
254 GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AGAATTAATAAG-TAAAGATTTAA
* * * *
141994 AAAAAAAATTTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTCAT
317 AAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * * * ** * *
142032 GTCCATTTGAACTATCATCTATTTAAAATTGTTATGACATTTTGCTTTGTAGTAAAATAATACCA
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAC-TTTTTATTT-T-GT--CATAA-AACA
* ** * ** *
142097 ATTATTCAGAATAATTGGTATTCATAAAAAATTATTTAGAATAAAATAATACCAATTTATTACTA
59 ATTGTT-----T--TT-G--TTCATCTAAGATTATTT--AATAAAATAATATTAATTTATTAATA
** * * * *** * *
142162 TTTCAAAAATTTATAAG--GATTT-TAAAA-AAATGTGTTT-GTGAACTAGTTCAAATAGTTAAG
112 TTTTGAAAATTAATAAGAAGATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
** ** * * * * *
142222 -CTTATGAGAACAATTATCTATTTCAAATCATTCTGATC-TTT-TTTAGTCATGAAATAATTGTT
177 AC-TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * * *
142284 TC-AGTTCATTCATGCTTATTC-GAAATAAAATATTAATAATTTATTAACATTCAAAAATTAATG
241 TCTA-TTCATACAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAGAATTAATA
* * * *
142347 AGCATGAA-A-TT-AAAAAAAAATCTATTTACTGAACAAGCTCAAATAGCTAT
304 AG--TAAAGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
* * * * *
142397 AACTATTTCAACAATTATATATTTAAAATTGTTATGACCTTTTATTTT
1 -ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTT
142445 TATTGTAAAT
Statistics
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.09, T:0.40
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ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT
TTGTTCATCTAAGATTATTTAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAA
GATTTAGAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
ATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT
CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAGAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAAAAAAT
CTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTTAT
Found at i:135793 original size:34 final size:34
Alignment explanation
Indices: 135744--135820 Score: 118
Period size: 34 Copynumber: 2.2 Consensus size: 34
135734 ACTGAACAAG
* *
135744 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTAT
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*
135779 TTCAAATCTCATAACTATTAGAATAATTATTTAT
1 TTCAAATCTCATAACTATTAGAATAATTATCTAT
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1 TTCAAATC
135821 ATTATGACCT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (34 bp):
TTCAAATCTCATAACTATTAGAATAATTATCTAT
Found at i:135961 original size:215 final size:214
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Indices: 135589--136001 Score: 537
Period size: 215 Copynumber: 1.9 Consensus size: 214
135579 CTATTTGAGC
* * * ** * *
135589 AATTATTTATTTTAAATCGTAATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTTATATAA
1 AATTATTTATTTCAAATCATAATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTAGTTCATATAA
* * * ** **
135654 GCTTATTTGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATCATTAATAAGTAACAGATTTTC
66 GCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTTC
* *
135719 AAAATAAATATGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA
131 AAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
135784 ATCTCATAACTATTAGAAT
196 ATCTCATAACTATTAGAAT
*
135803 AATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTAGTTCATATA
1 AATTATTTATTTCAAATCATAATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGT-TTAGTTCATATA
* *
135868 GGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATGAA-TAAGAGA-TT
65 AGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AAGTAACAGATTT
* * * * *
135931 T-AAAATATGAATTTATTTA-TGGGACAAGTTCAAATGGTTATAACTGTTTGAACAATTATCTAT
129 TCAAAATA--AATATATTTACT-GAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTAT
135994 TTCAAATC
191 TTCAAATC
136002 ATTATGACTT
Statistics
Matches: 170, Mismatches: 24, Indels: 9
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (214 bp):
AATTATTTATTTCAAATCATAATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTTTAGTTCATATAA
GCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACAGATTTTC
AAAATAAATATATTTACTGAACAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
ATCTCATAACTATTAGAAT
Found at i:137417 original size:720 final size:719
Alignment explanation
Indices: 133790--140706 Score: 4060
Period size: 720 Copynumber: 9.6 Consensus size: 719
133780 AAATCTCATA
* ** * * * * *
133790 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTACGACCTTTTGTTTTGCCATAAAAAAATTGTAT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTAT-T
* * * * * *
133855 T-AGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATG
65 TCATTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAATA
* * ** * * *
133918 AGTAAGAGATTTAAAATATGAATCTGTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACA
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATA
* * ** * * *
133983 ACTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTATGTTCATACA
193 ATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACA
* * * ** * *
134047 TGCTTATTTC-AAACAAAATAATA-TAAATTTATTGATATTCCAAGAATTAACAAGTAA-AAATT
257 AGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATT
* * ** * * *
134109 TT-TAAAATAAA-TTAGTTTTCTGAACAAGTTTAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTATGTA
320 TTAAAAAATAAATTTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * * *
134171 TTTCAAATAGTTATGACTTTTTGTTTTTTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAGCATATT-
383 TTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * * *
134235 --AA-AAAA-AATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTTAAAAATATA
447 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGA-TTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
134296 TTTGTTTAT-CGAGCAAGTTCATATCGTTATTACTATTTGAATAATTATTTCTTTCAAAT-AGTT
511 TTTCTTTATCCAATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TT
* * * * * * *
134359 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCAAACAAGTTTA-TTCAGAATAAAATA
575 ATGA-CTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTAGTCATACAAGCTTATTTC-GTA-AAAATA
* * * * * * * *
134423 ATACTAATTTATTACTA-TTC-TAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAAAAAATCTGTTTACCG
637 ATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATA--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTGCCA
* * * *
134486 AACAAATTCAAATAGTCATA-
700 AACCAGTTCAAAGAGTTA-AG
* * * * * * *
134506 TCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATCGTTATGA-CTTTT-TATTATGTCATAAAACAATTGT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGT-TTA-GTCATAAAACAATTAT
* * * ** ** * * * *
134569 TT-TTGTTCATGCTAA-ATTATTCATAATAAAATAATGTTGATCTATTAATATTTTG-AAAA-T-
64 TTCAT-TTCATAC-AAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTA
* * * *
134629 -TAA-TAAGAGATTTAGAAACTAAATTTATTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTG
126 ATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTG
* * * * * * * **
134691 AACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTTTTCA
189 AATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCA
* **** ** * * *
134755 TACAAGCTTGTTCGGCTTAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAGAATTAGTAAGTAAGAGA
253 TACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAA
* * **** * * * ** * **
134820 -TTTAAAAAATAAATGTGTTTGTTGAACCATTTCAAGTAG-TTAAAACTATTAGAAGTATTATCT
318 TTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCT
** * * * * *** * * * * *
134883 ATTTCAAATCACTCTGACCTTTTCTTTTGTTATAAAACAAACGTTTTTGTCCATATAAGTTTGTT
382 ATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATT
*** * * * ** **
134948 TGGAACAAAATAATATTAATTTATTAATGTTTTGAAAATTAATAAG---AGATTT---AGGTAAA
446 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * * **
135007 TCTATTTA-CCAAACCAGTTCAATTAGTTATAACAATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTA
511 TTTCTTTATCCAATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * *
135071 TGACCATTTATTTTATAATAAAACAATTATTTTTATTAATACAATCTTA-TTCGCAATAAAGTAA
576 TGA-CTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTAGTCATACAAGCTTATTTCGTAA-AAA-TAA
* *** * * * * ** *
135135 TGCTAATTCGTTAATA-TTCTAAAATTTAATAAGTAAAAAGTTTTAAAAAAT-AATCTATCAGCT
638 TACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAAT-A-T-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTGCC
** * *
135198 TGACCAGTACAAATAGTTATA-
699 AAACCAGTTCAAAGAGTTA-AG
* * * * * * *
135219 ACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTATTTTGTCACAAAACAACTCT-T
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA-T-TAT
* ** ** * * * * *
135283 TTTA-TTCATACAAGCTGCTTCCAAATAACATAATTCTGATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
64 TTCATTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATA
* * * * * * *
135347 AGTAACAAATTTAAAAACTGAATCTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
129 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATA
* * *** * * * *
135412 ATTACCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTATTTTGTCATAAAATAAAATT-TTCTA-TCCATAC
193 ATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-ACAATTGTTTTAGTTCATAC
** * * * *
135475 AAGCTTATTTTAATTAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTTAGACAACTAATAAGTAA-AAGA-
256 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGAA-AT
* * * * * *
135537 -TTAAAAAA-AAA-CTGTTTACCAAATAAGTGCAAATAG-TTATGACTATTTGAGCAATTATTTA
319 TTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTA
* * * * * * *
135598 TTTTAAATCGTAATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TGTTTATATAAGCTTATTT
383 -TTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * ** ** * **
135662 GAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATCATTAATAAGTAACAGATTTTCAAAATAAA
447 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAA-AGATTTAAAAAATAAA
* * * * * *
135727 TATGTTTA-CTGAA-CAAGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCTCA
511 TTTCTTTATC-CAATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA--TCA
135790 TAACTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGT
573 T---TA-T-G-----------A---C---T--TT-TG----TTT-TTT-A--ATAAAACAATTGT
* * * * * *
135855 AT-TAGTTCATATAGGCTTATTT-GAAATAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA
605 TTCTAG-TCATACAAGCTTATTTCG-TA-AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA
* * * ** *
135918 TGAATAAGAGATTTAAAATATGAATTTATTTATG--GGACAAGTTCAAATG-GTTATA-
667 T--ATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTT-TGCCAAACCAGTTCAAA-GAGTTA-AG
* * * * * * *
135973 ACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * * * *
136038 TATGATCATACATGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATT-ACTATTCCAAAAATTAA
66 CAT-TTCATACAAGCTTA-TTCGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAC-ATTCGAAAAATTAA
* * * * ** * *
136100 TAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATCTATTTTCTGAACACGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
127 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
* * * * * *
136164 TAATTATGTATTTCAAAT-AGTTAAAACCTTTTGCTTTGTCATAAACCAAATGTTTCTA-TTCAT
191 TAATTATCTATTTAAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCAT
** * * *
136227 ACAAGGGTATTCAAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-AAAT
254 ACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAAT
* * * * * * * *
136291 TTTAAAACATAAATTTGTTTACCAAGCAAGTTTATATCG-TTATGACTGTTTGAACAATTATTTA
319 TTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTA
** * ** * * * * *
136355 TTTCAAAAAGTTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTCTTTATAAAAGTTTAGTC
383 TTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTC
* * * ** *
136420 AGAATAAAATAATACTATTTTATTAATA-TTCTGAAAATTAATTGGCAGGAGATTTAAAAAATAA
447 AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCA-AAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * * *
136484 ATTTGTTTATCGAAT-AAGTTCAAATAATCATGTCCATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCATT
510 ATTTCTTTATCCAATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * ** * *
136548 ATGACTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATCTT-TATTCATGCAAAATTATTTAGAATAAAATAA
575 ATGACTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGT-TTCTAGTCATACAAGCTTATTTCGTA-AAAATAA
* * *
136612 TACTGATCT-ATCAATATTTTAAAAATT-A-ATAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTTTTTAG-CA
638 TACTAATTTAAT-AATATTTCAAAAATTAATATAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTTTTT-GCCA
** * *
136672 AAATAGTTCAAATAGTTAGG
700 AACCAGTTCAAAGAGTTAAG
* * * * *
136692 ACTATTTGAACT-ATTA-CTTATCTCCAATCATTATGATCTTTAT-TTT-GTCATAAAACAAATA
1 ACTATTAGAA-TAATTATC-TATTTCAAATCATTATGACCTTT-TGTTTAGTCATAAAACAATTA
* * * * * * * *
136753 TTT-ATTTTCACACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAAAACTTAG
63 TTTCA-TTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAA
* *
136817 TAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATACATGTGTTTGCCAAACCAA-TTC-AATAGTTAAGACT-TTT
127 TAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTT
* * * * *
136879 AGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTACTTC
188 -GAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTC
* * ** * **
136944 ATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGTAAGTG
252 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAA
137009 ATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCT
317 ATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * * * *
137074 ATTTAAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATCATTTCAGTTCAAAAAAACTTATC
382 ATTTAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATT
* * * * **
137139 CAAAATAAAATAATACCACTTTTTTTATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAACCTAA
446 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-AAAGATTTAAAAAATAA
* * * * * * *
137204 AGTTCTTT-TCCAATCTAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATT
510 ATTTCTTTATCCAATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
* * *
137268 ATGA-TCTTTGTTTTCTAATAAAACAATTGTTTCTAGTCATATAAGTTTATTTCGTAAAAATAAT
575 ATGACT-TTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTAGTCATACAAGCTTATTTCGTAAAAATAAT
*
137332 ACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT-AT-TAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTTTTTGCCAAAC
639 ACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTTTTTGCCAAAC
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703 CAGTTCAAAGAGTTAAG
* * * * *
137412 ACTATTAGAAAAATTATCTATTTTAAATCGCTT-TGACCTTTTGTTTAGTCATACAATAATTATT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC-ATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATT
* * * * *
137476 TCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTGTTAACATTTGAAAAAGTAATAA
65 TCATTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAA
* * * *
137541 GCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATA
130 GTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATA
** * *
137606 ATTATCTATTTAAAAT-ATTTATGAA-AATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAA
193 ATTATCTATTTAAAATCA-TTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAC
* * * * * * *
137669 AATCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAATAA-AAAATT
256 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTT
* * * * * * * *
137732 TAAAAAATAAA-TCAGTTTATCAAATC-ATTTCAAATA-ATAATGGCCATTT-AACAACTATTTA
321 TAAAAAATAAATTTA-TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGAT-TTGACTATTTGAACAATTATCTA
* * *** *
137793 TTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTT-TCCAACATACAAGCTTATT
383 TTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATAAAAGCTTATT
** * *
137857 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTAATAAG---AGATTGAAAAAATAAA
446 CAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
137919 TTTGTTT-GCCGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTTAAAT-A--
511 TTTCTTTATCC-AATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * * * * * *
137979 A--CCTTTTATTCTATCATAAAACAAATGTTTCTATTCGTACAAGCTTA-TTCATAATAAAAAAA
575 ATGACTTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTAGTCATACAAGCTTATTTCGTAA-AAATAAT
* ** * **
138041 ACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTGCTGA
639 ACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTTGCCAA
*
138105 ACC-GTTCAAACAGTTAAG
701 ACCAGTTCAAAGAGTTAAG
* * * * ** *
138123 ACTA-TATGAACAGTTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATT
1 ACTATTA-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATT
* ** * * * *
138187 TTAGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAA-AGCTAACTT-TTAATATTTC-AAAAATTTAT
65 TCATTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATA-CTAATTTATTAACA-TTCGAAAAATTAAT
* * * * * *
138249 ACA-TAAGAGATTTAGAAAAT-AATTCTACTTATCGAACCA-TTCAAATAATTATA-ACTATTTG
128 A-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTGT--TTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTG
* * * * *
138310 AATAATTATCTATTTCAAATC-TTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTGTTAA
189 AATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA
* * * * *
138373 TATAAG-TTCGTTCGAAAGAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATCAGTAAGA
253 TACAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAAGTAAGA
* * ** * * * * *
138436 GA-TTTAAAAAGTAAATTTGCTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATC
316 AATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * * * ** ** **
138500 TATTTAAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTGTTCATACTATTTTAT
381 TATTT-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTAT
** * * ** * * * *
138565 TCAGCATAAAATAAGACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAATA
445 TCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAA-AGATTTAAAAAATA
* ** * ** * * * **
138630 AATCTAATTGTTGAA-CCAATTCAAATAGTTCA-GACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATTG
509 AATTTCTTTATCCAATCCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
** * ** *
138693 TTATGACATTTT-TTTTTTTGTAAAACAATTGTTT-TTGTTTGTACAAGCTTA-TTCTGATTAAA
573 TTATGAC-TTTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTAG-TCATACAAGCTTATTTC-G-TAAAA
* **
138755 ATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATT-A-ATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTGTTTAT
634 ATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTT-TTTGC
* *
138817 CAAA-CAATTCAAATG-GCTAAG
698 CAAACCAGTTCAAA-GAGTTAAG
* * *
138838 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * ** * * *
138903 CAATTCATACAACCTTATTCAAAATAAATTAATACTAATTTATTAACGTTCGAAAAGTTAATAAC
66 CATTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAAT-A-
** * ** ** *
138968 AAAAAGAGATTT--AAAA-AAA-TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATTACTATTCAAACAA
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* * *
139029 TTGTCAATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTT-AGTACAA
194 TTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCA-TACAA
*** * * *
139093 GCTTAGAGAGAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAATAAGAAA-TTTA
258 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTA
* * * ** * * * **
139157 AAAGATAAATTTGTTTACGAAATTAGTTGAAATA-ATTATGGCTATTTAAATGATTATCTATTTG
323 AAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTT-
** * * * * **
139221 AAATCGTTATGATTTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAA
386 AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAA
* * * * * *
139286 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATCTG
451 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAA-AGATTTAAAAAATAAATTTC
* * * * * * * * *
139351 TTTA-CCAAACTAGCTCAAATAGTTATGACTGTTTGCATAATT-TTTAATCTCAAATCGTTAAGA
515 TTTATCCAATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGA
*
139414 -TCTTTGTTTTGTTAA-AAAACAATTGTTTCT-GATCATAGAAGCTTATTT-GATTAAAAATAAT
579 CT-TTTGTTTT-TTAATAAAACAATTGTTTCTAG-TCATACAAGCTTATTTCG--TAAAAATAAT
* ** ***
139475 ACTAATTTAATAATATTTCATAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTACTTGTGGAA
639 ACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTGCCAAA
* *
139540 CCAAG-TCAAATAGTTAAA
702 CC-AGTTCAAAGAGTTAAG
* * * * ** * ***
139558 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTCTAATATTTTGTTTAGTCATAAGATTTTTATTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * * * * * * *
139623 CATATCTTGCAAGCTTATTAGGAATAAAATAATTCAAATTTATTAGCATTTGAAAAATTAATAAG
66 CATTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCGAAAAATTAATAAG
* * * * * *
139688 CAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATA-ATTATTTGAACA
131 TAAGAGATTT-AAAAAATAAAT-TGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTTGAATA
* ** * * * * *
139752 ATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAAA
193 ATTATCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAA
* * * * * * * * *
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258 GCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTT
* * * * *
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* * * * * ** * **
139944 AAAATTGTTATGACCTTTTGGTCTATTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTTGAA
386 -AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAAA
* * * * *
140009 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG---TGATTTAAAAAGTGAATTTG
450 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGATTTAAAAAATAAATTTC
* * * * * ** *
140071 TTTAACGAAT-CAGCTCAAATAATTATTG-CCA-TTGTAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATT
515 TTTATCCAATCCAGTTCAAATAGTTA-TGACTATTTG-AATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
** * * * * * *
140133 ACCTTTTGTTTAGTCATATAACAAATTTTTTTTA-TCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATA
578 A-CTTTTGTTTTTTAATAAAAC-AATTGTTTCTAGTCATACAAGCTTATTTCGTA-AAAATAATA
* * * *
140197 CTAATTTAGTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAC
640 CTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTGCCAAAC
* *
140262 CAGTTCAAAAAGTTATG
703 CAGTTCAAAGAGTTAAG
* * ** * * * * *
140279 ACTATTTGAAGAATGGTATACTTAAAAT-AAATTATTTACAAAATAAACCTTTGGTTTTGTTATA
1 ACTATTAGAATAAT--TAT-C-T-ATTTCAAATCA-TT-----AT-GACCTTTTGTTTAGTCATA
* * * * * * * *
140343 AAATAATTATTT-ATGTTTATACAAACTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCC
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* * * ** * * *
140407 AAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGTTTGTCAAACTAGTTCAACTTGTTAAGA
118 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTAAGA
** * * * ** *
140472 CTACATGAACAATTACCAATTTAAAATTGTTACT-ACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTT
182 CTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTA-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* ** *
140535 TCAATTCATATTAGCTTATTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
246 T-AGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
* * * * *
140599 AGTTAGAGA-TTTAAAAAAT-AATTCTATTTACCTAACTAGTTCTAATAG-TTATGACTATTTGA
309 AGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATT-TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGA
* * *
140661 ATAATTATCTATTTTAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
372 ACAATTATCTA-TTTAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAA
140707 CAAATGTTTT
Statistics
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706 5 0.00
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Consensus pattern (719 bp):
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TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAA
AATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAATC
GTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTCTGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAGATTTAAAAAATAAATTTCTTTATC
CAATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTGT
TTTTTAATAAAACAATTGTTTCTAGTCATACAAGCTTATTTCGTAAAAATAATACTAATTTAATA
ATATTTCAAAAATTAATATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTGCCAAACCAGTTCAAAGAGT
TAAG
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Alignment explanation
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* * *
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* * * * * *
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* * **** * * *
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* * * *
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* * * * *
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** * * * **
136176 TCAAAT-AGTTAAAACCTTTTGCTTTGTCATAAACCAAATGTTTCTATTCATACAAGGGTA-TTC
380 TCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC
* * * * *
136239 AAAATAAAATAATATTATTTTATTAATATTTCAAAAATTA-ATAAGTAAAAATTTTAAAACATAA
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* * * * *
136303 ATTTGTTTACCAAGCAAGTTTATATCGTTATG
505 ATTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * ** * * ** *
136335 ACTGTTTGAACAATTATTTATTTCAAAAAGTTATGATCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTC-AAATCTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
** * * * * * * * * **
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* * * * * * * * * * *
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130 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
** * *
136530 TATCTATTTGAAATCATTATGACTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATCTTTA-TTCATGCAAAA
195 TATCTATTTGAAATTGTTATGACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGT-TTTAGTTCAT--AAAA
* * * * * *
136594 --TTATTTAGAATAAAATAATACTGATCTATCAATATTTTAAAAATTAATAAG----AGATTTAA
257 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAA
* * * * *
136653 AAACA-AAA-TCTTTTTAGCAAAATAGTTCAAATAGTTAGGACTATTTGAACTATTA-CTTATCT
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* * * * * * * * *
136715 CCAATCATTATGATC-TTTATTTTGTCATAAAACAAATATTTATTTTCACACAAGCTTA-TTCGG
381 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGA
* * * * * *
136778 ATTAAAATAATACTAATTCAATAATATTCCAAAACTTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATACA
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* * * *
136843 TGTGTTTGCCAAACCAATTC-AATAGTTAAG
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* *
136873 ACTTTTAGAATAATTATCTATTTCAAATCATTCTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * * ** * ** *
136938 TACTTCATACAATCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAG
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*
137003 TAAGTGATTTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTGAACA
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** * *
137067 ATTATCTATTT-AAAGTTGTTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATCATTTCAGTTCAAAAA
193 ATTATCTATTTGAAA-TTGTTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
* * * * * *
137131 AACTTATCCAAAATAAAATAATACCACTTTTTTTATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTA
256 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTA
** * * * *
137196 AAACCTAAAGTTCTTTTCCAATCTAGTTAAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCA
321 AAAAATAAA-TTCTTTTCCAA-C-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * *
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*
137324 -AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAT-TAAGAGATTTAAAAAAATAAATGTT-T
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* * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * *
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* ** * *
137606 ATTATCTATTTAAAATAT-TTATGAAAATTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTAGTTCATAAA
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* * * * ** *
137670 ATCTTA-TCCAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAATAAAAAATTTA
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* * * * * * * *
137734 AAAAATAAA-TCAGTTTATCAAATCATTTCAAATAATAATGGCCATTT-AACAACTATTTATTTC
321 AAAAATAAATTC--TTT-TCCAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* * * * * *
137797 AAATCGTTATTACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTTCCA-ACATACAAGCTTATTT-GA
382 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGA
* *
137860 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATTA-ATAAGAGATTGAAAAAATAAATTTGT
446 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT
* *
137924 TTGCCGAACCAGTTCAAATAGTTATG
511 TTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * *
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1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCTTATAACCTTTTGTT-TAGTCATAAAACAATTATTT
* ** * * *
138009 CTA-TTCGTACAAGCTTATTCATAATAAAA-AAAACTAATTTAGTAATATTTTGAAAATTAATAA
65 C-AGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
* ** * ** * * * * *
138072 CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTCGTTTGCTGAAC-CGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAACAG
129 GTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAA
* * * * *
138136 TTATTTATTTGAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGCTCATACAAG
194 TTATCTATTTGAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAG
** * * *
138201 CTTATTCGGAATAGAATAA-AGCTAACTT-TTAATATTTCAAAAATTTAT-A-CATAAGAGATTT
258 CTTATTCAAAATAAAATAATA-CTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCA-AA-AGATTT
* * * * *
138262 AGAAAAT-AATTCTACTTATCGAACCA-TTCAAATAATTATAACTATTTGAATAATTATCTATTT
320 AAAAAATAAATTCT--TT-TCCAA-CAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * **
138325 CAAATC-TTATTA-CTTTATGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTGTTAATATAAG-TTCGTTCG
381 CAAATCATTATGACCTTT-TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG
* *
138387 AAAGAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAA
445 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCA-AAAATT-AT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * *
138451 TTTGCTTACTAAACCATTTCAAATAGTTTTG
506 TTTGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * **
138482 ACTATTTGAATAATTATCTATTTAAAATCATTATAACATTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * ** * * * * * * *
138547 CTGTTCATACTATTTTATTCAGCATAAAATAAGACTAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAAC
65 CAGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG
* * * * ** * * *
138612 CAAGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGT-TGAACCAA-TTCAAATAGTTCA-GACTATATGAAT
130 TAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TTATT-TACCAAACAAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAAC
* * * ** * ** *
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192 AATTATCTATTTGAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
** * * *
138738 AGCTTATTCTGATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTA
256 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTA
* * * * * * * *
138799 AAAAATAAATTTGTTTATCAAACAATTCAAATGGCTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAA
321 AAAAATAAA-TTCTTT-TCCAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * *
138864 ATCATTTTGACCTTTTGTTTAGTTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAACCTTA-TTCAAAAT
384 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAAAT
* ** * *
138928 AAATTAATACTAATTTATTAA-CGTTCGAAAAGTTAATAACAAAAAGAGATTT--AAAA-AAA--
449 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATT-AT----ATAAGAGATTTAAAAAATAAATT
** *
138987 TGTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATT
508 TGTTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
139016 ACTATTCA-AACAATTGTCAATTTAAAATCATTATAACCTTTTGATTT-GTCATAAAACAATTGT
1 ACTATT-AGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAAACAATTAT
* ** *
139079 TTTAGTT-AGTACAAGCTTA-GAGAGAATAAAATAATCCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
63 TTCAGTTCA-TACAAGCTTATTCG-GAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA
* * * * * ** * * * *
139142 TAAATAAGAAATTTAAAAGATAAATTTGTTTACGAAATTAGTTGAAATAATTATGGCTATTTAAA
126 TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
** * * * * *
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191 CAATTATCTATTTGAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAA
** * * * *
139272 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTTAATAAGTAAGAGATTT
255 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT
* * * * * * *
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320 AAAAAATAAATTCT-TTT-CC-AAC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATT
* * * * * *
139400 TCAAATCGTTAAGATC-TTTGTTTTGTTAAAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAGCTTATTT-
380 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTTC
* * *
139462 G-ATTAAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCATAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA
444 GAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT-AT-A-TAAGAGATTTAAAAAATAA
* ** **** **
139526 ATCTACTTGTGGAACCAAG-TCAAATAGTTAAA
505 ATTTGTTTACCAAACC-AGTTCAAATAGTTATG
* * ** * ***
139558 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAGATCGTTCTAATATTTTGTTTAGTCATAAGATTTTTATTT
1 ACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATC-TTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT
* * * * * ** *
139623 CA-TATCTTGCAAGCTTATTAGGAATAAAATAATTCAAATTTATTAGCATTTGAAAAATTAATAA
65 CAGT-TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA
* * * * * *
139687 GCAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACA
129 GTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * * *
139752 ATTATTTATTTAAAATTGTTATGACCTATTGTTTTGA-CATAAAACAATTGTTTTAGTTTATAAA
193 ATTATCTATTTGAAATTGTTATGA-CTTTTGTTTT-ATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAA
* * * * ** *
139816 AGGTTATCCAAAATGAAATAATA-TAAATTTCTTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAATAG-TTT
256 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTT
* * *
139879 AAAAAAATAAAATCATTTACCGAACAAAG-TCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
320 -AAAAAATAAATTC-TTTTCC-AAC--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* ** * * * * *
139943 TAAAATTGTTATGACCTTTTGGTCTATTATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTT-G
380 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCG
* * * *
140007 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTA-ATAAGTGATTTAAAAAGTGAATTTG
445 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTG
* * * * *
140071 TTTAACGAATCAGCTCAAATAATTATTG
510 TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTA-TG
* * * *
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1 ACTATTAG-AATAATTATCTATTTCAAA-TCTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAAC-AATTAT
** * * * *
140161 TT-TTTATCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAGTAATCTTTCAAAAATTAAT
63 TTCAGT-TCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
* * * *
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** * * * * * * *
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192 AAT--TAT-C-T-ATTTGAAATT-GTT-----AT-GA-CTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTT
* * * * * *
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244 TTA-GTTCATA-AAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * * * **
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* * * ** * * *
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368 CAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
** * * * *
140545 TTAGCTTA-TTCAAAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTTAGAGA
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* * * *
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* * *
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Statistics
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AGTTCATACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
ATCTATTTGAAATTGTTATGACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTT
ATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAAAA
TAAATTCTTTTCCAACAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAAATAAAATAA
TACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTATATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACC
AGTTCAAATAGTTATG
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*
137629 AAAATTTGTTTT-G-TCATAA
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1 AA
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Statistics
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*
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TTTTGTTCTGTCATAAAACAAATGT
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* * * *
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* * * * *
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* * *
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* *
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** *
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** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * ** *
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** * * ** * *
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1 TTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGCATTTGTTCATA-C-AAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTA
* * * ** * *
141773 ATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCAAGCGAG
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* * * ** * **
141838 TTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATT
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
* * * * * * ** *
141890 TTTTGTTTTGTAATAAAGCAATTG-TTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTA
1 TTTTGTTTTGTCATAAA-AAATTGCATT-TGTTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATTA
* * * * *
141954 ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCGAACAAG
64 ATTTATTAATA-T-TAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAG
* * * * * * *
142019 TTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATCATCTATTTAAAAT
127 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
142061 TGTTATGACA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TTATTAATATTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCA
AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
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141003 TCACTATAAC
* * *
141013 CTTTTGTTTTGTCATATAAAGATTTCATTTGTTCATACAAGATTATTTCAAATAAAATAATACAA
1 CTTTTGTTTTGTCATATAAAAATTGCATTTGTTCATACAAGACTATTTCAAATAAAATAATACAA
*
141078 ATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTCACCAAACAAA
66 ATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTCACCAAACAAA
*
141143 TTCAAATCA-TTATGACTATTTGAACAACAAATTGTTATGA
131 TTCAAAT-AGTTAAGACTATTTGAACAACAAATTGTTATGA
** * * * *
141183 CTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGGTTTTGTTTATACAAGCCTA-TTCAGATTAAAATAATAT
1 CTTTTGTTTTGTCATATAAA-AATTGCATTTGTTCATACAAGACTATTTCA-AATAAAATAATAC
* ** * * *
141246 TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTAT-ATCGAAT
64 AAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGT-TCACCAAAC
*
141310 AATTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
128 AAATTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
141337 TAATTATCCA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTCACCAAACAAA
TTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAACAAATTGTTATGA
Found at i:141744 original size:161 final size:162
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Period size: 162 Copynumber: 1.9 Consensus size: 162
141564 AACAATTGGC
*
141574 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TATATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
1 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATA
* * *
141638 AGC-AAAA-ATTTGAAAAATAAATTTATTT-TCTAAAC-ACGTTCAAATAGTTATGACCATTTGA
65 A-CTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTC-AAACGA-GTTCAAATAGTTATGACCATTTAA
141699 ACAATTATCTATTTCAAATCGGTATGACCAATTGTT
127 ACAATTATCTATTTCAAATCGGTATGACCAATTGTT
** * *
141735 TCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATGAAATAATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAA
1 TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAA
* * *
141800 CTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCAAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAA
66 CTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACCATTTAAACAA
*
141865 TTATTTATTTCAAAT
131 TTATCTATTTCAAAT
141880 TGTTATGATT
Statistics
Matches: 128, Mismatches: 12, Indels: 9
0.86 0.08 0.06
Matches are distributed among these distances:
160 1 0.01
161 61 0.48
162 63 0.49
163 3 0.02
ACGTcount: A:0.44, C:0.11, G:0.07, T:0.38
Consensus pattern (162 bp):
TCTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAA
CTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTCAAACGAGTTCAAATAGTTATGACCATTTAAACAA
TTATCTATTTCAAATCGGTATGACCAATTGTT
Found at i:141877 original size:525 final size:528
Alignment explanation
Indices: 140857--142028 Score: 1265
Period size: 525 Copynumber: 2.2 Consensus size: 528
140847 AAAAAATTTA
* * ** * * *
140857 TTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAACATAATATTAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAGT
1 TTTCTATTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAGT
* * * * * * *
140922 AATTAAGAGATTTAGAAAATGAAACTGTTTACCGAAAAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
66 AAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAAC
** * * * * * * * * *
140987 AATTATCTATTTAGATTCACTATAACCTTTTGTTTTGTCATATAAAGATTTCATTTGTTCATACA
131 AATTATCTATTTAGAAACACTATAACCTTTTATTTTATAAAAAAAAAATTGCATCTATTCATACA
*
141052 AGATTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTA
196 AGATTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGCAAAAGATTTA
* * *
141117 AAAAATAAATCTGTTCACCAAACAAATTCAAATCATTATGACTATTTGAACAACAAATTGTTATG
261 AAAAATAAATCTATTCACCAAACAAATTCAAATCATTATGACCATTTG-A-AACAAATTATTAT-
**** ** * * * *
141182 ACTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTTATACAAGCCTATTCAGATTAAAATAATATT
323 A-TTCAAATCGGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACT
* ** * * * *
141247 AATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTATATCGAATAA
387 AATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATATATCGAACAA
* *
141312 TTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAATTATCCATTTCAAATCATTATAATCTTTTATTTTGTA
452 GTTCAAATAGTTAAGACTATTTAAATAATTATCCATTTCAAATCATTATAATCTTTTATTTTGTA
*
141377 ATAAAATAATAG
517 ATAAAACAATAG
141389 TTT-TAGTTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAG
1 TTTCTA-TTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAG
* **
141453 TGAGTAAGAGAACTAAAACAATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAA
65 TAAGTAAGAGATTTAAAA-AATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAA
* *
141518 ACAATTATCTATTTCA-AAACATTATGACCTTTTATTTTATAAAAAAAACAATTGGC-TCTATTC
129 ACAATTATCTATTT-AGAAACACTATAACCTTTTATTTTATAAAAAAAA-AATT-GCATCTATTC
* * *
141581 ATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATATATATTTATTAATATTCCAA-A-AATTAATAAGCAAA
191 ATACAAGATTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT--AAGACAATTAATAAGCAAA
* * ** * **
141644 A-ATTTGAAAAATAAATTTATTTTCTAAACACGTTCAAAT-AGTTATGACCATTTG-AAC-AATT
254 AGATTTAAAAAATAAATCTATTCACCAAACAAATTCAAATCA-TTATGACCATTTGAAACAAATT
* * * ** *
141705 ATCTAT-TTCAAATCGGT-AT-GACCAATT-GTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGGAATGAAAT
318 AT-TATATTCAAATCGGTCATAAAACAATTGGTTT-TATTCATACAAGCCTATTCAGAATAAAAT
* * *
141766 AATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGTC
381 AATACTAATTTATTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATATATC
* * ** ** * * *
141831 -AAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTG
446 GAA-CAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTAAATAATTATCCATTTCAAATCATTATAATCTTTTA
* *
141895 TTTTGTAATAAAGCAATTG
510 TTTTGTAATAAAACAATAG
* * * * *
141914 TTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
1 TTTCTATTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAGT
* ** * *
141979 AAGTTAGAGATTTAAAAAAAAAATTTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGT
66 AAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGT
142029 CATGTCCATT
Statistics
Matches: 531, Mismatches: 97, Indels: 32
0.80 0.15 0.05
Matches are distributed among these distances:
524 35 0.07
525 218 0.41
526 4 0.01
527 5 0.01
529 5 0.01
530 6 0.01
531 1 0.00
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535 2 0.00
536 2 0.00
ACGTcount: A:0.43, C:0.09, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (528 bp):
TTTCTATTAATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAGT
AAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAAC
AATTATCTATTTAGAAACACTATAACCTTTTATTTTATAAAAAAAAAATTGCATCTATTCATACA
AGATTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGCAAAAGATTTA
AAAAATAAATCTATTCACCAAACAAATTCAAATCATTATGACCATTTGAAACAAATTATTATATT
CAAATCGGTCATAAAACAATTGGTTTTATTCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATT
TATTAAAATTTCAAAAATTAATAACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATATATCGAACAAGTTC
AAATAGTTAAGACTATTTAAATAATTATCCATTTCAAATCATTATAATCTTTTATTTTGTAATAA
AACAATAG
Found at i:142054 original size:343 final size:344
Alignment explanation
