Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Sequence: NW_019168270.1 Durio zibethinus cultivar Musang King isolate D1 unplaced genomic scaffold, Duzib1.0 scaffold_5, whole genome shotgun sequence
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
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tuple sizes 0,4,5,7
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ACGTcount: A:0.35, C:0.15, G:0.15, T:0.35
Warning! 124000 characters in sequence are not A, C, G, or T
File 109 of 147
Found at i:19702563 original size:76 final size:76
Alignment explanation
Indices: 19702476--19702629 Score: 308
Period size: 76 Copynumber: 2.0 Consensus size: 76
19702466 ATAATTTTCT
19702476 TATGACAAAACAAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAAATATTTATTCAAAAAGTCATGACTATTTG
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1 TATGACAAAACAAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAAATATTTATTCAAAAAGTCATGACTATTTG
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66 ATCTAGATCGA
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1 TA
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TATGACAAAACAAAAAGGTCAAATGATTTGAAATAAATATTTATTCAAAAAGTCATGACTATTTG
ATCTAGATCGA
Found at i:19703661 original size:141 final size:145
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19703470 TTGAAATGGC
* *
19703480 CATAATTATTTAAACTGATTTGGTAAACAAATTCA-CTTTTTAAA-TC-ACTTATTAATTTTTGA
1 CATAACTATTTAAACTGATTTGGTAAAAAAATTCATCTTTTTAAACTCTACTTATTAATTTTTGA
* * * *
19703542 AATATTAATAAATTAGTATCATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAGACAATTGTTTTGT
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131 AACAAAACAAAAGGT
* * * *
19703621 CATAACTATTTGAAA-TTATTTGGTAAAAAAATTTATTTTTTTTAAACTCTTGCTTATTAATTTT
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* *** *
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63 TGAAATATTAAAAAATTAGTATCAATTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTT
**
19703750 TATGTCAAAACAAAAGGT
128 TATAACAAAACAAAAGGT
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1 CATAA
19703773 TGATTTTCAA
Statistics
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141 27 0.21
142 3 0.02
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CATAACTATTTAAACTGATTTGGTAAAAAAATTCATCTTTTTAAACTCTACTTATTAATTTTTGA
AATATTAAAAAATTAGTATCAATTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTGTTTTAT
AACAAAACAAAAGGT
Found at i:19704280 original size:21 final size:20
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Indices: 19704251--19704289 Score: 53
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19704241 TTTTGATTAA
19704251 GTTTGTATGATCATAAACAATT
1 GTTTGTATGA-CA-AAACAATT
19704273 GTTT-TATGACAAAACAA
1 GTTTGTATGACAAAACAA
19704290 AAGGTCATAA
Statistics
Matches: 17, Mismatches: 0, Indels: 3
0.85 0.00 0.15
Matches are distributed among these distances:
19 6 0.35
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22 4 0.24
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Consensus pattern (20 bp):
GTTTGTATGACAAAACAATT
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Indices: 19703619--19705337 Score: 1198
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19703609 CAAAACAAAG
* * * * *
19703619 GTCATAACTATTTGAAATTATTTGGTAAAAAAATTTATTTTTTTTAAA-CTCTTGCTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAAATTTA--TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-T
* * *** * *
19703683 TTTGAAATATTAAAAAATTAGTATTAATTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGT
63 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTGT
* * ** * * *
19703748 TTTATGTCAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTCAATAAATAACTATTCAATTA
127 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * *
19703801 GTCATAACTGTTTGAACTTG-TTCGGTAAGTAGATTTATTTTTTCAAATCTTTTGCTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-T
** * * * * * * * * ** * *
19703865 TTTTCAATGTTAATAAATTTGAATTATTTTAATCCGAATAAGCTTGTAAGATATGAAACAAATAT
63 TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGA-ACAAAACAATTGT
* * * *
19703930 TTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATATATAATTATT-ATAATA
127 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCA-AATA
** * * * * *
19703983 GTTTTAACTATTTGAACTGGTTTGGTAAAGACATTTATATTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* ** * * * * *
19704048 ----CA-TAAT--A-T--TA-TA-TTTAGCT-GAATAACCTTCTATGATCAAAGACAATTATTTT
66 GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAAA-ACAATTGTTTT
* * * * *
19704100 ATGACAAAA-TAAA-GATATTAATGATTTGAGATTGATAATTGTTCAAATA
130 ATGACAAAACAAAAGGTTA-TAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * *
19704149 GTCATAAC--TTTGAACTGGTTCGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTATTACTTATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * ** * ** *
19704212 TCAAATATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGATTAAGTTTGTATGATCATAAACAATTGTTT
65 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACA-AAACAATTGTTT
* * *
19704277 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATCATTCAAATG
129 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * *
19704328 GTCATAATTATTTTAACTGATTCGGTAAATAAATTTACTTTTTAAATTTCTTACTTATT-ATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * * *
19704392 AGGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCAATCTAAGCTTATATTAACTGAAACAATTAT
66 --GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAA-ATAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTGT
* * * * * * *
19704456 TTTGTGACAAATCAAAAGGTTATAATGATTTTAAATAAACAGTTGTTCAAATA
127 TTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * *
19704509 GTAATAACTATTTGAACTTG-TTCAGTAAACAAATTTATTTTTTTAAATCTCTTTCTTATTAATT
1 GTCATAACTATTTGAAC-TGATTCGGTAAATAAATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA--
* * * *
19704573 TTTTG-AATGTTAATAAATTAGTATTAATTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAGCTAAAACAATT
62 TTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAACTTGTATGAAC-AAAACAATT
** * ** * *
19704636 GTTTTATGATTAAACAAAAGGTTAGAACAATTTCAAATAGATAATTGTTTTTGAAATTGTTCTAA
125 GTTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAA------TT---A---TTCAAA
19704701 TA
178 TA
* * * * * *
19704703 GTCTTAACTATTTGAATTGTTTAGGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTTATTAATTTC
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT-
** * * * * ** *
19704768 CAAAATATTATTAAATCATTATTATTTTA-ATCAGAATAAACTTGTACAAACAAAACAATTCTTT
65 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAACTTGTATGAACAAAACAATTGTTT
* * * * * * * * *
19704832 TACGATAAAAGAAAAGGTCATAACGATTTGAAATGGAAAATCATTCATATA
129 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * ** * * * * **
19704883 GTCATAACTATTTGAACCGGTTCGACAATTAGATTTATTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTT
* * * *
19704948 TGAAATATTATTAAATTAG---TATTTTATTGCAAATAAAATAGTATGAACAAAACCAATTGTTT
65 TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAAAA-CAATTGTTT
* * * ** * *
19705010 GATGAGAAAATAAAAGGTTATAACAATTTGAAATCGAAAATTATTCAAATA
129 TATGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * * * * * * * *
19705061 GTTAAAACTATTGGAAATGTTTTGGTAAACAAATTCACTTTTTAAATCTCTTACTGATTAATTTT
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT
* * * * *
19705126 CTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAACAAAATTATATTAACAAAAACAATTGTTT
66 -GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAAC-AAAACAATTGTTT
* *
19705191 TAATGATAAAA-AGAAA-GTAATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
129 T-ATGACAAAACA-AAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
* * * ** * *
19705242 GTTATAATTATTTGAACTAATTTAGTAAATAGAA-TTATTTTCTAAATCTCTTACTTATAAAATT
1 GTCATAACTATTTGAACTGATTCGGTAAATA-AATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT-TAATT
* *
19705306 TTGAAATATTAATAAATTAGTTTTATTCTATT
64 TTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
19705338 CCTAATTTGT
Statistics
Matches: 1209, Mismatches: 262, Indels: 133
0.75 0.16 0.08
Matches are distributed among these distances:
164 45 0.04
165 6 0.00
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167 32 0.03
168 4 0.00
169 3 0.00
170 5 0.00
172 2 0.00
173 2 0.00
175 5 0.00
176 2 0.00
177 33 0.03
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179 42 0.03
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183 7 0.01
185 4 0.00
186 1 0.00
188 2 0.00
191 3 0.00
192 44 0.04
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GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTGTATGAACAAAACAATTGTTTTA
TGACAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATA
Found at i:19705242 original size:16 final size:17
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19705211 TAATGATTTG
19705221 AAATAG-ATAATTATTC
1 AAATAGTATAATTATTC
19705237 AAATAGTTATAATTATT
1 AAATAG-TATAATTATT
19705254 TGAACTAATT
Statistics
Matches: 15, Mismatches: 0, Indels: 2
0.88 0.00 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.40
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Consensus pattern (17 bp):
AAATAGTATAATTATTC
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19705436 TGAAATAAAT
* * *
19705446 AAATGTTAATAAATTTGTAATATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA
* * * ** * * * *
19705511 TGACTAAGCAAAAGGTCAAAACAATTTAAAATAAATAATTATTCTAATAGTCTTAAGTATTTGAA
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* * *
19705576 CTGGTTCGGCAAACACATTTATTTTGTAAATCTCTTATTAATTTTTA
130 CTGGTTTGGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
* * * * *
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* * * * * * *
19705686 TATGAGAAAAC-AATGATCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAGTTATAACTATTTG
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* * * *
19705750 AACTGGTTTAGAAAACAATTTTAGTGTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
128 AACTGGTTTGGCAAACAA-TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
* ** * * ** * * * *
19705799 AAACATTAGCAAAGTAGTATTATTTTATTTCGGATAAATTTTTATGAACTGAAACAACTATTCTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA
* * * *
19705864 TGA-TAGAAGAAAAGGTCATAATAACTTTAAATAGTCAGATCGATTATTCAAATAG--T--CTAT
66 TGAGTA-AACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAA-A-T-AGAT-AATTATTCAAATAGTTTAACTAT
* * * *
19705924 TTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTTTCAAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTC-
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* * * *
19705982 AAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTTGTATGAACTAAAGCAATTATTATA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA
* * * * *
19706047 TGATTAAACAAAAGCTCAAAATGATTGGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA
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* * * * * * *
19706159 AAATATTATTAAATTAGTATTATTTT-TATTCAAATAAGCTTGGAAG-ATTAGAAATAATTATTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT-TTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTA
* * * * * * * *
19706222 TATGAGAAAAC-AAAGGTCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAATAATAACAATTTG
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* ** *
19706286 AATTGGTTCAG-AGAACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
128 AACTGGTTTGGCA-AACAA-TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
* * * * * *** * * *
19706335 AAATATTAAAAAAGTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGTTTTTATAAACCGCAACAACTGTTCTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA
* * * * * * **
19706400 TGA-CAGAAGAAAAAGTCATAACGACTTTAAATAGTCAGATCAATTGTTCAAATAGTCAAATCTA
66 TGAGTA-AACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAA-A-T-AGAT-AATTATTCAAATAGTTTAA-CTA
* * * * * * **
19706464 TTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT-GCTAATAAATTAACA
124 TTTGAACTGGTTTGGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
** * * * * * * * * ** * *
19706516 TTATTTTATTCTAAATAAG-CTTGTATGAATTAAAATAATTG-TTTTATG-ACT-AAACAA-AAG
1 AAATATTA--ATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAA--GCTTGTATGAACTAAAACAATTA-
* ** ** * * * * **
19706576 TT-CA-GAACAATTTAAAA--TAGATAATTG-TTCT--AATAG-T-CTTA-TGAACTAGTTCGAC
61 TTATATGAGTAA-ACAAAAGGT-CATAA-TGATT-TGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTAAC
* * * * * **
19706631 -A----AACAT-ATTT-----A---TTTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
122 TATTTGAAC-TGGTTTGGCAAACAATTTATTTTTTAA--ATCT-CTTATTAATTTTCA
* * * * * * *
19706675 AAATATTATTAGATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGGTTGTATGAA-AAGAAACAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTAT
* ** * * * * *
19706739 ATAACAAAATAAAA-ATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGA
65 ATGAGTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTGA
* * * * *
19706803 ACT-ATTTCAGAAAACAGATTTA-GTTTTAAATCTCTTGTTAATTTTCA
129 ACTGGTTT-GGCAAACA-ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
* * * * ** * * * *
19706850 AAATATTAATAGATAAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTA
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA
** ** * * * **
19706915 TGACAAAACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACCTAACTATTTGAA
66 TGAGTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAG-TTTAACTATTTGAA
** * **
19706980 CTTATTCGATAAACAAATTT-TATTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTATT-A
130 CTGGTTTGGCAAAC-AATTTAT-TTTTTAAATCT-CT---TATTAATT-TTCA
* * ** *
19707031 GAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAATTTGTATGAA-TAGAAACAATTATTTT
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATTATTAT
* * * ** * *
19707095 ATGACTAAACAAAAGATCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAACCAATCATAACTATTTG
65 ATGAGTAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTTG
** * * **
19707159 AACTGACTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTT
128 AACTGGTTTGGCAAAC-AATTTATTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCA
** * * * * * * * * *
19707212 GGATATGAGTAAACTAGTATTGTTTTATTTTGAATATGCATGTATGGA-TAGAAACAATTGGTT-
1 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAACAATT-ATTA
** * * * * *
19707275 TATGACAAAATAAAATGTCATAACT-ATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTT
64 TATGAGTAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGT-TTAACTATTT
19707339 GAA
127 GAA
19707342 TGTGTTTTAT
Statistics
Matches: 1297, Mismatches: 310, Indels: 220
0.71 0.17 0.12
Matches are distributed among these distances:
155 10 0.01
156 1 0.00
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162 1 0.00
163 2 0.00
164 13 0.01
165 3 0.00
166 1 0.00
168 1 0.00
169 6 0.00
170 11 0.01
171 2 0.00
173 1 0.00
174 2 0.00
175 90 0.07
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184 11 0.01
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Consensus pattern (175 bp):
AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATTATTATA
TGAGTAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTTAACTATTTGAAC
TGGTTTGGCAAACAATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCA
Found at i:19706919 original size:515 final size:512
Alignment explanation
Indices: 19705975--19706948 Score: 1199
Period size: 515 Copynumber: 1.9 Consensus size: 512
19705965 TTGCTTAATA
* ** * *
19705975 ATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAATCTTGTATGAACTAAAGCAAT
1 ATTTTTCAAATGCTAATAAATTAACATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
* ** *
19706040 TATTATATGATTAAACAAAAGCTCAAAATGATTGGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACT
66 TATTATATGACTAAACAAAAGCTCAAAACAATTGAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTT-A-T
* * *
19706105 ATTTGAACTGGTTTGGCAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTATTA
129 A-TTGAACTAGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTATTA
* ** * * *
19706170 AATTAGTATTATTTTTATTCAAATAAGCTTGGAAGATTAGAAATAATTATTTTATGAGAAAACAA
193 AATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGGAAGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAA
** * * * * *
19706235 AGGTCATAATGATTTGAGATTGATATTTGTTCAAATAATAATAACAATTTGAATTGGTTCAGAGA
258 AAATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATAATAACAATTTGAACTAGTTCAGAAA
*
19706300 ACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAAAGTAGTATTATTTTATTT
323 ACAATTTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAAAGTAATATTATTTTATTT
* *** * * *
19706365 CGAATAAGTTTTTATAAACCGCAACAACTGTTCTATGACAGAAGAAAAAGTCATAACGACTTTAA
388 CGAATAAGTTTTCATAAACAAAAACAACTGTTCTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAACTTTAA
19706430 ATAGTCAGATCAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT
453 ATAGTCAGATCAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT
* * *
19706490 ATTTTTTAAATGCTAATAAATTAACATTATTTTA-TTCTAAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAA
1 ATTTTTCAAATGCTAATAAATTAACATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * * *
19706554 TTGTTTTATGACTAAACAAAAGTTCAGAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAGTC-T-TA
65 TTATTATATGACTAAACAAAAGCTCAAAACAATTGAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTATA
* **
19706617 -TGAACTAGTTCGACAAACATATTTATTTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
130 TTGAACTAGTTCGACAAACACATTTA---TTTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATAT
* * * *
19706681 TATTAGATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGGTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAA
188 TATTAAATTAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGGAAGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAA
* * * * *
19706746 AATAAAAATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTC
253 AACAAAAATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATAATAACAATTTGAACTAGTTC
* * *
19706811 AGAAAACAGA-TTTAG-TTTTAAATCTCTTGTTAATTTTCAAAATATTAATAGA-TAAATATTAT
318 AGAAAACA-ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAAAGT-AATATTAT
* * * * *
19706873 TTTATTTTGAATAA-TTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAAC
381 TTTATTTCGAATAAGTTTT-CATAAACAAAAACAACTGTTCTATGACAAAACAAAAAGTCATAAC
*
19706937 AATTTTAAATAG
445 AACTTTAAATAG
19706949 ATAATTGTTC
Statistics
Matches: 385, Mismatches: 63, Indels: 22
0.82 0.13 0.05
Matches are distributed among these distances:
509 21 0.05
511 2 0.01
512 11 0.03
514 9 0.02
515 202 0.52
516 139 0.36
517 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.40
Consensus pattern (512 bp):
ATTTTTCAAATGCTAATAAATTAACATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAAT
TATTATATGACTAAACAAAAGCTCAAAACAATTGAAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTATAT
TGAACTAGTTCGACAAACACATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTATTAAAT
TAGTATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGGAAGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAA
TCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATAATAACAATTTGAACTAGTTCAGAAAACA
ATTTTAGTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATTAAAAAAGTAATATTATTTTATTTCGA
ATAAGTTTTCATAAACAAAAACAACTGTTCTATGACAAAACAAAAAGTCATAACAACTTTAAATA
GTCAGATCAATTGTTCAAATAGTCAAATCTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAGATTT
Found at i:19707098 original size:181 final size:179
Alignment explanation
Indices: 19706503--19707341 Score: 717
Period size: 181 Copynumber: 4.7 Consensus size: 179
19706493 TTTTAAATGC
** *
19706503 TAATAAATTAACATTATTTTATTCTA-AATAAGCTTGTATGAATTA-AAATAATTGTTTTATGAC
1 TAATAAATTAGTATTATTTTATT-TAGAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTATGAC
* * * * * * *
19706566 TAAACAAAAGTTCAGAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAG---T--CT-TATGAACTAG
64 AAAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTAC
* * * *
19706625 TTCGACAAACATATTTATTTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATAT
129 TTCGATAAACA-A---ATTTATTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTAG-AATAT
* * * * * * *
19706681 TATTAGATTAGTATTATTTTAATTCA-AATAAGGTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATAACA
1 TAATAAATTAGTATTATTTT-ATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACA
* ** * * *
19706745 AAATAAAA-ATCATAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATT
65 AAACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTACT
* * * *
19706809 TCAGA-AAACAGATTTAGTTTTAAA---TCT-CTTGTTAATTTTCAAAATAT
130 TC-GATAAACAAATTTATTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTT-AGAATAT
* * * * ** * * *
19706856 TAATAGATAAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAA
1 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * *
19706921 AACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACCTAACTATTTGAACTTA-T
66 AACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAAC-TACT
* *
19706985 TCGATAAACAAATTTTATTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTATTAGAATAT
130 TCGATAAACAAA-TTTATTTTTAAATCTTCTACTTATTAATT-TTAGAATAT
** * *
19707037 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAATTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACTA
1 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * **
19707102 AACAAAAGATCATAACTATTTGAAATAAATAATTATTCAACCA-ATCATAACTATTTGAACTGAC
66 AACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGA-CATAACTATTTGAACT-AC
* * * *
19707166 TTAG-TAAACAAATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGGATAT
129 TTCGATAAACAAATTTA-TTTTTAAATCTTCTACTTATTAA-TTTTAGAATAT
* * * * * * * * *
19707218 GAGTAAACTAGTATTGTTTTATTTTGAATATGCATGTATGGATAGAAACAATTGGTTTATGACAA
1 TAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * * * *
19707283 AATAAAATG-TCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAA
66 AACAAAA-GATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAA
19707342 TGTGTTTTAT
Statistics
Matches: 534, Mismatches: 100, Indels: 51
0.78 0.15 0.07
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.01
175 73 0.14
176 55 0.10
177 43 0.08
178 54 0.10
179 14 0.03
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181 255 0.48
182 10 0.02
183 16 0.03
184 2 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TAATAAATTAGTATTATTTTATTTAGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAA
AACAAAAGATCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGACATAACTATTTGAACTACTT
CGATAAACAAATTTATTTTTAAATCTTCTACTTATTAATTTTAGAATAT
Found at i:19707336 original size:362 final size:355
Alignment explanation
Indices: 19706504--19707341 Score: 811
Period size: 362 Copynumber: 2.3 Consensus size: 355
19706494 TTTAAATGCT
* * * * * * * ** * * *
19706504 AATAAATTAACATTATTTTATTCTAAATAAGCTTGTATGAATTAAAATAATTGTTTTATGACTAA
1 AATAAATAAATATTATTTTATTTTGAATAATCATGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAA
* * * * * *
19706569 ACAAAAGTTCAGAACAATTTAAAATAGATAATTGTTCTAATAG---T--CT-TATGAAC-TAGTT
66 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACCTAACTATTTGAACTTA-TT
* ** * * * *
19706627 CGACAAACATATTTATTTTTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAGATTAG
130 CGATAAACA-A---ATTTTTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAG
* *
19706692 TATTATTTTAATTCAAATAAGGTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAAAATAAAAATCA
191 TATTATTTTAATTCAAATAAAGTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAATCA
* * * * * * *
19706757 TAATGATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTATTTCAGAAAACAGAT
256 TAATGATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGAACTACTTCAGAAAACAAAT
* *
19706822 TTAGTTTTAAATCTCTTGTTAATTTTCAAAATATT
321 TTAGTTTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATG
* ** *
19706857 AATAGATAAATATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAA
1 AATAAATAAATATTATTTTATTTTGAATAATCATGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAA
* * *
19706922 ACAAAAGGTCATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATGGACCTAACTATTTGAACTTATTC
66 ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACCTAACTATTTGAACTTATTC
19706987 GATAAACAAATTTTATTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTATTAG-AATATTAATAAATTAGTAT
131 GATAAACAAATTTT-TTTTTAAATCTCCTACCTATTAATT-TTAGAAATATTAATAAATTAGTAT
* * * * *
19707051 TATTTT-ATTTAGAATAAATTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGATCAT
194 TATTTTAATTCA-AATAAAGTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAA-ATCAT
* *
19707115 AACT-ATTTGAAATAAATAATTATTCAACCAATCATAACTATTTGAACTGACTT-AGTAAACAAA
257 AA-TGATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGAACT-ACTTCAGAAAACAAA
* ****
19707178 TTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTTGGATATG
320 TTTA-GTTTTAAATC---T-CTTATTAATTTTCAAAATATG
* * * * * * *
19707219 AGTAAACT-AGTATTGTTTTATTTTGAAT-ATGCATGTATGGATAGAAACAATTGGTTTATGACA
1 AATAAA-TAAATATTATTTTATTTTGAATAAT-CATGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACA
* * * * * *
19707282 AAATAAAATGTCATAACTATTTGAAATAAATAATTGTTTAAATAGTCTTAACTATTTGAA
64 AAACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACCTAACTATTTGAA
19707342 TGTGTTTTAT
Statistics
Matches: 397, Mismatches: 68, Indels: 31
0.80 0.14 0.06
Matches are distributed among these distances:
353 91 0.23
355 9 0.02
356 86 0.22
357 60 0.15
358 16 0.04
359 16 0.04
360 2 0.01
361 3 0.01
362 113 0.28
363 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.08, G:0.09, T:0.41
Consensus pattern (355 bp):
AATAAATAAATATTATTTTATTTTGAATAATCATGCATGAACAAAAACAATTGGTTTATGACAAA
ACAAAAGGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGACCTAACTATTTGAACTTATTC
GATAAACAAATTTTTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTA
TTTTAATTCAAATAAAGTTGTATGAAAAGAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAATCATAATG
ATTTGAAATAAATAATTATTCAAACAATCATAACTATTTGAACTACTTCAGAAAACAAATTTAGT
TTTAAATCTCTTATTAATTTTCAAAATATG
Found at i:19707807 original size:180 final size:178
Alignment explanation
Indices: 19707392--19707820 Score: 437
Period size: 176 Copynumber: 2.4 Consensus size: 178
19707382 TCGGCAAAAC
* * * *
19707392 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATACTATTAAATTAGTATTATTTTA
1 AGATTTA-TTTTTAAATCTCCTAC-TATTAATTTTAAG-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* * ** *
19707456 ATCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAATAAAGATTGTAACTATTTG
63 TTCCAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAACGATTTG
* *
19707521 AGATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGTTTCAATAAAT
128 AAATAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTGTTTCAATAAAT
* ** *
19707572 AAATTTAGTTTTTAAATCT-CT--TATTAATTTTTAA-AATATTAATGGATCAGTATTATTTTAT
1 AGATTTA-TTTTTAAATCTCCTACTATTAA-TTTTAAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
*** * *
19707633 TTTGAATAA-TTTGTAT-AAACTA-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
64 TCCAAATAAGCTTGTATGAAA--AGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGATCATAACGATT
* * ** *
19707695 TGAAATAGATAATTGA-TCAAATGGACATGACTATTTGAACT-TGTTCGGTAAGT
126 TGAAATAGATAATT-ATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTGT-TTCAATAAAT
*
19707748 AGATTTATATTTTAATTCTCCTACCTATTAATTTTAAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
1 AGATTTAT-TTTTAAATCTCCTA-CTATTAATTTTAAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
*
19707813 TCTAAATA
64 TCCAAATA
19707821 GTAATAAGTT
Statistics
Matches: 203, Mismatches: 33, Indels: 26
0.77 0.13 0.10
Matches are distributed among these distances:
174 3 0.01
175 30 0.15
176 103 0.51
177 7 0.03
179 7 0.03
180 53 0.26
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
AGATTTATTTTTAAATCTCCTACTATTAATTTTAAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
CAAATAAGCTTGTATGAAAAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATCATAACGATTTGAAA
TAGATAATTATTCAAATAGACATAACTATTTGAACTGTTTCAATAAAT
Found at i:19707827 original size:31 final size:31
Alignment explanation
Indices: 19707786--19707844 Score: 100
Period size: 31 Copynumber: 1.9 Consensus size: 31
19707776 TAATTTTAAG
*
19707786 AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
1 AATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
*
19707817 AATAGTAATAAGTTAGTATTATTTTATT
1 AATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATT
19707845 TCAAAACGAT
Statistics
Matches: 26, Mismatches: 2, Indels: 0
0.93 0.07 0.00
Matches are distributed among these distances:
31 26 1.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.02, G:0.07, T:0.51
Consensus pattern (31 bp):
AATAGTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTA
Found at i:19708240 original size:180 final size:180
Alignment explanation
Indices: 19707913--19709206 Score: 763
Period size: 180 Copynumber: 7.2 Consensus size: 180
19707903 AAAGAGCTAT
* * * * *
19707913 GACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTT-TCTCTGTCATAAAACAATTAT
1 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGT-TTTGTTATAAAATAATTAT
* * * * * * *
19707977 TTCTGTTCATATACATTTATTTGAAATAAAAATAATACTAAATTAATAATATTTTAAAAATTCAT
65 TTCAGCTCATATA-ATTTATTCGAAAT-AAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * * *
19708042 AACTAAGAGATTTAAAAAAT-ATTTTTTTTATCAAACTAGTTTAAACAGTTAA
128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTAA
*
19708094 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
1 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
** ** ** *
19708159 TCAGCTCATCCAAGTTTATTCGTGATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTCAAAAATTTATAA
66 TCAGCTCATATAA-TTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAA
* * * *
19708224 GTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTAATTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATA
130 CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTT-TTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTA-A
* * ** * * *
19708276 G--TAT-TCAAATAATTATATATATATCAAATTATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAATAATT
1 GACTATAT-GAATAATTATCTAT-T-TCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATT
* * * * * ** *
19708338 ATTTTTA-TTCATATAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTTGACAATT
63 A-TTTCAGCTCATATAA-TTTATTCGA-AATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATT
* * * * *
19708401 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAACTTGTTTGCCAAACCATTTCAAATAATGAA
125 AATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTAA
* * * * * * * * ** *
19708457 GGCTATATGAACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACATTTTATTTTATTGTAAAACCATTTTT
1 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
* * * * * * *
19708522 TTAGCTCTTACTAATTTATTCAAAATAAAACAAATC-AATTTTATTGATATTTC-AAAATTAATA
66 TCAGCTCATA-TAATTTATTCGAAATAAAATAAAACTAA-TTTAATAATATTTCAAAAATTAATA
* * *
19708585 AGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTTGTTAGCCAAACCAGTTCAAATAATTAT
129 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-CCAAACCAGTTCAAATAATTAA
* * * * * * * *
19708637 GAATATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAAATGTT
1 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
** * * * * * * * *
19708702 TTTGTTCCTATAAATTTGTT-TAGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATCTT-GAAAATTAAT
66 TCAGCTCATAT-AATTTATTCGA-AATAAAATAAAACTAATTTAATAATAT-TTCAAAAATTAAT
* * * * * * *
19708765 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTGCCAAACCAATTCAATTATTTATA
128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTA-A
* * * * * ** * * * * *
19708819 -ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAGTTGTTATGGCCATTT-TTTTATCATAAAACAATTGTT
1 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
* * * * **
19708882 TCTA-TTCATA-AAGTCTTATTTGGAATAAAGTAATGCTAATTT-A-AA-A-TT----AA-TAAG
66 TC-AGCTCATATAA-T-TTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAA-
* ** ** * * * *
19708936 TAAC--A-A-ATTTAGAAAATGTA-TTAGTTAGCCTAACCAGTGCAAATAGTTAT
127 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTA-CCAAACCAGTTCAAATAATTAA
* * * * * * *
19708986 GACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT
1 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
* * * ** * *
19709051 TCTGCTTGCATA-AACTTATTC-AGAATAACATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAA-T--T
66 TCAGC-T-CATATAATTTATTCGA-AATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT
* * * * *
19709111 AACAAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATA
128 AACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTA-A
* * **
19709165 G-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTTTTATAACCTTTT
1 GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT
19709207 TATTTTTTCA
Statistics
Matches: 873, Mismatches: 189, Indels: 105
0.75 0.16 0.09
Matches are distributed among these distances:
167 4 0.00
168 63 0.07
169 44 0.05
170 2 0.00
171 11 0.01
172 6 0.01
173 1 0.00
174 4 0.00
175 2 0.00
176 1 0.00
177 5 0.01
178 70 0.08
179 17 0.02
180 249 0.29
181 240 0.27
182 131 0.15
183 22 0.03
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (180 bp):
GACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTATT
TCAGCTCATATAATTTATTCGAAATAAAATAAAACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATAAC
TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTTTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTAA
Found at i:19708302 original size:19 final size:17
Alignment explanation
Indices: 19708262--19708312 Score: 66
Period size: 17 Copynumber: 2.9 Consensus size: 17
19708252 ATCGAACCAG
*
19708262 TTCAAATAATTATAGTA
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* * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* ** * * *
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*
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * *
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* ** * * * **
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *** * * * ** *
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** * * * * *
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** * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * ** *
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* * * *
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* * * **
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* * * * * *
19711016 TCAAAAATTAAT---AAG---TAAGAGAT-TATTTGTTTAT
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** * * * * * *
19711050 CGAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTGTATATTTCAAGTTGTTATAACCTCTTG
1 CGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAA--TCTTT
* * * * ** * * *
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* * * * * *
19711179 TAATA-TCATGATAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-T-TGTT-T----G--TT--A
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* * * * * * * *
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** * * * *
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** * * * * *
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* * * * *
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* * * * * ** ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * ** ** *
19711589 TCGTAAAA-AATTATTT-TAGTTAATATAAAATTATTTGAAATAAAATAATACTAAGCTGTTAAT
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* * *
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* * * ** * * * * *
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1 C-GAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTTATAATCTTTT
* * * * ***
19711762 GATTTGTCATAAAAGAATT-TTT-TGTTCATACAAGCTTTTTTTGAATAAAATAATATAAATTTA
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* * * * * *
19711825 TTAAT-CT-TAAGACAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAG--T
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* * * * * *
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* * * * *
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* * * *
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311 CCAAAAATTAATA---CAAAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTAT
* * * * * * * **
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* * ** *
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* ** * * * * * * * * *
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* * * * *
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* *
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* ** * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * **
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* * ** * * * * * *
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* * * * *
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* ** ** *
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* *** *
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* * * * * ** * *
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* * * * ** * * * *
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* * * * *
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** * * * *
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* ** * * * * *
19713018 A-AATTGATCCTTTTCATACAAGCTTA-CTCAAATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTACAA
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* * * *
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
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* * ** * * * * * *
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126 ATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTAGAGATTT-TAAAAATAAATATATTTTCTAAAAGCA-TT
* * * * * * *
19713312 CAAAAAGATTTGACTTTTTGAACAATCATTCTAACTATTTAAAGTTGTTATGAGCTTTT-TTTTT
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* * * * *
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* ** * *
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* ** * ** * * *
19713487 CAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATAAATCTCAAATCATTGA-GATCTTTG
1 CGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCGTT-ATAATCTTT-
* * * * * *
19713551 TTTTCTCATAAAACAATTATTTCTAATCATTCAAGCTTATTC-AGATAAAATGAATACAAATTTA
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* * * *
19713615 ATAATATT-TAGAAAATTAAT-AG---GAGATTTAAAAAATAAATATATTTGT-T-GAACCAATT
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* * * * * * * *
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* * *
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* * * * *
19709400 TTCAATAATTAATAAATAAAAGATTTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAACAA
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* * * ** * * * *
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* * ** * * * *
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* * * ** *
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* * * * * * * *
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65 ATAAAACAATTGTTTTTCATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAA-TTTATTAATA
* ** * * *
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* * * * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGTC
* * ** * * *
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65 ATAAAACAATTGTTTTTCATTCATACAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATATTAATTTATTAATA
* * * * *
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129 TTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAAC-AA
* * * * * * *
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* * * * * * * * ** ** *
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* * * *
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* ** * * * *
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* * * * * * *
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65 ATAAAACAATTGTTTTTC-ATTCATACA-AGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
* *
19710650 A-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGTA-ATTTAAAGAAATAAATCTATTTA-CTGAATAA
128 ATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTAAA-AAATAAATCTATTTATC-GAACAA
* * * * * *
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1 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTTGT
* * * * * *
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64 CATAAAACAATTGTTTTTCA-TTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATATTAATTTATTAAT
** *
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128 ATTTCAAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCGAA-CAA
* * *
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1 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTTTGTCA
* * ** * *
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* *
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131 TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAA
* * * * * * *
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* * * * * * * *
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* *
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* ** * * *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* * * * ** ** *
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* * * * ** *
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* * * * * * * *
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* * * *
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* *
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** * * * * *
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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* *
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** * * * * *
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* * * * * ***
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* * *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * * *
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* * * **
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* * * * *
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** **
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* * * ** * * ** *
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* * * * **
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* ** * *
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*
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* * * *
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* * * * *
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*
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* * * * * *
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** * *
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* * *
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* * ** * *
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* * ** * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * * * *
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* ** * * ** *
19713253 TA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAAAAGTTCAAAA
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* **
19713317 AGATT-TGACTTTTTGAACAATCATTCTAACTATTTAAAGTTGTTATGAGCTTTT-TTT
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* * *
19713374 TTTCATAAAATAACTGTTTCAATTCATAACAACTTATCTAAAATAAAATAATACTACTTTATTAA
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* ** *
19713439 TATTTCAAAAATTAATAAGCAAAAGATTTAAAATCTAAAACTATTTTTCAAACCAGTTCAAATAG
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* * * *
19713504 TTATGACTATTTGAACAA--ATATAA--ATCTCAAATCA-T-TGAGATCTTTGTTT
130 TTATGACTATTTGAACAATCATTTAACTAT-TTAAATCATTATGAGCT-TTTATTT
* * * * * * * *
19713554 TCTCATAAAACAATTATTTCTAA-TCATTCAAGCTTAT-TCAGATAAAATGAATACAAATTTAAT
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** * *
19713617 AATATTT-AGAAAATTAAT-AG---GAGATTTAAAAAATAAATA-TATTTGT-TGAACCAATTTA
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* * * * * * * * * *
19713675 AATAGCTAAGAGTA-TT--AGAAT-AATTATCTATTTAAAATCATTCTAACCTTTTGTTT
125 AATAGTTATGACTATTTGAACAATCATTTAACTATTT-AAATCATTATGAGCTTTTATTT
* * * * * * * *
19713731 AGTTATATAATAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATT
1 TGTCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAA-CTTATCTAAAATAAAATAATACTAATTTATT
19713794 GACATTTATT
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Period size: 181 Copynumber: 4.1 Consensus size: 180
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* * * *
19713937 ATAAAACTAATTTATTAATATTTCAAAATTTATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAATTTTATTTAT
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* * * ** *
19714002 CGAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTTTTTG
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* * * *
19714067 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTAAGATAAGTTTGTTCAAAATAAA
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*
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* * * * * *
19714179 TTACCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCA
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* * * * *
19714244 TTTATTTTGTCATCAAACAATTGGTTCTATTCATATTATTTTATTCAAAATAAA
127 TTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTAAGATAAGTTTATTCAAAATAAA
** ** * * * * *
19714298 ATAATACTAATTTAACAATATTTCAAAACTTAATAACCAAGAAAATTA-AAAGCTAAATCTAATT
1 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAGAAA-ATAAATTTATTT
** ** * * * * * ** *
19714362 GTCAAAGTAGTTTAAATGGA-TA-AGACTATATGAACAATTATCTATTTTAAATTGTTATGACCT
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* * * * * * * * * *
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* * * * * *
19714479 ATAATGCTAGTTTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTT-TTT
1 ATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAGAAAATAAAT-TTATTT
* ** ** * * * *
19714543 ACCGAATAAGTTCAAATGGTTA-AGACTA-TTAGAACAATTATTTATTTGAAATCGTTCTAACCT
64 ACCAAACCAGTTCAAATAATTATA-ACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-
* * * * * * * * *
19714606 TTTTATTTAGTTACAAAACAATT-GTTCCAGTTCATATAAGCTTATTCAGAATAAA
126 ATTTATTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTA-TTAAGATAAGTTTATTCAAAATAAA
* *
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1 ATAATACTAATTTATTA
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CAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCATTTA
TTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTAAGATAAGTTTATTCAAAATAAA
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*
19715485 ATAAAATAATTATTTATAATCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATACTAATATGATAATA-T
1 ATAAAATAATTATTTATAATCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAATAATATGATAATATT
* * * * * *
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*
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* * * *
19715659 ATAAAATAATTTTTTTTAATTCATACTAGCTTATT-CATAATAAAATAA-AATGAAT-TTATTAA
1 ATAAAATAATTATTTATAA-TCATACAAGCTTATTCCA-AATAAAATAATAAT-AATATGA-TAA
** * *
19715721 TATTTCCAAAAGTAATATGTAATAGATTTAAAAAATAATATGGTTTACCTAACCAGTTCAAATAA
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* *
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127 TTAAGACGATATGAACAATTATCTATTT
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ATAAAATAATTATTTATAATCATACAAGCTTATTCCAAATAAAATAATAATAATATGATAATATT
TCCAAAAGTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAATATGGTTTACCAAACCAGTTCAAATAATTAA
GACGATATGAACAATTATCTATTTTAAATCGTTTTTGTTTTGCC
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* * * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * * * * *
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** ** * *
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* *
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* *
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* * * * ** *
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* * * ** * *
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65 -ATTCATACAAGCTTATTCAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * * * * **
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127 TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
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* *** * * * * * *
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* *** * * *
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* * * ** * * * * * *
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* * * *
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* * * * * ** * *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* * ** * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * * * ***
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* * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* ** *
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* ** * * *
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* * ** * * * * *
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1 ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCTA
* * * *
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* * * *
19716458 TAAA-ATATTTAAAAATAAATTTGTTTACTGAA-CATGTTAAAAT-CTTAATGACT
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* * * * * *
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* * ** * *
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* * * *
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* * * * * * *
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** * * *
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* *
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127 TAA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTACT-GAACCA-GTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * * * *
19716873 ATCTAAACAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGACTTTTTGTTTTATCATAAAACAACTGGTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
* * **
19716937 GTTCATGCAAGCTTATTTTGAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTCAAAAAATTAATAAG
65 ATTCATACAAGCTTA-TTCAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG
* * * ** * *
19717001 TAAAAGATTTAAAAAAGAAATCTATTTACT-AAGTGAGTTTAAATAGTTATCACT
127 T-AAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAA-CCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * *
19717055 ATTTGAACAATTATTTATTAT-AAATCGTTATGATCTTTTGTTCTGTCATAAAATAATTGTTTCT
1 ATTTGAACAATTATCTATT-TCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
** * *
19717119 ATTCATACAATTTTATTCAAAATTAAATAATACTAATTTATAAATATTAT-AAAAATTAATAAGT
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** ** ** * * *
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127 TAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT
* * * * * *
19717234 CATTTGAACTATCATTTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTATCATAAAACAATTGTTTCT
1 -ATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTCT
** * * * * *
19717299 ATTCATACAAAATTATTAAGAATAAAATAACAATAATTTTTTAATATTTCAAAAAATAATAAG--
65 ATTCATACAAGCTTATTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTA
*
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* *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* * * * ** * * * *
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** * * * * * * ** *
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* ** * ** * * * *
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* * * ** * * * * * *
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* * * * *
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* *** * ** *
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* * * * * * * * * *
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* * * ** * * * * **
19718985 AATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCAT
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* * * * *
19719050 ATAAGTTTGTTC-AGA-AAAA-AA-ACTAATCTATTAATACTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGAT
65 ATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * * * *
19719107 TTGAAAAATAAATTTGTTT-CTCAAAGCAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TT
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* * * ** * * * * *
19719157 AAGCAATTATATTTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATAGTTTCTATTCA
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*** * * * * * *
19719222 TA-AATGCTTATTTGGATTTAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-GATAATTAATAACTAAAA
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* *
19719285 AATTTTAAAAATAAATATATTTACC
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19719310 AAACTAGATC
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Consensus pattern (179 bp):
AACAATAATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATAATTGTTTCAGTCATA
TAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
TAAAAATAAATCTATTTACCGAAGCAGTTCAAATAATTAAGACTATATC
Found at i:19718766 original size:181 final size:179
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Period size: 181 Copynumber: 13.9 Consensus size: 179
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** * * * *
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* * * * *
19718150 AATTCATATAAGCTTATTCTG-AATAAAATAATACTAATTTAATAATAATCCAAAAATTAATGAC
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* * * *
19718214 TAAGAGATTTAGAAAATAAATTTATTTACCGAAGCAGTTTAAATAGTTAAGA
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * * * * *
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* *
19718331 AGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAGT
66 AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TA-TAATATTTTCAAAAATTAATAACT
* * * * * * * *
19718395 AAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTACTGAATCAGTTCAAATAATTGT-A
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * * * * * *
19718445 GCTATTTCAACAATAATCTATTTCAAATCGTTATTACGTTTTGTT-TGTCATATACCAATTATTT
1 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTT
** * ** * * *
19718509 -TTTATCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATAAATAA
65 CAGT-TCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAT-AT-TTTCAAAAATTAATAA
* * * *
19718573 GTATA-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTTAATAATTATGA
127 CTA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * * *
19718626 TTATTTGAACAATTGTAC-ACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTT
1 CTATTTGAACAATTAT-CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTT
** * * * * *
19718690 TTGTTTATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAACATAATATTATTCTAAGAATTAATAAC
65 CAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAATATT-TTC-AAAAATTAATAAC
* * ** ** * ** * *
19718755 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCAAAAGTAATTCCAATAGTTAAG-
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * *
19718806 CTATGTGAACAATTATCTATTTCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTC
* * * * *
19718863 AATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTT-GAAAATTAATAT
66 AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AA--TA-TAATATTTTCAAAAATTAATA-
* * * * * * *
19718926 A-TAAGGGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATCTAACCAATTCAAAT-ATTATGA
126 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * ** * * * * *
19718978 CTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTC
* * * * * *
19719043 TGTTCATATAAGTTTGTTCAGAAAAAAAACTAAT-CT-AT-TAATA-CTTCAAAAA-T--TAA-T
66 AGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATAAAA-TAATACTAATATAATATTTTCAAAAATTAATAACT
* * * * * *
19719100 AAGAGATTTGAAAAATAAATTTGTTT-CTCAAAGCAGTTCAAATAGTTATGA
129 AAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTAC-CGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * ** * * * *
19719151 CTATTT-AAGCAATTATATTTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAA-TAGTT
1 CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTA-TT
* * * * * *
19719214 TCTA-TTCATA-AATGCTTATTTGGATTTAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-GATAATTAA
64 TC-AGTTCATATAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA--TA-TAATATTTTCAAAAATTAA
* * * * * * * * *
19719276 TAACTAAAAAATTTTAAAAATAAATATATTTACCAAACTAGATCAAATATTTTGATAATCAATAA
124 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATA-----AT--T--ATGA
* * * * * *
19719341 CTAAAAACTTTTAAAAATAAATAGCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTTTTGTCATAAAA-A
1 CT----A-TTTGAACAAT---TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACA
* * *
19719405 ATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGT-TATTTATATTTCAAAAA
58 ATTATTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA-TATA-ATAT-TTTCAAAAA
* * * * * ** *
19719469 TTAATAACTAAGAGATTTTAAAAGTGAATCTGTTTAGTGAACAAGTTTAAATAATTATGA
120 TTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * * * *** * * * *
19719529 CTATTTCAACAATTCTTTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAATGACTT-TTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAA-CAATTATTT
** * * * * * * * ** *
19719593 TTGTTTACACAAG-TTATTTCAAATAAAATAATACAAATTTATTAATAATAAAACAATTAATAAG
65 CAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATATAAT-ATTTTCAAA-AATTAATAA-
* * * * * **
19719657 C-AAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAGGTTCAAATGTTTATGA
127 CTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCA-GTTTAAATAATTATGA
* * * * * * *
19719709 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACATCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-ATTT
** * * * * * * ** *
19719774 TTGTTTAGACAAGGTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTATTCATTATTAATATTTTGACAAT
65 CAGTTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAA-TA-T-A--A-T-AT-TTTCAAAAAT
* * * * * * * * * * *
19719838 TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTTCCAAACAAGTTCAAATAGTCAAGA
121 TAATAACTAAGAGATTT-AAAAAATAAATTTATTTACCGAACCAGTTTAAATAATTATGA
* * * * * * * * *
19719898 CTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATAATAACCATTTGTTTTGTAATAAAATAATTTTTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTC
* * * *
19719963 AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATATAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAATGAG
66 AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA--TA-TAATATTTTCAAAAATTAATAAC
* * * * * ** * * *
19720027 TAAGATAATTAAAAAATGAATCTATTTA-CTAAATATGTTCAAATAGTTATAA
128 TAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCA-GTTTAAATAATTATGA
* * * * * * **
19720079 CTATCTGAACAATTTTCTATTTCAAAACATTATTACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGGTTC
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTC
** *
19720144 TA-TTCATGCACGCTTATTTTG-AATAAAATAATA-TAGATTCATTAATA--TTCAAAAAATTAA
66 -AGTTCATATAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTA-A-T-A-TAATATTTTC-AAAAATTAA
* * * * * * * * *
19720204 TAAGTAA-A-AATTAAAAAATATATATGTTTTCTGAA-CATGTTTAAATAGTTTTGA
124 TAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTACCGAACCA-GTTTAAATAATTATGA
* * * * * * *
19720258 CTATTTGAAGAATTGTCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAATTGTTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTC
* * * * * * *
19720323 TGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAAT-ATACTAATTTATTAA-AATTCCAAAAGTTAATAAG
66 AGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA--TA-TAATATTTTCAAAAATTAATAAC
* * * * * ** *
19720386 TAAAATATTTCAAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAAGAGAGTTTAAATAGTTATGA
128 TAAGAGATTT--AAAAAATAAATTTATTTACCGAA-CCAGTTTAAATAATTATGA
* * * ** * *
19720440 CTATTTCAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCCTTTAT-TT-TGTCATAAAACAATTGCT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTTT-TGTTCTGTCATAAAACAATT-AT
* * * ** * * *
19720503 TCCA-CTCATAGAATTTTATTCGATATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTAAT
63 TTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAA--TA-TAATATTTTCAAAAATTAAT
* * *
19720566 AA-GATGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA
125 AACTA-AGAGATTTAAAAAATAAATTTATTTA
19720597 TCAAATAAGT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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* * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * ** *
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* * * *
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* * ** * *
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* *
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* * * * *
19718511 TA-TCATATAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATAAATAAGT
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* *
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* * * * * *
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*
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* * * * *
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317 AAATAAATCTATTTACAAAA-TCAATTCAAATAATTGAAG
* * *
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* ** * **
19718864 ATTCATATTAGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATATAT
64 ATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATAT
* * * * *
19718928 AAGGGATTTAAAAAATAATTTTGTTTATCTAACCAATTCAAAT-ATTATGACTATTTGAATAATT
128 AA--GATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATT
* ** * * *
19718992 ATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAG-T
191 A-TCATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCT
* * * * *
19719056 T-TGTTCAGA-AAAA-AA-ACTAATCTATTAATACTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTGAAA
255 TAT-TTGAAATAAAATAATAATAATC-ATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA
* * * * * * *
19719113 AATAAATTTGTTT-CTCAAAGCAGTTCAAATAGTT-ATG
318 AATAAATCTATTTAC-AAAATCAATTCAAATAATTGAAG
* * * * * * *
19719150 ACTATTT-AAGCAATTATATTTTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATAGTT
1 -CTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCGTTATTAC-TTTTGTT-TGTCAT-ATACAATA-TT
* ** * * * *
19719214 TCT-ATTCATA-AATGCTTATTTGGATTTAAATAATACTAATTTATTAATATTAT-GATAATTAA
60 TTTAATTCATATAA-GCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAA
* * * * * * *
19719276 TAACTAAAAAATTTTAAAAATAAATATATTTACCAAACTAGATCAAATATTTTGATAATCAATAA
123 T-A-TATAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAAC-----C--A-A-TTT-A-AAT-AATTA
* ** * * * * *
19719341 CTAAAAACTTTTAAAAATAAATAGCTATTTCAAATCATTATGACCTTTAGTTTTGTCATAAAA-A
174 -TGACTA-TTTGAACAAT---TATC-ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA
* *** * * * * *
19719405 ATTATTTCAATTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGTTATTTATATTTCAAAAAT
233 ATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAA-TCATTAATATTTCAAAAAT
* * * * *** * *
19719470 TAATAACTAAGAGATTTTAAAAGTGAATCTGTTTAGTGAA-CAAGTTTAAATAATT-ATG
297 TAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACAAAATCAA-TTCAAATAATTGAAG
* * * * * * * *
19719528 ACTATTTCAACAATTCTTTATTTGAAATTGCTATAACCTTTTGTTTTGT--TATAAAATGACTTT
1 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTTG-TTTGTCATATACAAT-A--TT