Indices: 141402--142069 Score: 806
Period size: 343 Copynumber: 1.9 Consensus size: 344
141392 TAGTTAATAT
* * * * *
141402 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAGTGAGTAAGAGAACT
1 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGAACT
* *
141467 AAAACAATGAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTT
66 AAAACAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTT
*
141532 CAAAACATTATGACCTTTTATTTTATAAAAAAAACAATTGGCTCTATTCATACAAGCTTATTTCA
131 CAAAACATTATGACCTTTTATTTTATAAAAAAAACAATTGGCTCTATTCATAAAAGCTTATTTCA
* *
141597 AATAAAATAATATATATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATTTGAAAAATAAATTT
196 AATAAAATAATATATATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATTTAAAAAAAAAATTT
* * * * * *
141662 ATTTTCTAAACACGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGGTATGAC
261 ATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATCATCTATTTAAAATCGGTATGAC
141727 CAATTGTTTCTATTCATAC
326 CAATTGTTTCTATTCATAC
* * **
141746 AAGCTTATTTGGAATGAAATAATACTAATTTATTAAAATT-TCAAAAATTAATAACTAAAAGATT
1 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCT-AAAAATTAATAACTAAAAGAAC
** * * * *
141810 TAAAA-AATAAATCTATTTGTC-AAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTAT
65 TAAAACAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTAT
*** ** * * * * ** *
141873 TTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTTTGT-AATAAAGCAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTT
129 TTCAAAACATTATGACCTTTTATTTTATAAAAAAAACAATTGGCTCTATTCATAAAAGCTTATTT
** * * * *
141937 GGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAAAAA
194 CAAATAAAATAATA-TATATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAG-CAAAAATTTAAAAAAAAA
* * * * * * *
142001 ATTTGTTTACCGAACAAGTTTAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATCATCTATTTAAAATTGTTA
257 ATTTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATCATCTATTTAAAATCGGTA
142066 TGAC
322 TGAC
142070 ATTTTGCTTT
Statistics
Matches: 269, Mismatches: 51, Indels: 9
0.82 0.16 0.03
Matches are distributed among these distances:
342 71 0.26
343 140 0.52
344 58 0.22
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.09, T:0.38
Consensus pattern (344 bp):
AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAACTAAAAGAACT
AAAACAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTT
CAAAACATTATGACCTTTTATTTTATAAAAAAAACAATTGGCTCTATTCATAAAAGCTTATTTCA
AATAAAATAATATATATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAATTTAAAAAAAAAATTT
ATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACCATTTGAACAATCATCTATTTAAAATCGGTATGAC
CAATTGTTTCTATTCATAC
Found at i:142745 original size:179 final size:179
Alignment explanation
Indices: 142526--142965 Score: 447
Period size: 178 Copynumber: 2.5 Consensus size: 179
142516 ATCAAATTAG
* * * * *
142526 TTCAAATAATTATGGCCATTTGAATAGTTATTTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTT-AACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * * * * * * *
142591 TAAAATAATTGTTTCTCATCATACAAGCCTATTCGGTATAAAATAATAGTAATTTACTAATATTT
65 TAAAACAATTATTT-TCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATACTT
* * * *
142656 TGAAAATTAATAAGTAAGAAATGTAAAAAATAAATTTGTTTACT-TAACCAA
129 TGAAAAGTAATAACTAAGAAATGTAAAAAATAAATTTATTT-CTCAAACCAA
* * *
142707 TTCAAATAGTTATGACTATTTAA-AATTATATATTTCAAATTGTTAT-AACCTTTTATTATGTCA
1 TTCAAATAGTTATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAA-CTTTTGTTTTGTCA
* ** * **
142770 TACAACAATTATTTTTTTTATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATACTTT
65 TAAAACAATTATTTTCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATACTTT
* * * * *
142835 GAAAAGTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATTTATTTGTCAAACCAT
130 GAAAAGTAATAACTAAGAAATGTAAAAAATAAATTTATTTCTCAAACCAA
* * * * ** * *
142885 TTTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTCTTTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCG
1 TTCAAATAGTTATGACTAT-TTAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
*
142950 TTAAACAATT-TTTTCA
65 TAAAACAATTATTTTCA
142966 GTTCTTAGTA
Statistics
Matches: 209, Mismatches: 45, Indels: 12
0.79 0.17 0.05
Matches are distributed among these distances:
177 1 0.00
178 98 0.47
179 51 0.24
180 40 0.19
181 19 0.09
ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (179 bp):
TTCAAATAGTTATGACTATTTAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAACTTTTGTTTTGTCAT
AAAACAATTATTTTCATCATACAAGCCTATTCAGAATAAAATAATACTAATATAATAATACTTTG
AAAAGTAATAACTAAGAAATGTAAAAAATAAATTTATTTCTCAAACCAA
Found at i:145255 original size:19 final size:20
Alignment explanation
Indices: 145231--145272 Score: 59
Period size: 19 Copynumber: 2.1 Consensus size: 20
145221 TGAATTTTTA
145231 GAAAAAAAAATTT-TGATTT
1 GAAAAAAAAATTTATGATTT
*
145250 GAAAAAGAAATTTGATGATTT
1 GAAAAAAAAATTT-ATGATTT
145271 GA
1 GA
145273 TGAATGAAAA
Statistics
Matches: 20, Mismatches: 1, Indels: 2
0.87 0.04 0.09
Matches are distributed among these distances:
19 12 0.60
21 8 0.40
ACGTcount: A:0.50, C:0.00, G:0.17, T:0.33
Consensus pattern (20 bp):
GAAAAAAAAATTTATGATTT
Found at i:150858 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 150529--151805 Score: 1087
Period size: 181 Copynumber: 7.1 Consensus size: 181
150519 TTTTGTTTTG
* * * * * * * *
150529 TCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGAAAATT-A-AA--AAG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
** * ** * * * *
150590 AGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTACTAAACTGGTTTAATTAGTTATAACT-TTCTGAATAATTA
66 AGATTTAAAAAATAAATTTG-TTGCCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAACAATTA
* * * * * * * * *
150653 TTTATTTTAAATCGTGATGACCATTTGTTTTGTCATTAAAGAATTGTTCCTGT
129 TCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* * *
150706 TCATAC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTA
1 TCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TA
* * * * *
150770 CGA-ATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTG-ACTAGTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATT
64 AGAGATTTAAAAAATAAATTTGTT-GCCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * *
150833 ATCTATTTCAAATCATTATGACCATTTGTTTTATCACAAAATAATTATTTGTAT
128 ATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* * * * *
150887 TCGTACAAGTTTA-TCTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCATACAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * *
150951 -AGGATTTAAAAAATGAATTTGTTTAG-C-GAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAATAAT
65 GA-GATTTAAAAAATAAATTTG-TT-GCCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * *
151013 TACCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
127 TATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* *
151068 TCATACAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA
1 TCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTA
** ** *
151131 A-A-ATTTTAAAAAATAAATAAGTTTTCTGAACACA-TTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAAT
64 AGAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTGCCTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
* * ** *
151193 TATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAACCAATTGTTTCTGT
127 TATCTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
* * * *
151248 TCATACGAGCGTATTC-AAAGTAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTGATAAGTAA
1 TCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
151312 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAACAATTA
65 GAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTGCCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * *
151376 TTTGTTTAAAAT-AGTCATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTCTAT
129 TCTATTTAAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTCTAT
* * * *
151430 TCAAACAAGTTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGT-A
1 TCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA
* * *** * * *
151493 GTAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACAAGATCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATAA
65 G-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTGCCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * * * * *
151558 TCTATTTTAAATTGTTATAACCTTTTGTTCT-ACAATAAAATAATTGTTTTTGT
129 TCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAATAATTGTTTCTAT
* * * * *
151611 TTATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAG
1 TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
151676 AGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCC-AAACCAA-TTCAAACAATTAAGACTATATAAACAATTA
66 AGATTTAAAAAATAAATTTG-TTGCCTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * * * * * *
151739 TTTATTTCAAATTGTTATAATCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTCAAC
129 TCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
151792 TCATACAAGCTTAT
1 TCATACAAGCTTAT
151806 CAAAAGTAAA
Statistics
Matches: 899, Mismatches: 159, Indels: 80
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
176 2 0.00
177 43 0.05
178 1 0.00
179 11 0.01
180 149 0.17
181 521 0.58
182 169 0.19
183 3 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (181 bp):
TCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAG
AGATTTAAAAAATAAATTTGTTGCCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTAT
Found at i:151333 original size:361 final size:357
Alignment explanation
Indices: 150521--151805 Score: 1290
Period size: 361 Copynumber: 3.6 Consensus size: 357
150511 TTATTACCTT
* * * * * * *
150521 TTGTTT-TG-TCATATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTAATTTATTAAAATTTTGAAAATT
1 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTA-TTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* ** * * *
150584 -A-AA--AAGAGATTTAAAAAATAAA-TTGATTTA-CTAAACTGGTTTAATTAGTTATAACTT-T
65 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTG-TTTAGC-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA-TTAT
* * * * * * * * *
150642 CTGAATAATTATTTATTTTAAATCGTGATGACCATTTGTTTTGTCATTAAAGAATTGTTCCTGTT
127 TTGAACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT
** * *
150707 CATAC-AGTCTTATTCGGAATAAAGTAATGCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAC
192 CATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAAT-ATAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAC
* * * ** * * *
150771 GAATTTAAAAAATGAATTTGTTGGCCTG-ACTAGTGCAAATAGTTATGACTGTTTGAACAATTAT
254 AAATTTAAAAAATAAATTAGTT-TTCTGAAC-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * *
150835 CTATTTCAAATCA-TTATGACCATTTGTTTTATCACAAAATAA
317 CTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTCT-TCATAAAATAA
* * * * * * * *
150877 TTATTTGTATTCGTACAAGTTTATCTGAAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATT
1 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTAT-TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * *
150942 AATAAGTAAAGGATTTAAAAAATGAATTTGTTTAGCGAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTG
65 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAGCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTG
* **
151007 AATAATTACCTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
130 AACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT
* *
151072 ACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA-AAATT
195 ACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTACAAA-T
* *
151136 TTAAAAAATAAATAAGTTTTCTGAACACATTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATT
258 TTAAAAAATAAATTAGTTTTCTGAACA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
**
151201 TCAAATAGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAACCAA
322 TCAAATAGTTATGACCTTTTGTTCT-TCATAAAATAA
* * * *
151238 TTGTTTCTGTTCATACGAGCGTATTCAAAGTAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATT
1 TTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATT
* * *
151303 GATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTGTTTG
65 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTAGCAAACAAGTTCAAATAGTTATGATTATTTG
* * * * *
151368 AACAATTATTTGTTTAAAATAGTCATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTTCTATTCA
130 AACAATTATTTATTTAAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCA
* * * * *
151433 AACAAGTTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGTAGA
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* * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
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Statistics
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* * * * * *
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** * *
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* * ** *
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155006 ACCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTCAAGAA-T--T
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
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155181 AACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAGTAATATTATGAAAATTAAT
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** * * *
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156890 GCAATTATTTATTTAAAATCATTATGACCTCTTCTTTTGAT-ATAAAATAATTGTTACAGTTCAT
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* * * *
156954 AAAAGCTTATCCAAAATTAAATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAAT
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* * ** * *
157493 AGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATAATTCAAAAATAAAT
131 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTTAAAAATTAAT
* * * * * * * * **
157544 AAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATACGAAC
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
** * * * **
157609 TGTTATCTATTTCAAATC------A-TTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACT
66 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA-T
* * * *
157667 -AGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTCATATTAAAAAAAATTAAT
130 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT--TAAAAATTAAT
* * * * * * * * *
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* * * * * * * *
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66 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATA
* * ** *
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131 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * * * * * *
157900 -A--AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACTAGTTTAATTAGTTGTGACTATTTGAGC
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* ** * * * * * * *
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66 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATA
* * *
158026 AGCTTATTCAAATTAAAATAAAACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAAT
131 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * ** * * ** *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAG-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * **
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* *
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129 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
* * ** * * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *** ** * ** * * * **
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66 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATATA
*** * *
158389 AGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGGCAATTAAT
131 AGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAA--AAATTAAT
* * * * *
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1 AAGTA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGA
* * ** * * * *
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64 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
* * * * * * *
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129 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
* * * * * * * * * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * *
158686 AATTATCTATTTCAAATTATTGTGACCTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATAT
66 AATTATCTATTTCAAATCATTATGA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATAT
** * *
158751 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAAT
130 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
* * * * * * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGA
* * * * * *
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64 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTGTTCAT
** *** *
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* * *** *
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* * * ** * *
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* * * * * *
159101 CTGATC--A-AAGCTTATT-AGATTAAAAT-AT-GTAA---ATT-AT-TTCAAAAGTT-AT
120 CTGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAATTAAT
* * * *** * **
159150 -ATTGA-AGA-TTAAAAAATGAAAT-TGTTTACCGAGTGA-TTCAAATAGCTATGAC--GCT--A
1 AAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * * *
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* ** *
159269 CAATTTTATTC-AAATAAAATAAT--TATTTTATT-ATATTTAAAAATTAAT
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* * * * * *
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1 AAGTAAG-AGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
** * * ** * *
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64 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
** * *
159444 TAAAATTACTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--T
129 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAAT
** * * * * * * * *
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
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* * * * * *
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130 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
* * * * * **
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1 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
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66 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT-TGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTCATA
* * ** * * *
159797 CATGCTTATTTGAAATACAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT
129 TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAAT
159850 AA
1 AA
159852 ATCATTTACC
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*
153508 CTATTTCAAATCATTAT
1 CTATTTCAAATAATTAT
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CTATTTCAAATAATTAT
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151988 AAAGAATTGA
* * * ** * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * *** * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** *
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* * * ** * * *
152514 AATATTTATAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAACCATTTCAAAT
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* * * * *
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** * ** * * * *
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648 ATTATTTCAATTCATA-TAAGCTTATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAA
** * * * * * *
152708 TTAATAACCAAGAAAATTAAAACATAAACCTAATTGCCAAACAAGTTCAAATAGTTGAGACTATA
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** * * *
152773 TGAACGTTTGTCTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTTTTAAAACAATTGTTTTGCT-T
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* * *
152837 GTA-CAAGCTTATTCAT-ATTAAAATAGTACTAATTTAATAATAGTTCAAAAATTAATAAG
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* * * *
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1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
* * * *
152960 TTATCTACTTCAAACTATTTTGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAG
65 TTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAG
* * * *
153025 CTTATTCATAATAAATTGATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAAT-ACAAAAGAGATTTAA
130 CTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAC-AAAGAGATTT-A
* * * * * *
153089 AAAAATAAATCTGTTTACCGAATAAGTTTAAATAGTTATTATTATTTGAATAATT-TTCTATTT-
193 AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATT-TATTTC
* * * *
153152 AGAATCACTATAATATTTTGATTTGTCATAAAACAACTGTTTCAGTTAATACAAGCTTATTTTGA
257 A-AATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTAATACAAGCTTATTTTGA
* * *
153217 ATAAAATAATACGAATTTATTAATAAGAAGAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTAT
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATAAGAAAATT--TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCT
* * * *
153282 GTTTACCGAA-CAAGTTCAAATTGTTATGACTATTT-AAGCAATTATTTATTTC-AATTCGTTAT
382 ATTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATT-ATTAT
* * * * *
153344 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAGACTTATTCAGATTAAAATAATT
444 GACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATA
* * * *
153409 TTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGTCGAAC
509 CTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAAC
* * *
153474 AAGTTCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTCTTTTG
573 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG
* * * * *
153539 TAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATGAGCTTATTTGAAGTAAAATAAAACTAATTTATTAATA
638 TCATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATA
**
153604 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGTGAATTAAAAAAAGAATCTATTTATTAAATAAGTTCAAATAGTT
703 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGT-AATTAAAAAAA-AATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT
* * ***
153669 ATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTCTAG-TTTGTCTTAAAACAATT
766 A-GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTT-T-GTTTTGTCTTAAAACAATT
* * * *
153733 GGTTCTATATATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
828 GTTTCTATATAT-CAAGCTTATTATGAATAAAATAATAT-AATTTAATAATATT-CAAAAATTAA
*
153798 TAAA
890 TAAG
* * * * * *
153802 TAA-AAATTTAAAAAATAAATTTGTTTTCTTAACTCGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT
* *** ** ** *
153866 TATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTG-TTTATGTTTGTGCAAG
66 TATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTA-GTTCATACAAG
* ** * * *
153930 TTTATTTGTAATAAAATAATATTAATTTATTAGA-ATT-TCAAAAGTTAATAAGTAAA-AGATAT
130 CTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTA-ATATTCT-AAAAATTAATAA-CAAAGAGAT-T
* * * * * * *
153992 AAAAAAAATAAATCCATTTATC-AAGCGAGTTCAACTAGTTATGATTATTTGAATAATTATTTAT
191 -TAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* * * *
154056 TTCAAATCATTATAA-ACTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTACTCATACAAGTTTA-TT
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* * ** * *
154119 TGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATAATAAAATTAATGAGTTGGAA-ACTT-AAAAATTA
317 TG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATAAGAAAATT--TAAG-TAAAAGATTTAAAAAATAA
* ** * * * ** * * *
154182 GTCGGTTTATCGAA-CAAGTTTAAAAAGTCGTGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTATT
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* * * * * *
154246 ATGACATTTTGTTTTTTCATAAAACAATTGCTTT-TATTCATACAAAATTATTTAGAATAAATTA
442 ATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATA
* * * * *
154310 ATATTAATTTATTAAT-TTTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAATCTGTTT-ACT
506 ATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCG
* * * * * ** *
154370 AGACCAGTTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATTGTTATGA-TCTTTGT
570 A-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGT
* * * *** **
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* * * * *
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* * * * *
154561 ATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATATATCTCAAATTGTTATGATCTTTGTTTTGTCATAAAAC
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* ** * * * ** *
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154690 TTAATAAG
886 TTAATAAG
* * * * *
154698 TAATAGATTAAAAAAATAAATGTGTTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT
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* * * * * *
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66 TATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGC
* * * * * * ***
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131 TTATTCATA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAA
* * * * * * * * *
154892 AAATAAATCAATTTGCTGAATAAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAACTATCTATTTCAAA
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** * * * ***
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260 TCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATT--A-ATACAAGCTTATTTTGAAT
* *
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* * * * * *
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* * * *
155145 TTGTTCTATAATAAAACAATTGTTTCTATTTATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
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* * * *
155210 TAGTAATATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCGTTTGTCGAACCAA-TT
515 TATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAA-CAAGTT
* * * ** * **
155274 CAAACAATTAAGACTACATGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTCAT
578 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG-ACTTTTTGTTTTGTCAT
* ** * * * *
155338 AAAATAATTATTTCACCTCATACAAGCTTATTC-ATAGTAGAGTAAAACTAATTTATTAATATTT
642 AAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGA-AGTAAAATAAAACTAATTTAATAATATTT
* * * * * ** * * *
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* * * * ** * * *
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* *** * * *** ** * *
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193 AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA
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* * * ** *
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323 AAATAATACTAATTTATTAATA-TAAGAAAATT--TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATT
* * *
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* * ** *
156016 TTGTTTAGTCATAAAACAATTGTTT-TTTATCATACAAGTTTATTCAAAATAAATTAATACTAAT
450 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * ** * * *
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514 TTATTAATATTTTAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAA-AATAAATCTGTTTGTCGAACAAGT
* * * * * * * ** * * * **
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577 TCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
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642 AAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTA-TTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATATTT
* * * * * * * * *
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706 -CAAAAATTAATAAGTAAGTAA-TT-AAAAAA-AAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * ** * * * *
156338 TGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATTGGTATGACCTTTTTTATTGTCATAAAACAATTAT
767 -GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTGTT-TTGTCTTAAAACAATTGT
* * ** *
156403 TT-TTTATCATACAAGCTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTGTTAATACTTCAAAAATTAG
830 TTCTATAT-AT-CAAGCTTATT-ATGAATAAAATAATA-TAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAA
156466 TAAG
890 TAAG
* * * * * *
156470 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAATTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
* * * * *** * * ** *
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65 TTATCTA-TTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGT-TCATACA
** * * * *
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128 AGCTTA-TTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACAAAGAGA-T
* * * ** ** * ** * * *
156656 TTGAAAAATAAATGTATTTGCTAAACCGGTTCAAATACTTAAAACTATTAGAATAATTATATATT
190 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
* * * * * * * ** * * *
156721 TTAAATCATTTTGACCA-TTTGTTTAGTCAGAAAATAATTGTTGCATATCTTACAATCCTA-TTC
255 TCAAATCATTAT-AACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAT-TAATACAAGCTTATTTT
* * * * * *
156784 GAAATTAAATAATCCAAATTTATTAACATTTAA-AAAATTAATAAGGAAAGGATTTGAAAAAATA
318 G-AATAAAATAATACTAATTTATT-A-ATATAAGAAAATT--TAAGTAAAAGATTT-AAAAAATA
* * * * * * * * * * *
156848 AATATGTTTATC-AAACAAGTTCAAATAGTGATGACAATTTGAGCAATTATTTATTTAAAATCAT
377 ATTCTATTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTAT
* * * * * * *
156912 TATGACCTCTTCTTTTGAT-ATAAAATAATTGTTAC-AGTTCATA-AAAGCTTATCCAAAATTAA
441 TATGACTTTTTGTTTTG-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-CTTATTCAAAATAAA
* * * * *
156974 ATAATACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAAGAG-TTTAAAAAAATAAATTTGTTC
503 ATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTGTTT
** * * * * * ** * * *
157038 ACCAAACAAATTCAAATAATTATGACAATTTGAACAATCGTCTATTTAAAATCGTTATGACCTTT
566 GTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTT
* * * * * * * *
157103 TGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACATGCTTATT-GAAAATAAAATAATACTAATG
631 TGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCG-AAGTAAAATAAAACTAATT
* * ** * * **
157167 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT--G-ATTTAAAAAGTGAATTTGTTTACCAAAGCAGTTCA
695 TAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTAATTAAAAA-AAAATCTATTTACCAAATAAGTTCA
* * * * ** ** * * * *
157229 AATAATTATGGCCATTTCCACAATTATCTATTTCAAATCATTATTACCTTTTGTTTAGTCATATA
759 AATAGTTA-GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTGTTTTGTCTTAAA
* * * * * *
157294 ACAATTGGTTTTTAT-TATACAAGTTTTATTCA-AAATAAAATAATAGTAATTCATTAATCTTTC
822 ACAATT-GTTTCTATATAT-CAAG-CTTATT-ATGAATAAAATAATA-TAATTTAATAAT-ATTC
157357 AAAAA-T--TAA-
881 AAAAATTAATAAG
* * * * * ** *
157366 TAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTGCAGAACCAGTTTAAATAGTTATTATTATTTA-AACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAACAA
* * * * * *** * * *
157430 TTGTATAGTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCT-GTTCATAAAA
65 TTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAA
* ** *
157494 GCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATATAAAAATAATTC-AAAAATAAATAA-ATAAGAGATT
129 GCTTATTC-ATAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-ATTCTAAAAATTAATAACA-AAGAGATT
* * * * * * * ** ** *
157556 TAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACTAGTTTAAATAGTTAAGACTATACGAACTGTTATCTATTT
191 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTT
* * * * * **
157621 CAAATC---AT----TTTTCTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCAATTCATACTAGCTTATTCAGA
256 CAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTAATACAAGCTTATTTTGA
* * * * * *
157679 ATAAAATAA-AATGAATTTATTCATATTAAAAAAAATTAATATGTAAGATATTTAAAAAATAATT
320 ATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-T-AAGAAAATT--TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATT
* * * * * * * * *
157743 CTGTTTACCTAACTAATTCAAATAATTATGATTATTTGAACAATTACCTATTTCAAATCACTATA
380 CTATTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATG
* * * * * * * ** * **
157808 ACCTTTCGTTTTATCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGGAATAAAATAATAC
445 ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * *
157873 TAATCTATTAATA-TTTAAAA--AATTAA-TAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCAAACT
510 TAATTTATTAATATTTTAAAATTAA-TAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACA
* * * ** * ** * *
157934 AGTTTAATTAGTTGTGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTAT
574 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGT
* * * * *
157999 TATAAAACAA-TAGTTT-ATATTCATACAAGCTTATTCAAATTAAAATAAAACTAATTTATTAAT
639 CATAAAACAATTA-TTTCA-ATTCATATAAGCTTATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAAT
* ** * ** **
158062 ATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTAAAAAATAAATATGCTTACCAAACT-AGATAAAAATA
702 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTAA-TTAAAAAA-AAATCTATTTACCAAA-TAAG-TTCAAATA
* * * ** * * *
158126 GTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAAAA
763 GTTA-GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCTTAAAACAA
** * * *
158191 TAATTT-TGATTCATAT-AAGCTTATT-CGAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTCTAAAA
826 TTGTTTCT-A-T-ATATCAAGCTTATTATG-AATAAAATAATA-TAATTTAATAATATTC-AAAA
158253 ATTAATAAG
885 ATTAATAAG
* * ** * * * * * * *
158262 TAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTAAGGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAATAGT
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT
* * ** ** *** * * * *
158327 TGTCTATTTGAAATTGCTACAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATGATTTTTTCTA-TTAATGCAAG
66 TATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTT-TAGTTCATACAAG
* * * * *
158391 CTTATT-TTGAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-T-TAAGGCAATTAATAAGTACA-AGATT
130 CTTATTCAT-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAA--AAATTAATAA-CAAAGAGATT
* * * * *
158452 TAAAAAATAAATCTATTTACTGAACAAGTTCAAA-ATTTTATGATTATTTGGACAATTATTTGTT
191 TAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATA-GTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
** * * * * *
158516 TCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTAG
255 TCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTAATACAAGCTTATTTTG
* * * * * *
158581 ATTAAAATAATATTAATTTATTTATATTTCAA-AAAATAATAAGTAAAAGAATTAAAAAATAAAT
319 AATAAAATAATACTAATTTA-TTA-ATAT-AAGAAAAT-TTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATT
* * * * * * * * *
158645 ATGTTTATCGAA-CAAGTTCAAATAATCAAGAGTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTGT
380 CTATTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * **
158709 GACCTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
444 GA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAA
* * * * * * ***
158773 TTCTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATGAGTATGAGAATTAAAAAATTAATC---TAACCGA
507 TACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGA
* * * * * * * *
158835 ACATA-TTCAAATAATTATCATTATCTT-AACAATTATTTATTTTAAAACATTATGACCTTTTGT
571 ACA-AGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGT
* * * ** * *
158898 TTTGTCATTAAACAATTGGTTT-TATTCATGCAAGCTTAATTTTGAA-T-AAATATATA-TAAAT
634 TTTGTCATAAAACAATT-ATTTCAATTCATATAAGCTT-A-TTCGAAGTAAAATA-AAACT-AAT
* * * **
158959 TT-ATTA-ATTTC-AAAATTAATAAGTAA--AATTTAAAAATATATAATATGTTT-TTAATACTA
694 TTAATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTAA-TTAAAAA-A-A-AATCTATTTACCAA-A-TA
* * * * **
159018 CA-TT-AAATATTTATGAC-ATATTAAACAATAATTATGATTATTCAAATTGTTATGAATTTTGT
753 -AGTTCAAATAGTTA-GACTATA-TGAACAATTA-TCT-A-T-TTCAAATTGTTATGACCTTTGT
* * * * *
159080 TTTTTCAT-AAACTAATTGTTTC--T-GATCAAAGCTTATTA-GATTAAAAT-ATGT-A---AAT
811 TTTGTCTTAAAAC-AATTGTTTCTATATATC-AAGCTTATTATGAATAAAATAATATAATTTAAT
* * *
159135 TAT-TTCAAAAGTT-AT-AT
874 AATATTCAAAAATTAATAAG
* * * * * **
159152 TGA-AGA-TTAAAAAATGAAA-TTGTTTACCG-AGT-GATTCAAATAGCTATGAC-GCT---ACA
1 TAAGAGATTTAAAAAAT-AAATTTGTTTACTGAACTAG-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
* * * ** ** * *
159208 ATAATTTATTTTAAATTATTATGATAATTTT-TT-TGTTATAAAATAATTGTTTCTA-TCCATAC
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** * ***
159270 AATTTTATTCA-AATAAAATAAT--TATTTTATT-ATATT-TAAAAATTAATAA-GTTGAAGATT
127 AAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACAAAG-AGATT
* * * * * * **
159329 TAAAAAATAAATTTGA-TTACTGAACCAGTT-AAATAGTCAAGTCTATTTGAATTATTATTTATT
191 TAAAAAATAAATCT-ATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
* ** * * * ** * **
159392 TCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTTTTTATTCATATAAAATTACTCAG
255 TCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCATTAATACAAGCTTATTTTG
*** * * ** * *
159457 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTT-AAAGTTAAATCT-G
319 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATAAGAAAATTTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTAT
* * * ** * * * * *
159519 TTAACAAACTAGCTCAAATAGTTTTAACTATTTGAATAATTATCTATCTT-AAATCATTATTA-T
384 TTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT-TTCAAATTATTATGACT
* * * * * * * *
159582 CTTTGTTTTGTTATAAGACAATTGCTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAA
448 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * **
159647 ATTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGTAAGAGATTT-TAAAA-AAATGTGTTTACCGAACCAA-
513 TTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAA-CAAG
* ** * * * *
159709 TTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATTATCTATTTTAAATCATTCTGACATTTTGTTTAT-TC
576 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT-TGTC
* * * * * * * * * * *
159773 ATAAAATAATTATTTTAGTTCATACATGCTTATTTGAAATACAATAATACTAATTTATTAACA-T
640 ATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATATT
159837 TC---AA--AA-AA-T---TAA-T------AAATC-ATTTACCAAA-ATAG-TC----A--T-GA
705 TCAAAAATTAATAAGTAAGTAATTAAAAAAAAATCTATTTACCAAATA-AGTTCAAATAGTTAGA
* * *** * *
159875 CTATTTGAATAATTATCTATTT-AGAATAAATATGACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTT
769 CTATATGAACAATTATCTATTTCA-AATTGTTATGACC-TTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTT
* * * * *
159939 C-AGTTTATAAAAGCTAATT-CGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA
832 CTA-TATAT-CAAGCTTATTATG-AATAAAATAATA-TAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAATA
160002 AG
892 AG
***** * * * * * * * *
160004 TTAA-AGATTTAAAAAATAAGCCAATTTA-TCAAATCGGTTCAAATAATTATGGCCATTTA-AAT
1 -TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAAC
* * * * *** * ***
160066 AATTATTTATTTCAAATTGTTATAAACTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTTTCATCATACA
63 AATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACA
* ** * ** * *
160131 AGCCTATGAAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGAGAATT
128 AGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACAAAGAGATTT
* * * *
160195 AAAAAATAAGTCAATTTACCG---AA---C---TAG-T-T-CCTATTTGAACAATTATCTATTTC
192 AAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC
* * * * * * * * * *
160248 AAATCGTTAGAA-ACTTTTCTTTTGTTATAAAATAGTTGTTGCAGTTCATATAAGCTTATTTGGA
257 AAATCATTATAACA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTAATACAAGCTTATTTTGA
* * * *
160312 ATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTAA-AAAATTGACAATAAAGAGATTTAAAAAAT-ATAC
320 ATAAAATAATACTAATTTATTAATA--TAAGAAAATTTA-AGTAAA-AGATTTAAAAAATAAT-T
* * ** * * * * * **
160375 CTATTTACCAAAGCGGTTCAAA-CGATTAAGACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTA
380 CTATTTACCGAACCAATTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATTATTA
* * * * **
160439 TGACCTTTTGTTTGGTTATATAACAA-T-TTT-T-TTCAT-----C--ATTCAAGCT----T-AT
443 TGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAAT
* * * * * * *
160488 GCGAA---A-TAA-A----ATAATTACTAA-TAAGAGATTTAAAAGATAAATCTATTTATCGAAC
508 ACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAAC
* * * ** * * * * *
160543 TAGTTCAAATA--TATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTCTG
573 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG
*** * ** * * **
160606 TCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATCGAATAATA
638 TCATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATA
* * * * * **** ** *
160671 TTTTAAAAATTAATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATATTT
703 TTTCAAAAATTAATAAGTAAG-TAATTAAAAAA-AAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTT
** * *
160736 AAAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGT
766 --AGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC-TTTGTTTTGTCTTAAAACAA-T
* * *
160801 T-TTTTTGA-AT-TCAACTAGCTTATT-TGGAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAA
827 TGTTTCT-ATATATC-A--AGCTTATTAT-GAATAAAATAATAT-AATTTAATAATA-TTCAAAA
160862 A-T--TAA-
885 ATTAATAAG
* * * * * * * * *
160867 TAAGAGATTTAAAAAACAATTTTGTTTACCT-AACCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGACCAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
** * * * *** * * * *
160931 TTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG
65 TTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAG
* *** * *
160996 TTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAAT----AAGAGATTTAAA
130 CTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAA
* * ** * * *
161057 AAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCCATTATTTATTTCAAA
195 AAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAA
* * * * * * * * * ** **
161122 TCATTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTTTATTCATATAAGCTTATTCAGGTTAA
260 TCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCATTAATACAAGCTTATTTTGAATAA
* *** * * * *
161187 AATAATACTAATTTATTAGTATTTTTAACAATTAATAAGCAAAA-AGTTTAAAAAGTAAATATAT
324 AATAATACTAATTTATTAATA-TAAGAA-AATT--TAAGTAAAAGA-TTTAAAAAATAATTCTAT
* * * * * * ** *
161251 TTATCGAACTAGA-TCAAATAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACA
384 TTACCGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACT
* * * * *
161315 TTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
448 TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * * * *
161380 GTTATTAATATTATGAAAAATAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAACAAGT
513 TTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACAAGT
* * * * * * * * * *
161445 TTAAATAATTTTGACTATTTCG-ACAATTATGTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTATGTCA
577 TCAAATAGTTATGACTATTT-GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCA
* * * * * ** * * * *
161509 TGCAAGC--TTATTTTGAA-TAAAATAATGCAAATT--TATTAACATTAAGAC-AA-TTAAT-A-
641 T-AAAACAATTA-TTTCAATTCATATAA-GCTTATTCGAAGTAA-AATAAAACTAATTTAATAAT
* * * * **
161565 AGTT---AAA--GATAA--AA--AA-T-AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTA
702 ATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTAATTAAAAAAAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTA
* * * * **
161619 TGACTATTTGAA-AATTTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTG
767 -GACTATATGAACAA-TTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTG
* * * * * * ** *
161683 TTTCTGTCGTA-CATGCTTATTTTGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAAT
829 TTTCTAT-ATATCAAGCTTATTATGAATAAAATAATA-TAATTTAATAATA-TTCAAAAATTAAT
161747 AAG
891 AAG
* ** * * * * *
161750 T-AGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAACTAGTCATA-ACTATTTGAATA
1 TAAG-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAACA
* * * * *** * * * * *
161813 ATTATCTGTTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAA
64 ATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAA
* * ** * *
161878 GCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATT-TCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTG
129 GCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACAAAGAGATTTA
* * * * * *
161941 CAAAATAAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCA
193 AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTC-
* ** * * * * * * **
162006 AAAT-ATTATGACAAGTTGTTTTGTCATAAAATATTTGGTTCTGTTCATGCAAGCTTATTTCCAA
257 AAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-ATTAATACAAGCTTATTTTGAA
** * * * * *
162070 TAAAATAATAAAAATTTGTTTATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAAA-ATTT-AAAAATAAATAT
321 TAAAATAATACTAATTT-ATTA-ATATAAGAAAATT--TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCT
* * * * * * *
162132 ATTT-TCTAAACACTTTCAAATAGTTAT-AATATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGA
382 ATTTACCGAACCA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGA
* * * * * ** *
162195 CCTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTTTTTCTATTCA-AAAAAGCTTATTTGAAATAAAATTATAC
446 CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAA-CTTATTCAAAATAAAATAATAC
* ** * * **
162259 TAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTG-CTGAGT
510 TAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTC-GAAC
* * * * *
162323 GAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTATTTTG
573 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTG
* * * * * * * *
162388 TCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
638 TCATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATA
* * * * * * *
162453 -TTCTAAAAATTAATAAGTTGGAG-ATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAACAA-TCTCAAATA
703 TTTC-AAAAATTAATAAG-T-AAGTAATTAAAAAA-AAATCTATTTACCAAATAAGT-TCAAATA
* * * * ** **
162515 GTCATG-TTCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCGAAAAACA
763 GTTA-GACT-ATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTGTTTTGTCTTAAAACA
* ** * * *
162579 ATTGTTTCTAT-TCATAGAAAATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTAAAAA
825 ATTGTTTCTATAT-AT-CAAGCTTATTAT-GAATAAAATAATA-TAATTTAATAATATTCAAAAA
*
162642 --ATTAA-
886 TTAATAAG
* * * * * * *
162647 TAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTATGT-C-AAACTATTTCAAATAGTTATGATTTTTTGAACA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGT-T-TACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACA
* * * * * *** * *
162710 ATTATCTATCTCAAATTGTGATAATC-TTTGTTTTGTTATAAAACAA------T--TTCATACAA
64 ATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAA
* * *
162766 GCTTATTCA-AAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAAT----AAGAGATTTA
129 GCTTATTCATAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTA
* * * * * * ** * *
162826 AAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTAAAAACTATTAGAACAATTATATATTTCA
193 AAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCA
* * ** * * * * * * * * ***
162891 AATCATTTTGATGTTTTGTGTAGTGATAAAATAATTTTTTTAGTTTATACATGCTTATTCAAAAT
258 AATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TTAATACAAGCTTATTTTGAAT
* * * * * * * *
162956 AAAGTAAAACAAATTTATTAACATTCA-AAAATTTAA-T----GA---ACAATA-AATT-TGTTT
322 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TAAGAAAATTTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTT
** * * * *
163010 ATTGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACATT
386 ACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTT
** * * * *
163074 TTGTTTTACCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAGCGTA-TCTAACATAAAATAATATTA
450 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAA-CTTATTC-AAAATAAAATAATACTA
* ** * * * ** ***
163136 CTTTATTAATACTTCAAAAATTAATATGTTAA-AGATTTAAAAAATAACTCAGTTTACCGAATTG
512 ATTTATTAATA-TTTTAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACAA
* * * ** *
163200 GTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTACAAAC-TTTTGTTTTTT
575 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTA-TGACTTTTTGTTTTGT
** * * * * * **
163264 CATAAAACAATTATTTTTA-TCATACAAG-TCCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATA
639 CATAAAACAATTATTTCAATTCATATAAGCT-TATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATA
* * * * **
163327 TTACAAAAATTAATACGTATGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTT-----AT-CG---AACCAGT
703 TTTCAAAAATTAATAAGTA--AGTAATTAAAAAA-AAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGT
* * * * * * * * *
163382 T--CCTATTTGAATAATTGTCTATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTTCTGT-TATAAAATAATT
765 TAGACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGAC-CTTTGTTTTGTCT-TAAAACAATT
*
163444 GTTT-TAATTCATAT-AAGCTTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATT-ATAGAAT
828 GTTTCT-A-T-ATATCAAGCTTATTAT-GAATAAAATAATA-TAATTTAATAATATTCA-A-AAA
*
163505 TTAATAAC
886 TTAATAAG
* * * *
163513 TAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAAGTAGTTCAAACAGTTAAAACTA-TACGAACAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GAACAA
* *** * * * *
163576 TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTTATAAAAG
65 TTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAG
* * * *
163641 CCTATTTGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAAT----AAGTGATTTA
130 CTTA-TTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAACAAAGAGATTTA
* * * * * * * * * * *
163700 AAAAGTGAATCTGTTTATCAAATC-GGTTCAATATTA-TTATGGCCATGTCAACAATTATCTATT
193 AAAAATAAATCTATTTACCGAA-CAAGTTCAA-A-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATT
** * * * * ** * *
163763 TCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTATTTGAACATTA-AAGCTTATTTG
255 TCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG--TTTCATTAATACAAGCTTATTTT
* * * * *
163827 GATTAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCA-AAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
318 GAATAAAATAATACTAATTTATTAA--TATAAGAAAATT--TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAT
* * * * ** * *
163891 TCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTAT
379 TCTATTTACCGAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTAT
* * * * *
163956 AAGC-TTTTGTTTCGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAAT
444 GA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAAT
* * ** * * * * * *
164020 ACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGGGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA
508 ACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAA
* * * ** * *
164085 TC-GGTTCAAATATTTAAGACTAAATGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTT
572 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTT
* * * *
164149 TGTCATAAAACAAGTTTATTTGAATTTATACT-AGCTTATTTGGAA-TAAAATAAAACAAATTTA
636 TGTCATAAAACAA--TTATTTCAATTCATA-TAAGCTTA-TTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTA
* ** * * * * *
164212 TTAATATTTTGAAAATTAAAAAGTACG-AGATTCAAAAAATAATTCTGTTTACCTAATCAA-TTC
697 ATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGTA-ATT-AAAAAA-AAATCTATTTACCAAAT-AAGTTC
* * * * * * ** ** *
164275 ATATAATTATGATTATTTGAACAATTACCTGTTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAA
758 AAATAGTTA-GACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTGTTTTGTCTTAA
* * * * * *
164340 AACAAATATTTTTGT-TCATAT-AAGTTTATT-CGAAATAAAGA-AATACTAATCTATTAATATT
821 AAC-AAT-TGTTTCTAT-ATATCAAGCTTATTATG-AATAAA-ATAATA-TAATTTAATAATA-T
*
164401 TC--AAA-TATTAA-
879 TCAAAAATTAATAAG
*** * *
164412 TAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAA
1 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TT-AG-AA
* * * ** * * * *
164476 CTATT-T-TATTTCAAATTGTTACGAGTTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGCTTCT-GTTCATA
62 CAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTG-TTTTAGTTCATA
* * * * *
164538 CATGCTTATTCGTATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCT-ATAATTAATAA-ATAA-AAA
126 CAAGCTTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAACA-AAGAGA
* * * ** * * * * * * * **
164600 TTTTAAAAATAAATATGTTTACAAAACTAGATCAAATAATTATAATTTTTTGAATAATTATCGAT
189 TTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTAT
* * * * *
164665 TTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAGAATTGTTTTAGTTCACATA-AA-CTTATT
254 TTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCA-TT-A-ATACAAGCTTATT
*** * * * *
164727 CAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAGTAATCCA-AAGATTAATAA-TAAAGAGATTTAAAAAAT
316 TTGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-AT-AAGAAAATT--TAAGTAAA-AGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * *
164790 GAATT-TGTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTCAACAATTATCTATTTGAAATC
376 -AATTCTATTTACCGAACCAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
** * * ** * * * * *
164853 GCTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAGAATTTTTTGTATTCATACAATCTTATTTC-AAATAAT
439 ATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTA-TTCAAAATAAA
* * * *
164917 ATAATACAAATTTATTAATA-TTAAGACAATTAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTT
503 ATAATACTAATTTATTAATATTTTA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTT
** * * * *** * * **
164980 TACCTAACAAGTTGAAATCGTTATGACTATTTGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTT
565 TGTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTT
165045 TTGTTTTGTCATAAAACAATT
630 TTGTTTTGTCATAAAACAATT
165066 GTCATTACTG
Statistics
Matches: 9370, Mismatches: 2122, Indels: 1354
0.73 0.17 0.11
Matches are distributed among these distances:
834 1 0.00
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852 2 0.00
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (893 bp):
TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAAT
TATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTCAATCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGC
TTATTCATAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAACAAAGAGATTTAAAA
AATAAATCTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT
CATTATAACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCATTAATACAAGCTTATTTTGAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATATAAGAAAATTTAAGTAAAAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCGA
ACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACTTTTTGTTT
TGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
TATTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTGTCGAACAAGTTCAAATAGT
TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
ATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAGTAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA
TAAGTAAGTAATTAAAAAAAAATCTATTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTAGACTATATGAACAA
TTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTGTTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTATATATCAAGCT
TATTATGAATAAAATAATATAATTTAATAATATTCAAAAATTAATAAG
Found at i:159540 original size:175 final size:170
Alignment explanation
Indices: 159211--159783 Score: 367
Period size: 174 Copynumber: 3.3 Consensus size: 170
159201 CGCTACAATA
* * * **
159211 ATTTATTTTAAATTATTATGATAATTTTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAATTTT
1 ATTTA-TTTAAATCATTATGACAATTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAAATT
* *
159276 ATTCAAATAAAATAATTATTTTATTATATTTAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAAATAAAT
65 ACTCAAATAAAATAATTAATTTATTATATTTAAAAATTAATAA--TGAAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *
159341 TTGATTACTGAACCAGTTAAATAG-TCAAGTCTATTTGAATTATT
128 CTGATTACTAAACCAGTCAAATAGTTCAA--CTATTTGAATAATT
* * * * *
159385 ATTTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAATGATTGTTTTTATTCATATAAAAT
1 ATTTATTT-AAATCATTATGACAATTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAAAT
**
159450 TACTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-G-AGATTT-AAAGTT
64 TACTCA-AATAAAATAAT--TAATTTATT-ATATTT-AAAAATTAATAATGAAGATTTAAAAAAT
* *
159512 AAATCTG-TTAAC-AAACTAGCTCAAATAGTTTTAACTATTTGAATAATT
124 AAATCTGATT-ACTAAACCAG-TCAAATAG-TTCAACTATTTGAATAATT
* * * * * * * **
159560 ATCTATCTTAAATCATTATTATC--TTTGTTTTGTTATAAGACAATTGCTTCTATTCATACAAGC
1 ATTTAT-TTAAATCATTATGA-CAATTT-TTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAAA
* * * * * * *
159623 TTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAATTAATAATATTCTAAAAACTAATAAGTAAGAGATTT-TAA
63 TTACTCAAA-TAAAATAAT--T-AATTTATTATATT-TAAAAATTAATAA-TGA-AGATTTAAAA
* * ** * * ** *
159687 AA-AAATGTGTTTACCGAACCAATTCAAATAGTTAAGACTATTAAAACAATT
121 AATAAATCTGATTACTAAACC-AGTCAAATAGTTCA-ACTATTTGAATAATT
* * *
159738 ATCTATTTTAAATCATTCTGAC-ATTTTGTTTATTCATAAAATAATT
1 ATTTA-TTTAAATCATTATGACAATTTT-TTT-GTCATAAAATAATT
159784 ATTTTAGTTC
Statistics
Matches: 316, Mismatches: 55, Indels: 51
0.75 0.13 0.12
Matches are distributed among these distances:
173 5 0.02
174 90 0.28
175 90 0.28
176 20 0.06
177 17 0.05
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179 18 0.06
180 12 0.04
ACGTcount: A:0.41, C:0.09, G:0.07, T:0.43
Consensus pattern (170 bp):
ATTTATTTAAATCATTATGACAATTTTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTATCCATACAAAATTA
CTCAAATAAAATAATTAATTTATTATATTTAAAAATTAATAATGAAGATTTAAAAAATAAATCTG
ATTACTAAACCAGTCAAATAGTTCAACTATTTGAATAATT
Found at i:161313 original size:182 final size:176
Alignment explanation
Indices: 160506--165065 Score: 2383
Period size: 181 Copynumber: 25.7 Consensus size: 176
160496 AAATAATTAC
*
160506 TAATAAGAGATTTAAAAGATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATA--TATGACTATTTGAAC
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* ** * * * *
160569 AATTGTAAACTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATA
** ** *
160634 AGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATCGAATAATATTTTAAAAATT
131 AGCTTA-TTAGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T
* * * * * * * * *
160682 AATAACTAAGAGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATATTTAAAGACTATAT
1 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTT
* * *
160747 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAAT
62 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAA-TTATTTTT--AT
* * *
160811 TCA-ACT-AGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT
124 TCATA-TAAGCTTATTAGG-ATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * * * * * *
160864 TAATAAGAGATTTAAAAAACAATTTTGTTTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGACC
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * *
160929 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAAACTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATA
* * *
160994 AGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAAT
131 AGCTTATTAGG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * *
161041 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-AAATGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAG
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * *
161105 CCATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTTTATTCATAT
65 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATAT
* * *
161170 AAGCTTATTCAGGTTAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTTTAACAAT
130 AAGCTTATT-AGGATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTTAAAAAT
* * * * * *
161219 TAATAAGCAAAAAGTTTAAAAAGTAAATATATTTATCGAACTAGATCAAATAGTCATAACTATTT
1 TAATAAG---AGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * **
161284 GAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCA
62 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCA
** * *
161349 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTATGAAAAAT
127 TATAAGCTTATT-AGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAAAT
* * * * * * *
161401 AATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTC
1 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-
* * ** * * * * * * *
161466 G-ACAATTATGTATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTATGTCATGCAAGC--TTATTTTGAATA
62 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCAT-AAAACAATTATTTTTATTC
* ** * * * ** *
161528 AAATAATGCAAATTTA--TTAACATTAAGAC--A---ATTAATAAGTTAAAGA-
126 ATATAA-GCTTA-TTAGGATAA-AATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * **
161574 TAA-AA-A-A--T--AAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAA-
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * * * * *
161631 AATTTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT-GTCGTAC
66 AA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATAT
* ** * * *
161695 ATGCTTATTTTGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAAT
130 AAGCTTATTAGGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * * *
161743 TAATAAGTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTTCAACTAGTCATAACTATTT
1 TAAT-A--AG-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * **
161808 GAATAATTATCTGTTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTT-TGGTAATAAAACAATTGTTTCAATTC
62 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTATTTTTATTC
** *
161872 ATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAAT
126 ATATAAGCTTATT-AGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* ** * * *
161923 TAATGAGTAAGAGAATTGCAAAATAAATCTATTTACCAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATC
1 T-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *** * * * ** * *
161987 TAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACAAGTTGTTTTGTCATAAAATATTTGGTTCTGTT
61 TGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATT
** *** ** * * *
162051 CATGCAAGCTTATTTCCAATAAAATAATAAAAATTTGTTTATATTTCAAAAAT
125 CATATAAGCTTA-TTAGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * *
162104 TAATAAGTAAAAATTT-AAAAATAAATATATTT-TCTAAAC-ACTTTCAAATAGTTAT-AATATT
1 TAATAAG---AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
162165 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTACGACCTTTGGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTTCTATT
61 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTT-TATT
* * * * * * **
162229 CAAAAAAGCTTATTTGAAATAAAATTATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAAT
125 CATATAAGCTTATTAG-GATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * *
162282 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTG-AGTGAGTTCAAATAGTTATGACTAT
1 TAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTAT
* * * * ** * * * * *
162345 TTAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTATTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATT
60 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATT
* * * *
162410 CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
125 CATATAAGCTTATTAG-GATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * *
162463 TAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAAC-AATCTCAAATAGTCATG-TTCAT
1 TAATAA----GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGT-TCAAATAGTTATGACT-AT
* * ** * * *
162526 TTGAACTATTATCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCGA-AAAACAATTGTTTCTAT
60 TTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTC-ATAAAACAATTATTTTTAT
* ** * * *
162590 TCATAGAAAATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTAAAAAAT
124 TCATATAAGCTTA-TTAGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * * * *
162644 TAATAAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTATGTCAAACTATTTCAAATAGTTATGATTTTTTGAAC
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * * * *
162709 AATTATCTATCTCAAATTGTGATAATC-TTTGTTTTGTTATAAAAC-A--A----T-TTCATACA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATA
* * * * *
162765 AGCTTATTCA-AAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAAT
131 AGCTTATT-AGGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * ** * * ** *
162812 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTAAAAACTATTAGAAC
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * ** * * * *
162877 AATTATATATTTCAAATCATTTTGATGTTTTGTGT-AGTGATAAAATAATT-TTTTTAGTTTATA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TCTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATA
* * ** * * * * *
162940 CATGCTTATTCAAAATAAAGTAAAACAAATTTATTAACA-TTCAAAAAT
129 TAAGCTTATT-AGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * *
162988 T--T---A-A--TGAACAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* *** * * ** * * * *
163045 AATTATCTATTTAAAATAAATATGACATTTTGTTTTACCATAAAATAATT-GTTTCAGTTCATAA
66 AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATAT
* ** * * * *
163109 AAGCGTATCTAACATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAAAAT
130 AAGCTTAT-TAGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * *
163157 TAATATGTTAAAGATTTAAAAAATAACTC-AGTTTACCGAATTGGTTCAAATAATTATGGCTATT
1 TAATA----AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** ** * * *
163221 TGAATAATTATCTATTTCAAATTATTACAAACTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTTTA-TC
61 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTC
* * * * * * **
163285 ATACAAG-TCCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTACAAAAAT
126 ATATAAGCT-TATTAG-GATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
*
163337 TAATACGTATGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC-----C----AG-T-T-CCTATTT
1 TAATA---A-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * * * *
163390 GAATAATTGTCTATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTTAATTCA
62 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCA
* * *
163455 TATAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTATAGAATTTAA-
127 TATAAGCTTA-TTAGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AA---AAT
* * * * * ** **
163509 TAACTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAAGTAGTTCAAACAGTTAAAACTATACGAA
1 TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
163573 CAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCAGTTTATA
65 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATA
* * * * * *
163637 AAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
129 TAAGCTTATTAG-GATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * * * * *
163686 TAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATC-AAATCGGTTCAATATTA-TTATGGCCATGTC
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAA-A-TAGTTATGACTATTTG
* * * * * * *
163749 AACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTATTTGA-ACA
63 AACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTAT-TTTTATTCA
* * * *
163813 T-TAAAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAAT
127 TAT-AAGCTTATTAGGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
163864 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
1 TAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * *
163928 TGAACAATTGTAAACTTCAAATCATTATAAGCTTTTGTT-TCGTCATAAAACAATTATTTTTATT
61 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTATTTTTATT
* ** * * **
163992 CATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATT
125 CATATAAGCTTATT-AGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T
* * * * * * * * * * **
164046 AATAACTAAGGGAATTAAAAAATAAATTTGTTT-GCCAAATCGGTTCAAATATTTAAGACTAAAT
1 --TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * **
164110 GAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAGTTTATTTGAATT
62 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAA--TTATTTTTATT
* * * * *
164175 TATACT-AGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTTGAAAAT
125 CATA-TAAGCTTATTAGG-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * * * * * * * * *
164228 TAAAAAGTACGAGATTCAAAAAATAATTCTGTTTACCTAA-TCAATTCATATAATTATGATTATT
1 T---AA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * ** * * *
164292 TGAACAATTACCTGTTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTC
61 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTC
* * * * * *
164357 ATATAAGTTTATTCGAAATAAAGA-AATACTAATCTATTAATATTTCAAATAT
126 ATATAAGCTTATTAG-GATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * **
164409 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGT
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * ** * * ** * * *
164474 AACTATTTTATTTCAAATTGTTACGAGTTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGCTTCTGTTCATAC
66 AATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATAT
* * *
164539 ATGCTTATTCGTATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTATAATTAAT
130 AAGCTTATTAGGA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TA-AA--AAT
* * * * * * * * * * *
164591 AAATAA-AAATTTTAAAAATAAATATGTTTA-CAAAACTAGATCAAATAATTATAATTTTTTGAA
1 TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
164654 TAATTATCGATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT-TGTCATAAAAGAATT-GTTTTAGTTCACA
65 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATA
* ** * * * ** *
164717 TAAACTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAGTAATCCAAAGATTAA
129 TAAGCTTATT-AGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA-A--AT
* * * * * * * * *
164769 TAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTCA
1 TAAT-AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATC-GAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** * *
164833 ACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAGAATT-TTTTGTATTCAT
64 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTT-TATTCAT
* * * * *
164897 ACAATCTTATTTCA-AATAATATAATACAAATTTATTAATA--TTAAGACAAT
128 ATAAGCTTA-TT-AGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AAT
* * * * * * *
164947 TAATAGGTAAAAGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTACCTAACAAGTTGAAATCGTTATGACTATT
1 T-A-A--TAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
** * * * * *
165011 TGTGCAATTATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
61 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT
165066 GTCATTACTG
Statistics
Matches: 3402, Mismatches: 766, Indels: 425
0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
161 2 0.00
162 9 0.00
163 76 0.02
164 8 0.00
165 2 0.00
167 6 0.00
168 307 0.09
169 81 0.02
170 11 0.00
171 7 0.00
172 3 0.00
173 6 0.00
174 6 0.00
175 12 0.00
176 52 0.02
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178 382 0.11
179 189 0.06
180 542 0.16
181 876 0.26
182 262 0.08
183 177 0.05
184 14 0.00
185 9 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (176 bp):
TAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
AATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATATA
AGCTTATTAGGATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
Found at i:161351 original size:359 final size:356
Alignment explanation
Indices: 160506--165067 Score: 3002
Period size: 359 Copynumber: 12.8 Consensus size: 356
160496 AAATAATTAC
* * * *
160506 TAATAAG--AGATTTAAAAGATAAATCTATTTATCGAACTAGTTCAAATA--TATGACTATTTGA
1 TAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* ** * * * * * * * *
160567 ACAATTGTAAACTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATA
66 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCATA
* ** * *
160632 CAAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATCGAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGAAT
131 CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA-T--TAA-TAAGAGATT
* **** * * * *
160697 TAAAAAATAAATTTGTTTGTTGAACCAGTTCAAATATTTAAAGACTATATGAACAATTATCTATT
192 TAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAACAATTATCTATT
*
160762 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAAGTT-TTTTTGAATTCA-ACT-AGCTTAT
256 TCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTTT--ATTCATA-TAAGCTTAT
** *
160824 TTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAAT
317 TCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * *
160864 TAATAAG--AGATTTAAAAAACAATTTTGTTTACCTAACCAGTTTAAATAATTATGATTATTTGA
1 TAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
160927 CCAATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AAACTTTTATTTTGTCATAAAACAAA-TGTTTTTGTTCA
66 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAA-AAATTGTTTCTATTCA
* * * *
160990 TATAAGTTTATTTGGAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTA
129 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * * * * *
161055 AAAAATAAATCTATTTATCAAATGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCCATTATTTATTTCA
194 AAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * **
161120 AATCATTATGACTTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTTTTATTCATATAAGCTTATTCAGGTT
259 AATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCTTATTCAGAAT
* * *
161185 AAAATAATACTAATTTATTAGTATTTTTAACAAT
324 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAAT
* * * * * * * *
161219 TAATAAGCAAAAAGTTTAAAAAGTAAATATATTTATCGAACTAGATCAAATAGTCATAACTATTT
1 TAATAAG-AAAGA-TTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * *
161284 GAATAATTATCTATTTTAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAATTCA
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCA
* ** * *
161349 TATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAAGTTATTAATATTATGAAAAATAATAATTAAGAGA
129 TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAAAT--TAA-TAAGAGA
* * * * * * * *
161414 TTTAAAAAATGAATTTGTTTATCGAA-CAAGTTTAAATAATTTTGACTATTTCG-ACAATTATGT
190 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTT-GAACAATTATCT
* * * * *
161477 ATTTGAAATCACTATAACCTTTTGTTATGTCAT---GCAA--G--------C-T-T-A--TT-TT
253 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCTTATT
* * *
161523 --GAATAAAATAATGCAAATTTATTAACA-TT-AAGACAAT
318 CAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AAT
** * * * * **
161560 TAATAAGTTAAAGATAAAAAATAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTA
1 TAATAAG--AAAGAT--TTAA-AAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTA
* * * * * *
161625 TTTGAA-AATTTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT-
61 TTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA
* * * * * * *
161688 GTCGTACATGCTTATTTTG-ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTA
125 TTCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT-A--A
* **** * * * *
161752 GAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAA-CAAGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAATAATT
186 G-AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * * * * **
161816 ATCTGTTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCT
249 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCT
*
161881 TATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAAT
314 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** * * * *
161923 TAATGAGTAAGAGAATTGCAAAATAAATCTATTTACCAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATC
1 TAATAAG-AA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTA-GTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * * *
161987 TAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACAAGTTGTTTTGTCATAAAATATTTGGTTCTGTT
63 TGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATT
* ** ** * * * *
162051 CATGCAAGCTTATTTCCAATAAAATAATAAAAATTTGTTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAA
127 CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---AG
* * * * * *
162116 ATTT-AAAAATAAATATATTTTCTAAA-CACTTTCAAATAGTTAT-AATATTTGAACAATTATCT
189 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
* * * * *
162178 ATTTCAAATCATTACGACCTTTGGTTTTGTCATAAACCAATT-TTTTCTATTCAAAAAAGCTTAT
253 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATTCATATAAGCTTAT
* * * *
162242 T-TGAAATAAAATTATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAAT
317 TCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* ** *
162282 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTT-GCTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATT
1 TAATAAG--AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * ** *
162346 TAAATAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTATTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTC
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTC
*
162411 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAG
128 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA----GAG
* * * * * * *
162476 ATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAA-CAATCTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAACTATTATC
189 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAGT-TCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATC
** ** * * **
162539 TATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCGA-AAAACAATTGTTTCTATTCATAGAAAATTA
252 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCTTA
* * *
162603 TTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTAAAAAAT
316 TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
162644 TAATAAG--AGATTTAAAAACTAAATTTGTATGTCAAACTATTTCAAATAGTTATGATTTTTTGA
1 TAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * * *
162707 ACAATTATCTATCTCAAATTGTGAT-A-ATCTTTGTTTTGTTATAAAACAA-------T-TTCAT
66 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAT-TTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCAT
* * * * *
162762 ACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATATTCTAAAAATTAATAAGAGATTTA
130 ACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTA
* * * ** * *
162826 AAAAATAAATGTGTTTGCCAAA-CTAGTTCAAATAGTAAAAACTATTAGAACAATTATATATTTC
194 AAAAATAAATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
* ** * * * * * * * *
162890 AAATCATTTTGATGTTTTGTGTAGTGATAAAATAATT-TTTTTAGTTTATACATGCTTATTCAAA
258 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTCAGA
* * * *
162954 ATAAAGTAAAACAAATTTATTAACA-TTCAAAAAT
322 ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * ** *
162988 T--T-----A-A--TGAACAATAAATTTGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
1 TAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* *** ** *
163043 ACAATTATCTATTTAAAATAAATATGACATTTTGTTTTACCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCAT
66 ACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTA-TTCAT
* * * * * * * *
163107 AAAAGCGTATCT-AACATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAAAATTAATATGTTAAAGA
130 ACAAGCTTATTTGAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA----AGAGA
* * * ** * * *
163171 TTTAAAAAATAACTCAGTTTACCGAATTGGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTATCTAT
190 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* ** * * * * *
163236 TTCAAATTATTACAAACTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTTTA-TCATACAAG-TCCATTC
255 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCT-TATTC
* * *
163299 -GAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTACAAAAAT
319 AG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
163337 TAATACGTATGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC-----C----AG-T-T-CCTATTT
1 TAATAAG-A-AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * * *
163390 GAATAATTGTCTATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TAATTC
64 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCT-ATTC
* * *
163454 ATATAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTATAGAATTTAA-TAACTAAG
128 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTA-AA---AATTAA-TAAG
* * * ** **
163517 AGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAAGT-AGTTCAAACAGTTAAAACTATACGAACAATTAT
187 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * *
163580 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTTATAAAAGCCT
251 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATAAGCTT
* *
163644 ATT-TGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
315 ATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * * * *
163686 TAATAAG--TGATTTAAAAAGTGAATCTGTTTATCAAA-TCGGTTCAATATTA-TTATGGCCATG
1 TAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACT-AGTTCAA-A-TAGTTATGACTATT
* * * * * *
163747 TCAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTATT-TGA-
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGT-TTCT-AT
* * * * * *
163810 ACATTA-AAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAA
126 TCA-TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG---
* ** *
163874 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAA-CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTG
187 -AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
** * * * * * *
163938 TAAACTTCAAATCATTATAAGCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTT
250 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCTT
* * * *
164003 ATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAAT
315 ATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * ** * * * **
164045 TAATAACTAAGGGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAA-TCGGTTCAAATATTTAAGACTAAA
1 TAATAA-GAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACT-AGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * **
164109 TGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAGTTTATTTGAAT
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAA-AA-ATTGTTTCTAT
* * * * * * *
164174 TTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAAAGTACG
126 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATT---AA-TAAG
* * * * * * * *
164239 AGATTCAAAAAATAATTCTGTTTACCTAATCAATTCATATAATTATGATTATTTGAACAATTACC
187 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* ** * * * *
164304 TGTTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGTTCATATAAGTTTAT
252 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCTTAT
* *
164369 TC-GAAATAAAGA-AATACTAATCTATTAATATTTCAAATAT
317 TCAG-AATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
***
164409 TAATAAG--AGATTTAAAAAATAAATCAATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
1 TAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
** * * * * ** * * * * * *
164472 GTAACTATTTTATTTCAAATTGTTACGAGTTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGCTTCTGTTCAT
66 ACAATTA-TCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTCAT
* * * * * *
164537 ACATGCTTATTCGTATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTATAATTAATAAATAA-AAAT
130 ACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TA-AA--AATTAATAAGAGAT
* * * * * * * * * *
164601 TTTAAAAATAAATATGTTTA-CAAAACTAGATCAAATAATTATAATTTTTTGAATAATTATCGAT
191 TTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
164665 TTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAGAATTG-TTTTAGTTCACATAAACTTATTC
255 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATATAAGCTTATTC
* * * * * *
164728 AAAATAAAATAATGCTAATTTATTAGTAATCCAAAGAT
319 AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
* * * * * *
164766 TAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA-CTAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATT
1 TAATAA-GAA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * ** * * *
164830 TCAACAATTATCTATTTGAAATCGCTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAGAATTTTTTGTATTC
63 TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTATTC
* * * * *
164895 ATACAATCTTATTTCAAATAATATAATACAAATTTATTAATA--TTAAGACAATTAATAGGTAAA
128 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-A-AATT-A-A--TAAG
* * * **
164958 AGATTTAAAAAATAAAT-TCGTTTACCTAA-CAAGTTGAAATCGTTATGACTATTTGTGCAATTA
187 AGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAATC-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** *
165021 TTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
250 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
165068 CATTACTGTT
Statistics
Matches: 3271, Mismatches: 725, Indels: 411
0.74 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
336 59 0.02
337 17 0.01
338 3 0.00
339 4 0.00
340 6 0.00
341 11 0.00
342 34 0.01
343 116 0.04
344 105 0.03
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346 8 0.00
347 6 0.00
348 110 0.03
349 303 0.09
350 14 0.00
351 2 0.00
352 5 0.00
353 10 0.00
354 37 0.01
355 78 0.02
356 52 0.02
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358 370 0.11
359 495 0.15
360 345 0.11
361 252 0.08
362 179 0.05
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364 210 0.06
365 4 0.00
367 2 0.00
368 3 0.00
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Consensus pattern (356 bp):
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CAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGAGATTTAAA
AAATAAATCTGTTTACCAAATCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA
TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCATATAAGCTTATTCAGAATAA
AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
Found at i:162411 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 161506--165067 Score: 2474
Period size: 181 Copynumber: 20.0 Consensus size: 180
161496 TTTTGTTATG
* * * *
161506 TCATGCAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATGCAAATTTATTAACA-TT-AAGACAATTAATAAGT
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* ** * * * * **
161568 TAAAGATAAAAAATAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATCTTTATGACTATTTGAA-A
63 AAAAGAT--TTAA-AAAATAAATTTGTTTACTAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
* * ** * * *
161632 ATTTATTTATTTTAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT-G
124 A-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * ** * *
161689 TCGTACATGCTTATTTTG-ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAGTAG
1 TCATACAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * *
161753 AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACA-AGTTCAACTAGTCATAACTATTTGAATAATTA
65 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * * * * *
161817 TCTGTTTTAAATCATTGTGACCTTTTGTTTGGTAATAAAACAATTGTTTCAAT
128 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** * *
161870 TCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAATGAGTAAG
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* ** * * * * * *
161934 AGAATTGCAAAATAAATCTATTTACCAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATC
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
*** * * * *
161999 TATTTCAAAAT-ATTATGACAAGTTGTTTTGTCATAAAATATTTGGTTCTGT
130 TATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** ** * *
162050 TCATGCAAGCTTATTTCCAATAAAATAATAAAAATTTGTTTATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
162115 A-ATTT-AAAAATAAATATATTTTCTAAACACTTTCAAATAGTTAT-AATATTTGAACAATTATC
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATA-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * *
162177 TATTTCAAATCATTACGACCTTTGGTTTTGTCATAAACCAATTTTTTCTAT
130 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * *
162228 TCAAAAAAGCTTATTTGAAATAAAATTATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAA
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
162293 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATT
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
** * *
162358 TATTTCAAATCATTATGATTTTTTATTTTGTCATAAAAAAATTGTTTCTAT
130 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
**
162409 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTTG
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* * ** * * * * *
162473 GAGATTTAAAAAATAAATTTGTTCACCGAACAATCTCAAATAGTCATG-TTCATTTGAACTATTA
65 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAGT-TCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTA
** **
162537 TCTATTTCAAATTGTTATGATATTTTGTTTTGTCGA-AAAACAATTGTTTCTAT
128 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTAT
* ** * *
162590 TCATAGAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTTAAAAAATTAATAAG---
1 TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
162651 -AGATTTAAAAACTAAATTTGTATGT-C-AAACTATTTCAAATAGTTATGATTTTTTGAACAATT
65 AAGATTTAAAAAATAAATTTGT-T-TACTAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * * *
162713 ATCTATCTCAAATTGTGATAATC-TTTGTTTTGTTATAAAACAA-------T-T
127 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * *
162758 TCATACAAGCTTA-TTCAAAGTAAAATATTACTAAATTAATAATA-TTCTAAAAATTAATAAG--
1 TCATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTA
* * * * ** *
162819 --AGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCCAAACTAGTTCAAATAGTAAAAACTATTAGAACAATTA
64 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * * * *
162882 TATATTTCAAATCATTTTGATGTTTTGTGTAGTGATAAAATAATT-TTTTTAGT
128 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * ** * * * *
162935 TTATACATGCTTATTCAAAATAAAGTAAAACAAATTTATTAACA-TTCAAAAATT--TAA-T---
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* *
162993 -G-----AACAATAAATTTGTTTATTGAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* * * * ** *
163051 CTATTTAAAATAAATATGACATTTTGTTTTACCATAAAATAATTGTTTC-AGT
129 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * * * * * *
163103 TCATAAAAGCGTATCT-AACATAAAATAATATTACTTTATTAATACTTCAAAAATTAATATGTTA
1 TCATACAAGCTTATTTGAA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * * * *
163167 AAGATTTAAAAAATAACTCAGTTTACCGAATTGGTTCAAATAATTATGGCTATTTGAATAATTAT
65 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * * * *
163232 CTATTTCAAATTATTACAAACTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTTTA-
129 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * *
163283 TCATACAAG-TCCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTACAAAAATTAATACGTAT
1 TCATACAAGCT-TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * ** * * *
163347 GAGATTTAAAAAATAAATCT-ATT--T--ATCG---AACCAG-T-T-CCTATTTGAATAATTGTC
65 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * * * * *
163401 TATTTCAAATCGTTATAACATTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTT-TAAT
130 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AT
* * * * *
163452 TCATATAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTAT-AGAATTTAATAACTA
1 TCATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA
* * * * ** **
163515 AGAGATTTAAAAAAT-AATTTGTTTACCGAAGTAGTTCAAACAGTTAAAACTATACGAACAATTA
64 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
163579 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGT
128 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * *
163632 TTATAAAAGCCTATTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT---
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * *
163694 -GATTTAAAAAGTGAATCTGTTTA-TCAAATCGGTTCAATATTA-TTATGGCCATGTCAACAATT
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAAT-AGTTCAA-A-TAGTTATGACTATTTGAACAATT
** * *
163756 ATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATATAACAATTGTATT-TGA-
127 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCT-AT
* * * * *
163810 ACATTA-AAGCTTATTTGGATTAAAATAATAGTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAA
1 TCA-TACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
163874 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTGT
65 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
** * * * * * *
163939 AAACTTCAAATCATTATAAGCTTTTGTTTCGTCATAAAACAATTATTTTTAT
129 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
** * * * * *
163991 TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAG
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * ** *
164056 GGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAATCGGTTCAAATATTTAAGACTAAATGAAGAATTATC
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* **
164121 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAGTTTATTTGAAT
130 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--TTGTTTCTAT
* * * * * ** * **
164174 TTATACTAGCTTATTTGGAATAAAATAAAACAAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAAAAGTACG
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * *
164239 AGATTCAAAAAAT-AATTCTGTTTACCT-AATCAATTCATATAATTATGATTATTTGAACAATTA
66 AGATTTAAAAAATAAATT-TGTTTA-CTAAAT-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * ** * * * *
164302 CCTGTTTCAAATCATTATGATATTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTTTGT
128 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * *
164355 TCATATAAGTTTATTCGAAATAAAGA-AATACTAATCTATTAATATTTCAAATATTAATAAG---
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAA-ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
*** ** *
164416 -AGATTTAAAAAATAAATCAATTTA-TCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAACTA
65 AAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-AAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* ** * ** * * * * *
164479 TTTTATTTCAAATTGTTACGAGTTTTTGTTCTATTATAAAACAATTGCTTCTGT
128 -TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * * * *
164533 TCATACATGCTTATTCGTATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCTATAATTAATAAATAAA
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * * * * *
164598 A-ATTTTAAAAATAAATATGTTTACAAAACTAGATCAAATAATTATAATTTTTTGAATAATTATC
66 AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * *
164662 GATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG-TTTGTCATAAAAGAATTGTTT-TAGT
130 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-T
* * * ** * * * * *
164712 TCACATAAACTTATTCAAAATAAAATAATGCTAATTTATTAGTAATCCAAAGATTAATAA-TAAA
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * * *
164776 GAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACTAAACAAGTTTAAATAATTATAACTATTTCAACAATTAT
66 -AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAA-TAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
* ** * ** * * *
164841 CTATTTGAAATCGCTATAACCTTTCATTTTGTCATAAAAGAATTTTTTGTAT
129 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
* * * * *
164893 TCATACAATCTTATTTCAAATAATATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAGGTA
1 TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAAGTA
* * * **
164956 AAAGATTTAAAAAATAAATTCGTTTACCTAACA-AGTTGAAATCGTTATGACTATTTGTGCAATT
64 AAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CTAA-ATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
* * ** *
165020 ATTTATTTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
127 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
165068 CATTACTGTT
Statistics
Matches: 2645, Mismatches: 603, Indels: 264
0.75 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
166 1 0.00
167 11 0.00
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170 3 0.00
171 5 0.00
172 1 0.00
173 1 0.00
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175 3 0.00
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184 3 0.00
185 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (180 bp):
TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAA
AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT
Found at i:163237 original size:16 final size:17
Alignment explanation
Indices: 163205--163237 Score: 50
Period size: 18 Copynumber: 1.9 Consensus size: 17
163195 AATTGGTTCA
163205 AATAATTATGGCTATTTG
1 AATAATTAT-GCTATTTG
163223 AATAATTAT-CTATTT
1 AATAATTATGCTATTT
163238 CAAATTATTA
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
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ACGTcount: A:0.36, C:0.06, G:0.09, T:0.48
Consensus pattern (17 bp):
AATAATTATGCTATTTG
Found at i:163528 original size:169 final size:168
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Indices: 163216--163531 Score: 381
Period size: 169 Copynumber: 1.9 Consensus size: 168
163206 ATAATTATGG
* *
163216 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTATTACAAACTTTTGTTTTTTCATAAAACAATTATTTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTGTTTGTTCATAAAACAATTATTTT
* * * **
163281 TATCATACAAGTCCATTCGAAATAAAATAATATTAATTTTTTAATATTACAAAAATTAATACGTA
66 AATCATACAAGTCCATTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAAAAATTAATACGTA
*
163346 TGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTC
131 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTC
* * * * *
163384 CTATTTGAATAATTGTCTATTTCAAATCGTTA-TAACATTTTGTTCTGTT-ATAAAATAATTGTT
1 CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAAAC-TTTTGTT-TGTTCATAAAACAATTATT
* * * * *
163447 TTAATTCATATAAG-CTTATTTAG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATATTATAGAATTTAAT
64 TTAA-TCATACAAGTC-CA-TTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAAAAATTAAT
163510 AAC-TAAGAGATTTAAAAAATAA
126 -ACGTAAGAGATTTAAAAAATAA
163532 TTTGTTTACC
Statistics
Matches: 124, Mismatches: 18, Indels: 11
0.81 0.12 0.07
Matches are distributed among these distances:
167 3 0.02
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169 64 0.52
170 5 0.04
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.06, T:0.42
Consensus pattern (168 bp):
CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTACAAACTTTTGTTTGTTCATAAAACAATTATTTT
AATCATACAAGTCCATTAGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAAAAATTAATACGTA
AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGTTC
Found at i:166718 original size:174 final size:175
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Indices: 166424--166756 Score: 451
Period size: 174 Copynumber: 1.9 Consensus size: 175
166414 CAAGGCCAAC
* *
166424 ATATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAAGAAAATATGTTTACC
1 ATATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATGAGTAAAAGATATAAAAAAGAAAATATATTTACC
* * * * * * *
166489 AAACAAGTTGAAATAGTCGTGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTC-
66 AAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACC-TTTCA
166553 TTTTGTAATAAAACAATT-GTTTTAGTTCATATTTTGAAGTAAAATA
130 TTTTGTAATAAAACAATTGGTTTT-GTTCATATTTTGAAGTAAAATA
* *
166599 ATATTAATTTATTAATATTCTGAA-AATTAATGAGTAAAAGA-ATAAAAAA-AAGAATCTATTTA
1 ATATTAATTTATTAATATT-TCAATAATTAATGAGTAAAAGATATAAAAAAGAA-AATATATTTA
* * * *
166661 TCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTC
64 CCAAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTC
*
166726 ATTTTGTCATAAAACAATTGGTTTTGTTCAT
129 ATTTTGTAATAAAACAATTGGTTTTGTTCAT
166757 GCAAGTTTAT
Statistics
Matches: 138, Mismatches: 16, Indels: 9
0.85 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
173 6 0.04
174 88 0.64
175 41 0.30
176 3 0.02
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.09, T:0.40
Consensus pattern (175 bp):
ATATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATGAGTAAAAGATATAAAAAAGAAAATATATTTACC
AAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCAT
TTTGTAATAAAACAATTGGTTTTGTTCATATTTTGAAGTAAAATA
Found at i:166946 original size:166 final size:166
Alignment explanation
Indices: 166669--166978 Score: 365
Period size: 166 Copynumber: 1.9 Consensus size: 166
166659 TATCGAATAA
166669 GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTGTC
1 GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTGTC
* * ** * * * *
166734 ATAAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATAT
66 ATAAAACAATTAGTTTTATTCATAAAAGGTTATTTGGAATAAAATAATACT-AATTTATTAAAAT
*
166798 TCCAAAAATTAATAAGAAAAAAATATTTTTTGAACAT
130 ACCAAAAATTAATAAGAAAAAAATATTTTTTGAACAT
* * ** ** * ** *
166835 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTC-AAATGTTATGGCCTTTTGTTTTGTT
1 GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTGTC
* **
166899 ATAAACCAA-TAGTTTCTATTTGTAAAAGGTTATTTGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAAAA
66 ATAAAACAATTAGTTT-TATTCATAAAAGGTTATTTGGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAAAA
*
166963 TACTAAAAATTAATAA
129 TACCAAAAATTAATAA
166979 ATAAAAGATT
Statistics
Matches: 118, Mismatches: 23, Indels: 6
0.80 0.16 0.04
Matches are distributed among these distances:
164 5 0.04
165 44 0.37
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167 1 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (166 bp):
GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTGTC
ATAAAACAATTAGTTTTATTCATAAAAGGTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAAAATA
CCAAAAATTAATAAGAAAAAAATATTTTTTGAACAT
Found at i:167127 original size:181 final size:182
Alignment explanation
Indices: 166830--169661 Score: 2068
Period size: 181 Copynumber: 15.7 Consensus size: 182
166820 ATATTTTTTG
* ** *
166830 AACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAAT-GTTATGGCCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * ** * * * *
166894 TTGTTATAAACCAA-TAGTTTCTATTTGTAAAAGGTTATTTGGAATAAAAATAATACTAATTTAT
66 TTGTCATAAAACAATTA-TTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTAT
* * *
166958 TAAAATACTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAAC-A
129 TAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * * * *
167011 AGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCATATCGTTATGATCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* ** * * *
167076 TTGTCATAAAATAATTATTACTATTCATACAAGTTTATTCGATATAAAATAATGCTAATTTATTA
66 TTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** *
167141 ATATTTTAAAAATTAA-AAAGTTGGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTT-ACTA
131 ATATTCTAAAAATTAATAAA-TAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * * * * *
167193 AACAAGCTT-AAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTATTATCCATTTCAAATCATTATAACATTTTG
1 AACAAG-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTG
* * * *
167256 TTTTGTCGT-TAACAATTATTTTTATTCATACAA-ATTATT-TAGAATAAAATAATACTAATTTA
64 TTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTA
*
167318 TTAATATT-TCAAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATTT-ACCA
128 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAA-ATAAATCTATTTAACTA
* * * * * *
167368 GACCAGTTTAAATAGTTATGACTAGTTT-AATAATTATCTATCTCAAATCAG-TATGA-TTTTTG
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTG
* * * * * **
167430 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTC-AAAGTAAAATATTGCTAAACTA
64 TTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
167494 ATAAAATTCTAAAAA-T--T-AATAAGAGA-TTAAAAAATAAATGTGTTT-GCTA
128 TTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * *
167543 AACCAGTT-ATAATAGTTAAGACTTTTAGAACAGTTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCT
1 AACAAGTTCA-AATAGTTATGAC---T-----A--TTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * *
167607 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTAGTTCATACAAGCTAATTCAAAATACAATAAT
55 GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAT
* * * ** *
167671 AC-AATTTTATTAACATTC-AGAAAGTTAACAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTT-AC
119 ACTAA-TTTATTAATATTCTA-AAAATTAATAAATAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTAAC
*
167733 CA
181 TA
* * * * *
167735 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
167800 TTATCATAAAACAATT-GTTTTAGTTAAAAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATT
66 TTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * *
167864 AATATT-TCAAAAATTAA-AAAGATGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATC-A
130 AATATTCT-AAAAATTAATAAATA-AGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAACTA
* * * * *
167916 AATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGT
1 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * *
167980 TTTATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGAC-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTA
65 TTTGTCATAAAACAATTATTTTT-ATTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * *
168043 TTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAGGTGAATTAAAAAATAAATATACTT-AC-A
128 TTAATATTCT-AAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * * * * *
168096 TAACCAGTTTAAATAGTTA-GTACTATTTGAATAATTATATATTTTAAATCATTATAACCTTTTT
1 -AACAAGTTCAAATAGTTATG-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTT
* * * ** * * * *
168160 GTTTTGTCATGAAATAATTATTTATATTTTTATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTA
63 GTTTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * * **
168225 ATAATAATATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAAT-TATTT-GTTGA
128 TTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTAACT-A
* * * * * * *
168280 ACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * * * *
168344 ATGTCGTAAAATAAATATTTTTGTTGATATAAG-TCTATTTTG-AATAAAATAATATTAATTTAT
66 TTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCT-TA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
168407 TAATATTTTGAAAA-T--T-AATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTT-ACCA
129 TAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * * * * * *
168456 AATCAA-TTCAAAT-GTTATAACAATTTGAACAATTATTTGTTTCAAATCATTATGATCGTTTCT
1 AA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * * **
168519 TTTATCACAAAACAATTGTGTCTATTGATAC-AGTATTATT-AAAAAAAAAGTAATGTTAATTTA
65 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAG-CTTATTCGAAATAAAA-TAATACTAATTTA
* * * * *
168582 CTGATATTCTAAAAATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATAAATCTATCTAGCCT-
128 TTAATATTCTAAAAATTAATAAATAA-GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-ACTA
* * * * * *
168637 AACCAGTACAAATAGTTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGT-GTTATGACCTTTGGT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * * * * *
168701 TTTATTACAAAATAATTGTTTATGT-TTCGTACAAG-TTGACTCCG-AATAACATAATTCTAATT
65 TTTGTCATAAAACAATTATTT-T-TATTCATACAAGCTT-A-TTCGAAATAAAATAATACTAATT
* * * *
168763 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATC-G
126 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * * *
168819 AACAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * *
168884 TTGTCATAAAA-TATGT-TTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATACAAATTTA
66 TTGTCATAAAACAAT-TATTTT-TATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
168946 TTAATATTC-ATACAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTT-ACCA
128 TTAATATTCTA-AAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * * * *
168999 AACAAGTTTAAATAGTTACGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * * *
169064 TTGTTATAAAATAATTATTTTTTTTCATAC-AGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTA
66 TTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * ** * * *
169128 ATATTTTGACAATTAATAAGTAA-AGTATTTTTAAAATAAATATGTTTATC-A
131 ATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * *
169179 AACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
** ** * * * * *
169244 TCATTGTAAAACAATT-GTATTAGTTCAGATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
66 TTGTCATAAAACAATTATTTTTA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
169308 AATATTCCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAATATGAATCTGTTT-ACTA
130 AATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * *
169360 AACAA--TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATCATTATGACCTTTTATT
1 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
* * * * * *
169423 TTGTCATAAAATAATTGTTTCTGTTCACACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TATAGTTAT
66 TTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTA-ATTTAT
* * * *
169486 TAATATTCCAAAAATTAATAAATAA-ATATTTAAAAAATAAATATATTT-TCTA
129 TAATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
* * * * *
169538 AACACA-TTCAAATAGTTATAAGTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTAT
1 AACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * * *
169602 TTTTTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAACATATTCGAAATAAAATAATACTAAT
65 TTTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAT
169662 AAGTAAAAAA
Statistics
Matches: 2125, Mismatches: 407, Indels: 239
0.77 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 17 0.01
175 120 0.06
176 144 0.07
177 37 0.02
178 33 0.02
179 176 0.08
180 358 0.17
181 519 0.24
182 491 0.23
183 80 0.04
184 15 0.01
185 29 0.01
186 57 0.03
187 4 0.00
189 1 0.00
190 6 0.00
192 37 0.02
193 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.09, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (182 bp):
AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTT
TTGTCATAAAACAATTATTTTTATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
ATATTCTAAAAATTAATAAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACTA
Found at i:169427 original size:539 final size:532
Alignment explanation
Indices: 166428--173671 Score: 4537
Period size: 539 Copynumber: 13.5 Consensus size: 532
166418 GCCAACATAT
* * * *
166428 TAATTTATTAATATTTCAATAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAAGAAAATATGTTTACCAAAC
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAA-TAAATATGTTTACCAAAC
* ** ** * *
166493 AAGTTGAAATAGTCGTGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG
64 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * *
166558 TAATAAAACAATTGTTTTAGTTC--AT-A---T-TTTGAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATA
129 TCATAAAACAATTG-TTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * *
166616 TTCTGAAAATTAATGAGTAAAAGA-ATAAAAAAAAGAATCTATTTA-TCGAATAAGTTCAAATAG
193 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AATCTATTTACT-AAACAAG-TCAAATAG
* * * * **
166679 TTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAAT
255 TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAT
* * * ** * *
166744 TGGTTTTGTTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATT
319 T-GTTTTATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAAAT
** * *
166808 AATAAGA-A---AAAAAT--AT-T-TTT--TGAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAA
381 AATAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
* * * * * * * ** *
166863 TTATCTATTTCAAA-TGTTATGGCCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATAGTTTCTATTTGTAAAAG
446 TTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAG
* * *
166927 GTTATTTGGAATAAAAATAATAC
511 CTTATTTAG-ATTAAAATAATAC
* ** * * * * * *
166950 TAATTTATTAAAATACTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACAAGCG
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * *
167015 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCATATCGTTATGATCTTTTGTTTTGT
65 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
167080 CATAAAATAATTATTACTA-TTCATACAAGTTTATTCGATATAAAATAATGCTAATTTATTAATA
130 CATAAAACAATTGTT--TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * ** * *
167144 TTTTAAAAATTAAAAAGTTGGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTAAACAAGCTTAAATAGT
193 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG-TCAAATAGT
* * * * * * * * * *
167209 CAT-ATCCATTTGAACTATTATCCATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTTTGTCGTTAACAATT
256 TATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATT
* * *
167273 ATTTTTATTCATACAA-ATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
320 -GTTTTATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATA
* * * *
167336 ATAAGAGATTTAAAAACAAAATCTATTTACCAGACCAGTTTAAATAGTTATGACTAGTTT-AATA
382 ATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAATA
* * *
167400 ATTATCTATCTCAAATCAG-TATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACA
445 ATTATCTATTTCAAAT-TGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* * * * *
167463 AGCTTATTCAAAGTAAAATATTGC
509 AGCTTATTTAGATTAAAATAATAC
** * * * * * * *
167487 TAAACTAATAAAATTCTAAAAATTAATAAG---AGA-TTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACCA
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAA
* * * *
167548 GTT-ATAATAGTTA-AGACTTTTAGAACAGTTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACC
66 GTTCA-AATAGTTATA-AC---T-----A--TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* * * * ** *
167611 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTAATTCAAAATACAATAATAC-AA
119 TTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * * * * *
167675 TTTTATTAACATT-CAGAAAGTTAACAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
183 -TTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
* * * * * *
167739 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTAT
245 AG-TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * *
167804 CATAAAACAATTGTTTTAGTTAAAAAAAGCTTA-TCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATA
309 CATAAAA-AATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * *
167868 TTTCAAAAATTAAAAAGATGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTATCAAATC-AGTTCAAATAA
371 -TTCAAAAAAT-AATA-A--GAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAG
* * * * * *
167931 TTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTATCATAAAACAA
428 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATG-ACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
** * * *
167995 TTGTTTTTCATCATACAAGAC-TATTCAAAATAAAATAATAC
492 TTGTTTTTGTTCATACAAG-CTTATTTAGATTAAAATAATAC
* ** * **
168036 TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGAATTAAAAAATAAATATACTTA-CATAAC
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTA-AAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA-AAC
* * * * * *
168100 CAGTTTAAATAGTTAGT-ACTATTTGAATAATTATATATTTTAAATCATTATAACCTTTTTGTTT
64 AAGTTCAAATAGTTA-TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTT
* * * * ** * * *
168164 TGTCATGAAATAATTATTTATATTTTTATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAA
127 TGTCATAAAACAATTGTTTA-GTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* *** * ** * *
168229 TAATATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAAT-TATTTGTTGAACCAATTCAAATA
191 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACT-AAACAAGTCAAATA
* * * * * * * *
168293 GTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTTATGTCGTAAAATAA
254 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAA-AA
* * * ** * **
168358 ATAT-TTTTGTTGATATAAG-TCTATTTTGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAA
317 AT-TGTTTTATTCATACAAGCT-TATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * *
168421 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAA-TTCAAAT-GTTATAACAATTTGA
379 ATAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** * * * * * * * *
168484 ACAATTATTTGTTTCAAATCATTATGA-TCGTTTCTTTTATCACAAAACAATTGTGTCTATTGAT
442 ATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCAT
* * ** **
168548 AC-AGTATTA-TTAAAAAAAAAGTAATGT
506 ACAAG-CTTATTTAGATTAAAA-TAATAC
* * * * * * * *
168575 TAATTTACTGATATTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATAAATCTATCTAGCCTAAC
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAAC
* * * * * *
168640 CAGTACAAATAGTTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGT-GTTATGACCTTTGGTTTT
64 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * * ** * *
168704 ATTACAAAATAATTGTTTATGTTTCGTACAAG-TTGACTCCG-AATAACATAATTCTAATTTATT
128 GTCATAAAACAATTGTTTA-G-TTCATATAAGCTT-A-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * *
168767 AATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTA-TCGAACAAGTTGAAA
189 AATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAAG-TCAAA
* * * * *
168831 TAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT
252 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
* * *
168896 ATGTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCATACAA
317 AT-TGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCA-A-AA
* * *
168961 CTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTACGACTATTT
378 --AATAA-TAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT
* * * * *
169026 GAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTTTTTTCA
440 GAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCA
* *
169091 TAC-AGCTTATTTGGATTAAAATAATAT
505 TACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATAC
* * ** *
169118 TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAGTATTTTTAAAATAAATATGTTTATCAAACA
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * **
169183 AGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCAT
65 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
** *
169248 TGTAAAACAATTGTATTAGTTCAGATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
130 CATAAAACAATTGT-TTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * *
169313 TCCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAATATGAATCTGTTTACTAAACAA-TCAAATAGTTAT
194 TCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTCAAATAGTTAT
* * *
169377 GACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAATAATTGTT
259 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AATTGTT
* * *
169442 TCTGTTCACACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TATAGTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
323 T-TATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTA-ATTTATTAATATT-C-AAAA--AAT-
* * * * * * *
169506 AATAA-ATATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTATAAGTATTTGAAC
381 AATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * *
169569 AATTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTATTTTTTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACA
444 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACA
* **
169634 AAC--A--T--ATT-CGA-AATA-
509 AGCTTATTTAGATTAAAATAATAC
* * * * * *
169649 -AA---A-TAATA--CT---AA-TAAGTAA--AAA-ATTTAAAAACTAAATCTATTTACTAAGCA
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA-TAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * * *** *
169700 TGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAATAATTATTTATTTCAATTAGTTATGATAATTTATTTTGT
65 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * *
169765 TATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAG-TT-TGTTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
130 CATAAAACAATTG--TTTAGTTCATATAAGCTTAT-TTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * *
169827 TTTTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTA-TCAAACAAGTTCAAACA
191 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AAACAAG-TCAAATA
* * * * * * **
169891 GTCATGTCCATTTGAACAACTATCTACTTCATATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAA
254 GTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA
* * ** * * * *
169956 TTGTTTGTATTGATGCAAAATTA-TTAAGAATAAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTAAAAA
318 TTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTCA-AAT-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAA
* * * * *
170020 CTAATAAAAAATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAA-ATAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGA
379 ATAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
* * * ** * *
170084 ACAATTATCTATCTCAAATTGTTATCA-TCCTT-TTTTGTCATAAAACAACTGTTTGTTTTTCAT
442 ATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCAT
* * *
170147 ACAACCTTATTCAGGTTAAAATAATAC
506 ACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATAC
* * *
170174 TAATTTAATT-ATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAA-AGTGTTTGCCAAA
1 TAATTT-ATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACCAAA
* * * *
170236 CCAA-TTCAAATCA-TTA-AGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGT
63 -CAAGTTCAAAT-AGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT
* * * * *
170298 TTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTTATACAAAG-TTATTT-AGAATAAAATAATATTAATTTA
125 TTTGTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATA-TAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTA
* * * *
170361 TTAATATTCAAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTTAAAAAAATAAATCTCTATACCAAACAAGTT
187 TTAATATTCCAAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG-T
* * * * * *
170425 CAAATCGATT-TGACTATTTAAACAATTATTTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGCTTTGTCA
248 CAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** * * *
170488 TAAAACAAATGTTTCAGTTCATAAAAATTTATCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTT
311 TAAAA-AATTGTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA--T
* * * * * *
170553 TAAAAATTAATAAGGAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTAAAC-AGTTCAAATAGTTATA
372 TCAAAA--AATAA-TAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * ** * * * * *
170617 ATTATTTGAATAAATATCAACCTCAAATCGTTATGA-TCTTTGTTTTCTTATAAAACAATTATTT
433 ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
** *
170681 TTGACCATACAAGCTTATTTGGA-TAAAACTAATAC
498 TTGTTCATACAAGCTTATTTAGATTAAAA-TAATAC
* * *
170716 TAATTTAATAATATTCTAAAAATTAAT-A--AAAGTTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-AC
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA-
* * * * *
170777 AGTTCAAATAGTTA-AGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGGCCTTTTGTTTAG
65 AGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * *
170841 TCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
129 TCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * * * * * *
170906 TTTGAAAAAGTAATAAGCATGAGATTTGAAAAGATAAATCTCTTTACTGAACAAGTTTAAATAGT
193 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG-TCAAATAGT
* * * **
170971 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAGCAATT
256 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAAAATT
* * * * *
171036 GTATTAGTTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATACTAT-GAAAATT
320 GTTTTA-TTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-T-TCAAAAAAT
* ** * * * * * *
171099 AATAAGAGATTTAAAAA-ATAATTTAGTTTACCAAATTAGTTCAAAAAATTATGGCCATTTAAAC
381 AATAAGAGATTTAAAAATA-AATCTA-TTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAT
* * * * * * * * ***
171163 AACTATCTATTTAAAATCGTTATTACCTATTATTTTGTTATAAAACAATT-TTTATTCAACATAC
444 AATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTGTTCATAC
* * *
171227 AAGCTT-TTTTGAAGTAAAATAATAT
508 AAGCTTATTTAG-ATTAAAATAATAC
* * * * ** * * *
171252 TAATTTATTAATATTTCAAGAATCAATCAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACC
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
171317 ATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGT
65 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * ** *** * *
171382 GATCAAACAATTGGTTCTA-TTCATACT-ATTTTATGCAAAATAAAATATTACTAATTTAATAAT
130 CATAAAACAATT-GTT-TAGTTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAAT
* * * * * * * * *
171445 ATTCCAAAACTTAAT-AGCCAAAAAAATTAAAAAATTAATCTAATTGCTAAACCAGTTGTTCAAA
192 ATTCCAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-CA--AG-TCAAA
* ** ** * *
171509 TAGTTAAGACTATAAGAATGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCGTAAAAC
252 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-
* * * * * *
171574 AATTATTTTATTCGTACAACCTTA-TTCAGATTAAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTTCAAA
316 AATTGTTTTATTCATACAAGCTTATTTCA-A--ATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAA
* * * * *
171638 AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTTATCAAATTAA-TTCAAATGGTTAAGACTATT
377 AAATAATAAGAGATTT-AAAAATAAATCTA-TTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
171701 AGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTC
439 TGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
* * **
171766 ATACAAGCTTATTTAGAATAAATTTTTAC
504 ATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATAC
* ** * * *
171795 TAATTTATTAACATTCAAAAAATT-ATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CAGAA
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCA-AA
* *** ** * * **
171858 CAAATTCAAATAGTTATTTTTATTTGAGCAATTGTCTATTT-AACATCGTTATAACCTTTTAATT
63 CAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAA-ATCGTTATGACCTTTTGTTT
* ** * *
171922 TGTCATAAAACAATTGTTTTAG-TCAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTTATTA
127 TGTCATAAAACAATTG-TTTAGTTC-ATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * * *
171986 ACATTTCC-TAAA-T--T-AGTAAGAAATTTAAAAAATAGATCTGTTTACCAAATC-AGTTAAAA
190 ATA-TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA-CAAG-TCAAA
** * * ** * *
172045 TAAATATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAA
252 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT--AAA
* * *
172110 AAATTTTTTTGA-TCACACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTCAAA
315 AAATTGTTTT-ATTCATACAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTC-AA
* * * **
172173 AATTAATAAGTAACATATTTAAACAATAAATCTATTTGCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
376 AA--AATAA-TAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTA
*
172238 TTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
437 TTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGT
172303 TCATACAAGCTTATTTAGATT-AAATAATA-
502 TCATACAAGCTTATTTAGATTAAAATAATAC
* *
172332 TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAG-TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * **
172397 AGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGT-AGCCTTTTATTTCA
65 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTG
* * * **
172461 TCATAAAACAATTGTATAAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAACG
129 TCATAAAACAATTGT-TTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * * * * **
172526 TTTCAAAAATTAATCAGT----GATTTCAAAAATGAATATGTTTAAC-AAATAA-TTATCTA-TT
193 TTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACTAAACAAGTCAAATAGTT
* * * * * * * * ** * *
172584 -TCAAATCATTATG-AC-CTT-T-TGTTTC-GA-C-ATA-AAACAATTGTTTCTATTCAT--ACA
257 AT-GACT-ATT-TGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTT-T-GTCATAAAAA
* * * ** * * ** * * * ** ** *
172638 A--G-CTTATTCCTAATAAAATAATAT-AAATTTACTGATATTTCAA-AAATTAATAAGC-AAAG
317 ATTGTTTTATTCAT-ACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-CT-AATTTATTAATATTCAAAAA
* * ** * *
172697 AT-TTAA-A-A---AATAAAT--ATGT-TTT-CTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAA
379 ATAATAAGAGATTTAA-AAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * *
172752 CAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTTTATTCATA
443 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTGTTCATA
* * *
172816 AAAGCTTATTTAGAATACAATAATAC
507 CAAGCTTATTTAGATTAAAATAATAC
* * * * *
172842 TAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTCAACAAATAAATATGTTTACCAAGAG
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA-AC
* * * * * *
172907 AA-TTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-TTTTTGGTTTT
64 AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTT
* * ** *
172969 GTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTGTTAA
128 GTCATAAAACAATTG-TT-TAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
** * * *
173033 TATTCCAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTGAGCAAGTTCAAATAT
191 TATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG-TCAAATAG
* * * * * * * **
173098 TTATGTCCATTTGAACTATTAT-TCATTTTAAATCATTATGTCATTTTGTTTTGTTGTAAAATAA
255 TTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AA
* ** *
173162 TTGTTTCTATTTATACAAAATTATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
318 TTGTTT-TATTCATACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAA
* * * * * *
173226 TAATTAGAGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAACCAA-CTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
380 TAATAAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA
* * * * * * * *
173290 CAATTATCTATCTCAAATTGGTAT-AATCTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
443 TAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAC
* * * *
173354 AAACTTATTT-GAAGT-AAATATTGC
508 AAGCTTATTTAG-ATTAAAATAATAC
** * * * * * * *
173378 TAAACTAATAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACC
1 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * ** *
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65 AGTTCAAATAGTTATA--ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** **
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128 GTCATAAAACAATTGTTT-AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC-TAATTTATTAA
* * * **
173571 CATT-TAGAAATTTAATATCTAAG-GAATTTAAGAAAATAAAATCTATTTA-TAGAACAAGTTCA
191 TATTCCA-AAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAA-AAAAT-AAATCTATTTACTA-AACAAG-TCA
* * *
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ATAAAACAATTGTTTAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC
CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAGTCAAATAGTTATGA
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAATTGTTTTA
TTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATAATAAGAGAT
TTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT
CAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAGA
TTAAAATAATAC
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* ** * * *
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* * * ** * * * * *
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* * *** *
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GAAATAAAATAATACTAATAAGTAAAAA
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* * * * * * * * *
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*
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* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* * * *
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1 ATTTAAAAAATAAATA-TGTTTACCAAA-CAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * *
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* * * * *
170336 TTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAATAAGAG
127 TTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAG
* * * * * *
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1 A-TTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * * * * *
170454 TTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAACAAATGTTTCAGTTCATAAAAATTT
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* *
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126 AT-TAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAG
* * * * *
170573 ATTTAAAAACTAAAGCTAT-TTT-CTAAAC-AGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAATAAATATC
1 ATTTAAAAAATAAA--TATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* ** * * * * * *
170635 AACCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTTATAAAACAATTATTTT-TGACCATACAAGCTTA
64 TATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT--TCATACAAACTTA
* * * *
170698 TT-TGGATAAAACTAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATA--AA-AG
127 TTAAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAGTAAGAG
* * * *
170748 TTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-ACAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCT
1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * * * *
170812 ATTTCAAATAGTTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAACTTATT
** * * * * *
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* * * ** * *
170929 ATTTGAAAAGATAAATCTCTTTACTGAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
1 ATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * * *
170994 ATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAGCAATTGTATTAGTTCATA-AAAGCTTAT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAA-CTTAT
* ** * *
171058 TCAA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATACTATGAAAATT-A-A-TAAGAG
128 T-AAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAGTAAGAG
* ** * * * * * * *
171107 ATTTAAAAAAT-AATTTAGTTTACCAAATTAGTTCAAAAAATTATGGCCATTTAAACAACTATCT
1 ATTTAAAAAATAAATAT-GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * * *
171171 ATTTAAAATCGTTATTACCTATTATTTTGTTATAAAACAA-T-TTTTATTCAACATACAAGCTT-
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATT---CATACAAACTTA
** * * * **
171233 TTTTGAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAGAATCAATCAGTTGGAG
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* * * * * *
171288 ATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * * * * ** *
171353 TTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTGATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTATGC
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTATTCATACAAACTTAT-T
* * * * * * * *
171418 AA-AATAAAATATTACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAATAGCCAAAAA
129 AAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAG-TAAGAG
* * * ** * * * * ** *
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1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTAT
* * * * *
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63 CTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAACTTAT
* * * *
171599 TCAGATTAAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTTC-AAAAATT-A-A-TAAGAG
128 TAAGA--ATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCTAAAAATTAATAGTAAGAG
* * * * *
171650 ATTTAAAAAATAAATTAT-TTTATCAAATTAA-TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATC
1 ATTTAAAAAATAAA-TATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* * * * * * *
171713 TATTTCAAATTGTTCTAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTAT
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* * ** ** * *
171778 TTAGAATAAATTTTTACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT-ATAAGAAAGAG
128 TAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAG
* * * *** ** *
171830 ATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CAGAACAAATTCAAATAGTTATTTTTATTTGAGCAATTGTC
1 ATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATC
* ** * *
171894 TATTT-AACATCGTTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTCAATACAAGCTTA
64 TATTTCAA-ATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTC-ATACAAACTTA
* * * * *
171958 -GATGGAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTTCCT--AAA-T--TAGTAAGAA
127 TTA-AGAATAAAATAATACTAATTTATT-A-ATTTTCTAAAAATTAATAGTAAGAG
* * * ** * * *
172008 ATTTAAAAAATAGATCTGTTTACCAAATC-AGTTAAAATAAATATGGCCATTTGAATGATTATCT
1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCT
* * * * * *
172072 ATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATTTTTTTGA-TCACACAAGCTTAT
65 ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTGTTTT-ATTCATACAAACTTAT
* * *
172136 TCAA-AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAACAT
128 T-AAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAG
* * * * ** *
172189 ATTTAAACAATAAATCTATTTGCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTA
1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * * *
172254 TTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTT
66 TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTATTCATACAAACTTATTA
* * *
172319 AG-ATTAAATAATA-TAATTTATTAATATTT-TGACAATTAATAAGTTAA-AG
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* *
172368 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTA
1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTA
* * * ** * * * **
172433 TTTCAAATTGTTGT-AGCCTTTTATTTCATCATAAAACAATTGTATAAGTTCATATAGGCTTATT
66 TTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATACAAACTTATT
* * *
172497 -TGAAATAAAATAATACTAACTTATTAACGTTTC-AAAAATTAATCAGT----G
129 AAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAA-TTTTCTAAAAATTAAT-AGTAAGAG
* * *
172545 ATTTCAAAAATGAATATGTTTAACAAA
1 ATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA
172572 TAATTATCTA
Statistics
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0.74 0.17 0.09
Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (179 bp):
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TTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATACAAACTTATTAA
GAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAGTAAGAG
Found at i:171068 original size:721 final size:721
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Indices: 169727--171847 Score: 1583
Period size: 721 Copynumber: 2.9 Consensus size: 721
169717 TTGTTTGAAT
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169727 AATTATTTATTTCAATTAGTTATGATAATTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA
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* * *
169792 AGTTTGTTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTA
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* * * * *
169857 AAAAATAATTATGTTTATCAAACAAGTTCAAACAGTCATGTCCATTTGAACAACTATCTACTTCA
131 AAAAATAACTATGTTTATCAAACAAGTTCAAACAGTCATATCCATTTGAACAAATATCAACCTCA
* * * ** *
169922 TATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTATTGATGCAAAATTATTAAGAAT
196 AATCGTTATGACCTTTCATTTTCTCATAAAACAATTATTTGTATCCATACAAAATTATTAAGAAT
* * * * *
169987 AAAAATAATACTGATCTATTAATATTTTAAAAACTAATAAAAAATTTAAAAACTAAATCTGTTTA
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* * * * * *
170052 CCAAAATAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATCATCCTTT
326 CCAAAACAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAATAGTTATCAGCCTTT
*** *
170117 TTTGTCATAAAACAACTGTTTGTTTTTCATACAACCTTATTCAGGTTAAAATAATACTAATTTAA
391 TTTGTCATAAAACAACTGTTTGCAGTTCATACAACCTTATTCAGGATAAAATAATACTAATTTAA
* * * * * * *
170182 TTATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAGTGTTTGCCAAACCAATTCAAAT
456 TTACATTTCAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAAAACTCTTTACCAAACCAATTCAAAT
* * * *