** * * * * * *
19719591 TTTTGTTTACACAAG-TTATTTCA-AATAAAATAATACAAATTTATTAATA-ATAAAACAATTAA
60 TTTAATTCATATAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAA
* * * * * * **
19719653 TAAGCAAAAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAGGTTCAAATGTTTATGACTATTTGA
123 T-A-TATAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCA-ATTTAAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * *
19719717 ACAATTATTTATTTCAAATTATTATGACATCTTGTTTTGTCATAAAACAATTGCTTTTTGTTTAG
185 ACAATTA-TCATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTTGTTCAT
* * * * ** * *
19719782 ACAAGGTTA-TTCAGAATAAAATAATATTAATTATTCATTATTAATATTTTGACAATTAATAAGT
248 AAAAGCTTATTTGA-AATAAAAT-A-A-TAA-TA---ATCATTAATATTTCAAAAATTAATAACT
* * * * * * *
19719846 AAAAGATTTAAAAAAATAAATATGTTTTCCAAA-CAAGTTCAAAT-AGTCAAG
305 AAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACAAAATCAA-TTCAAATAATTGAAG
* * * * * * * * * *
19719897 ACTATTTGAATAATTATCTATTTTAAATCATAATAACCATTTGTTTTGTAATAAAATAATTTTTT
1 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTTG-TTTGTCAT-ATACAATATTTT
* * * *
19719962 TAGTTCATATAAGCTTATT-TGAAATATAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGA
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* * * * * * * *
19720026 -GTAAGATAATTAAAAAATGAATCTATTTA-CTAA--ATATGTTCAAATAGTTATAACTATCTGA
125 TATAAGAT--TTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCA-AT-TT-AAATAATTATGACTATTTGA
* * * * * * * * *
19720087 ACAATTTTCTATTTCAAAACATTATTACCTTTTGTTGTGTCATAAAATAATTGGTTCTATTCATG
185 ACAATTATC-ATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
* * *
19720152 CACGCTTATTTTG-AATAAAATAAT-ATAGATTCATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAA-A-
249 AAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATAATA-A-TCATTAATATTTC-AAAAATTAATAACTAAGAG
* * * * * ** * * *
19720212 AATTAAAAAATATATATGTTTTCTGAA-CATGTTTAAATAGTTTTG-A-
310 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACAAAATCA-ATTCAAATA--ATTGAAG
* * * *
19720258 CTATTTGAAGAATTGTCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAATCAAT-TGTTT
1 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTA-CTTTTG-TTTGTCATATA-CAATAT-TTT
** * ** * * *
19720322 TTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAAT-ATACTAATTTATTAAAATTCCAAAAGTTAATAAG
62 TAATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A-
* * * * * * *
19720386 TAAAATATTTCAAAAAAATAAATCTGTTTA-CTAA-GAGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTCAA
125 TATAAGATTT--AAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCA-A-TTTAAATAATTATGACTATTTGAA
* * ** * * * ****
19720449 TAATTATTTATTTCAAATTGTTATGATCC-TTTATTTTGTCATAAAACAATTGCTTCCACTCATA
186 CAATTA-TCATTTCAAATCATTAT-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATA
* ** * * * * * * *
19720513 GAATTTTATTCGATATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-GATGGAGAT
249 AAAGCTTATTTGAAATAAAATAATAATAA-TCATTAATATTTCAAAAATTAATAACTA-AGAGAT
* * * * * *
19720577 TTAAAAAATAAATTTGTTTATC-AAAT-AAGTTTAAAT-AGTCATG
312 TTAAAAAATAAATCTATTTA-CAAAATCAA-TTCAAATAATTGAAG
* * * * * * * ** * *
19720620 TCCATTTGAACTATCATATATTTGAAATTGTTATGACATTTTGTTGTGTTGTAAAACAACTGTTT
1 -CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTAC-TTTTGTT-TGTCAT-ATACAA-TATTT
* * ** *
19720685 CT-ATTCATACAAAATTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTTTTAATATTTCAAAAAT
61 TTAATTCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAAT
19720743 AAATTTGTTT
Statistics
Matches: 1775, Mismatches: 377, Indels: 287
0.73 0.15 0.12
Matches are distributed among these distances:
343 1 0.00
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364 41 0.02
365 6 0.00
366 9 0.01
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Consensus pattern (355 bp):
CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACTTTTGTTTGTCATATACAATATTTTTAAT
TCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATATATAAG
ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCAT
TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATAAAAGCTTATTTG
AAATAAAATAATAATAATCATTAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
TATTTACAAAATCAATTCAAATAATTGAAG
Found at i:19720092 original size:550 final size:540
Alignment explanation
Indices: 19717490--19720585 Score: 2187
Period size: 550 Copynumber: 5.7 Consensus size: 540
19717480 ATAAGATTCT
* * * * * * *
19717490 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAGATAAATGTGCTTATCGAACCAGTTC-AATAG-TTAAG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTA-CCAAACAGTTCAAATAGTTTATG
* * * * * * *
19717553 ACCATTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTGGTT-TAGTCATAAAACAATT-TT
65 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCT-GTCATAAAACAATTGTT
* * * * ***
19717616 TTCAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-A-AT-TTATTAACATTCAAAAAATTA
129 TT-TGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAAT-ATACTAATATATTATTAATATTTTGAAAATTA
* * * * **
19717678 AT-GCATAAGAA-ATTTTAAAAAATAAATCTGCTTACCGAGTAAGTTCAAATAGTTATA-ACTAT
192 ATAAC-TAA-AAGA-TTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTA-AGACTAT
* * * * * * *
19717740 TTGAATAATTATCTATTTAAAATAAATATAACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAGTT
253 TTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATT
* * * * * * * *
19717805 CA-AAAATGTTTATATGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAG
317 CATATAA-GCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * *** ** * *
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* ** * * ** **
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* * *
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* * * * * * *
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1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAGTTCAAATAGTTTATGA
* ** * * * *
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66 CTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTGTTTT
** * * * ***
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* * * * * * * *
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194 AACTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
* * * * * * *
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*
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* * * * * *
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387 AAAAAATGAATCTATTTACT-AAACAGTTCAAATAATTATAACTATTTCAACAATTATTTATTTC
* * ** *
19718469 AAATCGTTATTACGTTTTG-TTTGTCATATACCAATTATTTTT-TATCATATAAGTTTATTCAAA
451 AAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTGT-TCATACAAGTTTATTC-AA
* * *
19718532 ATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC
513 ATAAAATAATACAAATTTATTAAT-ATTA
* * * * ** *
19718561 AAAAATAAATAAGTATAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACCAATTTTAATA-ATTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-AAACAGTTCAAATAGTTTATG
* * ** * * *
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65 ACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTGTTT
* * * *
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130 TTGTTCATAAAAGCTTATTTGGAATAAAATATACTAATATATTATTAATATT-TT-GAA-AATTA
* * * * * * *
19718750 ATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCAAAAGTAA-TTCCAATAGTTAAG-CTATGTG
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* *
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256 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAATTCATA
* * * ** *
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* * * * * * *
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384 TTTAAAAAATGAA-TCTATTTA-CTAAACAGTTCAAATAATTATAACTATTTCAACAATTATTTA
* * * * * *
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* * * *
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*
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** * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * *
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* * * * *
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247 GACT----A--TTT--GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTT-GTTTTGTCATAAAA
* * * *
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303 CAATTTTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAA
* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * *
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* *
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* * * * *
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* * * * ** * *
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* * *
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* * * * * *
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* * *
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317 CATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * *
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382 GATTTAAAAAATGAATCTATTTACTAAACA-GTTCAAATAATTATAACTATTTCAACAATTATT-
* * * * * * * * *
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445 TATTTCAAATCGTTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTGTTCATACAAGTTTA-
** * * *
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* * * ** *
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* * * * * *
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* **
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* * * * * * * *
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* ** * * ** * *
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* ** * * * *
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** * *
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** * * *
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* * * * *
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* * * **
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**
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* * * * *
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** * * *
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* *
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*** * * *
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* * **
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*
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GACCAGTTC
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* *
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* * * * ** * * * *
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* * * * *
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* ** **** * * *
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* ** *
19721589 TCAATTTACTGAAC-----C----A-TT-T-CCTATTTGAACAATTATCTAT
129 TCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * ** *
19721629 TTCAAAAT-GTTATAACCTTTTGTTCTATTATAAAATAATTGTTT-AATTCATATAATTTTATTT
1 TTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC
** *
19721692 GAAATAAAATAATACTAATTTA-TAATATTTTGAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAA
* ** * * * *
19721756 TCTATTTACCGAAGTAGTTTAAACAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTAT
129 TCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
19721808 TTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAATAATTGTTTCAATTCATACAAGCTCATTCA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCG
* * * *
19721873 AAATAAAATAAAACTAATTTATT-A-A--T-----ATT--T--T--GAAATTTAACAAGTGAATC
66 AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAATAAGAAATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
19721923 TGTTTATCGAATCAA-TTCAAATAATTATGGCTATGTCAACAATTATCTAC
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* * ** * * * *
19721973 TTCAAATCATTATTACCTTTTGTCTCATCATATAAGAA--TTGT-A-TT--TGA-AA--TT-TTA
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCAT-ACAAGCTTATTC
* * * *
19722028 G-AATAAAATAACACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATAAA
65 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-TAAGAAATTTAAAAAATAAA
* * * * * ** *
19722092 TATGTTTATCAAACTAA-TTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTGTAAAC
129 TCTATTTACCAAAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
19722144 TTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTT-TG-TCATACAAGTTTATTC
1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-TTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC
* * * *
19722207 -AGAATAAAATAACACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTTAA-AGAA-TTAAAAAAT
65 GA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAA--TAAGA-AATTTAAAAAAT
* * * * ** *
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126 AAATCTATTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA--ATTT-TTTCAGTTCATACAAGCTTAT
* * ** * *
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* * * * * * * *
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126 AAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AAT-TTTTTCAGTTCATACAAGCTTATT
*
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* * * * *
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* * * *
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** * * * * * * *
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** * * * * * * * *
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1 TTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTCAGTTCATACAAGCTTATTC-
* * * *
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** * * * * * *
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* * * * * * *
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** * *
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* * *
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* * * * * ** * *
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* * * *
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** * * * * * * *
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* * * * * * *
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* * ** * *
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* ** *
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* * * *
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* **** * *
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127 AATCTATTTACCAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * *
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*** * * *
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* ** ** * * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * *
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** * * *
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* * * * * *
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* * * * * ** * * *
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* * ** **
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* * * * * * * * * * *
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** * * * * *
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* ** *
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* *
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Consensus pattern (176 bp):
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ATTTACTCAACTAGATAAATAATCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATAGCTATAACA
TTCTATTGTCACAAAAGAATTCTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTG
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Period size: 720 Copynumber: 2.9 Consensus size: 710
19722021 AATTTTAGAA
* * *
19722031 TAAAATAACACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAGTTAAAAAATAAATATG
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* * * * * *
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* * * * *
19722159 CCTTTTGTTCTGTCATAAAACAATTATT-TTTGTCATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAACACT
129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTCTAT-TCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAA-TCT
* * * * *
19722223 AATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTTAAAGAATTAAAAAATAAA-T-TTGTTTGCCAA-A
192 AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAA--TAAAGATTTAAAAAATAAATTATTTTTTG--AACA
* ** * * * * * *
19722285 TCAGTTCAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCATTAGTTTT
253 -CA-TTCAAATAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTT
* * * * * ** *
19722350 GTCATAAAATAGGTTTTATTTGAATTCATACTAGCTTATTTGGAGCAAAATAA-ATTGAATTTAT
316 GTCATAAAACA-ATTTT-TCT--ATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAT-AATTTAT
* * * * * *
19722414 TAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGATATTTAAAAAATAATTTTGTTTACCTAACCAGTTCAAA
376 TAA-AATTCAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTA-CTAACAAGTTCAAA
* * *
19722479 TAATTATGACCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTTCTCATAAAAC
439 T-ATTATGACCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGA-TTTTTTTTTTGTCATAAAAC
* * * * * *
19722544 AAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA
502 AATTG-TTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAA
* * * *
19722609 TTAATAAGT-GATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA
566 TTAATAAGTAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGA
* * * *
19722673 GCAATTATTTATTTCAAATCATTATGACTTTTTACTCTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATA
631 ACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACTTTTTACTCTGTAATAAAACAATTCTTTCTATTCATA
*
19722738 CAAGCTTATTTGAAT
696 CAAGCTTATTTGAAG
* * * *
19722753 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCGACAATTAATAATTAA-A-AATTTTAAAAATAAATCT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAA--TTAAAAATAAATAT
* * * * * * * *
19722816 ATTTACTGAACT-AGAT-AAATAATCATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA
64 GTTTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATGA
* * * * * * * *
19722879 -C-ATTCTATTGTCACAAAAGAATTCTT-TCAGTTCATATATGCTTA-TCTGAAATAAAATAATA
129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTCT-A-TTCATACAAGCTTATTCTG-AATAAAATAAT-
* * *
19722940 CTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTGTTCAAC
190 CTAATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAAT-AA-AGATTTAAAAAATAAAT-TATTTTTTGAAC
* * * * * * * * *
19723005 ATATTTAAATAATTATGATTTTTTAAATAATTATCTATTTGAAATAGCTATAACCTTTTGTTTTG
252 ACATTCAAATAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTG
* * * * * * *
19723070 TCAGAAAAGAATTTTTTGCTGTTCATCCAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAAAAATTTGTTAAT
317 TCATAAAACAA-TTTTT-CTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAATAATTTATTAAA
* * *
19723135 ATTAAGAAAATTAATAAGTAAAATATTTTAAAAAAATAAAATCTATCTACCAAACAAGTTCAAAT
380 ATTCA-AAAATTAATAAGTAAAATA-TTT-AAAAAAT-AAATCTATTTA-CTAACAAGTTCAAAT
* * * * *
19723200 CATTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAACTTATTATGATTTTTTGTTTTGTCATAAAATA
440 -ATTATGACCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTT-TTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
19723265 ATTAGTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGGATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTGATAAT
503 ATT-GTTTTGTTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAAT
* * *
19723330 TTATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCGAACAAGTTCAAATAGTCATGACTATTT
567 TAATAAGT---AGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTT
* * * *
19723395 GAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TATTTT-CTTTTGTAATAAGACACTTCTTTC-AGT
629 GAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACT-TTTTAC-TCTGTAATAAAACAATTCTTTCTA-T
*
19723457 TCATATAAGCTTATTTGAAG
691 TCATACAAGCTTATTTGAAG
* * * *
19723477 TAAGATAATACTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGAATTGAAAGAA-GAATAT
1 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATT-AAA-AATAAATAT
* * * *
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* * * *
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129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATCT-
19723670 AATTTATTAATAATCCAAAAATTAATAAGTAAA-ATTTAAAAAATAAATGTATTTTTTGAACACA
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*
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255 TTCAAATAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * * *
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320 TAAAACAATT-TTTCTATTCATACAAGCTTATTTC-GAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATT
* ** * *
19723863 CCAAAA-TGCTAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAATAAGTTCAAATAGTTATG
383 CAAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACT-AACAAGTTCAAATA-TTATG
* * *
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446 ACCATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATTATGATT-TTTT-TTTTGTCATAAAACAATTGTT
* *
19723991 TCTATTCATACAA-TTTAATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATA
509 T-TGTTCATACAAGTTT-ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
* * * *
19724055 AGTTTGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAACAACTCCAAATAATCATGA
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TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAATTAAAAATAAATATGT
TTACTGAACTAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCGTTATGACC
TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTCTATTCATACAAGCTTATTCTGAATAAAATAATCTAATT
TATTAATAATCCAAAAATTAATAATAAAGATTTAAAAAATAAATTATTTTTTGAACACATTCAAA
TAATTATGACTATTTAAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC
AATTTTTCTATTCATACAAGCTTATTTCGAATAAAATAATAATAATTTATTAAAATTCAAAAATT
AATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAACAAGTTCAAATATTATGACCATTTGAA
CAATTATTTATTTCAAATCATTATGATTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTCATACAA
GTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGTAGATTTAAAAA
ATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAATCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
ATTATGACTTTTTACTCTGTAATAAAACAATTCTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAG
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*
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*
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* * *
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* ** * *
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*
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ATAAAATTGCAAAATA
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** * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * ***
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* *
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* * * * * *
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* * * *
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* * * **
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*
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CAAAACAAAATAGCATAACTATTTGAAAAAAATGGTTCAAACAATCATAACTAATTGAACTTGTT
TGGTAAACAAATTCATTTTTAAAATATCTTACTCACTAATTTTTGTAATATTAGTAAATTAGTAT
TATTTTATTTAGAATAAGCCTATATGAATAGAAACAATTGGTTTATAACAAAACAAAAGGTCATA
ACGATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTTAAATAGTCATAACTATTGAAC
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*
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* * * * *
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* * **
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* * *
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* * * * * * * *
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* *
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* * *** * **
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* * * *
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* * * * * *
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*
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AGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAA
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* ** * *
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* * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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*** * *
19725281 AATCTTTTACTTATTAATTGGCAAAATATTAATAAATTCATATTATTTTAATCCAAATAAGTTTG
1 AATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATT-ATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTG
* * * * *
19725346 TATGAAGAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTCT
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* * * *
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130 TCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTA---TTTTAA
* * * * * ** ** ** *
19725464 AATATTTTACTTATTAA-TTTT---AT-TTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAA-AAAAATTTGAT
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* * ** * *** * *
19725523 T-TATG-ACAAAATAAAAAGGTTATAGTGATTTGA-AATA-G--ATAAT--TGTTCAAATAGTCA
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* * **** * * *
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** * ** * * * * *
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* ** * * * * *
19725683 TATACAAATAGAAACAATTATTTTGTGATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGAAATAGATAATT
63 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * * * * *
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** * * * * * * ** *
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* * * * * * *
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64 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * *
19725930 TTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTAGT-AATAGATTTATTTTTTA
129 TTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTA-TTTTAA
* ** * * * * * *
19725981 AATCTCTTACTCCTTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAATCTTATTTTATTTCAAACAAACTTA
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* ** * * *
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* * * * * *
19726110 AATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAACATAA-TTATTTTTTA
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* * *
19726174 AATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTT-ATTCCAAATAAG-TT
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* * ** * * * ** * * *
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64 -GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATT
* * * * * * * *
19726301 GCTT-ATATAGCCTTAACTATTT-ACACTGGTTTGGGAAACAAATTTATTTTTTA
128 -ATTCAAATAGTCATAACTATTTGA-ACTTGTTTGGTAAATAAATTTA-TTTTAA
* * * * *
19726354 AAT-TTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTATTATATTAGTATTATTTT-ATTCCAAATAAACT
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* * * * * * * * *
19726417 TGTATGTATAGAAATAATTGTTTTATGACATAATAAAAGGTTATAATAATTTGAAATATATAATT
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* * * ** * * *
19726482 GTTCAAATTGTCATAACTATTTAAACTAATTTAGTAAATATATTTATTTTTTA
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* * * *
19726535 AATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTT-ATTCTGAATAAGCTT
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* * * * ** * *
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* * * * * * * ** * * * *
19726663 GTTGAAATGGCCCTAATTATTTGAA-ATGATTCAGTAAACAGATTCATTTTTTA
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** * * ** *
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65 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTAT
* * * * ** * *
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* * * * * * * *
19726897 AATCTCTTAATTATT-ACTTTTATGAATAATATTAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTT
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* * * * * * *
19726961 CTATGAGCTGAAA-AATTAG-TTTAT-AGTAGAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGGTAAT
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* ** * * *
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** * *
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** * * * * * * *
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64 GTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* * * * * * * *
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* * ** *
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* * * * * ** * * *
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**
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* * ** * * *
19727492 TATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGGCTTT-AAATA-AGTAA
63 TGTATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAA-TGATTTGAAATAGA-TAA
* * * * * *
19727555 TTGTT-AGAATAGTAATAACTATTTGAGCTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCA
126 TTATTCA-AATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTA--TTTTAA
* * * ** * * * * **
19727611 AATCTCTTGCTTATTATTTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTG
1 AATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTA-TATTATTTTAATTCAAATAAGCTTG
*** * * *
19727676 TATGATGTGAAACAAATATTTTATGACTAAAAC--AAGGTCA-AACGATTTGAAATAGATAATTA
65 TATGAACAGAAACAATTGTTTTATGA-TAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTA
* *
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AATCTTTTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATAAATTATATTATTTTAATTCAAATAAGCTTGT
ATGAACAGAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT
CAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTAA
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19725325 ATTTTAATCC
* * *
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* * *
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66 TAAATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGGTAAACAGA-TTAATTTTTT-AA
*
19725465 ATATTTTACTTATTAATTTTATTTG
129 ATATCTTACTTATTAATTTTATTTG
* * *
19725490 AAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAA-AATTTGATTTATGACAAAATAAAAAGGTTATAGTGATTT
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* * * *
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*
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AAATAAGCTTGTATGAAGAAAAACAATTGATTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAA
TAAATAATTCTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTATTAGGTAAACAGATTAATTTTTTAAAT
ATCTTACTTATTAATTTTATTTG
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19725512 AAAAATTTGA
* * * ** *
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* * *
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* **
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126 ATAAATTAGAATTATGTCATTTCGAATAAACTTATA-AAATAGAAACAATTAT
* * * * *
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1 TTTATGACAAAACAAAAGA-TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAT
* *
19725768 TTGCACTGGTTAGACTAATAAATTCATTTTTTAAATC-CATTACTTATTAACTTTTAGAATATTA
65 TTGAACTGGTTAG--TAATAAATTAATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAA-TTTTAGAATATTA
* * *
19725832 ATAAATTAGCATTACT-TCATTTTGAATAAAACTGTAT-GAATAGAAACAATTAT
126 ATAAATTAGAATTA-TGTCATTTCGAAT-AAACT-TATAAAATAGAAACAATTAT
* * * *
19725885 TTTATGACAAAACAAATGATCATAATGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * ** *
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66 TGAACTGG-TTAGTAATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-AGAATATTAATA
* * * * * * * * **
19726015 AATTA-ATCTTATTTTATTTCAAACAAACTTATATGAACAAAAACTTTTAT
129 AATTAGA-ATTATGTCATTTCGAATAAACTTATA-AAATAGAAACAATTAT
*** * *
19726065 TCTATGAATGAACAAAAACATTTGTTTTATGTTATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
1 T-T-T--ATG-AC-AAAACAAAAG----A--TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATA
* * * * * * *
19726130 GTCATAATTATTTGAACTAGTTTGGCAAACATAATT-ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTT
54 GTTATAACTATTTGAACT-GGTTAG-TAATA-AATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTT
* * ** * * * * * *
19726194 TTGAAATATTAATAAATTTGTTTTATTTTATTCCAAAT-AAGTTACTAAGAATTGAAA-AATTAT
116 TAG-AATATTAATAAATTAGAATTATGTCATTTCGAATAAACTTA-TAA-AATAGAAACAATTAT
* * * * * * * * * *
19726257 TCTACGGCAAAACAAAAGGTTATAATGATTTGAAATAAAGAATTGCTT-ATATAGCCT-TAACTA
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAG-TTATAACTA
* * * * * *
19726320 TTT-ACACTGGTTTGGGAAACAAATTTATTTTTTAAATTTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATT
64 TTTGA-ACTGG-TT-AGTAATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATT
* * * * * * * * ** * *
19726384 ATTATATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAACTTGTATGTATAGAAATAATTGT
125 AATAAATTAGAATTATGTCATTTCGAATAAACTTATA-AAATAGAAACAATTAT
* * * * ** * * *
19726438 TTTATGACATAATAAAAGGTTATAATAATTTGAAATATATAATTGTTCAAATTGTCATAACTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
* ** * * * * * *
19726503 TAAACTAATTTAGTAAATATATTTATTTTTTAAATCTTTTACATATTAATTTTTGAAATATTAGT
66 TGAACT-GGTTAGT-AATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAAT
* * * * * * *
19726568 AAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGAATGATAA-A-AAACATTTGT
128 AAATTAGAATTATGTCATTTC-GAATAAACTT--AT-AAAATAGAAACAATTAT
* * * * ** * * *** *
19726619 TATATGACCAAACAAAAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTGAAATGGCCCTAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * *
19726684 TGAAATGATTCAGTAA-ACAGATTCATTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAA
66 TGAACTGGTT-AGTAATA-A-ATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAA
* * * * * * * ** *
19726748 TAAATTTA-TATTATTTTATTTTGAATAAGCCTGTATGAACT-GAAATGATTGT
127 TAAA-TTAGAATTATGTCATTTCGAATAA-ACT-TATAAAATAGAAACAATTAT
* * * * * * * * *
19726800 TTTATGATAGAACCAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT-TAAATGT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTAT
* * * * * * * *
19726864 TTGAATTGCTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAATTATTACTTTTATGAATAATAT
65 TTGAACTGGTT-AGT-AATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA-GAATATTAA
* * * * * ** *
19726929 TAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAACTTCTATGAGCT-GAAA-AATTAG
127 TAAATTAGAATTATGTCATTTCGAATAAAC-T-TATAAAATAGAAACAATTAT
* * * * * * * * * *
19726980 TTTAT-AGTAGAACAAAAGGTTATAATGATTTAAAATAGGTAATTATTCAAATAG---GAACTAG
1 TTTATGA-CAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * * *
19727041 TT---C-AG-TA--AACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTAAAATATTAATA
65 TTGAACTGGTTAGTAATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTAGAATATTAATA
* * * * ** * ** * *
19727099 AATTAGTATTATTTTA-TTCTAGATAGGCTTGTATGATGACAAACAATTGT
129 AATTAGAATTATGTCATTTCGA-ATAAACTTATAAAAT-AGAAACAATTAT
* * * * * * * ** *
19727149 TTTTTCACAAAACAAAAGTTCATAATGATTTGAAACAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * * * * * * * *
19727214 TAAATTGATTTGGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTAGGAATACTAAT
66 TGAACTG-GTTAGT-AATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTA-GAATATTAAT
* * * * * *
19727279 AAATTATTGTTATTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTA-AAAAAATTAT
128 AAATTA--G--A--ATTATGTCATTTCGAATAAAC-T-TATAAAATAGAAACAATTAT
* * * * * ** *
19727336 TTTATGATAAAACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
* ** * *
19727401 TTAACTAATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTAGAAATATTAAT
66 TGAACT-GGTTAGT-AATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAAT
* * * * * * * * *
19727462 AAATTAGTATTATTTTATTCCGTATAAGCTTATATTAATTGAAACAATTGT
128 AAATTAGAATTATGTCATTTCGAATAAACTTATA-AAATAGAAACAATTAT
* * *
19727513 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGGCTTT-AAATA-AGTAATTGTT-AGAATAGTAATAACT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAAC-GATTTGAAATAGA-TAATTGTTCA-AATAGTTATAACT
* ** * * * * * * *
19727575 ATTTGAGCTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTATTTTTTTGAATGT
63 ATTTGAAC-TGGTTAGT-AATAAATTAATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTA-ATTTTAGAATAT
* * * * * * * ** * *
19727640 TAATATATTAGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATGATGTGAAACAAATAT
124 TAATAAATTAGAATTATGTCATTTCGAATAAACTTATAAAAT-AGAAACAATTAT
* * *
19727695 TTTATGACTAAAAC--AAGGTCA-AACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTT-TAACTA-
1 TTTATGAC-AAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAT
* * * *
19727755 TT----TGG--A--AACACATTTA-TTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
65 TTGAACTGGTTAGTAATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAATA
* * * * * * *** * *
19727807 AATCAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTCTGATCAAAAACAATTGT
129 AATTAGAATTATGTCATTTCGAATAAACTTATAAAAT-AGAAACAATTAT
* * ** * * * * * * * ** * *
19727857 TTGATAACAAAGTAAAAGGTTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAGATGGCCATAATTA-G
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
* * *
19727921 TGTAATTGATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTAGAAATATTAA
66 TG-AACTGGTT-AGT-AATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAA
* * * * * * * * *
19727982 TAACTTAGTATTATTTTA-TTCTGTATAAGCTTGTATTAACTA-AAACAATTGT
127 TAAATTAGAATTATGTCATTTC-GAATAAAC-T-TATAAAATAGAAACAATTAT
* * * * *
19728034 TTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTTCAACTAGTAATAACTAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTTATAACTAT
* * * * * * *
19728099 TTGAACCT-ATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCTCTTTCATATTAATTTTTCA-AATTT
65 TTGAA-CTGGTT-AGT-AATAAATTAATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAA-TTTT-AGAATAT
* * * * ** *
19728162 TAATAAATTAGTATTAAT-TTATTTTGAATAAACTTGTGTGAATTGAAACAATTAT
124 TAATAAATTAGAATT-ATGTCATTTCGAATAAACTTAT-AAAATAGAAACAATTAT
* * * * * *
19728217 TTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAACCAT
1 TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TATAACTAT
* * ** * * * *
19728281 ATAAACTTATTTGATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAT
65 TTGAACTGGTTAG-T-AATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAG-AATATTAA
19728346 TAAATT
127 TAAATT
19728352 TGTATTATTT
Statistics
Matches: 2079, Mismatches: 412, Indels: 315
0.74 0.15 0.11
Matches are distributed among these distances:
161 9 0.00
162 62 0.03
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ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (177 bp):
TTTATGACAAAACAAAAGATCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTATAACTATT
TGAACTGGTTAGTAATAAATTAATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTAGAATATTAATAAA
TTAGAATTATGTCATTTCGAATAAACTTATAAAATAGAAACAATTAT
Found at i:19725924 original size:520 final size:512
Alignment explanation
Indices: 19724957--19725979 Score: 1292
Period size: 520 Copynumber: 2.0 Consensus size: 512
19724947 ATTAACAAAT
* * * *
19724957 TTATTTATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAATAATTGCTTTATGACAATATAAAAGG
1 TTATTAATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGATTTATGACAAAATAAAAGG
* *
19725022 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTTGGTAAGCA
66 TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTCGGTAAACA
* * * *
19725087 AATTCATTTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTGATAAATTAGTATTATTTTAT
131 AATTCAATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTAT
** * * * * *
19725152 TTAGAATAAGCCTATGTGAACTGGAACAATTGTTTTATAATGAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
196 TTAGAATAAGCCTATGACAAATGAAACAATTATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG
* * * * * *
19725217 AAATAGATAATTATTTAAATAGTGAAGACTATTTGAACTTGTTTGGTAAATAAATTTATTTTAAA
261 AAATAGATAATTATTTAAACAATGAAGACTATTTGAACTGGTTAGCTAAATAAATTCATTTTAAA
** *
19725282 ATCTTTTACTTATTAATTGGCAAAATATTAATAAATTCATATTATTTTAATCCAAATAAGTTTGT
326 ATCCATTACTTATTAATTGGCAAAATATTAATAAATTCATATTATTTTAAT-C-AATAAG-CTGT
* *
19725347 ATGAAGAAAAACAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTCTT
388 ATGAAGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTCTT
* *
19725412 CAAATAGTCATAATTATTTGAACT-TATTAGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAAATATTTTAC
453 CAAATAGTCATAACTAATTGAACTGT-TTA-GT-AATAGATTTATTTTTTTAAAATATTTTAC
*
19725474 TTATTAATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAATAGAAAAAAATTTGATTTATGACAAAATAAAA
1 TTATTAATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAG-AAAAAA-TTGATTTATGACAAAAT-AAA
* * *
19725539 AGGTTATAGTGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAA
63 AGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTCGGTAA
* * *
19725604 ACAGATT-AATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTAGAATTATGT
128 ACAAATTCAATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGT
* * * * *
19725668 TATTTCGAATATGCTTAT-ACAAATAGAAACAATTATTTTGTGATAAAACAAAAAGTCATAACGA
193 TATTTAGAATAAGCCTATGACAAAT-GAAACAATTATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGA
* * *
19725732 TTTGAAATAGATAATTGTTTAAACAATTATA-ACTATTTGCACTGGTTAGACT-AATAAATTCAT
257 TTTGAAATAGATAATTATTTAAACAATGA-AGACTATTTGAACTGGTTAG-CTAAATAAATTCA-
* ** *
19725795 TTTTTAAATCCATTACTTATTAACTT-TTAGAATATTAATAAATTAGCATTACTTCATTTTGAAT
319 TTTTAAAATCCATTACTTATTAA-TTGGCAAAATATTAATAAATT--CA-TA-TT-ATTTT-AAT
* * *
19725859 -AA-AA-CTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAAC-AAATGATCATAATGATTTGAAA
377 CAATAAGCTGTATGAAGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAA
* *
19725920 TAAATAATTGTTCAAATAGTTATAACTAATTGAACTGGTTTAGTAATAGATTTATTTTTT
441 TAAATAATTCTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACT-GTTTAGTAATAGATTTATTTTTT
19725980 AAATCTCTTA
Statistics
Matches: 435, Mismatches: 54, Indels: 32
0.83 0.10 0.06
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.11, T:0.41
Consensus pattern (512 bp):
TTATTAATTTTATTTGAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTGATTTATGACAAAATAAAAGG
TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTAATTGAACTTGTTCGGTAAACA
AATTCAATTTTTTAAATCTCTTACTCATTAATTTTTAGAATATTAATAAATTAGAATTATGTTAT
TTAGAATAAGCCTATGACAAATGAAACAATTATTTTATAATAAAACAAAAAGTCATAACGATTTG
AAATAGATAATTATTTAAACAATGAAGACTATTTGAACTGGTTAGCTAAATAAATTCATTTTAAA
ATCCATTACTTATTAATTGGCAAAATATTAATAAATTCATATTATTTTAATCAATAAGCTGTATG
AAGAAAAACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATAATTCTTCAA
ATAGTCATAACTAATTGAACTGTTTAGTAATAGATTTATTTTTTTAAAATATTTTAC
Found at i:19727558 original size:177 final size:177
Alignment explanation
Indices: 19727035--19728614 Score: 1049
Period size: 177 Copynumber: 8.8 Consensus size: 177
19727025 TTCAAATAGG
* *
19727035 AACTAGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCCTACTTATTAATTTTTA-AAATATTAATA
1 AACTA-TTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAA--T-CTACTTATTAA-TTTTAGAAATATTAATA
* * * * *
19727099 AATTAGTATTATTTTA-TTCTAGATAGGCTTGTA-TGA-TGACAAACAATTGTTTTTTCACAAAA
61 AATTAGTATTATTTTATTTCGA-ATAAGCTTGTATTAATTG--AAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * * * * * * *
19727161 CAAAAGTTCATAATGATTTGAAACAGATAATTGTTGAAATGGCCATAATTATTTA
123 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTT
* * * * * *
19727216 AATTGATTTGGTAAATAGATTCACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTAGGAATACTAATAA
1 AACT-ATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAAT--C-TACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAA
* * * * * *
19727281 ATTATTGTTATTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATGATAA
62 ATTA--G----TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAA
* * * *
19727346 AACAAAAGGTCATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTT
121 AACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTT
* *
19727403 AACTAATTTAGTAAACAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATT
1 AACT-ATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATT
* * *
19727467 AGTATTATTTTATTCCGTATAAGCTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
65 AGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * *
19727532 TCATAACGGCTTT-AAATA-AGTAATTG-TTAGAATAGTAATAACTATTTG
130 TCATAAC-GATTTGAAATAGA-TAATTGTTTA-AATAGTCATAACTATTTT
* * * * * *
19727580 AGCTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATCTCTTGCTTATTATTTTTTTG-AATGTTAAT
1 AAC-TATTTAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAA--TC-TACTTATTA-ATTTTAGAAATATTAAT
* * * * * *
19727644 ATATTAGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTA-TGATGTGAAACAAATATTTTATGACTAAAA
60 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAAT-TGAAACAATTGTTTTATGAC-AAAA
*
19727708 C--AAGGTCA-AACGATTTGAAATAGATAA----TT--AT--TC-TAA-TAGTTT
123 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTT
* * * * *
19727750 AACTATTT-GGAAACACATTTA-TTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATCA
1 AACTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTA
* * ** * * **
19727812 GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGT-CTGATCAAAAACAATTGTTTGATAACAAAGTAAAAGG
66 GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAAT-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * * * * * *
19727876 TTAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAGATGGCCATAATTAGTGT
130 TCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTT
* * * *
19727924 AATTGATTCAGTAAATAAATTTATTTTTTAAATCT-CTTATTAATTTTAGAAATATTAATAACTT
1 AACT-ATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATT
* * *
19727988 AGTATTATTTTA-TTCTGTATAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
65 AGTATTATTTTATTTC-GAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAG
* * * * *
19728052 GTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTTCAACTAGTAATAACTATTTG
129 GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTT-AAATAGTCATAACTATTTT
** ** *
19728102 AACCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCT-CTTTCATATTAATTTTTCAAATTTTAAT
1 AA-CTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTT-AAATCTAC--T--TATTAATTTTAGAAATATTAAT
* * * * * * *
19728166 AAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAACTTGTGTGAATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACA
60 AAATTAGTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * *
19728231 AAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACCATATA
125 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-TAAATAGTCATAACTATTTT
* * *
19728284 AACTTATTT-GATAAATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTA
1 AAC-TATTTAG-TAAATAGATTTATTTTTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTAGAAATATTAATA
* *** * * ** * *
19728348 AATTTGTATTATTTTAAAACCAAATAAGCTTGTA-CAA-ACAAAAAATTTGTTTTATGATAAAAC
61 AATTAGTATTATTTT-ATTTCGAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAA-TTGTTTTATGACAAAAC
* * ** ** * * * *
19728411 -AATGGTCATAAGGATTTGAAATTCATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTG
124 AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTT
* * ** * * * * * * *
19728464 AACTGGTTCAACAATTAGATTTTTTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTATGTTTCA-AAATATTATT
1 AACT-ATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTACTT-ATTA--AT-TTT-AGAAATATTAAT
* ** * * * * *
19728528 AAATTAGTA-TATTTCA-TTCTGAAATAAAATAGTATAAATAGAACCAATTGTTTGATGACAAAA
60 AAATTAGTATTATTTTATTTC-G-AATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA
* * *
19728591 CAAAAGGTTATAGCTATTTGAAAT
123 CAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT
19728615 GGATTGGTAA
Statistics
Matches: 1108, Mismatches: 214, Indels: 153
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
161 9 0.01
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166 3 0.00
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189 1 0.00
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Consensus pattern (177 bp):
AACTATTTAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTA
GTATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGT
CATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTTAAATAGTCATAACTATTTT
Found at i:19727916 original size:521 final size:525
Alignment explanation
Indices: 19727292--19728277 Score: 1464
Period size: 521 Copynumber: 1.9 Consensus size: 525
19727282 TTATTGTTAT
* * *
19727292 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTTATGATAAAACAAAAGGTC
1 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTGATAACAAAACAAAAGGTC
* * * * *
19727357 ATAACAATTTAAAATAGATAATTGTTTAAATAGCCATAATTATTTTAACTAATTTAGTAAACAAA
66 AGAACAATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGCCATAATTAGTGTAACTAATTCAGTAAACAAA
19727422 TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGTAT
131 TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGTAT
* * *
19727487 AAGCTTATATTAATTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGGCTTTAAATA-A
196 AAGCTTATATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTTAAATAGA
* * * * *
19727551 GTAATTGTTAGAA-TAGTAATAACTATTTGAGCTTATTTGGTAAATAGATTTATTTTTTCAAATC
261 -TAATTGTTACAACTAGTAATAACTATTTGAACCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATC
* * ** * * *
19727615 TCTTGCTTATTATTTTTTTGAATGTTAATATATTAGGATTATTTTATTTTGAATAAGCTTGTATG
325 TCTTGCATATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTTTGAATAAACTTGTATG
*
19727680 -ATGTGAAACAAATATTTTATGACTAAA-ACAAGGTC-AAACGATTTGAAATAGATAATTATTCT
390 AAT-TGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCT
19727742 AATAGT-TTAACTATTTGGAAACACATTTATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
454 AATAGTCTTAACTATTTGGAAACACATTTATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
19727806 AAATCAG
519 AAATCAG
* * * **
19727813 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTCTGATC-AAAAACAATTGTTTGATAACAAAGTAAAAGGT
1 TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAA-AATTATTTGATAACAAAACAAAAGGT
* * * * * * * *
19727877 TAGAACGATTTGAAATAGATAATTATTTAGATGGCCATAATTAGTGTAATTGATTCAGTAAATAA
65 CAGAACAATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGCCATAATTAGTGTAACTAATTCAGTAAACAA
* *
19727942 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAACTTAGTATTATTTTATTCTGTA
130 ATTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGTA
* * *
19728007 TAAGCTTGTATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTTAAATAG
195 TAAGCTTATATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTTAAATAG
*
19728072 ATAATTGTTTCAACTAGTAATAACTATTTGAACCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATC
260 ATAATTGTTACAACTAGTAATAACTATTTGAACCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATC
* * * *
19728137 TCTTTCATATTAATTTTTCAAATTTTAATAAATTAGTATTAATTTATTTTGAATAAACTTGTGTG
325 TCTTGCATATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTTTGAATAAACTTGTATG
*
19728202 AATTGAAACAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
390 AATTGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTA
19728267 ATAGTCTTAAC
455 ATAGTCTTAAC
19728278 CATATAAACT
Statistics
Matches: 410, Mismatches: 48, Indels: 10
0.88 0.10 0.02
Matches are distributed among these distances:
520 5 0.01
521 233 0.57
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523 9 0.02
524 33 0.08
525 5 0.01
ACGTcount: A:0.40, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (525 bp):
TATTATTTTATTTCGAATAAGCTTGTATGAACTAAAAAAATTATTTGATAACAAAACAAAAGGTC
AGAACAATTTAAAATAGATAATTATTTAAATAGCCATAATTAGTGTAACTAATTCAGTAAACAAA
TTTATTTTTTAAATCTCTTATTAATTTTAGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCGTAT
AAGCTTATATTAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGACTTTAAATAGA
TAATTGTTACAACTAGTAATAACTATTTGAACCTATTCGGTAAATAGATTTATTTTTTAAAATCT
CTTGCATATTAATTTTTCAAATGTTAATAAATTAGGATTAATTTATTTTGAATAAACTTGTATGA
ATTGAAACAAATATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAA
TAGTCTTAACTATTTGGAAACACATTTATTTTTAAATCTCTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
ATCAG
Found at i:19728791 original size:18 final size:17
Alignment explanation
Indices: 19728746--19728793 Score: 53
Period size: 18 Copynumber: 2.8 Consensus size: 17
19728736 ACAAAAACTA
*
19728746 ATAATGATTTAAAATAGT
1 ATAATTATTT-AAATAGT
*
19728764 -TAATTGTTTAAATAGTT
1 ATAATTATTTAAATAG-T
19728781 ATAATTATTTAAA
1 ATAATTATTTAAA
19728794 CTGGTTTGGT
Statistics
Matches: 25, Mismatches: 3, Indels: 4
0.78 0.09 0.12
Matches are distributed among these distances:
16 6 0.24
17 8 0.32
18 11 0.44
ACGTcount: A:0.46, C:0.00, G:0.08, T:0.46
Consensus pattern (17 bp):
ATAATTATTTAAATAGT
Found at i:19729004 original size:181 final size:178
Alignment explanation
Indices: 19728629--19730221 Score: 557
Period size: 181 Copynumber: 8.9 Consensus size: 178
19728619 TGGTAAACAA
* * *
19728629 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTAATTAATTTTCTAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTT
1 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* * * * * ** * *
19728694 CAAACAAACTTATATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAACTAATAATGATTTAAA
65 CCAATAAACTTATATG-ACTAAAATAATTG-TTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAA
* * * * * * **
19728759 ATAGTTAATTGTTTAAATAGTTATAATTATTTAAACTGGTTTGGTAAATAG
128 ATAGATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAG
* * * * * *
19728810 AATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATAAAATTTT-GAAATCTTAACAAATTAGTTTTATTTTATT
1 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTAT-AAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* *
19728874 CCAAGTAAACTTATATGAGCTAAAATAATTGTCTTAAGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTGGA
65 CCAA-TAAACTTATATGA-CTAAAATAATTGT-TTAAGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGA
* * * * *
19728939 AATAGATAATTCTTCATATAGTCT-CAACTGTTTGAACTAGTTCGACAAATGG
127 AATAGATAATTGTTCAAATAGT-TACAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAG
* * * * * *
19728991 ATTTACATTTTAAATCTCTTAGTTATGAATTTTCAAAATATTATTACATTAATATTATTTTATTT
1 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TT
* * * * * * * * *
19729056 CGAATAAACTTGTATGAATAGAAATAATTATTTTATACAGAACAAAAGGTTATAACAATTTGAAA
65 CCAATAAACTTATATGACTA-AAATAATTGTTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAA
* * * ** *
19729121 TAGATAATTGTTCAAATA--CATAATTATTTAAACTAGTTTAATAAATAG
129 TAGATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAG
* ** *
19729169 ATTTAATTTTTAAATCAATTAC---T-AATTCTT-GAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
1 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATT-TTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
** * * * * * *
19729229 TTAAATAAGCTTGTATG-TTGGAAAA-AATTGTTTTATGACCAAACGAAAA-GTATTAAC----T
64 TCCAATAAACTTATATGACT--AAAATAATTG-TTTAAGACAAAAC-AAAAGGTAATAACGATTT
* * * * * * * * ** *
19729287 ---AT---T--TTGTTTAAATGGCTAAAATTATTTGAGCT-GATTTGGTAAATTG
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACTAG-TTCGACAAATAG
* ** * *
19729333 ATTTA-TTTTTCAAATCTTTTAC---T-AATTTTTGAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATT
1 ATTTACTTTTT-AAATCTCTTACTTATAAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
*** * * * * * * * * ** *
19729393 TTGGAGAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTACGATAAAACAAAAGTTCATAAAAATTTTA
64 TCCAATAAACTTATATG-ACTAAAATAATTG-TTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGA
* * * * * * * * *
19729458 AATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTC-AGTAAACAA
127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACTAGTTCGA-CAAATAG
* * * * ** *
19729510 ATTTATTTTTTCAAATCTTTTAATTATTAATCTTT-TGAATGTTAATAAATTAG---TA-TTTAT
1 ATTTACTTTTT-AAATCTCTTACTTATAAAT-TTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAT
* * * * * * * *
19729570 TCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAATAGTTTTATGACTAAACAAAAAGTTAA-AACAATTT
64 TCC-AATAAACTTATATG-ACTAAAATAATTG-TTTAAGACAAAAC-AAAAGGTAATAACGATTT
* * * * * * * * *
19729634 GAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT-TAGCCATTTAAACTGATTTAG-CAAACAT
125 GAAATAGATAATTGTTCAAATAGT-TACAACTATTTAAACT-AGTTCGACAAATAG
* * ** * *
19729688 ATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAAATTAATA-T-TTTTA-T
1 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTCAAAATATTAAT-AAATTAGTATTATTTTATT
** ** ** * *
19729750 CCAAATAGGCTTATATGA-TCAGAAACTCTTTTTGTTTTTGACAAAAC-AAAGATTATAACGATT
65 CC-AATAAACTTATATGACT-A-AAA---TAATTGTTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAACGATT
* * * * * *** * * * * * *
19729813 TGAGATTGATATTTATTCAAATGGTCGTAACAAATTGAACTGGTTCAAAAAATAG
124 TGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAG
* * * ** * *
19729868 TTTTAGTTTTTAAATCTCTTATTTA-ATAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTGTTATTTTAGT
1 ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATA-AATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-T
*** * *** * * * * * * *
19729932 TTGGACATGTTTTTATGAACTAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTTA
64 TCCAATAAACTTATATG-ACTAAAATAATTG-TTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGA
* * * * * * * * *
19729997 AATAGATAATTGTTCAAATAATCATATCTA-TTAGAGCTTA-TTTGATAAACAT
127 AATAGATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTA-AAC-TAGTTCGACAAATAG
* * *** * *
19730049 ATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTTAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTTTT
1 ATTTA-CTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * *
19730114 CCAAATAATCTTGTATGAACTAAAATAATTGCTTTATGACTAAAA-AAAAGGTTAGAACGATTT-
65 CC-AATAAACTTATATG-ACTAAAATAATTG-TTTAAGAC-AAAACAAAAGGTAATAACGATTTG
* * ** * *
19730177 AATATTGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACCATTTGAACTAGTTC
126 AA-ATAGATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACTAGTTC
19730222 TGCAACACAC
Statistics
Matches: 1070, Mismatches: 263, Indels: 157
0.72 0.18 0.11
Matches are distributed among these distances:
162 9 0.01
163 8 0.01
164 90 0.08
165 20 0.02
166 1 0.00
167 2 0.00
169 1 0.00
170 1 0.00
172 2 0.00
173 5 0.00
174 61 0.06
175 9 0.01
176 3 0.00
177 59 0.06
178 154 0.14
179 48 0.04
180 158 0.15
181 267 0.25
182 159 0.15
183 12 0.01
184 1 0.00
ACGTcount: A:0.40, C:0.09, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATAAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTC
CAATAAACTTATATGACTAAAATAATTGTTTAAGACAAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATA
GATAATTGTTCAAATAGTTACAACTATTTAAACTAGTTCGACAAATAG
Found at i:19730243 original size:182 final size:177
Alignment explanation
Indices: 19729355--19730243 Score: 624
Period size: 182 Copynumber: 4.9 Consensus size: 177
19729345 AATCTTTTAC
* * *** * *
19729355 TAATTTTTGAAATATTAAAAAAATAGTATTATTTTATTT-TGGAGAAGCTTTTATGAACTAAAAC
1 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-A-TATTTT-TTTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAAC
* * ** * *
19729419 AATTGTTTTACGATAAAACAAAAG-TTCATAAAAATTTTAAATAAATAATTGTTCAAATAATCAT
63 AATTGTTTTATGACAAAA-AAAAGATT-ATAACGA-TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * *
19729483 AACTATTTGAACTTGTTCAGTAAACAAATTTATTTTTTCAAATCTTTTAATTAT
125 AACCATTTGAACTAGTTCTGCAAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTAT
* *
19729537 TAATCTTTTG-AATGTTAATAAATTAG-TA-TTTATTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
1 TAAT-TTTTGAAATATTAATAAATTAGATATTTTTTTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACAA
* * * * * * *
19729599 TAGTTTTATGACTAAACAAAAAG-TTAAAACAATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAG
65 TTGTTTTATGAC-AAA-AAAAAGATTATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAA
*
19729663 CCATTTAAACT-GATT-TAGCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
127 CCATTTGAACTAG-TTCT-GCAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * * * *
19729714 TAATTTTTGAAATATTATTAAAATTA-ATATTTTTATCCAAATAGGCTTATATGATC-AGAAACT
1 TAATTTTTGAAATATTAAT-AAATTAGATATTTTTTTCCAAATAAGCTTGTATGAACTA-AAA--
** * * * * * * *
19729777 CTTTTTGTTTT-TGACAAAACAAAGATTATAACGATTTGAGATTGATATTTATTCAAATGGTCGT
62 C-AATTGTTTTATGACAAAAAAAAGATTATAACGATTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCAT
* * * * * * * *
19729841 AACAAATTGAACTGGTTC--AAAAAATAGTTTTAGTTTTTAAATCTCTTATTTAA
125 AACCATTTGAACTAGTTCTGCAAACATA--TTTATTTTTTAAATCTCTTACTTAT
* * ** * * *
19729894 TAATTTTTGAAATATTAATAAAGTAGTGTTATTTTAGTTTGGACAT--GTTTTTATGAACTAAAA
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* * *
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* * * * *
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** * * *
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1 TAATTTTTGAAATATTAATAAATTAG-A-TATTTTTTTCCAAATAAGCTTGTATGAACTAAAACA
* * * * * **
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*
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* * * * *
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* * *
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* * * ** * * *
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* ** * * * * *
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*
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*
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* * * *
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* *
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* * * * * * *
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* * *
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* * * * *** *
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * * *
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** * * * * * * * *
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* ** * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * * *
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* * * * * * *
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* *
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* * * *
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1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC-
** * * * *
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* ** * * *
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* * *
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* * * * * ** * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * *** *
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* * ** * *
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* * * * * *
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1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * ** * *
19732439 TAACTATTTGATCTGGTTCAATAAACATATTGACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAA
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* * * * * * * *
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* * * ** **
19732555 ACAATTATTTTATGAC-AAACGAAGA-TCATAGCGATTTGTGATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
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* *** * *
19732618 TAACTATTTGAAAT-GATTTTTTAAACAAATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTGAA
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* ** * * *
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129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGTATGAA--CATAA
* * * * * *