170247 CATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACA
521 CATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTGTTTAGTCATAAAACA
* * * *
170312 ATTATTTCAGTTTATACAAAGTTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCAAAAAAT
586 ATTATTTCAGTTCATACAAAGTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAAT
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* *
170448 AATTATTTATTTAAAGTT-GTTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAACAAATG-TTTCAGTTCATA
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*
170511 AAAATTTATCTAA-AATAAAATAATACTACTTTATTAATATTT-TAAAAATTAATAAGG-AAGAG
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* * * * * *
170573 ATTTAAAAACTAAAGCTAT-TTTCT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATAAT-TATTTGAATAAATAT
126 ATTTAAAAAAT-AA-CTATGTTTATCAAACAAGTTCAAACAGTCAT-ATCCATTTGAACAAATAT
* * * * **
170634 CAACCTCAAATCGTTATGATCTTT-GTTTTCTTATAAAACAATTATTTTTGA-CCATACAAGCTT
188 CAACCTCAAATCGTTATGACCTTTCATTTTCTCATAAAACAATTATTTGT-ATCCATACAAAATT
* * * * * **
170697 ATT-TGGATAAAACTAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAAAGTTTTAAAAAATAA
252 ATTAAGAATAAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAACTAATAAAAAATTTAAAAAATAA
* * *
170761 ATATGTTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTA
317 ATATGTTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAATAGTTA
* * * * * *
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382 TCAGCC-TTT-TTT-GTCATAAAACAACTGTTTGCAGTTCATACAACCTTATTCAGG-ATAAAAT
* * * *
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** * * * *
170952 CTGAA-CAAGTTTAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCAT
505 CCAAACCAA-TTCAAATCA-TTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCAT
* * * * *
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* * * * * *
171078 TTTATTAATACT-ATGAAAA-T--T-AATAAGAGA-TTT-AAAAAAT-AATTTAGTTTACCAAAT
631 TTTATTAATATTCA-AAAAATTAATGAATAAGAGATTTTAAAAAAATAAATCT-CTATACCAAAC
* ** * *
171135 TAGTTCAAA-AAATTATGGCCATTTAAAC
694 AAGTTCAAATCGATT-TGACTATTTAAAC
* * * * * * * * * * *
171163 AACTATCTATTTAAAATCGTTATTAC-CTATTATTTTGTTATAAAACAATTTTTATTCA-ACATA
1 AATTATTTATTTAAATTAGTTATGACAAT-TTACTTTGTCATAAAACAAATGTT-TTCATTCATA
** * * * * **
171226 CAAGCTTT-TT-TGAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AAGAATCAATCA-GTTGGA
64 -AAAATTTATTAAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT-TTTCTAAAAATTAAT-AGGTAAGA
* * * * * * * * ** * * *
171287 GATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTTAAATAGTTTTGA-CTATTTGAATAATTATC
125 GATTTAAAAAATAACTATGTTTATCAAACAAGTTCAAACAGTCAT-ATCCATTTGAACAAATATC
* ** * * * * * * ** * * * **
171351 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTGATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTTTAT
189 AACCTCAAATCGTTATGACCTTTCATTTTCTCATAAAACAATTATTTGTATCCATACAAAATTAT
* * * * *
171416 GCAA-AAT-AAAATATTACTAATTTAATAATATTC-CAAAACTTAATAGCCAAAAAAATTAAAAA
254 -TAAGAATAAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAAC-TAAT----AAAAAATTTAAAAA
* * ** * * * * ** *
171478 ATTAATCTAATTGCTAAACCAGTTGTTCAAATAGTTAAGACTATAAGAATGATTATCTATTTCAA
313 ATAAATATGTTTACCAAAACA---GTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAA
* * * * * * *
171543 ATCGTTATGA-CCTTTTCTTTTGTCGTAAAACAATTATTT-TA-TTCGTACAACCTTATTCA-GA
375 ATAGTTATCAGCC--TT-TTTTGTCATAAAACAACTGTTTGCAGTTCATACAACCTTATTCAGGA
* * * * * *
171604 TTAAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
437 -T--AAAATAATACTAATTTAATTACATTTCAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAAAAC
* * ** ** * * ** *
171665 TATTTTATCAAATTAATTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTA
499 T-CTTTACCAAACCAATTCAAATCATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATA
* * * * * * **
171730 A-CATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATAC-AAGCTTATTTAGAATAAATTTTT
563 ACCA-TTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTCAGTTCATACAAAG-TTATTCAAAATAAAATAAT
* *
171793 ACTAATTTATTAACATTCAAAAAATT-AT-AAGAAAGAGA-TTTAAAAAAATAAATCT
626 ACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTTAAAAAAATAAATCT
171848 ATTTACAGAA
Statistics
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Consensus pattern (721 bp):
AATTATTTATTTAAATTAGTTATGACAATTTACTTTGTCATAAAACAAATGTTTTCATTCATAAA
AATTTATTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAGGTAAGAGATTTA
AAAAATAACTATGTTTATCAAACAAGTTCAAACAGTCATATCCATTTGAACAAATATCAACCTCA
AATCGTTATGACCTTTCATTTTCTCATAAAACAATTATTTGTATCCATACAAAATTATTAAGAAT
AAAAATAATACTAATCTAATAATATTCTAAAAACTAATAAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTA
CCAAAACAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAATTATCTATCTCAAATAGTTATCAGCCTTT
TTTGTCATAAAACAACTGTTTGCAGTTCATACAACCTTATTCAGGATAAAATAATACTAATTTAA
TTACATTTCAAAAAGTAATAAGCAAGAGATTTAAAAAAAAAACTCTTTACCAAACCAATTCAAAT
CATTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTGTTTAGTCATAAAACA
ATTATTTCAGTTCATACAAAGTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAAT
TAATGAATAAGAGATTTTAAAAAAATAAATCTCTATACCAAACAAGTTCAAATCGATTTGACTAT
TTAAAC
Found at i:171172 original size:359 final size:351
Alignment explanation
Indices: 169760--172571 Score: 1521
Period size: 358 Copynumber: 7.8 Consensus size: 351
169750 GATAATTTAT
* * * * *
169760 TTTGTTATAAAACAATTGTTTTTA-TTCATACAAGTTTGTTAAGAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTTGTCATAAAACAATTG-TTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
169824 TAAT-TTTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTA-TCAAACAAGTTCA
65 TAATATTTC-AAAAA-TAATAAG-ATGAGATTTAAAAGATAAATCTATTTACT-AAAC-AGTTTA
* * * * * * * * * **
169887 AACAGTCATGTCCATTTGAACAACTATCTACTTCATATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAA
125 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * *
169952 ACAATTGTTT-GTATTGATGCAAAA--TTATTAAGAATAAAAATAATACTGATCTATTAATATTT
190 ACAATTATTTAG--TTCAT--AAAAGCTTATT-AGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTA
* * * * * * * * *
170014 TAAAAACTAATAAAAAATTTAAAAACTAA-ATCTGTTTACCAAAATAGTTCAGATAGTTATGACT
249 TAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATAT-AGTTTACCAAAAAAGTTCAAAAAATTATGACT
* * * *
170078 ATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATCATCC-TTT-
313 ATTTAAACAATTATCTAT-TTAAATAGTTATGA-CCTTTTG
* *** * * **
170117 TTTGTCATAAAACAACTGTTTGTTTTTCATACAACCTTATTCAGGTTAAAATAATACTAATTTAA
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTT-CAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-A
* * * ** * * * * *
170182 TT-ATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAA-AAAAAAGTGTTTGCCAAACCAATTCAA
64 TTAATATTTCAAAAA-TAATAAG-ATGAGATTTAAAAGATAAATCTATTTACTAAA-CAGTTTAA
* * * * *
170245 ATCA-TTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAA
126 AT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* *
170309 ACAATTATTTCAGTTTATACAAAG-TTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTCA-A
190 ACAATTATTT-AGTTCATA-AAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-ATA
* * **
170372 AAAATTAATGAATAAGAGATTTTAAAAAAATAA-AT-CTCTATACCAAACAAGTTCAAATCGATT
251 AAAA-T--T-AATAAGAGA-TTT-AAAAAATAATATAGT-T-TACCAAAAAAGTTCAAA-AAATT
* * *
170435 -TGACTATTTAAACAATTATTTATTTAAAGTTGTTATGACATTTTG
307 ATGACTATTTAAACAATTATCTATTTAAA-TAGTTATGACCTTTTG
* * ** * * *
170480 CTTTGTCATAAAACAAATGTTTCAGTTCATAAAAATTTATCTAAAATAAAATAATACTACTTTAT
1 -TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * *
170545 TAATATTTTAAAAATTAATAAGGAAGAGATTTAAAA-ACTAAAGCTATTTTCTAAACAGTTCAAA
65 TAATATTTCAAAAA-TAATAA-GATGAGATTTAAAAGA-TAAATCTATTTACTAAACAGTTTAAA
* * * * * ** * * * * *
170609 TAGTTATAATTATTTGAATAAATATCAACCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTTATAAAAC
127 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** * * * * *
170673 AATTATTTTTGACCATACAAGCTTATTTGGATAAAACTAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAA
192 AATTA-TTTAGTTCATAAAAGCTTATTAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTATAAAAA
* * * * * * *
170738 TTAATAAAAGTTTTAAAAAATAA-ATATGTTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTAAGATTA-TTAG
255 TTAATAAGAGATTTAAAAAATAATATA-GTTTACCAAAAAAGTTCAAAAAATTATGACTATTTA-
* *
170801 AATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGGCCTTTTG
318 AACAATTATCTATTT-AAATAGTTATGACCTTTTG
* * *
170836 TTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTAT
1 TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * *
170901 TAACATTTGAAAAAGTAATAAGCATGAGATTTGAAAAGATAAATCTCTTTACTGAACAAGTTTAA
65 TAATATTTCAAAAA-TAATAAG-ATGAGATTT-AAAAGATAAATCTATTTACTAAAC-AGTTTAA
* * * * *
170966 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAG
126 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
171031 CAATTGTATTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATACTATGAAA
191 CAATTAT-TTAGTTCATAAAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAA
* ** * *
171096 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATTTAGTTTACCAAATTAGTTCAAAAAATTATGGCCATTTAA
254 ATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATATAGTTTACCAAAAAAGTTCAAAAAATTATGACTATTTAA
* * *
171161 ACAACTATCTATTTAAAATCGTTATTACCTATTAT-
319 ACAATTATCTATTT-AAATAGTTATGACCT-TT-TG
* * *
171196 TTTGTTATAAAACAATT-TTT-A-TTCAACATACAAGCTT-TTTTGAAGTAAAATAATATTAATT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT---CATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATT
* * * * * *
171257 TATTAATATTTCAAGAATCAATCAGTTGGAGATTTAAAA-AGTAAATCTGTTTACCAAACCATTT
62 TATTAATATTTCAAAAAT-AATAAGAT-GAGATTTAAAAGA-TAAATCTATTTACTAAA-CAGTT
* * * * *
171321 TAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTGATC
123 TAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATA
* ** ** * * * * **
171386 AAACAATTGGTTCTA-TTCATACTATTTTATGCAAAATAAAATATTACTAATTTAATAATATTCC
188 AAACAATT-ATT-TAGTTCATAAAAGCTTAT-TAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT
* * * * * * * * ** * *
171450 AAAACTTAATAGCCAAAAAAATTAAAAAATTAATCTA-ATTGCTAAACCAGTTGTTCAAATAGTT
250 AAAAATTAAT----AAGAGATTTAAAAAA-TAATATAGTTTACCAAA--A-AAGTTCAAAAAATT
* * ** * *
171514 AAGACTA-TAAGAATGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCT
307 ATGACTATTTA-AACAATTATCTATTT-AAATAGTTATGACCTTTT-G
* * * * * * * *
171561 TTTGTCGTAAAACAATTATTTTA-TTCGTACAACCTTATTCAGATTAAAAAAAAATACTAATTTA
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGA--ATAAAATAATACTAATTTA
* * * * *
171625 ATAATATTTCAAAAATTAAT-A-A-GAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTTA-TCAAATTAATTCA
64 TTAATATTTCAAAAA-TAATAAGATGAGATTTAAAAGATAAATCTA-TTTACT-AAA-CAGTTTA
* * * * ** * * *
171685 AATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACATTTTGTTTAGTCATAAA
125 AATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* * * * ** *
171750 ATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTTTTACTAATTTATTAACATTCA-AA
190 ACAATT-ATTTAGTTCATAAAAGCTTA-TTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-ATAA
* * * * *
171814 AAATTATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTA-TTTA-CAGAACAAA-TTCAAATAGTTATT
252 AAA-T-TAA-TAAGAGATTT-AAAAAAT-AATATAGTTTACCA-AA-AAAGTTCAAAAAATTATG
** * * * * * *
171876 TTTATTTGAGCAATTGTCTATTTAACATCGTTATAACCTTTTAA
310 ACTATTTAAACAATTATCTATTTAA-ATAGTTATGACCTTTT-G
* ** * *
171920 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG-TCAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTTAT
1 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTC-ATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * * *
171984 TAACATTTCCTAAATTAGTAAGA--A-ATTTAAAAAATAGATCTGTTTACCAAATCAGTTAAAAT
65 TAATATTT-CAAAAATAATAAGATGAGATTTAAAAGATAAATCTATTTACTAAA-CAGTTTAAAT
** * * ** * * *
172046 AAATATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAA
128 AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAAC
* * * * * * *
172111 AATTTTTTTGATCACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATTAATATT-TCAAAAA
192 AATTATTTAGTTCATAAAAGCTTATT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAAA
* * * * ** * * *
172175 TTAATAAGTAACATATTTAAACAATAAATCTA-TTTGCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
255 TTAATAAG----AGATTTAAAAAAT-AATATAGTTTACCAAAAAAGTTCAAAAAATTATGACTAT
* * * * *
172239 TTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTG
315 TTAAACAATTATCTATTT-AAATAGTTATGACCTTTTG
** *
172277 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAG-ATTAAATAATA-TAATTTAT
1 -TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * * * * *
172340 TAATATTTTGACAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAA
65 TAATA-TTTCAAAAATAATAAGAT-GAGATTTAAAAGATAAATCTATTTACTAAAC-AGTTTAAA
* * * ** * * * **
172405 TAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGTAGCCTTTTATTTCATCATAAAAC
127 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* * * * * * **
172470 AATTGTATAAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAACTTATTAACGTT-TCAAAA
192 AATTAT-TTAGTTCATAAAAGCTTATTAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-AAAA
* * * *
172534 ATTAATCAGTGATTTCAAAAATGAATAT-GTTTAACAAA
254 ATTAATAAGAGATTTAAAAAAT-AATATAGTTTACCAAA
172572 TAATTATCTA
Statistics
Matches: 1913, Mismatches: 420, Indels: 245
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
355 13 0.01
356 210 0.11
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358 502 0.26
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367 5 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (351 bp):
TTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
AATATTTCAAAAATAATAAGATGAGATTTAAAAGATAAATCTATTTACTAAACAGTTTAAATAGT
TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
ATTTAGTTCATAAAAGCTTATTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTATAAAAATTAATA
AGAGATTTAAAAAATAATATAGTTTACCAAAAAAGTTCAAAAAATTATGACTATTTAAACAATTA
TCTATTTAAATAGTTATGACCTTTTG
Found at i:172289 original size:358 final size:354
Alignment explanation
Indices: 166428--172539 Score: 3751
Period size: 359 Copynumber: 17.1 Consensus size: 354
166418 GCCAACATAT
* * * * * * *
166428 TAATTTATTAATATTTCAATAATTAATGAGTAAAAGATTTAAAAAAGAAAATATGTTTACCAAAC
1 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAAGATTTAAAAAA-TAAATCTATTTACTAAAC
* ** * * ** *
166493 AAGTTGAAATAGTCGTGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * *
166558 TAATAAAACAATTGTTTTAGT--T-C-A---TATTTTGAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATA
128 TCATAAAACAATTGTTTTAGTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * *
166616 TTCTGAAAATTAATGAGTAA-AAGA-ATAAAAAAAAGAATCTATTTATCGAATA-AGTTCAAATA
192 TT-T-CAAA--AATTAGTAAGAA-ATTTAAAAAATA-AATCTGTTTA-CCAA-ACAGTTCAAATA
* * * * * **
166678 GTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAACATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAA
249 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * * * *** *
166743 TTGGTTTTGTTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-T
314 TTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
166783 TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT----AAGA---AAAAAAT--AT-T-TTT--TGAACAT
1 T-AATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAA
** * * *
166835 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGGCCTTTTGTTTTGTT
65 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTC
* * * ** * * * *
166899 ATAAACCAATAGTTTCTATTTGTAAAAGGTTATTTGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAA-AA
130 ATAAAACAATTGTTT-TAGTCATACAAGCTTATTTAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATAT
* * * * * *
166963 TACTAAAAATTAATAAATAAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAACAAGCGAGTTCAAATAGTT
193 TTC-AAAAATTAGT--A-AGAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTT
* * * * * * *
167028 ATGACTATTTAAACAATTATTTATTTCATATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTA
252 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
** * * * *
167093 TTACT-ATTCATACAAGTTTATTCGATATAAAATAATGC
317 TTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * ** *
167131 TAATTTATTAATATTTTAAAAATTAAAAAGTTGGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACTAAAC
1 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAAAC
* * * * ** * * *
167196 AAGCTT-AAATAGTCAT-ATCCATTTGAACTATTATCCATTTCAAATCATTATAACATTTTGTTT
63 AAG-TTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTT
* * * * *
167259 TGTCGT-TAACAATTATTTTTATTCATACAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
126 TGTCATAAAACAATT-GTTTTAGTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * *
167322 TATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATTTACCAGACCAGTTTAAATAGTTA
190 TATTTCAAAAATTAGTAAGAAATTTAAAAA-ATAAATCTGTTTACCA-AACAGTTCAAATAGTTA
* *
167386 TGACTAGTTT-AATAATTATCTATCTCAAATCAG-TATGA-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
253 TGACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATC-GTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * *
167448 GTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTGC
316 GTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * *
167487 TAAACTAA-TAA-AATTCTAAAAATTAATAAG--AGA-TTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACC
1 T-AATTAATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
* * *
167547 AGTT-ATAATAGTTAAGACTTTTAGAACAGTTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACC
64 AGTTCA-AATAGTTATGAC---T-----A--TTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACC
* * * * * * *
167611 TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTTAGTTCATACAAGCTAATTCAAAATACAATAATAC-AA
118 TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAA
* * * *
167675 TTTTATTAACA-TTCAGAAAGTTAACAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACA
182 -TTTATTAATATTTCA-AAAATT----AGTAAGAAA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-
* * * * *
167739 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTAT
239 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGT
* * * * * * *
167804 CATAAAACAATTGTTTTAGTTAAAAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATAT
304 CATAAAACAATTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
167855 TACTTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGATGGAGATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTA-TCAAA
1 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGA--AAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACT-AAA
* * * * * * *
167918 TC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTT
62 -CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTT
* * *
167982 TATCATAAAACAATTGTTTTTCA-TCATACAAGAC-TATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
126 TGTCATAAAACAATTG-TTTT-AGTCATACAAG-CTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * ** *
168045 AATATTTCAAAAATTAATAAGTAGGTGAA-TTAAAAAATAAATATACTTA-CATAACCAGTTTAA
188 AATATTTCAAAAATTAGTAAG-A----AATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCA-AA-CAGTTCAA
* * * * *
168108 ATAGTTA-GTACTATTTGAATAATTATATATTTTAAATCATTATAACCTTTTTGTTTTGTCATGA
246 ATAGTTATG-ACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAA
* * * ** * * **
168172 AATAATTATTTAT-ATTTTTATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATAC
309 AACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * **
168218 TAATCTAA-TAATAATAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAAT-TATTTGTTGA
1 TAAT-TAATTAAT-ATTTCAAAAATTAATAA-GAA-AGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTACT-A
* * * * * * *
168280 ACCAA-TTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATCTTTTGTT
60 AACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATT
* * * * * * * * * *
168344 ATGTCGTAAAATAAATATTTTTGTTGATATAAG-TCTATTTTGAATAAAATAATATTAATTTATT
125 TTGTCATAAAACAATTGTTTTAG-TCATACAAGCT-TATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
** * * *
168408 AATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATCAATTCAAAT-GTT
188 AATATTTCAAAAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTT
* * * * * * * * * * *
168472 ATAACAATTTGAACAATTATTTGTTTCAAATCATTATGATCGTTTCTTTTATCACAAAACAATTG
252 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * **
168537 TGTCT-ATTGATAC-AGTATTATT-AAAAAAAAAGTAATGT
317 TTTTTGA-TCATACAAG-CTTATTCAAAATAAAA-TAATAC
* * * * *
168575 TAATTTACTGATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAATGGATTTAAAAAATAAATCTATCTAGCCT-A
1 TAATTAATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTA--CTAA
* * * * * * **
168638 ACCAGTACAAATAGTTATAATTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGTGTTATGACCTTTGGTTT
61 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTT
* * * * * * ** * *
168703 TATTACAAAATAATTG-TTTATGTTTCGTACAAG-TTGACTCCGAATAACATAATTCTAATTTAT
126 TGTCATAAAACAATTGTTTTA-G--TCATACAAGCTT-ATTTAGAATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * *
168766 TAATA-TTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACAAGTTGAA
187 TAATATTTC-AAAAA-T--T-AGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTTCAA
* * *
168830 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
246 ATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * *
168895 -TA-TGTTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-AATTAAAATAATAC
311 CAATTGTTTTT-GA-TCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
168939 AAATTTATTAATA-TTCATACAACTAATAAGTAAAAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAAC
1 TAATTAATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG--AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAAC
* * * * * *
169002 AAGTTTAAATAGTTACGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTG
63 AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * * ** * * *
169067 TTATAAAATAATTATTTTTTTTCATAC-AGCTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATA
128 TCATAAAACAATT-GTTTTAGTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
** * * ** * * *
169131 TTTTGACAATTAATAAGTAAAGTATTTTTAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTC
192 TTTCAAAAATTAGTAAG--AA--ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTT
* * ** **
169196 ATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTCATTGTAAAACAATTG
252 ATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* * * * * **
169261 TATTAGTTCAGATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
317 TTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
169299 TAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAATATGAATCTGTTTACTAAACA
1 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-A-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
* **
169364 A--TCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * *
169427 CATAAAATAATTGTTTCT-GTTCACACAAGCTTATTTCA-AATAAAATAATA-TATAGTTATTAA
129 CATAAAACAATTGTTT-TAG-TCATACAAGCTTATTT-AGAATAAAATAATACTA-ATTTATTAA
* * * * * * * *
169489 TATTCCAAAAATTAATAAATAAATATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACACATTCAAATAGT
190 TATTTCAAAAATTAGT-AA-GAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACA-GTTCAAATAGT
* * * * * * * *
169554 TATAAGTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTATTTTTTCATAAACCAATT
251 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
169619 GTTTTTGTTCATACAAACATATTCGAAATAAAATAATAC
316 GTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
169658 --------T-A-A--T-----A--AGTAA-AAA-ATTTAAAAACTAAATCTATTTACTAAGCATG
1 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
* * * * *** *
169702 TTCAAATAGTTATGATTGTTTGAATAATTATTTATTTC-AATTAGTTATGATAATTTATTTTGTT
66 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT-GTTATGACCTTTTATTTTGTC
* * * *
169766 ATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGTTTGTTAAGAATAAAATAATACTAATTTATTAAT-TT
130 ATAAAACAATTG-TTTTAGTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * *
169830 TCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAATTATGTTTATCAAACAAGTTCAAACAGTCA
194 TC-AAAAA-T--TA-GTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTA
* * * * * * **
169895 TGTCCATTTGAACAACTATCTACTTCATATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGT
253 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * **
169960 TTGT-ATTGATGCAAAATTATT-AAGAATAAAAATAATAC
318 TTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAA-AAT-AAAATAATAC
* * * * * *
169998 TGATCT-ATTAATATTTTAAAAACTAATAA-AAA-ATTTAAAAACTAAATCTGTTTACCAAA-AT
1 TAAT-TAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA-
* * *
170059 AGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATCATCC--TT-TTTTG
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGA-CCTTTTATTTTG
* ** * * **
170121 TCATAAAACAACTGTTTGTTTTTCATACAACCTTATTCAGGTTAAAATAATACTAATTTAATT-A
128 TCATAAAACAATTG-TT-TTAGTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAA
** * *
170185 TATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAA-AAAAGTGTTTGCCAAACCAATTCAAATCA
190 TATTTCAAAAATTAGTAAG--A-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGTTCAAAT-A
* * * * * *
170249 -TTAAGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAA
249 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* ** * * * * *
170313 TTATTTCAGTTTATACAAAG-TTATTTAGAATAAAATAATAT
314 TTGTTTTTGATCATAC-AAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * *
170354 TAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATGAATAAGAGATTTTAAAAAAATAAATCTCTATACCAA
1 TAATTAATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AAGAA-AGA-TTT-AAAAAATAAATCTATTTACTAA
* * * * **
170418 ACAAGTTCAAATCGATT-TGACTATTTAAACAATTATTTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGC
61 ACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TTGTTATGACCTTTTAT
* * * ** * * *
170481 TTTGTCATAAAACAAATGTTTCAGTTCATAAAAATTTATCTAAAATAAAATAATACTACTTTATT
124 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAG-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * *
170546 AATATTTTAAAAATTAATAAGGAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTAAACAGTTCAAATA
188 AATATTTCAAAAATTAGTAA-G-A-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAGTTCAAATA
* * * * ** * * *
170611 GTTATAATTATTTGAATAAATATCAACCTCAAATCGTTATGATC-TTTGTTTTCTTATAAAACAA
249 GTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA
* * ***
170675 TTATTTTTGACCATACAAGCTTATT-TGGATAAAACTAATAC
314 TTGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA-TAATAC
* * * *
170716 TAATTTAA-TAATA-TTCTAAAAATTAAT-A-AAAGTTTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-A
1 TAA-TTAATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
* * * * * * * *
170776 CAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGGCCTTTTGTTTAG
64 -AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTG
* * * * *
170841 TCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
128 TCATAAAACAATTGTTTTAG-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * * ** *
170906 TTTGAAAAAGTAATAAGCATGAGATTTGAAAAGATAAATCTCTTTACTGAACAAGTTTAAATAGT
192 TTTCAAAAATTAGTAAG-A--A-ATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGT
* * * * * *
170971 TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATCAAGCAATT
251 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * *
171036 GTATTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
316 GTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * **
171075 TACTTTATTAATACTAT-GAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAAAT-AATTTAGTTTACCAAATT
1 TAATTAATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACTAAACA
* * * * * * * * * *
171136 AGTTCAAAAAATTATGGCCATTTAAACAACTATCTATTTAAAATCGTTATTACCTATTATTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* * * * *
171201 TATAAAACAATTTTTATTCA-ACATACAAGCTT-TTTTGAAGTAAAATAATATTAATTTATTAAT
129 CATAAAACAATTGTT-TT-AGTCATACAAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAAT
* ** * * * *
171264 ATTTCAAGAATCAATCAGTTGGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTTAAATAGT
191 ATTTC-A-AA--AATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGT
* * * * * *
171329 TTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTGATCAAACAATT
251 TATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * ** * *
171394 GGTTCT-ATTCATACTATTTTATGCAAAATAAAATATTAC
316 GTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * * * * *
171433 TAATTTAA-TAATATTCCAAAACTTAAT-AGCCAAAAAAATTAAAAAATTAATCTAATTGCTAAA
1 TAA-TTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAG---AAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAA
* * ** ** * *
171496 CCAGTTGTTCAAATAGTTAAGACTATAAGAATGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTCT
62 -CA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTAT
* * * * * * * * *
171561 TTTGTCGTAAAACAATTATTTTATTCGTACAACCTTATTCAGATTAAAAAAAAATACTAATTTAA
124 TTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTCATACAAGCTTATTTAGA--ATAAAATAATACTAATTTAT
* * * * * * *
171626 TAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAAT-TATTTTATCAAATTAATTCAAATGG
187 TAATATTTCAAAAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAA-CAGTTCAAATAG
* * * * * * * *
171690 TTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAAT
250 TTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * **
171755 TGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTTTTAC
315 TGTTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* *
171795 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATT-ATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTAC-AGA
1 TAATTAATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AA-AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACTA-A
* *** * * * * *
171857 ACAAATTCAAATAGTTATTTTTATTTGAGCAATTGTCTATTT-AACATCGTTATAACCTTTTAAT
61 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATTGTTATGACCTTTTATT
** * *
171921 TTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTCAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATATTAATTTATTA
125 TTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTC-ATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTA
* ** * * **
171986 ACATTTCCTAAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAGATCTGTTTACCAAATCAGTTAAAATAAATA
189 ATATTTCAAAAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAGTTCAAATAGTTA
* * * * * *
172051 TGGCCATTTGAATGATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAATT-
253 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAATTG
*
172115 TTTTTGATCACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
317 TTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * * *
172153 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAACATATTTAAACAATAAATCTATTTGCTGAACA
1 TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AA-AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACA
* * * *
172218 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGT
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGT
* *
172283 CATAAAACAATTGTTTTTGTTCATACAAGCTTATTTAG-ATTAAATAATA-TAATTTATTAATAT
129 CATAAAACAATTGTTTTAG-TCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
** * * * *
172346 TTTGACAATTAATAAGTTAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAA
193 TTCAAAAATTAGTAAG---AA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-AGTTCAAATAGTTA
* * * * **
172411 TAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTGT-AGCCTTTTATTTCATCATAAAACAATTG
253 TGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG
* ** * * * **
172475 TATAAGTTCATATAGGCTTATTTGAAATAAAATAATAC
317 TTTTTGATCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
**
172513 TAACTT-ATTAACGTTTCAAAAATTAAT
1 TAA-TTAATTAATATTTCAAAAATTAAT
172540 CAGTGATTTC
Statistics
Matches: 4484, Mismatches: 972, Indels: 597
0.74 0.16 0.10
Matches are distributed among these distances:
336 24 0.01
337 8 0.00
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339 139 0.03
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343 6 0.00
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352 4 0.00
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354 4 0.00
355 15 0.00
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374 2 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (354 bp):
TAATTAATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAAG
TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTATTTTGTCA
TAAAACAATTGTTTTAGTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
AAAAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAGTTCAAATAGTTATGACTATT
TGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGATC
ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAC
Found at i:172308 original size:901 final size:893
Alignment explanation
Indices: 166428--173673 Score: 3099
Period size: 901 Copynumber: 8.1 Consensus size: 893
166418 GCCAACATAT
* * * * * *
166428 TAATTTATTAATATTTCAATAATTAATGAGTAAA-AGATTTAAAAAAGA-AAATATGTTTACCA-
1 TAATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAA-ATAAATCTATTTA-CAG
* * ** * * * * * **
166490 AACAAGTTGAAATAGTCGTGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTT
63 AACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTAAT
* * ** * *
166555 TTGTAATAAAACAATTGTTTTAGTTCAT---A--TT--TTGAAGTAAAATAATATTAATTTATTA
128 TTGTCATAAAACAATTGTATTAGTTCATAAAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * ** * * * * *
166613 ATATTCTGAAAATTAATGAGTAAAAGAATAAAAAAAAGAATCTA-TTTATCGAATAAGTTCAAAT
193 ACACTATCAAAATT-A--A-TAAGA-AATTTAAAAAATAATCTAGTTTACCAAATCAGTTCAAAA
** * * * * * **
166677 AGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAAAA-CATTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAAC
253 AAATATGGCCATTTAAACAATTATCTATTT-AAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
* ** ** * ** *
166741 AATTGGTT-TTGTTCATGCAAGTTTATTTTGAATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAA
317 AATT-TTTATTCATCACACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATT-AATTTATTAATATTTCAAA
** *
166804 AA-T--TAA-TAAGA-A---AAAAAT--AT-T-TTT--TGAACATGTTCAAATAGTTATGACTAT
380 AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTAT
* * * * * * * *
166855 TTGAGTAATTATCTATTTCAAA-TGTTATGGCCTTTTGTTTTGTTATAAACCAATAGTTTCTATT
444 TTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTT
** * * ** * * * * **
166919 TGTA-AAAGGTTATTTGGAATAAAAATAATACTAATTTATTAAAATACTAAAAATTAATAAATAA
509 CATACAAA-TTTATCTAAAAT-AAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGCAA
* * * * * * * * * *
166983 AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTAAC-AAGCGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATT
572 AAAAATTAAAAAATAAAGCTAATT-GCTAAAC-AGTTCAAATAGTTATAACTA-TAAGAATAAAT
** ** * * * * * ** * **
167046 ATTTATTTCATATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTACTATTCATACAAGTT
634 ATCAACCTCAAATCGTTATGA-CCTTTCTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTA-CCATACAACCT
* * * *
167111 TATTC-GATATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAA-AAAGTTGGAGATTTGAA
697 TATTCAGATA-AAAAAAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAA-----AGATTT-AA
* * * * * * *
167174 AAAATAAATCTGTTTA-CTAAACAAGCTT-AAATAGTCATA-TCCATTTGAACT-ATTATCCATT
755 AAAATAAATATGTTTACCAAAACAA--TTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAA-TAATTATCTATT
* * * *
167235 TCAAATCA-TTATAACATTTTGTTTTGTCGTTAACAATTATT-TTT-A-TTCATACAA-ATTATT
816 TCAAAT-AGTTATAACATTTTGTTTAGTC-ATAA-AATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
167295 TAGAATAAAATAATAC
878 TAGAATAAAATAATAC
* * *
167311 TAATTTATTAATATTTC-AAAAAT--TAA-TAAGAGATTTAAAAACA-AAATCTATTTACCAG-A
1 TAATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CAGAA
* * * * * * * * ** **
167370 CCAGTTTAAATAGTTATGACTAGTTT-AATAATTATCTATCTCAAATCAGTATGA-TTTTTGTTT
65 CAAATTCAAATAGTTATGACTA-TTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTAATT
* * * * * * * * ** *
167433 TGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCAAAGTAAAATATTGCTAAACTAATAA
129 TGTCATAAAACAATTGTATTAGTTCATAAAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * * * * * * * *
167498 AATTCTAAAAATTAATAAGAGA-TTAAAAAATAAATGT-GTTTGCTAAACCAGTT-ATAATAGTT
194 CACTATCAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAAT-AATCTAGTTTACCAAATCAGTTCA-AA-A---
* ** * * * *
167560 AAGACTTTTAGAACAGTTTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAACCTTTTGTTTTGTCAT
253 AA-A--TAT-GGCCA--TTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *
167625 AAAATAATTTTT-TT-AGTTCATACAAGCTAATTCAAAATACAATAATA-CAATTTTATTAACA-
312 AAAACAATTTTTATTCA--TCACACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAA-TTTATTAATAT
* * * *
167686 TTCAGAAAGTTAACAAGCAAGAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
374 TTCA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGT
* * * * * *
167751 TATGACTATTTAAATAATTATCTATTTAAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATCATAAAACAATT
436 T-TGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * *
167816 GTTT-TAGTT-AAAAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATT
500 GTTTCT-GTTCATACAAA-TTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATT
* ** * * * * ** * ** * *
167879 AAAAAG-ATGGAGATTTAAAAAATAAA-TTAGTTTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATT
563 AATAAGCA-AAAAAATTAAAAAATAAAGCTAATTGCT-AAA-CAGTTCAAATAGTTATAACTATA
* * * ** ** * * * * *
167942 TGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTTTCATC
625 AGAATAAATATCAACCTCAAATCGTTATG-ACCTTTCTTTTCTCATAAAACAATTATTTTT-ACC
* *
168007 ATACAAGAC-TATTCA-A-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTA
688 ATACAA-CCTTATTCAGATAA-AAAA-AATACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAA--A
* * ** * * * *
168068 GGTGAATTAAAAAATAAATATACTTA-CATAACCAGTTTAAATAGTT-AGTACTATTTGAATAAT
747 --AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA-AAACAATTCAAATAGTTAAG-ACTATTAGAATAAT
* * * * * * * ** *
168131 TATATATTTTAAATCA-TTATAACCTTTTTGTTTTGTCATGAAATAATTATTT-ATATTTTTATA
808 TATCTATTTCAAAT-AGTTATAA-CATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCA-GTTCATACA
*
168194 AGTTTATTT-GAAATAAAATAATAC
870 AGCTTATTTAG-AATAAAATAATAC
* * * * * * ** ***
168218 TAATCTAATAATAATAT-GAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAAAT-TATTTGTTGA
1 TAATTTATTAA-CATTTCAAAAAATAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAAT-AAATCTATTTACAGA
* * * * * * ** * * **
168280 ACCAATTCAAATAGTTAAGGCTATATGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGATC-TTTTGTT
64 ACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTAATT
* * * * * * * * * *** *
168344 ATGTCGTAAAATAAATATTTTTGTTGATATAAG-TCTATTTTGAATAAAATAATATTAATTTATT
129 -TGTCATAAAACAATTGTATTAGTTCATAAAAGCT-TAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * * * ***
168408 AATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCAAATCAATTC-AAATGT
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** * * * * * * * * * * * *
168471 TATAACAATTTGAACAATTATTTGTTTCAAATCATTATGATCGTTTCTTTTATCACAAAACAATT
256 TATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* ** * * * *
168536 GTGTCTATTGAT-ACAGTA--TTA-TTAAAAAAAAAGTAATGTTAATTTACTGATA-TTCTAAAA
321 -T-T-TATTCATCACACAAGCTTATTTAAAATAAAA-TAATATTAATTTATTAATATTTC-AAAA
* * * * * *
168596 ATTAATAAGTAATG-GATTTAAAAAATAAATCTATCTAGCCTAACCAGTACAAATAGTTATAATT
381 ATTAATAAGTAA-GAGATTT-AAAAATAAATCTATTTA-CCAAACAAGTTCAAATAGTT-TGACT
* * * * * * * * * * *
168660 GTTTGAACAATTATCTATTTCAAAGTGTTATGACCTTTGGTTTTATTACAAAATAATTGTTTATG
442 ATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTG
* * * ** * * * * *
168725 TTTCGTACAAGTTGA-CTCCGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGT
507 -TTCATACAAATTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGC
* * * * * ** * * * ** *
168789 AAGAGATTTAAAAACTAAATCT-ATTTATCGAACAAGTTGAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
570 AAAAAAATTAAAAAATAAAGCTAATTGCT-AAAC-AGTTCAAATAGTTATAACTATAAGAATAAA
* ** * * * * * * *
168853 TATCTATTTCAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-TATGT-TTTTCTATTCATACAA
633 TATCAACCTCAAATCGTTATGACC-TTTCTTTTCTCATAAAACAAT-TATTTT-TA-CCATACAA
* * * * *
168916 GCTTATTTCA-ATTAAAATAATACAAATTTATTAATATTCATACAACTAA-TAAGTAAAAGATTT
694 CCTTA-TTCAGATAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTC-TA-AA--AATTAA-TAAAAGATTT
* * * * * *
168979 -AAAAATAAATCTATTTACC-AAACAAGTTTAAATAGTTACGACTATTTGAATAATTATTTATTT
753 AAAAAATAAATATGTTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTT
* * * * * * *** *
169042 CAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATTTTTTTTCATAC-AGCTTATTTGGA
817 CAAATAGTTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGA
* *
169106 TTAAAATAATAT
882 ATAAAATAATAC
* ** * * * ** * *
169118 TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAG-TATTT-TTAAAATAAATATGTTTATCA-A
1 TAATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAG-AAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CAGA
* * * * * * * * **
169180 ACAAGTTCAAATAGTCATAACTACTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC-TTTTGTT
64 ACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTAATT
* ** * * * **
169244 TCATTGTAAAACAATTGTATTAGTTCAGATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTA
129 T-GTCATAAAACAATTGTATTAGTTCATAAAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * *
169309 ATA-T-TCCAAAAATTAATGAGTAGGAGATTTAAAATATGAATCT-GTTTACTAAA-CA-ATCAA
193 ACACTAT-C-AAAATTAAT-A--A-GAAATTTAAAAAAT-AATCTAGTTTACCAAATCAGTTCAA
* ** * * * * * * * *
169369 ATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA
251 AAAAATATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
* * * * *
169434 TAATTGTTTCTGT--TCACACAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TATAGTTATTAATATTCCA
316 CAATT-TTTAT-TCATCACACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTA-ATTTATTAATATTTCA
* * * * * *
169496 AAAATTAATAAATAA-ATATTTAAAAAATAAATATATTTTCTAAACACA-TTCAAATAGTTATAA
378 AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTT-TGA
* * * * * * * * * *
169559 GTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTTTGACCTTTTATTTTTTCATAAACCAATTGTTTT
440 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTC
** * *
169624 TGTTCATACAAACATAT-TCGAAATAAAATAATACTAA--T-A-AGTA----AAAAATT--T---
505 TGTTCATACAAATTTATCT-AAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG
* * * * * * * ** *
169675 ---AAAAACT---AAAT----CTATTTACTAAGCATGTTCAAATAGTTATGATTGTTTGAATAAT
569 CAAAAAAATTAAAAAATAAAGCTAATTGCTAAACA-GTTCAAATAGTTATAACTATAAGAATAAA
** ** * * ** * * * * * **
169730 TATTTATTTCAATTAGTTATGATAATTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGT
633 TATCAACCTCAAATCGTTATGA-CCTTTCTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTA-CCATACAACC
* * * * * *
169795 TTGTTAAGA-ATAAAATAATACTAATTTATTAATTTTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAA
696 TTATTCAGATA-AAAAAAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATA---A-AAGATTTAAA
* * * * * * * * * * * *
169859 AAATAATTATGTTTATC-AAACAAGTTCAAACAGTCATGTCCATTTGAACAACTATCTACTTCAT
756 AAATAAATATGTTTACCAAAACAA-TTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAA
* * * ** * * * * * ** *
169923 ATCGTTATGACCTTTCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTGTA-TTGATGCAAAATTATTAAGAAT
820 ATAGTTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-CAGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT
169987 AAAAATAATAC
884 -AAAATAATAC
* * * * * * *
169998 TGATCTATTAATATTTTAAAAACTAAT-A-AAA-A-ATTT-AAAAACTAAATCTGTTTACCA-AA
1 TAATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTA-CAGAA
* * * * ** *
170057 -ATAGTTCAGATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATTGTTATCATCC-TTT--T
65 CA-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTAT-AACCATTTAAT
* * ** * * * ***
170118 TTGTCATAAAACAACTGTTTGTTTTTCATACAACCTTATTCAGGTTAAAATAATACTAATTTAAT
128 TTGTCATAAAACAATTGTAT-TAGTTCATAAAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTT-AT
* * * * ** * * *
170183 T-ATA-TTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAAAAAAGT-GTTTGCCAAACCAATTCAA
191 TAACACTATC-AAAA-T--TAA-TAAGAAATTTAAAAAATAATCTAGTTTACCAAATCAGTTCAA
** * * * * * * *
170245 ATCATTAAGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTTTAACCTTTTGTTTAGTCATAAA
251 AAAAATATGGCCATTTA-AACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAA
* *
170309 ACAATTATTTCAGTTTAT-ACA-AAG-TTATTTAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATA-TTC
315 ACAATT-TTT-A-TTCATCACACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC
* * *
170370 AAAAAATTAATGAA-TAAGAGATTTTAAAAAAATAAATCTCTATACCAAACAAGTTCAAATCGAT
377 -AAAAATTAAT-AAGTAAGAGA-TTT--AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-T
* * * *
170434 TTGACTATTTAAACAATTATTTATTT-AAAGTTGTTATGACATTTTGCTTTGTCATAAAACAAAT
436 TTGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAA-TTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * **
170498 GTTTCAGTTCATAAAAATTTATCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTTAAAAATTAA
500 GTTTCTGTTCATACAAATTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAA
* * * * * * * * **
170563 TAAGGAAGAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTAAACAGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAAT
565 TAAGCAAAAAAATTAAAAAATAAAGCTAATTGCTAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATAAGAAT
* * *
170628 AAATATCAACCTCAAATCGTTATGATCTTTGTTTTCTTATAAAACAATTATTTTTGACCATACAA
630 AAATATCAACCTCAAATCGTTATGACCTTTCTTTTCTCATAAAACAATTATTTTT-ACCATACAA
* ** ** *
170693 GCTTATTTGGATAAAACTAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAAAGTTTTAAAAAA
694 CCTTATTCAGATAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAA
* *
170758 TAAATATGTTTACCAAAACAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAG
759 TAAATATGTTTACCAAAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAG
** * * *
170823 TTATGGCCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAAT
824 TTATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAAT
170888 AATAC
889 AATAC
* * * * * * * *
170893 TAATTTATTAACATTTGAAAAAGTAATAAGCATGAGATTTGAAAAGATAAATCTCTTTACTGAAC
1 TAATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACAGAAC
* * * **
170958 AAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTG
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* * * * *
171023 TCATCAAGCAATTGTATTAGTTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATA
131 TCATAAAACAATTGTATTAGTTCATAAAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
* * * * *
171088 CTATGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAATTTAGTTTACCAAATTAGTTCAAAAAATTATGG
196 CTATCAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAATCTAGTTTACCAAATCAGTTCAAAAAAATATGG
* * * * *
171153 CCATTTAAACAACTATCTATTTAAAATCGTTATTACCTATTATTTTGTTATAAAACAATTTTTAT
261 CCATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTAT
* * * * * * * *
171218 TCAACATACAAGCTTTTTTGAAGTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAGAATCAATCAGT
326 TCATCACACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
** * * * *
171283 TGGAGATTTAAAAAGTAAATCTGTTTACCAAACCATTTTAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATT
391 AAGAGATTTAAAAA-TAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAG-TTTGACTATTTGAATAATT
* ** * * * * * * * * *
171348 ATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTGATCAAACAATTGGTTCTATTCATACTATTT
454 ATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAATT
* *
171413 TATGC-AAAATAAAATATTACTAATTTAATAATATTCCAAAACTTAAT-AGCCAAAAAAATTAAA
519 TAT-CTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAG-CAAAAAAATTAAA
* * * * * **
171476 AAATTAATCTAATTGCTAAACCAGTTGTTCAAATAGTTA-AGACTATAAGAATGATTATCTATTT
582 AAATAAAGCTAATTGCTAAA-CA---GTTCAAATAGTTATA-ACTATAAGAATAAATATCAACCT
* * * *
171540 CAAATCGTTATGACCTTTTCTTTTGTCGTAAAACAATTA-TTTTATTCGTACAACCTTATTCAGA
642 CAAATCGTTATGACC-TTTCTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTA-CCATACAACCTTATTCAGA
*
171604 TTAAAAAAAAATACTAATTTAATAATATT-TCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATTAT
705 -T-AAAAAAAATACTAATTTAATAATATTCT-AAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAA-TAT
* ** * * *
171668 -TTTATCAAATTAATTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCTAAC
766 GTTTACCAAAACAATTCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAAC
* * **
171732 ATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAATTTTTAC
831 ATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC
*
171795 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACAGAAC
1 TAATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACAGAAC
*** * * * * *
171859 AAATTCAAATAGTTATTTTTATTTGAGCAATTGTCTATTTAACATCGTTATAACCTTTTAATTTG
66 AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTAATTTG
* * ** *
171924 TCATAAAACAATTGTTTTAG-TCAATACAAGCTTAGAT-GGAATAAAATAATATTAATTTATTAA
131 TCATAAAACAATTGTATTAGTTC-ATAAAAGCTTA-ATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA
* * *
171987 CA-TTTCCTAAATTAGTAAGAAATTTAAAAAATAGATCT-GTTTACCAAATCAGTT-AAAATAAA
194 CACTAT-CAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATA-ATCTAGTTTACCAAATCAGTTCAAAA-AAA
* ** * * * *
172049 TATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTTAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAAAT
256 TATGGCCATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT
* * * *
172114 TTTT-TTGATCACACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTCAAAAATTA
320 TTTTATTCATCACACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTA
* * * **
172178 ATAAGTAACATATTTAAACAATAAATCTATTTGCTGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGA
385 ATAAGTAAGAGATTTAAA-AATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-TGACTATTTGA
* *
172243 ATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
448 ATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATA
** * * * * *** * ** * *
172308 CAAGCTTAT-TTAGATTAAATAATA-TAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTTAAAGATT
513 CAAATTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAAAAT
** ** * * * ** * * **
172371 TAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAATAATTATCTATTT
578 TAAAAAATAAAGCTAATTGCTAAAC-AGTTCAAATAGTTATAACTATAAGAATAAATATCAACCT
* * ** * **
172436 CAAATTGTTGT-AGCCTTT-TATTTCATCATAAAACAATTGTATAAGTT--CATATAGGCTTATT
642 CAAATCGTTATGA-CCTTTCT-TTTC-TCATAAAACAA-T-TAT-TTTTACCATACAACCTTATT
* * * * * *
172497 ----T-----GAA-A-TAA---AATAATA--CT--AACTT-ATTAACG-TTTCAAAAATTAATCA
701 CAGATAAAAAAAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAAT-A
* *
172542 GTGATTT--C-AAA-AA-T-GAATATGTTTA-AC----A-AATAATTATCTATTTCAAATCA-TT
765 -TG-TTTACCAAAACAATTCAAATA-GTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTT
* * * * * ***
172594 ATGACCTTTTGTTTCGACATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCCTAATAAAATA
826 ATAACATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATA
172658 ATA-
890 ATAC
* * * * * * * * *
172661 TAAATTTACTGATATTTCAAAAATTAATAAGCAA-AGATTT-AAAAAATAAATATGTTTTCTGAA
1 T-AATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACAGAA
** * * * * **
172724 CACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTT
65 CAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTAATTT
* * * * *
172789 GTCAT-AAACTAATTGTTTTTA-TTCATAAAAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATTTATTA
130 GTCATAAAAC-AATTG-TATTAGTTCATAAAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTA
* * * * * *
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* ** * * * * * * *
172914 ATAGTTAT-ACTATTTAAACAATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-TTTTTGGTTTTGTCATAAA
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* * * * *
172977 ACAATTGTTTCTATTCAT---ACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTCC
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** ** * * *
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377 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTT-TGA
* * * ** * ** *
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440 CTATTTGAA-TAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * * * * * *
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* * * ** ** * * * ** * ** * *
173233 ----AGATTTAAAAACTAAATTTGTTTATCGAACCAACTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAT
569 CAAAAAAATTAAAAAATAAAGCTAATT-GCTAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATAAGAATAAA
* * * * * * * * * * *
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633 TATCAACCTCAAATCGTTATGACCTTTCTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTA-CCATACAACCT
* * * * * ** *
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697 TATTCAGATA-AAAAAAATACTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAA
* * * * * *
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757 AATAAATATGTTTACCAAAACAATTCAAATAGTTAA-GACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAA
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173551 AATAATAC
886 AATAATAC
** ** *** * *
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* * *
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173674 ATGAACTTAT
Statistics
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Consensus pattern (893 bp):
TAATTTATTAACATTTCAAAAAATAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTACAGAAC
AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATAACCATTTAATTTG
TCATAAAACAATTGTATTAGTTCATAAAAGCTTAATCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACA
CTATCAAAATTAATAAGAAATTTAAAAAATAATCTAGTTTACCAAATCAGTTCAAAAAAATATGG
CCATTTAAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTAT
TCATCACACAAGCTTATTTAAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT
AAGAGATTTAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTTGACTATTTGAATAATTAT
TTATTTCAAATTGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAATTTA
TCTAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGCAAAAAAATTAAAAAAT
AAAGCTAATTGCTAAACAGTTCAAATAGTTATAACTATAAGAATAAATATCAACCTCAAATCGTT
ATGACCTTTCTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTACCATACAACCTTATTCAGATAAAAAAAATA
CTAATTTAATAATATTCTAAAAATTAATAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAAACAAT
TCAAATAGTTAAGACTATTAGAATAATTATCTATTTCAAATAGTTATAACATTTTGTTTAGTCAT
AAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC
Found at i:172928 original size:180 final size:180
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 6.1 Consensus size: 180
172563 TTTAACAAAT
* * * * *
172573 AATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTCGACATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
*** * * *
172638 AGCTTATTCCTAATAAAATAATA-TAAATTTACTGATATTTCAAAAATTAATAAGCAA-AGATTT
66 AGCTTATTTAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* ** * * *
172701 AAAAAATAAATATGTTTTCTGAACACGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC
130 AAAAAATAAATATGTTTACCAAAGA-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
*
172753 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAACTAATTGTTTTTATTCATAA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATAA
* * * *
172817 AAGCTTATTTAGAATACAATAATACTAATTTATTAACATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTC
65 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* *
172882 AACAAATAAATATGTTTACCAAGAGAATTCAAATAGTTAT-ACTATTTAAAC
130 AAAAAATAAATATGTTTACCAA-AGAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * * *
172933 AATTATTTATTTTAAATTGTTATGA-TTTTTGGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAA
* * * * * **
172997 AAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTGTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTGGAGATTT
65 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * *
173062 AAAAAATAAATCTATTTA-CTGAGCAAGTTCAAATATTTATGTCCATTTGAAC
130 AAAAAATAAATATGTTTACCAAAG-AA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * ** * ** * *
173114 TATTAT-TCATTTTAAATCATTATGTCATTTTGTTTTGTTGTAAAATAATTGTTTCTATTTATAC
1 AATTATCT-ATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-
*
173178 AAA-ATTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT---T-AGAGATT
64 AAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * * ** *
173238 TAAAAACTAAATTTGTTTATCGAACCAACTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
129 TAAAAAATAAATATGTTTA-CCAAAGAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* * * * *
173291 AATTATCTATCTCAAATTGGTATAATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-A
* * ** * *
173355 AA-CTTATTT-GAAGT-AAATATTGCTAAACTAATAA-AATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
65 AAGCTTATTTAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * * *
173416 TTAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGGA-TATTAGAAC
128 TTAAAAAATAAATATGTTTACCAAA-GAATTCAAATAGTT-ATGACTATTTGAAC
* ** * * * * *
173470 AATTATCTATTTCAAATCGTTTTAATATTTTGTTTAGTCATAAAATAATTATTTC-AGTTCACAC
1 AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAA
* * * ** * * **
173534 ATGCTTATTCAAAATAAAATAATACTTTTTTTATTAACATTT-AGAAATTTAATATCTAAG-GAA
65 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATAC-TAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAGTAAGAG-A
* * * * *
173597 TTTAAGAAAATAAAATCTATTTA-TAGAACAAGTTCAAATAGTTACGACTATTTGAAC
127 TTTAA-AAAAT-AAATATGTTTACCA-AAGAA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
* *
173654 AATTATTTATTTAAAATC
1 AATTATCTATTTCAAATC
173672 ATATGAACTT
Statistics
Matches: 740, Mismatches: 142, Indels: 70
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 4 0.01
175 28 0.04
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178 10 0.01
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183 15 0.02
184 45 0.06
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
AATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAA
AGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTA
AAAAATAAATATGTTTACCAAAGAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC
Found at i:174584 original size:299 final size:299
Alignment explanation
Indices: 174067--174611 Score: 666
Period size: 299 Copynumber: 1.8 Consensus size: 299
174057 GAACTTATGC
** * ** * *
174067 AATTGTTTTATGATGAAACAAAAGGTTCTAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
* * * * *
174132 ACTGTTAGAACATGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTCCAAAAT
66 ACTATTAGAACATGCTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAATTCTTACTTATTAATTTCCAAAAT
* * * * *** *
174197 ATTAATAAATATATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTTTGAACAGAAACGATCGTTCTATGACAA
131 ACTAATAAATAAATTATGTTAATCCAAATAAGCTTGCACGAACAGAAACAATCGTTCTATGACAA
*
174262 AACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACAAATTGAACTTATT
196 AACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACAAATTGAACTTATT
174327 TGGTAAACAGATTTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA
261 TGGTAAACAGATTTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA
*
174366 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTGA-TCAAATAGTCAT
1 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGTCAT
* * * ****
174430 AACTATTTGAACTTGCTCGATAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGA
65 AACTATTAGAACATGCTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAAT-TCTTACTTATTAATTTCCAAA
* * * *
174494 ATACTAATAAATTAGAATTATGTT-ATCCAAATAAGCTTGCACGAATAGAAACAATTGTTTTGTG
129 ATACTAATAAA-TA-AATTATGTTAATCCAAATAAGCTTGCACGAACAGAAACAATCGTTCTATG
* * * ** **
174558 AC-AAATAGAAGGTCATAATGATTTGAAATAGTTAATTGTTCAAACAGTCATAAC
192 ACAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAAC
174612 TGTTTGCACT
Statistics
Matches: 202, Mismatches: 40, Indels: 8
0.81 0.16 0.03
Matches are distributed among these distances:
298 4 0.02
299 155 0.77
300 36 0.18
301 7 0.03
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.12, T:0.37
Consensus pattern (299 bp):
AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATA
ACTATTAGAACATGCTCGATAAACAGATTTATTTTTTAAAATTCTTACTTATTAATTTCCAAAAT
ACTAATAAATAAATTATGTTAATCCAAATAAGCTTGCACGAACAGAAACAATCGTTCTATGACAA
AACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAACAGTCATAACAAATTGAACTTATT
TGGTAAACAGATTTGAAATAAGCTTGTATAAATAGAAAA
Found at i:174999 original size:175 final size:178
Alignment explanation
Indices: 174654--175054 Score: 424
Period size: 176 Copynumber: 2.3 Consensus size: 178
174644 TCTAAATCCA
* * * * *
174654 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTACATTACTTTATATCGAATAAGACTATATGAAT
1 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTTGAACAAGACTATATGAAT
** * * *
174719 AGGAACAATTATTTTATGACAAAAAAATGATTATAAGGATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAG
66 AAAAACAATTATTTTAAGACAAAAAAATGATAATAAGGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
* * * ****
174784 TTAAAACTAATTGAACCGGTTTGGTAAATAGATATATTTTTTAAA-TC
131 TCAAAACTAATTCAACCAGTTCAACAAATAGATATATTTTTTAAACTC
174831 -T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAACAA-ACTTATATGA
1 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTATTTTGAACAAGAC-TATATGA
* * * *
174893 ATAAAAACATTTGTTTTAAGACAAAACAAA-GGTAAT-AGATATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
64 ATAAAAACAATTATTTTAAGACAAAA-AAATGATAATAAG-GATTTGAAATAAATAATTGTTCAA
* * * * *
174956 AT-GTCATAATTATTTCAACTAGTTCAACAAGTAGA-ATTATTTTTTAAATCTC
127 ATAGTCAAAACTAATTCAACCAGTTCAACAAATAGATA-TATTTTTTAAA-CTC
* *
175008 TTACTTATTAATTTT-AAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTTT
1 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAA-TTATATTATTTTATTTT
175055 AAATAAGTTA
Statistics
Matches: 186, Mismatches: 28, Indels: 19
0.80 0.12 0.08
Matches are distributed among these distances:
174 1 0.01
175 65 0.35
176 73 0.39
177 5 0.03
178 28 0.15
179 14 0.08
ACGTcount: A:0.43, C:0.07, G:0.08, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTATATTATTTTATTTTGAACAAGACTATATGAAT
AAAAACAATTATTTTAAGACAAAAAAATGATAATAAGGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAG
TCAAAACTAATTCAACCAGTTCAACAAATAGATATATTTTTTAAACTC
Found at i:176161 original size:164 final size:159
Alignment explanation
Indices: 175842--176163 Score: 378
Period size: 164 Copynumber: 2.0 Consensus size: 159
175832 AAGGTAAAAA
* * * *
175842 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGTCAAAATTATTTGAACTAATTCAGTAAATTGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTAATTCAGTAAATAGATTTA
* * *
175907 TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGGATAAGT
66 TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGC
*
175972 TTTTATAAACTGAAACAATTATTTTATGG
131 TTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATGG
* * * * ** *
176001 TGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTGGTAAATAGTTTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTAATTCAGTAAATAGATTTA
** * *
176066 CTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATTACTTTT-TTTAG
66 -TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAA-TTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTA-TTTTATTTAG
* *
176129 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATG
124 AATAAGCTTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATG
176164 ACTAAATAAA
Statistics
Matches: 135, Mismatches: 21, Indels: 9
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
159 54 0.40
160 9 0.07
162 2 0.01
163 1 0.01
164 58 0.43
165 11 0.08
ACGTcount: A:0.36, C:0.06, G:0.11, T:0.47
Consensus pattern (159 bp):
TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAACTAATTCAGTAAATAGATTTA
TTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGC
TTGTATAAACTGAAACAATTATTTTATGG
Found at i:176321 original size:181 final size:180
Alignment explanation
Indices: 176001--187281 Score: 4683
Period size: 181 Copynumber: 62.4 Consensus size: 180
175991 TATTTTATGG
* * * ** * * *
176001 TGATTTTAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAATTTATTTGGTAAATAGTTTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
176066 CTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAAA-GTTAATAAATTAGTATTACTTTTTTTAGA
66 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGA
* * * * * *
176130 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAATAAAATGTTAGAA
128 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * ** * *
176183 TGATTTGAAATAGATAATTATTCTAACAGTCTTAACTATTTGAACTAATTCGGCAAACACATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * *
176248 TTTTTTAAATCGCTTACTTATTATTTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTTATTCGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTCGAAT
** * * *
176313 CGGCTTGTATG-ATCAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA
130 AAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** * * *** * *
176363 TGACTTTTG--ATTGATCTTTGTTTAAATAATCATAACTATTTGAACTGGTTCAAAAAATAGCTT
1 TGA--TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATT
* * * * * * *
176426 TAGTTTTTAAAGCTCTTATTTAATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTATTATTTTATTTTGG
64 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGA
* * * * *
176491 ATAAGTTTTTATGAACTAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
128 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ** * * * *
176544 TGACTTT-AAATGGATAATTGTTCAAAAAGTCATATTTATTTGAACTTGTTTGGCAAACAAATTT
1 TGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
** *
176608 AATTTTTTAAATCTCTTGTTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG
65 -ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCG
* * * * * * *
176672 AATAAGCATGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTCAAAA
127 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * *
176726 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACATATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * *
176791 TTTTTTAATTCCCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTAGATTTGAA-
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT-TATTCGAAT
* * * * **
176855 CA-CTTGTATGGAA-GGAAACAATTGTTCTATGACAAAA-TAAAGACCATAA
130 AAGCTTGTAT-GAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
176904 TGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAAATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
** ** * * *
176969 GATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATCAGTATTAGTTTATTTTGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * * * * * **
177030 AA-TTCTATATGCATAGAAAC-ATTTTTTTATGATAAAATGAAAGGTCATAA
130 AAGCT-TGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * **
177080 TGATTTGAAATAGATAAATGTTTAAATGGACATGACTATTTTG-ACTTGTTTGGTAGATGGATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* * ** * * *
177144 ATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTGCAGAAA-ACTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTGA
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGA
* * * **
177208 ATAAACTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGAACATAA
128 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
177261 CT-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTT-GGTAAATAGATT
1 -TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGGTAAACAGATT
* * * * *
177324 TATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGA
64 TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGA
* ** * *
177389 ATAAGCTTGCATGAACAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
128 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** * * *
177442 CT-ATTTGAAATAGATAATTG-TCGAAATAGTCAAAACTATTTGAACAT-GTTTAGAAAATACAT
1 -TGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGGTAAACAGAT
* * * * *
177504 TTA-TTTTAAAAT-TTTTATTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTACTCA
63 TTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-
* * * * *
177566 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCATTA
126 GAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * ** * * * * * *
177621 CGATTTGAAATAGATAATAT-TTCATATAGTCATAACGGTTCGACCTTGTTTGATAAACAAATTC
1 TGATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATT-
* *
177685 T-TTTTTTAAAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTT
64 TATTTTTT--AAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* * * * * * * ** * * *
177748 TGAATAAGCTTATTTAAATTGATACAACTGTTTTAGGATGAAATAAAAGGTTACAA
125 CGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * *
177804 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAATTATGACTATTTGAAC-GTGTTCGGTAAACATATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGGTAAACAGATTT
* * * ** * * *
177868 A-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAGTCCAAA
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
* *** * * * * *
177932 TAAGCTTGTATAAACAAAAACAAATGTTTAATGATAAAA-AAAAAGTCA-GA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** ** * *
177982 TGGGTTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTATTCAATAAATAGGTTT
1 T-GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* * * * * * * *
178047 AATTTTTAAAAATATTTTACTTATTAATTGTTG-ATTATTAATAAATTTGTATAATTTTATTTGA
65 -ATTTTT-TAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCG-
* * * * *
178111 AATAAGCTTGTACG-ATTAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAG
127 AATAAGCTTGTATGAATT-GAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * *
178165 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTAGCTGGGTAAATAGATTCA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * *
178230 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAGATTAGAATTATGTAATTTCAAA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
* *** ** * * * *
178294 TACGCTTGTGCAAATAAAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAATGTTATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * ** *
178346 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCACTCG-TCAGGCCAACAGATTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GGTAAACAGATTT
* * * *
178410 ATTTTTTAAATC-CGTTACTTATTAACTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTG
65 ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCG
* * * * * *
178473 AATAAGAC-TGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACCAAATAAATA-GTCGTAA
127 AATAAG-CTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA-AGGTCATAA
* * * * ** * **
178527 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTAATAACTAATTGAACTTGTTTAGCAAATGGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* ** * * *
178592 TTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAAC
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * *** * * *
178657 AAACTTATATGAAAAAAAAAACATTTGTTTTTATAAGAAAACAAAAGGTCATAA
130 AAGCTTGTATG--AATTGAAACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
178711 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTGG-TCGATGAACAAAATTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
178775 TTTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTTAAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTGTGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAAT
* * * * * * * *
178836 AAG-TTACTA-AAAGCTGAAAAAATTATTTTAGGACAAAATAAAAAGGTTATAA
130 AAGCTT-GTATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAAGGTCATAA
** * * * * * * * * * * *
178888 CAATTTGAAATAAAGAACTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACAAATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * ** * * * *
178953 TTTTTGAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATCATTACATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * * * ** *
179018 AAACTTGTATGAACATAAAATAATTGTTTTATGACTTAACAAAAGGTTATAA
130 AAGCTTGTATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
179070 TAATTTGAAATATATAATTGTTCAAAT-GTTTATAACTATTTGAACTCGTTTGGTAAACAGATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* * *
179134 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTACTCCAAA
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
* * * ** * * * * *
179199 TAGGCTTGAATG-ATTAAAAACTTTTGTTATATGGCCAACCAATAGG-CAATAA
129 TAAGCTTGTATGAATT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAA
** * * * * * * ** * *
179251 TGATTTGAAATACCTAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAATGATTCGACAAACAAATTCA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
179316 CTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTATTTTGAA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTA-TTCGAA
* * * * * * * * * * *
179380 CAAGCCTATATGAACTGAAACGAGTATTTTATGGCAAGACAAATGGTCAAAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* ** ** * * ** * *
179432 TGATTTGAAATAGATTATTGTTCATGTAGTTTTAACTGTTTGCACTATTTCGGCAAATAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * * * *
179497 TGTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTAAAATATT-ATCAAATTAGTATTAATTAATTCTAAA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTC-GAA
* * * * * * * * * *
179561 TAAGCTTGTATGAACTGAGACAAATATTTTATAATAGAATAAAATGTTATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * **
179613 TGATTTAAAATAGGTAATTATTC-------CAT-A-TA--GGACCTGGTTCTGTAAATTGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
179667 TTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAACT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGAA-T
* * *
179732 AGGCTTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAA
130 AAGCTTGTATGAATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * * * * * *
179783 TAATTTGATATAGATAATTATTGAAATGGCCATAATTATTTGAATTGATTCGATAAATAAATTCA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * *
179848 CTTTTTAAATCACGTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAACT-GTTATTATTTTATTTCGAA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTA-TTCGAA
* *
179912 TAAGCTTGTATAAATTGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * ** * * * *** *
179964 CAATTTTAAAT-GTACAATTGTTCAAATAGTTTTAACTATTTAAATTTGTTCAAAAAACATATTT
1 TGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* *
180028 ATTTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG
65 A--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCG
* * * *
180093 GATAAGCTTTTATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
127 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
180147 CGATTTTAAATA-AGTAATTG-TCTAAATAGTCAAAACTATTTGAGCAT-ATTTGGTAAACAGAT
1 TGATTTGAAATAGA-TAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTCGGTAAACAGAT
* * * *
180209 TTATTTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTATT
63 TTA-TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * *
180273 CCGAATAAACTTATAT-CATGTAAAAGAAATATTTTATGACTAAAA-AAAAGGTCAGAA
125 -CGAATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAA
** * * ** * * * *
180330 CAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTA-TTAAACTAGTTCGGCAAACACATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * *
180394 TTTTTTTAAATC-CGGTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGA
66 -TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGA
** ** * *
180458 ATAAGCTTGTATG-ATCAAAAACAATAATTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAA
128 ATAAGCTTGTATGAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * *
180511 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTGGCCATAATTATTTTAACTGATTCAGTAAACAAATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
180576 TTTTTTAAATTTCTTACTTATCAATTTTAGAAATATTAATAAATT-GTATTATTTTATTCCATAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCGA-AT
* * * * * * *
180640 AAACTTGTATTAACTGAAATAATTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAG
130 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * *
180691 CGATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* *
180756 TTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTGT-TTCGA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTT-TATTCGA
* * * * * *
180819 ATAAGCTTGTATGAATGGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAA
128 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
180872 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAA-AGTCTTAACCATATGAATTGGTTCGGTAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
** * * *
180936 ATTTTTTAAATCTCTTAC-TAGTTAATTTTCAAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCAA
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGA
*** * *
181000 ATAAGCTTG--TGCAAACAAAAAAATTGTTTTACGAC--AAC-AAAGGTCATAA
128 ATAAGCTTGTATG-AATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * **
181049 TGATCTGAAATTGATAATTGATCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTAGGCAATTAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * ** * * *
181114 TTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
66 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAA
** * * * * ** * *
181179 TAATATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGACAACAAAACAAAATGTTATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * * *
181231 CAATTTGAAATAGATAATTACTACAAATAGTTAAAACTATTTGAAATGGTTAGGTAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* * * *
181296 ACTTTTTAAATCGCTTA-TTGATCAATTTTCT-TAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATGTCG
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTT-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TCG
* * * *** * * * *
181358 AACAAACTTATATGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTAATAA
127 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * *** * * *
181412 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTTTATAAATAAAATTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * * *
181477 TTTTTTAAATATCTTACTTATAAAATTTTGAAATATTAACAAATTAGTTTTAATTTATTTCGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * *
181542 AAACTTGTAT--ATGCTGAAATAATTGTTTTATGACAACACAAAAGGTCATAA
130 AAGCTTGTATGAAT--TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * *** * *
181593 CGACTTGAAATACATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAAAAAATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * ** * * * *
181658 TTTTTTAAATCTCTTAATTATGAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGAATTACTTTATTTTGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * * * * * *
181723 AAACTTCTATGAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAA
130 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * ** *
181774 CAATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTAGTAAATAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
181839 TTGTTTAAATCTCTTAC----TAATTCTTGAAATTATTCAA-ACAGTTA-TAATTATTTGAACTT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAA-TATT-AATA-AATTAGT-ATTATTT-TA--T
* ** * * * *** * * * ** *
181898 GCTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAGA-ATATTAATAA-AT
124 --TC-G--AA-TAA--GCTTGTATGAAT-TGAAAC-AATT-GTTTTAT-GACAAAACAA-AAGGT
*
181960 TAGT-A
176 CA-TAA
* * ** * * * * * * * *
181965 TTATTTTATTTTGAATACACTTGTAT-GAAT-G-GA-AACAATTGGATAAT-G-AC--AAAACAG
1 TGATTTGAAATAG-ATA-A-TTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTGGTTCGGTAAACAG
** ** * * ** * * * * * * *** *
182022 A---AGGTCATAACTAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCAT-AACTA-T-TTGAACATG
61 ATTTATTTTTTAAATCTCTT-ACTTA-TTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATT-ATTTTA
* * * *** * * * ** ** *
182080 TTCAGAAAATAGATT-TATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTT-TGGA-ATATTAATAAATTT
123 TTC-GAATA-AGCTTGTA----T-GAATTGAAAC-AATT-GTTTTAT-GACAAAACAA-AAGGTC
*
182142 ATAT
177 ATAA
* ** * ** * **** **
182146 TG-TTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACGACAAAAACAAAAGGTCA
1 TGATTTGAAATAG-ATAA--TTGT-T---C----A-AATAGTCATA--ACTATTTGAACTGGT--
* * * * * * * * * *
182210 TAATGATTTGAAATAGA-TAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCG--ATA--AA
50 T--CG--GT-AAACAGATTTATTTTTTAAAT-CTCTTACTTA-TT-AA-TT-TTTGAAATATTAA
* * * * * ** * * * **
182270 TAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTC-ATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGTATTGTTTT
105 TAAATT-A-GTATT--AT-T-TTATTCGAATAA-GCTT-G--TATGAATTGA-AACAATTGTTTT
* ** *
182334 ATTTTGA-ATAAGCCTATATAAACTGATACAA
159 A---TGACA-AA-AC-A-A-AAGGTCAT--AA
* * * * *** *** **
182365 TTG-TTT--TAT-GATGAA----ACAAA-GGTCATAA-TGATTTGAAATAAATAATTATTCAGAT
1 -TGATTTGAAATAGAT-AATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGAT
* * * * * * * ** *
182420 AGTTATGCCTATTTGAA-CTTGCTTGAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTTCTTGT
63 --TTAT---TTTTTAAATC-T-CTT---ACTTATTAATTTTTGAAA--TATTA-ATAAAT-TAGT
** * * * * ** * * * ** * * *
182484 CAAAATATTAATAGATTAATATTATTTTAATCCAAATAA--GCTTATATGA-ATAAA-AATAATT
114 -ATTATTTTATTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTG-TTTTATGACA-AAACAA-AA-G
* *
182545 GT-TTTA
174 GTCATAA
** * * * ** * * ** * * * * *
182551 TGA--CAAAACA-AAAAGTCATAAAGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTT--AT-AACTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-A-TAGTCATAACT-A-T-TTGAACTGGTTCGGTAAAC-A
* * * ** * **
182610 -ATTGAACTTATTCAGTAAA-CATATTTATTTTTTAAATCTTTT-ACTTATTAATTGTCTAAA-T
60 GATT-TA-TT-TT--TTAAATC-TCTTACTTAT-T-AAT-TTTTGAAATATTAA-----TAAATT
* * **** * * **
182671 ATTAATAAATTTGTATTATTTTAA--TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATAATTTTATG
111 AGT-AT-TATTT-TATTCGAATAAGCTTG---T-A-----T--GAATTGAAACAATTGTTTTATG
* *
182734 ACAAAACAAAAGGTTATAG
162 ACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * *
182753 TAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTCAACTTGTTTGATAAACCGATTCA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * ** * *
182816 GTTTTTAAATCTTTTATTTATTAGCTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTCTGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAT
** * * * * * ** *
182881 AAGCTCATACGAATAGAAACACTTTTTTTGTGACAAAACAATTGGTTATAA
130 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * ** * *
182932 CGATTTGAAATAAATAATT-TTCAAACAATGATAATTATTTGCACTAG-TCAGGCCAACAAATTC
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTC-GGTAAACAGATTT
* * *
182995 ATTTTCTAAAT-TCGTTACTTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTG
65 ATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-G
* * * * * *
183058 AATAAGATTGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAA
127 AATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * * *
183112 CAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* ** ** * *
183177 TTTTTT--ATATCTT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTATTTCAAAC
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * *** * * *
183238 AAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA
130 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * ** * *
183289 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CCTCAACTATTTGAACTGGTTAAGCAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* * * * *
183353 ATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTT-ATAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGA
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGA
* * * *
183417 ATAAGCTTGTATGAACAT-AAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAA
128 ATAAGCTTGTATGAA-TTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * *
183470 CAATTTGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAGGTTCCGTAAACA-A---A
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
*
183531 -----T-AATCTCTTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTCTGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAAT
* * *
183589 AGGCTTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAAC-AAAGTTCATAA
130 AAGCTTGTATGAATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * ** * * *
183639 AGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAA-TGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
** * ** * * * * * * *
183703 TTTTTTAAATCTCCAACTTCTCGACTTTTGAAATTTTAATAAAGTAATATTATTTAATTTTGGAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * * * *
183768 AAGCTTTTGTGAACTGAAACAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAA
130 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * ** ** **
183819 CAATTTTAAGTAAATAATCATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCTATAAATC-GATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAA-CAGATTT
* * * *
183883 ATTTTCTTAAAT-TCATTGCATATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAA-AATGTATTATTTTATTT
65 ATTTT-TTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTA-TT
* * * * ** *
183945 CGAATAAGCATGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAATATCAAAA
125 CGAATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * * *
184001 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACAGGTTTGGCAAACACATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * ** * * *
184066 TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-AGAATTTTATTAGTTTAGCA--ATGTTTACTCCAA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTA-TTCGA
* ** * * * **
184124 ATAAGTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATTATTC
128 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * * * **
184176 CAATTTGAGATAGTTAATTGTTCAAATAATCATGACTATTT-AAGTCAGTCCGGTAAGTAGATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GGTTCGGTAAACAGATTT
* * *
184240 AATTTTTAAATCTC-T-C--ATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAA
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC-GAA
** * ** * * * * *
184301 TAATTTTATATGAATAAAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAATGACATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * * * *
184353 CGATTTAAAAT-GAATAATAGCTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGCTCGGTAAATAGATTT
1 TGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* * *
184417 ATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAA
* ** * *
184482 TAAACTTGTGCGAATAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * * *
184533 CAATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTCGCTCGGTAAATAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
** * * * * * *
184598 TTTTTTAAAAATTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAGATTAGTGTTATTGTATTTTGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCGAAT
* * ** * *
184663 AAGCTTTTTATGAATAGAAACAATTAATTTATGACAAAACAAATGGTTATAA
130 AAGC-TTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * *
184715 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTT-AAATGTGTTCAGAAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-GTTCGGTAAACAGATTT
* * * * *
184779 ATTTTTTAAATAT-TTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTTA-TATTATTTTATTAGGT
65 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATT-CGA
* * * **
184842 GTAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGACCATAA
128 ATAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * ** *
184895 TGATTAAAAATAGATAATTATT----TAGT-A-AACAGATTT--A-T--TT-TTTAAATCACTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTGGTTCGGTAAA-CA--GA
* * * * * * ** * **
184948 TTGATTTTTGAAA-C-GTTAATAAGTTAGTATTATTT--TAT-TTCAAATAAGCCTA-TATCAAC
62 TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTA--ATT-TTTGAAATATT--AATAA-ATTAGTATTATT
* * * ** * **** *
185007 TTATAC-AAT-TG-TTATATG-A-TGAAACAAAAGGTTATAATGATTTGA-AATA-G--ATAA
120 TTATTCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAAC-AATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * *
185061 TTA-TT--CA-A-AT-A--GTT---AT--T-AT---TATTTGAACTTGTTCGGTAAATATATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* ** *
185109 TTTTTTAAATCT-TATACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATCCGAA
66 TTTTTTAAATCTCT-TACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-ATTCGAA
*** * *
185172 TAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGCCATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * *
185224 CAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAACT--TAT-GGTAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-TCGGTAAACAGATTT
* *** *** ** * * ** * * *
185286 GAAATAAACTTGTATAAA--TAGAAAAAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTTACTATTTGAAC
65 ---AT----TT-TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATA-TTAA---TA-AATTAGTA-
* * * * * *
185349 TTATTCAGTAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTATAAATAG-AACAAATTGGTTTATGATAAAACA
115 TTATT---T-----TATTCG-AATAAGCTTGTATGAATTGAAAC-AATTGTTTTATGACAAAACA
* *
185413 AAAGGTTATAG
170 AAAGGTCATAA
** * * * * * *
185424 CAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAAAAGATTCA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * ** * * *
185489 TTTGTTAAA-C-C-T-CTTATTAATTTTTGGAATGCTAATAAATTAGAATTATGTTATTATGAAT
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-CGAAT
* *** * * *
185550 AAGCTTGTCTGAACAAAAACAATTATTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAA
130 AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * ** **
185601 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGTAATCATAACTATTTGCACTGGTTAGGCCAACAGATAC
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
* ** ** * * *
185666 ATTTTCTAAATC-CATTACTTGCTAATTTTCAAAATATTAATAAATTA-CATTACTTTATTCCAA
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* * *** * *
185729 ATAAAAC-TATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGGTTATAA
128 AT-AAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * ** *
185782 TGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAGTTATAACTAAATTGAACTAGTTTTGTAAACAAATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTT
** * *
185847 ATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAA
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* * * *** * *
185908 CAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * *** * * *
185960 CGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGAAC-GGTTCAACAAGCAAAATTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * *
186023 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTATTCTAAA
66 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTC-GAA
* * ** * * *
186087 TAAGCTAGTAAGAGCT-AAA-ATTTTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * *
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1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGG----TAAA--CA
** * * * * * * * * *
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60 -GATTT--ATTTTTTA--AATCT-CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTAT
* *** * * * *** **
186240 TTTATTCCGAATAAGCTTCTATGAACAAAAATAATTATATTATGACTTGACAAAAGGTTGTAA
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* * * * * * * *
186303 TGGTTAGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * *
186368 TTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAAAAAATTATTTTTATTTTATTTCGAAT
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* ** * * * * *