19732732 AAAATTGTTTTATGACAAAATAAAATA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTTAAATGGAC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA-AGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * ** *
19732796 ATGAA-TATTTAAACTTA-TTTGATAAATAAATATATTTTTCAAATCTCCAAATTATTAATTTTT
65 AT-AACTATTTGAAC-TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCT-TTACTTATTAATTTTT
** * * * *
19732859 ACAATATTAATAAATTAGCGTTATTTTATT-TCAAATAAACTTGTATGAATAGAA
127 A-AATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACATAA
* * ** * * *
19732913 ACAATAGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATTATAACAATTTGAAATAAATAATTTTTTAAATAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* ** * ** *
19732977 ATAACTATTTGAACTCA-CTCTATAAATAGGTTT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTTG
65 ATAACTATTTGAACT-AGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATC-TTTACTTATTAATTTTT-
* * * * * * * *
19733040 GAATTTTAATAAATTGGTATTATTTTATTC-CAATTAAGTTTTTATGAATAGAA
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* * * *
19733093 ACAATGGGTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTC
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTC
* * *
19733158 ATAACTATTTGAAC-ATGTTCAG-AAA-ATGGATTTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTT
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** *
19733220 GAAATATTAATAAATT--TAACTTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATG-A-ATAA
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* * * * * **
19733272 ACCAATTGTTTTATGTCAAAATAAAAGGT--TAATGTTTTGAAATATATAATTGTTCAGCTAGTC
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* * *
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* * * * * *
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* * * * ** * *
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1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* ** * *
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* * * * *
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* ** * * *
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1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTG-TTCAAATAGTC
* *
19733698 ATAA-TGATTTAAACTTA-TTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTT
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*
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* * * * * ** * * * *
19733815 AAAATTCTTTTATAACAAAACAAAATGTTATAGCGTTTTCAAATATATAATTGTTCAAACAGTCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * ** * * * *** *
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* * *
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* * * * * * *
19733996 ACAATTCTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAATCA
1 ACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * *
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* * * *
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* * * ** * *
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* *** * * *
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* *
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* * * **
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* * * * * * *** * *
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* * * ** * * ** * * *
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* * *
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* * ** * *
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* * ** * *
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* * * * *
19735186 AAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTATCCTAAATAAGTTTATATGAAC-TAAA
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* * * * * ** *
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* * * *
19735367 GAATGTTAATAAATTAATATTATTTTATT-TCGAATAAGCATGTATGAAC-TAAA
127 AAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACAT-AA
* * * * * * * *
19735420 AAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT
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* * * * *
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* * *
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** * * * *
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* * * * *
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* * * * * *
19732513 GTATAGCAATATTTTACTCTAAATAAGCTTGTATGAATAGAA
319 AT-TAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAA
* * ** **
19732555 ACAATTATTTTATGAC-AAACGAAGA-TCATAGCGATTTGTGATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
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* *** * *
19732618 TAACTATTTGAAAT-GATTTTTTAAACAAATTTAGTTTTTAAATC--T-CTTATTAATTTTTGAA
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19732743 ATGACAAAATAAAATATCATAATGATTTGAAATAGATAATAGTTTAAATGGACATGAA-TATTTA
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* * * * * * ** *
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* ** * * *
19732913 ACAA-TAGTTTTATGACAAAAC-AAAAGATTATAACAATTTGAAATAAATAATTTTTTAAATAGT
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* ** * ** *
19732976 CATAACTATTTGAACTCA-CTCTATAAATAGGTTT-TTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTTTT
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19733039 GGAATTTTAATAAATTGGTATTATTTTATTCCAATTAAGTTTTTATGAAT-AGAAACAATGGGTT
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* *
19733103 TATGACAAAACAAAAGGTCATAATTATTTGAAATAGATAATTTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
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* * ** * *
19733168 GAACATGTTCAGAAAATGGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATA
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** * *
19733232 AATT--TAACTTATTTTATTCAAAATAAGCTTGCATGAATA-AA
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* * *
19733336 TAACTATTTGAACTTA-TAT-GGTAAATAAATTCT-TTTTTTAATTCTCTTACTCT-TTAATTTT
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* * * * * * *
19733397 CAGAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAGTTC-AAACAAACTTATAAGAA-CTAAAACAATTAT
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19733460 TTTATTACAAAAGAAAAGGTCATTGTGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATT
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* * * * *
19733525 TGAACTTGTTTAGTAAACATATTTATTTTTTAAAATATTTTACTTATTAATTGTCTAAATATTAA
254 TGAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATT-TTTAAATATTAA
* * * *
19733590 TAAATTAGTATTATTTTAATATGAATAAACTTGTATGAATAGAA
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* * ** * * *
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* *
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* *
19733761 TTAATATTAATAAATTTA-TATTATTTTATT-TGAAATAAGCTTGTATGAA-CATAAAA-AATTC
126 TAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATCA-AAAACAATTG
* * ** * * * * *
19733822 TTTTATAACAAAACAAAATG-TTATAGCGTTTTCAAATATATAATTGTTCAAACAGTCATAATTA
188 TTTTATGACAAAACAAAA-GATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTA
* * * * * *** * *
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* * *
19733951 ATAAATTAATATTATTTTATTCCT-AATAAGCTTATATGAACTGAA
315 ATAAATTAGTATTATTTTATT-CTGAATAAGCTTGTATGAACAGAA
* * * * * * *
19733996 ACAATTCTTTTATGACAAAATAAAAGGTCATAATGATTTAAAATAAATAATTATTCAAATAATCA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
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19734061 TGATTATTTGATCCAGTTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTATTGAA
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* * * *
19734126 ATATTAATAAATTGGTATTATTTTAATCTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTAT
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* * * * ** * * *
19734190 AACAAAACAAAAAAGTTATAATGATTTGAAATAAATAATTACTGAAATAGTAATAACTATTTAAA
194 GACAAAACAAAAGA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * * * * *
19734255 CTAGTTTAATAAATATATTTATTTTTTGAA--TCTT--TTATTAATGTTTGAAATATTAATAGAT
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* * * * *
19734316 TAATATTACCTTTT-TTC-GAACAAACTTATATGAACAAAA
321 TAGTATTA--TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAA
*
19734355 ACATTTATTTTATGACAAAACAAACAA-TCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTT-AAATAGTC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAA-AAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTC
* * * * * * * *
19734418 ATAATTATTTGAACTGGTTAGGTAAATAGATTAATAATTTTTGAA-----A--TATCAATTTTTG
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* * * * * *
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* * * *
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* * * * * *
19734601 ATTTAAATTGGTTCAGCAAACAAATTTATTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAATATT
251 ATTTGAATT-GTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATT
* * * * * *
19734666 ATTAGATTAATATTATTTTATT-TCGAATATGCTTATATGAACAAAA
314 AATAAATTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACAGAA
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19734712 ATAATTGTTTTATGATAGTAC-AAAAGATTATAATGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTC
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19734966 CTAATTC-GATAATTAGATTCACCTTTTAAATCACTTCCTTATTAATTTTGAGAATATTAACAAA
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19735030 TTATTATTATTTTAATT-TGAATAAG-TGTGTATGAATTGAA
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19735070 ACAATTATTTTATGACAAAATAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCATATAGTCT
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* * ** * *
19735135 TAACTGTCTT-AACT-GCTTTGGCGAACA-A---A-----T--CTC-TTAGTTATTAATTTTTGG
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* * * * * *
19735186 AAATATTATTAAATTAGTATTA-TTTATCCTAAATAAGTTTATATGAA-CTAAAACAATTATTTT
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* * * ** * * *
19735249 A-GAACAGAACAAAAGGTTATAACAAGTTGAAATAGAAAATTGTTCAAATAGCCATAACTATTTG
192 ATG-ACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTG
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19735313 AACTTGTTC-GATAAATAGATTTATTTTTTAAAATTTGTTGTTTAATAATTTTCTGAATGTTAAT
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* *
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* * * * * * *
19735420 AAAATTATTTTATGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCT
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * ** *
19735485 TAATTGTTTGAACTAGTTCGACAAACACATTTATTTTTTACATATC-TTACTTATTAATTTTTAG
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* * * * * * * * * * *
19735549 AATACTATTAATTTAGCAATATTTTACTCCAAATACGCTTGCATGAAT-ATAAACAATTTTTTTA
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* * * **
19735613 TGACAAAAC-AAAGATCAT-ATCAATTTGAGATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAAA
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* *
19735676 ATTAGTTC-GATAAACAGATTTAGTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTAAAAATTAATAAA
257 ATT-GTTCAG-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAAATATTAATAAA
* * * ** * *
19735736 TTGGAATTATTTTATTTTGAATAATTTTGTATAAATAGAA
320 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACAGAA
* * * * * * * * *
19735776 ACAATTGTTTTACGACAAAATATAATGTCATAACGATTTGAAATAGATAATAGTTCAAATGGTTA
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCA
* * * * * * * ** *
19735841 TGACTAATTAAACTTGTTCAGTGAACAAATTTATTTTTTAAATCTCCAACTTATAAATTTTTAGA
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* * * * *
19735906 ATATTGATAAATTAGTATTATTTTATT-TCAAATAAACTTATATGAAT-AGAAACAATAGTTTTA
129 ATATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTTGTATGAATCAAAAACAATTGTTTTA
* * * * * *
19735969 TGACAAAGCAAAAGATCATAGTGATTTGGAATAAATAACTGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAA
193 TGACAAAACAAAAGATCATAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** * * * *
19736034 CTCACTT-AGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTTTTACATT-TGAATTTTTGTAATTTTAATAA
258 -T-TGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTAC-TTATTAATTTTT-AAATATTAATAA
* * *
19736097 ATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTTTTATGAATAGAA
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* * * *
19736138 ACAATTAGTTTATGACAAAACAAAAGGTCAAAATGATTTGAAATAGA-AAGTTGATCAAATAGTC
1 ACAATTATTTTATGACAAAACAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAGATAA-TTGTTCAAATAGTC
*** * * *
19736202 ATAACTATTTGAACGT-GTTCAAAAAACATAATTATTTTTAAAATTTTTACTTATTAATTTTTTA
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* * * * * *
19736266 AATATTAATAAATTTA-TATTATTATATTCAAAATAAGCTTGCATGAA-CAGAACCAATTATTTT
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* * * * *
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192 ATGACAAAACAAAA-GATCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTT
* * * * ** * *
19736392 GAACATGTTCGGTAAACAAATTCATTTTTTAGTTCTCTTACTCATTAATTTTTGGAATATTAATA
255 GAA-TTGTTCAGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-AAATATTAATA
* * *
19736457 AATTAGTACTATTTTATGTC-AAATAAGCTTATATGAACTA-AA
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* * ** * * ** *
19736499 ACAATTGTTTTATTACAAAACAAATGGTCACAATGATTTAAAATAGATAATTAATCAAATAGTTA
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19736564 GGACTATTTGAACTTGTTCAAAAAACATATTTATTTCTTAAATCTTTTACTTATTAATTGTCAAA
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* * * * *
19736629 ATATTAATAAATTAATATTATTGTAATTTTGAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTA
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* * *
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* * *
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* * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * * * * *
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* *** ***** * * * * * * *
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* *** ** * *** * * * * *
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** * * * * * *
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** ** * *** ** * * ** *
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* * * * * * *
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** *
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* *
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* * * * *
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* * * * *
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* *
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* ** * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * * *
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* **
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* * * *
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* * *
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* * * * * * *
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* ** * *
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* *
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* * * ** ** * * * *
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* * * * * * * *
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129 AAATAAATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTTGAACTTGTTCAGA-AAACAA
* * * *
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1 ATTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTTA-TATTATTTTAT
** * * * * * * *
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* * * * ** * *
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* * * * * *
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* * ** * * * * * **
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* * * * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* *
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* *** * *
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*** * * * *** **
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* * * * * *
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* * * ** *
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* * *
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* *
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* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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*
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* *
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* * * *
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* * * *
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* * * *
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* * ** ** * * *
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* * * *
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* * * * ***
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* * * ** * * * *
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* * * *** * *
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* *
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* * ** * * * * * ** *
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* ** * * * * *
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* * ** ** * * *
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* * * * * * *
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* * ** ** *
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* * * * * *
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*
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** *
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TACTTATTAATTTTTGGAATATTAATAAATTTATATTATTTTATTAAAAATAAGCTTGCATAAAC
AGAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAGCCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAATTAA
TCATAACGATTTGAATATGTTCAATAAACAAATTAA
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* * * * *
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* * *
19741246 AACAAATTTATTTTTTCAAATCTCTTCCTTATTAATTTTTTTGAATGTTAATAAA
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* * * * * * * * *
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* * * * ** * *
19741364 AAGGTTAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTTTTAACTATTTGAA-TTAGTTCAGA
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* *
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* * * * * * *
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19741545 AGATCT-TAACAATTTGAGATTA-ATAATTGTTTAAATAGTCCTAACTATTTGAAC-TGATTCGG
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* * *
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* * *
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* * * * * * * *
19741780 ATAAACTGATTTATTTTCTAAGTTTCATACTTATT-ATTTTAGTAAGTATTAATGAA
126 GTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AA-TATTAATAAA
* * * * * * * *
19741836 TTAGTATTATTTTAATC-CATCTAAGCTTGAATTAACTAAAACAAATGTTTTATGACAAATCAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGA-ATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * ** *
19741900 AGGTTATAACAATTTTAAATTA-ACAATTGTTCAAATAGTAATAACTATTCAAACTTATTCGGTA
65 AGGTTATAATAATTTGAAA-TAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTA
* * *
19741964 AACAGATTTATTTTTTTAAATCTATTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA
129 AACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA
* * * *
19742018 TTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * *
19742083 AGTTAGAATAATTTCAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACCATTTGAAC-TGATTCGGAAA
66 GGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTG-TTCGGTAA
* * *
19742147 ATAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTATTAAA
130 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * * * *
19742199 TTAGCATTATTTTAATCTGAGTAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAGAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAA-CAAA
* * * * ** * * * *
19742263 AGATTATAATGATTTGGAACAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGATAA
65 AGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAA
** * * ** * * *
19742328 TTAGATTTATTTTTTTAATTTTCTTGGTTATTAAGCTTTGGAATATTATTAAA
130 ACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA
* ** * * * *
19742381 TTAGTATTATTTTATTATGAATAAAATAGTATGAA-TAGGACCAATTGTTTAATGACAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * **
19742445 AAGTTATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGTAA
65 AGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGGTAA
* * * * * *
19742510 ACAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATCAATTTTCTAAAATATCAATAAC
130 ACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-T-GAATATTAATAAA
* * * * * ** * *
19742563 TTAGTATTATTTTATT-TCAAACAAACTTATATTAACAAAAAGCAATTGTTTTATAACAAAATAA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAACTGAAA-CAATTGTTTTATGACAAAACAA
* * * * * * * * *
19742627 AAGGTCATAACAATTTTAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTCAGCA
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** * *
19742692 AATGGATTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAAA
129 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAAT-AAA
* * * * * *
19742746 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTAT-AAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * ** *
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* * *
19742875 ATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAA
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* * * * * *
19742923 TTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCTTCTAT--ATTGAAAAAAATTGTTTTAAGAGAAAACAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTG-AAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * * *
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* * * *
19743050 AACTA-ATTTACTTTTTAAATCTCTTACTTATTAACTTTTGAAATATCAATACA
129 AAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * * *
19743103 -T--CATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACCAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * *
19743164 GGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTTGATAAA
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* *
19743229 AAGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAGA
131 CAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAATATTAATAAA
* * ** * * * * ** * * *
19743276 TTGGCATTATTTTATTCCAAACAAACTTATTTGAACAAAAACATTTTTTTTTATGACAAAACTAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACA-ATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * * * * *
19743341 AGGTCATAATGATTTTAAATAGATAATTGTTAAAAAATTCATAATTATTAGAA-TTGGTTAGGTA
65 AGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTA
* *
19743405 AATAGAATTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
129 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * * *
19743458 TTCA-TTTTATTTTATTCTGAATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAGAAA
1 TT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
** * * * * * *
19743522 AGGTTATAATAATTTGAAATAGATAGCTGTTTATATAGTCTTAATTATTTGAA-TTGGTTTGGCA
65 AGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT-GTTCGGTA
* * * * * *
19743586 AACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCAGAATATTATTAGA
129 AACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAATATTAATAAA
* * * *
19743639 TTACTATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATGAGCAT-AAATAATTGTTTTATGA-AAGAACA
1 TTAGTATTATTTTATTCT-GAATAAGCTTGTATGAAC-TGAAACAATTGTTTTATGACAA-AACA
* * * * *
19743701 AAAGGTTATTTTTTAAATAATTCATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAGCGATTTGAA
63 AAAGGTTA-----T-AAT-A---ATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* * * * *
19743766 CTGGTTCAGTAAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAAGATTAATCAA
118 CTTGTTCGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * ** * *
19743830 TTAGTATTATTTTTTTTCTAAACAACCTTGTATGATA-AAAAACAATTGTTATATGACTAAACAA
1 TTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAA
* ** * * * **
19743894 AAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-AAGATGGACATATCTATTT-AAGCTTGTTCAA
64 AAGGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAA-CTTGTTCGG
* * * * *
19743957 TAAACATATTTATTTTTTTTAAAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTTAAATTTTAATAAA
127 TAAACAGATTTA--TTTTTT--AAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAATATTAATAAA
* * * * * *
19744016 TTAGTATTATTTTATGCCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACCAAACGAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * ** * **
19744081 GGTCAAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACT
66 GGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
19744135 GGTTTTGCAA
Statistics
Matches: 2370, Mismatches: 520, Indels: 248
0.76 0.17 0.08
Matches are distributed among these distances:
172 3 0.00
173 32 0.01
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Found at i:19742340 original size:363 final size:362
Alignment explanation
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* *
19740939 TTAGTATTATTTTA-TCTTAACTAAGCTTGTATGAATTCAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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** * * * * * *
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** * * * * * * * *
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* * *
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* * * * * * * * *
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* * * * ** *
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* *
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* * * ** * * * * * *
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* * * * * * *
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* **
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* * *
19741656 TTAATATTATTTTATT-TCAAATAAGCTTGTATG-ATAAAAGGCAATTGTTTTATGACAAAA-AA
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* * * * * * * **
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** * * * * * * *
19741780 ATAAACTGATTTATTTTCTAAGTTTCATACTTATT-ATTTTAGTAAGTATTAATGAATTAGTATT
126 A-AAACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTG-AAATATTAATAAATTAGTATT
* * * * * ** *
19741844 ATTTTAATC-CATCTAAGCTTGA-ATTAACTAAAACAAATGTTTTATGACAAATCAAAAGGTTAT
189 ATTTTAATCTGA-ATAAGCTT-ATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAAGGTCAT
* * ** ** * *
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* * *
19741971 TTATTTTTTTAAATCTATTTCTTATTAATTTTTTGAATGTTAATAAA
316 TTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
* * * *
19742018 TTAGTATTAATTTATTCTGAATAAGCTTTTATGAACTGAAACAATTGTTTTATGACTAAATAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
19742083 AGTTAGAATAATTTCAAATAGATAATTATTCTAATAATCTTAACCATTTGAACTGATTCGGAAAA
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* * *
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* * * **
19742213 ATCTGAGTAAGCTTATATGAA-TAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAGAAAAAGATTATAATGATT
195 ATCTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAA-AAAAAGGTCATAACAATT
** * ** * * *
19742277 TGGAACAGATAATCATTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTGGTTCGATAATTAGATTTATTTTT
259 TTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTT
* * ** ** * *
19742342 TTAATTTTCTTGGTTATTAAGCTTTGGAATATTATTAAA
324 TTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
* ** * * * *
19742381 TTAGTATTATTTTATTATGAATAAAATAGTATGAATAGGACCAATTGTTTAATGACAAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
19742446 AGTTATAATGATTTGAAATGGATAATTATTCAAATAGTCAAAACTATTTGAAATGGTTTAGTAAA
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* * * * * * *
19742511 CAGATTTACTTTTTAAATCTCTTACTGATCAATTTTCTAAAATATCAATAACTTAGTATTATTTT
130 CAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTT-TGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * *
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* * * * * *
19742639 ATTTTAAATAAATAATTGTTCATATAGTCTTAACTATTTGAACTAGTTC-AGCAAATGGATTTA-
256 ATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAATAGATTTAT
* * *
19742702 TTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTAGAATATTACTAAAA
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* * * * * *
19742746 TTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGTTTGTATAAATAGAAACAATTATTTTATGATAGAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAAT-GAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * *
19742811 GGTTATAAAAATTTTAAATAAAGAATTTTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACCGGTTC-GATAA
65 AGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGA-AA
* * * *
19742875 ATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATTCTTGAAATATTAGTAAATTAGTATTATTTT
129 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* * * * * * * * *
19742936 ATTTTGAATAAGCTTCTAT--ATTGAAAAAAATTGTTTTAAGAGAAAACAAAAGGTAATAACAAT
194 AATCTGAATAAGCTTATATGAACT-AAAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * * * *
19742999 TTGAAATAGACAGTTATTTAAATGGCCATAATTATTTGAACTGATTC-AGTAAACTA-ATTTA-C
258 TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAAA-TAGATTTATT
* * *
19743061 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-CTTTTGAAATATCAATACA
321 TTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * * *
19743103 -T--CATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAACTAAAACAATTG-TTTATGACCAAACAAAA
1 TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * *
19743164 GGTCATAATAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTCGTTTGATAAA
65 AGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT-GATTCAGAAA
* * * * *
19743229 A-AGATTTATTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGGAATATTAATAGATTGGCATTATTTT
129 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
* ** * * * * * * * ** **
19743289 ATTCCAAACAAACTTATTTGAACAAAAACATTTTTTTTTATGACAAAACTAAAGGTCATAATGAT
194 AATCTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACA-ATTGTTTTATGAAAAAAAAAAAGGTCATAACAAT
* * * * * * * * *
19743354 TTTAAATAGATAATTGTTAAAAAATTCATAATTATTAGAATTGGTTAGGTAAATAGAATTA-TTT
258 TTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGATTTATTTT
19743418 TTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAATATTAATAAA
323 TTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * *
19743458 TTCA-TTTTATTTTATTCTGAATAAGCTAGTATAAATTGAAAAAATTGTTTTATGACAAAAGAAA
1 TT-AGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAA-TGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* ** * * * * * * * ** *
19743522 AGGTTATAATAATTTGAAATAGATAGCTGTTTATATAGTCTTAATTATTTGAATTGGTTTGGCAA
64 AAGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGAAA
* * * * * *
19743587 ACAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAA-TTTTCAGAATATTATTAGATTACTATTATTT
129 ACAAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTATTT
* * * * * * * *
19743651 T-ATTTCAAATAAGCTTGTATGAGC-ATAAATAATTGTTTTATGAAAGAACAAAAGGTTATTTTT
193 TAATCT-GAATAAGCTTATATGAACTA-AAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAAGGTCA-----
* * * * * *
19743714 TAAATAATTCATTTGAAGTATACAATTGTTCAAATAGTCATAGCGATTTGAACTGGTTC-AGTAA
251 T-AACAA-T--TTT-AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGA-TAA
* *
19743778 ATAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAA-TTTTTGAAAGATTAATCAA
310 ATAGATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTTG-AATATTAATAAA
* * * * ** * *
19743830 TTAGTATTATTTTTTTTCTAAACAACCTTGTATGATAAAAAACAATTGTTATATGACTAAACAAA
1 TTAGTATTA-TTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGA-ATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * ** * * * *
19743895 AGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGTT-AAGATGGACATATCTATTT-AAGCTTG-TTCA-
64 AAGTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAA-ATAGTCATAACTATTTGAA-C-TGATTCAG
* * * * *
19743956 ATAAACATATTTATTTTTTTTAAAAATCTCTTGCTTAATAATTTTTTAAATTTTAATAAATTAGT
126 A-AAACAAATTTA--TTTTTT--AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGT
* * * * * ** **
19744021 ATTATTTT-ATGCCGAATAAGCTTGTATGAATTGAAATAATTGTTTTATGACCAAACGAAAGGTC
186 ATTATTTTAAT-CTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAAGGTC
* * * * **
19744085 AAAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCTAATAGTTTTAACTATTTGAACTGGTT
250 ATAACAATTTTAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTT
19744139 TTGCAAATTT
Statistics
Matches: 2212, Mismatches: 521, Indels: 204
0.75 0.18 0.07
Matches are distributed among these distances:
352 1 0.00
353 144 0.07
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ACGTcount: A:0.39, C:0.08, G:0.10, T:0.42
Consensus pattern (362 bp):
TTAGTATTATTTTATTCTGAATAAGCTTGTATGAATGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAA
GTTATAATAATTTGAAATAGATAATTATTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGATTCAGAAAAC
AAATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTAA
TCTGAATAAGCTTATATGAACTAAAACAATTGTTTTATGAAAAAAAAAAAGGTCATAACAATTTT
AAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTGGTTCGATAAATAGATTTATTTTTTT
AAATCTCTTACTTATTAATTTTTTGAATATTAATAAA
Found at i:19744584 original size:181 final size:181
Alignment explanation
Indices: 19744159--19749802 Score: 4082
Period size: 181 Copynumber: 31.5 Consensus size: 181
19744149 CATTTATCTT
* * * * * * * * *
19744159 TATTATTAAATTAATATTATCTTAATTCGAATAAGCTTATAAGAAAAGAAACAATTGTTCTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
19744224 CAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATATATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAAC-T
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
19744287 AGTTCGATAAACAGATTTAGTTTTT-AAT-AC-T-CTTATTAATTTTCAAAA
131 A-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * *
19744335 TCTTAATGAA-TCGTTATTATTTTA-TTCTAAATAA-TTCTATATAAACAAAAACAGTTGTTTTA
1 TATTAATAAATTAG-TATTATTTTATTTC-AAATAAGCT-TGTATGAATAGAAACAATTGTTTTA
* * * *
19744397 TGACAAAATAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAGTT-TTCAAATGGACATGACTATTTGA
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* * * *
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127 ACTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
** * *
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1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
19744581 CAAAATAAAAGATCATAACTATTTGAAAT-GAATAAATGTTCAAACAGTCATAA-TATTTGAGCT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
19744644 T-GTTCAGTAAATAGATTCATATTTTAAA--TC-T-CTTATTCATTTTT-GAAA
130 TATTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* ** * * * * * *
19744692 TATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCCTATATAAATTGATACAATTGTTTCATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * *
19744757 CGAAACAAAAGGTCATAAAGATATAAAATAGATAATTATTCAAGTAGTTATGACTATTAGAACTT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * *** *
19744822 GTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGGCAAAA
131 ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * *
19744873 TGTTAATAAATTAATATTATTTTAATCCAAATAAGCCTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
19744938 CAAAACAAAAAGTCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * * * **
19745003 ATTTGGTAAACAAATTTATTTTTTCAATCTTTTACTAATTAGTTGTCCGAA
131 ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * *
19745054 TATTAATAAATTTGTATTATTTCAATTGAAATAAGTTTGTATGAATAGAAAAAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * *
19745119 CAAAACAAAAGGTTATAGCGATTTGAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATAACTATTTAAACTT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * *
19745184 AATCGATAAACATATTCAGTTTTTAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTAGAA
131 ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * * * * * * * *
19745235 TATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTTTGAGTCAGCTTGTTTGAACAAAAACAATTATTTTGTA
1 TATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* ** * *
19745299 ACAAAACAAAAGGTTATAAC-ACTTTGAAATAGATAATCATT-AAATAGTTATAACTATTTGTAC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAACGA-TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** ** ** * * ** *
19745362 TGGTCAGGCCAGA-AGATTAATTTTTTAAATC-CGTCGCTTATTAATTTTTAGGA
129 TTAT-TTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * *
19745415 TATTAACAAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGATTGTATCAATAGAAACAATTATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
19745480 CAAAACAAATGGTTATAATGATTTAAAATA-ATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTAAACTG
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * * *
19745544 GTTTGGTAAATAGATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAA
131 ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * *
19745591 TATTAATAAATTAGTATTATTTAATTTTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTCTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * *
19745656 CAAAACAAAAGGTCATAACGGTTTGAAATAGATAATTATTCATAGAGCCTTAACTATTT-AAATT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
*** * * * * * * *
19745720 GGCTCAGTAAAAAAATTTAATTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
131 ATTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * * * *
19745772 TATTATTAGATTAATATTATTGTATTCCAAATAAGCTTATATAAACATAAATAAGTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * *
19745837 CAAAACAAAACGTTATAACGATTTGAAATATG-TAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAACT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATA-GATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
** * * *
19745901 GGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTT-GAAA
130 TATTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
** * * *
19745954 TATTAATAAATTAGTATTGGTTTATTTCGAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAATAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * *
19746018 GACAAAACAAAAGATCAAAAAGATTT-CAATAGATAATTGTTCAAATGGTAATAATTATTTGAA-
64 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
** **
19746081 TTGATTCAATAAACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTT-GAAA
129 TT-ATTTGATAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTAG-AA
* * * *** * * *
19746135 TACTAATAAAGTAATATTATTTTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAACTGTTTTATG-
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
** * * *
19746199 --ATGCAAAAGGTTATAACAATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
19746262 GTTCGATAAACA-ATTTATTTTTTAAA-CTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAA
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** * *
19746312 TGA-TAATAAAAAAGTATTA--TTATTTCAAATAAGCATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTAT
1 T-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * *
19746373 GACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAACTATTTGAA-
64 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* ** * * ** *
19746437 TTGGTTCAATAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTTTTTATTAATTTTTAAAA
129 TT-ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * * * * *
19746491 TATTATTAGTTTAGCAATGTTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * *
19746556 CAAAAC-AAA-G--AT-ACGATTTGAGATAGATTATTGTTCATATAGTCATAACTATTT-AAATT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * **
19746615 GATTTTG-TAAA-AAAATTAAATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTT-GAAA
131 -A-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* ** ** * *
19746662 TATAAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAATTTTGCT-TGAATAAAAATAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTG-TATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * ** * * * * * *
19746726 ATAAAATAAAATATCATAACGATTTCAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACT
65 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * ** *
19746791 TATTTGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAA
130 TATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
19746843 TATTAATAAATTAGTATAATTTTATTTCAAATAAACTTGTCTGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
19746908 CAAAACAAAAGAAT-ATGACAATTTGGAATAAATAATTATTTAAATAATCATAACTATTTGAACT
66 CAAAACAAAAG-GTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * ** * * *
19746972 CACTCAATAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTT-GAAA
130 TATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * * * *
19747024 TTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTAAGAACA-AAACCAATGGGTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAA-CAATTGTTTTATG
* * *
19747088 ACAAAACAAAATGTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACG
65 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * *
19747153 TGTTTAGA-AAATAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAGTTTTTGGAA
130 TATTT-GATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * *
19747204 TATTAATAAATTTA-AATTATTTTA-TTCAGAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAA-TTAGTATTATTTTATTTCA-AATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * *
19747267 GATAAAACAAAAAGTCATAATGTTTTAAAATAGATAATTATTCATATAGTCAAAACTATTTGAAC
64 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * *
19747332 TT-TTTCAGTAAATAGATTT-TTTTTTAATTCTTTTACTCATTAAATTTTGGAA
129 TTATTTGA-TAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * ** * * *
19747384 TATTAGTAAATTAGTATTATTTTAGTTCAAGCAAACTTATATGAACT-GAAAACAATTATTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA-TAG-AAACAATTGTTTTAT
* * * * * * * * *
19747448 TATAAAAGAAAAGGTCATTATGATTTGAAATTGATAATTATTCTAATAGTCATGACTATTTGAAC
64 GACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * *
19747513 TTATTTTG-TAAATATAGTTATTTTTTAAAATCTTTTACTTATTAA-TTGTAGAAA
129 TTA-TTTGATAAACAGATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * *
19747567 TATTAATAAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * ** *
19747632 TAAAA-AATA-GTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCACAAATATTCATAA-TGATTTGAACT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAACT
** * * * *
19747694 TATTCAATAAACAAATTTA-TTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTT--AA
130 TATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-T-TTAGAA
* * * * * *
19747745 TATTAATAAATTTGTATTATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAAAATTCTTTTATAA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* ** * * *
19747810 CAAAACAAAAGGTTATAGTGATTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTAAACTT
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
19747875 -GTTCAGTAAACTA-ATTCATTTTTTAAATCTCTTTA-TTATTAATTTTTGGAT
131 ATTTGA-TAAAC-AGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * *
19747926 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCCCAATAAGCTTATATGAATTGAAACAATTCTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * * * *
19747991 TAAAACAAAAAGTCATAACGATTTGATATAAAAAAATTATTCAAATAATCATGATTATTTGATC-
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAAT-AGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * *
19748055 TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTT-GAAA
130 TA-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * * * * *
19748108 TATTAATAAATTAGTATTGTTTTAATCCAAATAAGCTTTTATAAACAAAAATAATTGTTTTAT--
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * * * *
19748171 -AAAACGAAAAAGTCATAATGATTTGAAATAAATGATTGCTCAAACAGTCATAATTATTTAAAC-
66 CAAAAC-AAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * *
19748234 TAGTTTGATAAATAGATTTATTTTTTAAA--TCTT--TTATTAATATTCAAAA
130 TA-TTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * *
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1 TATTAATA-AATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* * * * *
19748347 ATAAAATAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAATTATTTGAACT
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** * * * * * *
19748412 GGTTAGGTAAACAAAATTATTTTTTAAA--TC--ACTTATTAATTTTCAAAA
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* * * * * *
19748460 TATTGATAAATTCA-TTTTATTTTA-TTCTAAATAAGCTAGTATGAATAAAAAAAACTTATTTTA
1 TATTAATAAATT-AGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAA-TTGTTTTA
* * * * * * * * *
19748523 TGACAAAATAAAAGGTCATGATGATTTGAAATAGATAATTATTTATATAGTCTTAAATATTTTAA
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* * * * *
19748588 C-TAGTTTGGTAAACA-ATTTTTTTTTTAATTCTCTTAGTTATTAATTTTTGGAA
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* * * * * *
19748641 TATTATTAGATTAGTAATATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* * * * * ** * **
19748706 CAATACAAAAGGTTATGAGGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGCGC-T
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
* * * * *
19748770 AGTTCAGTAAATAGGTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTT-GAAA
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* * * * * *
19748822 GATTAAT-AATTAGTATTATTTTA-TTCTGAATAAGCTTGAATG-TTCA-AATATAATTGTTATA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAAT-AGAA-ACAATTGTTTTA
* * * *** * * * *
19748883 TGACCAAACAAAAGGTAATAACGATTTGAAATAGATAATTGCTGGCATGGCCATAATTATTTAAA
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
* ** * * * * *
19748948 CTGATTCAACAAATAGGTTTACTTTTTAAATCACTTACTTATTAATTTTTAG-A
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*
19749001 TATTAATAAATTATTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACT-GAAACAATTGTTTTATG
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* ** * * * *
19749065 ACAAAAC-AAAGGTCTTAGTGATTTGAAATAGATAGTTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAA-T
65 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * * * * * *
19749128 TGCTTCGACAAATAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAGTTTTGGAA
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* * * * * *
19749181 TAATATTAAATTAGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGTTTATATGAACTA-CAACAAATTTTTTTA
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* * * * ** * **
19749244 TAATAGAACAAAAGGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTG------T--T--TAA--ATGGGAA
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAA
** *
19749297 CTGGTTTGGTAAACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTTACTTATTAATTTTT-GAAA
128 CTTATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
19749351 TATTAATAAATTACTATTATTTTATTTCAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAAT-AGAAACAATTGTTTTATG
* * * * * * *
19749415 ACAAAACAAAAGTTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCAAAACTTTTTAAACC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACT
* * * ** * * *
19749480 AATTCGATAAACTGACATATTTTTTAAATCTCTAATTTATCAATTTTT-GAAA
130 TATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * *
19749532 TATTAATAAAGTAATATTATTTTATTTCAGATAAGCATT-TACGAATTGAAACAATTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGC-TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATG
* *** * * *
19749596 ATAAAACAAAAGGTCATATTTATAAT-AAATAGATAATTGTTCTAATAGCCATAACTATTTGAAC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAACGAT-TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC
* * * * * * ** *
19749660 TTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTGTTGTTTATTAATTTCT-GAA
129 TTATTTGATAAACAGATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
* ** * * * * *
19749713 TGTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAAAAAATATTTTATGA
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
* *
19749778 CTAAGCAAAAGGTCATAACGATTTG
66 CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTG
19749803 TTAGCCTTGA
Statistics
Matches: 4307, Mismatches: 969, Indels: 379
0.76 0.17 0.07
Matches are distributed among these distances:
168 1 0.00
169 47 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.10, T:0.41
Consensus pattern (181 bp):
TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGA
CAAAACAAAAGGTCATAACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTT
ATTTGATAAACAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTAGAA
Found at i:19748838 original size:538 final size:539
Alignment explanation
Indices: 19744159--19749802 Score: 3966
Period size: 538 Copynumber: 10.5 Consensus size: 539
19744149 CATTTATCTT
* * * * * * * *
19744159 TATTATTAAATTAATATTATCTTAATTC-GAATAAGCTTA-TAAGAAAAGAAACAATTGTTCTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTAT-TTTATTCTAAATAAGC-TAGTATGAATAGAAACAATTATTTTAT
* * * * * * * *
19744222 GACAAAA-TAAAGATCATAATGATTTGAGATATATAATTGTTCAAAAAGTCATAACTATTTGAAC
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCTTAACTATTTGAAC
* * * * ** * *
19744286 TAGTTCGATAAACAGATTTAGTTTTT-AAT-AC-T-CTTATTAATTTTCAAAATCTTAATGAA-T
129 TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * * *
19744346 CGTTATTATTTTA-TTCTAAATAA-TTCTATATAAACAAAAACAGTTGTTTTATGACAAAATAAA
194 AG-TATTATTTTATTTC-AAATAAGCT-TGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAA
* * * * * *
19744409 AGGTCATAACGATTTGAAATAGATAAGTT-TTCAAATGGACATGACTATTTGAACTTAATTGA-T
256 AGGTCATAACGATTTGAAATAAATAA-TTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTAGT
* * * *
19744472 AAACATATTTATTTTTTAAATCTCCTACCTATTAATTTTT-AGAATATTAATAAATTAGTATTAT
319 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAATAAATTAGTATTAT
* * * * *
19744536 TTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAATAAAAGATCATAACT
383 TTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACG
* * * * * *
19744601 ATTTGAAAT-GAATAAATGTTCAAACAGTCATAA-TATTTGAGCTTGTTCAGTAAA-TAGATTCA
448 ATTTGAAATAG-ATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTT-AGTAAACAAAATT-A
* *
19744663 TATTTTAAATCT-CTTATTCATTTTT-GAAA
510 TTTTTTAAATCTACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * * * * *
19744692 TATTAATAAATTAGAATTATTTTATTTTGAATAAGCCTA-TATAAATTGATACAATTGTTTCATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAG-CTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATG
* * * * * * * *
19744756 ACGAAACAAAAGGTCATAAAGATATAAAATAGATAATTATTCAAGTAGT-TATGACTATTAGAAC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCT-TAACTATTTGAAC
* * * * **** *
19744820 TTGTTTGGTAAACATATTTATTTTTAAAATCTTTTACTTATTAATTGGCAAAATGTTAATAAATT
129 TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATT
* * * * *
19744885 AATATTATTTTAATCCAAATAAGCCTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAAG
194 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * *
19744950 TCATAACAATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGTA-TTTGGTAAAC
259 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTAGTAAAT
* * * * * ** * *
19745014 AAATTTATTTTTTCAATCTTTTACTAATTAGTTGTCCG-AATATTAATAAATTTGTATTATTTCA
323 AGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATT-TTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTA
* ** * * *
19745078 -ATTGAAATAAGTTTGTATGAATAGAAAA-AATTATTTTATGACAAAACAAAAGGTTATAGCGAT
387 TTTTG-AATAAACTTGTATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * ** * * *
19745141 TTGAAATAAATAATTATTCAAAAAGTCATAACTATTTAAACTTAATCGATAAAC-ATATTCAGTT
450 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTAG-TAAACAAAATT-ATTT
*
19745205 TTTAAATCTCTTACTTAGTAATTTTTAGAA
513 TTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * * * *
19745235 TATTAATAAATTAG-ATTTATGTTATTTTGAGTCAGCTTGTTTGAACAAAAACAATTATTTTGTA
1 TATTAATAAATTAGTA-TTATTTTATTCTAAATAAGCTAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATG
* * * *
19745299 ACAAAACAAAAGGTTATAA-CACTTTGAAATAGATAATCA-TTAAATAGT-TATAACTATTTGTA
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGA-TTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCT-TAACTATTTGAA
* * * * * ** * *
19745361 CT-GGTCAGGCCAGA-AGATTAATTTTTTAAATC-CGTCGCTTATTAATTTTT-AGGATATTAAC
128 CTAGTTC-GG-TAAACATATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGA-AATATTAAT
* * * * * * *
19745422 AAATTAGCATTACTTTATTTCAAATAAGATTGTATCAATAGAAACAATTATTTTATGACAAAACA
189 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * * * * * * *
19745487 AATGGTTATAATGATTTAAAAT-AATAATTGTTCAAATTGTTATAACTATTTAAACTGGTTTGGT
254 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGT
* **
19745551 AAATAGATTTACTTTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTCAAAATATTAATAAATTAGTATTATT
319 AAATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * * * * * *
19745612 TAATTTTAAACAAACTTATATGAACAAAAACATTTCTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGG
384 TTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * * * *
19745677 TTTGAAATAGATAATTATTCATAGAGCCTTAACTATTTAAA-TTGGCTCAGTAAA-AAAATTTAA
449 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-G-TTAGTAAACAAAA-TTAT
* * *
19745740 TTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTCATAA
511 TTTTTAAA--TC-TACTTATTAATTTTTAGAA
* * * * * * * * * * *
19745772 TATTATTAGATTAATATTATTGTATTCCAAATAAGCTTA-TATAAACATAAATAAGTGTTTTATG
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGC-TAGTATGAATAGAAACAATTATTTTATG
* * * * * * *
19745836 ACAAAACAAAACGTTATAACGATTTGAAATATG-TAATTGTTCAAATGGTCATAACTATTTGAAC
65 ACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATA-GATAATTATTTAAATAGTCTTAACTATTTGAAC
* * *
19745900 TGGTTTGGTAAGCATATTTATTTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
129 TAGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
** * ** *
19745965 TAGTATTGGTTTATTTCGAAATAGGCTTGTATGATGAAAAATAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
193 TAGTATTATTTTATTTC-AAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * * * * * *
19746030 GATCAAAAAGATTT-CAATAGATAATTGTTCAAATGGTAATAATTATTTGAA-TTGATTCAATAA
257 GGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTAGTAA
** * * *
19746093 ACTA-ATTTATTTTTTAAATCTCCAACTT-TTCAATTTTTGAAATACTAATAAAGTAATATTATT
321 A-TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATT-AATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATT
* * * ** * ** * *
19746156 TTATTTTGGATAAGCTTTTATGAATTGAAACAACTGTTTTATG---ATGCAAAAGGTTATAACAA
384 TTATTTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * *
19746218 TTTCAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTTGTTCGATAAAC-AATTTATTT
449 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTAG-TAAACAAAATTATTT
* * *
19746282 TTTAAACTTTTTGCTTATTAATTTTTTGAA
513 TTTAAA---TCTACTTATTAATTTTTAGAA
** *
19746312 TGA-TAATAAAAAAGTATTATTAT-TTC-AAATAAGC-ATGTATGAACT-GAAACAATTATTTTA
1 T-ATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCTAAATAAGCTA-GTATGAA-TAGAAACAATTATTTTA
* *
19746372 TGACTAAACAAAAGGTCAGAATGATTTGAAATAGATAATTATTCT-AATAGTCTTAACTATTTGA
63 TGACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATT-TAAATAGTCTTAACTATTTGA
* * ** * * ** * * **
19746436 ATTGGTTCAATAAACACATTGATTTTTTAAATCTCTTTTTTATTAATTTTTAAAATATTATTAGT
127 ACTAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA
* * * * * * *
19746501 TTAGCAATGTTTTACTTCGAATAAGCTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAA
192 TTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAA
* * * * * * *
19746565 -G--AT-ACGATTTGAGATAGATTATTGTTCATATAGTCATAACTATTT-AAATTGATTTTGTAA
257 GGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAG-TTTAGTAA
* * ** *
19746625 A-AAAATTAAATTTTAAA--TC-T-CTTATTAATTTTTGAAATATAAATAAATTAGTATTATTTT
321 ATAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTT
** * * * **
19746685 ATTTTGAATAATTTTGCT-TGAATAAAAATAATTGTTTTATGATAAAATAAAATATCATAACGAT
386 ATTTTGAATAAACTTG-TATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGAT
* * * * * * * * *
19746749 TTCAAATAGATAATAGTTCAAATGGACATGACTATTTAAACTTATTTGGTAAACATATTTATTTT
450 TTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTT-GTTAGTAAACAAAATTATTTT
*
19746814 TTAAATCTCCAAATTATTAATTTTTAGAA
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* * * * *
19746843 TATTAATAAATTAGTATAATTTTATT-TCAAATAAACTTGTCTGAATAGAAACAATTGTTTTATG
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* * ** * * * *
19746907 ACAAAACAAAAGAAT-ATGACAATTTGGAATAAATAATTATTTAAATAATCATAACTATTTGAAC
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* ** * * * * *
19746971 TCA-CTCAATAAATAGACTTATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTGAAATTTTAATAAAT
129 T-AGTTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * * *
19747035 TAGTATTATTTTATTCCAAATAAGCTTTTAAGAACAAAACCAATGGGTTTATGACAAAACAAAAT
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* * *
19747100 GTCATAACAATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACGT-GTTTAGAAAA
258 GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAAC-TAGTTTAGTAAA
* * * * *
19747164 TAGATTTATTTTTAAAAT-TTTTACTTATTAGTTTTTGGAATATTAATAAATTTA-AATTATTTT
322 TAGATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAA-TTAGTATTATTTT
** * * * * * * * *
19747227 ATTCAGAATAAGCTTGCATGAATAGAACCAATTGTTTTATGATAAAACAAAAAGTCATAATGTTT
386 ATTTTGAATAAACTTGTATGAATAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGATT
* * * * * * * * *
19747292 TAAAATAGATAATTATTCATATAGTCAAAACTATTTGAACTTTTTCAGTAAA-TAGATTTTTTTT
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* * * *
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* ** *
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* * * * * * *
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** * * * * *
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126 AAC-TAGTTCGGTAAACATATTTATTTTTT-AAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAAT
* * * * * * *
19747574 AAATTAGTATTATTTTAATCCAAATAAACTTGCATGAATAGAAACAATTGTTTTATGATAAAA-A
189 AAATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
* * * ** * *
19747638 ATA-GTCATAACAAGTTGAAATAAATAATTGCACAAATATTCATAA-TGATTTGAACTTA-TTCA
254 AAAGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACT-ATTTGAAC-TAGTTTA
* * * * * * *
19747700 ATAAACAAATTTA-TTTTAAAATTTTTTACTTATTAATTGTCTT--AATATTAATAAATTTGTAT
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** * * * * *
19747762 TATTTTATTTAAAATAAGCTTGTATGAACAGAAAA-AATTCTTTTATAACAAAACAAAAGGTTAT
380 TATTTTATTTTGAATAAACTTGTATGAATA-AAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCAT
** * * *
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* *
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** * *
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* * * * * * * * * * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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258 GTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAG-TAAA
* ** *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* *
19748436 TAAATC-ACTTATTAATTTTCAAAA
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* * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * *
19748653 AGTAATATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAATAATTGTTTTATGACAATACAAAAGG
194 AGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAACAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGG
* * * * ** * ** *
19748718 TTATGAGGATTTGAAGTTTACAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGCGCTAGTTCAGTAAATA
259 TCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAAATA
* * *
19748783 GGTTTATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAATTTTTGAAAGATTAAT-AATTAGTATTATTTTATT
324 GATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTTTATT
* * * * * * * * *
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* *** * * * * * *
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* * *
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* * * * * * *
19749064 GACAAAAC-AAAGGTCTTAGTGATTTGAAATAGATAGTTGTTCATATAGTCTTAATTATTTGAA-
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCTTAACTATTTGAAC
* ** * * * * * * * *
19749127 TTGCTTCGACAAATAGATTAATTTTTTAAATCTCTTAGTTATTAAGTTTTGGAATAATATTAAAT
129 TAG-TTCGGTAAACATATTTATTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAAT
* * * * * * * *
19749192 TAGTATTATTTTA-TTCAAAATAAGTTTATATGAACTACAACAAATTTTTTTATAATAGAACAAA
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* ** * * ** * *
19749256 AGGTTATAATAATTTAAAATAGATAATTG------T--T--TAA--ATGGGAACTGGTTTGGTAA
256 AGGTCATAACGATTTGAAATAAATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTGAACTAGTTTAGTAA
* *
19749309 ACAGATTTATTTTTTAAATC-CTTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTACTATTATTT
321 ATAGATTTATTTTTTAAATCTC-TTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAAATTAGTATTATTT
** ** * * *
19749373 TATTTCAAATAGGCTTGTATG-ATGAAAAACAATTATTTTATAACAAAACAAAAGTTCATAACGA
385 TATTTTGAATAAACTTGTATGAAT-AAAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAAGGTCATAACGA
* * * * *** * * *
19749437 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATGGCCAAAACTTTTTAAACCAATTCGATAAACTGACA-TATT
449 TTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAGTCATAACTATTTAAACTTGTTAG-TAAAC-AAAATTATT
* *
19749501 TTTTAAATCTCTAATTTATCAATTTTT-GAAA
512 TTTTAAA--TCT-ACTTATTAATTTTTAG-AA
* * * * * * *
19749532 TATTAATAAAGTAATATTATTTTATT-TCAGATAAGC-ATTTACGAATTGAAACAATTGTTTTAT
1 TATTAATAAATTAGTATTATTTTATTCT-AAATAAGCTA-GTATGAATAGAAACAATTATTTTAT
* * * * * * *
19749595 GATAAAACAAAAGGTCATATTTATAAT-AAATAGATAATTGTTCT-AATAGCCATAACTATTTGA
64 GACAAAACAAAAGGTCATAATGAT-TTGAAATAGATAATTATT-TAAATAGTCTTAACTATTTGA
* * * * * ** * *
19749658 ACTTGTTCGGTAAATAGATTTATTTTTTTAAATTTGTTGTTTATTAATTTCTG-AATGTTAATAA
127 ACTAGTTCGGTAAACATATTTA-TTTTTTAAATCTCTTACTTATTAATTTTTGAAATATTAATAA
** * * * * *
19749722 ATTAGTATTATTTTATTTTGAATAAGCATGTATGAATTGAAAAA-AA-TATTTTATGACTAAGCA
191 ATTAGTATTATTTTATTTCAAATAAGCTTGTATGAA--CAAAAACAATTGTTTTATGACAAAACA
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Statistics
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*** * *
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Statistics
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Consensus pattern (21 bp):
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19757521 AAAAGCTAAC
* * * * * * * * ** *
19757531 ACGATTTGAAATAGATAATTATTCTAATAGTCTTAA-TCATTTGAATTGGTTCGGCAAATACATT
1 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACT-ATTAGAACTCGTTTGATAAATAGATT
* * * * * * * * *
19757595 TATTTTTTAAATC-TCTTATTAATTTTTAGAATACTACTAATTTAGCAGTAATTTACTCTGAATA
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* * * *
19757659 AGCTTGCATTAATATAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATA
128 AACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATA
* * *
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1 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAGAACTCGTTTGATAAATAGATTT
* * *
19757772 AGTTTTTAAA-CATT-TTATTAATTTTCAAAATATTGATAAATTGGTATTATTTTATTTTGAATA
66 ATTTTTTAAATC-TTATTATTAATTTT-AGAATATTAATAAATT-GTATTATTTTATTTTGAATA
** * **
19757835 ATTTTGTATGAATAGAAATAATTGTTTTACAACAAAACAAA-ATGTCATA
128 AACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGA--TCATA
* * * * * * *
19757884 ACGATTTGAAATAGATAATAGCTCAAATGGAT-ATGACTATTTA-AACTTGTTTGATGAATAAAT
1 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAAT-AATCATAACTA-TTAGAACTCGTTTGATAAATAGAT
* * *
19757947 GTATTTTTTAAATCTCTAACTTATTAATTTTATGAATATTAAT-AA--GT-TAATATTATTTTGA