186433 AAACTTAG-ATGAGCTGAAATAAATATTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAA
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* * * * * * ** *
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1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * ** * *
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* * ** * * * * *
186612 AAACTTATATGAA-CAACAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAA
130 AAGCTTGTATGAATTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * *
186663 CAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAACCGGTTTGGTAAACAGATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * * * *
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* * * *
186789 AAGCTTGTATG--TTGAAAAACAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTAAAAA
130 AAGCTTGTATGAATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
* * * * * * * **
186840 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAGATGGCCATAATTATTTGAATTGATAT-GGTAAATTGATTT
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGT-TCGGTAAACAGATTT
** * * * *
186904 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGA
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* * * *
186969 TAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCTTAA
129 TAAGCTTGTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAA
** * * * * *
187021 CAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTCAACTTGTTCGGTAAACAAATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
* * * * * * * * *
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66 -TTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA-ATTTTTGAAATATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTCG
* * * * *
187149 AATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAA
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* * * * * * ** *
187203 CGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAAACACATTTA
1 TGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGGTAAACAGATTTA
187268 TTTTTTAAATCTCT
66 TTTTTTAAATCTCT
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Statistics
Matches: 8374, Mismatches: 2124, Indels: 1204
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Matches are distributed among these distances:
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175992 ATTTTATGGT
* * * * * **
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* * *
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* * * * * **
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128 ATAAGCTTGTATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATA
* * * *
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* * **
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * *
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*
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* * ** *
176545 GACTTT-AAATGGATAATTGTTCAAAAAGTCATATTTATTTGAACTTGTTTGGCAAACAAATTTA
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** * *
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* * * * *
176674 TAAGCATGTATGAACTAAAATAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTCAAAACAATTTGAAATAG
129 TAAGCTTGTATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAG
* * * * * *
176739 ATAATTGTTCAAATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAGCAAACATATTTATTTTTTAATTCCC
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* ** * *
176804 TTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTATTTAGATTTGAA-CA-CTTGTATGGA
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* * * *
176867 A-GGAAACAATTGTTCTATGACAAAATAAAGACCATAATGA-TTTGAGATAGATAATTGTTCAAA
322 ACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTTGA-ATAGATAATTGTTCAAA
* * * * * * *
176930 TAGTTATAACTATTTAAACTGGTTTGGTAAACAAATTTAGATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATT
386 TAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT
** * * * * *
176991 TTCAAAATATTAATAAATCAGTATTAGTTTATTTTGAATAA-TTCTATATGCATAGAAAC-ATTT
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* ** *
177054 TTTTATGATAAAATGAAAGGTCATAAT
515 TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * ***
177081 GATTTGAAATAGATAAATGTTTAAATGGACATGACTATTTTG-ACTTGTTTGGTAGATGGATTTA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA-TTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA
* * ** * * * *
177145 TTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTGCAGAAAACTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTGAAT
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* * ** *
177210 AAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GAACATAACTATTTGAAATA
130 AAGCTTGTATGAAATA-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATG-TTATAACAATTTGAAATA
* * * * * * * *
177273 AATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTT-GGTAAATAGATTTATTTTTAAAATC
193 GATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAAC-TG-TTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
177337 TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGCTTGCAT
256 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTGTAT
* * *
177401 GAACAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT-A-TTTGAAATAGATAATTG-T
320 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAA-TGATTTTG-AATAGATAATTGTT
* * * * *
177463 CGAAATAGTCAAAACTATTTGAACAT-GTTTAGAAAATACATTTA-TTTTAAAAT-TTTTATTTA
382 C-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * *** *
177525 TTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTACTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
445 TTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAA
* * *
177589 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCATTAC
509 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* ** * * *
177622 GATTTGAAATAGATAATAT-TTCATATAGTCATAACGGTTCGACCTTGTTTGATAAACAAATTCT
1 GATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATT-T
* * *
177686 -TTTTTTAAAAATCTCTTA-TTCATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTT
64 ATTTTTT--AAATCTCTTACTT-ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC
* * * * * * * * *
177749 GAATAAGCTTAT-TTAAATTGATACAACTGTTTTAGGA-TGAAATAAAAGGTTACAACAATTTGA
126 GAATAAGCTTGTATGAAA-TAAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAATGTTATAACAATTTGA
* * * * *
177812 AATAGATAATTATTCAAACAAT-TATGACTATTTGAACGTGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTAA
189 AATAGATAATTATTCAAACAGTCT-TAACTATTTGAAC-TGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTA
* * ** * * *
177875 AATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTA-TTTTAGTCCAAATAAGCTT
252 AATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTT
* * * * * * * ** *
177939 GTATAAACAAAAACAAATGTTTAATGATAAAA-AAAAAGTCA-GATGGGTTTGAAATAAATAATT
316 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTTG-AATAGATAATT
* ** * * * * *
178002 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTATTCA-ATAAATAGGTTTAATTTTTAAAAATATTTTA
379 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGA-AAATAGATTTAGTTTTT--AAATCTCTTA
* * * * * * *
178066 CTTATTAATTGTTG-ATTATTAATAAATTTGTATAATTTTA-TTTGAAATAAGCTTGTACGATTA
441 CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTG-AATAAGCTTATATGAATA
* * * *
178129 GAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAGC
505 GAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * *
178166 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAAATATTTAAACTAGCTGGGTAAATAGATTCAT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT
* * * * *
178231 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGAATTATGTAATTTCAAATA
66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * *
178296 CGCTTG--TGCAAATAAAAACAATTGTTTTGTGA-TAAAACAAAATGTTATAACGATTTGAAATA
131 AGCTTGTATG-AAAT-AAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATA
* * * * * *
178358 GATAATTGTTCAAACAATCATAACTATTTGCACTCG-TCAGGCCAACAGATTAATTTTTTAAATC
193 GATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTC-GGCAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* *
178422 -CGTTACTTATTAACTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATT-TT-GAATAAGAC-T
256 TC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-TTATTCGAATAAG-CTT
* * * * * * * *
178482 GTATAAATAGAAACAATTATTTTATGACCAAATAAATAGTCGTAATGA-TTTGAAATAAATAATT
316 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTTG-AATAGATAATT
* * * * * *
178546 GTTCAAATAGTAATAACTAATTGAACTTGTTTAGCAAATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
379 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTT
* ** * ** * * * *
178611 CTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAAAAAAAA
444 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATG--AATAGA
* * *
178676 AACATTTGTTTTTATAAGAAAACAAAAGGTCATAAC
507 AACAATTG-TTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * *
178712 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAAC-TGGTCGATGAACAAAATTAT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT
* * *
178776 TTTTTAAATCTCTTAC----TAATTTTTAAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTGT-GAAT
66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAAT
* * * * * *
178836 AAG--T-TACTAAAAGCTGAAAA-AATTATTTTAGGACAAAATAAAAAGGTTATAACAATTTGAA
130 AAGCTTGTA-TGAAA--T-AAAACAATTGTTTTATGACTAAA-CAAAATGTTATAACAATTTGAA
* * * * * * * * *
178897 ATAAAGAACTATTCATATAGCCTTAACTATTTGAACTTGTTTGGCAAACAAATTTATTTTTGAAA
190 ATAGATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAA
* ** * * * * *
178962 TCTCTTAGTTATTAATTTTCAAAATATCATTACATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAACTTGT
254 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTGT
* * ** * * * *
179026 ATGAACATAAAATAATTGTTTTATGACTTAACAAAAGGTTATAAT-AATTTGAAATATATAATTG
318 ATGAACA-GAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTG
* * * * * *
179090 TTCAAAT-GTTTATAACTATTTGAACTCGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTT
380 TTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTT
* * *** * * *
179154 ATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATAGGCTTGA-ATGATTAAAA
444 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTT-ATATGAATAGAA
** * * * * * *
179218 ACTTTTGTTATATGGCCAACCAATAGG-CAATAAT
508 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAAC
** * * * * * * ** *
179252 GATTTGAAATACCTAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAA-ATGATTCGACAAACAAATTCA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTA
* * * *
179316 CTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTATTTTGA
65 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * * * * * * * **
179379 ACAAGCCTATATGAACTGAAACGAGTATTTTATGGC-AAGAC-AAATGGTCAAAATGATTTGAAA
128 ATAAGCTTGTATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACTAA-ACAAAAT-GTTATAACAATTTGAAA
* * *** * * * * * *
179442 TAGATTATTGTTCATGTAGTTTTAACTGTTTGCACTATTTCGGCAAATAGATTTATGTTTTAAAT
191 TAGATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAAT
* * * * * *
179507 CTTTTAGTTATTAATTTTTAAAATATT-ATCAAATTAGTATTA-ATTAATTCTAAATAAGCTTGT
255 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTTATTC-GAATAAGCTTGT
* * * * * * * ** * *
179570 ATGAACTGAGACAAATATTTTATAATAGAATA-AAATG-TTATAATGATTTAAAATAGGTAATTA
318 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACA-AA-ACAAA-GATCATAATGATTTTGAATAGATAATTG
* * * * * *
179633 TTC-------CAT-A-TA--GGACCTGGTTCT-GTAAATTGATTTATTTTTTAAAACTCTTACTT
380 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT-TAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTT
* * ** * * *
179686 ATTAATTTTTGAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCCAACTAGGCTTGTATG-ATGAAA
444 ATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAA-TAAGCTTATATGAAT-AGA
* * *
179749 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAAT
507 AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * * * * *
179784 AATTTGATATAGATAATTATTGAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTCGATAAATAAATTCA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTA
* * * * *
179848 CTTTTTAAATCACGTACTTATTAAATTTT-GAAATATTAATAAACT-GTTATTATTTTATTTCGA
65 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCGA
* * * * * *
179911 ATAAGCTTGTAT-AAATTGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAAT
128 ATAAGCTTGTATGAAA-TAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAAT
* * * * * * *** *
179975 -GTACAATTGTTCAAATAGTTTTAACTATTTAAATTTGTTCAAAAAACATATTTATTTTTTTTAA
192 AG-ATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAA-CTGTTCGGCAAACAGATTTA--TTTTTTAA
* * * *
180039 ATCTCTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGGATAAGCTTT
253 ATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTG
** * * * * *
180103 TATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATA-AGTAATTG
317 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTTGAATAGA-TAATTG
* * * * * * * *
180167 -TCTAAATAGTCAAAACTATTTGAGCAT-ATTTGGTAAACAGATTTATTTTTTTCAAATCTCTTG
380 TTC-AAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGGTTTAGAAAATAGATTTA-GTTTTT-AAATCTCTTA
* * * ** * * *
180230 CTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCCGAATAAACTTATATCATGT
441 CTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGA-AT
* * * *
180294 A-AAAGAAATATTTTATGACTAAAA-AAAAGGTCAGAAC
504 AGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** * * * * *
180331 AATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTA-TTAAACTAGTTCGGCAAACACATTTAT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTA-
* * *
180395 TTTTTTAAATC-CGGTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGA
65 TTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* ** * * * * **
180458 ATAAGCTTGTATGATCA-AAAACAATAATTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAAT
128 ATAAGCTTGTATGA-AATAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAAT
* * *** * * * * * * * *
180522 AAATAATTGTTCAATTGGCCATAATTATTTTAACTGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATT
192 AGATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACTG-TTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATC
* * * *
180587 TCTTACTTATCAATTTTAGAAATATTAATAAATT-GTATTA-TTTTATTCCATATAAACTTGTAT
256 TCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTCGA-ATAAGCTTGTAT
* * * * * * ** * *
180650 TAACTGAAATAATTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAGCGATTTTAAATAGACAATTGTTCA
320 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAAGATCATAATGATTTTGAATAGATAATTGTTCA
* * * * * *
180715 AATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAA
384 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * * * *
180780 TTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTGTTTCGAATAAGCTTGTATGAATGGAAATAAT
449 -TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAAT
* * * * *
180844 TGTTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAAT
513 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * *
180873 GATTTGAAATAGATAATTGTTCTAAA-AGTCTTAACCATATGAA-TTGGTTCGGTAAACAAATTT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTGGTAAACAAATTT
* * * * * *
180936 ATTTTTTAAATCTCTTAC-TAGTTAATTTTCAAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCAA
64 ATTTTTTAAATCTCTTACTTA-TTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * ** *
181000 ATAAGCTTG--TGCAAACAAAAAAATTGTTTTACGAC--AAC-AAAGGTCATAATGATCTGAAAT
128 ATAAGCTTGTATG-AAATAAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAAT
* * * * ** *
181060 TGATAATTGA-TCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTAGGCAATTAGATTTATTTTTTTAAT
192 AGATAATT-ATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTCGGCAAACAGATTTA-TTTTTTAAA
* ** * * * ** *
181124 TTTCTTGGTTATTAAGTTTTGAAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTTATTCCAAATAATATAGT
254 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATT-CGAATAAGCTTGT
* * * ** * * *
181188 ATGAATAGAACCAATTGTTTGACAACAAAACAAA-ATGTTATAA-CAATTTGAAATAGATAATTA
318 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA--TCATAATGATTTTG-AATAGATAATT-
* * * * * * * * * *
181251 CTACAAATAGTTAAAACTATTTGAAATGG-TTAGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATCGCTTA-T
379 GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTA-GAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACT
* * * * * * * *
181314 TGATCAATTTTCT-TAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATGTCGAACAAACTTATATGAACAA
443 T-ATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAG
* * * * *
181377 AAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTAATAAT
506 AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** * *
181413 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTTTATAAATAAAATTAT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT
* * * * * *
181478 TTTTTAAATATCTTACTTATAAAATTTT-GAAATATTAACAAATTAGTTTTAATTTATTTCGAAT
66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* ** * * * * * *
181542 AAACTTGTAT-ATGCTGAAATAATTGTTTTATGAC-AACACAAAAGGTCATAACGACTTGAAATA
130 AAGCTTGTATGA-AATAAAACAATTGTTTTATGACTAA-ACAAAATGTTATAACAATTTGAAATA
* * * * ** * *
181605 CATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAACAAAAAAATTTATTTTTTAAATCT
193 GATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * ** * * * *
181670 CTTAATTATGAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGAATTACTTTATT-TT-GAATAAACTTCTAT
257 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTT-TTATTCGAATAAGCTTGTAT
* * * * * ** **
181733 GAATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCA
320 GAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA-TCATAATGATTTTGAATAGATAATTGTTCA
* *
181798 AATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTAGTAAATAGATTTA-TTGTTTAAATCTCTTAC----TA
384 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTT-TTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * * * ** *
181858 ATTCTTGAAATTATTCAA-ACAGTTA-TAATTATTTGAACTTGCTCGGTAAACAAATTTATTTTT
448 ATTTTTGAAA-TATT-AATA-AATTAGT-ATTATTT-TA-TT--T---TGAATAAGCTTA---TA
* **** * * * * * **
181921 TTAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAGA-ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTT
499 TGAAT-AGAAAC-AATT-GTTTTAT-GACA-A--AACAAA--AG-GTCA---TA--AC
* * *
181977 GAATACACTTGTATGAATGGAAACAATTGGATAATGACAAAACAGAAGGTCATAACTATTTGAAA
1 G-AT----TTG-A--AAT--AGATAATT-G-T--T--C--AA-A-TA-GTCATAAC---------
* * *
182042 TAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT
36 T--AT--TTG-------AA-C-T---TGTTTG-----G-T-A-AACA-A-ATTTATTTTTTAAAT
* * * *
182107 -TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTA-TATTGTTTTATTTAGAATAAGCTTGTA
75 CTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA
* * * * ** *
182170 TGAACA-AAAACAATTGTTTTACGACAAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGT
139 TGAA-ATAAAACAATTGTTTTATGAC-TAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTAT
* * * ** * * *
182234 TCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCAT
202 TCAAACAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * * * * *
182299 TAATTTTT-AGAATATTAATAGATTAGTATT-GTTTTATTTTGAATAAGCCTATATAAACTGATA
266 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAA
** * * * * *
182362 CAATTGTTTTATGATGAAACAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAAATAATTATTCAGATAGTTAT
329 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
** * * * * ** * **
182426 GCCTATTTGAACTTGCTT-GAAACAT--ATTTA-TTTTTAAAATTTTTTACTTATTTCTTGTCAA
393 AACTATTTGAACTGGTTTAGAAA-ATAGATTTAGTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA
* * * *** * *
182487 AATATTAATAGATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAATAAAAATAATTGTTTTAT
456 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
* *
182552 GACAAAACAAAAAGTCATAAA
521 GACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * ** *
182573 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTTATTCAGTAAACATATTTAT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT
* * * *
182638 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTA-AATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAAA
66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-AA
* ** * * **
182701 TAAGCTTGTATG-AATAGAAAAAATAATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTAATTTGAAATA
129 TAAGCTTGTATGAAATA-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATA
* * * * * ** * * *
182765 GGTAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTCAACTTGTTTGATAAACCGATTCAGTTTTTAAATCT
193 GATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * ** * * ** *
182828 TTTATTTATTAGCTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTCATACG
257 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTATTC-GAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * * *
182892 AATAGAAACACTTTTTTTGTGACAAAACAATTGGTTATAACGA-TTTGAAATAAATAATT-TTCA
321 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTGTTCA
* * * * * * * ** * * *
182955 AACAATGATAATTATTTGCACTAG-TCAGGCCAACAAATTCA-TTTTCTAAAT-TCGTTACTTAT
384 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTA-GAAAATAGATTTAGTTTT-TAAATCTC-TTACTTAT
* * * * * * *
183017 TAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAGATTGTATCAATAGAAAT
446 TAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAAC
* *
183081 AATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAAC
510 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * *
183113 AATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTGGTTTGGTAAACAAATTTAT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT
* * * ** * *
183178 TTTTT--ATATCTT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTATTTCAAACA
66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * *
183239 AACTTATATGAACA-AAAACATTTATTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAG
131 AGCTTGTATGAA-ATAAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAG
* * * ** * *
183302 ATAATTATTCAAATAGCCTCAACTATTTGAACTGGTTAAGCAAACAAATTTATTTTTTAAATTTC
194 ATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC
* * * *
183367 TTAGTTATTAATTTTT-ATAATATTATTAGATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
258 TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * * *
183430 AACATAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAA-CAATTTGAAATATATAATTATTCA
321 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTGTTCA
* * ** * *
183494 AATAGTTATAACTATTTGAACAGGTTCCGTAAACA-A---A-----T-AATCTCTTA-TTATTAA
384 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA
* * * * *
183548 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTCTGAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAAT
449 TTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAAT-AGAAACAAT
* * *
183612 TGTTTTATGGCAAAAC-AAAGTTCATAAA
513 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * ** * **
183640 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTTGATAAA-TGATTTAT
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT
** * ** * * * * * * *
183704 TTTTTAAATCTCCAACTTCTCGACTTTT-GAAATTTTAATAAAGTAATATTATTTAATTTTGGAT
66 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * * * * * *
183768 AAGCTTTTGTGAACTGAAACAATTGTTTTAAGA-TAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAGTAA
130 AAGCTTGTATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAG
* * * * ***
183832 ATAATCATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCTATAAATC-GATTTATTTTCTTAAAT-
194 ATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTCGGCAAA-CAGATTTATTTT-TTAAATC
* * * * *
183895 TCATTGCATATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAA-AATGTATTA-TTTTATTTCGAATAAGCATG
256 TC-TTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTG
* * * * ** *
183957 TATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAATATCA-AAACAATTTGAAATAGATAATTG
317 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTG
* * * * * * * * *
184021 TTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACAGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTA
380 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTA
* * ** * * *** * * *
184082 TTAATTTTT-AGAATTTTATTAGTTTAGCA--ATGTTTACTCCAAATAAGTTTGTATGAATAAAA
445 TTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAA
* * * **
184144 ACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATTATTCC
508 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * * ** ** *
184177 AATTTGAGATAGTTAATTGTTCAAATAATCATGACTATTT-AAGTCAGTCCGGTAAGTAGATTTA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTA
* *
184241 ATTTTTAAATCTC-T-C--ATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAA
65 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GA
** * * * ** ** * *
184300 ATAATTTTATATG-AATAAAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAATGACATAACGATTTAAAAT
128 ATAAGCTTGTATGAAAT-AAAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAAT
* ** * * * * * *
184364 -GAATAA-TAGCTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAA
192 AG-ATAATTA-TTCAAACAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAA
* * * *
184427 TCTTTTACTAATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTA-TTTTATTTTGAATAAACTTGT
254 TCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTGT
** * * * *
184491 GCGAATAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAA-CAATTTGAAATAAATAATTGT
318 ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTGT
* * * * ** * * ** *
184554 TTAAATAGTCATAACTATTTGAATTCGCTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAATTTTACTTAT
381 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
184619 TAATTTTTGAAATTTTAATAGATTAGTGTTATTGTATTTTGAATAAGCTTTTTATGAATAGAAAC
446 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGC-TTATATGAATAGAAAC
** * * *
184684 AATTAATTTATGACAAAACAAATGGTTATAAT
510 AATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * ** *
184716 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTT-AAATGTGTTCAGAAAACAAATTTA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTGGTAAACAAATTTA
* * * ** *
184780 TTTTTTAAATAT-TTGCTTATTAATTTTT-GAAATATTAGTAAATTTA-TATTATTTTATTAGGT
65 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * *
184842 GTAAGCTTGTATG-AATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAA-G-----ACCA--T--AAT
128 ATAAGCTTGTATGAAATA-AAACAATTGTTTTATGACTAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAAT
* * * *
184896 -G---ATTA--AAAATAG--ATAATTATTT--A--G-T----AAACAGATTTATTTTTTAAA--T
192 AGATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACTGTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* ** * * * * *
184942 C--ACTTATTGATTTTTGAAACGTTAATAAGTTAGTATTA-TTTTATTTCAAATAAGCCTATATC
257 CTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTTA-TTCGAATAAGCTTGTATG
** * * ** * * *
185004 AACTTATACAATTGTTATATGATGAAACAAAAGGTTATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTCA
321 AACAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTGTTCA
* * * * ** * * *
185068 AATAGTTATTATTATTTGAACTTGTTCGGTAAATATATTTATTTTTTAAATCT-TATACTTATTA
384 AATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCT-TACTTATTA
* ** * ** * * *
185132 ATTGTCAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAAT
448 ATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAAT
* *
185196 TGTTTTATGACAAAACAAAAAGCCATAAC
513 TGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * *
185225 AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAAC-T-TATGGTAAACAAATTTGA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTT-A
** * * * ** * * *
185288 ---AATAAA-CTTGTATAAATAGAAAAAATTGGTTTATG-ATA-AAACAAAAGGTTACTATTTGA
65 TTTTTTAAATC-TCT-T-ACT--TATTAATT--TTTA-GAATATTAA-TAAA--TTAGTA-TT--
* * *
185347 ACTTATTCAGTAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTAT-AAATAGAACAAATTGGTTTATGA-TAAA
116 A-TT-TT-A-T-------TTCG-AATAAGCTTGTATGAAATAAAAC-AATTGTTTTATGACT-AA
* * * * *
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167 ACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAAC-TGTTC
* * * * * * ** *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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** ** ** * *
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*** * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * * * *
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* ** * *
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* * * * * * * * *
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385 ATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTAAT
* * * * * * * ** * * * *
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450 TTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTATATGAATAGAAACAATT
* * *** ** *
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514 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
* * * * * * ** * *
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1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAACAAATTTAT
* * * *
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* ** * * * * * * * ** *
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130 AAGCTT-GTATGAAATAAAACAATTGTTTTATGACT-AAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATA
* * ** * * * *
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193 GATAATTATTCAAACAGTCTTAACTATTTGAACT-GTTCGGCAAACAGATTTATTTTTTAAATCT
* * * ** * * * *
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* * * * * * * *
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321 AACAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATAATGATTTTG-AATAGATAATTGTTC
* * * * * * * * *
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383 AAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGAAAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCTTACTTATTA
* * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * * ***
186841 GATTTGAAATAGATAATTATTCAGATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATATGGTAAATTGATTTA
1 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTTGGTAAACAAATTTA
* * * * * *
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* * * * * * *
186970 AAGTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCTTAACAATTTTAAATAG
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * *
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382 CAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTTAGA-AAATAGATTTAGTTTTTAAATCTCT
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Statistics
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175993 TTTTATGGTG
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* * * * * * * *
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* * * *
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* ** * * * ** *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * ** *
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** ** * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * ** *
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* * * **
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* * * * * *
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* * * * * **
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* * * * * * * *
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* * ** * * *
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* **
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* * * * * *
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* ** * * *
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*
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* * *
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* * * * * *
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* * * * *
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127 TAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* ** * * *
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** * * *
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* * ** * * * * ** * * * *
177760 TTTAAATTGATACAACTGTTTTAGGATGAAATAAAAGGTTACAACA
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* * * * * ** * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * * * *
177934 AGCTTGTATAAACAAAAACAAATGTTTAATGATAAAA-AAAAAGTCA-GATGGGTTTGAAATAAA
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* * ** * ** * *
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* * * * * * *
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** * * * * *
178124 GATTAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAGCG
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* * * ** *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * * *
178844 A-AAAGCTGAAAAAATTATTTTAGGACAAAATAAAAAGGTTATAACA
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* * * * * * * * *
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128 AAGCTTGTAT-AA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * *
179082 TATAATTGTTCAAAT-GTTTATAACTATTTGAACTCGTTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTAAAT
191 GATAATTGTTCAAATAG-TCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * * * *
179145 CTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTTACTCCAAATAGGCTTGAAT
255 CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT
** * * * * * * *
179210 GATTAAAAACT-TTTGTTATATGGCCAACCAATAGG-CAATAA-T
320 GAACAGAAA-TAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTC-ATAACT
** * * * * * * * * * * * *
179252 GATTTGAAATACCTAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTGAAATGATTCGACAAACAAATTCAC
1 -ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAG-TAAATAGATTTAT
* * *
179317 TTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAACAAATTTA-TATTATTTTATTTTGAA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * * * * * * *
179380 CAAGCCTATATGAACT-GAAACGAGTATTTTATGGCAAGACAAATGGTCAAAATGATTTGAAATA
127 TAAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* ** ** * * * * * * *
179444 GATTATTGTTCATGTAGTTTTAACTGTTTGCAC-TATTTCGGCAAATAGATTTATGTTTTAAATC
191 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * *
179508 TTTTAGTTATTAATTTTTAAAATATT-ATCAAATTAGTATTA-ATTAATTCTAAATAAGCTTGTA
256 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTA
* * * * * * * * * * *
179571 TGAACTGAGACAAATATTTTATAATAGAATAAAATGTTATAA-T
319 TGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * *
179614 GATTTAAAATAGGTAA-T-T---AT--TCCAT-A-TA--GGACCTGGTTCT-GTAAATTGATTTA
1 -ATTTGAAATAGATAATTGTCAAATAGT-CATAACTATTTGAACT-GTT-TAGTAAATAGATTTA
* * * *
179667 TTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTT-GAAAAATTAATAAATTAATATTATTTTA-TTCCAA
62 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * * *
179730 CTAGGCTTGTAT-GATGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTTATAATAATTTGATAT
127 -TAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAAT
* * * * * * * * * *
179794 AGATAATTATTGAAATGGCCATAATTATTTGAA-TTGATTCGATAAATAAATTCACTTTTTAAAT
190 AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAAT
* * * * *
179858 CACGTACTTATTAAATTTTGAAATATTAATAAACT-GTTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA
255 CTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA
* ** * * *
179922 TAAATTGAAACAATTGTTTTATGGCAAAACAAAAGGTCATAACA
319 TGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * ** * * * ** * *
179966 ATTTTAAAT-GTACAATTGTTCAAATAGTTTTAACTATTTAAATTTGTTCAAAAAACATATTTAT
1 ATTTGAAATAG-ATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAA-CTGTTTAGTAAATAGATTTA-
* * *
180030 TTTTTTTAAATCTCTTGCTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGG
62 -TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * * * * *
180094 ATAAGCTTTTATGAATTGAAAAAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTTAAATA
126 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * *
180159 -AGTAATTG-TCTAAATAGTCAAAACTATTTGAGCATATTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTTCA
191 GA-TAATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTT-A
* ** * * * * * *
180221 AATCTCTTGCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTCCGAATAAACTTA
252 AATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTG
* ** * * * * *
180286 TATCATGTA-AAAGAAATATTTTATGACTAAAA-AAAAGGTCAGAACA
317 TATGA-ACAGAAATAATTGTTTTATGAC-AAAACAAAAGGTCATAACT
* * ** * ** * * *
180332 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTA-TTAAACTAGTTCGGCAAACACATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATT-GTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAATAGATTTA-T
* * *
180396 TTTTTAAATC-CGGTACTTATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAA
63 TTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * ** * *
180459 TAAGCTTGTAT-GATCAAAAACAATAATTTTATAACAAAACAAAAGGTAATAATGATTTGAAATA
127 TAAGCTTGTATAAAT-AGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * * * * * *
180523 AATAATTGTTCAATTGGCCATAATTATTTTAAC-TGATTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATT
191 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * *
180587 TCTTACTTATCAA-TTTTAGAAATATTAATAAATT-GTATTATTTTA-TTCCATATAAACTTGTA
256 TCTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTA
* * * * * *
180649 TTAACTGAAATAATTGCTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAGCG
319 TGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * *
180693 ATTTTAAATAGACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAATAGATTTATT
* * * * *
180758 TTTTAAATCTCTTTCTTATTAATTTTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTGTTTCGAATA
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * * *
180822 AGCTTGTATGAATGGAAATAATTGTTTTATAACTAAACAAAAGGTTAGAATGATTTGAAATAGAT
129 AGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * *
180887 AATTGTTCTAAA-AGTCTTAACCATATGAA-TTGGTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
194 AATTGTTC-AAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * * * * ***
180950 TTAC-TAGTTAATTTTCAAAATATTATTAAATTTGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTGCAA
258 TTACTTA-TTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA
* *
181014 ACA-AAAAAATTGTTTTACGAC--AAC-AAAGGTCATAA-T
322 ACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * *
181050 GATCTGAAATTGATAATTGATCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTAGGCAATTAGATTTAT
1 -ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTA-GTAAATAGATTTA-
* * ** * * * *
181115 TTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTTT-GAAATATTATTAAATTAGTATTATTTTATTCCAAA
62 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
** * * * * ** * * **
181179 TAATATAGTATGAATAGAACCAATTGTTTGACAACAAAACAAAATGTTATAACAATTTGAAATAG
127 TAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * * * * *
181244 ATAATTACTACAAATAGTTAAAACTATTTGAA-ATGGTTAGGTAAACAAATTTACTTTTTAAATC
192 ATAATT-GTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * *
181308 GCTTA-TTGATCAATTTTCT-TAATATTAAT-AATTAGTATTATTTTATGTCGAACAAACTTATA
256 TCTTACTT-ATTAATTTT-TAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTA
* * * *
181370 TGAACAAAAATAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTAATAA-T
319 TGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * *
181413 GATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTGGTTTTA-TAAATAAAATTA
1 -ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-G-TTTAGTAAATAGATTTA
* * * * * *
181477 TTTTTTAAATATCTTACTTATAAAATTTT-GAAATATTAACAAATTAGTTTTAATTTATTTCGAA
62 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* ** * * * *
181541 TAAACTTGTATATGCT-GAAATAATTGTTTTATGACAACACAAAAGGTCATAACGACTTGAAATA
127 TAAGCTTGTATA-AATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * *** *
181605 CATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAG-TTCAACAAAAAAATTTATTTTTTAAATC
191 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * * * * * * *
181669 TCTTAATTATGAATTTTCAAAATATTATTAAATTAGAATTACTTTATTTTGAATAAACTTCTATG
256 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATG
* * * * *
181734 AATAGAAATAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTTATAACA
321 AACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* *
181776 ATTTAAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTGGTTTAGTAAATAGATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAATAGATTTATT
* * * *
181841 GTTTAAATCTCTTAC----TAATTCTT-GAAATTATTCAA-ACAGTTA-TAATTATTTGAACTTG
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAA-TATT-AATA-AATTAGT-ATTATTT-TA-TT-
* ** * * * **** * * * ** * *
181899 CTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTAATCTTTTACTTATTAATTTT-TAGA-ATATTAATAA-ATT
122 -TC-G--AA-TAA--GCTTGTATAAAT-AGAAAC-AATT-GTTTTAT-GACAAAACAA-AAGGTC
* * ** * * * * * * * *
181961 AGT-ATTATTTTATTTTGAATACACTTGTAT-GAAT-G-GA-AACAATTGGATA-ATG--AC--A
175 A-TAATGATTTGAAATAG-ATA-A-TTGT-TCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTTCGGT
** * * * * * *
182016 AAACAGAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAAT-TGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACATG
234 AAACA-AA--T--T---TATTT----TTTA-AATCTCTT--ACTTAT--TAA-T-TTTTAAAATA
* * * * * ** * * *
182080 TTCAGAAAATAG-ATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATA-AATTTA
280 TTAATAAATTAGTA-TTA-TTTT---A--TTT-C-GAATAA-GCTT-G--TATGAACAGAA-ATA
* * ** * ** *
182143 TATTGTTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAAAC-
331 -ATTGTTTTA-TGACAA-AA-C--AAAAGGTC-ATAACT
* *** * *** *
182181 AATTGTTTTACGACAA-AAACAAA-AGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATT-GTTCAAATAG
1 ATTTGAAATA-GATAATTGTCAAATA-GTCATAACT-ATTTGAACT-G-T--TTAG-T-AAATAG
* * * **
182242 TCATAATTATTTGAACTTGTTCGATAAATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTT
57 --AT--TTA--T----TT-TT---T--A-A-A-TC---TCTT--A---CTTATTAATT--TTTAG
* * * * * *
182307 AGAATATTAATAGATTAGTATTGTTTTATTTTGAATAAGCCTATATAAACT-GATACAATTGTTT
93 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATAAA-TAGAAACAATTGTTT
** * * * * **
182371 TATGATGAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAGATAGTTATGCCTATTTG
156 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
* * * * * ** * *
182435 AACTTGCTT--G-AAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTTCTTGTCAAAATATTAATA
221 AACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
* * * * * * * *
182497 GATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCTTATATGAATAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAA
286 AATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAA
* **
182562 AAAGTCATAAAG
351 AAGGTCATAACT
* * * * *
182574 ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACT-TATTCAGTAAACATATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TT-AGTAAATAGATTTAT
* * * *
182638 TTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCT--AAATATTAATAAATTTGTATTATTTTAATT-GAA
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCG-A
* * ** * * *
182700 ATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAATAATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGTAATTTGAAATA
126 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * ** * *
182765 GGTAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTCAACTTGTTT-GATAAACCGATTCAGTTTTTAAATC
191 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * ** ** * ** *
182827 TTTTATTTATTAGCTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTCATAC
256 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAT
* * * * * ** * *
182891 GAATAGAAACACTTTTTTTGTGACAAAACAATTGGTTATAACG
320 GAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * * ** * * *
182934 ATTTGAAATAAATAATTTTCAAACAATGATAATTATTTGCACTAG-TCAGGCCAACAAATTCATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTA-GTAAATAGATTTATT
* * *
182998 TTCTAAAT-TCGTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAAATTAGCATTACTTTA-TTCTGAA
64 TTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAA
* * * * * ** * *
183060 TAAGATTGTATCAATAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAATGGCCATAACAATTTAAAATAA
127 TAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * * * *
183125 ATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGAACTGGTTT-GGTAAACAAATTTATTTTTT--ATAT
192 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* ** * * * *
183187 CTT--TTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAAAATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGA
257 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGA
* * * * * *
183250 ACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACA
322 ACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * *
183291 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-CCTCAACTATTTGAACTGGTTAAGCAAACAAATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATT-GTCAAATAGTCAT-AACTATTTGAACT-GTTTAGTAAATAGATTTAT
* * * * * *
183355 TTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTTA-TAATATTATTAGATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * * ** *
183419 AAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATATA
128 AAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * *
183484 TAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-AGGTTCCGTAAAC-AA---A-----T-AATCTC
193 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTC
* * *
183538 TTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT-GTTCTGAATAGGCTTGTATGA