64 TTATTTTTTAAATCT-T-A-TTATTAATTTTA-GAATATTAATAAATTGTATTATTTTATTTTGA
* * **
19758008 ATAAACTTATATGAATAGAAACAATTATTTTATGATGAAACAAAAGATCATA
125 ATAAACTTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAAC-AAAGATCATA
* * * * * * * * * *
19758060 GCGATTTAAAATAAATAATTATTCATATAGTCATAACTATTTGAACTCGCTTGGTAAACAGATTT
1 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAGAACTCGTTTGATAAATAGATTT
* **
19758125 ATTTTTTAAATCTTTTACTTATTAATTTTTAGAATTTTAATAAATTAGTATTATTTTATTTCAAA
66 ATTTTTTAAATC--TTA-TTATTAA-TTTTAGAATATTAATAAATT-GTATTATTTTATTTTGAA
* * * *
19758190 TAACCTTTTATGAACAGAAACAATTAG---TA--AC---A-AAAGGTCATA
126 TAAACTTGTATGAATAGAAACAATT-GTTTTATGACAAAACAAAGATCATA
* * * * * ** * * *
19758232 ACAATTTGAAATAGATAATTATTTAAATAGTCATAACTATTTGAACAT-GTTCAAAAAACATATT
1 ACGATTTGAAATAGATAATTGTTCAAATAATCATAACTATTAGAAC-TCGTTTGATAAATAGATT
* *
19758296 TATTTTTTAAATTTTTACTTATTAATTTTTCA-AATATTAATAAATTTATATTATTTTATTT
65 TATTTTTTAAA-TCTTA-TTATTAA-TTTT-AGAATATTAATAAA-TTGTATTATTTTATTT
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ATTTTTTAAATCTTATTATTAATTTTAGAATATTAATAAATTGTATTATTTTATTTTGAATAAAC
TTGTATGAATAGAAACAATTGTTTTATGACAAAACAAAGATCATA
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GTCATAACTATTTGAAATA
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* * *
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*** *
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* * * *
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*
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*
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19758361 TAAGTTTGCA
** * * **
19758371 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATT-TTCTCAATT
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* * *
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* * * * * *
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128 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
19758551 TGAACAATTATATATTTAAAATCATTATTA-CTATTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATT
* * *
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65 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * *
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** * * * * * * *
19758728 TGGGCAATTATTTATTTCAAATCGTTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCTATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* ** * ** * *
19758793 ATACAAGCTT-TTTTAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAA-A
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* * * * * * * *
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130 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTA-TT
* * * * *
19758908 TTAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGATTTG-CACAAAAGAATTG-TTTTAGTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TT
* * * * *
19758971 CATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATATATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAA
65 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AAG
* * * * * * * * * *
19759035 AGATTTAAAAAATGACTCTGTTTACTAAACAAATTTAAATAATTAGGACTGTT
129 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
19759088 TGAATAATTATCTATTTGAAAT-AGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTTTTTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA---TTGTTTT-
* *
19759152 TATTCATCTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATA-TT-AAGACAATTAATA
61 TATTCATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATA
* * * * *
19759214 AGTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATTGTTATGGCTATT
123 AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * * *
19759273 T-AAGCAA-TATTTTATTTCAACTTGTTATGA-CTTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTG
1 TGAA-CAATTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-GTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA
* * * * * ** *
19759335 TTCATACAAGTTTATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTTACAATTAATAAGTAA
63 TTCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * *
19759400 AAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGAATATT
128 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * **
19759454 TGAATAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACACTTGTTTCAATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * * * *
19759519 ATATAAGCTTATTTGAAGTAAGATAATACTAATTTATTAATAGTCCAAAAATTAATGAGTAAGAG
66 ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * ** * *
19759584 AATTAAAAAA-AGAATATGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATC
131 ATTTAAAAAATA-AATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
19759635 TAAACAATTATCTATTACAAAACATTATGACCTTTT-TTTTTTCCACAAAACAATTGGTTCTATT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGT-CATAAAACAATTGTTTTTATT
*** * *
19759699 CATGCGAGCTTATTTCG-AATAAAATAAT-TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA
65 CATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * *
19759762 -A-ATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATT
128 GAGA-TTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCA-GTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
19759815 TGAAGAGTTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * *
19759880 ATAAAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAATAAG--A-AG
66 ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAG
* ** * * *
19759941 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGCAAGCTCAAATAGTTATGACTA-T
131 ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * *
19759991 TGTAATAATTAT-TAATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTAT
1 TG-AACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT
* ** * * **
19760055 TCATACAATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTA-TTCTAAAAATTAATAAGTTT
64 TCATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA
* *** * * * *
19760119 GAGATTTAAAAAATAAATTTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATT
128 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
19760173 TGAACTATTATCTATTTCAAATCATAATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* ** ** * ** *
19760238 ATGTAAAATTATTC-AGAATAAAATAATACCGATCTATTAATATTTTGATAA-T--TAA-TAAGA
66 ATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** *
19760298 GATTTTAAAAA-AAATCTATTTACCAAAATAGTTCAAATATTTATGACTATT
130 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
19760349 TGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATC-TTTATTTTGTTATGAAACAAGTGTTTCTT-TT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TTATT
* * * * * * * *
19760412 CATACAAGCTTATTTG-ATTCAAATAATACTAATTTAATAAGATTGCAAAAATTAGTAAGT-AGA
65 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG-
* * ** * * *
19760475 AGATTTAAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACTAGTTCAAATGGTTAAGACTATT
129 AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * **
19760529 AGAACAATTATCTATTT---ATCATTTTAAGCTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTATTTCAATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * ** *
19760591 ATACAAGCTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAAATTAATGTGCAA
66 ATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC--AAAAATTAATAAGTAA
* * *
19760654 GAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTACCAAACAAGTTAAAATAGATT-TAACTATT
128 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATT
* * * * *
19760707 TGAAAAACTATCTATTT-AAAGTCATTATGACCTTTTATCTTGTCATAAAACAATAG-TTTTAGT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
* * * * * *
19760770 TCATAAAAACTTA-TCTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTGAAAAATTAATATGCAA
64 TCATATAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * ** * *
19760834 GAGATTTAAAAACTAAAGCTATTTTCTGAACCACTTTAAATAGTTATGACTATT
128 GAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * *
19760888 TGAACAAATATCAATCTCAAATCATTATG--GTATTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTTT-TG
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTAT-
* *
19760950 TCAT-TCAAGCTTATTCG-AATAAAAAAAATACTAATTTAATAATA-TTC--AAA-TAATTAA-T
64 TCATAT-AAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGT
* *** * * * * **
19761008 AAGAGATTTATAAAATAAATGGGTTTGCCAAATCAGTTTAAATATTTAAAACTATT
126 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
19761064 GGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATT-ATTTTAGTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TT
* * * * * * *
19761128 CATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTGACA-TTCAAAAAATTAATAAGCATG
65 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * *
19761192 AAATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATT
129 AGATTT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * *
19761245 TCAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TT
* * * * **
19761309 CATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCACAAATTAATAAACAAGA
65 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
*** * * * * * *
19761374 GATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTAATGAATCAATTCAAATAATCATGGCCATT
130 GATTTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
19761426 TAAATAACTATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-A
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTT-ATT
* * * *
19761489 CATACAAGCTTTTTCTAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAA-T--TAA-TAAGA
65 CATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * **** *
19761550 GATTTAAAAAAGAAATCTGTTTGTTGATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
130 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * * *
19761602 TGAACAATTATCAATTTCAAATTATTAAAACC-TTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * *
19761666 ATATAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATAATAATTTAGTAATA-TTCTAAAAATTAATAACTATG
66 ATATAAGCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAG
* * * * ** *
19761729 AGATTTAAAAAATAAGT-TCATTTACCGAACTAGTTCAAACAGTTAAAACTATA
129 AGATTTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * ** * * * * * *
19761782 TGAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTGTCATAAAACAATT-ATTTAAGCT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TT
* * * * * *
19761846 CATAGAAGCTTATTC-AAATTAGAACAAAATTAATTTATTAATATTTCAAAAATT--T-A-TAAA
65 CATATAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
19761906 AGCTTTAGAAAATAATTCTACTTACGAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATT
129 AGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
** * * *
19761959 TTCACAATTATCTATTTGAAATCATTATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * *
19762023 AATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGA
66 -ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* ** * * * *
19762088 GATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTAACTATT
130 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * * *
19762140 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTATTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
** * * * * ** * **
19762205 ATACT-ATTTTATTTGAAATAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGA
66 ATA-TAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * ** *
19762269 AAATAAAAAAATAAATCTAATTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAAACTATA
130 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** ** *
19762321 TAAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGT-TT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTT-TATT
* * * * * *
19762385 -GTACAAGCTTATTC-ATATTAAAATAATACCAATTTCA-TAATATTTAAAAAAACTAATAAGTA
65 CATATAAGCTTATTCGA-AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTA
* * * * * * * * *
19762447 AGACATTTGAAAAATAAATTTATCTACCGAATCATTTCAAATGGTTAAGACTATT
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* * * * * * * * **
19762502 AGAATAATTATATACTTCAAATCGTTTTGACCATTT-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTC
* * * * * * *
19762566 ATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTAATTAATA-TTCAAAAAAGTAATGAGCAAGA
66 ATATAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAGA
* * ** *
19762630 GATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTGAAATAGATT-TGACTATT
130 GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACCAGTTCAAATAG-TTATGACTATT
* * * **
19762681 TGAACAATTATCTATTT-AAAGCCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTCAATT
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* * * * * * *
19762745 CATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTGAAAAATTAATATGCAAGA
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* * * * ** *
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*** ** ** * * **
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* * * * * * * ** * * *
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* ** * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* * * * *** * * * * * * *
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** ** * * * *
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*
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* ** * * *** ** * ** ** *
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* * *** *** * * * *
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** ** * * ** * * *
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*
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177 CTATT
* * * * * *** * * ** * *
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* * * ** ** * * *
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59 TTT--ATTCA-TATAAGC--TTA-TTCGAAAT-AAA--A-TAATACTAATTTATTAATATTTCA-
* * * * * * * *
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113 --AAAATTAATAAGTAA-G-AGATTTAA-AA-AAT---AAATCTATTTACCAA-ACCAGTTCAAA
** *
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* ** ** * *
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* * * * * *
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* * * *
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* * ** * *
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64 TCATATAAGCTTATTCGAAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA
* * * * ** *
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* * * * *
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Statistics
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* *
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* * * ** *
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* * *
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* * * * ***
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* *
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* * * *
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* * *
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* * ** *
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*
19759970 AGCTCAAATAGTTATGACTA-T
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* * * *
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** * * **
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* * * * *
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** * ** * * *
19760248 ATTCAGAATAAAATAATACCGATCTATTAATATTTTGATAATTAATAAG--AGATTTTAAAAA-A
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* * * * *
19760310 AATCTATTTACCAAA-ATAGTTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGT
319 AATCTATTTACTAAACAT-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * * *
19760374 TATGATC-TTTATTTTGTTATGAAACAAGTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTT--GATTCAAAT
383 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-TTTCAAAATAAAAT
* * * * * * *
19760436 AATACTAATTTAATAAGATTGCAAAAATTAGTAAGTAGAAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTGC
447 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-A-AAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTAC
** * * *
19760501 TGAACTAGTTCAAATGGTTAAGACTATT
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* * * * *
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1 TGAACAATTATCTATTTCA-AATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATT
* * ** *
19760590 CATACAAGCTTA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATTAATGTGCAA
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* * * *
19760654 GAGATTTAAAAAATAAATCT-TTTACCAAACAAGTTAAAATAGATT-TAACTATTTGAAA-AACT
128 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTT-AAACAATT
* * * *
19760716 ATCTATTTA-AAGTCATTATGACCTTTTATCTTGTCATAAAACAATAGTTTTAGTTCATAAAAAC
191 ATCTA-TTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATAAAAGC
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19760780 TTA-TCTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTGAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAA
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19760844 AACTAAAGCTATTTTCTGAACCACT-TT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCA
314 AAATAAATCTATTTACT-AAACA-TGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCA
* * * * * *
19760907 AATCATTATG--GTATTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTT-TTTGTCATTCAAGCTTATTCGAA
377 AATCATTATGACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTTTTC-AA
* * *
19760969 TAA-AAAA-AATACTAATTTAATAATA-TTCAAATAATTAATAAG--AGATTTATAAAATAAATG
439 -AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATA
* * * * **
19761029 GGTTTGCCAAATC-AGTTTAAATATTTAAAACTATT
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19761064 GGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTGGTCATATAATAATTATTT-TAGTT
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* * * * *
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* * *
19761193 AATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAG-TCAAATAGTTATGACTATTTCAACAATTATC
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* *
19761257 TATTTA-AAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATAAAAGCTTA
194 TA-TTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATAAAAGCTTA
* * * **
19761321 TTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTCACAAATTAATAAACAAGAGATTTAAAAAAT
257 TTC-GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * * *
19761386 AAAT-TAGTTTAATGAATCA-ATTCAAATAATCATGGCCATTTAAATAACTATCTATTTTAAATC
318 AAATCTA-TTTACT-AAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *
19761449 ATTATTACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATT-TTTTTCA-ACATACAAGCTTTTTCTAAATAAA
381 ATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTTTTCAAAATAAA
* * * ***
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19761575 GATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
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* ** * *
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* * * * * *
19761666 ATATAAGCTTATTTCG-AATAAAATAATAATAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTATGA
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* * * ** *
19761858 TTCAAATTAGAACAAAAT-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTTATAA--AAGCTTTAGAAAATA
257 TTCGAA-TA-AA-ATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATA
* * * * * ** * *
19761920 ATTCTACTTACGAAACCA-GTTCAAATAATTATAACTATTTTCACAATTATCTATTTGAAATCAT
319 AATCTATTTACTAAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * *
19761984 TATTACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-TCAATATAAG-TTTGTTCGAAATAAAA
383 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATACAAGCTTT-TTCAAAATAAAA
* * * * * *
19762047 TAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGC
446 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* * * *
19762112 CAAACCATTTCAAATAGTTTTAACTATT
509 CAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * ** *
19762140 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAATAATTGGTTCTATTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
* ** * * * *** * ** *
19762205 ATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAA
66 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * ** * * ** * **
19762270 AATAAAAAAATAAATCTAATTGCCAAACCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATATAAATGATTATCT
131 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
* ** * * ** *
19762334 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTTTGTACAAGCTTATTC
195 ATTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATAAAAGCTTATTC
* * * *
19762399 -ATATTAAAATAATACCAATTTCA-TAATATTTAAAAAAACTAATAAGTAAGACATTTGAAAAAT
260 GA-A-TAAAATAATA-TAATTT-ATTAATATTT-CAAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAAT
* * * * * * * * * * *
19762462 AAATTTATCTACCGAATCAT-TTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATCG
318 AAATCTATTTA-CTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
19762526 TTTTGACCATTT-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAAT
382 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTTTTCAAAATAAAAT
* * * *
19762590 AATACCAATTAATTAATA-TTCAAAAAAGTAATGAGCAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTAC
447 AATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC
* *
19762653 CAAATAAGTTGAAATAGATT-TGACTATT
509 CAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATT
** * * * *
19762681 TGAACAATTATCTATTT-AAAGCCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTCAATT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAA-TTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATT
* * * ** * *
19762745 CATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTGAAAAATTAATATGCAAGA
65 CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * *
19762810 GATTTAAAAACTAAAGT-TATTTTCTGAACCACTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAACTATC
130 GATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATC
* * * * * * * *
19762874 AATCT-CAAAT-GTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTA
194 TAT-TACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAT-TCATAAAAGCTTA
* * * ** * *
19762936 TTCGGATAAAAATAATACTAATTTAATAGTATTTTGATAATTAATAA--AAGATTTAAAAAATAA
257 TTCGAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAA
*** * * * * ** * * * * *
19762999 ATGGGTTTGGC-AAA-TTAATTCAAGTAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTCCCAATCGT
320 ATCTATTT-ACTAAACAT-GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCAT
* * ** * * * * **
19763062 T-TCAACCTTTTGTTTAGTCATATGATAATTATTTC-AGTTTATGCAAGCTTATTT-GGAATAAA
383 TAT-GACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTT-TTTCAAAATAAA
* * * * * * *
19763124 ATAATA--AA--CATT--CA----AAAAATTAATAAGCATGAGAATTGAATAAATAAATCTATTT
445 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-A-AAG-ATTTAAAAAATAAATATGTTT
*
19763179 ACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT-ACTATT
507 ACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * *
19763208 TCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTA-TT
* * * ** *** * * *
19763272 TATAAAAGCCTA-TCCAAATTGTTATAA-CCT--TTTGTT--T-TGTCATAAAACAATTATTTAA
65 CATACAAGCTTATTTGAAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TC--AAAA-AATTA-ATAA
** * ** * ** * *
19763330 GTTCATAGAAGCTTATTCGTAATGGAATAAAAT-TAATTTA-TTAATATTTTAAAAT-TTTATAA
124 G-T-A-AG-AG---ATT--TAA-AAAAT-AAATCT-GTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTAT--
* * * * * *** * * ** **
19763392 GA-GATTTAGAA-AATAATTCTACTTAAAAAACCAGT-T--CAAATAATTATAACTATTAGCACA
175 GACTATTTA-AACAATTA-TCTA-TT-ACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTC-A-TAAAACA
* * ** *** * * *
19763452 ATT-ATTTATTTCA-AATCATTATTACTT-TTCGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TT--T-TGTC
234 ATTGTTTTA-TTCATAA--A--A--GCTTATTCG-AATAAAATAATATAATT-TATTAATATTTC
* * ** * * * **
19763510 -AATATAAATTTGTTCGAAA--TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAA-AAATT--AATCA
290 AAAAATTAATAAG-T-AAAATTTAAAA-AATA--AATCTATT--TA-CTAAACATGTTCAAAT-A
* * * * * * * *** * *
19763569 G-TAAGA-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTGCCAAACCATT-T--CAAATAGTTTTGACTATTTG
346 GTTATGACTATTTGAAGAAT-TATCTATTT--CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-A--T-
** * * * * * * * ** *
19763629 AATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAAT-TATTTGTTCT-ATTT
404 AA-AACAAT-TGTTTCTATTCA-TACAAGC-----TTTT-TCA--AAATAAAATAATACTAATTT
* * * * ** *
19763692 ATACTATTTTATTTGAAATAA--AATAATGCAA-ATTTAATAATATTCCAAA-ACCTAATAACCA
458 AT--TA--ATATTTCAAA-AATTAATAA-GAAAGATTTAA-AA-AAT--AAATA--TGTTTACCA
* ** *
19763753 AGA-AAATT-AAATAGTTAAAACTATA
511 A-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* ** * * * * * *
19763778 TAAATGATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAATAATTGTTT-TGTTT
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
* * * * * *
19763842 GTACAAGCTTA-TTCATATTAAAATAATACTAATTTCA-TGATATTTAAAAAACTAATAAGTAAG
66 ATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAG
* * * * * * *
19763905 AGATTTAAAAAATAAATTTGTCTATCAAATC-ATTTCAAAT-GATTAAGACTA-TTAGAATAATT
129 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTA-AACAATT
* * * * * * * * *
19763967 ATATACTT-TAAATTATTTTGACCATTT-TTTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATCGATACAAGC
191 ATCTA-TTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTC-ATAAAAGC
* *
19764030 TTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAA
254 TTATTC-GAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAA
* * * * * * * *
19764094 AAATAAATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATTATTATTTGAATAATTGTCTATTTAAA
314 AAATAAATCTATTTACT-AAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAA
* ** * * * * * ** **
19764158 ATCATTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAACAATTGATTCAAGTAATACATGCTTAGAT-GGAAT
378 ATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-TTTCAAAAT
* * *
19764222 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTTC-TAAATTAATAAGTAAGAAATTTAAAAAAATAAATCT
442 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAATAAG-AA-AGATTT-AAAAAATAAATAT
* * * *
19764286 GTTTAACAAATC-AGTTAAAATAATTATGATTATT
503 GTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * *
19764320 TGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-T-TTA
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATT-
* * * * * *
19764383 CCTTACAAGCTTA-TTCAAAAAAAATAATATTAATTGATTAATACTTC-AAAAATTAATAGGTAA
65 -CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * *
19764446 CAGATTTAAACAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTAT
128 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
* ** ** * * *
19764511 CAATCT-CAAATTGTTAAAATCCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATAGAAGC
193 CTAT-TACAAATCATTATGA-CC-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATAAAAGC
* ** * * *
19764575 CTATTCGGTTAAAAATAATACTAATTTAATAACATTTCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAAA
254 TTATTCGAAT-AAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAA
* * * ** * * * *
19764638 TAAATATATTTGCTAAACCA-ATTCAAATAGTTAAAACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATT
317 TAAATCTATTTACTAAA-CATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * *
19764702 GTTCAAG-CCCTTTGTTTAGTCATAAAATATTTGTTTC-ATGTCTTACAAGCTTATTTGGAAAA-
381 ATT-ATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTT-TTT-CAAAAT
* * * * ** *
19764764 AAAA-AATCCAAATTTATGAACATTTGGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAAATAAATTT
442 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AAAGA-TTT-AAAAAATAAATAT
*
19764828 GTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATGACTATT
503 GTTTACCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
19764862 TGATCAATTAT-TTTTATAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATT
1 TGAACAATTATCTATT-TCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATT
** * * *
19764926 CAT--AA----A----ACCT----T-AT-C-CA---A--AATA--AAAAAAATTAATAAGTAGGA
65 CATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGA
* * * * * * * * * *
19764967 GTTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTTAGATAGTTACGACTATTTGAACAAATGTCT
130 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
* * * * * * *
19765032 ATTTA-AAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTAT
195 A-TTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATAAAAGCTTAT
* * * * * *
19765096 TCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTG
258 TC-GAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAA--AATTTAAAAAATA
* * * * * * *
19765161 AATCTATTTGCCAAA-TTAGTTCAAATAATTATG-CTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCG
319 AATCTATTTACTAAACAT-GTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCA
* * * * *
19765224 TTATCACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTT-GAAATAAA
382 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTT-TTTCAAAATAAA
* * * *
19765287 ATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTA
445 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG-AA-AGATTTAAAAAATAAATATGTTTA
* *
19765351 CCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATT
508 CCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * * * * *
19765380 TGAACAATTCTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAATAATTATTTCTATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
* * * * * *
19765445 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGGG
66 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
* * * * * * *
19765510 ATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCT
131 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
** * * * * ** *
19765575 AATT-CAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATT-TTCTCAATTCATACTATCTTA
195 -ATTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTT-T-TATTCATAAAAGCTTA
* *
19765638 TTCAGAATAAAATAAAATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAAATAA
257 TTC-GAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAA
* * * * * *
19765701 TTCTATTTACCTAATCAAT-TT-AAATAATTATGATTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCAT
320 ATCTATTTA-CTAAAC-ATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * * * * * ** *
19765764 TATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTT-TGTTCATATAAG-TTTAGTCGGAATAAAGT
383 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTT-TTCAAAATAAAAT
** * * * * *
19765827 AATACTAATCCATTAATATTTCAAACATTAATAAG--TGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAA
447 AATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAA
*
19765890 ACTAGTTCAAATAGTTATGACTATT
512 ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATT
* * * ** * * * * *
19765915 TGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAATTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTGTTTCTATTC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
* * *** *
19765980 ATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTTAA-A
66 ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG-TAAGA
** * ** * * * * * *
19766044 -ATTTTTAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAACTATCT
130 GATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT
* * * * * * *
19766108 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAGTTCATATAAGGTTATT
195 ATTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-TTCATAAAAGCTTATT
* *
19766173 GGAAATAAAATAATAGT-ATGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAAT
259 CG-AATAAAATAATA-TAAT-TTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAAT
* ** * * * * * * * * * **
19766236 GAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGGCCATTTAAATAATTATCGATTTGAAATCGC
318 AAATCTATTTACTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCAT
* * * ** * * **
19766301 TATAACCTTTTGGTTTGTCATATAATGATT-TTAT-TGGTTCATATAAGCTTATTT-TGAATAAA
383 TATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCT-ATTCATACAAGCTT-TTTCAAAATAAA
* * * * *
19766363 ATAATACAAAATTATTAATA-TT-AAGACAATTAATAAGGAAATATTTAAAAAATAAATCTATTT
445 ATAATACTAATTTATTAATATTTCAA-A-AATTAATAA-GAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTT
* * *
19766426 ACCGAACAAATTCAAATCA-TTATGACTACT
507 ACCAAACAAGTTCAAAT-AGTTATGACTATT
* * * * * ** * * * ** *
19766456 TGAATAATTATTTATTTCATATTCTTTTGATTTTCTTCTTTTATCATAAAATAATCGTTTCTATC
1 TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATT
** * * * * *
19766521 CATATGAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC-AACAATTAACAAGTAA
65 CATACAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGTAA
* ** * * * * *
19766584 AAGATTT-TTAAA-AAATATGTTTACCGAA-AAGTTCAAGTAGTCATGACTATTTGAATAATTAT
128 GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAT
* * * * * * * *** *
19766646 CTA-CATCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTAATCAAACAATTGTTTCAATTCATGTTAGCTA
193 CTATTA-CAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TATTCATAAAAGCTT
* * *
19766710 ATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGAATTAAAAAA
256 ATTCG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-A-A-AATTTAAAAA
* * * * * * *
19766775 ATTAGTCTGTTTA-TCGAACAAGTCCAAATA-TTATGACTATCTT-AATAATTATCTATTTCAAA
316 ATAAATCTATTTACT-AAACATGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAAGAATTATCTATTTCAAA
* * * * * * *
19766837 ACATTACGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATTCAACCTTATTTC-AAAT
379 TCATTATGA-CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTT-TTTCAAAAT
* * * *
19766901 AAAATAATA-TAAATTTATTAAT-GTTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAACAATAAAT
442 AAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAG-AAAGATTTAAAAAATAAAT
19766961 TTATTTAAAA
Statistics
Matches: 6248, Mismatches: 1354, Indels: 898
0.74 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (536 bp):
TGAACAATTATCTATTTCAAATTATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTC
ATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGTAAGAG
ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA
TTACAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTATTCATAAAAGCTTATTCG
AATAAAATAATATAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCTAT
TTACTAAACATGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAGAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAAT
TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCA
AATAGTTATGACTATT
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19758361 TAAGTTTGCA
** * * *
19758371 TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATT-TTCTCAATT
1 TGAACAATTATCTATTT--AATCATTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAATT
** * * * *
19758435 CATATTAGCTTATTCAGAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG
62 CATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT-AGCAAG
* * * * * * *
19758499 AGATTAAAAAAATAATTCTGTTTACCTATCCAGTTCAAATA-A-TTATACTATTTGAACAATTAT
125 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTA-ACTATTTGAAAAACTAT
* * * * * * ***
19758562 ATATTTAAAATCATTATTA-CTATTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATATGTTT
189 CTATTTCAAATCATTATGACCT-TTTATTTTGTCATAAAAC-AAT-ATTTTATTCATACAAACTT
* *
19758626 AT-TCGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATT-A-AT-AAGTGATTTAAAAAA
251 ATCT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATATGAAGAGATTTAAAAAA
* * ** * * ** **
19758687 TAAATCTATATGTCAAACTAGTGCAAATAGTTATGA-TGATTTGGGCAATTATTTATTTCAAATC
314 TAAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCAATTTCAAATC
* * * * * * * * * * * *
19758751 GTTATGACTTTTTGTTCTGTTATAAAATAATTGTTTCTAT-TCATACAAGCTTTTTTAGATTAAA
378 ATTATGAC-ATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TTTGTCATATAAGC-TTATTCGAATAAA
* * * * *
19758815 ATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAGTAAGTAA-AAATTTTAAAAATAAATATATTTA
440 ATAATACTAATTTAATAATA--TTCA-AATAATTAA-TAAGAGATTTTAAAAA-AAAT-TATTTA
* * * * ** * * *
19758879 CCACACTAGATCAAATAATCATGAC-AGTTTTAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AACCTT
499 CCA-AATAGTTCAAATATTTAAAACTA-TTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTT
* * * * ** * *
19758942 TTGATTTG-CACAAAAGAATTGTTTTAGTTCATATAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATA
561 TTG-TTTGTCA-TAAACAATTATTTT-GTTCATACAAGCTTATT--TGATTAAATAATACTAATT
* * * * * * * *
19759006 TATTAATAATCCAAAAATTAATAA-TAAAAAGATTTAAAAAATGACTCTGTTTACTAAACAAATT
621 TATTAAT-ATTCAAAAATTAATAAGT-AGAA-ATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTT
* * * *
19759070 TAAATAATTAGGACTGTT
682 CAAATAGTTAAGACTATT
* * * * *
19759088 TGAATAATTATCTATTTGAAAT-AGCTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAGAATTTTTTTTTTC
1 TGAACAATTATCTATTT--AATCA-TTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA----TTGTTTC
* ** * *
19759152 TATTCATCTAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATACAAATTTATTAATATT-AAGACAATTAATAA
58 AATTCATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-AAAATTAAT-A
* * * * * ** *
19759215 GTAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAGTTCAAATTG-TTATGGCTATTT-AAGC
120 GCAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAA-A
* * ** * * *
19759278 AA-TATTTTATTTCAACTTGTTATGA-CTTTTGGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTGTTCATA
183 AACTA-TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-ATTTTGTCATAAAACAA-TATTT-TATTCATA
** * * * * * * *
19759341 CAAGTTTAT-TCGAATTAAAATAATATTAATTTATAAATATTTTTACAATTAATAAGTAAAAGAT
244 CAAACTTATCT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATATG-AAGAGAT
* *** * * * * *
19759405 TTAAAAAATAAATATATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGAATATTTGAATAATTATCTATT
306 TTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATT
* * * * * * * ** *
19759470 TCAAATTATTATGACCTTTTCTTTTGTAATAAAACACTTGTTTCAAT-TCATATAAGCTTATTTG
371 TCAAATCATTATGA-CATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TTTGTCATATAAGCTTATTCG
* * * * *
19759534 AAGTAAGATAATACTAATTTATTAATAGTCCAAA-AATTAATGAGTAAGAGAATTAAAAAAAGAA
434 AA-TAAAATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAATAATT-A--A-TAAGAGATTTTAAAAAA-AA
* * * ** * * * * * * *
19759598 TATGTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGATTATCTAAACAATTATCTATTACAAAACATTAT
492 T-TATTTACCAAAT-AGTTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTAT
* * * * * * * * * *
19759663 GACCTTTTTTTTTTCCACAAAACAATTGGTTCTATTCATGCGAGCTTATTTCGAATAAAATAAT-
555 GAACTTTTGTTTGT-CA-TAAACAATT-ATTTTGTTCATACAAGCTTATTT-G-ATTAAATAATA
* * * *
19759727 TTAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTA-AAATTTTAAAAAATAAATATGTTTTCTAAA
615 CT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAGAAA-TTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA
*
19759791 CATGTTCAAATAGTTATGACTATT
677 CA-GTTCAAATAGTTAAGACTATT
* * * * *
19759815 TGAAGAGTTATCTATTTCAAATCATTATGGCCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTC
1 TGAACAATTATCTATTT--AATCATTATAG-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* *
19759880 ATAAAAGCTTTTTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAA-ATTCCAAAAATTAAT---AAGAAG
63 ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAGCAAG-AG
** * * * * *
19759941 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAGCAAGCTCAAATAG-TTATGACTA-TTGTAATAATTAT-
127 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTG-AAAAACTATC
** * **
19760003 TAATTTCAAATTGTTATGATCTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTCTATTCATACAATTTTA
190 T-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TATTT-TATTCATACAAACTTA
* * * **
19760068 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGTATTCTAAAAATTAATAAGTTTGAGATTTAAAAAAT
252 TCTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATATG-AAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * *
19760133 AAATTTATTTATTGAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACTATTATCTATTTCAAATCAT
315 AAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCAT
* * * * **
19760198 AATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTTTGTTCATGTAAAATTATTCAGAATAAAAT
380 TATGACA-TTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTTG-TCATATAAGCTTATTC-GAATAAAAT
** * * ***
19760262 AATACCGATCTATTAATATTTTGATAATTAATAAGAGATTTTAAAAAAAATCTATTTACCAAAAT
442 AATACTAATTTAATAATATTCAAATAATTAATAAGAGATTTTAAAAAAAAT-TATTTACC-AAAT
** * *
19760327 AGTTCAAATATTTATGACTATTTGAATAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTAT-TTTGT
505 AGTTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTT-TGTTTGT
* * * * * *
19760391 TATGAAACAAGTGTTTCTTTTCATACAAGCTTATTTGATTCAAATAATACTAATTTAATAAGATT
569 CAT-AAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATTTGATT-AAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * *
19760456 GCAAAAATTAGTAAGTAGAAGATTTAAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACTAGTTCAAATGGTTA
631 -CAAAAATTAATAAGTAGAA-ATTT-AAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTA
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692 AGACTATT
* * * *
19760529 AGAACAATTATCTATTT-ATCATTTTAAGCTTTTGTTTGGTCATAAAACAATTATTTCAATTCAT
1 TGAACAATTATCTATTTAATCATTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
* * * *
19760593 ACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAAATTAATGTGCAAGAGA
65 AAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAAATTAAT-AGCAAGAGA
*
19760658 TTTAAAAAATAAATCT-TTTACCAAACAAGTTAAAATAGATTTAACTATTTGAAAAACTATCTAT
128 TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTAACTATTTGAAAAACTATCTAT
* *
19760722 TT-AAAGTCATTATGACCTTTTATCTTGTCATAAAACAATAGTTTTAGTTCATAAAAACTTATCT
193 TTCAAA-TCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATA-TTTTA-TTCATACAAACTTATCT
* *
19760786 GAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTGAAAAATTAATATGCAAGAGATTTAAAAACTAAA
255 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATATG-AAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
19760851 GCTATTT-TCTGAACCACTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCATTA
318 TCTATTTAT-TGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTA
** * *
19760915 TGGTATTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTTGTCAT-TCAAGCTTATTCGAATAAAAAAAAT
382 TGACATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTTGTCATAT-AAGCTTATTCGAAT-AAAATAAT
* ** *
19760979 ACTAATTTAATAATATTCAAATAATTAATAAGAGATTTATAAAATAAATGGGTTTGCCAAATCAG
445 ACTAATTTAATAATATTCAAATAATTAATAAGAGATTT-TAAAAAAAAT-TATTTACCAAAT-AG
* * * *
19761044 TTTAAATATTTAAAACTATTGGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTTTGACCTTTTGTTTGGTCA
507 TTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTGTTT-GTCA
* * * *
19761109 TATAATAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTGACATTC
571 TA-AACAATTATTTT-GTTCATACAAGCTTATTT-G-ATTAAATAATACTAATTTATTAATATTC
* * * * *
19761174 AAAAAATTAATAAGCATGAAATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAG-TCAAATAGTTAT
632 -AAAAATTAATAAGTA-GAAATTT-AAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTTCAAATAGTTAA
19761238 GACTATT
693 GACTATT
* * * * *
19761245 TCAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTC
1 TGAACAATTATCTATTT--AATCATTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* * *
19761310 ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTC-ACAAATTAATAAACAAGA
63 ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAAT-AGCAAGA
** * * ** *
19761374 GATTTAAAAAATAAAT-TAGTTTAATGAATCAA-TTCAAATA-ATCATGGCCATTT-AAATAACT
126 GATTTAAAAAATAAATCT-GTTT-ACCAAACAAGTTCAAATAGAT-TTAACTATTTGAAA-AACT
* * *
19761435 ATCTATTTTAAATCATTATTACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAT-TTTT-TTCAACATACAAGC
187 ATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATATTTTATT---CATACAAAC
* *
19761498 TTTTTCT-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAGAATT-A-AT-AAGAGATTTAAAA
249 -TTATCTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATATGAAGAGATTTAAAA
* * * *
19761559 AAGAAATCTGTTTGTTGATCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAAT
312 AATAAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAAT
* ** * * *
19761624 TATTAAAACCTTTGTTCTATCATAAAACAATTATTTCTAT-TCATATAAGCTTATTTCGAATAAA
377 CATTATGACATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TTTGTCATATAAGCTTA-TTCGAATAAA
* *
19761688 ATAATAATAATTTAGTAATATTCTAAA-AATTAATAACTATGAGA-TTTAAAAAATAAGTTCATT
440 ATAATACTAATTTAATAATATTC-AAATAATTAAT-A--A-GAGATTTTAAAAAA-AA-TT-ATT
* * * * * * *
19761751 TACCGAACTAGTTCAAACAGTTAAAACTATATGAAAAATTATTTATTTCAAATTGTTAT-AACTT
497 TACC-AAATAGTTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-T
* * * ** * * *
19761815 TTTGTTCTGTCATAAAACAATTATTTAAGCTCATAGAAGCTTATTCAAATTAGAACAAAATTAAT
560 TTTGTT-TGTCAT-AAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATT-TGATTA-AATAATACTAAT
* ** * * * *
19761880 TTATTAATATTTCAAAAATTTATAA--A-AGCTTTAGAAAATAATTCTACTTAC-GAAACCAGTT
620 TTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTACTG-AA-CAGTT
*
19761941 CAAATAATTATA-ACTATT
682 CAAATAGTTA-AGACTATT
** **
19761959 TTCACAATTATCTATTTGAAATCATTATTA-CTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTA-T
1 TGAACAATTATCTATTT--AATCATTA-TAGC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATT
* * * * * *
19762022 CAATATAAGTTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAG
62 C-ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT-AGCAAG
* * * * * * * *
19762087 AGATTTAAAAAGTAAATCTGCTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTAACTATTTGAATAATTATC
125 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTAACTATTTGAAAAACTATC
* * * * * **
19762152 TATTTCAAATCATTATAACCTTTTATTTTGTCATCAAATAAT-TGGTTCTATTTATACTATTTTA
190 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATAT--TT-TATTCATACAAACTTA
* * * * * * ** * * *
19762216 TTTGAAATAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTTGAAACTTAATAACCAAGAAAATAAAAAAAT
252 TCTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAAT-ATGAAGAGATTTAAAAAAT
* **** * ** * * ** * **
19762281 AAATCTAATTGCCAAACCAATTCAAATAGTTAAAACTATATAAATGATTATCTATTTCAAATTGT
315 AAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCAT
* * * * * *
19762346 TATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTGTT-T-GTACAAGCTTATTC-ATATTAAAA
380 TATGA-CATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTT-TTGTCATATAAGCTTATTCGA-A-TAAAA
* * * * * * *
19762408 TAATACCAATTTCATAATATTTAAAAAAACTAATAAGTAAGACATTTGAAAAATAAATTTATCTA
441 TAATACTAATTTAATAATA-TTCAAATAA-T--TAA-TAAGAGATTTTAAAAA-AAA-TTATTTA
* * ** * * * * * *
19762473 CCGAATCATTTCAAATGGTTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTCAAATCGTTTTGACCATTT
499 CCAAAT-AGTTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAAC-TTT
* * ** ** * * *
19762538 T-TTAGTCATAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACCAATTAA
562 TGTTTGTCAT-AAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATT--TGATTAAATAATACTAATTTA
* * * * * ** * *
19762602 TTAATATTCAAAAAAGTAATGAGCAAGAGATTT-AAAAATAAATATGTTTACCAAATAAGTTGAA
623 TTAATATTC-AAAAATTAATAAG-TAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAA-CAGTTCAA
*
19762666 ATAGATT-TGACTATT
685 ATAG-TTAAGACTATT
* *
19762681 TGAACAATTATCTATTTAAAGCCATTATGAGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAACTGTTTCAATTC
1 TGAACAATTATCTATTT-AA-TCATTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* ** * **
19762746 ATAAAAACTTATTTGAAATAAAATAATACTACTTTATTAATATTTGAAAAATTAATATGCAAGAG
63 ATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATA-GCAAGAG
* * * ** * * * * *
19762811 ATTTAAAAACTAAAGT-TATTTTCTGAACCACTTTAAATAG-TTATGACTATTTGAACAACTATC
127 ATTTAAAAAATAAA-TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAAAAACTATC
* * * * * * * *
19762874 AATCTCAAAT-GTTATGATC-TTTGTTTTCTCATAAAACAATTATTTTTTATCATACAAGCTTAT
190 TATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TATTTTAT-TCATACAAACTTA-
* * * * * *
19762937 TCGGATA-AAAATAATACTAATTTAATAGTATTTTGATAATTAATA--AA-AGATTTAAAAAATA
252 TCTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATATGAAGAGATTTAAAAAATA
*** **** ** * * ** * * * * * *
19762998 AATGGGTTTGGCAAATTAATTCAAGTAGTTAAAACTATTAGAATAATTATCTATTCCCAATCGTT
316 AATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATT
* * ** * * ** *
19763063 -TCAACCTTT-TGTTTAGTCATATGATAATTATTTCAGTT-T-ATGCAAGCTTATTTGGAATAAA
381 AT-GACATTTGT-TTTA-TCATAAAACAATTATTT--TTTGTCATATAAGCTTA-TTCGAATAAA
* * * ** * *
19763124 ATAATA-AACATTCAA-AAAATT--AATAA-GCAT--GAGAATTGAATAAATAAATCTATTTACC
440 ATAATACTA-ATTTAATAATATTCAAATAATTAATAAGAGATTTTAA-AAA-AAAT-TATTTACC
* * * * * * * *
19763182 GAACA-AGTTCAAATAGTT-ATACTATTTCAACAATTATCTATTTTAAATCATTATGACCATTTG
501 -AA-ATAGTTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAACTTTTG
* * * *** ** * *
19763245 TTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTTATAAAAGCCTATCCAAATTGTTATAA-CCT--TTTGT
564 -TTTGTCAT-AAACAATTATTTT-GTTCATACAAGCTTAT-TTGATT-AAATAATACTAATTTAT
* * * * **
19763307 T-TTGTCATAAAACAATTATTTAAGTTCATAGAAGCTTATTCGTAATGGAATAAA-ATTAATTTA
624 TAATAT--TCAAA-AATTA-ATAAG----TAGAA----ATT--TAA-AAAATAAATA-T-ATTTA
* * * * ** *
19763370 -TTAATATTTTAAAATTTTATAAGA-GATT
672 CTGAACA-GTTCAAATAGT-TAAGACTATT
* * * *
19763398 TAGAA-AATAATTCTACTTAAAAAACCAGTTCAAATAATTATAACTATTAGCACAATTATT-T-A
1 T-GAACAATTA-TCTA--T----------TT--AATCATTATAGCT-TTTG-----TT-TTGTCA
* * ** * * * *
19763460 TTTCAAATCATTATTACTTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTCAATATAAATTTGTTC
43 --T-AAAACA--ATT--GTTTC--AAT-TCAT--AA-AA--GCTTAT-TCAAAATAAA----AT-
* * * *
19763525 GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
87 --AAT--ACTAATT------TATTAATATTCAAAAAATTAAT-AGCAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * *
19763590 TCTGTTTGCCAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
141 TCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTAACTATTTGAAAAACTATCTATTTCAAATCATTAT
* * ** * * * ** * *
19763655 AACCTTTTATTTTGTCATCAAATTATTTGTTCTATTTATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATG
206 GACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATAT-TT-TATTCATACAAACTTATCTGAAATAAAATAATA
* * * ** ** * * *
19763720 CAAATTTAATAATATTCCAAAACCTAATA--ACCA-A---GAAAATTAAA--TAGTTA---AA--
269 CTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATATGAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATTGAACC
* * ** * * *
19763772 A---C---TA--TAT-A--A-ATG----ATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTCTTTTGT
333 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCATTATGA-CATTTGTTTTAT
* * * * * *
19763821 CATAAAATAATTGTTTTGTT-T-GTACAAGCTTATTC-ATATTAAAATAATACTAATTTCATGAT
397 CATAAAACAATTATTTT-TTGTCATATAAGCTTATTCGA-A-TAAAATAATACTAATTTAATAAT
* * * * *
19763883 ATTTAAAAAACTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATT-TGTCTATCAAATCATTTCAAATGA
459 ATTCAAATAA-T--TAA-TAAGAGATTTTAAAAA-AAATTAT-T-TACCAAAT-AGTTCAAAT-A
* * * ** * * *
19763947 -TTAAGACTATTAGAATAATTATATACTTT-AAATTATTTTGACCATTTT-TTAGTCATAAAACA
515 TTTAAAACTATTTGAATAATTATCTA-TTTCAAATCGTTATGAAC-TTTTGTTTGTCAT-AAACA
* *** * *
19764009 ATTGTTTCAATCGATACAAGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAAT
577 ATTATTTTGTTC-ATACAAGCTTATT-TGATTAAA-TAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAAT
* * * * ** *
19764074 TAATAAGAAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-TCGAACAAGTTCAAATAGTTATTATTATT
638 TAATAAG-TAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTACT-GAAC-AGTTCAAATAGTTAAGACTATT
* * * ** * * *
19764138 TGAATAATTGTCTATTTAAAATCATTATAACCTTTTAATTTGTCATAAAACAATTGATTCAAGTA
1 TGAACAATTATCTATTT--AATCATTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAATTC
* * * ** **** *
19764203 ATACATGCTTAGAT-GGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTCTAAATTAATAAGTAAGA
63 ATAAAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT-AGCAAGA
* * * * * * *
19764267 AATTTAAAAAAATAAATCTGTTTAACAAATC-AGTTAAAATA-ATTATGATTATTTGAATAATTA
126 GATTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAAAAACTA
* * * *
19764330 TCTATTTCAAATCATTATGACATTTTATTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTTTTACCTTACAAGCT
188 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAATAT-TTTATT--CATACAAACT
* * * * * * * *
19764394 TAT-TCAAAAAAAATAATATTAATTGATTAATACTTCAAAAATTAATAGGTAACAGATTTAAACA
250 TATCTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATATG-AAGAGATTTAAAAA
*** * * * *
19764458 ATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATT
313 ATAAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATC
* ** * * * * * ** * * **
19764523 GTTAAAATCCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAATCATAGAAGCCTATTCGGTTAAA
378 ATTATGA--C-ATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTTGTCATATAAGCTTATTCGAAT-AA
* * * *
19764588 AATAATACTAATTTAATAACATTTCAAA-AATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTGCT
439 AATAATACTAATTTAATAATA-TTCAAATAATTAATAAGAGATTTTAAAAA-AAAT-TATTTACC
* * * * * * * * *
19764652 AAACCAATTCAAATAGTTAAAACAATTAGAATAATTATCTATTTCAAATTGTTCAAG-CCCTTTG
501 AAA-TAGTTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT-ATGAACTTTTG
* * ** * * *
19764716 TTTAGTCATAAA-ATATT-TGTTTCATGTCTTACAAGCTTATTTGGAAAAAAAAAATCCAAATTT
564 TTT-GTCATAAACA-ATTAT-TTT-GT-TCATACAAGCTTATTT-G-ATTAAATAATACTAATTT
* * ** * * * * **
19764779 ATGAACATTTGGAAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTT
622 ATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAGAA-A-TTT-AAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTT
* *
19764844 TAAATAGTTATGACTATT
682 CAAATAGTTAAGACTATT
* * * *
19764862 TGATCAATTAT-TTTTATAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTTCAATT
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* * *
19764926 CATAAAACCTTATCCAAAAT--AA-AA-A--AA---ATT-A-A-T------A--AGTAG---GAG
62 CATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAGCAAGAG
* * * * * * * *
19764968 TTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTTAGATAG--TTACGACTATTTGAACAAA-TGT
127 ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATTTA--ACTATTTGAA-AAACTAT
* * * * * * * **
19765030 CTATTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTA
189 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAA-TATTT-TATTCATACAAACTTA
* * * * * *
19765095 T-TCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAG
252 TCT-GAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATATG-AAGAGATTTAAAAAA
* **** ** * * *
19765159 TGAATCTATTTGCCAAATTAGTTCAAATAATTATG-CTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATC
314 TAAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACT-ATTTGAACAATTATCAATTTCAAATC
* * * ** * * * *
19765223 GTTATCACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATT-GTTTTTGATCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
378 ATTATGA-CATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTTTTTG-TCATATAAGCTTATTCG-AATAAA
* * * *
19765287 ATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAA-AATTAATAGTAAGAGA-TTTAAAAAATGAATCTGTTT
440 ATAATACTAATTTAATAAT-ATTCAAATAATT-A-A-TAAGAGATTTTAAAAAA--AAT-TATTT
** * ** * * * * *
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498 ACC-AAATAGTTCAAATATTTAAAACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATGAA-CTT
* * * * *
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561 TTGTT-TGTCAT-AAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATTTG--ATTAAATAATACTAATT
* * ** * * * **
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621 TATTAATATT-CAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATATATTT-ACTGAA-CAGTT
*
19765544 CAAATAGTTAAGACTATA
682 CAAATAGTTAAGACTATT
* ** * * *
19765562 TGAACAATTATCTAATTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATT-TTCTCAATT
1 TGAACAATTATCT-ATT-TAATCATTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAATT
** * * *
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62 CATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAGCAAG
* * * * * * * *
19765686 AGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAATCAA-TTTAAATA-ATTATGATTATTTGAACAATTA
125 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAAAAACTA
* * * * * * * * **
19765749 TATATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTTTGTTCATATAAGTTTA
188 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAA-CAATATTTTATTCATACAAACTTA
* * ** * *
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252 -TCTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATATGAAGAGATTTAAAAAAT
** * * ** **
19765875 AAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGT
315 AAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAATCAT
* * * * * *
19765940 TATGA-ATTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTGTTTCTAT-TCATATAAGCTTATTTGGAATAAAA
380 TATGACA--TTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TTTGTCATATAAGCTTA-TTCGAATAAAA
* *** * * * * *
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441 TAATACTAATTTAATAATATTCAAATAATTAATAAG---AGA-TTTTAAAAAAAAT-TATTTA-C
* * * * * ** * * *
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* * * * * * *
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564 TTTGTCAT-AAACAATTATTT-TGTTCATACAAGCTTATTTG--ATTAAATAATACTAAT-TTAT
* * * * * *
19766197 TAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAA
624 TAATATTC-AAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATATATTTACTGAAC-AGTTCAAA
* * * *
19766262 TAATTATGGCCATT
686 TAGTTAAGACTATT
* * * ** * * * ** ***
19766276 TAAATAATTATCGATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGGTTTGTCATATAATGATT-TTATTGGTT
1 TGAACAATTATCTATTT--AATCATTAT-AGCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTT-TCAATT
* *** * * * *
19766340 CATATAAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAAATTATTAATATT-AAGACAATTAATAAGGAA-
62 CATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAA-AAAATTAAT-AGCAAG
* * * * * * * * *
19766403 ATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAAT-CATTATGACTACTTGAATAATTAT
125 AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAGATT-TAACTATTTGAAAAACTAT
* * * ** * * * * * ** *
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189 CTATTTCA-AATCATTATGACCTT-TTATTTTGTCATAAAACAAT-ATTT-TATTCATACAAACT
* * * * * * * **
19766531 TAT-TCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAACAAGTAAAAGATTT-TTA
250 TATCTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATATG-AAGAGATTTAAAA
* * ** * * * * * **
19766594 AA-AAATATGTTTACCGAA-AAGTTCAAGTAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTACATCAAAT
312 AATAAATCTATTTATTGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATTTCAAAT
* * * * * * * ** * * * *
19766657 CATTGTAACCTTTTGTTTTGTAATCAAACAATTGTTTCAAT-TCATGTTAGCTAATTTGAAATAA
377 CATTATGA-CATTTGTTTTATCATAAAACAATTATTT-TTTGTCATATAAGCTTATTCG-AATAA
* * *
19766721 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAA-AATTAAAAAGTAAGAGA-ATTAAAAAAATTAGTCTG
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* * ** * * *
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* * * * * * * * *
19766846 TCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATTCAACCTTATTTCAAATAAAATAATA-
557 AC--TTTTGTTTGTCAT-AAACAATT-ATTTTGTTCATACAAGCTTATTT--GATTAAATAATAC
* * * * *
19766910 TAAATTTATTAATGTTCTAAAAATTAATAAGTAAAAATTTTAACAATAAATTTATTTA
616 T-AATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATATATTTA
19766968 AAAATTAATG
Statistics
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* * * *
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* * * ** * *
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* * * *
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** ** * * *
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* * * * *
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* * *
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* * * * * *
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*** * *
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* * ** * * * * ** *
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* * * * * * **
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* * * * *
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123 TT-AAAAAATAAATCTATTTA-CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAT-A
* * ** ** * * * *
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* * * * * * ** * * * ** ** **
19764930 AAACCTTATCCAAAATAAAA-AAAATTAA-TAAGTAGGAGTTTTAAAAAATAAATTTGTTTATCG
64 AAGCC-TATTCAAAA-AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTTCAAAAATTAAGTAAG-AGATTT
* ** ** * * * ** * * * *
19764993 AACAAATTTAGATAGTTAC-GACTA-TTTGAACAA--ATGTCTATTTAAAATC
125 AAAAAATAAATCTATTTACAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTT-GAATA
**** * * * **
19765042 ATTATGACT-TTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGT-TTCTGTTCAT---ACAA--G-TT-TATTC
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*** * * * *
19765098 A-A-AA---TA---AAATAATTCTAAT--TTA-TTAAT-A--TTCCAAAAATTAATAAGTAAGTG
60 ATACAAGCCTATTCAAA-AAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAAGTAAGAG
* * * ** * *
19765149 ATTTAAAAAGTGAATCTATTTGCCAAATTAGTTCAAATAATTATG-CTCATTTCAACA
121 ATTTAAAAAATAAATCTATTT-ACAAACCAGTTCAAATAATTATGACT-ATTTGAATA
* ** * * * * * * *
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* * * * *
19765271 GCTTATTTGAAATAAAATAATAATAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAGTAAGAGATTTAAA
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* * * * *
19765336 AAATGAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACA
128 AAATAAATCTATTTA-CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
* * * ** * * * * * * **
19765386 ATTCTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAA
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* * * * * * * * *
19765451 GCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGGGATTTAA
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* * * * * * *
19765516 AAAATAAATTTGTTTGCCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACA
127 AAAATAAATCTATTT-AC-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
* ** * * * * *
19765568 ATTATCTAATTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAA-T-TTTCTCAATTCATAC
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTAAAACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-AA-CCATAC
* * * * *
19765631 TATCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTCAAAAATTAA-TAAGAGATTTAA
64 AAGCCTATTCA-AAAAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAA
* * * * * * *
19765694 AAAATAATTCTATTTACCTAATCAATTTAAATAATTATGATTATTTGAACA
127 AAAATAAATCTATTTA-CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
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19765745 ATTATATATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTT-TGTTCATATAA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTAAAACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAACCATACAA
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130 ATAAATCTATTTA-CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
* ** * * * ** *
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* ** * ** * *
19765984 AAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGACAATTAA-TAAGTTAAAATTT
64 AAGCCTA-TTCAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAG---AGATTT
** * * ** * * * *
19766048 TTAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATA
125 AAAAAATAAATCTATTTA-CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
* ** ** * * * * ** *
19766101 ACTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTC-AGTTCATATA
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** * * * *
19766165 AGGTTATTGGAAATAAAATAATAGT-ATGTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATT
65 AGCCTATT-CAAAAAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAAGTAAGAGATT
* * * * * * *
19766228 TAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGGCCATTTAAATA
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* ** * * * *
19766345 AAGCTTATTTTGAATAAAATAATACAAAATTATTAATA-TT-AAGACAATTAA-TAAGGAAATAT
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* * * * *
19766407 TTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATCATTATGACTACTTGAATA
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19766527 AGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATTAACAAGTAAAAGATTT-
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** * * * * *
19766591 TTAAA-AAATATGTTTACCGAAA--AGTTCAAGTAGTCATGACTATTTGAATA
126 AAAAATAAATCTATTTA-C-AAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
** ** ** * * * * * ***
19766641 ATTATCTACATCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTAATCAAACAATTGTTTC-AATTCATGTT
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTAAAACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAA-CCATACA
* *
19766705 AG-CTAATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAAAAGTAAGAGAATT
65 AGCCT-A-TTCAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATT---AAGTAAGAG-ATT
* * * * * * *
19766769 AAAAAAATTAGTCTGTTTATCGAACAAGTCCAAAT-ATTATGACTATCTT-AATA
124 TAAAAAATAAATCTATTTA-CAAACCAGTTCAAATAATTATGACTAT-TTGAATA
*** * * * * * ** *
19766822 ATTATCTATTTCAAAACATTACGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATTCA
1 ATTATCTATTTCAAATTGTTA-AAACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAACCATACA
* *
19766887 A-CCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-GTTCTAAAAATTAA-TAAG
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19766941 TAAAAATTTT
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ATTATCTATTTCAAATTGTTAAAACATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAACCATACAA
GCCTATTCAAAAAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAGTAAGAGATTTAAAAAA
TAAATCTATTTACAAACCAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAATA
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19764781 GAACATTTGG
* *
19764791 AAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAATAGTTATG
1 AAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTTAAATAGTTACG
* * *
19764856 ACTATTTGATCAATTATTTTTATAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGACATAAAACAATTGTTT
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* ** * * *
19764950 AAAATTAATAAGTAGGAG-TTTT-AAAAAATAAATTTGTTTATCGAACAAATTTAGATAGTTACG
1 AAAATTAATAAGCAAAAGATTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAATTTAAATAGTTACG
* * *
19765013 ACTATTTGAACAAATGTCTATT-TAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTA-ATAAAATAATTGT
66 ACTATTTGAACAAATAT-TATTATAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG-ACATAAAACAATTGT
** * ** *
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129 TTCAATTCATAAAACCTTATCCAAAATAAAA
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Statistics
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CAATTCATAAAACCTTATCCAAAATAAAA
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1 AATTATGCTCATTTCAA
19765220 ATCGTTATCA
Statistics
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AATTATGCTCATTTCAAC
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19764939 CCAAAATAAA
* * * * * * * *
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* * * * * *
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* * * ** * *
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131 TATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * ** *
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1 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * * *
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* * * *
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130 CT-ATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* *
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1 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * * * *
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66 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * * *
19765440 TATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCC
131 TATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * *
19765491 AAAAATTAATAACTAAGGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAG
1 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * ** * * *
19765556 ACTATATGAACAATTATCTAATTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATT-TTC
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT-
* * * *
19765620 TCAATTCATACT-ATCTTA-TTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTC
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* * * * *
19765673 AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCTAATCAA-TTTAAATAATTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAA-CAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
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* * * * * * **
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* * * * *
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1 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* * ** * * * * *
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* *
19765974 CTATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
130 CTATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * ** * ** * * *
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1 AAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * *
19766089 ACTATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTT
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTT
* * *
19766154 C-AGTTCATATAAGGTTATTGGAAATAAAATAATAGT-ATGTTATTAATA-TTC
130 CTA-TTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT-TTATTAATATTTC
* * * * *
19766205 TAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATG
1 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * ** * * *
19766270 GCCATTTAAATAATTATCGATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGGTTTGTCATATAATGATT-TTA
65 ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTT-
* * *
19766334 T-TGGTTCATATAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATACAAAATTATTAATA-TT-
129 TCT-ATTCATATAAGCTTA-TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * *
19766385 AAGACAATTAATAAGGAA-ATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAATTCAAATCA-TTA
1 AA-A-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-AGTTA
* * * * * * ** * * *
19766448 TGACTACTTGAATAATTATTTATTTCATATTC-TTTTGATTTTCTTCTTTTATCATAAAATAATC
63 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATTATAACCTT-TTGTTTTGTCATAAAATAATT
* * * * *
19766512 GTTTCTATCCATATGAGCTTA-TTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTC
126 GTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * ** * * *
19766568 AACAATTAACAAGTAAAAGATTT-TTAAA-AAATATGTTTACCGAA-AAGTTCAAGTAGTCATGA
1 AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATGA
* ** * * * *
19766630 CTATTTGAATAATTATCTACATCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGTAATCAAACAATTGTTTC
66 CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGTTTC
* * * *
19766695 AATTCATGTTAGCTAATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
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* * * * * *
19766746 AAAAATTAAAAAGTAAGAGAATTAAAAAAATTAGTCTGTTTATCGAACAAGTCCAAATA-TTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTATG
* * * * * * * *
19766810 ACTATCTT-AATAATTATCTATTTCAAAACATTACGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGG
65 ACTAT-TTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTGT
* * *
19766874 TTCTATTCAT-TCAACCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAAT-GTTC
128 TTCTATTCATAT-AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTC
* * *
19766927 TAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTTAACAATAAAT
1 -AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
19766961 TTATTTAAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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TATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
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** * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * *
19765077 TCTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAA
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* * * * *
19765142 GTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTATTTGCCAAATTAGTTCAAATAATTATG-CTCATTTCAACA
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* * *
19765206 ATTATCTATTTCAAATCGTTATCACCTTTTGTTTGGTCATATAACAATTGTTTT-TGATCATACA
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*
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* * * *
19765311 AAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAACCAGTTCAAATAGTTATGA
1 AAAAATTAATAAGTAA-A-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTTATGA
* *
19765375 CTATTTGAACAAT-TCTATACTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAATAATTATTT
64 CTATTTGAACAATATCTAT--TTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTT
* * * *
19765439 CTA-TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAACAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAA
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* * * * * * * * *
19765503 CTAAGGGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACA
191 -TAAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACA
* * * *
19765568 ATTATCTAATTCAAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATA-AAAGAATT-TTCTCAATTCATAC
254 ATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGT-TTGTCATATAAA-AATTGTT-T-TATTCATA-
* **
19765631 T-ATCTTATTCAGAATAAAATAA-AATAAATTTATTAATATTTC
314 TAAGCTTATTTTGAATAAAATAATAAT-AATTTATTAATATTTC
* * * * *
19765673 AAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAAATAATTCTATTTACCT-AA-TCA-ATTTAAATAATTATG
1 AAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CTGAACT-AGA-TCAAATAGTTATG
* * *
19765733 ATTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGT-T
63 ACTATTTGAACAA-TATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA-AAAT-TAT
* * * * * *
19765797 TT--GTTCATATAAGTTTAGTCGG-AATAAAGTAATACTAATCCATTAATATTTCAAACA-T--T
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* * * *
19765856 AATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCA
189 AATAAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACA
* * * * * *
19765921 ATTATTTATTTCAAATTGTTATGAA-TTTTTGTTCTATTATAAAAAAATTGTTTCTATTCATATA
254 ATTATCTATTTCAAATCGTTAT-AACCTTTTGTT-TGTCATATAAAAATTGTTT-TATTCATATA
* * *
19765985 AGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT
316 AGCTTATTTTGAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC
* * ** * * *
19766026 GACAATTAATAAGTTAAAATTTTTAAAATAAATATGTTTATTGAACTAGATCAAATAGTCATGAC
1 AAAAATTAATAAG-TAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTTATGAC
* *
19766091 TATTTGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCA
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* * * * *
19766156 GTTCATATAAGGTTATTGGAAATAAAATAATAGT-ATGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATT
129 GTTCATACAAGTTTATTGGAAATAAAATAATACTAAT-CTATTAATATTCCAAAAATTAATAA-T
* * * * * * * *
19766220 AAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTACCGAACAAGTTTAAATAATTATGGCCATTTAAATAATT
192 AAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATT
* * * ** *
19766285 ATCGATTTGAAATCGCTATAACCTTTTGGTTTGTCATATAATGATT-TTATTGGTTCATATAAGC
257 ATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTT-GTTTGTCATATAAAAATTGTT-TT-ATTCATATAAGC
*
19766349 TTATTTTGAATAAAATAATACA-AAATTATTAATA-TT-
319 TTATTTTGAATAAAATAATA-ATAATTTATTAATATTTC
* * * *
19766385 AAGACAATTAATAAGGAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAC-AAATTCAAATCA-TTA
1 AA-A-AATTAATAAGTAAA-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGA-TCAAAT-AGTTA
* * * * * * ** * * * *
19766448 TGACTACTTGAATAATTATTTATTTCATATTC-TTTTGATTTTCTTCTTTTATCATAAAATAATC
61 TGACTATTTGAACAA-TATCTATTTCA-AATCATTATAACCTT-TTGTTTTGTCATAAAAAAATT
* * ** * * * * * * *
19766512 GTTTCTA-TCCATATGAGCTTATT-CAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAACAATT
123 ATTTC-AGTTCATACAAGTTTATTGGA-AATAAAATAATACTAATCTATTAATATTCCAAAAATT
* ** ** * * * * * *
19766575 AACAAGTAAAAGATTT-TTAAA-AAATATGTTTACCGAAA--AGTTCAAGTAGTCATGACTATTT
186 AATAA-TAAGTGATTTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTT
* ** * * *
19766636 GAATAATTATCTACATCAAATCATTGTAACCTTTTGTTTTGT-A-ATCAAACAATTGTTTCAATT
249 GAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTGTCATAT-AAA-AATTGTTT-TATT
* * * *
19766699 CATGTTAGC-TAATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
310 CATATAAGCTTATTTTG-AATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC
* * * * *
19766746 AAAAATTAAAAAGTAAGAGAATTAAAAAAATTAGTCTGTTTA-TCGAACAAG-TCCAAATA-TTA
1 AAAAATTAATAAGT-A-A-AATTTAAAAAATAAATCTGTTTACT-GAACTAGAT-CAAATAGTTA
* * * * * * *
19766808 TGACTATCTT-AATAATTATCTATTTCAAAACATTACGATCTTTTTTTTTTGTCATAAAACAATT
61 TGACTAT-TTGAACAA-TATCTATTTCAAATCATTA-TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATT
** * ** ** * * *
19766872 GGTTCTA-TTCATTCAACCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATGTTCTAAAAATT
123 ATTTC-AGTTCATACAAGTTTATTGGAAATAAAATAATACT-AATCTATTAATATTCCAAAAATT
19766935 AATAA
186 AATAA
19766940 GTAAAAATTT
Statistics
Matches: 1302, Mismatches: 243, Indels: 170
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Matches are distributed among these distances:
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364 1 0.00
ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (356 bp):
AAAAATTAATAAGTAAAATTTAAAAAATAAATCTGTTTACTGAACTAGATCAAATAGTTATGACT
ATTTGAACAATATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAAAAATTATTTCAGT
TCATACAAGTTTATTGGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTCCAAAAATTAATAATAAGT
GATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACTAGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCT
ATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTGTCATATAAAAATTGTTTTATTCATATAAGCTTATTTT
GAATAAAATAATAATAATTTATTAATATTTC
Found at i:19766906 original size:541 final size:541
Alignment explanation
Indices: 19764974--19766967 Score: 1382
Period size: 541 Copynumber: 3.7 Consensus size: 541
19764964 GGAGTTTTAA
* * * * * * * * * ** *
19764974 AAAATAAATTTGTTTATCGAACAA-ATTTAGATAGTTACGACTATTTGAACAAATGTCTATTTAA
1 AAAATAAATATGTTTACCGAACAAGA-TCAAATAGTCATGACTATTTGAATAACTATCTACATCA
* * * * ** * * * **
19765038 AATCATTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTGTTCATACAAGTTTATTCAAAAT
65 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTAATTGGAAAT
* * * * * *
19765103 AAAATAATTCTAAT-TTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGTGATTTAAAAAGTGAATCTA
130 AAAATAATACT-ATGTTATTAATATTCTAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTA
* * ** * * * * * ** **
19765167 TTTGCCAAATTAGTTCAAATAATTATG-CTCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATCAC
194 TTTACCGAACAAGTCCAAATAATTATGAC-CATTTAAATAATTATCGATTTCAAAACACTAGAAC
* ** * * *
19765231 CTTTT-GTTTGGTCATATAACAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATA-
258 CTTTTGGTTT-GTCATAAAACAATT-TTACTGATTCATATAACCTTATTTCAAATAAAATAATAC
* * * * * * * *
19765293 ATAATTTATTAAT-CTTTCAAAAATTAAT-AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTACCGAA
321 A-AAATTATTAATGATCT-AAAAATTAATAAGGAA-AAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA
* * * * * * * *
19765356 CCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTCTATACTTCAAA-TCATTAT-AACCTTTTGTT
383 CAAATTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGAA-TTTTTCTT
* * * ** * * * * * *
19765419 ATGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATT-TGAAATAAAACAATACTAATCTAAT
446 CTATCATAAAAAAATCGTTTCTATCCATATAAGCTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATT
* * * * ** **
19765483 AATATTCCAAAAATTAATAACTAAGGGATTTAA
510 AATATTTCAACAATTAACAAGTAA-AAATTTTT
* * * * * * * * * *
19765516 AAAATAAATTTGTTTGCCAAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCTA-ATTC
1 AAAATAAATATGTTTACC-GAACAAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAACTATCTACA-TC
** * * * * * * *
19765580 AAATTGTTATGACCTTTTGTCTTGTCATAAAAGAATT-TTCTCAATTCATACT-ATCTTATT-CA
64 AAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTATT-TCAATTCATA-TAAGCTAATTGGA
* *
19765642 GAATAAAATAAAATA-AAT-TTATTAATATT-TCAAAAATT---AA-TAAGAGATTTAAAAAAT-
127 -AATAAAAT--AATACTATGTTATTAATATTCT-AAAAATTAAAAAGTAAGAGATTAAAAAAATG
* ** ** * * ** *
19765699 AATTCTATTTACCTAATCAA-TTTAAATAATTATGATTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA
188 AA-TCTATTTACCGAA-CAAGTCCAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCGATTTCAAAACA
* * * * * ** * *
19765763 TTATAACTTTTTGTTTTGTCATAAAAGAAATGTTT--TG-TTCATATAAGTTTA-GTCGGAATAA
251 CTAGAACCTTTTGGTTTGTCATAAAA-CAAT-TTTACTGATTCATATAACCTTATTTC-AAATAA
* * * * *
19765824 AGTAATAC-TAATCCATTAAT-ATTTCAAACATTAATAAGTG----ATTTAAAAAATAAATCTAT
313 AATAATACAAAAT-TATTAATGATCT-AAAAATTAATAAG-GAAAAATTTAAAAAATAAATCTAT
* * * * * *
19765883 TTATCAAACTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATTGTTATGAATT
375 TTACCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTACTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTATGAATT
* * * * **
19765948 TTTGTTCTATTATAAAAAAATTGTTTCTATTCATATAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAAT
440 TTTCTTCTATCATAAAAAAATCGTTTCTATCCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAAT
** * *
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** * **
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1 AAAATAAATATGTTTACCGAACAAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAACTATCTACATCAA
* * * * *
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* * * *
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131 AAATAATACTATGTTATTAATATTCTAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTATT
** * * * * *
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* ** * * * **
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261 TTGGTTTGTCATAAAACAATTTTACTGATTCATATAACCTTATTTCAAATAAAATAATACAAAAT
* *
19766375 TATTAAT-AT-TAAGACAATTAATAAGGAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAACAAATT
326 TATTAATGATCTAA-A-AATTAATAAGGAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATT
* * * * *
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* * * *
19766502 TAAAATAATCGTTTCTATCCATATGAGCTTATTCAGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTT
452 TAAAAAAATCGTTTCTATCCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT
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517 CAACAATTAACAAGTAAAA-ATTTTT
* * *
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1 AAAATAAATATGTTTACCGAACAAGATCAAATAGTCATGACTATTTGAATAACTATCTACATCAA
* * * * * * *
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* *
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* * * * *
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* * **
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* * * * * * *
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ATCATTATAACCTTTTGTTTTGTAATAAAAAAATTATTTCAATTCATATAAGCTAATTGGAAATA
AAATAATACTATGTTATTAATATTCTAAAAATTAAAAAGTAAGAGATTAAAAAAATGAATCTATT
TACCGAACAAGTCCAAATAATTATGACCATTTAAATAATTATCGATTTCAAAACACTAGAACCTT
TTGGTTTGTCATAAAACAATTTTACTGATTCATATAACCTTATTTCAAATAAAATAATACAAAAT
TATTAATGATCTAAAAATTAATAAGGAAAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAACAAATTCA
AATAGTTATGACTACTTGAACAATTATTTATTTCAAATTCTTATGAATTTTTCTTCTATCATAAA
AAAATCGTTTCTATCCATATAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAC
AATTAACAAGTAAAAATTTTT
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19767660 ATAAAACAAT
** *
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130 AACAATTATATATTTCAAATTGTTA
* *
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* * *
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66 ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGA
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131 ACAATTATATATTTCAAATTGTTA
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1 T
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ATAAGTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTTTTTATCAAACCAATTCAAATAGTTATGACTATTTGA
ACAATTATATATTTCAAATTGTTA
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** *
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*
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***
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66 GAACAAGTTTAAATAATTAT
19768484 GACCATTTGA
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GAACAAGTTTAAATAATTATT
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* * * *
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* * * * * ** * * *
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** * * *
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* *
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* * *
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* * ** *
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128 AAACAATTTTTTCTGTCCACACAAGCTTATTTCT-AATAAAATAATACAAAA
** * *
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* * *
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65 CAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATTC-TTA-GA-CTTTTGTTTTGTCAT
*
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127 AAAACAATTTTTTC
19768907 AATTCATGTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CAATTTTTTCTGTCCACACAAGCTTATTTCTAATAAAATAATACAAAA
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* * * * * *
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* * * * *
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* * ***
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* * * ***
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*
19768803 TT-AAAA-AGAT-GTTTA-CCACACAAGTTCAAATAGTCATGACT-ATTTGAATAATTATCTACT
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* * * *
19768863 TCAAA-TCATTATGATCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCAT
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**
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19768956 CCAAAATTTA
Statistics
Matches: 182, Mismatches: 30, Indels: 16
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.11, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (177 bp):
ACAAACTTATTTGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTAAGACAATTAATAAGTAAAAGATT
TAAAAATAAATAGTTTATCCAACAAGTTCAAATAGTCATGACTAATTTAATAATTATCTACTTCA
AATTCTTAGGACTTTTGTTTTATAATAAAACAATTGTTTCAATCCAC
Found at i:19769347 original size:177 final size:176
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19769069 TATGCAAGCT
* *
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* * *
19769143 TAAATTTATTTTTTGAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTGAAATCA
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*
19769208 TTATGA-CCATT-CATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCAAAAAACAA
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*** * **
19769321 AAATCTATTTATT-AAGTGAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATTG
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* * * ***
19769385 TTATGATCCTTGGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTT
127 TTATGATCCTTGCATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAAAAACAA
* ** * *
19769435 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATGTTATAAAAATTAATAAGTTGAAGATTTAAAAA
1 TATTTGAAATAAAATAATACTAA--T-TTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAAA
* * * * * * * *
19769500 CTTAATCTATTTTTTGAACA-ACTTCAAATAGTCA-CATCGATCTAAACT-GTTATCTATTTCAA
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* * ** * * * * *
19769562 ATCATTATGA-CATTTTG-TTTTGTTGTAAAAAAATTGTTTTTGTTCATACAAA-AT
123 ATCATTATGATC--CTTGCATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCA-AAAAACAA
* * *
19769616 TATTT-AGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAGT---GATATAAAAA
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* *** * * *
19769677 CTAAATCTCTTTACCAAAC-CAATTCAAATAGTTATGACTATTTAAAGAATTATCTATCTCAAAT
62 -TAAATCTATTTATTGAACAC-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
** * ** * * ** * *
19769741 CATTATGATTTTTG-TTTTGTCCCAAAACATTTATTTCTATTCATGCAAGC-T
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* * * * * * * **
19769792 TATTTGGATTAAAGTATTGCTAAATTAATAATATTCTAAACATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAA
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* * * * * * * * *
19769857 TAAATATTTTTGTTAAAC-CAGTTCAAATAGTTAAGGCTAATAGAACAATTATCTATTTCAAATC
62 TAAATCTATTTATTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
*** * * * * ** *
19769921 ATTATGA-CCTTTTGTTTAGTCATAAAATAGTTGTTT-TAGCTCATACATGC-T
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* * *
19769972 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAGCATT-CAAAAATTTAATAAGTAAGAAAGTGAAAA
1 TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTA--A-TATTCCAAAAA-TTAATAAGTAA-AAATTTAAAA
*** * * * * * *
19770036 A-AAATCTATTTACCCAATA-AGTTCAAATAATTTTGGCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
61 ATAAATCTATTTATTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAAT
** * * * *
19770099 CATTATGAT-CTTTTATTTTATCGTAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAAAAGC-T
125 CATTATGATCCTTGCA-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCA-AAAAACAA
* * * *** * * * *
19770151 TATTCGAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATAAAAAAAATTGATAAGTTAGAGATTGAAAAC
1 TATTTGAAATAAAATAATACTA--AT-TTAATATTCCAAAAATTAATAAG-TAAAAATTTAAAA-
* * * * * * *
19770216 ATAAATC-AGTTAATCGAATCA-GTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTCTTTCAAA
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* * * * * * *
19770279 TCATTATTAAAT-TTTG-TTTTGTAATAAAACAATTGTTT-T-TTAGCATACAAGC-C
124 TCATTA-T-GATCCTTGCATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATT--CA-AAAAACAA
* * *
19770332 TATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATAAAAATTCAAAA
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* * * * *
19770397 ATAAAT-TAGTTTATCGAAC-CAGTTCAAACAATT-TGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAA
61 ATAAATCTA-TTTATTGAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAA
19770459 T
124 T
19770460 TGTTATAACC
Statistics
Matches: 942, Mismatches: 189, Indels: 141
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Matches are distributed among these distances:
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TATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAATAAA
TCTATTTATTGAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
GATCCTTGCATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAAAAAACAA
Found at i:19770061 original size:179 final size:179
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* * * * *
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* * *
19769091 AATAATA-TAAATTTATTAATGTTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAATAAATTTATTT
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**** * * * *
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** * * * *
19769207 ATTATGACCA-TTCATTTTGTCATAAACCAATTGTTTCTA-TTCA-AAAAACAATATTTGGAAA-
1 ATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGC-TTATTT-GAAAT
* *
19769268 AAAATAATACTAA--T-TTAATATTCCAAAATTAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATAAATCTAT
62 AAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTGAAAAATAAATCTAT
** *** * * * * *
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125 TTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *
19769384 GTTATGATC-CTTGGATTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTTATTTGAAATAA
1 ATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAA
* * * * *
19769447 AATAATACTAATTTATTAATGTTATAAAAATTAATAAGT-TGAAGATTTAAAAACTTAATCTATT
64 AATAATACTAATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAA-ATTGAAAAA-TAAATCTATT
**** * * * * * **
19769511 TTTTGAACAACTTCAAATAGTCA-CATCGATCTA-AACTGTTATCTATTTCAAATC
126 TACCAAACAAGTTCAAATAATTATGA-CTAT-TAGAACAATTATCTATTTCAAATC
** * * **
19769565 ATTATGACATTTTGTTTTGTTGTAAAAAAATTGTTTTTGTTCATACAAAATTATTT-AGAATAAA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGA-AATAAA
* * *
19769629 ATAATACTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAAGT--GATA-T-AAAAACTAAATCTCTTTA
65 ATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTGAAAAA-TAAATCTATTTA
* * *
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128 CCAAA-CAAGTTCAAATAATTATGACTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* ** * * * * *
19769742 ATTATGA-TTTTTGTTTTGTCCCAAAACATTTATTTCTA-TTCATGCAAGCTTATTTGGATTAAA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * * * * * * * * * * **
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65 ATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTGAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * *
19769870 TAAACCAGTTCAAATAGTTAAGGCTAATAGAACAATTATCTATTTCAAATC
129 CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
19769921 ATTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAGTTGTTTTAGCTCATACATGCTTATTTGAAATAAAA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
** *
19769986 TAATACTAATTTATTAGCATTCAAAAATTTAATAAGTAAGAAAGTGAAAAA-AAATCTATTTACC
66 TAATACTAATTTATTAATATTCAAAAA-TTAATAAGTAAGAAATTGAAAAATAAATCTATTTACC
* * * * * *
19770050 CAATAAGTTCAAATAATTTTGGCTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC
130 AAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
19770100 ATTATGATC-TTTTATTTTATCGTAAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATTCGAAATAAA
1 ATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * ** * * * *
19770164 ATAATATTACTTTATTAATATAAAAAAAATTGATAAGTTAGAGATTGAAAACATAAATC-AGTTA
65 ATAATACTAATTTATTAATAT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTGAAAA-ATAAATCTA-TTT
* * * * *
19770228 ATCGAATC-AGTTCAAATAATTATGACCATTTGAACAATTATCTCTTTCAAATC
127 A-CCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * *
19770281 ATTATTAAATTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTT--TTAGCATACAAGCCTATTTGGAATAA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTT--CATACAAGCTTATTTGAAATAA
* *
19770344 AATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTATAAAAATTCAAAAATAAAT-TAGTT
64 AATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTA-AGAAATTGAAAAATAAATCTA-TT
* * * * * * *
19770408 TATCGAACCAGTTCAAACAATT-TGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATT
126 TACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * *
19770461 GTTATAACCTTTTGTTCTATCAT-AAACAAATGTTTTTA-TTCAGATAAG-TT-TGTTCAGAATA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTG-TTTTAGTTCATACAAGCTTAT-TTGA-AATA
* ** * * *
19770522 AAATAATATTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATGAGTAAGAGAATT-AAAAATAAATATGTT
63 AAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAAGA-AATTGAAAAATAAATCTATT
* * * * * * * * * * * *
19770586 TACTAAGCCATTTTAATTAGTTA-AACTATTTGAACAATTATTTATTTTAAATT
126 TACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * *
19770639 GTTATGGCCA-TTCGTTTTGTCATGAAACAATTG-TTTATGTTCAAAC-AGTCTTA-TTCAGAAT
1 ATTAT-GACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTA-GTTCATACAAG-CTTATTTGA-AAT
* * ** * * * *
19770700 AAAGTAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGCAATGGATTTAAAAAATAAA--TA-
62 AAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAATTAATAAGTAA-GAAATTGAAAAATAAATCTAT
** * *
19770762 -T---------GTT--GGT--TT-TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATT
125 TTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * * * * * * * *
19770802 GTTATAACCTTTTGTTTTATGACAAATCAATTGTTTCTA-TTCGTACAACCTTACTTCAAACAAT
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAA
* * * * * * *
19770866 ATAATTCTAACTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAG--A-TATTTAAAAAATGAATTTATTTAC
65 ATAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGAAATTGAAAAATAAATCTATTTAC
* * * * * *
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129 -CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
19770979 ACTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTTT-TTTCTATTTAGAGAAGCTTATTTCAAA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTC-A--T--ACAAGCTTATTTGAAA
* * * * * * *
19771042 TAAAATGACACAAATTTATTAATATTCAAACAATTAAAAAGTACA-AGATTTAAAAAATAAATTT
61 TAAAATAATACTAATTTATTAATATTCAAA-AATTAATAAGTA-AGA-AATTGAAAAATAAATCT
* * * * * * * *
19771106 GTTTACCGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATC
123 ATTTACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
19771163 GTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * *
19771228 T-A-A-TAATGTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAA-AAGATTTTAAAAATAAATATGTTT
66 TAATACTAATTTATTAATA--TTCAAAAATTAATAAGTAAGAA-A-TTGAAAAATAAATCTATTT
* * * * * ** * * *
19771288 ATCGAACAAGTCCAAATAATCATAACTATTTTAATAGTTATCTATTTCAAATT
127 ACCAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * * * * *
19771341 GTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTATTAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAA
1 ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
* * * * * * *
19771406 TAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTAC
66 TAATACTAATTTATTAATATTC-AAAAATTAATAAGTAAGA-AATTGAAAAATAAATCTATTTAC
* * * *
19771471 CAAACAAGTTCAAAT-AGT-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATT
129 CAAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
19771520 GTTTTGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-GTTTATACAAACTTATTTCG-AATA
1 ATTATGA-CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAGTTCATACAAGCTTATTT-GAAATA
* * *
19771582 AAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGT-AGAAATTTAAAAAATAAATTTGT
63 AAATAATACT-AATTTATTAATATT-CAAAAATTAATAAGTAAGAAA-TTGAAAAATAAATCTAT
* * * *
19771645 TT-CCTGAACACA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTTAAAT-
125 TTACC-AAACA-AGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
*
19771699 AGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 A-TTATGACATTTTGTTTTGT
19771720 TGTAAACTAA
Statistics
Matches: 1985, Mismatches: 397, Indels: 261
0.75 0.15 0.10
Matches are distributed among these distances:
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165 3 0.00
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ATTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTAGTTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAA
TAATACTAATTTATTAATATTCAAAAATTAATAAGTAAGAAATTGAAAAATAAATCTATTTACCA
AACAAGTTCAAATAATTATGACTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATC
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* *
19771224 AAAATAATAATGTATTAATATTTTGA
1 AAAATAATAATGTATAAAGATTTTGA
*
19771250 CAAATAATAA-GTA-AAAGATTTT-A
1 AAAATAATAATGTATAAAGATTTTGA
19771273 AAAATAA
1 AAAATAA
19771280 ATATGTTTAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (26 bp):
AAAATAATAATGTATAAAGATTTTGA
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19770761 ATGTTGGTTT
* * * * *
19770771 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATGACAAATCAATTGT
1 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * * * * * *
19770836 TTCTATTCGTACAACCTTACTTC-AAACAATATAATTCTAACTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
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* * * * * *
19770900 AAG----ATATTTAAAAAATGAATTTATTTACTGAAAAAGTTCAAATACTTA
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* * * *** * *
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1 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * *
19771012 TTTT-TTCTATTTAGAGAAGCTTATTTC-AAATAAAATGACACAAATTTATTAATA-TTCAAACA
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* * * *
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* * * * *
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1 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * *
19771197 TTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAATAATAATGTATTAATATTTTGACAAA-TAATAAG
66 TTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAATTTATTAATATTTT-AAAAATTAATAAG
* * * * *
19771261 TAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTATCGAACAAGTCCAAATAATCA
130 TAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTA
* * * * * *
19771310 TAACTATTTTAATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * * *
19771375 ATTAGTTCATATAGGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATG
66 TTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATA--A-TTTATTAATATTTTAAAAATTAATA
* * * *
19771440 AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAAT-AGT-
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* * *
19771489 TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
1 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
* * * * **
19771554 TTCTGTTTATACAAACTTATTTC-GAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAAT
66 TTTTGTTCATATAAGCTTA-TTCGGAATAAAAT-A-AT-AATTTATTAATATTTTAAAAATTAAT
*
19771618 AAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CCTGAACACA-TTCAAATAATTA
127 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACC-GAACA-AGTTCAAATAATTA
* * *
19771669 TGACTATTTGAGCAATTATCTATTTTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
1 TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
19771720 TGTAAACTAA
Statistics
Matches: 635, Mismatches: 108, Indels: 55
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (178 bp):
TGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT
TTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGAATAAAATAATAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAAGT
AAAAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAATAATTA
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Alignment explanation
Indices: 19770769--19771719 Score: 1025
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19770759 ATATGTTGGT
* * * * * *
19770769 TTTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTGTTTTATGACAAATCAATT
1 TTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * * *
19770834 GTTTCTATTCGTACAACCTTACTTCAAACAATATAATTCTAACTTATTAATATTCTAAAAATTAA
66 GTTTCTGTTCATACAAACTTA-TTCGAATAAAATAA-TATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* * * * * *
19770899 T-A--AGATATTTAAAAAATGAATTTATTTACTGAAAAAGTTCAAATACTTATGAGTATTTGAAC
129 TAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAAC
* * * * * **
19770961 AATTATTTTTTTCAAATCA-CTATAACCTTTTGTTTTGTTATAAAACAATTTTTTTTTCTATTTA
194 AATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTTTTAGTTCTA-TTA
*
19771025 GAGAAGCTTATTTCAAATAAAATGACACAAATTTATTAATATTCAAACAATTAAAAAGTACAAGA
257 GAG-AGCTTATTTCAAATAAAATAACACAAATTTATTAATATTCAAACAATTAAAAAGTACAAGA
* *
19771090 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATAG
321 TTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* * * *
19771129 TTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTTAAATCGTTATGACTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
1 TT-TGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAT
* * * * * ** *
19771194 TGTTTTTGTTCATATAAGCTTATTCGGATTAAAAT-A-ATAATGTATTAATATTTTGACAAA-TA
65 TGTTTCTGTTCATACAAACTTATTC-GAATAAAATAATATAATTTATTAATA-TTCCAAAAATTA
* * * * * * *
19771256 ATAAGTAAAAGATTTTAAAAATAAATATGTTTA-TCGAACAAGTCCAAATAATCATAACTATTTT
128 ATAAGTAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACT-GAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTG
* * * *
19771320 AATAGTTATCTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTATTAGTTC-A
191 AACAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATT-T-TTAGTTCTA
* * * * **
19771384 -TATAG-GCTTA-TTCGAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAA-AATTAATGAGTA-
254 TTAGAGAGCTTATTTC-AAATAAAATAACACAAATTTATTAATATTC-AAACAATTAAAAAGTAC
*
19771444 AGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
317 A-AGATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
* *
19771488 -TTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCATTTGTTTTGTCATAAAACAATT
1 TTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
*
19771552 GTTTCTGTTTATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
66 GTTTCTGTTCATACAAACTTA-TTCGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTCCAAAAATTAA
* *
19771617 TAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTCCTGAACACA-TTCAAATAATTATGACTATTTGAG
129 TAAGTAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACA-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA
*
19771681 CAATTATCTATTTTAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
193 CAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGT
19771720 TGTAAACTAA
Statistics
Matches: 482, Mismatches: 88, Indels: 43
0.79 0.14 0.07
Matches are distributed among these distances:
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358 24 0.05
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362 83 0.17
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ACGTcount: A:0.40, C:0.10, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (359 bp):
TTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
GTTTCTGTTCATACAAACTTATTCGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATA
AGTAGAAATTTAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA
TTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTTTTAGTTCTATTAGAGA
GCTTATTTCAAATAAAATAACACAAATTTATTAATATTCAAACAATTAAAAAGTACAAGATTTAA
AAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTCAAATAG
Found at i:19771916 original size:318 final size:316
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Indices: 19771405--19772044 Score: 783
Period size: 318 Copynumber: 2.0 Consensus size: 316
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* * *
19771405 ATAATACTAGTTTATTAATATTCTAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATTTGTTTA
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* * *
19771470 CCAAACAAGTTCAAATAGTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTTTGACCATTTGT
65 CCAAACAAGCTCAAATAGTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACCATTTGT
* * *
19771535 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGTTTATACAAACTTATTTCGAATAAAATAATATAAATTTATT
130 TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAACAATATAAATTTATT
* *
19771600 AATATTCCAAAAATTAATAAG-TAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTT-CCTGAACACA-TTCA
195 AATATTCCAAAAATTAAT-AGTTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AAACA-AGTTCA
* * * *
19771661 AATAATTATGACTATTTGAGCAATTATCTATTTTAAAT-AGTTATGACCTTTTGTTTTGTT
257 AATAATCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTATAACCTTTTGTTTTGTT
* *
19771721 GTAAACTAATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTTAGAAAATGAATATGTTT
1 ATAAACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATGAATATGTTT
* * * * * *
19771784 ATCAAGCAAGCTCTAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTACTTTCAAATAGTTATGATCTT
64 ACCAAACAAGCTCAAATAG-T-TGACTATTTGAACAATTATTTA-TTTCAAATAGTTATGACCAT
* * * ** *
19771849 TTGTTTTGTTATCAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAACAATACT-AAT
126 TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAACAATA-TAAAT
*** *
19771913 TTATTAATATTTTGAAAATTAATAGTTAGAAGATTTAAGAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTT
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* * * * *
19771978 CATATAGTCATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTGTT
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CAAACAAGCTCAAATAGTTGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATAGTTATGACCATTTGTT
TTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAACTTATTTCGAATAAAACAATATAAATTTATTA
ATATTCCAAAAATTAATAGTTAGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACAAGTTCAAATA
ATCATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTT
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Alignment explanation
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19771715 TTTGTTGTAA
** *
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1 ACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAAT-AGTAGAA-GATTTAAG-AAATAAATATGTTTATCA
* * *
19771788 AGCAAGCTC-TAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTACTTTCAAAT-AGTTATGATCTTTT
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* * ***
19771851 GTTTTGTTATCAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAACAAT
124 GTTTTGTTATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAACAAT
*
19771907 ACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGTTAGAAGATTTAAGAAATAAATATGTTTACCAAA
1 ACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAG-TAGAAGATTTAAGAAATAAATATGTTTATCAAA
* * *
19771972 CAAGTTCATATAGTCATGTCTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTT
65 CAAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGA-TTTTTGTTTT
* * *
19772037 GTTATAAAACAATTGTTTTTGTTCA-A-ATAGAATTATTCAAAATACAATAAT
129 GTTATAAAACAATTGTTTTTATTCATACA-AG-ATTATTCAAAATAAAACAAT
* * *
19772088 ATTGATTTATTAATATTTTGAAAATTAATA--AG-AGATTTAA-AAACTAAATCTGTTTATCAAA
1 ACTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAGTAGAAGATTTAAGAAA-TAAATATGTTTATCAAA
* * * * * * *
19772149 CTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATGATCTTTATTTTG
65 CAAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTGTTTTG
* *
19772214 TTATAGAACAATTATTTCTT-TTCATA
130 TTATAAAACAATTGTTT-TTATTCATA
19772240 TTAGCTTATT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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AAGTTCATATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGATTTTTGTTTTGT
TATAAAACAATTGTTTTTATTCATACAAGATTATTCAAAATAAAACAAT
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Alignment explanation
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19772135 ATCTGTTTAT
* * *
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1 CAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAACCTTTAT
* * ** ** * *
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* *
19772298 CAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTT
1 CAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTA-T-TT-GAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAACCTT
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19772425 ATTTA
124 ATTTA
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Statistics
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ACGTcount: A:0.39, C:0.12, G:0.08, T:0.41
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CAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAACAATTATCTATCTCAAATCGTTATAACCTTTAT
TTTGTCATAGAACAATTATTTCTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAAT
AATCAAAAACAAATGTATTTTGG
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19772288 TGTATTTTGG
* * * * *
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* * *
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* * * **
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* * *
19772545 TTGCTTT-GTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATAAAAACTTA-TCTTAAATAAAATAATACTAC
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** ** *
19772608 TTTATTAGTATTTC-AAAAATTTTTAAGCAAGAGATTTAAAAA
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19772650 TTAAAGTTGG
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CAAACAAGGTCAAATAGATAAGACTATTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTT
TTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
TATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATATTTAC
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Alignment explanation
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19772288 TGTATTTTGG
* * * *
19772298 CAAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTCTAACCTT
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* * *
19772363 TTGTTTAGTCATAAAGCAATTATTTTAGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
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* * * * **
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* *
19772544 TTTGCTTT-GTCATAAAATAATTATTTTAGTTCATAAAAACTTA-TCTTAAATAAAATAATACTA
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* ** ** * * *
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* * * * * * * * * * *
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* * * * * **
19772725 -TTTGTTTTGTCATCAAAA-AATTGTTTCT-G-ACATACAAGCTTATTC-GGATAAAAATAATAC
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* * * * *
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* *
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175 --AATATATTT-A
* * ** * ** * * *
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* * ** * ** * * * * * * *
19772927 ATTGTTCTAAGATTTTATTTTCTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATA
52 ATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATA
* * ** * * *
19772992 AAATAAT-CTAATTTATTAACATTTAAAAAATTAATAGGCTAGAGATTTGAAGAAATAAATCTAT
117 AAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATAT
19773056 TTA
182 TTA
* * * * *
19773059 TCAAACAAGTTCAAATAG-T--TACGATTATTTGAACTATTATCTATTTAAAATCATTATGAA-C
1 -CAAACAAGTTCAAATAGATAAGACTATTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTAT-AACC
* * * * * * * *
19773120 TTTTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAATAAAATAGTACTAC
64 TTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAA
* * * * *
19773185 TTTATTAATATTTC-AGAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAGAATAAATCA-GTTTA
129 TTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAAT-ATATTTA
* * * * * * *
19773240 TCAAATC-AGTTCAAATA-ATTATGGCCA-T-TT-GAACAATTATATATTTCAAATCATTATTAC
1 -CAAA-CAAGTTCAAATAGA-TAAGACTATTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAAC
* ** * * * * * * *
19773300 CTATCATTTTGTCATAAAACAATT-GTTT-CTTAACAAACAAGCTTACT-GAAATAAAATAATAC
63 CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAA-AA-CTTATTCAAAATAAAATAATAC
* * *
19773362 TAATTTATTAATATTTC-AAAAA-T--T-AGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTA
126 TAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATATTTA
* * * * * * * * *
19773416 CTAAACCAGTTTAAATAGCTATG---ATTATTTGAACAATTATCTAGTTCAAATTGTTATAAGCT
1 C-AAACAAGTTCAAATAGATAAGACTATTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCT
* ** **
19773478 TTTTTTCTA-TCA-AAAATCAATTA-TTTATGTTCATGCAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT
65 TTTGTT-TAGTCATAAAA-CAATTATTTTA-GTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * **
19773540 AATTTAATAATATT-ATGAAAATTCATTATTAAGAGATTT-AAAAAATAAAT
127 AATTTATTAACATTCA-AAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
19773590 CCATTTCTCG
Statistics
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0.70 0.14 0.16
Matches are distributed among these distances:
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174 1 0.00
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CAAACAAGTTCAAATAGATAAGACTATTATTAGAACAATTATCTATTTAAAATCGTTATAACCTT
TTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATAAAAACTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
TATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATATATTTA
Found at i:19772802 original size:35 final size:35
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Indices: 19772763--19772832 Score: 113
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*
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* *
19772798 CTTATTCAGATAAAAATAATAGTTATTTAATAATA
1 CTTATTCAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATA
19772833 TTTCAAAAAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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CTTATTCAGATAAAAATAATACTAATTTAATAATA
Found at i:19773072 original size:181 final size:178
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Indices: 19772810--19773650 Score: 713
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* * * * * * *
19772810 AAAATAATAGTTATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
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** * * * * * ** * *
19772875 TTA-CCGACTTAGTTCAAATGGTTAAGATTATTAGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTCTAAGA
64 TTATCAAAC--AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAGC
* * * *
19772939 TTTTATTTTCTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAAT
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* *
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1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATA-G-TAGAGATTT-AAGAAATAAATCTA
* * *
19773055 TTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTACGATTATTTGAACTATTATCTATTTAAAATCATTATGAA-
63 TTTATCAAAC-AGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT-AAG
* * * *
19773119 CTTTTGTTTTGTCATGAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
126 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * *
19773172 AAAATAGTACTACTTTATTAATATTTCAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAA-AGAATAAATC-A
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAAT-AGT-AGAGATTTAAGA-AATAAATCTA
* *** * * *
19773235 GTTTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATTAC
63 -TTTATCAAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAG
* * * * *
19773300 CTATCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC--TTAACAAACAAGCTTACT-GAAAT
126 CTTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTT--CATACAAGCTTATTCAAAAT
* *
19773352 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAGTA--AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTT
1 AAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAGTAGAGATTTAAGAAATAAATCTATTT
* * * **
19773415 A-CTAAACCAGTTTAAATAGCTATGATTATTTGAACAATTATCTAGTTCAAATTGTTATAAGCTT
66 ATC-AAA-CAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAGCTT
* * * *
19773479 TT-TTTCTATCA-AAAATCAATTATTT-ATGTTCATGCAAGTTTATTCAAAAT
129 TTATTT-TGTCATAAAA-CAATTGTTTCA-GTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
* * * * * *
19773529 AAAATAATACTAATTTAATAATATTAT-GAAAATTCATTATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCA
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* * * * ** * *
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63 TTTATC-AAACAGTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCAT
19773651 ACTATTTTAG
Statistics
Matches: 533, Mismatches: 98, Indels: 58
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (178 bp):
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ATTTTGTCATAAAACAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTCAAAAT
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Alignment explanation
Indices: 19772810--19773650 Score: 853
Period size: 357 Copynumber: 2.3 Consensus size: 358
19772800 TATTCAGATA
* * * * **
19772810 AAAATAATAGTTATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTGT
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** * ** ** * * ** * * *
19772875 TTA-CCGACTTAGTTCAAATGGTTAAGATTAT-TAGAATAATTATTTATTTCAAATTGTTCTAAG
66 TTATCAAAC-CAGTTCAAATAATTAAGACAATAT-GAACAATTATATATTTCAAATCATTATTAC
* * * * * * *
19772938 ATTTTATTTTCTCATAAAATAATTGTTTCAGTTCATACAAGCTTATTTAGAATAAAATAATCTAA
129 CTATCATTTTCTCATAAAACAATTGTTTCA-TTCAAACAAGCTTACTGAGAATAAAATAATCTAA
*
19773003 TTTATTAACATTTAAAAAATTAATAGGCTAGAGATTTGAAGAAATAAATCTATTTATCAAACAAG
193 TTTATTAACATTTAAAAAATTAATA-G--AGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAG
* * * *
19773068 TTCAAATAGTTACGATTATTTGAACTATTATCTATTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGTCA
255 TTCAAATAGCTACGATTATTTGAACAATTATCTAGTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATCA
* *
19773133 TGAAACAATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
320 TAAAACAATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
* * * *
19773172 AAAATAGTACTACTTTATTAATATTTCAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAGAATAAATCAGT
1 AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGT
* * * * *
19773237 TTATCAAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATTACCT
66 TTATCAAACCAGTTCAAATAATTAAGACAATATGAACAATTATATATTTCAAATCATTATTACCT
*
19773302 ATCATTTTGTCATAAAACAATTGTTTC-TTAACAAACAAGCTTACTGA-AATAAAATAATACTAA
131 ATCATTTTCTCATAAAACAATTGTTTCATT--CAAACAAGCTTACTGAGAATAAAATAAT-CTAA
* * * *
19773365 TTTATTAATATTTCAAAAATTAGTA-AGAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTA-CTAAACCAGTT
193 TTTATTAACATTTAAAAAATTAATAGAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATC-AAACAAGTT
* * * **
19773427 TAAATAGCTATGATTATTTGAACAATTATCTAGTTCAAATTGTTAT-AAGCTTTT-TTTCTATCA
257 CAAATAGCTACGATTATTTGAACAATTATCTAGTTAAAATCATTATGAA-CTTTTGTTT-TATCA
** * *
19773490 -AAAATCAATTATTT-ATGTTCATGCAAGTTTATTCAAAAT
320 TAAAA-CAATTATTTCA-GTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
* * * *
19773529 AAAATAATACTAATTTAATAATATTATGA-AAATTCATTATTAAGAGATTTAAAAAATAAATCCA
1 AAAATAATACTAATTTAATAATATT-TCAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-CA
* * * * *
19773593 -TTTCTCGAACCAGTTCAAATACTTAAGACAATATGAATAATTATCTATTTCAAATCAT
64 GTTTATCAAACCAGTTCAAATAATTAAGACAATATGAACAATTATATATTTCAAATCAT
19773651 ACTATTTTAG
Statistics
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Consensus pattern (358 bp):
AAAATAATACTAATTTAATAATATTTCAGAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCAGT
TTATCAAACCAGTTCAAATAATTAAGACAATATGAACAATTATATATTTCAAATCATTATTACCT
ATCATTTTCTCATAAAACAATTGTTTCATTCAAACAAGCTTACTGAGAATAAAATAATCTAATTT
ATTAACATTTAAAAAATTAATAGAGAGATTTGAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAA
TAGCTACGATTATTTGAACAATTATCTAGTTAAAATCATTATGAACTTTTGTTTTATCATAAAAC
AATTATTTCAGTTCATAAAAGCTTATCCAAAAT
Found at i:19774358 original size:181 final size:179
Alignment explanation
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19773645 AATCATACTA
* * * * * *
19773655 TTTTAGCTT-ATACAAGTTTATTCAGAATAAAATAAAACTAATTTGTTAATATTTC-AAAACTTT
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* * * * *
19773718 ATAGGTAAGAGATTTAAAAAAATAATTCTA-TTAACTGAACCAA-TTCAAACAATTATA-ACTAT
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* * * * * * *
19773780 TTGAA-AA-TATATATTTCATATCGTTA-GTACTTTTTGTTTTATCATAAAATAAAATT-
123 TAGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATG-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAT--AATTG
* * * * * * * * * *
19773836 TTTT-GTTTATATAAGTTTGTTTGAAATAAAATGATACTAATTTATTTATATTTAGAAAATTAAT
1 TTTTAGTTAATACAAGCTT-ATT-CAATAAAATAAT-CAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT
* * * * * * * *** *
19773900 TAGTAAGAGCTTT-AAAAAGTAAATTTGTTTA-CCAAGCTA-TTCCAAATAGTTTTCACTATTTG
63 AAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAA-CAAGTT-CAAATAGTTAAGACTATTAG
* ** * * * *
19773962 AATAATTGCCTATTTCAAATCATTATAAGCTTTTGTTTTGTCATCAAACT-ATTGG
126 AACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAATAATT-G
* * * ** * * * * *
19774017 TTCT-GTTCATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTCTAAAACTTAAT
1 TTTTAGTTAATACAAGCTTA-TT-CAATAAAATAAT-CAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT
** * * * * * *
19774081 AACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTGTTGAACGAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TATGA
63 AAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTA-GA
** * *
19774145 ATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGTCTTAAAATAATT-
127 ACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* *** * *
19774198 TTTTTGTTCGCACCAGCTTATTCAGATTAAAATAATGCAAATTTAATAATATTTC-AAAAATTAA
1 TTTTAGTTAATACAAGCTTATTCA-A-TAAAATAAT-CAAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAA
* *
19774262 TAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAAAT-TGTTT-TCTGAATCAA-TTCATATAGTTAAGACTATT
62 TAAGTAAGAGATTTAAAAAAAT-AAATCTATTTATC-GAA-CAAGTTCAAATAGTTAAGACTATT
* * * * * * *
19774323 AAAACAATTATCCATTTGAAATCATTCTTACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTG
124 AGAACAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* * * *
19774379 TTTTAGTTAATTCAAGTTTATTTGCAATAAATTAATACTAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT
1 TTTTAGTTAATACAAGCTTA-TT-CAATAAAATAAT-CAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAAT
* * ** *
19774444 AA-AAAGATATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAA
63 AAGTAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA
*
19774508 CAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
128 CAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
* *
19774560 TTTTAGTTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAAAACTTTATTAATATTCTAAAAATTAAT
1 TTTTAGTTAATACAAGCTTATTC--AATAAAATAATCAAA-TTTATTAATATTCAAAAAATTAAT
19774625 AAGT
63 AAGT
19774629 GATTTAAAAA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.08, T:0.41
Consensus pattern (179 bp):
TTTTAGTTAATACAAGCTTATTCAATAAAATAATCAAATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAG
TAAGAGATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAACAA
TTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG
Found at i:19774682 original size:19 final size:17
Alignment explanation
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Period size: 18 Copynumber: 2.7 Consensus size: 17
19774648 TTTACAGAAT
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*
19774677 CATTTC-AACAATTATC
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*
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1 CATTTCAAATAA
19774705 CAAATGATTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.43, C:0.17, G:0.04, T:0.36
Consensus pattern (17 bp):
CATTTCAAATAATTATC
Found at i:19774931 original size:180 final size:179
Alignment explanation
Indices: 19774724--19775691 Score: 756
Period size: 180 Copynumber: 5.4 Consensus size: 179
19774714 TTGATCATTT
** * * * *
19774724 AAGCTTATTTTTAATAAAATAATACTAATTTATGAATCTTTCAAAAACTAACAAGTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * * *
19774789 AAAAATAAATATGTTTACCGAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCA
66 AAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * *
19774854 AATTTTTATAACCTTGTGTTCTATCACAAAACAATTATTTCTATTCATAC
131 AATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATT-TTTCTATTCATAC
* * * * * **
19774904 AAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCGATAATTAATAACTAAGAGAACT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * ** * * * *
19774969 AAATATAAATTTGTTTATTAAACCAGTCTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCA
66 AAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
* * * * * *
19775034 AAATGTTATGGCCTTTTGTTTTGTTATAAAACAA-TTTTCAATTCATAC
131 AATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTTTTCTATTCATAC
* **
19775082 TAGCTTATTTGGAATAAAACTAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAA-TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
19775145 TTAAAAAATATAATTCTGTTTACCTAAA-CAATTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCT
64 TT-AAAAATA-AA-TATGTTTACC-AAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT
** * * * * *
19775209 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-TGTTCATAT
125 ATTTCAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAAC-AAT-TTTTCTATTCATAC
* * * * *
19775265 AAGTTTGTTTCAAATAAACTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-ATATTT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * *
19775326 AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTT-AACAAATTATTTATTT
66 -AAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTT
* * * *
19775390 CAAATTGTTATGACTTTTTGTCCTATTATAAAAC-ATTTGCTTTTATTCATAC
129 CAAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTT--TTCTATTCATAC
* * ** * * * **
19775442 AAGCTT-GTTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAATAAAATTTT
1 AAGCTTATTTCA-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATT
* * ** * * * * * * *
19775506 TTAAAATAAATATGTTTGCTGAACTAGATCAATTAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
65 TAAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC
*** * * * ** * * * *
19775571 AAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCATGAAGGAATTGTT-AAGTTCTTAT
130 AAATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTTTTCTA-TTCATAC
* ** * * * ** *
19775621 AAGTTTATTAGAAATAAAATAAAACCAATTTATTAATATTTTAAATTTTAATAATTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TT
19775686 TAAAAA
65 TAAAAA
19775692 AATCTATTTA
Statistics
Matches: 619, Mismatches: 143, Indels: 52
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Consensus pattern (179 bp):
AAGCTTATTTCAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
AAAAATAAATATGTTTACCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA
AATTGTTATGACCTTTTGTTCTATCATAAAACAATTTTTCTATTCATAC
Found at i:19775301 original size:873 final size:870
Alignment explanation
Indices: 19773860--19775495 Score: 1973
Period size: 873 Copynumber: 1.9 Consensus size: 870
19773850 GTTTGTTTGA
* ** * ** * *
19773860 AATAAAATGATACTAATTTATTTATATTTAGAAAATTAATTAGTAAGAGCTTTAAAAAGTAAATT
1 AATAAAATAATACTAATTTATGAATATTTAGAAAACTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATA
* * *
19773925 TGTTTACCAAGCTATTCCAAATAGTTTTCACTATTTGAATAATTGCCTATTTCAAATCATTATAA
66 TGTTTACCAAGCTATTCCAAATAGTTATCACTATTTGAATAATTGCATACTTCAAATCATTATAA
* * * * * * * * **
19773990 GCTTTTGTTTTGTCATCAAACTATTGGTTCTGTTCATACTATTTTATTTGAAATAAAATAATACT
131 CCTTGTGTTCTATCATCAAACAATTAGTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * *
19774055 AATTTAATAATATTCTAAAACTTAATAACCAAGAAAATTAAAAAAATAAATCTAATTGTTGAACG
196 AATCTAATAATATTCGAAAACTTAATAACCAAGAAAACT-AAAAAATAAATCTAATTATTAAACC
** *
19774120 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTG
260 AGTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTG
* *** * *
19774185 TCTTAAAATAATTTTTTTGTTCGCACCAGCTTATTCAGATTAAAATAATGCAAATTTAATAATAT
325 TCTTAAAACAATTTTTCAATTCACACCAGCTTATTCAGAATAAAATAATG-AAATTTAATAATAT
* * * *
19774250 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATTGTTTTCTGAATCAATTCATATAGTTA
389 TTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATTGTTTCCTGAAACAATTCAAATAATTA
* * * * *
19774315 AGACTATTAAAACAATTATCCATTTGAAATCATTCTTACCTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTGT
454 AGACTATTAAAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAAATGT
* *
19774380 TTTAGTTAATTCAAGTTTATTTGCAATAAATTAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAAT
519 TTTAGTTAATTCAAGTTTATTTGCAATAAACTAATACTAATCTATTAATATTTC-AAAAATTAAT
* *
19774444 AAAAAGATATTTAAAAAAATAAATCTATTTATCGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAAC
583 --AAA-ATATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAC
* ** * *
19774509 -AATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTG-TTTTAGTTAATA
643 AAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTCCTATCATAAAACAATTGCTTTTA-TTAATA
19774572 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATA-AAACTTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGATTTAA
707 CAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAA-TTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGATTTAA
19774636 AAAGTGAATCAGTTTACAGAATCATTTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATTATCGATTTCAA
771 AAAGTGAATCAGTTTACAGAATCATTTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATTATCGATTTCAA
19774701 ATAACAAATGATTTTGATCATTTAAGCTTATTTTT
836 ATAACAAATGATTTTGATCATTTAAGCTTATTTTT
*
19774736 AATAAAATAATACTAATTTATGAATCTTTCA-AAAACTAACAAGTAAGAGATTTAAAAA-TAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTTATGAATATTT-AGAAAACTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAAT
* * * **
19774799 ATGTTTACCGAA-CTAGTT-TAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTCAAATTTTTA
65 ATGTTTACC-AAGCTA-TTCCAAATAGTTATCACTATTTGAATAATTGCATACTTCAAATCATTA
*
19774862 TAACCTTGTGTTCTATCA-CAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
128 TAACCTTGTGTTCTATCATC-AAACAATTAGTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * * * * **
19774926 TACTAATCTATTAATATTTCGATAA-TTAATAACTAAGAGAACT-AAATATAAATTTGTTTATTA
192 TACTAATCTAATAATA-TTCGAAAACTTAATAACCAAGAAAACTAAAAAATAAATCTAATTATTA
* *
19774989 AACCAG-TCTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAAAT-GTTATGGCC-TTTT
256 AACCAGTTC-AAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTC-AAATCATTATGACCTTTTT
* * **
19775051 GTTTTGT-TATAAAACAA-TTTTCAATTCATACTAGCTTATTTGGAATAAAACTAAATG-AATTT
319 GTTTTGTCT-TAAAACAATTTTTCAATTCACACCAGCTTATTCAGAATAAAA-T-AATGAAATTT
* *
19775113 ATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATAATTCTGTTTACCT-AAACAAT
381 AATAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATA-AAAT-TGTTT-CCTGAAACAAT
* ** * *
19775177 TTAAATAATTATA-ACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCA
443 TCAAATAATTA-AGACTATTAAAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCA
* * *
19775241 TAAAACAAATGTTTTTGTTCATAT-AAGTTTGTTT-CAAATAAACTAATACTAATCTATTAATAT
507 TAAAACAAATGTTTTAGTTAAT-TCAAGTTTATTTGC-AATAAACTAATACTAATCTATTAATAT
* *
19775304 TTCAAAAATTAATAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGAC
570 TTCAAAAATTAATAAAATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGAC
* * ** * * *
19775369 TATTTAACAAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTTTTGTCCTATTATAAAACATTTGCTTTT
635 TATTTAACAAATTATCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTCCTATCATAAAACAATTGCTTTT
* * * * * * * *
19775434 ATTCATACAAGCTTGTTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAA
700 ATTAATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAA
19775496 ATAAAATTTT
Statistics
Matches: 638, Mismatches: 102, Indels: 47
0.81 0.13 0.06
Matches are distributed among these distances:
868 3 0.00
869 133 0.21
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874 12 0.02
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877 1 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (870 bp):
AATAAAATAATACTAATTTATGAATATTTAGAAAACTAACAAGTAAGAGATTTAAAAAGTAAATA
TGTTTACCAAGCTATTCCAAATAGTTATCACTATTTGAATAATTGCATACTTCAAATCATTATAA
CCTTGTGTTCTATCATCAAACAATTAGTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACT
AATCTAATAATATTCGAAAACTTAATAACCAAGAAAACTAAAAAATAAATCTAATTATTAAACCA
GTTCAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTTGTTTTGT
CTTAAAACAATTTTTCAATTCACACCAGCTTATTCAGAATAAAATAATGAAATTTAATAATATTT
CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAATTGTTTCCTGAAACAATTCAAATAATTAAG
ACTATTAAAACAATTATCCATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTAGTCATAAAACAAATGTTT
TAGTTAATTCAAGTTTATTTGCAATAAACTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAA
ATATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAACAAATTATC
TATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTCCTATCATAAAACAATTGCTTTTATTAATACAAGCTTAT
TCAAAATAAAATAATACAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTGATTTAAAAAGTGAATC
AGTTTACAGAATCATTTCAAATAATTATGACCATTTCAACAATTATCGATTTCAAATAACAAATG
ATTTTGATCATTTAAGCTTATTTTT
Found at i:19775401 original size:358 final size:358
Alignment explanation
Indices: 19774724--19775598 Score: 926
Period size: 358 Copynumber: 2.4 Consensus size: 358
19774714 TTGATCATTT
** * * * *
19774724 AAGCTTATTTTTAATAAAATAATACTAATTTATGAATCTTTCAAAAACTAACAAGTAAGAGATTT
1 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * *
19774789 AAAAATAAATATGTTTACC-GAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTGTATACTTC
66 AAAAATAAATATGTTTACCTGAACTAATTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
** * * * * * * *
19774853 AAATTTTTATAACCTTGTGTTCTATCACAAAACAATTATTTCTATTCATACAAGCTTATTTGAAA
131 AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA
* * * *
19774918 TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCGATAATTAATAACTAAGAGAACTAAATATAAATTTGT
196 TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAAC-AAGAGAAC-AAATATAAATCTAT
* *
19774983 TTATTAAACCAGTCTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAAATGTTATGGCCT
259 TTATCAAACCAGTCTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAAATGTTATGACCT
** *
19775048 TTTGTTTTGTTATAAAACAATT-TTCAATTCATAC
324 TTTGTCCTATTATAAAACAATTCTTCAATTCATAC
* *
19775082 TAGCTTATTTGGAATAAAACTAA-A-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
1 AAGCTTATTTAGAATAAAA-TAATACT-AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGAT
* * * *
19775145 TTAAAAAATATAATTCTGTTTACCTAAAC-AATTTAAATAATTATAACTATTTGAACAATTATCT
64 TT-AAAAATA-AA-TATGTTTACCTGAACTAATTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCT
* * * * * * *
19775209 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTATTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT
126 ATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATT
* * *
19775274 TCAAATAAACTAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAA-AATATTTAA-AAA-ATAAA
191 TCAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAACAAGA--GAACAAATATAAA
* * * ** *
19775336 TCTATTTATCAAACCAGTTTAAATAGTTATGACTAT-TTAACAAATTATTTATTTCAAATTGTTA
254 TCTATTTATCAAACCAGTCTAAATAGTTAAGACTATATGAAC-AATTATCCATTTCAAAATGTTA
* * **
19775400 TGACTTTTTGTCCTATTATAAAACATTTGCTTTTATTCATAC
318 TGACCTTTTGTCCTATTATAAAACAATT-CTTCAATTCATAC
* * * ** * * * **
19775442 AAGCTTGTTCAGATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTGATAATTAATAAATAAAATTTTT
1 AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
* * * * *
19775507 TAAAATAAATATGTTT-GCTGAACTAGA-TCAATTAGTCATAACTATTTGAATAATTATCTATTT
66 AAAAATAAATATGTTTACCTGAACTA-ATTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTT
*
19775570 CAAATCAATATGACCTTTTGTTTTGTCAT
130 CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
19775599 GAAGGAATTG
Statistics
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ACGTcount: A:0.41, C:0.10, G:0.07, T:0.41
Consensus pattern (358 bp):
AAGCTTATTTAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
AAAAATAAATATGTTTACCTGAACTAATTTAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATCTATTTC
AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATATTTCTATTCATACAAGCTTATTTCAAA
TAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATAACAAGAGAACAAATATAAATCTATTT
ATCAAACCAGTCTAAATAGTTAAGACTATATGAACAATTATCCATTTCAAAATGTTATGACCTTT
TGTCCTATTATAAAACAATTCTTCAATTCATAC
Found at i:19776095 original size:176 final size:175
Alignment explanation
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Period size: 180 Copynumber: 5.2 Consensus size: 175
19775694 TCTATTTACT
* * *
19775704 AAACAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTTATTAATAGTAGGACAATTAGTAAGTAAAAG
1 AAACAAGCTT-TTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTGGACAATTAATAAGTAAAAG
* * * * * * **
19775769 ATATAAACAAAAATTTGTTTATCAAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTAT
64 ATATAAAAAAAAATATATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTGGAATAATTAACTAT
* * *
19775834 TTCAACTTGTTATGACTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTATTC
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* * ** * * *
19775884 ATACAAGGTTATTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATATGTAAAAG
1 AAACAAGCTT-TTTTGAATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTGGACAATTAATAAGTAAAAG
* * * *
19775949 ATTTAAAAAATAAATATATTTA-CTGAATAAGTTGAAATAGTCATGATTATTGGAATAATTAACT
64 ATATAAAAAA-AAATATATTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTGGAATAATTAACT
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127 ATTTCAACTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTA-TTC
* * * * * *
19776060 AAATAAGCTTTTTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-AAAAATTAATGACTAAGAG
1 AAACAAGCTTTTTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTGGACAATTAATAAGTAAAAG
** * * * * * ** * ** *
19776124 A-ATTAAAAACTAATCTTTTTACCGAATATGTTCAAATAGTTTTGACTATAT-AAACGATTATCT
64 ATA-TAAAAAAAAATATATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTAT-TGGAATAATTAACT
* * * * *
19776187 ATTTCAAAATATTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTATTC
127 ATTTC--AA-CTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTATTC
**** * *** *
19776239 TTGTAAGCTTATTTTGAATAAAATAATATAAATTGATTAATATTACAAAAATTAATAAGTAAAA-
1 AAACAAGCTT-TTTTGAATAAAATAATAT-AATTTATTAATATTTGGACAATTAATAAGTAAAAG
* * * * ** * * * ** ** * *
19776303 ATTTAAAAAATAAATTTCTTTTTTGAATACGTTCAAATGGTTACAACTATTTCAAAAATT-ATTC
64 ATATAAAAAA-AAATATATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTGGAATAATTAACT-
** * * * *
19776367 ATTTCAAATCGTTATGATGTTTTGTTTTGTTAT-AAACTAATTGTTTTTGTTC
127 ATTTC-AA-C-TTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAC-AATTGCTTCTATTC
** * * * ** * * *
19776419 ATAA-AAG-TTTATTTGAAATAAAAGGATACTAATTTTTTAAAATGTCAAAAATTAATAAATAGA
1 A-AACAAGCTTT-TTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATTTGGACAATTAATAAGTAAA
* * * *** * * *
19776482 AGAT-TGAAATAATAAATCTATTT-TCTGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTA
62 AGATAT-AAA-AAAAAATATATTTATC-AAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTGGAATAATTA
** * * * * **
19776545 TTTATTTCAAATCATTATGATCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAATATTTCTATTC
124 ACTATTTC-AA-C-TTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTATTC
19776600 ATAA-AAG-TTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
1 A-AACAAGCTTT-TTTG-AATAAAATAATA-TAATTTATTAATATT
19776644 CTAAAAATTA
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (175 bp):
AAACAAGCTTTTTTGAATAAAATAATATAATTTATTAATATTTGGACAATTAATAAGTAAAAGAT
ATAAAAAAAAATATATTTATCAAATAAGTTCAAATAGTCATGACTATTGGAATAATTAACTATTT
CAACTTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTCTATTC
Found at i:19776700 original size:181 final size:181
Alignment explanation
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Period size: 181 Copynumber: 5.9 Consensus size: 181
19775706 ACAAGCTTAT
* *** * * * *
19775716 TTTG-AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATAGTAGGACAATTAGTAAGTAAAAGATATAAACAA
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* * * *
19775779 -AAAT-TTGTTTA-TCAAATAAGTTCAAATCGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAACT
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* * * * *
19775841 TGTTATGA-CTTTTTGTTTTGTAATAAAATAATTGTTTCTATTCATACAAGGTTA
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* * * * * * * *
19775895 TTCGGATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATATGTAAAAGATTTAAAAAAT
1 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * *
19775960 AAATATATTTACTGAATAAGTTGAAATAGTCATGATTATTGGAATAATTAACTATTTC-AA-C--
66 AAATATTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
* * *
19776021 T-TGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGCTTC-AGTTCA-AATAAGCTTT-
131 TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAA-AAG-TTTA
* * * * *
19776071 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TAAAAATTAATGACTAAGAGAATTAAAAACT
1 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * * ** *
19776135 -AATCTTTTTACCGAATATGTTCAAATAGTTTTGACTATATAAACGATTATCTATTTCAAAAT-A
66 AAATATTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCG
* * * ** *
19776198 TTATGATCTTTTGTTTTATCATAAAACAATTGGTTCTATTCTTGTAAGCTTA
130 TTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTA
*
19776250 TTTTG-AATAAAATAATA-TAAATTGATTAATATTAC-AAAAATTAATAAGTAAAA-ATTTAAAA
1 -TTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAA
** * * ** * *
19776311 AATAAAT-TTCTTTTTTGAATACGTTCAAATGGTTACAACTATTTCAAAAATTAT-TCATTTCAA
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* * * *
19776374 ATCGTTATGATGTTTTGTTTTGTTAT-AAACTAATTGTTTTTGTTCATAAAAGTTTA
126 ATCGTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTA
** * * * * * *
19776430 TTTGAAATAAAAGGATACTAATTTTTTAAAATGTC-AAAAATTAATAAATAGAAGATTGAAATAA
1 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT-TCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAA
* *** * *
19776494 TAAATCTATTTT-CTGAGCGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATC
65 TAAATAT-TTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATC
* * * *
19776558 ATTATGATCTTTTGTCTTGTCATAAAACAAATATTTCTATTCATAAAAGTTTA
129 GTTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTA
***
19776611 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAAT
1 TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * *
19776676 AAATATGTTCATTGAACAAGTTTAAATACTCATGTCCATTCT-AACT-ATTATCTATTTCAAATC
66 AAATATTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATT-TGAA-TAATTATCTATTTCAAATC
* *
19776739 GTTATGA-CATTTTATTTTGTCATAAAATAATT
129 GTTATGATC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATT
19776771 TTTTTGGTTT
Statistics
Matches: 696, Mismatches: 140, Indels: 78
0.76 0.15 0.09
Matches are distributed among these distances:
174 43 0.06
175 25 0.04
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177 4 0.01
178 4 0.01
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ACGTcount: A:0.41, C:0.08, G:0.09, T:0.42
Consensus pattern (181 bp):
TTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAAT
AAATATTTTTACTGAATAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGT
TATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTA
Found at i:19776850 original size:22 final size:22
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Indices: 19776809--19776853 Score: 74
Period size: 21 Copynumber: 2.1 Consensus size: 22
19776799 TAACATTCAA
19776809 AAAATTAATAAGCAAGAAATTT
1 AAAATTAATAAGCAAGAAATTT
*
19776831 AAAA-TAATAAGCAAGAAAATT
1 AAAATTAATAAGCAAGAAATTT
19776852 AA
1 AA
19776854 TAAGCTTGTT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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Consensus pattern (22 bp):
AAAATTAATAAGCAAGAAATTT
Found at i:19778362 original size:191 final size:191
Alignment explanation
Indices: 19778018--19778368 Score: 411
Period size: 191 Copynumber: 1.8 Consensus size: 191
19778008 TTTTTTAGTC
* * * * *
19778018 ATAATTATTTTTTATCATACAAAGTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAA
1 ATAATTATTTTATATCATACAAAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAA
* ** * * *
19778083 AATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACCCACTCAAATAGTTATGACTA
66 AATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACGAAACCAACTCAAATAGTTAAGAATA
* *
19778148 TTTAAACAATTGTATACTTCAAATAATTATTTAAAAAATAAACGTTTTGTTTTGTCATAAA
131 TATAAACAATTATATACTTCAAATAATTATTTAAAAAATAAACGTTTTGTTTTGTCATAAA
* * *
19778209 ATAATTA-TTTATATTCATAC-AAGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTTTA
1 ATAATTATTTTATA-TCATACAAAG-TTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCA
* * * * * *
19778272 AAAATTAATAAC-TAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGGTTGCGAAACCAATTTAAATAGTTAAGA
64 AAAATTAAT-ACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACGAAACCAACTCAAATAGTTAAGA
* * * * *
19778336 ATATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTAT
128 ATATATAAACAATTATATACTTCAAATAATTAT
19778369 GACCTTTTCT
Statistics
Matches: 130, Mismatches: 27, Indels: 6
0.80 0.17 0.04
Matches are distributed among these distances:
190 8 0.06
191 120 0.92
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ACGTcount: A:0.45, C:0.09, G:0.07, T:0.39
Consensus pattern (191 bp):
ATAATTATTTTATATCATACAAAGTTATTCGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAA
AATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTAGTTACGAAACCAACTCAAATAGTTAAGAATA
TATAAACAATTATATACTTCAAATAATTATTTAAAAAATAAACGTTTTGTTTTGTCATAAA
Found at i:19778388 original size:830 final size:827
Alignment explanation
Indices: 19776855--19778390 Score: 1809
Period size: 830 Copynumber: 1.8 Consensus size: 827
19776845 GAAAATTAAT
* * * * *
19776855 AAGCTTGTTCAGAATAAATTAATATTAATTTATTAGCATTCAAAAAATTAATAAGAAAGGGATCT
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATCT
* * * **
19776920 AAAAAAATAAAATTGTTTACCAAACAATTTTAAATAGTTATTACTATTTGAATAATTGTCTATGT
66 AAAAAAATAAAATTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTACGACTATTTGAATAATTGTCTATGT
** ** * * * *
19776985 AAAATTGTTATAACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTATTTCAGTTAATACAAGCTTAGATGGA
131 AAAATCATTATAACCTTTTGATTTACCACAAAACAATTATTTCAATTAATACAAGATT--ATGAA
* *** * *
19777050 ATAAAATAATATTAGTTTATTAATATTTTTGAAATTAATAAGTAAGAAATTTTAAAAAATAAATC
194 ATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-AG-AATTCTAAAAAATAAATA
** * * * **
19777115 TGTTTACTGAATCAATTAATATGATTATGGCCATTTGAATGATTATCTATTTCAAATCATTATGA
257 TGTTTACCAAATCAATTAATATAATTATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* *
19777180 CATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTTATCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAACACT
322 CATTTTGTTTTGTCAT---A-AATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACT
* * *
19777245 AATTTATTAATATTTGAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCGAACCA
383 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCA
* * * ** *
19777310 GTTCAAATAGTTATGATTATTTGAACAATTAACAATCTCAAATCATTAAGATCTTTGTTTTGTCA
448 GCTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTAACAATCAAAAATCATTAAAATCTTTGTTTTGTCA
* * ** * *
19777375 TAAAATAGTTATTTCTAATACTAAAAGTTTATTCAGTTAAAAATAATTCTAATTTAATAATATTT
513 TAAAATAATTATTTATAATACTAAAAGTTTATTCAAATAAAAATAATACTAATCTAATAATATTT
* *
19777440 CAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTGAAAAATAAATGTGCTTGCGAAACCAGTTCAAAAAGTTAAA
578 CAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATGTGCTTGCGAAACCAATTCAAAAAGTTAAA
*** * * *
19777505 ACCATTAGAATAACTATCTATTTTGGATCGTTTTGATCTTTTTTTTAGTCATAAAATATTTGTTT
643 ACCATTAGAATAACTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTAGTCATAAAATATTTGTTT
19777570 CATATCTTACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAGAAAATAAATAAG
708 CATATCTTACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAGAAAATAAATAAG
19777635 CAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAAAATTTGCAATTGTTTTAGTTCATAA
773 CAAAAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTAAAATTTGCAATTGTTTTAGTTCATAA
* * *
19777690 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTC-AAAAATTAATAAGCAAGAG-T-
1 AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATC
* * * *
19777752 TAAAAAAATAAATTTGTTTACCCATCAAATTCAAATAATTACGACTATTTGAATAATTGTCTATT
65 TAAAAAAATAAAATTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTACGACTATTTGAATAATTGTCTATG
* * * * *
19777817 TAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTACCACAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA-ATT-TGAAA
130 TAAAATCATTATAACCTTTTGATTTACCACAAAACAATTATTTCAATTAATACAAGATTATGAAA
* *
19777880 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGT-G-A-TCTAAAAAGTGAATATGT
195 TAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAATTCTAAAAAATAAATATGT
* * * * *
19777942 TTACCAAATTAGTTCAA-ATAATTATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACC
260 TTACCAAATCAATT-AATATAATTATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACA
* *
19778006 TTTT-TTTTAGTCAT-AATTATTTTTTATCATACAAAG-TTGTTCGAAATAAAATAATACTAATT
324 TTTTGTTTT-GTCATAAATTATTTTTTATCATAC-AAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTAATT
* *
19778068 TATTAATCTTTCAAAAATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTC-AACCCA-C
387 TATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTA-TCGAA-CCAGC
* *
19778131 TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTGTATAC-TTCAAATAATTATTTAAAAAATAAACGTTT
450 TCAAATAGTTATGACTATTTAAACAA-T-TA-ACAATCAAA-AATCA-TT--AAAAT---C--TT
* * * *
19778195 TGTTTTGTCATAAAATAATTATTTAT-ATTCATACAAGTTTATTTGAAAT-AAAATAATAGTAAT
503 TGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATAATAC-TAAAAGTTTA-TTCAAATAAAAATAATACTAAT
* * *
19778258 CTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTT-AAAAATTAAATTTGGTTGCGAAACCAAT
566 CTAATAATATTTCAAAAATTAATAACTAAGAGATTTGAAAAA-TAAATGTGCTTGCGAAACCAAT
* * * *
19778322 TTAAATAGTTAAGA--ATATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTT-GT
630 TCAAAAAGTTAAAACCAT-TA-GAATAACTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTT-TTTTAGT
19778384 CATAAAA
692 CATAAAA
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Statistics
Matches: 585, Mismatches: 92, Indels: 53
0.80 0.13 0.07
Matches are distributed among these distances:
819 114 0.19
820 9 0.02
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823 6 0.01
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833 100 0.17
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836 3 0.01
ACGTcount: A:0.43, C:0.10, G:0.08, T:0.39
Consensus pattern (827 bp):
AAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATAAGAAAGAGATCT
AAAAAAATAAAATTGTTTACCAAACAAATTCAAATAATTACGACTATTTGAATAATTGTCTATGT
AAAATCATTATAACCTTTTGATTTACCACAAAACAATTATTTCAATTAATACAAGATTATGAAAT
AAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAGAATTCTAAAAAATAAATATGTT
TACCAAATCAATTAATATAATTATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACATT
TTGTTTTGTCATAAATTATTTTTTATCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAACACTAATTTATT
AATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCGAACCAGCTCAAAT
AGTTATGACTATTTAAACAATTAACAATCAAAAATCATTAAAATCTTTGTTTTGTCATAAAATAA
TTATTTATAATACTAAAAGTTTATTCAAATAAAAATAATACTAATCTAATAATATTTCAAAAATT
AATAACTAAGAGATTTGAAAAATAAATGTGCTTGCGAAACCAATTCAAAAAGTTAAAACCATTAG
AATAACTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTTTTTAGTCATAAAATATTTGTTTCATATCTT
ACAAGCTTATTCGGAATAAAATAATCCAAATTTATTAACATTCAGAAAATAAATAAGCAAAAGAT
TTGAAAAAATAAATCTGTTTAAAATTTGCAATTGTTTTAGTTCATAA
Found at i:19778690 original size:177 final size:175
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Period size: 177 Copynumber: 11.1 Consensus size: 175
19778183 AAATAAACGT
* * * * *
19778193 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATATTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * * * *
19778258 CTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAATTAAATTTGGTTGCGAAACCAATT
66 TTATTAATATTTCAAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATT
* * * * *
19778323 TAAATAGTTAAGAATATATGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
126 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * *
19778373 TTTTCTTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACT-AGGTTATTTAAAATAAAATAA-AAT
1 -TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATA-TAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * **
19778435 GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAGATATAATTATATTTACCTAACCGGTT
63 -AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC-AAACAATT
* * * *
19778500 CTAATAATTATGACTATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTTATGACAC
126 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-C
* * * * *
19778551 TTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * * *
19778616 CTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATCTAAAAATTAAATCTTTTTATCAAACCAATTCAAT
66 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAA-CAATTCAAA
* * * *
19778681 TAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATTACTT
130 TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-C
* * * * * * * * * *
19778728 TTTGTTCTATTATAAAAAAATAGTTTCTATTCATACAAGCTTGTTTGGATTAAAATAATACTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
* * ** *
19778793 TTTTTAAGATTTCAACTATGTAA-AA-A-A-TTAAAAAAGTAAATATGTTTACCAAACTAGA-TC
66 TTATTAATATTTCAAAAAT-TAATAAGAGATTTAAAAAA-TAAATCTGTTTACCAAAC-A-ATTC
* * * ** *
19778853 AAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACT
127 AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * ** * * *
19778902 TTTGTTTTGCCATAAAA-AATTATTT-TAGTTCATATAAGCCTACTCGAAATAAAATAGTACTAA
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAA
* * *
19778965 GTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAGATGAATCTGTTTACCAAACAAG
65 TTTATTAATATTTC-AAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-
* * * ** *
19779029 TTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCGCTATAACC
124 TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * *
19779081 TTTTTTTTTGTAATAAAAAAATTTTCTTTTGTTCATAAAAGTTTATTTCAAATAAAATAATA-TA
1 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACT-
* * *
19779145 AATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAGTAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAAC
63 AATTTATTAATATTTCAA-A-AA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * ** * * *
19779208 AAGTTTAAATCA-TTATGATTATTTGAACAAAAAT-T-GTT---ATGA--AT---T
122 AA-TTCAAAT-AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * *
19779253 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTCTATTCA-AAAAG-TTATTCGAATTAAAATAATATTAAT
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
* * * * *
19779316 TTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATCGAATAAGTT
66 TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA-TT
* * * *
19779381 CAAATAGTCATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGTGACC
126 CAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * *
19779431 TTTTATTTTGTAAGAAAACAATTGTTTC-AGTTAATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
1 -TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * * * * **
19779495 ATTTATTAATGTTTCAAAAATTAATGAGTAAAAGAATTAAAAAATGAATCTATTTATTGAAA-AA
64 ATTTATTAATATTTCAAAAATT-A--A-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTA-CCAAACAA
* * *
19779559 GTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAATTATCTATTTCAACA-CATTATGACTT
124 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTATGAC-C
* * * ** * *
19779613 TTTGTTTTATCAGAAAGCAATTGAATCTATTCGTGA-AA-TCTTATTTCG-AATAAAATAACA-T
1 TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ATAAGT-TTATTT-GAAATAAAATAATACT
* * ** *
19779674 AAATTTATTAATA-TTCTAAAAATTAATAAATAATAATTTAAATAAATTTAT-T-TTT-CTAAAC
63 -AATTTATTAATATTTC-AAAAATTAAT-AA-GA-GATTTAAA-AAATAAATCTGTTTACCAAAC
* * * * * **
19779735 ATGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATTTATTTGAAATTGTTATGACC
122 A-ATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * * * * * * *
19779790 ATTTTTTTTTGTGATAAATCAATTACTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT
1 --TTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACT
* * * * * * * * *
19779854 AATCTATTAAAATTCCAAAATTTAATAAGTAAAACATTTAAAAAATAAATCCGTTAACCGAGCGA
63 AATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG----AGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAAC-A
* * * * *
19779919 GTTCAAATAGTTATGACTATTTATTTCAACAAATATTTATTTCAAATCATTATGATC
123 ATTCAAATAGTTATGAC----TATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
* * *
19779976 TTT-TCTTTGGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGTTTATTTGGAATAAAATAATATTA
1 TTTGT-TTT-GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTA
* * *** *
19780040 ATTTACTAATATTAT-AAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAATGAATAA
64 ATTTATTAATATT-TCAAAAATTAATAA----GAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAA
* * * * * * * * *
19780104 GCTCAGACAATTATGTCTATTTGAGCTATTTTCTATTTCAAATCATTATGACAT
124 -TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGAC-C
19780158 TTTGTTTTGT
1 TTTGTTTTGT
19780168 TGTAAAATAA
Statistics
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0.73 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
164 3 0.00
165 3 0.00
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Consensus pattern (175 bp):
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TTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCAAACAATTCAAAT
AGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC
Found at i:19778823 original size:544 final size:532
Alignment explanation
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Period size: 544 Copynumber: 2.1 Consensus size: 532
19777673 ATTGTTTTAG
* ** * * ** * *
19777683 TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGC-A
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* * * * ** * * * * * * * *
19777747 AGAG-TTAAAAAAATAAATTTGTTTACCCATCAAATTCAAATAATTACGACTATTTGAATAATTG
65 AGAGATTTAAAAATTAAATTTGGTTGCGAAACCAATTTAAATAGTTAAGAATATATGAATAATTA
* * *
19777811 TCTATTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTACCACAAAACAATTGTTTCAATTCATACAAATTT
130 TCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTACCACAAAACAAATGTTTCAATTCATACAAATTT
* * * * *
19777876 GAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTGATCTAAAAAGTGAATATG
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** * *
19777941 TTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATTACC
260 TTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACC
* ** *
19778006 TTTTTTTTAGTCATAATTATTTTTTATCATACAAAGTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATTTAT
325 TTTGTTTTAGTCATAAAAATTTTTTATCATACAAAGTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATCTAT
* * *
19778071 TAATCTTTCAAAAATTAATACGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACCCACTCAAA
390 TAATATTTCAAAAATTAATAC-TAAGAGATCTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACCAACTCAAA
* *
19778136 TAGTTATGACTATTTAAACAATTGTATACTTCAAATAATTATTTAAAAAATAAACGTTTTGTTTT
454 TAGTTATGACTATTTAAACAATTATATACTTCAAATAATTA-TT-----AT-AACGTTTTGTTCT
* *
19778201 GTCATAAAATAATTATTTATA
512 ATCATAAAATAAATATTTATA
* * * *
19778222 TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAA
1 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATGTAAAAAATTAATAACTAA
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66 GAGATTTAAAAATTAAATTTGGTTGCGAAACCAATTTAAATAGTTAAGAATATATGAATAATTAT
* ** * *
19778352 CTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAGGTT
131 CTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTACCACAAAAC-AAATGTTTCAATTCATAC-A---A
* *
19778416 ATTTAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATTTAAGATA-T-A
191 ATTTAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATCTAA-AAAGTGA
* * * * * * *
19778479 ATTATATTTACCTAACCGGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACGATTATCTATTTCAAATCGTT
255 A-TATATTTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
* * * *
19778544 ATGACACTTTGTTTT-GTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATA-TAAGTTTGTTTGGAATAAAAT
319 ATGAC-CTTTGTTTTAGTCAT--AA-AAAT-TTTTT-ATCATACAAAG-TTGTTCGAAATAAAAT
* *
19778607 AATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATT-A-A-TAAGAGATCTAAAAATTAAATCTTTTTA-TC
377 AATACTAATCTATTAATATTTCAAAAATTAATACTAAGAGATCTAAAAAATAAATCTATTTACTC
* * * * * * * *
19778668 AAACCAATTCAATTAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTA-T-T-ACTTTT
442 -AACCAACTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATATACTTCAAATAATTATTATAACGTTT
* *
19778730 TGTTCTATTATAAAA-AAATAGTTTCTA
506 TGTTCTATCATAAAATAAATA-TTTATA
* * *
19778757 TTCATACAAGCTTGTTTGGATTAAAATAATACTAAT
1 TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAAT
19778793 TTTTTAAGAT
Statistics
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Matches are distributed among these distances:
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ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.07, T:0.40
Consensus pattern (532 bp):
TTCATACAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATGTAAAAAATTAATAACTAA
GAGATTTAAAAATTAAATTTGGTTGCGAAACCAATTTAAATAGTTAAGAATATATGAATAATTAT
CTATTTAAAATCATTATGACCTTTTCTTTTACCACAAAACAAATGTTTCAATTCATACAAATTTA
AAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGATCTAAAAAGTGAATATAT
TTACCAAACCAGTTCAAATAATTATGACCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCT
TTGTTTTAGTCATAAAAATTTTTTATCATACAAAGTTGTTCGAAATAAAATAATACTAATCTATT
AATATTTCAAAAATTAATACTAAGAGATCTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACCAACTCAAATA
GTTATGACTATTTAAACAATTATATACTTCAAATAATTATTATAACGTTTTGTTCTATCATAAAA
TAAATATTTATA
Found at i:19778998 original size:354 final size:356
Alignment explanation
Indices: 19777683--19780088 Score: 1147
Period size: 354 Copynumber: 6.7 Consensus size: 356
19777673 ATTGTTTTAG
* * * * * *
19777683 TTCATAAAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGCAA
1 TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAAGATTTCAAAAATTAATAAG--A
* * * * * * * * * * *
19777748 GAGTTAAAAAAATAAATTTGTTTACC-CATCAAATTCAAATAATTACGACTATTTGAATAATTGT
64 GA-TTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGA-TCAAATAATCATGACTATTTAAACAATTAT
* * * ** * * * * *
19777812 CTATTTAAAATCATTATGACTTTTTGTTTTACCACAAAACAATTGTTTCAATTCATACAA----A
127 CTATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGTTTA
* * * * * *
19777873 TTTGAAATAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGTGATCTAAAAAGTG
192 TTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTT-AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAATTA
* * ** * * * * * * * *
19777935 AATATGTTTACCAAATTAGTTCAAATAATTATGGCCATCTCAACAATTATCTATTTCAAATCGTT
256 AATCTTTTTACCAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * ** * **
19778000 ATTACCTTTT-TTTTAGTCAT---A-ATTATTTTTTA
321 ATGACCTTTTCTTCTA-TCATAAAACAAAAGTTTCAA
* ** * **
19778032 -TCATACAAAG-TTGTTCGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATACGT
1 TTCATAC-AAGCTTATTTAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAAGATTTCAAAAATT-A-A--T
* * * * *
19778094 AAGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTCAACCCA-CTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAT
60 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTAC-CAAACCAGATCAAATAATCATGACTATTTAAACAAT
* * * ** * * *
19778158 TGTATACTTCAAATAATTATTTAAAAAATAAACGTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTATA-
124 TATCTATTTC--A-AA-TCGTT-----AT-GACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAG
* * *
19778222 TTCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAATAGTAATCTAATAATATTTTAAAAATTAATAACTAA
178 TTCATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATA-TTTAAAAATTAATAA-TAA
* * * * * * *
19778287 GAGATTTAAAAATTAAAT-TTGGTTGCGAAACCAATTTAAATAGTTAAGAATATATGAATAATTA
241 GAGATTTAAAAATTAAATCTT-TTTACCAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTA
* * *
19778351 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTTTGTCATAAAACAAAATTTTCAA
305 TCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTCTTCTATCATAAAACAAAAGTTTCAA
* * *
19778403 TTCATACTAGGTTATTTAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGAGA
1 TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAAGATTTCAAAAATTAATAAGAGA
* * * * * * * * * *
19778468 TTTAAGATATAATTATATTTACCTAACCGGTTCTAATAATTATGACTATTTGAACGATTATCTAT
66 TTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGATCAAATAATCATGACTATTTAAACAATTATCTAT
* * * * *
19778533 TTCAAATCGTTATGACACTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTTG
131 TTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGTTTATTTG
* *
19778598 GAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTTCAAAAA-T--TAATAAGAGATCTAAAAATTAAATC
196 AAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTT-AAAAATTAATAATAAGAGATTTAAAAATTAAATC
* * * * * *
19778660 TTTTTATCAAACCAATTCAATTAGTTATGACTATTTGAGCAATTATTTATTTCAAATCATTATTA
260 TTTTTACCAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATGA
* * * *
19778725 CTTTTTGTTCTATTATAAAA-AAATAGTTTCTA
325 CCTTTTCTTCTATCATAAAACAAA-AGTTTCAA
* ** * * * **
19778757 TTCATACAAGCTTGTTTGGATTAAAATAATACT-AATTTTTTAAGATTTCAACTATGTAA-AA-A
1 TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAAGATTTCAAAAAT-TAATAAGA
* * * *
19778819 -A-TTAAAAAAGTAAATATGTTTACCAAACTAGATCAAATAGTCATGACTATTTAAATAATTATC
64 GATTTAAAAAA-TAAATATATTTACCAAACCAGATCAAATAATCATGACTATTTAAACAATTATC
* * ** *
19778882 TATTTCAAATTGTTATGAC-TTTTGTTTTGCCATAAAA-AATTATTTTAGTTCATATAAGCCTAC
128 TATTTCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTTTAGTTCATATAAGTTTAT
* *
19778945 TCGAAATAAAATAGTACTAAGT-TATTAATATTCTAAAAATTAATAATTAAGAGATTTAAAAGA-
193 TTGAAATAAAATAATACTAA-TCTATTAATATT-TAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAA-AT
* * * *
19779008 TGAATCTGTTTACCAAA-CAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC
254 TAAATCTTTTTACCAAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATC
** * * * * * * **
19779072 GCTATAACCTTTTTTTTTGTAAT-AAA-AAAATTTTCTTTTG
318 ATTATGACCTTTTCTTCTATCATAAAACAAAAGTTTC---AA
* * * * * *
19779112 TTCATAAAAGTTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATA-TT-AAGATAATTAGTAAGT
1 TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAAAATGAATTTATTAAGATTTCAA-A-AA-T--TAA-T
* * * * * * * * * * *
19779175 AAAATATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAAACAAGTTTAAATCATTATGATTATTTGAAC----
60 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTACCAAACCAGATCAAATAATCATGACTATTTAAACAATT
* * *
19779236 A---A----AAATTGTTATGA-ATTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTCTA-TTCA-AAAAG
125 ATCTATTTCAAATCGTTATGACA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATATAAG
* * * * * *
19779291 -TTATTCGAATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTCAATAATTAATAAGTAAAAGATTTAAA
188 TTTATTTGAAATAAAATAATACTAATCTATTAATATTT-AAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAA
* * * * * * * * * *
19779355 AAATAAATATGTTTATCGAA-TAAGTTCAAATAGTCATGACTGTTTGAATAATTATCTATTTCAA
251 AATTAAATCTTTTTACCAAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAA
* * * * * * ** *
19779419 ATCATTGTGACCTTTTATTTTGTAAGAAAACAATTGTTTCAG
315 ATCATTATGACCTTTTCTTCTATCATAAAACAAAAGTTTCAA
* * * * *
19779461 TTAATATAAGTTTATTTGAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATG-TTTCAAAAATTAATGAGT
1 TTCATACAAGCTTATTTAAAATAAAATAA-AATGAATTTATTAA-GATTTCAAAAATT-A--A-T
* * * * ** * * * * *
19779524 AAAAGAATTAAAAAATGAATCTATTTATTGAAA-AAGTTCAAATAGTTATGACTATCTAAACAAT
60 AAGAGATTTAAAAAATAAATATATTTA-CCAAACCAGATCAAATAATCATGACTATTTAAACAAT
* * * * * * * *
19779588 TATCTATTTCAACA-CATTATGACTTTTTGTTTTATCAGAAAGCAATTGAATCTA-TTCGTGA-A
124 TATCTATTTCAA-ATCGTTATGACATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-ATTTTAGTTCAT-ATA
* * *
19779650 A-TCTTATTTCG-AATAAAATAACA-TAAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAATAATA-AT
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* * * *
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** * *
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** ** * *
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* * ** *
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* *
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* * * * *
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* * * * *** ***
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* ** * ** * * * * * ** *
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* ** * ** * ** * * ** *
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* * * * * * * * *
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* * *
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* **
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* * * * * * * *
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*** * *
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** * * * * *
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* * * *
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** * * * *
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* * * *
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19785633 AATAAAATAAT-CTCATTTATTAATATTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AAATC
** * * * * * **
19785694 TATTTACCGAGCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCAATCTCAAATCGCTA-AG
65 TATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA-
* * **
19785758 ATC-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAG-CTTATTC-GGTTAAAAATAA
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTCTTATTCAGAAT-AAAATAA
* ** * * * ***
19785819 TAA-TAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAAAACATAAATGTGTTTGTTG
191 -AACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAA-ATAACTATG-TTACCG
* ** * * * *
19785883 AACTAGTTTAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTA-TTCAAATCATTTTGACC-TTTT-T
252 -A-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTAT
* * * * *
19785945 CTTAGTCATAAAATACTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTATTC-A
314 TTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAAAAGCTTATTCGA
* * * *** * *
19785988 GAATAAAATAATCCAAATTTATTAACT-TCAAAAAATTAATAA-TCAAAAGTTTTGAAAAAATAA
1 -AATAAAATAATACTAATTAATTAA-TATTTTAAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATAA
* * * * *
19786051 ATCTATTTATTGAGCAAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATTA
62 ATCTATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
19786115 CAATCTTTTGTTTTGACACAAAACAATTGTTT-TAGTTCATAAAAG-CTTATCCA-ACATAAAAT
126 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTATTCAGA-ATAAAAT
* * * * * * *
19786177 GACACTAATTTCTTAATATTTCAAAAATTAATAAGGAA-GAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTAC
189 AAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGGA-TTT--AAAAATAACTATG-TTAC
** * * * * *
19786241 TAAATAAATTCAAATAGTT-TGACTATTTGAACAATTCTATATTTAAAATCATTATGA-CATTTT
250 -CGAT--AGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTT
* * ** *
19786304 GTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATACTAGCTTATTCAA
312 ATTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * *
19786349 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-ATGATTTAAAAAGTGAAT
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGA-GATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
19786413 TTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTCAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
64 CTATTTA-T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * * * * *
19786476 TTACTTTTTGTTTGGTCATATAATAATTGTTT-TAAATCGTACAAG-CTTATT-TGAAATAAATT
126 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAAT
** * * * *
19786538 AGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAAATAAATCTGTTTAACA
189 AAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGGATTT-AAAAATAACTATG-TT-AC-
* * * * * * * * * * *
19786600 AACCA-ATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATCATATACTTGAAATCATTATAATC-TTTTG
250 --CGATAGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTA
** * * * * ** *
19786663 TCCTATAATAAAACAATTATTTTTGTTCATACTAGCTTATTTGA
313 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * *
19786707 GATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAGTC
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TC
* * * ** * * * *
19786769 GT-TTAACAAACCAA-TTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATCGTGTACTTGAAATCGTTATA
65 -TATTTATAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* ** * * * * * * * * *
19786832 ATCTTTTGTCCTATAATAAAACAATTATTTTTGTTCATAC-TGGCTTATT-TGAAATAAAATAAT
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAATAAA
* * ** * * * * *
19786895 ACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATTTTTTTACC---
192 ACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAAT-AACTATGTTACCGAT
** * ** * * * *
19786957 A---AACCAATT-CGA--AAATGAAAAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGT-TTTGA
254 AGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTT-TATTTTA
* * * ** *
19787015 -CATAAAA-AACT-ATTCAATTCATACTAGCTTACTT-GG
318 TCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCGA
* * * **
19787051 AATAAAATAA-AATGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATATTT
1 AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
19787115 CTATTTACCT-TACTAGATCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTC-TTA
64 CTATTTA--TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTA
* * * * * *
19787178 TGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGT-TTATTCAGAATAAATTAA
126 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAA
* * * * * * * **
19787242 TATTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAA
191 AACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAACTATG-TTA-CCG
* * * * * * * * *
19787307 ACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTAAACAATTATCTATTTAAAAT-TTTATGACCTTTTGA-T
252 A-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATT
* * *
19787370 TTGTCATAAAACAATCT-ATTC-ATTC--AAAA--TTATTCAA
315 TTATCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* *
19787407 AATTAAATAATA-TCAATCT-ATTAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAACTAAA
1 AATAAAATAATACT-AAT-TAATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * *
19787466 TATGTTCATGAAA-ACAGTTTAAATAGTTATGGCTA-TTGAACAATTATCTATGTCAAATCGTTA
63 TCTATTTAT-AAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * * *
19787529 TGATC-TTTATTTTGTTATAAAACAATTG-TTCCATTTCATACAAG-CTAATTCA-AATTAAAAT
126 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTATTCAGAA-TAAAAT
* * * ** * * * **
19787590 AATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATGTGTAAGAGATTAAAAAAATAAGTGT-TTGTCG
189 AAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATT-TAAAAATAACTATGTTACCG
* * * * * *
19787654 ATCTAGTTTAAATAGTTAAGACTA-TT--A-GA-TATATATTTCAAATCATTCTAACC-TTTT-T
252 A--TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTAT
* ** **
19787712 TTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATACCAGCTTATTTAA
314 TTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * * * *
19787756 AATAAAATAATACTAATTTATTAACATTTGAAAAATTAATGAGCAACATATTTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
19787821 ATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTAAACAATTTTCTATTTAAAGAT-GTTA
64 CTATTTA-TAAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAA-ATCATTA
* * * ** * *
19787884 TGACCTTTTGTGTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAACCTGTTC-GAAATAAAAT
126 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAAT
* * * * * * * *
19787946 AATACTACTTTACTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAAAGATTTAAAAATTAAATCTGTTTACC
189 AAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGT-AAGGATTTAAAAA-TAACTATG-TTACC
* * * * *
19788011 GAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTATCTCAAATCATTATG--------A
251 G-A-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTA
* * * * *
19788068 TCTT-T-GT-AAACAATTGTTTCT-CTCTATATAAGCTTATT-TA
313 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTC-ATAAAAGCTTATTCGA
* * * * * *
19788108 GAGTAAAATATTGCTAAACTAA-TAATATTCTAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 -AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * *
19788172 GTGTTTTGTTAAACCAA-TTCAAATAGTTAAGATTA-TTAGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
64 CT-ATTT-ATAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** * * *
19788235 CTGACCTTTTGCTTAATCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATA-ATG-CTTATT-TGAAATAAAA
125 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAA
* * * * * * * * * *
19788296 TAATACTATTTTGTTAACATTTAGACAATTAATAAGTTAGAAATTTAAAAAAATAAATCTGTTTA
188 TAAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT--AAAAATAACTATG-TTA
* * * * *
19788361 TCAAAC-AAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTACT-TATTTCAAATCATTATGGCC-T
249 -C---CGATAGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA-TATATTTCAAATCATTATGACCTT
* * * * * *
19788423 TTTGTTTTATGATAAAACAATTGTTTCAATTCTTAAAAGCTTATCCAA
309 TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * * *
19788471 AATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGTTATAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTT-TAAAATT-AATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
19788535 CAATTTATCGAATC-AGTTTAAATAATTATG-GTAATTGATCAATTATCTATTTCAAATCATCAT
64 CTATTTAT--AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * * *
19788598 GAA-CATTTATTTTGTCATAAAATAATT-TTTTTCA-TCCTATAAG-CCTATT-TGAAATAAAAT
127 -AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAAT
* * *** * * *
19788658 AATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAATGCTTAGGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACC
189 AAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAACTATG-TTACC
* * * * * * *
19788722 AAACTAGTTTAAATAGTTATGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATACTAATCTAATAA
251 -GA-TAG-TCAAATAATTATG-AC-TAT----TTGA---ACAAT----T-ATA-T-ATTTCA-AA
** ** ** * ** ** * * *
19788786 T-ATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAA-AATAAATTTGT-TTGCCT--AA-C-CAGTT
296 TCATTATG-ACCTTTTTATTTTA-TCA--TAAAACAAT-TGTTTCTATT-CATAAAAGCTTA-TT
19788844 C-A
354 CGA
* * * * ** ** **
19788846 AATAGTTAAGGTTATA-TGAA-TAATTATCTATTTCAAATCATT-ATGACCTTTTG-TTTTGTCG
1 AATA---AA-ATAATACT-AATTAATTA-ATATTTTAAA--ATTAAT-A-AGTAAGAGATT-T--
** * * *** ** * *** *
19788907 CAAAAAA-AGTGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAGAATA-AAAT-AATA-TTAATTTATTA-A
53 -AAAAAATA-AATCTAT-TT-ATA-AA-CAAGTTCA-AATAGTTATGACTATTTAAACAATTATC
* ** * * * * * * * *
19788967 TATTTTGAAA--ATTAATAA----GAG-ATT-T-AAAAAATAAATCTATT-TA-CCAAACCAATT
111 TA-TTTCAAATCATT-ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCATA-CAAGT
* * * ** ** **
19789021 C-AATT-AGTTATAACAGTTTGAAC-AA-TTATT--TATTTCAAATCATT-ATGACCATTTGTTT
172 CTTATTCAG-AATAA-A-ATAAAACTAATTTATTAATATTT-AAAAAATTAAT-A--A---GTAA
* ** * * * * *
19789079 TG-TTATAAAATAGTTTTTTCTATTGATACAGTCTTATTCGAAATAAAGTAATG-CTAATTTATG
227 GGATT-TAAAA-A----TAACTA-TGTTACCG--ATAGTC-AAAT-AA-TTATGACT-A-TT-TG
* * * * * * * *** * * * *
19789142 AATATTCTAAAAATTAATCAATAACAAATTTAAAAAATGAATCTGTTGGCTTGACCAATGCAAAT
277 AACAAT-TATATATT--TCAA-ATC--A-TT-----ATG-ACCTTTTTATTTTATC-AT-AAAAC
* * * *
19789207 AGTT-TTGACTGTT--TGAACAA--TTA-TCTA
327 AATTGTT-TCTATTCAT-AA-AAGCTTATTCGA
** * * * * ** * *
19789234 TTTCAAATCATTA-TAACATT--TTATTTTGTTATAAGACAATTGTTTCTAATCCTACA-AGCTT
1 AATAAAAT-AATACT-A-ATTAATTAATAT-TT-T-A-A-AA---TTAATAA--GTA-AGAG-AT
** * * * * * *
19789295 GTTCGGAATAACGTAATTCTAATTTATCAA-TATTATGAAA-A-TTAATAAGA-GATTTAAA-AA
51 -TT---AA-AAAATAAATCT-ATTTATAAACAAGT-TCAAATAGTT-AT--GACTATTTAAACAA
* * ** * * * *
19789355 TTGAATTTGTTTATCAAA-CAAGTTGA-AATAGTTATGACTATTTAAGTGAT--TAC--TTATTT
106 TT--ATCT-ATT-TCAAATC-A-TT-ATAA-CCTTTTG--T-TTT--GTCATAAAACAATTGTTT
* * ** * * ** * ** *
19789414 CAAATCGCAATA-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCT-ATTTATACAAGCTTATTTC
158 C-TAT-TC-ATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAATAA----AACTAATTTAT-TAA---TATTT-
* * ** * * * ** * *** *
19789477 AATTAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAACAATTAA-TAAGTAAAAGGTTTAAAAAAACAA
210 AA--AAAATTA-AT-AA-GTA--AGGATTTAAA-AA-TAACTATGT-TACCG-ATAGTCAAATAA
* * * * *
19789541 CTCTATTTACCAAATAAATTCAA-ATAGTTACAACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATCATT
264 -T-TA-TGA-C---T-ATTTGAACA-A-TTA-TA-TATTT---CAA--A-TCA-TT---------
* * * * * *
19789605 ATGA-CTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAA-TG-TT-T-TTCATACAAGCTTATTTGC
301 ATGACCTTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * * * * *
19789656 ATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTAAAAACAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * * *
19789721 TGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAAT-TTTATGA
65 TATTTAT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* ** * * * *
19789785 CATTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTC-ATT-AGTA-TAGGCTTATTCAAAATAAAATAAT
129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTCTATTCA-TACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAAA
* * *
19789847 ACTAATTTATTAATATTCT-GAAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAAAATGAATCTAT-TTACTG
192 ACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGTAAG-GAT-TTAAAAAT-AA-CTATGTTACCG
* * * * * *
19789910 AATAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGA-CATTTTGT
252 -AT-AG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTAT
* * * * *
19789974 TTTGTCAAAAAATAATTGTTTTTATTCATATAAA-CTTATTCCA
314 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATA-AAAGCTTATTCGA
* ** * *
19790017 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAGCAA-AAATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATT--TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
19790080 TGTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAATTATCTACTTT-AAAT-AGT
63 TCTA-TTTATAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTA-TTTCAAATCA-T
* * * * * * *
19790142 TATGACCATTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACAAG-CATATTCAAAATAAAAT
124 TATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAAT
* * **
19790206 AATACTAGTTTATTAATATTCCAAAAA-T--TAA-TAA-GATTTAAAAAAATAAATCTAT-TTAC
189 AAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGGATTT--AAAAAT-AA-CTATGTTAC
* * * *
19790265 CGAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCAC-ATTTGAACAATTATTTATTTCAAAT-AGTTATGATC
250 CGA--TAG-TCAAATA---ATTATG-ACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTATGACC
* * * * ** *
19790328 TTTTGT-TTTT-TCATAAAATAATTTTTTCTATTCTTACAATTTTATTCAA
307 TTTT-TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * *
19790377 AATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * *
19790441 TATTTACCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAATAATTATCTATTTTAAATC-TTATGA
65 TATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * * * ** * *
19790505 CCATTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGTTCATGCAA-AATTATTCAGAATAAAATAATAT
129 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAAAAC
* ** * * *
19790569 TGATCCATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAACTAAATTTGTTTACCGAAATA
194 TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-TAACTATG-TTACCG--ATA
* * * * * * * *
19790631 GTTTAAATAGTTATGACTATGTGAGCAATTATCTATCTCAAATCATTATGA--TCTTTATTTCAT
255 G-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTAT
* * * * * *
19790694 CACAAAACAATT-TTT-TTTTCATACAAGCATATTTGG
319 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* ** *
19790730 ATTAAAAT-A-ACTAATTTAA-TAATATTCCAAAAATTACTAAGTAAGAGATTT-AAAAA-AAAT
1 AATAAAATAATACTAA-TTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
19790790 GTGTTTGTTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTA-TTAGAA-AATTATCTATTTCAAATC-GTAT
64 CTATTT-ATAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
19790852 GACTTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAATTCATACAAG-CTTATTCAGAATAAAATA
127 AAC-CTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * * * **
19790915 ATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAAAAATCTAT-TTATTG
190 AAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAA-CTATGTTACCG
* * * * * * *
19790979 AACAAGTACAAATAGATT-TAAGTATTTGAAAAATTATCTATTT-AAAGTCGTTA-AACC-TTTT
252 -A-TAGT-CAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAA-TCATTATGACCTTTTT
* * * * *
19791040 -GTTTAGTCATAAAATAATT-TTTTTAGATCATAAAAACTT-TTCTGA
312 ATTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-GA
* ** * * *
19791085 AATAAAATAATACTACTTTGTTAAT-TTTTCAAAAATTAAAAAGCAAGTTATGACTATTTGAACA
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTT--AAAATTAATAAGTAAG--A-G---ATTT-AAAA
* * * * ** ** * *
19791149 AAT--ATCAATCTCA-AATC-A-TT-ATGATCTTTATTTTCTCA--TAAA-AA-AAT-TATTTCT
57 AATAAATCTAT-TTATAAACAAGTTCA-AATAGTTA-TGACT-ATTTAAACAATTATCTATTTCA
* * * * * * * * * *** *
19791203 GATCA-TACAAGC--TTATTTAG--ATAAAAATAATGCTAGTTTAATAGT-ATTCCAAAAATTAG
118 AATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT--T-GTTT-CTATTCA-TACAAGTCTTAT
* *** * *** **
19791262 TAAGAGATTTGA-AAAA-TAAATATATT--TACCGAACCAATTCAA-ATAGTTAA-GACTATT-A
177 TCAGA-ATAAAATAAAACT-AATTTATTAATATTTAAAAAATT-AATA-AG-TAAGGA-T-TTAA
* * * * ** * * * **
19791320 GAAT-A-TTTTTTA---AT-TTCAAATTGTTTTGACTTTTTGTTTAGTCATAGAATA-ATTTTCA
235 AAATAACTATGTTACCGATAGTCAAATAATTATGACTATTTG---A-ACA-ATTATATA-TTTCA
** ** * * * * ** * * *
19791378 GTTCA-TACAAGCTTATTCTTAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT--TGAAAA-ATTAAT
294 AATCATTATGACCTTTTTATT-TTATCATAAAAC-AATTGT-TT-CTATTCAT-AAAAGCTT-AT
*
19791438 AAGCAAGA
353 --TC--GA
* * ** * ** * * * *
19791446 GATTTGAAAAAAATA--AATTTGTT--TACTAAACAAATTTGAAT-AGTTATGACTATTTGAACA
1 -A-AT-AAAATAATACTAATTAATTAATATTTTA-AAA-TT-AATAAG-TAAGA-GATTTAAAAA
* * * *** * * * *
19791506 AT-TATCAATTTA-AAATCATTA-TGACCTTTTGTTTTGTC-A--TAAACAAGTACTGTATTAAT
58 ATAAATCTATTTATAAA-CA--AGT-TCAAATAGTTATGACTATTTAAAC-A--A-T-TA-T-CT
* *** * * * * * * * *
19791565 ATTTCAAA--AGTTAATAA-GTAAAAG-ATT-TAAAAAAAAAATCAGTTTACTGAATCGGTTCAA
112 ATTTCAAATCA-TT-ATAACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTT-CT-ATTC-ATACAA
* * * * * * * * ***** *
19791625 ATAATTATGGC-CATTTAAATAACTATCT-ATTTCAAATTGTTATTACCTTT-CGTTTTCTCATA
170 GT-CTTAT-TCAGAATAAAATAA--AACTAATTT---A---TTAATA--TTTAAAAAAT-TAAT-
** ** * ** * *
19791687 AAACAATTGCTTTTCAATATAA-AAGCCTAT-TCA-AAATAAAAT-AATACTAATTTACT-AATA
221 AAGTAA--GGATTT-AA-A-AATAA--CTATGTTACCGAT--AGTCAA-A-TAA-TTA-TGACTA
* * * * * * * * **** * * *
19791747 TTTCAAGAATTAATAAGAGATTT-AAA-AAATA-AATCTATTTACCGAAGT-AGTTCAAATAGTT