258 TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATGA
** * * * * **
183601 TGAAAAACAATTGTTTTATGGCAAAAC-AAAGTTCATAAAG
322 ACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * *
183641 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGAACTAATTT-GATAAAT-GATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAATAGATTTAT
** * ** * * * * * * *
183704 TTTTTAAATCTCCAACTTCTCGACTTTT-GAAATTTTAATAAAGTAATATTATTTAATTTTGGAT
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * ** * * *
183768 AAGCTTTTGTGAACT-GAAACAATTGTTTTAAGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAGTAA
128 AAGCTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
** * ** *
183832 ATAATCATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-ATTCTATAAATC-GATTTATTTTCTTAAAT
192 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAA-CAAATTTATTTT-TTAAAT
* * ** * * *
183895 -TCATTGCATATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA-AATGTATTATTTTATTTCGAATAAGCATGT
255 CTC-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGT
* * * * ** * *
183958 ATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAATATCAAAACA
318 ATGAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * *
184003 ATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAACAGGTTTGGCAAACACATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAATAGATTTATT
* * ** * * * *
184068 TTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAG-AATTTTATTAGTTTAGCA--ATGTTTACTCCAAAT
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTTCGAAT
* * * * * * **** * *
184126 AAGTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGAGAAAAC-AAAGATTATTCCAATTTGAGATAGT
128 AAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * * ** * *
184190 TAATTGTTCAAATAATCATGACTATTT-AAGTCAG-TCCGGTAAGTAGATTTAATTTTTAAATCT
193 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-TGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * ** *
184253 C-T-C--ATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTAAATAATTTTATATG
257 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATG
* * * * * * * * *
184313 AATAAAAACAATTATTTTACGAGAAAACAAAATGACATAACG
321 AACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * **
184355 ATTTAAAAT-GAATAATAGCTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGCTCGGTAAATAGATTTAT
1 ATTTGAAATAG-ATAATTG-TCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAATAGATTTAT
* * *
184419 TTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAAT
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* *** * ** *
184483 AAACTTGTGCGAATAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAAA
128 AAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * **
184547 TAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAA-TTCG-CTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAAAT
193 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * * * * *
184610 TTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAGATTAGTGTTATTGTATTTTGAATAAGCTTTTTATG
257 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGC-TTGTATG
* * ** * *
184675 AATAGAAACAATTAATTTATGACAAAACAAATGGTTATAA-T
321 AACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * *
184716 GATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGATAACTATTT-AAATGTGTTCAGAAAACAAATTTA
1 -ATTTGAAATAGATAATT-GTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGT-TT-AGTAAATAGATTTA
* * * ** *
184780 TTTTTTAAATAT-TTGCTTATTAATTTTT-GAAATATTAGTAAATTTA-TATTATTTTATTAGGT
62 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCGA
* * * ** **
184842 GTAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACAAAAGACCATAATGATTAAAAATA
126 ATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* * * * *
184907 GATAATTATT----TAGT-A-AACAGATTT--A-TT-TTT---TAAATCACTTATTGATTTTTGA
191 GATAATTGTTCAAATAGTCATAAC-TATTTGAACTTGTTTCGGTAAA-CA--AATTTATTTTTTA
* * * * ** * ** *
184959 AA-C-GTTAATAAGTTAGTATTATTT--TAT-TTCAAATAAGCCTA-TATCAACTTA-TAC-AAT
252 AATCTCTTACTTA-TTA--ATT-TTTAAAATATT--AATAA-ATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * ** * **** * *
185016 -TG-TTATATG-A-TGAAACAAAAGGTTATAATGATTTGA-AATA-G--ATAATT
310 AAGCTTGTATGAACAGAAA-TAATTGTT-TTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * * *
185063 A-TTCAAATAGTTATTATTATT-TGAACTTGTTCGGTAAATATATT-TA-T-TTT-TTAAAT--C
1 ATTTGAAATAG--A-TA--ATTGTCAAATAG-TC-ATAACTAT-TTGAACTGTTTAGTAAATAGA
* * * * * * *
185120 TTATACTTATT-AAT-T-GT-C--A--AAATATTA-ATA--------AATTA-TATTATTTTAAT
58 TT-TATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * **
185167 CCGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGCCATAACAATTTGA
122 TCGAATAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGA
* * *
185232 AATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGAAC-T-TAT-GGTAAACAAATTTGAAATAAA
187 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTT---AT---
* ***** * * * * ** * * * *
185294 CTTGTATAAATAGAAAAAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTTACTATTTGAACTTATTCAGTA
246 -TT-TTTAAAT-CTCTTACTT-ATTAAT-TTTTAA-AATA--TTA--A--T-AAATTAGT-A-TT
**** * * * * *
185359 AACAAATTT-GAAATAAGCTTGTATAAATAGAACA-AATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTTAT
296 ATTTTATTTCG-AATAAGCTTGTATGAACAGAA-ATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
* *
185422 AGCA
359 AACT
* * * * *
185426 ATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTCAGTAAAAAGATTCATT
1 ATTTGAAATAGATAATT-GTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TGTTTAGTAAATAGATTTATT
* * ** * *
185491 TGTTAAA-C-C-T-CTTATTAATTTTT-GGAATGCTAATAAATTAGAATTATGTTATTAT-GAAT
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT-TCGAAT
* * * * * * * **
185550 AAGCTTGTCTGAACAAAAACAATTATTTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGA
128 AAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* * * * ** * ** *
185615 TAATTGTTCAAAGTAATCATAACTATTTGCAC-TGGTTAGGCCAACAGATACATTTTCTAAATC-
193 TAATTGTTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
** * * * * * * *
185678 CATTACTTGCTAATTTTCAAAATATTAATAAATTA-CATTACTTTATTCCAAATAAAAC-TATAT
257 C-TTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT-AAGCTTGTAT
* * * *
185741 GAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGGTTATAA-T
320 GAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * *
185783 GATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAGTTATAACTAAATTGAACTAGTTTTGTAAACAAATTTA
1 -ATTTGAAATAGATAATTG-TCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACT-GTTTAGTAAATAGATTTA
* * * *
185848 TTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCA-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTATTCCAAA
62 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * * * * *
185908 CAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAG
127 TAAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAG
* * *** * *
185973 ATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGAAC--GGTTCAACAAGCAAAATTATTTTTTAAATCT
192 ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT
* * * * *
186035 CTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAATAAATTTA-TTTTATTTTA-TTCTAAATAAGCTAGTAA
257 CTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTAT
* * *
186098 GAGCTA-AAAT-TTTGTTTTATGACAAAATAAAA-GT--T--C-
320 GAAC-AGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * *
186134 A--T--AAT-GAT--TTG--AAATTA-CCTTAACTATTTGAAGTGGTTTGGTAAATAAATTTATT
1 ATTTGAAATAGATAATTGTCAAA-TAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAGTAAATAGATTTATT
* * * * * * * * * * *
186189 TTTTAAATCTCTTAGTAATTAATTATCA-TAATCTTATTAGATTAATACTATTTTATTCCGAATA
64 TTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATA
* * * * * * * *** ** * * *
186253 AGCTTCTATGAACAAAAATAATTATATTATGACTTGACAAAAGGTTGTAATGGTTAGAAATATAT
129 AGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGAT
* * * * * *
186318 AATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAG-TTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCT
194 AATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCT
* * * * * * *
186382 TACTTATAAATTTTTGAAATATTAAAAAATTATTTTTATTTTATTTCGAATAAACTTAG-ATGAG
259 TACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTT-GTATGAA
* * * * *
186446 CTGAAATAAATATTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAA-T
323 CAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * *
186485 GATTTAAAATAGATAATTCTTCATATGGTCTTAACTATTTGAACTGGTTT-GACAAATAGA-TT-
1 -ATTTGAAATAGATAATT-GTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GTTTAG-TAAATAGATTTA
* * * * * * *
186547 TTTTTAAAATCTTTTAGTTATGAATTTTCA-AAATATTATTAATTTAGTATTATTTTATTTCGAA
62 TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAA
* * * * * * * * * **
186611 TAAACTTATATGAACA-ACAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAATA
127 TAAGCTTGTATAAATAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA
* ** * * *
186675 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAACCGGTTT-GGTAAACAGATTTATTTTTTGAGTC
191 GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC
* * * *
186739 TC--A--TACTAA-TTTTAGAAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCAAATAAGCTTGTAT
256 TCTTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTAT
*** * * * * * *
186799 GTTGAAAAACAATTATTTTATGACATAACAAAAGGT-AAAAAT
320 GAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * * * * *
186841 GATTTGAAATAGATAATTATTCAGATGGCCATAATTATTTGAATTGATATGGTAAATTGATTTAT
1 -ATTTGAAATAGATAATT-GTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAGTAAATAGATTTAT
* * * * *
186906 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCA-AAATATTAATAAAGTAGCATTATTTTATTTTGGAT
63 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAAT
* * * * * * ** *
186970 AAGTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGTTCTTAACAATTTTAAATAGA
128 AAGCTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGA
* *
187035 TAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTCAACTTG-TTCGGTAAACAAATTTATTTTTTTCAAATC
193 TAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTA-TTTTTT-AAATC
* * * *** * * * *
187099 CCTTGCTTATTATTTTTTTGCATGTTAATAGATTA--ATTATTTTTTCTTCAAATAAGCTTGTAT
256 TCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTAT
* * * * * * *
187162 GAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACG
320 GAACAGAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
* * * * * *
187205 ATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACTGATTT-GACAAACACATTTAT
1 ATTTGAAATAGATAATT-GTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTG-TTTAG-TAAATAGATTTAT
187269 TTTTTAAATCTCT
63 TTTTTAAATCTCT
187282 AATTAATT
Statistics
Matches: 8285, Mismatches: 2032, Indels: 1199
0.72 0.18 0.10
Matches are distributed among these distances:
329 78 0.01
330 2 0.00
333 4 0.00
334 5 0.00
335 6 0.00
336 4 0.00
337 2 0.00
338 13 0.00
339 32 0.00
340 8 0.00
341 4 0.00
342 4 0.00
343 111 0.01
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345 93 0.01
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348 16 0.00
349 150 0.02
350 99 0.01
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353 21 0.00
354 134 0.02
355 101 0.01
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370 10 0.00
371 7 0.00
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373 16 0.00
374 4 0.00
375 6 0.00
376 7 0.00
377 90 0.01
378 17 0.00
379 3 0.00
380 10 0.00
381 5 0.00
382 3 0.00
383 5 0.00
384 1 0.00
385 2 0.00
386 5 0.00
387 18 0.00
388 5 0.00
390 7 0.00
391 3 0.00
392 7 0.00
393 11 0.00
394 17 0.00
395 7 0.00
396 4 0.00
397 4 0.00
398 11 0.00
399 18 0.00
400 10 0.00
401 4 0.00
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431 5 0.00
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433 2 0.00
434 2 0.00
435 1 0.00
436 1 0.00
437 1 0.00
439 6 0.00
440 1 0.00
441 13 0.00
442 7 0.00
443 2 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (362 bp):
ATTTGAAATAGATAATTGTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTAGTAAATAGATTTATTTT
TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAG
CTTGTATAAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAA
TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTCGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTA
CTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACAG
AAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACT
Found at i:178447 original size:723 final size:725
Alignment explanation
Indices: 177139--178753 Score: 1617
Period size: 723 Copynumber: 2.2 Consensus size: 725
177129 TTGGTAGATG
* * * * * *
177139 GATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATT-TGCAGAAA-ACTAATAAATTAGTATAATTTTA
1 GATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGT-CA-AAATATTAATAAATTAATATTATTTTA
* *** * * * * * * * * * *
177202 TTTTGAATAAACTTGTAT-AAATAGAAACAATTGTTTT-ATGACAAAAC-AAAAGAACATAACTA
64 GTCCAAACAAACTTATATAAAAAAAAAACAAATGTTTTAATAAGAAAACAAAAAG-TCAGAACGA
* * **
177264 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAGCTTGCTTGGTAAATAGATTTATTT
128 TTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTGATTAATAAATAGATTTATTT
* * * *
177329 TTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAGTTAGTATTATTTTATTTTGAATAAG
193 TTAAAATATTTTACTTATTAATTGTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTGAATAAG
* *
177394 CTTGCATGAACAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAA
258 CTTGCACGAACAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAA
* * * * * *
177459 TTGTCGAAATAGTCAAAACTATTTGAACATGTTTAGAAAATACATTTATTTTAAAATTTTTATTT
323 TTGTCGAAATAGTCAAAACTATTTAAACATGCTGAGAAAATACATTCATTTTAAAATTCTTACTT
* * * * ** *
177524 ATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTACTCAAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA
388 ATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTAAATTATGTAACTCAAAATAAGCTTGTACAAATAAAAA
* * * * *
177589 CAATTGTTTTATGACAAAATAAAATGTCATTACGATTTGAAATAGATAATATTTCATATAGTCAT
453 CAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATATTTCAAACAATCAT
* * ** * ** * *
177654 AACGGTTCGACCTTGTTTGATAAACAAATTCTTTTTTTAAAAATCTCTTATTCATTAATTTTTGG
518 AACGATTCGACCTCGTCAGACAAACAAATTAATTTTTT-AAAATCTCTTATTCATTAACTTTTAG
* * * * *
177719 AATATTAATAAATTAATATTATTTTATTTTGAATAAG-CT-TATTTAAATTGATACAACTGTTTT
582 AATATTAATAAATTAACATTACTTTATTTTGAATAAGACTGTA--TAAATAGAAACAACTATTTT
** * * * * *
177782 AGGATGAAATAAA-AGGTTACAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAACAATTATGACTATTTG
645 AGGACCAAATAAATA-GTCACAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATAATAACTAATTG
* *
177846 AACGTGTTCGGTAAACA
709 AACGTGTTCAGCAAACA
* *
177863 TATTTA-TTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAGT
1 GATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAGT
* * * * * * ** *
177927 CCAAATAAGCTTGTAT-AAACAAAAACAAATG-TTTAATGATAAAA-AAAAAGTCAGATGGGTTT
66 CCAAACAAACTTATATAAAAAAAAAACAAATGTTTTAATAAGAAAACAAAAAGTCAGAACGATTT
*
177989 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTT-ATTCAATAAATAGGTTTAATTTT
131 GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTGATT-AATAAATAGATTT-ATTTT
* *
178053 TAAAAATATTTTACTTATTAATTGTT-GATTATTAATAAATTTGTATAATTTTA-TTTGAAATAA
194 T-AAAATATTTTACTTATTAATTGTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTG-AATAA
* ** * * * * *
178116 GCTTGTACGATTAGAAA-ATTTTGTTTTATGACAAAACAAAATGTTATAGCGATTTGAAATAGAT
257 GCTTGCACGAACAGAAATA-ATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGAT
* * * *
178180 AATTGTTC-AAATAGTCATAAA-TATTTAAAC-TAGCTGGGTAAATAGATTCATTTTTTAAATCT
321 AATTG-TCGAAATAGTCA-AAACTATTTAAACAT-GCTGAGAAAATACATTCA-TTTTAAAAT-T
* * * *
178242 CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGA-TTAGAATTATGTAATTTC-AAATACGCTTGTGC
381 CTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTTA-AATTATGTAA-CTCAAAATAAGCTTGTAC
* * *
178305 AAATAAAAACAATTGTTTTGTGATAAAACAAAATGTTATAACGATTTGAAATAGATAAT-TGTTC
444 AAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAT-TTC
* * * * *
178369 AAACAATCATAACTATTTG-CACTCGTCAGGCCAACAGATTAATTTTTT-AAATC-CGTTACTT-
508 AAACAATCATAACGATTCGAC-CTCGTCAGACAAACAAATTAATTTTTTAAAATCTC-TTA-TTC
*
178430 ATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTTTGAATAAGACTGTATAAATAGAAA
570 ATTAACTTTTAGAATATTAATAAATTAACATTACTTTATTTTGAATAAGACTGTATAAATAGAAA
* * ** ** * * *
178495 CAATTATTTTATGACCAAATAAATAGTCGTAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTAAT
635 CAACTATTTTAGGACCAAATAAATAGTCACAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATAAT
* * **
178560 AACTAATTGAACTTGTTTAGCAAATG
700 AACTAATTGAACGTGTTCAGCAAACA
* * * *
178586 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTATT
1 GATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAGT
* ** * * *
178651 TCAAACAAACTTATATGAAAAAAAAAACATTTGTTTTTATAAGAAAACAAAAGGTCATAACGATT
66 CCAAACAAACTTATAT-AAAAAAAAAACAAATGTTTTAATAAGAAAACAAAAAGTCAGAACGATT
* *
178716 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGA
130 TGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
178754 ACTGGTCGAT
Statistics
Matches: 725, Mismatches: 138, Indels: 52
0.79 0.15 0.06
Matches are distributed among these distances:
721 2 0.00
722 69 0.10
723 332 0.46
724 116 0.16
725 134 0.18
726 14 0.02
727 10 0.01
728 48 0.07
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (725 bp):
GATTTATTTTTAAAATCTCTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAATATTATTTTAGT
CCAAACAAACTTATATAAAAAAAAAACAAATGTTTTAATAAGAAAACAAAAAGTCAGAACGATTT
GAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGACCTTGATTAATAAATAGATTTATTTTTA
AAATATTTTACTTATTAATTGTTGGAATATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTTGAATAAGCTT
GCACGAACAGAAATAATTGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTG
TCGAAATAGTCAAAACTATTTAAACATGCTGAGAAAATACATTCATTTTAAAATTCTTACTTATT
AATTTTTAGAATATTAATAAATTTAAATTATGTAACTCAAAATAAGCTTGTACAAATAAAAACAA
TTGTTTTATGACAAAACAAAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATATTTCAAACAATCATAAC
GATTCGACCTCGTCAGACAAACAAATTAATTTTTTAAAATCTCTTATTCATTAACTTTTAGAATA
TTAATAAATTAACATTACTTTATTTTGAATAAGACTGTATAAATAGAAACAACTATTTTAGGACC
AAATAAATAGTCACAACAATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATAATAACTAATTGAACGTGT
TCAGCAAACA
Found at i:179803 original size:170 final size:170
Alignment explanation
Indices: 179486--179804 Score: 360
Period size: 170 Copynumber: 1.9 Consensus size: 170
179476 CTATTTCGGC
* * * *
179486 AAATAGATTTATGTTTTAAATCTTTTAGTTATTAATTTTTAAAATATTATCAAATTAGTATTAAT
1 AAATAGATTTATGTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATCAAATTAATATTAAT
* * * * * *
179551 TAATTCTAAATAAGCTTGTATGAACTGAGACAAATATTTTATAATAGAATAAAATGTTATAATGA
66 TAATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAAATATTTTATAACAAAACAAAATGTTATAATAA
*
179616 TTTAAAATAGGTAATTATTCCATATAGGACCTGGTTCTGT
131 TTTAAAATAGATAATTATTCCATATAGGACCTGGTTCTGT
* *
179656 AAATTGATTTATTTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTGAAAA-ATTAAT-AAATTAATATTA
1 AAATAGATTTATGTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTT-AAAATATT-ATCAAATTAATATTA
* * * * * * *
179719 TTTTATTCCAACTAGGCTTGTATG-A-TGAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTTAT
64 ATTAATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTG--AAACAAATATTTTATAACAAAACAAAATG-TTAT
* *
179781 AATAATTTGATATAGATAATTATT
126 AATAATTTAAAATAGATAATTATT
179805 GAAATGGCCA
Statistics
Matches: 122, Mismatches: 22, Indels: 10
0.79 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
168 2 0.02
169 2 0.02
170 112 0.92
171 6 0.05
ACGTcount: A:0.41, C:0.07, G:0.10, T:0.43
Consensus pattern (170 bp):
AAATAGATTTATGTTTTAAAACTCTTACTTATTAATTTTTAAAATATTATCAAATTAATATTAAT
TAATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAAATATTTTATAACAAAACAAAATGTTATAATAA
TTTAAAATAGATAATTATTCCATATAGGACCTGGTTCTGT
Found at i:183015 original size:540 final size:536
Alignment explanation
Indices: 182010--187248 Score: 2245
Period size: 540 Copynumber: 9.8 Consensus size: 536
182000 CAATTGGATA
* * * * * *
182010 ATGACAAAACAGAAGGTCATAACTATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* * * * * * *
182075 ACATGTTCAGAAAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAA
65 ACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-AAATATTAATAAA
* * * *
182139 TTTATATTGTTTT-ATTTAGAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTACGACAAAAACAA
129 TTTATATTATTTTAATTCA-AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGAC-AAAACAA
* * *
182203 AAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTTGTTCGATA
192 AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTGAACTTGTTTGATA
* * * *
182268 AATAGATTCATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGTATTGTTT
255 AACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGTATTATTT
* * ** * *
182333 TATTTTGAATAAGC-CTATATAAACT-GATACAATTGTTTTATGATGAAACAAAGGTCATAATGA
320 TATTTTGAATAAGCTC-ATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTTATAACGA
* * * * ** * ** * *
182396 TTTGAAATAAATAATTATTCAGATAGTTATGCCTATTTGAACTTGCTTGAAACATATTTATTTTT
383 TTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTAGCAGGAAACAAATTCATTTTT
** ** * * * *
182461 AAAATTTTTTACTTATTTCTTGTCAAAATATTAATAGATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCT
448 AAAATTCGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTAATCCAAATAAGAT
*
182526 TATATGAATAAAAATAATTGTTTT
513 TATATCAATAAAAATAATTGTTTT
*
182550 ATGACAAAACAAAAAGTCATAAAGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAAA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* *
182615 ACTTATTCAGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAATAAA
65 ACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATT-TCTAAATATTAATAAA
* * * *
182680 TTTGTATTATTTTAATTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAA-AATAATTTTATGACAAAACAAA
129 TTTATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAACAATTATTTTATGACAAAACAAA
* * * *
182744 AGGTTATAGTAATTTGAAATAGGTAATTGTTCAAATAGTCAACTATTTCAACTTGTTTGATAAAC
193 AGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAACTATTTGAACTTGTTTGATAAAC
* * * ** * * *
182809 CGATTCAGTTTTTAAATCTTTTATTTATTAGCTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATTTTAT
258 AGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGTATTATTTTAT
* * * * * *
182874 TCTGAATAAGCTCATACGAATAGAAACACTTTTTTTGTGACAAAACAATTGGTTATAACGATTTG
323 TTTGAATAAGCTCATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA-AGGTTATAACGATTTG
* * *
182939 AAATAAATAATT-TTCAAACAATGATAATTATTTGCACTAGTCAGGCCAACAAATTCATTTTCT-
387 AAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTAG-CAGG-AAACAAATTCATTTT-TA
* * * * * **
183002 AAATTCGTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTTATTCTGAATAAGATT
449 AAATTCGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTAATCCAAATAAGATT
* *
183067 GTATCAATAGAAATAATTGTTTT
514 ATATCAATAAAAATAATTGTTTT
* * * *
183090 ATGACAAAACAAATGGCCATAACAATTTAAAATAAATAATTGTTCAAATTGTTATAACTAATTGA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* ** * * *
183155 ACTGGTTTGGTAAACAAATTTATTTTTTATATCTTTTA-TTA--ATTTTCAAAATATTAATAAAT
65 ACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCTAAATATTAATAAAT
* * * * * * * *
183217 TAAAATTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTATTTTATGATAAAACAAAAG
130 TTATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * *
183282 GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGCCTCAACTATTTGAAC-TGGTTAAGCAAA
195 GTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAG--TCAACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAA
* * * * *
183346 CAAATTTATTTTTTAAAT-TTCTTAGTTATTAATTTTTATAATATTATTAGATTAGTATTATTTT
257 CAGATTCATTTTTTAAATCTT-TTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGTATTATTTT
** * * * * *
183410 ATTTTGAATAAGCTTGTATGAACATAAATAATTGTTTTATAACAAAACAAAAGGTTATAACAATT
321 ATTTTGAATAAGCTCATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAACGATT
* * * * * *
183475 TGAAATATATAATTATTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC-AGGTTCCGTAAAC-AA---A----
385 TGAAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTA-G--CAGGAAACAAATTCATTTT
* ** ** * ** ** *
183531 T--AATCTC-TTA-TTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTGTTCTGAATAGG
447 TAAAAT-TCGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTAATCCAAATAAG
* * * *
183592 CTTGTAT-GATGAAAAACAATTGTTTT
511 ATTATATCAAT-AAAAATAATTGTTTT
* * * * ** *
183618 ATGGCAAAAC-AAAGTTCATAAAGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCATAACTATTTGA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAAA-ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* ** *** * * * *
183682 ACTAAT-TTGA-TAAA-TGATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTCTCGACTTT-TGAAATTTTAAT
65 ACT--TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTAT-TAATTTCT-AAATATTAAT
* * *** * * ** * * *
183743 AAAGTAATATTA-TTTAATTTTGGATAAGCTTTTGTGAACTGAAACAATTGTTTTAAGATAAAAC
126 AAATTTATATTATTTTAA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * ** *
183807 AAAAGGTCATAACAATTTTAAGTAAATAATCATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTCT-
190 AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTGAACTTGTT-TG
* * * * * * **
183871 ATAAATC-GATTTATTTTCTTAAAT-TCATTGCATATTAATTTTTTGAATGTTAATA-AAAATGT
252 ATAAA-CAGATTCATTTT-TTAAATCT-TTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTA-GT
* * * * *
183933 ATTATTTTATTTCGAATAAGCAT-GTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAA-ATA
313 ATTATTTTATTTTGAATAAGC-TCATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGT-
* * * * * * * ** * **
183995 TCAAAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTCTTAACTATTTAAAC-AGGTTTGGCAAAC
375 T-ATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTA-G-CAGG-AAAC
* * * * * * * * ** * * * *
184059 ACATTTATTTTTTAAA-TC--T-CTTATTAATTTTTAGAATTTTATTAGTTTAGCAAT-GTTTAC
436 AAATTCATTTTTAAAATTCGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTAA
* * * *
184119 TCCAAATAAGTTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTT
501 TCCAAATAAGATTATATCAATAAAAATAATTGTTTT
* * * ** * ** * * * *
184155 ATGAGAAAAC-AAAGATTATTCCAATTTGAGATAGTTAATTGTTCAAATAATCATGACT-ATTTA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCA-TAAAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* * * * ** * * * *
184218 AGTCAGTCCGGTAAGTAGATTTAATTTTTAAATC---T-CTCATTAATTTTTTAAATATTAATAA
65 ACT-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCTAAATATTAATAA
** * * * *
184279 A-TTAGTATTATTTT-ATTCTAAATAATTTTATATGAATAAAAACAATTATTTTACGAGAAAACA
128 ATTTA-TATTATTTTAATTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA
* * ** * * * * * * * *
184342 AAATGACATAACGATTTAAAAT-GAATAATAGCTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTGCTCGG
191 AAAGGTCATAATAATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCA--ACTATTTGAACTTGTTTGA
* * * *
184406 TAAATAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTAATTAATTTTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTA
253 TAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAG-AATATTAATAGATTAGTATTA
* ** ** * *
184470 TTTTATTTTGAATAAACTTGTGCGAATAGAAACAATT-TTTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC
317 TTTTATTTTGAATAAGCTCATATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAAC
* * * * * * * * * * * *
184534 AATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTGAATTCGCTCGGTAAATAGATTTAT
381 GATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTAGC-AGG-AAACAAATTCA-
* ** * * *** * ***
184599 TTTTTAAAAATT--TTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAGATTAGTGTTA-TTGTATTTTGA
443 TTTTT-AAAATTCGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTT-TAATCCAA
* * * * * **
184661 ATAAGCTTTTTATGAATAGAAACAATTAATTT
506 ATAAG-ATTATATCAATAAAAATAATTGTTTT
* * * * * * *
184693 ATGACAAAACAAATGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTGATAACT-ATTTA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* * * * * *
184757 AATGTGTTCAGAAAACAAATTTATTTTTTAAAT-ATTTGCTTATTAATTTTTGAAATATTAGTAA
65 ACT-TGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-AAATATTAATAA
** * * * *
184821 ATTTATATTATTTT-ATT-AGGTGTAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGTCAAAACA
128 ATTTATATTATTTTAATTCA--AATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACA
** * *
184884 AAA-G--ACCATAA--TG--AT---TAA------AAATAG---A-TAATT--A--T-TTAG-TAA
191 AAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAACTATTTGAACTTGTTTGATAA
* *
184923 ACAGATTTATTTTTTAAATC----ACTTATTGATTTTT-GAA-ACGTTAATA-AGTTAGTATTAT
256 ACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATA--TTAATAGA-TTAGTATTAT
** * * * * **
184981 TTTATTTCAAATAAGC-CTATATCAACT-TATACAATTGTTATATGATGAAACAAAAGGTTATAA
318 TTTATTTTGAATAAGCTC-ATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAA
* * * * * * * * * * *
185044 TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTATTATTATTTGAACTTGTTC-GGTAAATATATTT
380 CGATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTAG--CAGG-AAACAAATTC
* * * * *
185108 ATTTTTTAAA-TCTTATACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTAATCCGA
442 ATTTTTAAAATTCGT-TACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTAATCCAA
* * * * *
185171 ATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTT
506 ATAAGATTATATCAATAAAAATAATTGTTTT
* * * * *
185202 ATGACAAAACAAAAAGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCACAACTATTTGA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* * *** *** **
185267 ACTT-AT-GGTAAACAAATTTGAAATAAACTTGTATAAATAGAAAAAATTGGTTTATGATAA-AA
65 ACTTGTTCAGTAAACAAATTT---AT----TT-T-T---T--AAATCTTTTACTTAT--TAATTT
* * * * * * **** * *
185329 CAAAAGGTTACTATTTGAACTTATTCAGTAAACAAATTTGAAATAAGCTTGTAT-AA-ATAGAAC
114 CTAAA---TATTA-ATAAATTTA-T-ATTATTTTAA-TTCAAATAAGCTTGTATGAACA-AAAAC
** * * ** *
185392 AAATTGGTTTATGATAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCAT
171 -AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--
* * * * * *
185457 AACTATTTAAACTTG-TTCAGTAAAAAGATTCATTTGTTAAA-C--CT-CTTATTAATTTTTGGA
233 AACTATTTGAACTTGTTTGA-TAAACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGA
** * * * * ** * * * * *
185517 ATGCTAATAAATTAGAATTATGTTATTATGAATAAGCTTGTCTGAACAAAAACAATTATTTTGTG
297 ATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTCATATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * * *
185582 ACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGTAATCATAACTATTTGCAC
362 ACAAAA-CAAAGGTTATAACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAA-CAATGATAACTATTTGAAC
* * * * * * * ** *
185647 TGGTTAGGCCAACAGATACATTTTCT-AAATCCATTACTTGCTAATTTTCAAAATATTAATAAAT
425 TAG-CAGG-AAACAAATTCATTTT-TAAAATTCGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAAT
* * * * * *
185711 T-ACATTACTTTATTCCAAATAAAACTATATGAACAAAAACAATTGTTTT
487 TAACATTACTTTAATCCAAATAAGATTATATCAATAAAAATAATTGTTTT
* * * *
185760 ATGACAAAACAAAGGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAGTTATAACTAAATTG
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACT-AATTG
* ** *
185825 AACTAGTTTTGTAAACAAATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
64 AACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCTAAATATTAATAA
* * * * * *
185886 ATTAATATTATTTT-ATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGTTTTATGACAAAACAA
128 ATTTATATTATTTTAATT-CAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* ** * * ** *
185950 AAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATTTGAAC-GGTTCAACA
192 AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTGAACTTGTTTGATA
* * * * *
186013 AGCAAAATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTA-AATATTAATAAATTTA-TTTTA
255 AAC-AGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTTTAGAATATTAATAGA-TTAGTATTA
* * * * ** * *
186075 TTTTATTCTAAATAAGCT-AGTAAGAGCTA-AAA-TTTTGTTTTATGACAAAATAAAAGTTCATA
317 TTTTATTTTGAATAAGCTCA-TATGA-ATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGGTT-ATA
* * * ** * *
186137 ATGATTTG------A-AATTA--C---C--T--TAACTATTTGAAGTGGTTTGGTAAATAAATTT
379 ACGATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTAG-CAGG-AAACAAATTC
* * * * * * * * * * * * *
186186 ATTTTTTAAATCTC-TTAGTAATTAATTATCATAATCTTATTAGATTAATACTATTTTATTCCGA
442 ATTTTTAAAAT-TCGTTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTAATCCAA
* * * * * *
186250 ATAAGCTTCTATGAACAAAAATAATTATATT
506 ATAAGATTATATCAATAAAAATAATTGTTTT
*** ** ** * * * *
186281 ATGACTTGACAAAAGGTTGTAATGGTTAGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGA
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAA-AATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGA
* * * * * *
186346 ACTAGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAA-AAA
65 ACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTCT-AAATATTAATAAA
* * * * * * ** * * * *
186410 ATTATTTTTATTTTATTTCGAATAAACTTAG-ATGAGCTGAAATAAATATTTTATAATAAAACAA
129 TTTA-TATTATTTTAATTCAAATAAGCTT-GTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAA
* * * * * * *
186474 AAGGTCATAATGATTTAAAATAGATAATTCTTCATATGGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACA
192 AAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTGAACTTGTTTGATA
* * * * * * *
186539 AATAGATT--TTTTTAAAATCTTTTAGTTATGAATTTTCAAAATATTATTA-ATTTAGTATTATT
255 AACAGATTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGA-TTAGTATTATT
* * * * * * * * *
186601 TTATTTCGAATAAACTTATATGAACA-ACAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATAACA
319 TTATTTTGAATAAGCTCATATGAATAGA-AACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTATAACG
* * * * * * ** ** * *
186665 ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAACCGGTTTGGTAAACAGATTTATT
382 ATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTAG-CAGG-AAACAAATTCATT
** * * * * * ** * * *
186730 TTT-TGAGTC--T-CATACTAATT-TTAGAAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCAAATA
445 TTTAAAATTCGTTACTTATTAATTGTCA-AAATATTAATAAATTAACATTACTTTAATCCAAATA
* * ** * *
186790 AGCTTGTAT-GTTGAAAAACAATTATTTT
509 AGATTATATCAAT-AAAAATAATTGTTTT
* * * * * * ** * *
186818 ATGACATAACAAAAGGT-AAAAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAGATGGCCATAATTATTTG
1 ATGACAAAACAAAAGGTCATAAA--ATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTG
* *** * *
186882 AA-TTGATAT-GGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
64 AACTTG-T-TCAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAA-TTTCTAAATATTAAT
* * * *** * * *** *
186945 AAA-GTAGCATTATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC
126 AAATTTA-TATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAAC
* * * * * * * *
187009 AAAAGTTCTTAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTCAACTTGTTCGG
190 AAAAGGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC--AACTATTTGAACTTGTTTGA
* * ** * * * * *
187074 TAAACAAATTTATTTTTTTCAAATCCCTTGCTTATTATTTTTTTGCATGTTAATAGATTA--ATT
253 TAAACAGATTCA-TTTTTT-AAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGTATT
* ** * *
187137 ATTTT-TTCTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTA
316 ATTTTATT-TT-GAATAAGCTCATATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGGTTA
* * * * * **
187200 GAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAACT
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Consensus pattern (536 bp):
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TATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGG
TCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAACTATTTGAACTTGTTTGATAAACAGA
TTCATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATATTAATAGATTAGTATTATTTTATTTT
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AAATAATTATTCAAACAATGATAACTATTTGAACTAGCAGGAAACAAATTCATTTTTAAAATTCG
TTACTTATTAATTGTCAAAATATTAATAAATTAACATTACTTTAATCCAAATAAGATTATATCAA
TAAAAATAATTGTTTT
Found at i:185396 original size:82 final size:80
Alignment explanation
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*
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* *
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1 ACTATTTGAACTTA-T-AGTAAACAAATTTGAAATAAACTTGTATAAATAGAAAAAATTGGTTTA
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185420 A
1 A
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Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (80 bp):
ACTATTTGAACTTATAGTAAACAAATTTGAAATAAACTTGTATAAATAGAAAAAATTGGTTTATG
ATAAAACAAAAGGTT
Found at i:186114 original size:178 final size:178
Alignment explanation
Indices: 185399--186148 Score: 607
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185389 AACAAATTGG
* * * * * *
185399 TTTATGATAAAACAAAAGGTTATAGCAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
* * ** * *** **
185464 TAAACTTGTTCAGTAA-AAAGATTCATTTGTTAAA-C-C-T-CTTATTAATTTTTGGAATGCTAA
66 TGAACTGGTT-AACAACAAA-ATT-ATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAA
* * *** * * * * *
185524 TAAA-TTAGAATTATGTTATTATGAATAAGCTTGTCTGAACAAAAACAATTAT
128 TAAATTTA-TATTATTTTATTCCAAATAAAC-TATATGAACAAAAACATTTGT
* * * * *
185576 TTTGTGACAAAATAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAGTAATCATAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAA-TAGTCATAATTAT
* * * * * **
185641 TTGCACTGGTTAGGCCAAC-AGATACATTTTCTAAATC-CATTACTTGCTAATTTTCAAAATATT
65 TTGAACTGGTTA--ACAACAAAAT-TATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTCAAAATATT
* * *
185704 AATAAA-TTACATTACTTTATTCCAAATAAAACTATATGAACAAAAACAATTGT
126 AATAAATTTATATTATTTTATTCCAAAT-AAACTATATGAACAAAAACATTTGT
* * * * * * * *
185757 TTTATGACAAAACAAAGGGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAGATAGTTATAACTAAA
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA-TTAT
* * *
185822 TTGAACTAGTTTTGTA-AACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTA
65 TTGAACT-G-GTT-AACAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTA
* *
185882 ATAAATTAATATTATTTTATTCCAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTGT
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*
185935 TTTATGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-GTCATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
**
185999 TGAAC-GGTTCAACAAGCAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTAAATATTAAT
66 TGAACTGGTT-AACAA-CAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAAT
* * * * * * *
186063 AAATTTATTTTATTTTATTCTAAATAAGCTAGTAAGAGCTAAAA-TTTTGT
129 AAATTTATATTATTTTATTCCAAATAAACTA-TATGAACAAAAACATTTGT
* * *
186113 TTTATGACAAAATAAAAGTTCATAATGATTTGAAAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
186149 TACCTTAACT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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174 3 0.01
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TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATT
TGAACTGGTTAACAACAAAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAA
ATTTATATTATTTTATTCCAAATAAACTATATGAACAAAAACATTTGT
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Alignment explanation
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Period size: 358 Copynumber: 2.4 Consensus size: 357
186227 AGATTAATAC
* * * * * * *** *
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1 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
*** * * * * * *
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66 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTT
* * * * * *
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* * * *
186432 TAAACTTAGATGAGCTGAAATAAATATTTTATAATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAG
194 TAAACTTAGAT-AGCTGAAAAAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTAAAAATGATTTAAAATAG
* * * * * * *
186497 ATAATTCTTCATATGGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAGATTTTTTTAAAATCTTTT
258 ATAATTATTCAGATGGCCATAACTATTTGAACTGATATGACAAATAGATTTTTTTAAAATCTCTT
* * ** *
186562 AGTTATGAATTTTCAAAATATTATTAATTTAGTAT
323 ACTTATGAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
* * *
186597 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATA
1 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
* ** *
186662 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAACCGGTTTGGTAAACAGATTT
66 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTT
* * * *
186727 ATTTTTTGAGTCTCATAC-T-AATTTTAGAAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTCAAATA
131 ATTTTTTAAATCTCATACTTAAATTTTAGAAATATTAAAAAATTAGTATTAATTTATTTCAAATA
* * * * *
186790 AGCTT-G-TATGTTGAAAAACAATTATTTTATGACATAACAAAAGGTAAAAATGATTTGAAATAG
196 AACTTAGATA-GCTGAAAAA-AA-TATTTTATAACAAAACAAAAGGTAAAAATGATTTAAAATAG
* * ** * *
186853 ATAATTATTCAGATGGCCATAATTATTTGAATTGATATGGTAAATTGATTTATTTTTTAAATCTC
258 ATAATTATTCAGATGGCCATAACTATTTGAACTGATATGACAAATAGA-TT-TTTTTAAAATCTC
*
186918 TTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
321 TTACTTATGAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
* * ** * ** * *
186955 TATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCT
1 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAA-CAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-A
* * * * *
187018 TAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTCAACTTGTTCGGTAAACAAAT
64 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGAT
187083 TTATTTTTT
129 TTATTTTTT
187092 TCAAATCCCT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (357 bp):
TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTCGGTAAACAGATTT
ATTTTTTAAATCTCATACTTAAATTTTAGAAATATTAAAAAATTAGTATTAATTTATTTCAAATA
AACTTAGATAGCTGAAAAAAATATTTTATAACAAAACAAAAGGTAAAAATGATTTAAAATAGATA
ATTATTCAGATGGCCATAACTATTTGAACTGATATGACAAATAGATTTTTTTAAAATCTCTTACT
TATGAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
Found at i:187136 original size:358 final size:356
Alignment explanation
Indices: 186237--187259 Score: 804
Period size: 358 Copynumber: 2.8 Consensus size: 356
186227 AGATTAATAC
* * * * * * *** *
186237 TATTTTATTCCGAATAAGCTTCTATGAACAAAAATAATTATATTATGACTTGACAAAAGGTTGTA
1 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
*** * * * ** * * ** * * *
186302 ATGGTTAGAAATATATAATTGTTCAAATAGTTATAATTATTTGAACTAGTTCAGTAAATAGATTT
66 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATATCAACCGGTTCGGTAAACAAATTT
* * * * *
186367 ATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTTGAAATATTAAAAAATTA-T-TT-TTATTTTAT-TT
131 ATTTTTTAAATCCCATAC---T-AA-TTTT--AATTTTAATAAATTAGTATTAATATTTTATCTT
* * * * * * * *
186428 CGAATAAACTTAG-ATGAGCTGAAATAAATATTTTAT-AATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTA
189 CAAATAAGCTT-GTATGA-CTGAAACAATTATTTTATGACT-AAACAAAAGGTAAAAATGATTTG
* * * * * *
186491 AAATAGATAATTCTTCATATGGTCTTAACTATTTGAACTGGTTTGACAAATAGATTTTTTTAAAA
251 AAATAGATAATTATTCAGATGGCCATAACTATTTGAACTGATATGACAAATAGATTTTTTTAAAA
* * * ** *
186556 TCTTTTAGTTATGAATTTTCAAAATATTATTAATTTAGTAT
316 TCTCTTACTTATGAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
* * *
186597 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAATAATTATTTTATGATAGAACAAAAGGTTATA
1 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
* * * *
186662 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATATGAACCGGTTTGGTAAACAGATTT
66 ACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATATCAACCGGTTCGGTAAACAAATTT
* * *
186727 ATTTTTTGAGTCTCATACTAATTTTAGAAATTTTAATAAATTAGTATT-A-A-TTTAT-TTCAAA
131 ATTTTTTAAATCCCATACTAATTTT---AATTTTAATAAATTAGTATTAATATTTTATCTTCAAA
*
186788 TAAGCTTGTATG-TTGAAAAACAATTATTTTATGAC-ATAACAAAAGGTAAAAATGATTTGAAAT
193 TAAGCTTGTATGACTG--AAACAATTATTTTATGACTA-AACAAAAGGTAAAAATGATTTGAAAT
* * ** * *
186851 AGATAATTATTCAGATGGCCATAATTATTTGAATTGATATGGTAAATTGATTTATTTTTTAAATC
255 AGATAATTATTCAGATGGCCATAACTATTTGAACTGATATGACAAATAGA-TT-TTTTTAAAATC
*
186916 TCTTACTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
318 TCTTACTTATGAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
* * ** * ** * *
186955 TATTTTATTTTGGATAAGTTTTTATGAATTGA-AACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-GTTCT
1 TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAA-CAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTT-A
* * **
187018 TAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATTTCAACTTGTTCGGTAAACAAAT
64 TAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACAATATCAACCGGTTCGGTAAACAAAT
* * * * * * *
187083 TTATTTTTTTCAAATCCCTTGCTTATTATT-TTTTTGCATGTTAA-TAG-ATTAATTATTTTTTC
129 TTA-TTTTTT-AAATCCCATACTAATT-TTAATTTT--A-ATAAATTAGTATTAA-TATTTTATC
* * *
187145 TTCAAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTTAGAACGATTTG
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* * * *
187210 AAATAGATAATTATTCTA-ATAGTCTTAACTATTTGAACTGATTTGACAAA
251 AAATAGATAATTATTC-AGATGGCCATAACTATTTGAACTGATATGACAAA
187260 CACATTTATT
Statistics
Matches: 537, Mismatches: 99, Indels: 51
0.78 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
354 2 0.00
355 6 0.01
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Consensus pattern (356 bp):
TATTTTATTTCGAATAAACTTATATGAACAACAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATA
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GCTTGTATGACTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTAAAAATGATTTGAAATAGATAA
TTATTCAGATGGCCATAACTATTTGAACTGATATGACAAATAGATTTTTTTAAAATCTCTTACTT
ATGAATTTTCAAAATATTAATAAAGTAGCAT
Done.