273 TTTGAACAATT-AT---ATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTTA-TCA--TAAAACAATT
* ** * **
19791808 ATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTC-A
331 GTTTCTATTCATAA-AA-GCT-TA-TTCGA
*** ** ** * * **** * **
19791836 AATTGTTATAACCTTTTTTTCTATCATAAAACAATTGTTTCTGTTCAT-A-TAAGCTTATTTAGA
1 AA-TAAAATAA--TACTAAT-TA--AT-TAA-TATT-TTAAAATTAATAAGTAAG-AGATTTA-A
* ** * * *
19791899 ATAAAAATAATACTAATTTAGT--ATTA-TTCTAAA-AATTATTAACTAAGAAATTTAAAAAATA
55 A-AAATA-AAT-CT-ATTTA-TAAACAAGTTC-AAATAGTTA-TGACT-----ATTTAAACAAT-
* * ** * ** * * *
19791960 AATCCATTTGTTGAA-CTAGTTCA-AA----TAGTTAAGACTACAT-GAACAATTATTTATTTTA
107 TATCTA-TT-TCAAATC-A-TT-ATAACCTTTTGTTTTG--T-CATAAAACAA-T-TGT-TTCT-
* *** * * * *** * *
19792018 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAA-AACAAT-TGTCT-TTGTTGATATAAGTTTGTTCAA
160 -A-T-TCAT-A-CAAGTCTTAT-TCAGAATAA-AATAAAACTAAT-TT-AT-TAA-TAT-TT---
* * ** * ** * * *
19792080 AATAAAATATTACTAATTTATTAATATTTTAGAAAATTAA-TCA-GTAAGAGGT-TTAAAAAGTA
210 -A-AAAA-ATTAATAA-GTA--AGGA-TTTA-AAAA-TAACT-ATGTTACCGATAGT-CAAA-TA
* * ** * * * * ** * * *
19792142 AATCTGTTTA-CTAAACCATTTCAAATAGTTTTGACTATTTCTATTTCAAATCATTATAACTTCT
263 ATTATGACTATTTGAA-CAATT-ATATA--TTT--C-AAATC-A-T-----T-A-T-GACCTTTT
* * * * * * ** ** *
19792206 TATTTTGTCATCAAATAATTGGTCCTGTTCATACTATTTTATTCAA
311 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* ** * * *
19792252 AATAAAATAATACTAATTTAA-TAATATTTCAAAACTTAATAACCATGAAAATTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAA-TTAATTAATATTTTAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
** * ** * * * * * * ** *
19792316 CTAATTGCTAAACCAA-TTCAAACAGTTAAAACTATATGAACGATTATTTGTTCCAAATTGTTGT
64 CT-ATTTATAAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * *
19792380 GACCTTTTTCTTTTGTCTTAAAATAGTTGTTT-TATTCATACAAG-CTTTTTCTA-ATTAAAATA
127 AACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTC-AGAATAAAATA
** * * * * * *
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190 AAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAACTATG-TTACCG
* * * * * ** * * * * *
19792506 AATTAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCCATTTGAAATCGTTCTGACC-TCTTGT
252 -A-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTAT
* * * * * *
19792570 TTAATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCCTATTCAA
314 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * ** *
19792613 AATAAATTAATACTAATTTAGTAACATTCGAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAATC
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATC
* * * * *
19792678 TATTTAATGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGT-TGATTTAAAATCATTATA
65 TATTT-ATAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTATA
* * * *
19792742 ACCTTTTGATTTGTCATAAAACAATTGTTTC-AGTTAATACAAG-CTTAGAT-GGAATAAAATAA
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTA-TTCAGAATAAAATAA
* * * *
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191 AACTAATTTATTAATA-TT--TAAAAAATTAA-TAAGTAAGGA-TTTAAAAAT-AA-CTATGTTA
* * * * * * **
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249 CC-GA-TAG-TCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTT
* * * * *
19792928 TCATTTTGTCATAAAAC-ATTGTTT-TTTATCATACAAGCTTATTTGA
310 TTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAAAAGCTTATTCGA
* * * *
19792974 AATACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAACATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTAAA-ATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * *
19793039 TGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATCTCAAATCGTTA-AG
65 TATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA-
* * * * **
19793103 A--TATTTGTTTTGACAGAAAACAATTGTTTTTGA-TCATA-AA-TCTTATT-TGGCTAAAAATA
128 ACCT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTCTTATTCAGAAT-AAAATA
* * * * * * *
19793162 ATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAATTAAATGTGTTTGCCT
190 AAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAAA-TAACTATG-TTACC-
* * ** * * * * *
19793227 AGCCA-ATTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT-TAATTTCAAATCGTTTTGACCCTTTG
251 -G--ATAGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATAT-ATTTCAAATCATTATGA-CCTTTT
* * * * * * * *
19793290 TA-TAT-TCATAAAA-TATTTTTTTTCATATCTTACAAGCTTATTTGG
311 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCT-AT-TCATAAAAGCTTATTCGA
* ** * *
19793335 AATAAAATAAT-CTTAAATT-ATTAACATTCAAAAAATTAATAAG-AAAATAATTTGAAAAAATA
1 AATAAAATAATAC-T-AATTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGA-GATTT-AAAAAATA
* * * * * * * *
19793397 AATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACATTTATTTATTTAAAATCATT
61 AATCTATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * ** * * *
19793462 ATGACCTTTTGATTTGACATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATA-AAAACTCATCCAAAATAAAAT
125 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAAT
* * * * * * * *
19793525 AATACTAATTTCTTAACAATTT-AAAAATTAATTAAATAA--AGTT---ATTTACTA----AAC-
189 AAAACTAATTTATTAA-TATTTAAAAAATTAA-TAAGTAAGGATTTAAAAATAACTATGTTACCG
* * ** * * * *
19793579 AAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGA-TTT
252 ATAGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTT
* * ** ** * *
19793643 GTCATAAAATAATTGTTTGAATTCATGCAAGCTTAGTCAA
317 ATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* ** * *
19793683 AATAAAATAATACTAATTTA-TATATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAAT
1 AATAAAATAATACTAATTAATTA-ATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * **
19793743 CTGTTTACTGAATC-AGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATTGTTAT
64 CTATTTA-T-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * * * *
19793807 CACCTTTTGTTTAGTCATATAATAATTGTTTTTAATCATACATGT-TTATTCAAAATAAAATAAT
127 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAAA
* * * *
19793871 AGTAATTTATT-A-ATTTACAAAAATTAATAAGTGAGAGATTTTTTAAAAAATAAATCTGTTTAT
192 ACTAATTTATTAATATTTA-AAAAATTAATAAGTAAG-GA---TTT-AAAAATAACTATG-TTA-
** * * * * ** * *
19793934 CAAACCAGTTTAAA-AAGTTATGACTATTTGGATAATTGCATACTTCAAATCATTAT-AACTTTT
249 CCGA-TAG-TCAAATAA-TTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * *
19793997 TATTCTATCATAAAACAATTACTTT-TGTTTATACAAGCTTATTCGA
311 TATTTTATCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * *
19794043 AATAAAATAATACTAATATAA-AAATATTCTAAAAAATAGTAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAAT-TAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * *** * * * * *
19794107 TTGTTTGTCAATGTAGTTCAAATAGTTAAGACGATATGAACAATTATCTATTCCAAATC---AT-
64 CTATTTAT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * *
19794168 ---TTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACTAG-CTTATTC-GAAATAAAATAA
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAATAA
* * * ** * *
19794227 AA-TGAATTCAATAATATTTTAAAAATTAATTTGTAAGAGATTTAAAACATAATTCTGTTTACCT
191 AACT-AATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTTAAAA-ATAACTATG-TTACC-
* * * * * * * *
19794291 AACCAGCTCAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACTATTACC-TTTTGT
251 GA-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTAT
* * * * * * * *
19794355 TTTGTCATAAAACAAATGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTCAA
314 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
*
19794398 AATAAAATAA-ATCTAATTTATTAATATTTTAAAAATTAATAA-T---AGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATA-CTAATTAATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * ** *
19794458 CTGTTTATCAAACTAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAGTTATTTATTTCAAATTGTTATG
64 CTATTTAT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
** * * * * * ** * * * ** * *
19794523 ATTTTTTGTTCTATTACAAGACAATAATCTCTGTTGATA-AAAACTTATTTA-AATTAAAATAAT
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAA-TAAAATAAA
* * ** * *
19794586 ACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAAAAATAAATATGTTTACCAAT
192 ACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGT-AAGGA-TTTAAAAATAACTATG-TTACCGA-
* * * * * * *
19794651 CTAGATCAAATAGTCATAACTATTTGAATAAGTAT-TCATTTCAAATCATTAT-AACTTTTTGTT
253 -TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATAT-ATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATT
** * *
19794714 TTATCATAAAA-AATTACTT-TAGTTTATATCAA-CTTATTCGA
315 TTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-AAAGCTTATTCGA
* * * * *
19794755 AATAAAATAATATTAAGTT-ATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTAGAGATTTAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAATACTAA-TTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * **
19794819 CTGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAAA-ATTTATCTATTTGAAATCGCTAT
64 CTATTTAT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * ** * * *
19794883 AACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTTCTATT-AGTACAAGT-TTATTTCA-AATAACAT
127 AACCTTTTGTTTTGTCA-TAAAACAATTGTTTCTATTCA-TACAAGTCTTA-TTCAGAATAAAAT
* * * * *
19794945 AATAC-AATTTATTAATA-TTAAGAAAATTAATAGGCGAA-GATTTAAAAAAATAAATTTGTTTA
189 AAAACTAATTTATTAATATTTAA-AAAATTAATAAG-TAAGGATTT--AAAAATAACTATG-TTA
** * * * * ** *
19795007 CCGAATAAGTTCAAATCTTTATCACTAATCGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGA-CTTAT
249 CCG-AT-AG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTT
* * * * *
19795071 TGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTTGC
311 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * *
19795117 ATTAAAATAATAGTAA-TATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAATTA-ATTAATATTTT-A-AAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * *
19795180 TATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTGT
63 TCTATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * ** *
19795245 GACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAG-CTT-TTTTGAATAAAATAAT
127 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAAA
* * * *
19795308 ACTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATTAGTGAGAGAATTAAAAAATTAATCTAT-TTACTA
192 ACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGT-A-AGGATTTAAAAA-TAA-CTATGTTAC-C
* * * * * * * *
19795371 AACATGTTCAAATAGTTATGACTATCT-AGATAATTATTTATTTCAAAACATTATGACC--TTTG
251 GATA-G-TCAAATAATTATGACTATTTGA-ACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTA
* * **
19795433 TTTTGTCATAAAACAATTGGTTT-TGTTCATGCAAGCTTATTTC-A
313 TTTTATCATAAAACAATT-GTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCGA
* * ** *
19795477 AATACAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * *
19795540 ATGTTTTTTGAACTA-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATG
64 CT-ATTTATAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * * *
19795604 ATCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATA-AAG-CTTATTCGGAATAAAATAATA
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAA-A
** * **
19795667 A-TAATTTATTTAA-ATTCCAAAAATTAATAGGTAAAACATTTAAAAGAAGTAATCTAT-TTACC
192 ACTAATTTA-TTAATATTTAAAAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAA-AA-TAA-CTATGTTACC
* * * * * *
19795729 AAGCTAGTTCAAATAGTTATGACT-TTTGAATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTT-
251 --GATAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTA
* * * ** *
19795792 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAATTTTATTCAA
313 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * ** *
19795836 AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * ** * * * * * ** **
19795901 TGTTCAGCGAACAAGTTTAAATAGTTATGTCCATTTGAGCTGTTATCTATTTCAAATGGTTATAA
65 TATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
* * * * * * * * * *
19795966 CATTTTGTTTT-ACTGTAAAATAATTATTTCCATTGATACAAAT-TTATTGAGAATAAAATAATA
129 CCTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAAAA
* * * **
19796029 CTAATTTATTACTATTTCAAAAATTAATAA--AA-GACTTAAAAATCAAATCTAT-TTATCAAAC
193 CTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAAT--AA-CTATGTTA-CCGA-
* * * * * * ** *
19796090 CAGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAATTACATATATCAAATTGTTATGA--TCTTTATTTT
253 TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATTTT
* * * *
19796153 GTCTTAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAGCTTATTCGA
317 ATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * ** * **
19796193 AGTAAAATATTA-TGAAATTAA-TAATATTCCAAAAATCAATAAGTAAGAGATTTAAAAAGCAAA
1 AATAAAATAATACT--AATTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * ** * * * * * * * * ** *
19796256 TGTGTTTGCCAAACCAGCTCAAAT-GTGAGGACTAGTAAAATAATTATCTATTTTAAATTGTTCT
63 TCTATTT-ATAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * * * * *
19796320 GACCTTTTATTTAGTCATAGAATAATTTTTTC-AGTTCATACATG-CTTAGTC-GAAATAAAATA
127 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAATA
** * * * * *
19796382 ATGCTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAATAAGAAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTAC
190 AAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GA-TTT--AAAAATAACTATG-TTAC
* ** * * * ** *
19796447 CAAATAAGTTCAAATAGCTATGATTATTTGAACTATTATCTATTT-ATAAGAAGTATGACC-TTT
250 C-GAT-AG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCA-AATCATTATGACCTTTT
*** * ** *
19796510 CGCTTTATCACAAAATGATTGTTTC-AGTTCATAAAAGCTTA-TCTAA
311 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTC-GA
* * ** * * * *
19796556 AATAAAATAATATTACTTTCTTGATATTTCAAAAATTGAA-AAGATAA-AGATTGAAAAAATAAG
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTT-TAAAATT-AATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * *
19796619 TCAATTTATCAAATC-ACTTCAAATAATTATGGCTATTTAAACAATTATCTCTTTCAAATCATTA
63 TCTATTTAT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * *
19796683 TGAA-CTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTCATT-ATACAAG-CCTATT-AGAAATAAAA
126 T-AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAA
* * * *
19796744 TAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTATTAAATAAATCTAT-TTA
188 TAAAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGT-AAGGATTTA-AAAAT-AA-CTATGTTA
* * * *
19796808 CCGA-A--C---TAATT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCCTTTT-T
249 CCGATAGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTAT
* * * * * *
19796863 TCTATTATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATATAAGCTTATTTGG
314 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAAAAGCTTATTCGA
** * * *
19796906 AATAAAATAATACTAATTTAA-TAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGATATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAA-TTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * ** * * * * **
19796970 CTGTTTATCAAAGC-AGTTCAAATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTA
64 CTATTTAT-AAA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTT-CAAATCATTA
** * * ** * * **
19797034 TGGCCTTTTGTTTGGTCATATAAA-AATTTTTTGGA-TCATTCAAG-CCTATTTGGAATAAAATA
126 TAACCTTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATA
* * * * *
19797096 ATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTAT-TTACC
190 AAACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAAT-AA-CTATGTTACC
* * * * * * *
19797160 GAATTAGTTTAAATAA--ATAACTATATGAACAA-TAGTAAACTACAAATCATTATAACC-TTTT
251 G-A-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTA-TATATTTCAAATCATTATGACCTTTTT
* * * * * * * *
19797221 GTTATGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCAA
312 ATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * ** * * * *
19797266 AATAAAATAATATTGATCTAA-TAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGGGAATTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACTAAT-TAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * *
19797330 TTGTTTGCTGAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATA
64 CTATTT-ATAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * ** **
19797395 ACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAGTT-TTTCTGAATTCAAACTTG-CTTATTTGGAATAAAATA
128 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAA-TTGTTTCT--ATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATA
* *
19797458 AAA-TGAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAA-TTTGGTTTAC
190 AAACT-AATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAATAACTAT-G-TTAC
* * * * * * *
19797521 CTAACCAGTTTAAATAATTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTT
250 C-GA-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCA-TTATGACCTTTT
* * ** * * * * * * *
19797585 TGTTTTGTCATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTTAGG
311 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * *
19797631 AATAAATTAATACTAATCT-GTTAATATTTCAAAAATTAAT-A--AA-AGATTTAAAAAATAAA-
1 AATAAAATAATACTAAT-TAATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
19797690 -TATTTATCAAACGAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATTTGTTTCAAAT-AGTTAT
64 CTATTTAT-AAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCA-TTAT
* * *
19797753 TA-CTTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG-CTTATAT-AGATTAAAA-A
127 AACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTAT-TCAGAATAAAATA
* * * * ** *
19797814 AATACTAATTTATTAATATTTCAACAATAAACAAGTAAAAATTTTTTAAAAATAAATATGTTTAC
190 AA-ACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGGA---TTTAAAAATAACTATG-TTAC
* * * * * *
19797879 TGAACTAGATCAAATAATCATGACT-TCTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAAC----
250 CG-A-TAG-TCAAATAATTATGACTAT-TTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTT
*
19797939 --TTTTGT--T-------TTG--TC-A-T-AT-AAAGCTTATTCGA
311 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* ** * *
19797968 AATAAAATAATACTAAGTT-ATCAATATTACGAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATGAAT
1 AATAAAATAATACTAA-TTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * * * *** *
19798028 CTTTTTGCTAAGCAACTTTAAATAATTATGACTATTTCAATC-ATTTTCTTTTTGAAATTGCTAC
64 CTATTT-ATAAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTT-AAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* **** * * **
19798092 AACTTTTTGTTTTGTCATAATTTGATTTTTTTTATTCATACAAGT-TTATTTTGAATAAAATAAT
127 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAA-
* ** * *
19798156 AA-GAATTTATTAATA--TAAAGATAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAAATAAATTTGTTTAC
191 AACTAATTTATTAATATTTAAA-A-AATTAATAAGT-AAGGATTT--AAAAATAACTATG-TTAC
* * * *
19798218 CGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTCAAATTC-TTATGA-CTTTC
250 CG-A-TAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAA-TCATTATGACCTTTT
* * * * *
19798280 TATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGCTTACTC-A
311 TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * * * * ** *
19798325 AACTACAATAATATTAATTTATGAATATTTCGACAATTAATAAGTAAAATTTTTAAGAAATAAAT
1 AA-TAAAATAATACTAATTAATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * * * **
19798390 ATGTTTTTTGAACAAGTACAAATAGTCT-TCACTATTTAAATAATTATCTATTTTAAATCATTGC
64 CT-ATTTATAAACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * *
19798454 GACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATATAAG-CTTATT-TGAAATAAAAT-
127 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTCTTATTCAG-AATAAAATA
* ** *
19798515 AATCTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAA-TAAGAGAATTAAAAAATGAATCTAT-TTA
190 AAAC-TAATTTATTAATATTTAAAAAATTAAT-AAGTAAG-G-ATTTAAAAAT-AA-CTATGTTA
* * * * * * *
19798578 CTGAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGA--TAT
249 CCG-ATA-G-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTC-AAATCATTATGACCT-T
* * * * * ***
19798640 TTTGTTTTGTCATAAAATAATTGGTTCTGTTCACGCAAGCTTATTTC-A
309 TTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTA-TTCGA
* * *
19798688 AATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA-TTTAAAAATAATAAGTAA-AAATTTAAAAAATAAATA
1 AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATTTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-
* * * * * * *
19798750 ATTTTTTTAAACACA-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATG
64 CTATTTATAAACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * *
19798814 ACCTTTTATATTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAAAG-CTTATAT-TGAATAAAATA
128 ACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACAAGTCTTAT-TCAGAATAAAATA
** * ** * *
19798877 ATGCTAATTTATTAAAATTCT-AAAAATTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTACT
190 AAACTAATTTATTAATATT-TAAAAAATTAATAAGT-AAGGATTT-AAAAATAACTATG-TTACC
* * * * * * * *** * *
19798941 AAGTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTTCGAATTGCTATGATC-TTTTG
251 GA-T-AG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTA
* * * * * *
19799005 TTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCACATAAGTTTATTCAA
313 TTTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* *
19799049 AATAAAATAATTCTAACTT-ATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTTAAAAAATAAA
1 AATAAAATAATACTAA-TTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAA
* * * * * * * * *
19799112 TTTGTTCATTGAACAAGTTCATATAGTTA-GATCCA-TT------TGAGCTA--TCAAATCGTTA
63 TCTATTTA-TAAACAAGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTAAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * ** ** * *
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126 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATAA
* * *
19799231 TA-TCAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAG--A-GATTTAAAAACTAAATCTAT-TTATCG
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* * ** * ** * * * * *
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252 -A--TAGTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTAT
* * * * * *
19799354 TTTGTCATAAAACAATTCTTTATATTCGTACAAGCTTAATT-GT
314 TTTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTT-ATTCGA
* * * * * *
19799397 AGTAAATTATTATTAAATTAA-TAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
1 AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * * *
19799461 GTATTTGCTGAACCAA-TTCAAGT-GATTAAGACTA-TTAGAATAATTATCTATTTCAAATCGTT
64 CTATTT-AT-AAACAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTA-AACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * * * *
19799523 ATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAA-TGTTT-TCAGCTCATGCATGT-TTATAC-GAAATAAA
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* * * ** **
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** * * * * * * *
19799647 TTTCGAACAAGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCT
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* * *
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* * * * * * *
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1 AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAA
* *** * * * * * * **
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* * * * * * * * *
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126 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGTCTTATTCAGAATAAAATA
* * * ** * *
19799949 ATATTAATTTATTAATATTTCAAATTTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCG
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* * ** * * *
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* * * *
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1 AATAAAATAATACTAA-TTAATTAATATT-TTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
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* * * * *
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* **
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190 A-A-ACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAGGATTTAAAAA-T-AACTATG-TTAC
* * *** * * ** *
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250 CG-AT-AG-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTT
* ** ** ** *
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* * * *
19800469 AATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCAAAAATTAATAAG--AGA-A-TTAAAAAATAAACC
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTT-TAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* ** * * * ** * *
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* * * * * * * * *
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* * * ** * * ** *
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* * * ** * *
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* * *
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1 AATAAAATAATACT-AATTAATTAATATTTT-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAAT
* * * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * *
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* * * * * * * *
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252 ATAG-TCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATATATTTCAAATCATTATGACCTTTTTATT
* * * * * *
19801141 TTGTTATAAAACAATTGTTTTTGTTTATACAAGCTTATTCG-
315 TTATCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
* * * * * * * * * *
19801182 ATTAAAACAATACTAATTTATTAATATTTCAACATTTAATAAGTAAAAAAATTAAAAAATAATTT
1 AATAAAATAATACTAATTAATTAATATTTTAA-AATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATC
* * * * * * * * *
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* * * * * * * **
19801310 TTATGACCTTTTGTTTTATCATAAAAGAA-GGTTT-TAGTTCATATTAAGCCCTTTTTGGGAATA
123 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA-CAAG-TCTTATTCAGAATA
* * ** *
19801373 AAATAATAGCTAATTTATT-ATAATCCAAAAATTAATAA-TAAGAGATTTAAAAAATGAA-TCTG
185 AAATAA-AACTAATTTATTAATATTTAAAAAATTAATAAGTAAG-GATTT-AAAAAT-AACTATG
** * * * *
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246 -TTACCG-ATA-G-TCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATATATTTCAAAT
19801490 TGCTATAACC
Statistics
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CAATTGTTTCTATTCATAAAAGCTTATTCGA
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19780319 G-A-TTTAAAAAATAAATATATTTGTCAAACTTGTTCAAATATTTAAAACTGTTAAAACAATT-T
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* * * * * * * ** **
19780381 TTTTTCAAATCGTTCTAACT-TTTTGTTTAGTCATAAAATAATTGTTT-TAGCTCATACTTGCCT
128 TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGTTT
* * * * ** *
19780444 ATTC-GAAATAAAATTATACTAATTTATTAACA-TTCAGGAAATTAATAAGCAAAAAATTAAAAA
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* * *
19780507 AAATAAATTAGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATATATTTAAA
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* * * *
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311 ATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATA
* * * *
19780636 AAATAATAT-T-ACTTATTAATATTTCAAAATTTGATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAAT-TAG
376 AAATAA-ATCTAATTTATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA-
* * * *
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* *
19780762 -CTTTTGTTTTGCCATAAAACAATTGTTTTTC-
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* *** * * *
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** *
19780857 AGGGGATTAAAAAAATAAATCTATTTACC---A-TTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTAT
64 AGAAGATT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
* * * * * **
19780918 ATATTTCAAATTCTTAT-AGTCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTCCGTTCATACAAGTTT
128 -TATTTCAAA-TATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTT
* * *
19780982 ATTCAAAATAAAATAATACT-ATTGTAATAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAA
191 ATTCAGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GATTT-AAAA
* * * * * * * * * *
19781046 ATAAATTTATTTG-ATGAACCAA-TTTAAATAGTTAAGGCTATATAAACAATTCTTTATTTCAAA
252 ATGAA--T-TTTGCCTG-A-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAA
* ** * * * * * *
19781109 TCGTTATGACCTTTCGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTAGTTCTTAGTAA-CTTA-TTCAGAAT
312 TCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-TAAGCTTATTTGA-AAT
* * * * * *
19781172 AAAATAAAACAAATTTATTAATATTTCAAAAAGTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAA--ATTATGT
375 AAAATAAATCTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
* * * ** ** *
19781235 TTATCGTATTAGTTTGAATAATTATGACTATTTGAGTAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCT
439 TTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC-
* * * *
19781300 TTTTCTTTTGTTATAAAATAAATGTTTT-T
503 TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
** * * * * * *
19781329 ATTCATTTAAGTTTGTTTGGAATAAAATAATGT--TAATTTATTCATATTTTGAAAATTAAGAAG
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAAT--TGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG
* * * * *
19781392 TA-ATAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACCAGTTCAATTAGTTACAATTATTTGAATAA
63 TAGA-AGA-TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* *
19781456 TTTTTTATTTCAAATCATTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATAC-A
124 -TTATTATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * *
19781519 GTCTGATTCAGAATAAAATAATGCTAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGTAATGGATTTA
187 GT-TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAACTAA-GGATTTA
* * * * * * *
19781584 AAAATGAACTTGTTGGCCTGACTAGTGCAAATAATTATGACTGTTTGAATAATTTTCTATTTCAA
249 AAAATGAA-TT-TT-GCCTGACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * ** *
19781649 ATCATTATGACCTTTTTATTTTATCACAAAGCAATTGTTTCTATTTGTAAAAGCTTATTTGAAAT
311 ATCATTATGACC-TTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAAT
* * *
19781714 AACATAAATCTAATTAATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
375 AAAATAAATCTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
* * * * *
19781779 TTATAGAATAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGGACAATTATCTATTTTAAATCACTATAACCT
439 TTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCT
* *
19781844 TTTGTTTTATCATAAAACAAGTTTTTTCT
504 TTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
**
19781873 ATTCATACAAGCTTATTTCAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAGACTATTAATAAGTA
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTA
* * *
19781938 GAAGATATAAAAAATAAATTTCTTTACCAAATAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAACTA
65 GAAGAT-TAAAAAATAAATCTATTTACC-AA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
* * * * *
19782003 CTTATTTCAAATAGTTGTGA-TATTTTATTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTCTCCATACAAGTT
127 -TTATTTCAAATA-TTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTT
* * * * * *
19782067 TAGTT-GGATTAAAATAATATTAATTTTTTAATATTTTAACAATTAATAATTAAAAGATTTTAAA
190 TA-TTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAACT-AAGGA-TTTAAA
* ** * * ** * *
19782131 AATAGATATATTTACCAAAAAAGTTTAAATAGTCCTAACAATTTG-ACTAATTATCTATTTAAAA
251 AAT-GA-AT-TTTGCCTGACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAAC-AATTATCTATTTAAAA
* * * * * * * * **
19782195 TCGTTATAACCTTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATAAATTCATATAGGCATATTAAAAATAA
312 TCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAA
* * * *
19782260 AAT-AATACTAATTTACTAATATTCCAAAA--AATAA-TAAGAGATTTAAAAAAAGAAACTATTT
377 AATAAAT-CTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTT
* * * * *
19782321 TTCGAACAAGTTCAAATAGTTGTGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
441 ATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTT
* * *
19782386 TGTTTTGTAATGAAAC-AA----TTGT
506 TGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * ** *
19782408 AAT-ATA-AA-TTTA-TT-AAT---A-T-T-CCAA-AAATTAATAAGTT--AAAATT--T---T-
1 ATTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATTGTACTAATTTATTAAT-ATTTAGAAAATTAATAAGTA
* ** * * * ** *
19782453 -AA-A--AATAAATATGT-TTTTTA--ACATGTTCAAATAGTTATGGCTATTTGAATAATTATCT
65 GAAGATTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT-T
* * ** * **
19782511 ATTTCAAATAGTAATGACT-TTTTATTTTGTCATAAGCCAATTGTTTCTGTTCATACAAGCATAT
129 ATTTCAAATA-TTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTTTAT
* * * * ** * * * * *
19782575 TCAAAATAAAATAGTATTAGTTTATTAATATTCCAAAAATTGATAAATAAAAGAGTTAAAAATAA
193 TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACT-AAGGATTTAAAAATGA
** * ** * * *
19782640 ATTTGTTTACTAAGCAAGTTCAAATAGTTATGACTGCTTGAACAATTATTTATTTTAAAT-AGCT
256 A-TT-TTGCCTGA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATCA-TT
* * * * * * * * *
19782704 ATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGTTTATTTGGAATAAAAT-A
317 ATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAA
* * * * * * *
19782768 ATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCA
382 AT-CTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTA-TA
* * * * * * ** * *
19782833 -AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTGAACAATTATCTATTTGAAATTGTTAAAACATTTTGT
444 GAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* *
19782897 TTTGTCATAAAAC--ATATGTTC-
509 TTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* ** * * * * *
19782918 ATGCA-A-AA--TTATTTAGAATAAAATAATATTGATCTATCAATATTTTGAAAATTAAT-A--A
1 ATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTA
* * * * * * *
19782976 G-AGA-TAAAAATTAAATATGTTTACAAAAATAGTTCAAATAGTTATGACCATTTGAACGATTAT
65 GAAGATTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAAA-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTAT
* * * * ** *
19783039 CTATCAT-AAATCGTTATG-GT-CTTTACTTTGTCATAAAACAATTGTTTCCT-TTCATACAAGC
128 -TAT-TTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGT
* * * ** *
19783100 TTATTCGGATTAAAATAATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAA
189 TTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GATTT---A
* * * ** ** * *
19783165 AAAATAAATGTGTTTG-CTAAAATAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAAAACAATGATCTATTTCA
249 AAAATGAA--T-TTTGCCTGACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
* * * * * ** *
19783229 AATTATTTTGACCTTTT-TGTTTAGTCATAAAAGAATTATTTCAGTTCATACGAGCTTATTTAAA
310 AATCATTATGACCTTTTAT-TTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19783293 ATAAAATAACTTTAATTTATTAATATTTGAAAAATTAA-AGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATA
373 ATAAAATAAATCTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* * * * * *
19783357 TGTTTATTGAACAAGTTTAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTTTCTATTT-AAAGTCGTTAT
436 TATTTATAGAATAAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTAT
* * * *
19783420 GACCTTTTATTTTGTCATAAAAC-AATTATTTCA
499 AACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** ** * * *
19783453 ATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACTACTTTACTAATACTTTA-AAAATTAATAAGC
1 ATTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATAAGT
* * * * **
19783517 A-AGAGATTTAGAAACTAAAGT-TGTTTTA-GAGCCAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
64 AGA-AGA-TTAAAAAATAAA-TCT-ATTTACCA-AAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * * * * * *
19783579 ATATGAATCTCAAATAGTTATGA-T-CTTTGTTTTCTCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATACA
124 TTAT-TATTTCAAATA-TTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACA
* * * *
19783641 AGCTTATTC-GAATAAAAGTAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-TGA-GATTTA
186 AGTTTATTCAGAATAAAA-TAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAACTAAGGATTT-
* * * * * * * * * *
19783702 AAAAATAAATGTGTTTGTC-GAAATAGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATATTTATTTATTTC
248 AAAAATGAA--T-TTTGCCTGACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA
* * * * * * * * *
19783766 AAATCGTTTTGGCCTTTT-GTTTAGTCATATAATAATTGTTTCAATTCACACAAGCTTATCTGAA
309 AAATCATTATGACCTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
* *
19783830 ATAAAAT-AATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAA
373 ATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATGAA
* * * * * * * **
19783893 TCTGTTTACCA-AATAAATTCAACT-CTTATGACTATTTGAACAATTATCCATTTAAAATTGTTA
434 TCTATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* *
19783956 TGACCTTTTGTTTTGTCA-AAAA-ATAATTGTTT-T
498 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-AATTTTTTCT
* * * ** * ** *
19783989 AGTTCACAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATGCTACCTTATTAATATTTCA-AAAGTTAATAAG
1 A-TTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG
* * ** * *
19784053 TTAG-AGATTTAAAAAATAAATCAAGTTACCAAATTAGTTCAAAT-GATTATGGCCATTGGAACA
63 -TAGAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAACA
* * * * * * * *
19784116 ACTACCTATTTCAAATTGTTATTACT-TTTTGTTTTGTCATAGAATAATTGTTTTTCA-ACATAC
123 ATTA-TTATTTCAAA-TATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATAC
* * * * * * *
19784179 AAGCTTATTCAAAATAAAATAACACTAATTTGTTAATATTTCAAGGATTAATAA--GA-GATTTA
185 AAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAACTAAGGATTTA
* * ** * * *
19784241 AAAAGTAAATCTATTTACCAAAACTAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTC
249 AAAA-TGAA--T-TTTGCC-TGACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA
** * * * ** * **
19784306 AAATTGTTATAACCTTATT-TTCTATCATAAAATAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAA
309 AAATCATTATGACCTT-TTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19784369 ATAAAAT-AATAGTAATTTAGTAATATTCTAAAAATTAATAACTAAGAGATTTAAAAAATAAAT-
373 ATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* ** * * * * * *
19784432 TCATTTGCT-GAACCAGTTCAAACAGTTAAGACTATATGAATAATTA-CATATTT-ACAATTATT
436 T-ATTT-ATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATC-TATTTCA-AATCATT
* * * * *
19784494 ATGACCTTCTATTTTGTCATAAAA-TAATTATTTC-
497 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* ** * *** * * *
19784528 AGCTCATACAAGCTTATTCGGAATAGAATAAAACTAATTTATTAATATCTCA-AAAATTTATATG
1 A-TTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATAT-TTAGAAAATTAATAAG
* * * * * * * * *
19784592 TA-AAGAGTTTAGAAAATAATTATATTTATCGAACCAGTTCAAATAATTATAACTAATTAAATAA
63 TAGAAGA--TTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * * * * * * * * *
19784656 TTATTTATTTCAAAATGTTATTA-TTTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTATTTTTGTTAATATAA
124 TTA-TTATTTC-AAATATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * *
19784720 GTTTGTTC-GAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTTAAAAAATTAATCAGTACGAGATCTA
187 GTTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAACTAAG-GATTTA
* * ** * * * *
19784784 GAAAATAAATCTGTTTACCAAACTAAGTT-AAATAGTTTTGACTATTTGAAAAATTATCAATTTT
249 -AAAATGAA--T-TTTGCCTGAC-AAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA
** * * * * * ** * *
19784848 AAATTGTTATAACCTTTTATTATGTCATAAAACAATTGGTTCTATTCATACT-ATTTTATTCGTA
309 AAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-TAAGCTTATTTGAA
* ** * * *
19784912 ATAAAAT-AATACTAATTTCA-TAATATTCCAAAACTTAATAAACAATAAAATTT-AAAAATAAA
373 ATAAAATAAAT-CTAATTT-ATTAATATTTCAAAA-TTAATAAGTAA-GAGATTTAAAAAATGAA
* * * * * * * * ** *
19784974 TTTAATTGTTGAACCAA-TTCAAATAGTTAAGACTATATGAATGATTATTTATTTCAAATCATTA
434 TCTATTTATAGAA-TAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * *
19785038 TGACCATTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTATTT-T
498 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * ** * * *
19785071 GTT-AGTACAAGCTTATTCAGATTAAAATAATAATAATTTAATAATATTTAAAAAAATTAATAAG
1 ATTCA-TACAAGCTTATTTA-AATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG
* * * * * *
19785135 TAAGAA-ATTTAAAAAATAAATTTGTTTACCAGATCAGTACAAATGGTTA-AGACTATTAGAACA
63 T-AGAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTACCA-A-AAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAACA
* * * *
19785198 ATTATCTATTTCAAGTCATT-TGAC-CTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTT-TAGTTCATAC
123 ATTAT-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
* * * * ** **
19785260 ATGCTTATTCAGAATAAATTAATACTAATTTAATCAA-ATTCAAAAAATGT-ATAAGAAAGAGAT
185 AAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTT-ATTAATATT-TTAAAAT-TAATAACTAAG-GAT
* ** * * * *
19785323 TTAAAAAAATAAATACGTTTATC-GAATAAGATCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGTCTA
246 TT--AAAAATGAAT---TTTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * * * * *
19785387 TTTAAAATTGTTAT-AAC-TTTATGATTTGTCATAAAATAGTTGTTTCAATTAATATAAGCTTAG
305 TTTAAAATCATTATGACCTTTTAT--TTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTAT
** * *
19785450 ACGAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTTCCTAAATTAATAAGTAAGACA-TTAAAAAA-
368 TTGAAATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * ** * * * * * *
19785512 AAATATGTTTACCGAATCAA-TTAAAATAATTGTGGCTATTTGAACGATTATCGATTTCAAATCT
431 GAATCTATTTATAGAAT-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * * *
19785576 TTATGACCTTTTGTTTTGTCATAACAC-AGTTATTTTTT
495 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTCT
* ** *
19785614 A-TCATACAAGTTTATTTGAAATAAAATAAT-CTCATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG-
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT
* ** *
19785675 AG-A-TTTAAAAAATAAAATCTATTTACCGAGCCAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATT
64 AGAAGATTAAAAAAT-AAATCTATTTACC-A-AAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
* * ** * * *
19785738 ATCAATCTCAAATCGCTAAGA-T-CTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTGA-TCATAGAAG
126 AT-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAG
* ** * * ** * *
19785800 CTTATTC-GGTTAAAAATAATAATAATTTAATAATATTCCAAAAATTAATGAGTAAGAGATTTAA
188 TTTATTCAGAAT-AAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GATTTAA
* * * * * ** * * *
19785864 AACATAAATGTGTTTG-TTGAACTAGTTTAAATAATTAAAACTATTAGAATAATTATCTA-TTCA
250 AA-ATGAA--T-TTTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
* * * * * * *
19785927 AATCATTTTGACCTTTT-TCTTAGTCATAAAATACTTGTTTC-ATATCTTACAAGCTTA-TTCAG
310 AATCATTATGACCTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAAT-TCATATAAGCTTATTTGA-
* * * * *
19785989 AATAAAAT-AATCCAAATTTATT-A-ACTTCAAAAAATTAATAA-TCAAAAGTTTTGAAAAAATA
372 AATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGT-AAGAGATTT-AAAAAATG
* ** * * *
19786050 AATCTATTTATTGAGCAAGTT-AAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATTTATTTAAAATCATT
432 AATCTATTTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATT
* * * * *
19786114 ACAATCTTTTGTTTTGACACAAAAC-AATTGTTT-T
497 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* ** * *
19786148 AGTTCATAAAAGCTTATCCAACATAAAA-TGACACTAATTTCTTAATATTTCA-AAAATTAATAA
1 A-TTCATACAAGCTTATTTAA-ATAAAATTG-TACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAA
* * * * *
19786211 G--GAAGAGTTTAAAAAAATAAATTTGTTTACTAAATAAATTCAAATAGTT-TGACTATTTGAAC
62 GTAGAAGA--TT-AAAAAATAAATCTATTTAC-CAA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* *
19786273 AATTCTATATTTAAAATCATTATGAC-ATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTT-TAATTCATA
122 AATTAT-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA
* * * * * *
19786336 CTAGCTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAATGATT
184 CAAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACT-AAGGATT
** * * *
19786401 TAAAAAGTGAATTTGTTTACTGA-ATCAGTTCAAATAATTAT-AGCCATTTCAACAATTATCTAT
247 TAAAAA-TGAA-TT-TTGCCTGACA--AGTTCAAATAGTTATGA-CTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * ** * * * * * *
19786464 TTCAAATCATTATTACTTTTTGTTTGGTCATATAATAATTGTTTTAAATCGTACAAGCTTATTTG
306 TTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTG
* * * * *
19786529 AAAT-AAATTAGTACTAATTTATTAATCTTTCAAAA--ATTAA-TAAGAGATTTAAAAAATAAAT
371 AAATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
* * * * * * * * * *
19786590 CTGTTTA-ACAA-ACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATCATATACTTGAAATCATTA
435 CTATTTATAGAATA--AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* ** * *
19786653 TAATCTTTTGTCCTATAATAAAAC-AATTATTTT-T
498 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTCT
* * * ** *
19786687 GTTCATACTAGCTTATTTGAGATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCA-AAAATTAATAAG-
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
19786750 AG-A-TTTAAAAAATAAAGTC-GTTTAACAAACCAATTTAAATAGTTATGACTATTTAAACAATC
64 AGAAGATTAAAAAATAAA-TCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
* * * * * * ** * * * * * ** *
19786812 GTGTACTTGAAATCGTTAT-AATCTTTTGTCCTATAATAAAACAATTATTTTTGTTCATACTGGC
126 AT-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGT
* * * ** *
19786876 TTATT-TGAAATAAAATAATACTAATCTAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGATATTTAAA
189 TTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GATTT-AA
* * * * * * ** * *
19786940 AAATAAATTTT--TTTAC-----CAAACCAATT-CGA--AAATGAAAAATTATCTATTTCAAATC
250 AAATGAATTTTGCCTGACAAGTTCAAA-TAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC
* * * * * *
19786995 GTTATGACCTTTTGTTTTGA-CATAAAA-AACT-ATTCAATTCATACT-AGCTTACTTGGAATAA
314 ATTATGACCTTTTATTTT-ATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATA-TAAGCTTATTTGAAATAA
* *
19787056 AATAAAAT-GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-ATTTCTAT
377 AAT-AAATCTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGA-ATCTAT
* * * * *
19787119 TTACCT-TACT-AGATCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATTC-TTATGA
439 TTA--TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAA
*
19787181 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-T
501 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * * * * *
19787212 GTTCATATAAGTTTATTCAGAAT-AAATTAATATTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAGG
1 ATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATT-GTACTAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATAAG
* * * * * ** *
19787275 TAGGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTCATGTCTATTTAAACAAT
63 TAGAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * * *
19787340 TATCTATTTAAAATTTTATGAC-CTTTTGATTTGTCATAAAACAATCT-ATTC-ATTCA-A-AA-
125 TAT-TATTTCAAATATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAAT-TGTTTCTATTCATACAAG
* * * *
19787399 -TTATTCAAAATTAAATAATA-TCAATCTATTAATATTTTGAAAATTAATAA--GA-GATTTAAA
188 TTTATTCAGAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAACTAAGGATTTAAA
* * * * * * *
19787459 AACTAAATATGTT-CATGAAAACAGTTTAAATAGTTATGGCTA-TTGAACAATTATCTATGTCAA
251 AA-TGAAT-T-TTGCCTG-ACA-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * * * * * * *
19787522 ATCGTTATGATC-TTTATTTTGTTATAAAACAATTGTTCCATTTCATACAAGC-TAATTCAAATT
311 ATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA-T
* ** * * *
19787585 AAAAT-AATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAATGTGTAAGAGATTAAAAAAAT-AA-GTG
375 AAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA
* * * * * * * * *
19787647 TTTGTCG-ATCTAGTTTAAATAGTTAAGACTA-TT--A-GA-TATATATTTCAAATCATTCTAAC
438 TTTATAGAAT-AAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
*
19787706 CTTTT-TTTTAGTCATAAAAC-AATTATTT-T
502 CTTTTGTTTT-GTCATAAAACAAATTTTTTCT
* ** * *
19787735 AGTTCATACCAGCTTATTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTT-GAAAAATTAATGAG
1 A-TTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAG-AAAATTAATAAG
* * * * ** * *
19787799 CA-ACATATTTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACAAGTTCAAATAGATT-TGACTATTTAAAC
63 TAGA-AGA--TTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAA-AAGTTCAAATAG-TTATAACTATTTGAAC
* * * * * *
19787862 AATTTTCTATTTAAAGATGTTATGAC-CTTTTGTGTTGTCATAAAATAATTGTTTC-AGTTCATA
122 AATTAT-TATTTCAA-ATATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATA
* *** * * * * * * *
19787925 AAAACCTGTTC-GAAATAAAATAATACTACTTTACTAATATTTCAAAAACTAATAAGTAAAAGAT
184 CAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAACT-AAGGAT
* * * * *
19787989 TTAAAAATTAAATCTGTTTACC-GAACTAGTTTAAATAGTTATGACTATTTGAGCAATTATCTAT
246 TTAAAAA-TGAA--T-TTTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * *
19788053 CTCAAATCATTATG-------ATCTT-T-GT-AAACAATTGTTTC--TCTCTATATAAGCTTATT
306 TTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAAT-TC-ATATAAGCTTATT
* * ** * *
19788106 T-AGAGTAAAAT-ATTGCTAAACTAATAATA-TTCTAAAATTAATAAGTGAGAGATTTAAAAAAT
369 TGA-AATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* * * * * * * * *
19788168 AAATGTGTTTTGTTA-AACCAA-TTCAAATAGTTAAGATTATTAGAACAATTATCTATTTCAAAT
431 GAATCT-ATTT-ATAGAA-TAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAAT
* * * ** * *
19788231 CATTCTGACCTTTTGCTTAATCATAAAA-TAATTGTTTC-
493 CATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* ** * * * *
19788269 AGTTCATA-ATGCTTATTTGAAATAAAATAATACTATTTTGTTAACATTTAGACAATTAATAAGT
1 A-TTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG-
* * * * *
19788333 TAGAA-ATTTAAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACAAATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAA
63 TAGAAGA-TT-AAAAAATAAATCTATTTA-CCAA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * * * * * *
19788397 TTACTTATTTCAAATCATTATGGC-CTTTTGTTTTATGATAAAACAATTGTTTCAATTCTTAAAA
124 TTA-TTATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * *
19788461 GCTTATCCAAAATAAAATAATATTACTTTATTAATATTTCAAAAATTGAA-AAGTTATA-GATTT
187 GTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATT-AATAA-CTA-AGGATTT
* ** * * * * *
19788524 AAAAAATAAATCAATTTATC-GA-ATCAGTTTAAATAATTATG-GTAATTGATCAATTATCTATT
248 -AAAAATGAAT---TTTGCCTGACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATT
* * * * * * * * *
19788586 TCAAATCATCATGAACATTTATTTTGTCATAAAATAATTTTTTTC-A-TCCTATAAGCCTATTTG
307 TAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAA-TTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTG
*** * *
19788649 AAATAAAAT-AATACTAATTT-TTAATATTTCAAAAATTAATGCTTAGGAGATTTAAAAAATAAA
371 AAATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA
* * * * * *
19788712 TCTGTTTACCA-AACT-AGTTTAAATAGTTATGTTCATATAAGCTT-ATTCAAAATAAAATAATA
434 TCTATTTA-TAGAA-TAAGTTCAAATAATTATG-AC-TAT----TTGA---ACAAT----T-AT-
* * ** ** * *
19788774 CTAATCTAATAAT-ATTATGAAAATTAATAACTAAGAGATT-T-AAAAAATAAATTTGTTTGCCT
482 CT-ATTTCA-AATCATTAT-AACCTT--T---T--G-TTTTGTCATAAAACAAATTT-TTT--CT
** * * * * **
19788836 AACCAGTTCAAATAG-TTAAGGTTATATGAATAATTAT-CT-ATTTCA--AATCA-TTATGACCT
1 ATTCA--T-ACA-AGCTT-A-TTTAAAT-AA-AATTGTACTAATTT-ATTAAT-ATTTA-GA-AA
* ** ** * * * *** * * * ** **
19788895 TTTGTTTTGTCGCA-A--AAAAAGTGTTTTTGTTCATA-TAAGTTTGTTCAGAATA-AAATAA-T
54 ATTAATAAGTAGAAGATTAAAAAATAAATCTATT--TACCAA--AAGTTCA-AATAGTTATAACT
** * * *** * * * * *
19788954 A-TT-AATTTATTAATATTTTGAAA-ATTA--A-TA-AGAG-ATT-T-AAAAAATAAATCTATT-
114 ATTTGAA-CAATTATTA-TTTCAAATATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGT-TTC
* * * * * * *
19789008 TA-CCAAACCAA-TTCAATT-AGTTATAACAGT-TTGAAC-AA-TTATT--TATTTCAAATCATT
176 TATTCATA-CAAGTT-TATTCAG-AATAA-AATAAT--ACTAATTTATTAATATTTTAAA--ATT
* ** ** * * * *
19789065 -ATGACCATTTGTTTTGTTATAAAAT-AGTTTTTTCTATTGATACAGTCTTATTCGAAATAAAGT
233 AAT-AAC-TAAG-GAT-TTA-AAAATGA-ATTTTGC--CTGACA-AG-----TTC-AAAT--AGT
* ** * * * ** * ** * *
19789128 AATG-CTAATTT-ATGAA-TATTCTA---AAAATTAATCAAT-AAC--AAATTTAAAAAATGAAT
281 TATGACT-ATTTGAACAATTA-TCTATTTAAAA-TCAT-TATGACCTTTTATTT-TATCATAAAA
** * * * * * ** ** *
19789184 CTGTTGGCTTGACCAATGCAAAT-AGTTTTGACTGTTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA-
341 CAATT-G-TT--TCAATTCATATAAG-CTT-A---TTTG-A-AATAAAATAAATCTAAT--TTAT
* * *** * * ** * *** * * **
19789247 TAACATTTTATTTTGTTATAAGACAATTG-TTTCTAATCCTACAAGCT-TGTT-CGGAATAACG-
393 TAATATTTCAAAAT-TAATAAG-TAAGAGATTT-AAAAAAT-GAATCTAT-TTATAGAATAA-GT
* * * ** * *
19789308 T-AATTCTAATTTATCAATATTATGAA-AATTAATAAGAGATTT-AAA-AATT-GAA---TTTG-
452 TCAA--ATAA-TTATGACTATT-TGAACAATT-AT---CTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGT
* * **
19789364 TTTATCA-AACAAGTTGAAATAGTTATGACT
509 TTTGTCATAA-AA---CAAAT--TT-TTTCT
* ** ** * * **
19789394 ATTTAAGTGATTA-CTTATTTCAAATCGCAATAACCTT-TTGT-TTTGTCATAAAATAATTTTTT
1 A-TTCA-T-ACAAGCTTATTT-AAAT---AA-AA--TTGTACTAATT-T-AT-TAAT-A-TTTAG
** * * ** * * * *
19789456 CTATTTATACAAGCTTATTTCA-ATTAAAATAATATAAATTTATTAATATTCAAACAATTAATAA
51 AAAATTA-ATAAG--TA--GAAGATT-AAA-AA-ATAAATCTATT--TA-CCAAA-AGTTCA-AA
* * * *
19789520 GTAAAAGGTTTAAAAAAACAACTCTATTT-ACCAAATAAATTCAAATAGTTACAACTATT-TGAA
103 -T---A-G-TT------ATAA--CTATTTGAAC-AAT-TATT---AT--TT-CAAATATTATG-A
* * ** ** *
19789583 CAATTATT-TATTTCAAATCATTATGACTTTTTGTTTTGTCAAAAAACAATGTTTTTCATACAAG
145 CTATT-TTGT-TTT---GTCA-TAAAAC-AATTG--TT-T-------C-----TATTCATACAAG
* * * * * * *
19789647 CTTATT-TGCATTAAAATAATATTAATTTATTAATATTTTGACAATTAATAAGTAAAAGATTTTA
188 TTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAACT-AAGGA-TTTA
** ** ** ** * * *
19789711 AAAACAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTACAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAA
249 AAAA-TGA-AT-TTTGCCTGACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * * * **
19789776 AT-TTTATGACATTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTC-ATT-AGTATAGGCTTATTCAAAA
311 ATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGT-TTCAATTCA-TATAAGCTTATTTGAAA
* *
19789838 TAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTCTGAAAATTAATAAGTAAGAGATATAAAAAATGAATCT
374 TAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
* * * *
19789902 ATTTACT-GAATAAGTTCGAATAGTTATGACTATTTGAACAATTTTCTATTTCAAATCATTATGA
437 ATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAA
*
19789966 CATTTTGTTTTGTCA-AAAA-ATAATTGTTTT-T
501 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACA-AATT-TTTTCT
* * * ** * *
19789997 ATTCATATAAACTTATTCCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCAAAAAATTAATAAG
1 ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATTGTACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAG
* * * * * * *
19790061 CA-AAAATTTAAAAAATAAATGTATTTTCTGAACACA-TTCAAATAGCTATGACTATTTGAACAA
63 TAGAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTAC-CAA-A-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAA
* * * *
19790124 TTATCTACTTT-AAATAGTTATGACCA-TTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATACA
124 TTAT-TA-TTTCAAATA-TTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
** * * ** *
19790187 AGCATATTCAAAATAAAATAATACTAGTTTATTAATATTCCAAAA--ATTAA-TAA-GATTTAAA
186 AGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAAATTAATAACTAAGGATTT--A
* * * *
19790248 AAAATAAATCTATTTACC-GAGCAAGTTTAAATAGTTATTATGCAC-ATTTGAACAATTATTTAT
249 AAAATGAA--T-TTTGCCTGA-CAAGTTCAAATAG---TTATG-ACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * * * * * * ** *
19790311 TTCAAAT-AGTTATGATCTTTTGTTTTTTCATAAAATAATTTTTTCTATTCTTACAATTTTATTC
306 TTAAAATCA-TTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTT
* * * * * *
19790375 AAAATAAAATAATTCTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAGGTAGGAGATTT-AAAAATAAA
370 GAAATAAAATAAATCTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAA
* * * * * * * * *
19790439 TCTATTTACCA-AACAAGTTCAAATAGTCATGTCCATTTAAATAATTATCTATTTTAAATC-TTA
434 TCTATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * * * *
19790502 TGACCATTTGTTTTTTAATAAAAC-AATTGTTTCT
498 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** * ** * * **
19790536 GTTCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATATTGATCCATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG-
1 ATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT
* * * * * * * *
19790599 AG-A-TTTAAAAACTAAATTTGTTTACCGAAATAGTTTAAATAGTTATGACTATGTGAGCAATTA
64 AGAAGATTAAAAAATAAATCTATTTACC-AAA-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTA
* * * ** * * **
19790662 TCTATCTCAAATCATTATGA-T-CTTTATTTCATCACAAAACAATT-TTT-TTTTCATACAAGCA
127 T-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGTT
** * * ** * *
19790723 TATTTGGATTAAAAT-A-ACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTACTAAGTAAGAGATTTAAAAA
190 TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GATTTAAAAA
* * * * * * *
19790786 -AAATGTGTTTG-TTAAACCAGTTCAAATAGTTAAGACTATTAGAA-AATTATCTATTTCAAATC
253 TGAA--T-TTTGCCT-GACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAATC
* * * * * *
19790848 -GTATGA-CTTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTTAATTCATACAAGCTTA-TTCAGAATA
314 ATTATGACCTTTTAT-TTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGA-AATA
* * * *
19790910 AAAT-AATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAAATTAATGAGCAAGAGATTTAAAAAA-AAATCTA
376 AAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC--AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTA
* * * * * * *
19790972 TTTATTGAACAAGTACAAATAGATT-TAAGTATTTGAAAAATTATCTATTT-AAAGTCGTTA-AA
438 TTTATAGAATAAGTTCAAATA-ATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAA-TCATTATAA
* *
19791034 CCTTTTGTTTAGTCATAAAA-TAATTTTTT-T
501 CCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * ** * * *
19791064 AGATCATAAAAACTT-TTCTGAAATAAAATAATACTACTTTGTTAATTTTTCA-AAAATTAA-AA
1 A-TTCATACAAGCTTATT-T-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAA
* * * *
19791126 --AGCAAG-TT-----AT-GA-CTATTTGAACAAATATCAATCTCAAATCA-TTATGATCTTTAT
62 GTAG-AAGATTAAAAAATAAATCTATTT--ACCAA-A--AGT-TCAAAT-AGTTAT-AAC--TA-
* * ** * * ** * * *
19791180 TTTCTCATAAAAAAATTATTTC---TGATCAT-ACAAGCTTATTTAG--ATAAAAATAATGCTAG
115 -TT-TGA-ACAATTATTATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCAT-AAAACAAT--T-G
* * * ** * * * * ***
19791239 TTTAATAGT-ATTCCAAAAATTAGTAAGAGATTTGAAA-AATA--AATATATT--TA-CCGAACC
172 TTT-CTATTCA-TAC-AAGTTTATTCAGA-A--TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA--
** * * * * * *
19791297 AATTCAAATAGTTAA-GACTATT-AGAAT--ATTTT---T--TAATTTCAAATTGTTTTGACTTT
229 AATT--AATAACTAAGGA-T-TTAAAAATGAATTTTGCCTGACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT
* ** * * ** ** * * * ** *
19791353 TTGTTTAGTCATAGAAT-AATTTTCAGTTCA-TACAAGCTTATTCTTAATAAAATAATACTAATT
290 TTG---A-ACA-ATTATCTA-TTTAAAATCATTATGACCTT-TTATT-TTATCATAAAAC-AATT
* * ** ** *
19791416 -TATTAATATTTGAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAA-AAAATAAAT-TTGTTTACTAAACA
346 GT-TTCA-A-TT----CA-T-ATAAGC---TTATTTGAAATAAAATAAATCTAATTTA-T-TA-A
* * * ** * * * * *
19791478 AATTTGAATAGTTATGACTATTTGAACA-ATTATCAATTTAAAATCATTATGACCTTTTGTTTTG
396 TATTTCAA-AATTA--A-TAAGT-AAGAGATT-T-AA---AAAATGA--AT---CTATT-TATAG
* * * * * * * * ** ** * **
19791542 TCATAA--ACAAGTACTGTATTAATATTTCAA-AAGTTA-ATAAGT-AAAAGATTTAAAAAAAAA
445 -AATAAGTTCAAATAAT-TATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCA-TT---ATAACC
* ** * * * * ** *
19791602 ATCAGTTTACTGAATCGGTTCAAA-TAATTATGGCC
503 TTTTGTTT--TG--TC--ATAAAACAAATTTTTTCT
* * * * ** * * * * * * * * *
19791637 ATTTAAATAA-C-TATCTATTTCAAATTGTTATTACCTTTCGTT-TTCTCATAAAACAATTGCTT
1 ATTCATACAAGCTTATTTAAATAAAATTG-TACTA-ATTT-ATTAATAT-TTAGAA-AA-T--TA
* * * * * * *
19791699 TTCAATATAAAAGCCTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTACTAATATTTCAAGA-A-TTAATA
58 AT-AA-GTAGAAG---ATT-AAAA-AATA-AAT-CT-ATTTACCAAAAGTTCAA-ATAGTT-ATA
** * *
19791762 AGAGATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAAGTAGTTCAAATAGTTATGACTATTTAAACAAT-T
111 A-CTATTT---GAA-CAAT-TA-TT-----A-T--TTCAAATA-TTATGACTATTT------TGT
* * ** * * *
19791826 ATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTTTTTTCTA-TCATAAAACAATTGTTTCTGTTCA-TATAAG
154 -T-T-TGTC--A----TAAAACAATTGTTTCTATTCAT---ACAA--G-TT-TATTCAGAATAA-
* ** * * * *
19791889 CTTATTTAGAATAAAAATAATACTAATTTAGTATTATTCTAAAAATTATTAACTAAGAAATTTAA
202 ---A---ATAATACTAAT-TTA-TTA---A-TA-T-TT-T-AAAATTAATAACTAAG-GATTT-A
* * * * ** * *
19791954 AAAATAAATCCATTTG-TTGAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTACATGAACAATTATTTATTTTA
249 AAAATGAAT---TTTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
** * * ** * * * **
19792018 AATTGTTATGACCTTTTGTTTTCTCATAAAACAATTGTCTT-TGTTGATATAAGTTTGTTCAAAA
310 AATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGT-TTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA
* * * * * *
19792082 TAAAAT-ATTACTAATTTATTAATATTTTAGAAAATTAATCAGTAAGAGGTTTAAAAAGTAAATC
374 TAAAATAAAT-CTAATTTATTAATA-TTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* ** * *
19792146 TGTTTACTA-AACCATTTC--A-AA-TA-G--T-TTTG-ACTATT-TCTATTTCAAATCATTATA
436 TATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * * ** *
19792200 A-CTTCTTATTTTGTCATCAAA-TAATTGGTCCT
500 ACCTT-TTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** * ** * * **
19792232 GTTCATACTATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTAATAATATTTCA-AAACTTAATAACC
1 ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT
* * * * * * * * *
19792296 ATGAAAATTAAAAAATAAATCTAATTGCTAAACCAATTCAAACAGTTAAAACTATATGAACGATT
64 A-GAAGATTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
* * * * * *
19792361 ATT-TGTTCCAAATTGTTGTGACCT-TTTTCTTTTGTCTTAAAATAGTTGTTT-TATTCATACAA
126 ATTAT-TT-CAAA-TATTATGA-CTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * *
19792423 GCTTT-TTCTA-ATTAAAATAATGCTAA-TTAATAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAGATATTT
187 G-TTTATTC-AGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-AAAATTAATAACTAAG-GATTT
* ** * * * * *
19792485 AAAAAATAAATTTGTTTACTGA-ATTAGTTCAAATAGTTAAGATTATTAGAATAATTATCCATTT
248 -AAAAATGAA-TT-TTGCCTGACA--AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * * * * **
19792549 GAAATCGTTCTGACCTCTTGTTTAATCATAAAACAATTGTTTCAATTTATACAAGCCTATTCAAA
308 AAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19792614 AT-AAATTAATACTAATTTAGTAACA-TTCGAAAATTAATAAGAAAGAGATTTAAAAAAATAAAT
373 ATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATGAAT
* * * * *
19792677 CTATTTA-ATGAACAAGTTCAAATAGTTATTACTATTTGAACAATTGT-TGATTTAAAATCATTA
435 CTATTTATA-GAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATCATTA
* *
19792740 TAACCTTTTGATTTGTCATAAAAC-AATTGTTTC-
498 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** ** * * *
19792773 AGTTAATACAAGCTTAGATGGAATAAAATAATACTAATTTATAAATACTTACTAAAA--AAGTAA
1 A-TTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTA-GAAAATTAA-TAA
* * * ** *
19792836 GTAAGAA-ACTTAAAAAATAAATCTATTTACCAAATTAGCTAAAATAATTATAGTTGTTTGAACA
62 GT-AGAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
* * * ** *
19792900 TTTATCTATTTCAAATGGTTATGAC-CTTTCATTTTGTCATAAAAC-ATTGTTT-TTTATCATAC
123 ATTAT-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTAT-TCATAC
* * * * *
19792962 AAGCTTATT-TGAAATACAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAACATTAATAAGTAAGAGATT
185 AAGTTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAAA-ATTAATAACTAAG-GATT
* ** * * * * * *
19793026 TAAAAAATAAATATGTTTACTAAACCATTTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAATTATCAATCT
247 T-AAAAATGAAT-T-TTGCCT-GACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * ** *
19793091 CAAATCGTTAAGA--TATTTGTTTTGA-CAGAAAACAATTGTTTTTGA-TCATA-AATCTTATTT
308 AAAATCATTATGACCT-TTTATTTT-ATCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATATAAGCTTATTT
** * * * *
19793151 G-GCTAAAA-ATAATACTAATTTAATAATATTTCAAAAATTAGTAAGTAAGAGATTTAAAAATTA
370 GAAATAAAATA-AAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATG
* * * ** * ** * *
19793214 AATGTGTTTGCCTAG-CCAA-TTCAAATAGTTAAAACTATTAGAATAATTAT-TAATTTCAAATC
432 AATCTATTT--ATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTCAAATC
* * * * * * **
19793276 GTTTTGACCCTTTGTATAT-TCATAAAATATTTTTTTTC-
494 ATTATAACCTTTTGT-TTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** * * * *
19793314 ATATCTTACAAGCTTATTTGGAATAAAATAAT-CTTAAATTATTAACATTCAAAAAATTAATAAG
1 AT-TCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTAC-TAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG
* * * * * * *
19793378 -AAAATAATTTGAAAAAATAAATTTGTTTACTGAACAAGTTCAAATAGTGATGACTATTTGAACA
63 TAGAA-GA-TT-AAAAAATAAATCTATTTAC-CAA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
* * * * * *
19793442 TTTATTTATTTAAAATCATTATGAC-CTTTTGATTTGACATAAAACAATTGTTTC-AGTTCATAA
123 ATTA-TTATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATAC
** * * * * * *
19793505 AAACTCATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAACAATTTAAAAATTAAT---TAA--A--T-
185 AAGTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAA-TATTTTAAAATTAATAACTAAGGATTTA
* * * * * * *
19793562 AAAGT-TA-TTT-ACTAAACAAATTCAAATTGTTATGACTATTTGAACAATTGTCTATTTAAAAT
249 AAAATGAATTTTGCCT-GACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAAAT
* * * ** * **
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313 CATTATGACCTTTT-ATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAA
* * *
19793688 AAT-AATACTAATTTA-TATATATTCCAAAAATTAATAAGT----GATTTAAAAAGTGAATCTGT
377 AATAAAT-CTAATTTATTA-ATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTAT
* * * * * ** *
19793747 TTACT-GAATCAGTTCAAATAATTATGGCCATTTCAACAATTATCAATTTCAAATTGTTATCACC
439 TTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACC
* * *
19793811 TTTTGTTTAGTCATATAA-TAATTGTTTT-T
503 TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTCT
* * * * ** * *
19793840 AATCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATT-A-ATTTACAAAAATTAATAAGT
1 ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTA-GAAAATTAATAAGT
* * * * * * *
19793903 -GAGAGATTTTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTTAAAAAGTTATGACTATTTGGAT
64 AGA-AGA----TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAAC
* * * * * * * *
19793967 AATTGCA-TACTTCAAATCATTATAACT-TTTTATTCTATCATAAAACAATTACTTT-TGTTTAT
122 AATT--ATTATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATT-GTTTCTATTCAT
* * ** * * *
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183 ACAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GA
* ** * * * *
19794093 TTTAAAAAAT-AAATTTGTTTGTCAATGTAGTTCAAATAGTTAAGACGATATGAACAATTATCTA
245 TTT-AAAAATGAATTTTGCCTGAC-A---AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTA
** * * *
19794157 TTCCAAATC---AT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACT-AGCTTAT
305 TTTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAAC-AATTGTTTCAATTCATA-TAAGCTTAT
* * * * * ** *
19794213 TCGAAATAAAATAAAAT-GAATTCAATAATATTTTAAAAATTAATTTGTAAGAGATTTAAAACAT
368 TTGAAATAAAAT-AAATCTAATTTATTAATA-TTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT
* *** ** * * *
19794277 -AATTCTGTTTACCTAACCAGCTCAAATAATTATGATTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA
431 GAA-TCTATTTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA
* * *
19794341 CTATTACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATGTTTT-T
495 TTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * * * **
19794378 GTTCATATAAGTTTGTTCAAAATAAAA-TAAATCTAATTTATTAATATTTTA-AAAATTAATAA-
1 ATTCATACAAGCTTATT-TAAATAAAATTGTA-CTAATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATAAG
* * * * * * *
19794440 TAG-A-TTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACTAGTTCAAAAAGTTATGACTATTTGAGCAGTT
63 TAGAAGATTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
* * * * * * * ** * * * * **
19794503 ATTTATTTCAAATTGTTATGA-TTTTTTGTTCTATTACAAGACAATAATCTCTGTTGATAAAAAC
126 A-TTATTTCAAA-TATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGT
* * * **
19794567 TTATTTA-AATTAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATTAATAAGTAAAAAATTTTAA
189 TTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAACT-AAGGA-TTTAA
* * * * * * * * * *
19794631 AAATAAATATGTTTACC-AATCTAGATCAAATAGTCATAACTATTTGAATAAGTAT-TCATTTCA
250 AAAT-GA-AT-TTTGCCTGA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCT-ATTTAA
* * * * * * *
19794694 AATCATTATAACTTTTTGTTTTATCATAAAA-AATTACTTT-AGTTTATATCAA-CTTATTCGAA
310 AATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATT-GTTTCAATTCATAT-AAGCTTATTTGAA
* * * *
19794756 ATAAAATAATAT-TAAGTTATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTAGAGATTTAAAAAATGAATC
373 ATAAAATAA-ATCTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* * * * * **
19794820 TGTTTATCGAACAAGTTTAAATAATTATGACTATTTGAA-AATTTATCTATTTGAAATCGCTATA
436 TATTTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAA-TTATCTATTTCAAATCATTATA
* ** ** *
19794884 ACTTTTTGTTTTGTCACCAAATGATTTTTTTCT
500 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** * *
19794917 ATT-AGTACAAGTTTATTTCAAATAACATAATAC-AATTTATTAATATTAAGAAAATTAAT-AGG
1 ATTCA-TACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGT
* * * ** * * *
19794979 CGAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATCTTTATCACTAATCGAACAAT
64 AGAAGA-TT-AAAAAATAAATCTATTTACC-AA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* *
19795044 TATTTATTTCAAATTGTTATGACT-TATTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
125 TA-TTATTTCAAA-TATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * * * * *
19795108 CTTATT-TGCATTAAAATAATAGTAATATATAAATATTTTGACAAA-TAATAAGTAAAAGATTTA
188 TTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTT-A-AAATTAATAACT-AAGGATTT-
* * * * *
19795171 AAAAATAAATATGTTTACC-GAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAATAATTATCTATTTC
248 AAAAAT-GA-AT-TTTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA
* * * * *
19795235 AAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTTTTTG-AA
309 AAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
19795299 TAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATTAGTGAGAGAATTAAAAAATTAATCT
374 TAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
* * * * * * * *
19795363 ATTTACTA-AACATGTTCAAATAGTTATGACTATCT-AGATAATTATTTATTTCAAAACATTATG
437 ATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGA-ACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
*
19795426 ACC-TTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGGTTT-T
500 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTTCT
* * * ** *
19795457 GTTCATGCAAGCTTATTTCAAATACAATAATA-TAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAATAAG
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACT-AATTTATTAATATT-TAGAAAATTAATAAG
* * * *** * * * *
19795520 TA-AAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACTA-TTCAAATAGTCATGACTATTTGAATAAT
63 TAGAAGA-TTAAAAAATAAATCT-ATTTACCAA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * *
19795583 TATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGTTTTTGTTCATA-AAG
125 TAT-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * ** ** **
19795646 CTTATTCGGAATAAAATAATAATAATTTATTTAA-ATTCCAAAAATTAATAGGTAAAACATTTAA
188 TTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTA-TTAATATT-TTAAAATTAATAACT-AAGGATTTAA
* * * * * * *
19795710 AAGAAGTAATCTATTTACC-AAGCTAGTTCAAATAGTTATGACT-TTTGAATAATTATTTATTTC
250 AA-ATG-AA--T-TTTGCCTGA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA
* * * * * * * ** **
19795773 AAATCGTTATGATCTTTTTTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCGTACAATTTTATTCAAAA
309 AAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA
* ** * *
19795838 TAAAAT-AATACTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATAT
374 TAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
* * ** * * * * * * ** **
19795902 GTTCAGCGAACAAGTTTAAATAGTTATGTCCATTTGAGCTGTTATCTATTTCAAATGGTTATAAC
437 ATTTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAAC
* * * * * *
19795967 ATTTTGTTTT-ACTGTAAAA-TAATTATTTCC
502 CTTTTGTTTTGTC-ATAAAACAAATTTTTTCT
* ** * ** *
19795997 ATTGATACAAATTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTCA-AAAATTAAT-A--
1 ATTCATACAAGCTTATTTA-AATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT
* * * *
19796058 A-AAGACTT-AAAAATCAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGACTACTTCAACAAT
64 AGAAGA-TTAAAAAAT-AAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * * * * *
19796121 TACATATATCAAATTGTTATGA-T-CTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTCTGTTCATACAAG
125 TA-TTATTTCAAA-TATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAG
* * * * ** * *
19796184 CTTATTC-GAAGTAAAATATTA-TGAAATTAATAATATTCCAAAAATCAATAAGTAAGAGATTTA
188 TTTATTCAGAA-TAAAATAATACT-AATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GATTTA
** * * * * * ** * *
19796247 AAAA-GCAAATGTGTTTGCCAAACCAGCTCAAAT-GTGAGGACTAGTAAAATAATTATCTATTTT
249 AAAATG--AA--T-TTTGCCTGACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTA
** * * * * * * * * *
19796310 AAATTGTTCTGACCTTTTA-TTTAGTCATAGAATAATTTTTTCAGTTCATACATGCTTAGTCGAA
309 AAATCATTATGACCTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * *
19796374 ATAAAAT-AATGCTAATTTATTAACATTTAGAAAATTAATAAATAAGAAATTTTAAAAAAATAAA
373 ATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTT-CAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATGAA
* * * ** * * ** *
19796438 TATGTTTACCA-AATAAGTTCAAATAGCTATGATTATTTGAACTATTATCTATTT-ATAAGAAGT
434 TCTATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCA-AATCATT
* * * * * ** *
19796501 ATGACCTTTCGCTTTATCACAAAA-TGATTGTTTC-
497 ATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** * * * *
19796535 AGTTCATAAAAGCTTATCTAAAATAAAATAATATTACTTTCTTGATATTTCA-AAAATTGAA-AA
1 A-TTCATACAAGCTTAT-TTAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATT-AATAA
* * * * * ** *
19796598 GATA-AAGATTGAAAAAATAAGTCAATTTATCAAATCACTTCAAATAATTATGGCTATTTAAACA
62 G-TAGAAGATT-AAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
* * * *
19796662 ATTATCTCTTTCAAATCATTATGA--ACTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTCATT-ATA
123 ATTAT-TATTTCAAAT-ATTATGACTA-TTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATA
** * * *
19796724 CAAGCCTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAAAGAT
184 CAAGTTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAACT-AAGGAT
* * * * *
19796788 TTATTAAATAAATCTATT---T-AC-CG---AACTAATT-T--CTATTTGAACAATTATCTATTT
246 TTA-AAAATGAAT-T-TTGCCTGACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* * * * * * *
19796842 TAAATCATTATAACCCTTTT-TTCTATTATAAAATAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGG
308 AAAATCATTATGA-CCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGA
* * * * * *
19796906 AATAAAAT-AATACTAATTTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGATATTTAAAAAATAAAT
372 AATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
* ** ** * * * **
19796970 CTGTTTATCA-AAGCAGTTCAAATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTA
435 CTATTTAT-AGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT-CAAATCATTA
** * * **
19797034 TGGCCTTTTGTTTGGTCATATAA-AAATTTTTTGG
498 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * ** * *
19797068 A-TCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTCA-AAAATTAATAACT
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAGT
* * * *
19797131 AAGAA-ATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATTAGTTTAAATA--AATAACTATATGAACAA-
64 -AGAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTACC-AA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * * * * * * *
19797192 TAGTAAACTACAAATCATTATAAC-CTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATTTTTGTTCATACAA
125 TA-T-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * ** * *
19797256 GCTTATTCAAAATAAAATAATATTGATCTAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGGGAATTAA
187 GTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAA-GG-ATTTA
* * * * * * *
19797321 AAAATAAATTTGTTTG-CTGAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAATAATTATCTATTTCA
249 AAAATGAA--T-TTTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
* * * * * *
19797385 AATCGTTATAACCTTTT-GTTTAGTCATAAAATAAGTT-TTTCTGAATTCAAACT-TGCTTATTT
310 AATCATTATGACCTTTTATTTTA-TCATAAAACAA-TTGTTTC--AATTCATA-TAAGCTTATTT
* *
19797447 GGAATAAAATAAAAT-GAATTTATTAATATTTCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-A
370 GAAATAAAAT-AAATCTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGA
* * *** ** * * * *
19797510 ATTTGGTTTACCTAACCAGTTTAAATAATTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGT
433 ATCT-ATTTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCA-T
* **
19797574 TATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACGTTTT-T
496 TATAACC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * * *
19797611 GTTCATATAAG-TT-TGTTAGGAAT-AAATTAATACTAATCTGTTAATATTTCA-AAAATTAAT-
1 ATTCATACAAGCTTAT-TTA--AATAAAATT-GTACTAATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATA
* * * *
19797671 A--A-AAGATTTAAAAAATAAA--TATTTATCAAACGAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCA
61 AGTAGAAGA-TTAAAAAATAAATCTATTTACCAAA--AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACA
* * * *
19797731 ATTATTTGTTTCAAATAGTTATTACT-TGTTGTTTTGTTATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
123 ATTA-TTATTTCAAATA-TTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACA
* * * * * * * **
19797795 AGCTTATAT-AGATTAAAAAAATACTAATTTATTAATATTTCAACAATAAACAAGTAAAAATTTT
186 AGTTTAT-TCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTTAA-AATTAATAACTAAGGA---T
* ** * * * * * *
19797859 TTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAATCATGACT-TCTTTAATAATTATCTATT
246 TTAAAAATGAAT-T-TTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGTTATGACTAT-TTGAACAATTATCTATT
* * * *
19797923 TCAAATCATTATGAAC-----TTTTGT--T-------TTG--TC-A-T-ATA-AAGCTTATTCGA
307 TAAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGA
* * * *
19797968 AATAAAAT-AATACTAAGTTATCAATATTACGAAAATTAAT-A---AGAGACTTAAAAAATGAAT
372 AATAAAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAAT
* * ** * * * * * * ***
19798028 CTTTTTGCTA-AGCAACTTTAAATAATTATGACTATTTCAATC-ATTTTCTTTTTGAAATTGCTA
435 CTATTT-ATAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTCAAATCATTA
* * **** *
19798091 CAACTTTTTGTTTTGTCAT-AATTTGATTTTTTTT
498 TAACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * ** ** ** *
19798125 ATTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAAGAATTTATTAATATAAAGATAATTAATAAGTA
1 ATTCATACAAGCTTA-TTTAAATAAAATTGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGTA
* * * * * *
19798190 AAACATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTCAAAT-CTTATGACTATTTGAACAATT
65 GAAGA-TT-AAAAAATAAATCTATTTACC-AA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATT
* * * * * *
19798254 ATTTATTTCAAATTCTTATGACT-TTCTATTTTGTCATAAAATAATTATTTCTATTCATACAAGC
126 A-TTATTTCAAA-TATTATGACTATTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGT
* * * * * * * *
19798318 TTACTCA-AACTACAATAATATTAATTTATGAATATTTCGACAATTAATAAGTAA-AATTTTTAA
189 TTATTCAGAA-TAAAATAATACTAATTTATTAATATTT-TAAAATTAATAACTAAGGA--TTTAA
* *** * * * * *
19798381 GAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTACAAATAGTCT-TCACTATTTAAATAATTATCTATTTTA
250 -AAATGAAT-T-TTGCCTG-ACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAA
** * * * *
19798445 AATCATTGCGACCTTTTGTTTTGTAATAAAACAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTATTTGAAAT
310 AATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAAT
* *
19798510 AAAAT-AATCTTAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATGAA-TAAGAGAATTAAAAAATGAATCT
375 AAAATAAATC-TAATTTATTAATATTTC-AAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCT
* * * * * * *
19798573 ATTTACT-GAACATGTTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATG
437 ATTTA-TAGAATAAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTC-AAATCATTATA
** * **
19798636 ATATTTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGGTTCT
500 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* ** **
19798668 GTTCACGCAAGCTTATTTCAAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATATTTA-AAAA-TAATAAGT
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACT-AATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAGT
* * *** * * *
19798730 A-AAAATTTAAAAAATAAAT-AATTTTTTTAAACACATTCAAATAGTTATGACTATTTGAATAAT
64 AGAAGA-TTAAAAAATAAATCTA-TTTACCAAA-A-GTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * * *
19798793 TATCTATTTCAAATCGTTATGAC-CTTTTATATTTGTCATAAACCAATTGTTTCTATTCATAAAA
125 TAT-TATTTCAAAT-ATTATGACTATTTTGT-TTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCAT-ACA
* * * * **
19798857 AGCTTATATT--GAATAAAATAATGCTAATTTATTAAAATTCTAAAAATTAATAAGTAAAATATT
186 AG-TT-TATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACT-AAGGATT
* ** * ** * * * *
19798920 TAAAAAATAAATATGTTTACTAAGTGAGTTTAAATAGTTATGACTATTTAAATAATTATTTATTT
247 T-AAAAATGAAT-T-TTGCCTGA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
** *** * * * ** * * **
19798985 CGAATTGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTTTATTCACATAAGTTTATTCAAA
308 AAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * * *
19799050 ATAAAATAATTCTAACTTATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTTAAAAAATAAATT
373 ATAAAATAAATCTAATTTATTAATATT-TCAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* * * * * * * * * *
19799114 TGTTCATTGAACAAGTTCATATAGTTA-GATCCATTTG-------AGCTA--TCAAATCGTTATG
436 TATTTATAGAATAAGTTCAAATAATTATGA-CTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATA
* * ** *
19799169 ACATTTTGTTTTCTTGTAAAAC-AATTGTTTCT
500 ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
** **
19799201 ATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATTTCA-AAAATTAATAAG
1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACT-AATTTATTAATATTT-AGAAAATTAATAAG
* * * ** ***
19799264 -AG-A-TTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAA-TTTTAATAGTTATGGTTATTTGAACAAT
63 TAGAAGATTAAAAAATAAATCTATTTA-CCAA--AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * *
19799325 TATCTATCTCAAATCATTAT-A--ATCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTTTATATTCGTACAA
125 TAT-TATTTCAAAT-ATTATGACTAT-TTTGTTTTGTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAA
* * * * * * * * * *
19799387 GCTTAATT--GTAGTAAATTATTATTAAATTAATAGTATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT
187 G-TTTATTCAG-AATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TTAAAATTAATAACTAAG-GATTT
* * * * *
19799450 AAAAAATAAATGTATTTG-CTGAACCAA-TTCAAGT-GATTAAGACTATTAGAATAATTATCTAT
248 -AAAAATGAA--T-TTTGCCTG-A-CAAGTTCAAATAG-TTATGACTATTTGAACAATTATCTAT
* * * * ** ** * * *
19799512 TTCAAATCGTTATGACCTTTT-GTTTAGTCATAAAATAA-TGTTTTCAGCTCATGCATGTTTATA
306 TTAAAATCATTATGACCTTTTATTTTA-TCATAAAACAATTG-TTTCAATTCATATAAGCTTATT
* * ** * *
19799575 CGAAATAAAAT-AATACTAATTTATTAACA-TTCAAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAAT
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* * * * * * * *
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* * * * *
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* * * ** * * *
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* * ** * * ** *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * ** *
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245 TTT-AAAAATGAATTTTGCCTGACAAGTTCAAATAGT-TATGACTATTTGAACAATTATCTATTT
* ** * * * * * * * * * *
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308 AAAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAA
* * * * *
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373 ATAAAATAA-ATCTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATC
* * * * * * **
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436 TATTT-ATAGAATA-AGTTCAAATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTAT
* * * * *
19800236 AGACATGTTGTTTTGTCATAAAA-TAATTGTTTCA
499 A-ACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * **
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1 ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAAT--TGTACTAATTTATTAATATTTAGAAAATTAATAAG
* * * * * * ** * ***
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63 TAGAAGATTAAAAAATAAATC-TATTTACC-AA-AAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAT
* * * * * ** *
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125 TAT-TATTTCAAA-TATTATGACTATTTTGTTTTGTCATA-AAACAATTGT-TTCTATTCATACA
* * * * * * *
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* * ** ** * * ** * *
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249 AAAATGAA--T-TTTGCCTGACAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTAAA
* * * * * * * * *** * **
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311 ATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATA
* * * * * * * * *
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376 AAATAAAT-CTAATTTATTAATATTTC-AAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATGAATCTA
** * * ** * ** *
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* * *
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501 CC-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTTCT
* * * ** *
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1 --ATTCATACAAGCTTATTT-AAATAAAATTGTACT-AATTTATTAATA-TTTAGAAAATTAATA
* * * * * * * *
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* * * *
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* * *
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187 GTTTATTCAGAATAAAATAATACTAATT-TATTAATATTTT-AAAATTAATAACTAAGGATTT-A
* ** * * * * * *
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249 AAAATGAAT-T-TTGCCT-GA-CAAGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAA-CAATTATCTATTTA
* ** * * * *** * * * *
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309 AAATCATTATGACCTTTTATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAA
* * * * *
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AAGATTAAAAAATAAATCTATTTACCAAAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATTAT
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TATTTTATCATAAAACAATTGTTTCAATTCATATAAGCTTATTTGAAATAAAATAAATCTAATTT
ATTAATATTTCAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATGAATCTATTTATAGAATAAGTTCAA
ATAATTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCATTATAACCTTTTGTTTTGTCATAAAA
CAAATTTTTTCT
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*
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* * *
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* * * * ** *
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* * * *
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AACAATTGTAATATA
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19782404 TTGTAATATA
* * ***
19782414 AATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTTAA-A-ATTTTAAAAATAAATATGTTT-TTTAACA
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** * * * *
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* * * * * * * * *
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** * * * * * *
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* * * ***
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* *
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* * * * * * *
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65 GTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTTGTC
* * * *
19782903 ATAAAAC-ATATG-TTC-ATGCA-A-AA--TTATTTAGAATAAAATAATATT
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* * * * * *
19782948 GATCTATCAATATTTTGAAAA-T--TAA-TAAGAGA--TAAAAATTAAATATGTTTA-CAAAAAT
1 AATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA-
* * * *** **
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** *
19783069 TCATAAAACAATTGTTTCCT-TTCATACAAGCTTATTCGGATTAAAATAATACT
128 TCATAAAACAATTGTTT-CTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * *
19783122 AATTTAATAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAAATAAATGTGTTTGCTAAA-
1 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT--AAAAAATAAATATGTTTACCAAAC
** ** * ** * *
19783186 ATAGTTCAAATAGTTAAAACTATTAAAACAATGATCTATTTCAAATTATTTTGACCTTTTTGTTT
63 A-AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACC-TTTTGTTT
* * * * * *
19783251 AGTCATAAAAGAATTATTTC-AGTTCATACGAGCTTATTTAAAATAAAATAACT-TT
126 TGTCATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAA-TACT
***
19783306 AATTTATTAATATTTGAAAAATTAA-AGAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTATTGAACA
1 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATA-AGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * *
19783370 AGTTTAAATAGATT-TGACTATTTGAACAATTTTCTATTT-AAAGTCGTTATGACCTTTTATTTT
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* * * * *
19783433 GTCATAAAACAATTATTTCAATTCATAAAAACTTATCCAAAATAAAATAATACT
127 GTCATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATACT
* * * * * * *
19783487 ACTTTACTAATACTTTAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTAGAAACTAAAGT-TGTTTTA--GAGC
1 AATTTATTAATA-TTTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAA-TATG-TTTACCAAAC
* * * ** * * * * *
19783549 CAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAAATATGAATCTCAAATAGTTATGATC-TTTGTTTTC
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* * *
19783613 TCATAAAATAATTGTTTTTGA-TCATACAAGCTTATTC-GAATAAAAGTAATACT
128 TCATAAAACAATTGTTTCT-ATTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAA-TAATACT
* * * * *
19783666 AATTTAATAATATTTCAAAAATTAAT-A-T--GAGATTTAAAAAATAAATGTGTTTGTCGAAA-T
1 AATTTATTAATATTT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATATGTTT-ACCAAACA
* * * * * * * ** *
19783726 AGTTCAAATAATTAAGACTATTAGAATATTTATTTATTTCAAATCGTTTTGGCCTTTTGTTTAGT
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* * * * *
19783791 CATATAATAATTGTTTCAATTCACACAAGCTTA-TCTGAAATAAAATAATACT
129 CATAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACT
* * * *
19783843 AATTTATTAATATTCAAAAAATTAATAAGCAAGAGATTTGAAAAAATAAATCTGTTTACCAAATA
1 AATTTATTAATATT-TAAAAATTAATAAGTAAGAGATTT-AAAAAATAAATATGTTTACCAAACA
* * * * * * *
19783908 AATTCAACT-CTTATGACTATTTGAACAATTATCCATTTAAAATTGTTATGACCTTTTGTTTTGT
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* * * * *
19783972 CAAAAAATAATTGTTT-TAGTTCACAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATGCT
129 CATAAAACAATTGTTTCTA-TTCATACAAGCTTATTC-AAAATAAAATAATACT
** * * * **
19784024 ACCTTATTAATATTTCAAAAGTTAATAAGTTAGAGATTTAAAAAATAAATCAAG-TTACCAAATT
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* * * * * * * *
19784088 AGTTCAAAT-GATTATGGCCATTGGAACAACTACCTATTTCAAATTGTTATTACTTTTTGTTTTG
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* * * * *
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19784205 AATTTGTTAATATTTCAAGGA-T--TAA-TAAGAGATTTAAAAAGTAAATCTATTTACCAAAACT
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* * * *
19784266 AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACCTTATT-TTCTA
64 AGTTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTT-TTGTTTTG
* * *
19784330 TCATAAAATAATTGTTT-TGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATAGT
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* * * * ** *
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** * *
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* * * * * *
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** * * * * *** *
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*
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* * * * * *
19789231 CTATTTCAAATCATTATAACATTTTATTTTGTTATAAGACAATTGTTTCTAATCCTACAAGCTTG
124 CTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAAAAAACAA-TGTTT-T--TCATACAAGCTTG
** * * *
19789296 TTCGGAATAACGTAAT-TCTAATTTATCAATATTATGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAATTGAA
185 TTCGGAATAAAATAATAT-TAATTTATTAATATTTTGAAAATTAATAAGAGATTTAAAAA-TAAA
* * * * * ***
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* *
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312 TGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTA-T
* *
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* ** ** **
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* * * *
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124 CTATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAAAAAACAATGTTTTTCATACAAGCTTGTTCG
* * * *
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* *
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249 ATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTATG
** * *
19789784 A-CATTTTGTTTCATCATAAAACAATTGTATTC-AT
314 ACCA-TTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTAT
* *
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1 TA-TACA-GCTTATTC-AAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-
* * * * *
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* * * *
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125 TATTTCAAATCATTATGACATTTTGTTTTGTCAAAAAACAA-TG--TTT-TTCATACAAGCTTGT
** * *** *
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186 TCGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TTGAAAATTAATAAG---AGATTT-AAAAATA
* * * * * * *
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246 AATATGTTTATC-AAACA-AGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTA-TTTCAAATC
** *
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308 A-TTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTAT
* * *
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1 T-ATAC-AGCTTATTC-AAATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAA
* * * * *
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62 AATTT-AAAAAATGAATCTATTTACTGA-AAAATTCAAATAG---TTATG-ACTATTTGAACAAT
* * * *
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** * ** * *
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* * * * ** * * * *
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239 AAAAATAAATATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATAACTATTTGAATAATTATTTATTTCA
* * * * *
19790495 AATC-TTATGACCATTTGTTTTTTAATAAAACAATTGTTTCTGT
304 AATCATTATGACCATTTGTTTTGTCATAAAATAATTTTTTCTAT
* ** * * **
19790538 TCATGCAAAATTATTCAGAATAAAATAATATTGATCCATTAATATT-TCAAAAATTAATAAG---
1 T-ATAC-AGCTTATTCA-AATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAA
* * * * * * * * * *
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61 AAATTTAAAAAATGAATCTATTTACTGAAA-AATTCAAATAGTTATGACTATTTGAACAATTATC
* * ** * * * *
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125 TATTTCAAATCATTATGACAT-TTTGTTTTGTCAAAAAACAA--TGTTTTTCATACAAGCTTGTT
* * * * ***
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* * * * * * *
19790789 TGTGTTTGTTAAACCAGTTCAAATAGTTA-AGACTATTAGAA-AATTATCTATTTCAAATC-GTA
248 TATGTTTATCAAACAAGTTCAAATAGTTATA-ACTATTTGAATAATTATTTATTTCAAATCATTA
** * * *
19790851 TGACTTTTTTGTTTAGTCATAAAACAATTATTTT-AAT
312 TGAC-CATTTGTTTTGTCATAAAATAATT-TTTTCTAT
* * * *
19790888 TCATACAAGCTTATTCAGAATAAAATAATACTAATTTATTAACATTCAAAAAATTAATGAGCAAG
1 T-ATAC-AGCTTATTCA-AATAAAATAAT-CTAATTTATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAA-
* * * * * * * *
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124 CTATTT
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* * * * *
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* * * **
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* *
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* * * * * * *
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* * * *
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* * * *
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* *
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* * * * *
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* ** * * * * *
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* * * ** * * *
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* * * * * *
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* ** * * **
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* * * * * * *
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* * * * ** *
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* ** * * * *
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* * **** * * *
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* * *
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* * *
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** * * *
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* * *
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* * * * * * *
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19791124 AAAGCAAGTT
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ATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTTGTCATAAAACAATTTTTTTA
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*
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*
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19791549 CAAGTACTGT
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AGCAAGAGATTTGAAAAATAAATATATTTACCAAACAAATTCAAAT
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* * * * *
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* * * *
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* * * ** * * * *
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* * * * ** * * *
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* * * *
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* * * * * * *
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* * * * * *
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* * * * * *
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* * *
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* ** *
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* * * * *
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* * * ***
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* *
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* * * * *
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* * *
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* * * * ** * * *
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* * * * * * *
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** * * ** ** * * * * * *
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* * * * * * * * *
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* * * * *
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* * * * * * *
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* * * * * * *
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* ** * * * ** *
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* * * * ** * *
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* * * * ** * * *
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* * * * *
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* * * * * *
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* * * * * * **
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* * * ** *
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* * * * * * *
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* ** * * * * *
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* * * * * * *** * *
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* * * * * * *
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190 TTTC-AAAAATTAATAAG-TAA-GATTT-AAAAAATAAATCTATTTATC-AAACCAGTTCAAAAA
* * * * * * *
19793424 GTGATGACTATTTGAAC-ATTTATTTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGA-TTTGACATAAAAC
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* ** * * * * * * * *
19793487 AATTGTTTCAGTTCATAAAAACTCATCCAAAATAAAATAATACTAATTTCTTAACAATT-T-AAA
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* * * * * * *
19793550 AAT--TAA-T-TAA-A--T--AAAGT---TA--TTTACTAAACAAATTCAAATTGTTATGACTAT
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* * * * * *
19793601 TTGAACAATTGTCTATTTAAAATCATTATGACCTTTTGATTTGTCATAAAA-TAATTGTTTGAAT
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* * * * *
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* * * *
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* * * * * ** * *
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* * * ** * * *
19793825 ATAATAATTGTTTTTAATCATACATGTTTATTCAAAATAAAATAATAGTAATTTATTAAT-TTAC
129 AAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* *
19793889 AAAAATTAATAAGTGAGAGATTTTTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAACCAGTTTAAAAAGTTA
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* * * * *
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* ** *
19794019 TTTTGTTTATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATAAAAATATTCTAAAAAATAGTA
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* * * ** * * * *
19794084 ACTAAGAGATTTAAAAAATAAATTTGTTTGTCAATGTAGTTCAAATAGTTAAGACGATATGAACA
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* *
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* * * ** * * *
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* * *
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* *
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* * * ** * * * * * * * * * * *
19794492 TTTGAGCAGTT-ATTTATTTCAAATTGTTATGATTTTTTGTTCTATTACAAGACAATAATCTCTG
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* * * * * * *
19794556 TTGATAAAAACTTATT-TAAATTAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATTAATAAGT
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* * *
19794683 TAT-TCATTTCAAATCATTATAACTTTTTGTTTTATCAT-AAA-AAATTACTTT-AGTTTATA-T
449 TATCT-ATTTCAAATC----T-A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT--TTTCAATTCATACT
* * *
19794743 CAACTTATTCGAAATAAAATAATATTAAGT
505 -AGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * * * *
19794773 TATTAATATTCTAAAAATTAATAATTTAGAGATTTAAAAAATGAATCTGTTTATCGAACAAGTTT
1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACCAGTTC
* ** * * **
19794838 AAATAATTATGACTATTTGAA-AATTTATCTATTTGAAATCGCTATAACTTTTTGTTTTGTCACC
66 AAATAATTATGACTATTTGAATAA-TTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
** * * * *
19794902 AAA-TGATTTTTTTCTATTAGTACAAGTTTATTTC-AAATAACATAATAC-AATTTATTAATA-T
130 AAACAAATGTTTTTGT-TCA-TACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT
* * * * * * * ** ***
19794963 TAAGAAAATTAATAGGCGAAGATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAATAAGTTCAAATCTTTA
192 TCA-AAAATTAATAAG-TAAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAAAAGTTA
* * * * ** * * * *
19795028 TCACTAATCGAACAATT-ATTTATTTCAAATTGTTATGACTTATTGTTTTGTCATAAAACAATTG
254 TGACTATTTGAACAATTCA--TACTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * * * * * * *
19795092 TTTCTATTCATACAAGCTTATTTGCATTAAAATAATAGTAATATATAAATATTTTGACAAATAAT
317 TTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAAAATAAT
* **
19795157 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGTTCAAATAGTTTTGACTATTTGAAT
382 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAAT
* *
19795222 AATTATCTATTTCAAATCATTGTGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAC-AATTGTTTCAATTCATA-
446 AATTATCTATTTCAAATC----T-A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCAATTCATAC
* * *
19795285 TAAGCTTTTTTG-AATAAAATAATACTAATT
504 T-AGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * * *
19795315 TATTAATATTCTAAAAATTAATTAGTGAGAGAATTAAAAAATTAATCTATTTA-CTAAACATGTT
1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACCA-GTT
* * * *
19795379 CAAATAGTTATGACTATCT-AGATAATTATTTATTTCAAAACATTATGACC-TTTGTTTTGTCAT
65 CAAATAATTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
* * * * *
19795442 AAAACAATTGGTTTTGTTCATGCAAGCTTATTTC-AAATACAATAATA-TAAATTTATTAATATT
129 AAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * * * ** * * *
19795505 CCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAATATGTTTTTTGAACTA-TTCAAATAGTCATG
192 TCAAAAATTAATAAGT-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAAAAGTTATG
* * * * * *
19795569 ACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCATTATGA-TCTTTTGTTTTGTCATAAACCAATTGT
256 ACTATTTGAACAATTCA--TACTTCAAATCATTATAACT-TTTTATTTTGTCATAAAACAATTAT
* * * * *
19795632 TTTTGTTCATA-AAGCTTATTCGGAATAAAATAATAATAATTTATTTAA-ATTCCAAAAATTAAT
318 TTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATA-TTAATATTCTAAAAAATAAT
* * * * *
19795695 AGGTAAAACATTTAAAAGAAGT-AATCTATTTACCAAGCTAGTTCAAATAGTTATGACT-TTTGA
382 AAGTAAAAGATTTAAAA-AA-TAAATATGTTTACCAA-CTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGA
* * * *
19795758 ATAATTATTTATTTCAAATCGTTATGATCTTTTTTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTCTATTCGT
444 ATAATTATCTATTTCAAATC----T-AT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCAATTCAT
* ** * *
19795822 ACAATTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATT
502 ACTAGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
** * * * * * *
19795854 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTTGGAGATTTAAAAAATAAATATGTTCAGCGAACAAGTTT
1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACCAGTTC
* * * * * ** * * * *
19795919 AAATAGTTATGTCCATTTGAGCT-GTTATCTATTTCAAATGGTTATAACATTTTGTTTT-ACTGT
66 AAATAATTATGACTATTTGA-ATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC-AT
* * * *** * * * * *
19795982 AAAATAATTATTTCCATTGATACAAATTTATTGAGAATAAAATAATACTAATTTATTACTATTTC
129 AAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* *
19796047 AAAAATTAATAA--AAGACTT-AAAAATCAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAATAGTTATGAC
194 AAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAAT-AAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAAAAGTTATGAC
* * ** * * * * *
19796109 TACTTCAACAATTACATA-TATCAAATTGTTATGA-TCTTTATTTTGTCTTAAAACAATTGTTTC
258 TATTTGAACAATT-CATACT-TCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATTTT
* * * *
19796172 TGTTCATACAAGCTTATTCGAAGTAAAATATTA-TGAA-ATTAATAATATTC-CAAAAATCAATA
321 TGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACT-AATA-TATTAATATTCTAAAAAAT-AATA
* ** * * * * * * * **
19796234 AGTAAGAGATTTAAAAAGCAAATGTGTTTGCCAAACCAGCTCAAAT-GTGAGGACTAGTAAAATA
383 AGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATA
* * * * * * * *
19796298 ATTATCTATTTTAAATTGTTCTGACCTTTTATTTAGTCATAGAATAATTTTTTCAGTTCATAC-A
447 ATTATCTATTTCAAA----TCT-A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTCAATTCATACTA
* **
19796362 TGCTTAGTCGAAATAAAATAATGCTAATT
506 -GCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * * **
19796391 TATTAACATT-TAGAAAATTAATAAATAAGAAATTTTAAAAAAATAAATATGTTTACCAAATAAG
1 TATTAATATTCTA-AAAATTAATAAGTAAGAGA-TTT-AAAAAATAAATCTGTTTACCTAACCAG
** * ** * * * *
19796455 TTCAAATAGCTATGATTATTTGAACT-ATTATCTATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTCGCTTTAT
63 TTCAAATAATTATGACTATTTGAA-TAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTTGT
* ** * ** * * * * * *
19796518 CACAAAATGATTGTTTCAGTTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATATTACTTTCTTGATA
126 CATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTC-AAAATAAAATAATACTAATTTATTAATA
* * * * *
19796582 TTTCAAAAATTGAA-AAGATAAAGATTGAAAAAATAAGTCAATTTATCAAATCACTTCAAATAA-
190 TTTCAAAAATT-AATAAG-T-AAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAA-AAG
* * *
19796645 TTATGGCTATTTAAACAATT-ATCTCTTTCAAATCATTATGAAC-TTTTATTTTGTCATAAAACA
251 TTATGACTATTTGAACAATTCAT-AC-TTCAAATCATTAT-AACTTTTTATTTTGTCATAAAACA
* * * * * *
19796708 GTTGTTTTTCATT-ATACAAGCCTATTAGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATT-TCAAAA
313 ATTATTTTT-GTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCT-AAAA
* ** * *
19796771 ATTAATAAGTAAAAGATTTATTAAATAAATCTATTTACCGAAC----T--AAT--TT----CTAT
376 AATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT
* * * * * * *
19796824 TTGAACAATTATCTATTTTAAATCATTATAACCCTTTT-TTCTATTATAAAA-TAATTGTTTCAG
440 TTGAATAATTATCTATTTCAAATC--TAT-----TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCAA
* * *
19796887 TTCATA-TAAGCTTATTTGGAATAAAATAATACTAATT
497 TTCATACT-AGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * * * * *
19796924 TAATAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAGCAGTTC
1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACCAGTTC
** * * * * ** * *
19796989 AAATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATA
66 AAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * * ** *** *
19797054 TAA-AAAT-TTTTTGGATCATTCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTTTC
130 AAACAAATGTTTTT-GTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * ** * *
19797117 AAAAATTAATAACTAAGAAATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAATTAGTTTAAATAA---ATA
194 AAAAATTAATAAGTAAG--ATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAA-AAGTTATG
* * * * * *
19797179 ACTATATGAACAATAGT-AAACTACAAATCATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAATTATT
256 ACTATTTGAACAAT--TCATACTTCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * * *
19797243 TTTGTTCATACAAGCTTATTCAAAATAAAATAATATTGATCTAATAATATTCCAAAAATTGATAA
319 TTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAAAATAATAA
* ** * * * * * * *
19797308 CTAAGGGAATTAAAAAATAAATTTGTTTGCTGAACCAGTTCAAATATTTAAGACTATATGAATAA
384 GTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAATAA
* * * *
19797373 TTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTGTTTAGTCATAAAATAAGTTTTTCTGAATTCAAACT
448 TTATCTATTTCAAATC--TAT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATTTTTC--AATTCATACT
* * *
19797438 TGCTTATTTGGAATAAAATAAAATGAATT
505 AGCTTATTCGAAATAAAATAAAAT-AATT
*
19797467 TATTAATATT-TCAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAAT-AATTTGGTTTACCTAACCAGT
1 TATTAATATTCT-AAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCT-GTTTACCTAACCAGT
* * *
19797530 TTAAATAATTATAACTATTTAAATAATTATCTATTTCAAAT-AGTTATGACCTTTTTGTTTTGTC
64 TCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCA-TTATGACC-TTTTGTTTTGTC
* * * * * * *
19797594 ATAAAACAAACGTTTTTGTTCATATAAGTTTGTT-AGGAATAAATTAATACTAATCTGTTAATAT
127 ATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATAT
*
19797658 TTCAAAAATTAATAA--AAGATTTAAAAAATAAA--TATTTATCAAACGAGTTCAAATAA-TTAT
191 TTCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAA-AAGTTAT
* ** * * * * *
19797718 GACTATTTGAGCAATT-ATTTGTTTCAAAT-AGTTATTACTTGTTGTTTTGTTATAAAACAATTG
255 GACTATTTGAACAATTCA--TACTTCAAATCA-TTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTA
* * * * * * * *
19797781 TTTCTATTCATACAAGCTTATATAG-ATTAAAAAAATACTAATTTATTAATATT-TCAACAATAA
317 TTTTTGTTCATACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAAAAT-A
* * * * * * *
19797844 ACAAGTAAAA-ATTTTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCAAATAATCATGACT-TCT
380 ATAAGTAAAAGA--TTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT-T
* * *
19797907 TTAATAATTATCTATTTCAAATC-A-TTATGAACTTTTG---T--------TTTGTC-A-T-ATA
441 TGAATAATTATCTATTTCAAATCTATTTTTG---TTTTGTCATAAAACAAATTTTTCAATTCATA
* * *
19797956 -AAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAAGT
503 CTAGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * ** * *
19797986 TATCAATATTAC-GAAAA-T--TAA-TAAGAGACTTAAAAAATGAATCT-TTTTGCTAAGCAACT
1 TATTAATATT-CTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAA-CCAGT
* * * * * * *** ** *
19798045 TTAAATAATTATGACTATTTCAATCATTTTCTTTTTGAAATTGCTACAACTTTTTGTTTTGTCAT
64 TCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCAT
**** * * * *** ** *
19798110 AATTTGATTTTTTTTATTCATACAAGTTTATTTTGAATAAAATAATAAGAATTTATTAATA--TA
129 AAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC
* * * * * * **
19798173 AAGATAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAAAATAAATTTGTTTACCGAACAAGTTC-AAATCTTA
194 AA-A-AATTAATAAGT--AAGATTT-AAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAAAAGTTA
* * * *
19798237 TGACTATTTGAACAATT-ATTTATTTCAAATTC-TTATGACTTTCTATTTTGTCATAAAATAATT
254 TGACTATTTGAACAATTCA--TACTTCAAA-TCATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATT
* * * * * * * * * *
19798300 ATTTCTATTCATACAAGCTTACTC-AAACTACAATAATATTAATTTATGAATATT-TCGACAATT
316 ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAA-TAAAATAATACTAATATATTAATATTCT-AAAAAAT
** * *** * * **
19798363 AATAAGTAAAATTTTTAAGAAATAAATATGTTTTTTGAACAAGTACAAATAGTCT-TCACTATTT
379 AATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATG-TTTACCAACTAGTTCAAATAGT-TAAGACTATTT
* * * * *
19798427 AAATAATTATCTATTTTAAATCATTGCGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAC-AATTGTTTCAGTTC
442 GAATAATTATCTATTTCAAATC--T---A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCAATTC
* **
19798491 ATA-TAAGCTTATTTGAAATAAAATAATCTTAATT
500 ATACT-AGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * *
19798525 TATTAATATTCCAAAAATTAATGAA-TAAGAGAATTAAAAAATGAATCTATTTA-CTGAA-CATG
1 TATTAATATTCTAAAAATTAAT-AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCT-AACCA-G
* * * **
19798587 TTTAAATAGTTATGACTATCTGAATAATTATCTATTTCAAAAT-ATTATGATATTTTGTTTTGTC
63 TTCAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTC-AAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTC
* * * * ** *
19798651 ATAAAATAATTGGTTCTGTTCACGCAAGCTTATTTC-AAATAAAATAATA-TAAATTTATTAATA
127 ATAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTA-TTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATA
* * * * *
19798714 TTT-AAAAA-TAATAAGTAAAAATTTAAAAAATAAAT-AATTTTTTTAAACACA-TTCAAATAGT
190 TTTCAAAAATTAATAAGT-AAGATTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAAC-CAGTTCAAAAAGT
* * * * * *
19798775 TATGACTATTTGAATAATT-ATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTATATTTGTCATAAACCAA
252 TATGACTATTTGAACAATTCA--TACTTCAAATCATTATAACTTTTTAT-TTTGTCATAAAACAA
* * * * * * * *
19798839 TTGTTTCTATTCATAAAAAGCTTATATTG-AATAAAATAATGCTAATTTATTAAAATTCTAAAAA
314 TTATTTTTGTTCAT-ACAAGCTTAT-TCGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAAA
* * * * * *
19798903 TTAATAAGTAAAATATTTAAAAAATAAATATGTTTACTAAGTGAGTTTAAATAGTTATGACTATT
377 ATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCAACT-AGTTCAAATAGTTAAGACTATT
* * * **
19798968 TAAATAATTATTTATTTCGAATTGCTATGATCTTTTGTTTTGTCATAAAAC-AATTGTTTTTATT
441 TGAATAATTATCTATTTC-AAAT-C--T-AT-TTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCAATT
* * * ** *
19799032 CACA-TAAGTTTATTCAAAATAAAATAATTCTAACT
499 CATACT-AGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * * *
19799067 TATTAATATTCTTAAAATTAATAAGTTAA-AGCTTTAAAAAATAAATTTGTTCA-TTGAACAAGT
1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAG-TAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCT-AACCAGT
* * * * * * * **
19799130 TCATATAGTTA-GATCCATTTG-------AGCTA--TCAAATCGTTATGACATTTTGTTTTCTTG
64 TCAAATAATTATGA-CTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCA
* * * ** *
19799185 TAAAACAATTGTTTCTATTCATACAAAATTATTTAAAATAAAATAATA-TCAATTTATTAATATT
128 TAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATATT
* * * ** * *
19799249 TCAAAAATTAATAAG--AGATTTAAAAACTAAATCTATTTATCGAACCAATTTTAATAGTTATGG
192 TCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAATAAATCTATTTATCAAACCAGTTCAAAAAGTTATGA
* * * *
19799312 TTATTTGAACAATT-AT-CTATCTCAAATCATTATAA-TCTTTGTTTTGTCATAAAACAATTCTT
257 CTATTTGAACAATTCATAC--T-TCAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATAAAACAATTATT
* * * * * * * * * * *
19799374 TATATTCGTACAAGCTTAATT-GTAGTAAATTATTATTAA-ATTAATAGTATTCTAAAAATTAAT
319 TTTGTTCATACAAGCTT-ATTCGAAATAAAATAATACTAATA-TATTAATATTCTAAAAAATAAT
* * * * * * * * *
19799437 AAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATGTATTTGCTGAACCAATTCAAGT-GATTAAGACTATTAGAA
382 AAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTAC-CAACTAGTTCAAATAG-TTAAGACTATTTGAA
* * ** *
19799501 TAATTATCTATTTCAAATCGTTATGACCTTTTGTTTAGTCATAAAA-TAATGTTTTCAGCTCATG
445 TAATTATCTATTTCAAATC--TAT----TTTTGTTTTGTCATAAAACAAAT-TTTTCAATTCATA
* * *
19799565 C-ATGTTTATACGAAATAAAATAATACTAATT
503 CTA-GCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* ** * * * ** * *
19799596 TATTAACATTC-AAAAATTAATAAACAACAAATTTTAAAAAATAAATCTATTTTTCGAACAAGTT
1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGA-TTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACCAGTT
* * * * * * *
19799660 CAAATAGTTATGGCTATTTGAACAATTATCTATTT-ATTATAAATATGACCTTTT-TTTTCATCA
65 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCA-AATCATTATGACCTTTTGTTTT-GTCA
* *** * * * *
19799723 TAAAACAATTGTTTCAATTCATAAAAGTTTA-TCTGAAATAAAATAATA-TGACTTTATTAATGT
128 TAAAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTC-AAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * ***
19799786 TTCAAAAATTGATAAGTTAGAGATTTTAAAAAA-AAGT-TAGTTTATCGAATTGGTTCAAATAA-
191 TTCAAAAATTAATAAG-TA-AGA-TTTAAAAAATAAATCTA-TTTATCAAACCAGTTCAAA-AAG
* * * * * ** * * * * * *
19799848 TTTTGGCCATTTGAACAATT-ATCTATTTTAAATTGTTACAAAC-TTCTGTTTTCTTATAAAATA
251 TTATGACTATTTGAACAATTCA--TACTTCAAATCATTA-TAACTTTTTATTTTGTCATAAAACA
* ** * * * * *
19799911 ATTGTTTTTCATCATAAAAG-TCTATTCGGAATAAAATAATATTAATTTATTAATATT-TCAAAT
313 ATTATTTTTGTTCATACAAGCT-TATTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCT-AAAA
** * * **
19799974 TTTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCGAAC-----C-AATTCTT--G--TA-
376 AATAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTAT
* * * * * * * *
19800028 -TGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATAACTTTTTGTTCTATTATAAAA-TAATTGTTTTAGT
440 TTGAATAATTATCTATTTCAAA----TCT-A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAAATT-TTTCAAT
* * * *
19800091 TCATA-TAAACTTATTTGGAATAAAATAATATTAATT
498 TCATACT-AGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * * * ** *
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1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAGATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCT-AACCAGTT
* * * * ** * * *
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65 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACCTTTTGTTTTGTCATA
* * *** ** *
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130 AAACAAATGTTTTTGTTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAAT-A-ATACTAATTTATTAATA-TT
* * * * * *
19800321 TC-AAAATTAATAAGT-A-ATTTAAAAAGTGAA-CTTGTTTACCGAATCAGTTCAAATAA-TTAT
192 TCAAAAATTAATAAGTAAGATTTAAAAAATAAATC-TATTTATCAAACCAGTTCAAA-AAGTTAT
* * *** ** * * * *
19800381 GGCCATGCCAACAATT-AT-CTATTCCAAATTGTTATTACCTTTTGTTTGGTCATATAAA-AATT
255 GACTATTTGAACAATTCATAC--TT-CAAATCATTATAACTTTTTATTTTGTCATA-AAACAATT
* * *** * * * * *
19800443 GTATTTAAACATTCAAGCTTATTTGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TCAAAAAT--
316 ATTTTTGTTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAATACTAATATATTAATATTCTAAAAAATAA
* * ** * * **
19800505 TAA-TAAGAGAATTAAAAAATAAACCTATTTACCAAAGTAGTT-AAATAGTTCTGACTATTTGAA
381 TAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACC-AACTAGTTCAAATAGTTAAGACTATTTGAA
* * ** * * * *
19800568 CAATTGTAAACTTCAAATCCTTATAACTTTTTGTATTGTCATAAAGCAATTATTTTT--GTTCAT
445 TAATTATCTATTTCAAAT-C---T-A-TTTTTGTTTTGTCATAAAACAA--ATTTTTCAATTCAT
* * * * *
19800631 ACAAGCTTATTCAAAATAAAGTAATACTAATC
502 ACTAGCTTATTCGAAATAAAATAA-AATAATT
* * * * * * * *
19800663 TAATAATATTCCAAAAATTAATAACTAAGAGCA-TCAAAAAATAAATTTGTTTGCCAAACCAATT
1 TATTAATATTCTAAAAATTAATAAGTAAGAG-ATTTAAAAAATAAATCTGTTTACCTAACCAGTT
* ** * * ** *
19800727 CAAATATTTAAAACTATATGAACAATTATCTATTTCAAATTGTTATGACCTTTTTATTTTGTCAT
65 CAAATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGACC-TTTTGTTTTGTCAT
* * * * * * *** *
19800792 AAAATAAGTTTTTTTGAATTTATACTAGCTTATTTGCAATAAAATAA-AATGAATTTATTAATAT
129 AAAACAAATGTTTTTG--TTCATACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACT-AATTTATTAATAT
* * * * * * *
19800856 TTTAAAAATTAATAAGT--GATTTAAAAAATAATTTTATTTACCTAACTAGTTTAAATAA-TTAT
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* * * * *
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* * * *
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*** * * * * * *
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* * *
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*** *
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* * *
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*
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*
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*
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* * * * *
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*
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* *
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19795916 TTTAAATAGTTATGTCCATTTGAGCTGTTATCTATTTCAAATGGTTATAACATT-TTGTTTT-AC
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316 CTGTTCATAAAAACTTATTTC-AAATAAAATAAT-ATAAATTTATTAATATTCCA-AAAATTAAT
* * * *
19796413 AAATAAGAAATTTTAAAAAAATAAATATG-TTTACCAAATAAGTTCAAATAG-CTATGATTATTT
378 AAGTAA-AAA-TTT-AAAAAATAAATATGTTTTACCAACTAA--TCAAATAGTC-ATAACTATTT
* ** * * * * * * * *
19796476 GAACT-ATTATCTATTT-ATAAGAAGTATGACCTTTCGCTTTATCACAAA-ATGATT-GTTTCAG
437 GAA-TAAGTATCTATTTCA-AATCATTATAATCTTTTGTTTTATCATAAACA-AATTACTTT-AG
* * ** * * * *
19796537 TTCATAAAAGCTTA-TCTAAAATAAAATAATATTACTTTCTTGATATTTCAAAAATTGAA-AAG-
498 TTCAT-AAAGCTTATTC-GAAATAAAATAATAATAAGTTATTTAAATTCCAAAAATT-AATAAGT
* * * * * * * * *
19796599 ATAAAGATTGAAAA-AA-TAAGTCAATTTATCAAATC-ACTTCAAATAATTATGGCTATTTAAAC
560 A-AAACATTTAAAAGAAGTAA-TCTATTTA-CCAAGCAAGTTCAAATAATTATGACT-TTTGAAT
* ** * * * *
19796661 AATTATCTCTTTCAAATCATTATGAACTTTTATTTTGTCATAAAACAGTTGTTTTTCATTA-TAC
621 AATTATCTATTTCAAATCGCTATGAACTTTTTTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCT-ATTAGTAC
** ***
19796725 AAGCCTATT-AGAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTTC-AAAAATTAATAAGTAAAAGAT
685 AAGTTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGGCGAAGAT
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19796788 TTATTAAATAAATCTATTTACCGAAC----T--AAT-TTCTAT---T--T-GAACAATTATCTAT
748 TTAAAAAATAAATATGTTCACCGAACAAGTTCAAATCTT-TATCACTAATCGAACAATTATTTAT
* ** * * * * * * * *
19796840 TTTAAATCATTATAACCCTT-TT-TTCTATTATAAAA-TAATTGTTTCAGTTCATATAAGCTTAT
812 TTCAAATTGTTATGA--CTTATTGTTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACAAGCTTAT
* * * *
19796902 TTGGAATAAAATAATACT-AATTTAA
874 TCGAAATAAAATAA-AATGAATTCAA
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19796927 TAATATTCCAAAAATTGATAACTAAGATATTTAAAAAATAAATCTGTTTATCAAAGC-AGTTCAA
1 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAA-CAAGCTCAA
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19796991 ATAATTAAAACTATATGAACAATTATCTGTTTATAAAAAATTATGGCCTTTTGTTTGGTCATATA
65 ATAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTT-CAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTAATA-A
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19797056 AA-AATTTTTTGGA-TCAT-TCAAGCCTATTTGGAATAAAATAATACTAATTTATTAATCTT-TC
128 AACAAATGTTTCAATTCATAT-AAG-CTTTTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCT-
** * *
19797117 AAAAATTAATAACTA-AGA-AATTTAAAAAATAAATCTATTTACCGAA-TTAGTTTAAATAA---
190 AAAAATTAAT---TAGAGAGAA-TTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACAT-GTTCAAA-AAGTT
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19797176 ATAACTATAT-GAACAA-TAGTAAACTACAAATCATTATAACCTTTTGTTATGTCATAAAACAAT
249 ATGACTATCTAG-ACAATTA-TTTATTTCAAAACATTATGACC-TTTGTTCTATCACAAAACAAT
* * * * ** * *
19797239 TATTTTTGTTCATACAAGCTTA-TTCAAAATAAAATAATATTGATCTAATAATATTCCAAAAATT
311 TAATTCTGTTCATAAAAACTTATTTC-AAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATT
* * * * * * * * * *
19797303 GATAACTAAGGGAA-TTAAAAAATAAATTTG-TTTGCTGAACCAGTTCAAATATTTA-AGACTAT
375 AATAAGTAA--AAATTTAAAAAATAAATATGTTTTAC-CAACTA-ATCAAATAGTCATA-ACTAT
* * * * *
19797365 ATGAATAATTATCTATTTCAAATCGTTATAACCTTTTG-TTTAGTCATAAA-ATAAGTT-TTTCT
435 TTGAATAAGTATCTATTTCAAATCATTATAATCTTTTGTTTTA-TCATAAACA-AA-TTACTT-T
* * * * * *
19797427 GAATTCA-AACTTGCTTATTTGGAATAAAATAA-AATGAATTTA-TTAATATTTCAAAAATTAAT
496 -AGTTCATAA--AGCTTATTCGAAATAAAATAATAAT-AAGTTATTTAA-ATTCCAAAAATTAAT
* * * * * * * *
19797489 AAGTAAGAGATTTAAAA-AA-TAATTTGGTTTACCTAA-CCAGTTTAAATAATTATAACTATTTA
556 AAGTAAAACATTTAAAAGAAGTAATCT-ATTTACC-AAGCAAGTTCAAATAATTATGACT-TTTG
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19797551 AATAATTATCTATTTCAAATAGTTATGACCTTTTTGTTTTGTCATAAAACAAACGTTTTTGTTCA
618 AATAATTATCTATTTCAAATCGCTATGAACTTTTT-TTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATT-A
* * * * * *
19797616 -TATAAGTTTGTT-AGGAATAAATTAATACTAATCTGTTAATATTTC-AAAAATTAATAA----A
681 GTACAAGTTTATTCA-AAATAAAATAATACTAATTTATTAATA-TTCAAAAAATTAATAAGGCGA
* * * ** * * * *
19797674 AGATTTAAAAAATAAATAT-TT-ATCAAACGAGTTCAAATAATTATGACTATTTGAGCAATTATT
744 AGATTTAAAAAATAAATATGTTCACCGAACAAGTTCAAATCTTTATCACTAATCGAACAATTATT
* * * * * * *
19797737 TGTTTCAAATAGTTATTACTTGTTGTTTTGTTATAAAAC-AATTGTTTCTATTCATACAAGCTTA
809 TATTTCAAATTGTTATGACTTATTGTTTTGTCATAAAACAAAAT-TTTCAATTCATACAAGCTTA
* * * *
19797801 TATAG-ATTAAAA-AAATACT-AATTTAT
873 T-TCGAAATAAAATAAA-A-TGAATTCAA
* * * * * * * *
19797827 TAATATTTCAACAATAAACAAGTAAAA-ATTTTTTAAAAATAAATATGTTTACTGAACTAGATCA
1 TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGA--TTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGCTCA
* * * *
19797891 AATAATCATGACT-TCTTTAATAATTATCTATTTCAAATCATTATGAACTTTTGTTTTGT
64 AATAATTATGACTAT-TTGAATAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGT
19797950 CATATAAAGC
Statistics
Matches: 4273, Mismatches: 911, Indels: 618
0.74 0.16 0.11
Matches are distributed among these distances:
879 1 0.00
880 6 0.00
881 133 0.03
882 53 0.01
883 20 0.00
884 5 0.00
885 89 0.02
886 42 0.01
887 12 0.00
888 80 0.02
889 235 0.05
890 128 0.03
891 99 0.02
892 301 0.07
893 443 0.10
894 266 0.06
895 278 0.07
896 385 0.09
897 29 0.01
898 20 0.00
899 121 0.03
900 674 0.16
901 457 0.11
902 135 0.03
903 121 0.03
904 127 0.03
905 13 0.00
ACGTcount: A:0.42, C:0.10, G:0.08, T:0.40
Consensus pattern (898 bp):
TAATATTTTAAAAATTAATAAGTAAAAGATTTAAAAAATAAATATGTTTACCGAACAAGCTCAAA
TAATTATGACTATTTGAATAATTATCTATTTCAAATCACTATGACCTTTTGTTTTGTAATAAAAC
AAATGTTTCAATTCATATAAGCTTTTTAAAATAAAATAATACTAATTTATTAATATTCTAAAAAT
TAATTAGAGAGAATTAAAAAATAAATCTATTTACTAAACATGTTCAAAAAGTTATGACTATCTAG
ACAATTATTTATTTCAAAACATTATGACCTTTGTTCTATCACAAAACAATTAATTCTGTTCATAA
AAACTTATTTCAAATAAAATAATATAAATTTATTAATATTCCAAAAATTAATAAGTAAAAATTTA
AAAAATAAATATGTTTTACCAACTAATCAAATAGTCATAACTATTTGAATAAGTATCTATTTCAA
ATCATTATAATCTTTTGTTTTATCATAAACAAATTACTTTAGTTCATAAAGCTTATTCGAAATAA
AATAATAATAAGTTATTTAAATTCCAAAAATTAATAAGTAAAACATTTAAAAGAAGTAATCTATT
TACCAAGCAAGTTCAAATAATTATGACTTTTGAATAATTATCTATTTCAAATCGCTATGAACTTT
TTTTTTGTCACAAAACAATTGTTTCTATTAGTACAAGTTTATTCAAAATAAAATAATACTAATTT
ATTAATATTCAAAAAATTAATAAGGCGAAGATTTAAAAAATAAATATGTTCACCGAACAAGTTCA
AATCTTTATCACTAATCGAACAATTATTTATTTCAAATTGTTATGACTTATTGTTTTGTCATAAA
ACAAAATTTTCAATTCATACAAGCTTATTCGAAATAAAATAAAATGAATTCAA
Done.